CN117089576B - 质粒及pv蛋白酶抑制剂筛选及药效评价的方法 - Google Patents
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Abstract
本发明公开了质粒及PV蛋白酶抑制剂筛选及药效评价的方法,在GFP中插入脊髓灰质炎病毒的3C蛋白酶相关裂解位点的序列,形成改造后的GFP报告蛋白,在上述改造后的GFP报告蛋白质粒上,克隆表达脊髓灰质炎病毒蛋白酶,可用于检测3C蛋白酶活性以及蛋白酶相关抑制剂活性,最终形成脊髓灰质炎病毒蛋白酶抑制剂筛选及药效评价平台。本发明能有效克服其他蛋白酶抑制剂筛选及活性评价方法的缺点,同时能够避免使用脊髓灰质炎病毒活病毒引发的安全性顾虑,对生物安全等级要求低,BSL‑1级实验室即可满足实验要求,是高效、准确、稳定、高通量、可重复的用于脊髓灰质炎病毒蛋白酶抑制剂筛选及药效评价平台。
Description
技术领域
本发明属于生物技术领域,涉及抗病毒药物筛选方法,尤其涉及一种质粒及PV蛋白酶抑制剂筛选及药效评价的方法。
背景技术
绿色荧光蛋白(GFP)最初是在维多利亚多管发光水母(Aequorea victoria)中发现的,它在没有任何外源底物的情况下吸收蓝光并发出绿色荧光。在过去的二十年中,设计了几种改进荧光光谱的绿色荧光蛋白变体,包括增强型绿色荧光蛋白EGFP、YFP、Venus等。
基于GFP的诸多优点,譬如广谱性、稳定性、易于载体构建与检测、无毒害,GFP在细胞筛选、基因表达、细胞标记、遗传跟踪等领域被广泛应用。GFP作为一种活体报告蛋白同时它的荧光强度很高,易于活体观测和用仪器进行定量检测。GFP主要由11股β链组成的桶状结构和其中的发色团组成,而发色团通过大量氢键稳定在中间位置。其三级结构对于荧光的产生是十分重要的,蛋白质变性及分离的发色团都无法产生荧光。通常情况下,为了不破坏GFP的三级结构,均是在其N端和C端进行多种蛋白质的融合。
脊髓灰质炎是由脊髓灰质炎病毒(Poliovirus,以下简称“PV”)所引起的一种急性传染病。PV属于小RNA病毒科(Picornavirus)肠道病毒(enterovirus)属。其拥有一个大约7.5 kb长的正义单链RNA基因组,病毒外壳呈现30nm的二十面体结构,包含多种衣壳结构蛋白。病毒的基因组会利用宿主细胞内物质翻译出多聚蛋白。病毒蛋白酶3C进一步裂解多聚蛋白产生衣壳蛋白VP1、VP3和VP0(VP2和VP4的前体)。而VP1、VP3和VP0对于病毒衣壳的组装尤为重要。同时前体蛋白P2和P3也经蛋白酶3C水解成7个非结构蛋白参与病毒各项生理活动。故3C蛋白酶作为PV的主要蛋白酶是抗病毒药物研发的一个重要靶点。
大多数高传染性病毒的细胞抗病毒实验需要在BSL-2+或者更高等级的实验室进行,然而这种实验室的资源相当短缺。目前缺少针对PV蛋白酶抑制剂的活性评价方法。因此,开发一种简洁、安全、高通量和可重复性的蛋白酶活性和蛋白酶抑制剂筛选及活性检测平台十分必要。
发明内容
为了解决上述问题,本发明提供了质粒及PV蛋白酶抑制剂筛选及药效评价的方法,首先提供了可用于检测PV蛋白酶抑制剂活性的质粒,本发明在GFP中插入PV的的3C蛋白酶相关裂解位点的序列,形成改造后的GFP报告蛋白,在上述改造后的GFP报告蛋白质粒上,克隆表达PV蛋白酶,可用于检测3C蛋白酶活性以及蛋白酶相关抑制剂活性,最终形成PV蛋白酶抑制剂筛选及药效评价平台。本发明能有效克服上述蛋白酶抑制剂筛选及活性评价方法的缺点,同时能够避免使用PV活病毒引发的安全性顾虑,对生物安全等级要求低,BSL-1级实验室即可满足实验要求,是高效、准确、稳定、高通量、可重复的用于PV蛋白酶抑制剂筛选及药效评价平台。
为了实现上述目的,本发明采用以下技术方案:
本发明首先提供了一种可用于检测脊髓灰质炎病毒蛋白酶抑制剂活性的质粒,所述质粒包含改造的GFP荧光蛋白的编码核苷酸序列以及脊髓灰质炎病毒蛋白的酶编码核苷酸序列,
所述的改造的GFP荧光蛋白内部包含可被脊髓灰质炎病毒蛋白酶裂解的蛋白酶切割序列,
所述可被脊髓灰质炎病毒蛋白酶裂解的蛋白酶切割序列插入于野生型GFP荧光蛋白的位置包括site1,site2或者site3,site1位于如SEQ ID NO.5所示的氨基酸序列的KQ和KN之间,site2位于如SEQ ID NO.6所示的氨基酸序列的EG和DT之间,site3位于如SEQ IDNO.7所示的氨基酸序列的QK和NG之间;所述的脊髓灰质炎病毒蛋白酶为3C。
作为本发明的一种优选方案,所述的脊髓灰质炎病毒蛋白酶的氨基酸序列如SEQID NO.3所示,所述蛋白酶切割序列包括:cut1如SEQ ID NO.1所示的氨基酸序列或者cut2如SEQ ID NO.2所示的氨基酸序列。
作为本发明的一种优选方案,所述的野生型GFP荧光蛋白的氨基酸序列如SEQ IDNO.4所示。
本发明第二方面提供了上述的质粒的构建方法,所述构建方法为通过P2A编码基因序列连接改造的GFP荧光蛋白编码核苷酸序列和脊髓灰质炎病毒蛋白酶3C的编码核苷酸序列,并将连接有改造的GFP荧光蛋白编码核苷酸序列和脊髓灰质炎病毒蛋白酶3C的编码核苷酸序列克隆到表达载体上,构建可用于检测脊髓灰质炎病毒蛋白酶抑制剂活性的质粒。
本发明中所述的表达载体可以是DNA也可以是RNA,优选地,本发明的表达载体为pcDNA3.1(+)。
本发明第三方面提供了一种检测脊髓灰质炎病毒蛋白酶抑制剂活性的方法,所述方法包括以下步骤:
1)将上述的质粒进行细胞转染,获得转染后的细胞;
2)添加脊髓灰质炎病毒蛋白酶抑制剂至上述转染后的细胞,观察是否可激发荧光产生以及检测荧光强度;
3)有激发荧光产生,则表示脊髓灰质炎病毒蛋白酶抑制剂起作用,反之表示脊髓灰质炎病毒蛋白酶抑制剂未起作用;检测荧光强度,荧光越亮,则表示脊髓灰质炎病毒蛋白酶抑制剂抑制效果越好,反之表示脊髓灰质炎病毒蛋白酶抑制剂抑制效果越差。
本发明第四方面提供了上述的质粒在检测脊髓灰质炎病毒蛋白酶抑制剂活性中的应用,可正向评价脊髓灰质炎病毒蛋白酶抑制剂的活性。
本发明最后提供了脊髓灰质炎病毒3C蛋白酶抑制剂抗病毒药物筛选与活性检测平台,采用上述的检测脊髓灰质炎病毒蛋白酶抑制剂活性的方法,通过荧光强度正向反映脊髓灰质炎病毒蛋白酶抑制剂的抑制效果以筛选有效的抗病毒药物。
与现有技术相比,本发明具有以下有益效果:
1)本发明开发了基于荧光蛋白GFP与脊髓灰质炎病毒蛋白酶活性的改造后的质粒系统,可用于检测PV蛋白酶相关抑制剂活性,借助本发明的质粒系统,蛋白酶相关抑制剂的活性与荧光强度呈正相关,可以在细胞水平非常便捷、直观的判断抑制剂的活性。
2)本发明构建了基于上述质粒的抗病毒药物筛选平台,能有效克服蛋白酶抑制剂筛选及活性评价方法的缺点,同时能够避免使用PV活病毒引发的安全性顾虑,对生物安全等级要求低,BSL-1级实验室即可满足实验要求,是高效、准确、稳定、高通量、可重复的用于PV蛋白酶抑制剂筛选及药效评价平台。
附图说明
图1是GFP中site1、site2以及site3插入3Ccut1和3Ccut2后所形成的改造的GFP的绿色荧光表达情况以及共表达含蛋白酶切割序列的GFP和PV蛋白酶后的绿色荧光表达情况。
图2是高通量检测荧光表达情况。01表示pGFP1~3-3Ccut1/2转染细胞后的荧光值,02表示pGFP1~3-3Ccut1/2-P2A-3C转染细胞后的荧光值,03表示pGFP1~3-3Ccut1/2-P2A-5Xstop-3C转染细胞后48h的荧光值,荧光值取三个重复的平均数。
图3是实施例4不同质粒添加不同浓度抑制剂后的绿色荧光表达情况。
具体实施方式
下面将结合具体实施例来进一步说明本发明,但实施例并不对本发明做任何形式的限定。除非特别说明,本发明采用的试剂、方法和设备为本技术领域常规试剂、方法和设备。显然,所描述的实施例仅仅是本发明一部分实施例,而不是全部的实施例。基于本发明中的实施例,本领域普通技术人员在没有做出创造性劳动前提下所获得的所有其他实施例,都属于本发明保护的范围:可用于检测PV蛋白酶抑制剂活性的质粒,检测PV蛋白酶抑制剂活性的方法和PV蛋白酶抑制剂抗病毒药物筛选与活性检测平台。
本发明提供的检测脊髓灰质炎病毒蛋白酶抑制剂活性的方法,本发明在GFP中插入PV的3C蛋白酶相关裂解位点的序列,形成改造后的GFP报告蛋白,在上述含GFP报告蛋白质粒上,克隆表达PV蛋白酶,可用于检测3C蛋白酶活性以及蛋白酶相关抑制剂活性,最终形成PV蛋白酶抑制剂筛选及药效评价平台。本发明能有效克服上述蛋白酶抑制剂筛选及活性评价方法的缺点,同时能够避免使用PV活病毒引发的安全性顾虑,对生物安全等级要求低,BSL-1级实验室即可满足实验要求,是高效、准确、稳定、高通量、可重复的用于PV蛋白酶抑制剂筛选及药效评价平台。
本发明的应用方向是:脊髓灰质炎病毒蛋白酶抑制剂抗病毒药物筛选与活性检测平台,在GFP中插入PV的3C蛋白酶相关裂解位点的序列,形成改造后的GFP报告蛋白,在上述含GFP报告蛋白质粒上,克隆表达PV蛋白酶,可用于检测3C蛋白酶活性以及蛋白酶相关抑制剂活性,最终形成PV蛋白酶抑制剂筛选及药效评价平台。
本发明实施例中,PV蛋白酶与GFP的氨基酸序列与核苷酸序列如下:
PV 蛋白酶的氨基酸序列如SEQ ID NO.3所示:
GPGFDYAVAMAKRNIVTATTSKGEFTMLGVHDNVAILPTHASPGESIVIDGKEVEILDAKALEDQAGTNLEITIITLKRNEKFRDIRPHIPTQITETNDGVLIVNTSKYPNMYVPVGAVTEQGYLNLGGRQTARTLMYNFPTRAGQCGGVITCTGKVIGMHVGGNGSHGFAAALKRSYFTQSQ。
PV 蛋白酶的编码核苷酸序列如SEQ ID NO.9所示:
ggaccagggttcgattacgcagtggctatggctaaaagaaacattgttacagcaactactagcaagggagagttcactatgttaggagtccacgacaacgtggctattttaccaacccacgcttcacctggtgaaagcattgtgatcgatggcaaagaagtggagatcttggatgccaaagcgctcgaagatcaagcaggaaccaatcttgaaatcactataatcactctaaagagaaatgaaaagttcagagacattagaccacatatacctactcaaatcactgagacaaatgatggagtcttgatcgtgaacactagcaagtaccccaatatgtatgttcctgtcggtgctgtgactgaacagggatatctaaatctcggtgggcgccaaactgctcgtactctaatgtacaactttccaaccagagcaggacagtgtggtggagtcatcacatgtactgggaaagtcatcgggatgcatgttggtgggaacggttcacacgggtttgcagcggccctgaagcgatcatacttcactcagagtcaa。
荧光蛋白GFP的氨基酸序列如SEQ ID NO.4所示:
MVSKGEELFTGVVPILVELDGDVNGHKFSVSGEGEGDATYGKLTLKFICTTGKLPVPWPTLVTTLTYGVQCFSRYPDHMKQHDFFKSAMPEGYVQERTIFFKDDGNYKTRAEVKFEGDTLVNRIELKGIDFKEDGNILGHKLEYNYNSHNVYIMADKQKNGIKVNFKIRHNIEDGSVQLADHYQQNTPIGDGPVLLPDNHYLSTQSALSKDPNEKRDHMVLLEFVTAAGITLGMDELYK。
荧光蛋白GFP的编码核苷酸序列如SEQ ID NO.8所示:
atggtgagcaagggcgaggagctgttcaccggggtggtgcccatcctggtcgagctggacggcgacgtaaacggccacaagttcagcgtgtccggcgagggcgagggcgatgccacctacggcaagctgaccctgaagttcatctgcaccaccggcaagctgcccgtgccctggcccaccctcgtgaccaccctgacctacggcgtgcagtgcttcagccgctaccccgaccacatgaagcagcacgacttcttcaagtccgccatgcccgaaggctacgtccaggagcgcaccatcttcttcaaggacgacggcaactacaagacccgcgccgaggtgaagttcgagggcgacaccctggtgaaccgcatcgagctgaagggcatcgacttcaaggaggacggcaacatcctggggcacaagctggagtacaactacaacagccacaacgtctatatcatggccgacaagcagaagaacggcatcaaggtgaacttcaagatccgccacaacatcgaggacggcagcgtgcagctcgccgaccactaccagcagaacacccccatcggcgacggccccgtgctgctgcccgacaaccactacctgagcacccagtccgccctgagcaaagaccccaacgagaagcgcgatcacatggtcctgctggagttcgtgaccgccgccgggatcactctcggcatggacgagctgtacaag。
PV 3C蛋白酶切割序列包括:cut1如SEQ ID NO.1:ALFQGP的氨基酸序列(编码核苷酸序列如SEQ ID NO.10所示:gctttgtttcaaggacca)或者cut2如SEQ ID NO.2:AKVQGP(编码核苷酸序列如SEQ ID NO.11所示:gcaaaggtacaaggacca)所示的氨基酸序列。
本发明实施例中所使用到的材料、试剂、仪器来源分别为:293T细胞由申请人公司保存。细胞培养板购自康宁公司。Uniclone One Step Seamless Cloning Kit试剂盒购自金沙生物。Primer Star酶购自Takara公司。无内毒素质粒小提中量试剂盒购自天根生化科技有限公司。引物均由擎科生物有限公司合成。二氧化碳细胞培养箱购自Thermo Fisher公司。荧光显微镜购自OLYMPUS 公司,型号CKX53。多功能酶标仪,帝肯贸易有限公司。Rupintrivir购自MedChemExpress公司。
实施例1
构建改造后的GFP荧光报告蛋白:
按照Primer Star酶说明书对GFP和常用表达载体进行PCR扩增,常用表达载体包括pcDNA3 .1,pCMV等,本发明实施例以pcDNA3.1(+)载体为例。将GFP基因序列通过同源重组方式(Uniclone One Step Seamless Cloning Kit试剂盒)克隆到pcDNA3.1(+)载体的多克隆位点(MCS)之间构建pGFP质粒,作为后续的模板。
随后通过PCR及同源重组技术(Uniclone One Step Seamless Cloning Kit试剂盒)在GFP的site1~3中插入PV 3C蛋白酶的切割序列cut1如SEQ ID NO.1:ALFQGP的氨基酸序列或者cut2如SEQ ID NO.2:AKVQGP所示的氨基酸序列,构建表达改造GFP的质粒pGFP1-3Ccut1/2,pGFP2-3Ccut1/2与pGFP3-3Ccut1/2(备注:cut1/2中的“/”代表“或”的意思,下同)。其中,GFP1-3Ccut1代表在表1(表1中,↓表示插入位置)中对应的site1位置(site1所在的氨基酸片段序列如SEQ ID NO.5所示,位点位置158~159aa,即KQ和KN之间)插入3C蛋白酶的cut1切割序列后,所形成的含有蛋白酶切割序列的荧光蛋白,依次类推;pGFP1-3Ccut1代表在GFP的site1位置(site1所在的氨基酸片段序列如SEQ ID NO.5所示,位点位置158~159aa,即KQ和KN之间)氨基酸之间插入PV 3C蛋白酶的切割序列cut1(SEQ ID NO.1)所形成的质粒,pGFP1- 3Ccut2代表在GFP的site1位置(site1所在的氨基酸片段序列如SEQ IDNO.5所示,158~159aa,即KQ和KN之间)氨基酸之间插入PV 3C蛋白酶的切割序列cut2(SEQID NO.2),pGFP3-3Ccut2代表在GFP的site3位置(site1所在的氨基酸片段序列如SEQ IDNO.7所示,159~160aa,即QK和NG之间)氨基酸之间插入PV 3C蛋白酶的切割序列cut2(SEQID NO.2)所形成的质粒,依次类推。
对构建好的pGFP1-3Ccut1/2,pGFP2-3Ccut1/2与pGFP3-3Ccut1/2 质粒进行转染。准备生长良好的293T细胞,向293T细胞中加入10%FBS DMEM培养基,置于37℃,5% CO2培养箱中培养。待293T细胞生长到70%~80%密度时进行转染实验, 6孔板质粒转染量为2μg。转染后每隔24 h观察细胞状态,48h后进行荧光拍照。
实施例2
改造后的GFP在共表达PV 3C蛋白酶时的荧光效果
为了验证PV 3C蛋白酶可以切割含有蛋白酶切割序列的GFP,在质粒pGFP1-3Ccut1/2,pGFP2-3Ccut1/2和pGFP3-3Ccut1/2基础上,利用2A肽连接表达PV 3C蛋白酶,构建pGFP1~3-3Ccut1/2 -P2A-3C质粒并转染293T细胞。转染后每隔24 h观察细胞状态及荧光拍照。
由图1可知,除pGFP2-3Ccut1和pGFP3-3Ccut1之外,改造后的GFP荧光蛋白质粒pGFP1-3Ccut1, pGFP1-3Ccut2,p GFP2-3Ccut2以及 pGFP3-3Ccut2均可观测到不同强度的激发荧光产生。同时,转染可以表达改造后的GFP荧光蛋白和蛋白酶3C的质粒后,在细胞中观测到激发荧光的消失(pGFP1-3Ccut1-P2A-3C, pGFP1-3Ccut2-P2A-3C, pGFP2-3Ccut2-P2A-3C和pGFP3-3Ccut2-P2A-3C)。可见,3C蛋白酶可以切割改造后GFP荧光蛋白,使得荧光淬灭。
实施例3
高通量模拟检测PV蛋白酶抑制剂抗病毒药物筛选平台效果
为了进一步验证抑制上述系统蛋白酶活性,发明人在pGFP1~3-3Ccut1 /2-P2A-3C质粒的基础上,在P2A后加入5个连续的终止密码子TGA,形成pGFP1~3-3Ccut1/2 -P2A-5×Stop-3C以破坏3C蛋白的表达。同时,利用高通量的方法检测荧光强度。荧光强度检测时,将293T细胞铺于96孔板中,37℃ 5% CO2培养箱中培养过夜;每孔转染0.5μg质粒,每组处理做三个重复孔取平均值,4-6h后换液;37℃ 5% CO2培养箱中培养48h后,于多功能酶标仪(帝肯贸易有限公司)读取荧光值,使用One-way ANOVA方法进行显著性差异分析(*p<0.05,**p<0.01,***p<0.001,**** p<0.0001)。
实验结果如下:
参见图2,图2(a)表示的是在野生型GFP的158~159aa(site1)位置氨基酸之间插入3Ccut1,其中,01为pGFP1-3Ccut1转染细胞后的荧光值,02表示pGFP1-3Ccut1-P2A-3C转染细胞后的荧光值,03表示pGFP1-3Ccut1-P2A-5Xstop-3C转染细胞后的荧光值。
图2(b)表示的是在野生型GFP的158~159aa(site1)位置氨基酸之间插入3Ccut2,其中,01为pGFP1-3Ccut2转染细胞后的荧光值,02为pGFP1-3Ccut2-P2A-3C转染细胞后的荧光值,03为pGFP1-3Ccut2-P2A-5Xstop-3C转染细胞后的荧光值。
图2(c)表示的是在野生型GFP的117~118aa(site2)位置氨基酸之间插入3Ccut2,其中,01为pGFP2-3Ccut2转染细胞后的荧光值,02为pGFP2-3Ccut2-P2A-3C转染细胞后的荧光值,03为pGFP2-3Ccut2-P2A-5Xstop-3C转染细胞后的荧光值。
图2(d)表示的是在野生型GFP的159~160aa(site3)位置氨基酸之间插入3Ccut1,其中,01为pGFP3-3Ccut1转染细胞后的荧光值,02为pGFP3-3Ccut1-P2A-3C转染细胞后的荧光值,03为pGFP3-3Ccut1-P2A-5Xstop-3C转染细胞后的荧光值。
图2(e)表示的是在野生型GFP的159~160aa(site3)位置氨基酸之间插入3Ccut2,其中,01为pGFP3-3Ccut2转染细胞后的荧光值,02为pGFP3-3Ccut2-P2A-3C转染细胞后的荧光值,03为pGFP3-3Ccut2-P2A-5Xstop-3C转染细胞后的荧光值。
由图2可知,实验组02处理荧光强度相比实验组01处理荧光强度均显著或极显著降低,实验组03处理荧光强度相比实验组02处理荧光强度均显著或极显著增强,由此可见,在转染共表达改造后的GFP荧光蛋白和3C蛋白酶的质粒后,3C蛋白酶将改造后的GFP荧光蛋白切割,推测3C蛋白酶对改造后的GFP荧光蛋白具有不同的切割能力,因此荧光强度下降程度有所区别。当使用终止密码子插入表达质粒P2A序列下游时,相当于抑制了3C蛋白酶的活性,可以检测到荧光恢复。因此,本发明所用到的质粒及方法,可以应用于PV蛋白酶抑制剂抗病毒药物的高通量筛选及PV蛋白酶抑制剂抗病毒药物的活性评价。
实施例4
评价蛋白酶抑制剂活性
将质粒pGFP1-3Ccut2-P2A-3C,pGFP2-3Ccut2-P2A-3C和pGFP3-3Ccut2-P2A-3C利用细胞24孔板进行抑制剂添加实验,待293T细胞生长到70%~80%时进行质粒转染实验。质粒转染量为0.5 μg,培养基使用2%FBS DMEM培养基。转染后4h配制含有不同浓度抑制剂的培养基,用PBS清洗细胞,向细胞中加入含有不同浓度PV 3C抑制剂的培养基,置于37℃,5%CO2培养箱中培养。每隔24 h观察细胞状态及并荧光拍照。
其中实验组和对照组的设置:一、实验组分别添加1μM,10μM,30μM,100μM浓度的抑制剂Rupintrivir;二、对照组添加10 μL DMSO(实验组最大添加体积为10 μL)。
由图3可见,添加抑制剂1µM Rupintrivir之后,三个实验组在48h还观察不到荧光,当抑制剂浓度达到10µM及以上时,pGFP1-3Ccut2-P2A-3C实验组可以观测到荧光,当抑制剂浓度达到100µM及以上时 pGFP2-3Ccut2-P2A-3C实验组和pGFP3-3Ccut2-P2A-3C实验组也可以观测到荧光,随着抑制剂浓度的提升,荧光强度越高。由此可见,本发明共表达改造的GFP和PV 3C蛋白酶的质粒是一种细胞水平评价PV蛋白酶抑制剂的抑制效果的极为简洁方便的产品。
以上所述,仅为本发明的较佳实施例,并非对本发明任何形式上和实质上的限制,应当指出,对于本技术领域的普通技术人员,在不脱离本发明方法的前提下,还将可以做出若干改进和补充,这些改进和补充也应视为本发明的保护范围。凡熟悉本专业的技术人员,在不脱离本发明的精神和范围的情况下,当可利用以上所揭示的技术内容而做出的些许更动、修饰与演变的等同变化,均为本发明的等效实施例;同时,凡依据本发明的实质技术对上述实施例所作的任何等同变化的更动、修饰与演变,均仍属于本发明的技术方案的范围内。
Claims (5)
1.一种可用于检测脊髓灰质炎病毒蛋白酶抑制剂活性的质粒,其特征在于,所述质粒包含改造的GFP荧光蛋白的编码核苷酸序列以及脊髓灰质炎病毒蛋白酶的编码核苷酸序列,
所述的改造的GFP荧光蛋白内部包含可被脊髓灰质炎病毒蛋白酶裂解的蛋白酶切割序列,
所述可被脊髓灰质炎病毒蛋白酶裂解的蛋白酶切割序列插入于野生型GFP荧光蛋白的位置包括site1,site2或者site3,site1位于如SEQ ID NO.5所示的氨基酸序列的KQ和KN之间,site2位于如SEQ ID NO.6所示的氨基酸序列的EG和DT之间,site3位于如SEQ ID NO.7所示的氨基酸序列的QK和NG之间;所述的脊髓灰质炎病毒蛋白酶为3C;所述的脊髓灰质炎病毒蛋白酶的氨基酸序列如SEQ ID NO.3所示,所述蛋白酶切割序列为cut1如SEQ ID NO.1所示的氨基酸序列或者cut2如SEQ ID NO.2所示的氨基酸序列,且所述蛋白酶切割序列cut1插入野生型GFP荧光蛋白的位置为site1或site3,所述蛋白酶切割序列cut2插入野生型GFP荧光蛋白的位置为site1,site2或者site3;
所述的野生型GFP荧光蛋白的氨基酸序列如SEQ ID NO.4所示。
2.一种如权利要求1所述的可用于检测脊髓灰质炎病毒蛋白酶抑制剂活性的质粒的构建方法,其特征在于,所述构建方法为通过P2A编码基因序列连接改造的GFP荧光蛋白编码核苷酸序列和脊髓灰质炎病毒蛋白酶3C的编码核苷酸序列,并将连接有改造的GFP荧光蛋白编码核苷酸序列和脊髓灰质炎病毒蛋白酶3C的编码核苷酸序列克隆到表达载体上,构建可用于检测脊髓灰质炎病毒蛋白酶抑制剂活性的质粒。
3.一种检测脊髓灰质炎病毒蛋白酶抑制剂活性的方法,其特征在于,所述方法包括以下步骤:
1)将如权利要求1所述的质粒进行细胞转染,获得转染后的细胞;
2)添加脊髓灰质炎病毒蛋白酶抑制剂至上述转染后的细胞,观察是否可激发荧光产生以及检测荧光强度;
3)有激发荧光产生,则表示脊髓灰质炎病毒蛋白酶抑制剂起作用,反之表示脊髓灰质炎病毒蛋白酶抑制剂未起作用;检测荧光强度,荧光越亮,则表示脊髓灰质炎病毒蛋白酶抑制剂抑制效果越好,反之表示脊髓灰质炎病毒蛋白酶抑制剂抑制效果越差。
4.如权利要求1所述的质粒在检测脊髓灰质炎病毒3C蛋白酶抑制剂活性中的应用,其特征在于,所述的应用可正向评价脊髓灰质炎病毒3C蛋白酶抑制剂的活性。
5.一种采用权利要求3所述的检测脊髓灰质炎病毒蛋白酶抑制剂活性的方法在脊髓灰质炎病毒3C蛋白酶抑制剂抗病毒药物筛选与脊髓灰质炎病毒3C蛋白酶抑制剂抗病毒药物活性检测中的应用,其特征在于,通过荧光强度正向反映脊髓灰质炎病毒蛋白酶抑制剂的抑制效果以筛选有效的抗病毒药物。
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Citations (4)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN1239512A (zh) * | 1997-08-07 | 1999-12-22 | 奥尔特威尔生物技术公司 | 脊髓灰质炎病毒具有复制能力的重组体萨宾i型株系 |
CN103993032A (zh) * | 2014-05-05 | 2014-08-20 | 上海博唯生物科技有限公司 | 一种制备重组脊髓灰质炎病毒样颗粒的方法 |
CN110195093A (zh) * | 2019-04-19 | 2019-09-03 | 中国农业科学院哈尔滨兽医研究所(中国动物卫生与流行病学中心哈尔滨分中心) | 一种基于表达绿色荧光蛋白的重组寨卡病毒的药物筛选系统及其应用 |
CN113292658A (zh) * | 2021-04-17 | 2021-08-24 | 复旦大学 | 一种融合蛋白及其在靶向降解细胞内蛋白中的应用 |
Family Cites Families (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
KR100481879B1 (ko) * | 2001-02-08 | 2005-04-11 | 크레아젠 주식회사 | (+)-단일쇄 rna 재조합 벡터내 삽입 서열의 유전적 안정성을 증가시키는 방법 |
-
2023
- 2023-10-20 CN CN202311362594.6A patent/CN117089576B/zh active Active
Patent Citations (4)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN1239512A (zh) * | 1997-08-07 | 1999-12-22 | 奥尔特威尔生物技术公司 | 脊髓灰质炎病毒具有复制能力的重组体萨宾i型株系 |
CN103993032A (zh) * | 2014-05-05 | 2014-08-20 | 上海博唯生物科技有限公司 | 一种制备重组脊髓灰质炎病毒样颗粒的方法 |
CN110195093A (zh) * | 2019-04-19 | 2019-09-03 | 中国农业科学院哈尔滨兽医研究所(中国动物卫生与流行病学中心哈尔滨分中心) | 一种基于表达绿色荧光蛋白的重组寨卡病毒的药物筛选系统及其应用 |
CN113292658A (zh) * | 2021-04-17 | 2021-08-24 | 复旦大学 | 一种融合蛋白及其在靶向降解细胞内蛋白中的应用 |
Non-Patent Citations (2)
Title |
---|
"Green fluorescent protein as a scaffold for intracellular presentation of peptides";Majid R. Abedi等;《Nucleic Acids Research》;第26卷(第2期);第625页左栏倒数第1段、右栏第1段,629页左栏倒数第1段-右栏第1段 * |
"HCV NS3 /4A 蛋白酶胞内荧光检测方法的建立";闫兴等;《中国生物工程杂志》;第32卷(第7期);第85页第2.1节,第86页第2.2节,第86-87页第3节,第88页左栏第1段 * |
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Denomination of invention: Method for screening and evaluating the efficacy of plasmids and PV protease inhibitors Granted publication date: 20240206 Pledgee: Hangzhou branch of Zhejiang Tailong Commercial Bank Co.,Ltd. Pledgor: Zhejiang Difu runsi Biotechnology Co.,Ltd. Registration number: Y2024980016282 |