CN116710553A - SARS-CoV-2刺突糖蛋白结合核酸分子、SARS-CoV-2检测用传感器、SARS-CoV-2检测试剂、SARS-CoV-2的检测方法和SARS-CoV-2病毒的灭活剂 - Google Patents

SARS-CoV-2刺突糖蛋白结合核酸分子、SARS-CoV-2检测用传感器、SARS-CoV-2检测试剂、SARS-CoV-2的检测方法和SARS-CoV-2病毒的灭活剂 Download PDF

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Abstract

本发明提供能够与SARS‑CoV‑2刺突糖蛋白特异性结合、结合力高且脱离慢的结合核酸分子。本发明的SARS‑CoV‑2刺突糖蛋白结合核酸分子的特征在于，含有下述(a)或(b)中的任一多核苷酸。(a)由序列号1～7的碱基序列或序列号1～7的碱基序列的部分序列构成的多核苷酸；(b)由与所述(a)的碱基序列具有80％以上的一致性的碱基序列构成、并且与SARS‑CoV‑2刺突糖蛋白结合的多核苷酸。

Description

SARS-CoV-2刺突糖蛋白结合核酸分子、SARS-CoV-2检测用传 感器、SARS-CoV-2检测试剂、SARS-CoV-2的检测方法和SARS- CoV-2病毒的灭活剂
技术领域
本发明涉及SARS-CoV-2刺突糖蛋白结合核酸分子、SARS-CoV-2检测用传感器、SARS-CoV-2检测试剂、SARS-CoV-2的检测方法和SARS-CoV-2病毒的灭活剂。
背景技术
近来，新型冠状病毒SARS-CoV-2(也称为“2019-nCoV”)的世界性大流行已成为问题，SARS-CoV-2所引起的感染的机制的阐明以及治疗法和疫苗的开发正在进行之中。
因此，为了进行SARS-CoV-2的检测，正在尝试获得以构成SARS-CoV-2的蛋白质为靶标的适配体(非专利文献1)。
现有技术文献
非专利文献
非专利文献1：Song Y et al,Anal.Chem.(2020),92,9895-9900.
发明内容
发明所要解决的问题
但是，需要能够与SARS-CoV-2特异性结合、结合力高且脱离慢的适配体。
因此，本发明的目的在于，提供能够对参与与SARS-CoV-2的靶标即血管紧张素转换酶2(ACE2)的结合的SARS-CoV-2刺突糖蛋白特异性结合、结合力高且脱离慢的结合核酸分子。
用于解决问题的方法
本发明的SARS-CoV-2刺突糖蛋白结合核酸分子(以下也称为“核酸分子”)的特征在于，含有下述(a)、(b)、(c)和(d)中的任一多核苷酸：
(a)由序列号1～7的碱基序列或序列号1～7的碱基序列的部分序列构成的多核苷酸；
(b)由与上述(a)的碱基序列具有80％以上的一致性的碱基序列构成、并且与SARS-CoV-2刺突糖蛋白结合的多核苷酸；
(c)由与由上述(a)的碱基序列构成的多核苷酸在严格条件下杂交的多核苷酸的互补碱基序列构成、并且与SARS-CoV-2刺突糖蛋白结合的多核苷酸；
(d)由在上述(a)的碱基序列中缺失、置换、插入和/或添加1个或2个以上碱基而成的碱基序列构成、并且与上述SARS-CoV-2刺突糖蛋白结合的多核苷酸；
序列号1：GGTATGTCTCCGCCACTGAAATCCGTGCCTAATCTCACCCCACGGAATTCATGGCAAAGCCGAGGTGTCTTGTATTC；
序列号2：GGTATGTCTCCGCCACTGAAATCTAATCTCACATTGTAAGCAAAGGAGAATAAGCAAAGCCGAGGTGTCTTGTATTC；
序列号3：GGTATGTCTCCGCCACTGAAATCCCTGACCGCTGACCAAATCTCAGTGCAGATGCAAAGCCGAGGTGTCTTGTATTC；
序列号4：GGTATGTCTCCGCCACTGAAATCTTGTCCCCTAATAGGTTCCGACTGACAAGTGCAAAGCCGAGGTGTCTTGTATTC；
序列号5：GGTTTAGCCCTCGACTCCAAATGTGCACTCTCCCGGTATCCCTAATCTCACCCGATACCGTTGATGTGCTGCCAATAC；
序列号6：GGTTTAGCCCTCGACTCCAAATGACATGAGCCAGGTGCATCTTGAACGTCATAGATACCGTTGATGTGCTGCCAATAC；
序列号7：GGTTTAGCCCTCGACTCCAAATGTGCTGATACTCGGTATCCCTAATCTCACCCGATACCGTTGATGTGCTGCCAATAC。
本发明的SARS-CoV-2检测用传感器的特征在于，含有上述本发明的SARS-CoV-2刺突糖蛋白结合核酸分子。
本发明的SARS-CoV-2检测试剂的特征在于，含有上述本发明的SARS-CoV-2刺突糖蛋白结合核酸分子。
本发明的SARS-CoV-2的检测方法的特征在于，包括使试样与核酸分子接触并检测上述试样中的SARS-CoV-2刺突糖蛋白的步骤，上述核酸分子为上述本发明的SARS-CoV-2刺突糖蛋白结合核酸分子，上述检测步骤中，使上述试样中的SARS-CoV-2刺突糖蛋白与上述核酸分子结合，通过上述结合来检测上述试样中的SARS-CoV-2。
发明效果
本发明的SARS-CoV-2刺突糖蛋白结合核酸分子能够与SARS-CoV-2刺突糖蛋白特异性结合，结合力高且脱离慢。因此，根据本发明的SARS-CoV-2刺突糖蛋白结合核酸分子，例如能够通过与试样中的SARS-CoV-2刺突糖蛋白的结合的有无以优良的精度检测SARS-CoV-2。
附图说明
图1为示出实施例1中的适配体对SARS-CoV-2刺突糖蛋白的结合能力的图。
图2为示出实施例2中的适配体对SARS-CoV-2刺突糖蛋白的结合能力的图。
图3为示出实施例2中的适配体对SARS-CoV-2刺突糖蛋白的结合能力的图。
图4为示出实施例2中的适配体对SARS-CoV-2刺突糖蛋白的结合能力的图。
图5为示出实施例2中的适配体对SARS-CoV-2刺突糖蛋白的结合能力的图。
图6为示出实施例2中的适配体对SARS-CoV-2刺突糖蛋白的结合能力的图。
图7为示出SARS-CoV-2刺突糖蛋白的序列的示意图。
图8为示出实施例3中的适配体对SARS-CoV-2刺突糖蛋白的结合能力的图。
具体实施方式
(1)SARS-CoV-2刺突糖蛋白结合核酸分子
本发明的SARS-CoV-2刺突糖蛋白结合核酸分子的特征在于，含有下述(a)、(b)、(c)和(d)中的任一多核苷酸：
(a)由序列号1～7的碱基序列或序列号1～7的碱基序列的部分序列构成的多核苷酸；
(b)由与上述(a)的碱基序列具有80％以上的一致性的碱基序列构成、并且与SARS-CoV-2刺突糖蛋白结合的多核苷酸；
(c)由与由上述(a)的碱基序列构成的多核苷酸在严格条件下杂交的多核苷酸的互补碱基序列构成、并且与SARS-CoV-2刺突糖蛋白结合的多核苷酸；
(d)由在上述(a)的碱基序列中缺失、置换、插入和/或添加1个或2个以上碱基而成的碱基序列构成、并且与上述SARS-CoV-2刺突糖蛋白结合的多核苷酸。
本发明中，“SARS-CoV-2”是指严重急性呼吸综合征冠状病毒2(severe acuterespiratory syndrome coronavirus 2)。SARS-CoV-2所引起的感染症也被称为COVID-19。SARS-Cov-2是被分类为β冠状病毒属的病毒。包括SARS-CoV-2在内的冠状病毒含有由包膜蛋白、膜蛋白和刺突糖蛋白等构成的包膜，作为基因组RNA的单链RNA被上述包膜包裹。上述刺突糖蛋白的表面氨基酸可以经过糖链修饰，也可以未经糖链修饰。
本发明的核酸分子如上所述能够与构成SARS-CoV-2的蛋白质即SARS-CoV-2刺突糖蛋白结合。SARS-CoV-2刺突糖蛋白参与与SARS-CoV-2的靶标即血管紧张素转换酶2(ACE2)的结合。将SARS-CoV-2刺突糖蛋白的序列的示意图示于图7。本发明的核酸分子例如可以与构成SARS-CoV-2刺突糖蛋白的RBD结构域、S1+S2结构域、S1结构域和上述S1+S2结构域的三聚体(也称为S-trimer)中的至少任意一者结合。另外，既可以与全部这些区域结合，也可以与SARS-CoV-2刺突糖蛋白的其它区域结合。本发明的核酸分子与上述RBD结构域、S1+S2结构域、S1结构域和三聚体的结合性例如分别可以通过使用后述实施例1中记载的表1所示的4种市售试剂作为靶标来确认。本发明的核酸分子以下也称为例如适配体。
SARS-CoV-2刺突糖蛋白的氨基酸序列的信息例如可列举UniProt(http://www.uniprot.org/)的登录号P0DTC2所登录的下述氨基酸序列(序列号15)。需要说明的是，关于SARS-CoV-2刺突糖蛋白的上述各结构域，在上述登录号P0DTC2的氨基酸序列号中，例如RBD结构域如319-541(序列号16)所示，S1+S2结构域如13-1273(序列号17)所示，S1结构域如13-685(序列号18)所示。上述SARS-CoV-2刺突糖蛋白及其各结构域中，例如可以在本发明的核酸分子进行结合的范围内对各氨基酸序列导入1个以上突变(例如缺失、置换、插入和/或添加)。
SARS-CoV-2刺突糖蛋白(序列号15)
MFVFLVLLPLVSSQCVNLTTRTQLPPAYTNSFTRGVYYPDKVFRSSVLHSTQDLFLPFFSNVTWFHAIHVSGTNGTKRFDNPVLPFNDGVYFASTEKSNIIRGWIFGTTLDSKTQSLLIVNNATNVVIKVCEFQFCNDPFLGVYYHKNNKSWMESEFRVYSSANNCTFEYVSQPFLMDLEGKQGNFKNLREFVFKNIDGYFKIYSKHTPINLVRDLPQGFSALEPLVDLPIGINITRFQTLLALHRSYLTPGDSSSGWTAGAAAYYVGYLQPRTFLLKYNENGTITDAVDCALDPLSETKCTLKSFTVEKGIYQTSNFRVQPTESIVRFPNITNLCPFGEVFNATRFASVYAWNRKRISNCVADYSVLYNSASFSTFKCYGVSPTKLNDLCFTNVYADSFVIRGDEVRQIAPGQTGKIADY NYKLPDDFTGCVIAWNSNNLDSKVGGNYNYLYRLFRKSNLKPFERDISTEIYQAGSTPCNGVEGFNCYFPLQSYGFQPTNGVGYQPYRVVVLSFELLHAPATVCGPKKSTNLVKNKCVNFNFNGLTGTGVLTESNKKFLPFQQFGRDIADTTDAVRDPQTLEILDITPCSFGGVSVITPGTNTSNQVAVLYQDVNCTEVPVAIHADQLTPTWRVYSTGSNVFQTRAGCLIGAEHVNNSYECDIPIGAGICASYQTQTNSPRRARSVASQSIIAYTMSLGAENSVAYSNNSIAIPTNFTISVTTEILPVSMTKTSVDCTMYICGDSTECSNLLLQYGSFCTQLNRALTGIAVEQDKNTQEVFAQVKQIYKTPPIKDFGGFNFSQILPDPSKPSKRSFIEDLLFNKVTLADAGFIKQYGDCLGDIAARDLICAQKFNGLTVLPPLLTDEMIAQYTSALLAGTITSGWTFGAGAALQIPFAMQMAYRFNGIGVTQNVLYENQKLIANQFNSAIGKIQDSLSSTASALGKLQDVVNQNAQALNTLVKQLSSNFGAISSVLNDILSRLDKVEAEVQIDRLITGRLQSLQTYVTQQLIRAAEIRASANLAATKMSECVLGQSKRVDFCGKGYHLMSFPQSAPHGVVFLHVTYVPAQEKNFTTAPAICHDGKAHFPREGVFVSNGTHWFVTQRNFYEPQIITTDNTFVSGNCDVVIGIVNNTVYDPLQPELDSFKEELDKYFKNHTSPDVDLGDISGINASVVNIQKEIDRLNEVAKNLNESLIDLQELGKYEQYIKWPWYIWLGFIAGLIAIVMVTIMLCCMTSCCSCLKGCCSCGSCCKFDEDDSEPVLKGVKLHYT
SARS-CoV-2刺突糖蛋白的RBD结构域(序列号16)
RVQPTESIVRFPNITNLCPFGEVFNATRFASVYAWNRKRISNCVADYSVLYNSASFSTFKCYGVSPTKLNDLCFTNVYADSFVIRGDEVRQIAPGQTGKIADYNYKLPDDFTGCVIAWNSNNLDSKVGGNYNYLYRLFRKSNLKPFERDISTEIYQAGSTPCNGVEGFNCYFPLQSYGFQPTNGVGYQPYRVVVLSFELLHAPATVCGPKKSTNLVKNKCVNF
SARS-CoV-2刺突糖蛋白的S1+S2结构域(序列号17)
SQCVNLTTRTQLPPAYTNSFTRGVYYPDKVFRSSVLHSTQDLFLPFFSNVTWFHAIHVSGTNGTKRFDNPVLPFNDGVYFASTEKSNIIRG WIFGTTLDSKTQSLLIVNNATNVVIKVCEFQFCNDPFLGVYYHKNNKSWMESEFRVYSSANNCTFEYVSQPFLMDLEGKQGNFKNLREFVFKNIDGYFKIYSKHTPINLVRDLPQGFSALEPLVDLPIGINITRFQTLLALHRSYLTPGDSSSGWTAGAAAYYVGYLQPRTFLLKYNENGTITDAVDCALDPLSETKCTLKSFTVEKGIYQTSNFRVQPTESIVRFPNITNLCPFGEVFNATRFASVYAWNRKRISNCVADYSVLYNSASFSTFKCYGVSPTKLNDLCFTNVYADSFVIRGDEVRQIAPGQTGKIADYNYKLPDDFTGCVIAWNSNNLDSKVGGNYNYLYRLFRKSNLKPFERDISTEIYQAGSTPCNGVEGFNCYFPLQSYGFQPTNGVGYQPYRVVVLSFELLHAPATVCGPKKSTNLVKNKCVNFNFNGLTGTGVLTESNKKFLPFQQFGRDIADTTDAVRDPQTLEILDITPCSFGGVSVITPGTNTSNQVAVLYQDVNCTEVPVAIHADQLTPTWRVYSTGSNVFQTRAGCLIGAEHVNNSYECDIPIGAGICASYQTQTNSPRRARSVASQSIIAYTMSLGAENSVAYSNNSIAIPTNFTISVTTEILPVSMTKTSVDCTMYICGDSTECSNLLLQYGSFCTQLNRALTGIAVEQDKNTQEVFAQVKQIYKTPPIKDFGGFNFSQILPDPSKPSKRSFIEDLLFNKVTLADAGFIKQYGDCLGDIAARDLICAQKFNGLTVLPPLLTDEMIAQYTSALLAGTITSGWTFGAGAALQIPFAMQMAYRFNGIGVTQNVLYENQKLIANQFNSAIGKIQDSLSSTASALGKLQDVVNQNAQALNTLVKQLSSNFGAISSVLNDILSRLDKVEAEVQIDRLITGRLQSLQTYVTQQLIRAAEIRASANLAATKMSECVLGQSKRVDFCGKGYHLMSFPQSAPHGVVFLHVTYVPAQEKNFTTAPAICHDGKAHFPREGVFVSNGTHWFVTQRNFYEPQIITTDNTFVSGNCDVVIGIVNNTVYDPLQPELDSFKEELDKYFKNHTSPDVDLGDISGINASVVNIQKEIDRLNEVAKNLNESLIDLQELGKYEQYIKWPWYIWLGFIAGLIAIVMVTIMLCCMTSCCSCLKGCCSCGSCCKFDEDDSEPVLKGVKLHYT
SARS-CoV-2刺突糖蛋白的S1结构域(序列号18)
SQCVNLTTRTQLPPAYTNSFTRGVYYPDKVFRSSVLHSTQDLFLPFFSNVTWFHAIHVSGTNGTKRFDNPVLPFNDGVYFASTEKSNIIRGWIFGTTLDSKTQSLLIVNNATNVVIKVCEFQFCNDPFLGVYYHKNNK SWMESEFRVYSSANNCTFEYVSQPFLMDLEGKQGNFKNLREFVFKNIDGYFKIYSKHTPINLVRDLPQGFSALEPLVDLPIGINITRFQTLLALHRSYLTPGDSSSGWTAGAAAYYVGYLQPRTFLLKYNENGTITDAVDCALDPLSETKCTLKSFTVEKGIYQTSNFRVQPTESIVRFPNITNLCPFGEVFNATRFASVYAWNRKRISNCVADYSVLYNSASFSTFKCYGVSPTKLNDLCFTNVYADSFVIRGDEVRQIAPGQTGKIADYNYKLPDDFTGCVIAWNSNNLDSKVGGNYNYLYRLFRKSNLKPFERDISTEIYQAGSTPCNGVEGFNCYFPLQSYGFQPTNGVGYQPYRVVVLSFELLHAPATVCGPKKSTNLVKNKCVNFNFNGLTGTGVLTESNKKFLPFQQFGRDIADTTDAVRDPQTLEILDITPCSFGGVSVITPGTNTSNQVAVLYQDVNCTEVPVAIHADQLTPTWRVYSTGSNVFQTRAGCLIGAEHVNNSYECDIPIGAGICASYQTQTNSPRRAR
本发明中，“与SARS-CoV-2刺突糖蛋白结合”例如也称为“具有对SARS-CoV-2刺突糖蛋白的结合能力”或“具有对SARS-CoV-2刺突糖蛋白的结合活性”。本发明的核酸分子与SARS-CoV-2刺突糖蛋白的结合例如可以通过表面等离子体共振(SPR：Surface Plasmonresonance)分析等来确定。上述分析例如可以使用ProteON(商品名、BioRad公司)。本发明的核酸分子与SARS-CoV-2刺突糖蛋白结合，因此例如可以用于SARS-CoV-2的检测。
本发明的核酸分子例如可以为由上述(a)或(b)的多核苷酸构成的分子，也可以为含有上述多核苷酸的分子。另外，本发明的核酸分子例如可以由DNA、RNA或者DNA和RNA构成。本发明的核酸分子由DNA构成时，本发明的核酸分子例如可以称为DNA分子、DNA适配体。
上述(a)的多核苷酸例如可以为包含上述序列号1～7的碱基序列的多核苷酸，也可以为由上述序列号1～7的碱基序列构成的多核苷酸。另外，上述(a)的多核苷酸可以为含有上述序列号1～7的碱基序列的部分序列的核苷酸，也可以为由上述部分序列构成的多核苷酸。上述部分序列没有特别限制，例如可以为在上述序列号1～7的碱基序列中使5’末端和3’末端中的至少一者的序列发生了缺失的序列，也可以为使中间区域的序列发生了缺失的序列。将上述序列号1～7的多核苷酸示于以下。需要说明的是，序列号1～7和后述的序列号8～13的碱基序列中，在修饰碱基带有下划线。关于修饰碱基，如后所述。
SARS-CoV-2刺突糖蛋白结合核酸分子1(序列号1)
GGTATGTCTCCGCCACTGAAATCCGTGCCTAATCTCACCCCACGGAATTCATGGCAAAGCCGAGGTGTCTTGTATTC
SARS-CoV-2刺突糖蛋白结合核酸分子2(序列号2)
GGTATGTCTCCGCCACTGAAATCTAATCTCACATTGTAAGCAAAGGAGAATAAGCAAAGCCGAGGTGTCTTGTATTC
SARS-CoV-2刺突糖蛋白结合核酸分子3(序列号3)
GGTATGTCTCCGCCACTGAAATCCCTGACCGCTGACCAAATCTCAGTGCAGATGCAAAGCCGAGGTGTCTTGTATTC
SARS-CoV-2刺突糖蛋白结合核酸分子4(序列号4)
GGTATGTCTCCGCCACTGAAATCTTGTCCCCTAATAGGTTCCGACTGACAAGTGCAAAGCCGAGGTGTCTTGTATTC
SARS-CoV-2刺突糖蛋白结合核酸分子5(序列号5)
GGTTTAGCCCTCGACTCCAAATGTGCACTCTCCCGGTATCCCTAATCTCACCCGATACCGTTGATGTGCTGCCAATAC
SARS-CoV-2刺突糖蛋白结合核酸分子6(序列号6)
GGTTTAGCCCTCGACTCCAAATGACATGAGCCAGGTGCATCTTGAACGTCATAGATACCGTTGATGTGCTGCCAATAC
SARS-CoV-2刺突糖蛋白结合核酸分子7(序列号7)
GGTTTAGCCCTCGACTCCAAATGTGCTGATACTCGGTATCCCTAATCTCACCCGATACCGTTGATGTGCTGCCAATAC
上述部分序列没有特别限制，例如上述序列号1的碱基序列的部分序列为序列号8的碱基序列，上述序列号2的碱基序列的部分序列为序列号9的碱基序列，上述序列号3的碱基序列的部分序列为序列号10的碱基序列，上述序列号5的碱基序列的部分序列为序列号11的碱基序列，上述序列号6的碱基序列的部分序列为序列号12的碱基序列，或上述序列号7的碱基序列的部分序列为序列号13的碱基序列。
SARS-CoV-2刺突糖蛋白结合核酸分子8(序列号8)
CCACTGAAATCCGTGCCTAATCTCACCCCACGGAATTCATGG
SARS-CoV-2刺突糖蛋白结合核酸分子9(序列号9)
TCCGCCACTGAAATCTAATCTCACATTGTAAGCAAAGGAGAATAA
SARS-CoV-2刺突糖蛋白结合核酸分子10(序列号10)
CCACTGAAATCCCTGACCGCTGACCAAATCTCAGTGCAGAT
SARS-CoV-2刺突糖蛋白结合核酸分子11(序列号11)
TGTGCACTCTCCCGGTATCCCTAATCTCACCCGATACC
SARS-CoV-2刺突糖蛋白结合核酸分子12(序列号12)
TGACATGAGCCAGGTGCATCTTGAACGTCATAGATACCGTTGATGTGCTG
SARS-CoV-2刺突糖蛋白结合核酸分子13(序列号13)
GCTGATACTCGGTATCCCTAATCTCACCCGATACCG
上述(b)中，“一致性”没有特别限制，例如为上述(b)的多核苷酸与SARS-CoV-2刺突糖蛋白结合的范围即可。上述一致性例如为80％以上、优选为85％以上、更优选为90％以上、进一步优选为95％以上、96％以上、97％以上、特别优选为98％以上、最优选为99％以上。上述一致性例如可以使用BLAST、FASTA等分析软件利用默认参数来计算(以下同样)。
上述(b)的多核苷酸例如可以为下述(b1)的多核苷酸。该情况下，本发明的核酸分子例如可以为由上述(b1)的多核苷酸构成的分子，也可以为含有上述多核苷酸的分子。下述(b1)中，“含有序列号8～13中的任一碱基序列”例如也可以称为“序列号8～13中的任一碱基序列保守”。
(b1)由与上述(a)的碱基序列具有80％以上的一致性的碱基序列构成、含有序列号8～13中的任一碱基序列、并且与SARS-CoV-2刺突糖蛋白结合的多核苷酸
本发明的核酸分子中的上述多核苷酸例如可以为下述(b2)的多核苷酸。该情况下，本发明的核酸分子例如可以为由上述(b2)的多核苷酸构成的分子，也可以为含有上述多核苷酸的分子。
(b2)由与上述(a)的碱基序列具有80％以上的一致性的碱基序列构成、能够形成下述式(2)～(14)所示的二级结构、并且与SARS-CoV-2刺突糖蛋白结合的多核苷酸
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上述(b2)的多核苷酸具体而言例如为：由与序列号1～13的碱基序列具有80％以上的一致性的碱基序列构成、分别能够形成上述式(2)～(14)所示的二级结构、并且与SARS-CoV-2刺突糖蛋白结合的多核苷酸。
上述(b1)和(b2)的多核苷酸中，一致性例如可以援引上述(b)的多核苷酸中的一致性的说明。
将上述序列号1～13的碱基序列与上述式(2)～(14)所示的二级结构的对应关系示于以下。
由序列号1的碱基序列构成的多核苷酸例如能够形成上述式(2)所示的二级结构。
由序列号2的碱基序列构成的多核苷酸例如能够形成上述式(3)所示的二级结构。
由序列号3的碱基序列构成的多核苷酸例如能够形成上述式(4)所示的二级结构。
由序列号4的碱基序列构成的多核苷酸例如能够形成上述式(5)所示的二级结构。
由序列号5的碱基序列构成的多核苷酸例如能够形成上述式(6)所示的二级结构。
由序列号6的碱基序列构成的多核苷酸例如能够形成上述式(7)所示的二级结构。
由序列号7的碱基序列构成的多核苷酸例如能够形成上述式(8)所示的二级结构。
由序列号8的碱基序列构成的多核苷酸例如能够形成上述式(9)所示的二级结构。
由序列号9的碱基序列构成的多核苷酸例如能够形成上述式(10)所示的二级结构。
由序列号10的碱基序列构成的多核苷酸例如能够形成上述式(11)所示的二级结构。
由序列号11的碱基序列构成的多核苷酸例如能够形成上述式(12)所示的二级结构。
由序列号12的碱基序列构成的多核苷酸例如能够形成上述式(13)所示的二级结构。
由序列号13的碱基序列构成的多核苷酸例如能够形成上述式(14)所示的二级结构。
另外，上述(b2)的多核苷酸具体而言例如为：由与序列号1～3和5～7的碱基序列具有80％以上的一致性的碱基序列构成、分别能够形成与序列号1～3和5～7的碱基序列的部分序列即序列号8～13对应的上述式(9)～(14)所示的二级结构、并且与SARS-CoV-2刺突糖蛋白结合的多核苷酸。
上述(b2)中，“能够形成二级结构”例如是指上述(b2)的多核苷酸能够形成上述式中的茎结构和环结构。茎结构和环结构如后文所述。上述茎结构中，彼此相对的碱基对为能够形成氢键的碱基的组合即可。上述能够形成氢键的碱基的组合可列举例如A-T、T-A、A-U、U-A、G-C、或C-G。上述“二级结构”例如可以为实际形成的二级结构，也可以为利用已知手段进行模拟时的二级结构。
本发明的核酸分子中的上述多核苷酸例如可以为下述(c)的多核苷酸。该情况下，本发明的核酸分子例如可以为由下述(c)的多核苷酸构成的分子，也可以为含有下述(c)的多核苷酸的分子。
(c)由与由上述(a)的碱基序列构成的多核苷酸在严格条件下杂交的多核苷酸的互补碱基序列构成、并且与SARS-CoV-2刺突糖蛋白结合的多核苷酸
上述(c)中，“能够杂交的多核苷酸”例如为与上述(a)的多核苷酸完全互补或部分互补的多核苷酸，在与上述SARS-CoV-2刺突糖蛋白结合的范围即可。上述杂交可以利用例如各种杂交分析来检测。上述杂交分析没有特别限制，也可以采用例如Sambrook等编的“Molecular Cloning:A Laboratory Manual 2nd Ed.”[Cold Spring Harbor LaboratoryPress(1989)]等中记载的方法。
上述(c)中，“严格条件”例如可以为低严格条件、中严格条件、高严格条件中的任一种。“低严格条件”例如为5×SSC、5×邓哈特溶液、0.5％SDS、50％甲酰胺、32℃的条件。“中严格条件”例如为5×SSC、5×邓哈特溶液、0.5％SDS、50％甲酰胺、42℃的条件。“高严格条件”例如为5×SSC、5×邓哈特溶液、0.5％SDS、50％甲酰胺、50℃的条件。严格程度可由本领域技术人员通过适当地选择例如温度、盐浓度、探针的浓度和长度、离子强度、时间等条件来设定。“严格条件”也可以采用例如上述Sambrook等编的“Molecular Cloning:ALaboratory Manual 2nd Ed.”[Cold Spring Harbor Laboratory Press(1989)]等中记载的条件。
本发明的核酸分子中的上述多核苷酸例如可以为下述(d)的多核苷酸。该情况下，本发明的核酸分子例如可以为由下述(d)的多核苷酸构成的分子，也可以为含有下述(d)的多核苷酸的分子。
(d)由在上述(a)的碱基序列中缺失、置换、插入和/或添加1个或2个以上碱基而成的碱基序列构成、并且与上述SARS-CoV-2刺突糖蛋白结合的多核苷酸
上述(d)中，“1个或2个以上”例如为上述(d)的多核苷酸与SARS-CoV-2刺突糖蛋白结合的范围即可。上述“1个或2个以上”可以为上述(a)的碱基序列中的例如1～16个、1～12个、1～10个、1～8个、1～7个、1～5个、1～3个、1～2个、1个。本发明中，碱基数和序列数等的个数的数值范围公开了例如属于该范围的全部正整数。即，例如“1～5个碱基”的记载表示公开了“1、2、3、4、5个碱基”中的全部(以下同样)。
上述(d)的多核苷酸例如可以为下述(d1)的多核苷酸。该情况下，本发明的核酸分子例如可以为由上述(d1)的多核苷酸构成的分子，也可以为含有上述多核苷酸的分子。下述(d1)中，“含有序列号8～13中的任一碱基序列”也可以称为“序列号8～13中的任一碱基序列保守”。
(d1)由在上述(a)的碱基序列中缺失、置换、插入和/或添加1个或2个以上碱基而成的碱基序列构成、含有序列号8～13中的任一碱基序列、并且与SARS-CoV-2刺突糖蛋白结合的多核苷酸
上述(d)的多核苷酸例如可以为下述(d2)的多核苷酸。该情况下，本发明的核酸分子例如可以为由上述(d2)的多核苷酸构成的分子，也可以为含有上述多核苷酸的分子。
(d2)由在上述(a)的碱基序列中缺失、置换、插入和/或添加1个或2个以上碱基而成的碱基序列构成、能够形成上述式(2)～(14)所示的二级结构、并且与SARS-CoV-2刺突糖蛋白结合的多核苷酸
上述(d1)和(d2)的多核苷酸中的“1个或2个以上”可以援引上述(d)的多核苷酸中的“1个或2个以上”的说明。
本发明的核酸分子中，上述多核苷酸的构成单元例如为核苷酸残基，可列举脱氧核糖核苷酸残基和核糖核苷酸残基。上述多核苷酸如后所述可以为例如由脱氧核糖核苷酸残基构成的DNA、含有脱氧核糖核苷酸残基和核糖核苷酸残基的DNA，可以还含有非核苷酸残基。
本发明的核酸分子例如可以为由上述(a)至(d)中的任一多核苷酸构成的分子，也可以为含有上述(a)至(d)中的任一多核苷酸的分子。后者的情况下，本发明的核酸分子例如如后所述可以含有2个以上的上述(a)至(d)中的任一多核苷酸。上述(a)至(d)中的2个以上多核苷酸可以为相同序列，也可以为不同序列。另外，后者的情况下，本发明的核酸分子例如可以还具有接头和/或添加序列等。在此，上述接头例如为多核苷酸间的序列，上述添加序列例如为添加于末端的序列。
本发明的核酸分子含有例如两个以上多核苷酸时，优选两个以上多核苷酸的序列连接而形成单链多核苷酸。上述两个以上多核苷酸的序列例如可以分别直接连接，也可以借助接头分别间接连接。上述多核苷酸的序列优选在各自的末端直接或间接地连接。含有两个以上的上述多核苷酸的序列时，上述序列的数量没有特别限制，例如为2以上、2～20、2～10、2或3。
上述接头的长度没有特别限制，例如为1～200碱基长、1～24碱基长、1～20碱基长、3～12碱基长、5～9碱基长。上述接头的构成单元例如为核苷酸残基，可列举脱氧核糖核苷酸残基和核糖核苷酸残基等。上述接头没有特别限制，可列举例如由脱氧核糖核苷酸残基构成的DNA、含有核糖核苷酸残基的DNA等多核苷酸。作为上述接头的具体例，可列举例如聚脱氧胸腺嘧啶(聚dT)、聚脱氧腺嘌呤(聚dA)、作为A与T的重复序列的聚dAdT等，优选为聚dT、聚dAdT。
本发明的核酸分子中，上述多核苷酸优选为单链多核苷酸。上述单链多核苷酸例如优选能够通过自退火而形成茎结构和环结构。上述多核苷酸优选能够形成例如茎环结构、内部环结构和/或凸出结构等。
本发明的核酸分子可以为例如双链。在双链的情况下，例如一条单链多核苷酸含有上述(a)～(d)中的任一多核苷酸、另一单链多核苷酸没有限制。上述另一单链多核苷酸可列举例如含有与上述(a)～(d)中的任一多核苷酸互补的碱基序列的多核苷酸。本发明的核酸分子为双链的情况下，例如优选在使用之前通过变性等解离为单链多核苷酸。另外，解离后的上述(a)～(d)中的任一单链多核苷酸优选例如如上所述形成了茎结构和环结构。
本发明中，“能够形成茎结构和环结构”包括例如下述情况：实际形成茎结构和环结构，以及，即使未形成茎结构和环结构，但是根据条件也能够形成茎结构和环结构。“能够形成茎结构和环结构”例如包括通过实验进行了确认的情况和通过计算机等的模拟进行了预测的情况这两种。
本发明的核酸分子的构成单元例如为核苷酸残基。上述核酸分子的长度没有特别限制。上述核酸分子的长度的下限例如为15碱基长、35碱基长、55碱基长、75碱基长。上述核酸分子的长度的上限例如为1000碱基长、200碱基长、100碱基长、90碱基长、80碱基长。上述核酸分子的长度的范围例如为15～1000碱基长、35～200碱基长、55～90碱基长、75～80碱基长。
上述核苷酸残基可列举例如脱氧核糖核苷酸残基和核糖核苷酸残基。本发明的核酸分子可列举例如仅由脱氧核糖核苷酸残基构成的DNA、含有1个或2个以上核糖核苷酸残基的DNA等。后者的情况下，“1个或2个以上”没有特别限制，例如为上述多核苷酸中的例如1～91个、1～30个、1～15个、1～7个、1～3个、1或2个。
上述多核苷酸中，作为核苷酸残基中的碱基，可以含有天然碱基，也可以含有修饰碱基。上述天然碱基(非人工碱基)没有特别限制，可列举例如具有嘌呤骨架的嘌呤碱基、具有嘧啶骨架的嘧啶碱基等。上述嘌呤碱基没有特别限制，可列举例如腺嘌呤(a)、鸟嘌呤(g)。上述嘧啶碱基没有特别限制，可列举例如胞嘧啶(c)、胸腺嘧啶(t)、尿嘧啶(u)等。
上述多核苷酸具有上述修饰碱基的情况下，其部位和个数没有特别限制。本发明的核酸分子具有上述修饰碱基的情况下，上述序列号1～13的多核苷酸中，例如下划线部的胸腺嘧啶的一部分或全部为修饰碱基。上述下划线部的胸腺嘧啶为修饰碱基的情况下，上述修饰碱基优选为修饰胸腺嘧啶碱基而成的修饰胸腺嘧啶。
上述修饰碱基例如为碱基被修饰基团修饰而成的。上述被修饰基团修饰后的碱基(被修饰碱基)例如为上述天然碱基。上述天然碱基可列举例如嘌呤碱基、嘧啶碱基等。上述修饰碱基没有特别限制，可列举例如修饰腺嘌呤、修饰鸟嘌呤、修饰胞嘧啶、修饰胸腺嘧啶、修饰尿嘧啶。
关于上述修饰碱基，例如上述被修饰碱基可以被上述修饰基团直接修饰，上述被修饰碱基也可以被上述修饰基团间接修饰。后者的情况下，可列举例如上述被修饰碱基借助接头被上述修饰基团修饰后的形态。上述接头没有特别限制。
上述被修饰碱基的被上述修饰基团修饰的修饰部位没有特别限制。上述碱基为嘧啶碱基的情况下，上述嘧啶碱基的修饰部位可列举例如上述嘧啶骨架的5位和6位，优选为5位。上述嘧啶碱基的5位被修饰的情况下，由于胸腺嘧啶在5位的碳上具有甲基，因此例如可以是在5位的碳上直接或间接结合有上述修饰基团，也可以是在5位的碳所键合的甲基的碳上直接或间接结合有上述修饰基团。上述嘧啶骨架中，在4位的碳上键合有“＝O”、在5位的碳上键合有“-CH3”或“-H”以外的基团的情况下，可以称为修饰胸腺嘧啶或修饰尿嘧啶。
上述修饰胸腺嘧啶碱基可列举下述式(1)所示的核苷酸残基(以下也称为“NG7”)。
该情况下，在上述多核苷酸的合成中，例如可以使用上述式(1)所示的核苷三磷酸作为单体分子。在上述多核苷酸的合成中，例如，上述单体分子通过磷酸二酯键与其它核苷三磷酸结合。关于上述单体的制造方法，可以通过公知的方法来制造，例如可以参照国际公开第2018/052063号公报。
含有式(1)所示的核苷酸残基作为上述修饰胸腺嘧啶碱基的情况下，上述多核苷酸中，含有上述修饰胸腺嘧啶碱基的核苷酸残基例如如下述式(1A)所示。
上述多核苷酸中，上述序列号1～13的碱基序列中的下划线部的胸腺嘧啶碱基优选为上述式(1)所示的修饰胸腺嘧啶碱基。该情况下，由上述序列号1～13的碱基序列构成的多核苷酸中，下划线部的核苷酸残基也可以称为上述式(1A)所示的核苷酸残基。
上述多核苷酸例如可以仅含有任意1种修饰碱基，也可以含有2种以上修饰碱基。
本发明的核酸分子例如可以含有修饰核苷酸。上述修饰核苷酸可以为上述的具有上述修饰碱基的核苷酸，也可以为具有糖残基被修饰后的修饰糖的核苷酸，还可以为具有上述修饰碱基和上述修饰糖的核苷酸。
上述糖残基没有特别限制，可列举例如脱氧核糖残基或核糖残基。上述糖残基中的修饰部位没有特别限制，可列举例如上述糖残基的2’位或4’位，可以是任意一者或两者被修饰。上述修饰糖的修饰基团可列举例如甲基、氟基、氨基、硫基等。
上述修饰核苷酸残基中碱基为嘧啶碱基的情况下，例如优选上述糖残基的2’位和/或4’位被修饰。上述修饰核苷酸残基的具体例可列举例如脱氧核糖残基或核糖残基的2’位被修饰后的、2’-甲基化-尿嘧啶核苷酸残基、2’-甲基化-胞嘧啶核苷酸残基、2’-氟代-尿嘧啶核苷酸残基、2’-氟代-胞嘧啶核苷酸残基、2’-氨基化-尿嘧啶核苷酸残基、2’-氨基化-胞嘧啶核苷酸残基、2’-硫化-尿嘧啶核苷酸残基、2’-硫化-胞嘧啶核苷酸残基等。
上述修饰碱基的个数没有特别限制。上述多核苷酸中，上述修饰碱基的个数例如为1个以上。上述修饰碱基为上述多核苷酸中的例如1～80个、1～70个、1～50个、1～40个、1～30个、1～20个、1～10个，另外，全部碱基可以为上述修饰碱基。上述修饰碱基的个数例如可以为任意1种上述修饰碱基的个数，也可以为2种以上上述修饰碱基的个数的合计。另外，含有上述多核苷酸的上述核酸分子的全长中的上述修饰碱基也没有特别限制，例如为1～80个、1～50个、1～20个，优选与上述范围相同。
上述多核苷酸中，上述修饰碱基的比例没有特别限制。上述修饰碱基的比例为上述多核苷酸的总碱基数中的例如1/100以上、1/40以上、1/20以上、1/10以上、1/4以上、1/3以上。另外，含有上述多核苷酸的上述核酸分子的全长中的上述修饰碱基的比例也没有特别限制，与上述的范围相同。在此，上述总碱基数例如为上述多核苷酸中的天然碱基的个数与上述修饰碱基的个数的合计。用分数表示上述修饰碱基的比例，但满足该比例的总碱基数和修饰碱基数分别为正的整数。
上述多核苷酸中的上述修饰碱基为上述修饰胸腺嘧啶的情况下，上述修饰胸腺嘧啶的个数没有特别限制。上述多核苷酸中，例如天然胸腺嘧啶可以置换为上述修饰胸腺嘧啶。上述多核苷酸中，上述修饰胸腺嘧啶的个数例如为1个以上。上述修饰胸腺嘧啶可以为上述多核苷酸中的例如1～80个、1～70个、1～50个、1～40个、1～30个、1～20个、1～10个，另外，全部胸腺嘧啶可以为上述修饰胸腺嘧啶。
上述多核苷酸中，上述修饰胸腺嘧啶的比例没有特别限制。上述修饰胸腺嘧啶的比例为上述天然胸腺嘧啶的个数与上述修饰胸腺嘧啶的个数的合计中的例如1/100以上、1/40以上、1/20以上、1/10以上、1/4以上、1/3以上。
本发明的核酸分子可以含有例如1个或2个以上人工核酸单体残基。上述“1个或2个以上”没有特别限制，例如为上述多核苷酸中的例如1～100个、1～50个、1～30个、1～10个。上述人工核酸单体残基可列举例如PNA(肽核酸)、LNA(Locked Nucleic Acid，锁核酸)、ENA(2’-O,4’-C-Ethylene-bridged Nucleic Acids，2’-O,4’-C-亚乙基桥连核酸)等。上述单体残基中的核酸例如与上述相同。
本发明的核酸分子优选例如为核酸酶耐受性。本发明的核酸分子优选具有例如上述修饰化核苷酸残基和/或上述人工核酸单体残基，以实现核酸酶耐受性。本发明的核酸分子可以在例如5’末端或3’末端结合有数10kDa的PEG(聚乙二醇)或脱氧胸腺嘧啶等，以实现核酸酶耐受性。
本发明的核酸分子例如可以还具有添加序列。上述添加序列优选结合于例如上述核酸分子的5’末端和3’末端中的至少一个末端，更优选为3’末端。上述添加序列没有特别限制。上述添加序列的长度没有特别限制，例如为1～200碱基长、1～50碱基长、1～25碱基长、18～24碱基长。上述添加序列的构成单元例如为核苷酸残基，可列举脱氧核糖核苷酸残基和核糖核苷酸残基等。上述添加序列没有特别限制，可列举例如由脱氧核糖核苷酸残基构成的DNA、含有核糖核苷酸残基的DNA等多核苷酸。作为上述添加序列的具体例，可列举例如聚dT、聚dA等。
本发明的核酸分子例如可固定化于载体而使用。上述本发明的核酸分子例如优选5’末端和3’末端中的任一末端被固定化，更优选为3’末端。在对本发明的核酸分子进行固定化的情况下，例如上述核酸分子可以直接固定化于上述载体，也可以间接固定化于上述载体。后者的情况下，例如优选借助上述添加序列而进行固定化。
本发明的核酸分子例如可以还具有标记物质，具体而言，上述核酸分子上可以结合有上述标记物质。结合有上述标记物质的上述核酸分子例如也可以称为本发明的核酸传感器。上述标记物质例如可以结合于上述核酸分子的5’末端和3’末端中的至少一个末端。利用上述标记物质进行的标记化例如可以为结合，也可以为化学修饰。上述标记物质没有特别限制，可列举例如酶、荧光物质、色素、同位素、药物、毒素和抗生素等。上述酶例如可列举荧光素酶、NanoLuc荧光素酶等。上述荧光物质可列举例如芘、TAMRA、荧光素、Cy3色素、Cy5色素、FAM色素、罗丹明色素、德克萨斯红色素、JOE、MAX、HEX、TYE等荧光团，上述色素可列举例如Alexa488、Alexa647等Alexa色素等。上述标记物质例如可以与上述核酸分子直接连接，也可以借助接头间接连接。上述接头没有特别限制，例如为多核苷酸的接头等。
本发明的核酸分子的制造方法没有特别限制，例如可以通过利用化学合成的核酸合成方法等、基因工程学方法、公知方法来合成。
本发明的核酸分子如上所述与上述SARS-CoV-2刺突糖蛋白显示结合性。因此，本发明的核酸分子的用途只要是利用与上述SARS-CoV-2刺突糖蛋白的结合性的用途就没有特别限制。本发明的核酸分子例如可以代替针对上述SARS-CoV-2刺突糖蛋白的抗体用于各种方法。
根据本发明的核酸分子，能够检测SARS-CoV-2刺突糖蛋白。由此，能够检测SARS-CoV-2。SARS-CoV-2刺突糖蛋白和SARS-CoV-2的检测方法没有特别限制，例如可以参照后述的检测方法通过检测SARS-CoV-2刺突糖蛋白与上述核酸分子的结合来进行。
(2)SARS-CoV-2检测用传感器
如上所述，本发明的检测用传感器为SARS-CoV-2的检测用传感器，其特征在于，含有上述本发明的核酸分子。本发明的检测用传感器只要含有上述本发明的核酸分子则其它构成没有特别限制。使用本发明的检测用传感器时，例如使上述核酸分子与上述SARS-CoV-2刺突糖蛋白结合，由此如上所述能够检测上述SARS-CoV-2。
本发明的检测用传感器例如可以还具有载体，在上述载体上配置有上述核酸分子。上述核酸分子优选固定化于上述载体。上述核酸分子向上述载体的固定化例如如前所述。本发明的检测用传感器的使用方法没有特别限制，可以援引上述本发明的核酸分子和上述本发明的检测方法。
(3)检测试剂和试剂盒
本发明的检测试剂的特征在于，含有上述本发明的SARS-CoV-2刺突糖蛋白结合核酸分子。本发明的检测试剂只要含有上述本发明的核酸分子则其它构成没有任何限制。使用本发明的检测试剂时，如上所述例如能够进行上述SARS-CoV-2的检测等。
本发明的检测试剂例如可以含有上述本发明的传感器作为上述本发明的核酸分子。本发明的检测试剂例如可以还具有标记物质，上述标记物质结合于上述核酸分子。上述标记物质例如可以援引上述本发明的核酸分子中的说明。另外，本发明的检测试剂例如可以还具有载体，在上述载体上固定化有上述核酸分子。上述载体例如可以援引上述本发明的核酸分子中的说明。
本发明的检测试剂例如除了含有上述本发明的核酸分子以外还可以含有其它构成要素。上述构成要素可列举例如非特异性吸附剂、上述载体、缓冲液、使用说明书等。作为上述非特异性吸附剂，可列举例如葡聚糖、tRNA(转运RNA)、鲑鱼精子DNA等。作为上述tRNA，可使用例如tRNA from E.coli MRE 600(メルクライフサイエンス公司制、Cat No.:10109541001)等。上述鲑鱼精子DNA例如可以使用脱氧核糖核酸，低分子量，来源于鲑鱼精子(Sigma-Aldrich公司制、Cat No.:31149-10G-F)等。
本发明的检测试剂中，例如上述核酸分子和上述缓冲液等其它构成要素可以分别收容在分开的容器中，也可以以混合或未混合的状态收容于同一容器中。上述核酸分子和上述其它构成要素被收容于分开的容器的情况下，本发明的检测试剂也可以称为检测试剂盒。
(4)检测方法
如上所述，本发明的检测方法的特征在于，包括使试样与核酸分子接触、并检测上述试样中的SARS-CoV-2刺突糖蛋白的步骤，上述核酸分子为上述本发明的SARS-CoV-2刺突糖蛋白结合核酸分子，上述检测步骤中，使上述试样中的SARS-CoV-2刺突糖蛋白与上述核酸分子结合，通过上述结合来检测上述试样中的SARS-CoV-2。本发明的检测方法的特征在于使用上述本发明的核酸分子，其它步骤和条件等没有特别限制。另外，本发明的检测方法中，可以使用上述本发明的SARS-CoV-2检测用传感器或本发明的检测试剂或检测试剂盒来作为上述本发明的核酸分子。
根据本发明，上述本发明的核酸分子与SARS-CoV-2刺突糖蛋白特异性结合，因此例如通过检测SARS-CoV-2刺突糖蛋白与上述核酸分子的结合，能够特异性检测试样中的SARS-CoV-2刺突糖蛋白和SARS-CoV-2。具体而言，本发明的检测方法例如能够检测试样中的SARS-CoV-2刺突糖蛋白的有无或SARS-CoV-2刺突糖蛋白的量，因此可以说能够进行定性或定量。另外，本发明的检测方法例如能够进行定性分析或定量分析，因此也可以称为分析方法。
本发明中，上述试样没有特别限制。上述试样可列举例如气溶胶、唾液、尿、血浆和血清等。上述气溶胶是指例如悬浮于气体中的微小液体、固体的粒子与周围气体的混合物。上述试样为气溶胶的情况下，例如可以将可能含有上述微小液体、固体的粒子等的气体作为试样。
上述试样例如可以为气体试样(包括上述气溶胶)，也可以为液体试样，还可以为固体试样。从容易与上述核酸分子接触、处理简便方面出发，上述试样例如优选为液体试样。在上述气体试样和固体试样的情况下，例如可以使用溶剂制备混合液、提取液、溶解液等并进行使用。上述溶剂没有特别限制，可列举例如水、生理盐水、缓冲液等。
上述检测步骤例如包括下述步骤：使上述试样与上述核酸分子接触而使上述试样中的SARS-CoV-2刺突糖蛋白与上述核酸分子结合的接触步骤；和检测上述SARS-CoV-2刺突糖蛋白与上述核酸分子的结合的结合检测步骤。另外，上述检测步骤例如还包括基于上述结合检测步骤的结果来检测上述试样中的SARS-CoV-2刺突糖蛋白的有无或量的步骤。
上述接触步骤中，上述试样与上述核酸分子的接触方法没有特别限制。上述试样与上述核酸分子的接触例如优选在液体中进行。上述液体没有特别限制，可列举例如水、生理盐水、缓冲液等。
上述接触步骤中，上述试样与上述核酸分子的接触条件没有特别限制。接触温度例如为4～37℃、18～25℃，接触时间例如为10～120分钟、30～60分钟。
上述接触步骤中，上述核酸分子例如可以为固定化于载体的固定化核酸分子，也可以为未固定的游离核酸分子。后者的情况下，例如在容器内与上述试样进行接触。从处理性优良方面出发，上述核酸分子优选例如上述固定化核酸分子。上述载体没有特别限制，可列举例如基板、珠、容器等，上述容器可列举例如微孔板、管等。上述核酸分子的固定化例如如前所述。
上述结合检测步骤如上所述为检测上述试样中的SARS-CoV-2刺突糖蛋白与上述核酸分子的结合的步骤。通过检测上述两者的结合的有无，例如能够对上述试样中的SARS-CoV-2刺突糖蛋白的有无进行检测(定性)，另外，通过检测上述两者的结合程度(结合量)，例如能够对上述试样中的SARS-CoV-2刺突糖蛋白的量进行检测(定量)。
另外，在未能检测到上述SARS-CoV-2刺突糖蛋白与上述核酸分子的结合时，可以判断为上述试样中不存在SARS-CoV-2刺突糖蛋白和SARS-CoV-2，在检测到上述结合时，可以判断为上述试样中存在SARS-CoV-2刺突糖蛋白和SARS-CoV-2。
上述SARS-CoV-2刺突糖蛋白与上述核酸分子的结合的检测方法没有特别限制。上述方法例如可以采用检测物质间的结合的现有公知方法，作为具体例，可列举上述的SPR等。另外，上述结合例如可以为上述SARS-CoV-2刺突糖蛋白与上述核酸分子的复合体的检测。
(5)SARS-CoV-2病毒的灭活剂
如上所述，本发明的SARS-CoV-2病毒的灭活剂含有上述本发明的SARS-CoV-2刺突糖蛋白结合核酸分子。本发明灭活剂的特征是使用上述本发明的核酸分子，其它构成没有特别限制。
“活性”例如是指SARS-CoV-2刺突糖蛋白和SARS-CoV-2的功能，具体而言，可列举例如与靶标(例如血管紧张素转换酶2(ACE2))结合的功能。另外，例如可以为SARS-CoV-2的感染性和毒性。“灭活(也称为失活)”例如是指抑制SARS-CoV-2刺突糖蛋白和SARS-CoV-2的上述功能。“灭活”可以是完全抑制上述活性，也可以是部分抑制上述活性。
根据本发明，上述本发明的核酸分子与SARS-CoV-2刺突糖蛋白特异性结合，因此，例如利用SARS-CoV-2刺突糖蛋白与上述核酸分子的结合，能够灭活SARS-CoV-2刺突糖蛋白和SARS-CoV-2。上述灭活或失活例如也可以称为“中和”。因此，本发明灭活剂也可以称为中和剂。
实施例
接着，对本发明的实施例进行说明。但是，本发明不受下述实施例限制。市售的试剂只要没有特别声明则可以基于它们的规程来使用。
[实施例1]
通过SPR对本发明的SARS-CoV-2刺突糖蛋白结合核酸分子对SARS-CoV-2刺突糖蛋白的结合能力进行确认。
(1)适配体
合成由上述序列号1～7的碱基序列构成的多核苷酸(SARS-CoV-2刺突糖蛋白结合核酸分子1～7(以下也分别称为“结合核酸分子1～7”))，作为实施例的DNA适配体。SARS-CoV-2刺突糖蛋白结合核酸分子1～7中，将上述序列号1～7的碱基序列中的下划线部的胸腺嘧啶核苷酸残基作为上述式(1)所示的NG7。
上述SARS-CoV-2刺突糖蛋白结合核酸分子1～7在其3’末端添加有20碱基长的聚脱氧腺嘌呤(聚dA)，作为聚dA添加适配体，用于后述的SPR。
(2)试样
使用下述表1所示的4种市售试剂，用于以下的试验中。需要说明的是，表中的靶标中，“RBD结构域”表示构成SARS-CoV-2刺突糖蛋白的RBD结构域(以下也称为RBD)、“S1+S2结构域”表示构成SARS-CoV-2刺突糖蛋白的S1+S2结构域(以下也称为S1S2)、“S1结构域”表示构成SARS-CoV-2刺突糖蛋白的S1结构域(以下也称为S1)、“三聚体”表示上述S1+S2结构域的三聚体(以下也称为三聚体)。需要说明的是，各靶标的氨基酸序列基于以下的NCBI登录号所登录的氨基酸序列来制备，具有上述序列号15～18的氨基酸序列。
RBD结构域：YP_009724390.1
S1+S2结构域：YP_009724390.1
S1结构域：QHD43416.1
三聚体：QHD43416.1
[表1]
将上述各试剂以1mg/mL的方式用灭菌蒸馏水溶解，将上述溶液作为试样使用。需要说明的是，在下述结合性的分析等中，上述各试样的稀释中使用SB1T缓冲液。上述SB1T缓冲液的组成为40mmol/L HEPES(pH为7.4)、125mmol/L NaCl、1mmol/L MgCl2、5mmol/L KCl和0.01％吐温(注册商标)20。
(3)利用SPR的结合能力分析
在结合能力分析中，按照其使用说明书来使用ProteOn XPR36(BioRad公司)。
首先，将作为ProteON专用传感器芯片的、固定化有链霉亲和素的芯片(商品名：ProteOn NLC Sensor Chip、BioRad公司)设置于ProteON XPR36。向上述传感器芯片的流动池内，用超纯水(DDW)注入2.5μmol/L的生物素化聚dT，结合至信号强度(RU：ResonanceUnit(共振单位))达到饱和为止。上述生物素化聚dT通过将20碱基长的脱氧胸腺嘧啶的5’末端进行生物素化而制备。然后向上述芯片的上述流动池中，使用SB1T缓冲液，分别以流速25μL/分钟进行80秒的200nmol/L的添加有上述聚dA的结合核酸分子1～7的注入，结合至信号强度达到饱和为止。接着，将400nmol/L的上述各试样分别用SB1T缓冲液以流速50μL/分钟进行120秒注入，接着，在相同条件下使SB1T缓冲液流动来进行300秒清洗。将上述试样开始注入时设为0秒，测定注入上述试样后的信号强度。上述SPR在25℃的条件下进行。
进而，作为对照，使用含有BSA(Sigma公司制、产品目录编号：#A7906)的试样代替上述表1所示的各试样，除此以外同样地进行操作，测定信号强度。
将该结果示于图1。图1的(A)～(G)为示出结合核酸分子1～7对400nmol/L的上述各试样的结合性的图。图1的各图中，横轴表示开始注入上述试样后的经过时间(秒)，纵轴表示信号强度(RU)。如图1的(A)、(B)和(E)～(G)所示，上述结合核酸分子1、2、5～7对上述各试样中的特别是RBD、S1S2、S1和三聚体显示出结合性。另外，如图1的(C)和(D)所示，上述结合核酸分子3、4对上述各试样中的特别是S1S2、S1和三聚体显示出结合性。另一方面，对于对照(BSA)，上述结合核酸分子1～7的信号强度均几乎为0，未显示结合性。由该结果可知，上述结合核酸分子1～7对上述各试样以优良的特异性结合，以及通过测定信号强度能够检测上述结合。
如上所述，利用SPR能够确认本发明的结合核酸分子对SARS-CoV-2刺突糖蛋白的结合能力。
[实施例2]
对于本发明的SARS-CoV-2刺突糖蛋白结合核酸分子，利用SPR在加入了具有防止核酸的非特异性结合的效果的葡聚糖的溶液条件下确认对SARS-CoV-2刺突糖蛋白的结合能力。另外，求出动力学参数。
(1)适配体
在由上述序列号1～7的碱基序列构成的多核苷酸的基础上，还与上述实施例1同样地合成了由上述序列号8～13的碱基序列构成的多核苷酸(SARS-CoV-2刺突糖蛋白结合核酸分子8～13(以下也分别称为结合核酸分子8～13))。
另外，作为对照核酸分子，使用由下述序列号14的碱基序列构成的对照核酸分子(序列号14)代替结合核酸分子1～13，同样地进行实验。下述序列号14的碱基序列为非专利文献1(Song Y et al,Anal.Chem.(2020),92,9895-9900.)中记载的碱基序列。
对照的核酸分子(序列号14)
CAGCACCGACCTTGTGCTTTGGGAGTGCTGGTCCAAGGGCGT TAATGGACA
(2)试样
作为试样，使用上述实施例1的表1所示的上述RBD和上述三聚体。
(3)利用SPR的结合能力分析
利用SPR的结合能力分析与上述实施例1同样地进行。关于上述各试样的浓度，在上述RBD的情况下设为400、200、100、50、25nmol/L，在上述三聚体的情况下设为200、100、50、25、12.5nmol/L。
进而，使用加入了葡聚糖的缓冲液(加入了葡聚糖的SB1T缓冲液)代替上述SB1T缓冲液，除此以外与上述实施例1同样地进行实验。上述加入了葡聚糖的SB1T缓冲液的组成为40mmol/L HEPES(pH为7.4)、125mmol/L NaCl、1mmol/L MgCl2、5mmol/L KCl、0.01％吐温(注册商标)20和0.1mmol/L葡聚糖。
将该结果示于图2～图6。图2～图5为示出结合核酸分子1、2、5～9、11～13对上述RBD的结合性的图，(A)～(K)示出无葡聚糖的结果，(L)～(V)示出有葡聚糖的结果。图2～图5的各图中，横轴表示开始注入上述试样后的经过时间(秒)，纵轴表示信号强度(RU)。需要说明的是，图2～图6的各图中，黑色虚线表示实测值，灰色实线表示基于上述实测值计算而得的拟合曲线。如图2～5的(A)～(J)和(L)～(U)所示，结合核酸分子1、2、5～9、11～13在无葡聚糖和有葡聚糖的条件下对上述RBD均显示高结合性。另外，如图3(K)和图5(V)所示，对照核酸分子(序列号14)在无葡聚糖的缓冲液中对上述RBD显示出结合性，但是在加入了葡聚糖的缓冲液中失去了对上述RBD的结合性。由该结果可知，结合核酸分子1、2、5～9、11～13与对照核酸分子(序列号14)相比以更优良的特异性对上述RBD结合。
图6为示出结合核酸分子3、4和10对上述三聚体的结合性的图，(A)～(D)示出无葡聚糖的结果，(E)和(F)示出有葡聚糖的结果。图6的各图中，横轴表示开始注入上述试样后的经过时间(秒)，纵轴表示信号强度(RU)。如图6(A)～(C)、(E)和(F)所示，结合核酸分子3、4和10在无葡聚糖和有葡聚糖的条件下开始注入后的信号强度(RU)恒定。与此相对地，如图6(D)所示，对照核酸分子(序列号14)随着开始注入后的时间经过，信号强度(RU)减少。由该结果可知，结合核酸分子3、4和10与对照核酸分子(序列号14)相比脱离更慢(脱离率低(slow off rate))，对上述三聚体具有更高的结合力。
进而，由上述图2～图6的SPR分析结果计算动力学参数。将该结果示于表2和3。表2和3分别示出结合核酸分子1～13对上述RBD和上述三聚体的解离常数(KD)。需要说明的是，表2中，“＊”表示解离常数(KD)为利用SPR能够测定的检测限以下。认为这是由于，结合核酸分子的脱离慢、脱离率(off rate)为非常小的值。如表2和3所示可知，结合核酸分子1～13与对照核酸分子(序列号14)相比，对上述RBD和上述三聚体的解离常数(KD)为非常低的值，结合性优良。
[表2]
[表3]
如上所述，利用SPR能够在加入了具有防止核酸的非特异性结合的效果的葡聚糖的溶液条件下确认本发明的结合核酸分子对SARS-CoV-2刺突糖蛋白的结合能力。另外，能求出动力学参数。
[实施例3]
利用ELAA(Enzyme Linked Aptamer Assay，酶联适配体分析)评价本发明的SARS-CoV-2刺突糖蛋白结合核酸分子对SARS-CoV-2刺突糖蛋白的结合能力。
(1)适配体
与上述实施例1同样地合成由上述序列号1和8的碱基序列构成的多核苷酸(结合核酸分子1和结合核酸分子8)。
(2)试样
作为试样，使用上述实施例1的表1所示的上述RBD。
(3)利用ELAA的结合能力分析
利用ELAA的结合能力分析与非专利文献2(I.Shiratori et al,Biochem BiophysRes Commun 443(2014)37-41.)中记载的方法同样地进行。具体而言，将上述RBD用50mmol/l碳酸缓冲液(pH9.6)稀释为1μg/100μl。在上述稀释后，向Maxisorp板(ThermoScientific/Nunc,Waltham,MA)的孔中以成为1μg/孔的方式加入上述RBD，在4℃、一晩的条件下进行固相化。在上述固相化后，将孔用200μl的SB1T缓冲液(40mmol/l HEPES(pH7.4)、125mmol/l NaCl、1mmol/l MgCl2、5mmol/l KCl、0.01％吐温20)清洗1次，在上述清洗后，用200μl的TBS封闭缓冲液(Cat No.：37570、Pierce Biotechnology公司制)在室温(约25℃、以下同样)、1小时的条件下进行封闭。接着与实施例1(3)同样地将适配体的5’末端生物素化。在上述生物素化后，将上述适配体用SB1T缓冲液调整为1μmol/l，在95℃、5分钟的条件下进行热变性。在上述变性后骤冷到4℃，进行折叠。将上述适配体以50μl/孔加入到固相化有RBD的上述孔中，在25℃、1小时的条件下进行孵育。在上述孵育后，将上述孔用200μl的SB1T缓冲液清洗3次。在上述清洗后，加入100μl用SB1T缓冲液稀释至1000倍的辣根过氧化物酶标记链霉亲和素(SA-HRP)(Citiva公司制)，在25℃、30分钟的条件下进行孵育。在上述孵育后，将上述孔用SB1T缓冲液清洗3次。在上述清洗后，加入100μl TMB溶液(MOSS公司制)，在室温、10分钟的条件下进行孵育。在上述孵育后，加入0.5N的硫酸使反应停止。然后，使用infinite M1000Pro(Tecan公司制)对上述孔测定490nm和620nm(背景)的吸光度。然后，对于各结合核酸分子计算490nm与620nm的吸光度的差值(ABS(490nm-620nm))。关于对照，除了未添加上述结合核酸分子1和8以外，同样地计算吸光度的差值。
将该结果示于图8。图8为示出结合核酸分子1和8对上述RBD的结合能力的图。图8中，纵轴表示同一样品的3个孔的吸光度的差值的平均，误差棒表示标准偏差，横轴表示结合核酸分子的种类和RBD的添加的有无。在无适配体的情况下，不论有无添加RBD，吸光度的差值都不变。另一方面，在上述结合核酸分子1和8的情况下，吸光度的差值在RBD存在下增加。
根据以上，利用ELAA能够确认本发明的结合核酸分子对SARS-CoV-2刺突糖蛋白的结合能力。
以上参照实施方式和实施例对本发明进行了说明，但是本发明不受上述实施方式和实施例限定。本发明的构成、详细情况可以在本发明的范围内进行本领域技术人员可理解的各种变更。
本申请基于2020年11月30日提出的日本申请特愿2020-198556要求优先权，将其公开全部引入于此。
＜附记＞
上述的实施方式和实施例的一部分或全部可如以下的附记那样记载，但是不限于以下。
(附记1)
一种SARS-CoV-2刺突糖蛋白结合核酸分子，其特征在于，含有下述(a)、(b)、(c)和(d)中的任一多核苷酸：
(a)由序列号1～7的碱基序列或序列号1～7的碱基序列的部分序列构成的多核苷酸；
(b)由与上述(a)的碱基序列具有80％以上的一致性的碱基序列构成、并且与SARS-CoV-2刺突糖蛋白结合的多核苷酸；
(c)由与由上述(a)的碱基序列构成的多核苷酸在严格条件下杂交的多核苷酸的互补碱基序列构成、并且与SARS-CoV-2刺突糖蛋白结合的多核苷酸；
(d)由在上述(a)的碱基序列中缺失、置换、插入和/或添加1个或2个以上碱基而成的碱基序列构成、并且与上述SARS-CoV-2刺突糖蛋白结合的多核苷酸；
序列号1：GGTATGTCTCCGCCACTGAAATCCGTGCCTAATCTCACCCCACGGAATTCATGGCAAAGCCGAGGTGTCTTGTATTC；
序列号2：GGTATGTCTCCGCCACTGAAATCTAATCTCACATTGTAAGCAAAGGAGAATAAGCAAAGCCGAGGTGTCTTGTATTC；
序列号3：GGTATGTCTCCGCCACTGAAATCCCTGACCGCTGACCAAATCTCAGTGCAGATGCAAAGCCGAGGTGTCTTGTATTC；
序列号4：GGTATGTCTCCGCCACTGAAATCTTGTCCCCTAATAGGTTCCGACTGACAAGTGCAAAGCCGAGGTGTCTTGTATTC；
序列号5：GGTTTAGCCCTCGACTCCAAATGTGCACTCTCCCGGTATCCCTAATCTCACCCGATACCGTTGATGTGCTGCCAATAC；
序列号6：GGTTTAGCCCTCGACTCCAAATGACATGAGCCAGGTGCATCTTGAACGTCATAGATACCGTTGATGTGCTGCCAATAC；
序列号7：GGTTTAGCCCTCGACTCCAAATGTGCTGATACTCGGTATCCCTAATCTCACCCGATACCGTTGATGTGCTGCCAATAC。
(附记2)
根据附记1所述的核酸分子，其中，
上述序列号1的碱基序列的部分序列为序列号8的碱基序列，
上述序列号2的碱基序列的部分序列为序列号9的碱基序列，
上述序列号3的碱基序列的部分序列为序列号10的碱基序列，
上述序列号5的碱基序列的部分序列为序列号11的碱基序列，
上述序列号6的碱基序列的部分序列为序列号12的碱基序列，或
上述序列号7的碱基序列的部分序列为序列号13的碱基序列，
序列号8：CCACTGAAATCCGTGCCTAATCTCACCCCACGGAATTCATGG；
序列号9：TCCGCCACTGAAATCTAATCTCACATTGTAAGCAAAGGAGAATAA；
序列号10：CCACTGAAATCCCTGACCGCTGACCAAATCTCAGTGCAGAT；
序列号11：TGTGCACTCTCCCGGTATCCCTAATCTCACCCGATACC；
序列号12：TGACATGAGCCAGGTGCATCTTGAACGTCATAGATACCGTTGATGTGCTG；
序列号13：GCTGATACTCGGTATCCCTAATCTCACCCGATACCG。
(附记3)
根据附记1或2所述的核酸分子，其中，上述(b)的多核苷酸为下述(b1)的多核苷酸：
(b1)由与上述(a)的碱基序列具有80％以上的一致性的碱基序列构成、含有序列号8～13中的任一碱基序列、并且与SARS-CoV-2刺突糖蛋白结合的多核苷酸。
(附记4)
根据附记1或2所述的核酸分子，其中，上述(d)的多核苷酸为下述(d1)的多核苷酸：
(d1)由在上述(a)的碱基序列中缺失、置换、插入和/或添加1个或2个以上碱基而成的碱基序列构成、含有序列号8～13中的任一碱基序列、并且与SARS-CoV-2刺突糖蛋白结合的多核苷酸。
(附记5)
根据附记1至4中任一项所述的SARS-CoV-2刺突糖蛋白结合核酸分子，其中，上述结合核酸分子含有碱基被修饰基团修饰后的修饰碱基。
(附记6)
根据附记5所述的SARS-CoV-2刺突糖蛋白结合核酸分子，其中，上述修饰碱基为胸腺嘧啶碱基被修饰基团修饰后的修饰胸腺嘧啶碱基。
(附记7)
根据附记6所述的SARS-CoV-2刺突糖蛋白结合核酸分子，其中，上述修饰胸腺嘧啶碱基为下述式(1)所示的修饰胸腺嘧啶碱基。
(附记8)
根据附记5至7中任一项所述的SARS-CoV-2刺突糖蛋白结合核酸分子，其中，上述多核苷酸中，上述序列号1～13的碱基序列中的下划线部的胸腺嘧啶碱基为修饰碱基。
(附记9)
根据附记1至8中任一项所述的SARS-CoV-2刺突糖蛋白结合核酸分子，其中，上述多核苷酸为DNA。
(附记10)
一种SARS-CoV-2检测用传感器，其特征在于，含有附记1至9中任一项所述的SARS-CoV-2刺突糖蛋白结合核酸分子。
(附记11)
一种SARS-CoV-2检测试剂，其特征在于，含有附记1至9中任一项所述的SARS-CoV-2刺突糖蛋白结合核酸分子。
(附记12)
一种SARS-CoV-2的检测方法，其特征在于，包括使试样与核酸分子接触并检测上述试样中的SARS-CoV-2刺突糖蛋白的步骤，上述核酸分子为附记1至9中任一项所述的SARS-CoV-2刺突糖蛋白结合核酸分子，上述检测步骤中，使上述试样中的SARS-CoV-2刺突糖蛋白与上述核酸分子结合，通过上述结合来检测上述试样中的SARS-CoV-2刺突糖蛋白。
(附记13)
根据附记12所述的SARS-CoV-2的检测方法，其中，上述试样为选自由气溶胶、唾液、尿、血浆和血清组成的组中的至少1种。
(附记14)
一种SARS-CoV-2病毒的灭活剂或中和剂，其特征在于，含有附记1至9中任一项所述的SARS-CoV-2刺突糖蛋白结合核酸分子。
产业上的可利用性
如上所述，本发明的SARS-CoV-2刺突糖蛋白结合核酸分子能够与SARS-CoV-2刺突糖蛋白特异性结合，结合力高且脱离慢。因此，根据本发明的SARS-CoV-2刺突糖蛋白结合核酸分子，例如能够通过与试样中的SARS-CoV-2刺突糖蛋白的结合的有无以优良的精度检测SARS-CoV-2刺突糖蛋白。因此可以说，本发明的SARS-CoV-2刺突糖蛋白结合核酸分子是在例如预防医学、健康管理和感染症等的诊断等领域的SARS-CoV-2检测中极有用的工具。本发明的SARS-CoV-2刺突糖蛋白结合核酸分子例如可以用于生物试样、气溶胶中的病毒检测和病毒的灭活等。
序列表
<110> 日本电气方案创新株式会社
<120> SARS-CoV-2刺突糖蛋白结合核酸分子、SARS-CoV-2检测用传感器、SARS-CoV-2检测试剂、SARS-CoV-2的检测方法和SARS-CoV-2病毒的灭活剂
<130> 1010100103
<150> JP 2020-198556
<151> 2020-11-30
<160> 18
<170> PatentIn version 3.5
<210> 1
<211> 77
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成的多核苷酸
<400> 1
ggtatgtctc cgccactgaa atccgtgcct aatctcaccc cacggaattc atggcaaagc 60
cgaggtgtct tgtattc 77
<210> 2
<211> 77
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成的多核苷酸
<400> 2
ggtatgtctc cgccactgaa atctaatctc acattgtaag caaaggagaa taagcaaagc 60
cgaggtgtct tgtattc 77
<210> 3
<211> 77
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成的多核苷酸
<400> 3
ggtatgtctc cgccactgaa atccctgacc gctgaccaaa tctcagtgca gatgcaaagc 60
cgaggtgtct tgtattc 77
<210> 4
<211> 77
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成的多核苷酸
<400> 4
ggtatgtctc cgccactgaa atcttgtccc ctaataggtt ccgactgaca agtgcaaagc 60
cgaggtgtct tgtattc 77
<210> 5
<211> 78
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成的多核苷酸
<400> 5
ggtttagccc tcgactccaa atgtgcactc tcccggtatc cctaatctca cccgataccg 60
ttgatgtgct gccaatac 78
<210> 6
<211> 78
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成的多核苷酸
<400> 6
ggtttagccc tcgactccaa atgacatgag ccaggtgcat cttgaacgtc atagataccg 60
ttgatgtgct gccaatac 78
<210> 7
<211> 78
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成的多核苷酸
<400> 7
ggtttagccc tcgactccaa atgtgctgat actcggtatc cctaatctca cccgataccg 60
ttgatgtgct gccaatac 78
<210> 8
<211> 42
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成的多核苷酸
<400> 8
ccactgaaat ccgtgcctaa tctcacccca cggaattcat gg 42
<210> 9
<211> 45
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成的多核苷酸
<400> 9
tccgccactg aaatctaatc tcacattgta agcaaaggag aataa 45
<210> 10
<211> 41
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成的多核苷酸
<400> 10
ccactgaaat ccctgaccgc tgaccaaatc tcagtgcaga t 41
<210> 11
<211> 38
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成的多核苷酸
<400> 11
tgtgcactct cccggtatcc ctaatctcac ccgatacc 38
<210> 12
<211> 50
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成的多核苷酸
<400> 12
tgacatgagc caggtgcatc ttgaacgtca tagataccgt tgatgtgctg 50
<210> 13
<211> 36
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成的多核苷酸
<400> 13
gctgatactc ggtatcccta atctcacccg ataccg 36
<210> 14
<211> 51
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成的多核苷酸
<400> 14
cagcaccgac cttgtgcttt gggagtgctg gtccaagggc gttaatggac a 51
<210> 15
<211> 1273
<212> PRT
<213> β冠状病毒
<400> 15
Met Phe Val Phe Leu Val Leu Leu Pro Leu Val Ser Ser Gln Cys Val
1 5 10 15
Asn Leu Thr Thr Arg Thr Gln Leu Pro Pro Ala Tyr Thr Asn Ser Phe
20 25 30
Thr Arg Gly Val Tyr Tyr Pro Asp Lys Val Phe Arg Ser Ser Val Leu
35 40 45
His Ser Thr Gln Asp Leu Phe Leu Pro Phe Phe Ser Asn Val Thr Trp
50 55 60
Phe His Ala Ile His Val Ser Gly Thr Asn Gly Thr Lys Arg Phe Asp
65 70 75 80
Asn Pro Val Leu Pro Phe Asn Asp Gly Val Tyr Phe Ala Ser Thr Glu
85 90 95
Lys Ser Asn Ile Ile Arg Gly Trp Ile Phe Gly Thr Thr Leu Asp Ser
100 105 110
Lys Thr Gln Ser Leu Leu Ile Val Asn Asn Ala Thr Asn Val Val Ile
115 120 125
Lys Val Cys Glu Phe Gln Phe Cys Asn Asp Pro Phe Leu Gly Val Tyr
130 135 140
Tyr His Lys Asn Asn Lys Ser Trp Met Glu Ser Glu Phe Arg Val Tyr
145 150 155 160
Ser Ser Ala Asn Asn Cys Thr Phe Glu Tyr Val Ser Gln Pro Phe Leu
165 170 175
Met Asp Leu Glu Gly Lys Gln Gly Asn Phe Lys Asn Leu Arg Glu Phe
180 185 190
Val Phe Lys Asn Ile Asp Gly Tyr Phe Lys Ile Tyr Ser Lys His Thr
195 200 205
Pro Ile Asn Leu Val Arg Asp Leu Pro Gln Gly Phe Ser Ala Leu Glu
210 215 220
Pro Leu Val Asp Leu Pro Ile Gly Ile Asn Ile Thr Arg Phe Gln Thr
225 230 235 240
Leu Leu Ala Leu His Arg Ser Tyr Leu Thr Pro Gly Asp Ser Ser Ser
245 250 255
Gly Trp Thr Ala Gly Ala Ala Ala Tyr Tyr Val Gly Tyr Leu Gln Pro
260 265 270
Arg Thr Phe Leu Leu Lys Tyr Asn Glu Asn Gly Thr Ile Thr Asp Ala
275 280 285
Val Asp Cys Ala Leu Asp Pro Leu Ser Glu Thr Lys Cys Thr Leu Lys
290 295 300
Ser Phe Thr Val Glu Lys Gly Ile Tyr Gln Thr Ser Asn Phe Arg Val
305 310 315 320
Gln Pro Thr Glu Ser Ile Val Arg Phe Pro Asn Ile Thr Asn Leu Cys
325 330 335
Pro Phe Gly Glu Val Phe Asn Ala Thr Arg Phe Ala Ser Val Tyr Ala
340 345 350
Trp Asn Arg Lys Arg Ile Ser Asn Cys Val Ala Asp Tyr Ser Val Leu
355 360 365
Tyr Asn Ser Ala Ser Phe Ser Thr Phe Lys Cys Tyr Gly Val Ser Pro
370 375 380
Thr Lys Leu Asn Asp Leu Cys Phe Thr Asn Val Tyr Ala Asp Ser Phe
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Val Ile Arg Gly Asp Glu Val Arg Gln Ile Ala Pro Gly Gln Thr Gly
405 410 415
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420 425 430
Val Ile Ala Trp Asn Ser Asn Asn Leu Asp Ser Lys Val Gly Gly Asn
435 440 445
Tyr Asn Tyr Leu Tyr Arg Leu Phe Arg Lys Ser Asn Leu Lys Pro Phe
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Glu Arg Asp Ile Ser Thr Glu Ile Tyr Gln Ala Gly Ser Thr Pro Cys
465 470 475 480
Asn Gly Val Glu Gly Phe Asn Cys Tyr Phe Pro Leu Gln Ser Tyr Gly
485 490 495
Phe Gln Pro Thr Asn Gly Val Gly Tyr Gln Pro Tyr Arg Val Val Val
500 505 510
Leu Ser Phe Glu Leu Leu His Ala Pro Ala Thr Val Cys Gly Pro Lys
515 520 525
Lys Ser Thr Asn Leu Val Lys Asn Lys Cys Val Asn Phe Asn Phe Asn
530 535 540
Gly Leu Thr Gly Thr Gly Val Leu Thr Glu Ser Asn Lys Lys Phe Leu
545 550 555 560
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565 570 575
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580 585 590
Gly Gly Val Ser Val Ile Thr Pro Gly Thr Asn Thr Ser Asn Gln Val
595 600 605
Ala Val Leu Tyr Gln Asp Val Asn Cys Thr Glu Val Pro Val Ala Ile
610 615 620
His Ala Asp Gln Leu Thr Pro Thr Trp Arg Val Tyr Ser Thr Gly Ser
625 630 635 640
Asn Val Phe Gln Thr Arg Ala Gly Cys Leu Ile Gly Ala Glu His Val
645 650 655
Asn Asn Ser Tyr Glu Cys Asp Ile Pro Ile Gly Ala Gly Ile Cys Ala
660 665 670
Ser Tyr Gln Thr Gln Thr Asn Ser Pro Arg Arg Ala Arg Ser Val Ala
675 680 685
Ser Gln Ser Ile Ile Ala Tyr Thr Met Ser Leu Gly Ala Glu Asn Ser
690 695 700
Val Ala Tyr Ser Asn Asn Ser Ile Ala Ile Pro Thr Asn Phe Thr Ile
705 710 715 720
Ser Val Thr Thr Glu Ile Leu Pro Val Ser Met Thr Lys Thr Ser Val
725 730 735
Asp Cys Thr Met Tyr Ile Cys Gly Asp Ser Thr Glu Cys Ser Asn Leu
740 745 750
Leu Leu Gln Tyr Gly Ser Phe Cys Thr Gln Leu Asn Arg Ala Leu Thr
755 760 765
Gly Ile Ala Val Glu Gln Asp Lys Asn Thr Gln Glu Val Phe Ala Gln
770 775 780
Val Lys Gln Ile Tyr Lys Thr Pro Pro Ile Lys Asp Phe Gly Gly Phe
785 790 795 800
Asn Phe Ser Gln Ile Leu Pro Asp Pro Ser Lys Pro Ser Lys Arg Ser
805 810 815
Phe Ile Glu Asp Leu Leu Phe Asn Lys Val Thr Leu Ala Asp Ala Gly
820 825 830
Phe Ile Lys Gln Tyr Gly Asp Cys Leu Gly Asp Ile Ala Ala Arg Asp
835 840 845
Leu Ile Cys Ala Gln Lys Phe Asn Gly Leu Thr Val Leu Pro Pro Leu
850 855 860
Leu Thr Asp Glu Met Ile Ala Gln Tyr Thr Ser Ala Leu Leu Ala Gly
865 870 875 880
Thr Ile Thr Ser Gly Trp Thr Phe Gly Ala Gly Ala Ala Leu Gln Ile
885 890 895
Pro Phe Ala Met Gln Met Ala Tyr Arg Phe Asn Gly Ile Gly Val Thr
900 905 910
Gln Asn Val Leu Tyr Glu Asn Gln Lys Leu Ile Ala Asn Gln Phe Asn
915 920 925
Ser Ala Ile Gly Lys Ile Gln Asp Ser Leu Ser Ser Thr Ala Ser Ala
930 935 940
Leu Gly Lys Leu Gln Asp Val Val Asn Gln Asn Ala Gln Ala Leu Asn
945 950 955 960
Thr Leu Val Lys Gln Leu Ser Ser Asn Phe Gly Ala Ile Ser Ser Val
965 970 975
Leu Asn Asp Ile Leu Ser Arg Leu Asp Lys Val Glu Ala Glu Val Gln
980 985 990
Ile Asp Arg Leu Ile Thr Gly Arg Leu Gln Ser Leu Gln Thr Tyr Val
995 1000 1005
Thr Gln Gln Leu Ile Arg Ala Ala Glu Ile Arg Ala Ser Ala Asn
1010 1015 1020
Leu Ala Ala Thr Lys Met Ser Glu Cys Val Leu Gly Gln Ser Lys
1025 1030 1035
Arg Val Asp Phe Cys Gly Lys Gly Tyr His Leu Met Ser Phe Pro
1040 1045 1050
Gln Ser Ala Pro His Gly Val Val Phe Leu His Val Thr Tyr Val
1055 1060 1065
Pro Ala Gln Glu Lys Asn Phe Thr Thr Ala Pro Ala Ile Cys His
1070 1075 1080
Asp Gly Lys Ala His Phe Pro Arg Glu Gly Val Phe Val Ser Asn
1085 1090 1095
Gly Thr His Trp Phe Val Thr Gln Arg Asn Phe Tyr Glu Pro Gln
1100 1105 1110
Ile Ile Thr Thr Asp Asn Thr Phe Val Ser Gly Asn Cys Asp Val
1115 1120 1125
Val Ile Gly Ile Val Asn Asn Thr Val Tyr Asp Pro Leu Gln Pro
1130 1135 1140
Glu Leu Asp Ser Phe Lys Glu Glu Leu Asp Lys Tyr Phe Lys Asn
1145 1150 1155
His Thr Ser Pro Asp Val Asp Leu Gly Asp Ile Ser Gly Ile Asn
1160 1165 1170
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Val Ala Lys Asn Leu Asn Glu Ser Leu Ile Asp Leu Gln Glu Leu
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Gly Lys Tyr Glu Gln Tyr Ile Lys Trp Pro Trp Tyr Ile Trp Leu
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Gly Phe Ile Ala Gly Leu Ile Ala Ile Val Met Val Thr Ile Met
1220 1225 1230
Leu Cys Cys Met Thr Ser Cys Cys Ser Cys Leu Lys Gly Cys Cys
1235 1240 1245
Ser Cys Gly Ser Cys Cys Lys Phe Asp Glu Asp Asp Ser Glu Pro
1250 1255 1260
Val Leu Lys Gly Val Lys Leu His Tyr Thr
1265 1270
<210> 16
<211> 223
<212> PRT
<213> β冠状病毒
<400> 16
Arg Val Gln Pro Thr Glu Ser Ile Val Arg Phe Pro Asn Ile Thr Asn
1 5 10 15
Leu Cys Pro Phe Gly Glu Val Phe Asn Ala Thr Arg Phe Ala Ser Val
20 25 30
Tyr Ala Trp Asn Arg Lys Arg Ile Ser Asn Cys Val Ala Asp Tyr Ser
35 40 45
Val Leu Tyr Asn Ser Ala Ser Phe Ser Thr Phe Lys Cys Tyr Gly Val
50 55 60
Ser Pro Thr Lys Leu Asn Asp Leu Cys Phe Thr Asn Val Tyr Ala Asp
65 70 75 80
Ser Phe Val Ile Arg Gly Asp Glu Val Arg Gln Ile Ala Pro Gly Gln
85 90 95
Thr Gly Lys Ile Ala Asp Tyr Asn Tyr Lys Leu Pro Asp Asp Phe Thr
100 105 110
Gly Cys Val Ile Ala Trp Asn Ser Asn Asn Leu Asp Ser Lys Val Gly
115 120 125
Gly Asn Tyr Asn Tyr Leu Tyr Arg Leu Phe Arg Lys Ser Asn Leu Lys
130 135 140
Pro Phe Glu Arg Asp Ile Ser Thr Glu Ile Tyr Gln Ala Gly Ser Thr
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Pro Cys Asn Gly Val Glu Gly Phe Asn Cys Tyr Phe Pro Leu Gln Ser
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Tyr Gly Phe Gln Pro Thr Asn Gly Val Gly Tyr Gln Pro Tyr Arg Val
180 185 190
Val Val Leu Ser Phe Glu Leu Leu His Ala Pro Ala Thr Val Cys Gly
195 200 205
Pro Lys Lys Ser Thr Asn Leu Val Lys Asn Lys Cys Val Asn Phe
210 215 220
<210> 17
<211> 1261
<212> PRT
<213> β冠状病毒
<400> 17
Ser Gln Cys Val Asn Leu Thr Thr Arg Thr Gln Leu Pro Pro Ala Tyr
1 5 10 15
Thr Asn Ser Phe Thr Arg Gly Val Tyr Tyr Pro Asp Lys Val Phe Arg
20 25 30
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35 40 45
Asn Val Thr Trp Phe His Ala Ile His Val Ser Gly Thr Asn Gly Thr
50 55 60
Lys Arg Phe Asp Asn Pro Val Leu Pro Phe Asn Asp Gly Val Tyr Phe
65 70 75 80
Ala Ser Thr Glu Lys Ser Asn Ile Ile Arg Gly Trp Ile Phe Gly Thr
85 90 95
Thr Leu Asp Ser Lys Thr Gln Ser Leu Leu Ile Val Asn Asn Ala Thr
100 105 110
Asn Val Val Ile Lys Val Cys Glu Phe Gln Phe Cys Asn Asp Pro Phe
115 120 125
Leu Gly Val Tyr Tyr His Lys Asn Asn Lys Ser Trp Met Glu Ser Glu
130 135 140
Phe Arg Val Tyr Ser Ser Ala Asn Asn Cys Thr Phe Glu Tyr Val Ser
145 150 155 160
Gln Pro Phe Leu Met Asp Leu Glu Gly Lys Gln Gly Asn Phe Lys Asn
165 170 175
Leu Arg Glu Phe Val Phe Lys Asn Ile Asp Gly Tyr Phe Lys Ile Tyr
180 185 190
Ser Lys His Thr Pro Ile Asn Leu Val Arg Asp Leu Pro Gln Gly Phe
195 200 205
Ser Ala Leu Glu Pro Leu Val Asp Leu Pro Ile Gly Ile Asn Ile Thr
210 215 220
Arg Phe Gln Thr Leu Leu Ala Leu His Arg Ser Tyr Leu Thr Pro Gly
225 230 235 240
Asp Ser Ser Ser Gly Trp Thr Ala Gly Ala Ala Ala Tyr Tyr Val Gly
245 250 255
Tyr Leu Gln Pro Arg Thr Phe Leu Leu Lys Tyr Asn Glu Asn Gly Thr
260 265 270
Ile Thr Asp Ala Val Asp Cys Ala Leu Asp Pro Leu Ser Glu Thr Lys
275 280 285
Cys Thr Leu Lys Ser Phe Thr Val Glu Lys Gly Ile Tyr Gln Thr Ser
290 295 300
Asn Phe Arg Val Gln Pro Thr Glu Ser Ile Val Arg Phe Pro Asn Ile
305 310 315 320
Thr Asn Leu Cys Pro Phe Gly Glu Val Phe Asn Ala Thr Arg Phe Ala
325 330 335
Ser Val Tyr Ala Trp Asn Arg Lys Arg Ile Ser Asn Cys Val Ala Asp
340 345 350
Tyr Ser Val Leu Tyr Asn Ser Ala Ser Phe Ser Thr Phe Lys Cys Tyr
355 360 365
Gly Val Ser Pro Thr Lys Leu Asn Asp Leu Cys Phe Thr Asn Val Tyr
370 375 380
Ala Asp Ser Phe Val Ile Arg Gly Asp Glu Val Arg Gln Ile Ala Pro
385 390 395 400
Gly Gln Thr Gly Lys Ile Ala Asp Tyr Asn Tyr Lys Leu Pro Asp Asp
405 410 415
Phe Thr Gly Cys Val Ile Ala Trp Asn Ser Asn Asn Leu Asp Ser Lys
420 425 430
Val Gly Gly Asn Tyr Asn Tyr Leu Tyr Arg Leu Phe Arg Lys Ser Asn
435 440 445
Leu Lys Pro Phe Glu Arg Asp Ile Ser Thr Glu Ile Tyr Gln Ala Gly
450 455 460
Ser Thr Pro Cys Asn Gly Val Glu Gly Phe Asn Cys Tyr Phe Pro Leu
465 470 475 480
Gln Ser Tyr Gly Phe Gln Pro Thr Asn Gly Val Gly Tyr Gln Pro Tyr
485 490 495
Arg Val Val Val Leu Ser Phe Glu Leu Leu His Ala Pro Ala Thr Val
500 505 510
Cys Gly Pro Lys Lys Ser Thr Asn Leu Val Lys Asn Lys Cys Val Asn
515 520 525
Phe Asn Phe Asn Gly Leu Thr Gly Thr Gly Val Leu Thr Glu Ser Asn
530 535 540
Lys Lys Phe Leu Pro Phe Gln Gln Phe Gly Arg Asp Ile Ala Asp Thr
545 550 555 560
Thr Asp Ala Val Arg Asp Pro Gln Thr Leu Glu Ile Leu Asp Ile Thr
565 570 575
Pro Cys Ser Phe Gly Gly Val Ser Val Ile Thr Pro Gly Thr Asn Thr
580 585 590
Ser Asn Gln Val Ala Val Leu Tyr Gln Asp Val Asn Cys Thr Glu Val
595 600 605
Pro Val Ala Ile His Ala Asp Gln Leu Thr Pro Thr Trp Arg Val Tyr
610 615 620
Ser Thr Gly Ser Asn Val Phe Gln Thr Arg Ala Gly Cys Leu Ile Gly
625 630 635 640
Ala Glu His Val Asn Asn Ser Tyr Glu Cys Asp Ile Pro Ile Gly Ala
645 650 655
Gly Ile Cys Ala Ser Tyr Gln Thr Gln Thr Asn Ser Pro Arg Arg Ala
660 665 670
Arg Ser Val Ala Ser Gln Ser Ile Ile Ala Tyr Thr Met Ser Leu Gly
675 680 685
Ala Glu Asn Ser Val Ala Tyr Ser Asn Asn Ser Ile Ala Ile Pro Thr
690 695 700
Asn Phe Thr Ile Ser Val Thr Thr Glu Ile Leu Pro Val Ser Met Thr
705 710 715 720
Lys Thr Ser Val Asp Cys Thr Met Tyr Ile Cys Gly Asp Ser Thr Glu
725 730 735
Cys Ser Asn Leu Leu Leu Gln Tyr Gly Ser Phe Cys Thr Gln Leu Asn
740 745 750
Arg Ala Leu Thr Gly Ile Ala Val Glu Gln Asp Lys Asn Thr Gln Glu
755 760 765
Val Phe Ala Gln Val Lys Gln Ile Tyr Lys Thr Pro Pro Ile Lys Asp
770 775 780
Phe Gly Gly Phe Asn Phe Ser Gln Ile Leu Pro Asp Pro Ser Lys Pro
785 790 795 800
Ser Lys Arg Ser Phe Ile Glu Asp Leu Leu Phe Asn Lys Val Thr Leu
805 810 815
Ala Asp Ala Gly Phe Ile Lys Gln Tyr Gly Asp Cys Leu Gly Asp Ile
820 825 830
Ala Ala Arg Asp Leu Ile Cys Ala Gln Lys Phe Asn Gly Leu Thr Val
835 840 845
Leu Pro Pro Leu Leu Thr Asp Glu Met Ile Ala Gln Tyr Thr Ser Ala
850 855 860
Leu Leu Ala Gly Thr Ile Thr Ser Gly Trp Thr Phe Gly Ala Gly Ala
865 870 875 880
Ala Leu Gln Ile Pro Phe Ala Met Gln Met Ala Tyr Arg Phe Asn Gly
885 890 895
Ile Gly Val Thr Gln Asn Val Leu Tyr Glu Asn Gln Lys Leu Ile Ala
900 905 910
Asn Gln Phe Asn Ser Ala Ile Gly Lys Ile Gln Asp Ser Leu Ser Ser
915 920 925
Thr Ala Ser Ala Leu Gly Lys Leu Gln Asp Val Val Asn Gln Asn Ala
930 935 940
Gln Ala Leu Asn Thr Leu Val Lys Gln Leu Ser Ser Asn Phe Gly Ala
945 950 955 960
Ile Ser Ser Val Leu Asn Asp Ile Leu Ser Arg Leu Asp Lys Val Glu
965 970 975
Ala Glu Val Gln Ile Asp Arg Leu Ile Thr Gly Arg Leu Gln Ser Leu
980 985 990
Gln Thr Tyr Val Thr Gln Gln Leu Ile Arg Ala Ala Glu Ile Arg Ala
995 1000 1005
Ser Ala Asn Leu Ala Ala Thr Lys Met Ser Glu Cys Val Leu Gly
1010 1015 1020
Gln Ser Lys Arg Val Asp Phe Cys Gly Lys Gly Tyr His Leu Met
1025 1030 1035
Ser Phe Pro Gln Ser Ala Pro His Gly Val Val Phe Leu His Val
1040 1045 1050
Thr Tyr Val Pro Ala Gln Glu Lys Asn Phe Thr Thr Ala Pro Ala
1055 1060 1065
Ile Cys His Asp Gly Lys Ala His Phe Pro Arg Glu Gly Val Phe
1070 1075 1080
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1085 1090 1095
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1100 1105 1110
Cys Asp Val Val Ile Gly Ile Val Asn Asn Thr Val Tyr Asp Pro
1115 1120 1125
Leu Gln Pro Glu Leu Asp Ser Phe Lys Glu Glu Leu Asp Lys Tyr
1130 1135 1140
Phe Lys Asn His Thr Ser Pro Asp Val Asp Leu Gly Asp Ile Ser
1145 1150 1155
Gly Ile Asn Ala Ser Val Val Asn Ile Gln Lys Glu Ile Asp Arg
1160 1165 1170
Leu Asn Glu Val Ala Lys Asn Leu Asn Glu Ser Leu Ile Asp Leu
1175 1180 1185
Gln Glu Leu Gly Lys Tyr Glu Gln Tyr Ile Lys Trp Pro Trp Tyr
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Ile Trp Leu Gly Phe Ile Ala Gly Leu Ile Ala Ile Val Met Val
1205 1210 1215
Thr Ile Met Leu Cys Cys Met Thr Ser Cys Cys Ser Cys Leu Lys
1220 1225 1230
Gly Cys Cys Ser Cys Gly Ser Cys Cys Lys Phe Asp Glu Asp Asp
1235 1240 1245
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1250 1255 1260
<210> 18
<211> 673
<212> PRT
<213> β冠状病毒
<400> 18
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1 5 10 15
Thr Asn Ser Phe Thr Arg Gly Val Tyr Tyr Pro Asp Lys Val Phe Arg
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35 40 45
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85 90 95
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100 105 110
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115 120 125
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275 280 285
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Thr Asn Leu Cys Pro Phe Gly Glu Val Phe Asn Ala Thr Arg Phe Ala
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435 440 445
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645 650 655
Gly Ile Cys Ala Ser Tyr Gln Thr Gln Thr Asn Ser Pro Arg Arg Ala
660 665 670
Arg

Claims (14)

1.一种SARS-CoV-2刺突糖蛋白结合核酸分子，其特征在于，含有下述(a)、(b)、(c)和(d)中的任一多核苷酸：
(a)由序列号1～7的碱基序列或序列号1～7的碱基序列的部分序列构成的多核苷酸；
(b)由与所述(a)的碱基序列具有80％以上的一致性的碱基序列构成、并且与SARS-CoV-2刺突糖蛋白结合的多核苷酸；
(c)由与由所述(a)的碱基序列构成的多核苷酸在严格条件下杂交的多核苷酸的互补碱基序列构成、并且与SARS-CoV-2刺突糖蛋白结合的多核苷酸；
(d)由在所述(a)的碱基序列中缺失、置换、插入和/或添加1个或2个以上碱基而成的碱基序列构成、并且与所述SARS-CoV-2刺突糖蛋白结合的多核苷酸；
序列号1：GGTATGTCTCCGCCACTGAAATCCGTGCCTAATCTC ACCCCACGGAATTCATGGCAAAGCCGAGGTGTCTTGTATTC；
序列号2：GGTATGTCTCCGCCACTGAAATCTAATCTCACATTG TAAGCAAAGGAGAATAAGCAAAGCCGAGGTGTCTTGTATTC；
序列号3：GGTATGTCTCCGCCACTGAAATCCCTGACCGCTGAC CAAATCTCAGTGCAGATGCAAAGCCGAGGTGTCTTGTATTC；
序列号4：GGTATGTCTCCGCCACTGAAATCTTGTCCCCTAATA GGTTCCGACTGACAAGTGCAAAGCCGAGGTGTCTTGTATTC；
序列号5：GGTTTAGCCCTCGACTCCAAATGTGCACTCTCCCGG TATCCCTAATCTCACCCGATACCGTTGATGTGCTGCCAATAC；
序列号6：GGTTTAGCCCTCGACTCCAAATGACATGAGCCAGGT GCATCTTGAACGTCATAGATACCGTTGATGTGCTGCCAATAC；
序列号7：GGTTTAGCCCTCGACTCCAAATGTGCTGATACTCGG TATCCCTAATCTCACCCGATACCGTTGATGTGCTGCCAATAC。
2.根据权利要求1所述的SARS-CoV-2刺突糖蛋白结合核酸分子，其中，
所述序列号1的碱基序列的部分序列为序列号8的碱基序列，
所述序列号2的碱基序列的部分序列为序列号9的碱基序列，
所述序列号3的碱基序列的部分序列为序列号10的碱基序列，
所述序列号5的碱基序列的部分序列为序列号11的碱基序列，
所述序列号6的碱基序列的部分序列为序列号12的碱基序列，或
所述序列号7的碱基序列的部分序列为序列号13的碱基序列，
序列号8：CCACTGAAATCCGTGCCTAATCTCACCCCACGGAAT TCATGG；
序列号9：TCCGCCACTGAAATCTAATCTCACATTGTAAGCAAA GGAGAATAA；
序列号10：CCACTGAAATCCCTGACCGCTGACCAAATCTCAGT GCAGAT；
序列号11：TGTGCACTCTCCCGGTATCCCTAATCTCACCCGAT ACC；
序列号12：TGACATGAGCCAGGTGCATCTTGAACGTCATAGAT ACCGTTGATGTGCTG；
序列号13：GCTGATACTCGGTATCCCTAATCTCACCCGATACC G。
3.根据权利要求1或2所述的SARS-CoV-2刺突糖蛋白结合核酸分子，其中，所述(b)的多核苷酸为下述(b1)的多核苷酸：
(b1)由与所述(a)的碱基序列具有80％以上的一致性的碱基序列构成、含有序列号8～13中的任一碱基序列、并且与SARS-CoV-2刺突糖蛋白结合的多核苷酸。
4.根据权利要求1或2所述的SARS-CoV-2刺突糖蛋白结合核酸分子，其中，所述(d)的多核苷酸为下述(d1)的多核苷酸：
(d1)由在所述(a)的碱基序列中缺失、置换、插入和/或添加1个或2个以上碱基而成的碱基序列构成、含有序列号8～13中的任一碱基序列、并且与SARS-CoV-2刺突糖蛋白结合的多核苷酸。
5.根据权利要求1至4中任一项所述的SARS-CoV-2刺突糖蛋白结合核酸分子，其中，所述结合核酸分子含有碱基被修饰基团修饰后的修饰碱基。
6.根据权利要求5所述的SARS-CoV-2刺突糖蛋白结合核酸分子，其中，所述修饰碱基为胸腺嘧啶碱基被修饰基团修饰后的修饰胸腺嘧啶碱基。
7.根据权利要求6所述的SARS-CoV-2刺突糖蛋白结合核酸分子，其中，所述修饰胸腺嘧啶碱基为下述式(1)所示的修饰胸腺嘧啶碱基，
8.根据权利要求5至7中任一项所述的SARS-CoV-2刺突糖蛋白结合核酸分子，其中，所述多核苷酸中，所述序列号1～13的碱基序列中的下划线部的胸腺嘧啶碱基为修饰碱基。
9.根据权利要求1至8中任一项所述的SARS-CoV-2刺突糖蛋白结合核酸分子，其中，所述多核苷酸为DNA。
10.一种SARS-CoV-2检测用传感器，其特征在于，含有权利要求1至9中任一项所述的SARS-CoV-2刺突糖蛋白结合核酸分子。
11.一种SARS-CoV-2检测试剂，其特征在于，含有权利要求1至9中任一项所述的SARS-CoV-2刺突糖蛋白结合核酸分子。
12.一种SARS-CoV-2的检测方法，其特征在于，包括使试样与核酸分子接触并检测所述试样中的SARS-CoV-2刺突糖蛋白的步骤，
所述核酸分子为权利要求1至9中任一项所述的SARS-CoV-2刺突糖蛋白结合核酸分子，
所述检测步骤中，使所述试样中的SARS-CoV-2刺突糖蛋白与所述核酸分子结合，通过所述结合来检测所述试样中的SARS-CoV-2刺突糖蛋白。
13.根据权利要求12所述的SARS-CoV-2的检测方法，其中，所述试样为选自由气溶胶、唾液、尿、血浆和血清组成的组中的至少1种。
14.一种SARS-CoV-2病毒的灭活剂，其特征在于，含有权利要求1至9中任一项所述的SARS-CoV-2刺突糖蛋白结合核酸分子。
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