CN117887699A - 来源于莫纳杆菌的d-阿洛酮糖3-差向异构酶及其用途 - Google Patents
来源于莫纳杆菌的d-阿洛酮糖3-差向异构酶及其用途 Download PDFInfo
- Publication number
- CN117887699A CN117887699A CN202211261242.7A CN202211261242A CN117887699A CN 117887699 A CN117887699 A CN 117887699A CN 202211261242 A CN202211261242 A CN 202211261242A CN 117887699 A CN117887699 A CN 117887699A
- Authority
- CN
- China
- Prior art keywords
- psicose
- epimerase
- mutant
- recombinant
- nucleic acid
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Pending
Links
- 108030002106 D-psicose 3-epimerases Proteins 0.000 title claims abstract description 97
- RMLYXMMBIZLGAQ-UHFFFAOYSA-N (-)-monatin Natural products C1=CC=C2C(CC(O)(CC(N)C(O)=O)C(O)=O)=CNC2=C1 RMLYXMMBIZLGAQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 title abstract description 14
- RMLYXMMBIZLGAQ-HZMBPMFUSA-N (2s,4s)-4-amino-2-hydroxy-2-(1h-indol-3-ylmethyl)pentanedioic acid Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@](O)(C[C@H](N)C(O)=O)C(O)=O)=CNC2=C1 RMLYXMMBIZLGAQ-HZMBPMFUSA-N 0.000 title abstract description 14
- BJHIKXHVCXFQLS-PUFIMZNGSA-N D-psicose Chemical compound OC[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](O)C(=O)CO BJHIKXHVCXFQLS-PUFIMZNGSA-N 0.000 claims abstract description 34
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 claims description 31
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 claims description 23
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 claims description 23
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 claims description 23
- RFSUNEUAIZKAJO-VRPWFDPXSA-N D-Fructose Natural products OC[C@H]1OC(O)(CO)[C@@H](O)[C@@H]1O RFSUNEUAIZKAJO-VRPWFDPXSA-N 0.000 claims description 21
- RFSUNEUAIZKAJO-ARQDHWQXSA-N Fructose Chemical compound OC[C@H]1O[C@](O)(CO)[C@@H](O)[C@@H]1O RFSUNEUAIZKAJO-ARQDHWQXSA-N 0.000 claims description 21
- 238000006555 catalytic reaction Methods 0.000 claims description 18
- 239000013598 vector Substances 0.000 claims description 18
- 238000000034 method Methods 0.000 claims description 17
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 claims description 11
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 claims description 9
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 claims description 9
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 claims description 7
- 229910021645 metal ion Inorganic materials 0.000 claims description 7
- JLVVSXFLKOJNIY-UHFFFAOYSA-N Magnesium ion Chemical compound [Mg+2] JLVVSXFLKOJNIY-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 6
- 229910001425 magnesium ion Inorganic materials 0.000 claims description 6
- 239000003054 catalyst Substances 0.000 claims description 5
- 229910001429 cobalt ion Inorganic materials 0.000 claims description 3
- XLJKHNWPARRRJB-UHFFFAOYSA-N cobalt(2+) Chemical compound [Co+2] XLJKHNWPARRRJB-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 3
- 230000006698 induction Effects 0.000 claims description 3
- 229910001437 manganese ion Inorganic materials 0.000 claims description 3
- 230000035484 reaction time Effects 0.000 claims description 3
- 125000003275 alpha amino acid group Chemical group 0.000 claims 2
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 abstract description 30
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 abstract description 30
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 abstract description 6
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 abstract description 5
- 238000012216 screening Methods 0.000 abstract description 4
- 241000222120 Candida <Saccharomycetales> Species 0.000 abstract 2
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 description 32
- 241000894006 Bacteria Species 0.000 description 16
- 238000003752 polymerase chain reaction Methods 0.000 description 16
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 description 16
- 230000000694 effects Effects 0.000 description 11
- 241000588724 Escherichia coli Species 0.000 description 10
- 150000001413 amino acids Chemical group 0.000 description 9
- 239000012634 fragment Substances 0.000 description 8
- 239000007791 liquid phase Substances 0.000 description 8
- 239000013612 plasmid Substances 0.000 description 7
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 7
- 241000235575 Mortierella Species 0.000 description 6
- 230000001580 bacterial effect Effects 0.000 description 4
- 239000013613 expression plasmid Substances 0.000 description 4
- 238000003259 recombinant expression Methods 0.000 description 4
- 239000000126 substance Substances 0.000 description 4
- WEVYAHXRMPXWCK-UHFFFAOYSA-N Acetonitrile Chemical compound CC#N WEVYAHXRMPXWCK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 238000012408 PCR amplification Methods 0.000 description 3
- 240000004808 Saccharomyces cerevisiae Species 0.000 description 3
- 229930006000 Sucrose Natural products 0.000 description 3
- CZMRCDWAGMRECN-UGDNZRGBSA-N Sucrose Chemical compound O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@@]1(CO)O[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O1 CZMRCDWAGMRECN-UGDNZRGBSA-N 0.000 description 3
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 3
- 235000013305 food Nutrition 0.000 description 3
- 238000010587 phase diagram Methods 0.000 description 3
- 239000000047 product Substances 0.000 description 3
- 238000001228 spectrum Methods 0.000 description 3
- 239000005720 sucrose Substances 0.000 description 3
- 241000196324 Embryophyta Species 0.000 description 2
- TWRXJAOTZQYOKJ-UHFFFAOYSA-L Magnesium chloride Chemical compound [Mg+2].[Cl-].[Cl-] TWRXJAOTZQYOKJ-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 2
- 241000133336 Mortierella pulchella Species 0.000 description 2
- 108010006785 Taq Polymerase Proteins 0.000 description 2
- 238000002835 absorbance Methods 0.000 description 2
- 239000000872 buffer Substances 0.000 description 2
- 238000005119 centrifugation Methods 0.000 description 2
- 238000010367 cloning Methods 0.000 description 2
- 238000010276 construction Methods 0.000 description 2
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 description 2
- 238000000105 evaporative light scattering detection Methods 0.000 description 2
- 238000000855 fermentation Methods 0.000 description 2
- 230000004151 fermentation Effects 0.000 description 2
- 238000010438 heat treatment Methods 0.000 description 2
- 238000004128 high performance liquid chromatography Methods 0.000 description 2
- 230000001939 inductive effect Effects 0.000 description 2
- 238000002347 injection Methods 0.000 description 2
- 239000007924 injection Substances 0.000 description 2
- 229930027917 kanamycin Natural products 0.000 description 2
- SBUJHOSQTJFQJX-NOAMYHISSA-N kanamycin Chemical compound O[C@@H]1[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CN)O[C@@H]1O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](O[C@@H]2[C@@H]([C@@H](N)[C@H](O)[C@@H](CO)O2)O)[C@H](N)C[C@@H]1N SBUJHOSQTJFQJX-NOAMYHISSA-N 0.000 description 2
- 229960000318 kanamycin Drugs 0.000 description 2
- 229930182823 kanamycin A Natural products 0.000 description 2
- 239000007788 liquid Substances 0.000 description 2
- 239000008176 lyophilized powder Substances 0.000 description 2
- 239000011777 magnesium Substances 0.000 description 2
- 230000014759 maintenance of location Effects 0.000 description 2
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 2
- 238000010369 molecular cloning Methods 0.000 description 2
- 230000035772 mutation Effects 0.000 description 2
- 229920001184 polypeptide Polymers 0.000 description 2
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 description 2
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 description 2
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 description 2
- 239000007787 solid Substances 0.000 description 2
- 239000006228 supernatant Substances 0.000 description 2
- 238000011282 treatment Methods 0.000 description 2
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 4-amino-1-[(2r)-6-amino-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-amino-3-phenylpropanoyl]amino]-3-phenylpropanoyl]amino]-4-methylpentanoyl]amino]hexanoyl]piperidine-4-carboxylic acid Chemical compound C([C@H](C(=O)N[C@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](CCCCN)C(=O)N1CCC(N)(CC1)C(O)=O)NC(=O)[C@H](N)CC=1C=CC=CC=1)C1=CC=CC=C1 FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 0.000 description 1
- 241001251200 Agelas Species 0.000 description 1
- VYZAMTAEIAYCRO-UHFFFAOYSA-N Chromium Chemical compound [Cr] VYZAMTAEIAYCRO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- BJHIKXHVCXFQLS-UYFOZJQFSA-N D-fructose group Chemical group OCC(=O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H](O)CO BJHIKXHVCXFQLS-UYFOZJQFSA-N 0.000 description 1
- 229930091371 Fructose Natural products 0.000 description 1
- 239000005715 Fructose Substances 0.000 description 1
- 108010093096 Immobilized Enzymes Proteins 0.000 description 1
- 229910021380 Manganese Chloride Inorganic materials 0.000 description 1
- GLFNIEUTAYBVOC-UHFFFAOYSA-L Manganese chloride Chemical compound Cl[Mn]Cl GLFNIEUTAYBVOC-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- WAEMQWOKJMHJLA-UHFFFAOYSA-N Manganese(2+) Chemical compound [Mn+2] WAEMQWOKJMHJLA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000588621 Moraxella Species 0.000 description 1
- 208000008589 Obesity Diseases 0.000 description 1
- 102100026974 Sorbitol dehydrogenase Human genes 0.000 description 1
- 241000230320 Verrucomicrobiales Species 0.000 description 1
- 238000009825 accumulation Methods 0.000 description 1
- 230000003321 amplification Effects 0.000 description 1
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 1
- 241000933939 bacterium 26 Species 0.000 description 1
- 239000012620 biological material Substances 0.000 description 1
- 239000006227 byproduct Substances 0.000 description 1
- 150000001720 carbohydrates Chemical class 0.000 description 1
- 230000003197 catalytic effect Effects 0.000 description 1
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 description 1
- 238000003776 cleavage reaction Methods 0.000 description 1
- 239000013599 cloning vector Substances 0.000 description 1
- 239000011248 coating agent Substances 0.000 description 1
- 238000000576 coating method Methods 0.000 description 1
- 230000000295 complement effect Effects 0.000 description 1
- 238000007796 conventional method Methods 0.000 description 1
- 238000012258 culturing Methods 0.000 description 1
- 238000005520 cutting process Methods 0.000 description 1
- 230000007547 defect Effects 0.000 description 1
- 238000001514 detection method Methods 0.000 description 1
- 238000010586 diagram Methods 0.000 description 1
- 239000012154 double-distilled water Substances 0.000 description 1
- 239000003814 drug Substances 0.000 description 1
- 230000002255 enzymatic effect Effects 0.000 description 1
- 238000006345 epimerization reaction Methods 0.000 description 1
- 210000003527 eukaryotic cell Anatomy 0.000 description 1
- 239000013604 expression vector Substances 0.000 description 1
- 238000001914 filtration Methods 0.000 description 1
- 239000000796 flavoring agent Substances 0.000 description 1
- 235000019634 flavors Nutrition 0.000 description 1
- 238000004108 freeze drying Methods 0.000 description 1
- 238000013537 high throughput screening Methods 0.000 description 1
- 210000001822 immobilized cell Anatomy 0.000 description 1
- 230000002401 inhibitory effect Effects 0.000 description 1
- 150000002500 ions Chemical class 0.000 description 1
- BPHPUYQFMNQIOC-NXRLNHOXSA-N isopropyl beta-D-thiogalactopyranoside Chemical compound CC(C)S[C@@H]1O[C@H](CO)[C@H](O)[C@H](O)[C@H]1O BPHPUYQFMNQIOC-NXRLNHOXSA-N 0.000 description 1
- 229910001629 magnesium chloride Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000011565 manganese chloride Substances 0.000 description 1
- 229940099607 manganese chloride Drugs 0.000 description 1
- 235000002867 manganese chloride Nutrition 0.000 description 1
- 238000005259 measurement Methods 0.000 description 1
- 239000012528 membrane Substances 0.000 description 1
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 1
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 1
- 229930027945 nicotinamide-adenine dinucleotide Natural products 0.000 description 1
- BOPGDPNILDQYTO-NNYOXOHSSA-N nicotinamide-adenine dinucleotide Chemical compound C1=CCC(C(=O)N)=CN1[C@H]1[C@H](O)[C@H](O)[C@@H](COP(O)(=O)OP(O)(=O)OC[C@@H]2[C@H]([C@@H](O)[C@@H](O2)N2C3=NC=NC(N)=C3N=C2)O)O1 BOPGDPNILDQYTO-NNYOXOHSSA-N 0.000 description 1
- 238000003199 nucleic acid amplification method Methods 0.000 description 1
- 235000020824 obesity Nutrition 0.000 description 1
- 239000012071 phase Substances 0.000 description 1
- 239000008363 phosphate buffer Substances 0.000 description 1
- 210000001236 prokaryotic cell Anatomy 0.000 description 1
- 238000000746 purification Methods 0.000 description 1
- 239000012264 purified product Substances 0.000 description 1
- 239000002994 raw material Substances 0.000 description 1
- 238000010188 recombinant method Methods 0.000 description 1
- 230000003362 replicative effect Effects 0.000 description 1
- 238000011160 research Methods 0.000 description 1
- 108010020957 ribitol 2-dehydrogenase Proteins 0.000 description 1
- 230000007017 scission Effects 0.000 description 1
- 238000012163 sequencing technique Methods 0.000 description 1
- 230000035939 shock Effects 0.000 description 1
- 238000013112 stability test Methods 0.000 description 1
- 238000006467 substitution reaction Methods 0.000 description 1
- 239000000758 substrate Substances 0.000 description 1
- 230000002194 synthesizing effect Effects 0.000 description 1
- 230000001131 transforming effect Effects 0.000 description 1
- 229910021642 ultra pure water Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000012498 ultrapure water Substances 0.000 description 1
Landscapes
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
Abstract
本发明属于功能酶筛选技术领域,具体涉及一种来源于莫纳杆菌(CandidatusMoanabactertarae)的D‑阿洛酮糖3‑差向异构酶、其突变体以及用途。本发明首次提供了来源于莫纳杆菌(CandidatusMoanabactertarae)的D‑阿洛酮糖3‑差向异构酶,该D‑阿洛酮糖3‑差向异构酶及其突变体可用于高效催化D‑阿洛酮糖的合成。
Description
技术领域
本发明涉及功能酶技术领域,具体涉及一种来源于莫纳杆菌(CandidatusMoanabacter tarae)的D-阿洛酮糖3-差向异构酶及其突变体、其编码核酸分子、重组载体、重组细胞,以及该D-阿洛酮糖3-差向异构酶或其突变体的制备方法和在制备D-阿洛酮糖中的用途。
背景技术
D-阿洛酮糖是D-果糖C3位置的差向异构体,是目前研究最热门的稀少糖,已经被美国FDA确认为普遍公认安全(GRAS),在医药和食品等领域具有巨大的应用价值和市场前景。D-阿洛酮糖甜度约为蔗糖的70%,但能量值却只有蔗糖的10%,是理想的蔗糖替代品,而且具有抑制脂肪堆积,预防肥胖的效果。同时,在食品体系中添加D-阿洛酮糖可以起到提高凝胶性的作用,并且能与食品体系中的蛋白质发生美拉德反应而产生良好的化学风味。D-阿洛酮糖可通过化学法合成,但存在许多弊端,例如会产生严重的化学污染,形成不必要的副产物,反应步骤繁琐,反应条件苛刻等。相比于化学合成,具有生态友好性和高度特异性的酶法生物转化是更具优势的D-阿洛酮糖生产策略。
D-阿洛酮糖3-差向异构酶可以以D-果糖为原料,通过C3位的差向异构一步合成D-阿洛酮糖,但目前大多数D-阿洛酮糖3-差向异构酶仍存在酶活低,热稳定性差等问题,限制了工业化应用。因此,有必要开发高酶活和热稳定性好的D-阿洛酮糖3-差向异构酶。
发明内容
本发明目的在于提供一种来源于莫纳杆菌(Candidatus Moanabacter tarae)的D-阿洛酮糖3-差向异构酶及其突变体,旨在解决现有的D-阿洛酮糖3-差向异构酶在催化D-果糖时存在的酶活性和稳定性不高的问题。
为了实现上述发明目的,本发明从莫纳杆菌(Candidatus Moanabacter tarae)中获得D-阿洛酮糖3-差向异构酶,并进一步对其进行突变处理,得到在酶活性、转化率和稳定性方面均显著改善的D-阿洛酮糖3-差向异构酶突变体。
具体地,第一方面,本发明提供了一种D-阿洛酮糖3-差向异构酶,其氨基酸序列如SEQ ID NO:1所示。
第二方面,本发明提供了编码所述D-阿洛酮糖3-差向异构酶的核酸分子,其核苷酸序列如SEQ ID NO:2所示。
第三方面,本发明提供了一种D-阿洛酮糖3-差向异构酶的突变体,其氨基酸序列如SEQ ID NO:3所示。
第四方面,本发明提供了编码所述D-阿洛酮糖3-差向异构酶突变体的核酸分子,其核苷酸序列如SEQ ID NO:4所示。
第五方面,本发明提供了一种重组载体,其包含编码所述D-阿洛酮糖3-差向异构酶或其突变体的核酸分子。
第六方面,本发明提供了一种重组细胞,其包含本发明所述的重组载体。
在一些实施方案中,所述重组细胞诱导产生本发明提供的所述来源于莫纳杆菌(Candidatus Moanabacter tarae)的D-阿洛酮糖3-差向异构酶或其突变体。
第七方面,本发明提供了一种D-阿洛酮糖3-差向异构酶的制备方法,包括:
对本发明提供的所述重组细胞进行诱导培养,得到培养物;
从所述培养物中分离所述D-阿洛酮糖3-差向异构酶和/或所述突变体。
第八方面,本发明提供了本发明所述D-阿洛酮糖3-差向异构酶、所述核酸分子、所述突变体、所述重组载体、所述重组细胞和/或所述制备方法制备得到的D-阿洛酮糖3-差向异构酶或其突变体在制备D-阿洛酮糖中的用途。
第九方面,本发明提供了一种D-阿洛酮糖的制备方法,包括:
以本发明所述D-阿洛酮糖3-差向异构酶、所述突变体、所述重组细胞和/或所述制备方法制备得到的D-阿洛酮糖3-差向异构酶或其突变体作为催化剂,对D-果糖进行催化反应,得到D-阿洛酮糖。
在一些实施方案中,所述催化反应的初始pH为6-8。
在一些实施方案中,所述催化反应的反应温度为50-60℃。
在一些实施方案中,所述催化反应的反应时间为3-10h。
在一些实施方案中,所述催化反应中,所述D-果糖的终浓度为300-700g/L,金属离子的终浓度为0.1-1mM,所述金属离子选自镁离子、钴离子、锰离子中的至少一种,优选镁离子。
本发明首次提供了一种来源于莫纳杆菌(Candidatus Moanabacter tarae)的D-阿洛酮糖3-差向异构酶,并进一步对其进行突变处理得到D-阿洛酮糖3-差向异构酶突变体。本发明提供的D-阿洛酮糖3-差向异构酶及其突变体可以高效催化D-阿洛酮糖合成,对D-阿洛酮糖的生产和应用具有重要意义。同时,所述突变体在催化D-果糖转化为D-阿洛酮糖时,酶活可达132.5U/mL,是原始酶的1.3倍;在50℃下的半衰期是560min,是原始酶的3.3倍,有利于提高D-阿洛酮糖的产量。
附图说明
图1为D-阿洛酮糖3-差向异构酶催化合成D-阿洛酮糖的反应图;
图2为D-果糖的液相谱图;
图3为D-阿洛酮糖的液相谱图;
图4为D-阿洛酮糖3-差向异构酶催化反应过程液相谱图。
具体实施方式
本发明实施例提供了一种来源于莫纳杆菌(Candidatus Moanabacter tarae)的D-阿洛酮糖3-差向异构酶,其氨基酸序列如SEQ ID NO:1所示。
来源于莫纳杆菌(Candidatus Moanabacter tarae)的D-阿洛酮糖3-差向异构酶的氨基酸序列(SEQ ID NO:1):
MELSCCIWALSESPGNALEQVSFAGFKSIDVCPGFLDTYEQIVRSQALELDVSCFGASFGLPDGISLDHEETFLRSQAVSYLEQGIQTSGELGANTVYVVPDKSEDRRNLSRYAHSLTLAADQAAAFGVKLCVEHFPGSALSTALGTIQYLRNIDHPNLFLLLDLGHLQISDENPAAIIDAAGSLLGYVHLDDNDGKDDLHLPLCDGILNLETLETTFQALYDNEYVGNVSLELSPNLDDPLDGLIRSRRVVEEFLNR
本发明实施例提供的来源于莫纳杆菌(Candidatus Moanabacter tarae)的D-阿洛酮糖3-差向异构酶可以是天然、重组或合成的活性多肽。该活性多肽可以是天然纯化的产物、化学合成的产物,或是使用重组技术从原核宿主(例如大肠杆菌)或真核宿主(例如酵母、高等植物)中产生的产物。
在一些实施方案中,所述来源于莫纳杆菌(Candidatus Moanabacter tarae)的D-阿洛酮糖3-差向异构酶是通过将含有其编码基因的重组载体导入大肠杆菌(例如E.coliBL21(DE3))得到重组基因工程菌,然后将该重组基因工程菌进行诱导表达得到D-阿洛酮糖3-差向异构酶。
相应地,编码该来源于莫纳杆菌(Candidatus Moanabacter tarae)的D-阿洛酮糖3-差向异构酶的核酸分子的核苷酸序列如SEQ ID NO:2所示。
本发明实施例提供的所述核酸分子通常可以通过PCR扩增或人工合成的方法获得。
编码来源于莫纳杆菌(Candidatus Moanabacter tarae)的D-阿洛酮糖3-差向异构酶的核酸分子的核苷酸序列(SEQ ID NO:2):
atggaattatcctgttgcatatgggcattgtcagagtctccgggaaatgcactcgagcaagtctcgtttgccggatttaagtcaatcgatgtttgtcctggttttttggatacctatgagcagattgtccggtctcaggctcttgaactagatgtctcctgctttggcgcatcctttggacttccggatggaatttccttggatcatgaggaaacttttctgcgaagccaagcggtttcctaccttgaacaagggatccaaactagtggtgaattgggcgctaatactgtctatgtcgttcccgataagtcggaagatcgcaggaatctttcacgctatgctcattcgcttaccttagcagcagatcaagctgcggcctttggggtaaaactgtgcgtggagcattttcctggaagcgcgctctcaaccgctctcggcactattcaatatttgagaaacatcgatcatcccaatctttttcttcttctggatctcggtcacttgcaaatatccgatgaaaatcctgccgccatcattgatgctgccggttctcttctcggatacgttcatcttgacgacaacgatgggaaagacgatttgcatcttcccctttgcgatgggatcttaaatctggaaacattggagactacttttcaagctctttatgacaatgagtatgtcggcaacgtcagcttagagctaagcccaaacctcgatgaccctctcgatggcctaatccgcagccgtcgagtagttgaggagtttctgaataggtga
本发明实施例还提供了来源于莫纳杆菌(Candidatus Moanabacter tarae)的D-阿洛酮糖3-差向异构酶的突变体,其氨基酸序列如SEQ ID NO:3所示。
来源于莫纳杆菌(Candidatus Moanabacter tarae)的D-阿洛酮糖3-差向异构酶的突变体的氨基酸序列(SEQ ID NO:3):
MELSCCIWALSESPGNALEQVSFAGFKSIDVCPGFLDTYEQIVRSQALELDVSCFGASFGLPDGISLDHEETFLRSQTVSYLEQGIQTGGELGANTVYVVTDKSEDRRNLSRYAHSLTLAADQAAAFGVKLCVERFPGSALSTALGTIQYLRNIDHPNLFLLLDLGHLQISDENPAAIIDAAGSLLGYVHLDDNDGKDDLHLPLCDGILNLETLETTFQALYDNEYVGNVSLELSPNLDDPLDGLIRSRRVVEEFLNR
所述突变体可人工合成,也可先合成其编码基因,再进行生物表达得到,例如使用重组技术从原核宿主(例如大肠杆菌)或真核宿主(例如酵母、高等植物)中表达获得。
在一些实施方案中,上述D-阿洛酮糖3-差向异构酶的突变体是通过将含有其编码基因的重组载体导入大肠杆菌(例如E.coli BL21(DE3))得到重组基因工程菌,然后将该重组基因工程菌进行诱导表达得到D-阿洛酮糖3-差向异构酶的突变体。
相应地,编码该来源于莫纳杆菌(Candidatus Moanabacter tarae)的D-阿洛酮糖3-差向异构酶的突变体的核酸分子的核苷酸序列如SEQ ID NO:4所示。
编码来源于莫纳杆菌(Candidatus Moanabacter tarae)的D-阿洛酮糖3-差向异构酶的突变体的核酸分子的核苷酸序列(SEQ ID NO:4):
atggaattatcctgttgcatatgggcattgtcagagtctccgggaaatgcactcgagcaagtctcgtttgccggatttaagtcaatcgatgtttgtcctggttttttggatacctatgagcagattgtccggtctcaggctcttgaactagatgtctcctgctttggcgcatcctttggacttccggatggaatttccttggatcatgaggaaacttttctgcgaagccaaacggtttcctaccttgaacaagggatccaaactggtggtgaattgggcgctaatactgtctatgtcgttaccgataagtcggaagatcgcaggaatctttcacgctatgctcattcgcttaccttagcagcagatcaagctgcggcctttggggtaaaactgtgcgtggagcgttttcctggaagcgcgctctcaaccgctctcggcactattcaatatttgagaaacatcgatcatcccaatctttttcttcttctggatctcggtcacttgcaaatatccgatgaaaatcctgccgccatcattgatgctgccggttctcttctcggatacgttcatcttgacgacaacgatgggaaagacgatttgcatcttcccctttgcgatgggatcttaaatctggaaacattggagactacttttcaagctctttatgacaatgagtatgtcggcaacgtcagcttagagctaagcccaaacctcgatgaccctctcgatggcctaatccgcagccgtcgagtagttgaggagtttctgaataggtga
本发明实施例提供的所述突变体的核酸分子通常可以通过PCR扩增或人工合成的方法获得。
在一些实施方案中,所述突变体的核酸分子是以莫纳杆菌(CandidatusMoanabacter tarae)的基因组DNA为模板,通过PCR扩增得到扩增片段后,在该扩增片段的基础上利用易错PCR方法获得。
本发明实施例还提供了一种重组载体,其包括编码所述D-阿洛酮糖3-差向异构酶或其突变体的核酸分子。具体地,所述重组载体包括克隆载体和表达载体,所述克隆载体用于复制相关序列,所述表达载体用于表达相关基因。
在一些实施方案中,所述重组载体为pET-CMDAE或pET-ΔCMDAE26,分别是将编码上述D-阿洛酮糖3-差向异构酶的核酸分子或上述D-阿洛酮糖3-差向异构酶的突变体的核酸分子替换pET-28a(+)的XbaI和BamHI酶切位点间序列,其余序列保持不变得到的。
本发明实施例还提供了一种重组细胞,其包括上述的重组载体。
在一些实施方案中,所述重组细胞诱导产生本发明提供的所述来源于莫纳杆菌(Candidatus Moanabacter tarae)的D-阿洛酮糖3-差向异构酶或其突变体。
在一些实施方案中,所述重组细胞的构建方法如下:
将所述重组载体转化到宿主细胞中,经诱导,得到表达D-阿洛酮糖3-差向异构酶或其突变体。
进一步地,所述重组载体为pET-CMDAE或pET-ΔCMDAE26,所述宿主细胞为原核生物细胞或真核生物细胞,例如大肠杆菌、酵母等,优选大肠杆菌E.coli BL21(DE3)。
所述重组细胞可以是重组基因工程菌。重组基因工程菌表达D-阿洛酮糖3-差向异构酶或其突变体时所使用的培养基可以是本领域可使重组基因工程菌生长并产生本发明的D-阿洛酮糖3-差向异构酶或其突变体的培养基,优选LB培养基。
在一些优选实施方案中,所述重组细胞为重组菌W和重组菌26,
本发明对重组细胞或重组基因工程菌的培养方法与培养条件没有特殊要求,只要能够使其正常生长并表达D-阿洛酮糖3-差向异构酶或其突变体即可。
在一些优选实施方案中,所述重组细胞的构建方法包括:
(i)D-阿洛酮糖3-差向异构酶的基因cmdae的扩增;
(ii)D-阿洛酮糖3-差向异构酶的突变体的基因Δcmdae的获得;
(iii)重组表达质粒pET-CMDAE和pET-ΔCMDAE的构建;
(iv)将重组表达质粒pET-CMDAE和pET-ΔCMDAE转化至宿主细胞中;
(v)经抗性培养基筛选得到阳性克隆。
本发明实施例还提供了一种D-阿洛酮糖3-差向异构酶或其突变体的制备方法,包括:
1)对所述的重组细胞进行诱导培养,得到培养物;
2)从所述培养物中分离所述D-阿洛酮糖3-差向异构酶和/或所述突变体。
本发明D-阿洛酮糖3-差向异构酶或其突变体的制备方法中,对重组细胞进行诱导培养的方法、从培养物中分离D-阿洛酮糖3-差向异构酶或其突变体的方法均为本领域的常规方法。
本发明实施例还提供了来源于莫纳杆菌(Candidatus Moanabacter tarae)的所述D-阿洛酮糖3-差向异构酶或其突变体、所述核酸分子、所述重组载体、所述重组细胞和/或所述制备方法制备得到的D-阿洛酮糖3-差向异构酶或其突变体在制备D-阿洛酮糖中的用途。
本发明实施例还提供了一种D-阿洛酮糖的制备方法,包括:
以所述D-阿洛酮糖3-差向异构酶、所述突变体、所述重组细胞和/或所述制备方法制备得到的D-阿洛酮糖3-差向异构酶或其突变体作为催化剂,对D-果糖进行催化反应,得到D-阿洛酮糖(如图1所示)。
在一些实施方案中,所述催化反应的反应温度为50-60℃,例如50℃、55℃、60℃,或这些数值中的任意二者之间的数值或范围,优选50℃;初始pH为6-8,可以用磷酸盐缓冲液(例如50mM的PBS)进行调整,例如调到pH 7.0。
在一些实施方案中,所述催化反应的反应时间为3-10h,例如3h、4h、5h、6h、7h、8h、9h、10h,或这些数值中的任意二者之间的数值或范围,优选3h。
D-果糖作为催化反应的底物,在一些实施方案中,其终浓度为300-700g/L,例如300g/L、400g/L、500g/L、600g/L、700g/L,或这些数值中的任意二者之间的数值或范围,优选500g/L。
所述催化反应中还包含金属离子作为D-阿洛酮糖3-差向异构酶的辅助因子,所述金属离子选自镁离子、钴离子、锰离子中的至少一种,优选镁离子。所述金属离子的浓度为0.1-1mM,例如0.1mM、0.4mM、0.6mM、0.8mM、1mM,或这些数值中的任意二者之间的数值或范围,优选0.8mM。
在一些实施方案中,所述催化反应包括将本发明所述的重组细胞对D-果糖进行催化反应,以得到D-阿洛酮糖。
具体地,可以以所述重组细胞作为催化剂进行全细胞催化以生产D-阿洛酮糖,催化剂的用量为5-10mg细胞/g D-果糖,优选8mg细胞/g D-果糖。
应当理解的是,本发明提供的所述D-阿洛酮糖3-差向异构酶或其突变体可以以工程菌全细胞形式使用,也可以是未经纯化的粗酶形式使用,也可以是部分纯化的或完全纯化的酶的形式使用;还可以利用本领域已知的固定化技术将本发明的D-阿洛酮糖3-差向异构酶或其突变体制成固定化酶或固定化细胞形式的催化剂。
为使本发明上述实施细节和操作能清楚地被本领域技术人员理解,以及本发明实施例来源于莫纳杆菌的D-阿洛酮糖3-差向异构酶及其用途的进步性能显著地体现,以下通过实施例来举例说明上述技术方案。
下面实施例中未注明具体条件的实验方法,通常按照分子生物学领域常规的实验方法进行,包括但不限于M.R.格林所著《分子克隆实验指南》[Molecular Cloning:ALaboratory Manual]、Robert·F·Weaver所著《分子生物学》[Molecular Biology]等所述的实验方法,或按照试剂盒及仪器设备厂商所建议的实验方法。实施例中使用的试剂和生物材料如无特殊说明均可从商业途径获得。
候选莫纳杆菌(Candidatus Moanabacter tarae)在文献“Julian,Vosseberg,Joran,et al.Draft Genome Sequence of"Candidatus Moanabacter tarae,"Representing a Novel Marine Verrucomicrobial Lineage.[J].Microbiologyresource announcements,2018.”中已公开,公众可从万华化学集团股份有限公司获得。
pET-28a(+)为生工生物工程(上海)股份有限公司产品,产品目录号为B540183。
实施例1:D-阿洛酮糖3-差向异构酶的基因序列的获得
(11)提取候选莫纳杆菌(Candidatus Moanabacter tarae)的基因组DNA;
(12)以步骤(11)获得的基因组DNA为模板,以引物1(5'-tctagaatggaattatcctgttgcatatgggca-3',SEQ ID NO:5)和引物2(5'-ggatcctcacctattcagaaactcctcaactac-3',SEQ ID NO:6)为引物对进行PCR,获得含有D-阿洛酮糖3-差向异构酶基因的PCR扩增片段。其中,D-阿洛酮糖3-差向异构酶基因的核苷酸序列如SEQ ID NO:2所示,其编码的D-阿洛酮糖3-差向异构酶的氨基酸序列如SEQ ID NO:1所示。
实施例2:利用易错PCR技术获得D-阿洛酮糖3-差向异构酶突变体的基因序列
易错PCR方法是在标准PCR的基础上改变和提高聚合酶的自然错误率。Taq聚合酶是最为常用的易错PCR聚合酶。与基本的PCR反应(1.5mM)相比,易错PCR反应通常含有更高浓度的氯化镁(7mM),以稳定非互补对,除此之外还可以添加氯化锰来增加错误率。本实施例利用易错PCR技术,获得D-阿洛酮糖3-差向异构酶基因的突变体。
具体地,以实施例1的PCR扩增片段为模板,以引物1和引物2为引物按照如下反应体系进行易错PCR,共获得D-阿洛酮糖3-差向异构酶基因的96个突变体。
易错PCR反应体系:10×扩增缓冲液5μl,4种dNTP混合物(2.5mmol/L)各4μl,引物各50pmol,模板DNA 1.5μg,Taq DNA聚合酶0.5μL,Mg2+7mmol/L,加双蒸水至50μl。
实施例3:D-阿洛酮糖3-差向异构酶基因(cmdae)的克隆和表达菌株的构建
(31)XbaI和BamHI双酶切实施例1获得的含有D-阿洛酮糖3-差向异构酶基因的PCR扩增片段,得到基因片段;XbaI和BamHI双酶切pET-28a(+),得到载体片段;将基因片段和载体片段连接得到重组表达质粒,将其命名为pET-CMDAE,将该质粒送测序,结果与预期一致。
(32)将步骤(31)获得的重组表达质粒pET-CMDAE通过热激转入E.coli DH5α感受态细胞中,涂布含有25μg/mL卡那霉素的LB固体培养基,培养得到相应的单克隆菌株,将其命名为H,再经过扩增质粒提取,得到pET-CMDAE质粒。将得到的质粒通过化学转化的方式转入E.coli BL21(DE3)中,涂布含有25μg/mL卡那霉素的LB固体培养基进行筛选,得到表达D-阿洛酮糖3-差向异构酶的重组菌W。
实施例4:D-阿洛酮糖3-差向异构酶基因突变体的克隆和表达菌株的构建
按照实施例3的方法,利用实施例2获得的D-阿洛酮糖3-差向异构酶基因的96个突变体分别构建重组质粒pET-ΔCMDAE1至pET-ΔCMDAE96,并获得表达D-阿洛酮糖3-差向异构酶突变体的重组菌1-重组菌96。
实施例5:利用高通量筛选得到具有高效催化效率的D-阿洛酮糖3-差向异构酶突变体
将实施例3和4中经过PCR验证正确的重组菌分别在5mL LB培养基中培养,同时加入IPTG诱导蛋白表达,16h后测量菌液的OD值,并用水稀释菌液使得OD值为2左右。将稀释后的菌液分别加入96孔板中进行反应,反应体系为200μL,包含10g/L D-果糖、0.8mM Mg2+并使用50mM PBS将初始pH调到7.0,在反应体系中按照1mg细胞/g D-果糖加入细胞。将制备的反应体系在50℃、120rpm的振荡混合器中孵育20min。反应结束后在95℃下加热5min后终止反应。
反应结束后,取50μl反应液加入50μl检测液(由PBS缓冲液(50mM,pH 7.0)配制含4mM NADH和0.5mg/mL核糖醇脱氢酶),置于30℃恒温培养箱中反应10min,反应结束后在95℃下加热5min后终止反应,在选定340nm波长测定吸光度。
将吸光度最低的反应液所对应的菌株(重组菌26)进行质粒提取,提取后的质粒测序,得到编码D-阿洛酮糖3-差向异构酶突变体的基因序列如SEQ ID NO:4所示,其编码的D-阿洛酮糖3-差向异构酶突变体的氨基酸序列如SEQ ID NO:3所示。与SEQ ID NO:1所示的D-阿洛酮糖3-差向异构酶的氨基酸序列相比,该D-阿洛酮糖3-差向异构酶突变体具有如下突变:第78位的Ala突变为Thr,第89位的Ser突变为Gly,第101位的Pro突变为Thr,第135位的His突变为Arg。
实施例6:酶的制备及酶活测定
分别将实施例3获得的重组菌W和实施例4筛选得到的重组菌26进行扩大培养,扩大培养后将发酵液经离心(8000rpm,10min)、细胞破碎、冷冻干燥等常规处理,制备得到D-阿洛酮糖3-差向异构酶(原始酶)和其突变体(突变体酶)的冻干粉并于-80℃保存。
酶活力单位(U)的定义为:在实施例5的反应条件下,毎分钟催化生成1μmol D-阿洛酮糖所需的酶量或每分钟消耗1μmol D-果糖所需的酶量。
原始酶和突变体酶的酶活分别为101.9U/mL和132.5U/mL,相比于原始酶,突变体酶的酶活是其1.3倍。
在1L的三角瓶中加入500mL、500g/L D-果糖,0.8mM Mg2+离子,8mg细胞/g果糖,在50℃水浴锅反应,反应3h后突变体及其野生型转化D-果糖生产D-阿洛酮糖的转化率分别为32.1%和28.6%,突变体是野生型的1.12倍,野生型D-阿洛酮糖产量为143g/L,而突变体最终的D-阿洛酮糖产量可达到160.5g/L。
HPLC的具体方法如下:
(61)取1mL反应液在8000rpm的转速下离心1min;
(62)离心后小心吸取上清液100μL于2mL离心管中,并加入900μL超纯水;
(63)用1mL注射器吸取稀释后的发酵液上清600-800μL,并用0.22μm的滤膜进行过滤并加到相应的液相瓶中;
(64)将液相瓶放入样品架上,建好方法,开始分析。HPLC分析的具体程序如下:色谱仪:Agilent1260;检测器:蒸发光散射检测器(Alltech Chrom,ELSD6000);进样:Agilent自动进样器;进样量10μL;色谱柱:Prevail Carbohydrate EScolumn-W(5μm,4.6×250mm,Agela Technologies,中国);柱温40℃;流动相:70%乙腈;流速1mL/min。
其中,D-果糖的液相谱图如图2所示,D-阿洛酮糖的液相谱图如图3所示,D-阿洛酮糖3-差向异构酶催化反应过程的液相谱图如图4所示。通过图4可以看出,D-果糖保留时间为16.46min,D-阿洛酮糖保留时间为17.52min。
实施例7:热稳定性测试
取少量实施例6中得到的原始酶和突变体酶的冻干粉,分别在50℃下孵育不同时间,按照实施例5中的反应条件进行反应测量残余酶活计算半衰期。两种酶的半衰期如表1所示。
表1
结果表明,突变体酶具有较好的热稳定性,在50℃下的半衰期由170min提升到了560min,提高了3.3倍。
以上所述,仅为本发明较佳的具体实施方式,但本发明的保护范围并不局限于此,任何熟悉本技术领域的技术人员在本发明揭露的技术范围内,根据本发明的技术方案及其发明构思加以等同替换或改变,都应涵盖在本发明的保护范围之内。
Claims (10)
1.一种D-阿洛酮糖3-差向异构酶,其特征在于,所述D-阿洛酮糖3-差向异构酶的氨基酸序列如SEQ ID NO:1所示。
2.编码权利要求1所述D-阿洛酮糖3-差向异构酶的核酸分子,其特征在于,所述核酸分子的核苷酸序列如SEQ ID NO:2所示。
3.权利要求1所述D-阿洛酮糖3-差向异构酶的突变体,其特征在于,所述突变体的氨基酸序列如SEQ ID NO:3所示。
4.编码权利要求3所述突变体的核酸分子,其特征在于,所述核酸分子的核苷酸序列如SEQ ID NO:4所示。
5.一种重组载体,其特征在于,包含权利要求2或权利要求4所述的核酸分子。
6.一种重组细胞,其特征在于,包含权利要求5所述的重组载体。
7.一种D-阿洛酮糖3-差向异构酶或其突变体的制备方法,其特征在于,包括:
对权利要求6所述重组细胞进行诱导培养,得到培养物;
从所述培养物中分离权利要求1所述D-阿洛酮糖3-差向异构酶和/或权利要求3所述突变体。
8.权利要求1所述D-阿洛酮糖3-差向异构酶、权利要求2所述核酸分子、权利要求3所述突变体、权利要求4所述核酸分子、权利要求5所述重组载体、权利要求6所述重组细胞和/或权利要求7所述制备方法制备得到的D-阿洛酮糖3-差向异构酶或其突变体在制备D-阿洛酮糖中的用途。
9.一种D-阿洛酮糖的制备方法,其特征在于,包括:
以权利要求1所述D-阿洛酮糖3-差向异构酶、权利要求3所述突变体、权利要求6所述重组细胞和/或权利要求7所述制备方法制备得到的D-阿洛酮糖3-差向异构酶或其突变体作为催化剂,对D-果糖进行催化反应,得到D-阿洛酮糖。
10.根据权利要求9所述的制备方法,其特征在于,所述催化反应的反应温度为50-60℃,初始pH为6-8,反应时间为3-10h;和/或
所述催化反应中,D-果糖的终浓度为300-700g/L,金属离子的终浓度为0.1-1mM,所述金属离子选自镁离子、钴离子、锰离子中的至少一种,优选镁离子。
Priority Applications (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
CN202211261242.7A CN117887699A (zh) | 2022-10-14 | 2022-10-14 | 来源于莫纳杆菌的d-阿洛酮糖3-差向异构酶及其用途 |
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
CN202211261242.7A CN117887699A (zh) | 2022-10-14 | 2022-10-14 | 来源于莫纳杆菌的d-阿洛酮糖3-差向异构酶及其用途 |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
CN117887699A true CN117887699A (zh) | 2024-04-16 |
Family
ID=90640026
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
CN202211261242.7A Pending CN117887699A (zh) | 2022-10-14 | 2022-10-14 | 来源于莫纳杆菌的d-阿洛酮糖3-差向异构酶及其用途 |
Country Status (1)
Country | Link |
---|---|
CN (1) | CN117887699A (zh) |
-
2022
- 2022-10-14 CN CN202211261242.7A patent/CN117887699A/zh active Pending
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
CN109182284B (zh) | 一种7β-羟基类固醇脱氢酶突变体、编码序列、重组表达载体、基因工程菌及应用 | |
CN110396508B (zh) | 源自Nocardia cyriacigeorgica的L-泛解酸内酯脱氢酶及应用 | |
CN112877307B (zh) | 一种氨基酸脱氢酶突变体及其应用 | |
CN109468291B (zh) | 一种羰基还原酶EbSDR8突变体及其构建方法和应用 | |
CN110396507B (zh) | 源自Cnuibacter physcomitrellae的L-泛解酸内酯脱氢酶 | |
CN113564136B (zh) | L-泛解酸内酯脱氢酶及其突变体、共表达工程菌及应用 | |
CN111763662A (zh) | 酮还原酶及其在替格瑞洛中间体合成中的应用 | |
CN117535256A (zh) | 一种羰基还原酶及其在玻色因合成中应用 | |
CN110904088B (zh) | 耐高温d-阿洛酮糖3-差向异构酶、突变体及其应用 | |
CN112280723B (zh) | 联产1,3-丙二醇和1,3-丁二醇的重组菌及其应用 | |
CN114908129B (zh) | 用于制备(r)-4-氯-3-羟基丁酸乙酯的脱氢酶 | |
CN117887699A (zh) | 来源于莫纳杆菌的d-阿洛酮糖3-差向异构酶及其用途 | |
CN110396506B (zh) | 源自Nocardia asteroides的L-泛解酸内酯脱氢酶及其应用 | |
CN117887698A (zh) | 来源于李斯特菌的d-阿洛酮糖3-差向异构酶及其用途 | |
CN110713990B (zh) | 一种烯酸还原酶的突变体蛋白及其应用 | |
CN106047826B (zh) | 醛脱氢酶、其重组表达转化体及在他汀前体合成中的应用 | |
CN114317631B (zh) | 单胺氧化酶在制备托品酮中的应用 | |
CN114196659B (zh) | 酰胺酶突变体、编码基因、工程菌及其应用 | |
CN117603930B (zh) | 一种表达突变型西罗血红素合酶的重组菌 | |
CN113512571B (zh) | 鸟氨酸环化脱氨酶催化合成l-哌啶酸的方法 | |
CN110527671B (zh) | 源自Nocardia farcinica的L-泛解酸内酯脱氢酶及其应用 | |
CN114410599B (zh) | 羰基还原酶突变体及其制备瑞舒伐他汀手性中间体的应用 | |
CN115322975B (zh) | 路德维希肠杆菌氧化还原酶的突变体及其应用 | |
CN113846082B (zh) | 一种卤醇脱卤酶突变体及其编码基因、重组载体、重组基因工程菌以及应用 | |
CN117721088A (zh) | 葡萄糖脱氢酶突变体及其用途 |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
PB01 | Publication | ||
PB01 | Publication | ||
SE01 | Entry into force of request for substantive examination | ||
SE01 | Entry into force of request for substantive examination |