CN115807099B - 与鸭生长性状相关的InDel分子标记及其应用、引物对、试剂盒 - Google Patents
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Abstract
本发明涉及一种与鸭生长性状相关的InDel分子标记及其应用、引物对、试剂盒，属于分子标记的技术领域。本发明的与鸭生长性状相关的InDel分子标记，位于鸭第28号染色体上，插入或缺失片段的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，或者插入或缺失片段的核苷酸序列为如SEQ ID NO.1所示核苷酸序列中任选的连续子序列。本发明的InDel分子标记，位于IGF2BP1基因的promoter区，不受鸭的性别、生活习性和环境等因素的影响，通过鉴定该分子标记在鸭基因组中存在的类型，可以在早期通过分子筛选来判断鸭的屠体性状，对鸭个体进行早期选择留种，在降低饲养成本的同时，改良生长性状，加速肉鸭的选育进程。
Description
技术领域
本发明涉及一种与鸭生长性状相关的InDel分子标记及其应用、引物对、试剂盒，属于分子标记的技术领域。
背景技术
我国是世界上水禽遗传资源非常丰富的国家之一，水禽遗传资源不仅数量众多，而且种质特性各异。基于地方品种的不同特点，培育出了部分专用型品种。但总体来说，水禽种业发展仍面临不少的问题，主要为缺乏由国际竞争力的标志性品种，肉鸭因生长速度慢、饲料转录率低等问题，其种源主要从国外引进。我国现今已经成为世界肉鸭生产和消费的第一大国，因此，培育具有我国自主知识产权的快大型肉鸭具有重要意义。生长性状一直是肉用畜禽遗传改良的关键经济性状之一。传统育种中通常根据个体测定、同胞测定或者后裔测定的表型性状留种，但传统育种方法无法进行早期选种，增大了世代间隔，降低了选择反应。因此，开发新的效应大的分子标记，借助分子标记辅助选择加快育种进程是肉鸭种质资源改良的可行方案。
发明内容
本发明的目的是提供一种与鸭生长性状相关的InDel分子标记，能够加快肉鸭的育种进程。
本发明还提供了上述鸭生长性状相关的InDel分子标记的应用以及、用于检测上述鸭生长性状相关的InDel分子标记的引物对以及用于检测上述与鸭生长性状相关的InDel分子标记基因型的试剂盒。
为了实现以上目的，本发明的与鸭生长性状相关的InDel分子标记所采用的技术方案是：
一种与鸭生长性状相关的InDel分子标记，位于鸭第28号染色体上，插入或缺失片段的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，或者插入或缺失片段的核苷酸序列为如SEQ ID NO.1所示核苷酸序列中任选的连续子序列。
本发明的与鸭生长性状相关的InDel分子标记位于IGF2BP1基因的promoter区，不受鸭的性别、生活习性和环境等因素的影响，通过鉴定该分子标记在鸭基因组中存在的类型，可以在早期通过分子筛选来判断鸭的屠体性状，对鸭个体进行早期选择留种，在降低饲养成本的同时，改良生长性状，加速肉鸭的选育进程。
所述IGF2BP1基因全称胰岛素样生长因子2结合蛋白，具有调节细胞增殖、分化、形态发生及代谢的作用，其作用机制通常为调控靶基因mRNA的定位、稳定性及翻译。
本发明的与鸭生长性状相关的InDel分子标记的所在染色体编号信息基于GCF_015476345.1_ZJU1.0_genomic.fna版本的鸭基因组数据。需要说明是在GCF_015476345.1_ZJU1.0_genomic.fna版本的鸭基因组数据中，鸭基因组chr28:113032-113510位置的长度为478bp的核苷酸序列为基因组拼接错误。该chr28:113032-113510位置存在如SEQ IDNO.1所示片段的插入或缺失。本发明的如SEQ ID NO.1所示片段的位置信息如图1所示。
可以理解的是，本发明中所述连续子序列的长度小于如SEQ ID NO.1所示片段。所述连续子序列的核苷酸序列不同于鸭第28号染色体中除如SEQ ID NO.1所示片段外的其他任意片段的核苷酸序列。进一步地，所述连续子序列的长度不小于30bp。
本发明的与鸭生长性状相关的InDel分子标记的应用所采用的技术方案为：
一种上述的与鸭生长性状相关的InDel分子标记在鉴定鸭屠体性状中的应用。
所述鸭屠体性状为宰前活重、屠体重、半净膛重、全净膛种、腿肌重、胸肌重、皮脂重、皮脂厚中的一种或任意组合。
所述生长性状包括体重，例如初生重、1周体重、2周体重、3周体重、4周体重、5周体重、6周体重、7周体重或8周体重。
一种上述的与鸭生长性状相关的InDel分子标记在鸭育种中的应用。
本发明的与鸭生长性状相关的InDel分子标记的应用，在降低肉鸭的饲养成本的同时，改良生长性状，加速肉鸭的选育进程。
优选的，上述与鸭生长性状相关的InDel分子标记在鸭育种中的应用，判断如SEQID NO.1所示片段或如SEQ ID NO.1所示核苷酸序列中任选的连续子序列片段插入或缺失，选择如SEQ ID NO.1所示片段或如SEQ ID NO.1所示核苷酸序列中任选的连续子序列片段插入的纯合型鸭个体留种。进一步优选的，上述与鸭生长性状相关的InDel分子标记在鸭育种中的应用，包括以下步骤：提取鸭的基因组DNA，利用上述的InDel分子标记的正、反向引物对提取的基因组DNA进行PCR扩增，获得PCR产物，检测PCR产物，根据检测结果判断如SEQID NO.1所示片段或如SEQ ID NO.1所示核苷酸序列中任选的连续子序列片段插入或缺失，选择如SEQ ID NO.1所示片段或如SEQ ID NO.1所示核苷酸序列中任选的连续子序列片段插入的纯合型鸭个体留种。
优选的，PCR扩增的条件为：95℃预变性5min；95℃变性15s，62℃退火30s，72℃延伸10s，共35个循环；72℃延伸5min。
优选的，提取鸭的基因组DNA的方法包括以下步骤：对待测鸭个体翅静脉采血，血液放入抗凝管，利用酚仿抽提法提取DNA。
本发明的用于检测与鸭生长性状相关的InDel分子标记的引物对所采用的技术方案为：
一种用于检测上述的与鸭生长性状相关的InDel分子标记的引物对。
所述引物对包括正向引物和反向引物，优选的，正向引物的核苷酸序列如SEQ IDNO.2所示，反向引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示。
本发明的与鸭生长性状相关的InDel分子标记的引物对，可以缩短育种周期，提高检测效率。
本发明的用于检测与鸭生长性状相关的InDel分子标记基因型的试剂盒所采用的技术方案为：
用于检测与鸭生长性状相关的InDel分子标记基因型的试剂盒包括上述的引物对。
在鸭基因组chr28存在长度为7105bp的如SEQ ID NO.1所示片段或如SEQ ID NO.1所示核苷酸序列中任选的连续子序列片段插入的为插入型(I型)，野生型(W型)在该染色体不存在插入。采用本发明的试剂盒，可以更好地鉴定出InDel分子标记基因型为II型的如SEQ ID NO.1所示片段或如SEQ ID NO.1所示核苷酸序列中任选的连续子序列片段插入的纯合型鸭个体。
为了更好地鉴定鸭的InDel分子标记基因型，优选的，用于检测上述的与鸭生长性状相关的InDel分子标记基因型的试剂盒，还包括核苷酸序列如SEQ ID NO.4所示的反向引物。
优选的，所述试剂盒还包括dNTPs、PCR反应缓冲液、DNA聚合酶中的一种或几种。
附图说明
图1为本发明的如SEQ ID NO.1所示片段在28号染色体上的位置信息示意图；
图2为具体实施方式中IGF2BP1启动子区三种基因型电泳图；
图3为具体实施方式中鸭IGF2BP1启动子区插入型的分布频率比较图；
图4为具体实施方式中得到的IGF2BP1启动子区利用等位基因特异性PCR检测结果图；
图5为具体实施方式中PCR测序揭示等位基因分布频率示意图。
具体实施方式
以下结合具体实施方式对本发明的技术方案作进一步的说明。
本发明的发明人利用全基因组重测数据，通过比较分析基因组深度和覆盖度的方法鉴定基因组调控区结构变异，发现IGF2BP1基因的promoter区存在插入变异(插入型和野生型)(如图2所示)，发现插入型和野生型在地方鸭和商品鸭品种中存在显著的频率差异(如图3所示)。
具体地，对不同鸭品种IGF2BP1基因promoter区进行检测，通过在插入位点两侧设计引物进行PCR测序以对该结构变异进行了基因分型，共发现2个等位基因，插入型(I型)：在chr28存在插入，插入长度为7105bp，野生型(W型)在该位置不存在插入(见图2)。图2中，YTG为插入型、wg为杂合子、wt为野生型。
发明人利用PCR技术鉴定两种等位基因，根据引物设计的物理位置和扩增组合，用487F和1347R引物组合鉴定I等位基因；用487F和1649R引物组合鉴定W等位基因；引物序列如表1。
表1IGF2BP1启动子两种等位基因特异性引物
| 引物ID | 引物序列(5'--3') |
| 487F | CATCTGGAATGCTCTACCAAGGG |
| 1347R | CAATAACTTAGGCTCAGGCGAGG |
| 1649R | CTGTGCTCTGTCCTACAGCGAGT |
采用以下PCR反应体系对各个体的基因组进行PCR扩增：
①2×Rapid Taq PCR Master Mix 10μl,487F 0.5μl,1347R 0.5μl,待测鸭DNA模板1μl,ddH2O 8μl；
②2×Rapid Taq PCR Master Mix 10μl,487F 0.5μl,1649R 0.5μl,待测鸭DNA模板1μl,ddH2O 8μl。
PCR扩增条件：95℃预变性5min；95℃变性15s，62℃退火30s，72℃延伸10s，共35个循环；72℃延伸5min；4℃保存。
琼脂糖凝胶电泳结果检测：取同一个样品两个PCR反应产物各5μL，进行1.5％(质量比)琼脂糖凝胶电泳。PCR检测结果见图4，图4中M为DM2000 marker，从下至上maker条带大小分别为：100bp、250bp、500bp、750bp、1000bp、2000bp、3000bp、5000bp。由图4可以看出W等位基因条带大小为707bp，I等位基因条带大小为882bp。WW基因型显示一条带为707bp；IW基因型显示707bp和882bp两条带；II基因型显示882bp一条带。
采用上述方法对不同鸭品种IGF2BP1基因promoter区进行检测，发现野生型等位基因W主要存在于家鸭野生祖先绿头鸭及地方家鸭(荆江麻鸭、绍兴鸭、攸县麻鸭、山麻鸭和连城白鸭)，而I等位基因主要存在于肉用商业品种(樱桃谷鸭、奥白星鸭和北京鸭)，分布频率如图5。
实施例1
本实施例的与鸭生长性状相关的InDel分子标记位于鸭第28号染色体上，插入或缺失片段的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示。
实施例2
本实施例的检测实施例1中与鸭生长性状相关的InDel分子标记的引物对，包括正向引物和反向引物，序列如下：
SEQ ID NO.2：487F：5’-CATCTGGAATGCTCTACCAAGGG-3’，
SEQ ID NO.3：1347R：5’-CAATAACTTAGGCTCAGGCGAGG-3’。
实施例3
本实施例的检测实施例1的与鸭生长性状相关的InDel分子标记基因型的试剂盒，包括核苷酸序列如SEQ ID NO.2(487F:5’-CATCTGGAATGCTCTACCAAGGG-3’)所示的正向引物、核苷酸序列如SEQ ID NO.3(1347R:5’-CAATAACTTAGGCTCAGGCGAGG-3’)所示反向引物和核苷酸序列如SEQ ID NO.4(1649R:5’-CTGTGCTCTGTCCTACAGCGAGT-3’)所示的反向引物，还包括dNTPs、PCR反应缓冲液和DNA聚合酶。
实施例4
本实施例的鸭生长性状相关的InDel分子标记在鸭育种中的应用，包括以下步骤：
1)对某待测鸭F2代资源群的383个个体(其中公鸭210只，母鸭173只)进行翅静脉采血，血液放入抗凝管，利用酚仿抽提法提取DNA，并稀释到60ng/μL；
2)利用表1中的引物487F(SEQ ID NO.2)、引物1347R(SEQ ID NO.3)和引物1649R(SEQ ID NO.4)采用以下PCR反应体系对提取的基因组DNA进行PCR扩增，得到PCR产物；
PCR反应体系为：
①2×Rapid Taq PCR Master Mix 10μl,487F 0.5μl,1347R 0.5μl,待测鸭DNA模板1μl,ddH2O 8μl；
②2×Rapid Taq PCR Master Mix 10μl,487F 0.5μl,1649R 0.5μl,待测鸭DNA模板1μl,ddH2O 8μl。
PCR反应条件为：95℃预变性5min；95℃变性15s，62℃退火30s，72℃延伸10s，共35个循环；72℃延伸5min；4℃保存。
3)利用1.5％(质量比)琼脂糖凝胶电泳检测PCR产物，筛选出PCR产物中仅含有一条882bp的条带的鸭个体(即II基因型个体)留种。
采用实施例3的方法最终确定对待测鸭F2代资源群的80个个体(其中公鸭41只，母鸭39只)留种。
步骤3)中对II基因型个体筛选留种的同时，对其他个体的分子标记基因型(IW基因型、WW基因型)进行鉴定。为了对效果验证，对上述实施例3中某待测鸭F2代资源群的383个个体公母混养，并于出生后记录各个体的初生重、1周体重、2周体重、3周体重、4周体重、5周体重、6周体重、7周体重、8周体重，并在8周屠宰后记录各个体的屠前活体重、屠体重、全净膛重、半净膛重、胸肌重、腿肌重、皮脂重、皮脂厚等屠体性能指标，然后基于单点变异一般线性模型、将InDel基因型作为固定效应，进行关联分析。当基因型与性状显著关联时，分析结果中P值小于0.05，结果见表2。
表2性能指标统计表
注：表中P是基因型与对应性状相关关系的显著性水平，P<0.05表示基因型与对应性状显著显著，P<0.01表示基因型与对应性状极显著相关。
由表2中数据可知，等位基因I与鸭高生长性状(8周体重、宰前活重、屠体重、半净膛重、全净膛种、腿肌重、胸肌重、皮脂重、皮脂厚、7周体重、6周体重、5周体重、4周体重、3周体重、2周体重、1周体重和初生重等17个性状)呈显著正相关，等位基因W与鸭低生长性状呈显著正相关。
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ctggtaaact cataggtgtg cggtaacgct ggcacgggga agtgcttggc ggtacacccc 1080
catttttcag tacgttggtg tgtggtacac tgcagaaggg aaatttctgt agcacatact 1140
ggcgagggtt aggaaaaatg ggaaaatatg agttccaggg gacagggaga tatccctggg 1200
ggagtgccta ctaatagttc ttcctgaaga atgataagaa attggaaaca taatcccaaa 1260
attagaggga ttgtaaaaga aaaataattt taaaaaaagg ttaaatattg tgtatcagtc 1320
tggacaaaag aaccaattaa ggaaacagca gtattttggc caaaatacgg gtctgatgaa 1380
aattcaggct ttaaatttat gtgtaaacaa gaagattcct ttttttagag aaggagccaa 1440
gtcatgctcc ctataatctt aatattgaac tggtgacagc agcagtcact ccaggaaggg 1500
agacaggggc tgtaattaac actgtcccta aagaaggatc gtactctagg ttctggcaag 1560
aattagaaca aggtagaaga gatattgaga attttgcctt ccctgatact aacagtacta 1620
acaataactg tgtatcctct taggtgaact accccccccc tccttaccag cagagaggtt 1680
aagactttta gaaggagagg aagtctttat tcaaggaccc caacagccta gttgaacaat 1740
tagaccagtt cctacgacct gatttatact cttgggggag ggaattatgt ctgtaagtat 1800
gttgtttaca gggaaagaaa cgggaatgat caggaggaga gctgctatac aagaatggga 1860
aagagctcat cctccaggac caggggtaat accggcaggg cagaaatacc cacttgccaa 1920
tcctggctgg aataataata gtgtgcaaca cagaaatcat atgagagact tggggtcaga 1980
atgagaaagt acttggggat gagacctgag gacccagtat cccaagggct cttgaaagtt 2040
cattgtgtga ttaaagcctg gcaaaatacg cagaaaatgc ttcagaaggt ggggggatgt 2100
agtgaacagt cactggggga ccctcctgtg ggaggccctg gaggtgtgtg tccagagggg 2160
agataagaag gaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaagt gaaactaatg gtattgacag 2220
tgcagcgggt agtgaagcag agggttggag aaagaggaaa aaatcttcag ggggagtcag 2280
ggccaggatg gaaaggagag gaagagagat gaaggaatgg caggcaaaga aggctgcctg 2340
cgttgtggcc tgagtcctag cagagacagg ctttgataag atgttttaag tgtggccagg 2400
ctggccactt cgaataggaa tatctggagt ggaagaagga ggaaagaagg aaaatggcat 2460
gaaatatact atattgatat gttgtttcag tatcttggag ggaaaaggta tggaattaag 2520
ttggaccctg actgagcctt tggtactggt attagaaaag tacaggctgg agaaagataa 2580
aggaagtgtt aaaagggttg ctgaaggtgt taaaggtgtg gcatgtagca tttaacagag 2640
ctgtttgaaa ttgaatgagc agggaaaggt gatgtaggca ttatctaagt aacagtctag 2700
aagttttggt atatttgccg tggtgtttgg tcagtttccc aaacatcggg gagggggacg 2760
gtggggggga acagcctgct ccaccagggg cctctccagc ggccgcaggg gggcttcggc 2820
tccagcgcct ggagcgcctc ctccccctcc ttctgcactg actttggtgt ctgcgggggg 2880
ggtttctcgc tctcccaact gctgttgagc agcaggcttt tgtttgtttc tttgtttgtt 2940
tgttttcgtg gatgtgctct cacagaggca cggactgtat tgctcatggc ttggctctgg 3000
gcagcagtga gccccttagg ggccggatga aattgtccct tacctgccac ggggaggctt 3060
ctgggttttt ctcacggggg ctgccactgc agtttcctac cccccccact cacagccccc 3120
gaaccttgcc atcaaaccca atacactggg gagcagctag gtcattactg acttgtaaag 3180
tatcagggat taaattaact aatgaaaccc taaaaagtga tgggggtaga aggggttggg 3240
ataacagtgc cacttttggg ggataccaag ctgagactag gggataaaat gatcgctagg 3300
taattgttgt atgtacccaa ggcaggaact aacttgttga gaaggaattt gatgattaaa 3360
ttgggcattc aaatagtaaa ttgttagact gaaataacag tgttattaat ggagtgctct 3420
cagaccctga gagcaaacat atattcacct ctgactggaa agaccctgaa atgggggcgg 3480
aagcaacaat ataggtggac aattttacct cagggctata cagggccacc tatctatttg 3540
ggtaagttct aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aagactttgg agcaattaca 3600
acctcccgag gaggtattaa tgttaacaaa tatgtggatc gttttctatt gtcaggacag 3660
gagaaaagag ttgtgaagaa agctactaac aagctattca actttctggg aaagcagggc 3720
ttgggagtat tgaaaaataa attacaatat ggagaaagag aagtcaggta tttaaggcat 3780
ctaatgtctg aaggaaaaca gaataaatgc agagaggatt cagggaattg ttgaaaatta 3840
agaaagaact aaaaagtttt aaaagaaaga tttttttaag gaatcaggag ctatgaagtc 3900
tgaaagaaaa tggatactcc ttgatgggag agaaatgctg aataaagtga taatgaggca 3960
aatattaact gttttacatc aaaagagtca ttgggaggtg caagcaacgt gtgatgttgt 4020
gctacgaaag tatgtctgta taggaatata cactttagcg aagcacatat gtagaggatg 4080
taccatatgt caaaaggtaa ataaaaagat cttctgtaac ccatctagag ggggacggga 4140
gccaggggtt tgacctttcc aaagtataca ggtaaatttt actgagttac ttgtttgtcc 4200
taattgacca cgtgactgga tgggtgtaaa gctttactgc aagggttaaa gcgggcctta 4260
gcgattgagt gggattttca cagcccctgg cacccctcct cttctgggaa ggtggagcga 4320
atgaatcaga cattaaagaa gcaattaact aaactagtgt tagaaaccca acttccttgg 4380
gtaaaatgct tactcctaca ggtttaaaca gcaccaagaa aggatacagg aattttacca 4440
tatgagatgc tgttcagatt gccctatctg ggcagaaggg atgagatacc acaattcaaa 4500
acaagagact tttcttaaga actgtattct ggggttgtcc tcttctttgt catttctcag 4560
gacctgtggg ttgttggctc aaaccccacc tttggaattc cccattcacc accatcaccc 4620
aggaaaccgg gtcctgattc ggacctggaa agagtcaact ccggcctgaa tgggaaggac 4680
aattactaac cactgaaaca gccgtaagaa ctgcggaaaa ggttggactc actatactcg 4740
agtgaaggca tccgtcgacg ctagtacctg ggaagctgtt cctacgaaag acttgttgga 4800
agttgaaatt gaagagaaaa atctcatagt ggactctgag caggataaga gcttacaatt 4860
gtaaactaac cttttatttt cacaggtaac taacgtctgt gacttgtgat tgagagaaag 4920
aacagaccta tagcgaattg cagtgctccc aagggggggt tgttatagta gtagtgtaca 4980
tcttattttt tgtatcgata attatttgga aacctaaggt ttaaaaataa tgacagggaa 5040
aaattgatta ctaattttgt ttttagtgat tctaggcctc agagaaggcc ttggtcaatt 5100
ggcaacttgc aaaaggcatg accagataat agcaaaaacg ggatacccca tcaaaatatg 5160
ggtgactgtg acagagggtt gtgtaccaca ttctgtcacg tttgatgttt gtgaggtgtt 5220
agcttgtgga gatctaaatg cccaacgaca attgagcaga gagaacaaat aactgggaga 5280
gacccaacag ccagattgag aatagctgta tggaaacaat cctctattgc catcagagaa 5340
agggagaaac tcaaggagaa aacaggagag aaaacaggaa gccctctgaa atgtgtcagt 5400
tcaaacaagg tatggggatg tgaatgcctg gatagaatgg gtcaaatata ccgtccagag 5460
tctcaaccat agctactgct atgcttgtgc ctcgggatga ccgattgccc agatagtgcc 5520
cttcccatgg tggtggacca aagactccca agagatgcga tgtatgattg cattgtacca 5580
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agggaagatc ttatggtcca ccctaccatc taattgggaa ggcacttgtg cacttgttca 5880
attagctata cccttcaccc tggcatttga aagagaaaca tcacaaatac ccagaggaag 5940
taaaagaggc ttaggaatat catttgatga tagagtatac atagattcta ttggggtacc 6000
tagaggagtt ccagatgaac ataaagccag aaatcaaatt gctgcagggt ttgagtcaat 6060
gttctggtgg gtaacaatca ataaaaatgt ggattgaatt aattatttct attataatca 6120
gtagagattc atcaattata ccaaggatgc gatgagagga atcgctgaac aactagatgc 6180
catcagcaaa atggcttggg aaaacaggat agccttagat atgatgctcg cagaggaagg 6240
aggtgtgttt gtgtgtgtaa tactgagcaa ccattgttgc acttataccc aacagtagtg 6300
tcccagatgg ctcggtaaca agagcattgc aagggcttac cacccttgcc agtgaattgg 6360
cagaaaaagt aggcatattt acatccttga tcgtagttgt aggagttttg acagccattg 6420
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tgaaacaaat gaccatggag ccaccacctt actcagataa ggtgataatg aggagatgga 6540
aagcaaagaa gaagaagtct atcaaattgc accttagaga aaggttttgc aaaaatcaac 6600
agtttataaa aaaagaaaag gggggaattg tgggaataga aatgttgttt ttgcagagtt 6660
acattgttta gaaggaggga atgtggtact gagatatgct tacagtgata agaaagttta 6720
gcaggcgacc tagtaaaatg cagacaacca gtctccttag gacaattagg tgaaaatcac 6780
ggtgttaagt caagtcagat aagtgaagaa acattaccac ttcaaacagt aaaaatgtca 6840
aaagaaattt gaaatttaac aggccggcaa ctgaaggcca tgcattgttt gtgaagcatc 6900
agatagattg tgaacctgga ttacccactc agtggggaaa caggggaggg tcctgccatc 6960
aaaaggtata taaactgtgt tttggaacta gtagatgcgc tctctcctgc ttctggggcg 7020
cccgccattg caatcgcgaa taaattacta cttcactgag atcctcgcct gagcctaagt 7080
tattggctac ggagtgtttc tcaca 7105
<210> 2
<211> 23
<212> DNA
<213> 人工序列（Artificial Sequence）
<221> 487F
<400> 2
catctggaat gctctaccaa ggg 23
<210> 3
<211> 23
<212> DNA
<213> 人工序列（Artificial Sequence）
<221> 1347R
<400> 3
caataactta ggctcaggcg agg 23
<210> 4
<211> 23
<212> DNA
<213> 人工序列（Artificial Sequence）
<221> 1649R
<400> 4
ctgtgctctg tcctacagcg agt 23
Claims (9)
1.一种与鸭生长性状相关的InDel分子标记，其特征在于，位于鸭第28号染色体上，插入或缺失片段的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示。
2.一种如权利要求1所述的与鸭生长性状相关的InDel分子标记作为检测靶点在鉴定鸭屠体性状中的应用。
3.一种如权利要求1所述的与鸭生长性状相关的InDel分子标记作为检测靶点在鸭育种中的应用。
4.根据权利要求3所述的与鸭生长性状相关的InDel分子标记作为检测靶点在鸭育种中的应用，其特征在于，判断如SEQ ID NO.1所示片段插入或缺失，选择如SEQ ID NO.1所示片段插入的纯合型鸭个体留种。
5.根据权利要求4所述的与鸭生长性状相关的InDel分子标记作为检测靶点在鸭育种中的应用，其特征在于，包括以下步骤：提取鸭的基因组DNA，利用如权利要求1所述的InDel分子标记的正、反向引物对提取的基因组DNA进行PCR扩增，获得PCR产物，检测PCR产物，根据检测结果判断如SEQ ID NO.1所示片段插入或缺失，选择如SEQ ID NO.1所示片段插入的纯合型鸭个体留种。
6.一种用于检测如权利要求1所述的与鸭生长性状相关的InDel分子标记的引物对。
7.根据权利要求6所述的引物对，包括正向引物和反向引物，其特征在于，正向引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示，反向引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示。
8.一种用于检测如权利要求1所述的与鸭生长性状相关的InDel分子标记基因型的试剂盒，其特征在于：包括如权利要求6或7所述引物对。
9.根据权利要求8所述的试剂盒，其特征在于：还包括核苷酸序列如SEQ ID NO.4所示的反向引物。
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