CN115109864A - 用于鉴定中国南瓜‘中蔬砧1号’杂交种的ssr分子标记e201及其引物、试剂盒与方法 - Google Patents
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Abstract
本发明“一种用于鉴定中国南瓜‘中蔬砧1号’杂交种的SSR引物及鉴定方法”,属于生物技术辅助育种领域。用于PCR扩增分子标记的引物对为E201‑F和E201‑R,E201‑F的核苷酸序列如SEQ ID No.3所示,E201‑R的核苷酸序列如SEQ ID No.4所示。基于PCR扩增反应,该SSR分子标记能够在短时间内快速完成中国南瓜‘中蔬砧1号’杂交种的纯度鉴定,稳定性高,方法简便快捷,结果准确,解决了现有的中国南瓜‘中蔬砧1号’杂交种品种鉴定存在的鉴定周期长、鉴定不准确等问题,可应用于中国南瓜‘中蔬砧1号’杂交种种子纯度的分子标记辅助育种筛选。
Description
技术领域
本发明属于生物技术辅助育种领域,特别涉及用于鉴定中国南瓜‘中蔬砧1号’杂交种的SSR分子标记E201及其引物、试剂盒与方法。
背景技术
中国南瓜(Cucurbita moschataD.),一年生蔓生草本植物,其作为一种重要的蔬菜作物,在全球范围内广泛栽培种植。由于杂种优势的存在,杂交一代种在抗病、抗逆和果实品质等方面明显优于两亲本。但在中国南瓜杂交制种过程中,授粉期间由于母本雄花摘除不彻底或不及时,导致花粉落到母本雌花柱头上产生自交种子,从而出现假杂种,导致种子遗传纯度下降,给生产造成巨大的经济损失。因此,优良一代杂交种纯度的快速、准确鉴定成为中国南瓜生产中最为迫切解决的问题之一。
种子纯度鉴定常用的方法主要包括田间形态鉴定、同工酶鉴定和分子标记鉴定等。田间形态鉴定成本较高,周期较长,且鉴定结果还会受到环境因素的影响;同工酶鉴定准确性高,但由于其具有组织和器官特异性,应用常常受到限制。分子标记技术能够从DNA水平上揭示子代和亲本间微小的遗传差异,不受生长季节、环境条件和栽培措施的影响,可以极大的缩短鉴定时间,其中SSR标记具有多态性高,数量多,稳定性好,并且易于检测等优点,被广泛应用于纯度鉴定和分子标记辅助育种等工作中。
近年来,中国南瓜‘中蔬砧1号’由于其生长势旺,抗病抗逆性强,根系强大等优点,常被用做砧木,用于提高黄瓜、西瓜等葫芦科作物的抗逆性,推广面积日益扩大,种子需求量随之增大。为了防止人工制种过程中出现母本自交形成假杂种这一现象,急需确定中国南瓜‘中蔬砧1号’杂交种种子纯度鉴定方法,为中国南瓜的纯度鉴定提供技术支持。
发明内容
基于上述领域的空白,本发明旨在提供一种用于鉴定中国南瓜‘中蔬砧1号’杂交种种子纯度的SSR分子标记;提供一种用于鉴定中国南瓜‘中蔬砧1号’杂交种种子纯度的PCR检测试剂盒;将所述的SSR标记应用于鉴定中国南瓜‘中蔬砧1号’杂交种真实性或种子纯度等方面,使得无需等待南瓜单株成长至果实成熟期再观察形态特征,在幼苗期即可提取DNA,根据扩增片段区分真假杂种,有效鉴定杂种纯度。
本发明的上述目的是通过以下技术方案来实现的:
用于鉴定中国南瓜‘中蔬砧1号’杂交种的SSR分子标记E201,其特征在于,检测所述SSR分子标记E201的上游引物E201-F序列如SEQ ID NO.3所示,下游引物E201-R序列如SEQ ID NO.4所示。
所述SSR分子标记在中国南瓜‘中蔬砧1号’杂交种的母本‘823’基因组中的特征条带序列如SEQ ID NO.1。
所述SSR分子标记在中国南瓜‘中蔬砧1号’杂交种的父本‘824’基因组中的特征条带序列如SEQ ID NO.2;
优选地,所述SSR分子标记在中国南瓜‘中蔬砧1号’杂交种基因组的特征条带序列分别如SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2所示。
一种检测用于鉴定中国南瓜‘中蔬砧1号’杂交种的SSR分子标记E201的引物,其特征在于,其上游引物E201-F序列如SEQ ID NO.3所示,下游引物E201-R序列如SEQ ID NO.4所示。
一种分子鉴定中国南瓜‘中蔬砧1号’杂交种的引物,其特征在于,包括:一种检测用于鉴定中国南瓜‘中蔬砧1号’杂交种的SSR分子标记E201的引物;所述引物的上游引物E201-F序列如SEQ ID NO.3所示,下游引物E201-R序列如SEQ ID NO.4所示。
用于鉴定中国南瓜‘中蔬砧1号’杂交种的试剂盒,其特征在于,包括:一种检测用于鉴定中国南瓜‘中蔬砧1号’杂交种的SSR分子标记E201的引物;所述引物的上游引物E201-F序列如SEQ ID NO.3所示,下游引物E201-R序列如SEQ ID NO.4所示。
所述的用于鉴定中国南瓜‘中蔬砧1号’杂交种的试剂盒还包括:PCR试剂和/或电泳试剂。
一种分子鉴定中国南瓜‘中蔬砧1号’杂交种的方法,其特征在于,采用检测用于鉴定中国南瓜‘中蔬砧1号’杂交种的SSR分子标记E201的引物对候选南瓜材料进行PCR。
所述PCR的体系包括:0.75ng/μl DNA模板,正向和反向引物各5ng/μl,0.5μL/μl 2×3G Taq Master Mix for PAGE(Red Dye);
优选地,所述PCR体系为:7.5ng DNA模板,正向和反向引物各50ng,5μL 2×3G TaqMaster Mix for PAGE(Red Dye),加双蒸水至10μl;
优选地,所述PCR的程序包括:95℃预变性3分钟;以95℃变性15秒,55℃退火15秒,72℃延伸30秒为1个循环,共35个循环;72℃保温5分钟;
优选地,所述DNA模板指候选南瓜材料的DNA。
根据所述PCR的产物的电泳结果或测序结果判别鉴定结果;
电泳结果显示2条特征条带或测序结果同时测出如SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2所示的2条序列的候选南瓜材料为中国南瓜‘中蔬砧1号’杂交种;
优选地,所述电泳指,将PCR产物用6%非变性聚丙烯酰胺凝胶分离;
优选地,电泳条件为150V恒功率电泳分离1h30min,电泳后银染显色。
本发明提供了一种所述SSR分子标记E201及其引物对E201-F和E201-R,主要应用于在南瓜杂交种子纯度鉴定和辅助鉴定、南瓜杂交种子纯度筛选和南瓜分子标记辅助育种中。
本发明的另一方面是提供一种用于中国南瓜品种‘中蔬砧1号’杂交种真实性或者鉴定‘中蔬砧1号’杂交种种子纯度的PCR检测试剂盒,该PCR检测试剂盒包括:dNTPs、Taq酶、由正向引物和反向引物组成的PCR引物对,扩增缓冲液和灭菌水;其中,所述的PCR引物是上述所述的SSR分子标记E201。
本发明的再一方面是提供一种鉴定中国南瓜品种‘中蔬砧1号’真实性或种子纯度的方法:应用所述的SSR标记,通过PCR扩增,经6%非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳检测,即可显示不同个体间的多态性,从而达到鉴定的目的。
具体的,本发明提供了一种应用所述的基于SSR标记鉴定中国南瓜品种‘中蔬砧1号’种子纯度的方法,该鉴定方法包括:
(1)提取待检测的南瓜种子样品的基因组DNA;
(2)以提取的样品基因组DNA为模板,利用SEQ ID No.3和SEQ ID No.4所示的上下游引物E201-F和E201-R进行PCR扩增反应,获得PCR产物;
(3)对步骤(2)的PCR扩增产物进行聚丙烯酰胺凝胶电泳检测;
(4)对步骤(3)的电泳结果进行分析,每一种扩增产物的带型均同时具有‘中蔬砧1号’杂交种父母本的带型,则待检测南瓜品种为‘中蔬砧1号’杂交种;如果任何一种扩增产物的带型不同时具有‘中蔬砧1号’杂交种父母本的带型,则待检测南瓜品种则不是‘中蔬砧1号’杂交种;
(5)计算真实的‘中蔬砧1号’杂交种个数占总检测种子个数的比率,得到‘中蔬砧1号’杂交种的种子纯度。
所述PCR体系包括:0.75ng/μl DNA模板,正向和反向引物各5ng/μl,0.5μL/μl 2×3G Taq Master Mix for PAGE(Red Dye);
优选地,所述PCR体系为:7.5ng DNA模板,正向和反向引物各50ng,5μL 2×3G TaqMaster Mix for PAGE(Red Dye),加双蒸水至10μl;
所述DNA模板母本‘823’、父本‘824’和‘中蔬砧1号’的单株幼苗基因组DNA;
优选地,所述PCR程序为:95℃预变性3分钟;以95℃变性15秒,55℃退火15秒,72℃延伸30秒为1个循环,共35个循环;72℃保温5分钟;
优选地,所述检测还包括:对PCR产物进行电泳;
所述电泳指,将PCR产物用6%非变性聚丙烯酰胺凝胶分离;
优选地,电泳条件为150V恒功率电泳分离1h30min,电泳后银染显色;
优选地,如果每一种扩增产物的带型均同时具有‘中蔬砧1号’杂交种父母本的带型,则待检测南瓜品种为‘中蔬砧1号’杂交种;如果任何一种扩增产物的带型不同时具有‘中蔬砧1号’杂交种父母本的带型,则待检测南瓜品种则不是‘中蔬砧1号’杂交种。
优选地,纯度计算是指杂交种子数量占检测样品种子粒数的百分率;
所述的南瓜杂交种‘中蔬砧1号’的母本为‘823’,所述南瓜杂交种‘中蔬砧1号’的父本为‘824’,所述的杂交F1单株均指‘中蔬砧1号’杂交种的单株。
本发明的有益效果:
1、本发明开发了一对可以用于鉴定中国南瓜‘中蔬砧1号’杂交种子纯度的分子标记及引物,该分子标记可以快速区分真假杂种,且特异性强,遗传稳定,可以快速应用于南瓜纯度的分子标记辅助育种筛选。
2、通过本发明的引物及方法,只需要提取南瓜幼苗期叶片基因组DNA,然后进行PCR扩增、聚丙烯酰胺凝胶电泳,即可快速有效鉴定‘中蔬砧1号’杂交种子的纯度,无需进行田间观察,快速,准确,成本低,具有较高的商业价值。
3、利用本发明方法鉴定南瓜杂交种子纯度特异性好、准确度高,与田间种子调查结果一致,鉴定准确率高达100%。通过本发明提供的E201分子标记及引物,按照本发明提供的鉴定方法可在幼苗期快速、准确检测出‘中蔬砧1号’杂交种子与其父母本种子,本发明开发的分子标记可应用于中国南瓜‘中蔬砧1号’杂交种子大田生产和制种生产实践中。
附图说明
图1为父母本和‘中蔬砧1号’抽样电泳图谱(Marker,750bp;P1,母本‘823’,P2,父本‘824’;其余条带为‘中蔬砧1号’杂交种条带;P1显示条带为SEQ ID No.1;P2显示条带为SEQID No.2)。
具体实施方式
下面结合具体实施方式对本发明作进一步的详细说明,但并不限制本发明的范围。如无特殊说明,下述实施例中使用的操作均为常规方法,所采用的试剂均可以商购获得。
生物材料的来源
本发明实验例所用的试验材料:母本‘823’、父本‘824’为申请人实验室自有南瓜株系,申请人承诺申请日起20年内向公众发放上述南瓜株系的种子用于验证本发明的效果;
杂交种‘中蔬砧1号’为公知公用的南瓜品种,可以商购获得。
主要试剂
PCR实验使用Vazyme公司的2×3G Taq Master Mix for PAGE(Red Dye);凝胶电泳使用北京酷来搏科技有限公司的40%非变性聚丙烯酰胺,将其稀释至6%后使用。测序在北京生工公司进行。
第1组实施例、本发明的SSR分子标记E201
本组实施例提供用于鉴定中国南瓜‘中蔬砧1号’杂交种的SSR分子标记E201。本组所有的实施例都具备如下共同特征:检测所述SSR分子标记E201的上游引物E201-F序列如SEQ ID NO.3所示,下游引物E201-R序列如SEQ ID NO.4所示。
在一些实施例中,所述SSR分子标记在中国南瓜‘中蔬砧1号’杂交种的母本‘823’基因组中的特征条带序列如SEQ ID NO.1;
在另一些实施例中,所述SSR分子标记在中国南瓜‘中蔬砧1号’杂交种的父本‘824’基因组中的特征条带序列如SEQ ID NO.2;
优选地,所述SSR分子标记在中国南瓜‘中蔬砧1号’杂交种基因组的特征条带序列分别如SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2所示。
第2组实施例、本发明SSR分子标记E201的引物
本组实施例提供一种检测用于鉴定中国南瓜‘中蔬砧1号’杂交种的SSR分子标记E201的引物。本组所有的实施例都具备如下共同特征:所述引物的上游引物E201-F序列如SEQ ID NO.3所示,下游引物E201-R序列如SEQ ID NO.4所示。
第3组实施例、本发明的杂交种鉴定引物
本组实施例提供一种分子鉴定中国南瓜‘中蔬砧1号’杂交种的引物。本组所有的实施例都具备如下共同特征:所述引物包括:一种检测用于鉴定中国南瓜‘中蔬砧1号’杂交种的SSR分子标记E201的引物;所述引物的上游引物E201-F序列如SEQ ID NO.3所示,下游引物E201-R序列如SEQ ID NO.4所示。
第4组实施例、本发明的杂交种鉴定试剂盒
本组实施例提供一种用于鉴定中国南瓜‘中蔬砧1号’杂交种的试剂盒。本组所有的实施例都具备如下共同特征:所述试剂盒包括:一种检测用于鉴定中国南瓜‘中蔬砧1号’杂交种的SSR分子标记E201的引物;所述引物的上游引物E201-F序列如SEQ ID NO.3所示,下游引物E201-R序列如SEQ ID NO.4所示。
在进一步的实施例中,所述的用于鉴定中国南瓜‘中蔬砧1号’杂交种的试剂盒还包括:PCR试剂和/或电泳试剂。
在具体的实施例中,所述PCR试剂包括:dNTP,Taq酶,缓冲液,双蒸水;
优选地,所述电泳试剂包括:电泳缓冲液、Tris-HCl、SDS、丙烯酰胺、过硫酸胺、TEMED、双蒸水、银染试剂。
第5组实施例、本发明的杂交种鉴定方法
本组实施例提供一种分子鉴定中国南瓜‘中蔬砧1号’杂交种的方法。本组所有的实施例都具备如下共同特征:采用检测用于鉴定中国南瓜‘中蔬砧1号’杂交种的SSR分子标记E201的引物对候选南瓜材料进行PCR;所述引物的上游引物E201-F序列如SEQ ID NO.3所示,下游引物E201-R序列如SEQ ID NO.4所示。
在一些实施例中,所述PCR的体系包括:0.75ng/μl DNA模板,正向和反向引物各5ng/μl,0.5μL/μl 2×3G Taq Master Mix for PAGE(Red Dye);
优选地,所述PCR体系为:7.5ng DNA模板,正向和反向引物各50ng,5μL 2×3G TaqMaster Mix for PAGE(Red Dye),加双蒸水至10μl;
所述PCR的程序包括:95℃预变性3分钟;以95℃变性15秒,55℃退火15秒,72℃延伸30秒为1个循环,共35个循环;72℃保温5分钟。
在进一步的实施例中,根据所述PCR的产物的电泳结果或测序结果判别鉴定结果;
电泳结果显示2条特征条带或测序结果同时测出如SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2所示的2条序列的候选南瓜材料为中国南瓜‘中蔬砧1号’杂交种;
如果只出现一个条带或者不出现条带或者测序结果只测出SEQ ID NO.1和SEQ IDNO.2的其中之一,则候选南瓜材料并非中国南瓜‘中蔬砧1号’杂交种。
优选地,所述电泳指,将PCR产物用6%非变性聚丙烯酰胺凝胶分离;
优选地,电泳条件为150V恒功率电泳分离1h30min,电泳后银染显色。
实验例1、特异性分子标记的筛选
根据南瓜SSR引物,以母本‘823’和父本‘824’全基因组DNA为模板,在亲本间筛选有多态性的引物,最终确定亲本间共显性差异标记,命名E201,序列如下:
E201-F:ACCCTTCATTTCCGCAAAAC(SEQ ID NO.3)
E201-R:TACGGTGACTTTCCTTTCCG(SEQ ID NO.4);
该标记带型清晰、重复性好。引物E201可扩增出197个核苷酸母本‘823’的特异性扩增片段,和202个核苷酸父本‘824’特异性片段(见图1)。
实验例2、‘中蔬砧1号’中国南瓜杂交种纯度鉴定
1.鉴定方法
1.1叶片基因组DNA的提取
将父母本(母本‘823’和父本‘824’)的种子和样品种子同时播种于72孔穴盘中,定期浇水,直至长出两片真叶;将父本、母本和145份杂交样品种子分别单株取样叶片。按照常规CTAB方法分别提取基因组DNA。
(1)取0.2g左右的鲜叶片于2ml离心管中,放入液氮中,然后迅速用玻璃棒研磨成粉末;
(2)加入800μl 2%CTAB预热缓冲液;
(3)65℃水浴1.0h(其间每隔10min将离心管上下缓慢摇晃一次,使干粉样品和CTAB充分混合);
(4)室温冷却至15℃以下后,加入等体积(800μl)24:1氯仿/异戊醇,上下混匀10min,保证样品和氯仿充分混合,离心10min(13000rpm/min);
(5)吸取上清液600μl到新的1.5ml离心管,重复第(4);
(6)吸取上清液400μl于另一个1.5ml的离心管中,加入事先在冰箱中预冷的无水乙醇800μl,上下混匀后,于-20℃冰箱中静置30min;
(7)13000rpm离心10min,弃上清液,收集沉淀;
(8)加入500ul 70%的乙醇,清洗两遍后,室温放置5~10min;
(9)7500rpm离心5min,弃上清液,开口置于超净工作台中吹干;
(10)加入100μl ddH2O溶解DNA。
1.2 PCR扩增及检测分析
以1.1所述的基因组DNA为模板,以E201为引物,分别进行PCR扩增;
PCR反应体系为:反应体系10μL,3μL DNA(5.0ng·μL-1),正向和反向引物(50ng·μL-1)各1μL,5μL 2×3G Taq Master Mix for PAGE(Red Dye)(Vazyme公司产品)。
PCR扩增程序为:95℃预变性3分钟;95℃变性15秒,55℃退火15秒,72℃延伸30秒,35个循环;72℃保温5分钟,10℃保存。
PCR产物用6%非变性聚丙烯酰胺凝胶分离,电泳缓冲液为0.5×TBE,150V恒功率电泳分离1h30min,电泳后银染显色,统计带型。
如果每一种扩增产物的带型均同时具有‘中蔬砧1号’杂交种父母本的带型,则待检测南瓜品种为‘中蔬砧1号’杂交种,缺少两亲本中任意一条特征带或者为非亲本特异条带的均为假杂种。
2.结果分析
利用SSR引物E201对‘中蔬砧1号’杂交种进行PCR扩增、电泳,完成纯度鉴定,结果见图1,从图1可以清晰的看出,在母本‘823’中扩增出197bp的特异性条带,父本‘824’中扩增出202bp的特异性条带。其中被检测种子中有135个泳道图谱与‘中蔬砧1号’杂交种图谱一致,有10个泳道的图谱与‘中蔬砧1号’杂交种标准图谱不一致,说明这10株为杂株,计算得出南瓜杂交种纯度为93.1%,与田间种子纯度调查结果一致,准确率为100%。145粒‘中蔬砧1号’种子的样本电泳图谱如图1所示。
所述田间种子纯度调查指:基于南瓜植株的田间形态(主要是果实形状这一性状)对具体植株所对应的种子纯度进行区分,果实形状为梨形(上端细下端粗)的植株所对应的种子为‘中蔬砧1号’种子,而果实形状为圆柱形(上下端粗细一致)的植株所对应的种子非‘中蔬砧1号’种子。这种田间种子纯度调查方式为本领域鉴定‘中蔬砧1号’种子纯度的常用方法。
SEQUENCE LISTING
<110> 中国农业科学院蔬菜花卉研究所
<120> 用于鉴定中国南瓜'中蔬砧1号'杂交种的SSR分子标记E201及其引物、试剂盒
与方法
<130> P220551/SCH
<160> 4
<170> PatentIn version 3.5
<210> 1
<211> 195
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> 中国南瓜(Cucurbita moschata
D.)'中蔬砧1号'的母本'823'的SSR分子标记E201的特征条带序列
<400> 1
acccttcatt tccgcaaaac cctttttctt cttcttcttc tctttctcgg tttcgtccgt 60
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<210> 2
<211> 202
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> 中国南瓜(Cucurbita moschata D.)'中蔬砧1号'的父本'824'
的SSR分子标记E201的特征条带序列
<400> 2
acccttcatt tccgcaaaac cctttcttct tcttcttctt cttcttctct ttctcggttt 60
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<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> 引物E201-F
<400> 3
acccttcatt tccgcaaaac 20
<210> 4
<211> 20
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> 引物E201-R
<400> 4
tacggtgact ttcctttccg 20
Claims (10)
1.用于鉴定中国南瓜‘中蔬砧1号’杂交种的SSR分子标记E201,其特征在于,检测所述SSR分子标记E201的上游引物E201-F序列如SEQ ID NO.3所示,下游引物E201-R序列如SEQID NO.4所示。
2.根据权利要求1所述的用于鉴定中国南瓜‘中蔬砧1号’杂交种的SSR分子标记E201,其特征在于,所述SSR分子标记在中国南瓜‘中蔬砧1号’杂交种的母本‘823’基因组中的特征条带序列如SEQ ID NO.1。
3.根据权利要求1或2所述的用于鉴定中国南瓜‘中蔬砧1号’杂交种的SSR分子标记E201,其特征在于,所述SSR分子标记在中国南瓜‘中蔬砧1号’杂交种的父本‘824’基因组中的特征条带序列如SEQ ID NO.2;
和/或,所述SSR分子标记在中国南瓜‘中蔬砧1号’杂交种基因组的特征条带序列分别如SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2所示。
4.一种检测用于鉴定中国南瓜‘中蔬砧1号’杂交种的SSR分子标记E201的引物,其特征在于,其上游引物E201-F序列如SEQ ID NO.3所示,下游引物E201-R序列如SEQ ID NO.4所示。
5.一种分子鉴定中国南瓜‘中蔬砧1号’杂交种的引物,其特征在于,包括:一种检测用于鉴定中国南瓜‘中蔬砧1号’杂交种的SSR分子标记E201的引物;所述引物的上游引物E201-F序列如SEQ ID NO.3所示,下游引物E201-R序列如SEQ ID NO.4所示。
6.用于鉴定中国南瓜‘中蔬砧1号’杂交种的试剂盒,其特征在于,包括:一种检测用于鉴定中国南瓜‘中蔬砧1号’杂交种的SSR分子标记E201的引物;所述引物的上游引物E201-F序列如SEQ ID NO.3所示,下游引物E201-R序列如SEQ ID NO.4所示。
7.根据权利要求6所述的用于鉴定中国南瓜‘中蔬砧1号’杂交种的试剂盒,其特征在于,还包括:PCR试剂和/或电泳试剂。
8.一种分子鉴定中国南瓜‘中蔬砧1号’杂交种的方法,其特征在于,采用检测用于鉴定中国南瓜‘中蔬砧1号’杂交种的SSR分子标记E201的引物对候选南瓜材料进行PCR。
9.根据权利要求9所述的一种分子鉴定中国南瓜‘中蔬砧1号’杂交种的方法,其特征在于,所述PCR的体系包括:0.75ng/μl DNA模板,正向和反向引物各5ng/μl,0.5μL/μl 2×3GTaq Master Mix for PAGE(Red Dye);
和/或,所述PCR体系为:7.5ng DNA模板,正向和反向引物各50ng,5μL 2×3G TaqMaster Mix for PAGE(Red Dye),加双蒸水至10μl;
和/或,所述PCR的程序包括:95℃预变性3分钟;以95℃变性15秒,55℃退火15秒,72℃延伸30秒为1个循环,共35个循环;72℃保温5分钟;
和/或,所述DNA模板指候选南瓜材料的DNA。
10.根据权利要求8或9所述的一种分子鉴定中国南瓜‘中蔬砧1号’杂交种的方法,其特征在于,根据所述PCR的产物的电泳结果或测序结果判别鉴定结果;
电泳结果显示2条特征条带或测序结果同时测出如SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2所示的2条序列的候选南瓜材料为中国南瓜‘中蔬砧1号’杂交种;
和/或,所述电泳指,将PCR产物用6%非变性聚丙烯酰胺凝胶分离;
和/或,电泳条件为150V恒功率电泳分离1h30min,电泳后银染显色。
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