CN115927556A - 一种用于制备微滴式数字pcr液滴的油相组合物及其制备方法 - Google Patents
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Abstract
本发明公开一种用于制备微滴式数字PCR液滴的油相组合物及其制备方法,所述油相组合物包括基础油、表面活性剂、纳米粒子;所述基础油为饱和烷烃和硅油的混合物,所述表面活性剂选自聚甘油‑3二硅氧烷聚二甲基硅氧烷和PEG 30二聚羟基硬脂酸酯的混合物;所述基础油的质量占油相组合物质量的95‑98%,其中,饱和烷烃的质量占所述油相组合物质量的0‑98%,硅油的质量占所述油相组合物质量的0‑98%;所述表面活性剂的质量占油相组合物质量的2‑5%。本发明提供了用于制备微滴式数字PCR液滴的油相组合物,应用本发明制备的液滴大小均匀、热稳定性好、不挥发,对PCR扩增无抑制作用,且对多数商品化PCR mix均适用。
Description
技术领域
本发明涉及微流控技术和分子生物学技术的交叉领域,特别涉及一种用于制备微滴式数字PCR液滴的油相组合物及其制备方法。
背景技术
微滴式数字PCR(droplet digital polymerase chain reaction,ddPCR),以荧光定量PCR为基础,采用基于微流控芯片,将包含核酸模板的荧光定量PCR反应液分散为数以万计的纳升级油包水液滴,每个液滴都可作为一个独立的PCR反应单元。每个液滴不含或含有一至数个待测核酸靶分子,PCR扩增后,包含待检核酸靶分子的液滴可产生荧光信号,不含待检核酸靶分子的液滴不产生荧光信号。逐个检测每个液滴的荧光信号,将有荧光信号的液滴判读为阳性,无荧光信号的液滴判读为阴性。统计阳性液滴的数量和占比,根据泊松分布原理,即可计算出待检核酸靶分子的起始拷贝数或浓度。
已公开报道的ddPCR大多采用微流控芯片,利用表面张力和/或剪切力的作用,将PCR反应液分散到油相中,产生油包水液滴。目前,应用于微流控芯片形成稳定液滴的油相主要有氟化油(包括FC 40、HFE 7500)、烃类油(包括矿物油、十六烷、十四烷等)。ddPCR使用的油相中都需要加入合适的表面活性剂,表面活性剂对于液滴的生成和稳定都具有极其重要的作用。表面活性剂既亲水又亲油,可以吸附在油水界面,这对于保持液滴在PCR热循环(高至95℃)过程的稳定、防止液滴融合至关重要,同时还可避免DNA聚合酶吸附在油/水界面,使PCR扩增反应正常进行。以氟化油为油相,液滴的热稳定性较好,但氟化油易挥发,加热时易产生气泡,对仪器和芯片的密封性要求很高,大大增加了一体化全自动微滴数字PCR系统的开发难度,另外所用表面活性剂价格昂贵,且PCR mix相对封闭,适配性不强。以矿物油等烃类为油相,采用公开报道的表面活性剂,如EM 90,所得液滴的热稳定性无法满足ddPCR反应的要求(高至95℃)。为用于一体化全自动微滴数字PCR,需开发一类新的油相组合物,满足生成液滴大小均匀、热稳定性好、不易挥发、不产生气泡、不抑制PCR扩增等要求。
发明内容
针对现有技术存在的问题,本发明提供一种用于制备微滴式数字PCR液滴的油相组合物及其制备方法,使用该油相组合物制备的液滴大小均匀、热稳定性好、不挥发,PCR加热过程不易产生气泡、对PCR扩增无抑制作用。
为了上述目的,本发明提供一种用于制备微滴式数字PCR液滴的油相组合物,所述油相组合物包括基础油、表面活性剂、纳米粒子;
所述基础油为饱和烷烃和硅油的混合物,所述基础油的质量占油相组合物质量的95-98%,其中,饱和烷烃的质量占所述油相组合物质量的0-98%,硅油的质量占所述油相组合物质量的0-98%;
所述表面活性剂的质量占油相组合物质量的2-5%;所述纳米粒子占所述油相组合物总质量的0.1-0.5%。
进一步的,所述饱和烷烃选自正十四烷、正十五烷、正十六烷中的一种或多种,优选的,所述饱和烷烃为正十四、正十五烷、十六烷的混合物。
进一步的,由于单独使用饱和烷烃作为油相的基础油,形成的液滴热稳定性不够,不能保持液滴在PCR扩增反应中的稳定,经过实验,发现向所述饱和烷烃中添加硅油可解决该问题;所述硅油为甲基硅油,优选的,所述硅油为聚甲基硅氧烷,进一步优选的,所述硅油的黏度与饱和烷烃(正十四~十六烷)相近,经过实验,发现八甲基环四硅氧烷、十甲基环五硅氧烷、十二甲基环六硅氧烷中的一种或多种混合物具有良好的效果,因此硅油选自八甲基环四硅氧烷、十甲基环五硅氧烷、十二甲基环六硅氧烷中的一种或多种。
进一步的,所述硅油的体积占所述基础油质量的10-90%,进一步优选的,所述硅油占所述基础油质量的60-80%。实验发现,所述硅油的量过高或过低,所得液滴在PCR扩增过程中易发生融合。
进一步的,所述表面活性剂选自聚甘油-3二硅氧烷聚二甲基硅氧烷、PEG30二聚羟基硬脂酸酯的的一种或多种,所述聚甘油-3二硅氧烷聚二甲基硅氧烷的质量占油相组合物总质量的2-5%,PEG 30二聚羟基硬脂酸酯的质量占油相组合物总质量的0.01%-5%,进一步优选的,所述表面活性剂的聚甘油-3二硅氧烷聚二甲基硅氧烷的质量占油相组合物的3~4%,PEG 30二聚羟基硬脂酸酯的质量占油相组合物的0.05~0.2%。
进一步的,实验发现,同时向油相中加入疏水性的纳米粒子对稳定液滴的效果更佳,因此,所述纳米粒子为表面经疏水修饰的无机或或有机纳米颗粒,优选的,所述纳米粒子为表面经硅烷化处理的二氧化硅纳米颗粒,所述纳米粒子的直径为50-200纳米。
本发明还提供一种微滴式数字PCR液滴的制备方法,包括以下步骤:
步骤S1:配制油相,将油相组合物的各组分按照配方均匀混合,获得的液体作为油相备用;
步骤S2:配置水相,该水相包括PCR缓冲溶液、引物、双链DNA荧光染料或Taqman荧光探针、内参基因ACTB、1%BSA、去离子水,将上述液体以一定的比例混合均匀,获得的溶液作为水相溶液备用;
步骤S3:在数字PCR芯片的水相存储池中加入配制的水相,在数字PCR芯片的油相存储池中加入配制的油相,然后将已加入水相和油相的数字PCR芯片放入数字PCR仪中生成液滴,所得液滴存储在所述数字PCR芯片的液滴存储池。
进一步的,所述步骤S2中的PCR缓冲溶液包括Taq酶、dNTP、镁离子。
进一步的,所述引物包括上游引物F、下游引物R,其中,所述上游引物F的序列为:GGAGAACCAACCAGATGTG,所述下游引物R的序列为:CCTTCGTGCTTGTGATGT。
进一步的,所述Taqman荧光探针的序列为CY5-ctcaccaggcacccagt-MGB,其中,CY5为荧光报告基团,MGB为荧光淬灭基团。
采用本发明的技术方案,具有以下有益效果:本发明提供了用于制备微滴式数字PCR液滴的油相组合物,应用本发明制备的液滴大小均匀、热稳定性好、不挥发,PCR加热过程不易产生气泡、对PCR扩增无抑制作用,且对多数商品化PCR mix均适用。
附图说明
图1为本发明实施例3中组合物(1)中得到的液滴图;
图2为本发明实施例3中组合物(2)中得到的液滴图;
图3为本发明实施例3中组合物(4)中得到的液滴图;
图4为本发明实施例3中组合物(5)中得到的液滴图;
图5为本发明实施例3中组合物(3)中得到的液滴图;
图6为本发明实施例3中组合物(6)中得到的液滴图;
图7为本发明实施例4中组合物(1)中得到的液滴图;
图8为本发明实施例4中组合物(4)中得到的液滴图;
图9为本发明实施例4中组合物(5)中得到的液滴图;
图10为本发明实施例4中组合物(6)中得到的液滴图;
图11为本发明实施例4中组合物(7)中得到的液滴图;
图12为本发明实施例4中组合物(8)中得到的液滴图;
图13为本发明实施例4中组合物(9)中得到的液滴图;
图14为本发明实施例4中组合物(10)中得到的液滴图;
图15为本发明实施例4中组合物(13)中得到的液滴图;
图16为本发明实施例4中组合物(14)中得到的液滴图;
图17为本发明实施例4中组合物(15)中得到的液滴图;
图18为本发明实施例4中组合物(16)中得到的液滴图;
图19为本发明实施例4中组合物(17)中得到的液滴图;
图20为本发明实施例4中组合物(18)中得到的液滴图;
图21为本发明实施例4中组合物(2)中得到的液滴图;
图22为本发明实施例4中组合物(3)中得到的液滴图;
图23为本发明实施例4中组合物(11)中得到的液滴图;
图24为本发明实施例4中组合物(12)中得到的液滴图;
图25为本发明实施例5中组合物(1)中得到的液滴图;
图26为本发明实施例5中组合物(2)中得到的液滴图;
图27为本发明实施例5中组合物(3)中得到的液滴图;
图28为本发明实施例5中组合物(4)中得到的液滴图;
图29为本发明实施例6中组合物(2)中得到的液滴图;
图30为本发明实施例6中组合物(3)中得到的液滴图;
图31为本发明实施例6中组合物(4)中得到的液滴图;
图32为本发明实施例6中组合物(5)中得到的液滴图;
图33为本发明实施例6中组合物(1)中得到的液滴图;
图34为本发明实施例6中组合物(1)中得到的液滴图;
图35为本发明实施例7中组合物(1)中得到的液滴图;
图36为本发明实施例7中组合物(2)中得到的液滴图;
图37为本发明实施例7中组合物(3)中得到的液滴图。
具体实施方式
以下结合附图和具体实施例,对本发明进一步说明。
实施例1
对油相加入不同的表面活性剂,根据不同表面活性剂和基础油的溶解性,设计以下几种油相组合物(以质量计):
(1)97%正十四烷+3%聚甘油-3二硅氧烷聚二甲基硅氧烷;
(2)97%十甲基环五硅氧烷+3%聚甘油-3二硅氧烷聚二甲基硅氧烷;
(3)97%正十四烷+3% PEG 30二聚羟基硬脂酸酯;
(4)97%十甲基环五硅氧烷+3% PEG 30二聚羟基硬脂酸酯;
结果:(1)、(2)、(3)的表面活性剂与油相可以较好相溶,(4)的表面活性剂与油相的相溶性较差。
实施例2
根据实施例1的实验结果,进一步对油相组合物加入不同的表面活性剂,根据不同表面活性剂和基础油的溶解性,设计以下几种油相组合物(以质量计):
(1)50%十甲基环五硅氧烷+47%正十四烷+3%聚甘油-3二硅氧烷聚二甲基硅氧烷
(2)50%十甲基环五硅氧烷+47%正十四烷+3% PEG 30二聚羟基硬脂酸酯
(3)50%十甲基环五硅氧烷+47%正十四烷+1.5%聚甘油-3二硅氧烷聚二甲基硅氧烷+1.5%PEG 30二聚羟基硬脂酸酯
(4)50%十甲基环五硅氧烷+47%正十六烷+3%聚甘油-3二硅氧烷聚二甲基硅氧烷
(5)50%十甲基环五硅氧烷+47%正十六烷+3% PEG 30二聚羟基硬脂酸酯
(6)50%十甲基环五硅氧烷+47%正十六烷+1.5%聚甘油-3二硅氧烷聚二甲基硅氧烷+1.5%PEG 30二聚羟基硬脂酸酯
结果:油相组合物(1)、(2)、(3)、(4)、(5)、(6)中的表面活性剂与基础油能够较好相溶。
实施例3
根据实施例2筛选到的(1)~(6)油相组合物进行液滴制备操作,并进行PCR扩增,具体步骤如下:
(1)按实施例2中(1)~(6)方案配制油相;
(2)配制水相即PCR反应体系;模板来自内参基因ACTB。
引物序列为:
F:GGAGAACCAACCAGATGTGT
R:CCTTCGTGCTTGTGATGT
探针序列为:CY5-ctcaccaggcacccagt-MGB
其中Cy5为荧光报告基团,MGB为荧光淬灭基团。
水相配方见表1:
表1
(3)将油相组合物灌入一种微滴数字PCR芯片内;
(4)将所述一种微滴数字PCR芯片放入一种全自动微滴数字PCR仪,气压驱动水相进入油相,采用阶梯乳化的方式生成液滴;
(5)生成好的液滴在所述一种微滴数字PCR芯片内以单层平铺排列,然后按如下程序进行PCR扩增:95℃预变性3min;95℃变性10s,58℃退火延伸30s,共40个循环;
(6)扩增结束,所述一种全自动微滴数字PCR仪自动拍照,观察液滴状态。
结果:PCR扩增后,实施例3中,采用实施例2中油相组合物(1)、(2)、(4)、(5)的液滴大小不均匀,融合严重,液滴连成一片(图1、图2、图3、图4);实施例3中,采用实施例2中油相组合物(3)、(6)中的液滴融合明显改善,大液滴和破碎液滴大幅减少(图5、图6)。即实施例3中,采用实施例2中油相组合物(3)、(6)保持液滴稳定的效果有所改善,但仍有较多破碎液滴和偏大液滴,应为PCR扩增加热所致。
实施例4
根据实施例3确定油相组合物的基础油为正十四烷(或正十六烷)和硅油,使用聚甘油-3二硅氧烷聚二甲基硅氧烷和PEG 30二聚羟基硬脂酸酯为表面活性剂,继续对正十四烷(或正十六烷)和硅油的添加比例进一步优化。
(1)87%十甲基环五硅氧烷+10%正十四烷+1.5%聚甘油-3二硅氧烷聚二甲基硅氧烷+1.5%PEG 30二聚羟基硬脂酸酯;
(2)77%十甲基环五硅氧烷+20%正十四烷+1.5%聚甘油-3二硅氧烷聚二甲基硅氧烷+1.5%PEG 30二聚羟基硬脂酸酯;
(3)67%十甲基环五硅氧烷+30%正十四烷+1.5%聚甘油-3二硅氧烷聚二甲基硅氧烷+1.5%PEG 30二聚羟基硬脂酸酯;
(4)57%十甲基环五硅氧烷+40%正十四烷+1.5%聚甘油-3二硅氧烷聚二甲基硅氧烷+1.5%PEG 30二聚羟基硬脂酸酯;
(5)47%十甲基环五硅氧烷+50%正十四烷+1.5%聚甘油-3二硅氧烷聚二甲基硅氧烷+1.5%PEG 30二聚羟基硬脂酸酯;
(6)37%十甲基环五硅氧烷+60%正十四烷+1.5%聚甘油-3二硅氧烷聚二甲基硅氧烷+1.5%PEG 30二聚羟基硬脂酸酯;
(7)27%十甲基环五硅氧烷+70%正十四烷+1.5%聚甘油-3二硅氧烷聚二甲基硅氧烷+1.5%PEG 30二聚羟基硬脂酸酯;
(8)17%十甲基环五硅氧烷+80%正十四烷+1.5%聚甘油-3二硅氧烷聚二甲基硅氧烷+1.5%PEG 30二聚羟基硬脂酸酯;
(9)7%十甲基环五硅氧烷+90%正十四烷+1.5%聚甘油-3二硅氧烷聚二甲基硅氧烷+1.5%PEG 30二聚羟基硬脂酸酯;
(10)87%十甲基环五硅氧烷+10%正十六烷+1.5%聚甘油-3二硅氧烷聚二甲基硅氧烷+1.5%PEG 30二聚羟基硬脂酸酯;
(11)77%十甲基环五硅氧烷+20%正十六烷+1.5%聚甘油-3二硅氧烷聚二甲基硅氧烷+1.5%PEG 30二聚羟基硬脂酸酯;
(12)67%十甲基环五硅氧烷+30%正十六烷+1.5%聚甘油-3二硅氧烷聚二甲基硅氧烷+1.5%PEG 30二聚羟基硬脂酸酯;
(13)57%十甲基环五硅氧烷+40%正十六烷+1.5%聚甘油-3二硅氧烷聚二甲基硅氧烷+1.5%PEG 30二聚羟基硬脂酸酯;
(14)47%十甲基环五硅氧烷+50%正十六烷+1.5%聚甘油-3二硅氧烷聚二甲基硅氧烷+1.5%PEG 30二聚羟基硬脂酸酯;
(15)37%十甲基环五硅氧烷+60%正十六烷+1.5%聚甘油-3二硅氧烷聚二甲基硅氧烷+1.5%PEG 30二聚羟基硬脂酸酯;
(16)27%十甲基环五硅氧烷+70%正十六烷+1.5%聚甘油-3二硅氧烷聚二甲基硅氧烷+1.5%PEG 30二聚羟基硬脂酸酯;
(17)17%十甲基环五硅氧烷+80%正十六烷+1.5%聚甘油-3二硅氧烷聚二甲基硅氧烷+1.5%PEG 30二聚羟基硬脂酸酯;
(18)7%十甲基环五硅氧烷+90%正十六烷+1.5%聚甘油-3二硅氧烷聚二甲基硅氧烷+1.5%PEG 30二聚羟基硬脂酸酯;
液滴制备方法、水相配方及数字PCR实验步骤与实施例3相同。
结果:组合物(1)、(4)、(5)、(6)、(7)、(8)、(9)、(10)、(13)、(14)、(15)、(16)、(17)、(18)中有较多破碎液滴和偏大液滴,应为液滴融合所致(图7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20);组合物(2)、(3)、(11)、(12)中绝大多数液滴均匀稳定,只有少量融合液滴(图21、22、23、24)。
实施例5
根据实施例4确定油相组合物的基础油为正十四烷(或正十六烷)和硅油,使用聚甘油-3二硅氧烷聚二甲基硅氧烷和PEG 30二聚羟基硬脂酸酯为表面活性剂,依据油相组合物(2)、(3)、(11)、(12),向油相组合物中添加纳米粒子,继续优化优化油相组合物。继续对聚甘油-3二硅氧烷聚二甲基硅氧烷和PEG 30二聚羟基硬脂酸酯的添加比例进一步优化。
(1)77%十甲基环五硅氧烷+20%正十四烷+1.5%聚甘油-3二硅氧烷聚二甲基硅氧烷+1.5%PEG 30二聚羟基硬脂酸酯+0.1%二氧化硅纳米颗粒(经硅烷化处理)
(2)67%十甲基环五硅氧烷+30%正十四烷+1.5%聚甘油-3二硅氧烷聚二甲基硅氧烷+1.5%PEG 30二聚羟基硬脂酸酯+0.1%二氧化硅纳米颗粒(经硅烷化处理)
(3)77%十甲基环五硅氧烷+20%正十六烷+1.5%聚甘油-3二硅氧烷聚二甲基硅氧烷+1.5%PEG 30二聚羟基硬脂酸酯+0.1%二氧化硅纳米颗粒(经硅烷化处理)
(4)7%十甲基环五硅氧烷+30%正十六烷+1.5%聚甘油-3二硅氧烷聚二甲基硅氧烷+1.5%PEG 30二聚羟基硬脂酸酯+0.1%二氧化硅纳米颗粒(经硅烷化处理)
液滴制备方法、水相配方及数字PCR实验步骤与实施例3相同。
结果:组合物(1)、(2)、(3)、(4)中基本没有破碎和融合液滴(图25、26、27、28)。
实施例6
根据实施例5确定油相组合物的基础油为正十四烷(或正十六烷)和硅油,使用聚甘油-3二硅氧烷聚二甲基硅氧烷和PEG 30二聚羟基硬脂酸酯为表面活性剂,继续对聚甘油-3二硅氧烷聚二甲基硅氧烷和PEG 30二聚羟基硬脂酸酯的添加比例进一步优化。
(1)67%十甲基环五硅氧烷+30%正十四烷+2.5%聚甘油-3二硅氧烷聚二甲基硅氧烷+0.5%PEG 30二聚羟基硬脂酸酯+0.1%二氧化硅纳米颗粒(经硅烷化处理);
(2)67%十甲基环五硅氧烷+30%正十四烷+2.0%聚甘油-3二硅氧烷聚二甲基硅氧烷+1.0%PEG 30二聚羟基硬脂酸酯+0.1%二氧化硅纳米颗粒(经硅烷化处理);
(3)67%十甲基环五硅氧烷+30%正十四烷+1.5%聚甘油-3二硅氧烷聚二甲基硅氧烷+1.5%PEG 30二聚羟基硬脂酸酯+0.1%二氧化硅纳米颗粒(经硅烷化处理);
(4)67%十甲基环五硅氧烷+30%正十四烷+1.0%聚甘油-3二硅氧烷聚二甲基硅氧烷+2.0%PEG 30二聚羟基硬脂酸酯+0.1%二氧化硅纳米颗粒(经硅烷化处理);
(5)67%十甲基环五硅氧烷+30%正十四烷+0.5%聚甘油-3二硅氧烷聚二甲基硅氧烷+2.5%PEG 30二聚羟基硬脂酸酯+0.1%二氧化硅纳米颗粒(经硅烷化处理);
液滴制备方法、水相配方及数字PCR实验步骤与实施例3、实施例4相同。
结果:组合物(2)、(3)、(4)、(5)中有少量偏大液滴,应为液滴融合所致(图29、30、31、32);组合物(1)中液滴比较稳定,基本没有融合液滴,可检测到较强荧光信号(图33、图34)。
实施例7
根据实施例6确定油相组合物的基础油为正十四烷(或正十六烷)和硅油,使用聚甘油-3二硅氧烷聚二甲基硅氧烷和PEG 30二聚羟基硬脂酸酯为表面活性剂,继续对正十四烷和正十六烷的添加比例进一步优化。
(1)67%十甲基环五硅氧烷+20%正十四烷+10%正十六烷+2.5%聚甘油-3二硅氧烷聚二甲基硅氧烷+0.5%PEG 30二聚羟基硬脂酸酯+0.1%二氧化硅纳米颗粒(经硅烷化处理);
(2)67%十甲基环五硅氧烷+15%正十四烷+15%正十六烷+2.5%聚甘油-3二硅氧烷聚二甲基硅氧烷+0.5%PEG 30二聚羟基硬脂酸酯+0.1%二氧化硅纳米颗粒(经硅烷化处理);
(3)67%十甲基环五硅氧烷+10%正十四烷+20%正十六烷+2.5%聚甘油-3二硅氧烷聚二甲基硅氧烷+0.5%PEG 30二聚羟基硬脂酸酯+0.1%二氧化硅纳米颗粒(经硅烷化处理);
液滴制备方法、水相配方及数字PCR实验步骤与实施例3、实施例4、实施例5相同。
结果:组合物(1)、(2)、(3)所得结果相近,均能获得均匀液滴,基本没有破碎和融合所致偏大液滴(图35、36、37)。
由上述实施例1至7可知,本发明提供了用于制备微滴式数字PCR液滴的油相组合物,应用本发明制备的液滴大小均匀、热稳定性好、不挥发,PCR加热过程不易产生气泡、对PCR扩增无抑制作用,且对多数商品化PCR mix均适用。
以上所述仅为本发明的优选实施例,并非因此限制本发明的专利范围,凡是在本发明的发明构思下,利用本发明说明书及附图内容所作的等效结构变换,或直接/间接运用在其他相关的技术领域均包括在本发明的专利保护范围内。
Claims (10)
1.一种用于制备微滴式数字PCR液滴的油相组合物,其特征在于,所述油相组合物包括基础油、表面活性剂、纳米粒子;
所述基础油为饱和烷烃和硅油的混合物,所述基础油的质量占油相组合物质量的95-98%,其中,饱和烷烃的质量占所述油相组合物质量的0-98%,硅油的质量占所述油相组合物质量的0-98%;
所述表面活性剂的质量占油相组合物质量的2-5%;所述所述纳米粒子占所述油相组合物总质量的0.1-0.5%。
2.根据权利要求1所述的用于制备微滴式数字PCR液滴的油相组合物,其特征在于,所述表面活性剂选自聚甘油-3二硅氧烷聚二甲基硅氧烷、PEG30二聚羟基硬脂酸酯的的一种或多种,所述聚甘油-3二硅氧烷聚二甲基硅氧烷的质量占所述油相组合物总质量的2-5%,所述PEG 30二聚羟基硬脂酸酯的质量占所述油相组合物总质量的0.01%-5%。
3.根据权利要求2所述的用于制备微滴式数字PCR液滴的油相组合物,其特征在于,所述饱和烷烃选自正十四烷、正十五烷、正十六烷中的一种或多种。
4.根据权利要求2所述的用于制备微滴式数字PCR液滴的油相组合物,其特征在于,所述硅油选自八甲基环四硅氧烷、十甲基环五硅氧烷、十二甲基环六硅氧烷中的一种或多种。
5.根据权利要求4所述的用于制备微滴式数字PCR液滴的油相组合物,其特征在于,所述硅油的体积占所述基础油质量的10-90%。
6.根据权利要求1所述的用于制备微滴式数字PCR液滴的油相组合物,其特征在于,所述纳米粒子为表面经硅烷化处理的二氧化硅纳米颗粒、PMMA纳米颗粒或其他油溶性纳米颗粒;所述纳米粒子的直径为50-200纳米。
7.一种微滴式数字PCR液滴的制备方法,其特征在于,包括以下步骤:
步骤S1:配制油相,将上述权利要求1-6所述的油相组合物的各组分按照配方均匀混合,获得的液体作为油相备用;
步骤S2:配置水相,该水相包括PCR缓冲溶液、引物、双链DNA荧光染料或Taqman荧光探针、内参基因ACTB、1%BSA、去离子水,将上述液体以一定的比例混合均匀,获得的溶液作为水相溶液备用;
步骤S3:在数字PCR芯片的水相存储池中加入配制的水相,在数字PCR芯片的油相存储池中加入配制的油相,然后将已加入水相和油相的数字PCR芯片放入数字PCR仪中生成液滴,所得液滴存储在所述数字PCR芯片的液滴存储池。
8.根据权利要求7所述的微滴式数字PCR液滴的制备方法,其特征在于,所述步骤S2中的PCR缓冲溶液包括Taq酶、dNTP、镁离子。
9.根据权利要求7所述的微滴式数字PCR液滴的制备方法,其特征在于,所述引物包括上游引物F、下游引物R,其中,所述上游引物F的序列为:GGAGAACCAACCAGATGTG,所述下游引物R的序列为:CCTTCGTGCTTGTGATGT。
10.根据权利要求7所述的微滴式数字PCR液滴的制备方法,其特征在于,所述Taqman荧光探针的序列为CY5-ctcaccaggcacccagt-MGB,其中,CY5为荧光报告基团,MGB为荧光淬灭基团。
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