CN115851668B - 高比活碱性木聚糖酶突变体 - Google Patents
高比活碱性木聚糖酶突变体 Download PDFInfo
- Publication number
- CN115851668B CN115851668B CN202211016968.4A CN202211016968A CN115851668B CN 115851668 B CN115851668 B CN 115851668B CN 202211016968 A CN202211016968 A CN 202211016968A CN 115851668 B CN115851668 B CN 115851668B
- Authority
- CN
- China
- Prior art keywords
- xylanase
- specific activity
- mutant
- enzyme
- xylanase mutant
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Active
Links
- 101710121765 Endo-1,4-beta-xylanase Proteins 0.000 title claims abstract description 75
- 230000000694 effects Effects 0.000 title abstract description 39
- 238000003259 recombinant expression Methods 0.000 claims description 8
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 claims description 4
- 125000003275 alpha amino acid group Chemical group 0.000 claims description 4
- 239000013613 expression plasmid Substances 0.000 claims description 4
- 102000053602 DNA Human genes 0.000 claims description 3
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 claims description 3
- 241000235648 Pichia Species 0.000 claims description 2
- 241000223259 Trichoderma Species 0.000 claims description 2
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 claims 5
- 210000004102 animal cell Anatomy 0.000 claims 1
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 abstract description 31
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 abstract description 29
- 230000035772 mutation Effects 0.000 abstract description 17
- 230000001976 improved effect Effects 0.000 abstract description 12
- 102220219006 rs1060501597 Human genes 0.000 abstract description 7
- 102220166659 rs76788243 Human genes 0.000 abstract description 6
- 102220118126 rs886041766 Human genes 0.000 abstract description 6
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 abstract description 5
- 238000010353 genetic engineering Methods 0.000 abstract description 3
- 230000009286 beneficial effect Effects 0.000 abstract description 2
- 230000001737 promoting effect Effects 0.000 abstract description 2
- 230000009145 protein modification Effects 0.000 abstract 1
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 description 18
- 238000000034 method Methods 0.000 description 13
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 13
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 description 10
- 239000006228 supernatant Substances 0.000 description 9
- 229920001221 xylan Polymers 0.000 description 9
- 150000004823 xylans Chemical class 0.000 description 9
- 235000019624 protein content Nutrition 0.000 description 8
- 239000013612 plasmid Substances 0.000 description 7
- 238000012216 screening Methods 0.000 description 7
- 241000235058 Komagataella pastoris Species 0.000 description 6
- OKKJLVBELUTLKV-UHFFFAOYSA-N Methanol Chemical compound OC OKKJLVBELUTLKV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 239000001888 Peptone Substances 0.000 description 6
- 108010080698 Peptones Proteins 0.000 description 6
- 235000019319 peptone Nutrition 0.000 description 6
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 241000588724 Escherichia coli Species 0.000 description 5
- 238000002835 absorbance Methods 0.000 description 5
- 229940041514 candida albicans extract Drugs 0.000 description 5
- NKLPQNGYXWVELD-UHFFFAOYSA-M coomassie brilliant blue Chemical compound [Na+].C1=CC(OCC)=CC=C1NC1=CC=C(C(=C2C=CC(C=C2)=[N+](CC)CC=2C=C(C=CC=2)S([O-])(=O)=O)C=2C=CC(=CC=2)N(CC)CC=2C=C(C=CC=2)S([O-])(=O)=O)C=C1 NKLPQNGYXWVELD-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 5
- 239000000047 product Substances 0.000 description 5
- 108091008146 restriction endonucleases Proteins 0.000 description 5
- 239000012138 yeast extract Substances 0.000 description 5
- YBJHBAHKTGYVGT-ZKWXMUAHSA-N (+)-Biotin Chemical compound N1C(=O)N[C@@H]2[C@H](CCCCC(=O)O)SC[C@@H]21 YBJHBAHKTGYVGT-ZKWXMUAHSA-N 0.000 description 4
- FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M Sodium chloride Chemical compound [Na+].[Cl-] FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 4
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 description 4
- 238000003776 cleavage reaction Methods 0.000 description 4
- 238000010276 construction Methods 0.000 description 4
- 238000012258 culturing Methods 0.000 description 4
- 238000009510 drug design Methods 0.000 description 4
- 230000007017 scission Effects 0.000 description 4
- 239000013598 vector Substances 0.000 description 4
- PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N Glycerine Chemical compound OCC(O)CO PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 241001506991 Komagataella phaffii GS115 Species 0.000 description 3
- 101000702488 Rattus norvegicus High affinity cationic amino acid transporter 1 Proteins 0.000 description 3
- AVKUERGKIZMTKX-NJBDSQKTSA-N ampicillin Chemical compound C1([C@@H](N)C(=O)N[C@H]2[C@H]3SC([C@@H](N3C2=O)C(O)=O)(C)C)=CC=CC=C1 AVKUERGKIZMTKX-NJBDSQKTSA-N 0.000 description 3
- 229960000723 ampicillin Drugs 0.000 description 3
- 238000007796 conventional method Methods 0.000 description 3
- 238000001816 cooling Methods 0.000 description 3
- 239000013604 expression vector Substances 0.000 description 3
- 238000000855 fermentation Methods 0.000 description 3
- 230000004151 fermentation Effects 0.000 description 3
- BRZYSWJRSDMWLG-CAXSIQPQSA-N geneticin Natural products O1C[C@@](O)(C)[C@H](NC)[C@@H](O)[C@H]1O[C@@H]1[C@@H](O)[C@H](O[C@@H]2[C@@H]([C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](C(C)O)O2)N)[C@@H](N)C[C@H]1N BRZYSWJRSDMWLG-CAXSIQPQSA-N 0.000 description 3
- 238000005259 measurement Methods 0.000 description 3
- 239000002609 medium Substances 0.000 description 3
- 238000006467 substitution reaction Methods 0.000 description 3
- 230000009466 transformation Effects 0.000 description 3
- LGQKSQQRKHFMLI-SJYYZXOBSA-N (2s,3r,4s,5r)-2-[(3r,4r,5r,6r)-4,5,6-trihydroxyoxan-3-yl]oxyoxane-3,4,5-triol Chemical compound O[C@@H]1[C@@H](O)[C@H](O)CO[C@H]1O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)OC1 LGQKSQQRKHFMLI-SJYYZXOBSA-N 0.000 description 2
- LGQKSQQRKHFMLI-UHFFFAOYSA-N 4-O-beta-D-xylopyranosyl-beta-D-xylopyranose Natural products OC1C(O)C(O)COC1OC1C(O)C(O)C(O)OC1 LGQKSQQRKHFMLI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- FBPFZTCFMRRESA-FSIIMWSLSA-N D-Glucitol Natural products OC[C@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)CO FBPFZTCFMRRESA-FSIIMWSLSA-N 0.000 description 2
- SQNRKWHRVIAKLP-UHFFFAOYSA-N D-xylobiose Natural products O=CC(O)C(O)C(CO)OC1OCC(O)C(O)C1O SQNRKWHRVIAKLP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- SRBFZHDQGSBBOR-IOVATXLUSA-N D-xylopyranose Chemical compound O[C@@H]1COC(O)[C@H](O)[C@H]1O SRBFZHDQGSBBOR-IOVATXLUSA-N 0.000 description 2
- 238000010521 absorption reaction Methods 0.000 description 2
- 239000003513 alkali Substances 0.000 description 2
- 239000002585 base Substances 0.000 description 2
- 229960002685 biotin Drugs 0.000 description 2
- 235000020958 biotin Nutrition 0.000 description 2
- 239000011616 biotin Substances 0.000 description 2
- 238000009835 boiling Methods 0.000 description 2
- 102220352427 c.194T>A Human genes 0.000 description 2
- 238000004364 calculation method Methods 0.000 description 2
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 2
- 230000002255 enzymatic effect Effects 0.000 description 2
- 239000012634 fragment Substances 0.000 description 2
- 239000000499 gel Substances 0.000 description 2
- 239000001963 growth medium Substances 0.000 description 2
- 238000010438 heat treatment Methods 0.000 description 2
- 238000009630 liquid culture Methods 0.000 description 2
- 244000005700 microbiome Species 0.000 description 2
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 2
- 238000002703 mutagenesis Methods 0.000 description 2
- 231100000350 mutagenesis Toxicity 0.000 description 2
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 description 2
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 description 2
- 239000008057 potassium phosphate buffer Substances 0.000 description 2
- 238000000746 purification Methods 0.000 description 2
- 238000002708 random mutagenesis Methods 0.000 description 2
- 238000012163 sequencing technique Methods 0.000 description 2
- 239000011780 sodium chloride Substances 0.000 description 2
- 239000000600 sorbitol Substances 0.000 description 2
- 239000008399 tap water Substances 0.000 description 2
- 235000020679 tap water Nutrition 0.000 description 2
- FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 4-amino-1-[(2r)-6-amino-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-amino-3-phenylpropanoyl]amino]-3-phenylpropanoyl]amino]-4-methylpentanoyl]amino]hexanoyl]piperidine-4-carboxylic acid Chemical compound C([C@H](C(=O)N[C@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](CCCCN)C(=O)N1CCC(N)(CC1)C(O)=O)NC(=O)[C@H](N)CC=1C=CC=CC=1)C1=CC=CC=C1 FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 0.000 description 1
- 108010013043 Acetylesterase Proteins 0.000 description 1
- 229920001817 Agar Polymers 0.000 description 1
- 229920000936 Agarose Polymers 0.000 description 1
- 244000153158 Ammi visnaga Species 0.000 description 1
- 235000010585 Ammi visnaga Nutrition 0.000 description 1
- 241000193375 Bacillus alcalophilus Species 0.000 description 1
- 241000194110 Bacillus sp. (in: Bacteria) Species 0.000 description 1
- 108700010070 Codon Usage Proteins 0.000 description 1
- 102000012410 DNA Ligases Human genes 0.000 description 1
- 108010061982 DNA Ligases Proteins 0.000 description 1
- 241000282326 Felis catus Species 0.000 description 1
- WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N Glucose Natural products OC[C@H]1OC(O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N 0.000 description 1
- 101150072436 H1 gene Proteins 0.000 description 1
- 102000003960 Ligases Human genes 0.000 description 1
- 108090000364 Ligases Proteins 0.000 description 1
- AFCARXCZXQIEQB-UHFFFAOYSA-N N-[3-oxo-3-(2,4,6,7-tetrahydrotriazolo[4,5-c]pyridin-5-yl)propyl]-2-[[3-(trifluoromethoxy)phenyl]methylamino]pyrimidine-5-carboxamide Chemical compound O=C(CCNC(=O)C=1C=NC(=NC=1)NCC1=CC(=CC=C1)OC(F)(F)F)N1CC2=C(CC1)NN=N2 AFCARXCZXQIEQB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000009004 PCR Kit Methods 0.000 description 1
- 238000012408 PCR amplification Methods 0.000 description 1
- 241001236817 Paecilomyces <Clavicipitaceae> Species 0.000 description 1
- 240000004808 Saccharomyces cerevisiae Species 0.000 description 1
- 108091081024 Start codon Proteins 0.000 description 1
- 108020005038 Terminator Codon Proteins 0.000 description 1
- 241001052560 Thallis Species 0.000 description 1
- YVNQAIFQFWTPLQ-UHFFFAOYSA-O [4-[[4-(4-ethoxyanilino)phenyl]-[4-[ethyl-[(3-sulfophenyl)methyl]amino]-2-methylphenyl]methylidene]-3-methylcyclohexa-2,5-dien-1-ylidene]-ethyl-[(3-sulfophenyl)methyl]azanium Chemical compound C1=CC(OCC)=CC=C1NC1=CC=C(C(=C2C(=CC(C=C2)=[N+](CC)CC=2C=C(C=CC=2)S(O)(=O)=O)C)C=2C(=CC(=CC=2)N(CC)CC=2C=C(C=CC=2)S(O)(=O)=O)C)C=C1 YVNQAIFQFWTPLQ-UHFFFAOYSA-O 0.000 description 1
- 125000000218 acetic acid group Chemical group C(C)(=O)* 0.000 description 1
- 239000003929 acidic solution Substances 0.000 description 1
- 230000002378 acidificating effect Effects 0.000 description 1
- 230000003213 activating effect Effects 0.000 description 1
- 239000008272 agar Substances 0.000 description 1
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 1
- PYMYPHUHKUWMLA-UHFFFAOYSA-N arabinose Natural products OCC(O)C(O)C(O)C=O PYMYPHUHKUWMLA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 235000013405 beer Nutrition 0.000 description 1
- SRBFZHDQGSBBOR-UHFFFAOYSA-N beta-D-Pyranose-Lyxose Natural products OC1COC(O)C(O)C1O SRBFZHDQGSBBOR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000012496 blank sample Substances 0.000 description 1
- 238000004061 bleaching Methods 0.000 description 1
- 229910052799 carbon Inorganic materials 0.000 description 1
- 230000003197 catalytic effect Effects 0.000 description 1
- 239000013592 cell lysate Substances 0.000 description 1
- 238000010367 cloning Methods 0.000 description 1
- 238000004737 colorimetric analysis Methods 0.000 description 1
- HEBKCHPVOIAQTA-NGQZWQHPSA-N d-xylitol Chemical compound OC[C@H](O)C(O)[C@H](O)CO HEBKCHPVOIAQTA-NGQZWQHPSA-N 0.000 description 1
- 238000006731 degradation reaction Methods 0.000 description 1
- 239000002761 deinking Substances 0.000 description 1
- 238000013461 design Methods 0.000 description 1
- 238000001514 detection method Methods 0.000 description 1
- 230000029087 digestion Effects 0.000 description 1
- 238000010790 dilution Methods 0.000 description 1
- 239000012895 dilution Substances 0.000 description 1
- 238000001035 drying Methods 0.000 description 1
- 238000004520 electroporation Methods 0.000 description 1
- -1 endo-beta-1 Chemical class 0.000 description 1
- 230000007071 enzymatic hydrolysis Effects 0.000 description 1
- 238000006047 enzymatic hydrolysis reaction Methods 0.000 description 1
- 238000006911 enzymatic reaction Methods 0.000 description 1
- 108010038658 exo-1,4-beta-D-xylosidase Proteins 0.000 description 1
- 238000000605 extraction Methods 0.000 description 1
- 230000002349 favourable effect Effects 0.000 description 1
- 235000013305 food Nutrition 0.000 description 1
- 239000008103 glucose Substances 0.000 description 1
- 238000013537 high throughput screening Methods 0.000 description 1
- 230000007062 hydrolysis Effects 0.000 description 1
- 238000006460 hydrolysis reaction Methods 0.000 description 1
- 230000003301 hydrolyzing effect Effects 0.000 description 1
- 238000009776 industrial production Methods 0.000 description 1
- BPHPUYQFMNQIOC-NXRLNHOXSA-N isopropyl beta-D-thiogalactopyranoside Chemical compound CC(C)S[C@@H]1O[C@H](CO)[C@H](O)[C@H](O)[C@H]1O BPHPUYQFMNQIOC-NXRLNHOXSA-N 0.000 description 1
- 239000008274 jelly Substances 0.000 description 1
- 239000006166 lysate Substances 0.000 description 1
- 239000000463 material Substances 0.000 description 1
- 238000002156 mixing Methods 0.000 description 1
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 1
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 1
- 238000012900 molecular simulation Methods 0.000 description 1
- 150000002772 monosaccharides Chemical class 0.000 description 1
- 230000007935 neutral effect Effects 0.000 description 1
- 229920001542 oligosaccharide Polymers 0.000 description 1
- 150000002482 oligosaccharides Chemical class 0.000 description 1
- 230000010355 oscillation Effects 0.000 description 1
- 239000010893 paper waste Substances 0.000 description 1
- 150000007965 phenolic acids Chemical class 0.000 description 1
- 239000000049 pigment Substances 0.000 description 1
- 238000012257 pre-denaturation Methods 0.000 description 1
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 description 1
- 238000004321 preservation Methods 0.000 description 1
- 238000004537 pulping Methods 0.000 description 1
- 230000035484 reaction time Effects 0.000 description 1
- 238000005215 recombination Methods 0.000 description 1
- 230000006798 recombination Effects 0.000 description 1
- 238000011084 recovery Methods 0.000 description 1
- 238000011160 research Methods 0.000 description 1
- 239000000523 sample Substances 0.000 description 1
- 239000012898 sample dilution Substances 0.000 description 1
- 239000000758 substrate Substances 0.000 description 1
- 239000000725 suspension Substances 0.000 description 1
- 230000002195 synergetic effect Effects 0.000 description 1
- 238000010257 thawing Methods 0.000 description 1
- 230000001131 transforming effect Effects 0.000 description 1
- 238000012795 verification Methods 0.000 description 1
- 238000005406 washing Methods 0.000 description 1
Landscapes
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
Abstract
本发明涉及基因工程与蛋白质改造技术领域，具体涉及一种高比活碱性木聚糖酶突变体及其应用。本发明以野生型木聚糖酶H1为基础，提供了分别包含I37L、G40E、V65E、F93W、D104F、N167T、I174L、F181Q单点突变以及T34C/T189C、V65S/I174V两点突变的突变体。与野生型木聚糖酶H1相比，本发明提供的木聚糖酶突变体的比活力普遍提高了9.5%‑64.1%；其中，含V65S/I174V两点突变的碱性木聚糖酶突变体的比活力最高，达2039.33 U/mg，有利于降低该酶的生产成本，促进其在工业领域的广泛应用。
Description
技术领域
本发明涉及基因工程和蛋白质工程技术领域，具体涉及一种高比活碱性木聚糖酶突变体及其应用。
背景技术
木聚糖是自然界中广泛存在的一种五碳糖，木聚糖酶是一类能将木聚糖降解为木二糖、木二糖以上的寡聚木糖及少量木糖等的酶，是在木聚糖降解过程中起关键作用的酶。由于木聚糖的组成成分复杂，其水解需要多种酶协同作用，所以广义上的木聚糖酶是指能够将木聚糖水解成寡糖或单糖的一系列酶的总称，包括内切β-1，4-D-木聚糖酶、β-D-木糖苷酶、α-L-阿拉伯糖苷酶、α-D-葡糖苷酸酶、乙酰基木聚糖酶、酚酸酯酶等，狭义上的木聚糖酶指内切β-1,4-D-木聚糖酶。木聚糖酶来源非常广泛，可以由不同种类的微生物产生。根据木聚糖酶对酸碱环境的耐受度，可以将其分为碱性、中性和酸性。
碱性木聚糖酶在造纸工业、饲料行业及食品工业中都起着十分重要的作用，尤其在造纸的制浆、促进漂白及废纸脱墨等的工业生产中，碱性木聚糖酶能显著降低造纸过程中的污染排放，提高产品的质量。目前木聚糖酶的商业化生产已经较为成熟，已经分离了多种产木聚糖酶的微生物，克隆并鉴定了编码木聚糖酶的基因。
蛋白质工程的概念提出以来，对于酶分子的改造经历了定向进化筛选、半理性设计和理性设计三个阶段。定向进化筛选是在不了解有关酶的结构与功能之间的关系等信息的情况下，通过对酶基因的随机突变和基因片段的重组来创造突变库，然后通过高通量的筛选手段鉴定性能改善的突变体，挑出有益突变基因作为下一轮突变的模板，进行多轮突变和筛选，以进一步提高酶的性能。半理性设计是利用计算机软件确定酶分子不稳定区域，对不稳定区域进行单点饱和突变、迭代突变等非理性设计，从而使酶的性质有所提升。理性设计是利用计算机分析软件和模拟软件等辅助手段来确定酶基因序列的不稳定区域，再对不稳定区域进行同源模板替换从而完成改造。
例如，Lai等从嗜碱芽孢杆菌（Bacillus sp．）中分离出一种新的耐高温和耐碱的木聚糖酶 xyn30Y5 基因，设计了47种突变体，其中21个突变体活性有所提高，再通过组合诱变，使得最佳突变体催化效率( kcat/Km) 和RA601/2h值增加了一倍，同时最适pH由7.0 提高至8.0，这不仅提供了一种具有工业应用潜力的新型耐高温和耐碱的木聚糖酶，而且为提高木聚糖酶活性提供了有效的诱变策略。曹宇帆等以GH11家族木聚糖酶xyn11A-LC为基础，建立随机突变基因文库，从中筛选野生型嗜碱性明显提高的三种突变体，通过蛋白质分子模拟，对分析出的关键位点进行定点突变，最后得到了比野生型嗜碱性明显提高的三种突变体。石敢当等运用计算机分析软件，从已知耐热性能较好的木聚糖酶蛋白序列出发，构建调和序列，合成新型木聚糖酶，再通过计算机软件确定其活性部位，对三级结构进行预测，得出其理论等电点为 6.82，最适温度为81.72℃，均高于改造前的基因。
目前已有大量的研究改造木聚糖酶的酶学性质以适应不同的应用场景，但比活力性也是限制木聚糖酶应用的一个关键指标。木聚糖酶本身的比活力越高，其生产成本就越低，酶的价格也就越低，也将更有利于促进其被广泛的应用。
发明内容
本发明的目的是提供一种碱性木聚糖酶突变体。与野生型相比，所述突变体的比活力得到显著提高，有利于其在造纸等工业领域的广泛应用。
为了实现上述发明目的，本发明提供以下技术方案：
本发明涉及一种木聚糖酶突变体，其包含与SEQ ID NO:1具有至少95%同一性的氨基酸序列，且与SEQ ID NO:1相比在选自下组中的至少一个位置上包含氨基酸的取代：34，37，40，65，93，104，167，174，181，189。
在本发明的一些实施例中，所述突变体包含下组中至少一个氨基酸的取代：T34C、I37L、G40E、V65E/S、F93W、D104F、N167T、I174L/V、F181Q、T189C。
在本发明的一些实施例中，所述突变体包含下组中至少一个氨基酸的取代组合：T34C/T189C、V65S/I174V。
本发明还涉及编码上述木聚糖酶突变体的DNA分子。
本发明还涉及包含上述DNA分子的重组表达载体。
本发明还涉及一种宿主细胞，包含上述重组表达载体。
将上述的质粒转入宿主细胞中，重组表达的木聚糖酶突变体的比活力得到显著提升。
在本发明的一些实施例中，宿主细胞为毕赤酵母（Pichia pastoris）。
在本发明的一些实施例中，宿主细胞为里氏木霉（Trichoderma reesei）。
本发明还提供了上述木聚糖酶突变体在造纸领域中的应用。
本发明以野生型木聚糖酶H1为基础，提供了分别包含I37L、G40E、V65E、F93W、D104F、N167T、I174L、F181Q单点突变以及包含T34C/T189C、V65S/I174V两点突变的突变体。与野生型木聚糖酶H1相比，本发明提供的木聚糖酶突变体的比活力普遍提高了9.5%-64.1%；其中，含V65S/I174V两点突变的碱性木聚糖酶突变体的比活力最高，达2039.33 U/mg，取得了意料不到的技术效果。
综上，本发明提供的木聚糖酶突变体的比活力得到显著提高，从而有利于降低木聚糖酶的生产成本，促进其在工业领域中的广泛应用。
具体实施方式
本发明用到了遗传工程和分子生物学领域使用的常规技术和方法，例如MOLECΜLAR CLONING：A LABORATORY MANUAL，3nd Ed. (Sambrook, 2001)和CURRENT PROTOCOLSIN MOLECΜLAR BIOLOGY (Ausubel, 2003)中所记载的方法。这些一般性参考文献提供了本领域技术人员已知的定义和方法。但是，本领域的技术人员可以在本发明所记载的技术方案的基础上，采用本领域其它常规的方法、实验方案和试剂，而不限于本发明具体实施例的限定。例如，本发明可选用如下实验材料和试剂：
菌株与载体：大肠杆菌DH5α、毕赤酵母GS115、载体pPIC9k、Amp、G418购自Invitrogen公司。
酶与试剂盒：PCR酶及连接酶购买自Takara公司，限制性内切酶购自Fermentas公司，质粒提取试剂盒及胶纯化回收试剂盒购自Omega公司，GeneMorph II随机诱变试剂盒购自北京博迈斯生物科技有限公司。
下面结合实施例，进一步阐述本发明：
实施例1 重组质粒的构建
将来源于拟青霉（Paecilomyces. sp）的木聚糖酶基因（GeneBank ACS26244. 1）根据毕赤酵母密码子偏好性进行优化，并在其起始密码子ATG前增加6个碱基GAATTC（EcoRI酶切位点），在其终止密码子TAA后增加GCGGCCGC（Not I酶切位点）。优化后的核苷酸序列由上海捷瑞生物工程有限公司合成。将该木聚糖酶命名H1，其氨基酸序列为SEQ ID NO：1，编码核苷酸序列为SEQ ID NO：2。
用限制性内切酶EcoR I和Not I（Fermentas）对木聚糖酶基因进行酶切；同时，用限制性内切酶EcoR I和Not I对质粒pPIC9K进行酶切。使用凝胶纯化试剂盒将酶切产物纯化，并用T4 DNA连接酶（Fermentas）将上述两个酶切产物连接。将连接产物转化进DH5α大肠杆菌（Invitrogen），用氨苄青霉素进行选择。为确保准确，对若干克隆进行测序（Invitrogen）。
使用质粒小量制备试剂盒（Omega）从测序结果正确的大肠杆菌克隆中纯化质粒，获得1个重组质粒，将其命名为pPIC9K-H1。
实施例2 高比活木聚糖酶突变体的筛选
为了进一步提高木聚糖酶H1的酶活性，申请人对其进行蛋白结构分析。该蛋白是GH11家族木聚糖酶，其结构为β-果冻卷的结构。申请人通过定向进化技术对该酶进行了大量突变的筛选。
1.1设计PCR引物H1-F1、H1-R1：
H1-F1：GGCGAATTCATGATGATTGGTATCACTTCTTTTGC（下划线为限制性内切酶EcoRI识别位点）；
H1-R1：ATAGCGGCCGC TTAACCGACGTCTGCAACGGTAATTC（下划线为限制性内切酶NotI识别位点）。
以H1基因（SEQ ID NO：2）为模板，利用上述引物用GeneMorph II随机突变PCR试剂盒（（博迈斯））进行PCR扩增，胶回收PCR产物，EcoRI、NotI进行酶切处理后与经同样酶切后的pET21a载体连接，转化至大肠杆菌BL21（DE3）中，涂布于LB+Amp平板（0.5%酵母提取物，1%蛋白胨，1%NaCl，1.5%琼脂，100μg/mL氨苄青霉素，pH7.0），37℃倒置培养，待转化子出现后，用牙签逐个挑至96孔板，每个孔中加入150μl含有0.1mM IPTG的LB+Amp培养基（0.5%酵母提取物，1%蛋白胨，1%NaCl，100μg/mL氨苄青霉素，pH7.0），37℃、220rpm培养6 h左右，离心弃上清，菌体用缓冲液重悬，反复冻融破壁，获得含有木聚糖酶的大肠杆菌细胞裂解液。
分别取出30 μl裂解液至两块新的96孔板；将其中一块96孔板加入30 μl底物，于37℃反应30 min后，DNS法测定生成的还原糖，另一块板加入150μl考马斯亮蓝溶液，静置10min，考马斯亮蓝（Bradford）结合法测定蛋白质含量，分别计算不同突变子酶活水平及蛋白含量。最终，申请人从两万多个转化子中筛选出显著提高木聚糖酶比活力的突变位点：T34C、I37L、G40E、V65E/S、F93W、D104F、N167T、I174L/V、F181Q、T189C。
在上述野生型木聚糖酶H1的基础上，本发明提供了分别包含I37L、G40E、V65E、F93W、D104F、N167T、I174L、F181Q单点突变以及包含T34C/T189C、V65S/I174V两点突变的突变体。
实施例3 木聚糖酶在毕赤酵母中的表达
3.1表达载体的构建
依照毕赤酵母的密码偏爱性分别对木聚糖酶H1及其突变体的基因序列进行优化，由上海捷瑞生物工程有限公司合成，并且在合成序列5’和3’两端分别加上EcoRI和NotI两个酶切位点。
按照实施例1中所述方法，将合成的木聚糖酶H1及其突变体的基因序列分别进行EcoRI和NotI双酶切，然后与经同样酶切后的pPIC-9K载体16℃过夜连接，并转化大肠杆菌DH5a，涂布于LB+Amp平板，37℃倒置培养，待转化子出现后，菌落PCR（反应体系：模板挑取的单克隆，rTaqDNA聚合酶 0.5μl，10×Buffer 2.0μL，dNTPs(2.5mM) 2.0μL，5’AOX引物（10mM）：0.5μL，3’AOX引物：0.5μL，ddH2O 14.5μL，反应程序：95℃预变性5min，30个循环：94℃ 30sec，55℃ 30sec，72℃ 2min，72℃ 10min）。验证阳性克隆子，经测序验证后获得了正确的重组表达质粒。
3.2毕赤酵母工程菌株的构建
3.2.1酵母感受态制备
将毕赤酵母GS115菌株进行YPD平板活化，30℃培养48 h后接种活化的GS115单克隆于6 mL YPD液体培养基（1%酵母提取物，2%蛋白胨，2%葡萄糖）中，30℃、220 rpm，培养约12 h后转接菌液于装有30mL YPD液体培养基的三角瓶中，30℃、220 rpm培养约5h，经紫外分光光度计检测其菌体密度，待其OD600值在1.D1–1.3范围后，4℃ 9000 rpm离心2 min分别收集4mL菌体至灭菌EP管中，轻轻弃上清，用灭菌的滤纸吸干残留的上清后用预冷的1 mL灭菌水重悬菌体，4℃、9000 rpm离心2 min，轻轻弃上清，重复用1mL灭菌水洗一遍后，4℃、9000 rpm离心2 min，轻轻弃上清，预冷的1mL山梨醇(1 mol/L)重悬菌体；4℃、9000 rpm离心2 min，轻轻弃上清，预冷的100-150μl山梨醇(1 mol/L)轻柔重悬菌体。
3.2.2转化和筛选
分别将3.1构建得到的重组表达质粒用Sac I进行线性化，线性化片段纯化回收后通过电穿孔法分别转化毕赤酵母GS115，在MD平板（2%蛋白胨，2%琼脂糖）上筛选得到毕赤酵母重组菌株，然后在含不同浓度遗传霉素的YPD平板（0.5mg/mL-8mg/mL）上筛选多拷贝的转化子。
将获得的转化子分别转接于BMGY培养基（2%蛋白胨，1%酵母提取物，100 mM磷酸钾缓冲液(pH6.0)，1.34% YNB，4×10-5 %生物素，1%甘油）中，30℃、250rpm振荡培养1d；再转入BMMY培养基（2%蛋白胨，1%酵母提取物，100 mM磷酸钾缓冲液(pH6.0)，1.34% YNB，4×10-5 %生物素，0.5%甲醇）中，30℃、250rpm振荡培养；每天添加0.5%的甲醇，诱导表达4 d；9000rpm离心10min去除菌体，即得到分别含木聚糖酶H1和木聚糖酶突变体的发酵上清液。
、木聚糖酶酶活测定方法
（1）木聚糖酶酶活单位的定义
在温度为50℃、pH为8.0的条件下，每分钟从浓度为5mg/ml的木聚糖溶液中降解释放1μmol还原糖所需要的酶量即为一个酶活性单位，以U表示。
（2）木聚糖酶酶活测定方法
吸取10.0 ml木聚糖溶液，50℃平衡20 min。
吸取10.0 ml经过适当稀释的酶液，50℃平衡5 min。
空白样品测定：吸取2.00 ml经过适当稀释的酶液（已经过50℃平衡），加入到刻度试管中，再加入5ml DNS试剂，电磁振荡3 s。然后加入2.0 ml木聚糖溶液，50℃平衡30 min，沸水浴加热5 min。用自来水冷却至室温，加水定容至25 ml，电磁振荡3 s～5s。以标准空白样为空白对照，在540 nm处测定吸光度AB。
样品测定：吸取2.00 ml经过适当稀释的酶液（已经过50℃平衡），加入到刻度试管中，再加入2.0 ml木聚糖溶液（已经过50℃平衡），电磁振荡3 s，50℃精确保温30 min。加入5.0 ml DNS试剂，电磁振荡3 s，以终止酶解反应。沸水浴加热5 min，用自来水冷却至室温，加水定容至25 ml，电磁振荡3 s。以标准空白样为空白对照，在540 nm处测定吸光度AE。
XD= 。
式中：
XD—试样稀释液中木聚糖酶的活力，U/ml；
AE—酶反应液的吸光度；
AB—酶空白样的吸光度；
K—标准曲线的斜率；
CO—标准曲线的截距；
M—木糖的摩尔质量M（C5XYN110O5）= 150.2 g/mol；
t—酶解反应时间，min；
N—酶液稀释倍数；
1000—转化因子，1 mmol = 1000 μmol。
（3）测定结果
按照上述方法进行酶活检测，结果显示：上述构建得到的重组表达木聚糖酶H1及其突变体的毕赤酵母重组菌株发酵上清液的酶活为475-830 U/mL。
、蛋白含量测定方法
考马斯亮蓝（Bradford）结合法测定蛋白质含量是比色法与色素法结合的复合方法。考马斯亮兰G-250在酸性溶液时呈棕红色，当与蛋白质结合后变为蓝色，且在蛋白质一定浓度范围内符合比尔定律，可在595nm处比色测定。在3～5分钟即成大量吸收，至少稳定1小时。在10～1000μg/mL范围内，吸光值与蛋白质浓度成正比。
按照酶液和考马斯亮蓝溶液体积比1：5的比例进行混合，静置10mim，考马斯亮蓝（Bradford）结合法测定蛋白质含量
按照上述方法进行蛋白含量的检测。结果显示：上述构建得到的重组表达木聚糖酶H1及其突变体的毕赤酵母重组菌株发酵上清液的蛋白含量为0.38-0.42mg/mL。
、比活力计算
“比活力 (Specific Activity)”是指：单位重量的蛋白质中所具有酶的活力单位数，一般用U/mg蛋白质来表示。
比活力计算公式：比活力（U/mg）=酶活（U/mL）/ 蛋白含量（mg/mL）。
具体结果见表1。
表1 碱性木聚糖酶突变体比活力比较
| 木聚糖酶及其突变体 | 比活力（U/mg） |
| 野生型H1 | 1243.01 |
| I37L | 1378.92 |
| G40E | 1361.35 |
| V65E | 1635.19 |
| F93W | 1524.23 |
| D104F | 1387.15 |
| N167T | 1340.18 |
| I174L | 1379.92 |
| F181Q | 1737.11 |
| T34C/T189C | 1914.79 |
| V65S/I174V | 2039.33 |
从表1的结果可以看出，与野生型木聚糖酶H1相比，本发明提供的碱性木聚糖酶突变体的比活力普遍提高了9.5%-64.1%；其中，含V65S/I174V两点突变的碱性木聚糖酶突变体的比活力最高，达2039.33 U/mg，取得了意料不到的技术效果。
综上，本发明提供的碱性木聚糖酶突变体的比活力得到显著提高，从而有利于降低该酶的生产成本，促进其在工业领域，尤其是造纸领域中的广泛应用。
Claims (6)
1.一种木聚糖酶突变体，其特征在于，所述突变体是氨基酸序列为SEQ ID NO:1的木聚糖酶的第181位氨基酸由Phe变为Gln。
2.编码权利要求1所述木聚糖酶突变体的DNA分子。
3.包含权利要求2所述DNA分子的重组表达质粒。
4.一种宿主细胞，其特征在于，所述的宿主细胞包含权利要求3所述的重组表达质粒；所述的宿主细胞非植物细胞或动物细胞。
5.如权利要求4所述的宿主细胞，其特征在于，所述的宿主细胞为毕赤酵母（Pichia pastoris）或里氏木霉（Trichoderma reesei）。
6.权利要求1所述木聚糖酶突变体在造纸领域中的应用。
Priority Applications (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| CN202211016968.4A CN115851668B (zh) | 2022-08-24 | 2022-08-24 | 高比活碱性木聚糖酶突变体 |
Applications Claiming Priority (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| CN202211016968.4A CN115851668B (zh) | 2022-08-24 | 2022-08-24 | 高比活碱性木聚糖酶突变体 |
Publications (2)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| CN115851668A CN115851668A (zh) | 2023-03-28 |
| CN115851668B true CN115851668B (zh) | 2024-04-02 |
Family
ID=85660603
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| CN202211016968.4A Active CN115851668B (zh) | 2022-08-24 | 2022-08-24 | 高比活碱性木聚糖酶突变体 |
Country Status (1)
| Country | Link |
|---|---|
| CN (1) | CN115851668B (zh) |
Citations (4)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| CN101415823A (zh) * | 2003-09-15 | 2009-04-22 | 金克克国际有限公司 | 修饰酶、生产修饰酶的方法及其用途 |
| CN105039289A (zh) * | 2015-09-11 | 2015-11-11 | 青岛蔚蓝生物集团有限公司 | 木聚糖酶突变体及其应用 |
| CN115704019A (zh) * | 2021-08-06 | 2023-02-17 | 青岛蔚蓝生物集团有限公司 | 高比活碱性木聚糖酶突变体 |
| CN115704018A (zh) * | 2021-08-06 | 2023-02-17 | 青岛蔚蓝生物集团有限公司 | 一种碱性木聚糖酶突变体及其应用 |
-
2022
- 2022-08-24 CN CN202211016968.4A patent/CN115851668B/zh active Active
Patent Citations (4)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| CN101415823A (zh) * | 2003-09-15 | 2009-04-22 | 金克克国际有限公司 | 修饰酶、生产修饰酶的方法及其用途 |
| CN105039289A (zh) * | 2015-09-11 | 2015-11-11 | 青岛蔚蓝生物集团有限公司 | 木聚糖酶突变体及其应用 |
| CN115704019A (zh) * | 2021-08-06 | 2023-02-17 | 青岛蔚蓝生物集团有限公司 | 高比活碱性木聚糖酶突变体 |
| CN115704018A (zh) * | 2021-08-06 | 2023-02-17 | 青岛蔚蓝生物集团有限公司 | 一种碱性木聚糖酶突变体及其应用 |
Non-Patent Citations (1)
| Title |
|---|
| Zhang,M.等.beta-1,4-xylanase [Paecilomyces sp. 'thermophila'].《Genbank Database》.2009,ACS26244.1. * |
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| CN115851668A (zh) | 2023-03-28 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| CN112094834B (zh) | 比活力提高的木聚糖酶突变体 | |
| CN115029334B (zh) | 一种高比活碱性木聚糖酶突变体 | |
| CN110607292A (zh) | 一种高比活木聚糖酶突变体 | |
| CN112877310B (zh) | 一种耐热性β-甘露聚糖酶突变体ManAK-7及其编码基因和应用 | |
| CN113684198B (zh) | 一种提高纤维素酶催化效率的方法及突变体5i77-m2 | |
| CN115704019A (zh) | 高比活碱性木聚糖酶突变体 | |
| CN115029335B (zh) | 一种耐高温木聚糖酶突变体及其应用 | |
| CN115851668B (zh) | 高比活碱性木聚糖酶突变体 | |
| CN116265580A (zh) | 高比活碱性木聚糖酶突变体 | |
| CN111117987B (zh) | 一种高比活酸性甘露聚糖酶突变体 | |
| CN117887695A (zh) | 一种耐高温木聚糖酶突变体 | |
| CN117778355A (zh) | 高比活碱性木聚糖酶突变体 | |
| CN116218818A (zh) | 一种高比活碱性木聚糖酶突变体及其应用 | |
| CN115960868A (zh) | 高比活碱性木聚糖酶突变体及其应用 | |
| CN114517191B (zh) | 热稳定性提升的酸性葡聚糖酶突变体及其应用 | |
| CN117757776A (zh) | 一种碱性木聚糖酶突变体及其应用 | |
| WO2024093141A1 (zh) | 高比活木聚糖酶突变体 | |
| CN106834254B (zh) | 一种酸性高比活木聚糖酶xyn11a及其基因和应用 |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| PB01 | Publication | ||
| PB01 | Publication | ||
| SE01 | Entry into force of request for substantive examination | ||
| SE01 | Entry into force of request for substantive examination | ||
| GR01 | Patent grant | ||
| GR01 | Patent grant |