CN1886506A - 在nk细胞中表达的蛋白质 - Google Patents

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Abstract

对纯化的免疫细胞的表达频率进行分析,成功地发现了在天然杀伤(NK)细胞中特异表达的NKIR基因。NKIR基因编码受体,通过使用这种受体,可以鉴定出受体的激动剂或拮抗剂。

Description

在NK细胞中表达的蛋白质
技术领域
本发明涉及在NK细胞中表达的蛋白质和编码该蛋白质的DNA,以及该分子的制备方法和用途。
背景技术
细胞毒性T细胞通过识别作为异物的特异性抗原肽与MHC(Major histocompatibility complex,主要组织相容性基因复合体)I类分子形成的复合体而被活化,从而对靶细胞起细胞毒性活性,与之相反天然杀伤(NK)细胞通常破坏不表达MHC I类分子的靶细胞。这种正常细胞表面上的MHC I类分子的表达被病毒感染和癌变所抑制。一般认为NK细胞对这种MHC I类分子的表达减少的异常细胞起细胞毒性活性,其通过在病毒感染和癌变细胞在自然免疫机制中承担着重要的作用。实际上,发现NK细胞是具有自发损伤某些癌细胞的活性的细胞(参见非专利文献1)。而且,NK细胞活性的丧失所引起的称之为Chediak-Higashi综合症(由于染色体异常,超过10岁时进入高级阶段,无法控制病毒感染,产生恶性淋巴瘤样病变,经过2-3个月由于各类血细胞减少症而死亡)的疾病的原因在于,这支持了NK细胞在生物体内的这种作用。
最近,制备出缺少被认为是NK细胞的标记的NK1.1+CD3-的转基因小鼠,对其特征进行分析,结果显示NK细胞
1)在癌细胞的转移和增殖的抑制中起着重要的作用、
2)应答细菌内毒素的干扰素(IFN)γ的主要产生细胞(参见非专利文献2)。
另一方面,近年来,清楚了这样的认识:具有相同T细胞受体,同时还具有NK细胞受体的兼有自然免疫和获得性免疫性质的第4淋巴细胞的NKT细胞在包括肝脏、骨髓在内的大量器官中广泛存在,并且这种细胞与免疫耐受,自身免疫性疾病,肝炎,传染病等多种疾病相关。根据对早期发病的多发性硬化症小鼠的研究,了解到作为包含于淋巴细胞的内的疫细胞的NKT细胞与多发性硬化症的发病有某种联系(参见非专利文献3)。并且,由于NKT缺损小鼠中没有显示出作为主要哮喘症状的气管超敏反应,提示通过使NKT细胞失活可以预防哮喘(参见非专利文献4)。已明确的活化机制表明,与NK细胞不同,活化这种NKT细胞可通过对T细胞受体进行刺激,或者通过递呈在树突状细胞的CD1d受体上的糖脂α-半乳糖基神经酰胺(α-GalCer)的活化进行(参见非专利文献3)。另一方面,与NK细胞相同,NKT细胞对MHC I型分子表达减少的细胞发挥细胞毒性活性,因此认为其以与杀伤细胞抑制受体(以下称为KIR)大致相同的机理调节细胞毒性活性所述杀伤细胞抑制受体被鉴定为淋巴细胞群的细胞毒性活性中的抑制调节分子。可是,还知道存在不表达已知的KIR的NKT亚群,且对于在活化中起负作用的抑制型受体和信号级联而言不清楚的地方还很多,因此就需要进一步的研究。
清楚了对NKT细胞的活化有效的配体物质,但是还没有鉴定出特异性活化NK细胞的低分子配体。
非专利文献1:Trinchieri G.,Adv Immunol.(1989),47,187-376
非专利文献2:Sungjin Kim,Koho Iizuka,Hector L.Aguila,IrvingL.Weissman,and Wayne M.Yokoyama,Proc.Natl.Acad.Sci.(2000),97,2731-2736
非专利文献3:原田通成,谷口克,蛋白质核酸酶(2002),47,2109-2116
非专利文献4:Akbari O,Stock P,Meyer E,Kronenberg M,SidobreS,Nakayama T,Taniguchi M,Grusby MJ,Dekruyff RH,Umetsu DT,Nat.Med.(2003),9,582-588
发明内容
发明要解决的问题
本发明是鉴于上述状况完成的,其目的在于分离特异性活化NK细胞或特异性使之失活的受体分子。更为具体地,以提供在NK细胞中表达的新型受体蛋白质和编码该蛋白质的DNA以及该分子的用途作为目标。
解决问题的方法
有人提出NK细胞的活化机制,是通过由蛋白质酪氨酸激酶磷酸化介导的正信号级联与由被磷酸化的信号传递分子的脱磷酸化产生的负信号级联的调节实施的。识别用于驱动这种负信号级联的分子的NK细胞的抑制型受体,在小鼠中是在细胞外具有C型凝集素结构域的C型凝集素家族的Ly49分子群,在人类中相当于在细胞外具有免疫球蛋白(Immunoglobulin,Ig)结构域的KIR分子家族。就KIR分子而言,渐渐清楚了包括KIR分子及其所识别的MHC同种异型的详细情况。如根据NK细胞对MHC I类分子表达减少的细胞发挥细胞毒性活性所揭示的那样,大多数KIR分子识别在几乎所有类型的细胞中表达的典型的MHC I类分子,从而在细胞内传递负信号。另一方面,KIR分子中也有以非典型的MHC I类分子作为配体的分子种类,据认为KIR分子整体在自然免疫系统中实现对自身来源的异常细胞进行监视的监视机构中心的作用。
与Ly49相似,KIR分子在细胞质内结构域中存在具有称为ITIM的V/IXYXXL/V(V:缬氨酸,I:异亮氨酸,Y:酪氨酸,L:亮氨酸,X为任意氨基酸)的基序的功能性序列,该ITIM基序中的酪氨酸残基一旦被磷酸化,具有SH2结构域的蛋白质酪氨酸脱磷酸酶SHP-1即与该部位结合。通过SHP-1介导NK细胞中正信号级联的活化所需的酪氨酸磷酸化蛋白质(SLP-67分子被认为是其最有希望的候选物)脱磷酸,抑制NK细胞的活化。
本申请发明人们为了解决上述问题进行了积极的研究。本申请发明人参照了 http://www.prevent.m.u-tokyo.ac.jp公开的纯化的免疫系统细胞(单核细胞/巨噬细胞,T细胞,树突状细胞,天然杀伤细胞,中性粒细胞等)的基因表达的系列分析(SAGE)分析数据(Hashimotos,Blood(2003),101,3509-3513)。分析数据中,除了鉴定了已知基因序列的序列标记,还鉴定了许多认为是源于未知基因的标记,并且还从其中鉴定出了具有特征表达图谱的标记。
本申请发明人从其中成功发现了在天然杀伤细胞(NK)中特异表达的NKIR基因。根据其预测的氨基酸序列的特征,提示出该基因是被鉴定为表达于NK细胞和T细胞亚群的、作为淋巴细胞群的细胞毒性活性抑制调节分子的杀伤细胞抑制受体(以下称为KIR)的同系物。与多数KIR分子群聚集于第19号染色体上不同,这种NKIR基因位于第1号染色体上。而且,本申请发明人为了追求在药物开发中应用的可能性,对该基因的特征进行了分析。已经报道了被认为是本发明基因的剪接变异体的序列(WO01/49728),通过基于基因组的预测,在NCBIAnnotation Project中给出了其剪接变异体(LOC343413),然而对于其功能完全不知道。而且,迄今为止尚不知道与本发明的基因序列完全一致的序列。
如上所述,NK细胞具有抗肿瘤,抗病毒活性,因此认为通过使用针对KIR的拮抗抗体抑制KIR的功能产生的抗肿瘤、抗病毒效果有临床应用的可能性。而且,以NKT细胞作为目标时,希望本发明可以应用于使用拮抗抗体抗C型肝炎等抗病毒性疾病或癌症,或者用于使用激动抗体抗过敏性疾病,抗哮喘,抗自身免疫疾病。
本发明涉及在NK细胞中表达的新型蛋白质,编码该蛋白质的DNA,以及它们的制备方法和用途,更为具体而言是提供了:
(1)下述(a)-(d)任一项记载的DNA:
(a)编码包含SEQ ID NO:2,4或6任一项记载的氨基酸序列的蛋白质的DNA;
(b)含有SEQ ID NO:1,3或5任一项记载的碱基序列的编码区域的DNA;
(c)编码包含在SEQ ID NO:2,4或6任一项记载的氨基酸序列中通过替换,缺失,插入和/或添加了1个或多个氨基酸的氨基酸序列的,并且与包含SEQ ID NO:2,4或6任一项记载的氨基酸序列的蛋白质具有相同功能的蛋白质的DNA
(d)与包含SEQ ID NO:1,3或5任一项记载的碱基序列的DNA在严紧条件下杂交的DNA;
(2)编码包含SEQ ID NO:2,4或6任一项记载的氨基酸序列的蛋白质的片段的DNA;
(3)由(1)或(2)中记载的DNA编码的蛋白质;
(4)含有(1)或(2)中记载的DNA的载体;
(5)带有(1)或(2)中记载的DNA或者(4)记载的载体的宿主细胞;
(6)(3)中记载的蛋白质的制备方法,包括培养(5)中记载的宿主细胞,从该宿主细胞或其培养上清中回收产生的蛋白质的步骤;
(7)与(3)中记载的蛋白质结合的抗体;
(8)针对(3)中记载的蛋白质的配体的鉴定方法,其包括以下的(a)和(b)的步骤:
(a)使候选化合物与(3)中记载的蛋白质或与表达(3)中记载的蛋白质的细胞接触的步骤
(b)检测候选化合物是否与(3)中记载的蛋白质或与表达(3)中记载的蛋白质的细胞结合的步骤;
(9)针对(3)中记载的蛋白质的激动剂的鉴定方法,其包括以下的(a)和(b)的步骤:
(a)使候选化合物与表达(3)中记载的蛋白质的细胞接触的步骤;和
(b)检测候选化合物是否产生了成为(3)中记载的蛋白质的活化标识的信号的步骤;
(10)针对(3)中记载的蛋白质的拮抗剂的鉴定方法,其包括以下的(a)和(b)的步骤:
(a)使候选化合物与表达(3)中记载的蛋白质的细胞接触的步骤;和
(b)通过与不存在候选化合物条件下检测的情况相比较,检测作为(3)中记载的蛋白质的活化标识的信号是否减少的步骤;
(11)通过(8)中记载的方法鉴定获得的针对(3)中记载的蛋白质的配体;
(12)通过(9)中记载的方法鉴定获得的针对(3)中记载的蛋白质的激动剂;
(13)通过(10)中记载的方法鉴定获得的针对(3)中记载的蛋白质的拮抗剂;
(14)用于(8)至(10)任一项记载的方法中的试剂盒,其含有以下(a)或(b)中的至少一项:
(a)(3)记载的蛋白质
(b)(5)记载的宿主细胞;
(15)一种免疫抑制剂,其含有针对(3)中记载的蛋白质的激动剂(或(12)中记载的激动剂)作为有效成分;
(16)一种过敏性疾病或自身免疫疾病治疗剂,其含有针对(3)中记载的蛋白质的激动剂(或(12)中记载的激动剂)作为有效成分;
(17)一种免疫增强剂,其含有针对(3)中记载的蛋白质的拮抗剂(或(13)中记载的拮抗剂)作为有效成分;
(18)一种抗肿瘤或抗病毒剂,其含有针对(3)中记载的蛋白质的拮抗剂(或(13)中记载的拮抗剂)作为有效成分;
(19)链长至少为15个核苷酸并且与(1)或(2)中记载的DNA互补或者与其互补链互补的DNA;
(20)一种与编码(3)中记载的蛋白质的基因的表达异常或者活性异常相关的疾病的检测药剂,其含有(19)中记载的DNA或(7)中记载的抗体。
此外,本发明的其它形式中,提供了:
(a)本发明的蛋白质在筛选针对该蛋白质的激动剂或拮抗剂中的用途。
(b)针对本发明的蛋白质的激动剂在制备免疫抑制剂中的用途。
(c)针对本发明的蛋白质的激动剂在制备过敏性疾病或自身免疫疾病治疗剂中的用途。
(d)针对本发明的蛋白质的拮抗剂在制备免疫增强剂中的用途。
(e)针对本发明的蛋白质的拮抗剂在制备抗肿瘤或抗病毒剂中的用途。
进而,本发明还涉及以下方法:
(a)一种抑制免疫功能的方法,其包括向给药对象(患者等)给药针对本发明的蛋白质的激动剂的步骤。
(b)一种过敏性疾病或自身免疫疾病的治疗方法(或预防方法),其包括向给药对象(患者等)给药针对本发明的蛋白质的激动剂的步骤。
(c)一种增强免疫功能的方法,其包括向给药对象(患者等)给药针对本发明的蛋白质的拮抗剂的步骤。
(d)一种癌症(肿瘤)或病毒性疾病的治疗方法(或预防方法),其包括向给药对象(患者等)给药针对本发明的蛋白质的拮抗剂的步骤。
附图的简要说明
图1:图1是表示通过使用His收集柱(trap column)纯化的NKIR蛋白质的SDS-PAGE电泳的分析结果的照片。
图2:图2是表示通过抗NKIR的多克隆抗体检测NKIR蛋白质的照片。
图3:图3是表示通过RT-PCR分析对组织表达进行分析的结果的照片。A表示MTC板I和II,B表示免疫系统和血液组分。各泳道表示如下:A:泳道1:心脏,泳道2:脑,泳道3:胎盘,泳道4:肺,泳道5:肝脏,泳道6:骨骼肌,泳道7:肾脏,泳道8:胰腺,泳道9:脾脏,泳道10:胸腺,泳道11:前列腺,泳道12:睾丸,泳道13:卵巢,泳道14:小肠,泳道15:大肠,泳道16:外周血白细胞,B:泳道1:脾脏,泳道2:淋巴结,泳道3:胸腺,泳道4:外周血白细胞,泳道5:扁桃体,泳道6:胎儿肝脏,泳道7:骨髓,泳道8:单核细胞,泳道9:休眠CD8+细胞,泳道10:休眠CD4+细胞,泳道11:活化的CD14+细胞,泳道12:休眠CD19+细胞,泳道13:活化的CD19+细胞,泳道14:活化的单核细胞,泳道15:活化的CD4+细胞,泳道16:活化的CD8+细胞。
图4:图4是表示通过抗NKIR多克隆抗体检测在NK-92细胞中表达的天然NKIR蛋白质的照片。
图5:图5是表示通过抗NKIR多克隆抗体对NK-92细胞的流式细胞检测分析的图。
图6:图6表示的是对COS-7株中的NKIR基因的瞬间表达的流式细胞检测分析的图。
图7:图7是表示以人NKIR作为query进行blast检索,将其与获得的与之匹配的小鼠染色体序列进行比对的图。
图8:图8是表示人-小鼠NKIR序列的比对的图。
图9:图9是表示对各转化细胞株的流式细胞检测分析的图。
图10:图10是表示以荧光素酶活性作为指标的ITIM活性的检测结果的图。
图11-1:图11-1是表示实施例16中选择的3个克隆的CD8嵌合结构的图。
图11-2:图11-2是表示使用实施例17中使用的抗CD8抗体,LT8(Serotec)和结合有FIT的山羊抗小鼠IgG抗体(Coulter)对以下这些克隆进行FACS分析的结果的图。A:F11克隆,没有LT8(第一抗体),B:F11克隆,有LT8(第一抗体),C:CD8嵌合克隆,没有LT8(第一抗体),D:CD8嵌合克隆,有LT8(第一抗体)。
图12:图12是表示通过实施例17的报告基因检测测定ITIM功能活性的结果的图。LT8:抗CD8抗体(LT8),CL:交联剂(大鼠抗小鼠IgG1抗体)
最佳实施方式
本申请发明人,通过使用PCR从人脾脏cDNA文库中克隆出在NK细胞中特异表达的基因。由于在获得克隆中包含被认为是剪接变异体的克隆,为了获得原始的序列进行5’RACE,鉴定出了NKIR基因,其被推测为属于KIR家族。该基因的碱基序列表示于SEQ ID NO:1中,该基因编码的蛋白质的氨基酸序列表示于SEQ ID NO:2中。进而,使用从NK-92株中制备的总RNA,通过5’和3’RACE法再次进行NKIR基因的全长克隆时,获得了在5’端具有36个碱基的信号样序列,在3’端约有500个碱基的延长序列的克隆。该克隆的碱基序列表示于SEQID NO:3中,由该碱基序列编码的蛋白质的氨基酸序列表示于SEQ IDNO:4中。进而,进行小鼠NKIR序列的克隆,获得的碱基序列表示于SEQ ID NO:5中,由该碱基序列编码的蛋白质的氨基酸序列表示于SEQ ID NO:6中。
本发明提供了在NK细胞中表达的新型蛋白质,以及编码这种蛋白质的DNA。作为本发明的DNA的优选的方式,是下列(a)-(d)任一项记载的DNA:
(a)编码包含SEQ ID NO:2,4或6任一项记载的氨基酸序列的蛋白质的DNA
(b)含有SEQ ID NO:1,3或5任一项记载的碱基序列的编码区域的DNA
(c)编码包含在SEQ ID NO:2,4或6任一项记载的氨基酸序列中替换,缺失,插入和/或添加了1个或多个氨基酸的氨基酸序列的并且与SEQ ID NO:2,4或6任一项记载的氨基酸序列构成的蛋白质具有相同功能的蛋白质的DNA
(d)与包含SEQ ID NO:1,3或5任一项记载的碱基序列的DNA在严紧条件下杂交的DNA(更优选的是与包含SEQ ID NO:1,3或5任一项记载的碱基序列的DNA在严紧条件下杂交的并且编码与包含SEQID NO:2,4或6任一项记载的氨基酸序列的蛋白质具有相同功能的蛋白质的DNA)。
本发明包括与由本申请发明人鉴定的NK细胞表达蛋白质(包含SEQ ID NO:2,4或6中记载的氨基酸序列的蛋白质)(下面,有时也称为“NKIR蛋白质”)功能相同的蛋白质。这种蛋白质中,包括例如这些蛋白质的变异体,及其人和小鼠之外的生物中的同系物等。这里所谓“功能相同”是指作为对象的蛋白质与NKIR蛋白质具有相同的生物学或生物化学活性。作为这种活性,可以列举有,例如KIR具有的活性,抑制NK细胞的细胞毒性活性,或者导入宿主T细胞或肥大细胞等免疫系统细胞中的KIR分子所产生的对各种细胞类型的活化信号传递的抑制活性等,所述宿主细胞在细胞的活化方面存在相似的细胞内信号传递。因此,作为对象的蛋白质是否与由本发明人鉴定的蛋白质具有相同的生物学或生物化学活性,可以通过例如通过细胞质内钙的浓度的测定(Bruhns P,Marchetti P,Fridman WH,Vivier E,DaeronM.,J Immunol.(1999),162,3168-3175)、测定含有钙调磷酸化酶级联控制之下的NF-At cis序列的报告基因的表达(Fry AM,Lanier LL,WeissA.,J Exp Med.(1996),184,295-300)对由转导等导入了目的分子的免疫系统细胞的活化信号的抑制活性进行检测的方法,或者在使用肥大细胞作为宿主细胞时通过经H3标记的血清素检测同样位于Ca级联下游的血清素的释放的方法(Blery M,Delon J,Trautmann A,Cambiaggi A,Olcese L,Biassoni R,Moretta L,Chavrier P,Moretta A,Daeron M,Vivier E.,J Boil Chem.(1997),272,8989-8996.),进行评价。
作为本领域技术人员熟知的用于制备与某些蛋白质具有相同功能的蛋白质的方法,可以例举有例如在蛋白质中的氨基酸序列导入变异的方法。具体而言,作为本领域技术人员可以通过采用定点诱变法(Hashimoto-Gotoh,T,等人(1995)Gene 152,271-275,Zoller,M.J,andSmith,M.(1983)Methods Enzymol.100,468-500,Kramer,W,等人(1984)Nucleic Acids Res.12,9441-9456,Kramer W,And Fritz HJ(1987)Methods.Enzymol.154,350-367,Kunkel,TA(1985)Proc Natl Acad SciUSA.82,488-492,Kunkel(1988)Methods Enzymol.85,2763-2766)等方法,在SEQ ID NO:2、4或6记载的氨基酸序列中导入适当变异,制备与该蛋白质具有相同功能的蛋白质。此外,氨基酸的变异也在自然界中发生。无论是人工合成的还是自然存在的,本发明的蛋白质还包括具有在由本发明人鉴定的NKIR蛋白质的氨基酸序列中存在一个或多个氨基酸发生变异的氨基酸序列,并且与该蛋白质具有相同功能的蛋白质。这种变异体中,一般认为变异的氨基酸数通常为50个氨基酸或以下,优选30个氨基酸或以下,更为优选10个氨基酸以内(例如,5个氨基酸或以下)。
而且,变异引入位点没有特别的限制,但优选在下述的基序或区域之外的位点。
在变异的氨基酸残基中,希望变异为其它的氨基酸而保留氨基酸侧链的性质。例如,作为氨基酸侧链的性质,可以举例为疏水性氨基酸(A,I,L,M,F,P,W,Y,V)、亲水性氨基酸(R,D,N,C,E,Q,G,H,K,S,T)、具有脂肪族侧链的氨基酸(G,A,V,L,I,P)、具有含羟基的侧链的氨基酸(S,T,Y)、具有含硫原子的侧链的氨基酸(C,M)、具有含羧基和酰胺基侧链的氨基酸(D,N,E,Q)、具有碱性侧链的氨基酸(R,K,H)、具有芳香族侧链的氨基酸(H,F,Y,W)(各括弧内表示的都是氨基酸的单字母代码)。
已知的是具有通过对某氨基酸序列缺失,添加一个或多个氨基酸残基和/或用其它氨基酸进行替换而被修饰的氨基酸序列的蛋白质可以维持其生物学活性(Mark,D.F.等人,Proc Natl Acad Sci USA(1984)81,5662-5666;Zoller,M.J.&Smith,M.Nucleic Acids Reseach(1982)10,6487-6500;Wang,A,等人,Science 224,1431-1433;Dalbadie-McFarland,G.等人,Proc Natl Acad Sci USA(1982)79,6409-6413)。
向NKIR蛋白质的氨基酸序列中添加了多个氨基酸残基所得的蛋白质包括含有这些蛋白质的融合蛋白质。本发明中包括这些蛋白质与其它的肽或蛋白质融合的融合蛋白质。制备融合蛋白质的方法,可以使用本领域技术人员公知的方法,优选将编码NKIR蛋白质的DNA与编码其它肽或蛋白质的DNA框架方向一致地连结,导入到表达载体中,在宿主细胞中表达。作为与本发明的蛋白质融合的其它的肽或蛋白质,没有特别的限定。
作为与本发明的蛋白质融合的其它的肽,可以使用例如FLAG(Hopp,T.P.等人,Biotechnology(1988)6,1204-1210)、6个His(组胺酸)残基构成的6×His,10×His,流感凝集素(HA),人c-myc的片段,VSV-GP的片段,p18HIV的片段,T7-标记,HSV-标记,E-标记、SV40T抗原的片段,lck-标记,α-微管蛋白的片段,B-标记,蛋白质C的片段等公知的肽。此外,作为与与本发明的蛋白质融合的其它的蛋白质,可以列举有例如GST(谷胱甘肽S转移酶)、HA(流感凝集素)、免疫球蛋白恒定区,β-半乳糖苷酶、MBP(麦芽糖结合蛋白)等。通过使市售的编码这些肽或蛋白质的DNA与编码本发明的蛋白质的DNA融合,使由此制备出的融合DNA进行表达,可以制备出融合蛋白质。
此外,本领域技术人员熟知的制备与某种蛋白质具有相同功能的蛋白质的其它方法,可以例举有利用杂交技术(SAMBROK,J等人,Molecular Cloning 2nd ed.,9.47-9.58,Cold Spring HarborLab.press,1989)的方法。也就是,只要是本领域技术人员,即可以基于编码NKIR蛋白质的DNA序列(SEQ ID NO:1,3或5)或其一部分,从同种或异种生物的DNA试样中分离与其具有高同源性的DNA,根据该DNA分离与NKIR蛋白质具有相同功能的蛋白质。
本发明中,包括由与编码NKIR蛋白质的DNA杂交的DNA编码的,与NKIR蛋白质具有相同功能的蛋白质。作为这种蛋白质,可以列举有例如人或小鼠和其它哺乳动物的同系物(例如,由大鼠,家兔,牛,猴等的同系物编码的蛋白质)。
用于分离编码与NKIR蛋白质具有相同功能的蛋白质的DNA的杂交条件可以由本领域技术人员进行适当选择。作为杂交条件,可以例举有低严紧条件。作为低严紧条件,是在杂交后的清洗中的例如42℃,0.1×SSC,0.1%SDS的条件,优选50℃,0.1×SSC,0.1%SDS的条件。作为更优选的杂交条件,可以例举有高严紧条件。作为高严紧条件,例如65℃,5×SSC,0.1%SDS的条件。在这种条件下,有望通过提高温度可以有效地获得具有更高同源性的DNA。但是,可以认为温度和盐浓度等多种因素是影响杂交的严紧条件的因素,只要是本领域技术人员对这些因素进行适当选择就可以实现类似的杂交的严紧。
此外,代替杂交,使用基因扩增技术(PCR)(Current Protocols inMolecular Biology Edit.Ausubel等人(1987)Publish.John Wiley&SonsSection 6.1-6.4),基于编码本发明人等鉴定的蛋白质的DNA序列(SEQID NO:1,3或5)或其一部分设计引物,分离与编码由本发明人鉴定的蛋白质的DNA序列具有高同源性的DNA,基于该DNA还可以获得与由本发明人鉴定的蛋白质具有相同功能的蛋白质。
本发明的蛋白质可以是“成熟”蛋白质的形式,也可以是融合蛋白质这样的更大的蛋白质的一部分。本发明的蛋白质中,也可以含有前导序列,pro序列,多个组胺酸残基这样利于纯化的序列,或者为确保重组生产的稳定性所添加的序列等。
由经这些杂交技术和基因扩增技术分离的DNA编码的并且与NKIR蛋白质功能相同的蛋白质,通常与这些蛋白质(包括SEQ IDNO:2,4或6记载的氨基酸序列的蛋白质)在氨基酸序列上具有高同源性。本发明的蛋白质中还包括与NKIR蛋白质功能相同并且与该蛋白质的氨基酸序列具有高同源性的蛋白质。所谓高同源性,在氨基酸水平上,通常是指至少50%及50%以上的同一性,优选75%及75%以上的同一性,更优选85%及85%以上的同一性,更优选95%及95%以上的同一性。蛋白质的同源性的确定可以按照文献中(Wilbur,W.J.andLipman,D.J.Proc Natl Acad Sci USA(1983)80,726-730)记载的算法进行。
氨基酸序列的同一性,可以通过例如由Karlin和Altschul提出的BLAST算法(Proc Natl Acad Sci USA.87:2264-2268,1990,Proc NatlAcad Sci USA.90,5873-5877,1993)进行确定。基于这种算法,现在开发出了称之为BLASTX的程序(Altschul等人j.mol.boil.215:403-410,1990)。以BLASTX分析氨基酸序列时,参数使用例如score=5,wordlength=3。使用BLAST和Grapped BLAST程序时,使用各程序的默认参数。这些分析方法的具体方法是公知的。( http://www.ncbi.nlm.nih.gov.)。
根据下述的产生这些蛋白质的细胞、宿主或纯化方法,获得的本发明的蛋白质在氨基酸序列,分子量,等电点或糖链的有无和形态等各不相同。但是,只要获得的蛋白质与本发明的蛋白质功能相同,就包括于本发明中。
本发明的蛋白质,可以通过本领域技术人员公知的方法,制备成重组蛋白质或天然蛋白质。如果是重组蛋白质,可以通过在适当的表达载体中插入编码本发明的蛋白质的DNA(例如,具有SEQ ID NO:1,3或5记载的碱基序列的DNA),将其导入适当的宿主细胞,回收获得的转化体,得到提取物后,经离子交换,反相、凝胶过滤等层析或者在柱中固定了针对本发明的蛋白质的抗体的亲合层析筛滤,或者进而通过将多个这些柱组合在一起纯化,进行制备。
此外,在宿主细胞内(例如,动物细胞和大肠杆菌等)表达作为本发明的蛋白质与谷胱甘肽S转移酶的融合蛋白质,或者添加了多个组胺酸的重组蛋白质时,表达的重组蛋白质可以使用谷胱甘肽柱或镍柱纯化。融合蛋白质纯化后,根据需要在融合蛋白质中通过凝血酶或Xa因子等切断,还可以除去目的蛋白质之外的区域。
如果是天然蛋白质,可以通过本领域技术人员公知的方法分离,例如通过使下述的与本发明的蛋白质结合的亲合层析柱作用于表达本发明的蛋白质的组织或细胞的提取物进行纯化而分离。抗体可以是多克隆抗体,也可以是单克隆抗体。
此外,本发明还提供了本发明的蛋白质的片段(部分肽)。这种片段是与所有前述本发明的蛋白质的氨基酸序列部分相同,但是不完全相同的蛋白质。本发明的蛋白质片段通常为由8个及8个以上的氨基酸残基,优选12个及12个以上的氨基酸残基(例如,15个及15个以上的氨基酸残基)的序列构成的蛋白质的片段。作为优选的片段,包括例如具有缺失了包括氨基端的一系列残基或包括羧基端的一系列残基,或者缺失了包括氨基端的一系列残基和包括羧基端的一系列残基这两部分残基的氨基酸序列的截短的(truncation)多肽。此外,还优选像含有α-螺旋与α-螺旋形成区域,β-折叠与β-折叠形成区域,扭曲与扭曲形成区域,卷曲与卷曲形成区域,亲水性区域,疏水性区域,α两亲性区域,β两亲性区域,可变性区域,表面形成区域,基质结合区域和高抗原指数区域的片段这样的特征取决于其构造或功能的特性片段。其它的优选片段是生物学活性的片段。生物学活性的片段包括具有同样活性的片段,其活性提高的片段,或者减少了所不希望的活性的片段,这种片段传递本发明的蛋白质的活性。可以例举有例如具有与配体结合从而在细胞内进行信号传递活性的片段。进而,还包括在动物尤其是人中有抗原性或免疫原性的片段。优选这些蛋白质片段保持包括抗原活性在内的本发明的蛋白质的生物学或生物化学活性。特定的序列和片段的变异体也是构成本发明的一部分。优选的变异体由于同类氨基酸取代而与原来的序列不同,也就是说,以同样性质的其它残基取代某残基。典型的取代发生在Ala,Val,Leu和Ile之间,Ser和Thr之间,酸性残基Asp和Glu之间,Asn和Gln之间,碱性残基Lys和Arg之间,或者在芳香族残基Phe和Tyr之间。
本发明的上述蛋白质片段没有特别的限制,但是优选至少含有下述基序或区域的片段。
上述片段可以用于例如制备针对本发明的蛋白质的抗体,筛选作为与本发明的蛋白质结合的配体的化合物,和筛选本发明的蛋白质的激动剂和拮抗剂。
可以通过基因工程方法,公知的肽合成法或用适当的肽酶切断制备本发明的蛋白质片段(部分肽)。蛋白质片段(部分肽)的合成也可以通过例如固相合成法,液相合成法任一项方法进行。
此外,本发明中所谓“配体”是指与本发明的蛋白质结合的分子。配体包括天然配体和合成配体。所谓“激动剂”是指与本发明的蛋白质结合,使之活化的分子。另一方面,所谓“拮抗剂”是指抑制本发明的蛋白质的活化的分子。
认为编码本发明的蛋白质的DNA,可以用于如上所述的本发明的蛋白质的体内的生产,此外还用于例如由于编码本发明的蛋白质的基因的异常而产生的疾病和本发明的蛋白质可以治疗的疾病的基因治疗或基因诊断等。本发明的DNA只要能够编码本发明的蛋白质,任意形态都可以。也就是说,无论是根据mRNA合成的cDNA,基因组DNA,还是化学合成DNA等都可以。此外,DNA只要可以编码本发明的蛋白质,其包括具有基于遗传密码简并性的任意碱基序列的DNA。
本发明的DNA可以通过本领域技术人员公知的方法进行制备。例如,可以通过以下方法进行制备:从表达本发明的蛋白质的细胞中制备cDNA文库,以本发明的DNA序列(例如,SEQ ID NO:1,3或5)的一部分作为探针进行杂交。cDNA文库,可以通过文献(Sambrook,J.等人,Molecular Cloning,Cold Spring Harbor Laboratory Press(1989))中记载的方法制备,或者也可以使用市售的DNA文库。此外,还可以通过以下方法进行制备:从表达本发明的蛋白质的细胞中制备RNA,经逆转录酶合成cDNA后,基于本发明的DNA序列(例如,SEQ ID NO:1,3或5)合成寡DNA,以其作为引物进行PCR反应,扩增编码本发明的蛋白质的cDNA。
此外,通过对获得的eDNA的碱基序列进行确定,可以确定其编码的翻译区域,从而可以获得本发明的蛋白质的氨基酸序列。此外,通过以获得的cDNA作为探针筛选基因组DNA文库,可以分离出基因组DNA。
具体地进行以下步骤:首先,从表达本发明的蛋白质的细胞,组织,器官(例如,NK细胞和下述的实施例中获得表达确认的组织)中分离mRNA。mRNA的纯化,用公知的方法例如胍超离心方法(Chirgwin,J.M.等人,Biochemistry(1979)18,5294-5299)、AGPC(Chomczynski,P.and Sacchi,N.,Anal.Biochem.(1987)162,156-159)等制备总RNA,使用mRNA纯化试剂盒(Pharmacia)从总RNA中纯化分离mRNA。此外也可以通过使用QuickPrep mRNA纯化试剂盒(Pharmacia)直接制备mRNA。
根据获得的mRNA用逆转录酶合成cDNA。cDNA的合成,还可以使用AMV逆转录酶第一链cDNA合成试剂盒(生物化学工业)进行。此外,使用本发明说明书中记载的引物等,按照采用5’-AmpliFINDER RACE Kit(Clontech制)和多聚酶链反应(polymerase chainreaction;PCR)的5’-RACE法(Frohman,M.A.等人,Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.(1988)85,8998-9002:Belyavsky,A.等人,Nucleic AcidsRes.(1989)17,2919-2932),进行cDNA的合成和扩增。从获得的PCR产物中制备出目的片段,与载体DNA连结。进而,由其制备重组载体,导入到大肠杆菌等中,选择克隆,制备出所希望的重组载体。可以通过公知的方法例如双脱氧核苷酸法确认目的DNA的碱基序列。
此外,本发明的DNA中,考虑到表达中使用的宿主的密码子使用频率,可以设计表达效率更高的碱基序列(Grantham,R.等人,NucleicAcids Research(1981)9,r43-74)。此外,本发明的DNA可以通过市售的试剂盒或公知的方法进行改变。作为改变,可以例举有,例如经限制酶的消化,合成寡核苷酸和适当的DNA片段的插入,接头的添加,起始密码子(ATG)和/或终止密码子(TAA,TGA或TAG)的插入等。
此外,本发明的DNA是与SEQ ID NO:1,3或5所示的各碱基序列构成的DNA杂交的DNA,并且其含有编码与上述本发明的蛋白质功能相同的蛋白质的DNA。本领域技术人员可以对杂交的条件进行适当选择,但是具体地可以使用上述条件。在这种条件下,提高温度可以获得同源性更高的DNA。上述的杂交DNA优选是天然来源的DNA,例如cDNA或基因组DNA。
此外,本发明还提供插入有本发明的DNA的载体。作为本发明的载体,有利于用于在宿主细胞内携带本发明的DNA,表达本发明的蛋白质。
作为本发明的载体,例如在以大肠杆菌为宿主时,为了在大肠杆菌(例如,JM109,DH5α,HB101,XL1Blue)等中大量扩增大量制备载体,载体应具有用于在大肠杆菌中扩增的“ori”,并具有用于选择经转化的大肠杆菌的选择基因(例如,可以通过任意药物(氨苄青霉素,四环素,卡那霉素,氯霉α素等)区别的药物抗性基因),无其它特别的限定。作为载体的例子,可以列举有M13系列载体,pUC系列载体,pBR322,pBluescript,pCR-Script等。此外,以cDNA的亚克隆,切除为目的时,除上述载体之外,还可以例举有例如pGEM-T,pDIRECT,pT7等。在以生产本发明的蛋白质为目的使用载体时,表达载体尤为有用。作为表达载体,例如,以在大肠杆菌中表达为目的时,表达载体具有上述特征以在大肠杆菌中被扩增,除此之外当以大肠杆菌JM109DH5αHB1-1或XL1Blue为宿主时载体不可缺少可以在大肠杆菌中以更高效率表达的启动子,例如lacz启动子(Ward等,NATURE(1989)341,544-546;FASEB J.(1992)6,2422-2427),B启动子(Better等人,SCIENCE(1988)240,1041-1043)或T7启动子等。这些载体,除上述之外,可举例有pGEX-5X-1(Pharmacia公司制),“QIA表达系统”(Qiagen公司制),pEGFP和pET(这种情况下,宿主优选表达T7RNA多聚酶的BL21)。
此外,在载体中,可以含有用于多肽分泌的信号序列。作为用于指导蛋白质分泌的信号序列,在大肠杆菌的周质中产生蛋白质时,可以使用pelB信号序列(Lei,S.P.et al J.Bacteriol.(1987)169,4379)。在宿主细胞中导入载体时,可以使用例如氯化钙法、电穿孔法等。
除大肠杆菌之外,例如作为用于制备本发明的蛋白质的载体,可以例举有哺乳动物来源的表达载体(例如,pcDNA3(InVitrogen公司制),pEGF-BOS(Nucleic Acids.Res.1990,18(17),p5322),pEF,pCDM8),昆虫细胞来源的表达载体(例如“BAC-to-Bac杆状病毒表达系统”(GIBCO BRL公司制),pBacPAK8),植物来源的载体(例如pMH1,pMH2),动物来源的表达载体(例如pHSV,pMV,pAdexLcw)逆转录病毒来源的载体(例如pZIPneo),酵母来源的表达载体(例如,“毕赤酵母表达试剂盒”(Invitrogen公司制),pNV11,SP-Q01),枯草杆菌来源的表达载体(例如pPL608,pKTH50)。
以在CHO细胞、COS细胞、NIH3T3细胞等动物细胞中表达为目的时,载体不可缺少用于在细胞内表达所必需的启动子,例如SV40启动子(Mulligan等人,Nature(1979)277,108),MMLV-LTR启动子,EF1α启动子(Mizushima等人,Nucleic Acids Res.(1990)18,5322),CMV启动子等,如果载体带有用于在细胞中选择转化的基因(例如,可以通过药物(新霉素,G418等)区别的药物抗性基因)就更为优选。作为具有这种特性的载体,可以列举有例如pMAM,pDR2,pBK-RSV,pBK-CMV,pOPRSV,pOP13等。
进而,在以稳定表达基因并且以增加细胞内基因的拷贝数为目的时,可例举有在缺失了核酸合成途径的CHO细胞中导入具有与其互补的DHFR基因的载体(例如,pCHO I等),经氨甲蝶呤(MTX)扩增的方法。此外,在以基因的瞬间表达为目的时,可以例举有使用在染色体上带有表达SV40T抗原的基因的COS细胞,通过带有SV40T的复制起始区域的载体(pcD等)转化的方法。此外,作为复制起始区域,还可以使用源于多瘤病毒,腺病毒,牛乳头状瘤病毒(BPV)等等的复制起始区域。进而,为了增加宿主细胞系统中的基因拷贝数,表达载体可以含有氨基糖甙转移酶(APH)基因,胸苷激酶(TK)基因,大肠杆菌黄嘌呤-鸟嘌呤磷酸核糖基转移酶(Ecogpt)基因,二氢叶酸还原酶(dhfr)基因等作为标记。
另一方面,作为在动物体内表达本发明的蛋白质的方法,可例举有在适当的载体中插入本发明的DNA,用例如逆转录病毒法,脂质体法,阳离子脂质体法,腺病毒法等导入到生物体内的方法等。通过这些方法,可以对由编码本发明蛋白质的基因的变异引起的疾病进行治疗。作为使用的载体,可以例举有例如腺病毒载体(例如pAdexlcw)或逆转录病毒(例如pZIPneo)等,但是并不仅限于此。在载体中插入本发明的DNA等一般的基因操作可以按照常规方法进行(MolecularCloning,5.61-5.63)。对生物体给药,可以用先体外后体内法,也可以用体内法。
此外,本发明提供导入了本发明的载体的宿主细胞。作为本发明的导入了本发明的载体的宿主细胞,没有特别的限制,可以使用例如大肠杆菌或各种动物细胞等。本发明的宿主细胞可以用作例如用于制备或表达本发明的蛋白质的生产系统。用于制备本发明的蛋白质的生产系统有体外和体内的生产系统。作为体外生产系统,可以举例有使用真核细胞的生产系统或使用原核细胞的生产系统。
使用真核细胞时,例如,可以使用动物细胞,植物细胞,真菌细胞作为宿主。作为动物细胞,已知有例如CHO(J.Exp.Med(1995),108,945)、COS、3T3、骨髓瘤、BHK(幼仑鼠肾)、HeLa、Vero这样的哺乳类细胞,例如爪蟾卵母细胞(Velle,等人,Nature(1981)291,358-340)这样的两栖类细胞,或例如Sf9,Sf21,Tn5这样的昆虫细胞。作为CHO细胞,特别是,可以优选使用缺失了DHFR基因的CHO细胞dhfr-CHO(Proc.Natl.Acad.Sci.USA(1980)77,4216-4220)或CHO K-1(Proc.Natl.Acad.Sci.USA(1968)60,1275)。在哺乳动物中,以大量表达为目的时,尤为优选CHO细胞。在宿主中导入载体可以用磷酸钙法,DEAE葡聚糖法,使用阳离子脂质体DOTAP(Boehringer Mannheim公司制)的方法,电穿孔法,脂质转染法等方法进行。
作为植物细胞,例如烟草(Nicotiana Tabacum)来源的细胞已知为蛋白质生产系统,也可以对其进行愈伤组织培养。作为真菌细胞,已知有包括酵母(saccharomyces)属的酵母,例如酿酒酵母(Saccharomyeescerevisiae),包括曲霉属(Aspergillus)的丝状真菌,例如黑曲霉(Aspergillus niger)。
使用原核细胞时,有使用细菌细胞的生产系统。作为细菌细胞,已知有大肠杆菌,此外还有枯草杆菌,大肠杆菌可以例举有例如JM109,DH5α,HB101等。
以这些细胞作为目标用DNA转化,通过在体外培养经转化的细胞获得蛋白质。培养可以按照公知的方法进行。例如,作为动物细胞的培养液,可以使用例如DMEM、MEM、RPMI1640、IMDM。这时,也可以结合使用胎儿牛血清等血清添加液,也可以无血清培养。培养时的pH优选为约6-8。培养通常在约30-40℃下进行15-200小时,根据需要增加培养基的更换,通气,搅拌。
另一方面,作为载体内生产蛋白质的系统,可以例举有例如使用动物的生产系统或使用植物的生产系统。以这些动物或植物作为目标导入DNA,在动物或植物体内产生蛋白质,回收。本发明中的所谓“宿主”,包括这些动物,植物。
使用动物时,有使用哺乳类动物、昆虫的生产系统。作为哺乳类动物,可以使用例如山羊,猪,绵羊,小鼠,牛等(Vicki Glaser,SPECTRUM Biotechnology Applications,1993)。此外,使用哺乳类动物时,可以使用转基因动物。
例如,将目的DNA制备成与编码山羊β酪蛋白这样的在乳汁中固有的蛋白质的基因的融合基因。接着,在山羊的胚胎中注射含有这种融合基因的DNA片段,将该胚胎移植到雌性山羊体内。从由接受胚胎的山羊产生的转基因山羊或其后代产生的乳汁中获得目的蛋白质。为了增加含有由转基因山羊的蛋白质的乳汁的产量,可以在转基因山羊中使用适当的激素(Ebert,K.M.等人,Bio/Technology(1994)12,699-702)。
此外,作为昆虫,可以使用例如蚕。使用蚕时,通过使插入有编码目的蛋白质的DNA的杆状病毒感染蚕,可以从该蚕体液中获得目的蛋白质(Susumu,M等人,Nature(1985)315,592-594)。
进而,使用植物时,可以使用例如烟草。使用烟草时,在例如PMON530这样的用于植物表达的载体中插入编码目的蛋白质的DNA,将该载体导入根癌农杆菌(Agrobacterium tumefaciens)这样的细菌中。使这种细菌感染烟草,例如烟草(Nicotiana tabacum),可以从该烟草的叶中获得所希望的多肽(Julian K.-C.Ma等人,Eur.J.Immunol.(1994)24,131-138)。
由此获得的本发明的蛋白质,可以从宿主细胞内或细胞外(培养基等)分离出来,纯化成基本纯净均一的蛋白质。
本发明提供了本发明的蛋白质的制备方法,其包括培养本发明的宿主细胞,从该宿主细胞或其培养上清中回收所产生的蛋白质的步骤。
蛋白质的分离纯化,使用通常的蛋白质的纯化中使用的分离纯化方法就可以了,没有任何限定。例如,如果对以下方法适当选择并进行组合,就可以分离纯化出蛋白质:柱层析,过滤,超滤,盐析,溶剂沉淀,溶剂抽提,免疫沉淀,SDS-聚丙烯酰胺电泳,等电点电泳,透析,再结晶等。
作为柱层析,可以例举有,例如亲合层析,离子交换层析,疏水性层析,凝胶过滤,反相层析,吸附层析等(Strategies for ProteinPurification and Characterization:A Laboratory Course Manual.EdDaniel R.Marshak等人,Cold Spring Harbor LaboratoryPress,1996)。这些层析可以使用例如HPLC、FPLC等液相层析进行。本发明还包括使用这些纯化方法高度纯化的蛋白质。
并且,在纯化蛋白质前或纯化后通过使蛋白质修饰酶作用,也可以任意添加修饰,部分地除去肽。作为蛋白质修饰酶,可以使用例如胰蛋白酶,胰凝乳蛋白酶,赖氨酰肽链内切酶(lysyl endopeptidase),蛋白激酶,糖苷酶等。
此外,本发明还提供了与本发明的蛋白质结合的抗体。本发明的抗体的形态没有特别的限制,除多克隆抗体外,还包括单克隆抗体。此外,还包括用本发明的蛋白质免疫家兔等动物,从中获得抗血清,所有类型的多克隆抗体和单克隆抗体,进而还包括人抗体和通过基因重组产生的人源化抗体。
作为获得抗体的致敏抗原使用的本发明的蛋白质,不限于作为其获得来源的动物种类,但优选例如人,小鼠或大鼠来源的蛋白质,尤为优选人源的蛋白质。人源的蛋白质,可以使用本说明书中公开的基因序列或氨基酸序列获得。
在本发明中,作为致敏抗原使用的蛋白质,可以是完整的蛋白质,也可以是蛋白质的部分肽。作为蛋白质的部分肽,可以例举有例如蛋白质的氨基(N)端片段或羧基(C)端片段。本说明书中所述“抗体”是指与蛋白质的全长或片段反应的抗体。
将编码本发明的蛋白质或其片段的基因插入到公知的表达载体系统中,用该载体转化本说明书中所述的宿主细胞,通过公知的方法从该宿主细胞内外获得这种片段,可以将其作为致敏抗原。此外,还可以将表达蛋白质的细胞或其溶解物或化学合成的本发明的蛋白质作为致敏抗原使用。短肽,优选与钥孔戚血蓝素,牛血清白蛋白,卵白蛋白等载体蛋白适当结合而形成抗原。
作为经致敏抗原免疫的哺乳动物,没有特别的限定,但是优选考虑到与细胞融合中使用的母细胞的适应性进行选择,一般来说,可以使用啮齿目,兔形目,灵长目动物。
作为啮齿目动物,可以使用例如小鼠,大鼠,仓鼠等。作为兔形目动物,可以使用例如家兔。作为灵长目动物,可以使用例如猴。作为猴,可以使用例如狭鼻亚目(东半球猴),如食蟹猴,恒河猴,狒狒和猩猩等。
可以按照公知的方法进行在动物中以致敏抗原免疫。作为一般的方法,在哺乳动物的腹腔内或皮下注射致敏抗原。具体而言,对于以PBS(磷酸缓冲盐)或生理盐水等适量稀释、悬浮的致敏抗原,根据需要,适量混合例如弗氏完全佐剂这样的常规佐剂,乳化后,对哺乳动物给药。优选,接着用适量混合了弗氏不完全佐剂的致敏抗原以每4-21天数次给药。此外,致敏抗原免疫时可以使用适当的载体。这样免疫后,通过常规方法对血清中所期待的抗体水平上升进行确认。
这里,为了获得针对本发明的蛋白质的多克隆抗体,在确认血清中所期待的抗体水平上升后,取出经抗原致敏的哺乳动物的血液。从该血液中通过公知的方法分离血清。作为多克隆抗体,还可以使用含有多克隆抗体的血清,根据需要从该血清中进而分离出含有多克隆抗体的部分,进而通过利用蛋白质A或蛋白质G柱纯化该部分,可以制备免疫球蛋白G或M。
为了获得单克隆抗体,可以在确认经上述抗原致敏的哺乳动物的血清中的所期待的抗体水平上升后,从哺乳动物脾中取出免疫细胞,使之细胞融合。这时,作为在细胞融合中使用的优选的免疫细胞,尤为优选的是脾细胞。作为与前述免疫细胞融合的其它的母细胞,优选哺乳细胞的骨髓瘤细胞,更优选的是通过药物获得了融合细胞选择特性的骨髓瘤细胞。
前述免疫细胞与骨髓瘤细胞的细胞融合可以按照公知的方法进行,例如Milstein等人(Galfre,G.and Milstein,C.,MethodsEnzymol(1981)73,3-46)等方法。
通过用例如HAT培养液(含有次黄嘌呤,氨喋呤,胸腺嘧啶脱氧核苷的培养基)这样的常规选择培养液培养,对经细胞融合得到的杂交瘤进行选择。在该HAT培养液中培养时,通常连续进行数日至数周,足以使目的杂交瘤之外的细胞(非融合细胞)死亡。接着,实施常规的有限稀释法,对产生目的抗体的杂交瘤进行筛选和克隆。
此外,除了通过对人以外的动物以抗原免疫获得的杂交瘤之外,还可以通过下述方法获得产生具有与蛋白质的结合活性的所希望的抗体的杂交瘤:以蛋白质,表达蛋白质的细胞、其细胞裂解物致敏淋巴细胞,例如经EB病毒感染的淋巴细胞,使致敏的淋巴细胞与例如U266这样的人源的具有永久分裂能力的骨髓瘤细胞融合(特开昭63-17688号公报)。
接着,可以按以下方法进行制备:将获得的杂交瘤移植到小鼠腹腔中,从该小鼠中回收腹水,通过例如硫铵沉淀,蛋白质A或蛋白质G柱,DEAE离子交换层析,偶联了本发明的蛋白质的亲合层析等对获得单克隆抗体进行纯化。本发明的抗体除了用于纯化检测本发明的蛋白质外,也成为本发明蛋白质的激动剂和拮抗剂的候选物。此外,认为该抗体还可应用于与本发明的蛋白质相关的疾病的抗体治疗。以在人体内以获得的抗体给药为目的(抗体治疗)使用时,为了降低免疫原性,优选使用人抗体或人源化抗体。
例如,可以以蛋白质、蛋白质表达细胞或其溶解物作为抗原免疫带有人抗体基因的所有组分的转基因动物,从而获得产生抗体的细胞,使用该细胞与骨髓瘤细胞融合的杂交瘤获得针对蛋白质的抗体(参照国际公开号WO92-03918,W093-2227,WO94-02602,WO94-25585,WO96-33735和WO96-34096)。
除了使用杂交瘤产生抗体外,还可以使用经癌基因使产生抗体的致敏淋巴细胞等免疫细胞无限增殖的细胞。
此外,这样获得的单克隆抗体还可以是使用基因重组技术产生的重组型抗体(参见,例如Borrebaeck,C.A.K.and Larrick,J.W.,THERAPEUTIC MONOCLONAL ANTIBODIES,Published in theUnited Kingdom by MACMILLAN PUBLISHERS LTD,1990)。从杂交瘤或产生抗体的致敏淋巴细胞等免疫细胞中克隆出编码重组型抗体的DNA,插入到适当的载体中,将其导入宿主从而产生重组型抗体。本发明包括这种重组型抗体。
进而,本发明的抗体只要是与本发明的蛋白质结合,可以是其抗体片段或抗体修饰物。例如,作为抗体片段,可以例举有用适当的接头将Fab,F(ab’)2,Fv或H链与L链的Fv连结的单链Fv(scFv)(Huston,J.S.等人,Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.(1988)85,5879-5883)。具体而言,用例如木瓜蛋白酶,胃蛋白酶等酶处理抗体,生成抗体片段,或者构建编码这些抗体片段的基因,将其导入表达载体中,于适当的宿主细胞中表达(参见,例如Co,M.S.等人,J.Immunol.(1994)152,2968-2976;Better,M.and Horwitz,A.H.,Methods Enzymol.(1989)178,476-496;Pluckthun,A.and Skerra,A.,Methods Enzymol.(1989)178,497-515;Lamoyi,E.,Methods Enzymol.(1986)121,652-663;Rousseaux,J.等人,MethodsEnzymol.(1986)121,663-669;Birg,R.E.and Walker,B.W.,TrendsBiotechnol.(1991)9,132-137)。
作为抗体修饰物,也可以使用与聚乙二醇(PEG)等各种分子结合的抗体。本发明的“抗体”还包括这些抗体修饰物。为了得到这种抗体修饰物,可以通过在获得的抗体上进行化学修饰获得。这些方法是本领域已经建立的方法。
此外,可以使用公知的技术将本发明的抗体制备为由非人抗体来源的可变区域与人抗体来源的恒定区构成的嵌合抗体,或者由非人抗体来源的CDR(互补性决定区域)和人抗体来源的FR(构架区域)和恒定区域构成的人源化抗体。
可以将如前述方法获得的抗体纯化至均一。本发明中使用的抗体的分离纯化可以使用常规的蛋白质中使用的分离纯化方法。例如,如果对亲合层析等柱层析,过滤,超滤,盐析,溶剂沉淀,溶剂抽提,免疫沉淀,SDS-聚丙烯酰胺电泳,等电点电泳等适当选择并进行组合,就可以分离纯化出蛋白质(Antibodies:A Laboratory Manual.EDHarlow and David Lane,Cold Spring Harbor Laboratory,1988),但并不仅限于此。由上述方法获得的抗体的浓度测定可以通过吸光度的测定或酶联免疫吸附测定法(Enzyme linked immunosorbent assay;ELISA)进行。
作为使用亲合层析中使用的柱,可以例举有蛋白质A柱,蛋白质G柱。例如,作为使用蛋白质A柱的株,可以例举有HyperD,POROS,Sepharose F.F.(Pharmacia)等。
作为亲合层析之外的层析,可以举例有例如离子交换层析,疏水性层析,凝胶过滤,反相层析,吸附层析等((Strategies for ProteinPurification and Characterization:A Laboratory Course Manual.EdDaniel R.Marshak等人,Cold Spring Harbor LaboratoryPress,1996)。这些层析可以使用例如HPLC、FPLC等液相层析进行。
此外,作为测定本发明的抗体的抗原结合活性的方法,可以使用例如吸光度的测定、酶联免疫吸附测定法(Enzyme linkedimmunosorbent assay;ELISA)、RIA(放射免疫测定法)或荧光抗体法。使用ELISA时,在固定了本发明的抗体的平板上添加本发明的蛋白质,接着,加入含有目的抗体的试样,例如抗体产生细胞的培养上清或纯化抗体。酶,可以通过添加识别经碱性磷酸酶标记的抗体的二级抗体,培养平板,接着清洗后,加入p-磷酸硝基苯等酶底物测定吸光度,从而评价抗原结合活性。作为蛋白质的蛋白质片段,也可以使用包含例如由其C末端的片段。本发明的抗体活性的测定,可以使用BIAcore(Pharmacia制)。
通过使用这些方法,可以实施本发明的蛋白质的检测或测定方法,其包括以下步骤:使本发明的抗体与预测含有本发明的蛋白质的试样接触,检测或测定该抗体与该蛋白质的免疫复合体。由于本发明的蛋白质的检测或测定方法可以特异性检测或测定蛋白质,因此其对于使用本发明的蛋白质的各种实验等有用。
此外,本发明还提供了与本发明的DNA(例如,SEQ ID NO:1,3或5记载的碱基序列构成的DNA)或其互补链互补的链长至少为15个核苷酸的DNA。
这里所谓“互补链”是指,与A:T(但是RNA时为U),G:C的碱基对构成的双链核酸的一条链相反的链。此外,所谓“互补”,不限于在至少有15个连续的核苷酸的区域完全互补的序列,可以具有至少70%,优选至少80%,更优选90%,更优选95%及95%以上的碱基序列的同源性。用于确定同源性的算法可以使用本说明书中记载的算法。
在这种核酸中包括编码本发明的蛋白质的DNA的检测或扩增中使用的探针或引物,用于检测该DNA的表达的探针或引物,用于控制本发明的蛋白质的表达的核苷酸或核苷酸衍生物(例如,反义寡核苷酸或核酶或编码它们的DNA等)。此外,这种核酸还可以用于DNA芯片的制备。
作为引物使用时,可以使3’侧的区域成为互补区域,在5’侧添加限制性酶识别序列或标记。
此外,本发明还提供了编码本发明的蛋白质的基因的表达异常或者活性(功能)异常相关的疾病的检测药剂。
其一个实例是一种包含与上述编码本发明的蛋白质的DNA或含有其表达控制区域的DNA杂交,并且链长至少为15个核苷酸的DNA的检测药剂。该DNA,可以用作在上述本发明的检测方法中作为用于检测编码本发明的蛋白质的基因或其表达控制区域的探针,也可以用作用于扩增编码本发明的蛋白质的基因或其表达控制区域的引物。本发明的DNA,可以通过例如市售的DNA合成仪进行制备。探针也可以制备成经限制性酶处理等获得的双链片段。本发明的DNA作为探针使用时,优选使用合适的标记。作为标记的方法,可以例举有通过使用T4多核苷酸激酶以32P使DNA的5’端磷酸化的标记方法,以及使用Klenow酶等DNA聚合酶,以随机六聚寡核苷酸作为引物,获得经32P同位素、荧光色素或生物素等标记的底物碱基的方法(随机引物法等)。
本发明的检测药剂的一个实例是含有下述与本发明的蛋白质结合的抗体的检测药剂。在上述本发明的检察方法中,该抗体可以用于检测本发明的蛋白质。抗体只要可以检测本发明的蛋白质,其形态没有限制。用于检测的抗体中包括多克隆抗体和多克隆抗体,根据需要也可以对抗体进行标记。
上述检测药剂中,除了作为有效成分的DNA或其抗体外,根据需要还可以混合例如无菌水,生理盐水,植物油,表面活性剂,脂质,助溶剂,缓冲剂,蛋白质稳定剂(BSA或明胶等),防腐剂等物质。
此外,本发明的受体蛋白质有利于鉴定这些配体,激动剂或拮抗剂。本发明提供了使用本发明的蛋白质鉴定(筛选)该蛋白质的配体,激动剂或拮抗剂的方法。
本发明的配体的鉴定方法的优选形态中,首先,使本发明的蛋白质或表达该蛋白质的细胞与候选化合物(被检试样)接触,接着检测候选化合物是否与本发明的蛋白质或表达该蛋白质的细胞结合(检验结合活性)。接着,选择具有结合活性的化合物作为配体。
本发明的鉴定(筛选)方法中使用的本发明的蛋白质可以是重组蛋白质,也可以是天然来源的蛋白质。此外也可以是部分肽。此外也可以是细胞表面上表达的形态,或者作为膜成分的形态。作为候选化合物,没有特别的限制,可以例举有例如细胞提取物,细胞培养物上清,发酵微生物产物,海洋生物提取物,植物提取物,纯化或粗纯化的蛋白质,肽,非肽性化合物,合成的低分子化合物,天然化合物。与候选化合物接触的本发明的蛋白质,可以与例如作为纯化的蛋白质、作为可溶性蛋白质、作为与载体结合的形态、作为与其它蛋白质融合的融合蛋白质、作为在细胞膜上表达的形态、或者作为膜成分的候选化合物(被检试样)接触。
作为采用本发明的蛋白质筛选例如与该蛋白质结合的蛋白质的方法,可以使用本领域技术人员公知的多种方法。这种筛选可以通过例如免疫沉淀法进行。具体而言,按以下方法进行。在pSV2neo,pcDNAI,pCD8等外来基因表达用载体中插入编码本发明的蛋白质的基因,在动物细胞等中表达该基因。作为表达中使用的启动子,只要是SV40早期启动子(Rigby In Williamson(ed.),Genetic Engineering,Vol.3.Academic Press,London,p.83-141(1982))、EF-1α启动子(Kim等人Gene 91,p.217-223(1990))、CAG启动子(Niwa等人Gene 108,p.193-200(1991))、RSV LTR启动子(Cullen Methods in Enzymology 152,p.684-704(1987))、SR α启动子(Takebe等人,Mol.Cell.Biol.8,p.466(1988)、CMV立即早期启动子(Seed and Aruffo Proc.Nati.Acad.Sci.USA 84,p.3365-3369(1987))、SV40晚期启动子(Gheysen and Fiers J.Mol.Appi.Genet.1,p.385-394(1982))、腺病毒晚期启动子(Kaufinan等人,Mol.Cell.Biol.9,p.946(1989))、HSV TK启动子等一般使用的启动子即可,没有特别的限定。
为了通过在动物细胞中导入基因表达外源基因,可使用电穿孔法(Chu G等人Nuci.Acids Res.15,1311-1326(1987)),磷酸钙法(Chen,Cand Okayama,H.Mol.Cell.Biol.7,2745-2752(1987)),DEAE葡聚糖法(Lopata,M.A.等人Nud.Acids Res.12,5707-5717(1984)),Sussman,D.J.and Milman,G.Mol.Cell.Biol.4,1642-1643(1985)),脂质转染法(Derijard,B.Cell 7,1025-1037(1994);Lamb,B.T.等人Nature Genetics 5,22-30(1993):Rabindran,S.K.等人Science 259,230-234(1993)),但也可以是任意方法。
通过在本发明的蛋白质的N末端或C末端导入特异性已经清楚的单克隆抗体的识别部位(表位),可以使本发明的蛋白质表达为具有单克隆抗体的识别部位的融合蛋白质。作为使用的表位-抗体系统,可以使用市售的表位-抗体系统(试验医学13,85-90(1995))。可以通过多克隆位点表达与β-半乳糖苷酶、麦芽糖-结合蛋白质、谷光苷肽S-转移酶、绿色荧光蛋白(GFP)等的融合蛋白质的载体现有市售。
现在已经报道了形成融合蛋白质而不改变本发明蛋白质的性质,只导入包含几个至十几个的小表位部分,制备融合蛋白质的方法。例如,可以使用聚组氨酸(His-t标记),流感凝集素HA,人c-myc,FLAG,水泡性口膜炎病毒糖蛋白(VSV-GP),T7基因10蛋白(T7-标记),人单纯疱疹病毒糖蛋白(HSV-标记),E-标记(单克隆噬菌体上的表位)等表位以及识别它们的单克隆抗体作为用于筛选与本发明的蛋白质结合的蛋白质的表位-抗体系统(实验医学13,85-90(1995))。
就免疫沉淀而言,通过在利用合适的表面活性剂制备的细胞裂解液中添加这些抗体,使其形成免疫复合体。这种免疫复合体由本发明的蛋白质、以及与其具有结合能力的蛋白质和抗体构成。除了使用针对上述表位的抗体之外,还可以利用针对本发明的蛋白质的抗体进行免疫沉淀。针对本发明的蛋白质的抗体,可以通过例如以下方法进行制备:在合适的大肠杆菌表达载体中导入编码本发明蛋白质的基因,于大肠杆菌中表达,纯化表达的蛋白质来免疫家兔,小鼠,大鼠,山羊,鸡等进行制备。此外,还可以通过以合成的本发明的蛋白质的部分肽免疫上述动物进行制备。
例如如果抗体是小鼠IgG抗体,可以使用蛋白质A Sepharose或蛋白质G Sepharose沉淀免疫复合体。此外,在将本发明的蛋白质制备成例如与GST等的表位的融合蛋白质时,可以利用谷胱甘肽-Sepharose4B等与这些表位特异性结合的物质,以与利用本发明的蛋白质的抗体的情况相同的形式形成免疫复合体。
就免疫沉淀一般的方法而言,可以按照或遵循例如文献(Harlow,B.and Lane,D.;Antibodies pp.511-552,Cold Spring Harbor Laboratorypublications,New York(1988))中记载的方法进行。
在免疫沉淀的蛋白质的分析中,SDS-PAGE是一般的方法,可以使用适当浓度的凝胶根据蛋白质的分子量分析结合的蛋白质。此外,这时,由于一般来说用考马斯染色或银染这样的蛋白质常规染色法难以检测出与本发明蛋白质结合的蛋白质,因此通过在含有放射性同位素35S蛋氨酸或35S-半胱氨酸的培养液中培养细胞,标记该细胞内的蛋白质,检测所述蛋白质可以提高检测敏感度。如果已知蛋白质的分子量,也可以由SDS-PAGE聚丙烯酰胺凝胶直接纯化目的蛋白质,测定其序列。
此外,作为使用本发明的蛋白质分离与该蛋白质结合的蛋白质的方法,可以使用例如Western blotting法(Skolnik E.Y.等人Cell 65:83-90(1991))进行。也就是说,可以通过以下方法进行检测:使用噬菌体载体(λgt11,ZAP等)从预期表达与本发明的蛋白质结合的蛋白质的细胞、组织、器官(例如,NK细胞)中制备cDNA文库,使其在LB-琼脂糖上表达,将表达的蛋白质固定在过滤器上,使纯化的经标记的本发明的蛋白质与上述过滤器反应,标记表达与本发明的蛋白质结合的蛋白质的噬菌斑。作为标记本发明的蛋白质的方法,可以例举有利用生物素与抗生物素蛋白的结合性的方法,与利用与本发明的蛋白质或者与本发明的蛋白质融合的肽或多肽特异性结合的抗体的方法(例如GST等),利用放射性同位素的方法或利用荧光的方法等。
此外,作为本发明的上述鉴定(筛选)方法的其它形态,可以例举有采用以下系统进行的方法:使用细胞的双杂交系统(Fields S.andSternglanz R.Trends Genet.10:286-292(1994);Dalton S.andTreisman R.Characterization of SAP-1,a protein recruited by serumresponse factor to the c-fos serum response element.Cell 68:597-612(1992);“MATCHMAKER双杂交系统”;“哺乳动物MATCHMAKER双杂交检测试剂盒”;“MATCHMAKER单杂交系统”(均由Clontech公司生产)以及“HybriZAP双杂交载体系统”(Stratagene公司生产))。在双杂交系统中,从预期使本发明的蛋白质或其部分肽与SRF DNA结合区域或GAL4DNA结合区域融合,在酵母细胞中表达,在预计表达与本发明的蛋白质结合的蛋白质的细胞中制备以与VP16或GAL4转录活化区域融合的形式表达的cDNA文库,将其导入到上述酵母细胞中,从检测出的阳性克隆中分离出来自文库的cDNA(酵母细胞中一旦表达与本发明的蛋白质结合的蛋白质,就可以通过二者的结合使报告基因活化,从而检定出阳性克隆)。
通过在大肠杆菌中导入分离的cDNA使其表达,可以获得该cDNA编码的蛋白质。由此可以制备出与本发明蛋白质结合的蛋白质或其基因。作为在双杂交系统中使用的报告基因,可以列举有例如HIS3基因,Ade2基因,LacZ基因,CAT基因,荧光素酶和PAI-1(1型纤溶酶原激活物抑制剂)等,但并不仅限于此。通过双杂交系统的筛选除酵母细胞外还可以使用哺乳动物细胞等进行。
与本发明的蛋白质结合的候选化合物的筛选也可以使用亲合层析进行。例如,将本发明的蛋白质固定在亲合柱的载体上,加入预计表达与本发明的蛋白质结合的蛋白质的候选化合物。作为这种情况下的候选化合物,可以例举有例如细胞提取物,细胞溶解物等。在加入候选化合物后,清洗柱,可以制备出与本发明的蛋白质结合的蛋白质。
对于获得的蛋白质,通过分析其氨基酸序列,基于此序列合成寡DNA,以该DNA作为探针筛选cDNA文库,可以获得编码该蛋白质的DNA。
在本发明中,还可以使用利用表面等离子体谐振现象的生物传感器作为检测或测定结合的候选化合物的手段。利用表面等离子体谐振现象的生物传感器,使用微量的蛋白质并且不进行标记,就可以实时观察到作为表面等离子体谐振的本发明的蛋白质与候选化合物之间的相互作用(例如BIAcore,Pharmacia制)。因此,通过使用BIAcore等生物传感器,可以对本发明的蛋白质与候选化合物的结合进行评价。
进而,本发明中还含有可以由上述的本发明的方法鉴定的配体。
针对本发明蛋白质的激动剂的鉴定方法的优选形态中,首先,使表达本发明的蛋白质的细胞与候选化合物接触,检测候选化合物是否产生成为本发明的蛋白质的活化的标识的信号。也就是说,使候选化合物作用于本发明的受体蛋白,以本发明的蛋白质应答于激动剂刺激而产生的信号的有无作为标识,判断候选化合物是否是激动剂。
本发明人发现了由本发明的受体蛋白质产生的信号诱导了免疫抑制作用。因此,本发明的上述信号的有无的检测,可以通过例如测定免疫抑制作用的诱导的有无等进行。作为一个实例,通过原本没有交叉性的人和小鼠之间的免疫系统,以下述方式对缺失了免疫能力的小鼠移植人造血干细胞重建免疫系统的人源化模式小鼠(Hiramatsu H,Nishikomori R,Heike T,Ito M,Kobayashi K,Katamura K,andNakahata T,Blood(2003),102,873-880)诱导实验性自身免疫性脑脊髓炎(Experimental autoimmune encephalomyelitis;EAE)后,然后对其施用激动剂候选物质,以对这种小鼠进行EAE评价(后肢的麻痹,尿失禁和体重减少的定量)。上述方法中,在检测出上述信号时,判定候选化合物是激动剂。并且本发明还包括可由上述方法鉴定出的激动剂。
此外,本发明还提供了一种免疫抑制剂,其含有针对本发明的蛋白质的激动剂作为有效成分。预计本发明的免疫抑制剂对例如过敏性疾病(例如过敏性性哮喘等)自身免疫性疾病等的治疗有效。因此本发明提供了含有针对本发明的蛋白质的激动剂作为有效成分的过敏性疾病或者自身免疫性疾病的治疗剂。
针对本发明蛋白质的拮抗剂的鉴定方法的优选实例中,首先,使表达本发明的蛋白质的细胞与候选化合物接触,接着,与在不存在候选化合物下的检测情况比较,检测成为本发明的蛋白质的活化的标识的信号是否减少。
认为由于减少(抑制)了本发明的受体蛋白质引发的信号,引起了免疫增强作用(例如,抗病毒活性,抗肿瘤活性等)。因此,通过检测例如免疫增强作用的上升可以测定本发明的上述信号的减少。作为一例研究例,通过以下方式进行:在体外,通过在存在或不存在这种拮抗剂条件下测定NK细胞对于靶细胞(例如K-562株等NK感受性株)的细胞毒性活性,并进行比较,或者在体内先使用前述重新构建了人免疫系统的人源化模式小鼠,在移植了病毒感染人细胞或人癌组织后施用以拮抗剂候选物质,评价移植的病毒感染人细胞或人癌组织对这种小鼠的细胞毒性活性。
在上述方法中,检测出上述信号时,判定候选化合物是拮抗剂。并且本发明还包括可由上述方法鉴定出的拮抗剂。
此外,本发明还提供了一种免疫增强剂,其含有针对本发明的蛋白质的拮抗剂作为有效成分。预计本发明的免疫增强剂作为抗肿瘤剂或者作为抗病毒剂有效。因此本发明提供了含有针对本发明的蛋白质的拮抗剂作为有效成分的抗肿瘤剂或者抗病毒剂。
此外,作为分离激动剂或拮抗剂等与本发明的蛋白质结合的化合物的方法,例如使合成化合物,天然物质库或随机噬菌体肽展示文库作用于固定的本发明的蛋白质,筛选与本发明的蛋白质结合的方法,或使用基于组合化学技术的高通量筛选方法(Wrighton NC,Farrell FX,Chang R,Kashyap AK,Barbone FP,Mulcahy LS,Johnson DL,BarrettRW,Jolliffe LK,Dower WJ;Small peptides as potent mimetics of theprotein hormone erythropoietin,Science(UNITED STATES)Jul 261996,273 p458-64,Verdine GL.,The combinatorial chemistry of nature.Nature(ENGLAND)Nov 7 1996,384,p1 1-13,Hogan JC Jr.,Directedcombinatorial chemistry.Nature(ENGLAND)Nov 7 1996,384 p17-9)等是本领域公知的方法。
本发明还提供了用于在上述鉴定方法中使用的试剂盒。该试剂盒含有本发明的蛋白质或表达本发明的蛋白质的细胞。该试剂盒中,也可以含有成为NKIR蛋白质的配体、激动剂或拮抗剂的候选化合物。
在使用本发明的蛋白质、或者通过本发明的鉴定(筛选)方法分离的化合物、本发明的上述药剂作为人或例如小鼠,大鼠,豚鼠,家兔,鸡,猫,狗,绵羊,猪,牛,猴,狒狒和黑猩猩这样的哺乳动物的药剂时,除了以蛋白质或分离的化合物本身直接施用外,还可以通过公知的制剂学方法制剂化进行施用。例如,可以根据需要作为糖包衣片,胶囊剂,酏剂或微胶囊剂口服给药,或者以与水或其它的药学上可允许的液体的无菌溶液或悬浮剂的注射剂的形式非口服给药。例如,一般认为,通过使其与作为药理学上允许的载体或媒介,具体而言,无菌水,生理盐水,植物油,乳化剂,悬浮剂,表面活性剂,稳定剂,调味剂,赋形剂,载体,防腐剂,结合剂等适当组合,以一般认为的制药实施中需要的单位用量形式混合而制剂化。这些制剂中的有效成分量是可以获得指示范围内的适当容量的剂量。
作为可以在片剂和胶囊剂中混合的添加剂,可以使用例如凝胶,玉米淀粉,黄蓍胶和阿拉伯树胶这样的结合剂,微晶纤维素这样的赋形剂,玉米淀粉,凝胶和褐藻胶这样的膨化剂,硬脂酸镁这样的润滑剂,蔗糖,乳糖或糖精这样的甜味剂,薄荷油、アカモノ油(Gaultheriaadenothrix oil)或樱桃这样的调味剂。在调剂单位形态为胶囊剂时,上述材料中进而还可以含有油脂之类的液状载体。用于注射的无菌组合物可以使用注射用蒸馏水这样的载体(vehicle)按照常规的制剂实施处方。
作为注射用的水溶液,可以例举有例如生理盐水,葡萄糖或含有其它辅药的等渗溶液,例如D-山梨糖醇,D-甘露糖,D-甘露醇和氯化钠,还可以与合适的助溶剂合用,所述合适的助溶剂例如醇,具体而言是乙醇,例如丙稀和聚乙烯这样的多元醇,和例如聚山梨醇酯80(TM)和HCO-50这样的非离子性表面活性剂。作为油性液,可例举有芝麻油,大豆油,也可以与作为助溶剂的苯甲基或苯甲醇合用。此外,也可以与例如磷酸盐缓冲液、醋酸钠缓冲液这样的缓冲液,例如盐酸普鲁卡因这样的止痛剂,例如苯甲基,苯酚这样的稳定剂,抗氧化剂配合。通常将制备的注射液填充于适当的安瓿中。
对患者给药,通过例如动脉内注射,静脉内注射,皮下注射等,除此之外还通过经鼻腔内的,支气管内的,肌肉内的,经皮的或者经口的公知的方法进行。根据患者的体重、年龄和给药方法等对给药量进行改变,但是只要是本领域技术人员就可以适当的选择出合适的给药量。此外,还认为如果该化合物是由DNA编码的化合物,就将该DNA插入基因治疗用载体,进行基因治疗。给药量、给药方法根据患者的体重、年龄和症状等进行改变,但是只要是本领域技术人员就可以适当的选择出合适的给药量。
本发明蛋白质的给药量、其每次给药量根据给药对象,对象器官,症状,给药方法而不同,但是一般认为以注射剂形态在正常成人(体重为60kg)中给药时是每天约100μg至20mg。
与本发明的蛋白质结合的化合物或调节本发明的蛋白质的活性的化合物的给药量根据症状而各有差异,但是一般认为在经口给药时,在正常成人(体重为60kg)中是每天约0.1至100mg,优选约1.0至50mg,更优选的是约1.0至20mg。
在非经口给药时,其每次给药量根据给药对象,对象器官,症状,给药方法而不同,但是一般认为以注射剂形态在正常成人(体重为60kg)中给药时合适的剂量通常是通过静脉注射以每天约0.01至30mg,优选约0.1至20mg,更优选约0.1至10mg给药。在其它动物给药时,也可以以换算成每60kg体重的量或换算成单位体表面积的量给药。
并且,本说明书中引用的所有现有技术文献均并入本说明书作为参考。
实施例
下面,通过实施例对本发明进行更为具体的说明,但是本发明并不受这些实施例的限制。
[实施例1]全长序列的克隆
本申请发明人在 http://www.prevent.m.u-tokyo.ac.jp所公开的免疫系统细胞的SAGE(SAGE:基因表达的系列分析)分析数据中,发现了特异于NK细胞的未知基因序列标记(表1),并发现该标记存在于公开公报(WO0149728)AX191619中。表1表示了序列标记(TGCCGCATAA)在NK细胞来源的文库中的选择表达。
[表1]
未成熟树突状细胞 GM-CSF诱导性巨噬细胞 LPS剌激性单核细胞 成熟树突状细胞 M-CSF诱导性巨噬细胞 单核细胞 Langerhans样细胞 CD4T细胞(天然) CD4T细胞(记忆细胞,CCR4阴性) CD4T细胞(记忆细胞,CCR4阳性) 粒细胞 活性化T细胞(TH1) 活性化T细胞(TH2) NK细胞
  TGCCGCATAA  0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   6
  所有分析的标记  50795   50041   30885   27602   46833   51228   44873   41789   27733   25415   23808   26498   25371   29878
基于此设计出完整编码区域的引物(SA1(5′-
5’-TTGAATTCACACACCCACAGGACCTGCAGCTGAA-3’/SEQ ID NO:7)、SA2
(5’-TTGGATCCACTGAAGGACCCACAGAAAGAGTTGA-3’/SEQ ID NO:8)),用PCR从人脾脏cDNA文库中克隆出基因。所得克隆的碱基序列示于SEQ ID NO:1中,由该碱基序列编码的蛋白质的氨基酸序列示于SEQID NO:2中。此外,更为详细的步骤如下所示:
(1)pGEMTE_NK1的构建
在以下反应条件下进行PCR。
模板:marathon-ready cDNA人脾脏(CLONTECH)
引物:SA1<=>SA2
反应条件:96℃下1分钟;
96℃下30秒,72℃下4分钟进行5个循环;
96℃下30秒,70℃下4分钟进行5个循环;及
96℃下20秒,68℃下4分钟进行25个循环。
用TaKaRa Ex Taq(添加了缓冲液,dNTP混合物)进行PCR。经琼脂糖凝胶电泳切出约1.5kb的条带。在用QIAquick Gel提取试剂盒纯化后,插入到pGEM T-Easy载体中制备成pGBMTE_NK1。用引物SA1-7,T7和SP6确认碱基序列。
SA3:5’-ACCCTGAGATGTCAGACAAAG-3’/SEQ ID NO:9
SA4:5’-GCCACCTCACACCAGTAAAG-3’/SEQ ID NO:10
SA5:5’-CCTCCGATCCTGTATTCCTTC-3’/SEQ ID NO:11
SA6:5’-TGGAGCTGTGGGTGGTATCTG-3’/SEQ ID NO:12
SA7:5’-AGAACCTCAAAGAGGAGTGAA-3’/SEQ ID NO:13
T7启动子引物:5’-ATTATGCTGAGTGATATCCC-3’/SEQ ID NO:14
SP6启动子引物:5’-ATTTAGGTGACACTATAGAA-3’/SEQ ID NO:15
(2)pCOS_NK1的构建
用EcoRI和BamHI切断pGBMTE_NK1,经琼脂糖凝胶电泳切出约1.5kb的条带,在用QIAquick Gel提取试剂盒纯化后,插入到pCOS1载体的EcoRI-BamHI位点制备成pCOS_NK1。
(3)pCHO2-NK1-FLAG的构建
在以下反应条件下进行PCR。
模板:pGBMTE_NK1
引物:SAS1(5’-GGGAATTCATGTTGCCATCTTTAGTTCC-3’/SEQ ID NO:16)SAS2(5’-AAGGATCCACTCCTCTCTCTGGAGAC-3’/SEQ ID NO:17)
反应条件:94℃下2分钟;94℃下15秒,55℃下30秒,68℃下1分钟,进行25个循环
使用KOD plus(TOYOBO;添加了缓冲液,dNTPs和MgSO4)进行PCR。在用QIAquick PCR纯化试剂盒(QIAGEN)纯化后,用EcoRI和BamHI切断,经琼脂糖凝胶电泳切出约1kb的条带。在用QIAquickGel提取试剂盒纯化后,插入到pCHO2-FLAG载体的EcoRI-BamHI位点制备成pCHO2-NK1-FLAG。用引物SAS1,SAS2,S3,S4,S5,EF1α,polyA确认碱基序列。
EF1α:5’-GCCTCAGACAGTGGTTCAAA-3’/SEQ ID NO:18
IgG1polyA5’-AGAACCATCACAGTCTCGCA-3’/SEQ ID NO:19
(4)pCHO2-SGNKl_FLAG的构建
在以下反应条件下进行PCR。
A:模板:pCOS2-SGhMPL-FLAG
引物:Hmpl-sig1(5’-AAGAATTCCACCATGGCTGGACCTGCCAC-3’/SEQ ID NO:20)NK1-sig2(5’-ACAGGGTTTGGCCAGGCTTGGGCTTCCTGCACTGTCCAGAG-3’/SEQ IDNO:21)
B:模板:pGBMTE_NK1
引物:NK1-sig1(5’-GCAGGAAGCCCAAGCCTGGCCAAACCCTGT-3’/SEQ ID NO:22)SAS2
C:模板:反应系统A和B的产物的混合物
引物:Hmpl-sig1<->SAS2
反应条件:94℃下2分钟;94℃下15秒,55℃下30秒,68℃下1分钟,进行25个循环。
使用KOD plus(TOYOBO;添加了缓冲液,dNTPs和MgSO4)进行PCR。在用QIAquick PCR纯化试剂盒(Qiagen)纯化后,用EcoRI和BamHI切断,经琼脂糖凝胶电泳切出约0.9kb的条带。在用QIAquickGel提取试剂盒纯化后,插入到pCHO2-FLAG载体的EcoRI-BamHI位点制备成pCHO2-SGNK1-FLAG。用引物NK1-sig1,NK1-sig2,SAS2,S3,S4,S5,EF1α,polyA确认碱基序列。
推测经测定的由以上(1)至(4)的步骤获得的克隆的碱基序列编码由429个氨基酸构成的膜蛋白质。将该序列与Sagami Chemical研究中心的序列(WO 01/49728)相比较,发现中央部分的序列与Sagami Chemical研究中心的序列相同,但是N末端不同,并且了解到在蛋白质序列中也存在差异。这次克隆到的克隆,在所有得到的克隆中C末端相同,但是由于获得了多个像是5′端的剪切变异体的克隆,因此按以下方式进行5′RACE以测定原来的序列。
用SMART RACE cDNA扩增试剂盒(CLONTECH)从1μg使用RNA-Bee_RNA ISOLATION REAGENT(Tel-Test)从NK细胞中提取的RNA(0.4μg/μl,20μl于DEPC-DDw中)合成出cDNA(5′-RACE-Ready cDNA,100μl于Tricine-EDTA缓冲液中),在以下反应条件下进行5′-RACE PCR。
第1轮:
模板:2.5μl 5′-RACE-Ready cDNA
引物:10×Universal引物A Mix(添加;以lx使用)<=>SAS2
10×Universal引物A Mix:(长,0.4μM:
5’CTAATACGACTCACTATAGGGCAAGCAGTGGTATCAACGCAGAGT-3’/SEQ ID NO:23)
(短,2μM:5’CTAATACGACTCACTATAGGGC-3’/SEQ ID NO:24)
第2轮:
模板::5ul第一轮PCR产物
引物:嵌套式Universal引物A(NUP)(5’-AAGCAGTGGTATCAACGCAGAGT-3’/SEQ ID NO:25)SA4
反应条件:94℃下30秒;
94℃下5秒,72℃下3分钟,进行5个循环;
94℃下5秒,70℃下10秒,72℃下3分钟,进行5个循环;
94℃下5秒,68℃下10秒,72℃下3分钟,进行30个循环;
72℃下7分钟。
对第2轮PCR的产物进行琼脂糖凝胶电泳,切出约650bp的条带。用QIAquick Gel提取试剂盒纯化后,插入到pGEM T-Easy载体中。用引物SA3,4,T7,SP6和NUP确认碱基序列。
其结果是,序列经确认的5个克隆的所有的编码序列与上述碱基序列相同(其中,1个克隆在5’端短)。因此,认为这次获到的克隆是实际上表达的碱基序列。
根据使用Prosite,Pfam,Psort等的基序检索结果,发现发现以下这些序列上的特征:
N-糖基化位点:(N[^P][ST][^P])60:NQTL,245:NHSA;和268:NYSC
ITIM基序(Yxx[VL]):351:YANV,366:YSVV
Ig样区域:27-80,120-177,216-273
跨膜区域:309-325
根据上文所述信息,推测这次分离的基因是作为配体识别属于FcR超家族的典型的MHC I型的抑制性受体(KIR)成员。由于该基因具有在NK细胞中特异性表达的特征,下面将其称之为NKIR基因。
[实施例2]用家兔多克隆抗体检测NKIR蛋白质
构建大肠杆菌表达系统,进行NKIR细胞外区域的融合蛋白质的表达纯化(图1)。详细的步骤如下所示:
(1)NKIR融合蛋白质大肠杆菌表达质粒pET32a-NK-so]的制备
在以下反应条件下进行PCR。
模板:pGEMTB-NK1
引物:NK融合(5’-CTCGGATCCTTGCCATCTTTAGTTCCCTGTGTT-3’/SEQ ID NO:26)NKr2(5’-GCTGTCGACTTAGTTGCTGGCGGGAGTGAACAAGAC-3’/SEQ ID NO:27)
反应条件:94℃下2分钟;
94℃下20秒,60℃下30秒,68℃下2分钟,进行25个循环。
使用KOD plus(TOYOBO;添加了缓冲液,dNTPs和MgSO4)进行PCR。在用Micro Spin S-300HR柱(Amersham Bio sciences)纯化后,用BamHI和SalI切断,经琼脂糖凝胶电泳切出约0.9kb的条带。在用MicroSpin S-300HR柱纯化后,插入到pET-32(a)(Novagen)载体的BamHI-SalI位点制备成pET32a-NK-sol。
(2)NKIR蛋白质动物细胞表达质粒PCOS2-NK-FLAG的制备
在以下反应条件下进行PCR。
模板:pGEMTB-NK1
引物:NKflag(
5’-GCGAATTCCACCATGGACTACAAAGACGATGACGACAAGTTGCCATCTTTAGTTCCCTGTGTT-3’/SEQ ID NO:28)NKr1(5’-CGTGTCGACTCACTAGCAGAGAACCTCCTCACAGTC-3’/SEQ ID NO:29)
反应条件:94℃下2分钟;
94℃下20秒,60℃下30秒,68℃下2分钟,进行25个循环。
使用KOD plus(TOYOBO;添加了缓冲液,dNTPs和MgSO4)进行PCR。在用Micro Spin S-300HR柱(Amersham Biosciences)纯化后,用EcoRI和SalI切断,经琼脂糖凝胶电泳切出约1.3kb的条带。在用MicroSpin S-300HR柱纯化后,插入到pCOS2的EcoRI-SalI位点制备成pCOS2-NK-FLAG。
(3)NKIR融合蛋白质和家兔NKIR多克隆抗体的制备
通过硫氧还蛋白融合蛋白质表达质粒pET32a-NK-sol,进行大肠杆菌BL21(DE3)的转化。将在含有50μg/ml氨苄青霉素的LB培养基中培养过夜的大肠杆菌悬液以1%的终浓度扩散于含有50μg/ml氨苄青霉素的LB培养基中进行培养,在600nm处的吸收度达到0.4后,以1mM的终浓度添加IPTG,进行蛋白质表达诱导。进行4.5小时培养后,通过离心收集菌体沉淀物,悬浮于PBS。通过超音波破碎机破碎菌体后进行离心,除去上清,回收沉淀级分。用含有7M尿素的磷酸缓冲液(PBS)溶解后,用0.45μM的过滤器进行过滤。用HisTrap试剂盒(AmershamBiosciences)从滤液中分离出NKIR融合蛋白质。针对50mM Tris(pH8.3)透析洗脱液,获得溶解的融合蛋白质试样。SDS-PAGE后经考马斯染色对具有预期分子量的所得融合蛋白质进行确认。
以所得NKIR融合蛋白质作为免疫原免疫家兔,制成多克隆抗体。将抗原蛋白质调制成0.2mg/0.5ml,加入0.5ml弗氏完全佐剂(BectonDickinson),在皮下接种1ml(第1、4、11天)。在第19天、26天、33天时静脉注射0.05mg抗原蛋白质。采取血液试样,确认抗体滴度提高后,进行采血,在蛋白质A亲合柱上装上抗血清,纯化抗体蛋白质。获得的多克隆抗体,通过以下的Western blotting对所得多克隆抗体显示出的与COS-7动物细胞中瞬间表达的NKIR的结合性进行确认。
按照制造商的指示使用FuGENE6(Roche Diagnostics)将pCOS2-NK-FLAG导入到COS-7细胞中。培养2天后,加入溶解液(10%甘油,50mM Tris pH7.6),150mM NaCl,5mM NP-40,和蛋白酶抑制剂(完全))悬浮细胞后离心,获得含有可溶性膜蛋白质级分的上清。在可溶性级分中添加抗FLAG M2抗体树脂,免疫沉淀FLAG-NKIR。在对所得试样进行SDS-PAGE后,转移到PVDF膜上,用抗NKIR多克隆抗体检测。使用稀释1000倍的从家兔获得的多克隆抗体(4.1mg/ml IgG)作为第一抗体,稀释3000倍的HRP标记的抗家兔抗体(AmershamBiosciences)作为第二抗体。检测中使用ECL Western Blotting检测系统(Amersham Biosciences)。此外,使用稀释1000倍的从抗FLAG M2抗体(Sigma)作为对照,使用稀释3000倍的HRP标记的抗小鼠抗体(Amersham Biosciences)作为第二抗体,对FLAG-NKIR蛋白质的存在进行确认(图2)。
[实施例3]组织表达分析和NK细胞株中的表达分析
使用市售的cDNA panel(Multiple Tissue cDNA(MTC)panel;Clontech Laboratories,Inc.)作为模板,通过PCR进行组织表达图谱分析。
在以下反应条件下进行PCR。
模板:MTC panel I,II,Human Immune System和Human BloodFraction(Clontech Laboratories,Inc.)
引物:NKIR07(5’-AGGTCAGAGTGCAGGCTCCTGTATC-3’/SEQ ID NO:30)NKIR08(5’-TAGAACTGTCCTTTCTCCCCACGGT-3’/SEQ ID NO:31)
反应条件:94℃下30秒;
94℃下30秒,65℃下2分钟,进行35个循环。
用TaKaRa Ex Taq(添加缓冲液,dNTP)进行PCR。反应在50μl下进行,提供5μl反应液进行琼脂糖凝胶电泳,确认出0.6kb条带。在对照反应中使用附加于MTC panel上的G3PDH引物作为引物。
结果显示,基因在脾脏、白血球等免疫系统中特异表达(图3)。当使用上述MTC panel的Blood Fraction和Immune System的子设备,分析对象增加时,在Blood Fraction中,检定出基因表达局限于单细胞、休眠CD8+,此外在Immune System中,检定出基因表达局限于白血球、淋巴结(图3)。
使用由ATCC购买的NK-92株(目录编号:CRL-2407)制备的细胞裂解液,进行Western blotting,该细胞株是一种株化的天然杀伤细胞(NK)株。
在10ng/ml白介素-2(SIGMA-ALDRICH)存在下,在NK-92传代培养基(含有12.5%胎儿牛血清(Invitrogen),12.5%马血清(InVitrogen),2mM谷氨酸盐(Invitrogen),0.1mg/l青霉素(InVitrogen),0.1mg/l链霉素(Invitrogen),1mM丙酮酸钠(Invitrogen),100μM 2-硫基乙醇(Invitrogen),2mM叶酸(SIGMA-ALDRICH)和20mM肌醇(SIGMA-ALDRICH)的α-MEM培养基(Invitrogen))中培养NK-92细胞株,将培养获得的1×107细胞悬浮于500μl的NP40溶解缓冲液(1% NP40,150mM NaCl,50mM Tris-HCl(pH8.0))中,在冰上静置30分钟后,以15000rpm的超离,分离出上清,将其作为细胞裂解液在Western blotting分析中使用。
以PIERCE制造的牛血清白蛋白(Fraction V)作为对照,用Dc蛋白质检测试剂盒(BIO-RAD Laboratories)测定出细胞裂解液的蛋白质浓度。
用于Western blotting分析的SDS-PAGE中使用PAG-Mini(4-20%梯度凝胶,第一化学药品株式会社),并向其提供10μg和20μg的NK-92株的细胞裂解液。用NP40裂解缓冲液将在用于制备多克隆抗体的免疫家兔时使用的免疫原稀释200倍,同时提供1μl的样品作为阳性对照。在20mA的条件下进行电泳,在以20volts下45分钟的条件下用SEMI-DRY TRANSFER CELL(BIO-RAD Laboratories)将电泳后的凝胶转移到PVDF膜(Hybond-P,Amersham Biosciences)上。按照手册中的方法使ECL+plus Western Blotting Detection System(Amersham Biosciences)进行Western blotting。但是,阻断试剂中以2%的浓度使用ECL-Advance阻断试剂(Amersham Biosciences)。使用稀释1000倍的从前述家兔获得的多克隆抗体(4.1mg/ml IgG)作为第一抗体,此外使用稀释3000倍的抗家兔Ig(整个抗体连接了辣根过氧化物酶(AmershamBiosciences))作为二级抗体,鉴定出了与抗NKIR多克隆抗体交叉的分子种类。
其结果显示,在NK-92细胞株中表达一种具有60kDa的分子量的蛋白质,该蛋白质与在家兔中以大肠杆菌中表达的NKIR蛋白免疫获得的多克隆抗体交叉(图4)。
进而,为了证实该NKIR分子在NK细胞表面表达,采用抗NKIR抗体进行了对NK-92株的流式细胞仪分析。
将5×105细胞悬浮于100μl的FACS缓冲液(含有2.5%胎儿牛血清和0.02% NaN3的磷酸盐缓冲液)中,以82μg/ml的终浓度添加抗NKIR多克隆抗体。还制备了添加了相同浓度的家兔纯化IgG的细胞作为阴性对照。在冰上静置1小时后,以低速离心(300×g,5分钟)回收细胞,用FACS缓冲液清洗,再次进行低速离心,回收细胞。接着,将回收的细胞悬浮于含有终浓度为14μg/ml的从山羊获得的结合了FITC的山羊抗家兔IgG抗体(Beckman Coulter)的FACS缓冲液中后,在冰上静置30分钟。在通过低速离心进行细胞回收,并且用FACS缓冲液清洗后,悬浮于500μl的FACS缓冲液中,进行流式细胞仪分析(BeckmanCoulter,EPICS)。结果显示,该NKIR分子在细胞表面表达(图5)。
[实施例4]通过使用由NK-92株获得的cDNA的RACE法对NKIR基因的全长克隆
用由NK-92株制备的总RNA通过5’和3’端-RACE法再次进行NKIR基因的全长克隆。
用RNeasy(QIAGEN)试剂盒从经实施例3中记载的方法培养的5.4×107个NK-92细胞中制备出总RNA,获得377.7μg的总RNA。以由此制备的1μg的RNA作为模板,使用SMART RACE cDNA扩增试剂盒(Clontech)进行5’和3’端-RACE。5’-RACE时使用NKIR08作为基因特异性引物,3’-RACE时使用NKIR07作为基因特异性引物。由于两次反应都在1次PCR反应中获得长度约为1.3kb的主要扩增产物,从琼脂糖凝胶中切出该扩增片段,用QIAquick(QIAGEN)试剂盒纯化后,克隆到pCR2.1-TOPO(Invitrogen)中。将产生的TOP10F’由来的转化株各8株培养在含有0.1mg/ml氨苄青霉素的2ml LB培养基中,用QIAprep试剂盒(QIAGEN)从培养的大肠杆菌中制备出质粒,确定序列。其结果是,从5’-RACE反应中,获得了具有在前述确定的序列之外还在5’端插入长度为36个碱基的cDNA,在以后的研究中作为pTOPONKIR626使用。此外,从3’-RACE反应中获得了cDNA克隆,pTOPONKIR620,其中含有约为500个碱基的下游延伸片段。其碱基序列在序列表中表示为SEQID NO:3,或者由该碱基序列编码的蛋白质的氨基酸序列在序列表中表示为SEQ ID NO:4。在人基因组上的1号染色体的NKIR区域中确认了该序列。
因此,以5’端的36个碱基的插入序列为目标,用pCOS1作为载体骨架构建分别含有实施例1中分配的序列、重新分离的序列的表达载体,在COS-7细胞中瞬间表达。
以pGEM-TE NK1作为模板,使用NKIR09(5’-GAATTCACACACCCACAGGACCTGCA-3’/SEQ ID NO:32)和NKIR10(5’-GGATCCACTGAAGGACCCACAGAAAG-3’/SEQ ID NO:33)
引物各0.2μM进行PCR。用HF聚合酶试剂盒(Clontech)作为PCR试剂盒,反应条件如下:94℃下变性30秒后,进行25个94℃下15秒+55℃下30秒+72℃下1分钟的循环后,在72℃下进行5分钟延长反应。给琼脂糖凝胶电泳提供反应液,用QIAquick Gel提取试剂盒(QIAGEN)纯化所产生的1.5kb片段后,克隆到pCR2.1-TOPO(Invitrogen)中,转化大肠杆菌TOP10F’。用QIAminiprep试剂盒(QIAGEN)从所产生的氨苄青霉素抗性株中制备出质粒,进行序列分析。选择没有PCR误差的克隆pTOPONKIR219用于以后的研究。
接着,5μg pTOPONKIR219和1.15μg PBLUESCRIPT II SK+(STRATAGENE),分别经20个单位的Ec0RI和BamHI在37℃消化1小时后,提供给琼脂糖凝胶电泳,用QIAquick Gel提取试剂盒(QIAGEN)分别纯化所产生的1.5kb和3.0kb的片段后,使用LigaFAST连接试剂盒(Promega)对每一份40μl的洗脱液中的1μl进行连接,转化大肠杆菌TOP10F’。用QIAminiprep试剂盒(QIAGEN)从产生的氨苄青霉素抗性株中制备出质粒,将经PstI酶限制性检验观察到了长度约为1.3kb的消化片段的克隆pBSNKIR224用于以后的研究。接着,经琼脂糖凝胶电泳分离出分别为pBSNKIR224和pTOPONKIR626的经BstP1和Bg1 II双重消化产生的4kb和0.4kb的片段,经QIAquick Gel提取试剂盒(QIAGEN)纯化后,用LigaFAST连接试剂盒(Promega)连接,转化大肠杆菌DH5α。用QIAminiprep试剂盒(QIAGEN)从所产生的氨苄青霉素抗性株中制备出质粒,进行序列分析,将经确认在5’端插入了36bp的克隆pBSNKIRfull605用于以后的研究。
最后,在pCOS1的EcoRI和NotI位点插入从pBSNKIR224和pBSNKIRfull605获得的长度为1.4kb的EcoRI-NotI片段,分别制备成表达载体pCOSNKIR610和pCOSNKIRfull610。使用MIRUS TransIT-LT1(PanVera)通过脂质转导法按照生产者的指导将作为DNA供体的两个质粒转化COS-7,培养2天后,使用胰岛素/EDTA溶液(Invitrogen)剥离细胞后,用含有10%胎儿牛血清(Invitrogen)的DMEM培养液(Invitrogen)清洗细胞两次,用与实施例3中记载的方法相同的步骤进行流式细胞仪分析。
结果,只有在用具有从NK-92分离的序列的5端’插入有36个碱基的序列的NKIR表达质粒进行转染时,确认出细胞级分在FITC检测中发生变化,因此显示出具有36个碱基的插入的克隆,以分泌型行使功能(图6)。
[实施例5]小鼠NKIR序列的克隆
以人NKIR氨基酸序列作为query,对小鼠基因组序列进行blast检索(tblastn),鉴定出与全长序列hit的1号染色体区域(图7)。该小鼠染色体区域是与人NKIR经基因定位的人染色体区域在染色体结构上匹配的区域。
基于预测的翻译区域设计引物(mNKIRf1(5’-CTCAGTAAAGGCAGAGTGGAGTACC-3’/SEQ ID NO:34)mNKIRr1(5’-ATACATTAGAACCACAGCCGCAATG-3’/SEQ ID NO:35)),根据小鼠脾脏cDNA文库进行PCR扩增,克隆基因。对该序列进行确认,其结果可以鉴定出经剪切的转录物的存在。
以小鼠脾脏Marathon-Ready cDNA(Clontech)为模板,在以下反应条件下进行5’-RACE和3’-RACE PCR。
第1轮:模板:Marathon Ready cDNA,2.5μl
引物:
用于3’-RACE的AP1(5’-CCATCCTAATACGACTCACTATAGGGC-3’/SEQ ID NO:36)mNKIRf1
用于5’-RACE的AP1<=>mNKIRr1
第2轮:模板:第1轮PCR产物稀释30倍的稀释物,2.5μl引物:
用于3’-RACE的
AP2(5’-ACTCACTATAGGGCTCGAGCGGC-3’/SEQ ID NO:37)mNKIRf3(5’-CTCAAGAAGTTCCCCTTGGTTGTCTC-3’/SEQ ID NO:38)
用于5’-RACE的
AP2mNKIRr3(5’-GCCAGATAGTTAGCATGTTGCTCTTG-3’/SEQ ID NO:39)
第1轮PCR反应条件:94℃下1分钟;94℃下10秒,68℃下3分钟,进行35个循环。
第2轮PCR反应条件:94℃下1分钟;94℃下10秒,68℃下3分钟,进行20个循环。
用TaKaRa LA Taq(TAKARA)(添加了缓冲液,dNTPs,MgCl2)按照制造者的指示制备反应液进行PCR。对第2轮PCR的PCR产物进行琼脂糖凝胶电泳,切出扩增的条带。经QIAquick Gel提取试剂盒(QIAGEN)纯化后,插入到pGEM T-Easy载体中。转化DH5α,从所得克隆中制备出质粒,确定碱基序列。
其结果是,预测其为由268个氨基酸构成的膜蛋白质。所得克隆的碱基序列在序列表中表示为SEQ ID NO:5,或者由该碱基序列编码的蛋白质的氨基酸序列在序列表中表示为SEQ ID NO:6。在人-小鼠序列的比较中(图8),小鼠序列与人的序列相比,其具有在N末端、C末端都缩短了的结构,但是其在相当区域保持了1个N型糖链添加部位,1个ITIM基序,跨膜区域,两个Ig样区域。
根据使用Prosite,Pfam,Psort等的基序检索结果,发现以下这些序列上的特征:
N-糖基化位点:(N[^P][ST][^P])180:NYSC,188:NISR
ITIM基序(Yxx[VL]):259:YANV
Ig样区域:33-89,128-185
跨膜区域:221-237
[实施例6]2KIR3DL的克隆
检测ITIM活性的检测系统,使用T细胞作为受体细胞,改变对NFAT级联控制下的荧光素酶活性进行测定的方法从而得以实施(FryAM,Lanier LL,Weiss A.,J Exp Med.(1996),184,295-300)。
用人脾脏cDNA文库克隆已知KIR基因2KIR3DL。在以下反应条件下进行PCR。
模板:人脾脏Marathon-Ready cDNA(Clontech)
引物:p58KIR01(5’-GAATTCATGTCGCTCATGGTCGTCAG-3’/SEQ IDNO:40)p58KIR02(5’-GGATCCTCAGGGCTCAGCATTTGGAA-3’/SEQ IDNO:41)
反应条件:94℃下30秒;94℃下15秒,52℃下30秒,72℃下1分钟,进行30个循环;72℃下5分钟
用HF聚合酶(Clontech)进行PCR。经琼脂糖凝胶电泳分离长度为1kb的片段后,用QIAquick(QIAGEN)纯化。将纯化产物克隆到pCR2.1-TOPO(Invitrogen)中,转化大肠杆菌TOPIOF’。用QIAprep试剂盒(QIAGEN)从转化株中制备出质粒,选择没有PCR误差的克隆(pTOPO58KIR303)用于进一步研究。
[实施例7]框架内融合的构建
按以下步骤构建由上述实施例6获得的2KIR3DL的细胞外区域与NKIR的细胞质内ITIM基序的框架内融合。
首先在以下反应条件下进行PCR。
第1轮PCR A
模板:pTOPO58KIR303
引物:p58KIR01p58NKIR04(5’-AGGGGCCCAGCTTTTCTCCAGCGATGAAGGAGAAAGAAGA-3’/SEQ ID NO:42)
第1轮PCR B
模板:pBSNKIR224
引物:p58KIR03(5’-TCTTCTTTCTCCTTCATCGCTGGAGAAAAGCTGGGCCCCT-3’/SEQ ID NO:43)T3+(5’-GCAATTAACCCTCACTAAAGGGAAC-3’/SEQ ID NO:44)
反应均在以下记载的条件下进行:
94℃下30秒;94℃下15秒,55℃下30秒,72℃下45秒,进行30个循环;72℃下2分钟。
用HF聚合酶(Clontech)进行PCR。经琼脂糖凝胶电泳从PCR A分离长度为0.8kb的片段、从PCR B分离长度为0.4kb的片段后,用QIAquick(QIAGEN)纯化。分别使用每份50μl纯化产物中的10μl作为下文所示第2轮PCR的模板。
模板:上述反应产物各10μl
反应在以下记载的条件下进行:
94℃下30秒;94℃下15秒,55℃下30秒,72℃下90秒,进行15个循环。
反应后,在50μl反应液中以终浓度1μM添加下述模板。
引物:p58KIR01<=>T3+
反应条件:94℃下30秒;94℃下15秒,55℃下30秒,72℃下2分钟,进行35个循环;72℃下4分钟
经琼脂糖凝胶电泳分离出长度为1.2kb的片段后,用QIAquick(QIAGEN)纯化。克隆到pCR2.1-TOPO中,转化大肠杆菌TOP10F’。用QIAprep试剂盒(QIAGEN)从转化株中制备出质粒,选择没有PCR误差的克隆(pBSKIR58NKIR314)用于进一步研究。
接着,1μg的pCXND3和pBSKIR58NKIR314分别经20个单位的EcoRI和NotI在37℃消化1小时后,提供给琼脂糖凝胶电泳,用QIAquickGel提取试剂盒(QIAGEN)分别纯化所产生的7.8kb和1.2kb的片段后,使用LigaFAST连接试剂盒(Promega)对每一份40μl的洗脱液中的1μl进行连接,转化大肠杆菌DH5α。挑选产生氨苄青霉素抗性株,先用p58KIR01和p58NKIR10引物各0.5μl进行克隆PCR。这时使用Premix ExTaq(TaKaRa)作为PCR多聚酶,反应条件是:94℃下变性5分钟后,进行35个94℃下30秒、55℃下30秒、72℃下90秒的循环。将所产生的反应产物的1/5的量提供给琼脂糖凝胶电泳,将观察到长度为1.3kb的PCR片段的克隆pCXND3KIR58NKIR313用于以后的研究。
[实施例8]稳定的转化株的获得
由上述实施例7获得的pCXND3KIR58NKIR313作为DNA供体,从T细胞株Jurkat株获得稳定的转化株候选株ChimeraA10株。获得的方法如下所述。
使用pCXND3KIR58NKIR313作为DNA供体,Jurkat株作为受体细胞,通过电穿孔法进行转导。20μg的DNA供体预先在37℃下用20个单位的Pvu II(TaKaRa)消化1小时,在氯仿/苯酚处理后接着进行乙醇沉淀,然后溶解于20μl的无菌水中。作为受体细胞,用钾-磷酸盐缓冲(K-PBS)液清洗经含有10%FBS的RPMI1640培养基传代的Jurkat细胞后,以107细胞/ml悬浮于K-PBS,制备0.8ml的细胞悬浮液。在电穿孔中使用Gene Pulsar II(Bio-Rad),在0.3kV、950μFD的脉冲条件下进行。实施脉冲后,悬浮于48ml的传代培养基中,在没有选择压的条件下培养过夜后,用终浓度为400μg/ml的遗传霉素(InVitrogen)给予选择压,获得稳定的转化株候选株ChimeraA10株。除了使用GL183单克隆抗体(Beckman Coulter)作为第一抗体,并以结合了FITC的抗家兔IgG抗体(Beckman Coulter)作为二级抗体之外,其余以与实施例3记载的方法相同的步骤进行流式细胞仪分析。
其结果显示,可以识别出经FITC染色的细胞级分,上述蛋白质在ChimeraA10株中表达(图9)。
[实施例9]双重转化株的制备
以上述实施例8获得的ChimeraA10株作为受体细胞,用荧光素酶报告质粒pNFATlucZEOR324转导,获得双重转化株。
如下方式构建pNFATlucZEOR324。
2.5μg包含于Mercury Pathway Profiling Luciferase system 2(Clontech)中的荧光素酶报告基因pNFAT-TA-Luc经20个单位的AccI(Takara)在37℃下消化1小时,或者由dam株SCS-110株(Stratagene)制备的5μg pCOS II ZEO经20个单位的Cla I(Takara)在37℃下消化1小、时,提供给琼脂糖凝胶电泳。用QIAquick Gel提取试剂盒(QIAGEN)分别纯化出长度为5kb、2.2kb的消化片段。
由pNFAT-TA-Luc获得的片段在在37℃下经牛肠碱性磷酸酶处理30分钟后,用QIAquick核苷酸转移试剂盒(QIAGEN)纯化。使用LigaFAST连接试剂盒(Promega)对连接两片段,转化大肠杆菌DH5α。用QIAminiprep试剂盒(QIAGEN)从产生的氨苄青霉素抗性菌株中制备出质粒,经EcoR I和Sal I双重消化进行限制性检验,观察到长度为4.15kb和3.15kb的消化片段的克隆作为正向插入克隆pNFATlucZEOF324用于以后的研究,观察到了长度为5.15kb和2.15kb的消化片段的克隆作为反向插入克隆pNFATlucZEOR324用于以后的研究。
以该pNFATlucZEOR324提供DNA,使用在ChimeraA10株作为受体细胞,通过电穿孔进行传导。20μg的供体DNA预先在37℃下用20个单位的Pvu II(TaKaRa)消化1小时后,在氯仿/苯酚处理后接着进行乙醇沉淀,然后溶解于20μl的无菌水中。作为受体细胞,用钾-磷酸盐缓冲(K-PBS)液清洗经含有10%FBS和400μg/ml的遗传霉素的RPMI1640培养基传代的ChimeraA10细胞后,以107细胞/ml悬浮于K-PBS,制备0.8ml的细胞悬浮液。在电穿孔中使用Gene Pulsar II(Bio-Rad),在0.3KV、950μFD的脉冲条件下进行。实施脉冲后,悬浮于48ml含有400μg/ml的遗传霉素的的传代培养基中,在没有选择压的条件下培养过夜后,用终浓度为100μg/ml的零霉素(Invitrogen)给予选择压,获得稳定的转化株候选株。用DNeasy组织试剂盒(QIAGEN)从所得零霉素抗性株中制备基因组DNA。用0.4ml最终洗脱液中的5μl作为模板进行PCR反应。使用Premix ExTaq作为PCR多聚酶,使用Luc01(5’-TTCATACAGAAGGCGTGGAG-3’/SEQID NO:45)和Luc02(5’-CGTTCGCGGGCGCAACTGCA-3’/SEQ ID NO:46)作为引物,反应条件是:94℃下变性5分钟后,进行25个94℃下15秒、55℃下30秒、72℃下45秒的循环后,再进行72℃下5分钟的延伸反应。通过琼脂糖凝胶电泳选择产生长度为0.5kb的PCR片段的克隆,经荧光素酶活性检测进行最终筛选。
按以下方法实施荧光素酶检测:将由ChimeraA10细胞株获得的pNFATlucZEOR324的稳定转化株以6.7×104细胞/ml的浓度悬浮于含有400μg/ml的遗传霉素和100μg/ml的零霉素的传代培养基中后,以75μl/孔接种于涂布抗人CD3的微孔板(Beckton Dickinson)和常规的免疫微孔板中。在37℃下培养20小时后,添加等量(75μl)的Dual-Glo荧光素酶缓冲液(Promega),静置10分钟后,用光度计MicroLumat LB96P(EG&G Berthold)对各孔的化学发光进行测定,每孔测定5秒。
选择只在涂布抗人CD3的微孔板培养下显示化学发光的菌株chimeraA10ZEOR12株作为稳定转化株。此外,以与上述方法相同的方法对该菌株进行流式细胞仪分析。
结果显示,该菌株表达ChimeraA10株中表达的融合蛋白质(图9)。
[实施例11]由NKIR获得的ITIM活性测定
用chimeraA10ZEOR12株进行对由NKIR获得的ITIM基序的功能评价。方法如下所示。
以5×105细胞/ml的浓度将chimeraA10ZEOR12株悬浮于含有400μg/ml的遗传霉素和100μg/ml的零霉素的传代培养基中,以平均每孔100μl接种于涂布抗人CD3的微孔板(Beckton Dickinson)中。在37℃下培养6小时后,以1μg/ml终浓度添加GL183抗体(BeckmanCoulter),在37℃下培养过夜。接着以含有400μg/ml的遗传霉素和100μg/ml的零霉素的传代培养基两次清洗后,在用含有浓度分别为0、2、10μg/ml的大鼠来源的抗小鼠IgG抗体的100μl培养基悬浮清洗细胞后,以与实施例10记载的方法相同的方法测定荧光素酶活性。
结果显示,由通过大鼠来源的抗小鼠IgG抗体的交联显示出在3个例子中平均抑制33.3%荧光素酶活性(图10),这表示NKIR分子的细胞质内区域发现的ITIM基序有ITIM活性。
[实施例12]CD8α链的克隆
ITIM活性的功能检测系统,与实施例6相同,使用T细胞作为受体细胞,改变对NFAT级联控制下的荧光素酶活性进行测定的方法从而得以实施(Fry AM,Lanier LL,Weiss A.,J Exp Med.(1996),184,295-300)。
以休眠CD8+Marathon cDNA文库(Clontech)作为模板,克隆已知的CD8α链基因。在以下反应条件下进行PCR。
引物:CD01(5’-GAATTCATGGCCTTACCAGTGACCGC-3’/SEQ ID NO:47)CD02(5’-GGATCCTTAGACGTATCTCGCCGAAA-3’/SEQ ID NO:48)
反应条件:94℃下30秒;94℃下15秒、50℃下30秒、72℃下30秒,30个循环;72℃下4分钟
用GC聚合酶(宝酒造)进行PCR。用琼脂糖凝胶电泳分离长度为0.7kb的片段后,用QIAquick(QIAGEN)纯化。将纯化产物克隆到pCR2.1-TOPO(Invitrogen)中,转化大肠杆菌TOP10F’。用QIAprep试剂盒(QIAGEN)从转化株中制备出质粒,选择没有PCR误差的克隆(pCD8full0113)用于进一步研究。
[实施例13]CD8-NKIR融合蛋白质表达载体的构建
按以下方法构建由上述实施例12获得的CD8α链的细胞外区域与NKIR的细胞质内ITIM基序的融合蛋白质。
首先,在以下的反应条件下进行融合PCR。
第1轮PCR A
模板:pCD8full0113
引物:CD03(5’GAATTCCACCATGGCCTTACCAGTGACCGC-3’/SEQ ID NO:49)CDNKIR12(5’-ACCAGCCAGTTGCTGGCGGGGTCCAGCCCCCTCGTGTGCA-3’/SEQ ID NO:50)
第1轮PCR B
模板:pBSNKIR224
引物:CDNKIR11(5’-TGCACACGAGGGGGCTGGACCCCGCCAGCAACTGGCTGGT-3’)/SEQ ID NO:51)T3+(SEQ ID NO:44)
反应均在以下记载的条件下进行:
94℃下30秒;94℃下15秒,55℃下30秒,72℃下1分钟,进行30个循环;72℃下4分钟。
用GC聚合酶(宝酒造)进行PCR。经琼脂糖凝胶电泳从PCR A分离长度为0.5kb的片段、从PCR B分离长度为0.6kb的片段后,用QIAquick(QIAGEN)纯化。分别使用每份50μl纯化产物中的10μl作为下文所示第2轮PCR的模板。
模板:上述PCR A和PCR B反应产物各10μl
反应在以下记载的条件下进行:
94℃下30秒;94℃下15秒,55℃下30秒,72℃下90秒,进行15个循环。
反应后,在50μl反应液中以终浓度1μM添加下述引物。
引物:CD03<=>T3+
反应条件:94℃下30秒;94℃下15秒,55℃下30秒,72℃下30秒,进行35个循环;72℃下4分钟
经琼脂糖凝胶电泳分离出长度为1.1kb的片段后,用QIAquick(QIAGEN)纯化。克隆到pCR2.1-TOPO(InVitrogen)中,转化大肠杆菌TOP10F’。用QIAprep试剂盒(QIAGEN)从转化株中制备出质粒,选择没有PCR误差的克隆(pTOPOCD8NKdIRfull)用于进一步研究。
接着,1μg的pCXND3和pTOPOCD8NKIRfull分别经20个单位的EcoRI和NotI在37℃消化1小时后,提供给琼脂糖凝胶电泳,用QIAquick Gel提取试剂盒(QIAGEN)分别纯化所产生的7.8kb和1.1kb的片段后,使用LigaFAST连接试剂盒(Promega)对每一份40μl的洗脱液中的1μl进行连接,转化大肠杆菌DH5α。挑选产生氨苄青霉素抗性株,将观察到正向插入长度为1.1kb的片段的克隆pCXND3CD8NKIRfull用于以后的研究。
[实施例14]CD8-NKIR融合蛋白质表达载体的构建
按以下方法构建由上述实施例12获得的CD8α链的细胞外区域与KIR的细胞质内ITIM基序的融合蛋白质。该构建体可以用作ITIM功能检测的阳性对照。
首先,在以下的反应条件下进行融合PCR。
第1轮PCR A
模板:pCD8full0113
引物:CD03(SEQ ID NO:49)CDKIR12(5’-ATCAGAACATGCAGGTGTCTTCCAGCCCCCTCGTGTGCA-3’)/SEQ ID NO:52)
第1轮PCR B
模板:pBSKIR306
引物:CDKIR11(5’-TGCACACGAGGGGGCTGGACAGACACCTGCATGTTCTGAT-3’)/SEQ ID NO:53)T3+(SEQ ID NO:44)
反应均在以下记载的条件下进行:
94℃下30秒;94℃下15秒,55℃下30秒,72℃下1分钟,进行30个循环;72℃下4分钟。
用GC聚合酶(宝酒造)进行PCR。经琼脂糖凝胶电泳从PCR A分离长度为0.5kb的片段、从PCR B分离长度为0.4kb的片段后,用QIAquick(QIAGEN)纯化。分别使用每份50μl纯化产物中的10μl作为下文所示第2轮PCR的模板。
模板:上述PCR A和PCR B反应产物各10μl
反应在以下记载的条件下进行:
94℃下30秒;94℃下15秒,55℃下30秒,72℃下90秒,进行15个循环。
反应后,在50μl反应液中以终浓度1μM添加下述引物。
引物:CD03<=>T3+
反应条件:94℃下30秒;94℃下15秒,55℃下30秒,72℃下30秒,进行35个循环;72℃下4分钟
经琼脂糖凝胶电泳分离出长度为0.9kb的片段后,用QIAquick(QIAGEN)纯化。克隆到pCR2.1-TOPO(Invitrogen)中,转化大肠杆菌TOP10F’。用QIAprep试剂盒(QIAGEN)从转化株中制备出质粒,将没有PCR误差的克隆的长度为0.9kb的EcoRI-NotI插入片段插入到pCXND3的EcoRI-NotI位点,获得pCXND3CD8KIRfull以用于进一步研究。
[实施例15]NFAT-荧光素酶报告基因稳定表达细胞株的建立
以由实施例9获得的荧光素酶报告质粒pNFATlucZEOF324提供DNA,并且以Jurkat株作为受体细胞,通过电穿孔法进行转导。20μg的DNA供体预先在37℃下用20个单位的Pvu II(TaKaRa)消化1小时,在氯仿/苯酚处理后接着进行乙醇沉淀,然后溶解于20μl的无菌水中。作为受体细胞,用钾-磷酸盐缓冲(K-PBS)液清洗经含有10%FBS的RPMI1640培养基传代的Jurkat细胞后,以107细胞/ml悬浮于K-PBS,制备0.8ml的细胞悬浮液。在电穿孔中使用Gene Pulsar II(Bio-Rad),在0.3KV、950μFD的脉冲条件下进行。实施脉冲后,悬浮于48ml的传代培养基中,在没有选择压的条件下培养过夜后,用终浓度为100μg/ml的零霉素(Invitrogen)给予选择压,获得稳定的转化株候选株。用DNeasy组织试剂盒(QIAGEN)从所得零霉素抗性株中制备基因组DNA。用0.4ml最终洗脱液中的5μl作为模板进行PCR反应。使用Premix ExTaq作为PCR多聚酶,使用Luc01(5’-TTCATACAGAAGGCGTGGAG-3’/SEQ ID NO:45)和Luc02(5’-CGTTCGCGGGCGCAACTGCA-3’/SEQ ID NO:46)作为引物,反应条件是:94℃下变性5分钟后,进行25个94℃下15秒、55℃下30秒、72℃下45秒的循环后,再进行72℃下5分钟的延伸反应。通过琼脂糖凝胶电泳选择产生长度为0.5kb的PCR片段的克隆,经荧光素酶活性检测进行最终筛选。
按以下方法实施荧光素酶检测:将由Juakat细胞株获得的pNFATlucZEOF324的稳定转化株以6.7×104细胞/ml的浓度悬浮于含有100μg/ml的零霉素的传代培养基中后,以75μl/孔接种于涂布抗人CD3的微孔板(Beckton Dickinson)和常规的免疫微孔板中。在37℃下培养20小时后,添加等量(75μl)的Dual-Glo荧光素酶缓冲液(Promega),静置10分钟后,用光度计MicroLumat LB96P(EG&G Berthold)对各孔的化学发光进行测定,每孔测定5秒。
选择只在涂布抗人CD3的微孔板培养下显示化学发光的菌株F11株作为稳定转化株。
[实施例16]双重转化株的制备
由上述实施例15获得的F11株作为受体细胞,转导上述实施例13中获得的CD-NKIR融合的pCXND3CD8NKIRfull和实施例14获得的CD-KIR融合的pCXND3CD8KIRfull获得双重转化株。
pCXND3CD8NKIRfull和pCXND3CD8KIRfull各20μg,在37℃下用20个单位的Pvu I(宝酒酿)消化2小时,用等量苯酚/氯仿(50%(v/v);Nacalai Tesque)纯化,用1/10量的3M醋酸钠(Nacalai Tesque)和2倍量的乙醇沉淀后,将风干的试样溶解于20μl的无菌水中进行使用。作为电穿孔及其后建立时的方法,除了使用含有100μg/ml的零霉素和10%(v/v)非活化胎儿牛血清和1%(v/v)青霉素和链霉素溶液的RPIM1640培养基,以700μg/ml遗传霉素实施作为选择药剂之外,其余以与实施例9相同的条件实施。通过使用抗CD8-FITC抗体(Bectondickinson)对所得单个克隆来源的抗药性克隆进行FACS分析,为每一个选择出6-8个表达克隆。
对这些转化株,通过实施例15中记载的报告基因活性测定,最终选择出3个带有报告基因活性的CD8嵌合克隆(NKIR#16 NKIR#19为pCXND3CD8NKIRfull的转化株,KIR#24为pCXND3CD8KIRfull的转化株)。这3个克隆的CD8嵌合结构示于图11-1中。图11-2表示的是采用实施例17中使用的抗CD8抗体,LT8(Serotec)和结合了FITC的山羊抗小鼠IgG抗体(Coulter)对这些克隆的分析结果。3株CD8嵌合克隆都观察到了LT8特异染色。
[实施例17]NKIR来源的ITIM活性测定
用由实施例16获得的双重转化株NKIR#16,NKIR#19和KIR#24及其宿主F11株实施荧光素酶报告基因检测,进行NKIR来源的ITIM活性测定。
使宿主F11株在传代培养基(含有100μg/ml的零霉素和10%(v/v)非活化胎儿牛血清和1%(v/v)青霉素和链霉素溶液的RPIM1640培养基)中生长。使CD8嵌合克隆在含有浓度为700μg/ml遗传霉素的上述培养基中生长。以5.33×105细胞/ml悬浮于各个的增殖培养基后,以每孔37.5μl分别加注在平底96-孔板上,37℃下培养16小时。每孔添加12.5μl(终浓度为1.5μg/ml)经各个增殖培养基稀释为6μg/ml的抗CD8抗体(LT8,Serotec,MCA1226XZ)作为第一抗体。在对照组中添加不含抗体的各种增殖培养基。37℃下培养1小时后,每孔添加12.5μl(终浓度为1.2μg/ml)经各个增殖培养基稀释为6μg/ml的家兔抗小鼠IgG1抗体(H143.225.8,Southern Biotech,1145-01)作为交联剂。在对照组中添加不含抗体的各种增殖培养基。37℃下培养1小时后,每孔添加12.5μl(终浓度为40μg/ml)经各个增殖培养基稀释为240μg/ml的ConA(SIGMA)。37℃下培养8小时和10后,加入等量(75μl)的荧光素酶试剂(promega),室温下静置10分钟后,用实施例15记载的方法测定发光。
报告基因检测的结果示于图12中。所有检测都以一式三分的方式实施,柱状图表示平均值,SD值记载为误差棒。在ConA刺激后8小时和10小时的比较中,10小时的结果显示出更高的效果,但是二者显示出基本相同的倾向,因此下面更为详细地记载10小时后的结果。就宿主F11而言,无论存在或不存在LT8抗体或交联剂都显示出大致一定的活性值。与之相对,就阳性对照克隆CD8-KIRfull转导CD8嵌合克隆KIR#24的活性而言,观察到在LT8存在下活性减弱,这种活性减弱显示出所假设的不受交联剂影响的模式。另一方面,两个CD8-NKIRfull转导CD8嵌合克隆均观察到在LT8存在下活性减弱,这种活性减弱不受交联剂影响。此外,减弱的程度,就CD8-KIR转染株#24而言为16.6%,CD8-NKIR转染株#16、#19分别为21.1%、30.2%,据此提示含有NKIR分子的细胞质内的ITIM基序的序列与已知的KIR2DL3分子的细胞质内的ITIM具有相同程度或比其程度更高的ITIM活性。
工业上利用的可能性
根据本发明,提供了在NK细胞中表达的新型蛋白质,编码该蛋白质的DNA,含有该DNA的载体,含有该载体的宿主细胞,以及该蛋白质的制备方法。进而,还提供了鉴定与该蛋白质结合的或调节其活性的化合物的方法。预计本发明的蛋白质或DNA,或者与本发明的蛋白质结合的或调节其活性的化合物可应用于与本发明的蛋白质相关的疾病的新的预防药物和治疗药物的开发中。
                           序列表
<110>CHUGAI SEIYAKU KABUSHIKI KAISHA
<120>在NK细胞中表达的蛋白质
<130>C1-A0308P
<150>JP 2003-338331
<151>2003-09-29
<160>53
<170>PatentIn version 3.1
<210>1
<211>1473
<212>DNA
<213>智人(Homo sapiens)
<220>
<221>CDS
<222>(87)..(1376)
<223>
<400>1
acacacccac aggacctgca gctgaacgaa gttgaagaca actcaggaga tctgttggaa    60
agagaacgat agaggaaaat atatga atg ttg cca tct tta gtt ccc tgt gtt    113
                             Met Leu Pro Ser Leu Val Pro Cys Val
                             1               5
ggg aaa act gtc tgg ctg tac ctc caa gcc tgg cca aac cct gtg ttt     161
Gly Lys Thr Val Trp Leu Tyr Leu Gln Ala Trp Pro Asn Pro Val Phe
10                  15                  20                  25
gaa gga gat gcc ctg act ctg cga tgt cag gga tgg aag aat aca cea     209
Glu Gly Asp Ala Leu Thr Leu Arg Cys Gln Gly Trp Lys Asn Thr Pro
                30                  35                  40
ctg tct cag gtg aag ttc tac aga gat gga aaa ttc ctt cat ttc tct     257
Leu Ser Gln Val Lys Phe Tyr Arg Asp Gly Lys Phe Leu His Phe Ser
            45                  50                  55
aag gaa aac cag act ctg tcc atg gga gca gca aca gtg cag agc cgt     305
Lys Glu Asn Gln Thr Leu Ser Met Gly Ala Ala Thr Val Gln Ser Arg
        60                  65                  70
ggc cag tac agc tgc tct ggg cag gtg atg tat att cca cag aca ttc     353
Gly Gln Tyr Ser Cys Ser Gly Gln Val Met Tyr Ile Pro Gln Thr Phe
    75                  80                  85
aca caa act tca gag act gcc atg gtt caa gtc caa gag ctg ttt cca     401
Thr Gln Thr Ser Glu Thr Ala Met Val Gln Val Gln Glu Leu Phe Pro
90                  95                  100                 105
cct cct gtg ctg agt gcc atc ccc tct cct gag ccc cga gag ggt agc     449
Pro Pro Val Leu Ser Ala Ile Pro Ser Pro Glu Pro Arg Glu Gly Ser
                110                 115                 120
ctg gtg acc ctg aga tgt cag aca aag ctg cac ccc ctg agg tca gcc     497
Leu Val Thr Leu Arg Cys Gln Thr Lys Leu His Pro Leu Arg Ser Ala
            125                 130                 135
ttg agg ctc ctt ttc tcc ttc cac aag gac ggc cac acc ttg cag gac     545
Leu Arg Leu Leu Phe Ser Phe His Lys Asp Gly His Thr Leu Gln Asp
        140                 145                 150
agg ggc cct cac cca gaa ctc tgc atc ccg gga gcc aag gag gga gac     593
Arg Gly Pro His Pro Glu Leu Cys Ile Pro Gly Ala Lys Glu Gly Asp
    155                 160                 165
tct ggg ctt tac tgg tgt gag gtg gcc cct gag ggt ggc cag gtc cag     641
Ser Gly Leu Tyr Trp Cys Glu Val Ala Pro Glu Gly Gly Gln Val Gln
170                 175                 180                 185
aag cag agc ccc cag ctg gag gtc aga gtg cag gct cct gta tcc cgt     689
Lys Gln Ser Pro Gln Leu Glu Val Arg Val Gln Ala Pro Val Ser Arg
                190                 195                 200
cct gtg ctc act ctg cac cac ggg cct gct gac cct gct gtg ggg gac     737
Pro Val Leu Thr Leu His His Gly Pro Ala Asp Pro Ala Val Gly Asp
            205                 210                 215
atg gtg cag ctc ctc tgt gag gca cag agg ggc tcc cct ccg atc ctg     785
Met Val Gln Leu Leu Cys Glu Ala Gln Arg Gly Ser Pro Pro Ile Leu
        220                 225                 230
tat tcc ttc tac ctt gat gag aag att gtg ggg aac cac tca gct ccc     833
Tyr Ser Phe Tyr Leu Asp Glu Lys Ile Val Gly Asn His Ser Ala Pro
    235                 240                 245
tgt ggt gga acc acc tcc ctc ctc ttc cca gtg aag tca gaa cag gat     881
Cys Gly Gly Thr Thr Ser Leu Leu Phe Pro Val Lys Ser Glu Gln Asp
250                 255                 260                 265
gct ggg aac tac tcc tgc gag gct gag aac agt gtc tcc aga gag agg     929
Ala Gly Asn Tyr Ser Cys Glu Ala Glu Asn Ser Val Ser Arg Glu Arg
                270                 275                 280
agt gag ccc aag aag ctg tct ctg aag ggt tct caa gtc ttg ttc act     977
Ser Glu Pro Lys Lys Leu Ser Leu Lys Gly Ser Gln Val Leu Phe Thr
            285                 290                 295
ccc gcc agc aac tgg ctg gtt cct tgg ctt cct gcg agc ctg ctt ggc    1025
Pro Ala Ser Asn Trp Leu Val Pro Trp Leu Pro Ala Ser Leu Leu Gly
        300                 305                 310
ctg atg gtt att gct gct gca ctt ctg gtt tat gtg aga tcc tgg aga    1073
Leu Met Val Ile Ala Ala Ala Leu Leu Val Tyr Val Arg Ser Trp Arg
    315                 320                 325
aaa gct ggg ccc ctt cca tcc eag ata cca ccc aca gct cca ggt gga    1121
Lys Ala Gly Pro Leu Pro Ser Gln Ile Pro Pro Thr Ala Pro Gly Gly
330                 335                 340                 345
gag cag tgc cca cta tat gcc aac gtg cat cac cag aaa ggg aaa gat    1169
Glu Gln Cys Pro Leu Tyr Ala Asn Val His His Gln Lys Gly Lys Asp
                350                 355                 360
gaa ggt gtt gtc tac tct gtg gtg cat aga acc tca aag agg agt gaa    1217
Glu Gly Val Val Tyr Ser Val Val His Arg Thr Ser Lys Arg Ser Glu
            365                 370                 375
gcc agg tct gct gag ttc acc gtg ggg aga aag gac agt tct atc atc    1265
Ala Arg Ser Ala Glu Phe Thr Val Gly Arg Lys Asp Ser Ser Ile Ile
        380                 385                 390
tgt gcg gag gtg aga tgc ctg cag ccc agt gag gtt tca tcc acg gag    1313
Cys Ala Glu Val Arg Cys Leu Gln Pro Ser Glu Val Ser Ser Thr Glu
    395                 400                 405
gtg aat atg aga agc agg act ctc caa gaa ccc ctt agc gac tgt gag    1361
Val Asn Met Arg Ser Arg Thr Leu Gln Glu Pro Leu Ser Asp Cys Glu
410                 415                 420                 425
gag gtt ctc tgc tag tgatggtgtt ctcctatcaa cacacgccca cccccagtct    1416
Glu Val Leu Cys
ccagtgctcc tcaggaagac agtggggtcc tcaactcttt ctgtgggtcc ttcagtg     1473
<210>2
<211>429
<212>PRT
<213>智人(Homo sapiens)
<400>2
Met Leu Pro Ser Leu Val Pro Cys Val Gly Lys Thr Val Trp Leu Tyr
1               5                   10                  15
Leu Gln Ala Trp Pro Asn Pro Val Phe Glu Gly Asp Ala Leu Thr Leu
            20                  25                  30
Arg Cys Gln Gly Trp Lys Asn Thr Pro Leu Ser Gln Val Lys Phe Tyr
        35                  40                  45
Arg Asp Gly Lys Phe Leu His Phe Ser Lys Glu Asn Gln Thr Leu Ser
    50                  55                  60
Met Gly Ala Ala Thr Val Gln Ser Arg Gly Gln Tyr Ser Cys Ser Gly
65                  70                  75                  80
Gln Val Met Tyr Ile Pro Gln Thr Phe Thr Gln Thr Ser Glu Thr Ala
                85                  90                  95
Met Val Gln Val Gln Glu Leu Phe Pro Pro Pro Val Leu Ser Ala Ile
            100                 105                 110
Pro Ser Pro Glu Pro Arg Glu Gly Ser Leu Val Thr Leu Arg Cys Gln
        115                 120                 125
Thr Lys Leu His Pro Leu Arg Ser Ala Leu Arg Leu Leu Phe Ser Phe
    130                 135                 140
His Lys Asp Gly His Thr Leu Gln Asp Arg Gly Pro His Pro Glu Leu
145                 150                 155                 160
Cys Ile Pro Gly Ala Lys Glu Gly Asp Ser Gly Leu Tyr Trp Cys Glu
                165                 170                 175
Val Ala Pro Glu Gly Gly Gln Val Gln Lys Gln Ser Pro Gln Leu Glu
            180                 185                 190
Val Arg Val Gln Ala Pro Val Ser Arg Pro Val Leu Thr Leu His His
        195                 200                 205
Gly Pro Ala Asp Pro Ala Val Gly Asp Met Val Gln Leu Leu Cys Glu
    210                 215                 220
Ala Gln Arg Gly Ser Pro Pro Ile Leu Tyr Ser Phe Tyr Leu Asp Glu
225                 230                 235                 240
Lys Ile Val Gly Asn His Ser Ala Pro Cys Gly Gly Thr Thr Ser Leu
                245                 250                 255
Leu Phe Pro Val Lys Ser Glu Gln Asp Ala Gly Asn Tyr Ser Cys Glu
            260                 265                 270
Ala Glu Asn Ser Val Ser Arg Glu Arg Ser Glu Pro Lys Lys Leu Ser
        275                 280                 285
Leu Lys Gly Ser Gln Val Leu Phe Thr Pro Ala Ser Asn Trp Leu Val
    290                 295                 300
Pro Trp Leu Pro Ala Ser Leu Leu Gly Leu Met Val Ile Ala Ala Ala
305                 310                 315                 320
Leu Leu Val Tyr Val Arg Ser Trp Arg Lys Ala Gly Pro Leu Pro Ser
                325                 330                 335
Gln Ile Pro Pro Thr Ala Pro Gly Gly Glu Gln Cys Pro Leu Tyr Ala
            340                 345                 350
Asn Val His His Gln Lys Gly Lys Asp Glu Gly Val Val Tyr Ser Val
        355                 360                 365
Val His Arg Thr Ser Lys Arg Ser Glu Ala Arg Ser Ala Glu Phe Thr
    370                 375                 380
Val Gly Arg Lys Asp Ser Ser Ile Ile Cys Ala Glu Val Arg Cys Leu
385                 390                 395                 400
Gln Pro Ser Glu Val Ser Ser Thr Glu Val Asn Met Arg Ser Arg Thr
                405                 410                 415
Leu Gln Glu Pro Leu Ser Asp Cys Glu Glu Val Leu Cys
            420                 425
<210>3
<211>2005
<212>DNA
<213>智人(Homo sapiens)
<220>
<221>CDS
<222>(88)..(1410)
<223>
<400>3
cacacaccca caggacctgc agctgaacga agttgaagac aactcaggag atctgttgga    60
aagagaacga tagaggaaaa tatatga atg ttg cca tct tta ggc ccc atg ctg   114
                              Met Leu Pro Ser Leu Gly Pro Met Leu
                              1               5
ctc tgg acg gct gtg ctg ctc ttt gtt ccc tgt gtt ggg aaa act gtc     162
Leu Trp Thr Ala Val Leu Leu Phe Val Pro Cys Val Gly Lys Thr Val
10                  15                  20                  25
tgg ctg tac ctc caa gcc tgg cca aac cct gtg ttt gaa gga gat gee     210
Trp Leu Tyr Leu Gln Ala Trp Pro Asn Pro Val Phe Glu Gly Asp Ala
                30                  35                  40
ctg act ctg cga tgt cag gga tgg aag aat aca cca ctg tct cag gtg     258
Leu Thr Leu Arg Cys Gln Gly Trp Lys Asn Thr Pro Leu Ser Gln Val
            45                  50                  55
aag ttc tac aga gat gga aaa ttc ctt cat ttc tct aag gaa aac cag     306
Lys Phe Tyr Arg Asp Gly Lys Phe Leu His Phe Ser Lys Glu Asn Gln
        60                  65                  70
act ctg tcc atg gga gca gca aca gtg cag agc cgt ggc cag tac agc     354
Thr Leu Ser Met Gly Ala Ala Thr Val Gln Ser Arg Gly Gln Tyr Ser
    75                  80                  85
tgc tct ggg cag gtg atg tat att cca cag aca ttc aca caa act tca     402
Cys Ser Gly Gln Val Met Tyr Ile Pro Gln Thr Phe Thr Gln Thr Ser
90                  95                  100                 105
gag act gcc atg gtt caa gtc caa gag ctg ttt cca cct cct gtg ctg     450
Glu Thr Ala Met Val Gln Val Gln Glu Leu Phe Pro Pro Pro Val Leu
                110                 115                 120
agt gcc atc ccc tct ect gag ccc cga gag ggt agc ctg gtg acc ctg     498
Ser Ala Ile Pro Ser Pro Glu Pro Arg Glu Gly Ser Leu Val Thr Leu
            125                 130                 135
aga tgt cag aca aag ctg cac ccc ctg agg tca gcc ttg agg ctc ctt     546
Arg Cys Gln Thr Lys Leu His Pro Leu Arg Ser Ala Leu Arg Leu Leu
        140                 145                 150
ttc tcc ttc cac aag gac ggc cac acc ttg cag gac agg ggc cct cac     594
Phe Ser Phe His Lys Asp Gly His Thr Leu Gln Asp Arg Gly Pro His
    155                 160                 165
cca gaa ctc tgc atc ccg gga gcc aag gag gga gac tct ggg ctt tac     642
Pro Glu Leu Cys Ile Pro Gly Ala Lys Glu Gly Asp Ser Gly Leu Tyr
170                 175                 180                 185
tgg tgt gag gtg gcc cct gag ggt ggc cag gtc cag aag cag agc ccc     690
Trp Cys Glu Val Ala Pro Glu Gly Gly Gln Val Gln Lys Gln Ser Pro
                190                 195                 200
cag ctg gag gtc aga gtg cag gct cct gta tcc cgt cct gtg ctc act     738
Gln Leu Glu Val Arg Val Gln Ala Pro Val Ser Arg Pro Val Leu Thr
            205                 210                 215
ctg cac cac ggg cct gct gac ccc gct gtg ggg gac atg gtg cag ctc     786
Leu His His Gly Pro Ala Asp Pro Ala Val Gly Asp Met Val Gln Leu
        220                 225                 230
ctc tgt gag gca cag agg ggc tcc cct ccg atc ctg tat tcc ttc tac     834
Leu Cys Glu Ala Gln Arg Gly Ser Pro Pro Ile Leu Tyr Ser Phe Tyr
    235                 240                 245
ctt gat gag aag att gtg ggg aac cac tca gct ccc tgt ggt gga acc     882
Leu Asp Glu Lys Ile Val Gly Asn His Ser Ala Pro Cys Gly Gly Thr
250                 255                 260                 265
acc tcc ctc ctc ttc cca gtg aag tca gaa cag gat gct ggg aac tac     930
Thr Ser Leu Leu Phe Pro Val Lys Ser Glu Gln Asp Ala Gly Asn Tyr
                270                 275                 280
tcc tgc gag gct gag aac agt gtc tcc aga gag agg agt gag ccc aag     978
Ser Cys Glu Ala Glu Asn Ser Val Ser Arg Glu Arg Ser Glu Pro Lys
            285                 290                 295
aag ctg tct ctg aag ggt tct caa gtc ttg ttc act ccc gcc agc aac    1026
Lys Leu Ser Leu Lys Gly Ser Gln Val Leu Phe Thr Pro Ala Ser Asn
        300                 305                 310
tgg ctg gtt cct tgg ctt cct gcg agc ctg ctt ggc ctg atg gtt att    1074
Trp Leu Val Pro Trp Leu Pro Ala Ser Leu Leu Gly Leu Met Val Ile
    315                 320                 325
gct gct gca ctt ctg gtt tat gtg aga tcc tgg aga aaa gct ggg ccc    1122
Ala Ala Ala Leu Leu Val Tyr Val Arg Ser Trp Arg Lys Ala Gly Pro
330                 335                 340                 345
ctt cca tcc cag ata cca ccc aca gct cca ggt gga gag cag tgc cca    1170
Leu Pro Ser Gln Ile Pro Pro Thr Ala Pro Gly Gly Glu Gln Cys Pro
                350                 355                 360
cta tat gcc aac gtg cat cac cag aaa ggg aaa gat gaa ggt gtt gtc    1218
Leu Tyr Ala Asn Val His His Gln Lys Gly Lys Asp Glu Gly Val Val
            365                 370                 375
tac tct gtg gtg cat aga acc tca aag agg agt gaa gcc agg tct gct    1266
Tyr Ser Val Val His Arg Thr Ser Lys Arg Ser Glu Ala Arg Ser Ala
        380                 385                 390
gag ttc acc gtg ggg aga aag gac agt tct atc atc tgt gcg gag gtg    1314
Glu Phe Thr Val Gly Arg Lys Asp Ser Ser Ile Ile Cys Ala Glu Val
    395                 400                 405
aga tgc ctg cag ccc agt gag gtt tca tcc acg gag gtg aat atg aga    1362
Arg Cys Leu Gln Pro Ser Glu Val Ser Ser Thr Glu Val Asn Met Arg
410                 415                 420                 425
agc agg act ctc caa gaa ccc ctt agc gac tgt gag gag gtt ctc tgc    1410
Ser Arg Thr Leu Gln Glu Pro Leu Ser Asp Cys Glu Glu Val Leu Cys
                430                 435                 440
tagtgatggt gttctcctat caacacacgc ccacccccag tctccagtgc tcctcaggaa  1470
gacagtgggg tcctcaactc tttctgtggg tccttcagtg tcccaagccc agcatcacag  1530
agccccctga gcccttgtcc tggtcaggag cacctgaacc ctgggttctt ttcttagcag  1590
aagaccaacc aatggaatgg gaagggagat gctcccacca acacacacac ttaggttcaa  1650
tcagtgacac tggacacata agccacagat gtcttctttc catacaagca tgttagttcg  1710
ccccaatata catatatata tgaaatagtc atgtgccgca taacaacatt tcagtcagtg  1770
atagactgca tacacaacag tggtcccata agactgtaat ggagtttaaa aattcctact  1830
gcctagtgat atcatagttg ccttaacatc ataacacaac acatttctca cgcgtttgtg  1890
gtgatgctgg tacaaacaag ctacagcgcc gctagtcata tacaaatata gcacatacaa  1950
ttatgtacag tacactatac ttgataatga taataaacaa ctatgttact ggttt       2005
<210>4
<211>441
<212>PRT
<213>智人(Homo sapiens)
<400>4
Met Leu Pro Ser Leu Gly Pro Met Leu Leu Trp Thr Ala Val Leu Leu
1               5                   10                  15
Phe Val Pro Cys Val Gly Lys Thr Val Trp Leu Tyr Leu Gln Ala Trp
            20                  25                  30
Pro Asn Pro Val Phe Glu Gly Asp Ala Leu Thr Leu Arg Cys Gln Gly
        35                  40                  45
Trp Lys Asn Thr Pro Leu Ser Gln Val Lys Phe Tyr Arg Asp Gly Lys
    50                  55                  60
Phe Leu His Phe Ser Lys Glu Asn Gln Thr Leu Ser Met Gly Ala Ala
65                  70                  75                  80
Thr Val Gln Ser Arg Gly Gln Tyr Ser Cys Ser Gly Gln Val Met Tyr
                85                  90                  95
Ile Pro Gln Thr Phe Thr Gln Thr Ser Glu Thr Ala Met Val Gln Val
            100                 105                 110
Gln Glu Leu Phe Pro Pro Pro Val Leu Ser Ala Ile Pro Ser Pro Glu
        115                 120                 125
Pro Arg Glu Gly Ser Leu Val Thr Leu Arg Cys Gln Thr Lys Leu His
    130                 135                 140
Pro Leu Arg Ser Ala Leu Arg Leu Leu Phe Ser Phe His Lys Asp Gly
145                 150                 155                 160
His Thr Leu Gln Asp Arg Gly Pro His Pro Glu Leu Cys Ile Pro Gly
                165                 170                 175
Ala Lys Glu Gly Asp Ser Gly Leu Tyr Trp Cys Glu Val Ala Pro Glu
            180                 185                 190
Gly Gly Gln Val Gln Lys Gln Ser Pro Gln Leu Glu Val Arg Val Gln
        195                 200                 205
Ala Pro Val Ser Arg Pro Val Leu Thr Leu His His Gly Pro Ala Asp
    210                 215                 220
Pro Ala Val Gly Asp Met Val Gln Leu Leu Cys Glu Ala Gln Arg Gly
225                 230                 235                 240
Ser Pro Pro Ile Leu Tyr Ser Phe Tyr Leu Asp Glu Lys Ile Val Gly
                245                 250                 255
Asn His Ser Ala Pro Cys Gly Gly Thr Thr Ser Leu Leu Phe Pro Val
            260                 265                 270
Lys Ser Glu Gln Asp Ala Gly Asn Tyr Ser Cys Glu Ala Glu Asn Ser
        275                 280                 285
Val Ser Arg Glu Arg Ser Glu Pro Lys Lys Leu Ser Leu Lys Gly Ser
    290                 295                 300
Gln Val Leu Phe Thr Pro Ala Ser Asn Trp Leu Val Pro Trp Leu Pro
305                 310                 315                 320
Ala Ser Leu Leu Gly Leu Met Val Ile Ala Ala Ala Leu Leu Val Tyr
                325                 330                 335
Val Arg Ser Trp Arg Lys Ala Gly Pro Leu Pro Ser Gln Ile Pro Pro
            340                 345                 350
Thr Ala Pro Gly Gly Glu Gln Cys Pro Leu Tyr Ala Asn Val His His
        355                 360                 365
Gln Lys Gly Lys Asp Glu Gly Val Val Tyr Ser Val Val His Arg Thr
    370                 375                 380
Ser Lys Arg Ser Glu Ala Arg Ser Ala Glu Phe Thr Val Gly Arg Lys
385                 390                 395                 400
Asp Ser Ser Ile IIe Cys Ala Glu Val Arg Cys Leu Gln Pro Ser Glu
                405                 410                 415
Val Ser Set Thr Glu Val Asn Met Arg Ser Arg Thr Leu Gln Glu Pro
            420                 425                 430
Leu Ser Asp Cys Glu Glu Val Leu Cys
        435                 440
<210>5
<211>1543
<212>DNA
<213>小家鼠(Mus musculus)
<220>
<221>CDS
<222>(115)..(921)
<223>
<400>5
cacctcttaa gtcagaaggg ccaccactca cctccagctc agaactacca gtctctctct     60
ccccagcttc agctctgcct gctgtttggc ctgctctgcc tcaagaaagg cacc atg      117
                                                            Met
                                                            1
ctg ctc tgg atg gtt ctc ctg ctc tgt gat tcc atg gtt gaa gct caa      165
Leu Leu Trp Met Val Leu Leu Leu Cys Asp Ser Met Val Glu Ala Gln
            5                   10                  15
gag ttg ttc cca aat cct gag ctg aca gaa ttc acc aat tca gag acg      213
Glu Leu Phe Pro Asn Pro Glu Leu Thr Glu Phe Thr Asn Ser Glu Thr
        20                  25                  30
atg gat gtc atc ctg aag tgt acc ata aag gtg gac ccc aag aat cca      261
Met Asp Val Ile Leu Lys Cys Thr Ile Lys Val Asp Pro Lys Asn Pro
    35                  40                  45
act tta cag ctc ttt tac act ttc tac aag gac aac cat gtc att caa      309
Thr Leu Gln Leu Phe Tyr Thr Phe Tyr Lys Asp Asn His Val Ile Gln
50                  55                  60                  65
gac agg agt ccc cac tca gta ttt tct gca gaa gcc aag gag gaa aac      357
Asp Arg Ser Pro His Ser Val Phe Ser Ala Glu Ala Lys Glu Glu Asn
                70                  75                  80
tct ggg ctc tac cag tgt atg gtg gac act gag gat ggc tta att cag      405
Ser Gly Leu Tyr Gln Cys Met Val Asp Thr Glu Asp Gly Leu Ile Gln
            85                  90                  95
aaa aaa agt ggc tat ctg gat atc cag ttc tgg act cct gta tcc cat      453
Lys Lys Ser Gly Tyr Leu Asp Ile Gln Phe Trp Thr Pro Val Ser His
        100                 105                 110
cct gtg ctc act ctg caa cat gaa gcc act aac ctt gct gta gga gac      501
Pro Val Leu Thr Leu Gln His Glu Ala Thr Asn Leu Ala Val Gly Asp
    115                 120                 125
aag gtg gag ttc ctc tgt gag gcc cac cag ggc tcc ctt cca atc ttt      549
Lys Val Glu Phe Leu Cys Glu Ala His Gln Gly Ser Leu Pro Ile Phe
130                 135                 140                 145
tac tca ttc tac att aat gga gaa atc cta ggg aaa ccc ctg gct ccc      597
Tyr Ser Phe Tyr Ile Asn Gly Glu Ile Leu Gly Lys Pro Leu Ala Pro
                150                 155                 160
tct ggc aga gct gcc tcc ctc cta gcc tca gta aag gca gag tgg agt     645
Ser Gly Arg Ala Ala Ser Leu Leu Ala Ser Val Lys Ala Glu Trp Ser
            165                 170                 175
acc aag aac tat tcc tgt gaa gct aaa aac aac atc tcc aga gaa ata     693
Thr Lys Asn Tyr Ser Cys Glu Ala Lys Asn Asn Ile Ser Arg Glu Ile
        180                 185                 190
agt gag ctc aag aag ttc ccc ttg gtt gtc tca ggt act gcc tgg atc     741
Ser Glu Leu Lys Lys Phe Pro Leu Val Val Ser Gly Thr Ala Trp Ile
    195                 200                 205
aag agc aac atg cta act atc tgg cta cct gca agc ctg ctt gga ggg     789
Lys Ser Asn Met Leu Thr Ile Trp Leu Pro Ala Ser Leu Leu Gly Gly
210                 215                 220                 225
atg gtc att gcg gct gtg gtt cta atg tat ttc ttc aaa ccc tgt aaa     837
Met Val Ile Ala Ala Val Val Leu Met Tyr Phe Phe Lys Pro Cys Lys
                230                 235                 240
aag cat gcc aga cct gag atg ccc acc cta aaa gag cca gac agt ttt      885
Lys His Ala Arg Pro Glu Met Pro Thr Leu Lys Glu Pro Asp Ser Phe
            245                 250                 255
cta tat gta tcg gtt gat aat cga aga tat aaa tga gattcccacc           931
Leu Tyr Val Ser Val Asp Asn Arg Arg Tyr Lys
        260                 265
aatgatttgg attcaaaaac caggacctgc caagatcccc ttggtcttta ggatcatgct    991
ctgtgttagt gcaatgtctt cctccagcat atactcaact ccagctccca gcctccaccc   1051
tccagcactc agcagtggct ccaagttctc cctgcaggtc acccagttcc tagcccagca   1111
gtgaggaagc ccatatgctc tattcctggc cagggctcct gaactgtggg ttctcttctg   1171
agcgggaaac caaacaatgg tgtgggaatg aacaatttcc accttgatac atacatatac   1231
acatgcacac acacaaacaa acacacatac acacacactt ccagatgtaa cattgtacac   1291
agagccacag ttatcttctt taagtacaaa aggaaaaggg ttttcacctc cagatagaca   1351
gataatagat acacagacac acaagacaga tagatgatag ataacatata gattagatag   1411
ataatagata gatggtagat aggtagatgg atgatagata gatagataga ttggatagat   1471
agatagatag atagatagat agatagatag ataataacat gacagataag atgatagaaa   1531
taagatacga ta                                                       1543
<210>6
<211>268
<212>PRT
<213>小家鼠(Mus musculus)
<400>6
Met Leu Leu Trp Met Val Leu Leu Leu Cys Asp Ser Met Val Glu Ala
1               5                   10                  15
Gln Glu Leu Phe Pro Asn Pro Glu Leu Thr Glu Phe Thr Asn Ser Glu
            20                  25                  30
Thr Met Asp Val Ile Leu Lys Cys Thr Ile Lys Val Asp Pro Lys Asn
        35                  40                  45
Pro Thr Leu Gln Leu Phe Tyr Thr Phe Tyr Lys Asp Asn His Val Ile
    50                  55                  60
Gln Asp Arg Ser Pro His Ser Val Phe Ser Ala Glu Ala Lys Glu Glu
65                  70                  75                  80
Asn Ser Gly Leu Tyr Gln Cys Met Val Asp Thr Glu Asp Gly Leu Ile
                85                  90                  95
Gln Lys Lys Ser Gly Tyr Leu Asp Ile Gln Phe Trp Thr Pro Val Ser
            100                 105                 110
His Pro Val Leu Thr Leu Gln His Glu Ala Thr Asn Leu Ala Val Gly
        115                 120                 125
Asp Lys Val Glu Phe Leu Cys Glu Ala His Gln Gly Ser Leu Pro Ile
    130                 135                 140
Phe Tyr Ser Phe Tyr Ile Asn Gly Glu Ile Leu Gly Lys Pro Leu Ala
145                 150                 155                 160
Pro Ser Gly Arg Ala Ala Ser Leu Leu Ala Ser Val Lys Ala Glu Trp
                165                 170                 175
Ser Thr Lys Asn Tyr Ser Cys Glu Ala Lys Asn Asn Ile Set Arg Glu
            180                 185                 190
Ile Ser Glu Leu Lys Lys Phe Pro Leu Val Val Ser Gly Thr Ala Trp
        195                 200                 205
Ile Lys Ser Asn Met Leu Thr Ile Trp Leu Pro Ala Ser Leu Leu Gly
    210                 215                 220
Gly Met Val Ile Ala Ala Val Val Leu Met Tyr Phe Phe Lys Pro Cys
225                 230                 235                 240
Lys Lys His Ala Arg Pro Glu Met Pro Thr Leu Lys Glu Pro Asp Ser
                245                 250                 255
Phe Leu Tyr Val Ser Val Asp Asn Arg Arg Tyr Lys
            260                 265
<210>7
<211>34
<212>DNA
<213>人工的
<220>
<223>人工合成的引物序列
<400>7
ttgaattcac acacccacag gacctgcagc tgaa                                 34
<210>8
<211>34
<212>DNA
<213>人工的
<220>
<223>人工合成的引物序列
<400>8
ttggatccac tgaaggaccc acagaaagag ttga                                 34
<210>9
<211>21
<212>DNA
<213>人工的
<220>
<223>人工合成的引物序列
<400>9
accctgagat gtcagacaaa g                                               21
<210>10
<211>20
<212>DNA
<213>人工的
<220>
<223>人工合成的引物序列
<400>10
gccacctcac accagtaaag                                                 20
<210>11
<211>21
<212>DNA
<213>人工的
<220>
<223>人工合成的引物序列
<400>11
cctccgatcc tgtattcctt c                                               21
<210>12
<211>21
<212>DNA
<213>人工的
<220>
<223>人工合成的引物序列
<400>12
tggagctgtg ggtggtatct g                                               21
<210>13
<211>21
<212>DNA
<213>人工的
<220>
<223>人工合成的引物序列
<400>13
agaacctcaa agaggagtga a                                               21
<210>14
<211>20
<212>DNA
<213>人工的
<220>
<223>人工合成的引物序列
<400>14
attatgctga gtgatatccc                                                 20
<210>15
<211>20
<212>DNA
<213>人工的
<220>
<223>人工合成的引物序列
<400>15
atttaggtga cactatagaa                                                 20
<210>16
<211>28
<212>DNA
<213>人工的
<220>
<223>人工合成的引物序列
<400>16
gggaattcat gttgccatct ttagttcc                                        28
<210>17
<211>26
<212>DNA
<213>人工的
<220>
<223>人工合成的引物序列
<400>17
aaggatccac tcctctctct ggagac                                          26
<210>18
<211>20
<212>DNA
<213>人工的
<220>
<223>人工合成的引物序列
<400>18
gcctcagaca gtggttcaaa                                                 20
<210>19
<211>20
<212>DNA
<213>人工的
<220>
<223>人工合成的引物序列
<400>19
agaaccatca cagtctcgca                                                 20
<210>20
<211>29
<212>DNA
<213>人工的
<220>
<223>人工合成的引物序列
<400>20
aagaattcca ccatggctgg acctgccac                                       29
<210>21
<211>41
<212>DNA
<213>人工的
<220>
<223>人工合成的引物序列
<400>21
acagggtttg gccaggcttg ggcttcctgc actgtccaga g                         41
<210>22
<211>30
<212>DNA
<213>人工的
<220>
<223>人工合成的引物序列
<400>22
gcaggaagcc caagcctggc caaaccctgt                                      30
<210>23
<211>45
<212>DNA
<213>人工的
<220>
<223>人工合成的引物序列
<400>23
ctaatacgac tcactatagg gcaagcagtg gtatcaacgc agagt                     45
<210>24
<211>22
<212>DNA
<213>人工的
<220>
<223>人工合成的引物序列
<400>24
ctaatacgac tcactatagg gc                                              22
<210>25
<211>23
<212>DNA
<213>人工的
<220>
<223>人工合成的引物序列
<400>25
aagcagtggt atcaacgcag agt                                             23
<210>26
<211>33
<212>DNA
<213>人工的
<220>
<223>人工合成的引物序列
<400>26
ctcggatcct tgccatcttt agttccctgt gtt                                  33
<210>27
<211>36
<212>DNA
<213>人工的
<220>
<223>人工合成的引物序列
<400>27
gctgtcgact tagttgctgg cgggagtgaa caagac                               36
<210>28
<211>63
<212>DNA
<213>人工的
<220>
<223>人工合成的引物序列
<400>28
gcgaattcca ccatggacta caaagacgat gacgacaagt tgccatct tt agttccctgt    60
gtt                                                                   63
<210>29
<211>36
<212>DNA
<213>人工的
<220>
<223>人工合成的引物序列
<400>29
cgtgtcgact cactagcaga gaacctcctc acagtc                               36
<210>30
<211>25
<212>DNA
<213>人工的
<220>
<223>人工合成的引物序列
<400>30
aggtcagagt gcaggctcct gtatc                                           25
<210>31
<211>25
<212>DNA
<213>人工的
<220>
<223>人工合成的引物序列
<400>31
tagaactgtc ctttctcccc acggt                                           25
<210>32
<211>26
<212>DNA
<213>人工的
<220>
<223>人工合成的引物序列
<400>32
gaattcacac acccacagga cctgca                                          26
<210>33
<211>26
<212>DNA
<213>人工的
<220>
<223>人工合成的引物序列
<400>33
ggatccactg aaggacccac agaaag                                          26
<210>34
<211>25
<212>DNA
<213>人工的
<220>
<223>人工合成的引物序列
<400>34
ctcagtaaag gcagagtgga gtacc                                           25
<210>35
<211>25
<212>DNA
<213>人工的
<220>
<223>人工合成的引物序列
<400>35
atacattaga accacagccg caatg                                           25
<210>36
<211>27
<212>DNA
<213>人工的
<220>
<223>人工合成的引物序列
<400>36
ccatcctaat acgactcact atagggc                                         27
<210>37
<211>23
<212>DNA
<213>人工的
<220>
<223>人工合成的引物序列
<400>37
actcactata gggctcgagc ggc                                             23
<210>38
<211>26
<212>DNA
<213>人工的
<220>
<223>人工合成的引物序列
<400>38
ctcaagaagt tccccttggt tgtctc                                          26
<210>39
<211>26
<212>DNA
<213>人工的
<220>
<223>人工合成的引物序列
<400>39
gccagatagt tagcatgttg ctcttg                                          26
<210>40
<211>26
<212>DNA
<213>人工的
<220>
<223>人工合成的引物序列
<400>40
gaattcatgt cgctcatggt cgtcag                                          26
<210>41
<211>26
<212>DNA
<213>人工的
<220>
<223>人工合成的引物序列
<400>41
ggatcctcag ggctcagcat ttggaa                                          26
<210>42
<211>40
<212>DNA
<213>人工的
<220>
<223>人工合成的引物序列
<400>42
aggggcccag cttttctcca gcgatgaagg agaaagaaga                           40
<210>43
<211>40
<212>DNA
<213>人工的
<220>
<223>人工合成的引物序列
<400>43
tcttctttct ccttcatcgc tggagaaaag ctgggcccct                           40
<210>44
<211>25
<212>DNA
<213>人工的
<220>
<223>人工合成的引物序列
<400>44
gcaattaacc ctcactaaag ggaac                                           25
<210>45
<211>20
<212>DNA
<213>人工的
<220>
<223>人工合成的引物序列
<400>45
ttcatacaga aggcgtggag                                                 20
<210>46
<211>20
<212>DNA
<213>人工的
<220>
<223>人工合成的引物序列
<400>46
cgttcgcggg cgcaactgca                                                 20
<210>47
<211>26
<212>DNA
<213>人工的
<220>
<223>人工合成的引物序列
<400>47
gaattcatgg ccttaccagt gaccgc                                          26
<210>48
<211>26
<212>DNA
<213>人工的
<220>
<223>人工合成的引物序列
<400>48
ggatccttag acgtatctcg ccgaaa                                          26
<210>49
<211>30
<212>DNA
<213>人工的
<220>
<223>人工合成的引物序列
<400>49
gaattccacc atggccttac cagtgaccgc                                      30
<210>50
<211>40
<212>DNA
<213>人工的
<220>
<223>人工合成的引物序列
<400>50
accagccagt tgctggcggg gtccagcccc ctcgtgtgca                           40
<210>51
<211>40
<212>DNA
<213>人工的
<220>
<223>人工合成的引物序列
<400>51
tgcacacgag ggggctggac cccgccagca actggctggt                           40
<210>52
<211>39
<212>DNA
<213>人工的
<220>
<223>人工合成的引物序列
<400>52
atcagaacat gcaggtgtct tccagccccc tcgtgtgca                            39
<210>53
<211>40
<212>DNA
<213>人工的
<220>
<223>人工合成的引物序列
<400>53
tgcacacgag ggggctggac agacacctgc atgttctgat                            40

Claims (20)

1、下述(a)-(d)任一项记载的DNA:
(a)编码包含SEQ ID NO:2,4或6任一项记载的氨基酸序列的蛋白质的DNA;
(b)含有SEQ ID NO:1,3或5任一项记载的碱基序列的编码区域的DNA;
(c)编码包含在SEQ ID NO:2,4或6任一项记载的氨基酸序列中替换,缺失,插入和/或添加了1个或多个氨基酸所得的氨基酸序列的、并且与包含SEQ ID NO:2,4或6任一项记载的氨基酸序列的蛋白质具有相同功能的蛋白质的DNA;
(d)与包含SEQ ID NO:1,3或5任一项记载的碱基序列的DNA在严紧条件下杂交的DNA。
2、编码包含SEQ ID NO:2,4或6任一项记载的氨基酸序列的蛋白质片段的DNA。
3、由权利要求1或2中记载的DNA编码的蛋白质。
4、含有权利要求1或2中记载的DNA的载体。
5、带有权利要求1或2中记载的DNA或者权利要求4记载的载体的宿主细胞。
6、权利要求3中记载的蛋白质的制备方法,包括培养权利要求5中记载的宿主细胞,从该宿主细胞或其培养上清中回收产生的蛋白质的步骤。
7、与权利要求3中记载的蛋白质结合的抗体。
8、针对权利要求3中记载的蛋白质的配体的鉴定方法,其包括以下的(a)和(b)的步骤:
(a)使候选化合物与权利要求3中记载的蛋白质或与表达权利要求3中记载的蛋白质的细胞接触的步骤;
(b)检测候选化合物是否与权利要求3中记载的蛋白质或与表达权利要求3中记载的蛋白质的细胞结合的步骤。
9、针对权利要求3中记载的蛋白质的激动剂的鉴定方法,其包括以下的(a)和(b)的步骤:
(a)使候选化合物与表达权利要求3中记载的蛋白质的细胞接触的步骤;
(b)检测候选化合物是否产生了成为权利要求3中记载的蛋白质的活化标识的信号的步骤。
10、针对权利要求3中记载的蛋白质的拮抗剂的鉴定方法,其包括以下的(a)和(b)的步骤:
(a)使候选化合物与表达权利要求3中记载的蛋白质的细胞接触的步骤;
(b)通过与不存在候选化合物条件下检测的情况相比较,检测作为权利要求3中记载的蛋白质的活化标识的信号是否减少的步骤。
11、通过权利要求8中记载的方法鉴定获得的针对权利要求3中的蛋白质的配体。
12、通过权利要求9中的方法鉴定获得的针对权利要求3中的蛋白质的激动剂。
13、通过权利要求10中的方法鉴定获得的针对权利要求3中的蛋白质的拮抗剂。
14、用于权利要求8至10任一项记载的方法的试剂盒,其含有以下(a)或(b)中的至少一项:
(a)权利要求3记载的蛋白质
(b)权利要求5记载的宿主细胞。
15、一种免疫抑制剂,其含有针对权利要求3中的蛋白质的激动剂作为有效成分。
16、一种过敏性疾病或自身免疫疾病治疗剂,其含有针对权利要求3中的蛋白质的激动剂作为有效成分。
17、一种免疫增强剂,其含有针对权利要求3中的蛋白质的拮抗剂作为有效成分。
18、一种抗肿瘤或抗病毒剂,其含有针对权利要求3中的蛋白质的拮抗剂作为有效成分。
19、链长至少为15个核苷酸并且与权利要求1或权利要求2中的DNA或者与其互补链互补的DNA。
20、一种与编码权利要求3中的蛋白质的基因的表达异常或者活性异常相关的疾病的检测药剂,其含有权利要求19中的DNA或权利要求7中的抗体。
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