CN115181803A - 检测多子小瓜虫的Taqman探针qPCR检测引物组和应用 - Google Patents
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- C12Q1/686—Polymerase chain reaction [PCR]
Abstract
本发明公开一种检测多子小瓜虫的Taqman探针qPCR检测引物组和应用,属于寄生虫检测领域。本发明根据多子小瓜虫的靶标分子组织蛋白酶L基因序列,设计一对特异引物和一条探针。该引物和探针对多子小瓜虫亲缘关系较近的四膜虫、草履虫以及养殖水体水样和底泥均无扩增,特异性强;检测灵敏度高,检测下限为5.4拷贝/μL,约为1只多子小瓜虫,重复性好(该技术的变异系数低于5%);方法检测方便,省去了常规PCR方法中的电泳步骤以及杜绝了传统PCR的气溶胶污染,大大节约时间和提高检测准确性;可应用于水体环境中和鱼体上的多子小瓜虫检测,为预防多子小瓜虫病,提供技术支持。
Description
技术领域
本发明属于寄生虫检测领域,具体涉及一种检测多子小瓜虫的Taqman探针qPCR检测引物组和应用。
背景技术
多子小瓜虫(Ichthyophthirius multifiliis)是世界上淡水和咸淡水鱼类的重要寄生纤毛虫,主要寄生于鱼类的鳃和皮肤,形成白点,又称白点病,该病危害大,病鱼死亡率高,造成严重经济损失。因此,防治小瓜虫病是水产养殖中的重要工作,而及时发现水体中存在多子小瓜虫是防治小瓜虫病的关键,这就需要检测水体中多子小瓜虫的检测技术。目前,国内外检测多子小瓜虫的方法主要是显微镜检查、常规PCR、荧光定量PCR,但是,这些现有检测方法要么应用范围受限,要么检测灵敏低,无法满足需求。Taqman探针荧光定量PCR技术特异性强、灵敏度高,更适合用于定量检测。因此,寻找新的靶标分子建立一种重现性好、特异性强、灵敏度高的Taqman探针荧光定量PCR方法,检测水体环境中和鱼体上的多子小瓜虫就十分必要。
发明内容
为了克服现有技术的缺点与不足,本发明的目的在于提供一种组织蛋白酶L基因在制备检测、鉴别或诊断多子小瓜虫的试剂中的应用。
本发明的另一目的在于提供一种检测多子小瓜虫的Taqman探针qPCR检测引物组。
本发明的另一目的在于提供一种检测多子小瓜虫的Taqman探针qPCR检测试剂盒。
本发明的另一目的在于提供上述引物组或试剂盒的应用。
本发明的再一目的在于提供一种定量检测样品中多子小瓜虫的方法。
本发明提供一种Taqman探针荧光定量PCR检测多子小瓜虫的试剂盒及检测方法,特别提供一对针对多子小瓜虫的特异性引物Cathepsin F和Cathepsin R以及一条特异性探针Cathepsin-Probe,使用该试剂盒和检测方法可快速检测水环境和鱼体上的多子小瓜虫。
本发明以组织蛋白酶L(Cathepsin L,CTSL)基因为新靶标分子建立了特异灵敏的Taqman探针实时荧光定量PCR技术,并组配了该技术配套使用的试剂盒。组织蛋白酶L基因在不同物种间的相似度低,与多子小瓜虫相似度最高的嗜热四膜虫在51%的覆盖率下也只有65.07%的相似度,但多子小瓜虫之间的组织蛋白酶L基因相似度高达99.64%,这说明该基因具有种间变异大,种内保守的特点,适合用作检测靶标。
本发明的目的通过下述技术方案实现:
组织蛋白酶L基因作为分子靶点在制备检测、鉴别或诊断多子小瓜虫的试剂中的应用。
优选的,所述的组织蛋白酶L基因的GenBank:XM_004039979.1。
所述的组织蛋白酶L的GenBank:XP_004040027.1。
一种用于检测多子小瓜虫的试剂,包含能够检测多子小瓜虫的组织蛋白酶L基因的引物;
具体的,以Taqman探针荧光定量PCR法为基础,针对多子小瓜虫的组织蛋白酶L基因,设计一对特异引物和Taqman探针,序列如下:
Cathepsin F:5’-CAGGAGTTGCTTTCTTTG-3’;
Cathepsin R:5’-CTCCTTTAATTCTTTATAAGTTTTC-3’;
Cathepsin-Probe:5’-FAM-TTTCTCACCATAAAGCTCCTACACATG-BHQ-3’;
其中,Cathepsin-Probe的5’端采用荧光基团FAM标记,3’端为淬灭基团BHQ标记,扩增得到的多子小瓜虫组织蛋白酶L基因长度为192bp。
上述用于检测多子小瓜虫的试剂在检测、鉴别或诊断多子小瓜虫的试剂盒中的应用。
一种用于检测多子小瓜虫的试剂盒,含有上述用于检测多子小瓜虫的试剂。
所述的试剂盒还包括qPCR反应试剂。
所述引物浓度为10μmol/L,探针浓度为10μmol/L。
反应试剂:10×PCR缓冲液(不含MgCl2)、氯化镁(MgCl2)、四种脱氧核苷酸的混合物(dNTPs)、Taq酶(5个单位/μL)。
一种定量检测多子小瓜虫的方法,包括如下步骤:所述方法为非疾病诊断方法;
(1)提取待测样品DNA;
(2)PCR扩增组织蛋白酶L基因,构建重组质粒,以其为模板建立qPCR反应体系以及用不同拷贝数(Sq)的重组质粒的对数值及其Ct值的关系绘制标准曲线;其中,拷贝数Sq与Ct值的关系为Ct=-3.164×lg(Sq)+36.848,相关系数R2=0.993;
(3)利用建立好的检测方法,加入上述用于检测多子小瓜虫的试剂和待测样品DNA,配成qPCR反应体系,进行qPCR反应,得到待测样品的Ct值;
(4)多子小瓜虫定量检测
qPCR完成后,根据Ct值判断:若无扩增,则判断该样品中无多子小瓜虫;若有扩增,则根据建立好的标准曲线计算相应的组织蛋白酶L基因拷贝数,阴性对照的Ct值应无扩增。
其中,每只多子小瓜虫的组织蛋白酶L基因拷贝数约为7个拷贝数。
优选的,步骤(1)中,待测样品为水体、底泥或鱼体组织;
优选的,步骤(2)、(3)中,qPCR反应体系,为:10×PCR缓冲液2.5μL,氯化镁(25mmol·mL-1)3.2μL,四种脱氧核苷酸的混合物(2.5mM)2μL,上下游引物(10μM)各1μL,特异性探针(10μM)0.5μL,Taq酶(5U/μL)0.25μL;模板DNA 1μL,灭菌双蒸水12.55μL;反应体系总体积为24μL。
qPCR反应条件为:95℃预变性2min,然后95℃变性15s,58℃退火30s;72℃延伸20s,如此40个循环。每次都在58℃退火结束时收集荧光信号;阴性对照的Ct值应不显示。
优选的,步骤(3)中,以不同拷贝数(Sq)的重组质粒是拷贝数为5.4×100~5.4×109拷贝/μL的重组质粒;具体为5.4×100、5.4×101、5.4×102、5.4×103、5.4×104、5.4×105、5.4×106、5.4×107、5.4×108、5.4×109拷贝/μL的重组质粒。
本发明的主要原理为:根据多子小瓜虫的靶标分子组织蛋白酶L基因序列,设计一对特异引物和一条探针,探针的5’带有荧光基团(如:FAM),3’端带有淬灭基团(BHQ),当荧光探针处于完整状态时受到淬灭基团限制,不能激发荧光,然而当探针被Taq酶降解后,5’端荧光基团便会游离出来,发出荧光,从而检测出样品中靶基因的拷贝数。
本发明相对于现有技术具有如下的优点及效果:
(1)本发明方法检测方便,省去了常规PCR方法中的电泳步骤以及杜绝了传统PCR的气溶胶污染,大大节约时间和提高检测准确性;
(2)本发明检测灵敏度高,检测下限为5.4拷贝/μL,约为1只多子小瓜虫,重复性好(该技术的变异系数低于5%);
(3)本发明提供的引物和探针对多子小瓜虫亲缘关系较近的四膜虫、草履虫以及养殖水体水样和底泥均无扩增,特异性强;
(4)本发明可应用于水体环境中和鱼体上的多子小瓜虫检测,为预防多子小瓜虫病,提供技术支持。
附图说明
图1是提取的总DNA电泳图;其中,泳道1为多子小瓜虫幼虫DNA,泳道2为嗜热四膜虫DNA,泳道3为尾草履虫DNA,泳道4为养殖水体混合浮游生物总DNA,泳道5为非养殖水体混合浮游生物总DNA,泳道6为养殖池塘底泥混合生物总DNA,M为标准分子量DL10000。
图2是不同退火温度PCR产物电泳结果;其中,泳道1为54℃、泳道2为58℃、泳道3为60℃、泳道4为阴性对照、M为标准分子量DL500。
图3是不同DNA模板的PCR产物电泳结果;其中,泳道1和2为多子小瓜虫幼虫DNA扩增产物、泳道3和4为嗜热四膜虫DNA扩增产物、泳道5和6为尾草履虫DNA扩增产物、泳道7和8为非养殖水体混合浮游生物DNA扩增产物,泳道9和10为一个养殖水体混合浮游生物DNA扩增产物、泳道11和12为另外一个养殖水体混合浮游生物DNA扩增产物、泳道13和14为养殖水体底泥混合生物DNA扩增产物、泳道15为阴性对照、M为标准分子量DL500。
图4是TaqMan探针实时荧光定量PCR重组质粒的标准曲线;其中,Cq为反应循环数。
图5是TaqMan探针实时荧光定量PCR检测重组质粒的动力学曲线;其中,图中从左到右的模板浓度依次为:5.4×109拷贝/μL,5.4×108拷贝/μL,5.4×107拷贝/μL,5.4×106拷贝/μL,5.4×105拷贝/μL,5.4×104拷贝/μL,5.4×103拷贝/μL,5.4×102拷贝/μL,5.4×101拷贝/μL,5.4×100拷贝/μL,NTC为阴性对照。
图6是TaqMan探针荧光定量PCR灵敏度试验扩增曲线;其中,1-10分别表示:5.4×109拷贝/μL,5.4×108拷贝/μL,5.4×107拷贝/μL,5.4×106拷贝/μL,5.4×105拷贝/μL,5.4×104拷贝/μL,5.4×103拷贝/μL,5.4×102拷贝/μL,5.4×101拷贝/μL,5.4×100拷贝/μL,11为阴性对照。
图7是不同浓度模板的PCR扩增产物电泳结果;其中,泳道1-10分别为5.4×109~5.4×100拷贝/μL模板扩增产物,泳道11为阴性对照,M为标准分子量DL2000。
图8是多子小瓜虫DNA模板扩增不受其它生物DNA干扰的荧光定量PCR扩增曲线,其中,图中的1-2代表稀释的纯重组质粒扩增曲线,3-4代表重组质粒与各样品模板混匀后的扩增曲线,5-6代表多子小瓜虫DNA扩增曲线,7-8代表多子小瓜虫DNA模板与其它样品模板混匀后扩增曲线,9-11代表阴性对照和未加入多子小瓜虫DNA模板和质粒的混合样品。
图9是Taqman探针荧光定量PCR特异性扩增曲线,其中,1,2是多子小瓜虫幼虫DNA和多子小瓜虫包囊DNA扩增曲线,3-8为嗜热四膜虫DNA、尾草履虫DNA、养殖水体混合浮游生物DNA、非养殖水体混合浮游生物DNA、养殖池塘底泥混合生物DNA和阴性对照扩增曲线。
图10是多子小瓜虫个数与基因拷贝数的线性关系;其中,1只虫子对应的组织基因拷贝数约为7个拷贝数。
图11是不同地区养殖水体样本DNA的扩增曲线;其中,A:1为阳性对照,2-3为花都水体阳性样本,4-14为花都其它水体样本及阴性对照;B:1,2为阳性对照,3-31为番禺、中山市养殖水体样本及阴性对照。
具体实施方式
下面结合实施例及附图对本发明作进一步详细的描述,但本发明的实施方式不限于此。
下列实施例中未注明具体实验条件的试验方法,通常按照常规实验条件或按照制造厂所建议的实验条件。所使用的材料、试剂等,如无特殊说明,为从商业途径得到的试剂和材料。
实施例中所用的多子小瓜虫、嗜热四膜虫、尾草履虫,均为常规病原体。
实施例1:按以下配方制作多子小瓜虫的Taqman探针荧光定量PCR试剂盒:
(a)引物和探针试剂:包括上游引物(Cathepsin F),下游引物(Cathepsin R)和探针(Cathepsin-Probe)反应液。
根据已公开的多子小瓜虫的组织蛋白酶L基因(CTSL基因)(登录号为XM_004039979.1)进行分析,设计一对特异引物和Taqman探针,具体序列如下:
上游引物(Cathepsin F):5’-CAGGAGTTGCTTTCTTTG-3’;(SEQ ID NO:1)
下游引物(Cathepsin R):5’-CTCCTTTAATTCTTTATAAGTTTTC-3’;(SEQ ID NO:2)
Taqman探针序列为(Cathepsin-Probe):
5’-FAM-TTTCTCACCATAAAGCTCCTACACATG-BHQ-3’;(SEQ ID NO:3)
其中,探针序列的5’端采用荧光基团FAM标记,3’端为淬灭基团BHQ标记,扩增得到的多子小瓜虫组织蛋白酶基因长度为192bp。
(b)聚合酶链式反应试剂:含有10×PCR缓冲液(不含MgCl2)、MgCl2(25mmol·mL-1)、四种脱氧核苷酸的混合物(2.5mM)、Taq酶(5个单位/μL)、灭菌双蒸水。
按照以下步骤建立检测多子小瓜虫的方法:
1.DNA的提取
提取多子小瓜虫幼虫、嗜热四膜虫、尾草履虫、水体混合浮游生物以及养殖池塘底泥总DNA,-20℃保存备用。阴性对照模板为无菌水。
提取的总DNA电泳图,如图1所示,可知,提取的总DNA完整性好,可满足后续实验。
2.Taqman探针引物合适退火温度的确定
以多子小瓜虫幼虫DNA为模板,进行常规PCR扩增,退火温度设置为54、58、60℃,实验结束后通过3%的琼脂糖凝胶电泳分析PCR产物,确定合适退火温度为58℃(图2所示)。
3.常规PCR检测引物特异性
以提取的多子小瓜虫幼虫DNA、嗜热四膜虫DNA、尾草履虫DNA、水体混合浮游生物DNA、底泥混合生物DNA为模板,退火温度58℃,常规PCR扩增,分析引物的特异性,扩增产物电泳图表明只有多子小瓜虫幼虫模板中有扩增,其它模板没有扩增(图3),说明该引物特异性良好,能够满足后续检测需要。
4.重组靶标质粒构建及标准品制备
采用CTSL基因引物(Cathepsin F/Cathepsin R),以多子小瓜虫幼虫DNA为模板,用高保真酶对组织蛋白酶L(CTSL)基因目的片段进行PCR扩增,获得片段长度为192bp的目标条带(PCR产物经纯化回收、连接、转化等步骤构建重组靶标基因片段质粒),将重组靶标质粒菌株进行阳性克隆筛选,再送去华大基因测序,结果与原序列相符,与多子小瓜虫相应蛋白酶序列的同源性高达99%,得到重组质粒。然后采用生工质粒提取试剂盒提取重组质粒,通过BioTek Epoch微型核酸定量仪测得浓度为170.5ng/μL,按照公式:拷贝/μL=6.02×1023×(ng/μL×10-9)/(DNAlength×660),计算其拷贝数为:5.4×1010拷贝/μL,按照10倍梯度稀释,保存于-20℃备用。
5.荧光定量PCR反应体系优化
用稀释的质粒标准品5.4×105拷贝/μL为模板,在最佳退火温度条件下,采用梯度实验优化荧光定量PCR引物、探针和Taq酶浓度以及反应体系中的四种脱氧核苷酸的混合物、镁离子浓度和缓冲液含量,综合考虑CT值、荧光强度和重复性,确定最佳的荧光定量PCR反应条件。
优化得到的反应体系为:总体积24μL,其中10×PCR缓冲液2.5μL,氯化镁(25mmol·mL-1)3.2μL,四种脱氧核苷酸的混合物(2.5mM)2μL,上下游引物(10μM)各1μL,特异性探针(10μM)0.5μL,Taq酶(5U/μL)0.25μL,质粒标准品1μL,去离子水12.55μL。
荧光定量PCR反应条件:95℃预变性2min,95℃变性15s;58℃退火30s;72℃延伸20s;如此40个循环。每次都在58℃退火结束时收集荧光信号;阴性对照的Ct值应不显示。
6.荧光定量PCR标准曲线的建立
以重组质粒为阳性模板进行荧光定量PCR反应,按照10倍梯度稀释得到5.4×109~5.4×100拷贝/μL的质粒,在Bio-Rad CFX96荧光定量PCR仪器上进行检测,得到检测重组质粒的扩增动力学曲线(图5),计算出扩增产物阈值循环数(Ct)与模板起始拷贝数(Sq)的对数值的标准曲线(图4),由图4所知荧光定量PCR标准品的浓度在5.4×109~5.4×100拷贝/μL范围内具有良好线性关系,Ct=-3.164×lg(Sq)+36.848,R2=0.993,扩增效率E=107%。
7.荧光定量PCR灵敏度试验
将阳性质粒以5.4×1010拷贝/μL为原始浓度经10倍梯度稀释,得到5.4×109~5.4×100拷贝/μL的质粒为模板,进行荧光定量PCR反应,得到灵敏度动力学扩增曲线(图6),当标准品的拷贝数为5.4×100拷贝/μL时仍能检测到,而阴性对照无扩增,说明该检测方法的最低检测限度可达5.4拷贝/μL。另外,常规PCR只能检测到5.4×104拷贝/μL(图7),因此,Taqman探针荧光定量PCR的检测灵敏度要比常规PCR的灵敏度要高10000倍。
8.荧光定量PCR特异性及其抗其它DNA对特异扩增的干扰
为验证本实验建立的荧光定量PCR引物的特异性以及抗其它DNA对特异扩增的干扰,以嗜热四膜虫DNA、尾草履虫DNA、水体混合浮游生物DNA、底泥生物混合DNA以及混合DNA(每种DNA取2μL混合)为模板。阳性对照为多子小瓜虫DNA,阴性对照为无菌水,用本研究建立的Taqman探针荧光定量PCR反应体系检测,分析引物的特异性及其抗其它DNA对特异扩增的干扰。结果显示该引物只能扩增多子小瓜虫DNA模板(图9),其它DNA不抑制特异引物扩增小瓜虫幼虫DNA(图8),表明该技术适合用于水体、底泥和鱼体的多子小瓜虫检测。
9.荧光定量PCR的重复性和稳定性
重复性分析包括组内重复和组间重复。选取5.4×108拷贝/μL~5.4×101拷贝/μL8个不同浓度的质粒为阳性模板,在最优反应体系条件下进行3次重复试验,每隔1天进行一次,重复三次,将得到的CT值进行分析,计算其变异系数,结果(如表1,表2)显示组内变异系数都小于5%,而且最大的组内变异系数为4.6%,组间变异系数为0.9%。
表1不同天数荧光定量PCR Ct值组内重复性试验数据
表2三次荧光定量PCR Ct值组间重复性试验数据
10.多子小瓜虫个数与基因拷贝数间的线性关系
在光学显微镜下分别计数收集100和200只多子小瓜虫幼虫,然后分别提取总DNA。将提取的100只幼虫的总DNA稀释至10,8,6,4,2,1只幼虫总DNA量,200只幼虫总DNA稀释至200,20,2只幼虫总DNA量,进行荧光定量PCR检测,结果如表3和表4所示,得到线性回归直线方程(图10所示)。根据表3和4可得1只虫子的基因拷贝数约为7个拷贝数。
表3虫子个数对应的基因拷贝数
虫子个数 | 10 | 8 | 6 | 4 | 2 | 1 | 0 |
基因拷贝数 | 87.09 | 67.61 | 46.77 | 33.88 | 13.49 | 7.24 | 0 |
表4虫子个数对应的基因拷贝数
虫子个数 | 0 | 2 | 20 | 200 |
基因拷贝数 | 0 | 14.13 | 123.03 | 1000 |
实施例2养殖水体样本检测
从广州花都、番禺以及广东中山市的草鱼养殖池塘分别采集1L水体样品,抽滤浓缩水样,提取水样DNA,然后用本发明所建立的检测方法对养殖水体40份样品进行TaqMan探针荧光定量PCR方法检测,同时设置阳性样品组和阴性样品组,其检测结果如表5和图11所示。
表5 TaqMan探针荧光定量PCR对养殖水体的检测结果
采样地点 | 池塘数量 | 阳性样品数量 | 阳性检出率(%) |
花都 | 12 | 2 | 16.7 |
番禺 | 12 | 0 | 0 |
中山市 | 16 | 0 | 0 |
由表5和图11可以看出,花都地区水样的检出率为16.7%,正是养草鱼苗患过多子小瓜虫病的池塘。番禺和中山市池塘水体没检出多子小瓜虫,可能与其所养为大个体的脆肉鲩有关,一般为2-3龄,难感染小瓜虫。
上述实施例为本发明较佳的实施方式,但本发明的实施方式并不受上述实施例的限制,其他的任何未背离本发明的精神实质与原理下所作的改变、修饰、替代、组合、简化,均应为等效的置换方式,都包含在本发明的保护范围之内。
序列表
<110> 暨南大学
<120> 检测多子小瓜虫的Taqman探针qPCR检测引物组和应用
<160> 3
<170> SIPOSequenceListing 1.0
<210> 1
<211> 18
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> Cathepsin F
<400> 1
caggagttgc tttctttg 18
<210> 2
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> Cathepsin R
<400> 2
ctcctttaat tctttataag ttttc 25
<210> 3
<211> 27
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> Cathepsin-Probe
<220>
<221> modified_base
<222> (1)..(1)
<223> FAM修饰
<220>
<221> modified_base
<222> (27)..(27)
<223> BHQ修饰
<400> 3
tttctcacca taaagctcct acacatg 27
Claims (10)
1.组织蛋白酶L基因作为分子靶点在制备检测、鉴别或诊断多子小瓜虫的试剂中的应用,其特征在于:
所述的组织蛋白酶L基因的GenBank:XM_004039979.1。
2.一种用于检测多子小瓜虫的试剂,其特征在于:包含能够检测多子小瓜虫的权利要求1中所述的组织蛋白酶L基因的引物。
3.根据权利要求2所述的用于检测多子小瓜虫的试剂,其特征在于:
能够检测多子小瓜虫的组织蛋白酶L基因的引物,序列如下:
Cathepsin F:5’-CAGGAGTTGCTTTCTTTG-3’;
Cathepsin R:5’-CTCCTTTAATTCTTTATAAGTTTTC-3’;
Cathepsin-Probe:5’-FAM-TTTCTCACCATAAAGCTCCTACACATG-BHQ3’。
4.权利要求2或3所述的用于检测多子小瓜虫的试剂在检测、鉴别或诊断多子小瓜虫的试剂盒中的应用。
5.一种用于检测多子小瓜虫的试剂盒,其特征在于:含有权利要求2或3所述的用于检测多子小瓜虫的试剂。
6.一种定量检测多子小瓜虫的方法,其特征在于:包括如下步骤:所述方法为非疾病诊断方法;
(1)提取待测样品DNA;
(2)PCR扩增组织蛋白酶L基因,构建重组质粒,以其为模板建立qPCR反应体系以及用不同拷贝数(Sq)的重组质粒的对数值及其Ct值的关系绘制标准曲线;其中,拷贝数Sq与Ct值的关系为Ct=-3.164×lg(Sq)+36.848,相关系数R2=0.993;
(3)利用建立好的检测方法,加入权利要求2或3所述的用于检测多子小瓜虫的试剂和待测样品DNA,配成qPCR反应体系,进行qPCR反应,得到待测样品的Ct值;
(4)多子小瓜虫定量检测
qPCR完成后,根据Ct值判断:若无扩增,则判断该样品中无多子小瓜虫;若有扩增,则根据建立好的标准曲线计算相应的组织蛋白酶L基因拷贝数,阴性对照的Ct值应无扩增。
7.权利要求6所述的方法,其特征在于:
每只多子小瓜虫的组织蛋白酶L基因拷贝数为7个拷贝数;
步骤(1)中,待测样品为水体、底泥或鱼体组织。
8.权利要求6所述的方法,其特征在于:
步骤(2)、(3)中,qPCR反应体系,为:10×PCR缓冲液2.5μL,25mmol·mL-1的氯化镁3.2μL,2.5mM四种脱氧核苷酸的混合物2μL,10μM的Cathepsin F/R各1μL,10μM的Cathepsin-Probe 0.5μL,5U/μL的Taq酶0.25μL;模板DNA 1μL,灭菌双蒸水12.55μL;反应体系总体积为24μL。
9.权利要求6所述的方法,其特征在于:
qPCR反应条件为:95℃预变性2min,然后95℃变性15s,58℃退火30s;72℃延伸20s,如此40个循环;每次都在58℃退火结束时收集荧光信号;阴性对照的Ct值应不显示。
10.权利要求6所述的方法,其特征在于:
步骤(3)中,以不同拷贝数(Sq)的重组质粒是拷贝数为5.4×100~5.4×109拷贝/μL的重组质粒;具体为5.4×100、5.4×101、5.4×102、5.4×103、5.4×104、5.4×105、5.4×106、5.4×107、5.4×108、5.4×109拷贝/μL的重组质粒。
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CN115807112A (zh) * | 2022-11-30 | 2023-03-17 | 中国科学院水生生物研究所 | 一种鉴别和定量检测多子小瓜虫的引物组及应用 |
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