CN114929634A - 用于废料、水或土壤处理或者用于饲喂动物的微生物 - Google Patents
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Abstract
本发明涉及包含微生物菌株的组合物，以及使用组合物在废料、水或土壤中去除污染物(比如在水、土壤或废料中修复染料和木质素、减少致污物、降解纸(比如可冲水或一次性或不可冲水湿巾纸)、减少气味、减少化学需氧量(COD)及其组合)，或用于在动物饲料或饮用水中给予动物的方法。更具体地说，本发明涉及分离的芽孢杆菌属菌株的组合物，所述菌株选自分离的芽孢杆菌属菌株地衣芽孢杆菌MDG‑1000(NRRL No.B‑67888)、地衣芽孢杆菌MDG‑1001(NRRL No.B‑67889)、枯草/解淀粉芽孢杆菌MDG‑8001(NRRL No.B‑67890)、短小芽孢杆菌MDG‑1047(NRRL No.B‑67891)、解淀粉芽孢杆菌MDG1607(NRRL No.B‑67666)、枯草芽孢杆菌MDGV18(NRRL No.B‑67665)、短小芽孢杆菌MDGV17(NRRL No.B‑67664)、枯草芽孢杆菌MDG‑1728(NRRL No.B‑67618)、巨大芽孢杆菌MDG‑2705(NRRL No.B‑67619)和具有这些菌株所有鉴定特征的菌株及其组合；以及使用这些菌株以在废料、水或土壤中去除污染物(比如在水、土壤或废料中修复染料和木质素、减少致污物、降解纸(比如可冲水或一次性或不可冲水湿巾纸)、减少气味、减少化学需氧量(COD)及其组合)，或用于在动物饲料或饮用水中给予动物的方法。
Description
相关申请的交叉引用
此申请根据35 U.S.C. § 119(e)要求提交于2019年8月27日的美国临时申请序列号62/892,150和提交于2020年5月5日的美国临时申请序列号63/020,507的优先权，所述临时申请的公开都明确地通过引用并入本文。
公开领域
本发明涉及包含微生物菌株的组合物，以及使用该组合物在废料、水或土壤中去除污染物(比如在水、土壤或废料中修复染料和木质素、减少致污物、减少气味、减少化学需氧量(COD)、降解纸(比如一次性可冲水或不可冲水湿巾纸)及其组合)，或用于在动物饲料或饮用水中给予动物的方法。更具体地说，本发明涉及分离的芽孢杆菌属(Bacillus)菌株的组合物，所述菌株选自分离的芽孢杆菌属菌株地衣芽孢杆菌(Bacillus licheniformis)MDG-1000 (NRRL No. B-67888)、地衣芽孢杆菌MDG-1001 (NRRL No. B-67889)、枯草/解淀粉芽孢杆菌(Bacillus subtilis/amyloliquefaciens)MDG-8001 (NRRL No. B-67890)、短小芽孢杆菌(Bacillus pumilus) MDG-1047 (NRRL No. B-67891)、解淀粉芽孢杆菌(Bacillus amyloliquefaciens) MDG1607 (NRRL No. B-67666)、枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis) MDGV18 (NRRL No. B-67665)、短小芽孢杆菌MDGV17 (NRRL No. B-67664)、枯草芽孢杆菌MDG-1728 (NRRL No. B-67618)、巨大芽孢杆菌(Bacillus megaterium) MDG-2705 (NRRL No. B-67619)或具有这些菌株所有鉴定特征的菌株及其组合，以及使用这些菌株以在废料、水或土壤中去除污染物(比如在水、土壤或废料中修复染料和木质素、减少致污物、降解纸(比如一次性可冲水或不可冲水湿巾纸)、减少气味、减少化学需氧量(COD)及其组合)，或用于在动物饲料或饮用水中给予至动物的方法。
发明背景和概述
染料主要为合成的有机芳香族化合物，所述化合物根据它们的溶解度和化学性质进行分类。商业上，最重要的两类染料为偶氮和蒽醌染料，分别占所有着色剂的大约66%和15%。染料的分类被分为表明应用的两组。第一组包括用在羊毛、蛋白纤维类、聚酰胺类、棉、亚麻、粘胶、丙烯酸、聚酯类和/或醋酸酯上的酸性、金属络合、直接、碱性和分散染料。第二组包括用在棉、亚麻、粘胶、羊毛和丝绸上的活性硫化和瓮染料。最大的水溶性染料类别包括活性和直接染料，分别占所生产染料的大约20-50%和5-20%。活性染料通常被用于染色棉、亚麻、粘胶、羊毛和丝绸；直接染料被用于染色棉、亚麻和粘胶。通常制造和引用的偶氮染料包括活性红120 (R120)、活性橙16 (RO16)、直接黄27 (DY27)和活性黑5 (RB5)。常见的蒽醌染料包括活性蓝4 (RB4)和Remazol亮蓝R (RBBR) (也称为活性蓝19)。
工业染料的合成为水污染的主要原因之一，因为染料和色素被设计为抗生物降解的。在染色过程中，平均12%的染料被浪费，且该废料的20%被释放到环境中，在其中它可持续数十年(例如RBBR的半衰期在25℃，pH 7.0下为大约四十六年)。染料的化学和结构性质两者使得它们抗衰坏。
木质素为自然界中最丰富的有机芳香族聚合物之一，因为它是维管植物细胞壁的成分。木质素也是造浆造纸的副产物，其中它作为废弃生物质持续存在。它的抗降解性和用于从废水去除木质素的化学处理通常导致急性毒性、增加的光吸收和富营养化。造浆过程中产生的排放被认为是最大的污染物之一；纸浆和造纸业平均每生产一吨纸使用250-500m³水。使用的水的大约75%作为污水排放并且平均含有50-95 mg/L木质素。
量化木质素降解的副产物是困难的，因为它们在水解产物中以痕量存在。研究降解的传统方法涉及观察苯丙素木质醇单体(甲氧基化至各种程度)。由于蒽醌染料相似的结构以及复杂芳香族结构的可比分解，蒽醌染料可被用作木质素降解活性的指示剂。例如，RBBR染料的脱色可被用于间接地估计木质素降解活性。另一种方法涉及使用10-乙酰基-3,7二羟基吩
嗪，因为当存在过氧化物酶和过量过氧化氢时，它产生荧光中间体试卤灵。在荧光和分光光度定量测定中，可使用试卤灵测量过氧化物酶活性。第三种方法使用丁香醛连氮作为底物来测量漆酶活性。
纸制品和湿巾纸在市政污水系统、提升站和废水处理厂中的降解也是需要进行解决的问题。可冲水无纺布一次性湿巾纸(包括婴儿湿巾纸、化妆湿巾和湿厕巾)的使用可在废水处理系统中导致问题。尽管作为可冲水和可生物降解的来进行销售，但无纺布湿巾纸比标准厕纸更厚且更结实，并且需要更长时间分解。这可导致碎片堆积，即其中湿巾纸变得纠缠和打结并且积聚在污水系统和泵中引起堵塞的问题。此外，并不预期将被冲入水中的湿巾纸和纸巾经常进入污水系统。不可冲水湿巾纸和纸巾通常在其中织有塑料纤维，这使得它们比可冲水湿巾纸更加难以降解。其他有机固体和脂肪类、油类和油脂的积累与积累的湿巾纸结合，并导致堵塞。湿巾纸通常需要从污水系统中物理地去除或从泵和其他设备上解开，以防止下水道倒灌和对设备的破坏。清理可为既费工又费钱的。用细菌和酶的生物强化技术具有以下潜力：加速污水系统中纸和湿巾纸的降解、减少碎片堆积和对物理去除和设备维护的需求。可冲水湿巾纸主要由木浆制成，尽管它们可含有一些合成的材料。木浆主要包含可被纤维素酶分解为葡萄糖或多糖的纤维素。由纤维素酶和产生纤维素酶的细菌加速的纤维素降解可通过分解无纺布可冲水湿巾纸来帮助防止碎片堆积。一些芽孢杆菌属菌株能够产生降解聚乙烯的酶，这可帮助消化不可冲水湿巾纸中的塑料纤维。此外，细菌可消化导致湿巾纸积累的有机固体，比如脂肪类、油和油脂。
本发明涉及包含微生物的组合物，用于修复染料或木质素污染的或者含纸或湿巾纸的水、土壤或废料，和/或用于在水、土壤或废料中减少致污物、减少气味、减少化学需氧量(COD)及其组合或者用于在动物饲料或饮用水中给予动物的方法。
申请人已开发了芽孢杆菌属菌株及其组合，它们对以下有用：水、土壤和废料的处理，染料和木质素的降解，染料褪色，纸或湿巾纸的降解以及比如通过减少或去除污染物(例如芳香族聚合物和芳香族化合物和含纸的污染物，比如湿巾纸(例如一次性和不可冲水湿巾纸))和/或减少气味和/或减少化学需氧量(COD)来控制废料的有害作用；或用于在动物饲料或饮用水中给予动物。
例如，这些微生物(即芽孢杆菌属菌株地衣芽孢杆菌MDG-1000 (NRRL No. B-67888)、地衣芽孢杆菌MDG-1001 (NRRL No. B-67889)、枯草/解淀粉芽孢杆菌MDG-8001(NRRL No. B-67890)、短小芽孢杆菌MDG-1047 (NRRL No. B-67891)、解淀粉芽孢杆菌MDG1607 (NRRL No. B-67666)、枯草芽孢杆菌MDGV18 (NRRL No. B-67665)、短小芽孢杆菌MDGV17 (NRRL No. B-67664)、枯草芽孢杆菌MDG-1728 (NRRL No. B-67618)和/或巨大芽孢杆菌MDG-2705 (NRRL No. B-67619))加速染料和木质素的降解和褪色并且分泌酶，包括但不限于氧化还原酶、水解酶、转移酶、裂解酶、异构酶、连接酶、过氧化物酶、漆酶、酯酶、淀粉酶、蛋白酶、木聚糖酶、脂肪酶、纤维素酶、加氧酶、还原酶、氧化酶、羟化酶和脱氢酶，这能够改善工业废水系统以及土壤和水的质量(例如通过修复染料、木质素和纸污染的土壤、废料和水)。这些芽孢杆菌属菌株也可减少气味、减少有机物、减少化学需氧量和减少致污物，包括但不限于木质素和染料(例如酸性、金属络合、直接、碱性、分散、活性、硫化和瓮染料)等。在仍然其他实施方案中，该芽孢杆菌属菌株可在动物饲料中或在动物饮用水中给予动物，并可改善动物表现(例如降低饲料转换、增加每日平均饲料摄入、增加每日平均增重、改善表现一致性及其组合)、改善动物健康、改善动物的环境及其组合。
在一个实施方案中，提供通过将水、土壤或废料与芽孢杆菌属菌株接触以去除污染物而处理水、土壤或废料的方法。该方法包含将水、土壤或废料与有效量的选自以下的分离的芽孢杆菌属菌株接触并去除污染物：芽孢杆菌属菌株地衣芽孢杆菌MDG-1000 (NRRLNo. B-67888)、地衣芽孢杆菌MDG-1001 (NRRL No. B-67889)、枯草/解淀粉芽孢杆菌MDG-8001 (NRRL No. B-67890)、短小芽孢杆菌MDG-1047 (NRRL No. B-67891)、解淀粉芽孢杆菌MDG1607 (NRRL No. B-67666)、枯草芽孢杆菌MDGV18 (NRRL No. B-67665)、短小芽孢杆菌MDGV17 (NRRL No. B-67664)、枯草芽孢杆菌MDG-1728 (NRRL No. B-67618)、巨大芽孢杆菌MDG-2705 (NRRL No. B-67619)和具有这些菌株所有鉴定特征的菌株。
在另一个实施方案中，提供商业包装。该商业包装包含选自以下的分离的芽孢杆菌属菌株：芽孢杆菌属菌株地衣芽孢杆菌MDG-1000 (NRRL No. B-67888)、地衣芽孢杆菌MDG-1001 (NRRL No. B-67889)、枯草/解淀粉芽孢杆菌MDG-8001 (NRRL No. B-67890)、短小芽孢杆菌MDG-1047 (NRRL No. B-67891)、解淀粉芽孢杆菌MDG1607 (NRRL No. B-67666)、枯草芽孢杆菌MDGV18 (NRRL No. B-67665)、短小芽孢杆菌MDGV17 (NRRL No. B-67664)、枯草芽孢杆菌MDG-1728 (NRRL No. B-67618)、巨大芽孢杆菌MDG-2705 (NRRL No.B-67619)和具有这些菌株所有鉴定特征的菌株。
在仍然另一个实施方案中，提供饲喂动物的方法。该方法包含给予动物饲料组合物或饮用水的步骤，所述饲料组合物或饮用水包含有效量的包含选自以下的分离的芽孢杆菌属菌株的添加剂：芽孢杆菌属菌株地衣芽孢杆菌MDG-1000 (NRRL No. B-67888)、地衣芽孢杆菌MDG-1001 (NRRL No. B-67889)、枯草/解淀粉芽孢杆菌MDG-8001 (NRRL No. B-67890)、短小芽孢杆菌MDG-1047 (NRRL No. B-67891)、解淀粉芽孢杆菌MDG1607 (NRRLNo. B-67666)、枯草芽孢杆菌MDGV18 (NRRL No. B-67665)、短小芽孢杆菌MDGV17 (NRRLNo. B-67664)、枯草芽孢杆菌MDG-1728 (NRRL No. B-67618)、巨大芽孢杆菌MDG-2705(NRRL No. B-67619)和具有这些菌株所有鉴定特征的菌株及其组合。
在下文编号的条款中描述的各种实施方案适用于在此“概述”部分和本专利申请的标题为“说明性实施方案的详述”或“实施例”的部分中或者在此申请所附的“权利要求”中描述的任意实施方案：
1. 通过将水、土壤或废料与芽孢杆菌属菌株接触以去除污染物而处理水、土壤或废料的方法，该方法包含将水、土壤或废料与有效量的选自以下的分离的芽孢杆菌属菌株接触并去除污染物：芽孢杆菌属菌株地衣芽孢杆菌MDG-1000 (NRRL No. B-67888)、地衣芽孢杆菌MDG-1001 (NRRL No. B-67889)、枯草/解淀粉芽孢杆菌MDG-8001 (NRRL No. B-67890)、短小芽孢杆菌MDG-1047 (NRRL No. B-67891)、解淀粉芽孢杆菌MDG1607 (NRRLNo. B-67666)、枯草芽孢杆菌MDGV18 (NRRL No. B-67665)、短小芽孢杆菌MDGV17 (NRRLNo. B-67664)、枯草芽孢杆菌MDG-1728 (NRRL No. B-67618)、巨大芽孢杆菌MDG-2705(NRRL No. B-67619)和具有这些菌株所有鉴定特征的菌株。
2. 条款1的方法，其中对水或废料进行处理以去除污染物，并且该水或废料选自工业废水、工业废料、生活废水、生活废料、农业废水、农业废料以及废水。
3. 条款1或2的方法，其中去除污染物导致水、废料或土壤中气味减少或化学需氧量减少。
4. 条款1至3中任一项的方法，其中污染物为有机化合物。
5. 条款4的方法，其中有机化合物通过降解去除。
6. 条款1至5中任一项的方法，其中污染物为合成化合物。
7. 条款1至6中任一项的方法，其中污染物为含纸的化合物。
8. 条款7的方法，其中含纸的化合物为湿巾纸。
9. 条款1至8中任一项的方法，其中至少一种芽孢杆菌属菌株具有抗微生物活性。
10. 条款9的方法，其中抗微生物活性针对选自以下的细菌：大肠杆菌(E. coli)细菌、沙门氏菌属(Salmonella)细菌、葡萄球菌属(Staphylococcus)细菌、肠球菌属(Enterococcus)细菌、弯曲杆菌属(Campylobacter)细菌及其组合。
11. 条款1至10中任一项的方法，其中芽孢杆菌属菌株产生选自以下的酶：氧化还原酶、水解酶、转移酶、裂解酶、异构酶、连接酶、过氧化物酶、漆酶、酯酶、淀粉酶、蛋白酶、木聚糖酶、脂肪酶、纤维素酶、加氧酶、还原酶、氧化酶、羟化酶、脱氢酶及其组合。
12. 条款11的方法，其中酶为氧化还原酶。
13. 条款11的方法，其中酶为水解酶。
14. 条款11的方法，其中酶为转移酶。
15. 条款11的方法，其中酶为裂解酶。
16. 条款11的方法，其中酶为异构酶。
17. 条款11的方法，其中酶为连接酶。
18. 条款11的方法，其中酶为过氧化物酶。
19. 条款11的方法，其中酶为漆酶。
20. 条款11的方法，其中酶为酯酶。
21. 条款11的方法，其中酶为淀粉酶。
22. 条款11的方法，其中酶为蛋白酶。
23. 条款11的方法，其中酶为木聚糖酶。
24. 条款11的方法，其中酶为脂肪酶。
25. 条款11的方法，其中酶为纤维素酶。
26. 条款11的方法，其中酶为加氧酶。
27. 条款11的方法，其中酶为还原酶。
28. 条款11的方法，其中酶为氧化酶。
29. 条款11的方法，其中酶为羟化酶。
30. 条款11的方法，其中酶为脱氢酶。
31. 条款1至30中任一项的方法，其进一步包含用选自另一种芽孢杆菌属菌株、乳酸菌菌株及其组合的另一种细菌菌株处理水、土壤或废料。
32. 条款1至31中任一项的方法，其中芽孢杆菌属菌株的有效量为约1.0 x 102CFU/克水、土壤或废料至约1.0 x 106 CFU/克水、土壤或废料。
33. 条款1至31中任一项的方法，其中芽孢杆菌属菌株的有效量为约1.0 x 102CFU/克水、土壤或废料至约1.0 x 104 CFU/克水、土壤或废料。
34. 条款1至31中任一项的方法，其中有效量为约1.0 x 102 CFU/克水、土壤或废料至约1.0 x 103 CFU/克水、土壤或废料。
35. 条款1至34中任一项的方法，其进一步包含将水、土壤或废料与选自以下的外源性酶接触：氧化还原酶、水解酶、转移酶、裂解酶、异构酶、连接酶、过氧化物酶、漆酶、酯酶、淀粉酶、蛋白酶、木聚糖酶、脂肪酶、纤维素酶、加氧酶、还原酶、氧化酶、羟化酶、脱氢酶及其组合。
36. 条款1至35中任一项的方法，其中给予的菌株为枯草芽孢杆菌MDG-1728(NRRL No. B-67618)或具有枯草芽孢杆菌MDG-1728 (NRRL No. B-67618)所有鉴定特征的菌株。
37. 条款1至35中任一项的方法，其中给予的菌株为芽孢杆菌属菌株巨大芽孢杆菌MDG-2705 (NRRL No. B-67619)或具有巨大芽孢杆菌MDG-2705 (NRRL No. B-67619)所有鉴定特征的菌株。
38. 条款1至35中任一项的方法，其中给予的菌株为芽孢杆菌属菌株地衣芽孢杆菌MDG-1000 (NRRL No. B-67888)或具有地衣芽孢杆菌MDG-1000 (NRRL No. B-67888)所有鉴定特征的菌株。
39. 条款1至35中任一项的方法，其中给予的菌株为芽孢杆菌属菌株解淀粉芽孢杆菌MDG1607 (NRRL No. B-67666)或具有解淀粉芽孢杆菌菌株MDG1607 (NRRL No. B-67666)所有鉴定特征的菌株。
40. 条款1至35中任一项的方法，其中给予的菌株为芽孢杆菌属菌株地衣芽孢杆菌MDG-1001 (NRRL No. B-67889)或具有地衣芽孢杆菌MDG-1001 (NRRL No. B-67889)所有鉴定特征的菌株。
41. 条款1至35中任一项的方法，其中给予的菌株为芽孢杆菌属菌株枯草/解淀粉芽孢杆菌MDG-8001 (NRRL No. B-67890)或具有枯草/解淀粉芽孢杆菌MDG-8001 (NRRLNo. B-67890)所有鉴定特征的菌株。
42. 条款1至35中任一项的方法，其中给予的菌株为芽孢杆菌属菌株短小芽孢杆菌MDG-1047 (NRRL No. B-67891)或具有短小芽孢杆菌MDG-1047 (NRRL No. B-67891)所有鉴定特征的菌株。
43. 条款1至35中任一项的方法，其中给予的菌株为芽孢杆菌属菌株枯草芽孢杆菌MDGV18 (NRRL No. B-67665)或具有枯草芽孢杆菌MDGV18 (NRRL No. B-67665)所有鉴定特征的菌株。
44. 条款1至35中任一项的方法，其中给予的菌株为芽孢杆菌属菌株短小芽孢杆菌MDGV17 (NRRL No. B-67664)或具有短小芽孢杆菌MDGV17 (NRRL No. B-67664)所有鉴定特征的菌株。
45. 条款1至35中任一项的方法，其中给予的菌株为枯草芽孢杆菌MDG-1728(NRRL No. B-67618)。
46. 条款1至35中任一项的方法，其中给予的菌株为芽孢杆菌属菌株巨大芽孢杆菌MDG-2705 (NRRL No. B-67619)。
47. 条款1至35中任一项的方法，其中给予的菌株为芽孢杆菌属菌株地衣芽孢杆菌MDG-1000 (NRRL No. B-67888)。
48. 条款1至35中任一项的方法，其中给予的菌株为芽孢杆菌属菌株解淀粉芽孢杆菌MDG1607 (NRRL No. B-67666)。
49. 条款1至35中任一项的方法，其中给予的菌株为芽孢杆菌属菌株地衣芽孢杆菌MDG-1001 (NRRL No. B-67889)。
50. 条款1至35中任一项的方法，其中给予的菌株为芽孢杆菌属菌株枯草/解淀粉芽孢杆菌MDG-8001 (NRRL No. B-67890)。
51. 条款1至35中任一项的方法，其中给予的菌株为芽孢杆菌属菌株短小芽孢杆菌MDG-1047 (NRRL No. B-67891)。
52. 条款1至35中任一项的方法，其中给予的菌株为芽孢杆菌属菌株枯草芽孢杆菌MDGV18 (NRRL No. B-67665)。
53. 条款1至35中任一项的方法，其中给予的菌株为芽孢杆菌属菌株短小芽孢杆菌MDGV17 (NRRL No. B-67664)。
54. 条款1至6或9至35中任一项的方法，其中污染物为染料。
55. 条款54的方法，其中染料为偶氮染料或蒽醌染料。
56. 条款54或55的方法，其中污染物为酸性染料。
57. 条款54或55的方法，其中污染物为金属络合染料。
58. 条款54或55的方法，其中污染物为直接染料。
59. 条款54或55的方法，其中污染物为碱性染料。
60. 条款54或55的方法，其中污染物为分散染料。
61. 条款54或55的方法，其中污染物为活性染料。
62. 条款54或55的方法，其中污染物为硫化染料。
63. 条款54或55的方法，其中污染物为瓮染料。
64. 条款54至63中任一项的方法，其中污染物为染料且芽孢杆菌属菌株引起染料的降解或褪色。
65. 条款1至53中任一项的方法，其中污染物为木质素。
66. 条款65的方法，其中木质素由造纸业或纸浆业产生。
67. 条款1至3或6至53中任一项的方法，其中污染物为无机化合物。
68. 商业包装，其包含选自以下的分离的芽孢杆菌属菌株：芽孢杆菌属菌株地衣芽孢杆菌MDG-1000 (NRRL No. B-67888)、地衣芽孢杆菌MDG-1001 (NRRL No. B-67889)、枯草/解淀粉芽孢杆菌MDG-8001 (NRRL No. B-67890)、短小芽孢杆菌MDG-1047 (NRRL No.B-67891)、枯草芽孢杆菌MDGV18 (NRRL No. B-67665)、枯草芽孢杆菌MDG-1728 (NRRL No.B-67618)、巨大芽孢杆菌MDG-2705 (NRRL No. B-67619)和具有这些菌株所有鉴定特征的菌株。
69. 条款68的商业包装，其中芽孢杆菌属菌株在水、废料或土壤中引起选自以下的效果：气味减少、化学需氧量减少、染料降解、染料褪色、木质素降解及其组合。
70. 条款68或69的商业包装，其中芽孢杆菌属菌株呈浓缩物形式。
71. 条款68或69的商业包装，其中芽孢杆菌属菌株呈超浓缩物形式。
72. 条款68至71中任一项的商业包装，其中芽孢杆菌属菌株呈干燥形式。
73. 条款68至72中任一项的商业包装，其中芽孢杆菌属菌株呈丸粒形式。
74. 条款68至71中任一项的商业包装，其中芽孢杆菌属菌株呈液体形式。
75. 条款68至74中任一项的商业包装，其进一步包含用于芽孢杆菌属菌株的载体。
76. 条款68至75中任一项的商业包装，其中该商业包装包含袋子。
77. 条款76的商业包装，其中袋子为塑料袋。
78. 条款68至77中任一项的商业包装，其进一步包含一种或多种芽孢杆菌属菌株的使用说明。
79. 包含20磅袋的条款68至78中任一项的商业包装。
80. 包含50磅袋的条款68至78中任一项的商业包装。
81. 呈粉末形式的条款68至72或75至80中任一项的商业包装。
82. 包含用于商业用途的容器的条款68至81中任一项的商业包装，其中该容器包含塑料。
83. 包含用于商业用途的容器的条款68至81中任一项的商业包装，其中该容器包含纸。
84. 条款68至83中任一项的商业包装，其进一步包含粘合剂。
85. 条款84的商业包装，其中粘合剂选自黏土、酵母细胞壁组分、硅酸铝和葡聚糖或其组合。
86. 条款68至85中任一项的商业包装，其中芽孢杆菌属菌株在水、废料或土壤中引起选自以下的效果：染料降解、染料褪色、木质素降解及其组合。
87. 条款68至86中任一项的商业包装，其中芽孢杆菌属菌株在废料、水或土壤中引起染料褪色或染料降解。
88. 条款68至86中任一项的商业包装，其中芽孢杆菌属菌株在水、废料或土壤中引起木质素降解。
89. 饲喂动物的方法，其包含给予动物饲料组合物或饮用水的步骤，所述饲料组合物或饮用水包含有效量的包含选自以下的分离的芽孢杆菌属菌株的添加剂：芽孢杆菌属菌株地衣芽孢杆菌MDG-1000 (NRRL No. B-67888)、地衣芽孢杆菌MDG-1001 (NRRL No. B-67889)、枯草/解淀粉芽孢杆菌MDG-8001 (NRRL No. B-67890)、短小芽孢杆菌MDG-1047(NRRL No. B-67891)、解淀粉芽孢杆菌MDG1607 (NRRL No. B-67666)、枯草芽孢杆菌MDGV18 (NRRL No. B-67665)、短小芽孢杆菌MDGV17 (NRRL No. B-67664)、枯草芽孢杆菌MDG-1728 (NRRL No. B-67618)、巨大芽孢杆菌MDG-2705 (NRRL No. B-67619)和具有这些菌株所有鉴定特征的菌株及其组合。
90. 条款89的方法，其中动物选自家禽物种、猪物种、山羊物种、牛物种、绵羊物种和马物种。
91. 条款90的方法，其中动物为猪物种，且该猪物种选自生长育成猪、保育猪、母猪和种猪。
92. 条款89至91中任一项的方法，其中芽孢杆菌属菌株产生选自α-半乳糖苷酶、蛋白酶、脂肪酶、淀粉酶、木聚糖酶、纤维素酶及其组合的酶。
93. 条款89至92中任一项的方法，其进一步包含给予动物选自另一种芽孢杆菌属菌株、乳酸菌菌株及其组合的另一种细菌菌株的步骤。
94. 条款89至93中任一项的方法，其中给予的菌株为枯草芽孢杆菌MDG-1728(NRRL No. B-67618)。
95. 条款89至93中任一项的方法，其中给予的菌株为芽孢杆菌属菌株巨大芽孢杆菌MDG-2705 (NRRL No. B-67619)。
96. 条款89至93中任一项的方法，其中给予的菌株为芽孢杆菌属菌株地衣芽孢杆菌MDG-1000 (NRRL No. B-67888)。
97. 条款89至93中任一项的方法，其中给予的菌株为芽孢杆菌属菌株解淀粉芽孢杆菌MDG1607 (NRRL No. B-67666)。
98. 条款89至93中任一项的方法，其中给予的菌株为芽孢杆菌属菌株地衣芽孢杆菌MDG-1001 (NRRL No. B-67889)。
99. 条款89至93中任一项的方法，其中给予的菌株为芽孢杆菌属菌株枯草/解淀粉芽孢杆菌MDG-8001 (NRRL No. B-67890)。
100. 条款89至93中任一项的方法，其中给予的菌株为芽孢杆菌属菌株短小芽孢杆菌MDG-1047 (NRRL No. B-67891)。
101. 条款89至93中任一项的方法，其中给予的菌株为芽孢杆菌属菌株枯草芽孢杆菌MDGV18 (NRRL No. B-67665)。
102. 条款89至93中任一项的方法，其中给予的菌株为芽孢杆菌属菌株短小芽孢杆菌MDGV17 (NRRL No. B-67664)。
103. 条款89至102中任一项的方法，其中芽孢杆菌属菌株在饲料组合物中以约1.0 x 103 CFU/克饲料组合物至约5.0 x 1012 CFU/克饲料组合物的剂量给予。
104. 条款89至102中任一项的方法，其中芽孢杆菌属菌株在饲料组合物中以约1.0 x 103 CFU/克饲料组合物至约1.0 x 107 CFU/克饲料组合物的剂量给予。
105. 条款89至102中任一项的方法，其中芽孢杆菌属菌株在饲料组合物中以大于约7.0 x 104 CFU/克饲料组合物的剂量给予。
106. 条款89至102中任一项的方法，其进一步包含给予动物选自以下的酶的步骤：半乳糖苷酶、蛋白酶、脂肪酶、淀粉酶、半纤维素酶、阿拉伯木聚糖酶、木聚糖酶、纤维素酶、NSP酶、植酸酶及其组合。
107. 条款91的方法，其中动物为母猪，且芽孢杆菌属菌株在哺乳期间给予。
108. 条款91的方法，其中动物为母猪，且芽孢杆菌属菌株在妊娠期间给予。
109. 条款89至108中任一项的方法，其中将饲料组合物每天给予动物。
110. 条款89的方法，其中动物选自鸡、猪、马、小马、牛、火鸡、山羊、绵羊、鹌鹑、野鸡、鸵鸟、鸭、鱼、甲壳类动物及其组合。
111. 条款35的方法，其中酶为纤维素酶。
112. 条款35的方法，其中酶为木聚糖酶。
113. 条款35的方法，其中酶为纤维素酶。
114. 条款35的方法，其中酶为木聚糖酶。
115. 条款68至88中任一项的商业包装，其进一步包含纤维素酶。
116. 条款68至88中任一项的商业包装，其进一步包含木聚糖酶。
附图简述
图1A为显示着色剂R120的生物修复结果的图表。
图1B为显示着色剂RO16的生物修复结果的图表。
图1C为显示着色剂DY27的生物修复结果的图表。
图1D为显示着色剂RB4的生物修复结果的图表。
图1E为显示着色剂RB5的生物修复结果的图表。
图1F为显示着色剂RBBR的生物修复结果的图表。
图2显示用芽孢杆菌属和纤维素酶处理3天和7天的湿巾纸的呈干重损失百分比的降解。星号(*)表示该值与对照显著不同(p < 0.05)。
图3A至D显示在未处理的烧瓶中在震荡培养箱中7天后的湿巾纸(图3A)、通过2 mm筛排干后的未处理的湿巾纸(图3B)、在烧瓶中的芽孢杆菌属和纤维素酶处理的湿巾纸(图3C)和通过2 mm筛排干后的芽孢杆菌属和纤维素酶处理的湿巾纸(图3D)。
图4显示了展示芽孢杆菌属菌株1000的RAPD-PCR谱的凝胶的照片。每组八条泳道的最左和最右泳道包括标志物。
图5显示了展示芽孢杆菌属菌株1001的RAPD-PCR谱的凝胶的照片。每组八条泳道的最左和最右泳道包括标志物。
图6显示了展示芽孢杆菌属菌株8001的RAPD-PCR谱的凝胶的照片。每组八条泳道的最左和最右泳道包括标志物。
图7显示了展示芽孢杆菌属菌株1047的RAPD-PCR谱的凝胶的照片。每组八条泳道的最左和最右泳道包括标志物。
图8显示了展示芽孢杆菌属菌株1607的RAPD-PCR谱的凝胶的照片。最左和最右泳道包括标志物。
图9显示了展示芽孢杆菌属菌株V18的RAPD-PCR谱的凝胶的照片。每组四条泳道的最左和最右泳道括包标志物。
图10显示了展示芽孢杆菌属菌株V17的RAPD-PCR谱的凝胶的照片。每组八条泳道的最左和最右泳道包括标志物。
图11显示了展示芽孢杆菌属菌株1728和2705的RAPD-PCR谱的凝胶的照片。最左和最右泳道以及中间泳道包括标志物。
说明性实施方案的详述
本发明涉及包含微生物菌株的组合物，以及使用该组合物在废料、水或土壤中去除污染物(比如在水、土壤或废料中修复染料和木质素、减少致污物、减少气味、减少化学需氧量(COD)、降解纸(比如湿巾纸(例如可冲水和不可冲水湿巾纸))及其组合)，或用于在动物饲料或饮用水中给予动物的方法。更具体地说，本发明涉及分离的芽孢杆菌属菌株的组合物，所述菌株选自分离的芽孢杆菌属菌株地衣芽孢杆菌MDG-1000 (NRRL No. B-67888)、地衣芽孢杆菌MDG-1001 (NRRL No. B-67889)、枯草/解淀粉芽孢杆菌MDG-8001 (NRRL No.B-67890)、短小芽孢杆菌MDG-1047 (NRRL No. B-67891)、解淀粉芽孢杆菌MDG1607 (NRRLNo. B-67666)、枯草芽孢杆菌MDGV18 (NRRL No. B-67665)、短小芽孢杆菌MDGV17 (NRRLNo. B-67664)、枯草芽孢杆菌MDG-1728 (NRRL No. B-67618)、巨大芽孢杆菌MDG-2705(NRRL No. B-67619)和具有这些菌株所有鉴定特征的菌株及其组合；以及使用这些菌株以在废料、水或土壤中去除污染物(比如在水、土壤或废料中修复染料和木质素、减少致污物、降解纸(比如湿巾纸(例如可冲水和不可冲水湿巾纸)、减少气味、减少化学需氧量(COD)及其组合)，或用于在动物饲料或饮用水中给予动物的方法。
在下文编号的条款中描述的各种实施方案适用于在此“说明性实施方案的详述”部分和本专利申请的标题为“概述”或“实施例”的部分中或者在此申请所附的“权利要求”中描述的任意实施方案：
1. 通过将水、土壤或废料与芽孢杆菌属菌株接触以去除污染物而处理水、土壤或废料的方法，该方法包含将水、土壤或废料与有效量的选自以下的分离的芽孢杆菌属菌株接触并去除污染物：芽孢杆菌属菌株地衣芽孢杆菌MDG-1000 (NRRL No. B-67888)、地衣芽孢杆菌MDG-1001 (NRRL No. B-67889)、枯草/解淀粉芽孢杆菌MDG-8001 (NRRL No. B-67890)、短小芽孢杆菌MDG-1047 (NRRL No. B-67891)、解淀粉芽孢杆菌MDG1607 (NRRLNo. B-67666)、枯草芽孢杆菌MDGV18 (NRRL No. B-67665)、短小芽孢杆菌MDGV17 (NRRLNo. B-67664)、枯草芽孢杆菌MDG-1728 (NRRL No. B-67618)、巨大芽孢杆菌MDG-2705(NRRL No. B-67619)和具有这些菌株所有鉴定特征的菌株。
2. 条款1的方法，其中对水或废料进行处理以去除污染物，并且该水或废料选自工业废水、工业废料、生活废水、生活废料、农业废水、农业废料以及废水。
3. 条款1或2的方法，其中去除污染物导致水、废料或土壤中气味减少或化学需氧量减少。
4. 条款1至3中任一项的方法，其中污染物为有机化合物。
5. 条款4的方法，其中有机化合物通过降解去除。
6. 条款1至5中任一项的方法，其中污染物为合成化合物。
7. 条款1至6中任一项的方法，其中污染物为含纸的化合物。
8. 条款7的方法，其中含纸的化合物为湿巾纸。
9. 条款1至8中任一项的方法，其中至少一种芽孢杆菌属菌株具有抗微生物活性。
10. 条款9的方法，其中抗微生物活性针对选自以下的细菌：大肠杆菌细菌、沙门氏菌属细菌、葡萄球菌属细菌、肠球菌属细菌、弯曲杆菌属细菌及其组合。
11. 条款1至10中任一项的方法，其中芽孢杆菌属菌株产生选自以下的酶：氧化还原酶、水解酶、转移酶、裂解酶、异构酶、连接酶、过氧化物酶、漆酶、酯酶、淀粉酶、蛋白酶、木聚糖酶、脂肪酶、纤维素酶、加氧酶、还原酶、氧化酶、羟化酶、脱氢酶及其组合。
12. 条款11的方法，其中酶为氧化还原酶。
13. 条款11的方法，其中酶为水解酶。
14. 条款11的方法，其中酶为转移酶。
15. 条款11的方法，其中酶为裂解酶。
16. 条款11的方法，其中酶为异构酶。
17. 条款11的方法，其中酶为连接酶。
18. 条款11的方法，其中酶为过氧化物酶。
19. 条款11的方法，其中酶为漆酶。
20. 条款11的方法，其中酶为酯酶。
21. 条款11的方法，其中酶为淀粉酶。
22. 条款11的方法，其中酶为蛋白酶。
23. 条款11的方法，其中酶为木聚糖酶。
24. 条款11的方法，其中酶为脂肪酶。
25. 条款11的方法，其中酶为纤维素酶。
26. 条款11的方法，其中酶为加氧酶。
27. 条款11的方法，其中酶为还原酶。
28. 条款11的方法，其中酶为氧化酶。
29. 条款11的方法，其中酶为羟化酶。
30. 条款11的方法，其中酶为脱氢酶。
31. 条款1至30中任一项的方法，其进一步包含用选自另一种芽孢杆菌属菌株、乳酸菌菌株及其组合的另一种细菌菌株处理水、土壤或废料。
32. 条款1至31中任一项的方法，其中芽孢杆菌属菌株的有效量为约1.0 x 102CFU/克水、土壤或废料至约1.0 x 106 CFU/克水、土壤或废料。
33. 条款1至31中任一项的方法，其中芽孢杆菌属菌株的有效量为约1.0 x 102CFU/克水、土壤或废料至约1.0 x 104 CFU/克水、土壤或废料。
34. 条款1至31中任一项的方法，其中有效量为约1.0 x 102 CFU/克水、土壤或废料至约1.0 x 103 CFU/克水、土壤或废料。
35. 条款1至34中任一项的方法，其进一步包含将水、土壤或废料与选自以下的外源性酶接触：氧化还原酶、水解酶、转移酶、裂解酶、异构酶、连接酶、过氧化物酶、漆酶、酯酶、淀粉酶、蛋白酶、木聚糖酶、脂肪酶、纤维素酶、加氧酶、还原酶、氧化酶、羟化酶、脱氢酶及其组合。
36. 条款1至35中任一项的方法，其中给予的菌株为枯草芽孢杆菌MDG-1728(NRRL No. B-67618)或具有枯草芽孢杆菌MDG-1728 (NRRL No. B-67618)所有鉴定特征的菌株。
37. 条款1至35中任一项的方法，其中给予的菌株为芽孢杆菌属菌株巨大芽孢杆菌MDG-2705 (NRRL No. B-67619)或具有巨大芽孢杆菌MDG-2705 (NRRL No. B-67619)所有鉴定特征的菌株。
38. 条款1至35中任一项的方法，其中给予的菌株为芽孢杆菌属菌株地衣芽孢杆菌MDG-1000 (NRRL No. B-67888)或具有地衣芽孢杆菌MDG-1000 (NRRL No. B-67888)所有鉴定特征的菌株。
39. 条款1至35中任一项的方法，其中给予的菌株为芽孢杆菌属菌株解淀粉芽孢杆菌MDG1607 (NRRL No. B-67666)或具有解淀粉芽孢杆菌菌株MDG1607 (NRRL No. B-67666)所有鉴定特征的菌株。
40. 条款1至35中任一项的方法，其中给予的菌株为芽孢杆菌属菌株地衣芽孢杆菌MDG-1001 (NRRL No. B-67889)或具有地衣芽孢杆菌MDG-1001 (NRRL No. B-67889)所有鉴定特征的菌株。
41. 条款1至35中任一项的方法，其中给予的菌株为芽孢杆菌属菌株枯草/解淀粉芽孢杆菌MDG-8001 (NRRL No. B-67890)或具有枯草/解淀粉芽孢杆菌MDG-8001 (NRRLNo. B-67890)所有鉴定特征的菌株。
42. 条款1至35中任一项的方法，其中给予的菌株为芽孢杆菌属菌株短小芽孢杆菌MDG-1047 (NRRL No. B-67891)或具有短小芽孢杆菌MDG-1047 (NRRL No. B-67891)所有鉴定特征的菌株。
43. 条款1至35中任一项的方法，其中给予的菌株为芽孢杆菌属菌株枯草芽孢杆菌MDGV18 (NRRL No. B-67665)或具有枯草芽孢杆菌MDGV18 (NRRL No. B-67665)所有鉴定特征的菌株。
44. 条款1至35中任一项的方法，其中给予的菌株为芽孢杆菌属菌株短小芽孢杆菌MDGV17 (NRRL No. B-67664)或具有短小芽孢杆菌MDGV17 (NRRL No. B-67664)所有鉴定特征的菌株。
45. 条款1至35中任一项的方法，其中给予的菌株为枯草芽孢杆菌MDG-1728(NRRL No. B-67618)。
46. 条款1至35中任一项的方法，其中给予的菌株为芽孢杆菌属菌株巨大芽孢杆菌MDG-2705 (NRRL No. B-67619)。
47. 条款1至35中任一项的方法，其中给予的菌株为芽孢杆菌属菌株地衣芽孢杆菌MDG-1000 (NRRL No. B-67888)。
48. 条款1至35中任一项的方法，其中给予的菌株为芽孢杆菌属菌株解淀粉芽孢杆菌MDG1607 (NRRL No. B-67666)。
49. 条款1至35中任一项的方法，其中给予的菌株为芽孢杆菌属菌株地衣芽孢杆菌MDG-1001 (NRRL No. B-67889)。
50. 条款1至35中任一项的方法，其中给予的菌株为芽孢杆菌属菌株枯草/解淀粉芽孢杆菌MDG-8001 (NRRL No. B-67890)。
51. 条款1至35中任一项的方法，其中给予的菌株为芽孢杆菌属菌株短小芽孢杆菌MDG-1047 (NRRL No. B-67891)。
52. 条款1至35中任一项的方法，其中给予的菌株为芽孢杆菌属菌株枯草芽孢杆菌MDGV18 (NRRL No. B-67665)。
53. 条款1至35中任一项的方法，其中给予的菌株为芽孢杆菌属菌株短小芽孢杆菌MDGV17 (NRRL No. B-67664)。
54. 条款1至6或9至35中任一项的方法，其中污染物为染料。
55. 条款54的方法，其中染料为偶氮染料或蒽醌染料。
56. 条款54或55的方法，其中污染物为酸性染料。
57. 条款54或55的方法，其中污染物为金属络合染料。
58. 条款54或55的方法，其中污染物为直接染料。
59. 条款54或55的方法，其中污染物为碱性染料。
60. 条款54或55的方法，其中污染物为分散染料。
61. 条款54或55的方法，其中污染物为活性染料。
62. 条款54或55的方法，其中污染物为硫化染料。
63. 条款54或55的方法，其中污染物为瓮染料。
64. 条款54至63中任一项的方法，其中污染物为染料且芽孢杆菌属菌株引起染料的降解或褪色。
65. 条款1至53中任一项的方法，其中污染物为木质素。
66. 条款65的方法，其中木质素由造纸业或纸浆业产生。
67. 条款1至3或6至53中任一项的方法，其中污染物为无机化合物。
68. 商业包装，其包含选自以下的分离的芽孢杆菌属菌株：芽孢杆菌属菌株地衣芽孢杆菌MDG-1000 (NRRL No. B-67888)、地衣芽孢杆菌MDG-1001 (NRRL No. B-67889)、枯草/解淀粉芽孢杆菌MDG-8001 (NRRL No. B-67890)、短小芽孢杆菌MDG-1047 (NRRL No.B-67891)、枯草芽孢杆菌MDGV18 (NRRL No. B-67665)、枯草芽孢杆菌MDG-1728 (NRRL No.B-67618)、巨大芽孢杆菌MDG-2705 (NRRL No. B-67619)和具有这些菌株所有鉴定特征的菌株。
69. 条款68的商业包装，其中芽孢杆菌属菌株在水、废料或土壤中引起选自以下的效果：气味减少、化学需氧量减少、染料降解、染料褪色、木质素降解及其组合。
70. 条款68或69的商业包装，其中芽孢杆菌属菌株呈浓缩物形式。
71. 条款68或69的商业包装，其中芽孢杆菌属菌株呈超浓缩物形式。
72. 条款68至71中任一项的商业包装，其中芽孢杆菌属菌株呈干燥形式。
73. 条款68至72中任一项的商业包装，其中芽孢杆菌属菌株呈丸粒形式。
74. 条款68至71中任一项的商业包装，其中芽孢杆菌属菌株呈液体形式。
75. 条款68至74中任一项的商业包装，其进一步包含用于芽孢杆菌属菌株的载体。
76. 条款68至75中任一项的商业包装，其中该商业包装包含袋子。
77. 条款76的商业包装，其中袋子为塑料袋。
78. 条款68至77中任一项的商业包装，其进一步包含一种或多种芽孢杆菌属菌株的使用说明。
79. 包含20磅袋的条款68至78中任一项的商业包装。
80. 包含50磅袋的条款68至78中任一项的商业包装。
81. 呈粉末形式的条款68至72或75至80中任一项的商业包装。
82. 包含用于商业用途的容器的条款68至81中任一项的商业包装，其中该容器包含塑料。
83. 包含用于商业用途的容器的条款68至81中任一项的商业包装，其中该容器包含纸。
84. 条款68至83中任一项的商业包装，其进一步包含粘合剂。
85. 条款84的商业包装，其中粘合剂选自黏土、酵母细胞壁组分、硅酸铝和葡聚糖或其组合。
86. 条款68至85中任一项的商业包装，其中芽孢杆菌属菌株在水、废料或土壤中引起选自以下的效果：染料降解、染料褪色、木质素降解及其组合。
87. 条款68至86中任一项的商业包装，其中芽孢杆菌属菌株在废料、水或土壤中引起染料褪色或染料降解。
88. 条款68至86中任一项的商业包装，其中芽孢杆菌属菌株在水、废料或土壤中引起木质素降解。
89. 饲喂动物的方法，其包含给予动物饲料组合物或饮用水的步骤，所述饲料组合物或饮用水包含有效量的包含选自以下的分离的芽孢杆菌属菌株的添加剂：芽孢杆菌属菌株地衣芽孢杆菌MDG-1000 (NRRL No. B-67888)、地衣芽孢杆菌MDG-1001 (NRRL No. B-67889)、枯草/解淀粉芽孢杆菌MDG-8001 (NRRL No. B-67890)、短小芽孢杆菌MDG-1047(NRRL No. B-67891)、解淀粉芽孢杆菌MDG1607 (NRRL No. B-67666)、枯草芽孢杆菌MDGV18 (NRRL No. B-67665)、短小芽孢杆菌MDGV17 (NRRL No. B-67664)、枯草芽孢杆菌MDG-1728 (NRRL No. B-67618)、巨大芽孢杆菌MDG-2705 (NRRL No. B-67619)和具有这些菌株所有鉴定特征的菌株及其组合。
90. 条款89的方法，其中动物选自家禽物种、猪物种、山羊物种、牛物种、绵羊物种和马物种。
91. 条款90的方法，其中动物为猪物种，且该猪物种选自生长育成猪、保育猪、母猪和种猪。
92. 条款89至91中任一项的方法，其中芽孢杆菌属菌株产生选自α-半乳糖苷酶、蛋白酶、脂肪酶、淀粉酶、木聚糖酶、纤维素酶及其组合的酶。
93. 条款89至92中任一项的方法，其进一步包含给予动物选自另一种芽孢杆菌属菌株、乳酸菌菌株及其组合的另一种细菌菌株的步骤。
94. 条款89至93中任一项的方法，其中给予的菌株为枯草芽孢杆菌MDG-1728(NRRL No. B-67618)。
95. 条款89至93中任一项的方法，其中给予的菌株为芽孢杆菌属菌株巨大芽孢杆菌MDG-2705 (NRRL No. B-67619)。
96. 条款89至93中任一项的方法，其中给予的菌株为芽孢杆菌属菌株地衣芽孢杆菌MDG-1000 (NRRL No. B-67888)。
97. 条款89至93中任一项的方法，其中给予的菌株为芽孢杆菌属菌株解淀粉芽孢杆菌MDG1607 (NRRL No. B-67666)。
98. 条款89至93中任一项的方法，其中给予的菌株为芽孢杆菌属菌株地衣芽孢杆菌MDG-1001 (NRRL No. B-67889)。
99. 条款89至93中任一项的方法，其中给予的菌株为芽孢杆菌属菌株枯草/解淀粉芽孢杆菌MDG-8001 (NRRL No. B-67890)。
100. 条款89至93中任一项的方法，其中给予的菌株为芽孢杆菌属菌株短小芽孢杆菌MDG-1047 (NRRL No. B-67891)。
101. 条款89至93中任一项的方法，其中给予的菌株为芽孢杆菌属菌株枯草芽孢杆菌MDGV18 (NRRL No. B-67665)。
102. 条款89至93中任一项的方法，其中给予的菌株为芽孢杆菌属菌株短小芽孢杆菌MDGV17 (NRRL No. B-67664)。
103. 条款89至102中任一项的方法，其中芽孢杆菌属菌株在饲料组合物中以约1.0 x 103 CFU/克饲料组合物至约5.0 x 1012 CFU/克饲料组合物的剂量给予。
104. 条款89至102中任一项的方法，其中芽孢杆菌属菌株在饲料组合物中以约1.0 x 103 CFU/克饲料组合物至约1.0 x 107 CFU/克饲料组合物的剂量给予。
105. 条款89至102中任一项的方法，其中芽孢杆菌属菌株在饲料组合物中以大于约7.0 x 104 CFU/克饲料组合物的剂量给予。
106. 条款89至102中任一项的方法，其进一步包含给予动物选自以下的酶的步骤：半乳糖苷酶、蛋白酶、脂肪酶、淀粉酶、半纤维素酶、阿拉伯木聚糖酶、木聚糖酶、纤维素酶、NSP酶、植酸酶及其组合。
107. 条款91的方法，其中动物为母猪，且芽孢杆菌属菌株在哺乳期间给予。
108. 条款91的方法，其中动物为母猪，且芽孢杆菌属菌株在妊娠期间给予。
109. 条款89至108中任一项的方法，其中将饲料组合物每天给予动物。
110. 条款89的方法，其中动物选自鸡、猪、马、小马、牛、火鸡、山羊、绵羊、鹌鹑、野鸡、鸵鸟、鸭、鱼、甲壳类动物及其组合。
111. 条款35的方法，其中酶为纤维素酶。
112. 条款35的方法，其中酶为木聚糖酶。
113. 条款35的方法，其中酶为纤维素酶。
114. 条款35的方法，其中酶为木聚糖酶。
115. 条款68至88中任一项的商业包装，其进一步包含纤维素酶。
116. 条款68至88中任一项的商业包装，其进一步包含木聚糖酶。
在各种水、废料、或土壤处理的实施方案中，使用本文所述的芽孢杆菌属菌株处理以去除污染物的水、废料或土壤可选自工业废水、工业废料、农业废水、农业废料、废水、生活废料、生活废水、市政固体废料、填埋废料、土壤废料、堆肥废料、污染的地下水和来自废料的浸出液。在另一个实施方案中，菌株可被用作垃圾处理。
在本文所述的水、废料或土壤处理方法的各种实施方案中，芽孢杆菌属菌株(例如地衣芽孢杆菌MDG-1000 (NRRL No. B-67888)、地衣芽孢杆菌MDG-1001 (NRRL No. B-67889)、枯草/解淀粉芽孢杆菌MDG-8001 (NRRL No. B-67890)、短小芽孢杆菌MDG-1047(NRRL No. B-67891)、解淀粉芽孢杆菌MDG1607 (NRRL No. B-67666)、枯草芽孢杆菌MDGV18 (NRRL No. B-67665)、短小芽孢杆菌MDGV17 (NRRL No. B-67664)、枯草芽孢杆菌MDG-1728 (NRRL No. B-67618)、巨大芽孢杆菌MDG-2705 (NRRL No. B-67619)或具有这些菌株所有鉴定特征的菌株)在水、废料或土壤中可具有效果，其包括但不限于选自以下的效果：污染物去除，气味减少，化学需氧量减少，废料、水或土壤的修复，染料降解，染料褪色，木质素降解，纸(比如湿巾纸(例如可冲水和不可冲水湿巾纸))的降解及其组合。
在本文所述的水、废料或土壤处理的任意实施方案中，芽孢杆菌属菌株可单独或以任意组合添加至废料、水或土壤，或可呈本文所述的任意组合物的形式，使得菌株单独或以任意组合在本文所述的组合物中。本文所述的芽孢杆菌属菌株也可与其他微生物菌株(包括其他芽孢杆菌属菌株或乳酸杆菌属菌株)组合使用。在另一个实施方案中，另外的芽孢杆菌属菌株可选自枯草芽孢杆菌、解淀粉芽孢杆菌、地衣芽孢杆菌、短小芽孢杆菌、摩加夫芽孢杆菌(Bacillus mojavensis)、甲基营养型芽孢杆菌(Bacillus methylotrophicus)、其他芽孢杆菌属菌株及其组合。
在本发明的一个实施方案中，可添加有效量的芽孢杆菌属菌株至废料、水或土壤以在水、废料或土壤中引起效果，其包括但不限于选自以下的效果：污染物去除，气味减少，化学需氧量减少，废料、水或土壤的修复，染料降解，染料褪色，木质素降解，纸(比如湿巾纸(例如可冲水和不可冲水湿巾纸))的降解及其组合。“有效量”为引起本段中描述的任意效果的量。
可使用本文所述的组合物处理废料、水或土壤达有效去除污染物的任意时间段。例如在一个实施方案中，废料、水或土壤的处理可每天发生。用于废料、水或土壤处理的时间段为非限制性的，且应当意识到可使用被确定为有效去除污染物的任意时间段或处理时间表。
如本文所使用的，对于水、废料或土壤处理的实施方案，“去除污染物”或“污染物去除”意为彻底去除污染物，减少污染物的量，使污染物失活，降解污染物或使得污染物转变为失活形式，或在废料中减少COD、减少有机物或减少气味等等。
在本文所述的任意实施方案中，至少一种芽孢杆菌属菌株可具有抗微生物活性，且该抗微生物活性可针对选自以下的细菌：大肠杆菌细菌、沙门氏菌属细菌、葡萄球菌属细菌、肠球菌属细菌、弯曲杆菌属细菌及其组合。
在本文所述的任意实施方案中，芽孢杆菌属菌株可产生选自以下的酶：氧化还原酶、水解酶、转移酶、裂解酶、异构酶、连接酶、过氧化物酶、漆酶、酯酶、淀粉酶、蛋白酶、木聚糖酶、脂肪酶、纤维素酶、加氧酶、还原酶、氧化酶、羟化酶、脱氢酶及其组合。
在水、废料或土壤处理方法的另一种说明性实施方案中，污染物可为有机或无机化合物，且该有机或无机化合物可通过将该有机或无机化合物与芽孢杆菌属菌株接触来降解该有机或无机化合物而被芽孢杆菌属菌株去除。在仍然另一个实施方案中，污染物可为合成化合物。在仍然其他实施方案中，污染物可为染料，且该染料可为偶氮染料或蒽醌染料，包括但不限于酸性染料、金属络合染料、直接染料、碱性染料、分散染料、活性染料、硫化染料和/或瓮染料。在各种实施方案中，偶氮染料可选自活性红120 (R120)、活性橙16(RO16)、直接黄27 (DY27)和活性黑5 (RB5)。在其他实施方案中，蒽醌染料可选自活性蓝4(RB4)和Remazol亮蓝R (RBBR)。在另一个实施方案中，污染物可为木质素。在一个方面，木质素可由造纸业或纸浆业产生。在另一个实施方案中，污染物可为纸废料，比如湿巾纸(例如可冲水或一次性或不可冲水湿巾纸)。
在另一个说明性方面，本领域已知的任意抗生素可与本文所述的芽孢杆菌属菌株一起添加至废料、水或土壤。在各种实施方案中，抗生素选自氨苄青霉素(ampicillin)、氯霉素(chloramphenicol)、环丙沙星(ciprofloxacin)、克林霉素(clindamycin)、四环素(tetracycline)、金霉素(chlortetracycline)、Denagard™(即泰妙菌素(tiamulin))、BMD™(即亚甲基双水杨酸杆菌肽(bacitracin methylene disalicylate))、Carbadox™(即卡巴氧(carbadox))、Stafac™(即维及尼霉素(virginiamycin))、红霉素(erythromycin)、左氧氟沙星(levofloxacin)、甲氧苄啶(trimethoprim)/磺胺甲
唑(sulfamethoxazole)、甲氧苄啶、达托霉素(daptomycin)、利福平(rifampicin)、Tylan™(即泰乐菌素(tylosin))、Pulmotil™(即替米考星(tilmicosin))、万古霉素(vancomycin)及其组合。在另一个实施方案中，不向含芽孢杆菌属菌株的废料、水或土壤添加抗生素。
在另一个说明性实施方案中，一种或多种酶可与本文所述的芽孢杆菌属菌株一起添加至废料、水或土壤。在各种实施方案中，可添加的外源性酶包括选自以下的外源性酶：氧化还原酶、水解酶、转移酶、裂解酶、异构酶、连接酶、过氧化物酶、漆酶、酯酶、淀粉酶、蛋白酶、木聚糖酶、脂肪酶、纤维素酶、加氧酶、还原酶、氧化酶、羟化酶、脱氢酶及其组合。在一个实施方案中，添加的酶为纤维素酶。在另一个实施方案中，添加的酶为木聚糖酶。
在水、废料或土壤处理方法的各种说明性实施方案中，芽孢杆菌属菌株地衣芽孢杆菌MDG-1000 (NRRL No. B-67888)、地衣芽孢杆菌MDG-1001 (NRRL No. B-67889)、枯草/解淀粉芽孢杆菌MDG-8001 (NRRL No. B-67890)、短小芽孢杆菌MDG-1047 (NRRL No. B-67891)、解淀粉芽孢杆菌MDG1607 (NRRL No. B-67666)、枯草芽孢杆菌MDGV18 (NRRL No.B-67665)、短小芽孢杆菌MDGV17 (NRRL No. B-67664)、枯草芽孢杆菌MDG-1728 (NRRL No.B-67618)、巨大芽孢杆菌MDG-2705 (NRRL No. B-67619)和/或具有这些菌株所有鉴定特征的菌株可以约1.0 x 102 CFU/克水、土壤或废料至约1.0 x 106 CFU/克水、土壤或废料的有效量，以约1.0 x 102 CFU/克水、土壤或废料至约1.0 x 104 CFU/克水、土壤或废料的有效量，以约1.0 x 102 CFU/克水、土壤或废料至约1.0 x 103 CFU/克水、土壤或废料的有效量，以约1.0 x 102 CFU/克废料、水或土壤至约5.0 x 1012 CFU/克废料、水或土壤的有效量或以约1.0 x 102 CFU/克废料、水或土壤至约1.0 x 107 CFU/克废料、水或土壤的有效量添加至废料、水或土壤。在其他实施方案中，芽孢杆菌属菌株可以大于约1.0 x 102 CFU/克废料、水或土壤的有效量，以大于约1.0 x 103 CFU/克废料、水或土壤的有效量，以大于约1.1x 103 CFU/克废料、水或土壤的有效量，以大于约1.25 x 103 CFU/克废料、水或土壤的有效量，以大于约1.5 x 103 CFU/克废料、水或土壤的有效量，以大于约1.75 x 103 CFU/克废料、水或土壤的有效量，以大于约1.0 x 104 CFU/克废料、水或土壤的有效量，以大于约2.0x 104 CFU/克废料、水或土壤的有效量，以大于约3.0 x 104 CFU/克废料、水或土壤的有效量，以大于约4.0 x 104 CFU/克废料、水或土壤的有效量，以大于约5.0 x 104 CFU/克废料、水或土壤的有效量，以大于约6.0 x 104 CFU/克废料、水或土壤的有效量，以大于约7.0 x104 CFU/克废料、水或土壤的有效量，以大于约8.0 x 104 CFU/克废料、水或土壤的有效量，以大于约1.0 x 105 CFU/克废料、水或土壤的有效量，以大于约1.0 x 106 CFU/克废料、水或土壤的有效量，以大于约1.0 x 107 CFU/克废料、水或土壤的有效量，以大于约1.0 x 108CFU/克废料、水或土壤的有效量，以大于约1.0 x 109 CFU/克废料、水或土壤的有效量，以大于约1.0 x 1010 CFU/克废料、水或土壤的有效量，以大于约1.0 x 1011 CFU/克废料、水或土壤的有效量或以大于约1.0 x 1012 CFU/克废料、水或土壤的有效量添加至废料、水或土壤。在另一个实施方案中，本文所述的任意量可呈在其中将菌株添加至任意种类的废水以处理废水的实施方案中的CFU/ml水。
在一个方面，这些菌株可单独或在组合中添加至废料、水或土壤。在一个实施方案中，两种菌株在单个组合物中组合添加至废料、水或土壤。在另一个实施方案中，两种菌株在分别的组合物中组合添加至废料、水或土壤。
在本文所述的任意实施方案中，芽孢杆菌属菌株地衣芽孢杆菌MDG-1000 (NRRLNo. B-67888)、地衣芽孢杆菌MDG-1001 (NRRL No. B-67889)、枯草/解淀粉芽孢杆菌MDG-8001 (NRRL No. B-67890)、短小芽孢杆菌MDG-1047 (NRRL No. B-67891)、解淀粉芽孢杆菌MDG1607 (NRRL No. B-67666)、枯草芽孢杆菌MDGV18 (NRRL No. B-67665)、短小芽孢杆菌MDGV17 (NRRL No. B-67664)、枯草芽孢杆菌MDG-1728 (NRRL No. B-67618)、巨大芽孢杆菌MDG-2705 (NRRL No. B-67619)或具有这些菌株所有鉴定特征的菌株可根据本文所述的方法和组合物使用。芽孢杆菌属菌株1728 (NRRL No. B-67618)和2705 (NRRL No. B-67619)于2018年5月8日保藏于农业研究机构培养物保藏中心(Agricultural ResearchService Culture Collection) (NRRL), National Center for AgriculturalUtilization Research, Agricultural Research Service, USDA, 1815 NorthUniversity Street, Peoria, Illinois 61604-3999，并分别获得登录号B-67618和B-67619。芽孢杆菌属菌株地衣芽孢杆菌MDG-1000 (NRRL No. B-67888)、地衣芽孢杆菌MDG-1001 (NRRL No. B-67889)、枯草/解淀粉芽孢杆菌MDG-8001 (NRRL No. B-67890)和短小芽孢杆菌MDG-1047 (NRRL No. B-67891)于2019年11月26日保藏于农业研究机构培养物保藏中心(Agricultural Research Service Culture Collection) (NRRL), NationalCenter for Agricultural Utilization Research, Agricultural Research Service,USDA, 1815 North University Street, Peoria, Illinois 61604-3999，并分别获得登录号B-67888、B-67889、B-67890和B-67891。芽孢杆菌属菌株解淀粉芽孢杆菌MDG1607(NRRL No. B-67666)、枯草芽孢杆菌MDGV18 (NRRL No. B-67665)和短小芽孢杆菌MDGV17(NRRL No. B-67664)于2018年8月9日保藏于农业研究机构培养物保藏中心(AgriculturalResearch Service Culture Collection) (NRRL), National Center for AgriculturalUtilization Research, Agricultural Research Service, USDA, 1815 NorthUniversity Street, Peoria, Illinois 61604-3999，并分别获得登录号B-67666、B-67665和B-67664。保藏根据国际承认用于专利程序的微生物保存布达佩斯条约(BudapestTreaty on the International Recognition of the Deposit of Microorganisms forthe Purposes of Patent Procedure)的规定进行。
如本文所使用的，“具有芽孢杆菌属菌株地衣芽孢杆菌MDG-1000 (NRRL No. B-67888)、地衣芽孢杆菌MDG-1001 (NRRL No. B-67889)、枯草/解淀粉芽孢杆菌MDG-8001(NRRL No. B-67890)、短小芽孢杆菌MDG-1047 (NRRL No. B-67891)、解淀粉芽孢杆菌MDG1607 (NRRL No. B-67666)、枯草芽孢杆菌MDGV18 (NRRL No. B-67665)、短小芽孢杆菌MDGV17 (NRRL No. B-67664)、枯草芽孢杆菌MDG-1728 (NRRL No. B-67618)或巨大芽孢杆菌MDG-2705 (NRRL No. B-67619)所有鉴定特征的菌株”可为具有芽孢杆菌属菌株地衣芽孢杆菌MDG-1000 (NRRL No. B-67888)、地衣芽孢杆菌MDG-1001 (NRRL No. B-67889)、枯草/解淀粉芽孢杆菌MDG-8001 (NRRL No. B-67890)、短小芽孢杆菌MDG-1047 (NRRL No.B-67891)、解淀粉芽孢杆菌MDG1607 (NRRL No. B-67666)、枯草芽孢杆菌MDGV18 (NRRLNo. B-67665)、短小芽孢杆菌MDGV17 (NRRL No. B-67664)、枯草芽孢杆菌MDG-1728 (NRRLNo. B-67618)或巨大芽孢杆菌MDG-2705 (NRRL No. B-67619)所有鉴定特征(例如具有对应于芽孢杆菌属菌株地衣芽孢杆菌MDG-1000 (NRRL No. B-67888)、地衣芽孢杆菌MDG-1001 (NRRL No. B-67889)、枯草/解淀粉芽孢杆菌MDG-8001 (NRRL No. B-67890)、短小芽孢杆菌MDG-1047 (NRRL No. B-67891)、解淀粉芽孢杆菌MDG1607 (NRRL No. B-67666)、枯草芽孢杆菌MDGV18 (NRRL No. B-67665)、短小芽孢杆菌MDGV17 (NRRL No. B-67664)、枯草芽孢杆菌MDG-1728 (NRRL No. B-67618)或巨大芽孢杆菌MDG-2705 (NRRL No. B-67619)的DNA指纹的基于DNA分析的DNA指纹；对应于芽孢杆菌属菌株地衣芽孢杆菌MDG-1000 (NRRL No. B-67888)、地衣芽孢杆菌MDG-1001 (NRRL No. B-67889)、枯草/解淀粉芽孢杆菌MDG-8001 (NRRL No. B-67890)、短小芽孢杆菌MDG-1047 (NRRL No. B-67891)、解淀粉芽孢杆菌MDG1607 (NRRL No. B-67666)、枯草芽孢杆菌MDGV18 (NRRL No. B-67665)、短小芽孢杆菌MDGV17 (NRRL No. B-67664)、枯草芽孢杆菌MDG-1728 (NRRL No. B-67618)或巨大芽孢杆菌MDG-2705 (NRRL No. B-67619)的酶活性；对应于芽孢杆菌属菌株地衣芽孢杆菌MDG-1000 (NRRL No. B-67888)、地衣芽孢杆菌MDG-1001 (NRRL No. B-67889)、枯草/解淀粉芽孢杆菌MDG-8001 (NRRL No. B-67890)、短小芽孢杆菌MDG-1047 (NRRL No.B-67891)、解淀粉芽孢杆菌MDG1607 (NRRL No. B-67666)、枯草芽孢杆菌MDGV18 (NRRLNo. B-67665)、短小芽孢杆菌MDGV17 (NRRL No. B-67664)、枯草芽孢杆菌MDG-1728 (NRRLNo. B-67618)或巨大芽孢杆菌MDG-2705 (NRRL No. B-67619)的抗微生物活性；对应于芽孢杆菌属菌株地衣芽孢杆菌MDG-1000 (NRRL No. B-67888)、地衣芽孢杆菌MDG-1001(NRRL No. B-67889)、枯草/解淀粉芽孢杆菌MDG-8001 (NRRL No. B-67890)、短小芽孢杆菌MDG-1047 (NRRL No. B-67891)、解淀粉芽孢杆菌MDG1607 (NRRL No. B-67666)、枯草芽孢杆菌MDGV18 (NRRL No. B-67665)、短小芽孢杆菌MDGV17 (NRRL No. B-67664)、枯草芽孢杆菌MDG-1728 (NRRL No. B-67618)或巨大芽孢杆菌MDG-2705 (NRRL No. B-67619)的抗生素敏感性或耐受性谱；或这些鉴定特征的组合)的突变菌株。在备选的实施方案中，突变可为天然突变或基因工程突变。在另一个实施方案中，“具有芽孢杆菌属菌株地衣芽孢杆菌MDG-1000 (NRRL No. B-67888)、地衣芽孢杆菌MDG-1001 (NRRL No. B-67889)、枯草/解淀粉芽孢杆菌MDG-8001 (NRRL No. B-67890)、短小芽孢杆菌MDG-1047 (NRRL No. B-67891)、解淀粉芽孢杆菌MDG1607 (NRRL No. B-67666)、枯草芽孢杆菌MDGV18 (NRRL No.B-67665)、短小芽孢杆菌MDGV17 (NRRL No. B-67664)、枯草芽孢杆菌MDG-1728 (NRRL No.B-67618)或巨大芽孢杆菌MDG-2705 (NRRL No. B-67619)所有鉴定特征的菌株”可为例如通过从芽孢杆菌属菌株地衣芽孢杆菌MDG-1000 (NRRL No. B-67888)、地衣芽孢杆菌MDG-1001 (NRRL No. B-67889)、枯草/解淀粉芽孢杆菌MDG-8001 (NRRL No. B-67890)、短小芽孢杆菌MDG-1047 (NRRL No. B-67891)、解淀粉芽孢杆菌MDG1607 (NRRL No. B-67666)、枯草芽孢杆菌MDGV18 (NRRL No. B-67665)、短小芽孢杆菌MDGV17 (NRRL No. B-67664)、枯草芽孢杆菌MDG-1728 (NRRL No. B-67618)或巨大芽孢杆菌MDG-2705 (NRRL No. B-67619)中分离一种或多种质粒，并将所述一种或多种质粒引入另一种细菌(比如另一种芽孢杆菌属菌株)而产生的菌株，只要所述一种或多种质粒含有提供芽孢杆菌属菌株地衣芽孢杆菌MDG-1000 (NRRL No. B-67888)、地衣芽孢杆菌MDG-1001 (NRRL No. B-67889)、枯草/解淀粉芽孢杆菌MDG-8001 (NRRL No. B-67890)、短小芽孢杆菌MDG-1047 (NRRL No.B-67891)、解淀粉芽孢杆菌MDG1607 (NRRL No. B-67666)、枯草芽孢杆菌MDGV18 (NRRLNo. B-67665)、短小芽孢杆菌MDGV17 (NRRL No. B-67664)、枯草芽孢杆菌MDG-1728 (NRRLNo. B-67618)或巨大芽孢杆菌MDG-2705 (NRRL No. B-67619)的鉴定特征(例如具有对应于芽孢杆菌属菌株地衣芽孢杆菌MDG-1000 (NRRL No. B-67888)、地衣芽孢杆菌MDG-1001(NRRL No. B-67889)、枯草/解淀粉芽孢杆菌MDG-8001 (NRRL No. B-67890)、短小芽孢杆菌MDG-1047 (NRRL No. B-67891)、解淀粉芽孢杆菌MDG1607 (NRRL No. B-67666)、枯草芽孢杆菌MDGV18 (NRRL No. B-67665)、短小芽孢杆菌MDGV17 (NRRL No. B-67664)、枯草芽孢杆菌MDG-1728 (NRRL No. B-67618)或巨大芽孢杆菌MDG-2705 (NRRL No. B-67619)的DNA指纹的基于DNA分析的DNA指纹)的DNA。在此申请中，当短语“和具有这些菌株所有鉴定特征的菌株”被用于提及菌株列表时，此短语意为在“具有这些菌株所有鉴定特征的菌株”之中的另外的菌株各自具有列表中任意一种菌株的所有鉴定特征。
在本发明的另外的实施方案中，提供包含选自以下的芽孢杆菌属菌株的组合物：地衣芽孢杆菌MDG-1000 (NRRL No. B-67888)、地衣芽孢杆菌MDG-1001 (NRRL No. B-67889)、枯草/解淀粉芽孢杆菌MDG-8001 (NRRL No. B-67890)、短小芽孢杆菌MDG-1047(NRRL No. B-67891)、解淀粉芽孢杆菌MDG1607 (NRRL No. B-67666)、枯草芽孢杆菌MDGV18 (NRRL No. B-67665)、短小芽孢杆菌MDGV17 (NRRL No. B-67664)、枯草芽孢杆菌MDG-1728 (NRRL No. B-67618)和巨大芽孢杆菌MDG-2705 (NRRL No. B-67619)及其组合。在一个实施方案中，提供包含选自以下的芽孢杆菌属菌株的商业包装：芽孢杆菌属菌株地衣芽孢杆菌MDG-1000 (NRRL No. B-67888)、地衣芽孢杆菌MDG-1001 (NRRL No. B-67889)、枯草/解淀粉芽孢杆菌MDG-8001 (NRRL No. B-67890)、短小芽孢杆菌MDG-1047(NRRL No. B-67891)、解淀粉芽孢杆菌MDG1607 (NRRL No. B-67666)、枯草芽孢杆菌MDGV18 (NRRL No. B-67665)、短小芽孢杆菌MDGV17 (NRRL No. B-67664)、枯草芽孢杆菌MDG-1728 (NRRL No. B-67618)、巨大芽孢杆菌MDG-2705 (NRRL No. B-67619)和具有这些菌株所有鉴定特征的菌株及其组合。
在各种实施方案中，在商业包装中的芽孢杆菌属菌株可在水、废料或土壤中引起选自以下的效果：污染物去除、气味减少、化学需氧量减少、染料降解、染料褪色、木质素降解、纸(例如可冲水或一次性或不可冲水湿巾纸)的降解及其组合。在另一个实施方案中，芽孢杆菌属菌株可在水、废料或土壤中引起选自以下的效果：染料降解、染料褪色、木质素降解及其组合。在仍然另一个实施方案中，芽孢杆菌属菌株可在废料、水或土壤中引起染料褪色或染料降解。在仍然另一个实施方案中，芽孢杆菌属菌株可在水、废料或土壤中引起木质素降解。
在仍然其他实施方案中，芽孢杆菌属菌株可在动物饲料中或在动物饮用水中给予动物，并可改善动物表现(例如降低饲料转换、增加每日平均饲料摄入、增加每日平均增重、改善表现一致性及其组合)、改善动物健康、改善动物的环境及其组合。
在一个说明性方面，在商业包装中，地衣芽孢杆菌MDG-1000 (NRRL No. B-67888)、地衣芽孢杆菌MDG-1001 (NRRL No. B-67889)、枯草/解淀粉芽孢杆菌MDG-8001(NRRL No. B-67890)、短小芽孢杆菌MDG-1047 (NRRL No. B-67891)、解淀粉芽孢杆菌MDG1607 (NRRL No. B-67666)、枯草芽孢杆菌MDGV18 (NRRL No. B-67665)、短小芽孢杆菌MDGV17 (NRRL No. B-67664)、枯草芽孢杆菌MDG-1728 (NRRL No. B-67618)、巨大芽孢杆菌MDG-2705 (NRRL No. B-67619)和/或具有这些菌株所有鉴定特征的菌株可呈浓缩物(例如约1 x 108至约5 x 109 CFU/g水、废料或土壤或者CFU/g动物饲料)形式或超浓缩物(例如约1 x 1010至约5 x 1012 CFU/g水、废料或土壤或者CFU/g动物饲料)形式。在另一个实施方案中，在商业包装中的组合物中的芽孢杆菌属菌株地衣芽孢杆菌MDG-1000 (NRRL No. B-67888)、地衣芽孢杆菌MDG-1001 (NRRL No. B-67889)、枯草/解淀粉芽孢杆菌MDG-8001(NRRL No. B-67890)、短小芽孢杆菌MDG-1047 (NRRL No. B-67891)、解淀粉芽孢杆菌MDG1607 (NRRL No. B-67666)、枯草芽孢杆菌MDGV18 (NRRL No. B-67665)、短小芽孢杆菌MDGV17 (NRRL No. B-67664)、枯草芽孢杆菌MDG-1728 (NRRL No. B-67618)、巨大芽孢杆菌MDG-2705 (NRRL No. B-67619)和/或具有这些菌株所有鉴定特征的菌株可呈干燥形式(例如粉末或冻干形式)、丸粒形式、液体形式，呈凝胶形式或任意其他适合的形式。
在另一个说明性实施方案中，包含地衣芽孢杆菌MDG-1000 (NRRL No. B-67888)、地衣芽孢杆菌MDG-1001 (NRRL No. B-67889)、枯草/解淀粉芽孢杆菌MDG-8001 (NRRL No.B-67890)、短小芽孢杆菌MDG-1047 (NRRL No. B-67891)、解淀粉芽孢杆菌MDG1607 (NRRLNo. B-67666)、枯草芽孢杆菌MDGV18 (NRRL No. B-67665)、短小芽孢杆菌MDGV17 (NRRLNo. B-67664)、枯草芽孢杆菌MDG-1728 (NRRL No. B-67618)、巨大芽孢杆菌MDG-2705(NRRL No. B-67619)和/或具有这些菌株所有鉴定特征的菌株的商业包装可进一步包含用于芽孢杆菌属菌株的载体。载体可选自盐、矿物油、糊精(例如麦芽糊精)、乳清、糖、蔗糖、石灰石、酵母培养物、干淀粉、硅铝酸钠、二氧化硅、聚丙二醇、聚山梨酯80、植物油、水、稻壳及其组合。在另一个实施方案中，载体可为本领域已知的任意适合的载体。在另一个实施方案中，商业包装可含有与本领域已知的任意微量营养素组合的芽孢杆菌属菌株。
在另一个实施方案中，包含芽孢杆菌属菌株地衣芽孢杆菌MDG-1000 (NRRL No.B-67888)、地衣芽孢杆菌MDG-1001 (NRRL No. B-67889)、枯草/解淀粉芽孢杆菌MDG-8001(NRRL No. B-67890)、短小芽孢杆菌MDG-1047 (NRRL No. B-67891)、解淀粉芽孢杆菌MDG1607 (NRRL No. B-67666)、枯草芽孢杆菌MDGV18 (NRRL No. B-67665)、短小芽孢杆菌MDGV17 (NRRL No. B-67664)、枯草芽孢杆菌MDG-1728 (NRRL No. B-67618)、巨大芽孢杆菌MDG-2705 (NRRL No. B-67619)和/或具有这些菌株所有鉴定特征的菌株的商业包装可进一步包含粘合剂，比如黏土、酵母细胞壁组分、硅酸铝、葡聚糖或其他已知的粘合剂。在另一个实施方案中，商业包装可进一步包含无机/有机粘合剂、精油和/或有机酸。
在仍然其他实施方案中，包含芽孢杆菌属菌株地衣芽孢杆菌MDG-1000 (NRRL No.B-67888)、地衣芽孢杆菌MDG-1001 (NRRL No. B-67889)、枯草/解淀粉芽孢杆菌MDG-8001(NRRL No. B-67890)、短小芽孢杆菌MDG-1047 (NRRL No. B-67891)、解淀粉芽孢杆菌MDG1607 (NRRL No. B-67666)、枯草芽孢杆菌MDGV18 (NRRL No. B-67665)、短小芽孢杆菌MDGV17 (NRRL No. B-67664)、枯草芽孢杆菌MDG-1728 (NRRL No. B-67618)、巨大芽孢杆菌MDG-2705 (NRRL No. B-67619)和/或具有这些菌株所有鉴定特征的菌株的商业包装可在用于商业用途的容器中。在各种实施方案中，容器可为例如袋子(例如20磅袋、50磅袋、2盎司袋、1磅袋或1千克袋)、小袋、桶、瓶或盒子。在说明性方面，用于商业包装的容器可包含塑料、金属、箔、纸、纤维或纸板(例如塑料提桶、纸袋、箔袋、纤维桶等)。在仍然另一个实施方案中，商业包装可进一步包含一种或多种芽孢杆菌属菌株的使用说明。
本文所述的用于饲喂菌株至动物的任意实施方案中，芽孢杆菌属菌株可单独或组合给予，且可呈本文所述的任意适合的组合物的形式。本文所述的用于饲喂动物的芽孢杆菌属菌株也可与其他微生物菌株组合使用，所述其他微生物菌株包括其他芽孢杆菌属菌株或乳酸杆菌属菌株。
在另一个实施方案中，如本文所述的饲料添加剂、饲料组合物或饮用水可给予选自家禽物种、猪物种、山羊物种、牛物种、绵羊物种和马物种的动物。在另一个实施方案中，可将饲料添加剂、饲料组合物或饮用水给予人类。在另一个方面，可将如本文所述的饲料添加剂、饲料组合物或饮用水给予动物，且该动物可为猪物种，以及该猪物种可选自生长育成猪、保育猪、母猪和种猪。在仍然另一个实施方案中，可将饲料添加剂、饲料组合物或饮用水给予选自鸡、猪、马、小马、牛、火鸡、山羊、绵羊、鹌鹑、野鸡、鸵鸟、鸭、鱼、甲壳类动物及其组合的动物。
在用于饲喂动物的一个实施方案中，可将有效量的芽孢杆菌属菌株给予动物以改善动物的表现、健康或环境。“有效量”意为能够通过任意机制改善动物表现、健康或环境的芽孢杆菌属菌株的量。
在其中将包含芽孢杆菌属菌株地衣芽孢杆菌MDG-1000 (NRRL No. B-67888)、地衣芽孢杆菌MDG-1001 (NRRL No. B-67889)、枯草/解淀粉芽孢杆菌MDG-8001 (NRRL No.B-67890)、短小芽孢杆菌MDG-1047 (NRRL No. B-67891)、解淀粉芽孢杆菌MDG1607 (NRRLNo. B-67666)、枯草芽孢杆菌MDGV18 (NRRL No. B-67665)、短小芽孢杆菌MDGV17 (NRRLNo. B-67664)、枯草芽孢杆菌MDG-1728 (NRRL No. B-67618)、巨大芽孢杆菌MDG-2705(NRRL No. B-67619)和/或具有这些菌株所有鉴定特征的菌株的本发明组合物给予动物的本文所述的实施方案中，该组合物优选地在饲料组合物或在饮用水中经口给予动物，但本领域技术人员已知的任意其他有效的给予方法也可被利用，比如在糊剂、液体兽用顿服药、顶部敷料或胶囊中。在一个说明性实施方案中，芽孢杆菌属菌株地衣芽孢杆菌MDG-1000(NRRL No. B-67888)、地衣芽孢杆菌MDG-1001 (NRRL No. B-67889)、枯草/解淀粉芽孢杆菌MDG-8001 (NRRL No. B-67890)、短小芽孢杆菌MDG-1047 (NRRL No. B-67891)、解淀粉芽孢杆菌MDG1607 (NRRL No. B-67666)、枯草芽孢杆菌MDGV18 (NRRL No. B-67665)、短小芽孢杆菌MDGV17 (NRRL No. B-67664)、枯草芽孢杆菌MDG-1728 (NRRL No. B-67618)、巨大芽孢杆菌MDG-2705 (NRRL No. B-67619)和/或具有这些菌株所有鉴定特征的菌株以用于添加至动物饮用水的添加剂的形式提供。
在另一个说明性实施方案中，芽孢杆菌属菌株地衣芽孢杆菌MDG-1000 (NRRL No.B-67888)、地衣芽孢杆菌MDG-1001 (NRRL No. B-67889)、枯草/解淀粉芽孢杆菌MDG-8001(NRRL No. B-67890)、短小芽孢杆菌MDG-1047 (NRRL No. B-67891)、解淀粉芽孢杆菌MDG1607 (NRRL No. B-67666)、枯草芽孢杆菌MDGV18 (NRRL No. B-67665)、短小芽孢杆菌MDGV17 (NRRL No. B-67664)、枯草芽孢杆菌MDG-1728 (NRRL No. B-67618)、巨大芽孢杆菌MDG-2705 (NRRL No. B-67619)和/或具有这些菌株所有鉴定特征的菌株以用于添加至饲料组合物的饲料添加剂的形式提供。饲料组合物可含有芽孢杆菌属菌株地衣芽孢杆菌MDG-1000 (NRRL No. B-67888)、地衣芽孢杆菌MDG-1001 (NRRL No. B-67889)、枯草/解淀粉芽孢杆菌MDG-8001 (NRRL No. B-67890)、短小芽孢杆菌MDG-1047 (NRRL No. B-67891)、解淀粉芽孢杆菌MDG1607 (NRRL No. B-67666)、枯草芽孢杆菌MDGV18 (NRRL No.B-67665)、短小芽孢杆菌MDGV17 (NRRL No. B-67664)、枯草芽孢杆菌MDG-1728 (NRRL No.B-67618)、巨大芽孢杆菌MDG-2705 (NRRL No. B-67619)和/或具有这些的所有鉴定特征的菌株，所述菌株与动物饲料掺混物(包括领域公认的任意动物饲料掺混物或本文所述的任意动物饲料掺混物)混合。如本文所使用的，“饲料组合物”或“动物饲料组合物”意为包含芽孢杆菌属菌株地衣芽孢杆菌MDG-1000 (NRRL No. B-67888)、地衣芽孢杆菌MDG-1001(NRRL No. B-67889)、枯草/解淀粉芽孢杆菌MDG-8001 (NRRL No. B-67890)、短小芽孢杆菌MDG-1047 (NRRL No. B-67891)、解淀粉芽孢杆菌MDG1607 (NRRL No. B-67666)、枯草芽孢杆菌MDGV18 (NRRL No. B-67665)、短小芽孢杆菌MDGV17 (NRRL No. B-67664)、枯草芽孢杆菌MDG-1728 (NRRL No. B-67618)、巨大芽孢杆菌MDG-2705 (NRRL No. B-67619)和/或具有这些菌株所有鉴定特征的菌株的饲料组合物，所述菌株与动物饲料掺混物和任选的可用于饲料组合物的任意其他组分(包括其他细菌菌株，比如其他芽孢杆菌属菌株或乳酸杆菌属菌株)混合。在一个实施方案中，饲料组合物可呈磨碎的粗粉形式。
任意动物饲料掺混物，包括本领域已知的那些和本文所述的那些，可根据在此专利申请中描述的方法使用，比如菜籽粕、棉籽粕、豆粕、玉米粉、大麦、小麦、青贮饲料和半干青贮料。在各种实施方案中，动物饲料掺混物可补充有芽孢杆菌属菌株地衣芽孢杆菌MDG-1000 (NRRL No. B-67888)、地衣芽孢杆菌MDG-1001 (NRRL No. B-67889)、枯草/解淀粉芽孢杆菌MDG-8001 (NRRL No. B-67890)、短小芽孢杆菌MDG-1047 (NRRL No. B-67891)、解淀粉芽孢杆菌MDG1607 (NRRL No. B-67666)、枯草芽孢杆菌MDGV18 (NRRL No. B-67665)、短小芽孢杆菌MDGV17 (NRRL No. B-67664)、枯草芽孢杆菌MDG-1728 (NRRL No. B-67618)、巨大芽孢杆菌MDG-2705 (NRRL No. B-67619)和/或具有这些菌株所有鉴定特征的菌株，但可任选地将其他成分(包括其他细菌菌株，比如其他芽孢杆菌属菌株或乳酸杆菌属菌株)添加至动物饲料掺混物。
在各种说明性实施方案中，动物饲料掺混物任选的成分包括糖类和复合碳水化合物，比如水溶性和水不溶性单糖、二糖和多糖。其他任选的成分包括干酒糟可溶物、脂肪(例如粗脂肪)、磷、碳酸氢钠、石灰石、盐、植酸盐、钙、钠、硫、镁、钾、铜、铁、锰、锌、灰分、鱼油、源自鱼粉的油、生种子(例如亚麻籽)、抗氧化剂和淀粉。在另一个实施方案中，矿物质可以矿物质预混物的形式添加。
可添加至动物饲料掺混物的任选的氨基酸成分为精氨酸、组氨酸、异亮氨酸、亮氨酸、赖氨酸、半胱氨酸、甲硫氨酸、苯丙氨酸、苏氨酸、色氨酸、缬氨酸、酪氨酸乙酯HCl、丙氨酸、天冬氨酸、谷氨酸钠、甘氨酸、脯氨酸、丝氨酸、半胱氨酸乙酯HCl及其类似物和盐。可任选地添加的维生素为硫胺素HCl、核黄素、吡哆醇HCl、烟酸、烟酰胺、肌醇、氯化胆碱、泛酸钙、生物素、叶酸、抗坏血酸和维生素A、B、K、D、E等等。在另一个实施方案中，维生素可以维生素预混物的形式添加。在仍然另一个实施方案中，可将蛋白成分添加至动物饲料掺混物，且所述蛋白成分包括从肉粉、骨粉或鱼粉、蛋液或蛋粉、鱼可溶物、粗蛋白等中获得的蛋白。
在各种实施方案中，抗生素可与芽孢杆菌属菌株一起添加至动物饲料组合物或动物饮用水以用于本文所述的饲喂动物方法，并且该抗生素选自氨苄青霉素、氯霉素、环丙沙星、克林霉素、四环素、金霉素、Denagard™ (即泰妙菌素)、BMD™ (即亚甲基双水杨酸杆菌肽)、Carbadox™ (即卡巴氧)、Stafac™ (即维及尼霉素)、红霉素、左氧氟沙星、甲氧苄啶/磺胺甲
唑、甲氧苄啶、达托霉素、利福平、Tylan™ (即泰乐菌素)、Pulmotil™ (即替米考星)、万古霉素、卑霉素(avilamycin) (Kavault™)、庆大霉素(gentamycin)和新霉素(neomycin)及其组合。在一个说明性实施方案中，抗生素选自泰乐菌素、替米考星、卑霉素、庆大霉素和新霉素。
在另一个说明性实施方案中，可将一种或多种酶添加至动物饲料掺混物。在各种实施方案中，可添加的酶包括半乳糖苷酶、植酸酶、蛋白酶、脂肪酶、淀粉酶、半纤维素酶、阿拉伯木聚糖酶、木聚糖酶、纤维素酶、NSP酶、其组合以及改善饲料组合物对于改善动物健康、表现或环境的有效性的任意其他酶。在仍然另一个实施方案中，可将酵母、真菌(例如曲霉菌属(Aspergillus)或木霉菌属(Trichoderma))或微量营养素添加至动物饲料。适合于添加至用于动物饮用水的添加剂的任意上述成分可作为如本文所述的用于动物饮用水的添加剂的组分进行添加。
在各种说明性实施方案中，可将芽孢杆菌属菌株(例如地衣芽孢杆菌MDG-1000(NRRL No. B-67888)、地衣芽孢杆菌MDG-1001 (NRRL No. B-67889)、枯草/解淀粉芽孢杆菌MDG-8001 (NRRL No. B-67890)、短小芽孢杆菌MDG-1047 (NRRL No. B-67891)、解淀粉芽孢杆菌MDG1607 (NRRL No. B-67666)、枯草芽孢杆菌MDGV18 (NRRL No. B-67665)、短小芽孢杆菌MDGV17 (NRRL No. B-67664)、枯草芽孢杆菌MDG-1728 (NRRL No. B-67618)、巨大芽孢杆菌MDG-2705 (NRRL No. B-67619)和/或具有这些菌株所有鉴定特征的菌株)，或者除了芽孢杆菌属菌株地衣芽孢杆菌MDG-1000 (NRRL No. B-67888)、地衣芽孢杆菌MDG-1001 (NRRL No. B-67889)、枯草/解淀粉芽孢杆菌MDG-8001 (NRRL No. B-67890)、短小芽孢杆菌MDG-1047 (NRRL No. B-67891)、解淀粉芽孢杆菌MDG1607 (NRRL No. B-67666)、枯草芽孢杆菌MDGV18 (NRRL No. B-67665)、短小芽孢杆菌MDGV17 (NRRL No. B-67664)、枯草芽孢杆菌MDG-1728 (NRRL No. B-67618)、巨大芽孢杆菌MDG-2705 (NRRL No. B-67619)和/或具有这些菌株所有鉴定特征的菌株之外添加的任意其他细菌菌株在饲料组合物中以约1.0 x 103 CFU/克饲料组合物至约5.0 x 1012 CFU/克饲料组合物的剂量或以约1.0 x103 CFU/克饲料组合物至约1.0 x 107 CFU/克饲料组合物的剂量给予。在其他实施方案中，芽孢杆菌属菌株(例如芽孢杆菌属菌株地衣芽孢杆菌MDG-1000 (NRRL No. B-67888)、地衣芽孢杆菌MDG-1001 (NRRL No. B-67889)、枯草/解淀粉芽孢杆菌MDG-8001 (NRRL No. B-67890)、短小芽孢杆菌MDG-1047 (NRRL No. B-67891)、解淀粉芽孢杆菌MDG1607 (NRRLNo. B-67666)、枯草芽孢杆菌MDGV18 (NRRL No. B-67665)、短小芽孢杆菌MDGV17 (NRRLNo. B-67664)、枯草芽孢杆菌MDG-1728 (NRRL No. B-67618)、巨大芽孢杆菌MDG-2705(NRRL No. B-67619)和/或具有这些菌株所有鉴定特征的菌株)在饲料组合物以大于约1.0x 103 CFU/克饲料组合物的剂量、以大于约1.1 x 103 CFU/克饲料组合物的剂量、以大于约1.25 x 103 CFU/克饲料组合物的剂量、以大于约1.5 x 103 CFU/克饲料组合物的剂量、以大于约1.75 x 103 CFU/克饲料组合物的剂量、以大于约1.0 x 104 CFU/克饲料组合物的剂量、以大于约2.0 x 104 CFU/克饲料组合物的剂量、以大于约3.0 x 104 CFU/克饲料组合物的剂量、以大于约4.0 x 104 CFU/克饲料组合物的剂量、以大于约5.0 x 104 CFU/克饲料组合物的剂量、以大于约6.0 x 104 CFU/克饲料组合物的剂量、以大于约7.0 x 104 CFU/克饲料组合物的剂量、以大于约8.0 x 104 CFU/克饲料组合物的剂量、以大于约1.0 x 105 CFU/克饲料组合物的剂量、以大于约1.0 x 106 CFU/克饲料组合物的剂量、以大于约1.0 x 107CFU/克饲料组合物的剂量、以大于约1.0 x 108 CFU/克饲料组合物的剂量、以大于约1.0 x109 CFU/克饲料组合物的剂量、以大于约1.0 x 1010 CFU/克饲料组合物的剂量、以大于约1.0 x 1011 CFU/克饲料组合物的剂量或以大于约1.0 x 1012 CFU/克饲料组合物的剂量给予。在另一个实施方案中，可将芽孢杆菌属菌株(例如地衣芽孢杆菌MDG-1000 (NRRL No.B-67888)、地衣芽孢杆菌MDG-1001 (NRRL No. B-67889)、枯草/解淀粉芽孢杆菌MDG-8001(NRRL No. B-67890)、短小芽孢杆菌MDG-1047 (NRRL No. B-67891)、解淀粉芽孢杆菌MDG1607 (NRRL No. B-67666)、枯草芽孢杆菌MDGV18 (NRRL No. B-67665)、短小芽孢杆菌MDGV17 (NRRL No. B-67664)、枯草芽孢杆菌MDG-1728 (NRRL No. B-67618)、巨大芽孢杆菌MDG-2705 (NRRL No. B-67619)和/或具有这些菌株所有鉴定特征的菌株)，或者除了芽孢杆菌属菌株地衣芽孢杆菌MDG-1000 (NRRL No. B-67888)、地衣芽孢杆菌MDG-1001(NRRL No. B-67889)、枯草/解淀粉芽孢杆菌MDG-8001 (NRRL No. B-67890)、短小芽孢杆菌MDG-1047 (NRRL No. B-67891)、解淀粉芽孢杆菌MDG1607 (NRRL No. B-67666)、枯草芽孢杆菌MDGV18 (NRRL No. B-67665)、短小芽孢杆菌MDGV17 (NRRL No. B-67664)、枯草芽孢杆菌MDG-1728 (NRRL No. B-67618)、巨大芽孢杆菌MDG-2705 (NRRL No. B-67619)和/或具有这些菌株所有鉴定特征的菌株之外添加的任意其他细菌菌株在饲料组合物中以约1.0 x 102 CFU/克饲料组合物至约5.0 x 1012 CFU/克饲料组合物的剂量，或以约1.0 x102 CFU/克饲料组合物至约1.0 x 107 CFU/克饲料组合物的剂量，或以大于约1.0 x 102CFU/克饲料组合物的剂量给予。在另一个实施方案中，本文所述的任意剂量可呈在其中菌株在动物饮用水中给予的实施方案中的CFU/ml饮用水。
可将包含芽孢杆菌属菌株地衣芽孢杆菌MDG-1000 (NRRL No. B-67888)、地衣芽孢杆菌MDG-1001 (NRRL No. B-67889)、枯草/解淀粉芽孢杆菌MDG-8001 (NRRL No. B-67890)、短小芽孢杆菌MDG-1047 (NRRL No. B-67891)、解淀粉芽孢杆菌MDG1607 (NRRLNo. B-67666)、枯草芽孢杆菌MDGV18 (NRRL No. B-67665)、短小芽孢杆菌MDGV17 (NRRLNo. B-67664)、枯草芽孢杆菌MDG-1728 (NRRL No. B-67618)、巨大芽孢杆菌MDG-2705(NRRL No. B-67619)和/或具有这些菌株所有鉴定特征的菌株的饲料组合物或饮用水给予动物达有效改善动物健康或表现的任意时间段。例如在一个实施方案中，可将饲料组合物或饮用水每天提供给动物。在备选的实施方案中，饲料组合物或饮用水可在哺乳期间和/或在妊娠期间给予动物。上述饲料组合物或饮用水的给予时间段为非限制性实例，且应当意识到可使用被确定为有效改善动物健康或表现的任意时间段或给予时间表。
在一个实施方案中，用于添加至动物饲料掺混物以产生全价饲料组合物的饲料添加剂可与动物饲料掺混物混合，这例如用自动微量营养素递送系统或者例如通过手动称重和添加进行，以实现任意剂量的本文所述的芽孢杆菌属菌株地衣芽孢杆菌MDG-1000 (NRRLNo. B-67888)、地衣芽孢杆菌MDG-1001 (NRRL No. B-67889)、枯草/解淀粉芽孢杆菌MDG-8001 (NRRL No. B-67890)、短小芽孢杆菌MDG-1047 (NRRL No. B-67891)、解淀粉芽孢杆菌MDG1607 (NRRL No. B-67666)、枯草芽孢杆菌MDGV18 (NRRL No. B-67665)、短小芽孢杆菌MDGV17 (NRRL No. B-67664)、枯草芽孢杆菌MDG-1728 (NRRL No. B-67618)、巨大芽孢杆菌MDG-2705 (NRRL No. B-67619)和/或具有这些菌株所有鉴定特征的菌株，用于以全价饲料组合物形式给予动物。也可通过本领域已知的用于将直接饲喂微生物与动物饲料掺混物合并以获得均匀混合物的任意其他适合的方法进行混合。在各种实施方案中，可以任意适合的时间段(例如约1至约4分钟)进行混合。在其中芽孢杆菌属菌株地衣芽孢杆菌MDG-1000 (NRRL No. B-67888)、地衣芽孢杆菌MDG-1001 (NRRL No. B-67889)、枯草/解淀粉芽孢杆菌MDG-8001 (NRRL No. B-67890)、短小芽孢杆菌MDG-1047 (NRRL No. B-67891)、解淀粉芽孢杆菌MDG1607 (NRRL No. B-67666)、枯草芽孢杆菌MDGV18 (NRRL No. B-67665)、短小芽孢杆菌MDGV17 (NRRL No. B-67664)、枯草芽孢杆菌MDG-1728 (NRRL No. B-67618)、巨大芽孢杆菌MDG-2705 (NRRL No. B-67619)和/或具有这些菌株所有鉴定特征的菌株呈用于动物饮用水的添加剂形式的实施方案中，芽孢杆菌属菌株地衣芽孢杆菌MDG-1000 (NRRL No. B-67888)、地衣芽孢杆菌MDG-1001 (NRRL No. B-67889)、枯草/解淀粉芽孢杆菌MDG-8001 (NRRL No. B-67890)、短小芽孢杆菌MDG-1047 (NRRL No. B-67891)、解淀粉芽孢杆菌MDG1607 (NRRL No. B-67666)、枯草芽孢杆菌MDGV18 (NRRL No. B-67665)、短小芽孢杆菌MDGV17 (NRRL No. B-67664)、枯草芽孢杆菌MDG-1728 (NRRL No. B-67618)、巨大芽孢杆菌MDG-2705 (NRRL No. B-67619)和/或具有这些菌株所有鉴定特征的菌株可呈例如粉末、液体或丸粒形式，并可使用本领域已知的任意适合的方法与饮用水混合，以实现任意剂量的本文所述的芽孢杆菌属菌株地衣芽孢杆菌MDG-1000 (NRRL No. B-67888)、地衣芽孢杆菌MDG-1001 (NRRL No. B-67889)、枯草/解淀粉芽孢杆菌MDG-8001(NRRL No. B-67890)、短小芽孢杆菌MDG-1047 (NRRL No. B-67891)、解淀粉芽孢杆菌MDG1607 (NRRL No. B-67666)、枯草芽孢杆菌MDGV18 (NRRL No. B-67665)、短小芽孢杆菌MDGV17 (NRRL No. B-67664)、枯草芽孢杆菌MDG-1728 (NRRL No. B-67618)、巨大芽孢杆菌MDG-2705 (NRRL No. B-67619)和/或具有这些菌株所有鉴定特征的菌株，用于在动物饮用水中给予动物。芽孢杆菌属菌株地衣芽孢杆菌MDG-1000 (NRRL No. B-67888)、地衣芽孢杆菌MDG-1001 (NRRL No. B-67889)、枯草/解淀粉芽孢杆菌MDG-8001 (NRRL No. B-67890)、短小芽孢杆菌MDG-1047 (NRRL No. B-67891)、解淀粉芽孢杆菌MDG1607 (NRRLNo. B-67666)、枯草芽孢杆菌MDGV18 (NRRL No. B-67665)、短小芽孢杆菌MDGV17 (NRRLNo. B-67664)、枯草芽孢杆菌MDG-1728 (NRRL No. B-67618)、巨大芽孢杆菌MDG-2705(NRRL No. B-67619)和/或具有这些菌株所有鉴定特征的菌株也可以粉末、液体或丸粒形式经口(即通过口腔插入)直接饲喂至动物。
在一个说明性方面，用于添加至饲料添加剂、用于动物饮用水的添加剂或饲料组合物的菌株可呈浓缩物(例如约1 x 108至约5 x 109 CFU/g)或超浓缩物(例如约1 x 1010至约5 x 1012 CFU/g)的形式。在另一个实施方案中，用于添加至饲料添加剂、饲料组合物或用于动物饮用水的添加剂的菌株可呈干燥形式(例如粉末)、丸粒形式、液体形式，呈顶部敷料形式或呈凝胶形式或任意其他适合的形式。
在另一个说明性实施方案中，饲料添加剂、用于动物饮用水的添加剂或饲料组合物可进一步包含用于芽孢杆菌属菌株的载体。载体可选自麸皮、稻壳、盐、矿物油、糊精(例如麦芽糊精)、水、乳清、糖、蔗糖、石灰石、酵母培养物、干淀粉、硅铝酸钠、二氧化硅、聚丙二醇、聚山梨酯80、植物油及其组合。在另一个实施方案中，载体可为本领域已知用于直接饲喂微生物的任意适合的载体。在另一个实施方案中，饲料添加剂、用于动物饮用水的添加剂或饲料组合物可进一步包含粘合剂，比如黏土、酵母细胞壁组分、硅酸铝、葡聚糖或其他已知的粘合剂。在另一个实施方案中，商业包装、饲料添加剂、用于动物饮用水的添加剂或饲料组合物可进一步包含无机/有机粘合剂、精油和/或有机酸。
以下实施例提供本文所述发明的各种另外的说明性方面，并且不预期以任何方式进行限制。
实施例
实施例1
来自矿物质培养基的着色剂的生物修复
实验室规模的测试在含有来自Millipore Sigma的六种分别的着色剂的矿物质培养基中以一式三份的实验进行，所述着色剂为：活性红120 (R120)；活性橙16 (RO16)；直接黄27 (DY27)；活性蓝4 (RB4)；活性黑5 (RB5)；和Remazol亮蓝R (RBBR)。通过将染料以0.05%与去离子水混合来制作各着色剂的染料储备物。将储备物离心并将上层相倾倒至新管。将染料储备物分别按以下浓度添加至六罐矿物质培养基：0.05% (w/v)、0.05% (w/v)、0.09% (w/v)、0.05% (w/v)、0.05% (w/v)和0.05% (w/v)；并将其在121℃灭菌30分钟。制作了三种制备物-含有无菌矿物质培养基的对照；包括矿物质培养基和MDG-1728的处理-1(TRT-1)；以及包括矿物质培养基和MDG-2705的处理-2 (TRT-2)。最初的实验以一式两份进行，且随后的实验以一式四份进行。在微生物在含矿物质培养基(无着色剂)的烧瓶中以30℃、150rpm (pH=7.0)孵育72小时进行生长后，对六个培养基种类中的每一个进行接种。对各制备物在600nm处读取光密度(OD)；使用对照吸光度在0.00nm，MDG-1728 OD= 1.73nm和MDG-2705 OD=1.69nm使分光光度计空白。将制备物添加至六个种类的染料培养基中，所述染料培养基包括以下着色剂中的一种：R120、RO16、DY27、RB4、RB5或RBBR。将样品以30℃、150rpm孵育24小时。
孵育后，使用对照作为空白，将样品对各着色剂在λmax处以分光光度法进行分析。经处理的样品的负吸光度(以纳米(nm)为单位)表示脱色。对各培养基种类以及处理的十个组合重复，使用单因素方差分析(ANOVA)确定处理的统计学显著性。处理-1显著地减少所有染料培养基的吸光度(p<0.01)；处理-2显著地减少除DY27外所有染料培养基的吸光度(p<0.01)。
实施例2
来自矿物质培养基的着色剂的生物修复的结果和分析
结果和分析包括各制备物(组合的n=10)的离群值。使用对照在各着色剂的最大波长(λmax)处使分光光度计空白；对各个经处理的制备物测量吸光度。所有处理的样品在单因素ANOVA后都显示统计学显著性，p值<0.01；这不包括用处理-2的DY27培养基，其中p值不显著(表1)。各着色剂和处理-1 (TRT-1)的吸光度的降低如下：R120= -0.28±0.05；RO16=-0.18±0.04；DY27= -0.05±0.04；RB4= -0.02±0.01；RB5= -0.10±0.03；和RBBR= -0.04±0.003。各着色剂和处理-2 (TRT-2)的吸光度的降低如下：R120= -0.33±0.08；RO16= -0.31±0.08；DY27= -0.002±0.03；RB4= -0.02±0.004；RB5= -0.14±0.006；和RBBR= -0.02±0.006。结果绘制于图1A-1F；误差条代表平均值的标准差。孵育后所有样品的平均pH为pH= 7.02±0.28。
表1. 来自矿物质培养基的着色剂的生物修复的结果。
实施例3
木质素过氧化物酶的分析
使用10-乙酰基-3,7二羟基吩
嗪进行实验室规模的测试，以确认从MDG-1728和MDG-2705的木质素过氧化物酶的定量产生，10-乙酰基-3,7二羟基吩
嗪在过氧化物酶和过量过氧化氢(H2O2)的存在下产生可用于测量酶活性的荧光中间体试卤灵。
在实验前制备了所有试剂和接种体。MDG-1728和MDG-2705在分别的烧瓶中在矿物质培养基+TSB中生长，以30℃、150rpm (pH=7.0)孵育72小时。将培养物离心，将上层相倾倒至Pierce Protein Concentrator管(PES, 100k MWCO, 5-20mL)。将Concentrator管以4000 rpm离心15分钟，在收获后将上清液用作接种体。阳性对照由50mM冷磷酸盐缓冲液(0.1μm过滤无菌，pH 7.4)中的0.5 U/mL木质素过氧化物酶组成；冷却至-20℃。在光照限制下，用二甲亚砜中的2.5ppm Ampliflu™ Red制备10-乙酰基-3,7二羟基吩
嗪储备溶液。用分子水制备0.50% w/w过氧化氢溶液；将其0.1μm过滤灭菌，冷却至-4℃。
在环境光下，通过将60μl 10-乙酰基-3,7二羟基吩
嗪储备物添加至12mL无菌分子水，将其分成6mL等分试样来制备两份工作溶液。将1mL无菌分子水加入其中一份，并将1mL 0.50% w/w过氧化氢溶液加入另一份。将180μl的各工作储备物添加至96孔板，每种32孔。制作四种制备物；阴性对照具有移液至各工作溶液的32个重复中的8个的20µl无菌矿物质培养基+TSB (-对照/空白)，阳性对照具有移液至各工作溶液的32个重复中的8个的20µl木质素过氧化物酶溶液，处理-1 (TRT-1)具有移液至各工作溶液的32个重复中的8个的20µl MDG-1728上清液，以及处理-2 (TRT-2)具有移液至各工作溶液的32个重复中的8个的20µl MDG-2705上清液。在光照限制下室温孵育30分钟后，使用Multiskan™ GO微板分光光度计在λ= 570nm处读取平板。
实施例4
木质素过氧化物酶的结果和分析
木质素过氧化物酶可通过催化H2O2和10-乙酰基-3,7-二羟基吩
嗪在1:1化学计量比下的反应而进行测量。此试剂被用作比色法/荧光法指示剂，在过氧化物酶的存在下在H2O2还原成水的期间充当电子供体，产生荧光中间体试卤灵。此实验的结果显示在阳性对照、MDG-1728和MDG-2705中定量的过氧化物酶产生。阴性对照的荧光发光指示了光氧化。不含H2O2的工作溶液中的制备物应具有最小反应至无反应。使用Iglewicz和Hoaglin离群值检验(1993)，“Volume 16: How to Detect and Handle Outliers”, the ASQC BasicReferences in Quality Control: Statistical Techniques, Edward F. Mykytka,Ph.D.编，确定了离群值。含H2O2的阴性对照样品平均值和含H2O2的阳性对照样品平均值之间的吸光度的平均百分比差异显示了在0.01825nm处的增加(17%)，含H2O2的TRT-1显示了在0.04482nm处的增加(42%)，以及含H2O2的TRT-2显示了在0.0273nm处的增加(26%)。
实施例5
可冲水湿巾纸的降解
在体外实验中评估可冲水湿巾纸的降解。选择了受欢迎品牌的无纺布可冲水湿巾纸用于此测试。令单张湿巾纸风干并记录干重。将一张湿巾纸置于250 ml锥形烧瓶中，所述烧瓶含200 ml低营养矿物质培养基以模拟废水环境。将烧瓶用1.00E+06 cfu/ml的芽孢杆菌属和5 U/ml的纤维素酶进行接种，或在对照烧瓶中为无菌水进行接种。将烧瓶置于25℃和190 rpm的震荡培养箱中3或7天。孵育时间段结束时，将烧瓶的内容物倾倒通过2 mm筛。将剩余的材料置于培养箱中以将其干燥。记录干重并将其与初始重量进行比较以计算干重损失的百分比。使用双样本t检验评估平均值的差异。
3天和7天处理后，相较于对照，用芽孢杆菌属和纤维素酶处理的湿巾纸的降解存在显著增加(p < 0.05) (图2)。3天后干重的损失从对照组中的平均12.6%增加到处理组中的15.5%。7天后干重的损失从对照组中的13.5%增加到对照组中的18.6%。除重量损失外，处理的烧瓶中湿巾纸的结构出现变化(图3)。未处理的湿巾纸保持了湿巾纸的外观和结构，而处理的湿巾纸分解成小块，其由于烧瓶旋转而形成球状。
实施例6
通过芽孢杆菌属物种的酶的产生
对芽孢杆菌属菌株测试了其产生纤维素酶和木聚糖酶的能力，所述酶为有助于纤维素和木聚糖(木浆和纸的常见组分)降解的酶。芽孢杆菌属菌株在胰蛋白酶大豆肉汤中在37℃生长过夜，然后将2 µl培养物点在补充有0.5%羧甲基纤维素(CMC)或1%木聚糖的胰蛋白酶大豆琼脂平板上。将琼脂平板在37℃孵育24小时。将CMC平板用碘染色1分钟。芽孢杆菌属菌落周围未染色区的存在表示了纤维素酶活性。木聚糖平板上芽孢杆菌属菌落周围的空白区表示了木聚糖酶活性的存在。
表1. 芽孢杆菌属菌株中纤维素酶和木聚糖酶活性的存在(+)或缺乏(-)。
实施例7
RAPD-PCR DNA谱
使用随机扩增多态性DNA PCR方法(在本文中称为RAPD-PCR)鉴定各菌株的遗传变异性。通过使用QIAGEN®组织和血液单柱试剂盒(QIAGEN®, Venlo, The Netherlands)完成待用于RAPD-PCR反应的DNA的制备。图4至11说明此申请中所述菌株的RAPD-PCR结果。该结果显示菌株彼此间是独特的。
Claims (26)
1.通过将水、土壤或废料与芽孢杆菌属菌株接触以去除污染物而处理所述水、所述土壤或所述废料的方法，所述方法包含将所述水、所述土壤或所述废料与有效量的选自以下的分离的芽孢杆菌属菌株接触并去除所述污染物：芽孢杆菌属菌株地衣芽孢杆菌MDG-1000(NRRL No. B-67888)、地衣芽孢杆菌MDG-1001 (NRRL No. B-67889)、枯草/解淀粉芽孢杆菌MDG-8001 (NRRL No. B-67890)、短小芽孢杆菌MDG-1047 (NRRL No. B-67891)、解淀粉芽孢杆菌MDG1607 (NRRL No. B-67666)、枯草芽孢杆菌MDGV18 (NRRL No. B-67665)、短小芽孢杆菌MDGV17 (NRRL No. B-67664)、枯草芽孢杆菌MDG-1728 (NRRL No. B-67618)、巨大芽孢杆菌MDG-2705 (NRRL No. B-67619)和具有这些菌株所有鉴定特征的菌株。
2.权利要求1的方法，其中对所述水或所述废料进行处理以去除污染物，且所述水或所述废料选自工业废水、工业废料、生活废水、生活废料、农业废水、农业废料和废水。
3.权利要求1的方法，其中去除所述污染物导致所述水、所述废料或所述土壤中气味减少或化学需氧量减少。
4.权利要求1的方法，其中所述污染物为有机化合物。
5.权利要求4的方法，其中所述有机化合物通过降解去除。
6.权利要求1的方法，其中所述污染物为合成化合物。
7.权利要求1的方法，其中所述污染物为含纸的化合物。
8.权利要求7的方法，其中所述含纸的化合物为湿巾纸。
9.权利要求1的方法，其中所述芽孢杆菌属菌株产生选自以下的酶：氧化还原酶、水解酶、转移酶、裂解酶、异构酶、连接酶、过氧化物酶、漆酶、酯酶、淀粉酶、蛋白酶、木聚糖酶、脂肪酶、纤维素酶、加氧酶、还原酶、氧化酶、羟化酶、脱氢酶及其组合。
10.权利要求1的方法，其进一步包含将所述水、所述土壤或所述废料与选自以下的外源性酶接触：氧化还原酶、水解酶、转移酶、裂解酶、异构酶、连接酶、过氧化物酶、漆酶、酯酶、淀粉酶、蛋白酶、木聚糖酶、脂肪酶、纤维素酶、加氧酶、还原酶、氧化酶、羟化酶、脱氢酶及其组合。
11.权利要求1的方法，其中所述污染物为染料。
12.权利要求11的方法，其中所述染料为偶氮染料或蒽醌染料。
13.权利要求11的方法，其中所述污染物为酸性染料。
14.权利要求11的方法，其中所述污染物为金属络合染料。
15.权利要求11的方法，其中所述污染物为直接染料。
16.权利要求11的方法，其中所述污染物为碱性染料。
17.权利要求11的方法，其中所述污染物为分散染料。
18.权利要求11的方法，其中所述污染物为活性染料。
19.权利要求11的方法，其中所述污染物为硫化染料。
20.权利要求11的方法，其中所述污染物为瓮染料。
21.权利要求1的方法，其中所述污染物为染料，且所述芽孢杆菌属菌株引起所述染料的降解或褪色。
22.权利要求1的方法，其中所述污染物为木质素。
23.权利要求22的方法，其中所述木质素由造纸业或纸浆业产生。
24.权利要求1的方法，其中所述污染物为无机化合物。
25.商业包装，其包含选自以下的分离的芽孢杆菌属菌株：芽孢杆菌属菌株地衣芽孢杆菌MDG-1000 (NRRL No. B-67888)、地衣芽孢杆菌MDG-1001 (NRRL No. B-67889)、枯草/解淀粉芽孢杆菌MDG-8001 (NRRL No. B-67890)、短小芽孢杆菌MDG-1047 (NRRL No. B-67891)、枯草芽孢杆菌MDGV18 (NRRL No. B-67665)、枯草芽孢杆菌MDG-1728 (NRRL No.B-67618)、巨大芽孢杆菌MDG-2705 (NRRL No. B-67619)和具有这些菌株所有鉴定特征的菌株。
26.饲喂动物的方法，其包含给予动物饲料组合物或饮用水的步骤，所述饲料组合物或饮用水包含有效量的包含选自以下的分离的芽孢杆菌属菌株的添加剂：芽孢杆菌属菌株地衣芽孢杆菌MDG-1000 (NRRL No. B-67888)、地衣芽孢杆菌MDG-1001 (NRRL No. B-67889)、枯草/解淀粉芽孢杆菌MDG-8001 (NRRL No. B-67890)、短小芽孢杆菌MDG-1047(NRRL No. B-67891)、解淀粉芽孢杆菌MDG1607 (NRRL No. B-67666)、枯草芽孢杆菌MDGV18 (NRRL No. B-67665)、短小芽孢杆菌MDGV17 (NRRL No. B-67664)、枯草芽孢杆菌MDG-1728 (NRRL No. B-67618)、巨大芽孢杆菌MDG-2705 (NRRL No. B-67619)和具有这些菌株所有鉴定特征的菌株及其组合。
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