CN1926431A - 地衣芽孢杆菌染色体 - Google Patents
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Abstract
本发明涉及地衣芽孢杆菌全染色体的分离的多核苷酸。本发明还涉及地衣芽孢杆菌染色体的编码生物活性物质的分离的基因，还有包括这些基因的核酸构建体、载体和宿主细胞，以及生产这些基因所编码的生物活性物质的方法和利用地衣芽孢杆菌全染色体的分离的基因的方法。
Description
发明背景
发明领域
本发明涉及包含地衣芽孢杆菌(Bacillus licheniformis)全染色体的分离的多核苷酸分子。本发明还涉及地衣芽孢杆菌全染色体DNA分子的编码生物活性物质的特征(feature)(基因)，和包含该特征的核酸构建体、载体和宿主细胞，以及生产由这些特征所编码的生物活性物质的方法，和使用来自地衣芽孢杆菌全染色体DNA分子的分离的特征的方法。
相关技术的描述
构成地球的大部分生物质(biomass)的微生物，已经进化了大约38亿年。在几乎任何环境里都能找到它们：它们在热、冷、辐射、压力、盐、酸性和黑暗等极端环境下都能生存并且旺盛地生长。通常在这样的环境中找不到其他的生命形式，唯一的营养物来自无机物质。环境适应的多样性和范围显示微生物在很久以前就已经“解决”了许多现在的科学家们仍在积极寻求解决的问题。确定微生物的全基因组序列的价值在于，它提供了该生物体的一幅详细的蓝图，揭示了所有生化途径、底物、中间体、终产物以及调控网络，还有和其他微生物的进化上的联系。全体蛋白质，包括结构性的和催化性的，以及它们在细胞中可能的位置，都被编码为包括基因组的DNA分子中的一系列特征。
对于微生物能力的巨大范围的认识，广泛和深远地影响了环境、能源、卫生健康和工业应用，例如有毒废物的清除、新型治疗和预防剂(药物和疫苗)的生产，能量生产，可再生能源的开发，用于改进工业过程的化学催化剂、试剂和酶的生产，环境中碳、氮和营养物循环的管理、致病生物的检测和食品和供水的安全监测，应用遗传改变的细菌作为活的传感器(生物传感器)来检测土壤、空气或水中的有害化学物质，以及了解微生物细胞所用来在自然环境中生存的专门的系统等。
地衣芽孢杆菌是一种形成芽孢的革兰氏阳性细菌，是环境中广泛分布的一种腐生生物(saprophytic organism)。和主要为好氧的其他芽孢杆菌不同，地衣芽孢杆菌是一种兼性厌氧菌，这使得它可以在更多生态位(ecologicalniche)中生长。这种生物产生多种被认为对自然中营养物循环的过程有贡献的胞外酶(Claus，D和Berkely，R.C.W.，1986，于Bergy’s Manual of systematicBacteriology，Vol.2.中，Sneath，P.H.A.等编，Williams and Wilkins Co.，Baltimore，MD，第1105-1139页)。某些地衣芽孢杆菌分离物有反硝化作用(denitrification)的能力，但是这种特性与环境中的反硝化作用相关性可能较小，因为这种生物通常以内生孢子(endospore)的形式在土壤中维持生存(Alexander，M.，1997，Introduction to Soil Microbiology.John Wiley and Sons，Inc.，New York)。
地衣芽孢杆菌和它的胞外产物在工业和农业上有很多应用。这种生物用于制造工业用酶，包括数种蛋白酶，α-淀粉酶、青霉素酶、戊聚糖酶(pentosanase)、环葡萄糖基转移酶(cycloglucosyltransferase)、β-甘露聚糖酶，和数种果胶分解酶(pectinolytic enzyme)，已经有数十年的历史，这主要是由于它能分泌相当大量的降解酶。地衣芽孢杆菌还被用来生产肽类抗生素(peptide antibiotics)，例如杆菌肽(bacitracin)和抗变形菌素(proticin)，以及多种专门化学品，例如柠檬酸、肌苷、肌苷酸和聚γ-谷氨酸。来自地衣芽孢杆菌的蛋白酶用于去污剂工业和皮革的脱毛和软化(batting)(Eveleigh，D.E.，1981，Scientific American 245，155-178)。来自地衣芽孢杆菌的淀粉酶被用于水解淀粉、织物脱浆和纸上浆(Erickson，R.J.，1976，于Microbiology中，Schlesinger，D.编(Am.Soc.Microbiol.，Washington DC)，406-419页)。某些地衣芽孢杆菌菌株显示破坏危害玉米、草类和蔬菜作物的真菌病原体的效用(美国专利5,589,381；美国专利5,665,354)。作为一种形成内生孢子的细菌，这种生物在不利环境条件下存活的能力可能会提高其作为自然控制剂(natural control agent)的潜力。
可以基于分解代谢和生理试验(Logan，N.A.和Berkley，R.C.W.，1981，于The aerobic Endospore-Forming Bacteria：Classification and Identification中，Berkley R.C.W.和Goodfellow，M.编，Academic Press，Inc.London，第106-140页；O’Donnell，A.G.，Norris，J.R.，Berkely R.C.W.，Claus，D.，Kanero，T.，Logan，N.A.，和Nozaki，R.，1980，Internat.J.Systematic Bacteriol.30：448-459)将地衣芽孢杆菌和其他的芽孢杆菌区分开。但是，在亲缘关系较近的物种之间，生化和表型的特征可能是不明确的。最近Lapidus等(Lapidus，A.，Galleron，N.，Andersen，J.T.，J_rgensen，P.L.Ehrlich，S.D.，和Sorokin，A.，2002，FEMS Microbiol.Lett.209：23-30)使用PCR方法建立了地衣芽孢杆菌基因组的物理图谱，并确定了多个共线性区(regions of co-linearity)，在这些共线性区中，基因的内容和组织表观上与枯草芽孢杆菌的基因组相保守。
获得地衣芽孢杆菌模式株ATCC 14580的染色体DNA分子的全部一级结构对于本技术领域是有利的。掌握了全部的染色体数据，就可能进行比较性基因组和蛋白质组研究，从而可以获得更优良的工业用菌株，还可以更好地了解枯草-地衣芽孢杆菌组(subtilis-lichenformis group)中亲缘关系紧密的芽孢杆菌之间的基因组进化。
本发明的目的是提供具有地衣芽孢杆菌全染色体序列的分离的多核苷酸。
发明概述
本发明涉及地衣芽孢杆菌ATCC 14580的全染色体DNA分子的分离的多核苷酸，其具有SEQ ID NO：1的核苷酸序列。
本发明还涉及地衣芽孢杆菌ATCC 14580的全染色体DNA分子的分离的特征(基因)，其编码生物活性物质，并选自：
(a)包含与SEQ ID NOs：2-4198的任一多核苷酸具有至少60％同一性的核苷酸序列的基因；和
(b)包含在至少中等严紧条件下与SEQ ID NOs：2-4198的任一多核苷酸或其互补链杂交的核苷酸序列的基因。
本发明还涉及由这些分离的基因编码的生物活性物质，以及包含这些基因的核酸构建体、载体和宿主细胞。
本发明还涉及生产所述具有生物活性的物质的方法，其包括(a)在适于生产该生物活性物质的条件下培养含有核酸构建体的重组宿主细胞，所述核酸构建体包含编码该生物活性物质的基因；和(b)回收该生物活性物质。
本发明还涉及监测在第一细菌细胞中的多个基因相对于一种或更多的第二细菌细胞中相同基因的表达的差异表达(differential expression)的方法，其包括：
(a)在一定条件下，将用检测报道分子标记的(reporter-labeled)从细菌细胞中分离的核酸的混合物加入含有地衣芽孢杆菌基因阵列的底物中，所述地衣芽孢杆菌基因阵列选自核苷酸SEQ ID NOs：2-4198、SEQ IDNOs：2-4198的互补链和SEQ ID NOs：2-4198的片段；在所述一定条件下，所述检测报道分子标记的核酸与所述阵列上的地衣芽孢杆菌基因的互补序列杂交；其中来自所述第一细菌细胞和一种或更多的第二细菌细胞的核酸分别被第一检测报道分子和一种或更多的不同的第二检测报道分子所标记；
(b)在一定条件下检查该阵列，在该条件下，其中所述细菌细胞中的基因的相对表达是由所观察到的阵列上每个点的检测信号决定的，其中，(i)阵列上与来自上述第一细菌细胞或上述一种或多种第二细菌细胞的核酸杂交的地衣芽孢杆菌基因，分别产生独特的第一检测信号或者一种或多种第二检测信号；和(ii)阵列上与来自第一细菌和一种或多种第二细菌的核酸都杂交的地衣芽孢杆菌基因产生独特的联合检测信号。
本发明还涉及分离编码酶的基因的方法，其包括：
(a)在一定条件下，向地衣芽孢杆菌基因的阵列加入标记的第一和第二核酸探针的混合物，所述第一核酸探针是从在不含诱导底物的培养基上培养的微生物菌株中分离的；所述第二核酸探针是从在含有诱导底物的培养基上培养的微生物菌株中分离的；所述地衣芽孢杆菌基因选自核苷酸SEQID NOs：2-4198、SEQ ID NOs：2-4198的互补链或SEQ ID NOs：2-4198的片段；在所述一定条件下，所述标记的核酸探针与所述阵列上的地衣芽孢杆菌基因的互补序列杂交；其中，所述第一核酸探针由第一报道分子(reporter)所标记，所述第二核酸探针由第二报道分子所标记；
(b)在一定的条件下检查该阵列，在该条件下，微生物菌株的基因的相对表达是由所观察到的阵列上每个点的杂交报道分子信号决定的，其中，(i)阵列上与第一核酸探针杂交的地衣芽孢杆菌基因产生独特的第一杂交报道分子信号，而与第二核酸探针杂交的地衣芽孢杆菌基因则产生独特的第二杂交报道分子信号；和(ii)阵列上与第一和第二核酸探针都杂交的地衣芽孢杆菌基因产生独特的联合杂交报道分子信号；及
(c)从微生物菌株中分离编码降解或转化该底物的酶的基因。
本发明还涉及由这些方法所分离的基因，和含有这些基因的核酸构建体、载体和宿主细胞。
定义
生物活性物质：本文中术语“生物活性物质”定义为任何这样的物质，其由单个基因或由组成生物合成或代谢途径或操纵子的一系列基因(相邻的或非相邻的)所编码，或者其可能是地衣芽孢杆菌染色体的单个基因或一系列基因的产物的直接或间接结果。这样的物质包括但不限于，生物聚合物、代谢物及细胞结构和组分(例如核糖体、鞭毛等)。对本发明而言，生物活性可以根据本技术领域已知的程序来确定，例如Carpenter和Sabatini，2004，Nature 5：11-22；Sordie等，2003，Proceedings of the National Academy ofSciences USA 100：11964-11969；Braun和LaBaer，2003，TRENDS inBiotechnology 21：383-388；及Kaberdin和McDowall，2003，Genome Research13：1961-1965所描述的那些。
在本发明的方法中，所述生物聚合物可以是任何生物聚合物。术语“生物聚合物”在本文中定义为由相同的，相似的或不相似的亚单位(单体)组成的链(或聚合物)。所述生物聚合物可以是但不限于，核酸、多胺、多元醇、多肽(或聚酰胺)或多糖。
在一个优选的方面中，所述生物聚合物是多肽。该多肽可以是任何具有目标生物活性的多肽。术语“多肽”在本文中不是指特定长度的被编码的产物，而因此包括肽、寡肽和蛋白质。术语“多肽”还包括天然存在的等位变异。
在一个优选的方面中，该多肽是抗体、抗原、抗微生物肽、酶、生长因子、激素、免疫扩张剂(immunodilator)、神经递质、受体、报道蛋白、结构蛋白、转录因子和转运蛋白。
在一个更优选的方面中，所述多肽是氧化还原酶、转移酶、水解酶、裂合酶、异构酶或连接酶。在最优选的方面中所述多肽是α-葡萄糖苷酶、氨肽酶、淀粉酶、糖酶、羧肽酶、过氧化氢酶、纤维素酶、几丁质酶、角质酶、环糊精糖基转移酶、脱氧核糖核酸酶、酯酶、α-半乳糖苷酶、β-半乳糖苷酶、葡糖淀粉酶、葡糖脑苷脂酶、α-葡萄糖苷酶、β-葡萄糖苷酶、转化酶、漆酶、脂肪酶、甘露糖苷酶、变位酶(mutanase)、氧化酶、溶果胶酶(pectinolyticenzyme)、过氧化物酶、磷脂酶、肌醇六磷酸酶、多酚氧化酶、蛋白水解酶、核糖核酸酶、转谷氨酰胺酶、尿激酶或木聚糖酶。
在另一个优选的方面中，所述多肽是胶原或明胶。
在另一个优选的方面中，所述生物聚合物是多糖。该多糖可以是任何多糖，包括但不限于，粘多糖(例如肝素和透明质酸)和含氮多糖(例如几丁质)。在一个更优选的方面中，所述多糖是透明质酸(乙酰透明质酸)。
在本发明的方法中，所述代谢物可以是任何代谢物。该代谢物可由，例如生物合成或代谢途径的一个或多个基因所编码。术语“代谢物”包括初级和次级代谢物。初级代谢物是细胞的初级代谢或一般代谢(generalcatabolism)的产物，其与能量代谢、生长和结构有关。次级代谢物是次级代谢的产物(参见，例如，R.B.Hubert，The Biosythesis of Secondary Catabolites，Chapman and Hall，New York，1981)。
初级代谢产物可为但不限于氨基酸、脂肪酸、核苷、核苷酸、糖、甘油三酯或维生素。
次级代谢产物可为但不限于生物碱、香豆素、类黄酮、聚酮化合物、奎宁、类固醇、肽或萜。在一个优选的方面中，所述次级代谢产物是抗生素、拒食剂、引诱剂、杀菌剂、杀真菌剂、激素、杀虫剂或杀鼠剂。
分离的生物活性物质：术语“分离的生物活性物质”在本文中定义为，如通过SDS-PAGE，HPLC，毛细管电泳或其他本技术领域中所用方法确定的，具有至少大约20％纯度，优选至少大约40％纯度，更优选大约60％纯度，更优选大约80％纯度，最优选大约90％纯度，和甚至最优选大约95％纯度的物质。
基本上(substantially)纯的生物活性物质或纯的生物活性物质：术语“基本上纯的生物活性物质”在本文中定义为生物活性物质的制备物，其含有以重量计最多10％，优选最多8％，更优选更多6％，更优选最多5％，更优选以重量计最多4％，最多3％，甚至更优选最多2％，最优选最多1％，和甚至最优选最多0.5％的天然地伴随该生物活性物质的其他物质。因此，优选地，该基本上纯地生物活性物质具有至少92％，优选至少94％，更优选至少95％，更优选至少96％，更优选至少97％，还更优选至少98％，最优选至少99％，和甚至最优选99.5％的纯度，以制备物中存在的总物质的重量计。术语“纯的生物活性物质”在本文中定义为生物活性物质的制备物，其不含有天然地伴随该生物活性物质的其他物质。
本发明的生物活性物质优选地为基本上纯的形式。具体地，该生物活性物质优选地为“实质上(essentially)纯的形式”，即，该生物活性物质的制备物实质上不含有(essentially free of)天然地伴随该生物活性物质的其他物质。这可以通过例如使用熟知的重组方法或经典的纯化方法制备该生物活性物质来实现。
同一性(identity)：两个氨基酸序列或两个核苷酸序列之间的相关性以参数“同一性”来描述。
对于本发明而言，两个氨基酸序列之间的同一性的程度通过如ParacelInc.(Pasadena，CA)所实施的用于Genematch2的Smith-Waterman蛋白质方法，或如Altschul等，1990，Journal of Molecular Biology 215：403-410所描述的BLASTP方法来确定。
对于本发明而言，两个核苷酸序列之间同一性的程度通过用于Genematch2的Smith-Waterman核苷酸方法或者如Paracel Inc.所实施的用于BlastMachine的BLASTN来确定。
多肽片段：本文中“多肽片段”定义为由任一本发明的基因所编码的多肽，即SEQ ID NOs：4199-8395的多肽，其从氨基端和/或羧基端缺失了一个或多个氨基酸，并保留了生物活性。优选地，多肽片段含有被编码多肽的成熟产物的氨基酸残基的至少80％，优选至少85％，更优选至少90％，还更优选至少95％，并最优选至少97％。
子序列(subsequence)：本文中“子序列”定义为这样的多核苷酸，其含有SEQ ID NOs：2-4198的任一核苷酸序列，只是从其5’和/或3’端已缺失了一个或多个核苷酸。优选地，子序列还含有本发明的任一基因的至少80％，优选至少85％，更优选至少90％，更优选至少95％，最优选至少97％的核苷酸。
等位变体(Allelic variant)：术语“等位变体”在本文中指一个基因的两个或更多的可选形式，它们占据相同的染色体基因座。等位变异通过突变而自然产生，并且会在群体中造成多态性(polymorphism)。基因突变可以是沉默的(被编码的多肽不发生变化)，或者，突变的基因可以编码具有改变的氨基酸序列的多肽。多肽的等位变体是被基因的等位变体所编码的多肽。
基本上纯的多核苷酸或纯的多核苷酸：术语“基本上纯的多核苷酸”在本文中指不含外来的或不需要的核苷酸，而且具有适合在基因工程生产系统中使用的形式的多核苷酸的制备物。因此，基本上纯的多核苷酸含有以重量计最多10％，优选最多8％，更优选更多6％，更优选最多5％，更优选最多4％，更优选最多3％，甚至更优选最多2％，最优选最多1％，和甚至最优选最多以重量计0.5％的天然地伴随该多核苷酸的其他多核苷酸物质。但是，基本上纯的多核苷酸还可以包含天然存在的5’和3’非翻译区，例如启动子或终止子。优选地，该基本上纯的多核苷酸具有以重量计至少92％，优选至少94％，更优选至少95％，更优选至少96％，更优选至少96％，更优选至少97％，更优选至少98％，最优选至少99％，和甚至最优选99.5％的纯度。本发明的多核苷酸优选地为基本上纯的形式。具体地，本文公开的多核苷酸优选为“-实质上纯的形式”，即，该多核苷酸的制备物实质上不含有天然地伴随该多核苷酸的其他多核苷酸物质。术语“纯的多核苷酸”在本文中定义为多核苷酸的制备物，其不含有天然地伴随该多核苷酸的其他物质。
核酸构建体：本文中使用的术语“核酸构建体”指单链或双链的核酸分子，其分离自天然存在的基因，或者该核酸分子已受到修饰使得其以自然界中本来不存在的方式含有核酸片段。当核酸构建体含有表达本发明的编码序列所需要的调控序列时，术语“核酸构建体”和术语“表达盒”是同义的。
调控序列：术语“调控序列”在这里定义为包括所有对于本发明的生物活性物质的表达而言是必需的或者有利的组分。每一调控序列对于编码该物质的多核苷酸可以是固有的或者外来的。这些调控序列包括但不限于，前导序列，前肽序列，启动子，信号肽序列和转录终止子。调控序列至少包括启动子及转录和翻译终止信号。这些调控序列还可以具有接头(linkers)，这些接头用于导入特定的限制性位点，以帮助将该调控序列和编码生物活性物质的多核苷酸的编码区域连接起来。
可操作地连接(operably linked)：术语“可操作地连接”指这样一种构型，其中调控序列被置于相对DNA序列的编码序列的合适位置上，使得该调控序列指导生物活性物质的表达。
编码序列：本文中使用术语“编码序列”时，意在包括这样的核苷酸序列，其直接指定其蛋白质产物的氨基酸序列。编码序列的边界一般是由开放阅读框确定的，开放阅读框一般从起始密码子ATG或可替换的起始密码子例如GTG和TTG开始。
表达：术语“表达”包括生物活性物质的生产中涉及的任何步骤，包括但不限于，转录、转录后修饰、翻译、翻译后修饰和分泌。
表达载体：术语“表达载体”在本文中包括线性或者环状的DNA分子，其包含编码本发明的生物活性物质的片段，且可操作地连接到帮助其转录的其他片段。
宿主细胞：本文使用的术语“宿主细胞”包括易于用核酸构建体、质粒或载体进行转化、转染、接合、电穿孔等的任何细胞种类。
发明详述
地衣芽孢杆菌染色体及其特征(基因)
本发明涉及地衣芽孢杆菌ATCC 14580的全染色体DNA分子的分离的多核苷酸，其具有SEQ ID NO：1的核苷酸序列。地衣芽孢杆菌ATCC 14580由一个包含4,222,336个碱基对的环状分子组成，其平均G+C含量为46.2％。该染色体包含4208个平均大小为873bp的预测的蛋白质编码基因(SEQ IDNOs：2-4198)，7个rRNA操纵子和72个tRNA基因。4208个预测的蛋白质编码基因的推测的氨基酸序列如SEQ ID NOs：4199-8395所示。SEQ IDNO：4210对应SEQ ID NO：2，SEQ ID NO：4211对应SEQ ID NO：3，SEQ IDNO：4212对应SEQ ID NO：4，等等。4208个基因产物的预测的功能如表1所示。
地衣芽孢杆菌染色体具有与枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)和Bacillushalodurans的染色体显著地共线性的区域，而且大约80％的预测的基因具有枯草芽孢杆菌的直向同源物(orthologue)。
本发明还涉及编码生物活性物质的地衣芽孢杆菌ATCC 14580的全染色体DNA分子的分离的特征(基因)，其选自：
(a)包含与SEQ ID NOs：2-4198的任一核苷酸具有至少60％同一性的核苷酸序列的基因；和
(b)包含在至少中等严紧条件下与SEQ ID NOs：2-4198的任一基因或其互补链杂交的核苷酸序列的基因。
在第一个方面，本发明涉及分离的基因，其与SEQ ID NOs：2-4198的任一核苷酸序列具有至少大约60％，优选至少大约65％，更优选至少大约70％，更优选至少大约75％，更优选至少大约80％，更优选至少大约85％，还更优选至少大约90％，最优选至少大约95％，和甚至最优选至少大约97％的同一性，且编码具有特定的生物活性的生物活性物质(下面称为“同源生物活性物质”)。
在第二个方面，本发明涉及分离的基因，其包含核苷酸序列，该核苷酸序列在极低严紧度的条件，优选低严紧度的条件，更优选中等严紧度的条件，更优选中高严紧度的条件，还更优选高严紧度的条件，最优选极高严紧度的条件下与(i)SEQ ID NOs：2-4198的基因或其子序列，或(ii)其互补链中的任一个杂交(J.Sambrook，E.F.Fritsch，和T.Maniatus，1989，MolecularCloning，A Laboratory Manual，2nd edition，Cold Spring Harbor，New York)。SEQ ID NOs：2-4198的子序列可以为至少100个核苷酸，或优选至少200个核苷酸。另外，该子序列可以编码基因产物的有生物活性的片段。所述生物活性物质也可以是生物活性物质的生物活性的等位变体。
SEQ ID NOs：2-4198的核苷酸序列或者其子序列，以及SEQ IDNOs：4399-8395的氨基酸序列或者其片段可以用来设计核酸探针，来用于根据本领域熟知的方法鉴定和克隆来自不同属和种的菌株的编码生物活性物质的DNA。具体地，这样的探针可以用于按照标准的Southern印迹步骤与目标属或种的基因组DNA杂交，以鉴定和分离其中的相应基因。这样的探针可以显著地短于整个的序列，但是其长度应该为至少14个，优选至少25个，更优选至少35个核苷酸，例如至少70个核苷酸的长度。但是该核酸探针优选地具有至少100个核苷酸的长度。例如，该核酸探针的长度可以为至少200个核苷酸，至少300个核苷酸，至少400个核苷酸或者至少为500个核苷酸。还可以使用更长的探针，例如至少600个核苷酸，至少700个核苷酸，至少800个核苷酸或者至少900个核苷酸长度的核酸探针。DNA和RNA探针都可以使用。探针通常被标记，用于检测相应的基因(例如用32P，3H，35S，生物素或者抗生物素蛋白标记)。这样的探针被包括在本发明中。
因此，可以从由这样的其他生物制备的基因组DNA文库中筛选与上述的探针杂交且编码生物活性物质的DNA。来自这样的其他生物的基因组DNA可以通过琼脂糖或者聚丙烯酰胺凝胶电泳或其他分离技术分离。来自文库的DNA或者该分离的DNA可以被转移到并固定在硝酸纤维素或其他合适的载体材料上。为了鉴定与SEQ ID NOs：2-4198的任一序列或其子序列同源的克隆或DNA，将该载体材料用于进行Southern印迹。
对于本发明而言，杂交指在极低到极高严紧度的条件下，多核苷酸与具有SEQ ID NOs：2-4198的任一所示的核苷酸序列，其互补链，或其子序列的标记的基因杂交。在这些条件下，与核酸探针杂交的分子可以用X射线胶片来检测。
在一个优选的方面中，所述核酸探针是SEQ ID NOs：2-4198的任一基因或其子序列。在另一个优选的方面中，所述核酸探针是SEQ ID NOs：2-4198的任一基因的成熟的编码区。在另一个优选的方面中，所述核酸探针是地衣芽孢杆菌ATCC 14580所包含的SEQ ID NOs：2-4198的任一基因。在另一个优选的方面中，所述核酸探针是地衣芽孢杆菌ATCC 14580所包含的SEQID NOs：2-4198的任一基因的成熟的编码区。
对于至少100个核苷酸长度的长探针，极低到极高严紧度的条件的定义是，按照标准Southern印迹程序，在下面的条件下进行杂交和预杂交：42℃、5×SSPE、0.3％SDS、200μg/ml剪切并变性的鲑鱼精子DNA、以及对于极低和低严紧度为25％，对于中等到中高严紧度为35％，对于高和极高严紧度为50％的甲酰胺。
对于至少100个核苷酸长度的长探针，载体材料最后在至少45℃(极低严紧度)，更优选至少为50℃(低严紧度)，更优选至少55℃(中等严紧度)，更优选至少60℃(中高严紧度)，还更优选至少65℃(高严紧度)，最优选至少70℃(极高严紧度)下，用2×SSC，0.2％SDS洗涤三次，每次15分钟。
对于大约14-大约70个核苷酸长度的短探针，严紧度条件定义为：按照标准Southern印迹步骤，在比根据Bolton和McCarthy(1962，Proceedings ofthe National Academy of Sciences USA 48：1390)的计算方法算得的Tm低大约5℃-大约10℃的温度下，在0.9M NaCl，0.09M Tris-HCl pH 7.6，6mMEDTA，0.5％NP-40，1×Denhardt′s溶液，1mM焦磷酸钠，1mM磷酸二氢钠，0.1mM ATP，和0.2mg每毫升酵母RNA中进行预杂交、杂交和杂交后洗涤。
对于大约14-大约70个核苷酸长度的短探针，载体材料在比算得的Tm低5℃-10℃的温度下，用6×SCC加0.1％SDS洗一次，15分钟；用6×SCC洗两次，每次15分钟。
在含盐的杂交条件下，有效的Tm控制着成功的杂交所要求的探针和滤膜上结合的DNA之间的同一性程度。有效的Tm可以用下面的公式来确定以得到两个DNA在不同严紧度条件下杂交所需的同一性程度。
有效Tm＝81.5+16.6(log M[Na+])+0.41(％G+C)-0.72(％甲酰胺)
SEQ ID NOs：2-4198的任一基因的％G+C含量可以容易地确定。例如，对于中等严紧度，甲酰胺浓度为35％，5×SSPE的Na+浓度为0.75M。对这些值使用这个公式，就可以计算以℃为单位的有效Tm值。另一种相关的联系是两个DNA的每1％的错配降低1.4℃的Tm值。为确定在中等严紧度条件下两个DNA在42℃杂交所需的同一性程度，使用下面的公式：
％同源性＝100-[(有效Tm-杂交温度)/1.4]
应用本公式，可以计算出在中等严紧度条件下两个DNA在42℃杂交所需的同一性程度。
在如本文所定义的其他严紧度条件下，可以进行类似的计算。
本发明还涉及分离的多核苷酸，其通过下面的手段得到：(a)在极低、低、中等、中高、高或极高的严紧度条件下使DNA群体与下面的任一个杂交：(i)SEQ ID NOs：2-4198的基因或其子序列，或(ii)其互补链；和(b)从该DNA群体中分离发生杂交的多核苷酸。在一个优选的方面中，发生杂交的多核苷酸编码SEQ ID NOs：2-4198的任一个的多肽，或其同源多肽。
在第三个方面中，本发明涉及具有生物活性的分离的多肽(下文称为“同源性多肽”)，其具有这样的氨基酸序列：该氨基酸序列与SEQ IDNOs：4199-8395的任一序列具有至少大约60％，优选至少大约65％，更优选至少大约70％，更优选至少大约75％，更优选至少大约80％，更优选至少大约85％，更优选至少大约90％，最优选至少大约95％，甚至最优选至少大约97％的同一性程度。在一个优选的方面中，所述同源性多肽具有与SEQID NOs：4199-8395的氨基酸序列有10个氨基酸不同，优选有5个氨基酸不同，更优选有4个氨基酸不同，更优选有3个氨基酸不同，最优选有2个氨基酸不同，甚至最优选有1个氨基酸不同的氨基酸序列。
本发明的多肽优选地包含SEQ ID NOs：4199-8395的任一氨基酸序列或其等位变体，或者其具有生物活性的片段。在一个更优选的方面中，本发明的多肽包含SEQ ID NOs：4199-8395的任一氨基酸序列。在另一个优选的方面中，本发明的多肽包含SEQ ID NOs：4199-8395的任一成熟的多肽区域，或其等位变体，或者其具有生物活性的片段。在另一个优选的方面中，本发明的多肽包含SEQ ID NOs：4199-8395的任一成熟的多肽区域。在另一个优选的方面中，本发明的多肽由SEQ ID NOs：4199-8395的任一氨基酸序列，或其等位变体，或者其具有生物活性的片段组成。在另一个优选的方面中，本发明的多肽由SEQ ID NOs：4199-8395的任一氨基酸序列组成。在另一个优选的方面中，所述多肽由SEQ ID NOs：4199-8395的任一成熟的多肽区域或其等位变体，或其具有生物活性的片段组成。在另一个优选的方面中，所述多肽由SEQ ID NOs：4199-8395的任一成熟的多肽区域组成。
在第四个方面中，本发明涉及分离的具有生物活性的物质，这些物质由多核苷酸编码，所述多核苷酸如上所述在极低严紧度的条件，优选低严紧度的条件，更优选中等严紧度的条件，更优选中高严紧度的条件，还更优选高严紧度的条件，最优选极高严紧度的条件下与下面的任一项杂交：(i)SEQ ID NOs：2-4198的基因或其子序列，或(ii)其互补链。SEQ ID NOs：2-4198的任一个的子序列可以为至少100个核苷酸或优选地为至少200个核苷酸。另外，该子序列可以编码具有生物活性的片段，例如多肽片段。
核酸构建体
本发明还涉及核酸构建体，其包含一个或多个(例如操纵子)本发明的分离的基因，该基因可操作地连接到一个或多个调控序列，在合适的宿主细胞中，在适合该调控序列的条件下，该调控序列指导编码序列的表达。
本发明的分离的基因可以经受通过多种方式的操作以用于生产被这些基因直接或间接编码的生物活性物质。在将核苷酸序列插入载体之前对核苷酸序列进行操作可能是理想的或者必需的，取决于该表达载体。使用重组DNA方法修饰核苷酸序列的技术在本领域是熟知的。
所述调控序列可以是适当的启动子序列，它是为宿主细胞所识别，用于表达编码所述生物活性物质的基因的核苷酸序列。启动子序列包含介导该生物活性物质的表达的转录调控序列。启动子可以是任何在所选的宿主细胞中表现出转录活性的核苷酸序列，包括突变的、截短的和杂合的启动子，也可以得自编码多肽或生物活性物质的基因，所述多肽和生物活性物质是胞外或胞内的，相对宿主细胞是同源的或异源的。
适于指导本发明的核酸构建体的转录，特别是在细菌宿主细胞中的转录的启动子的例子有：来自大肠杆菌(E.coli)的lac操纵子、天蓝色链霉菌(Streptomyces coelicolor)的琼脂酶基因(dagA)，枯草芽孢杆菌的果聚糖蔗糖酶基因(sacB)，地衣芽孢杆菌的α-淀粉酶基因(amyL)，嗜热脂肪芽孢杆菌(Bacillus stearothermophilus)的生麦芽糖淀粉酶基因(amyM)，解淀粉芽孢杆菌(解淀粉芽孢杆菌)的α-淀粉酶基因(amyQ)，地衣芽孢杆菌的青霉素酶基因(penP)，枯草芽孢杆菌的xylA和xylB基因，和原核β-内酰胺酶基因(Villa-Kamaroff等，1978，Proceedings of the NationalAcademy of Sciences USA 75：3727-3731)，及tac启动子(DeBoer等，1983，Proceedings of the National Academy of Sciences USA 80：21-25)的启动子。在″Useful proteins from recombinant bacteria″Scientific American，1980，242：74-94和Sambrook等.，1989，(见上)中描述了更多的启动子。
调控序列还可以是合适的转录终止子序列，即为宿主细胞所识别而终止转录的序列。终止子序列可操作地连接到编码生物活性物质的基因的3’末端。任何在所选宿主细胞中有功能的终止子在本发明中都可以使用。
调控序列调控序列还可以是信号肽编码区，其编码一段氨基酸序列，此序列连接到多肽的氨基末端并引导表达后的多肽进入宿主细胞的细胞分泌途径。核酸序列的编码序列的5’端可能固有地包含信号肽编码区，此信号肽编码区天然地与编码区中编码分泌性多肽的片段按翻译阅读框连接。另一情况下，编码序列的5’端可能包含一信号肽编码区，此信号肽编码区相对编码序列是外来的。若编码序列天然地不含有信号肽编码区，则可能需要外来的信号肽编码区。另一情况下，外来的信号肽编码区可能直接替代天然的信号肽编码区以增加多肽的分泌。不过，在本发明中可能使用任何能够在所选宿主细胞中指导表达后的多肽进入分泌途径的信号肽编码区。
用于细菌宿主细胞的有效的信号肽编码区为来自芽孢杆菌NCIB 11837产麦芽糖淀粉酶基因、嗜热脂肪芽孢杆菌α-淀粉酶基因、地衣芽孢杆菌枯草杆菌蛋白酶基因、地衣芽孢杆菌β-内酰胺酶基因、嗜热脂肪芽孢杆菌中性蛋白酶基因(nprT，nprS，nprM)和枯草芽孢杆菌prsA基因的信号肽编码区。Simonen和Palva，1993，Microbiological Reviews 57：109-137中描述了更多信号肽。
调控序列还可以是前肽编码区，其编码位于多肽氨基末端的一段氨基酸序列。由此得到的多肽称为酶原(proenzyme)或多肽原，有时也称为酶原(zymogen)。多肽原一般没有活性，通过催化或自身催化从多肽原切除其前肽后，可转化为有活性的成熟多肽。前肽编码区可以得自枯草芽孢杆菌碱性蛋白酶基因(aprE)和枯草芽孢杆菌中性蛋白酶基因(nprT)。
当信号肽和前肽区都存在于多肽的氨基末端时，前肽区与多肽的氨基末端相邻，而信号肽区则与前肽区的氨基末端相邻。
最好还加入某些调节序列，其允许相应于宿主细胞的生长调节生物活性物质的表达。某些调节系统的实例是那些使得基因的表达响应于物理或化学的刺激因素，包括调节性化合物的存在，而被打开或关闭的系统。原核系统中的调节系统包括lac，tac，和trp操纵子系统。调节序列的其它实例是那些允许基因扩增的序列。在真核系统中，这样的序列包括二氢叶酸还原酶基因，其在氨甲蝶呤存在下扩增；和金属硫蛋白基因，其在重金属存在下扩增。在这些情况下，编码生物活性物质的核苷酸序列可与调节序列可操作地连接。
表达载体
本发明还涉及重组表达载体，其包含本发明的分离的基因、启动子和转录和翻译终止信号。可以把上述的多种核酸和调控序列连接到一起产生重组表达载体，其可包括一个或多个方便的限制性位点以便于在这些位点插入或取代编码多肽的核苷酸序列。或者，可以通过将核苷酸序列或包含所述序列的核酸构建体插入到合适的用于表达的载体中而表达本发明的基因。在表达载体的构建中，编码序列位于载体中，使得该编码序列与该合适的用于表达的调控序列可操作地连接。
所述重组表达载体可以是任何载体(例如质粒或病毒)，其可以方便地进行重组DNA步骤并可以实现本发明的基因的表达。载体的选择通常取决于载体与其将要导入的宿主细胞之间的相容性。载体可以是线性的或者闭合环状的质粒。
载体可以是：自主复制载体，即作为染色体外的实体存在，其复制独立于染色体复制的载体，例如质粒；染色体外元件；微型染色体；或人工染色体。载体可以包含任何用于确保自我复制的元件(means)。另外，载体也可以在导入宿主细胞时整合到基因组中，并与其整合进入的染色体一起复制。还可以使用一个单独的载体或质粒，或者共同包含要导入宿主细胞基因组的整个DNA的两个或更多的载体或质粒，或者转座子。
本发明的载体优选地包含一个或更多可选择的标记，其允许容易地选择转化的细胞。可选择的标记是一种基因，其表达产物提供杀微生物剂(biocide)或病毒抗性，对重金属的抗性，营养缺陷型向原养型的转化，等等。
细菌的可选择标记的例子包括枯草芽孢杆菌或地衣芽孢杆菌的dal基因，或者赋予如氨苄青霉素、卡那霉素、氯霉素或四环素抗性等抗生素抗性的标记。
为了整合进入宿主细胞基因组，载体可能依靠该基因的一些部分或该载体的任何其他元件，用于通过同源或非同源重组，来将载体整合到基因组中。或者，该载体可以包括用于引导通过同源重组整合入宿主细胞基因组的附加核苷酸序列。这些附加的核苷酸序列使载体能够在染色体上的精确位置整合到宿主细胞基因组中。为了提高在精确的位置上整合的可能性，整合元件优选地应含有足够数量的核苷酸，例如100到10,000个碱基对，优选为400到10,000个碱基对，最优选为800到10,000个碱基对，这些核苷酸与相应的目标序列高度同源，以提高同源重组的概率。整合元件可以是任何与宿主细胞基因组中的目标序列同源的序列。此外，整合元件可以是非编码的或者编码的核苷酸序列。另一方面，载体也可以借助非同源重组整合入宿主细胞的基因组。
为实现自主复制，载体还可进一步包括复制起点，复制起点使得该载体可以在所述的宿主细胞中自主复制。复制起点可以是任何在细胞中行使功能的介导自主复制的质粒复制子。术语“复制起点”或“质粒复制子”在本文中定义为使得质粒或载体可以在体内复制的序列。细菌的复制起点的实例为允许在大肠杆菌中复制的质粒pBR322、pUC19、pACYC177、pACYC 184的复制起点，以及允许在芽孢杆菌中复制的质粒pUB 110、pE194、pTA1060和pAMβ1的复制起点。
可以在宿主细胞中插入多于一个拷贝的本发明的基因以提高该基因产物的生产。增加基因的拷贝数可以通过将该序列的至少一个额外的拷贝整合到宿主细胞基因组中来实现，或者通过将可扩增的可选择标记基因包含在本发明的基因中，这样，通过在合适的选择剂的存在下培养细胞，就可以选择那些含有该可选择标记基因的扩增的拷贝、并因而也就含有本发明的基因的更多的拷贝的细胞，来实现基因的拷贝数的增加。
用于连接上述元件以构建本发明的重组表达载体的步骤对于本领域的技术人员是熟知的(例如见上文Sambrook等，1989)。
宿主细胞
本发明还涉及含有本发明的分离的基因的重组宿主细胞，这些宿主细胞有利地用于重组生产由该基因编码的生物活性物质。含有本发明的基因的载体被导入宿主细胞，使得该载体作为染色体整合体或作为自我复制的染色体外载体而被保持，如前面所述。术语“宿主细胞”包括所有在复制时发生了突变从而与亲代细胞不相同的亲代细胞的子代。宿主细胞的选择在很大程度上取决于编码该生物活性物质的基因和其来源。
宿主细胞可以是任何单细胞微生物，例如原核生物。
有用的单细胞细胞为细菌细胞，例如革兰氏阳性细菌，包括但不限于：芽孢杆菌属(Bacillus)的细胞，例如嗜碱芽孢杆菌(Bacillus alkalophilus)，解淀粉芽孢杆菌，短芽孢杆菌(Bacillus brevis)，蜡状芽孢杆菌(Bacilluscereus)，Bacillus clausii，环状芽孢杆菌(Bacillus circulans)，凝结芽孢杆菌(Bacillus coagulans)，苛求芽孢杆菌(Bacillus fastidiosus)，坚强芽孢杆菌(Bacillus firmus)，灿烂芽胞杆菌(Bacillus lautus)，迟缓芽孢杆菌(Bacilluslentus)，地衣芽孢杆菌，浸麻芽孢杆菌(Bacillus macerans)，短小芽孢杆菌(Bacillus pumilus)，球形芽孢杆菌(Bacillus sphaericus)，巨大芽孢杆菌(Bacillus megaterium)，甲醇芽孢杆菌(Bacillus methanolicus)，嗜热脂肪芽胞杆菌，枯草芽孢杆菌及苏云金芽孢杆菌(Bacillus thuringiensis)；或者为链霉菌属(Streptomyces)的细胞，例如浅青紫链霉菌(Streptomyces lividans)或鼠灰链霉菌(Streptomyces murinus)；还可以是革兰氏阴性细菌，例如大肠杆菌(E.coli)和假单孢菌属(Pseudomonas)的菌种。在一个优选的方面中，细菌宿主细胞为迟缓芽孢杆菌、地衣芽孢杆菌、嗜热脂肪芽胞杆菌或枯草芽孢杆菌细胞。在另一优选的方面中，该芽孢杆菌细胞是嗜碱的芽孢杆菌。
将载体导入细菌宿主细胞的转化可以通过例如下列手段来实现：原生质体转化(参考例如Chang和Cohen，1979，Molecular General Genetics168：111-115)，使用感受态细胞(参考例如Young和Spizizin，1961，Journalof Bacteriology 81：823-829，或Dubnar和Davidoff-Abelson，1971，Journalof Molecular Biology 56：209-221)，电穿孔(参考例如Shigekawa和Dower，1988，Biotechniques 6：742-751)，或接合(参考例如Koehler和Thorne，1987，Journal of Bacteriology 169：5771-5278)。
生产方法
本发明还涉及生产本发明的生物活性物质的方法，其包括(a)在有助于产生该生物活性物质的条件下培养菌株，所述菌株的野生型形式能够产生该生物活性物质；和(b)回收该生物活性物质。优选地，所述菌株来自芽孢杆菌属，更优选为地衣芽孢杆菌。
本发明还涉及生产本发明的生物活性物质的方法，其包括(a)在有助于产生该生物活性物质的条件下培养宿主细胞，和(b)回收该生物活性物质。
本发明还涉及生产本发明的生物活性物质的方法，其包括(a)在有助于产生该生物活性物质的条件下培养宿主细胞，其中该宿主细胞包括突变的多核苷酸，该多核苷酸在SEQ ID Nos：2-4198的任一个的编码区具有至少一个突变，其中该突变的多核苷酸编码分别由SEQ ID Nos：4199-8395组成的生物活性物质；和(b)回收该生物活性物质。
在本发明的生产方法中，将所述细胞在适合于使用本领域已知的方法生产所述生物活性物质的营养培养基中培养。例如，可以通过摇瓶培养和在实验室或工业发酵罐中进行小规模或大规模发酵(包括连续、分批、分批补料或固态发酵)，在合适的培养基中，在允许该生物活性物质被表达和/或分离的条件下，培养所述细胞。培养在含有碳源和氮源和无机盐的合适的营养培养基中使用本领域已知的步骤进行。合适的培养基可以从提供商获得或者根据已公开的组成(例如在美国典型培养物保藏中心的目录中)制备。如果该生物活性物质分泌到营养培养基中，可将该生物活性物质直接从培养基中回收。如果该生物活性物质不分泌，其可以从细胞裂解物中回收。
所述生物活性物质可以通过本领域已知的对多肽特异性的方法来检测。这些检测方法包括特异性抗体的使用，酶产物的生成，或者酶底物的消失。例如，可使用酶试验来确定酶的活性。
所得生物活性物质可以用本领域已知的方法来回收，例如，可以通过常规步骤来从营养培养基回收该生物活性物质，所述常规步骤包括但不限于离心、过滤、萃取、喷雾干燥、蒸发或沉淀。
所得生物活性物质可以用本领域已知多种方法纯化，所述方法包括但不限于：层析(例如离子交换，亲和，疏水，层析聚焦及体积排阻)；电泳方法(例如制备型等电聚焦(IEF))；溶解度差异(例如硫酸铵沉淀)；SDS-PAGE；或萃取(参见例如Protein Purification，J.-C.Janson和Lars Ryden编，VCH Publishers，New York，1989)。
植物
本发明还涉及被用编码本发明的生物活性物质的基因所转化的，从而以可回收的量表达和生产该生物活性物质的转基因植物、植物部分或者植物细胞。该生物活性物质可以从该植物或植物部分中回收。或者，含有该重组的生物活性物质的植物或植物部分本身可以用来提高食品或饲料的质量，例如，用来改善营养价值、适口性和流变学性质，或破坏抗营养因子(antinutritional factor)。
所述转基因植物可以是双子叶的(双子叶植物)或单子叶的(单子叶植物)。单子叶植物的例子有：禾草(grasses)，例如早熟禾(blue grass，Poa)；牧草(forage grass)，例如狐茅属(festuca)和黑麦草属(lolium)；寒地型牧草(temperate grass)，例如剪股颖属(Agrotis)；和谷类(cereals)，如小麦、燕麦、黑麦、大麦、水稻、高粱和玉米(maize)(玉米(corn))。
双子叶植物的例子有：烟草；豆类(legumes)，例如羽扇豆(lupins)；马铃薯；甜菜；豌豆；菜豆(bean)和大豆，和十字花科(Brassicaceae)植物，例如花椰菜、油菜籽(rape seed)和与之亲缘关系紧密的模式生物拟南芥(Arabidopsis thaliana)。
植物部分的例子有茎、愈伤组织、叶、根、果实、种子、块茎以及构成这些部分的单独组织，例如表皮、叶肉、薄壁组织、维管组织和分生组织。在当前的上下文中，特定的植物细胞区室(compartments)，例如叶绿体、质外体、线粒体、液泡、过氧化物酶体和细胞质，都被认为是植物部分。另外，任何植物细胞，不管其来自什么组织，都被认为是植物部分。类似地，诸如为便于本发明的应用而分离的具体组织和细胞，例如胚、胚乳、糊粉和种皮等，都被认为是植物部分。
这些植物、植物部分和植物细胞的后代也被包括在本发明的范围之内。
所述表达本发明的生物活性物质的转基因植物或植物细胞可以根据本领域已知的方法构建。简单地说，所述植物或植物细胞这样构建的：将一个或多个编码本发明的生物活性物质的表达构建体整合入植物宿主的基因组，并使所得的修饰植物或植物细胞增殖形成转基因植物或植物细胞。
所述表达构建体合适地为核酸构建体，其包含编码本发明的生物活性物质、且可操作地连接于在所选植物或植物部分中表达该核苷酸序列所需的合适的调控序列的基因。另外，该表达构建体还可以包括：可选择的标记，其可用于鉴定其内部已经整合了表达构建体的宿主细胞；以及将该构建体导入所述的植物所需的DNA序列(后者取决于使用的DNA导入方法)。
调节序列——例如启动子和终止子序列，以及可选的信号或转运序列——的选择，是根据例如想要在何时、何处、怎样表达该生物活性物质而决定的。例如，编码本发明的生物活性物质的基因的表达可以是组成型或诱导型的，或者可为发育特异性、阶段特异性或组织特异性的，而且基因产物可以被靶向于具体的组织或者植物部分例如种子或叶。对调节序列的描述有例如Tague等，1988，Plant Physiology 86：506。
对于组成性表达，可以使用35S-CaMV、玉米泛素1和水稻肌动蛋白启动子(Franck等.，1980.Cell 21：285-294，Christensen AH，Sharrock RA和Quail，1992，Plant Mo.Biol.18：675-689；Zhang W，McElroy D.和Wu R.，1991，PlantCell 3：1155-1165)。器官特异性的启动子可以是，例如，来自存储性贮藏组织(storage sink tissues)例如种子、马铃薯的块茎及果实的启动子(Edwards和Coruzzi，1990，Ann.Rev.Genet.24：275-303)，或者来自代谢性贮藏组织(metabolic sink tissues)，例如分生组织的启动子(Ito等，1994，Plant Mol.Biol.24：863-878)；或者是种子特异性的启动子，例如来自水稻的谷蛋白、谷醇溶蛋白、球蛋白或白蛋白启动子(Wu等，1998，Plant and Cell Physiology39：885-889)，来自蚕豆(Vicia faba)的豆球蛋白B4和未知的种子蛋白基因的蚕豆启动子(Conrad等，1998，Journal of Plant Physiology 152：708-711)，来自一种种子油体蛋白的启动子(Chen等，1998，Plant and cell Physiology39：935-941)，来自欧洲油菜(Brassica napus)的贮存蛋白napA启动子，或任何其他本领域已知的种子特异性的启动子，例如WO 91/14772所描述的。另外，该启动子还可以是叶特异性的启动子，例如水稻或西红柿的rbcs启动子(Kyozuka等，1993，Plant Physiology 102：991-1000)；小球藻病毒腺嘌呤甲基转移酶基因启动子(Mitra和Higgins，1994，Plant Molecular Biology26：85-93)，或来自水稻的aldP基因启动子(Kagaya等，1995，Molecular andGeneral Genetics 248：668-674)；或为创伤诱导的启动子例如马铃薯pin2启动子(Xu等，1993，Plant Molecular Biology 22：573-588)。类似地，该启动子也可以被非生物性的处理例如温度、干旱或盐度变化所诱导，或者被外加的活化启动子的物质，例如乙醇、雌激素、植物激素如乙烯、脱落酸和赤霉酸、及重金属所诱导。
也可以使用启动子增强元件来获得在植物中酶的更高表达。例如，启动子增强元件可以是位于启动子和编码本发明的生物活性物质的核苷酸序列之间的内含子。例如Xu等，1993(同上)公开了水稻肌动蛋白1基因的第一个内含子增强表达的用途。
可选择的标记基因和表达构建体的任何其他部分都可以从本领域可用的那些进行选择。
根据本领域已知的常规技术将该核酸构建体整合入植物基因组，所述技术包括农杆菌介导的转化、病毒介导的转化、显微注射、粒子轰击、生物射弹转化和电穿孔(Gasser等，1990，Science 244：1293；Potrykus，1990，Bio/Technology 8：535；Shimamoto等，1989，Nature 338：274)。
目前，根瘤农杆菌(Agrobacterim tumefaciens)介导的基因转移是产生转基因双子叶植物的优选方法(见Hooykas和Schilperoort，1992，PlantMolecular Biology 19：15-38的综述)。不过该方法也可以用于转化单子叶植物，尽管单子叶植物一般优选别的转化方法。目前，产生转基因单子叶植物的优选方法是粒子(极小金或钨粒子，被用于转化的DNA所包被)轰击胚愈伤组织(embroynic calli)或发育中的胚(Christou，1992，Plant Journal 2：275-281；Shimamoto，1994，Current Opinion Biotechnology 5：158-162；Vasil等，1992，Bio/Technology 10：667-674)。另外一种可选的转化单子叶植物的方法是基于原生质体转化，如Omirulleh等，1993，Plant Molecular Biology 21：415-428所述。
转化以后，选择整合了表达构建体的转化子，并根据本领域熟知的方使其再生为完整植株。通常设计转化方法以在再生过程或后续的世代中选择性地除去选择基因，例如通过将两个单独的T-DNA构建体共转化，或通过特异性的重组酶位点特异性地切下选择基因。
本发明还涉及产生本发明的生物活性物质的方法，其包括(a)在有利于生产所述生物活性物质的条件下，培养含有编码本发明的生物活性物质的基因的转基因植物或植物细胞；和(b)回收该生物活性物质。
除去或减少生物活性物质
本发明还涉及产生亲代细胞的突变体的方法，其包括破坏或缺失编码本发明的生物活性物质的基因的全部或者部分，结果产生突变体细胞，其在相同的条件下培养时，产生比亲代细胞少的生物活性物质。
可以使用本领域熟知的方法，例如插入、破坏、取代或者缺失，通过降低或者消除编码本发明的生物活性物质或调节其合成的基因的表达来构建突变体细胞。这些被修饰或失活的基因可以是，例如，对活性关键的编码区或其部分，或者表达该编码区所必需的基因的调节元件。这种调节或调控序列的例子可以是启动子序列，或其功能性部分，即足以影响基因表达的部分。其他可能被修饰的调控序列包括但不限于，前导序列，前肽序列，信号肽序列，转录终止子和转录激活子。
基因的修饰或者失活可以通过对亲代细胞进行诱变并选择细胞中该基因的表达已经被降低或者消除的突变细胞。诱变可以是特异性的或随机的，其可以通过，例如，使用合适的物理或化学诱变剂，使用合适的寡核苷酸，或者对DNA序列进行PCR产生的诱变来进行。另外，诱变也可以使用这些诱变剂的组合来进行。
适用于本发明的目的的物理或化学诱变剂的例子有紫外(UV)辐射、羟胺、N-甲基-N’-硝基-N-亚硝基胍(MNNG)、O-甲基羟胺、亚硝酸、甲磺酸乙酯(EMS)、亚硫酸氢钠、甲酸和核苷酸类似物。
当使用这些诱变剂时，诱变通常是这样进行的：在合适的条件下，优选的诱变剂存在下温育待诱变的亲代细胞，然后筛选和/或选择那些显示该基因表达降低或没有表达的突变体细胞。
核苷酸序列的修饰和失活可以通过在所述基因或其转录或翻译所需的调节元件中导入、取代或除去一个或多个核苷酸来实现。例如，可以通过插入或除去核苷酸来导入终止密码子、去除起始密码子或改变开放阅读框。这样的修饰或失活可以按照本领域已知的方法通过定点诱变或PCR产生的诱变来实现。尽管在理论上，修饰可以在体内，即直接在表达将被修饰的核苷酸序列的细胞上进行，优选以下面例示的方式在体外进行诱变。
方便地消除或降低核苷酸序列的表达的方法的例子之一是基于基因取代、基因缺失或基因破坏的技术。例如，在基因破坏方法中，与内源核苷酸序列相应的核酸序列在体外被诱变而产生缺陷的核酸序列，然后把它转化到亲代细胞中产生缺陷的基因。通过同源重组，该缺陷的核酸序列取代内源的核苷酸序列。可预期缺陷的核苷酸序列也编码一个标记，该标记可以用来选择所述核苷酸序列已经被修饰或者破坏的转化子。在一个特别优选的方面中，用可选择的标记，例如本文中描述的那些，来破坏所述核苷酸序列。
或者，可以使用与所述核苷酸序列互补的序列，通过已建立的反义技术来进行所述核苷酸序列的修饰或失活。更具体地，可以通过导入与基因的核酸序列互补的序列，该序列可以在细胞中被转录并能与细胞中产生的mRNA杂交，从而降低或消除细胞对于所述核苷酸序列的表达。在允许互补的反义核苷酸序列与mRNA杂交的条件下，翻译的蛋白质的量也相应地减少或消除。
本发明进一步涉及亲本细胞的突变体细胞，其包含编码所述生物活性物质的核苷酸序列或其调控序列的破坏或缺失，使得该突变体细胞产生比亲本细胞少的所述生物活性物质。
这样构建的生物活性物质缺陷的突变体细胞具体用作表达同源和/或异源物质例如多肽的宿主细胞。因此，本发明进一步涉及生产同源或异源物质的方法，其包括(a)在有利于生产所述物质的条件下培养突变体细胞；和(b)回收该物质。术语“异源物质”在本文中定义为：对宿主细胞而言非天然的物质；被修饰而改变了其天然序列的天然物质；或由于使用重组DNA技术操作宿主细胞而使其表达发生了数量变化的天然物质。
在另一个方面，本发明涉及生产实质上不含有生物活性物质的蛋白质产物的方法，该方法通过发酵同时生产本发明的生物活性物质和目标蛋白质产物的细胞，在发酵之前、发酵过程中和发酵结束后向发酵液中添加有效量的能够抑制所述生物活性物质的活性的试剂，从发酵液中回收目标产物，和可选地对回收的产物进行进一步纯化。
根据本发明的这个方面，可能除去至少60％，优选至少75％，更优选至少85％，还更优选至少95％，最优选至少99％的生物活性物质。使用此方法可以完全去除生物活性物质。
用于培养和纯化目标产物的方法可以使用本领域已知的方法。
本发明的生产实质上不含生物活性物质的产物的方法对于原核多肽特别是细菌蛋白例如酶的生产特别有意义。所述酶可选自，例如，淀粉分解酶、脂肪分解酶、蛋白水解酶、纤维素分解酶，氧化还原酶，或植物细胞壁降解酶。这些酶的例子包括氨肽酶、淀粉酶、淀粉葡萄糖苷酶、糖酶、羧肽酶、过氧化氢酶、纤维素酶、几丁质酶、角质酶、环糊精糖基转移酶、脱氧核糖核酸酶、酯酶、半乳糖苷酶、β-半乳糖苷酶、葡糖淀粉酶、葡萄糖氧化酶、葡萄糖苷酶、卤素过氧化物酶(haloperoxidase)、半纤维素酶、转化酶、异构酶、漆酶、连接酶、脂肪酶、裂合酶、甘露糖苷酶、氧化酶、溶果胶酶、过氧化物酶、肌醇六磷酸酶、酚氧化酶、多酚氧化酶、蛋白水解酶、核糖核酸酶、转移酶、转谷氨酰胺酶或木聚糖酶。也可将该生物活性物质缺陷的细胞用来表达药用目的的异源蛋白质，例如激素、生长因子和受体等。
应当理解，术语“原核多肽”不但包括天然的多肽，还包括那些多肽，例如酶，它们被通过氨基酸取代、缺失或添加或其他所述修饰以增加活性、热稳定性、pH耐受性等等。
在另一个方面，本发明还涉及实质上不含有本发明的生物活性物质的蛋白质或物质，其由本发明的方法所生产。
组合物
本发明还涉及包含本发明的生物活性物质的组合物。优选地，所述组合物富集了该生物活性物质。术语“富集”表示该组合物的生物活性物质已经被增加，例如以富集因子(enrichment factor)1.1增加。
该组合物可以含有一种本发明的生物活性物质作为主要组分，例如单组分组合物。或者，该组合物可以含有多种生物活性物质，比如多种酶，例如氨肽酶、淀粉酶、糖酶、羧肽酶、过氧化氢酶、纤维素酶、几丁质酶、角质酶、环糊精糖基转移酶、脱氧核糖核酸酶、酯酶、α-半乳糖苷酶、β-半乳糖苷酶、葡萄糖淀粉酶、α-葡萄糖苷酶、β-葡萄糖苷酶、卤素过氧化物酶、转化酶、漆酶、脂肪酶、甘露糖苷酶、氧化酶、溶果胶酶、肽谷氨酰胺酶、过氧化物酶、肌醇六磷酸酶、多酚氧化酶、蛋白水解酶、核糖核酸酶、转移酶、转谷氨酰胺酶或木聚糖酶。
所述组合物可以根据本领域已知的方法制备，并可以为液体或干组合物的形式。例如，该组合物可以是颗粒或者微粒(microgranulate)的形式。可以用本领域已知的方法稳定组合物中要包含的生物活性物质。
使用地衣芽孢杆菌染色体的方法
本发明还涉及使用地衣芽孢杆菌染色体的方法。
地衣芽孢杆菌的染色体是在环境、能源、卫生和工业方面具有潜在应用的新基因/蛋白质(例如酶、抗生素、生物化学品)的储库。明显地，还可以将新发现的分子用作已建立的基因改组(gene shuffling)、定向进化及蛋白质工程方法的起始分子以对其作进一步改进。另外，来自新发现的分子的区域或基序(motifs)(例如信号肽、活性位点、底物结合区域)可以用来衍生具有工业上有利的性质的新嵌合体。
染色体中编码的基因可以用来监测生物体的生命周期中或工业发酵过程中的全局基因表达(例如在DNA微阵列上实现)。通过监测全局基因表达，例如，可以改善工业发酵工艺，提高其效率和经济性。
染色体可应用于比较进化和生态学研究。例如，对于数十个地衣芽孢杆菌分离株，可以通过将其基因组DNA与由此情况下存在的参考株制成的微阵列杂交，而对其进行方便的全局性比较(即所谓比较基因组杂交)。使用此方法，就可以比较不同的分离株以寻找地理生态位和环境生态位(geographical and environmental niches)之间，以及生物控制株(biocontrolstrains)相对于腐生分离株(saprophytic isolates)的相似性/区别。
染色体序列可以用于构建地衣芽孢杆菌的代谢蓝图(metabolicblueprint)，其包括所有的分解代谢和合成代谢途径，信号传导途径，调节网络，生长底物，生化中间体，终产物，电子供体/受体等等。在构建过程中，可以通过删除不需要的途径和/或添加来自别的生物的酶/途径来改变生物体的代谢机制，以产生有用的化学品和中间体。
从染色体序列中可以提取出对地衣芽孢杆菌的胞外和表面蛋白的生产有贡献的途径和组分。这为通过对分泌机制进行遗传操作而提高胞外蛋白的生产提供了机会。
染色体数据使得推测地衣芽孢杆菌的关键基因(通过与亲缘细菌例如枯草芽孢杆菌比较，或通过系统的逐个基因敲除(gene-by-gene knock outs))成为可能。因此，现在已经能够设计只含有对于特定蛋白或代谢物的生产来说关键的基因的定制菌株(即所谓细胞工厂的概念)。
染色体数据可用于构建地衣芽孢杆菌和其他细菌之间的种间杂交体。Venter等，2003，Proc.Nat.Acad.Sci.USA 100，15440-15445证实了从较小的DNA片段构建整个病毒基因组是可能的。因此，地衣芽孢杆菌染色体片段可以用来衍生出新的染色体片段或甚至用于特定应用的完整嵌合染色体。
在一个优选的方面中，使用地衣芽孢杆菌染色体的方法包括：宿主改良，例如蛋白质或代谢物的分泌；基因组改组(genome shuffling)；新基因组的构建；代谢工程和途径重建；异源表达载体(vector)的载体(carrier)；如本文所述的微阵列；蛋白质组分析中多肽的鉴定，以及和其他芽孢杆菌菌种或亲缘生物的比较基因组学。
分离基因的方法
本发明还涉及从微生物菌株中分离编码生物活性物质的基因的方法。该方法包括在一定条件下，向地衣芽孢杆菌基因的阵列加入标记的第一核酸探针的混合物和标记的第二核酸探针的混合物，所述第一核酸探针是从在不含诱导底物的培养基上培养的微生物菌株中分离的；所述第二核酸探针是从在含有诱导底物的培养基上培养的微生物菌株中分离的；所述地衣芽孢杆菌基因选自核苷酸SEQ ID NOs：2-4198、SEQ ID NOs：2-4198的互补链或SEQ ID NOs：2-4198的片段；在所述一定条件下，所述标记的核酸探针与所述阵列上的地衣芽孢杆菌基因的互补序列杂交。所述第一核酸探针由第一报道分子所标记，所述第二核酸探针由第二报道分子所标记。然后在一定的条件下检查该阵列，在此条件下，微生物菌株的基因的相对表达是由所观察到的阵列上每个点的杂交报道分子信号决定的，其中，(i)阵列上与第一核酸探针杂交的地衣芽孢杆菌基因产生独特的第一杂交报道分子信号，而与第二核酸探针杂交的地衣芽孢杆菌基因则产生独特的第二杂交报道分子信号，和(ii)阵列上与第一和第二核酸探针都杂交的地衣芽孢杆菌基因产生独特的组合杂交报道分子信号。然后对所述探针测序，以从微生物菌株中分离出编码降解或转化该底物的酶的相应基因。
酶.目的基因可以编码任何酶，包括氧化还原酶、转移酶、水解酶、裂合酶、异构酶或连接酶。在一个优选的方面中，所述酶是酰基转移酶、α-葡萄糖苷酶、酰胺酶、氨肽酶、淀粉酶、糖酶、羧肽酶、过氧化氢酶、纤维素酶、几丁质酶、角质酶、环糊精糖基转移酶、脱氧核糖核酸酶、糊精酶、内切葡聚糖酶、酯酶、半乳聚糖酶、α-半乳糖苷酶、β-半乳糖苷酶、葡萄糖淀粉酶、葡聚糖酶、葡糖脑苷脂酶、α-葡萄糖苷酶、β-葡萄糖苷酶、半纤维素酶、转化酶、漆酶、木质酶、脂肪酶、溶素、甘露糖苷酶、变位酶(mutanase)、氧化酶、溶果胶酶、过氧化物酶、磷酸酶、磷脂酶、肌醇六磷酸酶、多酚氧化酶、蛋白水解酶、支链淀粉酶、核糖核酸酶、转谷氨酰胺酶、尿激酶或木聚糖酶。
诱导底物.诱导底物可以是任何受酶的作用的底物，酶的作用即对底物的降解和转化。在一个优选的方面中，诱导底物是木质素或含木质素的物质。在一个更优选的方面中，含木质素的物质是木质纤维素。在另一个优选的方面中，诱导底物是纤维素。在另一个优选的方面中，诱导底物是半纤维素。在另一个优选的方面中，诱导底物是果胶。在另一个优选的方面中，诱导底物是脂质。在另一个优选的方面中，诱导底物是磷脂。在另一个优选的方面中，诱导底物是植酸。在另一个优选的方面中，诱导底物是蛋白质。在另一个优选的方面中，诱导底物是淀粉。在另一个优选的方面中，诱导底物是含较低的营养物例如氨基酸、碳、氮、磷酸盐或铁的培养基。
在一个更优选的方面中，蛋白质底物是血液、酪蛋白、卵、明胶、谷蛋白、乳蛋白或大豆蛋白。在另一个更优选的方面中，所述含木质素的物质是硬木预热磨木浆(hardwood thermomechanical pulp)。在另一个更优选的方面中，所述木质纤维素是玉米秸(corn stover)。在另一个更优选的方面中，所述木质纤维素是白杨树(white poplar)。在另一个更优选的方面中，所述木质纤维素是稻草(rice straw)。在另一个更优选的方面中，所述木质纤维素是柳枝稷(switch grass)。
微生物菌株.在本发明的方法中，微生物菌株可以是任何微生物菌株。菌株在含有和不含目标底物的合适的营养培养基上培养。在不含底物的培养基上培养的菌株用作对照，来鉴定在含有底物的培养基上培养的菌株中的相同或相似的基因互补的表达差异。所述菌株可以是野生型，突变体，或重组菌株。
在本发明的方法中，微生物菌株优选为细菌。在一个更优选的方面中，该细菌是芽孢杆菌属(Bacillus)，假单胞菌属(Pseudomonas)或链霉菌属菌株，或大肠杆菌。
所述芽孢杆菌属菌株可以是任何芽孢杆菌属菌株。在一个优选的方面中，所述芽孢杆菌属菌株是嗜碱芽孢杆菌，解淀粉芽孢杆菌，短芽孢杆菌、蜡状芽孢杆菌、环状芽孢杆菌、Bacillus clausii、凝结芽孢杆菌、苛求芽孢杆菌、坚强芽孢杆菌、灿烂芽孢杆菌、迟缓芽孢杆菌、地衣芽孢杆菌、浸麻芽孢杆菌、巨大芽孢杆菌、甲醇芽孢杆菌、短小芽孢杆菌、球形芽孢杆菌、嗜热脂肪芽孢杆菌、枯草芽孢杆菌或苏云金芽孢杆菌。应当理解，术语“芽孢杆菌”也包括芽孢杆菌属的亲缘菌属，例如类芽孢杆菌属(Paenibacillus)、海洋芽孢杆菌属(Oceanobacillus)等。
所述假单胞菌菌株可以是任何假单胞菌菌株，在一个优选的方面中，所述假单胞菌菌株是食酸假单胞菌(Pseudomonas acidovorans)，铜绿假单胞菌(Pseudomonas aeruginosa)，产碱假单胞菌(Pseudomonas alcaligenes)，病鳝假单胞菌(Pseudomonas anguilliseptica)，抗微生物假单胞菌(Pseudomonas abtimicrobica)，桔黄假单胞菌(Pseudomonas aurantiaca)，致金色假单胞菌(Pseudomonas aureofaciens)，拜氏假单胞菌(Pseudomonasbeijerinckii)，北城假单胞菌(Pseudomonas boreopolis)，绿针假单胞菌(Pseudomonas chlororaphis)，香茅醇假单胞菌(Pseudomonas citronellolis)，椰毒假单胞菌(Pseudomonas cocovenenans)，缺陷假单胞菌(Pseudomonasdiminuta)，杜氏假单胞菌(Pseudomonas doudoroffii)，刺状假单胞菌(Pseudomonas echinoides)，伸长假单胞菌(Pseudomonas elongata)，荧光假单胞菌(Pseudomonas fluorescens)，莓实假单胞菌(Pseudomonas fragi)，憎盐假单胞菌(Pseudomonas halophobica)，哈特假单胞菌(Pseudomonashuttiensis)，产靛假单胞菌(Pseudomonas indigofera)，柳叶刀形假单胞菌(Pseudomonas lanceolata)，勒氏假单胞菌(Pseudomonas lemoignei)，隆德假单胞菌(Pseudomonas lundensis)，门多萨假单胞菌(Pseudomonasmendocina)，臭味假单胞菌(Pseudomonas mephitica)，霉味假单胞菌(Pseudomonas mucidolens)，食油假单胞菌(Pseudomonas oleovorans)，吩嗪假单胞菌(Pseudomonas phenazinium)，皮氏假单胞菌(Pseudomonaspictorium)，恶臭假单胞菌(Pseudomonas putida)，食树脂假单胞菌(Pseudomonas resinovorans)，嗜糖假单胞菌(Pseudomonas saccharophila)，斯塔氏假单胞菌(Pseudomonas stanieri)，施氏假单胞菌(Pseudomonasstutzeri)，腐臭假单胞菌(Pseudomonas taetrolens)，或泡囊假单胞菌(Pseudomonas vesicularis)。
所述链霉菌属菌株可以是任何链霉菌属菌株。在一个优选的方面中，所述链霉菌属菌株是浅青紫链霉菌。在另一个优选的方面中，所述链霉菌属菌株是鼠灰链霉菌。
微阵列.术语“地衣芽孢杆菌基因的阵列”在本文中定义为：在固相支持物的表面上形成的、由优选地为不连续的单元所构成的线性或二维的阵列，其中所述单元是地衣芽孢杆菌基因的阵列，所述地衣芽孢杆菌基因选自：SEQ ID Nos：2-4198的核苷酸、SEQ ID Nos：2-4198的互补链，和SEQ ID Nos：2-4198的片段(例如，长度为例如40-60个核苷酸的合成寡核苷酸)，其中每个不连续的单元具有限定的区域。应当理解术语“地衣芽孢杆菌基因”包括SEQ ID Nos：2-4198的核苷酸、SEQ ID Nos：2-4198的互补链，或SEQ ID Nos：2-4198的片段。
术语“微阵列”在本文中定义为地衣芽孢杆菌基因单元的阵列，其所具有的不连续的地衣芽孢杆菌基因单元的密度为至少约100/cm2，并优选为至少约1000/cm2。微阵列中的地衣芽孢杆菌基因单元的通常尺寸，例如直径，为大约10-大约250μm，优选在大约10-大约200μm，更优选在大约20-大约150μm，更优选在大约20-大约100μm，最优选在大约50-大约100μm，甚至最优选在大约80-大约100μm，而且与微阵列中其他的基因单元隔开大约同样的距离。
在固体支持物的表面上形成微阵列的方法和设备在本领域是熟知的。参考例如美国专利No.5,807,522；美国专利No.5,700,637；和美国专利No.5,770,151。所述设备可以是如美国专利No.5,807,522所描述的自动化设备。
术语“含有地衣芽孢杆菌基因阵列的基片(底物)”在本文中定义为固相支持物，其表面上沉积(deposited)有如本文所述的多个地衣芽孢杆菌基因，用于检测标记的核酸与地衣芽孢杆菌基因的结合。
在一个方面中，所述基片可以是玻璃支持物(例如载玻片)，支持物表面具有亲水性或疏水性的涂层，涂层上结合了不同的随机核酸片段的阵列，其中每个不同的随机核苷酸片段置于独立的确定位置。
基片上的每个微阵列优选地在大约5或6cm2的表面积上含有至少103个不同的地衣芽孢杆菌。每个不同的地衣芽孢杆菌基因(i)置于阵列上的独立的确定位置；(ii)具有至少50bp的长度；(iii)以大约0.1飞摩尔(femtomole)-100纳摩尔的量存在，必要时量可以更高。
对于亲水性的涂层，载玻片是这样被涂覆的：将厚度均匀的聚阳离子聚合物膜置于玻片的表面，并干燥该膜而形成干燥涂层。聚阳离子聚合物的添加量应该足以在所述玻璃表面形成至少单层的聚合物。聚合物膜通过带负电的甲硅烷基-OH(silyl-OH)基团与聚合物中带电的阳离子基团之间的静电结合作用而结合到所述表面上。所述聚阳离子聚合物包括但不限于聚赖氨酸和聚精氨酸。
另一种涂覆策略是使用活性醛来将DNA偶联到玻片上(Schena等，1996，Proceedings of the National Academy of Science USA 93：10614-10619；Heller at al.，1997，Proceedings of the National Academy of Science USA 94：2150-2155)。
或者，所述表面可能具有相对疏水的性质，即促使沉积于该表面上的水性介质形成液珠的性质。多种已知的疏水性聚合物，例如聚苯乙烯、聚丙烯或聚乙烯，与玻璃，及多种润滑剂或其他可施加到支持物表面的疏水性的膜一样，都具有理想的疏水性质。如果将水性的液滴施加到支持物的表面上时，该液滴不显著地扩散超过被施加的液滴的面积大小(area size)，则称该支持物表面是“疏水性”的，其中，该表面通过与该被施加到该表面上的液滴发生疏水相互作用而阻止该液滴的扩散。
在另一个方面中，所述基片可以是具有多个小室的(multi-cell)基片，其中每个小室含有在多孔表面上形成的地衣芽孢杆菌的微阵列，优选为相同的微阵列。例如，96个小室的阵列通常具有宽度大约12-244mm，长度8-400mm的阵列尺寸，而阵列中的小室的宽度和长度尺寸分别为阵列的宽度和长度尺寸的1/12和1/8，即，宽度为大约1-20mm，长度为大约1-50mm。
所述固体支持物可以包括非透水性的垫片(backing)，例如载玻片或者刚性聚合物片，或其他非多孔(non-porous)材料。在垫片的表面形成一层由多孔材料形成的透水膜。这些多孔材料包括但不限于，硝酸纤维素膜尼龙，聚丙烯和聚偏二氟乙烯(PVDF)聚合物。膜的厚度优选地在大约10-1000μm。可以通过喷涂(spraying)或者涂覆(coating)将膜施加于垫片上，或者将预成型的膜施加于垫片上。
或者，所述固体支持物可简单地为由硝酸纤维素、尼龙、聚丙烯或聚偏二氟乙烯(PVDF)聚合物组成的滤膜，或者，就此处而言，任何适用的材料。
所述膜的表面可以被不透水的网格线(grid lines)划分为所需的小室阵列，所述网格线通常在膜表面上方100到2000μm距离处。这些网格线可以通过如下方法在所述膜的表面形成：在阵列网格(array grid)中沉积(layingdown)未硬化、可流动的树脂或弹性体溶液，使该物质向下渗透过多孔的膜而到达垫片，然后使网格线硬化从而形成具有小室阵列的基片。
网格线的隔栅(barrier)材料可以是可流动硅酮(flowable silicone)，蜡基材料(wax-based materials)，热固性材料(例如环氧树脂)，或任何其他有用的材料。可以使用细注射器、印刷技术、热封冲压(heat-sealstamping)，或任何本领域已知的有用的方法将网格线施加到固态支持物上。
每个小室(well)优选地含有不同的地衣芽孢杆菌基因的微阵列。“不同的地衣芽孢杆菌基因”，对于构成微阵列的基因而言，在本文中定义为阵列的成员，其与阵列的其他成员基于以下的差异而区别开来：不同的地衣芽孢杆菌基因序列或其寡聚物序列；和/或，相同或不同地衣芽孢杆菌基因的不同浓度；和/或，不同地衣芽孢杆菌基因或不同地衣芽孢杆菌基因浓度的不同混合物。因此，“不同的地衣芽孢杆菌基因”的阵列可以包含下列作为其成员：(i)不同的地衣芽孢杆菌基因，其中每个成员都有确定的量；(ii)特定的地衣芽孢杆菌基因的不同的、分级的浓度；和/或(iii)两个或多个不同的地衣芽孢杆菌基因的不同组成的混合物。
但是应当理解，在本发明的方法中，本领域中已知的任何形式的基片都可以使用。
优选使用分配装置(dispensing device)将已知量的所选地衣芽孢杆菌基因输送到支持物表面上的特定位置，所述分配装置具有一个或多个尖头(tips)，用于保证可重复地进行地衣芽孢杆菌基因的沉积和定位并用于制备多个阵列。任何本领域已知的分配装置都可用于本发明的方法。例如参考美国专利No.5,807,522。
对于在亲水表面上的液体分配，液体形成液珠的倾向小一些，分配的体积对于分配装置尖头在紧邻支持物表面处的总停留时间更加敏感。
对于在疏水表面的液体分配，从尖头到支持物表面的流体流动将保持从该分配器到支持物表面直到形成液珠为止。在一定的液珠大小，即体积下，液体流动到表面上的倾向可以被下面两种作用抵消：一是液珠和支持物表面的疏水表面相互作用，其限制表面上总液珠的面积；二是液滴的表面张力，其趋向于达到一定的液滴曲率。这种情况下，会形成一定的液珠体积，而分配器的尖头在收回过程中保持和液珠的接触，几乎不会影响液珠的体积。
形成的所需沉积体积，即液珠体积优选地在2pl(皮升)到2nl(纳升)的范围内，尽管也可以分配100nl或更高的体积。应当理解所选的分配体积取决于(i)分配器尖头的“足迹”(footprint)，即尖头所延伸的区域的大小；(ii)支持物表面的疏水性；和(iii)尖头与支持物表面接触的时间和从该表面收回的速度。另外，可以通过提高介质的粘度从而有效地减少液体从分配装置流到支持物表面的流动时间，来缩小液珠的尺寸。还可以将液滴沉积于支持物表面上被疏水的网格图案包围的亲水区域中，来进一步限制液滴的尺寸。
在一定的尖头尺寸下，可以通过增加表面疏水性、减少尖头与表面的接触时间、增加尖头离开表面的运动速率、和/或增加介质的粘度，来以可控的方式减小液滴的体积。当上述参数固定时，可以以可重复的方式实现选定的在所需的皮升到纳升的范围内的沉积体积。
将地衣芽孢杆菌基因样品的液滴沉积到一个支持物上的选定的位置之后，可以将尖头移到第二个支持物上的相应位置，将地衣芽孢杆菌基因样品沉积到该位置，并重复该过程，直到随机的核酸片段样品被沉积到在多个支持物上的选定位置。
然后，可用另一个随机核酸片段样品在每个支持物上的另一个微阵列位置重复此沉积过程。
每个地衣芽孢杆菌基因区域的直径优选为大约20-200μm。每个区域和其最近的(非对角线的)邻居之间的间距，以从中心到中心的距离测量，优选为大约20-400μm的范围。因此，例如，一个具有大约250μm的中心到中心间距的阵列含有大约40个区域/cm或1,600个区域/cm2。形成阵列后，处理支持物以蒸发掉形成每个区域的液滴的液体，留下干燥的、相对平坦的地衣芽孢杆菌基因或其寡聚物的区域的所需阵列。干燥可以通过加热或真空实现。所述DNA也可以紫外-交联到聚合物涂层上。
核酸探针.在本发明的方法中，所述菌株在含和不含底物的营养培养基中使用本领域熟知的方法进行培养，以分离用作探针的核酸。例如，所述菌株可以在合适的培养基中在实验室或工业发酵罐中通过摇瓶培养、小规模或大规模发酵(包括连续、分批、补料分批或固态发酵)来进行培养。培养在合适的含有碳源、氮源和无机盐的营养培养基中使用本领域已知的方法进行。合适的培养基可以从供货商获得或者根据公开的组成(例如在美国典型培养物保藏中心的目录中)制备。
来自在含和不含底物的营养培养基中培养的微生物菌株的核酸探针可以是任何核酸，其包括基因组DNA，cDNA和RNA，而且可以用本领域已知的标准方法分离。
分离的核酸探针群体可以使用本领域已知的方法以检测报道分子来标记，例如比色(colorimetric)的、放射性的、包括32P、33P或35S；荧光报道分子，和其他报道分子(Chen等，1998，Genomics 51：313-324；DeRisi等，1997，Science 278：680-686；美国专利No.5,770,367)。
在一个优选的方面中，所述探针用荧光报道分子标记。例如，可以在从各个RNA池逆转录的过程中，通过掺入荧光团作为染料标记的核苷酸(DeRisi等1997，同上)，例如Cy5-标记的三磷酸脱氧尿苷，来标记DNA探针；或者，可以直接用不同的荧光官能团标记分离的cDNA。荧光标记的核苷酸包括但不限于荧光素结合的核苷酸类似物(绿色荧光)和丽丝胺(lissamine)核苷酸类似物(红色荧光)。荧光官能团包括但不限于Cy3(一种绿色荧光染料)和Cy5(红色荧光染料)。
阵列杂交.然后，在一定条件下，将来自用和不用底物培养的两种菌株的标记的核酸加到地衣芽孢杆菌基因的阵列中，在所述条件下，来自所述两种菌株的核酸池(pool)与阵列上的地衣芽孢杆菌基因的互补序列杂交。对于本发明，杂交表明来自两种菌株的被标记的核酸与地衣芽孢杆菌基因在极低到极高的严紧度条件下杂交。
将小体积的被标记的核酸混合物加到基片上。该溶液会扩散以覆盖整个微阵列。对于具多个小室的基片，每个小室中加入一种或多种溶液，这些溶液在隔栅元件处被阻止。
对于长度至少为大约100个核苷酸的核酸探针，可以使用Eisen和Brown，1999，Methods of Enzymology，303：179-205所描述的微阵列杂交条件。杂交在盖玻片下，65℃、3×SSC的条件下进行4-16小时，然后在2×SSC，0.1％SDS中去掉盖玻片，在室温下通过在该溶液中洗涤阵列2到3次以进行后杂交(post-hybridization)，然后连续先后在1×SSC中洗涤2分钟和0.2×SSC中洗涤2分钟或更长时间。
还可以使用常规的极低严紧度到极高严紧度的条件。极低到极高严紧度的条件的定义是，按照标准Southern印迹程序，在下面的条件下进行杂交和预杂交：42℃、5×SSPE、0.3％SDS、200μg/ml剪切并变性的鲑鱼精子DNA、以及对于极低和低严紧度为25％的甲酰胺，对于中等到中高严紧度为35％的甲酰胺，对于高和极高严紧度为50％的甲酰胺。
载体材料最后在至少45℃(极低严紧度)，更优选至少为50℃(低严紧度)，更优选至少55℃(中等严紧度)，更优选至少60℃(中高严紧度)，更优选至少65℃(高严紧度)，最优选至少70℃(极高严紧度)下，用2×SSC，0.2％SDS洗涤三次，每次15分钟。
对于少于50个核苷酸的较短核酸探针，可以使用Kane等，2000，NucleicAcids Research 28：4552-4557描述的微阵列杂交条件。杂交在有支持物的盖玻片下进行，条件是42℃，高湿度下，50％甲酰胺，4.1×Denhardt’s溶液，4.4×SSC，100μg/ml鲱鱼(herring)精子DNA中，进行16-18小时。在4×SCC中除去盖玻片后，通过将阵列浸没在1×SCC，0.1％SDS中10分钟，0.1×SCC，0.1％SDS中两次10分钟，和0.1×SCC中两次10分钟，来洗涤阵列。
对于长度大约50-大约100个核苷酸的较短的核酸探针，可以使用常规的严紧度条件。这样的严紧度条件定义为，按照标准Southern印迹程序，在比根据Bolton和McCarthy(1962，Proceedings of the National Academy ofSciences USA 48：1390)的计算方法算得的Tm低5℃到10℃的温度下，在0.9MNaCl，0.09M Tris-HCl pH 7.6，6mM EDTA，0.5％NP-40，1×Denhardt′s溶液，1mM焦磷酸钠，1mM磷酸二氢钠，0.1mM ATP，和0.2mg每毫升酵母RNA中进行预杂交、杂交和杂交后洗涤。
载体材料最后在比算得的Tm低5℃到10℃的温度下，在6×SCC加0.1％SDS中洗一次，15分钟；用6×SCC洗两次，每次15分钟。
杂交条件的选择取决于地衣芽孢杆菌基因和从用和不用诱导底物培养的菌株中得到的核酸探针之间的同源性程度。例如，当核酸探针和地衣芽孢杆菌基因来自相同的菌株时，高严紧度条件是最适当的。当所述菌株来自和地衣芽孢杆菌基因来源不同的属或种时，低或中等的严紧度条件可为更适合的。
在一个优选的方面中，杂交在低严紧度的条件下进行。在一个更优选的方面中，杂交在中等严紧度的条件下进行。在一个最优选的方面中，杂交在高严紧度的条件下进行。
然后，如果需要，使整个固态支持物与检测试剂反应并使用标准的比色、放射或荧光检测手段来分析。所有处理和检测步骤对固态支持物上的所有微阵列而言都是同时进行的，以保证固态支持物上的所有微阵列具有一致的分析条件。
检测.最常用的检测方法是使用共焦光学系统(confocal optics)进行的激光诱导荧光检测(Cheung等，1998，Nat.Genet.18：225-230)。将阵列在这样的荧光激发条件下检测：(i)阵列上的分别与从不用诱导底物培养的菌株中获得的第一核酸探针和用诱导底物培养的菌株中获得的第二核酸探针杂交的地衣芽孢杆菌基因分别产生独特的第一荧光发射颜色和独特的第二荧光发射颜色；及(ii)与基本上相同数目的从不用诱导底物培养的菌株中获得的和从用诱导底物培养的菌株中获得的核酸探针杂交的地衣芽孢杆菌基因产生独特的复合荧光发射颜色；其中所述菌株中所述基因的相对表达可以通过观察阵列上每个点的荧光发射颜色来确定。
荧光激发条件基于荧光报道物的选择。例如，Cy3和Cy5报道物分别用在532nm和632nm下工作的固态激光器来检测。
但是，也可以使用其他本领域中熟知的检测方法，例如标准的光度、比色、或放射检测手段，如较早前描述的。
数据分析.可以使用任何商业上可获得的图象分析软件分析从扫描的图象获得的数据。优选地，这些软件有鉴定阵列元素、减去背景、对多色图象进行去褶合(deconvolute)、标记或除去假象(artifacts)、确认控制的恰当进行、和对信号进行归一化(normalize)等功能(Chen等，1997，Journal of Biomedical Optics 2：364-374)。
已经描述了数种用于分析和判读基于微阵列的表达谱的计算方法，包括聚类分析(cluster analysis)(Eisen等，1998，Proc.Nat.Acad.Sci.USA 95：14863-14868)，基因的参数排序(parametric ordering of genes)(Spellman等，1998，Mol Biol.Cell 9：3273-3297)，和基于代表性的手工挑选的或计算机产生的表达谱的监督聚类(supervised clustering)方法(Chu等，1998.Science282：699-705)。优选的评价微阵列的结果的方法利用统计学分析来确定表达水平差异的显著性。在本发明的方法中，检测到的表达水平中的差异为至少约10％或更多，优选至少约20％或更多，更优选至少约50％或更多，还更优选至少约75％或更多，并最优选至少约100％或更多。
微阵列显著性分析系统(Significance Analysis of Microarrays，SAM)就是一个这样的优选系统(Tusher等，2001，Proc.Natl.Acad.Sci.USA 98：5116-5121)。统计学分析使得确定50％或更少的显著改变的表达水平成为可能。PAM(微阵列预测性分析)代表了另外一种分析微阵列结果的方法(Tibshirani等，2002，Proc.Natl.Acad.Sci.USA 99：6567-6572)。
聚类算法也可以用来分析微阵列表达数据。通过表达谱的分析，可以鉴定实施共同的代谢或生物合成功能的共调节的(co-regulated)基因。分级聚类(hierarchical clustering)已经用于微阵列表达数据的分析中，以基于共有相似的表达模式将基因归于类群(clusters)中(Eisen等，1998，同上)。该方法产生一种图形显示，其类似于一种系统树，其中任一基因和每一个其他基因的表达行为的相关性都用树枝(branch)的长度来表示。MichaelEisen编写的Cluster和TreeView程序(Eisen等，1998 Proc.Nat.Acad.Sci.USA 95：14863-14868)可以免费获得。Genespring是可用于此类分析的一种商业程序(Silicon Genetics，Redwood City，CA)。
自组织图(self-organizing maps，SOMs)是一种非分级的(non-heirarchical)方法，其也被用于微阵列表达数据(Tamayo等，1999，Proc.Natl.Acad.Sci.USA 96：2907-2912)。该方法包括选择一定几何形状(geometry)的节点(nodes)，节点的数目决定类群的数目。然后将被分析的基因的数目和用于提供这些基因的表达值的实验条件的数目进行迭代过程(20,000-50,000次迭代)，该迭代过程将节点和数据点映射到多维基因表达空间(multidimensional gene expression space)中。在鉴定了显著地受调节的基因之后，将每个基因的表达水平在各次实验之间均一化。结果，就以一种相对不依赖于每一基因的表达量的方式显著地突出了基因组的表达谱。用于微阵列表达分析的“GENECLUSTER”SOM程序的软件可以从Whitehead/MIT Center for Genome Research得到。也可以用GeneSpring软件包构建SOMs。
基因的分离.对含有被鉴定为受培养基中存在的底物的诱导的基因或其部分的探针进行序列测定来定性。根据该序列，可以用本领域熟知的方法将基因分离。
用于分离或克隆基因的技术包括从基因组DNA中分离，从cDNA制备，或者二者的结合。从所述的基因组DNA中克隆基因可以通过，例如，使用熟知的聚合酶链式反应(PCR)或对表达文库进行抗体筛选来检测具有共同结构特征的克隆DNA片段来实现。参见，例如，Innis等，1990，PCR：A Guideto Methods and Application，Academic Press，New York。也可以使用其他核酸扩增方法例如连接酶链式反应(LCR)，连接激活转录(ligated activatedtranscription，LAT)和基于核酸序列的扩增(nucleic acid sequence-basedamplification，NASBA)。所述基因可以从目标菌株中克隆，也可以从另一种或者亲缘的生物中克隆，因此，例如，也可以是该基因的等位变体或种间变体(species variant)。
监测多个基因的差异表达的方法
本发明还涉及监测在第一细菌细胞中的多个基因相对于一个或多个第二细菌细胞中相同基因的表达的差异表达的方法，该方法包括：
(a)在一定条件下，将用检测报道分子标记的从细菌细胞中分离的核酸的混合物加入含有地衣芽孢杆菌基因阵列的底物中，所述地衣芽孢杆菌基因阵列选自核苷酸SEQ ID NOs：2-4198、SEQ ID NOs：2-4198的互补链和SEQ ID NOs：2-4198的片段；在所述一定条件下，所述检测报道分子标记的核酸与所述阵列上的地衣芽孢杆菌基因的互补序列杂交；其中来自所述第一细菌细胞和一个或多个第二细菌细胞的核酸分别被第一检测报道分子和一种或更多的第二检测报道分子所标记；
(b)在一定条件下检查该阵列，在所述条件下，所述细菌细胞中的基因的相对表达是由所观察到的阵列上每个点的检测信号决定的，其中，(i)阵列上与来自第一细菌细胞的核酸或者与来自一种或多种第二细菌细胞的核酸杂交的地衣芽孢杆菌基因分别产生独特的第一检测信号或者一种或多种第二检测信号；和(ii)阵列上与来自第一细菌细胞和一种或多种第二细菌细胞的核酸都杂交的地衣芽孢杆菌基因产生独特的联合检测信号。
本发明的方法还可以用于监测来自芽孢杆菌细胞的多个基因的全局表达，发现新基因，鉴定未知的开放阅读框的可能功能，和监测基因拷贝数的变化和稳定性。例如，对基因表达变化的全局性观察可以用来描绘出芽孢杆菌细胞适应培养条件、环境压力和其他生理性刺激的变化的途径。监控全局表达的其它可能性包括孢子形态发生、重组、以及代谢或催化途径工程。
本发明的方法是特别有利的，因为阵列上的一个点就等于一个基因或开放阅读框，由于基因的序列信息是可以得到的，后面就不必再进行大量的定性工作，而且可以根据基因产物的功能来组织地衣芽孢杆菌微阵列。
微阵列.制备微阵列的方法在本文中已有描述。
细菌细胞.在本发明的方法中，所述两种或多种芽孢杆菌细胞可以是任何芽孢杆菌细胞，其中一种细胞作为参照，用于鉴定另外一种(或多种)细胞中基因的相同或相似的互补体的表达差异。在一个方面中，所述的两种或多种细胞是相同的细胞。例如，可以在不同的生长条件，例如氧限制(oxygen limitation)、营养和/或生理下比较它们。在另一个方面，一种或多种细胞是所述参照细胞的突变体。例如，所述突变体可能具有不同的表型。进一步地在另一个方面，所述两种或多种细胞属于不同的种(例如Bacillus clausii和枯草芽孢杆菌)。更进一步地在另一个方面，所述两种或多种细胞是来自不同的属。更进一步地在另一个方面，一种或多种细胞是所述参照细胞的转化体，其中所述一种或多种转化体表现出另外的性质。例如，所述转化体可能具有相对该参照细胞和/或另外的转化体中的一种改进的表型。本文中，术语“表型”定义为细胞的可观察的或者外在的特征，其由细胞的基因型决定并受细胞的环境所调节。这些改进的表型可以包括但不限于，蛋白质或化合物的分泌或生产的提高、蛋白质或化合物的分泌或生产的减少或消失，基因表达的提高或减少，理想的形态，在理想的条件下改变的生长速度，减轻由过量表达所导致的生长抑制，或针对低氧条件的耐性。
所述芽孢杆菌细胞可以是任何芽孢杆菌细胞，但优选为嗜碱芽孢杆菌，解淀粉芽孢杆菌，短芽孢杆菌、蜡状芽孢杆菌、环状芽孢杆菌、Bacillusclausii、凝结芽孢杆菌、苛求芽孢杆菌、坚强芽孢杆菌、灿烂芽孢杆菌、迟缓芽孢杆菌、地衣芽孢杆菌、浸麻芽孢杆菌、巨大芽孢杆菌、甲醇芽孢杆菌、短小芽孢杆菌、球形芽孢杆菌、嗜热脂肪芽孢杆菌、枯草芽孢杆菌或苏云金芽孢杆菌。
在一个优选的方面，所述芽孢杆菌细胞是嗜碱芽孢杆菌细胞。在另一个优选的方面，所述芽孢杆菌细胞是解淀粉芽孢杆菌细胞。在另一个优选的方面，所述芽孢杆菌细胞是短芽孢杆菌细胞。在另一个优选的方面，所述芽孢杆菌细胞是蜡状芽孢杆菌细胞。在另一个优选的方面，所述芽孢杆菌细胞是环状芽孢杆菌细胞。在另一个优选的方面，所述芽孢杆菌细胞是Bacilus clausii细胞。在另一个优选的方面，所述芽孢杆菌细胞是凝结芽孢杆菌细胞。在另一个优选的方面，所述芽孢杆菌细胞是苛求芽孢杆菌细胞。在另一个优选的方面，所述芽孢杆菌细胞是坚强芽孢杆菌细胞。在另一个优选的方面，所述芽孢杆菌细胞是灿烂芽孢杆菌细胞。在另一个优选的方面，所述芽孢杆菌细胞是迟缓芽孢杆菌细胞。在另一个优选的方面，所述芽孢杆菌细胞是地衣芽孢杆菌细胞。在另一个优选的方面，所述芽孢杆菌细胞是浸麻芽孢杆菌细胞。在另一个优选的方面，所述芽孢杆菌细胞是巨大芽孢杆菌细胞。在另一个优选的方面，所述芽孢杆菌细胞是甲醇芽孢杆菌细胞。在另一个优选的方面，所述芽孢杆菌细胞是短小芽孢杆菌细胞。在另一个优选的方面，所述芽孢杆菌细胞是球形芽孢杆菌细胞。在另一个优选的方面，所述芽孢杆菌细胞是嗜热脂肪芽孢杆菌细胞。在另一个优选的方面，所述芽孢杆菌细胞是枯草芽孢杆菌细胞。在另一个优选的方面，所述芽孢杆菌细胞苏云金芽孢杆菌细胞。
在一个更优选的方面，所述芽孢杆菌细胞是地衣芽孢杆菌细胞。在一个最优选的方面，所述地衣芽孢杆菌细胞是地衣芽孢杆菌ATCC 14580细胞。
在另一个更优选的方面，所述芽孢杆菌细胞是Bacillus clausii细胞。在另一个最优选的方面，所述Bacillus clausii细胞是Bacillus clausii NCIB10309细胞。
应当理解，术语“芽孢杆菌”还包括芽孢杆菌属的亲缘菌属，例如类芽孢杆菌属、海洋芽孢杆菌属等。
在本发明的方法中，细胞在合适生长的营养培养基中，使用本领域熟知的方法进行培养，以分离用作探针的核酸。例如，所述细胞可以使用合适的培养基在实验室或工业发酵罐中进行摇瓶培养、小规模或大规模发酵(包括连续、分批、补料分批或固态发酵)。培养在合适的营养培养基中使用本领域已知的方法进行，所述培养基含有碳、氮源和无机盐。合适的培养基可以从供货商获得或者根据公开的组成(例如在美国典型培养物保藏中心的目录中)制备。
核酸探针.来自两种或多种芽孢杆菌细胞的核酸探针可以是任何核酸，包括基因组DNA，cDNA和RNA，而且如本文所述，可以用本领域已知的标准方法分离。分离的核酸探针群体可以通过本文描述的方法用比色的、放射性的、荧光报道分子或其他报道分子进行标记。
在优选的方面，探针用如本文所述的荧光报道物诸如Cy3(绿色荧光染料)和Cy5(红色荧光染料)进行标记。
阵列杂交.在本文描述的一定条件下，将来自两种或多种芽孢杆菌细胞的标记的核酸加到含有地衣芽孢杆菌基因阵列的基片上，在该条件下，来自两种或多种芽孢杆菌细胞的核酸池(pools)与阵列上地衣芽孢杆菌基因的互补序列杂交。
检测和数据分析.使用本文中描述的相同方法进行检测和数据分析。
计算机可读取介质和基于计算机的系统
本文所述的地衣芽孢杆菌染色体和其基因可以在多种介质中“提供(provided)”以便于它们的使用。术语“提供”指包含地衣芽孢杆菌基因阵列的制成品。一些制造商以这样的形式提供地衣芽孢杆菌基因，其使得本领域的技术人员能够使用不可直接用于检查以天然形式或纯化形式存在的所述染色体或其子集(subset)的方法来检查该制成品。
因此，本发明还涉及所述包括地衣芽孢杆菌基因阵列的计算机可读取介质形式的制成品，所述基因选自SEQ ID Nos：2-4198的核苷酸、SEQ IDNos：2-4198的互补链和SEQ ID Nos：2-4198的片段。
在该方面的一个应用中，所述本发明的地衣芽孢杆菌基因可以记录在计算机可读取的介质上。术语“计算机可读取的介质”在此定义为任何可以被计算机读取或访问的介质。这样的计算机可读取的介质包括但不限于，磁性存储介质，例如软盘、硬盘存储介质，和磁带；光存储介质，例如CD-ROM，DVD；电存储介质，例如随机存储器(RAM)和只读存储器(ROM)，和这些类别的组合，例如磁/光存储介质。本领域的技术人员可以容易地了解如何使用任何已知的计算机可读取介质来制造包含记录了本发明的核苷酸序列的计算机可读取介质的产品。同样，本领域的技术人员应该清楚如何使用可被开发的其他计算机可读取介质来制造类似产品，其上记录有本发明的核苷酸序列。
本处所用的“记录”是指的将信息保存在计算机可读取的介质上的过程。本领域的技术人员可以容易地采用任何已知的将信息记录到计算机可读取介质上的方法来生产包含本发明的核苷酸序列信息的产品。
有多种数据存储结构可用于创建记录了本发明的核苷酸序列的计算机可读取介质。数据存储结构的选择通常基于所选的访问存储数据的方法。另外，可以使用多种数据处理程序和格式来将本发明的核苷酸序列信息存储到计算机可读取介质上。所述序列信息可以表现为商业软件例如WordPerfect或Microsoft Word格式的字处理文本文件的形式，或可以表现为存储在应用数据库例如DB2、Sybase、Oracle等中的ASCII文件的形式。技术人员可以容易地采用任意种数据处理结构格式(例如文本文件或数据库)来获得记录了本发明的核苷酸序列的计算机可读取介质。
可公开得到多种计算机软件程序，其使得技术人员可以访问计算机可读取介质中提供的序列信息。因此，通过以计算机可读取的形式提供选自核苷酸SEQ ID NOs：2-4198、SEQ ID NOs：2-4198的互补链和SEQ IDNOs：2-4198的片段的地衣芽孢杆菌基因的阵列，本领域的技术人员就可以程序性地访问提供的序列信息以达到多种目的。
使用BLAST(Altschul等，1990，(同上))、BLAZE(Brutlag等，1993，Comp.Chem.17：203-207)、GENEMARK(Lukashin和Borodovsky，1998，Nucleic Acids Research 26：1107-1115)、GENSCAN(Burge and Karlin，1997，Journal of Molecular Biology 268：78-94)、GLIMMER(Salzberg等，1998，Nucleic Acids Research 26：544-548)和GRAIL(Xu等，1994，Comput.Appl.Biosci.10：613-623)搜索算法的软件可以用来鉴定目标基因组中的开放阅读框(ORFs)，这些开放阅读框含有与来自地衣芽孢杆菌、Bacillus clausii以及其他生物的ORFs和蛋白质的同源性。本文所讨论的ORFs中包括地衣芽孢杆菌和Bacillus clausii基因组的蛋白编码片段，其可用于生产商业上重要的蛋白质，例如发酵反应中或商业上有用的代谢物的生产中有用的酶。
本发明还提供包含本文所讨论的序列信息的系统，特别是基于计算机的系统。设计这些系统用来鉴定其中的基因或基因产物——它们很多本身可为产品，或者用于通过增加或降低特定基因序列的表达来对工业表达宿主进行遗传修饰。
术语“基于计算机的系统”在本文中定义为用于分析本发明的核苷酸序列信息的硬件工具、软件工具和数据存储工具。本发明的基于计算机的系统的硬件工具至少包括中央处理器(CPU)、输入设备、输出设备和数据存储设备。本领域的技术人员很容易理解，任何目前可得到的基于计算机的系统都是适用于本发明的。
如上所述，本发明的基于计算机的系统包括数据存储工具，其中存储了本发明的核苷酸序列；以及为支持和执行搜索工具所必须的硬件和软件工具。
术语“数据存储工具”在本文中定义为：可以保存本发明的核苷酸序列信息的存储器；或存储器访问工具，其可以访问记录了本发明的核苷酸序列信息的制品。
术语“搜索工具”在本文中定义为，一种或多种程序，其在基于计算机的系统上执行，以将目标序列或目标结构基序与数据存储工具中存储的序列信息作比较。搜索工具用于鉴定当前基因组序列中与具体的目标序列或目标基序相匹配的片段或区域。已经公开了多种已知的算法，而且在本发明的基于计算机的系统中已经并可以使用多种用于执行搜索工具的商业软件。这些软件的例子包括但不限于MacPattern(Fuchs，1991，Comput.Appl.Biosci.7：105-106)，BLASTN和BLASTX国立生物技术信息中心(NationalCenter for Biotechnology Information(NCBI))。本领域的技术人员很容易想到，任何用于进行同源性搜索的可得到的算法或实现性的软件包都可适用于本发明的基于计算机的系统。
术语“目标序列”在本文中定义为任何具有6个或6个以上核苷酸的DNA(基因组DNA，cDNA)序列或2个以上氨基酸的氨基酸序列。本领域的技术人员很容易想到，目标序列越长，在数据库中随机地出现该目标序列的概率就越小。目标序列最优选的序列长度为大约10到100个氨基酸或大约30到300个核苷酸残基。但是如公认的，用于搜索商业上重要的片段——例如参与基因表达和蛋白质加工的序列片段——的序列，长度可能短一些。
术语“目标结构基序”或“目标基序”(target motif)在本文中定义为任何合理选择的序列或序列组合，其中所述序列是根据该目标基序折叠时所形成的三维构型而选择的。本领域中有多种已知的目标基序。蛋白质目标基序包括但不限于酶活性部位和信号序列、底物和辅因子结合域、跨膜域、及翻译后修饰位点。核酸目标基序包括但不限于启动子序列、发夹结构和可诱导表达元件(蛋白质折叠序列)，重复序列，回文序列、二重对称(dyad)、及转录和翻译的起始和终止位点。
可以使用多种输入和输出工具的结构格式来对本发明的基于计算机的系统中的信息进行输入和输出。一个优选的输出工具格式对与目标序列或目标基序具有不同同源程度的地衣芽孢杆菌或Bacillus clausii基因组序列的片段进行分级。这种输出方式提供给本领域的技术人员一个对含有不同量的目标序列或目标基序的序列的分级顺序，还对被鉴定的片段中的同源性程度进行鉴定。
可以使用多种比较工具来将目标序列或目标基序与数据存储工具作比较以鉴定地衣芽孢杆菌和Bacillus clausii基因组的序列片段。例如，利用BLAST和BLAZE算法的实现性软件，如Altschul等，1990，(同上)所描述的，可以用来鉴定地衣芽孢杆菌和Bacillus clausii基因组或其他生物的基因组中的开放阅读框。本领域的技术人员可以容易地理解，任何公众可获得的同源性搜索程序都可以用作本发明的基于计算机的系统的搜索工具。本领域技术人员可能知晓的合适的专有系统也可以用于该方面。
密码子使用表
本发明还涉及制备合成基因的方法，其包括(a)基于SEQ ID NO：1的一个或多个开放阅读框或其部分中所使用的密码子，产生密码子使用表；(b)构建合成基因或其部分，其中包含取代了一个或多个天然密码子的选自上述密码子使用表的偏好密码子(preferred codons)；和(c)回收该合成基因。在一个优选的方面，所述密码子使用表是表4和/或表5。
可以用SEQ ID NO：1或其部分的地衣芽孢杆菌染色体序列来生成密码子使用表来设计合成基因，以使其在地衣芽孢杆菌宿主细胞中高效地异源表达。该密码子使用表可以根据(1)在所有开放阅读框中使用的密码子；(2)所选的开放阅读框；(3)开放阅读框的片段；或(4)所选开放阅读框的片段。根据密码子使用表，设计合成基因时，就可以对于每种氨基酸只使用最偏好的密码子，或者每种氨基酸使用若干个普通密码子，或按在所选密码子使用表中密码子使用情况的统计平均或其近似值使用密码子。
可以用任何方法，例如按本领域已知的方法进行定点诱变或PCR产生的诱变，来构建所述合成基因。虽然，从理论上说，上述修饰可以在体内进行，即直接在表达要被修饰的核苷酸序列的细胞中进行，优选在体外进行所述修饰。
可以对所述合成基因进行进一步修饰，将其可操作地连接到一个或多个调控序列，这些序列在与其相容的条件下，通过使用本发明描述的方法，可以指导该编码序列在合适的宿主细胞中表达。使用本发明描述的方法还可以制备包含合成基因的核酸构建体、重组表达载体和重组宿主细胞。
本发明还涉及生产这样合成基因所编码的多肽的方法，包括(a)在有助于生产该多肽的条件下培养含有所述合成基因的宿主细胞；和(b)回收该多肽。
下面用实施例来进一步描述本发明，这些实施例不应被理解为对本发明范围的限制。
实施例
实施例1：鸟枪法(shotgun)DNA测序和基因组组装(genome assembly)
对模式株地衣芽孢杆菌ATCC 14580的基因组进行测序，结合使用全基因组鸟枪法(Wilson，R.K.和Mardis，E.R.，1997，于Genome Analysis：ALaboratory Manual，Vol.1，Birren，B.，Green，E.D.，Meyers，R.M.和Roskams，J.编，(Cold Spring Harbor Press，Cold Spring Harbor，NY)，pp.397-454)和fosmid末端测序(Kim，U.J.，Shizuya，H.，de Jong，P.J.，Birren，B.和Simon，M.I.，1992，Nucleic Acids Res.20：1083-1085；Longmire，J.L.和Brown，N.C.，2003，Biotechniques 35：50-54；Zhao，S.，Malek，J.，Mahairas，G.，Fu，L.，Nierman，W.，Venter，J.C.，和Adams，M.D.，2000，Genomics 63：321-332)。
用下面的方法分离地衣芽孢杆菌ATCC 14580的基因组DNA：用单菌落接种125ml无菌锥形烧瓶中20ml的LB肉汤(Davis，R.W.，Botstein，D.，和Roth，J.R.1980，Advanced Bacterial Genetics，Cold Spring Harbor Press，ColdSpring Harbor，NY)。将培养物在240rpm振荡下在37℃温育过夜。通过在45ml Oak Ridge管中6000×g离心10分钟收集所得细胞，并将沉积的细胞重悬在5ml的Tris-葡萄糖缓冲液(50mM Tris-HCl，pH 8.0，50mM葡萄糖，10mM EDTA)中。加入溶菌酶至终浓度50μg/ml，并将悬液在37℃水浴中温育25分钟。然后，加入200μl 10％SDS，并轻柔地将管翻转数次。加入5微升的第二去污剂混合物(1％玻雷吉(Brij)，1％脱氧胆酸盐，50mM EDTA，pH 7.5)，在室温下保温20分钟，同时将管翻转数次。加入相等体积的苯酚：氯仿(1∶1v/v)并在室温下轻柔地将管翻转20-30分钟。管在4℃下12,000×g离心20分钟。用大口吸液管(wide-bore pipette)小心地吸出上面的水层置于干净的45ml Oak Ridge管中。重复一次苯酚∶氯仿抽提，然后在水层中加入1/10体积的3M乙酸钠，pH 5.2。小心地加入2倍体积的冷乙醇形成上层，用无菌的玻璃棒小心地从溶液中卷取DNA。用70％乙醇小心地冲洗卷取的DNA，再在合适的量的TE缓冲液(10mM Tris-HCl，pH 8.0，1mM EDTA)中将其重悬。
用随机剪切并用BamHI消化的基因组DNA片段构建质粒文库，这些片段已经过制备性琼脂糖凝胶电泳富集了2-3kb的片段(Berka，R.M.，Schneider，P.，Golightly，E.J.，Brown，S.H.，Madden，M.，Brown，K.M.，Halkier，T.，Mondorf，K.，和Xu，F.，1997，Appl.Environ.Microbiol.63：3151-3157).用染料终止化学法(Applied Biosytems，Foster City，CA)在ABI 377和ABI 3700自动测序仪上对大约49,000个随机克隆进行了测序，产生了大约6×基因组的覆盖度。组合使用多种方法进行缺口闭合(gap closure)，这些方法包括fosmid测序(Kim，U.J.，Shizuya，H.，de Jong，P.J.，Birren，B.，和Simon，M.I.，1992，Nucleic Acids Res.20：1083-1085)，在选择的克隆上进行引物步移(primer walking)，和PCR扩增的DNA片段。使用来自Epicentre(Madison，WI)的商品化试剂盒构建fosmid文库。使用了来自大约1975个平均为40kb大小的fosmid克隆的两端的数据来辅助进行最终组装的确证。总共的输入读数为62,685个，其中78.6％被纳入最终组装中。序列周TraceTuner 2.0(Paracel，Inc.，Pasadena，CA)进行碱基判定(base-call)，并用Paracel GenomeAssembler(Paracel，Inc.，Pasadena，CA)在优化的参数和质量评分设为＞20下进行组装。用Phrap、Crossmatch和Consed进行序列修整(sequence finishing)(Gordon D.，Abajian C.，和Green P.，1998，Genome Res.8：195-202)。
实施例2开放阅读框(ORF)的鉴定和注释
用EasyGene(Larsen，T.S.和Krogh，A.，2003，BMC Bioinformatics 4：21)、Glimmer(Delcher，A，L.，Harmon，D.，Kasif，S.，White，O.和Salzberg，S.L.，1999，Nucleic Acids Res.27，4636-4641)和FrameD(Schiex，T.，Gouzy，J.，Moisan，A.和de Oliveira，Y.，2003，Nucleic Acids Res.31，3738-3741)鉴定组装的基因组序列数据中的蛋白质编码区域。只使用了R值小于2、log-odds分值大于-10的EasyGene基因模型。使用BLASTP，E-值阈值为10-5，将预测的蛋白质与非冗余数据库PIR-NREF(Wu，C.H.，Huang，H.，Arminski，L.，Castro-Alvear，J.，Chen，Y.，Hu，Z.Z.，Ledley，R.S.，Lewis，K.C.，Mewes，H.W.，Orcutt，B.C.，2002，Nucleic Acids Research 30：35-37)和枯草地衣芽孢杆菌基因组(SubtilList)进行比较。使用InterProScan进行假设功能的预测。(Zdobnov，E.M.和Apweiler，R.，2001，Bioinformatics 17，847-848)。InterPro分析包括与Pfam(Bateman，A.，Coin，L.，Durbin，R.，Finn，R.D.，Hollich，V.，Griffiths-Jones，S.，Khanna，A.，Sonnhammer，E.L.等，2004，Nucleic Acids Res.32，D138-D141)、TIGRfam(Haft，D.J.，Selengut，J.D.和White，O.，2003，Nucleic Acids Res.31：371-373)、Interpro(Apweiler，R.，Attwood，T.K.，Bairock，A.，Bateman，A.，Birney，E.，Biswas，M.，Bucher，P.，Cerutti，L.，Corpet，F.，Croning，M.D.，等，2001，Nucleic Acids Res.29：37-40)，使用SignalP的信号肽预测(Nielsen，H.，Engelbrecht，J.，Brunak，S.，和von Heijne，G.，1997，ProteinEngineering 10：1-6)、和使用TMHMM的跨膜区预测(Krogh，A.，Larsson，B.，von Heijne，G.和Sonnhammer，E.L.L.，2000，J.Mol.Biol.305，567-580)进行比较。这些ORF根据直向同源组聚类(Cluster of Orthologous Groups，COG)数据库(
www.ncbi.nlm.nih.gov/COG)指定为各功能类别，根据Tatusov，R.L.，Koonin，E.V.和Lipman，D.J.，1997，Science 278：631-637；Koonin，E.V.和Galperin，M.Y.，2002，Sequence-Evolution-Function：ComputationalApproaches in Comparative Genomics(Kluwer，Boston)的描述进行人工校验。使用tRNAscan-SE鉴定转运RNA基因(Lowe，T.M.和Eddy，S.R.，1997，Nucleic Acids Res.25：955-964)。
实施例3：地衣芽孢杆菌基因组的一般特征
地衣芽孢杆菌ATCC 14580基因组被确定为由4,222,336bp的环状分子构成，平均GC含量为46.2％(表2)。基因组分析中没有发现质粒，通过琼脂糖凝胶电泳也没有发现质粒。
该基因组包含4208个预测的蛋白质编码基因，其平均大小为873bp，7个rRNA操纵子和81个tRNA基因。通过组合使用数个寻找基因的算法预测了4208个蛋白质编码ORFs。这些ORFs构成了基因组的87％，且其平均长度为873bp。这些的ORFs中大约48％在一条DNA链上编码，52％在另一条链上编码。在这些蛋白质编码ORFs中，3948个(94％)与PIR中的蛋白质有显著的相似性，而这些基因模型中，有3187个含有Interpro基序，2895个含有PFAM中的蛋白质基序。在PIR数据库中能检索到结果的地衣芽孢杆菌基因组中的假定蛋白质和保守性假定蛋白质有1318个(212个保守的假设ORFs)。在假定和保守性假定ORFs中，有683个(52％)具有PFAM中所含的蛋白质基序(148个保守性假定ORFs)。有72个tRNA基因，其代表全部20种氨基酸和7个rRNA操纵子。
基于与枯草芽孢杆菌复制起点(Moriya，S.，Fukuoka，T.，Ogasawara，N.，和Yoshikawa，H.，1988，EMBO Journal 7：2911-2917；Ogasawara，N.，Nakai，S.，和Yoshikawa，H.，1994，DNA Res.1，1-14；Kadoya，R.，Hassan，A.K.，Kasahara，Y.，Ogasawara，N.，和Moriya，S.，2002，Mol.Microbiol.45：73-87；Tosato，V.，Gjuracic，K.，Vlahovicek，K.，Pongor，S.，Danchin，A.，和Bruschi，C.V.，2003，FEMS Microbiol.Lett.218：23-30)的一些特征的相似性鉴定了可能的复制起点。这些特征包括(a)枯草芽孢杆菌基因组上复制起点附近四个基因(rpmH、dnaA、dnaN和recF)的共定位(colocalization)，(b)GC核苷酸skew[(G-C)/(G+C)]分析，和(c)多个dnaA盒(Pedersen，A.G.，Jensen，L.J.，Brunak，S.，Staerfeldt，H.H.，和Ussery，D.W.，2000，Mol.Biol.299：907-930；Christensen，B.B.，Atlung，T.，和Hansen，F.G.，1999，J.Bacteriol.181：2683-2688；Majka，J.，Jakimowicz，D.，Messer，W.，Schrempf，H.，Lisowski，M.，和
，J.，1999，Eur.J.Biochem.260：325-335)和dnaA基因紧邻上游区中富含AT序列的存在。基于这些结果，将rpmH和dnaA基因之间BstBI限制性位点中的胞嘧啶残基指定为地衣芽孢杆菌基因组的第一个核苷酸。复制终止位点通过GC skew分析定位于2.02Mb附近。该区域大致在与复制起点相对的位置上。
和枯草芽孢杆菌不同，在地衣芽孢杆菌中没有找到明显地编码复制终止蛋白(rtp)的基因。Bacillus halodurans基因组也缺乏rtp功能(Takami，H.，Nakasone，K.，Takaki，Y.，Maeno，G.，Sasaki，R.，Masui，N.，Fuji，F.，Hirama，C.，Nakamura，Y.，Ogasawara，N.等，2000，Nucleic Acids Res.28：4317-4331)，可能枯草芽孢杆菌在与Bacillus halodurans和地衣芽孢杆菌趋异(divergence)后获得了rtp基因。
可转座元件和原噬菌体。地衣芽孢杆菌ATCC 14580基因组被确定为含有一个1285bp的插入序列元件的9个相同的拷贝，该元件名为IS3Bli1(Lapidus，A.，Galleron，N.，Andersen，J.T.，J_rgensen，P.L.Ehrlich，S.D.，和Sorokin，A.，2002，FEMS Microbiol.Lett.209：23-30)。该序列与其他IS3家族元件具有一些共同特征，包括3到5bp的同向重复单位，一个10bp的左反向重复序列，和一个9bp的右反向重复序列。IS3Bli1编码两个预测的重叠ORF，分别名为orfA和orfB，处于相对翻译阅读框0和-1中。orfA中终止密码子前“滑动七体”(slippery heptamer)基序AAAAAAG的存在暗示在这两个ORFs之间有编程性翻译移码的发生，导致单一的基因产物(Farabaugh，P.，1996，Microbiol.Rev.60：103-134)。orfB基因产物含有DD[35]E[7]K基序，这是插入序列中高度保守的模式。IS3Bli1元件中有8个位于基因区间，有1个隔断comP基因。除了这些插入序列之外，该基因组还编码假设的转座酶，其与腾冲热厌氧杆菌(Thermoanaerobactertengcongensis)基因组中鉴定的转座酶(Bao，Q.，Tian，Y.，Li，W.，Xu，Z.；Xuan，Z.，Hu，S.，Dong，W.，Yang，J.，Chen，Y.，Xue，Y.，等，2002，Genome Res.12：689-700)最为接近(E＝1.8e-11)，但是，在Bacillus halodurans(Takami，H.，Nakasone，K.，Takaki，Y.，Maeno，G.，Sasaki，R.，Masui，N.，Fuji，F.，Hirama，C.，Nakamura，Y.，Ogasawara，N.等，2000，Nucleic Acids Res.28：4317-4331)、Oceanobacillus iheyensis(Takami，H.，Takaki，Y.，和Uchiyama，I.，2002，Nucleic Acids Res.30：3927-3935.)，无乳链球菌(Streptococcus agalagiae)(Takahashi，S.，Detrick，S.，Whiting，A.A，Blaschke-Bonkowksy，A.J.，Aoyagi，Y.，Adderson，E.E.，和Bohnsack，J.F.，2002，J.Infect.Dis.186：1034-1038)、和酿脓链球菌(Streptococcus pyrogenes)(Smoot，J.C.，Barbian，K.D.，VanGompel，J.J.，Smoot，L.M.，Chaussee，M.S.，Sylva，G.L.，Sturdevant，D.E.，Ricklefs，S.M.，Porcella，S.F.，Parkins，L.D.，等，2002，Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.99：4668-4673)染色体中也找到了类似的基因。
与其他细菌基因组的Smith-Waterman比较以及其富含AT的特征序列(signitures)揭示了一些噬菌体溶源体或类原噬菌体元件(prophage-likeelements)的存在。注意到近邻的编码末端酶大亚基的基因的存在，从而发现了命名为NZP1和NZP3(分别类似于PBSX和_-105)的原噬菌体序列，所述末端酶是在原噬菌体当中高度保守的特征蛋白(Casjens，S.，2003，Mol.Microbiol.49：277-300)。在第三个假设的命名为NZP2(与SPP1类似)的原噬菌体中没有观察到末端酶基因，但该末端酶基因的缺失可能是进化过程中基因组退化(genome deterioration)的结果。观察到一些GC含量小于39％的区域，这些区域通常编码不含枯草芽孢杆菌直向同源物、只和假设基因或保守性假设基因具有同一性的蛋白质。这些富含AT的片段中的两个对应于NZP2和NZP3原噬菌体。
异位带图(isochore plot)也揭示出具有异常高(62％)G+C含量的区域的存在。这个片段含有两个假设ORFs，其大小(3831和2865bp)大大超过地衣芽孢杆菌平均基因大小。第一个蛋白质编码一个1277个氨基酸的蛋白质，Interpro预测其中有16个胶原蛋白三螺旋重复，且在这个多肽中氨基酸模式TGATGPT被重复了75次。第二个ORF较小一些，其编码具有11个胶原蛋白三螺旋重复的蛋白，且相同的TGATGPT基序重复出现56次。有趣的是，与这些基因相邻的染色体区域(19kb)明显地与枯草芽孢杆菌基因组非共线性(non-colinear)，而且几乎所有预测的ORFs都是假设的或保守性假设的蛋白质。在PIR中列出了一些含有胶原蛋白三螺旋重复区的细菌蛋白，其包括来自百脉中根瘤菌(Mesorhizobium loti)的两个蛋白(登记号NF00607049和NF00607035)，和来自蜡状芽孢杆菌的3个蛋白(登记号NF01692528，NF01269899，和NF01694666)。这些推测的直向同源物与它们在地衣芽孢杆菌中的对应物有53-76％的氨基酸序列同一性，尽管它们的功能还是未知的。
胞外酶.在地衣芽孢杆菌基因组中，4208个基因模型中的689个具有信号肽，如通过SignalP(Identification of prokaryotic and eukaryotic signalpeptides and prediction of their cleavage sites.Henrik Nielsen，JacobEngelbrecht，S_ren Brunak和Gunnar von Heijne，1997，Protein Engineering 10：1-6)所预测的。其中，309个没有跨膜区，如用TMHMM所预测的(A.Krogh，B.Larsson，G.von Heijne，和E.L.L.Sonnhammer，2000，Journal of MolecularBiology 305：567-580)，134个是假设的或者保守性假设的基因。根据对余下175个ORFs的人工检查，至少有82个被确定为有可能编码分泌的蛋白质和酶。这些基因各自的序列ID号如表3所示。
蛋白质分泌、芽孢形成，和感受态途径.Kunst等(Kunst，F.，Ogasawara，N，Mozser，I.，Albertini，A.M.，Alloni，G.，Azebedo，V.，Bertero，M.G.，Bessieres，P.，Bolotin，A.，和Borchert，S.，1997，Nature 390：249-256)列出了18个在枯草芽孢杆菌168的胞外酶分泌中起主要作用的基因。这个列表包括数种陪伴蛋白(chaperonins)，信号肽酶，信号识别颗粒的组分，和蛋白质移位酶复合物。因此就有理由预测，该分泌机构(secretory apparatus)的核心特征在枯草芽孢杆菌和地衣芽孢杆菌中是保守的。
在Kunst等的表中(Kunst，F.，Ogasawara，N，Mozser，I.，Albertini，A.M.，Alloni，G.，Azebedo，V.，Bertero，M.G.，Bessieres，P.，Bolotin，A.，和Borchert，S.等，1997，Nature 390：249-256)所列的139个芽孢形成基因中，除了6个以外，其他所有的基因都在地衣芽孢杆菌中有明显的对应物。上述6个例外(spsABCEFG)构成操纵子，参与枯草芽孢杆菌中芽孢外被多糖的合成。另外，应答调节基因家族(phrACEFGI)在枯草芽孢杆菌和地衣芽孢杆菌之间似乎具有低水平的序列保守性。
几乎没有地衣芽孢杆菌株具备天然感受态(在特定的生长条件下摄入并保有外源DNA的能力)的特征(Gwinn，D.D.and Thorne，C.B.，1964，J.Bacteriol.87：519-526)。感受态表型变化性的原因尚未在基因水平上得以探讨，但基因组数据提供了一些可能的解释。尽管所述模式株基因组编码了所有属于枯草芽孢杆菌的晚期感受态功能(例如comC，comEFG操纵子，comK，mecA)，但它缺少明显的comS基因，且comP基因被插入序列元件打断，暗示地衣芽孢杆菌ATCC 14580中的感受态形成的早期阶段就被阻止了(preempt)。能否通过导入来自枯草芽孢杆菌的相应基因而恢复这些早期功能还不清楚。除了DNA摄取中的表观缺陷外，还发现两个I型限制修饰系统，其也可能对转化效率的降低有贡献。它们和枯草芽孢杆菌的ydiOPS基因不同，可能参与降解重组表达载体构建中所用的来自异源宿主的不合适地修饰的DNA。最后，谷氨酰多肽荚膜(capsule)的合成也被认为是地衣芽孢杆菌菌株转化的可能障碍之一(Thorne，C.B.和Stull，H.B.，1966，J.Bacteriol.91：1012-1020)。已经预测了6个可能涉及了上述荚膜物质的合成的基因(ywtABDEF和ywsC直向同源物)。
抗生素和次级代谢物.杆菌肽(Bacitracin)是一种地衣芽孢杆菌中非核糖体合成的环肽抗生素(Katz，E.和Demain，A.L.，1977，Bacteriol.Rev.41：449-474)，虽然在该物种的实验室菌株之间杆菌肽合成酶基因的普遍性有差别，一项研究提示多至50％的菌株可含有bac操纵子(Ishihara，H.，Takoh，M.，Nishibayashi，R.，和Sato，A.，2002，Curr.Microbiol.45：18-23)。bac操纵子已确认为不存在于模式株(ATCC 14580)基因组中。看起来，地衣芽孢杆菌模式株基因组所编码的唯一的非核糖体肽合成酶操纵子是负责lichenysin生物合成的肽合成酶操纵子。lichenysin结构上与枯草芽孢杆菌的表面活性肽(surfactin)类似(Grangemard，I.，Wallach，J.，Maget-Dana，R.，和Peypoux，F.，2001，Appl.Biochem.Biotechnol.90：199-210)，而且它们各自的生物合成操纵子高度类似。在地衣芽孢杆菌中没有找到枯草芽孢杆菌的pps(制磷脂菌素合酶(plipastatin synthase))和聚酮合成酶(polyketide synthase)(pks)操纵子的对应物。这两个区域共同占枯草芽孢杆菌染色体的相当大的部分(两个分别为80kb和38kb)，尽管有报道说它们不是必需的(Westers，H.，Dorenbos，R.，van Dijl，J.M.，Kable，J.，Flanagan，T.，Devine，K.M.，Jude，F.，Séror，S.J.，Beekman，A.C.，Darmon，E.，2003，Mol.Biol.Evol.20：2076-2090)。出乎意料的是，发现一个基因簇编码一种羊毛硫抗生素(lantibiotic)及其相关加工和转运功能。此69个氨基酸的肽被命名为lichenicidin，其最接近的已知直向同源物是来自芽孢杆菌HIL-Y85/54728菌株的mersacidin(Altena，K.，Guder，A.，Cramer，C.，和Bierbaum，G.，2000，Appl.Envrion.Microbiol.66：2565-2571)。羊毛硫抗生素是核糖体合成的肽，其经过翻译后修饰，使最终分子中含有少见的硫醚氨基酸例如羊毛硫氨酸(lanthionine)和/或甲基羊毛硫氨酸(Pag，U.和Sahl，H.G.，2002，Curr.Pharm.Des.8：815-833)。这些抗微生物化合物作为设计新抗生素的模型，在近年来引起了不少注意(Hoffmann，A.，Pag，U.，Wiedemann，I.，和Sahl，H.G.，2002，Farmaco.57：685-691)。
必需基因.也将上述基因模型与枯草芽孢杆菌必需基因的列表(Kobayashi，K.，Ehrlich，S.D.，Albertini，A.，Amati，G.，Andersen，K.K.，Arnaud，M.，Asai，K.，Ashikaga，S.，Aymerch，S.，Bessieres，P.，2003，Proc.NatlAcad.Sci.USA 100：4678-4683)比较。所有枯草芽孢杆菌必需基因在地衣芽孢杆菌中都有直向同源物，而且大多数存在于范围广泛的细菌分类单元中。(Pedersen，P.B.，Bj_rnvad，M.E.，Rasmussen，M.D.，和Petersen，J.N.，2002，Reg.Toxicol.Pharmacol.36：155-161)。
实施例4地衣芽孢杆菌基因组与其他芽孢杆菌的比较
使用VisualGenome软件(Rational Genomics，San Francisco，CA)对地衣芽孢杆菌、枯草芽孢杆菌和Bacillus halodurans基因组进行GC-skew分析和全局同源性比较，预计算的BLAST结果保存在本地数据库。在配对比较(E分值阈值为10-5)中，预测的地衣芽孢杆菌ORFs中有66％(2771/4208)在枯草芽孢杆菌中有直向同源物，基因模型中有55％(2321/4208)表现为Bacillus halodurans中的直向同源序列。使用交互BLASTP(reciprocalBLASTP)分析发现了这三种菌种共有的1719个直向同源物(E分值阈值为10-5)。
如Lapidus等所指出的(Lapidus，A.，Galleron，N.，Andersen，J.T.，J_rgensen，P.L.Ehrlich，S.D.，和Sorokin，A.，2002，FEMS Microbiol.Lett.209：23-30)，地衣芽孢杆菌和枯草芽孢杆菌基因组之间有宽的共线性区。地衣芽孢杆菌和Bacillus halodurans之间存在较低的基因组组织的保守性，且明显存在一个或多个大基因组片段的倒位(inversion)。这显然支持了先前的发现(Xu，D.和
J.C.，2003，Internat.J.Syst.Evol.Microbiol.53：695-704)，即在系统发生上和进化上，枯草芽孢杆菌与地衣芽孢杆菌都比二者中任一个与Bacillus halodurans要更接近。但是，在原噬菌体和可转座元件的数目和位置中，以及一些生化途径中也观察到了一些区别地衣芽孢杆菌和枯草芽孢杆菌的重要的不同，这些不同包括一个大于80kb的区域，该区域包括聚酮合成酶基因的簇，这些基因在地衣芽孢杆菌是不存在的。
实施例5：密码子使用表
密码子偏倚(bias)——即同义密码子的不均等使用——的进化，被认为是自然选择倾向于使用与丰度最高的同工tRNA种类相匹配的偏好密码子以提高翻译效率和精确性的结果。利用密码子偏倚信息的实际应用包括异源和突变基因的表达的优化(Jiang和Mannervik，1999，Protein Expressionand Purification 15：92-98)，定点诱变以从特定的基因衍生变体多肽(Wong等，1995，J.Immunol.154：3351-3358；Kaji，H.等，1999，J.Biochem.126：769-775)，合成基因的设计和合成(Libertini和Di Donato，1992，ProteinEngineering 5：821-825；Feng等，2000，Biochem.39：15399-15409)，和通过导入非偏好密码子微调或降低特定基因的翻译效率(Crombie，T.等，1992，J.Mol.Biol.228：7-12；Carlini和Stephan，2003，Genetics 163：239-243)。
对地衣芽孢杆菌染色体中所有预测的蛋白编码基因，使用EMBOSS软件包(Rice，Longden，和Bleasby，2000，EMBOSS：The European MolecularBiology Open Software Suite.Trends in Genetics 16：276-277)的成员软件CUSP从SEQ ID NO：1生成了密码子使用表(表4)。CUSP读取编码序列并计算出密码子频率表，如表4所示。
基于实施例3描述的82个胞外蛋白的信号肽，还生成了一个密码子使用表(表5)。
表1.预测的功能
| 序列号 | 描述 | UniRef登记号 | 生物 | 枯草芽孢杆菌直向同源物(基因名) |
| 2 | 染色体复制起始蛋白dnaA[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P05648 | 枯草芽孢杆菌 | DnaA |
| 3 | DNA聚合酶III，β链[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P05649 | 枯草芽孢杆菌 | DnaN |
| 4 | ||||
| 5 | DNA复制及修复蛋白recF[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P05651 | 枯草芽孢杆菌 | RecF |
| 6 | ||||
| 7 | DNA促旋酶亚基B[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P05652 | 枯草芽孢杆菌 | GyrB |
| 8 | DNA促旋酶亚基A[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P05653 | 枯草芽孢杆菌 | GyrA |
| 9 | YaaC | |||
| 10 | 肌苷-5′-单磷酸脱氢酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P21879 | 枯草芽孢杆菌 | GuaB |
| 11 | D-丙氨酰-D-丙氨酸羧肽酶前体[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P08750 | 枯草芽孢杆菌 | DacA |
| 12 | 吡哆醇生物合成蛋白pdx1[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P37527 | 枯草芽孢杆菌 | YaaD |
| 13 | 假设的UPF0030蛋白yaaE[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P37528 | 枯草芽孢杆菌 | YaaE |
| 14 | 丝氨酰(seryl)-tRNA合成酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P37464 | 枯草芽孢杆菌 | SerS |
| 15 | 甘油酸激酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P42100 | 枯草芽孢杆菌 | YxaA |
| 16 | H+/葡糖酸同向转运蛋白(symporter)[创伤弧菌(Vibriovulnificus)] | UniRef100_Q7MHW6 | 创伤弧菌 | YuiF |
| 17 | 糖二酸利用调节蛋白(regulator)[创伤弧菌] | UniRef100_Q8DBZ9 | 创伤弧菌 | YsfB |
| 18 | 假设的蛋白[苏云金芽孢杆菌] | UniRef100_Q6HH43 | 苏云金芽孢杆菌 | |
| 19 | 假设的蛋白yaaF[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P37529 | 枯草芽孢杆菌 | Dck |
| 20 | 假设的蛋白yaaG[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P37530 | 枯草芽孢杆菌 | Dgk |
| 21 | 假设的蛋白yaaH[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P37531 | 枯草芽孢杆菌 | YaaH |
| 22 | 假设的蛋白yaaI[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P37532 | 枯草芽孢杆菌 | YaaI |
| 23 | YaaJ | |||
| 24 | DnaX | |||
| 25 | 假设的UPF0133蛋白yaaK[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P24281 | 枯草芽孢杆菌 | YaaK |
| 26 | 重组蛋白recR[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P24277 | 枯草芽孢杆菌 | RecR |
| 27 | 假设的蛋白yaaL[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P37533 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 28 | σ-K因子加工调节蛋白BOFA[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P24282 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 29 | CsfB蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P37534 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 30 | XpaC蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P37467 | 枯草芽孢杆菌 | XpaC |
| 31 | 假设的蛋白yaaN[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P37535 | 枯草芽孢杆菌 | YaaN |
| 32 | YaaO | |||
| 33 | 胸苷酸激酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P37537 | 枯草芽孢杆菌 | Tmk |
| 34 | 假设的蛋白yaaQ[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P37538 | 枯草芽孢杆菌 | YaaQ |
| 35 | ||||
| 36 | DNA聚合酶III，δ′亚基[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P37540 | 枯草芽孢杆菌 | HolB |
| 37 | 假设的蛋白yaaT[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P37541 | 枯草芽孢杆菌 | YaaT |
| 38 | 假设的蛋白yabA[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P37542 | 枯草芽孢杆菌 | YabA |
| 39 | 假设的蛋白yabB[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P37543 | 枯草芽孢杆菌 | YabB |
| 40 | 假设的UPF0213蛋白yazA[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31414 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 41 | 假设的UPF0011蛋白yabC[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P37544 | 枯草芽孢杆菌 | YabC |
| 42 | 过渡态调节蛋白abrB[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P08874 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 43 | 甲硫氨酰-tRNA合成酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P37465 | 枯草芽孢杆菌 | MetS |
| 44 | 推测的脱氧核糖核酸酶yabD[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P37545 | 枯草芽孢杆菌 | YabD |
| 45 | YabE | |||
| 46 | 假设的蛋白yabF[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P37547 | 枯草芽孢杆菌 | RnmV |
| 47 | 二甲基腺苷酸转移酶(EC 2.1.1.-)(S-腺苷酰甲硫氨酸-6-N′，N′-腺苷酰(rRNA)二甲基转移酶)[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P37468 | 枯草芽孢杆菌 | KsgA |
| 48 | 假设的蛋白yabG[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P37548 | 枯草芽孢杆菌 | YabG |
| 49 | Veg蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P37466 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 50 | SspF蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P37549 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 51 | IspE | |||
| 52 | Pur操纵子阻抑蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P37551 | 枯草芽孢杆菌 | PurR |
| 53 | UPF0076蛋白yabJ[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P37552 | 枯草芽孢杆菌 | YabJ |
| 54 | 阶段V芽孢形成蛋白G[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P28015 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 55 | 双功能gcaD蛋白(TMS蛋白[包括：UDP-N-乙酰葡糖胺焦磷酸化酶(EC 2.7.7.23)(N-乙酰葡糖胺-1-磷酸尿苷酰转移酶)；葡糖胺-1-磷酸N-乙酰基转移酶(EC2.3.1.157)][枯草芽孢杆菌] | UniRef100P_14192 | 包括：UDP-N-乙酰葡糖胺焦磷酸化酶(EC2.7.7.23)(N-乙酰葡糖胺-1-磷酸尿苷酰转移酶)；葡糖胺-1-磷酸N-乙酰基转移酶(EC2.3.1.157) | GcaD |
| 56 | 磷酸核糖焦磷酸激酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P14193 | 枯草芽孢杆菌 | Prs |
| 57 | 普通应激蛋白(general stressprotein)ctc[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P14194 | 枯草芽孢杆菌 | Ctc |
| 58 | 肽酰-tRNA水解酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P37470 | 枯草芽孢杆菌 | SpoVC |
| 59 | 假设的蛋白yabK[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P37553 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 60 | 转录-修复偶联因子[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P37474 | 枯草芽孢杆菌 | Mfd |
| 61 | 阶段V芽孢形成蛋白T[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P37554 | 枯草芽孢杆菌 | SpoVT |
| 62 | 假设的蛋白yabM[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P37555 | 枯草芽孢杆菌 | YabM |
| 63 | 假设的蛋白yabN[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P37556 | 枯草芽孢杆菌 | YabN |
| 64 | 假设的蛋白yabO[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P37557 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 65 | 假设的蛋白yabP[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P37558 | 枯草芽孢杆菌 | YabP |
| 66 | 假设的蛋白yabQ[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P37559 | 枯草芽孢杆菌 | YabQ |
| 67 | 细胞分裂蛋白divIC[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P37471 | 枯草芽孢杆菌 | DivIC |
| 68 | 假设的蛋白yabR[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P37560 | 枯草芽孢杆菌 | YabR |
| 69 | 阶段II芽孢形成蛋白E[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P37475 | 枯草芽孢杆菌 | SpoIIE |
| 70 | 假设的蛋白yabS[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P37561 | 枯草芽孢杆菌 | YabS |
| 71 | 可能的丝氨酸/苏氨酸-蛋白激酶yabT[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P37562 | 枯草芽孢杆菌 | YabT |
| 72 | 假设的UPF0072蛋白yacA[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P37563 | 枯草芽孢杆菌 | YacA |
| 73 | 次黄嘌呤-鸟嘌呤磷酸核糖转移酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P37472 | 枯草芽孢杆菌 | HprT |
| 74 | 细胞分裂蛋白ftsH同源物[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P37476 | 枯草芽孢杆菌 | FtsH |
| 75 | 推测的32kDa复制蛋白[嗜热脂肪芽孢杆菌] | UniRef100_Q9F985 | 嗜热脂肪芽孢杆菌 | YacB |
| 76 | 33kDa陪伴蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P37565 | 枯草芽孢杆菌 | YacC |
| 77 | YacD | |||
| 78 | CysK | |||
| 79 | 对氨基苯甲酸合酶组分I[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P28820 | 枯草芽孢杆菌 | PabB |
| 80 | 对氨基苯甲酸/邻氨基苯甲酸合酶谷氨酰胺酰胺基转移酶组分II[包括：对氨基苯甲酸合酶谷氨酰胺酰胺基转移酶组分II(EC6.3.5.8)(ADC合酶)；邻氨基苯甲酸合酶组分II(EC 4.1.3.27)][枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P28819 | 包括：对氨基苯甲酸合酶谷氨酰胺酰胺基转移酶组分II(EC 6.3.5.8)(ADC合酶)；邻氨基苯甲酸合酶组分II(EC 4.1.3.27) | PabA |
| 81 | 氨基脱氧分支酸裂合酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P28821 | 枯草芽孢杆菌 | PabC |
| 82 | 二氢蝶酸合酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P28822 | 枯草芽孢杆菌 | Sul |
| 83 | 二氢新蝶呤醛缩酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P28823 | 枯草芽孢杆菌 | FolB |
| 84 | 2-氨基-4-羟基-6-羟甲基二氢蝶啶焦磷酸激酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P29252 | 枯草芽孢杆菌 | FolK |
| 85 | YazB蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31417 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 86 | 可能的tRNA-二氢尿苷合酶1[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P37567 | 枯草芽孢杆菌 | YacF |
| 87 | 赖氨酰-tRNA合成酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P37477 | 枯草芽孢杆菌 | LysS |
| 88 | 转录调节蛋白ctsR[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P37568 | 枯草芽孢杆菌 | CtsR |
| 89 | 假设的蛋白yacH[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P37569 | 枯草芽孢杆菌 | McsA |
| 90 | 假设的ATP：胍基磷酸转移酶yacI[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P37570 | 枯草芽孢杆菌 | McsB |
| 91 | 遗传感受态负调节蛋白clpC/mecB[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P37571 | 枯草芽孢杆菌 | ClpC |
| 92 | RadA | |||
| 93 | 假设的蛋白yacK[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P37573 | 枯草芽孢杆菌 | YacK |
| 94 | 假设的蛋白yacL[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q06754 | 枯草芽孢杆菌 | YacL |
| 95 | 2-C-甲基-D-赤藓糖醇4-磷酸胞苷酰转移酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q06755 | 枯草芽孢杆菌 | YacM |
| 96 | 2-C-甲基-D-赤藓糖醇2，4-环二磷酸合酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q06756 | 枯草芽孢杆菌 | YacN |
| 97 | 谷氨酰-tRNA合成酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P22250 | 枯草芽孢杆菌 | GltX |
| 98 | 丝氨酸乙酰基转移酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q06750 | 枯草芽孢杆菌 | CysE |
| 99 | 半胱氨酰-tRNA合成酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q06752 | 枯草芽孢杆菌 | CysS |
| 100 | YazC蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31418 | 枯草芽孢杆菌 | YazC |
| 101 | 假设的tRNA/rRNA甲基转移酶yacO[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q06753 | 枯草芽孢杆菌 | YacO |
| 102 | 假设的蛋白yacP[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P37574 | 枯草芽孢杆菌 | YacP |
| 103 | RNA聚合酶σ-H因子[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P17869 | 枯草芽孢杆菌 | SigH |
| 104 | 前蛋白(preprotein)移位酶secE亚基[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q06799 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 105 | NusG | |||
| 106 | 50S核糖体蛋白L11[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q06796 | 枯草芽孢杆菌 | RplK |
| 107 | 50S核糖体蛋白L1[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q06797 | 枯草芽孢杆菌 | RplA |
| 108 | 50S核糖体蛋白L10[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P42923 | 枯草芽孢杆菌 | RplJ |
| 109 | 50S核糖体蛋白L7/L12[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P02394 | 枯草芽孢杆菌 | RplL |
| 110 | 假设的蛋白ybxB[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P37872 | 枯草芽孢杆菌 | YbxB |
| 111 | DNA指导的RNA聚合酶β链[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P37870 | 枯草芽孢杆菌 | RpoB |
| 112 | DNA指导的RNA聚合酶β′链[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P37871 | 枯草芽孢杆菌 | RpoC |
| 113 | 推测的核糖体蛋白L7Ae-类[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P46350 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 114 | 30S核糖体蛋白S12[枯草芽孢 | UniRef100_P21472 | 枯草芽孢杆菌 | RpsL |
| 杆菌] | ||||
| 115 | 30S核糖体蛋白S7[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P21469 | 枯草芽孢杆菌 | RpsG |
| 116 | 延伸因子G[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P80868 | 枯草芽孢杆菌 | FusA |
| 117 | 延伸因子Tu[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P33166 | 枯草芽孢杆菌 | TufA |
| 118 | 30S核糖体蛋白S10[Bacillushalodurans] | UniRef100_Q9Z9L5 | Bacillushalodurans | RpsJ |
| 119 | 50S核糖体蛋白L3[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P42920 | 枯草芽孢杆菌 | RplC |
| 120 | 50S核糖体蛋白L4[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P42921 | 枯草芽孢杆菌 | RplD |
| 121 | 50S核糖体蛋白L23[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P42924 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 122 | 50S核糖体蛋白L2[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P42919 | 枯草芽孢杆菌 | RplB |
| 123 | 30S核糖体蛋白S19[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P21476 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 124 | 50S核糖体蛋白L22[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P42060 | 枯草芽孢杆菌 | RplV |
| 125 | 30S核糖体蛋白S3[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P21465 | 枯草芽孢杆菌 | RpsC |
| 126 | 50S核糖体蛋白L16[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P14577 | 枯草芽孢杆菌 | RplP |
| 127 | 50S核糖体蛋白L29[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P12873 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 128 | 30S核糖体蛋白S17[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P12874 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 129 | ||||
| 130 | 50S核糖体蛋白L24[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P12876 | 枯草芽孢杆菌 | RplX |
| 131 | 50S核糖体蛋白L5[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P12877 | 枯草芽孢杆菌 | RplE |
| 132 | 核糖体蛋白S14[蜡状芽孢杆菌(Bacillus cereus)ZK] | UniRef100_Q63H77 | 蜡状芽孢杆菌ZK | |
| 133 | 30S核糖体蛋白S8[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P12879 | 枯草芽孢杆菌 | RpsH |
| 134 | 50S核糖体蛋白L6[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P46898 | 枯草芽孢杆菌 | RplF |
| 135 | 50S核糖体蛋白L18[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P46899 | 枯草芽孢杆菌 | RplR |
| 136 | 30S核糖体蛋白S5[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P21467 | 枯草芽孢杆菌 | RpsE |
| 137 | 50S核糖体蛋白L30[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P19947 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 138 | 50S核糖体蛋白L15[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P19946 | 枯草芽孢杆菌 | RplO |
| 139 | SecY | |||
| 140 | 腺苷酸激酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P16304 | 枯草芽孢杆菌 | Adk |
| 141 | 甲硫氨酸氨肽酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P19994 | 枯草芽孢杆菌 | Map |
| 142 | C-125起始因子IF-I，RNA聚合 | UniRef100_O50629 | Bacillus halodurans | |
| 酶α亚基和核糖体蛋白，部分和全部编码序列[Bacillushalodurans] | ||||
| 143 | 翻译起始因子IF-1[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P20458 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 144 | ||||
| 145 | RpsM | |||
| 146 | 30S核糖体蛋白S11[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P04969 | 枯草芽孢杆菌 | RpsK |
| 147 | DNA指导的RNA聚合酶α链[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P20429 | 枯草芽孢杆菌 | RpoA |
| 148 | 50S核糖体蛋白L17[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P20277 | 枯草芽孢杆菌 | RplQ |
| 149 | 假设的ABC转运蛋白ATP结合蛋白ybxA[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P40735 | 枯草芽孢杆菌 | YbxA |
| 150 | 假设的蛋白orf5[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P70970 | 枯草芽孢杆菌 | YbaE |
| 151 | YbaF蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P70972 | 枯草芽孢杆菌 | YbaF |
| 152 | tRNA假尿苷合酶A[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P70973 | 枯草芽孢杆菌 | TruA |
| 153 | 50S核糖体蛋白L13[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P70974 | 枯草芽孢杆菌 | RplM |
| 154 | 30S核糖体蛋白S9[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P21470 | 枯草芽孢杆菌 | RpsI |
| 155 | 假设的蛋白[蜡状芽孢杆菌] | UniRef100_Q737T6 | 蜡状芽孢杆菌 | YizA |
| 156 | 假设的蛋白ybaK[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P50862 | 枯草芽孢杆菌 | YbaK |
| 157 | 萌发特异性N-乙酰胞壁酰-L-丙氨酸酰胺酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P50864 | 枯草芽孢杆菌 | CwlD |
| 158 | YbaL | |||
| 159 | 芽孢萌发蛋白gerD前体[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P16450 | 枯草芽孢杆菌 | GerD |
| 160 | KinB信号传导途径活化蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P16449 | 枯草芽孢杆菌 | KbaA |
| 161 | 假设的蛋白ybaN前体[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P50865 | 枯草芽孢杆菌 | YbaN |
| 162 | 青霉素结合蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31773 | 枯草芽孢杆菌 | PbpX |
| 163 | ||||
| 164 | 假设的蛋白ybaS[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P55190 | 枯草芽孢杆菌 | YbaS |
| 165 | 假设的蛋白yxaJ[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P42109 | 枯草芽孢杆菌 | YxaJ |
| 166 | 吩嗪生物合成蛋白[盐杆菌属(Halobacterium)菌种] | UniRef100_Q9HHG6 | 盐杆菌属菌种 | YfhB |
| 167 | 假设的蛋白ybbC前体[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P40407 | 枯草芽孢杆菌 | YbbC |
| 168 | 假设的脂蛋白ybbD前体[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P40406 | 枯草芽孢杆菌 | YbbD |
| 169 | 假设的UPF0214蛋白ybbE前体[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O05213 | 枯草芽孢杆菌 | YbbE |
| 170 | YbbF蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q797S1 | 枯草芽孢杆菌 | YbbF |
| 171 | 推测的HTH-类转录调节蛋白ybbH[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q45581 | 枯草芽孢杆菌 | YbbH |
| 172 | 假设的蛋白ybbI[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q45582 | 枯草芽孢杆菌 | YbbI |
| 173 | 假设的蛋白ybbK[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q45584 | 枯草芽孢杆菌 | YbbK |
| 174 | 精氨酸酶[热速芽孢杆菌(Bacilluscaldovelox)] | UniRef100_P53608 | 热速芽孢杆菌 | RocF |
| 175 | RNA聚合酶σ因子sigW[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q45585 | 枯草芽孢杆菌 | SigW |
| 176 | YbbM蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q45588 | 枯草芽孢杆菌 | YbbM |
| 177 | YbbP蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q45589 | 枯草芽孢杆菌 | YbbP |
| 178 | YbbR蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34659 | 枯草芽孢杆菌 | YbbR |
| 179 | YbbT蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34824 | 枯草芽孢杆菌 | YbbT |
| 180 | 葡糖胺-果糖-6-磷酸氨基转移酶[异构][枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39754 | 异构 | GlmS |
| 181 | ||||
| 182 | 假设的蛋白[苏云金芽孢杆菌] | UniRef100_Q6HH47 | 苏云金芽孢杆菌 | |
| 183 | UPI00003CBF92 UniRef100条目 | UniRef100_UPI00003CBF92 | YtrB | |
| 184 | 转录调节蛋白[Bacillushalodurans] | UniRef100_Q9KF35 | Bacillushalodurans | YtrA |
| 185 | ||||
| 186 | YbcL蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34663 | 枯草芽孢杆菌 | YbcL |
| 187 | BH0186蛋白[Bacillus halodurans] | UniRef100_Q9KGB8 | Bacillus halodurans | |
| 188 | ABC转运蛋白[Bacillushalodurans] | UniRef100_Q9KEY6 | Bacillushalodurans | YvcC |
| 189 | 假设的蛋白ywbO[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39598 | 枯草芽孢杆菌 | YwbO |
| 190 | ||||
| 191 | BH0695蛋白[Bacillus halodurans] | UniRef100_Q9KF04 | Bacillus halodurans | |
| 192 | 氨基糖苷6-腺苷酰转移酶[屎肠球菌(Enterococcus faecium)] | UniRef100_Q6V4U6 | 屎肠球菌 | AadK |
| 193 | 假设的保守蛋白[Oceanobacillusiheyensis] | UniRef100_Q8ERX2 | Oceanobacillus iheyensis | |
| 194 | YfnB[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O06480 | 枯草芽孢杆菌 | YfnB |
| 195 | 假设的转运蛋白ybxG[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54425 | 枯草芽孢杆菌 | YbxG |
| 196 | Mg(2+)/柠檬酸复合物次级转运蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P55069 | 枯草芽孢杆菌 | CitM |
| 197 | YflP蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34439 | 枯草芽孢杆菌 | YflP |
| 198 | CitT | |||
| 199 | 传感蛋白citS[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34427 | 枯草芽孢杆菌 | CitS |
| 200 | 转录调节蛋白[腾冲热厌氧杆菌] | UniRef100_Q8RB37 | 腾冲热厌氧杆菌 | YwfK |
| 201 | 全基因组；片段8/17[发光光杆状菌(Photorhabdus luminescens)] | UniRef100_Q7N4W7 | 发光光杆状菌 | YwfE |
| 202 | 多药抗性蛋白B[蜡状芽孢杆菌] | UniRef100_Q81AF0 | 蜡状芽孢杆菌 | YqjV |
| 203 | σ-G-依赖性芽孢形成特异性SASP蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54379 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 204 | 假设的蛋白ybxH[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54426 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 205 | YbyB蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31441 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 206 | 假设的蛋白yyaL[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P37512 | 枯草芽孢杆菌 | YyaL |
| 207 | 假设的蛋白yyaO[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P37509 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 208 | 苏氨酰-tRNA合成酶2[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P18256 | 枯草芽孢杆菌 | ThrZ |
| 209 | ||||
| 210 | YttB | |||
| 211 | 假设的蛋白[不动杆菌属(Acinetobacter)菌种] | UniRef100_Q6FDN0 | 不动杆菌属菌种 | |
| 212 | 假设的UPF0053蛋白yrkA[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54428 | 枯草芽孢杆菌 | YrkA |
| 213 | YdeG | |||
| 214 | YbaJ | |||
| 215 | ||||
| 216 | YqeW | |||
| 217 | YubF蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32082 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 218 | YbfF | |||
| 219 | 假设的蛋白[脆弱拟杆菌(Bacteroides fragilis)] | UniRef100_Q64UG6 | 脆弱拟杆菌 | |
| 220 | 假设的转运蛋白ybhF[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31448 | 枯草芽孢杆菌 | YbfH |
| 221 | YbfI蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31449 | 枯草芽孢杆菌 | YbfI |
| 222 | ||||
| 223 | UPI00003CBC98 UniRef100条目 | UniRef100_UPI00003CBC98 | ||
| 224 | ||||
| 225 | 氧化还原酶[乳酸乳球菌(Lactococcus lactis)] | UniRef100_Q9CFC5 | 乳酸乳球菌 | |
| 226 | 接纳甲基的趋化蛋白[Oceanobacillus iheyensis] | UniRef100_Q8EST3 | Oceanobacillusiheyensis | YvaQ |
| 227 | D-木糖结合蛋白[产乙醇热厌氧杆菌(Thermoanaerobacterethanolicus)] | UniRef100_O68456 | 产乙醇热厌氧杆菌 | RbsB |
| 228 | 假设的蛋白O80544[Oceanobacillus iheyensis] | UniRef100_Q8ESS4 | Oceanobacillusiheyensis | YomI |
| 229 | 假设的蛋白[蜡状芽孢杆菌] | UniRef100_Q81IR4 | 蜡状芽孢杆菌 | |
| 230 | 链阳性菌素B内酯酶[科氏葡萄球菌(Staphylococcus cohnii)] | UniRef100_O87275 | 科氏葡萄球菌 | |
| 231 | 假设的蛋白ycbP[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P42248 | 枯草芽孢杆菌 | YcbP |
| 232 | YbgF蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31462 | 枯草芽孢杆菌 | YbgF |
| 233 | YbgG蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31463 | 枯草芽孢杆菌 | YbgG |
| 234 | ||||
| 235 | PTS系统，n-乙酰葡糖胺特异性酶II，ABC组分[Bacillus halodurans] | UniRef100_Q9KF24 | Bacillushalodurans | NagP |
| 236 | UPI00003CBDBC UniRef100条目 | UniRef100_UPI00003CBDBC | Mta | |
| 237 | 假设的蛋白[苏云金芽孢杆菌] | Uniref100_Q6HIW0 | 苏云金芽孢杆菌 | YdfS |
| 238 | 碳酸酐酶[梅氏甲烷八叠球菌(Methanosarcina mazei)] | UniRef100_Q8PSJ1 | 梅氏甲烷八叠球菌 | YtoA |
| 239 | 假设的蛋白yjgA[苏云金芽孢杆菌] | UniRef100_Q6HHU2 | 苏云金芽孢杆菌 | YjgA |
| 240 | 氨基酸载体蛋白[苏云金芽孢杆菌] | UniRef100_Q6HGU4 | 苏云金芽孢杆菌 | YbgH |
| 241 | 可能的谷氨酰胺酶ybgJ[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31465 | 枯草芽孢杆菌 | YbgJ |
| 242 | 双组分传感蛋白激酶ycbA[蜡状芽孢杆菌] | UniRef100_Q81BN8 | 蜡状芽孢杆菌 | YcbA |
| 243 | 假设的感觉转导蛋白ycbB[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P40759 | 枯草芽孢杆菌 | YcbB |
| 244 | YoaA | |||
| 245 | YbxI | |||
| 246 | ||||
| 247 | β-内酰胺酶前体(EC 3.5.2.6)(青霉素酶)[包含：大外切青霉素酶；小外切青霉素酶][地衣芽孢杆菌] | UniRef100_P00808 | 包含：大外切青霉素酶；小外切青霉素酶 | PenP |
| 248 | 碱性磷酸酶D前体[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P42251 | 枯草芽孢杆菌 | PhoD |
| 249 | ||||
| 250 | 假设的蛋白ycbT[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P42252 | 枯草芽孢杆菌 | TatCD |
| 251 | YcbC | |||
| 252 | 可能的醛脱氢酶ycbD[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P42236 | 枯草芽孢杆菌 | YcbD |
| 253 | 可能的葡萄糖二酸转运蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P42237 | 枯草芽孢杆菌 | YcbE |
| 254 | 可能的葡萄糖二酸脱水酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P42238 | 枯草芽孢杆菌 | YcbF |
| 255 | 假设的转录调节蛋白ycbG[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P42239 | 枯草芽孢杆菌 | YcbG |
| 256 | 可能的D-半乳糖二酸脱水酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P42240 | 枯草芽孢杆菌 | YcbH |
| 257 | 假设的感觉转导蛋白ycbL[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P42244 | 枯草芽孢杆菌 | YcbL |
| 258 | 传感蛋白组氨酸激酶[蜡状芽孢杆菌ZK] | UniRef100_Q633Q6 | 蜡状芽孢杆菌ZK | |
| 259 | 假设的ABC转运蛋白ATP结合蛋白ycbN[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P42246 | 枯草芽孢杆菌 | YcbN |
| 260 | 假设的蛋白ycbO[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P42247 | 枯草芽孢杆菌 | YcbO |
| 261 | YcbO | |||
| 262 | YfnK[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O06490 | 枯草芽孢杆菌 | YetN |
| 263 | 假设的蛋白ybdO[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31437 | 枯草芽孢杆菌 | YbdO |
| 264 | 假设的蛋白ycbJ[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P42242 | 枯草芽孢杆菌 | YcbJ |
| 265 | 假设的蛋白ywhA[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P70993 | 枯草芽孢杆菌 | YwhA |
| 266 | YdaB | |||
| 267 | All0778蛋白[鱼腥蓝细菌属(Anabaena)菌种] | UniRef100_Q8YYR8 | 鱼腥蓝细菌属菌种 | |
| 268 | BH1298蛋白[Bacillus halodurans] | UniRef100_Q9KDB5 | Bacillushalodurans | YbdN |
| 269 | BH1299蛋白[Bacillus halodurans] | UniRef100_Q9KDB4 | Bacillus halodurans | |
| 270 | 转录激活蛋白tipA，推测的[炭疽芽孢杆菌(Bacillus anthracis)] | UniRef100_Q81XN3 | 炭疽芽孢杆菌 | Mta |
| 271 | ||||
| 272 | 转录调节蛋白，PadR家族[蜡状芽孢杆菌] | UniRef100_Q81BZ0 | 蜡状芽孢杆菌 | |
| 273 | 假设的蛋白[蜡状芽孢杆菌ZK] | UniRef100_Q639U7 | 蜡状芽孢杆菌ZK | |
| 274 | 色氨酸RNA结合弱化子蛋白抑制蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31466 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 275 | 假设的转运蛋白ycbK[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P42243 | 枯草芽孢杆菌 | YcbK |
| 276 | YczC | |||
| 277 | 假设的蛋白yccF[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34478 | 枯草芽孢杆菌 | YccF |
| 278 | SpaF[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q45404 | 枯草芽孢杆菌 | YhcH |
| 279 | SpaE[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O52853 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 280 | 推测的SpaG[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q93GG9 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 281 | 枯草菌素生物合成调节蛋白spaR[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P33112 | 枯草芽孢杆菌 | YycF |
| 282 | 推测的组氨酸激酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q93GG7 | 枯草芽孢杆菌 | ResE |
| 283 | UPI00003CA401 UniRef100条目 | UniRef100_UPI00003CA401 | YtlI | |
| 284 | YusQ蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32183 | 枯草芽孢杆菌 | YusQ |
| 285 | 全基因组；片段6/17[发光光杆状菌] | UniRef100_Q7N6K9 | 发光光杆状菌 | YusR |
| 286 | 甲基转移酶[苏云金芽孢杆菌] | UniRef100_Q6HK82 | 苏云金芽孢杆菌 | |
| 287 | 假设的脂蛋白ycdA前体[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34538 | 枯草芽孢杆菌 | YcdA |
| 288 | UPI00003CB481 UniRef100条目 | UniRef100_UPI00003CB481 | YcgA | |
| 289 | 假设的保守蛋白[Oceanobacillusiheyensis] | UniRef100_Q8ESQ2 | Oceanobacillusiheyensis | YtnL |
| 290 | 假设的保守蛋白[Oceanobacillusiheyensis] | UniRef100_Q8ET83 | Oceanobacillusiheyensis | YvbK |
| 291 | GatA | |||
| 292 | 寡聚内肽酶F，推测的[炭疽芽孢杆菌] | UniRef100_Q81JJ8 | 炭疽芽孢杆菌 | YjbG |
| 293 | ||||
| 294 | UPI00003CC42D UniRef100条目 | UniRef100_UPI00003CC42D | PbpX | |
| 295 | 假设的蛋白ysfD[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P94534 | 枯草芽孢杆菌 | YsfD |
| 296 | 假设的蛋白ysfC[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P94535 | 枯草芽孢杆菌 | YsfC |
| 297 | PTS系统，纤维二糖酶特异性酶II，B组分[Bacillus halodurans] | UniRef100_Q9KEE3 | Bacillus halodurans | |
| 298 | PTS系统，纤维二糖酶特异性酶II，A组分[Bacillus halodurans] | UniRef100_Q9KEE2 | Bacillushalodurans | LicA |
| 299 | PTS系统，纤维二糖酶特异性酶II，C组分[Oceanobacillusiheyensis] | UniRef100_Q8EP43 | Oceanobacillusiheyensis | YwbA |
| 300 | 6-磷酸-β-葡萄糖苷酶[Bacillushalodurans] | UniRef100_Q9KEE0 | Bacillushalodurans | LicH |
| 301 | 转录调节蛋白[Bacillushalodurans] | UniRef100_Q9KED8 | Bacillushalodurans | YbgA |
| 302 | ||||
| 303 | YvbX | |||
| 304 | 几丁质酶前体[橄榄绿链霉菌(Streptomyces olivaceoviridis)] | UniRef100_Q9L3E8 | 橄榄绿链霉菌 | |
| 305 | 胞外金属蛋白酶前体[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39790 | 枯草芽孢杆菌 | Mpr |
| 306 | 葡萄糖1-脱氢酶II[枯草芽孢杆 | UniRef100_P80869 | 枯草芽孢杆菌 | YcdF |
| 菌] | ||||
| 307 | 假设的蛋白OB0244[Oceanobacillus iheyensis] | UniRef100_Q8ETL6 | Oceanobacillus iheyensis | |
| 308 | 假设的蛋白ycdC[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34772 | 枯草芽孢杆菌 | YcdC |
| 309 | ||||
| 310 | 细胞壁水解酶cwlJ[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P42249 | 枯草芽孢杆菌 | CwlJ |
| 311 | 假设的蛋白yceB[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34504 | 枯草芽孢杆菌 | YceB |
| 312 | 假设的蛋白yvcE[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P40767 | 枯草芽孢杆菌 | YvcE |
| 313 | ABC转运蛋白，通透酶[蜡状芽孢杆菌ZK] | UniRef100_Q637N2 | 蜡状芽孢杆菌ZK | YfiM |
| 314 | ABC转运蛋白，ATP结合蛋白[蜡状芽孢杆菌] | UniRef100_Q733P8 | 蜡状芽孢杆菌 | YfiL |
| 315 | UPI00003CC482 UniRef100条目 | UniRef100_UPI00003CC482 | YsiA | |
| 316 | 假设的蛋白OB3113[Oceanobacillus iheyensis] | UniRef100_Q8ELV2 | Oceanobacillus iheyensis | |
| 317 | BH3953蛋白[Bacillus halodurans] | UniRef100_Q9K5Y3 | Bacillus halodurans | |
| 318 | BH3951蛋白[Bacillus halodurans] | UniRef100_Q9K5Y4 | Bacillushalodurans | PadR |
| 319 | 应激响应蛋白SCP2[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P81100 | 枯草芽孢杆菌 | YceC |
| 320 | 普通应激蛋白16U[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P80875 | 枯草芽孢杆菌 | YceD |
| 321 | 假设的蛋白yceE[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34384 | 枯草芽孢杆菌 | YceE |
| 322 | 假设的蛋白yceF[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34447 | 枯草芽孢杆菌 | YceF |
| 323 | 假设的蛋白[蜡状芽孢杆菌] | UniRef100_Q72YD0 | 蜡状芽孢杆菌 | |
| 324 | YceG[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34809 | 枯草芽孢杆菌 | YceG |
| 325 | 假设的蛋白yceH[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34833 | 枯草芽孢杆菌 | YceH |
| 326 | UPI00003CB694 UniRef100条目 | UniRef100_UPI00003CB694 | CcdA | |
| 327 | 假设的保守蛋白[Oceanobacillusiheyensis] | UniRef100_Q8ELB4 | Oceanobacillusiheyensis | YdiL |
| 328 | Mta | |||
| 329 | 硝酸盐转运蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P42432 | 枯草芽孢杆菌 | NasA |
| 330 | L-乳酸脱氢酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P13714 | 枯草芽孢杆菌 | Ldh |
| 331 | L-乳酸通透酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P55910 | 枯草芽孢杆菌 | LctP |
| 332 | YcgF蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P94381 | 枯草芽孢杆菌 | YcgF |
| 333 | 大肠杆菌芳香族氨基酸转运蛋白同源物[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P94383 | 枯草芽孢杆菌 | YcgH |
| 334 | NH(3)-依赖性NAD(+)合成酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P08164 | 枯草芽孢杆菌 | NadE |
| 335 | 莽草酸激酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P37944 | 枯草芽孢杆菌 | AroK |
| 336 | YcgL蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P94389 | 枯草芽孢杆菌 | YcgL |
| 337 | 脯氨酸脱氢酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q8RL79 | 枯草芽孢杆菌 | YcgM |
| 338 | 1-吡咯啉-5-羧酸脱氢酶2[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P94391 | 枯草芽孢杆菌 | YcgN |
| 339 | 大肠杆菌脯氨酸通透酶同源物[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P94392 | 枯草芽孢杆菌 | YcgO |
| 340 | 假设的蛋白ycgP[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P94393 | 枯草芽孢杆菌 | YcgP |
| 341 | YcgQ蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P94394 | 枯草芽孢杆菌 | YcgQ |
| 342 | YcgR | |||
| 343 | 头孢菌素-C脱乙酰基酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q59233 | 枯草芽孢杆菌 | Cah |
| 344 | 转录调节蛋白[Bacillushalodurans] | UniRef100_Q9KF41 | Bacillushalodurans | YdgG |
| 345 | ||||
| 346 | ||||
| 347 | 可能的氨基酸ABC转运蛋白通透酶蛋白yckA[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P42399 | 枯草芽孢杆菌 | YckA |
| 348 | 可能的ABC转运蛋白胞外结合蛋白yckB前体[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P42400 | 枯草芽孢杆菌 | YckB |
| 349 | NAD(P)H脱氢酶(醌)；可能的药物活性B调节子[蜡状芽孢杆菌ZK] | UniRef100_Q63FG6 | 蜡状芽孢杆菌ZK | YwrO |
| 350 | BH0315蛋白[Bacillus halodurans] | UniRef100_Q9KG01 | Bacillus halodurans | |
| 351 | 可能的β-葡萄糖苷酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P42403 | 枯草芽孢杆菌 | YckE |
| 352 | Nin[解淀粉芽孢杆菌(Bacillusamyloliquefaciens)] | UniRef100_Q70KK3 | 解淀粉芽孢杆菌 | Nin |
| 353 | DNA-进入核酸酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P12667 | 枯草芽孢杆菌 | NucA |
| 354 | YbdM | |||
| 355 | 接纳甲基的趋化蛋白tlpC[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39209 | 枯草芽孢杆菌 | TlpC |
| 356 | 假设的蛋白yqcG[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P45942 | 枯草芽孢杆菌 | YqcG |
| 357 | 乙内酰脲利用蛋白A[支气管炎博德特氏菌(Bordetellabronchiseptica)] | UniRef100_Q7WCS3 | 支气管炎博德特氏菌 | |
| 358 | 乙内酰脲利用蛋白B[百脉根瘤菌(Rhizobium loti)] | UniRef100_Q987J6 | 百脉根瘤菌 | |
| 359 | UPI000027D233 UniRef100条目 | UniRef100_UPI000027D233 | YvfK | |
| 360 | 358个氨基酸长的假设的转运蛋白ATP结合蛋白[Aeropyrumpernix] | UniRef100_Q9YB65 | Aeropyrumpernix | MsmX |
| 361 | 类AttA2 ABC转运蛋白，通透酶蛋白[苜蓿根瘤菌(Rhizobiummeliloti)] | UniRef100_Q92ZH0 | 苜蓿根瘤菌 | YesP |
| 362 | YurM | |||
| 363 | SrfAA | |||
| 364 | SrfAB | |||
| 365 | SrfAC | |||
| 366 | SrfAD | |||
| 367 | YcxC | |||
| 368 | YcxD | |||
| 369 | 4′-磷酸泛酰巯基乙胺基转移酶sfp[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39135 | 枯草芽孢杆菌 | Sfp |
| 370 | 预测的α/β水解酶超家族酯酶，YBBA枯草芽孢杆菌直向同源物[丙酮丁醇梭菌(Clostridiumacetobutylicum)] | UniRef100_Q97HP7 | 丙酮丁醇梭菌 | YbbA |
| 371 | 转录调节蛋白[丙酮丁醇梭菌] | UniRef100_Q97LX8 | 丙酮丁醇梭菌 | YdeE |
| 372 | YczE[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q9F4F8 | 枯草芽孢杆菌 | YczE |
| 373 | 假设的蛋白[Symbiobacteriumthermophilum] | UniRef100_Q67MZ7 | Symbiobacterium thermophilum | |
| 374 | YfiL | |||
| 375 | ||||
| 376 | 假设的蛋白[Symbiobacteriumthermophilum] | UniRef100_Q67MZ9 | Symbiobacterium thermophilum | |
| 377 | ||||
| 378 | ||||
| 379 | 接纳甲基的趋化蛋白[苏云金芽孢杆菌] | UniRef100_Q6HJV7 | 苏云金芽孢杆菌 | TlpB |
| 380 | YckI[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q9F4F9 | 枯草芽孢杆菌 | YckI |
| 381 | YckJ[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q9F4G0 | 枯草芽孢杆菌 | YckJ |
| 382 | YckK | |||
| 383 | RocR | |||
| 384 | 鸟氨酸氨基转移酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P38021 | 枯草芽孢杆菌 | RocD |
| 385 | 氨基酸通透酶rocE[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39137 | 枯草芽孢杆菌 | RocE |
| 386 | 精氨酸酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39138 | 枯草芽孢杆菌 | RocF |
| 387 | 枯草芽孢杆菌als操纵子调节蛋白AlsR的同源物[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P94403 | 枯草芽孢杆菌 | YclA |
| 388 | 可能的芳香酸脱羧酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P94404 | 枯草芽孢杆菌 | YclB |
| 389 | 假设的蛋白yclc[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P94405 | 枯草芽孢杆菌 | YclC |
| 390 | YclD蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P94406 | 枯草芽孢杆菌 | YclD |
| 391 | ||||
| 392 | ||||
| 393 | ||||
| 394 | 假设的蛋白[苏云金芽孢杆菌] | UniRef100_Q6HMQ9 | 苏云金芽孢杆菌 | |
| 395 | 假设的蛋白OB2810[Oceanobacillus iheyensis] | UniRef100_Q8EMN2 | Oceanobacillus iheyensis | |
| 396 | ||||
| 397 | YxiD | |||
| 398 | ||||
| 399 | YxiB | |||
| 400 | 糖ABC转运蛋白[Bacillushalodurans] | UniRef100_Q9K7B8 | Bacillushalodurans | RbsB |
| 401 | 双组分传感蛋白组氨酸激酶[Bacillus halodurans] | UniRef100_Q9K789 | Bacillushalodurans | YesM |
| 402 | YesN | |||
| 403 | 多种糖转运系统[Bacillushalodurans] | UniRef100_Q9K7C2 | Bacillushalodurans | RbsB |
| 404 | L-阿拉伯糖转运ATP结合蛋白araG[嗜热脂肪芽孢杆菌] | UniRef100_Q9S472 | 嗜热脂肪芽孢杆菌 | RbsA |
| 405 | L-阿拉伯糖膜通透酶[嗜热脂肪芽孢杆菌] | UniRef100_Q9S471 | 嗜热脂肪芽孢杆菌 | RbsC |
| 406 | 转运蛋白[Bacillus halodurans] | UniRef100_Q9K9F3 | Bacillushalodurans | YbfB |
| 407 | YbfA蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31443 | 枯草芽孢杆菌 | YbfA |
| 408 | β-D-半乳糖苷酶[环状芽孢杆菌] | UniRef100_Q45093 | 环状芽孢杆菌 | LacA |
| 409 | Phy | |||
| 410 | 假设的转运蛋白yclF[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P94408 | 枯草芽孢杆菌 | YclF |
| 411 | YclG蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P94409 | 枯草芽孢杆菌 | YclG |
| 412 | ||||
| 413 | GerKA | |||
| 414 | 芽孢萌发蛋白KC前体[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P49941 | 枯草芽孢杆菌 | GerKC |
| 415 | 芽孢萌发蛋白KB[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P49940 | 枯草芽孢杆菌 | GerKB |
| 416 | Mta | |||
| 417 | 假设的蛋白yclH[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P94411 | 枯草芽孢杆菌 | YclH |
| 418 | 假设的蛋白yclI[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P94412 | 枯草芽孢杆菌 | YclI |
| 419 | 假设的感觉转导蛋白yclJ[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P94413 | 枯草芽孢杆菌 | YclJ |
| 420 | 假设的类传感蛋白组氨酸激酶yclK[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P94414 | 枯草芽孢杆菌 | YclK |
| 421 | 接纳甲基的趋化蛋白[Bacillushalodurans] | UniRef100_Q9K632 | Bacillushalodurans | TlpA |
| 422 | 可能的天冬氨酸激酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P94417 | 枯草芽孢杆菌 | YclM |
| 423 | 鳗弧菌(V.anguillarum)ferricanguibactin转运系统通透酶蛋白FatD同源物[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P94418 | 枯草芽孢杆菌 | YclN |
| 424 | 鳗弧菌ferric anguibactin转运系统通透酶蛋白FatC同源物[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P94419 | 枯草芽孢杆菌 | YclO |
| 425 | 大肠杆菌二柠檬酸铁转运ATP结合蛋白FecE同源物[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P94420 | 枯草芽孢杆菌 | YclP |
| 426 | 鳗弧菌Ferric anguibactin结合蛋白前体FatB[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P94421 | 枯草芽孢杆菌 | YclQ |
| 427 | 大肠杆菌多药耐性蛋白B的同源物，EmrB[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P94422 | 枯草芽孢杆菌 | YcnB |
| 428 | YcnC蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P94423 | 枯草芽孢杆菌 | YcnC |
| 429 | 假设的蛋白[蜡状芽孢杆菌ZK] | UniRef100_Q636R0 | 蜡状芽孢杆菌ZK | YqiQ |
| 430 | 假设的氧化还原酶ycnD[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P94424 | 枯草芽孢杆菌 | YcnD |
| 431 | 假设的蛋白ycnE[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P94425 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 432 | YczG蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31480 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 433 | 苜蓿根瘤菌调节蛋白MocR的同源物[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P94426 | 枯草芽孢杆菌 | GabR |
| 434 | 可能的4-氨基丁酸氨基转移酶(EC 2.6.1.19)((S)-3-氨基-2-甲基丙酸转氨酶)[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P94427 | 枯草芽孢杆菌 | GabT |
| 435 | 阳离子氨基酸转运蛋白[Oceanobacillus iheyensis] | UniRef100_Q8ESX7 | Oceanobacillusiheyensis | YhdG |
| 436 | 大肠杆菌琥珀酸半醛脱氢酶 | UniRef100_P94428 | 枯草芽孢杆菌 | GabD |
| GabD同源物[枯草芽孢杆菌] | ||||
| 437 | YwfM | |||
| 438 | ||||
| 439 | YcnI蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P94431 | 枯草芽孢杆菌 | YcnI |
| 440 | 大肠杆菌铜输出蛋白(exportprotein)PcoD同源物[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P94432 | 枯草芽孢杆菌 | YcnJ |
| 441 | YcnK蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P94433 | 枯草芽孢杆菌 | YcnK |
| 442 | 同化性硝酸还原酶电子传递亚基[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P42433 | 枯草芽孢杆菌 | NasB |
| 443 | 同化性硝酸还原酶催化亚基[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P42434 | 枯草芽孢杆菌 | NasC |
| 444 | 亚硝酸还原酶[NAD(P)H][枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P42435 | NAD(P)H | NasD |
| 445 | 同化性亚硝酸还原酶[NAD(P)H]小亚基[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P42436 | NAD(P)H | NasE |
| 446 | 尿卟啉-III C-甲基转移酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P42437 | 枯草芽孢杆菌 | NasF |
| 447 | 假设的转录调节蛋白ydhC[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O05494 | 枯草芽孢杆菌 | YdhC |
| 448 | 钠依赖转运蛋白[Oceanobacillusiheyensis] | UniRef100_Q8ENE3 | Oceanobacillusiheyensis | YflS |
| 449 | 假设的蛋白ycsD[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P42961 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 450 | UPI00003CC424 UniRef100条目 | UniRef100_UPI00003CC424 | ||
| 451 | 可能的转录抗终止子，bglG家族[蜡状芽孢杆菌ZK] | UniRef100_Q63A16 | 蜡状芽孢杆菌ZK | MtlR |
| 452 | 推测的糖特异性PTS组分EIIB[棉子糖乳球菌(Lactococcusraffinolactis)] | UniRef100_Q7X1N9 | 棉子糖乳球菌 | |
| 453 | SgaT蛋白[Mannheimiasucciniciproducens MBEL55E] | UniRef100_Q65WA2 | Mannheimiasucciniciproducens MBEL55E | |
| 454 | 转酮酶，N-末端亚基[无乳链球菌(Streptococcus agalactiae)] | UniRef100_Q8E202 | 无乳链球菌 | Tkt |
| 455 | 推测的转酮酶[鼠伤寒沙门氏菌(Salmonella typhimurium)] | UniRef100_Q8ZND5 | 鼠伤寒沙门氏菌 | Dxs |
| 456 | 假设的蛋白ycsE[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P42962 | 枯草芽孢杆菌 | YcsE |
| 457 | 假设的UPF0271蛋白ycsF[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P42963 | 枯草芽孢杆菌 | YcsF |
| 458 | 假设的蛋白ycsG[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P42964 | 枯草芽孢杆菌 | YcsG |
| 459 | 假设的UPF0317蛋白ycsI[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P42966 | 枯草芽孢杆菌 | YcsI |
| 460 | 激酶A抑制物[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P60495 | 枯草芽孢杆菌 | KipI |
| 461 | KipI拮抗物[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q7WY77 | 枯草芽孢杆菌 | KipA |
| 462 | HTH型转录调节蛋白kipR[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P42968 | 枯草芽孢杆菌 | KipR |
| 463 | 假设的蛋白ycsK[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P42969 | 枯草芽孢杆菌 | YcsK |
| 464 | PTS系统，甘露醇特异性IIABC组分[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P42956 | 枯草芽孢杆菌 | MtlA |
| 465 | 甘露醇-1-磷酸5-脱氢酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P42957 | 枯草芽孢杆菌 | MtlD |
| 466 | YdaA蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P96574 | 枯草芽孢杆菌 | MtlR |
| 467 | 普通应激蛋白39[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P80873 | 枯草芽孢杆菌 | YdaD |
| 468 | 假设的蛋白ydaE[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P96578 | 枯草芽孢杆菌 | YdaE |
| 469 | 假设的蛋白[炭疽芽孢杆菌] | UniRef100_Q81U55 | 炭疽芽孢杆菌 | |
| 470 | 普通应激蛋白26[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P80238 | 枯草芽孢杆菌 | YdaG |
| 471 | YdaH蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P96581 | 枯草芽孢杆菌 | YdaH |
| 472 | Lin0463蛋白[无害利斯特氏菌] | UniRef100_Q92EJ6 | 无害利斯特氏菌 | YvhJ |
| 473 | YdzA蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31485 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 474 | BH0424蛋白[Bacillus halodurans] | UniRef100_Q9KFQ4 | Bacillus halodurans | |
| 475 | HTH型转录调节蛋白lrpC[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P96582 | 枯草芽孢杆菌 | LrpC |
| 476 | 可能的DNA拓扑异构酶III[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P96583 | 枯草芽孢杆菌 | TopB |
| 477 | ||||
| 478 | ||||
| 479 | ||||
| 480 | YdaO | |||
| 481 | YdaO | |||
| 482 | YdaP蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P96591 | 枯草芽孢杆菌 | YdaP |
| 483 | ||||
| 484 | UPI00003CC069 UniRef100条目 | UniRef100_UPI00003CC069 | ||
| 485 | IS1627s1-相关的，转座酶[炭疽芽孢杆菌A2012菌株] | UniRef100_Q7CMD0 | 炭疽芽孢杆菌A2012菌株 | |
| 486 | ||||
| 487 | 类似于核糖体-蛋白-丝氨酸N-乙酰基转移酶[金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)] | UniRef100_Q99WN5 | 金黄色葡萄球菌 | YdaF |
| 488 | 锰转运蛋白mntH[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P96593 | 枯草芽孢杆菌 | MntH |
| 489 | ||||
| 490 | AnsB | |||
| 491 | YojK | |||
| 492 | YdaT蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P96595 | 枯草芽孢杆菌 | YdaT |
| 493 | 假设的蛋白ydbA[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P96596 | 枯草芽孢杆菌 | YdbA |
| 494 | Na+/H+反向转运蛋白NhaC[蜡状芽孢杆菌] | UniRef100_Q81FX8 | 蜡状芽孢杆菌 | NhaC |
| 495 | YdbB蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P96597 | 枯草芽孢杆菌 | YdbB |
| 496 | 葡萄糖饥饿诱导蛋白B[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P26907 | 枯草芽孢杆菌 | GsiB |
| 497 | 假设的UPF0118蛋白ydbI[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P96604 | 枯草芽孢杆菌 | YdbI |
| 498 | GltT | |||
| 499 | YdbJ蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P96605 | 枯草芽孢杆菌 | YdbJ |
| 500 | YdbK蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P96606 | 枯草芽孢杆菌 | YdbK |
| 501 | 假设的蛋白ydbL[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P96607 | 枯草芽孢杆菌 | YdbL |
| 502 | YdbM蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P96608 | 枯草芽孢杆菌 | YdbM |
| 503 | ||||
| 504 | ||||
| 505 | YdbP蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P96611 | 枯草芽孢杆菌 | YdbP |
| 506 | D-丙氨酸--D-丙氨酸连接酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P96612 | 枯草芽孢杆菌 | Ddl |
| 507 | MurF | |||
| 508 | 酯酶[Oceanobacillus iheyensis] | UniRef100_Q8ESM0 | Oceanobacillusiheyensis | YvaK |
| 509 | YdbR蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P96614 | 枯草芽孢杆菌 | YdbR |
| 510 | YdbS蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P96615 | 枯草芽孢杆菌 | YdbS |
| 511 | YdbT蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P96616 | 枯草芽孢杆菌 | YdbT |
| 512 | YdcA蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P96617 | 枯草芽孢杆菌 | YdcA |
| 513 | YdcC | |||
| 514 | Alr | |||
| 515 | ||||
| 516 | YdcE蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P96622 | 枯草芽孢杆菌 | YdcE |
| 517 | RsbR | |||
| 518 | RsbS | |||
| 519 | RsbT | |||
| 520 | RsbU | |||
| 521 | RsbV | |||
| 522 | RsbW | |||
| 523 | SigB | |||
| 524 | RsbX | |||
| 525 | YdcI蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31489 | 枯草芽孢杆菌 | YdcI |
| 526 | 转录调节蛋白，TetR家族[苏云金芽孢杆菌] | UniRef100_Q6HGY5 | 苏云金芽孢杆菌 | YxbF |
| 527 | Lin1189蛋白[无害利斯特氏菌(Listeria innocua)] | UniRef100_Q92CI2 | 无害利斯特氏菌 | YdgH |
| 528 | ||||
| 529 | 类蛋白sprT[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P96628 | 枯草芽孢杆菌 | YdcK |
| 530 | 可能的转运蛋白，EamA家族[蜡状芽孢杆菌ZK] | UniRef100_Q638K5 | 蜡状芽孢杆菌ZK | |
| 531 | ||||
| 532 | 假设的蛋白ORF00034[乳酸乳球菌] | UniRef100_O87235 | 乳酸乳球菌 | |
| 533 | Δ5酰基脂质去饱和酶[蜡状芽孢杆菌] | UniRef100_Q81C02 | 蜡状芽孢杆菌 | Des |
| 534 | 冷休克蛋白cspC[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39158 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 535 | YogA | |||
| 536 | 推测的膜蛋白[蜡状芽孢杆菌] | UniRef100_Q734Y0 | 蜡状芽孢杆菌 | YyaS |
| 537 | 转录调节蛋白，MarR家族[蜡状芽孢杆菌] | UniRef100_Q734X9 | 蜡状芽孢杆菌 | YybA |
| 538 | 乙酰基转移酶，GNAT家族[蜡状芽孢杆菌] | UniRef100_Q734X8 | 蜡状芽孢杆菌 | PaiA |
| 539 | 蛋白酶合酶和芽孢形成负调节蛋白PAI2[蜡状芽孢杆菌] | UniRef100_Q734X7 | 蜡状芽孢杆菌 | PaiB |
| 540 | BH0654蛋白[Bacillus halodurans] | UniRef100_Q9KF33 | Bacillushalodurans | RocF |
| 541 | ||||
| 542 | YdeO蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P96672 | 枯草芽孢杆菌 | YdeO |
| 543 | 转运蛋白，LysE家族[蜡状芽孢杆菌] | UniRef100_Q81DI7 | 蜡状芽孢杆菌 | YrhP |
| 544 | YwqM | |||
| 545 | ||||
| 546 | 推测的通透酶[炭疽芽孢杆菌] | UniRef100_Q81QY7 | 炭疽芽孢杆菌 | YvqJ |
| 547 | 推测的环化酶[沼泽红假单胞菌(Rhodopseudomonas palustris)] | UniRef100_Q6N497 | 沼泽红假单胞菌 | |
| 548 | 假设的转运蛋白ydgF[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P96704 | 枯草芽孢杆菌 | YdgF |
| 549 | ||||
| 550 | YknW | |||
| 551 | RNA聚合酶σ因子sigV[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O05404 | 枯草芽孢杆菌 | SigV |
| 552 | 推测的抗SigV因子[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O05403 | 枯草芽孢杆菌 | YrhM |
| 553 | 假设的蛋白yrhL[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O05402 | 枯草芽孢杆菌 | YrhL |
| 554 | YdgK | |||
| 555 | YwpD | |||
| 556 | LytT | |||
| 557 | 胶原粘着蛋白[蜡状芽孢杆菌ZK] | UniRef100_Q630P2 | 蜡状芽孢杆菌ZK | |
| 558 | Lin0929蛋白[无害利斯特氏菌] | UniRef100_Q92D88 | 无害利斯特氏菌 | |
| 559 | ||||
| 560 | 代谢物转运蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34718 | 枯草芽孢杆菌 | YdjK |
| 561 | 硫胺素-单磷酸激酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O05514 | 枯草芽孢杆菌 | ThiL |
| 562 | 假设的UPF0079蛋白ydiB[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O05515 | 枯草芽孢杆菌 | YdiB |
| 563 | YdiC蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O05516 | 枯草芽孢杆菌 | YdiC |
| 564 | YdiD蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O05517 | 枯草芽孢杆菌 | YdiD |
| 565 | 可能的O-唾液酸糖蛋白内肽酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O05518 | 枯草芽孢杆菌 | Gcp |
| 566 | YdiF | |||
| 567 | YdiF | |||
| 568 | 钼辅因子生物合成蛋白C[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O05520 | 枯草芽孢杆菌 | YdiG |
| 569 | 氧化还原传感转录阻抑蛋白rex[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O05521 | 枯草芽孢杆菌 | YdiH |
| 570 | YdiI[Bacillus halodurans] | UniRef100_Q9Z9P5 | Bacillus halodurans | |
| 571 | TatCY | |||
| 572 | 假设的脂蛋白ydiK前体[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O05524 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 573 | YdiL | |||
| 574 | 10kDa陪伴蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P28599 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 575 | 60kDa陪伴蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P28598 | 枯草芽孢杆菌 | GroEL |
| 576 | ||||
| 577 | ||||
| 578 | 假设的蛋白yolD[噬菌体SPBc2] | UniRef100_O64030 | 噬菌体SPBc2 | |
| 579 | ||||
| 580 | ||||
| 581 | YoaR[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34611 | 枯草芽孢杆菌 | YoaR |
| 582 | 假设的蛋白yfmQ[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O06475 | 枯草芽孢杆菌 | YfmQ |
| 583 | ||||
| 584 | YoqW蛋白[噬菌体SPBc2] | UniRef100_O64131 | 噬菌体SPBc2 | YoqW |
| 585 | Lin2076蛋自[无害利斯特氏菌] | UniRef100_Q92A46 | 无害利斯特氏菌 | YerO |
| 586 | PEP合酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34309 | 枯草芽孢杆菌 | Pps |
| 587 | 假设的蛋白yoaF[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31829 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 588 | 假设的蛋白[金黄色葡萄球菌] | UniRef100_Q6GK76 | 金黄色葡萄球菌 | |
| 589 | 短链脱氢酶[丙酮丁醇梭菌(Clostridium acetobutylicum)] | UniRef100_Q97LM1 | 丙酮丁醇梭菌 | DltE |
| 590 | B型羧酸酯酶[芽孢杆菌菌种BP-7] | UniRef100_Q9L378 | 芽孢杆菌菌种BP-7 | PnbA |
| 591 | 肌醇转运蛋白[Oceanobacillusiheyensis] | UniRef100_Q8ESX2 | Oceanobacillusiheyensis | IolF |
| 592 | 噬菌体休克蛋白A同源物[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54617 | 枯草芽孢杆菌 | PspA |
| 593 | YdjG蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34434 | 枯草芽孢杆菌 | YdjG |
| 594 | YdjH蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O35004 | 枯草芽孢杆菌 | YdjH |
| 595 | YdjI蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34789 | 枯草芽孢杆菌 | YdjI |
| 596 | 推测的氧化还原酶[Symbiobacterium thermophilum] | UniRef100_Q67S08 | Symbiobacteriumthermophilum | YtmO |
| 597 | YrhO[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O05405 | 枯草芽孢杆菌 | YrhO |
| 598 | YrhP | |||
| 599 | 螺旋-转角-螺旋结构域蛋白[蜡状芽孢杆菌] | UniRef100_Q73C00 | 蜡状芽孢杆菌 | |
| 600 | 阶段V芽孢形成蛋白E[Bacillushalodurans] | UniRef100_Q9K7T4 | Bacillushalodurans | SpoVE |
| 601 | 阶段V芽孢形成蛋白E[Bacillushalodurans] | UniRef100_Q9K7T3 | Bacillushalodurans | FtsW |
| 602 | ||||
| 603 | 假设的蛋白[蜡状芽孢杆菌] | UniRef100_Q72Z89 | 蜡状芽孢杆菌 | |
| 604 | BH1889蛋白[Bacillus halodurans] | UniRef100_Q9KBN6 | Bacillushalodurans | YobV |
| 605 | YjeA | |||
| 606 | YjeA | |||
| 607 | TreA | |||
| 608 | 推测的HTH型转录调节蛋白yvdE[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O06987 | 枯草芽孢杆菌 | YvdE |
| 609 | 假设的蛋白yvdF[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O06988 | 枯草芽孢杆菌 | YvdF |
| 610 | 假设的蛋白yvdG[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O06989 | 枯草芽孢杆菌 | YvdG |
| 611 | 假设的蛋白yvdH[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O06990 | 枯草芽孢杆菌 | YvdH |
| 612 | 假设的蛋白yvdI[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O06991 | 枯草芽孢杆菌 | YvdI |
| 613 | 假设的蛋白yvdJ[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O06992 | 枯草芽孢杆菌 | YvdJ |
| 614 | 假设的糖基水解酶yvdK[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O06993 | 枯草芽孢杆菌 | YvdK |
| 615 | 寡聚-1，6-葡萄糖苷酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O06994 | 枯草芽孢杆菌 | MalL |
| 616 | 推测的β-磷酸葡萄糖变位酶[枯草 | UniRef100_O06995 | 枯草芽孢杆菌 | PgcM |
| 芽孢杆菌] | ||||
| 617 | 酪氨酰-tRNA合成酶2[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P25151 | 枯草芽孢杆菌 | TyrZ |
| 618 | 推测的HTH型转录调节蛋白ywaE[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P25150 | 枯草芽孢杆菌 | YwaE |
| 619 | ||||
| 620 | 假设的蛋白SE2399[表皮葡萄球菌(Staphylococcus epidermidis)] | UniRef100_Q8CQM7 | 表皮葡萄球菌 | |
| 621 | 假设的蛋白ydjM[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P40775 | 枯草芽孢杆菌 | YdjM |
| 622 | YdjN蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34353 | 枯草芽孢杆菌 | YdjN |
| 623 | 假设的蛋白[蜡状芽孢杆菌] | UniRef100_Q81AT6 | 蜡状芽孢杆菌 | YeaA |
| 624 | ||||
| 625 | 信号肽酶I[蜡状芽孢杆菌] | UniRef100_Q73C25 | 蜡状芽孢杆菌 | SipS |
| 626 | ||||
| 627 | 假设的蛋白yhfK[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O07609 | 枯草芽孢杆菌 | YhfK |
| 628 | 转录调节蛋白[Bacillushalodurans] | UniRef100_Q9K766 | Bacillushalodurans | YdeE |
| 629 | 芽孢外被蛋白A[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P07788 | 枯草芽孢杆菌 | CotA |
| 630 | YkrP | |||
| 631 | 胞外蛋白[植物乳杆菌(Lactobacillus plantarum)] | UniRef100_Q88T27 | 植物乳杆菌 | YcdA |
| 632 | 假设的UPF0018蛋白yeaB[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P46348 | 枯草芽孢杆菌 | YeaB |
| 633 | YeaC[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P94474 | 枯草芽孢杆菌 | YeaC |
| 634 | 假设的蛋白[蜡状芽孢杆菌] | UniRef100_Q739D8 | 蜡状芽孢杆菌 | YeaD |
| 635 | YebA[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P94476 | 枯草芽孢杆菌 | YebA |
| 636 | GMP合酶[水解谷氨酰胺][枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P29727 | 水解谷氨酰胺 | GuaA |
| 637 | 次黄嘌呤/鸟氨酸通透酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34987 | 枯草芽孢杆菌 | PbuG |
| 638 | YebC | |||
| 639 | 假设的UPF0316蛋白yebE[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34624 | 枯草芽孢杆菌 | YebE |
| 640 | YebG蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34700 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 641 | 氨基咪唑核苷酸羧化酶催化亚基[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P12044 | 枯草芽孢杆菌 | PurE |
| 642 | PurK | |||
| 643 | 腺苷酸基琥珀酸裂合酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P12047 | 枯草芽孢杆菌 | PurB |
| 644 | 磷酸核糖酰氨基咪唑琥珀酸甲酰胺(Phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide)合酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P12046 | 枯草芽孢杆菌 | PurC |
| 645 | 假设的UPF0062蛋白yexA[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P12049 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 646 | 甲酰甘氨脒核苷酸(Phosphoribosylformylglycinamidine)合酶I[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P12041 | 枯草芽孢杆菌 | PurQ |
| 647 | 甲酰甘氨脒核苷酸合酶II[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P12042 | 枯草芽孢杆菌 | PurL |
| 648 | 酰胺磷酸核糖转移酶前体[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P00497 | 枯草芽孢杆菌 | PurF |
| 649 | PurM | |||
| 650 | 磷酸核糖甘氨酰胺甲酰基转移酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P12040 | 枯草芽孢杆菌 | PurN |
| 651 | 双功能嘌呤生物合成蛋白purH[包括：磷酸核糖氨基咪唑甲酰胺甲酰转移酶(Phosphoribosylaminoimidazolecarboxamide formyltransformylase)(AICAR转甲酰酶)(EC 2.1.2.3)；IMP环化水解酶(EC 3.5.4.10)(肌苷酸酶)(IMP合成酶)(ATIC)][枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P12048 | 包括：磷酸核糖酰氨基咪唑甲酰胺甲酰转移酶(AICAR转甲酰酶)(EC2.1.2.3)；IMP环化水解酶(EC3.5.4.10)(肌苷酸酶)(IMP合成酶)(ATIC) | PurH |
| 652 | 磷酸核糖胺-甘氨酸连接酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P12039 | 枯草芽孢杆菌 | PurD |
| 653 | YxbF | |||
| 654 | 推测的细胞色素P450 yjiB[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34374 | 枯草芽孢杆菌 | YjiB |
| 655 | ||||
| 656 | 假设的脂蛋白yybP前体[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P37488 | 枯草芽孢杆菌 | YybP |
| 657 | 转座酶[腾冲热厌氧杆菌] | UniRef100_Q8RCM3 | 腾冲热厌氧杆菌 | |
| 658 | 假设的蛋白[炭疽芽孢杆菌] | UniRef100_Q81ZG4 | 炭疽芽孢杆菌 | |
| 659 | 推测的腺嘌呤脱氨酶yerA[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34909 | 枯草芽孢杆菌 | YerA |
| 660 | YerB蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34968 | 枯草芽孢杆菌 | YerB |
| 661 | YecD[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q7BVT7 | 枯草芽孢杆菌 | YerC |
| 662 | PcrB蛋白同源物[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34790 | 枯草芽孢杆菌 | PcrB |
| 663 | ATP依赖DNA解旋酶pcrA[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34580 | 枯草芽孢杆菌 | PcrA |
| 664 | DNA连接酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31498 | 枯草芽孢杆菌 | LigA |
| 665 | YerH蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34629 | 枯草芽孢杆菌 | YerH |
| 666 | BH0586蛋白[Bacillus halodurans] | UniRef100_Q9KF99 | Bacillus halodurans | |
| 667 | ||||
| 668 | ||||
| 669 | BH0589蛋白[Bacillus halodurans] | UniRef100_Q9KF96 | Bacillus halodurans | |
| 670 | 磷酸三酯酶同源蛋白[大肠杆菌] | UniRef100_P45548 | 大肠杆菌 | |
| 671 | 与大肠杆菌未知蛋白YhfS相似[发光光杆状菌] | UniRef100_Q7N5F2 | 发光光杆状菌 | Csd |
| 672 | 磷酸戊糖变位酶(Phosphopentomutase)[Symbiobacterium thermophilum] | UniRef100_Q67S06 | Symbiobacteriumthermophilum | Drm |
| 673 | 推测的丙氨酸消旋酶[Symbiobacterium thermophilum] | UniRef100_Q67S05 | Symbiobacterium thermophilum | |
| 674 | 葡糖胺-6-磷酸脱氨酶[Oceanobacillus iheyensis] | UniRef100_Q8ESL6 | Oceanobacillusiheyensis | NagB |
| 675 | SapB蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q45514 | 枯草芽孢杆菌 | SapB |
| 676 | OpuE | |||
| 677 | 谷氨酰-tRNA(Gln)酰胺基转移酶亚基C[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O06492 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 678 | 谷氨酰-tRNA(Gln)酰胺基转移酶亚基A[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O06491 | 枯草芽孢杆菌 | GatA |
| 679 | GatB | |||
| 680 | 假设的蛋白[巨大芽孢杆菌] | UniRef100_Q848Y2 | 巨大芽孢杆菌 | |
| 681 | ||||
| 682 | YdhT | |||
| 683 | ||||
| 684 | 推测的HTH型转录调节蛋白yerO[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31500 | 枯草芽孢杆菌 | YerO |
| 685 | 游动性(Swarming motility)蛋白swrC[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31501 | 枯草芽孢杆菌 | YerP |
| 686 | YjcK | |||
| 687 | 肌苷-尿苷偏好核苷水解酶[蜡状芽孢杆菌] | UniRef100_Q81DM6 | 蜡状芽孢杆菌 | |
| 688 | YerQ蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31502 | 枯草芽孢杆菌 | YerQ |
| 689 | 假设的RNA甲基转移酶yefA[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31503 | 枯草芽孢杆菌 | YefA |
| 690 | I型限制修饰系统特异性亚基[蜡状芽孢杆菌] | UniRef100_Q817S1 | 蜡状芽孢杆菌 | |
| 691 | I型限制修饰系统甲基化亚基[蜡状芽孢杆菌] | UniRef100_Q817S2 | 蜡状芽孢杆菌 | |
| 692 | IC型特异性亚基[嗜热链球菌(Streptococcus thermophilus)] | UniRef100_Q9RNW0 | 嗜热链球菌 | |
| 693 | I型限制修饰系统限制亚基[蜡状芽孢杆菌] | UniRef100_Q817S4 | 蜡状芽孢杆菌 | |
| 694 | ||||
| 695 | β-葡萄糖苷PTS，EIIBCA[植物乳杆菌] | UniRef100_Q88T54 | 植物乳杆菌 | BglP |
| 696 | 6-磷酸-β-葡萄糖苷酶[植物乳杆菌] | UniRef100_Q88T55 | 植物乳杆菌 | BglH |
| 697 | LicT | |||
| 698 | 应答调节蛋白天冬氨酸磷酸酶K[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34930 | 枯草芽孢杆菌 | RapK |
| 699 | ||||
| 700 | 甲基转移酶[蜡状芽孢杆菌ZK] | UniRef100_Q639N2 | 蜡状芽孢杆菌ZK | |
| 701 | 假设的UPF0082蛋白BCE0595[蜡状芽孢杆菌] | UniRef100_P62032 | 蜡状芽孢杆菌 | YeeI |
| 702 | 推测的HTH型转录调节蛋白AF1627[闪烁古生球菌(Archaeoglobus fulgidus)] | UniRef100_O28646 | 闪烁古生球菌 | |
| 703 | ||||
| 704 | YfmT[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O06478 | 枯草芽孢杆菌 | YfmT |
| 705 | YfmS[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O06477 | 枯草芽孢杆菌 | YfmS |
| 706 | YflS | |||
| 707 | YfmR[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O06476 | 枯草芽孢杆菌 | YfmR |
| 708 | ||||
| 709 | YciA蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P94398 | 枯草芽孢杆菌 | YciA |
| 710 | UPI00002BDF65 UniRef100条目 | UniRef100_UPI00002BDF65 | YpdA | |
| 711 | 亚铁离子转运蛋白[肺炎克雷伯氏菌(Klebsiella pneumoniae)] | UniRef100_Q6U5S9 | 肺炎克雷伯氏菌 | |
| 712 | ||||
| 713 | YciC蛋白[解淀粉芽孢杆菌] | UniRef100_Q70KK8 | 解淀粉芽孢杆菌 | YciC |
| 714 | BioW | |||
| 715 | 腺苷甲硫氨酸-8-氨基-7-氧壬酸氨基转移酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P53555 | 枯草芽孢杆菌 | BioA |
| 716 | 8-氨基-7-氧壬酸合酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P53556 | 枯草芽孢杆菌 | BioF |
| 717 | BioD蛋白[解淀粉芽孢杆菌] | UniRef100_Q70JZ0 | 解淀粉芽孢杆菌 | BioD |
| 718 | BioB蛋白[解淀粉芽孢杆菌] | UniRef100_Q70JZ1 | 解淀粉芽孢杆菌 | BioB |
| 719 | BioI蛋白[解淀粉芽孢杆菌] | UniRef100_Q70JZ2 | 解淀粉芽孢杆菌 | BioI |
| 720 | BH1501蛋白[Bacillus halodurans] | UniRef100_Q9KCR8 | Bacillus halodurans | |
| 721 | YfmP | |||
| 722 | 多药运出蛋白yfmO[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O06473 | 枯草芽孢杆菌 | YfmO |
| 723 | YfmM蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34512 | 枯草芽孢杆菌 | YfmM |
| 724 | YfmL蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34750 | 枯草芽孢杆菌 | YfmL |
| 725 | YfmJ蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34812 | 枯草芽孢杆菌 | YfmJ |
| 726 | 假设的蛋白yfmB[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34626 | 枯草芽孢杆菌 | YfmB |
| 727 | 普通应激蛋白17M[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P80241 | 枯草芽孢杆菌 | YflT |
| 728 | YflS | |||
| 729 | YflS | |||
| 730 | 推测的通透酶[破伤风梭菌(Clostrdium tetani)] | UniRef100_Q895A0 | 破伤风梭菌 | |
| 731 | 可能的Zn依赖水解酶，β-内酰胺酶超家族[苏云金芽孢杆菌] | UniRef100_Q6HKH5 | 苏云金芽孢杆菌 | YqgX |
| 732 | YflN蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34409 | 枯草芽孢杆菌 | YflN |
| 733 | Zink-羧肽酶[破伤风梭菌] | UniRef100_Q898E1 | 破伤风梭菌 | |
| 734 | 氧化氮合酶加氧酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34453 | 枯草芽孢杆菌 | YflM |
| 735 | 推测的膜蛋白[蜡状芽孢杆菌] | UniRef100_Q72YN4 | 蜡状芽孢杆菌 | YvaZ |
| 736 | 转录调节蛋白，ArsR家族[蜡状芽孢杆菌ZK] | UniRef100_Q632K6 | 蜡状芽孢杆菌ZK | |
| 737 | 推测的酰基磷酸酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O35031 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 738 | YflK蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34542 | 枯草芽孢杆菌 | YflK |
| 739 | ||||
| 740 | ||||
| 741 | YflG蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34484 | 枯草芽孢杆菌 | YflG |
| 742 | YflE | |||
| 743 | 假设的蛋白yflB[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34887 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 744 | YflA | |||
| 745 | 可能的PTS系统，海藻糖特异性IIBC组分[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39794 | 枯草芽孢杆菌 | TreP |
| 746 | α-葡萄糖苷酶[芽孢杆菌菌种DG0303] | UniRef100_Q9L872 | 芽孢杆菌菌种DG0303 | TreA |
| 747 | 海藻糖操纵子转录阻抑蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39796 | 枯草芽孢杆菌 | TreR |
| 748 | 乙酰基转移酶[腾冲热厌氧杆菌] | UniRef100_Q8RBZ9 | 腾冲热厌氧杆菌 | YvfD |
| 749 | ||||
| 750 | ||||
| 751 | 预测的吡哆醛磷酸依赖酶，明显参与了细胞壁生物生成的调节[腾冲热厌氧杆菌] | UniRef100_Q8RBY7 | 腾冲热厌氧杆菌 | SpsC |
| 752 | YkuQ | |||
| 753 | UPI000029FB28 UniRef100条目 | UniRef100_UPI000029FB28 | YtcB | |
| 754 | 假设的蛋白MA2181[噬乙酸甲烷八叠球菌(Methanosarcinaacetivorans)] | UniRef100_Q8TNU7 | 噬乙酸甲烷八叠球菌 | |
| 755 | ||||
| 756 | β1，4-葡萄糖基转移酶[蜡状芽孢杆菌] | UniRef100_Q81GJ1 | 蜡状芽孢杆菌 | YolJ |
| 757 | 预测的吡哆醛磷酸依赖酶，明显参与了细胞壁生物生成的调节[腾冲热厌氧杆菌] | UniRef100_Q8RC02 | 腾冲热厌氧杆菌 | SpsC |
| 758 | 预测的脱氢酶和相关蛋白[腾冲热厌氧杆菌] | UniRef100_Q8RC00 | 腾冲热厌氧杆菌 | YrbE |
| 759 | UDP-葡萄糖：GDP-甘露糖脱氢酶[Oceanobacillus iheyensis] | UniRef100_Q8CXB6 | Oceanobacillusiheyensis | TuaD |
| 760 | 假设的蛋白[蜡状芽孢杆菌ZK] | UniRef100_Q635H5 | 蜡状芽孢杆菌ZK | YqkD |
| 761 | 假设的UPF0087蛋白ydeP[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P96673 | 枯草芽孢杆菌 | YdeP |
| 762 | 推测的NAD(P)H硝基还原酶yfkO[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34475 | 枯草芽孢杆菌 | YfkO |
| 763 | YfkN | |||
| 764 | 普通应激蛋白18[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P80876 | 枯草芽孢杆菌 | YfkM |
| 765 | YfkK蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O35019 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 766 | 氨基酸转运蛋白[Bacillushalodurans] | UniRef100_Q9K5Q5 | Bacillushalodurans | YflA |
| 767 | YfkJ蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O35016 | 枯草芽孢杆菌 | YfkJ |
| 768 | 假设的蛋白yfkI前体[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34418 | 枯草芽孢杆菌 | YfkI |
| 769 | YfkH蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34437 | 枯草芽孢杆菌 | YfkH |
| 770 | YfkF蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34929 | 枯草芽孢杆菌 | YfkF |
| 771 | 假设的保守蛋白[Oceanobacillusiheyensis] | UniRef100_Q8ELS1 | Oceanobacillus ineyensis | |
| 772 | YfkE蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34840 | 枯草芽孢杆菌 | YfkE |
| 773 | YfkD蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34579 | 枯草芽孢杆菌 | YfkD |
| 774 | 类硫氧还蛋白氧化还原酶[蜡状芽孢杆菌] | UniRef100_Q81IC7 | 蜡状芽孢杆菌 | YfkA |
| 775 | YfjT蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O35041 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 776 | YfjS | |||
| 777 | UPI000029390C UniRef100条目 | UniRef100_UPI000029390C | AraM | |
| 778 | ||||
| 779 | YfjQ蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31543 | 枯草芽孢杆菌 | YfjQ |
| 780 | YfjP蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31544 | 枯草芽孢杆菌 | YfjP |
| 781 | YfjO | |||
| 782 | YfjM蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31547 | 枯草芽孢杆菌 | YfiM |
| 783 | ||||
| 784 | 假设的蛋白yfjL[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P40773 | 枯草芽孢杆菌 | YfjL |
| 785 | UPI00003CB259 UniRef100条目 | UniRef100_UPI00003CB259 | YvkB | |
| 786 | YdhE蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O05496 | 枯草芽孢杆菌 | YdhE |
| 787 | 假设的蛋白yckD前体[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P42402 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 788 | 假设的分解代谢物转运蛋白yceI[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34691 | 枯草芽孢杆菌 | YceI |
| 789 | SacX | |||
| 790 | 果聚糖蔗糖酶和蔗糖酶合成操纵子抗终止子[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P15401 | 枯草芽孢杆菌 | SacY |
| 791 | 假设的蛋白[炭疽芽孢杆菌] | UniRef100_Q81NL1 | 炭疽芽孢杆菌 | YbcF |
| 792 | 假设的蛋白ybcD[蜡状芽孢杆菌ZK] | UniRef100_Q639F7 | 蜡状芽孢杆菌ZK | YbcD |
| 793 | 可能的NADH-醌氧化还原酶亚基5[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39755 | 枯草芽孢杆菌 | NdhF |
| 794 | YbcI蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34380 | 枯草芽孢杆菌 | YbcI |
| 795 | YraA | |||
| 796 | TPP依赖羟基丁酮脱氢酶E1 α-亚基[炭疽芽孢杆菌] | UniRef100_Q81PM6 | 炭疽芽孢杆菌 | AcoA |
| 797 | TPP依赖羟基丁酮脱氢酶E1 β-亚基[蜡状芽孢杆菌] | UniRef100_Q736U7 | 蜡状芽孢杆菌 | AcoB |
| 798 | 羟基丁酮剪切(cleaving)系统二氢硫辛酰赖氨酸-残基乙酰基转移酶组分[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31550 | 枯草芽孢杆菌 | AcoC |
| 799 | 二氢硫辛酰脱氢酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34324 | 枯草芽孢杆菌 | AcoL |
| 800 | 推测的羟基丁酮操纵子转录激活蛋白[蜡状芽孢杆菌] | UniRef100_Q736V6 | 蜡状芽孢杆菌 | AcoR |
| 801 | 假设的UPF0060蛋白yfjF[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31553 | 枯草芽孢杆菌 | YfjF |
| 802 | 麦芽糖-6’-磷酸葡萄糖苷酶[枯草芽孢杆茵] | UniRef100_P54716 | 枯草芽孢杆菌 | MalA |
| 803 | HTH型转录调节蛋白glvR[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54717 | 枯草芽孢杆菌 | YfiA |
| 804 | PTS系统，类熊果苷IIBC组分[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54715 | 枯草芽孢杆菌 | MalP |
| 805 | UPI00003651CF UniRef100条目 | UniRef100_UPI00003651CF | ||
| 806 | UPI000034AA1D UniRef100条目 | UniRef100_UPI000034AA1D | ||
| 807 | 转录调节蛋白，MarR家族[蜡状芽孢杆菌zK] | UniRef100_Q63812 | 蜡状芽孢杆菌ZK | YvaP |
| 808 | YfiD | |||
| 809 | 假设的蛋白yfiE[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54721 | 枯草芽孢杆菌 | YfiE |
| 810 | 木糖苷酶/阿拉伯糖苷酶[多形拟杆菌(Bacteroidesthetatiotaomicron)] | UniRef100_Q8A036 | 多形拟杆菌 | XynB |
| 811 | 木聚糖β-1，4-木糖苷酶[Bacillushalodurans] | UniRef100_Q9K6P5 | Bacillushalodurans | XynB |
| 812 | AraC家族转录调节蛋白[丙酮丁醇梭菌] | UniRef100_Q97FW8 | 丙酮丁醇梭菌 | YbfI |
| 813 | YtcQ | |||
| 814 | NAD(P)H脱氢酶，醌家族[蜡状芽孢杆菌ZK] | UniRef100_Q638S8 | 蜡状芽孢杆菌ZK | |
| 815 | 增变MutT蛋白[Bacillushalodurans] | UniRef100_Q9K8B7 | Bacillushalodurans | YhhB |
| 816 | YfiT蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31562 | 枯草芽孢杆菌 | YfiT |
| 817 | YfiX[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O52961 | 枯草芽孢杆菌 | YfiX |
| 818 | 假设的蛋白yfhB[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31570 | 枯草芽孢杆菌 | YfhB |
| 819 | YfhC蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31571 | 枯草芽孢杆菌 | YfhC |
| 820 | 假设的蛋白yfhD[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31572 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 821 | ||||
| 822 | BH0923同源物[蜡状芽孢杆菌] | UniRef100_Q81IA0 | 蜡状芽孢杆菌 | |
| 823 | 假设的UPF0105蛋白yfhF[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31574 | 枯草芽孢杆菌 | YfhF |
| 824 | 调节蛋白recX[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31575 | 枯草芽孢杆菌 | YfhG |
| 825 | YfhH蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31576 | 枯草芽孢杆菌 | YfhH |
| 826 | ||||
| 827 | YfhJ蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31578 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 828 | CsbB蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q45539 | 枯草芽孢杆菌 | CsbB |
| 829 | 假设的蛋白SE1997[表皮葡萄球菌] | UniRef100_Q8CR87 | 表皮葡萄球菌 | |
| 830 | YfhO蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31582 | 枯草芽孢杆菌 | YfhO |
| 831 | YfhP蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31583 | 枯草芽孢杆菌 | YfhP |
| 832 | YfhQ蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31584 | 枯草芽孢杆菌 | YfhQ |
| 833 | YfhS蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31585 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 834 | 未鉴定的脱氢酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P71079 | 枯草芽孢杆菌 | FabL |
| 835 | ||||
| 836 | 假设的蛋白ygaB[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P71080 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 837 | YgaC蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q796Z1 | 枯草芽孢杆菌 | YgaC |
| 838 | 未鉴定的转运蛋白-结合ATP的[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P71082 | 枯草芽孢杆菌 | YgaD |
| 839 | 寡肽ABC转运蛋白[Bacillushalodurans] | UniRef100_Q9K6T0 | Bacillushalodurans | AppD |
| 840 | 寡肽ABC转运蛋白[Bacillishalodurans] | UniRef100_Q9K6T1 | Bacillushalodurans | AppF |
| 841 | 二肽转运蛋白DppA[坚强芽孢杆菌] | UniRef100_P94310 | 坚强芽孢杆菌 | OppA |
| 842 | 二肽ABC转运蛋白[Bacillushalodurans] | UniRef100_Q9K6T3 | Bacillushalodurans | AppB |
| 843 | 二肽转运系统通透酶蛋白dppC[假坚强芽孢杆菌(Bacilluspseudofirmus)] | UniRef100_P94312 | 假坚强芽孢杆菌 | AppC |
| 844 | 假设的40.7kd蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P71083 | 枯草芽孢杆菌 | YgaE |
| 845 | 谷氨酸-1-半醛2，1-氨基变位酶2[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P71084 | 枯草芽孢杆菌 | GsaB |
| 846 | YgaF蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q796Y8 | 枯草芽孢杆菌 | YgaF |
| 847 | 过氧化物操纵子调节蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P71086 | 枯草芽孢杆菌 | PerR |
| 848 | ||||
| 849 | 假设的蛋白ygxA[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q04385 | 枯草芽孢杆菌 | YgxA |
| 850 | RapD | |||
| 851 | ||||
| 852 | ||||
| 853 | ||||
| 854 | ||||
| 855 | ||||
| 856 | 假设的蛋白[苏云金芽孢杆菌] | UniRef100_Q6HH72 | 苏云金芽孢杆菌 | |
| 857 | YxiD | |||
| 858 | 假设的蛋白[未培养的古细菌GZfos18F2] | UniRef100_Q64DF2 | 未培养的古细菌GZfos18F2 | |
| 859 | ||||
| 860 | YxiD | |||
| 861 | RapE | |||
| 862 | 推测的膜蛋白[除虫链霉菌(Streptomyces avermitilis)] | UniRef100_Q82NM0 | 除虫链霉菌 | |
| 863 | 3-脱氢奎尼酸(3-dehydroquinate)脱水酶[单核细胞增生利斯特氏菌(Listeria monocytogenes)] | UniRef100_Q8Y9N4 | 单核细胞增生利斯特氏菌 | AroC |
| 864 | ThiC | |||
| 865 | 推测的脂族磺酸转运ATP结合蛋白ssuB[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P97027 | 枯草芽孢杆菌 | SsuB |
| 866 | 推测的脂族磺酸结合蛋白前体[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P40400 | 枯草芽孢杆菌 | SsuA |
| 867 | 推测的脂族磺酸转运通透酶蛋白ssuC[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P40401 | 枯草芽孢杆菌 | SsuC |
| 868 | SsuD | |||
| 869 | SsuD | |||
| 870 | 假设的脂蛋白ygaO前体[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P97029 | 枯草芽孢杆菌 | YgaO |
| 871 | DNA结合蛋白[炭疽芽孢杆菌] | UniRef100_Q81V18 | 炭疽芽孢杆菌 | |
| 872 | ||||
| 873 | ABC型多药转运系统，ATP酶组分[腾冲热厌氧杆菌] | UniRef100_Q8RBH0 | 腾冲热厌氧杆菌 | YhaQ |
| 874 | ||||
| 875 | ||||
| 876 | ||||
| 877 | ||||
| 878 | 30S核糖体蛋白S14-2[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31587 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 879 | 假设的蛋白yhzB[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31588 | 枯草芽孢杆菌 | YhzB |
| 880 | 假设的48.5kd蛋白[枯草芽孢杆 | UniRef100_P97030 | 枯草芽孢杆菌 | YhbA |
| 菌] | ||||
| 881 | 假设的35.8kd蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P97031 | 枯草芽孢杆菌 | YhbB |
| 882 | CspR[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q45512 | 枯草芽孢杆菌 | CspR |
| 883 | 假设的27kd蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P97032 | 枯草芽孢杆菌 | YhbD |
| 884 | 假设的胞质蛋白[蜡状芽孢杆菌] | UniRef100_Q813H1 | 蜡状芽孢杆菌 | YhbE |
| 885 | 假设的蛋白[炭疽芽孢杆菌] | UniRef100_Q81PD2 | 炭疽芽孢杆菌 | YhbF |
| 886 | ||||
| 887 | PrkA蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39134 | 枯草芽孢杆菌 | PrkA |
| 888 | 应激响应UPF0229蛋白yhbH[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P45742 | 枯草芽孢杆菌 | YhbH |
| 889 | YhbJ蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31593 | 枯草芽孢杆菌 | YhbJ |
| 890 | 假设的转运蛋白yhcA[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54585 | 枯草芽孢杆菌 | YhcA |
| 891 | 假设的蛋白yhcB[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54586 | 枯草芽孢杆菌 | YhcB |
| 892 | YhcC | |||
| 893 | ||||
| 894 | 假设的ABC转运蛋白ATP结合蛋白yhcG[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54591 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 895 | 假设的ABC转运蛋白ATP结合蛋白yhcH[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54592 | 枯草芽孢杆菌 | YhcH |
| 896 | 假设的蛋白yhcI[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54593 | 枯草芽孢杆菌 | YhcI |
| 897 | 冷休克蛋白cspB[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P32081 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 898 | ABC转运蛋白，ATP结合蛋白[苏云金芽孢杆菌] | UniRef100_Q6HP89 | 苏云金芽孢杆菌 | YusC |
| 899 | MW0417蛋白[金黄色葡萄球菌] | UniRef100_Q8NY20 | 金黄色葡萄球菌 | YusB |
| 900 | ABC转运蛋白底物结合蛋白[蜡状芽孢杆菌] | UniRef100_Q81IN6 | 蜡状芽孢杆菌 | YhcJ |
| 901 | 假设的同向转运蛋白yhcL[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54596 | 枯草芽孢杆菌 | YhcL |
| 902 | 假设的蛋白yhcM[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54597 | 枯草芽孢杆菌 | YhcM |
| 903 | 酰基氨基酸释放酶[Oceanobacillus iheyensis] | UniRef100_Q8CXN6 | Oceanobacillusiheyensis | YuxL |
| 904 | 脂蛋白yhcN前体[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54598 | 枯草芽孢杆菌 | YhcN |
| 905 | 假设的蛋白yhcP[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54600 | 枯草芽孢杆菌 | YhcP |
| 906 | 假设的蛋白yhcQ[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54601 | 枯草芽孢杆菌 | YhcQ |
| 907 | 双组分传感蛋白组氨酸激酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31661 | 枯草芽孢杆菌 | KinE |
| 908 | 假设的蛋白yhcR前体[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54602 | 枯草芽孢杆菌 | YhcR |
| 909 | 假设的蛋白yhcS[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54603 | 枯草芽孢杆菌 | YhcS |
| 910 | 假设的假尿苷合酶yhcT[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54604 | 枯草芽孢杆菌 | YhcT |
| 911 | 假设的蛋白yhcU[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54605 | 枯草芽孢杆菌 | YhcU |
| 912 | 假设的蛋白yhcV[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54606 | 枯草芽孢杆菌 | YhcV |
| 913 | 假设的蛋白yhcW[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54607 | 枯草芽孢杆菌 | YhcW |
| 914 | 假设的UPF0012蛋白yhcX[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54608 | 枯草芽孢杆菌 | YhcX |
| 915 | ABC转运蛋白[Bacillushalodurans] | UniRef100_Q9KBA3 | Bacillushalodurans | YdiF |
| 916 | 假设的转运蛋白yrhG[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O05399 | 枯草芽孢杆菌 | YrhG |
| 917 | Lin0826蛋白[无害利斯特氏菌] | UniRef100_Q92DI7 | 无害利斯特氏菌 | YwkB |
| 918 | 醇脱氢酶[蜡状芽孢杆菌] | UniRef100_Q81CT4 | 蜡状芽孢杆菌 | YogA |
| 919 | 甘油摄取操纵子抗终止子调节蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P30300 | 枯草芽孢杆菌 | GlpP |
| 920 | 甘油摄取易化蛋白(glyceroluptake facilitator)[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P18156 | 枯草芽孢杆菌 | GlpF |
| 921 | 甘油激酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P18157 | 枯草芽孢杆菌 | GlpK |
| 922 | 需氧甘油-3-磷酸脱氢酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P18158 | 枯草芽孢杆菌 | GlpD |
| 923 | α-磷酸葡萄糖变位酶[枯草芽孢杆菌枯草亚种(subsp.subtilis)] | UniRef100_Q68VA2 | 枯草芽孢杆菌枯草亚种 | YhxB |
| 924 | 假设的保守蛋白[Oceanobacillusiheyensis] | UniRef100_Q8ELS7 | Oceanobacillusiheyensis | YcgB |
| 925 | 转录调节蛋白[Oceanobacillusiheyensis] | UniRef100_Q8ELS8 | Oceanobacillus iheyensis | |
| 926 | YhcY | |||
| 927 | 假设的蛋白yhcZ[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O07528 | 枯草芽孢杆菌 | YhcZ |
| 928 | 假设的蛋白yhdA[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O07529 | 枯草芽孢杆菌 | YhdA |
| 929 | ||||
| 930 | ||||
| 931 | 假设的UPF0074蛋白yhdE[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O07573 | 枯草芽孢杆菌 | YhdE |
| 932 | 黄素血红蛋白(Flavohemoprotein)[Bacillus halodurans] | UniRef100_Q9RC40 | Bacillushalodurans | Hmp |
| 933 | 阶段V芽孢形成蛋白R[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P37875 | 枯草芽孢杆菌 | SpoVR |
| 934 | 可能的内肽酶lytE前体[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54421 | 枯草芽孢杆菌 | LytE |
| 935 | CitR | |||
| 936 | CitA | |||
| 937 | 葡萄糖脱氢酶-B[Bacillushalodurans] | UniRef100_Q9Z9R3 | Bacillus halodurans | |
| 938 | 假设的氧化还原酶yhdF[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O07575 | 枯草芽孢杆菌 | YhdF |
| 939 | 假设的蛋白yhdH[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O07577 | 枯草芽孢杆菌 | YhdH |
| 940 | 2，4-二氨基丁酸脱羧酶[Bacillushalodurans] | UniRef100_Q9KFB9 | Bacillus halodurans | |
| 941 | YdeE蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P96662 | 枯草芽孢杆菌 | YdeE |
| 942 | YdeL蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P96669 | 枯草芽孢杆菌 | YdeL |
| 943 | BH 1582蛋白[Bacillus halodurans] | UniRef100_Q9KCI9 | Bacillushalodurans | YhdJ |
| 944 | YhdK[枯草芽孢杆菌spizizenii亚种] | UniRef100_Q7X2K9 | 枯草芽孢杆菌spizizenii亚种 | |
| 945 | YhdL[枯草芽孢杆菌spizizenii亚种] | UniRef100_Q7X2L0 | 枯草芽孢杆菌spizizenii亚种 | YhdL |
| 946 | 假设的蛋白yhdM(RNA聚合酶ECF(胞质外功能)型σ因子)[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O07582 | 枯草芽孢杆菌 | SigM |
| 947 | YrkC | |||
| 948 | 假设的蛋白yhdO[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O07584 | 枯草芽孢杆菌 | YhdO |
| 949 | ||||
| 950 | 酰基辅酶A硫酯酶1[丙酮丁醇梭菌] | UniRef100_Q97DR5 | 丙酮丁醇梭菌 | |
| 951 | UPI00003CB259 UniRef100条目 | UniRef100_UPI00003CB259 | YvkB | |
| 952 | YhdP | |||
| 953 | HTH型转录调节蛋白cueR[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O07586 | 枯草芽孢杆菌 | YhdQ |
| 954 | YhdT | |||
| 955 | ||||
| 956 | BH3511蛋白[Bacillus halodurans] | UniRef100_Q9K762 | Bacillus halodurans | |
| 957 | 芽孢形成特异性N-乙酰胞壁酰-L-丙氨酸酰胺酶[Oceanobacillusiheyensis] | UniRef100_Q8CX69 | Oceanobacillusiheyensis | CwlC |
| 958 | 蛋白crcB同源物1[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O07590 | 枯草芽孢杆菌 | YhdU |
| 959 | 蛋白crcB同源物2[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O07591 | 枯草芽孢杆菌 | YhdV |
| 960 | YhdW | |||
| 961 | ||||
| 962 | 假设的UPF0003蛋白yhdY[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O07594 | 枯草芽孢杆菌 | YhdY |
| 963 | NAD依赖脱乙酰基酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O07595 | 枯草芽孢杆菌 | YhdZ |
| 964 | ||||
| 965 | 假设的蛋白yheN[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O07596 | 枯草芽孢杆菌 | YheN |
| 966 | Dat | |||
| 967 | Na(+)/H(+)反向转运蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O07553 | 枯草芽孢杆菌 | NhaC |
| 968 | 假设的蛋白yoxA[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39840 | 枯草芽孢杆菌 | YoxA |
| 969 | 假设的蛋白ydhH[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O05500 | 枯草芽孢杆菌 | YdhH |
| 970 | 假设的蛋白[蜡状芽孢杆菌ZK] | UniRef100_Q63EB4 | 蜡状芽孢杆菌ZK | |
| 971 | 假设的蛋白[蜡状芽孢杆菌] | UniRef100_Q81GF4 | 蜡状芽孢杆菌 | |
| 972 | 应激响应蛋白nhaX[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O07552 | 枯草芽孢杆菌 | NhaX |
| 973 | 假设的蛋白yheI[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O07550 | 枯草芽孢杆菌 | YheI |
| 974 | 假设的蛋白yheH[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O07549 | 枯草芽孢杆菌 | YheH |
| 975 | 假设的蛋白yheG[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O07548 | 枯草芽孢杆菌 | YheG |
| 976 | 小酸溶性芽孢蛋白B[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P04832 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 977 | BH1139蛋白[Bacillus halodurans] | UniRef100_Q9KDS2 | Bacillus halodurans | |
| 978 | 糖ABC转运蛋白ATP结合蛋白[Oceanobacillus iheyensis] | UniRef100_Q8CUH3 | Oceanobacillusiheyensis | MsmX |
| 979 | Fis型螺旋-转角-螺旋结构域蛋白 | UniRef100_Q73A84 | 蜡状芽孢杆菌 | YxkF |
| [蜡状芽孢杆菌] | ||||
| 980 | 假设的蛋白yheE[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O07546 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 981 | 假设的蛋白yheD[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O07545 | 枯草芽孢杆菌 | YheD |
| 982 | 假设的蛋白yheC[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O07544 | 枯草芽孢杆菌 | YheC |
| 983 | 假设的蛋白yheB[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O07543 | 枯草芽孢杆菌 | YheB |
| 984 | 假设的蛋白yheA[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O07542 | 枯草芽孢杆菌 | YheA |
| 985 | 应激响应蛋白yhaX[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O07539 | 枯草芽孢杆菌 | YhaX |
| 986 | HemZ | |||
| 987 | YhaR蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O07533 | 枯草芽孢杆菌 | YhaR |
| 988 | 应答调节蛋白天冬氨酸磷酸酶I[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P96649 | 枯草芽孢杆菌 | RapI |
| 989 | ||||
| 990 | 假设的蛋白yhaQ[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O07524 | 枯草芽孢杆菌 | YhaQ |
| 991 | 假设的蛋白yhaP[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O07523 | 枯草芽孢杆菌 | YhaP |
| 992 | YhaO | |||
| 993 | 假设的蛋白yhaN[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O08455 | 枯草芽孢杆菌 | YhaN |
| 994 | YhaM | |||
| 995 | 假设的蛋白yhaL[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O07520 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 996 | 折叠酶蛋白prsA前体[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P24327 | 枯草芽孢杆菌 | PrsA |
| 997 | ||||
| 998 | 假设的蛋白yhaK[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O07519 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 999 | 假设的蛋白yhaI[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O07517 | 枯草芽孢杆菌 | YhaI |
| 1000 | 蛋白酶生产调节蛋白hpr[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P11065 | 枯草芽孢杆菌 | Hpr |
| 1001 | 假设的蛋白yhaH[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O07516 | 枯草芽孢杆菌 | YhaH |
| 1002 | 可能的色氨酸转运蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O07515 | 枯草芽孢杆菌 | YhaG |
| 1003 | 磷酸丝氨酸氨基转移酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P80862 | 枯草芽孢杆菌 | SerC |
| 1004 | Hit蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O07513 | 枯草芽孢杆菌 | Hit |
| 1005 | ||||
| 1006 | ABC型转运蛋白ATP结合蛋白ecsA[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P55339 | 枯草芽孢杆菌 | EcsA |
| 1007 | 蛋白ecsB[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P55340 | 枯草芽孢杆菌 | EcsB |
| 1008 | 蛋白ecsC[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P55341 | 枯草芽孢杆菌 | EcsC |
| 1009 | YhaA蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O07598 | 枯草芽孢杆菌 | YhaA |
| 1010 | 假设的蛋白yhfA[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O07599 | 枯草芽孢杆菌 | YhfA |
| 1011 | 假设的蛋白yhgC[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P38049 | 枯草芽孢杆菌 | YhgC |
| 1012 | 青霉素结合蛋白1F[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P38050 | 枯草芽孢杆菌 | PbpF |
| 1013 | 尿卟啉原脱羧酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P32395 | 枯草芽孢杆菌 | HemE |
| 1014 | 亚铁螯合酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P32396 | 枯草芽孢杆菌 | HemH |
| 1015 | 原卟啉原氧化酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P32397 | 枯草芽孢杆菌 | HemY |
| 1016 | YhgD | |||
| 1017 | 假设的蛋白yhgE[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P32399 | 枯草芽孢杆菌 | YhgE |
| 1018 | 3-氧酰基-[酰基-载体-蛋白]合酶III蛋白2[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O07600 | 酰基-载体-蛋白 | FabHB |
| 1019 | 假设的蛋白yhfE[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O07603 | 枯草芽孢杆菌 | YhfE |
| 1020 | ||||
| 1021 | 假设的蛋白yhfG[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O07605 | 枯草芽孢杆菌 | GltT |
| 1022 | 假设的蛋白yhfI[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O07607 | 枯草芽孢杆菌 | YhfI |
| 1023 | 假设的蛋白yhfJ[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O07608 | 枯草芽孢杆菌 | YhfJ |
| 1024 | 假设的蛋白yhfL[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O07610 | 枯草芽孢杆菌 | YhfL |
| 1025 | 假设的蛋白yhfM前体[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O07611 | 枯草芽孢杆菌 | YhfM |
| 1026 | BH2909蛋白[Bacillus halodurans] | UniRef100_Q9K8U3 | Bacillus halodurans | |
| 1027 | 支链氨基酸转运蛋白[Bacillushalodurans] | UniRef100_Q9K8U2 | Bacillushalodurans | AzlC |
| 1028 | BH2911蛋白[Bacillus halodurans] | UniRef100_Q9K8U1 | Bacillus halodurans | |
| 1029 | 推测的金属蛋白酶yhfN[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P40769 | 枯草芽孢杆菌 | YhfN |
| 1030 | AprE | |||
| 1031 | 转运蛋白，药物/代谢物输出蛋白家族[蜡状芽孢杆菌ZK] | UniRef100_Q63D40 | 蜡状芽孢杆菌ZK | YdeD |
| 1032 | 假设的蛋白yhfQ[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O07616 | 枯草芽孢杆菌 | YhfQ |
| 1033 | YfmD蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34933 | 枯草芽孢杆菌 | YfmD |
| 1034 | YfmE蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34832 | 枯草芽孢杆菌 | YfmE |
| 1035 | 假设的蛋白yhfR[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O07617 | 枯草芽孢杆菌 | YhfR |
| 1036 | 基于血红素的趋氧转导蛋白(heme-based aerotactic transducer)hemAT[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O07621 | 枯草芽孢杆菌 | HemAT |
| 1037 | 推测的Rieske 2Fe-2S铁-硫蛋白[蜡状芽孢杆菌] | UniRef100_Q73E94 | 蜡状芽孢杆菌 | YhfW |
| 1038 | YhxC | |||
| 1039 | 假设的蛋白yhzC[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31594 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 1040 | ComK | |||
| 1041 | YhjD | |||
| 1042 | YhjE | |||
| 1043 | 信号肽酶IV[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O07560 | 枯草芽孢杆菌 | SipV |
| 1044 | 次要胞外蛋白酶epr前体[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P16396 | 枯草芽孢杆菌 | Epr |
| 1045 | 推测的通透酶[肺炎克雷伯氏菌] | UniRef100_Q765R6 | 肺炎克雷伯氏菌 | YybO |
| 1046 | 假设的蛋白[粪肠球菌(Enterococcus faecalis)] | UniRef100_Q82ZQ4 | 粪肠球菌 | PucR |
| 1047 | 推测的尿囊素酶[木糖葡萄球菌(Staphylococcus xylosus)] | UniRef100_Q9EV52 | 木糖葡萄球菌 | PucH |
| 1048 | 肽酶，M20/M25/M40家族[粪肠球菌] | UniRef100_Q82ZQ2 | 粪肠球菌 | YurH |
| 1049 | 假设的蛋白STY0574[伤寒沙门氏菌(Salmonella typhi)] | UniRef100_Q8XFX7 | 伤寒沙门氏菌 | |
| 1050 | 脲基羟乙酸脱氢酶[粪肠球菌] | UniRef100_Q838P9 | 粪肠球菌 | YjmC |
| 1051 | 脲基羟乙酸脱氢酶[粪肠球菌] | UniRef100_Q838P9 | 粪肠球菌 | YjmC |
| 1052 | 假设的蛋白[粪肠球菌] | UniRef100_Q838Q3 | 粪肠球菌 | SucD |
| 1053 | 假设的蛋白[粪肠球菌] | UniRef100_Q838Q3 | 粪肠球菌 | |
| 1054 | ||||
| 1055 | 氨基甲酸激酶[破伤风梭菌] | UniRef100_Q890W1 | 破伤风梭菌 | |
| 1056 | 主要易化蛋白家族转运蛋白[粪肠球菌] | UniRef100_Q838Q1 | 粪肠球菌 | YcbE |
| 1057 | 假设的蛋白yjfA前体[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34554 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 1058 | 应答调节基因天冬氨酸磷酸酶G[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32294 | 枯草芽孢杆菌 | RapG |
| 1059 | ||||
| 1060 | ||||
| 1061 | ||||
| 1062 | LacI-家族转录调节蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34829 | 枯草芽孢杆菌 | MsmR |
| 1063 | 多种糖结合蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34335 | 枯草芽孢杆菌 | MsmE |
| 1064 | 糖转运蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34706 | 枯草芽孢杆菌 | AmyD |
| 1065 | 糖转运蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34518 | 枯草芽孢杆菌 | AmyC |
| 1066 | α-半乳糖苷酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34645 | 枯草芽孢杆菌 | MelA |
| 1067 | 假设的蛋白yhjN[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O07568 | 枯草芽孢杆菌 | YhjN |
| 1068 | 芽孢外被相关蛋白JA[蜡状芽孢杆菌ZK] | UniRef100_Q63FK5 | 蜡状芽孢杆菌ZK | |
| 1069 | CotJB蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q45537 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 1070 | CotJC蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q45538 | 枯草芽孢杆菌 | CotJC |
| 1071 | 长链脂肪酸-辅酶A连接酶[Bacillus halodurans] | UniRef100_Q9KDT0 | Bacillushalodurans | YngI |
| 1072 | 假设的蛋白yhjO[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O07569 | 枯草芽孢杆菌 | YhjO |
| 1073 | 假设的蛋白[蜡状芽孢杆菌ZK] | UniRef100_Q63FZ3 | 蜡状芽孢杆菌ZK | LytB |
| 1074 | 传感蛋白组氨酸激酶[苏云金芽孢杆菌] | UniRef100_Q6HNG3 | 苏云金芽孢杆菌 | PhoR |
| 1075 | 双组分应答调节蛋白[蜡状芽孢杆菌] | UniRef100_Q81I36 | 蜡状芽孢杆菌 | YclJ |
| 1076 | YhjR | |||
| 1077 | 推测的钼酸结合蛋白YvgL[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32208 | 枯草芽孢杆菌 | YvgL |
| 1078 | 推测的钼酸转运蛋白YvgM[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32209 | 枯草芽孢杆菌 | YvgM |
| 1079 | ATP依赖核酸酶亚基B[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P23477 | 枯草芽孢杆菌 | AddB |
| 1080 | ATP依赖核酸酶亚基A[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P23478 | 枯草芽孢杆菌 | AddA |
| 1081 | 外切核酸酶sbcD同源物[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P23479 | 枯草芽孢杆菌 | SbcD |
| 1082 | 核酸酶sbcCD亚基C[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O06714 | 枯草芽孢杆菌 | YirY |
| 1083 | 可能的芽孢萌发蛋白gerPF[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O06716 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 1084 | 可能的芽孢萌发蛋白gerPE[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O06717 | 枯草芽孢杆菌 | GerPE |
| 1085 | 可能的芽孢萌发蛋白gerPD[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O06718 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 1086 | 可能的芽孢萌发蛋白gerPC[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O06719 | 枯草芽孢杆菌 | GerPC |
| 1087 | 可能的芽孢萌发蛋白gerPB[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O06720 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 1088 | 可能的芽孢萌发蛋白gerPA[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O06721 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 1089 | 假设的蛋白yitR[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O06753 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 1090 | ||||
| 1091 | 芽孢外被蛋白H[蜡状芽孢杆菌] | UniRef100_Q81EE9 | 蜡状芽孢杆菌 | CotH |
| 1092 | CotG | |||
| 1093 | YisK[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O06724 | 枯草芽孢杆菌 | YisK |
| 1094 | 假设的蛋白yloQ[蜡状芽孢杆菌ZK] | UniRef100_Q63CF2 | 蜡状芽孢杆菌ZK | YloQ |
| 1095 | YisL[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O06725 | 枯草芽孢杆菌 | YisL |
| 1096 | 假设的蛋白yisN[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O06727 | 枯草芽孢杆菌 | YisN |
| 1097 | 天冬酰胺合成酶[水解谷氨酰胺]3[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O05272 | 水解谷氨酰胺 | AsnO |
| 1098 | NrgA | |||
| 1099 | 氮调节PII蛋白[Oceanobacillusiheyensis] | UniRef100_Q8ERT8 | Oceanobacillus iheyensis | |
| 1100 | YisQ[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O07940 | 枯草芽孢杆菌 | YisQ |
| 1101 | 推测的HTH型转录调节蛋白yisR[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P40331 | 枯草芽孢杆菌 | YisR |
| 1102 | 乙酰基转移酶，GNAT家族[蜡状芽孢杆菌ZK] | UniRef100_Q63C80 | 蜡状芽孢杆菌ZK | YokL |
| 1103 | HTH型转录调节蛋白degA[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P37947 | 枯草芽孢杆菌 | DegA |
| 1104 | 假设的氧化还原酶yisS[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P40332 | 枯草芽孢杆菌 | YisS |
| 1105 | YisV蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q796Q6 | 枯草芽孢杆菌 | YisV |
| 1106 | 二氨基丁酸-丙酮酸转氨酶[Bacillus halodurans] | UniRef100_Q9K9M1 | Bacillushalodurans | GabT |
| 1107 | L-2，4-二氨基丁酸脱羧酶[鱼腥蓝细菌菌种)] | UniRef100_Q8YZR2 | 鱼腥蓝细菌菌种 | |
| 1108 | All0394蛋白[鱼腥蓝细菌菌种] | UniRef100_Q8YZR3 | 鱼腥蓝细菌菌种 | |
| 1109 | BH2621蛋白[Bacillus halodurans] | UniRef100_Q9K9M4 | Bacillus halodurans | |
| 1110 | BH2620蛋白[Bacillus halodurans] | UniRef100_Q9K9M5 | Bacillus halodurans | |
| 1111 | BH2618蛋白[Bacillus halodurans] | UniRef100_Q9K9M7 | Bacillus halodurans | |
| 1112 | YitI蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O06744 | 枯草芽孢杆菌 | YitI |
| 1113 | Glr2355蛋白[紫色粘杆菌] | UniRef100_Q7NI29 | 紫色粘杆菌 | YcdF |
| 1114 | BH0411蛋白[Bacillus halodurans] | UniRef100_Q9KFR6 | Bacillushalodurans | YobV |
| 1115 | 5-甲基四氢叶酸S-高半胱氨酸甲基转移酶[Bacillus halodurans] | UniRef100_Q9KCE1 | Bacillushalodurans | YitJ |
| 1116 | YitJ[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O06745 | 枯草芽孢杆菌 | YitJ |
| 1117 | 假设的UPF0234蛋白yitk[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O06746 | 枯草芽孢杆菌 | YitK |
| 1118 | YitL蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O06747 | 枯草芽孢杆菌 | YitL |
| 1119 | ||||
| 1120 | ||||
| 1121 | 假设的UPF0230蛋白yitS[枯草 | UniRef100_P70945 | 枯草芽孢杆菌 | YitS |
| 芽孢杆菌] | ||||
| 1122 | 假设的蛋白yitT[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39803 | 枯草芽孢杆菌 | YitT |
| 1123 | 胞内蛋白酶抑制物[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39804 | 枯草芽孢杆菌 | Ipi |
| 1124 | GMP还原酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O05269 | 枯草芽孢杆菌 | GuaC |
| 1125 | ||||
| 1126 | ||||
| 1127 | 推测的orf蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P70947 | 枯草芽孢杆菌 | YitU |
| 1128 | 推测的orf蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P70948 | 枯草芽孢杆菌 | YitV |
| 1129 | YitW | |||
| 1130 | N-乙酰-γ-谷氨酰-磷酸还原酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P23715 | 枯草芽孢杆菌 | ArgC |
| 1131 | 精氨酸生物合成双功能蛋白argJ[包括：谷氨酸N-乙酰基转移酶(EC 2.3.1.35)(鸟氨酸乙酰基转移酶)(鸟氨酸转乙酰基酶)(OATase)；氨基酸乙酰基转移酶(EC 2.3.1.1)(N-乙酰谷氨酸合酶)(AGS)][contai | UniRef100_Q9ZJ14 | 包括：谷氨酸N-乙酰基转移酶(EC2.3.1.35)(鸟氨酸乙酰基转移酶)(鸟氨酸转乙酰基酶)(OATase)；氨基酸乙酰基转移酶(EC2.3.1.1)(N-乙酰谷氨酸合酶)(AGS) | ArgJ |
| 1132 | 乙酰谷氨酸激酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P36840 | 枯草芽孢杆菌 | ArgB |
| 1133 | 乙酰鸟氨酸氨基转移酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P36839 | 枯草芽孢杆菌 | ArgD |
| 1134 | 氨甲酰-磷酸合酶，精氨酸特异性，小链[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P36838 | 枯草芽孢杆菌 | CarA |
| 1135 | 氨甲酰-磷酸合酶，精氨酸特异性，大链[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P18185 | 枯草芽孢杆菌 | CarB |
| 1136 | 鸟氨酸氨甲酰转移酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P18186 | 枯草芽孢杆菌 | ArgF |
| 1137 | 十一异戊烯基-二磷酸酶1[蜡状芽孢杆菌] | UniRef100_Q81HV4 | 蜡状芽孢杆菌 | YubB |
| 1138 | YjzC蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34585 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 1139 | ||||
| 1140 | 假设的蛋白yjaU[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O35001 | 枯草芽孢杆菌 | YjaU |
| 1141 | ArgF和med基因，部分和全部编码序列[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32435 | 枯草芽孢杆菌 | YjaV |
| 1142 | 转录激活蛋白med前体[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32436 | 枯草芽孢杆菌 | Med |
| 1143 | ComG操纵子阻抑蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32437 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 1144 | 假设的蛋白yjzB[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34891 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 1145 | 3-氧酰基-[酰基-载体-蛋白]合酶III蛋白1[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34746 | 酰基-carrier-蛋白 | FabHA |
| 1146 | β-酮酰基-酰基载体蛋白合酶II[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34340 | 枯草芽孢杆菌 | FabF |
| 1147 | YjaZ蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31596 | 枯草芽孢杆菌 | YjaZ |
| 1148 | 寡肽转运ATP结合蛋白appD[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P42064 | 枯草芽孢杆菌 | AppD |
| 1149 | 寡肽转运ATP结合蛋白appF[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P42065 | 枯草芽孢杆菌 | AppF |
| 1150 | 寡肽结合蛋白appA前体[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P42061 | 枯草芽孢杆菌 | AppA |
| 1151 | 寡肽转运系统通透酶蛋白appB[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P42062 | 枯草芽孢杆菌 | AppB |
| 1152 | 寡肽转运系统通透酶蛋白appC[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P42063 | 枯草芽孢杆菌 | AppC |
| 1153 | 推测的通透酶[蜡状芽孢杆菌] | UniRef100_Q734Y3 | 蜡状芽孢杆菌 | YvqJ |
| 1154 | YjbA | |||
| 1155 | 色氨酰-tRNA合成酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P21656 | 枯草芽孢杆菌 | TrpS |
| 1156 | 寡肽结合蛋白oppA前体[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P24141 | 枯草芽孢杆菌 | OppA |
| 1157 | 寡肽转运系统通透酶蛋白oppB[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P24138 | 枯草芽孢杆菌 | OppB |
| 1158 | 寡肽转运系统通透酶蛋白oppC[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P24139 | 枯草芽孢杆菌 | OppC |
| 1159 | 寡肽转运ATP结合蛋白oppD[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P24136 | 枯草芽孢杆菌 | OppD |
| 1160 | 寡肽转运ATP结合蛋白oppF[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P24137 | 枯草芽孢杆菌 | OppF |
| 1161 | YjbC蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31601 | 枯草芽孢杆菌 | YjbC |
| 1162 | 调节蛋白spx[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31602 | 枯草芽孢杆菌 | YjbD |
| 1163 | YjbE蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31603 | 枯草芽孢杆菌 | YjbE |
| 1164 | 接合蛋白(adapter protein)mecA1[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P37958 | 枯草芽孢杆菌 | MecA |
| 1165 | 假设的保守蛋白[Oceanobacillusiheyensis] | UniRef100_Q8ELH8 | Oceanobacillsiheyensis | YflP |
| 1166 | 假设的蛋白OB3248[Oceanobacillus iheyensis] | UniRef100_Q8ELH9 | Oceanobacillus iheyensis | |
| 1167 | 假设的保守蛋白[Oceanobacillusiheyensis] | UniRef100_Q8ELI0 | Oceanobacillus iheyensis | |
| 1168 | 柠檬酸/苹果酸代谢的应答调节蛋白[创伤弧菌] | UniRef100_Q7ML23 | 创伤弧菌 | CitT |
| 1169 | 传感蛋白citS[Bacillushalodurans] | UniRef100_Q9RC53 | Bacillushalodurans | YufL |
| 1170 | YjbF蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31604 | 枯草芽孢杆菌 | YjbF |
| 1171 | YjbG | |||
| 1172 | ||||
| 1173 | YjbH蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31606 | 枯草芽孢杆菌 | YjbH |
| 1174 | YjbI蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31607 | 枯草芽孢杆菌 | YjbI |
| 1175 | YjbJ蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31608 | 枯草芽孢杆菌 | YjbJ |
| 1176 | YjbK蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31609 | 枯草芽孢杆菌 | YjbK |
| 1177 | YjbL蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31610 | 枯草芽孢杆菌 | YjbL |
| 1178 | YjbM蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31611 | 枯草芽孢杆菌 | YjbM |
| 1179 | YjbN | |||
| 1180 | 假设的假尿苷合酶yjbO[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31613 | 枯草芽孢杆菌 | YjbO |
| 1181 | YjbP蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31614 | 枯草芽孢杆菌 | YjbP |
| 1182 | YjbQ蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31615 | 枯草芽孢杆菌 | YjbQ |
| 1183 | 转录激活蛋白tenA[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P25052 | 枯草芽孢杆菌 | TenA |
| 1184 | 调节蛋白tenI[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_p25053 | 枯草芽孢杆菌 | TenI |
| 1185 | 甘氨酸氧化酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31616 | 枯草芽孢杆菌 | GoxB |
| 1186 | ThiS蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31617 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 1187 | 噻唑生物合成蛋白thiG[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31618 | 枯草芽孢杆菌 | ThiG |
| 1188 | ThiF蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31619 | 枯草芽孢杆菌 | ThiF |
| 1189 | YjbV蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31620 | 枯草芽孢杆菌 | YjbV |
| 1190 | 烯酰基-[酰基-载体-蛋白]还原酶[NADH][枯草芽孢杆菌] | UniRef100_p54616 | 酰基-carrier-蛋白 | FabI |
| 1191 | YjbX蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31622 | 枯草芽孢杆菌 | YjbX |
| 1192 | 芽孢外被蛋白Z[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q08312 | 枯草芽孢杆菌 | CotZ |
| 1193 | 芽孢外被蛋白Y[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q08311 | 枯草芽孢杆菌 | CotY |
| 1194 | 芽孢外被蛋白X[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q08313 | 枯草芽孢杆菌 | CotX |
| 1195 | 芽孢外被蛋白W[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q08310 | 枯草芽孢杆菌 | CotW |
| 1196 | 芽孢外被蛋白V[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q08309 | 枯草芽孢杆菌 | CotV |
| 1197 | YjcA蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31623 | 枯草芽孢杆菌 | YjcA |
| 1198 | ||||
| 1199 | ||||
| 1200 | YjcC蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31625 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 1201 | YjcD | |||
| 1202 | YngC | |||
| 1203 | GalE | |||
| 1204 | YngB蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31822 | 枯草芽孢杆菌 | YngB |
| 1205 | YngA蛋白[解淀粉芽孢杆菌] | UniRef100_Q70JY6 | 解淀粉芽孢杆菌 | YngA |
| 1206 | YjcF蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31628 | 枯草芽孢杆菌 | YjcF |
| 1207 | YjcG蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31629 | 枯草芽孢杆菌 | YjcG |
| 1208 | YjcH蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31630 | 枯草芽孢杆菌 | YjcH |
| 1209 | 假设的蛋白[蜡状芽孢杆菌] | UniRef100_Q739H9 | 蜡状芽孢杆菌 | |
| 1210 | BH1889蛋白[Bacillus halodurans] | UniRef100_Q9KBN6 | Bacillushalodurans | YobV |
| 1211 | YjcI蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31631 | 枯草芽孢杆菌 | YjcI |
| 1212 | YjcJ蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31632 | 枯草芽孢杆菌 | YjcJ |
| 1213 | YjcL蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31634 | 枯草芽孢杆菌 | YjcL |
| 1214 | 转录调节蛋白，MarR/EmrR家族[丙酮丁醇梭菌] | UniRef100_Q97DR6 | 丙酮丁醇梭菌 | |
| 1215 | 青霉素结合蛋白4*[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P32959 | 枯草芽孢杆菌 | PbpE |
| 1216 | AbnA | |||
| 1217 | ||||
| 1218 | 麦芽糖转乙酰基酶[嗜热脂肪芽孢杆菌] | UniRef100_Q75TH6 | 嗜热脂肪芽孢杆菌 | Maa |
| 1219 | ||||
| 1220 | 推测的HTH型转录调节蛋白ywfK[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39647 | 枯草芽孢杆菌 | YwfK |
| 1221 | 亚硫酸还原酶[Bacillushalodurans] | UniRef100_Q9KF76 | Bacillushalodurans | YvgR |
| 1222 | 亚硫酸还原酶[Bacillushalodurans] | UniRef100_Q9KF75 | Bacillushalodurans | YvgQ |
| 1223 | 推测的HTH型转录调节蛋白yoaU[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34701 | 枯草芽孢杆菌 | YoaU |
| 1224 | 假设的转运蛋白yoaV[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34416 | 枯草芽孢杆菌 | YoaV |
| 1225 | 假设的蛋白VPA0302[副溶血弧菌(Vibrio parahaemolyticus)] | UniRef100_Q87JF1 | 副溶血弧菌 | YyaH |
| 1226 | 假设的蛋白yoeB前体[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34841 | 枯草芽孢杆菌 | YoeB |
| 1227 | YocH | |||
| 1228 | 通透酶，通用底物转运蛋白[苏云金芽孢杆菌] | UniRef100_Q6HMC3 | 苏云金芽孢杆菌 | LmrB |
| 1229 | 推测的HTH型转录调节蛋白yxaF[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P42105 | 枯草芽孢杆菌 | YxaF |
| 1230 | ||||
| 1231 | YmzD | |||
| 1232 | YeeF | |||
| 1233 | YjqB | |||
| 1234 | 类噬菌体元件(Phage-likeelement)PBSX蛋白xkdA[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39780 | 枯草芽孢杆菌 | XkdA |
| 1235 | HTH型转录调节蛋白xre[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P23789 | 枯草芽孢杆菌 | Xre |
| 1236 | ||||
| 1237 | ||||
| 1238 | 类噬菌体元件PBSX蛋白xkdB[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39781 | 枯草芽孢杆菌 | XkdB |
| 1239 | 类噬菌体元件PBSX蛋白xkdC[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39782 | 枯草芽孢杆菌 | XkdC |
| 1240 | 类噬菌体元件PBSX蛋白xkdD[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39783 | 枯草芽孢杆菌 | XkdD |
| 1241 | 类噬菌体元件PBSX蛋白xtrA[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54344 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 1242 | 正控制因子(positive controlfactor)[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39784 | 枯草芽孢杆菌 | Xpf |
| 1243 | PBSX噬菌体末端酶小亚基[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39785 | 枯草芽孢杆菌 | XtmA |
| 1244 | PBSX噬菌体末端酶大亚基[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39786 | 枯草芽孢杆菌 | XtmB |
| 1245 | 类噬菌体元件PBSX蛋白xkdE[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54325 | 枯草芽孢杆菌 | XkdE |
| 1246 | 类噬菌体元件PBSX蛋白xkdF[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54326 | 枯草芽孢杆菌 | XkdF |
| 1247 | 类噬菌体元件PBSX蛋白xkdG[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54327 | 枯草芽孢杆菌 | XkdG |
| 1248 | 假设的蛋白yqbG[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P45923 | 枯草芽孢杆菌 | YqbG |
| 1249 | 假设的蛋白yqbH[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P45924 | 枯草芽孢杆菌 | YqbH |
| 1250 | 类噬菌体元件PBSX蛋白xkdI[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54329 | 枯草芽孢杆菌 | XkdI |
| 1251 | 类噬菌体元件PBSX蛋白xkdJ[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54330 | 枯草芽孢杆菌 | XkdJ |
| 1252 | Lin1277蛋白[无害利斯特氏菌] | UniRef100_Q92CB2 | 无害利斯特氏菌 | |
| 1253 | 类噬菌体元件PBSX蛋白xkdK[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54331 | 枯草芽孢杆菌 | XkdK |
| 1254 | 类噬菌体元件PBSX蛋白xkdM[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54332 | 枯草芽孢杆菌 | XkdM |
| 1255 | 类噬菌体元件PBSX蛋白xkdN[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54333 | 枯草芽孢杆菌 | XkdN |
| 1256 | 类噬菌体元件PBSX蛋白xkdO[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54334 | 枯草芽孢杆菌 | XkdO |
| 1257 | 类噬菌体元件PBSX蛋白xkdP[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54335 | 枯草芽孢杆菌 | YqbP |
| 1258 | 假设的蛋白yqbQ[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P45950 | 枯草芽孢杆菌 | YqbQ |
| 1259 | 假设的蛋白yqbR[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P45933 | 枯草芽孢杆菌 | YqbR |
| 1260 | 类噬菌体元件PBSX蛋白xkdS[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54338 | 枯草芽孢杆菌 | XkdS |
| 1261 | 假设的蛋白yqbT[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P45935 | 枯草芽孢杆菌 | YqbT |
| 1262 | 类噬菌体元件PBSX蛋白xkdU[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54340 | 枯草芽孢杆菌 | XkdU |
| 1263 | ||||
| 1264 | XkdV | |||
| 1265 | YomR | |||
| 1266 | ||||
| 1267 | ||||
| 1268 | BlyA | |||
| 1269 | 调节蛋白[嗜热脂肪芽孢杆菌] | UniRef100_Q9ZFL9 | 嗜热脂肪芽孢杆菌 | YdhC |
| 1270 | 含锌醇脱氢酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O35045 | 枯草芽孢杆菌 | YjmD |
| 1271 | 甘露糖酸脱水酶1[Bacillushalodurans] | UniRef100_Q9KDZ8 | Bacillushalodurans | UxuA |
| 1272 | D-甘露糖酸氧化还原酶[Bacillushalodurans] | UniRef100_Q9KDZ4 | Bacillushalodurans | YjmF |
| 1273 | UPI00002F2634 UniRef100条目 | UniRef100_UPI00002F2634 | YjmD | |
| 1274 | 己糖醛酸转运蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34456 | 枯草芽孢杆菌 | ExuT |
| 1275 | 阶段II芽孢形成蛋白SB[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34800 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 1276 | 阶段II芽孢形成蛋白SA[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34853 | 枯草芽孢杆菌 | SpoIISA |
| 1277 | UPI00003CC121 UniRef100条目 | UniRef100_UPI00003CC121 | Pit | |
| 1278 | 假设的UPF0111蛋白ykaA[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34454 | 枯草芽孢杆菌 | YkaA |
| 1279 | Ggt | |||
| 1280 | YesL蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31515 | 枯草芽孢杆菌 | YesL |
| 1281 | YesM蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31516 | 枯草芽孢杆菌 | YesM |
| 1282 | YesN蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31517 | 枯草芽孢杆菌 | YesN |
| 1283 | YesO蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31518 | 枯草芽孢杆菌 | YesO |
| 1284 | 可能的ABC转运蛋白通透酶蛋白yesP[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31519 | 枯草芽孢杆菌 | YesP |
| 1285 | 可能的ABC转运蛋白通透酶蛋白yesQ[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31520 | 枯草芽孢杆菌 | YesQ |
| 1286 | YesR蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31521 | 枯草芽孢杆菌 | YesR |
| 1287 | YesS蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31522 | 枯草芽孢杆菌 | YesS |
| 1288 | YesT蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31523 | 枯草芽孢杆菌 | YesT |
| 1289 | YesU | |||
| 1290 | YesV蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31525 | 枯草芽孢杆菌 | YesV |
| 1291 | YesW蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31526 | 枯草芽孢杆菌 | YesW |
| 1292 | ||||
| 1293 | YesT | |||
| 1294 | YesX蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31527 | 枯草芽孢杆菌 | YesX |
| 1295 | 推测的离子通道蛋白[伤寒沙门氏菌] | UniRef100_Q8Z4X6 | 伤寒沙门氏菌 | YccK |
| 1296 | YesY蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31528 | 枯草芽孢杆菌 | YesY |
| 1297 | YesZ蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31529 | 枯草芽孢杆菌 | YesZ |
| 1298 | YetA | |||
| 1299 | 脂蛋白lplA前体[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P37966 | 枯草芽孢杆菌 | LplA |
| 1300 | LplB蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39128 | 枯草芽孢杆菌 | LplB |
| 1301 | LplC蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39129 | 枯草芽孢杆菌 | LplC |
| 1302 | YkbA蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34739 | 枯草芽孢杆菌 | YkbA |
| 1303 | YkcA蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34689 | 枯草芽孢杆菌 | YkcA |
| 1304 | 假设的蛋白[蜡状芽孢杆菌] | UniRef100_Q81CP9 | 蜡状芽孢杆菌 | |
| 1305 | 可能的丝氨酸蛋白酶功能类似物(do-like)htrA[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34358 | 枯草芽孢杆菌 | HtrA |
| 1306 | 吡咯啉-5-羧酸还原酶3[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q00777 | 枯草芽孢杆菌 | ProG |
| 1307 | D-氨肽酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P26902 | 枯草芽孢杆菌 | DppA |
| 1308 | 二肽转运系统通透酶蛋白dppB[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P26903 | 枯草芽孢杆菌 | DppB |
| 1309 | 二肽转运系统通透酶蛋白dppC[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P26904 | 枯草芽孢杆菌 | DppC |
| 1310 | 二肽转运ATP结合蛋白dppD[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P26905 | 枯草芽孢杆菌 | DppD |
| 1311 | 二肽结合蛋白dppE前体[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P26906 | 枯草芽孢杆菌 | DppE |
| 1312 | 假设的蛋白ykfA[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34851 | 枯草芽孢杆菌 | YkfA |
| 1313 | YkfB[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34508 | 枯草芽孢杆菌 | YkfB |
| 1314 | YkfC[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O35010 | 枯草芽孢杆菌 | YkfC |
| 1315 | YkfD[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34480 | 枯草芽孢杆菌 | YkfD |
| 1316 | BH1779蛋白[Bacillus halodurans] | UniRef100_Q9KBZ5 | Bacillushalodurans | YkgA |
| 1317 | 推测的酰基-辅酶A硫酯水解酶ykhA[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P49851 | 枯草芽孢杆菌 | YkhA |
| 1318 | YkjA | |||
| 1319 | 果胶酸裂合酶47前体[芽孢杆菌 | UniRef100_Q9AJM4 | 芽孢杆菌属种 | Pel |
| 菌种TS-47] | TS-47 | |||
| 1320 | 转录调节蛋白，PadR家族[苏云金芽孢杆菌] | UniRef100_Q6HED5 | 苏云金芽孢杆菌 | |
| 1321 | 假设的蛋白OB0568[Oceanobacillus iheyensis] | UniRef100_Q8ESQ3 | Oceanobacillus iheyensis | |
| 1322 | BH1312蛋白[Bacillus halodurans] | UniRef100_Q9KDA2 | Bacillus halodurans | |
| 1323 | 假设的蛋白ykkA[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P49854 | 枯草芽孢杆菌 | YkkA |
| 1324 | 假设的蛋白ykkC[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P49856 | 枯草芽孢杆菌 | YkkC |
| 1325 | ||||
| 1326 | YkkE[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34990 | 枯草芽孢杆菌 | YkkE |
| 1327 | 谷氨酸5-激酶1[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39820 | 枯草芽孢杆菌 | ProB |
| 1328 | γ-谷氨酰磷酸还原酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39821 | 枯草芽孢杆菌 | ProA |
| 1329 | 有机氢过氧化物耐性蛋白ohrA[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34762 | 枯草芽孢杆菌 | YklA |
| 1330 | 有机氢过氧化物耐性转录调节蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34777 | 枯草芽孢杆菌 | YkmA |
| 1331 | 有机氢过氧化物耐性蛋白ohrB[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P80242 | 枯草芽孢杆菌 | YkzA |
| 1332 | ||||
| 1333 | 鸟氨酸脱氨酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34598 | 枯草芽孢杆菌 | GuaD |
| 1334 | 磷酸甘油酸变位酶[嗜热脂肪芽孢杆菌] | UniRef100_Q9ALU0 | 嗜热脂肪芽孢杆菌 | YhfR |
| 1335 | ||||
| 1336 | ||||
| 1337 | 5-甲基四氢蝶酰三谷氨酸--高半胱氨酸甲基转移酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P80877 | 枯草芽孢杆菌 | MetE |
| 1338 | 胞内丝氨酸蛋白酶[芽孢杆菌菌种WRD-2] | UniRef100_Q69DB4 | 芽孢杆菌属WRD-2种 | IspA |
| 1339 | ||||
| 1340 | YkoK[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34442 | 枯草芽孢杆菌 | YkoK |
| 1341 | ||||
| 1342 | 整合酶[Oceanobacillusiheyensis] | UniRef100_Q8ETV2 | Oceanobacillusiheyensis | YdcL |
| 1343 | YqaB | |||
| 1344 | 假设的蛋白[炭疽芽孢杆菌] | UniRef100_Q81UE0 | 炭疽芽孢杆菌 | |
| 1345 | YonS | |||
| 1346 | ||||
| 1347 | 推测的HTH型转录调节蛋白yqaE[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P45902 | 枯草芽孢杆菌 | YqaE |
| 1348 | 转录调节蛋白[具核梭杆菌文氏亚种(Fusobacterium nucleatumsubsp.vincentii)ATCC 49256] | UniRef100_Q7P886 | 具核梭杆菌文氏亚种ATCC49256 | |
| 1349 | ||||
| 1350 | ||||
| 1351 | Lin1236蛋白[无害利斯特氏菌](Listeria innocua) | UniRef100_Q92CD6 | 无害利斯特氏菌 | |
| 1352 | ||||
| 1353 | ||||
| 1354 | ||||
| 1355 | YqaJ | |||
| 1356 | 35蛋白[噬菌体SPP1] | UniRef100_Q38143 | 噬菌体SPP1 | YqaK |
| 1357 | YqaL | |||
| 1358 | YqaM | |||
| 1359 | 假设的蛋白yqaO[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P45912 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 1360 | 假设的蛋白yopY[噬菌体SPBc2] | UniRef100_O64108 | 噬菌体SPBc2 | |
| 1361 | ||||
| 1362 | ||||
| 1363 | ||||
| 1364 | 假设的蛋白CTC02137[破伤风梭菌] | UniRef100_Q892G2 | 破伤风梭菌 | |
| 1365 | 假设的蛋白MW1918[金黄色葡萄球菌] | UniRef100_Q8NVN5 | 金黄色葡萄球菌 | YqaN |
| 1366 | ||||
| 1367 | 单链结合蛋白2[单核细胞增生利斯特氏菌] | UniRef100_Q8Y4X1 | 单核细胞增生利斯特氏菌 | |
| 1368 | ||||
| 1369 | ||||
| 1370 | 假设的蛋白yqaQ[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P45948 | 枯草芽孢杆菌 | YqaQ |
| 1371 | ||||
| 1372 | 假设的蛋白yqaS[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P45915 | 枯草芽孢杆菌 | YqaS |
| 1373 | 假设的蛋白yqaT[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P45916 | 枯草芽孢杆菌 | YqaT |
| 1374 | 假设的噬菌体相关的蛋白SpyM3_1326[酿脓链球菌] | UniRef100_Q8K6I0 | 酿脓链球菌 | |
| 1375 | 小头(minor head)结构组分GP7[噬菌体SPP1] | UniRef100_Q38442 | 噬菌体SPP1 | |
| 1376 | ||||
| 1377 | ||||
| 1378 | ||||
| 1379 | 假设的蛋白CTC01553[破伤风梭菌] | UniRef100_Q894J0 | 破伤风梭菌 | |
| 1380 | 主要衣壳蛋白[噬菌体A118] | UniRef100_Q9T1B7 | 噬菌体A118 | |
| 1381 | ORF28[噬菌体phi-105] | UniRef100_Q9ZXF5 | 噬菌体phi-105 | |
| 1382 | ||||
| 1383 | 15蛋白[噬菌体SPP1] | UniRef100_Q38584 | 噬菌体SPP1 | |
| 1384 | 全核苷酸序列[噬菌体SPP1] | UniRef100_O48446 | 噬菌体SPP1 | |
| 1385 | ||||
| 1386 | 全核苷酸序列[噬菌体SPP1] | UniRef100_O48448 | 噬菌体SPP1 | |
| 1387 | 全核苷酸序列[噬菌体SPP1] | UniRef100_O48449 | 噬菌体SPP1 | |
| 1388 | ||||
| 1389 | 全核苷酸序列[噬菌体SPP1] | UniRef100_O48453 | 噬菌体SPP1 | |
| 1390 | ||||
| 1391 | 全核苷酸序列[噬菌体SPP1] | UniRef100_O48455 | 噬菌体SPP1 | XkdO |
| 1392 | 全核苷酸序列[噬菌体SPP1] | UniRef100_O48459 | 噬菌体SPP1 | |
| 1393 | 全核苷酸序列[噬菌体SPP1] | UniRef100_O48463 | 噬菌体SPP1 | |
| 1394 | ||||
| 1395 | ||||
| 1396 | LycA[肉毒梭菌(Clostridium | UniRef100_Q6RI00 | 肉毒梭菌 | |
| botulinum)] | ||||
| 1397 | 假设的蛋白yrkC[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54430 | 枯草芽孢杆菌 | YrkC |
| 1398 | YhjR | |||
| 1399 | YdfS蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P96697 | 枯草芽孢杆菌 | YdfS |
| 1400 | HTH型转录调节蛋白tnrA[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q45666 | 枯草芽孢杆菌 | TnrA |
| 1401 | 假设的蛋白ykzB[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34923 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 1402 | ||||
| 1403 | YkoM[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34949 | 枯草芽孢杆菌 | YkoM |
| 1404 | YkoU蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34398 | 枯草芽孢杆菌 | YkoU |
| 1405 | YkoV蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34859 | 枯草芽孢杆菌 | YkoV |
| 1406 | 信号蛋白ykoW[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34311 | 枯草芽孢杆菌 | YkoW |
| 1407 | YkoX蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34908 | 枯草芽孢杆菌 | YkoX |
| 1408 | YkoY蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34997 | 枯草芽孢杆菌 | YkoY |
| 1409 | RNA聚合酶σ因子[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31654 | 枯草芽孢杆菌 | SigI |
| 1410 | YkrI | |||
| 1411 | 小酸溶性芽孢蛋白C3[巨大芽孢杆菌] | UniRef100_P10572 | 巨大芽孢杆菌 | |
| 1412 | YkrK蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31656 | 枯草芽孢杆菌 | YkrK |
| 1413 | 可能的蛋白酶htpX同源物[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31657 | 枯草芽孢杆菌 | YkrL |
| 1414 | YkrM蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31658 | 枯草芽孢杆菌 | YkrM |
| 1415 | 青霉素结合蛋白3[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P42971 | 枯草芽孢杆菌 | PbpC |
| 1416 | 假设的蛋白[蜡状芽孢杆菌] | UniRef100_Q73BI4 | 蜡状芽孢杆菌 | |
| 1417 | ||||
| 1418 | YkrP蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31660 | 枯草芽孢杆菌 | YkrP |
| 1419 | 双组分传感蛋白组氨酸激酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31661 | 枯草芽孢杆菌 | KinE |
| 1420 | 甲基化-DNA--蛋白半胱氨酸甲基转移酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P11742 | 枯草芽孢杆菌 | Ogt |
| 1421 | ||||
| 1422 | 甲硫基核糖-1-磷酸异构酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31662 | 枯草芽孢杆菌 | YkrS |
| 1423 | 甲硫基核糖激酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31663 | 枯草芽孢杆菌 | YkrT |
| 1424 | YkrU蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31664 | 枯草芽孢杆菌 | YkrU |
| 1425 | 转氨酶mtnE[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31665 | 枯草芽孢杆菌 | YkrV |
| 1426 | 2，3-二酮-5-甲硫基戊基-1-磷酸烯醇化酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31666 | 枯草芽孢杆菌 | YkrW |
| 1427 | 甲硫基核酮糖-1-磷酸脱水酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31668 | 枯草芽孢杆菌 | YkrY |
| 1428 | 1，2-二羟-3-酮-5-甲硫基戊烯双加氧酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31669 | 枯草芽孢杆菌 | YkrZ |
| 1429 | 金属巯基转移酶fosB[Oceanobacillus iheyensis] | UniRef100_Q8CXK5 | Oceanobacillusiheyensis | YndN |
| 1430 | YkvA蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31670 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 1431 | 阶段0芽孢形成调节蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P05043 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 1432 | 双组分传感蛋白组氨酸激酶[枯 | UniRef100_O31671 | 枯草芽孢杆菌 | KinD |
| 草芽孢杆菌] | ||||
| 1433 | YkvE | |||
| 1434 | 趋化motB蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P28612 | 枯草芽孢杆菌 | MotB |
| 1435 | 趋化motA蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P28611 | 枯草芽孢杆菌 | MotA |
| 1436 | 类ATP依赖Clp蛋白酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31673 | 枯草芽孢杆菌 | ClpE |
| 1437 | YkvI蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31674 | 枯草芽孢杆菌 | YkvI |
| 1438 | YkvJ蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31675 | 枯草芽孢杆菌 | YkvJ |
| 1439 | YkvK蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31676 | 枯草芽孢杆菌 | YkvK |
| 1440 | YkvL蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31677 | 枯草芽孢杆菌 | YkvL |
| 1441 | YkvM蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31678 | 枯草芽孢杆菌 | YkvM |
| 1442 | DNA整合/重组蛋白[破伤风梭菌] | UniRef100_Q894H7 | 破伤风梭菌 | CodV |
| 1443 | 整合酶/重组酶[蜡状芽孢杆菌ZK] | UniRef100_Q633V7 | 蜡状芽孢杆菌ZK | RipX |
| 1444 | ||||
| 1445 | ||||
| 1446 | ||||
| 1447 | YoqV蛋白[噬菌体SPBc2] | UniRef100_O64130 | 噬菌体SPBc2 | LigB |
| 1448 | ||||
| 1449 | ||||
| 1450 | UPI00003CC586 UniRef100条目 | UniRef100_UPI00003CC586 | ||
| 1451 | ||||
| 1452 | ||||
| 1453 | ||||
| 1454 | ||||
| 1455 | 原噬菌体Lambda Ba02，HNH内切核酸酶家族蛋白[炭疽芽孢杆菌] | UniRef100_Q81W86 | 炭疽芽孢杆菌 | |
| 1456 | 末端酶小亚基[金黄色葡萄球菌] | UniRef100_Q6GAL5 | 金黄色葡萄球菌 | |
| 1457 | 推测的原噬菌体Lambda Ba02，末端酶，大亚基[炭疽芽孢杆菌] | UniRef100_Q6HUD2 | 炭疽芽孢杆菌 | |
| 1458 | 假设的蛋白[炭疽芽孢杆菌] | UniRef100_Q81W89 | 炭疽芽孢杆菌 | |
| 1459 | 可能的噬菌体相关的ClpP家族丝氨酸蛋白酶[丙酮丁醇梭菌] | UniRef100_Q97HW4 | 丙酮丁醇梭菌 | ClpP |
| 1460 | 推测的原噬菌体Lambda Ba02主要衣壳蛋白[炭疽芽孢杆菌] | UniRef100_Q81W91 | 炭疽芽孢杆菌 | |
| 1461 | 前体多肽(氨基酸-37到1647)前体[未鉴定细菌] | UniRef100_Q03658 | 未鉴定bacterium | |
| 1462 | Gp7蛋白[噬菌体phi3626] | UniRef100_Q8SBP7 | 噬菌体phi3626 | |
| 1463 | 未描述性质的噬菌体相关蛋白[丙酮丁醇梭菌] | UniRef100_Q97HW7 | 丙酮丁醇梭菌 | |
| 1464 | 假设的蛋白CAC1887[丙酮丁醇梭菌] | UniRef100_Q97HW9 | 丙酮丁醇梭菌 | |
| 1465 | 原噬菌体LambdaBa02，主要尾蛋白(tail protein)，推测的[炭疽芽孢杆菌] | UniRef100_Q81W97 | 炭疽芽孢杆菌 | |
| 1466 | ||||
| 1467 | ||||
| 1468 | 推测的原噬菌体LambdaBa02， | UniRef100_Q81WA0 | 炭疽芽孢杆菌 | YqbO |
| 卷尺蛋白(tape measure protein)[炭疽芽孢杆菌] | ||||
| 1469 | Lin2382蛋白[无害利斯特氏菌] | UniRef100_Q928Z8 | 无害利斯特氏菌 | |
| 1470 | 蛋白gp18[单核细胞增生利斯特氏菌] | UniRef100_Q8Y4Z4 | 单核细胞增生利斯特氏菌 | |
| 1471 | YclG | |||
| 1472 | XkdV | |||
| 1473 | XkdW | |||
| 1474 | YomP蛋白[噬菌体SPBc2] | UniRef100_O64052 | 噬菌体SPBc2 | |
| 1475 | 推测的甘油磷酰二酯磷酸二酯酶[蜡状芽孢杆菌] | UniRef100_Q737E6 | 蜡状芽孢杆菌 | GlpQ |
| 1476 | 蛋白bhlA[噬菌体SPBc2] | UniRef100_O64039 | 噬菌体SPBc2 | |
| 1477 | ORF46[噬菌体phi-105] | UniRef100_Q9ZXD7 | 噬菌体phi-105 | XlyB |
| 1478 | ||||
| 1479 | ||||
| 1480 | ||||
| 1481 | 转录调节蛋白，DeoR家族[蜡状芽孢杆菌] | UniRef100_Q816D5 | 蜡状芽孢杆菌 | |
| 1482 | 假设的蛋白yolD[噬菌体SPBc2] | UniRef100_O64030 | 噬菌体SPBc2 | |
| 1483 | DNA整合/重组/倒位蛋白[蜡状芽孢杆菌] | UniRef100_Q81GD4 | 蜡状芽孢杆菌 | YdcL |
| 1484 | YkvM蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31678 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 1485 | 应答调节蛋白天冬氨酸磷酸酶H[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P40771 | 枯草芽孢杆菌 | RapH |
| 1486 | YoaT[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34535 | 枯草芽孢杆菌 | YoaT |
| 1487 | YozG蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31834 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 1488 | YoaS蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31833 | 枯草芽孢杆菌 | YoaS |
| 1489 | ||||
| 1490 | ||||
| 1491 | ||||
| 1492 | ||||
| 1493 | ||||
| 1494 | YkvS蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31684 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 1495 | BH2327蛋白[Bacillus halocdurans] | UniRef100_Q9KAG0 | Bacillus halodurans | |
| 1496 | YkvT蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31685 | 枯草芽孢杆菌 | YkvT |
| 1497 | YkvU蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31686 | 枯草芽孢杆菌 | YkvU |
| 1498 | YkvV蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31687 | 枯草芽孢杆菌 | YkvV |
| 1499 | YkvW | |||
| 1500 | YkvY蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31689 | 枯草芽孢杆菌 | YkvY |
| 1501 | 坏死和乙烯诱导蛋白[Bacillushalodurans] | UniRef100_Q9KFT2 | Bacillus halodurans | |
| 1502 | 推测的HTH型转录调节蛋白ykvZ[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31690 | 枯草芽孢杆菌 | YkvZ |
| 1503 | 转录抗终止子[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O06710 | 枯草芽孢杆菌 | GlcT |
| 1504 | PtsG | |||
| 1505 | 磷酸载体蛋白HPr[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P08877 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 1506 | 磷酸烯醇丙酮酸-蛋白磷酸转移酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P08838 | 枯草芽孢杆菌 | PtsI |
| 1507 | SplA[解淀粉芽孢杆菌] | UniRef100_O54358 | 解淀粉芽孢杆菌 | |
| 1508 | 芽孢光生产物裂合酶[解淀粉芽孢杆菌] | UniRef100_O54359 | 解淀粉芽孢杆菌 | SplB |
| 1509 | 假设的蛋白orf1[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O05187 | 枯草芽孢杆菌 | YkwB |
| 1510 | 接纳甲基的趋化蛋白mcpC[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54576 | 枯草芽孢杆菌 | McpC |
| 1511 | 3-氧酰基-(酰基载体蛋白还原酶[Oceanobacillus iheyensis] | UniRef100_Q8EMP9 | Oceanobacillusiheyensis | FabG |
| 1512 | 假设的氧化还原酶ykwC[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34948 | 枯草芽孢杆菌 | YkwC |
| 1513 | YkwD蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31694 | 枯草芽孢杆菌 | YkwD |
| 1514 | YkuA蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31399 | 枯草芽孢杆菌 | YkuA |
| 1515 | 芽孢形成激酶A[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P16497 | 枯草芽孢杆菌 | KinA |
| 1516 | 推测的氨基转移酶A[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P16524 | 枯草芽孢杆菌 | PatA |
| 1517 | ||||
| 1518 | 假设的蛋白yxaI[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P42108 | 枯草芽孢杆菌 | YxaI |
| 1519 | YxiO | |||
| 1520 | 趋化蛋白cheV[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P37599 | 枯草芽孢杆菌 | CheV |
| 1521 | 假设的蛋白ykyB[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P42430 | 枯草芽孢杆菌 | YkyB |
| 1522 | YkuC | |||
| 1523 | YkuD蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34816 | 枯草芽孢杆菌 | YkuD |
| 1524 | YkuE | |||
| 1525 | 假设的氧化还原酶ykuF[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34717 | 枯草芽孢杆菌 | YkuF |
| 1526 | YkuI蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O35014 | 枯草芽孢杆菌 | YkuI |
| 1527 | ||||
| 1528 | YkuJ蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34588 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 1529 | YkuK蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34776 | 枯草芽孢杆菌 | YkuK |
| 1530 | 假设的蛋白ykzF[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31697 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 1531 | YkuL蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31698 | 枯草芽孢杆菌 | YkuL |
| 1532 | 推测的HTH型转录调节蛋白ykuM[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34827 | 枯草芽孢杆菌 | CcpC |
| 1533 | 可能的黄素氧还蛋白1[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34737 | 枯草芽孢杆菌 | YkuN |
| 1534 | YkuO蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34879 | 枯草芽孢杆菌 | YkuO |
| 1535 | 可能的黄素氧还蛋白2[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34589 | 枯草芽孢杆菌 | YkuP |
| 1536 | YkuQ蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34981 | 枯草芽孢杆菌 | YkuQ |
| 1537 | YkuR蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34916 | 枯草芽孢杆菌 | YkuR |
| 1538 | 假设的UPF0180蛋白ykuS[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34783 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 1539 | YkuU蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34564 | 枯草芽孢杆菌 | YkuU |
| 1540 | YkuV蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31403 | 枯草芽孢杆菌 | YkuV |
| 1541 | 阻抑蛋白rok[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34857 | 枯草芽孢杆菌 | Rok |
| 1542 | YknT蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31700 | 枯草芽孢杆菌 | YknT |
| 1543 | MobA | |||
| 1544 | 钼蝶呤生物合成蛋白MoeB[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31702 | 枯草芽孢杆菌 | MoeB |
| 1545 | 钼蝶呤生物合成蛋白MoeA[枯草 | UniRef100_O31703 | 枯草芽孢杆菌 | MoeA |
| 芽孢杆菌] | ||||
| 1546 | 钼蝶呤-鸟氨酸二核苷酸生物合成蛋白B[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31704 | 枯草芽孢杆菌 | MobB |
| 1547 | 钼蝶呤转化因子亚基2[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31705 | 枯草芽孢杆菌 | MoaE |
| 1548 | 钼蝶呤转化因子，亚基1[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31706 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 1549 | ||||
| 1550 | YknU蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31707 | 枯草芽孢杆菌 | YknU |
| 1551 | YknV蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31708 | 枯草芽孢杆菌 | YknV |
| 1552 | 假设的蛋白yknW[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31709 | 枯草芽孢杆菌 | YknW |
| 1553 | YknX蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31710 | 枯草芽孢杆菌 | YknX |
| 1554 | YknY蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31711 | 枯草芽孢杆菌 | YknY |
| 1555 | 假设的蛋白yknZ[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31712 | 枯草芽孢杆菌 | YknZ |
| 1556 | FruR | |||
| 1557 | 1-磷酸果糖激酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31714 | 枯草芽孢杆菌 | FruK |
| 1558 | 磷酸转移酶系统(PTS)果糖特异性酶IIABC组分[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P71012 | 枯草芽孢杆菌 | FruA |
| 1559 | 信号肽酶IT[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P71013 | 枯草芽孢杆菌 | SipT |
| 1560 | 假设的蛋白ykoA[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31715 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 1561 | ||||
| 1562 | YkpA蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31716 | 枯草芽孢杆菌 | YkpA |
| 1563 | BH1921蛋白[Bacillus halodurans] | UniRef100_Q9KBK5 | Bacillus halodurans | |
| 1564 | 氨肽酶ampS[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39762 | 枯草芽孢杆菌 | AmpS |
| 1565 | ||||
| 1566 | MreBH蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39763 | 枯草芽孢杆菌 | MreBH |
| 1567 | ||||
| 1568 | 芽孢形成激酶C[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39764 | 枯草芽孢杆菌 | KinC |
| 1569 | 假设的蛋白ykqB[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39760 | 枯草芽孢杆菌 | YkqB |
| 1570 | 腺嘌呤脱氨酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39761 | 枯草芽孢杆菌 | AdeC |
| 1571 | YkqC | |||
| 1572 | YkzG蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31718 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 1573 | 假设的蛋白ykrA[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q45494 | 枯草芽孢杆菌 | YkrA |
| 1574 | YkrB | |||
| 1575 | ||||
| 1576 | 假设的蛋白ykyA[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P21884 | 枯草芽孢杆菌 | YkyA |
| 1577 | 丙酮酸脱氢酶E1组分，α亚基[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P21881 | 枯草芽孢杆菌 | PdhA |
| 1578 | 丙酮酸脱氢酶E1组分，β亚基[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P21882 | 枯草芽孢杆菌 | PdhB |
| 1579 | 丙酮酸脱氢酶复合物的二氢硫辛酰赖氨酸-残基乙酰基转移酶组分[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P21883 | 枯草芽孢杆菌 | PdhC |
| 1580 | 二氢硫辛酰脱氢酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P21880 | 枯草芽孢杆菌 | PdhD |
| 1581 | UPI00003CC069 UniRef100条目 | UniRef100_UPI00003CC069 | ||
| 1582 | IS1627s1-相关的，转座酶[炭疽芽孢杆菌A2012株] | UniRef100_Q7CMD0 | 炭疽芽孢杆菌A2012株 | |
| 1583 | ||||
| 1584 | ||||
| 1585 | 精氨酸脱羧酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P21885 | 枯草芽孢杆菌 | SpeA |
| 1586 | 假设的UPF0223蛋白yktA[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q45497 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 1587 | 假设的蛋白yktB[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q45498 | 枯草芽孢杆菌 | YktB |
| 1588 | YkzI蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31719 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 1589 | 肌醇-1-单磷酸酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q45499 | 枯草芽孢杆菌 | YktC |
| 1590 | 假设的蛋白ykzC[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31720 | 枯草芽孢杆菌 | YkzC |
| 1591 | 假设的蛋白ylaA[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O07625 | 枯草芽孢杆菌 | YlaA |
| 1592 | 假设的蛋白ylaB[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O07626 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 1593 | YlaC蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O07627 | 枯草芽孢杆菌 | YlaC |
| 1594 | 假设的蛋白ylaD[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O07628 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 1595 | 假设的蛋白ylaF[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O07630 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 1596 | GTP结合蛋白typA/bipA同源物[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O07631 | 枯草芽孢杆菌 | YlaG |
| 1597 | YlaH蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O07632 | 枯草芽孢杆菌 | YlaH |
| 1598 | YhzA同源物[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O07562 | 枯草芽孢杆菌 | YhjH |
| 1599 | 假设的蛋白yhjG[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O07561 | 枯草芽孢杆菌 | YhjG |
| 1600 | ||||
| 1601 | 假设的脂蛋白ylaJ前体[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O07634 | 枯草芽孢杆菌 | YlaJ |
| 1602 | YlaK蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O07635 | 枯草芽孢杆菌 | YlaK |
| 1603 | UPI00003CB7B1 UniRef100条目 | UniRef100_UPI00003CB7B1 | YlaL | |
| 1604 | 可能的谷氨酰胺酶ylaM[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O07637 | 枯草芽孢杆菌 | YlaM |
| 1605 | YlaN蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O07638 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 1606 | 假设的蛋白ylaO[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O07639 | 枯草芽孢杆菌 | FtsW |
| 1607 | PycA | |||
| 1608 | 细胞色素AA3控制蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P12946 | 枯草芽孢杆菌 | CtaA |
| 1609 | 正铁血红素IX法尼基转移酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P24009 | 枯草芽孢杆菌 | CtaB |
| 1610 | 细胞色素c氧化酶多肽II前体(EC 1.9.3.1)(细胞色素aa3亚基2)(Caa-3605亚基2)(氧化酶aa(3)亚基2)[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P24011 | 枯草芽孢杆菌 | CtaC |
| 1611 | 细胞色素c氧化酶多肽I(EC1.9.3.1)(细胞色素aa3亚基1)(Caa-3605亚基1)(氧化酶aa(3)亚基1)[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P24010 | 枯草芽孢杆菌 | CtaD |
| 1612 | 细胞色素c氧化酶多肽III(EC1.9.3.1)(细胞色素aa3亚基3)(Caa-3605亚基3)(氧化酶aa(3)亚基3)[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P24012 | 枯草芽孢杆菌 | CtaE |
| 1613 | 细胞色素c氧化酶多肽IVB[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P24013 | 枯草芽孢杆菌 | CtaF |
| 1614 | CtaG蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34329 | 枯草芽孢杆菌 | CtaG |
| 1615 | YlbA蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34743 | 枯草芽孢杆菌 | YlbA |
| 1616 | YlbB蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34682 | 枯草芽孢杆菌 | YlbB |
| 1617 | YlbC蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34586 | 枯草芽孢杆菌 | YlbC |
| 1618 | YlbD蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34880 | 枯草芽孢杆菌 | YlbD |
| 1619 | YlbE蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34958 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 1620 | 调节蛋白ylbF[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34412 | 枯草芽孢杆菌 | YlbF |
| 1621 | 假设的UPF0298蛋白ylbG[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34658 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 1622 | YlbH蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34331 | 枯草芽孢杆菌 | YlbH |
| 1623 | 磷酸泛酰巯基乙胺转腺苷酰酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34797 | 枯草芽孢杆菌 | YlbI |
| 1624 | YlbJ | |||
| 1625 | YlbL蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34470 | 枯草芽孢杆菌 | YlbL |
| 1626 | YlbM蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34513 | 枯草芽孢杆菌 | YlbM |
| 1627 | YlbN蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34445 | 枯草芽孢杆菌 | YlbN |
| 1628 | 50S核糖体蛋白L32[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34687 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 1629 | 假设的蛋白ylbO[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34549 | 枯草芽孢杆菌 | YlbO |
| 1630 | YlbP蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34468 | 枯草芽孢杆菌 | YlbP |
| 1631 | 可能的2-脱氢泛解酸2-还原酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34661 | 枯草芽孢杆菌 | YlbQ |
| 1632 | YllA | |||
| 1633 | 蛋白mraZ[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P55343 | 枯草芽孢杆菌 | YllB |
| 1634 | S-腺苷酰-甲基转移酶mraW[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q07876 | 枯草芽孢杆菌 | YlxA |
| 1635 | FtsL | |||
| 1636 | 青霉素结合蛋白2B[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q07868 | 枯草芽孢杆菌 | PbpB |
| 1637 | 阶段V芽孢形成蛋白D[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q03524 | 枯草芽孢杆菌 | SpoVD |
| 1638 | UDP-N-乙酰胞壁酰丙氨酰-D-谷氨酸--2，6-二氨基庚二酸连接酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q03523 | 枯草芽孢杆菌 | MurE |
| 1639 | 磷酸-N-乙酰胞壁酰-五肽-转移酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q03521 | 枯草芽孢杆菌 | MraY |
| 1640 | UDP-N-乙酰胞壁酰丙氨酸--D-谷氨酸连接酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q03522 | 枯草芽孢杆菌 | MurD |
| 1641 | 阶段V芽孢形成蛋白E[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P07373 | 枯草芽孢杆菌 | SpoVE |
| 1642 | UDP-N-乙酰葡糖胺--N-乙酰胞壁酰-(五肽)焦磷酰-十一萜醇(undecaprenol)N-乙酰葡糖胺转移酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P37585 | 枯草芽孢杆菌 | MurG |
| 1643 | UDP-N-乙酰烯醇丙酮酰葡糖胺还原酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P18579 | 枯草芽孢杆菌 | MurB |
| 1644 | DivIB | |||
| 1645 | YlxW | |||
| 1646 | YlxX | |||
| 1647 | Sbp | |||
| 1648 | FtsA | |||
| 1649 | 细胞分裂蛋白ftsZ[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P17865 | 枯草芽孢杆菌 | FtsZ |
| 1650 | Bpr | |||
| 1651 | 芽孢杆菌肽酶(bacillopeptidase)F前体[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P16397 | 枯草芽孢杆菌 | Bpr |
| 1652 | 芽孢形成σ-E因子加工肽酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P13801 | 枯草芽孢杆菌 | SpoIIGA |
| 1653 | RNA聚合酶σ-E因子前体[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P06222 | 枯草芽孢杆菌 | SigE |
| 1654 | RNA聚合酶σ-G因子[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P19940 | 枯草芽孢杆菌 | SigG |
| 1655 | YlmA蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31723 | 枯草芽孢杆菌 | YlmA |
| 1656 | ||||
| 1657 | YlmC蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31725 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 1658 | 假设的UPF0124蛋白ylmD[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31726 | 枯草芽孢杆菌 | YlmD |
| 1659 | YlmE | |||
| 1660 | YlmF蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31728 | 枯草芽孢杆菌 | YlmF |
| 1661 | YlmG蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31729 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 1662 | 小细胞相关蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P71020 | 枯草芽孢杆菌 | YlmH |
| 1663 | 小细胞相关蛋白DivIVA[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P71021 | 枯草芽孢杆菌 | DivIVA |
| 1664 | 异亮氨酰-tRNA合成酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q45477 | 枯草芽孢杆菌 | IleS |
| 1665 | YlyA | |||
| 1666 | LspA | |||
| 1667 | 假设的假尿苷合酶ylyB[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q45480 | 枯草芽孢杆菌 | YlyB |
| 1668 | PyrR双功能蛋白[包括：嘧啶操纵子调节蛋白；尿嘧啶磷酸核糖转移酶(EC 2.4.2.9)(UPRTase)][枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39765 | 包括：嘧啶操纵子调节蛋白；尿嘧啶磷酸核糖转移酶(EC2.4.2.9)(UPRTase) | PyrR |
| 1669 | 尿嘧啶通透酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39766 | 枯草芽孢杆菌 | PyrP |
| 1670 | 天冬氨酸氨甲酰转移酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P05654 | 枯草芽孢杆菌 | PyrB |
| 1671 | 二氢乳清酸酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P25995 | 枯草芽孢杆菌 | PyrC |
| 1672 | 氨甲酰-磷酸合酶，嘧啶特异性，小链[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P25993 | 枯草芽孢杆菌 | PyrAA |
| 1673 | 氨甲酰-磷酸合酶，嘧啶特异性，大链[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P25994 | 枯草芽孢杆菌 | PyrAB |
| 1674 | 二氢乳清酸脱氢酶电子传递亚基[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P25983 | 枯草芽孢杆菌 | PyrK |
| 1675 | 二氢乳清酸脱氢酶，催化亚基[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P25996 | 枯草芽孢杆菌 | PyrD |
| 1676 | 乳清苷5′-磷酸脱羧酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P25971 | 枯草芽孢杆菌 | PyrF |
| 1677 | 乳清酸磷酸核糖转移酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P25972 | 枯草芽孢杆菌 | PyrE |
| 1678 | ||||
| 1679 | CysH |
| 1680 | YlnA蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34734 | 枯草芽孢杆菌 | CysP |
| 1681 | 硫酸腺苷酰转移酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34764 | 枯草芽孢杆菌 | Sat |
| 1682 | 可能的腺苷酰-硫酸激酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34577 | 枯草芽孢杆菌 | CysC |
| 1683 | 推测的S-腺苷酰L-甲硫氨酸：尿卟啉原III甲基转移酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34744 | 枯草芽孢杆菌 | YlnD |
| 1684 | Sirohydrochlorin亚铁鳌合酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34632 | 枯草芽孢杆菌 | YlnE |
| 1685 | YlnF蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34813 | 枯草芽孢杆菌 | YlnF |
| 1686 | 推测的纤连蛋白结合蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34693 | 枯草芽孢杆菌 | YloA |
| 1687 | YloB蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34431 | 枯草芽孢杆菌 | YloB |
| 1688 | YloC蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34441 | 枯草芽孢杆菌 | YloC |
| 1689 | 假设的UPF0296蛋白ylzA[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q7WY72 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 1690 | 鸟苷酸激酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34328 | 枯草芽孢杆菌 | Gmk |
| 1691 | DNA指导的RNA聚合酶ω链[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O35011 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 1692 | YloI蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O35033 | 枯草芽孢杆菌 | YloI |
| 1693 | 引发体蛋白N′[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P94461 | 枯草芽孢杆菌 | PriA |
| 1694 | 肽脱甲酰基酶1[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P94462 | 枯草芽孢杆菌 | Def |
| 1695 | 甲硫氨酰-tRNA甲酰转移酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P94463 | 枯草芽孢杆菌 | Fmt |
| 1696 | 核糖体RNA小亚基甲基转移酶B(EC 2.1.1.-)(rRNA(胞嘧啶-C(5)-)-甲基转移酶)[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P94464 | 枯草芽孢杆菌 | YloM |
| 1697 | 假设的UPF0063蛋白yloN[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34617 | 枯草芽孢杆菌 | YloN |
| 1698 | 蛋白磷酸酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34779 | 枯草芽孢杆菌 | PrpC |
| 1699 | 可能的丝氨酸/苏氨酸-蛋白激酶yloP[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34507 | 枯草芽孢杆菌 | PrkC |
| 1700 | 可能的GTP酶engC[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34530 | 枯草芽孢杆菌 | YloQ |
| 1701 | 核酮糖-磷酸3-差向异构酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34557 | 枯草芽孢杆菌 | Rpe |
| 1702 | YloS蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34664 | 枯草芽孢杆菌 | YloS |
| 1703 | ||||
| 1704 | 50S核糖体蛋白L28[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P37807 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 1705 | 假设的蛋白yloU[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34318 | 枯草芽孢杆菌 | YloU |
| 1706 | YloV | |||
| 1707 | 可能的L-丝氨酸脱水酶，β链[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34635 | 枯草芽孢杆菌 | SdaAB |
| 1708 | 可能的L-丝氨酸脱水酶，α链[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34607 | 枯草芽孢杆菌 | SdaAA |
| 1709 | ATP依赖DNA解旋酶recG[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34942 | 枯草芽孢杆菌 | RecG |
| 1710 | 转录因子fapR[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34835 | 枯草芽孢杆菌 | YlpC |
| 1711 | 脂肪酸/磷脂合成蛋白plsX[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P71018 | 枯草芽孢杆菌 | PlsX |
| 1712 | 丙二酰辅酶A-酰基载体蛋白转酰基酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P71019 | 枯草芽孢杆菌 | FabD |
| 1713 | 3-氧酰基-[酰基-载体-蛋白还原酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P51831 | 酰基-载体-蛋白 | FabG |
| 1714 | 酰基载体蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P80643 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 1715 | Rnc | |||
| 1716 | 染色体分配蛋白smc[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P51834 | 枯草芽孢杆菌 | Smc |
| 1717 | FtsY | |||
| 1718 | ||||
| 1719 | 信号识别颗粒蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P37105 | 枯草芽孢杆菌 | Ffh |
| 1720 | 30S核糖体蛋白S16[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P21474 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 1721 | ||||
| 1722 | YlqD蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31739 | 枯草芽孢杆菌 | YlqD |
| 1723 | RimM | |||
| 1724 | TrmD | |||
| 1725 | 50S核糖体蛋白L19[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31742 | 枯草芽孢杆菌 | RplS |
| 1726 | YlqF蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31743 | 枯草芽孢杆菌 | YlqF |
| 1727 | 核糖核酸酶HII[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31744 | 枯草芽孢杆菌 | RnhB |
| 1728 | YlqG蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31745 | 枯草芽孢杆菌 | YlqG |
| 1729 | YlqH蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34867 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 1730 | 琥珀酰-辅酶A合成酶β链[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P80886 | 枯草芽孢杆菌 | SucC |
| 1731 | 琥珀酰-辅酶A合成酶α链[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P80865 | 枯草芽孢杆菌 | SucD |
| 1732 | Smf | |||
| 1733 | TopA | |||
| 1734 | 蛋白gid[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39815 | 枯草芽孢杆菌 | Gid |
| 1735 | 酪氨酸重组酶xerC[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39776 | 枯草芽孢杆菌 | CodV |
| 1736 | ATP依赖蛋白酶hslV前体[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39070 | 枯草芽孢杆菌 | ClpQ |
| 1737 | ATP依赖hsl蛋白酶ATP-结合亚基hslU[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39778 | 枯草芽孢杆菌 | ClpY |
| 1738 | GTP感应转录多效阻抑蛋白codY[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39779 | 枯草芽孢杆菌 | CodY |
| 1739 | 鞭毛基体杆(rod)蛋白flgB[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P24500 | 枯草芽孢杆菌 | FlgB |
| 1740 | 鞭毛基体杆蛋白flgC[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P24501 | 枯草芽孢杆菌 | FlgC |
| 1741 | 鞭毛钩(hook)-基体复合物蛋白fliE[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P24502 | 枯草芽孢杆菌 | FliE |
| 1742 | 鞭毛M-环蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P23447 | 枯草芽孢杆菌 | FliF |
| 1743 | 鞭毛马达开关(switch)蛋白fliG | UniRef100_P23448 | 枯草芽孢杆菌 | FliG |
| [枯草芽孢杆菌] | ||||
| 1744 | 可能的鞭毛组装蛋白fliH[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P23449 | 枯草芽孢杆菌 | FliH |
| 1745 | 鞭毛特异性ATP合酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P23445 | 枯草芽孢杆菌 | FliI |
| 1746 | 鞭毛fliJ蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P20487 | 枯草芽孢杆菌 | FliJ |
| 1747 | FlaA基因座22.9kDa蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P23454 | 枯草芽孢杆菌 | YlxF |
| 1748 | 可能的鞭毛钩长度控制蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P23451 | 枯草芽孢杆菌 | FliK |
| 1749 | FlaA基因座假设的蛋白ylxG[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P23455 | 枯草芽孢杆菌 | YlxG |
| 1750 | FlgE | |||
| 1751 | BH2448蛋白[Bacillus halodurans] | UniRef100_Q9KA42 | Bacillus haladurans | |
| 1752 | 鞭毛fliL蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P23452 | 枯草芽孢杆菌 | FliL |
| 1753 | 鞭毛马达开关蛋白fliM[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P23453 | 枯草芽孢杆菌 | FliM |
| 1754 | 鞭毛马达开关蛋白fliY[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P24073 | 枯草芽孢杆菌 | FliY |
| 1755 | 趋化蛋白cheY同源物[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P24072 | 枯草芽孢杆菌 | CheY |
| 1756 | 鞭毛生物合成蛋白fliZ前体[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P35536 | 枯草芽孢杆菌 | FliZ |
| 1757 | 鞭毛生物合成蛋白fliP[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P35528 | 枯草芽孢杆菌 | Flip |
| 1758 | 鞭毛生物合成蛋白fliQ[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P35535 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 1759 | 鞭毛生物合成蛋白fliR[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P35537 | 枯草芽孢杆菌 | FliR |
| 1760 | 鞭毛生物合成蛋白flhB[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P35538 | 枯草芽孢杆菌 | FlhB |
| 1761 | 鞭毛生物合成蛋白flhA[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P35620 | 枯草芽孢杆菌 | FlhA |
| 1762 | 鞭毛生物合成蛋白flhF[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q01960 | 枯草芽孢杆菌 | FlhF |
| 1763 | 假设的蛋白ylxH[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P40742 | 枯草芽孢杆菌 | YlxH |
| 1764 | 趋化响应调节蛋白谷氨酸甲酯酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q05522 | 枯草芽孢杆菌 | CheB |
| 1765 | 趋化蛋白cheA[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P29072 | 枯草芽孢杆菌 | CheA |
| 1766 | 趋化蛋白cheW[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39802 | 枯草芽孢杆菌 | CheW |
| 1767 | 趋化蛋白cheC[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P40403 | 枯草芽孢杆菌 | CheC |
| 1768 | 趋化蛋白cheD[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P40404 | 枯草芽孢杆菌 | CheD |
| 1769 | RNA聚合酶σ-D因子[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P10726 | 枯草芽孢杆菌 | SigD |
| 1770 | 游动性(swarming motility)蛋白swrB[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P40405 | 枯草芽孢杆菌 | YlxL |
| 1771 | 30S核糖体蛋白S2[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P21464 | 枯草芽孢杆菌 | RpsB |
| 1772 | 翻译延伸因子Ts[蜡状芽孢杆菌] | UniRef100_Q65JJ8 | 蜡状芽孢杆菌 | Tsf |
| 1773 | PyrH | |||
| 1774 | Frr | |||
| 1775 | 十一异戊二烯(undecaprenyl)基焦磷酸合成酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31751 | 枯草芽孢杆菌 | UppS |
| 1776 | 磷脂酸胞苷酰转移酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31752 | 枯草芽孢杆菌 | CdsA |
| 1777 | 1-脱氧-D-木酮糖5-磷酸还原异构酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31753 | 枯草芽孢杆菌 | Dxr |
| 1778 | 假设的锌金属蛋白酶yluc[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31754 | 枯草芽孢杆菌 | YluC |
| 1779 | 脯氨酰-tRNA合成酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31755 | 枯草芽孢杆菌 | ProS |
| 1780 | DNA聚合酶III polC型[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P13267 | 枯草芽孢杆菌 | PolC |
| 1781 | ||||
| 1782 | 纤维素1，4-β-纤维二糖苷酶前体[类芽孢杆菌属(Paenibacillus)BP-23菌种] | UniRef100_Q8KKF7 | 类芽孢杆菌属BP-23种 | |
| 1783 | 内切葡聚糖酶B前体[灿烂类芽孢杆菌(Paenibacillus lautus)] | UniRef100_P23550 | 灿烂类芽孢杆菌 | |
| 1784 | β-甘露糖苷酶[那不勒斯栖热袍菌(Thermotoga neapolitana)] | UniRef100_Q9RIK7 | 那不勒斯栖热袍菌 | |
| 1785 | 假设的UPF0090蛋白ylxS[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P32726 | 枯草芽孢杆菌 | YlxS |
| 1786 | 转录延伸蛋白nusA[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P32727 | 枯草芽孢杆菌 | NusA |
| 1787 | 假设的蛋白ylxR[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P32728 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 1788 | 可能的核糖体蛋白ylxQ[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P32729 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 1789 | 翻译起始因子IF-2[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P17889 | 枯草芽孢杆菌 | InfB |
| 1790 | 假设的蛋白ylxP[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P32730 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 1791 | 核糖体结合因子A[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P32731 | 枯草芽孢杆菌 | RbfA |
| 1792 | TruB | |||
| 1793 | 核黄素生物合成蛋白ribC[包括：核黄素激酶(EC 2.7.1.26)(黄素激酶)；FMN腺苷酰转移酶(EC2.7.7.2)(FAD焦磷酸化酶)(FAD合成酶)][枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54575 | 包括：核黄素激酶(EC2.7.1.26)(黄素激酶)；FMN腺苷酰转移酶(EC 2.7.7.2)(FAD焦磷酸化酶)(FAD合成酶) | RibC |
| 1794 | 30S核糖体蛋白S15[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P21473 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 1795 | 多核糖核苷酸核苷酰转移酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P50849 | 枯草芽孢杆菌 | PnpA |
| 1796 | 假设的蛋白ylxY前体[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P50850 | 枯草芽孢杆菌 | YlxY |
| 1797 | 假设的锌蛋白酶ymxG[枯草芽孢 | UniRef100_Q04805 | 枯草芽孢杆菌 | MlpA |
| 杆菌] | ||||
| 1798 | 假设的蛋白ymxH[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q04811 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 1799 | 吡啶二羧酸合酶，A链[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q04809 | 枯草芽孢杆菌 | SpoVFA |
| 1800 | 吡啶二羧酸合酶，B链[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q04810 | 枯草芽孢杆菌 | SpoVFB |
| 1801 | 天冬氨酸-半醛脱氢酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q04797 | 枯草芽孢杆菌 | Asd |
| 1802 | 天冬氨酸激酶1(EC 2.7.2.4)(天冬氨酸激酶I)(天冬氨酸激酶1)[包含：天冬氨酸激酶Iα亚基；天冬氨酸激酶Iβ亚基][枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q04795 | 包含：天冬氨酸激酶Iα亚基；天冬氨酸激酶Iβ亚基 | DapG |
| 1803 | 二氢吡啶二羧酸合酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q04796 | 枯草芽孢杆菌 | DapA |
| 1804 | YmfA蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31760 | 枯草芽孢杆菌 | YmfA |
| 1805 | 易位促进蛋白tepA[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q99171 | 枯草芽孢杆菌 | TepA |
| 1806 | ||||
| 1807 | DNA移位酶ftsK[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P21458 | 枯草芽孢杆菌 | SpoIIIE |
| 1808 | 假设的转录调节蛋白ymfC[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31761 | 枯草芽孢杆菌 | YmfC |
| 1809 | 多药耐性蛋白[Bacillushalodurans] | UniRef100_Q9K7Q2 | Bacillushalodurans | YitG |
| 1810 | 假设的蛋白[炭疽芽孢杆菌] | UniRef100_Q81WP6 | 炭疽芽孢杆菌 | YmfG |
| 1811 | YmfH蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31766 | 枯草芽孢杆菌 | YmfH |
| 1812 | ||||
| 1813 | ||||
| 1814 | YmfJ蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31768 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 1815 | 假设的蛋白[蜡状芽孢杆菌ZK] | UniRef100_Q636P2 | 蜡状芽孢杆菌ZK | YmfK |
| 1816 | YmfM | |||
| 1817 | CDP-二酰基甘油--甘油-3-磷酸3-磷脂酰转移酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P46322 | 枯草芽孢杆菌 | PgsA |
| 1818 | 类CinA蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P46323 | 枯草芽孢杆菌 | CinA |
| 1819 | RecA蛋白[解淀粉芽孢杆菌] | UniRef100_Q8GJG2 | 解淀粉芽孢杆菌 | RecA |
| 1820 | 假设的UPF0144蛋白ymdA[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31774 | 枯草芽孢杆菌 | YmdA |
| 1821 | YmdB蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31775 | 枯草芽孢杆菌 | YmdB |
| 1822 | 阶段V芽孢形成蛋白S[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P45693 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 1823 | ||||
| 1824 | ||||
| 1825 | L-苏氨酸3-脱氢酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31776 | 枯草芽孢杆菌 | Tdh |
| 1826 | 2-氨基-3-丁酮酸辅酶A连接酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31777 | 枯草芽孢杆菌 | Kbl |
| 1827 | 假设的UPF0004蛋白ymcB[枯草 | UniRef100_O31778 | 枯草芽孢杆菌 | YmcB |
| 芽孢杆菌] | ||||
| 1828 | YmcA蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31779 | 枯草芽孢杆菌 | YmcA |
| 1829 | 芽孢外被蛋白E[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P14016 | 枯草芽孢杆菌 | CotE |
| 1830 | MutS | |||
| 1831 | DNA错配修复蛋白mutL[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P49850 | 枯草芽孢杆菌 | MutL |
| 1832 | YjcS蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31641 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 1833 | YxiD | |||
| 1834 | ||||
| 1835 | ||||
| 1836 | All1751蛋白[鱼腥蓝细菌菌种] | UniRef100_Q8YW65 | 鱼腥蓝细菌属某个种 | YciC |
| 1837 | BH0367蛋白[Bacillus halodurans] | UniRef100_Q9KFV4 | Bacillus halodurans | |
| 1838 | 膦丝菌素(phosphinothricin)N-乙酰基转移酶[Bacillus halodurans] | UniRef100_Q9KFP5 | Bacillushalodurans | YwnH |
| 1839 | UPI00003CC0D8 UniRef100条目 | UniRef100_UPI00003CC0D8 | ||
| 1840 | ||||
| 1841 | 推测的L-氨基酸氧化酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34363 | 枯草芽孢杆菌 | YobN |
| 1842 | YoaK | |||
| 1843 | Na+/H+反向转运蛋白[Bacillushalodurans] | UniRef100_Q9K5Q0 | Bacillushalodurans | YvgP |
| 1844 | 芳香烃代谢蛋白[Oceanobacillusiheyensis] | UniRef100_Q8CV32 | Oceanobacillus iheyensis | |
| 1845 | 假设的UPF0145蛋白VP1283[副溶血弧菌] | UniRef100_Q87Q67 | 副溶血弧菌 | |
| 1846 | 假设的蛋白yqeD[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54449 | 枯草芽孢杆菌 | YqeD |
| 1847 | 推测的青霉素结合蛋白[蜡状芽孢杆菌] | UniRef100_Q738U9 | 蜡状芽孢杆菌 | PbpE |
| 1848 | 假设的糖基转移酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34539 | 枯草芽孢杆菌 | YjiC |
| 1849 | 天冬氨酸-质子同向转运蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O07002 | 枯草芽孢杆菌 | YveA |
| 1850 | 芽孢外被蛋白[Bacillushalodurans] | UniRef100_Q9KEV6 | Bacillus halodurans | |
| 1851 | ||||
| 1852 | YdhD | |||
| 1853 | 推测的HTH型转录调节蛋白yezE[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q7WY76 | 枯草芽孢杆菌 | YezE |
| 1854 | 假设的蛋白yesE[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31511 | 枯草芽孢杆菌 | YesE |
| 1855 | YesF蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31512 | 枯草芽孢杆菌 | YesF |
| 1856 | UPI00003CBA3B UniRef100条目 | UniRef100_UPI00003CBA3B | ||
| 1857 | YmaD蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31790 | 枯草芽孢杆菌 | YmaD |
| 1858 | 多药耐性蛋白ebrB[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31791 | 枯草芽孢杆菌 | EbrB |
| 1859 | 多药耐性蛋白ebrA[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31792 | 枯草芽孢杆菌 | EbrA |
| 1860 | ||||
| 1861 | 假设的蛋白ymaF[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31794 | 枯草芽孢杆菌 | YmaF |
| 1862 | tRNA δ(2)-异戊烯基焦磷酸转移 | UniRef100_O31795 | 枯草芽孢杆菌 | MiaA |
| 酶[枯草芽孢杆菌] | ||||
| 1863 | Hfg蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31796 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 1864 | 假设的蛋白ymzA[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31798 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 1865 | NrdI蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P50618 | 枯草芽孢杆菌 | YmaA |
| 1866 | 核糖核苷-二磷酸还原酶α链[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P50620 | 枯草芽孢杆菌 | NrdE |
| 1867 | 核糖核苷-二磷酸还原酶β链[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P50621 | 枯草芽孢杆菌 | NrdF |
| 1868 | 假设的蛋白ymaB[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P50619 | 枯草芽孢杆菌 | YmaB |
| 1869 | Blr6966蛋白[大豆慢生根瘤菌(Bradyrhizobium japonicum)] | UniRef100_Q89EV4 | 大豆慢生根瘤菌 | YtnP |
| 1870 | 固氮蛋白[Bacillus halodurans] | UniRef100_Q9KFV2 | Bacillushalodurans | YurV |
| 1871 | 转录调节蛋白Fur家族样蛋白[表皮葡萄球菌] | UniRef100_Q8CNQ7 | 表皮葡萄球菌 | PerR |
| 1872 | UPI00003CB681 UniRef100条目 | UniRef100_UPI00003CB681 | YdhC | |
| 1873 | 假设的蛋白[蜡状芽孢杆菌] | UniRef100_Q81C60 | 蜡状芽孢杆菌 | YjlA |
| 1874 | CwlC | |||
| 1875 | 推测的膜蛋白[单核细胞增生利斯特氏菌] | UniRef100_Q720L9 | 单核细胞增生利斯特氏菌 | |
| 1876 | Lin1174蛋白[无害利斯特氏菌] | UniRef100_Q92CJ7 | 无害利斯特氏菌 | |
| 1877 | ||||
| 1878 | ||||
| 1879 | 转录调节蛋白[嗜火产液菌(Aquifex aeolicus)] | UniRef100_O66635 | 嗜火产液菌 | YdgC |
| 1880 | 假设的膜锚定蛋白[苜蓿根瘤菌] | UniRef100_Q92VA1 | 苜蓿根瘤菌 | |
| 1881 | 胞嘧啶通透酶[Bacillushalodurans] | UniRef100_Q9KBP3 | Bacillushalodurans | YxlA |
| 1882 | AgaF[枯瘤农杆菌(Agrobacterium tumefaciens)] | UniRef100_O50265 | 根瘤农杆菌 | |
| 1883 | ||||
| 1884 | 乙内酰脲利用蛋白B[恶臭假单胞菌] | UniRef100_Q88H51 | 恶臭假单胞菌 | |
| 1885 | 假设的蛋白SMb20139[苜蓿根瘤菌] | UniRef100_Q92X23 | 苜蓿根瘤菌 | |
| 1886 | BH2340蛋白[Bacillus halodurans] | UniRef100_Q9KAE7 | Bacillus halodurans | |
| 1887 | ||||
| 1888 | ||||
| 1889 | 阶段V芽孢形成蛋白K[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P27643 | 枯草芽孢杆菌 | SpoVK |
| 1890 | YnbA[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P94478 | 枯草芽孢杆菌 | YnbA |
| 1891 | YnbB[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P94479 | 枯草芽孢杆菌 | YnbB |
| 1892 | HTH型转录调节蛋白glnR[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P37582 | 枯草芽孢杆菌 | GlnR |
| 1893 | 谷氨酰胺合成酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P12425 | 枯草芽孢杆菌 | GlnA |
| 1894 | ||||
| 1895 | 假设的蛋白CAC3435[丙酮丁醇 | UniRef100_Q97DN7 | 丙酮丁醇梭菌 | |
| 梭菌] | ||||
| 1896 | ||||
| 1897 | ||||
| 1898 | 假设的蛋白CAC0350[丙酮丁醇梭菌] | UniRef100_Q97M50 | 丙酮丁醇梭菌 | |
| 1899 | 假设的类HIT蛋白MJ0866[詹氏甲烷球菌(Methanococcusjannaschii)] | UniRef100_Q58276 | 詹氏甲烷球菌 | Hit |
| 1900 | 假设的蛋白[炭疽芽孢杆菌] | UniRef100_Q6I2B3 | 炭疽芽孢杆菌 | |
| 1901 | 假设的蛋白[蜡状芽孢杆菌] | UniRef100_Q81CM1 | 蜡状芽孢杆菌 | YdjC |
| 1902 | ||||
| 1903 | 甲基转移酶[蜡状芽孢杆菌] | UniRef100_Q81CJ2 | 蜡状芽孢杆菌 | |
| 1904 | YoaO | |||
| 1905 | 乙酰基转移酶，GNAT家族[蜡状芽孢杆菌] | UniRef100_Q737B4 | 蜡状芽孢杆菌 | |
| 1906 | 阻抑蛋白rok[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34857 | 枯草芽孢杆菌 | Rok |
| 1907 | ||||
| 1908 | 假设的蛋白[噬菌体T5] | UniRef100_Q6QGK2 | 噬菌体T5 | |
| 1909 | 假设的蛋白yvdT[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O07001 | 枯草芽孢杆菌 | YvdT |
| 1910 | 假设的蛋白yvdS[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32262 | 枯草芽孢杆菌 | YvdS |
| 1911 | 假设的蛋白yvdR[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O06999 | 枯草芽孢杆菌 | YvdR |
| 1912 | 亚精胺N1-乙酰基转移酶[蜡状芽孢杆菌] | UniRef100_Q72Y03 | 蜡状芽孢杆菌 | YoaA |
| 1913 | 假设的膜相关蛋白[蜡状芽孢杆菌] | UniRef100_Q812L6 | 蜡状芽孢杆菌 | |
| 1914 | 假设的蛋白yoaW前体[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34541 | 枯草芽孢杆菌 | YoaW |
| 1915 | 巯基-二硫键氧化还原酶resA[Bacillus halodurans] | UniRef100_Q9KCJ4 | Bacillushalodurans | ResA |
| 1916 | 含锰过氧化氢酶[Bacillushalodurans] | UniRef100_Q9KAU6 | Bacillushalodurans | YdbD |
| 1917 | BH1562蛋白[Bacillus halodurans] | UniRef100_Q9KCK9 | Bacillus halodurans | |
| 1918 | 乙酰基转移酶，GNAT家族[蜡状芽孢杆菌] | UniRef100_Q739K0 | 蜡状芽孢杆菌 | YjcK |
| 1919 | 假设的保守蛋白[Oceanobacillusiheyensis] | UniRef100_Q8ELR7 | Oceanobacillus iheyensis | |
| 1920 | ||||
| 1921 | 转录调节蛋白，MarR家族[蜡状芽孢杆菌] | UniRef100_Q81BM5 | 蜡状芽孢杆菌 | YkvE |
| 1922 | 推测的NAD(P)H硝基还原酶ydfN[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P96692 | 枯草芽孢杆菌 | YdfN |
| 1923 | YdfO蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P96693 | 枯草芽孢杆菌 | YdfO |
| 1924 | 假设的蛋白[蜡状芽孢杆菌ZK] | UniRef100_Q630S7 | 蜡状芽孢杆菌ZK | YwrF |
| 1925 | BH1010蛋白[Bacillus halodurans] | UniRef100_Q9KE48 | Bacillushalodurans | YhcB |
| 1926 | ORF28[葡萄球菌噬菌体K] | UniRef100_Q6Y7T8 | Staphylococcus phage K | |
| 1927 | ||||
| 1928 | 胸苷酸合酶[噬菌体phi-3T] | UniRef100_P07606 | 噬菌体phi-3T | ThyA |
| 1929 | 芽孢形成特异性胞外核酸酶前体 | UniRef100_P42983 | 枯草芽孢杆菌 | NucB |
| [枯草芽孢杆菌] | ||||
| 1930 | LexA阻抑蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P31080 | 枯草芽孢杆菌 | LexA |
| 1931 | YneA[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q45056 | 枯草芽孢杆菌 | YneA |
| 1932 | YneB[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q45057 | 枯草芽孢杆菌 | YneB |
| 1933 | 假设的UPF0291蛋白ynzC[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31818 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 1934 | 转酮酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P45694 | 枯草芽孢杆菌 | Tkt |
| 1935 | 假设的蛋白yneE[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P45707 | 枯草芽孢杆菌 | YneE |
| 1936 | 假设的UPF0154蛋白yneF[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P45708 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 1937 | ||||
| 1938 | 细胞色素c型生物生成蛋白ccdA[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P45706 | 枯草芽孢杆菌 | CcdA |
| 1939 | CcdB蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P45709 | 枯草芽孢杆菌 | YneI |
| 1940 | CcdC蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P45710 | 枯草芽孢杆菌 | YneJ |
| 1941 | 假设的蛋白yneK[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P45711 | 枯草芽孢杆菌 | YneK |
| 1942 | 芽孢外被蛋白M[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q45058 | 枯草芽孢杆菌 | CotM |
| 1943 | ||||
| 1944 | ||||
| 1945 | CitB | |||
| 1946 | YneN蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31820 | 枯草芽孢杆菌 | YneN |
| 1947 | ||||
| 1948 | ||||
| 1949 | 小酸溶性芽孢蛋白tlp[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q45060 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 1950 | YneP[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q45061 | 枯草芽孢杆菌 | YneP |
| 1951 | YneQ[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q45062 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 1952 | 假设的蛋白[蜡状芽孢杆菌] | UniRef100_Q815P1 | 蜡状芽孢杆菌 | |
| 1953 | 保守域蛋白[蜡状芽孢杆菌] | UniRef100_Q72YR7 | 蜡状芽孢杆菌 | |
| 1954 | YneR[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q45063 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 1955 | 假设的UPF0078蛋白yneS[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q45064 | 枯草芽孢杆菌 | YneS |
| 1956 | YneT[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q45065 | 枯草芽孢杆菌 | YneT |
| 1957 | 拓扑异构酶IV亚基B[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q59192 | 枯草芽孢杆菌 | ParE |
| 1958 | 拓扑异构酶IV亚基A[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q45066 | 枯草芽孢杆菌 | ParC |
| 1959 | AraR | |||
| 1960 | 假设的保守蛋白[Oceanobacillusiheyensis] | UniRef100_Q8EMP2 | Oceanobacillusiheyensis | XylB |
| 1961 | L-核酮糖-5-磷酸4-差向异构酶[Oceanobacillus iheyensis] | UniRef100_Q8EMP3 | Oceanobacillusiheyensis | AraD |
| 1962 | L-阿拉伯糖异构酶[Oceanobacillus iheyensis] | UniRef100_Q8EMP4 | Oceanobacillusiheyensis | AraA |
| 1963 | YwtG | |||
| 1964 | FabG | |||
| 1965 | 假设的蛋白ynfC[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q45067 | 枯草芽孢杆菌 | YnfC |
| 1966 | 氨基酸载体蛋白alsT[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q45068 | 枯草芽孢杆菌 | AlsT |
| 1967 | NarI |
| 1968 | NarJ | |||
| 1969 | NarH | |||
| 1970 | NarG | |||
| 1971 | ||||
| 1972 | 假设的蛋白yqfB[乳酸乳球菌] | UniRef100_Q9CF70 | 乳酸乳球菌 | |
| 1973 | AlbA | |||
| 1974 | ArfM | |||
| 1975 | YwiC | |||
| 1976 | 厌氧基因转录调节蛋白[Bacillushalodurans] | UniRef100_Q9KG81 | Bacillushalodurans | Fnr |
| 1977 | 亚硝酸排出蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P46907 | 枯草芽孢杆菌 | NarK |
| 1978 | ||||
| 1979 | CAMP结合域-代谢产物基因激活蛋白和cAMP依赖蛋白激酶调节亚基[腾冲热厌氧杆菌] | UniRef100_Q8R5P4 | 腾冲热厌氧杆菌 | Fnr |
| 1980 | 推测的氧化氮还原酶[金黄色葡萄球菌] | UniRef100_Q6GK48 | 金黄色葡萄球菌 | |
| 1981 | ||||
| 1982 | YngL | |||
| 1983 | BglC | |||
| 1984 | 假设的蛋白ynfE[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q45069 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 1985 | 假设的蛋白[巨大芽孢杆菌] | UniRef100_Q9ZF48 | 巨大芽孢杆菌 | YkkB |
| 1986 | 假设的蛋白[解淀粉芽孢杆菌] | UniRef100_Q70K06 | 解淀粉芽孢杆菌 | |
| 1987 | 烷基氢过氧化物还原酶大亚基[Bacillus halodurans] | UniRef100_Q9Z9W3 | Bacillushalodurans | AhpF |
| 1988 | 甲基转移酶[梅氏甲烷八叠球菌] | UniRef100_Q8PU82 | 梅氏甲烷八叠球菌 | |
| 1989 | 与枯草芽孢杆菌ywgB基因相似[Bacillus halodurans] | UniRef100_Q9Z9W2 | Bacillushalodurans | YwgB |
| 1990 | 假设的蛋白ywoF[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P94576 | 枯草芽孢杆菌 | YwoF |
| 1991 | 支链氨基酸转运系统载体蛋白brnQ[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P94499 | 枯草芽孢杆菌 | BrnQ |
| 1992 | NADP依赖醇脱氢酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O06007 | 枯草芽孢杆菌 | AdhA |
| 1993 | 转录调节蛋白，MerR家族[单核细胞增生利斯特氏菌] | UniRef100_Q721Z3 | 单核细胞增生利斯特氏菌 | YraB |
| 1994 | 类HPr蛋白crh[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O06976 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 1995 | BH2089蛋白[Bacillus halodurans] | UniRef100_Q9Z9R4 | Bacillushalodurans | YddR |
| 1996 | ||||
| 1997 | 烯酰基-辅酶A水合酶/异构酶家族蛋白[蜡状芽孢杆菌] | UniRef100_Q738L0 | 蜡状芽孢杆菌 | YngF |
| 1998 | 假设的蛋白ysiB[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P94549 | 枯草芽孢杆菌 | YsiB |
| 1999 | 甲基丙二酸半醛脱氢酶[蜡状芽孢杆菌ZK] | UniRef100_Q63BL0 | 蜡状芽孢杆菌ZK | MmsA |
| 2000 | 3-羟基异丁酸脱氢酶[蜡状芽孢杆菌ZK] | UniRef100_Q63BL1 | 蜡状芽孢杆菌ZK | YkwC |
| 2001 | 酰基-辅酶A脱氢酶[蜡状芽孢杆菌] | UniRef100_Q81DR7 | 蜡状芽孢杆菌 | YusJ |
| 2002 | 甘露糖-6-磷酸异构酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31646 | 枯草芽孢杆菌 | ManA |
| 2003 | 磷酸转移酶系统(PTS)甘露糖特异性酶IIBCA组分[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31645 | 枯草芽孢杆菌 | ManP |
| 2004 | ||||
| 2005 | ||||
| 2006 | 假设的蛋白[蜡状芽孢杆菌] | UniRef100_Q72YT6 | 蜡状芽孢杆菌 | |
| 2007 | 转录调节蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31644 | 枯草芽孢杆菌 | ManR |
| 2008 | ||||
| 2009 | UPI00003CC220 UniRef100条目 | UniRef100_UPI00003CC220 | YtrB | |
| 2010 | 转录调节蛋白[Bacillushalodurans] | UniRef100_Q9KF35 | Bacillushalodurans | YtrA |
| 2011 | 可能的氧化还原酶[产气荚膜梭菌(Clostridium perfringens)] | UniRef100_Q8Xp17 | 产气荚膜梭菌 | YjmF |
| 2012 | 甘露糖酸脱水酶[产气荚膜梭菌] | UniRef100_Q8XP15 | 产气荚膜梭菌 | UxuA |
| 2013 | 葡萄糖苷酶[Bacillus halodurans] | UniRef100_Q9KEZ5 | Bacillus halodurans | |
| 2014 | C4-二羧酸转运系统[Bacillushalodurans] | UniRef100_Q9KEZ6 | Bacillus halodurans | |
| 2015 | C4-二羧酸转运系统通透酶小蛋白[Oceanobacillus iheyensis] | UniRef100_Q8EMM5 | Oceanobacillus iheyensis | |
| 2016 | C4-二羧酸转运系统[Bacillushalodurans] | UniRef100_Q9KEZ8 | Bacillushalodurans | DctB |
| 2017 | 转录调节蛋白[Oceanobacillusiheyensis] | UniRef100_Q8EL22 | Oceanobacillusiheyensis | CcpA |
| 2018 | 砷酸还原酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P45947 | 枯草芽孢杆菌 | ArsC |
| 2019 | YdfA蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P96678 | 枯草芽孢杆菌 | YdfA |
| 2020 | YdeT蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P96677 | 枯草芽孢杆菌 | YdeT |
| 2021 | YdeI[Bacillus halodurans] | UniRef100_Q9Z9R5 | Bacillushalodurans | YdeI |
| 2022 | 推测的分泌蛋白[天蓝色链霉菌] | UniRef100_Q9S1Z5 | 天蓝色链霉菌 | |
| 2023 | 可能的葡萄糖摄取蛋白glcU[巨大芽孢杆菌] | UniRef100_P40419 | 巨大芽孢杆菌 | GlcU |
| 2024 | YngK蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O35015 | 枯草芽孢杆菌 | YngK |
| 2025 | YngD蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31824 | 枯草芽孢杆菌 | YngD |
| 2026 | 丙酮酸甲酸-裂合酶-激活酶[蜡状芽孢杆菌] | UniRef100_Q73DZ6 | 蜡状芽孢杆菌 | YkvL |
| 2027 | 甲酸乙酰基转移酶[炭疽芽孢杆菌] | UniRef100_Q81YX1 | 炭疽芽孢杆菌 | |
| 2028 | DacC | |||
| 2029 | 类NADH脱氢酶蛋白yjlD[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P80861 | 枯草芽孢杆菌 | YjlD |
| 2030 | 假设的蛋白yjlC[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34633 | 枯草芽孢杆菌 | YjlC |
| 2031 | ||||
| 2032 | 假设的蛋白[蜡状芽孢杆菌] | UniRef100_Q81IJ8 | 蜡状芽孢杆菌 | |
| 2033 | 假设的蛋白ykzH[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31653 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 2034 | 乙酰-辅酶A合成酶[Bacillushalodurans] | UniRef100_Q9KDS4 | Bacillushalodurans | AcsA |
| 2035 | YngE蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31825 | 枯草芽孢杆菌 | YngE |
| 2036 | 羟基丁酰-脱水酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q9L7W1 | 枯草芽孢杆菌 | YngF |
| 2037 | YngG蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34873 | 枯草芽孢杆菌 | YngG |
| 2038 | YngXX[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q9R9I3 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 2039 | YngH[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q9R9I4 | 枯草芽孢杆菌 | YngH |
| 2040 | YngI[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q9R9I5 | 枯草芽孢杆菌 | YngI |
| 2041 | YngJ蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34421 | 枯草芽孢杆菌 | YngJ |
| 2042 | NAD(P)H氧化还原酶YRKL[具核梭杆菌文氏亚种ATCC 49256] | UniRef100_Q7P6P0 | 具核梭杆菌文氏亚种ATCC49256 | YrkL |
| 2043 | 转录调节蛋白，MarR家族[具核梭杆菌] | UniRef100_Q8RE85 | 具核梭杆菌 | |
| 2044 | 谷氨酸-5-半醛脱氢酶[苏云金芽孢杆菌] | UniRef100_Q6HHC2 | 苏云金芽孢杆菌 | ProA |
| 2045 | 谷氨酸5-激酶2[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O07509 | 枯草芽孢杆菌 | ProJ |
| 2046 | 吡咯啉-5-羧酸还原酶1[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P14383 | 枯草芽孢杆菌 | ProH |
| 2047 | UPI00003CB6CD UniRef100条目 | UniRef100_UPI00003CB6CD | YetF | |
| 2048 | 钠依赖磷酸转运蛋白[Bacillushalodurans] | UniRef100_Q9KCT1 | Bacillushalodurans | CysP |
| 2049 | 可能的磷酸腺苷磷酰硫酸还原酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O06737 | 枯草芽孢杆菌 | YitB |
| 2050 | 磷酸磺酸基乳酸(phosphosulfolactate)合酶(EC4.4.1.19)((2R)-磷酸-3-磺酸基乳酸合酶)[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O06739 | 枯草芽孢杆菌 | YitD |
| 2051 | YitE[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O06740 | 枯草芽孢杆菌 | YitE |
| 2052 | YitF[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O06741 | 枯草芽孢杆菌 | YitF |
| 2053 | YitG[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O06742 | 枯草芽孢杆菌 | YitG |
| 2054 | 推测的糖基转移酶ykoT[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34755 | 枯草芽孢杆菌 | YkoT |
| 2055 | YkoR[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34830 | 枯草芽孢杆菌 | YkoS |
| 2056 | 谷氨酸合酶[NADPH]小链[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34399 | NADPH | GltB |
| 2057 | GltA | |||
| 2058 | HTH型转录调节蛋白gltC[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P20668 | 枯草芽孢杆菌 | GltC |
| 2059 | All7121蛋白[鱼腥蓝细菌菌种] | UniRef100_Q8YL17 | 鱼腥蓝细菌菌种 | |
| 2060 | ||||
| 2061 | Lmo0606蛋白[单核细胞增生利斯特氏菌] | UniRef100_Q8Y9C6 | 单核细胞增生利斯特氏菌 | |
| 2062 | ABC转运蛋白ATP结合蛋白[Symbiobacterium thermophilum] | UniRef100_Q67MU2 | Sumbiobacterium thermophilum | YfiB |
| 2063 | ABC转运蛋白ATP结合蛋白[Symbiobacterium thermophilum] | UniRef100_Q67MU3 | Symbiobacterium thermophilum | YfiC |
| 2064 | 细胞色素P450 109[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P27632 | 枯草芽孢杆菌 | YjiB |
| 2065 | 假设的氧化还原酶yoxD[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P14802 | 枯草芽孢杆菌 | YoxD |
| 2066 | Pps | |||
| 2067 | 通透酶，通用底物转运蛋白[苏云金芽孢杆菌] | UniRef100_Q6HMC3 | 苏云金芽孢杆菌 | LmrB |
| 2068 | 推测的甲酸脱氢酶[枯草芽孢杆 | UniRef100_O34323 | 枯草芽孢杆菌 | YoaE |
| 菌] | ||||
| 2069 | 转录调节蛋白[大豆慢生根瘤菌] | UniRef100_Q89KD1 | 大豆慢生根瘤菌 | YcgE |
| 2070 | 药物耐性转运蛋白(Drugresistance transporter)，EmrB/QacA家族[蜡状芽孢杆菌] | UniRef100_Q736I5 | 蜡状芽孢杆菌 | Mdr |
| 2071 | YndE蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31809 | 枯草芽孢杆菌 | YndE |
| 2072 | YndF蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31810 | 枯草芽孢杆菌 | YndF |
| 2073 | YndE | |||
| 2074 | YndE | |||
| 2075 | UPI00003CB22E UniRef100条目 | UniRef100_UPI00003CB22E | YndD | |
| 2076 | ||||
| 2077 | 核苷酸结合蛋白expZ[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39115 | 枯草芽孢杆菌 | ExpZ |
| 2078 | TlpB | |||
| 2079 | CsaA蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P37584 | 枯草芽孢杆菌 | CsaA |
| 2080 | 碱性丝氨酸蛋白酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31788 | 枯草芽孢杆菌 | AprX |
| 2081 | 假设的蛋白[炭疽芽孢杆菌] | UniRef100_Q81SD4 | 炭疽芽孢杆菌 | YnzE |
| 2082 | 转录调节蛋白，TetR家族[蜡状芽孢杆菌ZK] | UniRef100_Q63D70 | 蜡状芽孢杆菌ZK | YrhI |
| 2083 | 推测的HTH型转录调节蛋白yvmB[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P40762 | 枯草芽孢杆菌 | YvmB |
| 2084 | 水解酶[蜡状芽孢杆菌] | UniRef100_Q81D79 | 蜡状芽孢杆菌 | YqeK |
| 2085 | 假设的保守蛋白[Oceanobacillusiheyensis] | UniRef100_Q8ETG3 | Oceanobacillus iheyensis | |
| 2086 | YndJ蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31813 | 枯草芽孢杆菌 | YndJ |
| 2087 | YndH蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31812 | 枯草芽孢杆菌 | YndH |
| 2088 | 假设的蛋白[蜡状芽孢杆菌] | UniRef100_Q73A97 | 蜡状芽孢杆菌 | YndG |
| 2089 | UPI00003CBA97 UniRef100条目 | UniRef100_UPI00003CBA97 | YobS | |
| 2090 | UPI00003CBA98 UniRef100条目 | UniRef100_UPI00003CBA98 | YobT | |
| 2091 | DNA结合蛋白YobU[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34637 | 枯草芽孢杆菌 | YobU |
| 2092 | 假设的蛋白[脆弱拟杆菌] | UniRef100_Q64RP1 | 脆弱拟杆菌 | |
| 2093 | 转录调节蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34920 | 枯草芽孢杆菌 | YobV |
| 2094 | YobW | |||
| 2095 | YozA蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31844 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 2096 | 可能的金属-β-内酰胺酶家族蛋白[蜡状芽孢杆菌ZK] | UniRef100_Q638G1 | 蜡状芽孢杆菌ZK | YmaE |
| 2097 | ||||
| 2098 | YfnA | |||
| 2099 | YocA | |||
| 2100 | UPI00003CBE6E UniRef100条目 | UniRef100_UPI00003CBE6E | YveM | |
| 2101 | 假设的蛋白[蜡状芽孢杆菌] | UniRef100_Q817C2 | 蜡状芽孢杆菌 | |
| 2102 | ||||
| 2103 | 糖基转移酶[Bacillus halodurans] | UniRef100_Q9K7I1 | Bacillushalodurans | YtcC |
| 2104 | YozB蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31845 | 枯草芽孢杆菌 | YozB |
| 2105 | Lmo2079蛋白[单核细胞增生利斯特氏菌] | UniRef100_Q8Y5I3 | 单核细胞增生利斯特氏菌 | |
| 2106 | YocC[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O35042 | 枯草芽孢杆菌 | YocC |
| 2107 | Na+/肌醇共转运蛋白[Bacillushalodurans] | UniRef100_Q9KAR5 | Bacillushalodurans | YcgO |
| 2108 | YocH[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34669 | 枯草芽孢杆菌 | YocH |
| 2109 | RecQ同源物[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34748 | 枯草芽孢杆菌 | YocI |
| 2110 | 假设的蛋白yqbC[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P45919 | 枯草芽孢杆菌 | YqbC |
| 2111 | 假设的蛋白yjfB[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34438 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 2112 | 假设的蛋白yyaQ[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P37507 | 枯草芽孢杆菌 | YyaQ |
| 2113 | 假设的蛋白OB2103[Oceanobacillus iheyensis] | UniRef100_Q8EPJ8 | Oceanobacillus iheyensis | |
| 2114 | ||||
| 2115 | 假设的蛋白yjgD[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34681 | 枯草芽孢杆菌 | YjgD |
| 2116 | YjgC | |||
| 2117 | YjgC | |||
| 2118 | 假设的蛋白OB3361[Oceanobacillus iheyensis] | UniRef100_Q8EL70 | Oceanobacillus iheyensis | |
| 2119 | 假设的蛋白ypfA[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P38491 | 枯草芽孢杆菌 | YpfA |
| 2120 | ||||
| 2121 | ||||
| 2122 | YxiB | |||
| 2123 | ||||
| 2124 | ||||
| 2125 | ||||
| 2126 | YndF | |||
| 2127 | ||||
| 2128 | 假设的蛋白[蜡状芽孢杆菌] | UniRef100_Q816C2 | 蜡状芽孢杆菌 | |
| 2129 | BH0185蛋白[Bacillus halodurans] | UniRef100_Q9KGB9 | Bacillus halodurans | |
| 2130 | ||||
| 2131 | YisY | |||
| 2132 | 假设的蛋白yoqH[噬菌体SPBc2] | UniRef100_O64117 | 噬菌体SPBc2 | YoqH |
| 2133 | ||||
| 2134 | BH0429蛋白[Bacillus halodurans] | UniRef100_Q9KFP9 | Bacillushalodurans | YrhP |
| 2135 | 30S核糖体蛋白S14[Oceanobacillus iheyensis] | UniRef100_Q8ETX0 | Oceanobacillus iheyensis | |
| 2136 | UPI00002DEBB5 UniRef100条目 | UniRef100_UPI00002DEBB5 | MutT | |
| 2137 | 丙酮酸水二激酶[噬乙酸甲烷八叠球菌] | UniRef100_Q8TN35 | 噬乙酸甲烷八叠球菌 | Pps |
| 2138 | 转录调节蛋白[Oceanobacillusiheyensis] | UniRef100_Q8ESJ8 | Oceanobacillusiheyensis | YxbF |
| 2139 | ||||
| 2140 | YndM蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31816 | 枯草芽孢杆菌 | YndM |
| 2141 | 假设的蛋白yisT[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O07939 | 枯草芽孢杆菌 | YisT |
| 2142 | 推测的酰基载体蛋白磷酸二酯酶1[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O35022 | 枯草芽孢杆菌 | YocJ |
| 2143 | 普通应激蛋白16O[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P80872 | 枯草芽孢杆菌 | YocK |
| 2144 | ||||
| 2145 | ||||
| 2146 | 醛脱氢酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34660 | 枯草芽孢杆菌 | DhaS |
| 2147 | YjbB蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31600 | 枯草芽孢杆菌 | YjbB |
| 2148 | 氨基糖苷N6′-乙酰基转移酶[蜡状芽孢杆菌] | UniRef100_Q81AT3 | 蜡状芽孢杆菌 | YjcK |
| 2149 | 杀稻瘟素S脱氨酶，推测的[炭疽芽孢杆菌] | UniRef100_Q81Y61 | 炭疽芽孢杆菌 | |
| 2150 | SqhC | |||
| 2151 | 可能的超氧化物歧化酶[Fe][枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O35023 | Fe | SodF |
| 2152 | 应激响应蛋白yvgO前体[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32211 | 枯草芽孢杆菌 | YvgO |
| 2153 | 推测的转运蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34383 | 枯草芽孢杆菌 | YocR |
| 2154 | 推测的转运蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34524 | 枯草芽孢杆菌 | YocS |
| 2155 | 2-氧戊二酸脱氢酶复合物的二氢硫辛酰赖氨酸-残基琥珀酰转移酶组分[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P16263 | 枯草芽孢杆菌 | OdhB |
| 2156 | 2-氧戊二酸脱氢酶E1组分[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P23129 | 枯草芽孢杆菌 | OdhA |
| 2157 | YojO蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31849 | 枯草芽孢杆菌 | YojO |
| 2158 | YojN蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31850 | 枯草芽孢杆菌 | YojN |
| 2159 | 假设的类超氧化物歧化酶蛋白yojM前体[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31851 | 枯草芽孢杆菌 | YojM |
| 2160 | 假设的蛋白yojL前体[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31852 | 枯草芽孢杆菌 | LytF |
| 2161 | 可能的多药耐性蛋白norM(Na(+)/药物反向转运蛋白)[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31855 | 枯草芽孢杆菌 | YojI |
| 2162 | 假设的蛋白[蜡状芽孢杆菌ZK] | UniRef100_Q637Z8 | 蜡状芽孢杆菌ZK | YojG |
| 2163 | YojF蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31858 | 枯草芽孢杆菌 | YojF |
| 2164 | YojE[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O68260 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 2165 | YojE蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31859 | 枯草芽孢杆菌 | YojE |
| 2166 | 假设的蛋白yozR[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q7WY67 | 枯草芽孢杆菌 | YozR |
| 2167 | YoaJ[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34918 | 枯草芽孢杆菌 | YoaJ |
| 2168 | ||||
| 2169 | UPI00003CBE9B UniRef100条目 | UniRef100_UPI00003CBE9B | YwfD | |
| 2170 | 假设的UPF0087蛋白yodB[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34844 | 枯草芽孢杆菌 | YodB |
| 2171 | 推测的NAD(P)H硝基还原酶12C[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P81102 | 枯草芽孢杆菌 | YodC |
| 2172 | YolF[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34842 | 枯草芽孢杆菌 | YodD |
| 2173 | UPI0000315ACC UniRef100条目 | UniRef100_UPI0000315ACC | ||
| 2174 | YodF蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34745 | 枯草芽孢杆菌 | YodF |
| 2175 | IS1627s1-相关的，转座酶[炭疽芽孢杆菌str.A2012] | UniRef100_Q7CMD0 | 炭疽芽孢杆菌str.A2012 | |
| 2176 | UPI00003CC069 UniRef100条目 | UniRef100_UPI00003CC069 | ||
| 2177 | OrfRM1[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34666 | 枯草芽孢杆菌 | CtpA |
| 2178 | YolB[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34954 | 枯草芽孢杆菌 | YodH |
| 2179 | ||||
| 2180 | 羧肽酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34866 | 枯草芽孢杆菌 | YodJ |
| 2181 | 嘌呤核苷磷酸化酶II[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34925 | 枯草芽孢杆菌 | DeoD |
| 2182 | 假设的跨膜蛋白[蜡状芽孢杆菌] | UniRef100_Q813P0 | 蜡状芽孢杆菌 | YcgR |
| 2183 | YcgQ蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P94394 | 枯草芽孢杆菌 | YcgQ |
| 2184 | ||||
| 2185 | 假设的蛋白yodL[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O30472 | 枯草芽孢杆菌 | YodL |
| 2186 | YodM | |||
| 2187 | 假设的蛋白yozD[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31863 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 2188 | 假设的蛋白yodN[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34414 | 枯草芽孢杆菌 | YodN |
| 2189 | ||||
| 2190 | YokU[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O30470 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 2191 | 假设的UPF0069蛋白yodO[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34676 | 枯草芽孢杆菌 | KamA |
| 2192 | YodP[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34895 | 枯草芽孢杆菌 | YodP |
| 2193 | 乙酰鸟氨酸脱乙酰基酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34984 | 枯草芽孢杆菌 | YodQ |
| 2194 | 丁酸(butirate)-乙酰乙酸辅酶A转移酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34466 | 枯草芽孢杆菌 | YodR |
| 2195 | 丁酸乙酰乙酸-辅酶A转移酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34317 | 枯草芽孢杆菌 | YodS |
| 2196 | 可能的氨基转移酶yodT[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34662 | 枯草芽孢杆菌 | YodT |
| 2197 | 多药耐性蛋白；可能的四环素抗性决定子[苏云金芽孢杆菌] | UniRef100_Q6HK46 | 苏云金芽孢杆菌 | YkuC |
| 2198 | 蛋白cgeE[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P42093 | 枯草芽孢杆菌 | CgeE |
| 2199 | 肽甲硫氨酸亚砜还原酶msrB[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54155 | 枯草芽孢杆菌 | YppQ |
| 2200 | MsrA | |||
| 2201 | 推测的HTH型转录调节蛋白ypoP[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54182 | 枯草芽孢杆菌 | Ypop |
| 2202 | ||||
| 2203 | 假设的蛋白yhcK[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54595 | 枯草芽孢杆菌 | YhcK |
| 2204 | 假设的蛋白ypnP[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54181 | 枯草芽孢杆菌 | YpnP |
| 2205 | 假设的保守蛋白[嗜热栖热菌(Thermus thermophilus)] | UniRef100_Q746K9 | 嗜热栖热菌 | |
| 2206 | ||||
| 2207 | 假设的蛋白ypmS[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54179 | 枯草芽孢杆菌 | YpmS |
| 2208 | 假设的蛋白ypmR[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P40766 | 枯草芽孢杆菌 | YpmR |
| 2209 | 假设的蛋白ypmQ[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54178 | 枯草芽孢杆菌 | YpmQ |
| 2210 | DegV家族蛋白[蜡状芽孢杆菌ZK] | UniRef100_Q63BU6 | 蜡状芽孢杆菌ZK | YviA |
| 2211 | 假设的蛋白ypmP[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54177 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 2212 | 苏氨酸脱水酶生物合成[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P37946 | 枯草芽孢杆菌 | IlvA |
| 2213 | 推测的σL依赖转录调节蛋白yplP[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54156 | 枯草芽孢杆菌 | YplP |
| 2214 | 溶血素III同源物[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54175 | 枯草芽孢杆菌 | YplQ |
| 2215 | 假设的蛋白ypkP[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54174 | 枯草芽孢杆菌 | YpkP |
| 2216 | 二氢叶酸还原酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P11045 | 枯草芽孢杆菌 | DfrA |
| 2217 | 假设的蛋白ypjQ[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54173 | 枯草芽孢杆菌 | YpjQ |
| 2218 | YpjP | |||
| 2219 | YpiP | |||
| 2220 | 假设的蛋白yphP[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54170 | 枯草芽孢杆菌 | YphP |
| 2221 | 二羟基酸脱水酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P51785 | 枯草芽孢杆菌 | IlvD |
| 2222 | YpgR | |||
| 2223 | 假设的蛋白ypgQ[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54168 | 枯草芽孢杆菌 | YpgQ |
| 2224 | 谷胱甘肽过氧化物酶同源物bsaA[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P52035 | 枯草芽孢杆菌 | BsaA |
| 2225 | UPI00003CBA0F UniRef100条目 | UniRef100_UPI00003CBA0F | ||
| 2226 | 高丝氨酸O-琥珀酰转移酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54167 | 枯草芽孢杆菌 | MetA |
| 2227 | 推测的糖基转移酶ypfP[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54166 | 枯草芽孢杆菌 | UgtP |
| 2228 | ||||
| 2229 | 冷休克蛋白cspD[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P51777 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 2230 | 调节蛋白degR[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P06563 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 2231 | 假设的蛋白ypzA[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32007 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 2232 | ||||
| 2233 | 假设的蛋白ypeP[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54164 | 枯草芽孢杆菌 | YpeP |
| 2234 | 假设的蛋白ypdP[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54163 | 枯草芽孢杆菌 | YpdP |
| 2235 | 14.7kDa类核糖核酸酶H蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54162 | 枯草芽孢杆菌 | YpdQ |
| 2236 | 可能的5′-3′外切核酸酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54161 | 枯草芽孢杆菌 | YpcP |
| 2237 | ||||
| 2238 | 假设的蛋白ypbS[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54160 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 2239 | 假设的蛋白ypbR[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54159 | 枯草芽孢杆菌 | YpbR |
| 2240 | ||||
| 2241 | 假设的蛋白ypbQ[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54158 | 枯草芽孢杆菌 | YpbQ |
| 2242 | BcsA | |||
| 2243 | 预测的乙酰基转移酶[丙酮丁醇梭菌] | UniRef100_Q97G03 | 丙酮丁醇梭菌 | YokL |
| 2244 | 黄嘌呤通透酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P42086 | 枯草芽孢杆菌 | PbuX |
| 2245 | 黄嘌呤磷酸核糖转移酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P42085 | 枯草芽孢杆菌 | Xpt |
| 2246 | 假设的金属蛋白酶ypwA[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P50848 | 枯草芽孢杆菌 | YpwA |
| 2247 | YpvA | |||
| 2248 | 假设的蛋白yptA前体[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P50841 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 2249 | ||||
| 2250 | 假设的UPF0020蛋白ypsC前体[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P50840 | 枯草芽孢杆菌 | YpsC |
| 2251 | 假设的蛋白ypsB[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P50839 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 2252 | 假设的蛋白ypsA[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P50838 | 枯草芽孢杆菌 | YpsA |
| 2253 | 芽孢外被蛋白D[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P07791 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 2254 | ||||
| 2255 | YprB | |||
| 2256 | YprA | |||
| 2257 | 推测的PTS系统IIA组分ypqE[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P50829 | 枯草芽孢杆菌 | YpqE |
| 2258 | 假设的蛋白ypqA前体[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P50836 | 枯草芽孢杆菌 | YpqA |
| 2259 | 假设的蛋白yppG[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P50835 | 枯草芽孢杆菌 | YppG |
| 2260 | ||||
| 2261 | YppE | |||
| 2262 | ||||
| 2263 | ||||
| 2264 | 假设的蛋白yppC[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39791 | 枯草芽孢杆菌 | YppC |
| 2265 | 重组蛋白U[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39792 | 枯草芽孢杆菌 | RecU |
| 2266 | 青霉素结合蛋白1A/1B(PBP1)[包括：青霉素非敏感转糖基酶(EC 2.4.2.-)(肽聚糖TG酶)；青霉素敏感转肽酶(EC 3.4.-.-)(DD-转肽酶)][枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39793 | 包括：青霉素非敏感转糖基酶(EC 2.4.2.-)(肽聚糖TG酶)；青霉素敏感转肽酶(EC3.4.-.-)(DD-转肽酶) | PonA |
| 2267 | 假设的蛋白ypoC[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39789 | 枯草芽孢杆菌 | YpoC |
| 2268 | 可能的内切核酸酶III(EC4.2.99.18)(DNA-(非嘌呤或非嘧啶位点)裂合酶)[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39788 | 枯草芽孢杆菌 | Nth |
| 2269 | DNA复制蛋白dnaD[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39787 | 枯草芽孢杆菌 | DnaD |
| 2270 | 天冬酰胺酰-tRNA合成酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39772 | 枯草芽孢杆菌 | AsnS |
| 2271 | 天冬氨酸氨基转移酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P53001 | 枯草芽孢杆菌 | AspB |
| 2272 | 假设的蛋白ypmB[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54396 | 枯草芽孢杆菌 | YpmB |
| 2273 | 假设的蛋白ypmA[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54395 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 2274 | 可能的ATP依赖解旋酶dinG同源物[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54394 | 枯草芽孢杆菌 | DinG |
| 2275 | 天冬氨酸1-脱羧酶前体[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P52999 | 枯草芽孢杆菌 | PanD |
| 2276 | 泛解酸--β-丙氨酸连接酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P52998 | 枯草芽孢杆菌 | PanC |
| 2277 | 3-甲基-2-氧丁酸羟甲基转移酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P52996 | 枯草芽孢杆菌 | PanB |
| 2278 | BirA双功能蛋白[包括：生物素操纵子阻抑蛋白；生物素--[乙酰-辅酶A-羧化酶]合成酶(EC6.3.4.15)(生物素--蛋白连接酶)][枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P42975 | 包括：生物素操纵子 阻抑蛋白；生物素-- | BirA |
| 2279 | Poly(A)聚合酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P42977 | 枯草芽孢杆菌 | Cca |
| 2280 | 推测的糖基转移酶ypjH[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P42982 | 枯草芽孢杆菌 | YpjH |
| 2281 | 假设的蛋白ypjG[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P42981 | 枯草芽孢杆菌 | YpjG |
| 2282 | 甲基乙二醛合酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P42980 | 枯草芽孢杆菌 | MgsA |
| 2283 | 二氢吡啶二羧酸还原酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P42976 | 枯草芽孢杆菌 | DapB |
| 2284 | 假设的蛋白ypjD[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P42979 | 枯草芽孢杆菌 | YpjD |
| 2285 | YpjC | |||
| 2286 | 假设的蛋白ypjB前体[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54393 | 枯草芽孢杆菌 | YpjB |
| 2287 | YpjA | |||
| 2288 | QcrC | |||
| 2289 | 甲基萘醌醇(menaquinol)-细胞色素c还原酶细胞色素b亚基[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P46912 | 枯草芽孢杆菌 | QcrB |
| 2290 | 甲基萘醌醇-细胞色素c还原酶铁-硫亚基[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P46911 | 枯草芽孢杆菌 | QcrA |
| 2291 | 假设的蛋白ypiF[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54391 | 枯草芽孢杆菌 | YpiF |
| 2292 | 假设的UPF0302蛋白ypiB[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54390 | 枯草芽孢杆菌 | YpiB |
| 2293 | 假设的蛋白ypiA[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54389 | 枯草芽孢杆菌 | YpiA |
| 2294 | 3-磷酸莽草酸1-羧乙烯基转移酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P20691 | 枯草芽孢杆菌 | AroE |
| 2295 | 预苯酸脱氢酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P20692 | 枯草芽孢杆菌 | TyrA |
| 2296 | HisC | |||
| 2297 | 色氨酸合酶α链[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P07601 | 枯草芽孢杆菌 | TrpA |
| 2298 | 色氨酸合酶β链[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P07600 | 枯草芽孢杆菌 | TrpB |
| 2299 | N-(5′-磷酸核糖)邻氨基苯甲酸异构酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P20167 | 枯草芽孢杆菌 | TrpF |
| 2300 | 吲哚-3-甘油磷酸合酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P03964 | 枯草芽孢杆菌 | TrpC |
| 2301 | 邻氨基苯甲酸磷酸核糖转移酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P03947 | 枯草芽孢杆菌 | TrpD |
| 2302 | 邻氨基苯甲酸合酶组分I[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P03963 | 枯草芽孢杆菌 | TrpE |
| 2303 | 分支酸变位酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P19080 | 枯草芽孢杆菌 | AroH |
| 2304 | 3-脱氢奎宁酸合酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P31102 | 枯草芽孢杆菌 | AroB |
| 2305 | 分支酸合酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P31104 | 枯草芽孢杆菌 | AroF |
| 2306 | 趋化蛋白甲基转移酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P31105 | 枯草芽孢杆菌 | CheR |
| 2307 | 核苷二磷酸激酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P31103 | 枯草芽孢杆菌 | Ndk |
| 2308 | 七异戊二烯基二磷酸合酶组分II[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P31114 | 枯草芽孢杆菌 | HepT |
| 2309 | 甲基萘醌生物合成甲基转移酶ubiE[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P31113 | 枯草芽孢杆菌 | MenH |
| 2310 | 七异戊二烯基二磷酸合酶组分I[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P31112 | 枯草芽孢杆菌 | HepS |
| 2311 | 转录衰减蛋白mtrB[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P19466 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 2312 | GTP环化水解酶I[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P19465 | 枯草芽孢杆菌 | MtrA |
| 2313 | DNA结合蛋白HU 1[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P08821 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 2314 | 阶段IV芽孢形成蛋白A[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P35149 | 枯草芽孢杆菌 | SpoIVA |
| 2315 | 假设的蛋白yphF[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39911 | 枯草芽孢杆菌 | YphF |
| 2316 | 假设的蛋白yphE[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P50744 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 2317 | 甘油-3-磷酸脱氢酶[NAD(P)+](EC 1.1.1.94)(NAD(P)H-依赖甘油-3-磷酸脱氢酶)(NAD(P)H依赖二羟丙酮-磷酸还原酶)[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P46919 | NAD(P)+ | GpsA |
| 2318 | YphC | |||
| 2319 | 假设的蛋白OB1798[Oceanobacillus iheyensis] | UniRef100_Q8EQA7 | Oceanobacillus iheyensis | |
| 2320 | 假设的蛋白yphB[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P50742 | 枯草芽孢杆菌 | SeaA |
| 2321 | 假设的蛋白yphA[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P50741 | 枯草芽孢杆菌 | YphA |
| 2322 | ||||
| 2323 | YpgA | |||
| 2324 | 30S核糖体蛋白S1同源物[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P38494 | 枯草芽孢杆菌 | YpfD |
| 2325 | 胞苷酸激酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P38493 | 枯草芽孢杆菌 | Cmk |
| 2326 | 假设的蛋白ypfB[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P38492 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 2327 | 芽孢形成蛋白ypeB[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P38490 | 枯草芽孢杆菌 | YpeB |
| 2328 | 芽孢皮层-裂解酶前体[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P50739 | 枯草芽孢杆菌 | SleB |
| 2329 | YpdC | |||
| 2330 | YccC | |||
| 2331 | 假设的蛋白ypdA[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P50736 | 枯草芽孢杆菌 | YpdA |
| 2332 | NAD特异性谷氨酸脱氢酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P50735 | 枯草芽孢杆菌 | GudB |
| 2333 | 接合蛋白mecA 2[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P50734 | 枯草芽孢杆菌 | YpbH |
| 2334 | 假设的蛋白ypbG前体[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P50733 | 枯草芽孢杆菌 | YpbG |
| 2335 | YpbF | |||
| 2336 | 假设的蛋白ypbE[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P50731 | 枯草芽孢杆菌 | YpbE |
| 2337 | 假设的蛋白ypbD[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P50730 | 枯草芽孢杆菌 | YpbD |
| 2338 | ATP依赖DNA解旋酶recQ[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P50729 | 枯草芽孢杆菌 | RecQ |
| 2339 | 假设的蛋白ypbB[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P50728 | 枯草芽孢杆菌 | YpbB |
| 2340 | 铁氧还蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P50727 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 2341 | 假设的蛋白ypaA[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P50726 | 枯草芽孢杆菌 | YpaA |
| 2342 | ||||
| 2343 | D-3-磷酸甘油酸脱氢酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P35136 | 枯草芽孢杆菌 | SerA |
| 2344 | BH 1600蛋白[Bacillus halodurans] | UniRef100_Q9KCH1 | Bacillus halodurans | |
| 2345 | σ-X负效应物[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P35166 | 枯草芽孢杆菌 | RsiX |
| 2346 | RNA聚合酶σ因子sigX[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P35165 | 枯草芽孢杆菌 | SigX |
| 2347 | 转录调节蛋白[蜡状芽孢杆菌] | UniRef100_Q72XJ3 | 蜡状芽孢杆菌 | LytR |
| 2348 | 内切-1，4-β-木聚糖酶[Bacillushalodurans] | UniRef100_Q9K630 | Bacillushalodurans | YheN |
| 2349 | ||||
| 2350 | 碱性磷酸酶合成传感蛋白phoR[破伤风梭菌] | UniRef100_Q898N3 | 破伤风梭菌 | YclK |
| 2351 | 响应调节蛋白，由类CheY受体域和HTH DNA-结合域构成[腾冲热厌氧杆菌] | UniRef100_Q8R9H7 | 腾冲热厌氧杆菌 | YycF |
| 2352 | 传感蛋白resE[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P35164 | 枯草芽孢杆菌 | ResE |
| 2353 | 转录调节蛋白resD[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P35163 | 枯草芽孢杆菌 | ResD |
| 2354 | 蛋白resC[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P35162 | 枯草芽孢杆菌 | ResC |
| 2355 | ResB蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P35161 | 枯草芽孢杆菌 | ResB |
| 2356 | 巯基-二硫键氧化还原酶resA[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P35160 | 枯草芽孢杆菌 | ResA |
| 2357 | 核糖体大亚基假尿苷合酶B[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P35159 | 枯草芽孢杆菌 | RluB |
| 2358 | 芽孢成熟蛋白B[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P35158 | 枯草芽孢杆菌 | SpmB |
| 2359 | 芽孢成熟蛋白A[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P35157 | 枯草芽孢杆菌 | SpmA |
| 2360 | 青霉素结合蛋白5*前体[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P35150 | 枯草芽孢杆菌 | DacB |
| 2361 | 假设的蛋白ypuI[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P35156 | 枯草芽孢杆菌 | YpuI |
| 2362 | 分离和凝聚蛋白(Segregation andcondensation protein)B[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P35155 | 枯草芽孢杆菌 | YpuH |
| 2363 | 分离和凝聚蛋白A[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P35154 | 枯草芽孢杆菌 | YpuG |
| 2364 | ||||
| 2365 | 假设的蛋白ypuF[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P17617 | 枯草芽孢杆菌 | YpuF |
| 2366 | RibT蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P17622 | 枯草芽孢杆菌 | RibT |
| 2367 | 6，7-二甲基-8-核糖醇基(ribityl)-2，4-二氧四氢蝶啶合酶[解淀粉芽孢杆菌] | UniRef100_Q44681 | 解淀粉芽孢杆菌 | RibH |
| 2368 | 核黄素生物合成蛋白ribA[包括：GTP环化水解酶II(EC 3.5.4.25)；3，4-二羟基-2-丁酮4-磷酸合酶(DHBP合酶)][枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P17620 | 包括：GTP环化水解酶II(EC 3.5.4.25)；3，4-二羟基-2-丁酮4-磷酸合酶(DHBP合酶) | RibA |
| 2369 | 核黄素合酶α链[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P16440 | 枯草芽孢杆菌 | RibE |
| 2370 | 核黄素生物合成蛋白ribD[包括：二氨基羟基磷酸核糖氨基嘧啶脱氨酶(EC 3.5.4.26)(核黄素特异性脱氨酶)；5-氨基-6-(5-磷酸核糖氨基)尿嘧啶还原酶(EC1.1.1.193)(HTP还原酶)][枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P17618 | 包括：二氨基羟基磷酸核糖氨基嘧啶脱氨酶(EC 3.5.4.26)(核黄素特异性脱氨酶)；5-氨基-6-(5-磷酸核糖氨基)尿嘧啶还原酶(EC | RibD |
| 1.1.1.193)(HTP还原酶) | ||||
| 2371 | 假设的蛋白ypuD[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P17616 | 枯草芽孢杆菌 | YpuD |
| 2372 | 推测的丝氨酸/苏氨酸蛋白磷酸酶[肝螺杆菌(Helicobacterhepaticus)] | UniRef100_Q7VFC1 | 肝螺杆菌 | YjbP |
| 2373 | 应激响应同源物Hsp[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q9X3Z5 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 2374 | 应答调节蛋白天冬氨酸磷酸酶A[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q00828 | 枯草芽孢杆菌 | RapA |
| 2375 | 肽酰-脯氨酰顺反异构酶B[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P35137 | 枯草芽孢杆菌 | PpiB |
| 2376 | YpuA | |||
| 2377 | IS1627s1-相关，转座酶[炭疽芽孢杆菌A2012菌株] | UniRef100_Q7CMD0 | 炭疽芽孢杆菌A2012株 | |
| 2378 | UPI00003CC069 UniRef100条目 | UniRef100_UPI00003CC069 | ||
| 2379 | YndL | |||
| 2380 | 二氨基庚二酸脱羧酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P23630 | 枯草芽孢杆菌 | LysA |
| 2381 | ||||
| 2382 | 阶段V芽孢形成蛋白AF[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P31845 | 枯草芽孢杆菌 | SpoVAF |
| 2383 | 阶段V芽孢形成蛋白AE[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P40870 | 枯草芽孢杆菌 | SpoVAE |
| 2384 | 阶段V芽孢形成蛋白AE[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P40870 | 枯草芽孢杆菌 | SpoVAE |
| 2385 | 阶段V芽孢形成蛋白AD[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P40869 | 枯草芽孢杆菌 | SpoVAD |
| 2386 | SpoVAC | |||
| 2387 | 阶段V芽孢形成蛋白AB[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P40867 | 枯草芽孢杆菌 | SpoVAB |
| 2388 | 阶段V芽孢形成蛋白AA[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P40866 | 枯草芽孢杆菌 | SpoVAA |
| 2389 | SigF | |||
| 2390 | SpoIIAB | |||
| 2391 | SpoIIAA | |||
| 2392 | 青霉素结合蛋白dacF前体[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P38422 | 枯草芽孢杆菌 | DacF |
| 2393 | 嘌呤核苷磷酸化酶I[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P46354 | 枯草芽孢杆菌 | PunA |
| 2394 | 磷酸戊糖变位酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P46353 | 枯草芽孢杆菌 | Drm |
| 2395 | 酪氨酸重组酶xerD[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P46352 | 枯草芽孢杆菌 | RipX |
| 2396 | ||||
| 2397 | 铁摄取调节蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54574 | 枯草芽孢杆菌 | Fur |
| 2398 | 阶段II芽孢形成蛋白M[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P37873 | 枯草芽孢杆菌 | SpoIIM |
| 2399 | Lmo2763蛋白[单核细胞增生利斯特氏菌] | UniRef100_Q926Y4 | 单核细胞增生利斯特氏菌 | YdhO |
| 2400 | UPI00003CA2F1 UniRef100条目 | UniRef100_UPI00003CA2F1 | ||
| 2401 | 可能的尿囊素通透酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P94575 | 枯草芽孢杆菌 | YwoE |
| 2402 | YdaF | |||
| 2403 | 假设的蛋白yqkK[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54573 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 2404 | YybD | |||
| 2405 | 假设的蛋白[短小芽孢杆菌] | UniRef100_Q93PN4 | 短小芽孢杆菌 | YqxK |
| 2406 | ADP-核糖焦磷酸酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54570 | 枯草芽孢杆菌 | NudF |
| 2407 | ||||
| 2408 | YdgC蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P96701 | 枯草芽孢杆菌 | YdgC |
| 2409 | 假设的蛋白ydgD[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P96702 | 枯草芽孢杆菌 | YdgD |
| 2410 | 假设的氧化还原酶yqkF[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54569 | 枯草芽孢杆菌 | YqkF |
| 2411 | ||||
| 2412 | YqkD | |||
| 2413 | 假设的蛋白yqkC[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54566 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 2414 | 假设的蛋白yqkB[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54565 | 枯草芽孢杆菌 | YqkB |
| 2415 | UPI00003CBE2B UniRef100条目 | UniRef100_UPI00003CBE2B | ||
| 2416 | 假设的UPF0157蛋白yqkA[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54564 | 枯草芽孢杆菌 | YqkA |
| 2417 | 假设的蛋白yqjZ[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54563 | 枯草芽孢杆菌 | YqjZ |
| 2418 | 脂肪酶前体[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P37957 | 枯草芽孢杆菌 | Lip |
| 2419 | ||||
| 2420 | 镍ABC转运蛋白[Bacillushalodurans] | UniRef100_Q9KBX8 | Bacillushalodurans | AppA |
| 2421 | 镍ABC转运蛋白[Bacillushalodurans] | UniRef100_Q9KBX7 | Bacillushalodurans | AppB |
| 2422 | 镍ABC转运蛋白[Bacillushalodurans] | UniRef100_Q9KBX6 | Bacillushalodurans | AppC |
| 2423 | 推测的寡肽ABC转运蛋白[破伤风梭菌] | UniRef100_Q895A4 | 破伤风梭菌 | DppD |
| 2424 | 推测的寡肽ABC转运蛋白[破伤风梭菌] | UniRef100_Q895A5 | 破伤风梭菌 | OppF |
| 2425 | DNA-损伤诱导蛋白[Bacillushalodurans] | UniRef100_Q9KDR1 | Bacillushalodurans | YojI |
| 2426 | 纤连蛋白结合蛋白[蜡状芽孢杆菌ZK] | UniRef100_Q63CW1 | 蜡状芽孢杆菌ZK | |
| 2427 | 假设的蛋白yolD[噬菌体SPBc2] | UniRef100_O64030 | 噬菌体SPBc2 | YolD |
| 2428 | UvrX | |||
| 2429 | 假设的蛋白yqzH[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32014 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 2430 | 假设的转运蛋白yqjV[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54559 | 枯草芽孢杆菌 | YqjV |
| 2431 | 假设的蛋白yqjT[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54557 | 枯草芽孢杆菌 | YqjT |
| 2432 | CoaA | |||
| 2433 | LacG[乳酸乳球菌] | UniRef100_Q9RAU9 | 乳酸乳球菌 | |
| 2434 | LacF[乳酸乳球菌] | UniRef100_Q9RAV2 | 乳酸乳球菌 | YdbJ |
| 2435 | ||||
| 2436 | 假设的蛋白[解淀粉芽孢杆菌] | UniRef100_Q70K07 | 解淀粉芽孢杆菌 | |
| 2437 | 假设的蛋白[蜡状芽孢杆菌] | UniRef100_Q737G3 | 蜡状芽孢杆菌 | |
| 2438 | YmaC蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31789 | 枯草芽孢杆菌 | YmaC |
| 2439 | 假设的氧化还原酶yqjQ[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54554 | 枯草芽孢杆菌 | YqjQ |
| 2440 | YqjP | |||
| 2441 | ProI | |||
| 2442 | 假设的蛋白yqjN[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54551 | 枯草芽孢杆菌 | YqjN |
| 2443 | 可能的NADH依赖黄素氧化还原酶yqjM[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54550 | 枯草芽孢杆菌 | YqjM |
| 2444 | 假设的蛋白yqjL[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54549 | 枯草芽孢杆菌 | YqjL |
| 2445 | ||||
| 2446 | 核糖核酸酶Z[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54548 | 枯草芽孢杆菌 | YqjK |
| 2447 | 葡萄糖-6-磷酸1-脱氢酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54547 | 枯草芽孢杆菌 | Zwf |
| 2448 | 假设的保守蛋白[Oceanobacillusiheyensis] | UniRef100_Q8ELZ9 | Oceanobacillusiheyensis | CitH |
| 2449 | 假设的蛋白OB3065[Oceanobacillus iheyensis] | UniRef100_Q8ELZ8 | Oceanobacillus iheyensis | |
| 2450 | 免疫原性蛋白[Oceanobacillusiheyensis] | UniRef100_Q8ELZ7 | Oceanobacillusiheyensis | SsuA |
| 2451 | YdhQ蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O05509 | 枯草芽孢杆菌 | YdhQ |
| 2452 | β-葡萄糖苷酶[Bacillushalodurans] | UniRef100_Q9K615 | Bacillushalodurans | YdhP |
| 2453 | 推测的纤维二糖酶特异性酶IIC[短小芽孢杆菌] | UniRef100_Q8KP28 | 短小芽孢杆菌 | YdhO |
| 2454 | YdhO蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O05507 | 枯草芽孢杆菌 | YdhO |
| 2455 | YdhN蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O05506 | 枯草芽孢杆菌 | YdhN |
| 2456 | PTS系统，纤维二糖酶特异性酶II，B组分[Bacillus halodurans] | UniRef100_Q9K613 | Bacillus halodurans | |
| 2457 | 碱性磷酸酶[蜡状芽孢杆菌ZK] | UniRef100_Q639W1 | 蜡状芽孢杆菌ZK | PhoB |
| 2458 | 葡萄糖1-脱氢酶A[巨大芽孢杆菌] | UniRef100_P10528 | 巨大芽孢杆菌 | Gdh |
| 2459 | 6-磷酸葡萄糖酸脱氢酶，脱羧的II[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P80859 | 枯草芽孢杆菌 | YqjI |
| 2460 | DNA聚合酶IV 1[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54545 | 枯草芽孢杆菌 | YqjH |
| 2461 | 假设的蛋白yqzJ[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q7WY64 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 2462 | YqjG | |||
| 2463 | 假设的蛋白yqjE[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54542 | 枯草芽孢杆菌 | YqjE |
| 2464 | 甲基丙二酰-辅酶A脱羧酶α亚基[Bacillus halodurans] | UniRef100_Q9K8P6 | Bacillushalodurans | YqjD |
| 2465 | 假设的蛋白yqjA[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54538 | 枯草芽孢杆菌 | YqjA |
| 2466 | 可能的氨基酸ABC转运蛋白ATP结合蛋白yqiZ[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54537 | 枯草芽孢杆菌 | YqiZ |
| 2467 | 可能的氨基酸ABC转运蛋白通透酶蛋白yqiY[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54536 | 枯草芽孢杆菌 | YqiY |
| 2468 | 可能的氨基酸ABC转运蛋白胞外结合蛋白yqiX前体[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54535 | 枯草芽孢杆菌 | YqiX |
| 2469 | 假设的蛋白yqiW[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54534 | 枯草芽孢杆菌 | YqiW |
| 2470 | 蛋白bmrU[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39074 | 枯草芽孢杆菌 | BmrU |
| 2471 | 支链α-酮酸脱氢酶复合物的硫辛酰胺酰基转移酶组分(EC2.3.1.168)(二氢硫辛酰赖氨酸-残基(2-甲基丙酰基)转移酶)[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P37942 | 枯草芽孢杆菌 | BkdB |
| 2472 | 2-氧异戊酸脱氢酶β亚基[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P37941 | 枯草芽孢杆菌 | BkdAB |
| 2473 | 2-氧异戊酸脱氢酶α亚基[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P37940 | 枯草芽孢杆菌 | BkdAA |
| 2474 | 二氢硫辛酰脱氢酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54533 | 枯草芽孢杆菌 | LpdV |
| 2475 | 可能的丁酸激酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54532 | 枯草芽孢杆菌 | Buk |
| 2476 | 亮氨酸脱氢酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54531 | 枯草芽孢杆菌 | Bcd |
| 2477 | 可能的磷酸丁酰转移酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54530 | 枯草芽孢杆菌 | Ptb |
| 2478 | 推测的σL依赖转录调节蛋白yqiR[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54529 | 枯草芽孢杆菌 | BkdR |
| 2479 | 假设的蛋白yqzF[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32015 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 2480 | 假设的蛋白yqiK[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54527 | 枯草芽孢杆菌 | YqiK |
| 2481 | 假设的蛋白yqiI[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54525 | 枯草芽孢杆菌 | YqiI |
| 2482 | YqiH | |||
| 2483 | 丝氨酸O-乙酰基转移酶[梅氏甲烷八叠球菌] | UniRef100_Q8PSY4 | 梅氏甲烷八叠球菌 | CysE |
| 2484 | ||||
| 2485 | 阶段0芽孢形成蛋白A[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P06534 | 枯草芽孢杆菌 | Spo0A |
| 2486 | SpoIVB | |||
| 2487 | DNA修复蛋白recN[解淀粉芽孢杆菌] | UniRef100_Q659H4 | 解淀粉芽孢杆菌 | RecN |
| 2488 | 精氨酸阻抑蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P17893 | 枯草芽孢杆菌 | AhrC |
| 2489 | 假设的蛋白yqxC[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P19672 | 枯草芽孢杆菌 | YqxC |
| 2490 | Dxs | |||
| 2491 | 牻牛儿基转移酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54383 | 枯草芽孢杆菌 | YqiD |
| 2492 | 可能的外切脱氧核糖核酸酶VII小亚基[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54522 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 2493 | 可能的外切脱氧核糖核酸酶VII大亚基[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54521 | 枯草芽孢杆菌 | YqiB |
| 2494 | FolD双功能蛋白[包括：亚甲基四氢叶酸脱氢酶(EC 1.5.1.5)；次甲基四氢叶酸环化水解酶(EC3.5.4.9)][枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54382 | 包括：亚甲基四氢叶酸脱氢酶(EC 1.5.1.5)；次甲基四氢叶酸环化水解酶(EC 3.5.4.9) | FolD |
| 2495 | N利用物质蛋白B同源物[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54520 | 枯草芽孢杆菌 | NusB |
| 2496 | 假设的蛋白yqhY[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54519 | 枯草芽孢杆菌 | YqhY |
| 2497 | AccC | |||
| 2498 | 乙酰-辅酶A羧化酶的生物素羧基载体蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P49786 | 枯草芽孢杆菌 | AccB |
| 2499 | 阶段III芽孢形成蛋白AH[枯草 | UniRef100_P49785 | 枯草芽孢杆菌 | SpoIIIAH |
| 芽孢杆菌] | ||||
| 2500 | 阶段III芽孢形成蛋白AG[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P49784 | 枯草芽孢杆菌 | SpoIIIAG |
| 2501 | 阶段III芽孢形成蛋白AF[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P49783 | 枯草芽孢杆菌 | SpoIIIAF |
| 2502 | 阶段III芽孢形成蛋白AE[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P49782 | 枯草芽孢杆菌 | SpoIIIAE |
| 2503 | 阶段III芽孢形成蛋白AD[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P49781 | 枯草芽孢杆菌 | SpoIIIAD |
| 2504 | 阶段III芽孢形成蛋白AC[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P49780 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 2505 | 阶段III芽孢形成蛋白AB[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q01368 | 枯草芽孢杆菌 | SpoIIIAB |
| 2506 | SpoIIIAA | |||
| 2507 | 假设的蛋白yqhV[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P49779 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 2508 | 延伸因子P[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P49778 | 枯草芽孢杆菌 | Efp |
| 2509 | 推测的肽酶yqhT[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54518 | 枯草芽孢杆菌 | YqhT |
| 2510 | 3-脱氢奎尼酸脱水酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54517 | 枯草芽孢杆菌 | YqhS |
| 2511 | 假设的蛋白yqhR[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54516 | 枯草芽孢杆菌 | YqhR |
| 2512 | 假设的蛋白yqhQ[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54515 | 枯草芽孢杆菌 | YqhQ |
| 2513 | 假设的蛋白yqhP[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54514 | 枯草芽孢杆菌 | YqhP |
| 2514 | 假设的蛋白yqhO[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54513 | 枯草芽孢杆菌 | YqhO |
| 2515 | 转录调节蛋白mntR[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54512 | 枯草芽孢杆菌 | MntR |
| 2516 | 假设的蛋白yqhM[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54511 | 枯草芽孢杆菌 | YqhM |
| 2517 | 假设的蛋白yqhL[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54510 | 枯草芽孢杆菌 | YqhL |
| 2518 | 甘氨酸甜菜碱结合蛋白前体[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P46922 | 枯草芽孢杆菌 | OpuAC |
| 2519 | 甘氨酸甜菜碱转运系统通透酶蛋白opuAB[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P46921 | 枯草芽孢杆菌 | OpuAB |
| 2520 | 甘氨酸甜菜碱转运ATP结合蛋白opuAA[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P46920 | 枯草芽孢杆菌 | OpuAA |
| 2521 | 可能的甘氨酸脱氢酶[脱羧的]亚基2[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54377 | 脱羧的 | GcvPB |
| 2522 | 可能的甘氨酸脱氢酶[脱羧的]亚基1[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54376 | 脱羧的 | GcvPA |
| 2523 | 氨基甲基转移酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54378 | 枯草芽孢杆菌 | GcvT |
| 2524 | 假设的解旋酶yqhH[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54509 | 枯草芽孢杆菌 | YqhH |
| 2525 | 假设的蛋白yqhG[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54508 | 枯草芽孢杆菌 | YqhG |
| 2526 | ||||
| 2527 | SinR | |||
| 2528 | 芽孢外被相关蛋白N[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54507 | 枯草芽孢杆菌 | TasA |
| 2529 | 信号肽酶IW[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54506 | 枯草芽孢杆菌 | SipW |
| 2530 | 假设的蛋白yqxM[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P40949 | 枯草芽孢杆菌 | YqxM |
| 2531 | YqzG蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32019 | 枯草芽孢杆菌 | YqzG |
| 2532 | YqzE蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32020 | 枯草芽孢杆菌 |
| 2533 | ComGG | |||
| 2534 | ComGF | |||
| 2535 | ComG操纵子蛋白5前体[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P25957 | 枯草芽孢杆菌 | ComGE |
| 2536 | ComG操纵子蛋白4前体[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P25956 | 枯草芽孢杆菌 | ComGD |
| 2537 | ComG操纵子蛋白3前体[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P25955 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 2538 | ComGB | |||
| 2539 | ComG操纵子蛋白1[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P25953 | 枯草芽孢杆菌 | ComGA |
| 2540 | 假设的蛋白yqhA[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54504 | 枯草芽孢杆菌 | YqhA |
| 2541 | 假设的蛋白yqgZ[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54503 | 枯草芽孢杆菌 | YqgZ |
| 2542 | 假设的蛋白yqgY[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54502 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 2543 | 假设的蛋白yqgX[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54501 | 枯草芽孢杆菌 | YqgX |
| 2544 | 假设的蛋白yqgW[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54500 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 2545 | 假设的蛋白[表皮葡萄球菌] | UniRef100_Q8CSE8 | 表皮葡萄球菌 | |
| 2546 | YqgU | |||
| 2547 | 假设的蛋白yqgT[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54497 | 枯草芽孢杆菌 | YqgT |
| 2548 | 铁色素结合蛋白前体[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P37580 | 枯草芽孢杆菌 | FhuD |
| 2549 | 假设的蛋白yqgS[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54496 | 枯草芽孢杆菌 | YqgS |
| 2550 | 葡萄糖激酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54495 | 枯草芽孢杆菌 | GlcK |
| 2551 | 假设的蛋白yqgQ[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54494 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 2552 | 阶段V芽孢形成蛋白AF[Oceanobacillus iheyensis] | UniRef100_Q8EQ08 | Oceanobacillusiheyensis | SpoVAF |
| 2553 | 假设的蛋白yqgP[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54493 | 枯草芽孢杆菌 | YqgP |
| 2554 | 假设的蛋白yqgO[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54492 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 2555 | 假设的蛋白yqgN[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54491 | 枯草芽孢杆菌 | YqgN |
| 2556 | ||||
| 2557 | YqgM | |||
| 2558 | 假设的蛋白yqgL[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54489 | 枯草芽孢杆菌 | YqgL |
| 2559 | YqzD | |||
| 2560 | YqzC蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32023 | 枯草芽孢杆菌 | YqzC |
| 2561 | 磷酸输入ATP结合蛋白pstB 1[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P46342 | 枯草芽孢杆菌 | PstBB |
| 2562 | 磷酸输入ATP结合蛋白pstB 2[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P46341 | 枯草芽孢杆菌 | PstBA |
| 2563 | 可能的ABC转运蛋白通透酶蛋白yqgI[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P46340 | 枯草芽孢杆菌 | PstA |
| 2564 | 可能的ABC转运蛋白通透酶蛋白yqgH[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P46339 | 枯草芽孢杆菌 | PstC |
| 2565 | 可能的ABC转运蛋白结合蛋白yqgG前体[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P46338 | 枯草芽孢杆菌 | PstS |
| 2566 | 假设的蛋白yqgF[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54488 | 枯草芽孢杆菌 | PbpA |
| 2567 | 假设的蛋白yqgE[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54487 | 枯草芽孢杆菌 | YqgE |
| 2568 | SodA | |||
| 2569 | 假设的蛋白yqgC[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54486 | 枯草芽孢杆菌 | YqgC |
| 2570 | 假设的蛋白yqgB[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54485 | 枯草芽孢杆菌 | YqgB |
| 2571 | 假设的蛋白yqfZ[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54483 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 2572 | 4-羟基-3-甲基丁-2-烯-1-基二磷酸合酶(EC 1.17.4.3)(1-羟基-2-甲基-2-(E)-丁烯基4-二磷酸合酶)[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54482 | 枯草芽孢杆菌 | YqfY |
| 2573 | 假设的蛋白yqfX[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54481 | 枯草芽孢杆菌 | YqfX |
| 2574 | 推测的核苷酸酶yqfW[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54480 | 枯草芽孢杆菌 | YqfW |
| 2575 | 锌特异性金属调节蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54479 | 枯草芽孢杆菌 | Zur |
| 2576 | 金属(锌)转运蛋白[无害利斯特氏菌] | UniRef100_Q926D9 | 无害利斯特氏菌 | YceA |
| 2577 | YcdI | |||
| 2578 | 假设的蛋白yqfU[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54478 | 枯草芽孢杆菌 | YqfU |
| 2579 | ||||
| 2580 | 可能的内切核酸酶IV[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54476 | 枯草芽孢杆菌 | YqfS |
| 2581 | 可能的RNA解旋酶yqfR[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54475 | 枯草芽孢杆菌 | YqfR |
| 2582 | 假设的蛋白yqfQ[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54474 | 枯草芽孢杆菌 | YqfQ |
| 2583 | 4-羟基-3-甲基丁-2-烯基二磷酸还原酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54473 | 枯草芽孢杆菌 | YqfP |
| 2584 | YqfO | |||
| 2585 | 假设的蛋白yqfN[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54471 | 枯草芽孢杆菌 | YqfN |
| 2586 | YwqL蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P96724 | 枯草芽孢杆菌 | YwqL |
| 2587 | ||||
| 2588 | ||||
| 2589 | ||||
| 2590 | ||||
| 2591 | 假设的蛋白CAC0336[丙酮丁醇梭菌] | UniRef100_Q97M62 | 丙酮丁醇梭菌 | |
| 2592 | 假设的蛋白[苏云金芽孢杆菌] | UniRef100_Q6HGF2 | 苏云金芽孢杆菌 | |
| 2593 | ||||
| 2594 | YwqJ蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P96722 | 枯草芽孢杆菌 | YwqJ |
| 2595 | 假设的蛋白ywqI[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P96721 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 2596 | YwqH | |||
| 2597 | 细胞色素c-550[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P24469 | 枯草芽孢杆菌 | CccA |
| 2598 | SigA | |||
| 2599 | DNA引物酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P05096 | 枯草芽孢杆菌 | DnaG |
| 2600 | 假设的UPF0178蛋白yqxD[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P17868 | 枯草芽孢杆菌 | YqxD |
| 2601 | 假设的UPF0085蛋白yqfL[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54470 | 枯草芽孢杆菌 | YqfL |
| 2602 | YqzB蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34994 | 枯草芽孢杆菌 | YqzB |
| 2603 | 甘氨酰-tRNA合成酶β链[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54381 | 枯草芽孢杆菌 | GlyS |
| 2604 | 甘氨酰-tRNA合成酶α链[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54380 | 枯草芽孢杆菌 | GlyQ |
| 2605 | DNA修复蛋白recO[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P42095 | 枯草芽孢杆菌 | RecO |
| 2606 | ||||
| 2607 | GTP结合蛋白era同源物[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P42182 | 枯草芽孢杆菌 | Era |
| 2608 | 胞苷脱氨酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P19079 | 枯草芽孢杆菌 | Cdd |
| 2609 | ||||
| 2610 | 假设的UPF0054蛋白yqfG[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P46347 | 枯草芽孢杆菌 | YqfG |
| 2611 | 假设的蛋白yqfF[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P46344 | 枯草芽孢杆菌 | YqfF |
| 2612 | 类PhoH蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P46343 | 枯草芽孢杆菌 | PhoH |
| 2613 | YqfD | |||
| 2614 | 假设的蛋白yqfC[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54468 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 2615 | 假设的蛋白yqfB[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54467 | 枯草芽孢杆菌 | YqfB |
| 2616 | 假设的蛋白yqfA[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54466 | 枯草芽孢杆菌 | YqfA |
| 2617 | YqeZ | |||
| 2618 | 假设的蛋白yqeY[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54464 | 枯草芽孢杆菌 | YqeY |
| 2619 | ||||
| 2620 | 假设的蛋白yqeW[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54463 | 枯草芽孢杆菌 | YqeW |
| 2621 | 磷酸脱氧核糖醛缩酶[无害利斯特氏菌] | UniRef100_Q92A19 | 无害利斯特氏菌 | Dra |
| 2622 | 假设的UPF0004蛋白yqeV[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54462 | 枯草芽孢杆菌 | YqeV |
| 2623 | 假设的UPF0088蛋白yqeU[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54461 | 枯草芽孢杆菌 | YqeU |
| 2624 | 核糖体蛋白L11甲基转移酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54460 | 枯草芽孢杆菌 | YqeT |
| 2625 | 分子伴侣蛋白dnaJ[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P17631 | 枯草芽孢杆菌 | DnaJ |
| 2626 | DnaK | |||
| 2627 | ||||
| 2628 | ||||
| 2629 | 热诱导转录阻抑蛋白hrcA[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P25499 | 枯草芽孢杆菌 | HrcA |
| 2630 | 可能的氧非依赖粪卟啉原III氧化酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54304 | 枯草芽孢杆菌 | HemN |
| 2631 | LepA | |||
| 2632 | 假设的蛋白yqxA[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P38425 | 枯草芽孢杆菌 | YqxA |
| 2633 | SpoIIP | |||
| 2634 | 萌发蛋白酶前体[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P22322 | 枯草芽孢杆菌 | Gpr |
| 2635 | 30S核糖体蛋白S20[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P21477 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 2636 | 假设的蛋白yqeN[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54459 | 枯草芽孢杆菌 | YqeN |
| 2637 | ||||
| 2638 | ComE操纵子蛋白3[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39695 | 枯草芽孢杆菌 | ComEC |
| 2639 | ComE操纵子蛋白2[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P32393 | 枯草芽孢杆菌 | ComEB |
| 2640 | ComE操纵子蛋白1[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39694 | 枯草芽孢杆菌 | ComEA |
| 2641 | ComE操纵子蛋白4[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39696 | 枯草芽孢杆菌 | ComER |
| 2642 | 假设的蛋白yqeM[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54458 | 枯草芽孢杆菌 | YqeM |
| 2643 | 假设的蛋白yqeL[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54457 | 枯草芽孢杆菌 | YqeL |
| 2644 | 假设的蛋白yqeK[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54456 | 枯草芽孢杆菌 | YqeK |
| 2645 | 烟酸-核苷酸腺苷酰转移酶(EC2.7.7.18)(脱酰胺基-NAD(+)焦磷酸化酶)(脱酰胺基-NAD(+)二磷酸化酶)[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54455 | 枯草芽孢杆菌 | YqeJ |
| 2646 | 假设的UPF0044蛋白yqeI[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54454 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 2647 | 莽草酸脱氢酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54374 | 枯草芽孢杆菌 | AroD |
| 2648 | 假设的蛋白yqeH[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54453 | 枯草芽孢杆菌 | YqeH |
| 2649 | 假设的蛋白yqeG[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54452 | 枯草芽孢杆菌 | YqeG |
| 2650 | ||||
| 2651 | ||||
| 2652 | 假设的脂蛋白yqeF前体[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54451 | 枯草芽孢杆菌 | YqeF |
| 2653 | 乙酰基转移酶，GNAT家族[炭疽芽孢杆菌] | UniRef100_Q81KW8 | 炭疽芽孢杆菌 | YdfB |
| 2654 | 假设的蛋白yrhF[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O05398 | 枯草芽孢杆菌 | YrhF |
| 2655 | 甲酸脱氢酶链A[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O05397 | 枯草芽孢杆菌 | YrhE |
| 2656 | 假设的蛋白yrhD[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O05396 | 枯草芽孢杆菌 | YrhD |
| 2657 | ||||
| 2658 | RNA聚合酶σ-K因子前体[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P12254 | 枯草芽孢杆菌 | SpoIIIC |
| 2659 | YcnB | |||
| 2660 | BH2157蛋白[Bacillus halodurans] | UniRef100_Q9KAX9 | Bacillushalodurans | YuaI |
| 2661 | ||||
| 2662 | ||||
| 2663 | 丙氨酰-tRNA合成酶家族蛋白[炭疽芽孢杆菌] | UniRef100_Q81Y73 | 炭疽芽孢杆菌 | AlaS |
| 2664 | 金属激活的吡哆醛酶[马尔他布鲁氏菌(Brucella melitensis)] | UniRef100_Q8YCI2 | 马尔他布鲁氏菌 | |
| 2665 | 可能的翻译起始抑制物[Photobacterium profundum)] | UniRef100_Q6LKM3 | Photobacteriumprofundum | YabJ |
| 2666 | YccC | |||
| 2667 | 推测的苏氨酸合酶[除虫链霉菌] | UniRef100_Q82IF6 | 除虫链霉菌 | ThrC |
| 2668 | YabJ | |||
| 2669 | 假设的蛋白[腾冲热厌氧杆菌] | UniRef100_Q8RBA0 | 腾冲热厌氧杆菌 | |
| 2670 | ||||
| 2671 | UPI000032CE59 UniRef100条目 | UniRef100_UPI000032CE59 | ||
| 2672 | 多药运出转运蛋白1调节蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39075 | 枯草芽孢杆菌 | BmrR |
| 2673 | 类金属-β-内酰胺酶/硫氰酸生成酶域蛋白[炭疽芽孢杆菌] | UniRef100_Q81Q95 | 炭疽芽孢杆菌 | YrkH |
| 2674 | 假设的蛋白[蜡状芽孢杆菌ZK] | UniRef100_Q63B51 | 蜡状芽孢杆菌ZK | YumB |
| 2675 | NreC[肉葡萄球菌(Staphylococcus carnosus)] | UniRef100_Q7WZY4 | 肉葡萄球菌 | DegU |
| 2676 | 双组分传感蛋白组氨酸激酶[Symbiobacterium thermophilum] | UniRef100_Q67JE7 | Symbiobacterium thermophilum | DegS |
| 2677 | YdfQ蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P96695 | 枯草芽孢杆菌 | YdfQ |
| 2678 | 假设的跨膜蛋白[蜡状芽孢杆菌] | UniRef100_Q813Y5 | 蜡状芽孢杆菌 | YrkJ |
| 2679 | 假设的UPF0033蛋白yrkI[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54436 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 2680 | UPI00003CB3C6 UniRef100条目 | UniRef100_UPI00003CB3C6 | YrkH | |
| 2681 | 钼蝶呤生物合成MoeB蛋白[蜡状芽孢杆菌] | UniRef100_Q81HL2 | 蜡状芽孢杆菌 | YrkF |
| 2682 | 假设的蛋白yrkE[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54432 | 枯草芽孢杆菌 | YrkE |
| 2683 | 假设的保守蛋白[Oceanobacillusiheyensis] | UniRef100_Q8EN37 | Oceanobacillus iheyensis | |
| 2684 | S-腺苷酰甲硫氨酸依赖甲基转移酶[丙酮丁醇梭菌] | UniRef100_Q97FB3 | 丙酮丁醇梭菌 | YcgJ |
| 2685 | 假设的蛋白[炭疽芽孢杆菌] | UniRef100_Q81N81 | 炭疽芽孢杆菌 | |
| 2686 | YciB蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P94399 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 2687 | 乙酰木聚糖酯酶相关酶[丙酮丁醇梭菌] | UniRef100_Q97LM8 | 丙酮丁醇梭菌 | |
| 2688 | 假设的UPF0161蛋白BCE4947[蜡状芽孢杆菌] | UniRef100_P61464 | 蜡状芽孢杆菌 | |
| 2689 | δ-氨基乙酰丙酸脱水酶[Bacillushalodurans] | UniRef100_Q9K8G2 | Bacillus halodurans | |
| 2690 | 6-磷酸-3-己酮糖异构酶[甲醇芽孢杆菌] | UniRef100_Q6TV53 | 甲醇芽孢杆菌 | HxlB |
| 2691 | 可能的己酮糖-6-磷酸合酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P42405 | 枯草芽孢杆菌 | HxlA |
| 2692 | 转录调节蛋白[解淀粉芽孢杆菌] | UniRef100_Q70KJ9 | 解淀粉芽孢杆菌 | HxlR |
| 2693 | 脂肪酸去饱和酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34653 | 枯草芽孢杆菌 | Des |
| 2694 | 传感蛋白激酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34757 | 枯草芽孢杆菌 | YocF |
| 2695 | 传感蛋白调节蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34723 | 枯草芽孢杆菌 | YocG |
| 2696 | UPI00003CC1E4 UniRef100条目 | UniRef100_UPI00003CC1E4 | YcgT | |
| 2697 | 镍转运系统[Bacillus halodurans] | UniRef100_Q9KFB8 | Bacillushalodurans | AppA |
| 2698 | 镍转运系统[Bacillus halodurans] | UniRef100_Q9KFB7 | Bacillushalodurans | AppB |
| 2699 | 镍转运系统[Bacillus halodurans] | UniRef100_Q9KFB6 | Bacillushalodurans | AppC |
| 2700 | 寡肽ABC转运蛋白[Bacillushalodurans] | UniRef100_Q9KFB5 | Bacillushalodurans | DppD |
| 2701 | 寡肽ABC转运蛋白[Bacillushalodurans] | UniRef100_Q9KFB4 | Bacillushalodurans | AppF |
| 2702 | UPI00003CB880 UniRef100条目 | UniRef100_UPI00003CB880 | YdfL | |
| 2703 | UPI00003CA374 UniRef100条目 | UniRef100_UPI00003CA374 | YoeA | |
| 2704 | 可能的转录调节蛋白[Ralstoniasolanacearum] | UniRef100_Q8XS91 | Ralstonia solanacearum | |
| 2705 | 短链脱氢酶家族蛋白[粪肠球菌] | UniRef100_Q834I5 | 粪肠球菌 | YvaG |
| 2706 | 未描述性质的蛋白，含有预测的磷酸酶域[丙酮丁醇梭菌] | UniRef100_Q97L24 | 丙酮丁醇梭菌 | |
| 2707 | UPI000025758C UniRef100条目 | UniRef100_UPI000025758C | PnbA | |
| 2708 | 细胞色素P450[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O08469 | 枯草芽孢杆菌 | CypA |
| 2709 | YtnM[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34430 | 枯草芽孢杆菌 | YtnM |
| 2710 | 假设的蛋白yndA前体[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31805 | 枯草芽孢杆菌 | YndA |
| 2711 | YvaG蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32229 | 枯草芽孢杆菌 | YvaG |
| 2712 | 果聚糖酶前体[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P05656 | 枯草芽孢杆菌 | SacC |
| 2713 | PTS系统，果糖特异性IID组分[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P26382 | 枯草芽孢杆菌 | LevG |
| 2714 | PTS系统，果糖特异性IIC组分[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P26381 | 枯草芽孢杆菌 | LevF |
| 2715 | PTS系统，果糖特异性IIB组分[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P26380 | 枯草芽孢杆菌 | LevE |
| 2716 | PTS系统，果糖特异性IIA组分[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P26379 | 枯草芽孢杆菌 | LevD |
| 2717 | 转录调节蛋白levR[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P23914 | 枯草芽孢杆菌 | LevR |
| 2718 | 假设的蛋白[蜡状芽孢杆菌] | UniRef100_Q734Q5 | 蜡状芽孢杆菌 | |
| 2719 | 假设的蛋白yrhK[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O05401 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 2720 | UPI00003CB785 UniRef100条目 | UniRef100_UPI00003CB785 | ||
| 2721 | AdaA | |||
| 2722 | 甲基化-DNA--蛋白半胱氨酸S-甲基转移酶[蜡状芽孢杆菌] | UniRef100_Q732Y7 | 蜡状芽孢杆菌 | AdaB |
| 2723 | 氧化还原酶，醛/酮还原酶家族[苏云金芽孢杆菌] | UniRef100_Q6HBJ5 | 苏云金芽孢杆菌 | YtbE |
| 2724 | YtbD | |||
| 2725 | 假设的UPF0087蛋白ytcD[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34533 | 枯草芽孢杆菌 | YtcD |
| 2726 | ||||
| 2727 | 假设的蛋白yjjA[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34394 | 枯草芽孢杆菌 | YjjA |
| 2728 | UPI000028298B UniRef100条目 | UniRef100_UPI000028298B | ||
| 2729 | YxeB | |||
| 2730 | 推测的HTH型转录调节蛋白yybE[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P37499 | 枯草芽孢杆菌 | YybE |
| 2731 | 假设的转运蛋白yybF[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P37498 | 枯草芽孢杆菌 | YybF |
| 2732 | 假设的蛋白[蜡状芽孢杆菌] | UniRef100_Q732J0 | 蜡状芽孢杆菌 | |
| 2733 | 可能的双功能P-450：NADPH-P450还原酶2[包括：细胞色素P450 102(EC1.14.14.1)；NADPH--细胞色素P450还原酶(EC 1.6.2.4)][枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O08336 | 包括：细胞色素P450 102(EC1.14.14.1)；NADPH--细胞色素P450还原酶(EC1.6.2.4) | YrhJ |
| 2734 | 调节蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O08335 | 枯草芽孢杆菌 | YrhI |
| 2735 | WprA | |||
| 2736 | YrhH[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O05400 | 枯草芽孢杆菌 | YrhH |
| 2737 | ||||
| 2738 | ||||
| 2739 | ||||
| 2740 | 胱硫醚γ-裂合酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O05394 | 枯草芽孢杆菌 | YrhB |
| 2741 | 半胱氨酸合酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O05393 | 枯草芽孢杆菌 | YrhA |
| 2742 | MTA/SAH核苷酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32028 | 枯草芽孢杆菌 | Mtn |
| 2743 | YrrT蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32029 | 枯草芽孢杆菌 | YrrT |
| 2744 | 假设的蛋白yrzA[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32030 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 2745 | YrrS | |||
| 2746 | YrrR蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32032 | 枯草芽孢杆菌 | YrrR |
| 2747 | 转录延伸因子greA[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P80240 | 枯草芽孢杆菌 | GreA |
| 2748 | 尿苷激酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32033 | 枯草芽孢杆菌 | Udk |
| 2749 | YrrO蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32034 | 枯草芽孢杆菌 | YrrO |
| 2750 | YrrN蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32035 | 枯草芽孢杆菌 | YrrN |
| 2751 | YrrM蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32036 | 枯草芽孢杆菌 | YrrM |
| 2752 | YrrL蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34758 | 枯草芽孢杆菌 | YrrL |
| 2753 | YrzB蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34828 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 2754 | 推测的霍利迪连接体解离酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34634 | 枯草芽孢杆菌 | YrrK |
| 2755 | 假设的UPF0297蛋白yrzL[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q7WY61 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 2756 | 丙氨酰-tRNA合成酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34526 | 枯草芽孢杆菌 | AlaS |
| 2757 | 假设的UPF0118蛋白yrrI[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34472 | 枯草芽孢杆菌 | YrrI |
| 2758 | ||||
| 2759 | 假设的蛋白[蜡状芽孢杆菌ZK] | UniRef100_Q634F2 | 蜡状芽孢杆菌ZK | |
| 2760 | YrrD蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34402 | 枯草芽孢杆菌 | YrrD |
| 2761 | YrrC蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34481 | 枯草芽孢杆菌 | YrrC |
| 2762 | YrrB蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34452 | 枯草芽孢杆菌 | YrrB |
| 2763 | 可能的tRNA(5-甲基氨基甲基-2-硫尿苷酸)-甲基转移酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O35020 | 枯草芽孢杆菌 | TrmU |
| 2764 | YrvO蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34599 | 枯草芽孢杆菌 | YrvO |
| 2765 | BH1259蛋白[Bacillus halodurans] | UniRef100_Q9KDF4 | Bacillus halodurans | |
| 2766 | YrvN蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34528 | 枯草芽孢杆菌 | YrvN |
| 2767 | YrvM蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32037 | 枯草芽孢杆菌 | YrvM |
| 2768 | 天冬氨酰-tRNA合成酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32038 | 枯草芽孢杆菌 | AspS |
| 2769 | 组氨酰-tRNA合成酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32039 | 枯草芽孢杆菌 | HisS |
| 2770 | ||||
| 2771 | YrvJ | |||
| 2772 | 推测的类D-酪氨酰-tRNA(Tyr)脱酰基酶蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32042 | 枯草芽孢杆菌 | YrvI |
| 2773 | GTP焦磷酸激酶(EC 2.7.6.5)(ATP：GTP 3′-焦磷酸转移酶)(ppGpp合成酶I)((P)ppGpp合成酶)[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O54408 | 枯草芽孢杆菌 | RelA |
| 2774 | 腺嘌呤磷酸核糖转移酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34443 | 枯草芽孢杆菌 | Apt |
| 2775 | YrvE蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32044 | 枯草芽孢杆菌 | YrvE |
| 2776 | YrvD蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32045 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 2777 | SecDF蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32047 | 枯草芽孢杆菌 | SecDF |
| 2778 | YrzD蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32049 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 2779 | SpoVB | |||
| 2780 | 假设的蛋白yrbG[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32050 | 枯草芽孢杆菌 | YrbG |
| 2781 | YrzE蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32051 | 枯草芽孢杆菌 | YrzE |
| 2782 | 假设的UPF0092蛋白yrbF[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32052 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 2783 | Q碱(Queuine)tRNA-核糖基转移酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32053 | 枯草芽孢杆菌 | Tgt |
| 2784 | S-腺苷酰甲硫氨酸：tRNA核糖基转移酶-异构酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32054 | 枯草芽孢杆菌 | QueA |
| 2785 | ||||
| 2786 | 霍利迪连接体DNA解旋酶ruvB[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32055 | 枯草芽孢杆菌 | RuvB |
| 2787 | 霍利迪连接体DNA解旋酶ruvA[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O05392 | 枯草芽孢杆菌 | RuvA |
| 2788 | BofC蛋白前体[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O05391 | 枯草芽孢杆菌 | BofC |
| 2789 | 假设的保守蛋白[Oceanobacillusiheyensis] | UniRef100_Q8ERL7 | Oceanobacillusiheyensis | YrzF |
| 2790 | ||||
| 2791 | 小酸溶性芽孢蛋白H[Bacillushalodurans] | UniRef100_Q9KB75 | Bacillus halodurans | |
| 2792 | 假设的蛋白yjoA[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34334 | 枯草芽孢杆菌 | YjoA |
| 2793 | YmaC蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31789 | 枯草芽孢杆菌 | YmaC |
| 2794 | ||||
| 2795 | ||||
| 2796 | 假设的UPF0082蛋白yrbC[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P94447 | 枯草芽孢杆菌 | YrbC |
| 2797 | 芽孢形成皮层蛋白coxA[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P94446 | 枯草芽孢杆菌 | CoxA |
| 2798 | SpoVID相关的形态发生蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32062 | 枯草芽孢杆菌 | SafA |
| 2799 | 喹啉酸合成酶A[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q9KWZ1 | 枯草芽孢杆菌 | NadA |
| 2800 | 可能的烟酸-核苷酸焦磷酸化酶[羧化的][枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39666 | 羧化的 | NadC |
| 2801 | L-天冬氨酸氧化酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P38032 | 枯草芽孢杆菌 | NadB |
| 2802 | 可能的半胱氨酸脱硫酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P38033 | 枯草芽孢杆菌 | NifS |
| 2803 | YrxA | |||
| 2804 | 预苯酸脱水酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P21203 | 枯草芽孢杆菌 | PheA |
| 2805 | ACT域蛋白pheB[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P21204 | 枯草芽孢杆菌 | PheB |
| 2806 | Spo0B相关GTP结合蛋白[解淀粉芽孢杆菌] | UniRef100_Q659J4 | 解淀粉芽孢杆菌 | Obg |
| 2807 | 芽孢形成起始磷酸转移酶B[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P06535 | 枯草芽孢杆菌 | Spo0B |
| 2808 | 50S核糖体蛋白L27[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P05657 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 2809 | ||||
| 2810 | 50S核糖体蛋白L21[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P26908 | 枯草芽孢杆菌 | RplU |
| 2811 | 阶段IV芽孢形成蛋白FB[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P26937 | 枯草芽孢杆菌 | SpoIVFB |
| 2812 | 阶段IV芽孢形成蛋白FA[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P26936 | 枯草芽孢杆菌 | SpoIVFA |
| 2813 | 假设的蛋白[蜡状芽孢杆菌] | UniRef100_Q816V6 | 蜡状芽孢杆菌 | YndB |
| 2814 | 转录调节蛋白，ArsR家族[蜡状芽孢杆菌ZK] | UniRef100_Q632Y0 | 蜡状芽孢杆菌ZK | |
| 2815 | 隔膜(Septum)位点决定蛋白minD[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q01464 | 枯草芽孢杆菌 | MinD |
| 2816 | MinC | |||
| 2817 | 杆状决定蛋白mreD[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q01467 | 枯草芽孢杆菌 | MreD |
| 2818 | 杆状决定蛋白mreC[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q01466 | 枯草芽孢杆菌 | MreC |
| 2819 | 杆状决定蛋白mreB[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q01465 | 枯草芽孢杆菌 | MreB |
| 2820 | DNA修复蛋白radC同源物[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q02170 | 枯草芽孢杆菌 | RadC |
| 2821 | 隔膜形成蛋白Maf[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q02169 | 枯草芽孢杆菌 | Maf |
| 2822 | 阶段II芽孢形成蛋白B[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P37575 | 枯草芽孢杆菌 | SpoIIB |
| 2823 | 4型前菌毛蛋白(prepilin)类蛋白前导肽加工酶(晚期感受态蛋白comC)[包括：前导肽酶(EC3.4.23.43)(前菌毛蛋白肽酶)；N-甲基转移酶(EC 2.1.1.-)][枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P15378 | 包括：前导肽酶(EC 3.4.23.43)(前菌毛蛋白肽酶)；N-甲基转移酶(EC2.1.1.-) | ComC |
| 2824 | FolC | |||
| 2825 | 缬氨酰-tRNA合成酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q05873 | 枯草芽孢杆菌 | ValS |
| 2826 | 假设的蛋白OB2062[Oceanobacillus iheyensis] | UniRef100_Q8EPN1 | Oceanobacillus iheyensis | |
| 2827 | 假设的蛋白ysxE[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P37964 | 枯草芽孢杆菌 | YsxE |
| 2828 | 阶段VI芽孢形成蛋白D[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P37963 | 枯草芽孢杆菌 | SpoVID |
| 2829 | 谷氨酸-1-半醛2，1-氨基变位酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P30949 | 枯草芽孢杆菌 | HemL |
| 2830 | δ-氨基乙酰丙酸脱水酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P30950 | 枯草芽孢杆菌 | HemB |
| 2831 | 尿卟啉原-III合酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P21248 | 枯草芽孢杆菌 | HemD |
| 2832 | 胆色素原脱氨酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P16616 | 枯草芽孢杆菌 | HemC |
| 2833 | 蛋白hemX[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P16645 | 枯草芽孢杆菌 | HemX |
| 2834 | 谷氨酰-tRNA还原酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P16618 | 枯草芽孢杆菌 | HemA |
| 2835 | 假设的蛋白ysxD[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P40736 | 枯草芽孢杆菌 | YsxD |
| 2836 | 可能的GTP结合蛋白engB[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P38424 | 枯草芽孢杆菌 | YsxC |
| 2837 | ATP依赖蛋白酶La1[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P37945 | 枯草芽孢杆菌 | LonA |
| 2838 | ATP依赖蛋白酶La同源物[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P42425 | 枯草芽孢杆菌 | LonB |
| 2839 | ATP依赖Clp蛋白酶ATP-结合亚基clpX[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P50866 | 枯草芽孢杆菌 | ClpX |
| 2840 | 引发因子[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P80698 | 枯草芽孢杆菌 | Tig |
| 2841 | 假设的蛋白ysoA[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P94569 | 枯草芽孢杆菌 | YsoA |
| 2842 | 3-异丙基苹果酸脱水酶小亚基[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P94568 | 枯草芽孢杆菌 | LeuD |
| 2843 | 3-异丙基苹果酸脱水酶大亚基[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P80858 | 枯草芽孢杆菌 | LeuC |
| 2844 | LeuB | |||
| 2845 | 2-异丙基苹果酸合酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P94565 | 枯草芽孢杆菌 | LeuA |
| 2846 | 酮醇-酸还原异构酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P37253 | 枯草芽孢杆菌 | IlvC |
| 2847 | 乙酰乳酸合酶小亚基[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P37252 | 枯草芽孢杆菌 | IlvH |
| 2848 | 乙酰乳酸合酶大亚基[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P37251 | 枯草芽孢杆菌 | IlvB |
| 2849 | 支链氨基酸氨基转移酶[苏云金芽孢杆菌] | UniRef100_Q6HLF7 | 苏云金芽孢杆菌 | Dat |
| 2850 | ||||
| 2851 | RocG | |||
| 2852 | BH3337蛋白[Bacillus halodurans] | UniRef100_Q9K7M4 | Bacillus halodurans | |
| 2853 | YxeD | |||
| 2854 | 假设的蛋白yqbA[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P45917 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 2855 | 假设的蛋白yqaT[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P45916 | 枯草芽孢杆菌 | YqaT |
| 2856 | Lin1266蛋白[无害利斯特氏菌] | UniRef100_Q92CC3 | 无害利斯特氏菌 | |
| 2857 | Lin1733蛋白[无害利斯特氏菌] | UniRef100_Q92B18 | 无害利斯特氏菌 | |
| 2858 | ||||
| 2859 | ||||
| 2860 | ||||
| 2861 | MtbP | |||
| 2862 | BH3535蛋白[Bacillus halodurans] | UniRef100_Q9K738 | Bacillus halodurans | |
| 2863 | YeeF | |||
| 2864 | YxiD | |||
| 2865 | RapI | |||
| 2866 | ||||
| 2867 | ||||
| 2868 | ||||
| 2869 | 假设的UPF0025蛋白ysnB[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P94559 | 枯草芽孢杆菌 | YsnB |
| 2870 | HAM1蛋白同源物[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P94558 | 枯草芽孢杆菌 | YsnA |
| 2871 | Rph | |||
| 2872 | 萌发蛋白gerM[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39072 | 枯草芽孢杆菌 | GerM |
| 2873 | RacE | |||
| 2874 | 假设的蛋白ysmB[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P97247 | 枯草芽孢杆菌 | YsmB |
| 2875 | 萌发蛋白gerE[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P11470 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 2876 | 氧化还原酶[丙酮丁醇梭菌] | UniRef100_Q97TP7 | 丙酮丁醇梭菌 | YqjQ |
| 2877 | 假设的蛋白ysmA[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q6L874 | 枯草芽孢杆菌 | YsmA |
| 2878 | 琥珀酸脱氢酶铁-硫蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P08066 | 枯草芽孢杆菌 | SdhB |
| 2879 | SdhA | |||
| 2880 | ||||
| 2881 | 琥珀酸脱氢酶细胞色素B-558亚基[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P08064 | 枯草芽孢杆菌 | SdhC |
| 2882 | 假设的蛋白yslB[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P42955 | 枯草芽孢杆菌 | YslB |
| 2883 | 天冬氨酸激酶2(EC 2.7.2.4)(天冬氨酸激酶II)(天冬氨酸激酶2)[包含：天冬氨酸激酶IIα亚基；天冬氨酸激酶IIβ亚基][枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P08495 | 包含：天冬氨酸激酶IIα亚基；天冬氨酸激酶IIβ亚基 | LysC |
| 2884 | UvrABC系统蛋白C[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P14951 | 枯草芽孢杆菌 | UvrC |
| 2885 | 硫氧还蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P14949 | 枯草芽孢杆菌 | TrxA |
| 2886 | 电子传递黄素蛋白α-亚基[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P94551 | 枯草芽孢杆菌 | EftA |
| 2887 | 电子传递黄素蛋白β-亚基[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P94550 | 枯草芽孢杆菌 | EtfB |
| 2888 | 假设的蛋白ysiB[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P94549 | 枯草芽孢杆菌 | YsiB |
| 2889 | 假设的蛋白ysiA[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P94548 | 枯草芽孢杆菌 | YsiA |
| 2890 | 长链脂肪酸--辅酶A连接酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P94547 | 枯草芽孢杆菌 | LcfA |
| 2891 | 假设的蛋白yshE[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P94546 | 枯草芽孢杆菌 | YshE |
| 2892 | MutS2蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P94545 | 枯草芽孢杆菌 | MutSB |
| 2893 | 假设的蛋白yshC[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P94544 | 枯草芽孢杆菌 | YshC |
| 2894 | YshB | |||
| 2895 | ||||
| 2896 | 核糖核酸酶HIII[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P94541 | 枯草芽孢杆菌 | RnhC |
| 2897 | ||||
| 2898 | ||||
| 2899 | ||||
| 2900 | ||||
| 2901 | YxlF | |||
| 2902 | ||||
| 2903 | 苯丙氨酰-tRNA合成酶β链[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P17922 | 枯草芽孢杆菌 | PheT |
| 2904 | 苯丙氨酰-tRNA合成酶α链[解淀粉芽孢杆菌] | UniRef100_Q659J3 | 解淀粉芽孢杆菌 | PheS |
| 2905 | 假设的蛋白ysgA[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P94538 | 枯草芽孢杆菌 | YsgA |
| 2906 | 小酸溶性芽孢蛋白I[枯草芽孢杆 | UniRef100_P94537 | 枯草芽孢杆菌 |
| 菌] | ||||
| 2907 | 碳饥饿蛋白A同源物[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P94532 | 枯草芽孢杆菌 | CstA |
| 2908 | α-N-阿拉伯呋喃糖苷酶[嗜热脂肪芽孢杆菌] | UniRef100_Q9XBQ3 | 嗜热脂肪芽孢杆菌 | AbfA |
| 2909 | L-阿拉伯糖转运系统通透酶蛋白araQ[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P94530 | 枯草芽孢杆菌 | AraQ |
| 2910 | L-阿拉伯糖转运系统通透酶蛋白araP[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P94529 | 枯草芽孢杆菌 | AraP |
| 2911 | 可能的阿拉伯糖结合蛋白前体[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P94528 | 枯草芽孢杆菌 | AraN |
| 2912 | 阿拉伯糖操纵子蛋白araM[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P94527 | 枯草芽孢杆菌 | AraM |
| 2913 | L-核酮糖-5-磷酸4-差向异构酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P94525 | 枯草芽孢杆菌 | AraD |
| 2914 | 核酮糖激酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P94524 | 枯草芽孢杆菌 | AraB |
| 2915 | L-阿拉伯糖异构酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P94523 | 枯草芽孢杆菌 | AraA |
| 2916 | AbnA | |||
| 2917 | 假设的蛋白ysdC[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P94521 | 枯草芽孢杆菌 | YsdC |
| 2918 | 假设的蛋白ysdB[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P94520 | 枯草芽孢杆菌 | YsdB |
| 2919 | 假设的蛋白ysdA[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P94519 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 2920 | 50S核糖体蛋白L20[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P55873 | 枯草芽孢杆菌 | RplT |
| 2921 | 50S核糖体蛋白L35[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P55874 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 2922 | InfC | |||
| 2923 | 抗穴蛋白(Antiholin)样蛋白lrgB[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P94516 | 枯草芽孢杆菌 | YsbB |
| 2924 | 抗穴蛋白样蛋白lrgA[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P94515 | 枯草芽孢杆菌 | YsbA |
| 2925 | PhoD | |||
| 2926 | 感觉转导蛋白lytT[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P94514 | 枯草芽孢杆菌 | LytT |
| 2927 | 传感蛋白lytS[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P94513 | 枯草芽孢杆菌 | LytS |
| 2928 | 假设的蛋白[炭疽芽孢杆菌] | UniRef100_Q81N00 | 炭疽芽孢杆菌 | |
| 2929 | 假设的蛋白ysaA[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P94512 | 枯草芽孢杆菌 | YsaA |
| 2930 | 苏氨酰-tRNA合成酶1[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P18255 | 枯草芽孢杆菌 | ThrS |
| 2931 | 假设的蛋白ytxC[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P06569 | 枯草芽孢杆菌 | YtxC |
| 2932 | 假设的UPF0043蛋白ytxB[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P06568 | 枯草芽孢杆菌 | YtxB |
| 2933 | 引发体蛋白dnaI[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P06567 | 枯草芽孢杆菌 | DnaI |
| 2934 | 复制起始和膜附着蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P07908 | 枯草芽孢杆菌 | DnaB |
| 2935 | 假设的UPF0168蛋白ytcG[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q45549 | 枯草芽孢杆菌 | YtcG |
| 2936 | ||||
| 2937 | SpeD | |||
| 2938 | GapB | |||
| 2939 | 果胶裂合酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P94449 | 枯草芽孢杆菌 | PelB |
| 2940 | 脱磷酸-辅酶A激酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34932 | 枯草芽孢杆菌 | YtaG |
| 2941 | YtaF | |||
| 2942 | 甲酰胺嘧啶-DNA糖基酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34403 | 枯草芽孢杆菌 | MutM |
| 2943 | DNA聚合酶I[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34996 | 枯草芽孢杆菌 | PolA |
| 2944 | 碱性磷酸酶合成传感蛋白phoR[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P23545 | 枯草芽孢杆菌 | PhoR |
| 2945 | 碱性磷酸酶合成转录调节蛋白phoP[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P13792 | 枯草芽孢杆菌 | PhoP |
| 2946 | 苹果酸脱氢酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P49814 | 枯草芽孢杆菌 | Mdh |
| 2947 | 异柠檬酸脱氢酶[NADP][枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39126 | NADP | Icd |
| 2948 | 柠檬酸合酶II[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39120 | 枯草芽孢杆菌 | CitZ |
| 2949 | YtwI[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34811 | 枯草芽孢杆菌 | YtwI |
| 2950 | 假设的UPF0118蛋白ytvI[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34991 | 枯草芽孢杆菌 | YtvI |
| 2951 | YtzA蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32064 | 枯草芽孢杆菌 | YtzA |
| 2952 | Pyk | |||
| 2953 | 6-磷酸果糖激酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34529 | 枯草芽孢杆菌 | PfkA |
| 2954 | 乙酰-辅酶A羧化酶羧基转移酶亚基α[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34847 | 枯草芽孢杆菌 | AccA |
| 2955 | 乙酰-辅酶A羧化酶亚基[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34571 | 枯草芽孢杆菌 | AccD |
| 2956 | YtsJ | |||
| 2957 | DNA聚合酶IIIα亚基[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34623 | 枯草芽孢杆菌 | DnaE |
| 2958 | 假设的跨膜蛋白[蜡状芽孢杆菌] | UniRef100_Q812P3 | 蜡状芽孢杆菌 | |
| 2959 | YtrI[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34460 | 枯草芽孢杆菌 | YtrI |
| 2960 | BH3172蛋白[Bacillus halodurans] | UniRef100_Q9K835 | Bacillus halodurans | |
| 2961 | YtqI[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34600 | 枯草芽孢杆菌 | YtqI |
| 2962 | YtpI[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34922 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 2963 | YtoI | |||
| 2964 | PadR | |||
| 2965 | YtkL蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q795U4 | 枯草芽孢杆菌 | YtkL |
| 2966 | YtkK | |||
| 2967 | ||||
| 2968 | 精氨琥珀酸裂合酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34858 | 枯草芽孢杆菌 | ArgH |
| 2969 | 精氨琥珀酸合酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34347 | 枯草芽孢杆菌 | ArgG |
| 2970 | 钼辅因子生物合成蛋白B[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34457 | 枯草芽孢杆菌 | MoaB |
| 2971 | AckA | |||
| 2972 | 假设的蛋白ytxK[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P37876 | 枯草芽孢杆菌 | YtxK |
| 2973 | 可能的巯基过氧化物酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P80864 | 枯草芽孢杆菌 | Tpx |
| 2974 | YtfJ[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34806 | 枯草芽孢杆菌 | YtfJ |
| 2975 | YtfI | |||
| 2976 | YteJ[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34424 | 枯草芽孢杆菌 | YteJ |
| 2977 | 推测的信号肽肽酶sppA[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34525 | 枯草芽孢杆菌 | SppA |
| 2978 | 可能的无机多聚磷酸/ATP-NAD激酶2(EC 2.7.1.23)(聚(P)/ATPNAD激酶2)[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34934 | 枯草芽孢杆菌 | YtdI |
| 2979 | YhbJ蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31593 | 枯草芽孢杆菌 | YhbJ |
| 2980 | 多药耐性蛋白[表皮葡萄球菌] | UniRef100_Q8CQB1 | 表皮葡萄球菌 | YubD |
| 2981 | 推测的HTH型转录调节蛋白yxaD[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P42103 | 枯草芽孢杆菌 | YxaD |
| 2982 | YtcI[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34613 | 枯草芽孢杆菌 | YtcI |
| 2983 | 小酸溶性芽孢蛋白1[嗜热脂肪芽孢杆菌] | UniRef100_P06552 | 嗜热脂肪芽孢杆菌 | |
| 2984 | 可能的硫胺素生物合成蛋白thiI[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34595 | 枯草芽孢杆菌 | YtbJ |
| 2985 | NifS2[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34874 | 枯草芽孢杆菌 | NifZ |
| 2986 | 支链氨基酸转运系统载体蛋白braB[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34545 | 枯草芽孢杆菌 | BraB |
| 2987 | IS1627s1-相关，转座酶[炭疽芽孢杆菌A2012菌株] | UniRef100_Q7CMD0 | 炭疽芽孢杆菌A2012菌株 | |
| 2988 | UPI00003CC069 UniRef100条目 | UniRef100_UPI00003CC069 | ||
| 2989 | 隔离环(Septation ring)形成调节蛋白ezrA[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34894 | 枯草芽孢杆菌 | EzrA |
| 2990 | 组氨醇-磷酸酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34411 | 枯草芽孢杆菌 | HisJ |
| 2991 | 可能的HTH型转录调节蛋白yttP[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34970 | 枯草芽孢杆菌 | YttP |
| 2992 | 假设的保守蛋白[Oceanobacillusiheyensis] | UniRef100_Q8EPB0 | Oceanobacillus iheyensis | |
| 2993 | YtrP[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34325 | 枯草芽孢杆菌 | YtrP |
| 2994 | 30S核糖体蛋白S4[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P21466 | 枯草芽孢杆菌 | RpsD |
| 2995 | ||||
| 2996 | ||||
| 2997 | YddR | |||
| 2998 | HTH型转录调节蛋白lrpA[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P96652 | 枯草芽孢杆菌 | LrpA |
| 2999 | ||||
| 3000 | 酪氨酰-tRNA合成酶1[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P22326 | 枯草芽孢杆菌 | TyrS |
| 3001 | 乙酰-辅酶A合成酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39062 | 枯草芽孢杆菌 | AcsA |
| 3002 | 羟基丁酮利用acuA蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39065 | 枯草芽孢杆菌 | AcuA |
| 3003 | 羟基丁酮利用acuB蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39066 | 枯草芽孢杆菌 | AcuB |
| 3004 | 羟基丁酮利用acuC蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39067 | 枯草芽孢杆菌 | AcuC |
| 3005 | 假设的蛋白ytxE[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39064 | 枯草芽孢杆菌 | YtxE |
| 3006 | 假设的蛋白ytxD[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39063 | 枯草芽孢杆菌 | YtxD |
| 3007 | 代谢物控制蛋白A[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P25144 | 枯草芽孢杆菌 | CcpA |
| 3008 | AroA(G)蛋白[包括：磷酸-2-脱氢-3-脱氧庚糖酸醛缩酶(EC2.5.1.54)(磷酸-2-酮-3-脱氧庚糖酸醛缩酶)(DAHP合成酶)(3-脱氧-D-阿拉伯糖-庚酮糖酸7-磷酸合酶)；分支酸变位酶(EC5.4.99.5)][枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39912 | 包括：磷酸-2-脱氢-3-脱氧庚糖酸醛缩酶(EC 2.5.1.54)(磷酸-2-酮-3-脱氧庚糖酸醛缩酶)(DAHP合成酶)(3-脱氧-D-阿拉伯糖-庚酮糖酸7-磷酸合酶)；分支酸变位酶(EC5.4.99.5) | AroA |
| 3009 | 与假设的含重复序列蛋白相似[发光光杆状菌] | UniRef100_Q7N3B8 | 发光光杆状菌 | |
| 3010 | 假设的蛋白ytxJ[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39914 | 枯草芽孢杆菌 | YtxJ |
| 3011 | 假设的蛋白ytxH[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P40780 | 枯草芽孢杆菌 | YtxH |
| 3012 | 假设的蛋白ytxG[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P40779 | 枯草芽孢杆菌 | YtxG |
| 3013 | MurC | |||
| 3014 | YtpT[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34749 | 枯草芽孢杆菌 | YtpT |
| 3015 | YtpR[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34943 | 枯草芽孢杆菌 | YtpR |
| 3016 | YtpQ[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34496 | 枯草芽孢杆菌 | YtpQ |
| 3017 | 推测的硫氧还蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34357 | 枯草芽孢杆菌 | YtpP |
| 3018 | YtoQ[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34305 | 枯草芽孢杆菌 | YtoQ |
| 3019 | YtoP[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34924 | 枯草芽孢杆菌 | YtoP |
| 3020 | YtzB蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32065 | 枯草芽孢杆菌 | YtzB |
| 3021 | 可能的NAD依赖苹果酸酶(malicenzyme)3[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34389 | 枯草芽孢杆菌 | MalS |
| 3022 | YtnP[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34760 | 枯草芽孢杆菌 | YtnP |
| 3023 | tRNA(鸟氨酸-N(7)-)-甲基转移酶(EC 2.1.1.33)(tRNA(m7G46)-甲基转移酶)[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34522 | 枯草芽孢杆菌 | YtmQ |
| 3024 | YtzH蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32066 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 3025 | YtmP[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34935 | 枯草芽孢杆菌 | YtmP |
| 3026 | AmyX蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34587 | 枯草芽孢杆菌 | AmyX |
| 3027 | YtlR[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34799 | 枯草芽孢杆菌 | YtlR |
| 3028 | YtlQ[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34471 | 枯草芽孢杆菌 | YtlQ |
| 3029 | 假设的UPF0097蛋白ytlP[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34570 | 枯草芽孢杆菌 | YtlP |
| 3030 | 可能的半胱氨酸合酶(EC2.5.1.47)(O-乙酰丝氨酸硫化氢解酶)(O-乙酰丝氨酸(巯基)-裂合酶)[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34476 | 枯草芽孢杆菌 | YtkP |
| 3031 | 假设的蛋白[蜡状芽孢杆菌] | UniRef100_Q81BR8 | 蜡状芽孢杆菌 | YncE |
| 3032 | 推测的肽酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34944 | 枯草芽孢杆菌 | YtjP |
| 3033 | YtiP[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34978 | 枯草芽孢杆菌 | YtiP |
| 3034 | YtzE蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32067 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 3035 | 核糖体小亚基假尿苷合酶A[蜡状芽孢杆菌] | UniRef100_Q816W1 | 蜡状芽孢杆菌 | YtzF |
| 3036 | YtgP[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34674 | 枯草芽孢杆菌 | YtgP |
| 3037 | YtfP[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O30505 | 枯草芽孢杆菌 | YtfP |
| 3038 | OpuD | |||
| 3039 | 蛋白cse60[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P94496 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 3040 | 类硫氰酸生成酶域蛋白[蜡状芽孢杆菌] | UniRef100_Q72YZ9 | 蜡状芽孢杆菌 | |
| 3041 | RapA | |||
| 3042 | 假设的蛋白[苏云金芽孢杆菌] | UniRef100_Q6HI31 | 苏云金芽孢杆菌 | |
| 3043 | YteU[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34378 | 枯草芽孢杆菌 | YteU |
| 3044 | YteT | |||
| 3045 | YteS | |||
| 3046 | YteR[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34559 | 枯草芽孢杆菌 | YteR |
| 3047 | 跨膜脂蛋白[Bacillus halodurans] | UniRef100_Q9KFJ5 | Bacillushalodurans | LplB |
| 3048 | YtdP蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32071 | 枯草芽孢杆菌 | YtdP |
| 3049 | YtcQ蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q795R2 | 枯草芽孢杆菌 | YtcQ |
| 3050 | YtcP | |||
| 3051 | 假设的蛋白ytbQ[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P53560 | 枯草芽孢杆菌 | YtbQ |
| 3052 | Ytap[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34973 | 枯草芽孢杆菌 | YtaP |
| 3053 | 氨基酸/多胺转运蛋白；家族I[海沼甲烷球菌(Methanococcusmaripaludis)] | UniRef100_Q6LYX9 | 海沼甲烷球菌 | YecA |
| 3054 | 转录调节蛋白，LysR家族[丙酮丁醇梭菌] | UniRef100_Q97DX1 | 丙酮丁醇梭菌 | YwqM |
| 3055 | 脯氨酰内肽酶[蜡状芽孢杆菌] | UniRef100_Q81C54 | 蜡状芽孢杆菌 | YycE |
| 3056 | 亮氨酰-tRNA合成酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P36430 | 枯草芽孢杆菌 | LeuS |
| 3057 | YtvB | |||
| 3058 | YttB[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34546 | 枯草芽孢杆菌 | YttB |
| 3059 | 脂蛋白[Oceanobacillus iheyensis] | UniRef100_Q8EPK3 | Oceanobacillusiheyensis | YusA |
| 3060 | YttA[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O30500 | 枯草芽孢杆菌 | YttA |
| 3061 | YtrF[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O35005 | 枯草芽孢杆菌 | YtrF |
| 3062 | 假设的ABC转运蛋白ATP结合蛋白ytrE[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34392 | 枯草芽孢杆菌 | YtrE |
| 3063 | YtrC[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34898 | 枯草芽孢杆菌 | YtrC |
| 3064 | 转运蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34641 | 枯草芽孢杆菌 | YtrB |
| 3065 | 转录调节蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34712 | 枯草芽孢杆菌 | YtrA |
| 3066 | 假设的蛋白ytzC[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32073 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 3067 | YtqA[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O35008 | 枯草芽孢杆菌 | YtqA |
| 3068 | YtqB | |||
| 3069 | 质子谷氨酸同向转运蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39817 | 枯草芽孢杆菌 | GltP |
| 3070 | 假设的蛋白ytpB[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34707 | 枯草芽孢杆菌 | YtpB |
| 3071 | 可能的溶血磷脂酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34705 | 枯草芽孢杆菌 | YtpA |
| 3072 | YtoA[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34696 | 枯草芽孢杆菌 | YtoA |
| 3073 | YwoA | |||
| 3074 | 糖基转移酶，组1家族[苏云金芽孢杆菌] | UniRef100_Q6HCB9 | 苏云金芽孢杆菌 | TuaC |
| 3075 | 天冬酰胺合成酶[水解谷氨酰胺]1[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54420 | 水解谷氨酰胺 | AsnB |
| 3076 | S-腺苷酰甲硫氨酸合成酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54419 | 枯草芽孢杆菌 | MetK |
| 3077 | 磷酸烯醇丙酮酸羧激酶[ATP][枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54418 | ATP | PckA |
| 3078 | 钠：二羧酸同向转运蛋白[Oceanobacillus iheyensis] | UniRef100_Q8EP16 | Oceanobacillusiheyensis | DctP |
| 3079 | 假设的蛋白ytmB[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34365 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 3080 | 推测的肽酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34493 | 枯草芽孢杆菌 | YtmA |
| 3081 | ABC转运蛋白底物结合蛋白[蜡状芽孢杆菌] | UniRef100_Q816P5 | 蜡状芽孢杆菌 | YtlA |
| 3082 | 推测的转运蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34314 | 枯草芽孢杆菌 | YtlC |
| 3083 | YtlD | |||
| 3084 | YtkD[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O35013 | 枯草芽孢杆菌 | YtkD |
| 3085 | 假设的蛋白[苏云金芽孢杆菌] | UniRef100_Q6HC91 | 苏云金芽孢杆菌 | |
| 3086 | 假设的蛋白ytkC[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34883 | 枯草芽孢杆菌 | YtkC |
| 3087 | 普通应激蛋白20U[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P80879 | 枯草芽孢杆菌 | Dps |
| 3088 | 假设的蛋白ytkA[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P40768 | 枯草芽孢杆菌 | YtkA |
| 3089 | S-核糖基高半胱氨酸酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34667 | 枯草芽孢杆菌 | LuxS |
| 3090 | 假设的UPF0161蛋白ytjA[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34601 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 3091 | YtiB[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34872 | 枯草芽孢杆菌 | YtiB |
| 3092 | 低亲和性锌转运蛋白[蜡状芽孢杆菌] | UniRef100_Q81F90 | 蜡状芽孢杆菌 | YciC |
| 3093 | 高亲和性锌摄取系统蛋白znuA[蜡状芽孢杆菌] | UniRef100_Q81EF8 | 蜡状芽孢杆菌 | YcdH |
| 3094 | 50S核糖体蛋白L31B型[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34967 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 3095 | YthA[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34655 | 枯草芽孢杆菌 | YthA |
| 3096 | YthB[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34505 | 枯草芽孢杆菌 | YthB |
| 3097 | 假设的蛋白[蜡状芽孢杆菌] | UniRef100_Q737J1 | 蜡状芽孢杆菌 | |
| 3098 | ||||
| 3099 | O-琥珀酰苯甲酸合酶(EC 4.2.1.-)(OSB合酶)(OSBS)(4-(2′-羧苯基)-4-羟基丁酸合酶)[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34514 | 枯草芽孢杆菌 | MenC |
| 3100 | O-琥珀酰苯甲酸--辅酶A连接酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P23971 | 枯草芽孢杆菌 | MenE |
| 3101 | 萘甲酸合酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P23966 | 枯草芽孢杆菌 | MenB |
| 3102 | YtxM | |||
| 3103 | 甲基萘醌生物合成蛋白menD[包括：2-琥珀酰-6-羟基-2，4-环己二烯-1-羧酸合酶(EC 2.5.1.64)(SHCHC合酶)；2-酮戊二酸脱羧酶(EC 4.1.1.71)(α-酮戊二酸脱羧酶)(KDC)][枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P23970 | 包括：2-琥珀酰-6-羟基-2，4-环己二烯-1-羧酸合酶(EC2.5.1.64)(SHCHC合酶)；2-酮戊二 | MenD |
| 酸脱羧酶(EC 4.1.1.71)(α-酮戊二酸脱羧酶)(KDC) | ||||
| 3104 | 甲基萘醌特异性异分支酸合酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P23973 | 枯草芽孢杆菌 | MenF |
| 3105 | 可能的1，4-二羟基-2-萘甲酸八异戊二烯基转移酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39582 | 枯草芽孢杆菌 | MenA |
| 3106 | 假设的蛋白yteA[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P42408 | 枯草芽孢杆菌 | YteA |
| 3107 | 糖原磷酸化酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39123 | 枯草芽孢杆菌 | GlgP |
| 3108 | 糖原合酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39125 | 枯草芽孢杆菌 | GlgA |
| 3109 | 糖原生物合成蛋白glgD[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39124 | 枯草芽孢杆菌 | GlgD |
| 3110 | 葡萄糖-1-磷酸腺苷酰转移酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39122 | 枯草芽孢杆菌 | GlgC |
| 3111 | 1，4-α-葡聚糖分支酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39118 | 枯草芽孢杆菌 | GlgB |
| 3112 | AraR | |||
| 3113 | YuaJ蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32074 | 枯草芽孢杆菌 | YuaJ |
| 3114 | BH4010蛋白[Bacillus halodurans] | UniRef100_Q9K5S8 | Bacillushalodurans | YhcS |
| 3115 | BH4011蛋白[Bacillus halodurans] | UniRef100_Q9K5S7 | Bacillus halodurans | |
| 3116 | ||||
| 3117 | RapD | |||
| 3118 | 吡咯烷酮-羧酸肽酶[解淀粉芽孢杆菌] | UniRef100_P46107 | 解淀粉芽孢杆菌 | Pcp |
| 3119 | BH0597蛋白[Bacillus halodurans] | UniRef100_Q9KF88 | Bacillushalodurans | YuaA |
| 3120 | YubG | |||
| 3121 | YxxF | |||
| 3122 | YuaE蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32078 | 枯草芽孢杆菌 | YuaE |
| 3123 | YuaD蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32079 | 枯草芽孢杆菌 | YuaD |
| 3124 | 醇脱氢酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P71017 | 枯草芽孢杆菌 | GbsB |
| 3125 | 甜菜碱醛脱氢酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P71016 | 枯草芽孢杆菌 | GbsA |
| 3126 | 假设的蛋白yuaC[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P71015 | 枯草芽孢杆菌 | YuaC |
| 3127 | UPI00002D3D35 UniRef100条目 | UniRef100_UPI00002D3D35 | OpuE | |
| 3128 | 假设的蛋白yktD[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q45500 | 枯草芽孢杆菌 | YktD |
| 3129 | 丙氨酸消旋酶2[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P94494 | 枯草芽孢杆菌 | YncD |
| 3130 | 草酸脱羧酶[蜡状芽孢杆菌] | UniRef100_Q81GZ6 | 蜡状芽孢杆菌 | YoaN |
| 3131 | 假设的蛋白CAC0135[丙酮丁醇梭菌] | UniRef100_Q97MQ7 | 丙酮丁醇梭菌 | |
| 3132 | 假设的蛋白[苏云金芽孢杆菌] | UniRef100_Q6HGC9 | 苏云金芽孢杆菌 | |
| 3133 | 假设的蛋白[苏云金芽孢杆菌] | UniRef100_Q6HGC8 | 苏云金芽孢杆菌 | |
| 3134 | ||||
| 3135 | 假设的蛋白[苏云金芽孢杆菌] | UniRef100_Q6HGC6 | 苏云金芽孢杆菌 | |
| 3136 | 假设的蛋白[苏云金芽孢杆菌] | UniRef100_Q6HGC5 | 苏云金芽孢杆菌 | |
| 3137 | 假设的保守蛋白[Oceanobacillusiheyensis] | UniRef100_Q8ETF5 | Oceanobacillus iheyensis | |
| 3138 | ||||
| 3139 | ||||
| 3140 | YkoN[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34625 | 枯草芽孢杆菌 | YkoN |
| 3141 | 假设的蛋白ykoP[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34495 | 枯草芽孢杆菌 | YkoP |
| 3142 | 假设的UPF0151蛋白ykoQ[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O35040 | 枯草芽孢杆菌 | YkoQ |
| 3143 | 十一异戊二烯基-二磷酸酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P94507 | 枯草芽孢杆菌 | YubB |
| 3144 | 假设的UPF0118蛋白yubA[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32086 | 枯草芽孢杆菌 | YubA |
| 3145 | 假设的氧化还原酶yulF[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O05265 | 枯草芽孢杆菌 | YulF |
| 3146 | Lmo2256蛋白[单核细胞增生利斯特氏菌] | UniRef100_Q929B9 | 单核细胞增生利斯特氏菌 | YraA |
| 3147 | McpA | |||
| 3148 | McpA | |||
| 3149 | McpA | |||
| 3150 | 蛋白谷氨酰胺γ-谷氨酰转移酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P40746 | 枯草芽孢杆菌 | Tgl |
| 3151 | 2-硝基丙烷双加氧酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O05413 | 枯草芽孢杆菌 | YrpB |
| 3152 | 假设的UPF0047蛋白yugU[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O05243 | 枯草芽孢杆菌 | YugU |
| 3153 | 假设的蛋白yugT[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O05242 | 枯草芽孢杆菌 | YugT |
| 3154 | 转录调节蛋白，TetR家族[蜡状芽孢杆菌] | UniRef100_Q81GX6 | 蜡状芽孢杆菌 | YfiR |
| 3155 | 假设的蛋白yqeB[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54447 | 枯草芽孢杆菌 | YqeB |
| 3156 | β(1，4)-葡聚糖葡聚糖水解酶[胡萝卜软腐欧文氏菌(Erwiniacarotovora)] | UniRef100_Q6D3B7 | 胡萝卜软腐欧文氏菌 | |
| 3157 | 假设的UPF0053蛋白yugS[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O05241 | 枯草芽孢杆菌 | YugS |
| 3158 | 假设的蛋白yugP[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O05248 | 枯草芽孢杆菌 | YugP |
| 3159 | YugO蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q795M8 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 3160 | 假设的蛋白yugN[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O05246 | 枯草芽孢杆菌 | YugN |
| 3161 | 假设的蛋白[苏云金芽孢杆菌] | UniRef100_Q6HIW1 | 苏云金芽孢杆菌 | YdfR |
| 3162 | YtaB蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34694 | 枯草芽孢杆菌 | YtaB |
| 3163 | 预测的乙酰基转移酶[丙酮丁醇梭菌] | UniRef100_Q97IT3 | 丙酮丁醇梭菌 | YkkB |
| 3164 | 葡萄糖-6-磷酸异构酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P80860 | 枯草芽孢杆菌 | Pgi |
| 3165 | 可能的NADH依赖丁醇脱氢酶1[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O05239 | 枯草芽孢杆菌 | YugJ |
| 3166 | YuzA蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32087 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 3167 | 普通应激蛋白13[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P80870 | 枯草芽孢杆菌 | YugI |
| 3168 | 丙氨酸转氨酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q795M6 | 枯草芽孢杆菌 | AlaT |
| 3169 | 转录调节蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O05236 | 枯草芽孢杆菌 | AlaR |
| 3170 | 假设的蛋白yugF[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O05235 | 枯草芽孢杆菌 | YugF |
| 3171 | 假设的蛋白yugE[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O05234 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 3172 | 假设的蛋白SMU.305[变异链球菌(Streptococcus mutans)] | UniRef100_Q9X669 | 变异链球菌 | |
| 3173 | 推测的氨基转移酶B[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q08432 | 枯草芽孢杆菌 | PatB |
| 3174 | ||||
| 3175 | 激酶相关脂蛋白B前体[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q08429 | 枯草芽孢杆菌 | KapB |
| 3176 | 假设的蛋白yugB[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O05231 | 枯草芽孢杆菌 | KapD |
| 3177 | YuxJ | |||
| 3178 | PbpD | |||
| 3179 | 假设的蛋白yuxK[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P40761 | 枯草芽孢杆菌 | YuxK |
| 3180 | 假设的蛋白yufK[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O05249 | 枯草芽孢杆菌 | YufK |
| 3181 | 假设的蛋白yufL[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O05250 | 枯草芽孢杆菌 | YufL |
| 3182 | 假设的蛋白yufM[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O05251 | 枯草芽孢杆菌 | YufM |
| 3183 | ||||
| 3184 | UPI00003CB938 UniRef100条目 | UniRef100_UPI00003CB938 | PssA | |
| 3185 | 假设的蛋白ybfM[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31453 | 枯草芽孢杆菌 | YbfM |
| 3186 | 磷脂酰丝氨酸脱羧酶[苏云金芽孢杆菌] | UniRef100_Q6HDI5 | 苏云金芽孢杆菌 | Psd |
| 3187 | UPI00003CC069 UniRef100条目 | UniRef100_UPI00003CC069 | ||
| 3188 | IS1627s1-相关，转座酶[炭疽芽孢杆菌A2012菌株] | UniRef100_Q7CMD0 | 炭疽芽孢杆菌A2012菌株 | |
| 3189 | Na(+)-苹果酸同向转运蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O05256 | 枯草芽孢杆菌 | MaeN |
| 3190 | ||||
| 3191 | Na(+)/H(+)反向转运蛋白亚基A[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q9K2S2 | 枯草芽孢杆菌 | MrpA |
| 3192 | Na(+)/H(+)反向转运蛋白亚基B[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O05259 | 枯草芽孢杆菌 | MrpB |
| 3193 | Na(+)/H(+)反向转运蛋白亚基C[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O05260 | 枯草芽孢杆菌 | MrpC |
| 3194 | Na(+)/H(+)反向转运蛋白亚基D[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O05229 | 枯草芽孢杆菌 | MrpD |
| 3195 | Na(+)/H(+)反向转运蛋白亚基E[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q7WY60 | 枯草芽孢杆菌 | MrpE |
| 3196 | Na(+)/H(+)反向转运蛋白亚基F[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O05228 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 3197 | Na(+)/H(+)反向转运蛋白亚基G[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O05227 | 枯草芽孢杆菌 | MrpG |
| 3198 | YuxO | |||
| 3199 | ComA | |||
| 3200 | ComP | |||
| 3201 | IS1627s1-相关，转座酶[炭疽芽孢杆菌A2012菌株] | UniRef100_Q7CMD0 | 炭疽芽孢杆菌A2012菌株 | |
| 3202 | UPI00003CC069 UniRef100条目 | UniRef100_UPI00003CC069 | ||
| 3203 | ComP | |||
| 3204 | ||||
| 3205 | ComQ[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q9K5L3 | 枯草芽孢杆菌 | ComQ |
| 3206 | ||||
| 3207 | 假设的蛋白yuzC[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32089 | 枯草芽孢杆菌 | YuzC |
| 3208 | 假设的蛋白yuxH[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P14203 | 枯草芽孢杆菌 | YuxH |
| 3209 | YueK蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32090 | 枯草芽孢杆菌 | YueK |
| 3210 | YueJ蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32091 | 枯草芽孢杆菌 | YueJ |
| 3211 | YueI | |||
| 3212 | ||||
| 3213 | 假设的蛋白yueG[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32094 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 3214 | YueF | |||
| 3215 | RRF2家族蛋白[蜡状芽孢杆菌] | UniRef100_Q81EX1 | 蜡状芽孢杆菌 | YwnA |
| 3216 | 可能的脂肪酶/酯酶[Rhodopirellula baltica] | UniRef100_Q7UUA2 | Rhodopirellulabaltica | YuxL |
| 3217 | BH1896蛋白[Bacillus halodurans] | UniRef100_Q9KBN0 | Bacillus halodurans | |
| 3218 | YueE蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32098 | 枯草芽孢杆菌 | YueE |
| 3219 | YueD蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32099 | 枯草芽孢杆菌 | YueD |
| 3220 | 假设的蛋白yueC[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32100 | 枯草芽孢杆菌 | YueC |
| 3221 | YueB蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32101 | 枯草芽孢杆菌 | YueB |
| 3222 | YukA蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P71068 | 枯草芽孢杆菌 | YukA |
| 3223 | YukC蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P71070 | 枯草芽孢杆菌 | YukC |
| 3224 | YukD蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P71071 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 3225 | Lin0049蛋白[无害利斯特氏菌] | UniRef100_Q92FQ4 | 无害利斯特氏菌 | |
| 3226 | YflA | |||
| 3227 | YukF蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P71073 | 枯草芽孢杆菌 | YukF |
| 3228 | 丙氨酸脱氢酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q08352 | 枯草芽孢杆菌 | Ald |
| 3229 | ||||
| 3230 | YuiH蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32103 | 枯草芽孢杆菌 | YuiH |
| 3231 | YuiG蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32104 | 枯草芽孢杆菌 | YuiG |
| 3232 | YuiF蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32105 | 枯草芽孢杆菌 | YuiF |
| 3233 | 可能的胞质氨肽酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32106 | 枯草芽孢杆菌 | YuiE |
| 3234 | YuiD蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32107 | 枯草芽孢杆菌 | YuiD |
| 3235 | YuiC蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32108 | 枯草芽孢杆菌 | YuiC |
| 3236 | YuiB蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32109 | 枯草芽孢杆菌 | YuiB |
| 3237 | ||||
| 3238 | YumB | |||
| 3239 | 硫氧还蛋白还原酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O05268 | 枯草芽孢杆菌 | YumC |
| 3240 | ||||
| 3241 | YdjO蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34759 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 3242 | YxbD | |||
| 3243 | 假设的蛋白yutM[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32113 | 枯草芽孢杆菌 | YutM |
| 3244 | 二氨基庚二酸差向异构酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32114 | 枯草芽孢杆菌 | DapF |
| 3245 | YutK蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32115 | 枯草芽孢杆菌 | YutK |
| 3246 | YuzB蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32116 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 3247 | YutJ蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32117 | 枯草芽孢杆菌 | YutJ |
| 3248 | YdhG蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O05499 | 枯草芽孢杆菌 | YdhG |
| 3249 | 应答调节蛋白天冬氨酸磷酸酶[Bacillus halodurans] | UniRef100_Q9KBE1 | Bacillushalodurans | RapI |
| 3250 | 酚酸脱羧酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O07006 | 枯草芽孢杆菌 | PadC |
| 3251 | BH2266蛋白[Bacillus halodurans] | UniRef100_Q9KAM1 | Bacillus halodurans | |
| 3252 | YuzD蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32118 | 枯草芽孢杆菌 | YuzD |
| 3253 | YutI蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32119 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 3254 | 可能的肽酶yuxL[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39839 | 枯草芽孢杆菌 | YuxL |
| 3255 | 高丝氨酸激酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P04948 | 枯草芽孢杆菌 | ThrB |
| 3256 | 苏氨酸合酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P04990 | 枯草芽孢杆菌 | ThrC |
| 3257 | 高丝氨酸脱氢酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P19582 | 枯草芽孢杆菌 | Hom |
| 3258 | 甘油酸脱氢酶[Oceanobacillusiheyensis] | UniRef100_Q8ENW9 | Oceanobacillusiheyensis | YvcT |
| 3259 | YutH蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32123 | 枯草芽孢杆菌 | YutH |
| 3260 | 假设的蛋白yutG[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32124 | 枯草芽孢杆菌 | YutG |
| 3261 | YutF蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32125 | 枯草芽孢杆菌 | YutF |
| 3262 | YutE蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32126 | 枯草芽孢杆菌 | YutE |
| 3263 | YutD蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32127 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 3264 | YutC蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32128 | 枯草芽孢杆菌 | YutC |
| 3265 | LipA | |||
| 3266 | YunA蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32130 | 枯草芽孢杆菌 | YunA |
| 3267 | ||||
| 3268 | 钠依赖转运蛋白[Bacillushalodurans] | UniRef100_Q9K7C5 | Bacillushalodurans | YocR |
| 3269 | YunB蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32131 | 枯草芽孢杆菌 | YunB |
| 3270 | YunC蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32132 | 枯草芽孢杆菌 | YunC |
| 3271 | YunD蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32133 | 枯草芽孢杆菌 | YunD |
| 3272 | YunE蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32134 | 枯草芽孢杆菌 | YunE |
| 3273 | YunF蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32135 | 枯草芽孢杆菌 | YunF |
| 3274 | YmcC | |||
| 3275 | TetR家族转录调节蛋白？[Symbiobacterium thermophilum] | UniRef100_Q67KA4 | Symbiobacterium thermophilum | PksA |
| 3276 | ||||
| 3277 | 嘌呤代谢蛋白pucG[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32148 | 枯草芽孢杆菌 | YurG |
| 3278 | 尿囊酸酰胺基水解酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32149 | 枯草芽孢杆菌 | YurH |
| 3279 | 嘌呤代谢调节蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32138 | 枯草芽孢杆菌 | PucR |
| 3280 | 多药耐性蛋白B[蜡状芽孢杆菌ZK] | UniRef100_Q63FH7 | 蜡状芽孢杆菌ZK | Blt |
| 3281 | BH2308蛋白[Bacillus halodurans] | UniRef100_Q9KAH9 | Bacillushalodurans | YcgA |
| 3282 | TrpD | |||
| 3283 | 邻氨基苯甲酸磷酸核糖转移酶[激烈火球菌(Pyrococcusfuriosus)] | UniRef100_Q8U089 | 激烈火球菌 | |
| 3284 | 胞外核糖核酸酶前体[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32150 | 枯草芽孢杆菌 | YurI |
| 3285 | BH1977蛋白[Bacillus halodurans] | UniRef100_Q9KBF1 | Bacillus halodurans | |
| 3286 | YurR | |||
| 3287 | 推测的膜蛋白[支气管炎博德特氏菌] | UniRef100_Q7WGW7 | 支气管炎博德特氏菌 | |
| 3288 | UPI00003CB453 UniRef100条目 | UniRef100_UPI00003CB453 | ||
| 3289 | 应答调节蛋白天冬氨酸磷酸酶I[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P96649 | 枯草芽孢杆菌 | RapI |
| 3290 | YurU蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32162 | 枯草芽孢杆菌 | YurU |
| 3291 | 类NifU蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32163 | 枯草芽孢杆菌 | YurV |
| 3292 | 可能的半胱氨酸脱硫酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32164 | 枯草芽孢杆菌 | Csd |
| 3293 | YurX蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32165 | 枯草芽孢杆菌 | YurX |
| 3294 | 营养(Vegetative)蛋白296[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P80866 | 枯草芽孢杆菌 | YurY |
| 3295 | Lmo2575蛋白[单核细胞增生利斯特氏菌] | UniRef100_Q8Y480 | 单核细胞增生利斯特氏菌 | CzcD |
| 3296 | ||||
| 3297 | BH3473蛋白[Bacillus halodurans] | UniRef100_Q9K796 | Bacillushalodurans | YurZ |
| 3298 | YusA蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32167 | 枯草芽孢杆菌 | YusA |
| 3299 | YusB蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32168 | 枯草芽孢杆菌 | YusB |
| 3300 | YusC蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32169 | 枯草芽孢杆菌 | YusC |
| 3301 | 假设的蛋白yusD[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32170 | 枯草芽孢杆菌 | YusD |
| 3302 | YusE蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32171 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 3303 | YusF蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32172 | 枯草芽孢杆菌 | YusF |
| 3304 | ||||
| 3305 | 甘氨酸切割系统H蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32174 | 枯草芽孢杆菌 | GcvH |
| 3306 | 假设的蛋白yusI[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32175 | 枯草芽孢杆菌 | YusI |
| 3307 | YusJ蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32176 | 枯草芽孢杆菌 | YusJ |
| 3308 | YusK蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32177 | 枯草芽孢杆菌 | YusK |
| 3309 | YusL蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32178 | 枯草芽孢杆菌 | YusL |
| 3310 | ||||
| 3311 | ||||
| 3312 | YusN蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32180 | 枯草芽孢杆菌 | YusN |
| 3313 | 假设的蛋白yusU[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32187 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 3314 | BH1040蛋白[Bacillus halodurans] | UniRef100_Q9KE18 | Bacillus halodurans | |
| 3315 | YusV蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32188 | 枯草芽孢杆菌 | YusV |
| 3316 | YfhA | |||
| 3317 | YfiZ蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31568 | 枯草芽孢杆菌 | YfiZ |
| 3318 | YfiY蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31567 | 枯草芽孢杆菌 | YfiY |
| 3319 | 假设的蛋白yusW前体[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32189 | 枯草芽孢杆菌 | YusW |
| 3320 | YusX蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32190 | 枯草芽孢杆菌 | YusX |
| 3321 | D-丙氨酰-D-丙氨酸羧肽酶[Oceanobacillus iheyensis] | UniRef100_Q8ERG0 | Oceanobacillusiheyensis | DacB |
| 3322 | 假设的氧化还原酶yusZ[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P37959 | 枯草芽孢杆菌 | YusZ |
| 3323 | 金属调节DNA结合应激蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P37960 | 枯草芽孢杆菌 | MrgA |
| 3324 | 可能的丝氨酸蛋白酶yvtA[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q9R9I1 | 枯草芽孢杆菌 | YvtA |
| 3325 | 转录调节蛋白cssR[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32192 | 枯草芽孢杆菌 | CssR |
| 3326 | 传感蛋白cssS[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32193 | 枯草芽孢杆菌 | CssS |
| 3327 | YirB[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32302 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 3328 | 推测的HTH型转录调节蛋白 | UniRef100_P40950 | 枯草芽孢杆菌 | YuxN |
| yuxN[枯草芽孢杆菌] | ||||
| 3329 | 延胡索酸水合酶类II[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P07343 | 枯草芽孢杆菌 | CitG |
| 3330 | ||||
| 3331 | 芽孢萌发蛋白A1[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P07868 | 枯草芽孢杆菌 | GerAA |
| 3332 | 芽孢萌发蛋白A2[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P07869 | 枯草芽孢杆菌 | GerAB |
| 3333 | 芽孢萌发蛋白A3前体[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P07870 | 枯草芽孢杆菌 | GerAC |
| 3334 | ||||
| 3335 | YvqC | |||
| 3336 | YvqE蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32198 | 枯草芽孢杆菌 | YvqE |
| 3337 | YvqF蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32199 | 枯草芽孢杆菌 | YvqF |
| 3338 | YvqG蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32200 | 枯草芽孢杆菌 | YvqG |
| 3339 | 假设的蛋白yvqH[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32201 | 枯草芽孢杆菌 | YvqH |
| 3340 | 假设的蛋白yvqI[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32202 | 枯草芽孢杆菌 | YvqI |
| 3341 | 果胶酸裂合酶P358[芽孢杆菌P-358菌种] | UniRef100_Q8RR73 | 芽孢杆菌P-358菌种 | |
| 3342 | YvqK蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34899 | 枯草芽孢杆菌 | YvqK |
| 3343 | UPI00002E3648 UniRef100条目 | UniRef100_UPI00002E3648 | FabG | |
| 3344 | ||||
| 3345 | GbsB | |||
| 3346 | DapA | |||
| 3347 | 推测的金属结合蛋白YvrA[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34631 | 枯草芽孢杆菌 | YvrA |
| 3348 | 推测的氯高铁血红素通透酶，YvrB[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34451 | 枯草芽孢杆菌 | YvrB |
| 3349 | 推测的金属结合蛋白YvrC[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34805 | 枯草芽孢杆菌 | YvrC |
| 3350 | 转录调节蛋白，GntR家族[炭疽芽孢杆菌] | UniRef100_Q81SA7 | 炭疽芽孢杆菌 | YdhC |
| 3351 | 推测的酮还原酶，YvrD[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34782 | 枯草芽孢杆菌 | YvrD |
| 3352 | UPI00003CC410 UniRef100条目 | UniRef100_UPI00003CC410 | YflK | |
| 3353 | 转录调节蛋白，LysR家族[蜡状芽孢杆菌] | UniRef100_Q81DJ6 | 蜡状芽孢杆菌 | AlsR |
| 3354 | 外切-聚-α-D-半乳糖醛酸糖苷酶，推测的[海栖热袍菌(Thermotogamaritima)] | UniRef100_Q9WYR8 | 海栖热袍菌 | |
| 3355 | 阿卓糖酸水解酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34673 | 枯草芽孢杆菌 | UxaA |
| 3356 | 阿卓糖酸氧化还原酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34354 | 枯草芽孢杆菌 | UxaB |
| 3357 | LacI阻抑蛋白类蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q9JMQ1 | 枯草芽孢杆菌 | ExuR |
| 3358 | 假设的同向转运蛋白yjmB[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34961 | 枯草芽孢杆菌 | YjmB |
| 3359 | 糖醛酸异构酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34808 | 枯草芽孢杆菌 | UxaC |
| 3360 | 推测的传感蛋白激酶，YvrG[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34989 | 枯草芽孢杆菌 | YvrG |
| 3361 | 推测的DNA结合应激调节蛋白，YvrH[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P94504 | 枯草芽孢杆菌 | YvrH |
| 3362 | 铁色素转运ATP结合蛋白fhuC[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P49938 | 枯草芽孢杆菌 | FhuC |
| 3363 | 铁色素转运系统通透酶蛋白fhuG[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P49937 | 枯草芽孢杆菌 | FhuG |
| 3364 | 铁色素转运系统通透酶蛋白fhuB[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P49936 | 枯草芽孢杆菌 | FhuB |
| 3365 | 推测的精氨酸鸟氨酸反向转运蛋白，YvsH[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32204 | 枯草芽孢杆菌 | YvsH |
| 3366 | 假设的蛋白yvsG前体[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32205 | 枯草芽孢杆菌 | YvsG |
| 3367 | 推测的钼酸结合蛋白YvgJ[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32206 | 枯草芽孢杆菌 | YvgJ |
| 3368 | YcnB | |||
| 3369 | 推测的还原酶蛋白YvgN[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32210 | 枯草芽孢杆菌 | YvgN |
| 3370 | 果糖激酶[单核细胞增生利斯特氏菌] | UniRef100_Q722A5 | 单核细胞增生利斯特氏菌 | YdhR |
| 3371 | 假设的蛋白ycbU前体[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P42253 | 枯草芽孢杆菌 | YcbU |
| 3372 | 假设的蛋白CPE0889[产气荚膜梭菌] | UniRef100_Q8XM01 | 产气荚膜梭菌 | |
| 3373 | YvgS蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32215 | 枯草芽孢杆菌 | YvgS |
| 3374 | 假设的UPF0126蛋白yvgT[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32216 | 枯草芽孢杆菌 | YvgT |
| 3375 | 富谷氨酸蛋白grpB[蜡状芽孢杆菌] | UniRef100_Q81CT5 | 蜡状芽孢杆菌 | YqkA |
| 3376 | 乙酰基转移酶，GNAT家族[苏云金芽孢杆菌] | UniRef100_Q6HJN8 | 苏云金芽孢杆菌 | YuaI |
| 3377 | 二硫键形成蛋白C[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32217 | 枯草芽孢杆菌 | BdbC |
| 3378 | 二硫键形成蛋白D前体[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32218 | 枯草芽孢杆菌 | BdbD |
| 3379 | YvgW蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32219 | 枯草芽孢杆菌 | YvgW |
| 3380 | ABC转运蛋白，底物结合蛋白[根瘤农杆菌] | UniRef100_Q8U7T8 | 根瘤农杆菌 | YvfK |
| 3381 | 推测的糖转运整合膜蛋白[天蓝色链霉菌] | UniRef100_Q9K442 | 天蓝色链霉菌 | YurN |
| 3382 | 推测的糖转运整合膜蛋白[天蓝色链霉菌] | UniRef100_Q9K441 | 天蓝色链霉菌 | YurM |
| 3383 | α-葡萄糖苷酶[丙酮丁醇梭菌] | UniRef100_Q97K36 | 丙酮丁醇梭菌 | |
| 3384 | 葡聚糖-葡萄糖水解酶[双孢小双孢菌(Microbispora bispora)] | UniRef100_Q59506 | 双孢小双孢菌 | YbbD |
| 3385 | ABC转运蛋白，ATP结合蛋白[炭疽芽孢杆菌] | UniRef100_Q81NK1 | 炭疽芽孢杆菌 | MntB |
| 3386 | ABC转运蛋白，通透酶蛋白[炭疽芽孢杆菌] | UniRef100_Q81NK2 | 炭疽芽孢杆菌 | MntD |
| 3387 | ABC转运蛋白，锰结合蛋白[单核细胞增生利斯特氏菌] | UniRef100_Q71YG9 | 单核细胞增生利斯特氏菌 | YcdH |
| 3388 | 假设的蛋白[蜡状芽孢杆菌] | UniRef100_Q74NQ1 | 蜡状芽孢杆菌 | YhjQ |
| 3389 | 磷酸糖结合转录调节蛋白，RpiR | UniRef100_Q837Y3 | 粪肠球菌 | YfiA |
| 家族，推测的[粪肠球菌] | ||||
| 3390 | 1-磷酸果糖激酶[粪肠球菌] | UniRef100_Q837Y2 | 粪肠球菌 | FruK |
| 3391 | PTS系统，果糖特异性家族，IIBC组分[粪肠球菌] | UniRef100_Q837Y1 | 粪肠球菌 | FruA |
| 3392 | PTS系统，IIA组分[粪肠球菌] | UniRef100_Q837Y0 | 粪肠球菌 | FruA |
| 3393 | 果糖/塔格糖双磷酸醛缩酶[创伤弧菌] | UniRef100_Q7MC78 | 创伤弧菌 | FbaA |
| 3394 | ||||
| 3395 | 重金属-转运ATP酶[苏云金芽孢杆菌] | UniRef100_Q6HF81 | 苏云金芽孢杆菌 | YvgX |
| 3396 | 铜分子伴侣copZ[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32221 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 3397 | YvgZ蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32222 | 枯草芽孢杆菌 | YvgZ |
| 3398 | 胞内蛋白酶[火山热原体(Thermoplasma volcanium)] | UniRef100_Q97BN0 | 火山热原体 | YraA |
| 3399 | 推测的HTH型转录调节蛋白yulB[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O05261 | 枯草芽孢杆菌 | YulB |
| 3400 | 鼠李树胶糖激酶/L-岩藻酮糖激酶[多形拟杆菌] | UniRef100_Q8A1A3 | 多形拟杆菌 | YulC |
| 3401 | 推测的糖异构酶[天蓝色链霉菌] | UniRef100_Q9XAB3 | 天蓝色链霉菌 | |
| 3402 | 假设的蛋白[纤维多囊菌(Polyangium cellulosum)] | UniRef100_Q9L8B7 | 纤维多囊菌 | |
| 3403 | 假设的氧化还原酶yuxG[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P40747 | 枯草芽孢杆菌 | YuxG |
| 3404 | YfhI蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31577 | 枯草芽孢杆菌 | YfhI |
| 3405 | YvmA[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34307 | 枯草芽孢杆菌 | YvmA |
| 3406 | YvmC[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34351 | 枯草芽孢杆菌 | YvmC |
| 3407 | 推测的细胞色素P450 CYPX[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34926 | 枯草芽孢杆菌 | CypX |
| 3408 | 假设的蛋白[Chromobacteriumviolaceum] | UniRef100_Q7NRR6 | Chromobacterium violaceum | |
| 3409 | YvnA | |||
| 3410 | 假设的蛋白BRA0099[猪布鲁氏菌(Brucella suis)] | UniRef100_Q8FXH8 | 猪布鲁氏菌 | |
| 3411 | 叶绿体Toc64-2[Physcomitrellapatens] | UniRef100_Q6RJN6 | Physcomitrellapatens | GatA |
| 3412 | 假设的氧化还原酶yvaA[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32223 | 枯草芽孢杆菌 | YvaA |
| 3413 | 推测的酰基载体蛋白磷酸二酯酶2[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32224 | 枯草芽孢杆菌 | YvaB |
| 3414 | 假设的UPF0176蛋白ybfQ[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31457 | 枯草芽孢杆菌 | YbfQ |
| 3415 | 推测的DNA结合应答调节蛋白，YvrH[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P94504 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 3416 | YvrI蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34843 | 枯草芽孢杆菌 | YvrI |
| 3417 | ||||
| 3418 | 草酸脱羧酶oxdC[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34714 | 枯草芽孢杆菌 | OxdC |
| 3419 | 假设的蛋白yvrL[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34686 | 枯草芽孢杆菌 | YvrL |
| 3420 | BH3120蛋白[Bacillus halodurans] | UniRef100_Q9K886 | Bacillus halodurans | |
| 3421 | ||||
| 3422 | 组特异性蛋白[蜡状芽孢杆菌ZK] | UniRef100_Q633V1 | 蜡状芽孢杆菌ZK | |
| 3423 | ||||
| 3424 | ||||
| 3425 | ||||
| 3426 | UPI00003CC069 UniRef100条目 | UniRef100_UPI00003CC069 | ||
| 3427 | IS1627s1-相关，转座酶[炭疽芽孢杆菌A2012菌株] | UniRef100_Q7CMD0 | 炭疽芽孢杆菌A2012菌株 | |
| 3428 | LexA阻抑蛋白[单核细胞增生利斯特氏菌] | UniRef100_Q720B9 | 单核细胞增生利斯特氏菌 | |
| 3429 | 假设的蛋白[蜡状芽孢杆菌ZK] | UniRef100_Q630E5 | 蜡状芽孢杆菌ZK | |
| 3430 | 假设的蛋白[炭疽芽孢杆菌] | UniRef100_Q81XX1 | 炭疽芽孢杆菌 | |
| 3431 | ||||
| 3432 | 假设的蛋白RSc1705[Ralstoniasolanacearum] | UniRef100_Q8XYQ3 | Ralstonia solanacearum | |
| 3433 | YxiD | |||
| 3434 | 假设的蛋白[苏云金芽孢杆菌] | UniRef100_Q6HH72 | 苏云金芽孢杆菌 | |
| 3435 | BlyA | |||
| 3436 | ||||
| 3437 | ||||
| 3438 | ||||
| 3439 | YomQ蛋白[噬菌体SPBc2] | UniRef100_O64053 | 噬菌体SPBc2 | YomQ |
| 3440 | XkdV | |||
| 3441 | ||||
| 3442 | ||||
| 3443 | YubE | |||
| 3444 | ORF38[噬菌体phi-105] | UniRef100_Q9ZXE5 | 噬菌体phi-105 | |
| 3445 | YqbO | |||
| 3446 | 假设的蛋白MW1895[金黄色葡萄球菌] | UniRef100_Q8NVQ7 | 金黄色葡萄球菌 | |
| 3447 | ||||
| 3448 | ||||
| 3449 | 原噬菌体LambdaBa02，主要尾蛋白，推测的[炭疽芽孢杆菌] | UniRef100_Q81W97 | 炭疽芽孢杆菌 | |
| 3450 | ||||
| 3451 | ORF32[噬菌体phi-105] | UniRef100_Q9ZXF1 | 噬菌体phi-105 | |
| 3452 | ||||
| 3453 | Gp7蛋白[噬菌体phi3626] | UniRef100_Q8SBP7 | 噬菌体phi3626 | |
| 3454 | ORF29[噬菌体phi-105] | UniRef100_Q9ZXF4 | 噬菌体phi-105 | |
| 3455 | ORF27[噬菌体phi-105] | UniRef100_Q9ZXF6 | 噬菌体phi-105 | |
| 3456 | ClpP家族丝氨酸蛋白酶，可能与噬菌体相关[丙酮丁醇梭菌] | UniRef100_Q97HW4 | 丙酮丁醇梭菌 | ClpP |
| 3457 | ORF25[噬菌体phi-105] | UniRef100_Q9ZXF8 | 噬菌体phi-105 | |
| 3458 | ||||
| 3459 | 推测的末端酶大亚基[噬菌体phi3626] | UniRef100_Q8SBQ2 | 噬菌体phi3626 | |
| 3460 | 类噬菌体末端酶蛋白小亚基[丙酮丁醇梭菌] | UniRef100_Q97HW1 | 丙酮丁醇梭菌 | |
| 3461 | 原噬菌体LambdaBa02，HNH内切核酸酶家族蛋白[炭疽芽孢杆菌] | UniRef100_Q81W86 | 炭疽芽孢杆菌 | |
| 3462 | 芽孢外被蛋白D[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P07791 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 3463 | ORF16[噬菌体phi-105] | UniRef100_Q9ZXB9 | 噬菌体phi-105 | |
| 3464 | ||||
| 3465 | ||||
| 3466 | ORF14[噬菌体phi-105] | UniRef100_Q9ZXC1 | 噬菌体phi-105 | |
| 3467 | ORF13[噬菌体phi-105] | UniRef100_Q9ZXC2 | 噬菌体phi-105 | |
| 3468 | ORF12[噬菌体phi-05] | UniRef100_Q9ZXC3 | 噬菌体phi-105 | |
| 3469 | ||||
| 3470 | ORF11[噬菌体phi-105] | UniRef100_Q9ZXC4 | 噬菌体phi-105 | |
| 3471 | ORF10[噬菌体phi-105] | UniRef100_Q9ZXC5 | 噬菌体phi-105 | |
| 3472 | DNA，全序列[噬菌体phi-105] | UniRef100_Q9ZXC7 | 噬菌体phi-105 | |
| 3473 | DNA，全序列[噬菌体phi-105] | UniRef100_Q9ZXC8 | 噬菌体phi-105 | |
| 3474 | ||||
| 3475 | ||||
| 3476 | ||||
| 3477 | Orf36[金黄色葡萄球菌噬菌体PVL] | UniRef100_Q9T1Z5 | 金黄色葡萄球菌 噬菌体PVL | |
| 3478 | ||||
| 3479 | Orf16[噬菌体bIL312] | UniRef100_Q9AZE4 | 噬菌体bIL312 | |
| 3480 | Gp26蛋白[噬菌体phi3626] | UniRef100_Q8SBM8 | 噬菌体phi3626 | |
| 3481 | 类CI蛋白[干酪乳杆菌(Lactobacillus casei)噬菌体A2] | UniRef100_O64370 | 干酪乳杆菌噬菌体A2 | |
| 3482 | Int基因产物[金黄色葡萄球菌] | UniRef100_Q932E5 | 金黄色葡萄球菌 | YdcL |
| 3483 | SsrA结合蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32230 | 枯草芽孢杆菌 | SmpB |
| 3484 | 核糖核酸酶R[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32231 | 枯草芽孢杆菌 | Rnr |
| 3485 | YvaK蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32232 | 枯草芽孢杆菌 | YvaK |
| 3486 | ||||
| 3487 | ||||
| 3488 | ||||
| 3489 | YvaO | |||
| 3490 | YvaO | |||
| 3491 | 甘氨酸甜菜碱/肉碱/胆碱转运系统通透酶蛋白opuCD[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34742 | 枯草芽孢杆菌 | OpuCD |
| 3492 | 甘氨酸甜菜碱/肉碱/胆碱结合蛋白前体[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32243 | 枯草芽孢杆菌 | OpuCC |
| 3493 | 甘氨酸甜菜碱/肉碱/胆碱转运系统通透酶蛋白opuCB[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34878 | 枯草芽孢杆菌 | OpuCB |
| 3494 | 甘氨酸甜菜碱/肉碱/胆碱转运ATP结合蛋白opuCA[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34992 | 枯草芽孢杆菌 | OpuCA |
| 3495 | ORF-1[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34709 | 枯草芽孢杆菌 | YvaV |
| 3496 | YvbG | |||
| 3497 | YvbI | |||
| 3498 | YvbJ蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32247 | 枯草芽孢杆菌 | YvbJ |
| 3499 | UPI00003CBDCC UniRef100条 | UniRef100_UPI00003CBDCC | YfiY | |
| 目 | ||||
| 3500 | ||||
| 3501 | YoaZ[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34947 | 枯草芽孢杆菌 | YoaZ |
| 3502 | 烯醇化酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P37869 | 枯草芽孢杆菌 | Eno |
| 3503 | 2，3-二磷酸甘油酸非依赖磷酸甘油酸变位酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39773 | 枯草芽孢杆菌 | Pgm |
| 3504 | 丙糖磷酸异构酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P27876 | 枯草芽孢杆菌 | TpiA |
| 3505 | 磷酸甘油酸激酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P40924 | 枯草芽孢杆菌 | Pgk |
| 3506 | 甘油醛-3-磷酸脱氢酶1[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P09124 | 枯草芽孢杆菌 | GapA |
| 3507 | 中枢糖酵解基因调节蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32253 | 枯草芽孢杆菌 | CggR |
| 3508 | 假设的蛋白yvbT[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32254 | 枯草芽孢杆菌 | YvbT |
| 3509 | YvbW蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32257 | 枯草芽孢杆菌 | YvbW |
| 3510 | ||||
| 3511 | ABC型多药转运系统，ATP酶组分[腾冲热厌氧杆菌] | UniRef100_Q8R7K3 | 腾冲热厌氧杆菌 | YfiL |
| 3512 | ||||
| 3513 | YvbY蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32259 | 枯草芽孢杆菌 | YvbY |
| 3514 | YvfW蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O07021 | 枯草芽孢杆菌 | YvfW |
| 3515 | YvfV | |||
| 3516 | 假设的蛋白yvfI[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O07007 | 枯草芽孢杆菌 | YvfI |
| 3517 | 推测的L-乳酸通透酶yvfH[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P71067 | 枯草芽孢杆菌 | YvfH |
| 3518 | RNA聚合酶σ-54因子[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P24219 | 枯草芽孢杆菌 | SigL |
| 3519 | 假设的蛋白yvfG[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P71066 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 3520 | 假设的蛋白yvfF[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P71065 | 枯草芽孢杆菌 | YvfF |
| 3521 | YvfE蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q795J3 | 枯草芽孢杆菌 | YvfE |
| 3522 | 假设的蛋白yvfD[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P71063 | 枯草芽孢杆菌 | YvfD |
| 3523 | 假设的蛋白yvfC[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P71062 | 枯草芽孢杆菌 | YvfC |
| 3524 | YvfB | |||
| 3525 | YvfA | |||
| 3526 | 假设的蛋白yveT[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P71059 | 枯草芽孢杆菌 | YveT |
| 3527 | 假设的蛋白yveS[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P71058 | 枯草芽孢杆菌 | YveS |
| 3528 | 假设的蛋白yveR[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P71057 | 枯草芽孢杆菌 | YveR |
| 3529 | 假设的蛋白yveQ[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P71056 | 枯草芽孢杆菌 | YveQ |
| 3530 | 假设的蛋白yveP[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P71055 | 枯草芽孢杆菌 | Yvep |
| 3531 | 假设的蛋白yveO[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P71054 | 枯草芽孢杆菌 | YveO |
| 3532 | 假设的蛋白yveN[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P71053 | 枯草芽孢杆菌 | YveN |
| 3533 | 假设的蛋白yveM[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P71052 | 枯草芽孢杆菌 | YveM |
| 3534 | YveL | |||
| 3535 | 链长决定蛋白[蜡状芽孢杆菌] | UniRef100_Q72XH7 | 蜡状芽孢杆菌 | YveK |
| 3536 | 假设的蛋白yveJ[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P71049 | 枯草芽孢杆菌 | Slr |
| 3537 | 普通应激蛋白14[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P80871 | 枯草芽孢杆菌 | YwrO |
| 3538 | YcbE | |||
| 3539 | UPI000027D43B UniRef100条目 | UniRef100_UPI000027D43B | YvcT | |
| 3540 | 4-羟基苏氨酸-4-磷酸脱氢酶(EC | UniRef100_Q8CUU4 | Oceanobacillus iheyensis | |
| 1.1.1.262)(4-(磷酸羟基)-L-苏氨酸脱氢酶)[Oceanobacillusiheyensis] | ||||
| 3541 | 假设的保守蛋白[Oceanobacillusiheyensis] | UniRef100_Q8CUU5 | Oceanobacillus iheyensis | |
| 3542 | GbsB | |||
| 3543 | DapA | |||
| 3544 | 转录调节蛋白[Oceanobacillusiheyensis] | UniRef100_Q8CUU7 | Oceanobacillusiheyensis | RocR |
| 3545 | 假设的蛋白[食菌蛭弧菌(Bdellovibrio bacteriovorus)] | UniRef100_Q6MH73 | 食菌蛭弧菌 | |
| 3546 | NADH依赖黄素氧化还原酶[Oceanobacillus iheyensis] | UniRef100_Q8ELB6 | Oceanobacillusiheyensis | YqiG |
| 3547 | 果聚糖蔗糖酶前体[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P05655 | 枯草芽孢杆菌 | SacB |
| 3548 | 假设的蛋白yveB[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O07003 | 枯草芽孢杆菌 | YveB |
| 3549 | 假设的蛋白[铜绿假单胞菌] | UniRef100_Q9I5B4 | 铜绿假单胞菌 | |
| 3550 | ATP依赖Clp蛋白酶蛋白水解亚基[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P80244 | 枯草芽孢杆菌 | ClpP |
| 3551 | 假设的蛋白yvdD[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O06986 | 枯草芽孢杆菌 | YvdD |
| 3552 | ||||
| 3553 | 可能的金属依赖磷酸水解酶；可能的oxetanocin A抗性蛋白[苏云金芽孢杆菌] | UniRef100_Q6HM73 | 苏云金芽孢杆菌 | YdhJ |
| 3554 | 假设的蛋白yvdB[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O06984 | 枯草芽孢杆菌 | YvdB |
| 3555 | 假设的蛋白yvdA[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O06983 | 枯草芽孢杆菌 | YvdA |
| 3556 | 可能的2-酮葡萄糖酸还原酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32264 | 枯草芽孢杆菌 | YvcT |
| 3557 | BH0392蛋白[Bacillus halodurans] | UniRef100_Q9KFT5 | Bacillushalodurans | YdfE |
| 3558 | BH0391蛋白[Bacillus halodurans] | UniRef100_Q9KFT6 | Bacillushalodurans | YdfF |
| 3559 | 核糖核酸酶[多粘类芽孢杆菌(Paenibacillus polymyxa)] | UniRef100_Q7M0X3 | 多粘类芽孢杆菌 | |
| 3560 | Barstar[解淀粉芽孢杆菌] | UniRef100_P11540 | 解淀粉芽孢杆菌 | |
| 3561 | 假设的蛋白yvcN[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O06977 | 枯草芽孢杆菌 | YvcN |
| 3562 | 类HPr蛋白crh[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O06976 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 3563 | 假设的蛋白yvcL[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O06975 | 枯草芽孢杆菌 | YvcL |
| 3564 | 假设的UPF0052蛋白yvcK[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O06974 | 枯草芽孢杆菌 | YvcK |
| 3565 | 假设的UPF0042蛋白yvcJ[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O06973 | 枯草芽孢杆菌 | YvcJ |
| 3566 | 假设的蛋白yvcI[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O06972 | 枯草芽孢杆菌 | YvcI |
| 3567 | 硫氧还蛋白还原酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P80880 | 枯草芽孢杆菌 | TrxB |
| 3568 | 假设的蛋白yvcD[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O06968 | 枯草芽孢杆菌 | YvcD |
| 3569 | 假设的保守蛋白[Oceanobacillusiheyensis] | UniRef100_Q8ETL1 | Oceanobacillusiheyensis | YbbJ |
| 3570 | 组氨酸生物合成双功能蛋白hisIE[包括：磷酸核糖-AMP环化水解 | UniRef100_O34912 | 包括：磷酸核糖-AMP环化水 | HisI |
| 酶(EC 3.5.4.19)(PRA-CH)；磷酸核糖-ATP焦磷酸酶(EC 3.6.1.31)(PRA-PH)][枯草芽孢杆菌] | 解酶(EC3.5.4.19)(PRA-CH)；磷酸核糖-ATP焦磷酸酶(EC3.6.1.31)(PRA-PH) | |||
| 3571 | 咪唑甘油磷酸合酶亚基hisF[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34727 | 枯草芽孢杆菌 | HisF |
| 3572 | 1-(5-磷酸核糖基)-5-[(5-磷酸核糖氨基)次甲基氨基]咪唑-4-甲酰胺异构酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O35006 | (5-磷酸核糖氨基)次甲基甲基氨基 | HisA |
| 3573 | 咪唑甘油磷酸合酶亚基hisH[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34565 | 枯草芽孢杆菌 | HisH |
| 3574 | 咪唑甘油-磷酸脱水酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34683 | 枯草芽孢杆菌 | HisB |
| 3575 | 组氨醇脱氢酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34651 | 枯草芽孢杆菌 | HisD |
| 3576 | ATP磷酸核糖转移酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34520 | 枯草芽孢杆菌 | HisG |
| 3577 | HisZ | |||
| 3578 | YvpB[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34735 | 枯草芽孢杆菌 | YvpB |
| 3579 | 果胶酸裂合酶Pel-28K[芽孢杆菌P-2850菌种] | UniRef100_Q8L0R5 | 芽孢杆菌P-2850菌种 | YvpA |
| 3580 | 推测的乙酰基转移酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34993 | 枯草芽孢杆菌 | YvoF |
| 3581 | 焦磷酸酶ppaX[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q9JMQ2 | 枯草芽孢杆菌 | HprP |
| 3582 | YvoD[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34382 | 枯草芽孢杆菌 | YvoD |
| 3583 | 脂蛋白原(prolipoprotein)二酰基甘油基转移酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34752 | 枯草芽孢杆菌 | Lgt |
| 3584 | HPr激酶/磷酸化酶(EC 2.7.1.-)(EC 2.7.4.-)(HPrK/P)(HPr(Ser)激酶/磷酸化酶)[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34483 | 枯草芽孢杆菌 | HprK |
| 3585 | YfiV蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31564 | 枯草芽孢杆菌 | YfiV |
| 3586 | YfiU蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31563 | 枯草芽孢杆菌 | YfiU |
| 3587 | YvnB[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34986 | 枯草芽孢杆菌 | YvnB |
| 3588 | YvlD[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34648 | 枯草芽孢杆菌 | YvlD |
| 3589 | YvlC[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34719 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 3590 | YvlB[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34628 | 枯草芽孢杆菌 | YvlB |
| 3591 | 假设的蛋白yvlA[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34322 | 枯草芽孢杆菌 | YvlA |
| 3592 | 假设的蛋白yvkN[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34604 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 3593 | ||||
| 3594 | UvrABC系统蛋白A[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34863 | 枯草芽孢杆菌 | UvrA |
| 3595 | UvrABC系统蛋白B[解淀粉芽孢杆菌] | UniRef100_Q659H3 | 解淀粉芽孢杆菌 | UvrB |
| 3596 | CsbA蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P37953 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 3597 | ||||
| 3598 | YvjD[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34375 | 枯草芽孢杆菌 | YvjD |
| 3599 | YvzD | |||
| 3600 | 推测的蛋白酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O35002 | 枯草芽孢杆菌 | YvjB |
| 3601 | 酒石酸脱氢酶[Oceanobacillusiheyensis] | UniRef100_Q8ESH5 | Oceanobacillusiheyensis | YcsA |
| 3602 | 细胞壁结合蛋白[Bacillushalodurans] | UniRef100_Q9K6X4 | Bacillushalodurans | YvcE |
| 3603 | 细胞分裂蛋白ftsX同源物[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34876 | 枯草芽孢杆菌 | FtsX |
| 3604 | 细胞分裂ATP结合蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34814 | 枯草芽孢杆菌 | FtsE |
| 3605 | 细胞色素c-551[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34594 | 枯草芽孢杆菌 | CccB |
| 3606 | YvjA[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34792 | 枯草芽孢杆菌 | YvjA |
| 3607 | 肽链释放因子2[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P28367 | 枯草芽孢杆菌 | PrfB |
| 3608 | 前蛋白移位酶secA亚基[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P28366 | 枯草芽孢杆菌 | SecA |
| 3609 | 假设的蛋白yvyD[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P28368 | 枯草芽孢杆菌 | YvyD |
| 3610 | ||||
| 3611 | 鞭毛的蛋白fliT[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39740 | 枯草芽孢杆菌 | FliT |
| 3612 | 鞭毛的蛋白fliS[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39739 | 枯草芽孢杆菌 | FliS |
| 3613 | 鞭毛钩相关蛋白2[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39738 | 枯草芽孢杆菌 | FliD |
| 3614 | 假设的蛋白yvyC[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39737 | 枯草芽孢杆菌 | YvyC |
| 3615 | 鞭毛蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P02968 | 枯草芽孢杆菌 | Hag |
| 3616 | 碳贮藏调节蛋白同源物[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P33911 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 3617 | 跨膜蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P96503 | 枯草芽孢杆菌 | YviF |
| 3618 | YviE蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P96502 | 枯草芽孢杆菌 | YviE |
| 3619 | 鞭毛钩相关蛋白3[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P96501 | 枯草芽孢杆菌 | FlgL |
| 3620 | 鞭毛钩相关蛋白1[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39810 | 枯草芽孢杆菌 | FlgK |
| 3621 | 假设的蛋白yvyG[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39808 | 枯草芽孢杆菌 | YvyG |
| 3622 | 鞭毛蛋白合成的负调节蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39809 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 3623 | 假设的蛋白yvyF[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39807 | 枯草芽孢杆菌 | YvyF |
| 3624 | ComFC | |||
| 3625 | ||||
| 3626 | ComFA | |||
| 3627 | DegV蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P32436 | 枯草芽孢杆菌 | YviA |
| 3628 | 转录调节蛋白degU[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P13800 | 枯草芽孢杆菌 | DegU |
| 3629 | DegS | |||
| 3630 | 假设的UPF0029蛋白yvyE[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P32437 | 枯草芽孢杆菌 | YvyE |
| 3631 | 推测的转录调节蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P96499 | 枯草芽孢杆菌 | YvhJ |
| 3632 | 假设的蛋白yunG[蜡状芽孢杆菌ZK] | UniRef100_Q63CU2 | 蜡状芽孢杆菌ZK | YunG |
| 3633 | 可能的十一异戊二烯基-磷酸N-乙酰葡糖胺1-磷酸转移酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34753 | 枯草芽孢杆菌 | TagO |
| 3634 | 推测的糖醛酸磷壁酸质生物合成 | UniRef100_O32267 | 枯草芽孢杆菌 | TuaH |
| 糖基转移酶tuaH[枯草芽孢杆菌] | ||||
| 3635 | 推测的糖醛酸磷壁酸质生物合成糖基转移酶tuaG[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32268 | 枯草芽孢杆菌 | TuaG |
| 3636 | 糖醛酸磷壁酸质生物合成蛋白tuaF[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32269 | 枯草芽孢杆菌 | TuaF |
| 3637 | 糖醛酸磷壁酸质生物合成蛋白tuaE[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32270 | 枯草芽孢杆菌 | TuaE |
| 3638 | 推测的UDP-葡萄糖4-差向异构酶[詹氏甲烷球菌] | UniRef100_Q57664 | 詹氏甲烷球菌 | GalE |
| 3639 | UDP-葡萄糖6-脱氢酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32271 | 枯草芽孢杆菌 | TuaD |
| 3640 | 推测的糖醛酸磷壁酸质生物合成糖基转移酶tuaC[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32272 | 枯草芽孢杆菌 | TuaC |
| 3641 | 糖醛酸磷壁酸质生物合成蛋白tuaB[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32273 | 枯草芽孢杆菌 | TuaB |
| 3642 | UPI00003CB85E UniRef100条目 | UniRef100_UPI00003CB85E | TuaA | |
| 3643 | LytC | |||
| 3644 | 酰胺酶增强子前体[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q02113 | 枯草芽孢杆菌 | LytB |
| 3645 | LytA | |||
| 3646 | 膜结合蛋白lytR[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q02115 | 枯草芽孢杆菌 | LytR |
| 3647 | UDP-N-乙酰葡糖胺2-差向异构酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39131 | 枯草芽孢杆菌 | YvyH |
| 3648 | UTP--葡萄糖-1-磷酸尿苷酰转移酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q05852 | 枯草芽孢杆菌 | GtaB |
| 3649 | TagH | |||
| 3650 | 胞壁酸转运通透酶蛋白tagG[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P42953 | 枯草芽孢杆菌 | TagG |
| 3651 | 胞壁酸生物合成蛋白[乳酸乳球菌] | UniRef100_Q9CH20 | 乳酸乳球菌 | TagF |
| 3652 | CDP-甘油：聚(甘油磷酸)甘油磷酸转移酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P13485 | 枯草芽孢杆菌 | TagF |
| 3653 | TagD | |||
| 3654 | TagA | |||
| 3655 | 推测的CDP-甘油：甘油磷酸甘油磷酸转移酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P27621 | 枯草芽孢杆菌 | TagB |
| 3656 | β-N-乙酰葡萄糖胺酶前体[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39848 | 枯草芽孢杆菌 | LytD |
| 3657 | 甘露糖-6-磷酸异构酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39841 | 枯草芽孢杆菌 | Pmi |
| 3658 | ||||
| 3659 | 厌氧核糖核苷三磷酸还原酶，推测的[蜡状芽孢杆菌] | UniRef100_Q733N6 | 蜡状芽孢杆菌 | |
| 3660 | 2-酮-3-脱氧葡萄糖酸通透酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P50847 | 枯草芽孢杆菌 | KdgT |
| 3661 | KHG/KDPG醛缩酶[包括：4-羟基-2-酮戊二酸醛缩酶(EC4.1.3.16)(2-酮-4-羟基戊二酸醛缩酶)(KHG-醛缩酶)；2-脱氢-3-脱氧-磷酸葡萄糖酸醛缩酶(EC | UniRef100_P50846 | 包括：4-羟基-2-酮戊二酸醛缩酶(EC4.1.3.16)(2-酮-4-羟基戊二酸 | KdgA |
| 4.1.2.14)(磷酸-2-脱氢-3-脱氧葡萄糖酸醛缩酶)(磷酸-2-酮-3-d | 醛缩酶)(KHG-醛缩酶)；2-脱氢-3-脱氧-磷酸葡萄糖酸醛缩酶(EC4.1.2.14)(磷酸-2-脱氢-3-脱氧葡萄糖酸醛缩酶)(磷酸-2-酮-3-脱氧葡萄糖酸aldol | |||
| 3662 | 2-脱氢-3-脱氧葡萄糖酸激酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P50845 | 枯草芽孢杆菌 | KdgK |
| 3663 | HTH型转录调节蛋白kdgR[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P50844 | 枯草芽孢杆菌 | KdgR |
| 3664 | KduI | |||
| 3665 | 2-脱氧-D-葡萄糖酸3-脱氢酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P50842 | 枯草芽孢杆菌 | KduD |
| 3666 | 醇脱氢酶，谷胱甘肽依赖型醛脱氢酶[苏云金芽孢杆菌] | UniRef100_Q6HGX1 | 苏云金芽孢杆菌 | AdhB |
| 3667 | YwtG蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P96742 | 枯草芽孢杆菌 | YwtG |
| 3668 | 假设的转录调节蛋白ywtF[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q7WY78 | 枯草芽孢杆菌 | YwtF |
| 3669 | YwtE蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P96741 | 枯草芽孢杆菌 | YwtE |
| 3670 | γ-DL-谷氨酰水解酶前体[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P96740 | 枯草芽孢杆菌 | YwtD |
| 3671 | ||||
| 3672 | YwtB蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P96738 | 枯草芽孢杆菌 | YwtB |
| 3673 | YwtA蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P96737 | 枯草芽孢杆菌 | YwtA |
| 3674 | YwsC蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P96736 | 枯草芽孢杆菌 | YwsC |
| 3675 | RbsR | |||
| 3676 | 核糖激酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P36945 | 枯草芽孢杆菌 | RbsK |
| 3677 | 高亲和核糖转运蛋白rbsD[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P36946 | 枯草芽孢杆菌 | RbsD |
| 3678 | 核糖转运ATP结合蛋白rbsA[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P36947 | 枯草芽孢杆菌 | RbsA |
| 3679 | 核糖转运系统通透酶蛋白rbsC[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P36948 | 枯草芽孢杆菌 | RbsC |
| 3680 | D-核糖结合蛋白前体[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P36949 | 枯草芽孢杆菌 | RbsB |
| 3681 | α-乙酰乳酸脱羧酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q04777 | 枯草芽孢杆菌 | AlsD |
| 3682 | 乙酰乳酸合酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q04789 | 枯草芽孢杆菌 | AlsS |
| 3683 | HTH型转录调节蛋白alsR[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q04778 | 枯草芽孢杆菌 | AlsR |
| 3684 | YwrD蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O05218 | 枯草芽孢杆菌 | YwrD |
| 3685 | YwrC蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O05217 | 枯草芽孢杆菌 | YwrC |
| 3686 | YwrB蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O05216 | 枯草芽孢杆菌 | YwrB |
| 3687 | YwrA蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O05215 | 枯草芽孢杆菌 | YwrA |
| 3688 | 推测的蛋白酪氨酸磷酸酶ywqE | UniRef100_P96717 | 枯草芽孢杆菌 | YwqE |
| [枯草芽孢杆菌] | ||||
| 3689 | 假设的蛋白ywqC[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P96715 | 枯草芽孢杆菌 | YwqC |
| 3690 | 假设的蛋白ywqB[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P96714 | 枯草芽孢杆菌 | YwqB |
| 3691 | YwqA蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P94593 | 枯草芽孢杆菌 | YwqA |
| 3692 | YwpJ蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P94592 | 枯草芽孢杆菌 | YwpJ |
| 3693 | YwpI蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P94591 | 枯草芽孢杆菌 | GlcR |
| 3694 | 果糖-6-磷酸醛缩酶2[大肠杆菌O157:H7] | UniRef100_P58424 | 大肠杆菌O157:H7 | YwjH |
| 3695 | 假设的蛋白PM1968[多杀巴斯德氏菌(Pasteurella multocida)] | UniRef100_Q9CJM9 | 多杀巴斯德氏菌 | FabG |
| 3696 | PTS系统，山梨醇特异性IIA组分[粪肠球菌] | UniRef100_Q82YX6 | 粪肠球菌 | |
| 3697 | PTS系统，山梨醇特异性IIBC组分[粪肠球菌] | UniRef100_Q82YX5 | 粪肠球菌 | |
| 3698 | UPI00002F4A3A UniRef100条目 | UniRef100_UPI00002F4A3A | ||
| 3699 | 山梨醇操纵子激活物[变异链球菌] | UniRef100_Q9X673 | 变异链球菌 | |
| 3700 | 推测的山梨糖摄取和利用基因的转录调节蛋白[弗氏志贺氏菌(Shigella flexneri)] | UniRef100_Q83PA8 | 弗氏志贺氏菌 | DeoR |
| 3701 | YwpH蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P94590 | 枯草芽孢杆菌 | YwpH |
| 3702 | 假设的蛋白ywpG[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P94589 | 枯草芽孢杆菌 | YwpG |
| 3703 | YwpF蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P94588 | 枯草芽孢杆菌 | YwpF |
| 3704 | 大电导率力敏感离子通道(Large-conductancemechanosensitive channel)[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P94585 | 枯草芽孢杆菌 | MscL |
| 3705 | (3R)-羟基肉豆蔻酰-[酰基载体蛋白脱水酶(EC 4.2.1.-)((3R)-羟基肉豆蔻酰ACP脱水酶)[炭疽芽孢杆菌] | UniRef100_Q81JE0 | 酰基载体蛋白 | YwpB |
| 3706 | 鞭毛钩-基体复合物蛋白flhP[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39753 | 枯草芽孢杆菌 | FlhP |
| 3707 | 鞭毛钩-基体复合物蛋白flhO[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39752 | 枯草芽孢杆菌 | FlhO |
| 3708 | 类MreB蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39751 | 枯草芽孢杆菌 | Mbl |
| 3709 | 阶段III芽孢形成蛋白D[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P15281 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 3710 | ||||
| 3711 | 假设的蛋白ywoH[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P94578 | 枯草芽孢杆菌 | YwoH |
| 3712 | 假设的蛋白ywoG[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P94577 | 枯草芽孢杆菌 | YwoG |
| 3713 | 假设的蛋白ywoA[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P94571 | 枯草芽孢杆菌 | YwoA |
| 3714 | 锰依赖无机焦磷酸酶[蜡状芽孢杆菌ZK] | UniRef100_Q63AC7 | 蜡状芽孢杆菌ZK | PpaC |
| 3715 | 可能的锰过氧化氢酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P80878 | 枯草芽孢杆菌 | YdbD |
| 3716 | 假设的蛋白yqjF[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54543 | 枯草芽孢杆菌 | YqjF |
| 3717 | BH2605蛋白[Bacillus halodurans] | UniRef100_Q9K9P0 | Bacillushalodurans | YhcV |
| 3718 | 假设的蛋白yqxL[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P40948 | 枯草芽孢杆菌 | YqxL |
| 3719 | 假设的UPF0053蛋白yqhB[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54505 | 枯草芽孢杆菌 | YqhB |
| 3720 | 铵转运蛋白nrgA[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q07429 | 枯草芽孢杆菌 | NrgA |
| 3721 | 类氮调节PII蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q07428 | 枯草芽孢杆菌 | NrgB |
| 3722 | ATP依赖Clp蛋白酶蛋白水解亚基[蜡状芽孢杆菌] | UniRef100_Q81CH1 | 蜡状芽孢杆菌 | ClpP |
| 3723 | RNA聚合酶ECF型σ因子[蜡状芽孢杆菌ZK] | UniRef100_Q63AF9 | 蜡状芽孢杆菌ZK | SigM |
| 3724 | 假设的蛋白ywnI[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P71044 | 枯草芽孢杆菌 | SpoIIQ |
| 3725 | 假设的蛋白ywnH[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P71043 | 枯草芽孢杆菌 | YwnH |
| 3726 | 假设的蛋白ywnF[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P71041 | 枯草芽孢杆菌 | YwnF |
| 3727 | 可能的心磷脂合成酶2[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P71040 | 枯草芽孢杆菌 | YwnE |
| 3728 | UPI00003CB764 UniRef100条目 | UniRef100_UPI00003CB764 | YhcA | |
| 3729 | 抗生素/铁载体生物合成蛋白[蜡状芽孢杆菌] | UniRef100_Q81DP7 | 蜡状芽孢杆菌 | |
| 3730 | 可能的丝氨酸活化酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P45745 | 枯草芽孢杆菌 | DhbF |
| 3731 | 异分支酸酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P45743 | 枯草芽孢杆菌 | DhbB |
| 3732 | 2，3-二羟基苯甲酸-AMP连接酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P40871 | 枯草芽孢杆菌 | DhbE |
| 3733 | 异分支酸合酶dhbC[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P45744 | 枯草芽孢杆菌 | DhbC |
| 3734 | 2，3-二氢-2，3-二羟基苯甲酸脱氢酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39071 | 枯草芽孢杆菌 | DhbA |
| 3735 | YuiI蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32102 | 枯草芽孢杆菌 | YuiI |
| 3736 | 铁摄取系统通透酶蛋白feuC[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P40411 | 枯草芽孢杆菌 | FeuC |
| 3737 | 铁摄取系统通透酶蛋白feuB[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P40410 | 枯草芽孢杆菌 | FeuB |
| 3738 | 铁摄取系统结合蛋白前体[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P40409 | 枯草芽孢杆菌 | FeuA |
| 3739 | 推测的HTH型转录调节蛋白ybbB[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P40408 | 枯草芽孢杆菌 | YbbB |
| 3740 | 假设的蛋白ywnG[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P71042 | 枯草芽孢杆菌 | YwnC |
| 3741 | UPI00003CC069 UniRef100条目 | UniRef100_UPI00003CC069 | ||
| 3742 | IS1627s1-相关，转座酶[炭疽芽孢杆菌A2012菌株] | UniRef100_Q7CMD0 | 炭疽芽孢杆菌A2012菌株 | |
| 3743 | 假设的蛋白ywnB[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P71037 | 枯草芽孢杆菌 | YwnB |
| 3744 | 假设的蛋白ywnA[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P71036 | 枯草芽孢杆菌 | YwnA |
| 3745 | ||||
| 3746 | 假设的蛋白ywmF[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P70963 | 枯草芽孢杆菌 | YwmF |
| 3747 | MoaA | |||
| 3748 | FdhD蛋白同源物[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39756 | 枯草芽孢杆菌 | FdhD |
| 3749 | BH2528蛋白[Bacillus halodurans] | UniRef100_Q9K9W7 | Bacillushalodurans | YbfB |
| 3750 | 甲酸脱氢酶α链[Bacillushalodurans] | UniRef100_Q9K9W5 | Bacillushalodurans | YjgC |
| 3751 | YwmD | |||
| 3752 | 假设的蛋白ywmC前体[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P70960 | 枯草芽孢杆菌 | YwmC |
| 3753 | 阶段II芽孢形成蛋白D[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P07372 | 枯草芽孢杆菌 | SpoIID |
| 3754 | UDP-N-乙酰葡糖胺1-羧乙烯基转移酶1[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P70965 | 枯草芽孢杆菌 | MurAA |
| 3755 | YwmB蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32277 | 枯草芽孢杆菌 | YwmB |
| 3756 | YwzB蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32278 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 3757 | ATP合酶ε链[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P37812 | 枯草芽孢杆菌 | AtpC |
| 3758 | ATP合酶β链[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P37809 | 枯草芽孢杆菌 | AtpD |
| 3759 | ATP合酶γ链[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P37810 | 枯草芽孢杆菌 | AtpG |
| 3760 | ATP合酶α链[解淀粉芽孢杆菌] | UniRef100_Q659H2 | 解淀粉芽孢杆菌 | AtpA |
| 3761 | ATP合酶δ链[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P37811 | 枯草芽孢杆菌 | AtpH |
| 3762 | ATP合酶B链[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P37814 | 枯草芽孢杆菌 | AtpF |
| 3763 | ATP合酶a链[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P37813 | 枯草芽孢杆菌 | AtpB |
| 3764 | AtpI | |||
| 3765 | 尿嘧啶磷酸核糖转移酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39149 | 枯草芽孢杆菌 | Upp |
| 3766 | 丝氨酸羟甲基转移酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39148 | 枯草芽孢杆菌 | GlyA |
| 3767 | 假设的蛋白ywlG[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39157 | 枯草芽孢杆菌 | YwlG |
| 3768 | 假设的lacA/rpiB家族蛋白ywlF[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39156 | 枯草芽孢杆菌 | YwlF |
| 3769 | 推测的低分子量蛋白酪氨酸-磷酸酶ywlE[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39155 | 枯草芽孢杆菌 | YwlE |
| 3770 | 假设的UPF0059蛋白ywlD[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39154 | 枯草芽孢杆菌 | YwlD |
| 3771 | 假设的蛋白ywlC[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39153 | 枯草芽孢杆菌 | YwlC |
| 3772 | 假设的蛋白ywlB[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39152 | 枯草芽孢杆菌 | YwlB |
| 3773 | 阶段II芽孢形成蛋白R[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39151 | 枯草芽孢杆菌 | SpoIIR |
| 3774 | 假设的蛋白yhjI[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O07563 | 枯草芽孢杆菌 | GlcP |
| 3775 | 假设的蛋白yhjJ[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O07564 | 枯草芽孢杆菌 | YhjJ |
| 3776 | 假设的蛋白[炭疽芽孢杆菌] | UniRef100_Q81NC8 | 炭疽芽孢杆菌 | YhjK |
| 3777 | 假设的蛋白yhjL[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O07566 | 枯草芽孢杆菌 | YhjL |
| 3778 | 假设的蛋白yhjM[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O07567 | 枯草芽孢杆菌 | YhjM |
| 3779 | HemK蛋白同源物[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P45873 | 枯草芽孢杆菌 | YwkE |
| 3780 | 肽链释放因子1[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P45872 | 枯草芽孢杆菌 | PrfA |
| 3781 | 假设的蛋白ywkD[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P45871 | 枯草芽孢杆菌 | YwkD |
| 3782 | 假设的蛋白ywkC[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P45870 | 枯草芽孢杆菌 | YwkC |
| 3783 | 假设的蛋白ywkB[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P45869 | 枯草芽孢杆菌 | YwkB |
| 3784 | 可能的NAD依赖苹果酸酶2[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P45868 | 枯草芽孢杆菌 | YwkA |
| 3785 | 胸苷激酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q03221 | 枯草芽孢杆菌 | Tdk |
| 3786 | 50S核糖体蛋白L31[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q03223 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 3787 | 转录终止因子rho[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q03222 | 枯草芽孢杆菌 | Rho |
| 3788 | 假设的蛋白ywjI[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q03224 | 枯草芽孢杆菌 | YwjI |
| 3789 | UDP-N-乙酰葡糖胺1-羧乙烯基转移酶2[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P19670 | 枯草芽孢杆菌 | MurAB |
| 3790 | 转醛醇酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P19669 | 枯草芽孢杆菌 | YwjH |
| 3791 | 可能的果糖-二磷酸醛缩酶1[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P13243 | 枯草芽孢杆菌 | FbaA |
| 3792 | 芽孢形成起始磷酸转移酶F[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P06628 | 枯草芽孢杆菌 | Spo0F |
| 3793 | 假设的蛋白ywjG[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P06629 | 枯草芽孢杆菌 | YwjG |
| 3794 | PyrG | |||
| 3795 | DNA指导的RNA聚合酶δ亚基[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P12464 | 枯草芽孢杆菌 | RpoE |
| 3796 | 酰基-辅酶A脱氢酶[蜡状芽孢杆菌] | UniRef100_Q814S9 | 蜡状芽孢杆菌 | AcdA |
| 3797 | 酰基-辅酶A脱氢酶[炭疽芽孢杆菌] | UniRef100_Q81JV7 | 炭疽芽孢杆菌 | MmgC |
| 3798 | UPI00003CC303 UniRef100条目 | UniRef100_UPI00003CC303 | MmgB | |
| 3799 | 乙酰-辅酶A乙酰基转移酶[Oceanobacillus iheyensis] | UniRef100_Q8EM47 | Oceanobacillusiheyensis | MmgA |
| 3800 | 假设的蛋白ywjF[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P45866 | 枯草芽孢杆菌 | YwjF |
| 3801 | YwjE | |||
| 3802 | 假设的蛋白ywjC[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P45863 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 3803 | 精氨酰-tRNA合成酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P46906 | 枯草芽孢杆菌 | ArgS |
| 3804 | YwiB | |||
| 3805 | 鲱精胺酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P70999 | 枯草芽孢杆菌 | SpeB |
| 3806 | 亚精胺合酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P70998 | 枯草芽孢杆菌 | SpeE |
| 3807 | UPI00002A1DD1 UniRef100条目 | UniRef100_UPI00002A1DD1 | ||
| 3808 | 假设的蛋白ywhE[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P70997 | 枯草芽孢杆菌 | YwhE |
| 3809 | 假设的蛋白ywhD[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P70996 | 枯草芽孢杆菌 | YwhD |
| 3810 | 假设的蛋白ywhC[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P70995 | 枯草芽孢杆菌 | YwhC |
| 3811 | 可能的互变异构酶ywhB[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P70994 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 3812 | 保守蛋白[梅氏甲烷八叠球菌] | UniRef100_Q8PUC6 | 梅氏甲烷八叠球菌 | |
| 3813 | 假设的蛋白ywgA[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P71046 | 枯草芽孢杆菌 | YwgA |
| 3814 | 假设的蛋白ywfO[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39651 | 枯草芽孢杆菌 | YwfO |
| 3815 | YwzC蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32280 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 3816 | 前芽孢特异性转录调节蛋白rsfA[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39650 | 枯草芽孢杆菌 | RsfA |
| 3817 | 假设的蛋白yjdJ前体[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31651 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 3818 | 假设的蛋白ywfL[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39648 | 枯草芽孢杆菌 | YwfL |
| 3819 | 4-羟基苯甲酸3-单加氧酶[假单胞菌菌种] | UniRef100_Q59724 | 假单胞菌菌种 | YhjG |
| 3820 | 苯甲酸转运蛋白[假单胞菌ND6菌种] | UniRef100_Q6XUN5 | 假单胞菌ND6菌种 | YceI |
| 3821 | 推测的3，4-二羟基苯乙酸2，3-双加氧酶[血色红假单胞菌] | UniRef100_Q6N986 | 血色红假单胞菌 | |
| 3822 | 4-草酰巴豆酸互变异构酶[恶臭假单胞菌] | UniRef100_Q9Z431 | 恶臭假单胞菌 | |
| 3823 | 4-草酰巴豆酸脱羧酶[假单胞菌S-47菌种] | UniRef100_Q84I96 | 假单胞菌S-47菌种 | |
| 3824 | DhaS | |||
| 3825 | 推测的转录调节蛋白[根瘤农杆菌] | UniRef100_Q9F7C7 | 根瘤农杆菌 | KipR |
| 3826 | 假设的蛋白SCO6305[天蓝色链霉菌] | UniRef100_Q93RT6 | 天蓝色链霉菌 | |
| 3827 | 磷酸乙酰基转移酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39646 | 枯草芽孢杆菌 | Pta |
| 3828 | 假设的蛋白ywfI[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39645 | 枯草芽孢杆菌 | YwfI |
| 3829 | YuaB | |||
| 3830 | Na+-转运ATP合酶[Bacillushalodurans] | UniRef100_Q9KF87 | Bacillushalodurans | YubG |
| 3831 | 假设的蛋白ywdL[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39620 | 枯草芽孢杆菌 | YwdL |
| 3832 | 多药ABC转运蛋白，通透酶[蜡状芽孢杆菌ZK] | UniRef100_Q63D13 | 蜡状芽孢杆菌ZK | YfiN |
| 3833 | ABC转运蛋白，通透酶蛋白[蜡状芽孢杆菌] | UniRef100_Q73AB4 | 蜡状芽孢杆菌 | YfiM |
| 3834 | 多药ABC转运蛋白，ATP结合蛋白[蜡状芽孢杆菌ZK] | UniRef100_Q63D15 | 蜡状芽孢杆菌ZK | YfiL |
| 3835 | 传感蛋白组氨酸激酶，推测的[蜡状芽孢杆菌] | UniRef100_Q73AB6 | 蜡状芽孢杆菌 | YfiJ |
| 3836 | DNA-结合应答调节蛋白，LuxR家族[蜡状芽孢杆菌] | UniRef100_Q73AB7 | 蜡状芽孢杆菌 | YfiK |
| 3837 | YwdK | |||
| 3838 | 推测的嘌呤通透酶ywdJ[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39618 | 枯草芽孢杆菌 | YwdJ |
| 3839 | 假设的蛋白ywdI[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39617 | 枯草芽孢杆菌 | YwdI |
| 3840 | 可能的醛脱氢酶ywdH[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39616 | 枯草芽孢杆菌 | YwdH |
| 3841 | 尿嘧啶-DNA糖基酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39615 | 枯草芽孢杆菌 | Ung |
| 3842 | YwdF | |||
| 3843 | 磷酸甲基嘧啶激酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39610 | 枯草芽孢杆菌 | ThiD |
| 3844 | 假设的蛋白ywdA[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39609 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 3845 | 蔗糖-6-磷酸水解酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P07819 | 枯草芽孢杆菌 | SacA |
| 3846 | PTS系统，蔗糖特异性IIBC组分[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P05306 | 枯草芽孢杆菌 | SacP |
| 3847 | SacT | |||
| 3848 | ||||
| 3849 | 次要(minor)胞外蛋白酶vpr前体[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P29141 | 枯草芽孢杆菌 | Vpr |
| 3850 | ||||
| 3851 | YwcH | |||
| 3852 | 硝基/黄素还原酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39605 | 枯草芽孢杆菌 | NfrA |
| 3853 | N-酰基-L-氨基酸酰胺基水解酶[Bacillus halodurans] | UniRef100_Q9KCF8 | Bacillushalodurans | YhaA |
| 3854 | 假设的蛋白ywcF[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39604 | 枯草芽孢杆菌 | RodA |
| 3855 | RodA | |||
| 3856 | 膜蛋白[破伤风梭菌] | UniRef100_Q897A1 | 破伤风梭菌 | |
| 3857 | 假设的蛋白ywcE前体[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39603 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 3858 | 梭菌蛋白酶[噬乙酸甲烷八叠球菌] | UniRef100_Q8TIY6 | 噬乙酸甲烷八叠球菌 | |
| 3859 | YfmK蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34536 | 枯草芽孢杆菌 | YfmK |
| 3860 | ABC转运蛋白，ATP-结合/通透酶蛋白[丁香假单胞菌(Pseudomonas syringae)] | UniRef100_Q882Y2 | 丁香假单胞菌 | YgaD |
| 3861 | HlyB/MsbA家族ABC转运蛋白[紫色粘杆菌] | UniRef100_Q7NIB9 | 紫色粘杆菌 | YwjA |
| 3862 | ||||
| 3863 | ||||
| 3864 | ||||
| 3865 | ||||
| 3866 | 应答调节蛋白[蜡状芽孢杆菌ZK] | UniRef100_Q63FE4 | 蜡状芽孢杆菌ZK | ComA |
| 3867 | ||||
| 3868 | 醌醇氧化酶多肽IV[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P34959 | 枯草芽孢杆菌 | QoxD |
| 3869 | 醌醇氧化酶多肽III(EC 1.10.3.-)(醌醇氧化酶氨基酸3-600，亚基qoxC)(氧化酶氨基酸(3)-600亚基3)[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P34958 | 枯草芽孢杆菌 | QoxC |
| 3870 | 醌醇氧化酶多肽I(EC 1.10.3.-)(醌醇氧化酶氨基酸3-600，亚基qoxB)(氧化酶氨基酸(3)-600亚基1)[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P34956 | 枯草芽孢杆菌 | QoxB |
| 3871 | QoxA | |||
| 3872 | UDP-葡萄糖4-差向异构酶[腾冲 | UniRef100_Q8R8R8 | 腾冲热厌氧杆 | GalE |
| 热厌氧杆菌] | 菌 | |||
| 3873 | ||||
| 3874 | ||||
| 3875 | ||||
| 3876 | 假设的蛋白ywqN[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P96726 | 枯草芽孢杆菌 | YwqN |
| 3877 | 假设的蛋白ywcB[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39600 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 3878 | 推测的同向转运蛋白ywcA[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39599 | 枯草芽孢杆菌 | YwcA |
| 3879 | XylB | |||
| 3880 | 木糖异构酶[芽孢杆菌菌种] | UniRef100_P54272 | 芽孢杆菌菌种 | XylA |
| 3881 | XylR | |||
| 3882 | 硫胺素-磷酸焦磷酸化酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39594 | 枯草芽孢杆菌 | ThiE |
| 3883 | 羟乙基噻唑激酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39593 | 枯草芽孢杆菌 | ThiM |
| 3884 | 推测的HTH型转录调节蛋白ywbI[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39592 | 枯草芽孢杆菌 | YwbI |
| 3885 | 推测的HTH型转录调节蛋白ywbI[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39592 | 枯草芽孢杆菌 | YwbI |
| 3886 | ||||
| 3887 | YwqH | |||
| 3888 | 穴蛋白类蛋白cidA[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39591 | 枯草芽孢杆菌 | YwbH |
| 3889 | 假设的蛋白ywbG[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39590 | 枯草芽孢杆菌 | YwbG |
| 3890 | HlyC域蛋白[蜡状芽孢杆菌] | UniRef100_Q731T5 | 蜡状芽孢杆菌 | |
| 3891 | OpuE | |||
| 3892 | 假设的UPF0064蛋白ywbD[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39587 | 枯草芽孢杆菌 | YwbD |
| 3893 | 假设的蛋白ywbC[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39586 | 枯草芽孢杆菌 | YwbC |
| 3894 | 磷酸甘油酸脱氢酶[凝固芽孢杆菌] | UniRef100_Q8GCC8 | 凝固芽孢杆菌 | YvcT |
| 3895 | 甘油酸脱氢酶[Oceanobacillusiheyensis] | UniRef100_Q8EP33 | Oceanobacillus iheyensis | |
| 3896 | 普通应激蛋白A[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P25148 | 枯草芽孢杆菌 | GspA |
| 3897 | YdfH蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P96685 | 枯草芽孢杆菌 | YdfH |
| 3898 | YdfI蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P96686 | 枯草芽孢杆菌 | YdfI |
| 3899 | YdfJ蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P96687 | 枯草芽孢杆菌 | YdfJ |
| 3900 | 假设的蛋白ywaF[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P25149 | 枯草芽孢杆菌 | YwaF |
| 3901 | MFS转运蛋白，邻苯二甲酸通透酶家族[丁香假单胞菌] | UniRef100_Q884B5 | 丁香假单胞菌 | YcbE |
| 3902 | 假设的蛋白OB2215[Oceanobacillus iheyensis] | UniRef100_Q8EP98 | Oceanobacillusiheyensis | YitF |
| 3903 | 2-脱氢-3-脱氧磷酸葡萄糖酸醛缩酶[Oceanobacillus iheyensis] | UniRef100_Q8EP99 | Oceanobacillusiheyensis | KdgA |
| 3904 | 2-酮-3-脱氧葡萄糖酸激酶[Oceanobacillus iheyensis] | UniRef100_Q8EPA0 | Oceanobacillusiheyensis | KdgK |
| 3905 | 转录调节蛋白[Oceanobacillusiheyensis] | UniRef100_Q8EPA1 | Oceanobacillusiheyensis | KipR |
| 3906 | YwaD | |||
| 3907 | 假设的蛋白ywoD[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P94574 | 枯草芽孢杆菌 | YwoD |
| 3908 | ||||
| 3909 | 假设的蛋白ywaC[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39583 | 枯草芽孢杆菌 | YwaC |
| 3910 | ||||
| 3911 | DltA | |||
| 3912 | 蛋白dltB[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39580 | 枯草芽孢杆菌 | DltB |
| 3913 | D-丙氨酸--聚(磷酸核糖醇)连接酶亚基2[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39579 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 3914 | 蛋白dltD前体[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39578 | 枯草芽孢杆菌 | DltD |
| 3915 | 推测的分枝链氨基酸氨基转移酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39576 | 枯草芽孢杆菌 | YwaA |
| 3916 | 推测的大环内酯流出决定子，YvqJ[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32203 | 枯草芽孢杆菌 | YvqJ |
| 3917 | 可能的6-磷酸-β-葡萄糖苷酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P46320 | 枯草芽孢杆菌 | LicH |
| 3918 | PTS系统，地衣淀粉特异性IIA组分[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P46319 | 枯草芽孢杆菌 | LicA |
| 3919 | PTS系统，地衣淀粉特异性IIC组分[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P46317 | 枯草芽孢杆菌 | LicC |
| 3920 | PTS系统，地衣淀粉特异性IIB组分[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P46318 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 3921 | 可能的licABCH操纵子调节蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P46321 | 枯草芽孢杆菌 | LicR |
| 3922 | ||||
| 3923 | 推测的3-甲基腺嘌呤DNA糖基酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P94378 | 枯草芽孢杆菌 | YxlJ |
| 3924 | 转录调节蛋白[百脉根瘤菌] | UniRef100_Q988D9 | 百脉根瘤菌 | YdhC |
| 3925 | 柠檬酸合酶III[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P45858 | 枯草芽孢杆菌 | MmgD |
| 3926 | 2-甲基异柠檬酸脱水酶[苏云金芽孢杆菌] | UniRef100_Q6HJ23 | 苏云金芽孢杆菌 | MmgE |
| 3927 | 推测的羧乙烯基-羧基膦酸磷酰基变位酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54528 | 枯草芽孢杆菌 | YqiQ |
| 3928 | 铬酸盐转运蛋白[苏云金芽孢杆菌] | UniRef100_Q6HIU6 | 苏云金芽孢杆菌 | YwrA |
| 3929 | BH0575蛋白[Bacillus halodurans] | UniRef100_Q9KFB0 | Bacillus halodurans | |
| 3930 | YwjA | |||
| 3931 | YesT蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31523 | 枯草芽孢杆菌 | YesT |
| 3932 | YweA | |||
| 3933 | YweA | |||
| 3934 | 药物耐性转运蛋白Bcr/CflA亚家族；可能的双环霉素抗性蛋白[苏云金芽孢杆菌] | UniRef100_Q6HPJ5 | 苏云金芽孢杆菌 | YdgK |
| 3935 | YxlG蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P94375 | 枯草芽孢杆菌 | YxlG |
| 3936 | YxlF蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P94374 | 枯草芽孢杆菌 | YxlF |
| 3937 | YxlE蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P94373 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 3938 | ||||
| 3939 | 假设的蛋白yxlC[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P94371 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 3940 | RNA聚合酶σ因子sigY[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P94370 | 枯草芽孢杆菌 | SigY |
| 3941 | YxlH蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P94376 | 枯草芽孢杆菌 | YxlH |
| 3942 | 过氧化氢酶[Bacillus halodurans] | UniRef100_Q9KDA8 | Bacillushalodurans | KatX |
| 3943 | 过氧化氢酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q9AQQ9 | 枯草芽孢杆菌 | KatA |
| 3944 | 过氧化物操纵子转录调节蛋白[单核细胞增生利斯特氏菌] | UniRef100_Q71YY4 | 单核细胞增生利斯特氏菌 | PerR |
| 3945 | 亚铁鳌合酶[Oceanobacillusiheyensis] | UniRef100_Q8ERX9 | Oceanobacillusiheyensis | HemH |
| 3946 | 假设的蛋白yhcI[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54593 | 枯草芽孢杆菌 | YhcI |
| 3947 | 杆菌肽转运ATP结合蛋白bcrA[蜡状芽孢杆菌] | UniRef100_Q81AB3 | 蜡状芽孢杆菌 | YhcH |
| 3948 | MrsE蛋白[芽孢杆菌菌种] | UniRef100_Q9RC25 | 芽孢杆菌菌种 | |
| 3949 | ||||
| 3950 | ABC-2型转运系统ATP结合蛋白[好气热棒菌(Pyrobaculumaerophillum)] | UniRef100_Q8ZZG9 | 好气热棒菌 | YdbJ |
| 3951 | ||||
| 3952 | 转录调节蛋白[Bacillushalodurans] | UniRef100_Q9KFL9 | Bacillus halodurans | |
| 3953 | ||||
| 3954 | ClyA蛋白[质粒pAD1] | UniRef100_Q52055 | 质粒pAD1 | IspA |
| 3955 | 硫醚抗生素mersacidin转运蛋白系统[Bacillus halodurans] | UniRef100_Q9KFM8 | Bacillushalodurans | YgaD |
| 3956 | ||||
| 3957 | 硫醚抗生素mersacidin[Bacillushalodurans] | UniRef100_Q9KFM5 | Bacillus halodurans | |
| 3958 | 硫醚抗生素mersacidin修饰酶[Bacillus halodurans] | UniRef100_Q9KFM4 | Bacillus halodurans | |
| 3959 | 果胶酸裂合酶Pel-34K[芽孢杆菌P-2850菌种] | UniRef100_Q8L0S6 | 芽孢杆菌P-2850菌种 | Pel |
| 3960 | 假设的UPF0031蛋白yxkO[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P94368 | 枯草芽孢杆菌 | YxkO |
| 3961 | 转运ATP结合蛋白cydD[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P94367 | 枯草芽孢杆菌 | CydD |
| 3962 | 转运ATP结合蛋白cydC[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P94366 | 枯草芽孢杆菌 | CydC |
| 3963 | 细胞色素d泛醇(ubiquinol)氧化酶亚基II[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P94365 | 枯草芽孢杆菌 | CydB |
| 3964 | 细胞色素d泛醇氧化酶亚基I[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P94364 | 枯草芽孢杆菌 | CydA |
| 3965 | 假设的转运蛋白ywcJ[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39608 | 枯草芽孢杆菌 | YwcJ |
| 3966 | 假设的蛋白[蜡状芽孢杆菌] | UniRef100_Q735J7 | 蜡状芽孢杆菌 | |
| 3967 | 可能的NAD依赖苹果酸酶1[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54572 | 枯草芽孢杆菌 | MleA |
| 3968 | 苹果酸-2H(+)/Na(+)-乳酸反向转运蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54571 | 枯草芽孢杆菌 | MleN |
| 3969 | AnsB | |||
| 3970 | L-天冬酰胺酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P26900 | 枯草芽孢杆菌 | AnsA |
| 3971 | AnsR | |||
| 3972 | 假设的蛋白ykgB[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34499 | 枯草芽孢杆菌 | YkgB |
| 3973 | 假设的感觉转导蛋白yxdJ[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P42421 | 枯草芽孢杆菌 | YxdJ |
| 3974 | 假设的类传感蛋白组氨酸激酶yxdK[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P42422 | 枯草芽孢杆菌 | YxdK |
| 3975 | 假设的ABC转运蛋白ATP结合蛋白yxdL[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P42423 | 枯草芽孢杆菌 | YxdL |
| 3976 | 假设的蛋白yxdM[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P42424 | 枯草芽孢杆菌 | YxdM |
| 3977 | 假设的蛋白yxeA前体[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54940 | 枯草芽孢杆菌 | YxeA |
| 3978 | YxkH蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P94361 | 枯草芽孢杆菌 | YxkH |
| 3979 | 转录调节蛋白[Bacillushalodurans] | UniRef100_Q9KFA7 | Bacillushalodurans | YdeL |
| 3980 | 假设的蛋白orfD[乳酸乳球菌] | UniRef100_O86288 | 乳酸乳球菌 | YdaM |
| 3981 | 柠檬酸/苹果酸转运蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P94363 | 枯草芽孢杆菌 | YxkJ |
| 3982 | 甘油磷酸二酯磷酸二酯酶[Oceanobacillus iheyensis] | UniRef100_Q8EMK9 | Oceanobacillusiheyensis | YhdW |
| 3983 | 假设的蛋白yhjA前体[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O07555 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 3984 | ||||
| 3985 | YfnI[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O06487 | 枯草芽孢杆菌 | YfnI |
| 3986 | 假设的脂蛋白yfjD前体[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31555 | 枯草芽孢杆菌 | YfjD |
| 3987 | YxkD蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P94357 | 枯草芽孢杆菌 | YxkD |
| 3988 | 精氨酸阻抑蛋白，argR[蜡状芽孢杆菌] | UniRef100_Q81II2 | 蜡状芽孢杆菌 | AhrC |
| 3989 | 精氨酸脱亚胺酶[蜡状芽孢杆菌] | UniRef100_Q73E87 | 蜡状芽孢杆菌 | YkgA |
| 3990 | 鸟氨酸氨甲酰转移酶[蜡状芽孢杆菌] | UniRef100_Q73E86 | 蜡状芽孢杆菌 | ArgF |
| 3991 | 精氨酸/鸟氨酸反向转运蛋白[蜡状芽孢杆菌] | UniRef100_Q73E85 | 蜡状芽孢杆菌 | YvsH |
| 3992 | 氨基甲酸激酶[蜡状芽孢杆菌] | UniRef100_Q81IH8 | 蜡状芽孢杆菌 | |
| 3993 | 转录调节蛋白，Crp家族[苏云金芽孢杆菌] | UniRef100_Q6HP25 | 苏云金芽孢杆菌 | Fnr |
| 3994 | β-葡萄糖苷酶[Oceanobacillusiheyensis] | UniRef100_Q8ES64 | Oceanobacillusiheyensis | YdhP |
| 3995 | PTS系统，地衣淀粉特异性IIc组分[胡萝卜软腐欧文氏菌(Erwinia carotovora)] | UniRef100_Q6D101 | 胡萝卜软腐欧文氏菌 | LicC |
| 3996 | 假设的蛋白[苏云金芽孢杆菌] | UniRef100_Q6HC13 | 苏云金芽孢杆菌 | |
| 3997 | SigV | |||
| 3998 | 厌氧核糖核苷-三磷酸还原酶活化蛋白[热自养甲烷杆菌(Methanobacteriumthermoautotrophicum)] | UniRef100_O26387 | 热自养甲烷杆菌 | |
| 3999 | 假设的蛋白yxeC[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54942 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 4000 | ||||
| 4001 | ||||
| 4002 | 假设的蛋白[鱼腥蓝细菌菌种] | UniRef100_Q9AIM4 | 鱼腥蓝细菌菌种 | FtsH |
| 4003 | 肽酶T[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P55179 | 枯草芽孢杆菌 | PepT |
| 4004 | β-果糖苷酶FruA[巨大芽孢杆菌] | UniRef100_Q8GM36 | 巨大芽孢杆菌 | SacA |
| 4005 | 糖转运蛋白FruP[巨大芽孢杆菌] | UniRef100_Q8GM37 | 巨大芽孢杆菌 | YwbF |
| 4006 | ABC转运蛋白跨膜通透酶-糖转运[肺炎链球菌(Streptococcuspneumoniae)] | UniRef100_Q8DNN9 | 肺炎链球菌 | YesQ |
| 4007 | ABC转运蛋白跨膜通透酶-糖转运蛋白[肺炎链球菌] | UniRef100_Q8DNN8 | 肺炎链球菌 | YurN |
| 4008 | YesO | |||
| 4009 | 阻抑蛋白FruR[巨大芽孢杆菌] | UniRef100_Q8GM38 | 巨大芽孢杆菌 | RbsR |
| 4010 | 假设的蛋白[蜡状芽孢杆菌] | UniRef100_Q738I8 | 蜡状芽孢杆菌 | |
| 4011 | YjeA | |||
| 4012 | 假设的蛋白yxjG[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P42318 | 枯草芽孢杆菌 | YxjG |
| 4013 | YkcB蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34575 | 枯草芽孢杆菌 | YkcB |
| 4014 | 推测的糖基转移酶ykcC[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34319 | 枯草芽孢杆菌 | YkcC |
| 4015 | GalE | |||
| 4016 | ||||
| 4017 | ||||
| 4018 | ||||
| 4019 | 假设的10.1kDa蛋白[假坚强芽孢杆菌] | UniRef100_O50571 | 假坚强芽孢杆菌 | |
| 4020 | ||||
| 4021 | 假设的转运蛋白yxjA[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P42312 | 枯草芽孢杆菌 | YxjA |
| 4022 | 过氧化氢酶2[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P42234 | 枯草芽孢杆菌 | KatE |
| 4023 | 过氧化氢酶2[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P42234 | 枯草芽孢杆菌 | KatE |
| 4024 | DNA促旋酶抑制蛋白GyrI[丙酮丁醇梭菌] | UniRef100_Q97DI7 | 丙酮丁醇梭菌 | YosT |
| 4025 | 可能的糖基水解酶[胡萝卜软腐欧文氏菌] | UniRef100_Q6D774 | 胡萝卜软腐欧文氏菌 | YckE |
| 4026 | PTS系统，β-葡萄糖苷特异性酶II，ABC组分[Bacillus halodurans] | UniRef100_Q9KG19 | Bacillushalodurans | BglP |
| 4027 | 转录抗终止子licT[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39805 | 枯草芽孢杆菌 | LicT |
| 4028 | 假设的保守蛋白[Oceanobacillusiheyensis] | UniRef100_Q8ES40 | Oceanobacillusiheyensis | YkoC |
| 4029 | 阳离子ABC转运蛋白ATP结合蛋白[Oceanobacillus iheyensis] | UniRef100_Q8ES39 | Oceanobacillusiheyensis | YkoD |
| 4030 | 假设的保守蛋白[Oceanobacillusiheyensis] | UniRef100_Q8ES38 | Oceanobacillusiheyensis | YkoE |
| 4031 | 胞外酶基因的转录激活蛋白[Oceanobacillus iheyensis] | UniRef100_Q8ESZ0 | Oceanobacillusiheyensis | TenA |
| 4032 | 异柠檬酸裂合酶[蜡状芽孢杆菌] | UniRef100_Q73C38 | 蜡状芽孢杆菌 | YqiQ |
| 4033 | 苹果酸合酶A[蜡状芽孢杆菌] | UniRef100_Q73C39 | 蜡状芽孢杆菌 | |
| 4034 | ||||
| 4035 | 假设的蛋白yycA[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P37483 | 枯草芽孢杆菌 | YycA |
| 4036 | 杆菌肽输出通透酶蛋白bceB[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34741 | 枯草芽孢杆菌 | YtsD |
| 4037 | 杆菌肽输出ATP结合蛋白bceA[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34697 | 枯草芽孢杆菌 | YtsC |
| 4038 | 传感蛋白bceS[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O35044 | 枯草芽孢杆菌 | YtsB |
| 4039 | 感觉转导蛋白bceR[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34951 | 枯草芽孢杆菌 | YtsA |
| 4040 | β-葡萄糖苷酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P40740 | 枯草芽孢杆菌 | BglH |
| 4041 | PTS系统，β-葡萄糖苷特异性IIABC组分[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P40739 | 枯草芽孢杆菌 | BglP |
| 4042 | 假设的蛋白yxeG[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54946 | 枯草芽孢杆菌 | YxeG |
| 4043 | 假设的蛋白yxeI[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54948 | 枯草芽孢杆菌 | YxeI |
| 4044 | ||||
| 4045 | ||||
| 4046 | 假设的蛋白yxiA前体[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P42293 | 枯草芽孢杆菌 | YxiA |
| 4047 | ATP依赖RNA解旋酶dbpA[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P42305 | 枯草芽孢杆菌 | DeaD |
| 4048 | 假设的蛋白OB2811[Oceanobacillus iheyensis] | UniRef100_Q8EMN1 | Oceanobacillus iheyensis | |
| 4049 | 假设的蛋白OB2810[Oceanobacillus iheyensis] | UniRef100_Q8EMN2 | Oceanobacillus iheyensis | |
| 4050 | YxiD | |||
| 4051 | ||||
| 4052 | BH4015蛋白[Bacillus halodurans] | UniRef100_Q9K5S3 | Bacillushalodurans | YxiB |
| 4053 | 嘧啶-核苷磷酸化酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39142 | 枯草芽孢杆菌 | Pdp |
| 4054 | 嘧啶核苷转运蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39141 | 枯草芽孢杆菌 | NupC |
| 4055 | 磷酸脱氧核糖醛缩酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39121 | 枯草芽孢杆菌 | Dra |
| 4056 | 脱氧核糖核苷调节蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39140 | 枯草芽孢杆菌 | DeoR |
| 4057 | 假设的蛋白[炭疽芽孢杆菌] | UniRef100_Q81X49 | 炭疽芽孢杆菌 | |
| 4058 | YdaJ蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P96584 | 枯草芽孢杆菌 | YdaJ |
| 4059 | YdaK蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P96585 | 枯草芽孢杆菌 | YdaK |
| 4060 | YdaL蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31487 | 枯草芽孢杆菌 | YdaL |
| 4061 | YdaM蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P96587 | 枯草芽孢杆菌 | YdaM |
| 4062 | YdaN蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31488 | 枯草芽孢杆菌 | YdaN |
| 4063 | 缬氨酸-丙酮酸氨基转移酶[鱼腥蓝细菌菌种] | UniRef100_Q8YTB2 | 鱼腥蓝细菌菌种 | AlaT |
| 4064 | 假设的蛋白[Leifsonia xyli] | UniRef100_Q6AEW0 | Leifsonia xyli | |
| 4065 | 假设的蛋白[Leifsonia xyli] | UniRef100_Q6AEW1 | Leifsonia xyli | YwfB |
| 4066 | 与推测的羧化酶的相似[发光光杆状菌] | UniRef100_Q7NA29 | 发光光杆状菌 | YwfE |
| 4067 | 转运蛋白，药物/代谢物输出蛋白家族[蜡状芽孢杆菌ZK] | UniRef100_Q63AK7 | 蜡状芽孢杆菌ZK | YoaV |
| 4068 | 可能的果糖-二磷酸醛缩酶2[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P42420 | 枯草芽孢杆菌 | FbaB |
| 4069 | IolI蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P42419 | 枯草芽孢杆菌 | IolI |
| 4070 | IolH蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P42418 | 枯草芽孢杆菌 | IolH |
| 4071 | 肌醇脱氢酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q6B6R7 | 枯草芽孢杆菌 | Idh |
| 4072 | 肌醇转运蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P42417 | 枯草芽孢杆菌 | IolF |
| 4073 | IolE蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P42416 | 枯草芽孢杆菌 | IolE |
| 4074 | 可能的丙二酸半醛氧化脱羧酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P42415 | 枯草芽孢杆菌 | IolD |
| 4075 | 蛋白iolC[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P42414 | 枯草芽孢杆菌 | IolC |
| 4076 | IolB蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P42413 | 枯草芽孢杆菌 | IolB |
| 4077 | 可能的甲基丙二酸-半醛脱氢酶[酰化的][枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P42412 | 酰化的 | MmsA |
| 4078 | DNA结合蛋白iolR[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P46337 | 枯草芽孢杆菌 | IolR |
| 4079 | IolS蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P46336 | 枯草芽孢杆菌 | IolS |
| 4080 | UPI00003CB380 UniRef100条目 | UniRef100_UPI00003CB380 | GlpQ | |
| 4081 | 推测的甘油-3-磷酸转运蛋白[金黄色葡萄球菌] | UniRef100_Q6GJY0 | 金黄色葡萄球菌 | GlpT |
| 4082 | 分子伴侣蛋白htpG[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P46208 | 枯草芽孢杆菌 | HtpG |
| 4083 | YfmM | |||
| 4084 | 假设的蛋白yxeH[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P54947 | 枯草芽孢杆菌 | YxeH |
| 4085 | 甘油脱氢酶[丙酮丁醇梭菌] | UniRef100_Q97IL4 | 丙酮丁醇梭菌 | AraM |
| 4086 | 磷酸丝氨酸磷酸酶家族蛋白[丙酮丁醇梭菌] | UniRef100_Q97IL5 | 丙酮丁醇梭菌 | YkrX |
| 4087 | BH0833蛋白[Bacillus halodurans] | UniRef100_Q9KEL9 | Bacillus halodurans | |
| 4088 | YxeB | |||
| 4089 | ||||
| 4090 | BH3956蛋白[Bacillus halodurans] | UniRef100_Q9K5Y0 | Bacillushalodurans | YraH |
| 4091 | ||||
| 4092 | 亚铁铁转运蛋白B[蜡状芽孢杆菌ZK] | UniRef100_Q632N2 | 蜡状芽孢杆菌ZK | |
| 4093 | Lmo2104蛋白[单核细胞增生利斯特氏菌] | UniRef100_Q929R6 | 单核细胞增生利斯特氏菌 | |
| 4094 | YfiQ蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O31559 | 枯草芽孢杆菌 | YfiQ |
| 4095 | ABC转运蛋白通透酶蛋白[蜡状芽孢杆菌] | UniRef100_Q81EI1 | 蜡状芽孢杆菌 | YxdM |
| 4096 | ABC转运蛋白ATP结合蛋白[蜡状芽孢杆菌] | UniRef100_Q81D39 | 蜡状芽孢杆菌 | YxdL |
| 4097 | 传感蛋白组氨酸激酶[蜡状芽孢杆菌ZK] | UniRef100_Q63AY4 | 蜡状芽孢杆菌ZK | YxdK |
| 4098 | UPI00003CBD9F UniRef100条目 | UniRef100_UPI00003CB | D9F | YxdJ |
| 4099 | 假设的蛋白[蜡状芽孢杆菌] | UniRef100_Q72X82 | 蜡状芽孢杆菌 | |
| 4100 | YoaH[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O34576 | 枯草芽孢杆菌 | YoaH |
| 4101 | 氨基酸转运蛋白[Bacillushalodurans] | UniRef100_Q9K609 | Bacillushalodurans | YflA |
| 4102 | 丙氨酸脱氢酶[Bacillushalodurans] | UniRef100_Q9KAF8 | Bacillushalodurans | Ald |
| 4103 | 假设的家族53糖基水解酶yvfO前体[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O07013 | 枯草芽孢杆菌 | YvfO |
| 4104 | 假设的蛋白yvfN[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O07012 | 枯草芽孢杆菌 | LacA |
| 4105 | 假设的蛋白yvfM[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O07011 | 枯草芽孢杆菌 | YvfM |
| 4106 | 麦芽糖/麦芽糖糊精转运系统[Bacillus halodurans] | UniRef100_Q9KBA8 | Bacillushalodurans | YvfL |
| 4107 | 假设的蛋白yvfK[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O07009 | 枯草芽孢杆菌 | YvfK |
| 4108 | LacR | |||
| 4109 | 半乳糖激酶[格氏链球菌(Streptococcus gordonii)] | UniRef100_Q840N8 | 格氏链球菌 | GalK |
| 4110 | UDP-葡萄糖4-差向异构酶[无害利斯特氏菌] | UniRef100_Q928B6 | 无害利斯特氏菌 | GalE |
| 4111 | UPI00003CB9B6 UniRef100条 | UniRef100_UPI00003CB9B6 | GalT | |
| 4112 | 木糖操纵子转录阻抑蛋白[Bacillus halodurans] | UniRef100_Q9KDW7 | Bacillushalodurans | XylR |
| 4113 | GntR | |||
| 4114 | GntK | |||
| 4115 | GntP | |||
| 4116 | GntZ | |||
| 4117 | 醇脱氢酶[蜡状芽孢杆菌] | UniRef100_Q818A4 | 蜡状芽孢杆菌 | GbsB |
| 4118 | 烷基氢过氧化物还原酶亚基C[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P80239 | 枯草芽孢杆菌 | AhpC |
| 4119 | NADH脱氢酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P42974 | 枯草芽孢杆菌 | AhpF |
| 4120 | ||||
| 4121 | ||||
| 4122 | ||||
| 4123 | YvfR | |||
| 4124 | 假设的蛋白yvfS[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O07017 | 枯草芽孢杆菌 | YvfS |
| 4125 | YvfT | |||
| 4126 | 假设的蛋白yvfU[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O07019 | 枯草芽孢杆菌 | YvfU |
| 4127 | ||||
| 4128 | ||||
| 4129 | YtrE | |||
| 4130 | ||||
| 4131 | ||||
| 4132 | ||||
| 4133 | ||||
| 4134 | 假设的蛋白[Desulfotaleapsychrophila] | UniRef100_Q6ARQ4 | Desulfotalea psychrophila | |
| 4135 | 假设的蛋白[DesulfotaleaPsychrophila] | UniRef100_Q6ARQ5 | Desulfotalea psychrophlia | |
| 4136 | ||||
| 4137 | ||||
| 4138 | 推测的锌金属肽酶[破伤风梭菌] | UniRef100_Q894N2 | 破伤风梭菌 | |
| 4139 | I型限制修饰系统限制亚基[食菌蛭弧菌] | UniRef100_Q6MH63 | 食菌蛭弧菌 | |
| 4140 | Lin0523蛋白[无害利斯特氏菌] | UniRef100_Q92ED7 | 无害利斯特氏菌 | |
| 4141 | ||||
| 4142 | 假设的蛋白CAC1662[丙酮丁醇梭菌] | UniRef100_Q97IH9 | 丙酮丁醇梭菌 | |
| 4143 | I型限制修饰系统，M亚基[普通脱硫弧菌(Desulfovibriovulgaris)] | UniRef100_Q72BC7 | 普通脱硫弧菌 | |
| 4144 | ||||
| 4145 | ||||
| 4146 | ||||
| 4147 | UPI00002C7192 UniRef100条目 | UniRef100_UPI00002C7192 | ||
| 4148 | 盒式染色体重组酶B[金黄色葡萄球菌] | UniRef100_Q8RPD2 | 金黄色葡萄球菌 | SpoIVCA |
| 4149 | 假设的UPF0247蛋白yyda[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q45601 | 枯草芽孢杆菌 | YydA |
| 4150 | ||||
| 4151 | ||||
| 4152 | YycN蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32293 | 枯草芽孢杆菌 | YvcN |
| 4153 | ||||
| 4154 | UPI00003CA59D UniRef100条目 | UniRef100_UPI00003CA59D | ||
| 4155 | 假设的丝氨酸蛋白酶yyxA[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P39668 | 枯草芽孢杆菌 | YvxA |
| 4156 | YycJ蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q45611 | 枯草芽孢杆菌 | YycJ |
| 4157 | YycI蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q45612 | 枯草芽孢杆菌 | YycI |
| 4158 | YycH蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q45613 | 枯草芽孢杆菌 | YycH |
| 4159 | 传感蛋白yycG[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q45614 | 枯草芽孢杆菌 | YycG |
| 4160 | 转录调节蛋白yycF[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P37478 | 枯草芽孢杆菌 | YycF |
| 4161 | 磷酸水解酶[蜡状芽孢杆菌] | UniRef100_Q81103 | 蜡状芽孢杆菌 | |
| 4162 | 腺苷酸基琥珀酸合成酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P29726 | 枯草芽孢杆菌 | PurA |
| 4163 | ||||
| 4164 | 复制DNA解旋酶[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P37469 | 枯草芽孢杆菌 | DnaC |
| 4165 | 假设的蛋白yycD[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P37480 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 4166 | 假设的蛋白yyzB[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_O32296 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 4167 | 假设的转运蛋白yycB[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P37482 | 枯草芽孢杆菌 | YycB |
| 4168 | N-乙酰葡糖胺-6-磷酸脱乙酰基酶[Bacillus halodurans] | UniRef100_Q9KFQ7 | Bacillushalodurans | NagA |
| 4169 | NagB | |||
| 4170 | 转录调节蛋白[BacillusHalodurans] | UniRef100_Q9KFQ9 | Bacillushalodurans | YvoA |
| 4171 | 假设的蛋白VP0543[副溶血弧菌] | UniRef100_Q87S81 | 副溶血弧菌 | YbbI |
| 4172 | PTS系统，n-乙酰葡糖胺特异性酶II，ABC组分[Bacillus halodurans] | UniRef100_Q9KF24 | Bacillushalodurans | NagP |
| 4173 | 50s核糖体蛋白L9[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P37437 | 枯草芽孢杆菌 | RplI |
| 4174 | 假设的蛋白yybT[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P37484 | 枯草芽孢杆菌 | YybT |
| 4175 | 假设的蛋白yybS[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P37485 | 枯草芽孢杆菌 | YybS |
| 4176 | 芽孢外被蛋白F前体[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P23261 | 枯草芽孢杆菌 | CotF |
| 4177 | 普通应激蛋白Usp家族[苏云金芽孢杆菌] | UniRef100_Q6HIV0 | 苏云金芽孢杆菌 | YxiE |
| 4178 | 硫酸通透酶[苏云金芽孢杆菌] | UniRef100_Q6HIU9 | 苏云金芽孢杆菌 | YbaR |
| 4179 | 假设的转运蛋白yybO[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P37489 | 枯草芽孢杆菌 | YybO |
| 4180 | 30S核糖体蛋白S18[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P21475 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 4181 | 单链结合蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P37455 | 枯草芽孢杆菌 | Ssb |
| 4182 | 30S核糖体蛋白S6[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P21468 | 枯草芽孢杆菌 | |
| 4183 | GTP依赖核酸结合蛋白engD[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P37518 | 枯草芽孢杆菌 | YyaF |
| 4184 | Lin2921蛋白[无害利斯特氏菌] | UniRef100_Q926W9 | 无害利斯特氏菌 | |
| 4185 | 假设的蛋白yyaD[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P37520 | 枯草芽孢杆菌 | YyaD |
| 4186 | 假设的蛋白yyaC[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P37521 | 枯草芽孢杆菌 | YyaC |
| 4187 | 阶段0芽孢形成蛋白J[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P26497 | 枯草芽孢杆菌 | Spo0J |
| 4188 | Soj | |||
| 4189 | 假设的蛋白[类鼻疽伯克霍尔德氏菌(Burkholderia pseudomallei)K96243] | UniRef100_Q63L10 | 类鼻疽伯克霍尔德氏菌K96243 | YdfG |
| 4190 | RNA聚合酶σ因子，ECF亚家族[蜡状芽孢杆菌ZK] | UniRef100_Q63BC0 | 蜡状芽孢杆菌ZK | SigM |
| 4191 | YyaA蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P37524 | 枯草芽孢杆菌 | YyaA |
| 4192 | 甲基转移酶gidB[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P25813 | 枯草芽孢杆菌 | GidB |
| 4193 | 葡萄糖抑制的分裂蛋白A[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P25812 | 枯草芽孢杆菌 | GidA |
| 4194 | 可能的tRNA修饰GTP酶trmE[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P25811 | 枯草芽孢杆菌 | ThdF |
| 4195 | Jag蛋白[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_Q01620 | 枯草芽孢杆菌 | Jag |
| 4196 | SpoIIIJ | |||
| 4197 | 核糖核酸酶P蛋白组分[枯草芽孢杆菌] | UniRef100_P25814 | 枯草芽孢杆菌 | RnpA |
表2地衣芽孢杆菌基因组的特征及其与芽孢杆菌属其他菌种的基因组的比较
| 特征 | 地衣芽孢杆菌 | 枯草芽孢杆菌a | B.haloduransb | Oceanobacillus iheyensisc | 炭疽芽孢杆菌d | 蜡状芽孢杆菌e |
| 染色体大小(bp) | 4,222,336 | 4,214,630 | 4,202,352 | 3,630,528 | 5,227,293 | 5,426,909 |
| G+C含量(mol％) | 46.2 | 43.5 | 43.7 | 35.7 | 35.4 | 35.4 |
| 蛋白编码序列 | 4197 | 4106 | 4066 | 3496 | 5508 | 5366 |
| 平均长度(bp) | 873 | 896 | 879 | 883 | 800 | 835 |
| 编码区域百分比 | 87 | 87 | 85 | 85 | 84 | 84 |
| 核糖体RNA操纵子 | 7 | 10 | 8 | 7 | 11 | 13 |
| tRNA数 | 81 | 86 | 78 | 69 | 95 | 108 |
| 噬菌体相关基因 | 71 | 268 | 42 | 27 | 62 | 124 |
| 插入序列元件的转座酶基因 | 10 | 0 | 93 | 14 | 18 | 10 |
aKunst，F.，Ogasawara，N，Mozser，I.，Albertini，A.M.，Alloni，G.，Azebedo，V.，Bertero，M.G.，Bessieres，P.，Bolotin，A.，和Borchert，S.等(1997)Nature 390，249-256.
bTakami，H.，Nakasone，K.，Takaki，Y.，Maeno，G.，Sasaki，R.，Masui，N.，Fuji，F.，Hirama，C.，Nakamura，Y.，Ogasawara，N.等(2000)NucleicAcids Res.28，4317-4331.
cTakami，H.，Takaki，Y.，和Uchiyama，I.(2002)Nucleic Acids Res.30，3927-3935.
dRead，T.D.，Peterson，S.N.，Tourasse，N.，Baillie，L.W.，Paulsen，I.T.，Nelson，K.E.，Tettelin，H.，Fouts，D.E.，Eisen，J.A.，和Gill，S.R.等(2003)Nature 423，81-86.
eIvanova，N，Sorokin，A.，Anderson，I，Galleron，N.，Candelon，B.，Kapatral，V.，Bhattacharyya，A.，Reznik，G.，Mikhailova，N.，and Lapidus，A.等(2003)Nature 423，87-91.
表3地衣芽孢杆菌基因组中预测的胞外蛋白
| SEQIDNO. | 基因名 | 信号肽位置 | 推测的产物 | 推测的功能 | 枯草芽孢杆菌基因 |
| 11 | dacA | [1-32] | D-丙氨酰-D-丙氨酸羧肽酶(青霉素结合蛋白5) | ″分子功能：丝氨酸羧肽酶活性(GO：0004185)，生物过程：蛋白水解和肽水解(GO：0006508)″ | DacA |
| 45 | yabE | [1-32] | 保守的，假设的，含有DUF348YabE域 | YabE | |
| 67 | divIC | [1-66] | 细胞分裂起始蛋白 | 同时为营养和芽孢生成隔膜的形成所需要，生物过程：细胞周期(GO：0007049)″ | DivIC |
| 157 | BL01016 | [1-28] | N-乙酰胞壁酰-L-丙氨酸酰胺酶 | ″细胞壁水解酶，分子功能：N-乙酰胞壁酰-L-丙氨酸酰胺酶活性(GO：0008745)，生物过程：肽聚糖代谢(GO：0009253)″ | CwlD |
| 159 | gerD | [1-27] | GerD | ″针对L-丙氨酸和针对葡萄糖、果糖、L-天冬酰胺和KCl的组合的萌发响应(早期)″ | GerD |
| 161 | ybaN | [1-42] | ″多糖脱乙酰基酶，糖酯酶家族4″ | ″生物过程：糖代谢(GO：0005975)，分子功能：水解酶活性，作用于碳-氮(但不是肽)键(GO：0016810)″ | YbaN |
| 162 | pbpX | [1-43] | 青霉素结合蛋白 | PbpX | |
| 167 | ybbC | [1-23] | 保守的假设的蛋白YbbC | YbbC | |
| 168 | ybbD | [1-27] | ″糖苷水解酶，家族3″ | ″分子功能：水解酶活性，水解O-糖基化合物(GO：0004553)，生物过程：糖代谢(GO：0005975)″ | YbbD |
| 169 | ybbE | [1-22] | 推测的β-内酰胺酶YbbE | YbbE | |
| 227 | [1-34] | 推测的核糖ABC转运蛋白(核糖结合蛋白) | ″核糖转运，″ | RbsB | |
| 228 | yomI | [1-32] | 推测的裂解转糖基酶YomI | YomI | |
| 247 | penP | [1-35] | β-内酰胺酶前体 | ″分子功能：天冬氨酸型内肽酶活性(GO：0004190)，生物过程：蛋白水解和肽水解(GO：0006508)″ | PenP |
| 249 | tatAD | [1-35] | 双精氨酸(twin-arginine)前体蛋白易位途径组分 | ″生物过程：蛋白转运(GO：0015031)，细胞组分：整合到膜上(GO：001602)″ | |
| 267 | [1-26] | ″推测的蛋白酶抑制蛋白I4，丝氨酸蛋白酶抑制蛋白″ | 分子功能：丝氨酸型内肽酶抑制蛋白活性(GO：0004867) | ||
| 268 | BL01663 | [1-22] | “类果胶裂合酶” | YbdN | |
| 287 | BL01793 | [1-31] | 推测的脂蛋白 | YcdA | |
| 303 | yvbX | [1-33] | ″保守的蛋白，糖苷水解酶家族18，YvbX″ | ″分子功能：催化活性(GO：0003824)，生物过程：糖代谢(GO：0005975)″ | YvbX |
| 304 | [1-27] | ″几丁质酶前体，糖苷水解酶家族18″ | ″分子功能：催化活性(GO：0003824)，生物过程：糖代谢(GO：0005975)″ | ||
| 312 | yvcE | [1-31] | ″推测的肽聚糖水解酶，DL-内肽酶II家族″ | YvcE | |
| 348 | yckB | [1-34] | 推测的胞外溶质结合 | ″分子功能：转运蛋白活性 | YckB |
| 蛋白YckB | (GO：0005215)，生物过程：转运(GO：0006810)，细胞组分：周质空间(特指革兰氏阴性 细菌)(GO：0030288)″ | ||||
| 353 | nucA | [1-37] | 核酸酶NucA | NucA | |
| 359 | BL01722 | [1-34] | 推测的胞外溶质结合蛋白 | ″分子功能：转运蛋白活性(GO：0005215)，生物过程：转运(GO：0006810)″ | YvfK |
| 373 | [1-25] | 假设的蛋白 | |||
| 382 | BL01829 | [1-25] | ″推测的胞外溶质结合蛋白，家族3″ | ″分子功能：转运蛋白活性(GO：0005215)，生物过程：转运(GO：0006810)，细胞组分：周质空间(特指革兰氏阴性 细菌)(GO：0030288)″ | YckK |
| 403 | BL01746 | [1-28] | 核糖ABC转运蛋白(核糖结合蛋白) | ″核糖转运，″ | RbsB |
| 409 | phy | [1-30] | 肌醇六磷酸酶 | ″将植酸水解为无机磷酸和肌醇，” | Phy |
| 426 | yclQ | [1-25] | 周质结合蛋白 | ″分子功能：铁离子转运蛋白 活性(GO：0005381)，生物过程：高亲和铁离子转运(GO：0006827)″ | YclQ |
| 438 | [1-26] | 假设的蛋白 | |||
| 472 | BL02821 | [1-34] | 胞外被膜相关的转录衰减子 | YvhJ | |
| 483 | [1-42] | 假设的蛋白 | |||
| 513 | ydcC | [1-28] | 保守的膜蛋白YdcC | YdcC | |
| 552 | yrhM | [1-68] | YrhM | YrhM | |
| 558 | ywpE | [1-26] | 保守的蛋白YwpE | ″生物过程：生物合成(GO：0009058)，分子功能：转移酶活性(GO：0016740)″ | |
| 576 | [1-34] | 推测的转运蛋白 | ″分子功能：转运蛋白活性(GO：0005215)，生物过程：转运(GO：0006810)，细胞组分：膜(GO：0016020)″ | ||
| 605 | yjeAA | [1-37] | 保守的假设的蛋白 | YjeA | |
| 607 | amyL | [1-30] | ″α-淀粉酶，糖苷水解酶家族13″ | ″分子功能：α-淀粉酶活性(GO：0004556)，生物过程：糖代谢(GO：0005975)″ | TreA |
| 610 | yvdG | [1-28] | 推测的麦芽糖/麦芽糖糊精转运系统底物结合蛋白 | ″分子功能：转运蛋白活性(GO：0005215)，生物过程：转运(GO：0006810)″ | YvdG |
| 619 | [1-37] | 假设的蛋白 | |||
| 620 | [1-28] | 假设的蛋白 | |||
| 621 | ydjM | [1-41] | YdjM | YdjM | |
| 622 | ydjN | [1-21] | YdjN | YdjN | |
| 660 | yerB | [1-28] | 保守的蛋白YerB | YerB | |
| 665 | yerH | [1-26] | YerH | YerH | |
| 683 | BL05063 | [1-35] | 甘露聚糖内切1，4-β-甘露糖苷酶 | 甘露聚糖多糖的降解 | |
| 733 | [1-29] | 推测的羧肽酶 | ″分子功能：羧肽酶A活性(GO：0004182)，生物过程：蛋白水解和肽水解(GO：0006508)″ | ||
| 773 | yfkD | [1-26] | 保守的蛋白YfkD | YfkD | |
| 776 | BL03088 | [1-24] | ″多糖脱乙酰基酶，糖酯酶家族4″ | ″生物过程：糖代谢(GO：0005975)，分子功能：水解酶活性，作用于碳-氮(但不是肽)键(GO：0016810)″ | YfjS |
| 784 | yfjL | [1-33] | 推测的转运蛋白YfjL | ″分子功能：转运蛋白活性(GO：0005215)，生物过程：转运(GO：0006810)，细胞组分：膜(GO：0016020)″ | YfjL |
| 787 | BL03096 | [1-26] | 假设的蛋白 | ||
| 813 | BL03024 | [1-26] | ″推测的胞外溶质结合蛋白，家族1″ | ″分子功能：转运蛋白活性(GO：0005215)，生物过程：转运(GO：0006810)″ | YtcQ |
| 841 | appAC | [1-30] | 寡肽ABC转运蛋白(结合蛋白) | 孢子形成、感受态产生和寡肽转运的起始所需，分子功能：转运蛋白活性(GO：0005215)，生物过程：转运(GO：0006810)″ | OppA |
| 866 | ssuA | [1-24] | 脂族磺酸ABC转运蛋白(结合脂蛋白) | SsuA | |
| 876 | [1-23] | 假设的蛋白 | |||
| 886 | [1-23] | 假设的蛋白 | |||
| 892 | [1-28] | 假设的蛋白 | YhcC | ||
| 900 | BL03178 | [1-27] | 推测的脂蛋白 | YhcJ | |
| 902 | BL03161 | [1-31] | 假设的蛋白 | YhcM | |
| 904 | BL03176 | [1-29] | 假设的蛋白 | YhcN | |
| 905 | BL03175 | [1-30] | 假设的蛋白 | YhcP | |
| 934 | lytE | [1-26] | 细胞壁水解酶磷酸酶相关蛋白 | ″细胞壁裂解活性，生物过程：细胞壁代谢(GO：0016998)，生物过程：细胞壁代谢(GO：0016998)″ | LytE |
| 937 | [1-26] | 推测的葡萄糖脱氢酶 | |||
| 965 | BL02841 | [1-41] | ″多糖脱乙酰基酶，糖酯酶家族4″ | ″生物过程：糖代谢(GO：0005975)，分子功能：水解酶活性，作用于碳-氮(但不是肽)键(GO：0016810)″ | YheN |
| 996 | prsA | [1-30] | 分子伴侣PrsA | ″对跨膜转运后的阶段中分泌蛋白的稳定性是必需的”，分子功能：异构酶活性(GO：0016853)″ | PrsA |
| 1001 | BL02907 | [1-31] | 假设的蛋白 | YhaH | |
| 1032 | yhfQ | [1-32] | 推测的转移酶 | ″生物过程：代谢(GO：0008152)，分子功能：转移酶活性(GO：0016740)″ | YhfQ |
| 1044 | epr | [1-27] | 胞外丝氨酸蛋白酶 | ″分子功能：枯草杆菌蛋白酶样丝氨酸蛋白酶(subtilase)活性(GO：0004289)，生物过程：蛋白水解和肽水解(GO：0006508)，分子功能：功能：枯草杆菌蛋白酶样丝氨酸蛋白酶活性(GO：0004289)，生物过程：蛋白水解和肽水解(GO：0006508)″ | Epr |
| 1061 | [1-24] | 假设的蛋白 | |||
| 1063 | msmE | [1-29] | 多种糖结合蛋白 | ″分子功能：转运蛋白活性 | MsmE |
| MsmE | (GO：0005215)，生物过程：转运(GO：0006810)″ | ||||
| 1073 | BL01323 | [1-28] | 保守的假设的蛋白 | LytB | |
| 1077 | yvgL | [1-29] | 钼酸转运系统底物结合蛋白 | ″分子功能：钼酸转运ATP酶活性(GO：0015412)，生物过程：钼酸离子转运(GO：0015689)″ | YvgL |
| 1113 | BL01309 | [1-24] | 短链脱氢酶/还原酶SDR | ″生物过程：代谢(GO：0008152)，分子功能：氧化还原酶活性(GO：0016491)″ | YcdF |
| 1150 | appA | [1-32] | 寡肽ABC转运蛋白(寡肽结合蛋白) | ″寡肽转运，分子功能：转运蛋白活性(GO：0005215)，生物过程：转运(GO：0006810)″ | AppA |
| 1156 | oppA | [1-29] | 寡肽ABC转运蛋白(结合蛋白) | “孢子形成、感受态产生和寡肽转运的起始所需”，分子功能：转运蛋白活性(GO：0005215)，生物过程：转运(GO：0006810)″ | OppA |
| 1165 | BL03332 | [1-31] | 保守的假设的蛋白 | YflP | |
| 1216 | abnAA | [1-26] | 糖苷水解酶家族43 | ″植物细胞壁多糖降解，分子功能：水解酶活性，水解O-糖基化合物(GO：0004553)，生物过程：糖代谢(GO：0005975)″ | AbnA |
| 1219 | [1-30] | 假设的蛋白 | |||
| 1226 | BL01957 | [1-23] | 保守的假设的蛋白 | YoeB | |
| 1227 | BL01953 | [1-26] | 肽聚糖结合蛋白 | ″生物过程：细胞壁代谢(GO：0016998)，生物过程：细胞壁代谢(GO：0016998)″ | YocH |
| 1283 | yesO | [1-28] | 推测的转运系统底物结合蛋白YesO | ″分子功能：转运蛋白活性(GO：0005215)，生物过程：转运(GO：0006810)″ | YesO |
| 1291 | yesW | [1-33] | 推测的多糖裂合酶家族11蛋白 | YesW | |
| 1299 | lplA | [1-32] | 脂蛋白 | ″分子功能：转运蛋白活性(GO：0005215)，生物过程：转运(GO：0006810)″ | LplA |
| 1311 | dppE | [1-27] | 二肽ABC转运蛋白(二肽-结合蛋白) | ″分子功能：转运蛋白活性(GO：0005215)，生物过程：转运(GO：0006810)″ | DppE |
| 1319 | pelI | [1-25] | ″果胶裂合酶家族1，PelI″ | Pel | |
| 1332 | [1-30] | 假设的蛋白 | |||
| 1341 | [1-27] | 假设的蛋白 | |||
| 1345 | [1-27] | 假设的蛋白 | YonS | ||
| 1368 | [1-28] | 假设的蛋白 | |||
| 1415 | pbpC | [1-30] | 青霉素结合蛋白3 | 分子功能：结合青霉素(GO：0008658) | PbpC |
| 1448 | [1-28] | 假设的蛋白 | |||
| 1475 | BL05139 | [1-27] | 甘油磷酸二酯磷酸二酯酶 | ″水解脱酰基的磷脂，生物过程：甘油代谢(GO：0006071)，分子功能：甘油磷酸二酯磷酸二酯酶活性(GO：0008889)″ | GlpQ |
| 1479 | [1-27] | 假设的蛋白 | |||
| 1493 | [1-27] | 假设的蛋白 | |||
| 1496 | BL03556 | [1-25] | 推测的细胞壁水解酶 | YkvT | |
| 1498 | ykvV | [1-28] | 假设的蛋白 | 含有硫氧还蛋白域2 | YkvV |
| 1501 | [1-25] | 假设的蛋白 | |||
| 1512 | ykwC | [1-24] | 假设的氧化还原酶 | YkwC | |
| 1513 | BL03646 | [1-27] | 免疫原V5/Tpx-1相关的 | 细胞组分：胞外(GO：0005576) | YkwD |
| 1527 | [1-28] | 假设的蛋白 | |||
| 1553 | BL01601 | [1-32] | ″推测的分泌蛋白，蛋白转运蛋白″ | ″分子功能：蛋白转运蛋白活性(GO：0008565)，生物过程：蛋白分泌(GO：0009306)，细胞组分：膜(GO：0016020)″ | YknX |
| 1565 | [1-40] | 假设的蛋白 | |||
| 1576 | ykyA | [1-29] | 假设的蛋白ykyA | YkyA | |
| 1601 | BL02997 | [1-27] | 假设的蛋白 | YlaJ | |
| 1617 | ylbC | [1-34] | 保守的假设的蛋白YlbC | 细胞组分：胞外(GO：0005576) | YlbC |
| 1625 | ylbL | [1-29] | YlbL | 分子功能：蛋白结合(GO：0005515) | YlbL |
| 1635 | ftsL | [1-59] | 细胞分裂蛋白 | ″隔膜形成(早期)，″ | FtsL |
| 1636 | pbpB | [1-42] | 青霉素结合蛋白2B | ″细胞分裂隔膜的形成(晚期)，″ | PbpB |
| 1644 | divIB | [1-57] | 细胞分裂起始蛋白 | ″可能参与稳定分裂复合物(division complex)或促进其组装(隔膜形成) | DivIB |
| 1645 | BL02246 | [1-29] | 保守的假设的蛋白 | YlxW | |
| 1646 | BL02248 | [1-30] | 假设的蛋白 | YlxX | |
| 1650 | bprA | [1-28] | 芽孢杆菌肽酶F | ″分子功能：枯草杆菌蛋白酶样丝氨酸蛋白酶活性(GO：0004289)，生物过程：蛋白水解和肽水解(GO：0006508)″ | Bpr |
| 1651 | bprB | [1-31] | 芽孢杆菌肽酶F | ″分子功能：枯草杆菌蛋白酶样丝氨酸蛋白酶活性(GO：0004289)，生物过程：蛋白水解和肽水解(GO：0006508)″ | Bpr |
| 1752 | fliL | [1-32] | 鞭毛的蛋白 | ″鞭毛生成所必需，生物过程：纤毛/鞭毛活动性(GO：0001539)，生物过程：趋化性(GO：0006935)，细胞组分：鞭毛基体(特指细菌)(GO：0009425)″ | FliL |
| 1781 | celA | [1-34] | 糖苷水解酶家族9 | ″分子功能：水解酶活性，水解O-糖基化合物(GO：0004553)，生物过程：糖代谢(GO：0005975)″ | |
| 1783 | celC | [1-34] | 糖苷水解酶家族5 | ″分子功能：水解酶活性，水解O-糖基化合物(GO：0004553)，生物过程：糖代谢(GO：0005975)″ | |
| 1784 | celD | [1-32] | 糖苷水解酶家族5 | ″分子功能：水解酶活性，水解O-糖基化合物(GO：0004553)，生物过程：糖代谢(GO：0005975)″ | |
| 1820 | BL03655 | [1-31] | 保守的假设的蛋白 | YmdA | |
| 1839 | [1-29] | 假设的蛋白 | |||
| 1904 | yoaO | [1-38] | YoaO | YoaO | |
| 1914 | yoaW | [1-26] | YoaW | YoaW | |
| 1926 | [1-38] | 类噬菌体蛋白 | |||
| 1929 | nucB | [1-34] | 核酸酶 | NucB | |
| 1931 | BL05188 | [1-29] | 肽聚糖结合蛋白 | 生物过程：细胞壁代谢(GO：0016998) | YneA |
| 1946 | yneN | [1-29] | 推测的巯基：二硫键交换蛋白YneN | ″分子功能：电子转运蛋白活性(GO：0005489)，生物过程：电子转运(GO：0006118)″ | YneN |
| 1983 | bglC | [1-50] | ″内切1，4-β-葡聚糖酶，糖苷水解酶家族5″ | ″分子功能：水解酶活性，水解O-糖基化合物(GO：0004553)，生物过程：糖代谢(GO：0005975)，″ | BglC |
| 1990 | ywoF | [1-22] | ″多糖裂合酶家族9，YwoF″ | YwoF | |
| 1995 | BL00297 | [1-27] | 保守的假设的蛋白 | YddR | |
| 2011 | yjmF | [1-31] | 短链脱氢酶/还原酶SDR | ″生物过程：代谢(GO：0008152)，分子功能：氧化还原酶活性(GO：0016491)″ | YjmF |
| 2016 | dctB | [1-29] | 可能的C4-二羧酸结合蛋白 | ″生物过程：转运(GO：0006810)，细胞组分：周质空间(特指革兰氏阴性细菌)(GO：0030288)″ | DctB |
| 2028 | dacC | [1-29] | 青霉素-结合蛋白(D-丙氨酰-D-丙氨酸羧肽酶) | ″分子功能：丝氨酸羧肽酶活性(GO：0004185)，生物过程：蛋白水解和肽水解(GO：0006508)″ | DacC |
| 2060 | [1-37] | 假设的蛋白 | |||
| 2072 | BL00899 | [1-28] | ″芽孢萌发B3GerAC样，C-末端″ | YndF | |
| 2105 | [1-33] | 保守的假设的蛋白 | |||
| 2108 | BL01303 | [1-26] | 肽聚糖-结合蛋白 | ″生物过程：细胞壁代谢(GO：0016998)，生物过程：细胞壁代谢(GO：0016998)″ | YocH |
| 2123 | [1-36] | 假设的蛋白 | |||
| 2132 | BL01404 | [1-24] | 假设的蛋白 | YoqH | |
| 2152 | yvgO | [1-25] | 保守的蛋白YvgO | YvgO | |
| 2160 | lytF | [1-27] | γ-D-谷氨酸-内消旋-二氨基庚二酸胞壁肽(主要的自溶素)(CWBP49′) | ″细胞壁裂解活性，生物过程：细胞壁代谢(GO：0016998)″ | LytF |
| 2167 | yoaJ | [1-26] | YoaJ | YoaJ | |
| 2177 | ctpA | [1-37] | 羧基端加工蛋白酶 | ″生物过程：蛋白水解和肽水解(GO：0006508)，分子功能：丝氨酸型肽酶活性(GO：0008236)″ | CtpA |
| 2180 | yodJ | [1-31] | 推测的羧肽酶 | YodJ | |
| 2207 | ypmS | [1-34] | 保守的蛋白YpmS | YpmS | |
| 2208 | ypmR | [1-24] | 保守的蛋白YpmR | 分子功能：催化活性(GO：0003824) | YpmR |
| 2209 | ypmQ | [1-25] | 保守的假设的YpmQ | 生物过程：电子转运(GO：0006118) | YpmQ |
| 2218 | ypjP | [1-30] | 保守的假设的蛋白YpjP | YpjP | |
| 2266 | ponA | [1-63] | ″青霉素-结合蛋白，糖基转移酶家族51″ | ″参与分裂隔膜的形成″ | PonA |
| 2271 | aspB | [1-23] | 天冬氨酸氨基转移酶 | ″分子功能：转氨酶活性(GO：0008483)，生物过程：生物合成(GO：0009058)″ | AspB |
| 2272 | ypmB | [1-25] | 保守的蛋白YpmB | YpmB | |
| 2315 | BL02789 | [1-29] | 假设的蛋白 | YphF | |
| 2328 | sleB | [1-34] | 芽孢皮层裂解酶 | SleB | |
| 2330 | ansZA | [1-18] | 推测的天冬酰胺酶/谷氨酰胺酶 | ″生物过程：氨基酸代谢(GO：0006520)，生物过程：氨基酸代谢(GO：0006520)″ | YccC |
| 2334 | BL02228 | [1-27] | 推测的水解酶 | 分子功能：水解酶活性(GO：0016787) | YpbG |
| 2344 | yocH | [1-31] | 推测的肽聚糖水解酶YocH | ″生物过程：细胞壁代谢(GO：0016998)，生物过程：细胞壁代谢(GO：0016998)″ | |
| 2347 | BL00652 | [1-32] | 假设的蛋白 | LytR | |
| 2348 | yheN | [1-53] | ″糖酯酶家族4，YheN″ | ″生物过程：糖代谢(GO：0005975)，分子功能：水解酶活性，作用于碳-氮(但不是肽)键(GO：0016810)″ | YheN |
| 2349 | [1-29] | 假设的蛋白 | |||
| 2360 | dacB | [1-28] | D-丙氨酰-D-丙氨酸羧肽酶(青霉素-结合蛋白5*) | ″芽孢皮层合成所需的，分子功能：丝氨酸羧肽酶活性(GO：0004185)，生物过程：蛋白水解和肽水解(GO：0006508)″ | DacB |
| 2371 | BL01892 | [1-44] | 保守的假设的蛋白 | YpuD | |
| 2376 | BL03279 | [1-24] | 保守的假设的蛋白 | YpuA | |
| 2392 | dacF | [1-33] | 青霉素结合蛋白(推测的D-丙氨酰-D-丙氨酸羧肽酶) | ″芽孢皮层合成所必需，分子功能：丝氨酸羧肽酶活性(GO：0004185)，生物过程：蛋白水解和肽水解(GO：0006508)″ | DacF |
| 2400 | BL01161 | [1-28] | ″磷酸转移酶系统，乳糖/纤维二糖特异性IIB亚基″ | ″分子功能：糖转运蛋白活性(GO：0005351)，生物过程：磷酸烯醇丙酮酸依赖的糖磷酸转移酶系统(GO：0009401)″ | |
| 2418 | lip | [1-31] | 脂肪酶 | 分子功能：催化活性(GO：0003824) | Lip |
| 2420 | appAA | [1-32] | 寡肽ABC转运蛋白(寡肽结合蛋白) | ″寡肽转运，分子功能：转运蛋白活性(GO：0005215)，生物过程：转运(GO：0006810)″ | AppA |
| 2435 | [1-24] | 假设的蛋白 | |||
| 2436 | [1-29] | 假设的蛋白 | |||
| 2438 | BL00808 | [1-38] | 假设的蛋白 | YmaC | |
| 2449 | [1-35] | 假设的蛋白 | |||
| 2450 | [1-31] | 保守的假设的蛋白 | SsuA | ||
| 2456 | BL01380 | [1-28] | ″磷酸转移酶系统，乳糖/纤维二糖特异性IIB亚基″ | ″分子功能：糖转运蛋白(porter)活性(GO：0005351)，生物过程：磷酸烯醇丙酮酸依赖的糖磷酸转移酶系统(GO：0009401)″ | |
| 2481 | BL01514 | [1-36] | 细胞壁水解酶/自溶素 | ″分子功能：N-乙酰胞壁酰-L-丙氨酸酰胺酶活性(GO：0008745)，生物过程：肽聚糖代谢 | YqiI |
| (GO：0009253)″ | |||||
| 2482 | yqiH | [1-33] | YqiH | YqiH | |
| 2484 | [1-26] | 假设的蛋白 | |||
| 2499 | spoIIIAH | [1-32] | SpoIIIAH | ″突变体在裹吞(engulfment)发生后阻断芽孢形成，″ | SpoIIIAH |
| 2505 | spoIIIAB | [1-23] | SpoIIIAB | ″突变体在裹吞发生后阻断芽孢形成，″ | SpoIIIAB |
| 2517 | yqhL | [1-24] | 保守的蛋白YqhL | YqhL | |
| 2518 | opuAC | [1-31] | 甘氨酸甜菜碱ABC转运蛋白(甘氨酸甜菜碱结合蛋白) | ″甘氨酸甜菜碱转运分子功能：转运蛋白活性(GO：0005215)，分子功能：结合(GO：0005488)，生物过程：转运(GO：0006810)″ | OpuAC |
| 2528 | tasA | [1-28] | 易位依赖性抗微生物芽孢组分 | TasA | |
| 2530 | yqxM | [1-44] | YqxM | YqxM | |
| 2531 | yqzG | [1-24] | YqzG | YqzG | |
| 2533 | comGG | [1-38] | 可能是DNA转运机制ComGG的部分 | ″结合外源DNA所必需″ | ComGG |
| 2546 | yqgU | [1-28] | 保守的蛋白YqgU | YqgU | |
| 2548 | fhuD | [1-32] | 铁色素ABC转运蛋白(铁色素结合蛋白) | ″分子功能：铁离子转运蛋白活性(GO：0005381)，生物过程：高亲和铁离子转运(GO：0006827)″ | FhuD |
| 2560 | yqzC | [1-33] | 保守的蛋白YqzC | YqzC | |
| 2565 | pstS | [1-33] | 磷酸ABC转运蛋白(结合蛋白) | ″参与高亲和磷酸摄取，分子功能：转运蛋白活性(GO：0005215)，生物过程：转运(GO：0006810)″ | PstS |
| 2566 | pbpA | [1-44] | 青霉素结合蛋白2A | ″参与芽孢长出(outgrowth)时细胞壁延伸相关的肽聚糖合成，分子功能：结合青霉素(GO：0008658)″ | PbpA |
| 2571 | yqfZ | [1-40] | 保守的蛋白YqfZ | ||
| 2616 | BL01411 | [1-37] | 保守的假设的蛋白 | YqfA | |
| 2632 | yqxA | [1-29] | YqxA | YqxA | |
| 2633 | spoIIP | [1-55] | SpoIIP | ″隔膜细胞壁溶解所必需的，″ | SpoIIP |
| 2652 | BL02075 | [1-36] | 推测的脂蛋白 | 分子功能：催化活性(GO：0003824) | YqeF |
| 2697 | appAB | [1-36] | 寡肽ABC转运蛋白(寡肽-结合蛋白) | ″寡肽转运，分子功能：转运蛋白活性(GO：0005215)，生物过程：转运(GO：0006810)″ | AppA |
| 2706 | [1-32] | 推测的磷酸酯酶 | |||
| 2707 | BL02428 | [1-27] | 羧酸酯酶家族 | 分子功能：催化活性(GO：0003824) | PnbA |
| 2710 | BL03118 | [1-28] | 假设的蛋白 | YndA | |
| 2712 | sacC | [1-24] | 糖苷水解酶家族32 | ″分子功能：水解酶活性，水解O-糖基化合物(GO：0004553)，生物过程：糖代谢(GO：0005975)″ | SacC |
| 2729 | BL00468 | [1-33] | 周质铁结合蛋白 | ″分子功能：铁离子转运蛋白活性(GO：0005381)，生物过程：高亲和铁离子转运(GO：0006827)″ | YxeB |
| 2745 | yrrS | [1-50] | 保守的蛋白YrrS | YrrS | |
| 2752 | yrrL | [1-44] | 保守的蛋白YrrL | YrrL | |
| 2771 | yrvJ | [1-29] | N-乙酰胞壁酰-L-丙氨酸酰胺酶YrvJ | YrvJ | |
| 2793 | ymaC | [1-24] | 噬菌体相关蛋白YmaC | YmaC | |
| 2797 | coxA | [1-27] | 芽孢皮层蛋白 | CoxA | |
| 2801 | nadB | [1-37] | L-天冬氨酸氧化酶 | ″NAD生物合成所必需的，″ | NadB |
| 2818 | mreC | [1-33] | 细胞形状决定蛋白 | ″，生物过程：细胞形状的调节(GO：0008360)″ | MreC |
| 2866 | [1-28] | 假设的蛋白 | |||
| 2872 | gerM | [1-34] | 芽孢萌发蛋白GerM | ″萌发(皮层水解)和孢子形成(阶段II，多个极性隔膜)，″ | GerM |
| 2898 | [1-33] | 假设的蛋白 | |||
| 2911 | araN | [1-32] | 糖结合蛋白 | ″L-阿拉伯糖转运，分子功能：转运蛋白活性(GO：0005215)，生物过程：转运(GO：0006810)″ | AraN |
| 2916 | abnAB | [1-28] | 糖苷水解酶家族43 | ″植物细胞壁多糖降解，分子功能：水解酶活性，水解O-糖基化合物(GO：0004553)，生物过程：糖代谢(GO：0005975)″ | AbnA |
| 2939 | pelB | [1-31] | ″果胶裂合酶，多糖裂合酶家族1″ | PelB | |
| 3005 | ytxE | [1-51] | YtxE | 细胞组分：外膜(特指革兰氏阴性细菌)(GO：0009279) | YtxE |
| 3049 | ytcQ | [1-30] | 推测的多种糖转运系统底物结合蛋白YtcQ | ″分子功能：转运蛋白活性(GO：0005215)，生物过程：转运(GO：0006810)″ | YtcQ |
| 3059 | BL00013 | [1-30] | 推测的脂蛋白 | YusA | |
| 3081 | ytlA | [1-33] | 推测的硫酸转运系统底物结合蛋白YtlA | YtlA | |
| 3088 | ytkA | [1-29] | 保守的蛋白YtkA | YtkA | |
| 3093 | BL05310 | [1-29] | 周质溶质结合蛋白 | ″分子功能：结合(GO：0005488)，细胞组分：周质空间(特指革兰氏阴性细菌)(GO：0030288)″ | YcdH |
| 3217 | [1-22] | 假设的蛋白 | 分子功能：催化活性(GO：0003824) | ||
| 3235 | yuiC | [1-34] | 保守的蛋白YuiC | YuiC | |
| 3264 | yutC | [1-24] | 保守的蛋白YutC | YutC | |
| 3266 | BL02121 | [1-22] | 推测的金属肽酶 | ″分子功能：金属内肽酶活性(GO：0004222)，生物过程：蛋白水解和肽水解(GO：0006508)″ | YunA |
| 3267 | [1-32] | 假设的蛋白 | |||
| 3269 | yunB | [1-41] | 保守的蛋白YunB | YunB | |
| 3284 | yurYA | [1-40] | 胞外核糖核酸酶 | 分子功能：核酸酶活性(GO：0004518) | YurI |
| 3298 | yusA | [1-28] | 推测的ABC转运系统底物结合蛋白YusA | YusA | |
| 3318 | yfiY | [1-29] | ABC转运系统底物结合蛋白 | ″分子功能：铁离子转运蛋白活性(GO：0005381)，生物过程：高亲和铁离子转运(GO：0006827)″ | YfiY |
| 3319 | yusW | [1-28] | YusW | YusW | |
| 3333 | gerAC | [1-25] | 芽孢萌发蛋白A3前体 | ″对L-丙氨酸和相关氨基酸的萌发响应(最早期)，″ | GerAC |
| 3338 | yvqG | [1-39] | 保守的蛋白YvqG | ″生物过程：代谢(GO：0008152)，分子功能：氧化还原酶活性 | YvqG |
| (GO：0016491)″ | |||||
| 3349 | yvrC | [1-37] | 推测的铁转运系统底物结合蛋白YvrC | ″分子功能：铁离子转运蛋白活性(GO：0005381)，生物过程：高亲和性铁离子转运(GO：0006827)″ | YvrC |
| 3380 | BL02684 | [1-27] | 推测的胞外溶质结合蛋白 | 分子功能：转运蛋白活性(GO：0005215) | YvfK |
| 3384 | BL02680 | [1-31] | 推测的糖苷水解酶家族3 | YbbD | |
| 3387 | mntA | [1-28] | 锰转运系统底物结合蛋白 | ″分子功能：结合(GO：0005488)，细胞组分：周质空间(特指革兰氏阴性细菌)(GO：0030288)″ | YcdH |
| 3429 | [1-33] | 假设的蛋白 | |||
| 3465 | [1-32] | 假设的蛋白 | |||
| 3492 | opuCC | [1-32] | 甘氨酸甜菜碱/肉碱/胆碱ABC转运蛋白(渗透保护剂结合蛋白) | ″甘氨酸、甜菜碱、肉碱和胆碱的高亲和性转运，分子功能：转运蛋白活性(GO：0005215)，分子功能：结合(GO：0005488)，生物过程：转运(GO：0006810)″ | OpuCC |
| 3499 | BL03470 | [1-29] | ″周质结合蛋白，推测的铁转运蛋白″ | ″分子功能：铁离子转运蛋白活性(GO：0005381)，生物过程：高亲和性铁离子转运(GO：0006827)″ | YfiY |
| 3510 | [1-26] | 假设的蛋白 | |||
| 3547 | sacB | [1-30] | ″果聚糖蔗糖酶，糖苷水解酶家族68″ | ″分子功能：水解酶活性，水解O-糖基化合物(GO：0004553)，生物过程：糖类利用(GO：0007587)″ | SacB |
| 3548 | levB | [1-33] | ″内切果聚糖酶，糖苷水解酶家族32″ | YveB | |
| 3559 | [1-29] | 推测的核糖核酸酶 | ″分子功能：RNA结合(GO：0003723)，分子功能：内切核糖核酸酶活性(GO：0004521)″ | ||
| 3578 | yvpB | [1-39] | 推测的半胱氨酸蛋白酶YvpB | ″分子功能：半胱氨酸型内肽酶活性(GO：0004197)，生物过程：蛋白水解和肽水解(GO：0006508)″ | YvpB |
| 3579 | yvpA | [1-29] | 多糖裂合酶家族3 | YvpA | |
| 3587 | yvnB | [1-29] | YvnB | YvnB | |
| 3600 | ctpB | [1-37] | ″肽酶S41A，C-末端蛋白酶″ | ″生物过程：蛋白水解和肽水解(GO：0006508)，分子功能：丝氨酸型肽酶活性(GO：0008236)″ | YvjB |
| 3602 | BL03388 | [1-29] | ″血影蛋白重复(spectrin repeat)，基本单杂交基序(Rudimentsingle hybrid motif)″ | YvcE | |
| 3643 | lytC | [1-14] | N-乙酰胞壁酰-L-丙氨酸酰胺酶(主要自溶素)(CWBP49) | ″参与细胞分离、细胞壁代谢(cellwall turnover)、抗生素诱导的裂解、运动性和叠氮化钠诱导的普通细胞裂解，分子功能：N-乙酰胞壁酰-L-丙氨酸酰胺酶活性(GO：0008745)，生物过程：肽聚糖代谢 | LytC |
| 3644 | lytB | [1-26] | 主要自溶素LytC(CWBP76)的修饰蛋白 | LytB | |
| 3645 | BL03297 | [1-25] | 膜结合脂蛋白 | 参与主要自溶素的分泌 | LytA |
| 3646 | lytR | [1-32] | 膜结合蛋白 | ″起lytABC和lytR表达的衰减子 | LytR |
| 作用″ | |||||
| 3656 | lytD | [1-29] | ″N-乙酰氨基葡萄糖苷酶(主要自溶素)，糖苷水解酶家族73″ | ″参与细胞分离，细胞壁代谢，抗生素诱导的裂解和活动性，分子功能：酰胺酶活性(GO：0004040)，生物过程：肽聚糖代谢(GO：0009253)″ | LytD |
| 3670 | pgdS | [1-34] | γ-DL-谷氨酰水解酶 | ″γ-DL-谷氨酰水解酶，只在PGA的D-和L-谷氨酸之间切割γ-谷氨酰键，DL-内肽酶II家族″ | YwtD |
| 3671 | ywtC | [1-25] | YwtC | ||
| 3672 | pgsAA | [1-47] | 聚-γ-谷氨酸合成蛋白 | YwtB | |
| 3680 | rbsB | [1-28] | 核糖ABC转运蛋白(核糖结合蛋白) | ″核糖转运，″ | RbsB |
| 3738 | feuA | [1-28] | 铁结合蛋白 | ″铁摄取系统的组分，分子功能：铁离子转运蛋白活性(GO：0005381)，生物过程：高亲和性铁离子转运(GO：0006827)″ | FeuA |
| 3751 | ywmD | [1-25] | YwmD | YwmD | |
| 3752 | ywmC | [1-24] | YwmC | YwmC | |
| 3753 | spoIID | [1-33] | SpoIID | “完全溶解不对称的隔膜所需要的，” | SpoIID |
| 3755 | ywmB | [1-30] | 保守的蛋白YwmB | YwmB | |
| 3773 | spoIIR | [1-29] | SpoIIR | 加工原-σ-E所需要的 | SpoIIR |
| 3801 | ywjE | [1-28] | 推测的磷酸脂肪酶 | ″分子功能：催化活性(GO：0003824)，生物过程：代谢(GO：0008152)″ | YwjE |
| 3808 | BL03962 | [1-41] | ″青霉素结合蛋白，糖基转移酶家族51″ | ″分子功能：青霉素结合(GO：0008658)，生物过程：细胞壁生物合成(特指细菌)(GO：0009273)” | YwhE |
| 3812 | [1-25] | 假设的蛋白 | |||
| 3829 | BL03904 | [1-32] | 假设的蛋白 | YuaB | |
| 3849 | vpr | [1-29] | 胞外丝氨酸蛋白酶 | ″分子功能：枯草杆菌蛋白酶样丝氨酸蛋白酶活性(GO：0004289)，生物过程：蛋白水解和肽水解(GO：0006508)″ | Vpr |
| 3906 | ywaD | [1-31] | 推测的氨肽酶 | ″生物过程：蛋白水解和肽水解(GO：0006508)，分子功能：肽酶活性(GO：0008233)″ | YwaD |
| 3914 | dltD | [1-27] | 前体DltD | 脂磷壁酸和壁磷壁酸(wallteichoic acid)的D-丙氨酸酯化(D-丙氨酸从十一异戊二烯醇-P到LTA的聚(甘油磷酸)链的转移) | DltD |
| 3920 | licB | [1-24] | 磷酸转移酶系统(PTS)地衣淀粉特异性酶IIB组分 | ″分子功能：糖转运蛋白活性(GO：0005351)，生物过程：磷酸烯醇丙酮酸依赖的糖磷酸转移酶系统(GO：0009401)″ | |
| 3933 | BL05372 | [1-31] | 假设的蛋白 | YweA | |
| 3954 | lanP | [1-25] | 丝氨酸蛋白酶 | ″功能：枯草杆菌蛋白酶样丝氨酸蛋白酶活性(GO：0004289)，蛋白水解和肽水解(GO：0006508)，硫 | IspA |
| 醚抗生素前导肽加工″ | |||||
| 3970 | ansA | [1-29] | L-天冬酰胺酶 | ″分子功能：天冬酰胺酶活性(GO：0004067)，生物过程：氨基酸代谢(GO：0006520)″ | AnsA |
| 3977 | BL02958 | [1-25] | 保守的假设的蛋白 | YxeA | |
| 3978 | yxkH | [1-28] | ″多糖脱乙酰基酶，糖酯酶家族4″ | ″生物过程：糖代谢(GO：0005975)，分子功能：水解酶活性，作用于碳-氮(但不是肽)键(GO：0016810)” | YxkH |
| 3982 | BL02963 | [1-30] | 甘油磷酰二酯磷酸二酯酶 | ″生物过程：甘油代谢(GO：0006071)，分子功能：甘油磷酸二酯磷酸二酯酶活性(GO：0008889)″ | YhdW |
| 3983 | BL05379 | [1-28] | 假设的蛋白 | ||
| 3996 | [1-73] | 假设的蛋白 | |||
| 4011 | BL05383 | [1-34] | 假设的蛋白 | YjeA | |
| 4016 | [1-31] | 假设的蛋白 | 生物过程：电子转运(GO：0006118) | ||
| 4046 | yxiA | [1-27] | ″糖苷水解酶，家族43″ | ″分子功能：水解酶活性，水解O-糖基化合物(GO：0004553)，生物过程：糖代谢(GO：0005975)″ | YxiA |
| 4058 | ydaJ | [1-29] | 推测的糖苷转移酶 | ydaJ | |
| 4080 | glpQ | [1-29] | 甘油磷酰二酯磷酸二酯酶 | ″水解脱酰基的磷脂，生物过程：甘油代谢(GO：0006071)，分子功能：甘油磷酸二酯磷酸二酯酶活性(GO：0008889)″ | GlpQ |
| 4099 | yxeA | [1-34] | 保守的假设的蛋白 | ||
| 4103 | yvfO | [1-28] | 糖基水解酶家族53 | YvfO | |
| 4107 | cycB | [1-32] | ″推测的胞外溶质结合蛋白，家族1CycB″ | ″分子功能：转运蛋白活性(GO：0005215)，生物过程：转运(GO：0006810)″ | YvfK |
| 4121 | [1-28] | 假设的蛋白 | |||
| 4128 | [1-34] | 假设的蛋白 | |||
| 4130 | [1-42] | 假设的蛋白 | |||
| 4158 | yycH | [1-36] | 保守的假设的YycH | YycH | |
表4染色体密码子使用表
| #密码子 | 氨基酸 | 分数 | /1000 | 数目 |
| GCA | A | 0.230 | 18.394 | 22495 |
| GCC | A | 0.272 | 21.724 | 26567 |
| GCG | A | 0.301 | 24.082 | 29451 |
| GCT | A | 0.197 | 15.766 | 19281 |
| TGC | C | 0.662 | 5.113 | 6253 |
| TGT | C | 0.338 | 2.613 | 3195 |
| GAC | D | 0.432 | 22.129 | 27063 |
| GAT | D | 0.568 | 29.114 | 35605 |
| GAA | E | 0.704 | 51.721 | 63253 |
| GAG | E | 0.296 | 21.797 | 26657 |
| TTC | F | 0.354 | 16.034 | 19609 |
| TTT | F | 0.646 | 29.223 | 35738 |
| GGA | G | 0.316 | 22.644 | 27693 |
| GGC | G | 0.374 | 26.825 | 32806 |
| GGG | G | 0.171 | 12.287 | 15026 |
| GGT | G | 0.139 | 9.957 | 12177 |
| CAC | H | 0.386 | 8.412 | 10288 |
| CAT | H | 0.614 | 13.369 | 16350 |
| ATA | I | 0.101 | 7.217 | 8826 |
| ATC | I | 0.487 | 34.741 | 42487 |
| ATT | I | 0.412 | 29.376 | 35926 |
| AAA | K | 0.693 | 49.125 | 60078 |
| AAG | K | 0.307 | 21.739 | 26586 |
| CTA | L | 0.032 | 3.106 | 3798 |
| CTC | L | 0.152 | 14.848 | 18158 |
| CTG | L | 0.263 | 25.592 | 31298 |
| CTT | L | 0.229 | 22.330 | 27309 |
| TTA | L | 0.143 | 13.920 | 17023 |
| TTG | L | 0.181 | 17.639 | 21572 |
| ATG | M | 1.000 | 26.541 | 32458 |
| AAC | N | 0.505 | 19.159 | 23431 |
| AAT | N | 0.495 | 18.780 | 22967 |
| CCA | P | 0.112 | 4.189 | |
| CCC | P | 0.120 | 4.477 | 5475 |
| CCG | P | 0.520 | 19.405 | 23731 |
| CCT | P | 0.248 | 9.236 | 11295 |
| CAA | Q | 0.465 | 16.656 | 20369 |
| CAG | Q | 0.535 | 19.179 | 23455 |
| AGA | R | 0.218 | 9.611 | 11754 |
| AGG | R | 0.146 | 6.448 | 7886 |
| CGA | R | 0.074 | 3.275 | 4005 |
| CGC | R | 0.253 | 11.173 | 13664 |
| CGG | R | 0.194 | 8.538 | 10441 |
| CGT | R | 0.114 | 5.044 | 6168 |
| AGC | S | 0.263 | 15.893 | 19436 |
| AGT | S | 0.063 | 3.820 | 4672 |
| TCA | S | 0.202 | 12.173 | 14887 |
| TCC | S | 0.154 | 9.287 | 11357 |
| TCG | S | 0.171 | 10.289 | 12583 |
| TCT | S | 0.147 | 8.865 | 10841 |
| ACA | T | 0.327 | 16.969 | 20752 |
| ACC | T | 0.188 | 9.765 | 11942 |
| ACG | T | 0.373 | 19.404 | 23730 |
| ACT | T | 0.112 | 5.833 | 7134 |
| GTA | V | 0.144 | 9.710 | 11875 |
| GTC | V | 0.361 | 24.342 | 29769 |
| GTG | V | 0.238 | 16.042 | 19619 |
| GTT | V | 0.257 | 17.354 | 21223 |
| TGG | W | 1.000 | 10.303 | 12600 |
| TAC | Y | 0.398 | 13.468 | 16471 |
| TAT | Y | 0.602 | 20.348 | 24885 |
| TAA | * | 0.551 | 1.962 | 2400 |
| TAG | * | 0.157 | 0.558 | 682 |
| TGA | * | 0.292 | 1.041 | 1273 |
表5信号肽密码子使用表
| 密码子 | 氨基酸 | 分数 | /1000 | 数目 |
| GCA | A | 0.294 | 42.315 | 106 |
| GCC | A | 0.219 | 31.537 | 79 |
| GCG | A | 0.242 | 34.731 | 87 |
| GCT | A | 0.244 | 35.13 | 88 |
| TGC | C | 0.543 | 9.98 | 25 |
| TGT | C | 0.457 | 8.383 | 21 |
| GAC | D | 0.231 | 2.395 | 6 |
| GAT | D | 0.769 | 7.984 | 20 |
| GAA | E | 0.784 | 15.968 | 40 |
| GAG | E | 0.216 | 4.391 | 11 |
| TTC | F | 0.335 | 21.956 | 55 |
| TTT | F | 0.665 | 43.513 | 109 |
| GGA | G | 0.341 | 22.355 | 56 |
| GGC | G | 0.262 | 17.166 | 43 |
| GGG | G | 0.183 | 11.976 | 30 |
| GGT | G | 0.213 | 13.972 | 35 |
| CAC | H | 0.316 | 2.395 | 6 |
| CAT | H | 0.684 | 5.19 | 13 |
| ATA | I | 0.142 | 9.98 | 25 |
| ATC | I | 0.466 | 32.735 | 82 |
| ATT | I | 0.392 | 27.545 | 69 |
| AAA | K | 0.767 | 61.876 | 155 |
| AAG | K | 0.233 | 18.762 | 47 |
| CTA | L | 0.05 | 7.186 | 18 |
| CTC | L | 0.098 | 13.972 | 35 |
| CTG | L | 0.235 | 33.533 | 84 |
| CTT | L | 0.16 | 22.754 | 57 |
| TTA | L | 0.221 | 31.537 | 79 |
| TTG | L | 0.235 | 33.533 | 84 |
| ATG | M | 1 | 51.497 | 129 |
| AAC | N | 0.482 | 10.778 | 27 |
| AAT | N | 0.518 | 11.577 | 29 |
| CCA | P | 0.164 | 479 | 12 |
| CCC | P | 0.192 | 5.589 | 14 |
| CCG | p | 0.452 | 13.174 | 33 |
| CCT | P | 0.192 | 5.589 | 14 |
| CAA | Q | 0.475 | 11.577 | 29 |
| CAG | Q | 0.525 | 12.774 | 32 |
| AGA | R | 0.333 | 9.98 | 25 |
| AGG | R | 0.08 | 2.395 | 6 |
| CGA | R | 0.107 | 3.194 | 8 |
| CGC | R | 0.16 | 4.79 | 12 |
| CGG | R | 0.173 | 5.19 | 13 |
| CGT | R | 0.147 | 4.391 | 11 |
| AGC | S | 0.171 | 14.77 | 37 |
| AGT | S | 0.093 | 7.984 | 20 |
| TCA | S | 0.241 | 20.758 | 52 |
| TCC | S | 0.148 | 12.774 | 32 |
| TCG | S | 0.134 | 11.577 | 29 |
| TCT | S | 0.213 | 18.363 | 46 |
| ACA | T | 0.262 | 11.178 | 28 |
| ACC | T | 0.234 | 9.98 | 25 |
| ACG | T | 0.327 | 13.972 | 35 |
| ACT | T | 0.178 | 7.585 | 19 |
| GTA | V | 0.216 | 14.371 | 36 |
| GTC | V | 0.186 | 12.375 | 31 |
| GTG | V | 0.335 | 22.355 | 56 |
| GTT | V | 0.263 | 17.565 | 44 |
| TGG | W | 1 | 7.585 | 19 |
| TAC | Y | 0.405 | 5.988 | 15 |
| TAT | Y | 0.595 | 8.782 | 22 |
| TAA | * | 0 | 0 | 0 |
| TAG | * | 0 | 0 | 0 |
| TGA | * | 0 | 0 | 0 |
实施例6：使用DNA微阵列鉴定被葡萄糖限制所诱导的基因
在一式二份含有100ml Spizizen I培养基(Anagnostopoulos和Spizizen，1961，Journal of Bacteriology 81：741-746)的摇瓶中培养地衣芽孢杆菌ATCC14580。从10ml对数生长中期细胞(大约80-90个克莱特单位(Klett units))获得摇瓶的接种物，并从30ml的对数生长中期细胞中提取0小时总RNA样品，如下所述。还在接种后2、4、6、8小时从Spizizen I摇瓶取样10ml，从中纯化总细胞RNA。将所有细胞样品和两倍体积的RNAProtect RNA稳定试剂(QIAGEN，Inc.，Valencia，CA))混合5分钟。2800×g，4℃离心10min沉降细胞，弃去上清，将细胞沉降物在-80℃冷冻，并用FastRNA Pro Blue试剂盒(QBio基因，Carlsbad，CA)根据制造商提供的操作规程纯化细胞RNA。来自每个样品的冷冻细胞沉降物在FastRNA Pro Blue试剂盒提供的2mlRNAPro溶液中重悬，从两个裂解基质B小瓶中获得RNA。
0时间点制备16个重复的cDNA靶，余下的每个时间点制备两个技术重复(techical replicate)的cDNA靶，并与按照Berka等，2002，MolecularMicrobiology 43：1331-1345的描述制备的地衣芽孢杆菌DNA微阵列杂交。根据Hu等的描述[在G.Parmigiani，E.S.Garrett，R.A Irizarry，和S.L Zeger(编)The Analysis of Gene Expression Data，pp.318-319，Springer-Verlag，NewYork(2003)中]准备染料交换杂交(dye swap hybridizations)，使用0时间点作对照。
用Axon 4000B扫描器扫描阵列并格式化以用GenePix Pro 5.0版(AxonInstruments，Inc.Redwood City，CA)进行分析。来自GenePix的荧光强度数据被直接输入S-Plus ArrayAnalyzer 2.0版软件(Insightful Corporation，Seattle，WA)进行统计分析。原始强度数据用S-Plus ArrayAnalyzer提供的lowess(locally weighted regression，局部加权回归)函数进行归一化，根据S-PlusArrayAnalyzer软件(Insightful Corp.，Seattle，WA)的用户手册所述，使用Bonferroni校正的多重比较t检验鉴定在每个时间点上相对0时间参考点有表达变化的基因。家族间误差率(family-wise error rate，FWER)设为0.1。使用每个时间点上通过了上述统计标准的基因的列表查询用Pathway ToolsSuite软件(Karp等，2002，Bioinformatics 18 suppl.1：S225-S232)建立的途径-基因组(pathway-genome)数据库，并将基因表达谱画到代谢途径示意图上。这样，就鉴定了每个时间点上有显著变化的途径。
根据分析结果得到下面的结论：(1)在培养的早期，编码糖酵解途径酶的基因被轻微诱导，显示从接种培养物中部分耗尽的葡萄糖水平到摇瓶培养基中充足的葡萄糖的变化；(2)当在摇瓶培养中葡萄糖逐渐被消耗(时间6和8小时)时，编码糖酵解途径酶的基因被下调；(3)编码苯丙氨酸、色氨酸、组氨酸和精氨酸生物合成途径的基因在静止期被上调，说明细胞已耗尽必需氨基酸，并正在打开途径基因以合成更多的这些必需营养素；(4)当细胞进入静止期时，细胞分裂、DNA复制和核糖体生产都降到低水平。这表现为嘌呤和嘧啶生物合成途径的关闭和编码许多核糖体蛋白基因的下调。
序列表
本文并入CD盘上两个拷贝的序列表供参考。拷贝1以Intel x86机器格式制作，与Windows XP操作系统兼容，有一个保存为10588.200的文件，该文件为19,455kb，生成于2004年11月4目。拷贝2与拷贝1相同。附带的CD盘的内容相同，不包含新的内容。
本文所描述和要求保护的发明的范围并不被本文所公开的具体方面所限制，因为这些方面旨在说明本发明的一些方面。任何等价的方面都被认为在本发明的范围之内。事实上，除了本文所揭示和描述的，任何针对前面的描述所作的本发明的修改对于本领域的技术人员都是显而易见的。这些修改被认为落入所附权利要求的范围内。在抵触的情况下，以包括定义的本公开为准。
本文引用了多篇参考文献，将其公开全文并入以供参考。
Claims (69)
1.编码生物活性物质的分离的基因，其选自：
(a)包括与SEQ ID NOs：2-4198的任一核苷酸序列具有至少60％同一性的核苷酸序列的基因；和
(b)包括与SEQ ID NOs：2-4198的任一核苷酸序列或其互补链在中等严紧度条件下杂交的核苷酸序列的基因。
2.权利要求1的分离的基因，其包括与SEQ ID NOs：2-4198的任一序列具有至少60％的同一性的核苷酸序列。
3.权利要求2的分离的基因，其包括与SEQ ID NOs：2-4198的任一序列具有至少65％的同一性的核苷酸序列。
4.权利要求3的分离的基因，其包括与SEQ ID NOs：2-4198的任一序列具有至少70％的同一性的核苷酸序列。
5.权利要求4的分离的基因，其包括与SEQ ID NOs：2-4198的任一序列具有至少75％的同一性的核苷酸序列。
6.权利要求5的分离的基因，其包括与SEQ ID NOs：2-4198的任一序列具有至少80％的同一性的核苷酸序列。
7.权利要求6的分离的基因，其包括与SEQ ID NOs：2-4198的任一序列具有至少85％的同一性的核苷酸序列。
8.权利要求7的分离的基因，其包括与SEQ ID NOs：2-4198的任一序列具有至少90％的同一性的核苷酸序列。
9.权利要求8的分离的基因，其包括与SEQ ID NOs：2-4198的任一序列具有至少95％的同一性的核苷酸序列。
10.权利要求1的分离的基因，其与SEQ ID NOs：2-4198的任一核苷酸序列或其互补链在中等严紧度条件下杂交。
11.权利要求10的分离的基因，其与SEQ ID NOs：2-4198的任一核苷酸序列或其互补链在中高严紧度条件下杂交。
12.权利要求11的分离的基因，其与SEQ ID NOs：2-4198的任一核苷酸序列或其互补链在高严紧度条件下杂交。
13.权利要求1的分离的基因，其包含在地衣芽孢杆菌ATCC 14580中。
14.包含权利要求1的分离的基因的核酸构建体，所述基因可操作地与一个或多个调控序列连接，所述调控序列在表达宿主中指导多肽的生产。
15.包含权利要求14的核酸构建体的重组表达载体。
16.包含权利要求14的核酸构建体的重组宿主细胞。
17.分离的生物活性物质，其选自：
(a)具有与SEQ ID NOs：4199-8395的任一序列具有至少60％的同一性的氨基酸序列的生物活性物质；和
(b)由包括与SEQ ID NOs：2-4198的任一核苷酸序列或其互补链在中等严紧条件下杂交的核苷酸序列的基因所编码的生物活性物质。
18.权利要求17的生物活性物质，其具有与SEQ ID NOs：4199-8395中的任一氨基酸序列具有至少60％同一性的氨基酸序列。
19.权利要求18的生物活性物质，其具有与SEQ ID NOs：4199-8395中的任一氨基酸序列具有至少65％同一性的氨基酸序列。
20.权利要求19的生物活性物质，其具有与SEQ ID NOs：4199-8395中的任一氨基酸序列具有至少70％同一性的氨基酸序列。
21.权利要求20的生物活性物质，其具有与SEQ ID NOs：4199-8395中的任一氨基酸序列具有至少75％同一性的氨基酸序列。
22.权利要求21的生物活性物质，其具有与SEQ ID NOs：4199-8395中的任一氨基酸序列具有至少80％同一性的氨基酸序列。
23.权利要求22的生物活性物质，其具有与SEQ ID NOs：4199-8395中的任一序列具有至少85％同一性的氨基酸序列。
24.权利要求23的生物活性物质，其具有与SEQ ID NOs：4199-8395中的任一氨基酸序列具有至少90％同一性的氨基酸序列。
25.权利要求24的生物活性物质，其具有与SEQ ID NOs：4199-8395中的任一氨基酸序列具有至少95％同一性的氨基酸序列。
26.权利要求17-25中的任一项的生物活性物质，其包含SEQ IDNOs：4199-8395中的任一氨基酸序列。
27.权利要求17-26中的任一项的生物活性物质，其由SEQ IDNOs：4199-8395中的任一氨基酸序列或其保持生物活性的片段组成。
28.权利要求27的生物活性物质，其由SEQ ID NOs：4199-8395中的任一氨基酸序列组成。
29.权利要求17的生物活性物质，其由包括与SEQ ID NOs：2-4198的任一核苷酸序列或其互补链在中等严紧条件下杂交的核苷酸序列的基因所编码。
30.权利要求17的生物活性物质，其由包括与SEQ ID NOs：2-4198的任一序列或其互补链在中高严紧度条件下杂交的核苷酸序列的基因所编码。
31.权利要求17的生物活性物质，其由包括与SEQ ID NOs：2-4198的任一序列或其互补链在高严紧度条件下杂交的核苷酸序列的基因所编码。
32.权利要求17的生物活性物质，其由地衣芽孢杆菌ATCC 14580中所包含的基因编码。
33.生产权利要求17-32的任一项的生物活性物质的方法，其包括(a)在有助于产生该生物活性物质的条件下培养菌株，所述菌株的野生型形式能够产生该生物活性物质；和(b)回收该生物活性物质。
34.生产权利要求17-32的任一项的生物活性物质的方法，其包括(a)在有助于产生该生物活性物质的条件下培养包含核酸构建体的宿主细胞，所述核酸构建体包括编码该生物活性物质的基因；和(b)回收该生物活性物质。
35.产生亲代细胞的突变体的方法，其包括破坏或删除权利要求17-32的任一项的基因，从而生成突变体，此突变体生产的所述生物活性物质比亲代细胞少。
36.通过权利要求35的方法产生的突变体。
37.权利要求36的突变体，其进一步包含编码天然或异源蛋白的核苷酸序列。
38.生产蛋白质的方法，其包括(a)在有助于产生该蛋白质的条件下培养权利要求37的突变体细胞；和(b)回收该蛋白质。
39.分离的核苷酸序列，其通过如下得到：(a)在中等严紧条件下使DNA群体与SEQ ID NOs：2-4198的任一核苷酸序列或其互补链杂交；和(b)分离杂交的核苷酸序列，该核苷酸序列编码生物活性物质。
40.权利要求39的分离的核苷酸序列，其如下述得到：(a)在中-高严紧度条件下使DNA群体与SEQ ID NOs：2-4198的任一核苷酸序列或其互补链杂交；和(b)分离杂交的核苷酸序列，该核苷酸序列编码生物活性物质。
41.权利要求40的分离的核苷酸序列，其通过如下得到：(a)在高严紧条件下使DNA群体与SEQ ID NOs：2-4198的任一核苷酸序列或其互补链杂交；和(b)分离杂交的核苷酸序列，该核苷酸序列编码生物活性物质。
42.转基因植物，植物的部分或植物细胞，其已被权利要求1-13的任一项的分离的基因所转化。
43.分离编码酶的基因的方法，其包括：
(a)在一定条件下，向地衣芽孢杆菌基因的阵列加入标记的第一和标记的第二核酸探针的混合物，所述第一核酸探针是从在不含诱导底物的培养基上培养的微生物菌株中分离的；所述第二核酸探针是从在含有诱导底物的培养基上培养的微生物菌株中分离的；所述地衣芽孢杆菌基因选自核苷酸SEQ ID NOs：2-4198、SEQ ID NOs：2-4198的互补链和SEQ ID NOs：2-4198的片段；在所述一定条件下，所述标记的核酸与所述阵列上的地衣芽孢杆菌基因的互补序列杂交；其中，所述第一核酸探针由第一报道分子所标记，所述第二核酸探针由第二报道分子所标记；
(b)在一定的条件下检查该阵列，在此条件下，微生物菌株的基因的相对表达是由所观察到的阵列上每个点的杂交报道分子信号决定的，其中，(i)阵列上与第一核酸探针杂交的地衣芽孢杆菌基因产生独特的第一杂交报道分子信号，而与第二核酸探针杂交的地衣芽孢杆菌基因则产生独特的第二杂交报道分子信号，表明该微生物的培养基中由于诱导底物的存在发生了基因的诱导；和(ii)阵列上与第一和第二核酸探针都杂交的地衣芽孢杆菌基因产生独特的联合杂交报道分子信号；及
(c)从微生物菌株中分离被该底物的存在所诱导的基因，其中该基因编码参与该底物的降解或转化的酶。
44.权利要求43的方法，其中诱导底物选自纤维素、半纤维素、木质素、植酸、淀粉、果胶质(pectin)和蛋白质。
45.权利要求43的方法，其中所述酶选自氧化还原酶、转移酶、水解酶、裂合酶、异构酶和连接酶。
46.权利要求43的方法，其中所述微生物菌株是细菌。
47.权利要求46的方法，其中所述细菌是芽孢杆菌属、假单胞菌属或链霉菌属的菌株。
48.监测在第一细菌细胞中的多个基因相对于一种或更多的第二细菌细胞中相同基因的表达的差异表达的方法，其包括：
(a)在一定条件下，将用检测报道分子标记的从细菌细胞中分离的核酸加入含有地衣芽孢杆菌基因阵列的底物中，所述地衣芽孢杆菌基因选自核苷酸SEQ ID NOs：2-4198、SEQ ID NOs：2-4198的互补链和SEQ IDNOs：2-4198的片段；在所述一定条件下，所述检测报道分子标记的核酸与所述阵列上的地衣芽孢杆菌基因的互补序列杂交；其中来自所述第一细菌细胞和一种或更多的第二细菌细胞的核酸分别被第一检测报道分子和一种或更多的不同第二检测报道分子所标记；和
(b)在一定条件下检查该阵列，在所述条件下，所述细菌细胞中的基因的相对表达是由所观察到的阵列上每个点的检测信号决定的，其中，(i)阵列上与来自第一细菌细胞的核酸或者与来自一种或多种第二细菌细胞的核酸杂交的地衣芽孢杆菌基因分别产生独特的第一检测信号或者一种或多种第二检测信号；和(ii)阵列上与由第一细菌细胞和一种或多种第二细菌细胞得到的核酸都杂交的地衣芽孢杆菌基因产生独特的联合检测信号。
49.权利要求48的方法，其中所述一种或多种细菌细胞选自芽孢杆菌、假单胞菌和链霉菌细胞。
50.权利要求48的方法，其中所述两种或多种细菌细胞是相同的细胞。
51.权利要求48的方法，其中所述两种或多种细菌细胞是嗜碱芽孢杆菌、解淀粉芽孢杆菌、短芽孢杆菌、蜡状芽孢杆菌、环状芽孢杆菌、Bacillusclausii、凝结芽孢杆菌、苛求芽孢杆菌、坚强芽孢杆菌、灿烂芽孢杆菌、迟缓芽孢杆菌、地衣芽孢杆菌、浸麻芽孢杆菌、巨大芽孢杆菌、甲醇芽孢杆菌、短小芽孢杆菌、球形芽孢杆菌、嗜热脂肪芽孢杆菌、枯草芽孢杆菌或苏云金芽孢杆菌。
52.权利要求48的方法，其中所述两种或多种细菌细胞是不同的细胞。
53.计算机可读取的介质，其上记录了地衣芽孢杆菌基因的阵列，所述地衣芽孢杆菌基因选自核苷酸SEQ ID NOs：2-4198、SEQ ID NOs：2-4198的互补链和SEQ ID NOs：2-4198的片段；该介质用于监测第一细菌细胞中的多个基因相对于一种或多种第二细菌细胞中相同基因表达的差异表达。
54.权利要求53的计算机可读取介质，其中所述一种或多种细菌细胞选自芽孢杆菌、假单胞菌和链霉菌细胞。
55.权利要求53的计算机可读取介质，其中所述两种或多种细菌细胞是相同的细胞。
56.权利要求53的计算机可读取介质，其中所述两种或多种细菌细胞是嗜碱芽孢杆菌、解淀粉芽孢杆菌、短芽孢杆菌、蜡状芽孢杆菌、环状芽孢杆菌、Bacillus clausii、凝结芽孢杆菌、苛求芽孢杆菌、坚强芽孢杆菌、灿烂芽孢杆菌、迟缓芽孢杆菌、地衣芽孢杆菌、浸麻芽孢杆菌、巨大芽孢杆菌、甲醇芽孢杆菌、短小芽孢杆菌、球形芽孢杆菌、嗜热脂肪芽孢杆菌、枯草芽孢杆菌或苏云金芽孢杆菌。
57.权利要求53的计算机可读取介质，其中所述两种或多种细菌细胞是不同的细胞。
58.权利要求53-57的任一项的计算机可读取介质，其中所述介质选自软盘、硬盘、随机存取存储器(RAM)、只读存储器(ROM)，和CD-ROM。
59.基于计算机的系统，用于监测在第一细菌细胞中的多个基因相对于一种或更多的第二细菌细胞中相同基因的表达的差异表达，该系统包括下列元件：
(a)数据存储工具，其包含选自核苷酸SEQ ID NOs：2-4198、SEQ IDNOs：2-4198的互补链和SEQ ID NOs：2-4198的片段的地衣芽孢杆菌基因；
(b)搜索工具，用于比较目标序列与(a)中的数据存储工具的地衣芽孢杆菌基因序列以确定同源序列；和
(c)检索工具，用于获得(b)的同源序列。
60.底物，其包含选自核苷酸SEQ ID NOs：2-4198、SEQ ID NOs：2-4198的互补链和SEQ ID NOs：2-4198的片段的地衣芽孢杆菌基因的阵列，用于监测在第一细菌细胞中的多个基因相对于一种或更多的第二细菌细胞中相同基因的表达的差异表达。
61.合成基因的制备方法，包括：
(a)基于SEQ ID NO：1中的一个或多个开放阅读框或其部分中所使用的密码子，制作密码子使用表；
(b)构建合成基因或其部分，其中包含取代了一个或多个天然密码子的一个或多个来自上述密码子使用表的偏好密码子；和
(c)回收该合成基因。
62.权利要求61的方法，其中所述密码子使用表是表4。
63.权利要求61的方法，其中所述密码子使用表是表5。
64.权利要求61的方法，其中所述密码子使用表是表4和表5。
65.由权利要求61的方法所获得的合成基因。
66.核酸构建体，其包括权利要求65的合成基因，该合成基因可操作地与一个或多个调控序列连接，所述调控序列指导所述合成基因在表达宿主中的表达。
67.包含权利要求66的核酸构建体的重组表达载体。
68.包含权利要求66的核酸构建体的重组宿主细胞。
69.生产由权利要求65的合成基因编码的多肽的方法，包括(a)在有助于生产该多肽的条件下培养含有所述合成基因的宿主细胞；和(b)回收该多肽。
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