CN1276788A - 用于有机合成的保护和连接基团 - Google Patents
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Abstract
本发明涉及用于合成有机化合物的方法,更具体而言是涉及在合成肽、寡糖、糖肽和糖脂中用作保护和连接基团的化合物。本发明提供在固相和溶液合成中都有用的保护和连接基团。在其最普通意义的方面中,本发明提供通式(Ⅰ)的环状化合物。
Description
本发明涉及用于合成有机化合物的方法,更具体而言是涉及在合成肽、寡糖、糖肽和糖脂中用作保护和连接基团的化合物。本发明提供在固相和液体合成中都有用的保护和连接基团,而且这些基团特别适用于组合性合成法。发明背景
在复杂有机结构的合成中官能团不配适性的问题需要使用官能团保护策略。复杂合成的中间体和产物通常包含多个反应性基团,这些基团的大多数都必须首先被保护,然后在合成中合适的时间再脱保护。该问题在多官能分子的设计和构建中是特别突出的,所述多官能分子例如是寡糖、肽、糖肽和糖脂。
在寡糖合成中,需要各种的保护基。必须在具体的位置处区域选择性地设置基团,在伯醇、cis-二醇、trans-二醇、1,2-二醇、1,3-二醇或者具体的仲醇上。另外,氨基糖是寡糖的重要组成部分,而且它们的氨基保护应与羟基保护策略相配适。邻近正位异构中心的保护基的性质也是重要的。无论该基团是否参与,其在糖苷立体化学的控制中都发挥重要的作用。因为糖苷中心处的大多数反应都通过缺电子中间体进行,C-2取代基上的电子释放取代基加速糖苷中心处的反应。吸电子取代基,通常为酯或酰胺,减慢反应。在固相寡糖合成中,第一个糖单元和树脂之间的连接基的稳定性和敏感性对于保护方案是非常关键的部分。有其他官能团如烯烃或酯的存在,或者例如目标寡糖中呋喃糖环的特征,都有可能使合成中所用的保护基对酸、碱、还原剂或者其他常规使用的断裂技术不敏感。因此,保护基的选择在成功实现固相寡糖合成中是决定性因素之一。
在固相肽和糖肽合成中,需要新的正交保护基是明显的。已知的正交脱保护基于氨基酸之众所周知的Fmoc和Boc保护。复杂肽或糖肽的构建通常需要针对侧链氨基官能度的第三正交保护基,该保护基的脱除不会影响其他正交位置中的保护基,或者反之亦然。
已研制了许多保护基用于氨基的保护,而且可分为7个大类。1、N-酰基衍生物
a)邻苯二酰胺特别适用于在氨基糖苷合成中保护氨基官能团(Nicolaou等人,1992),这是因为它们在糖基化期间是稳定的,而且它们通过相邻基团的参与有助于控制立体化学。令人遗憾的是,脱保护需要非常激烈的条件,这经常导致部分产物分解。
b)三氟乙酰胺(Weygand和Czendes,1952),该简单的酰胺衍生物在用作保护基时通常是无价值的,这是因为除去它们所需要的条件太过激烈。但是,三氟乙酰胺基团非常易于碱水解,并因此可用于胺的保护。
c)氨基甲酸酯可用作氨基酸的保护基,以使肽合成中的外消旋化作用最小。外消旋化发生在N-保护的羧基活化的氨基酸的碱催化偶联反应期间,并通过中间体恶唑酮进行,该中间体易于形成N-酰基保护的氨基酸。许多的氨基甲酸酯,例如Boc(McKay和Albertson,1957)、Cbz(Bergman和Zervas,1932)、Alloc(Kunz和Unverzagt,1984)、Teoc(Carpino等人,1978)和Troc(Windholz和Johnston,1967),都已被用作氨基保护的保护基。2、N-磺酰基衍生物
磺酰胺衍生物通常用于氮杂环类化合物(Gribble等人,1992),而芳基磺酰基(Fischer和Livschitz,1915)对于大范围的伯胺和仲胺都是有效的保护基,但是它们的脱除需要激烈的条件。β-(三甲基甲硅烷基)乙磺酰基(Weinreb等人,1986)衍生物与芳基磺酰基一样稳定,但是断裂步骤仅需要用TBAF或CsF温热。3、N-亚磺酰基
亚磺酰胺比磺酰胺更不稳定,对酸和亲核取代敏感。它们的脱除需要非常温和的条件。已有几个亚磺酰基用于保护氨基官能团,包括三苯甲基亚磺酰基(Brandchaud,1983)、o-硝基苯基亚磺酰基(Goerdeler和Holst,1959)、以及五氯苯基亚磺酰基(Kessler和Iselin,1966)。4、N-烷基衍生物
苄胺可在使用金属氢化物的反应中提供保护,而氨基甲酸酯不稳定。相对于苄醚或苄酯,苄胺对于催化氢解不太敏感,因此通常可实现选择性脱保护(Goldstein等人,1992)。三苯甲基(Sieber和Riniker,1991)用于保护氨基酸,但是该基团的立体障碍以及高度的酸不稳定性有损于肽偶联。9-苯基芴基(PhFl;Koskinen和Rapoport,1989)可用于保护伯胺和仲胺。其疏水性、立体障碍和易于引入都与三苯甲基类似,但是PhFl基团对酸的稳定性高于三苯甲基约6000倍。5、N-甲硅烷基衍生物
甲硅烷基的高度酸和水敏感性都严重地阻碍了它们在氨基保护中的应用。丁基二苯基甲硅烷基胺(Overman和Okazaki,1986)对于强碱条件具有显著的稳定性,但它们对酸仍是非常不稳定的。6、亚胺衍生物
亚胺官能团中的双键使得可以同时保护伯胺的两个N-H键。亚胺对于强碱条件通常是稳定的,但它们对于含水酸却是不稳定的。N-甲硅烷基亚胺(Colvin等人,1988)、N-二(甲硫基)亚甲基胺(Hoppe和Beckmann,1979)和N-二苯基亚甲基胺(Polt等人,1979),都可在合成α-氨基酸中用于保护氨基。7、烯胺衍生物
N-(5,5-二甲基-3-氧-1-环己烯基)胺(Halpem和James,1964)可用于保护氨基酸,形成插烯物酰胺衍生物。这些化合物可通过用盐水或硝酸处理来断裂。插烯物酰胺保护的伯胺的稳定性主要取决于1,3-二酮的结构以及连接在烯胺双键上的官能团。开链N-(4-氧戊-2-烯基)-保护的胺对于含水且中等酸性的条件是不稳定的。该酸敏感性限制了它们作为合成试剂的用途(Kellam,1996)。环1,3-二酮,例如5,5-二甲基环己烷-1,3-二酮(双甲酮),与二甲基甲酰胺二甲基乙缩醛反应,形成5,5-二甲基-2-(二甲基氨基亚甲基)环己烷-1,3-二酮。Bycroft等人(1993)使用该试剂合成了Dmc-保护的α-氨基酸,并发现对酸性条件有显著的稳定性。这些化合物的脱除可通过稀肼溶液在室温下快速实现。在烯胺双键中引入甲基形成N-1-(4,4-二甲基-2,6-二氧环亚己基)乙基(Dde)保护基,可提高对仲胺的稳定性(Bycroft等人,1993)。N-1-(4,4-二甲基-2,6-二氧环亚己基)-3-甲基丁基保护的氨基酸(Chan等人,1995),在烯胺双键上携带位阻更大的基团,具有优异的碱稳定性。N-1-(4-硝基-1,3-二氧茚满-2-亚基)-乙基(Nde;Kellam,1996;Mosher和Meier,1970)保护氨基酸,与插烯物系统相同,并在非常温和的条件下即可脱除这些基团。
许多年来,化学家一直试图将常规用于肽合成的固相技术应用于寡糖合成中,并取得了不同程度的成功。第一次尝试是在大约25年前(Frechet和Schuerch,1971;Frechet和Schuerch,1972;Guthrie等人,1971;Guthrie等人,1973)。但是,臭氧介导的脱保护产物是醛取代的糖苷。Danishefsky及合作者描述了首先通过甲硅烷基醚连接将寡糖的初始糖单元连接在1%二乙烯基苯-苯乙烯共聚物载体上,由此固相合成Lewis b抗原(Randolph等人,1995)和N-连接的糖肽(Roberge等人,1995)。在该例子中,结合树脂的糖单元是烯糖,树脂上的活化是通过使双键环氧化来实现的,而所得到的烯糖残基则通过环氧化物的亲核开环起到糖供体的作用。因为对于糖化学家没有现成的比色法来监控树脂上的糖基化反应,所以评估反应进程的唯一方法是溶解寡糖-树脂键,然后发现断裂产物,通常是通过薄层色谱法。断裂Danishefsky's甲硅烷基醚连接基所必须的由四正丁基氟化铵介导的脱保护条件不仅危险,而且还非常缓慢。这与结合烯糖在树脂上活化的要求一起,使总的策略和方法都远非理想。
在替代方法中,Douglas及合作者描述了通过使用聚乙二醇w-单甲基醚共聚物和琥珀酰或α,α'-二氧二甲苯基二醚连接基来合成D-甘露戊糖(Douglas等人,1995)。该反应在溶液相中进行,并通过沉淀出寡糖-聚合物复合物、然后洗涤来除去未使用的反应剂。在后一个例子中,寡糖-聚合物键的断裂是通过催化氢化实现的,这需要将该结合物暴露于1atm的氢气中48小时,以达到可观的产率。这又是非常缓慢的,使得不能监控每个糖基化反应。Yan等人报道了在Merrifield树脂上由亚砜介导的糖基化反应,其是使用苯硫酚连接基来连接初始糖残基(Yan等人,1994)。该方法导致(1-6)-连接的寡糖的构建,而且适合于合成α-和β-糖苷键。但是,硫代糖苷与树脂的连接使得在该方法中不能使用类似的糖供体。
近来,Rademann和Schmidt报道了在通过烷基硫醇而与树脂连接在一起的糖上使用三氟acetimidate糖供体(Rademann和Schmidt,1996);但该方法还是阻碍了性能非常优越的硫代糖苷糖供体的使用。同时,Adinolfi等人描述了通过使用聚乙二醇-聚苯乙烯树脂来合成二糖,其是通过琥珀酸酯间隔基将第一个糖连接在聚合物载体上(Adinolfi等人,1996)。但是,该连接基表现出的酸不稳定性意味着初始糖不能通过糖苷位置被连接在树脂上。
这些例子说明,固相合成中的关键因素是固相载体和初始合成子之间的连接基的性质。该连接基必须对偶联和脱保护条件具有优异的稳定性,而在固相寡糖合成中,其还应能够被快速且有效地断裂掉,以监控每个偶联反应的进程。所述断裂理想的是通过使用相对无害的化学试剂来实现。在本领域中仍需要例如用于固相合成寡糖的有效且经济的方法。
在我们的国际专利申请PCT/AU97/00544(优先权日为1996年8月28日)中,我们已举出了固定2-酰基-5,5-二甲基-1,3-环己烷二酮以及在固相寡糖合成中使用该固定化合物的几种方法。在我们的国际专利申请PCT/AU98/00131(优先权日为1997年2月28日)中,我们已表明,插烯物酰胺保护氨基糖可通过使用Dde-OH和Nde-OH试剂在简单的反应中实现。上述文献的全部内容在此并入作为参考。Dde-和Nde-保护的单糖在大多数羟基保护剂操作以及在糖苷中心发生的反应中都能够保存下来,提供多种糖供体。这些插烯物酰胺保护的氨基糖供体不邻接基团活性的糖,在糖基化期间形成糖苷的正位异构混合物。我们已经证实了Dde-和Nde-保护的氨基糖在以糖为基础的方法中的稳定性和易脱除性。
令人遗憾的是,这些保护方法仍有一些难题。
Dde保护的氨基糖在有氰基硼氢化钠和金属氢化物存在时是不稳定的。这些试剂通常用于亚苄基开环反应中以及羟基的苄基保护期间。Dde基团对氢化物的敏感性限制了其在糖化学中的应用。制备2-酰基-双甲酮通常是非常困难的。其中一个主要的副反应是O-酰基化,该反应降低了总产率,并产生难以色谱纯制的难题。
Nde保护伯胺通常形成E/Z异构体混合物,该混合物不可分离,产生难以表征的问题。形成2-乙酰基-4-硝基茚满-1,3-二酮涉及4-硝基邻苯二甲酸酐和2,4-戊二酮之间的反应,该反应经过缩合和两个重排。该合成方法没有机会制备Nde-OH类似物。
我们现已合成了一类新型的化合物,它们可在有机合成中用作保护和连接基团。发明简述
在最广泛的方面中,本发明提供通式I的环状化合物:其中:所述环是环烷基、经取代的环烷基、环杂烷基、经取代的环杂烷基、饱和二环[p,q,r]、经取代的饱和二环[p,q,r]、饱和杂二环[p,q,r]、经取代的饱和杂二环[p,q,r]、不饱和二环[p,q,r]、经取代的不饱和二环[p,q,r]、不饱和杂二环[p,q,r]、经取代的不饱和杂二环[p,q,r]、饱和三环[p,q,r,s]、经取代的饱和三环[p,q,r,s]、不饱和三环烷基[p,q,r,s]、经取代的不饱和三环烷基[p,q,r,s]、饱和杂三环[p,q,r,s]、经取代的饱和杂三环[p,q,r,s]、不饱和杂三环[p,q,r,s]、或者经取代的不饱和杂三环[p,q,r,s]环系;p、q、r和s可相同或不同,而且p、q、r和s分别是0-5的整数;
X是氧、硫、亚氨基或经取代的亚氨基;
R1是氢;烷基、烯基、炔基、杂烷基、芳基、杂芳基、环杂芳基、环烷基、杂环烷基、链烷醛或者硫代链烷醛基,这些基团可以是经取代的或者未经取代的;NH2、胍基、CN、经取代的氨基、季铵、O-、甲酰基、亚氨基或经取代的亚氨基、COOH、或者羧酸衍生物;
R2是烷基氨基、二烷基氨基、芳基氨基、或者二芳基氨基,这些基团可以是经取代的或者未经取代的;O-取代的羟基氨基、经取代或未经取代的肼基、经取代或未经取代的酰肼基(hydrazido)、经取代或未经取代的硫代酰肼基、半卡巴肼基(semicarbazido)、硫代半卡巴肼基、OH、O-M、NH2、NHOH、SH、S-M+、卤素;O-烷基、O-酰基、O-芳基、烷硫基、S-芳基、酰基硫基、烷基磺酰基或者芳基磺酰基,这些基团可以是经取代的或者未经取代的;而M是金属离子,或者是有机或无机阳离子如季铵基、三苯甲基或者铵基,
其条件是,所述化合物不是国际专利申请PCT/AU97/00544中所公开者。
在本领域中已知有许多的合适阳离子。金属离子可为单或多价的,并可形成复合物盐。
优选的是,所述环是4-8元环烷基、经取代的环烷基、环杂烷基或经取代的环杂烷基。
另外,在其他优选实施方案中,所述环是如下之5-8元的内酯或内酰胺类型的环系,或者是6-8元的脲基或经取代的脲基类型的环系:其中:各R相互独立地是H、经取代的或未经取代的烷基、芳基、烯基、炔基或酰基,或者是如下之6-8元的碳酸酯型的环系。
可以清除理解的是,在本发明说明书的通式中,各取代基R、R1、R2和R3本身可以是经取代的,也就是说,一个或多个氢原子被取代基取代。
在本发明的说明书中,R、R1、R2和R3以及本说明书中的其他取代基定义中的术语“经取代的”是指,所述取代基本身被改性其化学特性的取代基取代。优选的取代基包括但不限于:卤素、硝基、氨基、叠氮基、氧、羟基、硫醇基、羧基、羧基酯、羧酰胺、烷基氨基、烷基二硫基、烷基硫基、烷氧基、酰基酰胺基、酰氧基、或酰基硫基,各具有1-3个碳原子。此等取代基可用于整体地改性分子的特性,如稳定性、溶解度、以及形成晶体的能力。本领域技术人员可意识到,在特定情况下可使用其他合适的具有类似尺寸和电荷特征的取代基作为替代。
在一组优选实施方案中,所述化合物为通式II所示者:其中:各R分别独立地是H或经取代的或未经取代的烷基、芳基、环烷基、杂烷基、杂芳基或杂环烷基;而且
R1和R2与通式I中的定义相同。
优选的是,各R具有1-6、更优选1-4个碳原子。
本发明的化合物可用于有机化学的多个领域中。该化合物特别适用于溶液和/或固相合成寡糖和肽。因此,本发明化合物的用途包括但不限于以下方面:
1、固相寡糖合成中的连接基团;
2、用于在寡糖合成中保护氨基糖的N-保护基团;
3、固相有机合成中的连接基团;
4、有机合成中的N-保护基团;
5、固相或溶液相肽合成中的N-侧链和/或Na保护基团;
6、用于糖、肽和有机化合物的氨基保护基团,形成另外的游离烯胺;
7、本发明的某些化合物是手性的,它们可用于拆分对映体和立体特异性合成中,
8、在固相合成寡糖、肽和其他有机化合物中用于将起始基团偶联在树脂上的连接基团。
因此在第二方面中,本发明提供用于寡糖、氨基酸、肽或有机物的N-保护基。
R3是经保护、未经保护或经取代的糖氨基基团、糖基氨基基团、或寡糖的糖基氨基基团;或者是通过经取代或未经取代的烷基氨基、芳基氨基、环烷基氨基、杂烷基氨基、杂芳基氨基或杂环烷基氨基偶联的单或寡糖。
在一组优选实施方案中,所述化合物是通式V所示者:其中:R和R1如通式II中所定义,而R3如通式IV中所定义。
优选的是,R3是经保护的、未经保护的或经取代的糖氨基基团、糖基氨基基团、或者寡糖的糖基氨基基团。
另外,R3是寡糖-O-CH2-(C6H4)-NH-、单糖-O-CH2-(C6H4)-NH、寡糖-CO2CH2-(C6H4)-NH-、或者单糖-CO2CH2-(C6H4)-NH基团。
在本发明的第三个方面中,其提供通式VI之用于固相合成寡糖、肽或有机化合物的载体,其包括树脂和共价键地连接在该树脂上的连接基:其中:所述环、X和R2都如通式I所述,而且
R1是经取代或未经取代的烷基、环烷基、杂烷基、杂芳基、杂环烷基、或羧酰胺基间隔基团,它们直接偶联在树脂载体上,或者任选地经过合适的共价连接而偶联在树脂载体上,而所述共价连接在寡糖合成和断裂条件下是稳定的。
所述共价连接可适当地用下述基团提供:-CONH-、-O-、-S-、-NH-、-COO-、-COS-、-CH=N-、-NHCONH-、-NHCSNH-、-NHNH-,例如:间隔基-CONH-树脂、间隔基-O-树脂、间隔基-S-树脂、间隔基-S-S-树脂、间隔基-CO2-树脂、间隔基-CH=N-树脂、间隔基-NHCONH-树脂、间隔基-NHCSNH-树脂、间隔基-NHNH-树脂。其他可能的共价连接基团对于本领域技术人员是已知的。
其中通式VII的化合物直接偶联在树脂载体上,或者任选地经过合适的共价连接而偶联在树脂载体上,而所述共价连接在寡糖合成和断裂条件下是稳定的。
所述共价连接可适当地用下述基团提供:-CONH-、-O-、-S-、-NH-、-COO-、-COS-、-CH=N-、-NHCONH-、-NHCSNH-、或-NHNH-,例如:间隔基-CONH-树脂、间隔基-O-树脂、间隔基-S-树脂、间隔基-S-S-树脂、间隔基-CO2-树脂、间隔基-CH=N-树脂、间隔基-NHCONH-树脂、间隔基-NHCSNH-树脂、间隔基-NHNH-树脂。其他可能的共价连接基团对于本领域技术人员是已知的。
所述树脂可以是任何在水和/或有机溶剂中溶涨的树脂,而且包括以下取代基之-:卤素、羟基、羧基、SH、NH2、甲酰基、SO2NH2、或NHNH2,例如甲基二苯甲基胺(MBHA)树脂、氨基或羧基tentagel树脂、或者4-氨磺酰基苄基AM树脂。其他合适的树脂对于本领域技术人员是已知的。另外,如受控孔径玻璃或者合适聚合物的载体也可使用。这些在本领域中是众所周知的。
本发明还提供固相合成寡糖的方法,其包括顺序地将单或寡糖基团连接在上述载体上的步骤。
连接基可在偶联初始糖基团之前分步直接合成在树脂上,或者可在溶液相中合成连接基-初始糖结合物,然后偶联至固体载体上,接着顺序地连接随后的糖。优选的是,第二和所有随后的糖基团在部分地脱除寡糖链中的最后糖的保护之后偶联至寡糖链-树脂上。
连接在树脂-连接基单元上的第一个糖可以是未经保护的、部分保护的、或者完全保护的糖苷、氨基糖苷或者醚-或氨基连接的糖。
优选的是,偶联在树脂上的第一个糖是氨基糖、氨基糖苷、或氨基寡糖、或者寡糖的糖基胺。
在一个特别优选的实施方案中,载体包括树脂、连接基和选自于以下组中的糖:单糖、寡糖、或氨基糖和氨基寡糖。
构建段单或寡糖供体可以是任何经活化的糖,其包括但不限于:原酸酯、硫代原酸酯、氰基亚烷基衍生物、1-O-酰基糖、氨基糖、acetimidates、三氯acetimidates、硫代糖苷、氨基糖苷、氨基寡糖、寡糖的糖基胺、糖基硫代氰酸酯、戊烯基糖苷、戊烯酰基糖苷、异丙烯基糖苷、烯糖、四甲基二氨基磷酸盐、糖diazirines、硒代糖苷、二硫代磷酸酯、糖基-二烷基亚磷酸酯、糖基亚砜和糖基氟化物。
优选的是,除永久性的醚型保护基外,部分糖脱保护可通过使用酰基型、三苯甲基、甲氧基三苯甲基、甲氧基苄基、各种甲硅烷基和/或光不稳定性保护基来实现。在单个糖供体上使用两个正交羟基保护基,由此可合成支链寡糖。
使用氨、肼或伯胺,如丁胺或环己胺,即可从树脂上断裂已合成的寡糖。为制备氨基糖苷,优选使用在有机溶剂中的氨或合适伯胺。为合成酰肼,优选使用在水或有机溶剂中的肼。为合成寡糖,优选使用在水或有机溶剂中的氨,然后酸化。如果连接基包含4-氨基苄基部分,在如上所述断裂后,游离的第一个糖仍可用氨基苄基基团保护,如果需要的话,这可通过氢化反应除去。
在优选实施方案中,本发明提供溶液相合成含糖化合物的试剂,其包括如上所述的通式II的巴比土酸衍生化合物。
本发明的化合物适合在固相合成寡糖的方法中用作保护基,在该方法中糖单元连接在树脂上。可使用任何合适的连接基化合物,其包括本发明的化合物。可以认为,我们的在先申请PCT/AU97/00544中描述的连接基和方法也适合于本发明的化合物。
因此,在第四方面中,本发明提供连接基-糖复合物,其包括连接基和起始化合物,所述起始化合物包括如上所述的通式I或II的保护基。可使用任何合适的连接基,其包括本发明的化合物。同样,也可使用PCT/AU97/00544中描述的连接基和方法。
在第五方面中,本发明提供溶液相合成寡糖的方法,其包括顺序地将单或寡糖基团连接在如上所述的连接基-糖复合物上的步骤。
这些方法特别适合于组合性合成应用中。本发明的溶液相方法可例如用于组合性合成氨基糖苷化合物中。
本发明还提供用于溶液相合成或者组合性合成寡糖或肽的试剂盒,其包括:
a)树脂-连接基-糖或树脂-连接基-肽(或氨基酸)载体,
b)连接基-糖或连接基-肽(或氨基酸)复合物,或者
c)根据本发明的上述树脂-连接基载体。
在合成肽时,在某些情况下可方便地由树脂-连接基-氨基酸载体或者连接基-氨基酸复合物起始,但在其他情况下可更合适地在载体或连接基复合物中提供起始肽。所述试剂盒还可任选地包括一种或多种适合于固相或组合性合成法的其他试剂如保护剂、脱保护剂、和/或溶剂。本领域技术人员对这些合适的其他试剂是已知的。然后可根据具体的应用选择不同类型的试剂盒。
本发明还提供用于固相相合成或者组合性合成寡糖的试剂盒,其包括根据本发明的上述连接基-糖复合物。所述试剂盒还可任选地包括一种或多种适合于固相或组合性合成法的其他试剂如保护剂、脱保护剂、和/或溶剂。本领域技术人员对这些合适的其他试剂是已知的。然后可根据具体的应用选择不同类型的试剂盒。本发明的详细描述
本说明书中所用的缩写的含意如下:Ac 乙酰基AcOH 乙酸ADA 5-乙基-1,3-二甲基巴比土酸Alloc 烯丙氧基羰基Boc 叔丁氧基羰基Bu 丁基Cbz 苄氧基羰基DBU 1,8-二氮杂二环[5.4.0]十一-7-烯DCC N,N’-二环己基碳化二亚胺Dde N-1-(4,4-二甲基-2,6-二氧环亚己基)-乙基DMAP 4-二甲基氨基吡啶Dmc N-(4,4-二甲基-2,6-二氧环亚己基-亚甲基)DMF N,N’-二甲基甲酰胺EtOH 乙醇FAB MS 快速原子轰击质谱Fmoc 9-芴基甲氧基羰基MBHA 甲基苄基羟基胺Me 甲基MeOH 甲醇Nde 1-(4-硝基-1,3-二氧茚满-2-亚基)乙基NMR 核磁共振ODmab -{N-[1-(4,4-二甲基-2,6-二氧环亚己基)-3-甲基丁基]-氨基}
苄基醇PhFl 9-苯基芴基TBAF 四丁基氟化铵TEAB 四乙基溴化铵Teoc 2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基羰基TNBS 2,4,6-三硝基苯磺酸Troc 2,2,2-三氯乙氧基羰基
以下将参考非限制性的实施例具体地描述本发明,其中各化合物的结构总结在下表中。
表1化合物1-20
化合物 | R1 | R2 |
1 | OH | CH3 |
2 | NHBu | CH3 |
3 | OH | Ph |
4 | NHBu | Ph |
5 | OH | 9-芴基 |
6 | OH | CH2Cl |
7 | OH | CHCl2 |
8 | OH | Bn |
9 | OH | CHPh2 |
10 | OH | -(CH2)3COOH |
11 | OH | t-Bu |
12 | OH | 1-金刚烷基 |
13 | NH2 | CCl3 |
14 | -NHCH2COOH | CH3 |
15 | -NHCH2COOH | Ph |
16 | -NHCH2COOH | Bn |
17 | -NHOH | Ph |
18 | -NHNHCOCH3 | Ph |
19 | -NH-NH2 | Ph |
20 | NH2 | Ph |
表2化合物21-29
化合物 | R |
21 | CH3 |
22 | Ph |
23 | 9-芴基 |
24 | Bn |
25 | CHPh2 |
26 | -(CH2)3COOH |
27 | NH2 |
28 | t-Bu |
29 | 1-金刚烷基 |
32 | R=Ac |
37 | R=H |
35 | R=NH2 |
36 | R=OH |
我们现已研制出一种新型的烯胺型保护系统,其包括试剂的制备以及选择性氨基保护和脱保护的方法。这可通过合成多种5-酰基-1,3-二甲基-巴比土酸(ADA)(实施例1-11)来说明。在合成期间,仅形成C-酰基产物;没有观察到O-酰基化。在DCC和DMAP存在下,通过使用羧酸可成功地进行1,3-二甲基巴比土酸的5-酰基化(实施例5-9)。还使用了反应性更强的酰氯(实施例3-4)和酸酐(实施例1-2),在DMAP催化反应中形成相同的产物。在DBU存在下可使用三氯乙腈构建类似的结构(实施例10)。
5-酰基-1,3-二甲基巴比土酸可容易地由极性溶剂中结晶,避免了色谱纯制法的使用。这些试剂价格非常低廉,而且可由容易得到的1,3-二甲基巴比土酸通过简单的反应容易地合成。我们使用了5-酰基-1,3-二甲基巴比土酸试剂制备多种经保护的一级烷基胺(实施例12-13)、氨基糖(实施例22-28)和氨基酸(实施例14-16)。
ADA保护的氨基糖可用作固相或溶液相合成寡糖时的氨基糖受体和氨基糖供体。ADA保护的氨基酸特别适合用作固相合成肽和糖肽的试剂,这是因为它们不能在偶联反应期间形成恶唑酮。因此,在肽键形成期间不会发生外消旋化(外消旋化仅发生在碱催化的质子提取中)。ADA保护特别理想地正交于Boc保护,并准正交于Fmoc系统。
我们已经证实,该系统可用于保护羟胺(实施例17)、肼(实施例19)、和酰肼(实施例18)。在无水乙醇中简单地回流未经保护的酰胺和前体(5-酰基-1,3-二甲基巴比土酸),即可有效地实现氨基的插烯物酰胺保护。
ADA保护的衍生物在许多反应和处理条件下都是非常稳定的。为断裂保护基,已研制出不同的试剂(NH3、N2H4、NH2OH、n-BuNH2、BuNH2、NHNHCOCH3、N2H4×AcOH、NaOH)(实施例17-20)。保护和断裂速度取决于5-酰基官能团的电子和立体效应。
我们还合成了双官能5-酰基-1,3-二甲基巴比土酸(实施例11),该酸可用作固相有机化学的连接基。我们已成功地固定了双官能的5-酰基-1,3-二甲基巴比土酸,产生“树脂-连接基结合物”(实施例35)。我们已固定了单糖(实施例32)、脱除其羟基保护基(实施例33)、后者在断裂期间实现保护基的脱除(实施例33),由此证实了该“树脂-连接基结合物”对于固相寡糖合成是合适的。我们还证明树脂-连接基结合物是可重新使用的,用含水碱处理再生了原始羟基官能团(实施例36)。另外,“氨基取代的树脂-连接基结合物”本身可用于下一步固定(实施例34)。
在保护基中引入另一个反应性中心使得该系统具有更多的灵活性。使用5-氯乙酰基-1,3-二甲基巴比土酸,我们合成了手性糖,其包含用于保护带有氨基官能团的有机化合物的试剂(实施例31)。这些类型的分子特别适合于拆分对映体。
5-亚氨三氯乙基(trichloroacetimino)-1,3-二甲基-巴比土酸在与伯胺的反应中产生少见的1,1-消除,形成新型的化合物(实施例29)。实施例1:5-乙酰基-1,3-二甲基-2,4,6(1H,3H,5H)-嘧啶三酮(Dtpc-OH)1
将1,3-二甲基巴比土酸(10g,64.04mmol)、4-二甲基氨基吡啶(9.49g,158.0mmol)在无水二氯甲烷(190ml)中的混合物冷却至0℃,然后在15分钟的时间内滴加乙酸酐(7.35ml,77.9mmol)。在室温下搅拌反应混合物过夜,用二氯甲烷(500ml)稀释,然后用2N盐酸溶液(80ml)洗涤。用硫酸镁干燥有机相,然后蒸发。残留物用甲醇结晶,得到5-乙酰基-1,3-二甲基-2,4,6(1H,3H,5H)-嘧啶三酮1(8.6g,68%)。Rf0.37(乙酸乙酯/己烷2∶1)FAB MS C8H10N2O4(198.18)m/z(%)199[M+H]+(100),183(18)1H NMR(CDCl3)d 17.26(s,1H,OH),3.36,3.32(2s,6H,2NCH3),2.71(s,3H,CH3)实施例2:5-氯乙酰基-1,3-二甲基-2,4,6(1H,3H,5H)-嘧啶三酮(Dtpc-OH)6
将1,3-二甲基巴比土酸(5.00g,32.02mmol)、4-二甲基氨基吡啶(9.76g,80.05mmol)在无水二氯甲烷(70ml)中的混合物冷却至0℃,然后在15分钟的时间内滴加氯乙酸酐(6.57g,38.46mmol)。在室温下搅拌反应混合物过夜,用二氯甲烷(150ml)稀释,然后用2N盐酸溶液(40ml)洗涤。用硫酸镁干燥有机相,然后蒸发。残留物用甲醇结晶,得到5-氯乙酰基-1,3-二甲基-2,4,6(1H,3H,5H)-嘧啶三酮6(4.57g,61%)。Rf0.41(己烷/乙酸乙酯/乙酸10∶5∶0.1)FAB MS C8H9ClN2O4(232.62)m/z(%)233[M+H]+(100),197(58),183(15)1H NMR(CDCl3)d 17.93(s,1H,OH),4.97(s,2H,CH2),3.41,3.34(2s,6H,2NCH3)实施例3:5-苯甲酰基-1,3-二甲基-2,4,6(1H,3H,5H)-嘧啶三酮(Dtpb-OH)3
将1,3-二甲基巴比土酸(5g,32.02mmol)、4-二甲基氨基吡啶(4.74g,38.79mmol)在无水二氯甲烷(75ml)中的混合物冷却至0℃,然后在15分钟的时间内滴加苯甲酰氯(4.95g,35.22mmol)。在室温下搅拌反应混合物3小时,用二氯甲烷(150ml)稀释,然后用2N盐酸溶液(40ml)洗涤。用硫酸镁干燥有机相,然后蒸发。残留物用二已丙基醚结晶,然后用甲醇重结晶,得到5-苯甲酰基-1,3-二甲基-2,4,6(1H,3H,5H)-嘧啶三酮3(8.6g,68%)。Rf0.45(乙酸乙酯/己烷/TFA 10∶15∶0.1)FAB MS C13H12N2O4(260.25)m/z(%)283[M+Na]+(25),261[M+H]+(100),245(45),183(55)1H NMR(CDCl3)d 16.58(s,1H,OH),7.57-7.45(m,5H,5Ar-H),3.44,3.27(2s,6H,2NCH3)实施例4:5-新戊酰基-1,3-二甲基-2,4,6(1H,3H,5H)-嘧啶三酮(Dtppe-OH)11
将1,3-二甲基巴比土酸(5g,32.02mmol)、4-二甲基氨基吡啶(4.69g,38.42mmol)在无水二氯甲烷(75ml)中的混合物冷却至0℃,然后在15分钟的时间内滴加新戊酰氯(4.24g,35.22mmol)。在室温下搅拌反应混合物过夜,用二氯甲烷(150ml)稀释,然后用2N盐酸溶液(40ml)洗涤。用硫酸镁干燥有机相,然后蒸发。残留物使用己烷/EtOAc/AcOH 15∶5∶0.1作为流动相进行色谱纯制,得到5-新戊酰基-1,3-二甲基-2,4,6(1H,3H,5H)-嘧啶三酮11(5.46g,71%)。Rf0.65(己烷/EtOAc/AcOH15∶5∶0.1)FAB MS C11H16N2O4(240.26)m/z(%)263[M+Na]+(7),241[M+H]+(100),223(15),183(15)1H NMR(CDCl3)d 19.14(s,1H,OH),3.38,3.33(2s,6H,2NCH3),1.41(s,9H,3CH3)实施例5:5-(9-芴基羰基)-1,3-二甲基-2,4,6(1H,3H,5H)-嘧啶三酮(Dtpf-OH)5
将1,3-二甲基巴比土酸(2.5g,16.01mmol)、9-芴基羧酸(5.05g,24.01mmol)、4-二甲基氨基吡啶(0.98g,8.00mmol)在无水二氯甲烷(15ml)中的混合物冷却至0℃,然后添加1,3-二环己基碳化二亚胺(3.30g,16.01mmol)。在室温下搅拌反应混合物过夜,然后过滤。固体用二氯甲烷(50ml)洗涤,而合并的溶液用2N盐酸溶液(5ml)洗涤。用硫酸镁干燥有机相,然后蒸发。结晶残留物,并用甲醇重结晶,得到5-(9-芴基羰基)-1,3-二甲基-2,4,6(1H,3H,5H)-嘧啶三酮5(2.85g,69%)。Rf0.49(EtOAc/己烷/TFA 10∶25∶0.1)FAB MS C20H16N2O4(348.35)m/z(%)349[M+H]+(100),338(32),183(72),164(71)1H NMR(CDCl3)d 17.33(s,1H,OH),7.81(d,2H,2Ar-H),7.42(m,4H,4Ar-H),7.30(d,2H,2Ar-H),6.92(s,1H,CH),3.48,3.40(2s,6H,2NCH3)实施例6:5-二氯乙酰基-1,3-二甲基-2,4,6(1H,3H,5H)-嘧啶三酮(Dtpd-OH)7
将1,3-二甲基巴比土酸(5.00g,32.05mmol)、二氯乙酸(6.19g,48.03mmol)、4-二甲基氨基吡啶(1.95g,16.01mmol)在无水二氯甲烷(30ml)中的混合物冷却至0℃,然后添加1,3-二环己基碳化二亚胺(7.26g,35.22mmol)。在室温下搅拌反应混合物过夜,然后过滤。固体用二氯甲烷(150ml)洗涤,而合并的溶液用2N盐酸溶液(40ml)洗涤。用硫酸镁干燥有机相,然后蒸发。残留物由甲醇中结晶,得到5-二氯乙酰基-1,3-二甲基-2,4,6(1H,3H,5H)-嘧啶三酮7(5.41g,63%)。Rf0.27(己烷/EtOAc/AcOH 15∶5∶0.1)FAB MS C8H8Cl2N2O4(267.07)m/z(%)289[M+Na]+(10),267[M+H]+(100),231(66),197(33),183(24)1H NMR(CDCl3)d 17.94(s,1H,OH),7.91(s,1H,CH),3.43,3.35(2s,6H,2NCH3)实施例7:5-苯乙酰基-1,3-二甲基-2,4,6(1H,3H,5H)-嘧啶三酮(Dtpp-OH)8
将1,3-二甲基巴比土酸(5.00g,32.05mmol)、苯乙酸(6.53g,48.03mmol)、4-二甲基氨基吡啶(1.95g,16.01mmol)在无水二氯甲烷(30ml)中的混合物冷却至0℃,然后添加1,3-二环己基碳化二亚胺(7.26g,35.22mmol)。在室温下搅拌反应混合物过夜,然后过滤。固体用二氯甲烷(150ml)洗涤,而合并的溶液用2N盐酸溶液(40ml)洗涤。用硫酸镁干燥有机相,然后蒸发。残留物由甲醇中结晶,得到5-苯乙酰基-1,3-二甲基-2,4,6(1H,3H,5H)-嘧啶三酮8(6.10g,69%)。Rf0.41(己烷/EtOAc/AcOH 15∶5∶0.1)FAB MS C14H14N2O4(274.27)m/z(%)297[M+Na]+(11),275[M+H]+(100),257(13),183(31)1H NMR(CDCl3)d 17.61(s,1H,OH),7.54-7.26(m,5H,5 Ar-H),4.49(s,2H,CH2Ar),3.38,3.34(2s,6H,2NCH3)实施例8:5-二苯基乙酰基-1,3-二甲基-2,4,6(1H,3H,5H)-嘧啶三酮(Dtpd-OH)9
将1,3-二甲基巴比土酸(5.00g,32.05mmol)、二苯基乙酸(10.19g,48.03mmol)、4-二甲基氨基吡啶(1.95g,16.01mmol)在无水二氯甲烷(30ml)中的混合物冷却至0℃,然后添加1,3-二环己基碳化二亚胺(7.26g,35.22mmol)。在室温下搅拌反应混合物过夜,然后过滤。固体用二氯甲烷(150ml)洗涤,而合并的溶液用2N盐酸溶液(40ml)洗涤。用硫酸镁干燥有机相,然后蒸发。残留物由乙醇中结晶,得到5-二苯基乙酰基-1,3-二甲基-2,4,6(1H,3H,5H)-嘧啶三酮9(6.70g,59%)。Rf0.64(己烷/EtOAc/AcOH 15∶5∶0.1)FAB MS C20H18N2O4(350.36)m/z(%)373[M+Na]+(8),351[M+H]+(100),338(24),333(16)1H NMR(CDCl3)d 18.28(s,1H,OH),7.23-7.27(m,10H,10Ar-H),7.02(s,1H,CHAr2),3.36,3.31(2s,6H,2NCH3)实施例9:5-(1-金刚烷羰基)-1,3-二甲基-2,4,6(1H,3H,5H)-嘧啶三酮(Dtpa-OH)12
将1,3-二甲基巴比土酸(5.00g,32.05mmol)、1-金刚烷羧酸(8.65g,48.03mmol)、4-二甲基氨基吡啶(1.95g,16.01mmol)在无水二氯甲烷(30ml)中的混合物冷却至0℃,然后添加1,3-二环己基碳化二亚胺(7.26g,35.22mmol)。在室温下搅拌反应混合物过夜,然后过滤。固体用二氯甲烷(150ml)洗涤,而合并的溶液用2N盐酸溶液(40ml)洗涤。用硫酸镁干燥有机相,然后蒸发。残留物由甲醇中结晶,得到5-(金刚烷羰基)-1,3-二甲基-2,4,6(1H,3H,5H)-嘧啶三酮12(7.10g,69%)。Rf0.57(己烷/EtOAc/AcOH 15∶5∶0.1)FAB MS C17H22N2O4(318.37)m/z(%)319[M+H]+(100),301(33),223(13),183(94)1H NMR(CDCl3)d 19.23(s,1H,OH),3.38,3.35(2s,6H,2NCH3),2.18,2.07(2s,12H,6CH2),1.79(m,3H,3CH)实施例10:5-亚氨三氯乙基-1,3-二甲基-2,4,6(1H,3H,5H)-嘧啶三酮(Dtpe-NH2)13
将1,3-二甲基巴比土酸(5.00g,32.05mmol)、4-二甲基氨基吡啶(1.95g,16.01mmol)、1,8-二氮杂二环[5.4.0]十一-7烯/DBU/(10滴)在无水二氯甲烷(30ml)中的混合物冷却至0℃,然后在15分钟的时间内滴加三氯乙腈(13.87g,96.06mmol)。在0℃下搅拌反应混合物30分钟,然后在室温下搅拌3小时,用二氯甲烷(50ml)稀释,然后用1N硫酸氢钾溶液(10ml)洗涤。用硫酸镁干燥有机相,然后蒸发。残留物由甲醇中结晶,得到5-亚氨三氯乙基-1,3-二甲基-2,4,6(1H,3H,5H)-嘧啶三酮13(6.22g,65%)。Rf0.61(EtOAc/己烷1∶1)FAB MS C8H8Cl3N3O3(300.53)m/z(%)322[M+Na]+(10),300[M+H]+(100),264(43),243(17),207(11),183(17)1H NMR(CDCl3)d 13.13,7.83(2s,2H,2 NH),3.37,3.33(2s,6H,2NCH3)实施例11:5-(4-羧基丁酰基)-1,3-二甲基-2,4,6(1H,3H,5H)-嘧啶三酮(Dtpp-OH)10和1,5-二(1,3-二甲基二2,4,6-(1H,3H,5H)-三氧嘧啶-5-亚基)-1,5-二羟基戊烷33
将1,3-二甲基巴比土酸(5.00g,32.02mmol)、4-二甲基氨基吡啶(9.789g,80.05mmol)在无水二氯甲烷(75ml)中的混合物冷却至0℃,然后添加戊二酸酐(4.38g,38.42mmol)。在室温下搅拌反应混合物过夜,用二氯甲烷(150ml)稀释,然后用2N盐酸溶液(40ml)洗涤。用硫酸镁干燥有机相,然后蒸发。残留物由乙酸中结晶,得到1,5-二(1,3-二甲基-2,4,6-(1H,3H,5H)-三氧嘧啶-5-亚基)-1,5-二羟基戊烷33(1.2g)。Rf0.71(二氯甲烷/MeOH/AcOH 96∶3∶1)FAB MS C17H20N4O8(408.36)m/z(%)431[M+Na]+(8),409[M+H]+(100)1H NMR(CDCl3)d 17.67(s,2H,2OH),3.37,3.31(2s,12H,4NCH3),3.27(t,4H,2CH2),2.12(m,2H,CH2)
蒸发滤液,残留物用甲苯结晶,得到5-(4-羧基丁酰基)-1,3-二甲基-2,4,6(1H,3H,5H)-嘧啶三酮10(2.10g,24%)。Rf0.66(二氯甲烷/MeOH/AcOH 96∶3∶1)FAB MS C11H14N2O6(270.24)m/z(%)293[M+Na]+(10),271[M+H]+(100),253(22),225(22),211(20)1H NMR(CDCl3)d17.67(s,1H,OH),3.37,3.32(2s,6H,2NCH3),3.23(t,2H,CH2),2.48(t,2H,CH2),2.05(m,2H,CH2)实施例12:N-[1-(1,3-二甲基-2,4,6(1H,3H,5H)-三氧嘧啶-5-亚基)乙基]-1-丁胺2
将5-乙酰基-1,3-二甲基-2,4,6(1H,3H,5H)-嘧啶三酮(100mg,0.50mmol)溶解在正丁胺(10ml)中,并在室温下搅拌过夜。蒸发溶剂,残留物用乙醚洗涤,得到N-[1-(1,3-二甲基-2,4,6(1H,3H,5H)-三氧嘧啶-5-亚基)乙基]-1-丁胺2(121mg,95%)。Rf0.33(EtOAc/己烷2∶1)FAB MS C12H19N3O3(253.28)m/z(%)266[M+Na]+(8),254[M+H]+(100),195(14)1H NMR(CDCl3)d 12.55(s,1H,NH),3.44(m,2H,CH2),3.31,3.30(2s,6H,2 NCH3),2.68(s,3H,CH3),1.69,1.45(2m,4H,2CH2),0.97(t,3H,CH3)实施例13:N-[1-(1,3-二甲基-2,4,6(1H,3H,5H)-三氧嘧啶-5-亚基)苯基甲基]-1-丁胺4
将5-苯甲酰基-1,3-二甲基-2,4,6(1H,3H,5H)-嘧啶三酮(500mg,1.92mmol)和N,N-二异丙基乙基胺(248mg,1.92mmol)在正丁胺(10ml)中的混合物回流2小时。蒸发溶剂,残留物用1M硫酸氢钾溶液洗涤,然后干燥并蒸发。残留物用乙醚洗涤,得到N-[1-(1,3-二甲基-2,4,6(1H,3H,5H)-三氧嘧啶-5-亚基)苯基甲基]-1-丁胺4(575mg,95%)。Rf0.41(EtOAc/己烷/TFA10∶15∶0.1)FAB MS C17H21N3O3(315.36)m/z(%)338[M+Na]+(16),316[M+H]+(100),307(14)1H NMR(CDCl3)d 12.42(s,1H,NH),7.48(m,3H,3Ar-H),7.17(m,2H,2Ar-H),3.37,3.15(2s,6H,2NCH3),3.04(m,2H,CH2),1.52,1.32(2m,4H,2CH2),0.86(t,3H,CH3)实施例14:N-[1-(1,3-二甲基-2,4,6(1H,3H,5H)-三氧嘧啶-5-亚基)乙基]-甘氨酸14
将5-乙酰基-1,3-二甲基-2,4,6(1H,3H,5H)-嘧啶三酮(396mg,2.00mmol)、甘氨酸(100mg,1.33mmol)和N,N-二异丙基乙基胺(172mg,1.33mmol)在无水乙醇(10ml)中的混合物回流搅拌过夜。蒸发溶剂,残留物在二氯甲烷(100ml)中处理,然后用1M硫酸氢钾溶液(10ml)洗涤。过滤所得到的悬浮液,沉淀物用乙醚洗涤,然后在乙醇中重结晶,由此得到N-[1-(1,3-二甲基-2,4,6(1H,3H,5H)-三氧嘧啶-5-亚基)乙基]-甘氨酸14(290mg,85%)。Rf0.28(CH2Cl2/EtOAc/MeOH 10∶7∶1)FAB MS C10H13N3O5(255.22)m/z(%)278[M+Na]+(15),256[M+H]+(100),210(44)1H NMR(CDCl3)d 12.58(s,1H,NH),3.64(s,2H,CH2),3.34,3.31(2s,6H,2NCH3),2.69(s,3H,CH3)实施例15:N-[1-(1,3-二甲基-2,4,6(1H,3H,5H)-三氧嘧啶-5-亚基)苯基甲基]-甘氨酸15
将5-苯甲酰基-1,3-二甲基-2,4,6(1H,3H,5H)-嘧啶三酮(519mg,2.00mmol)、甘氨酸(100mg,1.33mmol)和N,N-二异丙基乙基胺(172mg,1.33mmol)在无水乙醇(10ml)中的混合物回流搅拌过夜。蒸发溶剂,残留物在二氯甲烷(100ml)中处理,用1M硫酸氢钾溶液(10ml)洗涤,然后用硫酸镁干燥并蒸发。残留物用乙醚悬浮,得到N-[1-(1,3-二甲基-2,4,6(1H,3H,5H)-三氧嘧啶-5-亚基)苯基甲基]-甘氨酸15(360mg,86%)。Rf 0.38(CH2Cl2/EtOAc/MeOH 10∶7∶1)FAB MS C15H15N3O5(317.29)m/z(%)318[M+H]+(60),272(15),130(100)1H NMR(DMSO-d6)d12.30(t,1H,NH),7.43(m,3H,3Ar-H),7.14(m,2H,2Ar-H),3.76(d,2H,CH2),3.20,2.93(2s,6H,2NCH3)实施例16:N-[1-(1,3-二甲基-2,4,6(1H,3H,5H)-三氧嘧啶-5-亚基)苯基乙基]-甘氨酸16
将5-苯乙酰基-1,3-二甲基-2,4,6(1H,3H,5H)-嘧啶三酮(548mg,2.00mmol)、甘氨酸(100mg,1.33mmol)和N,N-二异丙基乙基胺(172mg,1.33mmol)在无水乙醇(10ml)中的混合物回流搅拌过夜。蒸发溶剂,残留物在二氯甲烷(100ml)中处理,用1M硫酸氢钾溶液(10ml)洗涤,然后用硫酸镁干燥并蒸发。残留物用乙醚悬浮,得到N-[1-(1,3-二甲基-2,4,6(1H,3H,5H)-三氧嘧啶-5-亚基)苯基乙基]-甘氨酸16(360mg,81%)。Rf0.40(CH2Cl2/EtOAc/MeOH10∶7∶1)FAB MS C16H17N3O5(331.32)m/z(%)354[M+Na]+(15),332[M+H]+(80),286(20),130(100)1H NMR(CDCl3)d 13.05(s,1H,NH),7.32-7.16(m,5H,5Ar-H),4.69(s,2H,CH2Ar),4.14(d,2H,CH2),3.37,3.29(2s,6H,2NCH3)实施例17:断裂5-酰基-1,3-二甲基巴比土酸保护的伯胺形成5-酰基-1,3-二甲基巴比土酸保护的羟胺34
在室温下于NH2OH/MeOH(20%,10ml)中搅拌N-[1-(1,3-二甲基-2,4,6(1H,3H,5H)-三氧嘧啶-5-亚基)苯基甲基]-羟胺17和苄基2-脱氧-2-氨基-α-D-吡喃葡糖苷34苄基2-脱氧-2-[1-(1,3-二甲基-2,4,6(1H,3H,5H)-三氧嘧啶-5-亚基)苯基甲基氨基]-α-D-吡喃葡糖苷22(100mg,0.19mmol)30分钟。蒸发溶液,残留物用乙醚(20ml)悬浮,然后过滤,得到苄基2-脱氧2-氨基-α-D-吡喃葡糖苷34(45mg,90%)。Rf0.11(CH2Cl2/EtOAc/MeOH 10∶7∶3)FAB MS C13H19NO5(269.28)m/z(%)292[M+Na]+(45),270[M+H]+(100),253(20),178(18)1H NMR(DMSO-d6)d7.35-7.25(m,5H,5Ar-H),4.91,4.56(2s,2H,2NH),4.73(d,1H,H-1,J1,2=3.44 Hz),4.66,4.40(2d,2H,CH2Ar),3.61-3.05(5糖-H),2.40(dd,1H,H-2)
蒸发滤液,使用CH2Cl2/EtOAc/MeOH 10∶7∶1进行色谱纯制,得到N-[1-(1,3-二甲基-2,4,6(1H,3H,5H)-三氧嘧啶-5-亚基)苯基甲基]-羟胺17(40mg,73%)。Rf0.76(CH2Cl2/EtOAc/MeOH 10∶7∶3)FAB MS C13H14N4O3(275.25)m/z(%)298[M+Na]+(13),276[M+H]+(100),243(20)1H NMR(CDCl3)d 13.95(s,1H,NH),7.32-7.16(m,5H,5Ar-H),3.39,3.14(2s,6H,2NCH3)实施例18:N-[1-(1,3-二甲基-2,4,6(1H,3H,5H)-三氧嘧啶-5-亚基)苯基甲基]-乙酰肼18
将5-苯甲酰基-1,3-二甲基-2,4,6(1H,3H,5H)-嘧啶三酮3(260mg,1.00mmol)和乙酰肼(222mg,3.00mmol)在无水乙醇(10ml)中回流搅拌过夜。蒸发溶剂,残留物在二氯甲烷(100ml)中处理,用1M硫酸氢钾溶液(10ml)洗涤,然后用硫酸镁干燥并蒸发。残留物用甲醇结晶,得到N-[1-(1,3-二甲基-2,4,6(1H,3H,5H)-三氧嘧啶-5-亚基)苯基甲基]-乙酰肼18(250mg,79%)。Rf0.42(MeCN/CHCl3 2∶1)FAB MS C15H16N4O4(316.31)m/z(%)339[M+Na]+(28),317[M+H]+(100)1H NMR(CDCl3)d 13.84(s,1H,NH),7.61(s,1H,NH),7.49,7.20(2m,5H,5Ar-H),3.38,3.13(2s,6H,2 NCH3),1.77(s,3H,NAc)实施例19:断裂5-酰基-1,3-二甲基巴比土酸保护的伯胺形成5-酰基-1,3-二甲基巴比土酸保护的肼N-[1-(1,3-二甲基-2,4,6(1H,3H,5H)-三氧嘧啶-5-亚基)苯基甲基]-肼19
在室温下于N2H4/MeOH(20%,10ml)中搅拌苄基2-脱氧-2-[1-(1,3-二甲基-2,4,6(1H,3H,5H)-三氧嘧啶-5-亚基)苯基甲基氨基]-α-D-吡喃葡糖苷22(100mg,0.19mmol)30分钟。蒸发溶液,残留物用乙醚(20ml)悬浮,然后过滤,得到苄基2-脱氧-2-氨基-α-D-吡喃葡糖苷34(45mg,90%)。Rf0.11(CH2Cl2/EtOAc/MeOH 10∶7∶3)
蒸发滤液,使用CH2Cl2/EtOAc/MeOH 10∶7∶3作为流动相进行色谱纯制,得到N-[1-(1,3-二甲基-2,4,6(1H,3H,5H)-三氧嘧啶-5-亚基)苯基甲基]-肼19(40mg,74%)。Rf0.66(CH2Cl2/EtOAc/MeOH 10∶7∶3)FAB MS C13H14N4O3(274.25)m/z(%)297[M+Na]+(15),275[M+H]+(100),243(20)1H NMR(CDCl3)d 13.75(s,1H,NH),7.32-7.16(m,5H,5Ar-H),3.38,3.13(2s,6H,2NCH3)实施例20:用氨断裂5-酰基-1,3-二甲基巴比土酸保护的伯胺形成氨基取代的5-酰基-1,3-二甲基巴比土酸5-苯亚氨基-1,3-二甲基-2,4,6(1H,3H,5H)-嘧啶三酮20
在室温下于NH3/MeOH(20%,10ml)中搅拌苄基2-脱氧-2-[1-(1,3-二甲基-2,4,6(1H,3H,5H)-三氧嘧啶-5-亚基)苯基甲基氨基]-α-D-吡喃葡糖苷22(100mg,0.19mmol)30分钟。蒸发溶液,残留物用乙醚(20ml)悬浮,然后过滤,得到苄基2-脱氧-2-氨基-α-D-吡喃葡糖苷34(48mg,92%)。Rf0.11(CH2Cl2/EtOAc/MeOH 10∶7∶3)
蒸发滤液,得到5-苯亚氨基-1,3-二甲基-2,4,6(1H,3H,5H)-嘧啶三酮20(47mg,93%)。Rf0.86(CH2Cl2/EtOAc/MeOH 10∶7∶3)FAB MS C13H13N3O3(259.25)m/z(%)282[M+Na]+(35),260[M+H]+(100),243(20)1H NMR(CDCl3)d 12.48(s,1H,NH),7.32-7.16(m,5H,5Ar-H),3.38,3.30(2s,6H,2NCH3)实施例21:用伯胺断裂5-酰基-1,3-二甲基巴比土酸保护的伯胺N-[1-(1,3-二甲基-2,4,6(1H,3H,5H)-三氧嘧啶-5-亚基)苯基甲基]-1-丁胺4
在室温下于10ml正丁胺中搅拌苄基2-脱氧-2-[1-(1,3-二甲基-2,4,6(1H,3H,5H)-三氧嘧啶-5-亚基)苯基甲基氨基]-α-D-吡喃葡糖苷22(100mg,0.19mmol)30分钟。蒸发溶液,残留物用乙醚(20ml)悬浮,然后过滤,得到苄基2-脱氧-2-氨基-α-D-吡喃葡糖苷34(48mg,92%)。Rf0.11(CH2Cl2/EtOAc/MeOH 10∶7∶3)
蒸发滤液,得到N-[1-(1,3-二甲基-2,4,6(1H,3H,5H)-三氧嘧啶-5-亚基)苯基甲基]-1-丁胺4(50mg,94%)。Rf0.89(CH2Cl2/EtOAc/MeOH 10∶7∶3)实施例22:苄基2-脱氧-2-[1-(1,3-二甲基-2,4,6(1H,3H,5H)-三氧嘧啶-5-亚基)乙基氨基]-α-D-吡喃葡糖苷21
将5-乙酰基-1,3-二甲基-2,4,6(1H,3H,5H)-嘧啶三酮1(220mg,1.11mmol)、苄基2-氨基-2-脱氧-α-D-吡喃葡糖苷34(200mg,0.74mmol)和N,N-二异丙基乙基胺(96mg,0.74mmol)在无水乙醇(10ml)中的混合物回流搅拌过夜。蒸发溶剂,残留物在二氯甲烷(100ml)中处理,然后用1M硫酸氢钾溶液(10ml)洗涤。过滤所得到的悬浮液,沉淀物用乙醚洗涤,得到苄基2-脱氧-2-[1-(1,3-二甲基-2,4,6(1H,3H,5H)-三氧嘧啶-5-亚基)乙基氨基]-α-D-吡喃葡糖苷21(245mg,73%)。Rf0.43(CH2Cl2/EtOAc/MeOH 10∶7∶3)FAB MS C21H27N3O8(449.45)m/z(%)472[M+Na]+(12),450[M+H]+(100),358(25),342(66)1H NMR(DMSO-d6)d12.68(s,1H,NH),7.46(d,2H,2Ar-H),7.31(m,3H,3Ar-H),4.95(d,1H,H-1,J1,2=3.60Hz),3.19,3.15(2s,6H,2NCH3),2.65(s,3H,CH3)实施例23:苄基2-脱氧-2-[1-(1,3-二甲基-2,4,6(1H,3H,5H)-三氧嘧啶-5-亚基)苯基甲基氨基]-α-D-吡喃葡糖苷22
将5-苯甲酰基-1,3-二甲基-2,4,6(1H,3H,5H)-嘧啶三酮3(290mg,1.11mmol)、苄基2-氨基-2-脱氧-α-D-吡喃葡糖苷34(200mg,0.74mmol)和N,N-二异丙基乙基胺(96mg,0.74mmol)的混合物在无水乙醇(10ml)中的混合物回流搅拌过夜。蒸发溶剂,残留物在二氯甲烷(100ml)中处理,然后用1M硫酸氢钾溶液(10ml)洗涤并蒸发。残留物由MeCN结晶,得到苄基2-脱氧-2-[1-(1,3-二甲基-2,4,6(1H,3H,5H)-三氧嘧啶-5-亚基)苯基甲基氨基]-α-D-吡喃葡糖苷22(270mg,71%)。Rf0.35(CH2Cl2/EtOAc/MeOH 10∶7∶1)FAB MS C26H29N3O8(511.51)m/z(%)534[M+Na]+(18),512[M+H]+(100),420(18),404(36),338(75)1H NMR(DMSO-d6)d12.47(s,1H,NH),7.41-7.17(m,10H,10Ar-H),4.66(d,1H,H-1,J1,2=3.55Hz),4.68,4.48(2d,2H,CH2Ar),2.99,2.94(2s,6H,2NCH3)实施例24:苄基2-脱氧-2-[1-(1,3-二甲基-2,4,6(1H,3H,5H)-三氧嘧啶-5-亚基)(9-芴基甲基氨基)]-α-D-吡喃葡糖苷23
将5-(9-芴基羰基)-1,3-二甲基-2,4,6(1H,3H,5H)-嘧啶三酮5(388mg,1.11mmol)和苄基2-氨基-2-脱氧-α-D-吡喃葡糖苷34(200mg,0.74mmol)在无水乙醇(10ml)中的混合物回流搅拌过夜。蒸发溶剂,残留物在二氯甲烷(100ml)中处理,然后用1M硫酸氢钾溶液(10ml)洗涤并蒸发。使用CHCl3/MeCN/AcOH10∶10∶0.1对残留物进行色谱纯制,得到苄基2-脱氧-2-[1-(1,3-二甲基-2,4,6(1H,3H,5H)-三氧嘧啶-5-亚基)(9-芴基甲基氨基)]-α-D-吡喃葡糖苷23(140mg,31%)。Rf0.37(CHCl3/MeCN/AcOH 10∶10∶0.1)FAB MS C33H33N3O8(599.61)m/z(%)662[M+Na]+(48),600[M+H]+(100),492(88),474(26),346(75)1H NMR(CDCl3)d12.72(d,1H,NH),7.85-6.77(m,14H,13 Ar-H,CH),4.57,4.22(2d,2H,CH2Ar),3.47,3.40(2s,6H,2NCH3)实施例25:苄基2-脱氧-2-[1-(1,3-二甲基-2,4,6(1H,3H,5H)-三氧嘧啶-5-亚基)苯基乙基氨基]-α-D-吡喃葡糖苷24
将5-苯乙酰基-1,3-二甲基-2,4,6(1H,3H,5H)-嘧啶三酮8(305mg,1.11mmol)、苄基2-氨基-2-脱氧-α-D-吡喃葡糖苷34(200mg,0.74mmol)和N,N-二异丙基乙基胺(96mg,0.74mmol)在无水乙醇(10ml)中的混合物回流搅拌过夜。蒸发溶剂,残留物在二氯甲烷(100ml)中处理,然后用1M硫酸氢钾溶液(10ml)洗涤并蒸发。使用CHCl3/EtOAc/MeOH 10∶7∶1作为流动相对残留物进行色谱纯制,得到苄基2-脱氧-2-[1-(1,3-二甲基-2,4,6(1H,3H,5H)-三氧嘧啶-5-亚基)苯基乙基氨基]-α-D-吡喃葡糖苷24(280mg,72%)。Rf0.47(CHCl3/EtOAc/MeOH10∶7∶1)FAB MS C27H31N3O8(525.54)m/z(%)548[M+Na]+(22),526[M+H]+(100),417(52),274(47)1H NMR(DMSO-d6)d12.88(d,1H,NH),7.41-7.01(m,10H,10Ar-H),4.65,4.39(2d,2H,CH2Ar),4.38(d,1H,H-1,J1,2=3.03Hz),3.23,3.09(2s,6H,2NCH3)实施例26:苄基2-脱氧-2-[1-(1,3-二甲基-2,4,6(1H,3H,5H)-三氧嘧啶-5-亚基)二苯基乙基氨基]-α-D-吡喃葡糖苷25
将5-二苯基乙酰基-1,3-二甲基-2,4,6(1H,3H,5H)-嘧啶三酮9(390mg,1.11mmol)、苄基2-氨基-2-脱氧-α-D-吡喃葡糖苷34(200mg,0.74mmol)和N,N-二异丙基乙基胺(96mg,0.74mmol)在无水乙醇(10ml)中的混合物回流搅拌过夜。蒸发溶剂,残留物在二氯甲烷(100ml)中处理,然后用1M硫酸氢钾溶液(10ml)洗涤并蒸发。使用1,2-二氯乙烷/MeOH/AcOH 10∶1∶0.1作为流动相对残留物进行色谱纯制,得到苄基2-脱氧-2-[1-(1,3-二甲基-2,4,6(1H,3H,5H)-三氧嘧啶-5-亚基)二苯基乙基氨基]-α-D-吡喃葡糖苷25(300mg,68%)。Rf0.37(1,2-二氯乙烷/MeOH/AcOH 10∶1∶0.1)FAB MS C33H35N3O8(601.63)m/z(%)624[M+Na]+(20),602[M+H]+(100),494(47),348(42),338(39)1H NMR(CDCl3)d13.44(d,1H,NH),8.15(s,1H,CHAr2),7.52-6.94(m,15H,15Ar-H),4.55,4.21(2d,2H,CH2Ar),3.39,3.29(2s,6H,2NCH3)实施例27:苄基2-脱氧-2-[1-(1,3-二甲基-2,4,6(1H,3H,5H)-三氧嘧啶-5-亚基)(2,2-二甲基戊基氨基)]-α-D-吡喃葡糖苷28
将5-新戊酰基-1,3-二甲基-2,4,6(1H,3H,5H)-嘧啶三酮11(267mg,1.11mmol)、苄基2-氨基-2-脱氧-α-D-吡喃葡糖苷34(200mg,0.74mmol)和N,N-二异丙基乙基胺(96mg,0.74mmol)在无水乙醇(10ml)中的混合物回流搅拌过夜。蒸发溶剂,残留物在二氯甲烷(100ml)中处理,然后用1M硫酸氢钾溶液(10ml)洗涤并蒸发。使用CH2Cl2/EtOAc/MeOH 10∶7∶3作为流动相对残留物进行色谱纯制,得到苄基2-脱氧-2-[1-(1,3-二甲基-2,4,6(1H,3H,5H)-三氧嘧啶-5-亚基)(2,2-二甲基戊基氨基)]-α-D-吡喃葡糖苷28(240mg,66%)。Rf0.47(CH2Cl2/EtOAc/MeOH 10∶7∶3)FAB MS C24H33N3O8(491.52)m/z(%)514[M+Na]+(28),492[M+H]+(100),270(52),240(54)1H NMR(CDCl3)d12.76(d,1H,NH),7.29(m,5H,5Ar-H),4.64,4.40(2d,2H,CH2Ar),3.24,3.21(2s,6H,2NCH3),1.37(s,9H,3CH3)实施例28:苄基2-脱氧-2-[1-(1,3-二甲基-2,4,6(1H,3H,5H)-三氧嘧啶-5-亚基)(1-金刚烷基甲基氨基)]-α-D-吡喃葡糖苷29
将5-金刚烷羰基-1,3-二甲基-2,4,6(1H,3H,5H)-嘧啶三酮12(709mg,2.23mmol)、苄基2-氨基-2-脱氧-α-D-吡喃葡糖苷34(200mg,0.74mmol)和N,N-二异丙基乙基胺(96mg,0.74mmol)在无水乙醇(10ml)中的混合物回流搅拌过夜。蒸发溶剂,残留物在二氯甲烷(100ml)中处理,然后用1M硫酸氢钾溶液(10ml)洗涤并蒸发。残留物用乙醚悬浮,得到苄基2-脱氧-2-[1-(1,3-二甲基-2,4,6(1H,3H,5H)-三氧嘧啶-5-亚基)-(1-金刚烷基甲基氨基)]-α-D-吡喃葡糖苷29(260mg,62%)。Rf0.45(CH2Cl2/EtOAc/MeOH 10∶7∶3)FAB MS C30H39N3O8(569.63)m/z(%)592[M+Na]+(60),570[M+H]+(100)1H NMR(CDCl3)d12.74(d,1H,NH),7.33(m,5H,5Ar-H),4.65,4.43(2d,2H,CH2Ar),3.27,3.22(2s,6H,2NCH3),2.13,2.04(2s,12H,6CH2),1.72(m,3H,3CH)实施例29:伯胺与5-亚氨三氯乙基-1,3-二甲基-2,4,6(1H,3H,5H)-嘧啶三酮的反应苄基2-脱氧-2-[1-(1,3-二甲基-2,4,6(1H,3H,5H)-三氧嘧啶-5-亚基)氨基甲基氨基]-α-D-吡喃葡糖苷27
将5-亚氨三氯乙基-1,3-二甲基-2,4,6(1H,3H,5H)-嘧啶三酮13(333mg,1.11mmol)、苄基2-氨基-2-脱氧-α-D-吡喃葡糖苷34(200mg,0.74mmol)和N,N-二异丙基乙基胺(96mg,0.74mmol)在无水乙醇(10ml)中的混合物回流搅拌过夜。蒸发溶剂,残留物在二氯甲烷(100ml)中处理,然后用1M硫酸氢钾溶液(10ml)洗涤并蒸发。使用CH2Cl2/EtOAc/MeOH 10∶7∶3作为流动相对残留物进行色谱纯制,得到苄基2-脱氧-2-[1-(1,3-二甲基-2,4,6(1H,3H,5H)-三氧嘧啶-5-亚基)氨基甲基氨基]-α-D-吡喃葡糖苷27(250mg,75%)。Rf0.41(CH2Cl2/EtOAc/MeOH 10∶7∶3)FAB MS C20H26N4O8(450.44)m/z(%)473[M+Na]+(21),451[M+H]+(100),358(15),342(74),265(269)1H NMR(DMSO-d6)d10.86(d,1H,NH),10.06(s,1H,NH),7.74(s,1H,NH),7.42(d,2H,2Ar-H),7.29(m,3H,3Ar-H),4.87(d,1H,H-1,J1,2=3.22Hz),4.69,4.48(2d,6H,2CH2Ar)实施例30:制备“连接基-糖结合物”苄基2-脱氧-2-[1-(1,3-二甲基-2,4,6(1H,3H,5H)-三氧嘧啶-5-亚基)(4-羧基丁基氨基)]-α-D-吡喃葡糖苷26
将5-(4-羧基丁酰基)-1,3-二甲基-2,4,6(1H,3H,5H)-嘧啶三酮10(301mg,1.11mmol)、苄基2-氨基-2-脱氧-α-D-吡喃葡糖苷(200mg,0.74mmol)和N,N-二异丙基乙基胺(240mg,1.85mmol)在无水乙醇(10ml)中的混合物回流搅拌过夜。蒸发溶剂,残留物在二氯甲烷(100ml)中处理,然后用1M硫酸氢钾溶液(10ml)洗涤。过滤所得的悬浮物,沉淀物用乙醚洗涤,由此得到苄基2-脱氧-2-[1-(1,3-二甲基-2,4,6(1H,3H,5H)-三氧嘧啶-5-亚基)(4-羧基丁基氨基)]-α-D-吡喃葡糖苷26(280mg,73%)。Rf 0.28(CH2Cl2/EtOAc/MeOH 10∶7∶5)FAB MS C24H31N3O10(521.51)m/z(%)544[M+Na]+(25),522[M+H]+(100),430(21),414(75)1H NMR(DMSO-d6)d12.70(d,1H,NH),7.45-7.18(m,5H,5Ar-H),4.97(d,1H,H-1,J1,2=3.47Hz),4.97,4.72(2d,2H,CH2Ar),3.17,3.14(2d,6H,2NCH3),3.00(t,2H,CH2),2.34(m,4H,2 CH2)实施例31:用于伯胺保护的手性5-酰基-1,3-二甲基巴比土酸衍生物N,N’-二(苄基2-脱氧-α-D-吡喃葡糖苷-2-基)-[5-(2-氨基亚氨乙基)-1,3-二甲基-2,4,6(1H,3H,5H)-嘧啶三酮]30和5-[N-(苄基2-脱氧-α-D-吡喃葡糖苷-2-基)氨基乙酰基]-1,3-二甲基-2,4,6(1H,3H,5H)-嘧啶三酮31
将5-氯乙酰基-1,3-二甲基-2,4,6(1H,3H,5H)-嘧啶三酮6(260mg,1.11mmol)、苄基2-氨基-2-脱氧-α-D-吡喃葡糖苷34(200mg,0.74mmol)和N,N-二异丙基乙基胺(96mg,0.74mmol)在无水乙醇(10ml)中的混合物回流搅拌过夜。蒸发溶剂,残留物在二氯甲烷(100ml)中处理,然后用1M硫酸氢钾溶液(10ml)洗涤并蒸发。使用CH2Cl2/EtOAc/MeOH 10∶7∶3作为流动相对残留物进行色谱纯制,得到苄基N,N’-二(苄基2-脱氧-α-D-吡喃葡糖苷-2-基)-[5-(2-氨基亚氨乙基)-1,3-二甲基-2,4,6(1H,3H,5H)-嘧啶三酮]30(110mg,21%)。Rf0.42(CH2Cl2/EtOAc/MeOH 10∶7∶3)FAB MS C34H44N4O13(716.72)m/z(%)739[M+Na]+(22),717[M+H]+(100)1H NMR(DMSO-d6)d 12.58(d,1H,NH),7.43-7.25(m,10H,10Ar-H),4.65-4.24(4d,4H,2CH2Ar),3.18,3.08(2s,6H,2NCH3)
还得到5-[N-(苄基2-脱氧-α-D-吡喃葡糖苷-2-基)氨基乙酰基]-1,3-二甲基-2,4,6(1H,3H,5H)-嘧啶三酮31(80mg,23%)。Rf0.33(CH2Cl2/EtOAc/MeOH 10∶7∶3)FAB MS C21H27N3O9(465.45)m/z(%)488[M+Na]+(27),466[M+H]+(100)1H NMR(DMSO-d6)d17.22(s,1H,OH),7.41-7.27(m,5H,5Ar-H),4.68,4.46(2d,2H,CH2Ar),3.19,3.14(2s,6H,2NCH3)实施例32:制备树脂-连接基-糖结合物苄基2-脱氧-2-[1-(1,3-二甲基-2,4,6(1H,3H,5H)-三氧嘧啶-5-亚基)(4-羧基丁基氨基)]-3,4,6-三-O-乙酰基-α-D-吡喃葡糖苷-MBHA树脂结合物32
将苄基2-脱氧-2-[1-(1,3-二甲基-2,4,6(1H,3H,5H)-三氧嘧啶-5-亚基)(4-羧基丁基氨基)]-α-D-吡喃葡糖苷26(300mg,1.11mmol)溶解在吡啶(10ml)中,冷却至0℃,然后添加乙酸酐(7ml)。在室温下搅拌反应混合物过夜。蒸发溶剂,在二氯甲烷(70ml)中处理残留物,用1M硫酸氢钾溶液洗涤,用硫酸镁干燥,然后蒸发。残留物在DMF(10ml)中处理,并在树脂工作期间作为试剂使用。在DMF中溶涨MBHA树脂(取代率:0.42mmol/g)(200mg)共20分钟,该树脂总共带有0.084mmol的胺官能度。接着用新制的DMF洗涤树脂,然后添加苄基2-脱氧-2-[1-(1,3-二甲基-2,4,6(1H,3H,5H)-三氧嘧啶-5-亚基)(4-羧基丁基氨基)]-3,4,6-三-O-乙酰基α-D-吡喃葡糖苷DMF溶液(5ml,6.6当量)和N,N’-二异丙基碳化二亚胺(88ml,6.6当量),最后轻柔地搅拌树脂30分钟。最终的TNBS实验为阳性,因此使用上述条件进行双偶联,此时产生阴性的TNBS测试结果。用DMF、甲醇和乙醚洗涤树脂。然后于氢氧化钾上在真空中使树脂干燥过夜。实施例33:“完全保护的糖-连接基-树脂结合物”的糖脱保护以及断裂产生“氨基取代的树脂一连接基结合物”35
在无水甲醇(5ml)中于室温下用甲醇钠(100mg,1.85mmol)轻柔地搅拌实施例32中的树脂1小时。用无水甲醇(5×10ml)、DMF(5×10ml)、乙醚(5×10ml)洗涤该树脂,然后真空干燥1小时,得到结合树脂的未经保护的苄基2-氨基-2-脱氧-α-D-吡喃葡糖苷。在室温下用饱和NH3/MeOH(0.2ml)断裂树脂样品(5mg)10分钟。过滤出树脂,蒸发滤液,产生定量的苄基2-氨基-2-脱氧-α-D-吡喃葡糖苷34。在断裂条件下,所述树脂转变为氨基取代的形式35。实施例34:使用“氨基取代的树脂-连接基结合物”制备“树脂-连接基-糖结合物”
在无水乙醇中轻柔地回流搅拌“氨基取代的树脂-连接基结合物”35(100mg,0.042mmol胺官能度)、苄基2-氨基-2-脱氧-α-D-吡喃葡糖苷34(34mg,0.13mmol)和二异丙基乙基胺(16mg,0.126mmol)过夜。过滤反应混合物,用MeOH、DMF、CH2Cl2、乙醚洗涤树脂,然后干燥,得到“树脂-连接基-糖结合物”37。实施例35:制备“羟基取代的树脂-连接基结合物”36
使带有总共0.084mmol之胺官能度的MBHA树脂(取代率:0.42mmol/g)(200mg)在DMF中溶涨20分钟。用新制的DMF洗涤树脂,然后在DMF(5ml)中添加5-(4-羧基丁酰基)-1,3-二甲基-2,4,6(1H,3H,5H)-嘧啶三酮10(68mg,0.25mmol)和N,N’-二异丙基碳化二亚胺(40ml,3.0当量),轻柔地搅拌树脂30分钟。最终的TNBS实验为阳性,因此使用上述条件进行双偶联,此时产生阴性的TNBS测试结果。用DMF、甲醇和乙醚洗涤树脂。然后于氢氧化钾上在真空中使树脂干燥过夜,得到36。实施例36:使用“氨基取代的树脂-连接基结合物”制备“羟基取代的树脂-连接基结合物”36
在1M氢氧化钠溶液(2.0ml)中于室温下搅拌“氨基取代的树脂-连接基结合物”35(50mg,0.021mmol官能度)10分钟。过滤混合物,用水、甲醇和乙醚洗涤。然后于氢氧化钾上在真空中使树脂干燥过夜,得到36。实施例37:制备“2-乙酰基-1,3-茚满二酮”38
在-20℃下在无水1,2-二氯乙烷(60ml)中搅拌4-二甲基氨基吡啶(664mg,5.44mmol)、三乙基胺(7.6ml,54.56mmol)、乙酸酐(6.2ml,65.48mmol)的混合物,然后在1.5小时的时间内滴加1,3-茚满二酮(7.96g,54.56mmol)在1,2-二氯乙烷中的溶液。搅拌反应混合物30分钟,然后用10%盐酸(80ml)洗涤,接着用水(80ml)洗涤两次。用硫酸镁干燥有机相,然后蒸发。残留物用甲基-叔丁基醚(50ml)结晶,得到2-乙酰基-1,3-茚满二酮38(6.5g,63%)。Rf0.27(己烷-乙酸乙酯-乙酸20∶5∶0.5)MSC11H8O3m/z(%)189[M+H]+(100),166(72),104(20)实施例38:甲基2-脱氧-2-[1-(1,3-二甲基-2,4,6(1H,3H,5H)-三氧嘧啶-5-亚基)乙基氨基]-1-硫代-b-D-吡喃葡糖苷39
将甲基2-脱氧-2-氨基-1-硫代-β-D-吡喃葡糖苷(5.00g,23.9mmol)溶解在无水乙醇(70ml)中,然后添加1,3-二甲基巴比土酸(9.47g,47.8mmol),形成悬浮液。接着添加三乙基胺(5.40g,53.3mmol),并在回流下加热所得的澄清溶液14小时。蒸发溶剂,将残留物溶解在二氯甲烷(200ml)中,然后添加5%盐酸溶液(200ml)。收集形成的沉淀物,并由乙酸乙酯中重结晶,得到甲基2-脱氧-2-[1-(1,3-二甲基-2,4,6(1H,3H,5H)-三氧嘧啶-5-亚基)乙基氨基]-1-硫代-β-D-吡喃葡糖苷39(7.82g,84.1%),其为无色固体。Rf0.57(CH3CN/H2O9∶1)ESI-MS MS m/z 390.0(M+H)1H NMR(CDCl3)d 4.650(d,3H,J1,2=9.9Hz,H1),3.894(dd,1H,H-3),3.716(dd,1H,H-4),3.547(dd,1H,H-2),3.426(d,2H,H-6),3.306(m,1H,H-5),3.266(s,6H,2×N-CH3),2.730(s,3H,vinylic-CH3),2.211(s,3H,S-CH3)
对本领域技术人员显而易见的是,虽然已经为清楚和理解的目的详细地说明了本发明,但在不偏离本发明之范围的情况下仍可对其进行多种的改进和修改。
以下列出本说明书中引用的参考文献,并在此并入作为参考。参考文献
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Claims (35)
1、一种通式I的环状化合物:其中:所述环是环烷基、经取代的环烷基、环杂烷基、经取代的环杂烷基、饱和二环[p,q,r]、经取代的饱和二环[p,q,r]、饱和杂二环[p,q,r]、经取代的饱和杂二环[p,q,r]、不饱和二环[p,q,r]、经取代的不饱和二环[p,q,r]、不饱和杂二环[p,q,r]、经取代的不饱和杂二环[p,q,r]、饱和三环[p,q,r,s]、经取代的饱和三环[p,q,r,s]、不饱和三环[p,q,r,s]、经取代的不饱和三环[p,q,r,s]、饱和杂三环[p,q,r,s]、经取代的饱和杂三环[p,q,r,s]、不饱和杂三环[p,q,r,s]、或者经取代的不饱和杂三环[p,q,r,s]环系;p、q、r和s可相同或不同,p、q、r和s分别是0-5的整数;
X是氧、硫、亚氨基或经取代的亚氨基;
R1是氢;烷基、烯基、炔基、杂烷基、芳基、杂芳基、环杂芳基、环烷基、杂环烷基、链烷醛或者硫代链烷醛基,这些基团可以是经取代的或者未经取代的;NH2、胍基、CN、经取代的氨基、季铵、O-、甲酰基、亚氨基或经取代的亚氨基、COOH、或者羧酸衍生物;
R2是烷基氨基、二烷基氨基、芳基氨基、或者二芳基氨基,这些基团可以是经取代的或者未经取代的;O-取代的羟基氨基、经取代或未经取代的肼基、经取代或未经取代的酰肼基、经取代或未经取代的硫代酰肼基、半卡巴肼基、硫代半卡巴肼基、OH、O-M、NH2、NHOH、SH、S-M+、卤素;O-烷基、O-酰基、O-芳基、烷硫基、S-芳基、酰基硫基、烷基磺酰基或者芳基磺酰基,这些基团可以是经取代的或者未经取代的;而M是金属离子,或者是有机或无机阳离子如季铵基、三苯甲基或者铵基,
其条件是:所述化合物不是国际专利申请PCT/AU97/00544中所公开者。
2、如权利要求1所述的化合物,其中,所述环是4-8元环烷基、经取代的环烷基、环杂烷基或经取代的环杂烷基。
5、如权利要求1或2所述的化合物,其为通式II所示者:其中:各R分别独立地是H或者经取代的或未经取代的烷基、芳基、环烷基、杂烷基、杂芳基或杂环烷基;而且
R1和R2如权利要求1中所定义。
6、如权利要求5所述的化合物,其中,各R基团具有1-6个碳原子。
7、如权利要求5或6所述的化合物,其中,各R基团具有1-4个碳原子。
8、如权利要求1-3、5或6之一所述的化合物,其选自于以下组中:5-酰基-1,3-二甲基巴比土酸、5-氯乙酰基-1,3-二甲基巴比土酸、5-亚氨三氯乙基-1,3-二甲基巴比土酸、以及它们的衍生物。
10、如权利要求1-9之一所述的化合物,其是手性的。
12、如权利要求11所述的化合物,其中,R3是氨基糖、寡糖、氨基酸或肽。
13、如权利要求11所述的化合物,其中,R3是经保护、未经保护或经取代的糖氨基基团、糖基氨基基团、寡糖的糖基氨基基团;或者是通过经取代或未经取代的烷基氨基、芳基氨基、环烷基氨基、杂烷基氨基、杂芳基氨基或杂环烷基氨基偶联的单或寡糖。
14、如权利要求11所述的化合物,其中,R3是寡糖-O-CH2-(C6H4)-NH-、单糖-O-CH2-(C6H4)-NH、寡糖-CO2CH2-(C6H4)-NH-、或者单糖-CO2CH2-(C6H4)-NH基团。
16、如权利要求15所述的化合物,其中,R3是氨基糖、寡糖、氨基酸或肽。
17、如权利要求15所述的化合物,其中,R3是经保护的、未经保护的或经取代的糖氨基基团、糖基氨基基团、或者寡糖的糖基氨基基团;或者是通过经取代或未经取代的烷基氨基、芳基氨基、环烷基氨基、杂烷基氨基、杂芳基氨基或杂环烷基氨基偶联的单或寡糖。
18、如权利要求15所述的化合物,其中,R3是寡糖-O-CH2-(C6H4)-NH-、单糖-O-CH2-(C6H4)-NH、寡糖-CO2CH2-(C6H4)-NH-、或者单糖-CO2CH2-(C6H4)-NH基团。
21、如权利要求19或20所述的化合物,其中,所述共价连接由下述基团提供:-CONH-、-O-、-S-、-NH-、-COO-、-COS-、-CH=N-、-NHCONH-、-NHCSNH-、或-NHNH-。
22、如权利要求19-21之一所述的载体,其中,所述树脂在水和/或有机溶剂中溶涨,而且包括以下取代基之一:卤素、羟基、羧基、SH、NH2、甲酰基、SO2NH2、或NHNH2。
23、一种固相合成寡糖的方法,其包括顺序地将单或寡糖基团连接在如权利要求19-22之一所述的载体上的步骤。
24、如权利要求23所述的方法,其中,
a)连接基可在偶联初始糖基团之前分步直接合成在树脂上,或者
b)在溶液相中合成连接基-初始糖结合物,然后偶联至固体载体上,接着顺序地连接随后的糖。
25、如权利要求23或24所述的方法,其中,所述载体包括树脂、连接基和选自以下组中的糖:单糖、寡糖、氨基糖和氨基寡糖。
26、如权利要求23-25之一所述的方法,其中,第二和所有随后的糖基团在部分地脱除寡糖链中的最后糖的保护之后偶联至寡糖链-树脂结合物上。
27、如权利要求23-26之一所述的方法,其中,连接在树脂-连接基单元上的第一个糖是未经保护的、部分保护的、或者完全保护的糖苷、氨基糖苷或者醚连接的糖、或者氨基连接的糖。
28、如权利要求27所述的方法,其中,偶联在树脂上的第一个糖是氨基糖、氨基糖苷、或氨基寡糖、或者寡糖的糖基胺。
29、如权利要求23-28之一所述的方法,其中,所述寡糖是分枝的,而且除永久性的醚型保护基外,脱保护是通过使用一种或多种选自以下组中的保护基来实现的:酰基型、三苯甲基、甲氧基三苯甲基、甲氧基苄基、甲硅烷基和/或光不稳定性保护基。
30、一种用于溶液相合成含糖化合物的试剂,其包括如权利要求5-8或15-18之一所述的巴比土酸衍生化合物。
31、一种连接基-糖复合物,其包括连接基以及如权利要求11-18所述的经保护的糖化合物。
32、一种溶液相合成寡糖的方法,其包括顺序地将单或寡糖基团连接在如权利要求13、14、17、18或31之一所述的化合物上的步骤。
33、如权利要求32所述的方法,其中,进行组合性合成氨基糖苷。
34、一种用于固相合成或者组合性合成法的试剂盒,其包括:
a)如权利要求19-22之一所述的树脂-连接基-糖、树脂-连接基-肽、树脂-连接基-氨基酸-载体,
b)如权利要求11-18之一所述的连接基-糖、连接基-氨基糖、连接基-肽、或连接基-氨基酸复合物,或者
c)如权利要求19-22之一所述的树脂-连接基载体复合物。
并任选地包括一种或多种适合于固相或组合性合成法的其他试剂如保护剂、脱保护剂、和/或溶剂。
35、一种用于溶液相合成或者组合性合成寡糖的试剂盒,其包括如权利要求13、14、17、18或31所述的化合物,并任选地包括一种或多种适合于固相或组合性合成法的其他试剂如保护剂、脱保护剂、和/或溶剂。
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