CN115558717A - Emc8基因的检测试剂在制备胃癌检测试剂盒中的应用及胃癌检测试剂盒 - Google Patents

Emc8基因的检测试剂在制备胃癌检测试剂盒中的应用及胃癌检测试剂盒 Download PDF

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Abstract

本发明涉及EMC8基因的检测试剂在制备胃癌检测试剂盒中的应用及胃癌检测试剂盒。本发明首次揭示了EMC8基因与胃癌相关,在胃癌患者中EMC8基因的表达水平显著升高且具有统计学意义。本发明中所述EMC8基因作为胃癌早期诊断的标志物具有重要参考价值。基于此,本发明将EMC8基因的检测试剂应用于制备胃癌的检测试剂盒,制备得到的试剂盒具有方便、快捷等特点,可用于胃癌的早期诊断领域,为胃癌患者的确诊提供指导。

Description

EMC8基因的检测试剂在制备胃癌检测试剂盒中的应用及胃癌 检测试剂盒
技术领域
本发明涉及EMC8基因的检测试剂在制备胃癌检测试剂盒中的应用及胃癌检测试剂盒,属于生物医学技术领域。
背景技术
胃癌具有高发病率和高死亡率的特点,是世界上主要的癌症之一,也是重要的全球医疗保健问题,对全人类的健康造成了重要影响。有资料显示,超过70%的胃癌发生在发展中国家,疾病负担严重是癌症防治的难点和重点。胃癌患者具有发病率高、转移率高、死亡率高,早诊率低、根治性切除率低、5年生存率低的特点。目前在胃癌领域,仍然十分缺乏有效的检测胃癌的试剂盒,以及早期诊断的肿瘤标记物,因此迫切的需要一种较为敏感的标志物,为胃癌的早期诊断提供客观依据。
聚合酶链反应(Polymerase Chain Reaction,PCR)是一种体外特异性扩增目的DNA片段的技术,其基本原理是利用碱基互补配对原则。实时荧光定量PCR是以cDNA作为模板,在 DNA Polymerase(聚合酶)作用下,参照目的片段的特异性引物序列,特异性合成上、下游引物之间的目的片段。检测结合在DNA双链中的荧光信号,根据Ct值等可以对目的mRNA进行定量检测。因此设计出能够识别目的片段的特异性引物序列,是保证目的mRNA定量准确的重要保证和重要环节。
发明内容
针对现有技术的不足,本发明提供了EMC8基因的检测试剂在制备胃癌检测试剂盒中的应用及胃癌检测试剂盒。
本发明的技术方案如下:
EMC8基因的检测试剂在制备胃癌检测试剂盒中的应用。
根据本发明优选的,所述EMC8基因的NCBI Gene数据库Gene ID为10328。
根据本发明优选的,所述胃癌检测试剂盒为荧光定量PCR检测试剂盒。
根据本发明优选的,所述胃癌检测试剂盒用于检测细胞、组织、血浆或血清中的EMC8 基因。
一种胃癌检测试剂盒,包括EMC8基因的荧光定量PCR反应试剂。
根据本发明优选的,所述EMC8基因的荧光定量PCR反应试剂包括EMC8基因的上游引物和下游引物;所述上游引物和下游引物的序列如下:
EMC8_F:5’-CCCATGCTGGAGGTGGCTCT-3’,
EMC8_R:5’-GGACTGGCATCCTTTACTCG-3’。
根据本发明优选的,所述胃癌检测试剂盒还包括内参体系。
进一步优选的,所述内参体系为内参基因β-actin(beta-actin)的荧光定量PCR的检测体系,包括β-actin基因的上游引物和下游引物;所述上游引物和下游引物的序列如下:
β-actin_F:5’-GAAGAGCTACGAGCTGCCTGA-3’,
β-actin_R:5’-CAGACAGCACTGTGTTGGCG-3’。
根据本发明优选的,所述试剂盒中还包括用于荧光定量PCR的酶液和缓冲液体系,为现有的市购产品。
上述胃癌检测试剂盒在胃癌早期诊断中的应用。
有益效果:
1、本发明首次揭示了EMC8基因与胃癌相关,在胃癌患者中EMC8基因的表达水平显著升高且具有统计学意义。基于此,本发明将EMC8基因的检测试剂应用于制备胃癌的检测试剂盒,制备得到的试剂盒具有方便、快捷等特点,可用于胃癌的早期诊断领域,为胃癌患者的确诊提供指导。
2、本发明中所述EMC8基因作为胃癌早期诊断的标志物具有重要参考价值。根据EMC8 基因设计的试剂盒可用于胃癌的筛查,有着较高的临床使用价值及推广价值。
附图说明
图1是实施例1中统计学检验分析结果图。
具体实施方式
下面结合实验例对本发明的技术方案作进一步描述,但是本发明的保护范围并不仅限于此。实施例中涉及的试剂及药品,若无特殊说明,均为普通市售产品;实施例中涉及的实验步骤,若无特殊说明,均为本领域常规操作。
实施例1、EMC8基因在胃癌患者中的表达水平
1、检测90个样本,分别来自45例胃癌患者,其中每例患者均取癌组织和癌旁组织样本,共90个样本(45对癌组织和癌旁组织)的cDNA。该90个样本的cDNA购买于上海芯超生物科技有限公司,型号为胃癌MecDNA-HStmA030CS01和MecDNA-HStmA060CS01。
2、荧光定量PCR:
根据NCBI Gene数据库Gene ID为10328所示的EMC8基因设计引物,具体如下:
EMC8_F:5’-CCCATGCTGGAGGTGGCTCT-3’,
EMC8_R:5’-GGACTGGCATCCTTTACTCG-3’。
以β-actin(beta-actin)基因作为内参基因进行qPCR,所述β-actin基因NCBI的Gene 数据库Gene ID为60;
内参基因β-actin的引物序列如下:
β-actin_F:5’-GAAGAGCTACGAGCTGCCTGA-3’,
β-actin_R:5’-CAGACAGCACTGTGTTGGCG-3’。
荧光定量PCR体系:总反应体系为10μL;2×SYBR Green PCR Master Mix 5μL,QNROX Reference Dye 0.05μL,上游引物稀释液0.7μL(终浓度0.7μM),下游引物稀释液0.7μL(终浓度0.7μM),RNase-Free water加cDNA溶解液3.55μL。反应试剂2×SYBR Green PCRMaster Mix,QN ROX Reference Dye购买自QuantiNovaTM
Figure BDA0003885136450000031
Green PCR Kit。
反应条件(最大/快速模式):PCR初始活化步骤,95℃,2分钟;两步循环,变性95℃,5秒;退火/延伸步骤,60℃,10秒,共40循环。仪器为赛默飞QuantStuidio 3。
通过以上荧光定量PCR获得45对来自胃癌患者的癌组织和癌旁组织样本中EMC8基因的表达水平数据。
3、统计学分析:
以2-ΔΔCt法数据进行数据标准化及分析,对每例胃癌患者(分别有一个癌组织样本和一个癌旁组织样本),分别进行2-ΔΔCt法进行计算,以计算出目的基因在每例胃癌患者的表达情况。
ΔCt=目的基因Ct值-内参基因Ct值,ΔΔCt=癌样本ΔCt值-癌旁样本ΔCt值,2-ΔΔCt反映每例胃癌患者的癌组织样本目的基因的相对表达水平。对实验检测的原始数据进行质控,其中取CT平均值的基本方法为,目的基因CT值取重复样本复孔平均值;内参基因CT值取重复样本复孔平均值。对数据进行质控后,分别按照以下两种方法分别进行分析。
①.单样本单侧t检验,H0:为胃癌患者中EMC8的相对表达水平为1,H1:为胃癌患者中EMC8的相对表达水平大于1,取α=0.1000。此次检测分析,样本例数为n=45例,单样本单侧t检验,对EMC8的mRNA相对表达水平进行统计学分析,取mu=1,α=0.1000(单侧)。
统计结果,t=1.7488,p-value=0.04365。经检验,按α水准拒绝H0。在45例胃癌中的EMC8的mRNA的相对表达水平平均为1.2024,因此胃癌患者中EMC8高表达且具有统计学意义。
②.u检验,样本均数与总体均数的比较,H0:为μ=1.0000,H1:为μ>1.0000,α=0.1000 (单侧)
统计结果,u=1.7488,p=0.040163。经检验,按α水准拒绝H0。在45例胃癌中的EMC8 的mRNA的相对表达水平平均为1.2024,因此胃癌患者中EMC8高表达且具有统计学意义。
以上分析通过简明统计14.0(Concise Statistics,CS14.0)计算。如图1所示,以上统计结果说明胃癌患者中EMC8基因的表达水平显著升高,具有统计学意义。可以根据EMC8基因的表达水平进行胃癌的早期诊断,因此可基于EMC8基因制作用于胃癌早期诊断的试剂盒。

Claims (8)

1.EMC8基因的检测试剂在制备胃癌检测试剂盒中的应用。
2.如权利要求1所述的应用,其特征在于,所述EMC8基因的NCBI Gene数据库Gene ID为10328。
3.如权利要求1所述的应用,其特征在于,所述胃癌检测试剂盒为荧光定量PCR检测试剂盒。
4.如权利要求1所述的应用,其特征在于,所述胃癌检测试剂盒用于检测细胞、组织、血浆或血清中的EMC8基因。
5.一种胃癌检测试剂盒,其特征在于,包括EMC8基因的荧光定量PCR反应试剂。
6.如权利要求5所述的胃癌检测试剂盒,其特征在于,所述EMC8基因的荧光定量PCR反应试剂包括EMC8基因的上游引物和下游引物;所述上游引物和下游引物的序列如下:
EMC8_F:5’-CCCATGCTGGAGGTGGCTCT-3’,
EMC8_R:5’-GGACTGGCATCCTTTACTCG-3’。
7.如权利要求5所述的胃癌检测试剂盒,其特征在于,所述胃癌检测试剂盒还包括内参体系;所述内参体系为内参基因β-actin(beta-actin)的荧光定量PCR的检测体系,包括β-actin基因的上游引物和下游引物;所述上游引物和下游引物的序列如下:
β-actin_F:5’-GAAGAGCTACGAGCTGCCTGA-3’,
β-actin_R:5’-CAGACAGCACTGTGTTGGCG-3’。
8.权利要求5所述的胃癌检测试剂盒在胃癌早期诊断中的应用。
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Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN109876144A (zh) * 2019-04-03 2019-06-14 山东大学 Emc8基因抑制剂在制备治疗胃癌药物中的用途
CN115386638A (zh) * 2022-10-11 2022-11-25 山东大学 Emc8基因的检测试剂在制备胃癌预后评估试剂盒中的应用及预后评估试剂盒

Patent Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN109876144A (zh) * 2019-04-03 2019-06-14 山东大学 Emc8基因抑制剂在制备治疗胃癌药物中的用途
CN115386638A (zh) * 2022-10-11 2022-11-25 山东大学 Emc8基因的检测试剂在制备胃癌预后评估试剂盒中的应用及预后评估试剂盒

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