CN116448859A - 一种基于寡糖链检测肠癌的检测试剂、制备方法及应用 - Google Patents
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Abstract
本发明提供了一种基于寡糖链检测肠癌的检测试剂及其制备方法和应用,检测试剂由以下试剂混合而成,试剂A:浓度为10mM、pH为8.3的碳酸氢铵溶液中加入质量浓度1~5%的SDS配制而成;试剂B:由0.05~10单位/10μl糖胺酰酶、质量浓度10%的NP‑40和浓度为10mM、pH为8.3的碳酸氢铵溶液混合配制而成,混合溶液pH值为5~9;试剂C:由8‑氨基芘‑1,3,6‑三磺酸溶于DMSO中配制成浓度为0.02mM~1M有机物还原剂;试剂D:终止液。本发明通过该试剂测定血清中的天然寡糖N‑糖组图谱,再将峰值量化并进行统计学分析,从而提供一种肠癌的血清天然寡糖N‑糖组图谱模型的建立方法,通过测定生理病理状态下蛋白质的天然糖基化修饰的改变来检测肠癌。
Description
技术领域
本发明属于生物医药技术领域,涉及一种肠癌的检测方法,具体涉及一种基于血清寡糖链G-Test特异指纹图谱的肠癌检测方法。
背景技术
肠道癌(carcinomaofrectum)简称肠癌,是胃肠道中常见的恶性肿瘤,发病率仅次于胃和食管癌。绝大多数病人在40岁以上,30岁以下者约占15%。男性较多见,男女病人之比为2-3:1。在我国,结直肠癌发病率自40岁后开始上升,并在50岁起呈现显著上升趋势。早期肠癌的临床特征主要为便血和排便习惯改变,在癌肿局限于直肠粘膜时便血作为唯一的早期症状占比达85%,但往往未被病人所重视,如果做肛指检查多可触及肿块;中、晚期肠癌患者除一般常见的食欲不振、体重减轻、贫血等全身症状外,尚有排便次数增多,排便不尽、便意频繁、里急后重等癌肿局部刺激症状。肠癌容易被误诊,在早期出现的大便次数增多、大便有粘液和脓血时,易误诊为痢疾、肠炎或痔疮等疾病,因而失去了早期根治治疗切除的机会。癌肿增大可致肠腔狭窄,出现肠梗阻征象。肠癌到晚期常侵犯周围组织器官,如膀胱和前列腺等邻近组织,引起尿频、尿急和排尿困难,侵及骶前神经丛,出现骶尾和腰部疼痛。
肠癌的临床诊断主要依靠组织病理学检测、影像学检测和肿瘤标志物检测。行结直肠镜的电子肠镜检查,发现了病灶后再进行病理活检为诊断肠癌的金标准,但由于是侵入式检测,患者的依从性差。影像学检查包括B超、CT、MRI作为辅助检查进行肠癌的诊断,其特异性有待进一步提高。临床上CEA、CA19-9和CA50用于肠癌的筛查,但目前使用的这几种肿瘤标志物的敏感度都不高。上述诊断方法都有自身的局限性,目前急需探索出用于辅助诊断肠癌并具有较高灵敏度和特异度的新型无创性的方法。
糖蛋白是通过蛋白质的翻译后修饰即糖基化后形成的一类结合蛋白。蛋白质的糖基化(Glycosylation)是一种最常见的蛋白翻译后修饰,是在糖基转移酶作用下将糖类转移至蛋白质和蛋白质上特殊的氨基酸残基形成糖苷键的过程。大多数的糖蛋白都是分泌蛋白,广泛存在于细胞膜、细胞间质、血浆以及粘液中。蛋白质上N-糖链通过加工修饰来调控蛋白质的结构、稳定性和活性,所以糖蛋白中糖链对于维持机体生物学功能起重要作用,从而赋予糖蛋白具有多种生物功能。因此了解糖链的改变有助于阐明炎症、肿瘤细胞对周围组织侵袭及转移等异常生物行为学的分子机理。
目前己经在多种肿瘤中发现了蛋白质N-糖链的异常改变,而N-糖链的末端唾液酸修饰改变是其中之一。唾液酸是一类带负电荷的9碳糖化合物,广泛存在于生物体内,常位于聚糖链末端;其在唾液酸酶的作用下通过α-2,3或α-2,6糖苷键与糖链上的半乳糖或N-乙酰半乳糖胺连接形成聚唾液酸链。研究发现聚糖链末端的唾液酸在调控细胞的相互识别、分子相互作用、病毒感染、免疫响应以及信号传导起到重要的功能,且细胞表面糖蛋白质唾液酸修饰具有组织和细胞特异性。众多研究表明唾液酸修饰异常参与了疾病的发生发展,且与多种疾病如感染性疾病以及肿瘤的浸润和转移有着密切关系。因此检测唾液酸相关的寡糖基的改变对于疾病的诊断和作为靶点开发治疗的药物具有潜在的临床价值。
发明内容
针对目前临床上使用的肠癌检测中存在的问题,如血液检查和影像学检测特异性和准确度不高,病理检查有创伤性,患者依存性差等,本发明提供一种肠癌检测试剂,通过该试剂测定血清中的天然寡糖N-糖组图谱,通过将峰值量化,进行统计学分析,从而提供一种肠癌的血清天然寡糖N-糖组图谱模型的建立方法,通过测定生理病理状态下蛋白质的天然糖基化修饰的改变来检测肠癌。
本发明采用的技术方案如下:
一种基于寡糖链检测肠癌的检测试剂,由以下试剂组成:
试剂A:浓度为10mM、pH为8.3的碳酸氢铵溶液中加入质量浓度1~5%的SDS配制而成;
试剂B:由0.05~10单位/10μl糖胺酰酶、质量浓度10%的NP-40和浓度为10mM、pH为8.3的碳酸氢铵溶液混合配制而成,混合溶液pH值为5~9;
试剂C:由8-氨基芘-1,3,6-三磺酸溶于DMSO中配制成浓度为0.02mM~1M有机物还原剂;
试剂D:终止液。
优选的,所述试剂A、试剂B与试剂C的体积比是1:1:1。
优选的,所述试剂A、试剂B与试剂C的体积都为5μl。
优选的,所述试剂D为超纯水。
一种基于寡糖链检测肠癌的检测试剂的制备方法,包括以下步骤:
步骤一 寡糖链的制备
在经过灭活处理的5μl血清样品中加入5μl试剂A,进行变性,冷却至室温后,加入5μl试剂B,37℃反应3h,然后进行干燥;
步骤二 寡糖链的标记
在步骤一干燥后得到的样品中加入5μl试剂C,60℃反应1h后进行荧光标记,然后加入100μl试剂D终止标记反应;
步骤三 寡糖链分离分析
取10μl寡糖链标记后的液体,用分析仪进行N-寡糖链分离检测,得到天然寡糖N-糖组图谱;
步骤四 数据处理分析
N-糖组图谱的峰值量化:将每个峰的峰高值除以所有峰的高度的总和,计算得到每个峰的相对含量。
一种组合物在制备寡糖链肠癌检测试剂中的应用,所述组合物由血清中的G4S4、G3S3、G2S2、G2S2F、G2S1、G2S1F、G1F和G2F2组成,所述组合物通过G2S2/G2S2F+G1S1F/G3S3的值来检测肠癌。
所述G1F为同分异构体。
本发明提供一种肠癌的血清天然寡糖N-糖组图谱模型的建立方法,通过测定血清天然寡糖链G-Test特异指纹图谱,进行统计学分析。
材料和方法:
一、检测样本:肠癌患者和健康人的血清。
二、实验设备:毛细管电泳分析仪,PCR,离心机。
三、试剂制备:
1、试剂A:浓度为10mM、pH为8.3的碳酸氢铵溶液中加入质量浓度1~5%的SDS配制而成;
2、试剂B:由0.05~10单位/10μl糖胺酰酶、质量浓度10%的NP-40和浓度为10mM、pH为8.3的碳酸氢铵溶液混合配制而成,混合溶液pH值为5~9;
3、试剂C:由8-氨基芘-1,3,6-三磺酸溶于DMSO中配制成浓度为0.02mM~1M有机物还原剂;
4、试剂D:终止液。
四、N-糖组图谱检测
1、寡糖链的制备
在经过灭活处理的5μl血清样品中加入5μl试剂A,进行变性;待冷却至室温后,加入5μl试剂B,37℃反应3h,然后进行干燥。
2、寡糖链的标记
(1)干燥后的样品中加入5μl试剂C,60℃反应1h,进行荧光标记;
(2)荧光标记完成后,加入100μl试剂D终止标记反应。
3、寡糖链分离分析
取10μl寡糖链标记后的液体,在ABI3500dx仪器下进行N-寡糖链分离检测,从而得到天然寡糖N-糖组图谱。
4、数据处理分析
(1)N-糖组图谱的峰值量化:将每个峰的峰高值除以所有峰的高度的总和,计算得到每个峰的相对含量。
(2)肠癌患者与健康人群N-糖组数据分析:将肠癌患者与健康人N-糖组数据进行对比分析。将每个峰峰高值除以所有峰高度的总和,定量计算得到每个峰的相对含量,即N-糖组图谱的峰值量化,然后对量化后的肠癌组和健康对照组N-糖组图谱中9个N-寡糖链峰进行比对统计分析。N-糖组图谱的组合物由G4S4、G3S3、G2S2、G2S2F、G2S1、G2S1F、G1F和G2F2组成,其中G1F为同分异构体;通过组合物G2S2/G2S2F+G1S1F/G3S3值来检测肠癌。
与现有技术相比,本发明的有益效果:
(1)将G-Test指纹图谱的各个峰值进行量化,然后将肠癌患者(128例)和健康人(136例)各峰相对含量结果进行对比分析,发现N-聚糖组合物G3S3,G2S2,G2S2F和G1S1F在两组间存在显著的统计学差异(p<0.05);因此,基于组合物G2S2/G2S2F+G1S1F/G3S3建立的模型在区分肠癌患者时ROC曲线下AUC值达到0.910,该G2S2/G2S2F+G1S1F/G3S3模型检测的cutoff值为3.50时,对肠癌的检测有85.70%的灵敏度和84.00%的特异性,表明血清中的N-聚糖组合物G2S2/G2S2F+G1S1F/G3S3可以作为辅助诊断肠癌的标志物。
(2)本发明提出的G-Test检测法是基于DNA测序仪的毛细管微电泳技术(DSA-FACE),将血清样本中糖蛋白N-糖链进行荧光标记后,用毛细管微电泳进行分离,通过测量荧光信号得到的糖蛋白的含量即天然寡糖N-糖组图谱。本发明通过检测生理病理状态下唾液酸寡糖链的变化与疾病状态的相关性,可以根据这些变化,建立N-聚糖组合物的预测模型来辅助诊断肠癌状态。
(3)基于本发明方法构建的G-Test天然N-糖组图谱模型,能够让众多患者接受常规、无创检测,帮助医生及患者及时监测肠癌的发生和疾病进展,本发明的检测技术具有灵敏度高、操作简单、微量(5μl血清)、重复性高、稳定性好、高通量(96-孔板)等优点,可在临床中推广使用。
附图说明
图1是健康人和肠癌患者的血清天然寡糖N-糖组图谱;
图2是基于N-糖组合物G2S2/G2S2F+G1S1F/G3S3建立的鉴别肠癌状态模型ROC曲线图;检测样本总数为264例,其中肠癌患者血清128例,健康人血清136例,得到ROC曲线下面积AUC=0.910。
具体实施方式
下面结合实施例和附图对本发明作进一步详述。需要说明的是,下列实施例仅用于说明本发明而不用于限制本发明的范围。下列实施例中未注明具体条件的实验方法,通常按照常规条件试验,或按照制造厂商建议的条件。
检测肠癌状态,通过测定血清天然寡糖N-糖组图谱,进行统计学分析,采用的材料和方法如下列实施例。
实施例一
1.检测样本:肠癌患者和健康人的血清。
2.实验设备:毛细管电泳分析仪,PCR,离心机。
3.试剂制备:
(1)试剂A:浓度为10mM的碳酸氢铵溶液中加入质量浓度2.5%的SDS配制而成;
(2)试剂B:由3.5单位/10μl糖胺酰酶、质量浓度10%的NP-40和浓度为10mM、pH为8.3的碳酸氢铵溶液混合配制而成,溶液pH值为7;
(3)试剂C:由8-氨基芘-1,3,6-三磺酸溶于DMSO中配制而成浓度为10mM有机物还原剂;
(4)试剂D:超纯水。
4.N-糖组图谱检测:
(1)寡糖链的制备
在经过灭活处理的5μl血清样品中加入5μl试剂A,进行变性;待冷却至室温后,加入5μl试剂B,37℃反应3h,然后进行干燥。
(2)寡糖链的标记
1)干燥后的样品中加入5μl试剂C,60℃反应1h,进行荧光标记;
2)荧光标记完成后,加入100μl试剂D终止标记反应。
(3)寡糖链分离分析
取10μl寡糖链标记后的液体,在ABI3500dx仪器下进行N-寡糖链分离检测,从而得到天然寡糖N-糖组图谱。
(4)数据处理分析
1)N-糖组图谱的峰值量化:将每个峰的峰高值除以所有峰的高度的总和,计算得到每个峰的相对含量。
2)肠癌患者与健康人群N-糖组数据分析:将肠癌患者与健康人N-糖组数据进行对比分析。如图1所示,人血清的N-糖组图谱显示出近9个N-寡糖链峰,不同寡糖链因所带电荷以及分子大小的不同而表现出不同的迁移率,即表现在N-糖组图谱上的不同的峰则代表了不同的寡糖链,其峰高代表了寡糖链的相对含量。图1中A为健康人血清N-聚糖图谱,B为肠癌患者血清N-聚糖图谱。N-糖组图谱的组合物由G4S4、G3S3、G2S2、G2S2F、G2S1、G2S1F、G1F和G2F2组成,其中G1F为同分异构体;通过计算组合物G2S2/G2S2F+G1S1F/G3S3值来辅助判断肠癌状态。
基于组合物G2S2/G2S2F+G1S1F/G3S3建立的模型在区分肠癌患者时ROC曲线下AUC值达到0.910(图2),该G2S2/G2S2F+G1S1F/G3S3模型检测的cutoff值为3.50时,对肠癌的检测有85.70%的灵敏度和84.00%的特异性,表明血清中的N-聚糖组合物G2S2/G2S2F+G1S1F/G3S3可以作为辅助诊断肠癌的标志物。
实施例二
1.检测样本:肠癌患者和健康人的血清。
2.实验设备:毛细管电泳分析仪,PCR,离心机。
3.试剂制备:
(1)试剂A:浓度为10mM的碳酸氢铵溶液中加入质量浓度1%的SDS配制而成;
(2)试剂B:由0.05单位/10μl糖胺酰酶、质量浓度10%的NP-40和浓度为10mM、pH为8.3的碳酸氢铵溶液混合配制而成,溶液pH值为5;
(3)试剂C:由8-氨基芘-1,3,6-三磺酸溶于DMSO中配制而成浓度为0.02mM有机物还原剂;
(4)试剂D:超纯水。
4.N-糖组图谱检测同实施例一。
实施例三
1.检测样本:肠癌患者和健康人的血清。
2.实验设备:毛细管电泳分析仪,PCR,离心机。
3.试剂制备:
(1)试剂A:浓度为10mM的碳酸氢铵溶液中加入质量浓度5%的SDS配制而成;
(2)试剂B:由10单位/10μl糖胺酰酶、质量浓度10%的NP-40和浓度为10mM、pH为8.3的碳酸氢铵溶液混合配制而成,溶液pH值为9;
(3)试剂C:由8-氨基芘-1,3,6-三磺酸溶于DMSO中配制而成浓度为1M有机物还原剂;
(4)试剂D:超纯水。
4.N-糖组图谱检测同实施例一。
本检测技术与现有技术相比,通过检测生理病理状态下唾液酸寡糖链的变化与疾病状态的相关性,可以根据这些变化,建立N-聚糖组合物的预测模型来辅助判断肠癌状态。基于本发明方法构建的G-Test天然N-糖组图谱模型,能够让众多患者接受常规、无创检测,帮助医生及患者及时监测肠癌的发生和疾病进展,可在临床中推广使用。
以上结合附图所述的具体实施例,对本发明的目的、技术方案和有益效果进行了进一步详细说明,所应理解的是,以上所述仅为本发明的具体实施例而已,但并非对本发明保护范围的限制,所属领域技术人员应该明白,凡在本发明的精神和原则之内,不需要付出创造性劳动即可做出的任何修改、等同替换、改进等,均应包含在本发明的保护范围之内。
Claims (7)
1.一种基于寡糖链检测肠癌的检测试剂,其特征在于,由以下试剂组成:
试剂A:浓度为10mM、pH为8.3的碳酸氢铵溶液中加入质量浓度1~5%的SDS配制而成;
试剂B:由0.05~10单位/10μl糖胺酰酶、质量浓度10%的NP-40和浓度为10mM、pH为8.3的碳酸氢铵溶液混合配制而成,混合溶液pH值为5~9;
试剂C:由8-氨基芘-1,3,6-三磺酸溶于DMSO中配制成浓度为0.02mM~1M有机物还原剂;
试剂D:终止液。
2.根据权利要求1所述的基于寡糖链检测肠癌的检测试剂,其特征在于,所述试剂A、试剂B与试剂C的体积比是1:1:1。
3.根据权利要求2所述的基于寡糖链检测肠癌的检测试剂,其特征在于,所述试剂A、试剂B与试剂C的体积都为5μl。
4.根据权利要求1所述的基于寡糖链检测肠癌的检测试剂,其特征在于,所述试剂D为超纯水。
5.根据权利要求1所述的基于寡糖链检测肠癌的检测试剂制备方法,其特征在于,包括以下步骤:
步骤一 寡糖链的制备
在经过灭活处理的5μl血清样品中加入5μl试剂A,进行变性,冷却至室温后,加入5μl试剂B,37℃反应3h,然后进行干燥;
步骤二 寡糖链的标记
在步骤一干燥后得到的样品中加入5μl试剂C,60℃反应1h后进行荧光标记,然后加入100μl试剂D终止标记反应;
步骤三 寡糖链分离分析
取10μl寡糖链标记后的液体,用分析仪进行N-寡糖链分离检测,得到天然寡糖N-糖组图谱;
步骤四 数据处理分析
N-糖组图谱的峰值量化:将每个峰的峰高值除以所有峰的高度的总和,计算得到每个峰的相对含量。
6.一种组合物在制备寡糖链肠癌检测试剂中的应用,其特征在于,所述组合物由血清中的G4S4、G3S3、G2S2、G2S2F、G2S1、G2S1F、G1F和G2F2组成,所述组合物通过G2S2/G2S2F+G1S1F/G3S3的值来检测肠癌。
7.根据权利要求6所述的一种组合物在制备寡糖链肠癌检测试剂中的应用,其特征在于,所述G1F为同分异构体。
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