CN115583946A - 杂环化合物及其作为cdk抑制剂的用途 - Google Patents
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Abstract
本发明涉及杂环化合物及其作为CDK抑制剂的用途,属于医药化学领域,具体涉及具有化学式(I)结构的化合物,其立体异构体、互变异构体或其混合物,或其可药用盐、前药或氘代化合物。本发明进一步提供了此类化合物的制备方法以及其用于调节细胞周期依赖性激酶(Cyclin‑dependent kinases,CDKs)的用途。此外,本发明还提供了应用此类化合物用于治疗或预防细胞增殖异常相关疾病或CDK相关性疾病中的用途。
Description
发明领域
本发明属于医药技术领域,具体涉及一种新的用作细胞周期蛋白依赖性激酶抑制剂(Cyclin-dependent kinases,CDKs)的杂环化合物、其衍生物及其立体异构体,其制备方法,以及其用于调节或抑制细胞周期依赖性激酶的活性、用于治疗和预防与CDK活性相关的疾病及用于制备治疗所述疾病的药物的用途。
背景技术
细胞周期依赖性激酶是一类调节多种细胞周期进程和基因转录调控的丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶。目前已报道有20个不同的CDK,它们都含有一段PSTAIRE的同源序列,并通过该序列与相应的调节亚基——细胞周期蛋白(cyclin)结合形成有活性的异源二聚体,参与转录、代谢、神经分化和发育等生理过程。其中,CDK1/2/4/6参与调控细胞周期进程,CDK7/8/9/12/13参与基因转录调控。
CDK7由346个氨基酸组成,在组织中广泛表达,通常与细胞周期蛋白H(Cyclin H)、MAT1结合形成细胞周期蛋白活化激酶(CAK)三聚体复合体。CDK7主要生理功能包括间接调控细胞周期、调控转录起始以及调控超级增强子介导的基因表达等。当作为CAK复合物时,CDK7通过磷酸化CDK1、CDK2、CDK4和CDK6等的T-loop结构域激活其活性,从而间接参与到细胞周期的所有阶段,促进细胞周期的顺利进行。同时,CAK属于通用转录复合物TFIIH的组成部分之一,而CDK7作为TFIIH的核心激酶,通过磷酸化RNA聚合酶II(POLR2A)的C-末端结构域(CTD)的5位-丝氨酸,从而介导转录起始过程。TFIIH复合物不仅在RNA转录过程中起作用,而且也是核苷酸切除修复(NER)所必须的。此外,CDK7还通过超级增强子(SE)影响大量基因(如转录因子、信号转导分子)的转录过程。
CDK7在多种肿瘤中表达上调,典型例如三阴乳腺癌(TNBC)、高级浆液性卵巢癌(HGSOC)、小细胞肺癌(SCLC)等,并通过增强子促进基因的表达,包括原癌基因Myc等。CDK7表达上调不仅是多种肿瘤发生和进展的机制,也是癌症的不良预后生物标志物。相反,通过RNAi、小分子药物等手段抑制CDK7在多种PDX肿瘤模型中均表现出了显著的抗肿瘤活性,达到肿瘤完全消退的结果。CDK7抑制剂可抑制乳腺癌和结直肠癌体内增殖,且与他莫昔芬在治疗ER+乳腺癌中发挥协同作用。抑制CDK7可以阻碍细胞周期进展,抑制细胞增殖,降低原癌基因c-Myc等表达并诱导凋亡。
目前在研的靶向CDK7小分子抑制剂尚无药物上市。进入临床的CDK7抑制剂包括Syros公司的SY-1365(已终止研发)和SY-5609(I期临床),Carrick公司的CT7001。SY-5609用于治疗晚期实体瘤,包括乳腺癌、卵巢癌、结直肠癌、肺癌等。CT7001用于治疗晚期实体瘤。此外,还有其他一些CDK7小分子抑制剂临床前在研。
CDK7在转录调控和细胞周期调控中扮演关键角色,越来越多的研究表明,CDK7抑制剂可有效抑制恶性肿瘤体内外增殖,且与其他药物能产生协同效应。本专利研究的目的是为提供用于治疗与CDK7相关的肿瘤等疾病的CDK7靶向抑制剂。
发明内容
本申请涉及一种杂环化合物、其立体异构体、互变异构体或其混合物,或其药学上可接受的盐、其溶剂化物、水合物、前药或氘代化合物,所述杂环化合物的结构如式(I)所示::
其中X1,X2各自独立地是CR3或N;
Rx选自H,卤素,氰基,异氰基,氨基,羟基,硝基,C1~C6烷基,卤代C1~C6烷基,C3~C6环烷基,3~6元杂环烷基;优选地,Rx选自H,卤素,氰基、异氰基、三氟甲基、三氯甲基、氨基、环丙基;
R1,R2,R3各自独立地选自:H,卤素,氰基,异氰基,氨基,羟基,巯基,羧基,C1~C6烷基,卤代C1~C6烷基,C1~C6烷氧基,C3~C6环烷基,3~6元杂环烷基,C3~C6环烷基氧基;
环B为选自下组的基团:
每个R4独立地选自H,卤素,氨基,羟基,硝基,巯基,氰基,异氰基,C1-C6烷基,C1-C6烷氧基,卤代C1-C6烷基,C3-C6环烷基,3~6元杂环烷基,-S(=O)Ra1,-S-Ra1,-S(=O)2Ra1,-(CH2)n-C(=O)ORa1,-(CH2)n-C(=O)Ra1,-(CH2)n-Ra2,-(CH2)n-S(=O)2Ra1,-(CH2)n-P(=O)(ORa1)2,-(CH2)n-P(=O)(Ra1)2,-(CH2)n-P(=O)(ORa1)(Ra1),-(CRb)2-Ra2,-NRb-(CH2)n-Ra2,芳基,杂芳基,-O(CH2)n-Ra2,-O-(C2~C4亚烯基)-Ra1,其中所述环烷基、杂环烷基、芳基、杂芳基是经一个或多个Rb取代的或未取代的,所述杂原子为N、O、或S的一个或多个;优选地,所述芳基为C6~C10芳基,所述杂芳基为5~10元杂芳基;
每个Ra1独立选自:H,羟基,氨基,C1~C6烷基,C1~C6烷氧基,卤代C1~C6烷基,C3~C6环烷基,3~6元杂环烷基,芳基,杂芳基;优选地,所述芳基为C6~C14芳基,更优选为C6~C10芳基,更优选地选自苯基和萘基;优选地,所述杂芳基为5~10元杂芳基,更优选地选自咪唑基、呋喃基、噻吩基、噻唑基、吡唑基、噁唑基、异噁唑基、吡咯基、四唑基、吡啶基、嘧啶基、噻二唑、吡嗪基;
每个Ra2独立选自:H,卤素,氨基,羟基,氰基,C1~C6烷基,C1~C6烷氧基,卤代C1~C6烷基,C3~C6环烷基,3~6元杂环烷基,芳基、杂芳基;优选地,所述芳基为C6~C14芳基,更优选为C6~C10芳基,更优选地选自苯基和萘基;优选地,所述杂芳基为5~10元杂芳基,更优选地选自咪唑基、呋喃基、噻吩基、噻唑基、吡唑基、噁唑基、异噁唑基、吡咯基、四唑基、吡啶基、嘧啶基、噻二唑、吡嗪基;
每个Rb独立选自:H,氨基,羟基,卤素,氰基,C1~C4烷基,卤代C1~C4烷基,C3~C4环烷基;
n=0、1、2、3、4、5或6;
p=0、1、2、3或4;
G是具有一个或多个取代基或者无取代的C3~C7环烷基、3~7元杂环烷基,其中所述G的取代基是选自下组的一项或多项:卤素、氨基、氰基、异氰基、羟基、硝基、羰基、醛基、酰基、酰胺基、磷酰基、磺酰基、酯基、羧基、C1~C6烷基、卤代C1~C6烷基、C3~C6环烷基、3~6元杂环烷基、C1~C6烷氧基、C3~C6环烷基氧基、3~6元杂环烷基氧基、芳基、杂芳基、C6~C10芳基氧基、5-10元杂芳基氧基,其中所述杂原子为N、O、或S的一个或多个;
L选自:-(CH2)m-,-O(CH2)m-,-(CH2)mO-,-C(=O)-,-NRc-,-O-,-C(=O)O-,-OC(=O)-,-NRc-C(=O)-,-C(=O)-NRc-,-NRc-(CH2)m-,-(CH2)m-NRc-,-S-,-S(=O)-,-S(=O)2-(CH2)m-,-(CH2)m-S(=O)2-,-S(=O)O-,-OS(=O)-,-S(=O)-NRc-,-NRc-S(=O)-,-S(=O)2O-,-OS(=O)2-,-S(=O)2NRc-,-NRc-S(=O)2-,不存在;m=0、1、2、3、4、5或6;
每个Rc独立选自:H,氨基,羟基,卤素,氰基,C1~C4烷基,卤代C1~C4烷基,C3~C4环烷基;
D选自取代或未取代的如下基团或是不存在:C3~C6环烷基、3~6元杂环烷基、芳基、杂芳基;其中所述D的取代基为氨基,羟基,卤素,氰基,C1~C4烷基,卤代C1~C4烷基,C3~C4环烷基的一个或多个;优选地,所述芳基为C6~C14芳基,更优选为C6~C10芳基;优选地,所述杂芳基为5~14元杂芳基,更优选为5~10元杂芳基;
Ry选自羟基、卤素、氨基、氰基、C1~C6烷基、C1~C6烷氧基、卤代C1~C6烷基、卤代C1~C6烷氧基、-(CH2)i-N(Rd)2、-(CH2)i-Re、-NRd-(CH2)i-Re、-(CH2)i-P(=O)(ORd)Re、-(CH2)i-P(=O)(ORd)2、-NRd-S(=O)2Rd、-NRd-S(=O)2Re、-S(=O)2Rd、-S(=O)2Re、-NRd-S(=O)Rd、-NRd-S(=O)Re、经Rd取代或未取代的Re、不存在;
Y为N或CRd;i=0、1、2、3或4;
每个Rd、R5A、R5B各自独立选自:H、羟基、氨基、卤素、氰基、C1~C6烷基、C1~C6烷氧基、卤代C1~C6烷基;R5C、R5D各自独立选自:Rd、-N(Rd)2、C2~C4烯基、C2~C4炔基;
每个Re独立选自经一个或多个Rd取代的如下基团:C3~C6环烷基,3~6元杂环烷基,芳基、杂芳基,其中所述杂原子为N、O、或S的一个或多个;优选地,所述芳基为C6~C14芳基,更优选为C6~C10芳基;优选地,所述杂芳基为5~14元杂芳基,更优选为5~10元杂芳基。
在本申请的化合物、其立体异构体、互变异构体或其混合物、药学上可接受的盐、其溶剂化物、水合物、前药或氘代化合物的一些实施方案中,G为C3~C6环烷基或3~6元杂环烷基;
L选自:-(CH2)m-,-O(CH2)m-,-(CH2)mO-,-C(=O)-,-C(=O)O-,-OC(=O)-,-NRc-C(=O)-,-C(=O)-NRc-,-NRc-(CH2)m-,-(CH2)m-NRc-,-S(=O)2NRc-,-O-,-S-,-S(=O)-,-S(=O)2-;m=0、1、2、3或4;
D选自取代或未取代的如下基团:C5~C6环烷基、5~6元杂环烷基、C6~C10芳基、5~10元杂芳基;其中所述D的取代基为氨基,羟基,卤素,氰基,C1~C4烷基,卤代C1~C4烷基,C3~C4环烷基的一个或多个;
Ry选自羟基、卤素、氨基、氰基、C1~C4烷基、C1~C4烷氧基、卤代C1~C6烷基、卤代C1~C6烷氧基、-(CH2)i-N(Rd)2、-(CH2)i-Re、-NRd-(CH2)i-Re、-NRd-S(=O)2Rd、经Rd取代或未取代的Re、不存在;
i=0、1、2、3或4;
每个Rd独立选自:H、羟基、氨基、卤素、氰基、C1~C6烷基、C1~C6烷氧基、卤代C1~C6烷基;每个R5A、R5B各自独立选自:H、羟基、氨基、卤素、氰基;R5C选自:Rd、-N(Rd)2、C2~C4烯基、C2~C4炔基;
每个Re独立选自经一个或多个Rd取代的如下基团:C3~C6环烷基,3~6元杂环烷基,C6~C10芳基、5~10元杂芳基,其中所述杂原子为N、O、或S的一个或多个。
在本申请的化合物、其立体异构体、互变异构体或其混合物、药学上可接受的盐、其溶剂化物、水合物、前药或氘代化合物的一些实施方案中,G选自如下基团:
W1,W2,W3各自独立为N或CR6;
每个R6独立选自:H、卤素、硝基、氨基、氰基、异氰基、羟基、醛基、酰基、酰胺基、酯基、羧基、C1~C6烷基、卤代C1~C6烷基、C3~C6环烷基、C3~C6杂环烷基、C1~C6烷氧基、C3~C6环烷基氧基、C3~C6杂环烷基氧基的一个或多个,其中所述杂原子为N、O、或S的一个或多个;
优选地,每个R6独立选自:H、卤素、氨基、羟基、C1~C4烷基、C1~C4烷氧基、CF3、环丙基、环丙基甲基、环丁基、环丁基甲基、C1~C4酯基、酰胺基;
q=0、1、2或3。
在本申请的化合物、其立体异构体、互变异构体或其混合物、药学上可接受的盐、其溶剂化物、水合物、前药或氘代化合物的一些实施方案中,L选自:-(CH2)m-,-C(=O)-,-C(=O)O-,-OC(=O)-,-NRc-C(=O)-,-C(=O)-NRc-,-NRc-(CH2)m-,-(CH2)m-NRc-,-S(=O)2NRc-,-NRc-S(=O)2-;m=0、1、2、3、或4;且每个Rc独立选自:H,氨基,羟基,卤素,氰基,C1~C4烷基。
在本申请的化合物、其立体异构体、互变异构体或其混合物、药学上可接受的盐、其溶剂化物、水合物、前药或氘代化合物的一些实施方案中,D为取代或未取代的C6~C10芳基或5~10元杂芳基。
在进一步的实施方案中,D选自取代或未取代的如下基团:
其中所述取代基为氨基,羟基,卤素,氰基,C1~C4烷基,卤代C1~C4烷基,C3~C4环烷基的一个或多个。
在更进一步的实施方案中,D选自取代或无取代的如下基团:
其中a端与L连接,b端与Ry连接;或者a端与Ry连接,b端与L连接;
其中所述取代基为氨基,羟基,卤素,氰基,C1~C4烷基,卤代C1~C4烷基,C3~C4环烷基的一个或多个。
在本申请的化合物、其立体异构体、互变异构体或其混合物、药学上可接受的盐、其溶剂化物、水合物、前药或氘代化合物的一些实施方案中,Ry选自羟基、卤素、氨基、氰基、C1~C4烷基、C1~C4烷氧基、卤代C1~C6烷基、卤代C1~C6烷氧基、不存在。
在本申请的化合物、其立体异构体、互变异构体或其混合物、药学上可接受的盐、其溶剂化物、水合物、前药或氘代化合物的一些实施方案中,Ry选自 -(CH2)i-N(Rd)2、-NRd-S(=O)2Rd、不存在;
i=0、1、2、3或4;
每个R5A、R5B各自独立选自:H、羟基、氨基、卤素、氰基;R5C选自:Rd、-N(Rd)2、C2~C4烯基、C2~C4炔基;每个Rd独立选自:H、羟基、氨基、卤素、氰基、C1~C4烷基、C1~C4烷氧基、卤代C1~C4烷基。
在本申请的化合物、其立体异构体、互变异构体或其混合物、药学上可接受的盐、其溶剂化物、水合物、前药或氘代化合物的一些实施方案中,Ry选自-(CH2)i-Re、-NRd-(CH2)i-Re、经Rd取代或未取代的Re、不存在;
i=0、1、2、3或4;
每个Rd独立选自:H、羟基、氨基、卤素、氰基、C1~C6烷基、C1~C6烷氧基、卤代C1~C6烷基;
每个Re独立选自经一个或多个Rd取代的如下基团:C3~C6环烷基,3~6元杂环烷基,C6~C10芳基、5~10元杂芳基,其中所述杂原子为N、O、或S的一个或多个。
在本发明的进一步实施方案中,每个Re独立选自经一个或多个Rd取代或无取代的如下基团:
在本发明的一些具体实施方案中,每个Re独立选自经一个或多个Rd取代或无取代的如下基团:
在本申请的化合物、其立体异构体、互变异构体或其混合物、药学上可接受的盐、其溶剂化物、水合物、前药或氘代化合物的一些实施方案中,每个Re独立选自经一个或多个Rd取代或无取代的如下基团:
在本发明的进一步实施方案中,每个Re独立选自经一个或多个Rd取代或无取代的如下基团:
在本发明的化合物、其立体异构体、互变异构体或其混合物、药学上可接受的盐、其溶剂化物、水合物、前药或氘代化合物的一些实施方案中,G是具有1-3个取代基或者无取代的C3~C7环烷基或3~7元杂环烷基,其中所述G的取代基是选自下组的一项或多项:卤素、氨基、氰基、异氰基、羟基、硝基、羰基、醛基、酰基、酰胺基、磷酰基、磺酰基、酯基、羧基、C1~C4烷基、卤代C1~C4烷基、C3~C6环烷基、3~6元杂环烷基、C1~C6烷氧基、C3~C6环烷基氧基、3~6元杂环烷基氧基、C6~C10芳基、5-10元杂芳基、C6~C10芳基氧基、C6~C10杂芳基氧基,其中所述杂原子为N、O、或S的一个或多个;且L、D和Ry为不存在。
在本发明的一些具体实施方案中,所述化合物具有选自下组的结构:
本发明还涉及前述任意化合物、其立体异构体、互变异构体或其混合物、药学上可接受的盐、其溶剂化物、水合物、前药或氘代化合物用于治疗或预防与细胞周期蛋白依赖性激酶(CDK)活性或表达量相关的疾病的用途,以及所属化合物化合物、其立体异构体、互变异构体或其混合物、药学上可接受的盐、其溶剂化物、水合物、前药或氘代化合物在制备用于治疗或预防与细胞周期蛋白依赖性激酶活性或表达量相关的疾病的药物中的用途。
在又一个方面,还提供了本发明所述化合物、其立体异构体、互变异构体或其混合物、药学上可接受的盐、其溶剂化物、水合物、前药或氘代化合物用于治疗或预防响应于对细胞周期蛋白依赖性激酶(CDK)的调节(例如促进或抑制)的疾病的用途,以及所述其在制备用于治疗或预防响应于对细胞周期蛋白依赖性激酶(CDK)的调节(例如促进或抑制)的疾病的药物中的用途。
在一些优选的实施方案中,所述CDK是选自CDK7、CDK12、CDK13的一种或多种。在一些实施方案中,所述CDK为CDK7。
在又一个方面,还提供了本申请所述化合物、其立体异构体、互变异构体或其混合物、药学上可接受的盐、其溶剂化物、水合物、前药或氘代化合物在制备用于治疗或预防细胞增殖异常相关疾病的药物中的用途。在一些实施方案中,所述细胞增殖异常相关疾病是肿瘤。在一些进一步的实施方案中,所述肿瘤选自膀胱癌、乳腺癌、肺癌(包括但不限于:小细胞肺癌,或非小细胞肺癌如肺腺癌、肺鳞癌和肺大细胞癌)、结直肠癌、肾癌、表皮癌、肝癌、食道癌、胆囊癌、卵巢癌、胰腺癌、胃癌、宫颈癌、甲状腺癌(包括但不限于:乳头状甲状腺癌、滤泡状甲状腺癌、甲状腺未分化癌)、鼻癌、头颈癌、前列腺癌、中枢或周围神经系统肿瘤、皮肤癌、血管内皮瘤、黑色素瘤、精原细胞瘤、白血病(例如急性白血病,如急性淋巴细胞白血病、急性非淋巴细胞白血病;或慢性白血病,如慢性淋巴细胞白血病、慢性粒细胞白血病、慢性单核细胞白血病)、多发性骨髓瘤、霍奇金淋巴瘤、非霍奇金淋巴瘤(包括但不限于:B细胞淋巴瘤、T细胞淋巴瘤)。
在一些实施方案中,所述肿瘤选自乳腺癌、卵巢癌、结直肠癌、肺癌。在一些实施方案中,所述肿瘤选自三阴乳腺癌、高级浆液性卵巢癌、小细胞肺癌。
本申请进一步涉及在体外或体内抑制细胞中的CDK功能的方法,其包括使所述细胞与有效量的本发明所述化合物、其立体异构体、互变异构体或其混合物、药学上可接受的盐、其溶剂化物、水合物、前药或氘代化合物接触。
本申请还涉及在体外或体内调控(例如抑制)细胞增殖、抑制细胞周期进展、促进凋亡、或其一项或多项的组合的方法,其包括使细胞与有效量的本发明所述化合物、其立体异构体、互变异构体或其混合物、药学上可接受的盐、其溶剂化物、水合物、前药或氘代化合物接触。
本申请还涉及治疗或预防疾病的方法,其包括向有需要的受试者施用有效量的本发明化合物、其立体异构体、互变异构体或其混合物、药学上可接受的盐、其溶剂化物、水合物、前药或氘代化合物;其中所述疾病是与CDK相关的疾病,例如与CDK活性相关的疾病(例如由CDK活性异常所致的疾病)、与CDK基因突变相关的疾病、与CDK表达相关(例如表达异常)的疾病、与CDK的上游路径活化相关的疾病、通过抑制CDK而得以改善的疾病、或响应于对CDK的抑制的疾病。优选地,所述疾病是与CDK活性相关的疾病、与CDK表达相关的疾病或响应于对CDK的抑制的疾病。在一些实施方案中,所述CDK是选自CDK7、CDK12、CDK13的一种或多种。在一些实施方案中,所述CDK为CDK7。
本申请进一步涉及治疗或预防细胞增殖异常相关疾病方法,其包括向有需要的受试者施用有效量的本发明化合物、其立体异构体、互变异构体或其混合物、药学上可接受的盐、其溶剂化物、水合物、前药或氘代化合物。在一些实施方案中,所述细胞增殖异常相关疾病是肿瘤。在一些优选实施方案中,肿瘤选自膀胱癌、乳腺癌、肺癌(例如小细胞肺癌,或非小细胞肺癌如肺腺癌、肺鳞癌和肺大细胞癌)、结直肠癌、肾癌、表皮癌、肝癌、食道癌、胆囊癌、卵巢癌、胰腺癌、胃癌、宫颈癌、甲状腺癌(例如乳头状甲状腺癌、滤泡状甲状腺癌、甲状腺未分化癌)、鼻癌、头颈癌、前列腺癌、中枢或周围神经系统肿瘤、皮肤癌、血管内皮瘤、黑色素瘤、精原细胞瘤、白血病(例如急性白血病,如急性淋巴细胞白血病、急性非淋巴细胞白血病;或慢性白血病,如慢性淋巴细胞白血病、慢性粒细胞白血病、慢性单核细胞白血病)、多发性骨髓瘤、霍奇金淋巴瘤、非霍奇金淋巴瘤(例如B细胞淋巴瘤、T细胞淋巴瘤)。在一些优选的实施方案中,所述肿瘤选自乳腺癌、卵巢癌、结直肠癌、肺癌。在更优选的实施方案中,所述肿瘤选自三阴乳腺癌、高级浆液性卵巢癌、小细胞肺癌。
本申请还涉及药物组合物,其包含治疗或预防有效量的本发明化合物、其立体异构体、互变异构体或其混合物、药学上可接受的盐、其溶剂化物、水合物、前药或氘代化合物,以及药学上可接受的载体或赋形剂。
本申请还涉及用于治疗或预防疾病的药物组合物,其包含本发明所述化合物、其立体异构体、互变异构体或其混合物、药学上可接受的盐、其溶剂化物、水合物、前药或氘代化合物。在一些实施方案中,所述疾病为细胞增殖异常相关的疾病、响应于对细胞周期蛋白依赖性激酶的调节的疾病或与细胞周期蛋白依赖性激酶活性或表达量相关的疾病。在一些实施方案中,所述周期蛋白依赖性激酶选自CDK7、CDK12、CDK13,优选为CDK7。在一些实施方案中,所述细胞增殖异常相关疾病是肿瘤,例如膀胱癌、乳腺癌、肺癌(例如小细胞肺癌,或非小细胞肺癌如肺腺癌、肺鳞癌和肺大细胞癌)、结直肠癌、肾癌、表皮癌、肝癌、食道癌、胆囊癌、卵巢癌、胰腺癌、胃癌、宫颈癌、甲状腺癌(例如乳头状甲状腺癌、滤泡状甲状腺癌、甲状腺未分化癌)、鼻癌、头颈癌、前列腺癌、中枢或周围神经系统肿瘤、皮肤癌、血管内皮瘤、黑色素瘤、精原细胞瘤、白血病(急性白血病,如急性淋巴细胞白血病、急性非淋巴细胞白血病;或慢性白血病,如慢性淋巴细胞白血病、慢性粒细胞白血病、慢性单核细胞白血病)、多发性骨髓瘤、霍奇金淋巴瘤、非霍奇金淋巴瘤(例如B细胞淋巴瘤、T细胞淋巴瘤)。在一些实施方案中,所述肿瘤选自乳腺癌、卵巢癌、结直肠癌、肺癌。在一些实施方案中,所述肿瘤选自三阴乳腺癌、高级浆液性卵巢癌、小细胞肺癌。
本申请进一步涉及本发明所述化合物、其立体异构体、互变异构体或其混合物、药学上可接受的盐、其溶剂化物、水合物、前药或氘代化合物,其用于治疗或预防疾病,所述疾病为细胞增殖异常相关的疾病、响应于对细胞周期蛋白依赖性激酶的调节的疾病或与细胞周期蛋白依赖性激酶活性或表达量相关的疾病。在一些实施方案中,所述周期蛋白依赖性激酶选自CDK7、CDK12、CDK13,优选为CDK7。在一些实施方案中,所述细胞增殖异常相关疾病是肿瘤,例如膀胱癌、乳腺癌、肺癌(例如小细胞肺癌,或非小细胞肺癌如肺腺癌、肺鳞癌和肺大细胞癌)、结直肠癌、肾癌、表皮癌、肝癌、食道癌、胆囊癌、卵巢癌、胰腺癌、胃癌、宫颈癌、甲状腺癌(例如乳头状甲状腺癌、滤泡状甲状腺癌、甲状腺未分化癌)、鼻癌、头颈癌、前列腺癌、中枢或周围神经系统肿瘤、皮肤癌、血管内皮瘤、黑色素瘤、精原细胞瘤、白血病(急性白血病,如急性淋巴细胞白血病、急性非淋巴细胞白血病;或慢性白血病,如慢性淋巴细胞白血病、慢性粒细胞白血病、慢性单核细胞白血病)、多发性骨髓瘤、霍奇金淋巴瘤、非霍奇金淋巴瘤(例如B细胞淋巴瘤、T细胞淋巴瘤)。在一些实施方案中,所述肿瘤选自乳腺癌、卵巢癌、结直肠癌、肺癌。在一些实施方案中,所述肿瘤选自三阴乳腺癌、高级浆液性卵巢癌、小细胞肺癌。
定义和一般术语
除非另有说明,在本申请说明书和权利要求书中出现的以下术语具有下述含义:
“烷基”是指脂肪族烃基团,指饱和烃基。烷基部分可以是直链烷基,亦可以是支链烷基。例如,C1~C6烷基。C1~C6烷基指具有1至6个碳原子的烷基,例如具有1个碳原子、2个碳原子、3个碳原子、4个碳原子、5个碳原子、6个碳原子的烷基。烷基的非限制性实例包括甲基、乙基、正丙基、异丙基、正丁基、异丁基、仲丁基、叔丁基、正戊基、新戊基、正己基等。所述烷基可以是非取代的或被一个或多个取代基所取代,所述取代基包括但不限于烷基、烷氧基、氰基、羟基、羰基、羧基、芳基、杂芳基、胺基、卤素、磺酰基、亚磺酰基、膦酰基等。
本申请中使用的C1-n包括C1-2、C1-3……C1-q。q为大于1的整数。典型的烷基包括但不限于甲基、乙基、丙基、异丙基、丁基、异丁基、叔丁基、戊基、己基等等。
“烯基”是指烷基的起始的两个原子形成双键,即烯基为-C(R)=C(R)-R’,其中,R’是指烯基的其余部分,各R可以相同或不同。烯基可以是任意取代的,包括但不限于-CH=CH2、-C(CH3)=CH2、-CH=CHCH3、-C(CH3)=CHCH3、-CH=CHCH2-等。烯基可具有2至6个碳原子,例如具有2个碳原子、3个碳原子、4个碳原子、5个碳原子、6个碳原子的烯基。
“炔基”是指烷基起始的两个原子形成叁键,即炔基为-C≡C-R,其中,R是指炔基的其余部分。炔基可以是任意取代的,包括但不限于-C≡CH、-C≡CCH3、-C≡CCH2CH3、-C≡C-和-C≡CCH2-等。炔基可具有2至6个碳原子,例如具有2个碳原子、3个碳原子、4个碳原子、5个碳原子、6个碳原子的炔基。
“酯基”表示具有式-COOR的化学结构,其中R可以为烷基、环烷基、杂环烷基、芳基、杂芳基等。C1-C4酯基是指具有式-COORx1的结构,其中Rx1为C1-C4烷基。
“酰胺基”表示具有式“-CONRx1Rx2”或“-NRx3CORx4”的化学结构,其中Rx1、Rx2、Rx3和Rx4独立地为H或C1-C4烷基。
“环”是指任意的共价封闭结构,包括例如碳环(例如芳基或环烷基)、杂环(例如杂芳基或杂环烷基)、芳香基(如芳基或杂芳基)、非芳香基(如环烷基或杂环烷基)。环可以是任选取代的,可以是单环或多环。典型的多环一般包括二环、三环。本申请的环通常具有1-20个环原子,例如1个环原子、2个环原子、3个环原子、4个环原子、5个环原子、6个环原子、7个环原子、8个环原子、9个环原子、10个环原子、11个环原子、12个环原子、13个环原子、14个环原子、15个环原子、16个环原子、17个环原子、18个环原子、19个环原子或20个环原子。
“元”是表示构成环的骨架原子的个数。典型的5元环包括例如环戊基、吡咯、咪唑、噻唑、呋喃和噻吩等;典型的6元环包括例如环己基、吡啶、吡喃、吡嗪、噻喃、哒嗪、嘧啶、苯等。其中,骨架原子中含有杂原子的环,即为杂环;含有杂原子的芳香基为杂芳基;含有杂原子的非芳香性基团为杂环基,其包括杂环烷基。
“杂原子”是指除了碳或氢以外的原子。本申请的杂环中的一个或多个杂原子可独立地选自O、S、N、Si和P,但不限于此。
本文所用术语“脂环基”是指包含饱和或部分不饱和(包含一个或多个双键,但没有一个环具有完全共轭的π电子体系,不具有芳香性)的包含一个或多个环的环状烃取代基。脂环基包括下位概念“环烷基”,即饱和的脂环基。环烷基进一步包括单环烷基和多环烷基,其包含3-20个可形成环的碳原子,优选3-10个碳原子。环烷基的例子包括但不限于:环丙基、环丁基、环戊基、环己基、环庚基、环辛基、环癸烷、环十二烷基、环己烯基等;多环烷基还包括含有螺环、稠环和桥环结构的环烷基。典型的脂环包括但不限于:
典型的脂环基包括但不限于上述脂环形成的基团。
本文所称的术语“脂杂环基”是指包含饱和或部分不饱和(包含一个或多个双键,但没有一个环具有完全共轭的π电子体系,不具有芳香性)的包含一个或多个环的环状取代基,且其环原子除碳以外还包含一个或多个(例如,1个、2个、3个或4个)杂原子,其中所述杂原子可为N、O、S或SO2 脂杂环基可以为单环、稠环、桥环和螺环结构。脂杂环基包括下位概念“杂环烷基”,即饱和的脂杂环基。杂环烷基可为3元至10元(例如,3元、4元、5元、6元、7元、8元、9元、10元,例如包含3个、4个、5个、6个、7个、8个、9个或10个环原子)的单环或双环或三环。典型的脂杂环包括但不限于:
典型的脂杂环基包括但不限于上述脂杂环形成的基团。
“芳基”指具有共轭的π电子体系的具有6至14个碳原子(6至14元)的单环或稠合多环(也就是共享毗邻碳原子对的环)基团,优选具有6至10个原子,例如苯基和萘基。更优选苯基。所述芳基环可以稠合于杂芳基、杂环烷基或环烷基环上,其中与母体结构连接在一起的环为芳基环。
术语“杂芳基”指包含1至4个(例如1、2、3或4个)杂原子、5至14个环原子(例如5、6、7、8、9、10、11、12、13、14个)的杂芳族体系,其中杂原子选自氧、硫和氮。杂芳基优选为5至10元,含1至3个杂原子;更优选为5元或6元,含1至2个杂原子;优选例如咪唑基、呋喃基、噻吩基、噻唑基、吡唑基、噁唑基、吡咯基、四唑基、吡啶基、嘧啶基、噻二唑、吡嗪基等,优选为咪唑基、噻唑基、吡唑基或嘧啶基、噻唑基;更有选吡唑基或噻唑基。所述杂芳基环可以稠合于芳基、杂环烷基或环烷基环上,其中与母体结构连接在一起的环为杂芳基环。
“取代的”指基团中的一个或多个氢原子,优选为最多5个(例如1、2、3、4、5个),更优选为1~3个氢原子可彼此独立地被相应数目的取代基所取代。不言而喻,取代基仅处在它们的可能的化学位置,本领域技术人员能够在不付出过多努力的情况下确定(通过实验或理论)可能或不可能的取代。例如,具有游离氢的氨基或羟基与具有不饱和(如烯属)键的碳原子结合时可能是不稳定的。举例而言,本申请中取代的基团可被选自如下的基团取代:C1-6烷基、C3-6环烷基、芳基、杂芳基、杂环烷基、羟基、烷氧基、烷硫基、芳氧基、硝基、酰基、卤素、卤代烷基、氨基、巯基、氰基、酯基、羧基、酰胺基、-C=O、卤代C1-6烷基、氨基取代的C1-6烷基、羟基取代的C1-6烷基、C1-6杂烷基、卤代C1-6杂烷基、氨基取代的C1-6杂烷基、羟基取代的C1-6杂烷基、烷基取代的C3-6环烷基、卤代C3-6环烷基、羟基取代的C3-6环烷基、氨基取代的C3-6环烷基或C3-6杂环烷基、烷基取代的C3-6杂环烷基、卤代C3-6杂环烷基、羟基取代的C3-6杂环烷基、和氨基取代的C3-6杂环烷基等。
“靶蛋白”,是指能够被选择性结合化合物结合的蛋白分子或蛋白的一部分。在某些实施方式中,靶蛋白是CDK7。
“抑制剂”,是指使下述化合物:所述化合物会使靶蛋白或靶分子的活性的量值与不存在该抑制剂时的该种活性量值相比降低。在一些具体实施方案中,抑制剂引起靶蛋白代谢活性降低。在一些具体实施方案中,抑制剂引起对应的酶活性下降。
“任选”或“任选地”意味着随后所描述地事件或环境可以但不必发生,该说明包括该事件或环境发生或不发生地场合。例如,“任选取代的”表示可以被取代也可以不被取代;“任选被烷基取代的杂环烷基”意味着烷基可以但不必须存在,包括杂环烷基被烷基取代的情形和杂环烷基团不被烷基取代的情形。
术语“取代或非取代的”在本文中是指该基团可以无取代基,也可由指定取代基单取代或多取代至这种单取代或多取代(包括在相同部分的多重取代)在化学上允许的程度,每个取代基可以位于该基团上任何可利用的位置,且可以通过所述取代基上任何可利用的原子连接。“任何可利用的位置”是指通过本领域已知的方法或本文教导的方法可化学得到,并且不产生过度不稳定的分子的所述基团上的任何位置。当在任何基团上有两个或多个取代基时,每个取代基独立于任何其它取代基而定义,因此可以是相同或不同的。
术语“卤素”是指氟、氯、溴或碘取代基。
术语“卤代烷基”指的是其中一个或多个氢被相同或不同的卤素代替的本文所定义的烷基。卤代烷基的实例包括-CF3、-CH2Cl、-CH2CF3、-CH2CCl3等。
术语“C1~C6烷氧基”是指如下基团:R’-O-,其中R’是C1~C6烷基。“C3~C6环烷基氧基”是指如下基团:R’-O-,其中R’是C1~C6环烷基。
术语“立体异构体”指具有相同的化学结构,但是在原子或基团的空间排列方面有所不同的化合物。本申请上下文所属化合物的立体异构体包括但不限于其对映异构体、非对映异构体、顺反异构体、内消旋体、外消旋体或其混合物形式。
在本申请的结构式中将至手性碳的键描绘为直线时,应理解的是,该结构式包含手性碳的(R)和(S)构型,并因此也包含两种对映异构体及其混合物。类似地,当描述化合物名称时没有指定手性碳的手性时,应理解该名称包括手性碳的(R)和(S)构型,由此也包含单独的对映异构体及其混合物。具体的立体异构体或其混合物的生成可在获得这种立体异构体或混合物的实施例中进行鉴定,但这绝不是限制所有立体异构体及其混合物不包含在本申请的范围内。
本申请包括所有可能的对映异构体和非对映异构体以及两种或更多种立体异构体的所有比例的混合物,例如对映异构体和/或非对映异构体的混合物。因此,对映异构体是以下形式的本申请的主题:对映体纯的形式(左旋和右旋对映体)、外消旋体的形式以及两种对映体所有比例的混合物形式。在顺式/反式异构体的情况下,本申请包括顺式和反式两种形式以及这些形式的所有比例的混合物。如果需要,可以通过以下进行单独的立体异构体的制备:用常规方法分离混合物,例如通过色谱法或结晶法;通过使用合成用的立体化学上均质的起始原料;或通过立体选择性合成。任选地,可以在分离立体异构体之前进行衍生化。立体异构体混合物的分离可以在目标化合物的合成的中间步骤进行,或者可以使用最终的外消旋产物进行。绝对立体化学可以通过结晶产物或衍生化的结晶中间体的X射线晶体学测定,如果需要,使用含有立体异构中心的、已知构型的试剂。当本申请的化合物能够互变异构时,所有单独的互变异构体及其混合物都包括在本申请的范围内。除非指明了这种外消旋体、对映异构体、非对映异构体或互变异构体的特定异构体、盐、溶剂化物(包括水合物)或溶剂化的盐,否则本申请包括这种外消旋体、对映异构体、非对映异构体和互变异构体及其混合物的所有这类异构体、盐、溶剂化物(包括水合物)或溶剂化的盐。
本文所用的术语“稠环”指5至20元,系统中的每个环与体系中的其他环共享毗邻的一对环原子的多环结构,其中一个或多个环可以含有一个或多个双键。优选为6至14元,更优选为7至10元。根据组成环的数目可以分为双环、三环、四环或更多环的稠环,优选为双环或三环,更优选为5元/5元或5元/6元双环。本申请上下文中所定义的术语“稠环”包括稠碳环和稠杂环。所述稠杂环是成环原子中除碳外还含有一个或多个选自O,S,N的杂原子的稠环,包括例如稠脂杂环和稠杂芳环。稠环可以是芳香性或非芳香性的,常见的典型稠环芳香化合物包括但不限于萘、蒽、菲等;稠环杂环化合物包括但不限于吲哚、喹啉、嘌呤等。
术语“桥环”指5至20元,任意两个环共用两个不相邻(即“不直接连接的”)环原子的多环结构,其可以含有一个或多个双键,但没有一个环具有完全共轭的π电子系统。优选为6至14元,更优选为7至10元。根据组成环的数目可以分为双环、三环、四环或多环的桥环,优选为双环、三环或四环,更优选为双环或三环。本申请上下文中所定义的术语“桥环”包括桥碳环和桥杂环。所述桥杂环,即成环原子中除碳外还含有一个或多个选自O,S,N的杂原子。
术语“螺环”指5至20元的单环之间共用一个碳原子(称螺原子)的多环结构,其可以含有一个或多个双键,但没有一个环具有完全共轭的π电子系统。优选为6至14元,更优选为7至10元。本申请上下文中所定义的术语“螺环”包括螺碳环和螺杂环。所述螺杂环,即成环原子中除碳外还含有一个或多个选自O,S,N的杂原子。
本申请中使用的术语“受试者”包括哺乳动物。
本申请所述哺乳动物包括牛科动物、马科动物、羊科动物、科动物、犬科动物、科动物、啮齿类动物、灵长类动物,其中优选的哺乳动物为人。
本申请中所使用的术语“有效量”是指,足以获得或至少部分获得期望的效果的量。例如,治疗有效量是指,足以治愈或至少部分阻止已患有疾病的患者的疾病和其并发症的量。预防有效量是指,能够有效预防、阻止或延迟疾病的发生的量。测定这样的有效量完全在本领域技术人员的能力范围之内。例如,对于治疗用途有效的量将取决于待治疗的疾病的严重度,患者自己的免疫系统的总体状态,患者的一般情况例如年龄、体重和性别,药物的施用方式,以及同时施用的其他治疗等等。
对受试者给予的本申请所述化合物、其立体异构体、互变异构体或其混合物、药学上可接受的盐、前药或氘代化合物的量取决于所述疾病或病况的类型和严重程度以及受试者的特征,如一般健康状况、年龄、性别、体重和对药物的耐受度,还取决于制剂的类型和药物的给药方式,以及给药周期或时间间隔等因素。本领域技术人员能够根据这些因素和其它因素来确定适当的剂量。一般而言,本申请所述化合物、其立体异构体、互变异构体或其混合物、药学上可接受的盐、前药或氘代化合物用于治疗日剂量可为大约0.0001~1000mg/kg体重/天,该日剂量可以视情况一次或分多次给予。
根据本申请的某些实施方案,本申请所述药学上可接受的盐包括所述化合物的无机或有机酸盐,以及无机或有机碱盐。例如所述药学上可接受的盐包括但不限于:所述化合物的包括钠盐、钾盐、锂盐的碱金属盐;包括钙盐、镁盐的碱土金属盐;包括铝盐、铁盐、锌盐、铜盐、镍盐、钴盐等的金属盐;葡甲胺盐、铵盐、叔辛胺盐、二苄胺盐、吗啉盐、葡糖胺盐、苯基甘氨酸烷基酯盐、单乙醇胺、二乙醇胺、三乙醇胺、N-甲基-D-葡糖胺、乙二胺盐、N-甲基葡糖胺盐、胍盐、二乙胺盐、三乙胺盐、二环己胺盐、N,N’-二苄基乙二胺盐、氯普鲁卡因盐、普鲁卡因盐、二乙醇胺盐、N-苄基-N-苯乙胺盐、哌嗪盐、四甲铵盐、三(羟甲基)氨基甲烷盐等胺盐;所述化合物与包括盐酸、氢溴酸、硫酸、磷酸、硝酸、高氯酸、富马酸、乙酸、丙酸、琥珀酸、羟基乙酸、甲酸、乳酸、马来酸、酒石酸、柠檬酸、扑酸、丙二酸、羟基马来酸、苯乙酸、谷氨酸、苯甲酸、水杨酸、富马酸、甲苯磺酸、甲磺酸、萘-2-磺酸、苯磺酸、羟基萘甲酸、氢碘酸、苹果酸、鞣酸等无机或有机酸形成的盐。
本申请所述的载体包括但不限于:离子交换剂,氧化铝,硬脂酸铝,卵磷脂,血清蛋白如人血白蛋白,缓冲物质如磷酸盐,甘油,山梨酸,山梨酸钾,饱和植物脂肪酸的部分甘油酯混合物,水,盐或电解质,如硫酸鱼精蛋白,磷酸氢二钠,磷酸氢钾,氯化钠,锌盐,胶态氧化硅,三硅酸镁,聚乙烯吡咯烷酮,纤维素物质,聚乙二醇,羧甲基纤维素钠,聚丙烯酸酯,蜂蜡,羊毛脂。
本申请中使用的术语“赋形剂”是指在药物制剂中除主药以外的附加物。其性质稳定,与主药无配伍禁忌,不产生副作用,不影响疗效,在常温下不易变形、干裂、霉变、虫蛀、对人体无害、无生理作用,不与主药产生化学或物理作用,不影响主药的含量测定等。如片剂中的黏合剂、填充剂、崩解剂、润滑剂;口服液体制剂中的防腐剂、抗氧剂、矫味剂、芳香剂、助溶剂、乳化剂、增溶剂、渗透压调节剂、着色剂等均可称为赋形剂,等等。
本申请中,对于同一化合物而言,若化合物名称与结构式不一致,以化合物结构式为准。
具体实施方式
为了进一步说明本申请,以下结合具体实施例对本申请的细胞周期蛋白依赖性激酶抑制活性化合物及其制备方法和应用作进一步的描述,但本申请的保护范围不限于此。
缩写术语释义:
BOC表示叔丁氧羰基;
ACN表示乙腈;
(Boc)2O表示二碳酸二叔丁酯;
Cs2CO3表示碳酸铯;
DMF表示N,N-二甲基甲酰胺;
DMSO表示二甲基亚砜;
NMP表示N-甲基吡咯烷酮;
NBS表示N-溴代丁二酰亚胺;
DCM表示二氯甲烷;
DIPEA表示N,N-二异丙基乙胺;
DMAP表示4-N,N-二甲氨基吡啶;
THF表示四氢呋喃;
TFA表示三氟乙酸;
TEA表示三乙胺;
K2CO3表示碳酸钾;
KOAc表示乙酸钾;
Pd(dppf)Cl2表示[1,1'-双(二苯基膦基)二茂铁]二氯化钯;
Pd2(dba)3表示三二亚苄基丙酮二钯;
Pd(t-Bu3P)2表示二(三叔丁基膦钯);
PCy3表示三环己基膦;
DIAD表示偶氮二羧酸二异丙酯;
PPh3表示三苯基膦;
Xantphos表示4,5-双(二苯基膦)-9,9-二甲基氧杂蒽;
Pd(OAc)2表示乙酸钯;
SEM表示2-(三甲硅烷基)乙氧甲基;
EA表示乙酸乙酯;
Pd(PCy)2Cl2表示二环己基膦二氯化钯;
Xphos Pd G3表示甲磺酸(2-二环己基膦-2',4',6'-三异丙基-1,1'-联苯基)(2'-氨基-1,1'-联苯-2-基)钯(II);
Brettphos Pd G3表示甲烷磺酸(2-二环己基膦)-3,6-二甲氧基-2',4',6'-三异丙基-1,1'-联苯)(2'-氨基-1,1'-联苯-2-基)钯(II)
Zn(CN)2表示氰化锌;
Pd(TFA)2表示三氟乙酸钯;
HATU表示2-(7-氮杂苯并三氮唑)-N,N,N',N'-四甲基脲六氟磷酸酯;
HOBt表示1-羟基苯并三唑;
EDCI表示1-(3-二甲胺基丙基)-3-乙基碳二亚胺;
DIEA表示N,N-二异丙基乙胺;
Py表示吡啶;
NIS表示N-碘代丁二酰亚胺。
本申请化合物的合成方法
本申请还提供了所述化合物的合成方法,本申请的合成方法主要从化学文献中报道的制备方法或者以市售化学试剂为起始物料进行相关合成。
实施例1:(R)-4-(1H-吲哚-3-基)-6-(吡咯烷-3-基氨基)-1,7-萘啶-3-甲腈的制
备
标题化合物合成路线如下
具体步骤
步骤1:3-(3-氰基-6-氟-1,7-萘啶-4-基)-1H-吲哚-1-甲酸叔丁酯的制备
在氮气保护下,将4-氯-6-氟-1,7-萘啶-3-甲腈(400mg,1.93mmol)和(1-(甲酸叔丁酯)-1H-吲哚-3-基)硼酸(603mg,2.31mmol)溶于二氧六环(10mL)和水(2mL)中,然后加入K2CO3(665mg,4.82mmol)和Pd(dppf)Cl2(141mg,192μmol),体系于80℃搅拌反应4h。反应完全后,向反应液中加入水稀释,然后乙酸乙酯萃取两次,合并有机相用饱和食盐水洗一次,有机相无水硫酸钠干燥,过滤浓缩,粗品经柱层析分离得到化合物1A。
MS(ESI)m/z 389.1(M+H)+
1HNMR(400MHz,CDCl3-d)δ=9.39(s,1H),9.17(s,1H),8.32(d,J=8.4Hz,1H),8.04(s,1H),7.52-7.45(m,1H),7.34-7.29(m,2H),7.21(d,J=7.8Hz,1H),1.74(s,9H)
步骤2:(3R)-3-((3-氰基-4-(1H-吲哚-3-基)-1,7-萘啶-6-基)氨基)吡咯烷-1-甲酸叔丁酯的制备
将3-(3-氰基-6-氟-1,7-萘啶-4-基)-1H-吲哚-1-甲酸叔丁酯(300mg,772μmol)溶于DMSO(6mL)中,然后加入(R)-3-氨基吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(215.8mg,1.16mmol),体系在120℃搅拌反应3h。反应完全后,向反应液中加入水稀释,然后乙酸乙酯萃取两次,合并有机相用饱和食盐水洗一次,无水硫酸钠干燥,过滤浓缩,粗品经柱层析分离得到化合物1B。
MS(ESI)m/z 455.2(M+H)+
1H NMR(400MHz,CDCl3-d)δ=9.21(s,1H),9.04(s,1H),8.79(s,1H),8.17(s,1H),7.71(s,1H),7.60-7.53(m,1H),7.43-7.38(m,1H),7.37-7.31(m,2H),6.62(s,1H),4.72-4.51(m,1H),4.49-4.28(m,1H),3.25(s,1H),3.04(d,J=15.2Hz,2H),2.00-1.96(m,1H),1.88(d,J=11.1Hz,1H),1.44(s,9H)
步骤3:(R)-4-(1H-吲哚-3-基)-6-(吡咯烷-3-基氨基)-1,7-萘啶-3-甲腈的制备
将(3R)-3-((3-氰基-4-(1H-吲哚-3-基)-1,7-萘啶-6-基)氨基)吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(100mg,220μmol)溶于DCM(1mL)中,然后加入氯化氢的1,4-二氧六环(4M,1mL)中,体系在室温下反应1h。反应完全后,将反应液减压浓缩,得到的粗品直接用高压制备分离纯化得到实施例1化合物。
MS(ESI)m/z 355.2(M+H)+
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ=11.78(s,1H),9.08(s,1H),8.73(s,1H),7.87(s,1H),7.58(d,J=8.4Hz,1H),7.34(d,J=7.9Hz,1H),7.25(t,J=7.6Hz,1H),7.15-7.08(m,1H),6.84(s,1H),6.59(s,1H),3.98(s,1H),2.91-2.80(m,2H),2.76-2.60(m,2H),1.86(s,1H),1.93-1.54(m,1H),1.54(d,J=5.5Hz,1H)
实施例2:(S)-4-(1H-吲哚-3-基)-6-(-哌啶-3-基氨基)-1,7-萘啶-3-甲腈的制备
参照实施例1中的制备方法,其中步骤2用(S)-3-氨基哌啶-1-甲酸叔丁酯替代(R)-3-氨基吡咯烷-1-甲酸叔丁酯,其他步骤及原料与实施例1相同,得到实施例2化合物。
MS(ESI)m/z 369.2(M+H)+
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ=11.95(s,1H),9.07(s,1H),8.74(s,1H),7.91(s,1H),7.57(d,J=8.3Hz,1H),7.33(d,J=7.9Hz,1H),7.24(t,J=7.5Hz,1H),7.14-7.08(m,1H),6.90(d,J=7.7Hz,1H),6.65(d,J=3.7Hz,1H),3.60(s,1H),3.03(d,J=11.0Hz,2H),2.78(d,J=11.1Hz,1H),1.86(s,2H),1.59(s,1H),1.32(d,J=8.7Hz,3H)
实施例3:6-(((1R,3S)-3-氨基环戊基)氨基)-4-(1H-吲哚-3-基)-1,7-萘啶-3-甲
腈的制备
参照实施例1中的制备方法,其中步骤2用((1S,3R)-3-氨基环戊基)氨基甲酸叔丁酯替代(R)-3-氨基吡咯烷-1-甲酸叔丁酯,其他步骤及原料与实施例1相同,得到实施例3化合物。
MS(ESI)m/z 369.2(M+H)+
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δppm 1.12-1.24(m,1H),1.28-1.38(m,1H),1.47-1.82(m,4H),2.02-2.11(m,1H),3.13-3.17(m,1H),3.66-3.94(m,2H),6.55(d,J=4.89Hz,1H),7.11(d,J=5.01Hz,2H),7.25(t,J=7.57Hz,1H),7.34(d,J=7.87Hz,1H),7.57(d,J=8.23Hz,1H),7.93(s,1H),8.73-8.76(m,1H),9.05-9.09(m,1H),11.81-12.13(m,1H).
实施例4:N-(4-((3R)-3-((3-氰基-4-(1H-吲哚-3-基)-1,7-萘啶-6-基)氨基)吡
咯烷-1-羰基)苯基)丙烯酰胺的制备
标题化合物合成路线如下:
具体步骤
步骤1:N-(4-((3R)-3-((3-氰基-4-(1H-吲哚-3-基)-1,7-萘啶-6-基)氨基)吡咯烷-1-羰基)苯基)丙烯酰胺的制备
将(R)-4-(1H-吲哚-3-基)-6-(吡咯烷-3-基氨基)-1,7-萘啶-3-甲腈(50.0mg,141μmol)和4-丙烯酰氨苯甲酸(32.4mg,169μmol)溶于DCM(1mL)中,然后加入三正丙基环磷酸酐50%乙酸乙酯溶液(67.3mg,211μmol)和DIPEA(36.5mg,282μmol),体系在室温下反应16h。反应完全后,将反应液减压浓缩,得到的粗品直接用高压制备分离纯化得到实施例4化合物。
MS(ESI)m/z 528.2(M+H)+
1HNMR(400MHz,DMSO-d6)δ=11.98(s,1H),10.32(s,1H),9.21-9.02(m,1H),8.77(d,J=12.6Hz,1H),7.92(d,J=14.5Hz,1H),7.78-7.54(m,4H),7.48(s,2H),7.40-7.06(m,3H),6.97-6.58(m,1H),6.43(s,1H),6.29(s,1H),5.79(s,1H),4.45-3.74(m,5H),2.12(s,1H),1.89(s,1H).
实施例5:N-(4-((3S)-3-((3-氰基-4-(1H-吲哚-3-基)-1,7-萘啶-6-基)氨基)吡
咯烷-1-羰基)噻唑-2-基)丙烯酰基酰胺的制备
参照实施例4中的制备方法,用2-丙烯酰氨基噻唑-4-羧酸替代4-丙烯酰氨苯甲酸,其他原料与实施例4相同,得到实施例5化合物。
MS(ESI)m/z 535.2(M+H)+
1HNMR(400MHz,DMSO-d6)δppm 12.37(s,1H),11.97(s,1H),9.12(d,J=14.99Hz,1H),8.78(d,J=7.28Hz,1H),7.84-7.98(m,1H),7.73(s,1H),7.50-7.61(m,1H),7.13-7.40(m,4H),6.69(d,J=13.45Hz,1H),6.45-6.59(m,1H),6.32-6.45(m,1H),5.91(t,J=9.37Hz,1H),4.30-4.54(m,1H),3.98-4.21(m,1H),3.90(s,1H),3.56-3.77(m,2H),2.07(s,1H),1.75(s,1H)
实施例6:(R)-4-(1H-吲哚-3-基)-6-((1-(4-(异丙基氨基)苯甲酰)吡咯烷-3-基)
氨基)-1,7-萘啶-3-甲腈的制备
参照实施例4中的制备方法,用4-(异丙基氨基)苯甲酸替代4-丙烯酰氨苯甲酸,其他原料与实施例4相同,得到实施例6化合物。
MS(ESI)m/z 516.2(M+H)+。
1HNMR(400MHz,DMSO-d6)δ=11.96(s,1H),9.09(s,1H),8.77(s,1H),7.92(s,1H),7.57(d,J=7.7Hz,1H),7.41-7.26(m,4H),7.25-7.01(m,2H),6.71(s,1H),6.50(d,J=8.3Hz,2H),5.88(d,J=7.8Hz,1H),4.30(s,1H),3.73(s,1H),3.67-3.42(m,3H),3.36(s,1H),2.08(d,J=3.9Hz,1H),1.84(s,1H),1.11(d,J=6.2Hz,6H)
实施例7:(R)-N-(4-(3-((3-氰基-4-(1H-吲哚-3-基)-1,7-萘啶-6-基)氨基)吡咯 烷-1-羰基)苯基)乙酰胺的制备
参照实施例4中的制备方法,用4-乙酰胺基苯甲酸替代4-丙烯酰氨苯甲酸,其他原料与实施例4相同,得到实施例7化合物。
MS(ESI)m/z 516.2(M+H)+。
1HNMR(400MHz,DMSO-d6)δ=11.96(d,J=7.9Hz,1H),10.09(s,1H),9.20-8.99(m,1H),8.77(d,J=13.0Hz,1H),7.92(d,J=16.8Hz,1H),7.59(t,J=9.0Hz,3H),7.49-7.40(m,2H),7.38-7.18(m,3H),7.15-6.88(m,1H),6.82-6.55(m,1H),4.43-4.13(m,1H),3.78-3.57(m,1H),3.54-3.39(m,3H),2.22-2.09(m,1H),2.04(s,3H),1.88(s,1H)
实施例8:(R)-6-((-1-(4-(1H-咪唑-2-基)苯甲酰)吡咯烷-3-基)氨基)-4-(1H-吲
哚-3-基)-1,7-萘啶-3-甲腈的制备
参照实施例4中的制备方法,用4-(1H-咪唑-2-基)苯甲酸替代4-丙烯酰氨苯甲酸,其他原料与实施例4相同,得到实施例8化合物。
MS(ESI)m/z 525.2(M+H)+。
1HNMR(400MHz,DMSO-d6)δppm 12.60(s,1H),11.96(d,J=9.66Hz,1H),9.00-9.20(m,1H),8.78(d,J=17.73Hz,1H),7.86-8.00(m,3H),7.49-7.65(m,3H),7.08-7.42(m,5H),7.04(s,1H),6.61-6.77(m,1H),4.16-4.48(m,1H),3.74(s,1H),3.61(s,1H),3.42-3.58(m,2H),2.03-2.23(m,1H),1.91(s,1H).
实施例9:(R)-4-(1H-吲哚-3-基)-6-((1-(4-(4-甲基-1H-1,2,3-三唑-1-基)苯甲
酰)吡咯烷-3-基)氨基)-1,7-萘啶-3-甲腈的制备
参照实施例4中的制备方法,用4-(4-甲基-1H-1,2,3-三唑-1-基)苯甲酸替代4-丙烯酰氨苯甲酸,其他原料与实施例4相同,得到实施例9化合物。
MS(ESI)m/z 540.2(M+H)+。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δppm 11.96(d,J=9.9Hz,1H),9.03-9.16(m,1H),8.77(d,J=16.5Hz,1H),8.58(d,J=7.5Hz,1H),7.85-7.98(m,3H),7.69(t,J=9.6Hz,2H),7.57(d,J=8.4Hz,1H),7.07-7.41(m,4H),6.60-6.77(m,1H),4.19-4.45(m,1H),3.38-3.79(m,4H),2.32(d,J=3.1Hz,3H),1.75-2.19(m,2H).
实施例10:(R)-6-((-1-(4-(1H-吡唑-1-基)苯甲酰)吡咯烷-3-基)氨基)-4-(1H-
吲哚-3-基)-1,7-萘啶-3-甲腈的制备
参照实施例4中的制备方法,用4-(1H-吡唑-1-基)苯甲酸替代4-丙烯酰氨苯甲酸,其他原料与实施例4相同,得到实施例10化合物。
实施例11:(3R)-N-(4-(3-((3-氰基-4-(1H-吲哚-3-基)-1,7-萘啶-6-基)氨基)吡
咯烷-1-羰基)苯基)甲磺酰胺的制备
参照实施例4中的制备方法,用4-(甲基磺酰氨基)苯甲酸替代4-丙烯酰氨苯甲酸,其他原料与实施例4相同,得到实施例11化合物。
MS(ESI)m/z 552.2(M+H)+
1HNMR(400MHz,DMSO-d6)δppm 11.97(d,J=8.11Hz,1H),9.94-10.12(m,1H),9.03-9.18(m,1H),8.78(d,J=12.64Hz,1H),7.88-7.99(m,1H),7.53-7.62(m,1H),7.43-7.52(m,2H),7.06-7.41(m,6H),6.59-6.76(m,1H),4.17-4.44(m,1H),3.49-3.84(m,4H),3.03(d,J=5.60Hz,3H),2.00-2.20(m,1H),1.75-1.98(m,1H).
实施例12:(3R)-4-(1H-吲哚-3-基)-6-((1-(4-(5-甲基-1,3,4-恶二唑-2-基)苯
甲酰基)吡咯烷-3-基)氨基)-1,7-萘啶-3-甲腈的制备
标题化合物合成路线如下:
具体步骤
步骤1:(3R)-4-(1H-吲哚-3-基)-6-((1-(4-(5-甲基-1,3,4-恶二唑-2-基)苯甲酰基)吡咯烷-3-基)氨基)-1,7-萘啶-3-甲腈的制备
在室温下,分别将DIPEA(255mg,1.98mmol),HOBt(45.7mg,338μmol)和EDCI(64.9mg,338μmol)加入到4-(5-甲基-1,3,4-恶二唑-2-基)苯甲酸(69.1mg,338μmol)的DMF(1mL)溶液中,搅拌2分钟后,将(R)-4-(1H-吲哚-3-基)-6-(吡咯烷-3-基氨基)-1,7-萘啶-3-甲腈(100mg,282μmol)加入到上述反应体系中,然后在室温下反应12h。反应完全后,将反应液减压浓缩,得到的粗品直接用高压制备分离纯化得到实施例12化合物。
MS(ESI)m/z 541.2(M+H)+
1HNMR(400MHz,DMSO-d6)δppm 11.97(d,J=9.17Hz,1H),9.03-9.17(m,1H),8.78(d,J=15.65Hz,1H),8.00(t,J=8.68Hz,2H),7.93(d,J=18.58Hz,1H),7.64-7.73(m,2H),7.53-7.61(m,1H),7.08-7.41(m,4H),6.60-6.77(m,1H),4.12-4.49(m,2H),3.40-3.80(m,3H),2.59(d,J=4.03Hz,3H),2.04-2.22(m,1H),1.77-2.02(m,1H).
实施例13:(R,E)-N-(4-(3-((3-氰基-4-(1H-吲哚-3-基)-1,7-萘啶-6-基)氨基)
吡咯烷-1-羰基)苯基)-4-(二甲基氨基)丁-2-烯酰胺的制备
标题化合物合成路线如下:
具体步骤
步骤1:(R,E)-N-(4-(3-((3-氰基-4-(1H-吲哚-3-基)-1,7-萘啶-6-基)氨基)吡咯烷-1-羰基)苯基)-4-(二甲基氨基)丁-2-烯酰胺的制备
将(R)-4-(1H-吲哚-3-基)-6-(吡咯烷-3-基氨基)-1,7-萘啶-3-甲腈(45mg,0.13mmol),(E)-4-(4-(二甲基氨基)丁-2-烯氨基)苯甲酸(38.7mg,0.156mmol),DIPEA(50.3mg,0.39mmol)溶于DCM(10mL)中,分批加入HATU(54.3mg,0.143mmol),加完后,体系在室温反应2h。反应完全后,将反应液减压浓缩,得到的粗品直接用高压制备分离纯化得到实施例13化合物。
MS(ESI)m/z 585.3(M+H)+
1HNMR(400MHz,DMSO-d6)δ11.97(d,J=9.8Hz,1H),10.22(s,1H),9.11(d,J=32.8Hz,1H),8.78(d,J=14.4Hz,1H),7.93(d,J=17.0Hz,1H),7.69(d,J=8.2Hz,2H),7.63–7.54(m,1H),7.48(t,J=9.7Hz,2H),7.35(dd,J=12.6,6.9Hz,2H),7.24(q,J=13.2,10.5Hz,1H),7.14(q,J=10.0,7.1Hz,1H),6.75(d,J=15.0Hz,2H),6.32–6.23(m,1H),4.34(d,J=27.9Hz,2H),3.73(s,1H),3.61(d,J=8.7Hz,1H),3.50(s,1H),3.39(d,J=12.4Hz,1H),3.06(d,J=5.7Hz,2H),2.18(s,6H),1.87(s,1H).
实施例14:(3R)-6-((1-(4-氯苯甲酰)吡咯烷-3-基)氨基)-4-(1H-吲哚-3-基)-1,
7-萘啶-3-甲腈的制备
标题化合物合成路线如下:
具体步骤
步骤1:(R,E)-N-(4-(3-((3-氰基-4-(1H-吲哚-3-基)-1,7-萘啶-6-基)氨基)吡咯烷-1-羰基)苯基)-4-(二甲基氨基)丁-2-烯酰胺的制备
将(R)-4-(1H-吲哚-3-基)-6-(吡咯烷-3-基氨基)-1,7-萘啶-3-甲腈(100mg,256μmol)溶于DCM(10mL)中,向反应液中加入DIPEA(99.2mg,767μmol),将体系冷至0℃,向反应液中缓慢滴加4-氯苯甲酰氯(35.8mg,204.7μmol),滴加完后,体系在0℃反应1h。反应完全后,向反应液中加入饱和氯化氨水溶液淬灭反应,加入乙酸乙酯萃取,有机相用饱和食盐水洗一次,用无水硫酸钠干燥,过滤浓缩,得到的粗品直接用高压制备分离纯化得到实施例14化合物。
MS(ESI)m/z 493.1(M+H)+
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ=11.36-12.29(m,1H),9.01-9.20(m,1H),8.78(d,J=11.25Hz,1H),7.93(d,J=15.16Hz,1H),7.43-7.63(m,5H),7.18-7.40(m,3H),6.85-7.15(m,1H),6.57-6.74(m,1H),4.19-4.44(m,1H),3.58-3.78(m,1H),3.45-3.57(m,1H),3.40(d,J=8.56Hz,1H),3.25(d,J=10.15Hz,1H),2.11(s,1H),1.78-1.99(m,1H).
实施例15:(3R)-4-(1H-吲哚-3-基)-6-((1-(异噻唑-5-羰基)吡咯烷-3-基)氨
基)-1,7-萘啶-3-甲腈的制备
如实施例14中的制备方法,用4-(甲基磺酰氨基)苯甲酸替代4-氯苯甲酰氯,其他原料与实施例14相同,得到实施例15化合物。
MS(ESI)m/z 450.2(M+H)+
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ=12.01(s,1H),9.13(d,J=9.38Hz,1H),8.79(d,J=4.38Hz,1H),8.74(d,J=1.75Hz,1H),7.91-7.96(m,1H),7.57(d,J=8.13Hz,1H),7.30-7.41(m,2H),7.20-7.27(m,1H),7.11(dd,J=12.94,8.32Hz,1H),6.98-7.03(m,1H),6.67-6.73(m,1H),4.40(s,2H),3.98-3.97(d,J=13.38Hz,1H),3.81(s,1H),3.61-3.59(m,1H),1.86-2.01(m,1H),1.95(s,1H).
实施例16:(3R)-1-丙烯酰吡咯烷-3-基-3-((3-氰基-4-(1H-吲哚-3-基)-1,7-萘
啶-6-基)氨基)吡咯烷-1-甲酸基酯的制备
标题化合物合成路线如下:
具体步骤
步骤1:叔丁基-3-(((4-硝基苯氧基)羰基)氧代)吡咯烷-1-甲酸酯的制备
将叔丁基-3-羟基吡咯烷-1-甲酸基酯(3.00g,16.0mmol)和DIPEA(3.11g,24.0mmol,4.19mL)溶于THF(30.0mL)中,将4-硝基氯甲酸苯酯(3.23g,16.0mmol)在0℃下分批加入上述反应体系中,然后在室温下反应2h。反应完全后,反应液直接用于下一步反应。
步骤2:(3R)-1-(叔丁氧羰基)吡咯烷-3-基-3-((3-氰基-4-(1H-吲哚-3-基)-1,7-萘啶-6-基)氨基)吡咯烷-1-甲酸酯的制备
将4-(1H-吲哚-3-基)-6-((R)-吡咯烷-3-基氨基)-1,7-萘啶-3-甲腈(400mg,1.13mmol)和DIPEA(291mg,2.26mmol,393μL)溶于THF(4.00mL)中,在0℃下加入含有叔丁基-3-(((4-硝基苯氧基)羰基)氧代)吡咯烷-1-甲酸酯(795mg,2.26mmol)的反应液,在室温下反应12h。
反应完全后,浓缩反应液,粗品经柱层析分离得到化合物16B。
MS(ESI)m/z568.3(M+H)+
1HNMR(400MHz,DMSO-d6)δppm 12.02(s,1H),9.13-9.24(m,1H),8.78-8.94(m,1H),7.97(s,1H),7.62(d,J=8.3Hz,1H),7.27-7.43(m,3H),7.16(t,J=6.8Hz,1H),6.67-6.77(m,1H),5.09(s,1H),4.31(s,1H),3.11-3.43(m,8H),1.29-1.57(m,12H).
步骤3:(3R)-吡咯烷-3-基-3-((3-氰基-4-(1H-吲哚-3-基)-1,7-萘啶-6-基)氨基)吡咯烷-1-甲酸酯的制备
在室温下,将(3R)-1-(叔丁氧羰基)吡咯烷-3-基-3-((3-氰基-4-(1H-吲哚-3-基)-1,7-萘啶-6-基)氨基)吡咯烷-1-甲酸酯(260mg,458μmol)溶于DCM(2.34mL)中,然后加入TFA(0.26mL),加完后反应体系在室温下反应5h。反应完全后,浓缩反应液,最后得到化合物16C。
MS(ESI)m/z 468.3(M+H)+
1HNMR(400MHz,DMSO-d6)δppm 12.55-14.35(m,3H),11.95(s,1H),8.90-9.10(m,2H),8.72(s,1H),7.86(d,J=2.2Hz,1H),7.52(d,J=8.2Hz,1H),7.01-7.30(m,3H),6.64(d,J=6.2Hz,1H),5.10(s,1H),4.11-4.41(m,1H),3.29-3.62(m,3H),3.04-3.23(m,3H),1.65-2.18(m,4H).
步骤4:(3R)-1-丙烯酰吡咯烷-3-基-3-((3-氰基-4-(1H-吲哚-3-基)-1,7-萘啶-6-基)氨基)吡咯烷-1-甲酸酯的制备
将(3R)-吡咯烷-3-基-3-((3-氰基-4-(1H-吲哚-3-基)-1,7-萘啶-6-基)氨基)吡咯烷-1-甲酸酯(214mg,457μmol)和TEA(185mg,1.83mmol,254.84μL)溶于DCM(2.14mL)中,在0℃下将丙烯酰氯(41.4mg,457μmol,37.32μL)缓慢滴加进反应体系中,反应在0℃下反应2h。反应完全后,反应液在真空下浓缩,得到的粗品直接用高压制备分离纯化得到实施例16化合物。
MS(ESI)m/z 522.2(M+H)+
1HNMR(400MHz,DMSO-d6)δppm 11.96(s,1H),9.10(s,1H),8.77(s,1H),7.92(s,1H),7.56(d,J=8.2Hz,1H),7.19-7.36(m,3H),7.10(s,1H),6.44-6.70(m,2H),6.03-6.16(m,1H),5.55-5.70(m,1H),5.03-5.18(m,1H),4.24(s,1H),3.33-3.81(m,7H),3.16(d,J=14.8Hz,1H),1.67-2.21(m,4H).
实施例17:N-(4-(((3R)-3-((3-氰基-4-(1H-吲哚-3-基)-1,7-萘啶-6-基)氨基)
吡咯烷-1-基)甲基)苯基)-N-甲基丙烯酰胺的制备
标题化合物合成路线如下:
具体步骤
步骤1:N-(4-(((3R)-3-((3-氰基-4-(1H-吲哚-3-基)-1,7-萘啶-6-基)氨基)吡咯烷-1-基)甲基)苯基)-N-甲基丙烯酰胺的制备
将4-(1H-吲哚-3-基)-6-((R)-吡咯烷-3-基氨基)-1,7-萘啶-3-甲腈(60.0mg,169μmol)和N-(4-甲酰基苯基)-N-甲基丙烯酰胺(35.2mg,186μmol)溶于DCM(3mL)中,然后加入冰乙酸(101.6μg,1.69μmol),体系在室温下搅拌反应1h,然后加入醋酸硼氢化钠(71.7mg,339μmol),在室温下继续搅拌反应16h。反应完全后,向反应液中加入水淬灭反应,加入乙酸乙酯萃取,有机相用饱和食盐水洗一次,用无水硫酸钠干燥,过滤浓缩,得到的粗品直接用高压制备分离纯化得到实施例17化合物。
MS(ESI)m/z 528.2(M+H)+
1HNMR(400MHz,DMSO-d6)δ=11.96(s,1H),9.07(s,1H),8.75(s,1H),7.93(s,1H),7.57(d,J=8.1Hz,1H),7.40-7.28(m,3H),7.27-7.15(m,4H),7.14-6.94(m,1H),6.68-6.55(m,1H),6.18-6.09(m,1H),6.02(s,1H),5.53(d,J=11.7Hz,1H),4.19-3.98(m,1H),3.64-3.47(m,2H),3.22(s,3H),2.80-2.55(m,2H),2.46-2.34(m,2H),2.07(s,1H),1.64(m,1H).
实施例18:4-(1H-吲哚-3-基)-6-(((R)-1-((2-甲基-1I-苯并[d]咪唑-5-基)甲
基)吡咯烷-3-基)氨基)-1,7-萘啶-3-甲腈的制备
参照实施例17中的制备方法,用2-甲基-1H-苯并咪唑-5-甲醛替代N-(4-甲酰基苯基)-N-甲基丙烯酰胺,其他原料与实施例17相同,得到实施例18化合物。
MS(ESI)m/z 499.2(M+H)+
1HNMR(400MHz,DMSO-d6)δppm 11.98(d,J=9.76Hz,1H),9.06(s,1H),8.74(s,1H),7.92(s,1H),7.57(dd,J=6.69,5.32Hz,1H),7.07-7.40(m,6H),7.01(d,J=8.13Hz,2H),6.57-6.66(m,1H),3.96-4.18(m,1H),3.49-3.69(m,4H),2.72-2.80(m,1H),2.63-2.84(m,1H),2.45(s,3H),2.00-2.12(m,1H),1.54-1.70(m,1H).
实施例19:4-(1H-吲哚-3-基)-6-(((R)-1-(4-吗啉代苄基)吡咯烷-3-基)氨基)-
1,7-萘啶-3-甲腈的制备
参照实施例17中的制备方法,用4-吗啉代苯甲醛替代N-(4-甲酰基苯基)-N-甲基丙烯酰胺,其他原料与实施例17相同,得到实施例19化合物。
MS(ESI)m/z 530.3(M+H)+
1HNMR(400MHz,DMSO-d6)δppm 11.96(s,1H),9.06(s,1H),8.75(s,1H),7.92(s,1H),7.58(d,J=8.19Hz,1H),7.20-7.37(m,2H),6.99-7.19(m,4H),6.86(d,J=5.75Hz,2H),6.60(d,J=15.53Hz,1H),3.97-4.20(m,1H),3.67-3.77(m,4H),3.37-3.50(m,3H),3.05(d,J=4.16Hz,3H),2.54-2.77(m,2H),2.27-2.43(m,2H),1.98-2.12(m,1H),1.54-1.71(m,1H).
实施例20:4-(1H-吲哚-3-基)-6-(((R)-1-(4-(4-甲基-1H-1,2,3-三唑-1-基)苯
甲基)吡咯烷-3-基)氨基)-1,7-萘啶-3-甲腈的制备
参照实施例17中的制备方法,用4-(4-甲基-1H-1,2,3-三唑-1-基)苯甲醛替代N-(4-甲酰基苯基)-N-甲基丙烯酰胺,其他原料与实施例17相同,得到实施例20化合物。
MS(ESI)m/z 526.2(M+H)+
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δppm 11.97(s,1H),9.08(s,1H),8.76(s,1H),8.50(s,1H),7.94(s,1H),7.78(t,J=7.69Hz,2H),7.55-7.61(m,1H),7.46(d,J=8.34Hz,2H),7.18-7.37(m,3H),6.98-7.16(m,1H),6.62(d,J=19.43Hz,1H),4.03-4.21(m,1H),3.56-3.67(m,2H),2.68(s,1H),2.56-2.61(m,1H),2.37-2.46(m,2H),2.33(s,3H),2.04-2.15(m,1H),1.58-1.75(m,1H).
实施例21:4-(1H-吲哚-3-基)-6-(((R)-1-(4-吗啉代苄基)吡咯烷-3-基)氨基)-
1,7-萘啶-3-甲腈的制备
参照实施例17中的制备方法,用4-(2-氧吡咯烷-1-基)苯甲醛替代N-(4-甲酰基苯基)-N-甲基丙烯酰胺,其他原料与实施例17相同,得到实施例21化合物。
MS(ESI)m/z 528.2(M+H)+
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δppm 11.97(s,1H),9.06(s,1H),8.75(s,1H),7.92(dd,J=4.30,3.20Hz,1H),7.52-7.59(m,3H),6.99-7.37(m,6H),6.56-6.65(m,1H),3.98-4.17(m,1H),3.80(t,J=6.73Hz,2H),3.43-3.56(m,2H),2.53-2.75(m,2H),2.44-2.47(m,2H),2.29-2.41(m,2H),1.99-2.09(m,3H),1.54-1.70(m,1H).
实施例22:4-(1H-吲哚-3-基)-6-(((R)-1-(4-((3-甲基噁丁环烷-3-基)氨基)苯
甲基)吡咯烷-3-基)氨基)-1,7-萘啶-3-甲腈的制备
参照实施例17中的制备方法,用4-[(3-甲基噁丁环烷-3-基)氨基]苯甲醛替代N-(4-甲酰基苯基)-N-甲基丙烯酰胺,其他原料与实施例17相同,得到实施例22化合物。
MS(ESI)m/z 530.3(M+H)+
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ11.96(s,1H),9.07(s,1H),8.75(s,1H),7.93(s,1H),7.58(d,J=8.2Hz,1H),7.20-7.37(m,2H),7.04(d,J=7.0Hz,2H),6.96(d,J=8.2Hz,2H),6.55-6.64(m,1H),6.29(d,J=7.0Hz,2H),5.95(s,1H),4.58(d,J=5.62Hz,2H),4.43(d,J=5.62Hz,2H),3.95-4.16(m,2H)2.32~2.40(m,4H),2.02~2.04(m,1H),1.59(m,2H),1.52(s,3H)
实施例23:N-(4-(((3R)-3-((3-氰基-4-(1H-吲哚-3-基)-1,7-萘啶-6-基)氨基)
吡咯烷-1-基)甲基)苯基)-N-甲基丙烯酰胺的制备
标题化合物合成路线如下:
具体步骤
步骤1:4-(1H-吲哚-3-基)-6-(((R)-1-((5-硝基吡啶-2-基)甲基)吡咯烷-3-基)氨基)-1,7-萘啶-3-甲腈的制备
如实施例17中的制备方法,用5-硝基甲基吡啶醛替代N-(4-甲酰基苯基)-N-甲基丙烯酰胺,其他原料与实施例17相同,得到23A化合物。
MS(ESI)m/z 491.2(M+H)+
步骤2:6-(((R)-1-((5-氨基吡啶-2-基)甲基)吡咯烷-3-基)氨基)-4-(1H-吲哚-3-基)-1,7-萘啶-3-甲腈的制备
在0℃下,将氯化铵(218mg,4.08mmol)慢慢加入到4-(1H-吲哚-3-基)-6-(((R)-1-((5-硝基吡啶-2-基)甲基)吡咯烷-3-基)氨基)-1,7-萘啶-3-甲腈(200mg,407μmol),锌(266mg,4.08mmol)的水(0.5mL)和甲醇(0.5mL)溶液中,将反应体系加热至65℃反应12h。反应完全后,反应液经硅藻土过滤,滤液在真空下浓缩,粗品经高压制备分离纯化得到实施例23化合物。
MS(ESI)m/z 461.2(M+H)+
1HNMR(400MHz,DMSO-d6)δppm 11.96(s,1H),9.07(s,1H),8.75(s,1H),7.92(s,1H),7.82(s,1H),7.57(d,J=7.70Hz,1H),6.94-7.42(m,6H),6.87(s,1H),6.51-6.67(m,1H),5.16(s,2H),3.93-4.25(m,1H),3.48(s,1H),2.67(s,2H),2.27-2.46(m,2H),2.04(s,1H),1.62(s,1H).
实施例24:6-(((S)-1-(4-(1H-咪唑-2-基)苯甲酰)哌啶-3-基)氨基)-4-(1H-吲
哚-3-基)-1,7-萘啶-3-甲腈的制备
标题化合物合成路线如下
具体步骤
步骤1:6-(((S)-1-(4-(1H-咪唑-2-基)苯甲酰)哌啶-3-基)氨基)-4-(1H-吲哚-3-基)-1,7-萘啶-3-甲腈的制备
将4-(1H-吲哚-3-基)-6-((S)-哌啶-3-基氨基)-1,7-萘啶-3-甲腈(190mg,496μmol)溶于DCM(2mL)中然后一次加入DIPEA(50.5mg,390μmol,68.0μL),4-(1H-咪唑-2-基)苯甲酸(14.7mg,78.1μmol)和三正丙基环磷酸酐50%乙酸乙酯溶液(62.1mg,97.7μmol,58.1μL,50%purity),加完后,反应体系在室温下反应16h。反应完全后,将反应液进行浓缩,粗品经高压制备分离纯化得到实施例24化合物。
MS(ESI)m/z 539.2(M+H)+
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δppm 12.55(s,1H),11.95(s,1H),8.57-9.20(m,2H),8.13(s,1H),7.67-8.01(m,3H),7.52-7.65(m,1H),6.86-7.51(m,8H),6.51-6.85(m,1H),2.75-3.20(m,4H),1.69-2.07(m,2H),1.43-1.62(m,2H).
实施例25:4-丙烯酰基酰氨基-N-((1S,3R)-3-((3-氰基-4-(1H-吲哚-3-基)-1,7-
萘啶-6-基)氨基)环戊基)苯甲酰胺的制备
标题化合物合成路线如下
具体步骤
步骤1:6-(((S)-1-(4-(1H-咪唑-2-基)苯甲酰)哌啶-3-基)氨基)-4-(1H-吲哚-3-基)-1,7-萘啶-3-甲腈的制备
将6-(((1R,3S)-3-氨基环戊基)氨基)-4-(1H-吲哚-3-基)-1,7-萘啶-3-甲腈(190mg,469.26μmol,HCl)溶于DCM(2mL)中,然后依次加入DIPEA(363mg,2.82mmol,490μL),4-丙烯酰基酰氨基苯甲酸(107mg,563μmol)和三正丙基环磷酸酐50%乙酸乙酯溶液(447mg,703μmol,418μL),加完后,反应体系在室温下反应16h。反应完全后,将反应液进行浓缩,粗品经高压制备分离纯化得到实施例25化合物。
MS(ESI)m/z 542.2(M+H)+
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δppm 11.97(d,J=1.55Hz,1H),10.35(s,1H),9.10(s,1H),8.76(s,1H),8.21-8.29(m,1H),7.95(d,J=2.26Hz,1H),7.77-7.83(m,2H),7.69-7.75(m,2H),7.58(d,J=8.23Hz,1H),7.35(d,J=7.87Hz,1H),7.25(t,J=7.45Hz,1H),7.17(t,J=5.54Hz,1H),7.08-7.14(m,1H),6.59(d,J=8.46Hz,1H),6.39-6.53(m,1H),6.23-6.33(m,1H),5.75-5.82(m,1H),4.15-4.28(m,1H),3.93(d,J=3.81Hz,1H),2.24-2.37(m,1H),1.77-1.97(m,2H),1.64(d,J=4.41Hz,2H),1.42-1.55(m,1H).
实施例26:N-((1S,3R)-3-((3-氰基-4-(1H-吲哚-3-基)-1,7-萘啶-6-基)氨基)环
戊基)-4-(1H-咪唑-2-基)苯甲酰胺的制备
参照实施例25中的制备方法,用4-(1H-咪唑-2-基)苯甲酸替代4-丙烯酰基酰氨基苯甲酸,其他原料与实施例25相同,得到实施例26化合物。
MS(ESI)m/z 539.2(M+H)+
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δppm 11.56-12.88(m,2H),9.10(s,1H),8.76(s,1H),8.35(d,J=7.39Hz,1H),8.00(s,1H),7.96(d,J=12.76Hz,2H),7.88(d,J=8.34Hz,2H),7.59(d,J=7.87Hz,1H),7.35(d,J=7.99Hz,1H),7.08-7.27(m,5H),6.60(s,1H),4.15-4.34(m,1H),3.88-4.04(m,1H),2.29-2.38(m,1H),1.78-1.97(m,2H),1.59-1.75(m,2H),1.47-1.57(m,1H).
实施例27:6-(((1R,3S)-3-((4-(1H-吡唑-1-基)苯甲基)氨基)环戊基)氨基)-4-
(1H-吲哚-3-基)-1,7-萘啶-3-甲腈的制备
标题化合物合成路线如下
具体步骤
步骤1:6-(((1R,3S)-3-((4-(1H-吡唑-1-基)苯甲基)氨基)环戊基)氨基)-4-(1H-吲哚-3-基)-1,7-萘啶-3-甲腈的制备
将6-(((1R,3S)-3-氨基环戊基)氨基)-4-(1H-吲哚-3-基)-1,7-萘啶-3-甲腈(100mg,271μmol)和4-(1H-吡唑-1-基)苯甲醛(56.1mg,325μmol)溶解在DCM(1mL)中,然后加入TEA(13.7mg,135μmol,18.9μL)并搅拌1小时后,再向混合物中加入醋酸硼氢化钠(115mg,542μmol)和醋酸(163μg,2.71μmol),在室温下反应48h。反应完全后,将反应液进行浓缩,粗品经高压制备分离纯化得到实施例27化合物。
MS(ESI)m/z 525.2(M+H)+
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ11.95(s,1H),9.08(s,1H),8.75(s,1H),8.45(d,J=2.2Hz,1H),7.94(s,1H),7.72-7.79(m,2H),7.71-7.78(m,1H),7.57(d,J=8.0Hz,1H),7.42(d,J=8.2Hz,2H),7.35(d,J=8.2Hz,1H),7.24(t,J=7.6Hz,1H),7.11(s,1H),7.09(s,1H),6.57(s,1H),6.52-6.55(m,1H),3.87(s,1H),3.67(s,2H),2.98(d,J=4.6Hz,1H),2.07-2.18(m,1H),1.72(s,2H),1.47-1.63(m,2H),1.31(s,2H).
实施例28:6-[[(3R)-1-[4-(1H-咪唑-2-基)苯甲酰]吡咯烷-3-基]氨基]-4-(1H-
吡唑-4-基)-1,7-萘啶-3-甲腈的制备
标题化合物合成路线如下
具体步骤
步骤1:6-氟-4-(1H-吡唑-4-基)-1,7-萘啶-3-甲腈的制备
在氮气保护下,将4-氯-6-氟-1,7-萘啶-3-甲腈(1.00g,4.82mmol)和4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二噁硼戊环-2-基)-1H-吡唑(1.56g,5.30mmol)溶于二氧六环(10mL)和水(2mL)中,然后加入K2CO3(1.33g,9.63mmol)和Pd(dppf)Cl2(352mg,481μmol),反应体系在80℃下反应2h。反应完全后,向反应液中加入水稀释,然后乙酸乙酯萃取两次,合并有机相用饱和食盐水洗一次,无水硫酸钠干燥,过滤浓缩,粗品经柱层析分离得到化合物28A。
MS(ESI)m/z 240.1(M+H)+
步骤2:(R)-3-((3-氰基-4-(1H-吡唑-4-基)-1,7-萘啶-6-基)氨基)吡咯烷-1-甲酸叔丁酯的制备
将6-氟-4-(1H-吡唑-4-基)-1,7-萘啶-3-甲腈(200mg,836μmol)和(R)-3-氨基吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(311mg,1.67mmol)溶于NMP(4mL)中,体系在130℃下反应16h。反应完全后,向反应液中加入水稀释,然后乙酸乙酯萃取两次,合并有机相用饱和食盐水洗一次,无水硫酸钠干燥,过滤浓缩,粗品经柱层析分离得到化合物28B。
MS(ESI)m/z 406.2(M+H)+
1HNMR(400MHz,DMSO-d6)δ=13.98-13.36(m,1H),9.07(s,1H),8.73(s,1H),8.25-8.13(m,2H),7.36(d,J=6.4Hz,1H),6.87(s,1H),4.40(d,J=13.2Hz,1H),3.63-3.51(m,1H),3.39(d,J=8.9Hz,2H),3.16-3.08(m,1H),2.14-2.05(m,1H),1.79(s,1H),1.41-1.37(m,9H)
步骤3:4-(1H-吡唑-4-基)-6-[[(3R)-吡咯烷-3-基]氨基]-1,7-萘啶-3-甲腈的制备
将(R)-3-((3-氰基-4-(1H-吡唑-4-基)-1,7-萘啶-6-基)氨基)吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(100mg,246μmol)溶解在DCM(1mL)中,向上述溶液中加入HCl的1,4-二氧六环(4M,1mL)溶液,体系在室温下反应8h。反应完全后,将反应液减压浓缩,得到化合物28C。
MS(ESI)m/z 306.1(M+H)+
步骤4:6-[[(3R)-1-[4-(1H-咪唑-2-基)苯甲酰]吡咯烷-3-基]氨基]-4-(1H-吡唑-4-基)-1,7-萘啶-3-甲腈的制备
将4-(1H-吡唑-4-基)-6-[[(3R)-吡咯烷-3-基]氨基]-1,7-萘啶-3-甲腈(89.3mg,261μmol)溶解在THF(5mL)中,加入TEA(79.3mg,784μmol),在0℃下搅拌10分钟,向混合物中缓慢滴加4-(1H-咪唑-2-基)苯甲酰氯化(54.0mg,261μmol),反应液在0℃反应4h。反应完全后,将反应液减压浓缩,粗品经高压制备分离纯化得到实施例28化合物。
MS(ESI)m/z 476.2(M+H)+
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ13.58(s,1H),12.60(s,1H),8.95-9.14(m,1H),8.75(d,J=18.58Hz,1H),7.85-8.48(m,3H),7.51-7.66(m,2H),7.42-7.45(m,1H),7.38-7.50(m,1H),7.36-7.51(m,1H),7.20-7.33(m,1H),7.06(d,J=6.0Hz,1H),6.89(d,J=15.8Hz,1H),4.37-4.57(m,1H),3.84-3.80(d,J=13.4Hz,1H),3.42-3.74(m,2H),3.42-3.74(m,1H),1.97(s,1H).
实施例29:(S)-5-(1H-吲哚-3-基)-3-(哌啶-3-基氨基)异喹啉-6-甲腈的制备
标题化合物合成路线如下
具体步骤
步骤1:甲基2-氯-5-(4-甲氧基-4-氧亚基丁-1-烯-1-基)异尼古丁酯的制备
在氮气保护下,将甲基5-溴-2-氯异尼古丁酯(25.0g,99.8mmol)溶于1,4-二氧六环(250mL)中,然后加入二(三叔丁基膦)钯(1.02g,2.00mmol),甲基丁-3-烯酯(14.9g,149mmol)和N,N-二环己基甲胺(42.8g,219mmol),加完后,反应体系在110℃下反应16h。反应完全后,将反应体系降至室温,然后过滤,收集母液并浓缩,粗品经柱层析分离得到化合物29A。
MS(ESI)m/z 270.0(M+H)+
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δppm 8.74(s,1H),7.72-7.84(m,1H),6.93(d,J=16.10Hz,1H),6.44(m,1H),3.86-3.88(m,3H),3.62-3.65(m,3H),3.35(s,2H).
步骤2:甲基3-氯-5-羟基异喹啉-6-甲酸基酯的制备
将甲基2-氯-5-(4-甲氧基-4-氧亚基丁-1-烯-1-基)异尼古丁酯(28.0g,103mmol)溶于THF(260mL)中,在0℃下加入叔丁醇钾(16.3g,145mmol),然后体系在室温下反应2h。反应完全后,反应液用20%的柠檬酸水溶液淬灭,PH调至7.0,然后用乙酸乙酯萃取三次,合并有机相,无水硫酸钠干燥,过滤浓缩,粗品经柱层析分离得到化合物29B。
MS(ESI)m/z 238.0(M+H)+
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δppm 11.65(s,1H),9.23(s,1H),8.09(s,1H),7.89(d,J=8.82Hz,1H),7.66(d,J=8.82Hz,1H),3.99(s,3H).
步骤3:3-氯-5-羟基异喹啉-6-甲酰胺的制备
在封管中,将甲基3-氯-5-羟基异喹啉-6-甲酸基酯(10.0g,42.0mmol)加入到NH3的MeOH(4M,100mL)中,将其加热到80℃反应16h。反应完全后,将体系冷至室温,然后将反应液浓缩,粗品经柱层析分离得到化合物29C。
MS(ESI)m/z 223.0(M+H)+
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δppm 14.86-15.18(m,1H),9.15-9.25(m,1H),8.80(s,1H),8.33(s,1H),8.03-8.07(m,2H),7.58(d,J=8.77Hz,1H).
步骤4:3-氯-5-羟基异喹啉-6-腈的制备
在0℃下,将TEA(10.6g,105mmol,14.6mL)滴加到3-氯-5-羟基-异喹啉-6-羧酰胺(7.8g,35.0mmol)和三正丙基环磷酸酐50%乙酸乙酯溶液(55.7g,87.6mmol,50%purity)的无水THF(100mL)混合溶液中,然后反应体系在0℃搅拌30min,再将体系升至室温20反应12h。反应完全后,用水淬灭反应,水相用乙酸乙酯萃取三次,合并有机相,无水硫酸钠干燥,过滤浓缩,粗品经柱层析分离得到化合物29D。
MS(ESI)m/z 205.0(M+H)+
1HNMR(400MHz,DMSO-d6)δppm 12.15(s,1H)9.25(s,1H)8.28(s,1H)7.69-7.76(m,2H).
步骤5:(S)-3-((6-氰基-5-羟基异喹啉-3-基)氨基)哌啶-1-甲酸叔丁酯的制备
在氮气保护下,将3-氯-5-羟基异喹啉-6-甲腈(500mg,2.44mmol)溶于DMF(5mL)中,然后加入叔丁醇钠(939mg,9.77mmol,),Brettphos Pd G3(221mg,244.36μmol)和(S)-3-氨基哌啶-1-甲酸叔丁酯(978mg,4.89mmol)加入反应液中,体系在160℃反应1h。反应完全后,用水淬灭反应,水相用乙酸乙酯萃取三次,合并有机相,无水硫酸钠干燥,过滤浓缩,粗品经柱层析分离得到化合物29E。
MS(ESI)m/z 369.2(M+H)+
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δppm 8.51(s,1H),7.06(s,1H),6.77(d,J=8.38Hz,1H),6.51(d,J=7.94Hz,1H),6.13(d,J=7.28Hz,1H),3.77-3.91(m,1H),3.57-3.67(m,2H),2.88(s,2H),1.88-1.97(m,2H),1.68-1.75(m,1H),1.30-1.42(m,11H).
步骤6:(S)-3-((6-氰基-5-(((三氟甲基)磺酰)氧代)异喹啉-3-基)氨基)哌啶-1-甲酸叔丁酯的制备
将(S)-3-((6-氰基-5-羟基异喹啉-3-基)氨基)哌啶-1-甲酸叔丁酯(198mg,537umol)溶于DCM(1mL)中,将TEA(163mg,1.61mmol)和1,1,1-三氟-N-苯基-N-((三氟甲基)磺酰)甲磺酰胺(230mg,644μmol)加入到上述溶液中,体系在室温下反应16h。反应完全后,将反应浓缩,粗品经柱层析分离得到化合物29F。
MS(ESI)m/z 501.1(M+H)+
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δppm 9.19(s,1H),8.16(d,J=8.38Hz,1H),7.55(d,J=8.25Hz,1H),7.05(d,J=7.75Hz,1H),6.68(s,1H),3.64-3.83(m,2H),3.17(s,1H),1.99(s,2H),1.75-1.86(m,1H),1.52-1.61(m,1H),1.40-1.46(m,2H),1.2 3-1.38(m,9H).
步骤7:(S)-3-((6-氰基-5-(1H-吲哚-3-基)异喹啉-3-基)氨基)哌啶-1-甲酸叔丁酯的制备
在氮气保护下,将(S)-3-((6-氰基-5-(((三氟甲基)磺酰)氧代)异喹啉-3-基)氨基)哌啶-1-甲酸叔丁酯(84.3mg,168μmol)溶于1,4-二氧六环(1mL)中,将K2CO3(42.3mg,306μmol),(1-(叔-丁氧羰基)-1H-吲哚-3-基)硼酸(40.0mg,153μmol),1,3-双(2,6-二异丙基苯)咪唑-2-叉(3-氯吡啶)二氯化钯(10.4mg,15.3μmol)加入到上述溶液中,然后将体系升至100℃反应16h。反应完全后,将反应液过滤,滤饼用乙酸乙酯3次,将滤液浓缩,粗品经柱层析分离得到化合物29G。
MS(ESI)m/z 468.2(M+H)+
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δppm 9.10(s,1H),8.19(dd,J=8.29,2.68Hz,1H),8.07(d,J=8.46Hz,2H),7.79(s,2H),7.39(s,2H),7.37(s,2H),3.74-3.78(m,1H),3.60-3.69(m,2H),3.07-3.24(m,2H),2.52(s,2H),1.84(d,J=5.60Hz,2H),1.68(s,1H),1.66(s,9H).
步骤8:(S)-5-(1H-吲哚-3-基)-3-(哌啶-3-基氨基)异喹啉-6-甲腈的制备
将(S)-3-((6-氰基-5-(1H-吲哚-3-基)异喹啉-3-基)氨基)哌啶-1-甲酸叔丁酯(50.0mg,88.0μmol)溶于DCM(0.9mL)中,然后将TFA(0.1mL)滴加到上述溶液中,体系在室温下反应2h。反应完全后,将反应液浓缩,粗品经高压制备分离纯化得到实施例29化合物。
MS(ESI)m/z 368.2(M+H)+
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δppm 11.65(s,1H),9.02(s,1H),7.93(d,J=8.58Hz,1H),7.70(d,J=2.38Hz,1H),7.54(d,J=8.11Hz,1H),7.40(dd,J=8.52,1.25Hz,1H),7.14-7.23(m,2H),7.00-7.06(m,1H),6.60(dd,J=8.34,2.86Hz,1H),6.49(d,J=6.56Hz,1H),3.43-3.61(m,1H),2.90-2.99(m,1H),2.71(dd,J=11.98,3.76Hz,1H),2.35-2.39(m,1H),2.16-2.30(m,2H),1.78-1.87(m,1H),1.52-1.57(m,1H),1.28-1.34(m,1H),1.21-1.26(m,1H).
生物实验
试验例1:体外CDK7激酶抑制活性实验
实验目的
利用微流体芯片技术的迁移率检测技术(Mobility-Shift Assay)的方法测试激酶活性,以化合物的IC50值为指标,评价化合物对周期蛋白依赖性激酶7(CDK7)的抑制作用。
实验材料
CDK7/CycH/MAT1(Carna,货号:04-108),Kinase substrate CTD3(GL,货号:0346885),Caliper substrate C(GL,货号:738989),DMSO(Sigma,货号:D8418-1L),384孔板(Corning,货号:3573)。
实验方法
利用Mobility shift assay检测受试化合物在CDK7激酶上的IC50值。化合物测试浓度为10000nM起始,3倍稀释,10个浓度,单孔检测。
化合物配制
待测化合物溶解在100%DMSO中,配制成10mM储存液,氮气柜中避光储存。
激酶反应过程
(1)配制1×激酶缓冲液(Kinase buffer)。
(2)化合物浓度梯度的配制:受试化合物起始浓度为10000nM,3倍稀释,10个浓度,单孔。在384source板中稀释成100倍终浓度的100%DMSO溶液。使用分液器Echo 550向目的板384孔板转移250nL 100倍终浓度的化合物。
(3)用1×Kinase buffer配制2.5倍终浓度的激酶溶液。
(4)在化合物孔和阳性对照孔分别加10μL的2.5倍终浓度的激酶溶液;在阴性对照孔中加10μL的1×Kinase buffer。
(5)1000rpm离心30秒,反应板振荡混匀后室温孵育10分钟。
(6)用1×Kinase buffer配制5/3倍终浓度的ATP和激酶底物(Kinase substrate)的混合溶液。
(7)加入15μL的5/3倍终浓度的ATP和底物的混合溶液,起始反应。
(8)将384孔板1000rpm离心30秒,振荡混匀后室温孵育相应的时间。
(9)加入30μL终止检测液停止激酶反应,1000rpm离心30秒,振荡混匀。
(10)用Caliper EZ酶标仪(Caliper EZ Reader)读取转化率。
数据分析
计算公式
其中:%Inhibition代表百分比抑制率,Conversion%_sample是样品的转化率读数;Conversion%_min:阴性对照孔均值,代表没有酶活孔的转化率读数;Conversion%_max:阳性对照孔均值,代表没有化合物抑制孔的转化率读数。
拟合量效曲线
以浓度的log值作为X轴,百分比抑制率为Y轴,采用分析软件GraphPad Prism 5的log(抑制剂)vs.响应-变量斜率(log(inhibitor)vs.response–Variable slope)拟合量效曲线,从而得出各个化合物对酶活性的IC50值。
计算公式是Y=Bottom+(Top-Bottom)/(1+10^((LogIC50-X)*HillSlope))
实验结果
表1
备注:IC50值在0-10nM标记为A;10-100nM标记为B;100-50000nM标记为C。
试验例3:体外增殖抑制实验
实验目的
通过检测化合物作用后肿瘤细胞活力,以IC50值为指标,评价化合物对卵巢癌细胞A2780的体外增殖抑制作用。
实验材料
A2780(南京科佰,货号:CBP60224),CellCounting-LiteTM2.0(诺唯赞,货号:0346885),DMSO(西亚试剂,货号:20190701),RPMI 1640(HyClone,货号:SH30809.01),胰酶(HyClone,货号:J190002),多功能酶标仪(BMG,型号:FSX),CO2培养箱(ThermoScientific,型号:RI-250)。
实验方法
(1)取对数生长期细胞A2780,胰酶消化,1000rpm离心3分钟,弃上清,培养基重悬后计数,按5*103个/每孔接种到96孔板中,于37℃,5%CO2培养箱中培养24h。
(2)将待测化合物溶解在100%DMSO中,配制成10mM储存液,4℃避光储存。取化合物储存液进行3倍梯度稀释,取稀释后的化合物溶液加入到接种后的96孔板中,此时药物终浓度分别为30000nM,10000nM,3333nM,1111nM,370nM,123nM,41nM,14nM和5nM,设置对照孔和空白孔,所有孔DMSO含量为0.5%。于37℃,5%CO2培养箱继续培养72h。
(4)取出待测细胞培养板,室温平衡30分钟,加入与待测细胞培养物等体积的CellCounting-LiteTM2.0,振荡混匀5分钟充分裂解细胞,静置10分钟后采用多功能酶标仪检测发光信号。
数据分析
计算公式
其中:Ls代表实验孔发光值,Lb代表空白空发光值,Lc代表对照孔发光值。
拟合量效曲线
以浓度的log值作为X轴,百分比抑制率为Y轴,采用分析软件GraphPad Prism 5的log(抑制剂)vs.响应-变量斜率(log(inhibitor)vs.response–Variable slope)拟合量效曲线,从而得出各个化合物对肿瘤细胞A2780的IC50值。
计算公式是Y=Bottom+(Top-Bottom)/(1+10^((LogIC50-X)*HillSlope))
实验结果
表2
实施例编号 | 72h IC<sub>50</sub>(nM) | 实施例编号 | 72h IC<sub>50</sub>(nM) |
2 | 215.3 | 3 | 1036 |
4 | 63.86 | 6 | 639 |
8 | 1561 | 9 | 326 |
10 | 389 | 11 | 5615 |
12 | 509 | 13 | 544.1 |
14 | 1010 | 15 | 1206 |
22 | 448 | 25 | 260 |
从上述数据可以看出,本发明化合物对肿瘤细胞具有增殖抑制作用。
以上实施例、试验例为具体阐述本发明的示例性实例,并非意欲限制本发明的保护范围范围,凡是利用本发明原理及说明书内容,所作的改进、修饰、等效结构或等效流程变换,或直接或间接运用在其他相关的技术领域,均同理包括在本发明的专利保护范围内。
Claims (24)
1.具有式(I)结构的化合物:
或其立体异构体、互变异构体或其混合物,或其药学上可接受的盐、其溶剂化物、水合物、前药或氘代化合物;其中
X1,X2各自独立地是CR3或N;
Rx选自H,卤素,氰基,异氰基,氨基,羟基,硝基,C1~C6烷基,卤代C1~C6烷基,C3~C6环烷基,3~6元杂环烷基;优选地,Rx选自H,卤素,氰基、异氰基、三氟甲基、三氯甲基、氨基、环丙基;
R1,R2,R3各自独立地选自:H,卤素,氰基,异氰基,氨基,羟基,巯基,羧基,C1~C6烷基,卤代C1~C6烷基,C1~C6烷氧基,C3~C6环烷基,3~6元杂环烷基,C3~C6环烷基氧基;
环B为选自下组的基团:
每个R4独立地选自H,卤素,氨基,羟基,硝基,巯基,氰基,异氰基,C1-C6烷基,C1-C6烷氧基,卤代C1-C6烷基,C3-C6环烷基,3~6元杂环烷基,-S(=O)Ra1,-S-Ra1,-S(=O)2Ra1,-(CH2)n-C(=O)ORa1,-(CH2)n-C(=O)Ra1,-(CH2)n-Ra2,-(CH2)n-S(=O)2Ra1,-(CH2)n-P(=O)(ORa1)2,-(CH2)n-P(=O)(Ra1)2,-(CH2)n-P(=O)(ORa1)(Ra1),-(CRb)2-Ra2,-NRb-(CH2)n-Ra2,芳基,杂芳基,-O(CH2)n-Ra2,-O-(C2~C4亚烯基)-Ra1,其中所述环烷基、杂环烷基、芳基、杂芳基是经一个或多个Rb取代的或未取代的,所述杂原子为N、O、或S的一个或多个;优选地,所述芳基为C6~C10芳基,所述杂芳基为5~10元杂芳基;
每个Ra1独立选自:H,羟基,氨基,C1~C6烷基,C1~C6烷氧基,卤代C1~C6烷基,C3~C6环烷基,3~6元杂环烷基,芳基,杂芳基;优选地,所述芳基为C6~C14芳基,更优选为C6~C10芳基,更优选地选自苯基和萘基;优选地,所述杂芳基为5~10元杂芳基,更优选地选自咪唑基、呋喃基、噻吩基、噻唑基、吡唑基、噁唑基、异噁唑基、吡咯基、四唑基、吡啶基、嘧啶基、噻二唑、吡嗪基;
每个Ra2独立选自:H,卤素,氨基,羟基,氰基,C1~C6烷基,C1~C6烷氧基,卤代C1~C6烷基,C3~C6环烷基,3~6元杂环烷基,芳基、杂芳基;优选地,所述芳基为C6~C14芳基,更优选为C6~C10芳基,更优选地选自苯基和萘基;优选地,所述杂芳基为5~10元杂芳基,更优选地选自咪唑基、呋喃基、噻吩基、噻唑基、吡唑基、噁唑基、异噁唑基、吡咯基、四唑基、吡啶基、嘧啶基、噻二唑、吡嗪基;
每个Rb独立选自:H,氨基,羟基,卤素,氰基,C1~C4烷基,卤代C1~C4烷基,C3~C4环烷基;
n=0、1、2、3、4、5或6;
p=0、1、2、3或4;
G是具有一个或多个取代基或者无取代的C3~C7环烷基或3~7元杂环烷基,其中所述G的取代基是选自下组的一项或多项:卤素、氨基、氰基、异氰基、羟基、硝基、羰基、醛基、酰基、酰胺基、磷酰基、磺酰基、酯基、羧基、C1~C6烷基、卤代C1~C6烷基、C3~C6环烷基、3~6元杂环烷基、C1~C6烷氧基、C3~C6环烷基氧基、3~6元杂环烷基氧基、芳基、杂芳基、C6~C10芳基氧基、5-10元杂芳基氧基,其中所述杂原子为N、O、或S的一个或多个;
L选自:-(CH2)m-,-O(CH2)m-,-(CH2)mO-,-C(=O)-,-NRc-,-O-,-C(=O)O-,-OC(=O)-,-NRc-C(=O)-,-C(=O)-NRc-,-NRc-(CH2)m-,-(CH2)m-NRc-,-S-,-S(=O)-,-S(=O)2-(CH2)m-,-(CH2)m-S(=O)2-,-S(=O)O-,-OS(=O)-,-S(=O)-NRc-,-NRc-S(=O)-,-S(=O)2O-,-OS(=O)2-,-S(=O)2NRc-,-NRc-S(=O)2-,不存在;m=0、1、2、3、4、5或6;
每个Rc独立选自:H,氨基,羟基,卤素,氰基,C1~C4烷基,卤代C1~C4烷基,C3~C4环烷基;
D选自取代或未取代的如下基团或是不存在:C3~C6环烷基、3~6元杂环烷基、芳基、杂芳基;其中所述D的取代基为氨基,羟基,卤素,氰基,C1~C4烷基,卤代C1~C4烷基,C3~C4环烷基的一个或多个;优选地,所述芳基为C6~C14芳基,更优选为C6~C10芳基;优选地,所述杂芳基为5~14元杂芳基,更优选为5~10元杂芳基;
Ry选自羟基、卤素、氨基、氰基、C1~C6烷基、C1~C6烷氧基、卤代C1~C6烷基、卤代C1~C6烷氧基、-(CH2)i-N(Rd)2、-(CH2)i-Re、-NRd-(CH2)i-Re、-(CH2)i-P(=O)(ORd)Re、-(CH2)i-P(=O)(ORd)2、-NRd-S(=O)2Rd、-NRd-S(=O)2Re、-S(=O)2Rd、-S(=O)2Re、-NRd-S(=O)Rd、-NRd-S(=O)Re、经Rd取代或未取代的Re、不存在;
Y为N或CRd;i=0、1、2、3或4;
每个Rd、R5A、R5B各自独立选自:H、羟基、氨基、卤素、氰基、C1~C6烷基、C1~C6烷氧基、卤代C1~C6烷基;R5C、R5D各自独立选自:Rd、-N(Rd)2、C2~C4烯基、C2~C4炔基;
每个Re独立选自经一个或多个Rd取代的如下基团:C3~C6环烷基,3~6元杂环烷基,芳基、杂芳基,其中所述杂原子为N、O、或S的一个或多个;优选地,所述芳基为C6~C14芳基,更优选为C6~C10芳基;优选地,所述杂芳基为5~14元杂芳基,更优选为5~10元杂芳基。
2.如权利要求1所述的化合物或其立体异构体、互变异构体或其混合物,或其药学上可接受的盐、其溶剂化物、水合物、前药或氘代化合物;其中
G为C3~C6环烷基或3~6元杂环烷基;
L选自:-(CH2)m-,-O(CH2)m-,-(CH2)mO-,-C(=O)-,-C(=O)O-,-OC(=O)-,-NRc-C(=O)-,-C(=O)-NRc-,-NRc-(CH2)m-,-(CH2)m-NRc-,-S(=O)2NRc-,-O-,-S-,-S(=O)-,-S(=O)2-;m=0、1、2、3或4;
D选自取代或未取代的如下基团:C5~C6环烷基、5~6元杂环烷基、C6~C10芳基、5~10元杂芳基;其中所述D的取代基为氨基,羟基,卤素,氰基,C1~C4烷基,卤代C1~C4烷基,C3~C4环烷基的一个或多个;
Ry选自羟基、卤素、氨基、氰基、C1~C4烷基、C1~C4烷氧基、卤代C1~C6烷基、卤代C1~C6烷氧基、-(CH2)i-N(Rd)2、-(CH2)i-Re、-NRd-(CH2)i-Re、-NRd-S(=O)2Rd、经Rd取代或未取代的Re、不存在;
i=0、1、2、3或4;
每个Rd独立选自:H、羟基、氨基、卤素、氰基、C1~C6烷基、C1~C6烷氧基、卤代C1~C6烷基;每个R5A、R5B各自独立选自:H、羟基、氨基、卤素、氰基;R5C选自:Rd、-N(Rd)2、C2~C4烯基、C2~C4炔基;
每个Re独立选自经一个或多个Rd取代的如下基团:C3~C6环烷基,3~6元杂环烷基,C6~C10芳基、5~10元杂芳基,其中所述杂原子为N、O、或S的一个或多个。
3.如权利要求1或2所述的化合物或其立体异构体、互变异构体或其混合物,或其药学上可接受的盐、其溶剂化物、水合物、前药或氘代化合物;其中
W1,W2,W3各自独立为N或CR6;
每个R6独立选自:H、卤素、硝基、氨基、氰基、异氰基、羟基、醛基、酰基、酰胺基、酯基、羧基、C1~C6烷基、卤代C1~C6烷基、C3~C6环烷基、C3~C6杂环烷基、C1~C6烷氧基、C3~C6环烷基氧基、C3~C6杂环烷基氧基的一个或多个,其中所述杂原子为N、O、或S的一个或多个;
优选地,每个R6独立选自:H、卤素、氨基、羟基、C1~C4烷基、C1~C4烷氧基、CF3、环丙基、环丙基甲基、环丁基、环丁基甲基、C1~C4酯基、酰胺基;
q=0、1、2或3。
4.如权利要求1-3任一项所述的化合物或其立体异构体、互变异构体或其混合物,或其药学上可接受的盐、其溶剂化物、水合物、前药或氘代化合物;其中
L选自:-(CH2)m-,-C(=O)-,-C(=O)O-,-OC(=O)-,-NRc-C(=O)-,-C(=O)-NRc-,-NRc-(CH2)m-,-(CH2)m-NRc-,-S(=O)2NRc-,-NRc-S(=O)2-;m=0、1、2、3、或4;
每个Rc独立选自:H,氨基,羟基,卤素,氰基,C1~C4烷基。
5.如权利要求1-4任一项所述的化合物,或其立体异构体、互变异构体或其混合物,或其药学上可接受的盐、其溶剂化物、水合物、前药或氘代化合物;其中D为取代或未取代的C6~C10芳基或5~10元杂芳基。
8.如权利要求1-7任一项所述的化合物,或其立体异构体、互变异构体或其混合物,或其药学上可接受的盐、其溶剂化物、水合物、前药或氘代化合物;其中Ry选自羟基、卤素、氨基、氰基、C1~C4烷基、C1~C4烷氧基、卤代C1~C6烷基、卤代C1~C6烷氧基、不存在。
10.如权利要求1-7任一项所述的化合物,或其立体异构体、互变异构体或其混合物,或其药学上可接受的盐、其溶剂化物、水合物、前药或氘代化合物;其中Ry选自-(CH2)i-Re、-NRd-(CH2)i-Re、经Rd取代或未取代的Re、不存在;
i=0、1、2、3或4;
每个Rd独立选自:H、羟基、氨基、卤素、氰基、C1~C6烷基、C1~C6烷氧基、卤代C1~C6烷基;
每个Re独立选自经一个或多个Rd取代的如下基团:C3~C6环烷基,3~6元杂环烷基,C6~C10芳基、5~10元杂芳基,其中所述杂原子为N、O、或S的一个或多个。
15.如权利要求1所述的化合物,或其立体异构体、互变异构体或其混合物,或其药学上可接受的盐、其溶剂化物、水合物、前药或氘代化合物;其中
G是具有1-3个取代基或者无取代的C3~C7环烷基或3~7元杂环烷基,其中所述G的取代基是选自下组的一项或多项:卤素、氨基、氰基、异氰基、羟基、硝基、羰基、醛基、酰基、酰胺基、磷酰基、磺酰基、酯基、羧基、C1~C4烷基、卤代C1~C4烷基、C3~C6环烷基、3~6元杂环烷基、C1~C6烷氧基、C3~C6环烷基氧基、3~6元杂环烷基氧基、C6~C10芳基、5-10元杂芳基、C6~C10芳基氧基、C6~C10杂芳基氧基,其中所述杂原子为N、O、或S的一个或多个;且
L、D和Ry为不存在。
17.权利要求1-16任一项的化合物或其立体异构体在制备用于治疗或预防与细胞周期蛋白依赖性激酶活性或表达量相关的疾病的药物中的用途。
18.权利要求1-16任一项的化合物或其立体异构体在制备用于治疗或预防响应于对细胞周期蛋白依赖性激酶的调节的疾病的药物中的用途。
19.如权利要求17或18所述的用途,其中所述周期蛋白依赖性激酶选自CDK7、CDK12、CDK13,优选为CDK7和/或CDK12。
20.权利要求1-16任一项的化合物或其立体异构体在制备用于治疗或预防细胞增殖异常相关疾病的药物中的用途。
21.如权利要求20所述的用途,其中所述细胞增殖异常相关疾病是肿瘤。
22.权利要求21所述的用途,其中所述肿瘤选自膀胱癌、乳腺癌、肺癌、结直肠癌、肾癌、表皮癌、肝癌、食道癌、胆囊癌、卵巢癌、胰腺癌、胃癌、宫颈癌、甲状腺癌、鼻癌、头颈癌、前列腺癌、中枢或周围神经系统肿瘤、皮肤癌、血管内皮瘤、黑色素瘤、精原细胞瘤、白血病、多发性骨髓瘤、霍奇金淋巴瘤、非霍奇金淋巴瘤。
23.权利要求22所述的用途,其中所述肿瘤选自乳腺癌、卵巢癌、结直肠癌、肺癌。
24.权利要求23所述的用途,其中所述肿瘤选自三阴乳腺癌、高级浆液性卵巢癌、小细胞肺癌。
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