CN114761000A - Cdk5的取代的1,6-萘啶抑制剂 - Google Patents
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Abstract
公开了具有结构式I的化合物以及相关的盐和药物组合物。还公开了例如使用式(I)化合物和相关的盐以及药物组合物治疗诸如肾脏疾病、肾衰竭、肾结石或多囊性肾病的疾病和病状的治疗方法。
Description
相关申请
本申请要求2019年10月1日提交的美国临时专利申请第62/908,952号；和2020年7月10日提交的美国临时专利申请第63/050,384号的优先权的权益。
背景技术
细胞周期蛋白依赖性激酶(CDK)属于脯氨酸导向的丝氨酸/苏氨酸激酶家族，在控制细胞周期进程和转录控制中起重要作用。细胞周期蛋白依赖性激酶5(CDK5)是一种脯氨酸导向的丝氨酸/苏氨酸激酶，因其在神经元发育和功能中不可或缺的作用而独特。CDK5是不寻常的，因为它通常在与细胞周期蛋白结合时不被活化，并且不需要T-环磷酸化来活化，即使它与其他CDK具有高氨基酸序列同源性。而以前认为CDK5仅与p35或p39及其裂解的对应物相互作用。最近的证据表明，CDK5可以与某些细胞周期蛋白以及其他蛋白质相互作用，调节CDK5的活性水平。最近的发现报道了调节CDK5活性的分子相互作用和与各种疾病有关的CDK5相关途径。本文还涵盖越来越多的证据表明CDK5有助于肿瘤发生的发作和发展。
CDK5在神经细胞中发挥多种生理作用，包括早期神经发育期间的神经元迁移(Xie等人,2003)和轴突导向(Connell-Crowley等人,2000)以及突触形成和突触可塑性(Cheung等人,2006；Lai和Ip,2009)。然而，最近还发现CDK5在中枢神经系统外发挥重要作用，诸如涉及感觉途径的疼痛信号(Pareek等人,2006)，以及调节胰腺β细胞中葡萄糖刺激的胰岛素水平(Wei等人,2005)。由于其关键的生理作用，CDK5不受控制的活性与各种疾病/病症相关，使得CDK5已成为治疗药物的潜在分子靶标。在神经元中，CDK5失调引发神经元凋亡(Cheung和Ip,2004)，这表明CDK5活性的异常调节是神经退行性疾病诸如阿尔茨海默病(Alzheimer's disease，AD)和帕金森病(Parkinson's disease，PD)进展的原因。例如，异常的CDK5活性也与癌症发展、进展和转移有关，例如前列腺癌和甲状腺癌(Strock等人,2006；Lin等人,2007)。
AD的两个主要病理特征是老年斑和神经原纤维缠结在患病脑中的积聚。CDK5的失调是由在病理条件下产生的p35的切割产物p25的存在引起的(Patrick等人,1999)。在AD患者的大脑中发现了p25蛋白的积聚(Patrick等人,1999)。最近的发现还表明，CDK5是调节老年斑(Monaco,2004)和神经原纤维缠结(Cruz等人,2003)形成的关键激酶之一。
与CDK5相关的另一种主要神经退行性疾病是帕金森病(PD)。在病理学上，PD的特征在于由于选择的神经元群体，尤其是黑质致密部中的多巴胺能神经元的进行性死亡而导致的运动障碍(Muntane等人,2008)。据报道，在由1-甲基-4-苯基-1,2,3,6-四氢吡啶(MPTP)诱导的PD小鼠模型中，CDK5的表达和活性升高与多巴胺能神经元细胞死亡相关(Smith等人,2003；Qu等人,2007)。此外，有趣的是注意到CDK5的抑制导致多巴胺释放的增加，这可能有助于改善PD进展(Chergui等人,2004)。CDK5还涉及许多其他神经退行性疾病和神经病症，例如亨廷顿舞蹈病(Anne等人,2007)、肌萎缩性侧索硬化(ALS；Bajaj等人,1998)和缺血性损伤(Wang等人,2003)。
异常的CDK5活性也与糖尿病(2型糖尿病)的发病机理有关。p35是CDK5的活化剂，存在于胰腺β细胞中，并且其活性负调节响应于葡萄糖的胰岛素释放(Wei和Tomizawa,2007)。据报道，在高葡萄糖暴露下，鼠类胰腺β细胞中p35蛋白和CDK5活性持续增加(Ubeda等人,2006)。此外，化学抑制剂对CDK5活性的抑制以葡萄糖依赖性方式增加了培养的β细胞和糖尿病小鼠模型中的胰岛素分泌(Ubeda等人,2006)。这些发现与p35-/-小鼠在葡萄糖刺激后表现出胰岛素分泌增强的观察结果一致(Wei等人,2005)。CDK5被认为在葡萄糖毒性期间通过调节Ca2+通道活性或调节胰岛素基因表达而起作用(Wei等人,2005；Ubeda等人,2006)。因此，CDK5抑制剂可能是用于治疗2型糖尿病的潜在治疗剂(Kitani等人,2007)。
CDK5也已成为镇痛药物的主要潜在靶点。CDK5/p35与伤害感受途径间接相关。例如，CDK5调节伤害感受神经元中丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)的活化，潜在地改变导致MAPK活性增加的痛觉过敏。CDK5还牵涉到其他疼痛途径，如钙调蛋白激酶II、δFosB、NMDA受体和P/Q型电压依赖性钙通道。此外，研究表明，CDK5抑制剂可能有利于管理急性疼痛。CDK5/p35被证明参与对疼痛的处理，而其抑制降低了正常疼痛途径的反应性(Pareek等人,2006；Pareek和Kulkarni,2006)。CDK5还在外周炎症反应期间通过负反馈回路调节丝裂原活化蛋白激酶1/2(MEK1/2)/1M活性(Pareek和Kulkarni,2006)。此外，由热、质子和辣椒素活化的配体门控阳离子通道瞬时受体电位香草素1(TRPV1)最近被确定为CDK5的底物(Pareek等人,2007)。由于CDK5对TRPV1的磷酸化在疼痛信号传导期间调节TRPV1的功能，因此认为CDK5可以作为用于开发镇痛药物的新分子靶点。
最近，CDK5被鉴定为在控制纤毛长度和管状上皮分化中起关键作用。CDK5的药理学或遗传学减少导致PKD受到有效且持续的抑制。CDK5可至少部分通过调节微管动力学来作用于初级纤毛。有人提出，旨在恢复细胞分化的新治疗方法可能会产生用于囊性肾病的有效治疗方法(Husson等人,2016)。此外，CDK5被证明是有害的，并通过DN中细胞外信号调节激酶1/2(ERK1/2)/过氧化物酶体增殖物活化受体γ(PPRAγ)途径来促进肾小管间质纤维化(TIF)。这些发现证明了CDK5通过活化DN中的ERK1/2/PPARγ途径和EMT来增加肾小管间质纤维化的新机制。因此，CDK5可能具有糖尿病性肾病的治疗潜力。(Bai等人2016)。
因此，需要额外的CDK5抑制剂。
发明内容
一方面，本发明的特征在于作为CDK5抑制剂的化合物。在一些实施方案中，本发明的化合物是具有结构式(I)的化合物：
环A是单环或双环环烷基或单环或双环饱和杂环基；
环B是单环或双环芳基、单环或双环杂芳基、或单环或双环杂环基；
R1为-N(R5)-、-C(O)-、-S-、-S(O)-、-S(O)2-、-[C(R4)2]1-2-、-[C(R4)2]0-1-CH＝、-N(R5)-S(O)2-、-S(O)2-N(R5)、-C(R4)2-N(R5)-、-N(R5)-C(R4)2-、-C(R4)2-S(O)2-、-C(＝N-OH)-、-C(＝N-O-C1-C4烷基)-或-S(O)2-C(R4)2-；
每个R2独立地是卤代、-OH、-C1-C6烷基、-C1-C6卤代烷基、-C1-C6羟基烷基、-(C0-C4亚烷基)-C(O)-OH、-(C0-C4亚烷基)-C(O)-O-C1-C4烷基、-(C0-C4亚烷基)-O-C1-C4烷基、-(C0-C4亚烷基)-O-C1-C4羟基烷基、-(C0-C4亚烷基)-C(O)-N(R6)2、-(C0-C4亚烷基)-N(R6)2或-(C0-C4亚烷基)-饱和杂环基，其中所述饱和杂环基任选地被卤代、-OH或-CH3取代；
每个R3独立地是卤代；-CN；-OH；-N(R6)2；-C1-C4烷基；-O-C1-C4烷基；-O-C1-C4亚烷基-C(O)-N(R6)2；-C(O)-O-C1-C4烷基；-C(O)-N(R6)2；-S(O)2-N(R6)2；-S(O)2-C1-C4烷基；任选地被一个或多个-OH取代的C2-C4炔基；1,2,4-三唑-1-基甲基；吗啉基甲基；环丙基；＝O；-CH2CH2-C(O)-O-CH3；-N(R6)-S(O)2-CH3；任选地取代的芳基；任选地取代的杂芳基；或任选地取代的杂环基，其中R3的任何烷基部分任选地被卤代、-CN或-N(R6)2或-OH中的一个或多个取代；
每个R4独立地是氢、卤代、-OH、-CN、-N(R6)2、任选地被-OH、卤代、-CN或-N(R6)2中的一个或多个取代的-C1-C4烷基；或任选地被-OH、卤代、-CN或-N(R6)2中的一个或多个取代的O-C1-C4烷基；
或者一个R4与环A中的环碳原子一起形成与环A螺稠合、稠合或桥连的环烷基或杂环基环；
或者键合至同一碳原子的两个R4一起形成＝CH2-(C0-C3烷基)、C3-C6环烷基或C4-C7杂环基；
R5是氢；任选地被-CN、-OH、-COOH、C(O)-O-C1-C4烷基或吡唑基中的一个或多个取代的C1-C4烷基；-S(O)2-C1-C4烷基；-C(O)C(O)OH；-COOH；或-C(O)-O-C1-C4烷基；
或者R5连同环A中的环碳一起形成与环A螺稠合、稠合或桥连的杂环基环；
每个R6独立地是氢或-C1-C4烷基；
m是0、1、2、3、4、5或6；
n是0、1、2、3、4、5或6；并且
“----”表示单键或双键。
一方面，本发明涉及包含本文公开的化合物和药学上可接受的载体的药物组合物。
一方面，本发明涉及治疗特征在于异常CDK5过度活性的疾病或病状的方法，其包括向有需要的受试者施用治疗有效量的本文公开的化合物或组合物的步骤。在一些实施方案中，疾病或病状是肾脏的疾病或病状。在一些实施方案中，疾病是多囊性肾病。在一些实施方案中，疾病或病状是纤毛类疾病。该方法对多种受试者有效，包括哺乳动物，例如人和其他动物，诸如实验室动物，例如小鼠、大鼠、兔或猴，或驯养和农场动物，例如猫、狗、山羊、绵羊、猪、奶牛或马。在一些实施方案中，受试者是人。
本发明提供了若干优点。本文所述的预防性和治疗性方法可有效治疗肾脏疾病和纤毛类疾病，并且具有极小的副作用，如果有的话。此外，本文所述的方法可有效鉴定治疗肾脏疾病(如多囊性肾病)或纤毛类疾病或降低其发展风险的化合物。
除非另有限定，否则本文中所使用的所有技术和科学术语具有与本发明领域内的普通技术人员对于该发明所属的通常理解的意义相同的意义。尽管与本文描述的那些方法和材料类似或等效的方法和材料可于本发明的实践或测试中，但以下描述适合的方法和材料。本文提及的所有出版物、专利申请、专利和其他参考文献全文以引用方式并入。当发生冲突时，以本说明书(包括定义)为准。此外，材料、方法和实例仅是说明性的而不是旨在进行限制。
本发明的其他特征、目标和优点通过详细描述以及权利要求将显而易见。
附图说明
图1示出了本发明示例性化合物的NMR和MS数据。
具体实施方式
定义
术语“酰基”是本领域公认的，并且是指由通式烃基C(O)-，优选烷基C(O)-表示的基团。
术语“酰基氨基”是本领域公认的，并且是指被酰基取代的氨基，并且可以例如由式烃基C(O)NH-表示。
术语“酰氧基”是本领域公认的，并且是指由通式烃基C(O)O-，优选烷基C(O)O-表示的基团。
术语“烷氧基”是指连接有氧的烷基，优选低级烷基。代表性烷氧基包括甲氧基、三氟甲氧基、乙氧基、丙氧基、叔丁氧基等。
术语“烷氧基烷基”是指被烷氧基取代的烷基，并且可以由通式烷基-O-烷基表示。
如本文所用，术语“烯基”是指含有至少一个双键的脂族基团，并且意欲包括“未取代的烯基”和“取代的烯基”两者，后者是指在烯基的一个或多个碳上具有置换氢的取代基的烯基部分。此类取代基可出现在包括或不包括在一个或多个双键中的一个或多个碳上。此外，此类取代基包括除了在稳定性禁止的情况下如下文所讨论的针对烷基所考虑的所有取代基。例如，考虑烯基被一个或多个烷基、碳环基、芳基、杂环基或杂芳基取代。
“烷基”或“烷烃”是完全饱和的直链或支链非芳族烃。通常，直链或支链烷基具有1至约20个碳原子，优选1至约10个，除非另外定义。直链和支链烷基的实例包括甲基、乙基、正丙基、异丙基、正丁基、仲丁基、叔丁基、戊基、己基、戊基和辛基。C1-C6直链或支链烷基也被称为“低级烷基”基团。
此外，在整个说明书、实施例和权利要求书中使用的术语“烷基”(或“低级烷基”)旨在包括“未取代的烷基”和“取代的烷基”，后者是指在烃主链的一个或多个碳上具有置换氢的取代基的烷基部分。如果没有另外说明，此类取代基可包括例如，卤素(例如，氟)、羟基、羰基(诸如羧基、烷氧基羰基、甲酰基或酰基)、硫代羰基(如硫酯、硫代乙酸酯或硫代甲酸酯)、烷氧基、磷酰基、磷酸基团、膦酸基团、次膦酸基团、氨基、酰胺基、脒、亚胺、氰基、硝基、叠氮基、巯基、烷硫基、硫酸基团、磺酸基团、氨磺酰基、磺酰胺基、磺酰基、杂环基、芳烷基或芳族或杂芳族部分。在优选的实施方案中，取代烷基上的取代基选自C1-6烷基、C3-6环烷基、卤素、羰基、氰基或羟基。在更优选的实施方案中，取代烷基上的取代基选自氟代、羰基、氰基或羟基。本领域技术人员将理解，如果合适，在烃链上取代的部分本身可被取代。例如，取代的烷基的取代基可包括氨基、叠氮基、亚氨基、酰胺基、磷酰基(包括膦酸基团和次膦酸基团)、磺酰基(包括硫酸基团、磺酰胺基、氨磺酰基和磺酸基团)和甲硅烷基以及醚、烷硫基、羰基(包括酮、醛、羧酸基团和酯)、-CF3、-CN等的取代的和未取代的形式。示例性取代的烷基在下文描述。环烷基可进一步被烷基、烯基、烷氧基、烷硫基、氨基烷基、羰基取代的烷基、-CF3、-CN等取代。
除非另有说明，“亚烷基”本身或作为另一取代基的一部分是指具有所述碳原子数并衍生自从对应烷烃去除两个氢原子的饱和直链或支链二价基团。直链和支链亚烷基的实例包括-CH2-(亚甲基)、-CH2-CH2-(亚乙基)、-CH2-CH2-CH2-(亚丙基)、-C(CH3)2-、-CH2-CH(CH3)-、-CH2-CH2-CH2-CH2-、-CH2-CH2-CH2-CH2-CH2-(亚戊基)、-CH2-CH(CH3)-CH2-和-CH2-C(CH3)2-CH2-。
当与诸如酰基、酰氧基、烷基、烯基、炔基或烷氧基的化学部分结合使用时，术语“Cx-y”意指包括在链中含有x至y个碳的基团。例如，术语“Cx-y烷基”是指取代或未取代的饱和烃基团，包括在链中含有x至y个碳的直链烷基和支链烷基，包括卤代烷基。优选的卤代烷基包括三氟甲基、二氟甲基、2,2,2-三氟乙基和五氟乙基。C0烷基在基团位于末端位置的情况下表示氢，如果位于内部则表示键。术语“C2-y烯基”和“C2-y炔基”是指取代或未取代的不饱和脂族基团，其长度和可能的取代类似于上述烷基，但分别含有至少一个双键或三键。
如本文所用，术语“烷基氨基”是指被至少一个烷基取代的氨基。
如本文所用，术语“烷硫基”是指被烷基取代的硫醇基，并且可由通式烷基S-表示。
如本文所用，术语“炔基”是指含有至少一个三键的脂肪族基团，并且意图包括“未取代的炔基”和“取代的炔基”两者，其中后者是指在炔基的一个或多个碳上具有置换氢的取代基的炔基部分。此类取代基可在包含或不包含于一个或多个三键中的一个或多个碳上进行。此外，此类取代基包括除了在稳定性禁止的情况下如上文所讨论的针对烷基所考虑的所有取代基。例如，考虑了炔基被一个或多个烷基、碳环基、芳基、杂环基或杂芳基取代。
如本文所用，术语“酰胺”是指基团
其中每个RA独立地表示氢或烃基，或两个RA与它们所连接的N原子合在一起形成在环结构中具有4至8个原子的杂环。
术语“胺”和“氨基”是本领域公认的，并且是指未取代的和取代的胺及其盐，例如可以由下式表示的部分
其中每个RA独立地表示氢或烃基，或两个RA与它们所连接的N原子合在一起形成在环结构中具有4至8个原子的杂环。
如本文所用，术语“氨基烷基”是指被氨基取代的烷基。
如本文所用，术语“芳烷基”是指被芳基取代的烷基。
如本文所用，术语“芳基”包括取代或未取代的单环芳族基团，其中环的每个原子为碳。优选地，该环是6或10元环，更优选地6元环。术语“芳基”还包括具有两个或更多个环的多环系统，其中两个或更多个碳是两个相邻环共有的，其中至少一个环是芳族的，例如，其他环可以是环烷基、环烯基、芳基、杂芳基和/或杂环基。芳基包括苯、萘、菲、苯酚、苯胺等。
术语“氨基甲酸酯”是本领域公认的，并且是指以下基团
其中每个RA独立地表示氢或烃基，诸如烷基，或两个RA与居间原子合在一起形成在环结构中具有4至8个原子的杂环。
如本文所用，术语“碳环(carbocycle)”和“碳环的(carbocyclic)”是指其中环的每个原子为碳的饱和或不饱和环。术语碳环包括芳族碳环和非芳族碳环。非芳族碳环包括其中所有碳原子都饱和的环烷烃环和含有至少一个双键的环烯烃环。“碳环”包括5-7元单环和8-12元双环。双环碳环的每个环可选自饱和环、不饱和环和芳环。碳环包括双环分子，其中在两个环之间共享一个、两个或三个或更多个原子。术语“稠合碳环”是指其中每个环与另一个环共享两个相邻原子的双环碳环。稠合碳环的每个环可选自饱和环、不饱和环和芳环。在示例性实施方案中，芳环(例如苯基)可与饱和环或不饱和环(例如环己烷、环戊烷或环己烯)稠合。在化合价允许时，饱和双环、不饱和双环和芳族双环的任何组合均包括在碳环的定义中。示例性“碳环”包括环戊烷、环己烷、双环[2.2.1]庚烷、1,5-环辛二烯、1,2,3,4-四氢萘、双环[4.2.0]辛-3-烯、萘和金刚烷。示例性稠合碳环包括萘烷、萘、1,2,3,4-四氢萘、双环[4.2.0]辛烷、4,5,6,7-四氢-1H-茚和双环[4.1.0]庚-3-烯。“碳环”可在能够携带氢原子的任何一个或多个位置处被取代。
“环烷基”是完全饱和的环状烃。“环烷基”包括单环和双环。通常，除非另外定义，否则单环环烷基具有3至约10个碳原子，更通常3至8个碳原子。双环环烷基的第二环可选自饱和环、不饱和环和芳环。环烷基包括双环分子，其中在两个环之间共享一个、两个或三个或更多个原子。术语“稠合环烷基”是指其中每个环与另一个环共享两个相邻原子的双环环烷基。稠合双环环烷基的第二环可选自饱和环、不饱和环和芳环。“环烯基”是含有一个或多个双键的环状烃。
如本文所用，术语“碳环基烷基”是指被碳环基团取代的烷基。
术语“碳酸酯”是本领域公认的，并且是指基团-OCO2-RA，其中RA表示烃基。
如本文所用，术语“羧基”是指由式-CO2H表示的基团。
如本文所用，术语“酯”是指基团-C(O)ORA，其中RA表示烃基。
如本文所用，术语“醚”是指通过氧连接至另一个烃基的烃基。因此，烃基的醚取代基可以是烃基-O-。醚可以是对称的或不对称的。醚的实例包括但不限于杂环-O-杂环和芳基-O-杂环。醚包括“烷氧基烷基”基团，其可以由通式烷基-O-烷基表示。
如本文所用，术语“卤代基”和“卤素”意指卤素，并且包括氯、氟、溴和碘。
如本文所用，术语“杂芳烷基(hetaralkyl)”和“杂芳烷基(heteroaralkyl)”是指被杂芳基取代的烷基。
如本文所用，术语“杂烷基”是指碳原子和至少一个杂原子的饱和或不饱和链，其中没有两个杂原子相邻。
术语“杂芳基(heteroaryl)”和“杂芳基(hetaryl)”包括取代的或未取代的芳族单环结构，优选地5元至7元环，更优选地5元至6元环，其环结构包含至少一个杂原子、优选地一至四个杂原子、更优选地一个或两个杂原子。术语“杂芳基(heteroaryl)”和“杂芳基(hetaryl)”还包括具有两个或更多个环的多环系统，其中两个或更多个碳是两个相邻环共有的，其中至少一个环是杂芳族的，例如，其他环可以是环烷基、环烯基、芳基、杂芳基和/或杂环基。杂芳基包括例如吡咯、呋喃、噻吩、咪唑、噁唑、噻唑、吡唑、吡啶、吡嗪、哒嗪和嘧啶等。
如本文所用，术语“杂原子”意指除碳或氢以外的任何元素的原子。优选的杂原子是氮、氧和硫。
术语“杂环基”、“杂环”和“杂环的”是指取代或未取代的非芳族环结构，优选地3至10元环，更优选地3至7元环，其环结构包含至少一个杂原子，优选地一至四个杂原子，更优选地一个或两个杂原子。术语“杂环基”和“杂环的”还包括具有两个或更多个环的多环系统，其中两个或更多个碳是两个相邻环共有的，其中至少一个环是杂环的，例如，其他环可以是环烷基、环烯基、芳基、杂芳基和/或杂环基。杂环基包括例如哌啶、哌嗪、吡咯烷、四氢吡喃、四氢呋喃、吗啉、内酯、内酰胺等。
如本文所用，术语“杂环基烷基”或“杂环烷基”是指被杂环基团取代的烷基。
如本文所用，术语“烃基”是指通过不具有＝O或＝S取代基的碳原子键合的基团，并且通常具有至少一个碳-氢键和主要为碳的主链，但是可以任选地包含杂原子。因此，出于本申请的目的，诸如甲基、乙氧基乙基、2-吡啶基和三氟甲基的基团被认为是烃基，但是诸如乙酰基(其在连接碳上具有＝O取代基)和乙氧基(其通过氧而不是碳连接)的取代基不被认为是烃基。烃基包括但不限于芳基、杂芳基、碳环、杂环基、烷基、烯基、炔基以及它们的组合。
如本文所用，术语“羟基烷基”是指被羟基取代的烷基。
当与化学部分如酰基、酰氧基、烷基、烯基、炔基或烷氧基结合使用时，术语“低级”意在包括其中在取代基中存在十个或更少、优选六个或更少非氢原子的基团。例如，“低级烷基”是指含有十个或更少，优选六个或更少的碳原子的烷基。在某些实施方案中，本文所定义的酰基、酰氧基、烷基、烯基、炔基或烷氧基取代基分别是低级酰基、低级酰氧基、低级烷基、低级烯基、低级炔基或低级烷氧基，无论它们是单独出现还是与其他取代基组合出现，诸如在叙述羟基烷基和芳烷基中(在这种情况下，例如，当计算烷基取代基中的碳原子时，不计算芳基内的原子)。
术语“多环基”、“多环”和“多环的”是指两个或更多个环(例如，环烷基、环烯基、芳基、杂芳基和/或杂环基)，其中两个或更多个原子是两个相邻环共用的，例如，环是“稠合环”。多环的每个环可以是取代或未取代的。在某些实施方案中，多环的每个环在环中含有3至10个原子，优选5至7个原子。
术语“甲硅烷基”是指具有三个与其连接的烃基部分的硅部分。
术语“取代的”是指在主链的一个或多个碳上具有置换氢的取代基的部分。应理解，“取代”或“被……取代”包括隐含的条件，即这种取代是根据取代原子和取代基的允许化合价，并且所述取代产生稳定的化合物，例如，其不会自发地进行诸如通过重排、环化、消除等的转化。如本文所用，术语“取代的”考虑包括有机化合物的所有可允许的取代基。在广义方面，可允许的取代基包括有机化合物的非环状的和环状的、支链的和非支链的、碳环的和杂环的、芳族的和非芳族的取代基。可允许的取代基可以是一个或多个取代基并且对于适当的有机化合物而言是相同或不同的。出于本发明的目的，杂原子诸如氮可以具有氢取代基和/或本文所述的有机化合物的满足杂原子的化合价的任何可允许的取代基。取代基可包括本文所述的任何取代基，例如卤素、羟基、羰基(诸如羧基、烷氧基羰基、甲酰基或酰基)、硫代羰基(诸如硫代酸酯、硫代乙酸酯或硫代甲酸酯)、烷氧基、磷酰基、磷酸基团、膦酸基团、次膦酸基团、氨基、酰胺基、脒、亚胺、氰基、硝基、叠氮基、巯基、烷硫基、硫酸基团、磺酸基团、磺酰胺基、亚磺酰胺基、磺酰基、杂环基、芳烷基或芳族或杂芳族部分。在优选的实施方案中，取代烷基上的取代基选自C1-6烷基、C3-6环烷基、卤素、羰基、氰基或羟基。在更优选的实施方案中，取代烷基上的取代基选自氟代、羰基、氰基或羟基。本领域的技术人员将理解，在适当的情况下取代基本身可被取代。除非具体地说明为“未取代的”，否则对本文的化学部分的提及应被理解为包括取代的变体。例如，提及“芳基”基团或部分隐含地包括取代的和未取代的变体。
术语“硫酸根”是本领域公认的，并且是指基团-OSO3H或其药学上可接受的盐。
术语“磺酰胺”是本领域公认的，并且是指由以下通式表示的基团
其中每个RA独立地表示氢或烃基，诸如烷基，或两个RA与居间原子合在一起形成在环结构中具有4至8个原子的杂环。
术语“亚砜”是本领域公认的，并且是指基团-S(O)-RA，其中RA表示烃基。
术语“磺酸酯”是本领域公认的，并指基团SO3H或其药学上可接受的盐。
术语“砜”是本领域公认的，并且是指基团-S(O)2-RA，其中RA表示烃基。
如本文所用，术语“硫代烷基”是指被硫醇基团取代的烷基。
如本文所用，术语“硫酯”是指基团-C(O)SRA或-SC(O)RA，其中RA表示烃基。
如本文所用，术语“硫醚”等同于醚，其中氧被硫替换。
术语“脲”是本领域公认的并且可以由以下通式表示
其中每个RA独立地表示氢或烃基，诸如烷基，或任何出现的RA与另一个和居间原子合在一起形成在环结构中具有4至8个原子的杂环。
“保护基团”是指当连接至分子中的反应性官能团时掩蔽、降低或防止所述官能团的反应性的原子团。通常，可在合成过程中根据需要选择性地除去保护基团。保护基团的实例可在Greene和Wuts,Protective Groups in Organic Chemistry,第3版,1999,JohnWiley&Sons,NY以及Harrison等人,Compendium of Synthetic Organic Methods,第1-8卷,1971-1996,John Wiley&Sons,NY中找到。代表性氮保护基团包括但不限于甲酰基、乙酰基、三氟乙酰基、苄基、苄氧羰基(“CBZ”)、叔丁氧羰基(“Boc”)、三甲基甲硅烷基(“TMS”)、2-三甲基甲硅烷基-乙磺酰基(“TES”)、三苯甲基和取代的三苯甲基、烯丙氧基羰基、9-芴基甲基氧基羰基(“FMOC”)、硝基-藜芦基氧基羰基(“NVOC”)等。代表性羟基保护基团包括但不限于羟基被酰化(酯化)或烷基化的那些，诸如苄基和三苯甲基醚，以及烷基醚、四氢吡喃基醚、三烷基甲硅烷基醚(例如，TMS或TIPS基团)、乙二醇醚如乙二醇和丙二醇衍生物以及烯丙基醚。
如本文所用，“预防”疾病、病症或病状或“降低其发展风险”的治疗剂是指化合物，其在统计学样品中，相对于未治疗的对照样品降低所治疗样品中的疾病、病症或病状的发生率，或者相对于未治疗的对照样品延迟病症或病状的一种或多种症状的发作或降低其严重程度。
术语“治疗”包括预防性和/或治疗性治疗。术语“预防性或治疗性”治疗是本领域公认的，并且包括向宿主施用一种或多种主题组合物。如果在不想要的病状(例如宿主动物的疾病或其他不想要的状态)的临床表现之前施用治疗，则所述治疗是预防性的(即，其保护宿主免于发展不想要的加混)，而如果在不想要的病状的表现之后施用治疗，则所述治疗是治疗性的(即，意图减轻、改善或稳定现有的不想要的病状或其副作用)。
短语“联合施用”和“联合地施用”是指两种或更多种不同治疗性化合物的任何施用形式，使得在事先施用的治疗性化合物在体内仍有效时施用第二化合物(例如，两种化合物在患者中同时生效，其可包括两种化合物的协同作用)。例如，不同治疗性化合物可以相同配制物或以单独配制物同时或连续地施用。在某些实施方案中，不同治疗性化合物彼此可在一小时、12小时、24小时、36小时、48小时、72小时或一周内施用。因此，接受这种治疗的个体可受益于不同治疗性化合物的组合作用。
术语“前药”旨在涵盖在生理条件下转化为本发明的治疗活性剂的化合物。用于制备前药的常用方法是包括在生理条件下水解以显示所需分子的一个或多个选定部分。在其他实施方案中，前药通过宿主动物的酶活性转化。例如，酯或碳酸酯(例如，醇或羧酸的酯或碳酸酯)是本发明的优选前药。在某些实施方案中，以上表示的制剂中的一些或所有本发明化合物可替换为对应的合适的前药，例如其中母体化合物中的羟基呈现为酯或碳酸酯，或母体化合物中存在的羧酸呈现为酯。
如本文所用，“小分子”是指分子量低于约3,000道尔顿的有机或无机小分子。通常，可用于本发明的小分子具有小于3,000道尔顿(Da)的分子量。小分子可以是例如至少约100Da至约3,000Da(例如，约100至约3,000Da、约100Da至约2500Da、约100Da至约2,000Da、约100Da至约1,750Da、约100Da至约1,500Da、约100Da至约1,250Da、约100Da至约1,000Da、约100Da至约750Da、约100Da至约500Da、约200Da至约1500Da、约500Da至约1000Da、约300Da至约1000Da、或约100Da至约250Da)。
在一些实施方案中，“小分子”是指通常具有小于约1000的分子量的有机、无机或有机金属化合物。在一些实施方案中，小分子是大小为约1nm的有机化合物。在一些实施方案中，本发明的小分子药物涵盖具有小于约1000的分子量的寡肽和其他生物分子。
“有效量”是指足以产生有益或期望结果的量。例如，治疗量是实现期望治疗性作用的量。该量可与预防有效量相同或不同，该预防有效量是预防疾病或疾病状状发作所必需的量。有效量可在一次或多次施用、应用或剂量中施用。组合物的治疗有效量取决于所选择的组合物。组合物可每天一次或多次至每周一次或多次施用；包括每隔一天一次施用。本领域技术人员将理解，某些因素可影响有效治疗受试者所需的剂量和时间安排，包括但不限于疾病或病症的严重程度、先前的治疗、受试者的一般健康状况和/或年龄、以及存在的其他疾病。此外，用治疗有效量的本文所述的组合物治疗受试者可包括单一治疗或一系列治疗。
本发明的化合物
本发明的一个方面提供了治疗特征在于异常CDK5过度活性的疾病或病状的方法，其包括向有需要的受试者施用治疗有效量的本文公开的化合物的步骤。在一些实施方案中，化合物是CDK5的小分子抑制剂。
在某些实施方案中，化合物具有结构式(I):
环A是单环或双环环烷基或单环或双环饱和杂环基；
环B是单环或双环芳基、单环或双环杂芳基、或单环或双环杂环基；
R1为-N(R5)-、-C(O)-、-S-、-S(O)-、-S(O)2-、-[C(R4)2]1-2-、-[C(R4)2]0-1-CH＝、-N(R5)-S(O)2-、-S(O)2-N(R5)、-C(R4)2-N(R5)-、-N(R5)-C(R4)2-、-C(R4)2-S(O)2-、-C(＝N-OH)-、-C(＝N-O-C1-C4烷基)-或-S(O)2-C(R4)2-；
每个R2独立地是卤代、-OH、-C1-C6烷基、-C1-C6卤代烷基、-C1-C6羟基烷基、-(C0-C4亚烷基)-C(O)-OH、-(C0-C4亚烷基)-C(O)-O-C1-C4烷基、-(C0-C4亚烷基)-O-C1-C4烷基、-(C0-C4亚烷基)-O-C1-C4羟基烷基、-(C0-C4亚烷基)-C(O)-N(R6)2、-(C0-C4亚烷基)-N(R6)2或
-(C0-C4亚烷基)-饱和杂环基，其中所述饱和杂环基任选地被卤代、-OH或-CH3取代；
每个R3独立地是卤代；-CN；-OH；-N(R6)2；-C1-C4烷基；-O-C1-C4烷基；-O-C1-C4亚烷基-C(O)-N(R6)2；-C(O)-O-C1-C4烷基；-C(O)-N(R6)2；-S(O)2-N(R6)2；-S(O)2-C1-C4烷基；任选地被一个或多个-OH取代的C2-C4炔基；1,2,4-三唑-1-基甲基；吗啉基甲基；环丙基；＝O；-CH2CH2-C(O)-O-CH3；-N(R6)-S(O)2-CH3；任选地取代的芳基；任选地取代的杂芳基；或任选地取代的杂环基，其中R3的任何烷基部分任选地被卤代、-CN或-N(R6)2或-OH中的一个或多个取代；
每个R4独立地是氢、卤代、-OH、-CN、-N(R6)2、任选地被-OH、卤代、-CN或-N(R6)2中的一个或多个取代的-C1-C4烷基；或任选地被-OH、卤代、-CN或-N(R6)2中的一个或多个取代的O-C1-C4烷基；
或者一个R4与环A中的环碳原子一起形成与环A螺稠合、稠合或桥连的环烷基或杂环基环；
或者键合至同一碳原子的两个R4一起形成＝CH2-(C0-C3烷基)、C3-C6环烷基或C4-C7杂环基；
R5是氢；任选地被-CN、-OH、-COOH、C(O)-O-C1-C4烷基或吡唑基中的一个或多个取代的C1-C4烷基；-S(O)2-C1-C4烷基；-C(O)C(O)OH；-COOH；或-C(O)-O-C1-C4烷基；
或者R5与环A中的环碳原子一起形成与环A螺稠合、稠合或桥连的杂环基环；
每个R6独立地是氢或-C1-C4烷基；
m是0、1、2、3、4、5或6；
n是0、1、2、3、4、5或6；并且
“----”表示单键或双键。
在式I的一些实施方案中，每个R3独立地是卤代；-CN；-OH；-N(R6)2；-C1-C4烷基；-O-C1-C4烷基；-O-C1-C4亚烷基-C(O)-N(R6)2；-C(O)-O-C1-C4烷基；-C(O)-N(R6)2；-S(O)2-N(R6)2；-S(O)2-C1-C4烷基；任选地取代的芳基；任选地取代的杂芳基；或任选地取代的杂环基，其中R3的任何烷基部分任选地被卤代、-CN或-N(R6)2或-OH中的一个或多个取代。
在某些实施方案中，环B是苯基、-C(O)-苯基、1,3,4-噻二唑-2-基、咪唑并[1,2-b]哒嗪-3-基、异噁唑-3-基、1,3-二氢异苯并呋喃-5-基、2H-色烯-6-基、1,2,3,4-四氢异喹啉-6-基、1,2,3,4-四氢异喹啉-7-基、异吲哚啉-5-基、1,2-二氢吡啶-3-基、1,2-二氢吡啶-5-基、吡啶基或嘧啶基。
在某些实施方案中，至少一个R3为氟、氯、-OH、＝O、-CH3、-CH2CH3、-C(CH3)3、-CH(CH3)2、-CN、-CH2CH2-C(O)-O-CH3、-C(O)-O-CH2CH3、-OCH3、-O-CH2CH2-C(O)-N(R6)2、-N(R6)2、-CH2-N(R6)2、-S(O)2-N(R6)2、-N(R6)-S(O)2-CH3、-S(O)2CH3、-C(O)-N(R6)2、-C((CH3)2)-OH、-C≡C-C((CH3)2)-OH或-CH2CN。
在某些实施方案中，至少一个R3是1,2,4-三唑-1-基、1,2,4-三唑-1-基甲基、1,2,3,4-四唑-1-基、1,2,3,4-四唑-5-基、1,2,4-噁二唑-3-基、1,2-二氢吡啶-6-基、1,2-二氢吡啶-3-基、1,2-二氢吡啶-5-基、1,2-二氢吡啶-1-基、4,5-二氢-1,2,4-噁二唑-3-基、异噻唑烷-2-基、吡唑基、吡嗪-2-基、吡啶-2-基、吡啶-3-基、吡啶-4-基、嘧啶-4-基、吡咯烷-1-基、吗啉-4-基、吗啉-4-基甲基、硫代吗啉-4-基、哌啶-1-基、哌嗪-1-基、四氢吡喃-4-基、噁唑烷-3-基、咪唑烷-1-基、环丙基或苯基，其中至少一个R3任选地且独立地被多至3个独立地选自以下的取代基取代：卤代、＝O、-OH、CN、C1-C4烷基、C1-C4羟基烷基、C1-C4卤代烷基、-COOH、-C(O)-N(R6)2、-(C0-C4亚烷基)-C(O)-O-C1-C4烷基或-O-C1-C4烷基。
在某些实施方案中，化合物的由
表示的部分为：1,3-二氢异苯并呋喃-5-基、1-氟-2-甲基异吲哚啉-6-基、1-氧代-1,2,3,4-四氢异喹啉-6-基、1-氧代-1,2,3,4-四氢异喹啉-7-基、2-(1-羟基-1-甲基乙烷-1-基)吡啶-5-基、2-(吗啉-4-基)苯基、2-氟-4-(1,2,4-噁二唑-3-基)苯基、2-氟-4-(1,2,4-三唑-1-基甲基)苯基、2-氟-4-(1-乙基-2-氧代-1,2二氢吡啶-3-基)苯基、2-氟-4-(1-甲基-2-氧代-1,2-二氢吡啶-3-基)苯基、2-氟-4-(1-甲基-2-氧代-1,2-二氢吡啶-5-基)苯基、2-氟-4-(1-甲基-2-氧代-1,2-二氢吡啶-6-基)苯基、2-氟-4-(2-氨甲酰基苯基)苯基、2-氟-4-(2-氰基苯基)苯基、2-氟-4-(2-乙氧基羰基苯基)苯基、2-氟-4-(2-甲氧基吡啶-3-基)苯基、2-氟-4-(2-甲氧基吡啶-4-基)苯基、2-氟-4-(2-甲氧基吡啶-5-基)苯基、2-氟-4-(2-甲氧基吡啶-6-基)苯基、2-氟-4-(2-氧代-1,2-二氢吡啶-1-基)苯基、2-氟-4-(2-氧代-1,2-二氢吡啶-3-基)苯基、2-氟-4-(2-氧代-1,2-二氢吡啶-5-基)苯基、2-氟-4-(2-氧代-1,2-二氢吡啶-6-基)苯基、2-氟-4-(2-氧代-3-甲基咪唑烷-1基)苯基、2-氟-4-(3-(1-羟基-1-甲基乙烷-1-基)吡唑-1-基)苯基、2-氟-4-(3-氨甲酰基苯基)苯基、2-氟-4-(3-氨甲酰基吡唑-1-基)苯基、2-氟-4-(3-羧基苯基)苯基、2-氟-4-(3-羧基吡唑-1-基)苯基、2-氟-4-(3-氰基苯基)苯基、2-氟-4-(3-氰基吡唑-1-基)苯基、2-氟-4-(3-乙氧基羰基苯基)苯基、2-氟-4-(3-氟苯基)苯基、2-氟-4-(3-羟基甲基吡唑-1-基)苯基、2-氟-4-(3-甲氧基羰基吡唑-1-基)苯基、2-氟-4-(3-甲氧基苯基)苯基、2-氟-4-(3-甲氧基吡嗪-2-基)苯基、2-氟-4-(3-甲基氨甲酰基吡唑-1-基)苯基、2-氟-4-(3-甲基苯基)苯基、2-氟-4-(3-N,N-二甲基氨甲酰基吡唑-1-基)苯基、2-氟-4-(4-氨甲酰基苯基)苯基、2-氟-4-(4-羧基吡唑-1-基)苯基、2-氟-4-(4-氰基苯基)苯基、2-氟-4-(4-氰基吡唑-1-基)苯基、2-氟-4-(4-乙氧基羰基苯基)苯基、2-氟-4-(4-氟苯基)苯基、2-氟-4-(4-甲氧基羰基吡唑-1-基)苯基、2-氟-4-(4-甲氧基苯基)苯基、2-氟-4-(4-甲基苯基)苯基、2-氟-4-(5-氰基吡啶-2-基)苯基、2-氟-4-(5-羟基甲基吡唑-1-基)苯基、2-氟-4-(5-氧代-4,5-二氢-1,2,4-噁二唑-3-基)苯基、2-氟-4-(吗啉-4-基甲基)苯基、2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基、2-氟-4-(吡唑-3-基)苯基、2-氟-4-(吡啶-3-基)苯基、2-氟-4-(吡啶-4-基)苯基、2-氟-4-(嘧啶-5-基)苯基、2-氟-4-甲基苯基、2-氟-5-(1-甲基-2-氧代-1,2-二氢吡啶-3-基)苯基、2-氟-5-(2-氧代吡咯烷-1-基)苯基、2-氟-5-(吗啉-4-基)苯基、2-氟-5-乙基苯基、2-氟苯基、2-羟基吡啶-3-基、2-甲基-4-(2-氨甲酰基乙氧基)苯基、2-甲基-4-(2-氧代吡咯烷-1-基)苯基、2-甲基-4-异丙基氨甲酰基苯基、2-甲基苯基、2-氧代-1,2-二氢吡啶-4-基、2-氧代-1,2-二氢吡啶-5-基、2-氧代-2H-色烯-6-基、3-(1,2,3,4-四唑-1-基)苯基、3-(2-氧代咪唑烷-1-基)苯基、3-(2-氧代-噁唑烷-3-基)苯基、3-(2-氧代吡咯烷-1-基)苯基、3-(3-羟基-3-甲基丁-1-炔-1-基)苯基、3-(4-甲基哌嗪-1-基)苯基、3-(氨基磺酰基)苯基、3-(氰基甲基)苯基、3-(乙氧基羰基)苯基、3-(甲基磺酰基)苯基、3-(吗啉-4-基)苯基、3-(吗啉-4-基甲基)苯基、3,5-二甲基苯基、3-氨基苯基羰基、3-氨甲酰基苯基、3-氰基苯基、3-环丙基苯基、3-乙基苯基、3-甲氧基-4-甲基磺酰基氨基苯基、3-甲基苯基、4-(1,1-二氧代异噻唑烷-2-基)苯基、4-(1,1-二氧代硫代吗啉-4-基)苯基、4-(1,2,3,4-四唑-5-基)苯基、4-(1,2,4-三唑-1-基)苯基、4-(2-甲氧基嘧啶-4-基)苯基、4-(2-氧代-噁唑烷-3-基)苯基、4-(3-氧代吗啉-4-基)苯基、4-(3-氧代哌嗪-1-基)苯基、4-(4-羟基哌啶-1-基)苯基、4-(4-甲基哌嗪-1-基)苯基、4-(4-甲基哌啶-1-基)苯基、4-(5-氧代-4,5-二氢-1,2,4-噁二唑-3-基)苯基、4-(吗啉-4-基)苯基、4-(吗啉-4-基甲基)苯基、4-(N,N-二甲基氨基甲基)苯基、4-(N,N-二甲基氨基磺酰基)苯基、4-(吡咯烷-1-基)苯基、4-(四氢吡喃-4-基)苯基、4-氰基甲基苯基、4-二甲基氨基苯基、4-异丙基苯基、4-甲基氨甲酰基苯基、4-甲基苯基、4-甲基磺酰基苯基、4-叔丁基苯基、5-(2-甲氧基羰基乙烷-1-基)-1,3,4-噻二唑-2-基、5-甲氧基吡啶-3-基、7-氯咪唑并[1,2-b]哒嗪-3-基、异噁唑-3-基、苯基或嘧啶-5-基。
在某些实施方案中，环A是哌啶基、哌啶亚基、哌嗪基、吡咯烷基、氮杂环丁烷基、环己基、环戊基、环丁基、氮杂双环[3.3.1]壬烷基或氮杂双环[2.2.1]庚烷基。
在某些实施方案中，每个R2独立地是-F、-OH、-CH3、-CH2CH3、-CH2CF3、-CH2CH2OH、-CH2CH(OH)CH2OH、-CH(CH3)2、-CH(CH3)-COOH、-COOH、-NH2、-NH(CH3)、-N(CH3)2-CH2C(O)NH2或氧杂环丁烷-3-基甲基。
在某些实施方案中，化合物的由
表示的部分为：1-(2,2,2-三氟乙基)哌啶-4-基、1-(2-羟乙基)哌啶-4-基、
1-(2,3-二羟基丙基)哌啶-4-基、1-(氨甲酰基甲基)哌啶-4-基、
1-(氧杂环丁烷-3-基甲基)哌啶-4-基、1,3-二甲基哌啶-4-基、
1,4-二甲基哌啶-4-基、1-乙基哌啶-4-基、1-异丙基哌啶-4-基、
1-甲基-1-氧代哌啶-4-基、1-甲基-3,3-二氟哌啶-4-基、
1-甲基-4-羟基哌啶-4-基、1-甲基哌啶-4-基、1-甲基哌啶-4-亚基、1-甲基吡咯烷-3-基、2-氮杂双环[2.2.1]庚烷-5-基、2-甲基哌啶-4-基、
3,3-二氟哌啶-4-基、3-氨基环丁基、3-氨基吡咯烷-1-基、
3-氨基哌啶-1-基、3-羧基哌啶-4-基、3-甲基哌啶-4-基、
4-(二甲基氨基)环己基、4-(甲基氨基)环己基、
4-氨基-4-甲基环己基、4-氨基环己基、4-羟基环己基、
4-羟基哌啶-4-基、4-甲基哌嗪-1-基、9-氮杂双环[3.3.1]壬烷-3-基、氮杂环丁烷-3-基、哌嗪-1-基、哌啶-4-基或哌啶-4-亚基。
在某些实施方案中，R1为-N(CH3)-、-NH-、-N(CH2CH2OH)-、-N(CH2COOH)-、-N(CH2CH2COOH)-、-N(S(O)2CH3)-、-N(C(O)C(O)OH)-、-C(O)-、-S-、-S(O)-、-S(O)2-、-C(CH3)(OH)-、-C(CH3)(F)-、-C(CH2CH3)(OH)-、-C(CF3)(OH)-、-CH(CH3)-、-CH(CH2CH3)-、-CH(OH)-、-CH(CH2OH)-、-CH(＝CH2)-、-C(＝N-OH)、-C(＝N-OCH3)、-CF2-、-CHF-、-CH(OCH3)-、-CH＝、-CH2-、-CH(NH2)-、-CH(NHCH3)-、-NH-S(O)2-、-N(CH2CN)-、-S(O)2-NH-、-N(CH2COOCH3)-、-CH2-S(O)2-、-N(CH(CH3)COOH)-、吡唑-4-基甲基亚氨基、环丙烷-1,1-二基和氧杂环丁烷-2,2-二基。
在某些实施方案中，化合物具有结构式(Ia)：
环B’为苯基、吡啶-3-基或1,3-二氢异苯并呋喃-5-基；
R11为-S-、-S(O)2-、-CF2-、-C(F)(CH3)-、-C(OH)(CH3)-、-CH(CH3)-或-C(O)-；
R12a是氢、-CH3、-CH2CH2OH或氧杂环丁烷-3-基甲基；
R12b是氢或-CH3；
每个R13如果存在的话独立地是氟；任选地被-CN和-OH中的一个或多个取代的C1-C4烷基；任选地被一个或多个-OH取代的C2-C4炔基；-C(O)N(R6)2；-C(O)O-C1-C4烷基；-N(R6)2；-S(O)2N(R6)2；-SO2-C1-C4烷基；任选地被氟、-CN、-C(O)N(R6)、-COOH、-O-C1-C4烷基和C1-C4羟基烷基中的一个或多个取代的苯基；任选地被一个或多个O-C1-C4烷基取代的吡啶基；任选地被-COOH、C1-C4羟基烷基、-C(O)O-C1-C4烷基中的一个或多个取代的吡唑基；任选地被O-C1-C4烷基取代的嘧啶基；氧代取代的1,2-二氢吡啶基；任选地被C1-C4烷基进一步取代的氧代取代的吡唑烷基；氧代取代的噁唑烷基；氧代取代的吡咯烷基；氧代取代的噻唑烷基；氧代取代的硫代吗啉基；吗啉基；或环丙基；
每个R6独立地是氢或C1-C4烷基；并且
p是0、1或2。
在某些实施方案中，p为2，并且一个R13为氟。
在某些实施方案中，环B为苯基。
在某些实施方案中，每个R13独立地是氟、-CH3、-CH2CH3、-CH2CN、
-CH(CH3)2、-C≡C-C(CH3)2OH、-C(OH)(CH3)CH3、-C(CH3)3、-C(O)NH2、-C(O)OCH2CH3、-N(CH3)2、-S(O)2NH2、-SO2CH3、1,1-二氧代噻唑烷-2-基、1,1-二氧代硫代吗啉-4-基、2-氰基苯基、2-甲氧基吡啶-4-基、2-甲氧基吡啶-5-基、2-甲氧基嘧啶-4-基、2-氧代-1,2-二氢吡啶-6-基、2-氧代-1,2-二氢吡啶-3-基、2-氧代-3-甲基吡唑烷-1-基、2-氧代噁唑-3-基、2-氧代吡咯烷-1-基、3-氨甲酰基苯基、3-羧基苯基、3-羧基吡唑-1-基、3-氰基苯基、3-氟苯基、3-羟基甲基吡唑-1-基、3-甲氧基苯基、4-羧基吡唑-1-基、4-氰基苯基、4-甲氧基羰基吡唑-1-基、4-甲氧基苯基、吗啉-4-基、吡唑-1-基、吡唑-3-基、吡啶-3-基、嘧啶-5-基或环丙基。
在某些实施方案中，化合物具有结构式(Ib):
R21为-CH(CH3)-、-CH(OH)-、-C(CH3)(OH)-、C(＝CH2)-、
N(CH2C(O)OH)-、-S-或-S(O)2-；
R22是氢、-CH3、-CH2CH3、-CH2CH2OH或氮杂环丁烷-3-基甲基；
每个R23独立地是氟；C1-C4烷基；任选地被羟基取代的C2-C4炔基；-N(R6)2；-O-C1-C4亚烷基-C(O)-N(R6)2；任选地被卤代、-CN、C1-C4烷基、-O-C1-C4烷基、-C(O)N(R6)2和-C(O)-C1-C4烷基中的一个或多个取代的苯基；任选地被-O-C1-C4烷基取代的吡啶基；任选地被-CN、-C1-C4烷基、-C1-C4羟基烷基、-C(O)N(R6)2、-COOH和-C(O)-O-C1-C4烷基中的一个或多个取代的吡唑基；氧代取代的噁二唑基；吗啉基；吗啉基甲基；四氢吡喃基；吡咯烷基；嘧啶基；四唑基；任选地被C1-C4烷基取代的哌啶基；或环丙基；并且
q为1或2。
在某些实施方案中，q为2；并且一个R23为-CH3或氟。
在某些实施方案中，每个R23独立地是氟、-CH3、-CH2CH3、-CH(CH3)2、C≡C-C((CH3)2)OH、-N(CH3)2、-OCH2CH2C(O)NH2、1,2,3,4-四唑-5-基、2-甲氧基吡啶-3-基、2-甲氧基吡啶-4-基、2-甲氧基吡啶-5-基、2-甲氧基吡啶-6-基、3-(N,N-二甲基氨甲酰基)吡唑-1-基、3-氨甲酰基苯基、3-氨甲酰基吡唑-1-基、3-羧基吡唑-1-基、3-氰基苯基、3-氰基吡唑-1-基、3-乙氧基羰基苯基、3-氟苯基、3-羟基甲基吡唑-1-基、3-甲氧基羰基吡唑-1-基、3-甲氧基苯基、3-甲基苯基、4-氨甲酰基苯基、4-氰基苯基、4-乙氧基羰基苯基、4-氟苯基、4-甲氧基羰基吡唑-1-基、4-甲氧基苯基、4-甲基苯基、4-甲基哌啶-1-基、5-氧代-1,2,4-噁二唑-3-基、环丙基、氟、吗啉-4-基、吗啉-4-基甲基、吡唑-1-基、吡啶-3-基、吡啶-4-基、嘧啶-5-基、吡咯烷-1-基或四氢吡喃-4-基。
在某些实施方案中，该化合物选自表1中化合物100-315中的任一种或其药学上可接受的盐。
在某些实施方案中，本发明的化合物可以是外消旋的。在某些实施方案中，本发明的化合物可富集一种对映异构体。例如，本发明的化合物可具有大于30％ee、40％ee、50％ee、60％ee、70％ee、80％ee、90％ee或甚至95％或更大ee。
本发明的化合物具有一个以上的立构中心。因此，本发明的化合物可富集一种或多种非对映异构体。例如，本发明的化合物可具有大于30％de、40％de、50％de、60％de、70％de、80％de、90％de或甚至95％或更大de。在某些实施方案中，本发明的化合物在一个或多个立体异构中心基本上具有一种异构构型，并且在其余立体异构中心具有多种异构构型。
在某些实施方案中，立构中心的对映异构体过量为至少40％ee、50％ee、60％ee、70％ee、80％ee、90％ee、92％ee、94％ee、95％ee、96％ee、98％ee或更大ee。
如本文所用，在无立体化学下绘出单键不指示化合物的立体化学。
如本文所用，切割键或粗体非楔形键指示相对的而不是绝对的立体化学构型(例如，不区分给定非对映异构体的对映异构体)。
如本文所用，切割键或粗体楔形键指示绝对的立体化学构型。
在一些实施方案中，本发明涉及包含本发明的化合物和药学上可接受的载体的药物组合物。在某些实施方案中，可富集本发明化合物的治疗性制剂或药物组合物以主要提供化合物的一种对映异构体。对映异构体富集的混合物可包含例如至少60mol％、或更优选地至少75mol％、90mol％、95mol％或甚至99mol％的一种对映异构体。在某些实施方案中，富集一种对映异构体的化合物基本上不含另一种对映异构体，其中基本上不含是指与例如组合物或化合物混合物中的该另一种对映异构体的量相比，所讨论的物质占小于10％、或小于5％、或小于4％、或小于3％、或小于2％、或小于1％。例如，如果组合物或化合物混合物包含98克的第一对映异构体和2克的第二对映异构体，那么可以说其含有98mol％的第一对映异构体和仅2％的第二对映异构体。
在某些实施方案中，可富集治疗性制剂或药物组合物以主要提供本发明化合物的一种非对映异构体。非对映异构体富集的混合物可包含例如至少60mol％、或更优选地至少75mol％、90mol％、95mol％或甚至99mol％的一种非对映异构体。
药物组合物
本发明的组合物和方法可以用于治疗有需要的受试者。在某些实施方案中，所述受试者是哺乳动物，诸如人或非人哺乳动物。当施用于受试者诸如人时，组合物或化合物优选以药物组合物形式施用，所述药物组合物包含例如本发明的化合物和药学上可接受的载体。药学上可接受的载体是本领域熟知的，并且包括例如水溶液，诸如水或生理缓冲盐水或其他溶剂或媒介物，诸如二醇类、甘油、油类诸如橄榄油或可注射的有机酯类。在优选的实施方案中，当此类药物组合物施用于人时，特别是用于侵入性施用途径(即，诸如规避通过上皮屏障的运输或扩散的注射或植入的途径)时，水溶液是无热原或基本上无热原的。可以选择赋形剂，例如以实现剂的延迟释放或选择性地靶向一种或多种细胞、组织或器官。药物组合物可以呈剂量单位形式，诸如片剂、胶囊(包括分散型胶囊和明胶胶囊)、颗粒剂、用于重构的冻干剂、散剂、溶液、糖浆剂、栓剂、注射剂等。所述组合物也可以存在于透皮递送系统中，例如皮肤贴剂。组合物也可以存在于适于局部施用的溶液，例如滴眼剂中。
药学上可接受的载剂可以含有生理上可接受的剂，所述剂例如起到稳定化合物(诸如本发明的化合物)、增加其溶解性或增加其吸收的作用。此类生理上可接受的剂包括例如碳水化合物，诸如葡萄糖、蔗糖或葡聚糖；抗氧化剂，诸如抗坏血酸或谷胱甘肽；螯合剂；低分子量蛋白质或其他稳定剂或赋形剂。药学上可接受的载体(包括生理上可接受的剂)的选择取决于(例如)组合物的施用途径。制剂或药物组合物可以是自乳化药物递送系统或自微乳化药物递送系统。药物组合物(制剂)也可以是脂质体或其他聚合物基质，其中可以掺入例如本发明的化合物。脂质体，例如包含磷脂或其他脂质的脂质体，是制造和施用相对简单的无毒的、生理上可接受的和可代谢的载体。
本文采用短语“药学上可接受的”指在合理医学判断范围内、适用于与受试者组织接触而没有过量毒性、刺激、过敏反应或其他问题或并发症、与合理的利益/风险比相称的那些化合物、材料、组合物和/或剂型。
“药学上可接受的盐”在本文中用于是指适用于治疗患者或与患者的治疗相容的酸加成盐或碱加成盐。
如本文所用，术语“药学上可接受的酸加成盐”意指所公开化合物的任何无毒的有机或无机盐。形成合适的盐的例示性无机酸包括盐酸、氢溴酸、硫酸和磷酸，以及金属盐诸如正磷酸一氢钠和硫酸氢钾。形成合适的盐的例示性有机酸包括一元羧酸、二元羧酸和三元羧酸，诸如乙醇酸、乳酸、丙酮酸、丙二酸、琥珀酸、戊二酸、富马酸、苹果酸、酒石酸、酒石氢酸、柠檬酸、抗坏血酸、马来酸、苯甲酸、苯乙酸、肉桂酸、水杨酸和磺基水杨酸以及磺酸，诸如对甲苯磺酸和甲磺酸。可以形成一元酸盐或二元酸盐，并且此类盐可以水合形式、溶剂化形式或基本上无水形式存在。通常，本文公开的化合物的酸加成盐更易溶于水和各种亲水性有机溶剂，并且与它们的游离碱形式相比，通常表现出更高的熔点。合适的盐的选择是本领域技术人员已知的。可以使用其他非药学上可接受的盐，例如草酸盐，例如，用于分离供实验室使用的本文公开的化合物，或用于随后转化为药学上可接受的酸加成盐。
如本文所用，术语“药学上可接受的碱加成盐”是指本文公开的任何酸化合物的任何无毒有机或无机碱加成盐。形成合适的盐的例示性无机碱包括氢氧化锂、氢氧化钠、氢氧化钾、氢氧化钙、氢氧化镁或氢氧化钡。形成合适的盐的例示性有机碱包括脂族、脂环族或芳族有机胺，诸如甲胺、三甲胺和甲基吡啶或氨。适当盐的选择将对本领域的技术人员是已知的。
本文采用的短语“药学上可接受的载体”意指药学上可接受的材料、组合物或媒介物，诸如液体或固体填充剂、稀释剂、赋形剂、溶剂或包封材料。每种载体在可与制剂的其他成分相容并且不损伤受试者的意义上必须是“可接受的”。可以用作药学上可接受的载体的材料的一些实例包括：(1)糖，诸如乳糖、葡萄糖以及蔗糖；(2)淀粉，诸如玉米淀粉和马铃薯淀粉；(3)纤维素和它的衍生物，诸如羧甲基纤维素钠、乙基纤维素以及乙酸纤维素；(4)黄芪胶粉；(5)麦芽；(6)明胶；(7)滑石；(8)赋形剂，诸如可可脂和栓剂蜡；(9)油，诸如花生油、棉籽油、红花油、芝麻油、橄榄油、玉米油以及大豆油；(10)二醇，诸如丙二醇；(11)多元醇，诸如甘油、山梨醇、甘露醇以及聚乙二醇；(12)酯，诸如油酸乙酯和月桂酸乙酯；(13)琼脂；(14)缓冲剂，诸如氢氧化镁和氢氧化铝；(15)褐藻酸；(16)无热原质水；(17)等渗盐水；(18)林格式溶液；(19)乙醇；(20)磷酸盐缓冲溶液；以及(21)药物制剂中采用的其他无毒相容性物质。
药物组合物(制剂)可以通过多种施用途径中的任一种施用给受试者，所述施用途径包括例如口服(例如，用于施加到舌的在水或非水溶液或混悬剂中的浸液、片剂、胶囊(包括分散型胶囊和明胶胶囊)、大丸剂、散剂、颗粒剂、糊剂)；通过口腔粘膜吸收(例如，舌下)；肛门、直肠或阴道(例如，作为阴道栓、乳膏或泡沫)；肠胃外(包括肌内、静脉内、皮下或鞘内，例如作为无菌溶液或悬浮液)；经鼻；腹膜内；皮下；经皮(例如作为贴片应用于皮肤)；以及局部施用(例如，作为应用于皮肤的乳膏、软膏或喷雾剂，或作为滴眼剂)。所述化合物还可以被配制成用于吸入。在某些实施方案中，化合物可以简单地溶解或混悬于无菌水中。适当的施用途径和适用于其的组合物的细节可以在例如美国专利号6,110,973、5,763,493、5,731,000、5,541,231、5,427,798、5,358,970和4,172,896以及其中引用的专利中找到。
制剂可以方便地以单位剂型存在并且可以通过药学领域中熟知的任何方法来制备。可与载体材料组合以产生单剂型的活性成分的量将根据被治疗的受试者、特定的施用方式而变化。可以与载体材料组合以制备单一剂型的活性成分的量通常将是产生治疗作用的化合物的量。一般来说，在一百份中，此量将在约1％至约99％活性成分的范围内，优选约5％至约70％，最优选约10％至约30％。
制备这些制剂或组合物的方法包括使活性化合物(诸如本发明的化合物)与载体和任选地一种或多种辅助成分缔合的步骤。一般来说，通过将本发明的化合物与液体载体、或精细分开的固体载体、或两者均匀且密切地缔合，然后必要时使产物成形来制备制剂。
适用于口服施用的本发明的制剂可呈以下形式：胶囊(包括分散型胶囊和明胶胶囊)、扁囊剂、丸剂、片剂、锭剂(使用经调味的基质，通常为蔗糖和阿拉伯胶或西黄蓍胶)、冻干剂、散剂、颗粒剂或作为水性液体或非水性液体中的溶液或混悬剂、或作为水包油或油包水乳剂、或作为酏剂或糖浆剂、或作为软锭剂(pastille)(使用惰性基质，诸如明胶和甘油，或蔗糖和阿拉伯胶)和/或为漱口剂等，每种均含有预定量的作为活性成分的本发明化合物。组合物或化合物还可以作为大丸剂、糖饵剂(electuary)或糊剂施用。
为了制备口服施用的固体剂型(胶囊(包括分散型胶囊和明胶胶囊)、片剂、丸剂、糖锭剂、散剂、颗粒剂等)，将所述活性成分与一种或多种药学上可接受的载体(诸如柠檬酸钠或磷酸二钙)和/或以下中的任何一种进行混合：(1)填充剂或增充剂，诸如淀粉、乳糖、蔗糖、葡萄糖、甘露醇、和/或硅酸；(2)粘合剂，例如像，羧甲基纤维素、海藻酸盐、明胶、聚乙烯吡咯烷酮、蔗糖和/或阿拉伯胶；(3)保湿剂，诸如甘油；(4)崩解剂，诸如琼脂、碳酸钙、马铃薯或木薯淀粉、海藻酸、某些硅酸盐、以及碳酸钠；(5)溶解延迟剂，诸如石蜡；(6)吸收加速剂，诸如季铵化合物；(7)润湿剂，例如像，鲸蜡醇和单硬脂酸甘油酯；(8)吸收剂，诸如高岭土和膨润土；(9)润滑剂，诸如滑石、硬脂酸钙、硬脂酸镁、固体聚乙二醇、月桂基硫酸钠及其混合物；(10)络合剂，诸如修饰和未修饰的环糊精；以及(11)着色剂。在胶囊(包括分散型胶囊和明胶胶囊)、片剂和丸剂的情况下，药物组合物还可包含缓冲剂。在使用赋形剂(诸如乳糖(lactose)或乳糖(milk sugar))以及高分子量聚乙二醇等的软质和硬质填充的明胶胶囊中还可采用相似类型的固体组合物作为填充剂。
片剂可通过任选地与一种或多种附属成分一起压缩或模制来制得。可以使用粘合剂(例如，明胶或羟丙基甲基纤维素)、润滑剂、惰性稀释剂、防腐剂、崩解剂(例如，羟基乙酸淀粉钠或交联羧甲基纤维素钠)、表面活性剂或分散剂来制备压缩片剂。模制片剂可以通过在合适的机器中模制用惰性液体稀释剂湿润的粉末状化合物的混合物来制备。
片剂和其他药物组合物的固体剂型诸如糖衣丸、胶囊(包括分散型胶囊和明胶胶囊)、丸剂和颗粒可任选地刻痕或用包衣和外壳，诸如肠溶包衣或药物配制领域熟知的其他包衣来制备。还可使用例如用于提供所需释放特征的不同比例的羟丙基甲基纤维素、其他聚合物基质、脂质体和/或微球将它们配制成用于提供其中所含活性成分的缓慢释放或受控释放。可以通过例如过滤通过截留细菌的滤膜或通过在使用前即刻掺入呈可以溶于无菌水或一些其他无菌可注射介质的无菌固体组合物形式的灭菌剂将它们灭菌。这些组合物还可任选地含有遮光剂并且可具有它们仅在或优先在胃肠道的某一部分中任选地以延迟方式释放活性成分的组成。可以使用的包埋组合物的实例包括聚合物质和蜡。所述活性成分还可以呈微囊化形式，在适当情况下，具有一种或多种上述赋形剂。
可用于口服施用的液体剂型包括药学上可接受的乳剂、用于重构的冻干剂、微乳剂、溶液、混悬剂、糖浆剂和酏剂。除活性成分以外，液体剂型可含有通常在本领域中使用的惰性稀释剂，例如像水或其他溶剂、环糊精及其衍生物、溶解剂和乳化剂诸如乙醇、异丙醇、碳酸乙酯、乙酸乙酯、苯甲醇、苯甲酸苄酯、丙二醇、1,3-丁二醇、油(具体地是棉籽油、花生油、玉米油、胚芽油、橄榄油、蓖麻油以及芝麻油)、甘油、四氢糠醇、聚乙二醇和山梨醇酐的脂肪酸酯及其混合物。
除了惰性稀释剂，所述口服组合物还可包含助剂，诸如润湿剂、乳化剂和助悬剂、甜味剂、矫味剂、着色剂、芳香剂和防腐剂。
除活性化合物以外，悬浮液还可含有悬浮剂，例如像乙氧基化异十八醇、聚氧乙烯山梨醇和脱水山梨醇酯、微晶纤维素、偏氢氧化铝、膨润土、琼脂和黄芪胶以及它们的混合物。
用于直肠、阴道或尿道施用的药物组合物的制剂可以作为栓剂存在，可以通过将一种或多种活性化合物与一种或多种合适的非刺激性赋形剂或载体(包括例如可可脂、聚乙二醇、栓剂蜡或水杨酸盐)混合来制备，并且所述栓剂在室温下为固体，但在体温下为液体，并且因此将在直肠或阴道腔中融化并释放活性化合物。
用于口腔施用的药物组合物的制剂可以作为漱口剂、或口腔喷雾剂、或口腔软膏存在。
或者或另外，组合物可被配制用于经由导管、支架、线或其他管腔内装置递送。通过此类装置的递送可尤其适用于递送到膀胱、尿道、输尿管、直肠或肠。
适于阴道施用的制剂还包括含有诸如本领域已知为适当的载体的阴道栓、棉塞、乳膏、凝胶、糊剂、泡沫或喷雾制剂。
用于局部或透皮施用的剂型包括散剂、喷雾剂、软膏、糊剂、乳膏、洗剂、凝胶剂、溶液、贴剂以及吸入剂。可以在无菌条件下将活性化合物与药学上可接受的载体以及与可能需要的任何防腐剂、缓冲剂、或推进剂进行混合。
除活性化合物以外，所述软膏、糊剂、乳膏和凝胶剂可含有赋形剂，诸如动物和蔬菜脂肪、油、蜡、石蜡、淀粉、黄蓍胶、纤维素衍生物、聚乙二醇、硅酮、膨润土、硅酸、滑石和氧化锌或其混合物。
除活性化合物以外，散剂和喷雾剂可含有赋形剂诸如乳糖、滑石、硅酸、氢氧化铝、硅酸钙和聚酰胺粉末或这些物质的混合物。喷雾剂可另外含有常规推进剂，诸如氯氟烃和挥发性未取代的烃(诸如丁烷或丙烷)。
透皮贴剂具有提供本发明化合物向身体的受控递送的附加优点。此类剂型还可通过将活性化合物溶解或分散于适当的介质中来制备。吸收增强剂也可以用于增加化合物穿过皮肤的通量。这种通量的速率可以通过提供速率控制膜或将化合物分散于聚合物基质或凝胶中来控制。
眼用制剂、眼膏、粉末、溶液等也被认为在本发明的范围内。示例性眼用制剂描述于美国公开号2005/0080056、2005/0059744、2005/0031697和2005/004074以及美国专利号6,583,124中，所述专利的内容以引用方式并入本文。如果需要，液体眼用制剂具有类似于泪液、房水或玻璃体液的性质，或者与此类流体相容。优选的施用途径是局部施用(例如，局部施用，如滴眼液，或通过植入物施用)。
如本文所用的短语“肠胃外施用”和“肠胃外地施用”意指除了肠内施用和局部施用以外的、通常通过注射进行的施用方式，并且包括但不限于静脉内、肌肉内、动脉内、鞘内、囊内、眼眶内、心内、真皮内、腹膜内、经气管、皮下、表皮下、关节内、眼内、囊下、蛛网膜下、脊柱内以及胸骨内注射和输注。
适合于肠胃外施用的药物组合物包含一种或多种活性化合物与一种或多种药学上可接受的无菌等渗水性溶液或非水性溶液、分散液、混悬剂或乳剂，或可在临使用前复原成无菌可注射溶液或分散液的无菌散剂的组合，所述组合可以含有抗氧化剂、缓冲剂、抑菌剂、使制剂与预期受体的血液等渗的溶质、或助悬剂或增稠剂。
可用于本发明的药物组合物中的合适的水性和非水性载体的实例包括水、乙醇、多元醇(诸如甘油、丙二醇、聚乙二醇等)和其合适的混合物、植物油(诸如橄榄油)和可注射有机酯(诸如油酸乙酯)。适当流动性可以例如通过使用包衣材料(诸如卵磷脂)、在分散液的情况下通过维持所需粒度以及通过使用表面活性剂加以维持。
这些组合物还可含有佐剂，诸如防腐剂、润湿剂、乳化剂和分散剂。可以通过包含各种抗细菌剂和抗真菌剂诸如对羟基苯甲酸酯、氯丁醇、苯酚、山梨酸等确保对微生物作用的预防。还可合乎需要的是在组合物中包含等渗剂，诸如糖、氯化钠等。另外，可通过包含延迟吸收的剂(诸如单硬脂酸铝和明胶)来实现可注射药物形式的延迟吸收。
在一些情况下，为了延长药物的效果，需要减缓皮下注射或肌肉内注射的药物的吸收。这可通过使用具有低水溶性的结晶或无定形材料的液态混悬剂来实现。药物的吸收速率则取决于其溶解速率，溶解速率进而可取决于晶体大小和晶形。可替代地，通过将药物溶解或混悬于油媒介物中来完成肠胃外施用的药物形式的延迟吸收。
可注射储库式形式是通过在诸如聚乳酸交酯-聚乙交酯等可生物降解聚合物中形成主题化合物的微囊化基质来制备。根据药物与聚合物的比率和所采用的特定聚合物的性质，可控制药物释放的速率。其他可生物降解聚合物的实例包括聚(原酸酯)和聚(酸酐)。还通过将药物包埋在与身体组织相容的脂质体或微乳液中来制备储库式可注射制剂。
为了用于本发明的方法，可本身或作为含有例如约0.1％至约99.5％(更优选约0.5％至约90％)的活性成分与药学上可接受的载体组合的药物组合物来提供活性化合物。
引入的方法也可由可再充电或可生物降解装置提供。关于药物(包括蛋白质生物制药)的受控递送，近年来已经开发了各种缓释聚合物装置并在体内进行了测试。包括可生物降解和不可降解的聚合物二者在内的多种生物相容性聚合物(包括水凝胶)可用于形成植入物，以在特定靶标部位持续释放化合物。
药物组合物中的活性成分的实际剂量水平可改变，以便获得对于特定患者、组合物以及施用模式有效实现所需治疗反应、而对患者无毒的活性成分的量。
选择的剂量水平取决于多种因素，包括使用的特定化合物或化合物的组合或其酯、盐或酰胺的活性、施用途径、施用时间、使用的特定化合物的排泄速率、治疗的持续时间、与使用的特定化合物组合使用的其他药物、化合物和/或材料、所治疗受试者的年龄、性别、体重、病状、综合的健康状态和先前的病史和在医学领域熟知的类似因素。
具有本领域中的普通技术的医师或兽医可容易地判定和开具治疗有效量的所需药物组合物。例如，医师或兽医可以低于为达成所需治疗效应所需水平的水平开始药物组合物或化合物剂量且逐渐增加剂量，直至达成所需效应。“治疗有效量”意指足以引起所需治疗效应的化合物的浓度。通常应理解，化合物的有效量将根据受试者的体重、性别、年龄和病史而变化。影响有效量的其他因素可以包括但不限于受试者病状的严重性、所治疗的病症、化合物的稳定性，以及需要时，与本发明的化合物一起施用的另一种类型的治疗剂。通过多次施用所述剂可以递送更大的总剂量。确定功效和剂量的方法是本领域技术人员已知的(Isselbacher等人(1996)Harrison’s Principles of Internal Medicine第13版,1814-1882,以引用方式并入本文)。
一般来说，用于本发明的组合物和方法中的活性化合物的合适日剂量将为化合物有效产生治疗作用的最低剂量的量。这种有效剂量将通常取决于上述因素。
需要时，活性化合物的有效日剂量可以任选地以单位剂型作为在全天内以适当间隔分开施用的一个、两个、三个、四个、五个、六个或更多个亚剂量来施用。在本发明的某些实施方案中，活性化合物可每天施用两次或三次。在某些实施方案中，活性化合物将每天施用一次。
在某些实施方案中，本发明的化合物可单独使用或与另一种类型的治疗剂联合施用。如本文所用，短语“联合施用”是指两种或更多种不同治疗性化合物的任何施用形式，使得在事先施用的治疗性化合物在体内仍有效时施用第二化合物(例如，两种化合物在受试者中同时生效，其可包括两种化合物的协同效应)。例如，不同治疗性化合物可以相同配制物或以单独配制物同时或连续地施用。在某些实施方案中，不同治疗性化合物彼此可在一小时、12小时、24小时、36小时、48小时、72小时或一周内施用。因此，接受这种治疗的受试者可受益于不同治疗性化合物的组合作用。
在某些实施方案中，本发明的化合物与一种或多种另外的治疗剂的联合施用相对于本发明的化合物或一种或多种另外治疗剂的各自单独施用提供改善的功效。在某些此类实施方案中，联合施用提供相加作用，其中相加作用是指单独施用本发明的化合物和一种或多种另外的治疗剂的每种作用的总和。
本发明包括本发明化合物的药学上可接受的盐在本发明的组合物和方法中的用途。在某些实施方案中，本发明所考虑的盐包括但不限于烷基、二烷基、三烷基或四烷基铵盐。在某些实施方案中，本发明所考虑的盐包括但不限于L-精氨酸、苯乙苄胺(benenthamine)、苄星(benzathine)、甜菜碱、氢氧化钙、胆碱、地阿诺(deanol)、二乙醇胺、二乙胺、2-(二乙氨基)乙醇、乙醇胺、乙二胺、N-甲基葡糖胺、海巴明(hydrabamine)、1H-咪唑、锂、L-赖氨酸、镁、4-(2-羟乙基)吗啉、哌嗪、钾、1-(2-羟乙基)吡咯烷、钠、三乙醇胺、氨丁三醇和锌盐。在某些实施方案中，本发明所考虑的盐包括但不限于Na、Ca、K、Mg、Zn或其他金属盐。
药学上可接受的酸加成盐也可以各种溶剂化物的形式存在，诸如与水、甲醇、乙醇、二甲基甲酰胺等的溶剂化物。也可以制备此类溶剂化物的混合物。此类溶剂化物的来源可以是来自结晶的溶剂，是制备或结晶的溶剂中固有的或者不溶于此类溶剂。
润湿剂、乳化剂和润滑剂诸如月桂基硫酸钠和硬脂酸镁以及着色剂、释放剂、包衣剂、甜味剂、矫味剂和芳香剂、防腐剂和抗氧化剂也可以存在于所述组合物中。
药学上可接受的抗氧化剂的实例包括：(1)水溶性抗氧化剂，诸如抗坏血酸、盐酸半胱氨酸、硫酸氢钠、焦亚硫酸钠、亚硫酸钠等；(2)油溶性抗氧化剂，诸如抗坏血酸棕榈酸酯、丁基化羟基茴香醚(BHA)、丁基化羟基甲苯(BHT)、卵磷脂、没食子酸丙酯、α-生育酚等；和(3)金属螯合剂，诸如柠檬酸、乙二胺四乙酸(EDTA)、山梨糖醇、酒石酸、磷酸等。
治疗方法
本文所述的化合物和组合物可用于治疗特征在于异常CDK5过度活性的疾病或病状，例如肾脏的疾病或病状或纤毛类疾病。施用CDK5抑制剂将显示出对与CDK5上调相关的治疗性适应症的益处(即，与健康组织相比，患病组织中CDK5蛋白的水平增加)。
在一些实施方案中，疾病或病状是肾脏的疾病或病状。在一些实施方案中，肾脏疾病或病状是囊性肾病、肾纤维化、糖尿病性肾病、实质性肾病或肾功能下降。在一些实施方案中，肾脏疾病或病状是慢性肾脏疾病、多囊性肾病、常染色体显性多囊性肾病、常染色体隐性多囊性肾病或肾消耗病-髓质囊性肾病。在一些实施方案中，疾病是多囊性肾病。
在一些实施方案中，疾病或病状是纤毛类疾病。在一些实施方案中，纤毛类疾病是神经退行性疾病、肝病、炎症、癌症或肿瘤。在一些实施方案中，神经退行性疾病是阿尔茨海默病或帕金森病。在一些实施方案中，肝病是多囊肝病。
肾脏疾病
肾脏疾病和病状包括但不限于肾衰竭(也称为晚期肾病或ESR D)、肾结石、多囊性肾病、囊性肾病、肾纤维化、糖尿病性肾病、实质性肾病、肾功能下降、慢性肾脏疾病、多囊性肾病、常染色体显性多囊性肾病、常染色体隐性多囊性肾病和肾消耗病-髓质囊性肾病。在美国，肾脏疾病的主要原因包括糖尿病、高血压和肾小球肾炎，肾小球肾炎是损害肾脏过滤单位肾小球的疾病。(https://www.kidney.org/atoz/content/kidneydiscauses)。
囊性肾病
囊性肾病是指一系列遗传性、发育性和获得性疾病。随着囊性变而包括肿瘤，已经确定了40多种分类和亚型。根据疾病的分类，疾病的表现可能从出生开始，或者进入成年后很晚才开始。囊性疾病可能涉及一个或两个肾脏，并可能出现或未出现其他异常。囊性肾病在男性人群中发病率较高，并且患病率随年龄增长而增加。据报道，超过50％的50岁以上的患者患有肾囊肿。通常，囊肿每年生长2.88mm，并引起相关疼痛和/或出血。
在囊性肾病中，最常见的是多囊肾；具有两种流行的亚型：常染色体隐性和常染色体显性多囊性肾病。常染色体隐性多囊性肾病(ARPKD)主要在婴儿和幼儿中诊断。常染色体显性多囊性肾病(ADPKD)最常在成人中诊断。
肾纤维化
纤维化病症是常见的，呈现多种形式，并且可能威胁生命。这种疾病最好的实例为随所有慢性肾病的进行性纤维化。肾纤维化是肾脏在损伤后再生能力有限的直接后果。肾瘢痕导致肾功能逐渐丧失，最终导致终末期肾衰竭并导致需要透析或肾移植。[Hewitson:Fibrosis in the kidney:is a problem shared a problem halved？Fibrogenesis&Tissue Repair 2012 5(Suppl 1):S14]。
实质性肾病
肾实质是肾的功能部分，包括肾皮质(肾的最外面部分)和肾髓质。肾皮质包含大约100万个肾单位(这些肾单位具有肾小球和肾小管，肾小球是血液通过肾脏的主要过滤器，肾小管改变流体以产生适当量/含量的尿液)。肾髓质主要由小管/导管组成，所述小管/导管是收集系统的起点，允许尿液向前流动以被排泄。肾实质疾病描述了损害肾脏这些部分的医学病状。这些疾病可能是先天性的、遗传性的或获得性的。原因多种多样，并且包括遗传病状，如多囊肾、父母遗传的遗传疾病、细菌和病毒感染、肾结石、高血压、糖尿病、自身免疫性疾病(如狼疮性肾炎或紫癜性肾炎)、药物治疗等。常见症状包括手/脚/眼睛肿胀(水肿)、高血压、贫血、骨骼变化、尿血、腹部肿胀。常见症状包括食欲不振、瘙痒、恶心呕吐、疲劳、关节痛、夜间尿频和头晕。[https://www.nicklauschildrens.org/conditions/renal-parenchyma-disease s]
慢性肾脏疾病
慢性肾脏疾病，也称为慢性肾衰竭，描述了肾功能的逐渐丧失。当慢性肾脏疾病发展到晚期时，液体、电解质和废物会在体内达到危险水平。慢性肾脏疾病可能不会变得明显，直到肾功能显著受损。慢性肾脏疾病的治疗集中于通常减缓肾脏损伤的进展，通过控制潜在的原因来进行。慢性肾脏疾病可以发展到终末期肾衰竭，不进行人工过滤(透析)或肾移植就会致命。当疾病或病状损害肾功能，导致肾脏损害在数月或数年内恶化时，就会发生慢性肾脏疾病。引起慢性肾脏疾病的疾病和病状包括但不限于糖尿病、高血压、肾小球肾炎、间质性肾炎、多囊性肾病、尿路长期阻塞(例如，由诸如前列腺肥大、肾结石和某些癌症的病状引起)、膀胱输尿管返流和复发性肾脏感染(也称为肾盂肾炎)。[https://www.mayoclinic.org/diseases-conditions/chronic-kidney-disease/symptoms-causes/syc-20354521]
肾消耗病-髓质囊性肾病
髓质囊性肾病(MCKD)和肾消耗病(NPH)是指两种具有相似肾脏形态学的遗传性疾病，其特征为尺寸正常或减小的肾脏的双侧小皮质髓质囊肿和导致终末期肾病的肾小管间质硬化(ESRD)。这些病症传统上被认为是复合体(NPH复合体)的一部分，因为它们共享许多临床和组织病理学特征。主要区别在于遗传方式、ESRD发病年龄和肾外表现。[https://emedicine.medscape.com/article/982359-overview]。
肾消耗病为影响儿童的肾脏遗传性病症。它被归类为髓质囊性肾病。这种病症以常染色体隐性方式遗传，并且虽然罕见，但却是儿童肾衰竭最常见的遗传原因。这是纤毛类疾病的一种形式。据估计，其发病率在美国为每百万人中有0.9例，并且在加拿大为每50,000名新生儿中有1例。已确定婴儿型、少年型和青少年型肾消耗病。虽然特征范围很广，但患有肾消耗病的人通常表现为多尿(产生大量尿液)、烦渴(摄入过量液体)，并在几个月至几年后出现终末期肾病，这是需要透析或肾移植才能存活的病状。一些患有肾消耗病的个体还具有所谓的“肾外症状”，可包括毯层视网膜变性、肝脏问题、眼运动失用症和锥形骨骺(萨尔迪诺-梅恩泽综合征(Saldino-Mainzer syndrome))。肾消耗病的机制表明，囊性肾病中突变的所有蛋白质都在初级纤毛中表达。NPHP基因突变导致信号传导缺陷，从而导致平面细胞极性的缺陷。纤毛理论表明NPHP(视网膜变性、小脑发育不全、肝纤维化和智力残疾)涉及多个器官。
髓质囊性肾病(MCKD)是一种常染色体显性肾脏病症，以肾小管间质硬化为特征，导致终末期肾脏疾病。因为囊肿的存在既不是所述疾病的早期诊断特征，也不是典型的诊断特征，并且因为至少4种不同的基因突变可能导致所述病状，所以提出了常染色体显性肾小管间质性肾脏疾病(ADTKD)的名称，附加特定个体的潜在遗传变异体。重要的是，如果在髓质集合管中发现囊肿，它们会导致肾脏萎缩，这与多囊性肾病不同。有两种已知形式的髓质囊性肾病，即粘蛋白-1肾脏疾病1(MKD1)和粘蛋白-2肾脏疾病/尿调节素肾脏疾病(MKD2)。这种疾病的第三种形式是由于编码肾素的基因(ADTKD-REN)发生突变而发生，并且以前被称为家族性青少年高尿酸血症肾病2型。就髓质囊性肾病的体征/症状而言，所述疾病不易诊断且不常见。在此病状中，肾功能丧失随着时间而缓慢发生，但是可以在受影响的个体中观察到以下体征/症状:烦渴、遗尿、虚弱、食欲不振、瘙痒、骨痛、苍白、恶心。患有这种疾病的一些个体会发展痛风，如果不治疗，会变成慢性的，并且大多数时间会影响关节，而不是间歇性的。
多囊性肾病
多囊性肾病(PKD)是一种遗传性病症，其中肾小管结构异常，导致肾脏内多个囊肿的发展和生长。这些囊肿可能在子宫内、婴儿期、儿童期或成年期开始发展。囊肿是无功能小管，充满了泵入其中的流体，其大小从微观到巨大，挤压邻近的正常小管，并最终使它们也无功能。PKD是美国最常见的遗传疾病之一，影响超过60万人。它是近10％的所有终末期肾脏疾病的原因。
多囊性肾病的原因
PKD是由产生特定异常蛋白质的异常基因引起的；这种蛋白质对小管发育具有不利影响。PKD是两种类型的统称，每种类型都有自己的病理和遗传原因：常染色体显性多囊性肾病(ADPKD)和常染色体隐性多囊性肾病(ARPKD)。异常基因存在于身体的所有细胞中；因此，囊肿可发生在肝脏、精囊和胰腺中。这种遗传缺陷也会导致主动脉根部动脉瘤和威利斯脑动脉(Willis cerebral artery)环中的动脉瘤，如果它们破裂，就会导致蛛网膜下腔出血。
可由以下一种、几种或全部情况中怀疑诊断：新发作的腰部疼痛或红色尿；阳性家族史；体检时触诊肿大的肾脏；腹部超声的偶然发现；或者在常规实验室工作中偶然发现肾功能异常(BUN、血清肌酐或eGFR)。多囊性肾病可以通过腹部的CT扫描以及同一区域的MRI和超声波来确定。体检/测试可以发现肝脏肿大、心脏杂音和血压升高。
并发症包括由于肾素-血管紧张素-醛固酮系统(RAAS)活化导致的高血压、经常性囊肿感染、泌尿系统出血和肾功能下降。高血压用血管紧张素转换酶抑制剂(ACEI)或血管紧张素受体阻滞剂(ARB)治疗。感染用抗生素治疗。肾功能下降用肾脏替代疗法(RRT)：透析和/或移植来治疗。从疑似或明确诊断开始，由委员会认证的肾病学家进行管理。没有FDA批准的治疗方法。然而，已有研究表明，轻度至中度的饮食限制减慢了常染色体显性多囊性肾病(ADPKD)的进展。如果疾病在给定情况下发展到足够大并且在此时，肾脏疾病学家或其他从业者和患者将必须决定使用何种形式的肾脏替代疗法来治疗终末期肾脏疾病(肾衰竭，通常为4期或5期慢性肾脏疾病)。
纤毛类疾病
纤毛类疾病是细胞纤毛或纤毛锚定结构、基体或纤毛功能的遗传性病症。初级纤毛在指导发育过程中非常重要，因此在胚胎发育时异常的纤毛功能会导致一系列畸形，不管特定的遗传问题如何都会发生。这些发育病症的临床特征的相似性意味着它们形成了一组可识别的综合征，大致归因于异常的纤毛功能，并因此被称为纤毛类疾病。不管实际原因是什么，它是一组特征性特征的聚集，这些特征定义了综合征是否是纤毛类疾病。
多囊性肝病
多囊肝病(PLD)通常描述分散在整个正常肝组织中的多个囊肿的存在。PLD通常发现与常染色体显性多囊性肾病相关，患病率为1/400至1/1000，并且占所有终末期肾脏疾病病例的8-10％。更罕见的常染色体显性多囊性肝病将在没有任何肾脏参与的情况下进展。已描述了与PRKCSH和SEC63的关联性。多囊性肝病有两种形式，即常染色体显性多囊性肾病(有肾囊肿)和常染色体显性多囊肝病(只有肝囊肿)。大多数PLD患者无症状，常规检查后发现简单囊肿。在确认肝脏中存在囊肿后，可能需要安排实验室测试来检查肝功能，包括胆红素、碱性磷酸酶、丙氨酸氨基转移酶和凝血酶原时间。患有PLD的患者通常肝脏肿大，这会压迫邻近的器官，导致恶心、呼吸问题和身体能力有限。疾病进展的分类考虑了与囊肿的数量和大小相比剩余肝实质的数量。许多患者没有症状，并因此不是手术候选者。对于患有疼痛或囊肿并发症的患者，治疗的目标是在保护功能性肝实质的同时减小囊肿的大小。囊肿可以通过手术或通过使用抽吸硬化疗法切除。
阿尔茨海默病
阿尔茨海默病(AD)是一种慢性神经退行性疾病，通常起病缓慢并随着时间的推移逐渐恶化。它是60-70％痴呆症病例的原因。最常见的早期症状是难以记住最近发生的事情。随着疾病的发展，症状可能包括语言问题、定向障碍(包括容易迷路)、情绪波动、缺乏动力、不能自理和行为问题。随着人的病状下降，他们往往会退出家庭和社会。身体机能逐渐丧失，最终导致死亡。虽然进展的速度会有所不同，但诊断后的典型预期寿命是三到九年。阿尔茨海默病的病因知之甚少。约70％的风险被认为是遗传自一个人的父母，通常涉及许多基因。其他危险因素包括头部受伤史、抑郁症和高血压。疾病过程与大脑中的斑块和神经原纤维缠结有关。可能的诊断是基于病史和认知测试，以及医学成像和血液测试，以排除其他可能的原因。最初的症状经常被误认为是正常的衰老。明确诊断需要检查脑组织。脑力和体力锻炼以及避免肥胖可以降低AD的风险；然而，支持这些建议的证据不足。没有证明可以降低风险的药物或补充剂。没有治疗可以阻止或逆转其进展，尽管有些治疗可以暂时改善症状。2015年，全世界有大约2980万人患有AD。它最常始于65岁以上的人，尽管4-5％的病例是早发性阿尔茨海默氏病。它影响了约6％的65岁及以上的人。
帕金森病
帕金森病(PD)是一种中枢神经系统的长期退行性病症，主要影响运动系统。随着病情恶化，非运动症状变得更加常见。症状通常缓慢出现。在疾病早期，最明显的症状是颤抖、僵硬、行动缓慢和行走困难。也可能出现思维和行为问题。痴呆症在疾病的晚期变得很常见。抑郁和焦虑也很常见，超过三分之一患有PD的人会出现抑郁和焦虑。其他症状包括感觉、睡眠和情绪问题。主要的运动症状统称为“帕金森症”或“帕金森综合征”。帕金森病的原因被认为包括遗传因素和环境因素。那些有家庭成员受到影响的人自己更有可能得这种病。暴露于某些杀虫剂的人和以前头部受伤的人风险也增加，而吸烟者和喝咖啡或茶的人风险降低。这种疾病的运动症状由中脑的黑质细胞死亡引起。这导致大脑的这个区域没有足够的多巴胺。这种细胞死亡的原因知之甚少，但它涉及蛋白质在神经元中堆积成路易体。典型病例的诊断主要基于症状，通过诸如神经成像的测试来排除其他疾病。2015年，PD影响了620万人，并导致全球约117,400人死亡。帕金森病通常发生在60岁以上的人中，其中约有1％的人受到影响。诊断后的平均预期寿命在7至15年之间。
蛋白尿
蛋白尿是一种其中尿液中存在蛋白质的病理学病状。白蛋白尿是一类蛋白尿。当肾脏向尿液中渗漏少量白蛋白时，发生微量白蛋白尿。在正常运作的身体中，尿液中通常不存在白蛋白，因为其被肾脏保持在血流中。可从24小时尿液收集物(20μg/min至200μg/min)或更常见的在至少两个时刻升高的浓度(30mg/L至300mg/L)来诊断微量白蛋白尿。微量白蛋白尿可能是糖尿病性肾病的先兆。超过这些值的白蛋白水平称为大量白蛋白尿。患有某些病状例如糖尿病性肾病的受试者可从微量白蛋白尿发展为大量白蛋白尿，并在肾脏疾病达到晚期时达到肾病范围(>3.5g/24小时)。
蛋白尿的病因
蛋白尿可能与多种疾病相关，包括局灶节段性肾小球硬化、IgA肾病、糖尿病性肾病、狼疮性肾炎、膜增生性肾小球肾炎、进行性(新月体性)肾小球肾炎和膜性肾小球肾炎。
A.局灶节段性肾小球硬化(FSGS)
局灶节段性肾小球硬化(FSGS)是一种攻击肾脏的过滤系统(肾小球)而导致严重瘢痕形成的疾病。FSGS是被称为肾病综合征的疾病的众多病因之一，当血液中的蛋白质泄漏到尿液中(蛋白尿)时发生这种疾病。原发性FSGS，当找不到根本病因时，通常表现为肾病综合征。继发性FSGS，当鉴定了潜在病因时，通常表现为肾脏衰竭和蛋白尿。FSGS可以是遗传性的；目前存在FSGS遗传形式的几种已知遗传性病因。
对于FSGS患者，几乎没有可用的治疗。许多患者用类固醇方案治疗，其中大多数具有非常严重的副作用。一些患者已显示对免疫抑制药物以及已显示降低尿液中蛋白质水平的血压药物有积极响应。迄今为止，没有普遍接受的有效治疗或治愈方法，并且也没有经FDA批准的用于治疗FSGS的药物。因此，需要更有效的降低或抑制蛋白尿的方法。
B.IgA肾病
IgA肾病(也称为IgA肾炎、IgAN、伯杰氏病和并咽喉炎性肾小球肾炎)是肾小球肾炎(肾脏的肾小球炎症)的一种形式。IgA肾病是全世界最常见的肾小球肾炎。原发性IgA肾病的特征在于IgA抗体沉积在肾小球中。存在其他与肾小球IgA沉积相关的疾病，最常见的是亨-舍二氏紫癜(HSP)，它被许多人视为IgA肾病的全身性形式。亨-舍二氏紫癜呈现出特征性的紫癜性皮疹、关节炎和腹痛并且更常发生在青年人(16岁-35岁)中。HSP与比IgA肾病更良好的预后相关。在IgA肾病中，25％-30％的病例在20年的时间内缓慢进展为慢性肾功能衰竭。
C.糖尿病性肾病
糖尿病性肾病，也称为金摩尔史迪尔-威尔逊(Kimmelstiel-Wilson)综合征和毛细管间肾小球肾炎，是一种由肾脏肾小球中毛细管的血管病变引起的进行性肾脏疾病。其特征在于肾病综合征和弥漫性肾小球硬化。这是由长期存在的糖尿病所致，并且是透析的主要原因。糖尿病性肾病病程中最早可检测的变化是肾小球增厚。在这个阶段，肾脏可能开始允许尿液中血清白蛋白高于正常水平。随着糖尿病性肾病的进展，越来越多的肾小球被结节性肾小球硬化破坏并且尿液中排泄的白蛋白量增加。
D.狼疮性肾炎
狼疮性肾炎是一种肾脏病症，是系统性红斑狼疮的并发症。当抗体和补体在肾脏中积聚从而引起炎症时，就会发生狼疮性肾炎。它通常引起蛋白尿，并可能迅速进展为肾功能衰竭。氮废物在血液中积聚。系统性红斑狼疮引起肾脏内部结构的各种病症，包括间质性肾炎。每10,000人中大约有3人受狼疮性肾炎的影响。
E.膜增生性肾小球肾炎I/II/III
膜增生性肾小球肾炎是一类肾小球肾炎，由肾脏肾小球系膜中的沉积物和基底膜增厚、活化补体和损害肾小球引起。有三种类型的膜增生性肾小球肾炎。I型是由免疫复合物沉积在肾脏中引起的，并且被认为与经典补体途径相关。II型与I型相似，但据信与替代补体途径有关。III型非常罕见，其特征在于上皮下沉积物和I型疾病的典型病理学发现混合在一起。
基于免疫荧光显微镜存在两种主要类型的MPGN：免疫复合物介导型和补体介导型。低补体血症在所有类型的MPGN中都很常见。在免疫复合物介导的MPGN中，补体活化通过经典途径发生，并且通常表现为正常或轻度降低的血清C3浓度和低血清C4浓度。在补体介导的MPGN中，由于替代途径的活化，通常存在低血清C3和正常C4水平。然而，正常的血清C3浓度不排除补体介导的MPGN，并且在患有致密物沉积病(DDD)或C3肾小球肾炎(C3GN)的成人中发现正常的C3浓度并不罕见。
C3肾小球肾炎(C3GN)在光学显微镜上(LM)显示肾小球肾炎，在免疫荧光显微镜(IF)上显示C3染色明亮且不存在C1q、C4和免疫球蛋白(Ig)，并且在电子显微镜(EM)上显示系膜和/或内皮下电子致密沉积物。还经常存在偶发性膜内和上皮下沉积。术语‘C3肾小球病’通常用于包括C3GN和致密物沉积病(DDD)，这两者都是由补体替代途径(AP)的失调引起的。C3GN和DDD在LM和IF研究中可能难以彼此区分。然而，EM在C3GN中显示系膜和/或内皮下、膜内和上皮下沉积物，而在DDD中沿肾小球基底膜(GBM)和系膜中存在致密的嗜锇沉积物。C3GN和DDD两者与免疫复合物介导的肾小球肾炎的区别在于IF上缺乏免疫球蛋白染色。(Sethi等人，Kidney Int.(2012)82(4):465-473)。
F.进行性(新月体性)肾小球肾炎
进行性(新月体性)肾小球肾炎(PG)是一种肾脏综合征，如果不及时治疗，会在数月内迅速进展为急性肾功能衰竭并死亡。在50％的病例中，PG与基础疾病诸如古德帕斯彻氏综合征(Goodpasture'ssyndrome)、系统性红斑狼疮或韦格纳氏肉芽肿(Wegenergranulomatosis)相关；其余病例是特发性的。无论潜在原因如何，PG涉及对肾脏肾小球的严重损伤，其中许多肾小球含有特征性的新月形疤痕。患有PG的患者患有血尿、蛋白尿，并且偶尔还有高血压和水肿。尽管蛋白尿程度可能偶尔超过3g/24小时，即与肾病综合征相关的范围，但临床现象与肾脏综合征一致。未治疗的疾病可能进展为尿液体积减少(少尿症)，这与肾脏功能不良相关。
G.膜性肾小球肾炎
膜性肾小球肾炎(MGN)是一种缓慢进展的肾脏疾病，主要影响30岁至50岁的患者，通常是白种人。其可发展为肾病综合征。MGN是由循环免疫复合物引起的。目前的研究表明，大多数免疫复合物是通过抗体与肾小球基底膜原位抗原结合形成的。所述抗原可以是基底膜内源性的，或者从体循环沉积。
H.奥尔波特综合征
奥尔波特综合征是一种遗传性病症，每5,000-10,000名儿童中就有1人受到影响，其特征在于肾小球肾炎、终末期肾脏疾病和听力损失。奥尔波特综合征也可影响眼睛，但这些变化通常不影响视力，除非在晚年发生晶状体变化。尿血是普遍的。蛋白尿是肾脏疾病进展的特征。
I.高血压肾脏疾病
高血压肾脏疾病(高血压肾硬化(HN或HNS)或高血压肾病(HN))是一种涉及由慢性高血压引起的肾脏损害的医学病状。HN可分为两种类型：良性和恶性。良性肾硬化在60岁以上的个体中很常见的，而恶性肾硬化并不常见，并且影响1％-5％的具有高血压的个体，其具有超过130mm Hg的舒张压。可能出现慢性肾脏疾病的体征和症状，包括食欲不振、恶心、呕吐、瘙痒、嗜睡或精神混乱、体重减轻和口腔异味。慢性高血压对肾脏组织造成损害；这个组织包括小血管、肾小球、肾小管和间质组织。组织变硬和变厚，这被称为肾硬化。血管的变窄意味着更少的血液进入组织，因此更少的氧到达组织，从而导致组织死亡(局部缺血)。
J.肾病综合征
肾病综合征是由肾脏损伤引起的一系列症状。这包括尿液中蛋白质、低血液白蛋白水平、高血脂和显著肿胀。其他症状可包括体重增加、感觉疲倦和泡沫尿。并发症可包括血液凝结、感染和高血压。病因包括许多肾脏疾病，诸如局灶节段性肾小球硬化、膜性肾病和微小病变疾病。它也可能作为糖尿病或狼疮的并发症而发生。潜在的机制通常涉及肾脏肾小球的损伤。诊断通常基于尿液测试，并且有时基于肾脏活组织检查。它与肾病综合征的不同之处在于尿液中没有红细胞。肾病综合征的特征在于大量的蛋白尿(>3.5g/1.73m2体表面积/天，或儿童>40mg/平方米体表面积/小时)、低白蛋白血症(<2,5g/dl)、高脂血症以及从面部开始的水肿。脂尿(尿液中脂质)也可能发生，但对于肾病综合征的诊断不是必需的。低钠血症也发生在低钠排泄时。遗传形式的肾病综合征通常对类固醇和其他免疫抑制治疗具有抗性。疗法的目标是控制尿蛋白损失和肿胀，提供良好的营养以允许儿童生长，并预防并发症。早期和积极的治疗用于控制该病症。
K.微小病变疾病
微小病变疾病(也称为MCD、微小病变肾小球病和无疾病等)是一种影响肾脏的疾病，其引起肾病综合征。微小病变疾病的临床体征是蛋白尿(蛋白质，主要是白蛋白异常排泄到尿液中)、水肿(由于水分潴留导致的软组织肿胀)、体重增加和低白蛋白血症(低血清白蛋白)。这些体征统称为肾病综合征。微小病变疾病的第一临床体征通常是水肿，伴随相关的体重增加。肿胀可以是轻微的，但患者可呈现出身体下半部水肿、眶周水肿、阴囊/阴唇区肿胀并且在更严重的情况下全身水肿。在老年人中，患者还可能出现急性肾脏损伤(20％-25％的受累成人)和高血压。由于疾病过程，具有微小病变疾病的患者也处于血液凝结和感染的风险中。
L.膜性肾病
膜性肾病是指免疫复合物沉积在肾小球基底膜(GBM)上，伴有GBM增厚。原因通常未知(特发性)，但次要原因包括药物、感染、自身免疫病症和癌症。表现包括水肿的隐伏发作和重度蛋白尿，伴有良性尿沉渣、正常肾功能和正常或升高的血压。膜性肾病通过肾活检来诊断。自发缓解是常见的。治疗处于进展高风险的患者通常使用皮质类固醇和环磷酰胺或苯丁酸氮芥。
M.感染后肾小球肾炎
急性增生性肾小球肾炎是肾脏中肾小球(肾小球肾炎)或小血管的病症。它是细菌感染的常见并发症，典型地是由12、4和1型链球菌细菌(脓疱病)引起的皮肤感染，但也发生在链球菌性咽炎之后，因此也称为感染后或链球菌感染后肾小球肾炎。它可能是未来白蛋白尿的风险因素。在成人中，当肾脏问题发展时，感染的体征和症状可能仍然存在，并且也使用术语感染相关的肾小球肾炎或细菌感染相关的肾小球肾炎。急性肾小球肾炎导致2013年19,000例死亡，低于1990年世界范围内24,000例死亡。急性增生性肾小球肾炎(链球菌感染后肾小球肾炎)是由链球菌细菌感染引起的，考虑到产生抗体和补体蛋白所需的时间，通常是感染后三周，通常是咽部或皮肤。感染引起肾脏中的血管发生炎症，这妨碍肾脏器官过滤尿液的能力。[需要引证]急性增生性肾小球肾炎最常见于儿童。
N.薄基底膜疾病
薄基底膜病(TBMD，也称为良性家族性血尿和薄基底膜肾病或TBMN)与IgA肾病一起，是没有其他症状的血尿的最常见原因。这种疾病唯一的异常发现是肾脏中肾小球基底膜变薄。它的重要性在于它具有良性预后，患者终生保持正常的肾脏功能。大多数患有薄基底膜病的患者在尿液分析时偶然发现有显微镜下血尿。血压、肾脏功能和尿蛋白排泄通常是正常的。少数患者可见轻度蛋白尿(小于1.5g/天)和高血压。弗兰克血尿(Frankhematuria)和腰痛应促使寻找其他原因，诸如肾结石或腰痛-血尿综合征。此外，没有全身表现，因此听力障碍或视力障碍的存在应促使寻找遗传性肾炎，诸如奥尔波特综合征(Alport syndrome)。一些TBMD患者被认为是引起奥尔波特综合征的基因的携带者。
O.系膜增生性肾小球肾炎
系膜增生性肾小球肾炎是主要与系膜相关的肾小球肾炎的形式。有一些证据表明白细胞介素-10可能在动物模型中抑制它。[2]世界卫生组织(WHO)将其归类为II型狼疮性肾炎。肾小球中的系膜细胞利用胞吞作用吸收和降解循环免疫球蛋白。这种正常过程刺激系膜细胞增殖和基质沉积。因此，在循环免疫球蛋白升高(即狼疮和IgA肾病)期间，人们将预期看到肾小球中的系膜细胞和基质数量增加。这是肾病综合征的特征。
P.淀粉样变性(原发性)
淀粉样变性是一组其中称为淀粉样原纤维的异常蛋白质在组织中积聚的疾病。[4]症状取决于类型并且通常是可变的。[2]它们可包括腹泻、体重减轻、感觉疲倦、舌头肿大、出血、麻木、站立时感觉虚弱、腿部肿胀或脾肿大。[2]有约30种不同类型的淀粉样变性，每一种都由特定的蛋白质错误折叠引起。[5]一些是遗传的，而另一些是获得的。[3]它们被分为局部和全身形式。[2]四种最常见的全身性疾病类型是轻链(AL)、炎症(AA)、透析(Aβ2M)和遗传与老年相关的(ATTR)。原发性淀粉样变性是指其中未鉴定出相关临床病状的淀粉样变性。
Q.c1q肾病
C1q肾病是一种罕见的肾小球疾病，在免疫荧光显微镜下观察到特征性的系膜C1q沉积。这是组织学上定义的并且了解甚少。光学显微镜特征是异质性的，包括微小病变疾病(MCD)、局灶节段性肾小球硬化(FSGS)和增生性肾小球肾炎。临床表现也多种多样，从儿童和成人的无症状血尿或蛋白尿到弗兰克肾炎或肾病综合征不等。诊断时高血压和肾功能不全是常见的发现。最佳治疗尚不清楚，并通常由潜在的光显微病变指导。皮质类固醇是治疗的主要手段，免疫抑制剂保留用于类固醇耐药病例。肾病综合征和FSGS的存在似乎预示着不良后果，与MCD患者的有利后果相反。(Devasahayam等人，“C1qNephropathy:The UniqueUnderrecognized Pathological Entity,”Analytical Cellular Pathology，第2015卷，文章ID 490413，5页，2015.https://doi.org/10.1155/2015/490413。)
R.抗GBM病
抗肾小球基底膜(GBM)病，也称为古德帕斯彻氏疾病，是一种罕见的病状，其引起肾脏和肺中小血管的炎症。抗肾小球基底膜(GBM)抗体主要攻击肾脏和肺部，但全身症状如不适、体重减轻、疲劳、发烧和发冷也很常见，关节疼痛和疼痛也很常见。60％至80％的患者同时出现肺部和肾脏受累；20％-40％仅受累肾脏，而不到10％仅受累肺部。肺部症状通常早于肾脏症状，并且通常包括：咳血、胸痛(少于总病例的50％)、咳嗽和呼吸急促。肾脏症状通常包括尿血、尿液中蛋白质、四肢或面部不明原因的肿胀、血液中尿素含量高和高血压。通过血液的血浆细胞，GPS引起抗GBM抗体的异常产生。抗GBM抗体攻击肺泡和肾小球基底膜。这些抗体将其反应性表位与基底膜结合并活化补体级联反应，导致标记细胞死亡。还牵涉T细胞。它通常被认为是II型超敏反应。
尿蛋白水平的测量
可以使用本领域已知的方法测量尿液中的蛋白质水平。直到最近，准确的蛋白质测量需要24小时的尿液收集。在24小时的收集中，患者排尿到容器中，该容器在两次上洗手间之间保持冷藏。指示患者在早晨第一次去洗手间后开始收集尿液。将当天其余时间的每滴尿液都应收集在容器中。次日早晨，在睡醒后患者增加第一次排尿，收集完成。
最近，研究人员发现单个尿液样品可提供所需的信息。在较新的技术中，将尿液样品中白蛋白的量与正常肌肉分解的废产物肌酐的量进行比较。测量结果称为尿白蛋白肌酐比(UACR)。每克肌酐含有超过30毫克白蛋白(30mg/g)的尿液样品警示可能存在问题。如果实验室测试超过30mg/g，则应在1至2周后进行另一次UACR测试。如果第二次测试也显示高水平的蛋白质，则该人具有持续性蛋白尿，这是肾脏功能下降的迹象，并且应进行评估肾功能的附加测试。
测量血液中肌酐量的测试也将显示受试者的肾脏是否有效地去除废物。血液中肌酐过多是人具有肾脏损害的迹象。医师可使用肌酐测量来估计肾脏如何有效地过滤血液。这种计算被称为估计肾小球滤过率或eGFR。当eGFR小于60毫升/分钟(mL/min)时存在慢性肾脏疾病。
CDK5
细胞周期蛋白依赖性激酶(CDK)是蛋白激酶家族，最初发现它们调节细胞周期的作用。它们也参与调节转录、mRNA加工和神经细胞分化。它们存在于所有已知的真核生物中，并且它们在细胞周期中的调节功能是进化上保守的。
最近，CDK5已成为感觉途径中的必需激酶。CDK5是大脑正常发育所必需的，并且为了被活化，CDK5必须与CDK5R1或CDK5R2结合。Cdk5参与神经元成熟和迁移的过程，从而使颤蛋白信号传导链的关键细胞内衔接蛋白磷酸化。这种酶的失调与包括阿尔茨海默氏病在内的几种神经退行性疾病有关。它还参与侵袭性癌症，明显是通过降低肌动蛋白调节蛋白钙调素结合蛋白的活性来参与。最近的数据也表明CDK5作为足状突细胞的分化、增殖和形态的调节因子的作用，所述足状突细胞是高度特化和终末分化的肾小球细胞，在肾生理学中起重要作用，包括预防蛋白尿(Griffin等人,Am J Pathol.(2004)165(4):1175-1185)。CDK5也被证明在其他非神经元组织中起作用(Dhavan R和Tsai LH,Nat Rev Mol CellBiol.(2001)2:749-759)。
因此，在某些实施方案中，本发明提供了用于治疗特征在于异常CDK5过度活性的疾病或病状或降低其发展风险的方法，其包括向有需要的受试者施用治疗有效量的本发明的化合物(例如，具有结构式(I)的化合物)或包含所述化合物的药物组合物的步骤。
在一些实施方案中，疾病或病状是肾脏的疾病或病状。在一些实施方案中，疾病是多囊性肾病。
待治疗的受试者
在本发明的一个方面，基于受试者患有特征在于异常CDK5过度活性的疾病或病状(例如肾脏的疾病或病状，如多囊性肾病)或处于发展患所述疾病或病状的风险下来选择受试者。
患有肾脏的疾病或病状或处于发展所述疾病或病状的风险下的受试者包括患有糖尿病、高血压或具有某些家族背景的受试者。在美国，糖尿病是终末期肾脏疾病(ESRD)的主要原因。在1型和2型糖尿病中，尿液中的白蛋白是肾脏功能退化的最初迹象之一。随着肾脏功能下降，尿液中白蛋白的量增加。另一个发展肾脏疾病的风险因素是高血压。具有高血压的人中的蛋白尿是肾脏功能下降的一个指标。如果不控制高血压，则这个人可能进展为完全肾脏衰竭。非裔美国人比白种人更可能具有高血压并因此发展肾脏问题，即使他们的血压只是轻微升高。处于蛋白尿风险中的其他群体是美国印地安人、西班牙裔/拉丁裔美洲人、太平洋岛民美国人、老年人和超重受试者。
在本发明的一个方面，基于受试者患有肾脏的疾病或病状或处于发展所述疾病或病状的风险下来选择受试者。患有肾脏的疾病或病状或处于发展肾脏疾病或病状的风险下的受试者是具有所述病状的一种或多种症状的受试者。蛋白尿的症状是本领域技术人员已知的并且包括但不限于尿液中大量蛋白质，这可能引起尿液在卫生间中看上去起泡。大量蛋白质的流失可能导致水肿，其中可能发生手、脚、腹部或面部的肿胀。这些是大量蛋白质流失的迹象并且指示肾脏疾病已经进展。实验室测试是在广泛的肾脏损害发生之前查明受试者尿液中是否存在蛋白质的唯一方法。
该方法对多种受试者有效，包括哺乳动物，例如人和其他动物，诸如实验室动物，例如小鼠、大鼠、兔或猴，或驯养和农场动物，例如猫、狗、山羊、绵羊、猪、奶牛或马。在一些实施方案中，受试者是哺乳动物。在一些实施方案中，受试者是人。
实施例
本发明在以下实施例中进一步描述，这些实施例不限制权利要求书中描述的本发明的范围。
在Waters C18柱上使用甲酸或碳酸氢铵作为改性剂，用水和乙腈的混合物进行梯度洗脱，来进行反相HPLC纯化(“制备型HPLC”)。
实施例1.中间体的制备
合成了下列化学中间体，并且它们可用于产生本发明的各种化合物。对本领域技术人员来说显而易见的是，在该实施例中以及在随后的化合物合成实施例中描述的某些中间体也是本发明范围内的化合物。
A.7-氯-1,6-萘啶-2-醇
(2E)-3-(4-氨基-6-氯吡啶-3-基)丙-2-烯酸乙酯。在氮气气氛下在室温下向搅拌的2-氯-5-碘吡啶-4-胺(350g，1375mmol，1当量)和三(2-甲氧基苯基)膦(8.37g，27.5mmol，0.02当量)在DMF(1.5L)中的混合物中逐滴添加TEA(167g，1651mmol，1.2当量)、Pd(OAc)2(9.26g，41.3mmol，0.03当量)和丙-2-烯酸乙酯(330.5g，3301mmol，2.4当量)。将所得混合物在100℃下在氮气气氛下搅拌2小时。通过LCMS监测反应。通过添加水(9000mL)将反应在室温下淬灭。通过过滤收集沉淀的固体，并用EtOAc(2×1000mL)洗涤。将所得混合物在减压下浓缩，得到呈棕色固体的(2E)-3-(4-氨基-6-氯吡啶-3-基)丙-2-烯酸乙酯(286g，92％)。
7-氯-1,6-萘啶-2-醇。在环境温度下向(2E)-3-(4-氨基-6-氯吡啶-3-基)丙-2-烯酸乙酯(120g，1当量)在DIEA(2400mL)中的溶液中添加DBU(161.2g，2当量)。将所得混合物在120℃下搅拌32小时。通过LCMS可检测到期望的产物。使混合物冷却至室温。在真空下浓缩反应混合物，将残余物倒入冰/水中并过滤，然后收集滤饼，得到呈浅棕色固体的7-氯-1,6-萘啶-2-醇(80g，84％)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ12.11(s,1H),8.70(s,1H),8.01(d,J＝9.6Hz,1H),7.21(s,1H),6.61(d,J＝9.6Hz,1H)
B.2,7-二氯-1,6-萘啶
在室温和氮气气氛下向搅拌的7-氯-1,6-萘啶-2-醇(16g，89mmol，1当量)在三氯氧化磷(50mL)中的溶液中分批添加DMF(0.1mL)。将所得混合物在110℃下在氮气气氛下搅拌8小时。通过LCMS监测反应。将所得混合物在减压下浓缩。将所得混合物用水(250mL)稀释并且用DCM(2×250mL)萃取。将合并的有机层用盐水(1x200 mL)洗涤，经无水Na2SO4干燥。过滤后，将滤液在减压下浓缩。通过硅胶柱色谱纯化残余物，用PE/EtOAc(10:1至3:1)洗脱，得到呈白色固体的2,7-二氯-1,6-萘啶(10.06g，57％)。1H NMR(400MHz,氯仿-d)δ9.10(s,1H),8.26(d,J＝8.6Hz,1H),7.92(s,1H),7.53(d,J＝8.6Hz,1H)
C.2-溴-7-氯-1,6-萘啶。
在室温下向搅拌的7-氯-1,6-萘啶-2-醇(10g，1当量)在DCE(100mL)中的溶液中添加POBr3(100克)和DMF(405mL，5.54mmol，0.1当量)。将所得混合物在80℃下搅拌16小时。通过LCMS监测反应。使混合物冷却至室温。将所得混合物用DCM(400mL)稀释，倒入冰水中，并用DCM(2×400mL)萃取。将合并的有机层用盐水(2x200 mL)洗涤，经无水Na2SO4干燥。过滤后，将滤液在减压下浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法纯化，用PE/EtOAc(10:1至1:1)洗脱，得到呈灰白色固体的2-溴-7-氯-1,6-萘啶(6g，45％)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ9.34(s,1H),8.63–8.51(m,1H),8.06(s,1H),7.91(d,J＝8.6Hz,1H)
D.7-氯-1,6-萘啶-2-硫醇
在氮气气氛下向搅拌的2,7-二氯-1,6-萘啶(1000mg，5.024mmol，1当量)在DMF(20mL)中的溶液中分批添加NaSH(1408.41mg，25.122mmol，5当量)。将所得混合物在110℃下在氮气气氛下搅拌16小时。通过LCMS监测反应。使混合物冷却至室温。将所得混合物过滤，将滤饼用ACN(3×10mL)洗涤。将滤液在减压下浓缩。将残余物通过反相快速色谱法经以下条件下纯化：柱：Spherical C18，20-40μm，330g；流动相A：水(加5mM NH4NO3)；流动相B：ACN；流速：80mL/min；梯度：5％-5％B，10min，25min内25％B-60％B梯度；检测器：245nm，并在33％B下收集所需产物。在减压下浓缩，得到呈橙色固体的7-氯-1,6-萘啶-2-硫醇(650mg，66％)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ13.85-13.82(brs,1H),8.85(s,1H),7.90(d,J＝9.2Hz,1H),7.44(s,1H),7.31(d,J＝9.2Hz,1H)。
E.4-(7-氯-1,6-萘啶-2-羰基)哌啶-1-羧酸叔丁酯
4-乙炔基哌啶-1-羧酸叔丁酯。在氮气气氛下在室温下向搅拌的4-甲酰基哌啶-1-羧酸叔丁酯(100g，469mmol，1当量)和二甲基-1-重氮-2-氧代丙基膦酸酯(99.08g，515.8mmol，1.1当量)在MeOH(1000mL)中的溶液中分批添加K2CO3(97.20g，703mmol，1.5当量)。将所得混合物在室温下在氮气气氛下搅拌16小时。通过TLC监测反应。将所得混合物过滤，将滤饼用乙醇(2×150mL)洗涤。将滤液在减压下浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法纯化，用PE/EtOAc(100:1至20:1)洗脱，得到呈白色固体的4-乙炔基哌啶-1-羧酸叔丁酯(97g，98％)。
4-(3-异丙氧基-3-氧代丙-1-炔-1-基)哌啶-1-羧酸叔丁酯。在-78℃氮气气氛下向搅拌的4-乙炔基哌啶-1-羧酸叔丁酯(100g，477.808mmol，1当量)在THF(1200mL)中的溶液中分批添加正丁基锂的己烷溶液(49.51mL，772.9mmol，1.1当量)。将所得混合物在-78℃下在氮气气氛下搅拌1小时。向混合物中逐滴加入THF(100mL)中的氯甲酸异丙酯(64.41g，525.589mmol，1.1当量)，然后在氮气气氛下在-78℃下搅拌3小时。通过TLC监测反应。将反应用饱和NH4Cl(水溶液)在-78℃下淬灭。将所得混合物用EtOAc(3×400mL)萃取。将合并的有机层用盐水(1×500mL)洗涤，经无水Na2SO4干燥。过滤后，将滤液在减压下浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法纯化，用PE/EtOAc(50:1至30:1)洗脱，得到呈白色固体的4-(3-异丙氧基-3-氧代丙-1-炔-1-基)哌啶-1-羧酸叔丁酯(120g，85％)。
4-[3-异丙氧基-3-氧代-1-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧硼杂环戊烷-2-基)丙-1-烯-1-基]哌啶-1-羧酸叔丁酯。在氮气气氛下在室温下向搅拌的4-(3-异丙氧基-3-氧代丙-1-炔-1-基)哌啶-1-羧酸叔丁酯(120g，406mmol，1当量)、CuCl(1206.57mg，12.188mmol，0.03当量)和XantPhos(7052.04mg，12.188mmol，0.03当量)在THF(1200mL)中的溶液中分批添加叔丁醇钠(2340.04mg，24.375mmol，0.06当量)。将所得混合物在室温下在氮气气氛下搅拌0.5小时。在氮气气氛下向混合物中添加双(频哪醇基)二硼(134.11g，528.135mmol，1.3当量)和MeOH(26034.54mg，812.515mmol，2当量)。将所得混合物在室温下搅拌16小时。通过TLC监测反应。将反应用饱和NH4Cl(水溶液)在室温下淬灭。将所得混合物用EtOAc(2×1500mL)萃取。将合并的有机层用盐水(1×1500mL)洗涤，经无水Na2SO4干燥。过滤后，将滤液在减压下浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法纯化，用PE/EtOAc(30:1至20:1)洗脱，得到呈白色固体的4-[3-异丙氧基-3-氧代-1-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧硼杂环戊烷-2-基)丙-1-烯-1-基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(170g，99％)。
4-[1-(7-氯-1,6-萘啶-2-基)-3-异丙氧基-3-氧代丙-1-烯-1-基]哌啶-1-羧酸叔丁酯。在氩气气氛下在室温下向1,4-二噁烷(1000mL)和H2O(200mL)中的4-[3-异丙氧基-3-氧代-1-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)丙-1-烯-1-基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(75g，1.50当量)、2-溴-7-氯-1,6-萘啶(45g，1当量)和KF(11.91g，10当量)添加Pd(PPh3)4(7.1g，0.30当量)。将所得混合物在氩气气氛下在75℃下搅拌24小时。通过添加盐水(600mL)猝灭反应。将水层用EtOAc(3×600mL)萃取。用盐水(3×500mL)洗涤所收集的有机层。将其经无水Na2SO4干燥，并在减压下浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法纯化，用PE:EtOAc(20:1-5:1)洗脱，得到呈黄色固体的4-[1-(7-氯-1,6-萘啶-2-基)-3-异丙氧基-3-氧代丙-1-烯-1-基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(80g，71％)。
4-(7-氯-1,6-萘啶-2-羰基)哌啶-1-羧酸叔丁酯(中间体E)。在环境温度下向搅拌的4-[1-(7-氯-1,6-萘啶-2-基)-3-异丙氧基-3-氧代丙-1-烯-1-基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(60.0g，130mmol)在丙酮(1.20L)和水(0.40L)中的溶液中添加脱水锇酸钾(14.4g，39.1mmol)和N-甲基吗啉-N-氧化物(91.7g，782mmol)将混合物在环境温度下搅拌36h。在0℃下通过硫代硫酸钠水溶液(300mL，饱和)猝灭反应混合物，并用乙酸乙酯(3×500mL)萃取。将合并的有机部分用盐水(3×300mL)洗涤，用无水硫酸钠干燥并过滤。将滤液在减压下浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法纯化，用1-20％乙酸乙酯的石油醚溶液洗脱，得到呈黄色固体的标题化合物(36.0g，73％)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ7.82(d,J＝8.2Hz,2H),7.51(d,J＝8.1Hz,2H),4.13(s,2H),2.44(s,3H),1.37-1.29(m,2H),1.13-1.05(m,2H)。
F.7-氯-2-(1-甲基哌啶-4-羰基)-1,6-萘啶。
7-氯-2-(哌啶-4-羰基)-1,6-萘啶。在0℃下向搅拌的4-(7-氯-1,6-萘啶-2-羰基)哌啶-1-羧酸叔丁酯(3750mg，10mmol，1当量)在DCM(100mL)中的溶液中分批添加TFA(100mL)将所得混合物在0℃下搅拌1小时。通过LCMS监测反应。将所得混合物用DCM(3×10mL)萃取。将合并的有机层用DCM(3×10mL)洗涤，经无水Na2SO4干燥。过滤后，在减压下浓缩滤液，得到呈棕色固体的7-氯-2-(哌啶-4-羰基)-1,6-萘啶(2600mg，95％)。
7-氯-2-(1-甲基哌啶-4-羰基)-1,6-萘啶(中间体F)。在室温下向搅拌的7-氯-2-(哌啶-4-羰基)-1,6-萘啶(140mg，0.508mmol，1当量)和NaBH(OAc)3(161.41mg，0.762mmol，1.50当量)在THF(3mL)中的溶液中分批添加HCHO(30.49mg，1.015mmol，2当量)。将所得混合物在室温下搅拌1小时。通过LCMS监测反应。将所得混合物在减压下浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法纯化，用DCM/MeOH(10:1)洗脱，得到呈棕黄色固体的7-氯-2-(1-甲基哌啶-4-羰基)-1,6-萘啶(130mg，88)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ9.48(s,1H),8.87(d,J＝8.6Hz,1H),8.21(d,J＝8.4Hz,1H),8.19(s,1H),4.13-4.07(m,1H),3.45-3.42(m,2H),3.20-3.16(m,2H),2.77(s,3H),2.20-2.16(m,2H),1.86-1.82(m,2H)。
G.2-氟-4-(吡唑-1-基)苯胺。
在室温下向搅拌的2-氟-4-碘苯胺(10g，42.191mmol，1当量)和吡唑(4.31g，63.3mmol，1.50当量)在DMSO(100mL)中的溶液中分批添加8-羟基喹啉(0.92g，6.3mmol，0.15当量)、K2CO3(8.75g，63.3mmol，1.50当量)和CuI(1.21g，6.35mmol，0.15当量)。将所得混合物在120℃下在氮气气氛下搅拌16小时。通过LCMS监测反应。将所得混合物在减压下浓缩。使混合物冷却至室温。用氨水溶液(3×200mL)洗涤所得混合物。将所得混合物用EtOAc(4×300mL)萃取。将合并的有机层用盐水(2×300mL)洗涤，经无水Na2SO4干燥。过滤后，将滤液在减压下浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法纯化，用PE/EtOAc(20:1至4:1)洗脱，得到呈红色油状物的2-氟-4-(吡唑-1-基)苯胺(7.0g，94％)。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ8.30(d,J＝2.4Hz,1H),7.64(d,J＝1.8Hz,1H),7.50(dd,J＝12.6,2.5Hz,1H),7.37-7.35(m,1H),6.86-6.82(m,1H),6.47-6.45(m,1H),5.27-5.25(brs,2H)。
下表中所示的中间体的制备通过对于中间体G的合成所述的方法和方案实现，使用适当的材料开始。
N.[1-(4-氨基-3-氟苯基)吡唑-3-基]甲醇。
在0℃下在氮气气氛下向搅拌的1-(4-氨基-3-氟苯基)吡唑-3-羧酸甲酯(9g，38.3mmol，1当量)在THF(50mL)中的溶液中分批添加LiAlH4(1.74g，45.9mmol，1.2当量)。将所得混合物在室温下在氮气气氛下搅拌1小时。在室温下用水(1.7mL)猝灭反应，添加15％NaOH(水溶液)(1.7mL)和水(5.1mL)。将所得混合物过滤，将滤饼用EtOAc(3x50 mL)洗涤。将滤液在减压下浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法纯化，用DCM/MeOH(50:1至10:1)洗脱，得到呈白色固体的[1-(4-氨基-3-氟苯基)吡唑-3-基]甲醇(7g，88％)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ8.20(d,J＝2.4Hz,1H),7.46(dd,J＝12.7,2.4Hz,1H),7.38-7.27(m,1H),6.86-6.81(m,1H),6.40(d,J＝2.4Hz,1H),5.20-5.19(brs,2H),5.09(t,J＝5.8Hz,1H),4.47(d,J＝5.8Hz,2H)。
下表所示中间体的制备遵循对于中间体N的合成所述的方法和方案，使用中间体I的合成中形成的副产物开始：
P.2-(1-(4-氨基-3-氟苯基)-1H吡唑-3-基)丙-2-醇。
在-78℃和氮气气氛下向搅拌的1-(4-氨基-3-氟苯基)吡唑-3-羧酸甲酯(300mg，1.275mmol，1当量)在THF(5mL)中的混合物中逐滴添加溴(甲基)镁(3.40mL，10.200mmol，8当量，乙醚中的3M)。将所得混合物在室温下在氮气气氛下搅拌4小时。将反应用饱和NH4Cl(水溶液)(5mL)在0℃下淬灭。将所得混合物用水(20mL)稀释并用EtOAc(3×30mL)萃取。将合并的有机层用盐水(3×30mL)洗涤，经无水Na2SO4干燥。过滤后，将滤液在减压下浓缩。通过制备型TLC(PE/EtOAc 2:1)纯化残余物，得到呈灰白色固体的2-[1-(4-氨基-3-氟苯基)吡唑-3-基]丙-2-醇(100mg，33％)。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ8.14(d,J＝2.4Hz,1H),7.57(dd,J＝11.5,3.0Hz,1H),7.35-7.29(m,1H),6.93-6.78(m,1H),6.40(d,J＝2.4Hz,1H),5.21-5.17(brs,2H),4.96-4.93(brs,1H),1.46(s,6H)。
Q.2-氟-4-(吗啉-4-基甲基)苯胺
4-(溴甲基)-2-氟-1-硝基苯。在80℃下在氮气气氛下向搅拌的2-氟-4-甲基-1-硝基苯(5g，32.231mmol，1当量)在DCE(41.50g，13.13当量)中的溶液中分批添加NBS(100mg，2当量)和AIBN(0.64g，3.868mmol，0.12当量)。粗产物原样使用。
4-[(3-氟-4-硝基苯基)甲基]吗啉。在氮气气氛下在室温下向搅拌的4-(溴甲基)-2-氟-1-硝基苯(7g，29.911mmol，1当量)和吗啉(7.82g，89.734mmol，3当量)在DCE(41.5g)中的溶液中。通过LCMS可检测到期望的产物。将残余物用HCl(水溶液)酸化/碱化/中和至pH6。将残余物通过反相快速色谱法经以下条件纯化：柱：Spherical C18，20-40um，330g；流动相A：水(加5mM FA)；流动相B：ACN；流速：80mL/min；梯度：5％-5％B，10min，20min内33％B-45％B梯度；检测器：220nm。在40％B下收集含有所需产物的级分，并在减压下浓缩，得到呈黄色固体的4-[(3-氟-4-硝基苯基)甲基]吗啉(1.2g，17％)。
2-氟-4-(吗啉-4-基甲基)苯胺(中间体Q)。在室温下向搅拌的4-[(3-氟-4-硝基苯基)甲基]吗啉(0.40g，1.67mmol)和铁粉(0.65g，11.7mmol)在甲醇(12.0mL)和水(1.20mL)中的混合物中添加氯化铵(0.89g，16.7mmol)。将反应混合物在65℃下搅拌0.5小时。冷却至室温后，在减压下浓缩混合物，用硅胶柱色谱纯化残余物，用1-8％甲醇的二氯甲烷溶液洗脱，得到呈黄色固体的标题化合物(0.28g，80％)。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ6.97-6.93(m,1H),6.86-6.83(m,1H),6.75-6.70(m,1H),5.13-5.09(brs,2H),3.63-3.59(m,4H),2.46-2.40(m,4H)。
R.6-(4-氨基-3-氟苯基)-1-甲基吡啶-2-酮
3-溴-1-甲基吡啶-2-酮。在室温下向搅拌的3-溴-1H-吡啶-2-酮(10g，57.472mmol，1当量)和K2CO3(11.91g，86.176mmol，1.50当量)在DMF(100mL)中的混合物中逐滴添加CH3I(12.24g，86.208mmol，1.5当量)。将所得混合物在60℃下搅拌2小时。通过LCMS监测反应。将所得混合物用EtOAc(8×500mL)萃取。将合并的有机层用盐水(2×100mL)洗涤，经无水Na2SO4干燥。过滤后，将滤液在减压下浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法纯化，用PE/EtOAc(4/1至1/1)洗脱，得到呈黄色油状物的3-溴-1-甲基吡啶-2-酮(8g，74)。
6-(4-氨基-3-氟苯基)-1-甲基吡啶-2-酮(中间体R)。在氮气气氛下向搅拌的2-氟-4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)苯胺(1.27g，05mmol，1当量)和6-溴-1-甲基吡啶-2-酮(1.51g，08mmol，1.50当量)在1,4-二噁烷(90mL)和H2O(30mL)中的混合物中分批添加Pd(PPh3)4(0.37g，00mmol，0.06当量)和K2CO3(1.48g，0.011mmol，2当量)。将所得混合物在80℃下在氮气气氛下搅拌2小时。通过LCMS监测反应。使混合物冷却至室温。用水(500mL)稀释所得混合物。用EtOAc(3×150mL)萃取所得混合物。将合并的有机层用盐水(2×100mL)洗涤，经无水Na2SO4干燥。过滤后，将滤液在减压下浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法纯化，用DCM/MeOH(50:1至20:1)洗脱，得到呈淡黄色固体的6-(4-氨基-3-氟苯基)-1-甲基吡啶-2-酮(856.8mg，73％)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ7.70-7.55(m,1H),7.57-7.53(m,1H),7.55-7.47(m,1H),7.30-7.27(m,1H),6.79-6.76(m,1H),6.29-6.25(m,1H),5.27-5.23(brs,2H),3.49(s,3H)。
下表所示的中间体的制备遵循对于中间体R的合成所述的方法和方案，使用适当的材料开始。
W.5-(4-氨基-3-氟苯基)-1-甲基吡啶-2-酮
向2-氟-4-碘苯胺(500mg，2.110mmol，1当量)和1-甲基-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧硼杂环戊烷-2-基)吡啶-2-酮(743.91mg，3.164mmol，1.50当量)在二噁烷(10mL)和H2O(2mL)中添加K2CO3(728.88mg，5.274mmol，2.50当量)和Pd(PPh3)4(243.77mg，0.211mmol，0.10当量)。在氮气气氛下在80℃下搅拌2小时后，将所得混合物冷却并在减压下浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法纯化，用PE/EtOAc(10:1至1:1)洗脱，得到呈浅黄色固体的5-(4-氨基-3-氟苯基)-1-甲基吡啶-2-酮(400mg，87％)。1H NMR(400MHz,CD3OD)δ7.87(d,J＝2.6Hz,1H),7.81(dd,J＝9.3,2.7Hz,1H),7.19(dd,J＝12.6,2.1Hz,1H),7.13-7.09(m,1H),6.91-6.87(m,1H),6.62(d,J＝9.3Hz,1H),3.64(s,3H)。
下表所示的中间体的制备遵循对于中间体W的合成所述的方法和方案，使用适当的材料开始。
AB.1-(3-氨基-4-氟苯基)吡咯烷-2-酮(中间体AB)。
在室温下在氮气气氛下向搅拌的5-溴-2-氟苯胺(800mg，4.210mmol，1当量)和吡咯烷酮(394.14mg，4.631mmol，1.10当量)在1,4-二噁烷(30mL)中的混合物中分批添加Pd(OAc)2(141.78mg，0.632mmol，0.15当量)、XantPhos(730.83mg，1.263mmol，0.30当量)和Cs2CO3(2.74mg，8.41mmol，2当量)。将所得混合物在100℃下在氮气气氛下搅拌16小时。通过LCMS监测反应。使混合物冷却至室温。将所得混合物用DCM/MeOH＝10/1(150mL)稀释。通过过滤收集沉淀的固体。将所得混合物在真空下浓缩。将残余物通过反相快速色谱法经以下条件纯化：柱：Spherical C18，20-40um，120g；流动相A：水(加5mM NH4HCO3)；流动相B：ACN；流速：40mL/min；梯度：5％-5％B，10min，30min内20％B-50％B梯度；检测器：220nm。在34％B下收集含有所需产物的级分，并在减压下浓缩，得到呈白色固体的1-(3-氨基-4-氟苯基)吡咯烷-2-酮(315mg，38％)。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ7.20-7.17(m,1H),6.97-6.92(m,1H),6.71-6.68(m,1H),5.19-5.15(brs,2H),3.73(t,J＝7.0Hz,2H),2.45(t,J＝8.1Hz,2H),2.10-1.96(m,2H)。
下表所示的中间体AC的制备遵循对于中间体AB的合成所述的方法和方案，使用适当的材料开始。
AD.2-氟-5-(吗啉-4-基)苯胺
在室温下向搅拌的5-溴-2-氟苯胺(1g，5.263mmol，1当量)和吗啉(550.20mg，6.315mmol，1.20当量)在DMSO(10mL)中的混合物中逐滴添加K3PO4(3.35g，15.782mmol，3当量)、L-脯氨酸(363.54mg，3.158mmol，0.60当量)和CuI(300.69mg，1.579mmol，0.30当量)。将所得混合物在120℃下在氮气气氛下搅拌2小时。通过LCMS监测反应。使混合物冷却至室温。将所得混合物在减压下浓缩。将所得混合物用EtOAc(3×100mL)萃取。将合并的有机层用盐水(2×100mL)洗涤，经无水Na2SO4干燥。过滤后，将滤液在减压下浓缩。将残余产物通过反相快速色谱经以下条件纯化(柱，C18，330g；流动相：A：水/0.05％NH4HCO3，流动相B：ACN；流速：80mL/min；梯度：25分钟内25％B到60％B；检测器，220nm，监测器，254nm，在33％B下收集所需产物)，得到呈浅棕色固体的2-氟-5-(吗啉-4-基)苯胺(190mg，18％)。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ6.85-6.88(m,1H),6.37-6.35(m,1H),6.10-6.07(m,1H),4.99-4.96(brs,2H),3.73-3.70(m,4H),2.97-2.93(m,4H)。
AE.3-(4-氨基-3-氟苯基)-4H-1,2,4-恶二唑-5-酮
4-氨基-3-氟-N-羟基苯甲酰胺。在氮气气氛下在室温下向搅拌的4-氨基-3-氟苯腈(1g，7.346mmol，1当量)和Na2CO3(4.28g，40.403mmol，5.50当量)在乙醇(20mL)和H2O(5mL)中分批添加盐酸羟胺(2.55g，36.730mmol，5当量)。将所得混合物在70℃下在氮气气氛下搅拌16小时。通过LCMS可检测到期望的产物。使混合物冷却至室温。在下一步骤中使用产物粗制物。
3-(4-氨基-3-氟苯基)-4H-1,2,4-噁二唑-5-酮(中间体AE)。在氮气气氛下在室温下向搅拌的4-氨基-3-氟-N-羟基苯甲酰胺(2.60g，15.370mmol，1当量)和DBU(2.60g，17.079mmol，1.11当量)在1,4-二噁烷(50mL)中的混合物中分批添加CDI(3.74g，23.055mmol，1.50当量)。将所得混合物在110℃下在氮气气氛下搅拌16小时。将所得混合物在减压下浓缩。将残余产物通过反相快速色谱法经以下条件纯化(柱：Spherical C18，20～40um，80g；流动相A：水(加0.05％FA)；流动相B：ACN；流速：80mL/min；B的梯度：5％，6分钟；5％～25％，15min；25％～45％，15min；45％～95％，15分钟，检测器：220nm。在30％B下收集含有所需产物的级分，并在减压下浓缩，得到呈浅棕色固体的3-(4-氨基-3-氟苯基)-4H-1,2,4-噁二唑-5-酮(730mg，24)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ7.57-7.26(m,2H),6.87-6.83(m,1H),5.99-5.96(brs,2H)。
AF.2-氟-4-(1,2,4-噁二唑-3-基)苯胺
在氮气气氛下在室温下向搅拌的4-氨基-3-氟-N-羟基苯甲酰胺(来自中间体AE合成的步骤1的粗产物，500mg，2.956mmol，1当量)在原甲酸三甲酯(20mL)中的溶液中分批添加TFA(1mL，13.463mmol，4.55当量)。将所得混合物在室温下搅拌30分钟，然后在氮气气氛下在60℃下搅拌1小时。通过LCMS监测反应。通过LCMS可检测到期望的产物。将所得混合物在减压下浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法纯化，用PE/EtOAc(4:1)洗脱，得到呈浅黄色固体的2-氟-4-(1,2,4-噁二唑-3-基)苯胺(220mg，42％)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ9.56(s,1H),7.62-7.53(m,2H),6.90-6.86(m,1H),5.89-5.85(brs,2H)。
实施例2.化合物100的制备
7-[(2-氟苯基)氨基]-1,6-萘啶-2-醇。在室温下向100mL圆底烧瓶中添加二噁烷(40mL)中的7-氯-1,6-萘啶-2-醇(3g，16.612mmol，1当量)、2-氟苯胺(2.03g，18.273mmol，1.10当量)、Pd(OAc)2(0.37g，1.661mmol，0.10当量)、XantPhos(1.92g，3.322mmol，0.20当量)和Cs2CO3(16.24g，49.837mmol，3当量)。将所得混合物在110℃下在氮气气氛下搅拌16小时。通过LCMS监测反应。使混合物冷却至室温。将所得混合物用EtOAc(3×400mL)萃取。将合并的有机层用水(3×100mL)洗涤，经无水Na2SO4干燥。过滤后，将滤液在减压下浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法纯化，用DCM/MeOH(12:1)洗脱，得到呈棕色固体的7-[(2-氟苯基)氨基]-1,6-萘啶-2-醇(3.2g，75％)。
2-氯-N-(2-氟苯基)-1,6-萘啶-7-胺。在室温下向100mL圆底烧瓶中添加DCE(40mL)中的7-[(2-氟苯基)氨基]-1,6-萘啶-2-醇(3.20g，12.537mmol，1当量)、PPh3(9.86g，37.610mmol，3当量)和CCl4(5.79g，37.610mmol，3当量)。将所得混合物在80℃下搅拌16小时。通过LCMS监测反应。使混合物冷却至室温。在室温下用NaHCO3猝灭反应。将所得混合物用DCM(3×100mL)萃取。将合并的有机层用水(3×50mL)洗涤，经无水Na2SO4干燥。过滤后，将滤液在减压下浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法纯化，用己烷/EtOAc(5:1)洗脱，得到呈黄色固体的2-氯-N-(2-氟苯基)-1,6-萘啶-7-胺(1.2g，35％)。
4-([7-[(2-氟苯基)氨基]-1,6-萘啶-2-基](甲基)氨基)哌啶-1-羧酸叔丁酯。在室温下向25mL密封管中添加2-氯-N-(2-氟苯基)-1,6-萘啶-7-胺(100mg，0.365mmol，1当量)和4-(甲氨基)哌啶-1-羧酸叔丁酯(86.13mg，0.402mmol，1.10当量)。将所得混合物在100℃下在氮气气氛下搅拌1小时。通过LCMS监测反应。使混合物冷却至室温。这产生呈黄色固体的4-([7-[(2-氟苯基)氨基]-1,6-萘啶-2-基](甲基)氨基)哌啶-1-羧酸叔丁酯(80mg，51％)。粗产物不经进一步纯化直接用于下一步。
N7-(2-氟苯基)-N2-甲基-N2-(哌啶-4-基)-1,6-萘啶-2,7-二胺(化合物100)。在室温下向搅拌的4-([7-[(2-氟苯基)氨基]-1,6-萘啶-2-基](甲基)氨基)哌啶-1-羧酸叔丁酯(80mg，0.177mmol，1当量)在DCM(5mL)中的溶液中逐滴添加1,4-二噁烷中的HCl(气体)(3mL，98.736mmol，557.30当量)。将所得混合物在室温下搅拌1小时。通过TLC监测反应。在室温下用NaHCO3猝灭反应。将所得混合物用DCM(3×30mL)萃取。将合并的有机层用水(3×15mL)洗涤，经无水Na2SO4干燥。过滤后，将滤液在减压下浓缩。将残余物通过反相快速色谱法经以下条件纯化：柱：Spherical C18，20-40um，120g；流动相A：水(加3.2gNH4HCO3)；流动相B：ACN；流速：90mL/min；梯度：5％-5％B，10min，20min内30％B-50％B梯度；检测器：254nm。在45％B下收集含有所需产物的级分，并在减压下浓缩，得到呈灰白色固体的N7-(2-氟苯基)-N2-甲基-N2-(哌啶-4-基)-1,6-萘啶-2,7-二胺(39.1mg)。
实施例3.化合物101和112的制备
4-[(2-甲氧基-2-氧乙基)氨基]哌啶-1-羧酸叔丁酯。在室温下在氮气气氛下向搅拌的4-氨基哌啶-1-羧酸叔丁酯(10g，49.930mmol，1当量)和2-溴乙酸甲酯(6.11g，39.941mmol，0.80当量)的混合物中分批添加DIEA(19.36g，149.795mmol，3当量)。将所得混合物在100℃下在氮气气氛下搅拌16小时。通过TLC监测反应。使混合物冷却至室温。将残余物通过硅胶柱色谱法纯化，用PE/EtOAc(5/1至1/1)洗脱，得到呈淡黄色油状物的4-[(2-甲氧基-2-氧代乙基)氨基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(4g，29％)。
4-[(7-氯-1,6-萘啶-2-基)(2-甲氧基-2-氧乙基)氨基]哌啶-1-羧酸叔丁酯。在室温下在氮气气氛下向搅拌的2,7-二氯-1,6-萘啶(1.12g，5.627mmol，0.90当量)和4-[(2-甲氧基-2-氧乙基)氨基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(1.70g，6.242mmol，1当量)的混合物中分批添加DIEA(2.42g，18.724mmol，3当量)。将所得混合物在110℃下在氮气气氛下搅拌2小时。通过LCMS监测反应。将残余物通过反相快速色谱法经以下条件纯化：柱：Spherical C18，20-40um，330g；流动相A：水(加5mM NH4HCO3)；流动相B：ACN；流速：80mL/min；梯度：5％-5％B，10min，20min内50％B-75％B梯度；检测器：220nm。在70％B下收集含有所需产物的级分，并在减压下浓缩，得到呈黄色固体的4-[(7-氯-1,6-萘啶-2-基)(2-甲氧基-2-氧乙基)氨基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(800mg，29％)。
2-[(7-氯-1,6-萘啶-2-基)(哌啶-4-基)氨基]乙酸甲酯。在室温下在氮气气氛下向搅拌的4-[(7-氯-1,6-萘啶-2-基)(2-甲氧基-2-氧乙基)氨基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(800mg)在MeOH(20mL)中的溶液中分批添加1,4-二噁烷(20mL)中的HCl(气体)。将所得混合物在室温下在氮气气氛下搅拌2小时。将所得混合物在真空下浓缩。通过LCMS监测反应。这产生呈黄色固体的2-[(7-氯-1,6-萘啶-2-基)(哌啶-4-基)氨基]乙酸甲酯(600mg)。
2-[[7-([2-氟-4-[3-(羟甲基)吡唑-1-基]苯基]氨基)-1,6-萘啶-2-基](哌啶-4-基)氨基]乙酸甲酯(化合物112)。在室温下在氮气气氛下向搅拌的2-[(7-氯-1,6-萘啶-2-基)(哌啶-4-基)氨基]乙酸甲酯(500mg，1.493mmol，1当量)和[1-(4-氨基-3-氟苯基)吡唑-3-基]甲醇(340.40mg，1.643mmol，1.10当量)在1,4-二噁烷(20mL)中的混合物中分批添加Pd(OAc)2(50.29mg，0.224mmol，0.15当量)、XantPhos(259.24mg，0.448mmol，0.30当量)和Cs2CO3(973.18mg，2.987mmol，2当量)。将所得混合物在100℃下在氮气气氛下搅拌2小时。通过LCMS监测反应。使混合物冷却至室温。将所得混合物用EtOAc(3×500mL)萃取。将合并的有机层用盐水(2×300mL)洗涤，经无水Na2SO4干燥。过滤后，将滤液在减压下浓缩。将残余物通过反相快速色谱法经以下条件纯化：柱：Spherical C18，20-40um，330g；流动相A：水(加5mM NH4HCO3)；流动相B：ACN；流速：80mL/min；梯度：5％-5％B，10min，20min内50％B-70％B梯度；检测器：220nm。在65％B下收集含有所需产物的级分，并在减压下浓缩，得到呈黄色固体的2-[[7-([2-氟-4-[3-(羟甲基)吡唑-1-基]苯基]氨基)-1,6-萘啶-2-基](哌啶-4-基)氨基]乙酸甲酯(200mg，26％)。
[[7-([2-氟-4-[3-(羟甲基)吡唑-1-基]苯基]氨基)-1,6-萘啶-2-基](哌啶-4-基)氨基]乙酸(化合物101)。在室温下向搅拌的2-[[7-([2-氟-4-[3-(羟甲基)吡唑-1-基]苯基]氨基)-1,6-萘啶-2-基](哌啶-4-基)氨基]乙酸甲酯(10mg，0.020mmol，1当量)在THF和H2O中的溶液中添加LiOH(1.42mg，0.059mmol，3当量)。将所得混合物在室温下搅拌1小时。通过TLC监测反应。将混合物/残余物用柠檬酸酸化至pH4。将所得混合物在减压下浓缩。将粗产物(10mg)通过制备型HPLC纯化，得到呈浅黄色固体的[[7-([2-氟-4-[3-(羟甲基)吡唑-1-基]苯基]氨基)-1,6-萘啶-2-基](哌啶-4-基)氨基]乙酸(2mg，21％)。
化合物111、120、125、126、176和178通过如对于化合物101的合成所述的方法和方案来合成，使用适当的材料开始。
实施例4.化合物119的制备。
2-[(7-氯-1,6-萘啶-2-基)(1-甲基哌啶-4-基)氨基]乙酸甲酯。在0℃下在氮气气氛下向搅拌的2-[(7-氯-1,6-萘啶-2-基)(哌啶-4-基)氨基]乙酸甲酯(来自化合物101的合成的步骤3，120mg，0.358mmol，1当量)和HCHO(16.14mg，0.538mmol，1.50当量)在THF(15mL)中的混合物中分批添加TEA(72.54mg，0.717mmol，2当量)和NaBH(OAc)3(113.95mg，0.538mmol，1.50当量)。将所得混合物在室温下在氮气气氛下搅拌1小时。通过LCMS监测反应。将所得混合物在减压下浓缩。将残余物通过反相快速色谱法经以下条件纯化：柱：Spherical C18，20-40um，120g；流动相A：水(加5mM NH4HCO3)；流动相B：ACN；流速：40mL/min；梯度：5％-5％B，10min，15min内40％B-55％B梯度；检测器：220nm。在45％B下收集含有所需产物的级分，并在减压下浓缩，得到呈黄色固体的2-[(7-氯-1,6-萘啶-2-基)(1-甲基哌啶-4-基)氨基]乙酸甲酯(90mg，72％)。
2-[[7-([2-氟-4-[3-(羟甲基)吡唑-1-基]苯基]氨基)-1,6-萘啶-2-基](1-甲基哌啶-4-基)氨基]乙酸甲酯。在室温下在氮气气氛下向搅拌的2-[(7-氯-1,6-萘啶-2-基)(1-甲基哌啶-4-基)氨基]乙酸甲酯(100mg，0.287mmol，1当量)和[1-(4-氨基-3-氟苯基)吡唑-3-基]甲醇(65.34mg，0.315mmol，1.10当量)在1,4-二噁烷(10mL)中的混合物中分批添加Pd(OAc)2(9.65mg，0.043mmol，0.15当量)、XantPhos(49.76mg，0.086mmol，0.30当量)和Cs2CO3(186.81mg，0.573mmol，2当量)。将所得混合物在100℃下在氮气气氛下搅拌2小时。通过LCMS监测反应。使混合物冷却至室温。将所得混合物用EtOAc(3×200mL)萃取。将合并的有机层用盐水(2×100mL)洗涤，经无水Na2SO4干燥。过滤后，将滤液在减压下浓缩。将残余物通过反相快速色谱法经以下条件纯化：柱：Spherical C18，20-40um，120g；流动相A：水(加5mM NH4HCO3)；流动相B：ACN；流速：40mL/min；梯度：5％-5％B，10min，20min内60％B-95％B梯度；检测器：220nm。在90％B下收集含有所需产物的级分，并在减压下浓缩，得到呈黄色固体的2-[[7-([2-氟-4-[3-(羟甲基)吡唑-1-基]苯基]氨基)-1,6-萘啶-2-基](1-甲基哌啶-4-基)氨基]乙酸甲酯(50mg，34％)。
[[7-([2-氟-4-[3-(羟甲基)吡唑-1-基]苯基]氨基)-1,6-萘啶-2-基](1-甲基哌啶-4-基)氨基]乙酸(化合物119)。在室温下向搅拌的2-[[7-([2-氟-4-[3-(羟甲基)吡唑-1-基]苯基]氨基)-1,6-萘啶-2-基](1-甲基哌啶-4-基)氨基]乙酸甲酯(200mg，0.385mmol，1当量)在THF(25mL)和水(5mL)中的溶液中逐滴添加LiOH(46.09mg，1.925mmol，5当量)。将反应混合物在室温下搅拌2小时。通过LCMS监测反应。将所得混合物在减压下浓缩。将残余物通过制备型HPLC纯化，得到甲酸；呈淡绿色固体的[[7-([2-氟-4-[3-(羟甲基)吡唑-1-基]苯基]氨基)-1,6-萘啶-2-基](1-甲基哌啶-4-基)氨基]乙酸(150.4mg，71％)。
化合物132和170遵循如对于化合物119的合成所述的方法和方案来合成，使用适当的材料开始。
实施例5.化合物144的制备。
2-[(7-氯-1,6-萘啶-2-基)(1-乙基哌啶-4-基)氨基]乙酸甲酯。在室温下在氮气气氛下向搅拌的2-[(7-氯-1,6-萘啶-2-基)(哌啶-4-基)氨基]乙酸甲酯(来自化合物101的合成的步骤3，300mg，0.896mmol，1当量)和TEA(272.02mg，2.688mmol，3当量)在DMF(10mL)中的混合物中分批添加乙基碘(139.75mg，0.896mmol，1当量)。将所得混合物在室温下在氮气气氛下搅拌2小时。通过LCMS监测反应。将残余物通过反相快速色谱法经以下条件纯化：柱：Spherical C18，20-40um，330g；流动相A：水(加5mM NH4HCO3)；流动相B：ACN；流速：80mL/min；梯度：5％-5％B，10min，20min内30％B-55％B梯度；检测器：220nm。在48％B下收集含有所需产物的级分，并在减压下浓缩，得到呈黄色固体的2-[(7-氯-1,6-萘啶-2-基)(1-乙基哌啶-4-基)氨基]乙酸甲酯(180mg，55％)。
2-[(1-乙基哌啶-4-基)[7-([2-氟-4-[3-(羟甲基)吡唑-1-基]苯基]氨基)-1,6-萘啶-2-基]氨基)乙酸甲酯。在室温下在氮气气氛下向搅拌的2-[(7-氯-1,6-萘啶-2-基)(1-乙基哌啶-4-基)氨基]乙酸甲酯(180mg，0.496mmol，1当量)和[1-(4-氨基-3-氟苯基)吡唑-3-基]甲醇(113.07mg，0.546mmol，1.10当量)在1,4-二噁烷(10mL)中的混合物中分批添加Pd(OAc)2(16.71mg，0.074mmol，0.15当量)、XantPhos(86.11mg，0.149mmol，0.30当量)和Cs2CO3(323.25mg，0.992mmol，2当量)。将所得混合物在110℃下在氮气气氛下搅拌2小时。通过LCMS监测反应。使混合物冷却至室温。将所得混合物用EtOAc(3×300mL)萃取。将合并的有机层用盐水(2×100mL)洗涤，经无水Na2SO4干燥。过滤后，将滤液在减压下浓缩。将残余物通过反相快速色谱法经以下条件纯化：柱：Spherical C18，20-40um，330g；流动相A：水(加5mM NH4HCO3)；流动相B：ACN；流速：80mL/min；梯度：5％-5％B，10min，25min内30％B-60％B梯度；检测器：220nm。在55％B下收集含有所需产物的级分，并在减压下浓缩，得到呈黄色固体的2-[(1-乙基哌啶-4-基)[7-([2-氟-4-[3-(羟甲基)吡唑-1-基]苯基]氨基)-1,6-萘啶-2-基]氨基]乙酸甲酯(200mg，76％)。
[(1-乙基哌啶-4-基)[7-([2-氟-4-[3-(羟甲基)吡唑-1-基]苯基]氨基)-1,6-萘啶-2-基]氨基)乙酸(化合物144)。在室温下向搅拌的2-[(1-乙基哌啶-4-基)[7-([2-氟-4-[3-(羟甲基)吡唑-1-基]苯基]氨基)-1,6-萘啶-2-基]氨基]乙酸甲酯(200mg，0.375mmol，1当量)在THF(25mL)和水(5mL)中的溶液中逐滴添加LiOH(44.88mg，1.874mmol，5当量)。将反应混合物在室温下搅拌2小时。通过LCMS监测反应。将所得混合物在减压下浓缩。将残余物通过制备型HPLC纯化，得到呈绿色固体的[(1-乙基哌啶-4-基)[7-([2-氟-4-[3-(羟甲基)吡唑-1-基]苯基]氨基)-1,6-萘啶-2-基]氨基]乙酸；甲酸(111.0mg，52％)。
化合物143、145和147遵循如对于化合物144的合成所述的方法和方案来合成，使用适当的材料开始。
实施例6.化合物155的制备
2-[(7-[[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]氨基]-1,6-萘啶-2-基)[(1s,4s)-4-(甲氨基)环己基]氨基]乙酸甲酯。在0℃下向搅拌的2-[(7-[[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]氨基]-1,6-萘啶-2-基)[(1s,4s)-4-氨基环己基]氨基]乙酸甲酯(来自化合物126的合成的倒数第二个中间体，300mg，0.613mmol，1当量)在CH3I(217.45mg，1.532mmol，1.50当量)中的溶液中分批添加DIEA(396mg，3.064mmol，3当量)。将所得混合物在室温下搅拌6小时。通过LCMS监测反应。将所得混合物在减压下浓缩。将残余物通过反相快速色谱法经以下条件纯化(柱：C18，120g；流动相A：水/0.05％NH4HCO3，流动相B：ACN；流速：40mL/min；梯度：20分钟内15％B到45％B；检测器，254nm和220nm，在28％B下收集所需产物)。在减压下浓缩，得到呈橙色固体的2-[(7-[[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]氨基]-1,6-萘啶-2-基)[(1s,4s)-4-(甲氨基)环己基]氨基]乙酸甲酯(100mg，32％)。
[(7-[[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]氨基]-1,6-萘啶-2-基)[(1s,4s)-4-(甲氨基)环己基]氨基]乙酸(化合物155)。在室温下向搅拌的2-[(7-[[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]氨基]-1,6-萘啶-2-基)[(1s,4s)-4-(甲氨基)环己基]氨基]乙酸甲酯(100mg，0.199mmol，1当量)在THF(5mL)和H2O(1mL)中的溶液中分批添加LiOH(14.27mg，0.596mmol，3当量)。将所得混合物在室温下搅拌60分钟。将所得混合物在减压下浓缩。通过LCMS监测反应。将所得混合物在减压下浓缩。将残余物通过反相快速色谱法经以下条件纯化：(柱：XBridge ShieldRP18 OBD柱，5μm，19*150mm)。在减压下浓缩，得到呈白色固体的[(7-[[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]氨基]-1,6-萘啶-2-基)[(1s,4s)-4-(甲氨基)环己基]氨基]乙酸(1.3mg，1％)。
实施例7.化合物182的制备。
2-[[7-([2-氟-4-[3-(羟甲基)吡唑-1-基]苯基]氨基)-1,6-萘啶-2-基][(1s,4s)-4-(二甲氨基)环己基]氨基]乙酸甲酯。在0℃下向搅拌的2-[[7-([2-氟-4-[3-(羟甲基)吡唑-1-基]苯基]氨基)-1,6-萘啶-2-基][(1s,4s)-4-氨基环己基]氨基]乙酸甲酯(来自化合物126的合成的倒数第二个中间体，320mg，0.616mmol，1当量)在CH3OH(5mL)中的溶液中分批添加NaBH(OAc)3(261.06mg，1.232mmol，2当量)和HCHO(0.20mL，6.571mmol，2当量)。将所得混合物在室温下搅拌6小时。通过LCMS监测反应。将所得混合物在减压下浓缩。将残余物通过反相快速色谱法经以下条件纯化(柱：C18，120g；流动相A：水/0.05％NH4HCO3，流动相B：ACN；流速：40mL/min；梯度：20分钟内15％B到45％B；检测器，254nm和220nm，在28％B下收集所需产物)。在减压下浓缩，得到呈浅绿色固体的2-[[7-([2-氟-4-[3-(羟甲基)吡唑-1-基]苯基]氨基)-1,6-萘啶-2-基][(1s,4s)-4-(二甲基氨基)环己基]氨基]乙酸甲酯(100mg，30％)。
[[7-([2-氟-4-[3-(羟甲基)吡唑-1-基]苯基]氨基)-1,6-萘啶-2-基][(1s,4s)-4-(二甲氨基)环己基]氨基]乙酸(化合物182)。在0℃下向搅拌的2-[[7-([2-氟-4-[3-(羟甲基)吡唑-1-基]苯基]氨基)-1,6-萘啶-2-基][(1s,4s)-4-(二甲基氨基)环己基]氨基]乙酸甲酯(100mg，0.183mmol，1当量)在THF(5mL)中的溶液中分批添加LiOH(13.12mg，0.548mmol，3当量)和H2O(1mL)。将所得混合物在室温下搅拌1小时。通过LCMS监测反应。将所得混合物在减压下浓缩。将粗产物(mg)通过制备型HPLC纯化，得到呈浅黄色固体的[[7-([2-氟-4-[3-(羟甲基)吡唑-1-基]苯基]氨基)-1,6-萘啶-2-基][(1s,4s)-4-(二甲基氨基)环己基]氨基]乙酸(4.7mg，5％)。
化合物160遵循如对于化合物182的合成所述的方法和方案来合成，使用适当的材料开始。
实施例8.化合物102的制备。
4-[(7-氯-1,6-萘啶-2-基)氨基]哌啶-1-羧酸叔丁酯。在室温下向2,7-二氯-1,6-萘啶(2g，10.049mmol，1当量)中添加4-氨基哌啶-1-羧酸叔丁酯(2.01g，10.036mmol，1当量)和DIEA(2.60g，20.117mmol，2当量)。将粘性混合物在100℃下加热16小时。通过LCMS可检测到期望的产物。将反应混合物通过反相快速色谱法经以下条件纯化(柱：C18，330g；流动相A：水/0.05％NH4HCO3，流动相B：ACN；流速：80mL/min；梯度：20分钟内40％B到70％B；检测器，254nm，监测器，220nm，在62％B下收集所需产物)，得到呈黄色固体的4-[(7-氯-1,6-萘啶-2-基)氨基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(3g，82％)。
4-[[7-([2-氟-4-[3-(羟甲基)吡唑-1-基]苯基]氨基)-1,6-萘啶-2-基]氨基]哌啶-1-羧酸叔丁酯。在氮气气氛下向4-[(7-氯-1,6-萘啶-2-基)氨基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(150mg，0.413mmol，1当量)在1,4-二噁烷(6mL)中的溶液中添加[1-(4-氨基-3-氟苯基)吡唑-3-基]甲醇(102.79mg，0.496mmol，1.20当量)、XantPhos(47.84mg，0.083mmol，0.20当量)、Cs2CO3(404.06mg，1.240mmol，3当量)和Pd(OAc)2(9.28mg，0.041mmol，0.10当量)。将所得混合物在100℃下搅拌16小时。通过LCMS可检测到期望的产物。使混合物冷却至室温。向混合物中添加EA(100mL)并过滤。将滤液浓缩，得到粗产物。将粗产物通过反相快速色谱法经以下条件纯化(柱：C18，330g；流动相A：水/0.05％NH4HCO3，流动相B：ACN；流速：80mL/min；梯度：20分钟40％B到70％B；检测器，254nm，监测器，220nm，在65％B下收集所需产物)，得到呈白色固体的4-[[7-([2-氟-4-[3-(羟甲基)吡唑-1-基]苯基]氨基)-1,6-萘啶-2-基]氨基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(215mg，97％)。
[1-(3-氟-4-[[2-(哌啶-4-基氨基)-1,6-萘啶-7-基]氨基]苯基)吡唑-3-基]甲醇(化合物102)。在环境温度下向TFA(3mL)在DCM(12mL)中的溶液中添加4-[[7-([2-氟-4-[3-(羟甲基)吡唑-1-基]苯基]氨基)-1,6-萘啶-2-基]氨基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(210mg，0.394mmol，1当量)。然后将混合物在环境温度下搅拌2小时。通过LCMS可检测到期望的产物。将所得混合物在减压下浓缩。将混合物用NaHCO3(水溶液)碱化至pH 8并在减压下浓缩，得到粗产物。将粗产物通过制备型HPLC纯化，得到呈浅绿色固体的[1-(3-氟-4-[[2-(哌啶-4-基氨基)-1,6-萘啶-7-基]氨基]苯基)吡唑-3-基]甲醇(33.2mg，19％)。
化合物104、166、172、173和179遵循如对于化合物102的合成所述的方法和方案来合成，使用适当的材料开始。
实施例9.化合物103和105的制备
4-[(7-氯-1,6-萘啶-2-基)[2-(环氧乙烷-2-基氧基)乙基]氨基]哌啶-1-羧酸叔丁酯。在室温下在氮气气氛下向搅拌的4-[(7-氯-1,6-萘啶-2-基)氨基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(来自化合物102的合成步骤1，100mg，0.276mmol，1当量)在DMF(5mL，64.609mmol，234.44当量)中在DMF(15mL，193.826mmol，175.83当量)中的溶液中添加NaH(34.39mg，1.433mmol，1.3当量)。在氮气气氛下将所得混合物搅拌30分钟。在室温下向上述混合物中添加2-(2-溴乙氧基)环氧乙烷(345.73mg，1.654mmol，1.5当量)。将所得混合物在80℃下搅拌16小时。通过LCMS监测反应。将反应用饱和NH4Cl(水溶液)淬灭。将所得混合物用EtOAc(2×50mL)萃取。将合并的有机层用盐水(1×50mL)洗涤，经无水Na2SO4干燥。过滤后，将滤液在减压下浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法纯化，用PE/EtOAc(20:1至3:1)洗脱，得到呈灰白色固体的4-[(7-氯-1,6-萘啶-2-基)[2-(环氧乙烷-2-基氧基)乙基]氨基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(350mg，65％)。
4-[[7-([2-氟-4-[3-(羟甲基)吡唑-1-基]苯基]氨基)-1,6-萘啶-2-基][2-(环氧乙烷-2-基氧基)乙基]氨基]哌啶-1-羧酸叔丁酯。在氮气气氛下在室温下向搅拌的4-[(7-氯-1,6-萘啶-2-基)[2-(环氧乙烷-2-基氧基)乙基]氨基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(220mg，0.448mmol，1当量)、[1-(4-氨基-3-氟苯基)吡唑-3-基]甲醇(111.40mg，0.538mmol，1.2当量)、XantPhos(51.85mg，0.090mmol，0.2当量)和Cs2CO3(291.96mg，0.896mmol，2当量)在1,4-二噁烷(6mL)中的溶液中逐滴添加Pd(OAc)2(20.12mg，0.090mmol，0.2当量)。将所得混合物在100℃下在氮气气氛下搅拌3小时。通过LCMS监测反应。将所得混合物在真空下浓缩。将残余物通过反相快速色谱法经以下条件纯化：柱：Spherical C18，20-40um，330g；流动相A：水(加5mM NH4CO3)；流动相B：ACN；流速：80mL/min；梯度：5％-5％B，10min，20min内5％B-45％B梯度；检测器：220nm。在40％B下收集含有所需产物的级分，并在减压下浓缩，得到呈白色固体的4-[[7-([2-氟-4-[3-(羟甲基)吡唑-1-基]苯基]氨基)-1,6-萘啶-2-基][2-(环氧乙烷-2-基氧基)乙基]氨基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(150mg，51％)
2-[[7-([2-氟-4-[5-(羟甲基)吡唑-1-基]苯基]氨基)-1,6-萘啶-2-基](哌啶-4-基)氨基]乙醇(化合物103)和2-[[7-([2-氟-4-[3-(羟甲基)吡唑-1-基]苯基]氨基)-1,6-萘啶-2-基)(哌啶-4-基)氨基]乙醇(化合物105)。在室温和氮气气氛下向搅拌的4-[[7-([2-氟-4-[3-(羟甲基)吡唑-1-基]苯基]氨基)-1,6-萘啶-2-基][2-(环氧乙烷-2-基氧基)乙基]氨基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(75mg，0.113mmol，1当量)在DCM(15mL，235.951mmol，2081.96当量)中的溶液中添加TFA(45mL，605.837mmol，5345.73当量)。将所得混合物在室温下搅拌2小时。通过LCMS监测反应。将所得混合物在减压下浓缩。将所得混合物用ACN(10mL)稀释。将混合物用饱和NaHCO3(水溶液)碱化至pH 8。将所得混合物在减压下浓缩。
将残余物通过反相快速色谱法经以下条件纯化：柱：Spherical C18，20-40um，330g；流动相A：水(加5mM NH4CO3)；流动相B：ACN；流速：85mL/min；梯度：5％-5％B，10min，20min内30％B-75％B梯度；检测器：254nm。在38％B下收集含所需产物的级分，并在减压下浓缩，得到所需产物(35mg混合物)。将混合物通过手性HPLC经以下条件分离：柱：CHIRALPAKIG，2*25cm，5μm；流动相A：HEX:DCM＝3:1(0.2％IPA)-HPLC，流动相B：EtOH-HPLC；流速：20mL/min；梯度：25分钟内30B到30B；220/254nm；收集17.7分钟时的级分，并在减压下浓缩，得到呈灰白色固体的2-[[7-([2-氟-4-[5-(羟甲基)吡唑-1-基]苯基]氨基)-1,6-萘啶-2-基](哌啶-4-基)氨基]乙醇(9.8mg，18％)。收集22.2分钟时的级分，并在减压下浓缩，得到呈灰白色固体的2-[[7-([2-氟-4-[3-(羟甲基)吡唑-1-基]苯基]氨基)-1,6-萘啶-2-基](哌啶-4-基)氨基]乙醇(3.9mg，7％)。
实施例10.化合物106的制备
4-[N-(7-氯-1,6-萘啶-2-基)甲磺酰胺基]哌啶-1-羧酸叔丁酯。在室温下向搅拌的4-[(7-氯-1,6-萘啶-2-基)氨基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(来自化合物102的合成的步骤1，250mg，0.689mmol，1当量)在DMF(5mL)中的溶液中添加NaH(55.11mg，1.378mmol，2当量，60％)。将所得混合物在室温下搅拌30分钟。然后添加MsCl(236.77mg，2.067mmol，3当量)。将所得混合物在室温下搅拌16小时。通过LCMS监测反应。将粗产物通过反相快速经以下条件纯化(柱：C18，330g；流动相A：水/0.05％TFA，流动相B：ACN；流速：80mL/min；梯度：20分钟内40％B到70％B；检测器，220nm，监测器，254nm，在70％B下收集所需产物)，得到呈黄色油状物的4-[N-(7-氯-1,6-萘啶-2-基)甲磺酰氨基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(200mg，66％)。
4-[N-(7-[[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]氨基]-1,6-萘啶-2-基)甲磺酰胺基]哌啶-1-羧酸叔丁酯。在室温和氮气气氛下向搅拌的4-[N-(7-氯-1,6-萘啶-2-基)甲磺酰氨基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(200mg，0.454mmol，1当量)和2-氟-4-(吡唑-1-基)苯胺(88.40mg，0.499mmol，1.10当量)在1,4-二噁烷(10mL)中的混合物中添加XantPhos(52.49mg，0.091mmol，0.20当量)、Cs2CO3(295.57mg，0.907mmol，2当量)和Pd(OAc)2(10.18mg，0.045mmol，0.10当量)。将所得混合物在100℃下在氮气气氛下搅拌3小时。通过LCMS监测反应。将所得混合物过滤，将滤饼用DCM(3×10mL)洗涤。将滤液在减压下浓缩。将残余物通过反相快速色谱法经以下条件纯化(柱：C18，330g；流动相A：水/0.05％TFA，流动相B：ACN；流速：80mL/min；梯度：20分钟内40％B到70％B；检测器，254nm，监测器，220nm，在69％B下收集的所需产物)，得到呈黄色固体的4-[N-(7-[[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]氨基]-1,6-萘啶-2-基)甲磺酰氨基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(200mg，76％)。
N-(7-[[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]氨基]-1,6-萘啶-2-基)-N-(哌啶-4-基)甲磺酰胺(化合物106)。在室温下向搅拌的4-[N-(7-[[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]氨基]-1,6-萘啶-2-基)甲磺酰氨基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(50mg，0.086mmol，1当量)在DCM(4mL)中的溶液中添加TFA(1mL，13.463mmol，156.62当量)。将所得混合物在室温下搅拌2小时。通过LCMS监测反应。将所得混合物在减压下浓缩。将残余物用饱和NaHCO3(水溶液)碱化至pH 8。将所得混合物在减压下浓缩。将粗产物(30mg)通过制备型HPLC纯化，得到呈黄色固体的N-(7-[[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]氨基]-1,6-萘啶-2-基)-N-(哌啶-4-基)甲磺酰胺(12.8mg，31％)。
实施例11.化合物109的制备
4-[N-(7-氯-1,6-萘啶-2-基)-2-甲氧基-2-氧代乙酰胺基]哌啶-1-羧酸叔丁酯。在0℃下向搅拌的4-[(7-氯-1,6-萘啶-2-基)氨基]哌啶-1-羧酸叔丁酯混合物(来自化合物102的合成步骤1，50mg，0.138mmol，1当量)和TEA(27.89mg，0.276mmol，2当量)在DCM(10mL)中的混合物中逐滴添加草酰氯甲酯(25.32mg，0.207mmol，1.50当量)。将所得混合物在室温下搅拌16小时。通过LCMS监测反应。将所得混合物用DCM(3×100mL)萃取。将合并的有机层用盐水(1×100mL)洗涤，经无水Na2SO4干燥。过滤后，将滤液在减压下浓缩。将残余物通过反相快速色谱法经以下条件纯化(柱：C18，330g；流动相A：水/0.05％TFA，流动相B：ACN；流速：80mL/min；梯度：20分钟内40％B到80％B；检测器，254nm，监测器，220nm，在74％B下收集所需产物)，得到呈粉红色固体的4-[N-(7-氯-1,6-萘啶-2-基)-2-甲氧基-2-氧代乙酰胺基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(450mg，91％)。
[[1-(叔丁氧基羰基)哌啶-4-基](7-[[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]氨基]-1,6-萘啶-2-基)氨基甲酰基]甲酸。在室温和氮气气氛下向搅拌的4-[N-(7-氯-1,6-萘啶-2-基)-2-甲氧基-2-氧代乙酰胺基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(400mg，0.891mmol，1当量)和2-氟-4-(吡唑-1-基)苯胺(189.46mg，1.069mmol，1.20当量)在1,4-二噁烷(10mL)中的混合物中添加XantPhos(103.12mg，0.178mmol，0.20当量)、Cs2CO3(580.65mg，1.782mmol，2当量)和Pd(OAc)2(20.01mg，0.089mmol，0.10当量)。将所得混合物在100℃下在氮气气氛下搅拌5小时。通过LCMS监测反应。使混合物冷却至室温。将所得混合物过滤，将滤饼用EtOAc(3×10mL)洗涤。将滤液在减压下浓缩。将残余物通过反相快速色谱法经以下条件纯化(柱：C18，330g；流动相A：水/0.05％NH4HCO3，流动相B：ACN；流速：80mL/min；梯度：30分钟内30％B到70％B；检测器，254nm，监测器，220nm，在57％B下收集所需产物)，得到呈黄色固体的[[1-(叔丁氧基羰基)哌啶-4-基](7-[[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]氨基]-1,6-萘啶-2-基)氨基甲酰基]甲酸(100mg，19％)。
[(7-[[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]氨基]-1,6-萘啶-2-基)(哌啶-4-基)氨基甲酰基]甲酸(化合物109)。在室温下向搅拌的[[1-(叔丁氧基羰基)哌啶-4-基](7-[[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]氨基]-1,6-萘啶-2-基)氨基甲酰基]甲酸(100mg，1当量)在DCM(4mL)中的溶液中添加TFA(1mL)。将所得混合物在室温下搅拌2小时。通过LCMS监测反应。将混合物用饱和NaHCO3(水溶液)碱化至pH 8。将所得混合物在减压下浓缩。将粗产物(50mg)通过制备型HPLC纯化，得到呈黄色固体的[(7-[[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]氨基]-1,6-萘啶-2-基)(哌啶-4-基)氨基甲酰基]甲酸(24.1mg，29％)。
实施例12.化合物110的制备
2-[(1r,4r)-4-羟基环己基]氨基]乙酸甲酯。在室温和氮气气氛下向搅拌的(1r,4r)-4-氨基环己烷-1-醇(5g，43.412mmol，1当量)和2-溴乙酸甲酯(6.64g，0.043mmol，1当量)在DMF(10mL)中的混合物中添加DIEA(11.22g，0.087mmol，2当量)。将所得混合物在110℃下在氮气气氛下搅拌16小时。通过LCMS监测反应。使混合物冷却至室温。将所得混合物在减压下浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法纯化，用DCM/MeOH(20:1至15:1)洗脱，得到呈白色固体的2-[(1r,4r)-4-羟基环己基]氨基]乙酸甲酯(3g，37％)。
2-[(7-氯-1,6-萘啶-2-基)[(1r,4r)-4-羟基环己基]氨基]乙酸甲酯。在室温下向搅拌的2-[(1r,4r)-4-羟基环己基]氨基]乙酸甲酯(2g，10.682mmol，1当量)和2,7-二氯-1,6-萘啶(1.06g，5.341mmol，0.50当量)在THF(2mL)中的混合物中添加DIEA(1.38g，10.678mmol，1当量)。将所得混合物在110℃下在氮气气氛下搅拌16小时。通过LCMS监测反应。使混合物冷却至室温。将残余物通过硅胶柱色谱法纯化，用PE/EtOAc(20:1至5:1)洗脱，得到呈黄色油状物的2-[(7-氯-1,6-萘啶-2-基)[(1r,4r)-4-羟基环己基]氨基]乙酸甲酯(200mg，36％)。
2-[[7-([2-氟-4-[3-(羟甲基)吡唑-1-基]苯基]氨基)-1,6-萘啶-2-基][(1r,4r)-4-羟基环己基]氨基]乙酸甲酯。在室温和氮气气氛下向搅拌的2-[(7-氯-1,6-萘啶-2-基)[(1r,4r)-4-羟基环己基]氨基]乙酸甲酯(300mg，0.858mmol，1当量)和[1-(4-氨基-3-氟苯基)吡唑-3-基]甲醇(195.47mg，0.943mmol，1.10当量)在1,4-二噁烷(10mL)中的混合物中添加XantPhos(148.86mg，0.257mmol，0.30当量)、Cs2CO3(558.84mg，1.715mmol，2当量)和Pd(OAc)2(28.88mg，0.129mmol，0.15当量)。将所得混合物在100℃下在氮气气氛下搅拌2小时。通过LCMS监测反应。使混合物冷却至室温。将所得混合物过滤，将滤饼用EtOAc(3×10mL)洗涤。将滤液在减压下浓缩。将残余物通过反相快速色谱法经以下条件纯化(柱：C18，330g；流动相A：水/0.05％NH4HCO3，流动相B：ACN；流速：80mL/min；梯度：20分钟内20％B到50％B；检测器，254nm和220nm，在46％B下收集所需产物)，得到呈黄色固体的2-[[7-([2-氟-4-[3-(羟甲基)吡唑-1-基]苯基]氨基)-1,6-萘啶-2-基][(1r,4r)-4-羟基环己基]氨基]乙酸甲酯(200mg，45％)。
[[7-([2-氟-4-[3-(羟甲基)吡唑-1-基]苯基]氨基)-1,6-萘啶-2-基][(1r,4r)-4-羟基环己基]氨基]乙酸(化合物110)。在室温下向搅拌的2-[[7-([2-氟-4-[3-(羟甲基)吡唑-1-基]苯基]氨基)-1,6-萘啶-2-基][(1r,4r)-4-羟基环己基]氨基]乙酸甲酯(120mg，0.231mmol，1当量)在THF(10mL)和H2O(2mL)中的溶液中添加LiOH(27.60mg，1.153mmol，5当量)。将所得混合物在室温下搅拌16小时。将混合物用HCl(水溶液)酸化至pH 6。通过LCMS监测反应。将所得混合物在减压下浓缩。将粗产物(100mg)通过制备型HPLC纯化，得到呈绿色固体的[[7-([2-氟-4-[3-(羟甲基)吡唑-1-基]苯基]氨基)-1,6-萘啶-2-基][(1r,4r)-4-羟基环己基]氨基]乙酸(71.5mg，73％)。
实施例13.化合物114和116的制备
3-甲基4-氨基-5,6-二氢-2H-吡啶-1,3-二羧酸1-叔丁酯。在0℃下向搅拌的3-甲基4-氧代哌啶-1,3-二羧酸1-叔丁酯(4g，15.547mmol，1当量)在MeOH(100mL)中的溶液中添加NH4OAc(3.60g，46.641mmol，3当量)。将所得混合物在室温下搅拌16小时。通过TLC监测反应。将所得混合物用DCM(3×200mL)萃取。将合并的有机层用盐水(1×300mL)洗涤，经无水Na2SO4干燥。过滤后，将滤液在减压下浓缩。这产生呈白色固体的4-氨基-5,6-二氢-2H-吡啶-1,3-二羧酸1-叔丁酯3-甲酯(3.8g，95％)。
4-氨基哌啶-1,3-二羧酸1-叔丁酯3-甲酯。在0℃下向搅拌的4-氨基-5,6-二氢-2H-吡啶-1,3-二羧酸1-叔丁酯3-甲酯(3.80g，14.826mmol，1当量)在THF(35mL)中的溶液中添加NaBH(OAc)3(7.86g，37.086mmol，2.50当量)和HOAc(10mL，174.515mmol，11.77当量)。将所得混合物在室温下搅拌2小时。通过LCMS监测反应。将混合物用饱和NaHCO3(水溶液)碱化至pH 8。将所得混合物用DCM/MeOH(10:1)(3×100mL)萃取。将合并的有机层用盐水(1×100mL)洗涤，经无水Na2SO4干燥。过滤后，将滤液在减压下浓缩。这产生呈白色固体的4-氨基哌啶-1,3-二羧酸1-叔丁酯3-甲酯(1.2g，31％)。
4-[(7-氯-1,6-萘啶-2-基)氨基]哌啶-1,3-二羧酸1-叔丁酯3-甲酯。在室温下向搅拌的4-氨基哌啶-1,3-二羧酸1-叔丁酯3-甲酯(500mg，1.936mmol，1当量)和2,7-二氯-1,6-萘啶(192.62mg，0.968mmol，0.5当量)在THF(5mL)中的混合物中添加DIEA(250.16mg，1.936mmol，1当量)。将所得混合物在110℃下搅拌16小时。通过LCMS监测反应。使混合物冷却至室温。将粗产物通过反相快速经以下条件纯化(柱：C18，330g；流动相A：水/0.05％TFA，流动相B：ACN；流速：80mL/min；梯度：20分钟内20％B到50％B；检测器，254nm和220nm，在50％B下收集所需产物)，得到呈白色固体的4-[(7-氯-1,6-萘啶-2-基)氨基]哌啶-1,3-二羧酸1-叔丁酯3-甲酯(500mg，61％)。
4-[[7-([2-氟-4-[3-(羟甲基)吡唑-1-基]苯基]氨基)-1,6-萘啶-2-基]氨基]哌啶-1,3-二羧酸1-叔丁酯3-甲酯。在环境温度下向搅拌的4-[(7-氯-1,6-萘啶-2-基)氨基]哌啶-1,3-二羧酸1-叔丁酯3-甲酯(0.50g，1.19mmol)和[1-(4-氨基-3-氟苯基)吡唑-3-基]甲醇(0.27g，1.31mmol)在1,4-二噁烷(10.0mL)中的溶液中添加XantPhos(0.21g，0.36mmol)、碳酸铯(0.77g，2.38mmol)和乙酸钯(40.0mg，0.18mmol)将反应混合物用氮气吹扫3次，并在氮气气氛下在100℃下搅拌2小时。将所得混合物冷却至环境温度并过滤。将滤饼用乙酸乙酯(3×10.0mL)洗涤。将滤液在减压下浓缩。将残余物通过反相快速色谱法纯化。收集含有所需产物的级分，并在减压下浓缩，得到呈黄色固体的标题化合物(0.27g，38％)。
4-[[7-([2-氟-4-[3-(羟甲基)吡唑-1-基]苯基]氨基)-1,6-萘啶-2-基]氨基]哌啶-3-羧酸甲酯。在0℃下向4-[[7-([2-氟-4-[3-(羟甲基)吡唑-1-基]苯基]氨基)-1,6-萘啶-2-基]氨基]哌啶-1,3-二羧酸1-叔丁酯3-甲酯(270mg，0.456mmol，1当量)在MeOH(8mL)中的溶液中逐滴添加1,4-二噁烷(2mL)中的HCl(气体)。将所得混合物在室温下搅拌1小时。通过LCMS监测反应。将所得混合物在减压下浓缩。将残余物用饱和NaHCO3(水溶液)碱化至pH 8。将所得混合物在减压下浓缩。将残余产物通过反相快速色谱法经以下条件纯化(柱：C18，330g；流动相A：水/0.05％NH4HCO3，流动相B：ACN；流速：80mL/min；梯度：20分钟内20％B到50％B；检测器，254nm和220nm，在45％B下收集所需产物)，得到呈白色固体的4-[[7-([2-氟-4-[3-(羟甲基)吡唑-1-基]苯基]氨基)-1,6-萘啶-2-基]氨基]哌啶-3-羧酸甲酯(150mg，66％)。将粗产物(150mg)通过制备型手性HPLC经以下条件纯化(柱：CHIRALPAK IE，2*25cm，5μm；流动相A：MTBE(10mM NH3-MEOH)-HPLC，流动相B：EtOH-HPLC；流速：20mL/min；梯度：20分钟内15B到15B；220/254nm；RT1：12.224；RT2：14.576)，得到(3S,4S)-4-[[7-([2-氟-4-[3-(羟甲基)吡唑-1-基]苯基]氨基)-1,6-萘啶-2-基]氨基]哌啶-3-羧酸甲酯和(3R，4R)-4-[[7-([2-氟-4-[3-(羟甲基)吡唑-1-基]苯基]氨基)-1,6-萘啶-2-基]氨基]哌啶-3-羧酸甲酯(各自60mg)
(3S,4S)-4-[[7-([2-氟-4-[3-(羟甲基)吡唑-1-基]苯基]氨基)-1,6-萘啶-2-基]氨基]哌啶-3-羧酸(化合物116)。在室温下向搅拌的(3S,4S)-4-[[7-([2-氟-4-[3-(羟甲基)吡唑-1-基]苯基]氨基)-1,6-萘啶-2-基]氨基]哌啶-3-羧酸甲酯(60mg，0.122mmol，1当量)在THF(2mL)和H2O(10mL)中的溶液中添加LiOH(14.62mg，0.610mmol，5当量)。将所得混合物在室温下搅拌2小时。通过LCMS监测反应。将所得混合物在减压下浓缩。将粗产物通过制备型HPLC纯化(60mg)，得到呈黄色固体的(3S,4S)-4-[[7-([2-氟-4-[3-(羟甲基)吡唑-1-基]苯基]氨基)-1,6-萘啶-2-基]氨基]哌啶-3-羧酸(33.8mg，57％)。
(3R,4R)-4-[[7-([2-氟-4-[3-(羟甲基)吡唑-1-基]苯基]氨基)-1,6-萘啶-2-基]氨基]哌啶-3-羧酸(化合物114)。在室温下向搅拌的(3R，4R)-4-[[7-([2-氟-4-[3-(羟甲基)吡唑-1-基]苯基]氨基)-1,6-萘啶-2-基]氨基]哌啶-3-羧酸甲酯(60mg，0.122mmol，1当量)在THF(10mL)和H2O(2mL)中的溶液中添加LiOH(14.62mg，0.610mmol，5当量)。将所得混合物在室温下搅拌2小时。通过LCMS监测反应。将所得混合物在减压下浓缩。将粗产物通过制备型HPLC纯化(60mg)，得到呈黄色固体的(3R,4R)-4-[[7-([2-氟-4-[3-(羟甲基)吡唑-1-基]苯基]氨基)-1,6-萘啶-2-基]氨基]哌啶-3-羧酸(29.3mg，50％)。
实施例14.化合物131的制备
4-氨基-5,6-二氢-2H-吡啶-1,3-二羧酸1-苄酯3-甲酯。在室温下向搅拌的4-氧代哌啶-1,3-二羧酸1-苄酯3-甲酯(3g，10.299mmol，1当量)在MeOH(100mL)中的溶液中添加NH4OAc(2.38g，30.896mmol，3当量)。将所得混合物在室温下搅拌16小时。通过LCMS监测反应。将所得混合物用DCM(3×300mL)萃取。将合并的有机层用盐水(1×300mL)洗涤，经无水Na2SO4干燥。过滤后，将滤液在减压下浓缩。这产生了呈白色固体的4-氨基-5,6-二氢-2H-吡啶-1,3-二羧酸1-苄酯3-甲酯(2.8g，93％)。
4-氨基哌啶-1,3-二羧酸1-苄酯3-甲酯。在0℃下向搅拌的4-氨基-5,6-二氢-2H-吡啶-1,3-二羧酸1-苄酯3-甲酯(2.80g，9.645mmol，1当量)在ACN(45mL)中的溶液中添加NaBH(OAc)3(8.18g，38.578mmol，4当量)和HOAc(30mL)。将所得混合物在室温下搅拌16小时。通过LCMS监测反应。将所得混合物在减压下浓缩。将残余物通过反相快速经以下条件纯化(柱：C18，330g；流动相A：水/0.05％NH4HCO3，流动相B：ACN；流速：80mL/min；梯度：20分钟内15％B到35％B；检测器，220nm，监测器，254nm，在32％B下收集所需产物)，得到呈白色固体的4-氨基哌啶-1,3-二羧酸1-苄酯3-甲酯(1.6g，56％)。
4-[(7-氯-1,6-萘啶-2-基)氨基]哌啶-1,3-二羧酸1-苄酯3-甲酯。在室温下向搅拌的4-氨基哌啶-1,3-二羧酸1-苄酯3-甲酯(800mg，2.737mmol，1当量)和DIEA(707.37mg，5.473mmol，2当量)在THF(2mL)中的混合物中添加2,7-二氯-1,6-萘啶(653.60mg，3.284mmol，1.20当量)。将所得混合物在110℃下搅拌16小时。通过LCMS监测反应。使混合物冷却至室温。将所得混合物在减压下浓缩。将残余物通过反相快速色谱法经以下条件纯化(柱：C18，330g；流动相A：水/0.05％TFA，流动相B：ACN；流速：80mL/min；梯度：20分钟内20％B到50％B；检测器，254nm，监测器，220nm，在42％B下收集所需产物)，得到4-[(7-氯-1,6-萘啶-2-基)氨基]哌啶-1,3-二羧酸1-苄酯3-甲酯(140mg，11％)。
4-[[7-([2-氟-4-[3-(羟甲基)吡唑-1-基]苯基]氨基)-1,6-萘啶-2-基]氨基]哌啶-1,3-二羧酸1-苄酯3-甲酯。在室温和氮气气氛下向搅拌的4-[(7-氯-1,6-萘啶-2-基)氨基]哌啶-1,3-二羧酸1-苄酯3-甲酯(140mg，0.308mmol，1当量)和[1-(4-氨基-3-氟苯基)吡唑-3-基]甲醇(76.52mg，0.369mmol，1.20当量)在1,4-二噁烷(4mL)中的混合物中添加Pd(OAc)2(10.36mg，0.046mmol，0.15当量)、XantPhos(53.42mg，0.092mmol，0.30当量)和Cs2CO3(200.54mg，0.616mmol，2当量)。将所得混合物在110℃下在氮气气氛下搅拌2小时。通过LCMS监测反应。使混合物冷却至室温。将所得混合物过滤，将滤饼用EtOAc(3×10mL)洗涤。将滤液在减压下浓缩。将残余物通过反相快速色谱法经以下条件纯化(柱：C18，330g；流动相A：水/0.05％TFA，流动相B：ACN；流速：80mL/min；梯度：20分钟内30％B到60％B；检测器，254nm，监测器，220nm，在48％B下收集所需产物)，得到呈绿色固体的4-[[7-([2-氟-4-[3-(羟甲基)吡唑-1-基]苯基]氨基)-1,6-萘啶-2-基]氨基]哌啶-1,3-二羧酸1-苄酯3-甲酯(110mg，57％)。
4-[[7-([2-氟-4-[3-(羟甲基)吡唑-1-基]苯基]氨基)-1,6-萘啶-2-基]氨基]哌啶-3-羧酸甲酯。在室温下在氢气气氛下向搅拌的4-[[7-([2-氟-4-[3-(羟甲基)吡唑-1-基]苯基]氨基)-1,6-萘啶-2-基]氨基]哌啶-1,3-二羧酸1-苄酯3-甲酯(110mg，0.176mmol，1当量)在MeOH(10mL)中的溶液中添加钯/碳(9.36mg，0.088mmol，0.50当量)。将所得混合物在室温下在氢气气氛下搅拌2小时。通过LCMS监测反应。将所得混合物过滤，将滤饼用MeOH(3×20mL)洗涤。将滤液在减压下浓缩。粗产物不经进一步纯化直接用于下一步。
顺式-4-[[7-([2-氟-4-[3-(羟甲基)吡唑-1-基]苯基]氨基)-1,6-萘啶-2-基]氨基]哌啶-3-羧酸(化合物131)。在室温和氮气气氛下向搅拌的4-[[7-([2-氟-4-[3-(羟甲基)吡唑-1-基]苯基]氨基)-1,6-萘啶-2-基]氨基]哌啶-3-羧酸甲酯(60mg，0.122mmol，1当量)在THF(5mL)和H2O(1mL)中的溶液中添加LiOH(14.62mg，0.610mmol，5当量)。将所得混合物在室温下搅拌1小时。通过LCMS监测反应。将所得混合物在减压下浓缩。将粗产物(30mg)通过制备型HPLC纯化，得到呈淡黄色固体的顺式-4-[[7-([2-氟-4-[3-(羟甲基)吡唑-1-基]苯基]氨基)-1,6-萘啶-2-基]氨基]哌啶-3-羧酸(7mg，12％)。
实施例15.化合物140的制备
4-[(7-氯-1,6-萘啶-2-基)氨基]-4-甲基哌啶-1-羧酸叔丁酯。在氮气气氛下在室温下向搅拌的4-氨基-4-甲基哌啶-1-羧酸叔丁酯(646.06mg，3.015mmol，1.20当量)和2,7-二氯-1,6-萘啶(500mg，2.512mmol，1当量)在THF(2mL)中的混合物中分批添加DIEA(974.05mg，7.537mmol，3当量)。将所得混合物在110℃下在氮气气氛下搅拌16小时。通过LCMS监测反应。使混合物冷却至室温，并在减压下浓缩。将残余物通过反相快速色谱法经以下条件纯化：柱：Spherical C18，20-40um，330g；流动相A：水(加5mM NH4NO3)；流动相B：ACN；流速：80mL/min；梯度：5％-5％B，10min，30min内55％B-95％B梯度；检测器：245nm。在83％B下收集含有所需产物的级分，并在减压下浓缩，得到呈白色固体的4-[(7-氯-1,6-萘啶-2-基)氨基]-4-甲基哌啶-1-羧酸叔丁酯(170mg，17％)。
7-氯-N-(4-甲基哌啶-4-基)-1,6-萘啶-2-胺。在室温下向搅拌的4-[(7-氯-1,6-萘啶-2-基)氨基]-4-甲基哌啶-1-羧酸叔丁酯(170mg，0.451mmol，1当量)在ClCH2CH2Cl(10mL)中的溶液中分批添加TFA(1mL，13.463mmol，29.85当量)。将所得混合物在室温下搅拌30分钟。通过LCMS监测反应。将所得混合物在减压下浓缩。将残余物通过反相快速色谱法经以下条件纯化：柱：Spherical C18，20-40um，330g；流动相A：水(加5mM NH4NO3)；流动相B：ACN；流速：80mL/min；梯度：5％-5％B，10min，30min内35％B-65％B梯度；检测器：254nm。在59％B下收集含有所需产物的级分，并在减压下浓缩，得到呈浅棕色固体的7-氯-N-(4-甲基哌啶-4-基)-1,6-萘啶-2-胺(50mg，40％)。
7-氯-N-(1,4-二甲基哌啶-4-基)-1,6-萘啶-2-胺。在室温和氮气气氛下向搅拌的7-氯-N-(4-甲基哌啶-4-基)-1,6-萘啶-2-胺(50mg，0.181mmol，1当量)和NaBH(OAc)3(76.58mg，0.361mmol，2当量)在THF(5mL)中的混合物中添加CH3COOH(21.70mg，0.361mmol，2当量)和HCHO(10.85mg，0.361mmol，2当量)。将所得混合物在80℃下在氮气气氛下搅拌4小时。通过LCMS监测反应。使混合物冷却至室温。将残余物通过反相快速色谱法经以下条件纯化：柱：Spherical C18，20-40um，330g；流动相A：水(加5mM NH4NO3)；流动相B：ACN；流速：80mL/min；梯度：5％-5％B，10min，30min内35％B-75％B梯度；检测器：254nm。在59％B下收集含有所需产物的级分，并在减压下浓缩，得到呈浅棕色固体的7-氯-N-(1,4-二甲基哌啶-4-基)-1,6-萘啶-2-胺(20mg，38％)。
[1-[4-([2-[(1,4-二甲基哌啶-4-基)氨基]-1,6-萘啶-7-基]氨基)-3-氟苯基]吡唑-3-基]甲醇(化合物140)。在室温下在氮气气氛下向搅拌的7-氯-N-(1,4-二甲基哌啶-4-基)-1,6-萘啶-2-胺(20mg，0.069mmol，1当量)和[1-(4-氨基-3-氟苯基)吡唑-3-基]甲醇(18.53mg，0.089mmol，1.30当量)在1,4-二噁烷(2mL)中的混合物中添加XantPhos(11.94mg，0.021mmol，0.30当量)、Cs2CO3(44.82mg，0.138mmol，2当量)和乙酸钯(3.09mg，0.014mmol)。将所得混合物在100℃下在氮气气氛下搅拌2小时。通过LCMS监测反应。使混合物冷却至室温。将残余物通过反相快速色谱法经以下条件下纯化：(柱：Sunfire PrepC18OBD柱，10um，19*250mm)，得到呈白色固体的[1-[4-([2-[(1,4-二甲基哌啶-4-基)氨基]-1,6-萘啶-7-基]氨基)-3-氟苯基]吡唑-3-基]甲醇(5.1mg，14％)。
化合物313和318遵循如对于化合物140的合成所述的方法和方案来合成，使用适当的材料开始。
实施例16.化合物162的制备
4-[(氨基甲酰甲基)氨基]哌啶-1-羧酸苄酯：在环境温度下向搅拌的4-氨基哌啶-1-羧酸苄酯(3.00g，12.8mmol)在N-乙基-N-异丙基丙-2-胺(10.0mL)中的溶液中添加2-溴乙酰胺(1.41g，10.2mmol)。将反应混合物在60℃下搅拌16小时。将所得混合物冷却至环境温度，并在减压下浓缩。将残余物通过反相快速色谱法经以下条件纯化：柱：C18柱330g；流动相A：水(加5mM NH4HCO3)；流动相B：ACN；流速：80mL/min；梯度：20分钟内33％B到45％B；检测器：UV254/220nm。在40％B下收集含有所需产物的级分，并在减压下浓缩，得到呈白色固体的标题化合物(2.00g，53％)。
4-[(氨基甲酰甲基)(7-氯-1,6-萘啶-2-基)氨基]哌啶-1-羧酸苄酯：在环境温度下向搅拌的2,7-二氯-1,6-萘啶(0.70g，3.52mmol)在N-乙基-N-异丙基丙-2-胺(3.00mL)中的溶液中添加4-[(氨基甲酰甲基)氨基]哌啶-1-羧酸苄酯(1.23g，4.22mmol)。将反应混合物在100℃下搅拌48h。将所得混合物冷却至环境温度，并在减压下浓缩。将残余物通过反相快速色谱法经以下条件纯化：柱：C18柱330g；流动相A：水(加5mM NH4HCO3)；流动相B：ACN；流速：80mL/min；梯度：20分钟内40％B到70％B；检测器：UV 254/220nm。在64％B下收集含有所需产物的级分，并在减压下浓缩，得到呈黄色固体的标题化合物(0.70g，43％)。
4-[(7-氯-1,6-萘啶-2-基)(氰基甲基)氨基]哌啶-1-羧酸苄酯：在0℃下向搅拌的4-[(氨基甲酰甲基)(7-氯-1,6-萘啶-2-基)氨基]哌啶-1-羧酸苄酯(0.70g，1.54mmol)和三氟乙酸酐(0.65g，3.08mmol)在二氯甲烷(20.0mL)中的溶液中添加三乙胺(0.47g，4.63mmol)。将反应溶液缓慢升温至室温并搅拌2小时。将所得混合物在减压下浓缩。将残余物用硅胶柱色谱纯化，用石油醚中的1-50％乙酸乙酯洗脱，得到呈黄色固体的标题化合物(0.50g，74％)。
4-[(氰甲基)[7-([2-氟-4-[3-(羟甲基)吡唑-1-基]苯基]氨基)-1,6-萘啶-2-基]氨基]哌啶-1-羧酸苄酯。在氮气气氛下在室温下向搅拌的4-[(7-氯-1,6-萘啶-2-基)(氰甲基)氨基]哌啶-1-羧酸苄酯(120mg，0.275mmol，1当量)和[1-(4-氨基-3-氟苯基)吡唑-3-基]甲醇(62.75mg，0.303mmol，1.10当量)在1,4-二噁烷(10.00mL)中的混合物中分批添加Pd(OAc)2(9.27mg，0.041mmol，0.15当量)、XantPhos(47.79mg，0.083mmol，0.30当量)和Cs2CO3(179.39mg，0.551mmol，2.00当量)。将所得混合物在100℃下在氮气气氛下搅拌2小时。通过LCMS监测反应。使混合物冷却至室温。将所得混合物用EtOAc(3×300mL)萃取。将合并的有机层用盐水(2×100mL)洗涤，经无水Na2SO4干燥。过滤后，将滤液在减压下浓缩。将残余物通过反相快速色谱法经以下条件纯化：柱：Spherical C18，20-40um，120g；流动相A：水(加5mM NH4HCO3)；流动相B：ACN；流速：45mL/min；梯度：5％-5％B，10min，20min内60％B-90％B梯度；检测器：220nm。在85％B下收集含有所需产物的级分，并在减压下浓缩，得到呈黄色固体的4-[(氰基甲基)[7-([2-氟-4-[3-(羟甲基)吡唑-1-基]苯基]氨基)-1,6-萘啶-2-基]氨基]哌啶-1-羧酸苄酯(120mg，72％)。
2-[[7-([2-氟-4-[3-(羟甲基)吡唑-1-基]苯基]氨基)-1,6-萘啶-2-基](哌啶-4-基)氨基]乙腈(化合物162)。在100mL圆底烧瓶中在氮气气氛下，向4-[(氰基甲基)[7-([2-氟-4-[3-(羟甲基)吡唑-1-基]苯基]氨基)-1,6-萘啶-2-基]氨基]哌啶-1-羧酸苄酯(100mg)在EtOH(40mL)中的溶液中添加Pd/C(30mg)。使用氢气球将混合物在室温下在氢气气氛下氢化48小时，通过硅藻土垫过滤并在减压下浓缩。通过LCMS监测反应。将残余物通过制备型HPLC纯化，得到呈黄色固体的2-[[7-([2-氟-4-[3-(羟甲基)吡唑-1-基]苯基]氨基)-1,6-萘啶-2-基](哌啶-4-基)氨基]乙腈(7.8mg)。
实施例17.化合物287和309的制备
4-甲基吡唑-1-羧酸叔丁酯。在室温下向搅拌的甲吡唑(2.50g，30.448mmol，1当量)和二碳酸二叔丁酯(7.31g，33.5mmol)在DCM(40mL)中的溶液中添加DMAP(371.98mg，3.045mmol，0.10当量)。将所得混合物在室温下搅拌1小时。将所得混合物用DCM(100mL)稀释，将所得混合物用稀盐酸(100mL，0.5N)、水(100mL)、饱和盐水(100mL)洗涤，用无水硫酸钠干燥。过滤后，在减压下浓缩滤液，得到呈棕色油状物的4-甲基吡唑-1-羧酸叔丁酯(5.20g，93％)。
4-[(1H-吡唑-4-基甲基)氨基]哌啶-1-羧酸叔丁酯。在环境温度下，向搅拌的4-甲基吡唑-1-羧酸叔丁酯(4.00g，21.9mmol)在四氯化碳(80mL)中的溶液中添加AIBN(0.36g，2.19mmol)和NBS(4.30g，24.1mmol)。将反应混合物在70℃下搅拌16小时。将所得混合物冷却至环境温度。向上述混合物中添加4-氨基哌啶-1-羧酸叔丁酯(6.59g，32.9mmol)和N-乙基-N-异丙基丙-2-胺(8.50g，65.9mmol)。将所得混合物在环境温度下再搅拌16小时将所得混合物在减压下浓缩。将残余物通过反相快速色谱法经以下条件纯化：柱：C18柱330g；流动相A：水(加0.05％FA)；流动相B：ACN；流速：45mL/min；梯度：20分钟内10％B到35％B；检测器：UV 254/220nm。在30％B下收集含有所需产物的级分，并在减压下浓缩，得到呈黄色固体的4-[(1H-吡唑-4-基甲基)氨基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(2.99g，36％)。
4-[(7-氯-1,6-萘啶-2-基)(1H-吡唑-4-基甲基)氨基]哌啶-1-羧酸叔丁酯。在氮气气氛下在℃下将4-[(1H-吡唑-4-基甲基)氨基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(1g，3.567mmol，1当量)、2,7-二氯-1,6-萘啶(0.71g，3.567mmol，1当量)和DIEA(1.38g，10.700mmol，3当量)在DMF(20mL)中的溶液搅拌16小时。将所得混合物通过反相快速色谱法经以下条件纯化(柱：Spherical C18，20～40um，330g；流动相A：水(10mM NH4HCO3)，流动相B：ACN；流速：85mL/min；梯度(B％)：5％，5min；5％～35％，15min；35％～75％，18min，75％～95％15min；95％，5min；检测器：220nm。收集含有所需产物的级分，并在减压下浓缩，得到呈淡黄色固体的4-[(7-氯-1,6-萘啶-2-基)(1H-吡唑-4-基甲基)氨基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(245mg，15％)。
4-[(7-氯-1,6-萘啶-2-基)([[1-(环氧乙烷-2-基)吡唑-4-基]甲基])氨基]哌啶-1-羧酸叔丁酯。在室温下向搅拌的4-[(7-氯-1,6-萘啶-2-基)(1H-吡唑-4-基甲基)氨基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(225mg，0.508mmol，1当量)和3,4-二氢-2H-吡喃(0.85g，10.2mmol)在THF(10mL)中的混合物中添加对甲苯磺酸(17.49mg，0.102mmol，0.20当量)。将所得混合物在60℃下在氮气气氛下搅拌16小时。将所得混合物在减压下浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法纯化，用DCM/MeOH(100:1至30:1)洗脱，得到呈淡黄色固体的4-[(7-氯-1,6-萘啶-2-基)([[1-(环氧乙烷-2-基)吡唑-4-基]甲基])氨基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(165mg，61％)。
4-[[7-([2-氟-4-[3-(羟甲基)吡唑-1-基]苯基]氨基)-1,6-萘啶-2-基]([[1-(环氧乙烷-2-基)吡唑-4-基]甲基])氨基]哌啶-1-羧酸叔丁酯。在环境温度下向搅拌的4-[(7-氯-1,6-萘啶-2-基)([[1-(环氧乙烷-2-基)吡唑-4-基]甲基])氨基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(50.0mg，0.095mmol)和[1-(4-氨基-3-氟苯基)吡唑-3-基]甲醇(21.6mg，0.11mmol)在1,4-二噁烷(3mL)中的溶液中添加乙酸钯(3.19mg，0.014mmol)、XantPhos(16.5mg，0.028mmol)和碳酸铯(61.8mg，0.19mmol)。将反应混合物用氮气吹扫3次，并在氮气气氛下在100℃下搅拌2h。将所得混合物冷却至环境温度，用水(20.0mL)稀释，用二氯甲烷(3×20.0mL)萃取。将合并的有机层用盐水(3×10.0mL)洗涤，用无水硫酸钠干燥并过滤。将滤液在减压下浓缩。将残余物通过制备型TLC(二氯甲烷:甲醇＝15:1)纯化，得到呈黄色固体的标题化合物(50.0mg，在LCMS上的纯度为62％，产率为75％)，其不经进一步纯化即直接用于下一步
[1-[3-氟-4-([2-[哌啶-4-基(1H-吡唑-4-基甲基)氨基]-1,6-萘啶-7-基]氨基)苯基]吡唑-3-基]甲醇(化合物287)。在室温下向搅拌的4-[[7-([2-氟-4-[3-(羟甲基)吡唑-1-基]苯基]氨基)-1,6-萘啶-2-基]([[1-(环氧乙烷-2-基)吡唑-4-基]甲基])氨基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(12mg)在DCM(4mL)中的溶液中逐滴添加TFA(0.5mL)。将反应混合物在室温下搅拌2小时。通过LCMS监测反应。将所得混合物在减压下浓缩。将残余物用饱和NaHCO3(水溶液)碱化至pH＝8。将所得混合物用EtOAc(2×50mL)萃取。将合并的有机层用盐水(1×50mL)洗涤，经无水Na2SO4干燥。过滤后，将滤液在减压下浓缩。将残余物通过制备型HPLC纯化，得到呈白色固体的[1-[3-氟-4-([2-[哌啶-4-基(1H-吡唑-4-基甲基)氨基]-1,6-萘啶-7-基]氨基)苯基]吡唑-3-基]甲醇(3.4mg)。
[1-[3-氟-4-([2-[(1-甲基哌啶-4-基)(1H-吡唑-4-基甲基)氨基]-1,6-萘啶-7-基]氨基)苯基]吡唑-3-基]甲醇(化合物309)。在0℃下向搅拌的[1-[3-氟-4-([2-[哌啶-4-基(1H-吡唑-4-基甲基)氨基]-1,6-萘啶-7-基]氨基)苯基]吡唑-3-基]甲醇(4mg，08mmol，1当量)和HCHO(0.01mL，0.333mmol，35.06当量)在MeOH(5mL)中的溶液中逐滴添加NaBH3CN(0.73mg，0.012mmol，1.49当量)。将反应混合物在室温下搅拌2小时。通过LCMS监测反应。将残余物用饱和NaHCO3(水溶液)碱化至pH＝8。将所得混合物在减压下浓缩。将残余物通过制备型HPLC纯化，得到呈白色固体的[1-[3-氟-4-([2-[(1-甲基哌啶-4-基)(1H-吡唑-4-基甲基)氨基]-1,6-萘啶-7-基]氨基)苯基]吡唑-3-基]甲醇(1.4mg，34％)。
实施例18.化合物124的制备
4-(溴亚甲基)哌啶-1-羧酸叔丁酯。在-20℃下在氮气气氛下向搅拌的(溴甲基)三苯基溴化磷鎓(15321.66mg，35.132mmol，1.4当量)在THF(50mL)中的溶液/混合物中逐滴/分批添加LiHMDS(7558.01mg，45.169mmol，1.8当量)。将所得混合物在-20℃下在氮气气氛下搅拌1小时。在-20℃下向上述混合物中逐滴添加4-氧代哌啶-1-羧酸叔丁酯(5g，25.094mmol，1当量)。将所得混合物在室温下再搅拌16小时。通过LCMS监测反应。将反应用饱和NH4Cl(水溶液)在室温下淬灭。将所得混合物用EtOAc(3×50mL)萃取。将合并的有机层用盐水(2×50mL)洗涤，经无水Na2SO4干燥。过滤后，将滤液在减压下浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法纯化，用PE/EtOAc(20:1至5:1)洗脱，得到呈灰白色固体的4-(溴亚甲基)哌啶-1-羧酸叔丁酯(2.5g，36％)。
4-[(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧硼杂环戊烷-2-基)亚甲基]哌啶-1-羧酸叔丁酯。在室温和氮气气氛下向搅拌的4-(溴亚甲基)哌啶-1-羧酸叔丁酯(2.50g，9.052mmol，1当量)和双(频哪醇)二硼(3.45g，13.578mmol，1.5当量)在1,4-二噁烷中的溶液/混合物中添加Pd(dppf)Cl2(0.66g，0.905mmol，0.10当量)和KOAc(2.67g，27.157mmol，3当量)。将所得混合物在80℃下在氮气气氛下搅拌16小时。将反应在室温下用水淬灭。将所得混合物用EtOAc(3×30mL)萃取。将合并的有机层用盐水(2×20mL)洗涤，经无水Na2SO4干燥。过滤后，将滤液在减压下浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法纯化，用PE/EtOAc(5:1)洗脱，得到呈灰白色固体的4-[(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧硼杂环戊烷-2-基)亚甲基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(1.2g，41％)。
4-[(7-氯-1,6-萘啶-2-基)亚甲基]哌啶-1-羧酸叔丁酯。2,7-二氯-1,6-萘啶(1.98g，9.948mmol，1当量)、4-[(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧硼杂环戊烷-2-基)亚甲基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(6.43g，19.896mmol，2当量)、Pd(PPh3)4(2.30g，1.990mmol，0.20当量)在二噁烷(100mL)和Na2CO3(2.11g，19.896mmol，2当量)中在H2O(10mL，555.084mmol，55.80当量)中的混合物并将所得混合物在N2气氛下在100℃下搅拌40小时。将反应混合物冷却至室温，并添加H2O(100mL)。将所得混合物用EtOAc(3×100mL)萃取。将合并的有机层用盐水(2×100mL)洗涤，经无水Na2SO4干燥。过滤后，在减压下浓缩滤液，得到残余物，将其通过硅胶柱色谱纯化，用PE:EtOAc(4:1至2:1)洗脱，得到呈淡黄色油状物的4-[(7-氯-1,6-萘啶-2-基)亚甲基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(2.0g，65％纯度，36％)。
4-[(7-[[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]氨基]-1,6-萘啶-2-基)亚甲基]哌啶-1-羧酸叔丁酯。在室温和氮气气氛下向搅拌的4-[(7-氯-1,6-萘啶-2-基)亚甲基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(100mg，0.278mmol，1当量)和2-氟-4-(吡唑-1-基)苯胺(54.16mg，0.306mmol，1.10当量)在1,4-二噁烷中的溶液/混合物中添加Pd(OAc)2(9.36mg，0.042mmol，0.15当量)和XantPhos(48.24mg，0.083mmol，0.3当量)和Cs2CO3(181.09mg，0.556mmol，2当量)。将所得混合物在110℃下在氮气气氛下搅拌2小时。将反应在室温下用水淬灭。将所得混合物用EtOAc(3×10mL)萃取。将合并的有机层用盐水(2×10mL)洗涤，经无水Na2SO4干燥。过滤后，将滤液在减压下浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法纯化，用DCM/MeOH(10:1)洗脱，得到呈浅棕色固体的4-[(7-[[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]氨基]-1,6-萘啶-2-基)亚甲基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(80mg，57％)。
4-[(7-[[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]氨基]-1,6-萘啶-2-基)甲基]哌啶-1-羧酸叔丁酯。在室温下在氢气气氛下向搅拌的4-[(7-[[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]氨基]-1,6-萘啶-2-基)亚甲基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(80mg，0.160mmol，1当量)在乙醇中的溶液/混合物中添加Pd/C(1.70mg，0.016mmol，0.1当量)。将所得混合物在室温下在氢气气氛下搅拌16小时。然后将所得混合物在氢气气氛下在50℃下搅拌4小时。将所得混合物过滤，将滤饼用乙醇(3x 10mL)洗涤。在减压下浓缩滤液，得到呈棕色油状物的4-[(7-[[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]氨基]-1,6-萘啶-2-基)甲基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(80mg，粗产物)。
N-[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]-2-(哌啶-4-基甲基)-1,6-萘啶-7-胺(化合物124)。在室温下向搅拌的4-[(7-[[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]氨基]-1,6-萘啶-2-基)甲基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(80mg)在DCM中的溶液/混合物中添加TFA(0.50mL)。将所得混合物在室温下搅拌4小时。将所得混合物在减压下浓缩。将粗产物(40mg)通过制备型HPLC纯化，得到呈红色固体的N-[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]-2-(哌啶-4-基甲基)-1,6-萘啶-7-胺；三氟乙酸(9mg)。
实施例19.化合物130的制备
在室温下向搅拌的4-[(7-[[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]氨基]-1,6-萘啶-2-基)亚甲基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(100mg，0.200mmol，1当量)在ClCH2CH2Cl(6mL)中的溶液中分批添加TFA(0.60mL，8.078mmol，40.44当量)。将所得混合物在室温下搅拌30分钟。通过LCMS监测反应。将所得混合物在减压下浓缩。将残余物通过制备型HPLC纯化，得到呈黄色固体的N-[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]-2-(哌啶-4-亚基甲基)-1,6-萘啶-7-胺(3.1mg，3％)。
实施例20.化合物150的制备
7-氯-2-(哌啶-4-亚基甲基)-1,6-萘啶。在室温和氮气气氛下向搅拌的4-[(7-氯-1,6-萘啶-2-基)亚甲基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(化合物124步骤3，200mg)在THF(5mL)中的溶液中分批添加1,4-二噁烷(5mL)中的HCl(气体)。将所得混合物在室温下搅拌1小时。通过LCMS监测反应。将所得混合物在减压下浓缩。将残余物通过反相快速色谱法经以下条件纯化：柱：Spherical C18，20-40um，330g；流动相A：水(0.5％TFA)；流动相B：ACN；流速：85mL/min；梯度：5％-5％B，10min，20min内33％B-45％B梯度；检测器：254nm。在40％B下收集含有所需产物的级分，并在减压下浓缩，得到呈黄色固体的7-氯-2-(哌啶-4-亚基甲基)-1,6-萘啶(90mg，62％)。
7-氯-2-[(1-甲基哌啶-4-亚基)甲基]-1,6-萘啶。在氮气气氛下在室温下向搅拌的7-氯-2-(哌啶-4-亚基甲基)-1,6-萘啶(300mg，1.155mmol，1当量)和HCHO(52.02mg，1.733mmol，1.5当量)在THF(30mL，370.290mmol，320.60当量)中的溶液中分批添加NaBH(OAc)3(367.19mg，1.733mmol，1.5当量)。将所得混合物在室温下搅拌1小时。通过LCMS监测反应。将所得混合物在减压下浓缩。将残余物通过反相快速色谱法经以下条件纯化：柱：Spherical C18，20-40um，330g；流动相A：水(0.5％TFA)；流动相B：ACN；流速：85mL/min；梯度：5％-5％B，10min，20min内33％B-45％B梯度；检测器：254nm。在40％B下收集含有所需产物的级分，并在减压下浓缩，得到呈黄色固体的7-氯-2-[(1-甲基哌啶-4-亚基)甲基]-1,6-萘啶(130mg，41％)。
[1-[3-氟-4-([2-[(1-甲基哌啶-4-亚基)甲基]-1,6-萘啶-7-基]氨基)苯基]吡唑-3-基]甲醇。在氮气气氛下在室温下向搅拌的7-氯-2-[(1-甲基哌啶-4-亚基)甲基]-1,6-萘啶(54mg，0.197mmol，1当量)、[1-(4-氨基-3-氟苯基)吡唑-3-基]甲醇(44.96mg，0.217mmol，1.10当量)、XantPhos(34.24mg，0.059mmol，0.3当量)和Cs2CO3(128.54mg，0.395mmol，2.0当量)在1,4-二噁烷(20mL)中的溶液中逐滴添加Pd(OAc)2(6.64mg，0.030mmol，0.15当量)。将所得混合物在100℃下在氮气气氛下搅拌2小时。通过LCMS监测反应。使混合物冷却至室温。将所得混合物过滤，将滤饼用乙酸乙酯(3×20mL)洗涤。将滤液在减压下浓缩。将残余物通过反相快速色谱法经以下条件纯化：柱：Spherical C18，20-40um，330g；流动相A：水(10mM NH4CO3)；流动相B：ACN；流速：85mL/min；梯度：5％-5％B，10min，20min内33％B-45％B梯度；检测器：254nm。在40％B下收集含有所需产物的级分，并在减压下浓缩，得到呈黄色固体的[1-[3-氟-4-([2-[(1-甲基哌啶-4-亚基)甲基]-1,6-萘啶-7-基]氨基)苯基]吡唑-3-基]甲醇(5.8mg，6％)
实施例21.化合物209和240的制备
4-[(7-[[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]氨基]-1,6-萘啶-2-基)(羟基)甲基]-4-羟基哌啶-1-羧酸叔丁酯。在室温下在氮气气氛下向搅拌的4-[(7-[[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]氨基]-1,6-萘啶-2-基)亚甲基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(化合物124步骤4，25mg，1当量)和NMO(15mg，2.50当量)在丙酮(1.50mL)中的混合物中添加K2OsO4.2H2O(2mg，0.10当量)和H2O(0.15mL)。将所得混合物在室温下在氮气气氛下搅拌2小时。通过LCMS监测反应。使混合物冷却至室温。将所得混合物过滤，将滤饼用EtOAc(3×10mL)洗涤。将滤液在减压下浓缩。将残余物通过制备型TLC(DCM/MeOH 100:1)纯化，得到呈黄色固体的4-[(7-[[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]氨基]-1,6-萘啶-2-基)(羟基)甲基]-4-羟基哌啶-1-羧酸叔丁酯(26mg)。
4-[(7-[[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]氨基]-1,6-萘啶-2-基)(羟基)甲基]哌啶-4-醇(化合物209)。在0℃下向搅拌的4-[(7-[[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]氨基]-1,6-萘啶-2-基)(羟基)甲基]-4-羟基哌啶-1-羧酸叔丁酯(110mg，1当量)在DCM(10mL)中的溶液中添加TFA(1mL)。将所得混合物在0℃下搅拌1小时。通过LCMS监测反应。将混合物用饱和NaHCO3(水溶液)碱化至pH 8。将所得固体在烘箱中在减压下干燥，得到呈黄色固体的4-[(7-[[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]氨基]-1,6-萘啶-2-基)(羟基)甲基]哌啶-4-醇(6.7mg)。
4-[(7-[[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]氨基]-1,6-萘啶-2-基)(羟基)甲基]-1-甲基哌啶-4-醇(化合物240)。在室温下向搅拌的4-[(7-[[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]氨基]-1,6-萘啶-2-基)(羟基)甲基]哌啶-4-醇(82mg，3.286mmol，1当量)和HCHO(27.30mg，4.272mmol，2当量)在DCM(5mL)中添加NaBH(OAc)3(53.40mg，0.329mmol，1.50当量)。将所得混合物在室温下搅拌1小时。通过LCMS监测反应。将所得混合物在减压下浓缩。将残余物通过制备型HPLC纯化，得到呈淡黄色固体的4-[(7-[[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]氨基]-1,6-萘啶-2-基)(羟基)甲基]-1-甲基哌啶-4-醇(27.3mg)。
实施例22.化合物164的制备
1-(7-氯-1,6-萘啶-2-基)-6-氮杂螺[2.5]辛烷-6-羧酸叔丁酯。在0℃、N2气氛下向4-[(7-氯-1,6-萘啶-2-基)亚甲基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(化合物124步骤3，430mg，1.195mmol，1当量)在DMSO(40mL)中的溶液中逐滴添加DMSO(20mL)中的t-BuONa(172.26mg，1.792mmol，1.50当量)和三甲基(氧代)-l^[6]-硫基碘化鎓(394.46mg，1.792mmol，1.50当量)。将所得混合物加热至70℃，并在70℃下搅拌16小时。将反应混合物冷却至室温，并添加DCM(100mL)和H2O(100mL)。将所得混合物用DCM(5×100mL)萃取。将合并的有机层用盐水(3×100mL)洗涤，经无水Na2SO4干燥。过滤后，在减压下浓缩滤液，得到残余物，将其通过硅胶柱色谱纯化，用PE:EtOAc(4:1)洗脱，得到呈浅黄色半固体的1-(7-氯-1,6-萘啶-2-基)-6-氮杂螺[2.5]辛烷-6-羧酸叔丁酯(288mg，64％)。
1-(7-[[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]氨基]-1,6-萘啶-2-基)-6-氮杂螺[2.5]辛烷-6-羧酸叔丁酯。在5mL微波小瓶中装入1-(7-氯-1,6-萘啶-2-基)-6-氮杂螺[2.5]辛烷-6-羧酸叔丁酯(37.40mg，0.100mmol，1当量)、2-氟-4-(吡唑-1-基)苯胺(17.72mg，0.100mmol，1当量)、Pd(OAc)2(3.37mg，0.015mmol，0.15当量)、XantPhos(17.36mg，0.030mmol，0.30当量)、Cs2CO3(65.18mg，0.200mmol，2当量)和二噁烷(2mL，23.608mmol，236.01当量)并将所得混合物通过密封管在N2气氛下在100℃下搅拌2小时。LCMS可以检测到所需产物，并且不进行后处理。
2-[6-氮杂螺[2.5]辛烷-1-基]-N-[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]-1,6-萘啶-7-胺。在室温下将1-(7-[[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]氨基]-1,6-萘啶-2-基)-6-氮杂螺[2.5]辛烷-6-羧酸叔丁酯(150mg，0.291mmol，1当量)在DCM(20mL，314.601mmol，1079.30当量)和TFA(2mL，26.926mmol，92.38当量)中的混合物搅拌1.5小时。将反应混合物用饱和NaHCO3(水溶液)碱化至pH 9，然后将所得混合物用DCM(5×100mL)萃取。将合并的有机层用盐水(2×100mL)洗涤，经无水Na2SO4干燥。过滤后，在减压下浓缩滤液，得到呈淡黄色固体的2-[6-氮杂螺[2.5]辛烷-1-基]-N-[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]-1,6-萘啶-7-胺(150mg，96％)，其无需进一步纯化。
N-[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]-2-[6-甲基-6-氮杂螺[2.5]辛烷-1-基]-1,6-萘啶-7-胺。将2-[6-氮杂螺[2.5]辛烷-1-基]-N-[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]-1,6-萘啶-7-胺(150mg，0.282mmol，1当量，78％)、HCHO(34.36mg，0.423mmol，1.50当量，37％)在THF(10mL)和NaBH(OAc)3(89.74mg，0.423mmol，1.50当量)中的混合物在室温下搅拌1小时。通过在室温下添加H2O(20mL)使反应猝灭，并将所得混合物用DCM(3×100mL)萃取。用盐水(100mL)洗涤合并的有机层，并在减压下浓缩，得到残余物，将其通过反向快速色谱法经以下条件纯化：柱：XBridge Prep OBD C18柱，30×150mm 5μm；流动相A：水(10mM NH4HCO3)，流动相B：ACN；流速：60mL/min；梯度：7分钟40B到60B；254/220nm；RT1：6.5分钟，得到呈淡黄色固体的N-[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]-2-[6-甲基-6-氮杂螺[2.5]辛烷-1-基]-1,6-萘啶-7-胺(54.9mg，45％)。
实施例23.化合物141和149的制备
4-(7-[[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]氨基]-1,6-萘啶-2-羰基)哌啶-1-羧酸叔丁酯。在室温和氮气气氛下向搅拌的4-(7-氯-1,6-萘啶-2-羰基)哌啶-1-羧酸叔丁酯(150mg，0.399mmol，1当量)和2-氟-4-(吡唑-1-基)苯胺(84.86mg，0.479mmol，1.2当量)在无水1,4-二噁烷(15mL)中的混合物中添加Cs2CO3(260.07mg，0.798mmol，2当量)、Pd(OAc)2(13.44mg，0.060mmol，0.15当量)和Xantphos(69.28mg，0.120mmol，0.3当量)。将所得混合物在100℃下在氮气气氛下搅拌2小时。将所得混合物过滤，将滤饼用DCM和MeOH(10:1)溶液洗涤。将滤液在减压下浓缩。将残余物通过制备型TLC(DCM/MeOH，40:1)纯化，得到呈黄色固体的4-(7-[[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]氨基]-1,6-萘啶-2-羰基)哌啶-1-羧酸叔丁酯(140mg，67％)。
N-[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]-2-(哌啶-4-羰基)-1,6-萘啶-7-胺(化合物141)。在0℃下向搅拌的4-(7-[[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]氨基]-1,6-萘啶-2-羰基)哌啶-1-羧酸叔丁酯(140mg)在DCM(18mg)中的溶液中逐滴添加TFA(2mL)将所得混合物在室温下搅拌2小时。将所得混合物在真空下浓缩。将残余物溶解在DCM(50mL)中，用饱和NaHCO3(水溶液)碱化至pH 8。将所得混合物用DCM(2×50mL)萃取。将合并的有机层用无水Na2SO4干燥。过滤后，将滤液在减压下浓缩。将残余物通过制备型TLC(DCM/MeOH 20:1)纯化，得到呈黄色固体的N-[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]-2-(哌啶-4-羰基)-1,6-萘啶-7-胺(100mg)。
(7-[[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]氨基]-1,6-萘啶-2-基)(哌啶-4-基)甲醇(化合物149)。在0℃下向搅拌的N-[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]-2-(哌啶-4-羰基)-1,6-萘啶-7-胺(100mg，0.240mmol，1当量)在MeOH(10mL)中的溶液中分批添加NaBH4(18.17mg，0.480mmol，2当量)。将所得混合物在室温下搅拌1小时。将所得混合物在真空下浓缩。将粗产物通过制备型HPLC纯化，得到呈淡黄色固体的(7-[[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]氨基]-1,6-萘啶-2-基)(哌啶-4-基)甲醇(80mg，79％)。
实施例24.化合物247和254的制备
4-[(7-氯-1,6-萘啶-2-基)(羟基)甲基]哌啶-1-羧酸叔丁酯。在室温下向搅拌的4-(7-氯-1,6-萘啶-2-羰基)哌啶-1-羧酸叔丁酯(200mg，0.532mmol，1当量)在MeOH(5mL)中的溶液中分批添加NaBH4(30.20mg，0.798mmol，1.50当量)。将所得混合物在0℃下搅拌10min。通过LCMS监测反应。将所得混合物在减压下浓缩。将残余物通过反相快速色谱法经以下条件纯化(柱：C18，120g；流动相A：水/0.05％NH4HCO3，流动相B：ACN；流速：40mL/min；梯度：20分钟内40％B到85％B；检测器，254nm和220nm，在68％B下收集所需产物)。在减压下浓缩，得到呈白色固体的4-[(7-氯-1,6-萘啶-2-基)(羟基)甲基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(130mg，64％)。
4-[[7-([2-氟-4-[3-(羟甲基)吡唑-1-基]苯基]氨基)-1,6-萘啶-2-基](羟基)甲基]哌啶-1-羧酸叔丁酯。在室温下在氮气气氛下向搅拌的4-[(7-氯-1,6-萘啶-2-基)(羟基)甲基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(450mg，1.191mmol，1当量)和[1-(4-氨基-3-氟苯基)吡唑-3-基]甲醇(271.44mg，1.310mmol，1.10当量)在1,4-二噁烷(15mL)中的混合物中分批添加Pd(OAc)2(40.10mg，0.179mmol，0.15当量)、XantPhos(206.72mg，0.357mmol，0.30当量)和Cs2CO3(776.03mg，2.382mmol，2当量)。将所得混合物在80℃下在氮气气氛下搅拌1小时。通过LCMS监测反应。使混合物冷却至室温。将所得混合物用EtOAc(3×300mL)萃取。将合并的有机层用盐水(2×100mL)洗涤，经无水Na2SO4干燥。过滤后，将滤液在减压下浓缩。将残余物通过反相快速色谱法经以下条件纯化：柱：Spherical C18，20-40um，330g；流动相A：水(加5mM FA)；流动相B：ACN；流速：80mL/min；梯度：5％-5％B，10min，25min内30％B-60％B梯度；检测器：220nm。在55％B下收集含有所需产物的级分，并在减压下浓缩，得到呈黄色固体的4-[[7-([2-氟-4-[3-(羟甲基)吡唑-1-基]苯基]氨基)-1,6-萘啶-2-基](羟基)甲基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(280mg，42％)。
[7-([2-氟-4-[3-(羟甲基)吡唑-1-基]苯基]氨基)-1,6-萘啶-2-基](哌啶-4-基)甲醇。在0℃下向搅拌的4-[[7-([2-氟-4-[3-(羟甲基)吡唑-1-基]苯基]氨基)-1,6-萘啶-2-基](羟基)甲基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(280mg，1当量)在DCM(10mL)中的溶液中逐滴添加TFA(1mL)。将反应混合物在0℃下搅拌0.5小时。通过LCMS监测反应。将所得混合物在减压下浓缩。将残余物用饱和NaHCO3(水溶液)碱化至pH＝8。将所得混合物用EtOAc(3×200mL)萃取。将合并的有机层用盐水(1×100mL)洗涤，经无水Na2SO4干燥。过滤后，将滤液在减压下浓缩。将残余物通过反相快速色谱法经以下条件纯化：柱：Spherical C18，20-40um，120g；流动相A：水(加5mM NH4HCO3)；流动相B：ACN；流速：40mL/min；梯度：5％-5％B，8min，20min内45％-70％B梯度；检测器：220nm。在65％B下收集含有所需产物的级分，并在减压下浓缩，得到呈黄色固体的[7-([2-氟-4-[3-(羟甲基)吡唑-1-基]苯基]氨基)-1,6-萘啶-2-基](哌啶-4-基)甲醇(180mg)。
(R)-和(S)-[7-([2-氟-4-[3-(羟甲基)吡唑-1-基]苯基]氨基)-1,6-萘啶-2-基](1-甲基哌啶-4-基)甲醇(化合物247和254)。在0℃下在氮气气氛下向搅拌的[7-([2-氟-4-[3-(羟甲基)吡唑-1-基]苯基]氨基)-1,6-萘啶-2-基](哌啶-4-基)甲醇(90mg，0.201mmol，1当量)和HCHO(0.50mL，13.655mmol，68.05当量)在THF(10mL)中的混合物中分批添加NaBH(OAc)3(63.79mg，0.301mmol，1.50当量)。将所得混合物在室温下在氮气气氛下搅拌0.5小时。通过LCMS监测反应。将所得混合物用DCM(3×300mL)萃取。将合并的有机层用盐水(2×200mL)洗涤，经无水Na2SO4干燥。过滤后，将滤液在减压下浓缩。将残余物通过反相快速色谱法经以下条件纯化：柱：Spherical C18，20-40um，120g；流动相A：水(加5mM FA)；流动相B：ACN；流速：45mL/min；梯度：5％-5％B，10min，25min内35％B-65％B梯度；检测器：220nm。在65％B下收集含所需产物的级分，并在减压下浓缩，得到40mg外消旋物。将外消旋物通过手性制备型HPLC在以下条件下纯化(柱：CHIRALPAK IG，2*25cm，5um；流动相A：Hex:DCM＝3:1(10mM NH3-MeOH)，流动相B：EtOH:DCM＝1:1；流速：19mL/min；梯度(％)：12分钟内60B到60B；检测器：220/254nm)。获得[7-([2-氟-4-[3-(羟甲基)吡唑-1-基]苯基]氨基)-1,6-萘啶-2-基](1-甲基哌啶-4-基)甲醇的分离的对映体。
化合物247在6.254分钟洗脱为黄色固体。化合物254在9.587分钟洗脱为黄色固体。
化合物241和243遵循如对于化合物247和254的合成所述的方法和方案来合成，使用适当的材料开始。
实施例25.化合物252和255的制备
在室温下在氮气气氛下向搅拌的[7-([2-氟-4-[3-(羟甲基)吡唑-1-基]苯基]氨基)-1,6-萘啶-2-基](哌啶-4-基)甲醇(化合物247，步骤3，90mg，0.201mmol，1当量)和2-碘-乙醇(69.02mg，0.401mmol，2当量)在DMF(6mL)中的混合物中分批添加TEA(60.92mg，0.602mmol，3当量)。将所得混合物在室温下在氮气气氛下搅拌4小时。通过LCMS监测反应。将残余物通过反相快速色谱法经以下条件纯化：柱：Spherical C18，20-40um，120g；流动相A：水(加5mM FA)；流动相B：ACN；流速：45mL/min；梯度：5％-5％B，10min，25min内36％B-70％B梯度；检测器：220nm。在66％B下收集含所需产物的级分，并在减压下浓缩，得到70mg外消旋物。将外消旋物通过手性制备型HPLC在以下条件下纯化(柱：CHIRALPAK IG，2*25cm，5um；流动相A：Hex:DCM＝3:1(10mM NH3-MeOH)，流动相B：EtOH:DCM＝1:1；流速：20mL/min；梯度(％)：13分钟60B到60B；检测器：220/254nm)。获得2-(4-[[7-([2-氟-4-[3-(羟甲基)吡唑-1-基]苯基]氨基)-1,6-萘啶-2-基](羟基)甲基]哌啶-1-基)乙醇的分离的对映体。
化合物252在10.754分钟洗脱为黄色固体。化合物255在8.52分钟洗脱为黄色固体。
实施例26.化合物250和251的制备
3'-氟-4'-[[2-(哌啶-4-羰基)-1,6-萘啶-7-基]氨基]-[1,1'-联苯]-3-腈。在室温和氮气气氛下向搅拌的4-[7-([3-氰基-3-氟-[1,1-联苯基]-4-基]氨基)-1,6-萘啶-2-羰基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(通过类似于化合物141步骤1的方法制备，100mg，1当量)在DCM(3mL)中的溶液中分批添加TFA(0.30mL)。将所得混合物在室温下在氮气气氛下搅拌16小时。通过LCMS监测反应。将所得混合物在减压下浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法纯化，用PE/EtOAc(10/1至1/1)洗脱，得到呈黄色固体的3’-氟-4’-[[2-(哌啶-4-羰基)-1,6-萘啶-7-基]氨基]-[1,1’-联苯]-3-腈(20mg，24％)。
3'-氟-4'-([2-[1-(2-羟乙基)哌啶-4-羰基]-1,6-萘啶-7-基]氨基)-[1,1'-联苯]-3-腈。在室温下向搅拌的3’-氟-4’-[[2-(哌啶-4-羰基)-1,6-萘啶-7-基]氨基]-[1,1’-联苯]-3-腈(86mg，0.190mmol，1当量)和2-碘-乙醇(39.31mg，0.229mmol，1.2当量)在DMF(2.50mL)中的混合物中添加TEA(38.55mg，0.381mmol，2当量)。将所得混合物在室温下搅拌1小时。通过LCMS监测反应。将所得混合物在减压下浓缩。将残余物通过反相快速色谱法经以下条件纯化(柱：C18，330g；流动相A：水/0.05％NH4HCO3，流动相B：ACN；流速：80mL/min；梯度：20分钟内20％B到50％B；检测器，254nm，监测器，220nm，在45％B下收集所需产物)，得到呈黄色固体的3’-氟-4’-([2-[1-(2-羟乙基)哌啶-4-羰基]-1,6-萘啶-7-基]氨基)-[1,1’-联苯]-3-腈(70mg，74％)。
(R)-和(S)-3'-氟-4'-[(2-[羟基[1-(2-羟乙基)哌啶-4-基]甲基]-1,6-萘啶-7-基)氨基]-[1,1'-联苯]-3-腈(化合物250和251)。在室温下向搅拌的3’-氟-4’-([2-[1-(2-羟乙基)哌啶-4-羰基]-1,6-萘啶-7-基]氨基)-[1,1’-联苯]-3-腈(70mg，0.141mmol，1当量)在MeOH(2mL)中的混合物中添加NaBH4(8.02mg，0.212mmol，1.5当量)。将所得混合物在室温下搅拌1小时。通过LCMS监测反应。将所得混合物在减压下浓缩。将残余物通过反向快速色谱经以下条件纯化：柱，C18硅胶；流动相，水中的MeOH，10分钟内30％至50％的梯度；检测器，UV 254nm，得到55mg外消旋物。将外消旋物通过SFC在以下条件下分离：柱：CHIRALPAKIG，2×25cm，5um；流动相A：Hex(加10mM NH3)，流动相B：EtOH:DCM＝1:1；流速：17mL/min；梯度：12分钟内等度90B；检测器：紫外220/254nm；RT1：6.247分钟；RT 2：9.324分钟。
化合物250-产率：20.4mg。化合物251-产率：21.9mg
实施例27.化合物217的制备
在氮气气氛下在室温下将N-[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]-2-(哌啶-4-羰基)-1,6-萘啶-7-胺(80mg，0.192mmol，1当量)、甲醛溶液(20.27mg，0.250mmol，1.30当量，37％)和三乙酰氧基硼氢化钠(122.14mg，0.576mmol，3当量)在THF(2mL)中的混合物搅拌3小时。将所得混合物在减压下浓缩。将残余物通过制备型HPLC纯化，得到呈橙色固体的N-[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]-2-(1-甲基哌啶-4-羰基)-1,6-萘啶-7-胺(46.6mg，56％)。
实施例28.化合物175和176的制备
在0℃下向搅拌的N-[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]-2-(1-甲基哌啶-4-羰基)-1,6-萘啶-7-胺(150mg，0.348mmol，1当量)在MeOH(10mL)中的混合物中分批添加NaBH4(26.37mg，0.697mmol，2当量)。将所得混合物在室温下搅拌2小时。将所得混合物在真空下浓缩。将残余物通过反相快速色谱法经以下条件纯化：柱：Spherical C18，20-40um，330g；流动相A：水(加5mM NH4HCO3；流动相B：ACN；流速：45mL/min；梯度：5％-5％B，10min，20min内20％B-40％B梯度；检测器：254nm。在33％B下收集含所需产物的级分，并在减压下浓缩，得到120mg外消旋物。将外消旋物通过手性HPCL在以下条件下纯化(柱：CHIRALPAK Ig，2*25cm，5μm；流动相A：Hex(10mM NH3)，流动相B：EtOH:DCM＝1:1-HPLC；流速：20mL/min；梯度：18分钟内60B到60B；220/254nm；RT1：5.664；RT2：9.823)。获得(R)-和(S)-(7-[[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]氨基]-1,6-萘啶-2-基)(1-甲基哌啶-4-基)甲醇。
化合物175-产率：50.9mg。化合物176-产率：46.3mg。
化合物344和347遵循如对于化合物175和176的合成所述的方法和方案来合成，使用适当的材料开始。
实施例29.化合物292的制备
1-(3-氟-4-[[2-(1-甲基哌啶-4-羰基)-1,6-萘啶-7-基]氨基]苯基]吡唑-3-羧酸。在0℃下向搅拌的1-(3-氟-4-[[2-(1-甲基哌啶-4-羰基)-1,6-萘啶-7-基]氨基]苯基)吡唑-3-羧酸甲酯(通过与化合物217类似的方法制备，80mg，0.164mmol，1当量)在THF(5mL)中的溶液中分批添加LiOH(19.61mg，0.819mmol，5当量)和H2O(2mL)。将所得混合物在室温下搅拌1小时。通过LCMS监测反应。将所得混合物在减压下浓缩。将残余物通过反相快速色谱法经以下条件纯化(柱：C18，120g；流动相A：水/0.05％NH4HCO3，流动相B：ACN；流速：40mL/min；梯度：20分钟内25％B到55％B；检测器，254nm和220nm，在38％B下收集所需产物)。在减压下浓缩，得到呈橙色固体的1-(3-氟-4-[[2-(1-甲基哌啶-4-羰基)-1,6-萘啶-7-基]氨基]苯基)吡唑-3-羧酸(55mg，70％)。
1-[3-氟-4-([2-[羟基(1-甲基哌啶-4-基)甲基]-1,6-萘啶-7-基]氨基)苯基]吡唑-3-羧酸。在室温下向搅拌的1-(3-氟-4-[[2-(1-甲基哌啶-4-羰基)-1,6-萘啶-7-基]氨基]苯基)吡唑-3-羧酸(55mg，0.116mmol，1当量)在MeOH(3mL)中的溶液中分批添加NaBH4(5.26mg，0.139mmol，1.20当量)。将所得混合物在0℃下搅拌10min。通过LCMS监测反应。将所得混合物在减压下浓缩。将残余物通过反相快速色谱法经以下条件纯化(柱：XBridgeShield RP18 OBD柱，5μm，19*150mm)。在减压下浓缩，得到呈黄色固体的1-[3-氟-4-([2-[羟基(1-甲基哌啶-4-基)甲基]-1,6-萘啶-7-基]氨基)苯基]吡唑-3-羧酸(14.6mg，26％)。
实施例30.化合物387和391的制备
4-[(7-氯-1,6-萘啶-2-基)(甲氧基)甲基]哌啶-1-羧酸叔丁酯。在氮气气氛下在0℃下向搅拌的4-[(7-氯-1,6-萘啶-2-基)(羟基)甲基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(化合物247步骤1，120mg，0.318mmol，1当量)在DMF(10mL)中的溶液中逐滴添加NaH(11.43mg，0.476mmol，1.5当量)。将所得混合物在室温下在氮气气氛下搅拌0.5小时。在0℃下在氮气气氛下向混合物中添加CH3I(90.15mg，0.635mmol，2.0当量)。将所得混合物在室温下在氮气气氛下搅拌1小时。将反应用饱和NH4Cl(水溶液)在室温下淬灭。将所得混合物用EtOAc(2×50mL)萃取。将合并的有机层用盐水(1×30mL)洗涤，经无水Na2SO4干燥。过滤后，将滤液在减压下浓缩。将残余物通过TLC纯化，用PE:EA(10:1)洗脱，得到呈白色固体的4-[(7-氯-1,6-萘啶-2-基)(甲氧基)甲基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(73mg，58％)。
4-[(7-[[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]氨基]-1,6-萘啶-2-基)(甲氧基)甲基]哌啶-1-羧酸叔丁酯。在氮气气氛下在25℃下向搅拌的4-[(7-氯-1,6-萘啶-2-基)(甲氧基)甲基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(70mg，0.179mmol，1当量)、2-氟-4-(吡唑-1-基)苯胺(47.47mg，0.268mmol，1.5当量)、BrettPhos Pd G3(32.37mg，0.036mmol，0.20当量)和Alphos(58.23mg，0.071mmol，0.40当量)在二噁烷(2mL)中的溶液中分批添加DBU(81.58mg，0.536mmol，3当量)。将所得混合物在66℃下在氮气气氛下搅拌2小时。将所得混合物在真空下浓缩。将残余物通过TLC纯化，用DCM/MeOH(10:1)洗脱，得到呈白色固体的4-[(7-[[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]氨基]-1,6-萘啶-2-基)(甲氧基)甲基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(55mg，57％)。
(R)-和(S)-N-[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]-2-[甲氧基(1-甲基哌啶-4-基)甲基]-1,6-萘啶-7-胺(化合物387和391)。在室温和氮气气氛下向搅拌的4-[(7-[[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]氨基]-1,6-萘啶-2-基)(甲氧基)甲基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(55mg，0.103mmol，1当量)在DCM(50mL)中的溶液中逐滴添加TFA(5mL)。将所得混合物在室温下在氮气气氛下搅拌1小时。通过TLC监测反应。将所得混合物在减压下浓缩。将所得混合物用DCM(15mL)稀释。向混合物中添加Et3N(10mL)。
将所得混合物搅拌1小时，并在减压下浓缩。将混合物用THF(15mL，246.860mmol)稀释，并添加HCHO(3.72mg，0.124mmol，1.2当量)、NaBH(OAc)3(30.64mg，0.145mmol，1.4当量)。将所得混合物搅拌1小时。通过LCMS监测反应。将反应用饱和NaHCO3(水溶液)在室温下淬灭。将所得混合物在真空下浓缩。将残余物通过制备型TLC(DCM/MeOH 5:1)纯化，得到20mg外消旋物。将外消旋物通过SFC经以下条件分离：柱：CHIRALPAK IG，2*25cm，5μm；流动相A：Hex(10mM NH3)，流动相B：EtOH:DCM＝1:1-HPLC；流速：20mL/min；梯度：20分钟内25B到25B；220/254nm；RT1：16.404分钟；RT2：18.501分钟。获得(R)-和(S)-(N-[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]-2-[甲氧基(1-甲基哌啶-4-基)甲基]-1,6-萘啶-7-胺。
化合物387-在16.4分钟洗脱；产率：3.2mg。化合物391-在18.5分钟洗脱；产率：5.4mg。
实施例31.化合物165的制备
4-[氨基(7-[[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]氨基]-1,6-萘啶-2-基)甲基]哌啶-1-羧酸叔丁酯。在室温下向搅拌的4-(7-[[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]氨基]-1,6-萘啶-2-羰基)哌啶-1-羧酸叔丁酯(200mg，0.387mmol，1当量)和四乙氧基钛(88.32mg，0.387mmol，1当量)在THF(20mL)中的溶液中添加MeOH(0.17mL，1.190mmol，3.07当量)中的NH3(g)。将所得混合物在80℃下搅拌16小时。将所得混合物在减压下浓缩。在0℃下向MeOH(20mL)中的4-(7-[[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]氨基]-1,6-萘啶-2-甲酰亚胺基)哌啶-1-羧酸叔丁酯(280mg，粗品)的粗产物中分批添加NaBH4(30.82mg，0.815mmol，1.50当量)。将所得混合物在0℃下搅拌1小时。将所得混合物在减压下浓缩。将残余物通过制备型TLC(DCM/MeOH 5:1)纯化，得到呈黄色泡沫的4-[氨基(7-[[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]氨基]-1,6-萘啶-2-基)甲基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(70mg，24％)。
2-[氨基(哌啶-4-基)甲基]-N-[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]-1,6-萘啶-7-胺(化合物165)。在室温下向搅拌的4-[氨基(7-[[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]氨基]-1,6-萘啶-2-基)甲基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(50mg，0.097mmol，1当量)在DCM(10mL)中的溶液中添加ZnBr2(217.56mg，0.966mmol，10当量)。将所得混合物在50℃下搅拌16小时。将所得混合物在减压下浓缩。将残余物通过反相快速色谱法经以下条件纯化：柱：Spherical C18，20-40um，330g；流动相A：水加0.5％FA)；流动相B：ACN；流速：80mL/min；梯度：5％-5％B，10min，25min内10％B-30％B梯度；检测器：254nm。在18％B下收集含有所需产物的级分，并在减压下浓缩，得到呈黄色固体的2-[氨基(哌啶-4-基)甲基]-N-[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]-1,6-萘啶-7-二甲酸铵(28.8mg)。
化合物395和400遵循如对于化合物165的合成所述的方法和方案来合成，使用适当的材料开始。
实施例32.化合物196、205和216的制备
4-[1-(7-氯-1,6-萘啶-2-基)-1-羟乙基]哌啶-1-羧酸叔丁酯。在0℃下在氮气气氛下向搅拌的4-(7-氯-1,6-萘啶-2-羰基)哌啶-1-羧酸叔丁酯(4070mg，10.829mmol，1当量)在THF(140mL)中的溶液中添加CH3MgBr(3873.80mg，32.486mmol，3当量)。将所得混合物在0℃下在氮气气氛下搅拌1小时。通过LCMS监测反应。将反应用饱和NH4Cl(水溶液)在0℃下淬灭。将所得混合物在减压下浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法纯化，用DCM/MeOH(60:1)洗脱，得到呈棕色油状物的4-[1-(7-氯-1,6-萘啶-2-基)-1-羟乙基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(4200mg，98％)。
4-[1-(7-[[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]氨基]-1,6-萘啶-2-基)-1-羟乙基]哌啶-1-羧酸叔丁酯。在室温和氮气气氛下向搅拌的4-[1-(7-氯-1,6-萘啶-2-基)-1-羟乙基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(260mg，0.663mmol，1当量)和2-氟-4-(吡唑-1-基)苯胺(152.81mg，0.862mmol，1.30当量)在1,4-二噁烷(50mL)中的混合物中添加XantPhos(115.16mg，0.199mmol，0.30当量)、Cs2CO3(432.32mg，1.327mmol，2当量)和Pd(OAc)2(29.79mg，0.133mmol，0.20当量)。将所得混合物在80℃下在氮气气氛下搅拌6小时。通过LCMS监测反应。使混合物冷却至室温。将所得混合物在减压下浓缩。将所得混合物过滤，将滤饼用EtOAc(3×20mL)洗涤。将滤液在减压下浓缩。将残余物通过反相快速色谱法经以下条件纯化(柱：C18，120g；流动相A：水/0.05％TFA，流动相B：ACN；流速：40mL/min；梯度：20分钟内40％B到95％B；检测器，254nm和220nm，在95％B下收集所需产物)。在减压下浓缩，得到呈棕色固体的4-[1-(7-[[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]氨基]-1,6-萘啶-2-基)-1-羟乙基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(300mg，84％)。
1-(7-[[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]氨基]-1,6-萘啶-2-基)-1-(哌啶-4-基)乙醇(化合物196)。在室温下向搅拌的N-[4-[7-([2-氟-4-[3-(羟甲基)吡唑-1-基]苯基]氨基)-1,6-萘啶-2-基磺酰基]-1-甲基环己基]氨基甲酸叔丁酯(200.00mg，0.327mmol，1.00当量)在CH2Cl2(20mL)中的溶液中分批添加TFA(20mL，20％)。将所得混合物在0℃下搅拌1h。通过LCMS监测反应。将所得混合物在减压下浓缩。将残余物通过反相快速色谱法经以下条件纯化(柱：C18，120g；流动相A：水/0.05％NH4NCO3，流动相B：ACN；流速：40mL/min；梯度：20分钟内30％B到65％B；检测器，254nm和220nm，在46％B下收集所需产物)。在减压下浓缩，得到呈黄色固体的1-(7-[[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]氨基]-1,6-萘啶-2-基)-1-(哌啶-4-基)乙醇；甲酸(230mg，91.43％)。
(R)-和(S)-1-(7-[[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]氨基]-1,6-萘啶-2-基)-1-(1-甲基哌啶-4-基)乙醇(化合物205和216)：
在0℃下向搅拌的1-(7-[[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]氨基]-1,6-萘啶-2-基)-1-(哌啶-4-基)乙醇(20mg，0.046mmol，1当量)和HCHO(2.78mg，0.093mmol，2当量)在THF(20mL)中的溶液中分批添加NaBH(OAc)3(19.60mg，0.092mmol，2当量)。将所得混合物在0℃下搅拌30min。通过LCMS监测反应。将所得混合物在减压下浓缩。将残余物通过反相快速色谱法经以下条件纯化(柱：XBridge Shield RP18 OBD柱，5μm，19*150mm)。在减压下浓缩，得到100mg外消旋物。将外消旋物通过SFC在以下条件下纯化：柱：CHIRALPAK IG，2*25cm，5μm；流动相A：Hex:DCM＝3:1(10mM NH3-MEOH)-HPLC，流动相B：EtOH--HPLC；流速：20mL/min；梯度：22分钟30B到30B；220/254nm；RT1：11.279；RT2：17.825；注入体积：1.35mL；运行次数：3；获得(R)-和(S)-1-(7-[[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]氨基]-1,6-萘啶-2-基)-1-(1-甲基哌啶-4-基)乙醇。
化合物205-在11.279分钟洗脱；产率：14.0mg。化合物216-在17.825分钟洗脱；产率：14.8mg
化合物389和392遵循如对于化合物196的合成所述的方法和方案来合成，使用适当的材料开始。
实施例33.化合物345的制备
4-[1-(7-氯-1,6-萘啶-2-基)-1-羟乙基]哌啶-1-羧酸叔丁酯。在0℃下在氮气气氛下向搅拌的4-(7-氯-1,6-萘啶-2-羰基)哌啶-1-羧酸叔丁酯(4070mg，10.829mmol，1当量)在THF(140mL)中的溶液中添加CH3MgBr(3873.80mg，32.486mmol，3当量)。将所得混合物在0℃下在氮气气氛下搅拌1小时。通过LCMS监测反应。将反应用饱和NH4Cl(水溶液)在0℃下淬灭。将所得混合物在减压下浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法纯化，用DCM/MeOH(60:1)洗脱，得到呈棕色油状物的4-[1-(7-氯-1,6-萘啶-2-基)-1-羟乙基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(4200mg，98％)。
4-[(1R)-1-(7-氯-1,6-萘啶-2-基)-1-羟乙基]哌啶-1-羧酸叔丁酯。将4-[1-(7-氯-1,6-萘啶-2-基)-1-羟基乙基]哌啶-1-羧酸(4.60g，11.7mmol)通过SFC在以下条件下分离：柱：CHIRALPAK IG，5*25cm，10um流动相A：CO2，流动相B：MeOH:ACN＝1:1(2mM NH3-MeOH)；流速：200mL/min；梯度：50％B；220nm；RT1：6.1；RT2：12.02；注入体积：15mL；运行次数：5次；收集12.02分钟的级分并在减压下浓缩，得到呈淡黄色固体的4-[(1R)-1-(7-氯-1,6-萘啶-2-基)-1-羟乙基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(1670mg，36％)。(较慢洗脱的异构体)。
(1R)-1-(7-氯-1,6-萘啶-2-基)-1-(1-甲基哌啶-4-基)乙醇。在0℃下在空气气氛下向搅拌的4-[(1R)-1-(7-氯-1,6-萘啶-2-基)-1-羟乙基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(1670mg，4.261mmol，1当量)在DCM(40mL)中的溶液中分批添加TFA(8mL，98.744mmol，23.17当量)。将所得混合物在0℃下搅拌1小时。通过LCMS监测反应。将所得混合物在减压下浓缩。在室温下向DCM(20mL)中的搅拌的混合物中分批添加TEA(13.72mL，98.707mmol，23.16当量)。5分钟后，添加福尔马林(255.90mg，8.523mmol，2当量，33％)和NaBH(OAc)3(1083.77mg，5.114mmol，1.20当量)。将所得混合物在室温下在空气气氛下搅拌1小时。将所得混合物在减压下浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法纯化，用DCM/MeOH(6:1)洗脱，得到呈淡黄色油状物的(1R)-1-(7-氯-1,6-萘啶-2-基)-1-(1-甲基哌啶-4-基)乙醇(1300mg，99％)。
(1R)-1-(1-甲基哌啶-4-基)-1-[7-(苯氨基)-1,6-萘啶-2-基]乙醇(化合物345)。在室温和氮气气氛下向搅拌的(1R)-1-(7-氯-1,6-萘啶-2-基)-1-(1-甲基哌啶-4-基)乙醇(40mg，0.131mmol，1当量)和苯胺(14.62mg，0.157mmol，1.2当量)在1,4-二噁烷(1.50mL)中的混合物中添加Pd(OAc)2(4.40mg，0.020mmol，0.15当量)、XantPhos(22.71mg，0.039mmol，0.3当量)和Cs2CO3(85.23mg，0.262mmol，2当量)。将所得混合物在100℃下在氮气气氛下搅拌0.5小时。通过LCMS监测反应。使混合物冷却至室温。将所得混合物过滤，将滤饼用EtOAc(3×10mL)洗涤。将滤液在减压下浓缩。将残余物通过制备型TLC(DCM/MeOH5:1)纯化，得到呈黄色固体的(1R)-1-(1-甲基哌啶-4-基)-1-[7-(苯基氨基)-1,6-萘啶-2-基]乙醇(16.5mg，34％)。
化合物320、325、335、341、342、346、348、350、351、351、352、354、355、356、358、366、367、369、370、371、372、373、377、383、388、393、397、399、402、404、405、406、407、408、409、411、412和413以及中间体AG：
(实施例360的制备(替代性起始材料)；实施例35，和AH：
(化合物414的制备；实施例37)遵循如对于化合物345的合成所述的方法和方案来合成，使用适当的材料开始。
实施例34.化合物359和363的制备
4-[1-(7-氯-1,6-萘啶-2-基)-1-氟乙基]哌啶-1-羧酸叔丁酯。在-78℃和氮气气氛下向搅拌的4-[1-(7-氯-1,6-萘啶-2-基)-1-羟乙基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(200mg，0.510mmol，1当量)在DCM(1mL)中的溶液中逐滴添加DAST(2mL)。将所得混合物在室温下在氮气气氛下搅拌2小时。通过LCMS监测反应。将反应用饱和NaHCO3(水溶液)在0℃下淬灭。将所得混合物用EtOAc(3×100mL)萃取。将合并的有机层用盐水(1×100mL)洗涤，经无水Na2SO4干燥。过滤后，将滤液在减压下浓缩。将残余物通过制备型TLC(PE/EtOAc 5:1)纯化，得到呈黄色固体的4-[1-(7-氯-1,6-萘啶-2-基)-1-氟乙基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(90mg，45％)。
7-氯-2-[1-氟-1-(哌啶-4-基)乙基]-1,6-萘啶。在室温下向搅拌的4-[1-(7-氯-1,6-萘啶-2-基)-1-氟乙基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(100mg，0.254mmol，1当量)在DCM(5mL)中的溶液中分批添加TFA(1mL)。将所得混合物在室温下搅拌1小时。通过LCMS监测反应。将所得混合物在减压下浓缩。这产生呈淡黄色固体的7-氯-2-[1-氟-1-(哌啶-4-基)乙基]-1,6-萘啶(70mg，94％)。
7-氯-2-[1-氟-1-(1-甲基哌啶-4-基)乙基]-1,6-萘啶。在室温下向搅拌的7-氯-2-[1-氟-1-(哌啶-4-基)乙基]-1,6-萘啶(70mg，0.238mmol，1当量)和NaBH(OAc)3(75.75mg，0.357mmol，1.50当量)在THF(4mL)中的混合物中逐滴添加HCHO(14.31mg，0.477mmol，2当量)。将所得混合物在室温下搅拌1小时。通过LCMS监测反应。将所得混合物在减压下浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法纯化，用DCM/MeOH(15:1)洗脱，得到呈淡黄色固体的7-氯-2-[1-氟-1-(1-甲基哌啶-4-基)乙基]-1,6-萘啶(50mg，68％)。
(R)-和(S)-2-[1-氟-1-(1-甲基哌啶-4-基)乙基]-N-[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]-1,6-萘啶-7-胺。在室温下向搅拌的7-氯-2-[1-氟-1-(1-甲基哌啶-4-基)乙基]-1,6-萘啶(60mg，0.195mmol，1当量)和2-氟-4-(吡唑-1-基)苯胺(37.99mg，0.214mmol，1.10当量)在1,4-二噁烷(4mL)中的混合物中分批添加XantPhos(33.84mg，0.058mmol，0.30当量)、Cs2CO3(127.03mg，0.390mmol，2当量)和Pd(OAc)2(6.56mg，0.029mmol，0.15当量)。将所得混合物在100℃下在氮气气氛下搅拌3小时。通过LCMS监测反应。将所得混合物在减压下浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法纯化，用DCM/MeOH(15:1)洗脱，得到外消旋物。将外消旋物通过手性SFC纯化，得到2-[(1S)-1-氟-1-(1-甲基哌啶-4-基)乙基]-N-[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]-1,6-萘啶-7-胺和2-[(1R)-1-氟-1-(1-甲基哌啶-4-基)乙基]-N-[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]-1,6-萘啶-7-胺。
化合物363-产率：14.1mg。化合物359：产率：8.9mg。
实施例35.化合物362的制备
在0℃下向搅拌的1-[3-氟-4-([2-[(1R)-1-羟基-1-(1-甲基哌啶-4-基)乙基]-1,6-萘啶-7-基]氨基)苯基]吡唑-4-羧酸甲酯(化合物367，50mg，0.099mmol，1当量)在H2O(2mL)中的混合物中添加LiOH(7.12mg，0.297mmol，3当量)。将所得混合物在室温下搅拌1小时。将混合物/残余物用HCl(水溶液)中和至pH 7。将所得混合物在真空下浓缩。将残余物通过制备型HPLC纯化，得到呈黄色固体的1-[3-氟-4-([2-[(1R)-1-羟基-1-(1-甲基哌啶-4-基)乙基]-1,6-萘啶-7-基]氨基)苯基]吡唑-4-羧酸(33.6mg，69％)。
化合物324和360遵循如对于化合物362的合成所述的方法和方案来合成，使用适当的材料开始。
实施例36.化合物364的制备
在氮气气氛下在40℃下将3-氟-4-([2-[(1R)-1-羟基-1-(1-甲基哌啶-4-基)乙基]-1,6-萘啶-7-基]氨基)-[1,1-联苯]-3-羧酸(化合物360，50mg，0.100mmol，1当量)、TEA(20.21mg，0.200mmol，2当量)、NH4HCO3(39.48mg，0.499mmol，5当量)和HATU(56.97mg，0.150mmol，1.50当量)在DMF(3mL)中的混合物搅拌3小时。将所得混合物通过制备型HPLC纯化，得到呈黄色固体的(R)-3’-氟-4’-((2-(1-羟基-1-(1-甲基哌啶-4-基)乙基)-1,6-萘啶-7-基)氨基)-[1,1’-联苯]-3-甲酰胺(10.4mg，21％)。
实施例37.化合物414的制备
在室温和空气气氛下向搅拌的(1R)-1-(7-[[2-氟-4-(1-[[2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基]甲基]吡唑-3-基)苯基]氨基]-1,6-萘啶-2-基)-1-(1-甲基哌啶-4-基)乙醇(45mg，0.078mmol，1当量)在DCM(3mL，78.650mmol，1008.11当量)中的溶液中逐滴添加TFA(3mL，40.389mmol，517.69当量)持续2h。将混合物用饱和NaHCO3(水溶液)碱化至pH 7。将所得混合物用EtOAc(3×5mL)萃取，用无水Na2SO4干燥。过滤后，将滤液在减压下浓缩。将粗产物(20.9mg)通过制备型HPLC纯化，得到呈淡黄色固体的(1R)-1-(7-[[2-氟-4-(1H-吡唑-3-基)苯基]氨基]-1,6-萘啶-2-基)-1-(1-甲基哌啶-4-基)乙醇(14.4mg，41％)。
实施例38.化合物186和188的制备
2-(7-氯-1,6-萘啶-2-基)丙二酸1-叔丁酯3-乙酯。在室温下向2,7-二氯-1,6-萘啶(7g，35.171mmol，1当量)在DMF(100mL)中的溶液中添加丙二酸1-叔丁酯3-乙酯(13.24g，70.341mmol，2当量)和Cs2CO3(22.92g，70.341mmol，2当量)。将所得混合物在80℃下搅拌隔夜。将反应混合物用水(500mL)？稀释，用乙酸乙酯(2×300mL)萃取。将合并的有机层用水(5×300mL)、盐水(300mL)洗涤，用无水硫酸钠干燥并过滤。在减压下浓缩滤液，将残余物通过硅胶柱色谱法纯化，用石油醚中的3～10％乙酸乙酯洗脱，得到呈棕色油状物的2-(7-氯-1,6-萘啶-2-基)丙二酸1-叔丁酯3-乙酯(7.5g，60％)。
2-(7-氯-1,6-萘啶-2-基)乙酸乙酯。在0℃下向2-(7-氯-1,6-萘啶-2-基)丙二酸1-叔丁基3-乙基酯(1.60g，4.561mmol，1当量)在DCM(40mL)中的溶液中添加TFA(10mL，134.630mmol，29.52当量)。将所得混合物在室温下搅拌2小时。将所得混合物在减压下浓缩。将所得混合物用EtOAc(100mL)萃取。将所得混合物用盐水(2×100mL)洗涤。将有机层用无水Na2SO4干燥，并在减压下浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法纯化，用PE/EtOAc(5:1)洗脱，得到呈黄色固体的2-(7-氯-1,6-萘啶-2-基)乙酸乙酯(1.2g)。
4-[1-(7-氯-1,6-萘啶-2-基)-2-乙氧基-2-氧乙基]哌啶-1-羧酸叔丁酯。在0℃下向2-(7-氯-1,6-萘啶-2-基)乙酸乙酯(5.30g，21.142mmol，1当量)在DMF(100mL)中的溶液中添加氢化钠(60％在油中，0.76g，31.714mmol，1.50当量)。将混合物搅拌30分钟。添加4-碘哌啶-1-羧酸叔丁酯(9.87g，31.720mmol，1.50当量)并将混合物升温至室温，并搅拌16小时。将反应混合物用水(500mL)猝灭，用乙酸乙酯(2×200mL)萃取。将合并的有机层用水(5×200mL)、盐水(200mL)洗涤，用无水硫酸钠干燥并过滤。在减压下浓缩滤液，将残余物通过硅胶柱色谱法纯化，用石油醚中的1～3％乙酸乙酯洗脱，得到呈棕色油状物的4-[1-(7-氯-1,6-萘啶-2-基)-2-乙氧基-2-氧乙基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(5.6g)。
4-[2-(7-氯-1,6-萘啶-2-基)-1-乙氧基-1-氧代丙-2-基]哌啶-1-羧酸叔丁酯。在室温和氮气气氛下向搅拌的4-[1-(7-氯-1,6-萘啶-2-基)-2-乙氧基-2-氧乙基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(1g，2.305mmol，1当量)在DMF(35mL)中的溶液中添加NaH(119.82mg，2.996mmol，1.3当量，60％)。将所得混合物在室温下搅拌30分钟。向混合物中添加CH3I(490.65mg，3.457mmol，1.5当量)。将所得混合物在室温下搅拌1h。将反应用饱和NH4Cl(水溶液)在室温下淬灭。将所得混合物用EtOAc(2×100mL)萃取。将合并的有机层用盐水(2×50mL)洗涤，经无水Na2SO4干燥。过滤后，将滤液在减压下浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法纯化，用PE/EtOAc(10:1至3:1)洗脱，得到呈灰白色固体的4-[2-(7-氯-1,6-萘啶-2-基)-1-乙氧基-1-氧代丙-2-基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(800mg，77％)。
4-[1-(7-氯-1,6-萘啶-2-基)乙基]哌啶-1-羧酸叔丁酯。在室温和氮气气氛下向搅拌的4-[2-(7-氯-1,6-萘啶-2-基)-1-乙氧基-1-氧代丙-2-基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(800mg，1.786mmol，1当量)在MeOH(20mL)中溶液中添加2N NaOH(20mL)。将所得混合物在50℃下在氮气气氛下搅拌36小时。通过LCMS监测反应。使混合物冷却至室温。将所得混合物在减压下浓缩。将所得混合物用盐水(100mL)稀释。将所得混合物用EtOAc(2×100mL)萃取。将合并的有机层用盐水(1×50mL)洗涤，用无水Na2SO4干燥。过滤后，将滤液在减压下浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法纯化，用PE/EtOAc(10:1至3:1)洗脱，得到呈灰白色固体的4-[1-(7-氯-1,6-萘啶-2-基)乙基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(500mg，74％)。
4-[1-[7-([2-氟-4-[3-(羟甲基)吡唑-1-基]苯基]氨基)-1,6-萘啶-2-基]乙基]哌啶-1-羧酸叔丁酯。在室温和氮气气氛下向搅拌的4-[1-(7-氯-1,6-萘啶-2-基)乙基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(510mg，1.357mmol，1当量)、[1-(4-氨基-3-氟苯基)吡唑-3-基]甲醇(309.24mg，1.492mmol，1.1当量)、XantPhos(235.51mg，0.407mmol，0.3当量)和Cs2CO3(884.11mg，2.713mmol，2.0当量)在1,4-二噁烷(50mL)中的溶液中添加Pd(OAc)2(45.69mg，0.204mmol，0.15当量)。将所得混合物在100℃下在氮气气氛下搅拌2小时。通过LCMS监测反应。使混合物冷却至室温。将残余物通过反相快速色谱法经以下条件纯化：柱：SphericalC18，20-40um，330g；流动相A：水(加5mM HOAc)；流动相B：ACN；流速：45mL/min；梯度：5％-5％B，10min，20min内33％B-45％B梯度；检测器：254nm。在40％B下收集含有所需产物的级分，并在减压下浓缩，得到呈白色固体的4-[1-[7-([2-氟-4-[3-(羟甲基)吡唑-1-基]苯基]氨基)-1,6-萘啶-2-基]乙基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(445mg，60％)
[1-[3-氟-4-([2-[1-(哌啶-4-基)乙基]-1,6-萘啶-7-基]氨基)苯基]吡唑-3-基]甲醇。在室温和氮气气氛下向搅拌的4-[1-[7-([2-氟-4-[3-(羟甲基)吡唑-1-基]苯基]氨基)-1,6-萘啶-2-基]乙基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(450mg，0.823mmol，1当量)在DCM(10mL)中的溶液中添加TFA(1mL)。将所得混合物在室温下在氮气气氛下搅拌1小时。通过LCMS监测反应。将所得混合物在减压下浓缩。将所得混合物用盐水(50mL)稀释。将混合物/残余物用饱和NaHCO3(水溶液)碱化至pH 8。将所得混合物用DCM(2×50mL)萃取。将合并的有机层用盐水(1×100mL)洗涤，经无水Na2SO4干燥。过滤后，将滤液在减压下浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法纯化，用PE/EtOAc(10:1至3:1)洗脱，得到呈黄色固体的[1-[3-氟-4-([2-[1-(哌啶-4-基)乙基]-1,6-萘啶-7-基]氨基)苯基]吡唑-3-基]甲醇(300mg，81％)。
(R)-和(S)-[1-[3-氟-4-([2-[1-(1-甲基哌啶-4-基)乙基]-1,6-萘啶-7-基]氨基)苯基]吡唑-3-基]甲醇(化合物186和188)。在室温和氮气气氛下向搅拌的[1-[3-氟-4-([2-[1-(哌啶-4-基)乙基]-1,6-萘啶-7-基]氨基)苯基]吡唑-3-基]甲醇(300mg，0.672mmol，1当量)和HCHO(26.22mg，0.873mmol，1.3当量)在THF(50mL)中的溶液中添加NaBH(OAc)3(213.59mg，18mmol，1.5当量)。将所得混合物在室温下在氮气气氛下搅拌1小时。通过LCMS监测反应。将所得混合物在减压下浓缩。将残余物通过反相快速色谱法经以下条件纯化：柱：Spherical C18，20-40um，330g；流动相A：水(加0.05％TFA)；流动相B：ACN；流速：85mL/min；梯度：5％-5％B，10min，20min内33％B-45％B梯度；检测器：254nm。在40％B下收集含有所需产物的级分，并在减压下浓缩，得到外消旋产物。将外消旋物通过制备手性色谱法在以下条件下分离：柱：CHIRALPAK IG，20*250mm，5μm；流动相A：Hex(8mmol/L NH3·MeOH)，流动相B：EtOH:DCM＝1:1；流速：20mL/min；梯度：20分钟内38B到38B；220/254nm；RT1：13.916分钟；RT2：16.349分钟；注入体积：0.5mL；运行次数：10次；获得(R)-和(S)-[1-[3-氟-4-([2-[1-(1-甲基哌啶-4-基)乙基]-1,6-萘啶-7-基]氨基)苯基]吡唑-3-基]甲醇。
化合物186-在16.349分钟洗脱；产率：43.7mg。化合物188-在13.916分钟洗脱；产率：48.4mg。
化合物204、244、246、310、311、314、315、319、322、333和339遵循如对于化合物186和188的合成所述的方法和方案来合成，使用适当的材料开始。
实施例39.化合物410的制备
7-氯-2-[1-(哌啶-4-基)乙基]-1,6-萘啶。在室温下向搅拌的4-[1-(7-氯-1,6-萘啶-2-基)乙基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(化合物188；步骤5，700mg，1.862mmol，1当量)在DCM(15mL)中的溶液中分批添加TFA(30mL，403.891mmol，216.89当量)。将所得混合物在0℃下搅拌1小时。通过LCMS监测反应。将所得混合物用DCM(3×10mL)萃取。将合并的有机层用DCM(3x10 mL)洗涤，经无水Na2SO4干燥。过滤后，在减压下浓缩滤液，得到呈棕色油状物的7-氯-2-[1-(哌啶-4-基)乙基]-1,6-萘啶(500mg，97％)。
7-氯-2-[1-(1-甲基哌啶-4-基)乙基]-1,6-萘啶。在0℃下向搅拌的7-氯-2-[1-(哌啶-4-基)乙基]-1,6-萘啶(500mg，1.813mmol，1当量)和HCHO(362.92mg，3.626mmol，2当量，30％)在MeOH(10mL)中的溶液中分批添加NaBH3CN(227.87mg，3.626mmol，2当量)。将所得混合物在0℃下搅拌1小时。通过LCMS监测反应。将所得混合物在减压下浓缩。将残余物通过反相快速色谱法经如下条件纯化下(柱：C18，120g；流动相A：水/0.05％NH4HCO3，流动相B：ACN；流速：40mL/min；梯度：20分钟内45％B到95％B；检测器，254nm和220nm，在75％B下收集所需产物)，得到呈棕色固体的7-氯-2-[1-(1-甲基哌啶-4-基)乙基]-1,6-萘啶(250mg，47％)。
3'-氟-4'-([2-[1-(1-甲基哌啶-4-基)乙基]-1,6-萘啶-7-基]氨基)-[1,1'-联苯]-3-甲酰胺(化合物410)。在室温和氮气气氛下向搅拌的7-氯-2-[1-(1-甲基哌啶-4-基)乙基]-1,6-萘啶(198.10mg，0.684mmol，1当量)和4-氨基-3-氟-[1,1-联苯]-3-甲酰胺(157.38mg，0.684mmol，1当量)在1,4-二噁烷(8.00mL)中的混合物中添加Pd(OAc)2(46.04mg，0.205mmol，0.30当量)、XantPhos(237.31mg，0.410mmol，0.60当量)和Cs2CO3(445.43mg，1.367mmol，2当量)。将所得混合物在100℃下在氮气气氛下搅拌1h。通过LCMS监测反应。使混合物冷却至室温。将所得混合物在减压下浓缩。将残余物通过制备型TLC(DCM/MeOH 5:1)纯化，得到粗产物，将其通过制备型HPLC进一步纯化，得到呈淡黄色固体的3’-氟-4’-([2-[1-(1-甲基哌啶-4-基)乙基]-1,6-萘啶-7-基]氨基)-[1,1’-联苯]-3-甲酰胺(14.6mg，4％)。
化合物368和386遵循如对于化合物410的合成所述的方法和方案来合成，使用适当的材料开始。
实施例40.化合物139的制备
4-[2-乙氧基-1-[7-([2-氟-4-[3-(羟甲基)吡唑-1-基]苯基]氨基)-1,6-萘啶-2-基]-2-氧乙基]哌啶-1-羧酸叔丁酯。在室温下在氮气气氛下向4-[1-(7-氯-1,6-萘啶-2-基)-2-乙氧基-2-氧乙基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(化合物188，步骤3，300mg，0.691mmol，1当量)和[1-(4-氨基-3-氟苯基)吡唑-3-基]甲醇(157.58mg，0.760mmol，1.10当量)在1,4-二噁烷(10mL)中的混合物中分批添加Pd(OAc)2(23.28mg，0.104mmol，0.15当量)、XantPhos(120.01mg，0.207mmol，0.30当量)和Cs2CO3(450.51mg，1.383mmol，2当量)。将所得混合物在100℃下在氮气气氛下搅拌2小时。通过LCMS监测反应。使混合物冷却至室温。将所得混合物用EtOAc(3×200mL)萃取。将合并的有机层用盐水(2×100mL)洗涤，经无水Na2SO4干燥。过滤后，将滤液在减压下浓缩。将残余物通过反相快速色谱法经以下条件纯化：柱：SphericalC18，20-40um，330g；流动相A：水(加5mM NH4HCO3)；流动相B：ACN；流速：80mL/min；梯度：5％-5％B，10min，30min内45％B-80％B梯度；检测器：220nm。在75％B下收集含有所需产物的级分，并在减压下浓缩，得到呈黄色固体的4-[2-乙氧基-1-[7-([2-氟-4-[3-(羟甲基)吡唑-1-基]苯基]氨基)-1,6-萘啶-2-基]-2-氧乙基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(200mg，47％)。
4-[1-[7-([2-氟-4-[3-(羟甲基)吡唑-1-基]苯基]氨基)-1,6-萘啶-2-基]-2-羟乙基]哌啶-1-羧酸叔丁酯。在室温和氮气气氛下向搅拌的4-[2-乙氧基-1-[7-([2-氟-4-[3-(羟甲基)吡唑-1-基]苯基]氨基)-1,6-萘啶-2-基]-2-氧乙基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(50mg，0.083mmol，1当量)在THF(6mL)中的溶液中添加LiAlH4(3.77mg，0.099mmol，1.20当量)。将所得混合物在室温下在氮气气氛下搅拌0.5小时。通过TLC监测反应。将反应在室温下用水(0.3mL)淬灭。将所得混合物在减压下浓缩。将残余物通过TLC纯化，用DCM/MeOH(10:1)洗脱，得到呈灰白色固体的4-[1-[7-([2-氟-4-[3-(羟甲基)吡唑-1-基]苯基]氨基)-1,6-萘啶-2-基]-2-羟乙基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(30mg，64％)。
[1-[3-氟-4-([2-[1-(哌啶-4-基)乙烯基]-1,6-萘啶-7-基]氨基)苯基]吡唑-3-基]甲醇。在室温下向搅拌的4-[1-[7-([2-氟-4-[3-(羟甲基)吡唑-1-基]苯基]氨基)-1,6-萘啶-2-基]-2-羟乙基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(15mg)在THF(2mL)中的溶液中添加1,4-二噁烷(2mL)中的HCl(气体)。将所得混合物在室温下搅拌3小时。通过TLC监测反应。将所得混合物在真空下浓缩。将残余物通过制备型HPLC纯化，得到呈淡黄色固体的[1-[3-氟-4-([2-[1-(哌啶-4-基)乙烯基]-1,6-萘啶-7-基]氨基)苯基]吡唑-3-基]甲醇(3.3mg)。
实施例41.化合物168的制备
2-[7-([2-氟-4-[3-(羟甲基)吡唑-1-基]苯基]氨基)-1,6-萘啶-2-基]-2-(哌啶-4-基)乙酸乙酯。在氮气气氛下在室温下向搅拌的4-[2-乙氧基-1-[7-([2-氟-4-[3-(羟甲基)吡唑-1-基]苯基]氨基)-1,6-萘啶-2-基]-2-氧乙基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(化合物139，步骤1，300mg，0.496mmol，1当量)在DCM(10mL，157.300mmol，317.06当量)中的溶液中分批添加TFA(1mL，13.463mmol，27.14当量)。将所得混合物在室温下搅拌2小时。通过LCMS监测反应。将所得混合物在减压下浓缩。将残余物通过反相快速色谱法经以下条件纯化：柱：Spherical C18，20-40um，330g；流动相A：水(0.5％TFA)；流动相B：ACN；流速：85mL/min；梯度：5％-5％B，10min，20min内33％B-45％B梯度；检测器：254nm。在40％B下收集含有所需产物的级分，并在减压下浓缩，得到呈黄色固体的2-[7-([2-氟-4-[3-(羟甲基)吡唑-1-基]苯基]氨基)-1,6-萘啶-2-基]-2-(哌啶-4-基)乙酸乙酯(160mg，63％)。
2-[7-([2-氟-4-[3-(羟甲基)吡唑-1-基]苯基]氨基)-1,6-萘啶-2-基]-2-(1-甲基哌啶-4-基)乙酸乙酯。在氮气气氛下在室温下向搅拌的2-[7-([2-氟-4-[3-(羟甲基)吡唑-1-基]苯基]氨基)-1,6-萘啶-2-基]-2-(哌啶-4-基)乙酸乙酯(160mg，0.317mmol，1当量)和HCHO(14.28mg，0.476mmol，1.50当量)在THF(15mL)中的溶液中分批添加NaBH(OAc)3(107.53mg，0.507mmol，1.60当量)。将所得混合物在室温下搅拌2小时。通过LCMS监测反应。将残余物通过反相快速色谱法经以下条件纯化：柱：Spherical C18，20-40um，330g；流动相A：水(0.5％TFA)；流动相B：ACN；流速：85mL/min；梯度：5％-5％B，10min，20min内33％B-45％B梯度；检测器：254nm。在40％B下收集含有所需产物的级分，并在减压下浓缩，得到呈黄色固体的2-[7-([2-氟-4-[3-(羟甲基)吡唑-1-基]苯基]氨基)-1,6-萘啶-2-基]-2-(1-甲基哌啶-4-基)乙酸乙酯(111mg，67％)
2-[7-([2-氟-4-[3-(羟甲基)吡唑-1-基]苯基]氨基)-1,6-萘啶-2-基]-2-(1-甲基哌啶-4-基)乙醇。在氮气气氛下在室温下向搅拌的2-[7-([2-氟-4-[3-(羟甲基)吡唑-1-基]苯基]氨基)-1,6-萘啶-2-基]-2-(1-甲基哌啶-4-基)乙酸乙酯(100mg，0.193mmol，1当量)在THF(10mL)中的溶液中分批添加LiAlH4(18.30mg，0.482mmol，2.5当量)。将所得混合物在室温下在氮气气氛下搅拌1小时。通过LCMS监测反应。将所得混合物在减压下浓缩。将残余物通过反相快速色谱法经以下条件纯化：柱：Spherical C18，20-40um，330g；流动相A：水(0.5％TFA)；流动相B：ACN；流速：85mL/min；梯度：5％-5％B，10min，20min内33％B-45％B梯度；检测器：254nm。在40％B下收集含有所需产物的级分，并在减压下浓缩，得到呈黄色固体的2-[7-([2-氟-4-[3-(羟甲基)吡唑-1-基]苯基]氨基)-1,6-萘啶-2-基]-2-(1-甲基哌啶-4-基)乙醇(55mg，59％)。
[1-[3-氟-4-([2-[1-(1-甲基哌啶-4-基)乙烯基]-1,6-萘啶-7-基]氨基)苯基]吡唑-3-基]甲醇。在室温下向搅拌的2-[7-([2-氟-4-[3-(羟甲基)吡唑-1-基]苯基]氨基)-1,6-萘啶-2-基]-2-(1-甲基哌啶-4-基)乙醇(55mg)在DCM(10mL)中的溶液中分批添加TFA(1mL)。将所得混合物在室温下搅拌2小时。通过LCMS监测反应。将所得混合物在减压下浓缩。将残余物通过反相快速色谱法经以下条件纯化：柱：Spherical C18，20-40um，330g；流动相A：水(0.5％TFA)；流动相B：ACN；流速：85mL/min；梯度：5％-5％B，10min，20min内33％B-45％B梯度；检测器：254nm。在40％B下收集含有所需产物的级分，并在减压下浓缩，得到呈黄色固体的三氟乙酸；[1-[3-氟-4-([2-[1-(1-甲基哌啶-4-基)乙烯基]-1,6-萘啶-7-基]氨基)苯基]吡唑-3-基]甲醇(7.1mg)
实施例42.化合物142的制备
在室温下向搅拌的4-[1-[7-([2-氟-4-[3-(羟甲基)吡唑-1-基]苯基]氨基)-1,6-萘啶-2-基]-2-羟乙基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(化合物139，步骤2，15mg)在THF(2mL)中的溶液中添加1,4-二噁烷(2mL)中的HCl(气体)。将所得混合物在室温下搅拌3小时。通过TLC监测反应。将所得混合物在真空下浓缩。将残余物通过制备型HPLC纯化，得到呈淡黄色固体的2-[7-([2-氟-4-[3-(羟甲基)吡唑-1-基]苯基]氨基)-1,6-萘啶-2-基]-2-(哌啶-4-基)乙醇；甲酸(2.1mg)。
实施例43.化合物312和316的制备
4-[1-(7-氯-1,6-萘啶-2-基)环丙基]哌啶-1-羧酸叔丁酯。在氮气气氛下在室温下向搅拌的4-[1-(7-氯-1,6-萘啶-2-基)乙烯基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(200mg，0.535mmol，1当量)和t-BuOK(90.04mg，0.802mmol，1.5当量)在THF(30mL，370.290mmol，692.22当量)中的溶液中添加分批碘化三甲基氧化锍(176.58mg，0.802mmol，1.5当量)。将所得混合物在室温下在氮气气氛下搅拌4小时。通过LCMS监测反应。将反应用饱和NH4Cl(水溶液)在室温下淬灭。将所得混合物用EtOAc(3×150mL)萃取。将合并的有机层用盐水(1x150 mL)洗涤，经无水Na2SO4干燥。过滤后，将滤液在减压下浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法纯化，用PE/EtOAc(1:1)洗脱，得到呈白色固体的4-[1-(7-氯-1,6-萘啶-2-基)环丙基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(150mg，72％)。
4-[1-[7-([2-氟-4-[3-(羟甲基)吡唑-1-基]苯基]氨基)-1,6-萘啶-2-基]环丙基]哌啶-1-羧酸叔丁酯。在氮气气氛下在室温下向搅拌的4-[1-(7-氯-1,6-萘啶-2-基)环丙基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(130mg，0.335mmol，1当量)、[1-(4-氨基-3-氟苯基)吡唑-3-基]甲醇(83.33mg，0.402mmol，1.20当量)、XantPhos(58.17mg，0.101mmol，0.3当量)和Cs2CO3(218.38mg，0.670mmol，2.0当量)在1,4-二噁烷(10mL)中的溶液中逐滴添加Pd(OAc)2(11.29mg，0.050mmol，0.15当量)。将所得混合物在100℃下在氮气气氛下搅拌2小时。通过LCMS监测反应。使混合物冷却至室温。将所得混合物在减压下浓缩。将残余物通过制备型TLC(DCM/MeOH 10:1)纯化，得到呈灰白色固体的4-[1-[7-([2-氟-4-[3-(羟甲基)吡唑-1-基]苯基]氨基)-1,6-萘啶-2-基]环丙基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(90mg，48％)。
[1-[3-氟-4-([2-[1-(哌啶-4-基)环丙基]-1,6-萘啶-7-基]氨基)苯基]吡唑-3-基]甲醇(化合物316)。在氮气气氛下向搅拌的4-[1-[7-([2-氟-4-[3-(羟甲基)吡唑-1-基]苯基]氨基)-1,6-萘啶-2-基]环丙基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(100mg，0.179mmol，1当量)在DCM(10mL)中的溶液中添加TFA(1mL)。将所得混合物在室温下在氮气气氛下搅拌2小时。将所得混合物在真空下浓缩。将所得混合物用DCM(10mL)稀释。将混合物用饱和NaHCO3(水溶液)碱化至pH 9。将所得混合物用DCM(3×50mL)萃取。将合并的有机层用盐水(1×30mL)洗涤，经无水Na2SO4干燥。过滤后，将滤液在减压下浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法纯化，用DCM/MeOH(10:1)洗脱，得到呈浅黄色固体的[1-[3-氟-4-([2-[1-(哌啶-4-基)环丙基]-1,6-萘啶-7-基]氨基)苯基]吡唑-3-基]甲醇(50mg，60％)。
[1-[3-氟-4-([2-[1-(1-甲基哌啶-4-基)环丙基]-1,6-萘啶-7-基]氨基)苯基]吡唑-3-基]甲醇(化合物312)。向搅拌的[1-[3-氟-4-([2-[1-(哌啶-4-基)环丙基]-1,6-萘啶-7-基]氨基)苯基]吡唑-3-基]甲醇(60mg，0.131mmol，1当量)、HCHO(4.71mg，0.157mmol，1.20当量)在THF(15mL)中的溶液中添加NaBH(OAc)3(41.60mg，0.196mmol，1.50当量)将所得混合物在室温下在氮气气氛下搅拌1小时。通过LCMS监测反应。将粗产物(30mg)通过制备型HPLC纯化，得到呈白色固体的[1-[3-氟-4-([2-[1-(1-甲基哌啶-4-基)环丙基]-1,6-萘啶-7-基]氨基)苯基]吡唑-3-基]甲醇(16mg，25％)。
实施例44.化合物169和291的制备
4-[(7-氯-1,6-萘啶-2-基)二氟甲基]哌啶-1-羧酸叔丁酯。在氮气气氛下在室温下将4-(7-氯-1,6-萘啶-2-羰基)哌啶-1-羧酸叔丁酯(200mg，0.532mmol，1当量)在DAST(5mL)中的混合物搅拌16小时。通过LCMS监测反应。将所得混合物添加到50mL冷的饱和NaHCO3(水溶液)中。将水层用EtOAc(2x100 mL)萃取。将合并的有机层用盐水(100mL)洗涤，经无水Na2SO4干燥。过滤后，将滤液在减压下浓缩。将残余物通过制备型TLC(DCM/MeOH 50:1)纯化，得到呈黄色泡沫的4-[(7-氯-1,6-萘啶-2-基)二氟甲基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(130mg，61％)。
4-[二氟(7-[[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]氨基]-1,6-萘啶-2-基)甲基]哌啶-1-羧酸叔丁酯。在室温和氮气气氛下向搅拌的4-[(7-氯-1,6-萘啶-2-基)二氟甲基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(130mg，0.327mmol，1当量)和2-氟-4-(吡唑-1-基)苯胺(63.68mg，0.359mmol，1.10当量)在无水1,4-二噁烷(15mL)中的混合物中添加Pd(OAc)2(11mg，0.049mmol，0.15当量)、Xantphos(56.72mg，0.098mmol，0.30当量)和Cs2CO3(212.93mg，0.654mmol，2当量)。将所得混合物在100℃下在氮气气氛下搅拌2小时。将所得混合物过滤，将滤饼用DCM和MeOH(10:1)洗涤。将滤液在减压下浓缩。将残余物通过制备型TLC(PE/EA，2:1)纯化，得到呈黄色泡沫的4-[二氟(7-[[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]氨基]-1,6-萘啶-2-基)甲基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(130mg，73％)。
2-[二氟(哌啶-4-基)甲基]-N-[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]-1,6-萘啶-7-胺(化合物169)。在室温下向搅拌的4-[二氟(7-[[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]氨基]-1,6-萘啶-2-基)甲基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(130mg，0.241mmol，1当量)在DCM(15mL)中的溶液中添加溴化锌(543.56mg，2.414mmol，10当量)。将所得混合物在50℃下搅拌16小时。将所得混合物用水(100mL)稀释并用DCM(3×50mL)萃取。将合并的有机层用无水硫酸钠干燥并过滤。将滤液在减压下浓缩，并将残余物通过制备型HPLC纯化，得到呈黄色固体的2-[二氟(哌啶-4-基)甲基]-N-[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]-1,6-萘啶-7-胺(33.9mg，32％)。
2-[二氟(1-甲基哌啶-4-基)甲基]-N-[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]-1,6-萘啶-7-胺(化合物291)。在0℃下向搅拌的2-[二氟(哌啶-4-基)甲基]-N-[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]-1,6-萘啶-7-胺(30mg，0.068mmol，1当量)和甲醛溶液(6.16mg，0.205mmol，3当量)在THF(10mL)中的溶液中分批添加NaBH(OAc)3(43.50mg，0.205mmol，3当量)。将所得混合物在0℃下搅拌1小时。将所得混合物用饱和NaHCO3水溶液(20mL)稀释，并用乙酸乙酯(2×50mL)萃取。将合并的有机层用无水Na2SO4干燥。过滤后，将滤液在减压下浓缩。将粗产物通过制备型HPLC纯化，得到呈黄色固体的2-[二氟(1-甲基哌啶-4-基)甲基]-N-[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]-1,6-萘啶-7-胺(13.3mg)。
实施例45.化合物375和381的制备
在50℃下将N-[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]-2-(1-甲基哌啶-4-羰基)-1,6-萘啶-7-胺(33mg，0.077mmol，1当量)、盐酸羟胺(13.32mg，0.192mmol，2.50当量)和吡啶(2mL)的混合物搅拌1h。将粗产物通过制备型HPLC纯化(33mg)，得到呈黄色固体的N-[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]-2-[(1E)-(羟基亚氨基)(1-甲基哌啶-4-基)甲基]-1,6-萘啶-7-胺(7.1mg，21％)和N-[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]-2-[(1Z)-(羟基亚氨基)(1-甲基哌啶-4-基)甲基]-1,6-萘啶-7-胺(4.8mg，14％)。
化合物357和361遵循如对于化合物375和381的合成所述的方法和方案来合成，使用适当的材料开始。
实施例46.化合物365的制备
7-氯-2-(2-(1-甲基哌啶-4-基)氧杂环丁烷-2-基)-1,6-萘啶。在室温和氮气气氛下向搅拌的7-氯-2-(1-甲基哌啶-4-羰基)-1,6-萘啶(120.mg，0.414mmol，1当量)和t-BuOK(185.88mg，1.657mmol，4当量)在t-BuOH(5mL)中的混合物中添加三甲基(氧代)-λ6-硫基碘化鎓(364.56mg，1.657mmol，4当量)。将所得混合物在50℃下在氮气气氛下搅拌16小时。通过LCMS监测反应。使混合物冷却至室温。将所得混合物在减压下浓缩。将残余物通过制备型TLC(DCM/MeOH＝15:1)纯化，得到呈黄色固体的7-氯-2-[2-(1-甲基哌啶-4-基)氧杂环丁烷-2-基]-1,6-萘啶(60mg，粗制物)。
N-(2-氟-4-(1H-吡唑-1-基)苯基)-2-(2-(1-甲基哌啶-4-基)氧杂环丁烷-2-基)-1,6-萘啶-7-胺(化合物365)。在室温和氮气气氛下向搅拌的7-氯-2-[2-(1-甲基哌啶-4-基)氧杂环丁烷-2-基]-1,6-萘啶(60mg，0.189mmol，1当量)和2-氟-4-(吡唑-1-基)苯胺(40.14mg，0.227mmol，1.20当量)在1,4-二噁烷(4mL)中的混合物中添加Cs2CO3(123.02mg，0.378mmol，2当量)、XantPhos(32.77mg，0.057mmol，0.30当量)和Pd(OAc)2(6.36mg，0.028mmol，0.15当量)。将所得混合物在100℃下在氮气气氛下搅拌3小时。通过LCMS监测反应。使混合物冷却至室温。将所得混合物过滤，将滤饼用EtOAc(3×10mL)洗涤。将滤液在减压下浓缩。将残余物通过制备型TLC(DCM/MeOH＝10:1)纯化，得到粗产物。将粗产物(60mg)通过制备型HPLC纯化，得到呈黄色固体的N-[2-氟-4-(1H-吡唑-1-基)苯基]-2-[2-(1-甲基哌啶-4-基)氧杂环丁烷-2-基]-1,6-萘啶-7-胺(7.6mg，8％)。
实施例47.化合物343和349的制备
1-(7-氯-1,6-萘啶-2-基)-2,2,2-三氟-1-(1-甲基哌啶-4-基)乙醇。在0℃和氮气气氛下向搅拌的7-氯-2-(1-甲基哌啶-4-羰基)-1,6-萘啶(0.10g，0.35mmol)和氟化铯(65.5mg，0.43mmol)在乙二醇二甲醚(4.00mL)中的混合物中逐滴添加(三氟甲基)三甲基硅烷(0.12g，0.86mmol)。在氮气气氛下在环境温度下将所得混合物搅拌48h。将反应用水(20.0mL)淬灭并用乙酸乙酯(3×20.0mL)萃取。将合并的有机层用盐水(3×10.0mL)洗涤，用无水硫酸钠干燥并过滤。在减压下浓缩滤液，得到呈黄色固体的标题化合物(0.13g，粗制物)，其不经进一步纯化即直接用于下一步。
2,2,2-三氟-1-(7-[[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]氨基]-1,6-萘啶-2-基)-1-(1-甲基哌啶-4-基)乙醇。在微波小瓶(10mL)中添加二噁烷(5mL)中的1-(7-氯-1,6-萘啶-2-基)-2,2,2-三氟-1-(1-甲基哌啶-4-基)乙醇(124mg，0.345mmol，1当量)、2-氟-4-(吡唑-1-基)苯胺(67.17mg，0.379mmol，1.1当量)、XantPhos(59.83mg，0.103mmol，0.3当量)、Pd(OAc)2(11.61mg，0.052mmol，0.15当量)和Cs2CO3(224.59mg，0.689mmol，2当量)，通过密封管将所得混合物在100℃下搅拌2小时。使混合物冷却至室温。将反应在室温下用水淬灭。将所得混合物用DCM(100×mL)萃取。将合并的有机层用盐水(3x50 mL)洗涤，经无水Na2SO4干燥。过滤后，将滤液在减压下浓缩。将残余物通过反向快速色谱法经以下条件纯化：柱，C18硅胶；流动相，MeOH水溶液，10分钟内10％至50％的梯度；检测器，UV 254nm，得到呈黄色固体的2,2,2-三氟-1-(7-[[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]氨基]-1,6-萘啶-2-基)-1-(1-甲基哌啶-4-基)乙醇(100mg，57％)。
(R)-2,2,2-三氟-1-(7-((2-氟-4-(1H-吡唑-1-基)苯基)氨基)-1,6-萘啶-2-基)-1-(1-甲基哌啶-4-基)乙-1-醇和(S)-2,2,2-三氟-1-(7-((2-氟-4-(1H-吡唑-1-基)苯基)氨基)-1,6-萘啶-2-基)-1-(1-甲基哌啶-4-基)乙-1-醇(化合物343和349)。将2,2,2-三氟-1-(7-[[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]氨基]-1,6-萘啶-2-基)-1-(1-甲基哌啶-4-基)乙醇(0.10g)通过手性制备型HPLC使用以下条件分离：柱：CHIRALPAK IG，2×25cm，5um；流动相A：己烷:二氯甲烷＝3:1(加MeOH中的10mM NH3)，流动相B：EtOH；流速：20mL/min；梯度：13分钟内等度25％B；检测器：UV 254/220nm。
化合物343-在10.83分钟洗脱；产率：30.4mg。化合物349-在7.84分钟洗脱；产率：32.5mg
化合物390、394、396、398、401和403遵循如对于化合物343和349的合成所述的方法和方案来合成，使用适当的材料开始。
实施例48.化合物215的制备
7-氯-1,6-萘啶-2-羧酸甲酯。在氮气气氛下在室温下向搅拌的2,7-二氯-1,6-萘啶(1700mg，8.54mmol，1当量)和TEA(2.59g，25.6mmol，3当量)在THF(40mL)和MeOH(10mL)中的混合物中分批添加Pd(OAc)2(383.5mg，1.708mmol，0.20当量)和DPPP(2113.7mg，5.125mmol，0.60当量)。在CO气氛下将所得混合物在60℃下搅拌过夜。将所得混合物在减压下浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱纯化，用PE/EtOAc(1:1)洗脱，得到呈灰白色固体的7-氯-1,6-萘啶-2-羧酸甲酯(700mg，37％)。
7-[[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]氨基]-1,6-萘啶-2-羧酸甲酯。在氮气气氛下在室温下向搅拌的7-氯-1,6-萘啶-2-羧酸甲酯(700mg，3.144mmol，1当量)、2-氟-4-(吡唑-1-基)苯胺(668.52mg，3.773mmol，1.20当量)和Cs2CO3(2048.90mg，6.288mmol，2当量)在二噁烷(40mL)中的混合物中分批添加Pd(OAc)2(141.18mg，0.629mmol，0.2当量)和XantPhos(1091.59mg，1.887mmol，0.6当量)。将所得混合物在100℃下在氮气气氛下搅拌1小时。将所得混合物在真空下浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法纯化，用PE/EtOAc(1:1)洗脱，得到呈黄色固体的7-[[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]氨基]-1,6-萘啶-2-羧酸甲酯(450mg，39％)。
7-[[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]氨基]-1,6-萘啶-2-羧酸。在室温下向搅拌的7-[[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]氨基]-1,6-萘啶-2-羧酸甲酯(450mg，1.238mmol，1当量)在THF(20mL，246.860mmol，199.33当量)和H2O(5mL，277.542mmol，224.10当量)中的溶液中分批添加LiOH(148.29mg，6.192mmol，5当量)。将所得混合物在60℃下搅拌16小时。将所得混合物在真空下浓缩。将残余物通过制备型TLC(DCM/MeOH 10:1)纯化，得到呈红色固体的7-[[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]氨基]-1,6-萘啶-2-羧酸(270mg，62％)。
N-[1-(7-[[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]氨基]-1,6-萘啶-2-羰基)吡咯烷-3-基]氨基甲酸叔丁酯。在室温下向搅拌的7-[[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]氨基]-1,6-萘啶-2-羧酸(270mg，0.773mmol，1当量)和N-(吡咯烷-3-基)氨基甲酸叔丁酯(431.88mg，2.319mmol，3当量)在DMF(4mL)中的溶液中逐滴添加HATU(382.05mg，15mmol，1.3当量)和TEA(234.64mg，2.319mmol，3当量)。将所得混合物在室温下搅拌2.5小时。将所得混合物在真空下浓缩。将残余物通过制备型TLC(EtOAc)纯化，得到呈黄色固体的N-[1-(7-[[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]氨基]-1,6-萘啶-2-羰基)吡咯烷-3-基]氨基甲酸叔丁酯(150mg，37％)。
2-(3-氨基吡咯烷-1-羰基)-N-[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]-1,6-萘啶-7-胺(化合物215)。在室温下向搅拌的N-[1-(7-[[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]氨基]-1,6-萘啶-2-羰基)吡咯烷-3-基]氨基甲酸叔丁酯(80.0mg，0.155mmol，1当量)在DCM(10mL)中的溶液中逐滴添加TFA(1mL)。将所得混合物在真空下浓缩。将残余物通过反向快速色谱法经以下条件纯化：柱：Spherical C18，20～40um，120g；流动相A：水(0.05％TFA)，流动相B：ACN；流速：45mL/min；梯度(B％)：5％～25％，10分钟；25％～37％，17分钟；37％～95％；2分钟；95％，5分钟；检测器：254nm；Rt：42分钟。在37％B下收集含有所需产物的级分，并在减压下浓缩，得到呈黄色固体的2-(3-氨基吡咯烷-1-羰基)-N-[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]-1,6-萘啶-7-胺；甲酸(51.9mg，73％)。
实施例49.化合物242的制备
7-氯-1,6-萘啶-2-羧酸。在室温下向搅拌的7-氯-1,6-萘啶-2-羧酸甲酯(化合物215，步骤1，400mg，1.797mmol，1当量)在THF(40mL)和H2O(10mL)中的混合物中分批添加LiOH(172.11mg，7.187mmol，4当量)。将所得混合物在50℃下搅拌3小时。将混合物用HCl(水溶液)中和至pH 7。将所得混合物在真空下浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法纯化，用己烷/EtOAc(1:1)洗脱，得到呈灰白色固体的7-氯-1,6-萘啶-2-羧酸(200mg，43％)。
N-[1-(7-氯-1,6-萘啶-2-羰基)哌啶-3-基]氨基甲酸叔丁酯。在室温下向搅拌的7-氯-1,6-萘啶-2-羧酸(250mg，1.198mmol，1当量)和N-(哌啶-3-基)氨基甲酸叔丁酯(480.06mg，2.397mmol，2当量)在DMF(12mL)中的混合物中分批添加TEA(363.82mg，3.595mmol，3当量)和HATU(683.54mg，1.798mmol，1.5当量)。将所得混合物在室温下搅拌3小时。将所得混合物在真空下浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法纯化，用EtOAc洗脱，得到呈黄色固体的N-[1-(7-氯-1,6-萘啶-2-羰基)哌啶-3-基]氨基甲酸叔丁酯(120mg，25％)。
N-[1-(7-[[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]氨基]-1,6-萘啶-2-羰基)哌啶-3-基]氨基甲酸叔丁酯。在氮气气氛下在室温下向搅拌的N-[1-(7-氯-1,6-萘啶-2-羰基)哌啶-3-基]氨基甲酸叔丁酯(200mg，0.512mmol，1当量)、2-氟-4-(吡唑-1-基)苯胺(108.79mg，0.614mmol，1.20当量)和Pd(OAc)2(22.98mg，0.102mmol，0.2当量)在二噁烷(10mL)中的混合物中分批添加XantPhos(177.64mg，0.307mmol，0.6当量)和Cs2CO3(266.74mg，0.819mmol，1.6当量)。将所得混合物在80℃下在氮气气氛下搅拌1.5小时。将所得混合物在真空下浓缩。将残余物通过制备型TLC(PE/EtOAc 1:1)纯化，得到呈黄色固体的N-[1-(7-[[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]氨基]-1,6-萘啶-2-羰基)哌啶-3-基]氨基甲酸叔丁酯(120mg，35％)。
2-(3-氨基哌啶-1-羰基)-N-[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]-1,6-萘啶-7-胺(化合物242)。在室温下向搅拌的N-[1-(7-[[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]氨基]-1,6-萘啶-2-羰基)哌啶-3-基]氨基甲酸叔丁酯(60mg，0.113mmol，1当量)在DCM(10mL)中的溶液中逐滴添加TFA(1mL)。将所得混合物在真空下浓缩。将残余物用饱和NaHCO3(水溶液)碱化至pH 8。将所得混合物在真空下浓缩。将残余物通过反向快速色谱法经以下条件纯化：柱：SphericalC18，20～40um，120g；流动相A：水(10mM NH4HCO3和0.05％NH3·H2O)，流动相B：ACN；流速：45mL/min；梯度(B％)：5％～25％，13分钟；25％～37％，17分钟；37％～95％；2分钟；95％，5分钟；检测器：254nm；Rt：30分钟。在37％B下收集含有所需产物的级分，并在减压下浓缩，得到呈黄色固体的2-(3-氨基哌啶-1-羰基)-N-[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]-1,6-萘啶-7-胺(72.1mg，92％)。
实施例50.化合物207的制备
2-(7-氯-1,6-萘啶-2-基)丙二酸1,3-二乙酯。在氮气气氛下在室温下向搅拌的2,7-二氯-1,6-萘啶(1200mg，1当量)和丙二酸二乙酯(1940mg，2当量)在DMF中的混合物中逐滴添加Cs2CO3(4000mg，2当量)。将所得混合物在80℃下在氮气气氛下搅拌4小时。将所得油状物在烘箱中在减压下干燥。将残余物通过反相快速色谱法经以下条件纯化(柱：C18，330g；流动相A：水/0.05％TFA，流动相B：ACN；流速：80mL/min；梯度：40分钟内20％B到60％B；检测器，254nm，监测器，220nm，在58％B下收集所需产物)。这产生呈白色固体的2-(7-氯-1,6-萘啶-2-基)丙二酸1,3-二乙酯(1400mg)。
7-氯-2-甲基-1,6-萘啶。在0℃和氮气气氛下向搅拌的2-(7-氯-1,6-萘啶-2-基)丙二酸1,3-二乙酯(1.60g，4.97mmol)在THF(45.0mL)和水(10.0mL)中的溶液中添加氢氧化钠(1.00g，25.0mmol)。通过LCMS监测反应。将残余物通过制备型TLC(PE/EtOAc 1:1)纯化，得到呈黄色固体的7-氯-2-甲基-1,6-萘啶(650mg)。
2-(溴甲基)-7-氯-1,6-萘啶。在80℃下在氮气气氛下向搅拌的7-氯-2-甲基-1,6-萘啶(550mg，1当量)在CCl4(17mL)中的溶液中分批添加NBS(1140mg，2当量)和BPO(155mg，0.20当量)。通过LCMS监测反应。将残余物通过制备型TLC(PE/EtOAc 1:1)纯化，得到呈白色固体的2-(溴甲基)-7-氯-1,6-萘啶(150mg)。
4-[(7-氯-1,6-萘啶-2-基)甲基]硫基]哌啶-1-羧酸叔丁酯。在氮气气氛下在室温向搅拌的2-(溴甲基)-7-氯-1,6-萘啶(150mg，1当量)和4-硫基哌啶-1-羧酸叔丁酯(153mg，1.20当量)在DMF中的混合物中逐滴添加NaH(21mg，1.50当量)下。将所得混合物在室温下在氮气气氛下搅拌1小时。将所得油状物在烘箱中在减压下干燥。将残余物通过反相快速色谱法经以下条件纯化(柱：C18，330g；流动相A：水/0.05％TFA，流动相B：ACN；流速：80mL/min；梯度：40分钟内20％B到60％B；检测器，254nm，监测器，220nm，在58％B下收集所需产物)。这产生呈白色固体的4-[(7-氯-1,6-萘啶-2-基)甲基]硫基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(128mg)。
4-[(7-氯-1,6-萘啶-2-基)甲磺酰基]哌啶-1-羧酸叔丁酯。在0℃下在氮气气氛下向搅拌的4-[(7-氯-1,6-萘啶-2-基)甲基]硫基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(128mg，1当量)在DCM(5mL)中的溶液中分批添加m-CPBA(168mg，3当量)。通过LCMS监测反应。通过LCMS监测反应。将所得混合物在减压下浓缩。将残余物通过反相快速经以下条件纯化(柱：C18，330g；流动相A：水/0.05％NH4HCO3，流动相B：ACN；流速：80mL/min；梯度：20分钟内20％B到50％B；检测器，254nm，监测器，220nm，在45％B下收集所需产物)，得到呈白色固体的4-[(7-氯-1,6-萘啶-2-基)甲磺酰基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(133mg)。
4-[[7-([2-氟-4-[3-(羟甲基)吡唑-1-基]苯基]氨基)-1,6-萘啶-2-基]甲磺酰基]哌啶-1-羧酸叔丁酯。在室温和氮气气氛下向搅拌的4-[(7-氯-1,6-萘啶-2-基)甲磺酰基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(100mg，1当量)和[1-(4-氨基-3-氟苯基)吡唑-3-基]甲醇(64mg，1.30当量)在1,4-二噁烷(3mL)中的混合物中添加Pd(OAc)2(8mg，0.15当量)、XantPhos(41mg，0.30当量)和K2CO3(65mg，2当量)。将所得混合物在100℃下在氮气气氛下搅拌2小时。通过LCMS监测反应。使混合物冷却至室温。将所得混合物过滤，将滤饼用EtOAc(3×10mL)洗涤。将滤液在减压下浓缩。将残余物通过反相快速色谱法经以下条件纯化(柱：C18，330g；流动相A：水/0.05％NH4HCO3，流动相B：ACN；流速：80mL/min；梯度：30分钟内20％B到60％B；检测器，254nm，监测器，220nm，在58％B下收集所需产物)，得到呈棕黄色固体的4-[[7-([2-氟-4-[3-(羟甲基)吡唑-1-基]苯基]氨基)-1,6-萘啶-2-基]甲磺酰基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(62mg)。
[1-[3-氟-4-([2-[(哌啶-4-磺酰基)甲基]-1,6-萘啶-7-基]氨基)苯基]吡唑-3-基]甲醇(化合物207)。在0℃下向搅拌的4-[[7-([2-氟-4-[3-(羟甲基)吡唑-1-基]苯基]氨基)-1,6-萘啶-2-基]甲磺酰基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(70mg，1当量)在DCM(10mL)中的溶液中添加TFA(1mL)将所得混合物在0℃下搅拌1小时。通过LCMS监测反应。将混合物用饱和NaHCO3(水溶液)碱化至pH 8。将所得固体在烘箱中在减压下干燥，得到呈黄色固体的[1-[3-氟-4-([2-[(哌啶-4-磺酰基)甲基]-1,6-萘啶-7-基]氨基)苯基]吡唑-3-基]甲醇(18mg)。
实施例51.化合物208的制备
4-(7-氯-1,6-萘啶-2-基磺酰基)哌嗪-1-羧酸叔丁酯。在-5℃下向冷却至-5℃的2M HCl(7.5mL)和DCM(20mL)的混合物中添加NaOCl(约10％溶液，6.50mL，10.075mmol，3.35当量)，然后将反应混合物在-5℃下搅拌30分钟。向上述反应混合物中添加7-氯-1,6-萘啶-2-硫醇(591mg，35mmol，1当量)并将此所得混合物在-5℃下搅拌60分钟。通过添加1M Na2SO3猝灭过量的氯，直到混合物的黄绿色消失。然后将反应混合物转移到分液漏斗中，快速分离有机层，并收集在烧瓶中的冰水中。将水相用DCM(2×50mL)快速萃取。将有机萃取物合并，并用Na2SO4干燥。将混合物过滤到冷的(-30℃)搅拌的哌嗪-1-羧酸叔丁酯(671.71mg，3.606mmol，1.20当量)和DIPEA(1.17g，9.016mmol，3当量)在DCM(20mL)中的溶液中。将反应混合物再搅拌1小时，在盐冰浴中冷却。通过添加H2O(100mL)猝灭反应，并将所得混合物用DCM(3×50mL)萃取。将合并的有机层用盐水(2x50mL)洗涤，经无水Na2SO4干燥。过滤后，将滤液在减压下浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法纯化，用PE:EtOAc(2:1)洗脱，得到呈白色固体的4-(7-氯-1,6-萘啶-2-基磺酰基)哌嗪-1-羧酸叔丁酯(420mg，33％)。
4-[7-([2-氟-4-[3-(羟甲基)吡唑-1-基]苯基]氨基)-1,6-萘啶-2-基磺酰基]哌嗪-1-羧酸叔丁酯。在20mL微波小瓶中装入[1-(4-氨基-3-氟苯基)吡唑-3-基]甲醇(175.65mg，0.848mmol，1当量)、4-(7-氯-1,6-萘啶-2-基磺酰基)哌嗪-1-羧酸叔丁酯(350mg，0.848mmol，1当量)、二噁烷(15mL，177.061mmol，208.88当量)、Pd(OAc)2(28.55mg，0.127mmol，0.15当量)、XantPhos(147.15mg，0.254mmol，0.30当量)和K3PO4(539.80mg，2.543mmol，3当量)，然后将所得混合物在N2气氛下在60℃下搅拌2小时。将反应混合物冷却至室温，并添加DCM(200mL)和H2O(100mL)。将有机层用盐水(2×50mL)洗涤，并在减压下浓缩。将残余物通过反向快速色谱法经以下条件纯化：柱，C18硅胶；流动相，水中的MeCN(10mmol/L NH4HCO3)，15分钟内40％至55％梯度；检测器，UV 220nm，得到呈浅黄色固体的4-[7-([2-氟-4-[3-(羟甲基)吡唑-1-基]苯基]氨基)-1,6-萘啶-2-基磺酰基]哌嗪-1-羧酸叔丁酯(75mg，15％)。
[1-(3-氟-4-[[2-(哌嗪-1-磺酰基)-1,6-萘啶-7-基]氨基]苯基)吡唑-3-基]甲醇(化合物208)。将4-[7-([2-氟-4-[3-(羟甲基)吡唑-1-基]苯基]氨基)-1,6-萘啶-2-基磺酰基]哌嗪-1-羧酸叔丁酯(75mg，0.129mmol，1当量)、DCM(25mL，393.251mmol，3060.23当量)和TFA(2.50mL，33.658mmol，261.92当量)的混合物在0℃下搅拌2小时。将反应通过添加饱和NaHCO3(水溶液20mL)在0℃下淬灭。将所得混合物用DCM(3×100mL)萃取。将合并的有机层用盐水(2x50 mL)洗涤并在减压下浓缩。将粗产物通过制备型HPLC纯化，得到呈黄色固体的[1-(3-氟-4-[[2-(哌嗪-1-磺酰基)-1,6-萘啶-7-基]氨基]苯基)吡唑-3-基]甲醇(28.4mg，45％)。
化合物248遵循如对于化合物208的合成所述的方法和方案来合成，使用适当的材料开始。
实施例52.化合物245的制备
在0℃下向搅拌的[1-(3-氟-4-[[2-(哌嗪-1-磺酰基)-1,6-萘啶-7-基]氨基]苯基)吡唑-3-基]甲醇(85mg，0.176mmol，1当量)和HCHO(10.56mg，0.352mmol，2当量)在THF(10mL)中的溶液中分批添加NaBH(OAc)3(74.52mg，1.186mmol，6.75当量)。将所得混合物在0℃下搅拌1小时。通过LCMS监测反应。将所得混合物在减压下浓缩。将残余物通过反相快速色谱法经以下条件纯化(柱：XBridge Shield RP18 OBD柱，5μm，19*150mm)。在减压下浓缩，得到呈橙色固体的[1-(3-氟-4-[[2-(4-甲基哌嗪-1-基磺酰基)-1,6-萘啶-7-基]氨基]苯基)吡唑-3-基]甲醇(28.7mg，32％)。
实施例53.化合物203的制备
2,3,4,5,6-五氟苯基7-氯-1,6-萘啶-2-磺酸酯。在-5℃下向冷却至-5℃的2M HCl(7.5mL)和DCM(20mL)的混合物中添加NaOCl(约10％溶液，6.50mL，10.075mmol，3.35当量)，然后将反应混合物在-5℃下搅拌30分钟。向上述反应混合物中添加7-氯-1,6-萘啶-2-硫醇(591mg，35mmol，1当量)并将此所得混合物在-5℃下搅拌60分钟。通过添加1M Na2SO3猝灭过量的氯，直到混合物的黄绿色消失。然后将反应混合物转移到分液漏斗中，快速分离有机层，并收集在烧瓶中的冰水中。将水相用DCM(2×50mL)快速萃取。将有机萃取物合并，并用Na2SO4干燥。在-30℃下将滤液添加到预冷却的搅拌的五氟苯酚(0.184g，1.01mmol)和三乙胺(0.15g，1.50mmol)在二氯甲烷(20.0mL)中的溶液中将所得反应混合物在-30℃下再搅拌1h。将反应混合物分别用水(60.0mL)、10％KH2PO4(2×30.0mL)、饱和NaHCO3(2×30.0mL)、水(30.0mL)和盐水(30.0mL)洗涤。将有机部分用无水硫酸钠干燥并过滤。在减压下浓缩滤液，得到呈淡黄色固体的标题化合物(0.41g，粗制物)，其不经进一步纯化即直接用于下一步。
7-氯-N-(1-甲基哌啶-4-基)-1,6-萘啶-2-磺酰胺。将粗制的2,3,4,5,6-五氟苯基7-氯-1,6-萘啶-2-磺酸酯(610mg，1.485mmol，1当量)、1-甲基哌啶-4-胺(186.57mg，1.634mmol，1.10当量)、DIPEA(575.88mg，4.456mmol，3当量)和MeCN(20.09mL，489.397mmol，257.34当量)的混合物在室温下搅拌1小时。将反应混合物浓缩，得到残余物，将其通过反向快速色谱法经以下条件纯化：柱，C18硅胶；流动相，水中的MeCN(10mmol/LNH4HCO3)，10分钟内20％至30％梯度；检测器，UV 220nm，得到呈浅黄色固体的7-氯-N-(1-甲基哌啶-4-基)-1,6-萘啶-2-磺酰胺(250mg，49％)。
7-([2-氟-4-[3-(羟甲基)吡唑-1-基]苯基]氨基)-N-(1-甲基哌啶-4-基)-1,6-萘啶-2-磺酰胺(化合物203)。在20mL微波小瓶中装入7-氯-N-(1-甲基哌啶-4-基)-1,6-萘啶-2-磺酰胺(250mg，0.734mmol，1当量)、[1-(4-氨基-3-氟苯基)吡唑-3-基]甲醇(151.99mg，0.734mmol，1当量)、二噁烷(15mL，177.061mmol，241.39当量)、Pd(OAc)2(24.70mg，0.110mmol，0.15当量)、XantPhos(127.33mg，0.220mmol，0.30当量)和K3PO4(467.09mg，2.201mmol，3当量)，然后将所得混合物在N2气氛下在100℃下搅拌2小时。将反应混合物冷却至室温，并添加EtOAc(150mL)和H2O(100mL)。将所得混合物用EtOAc(3×50mL)萃取。将合并的有机层用盐水(2×50mL)洗涤，并在减压下浓缩，得到残余物，将其通过制备型HPLC纯化，得到呈黄色固体的7-([2-氟-4-[3-(羟甲基)吡唑-1-基]苯基]氨基)-N-(1-甲基哌啶-4-基)-1,6-萘啶-2-磺酰胺(13.7mg，3％)。
实施例54.化合物107的制备
4-[(7-氯-1,6-萘啶-2-基)硫基]哌啶-1-羧酸叔丁酯。在室温和氮气气氛下向搅拌的2,7-二氯-1,6-萘啶(1g，5.024mmol，1当量)和4-硫基哌啶-1-羧酸叔丁酯(1.31g，6.029mmol，1.20当量)在1,4-二噁烷(20mL)中的混合物中添加DIEA(1.30g，10.049mmol，2当量)、XantPhos(581.44mg，15mmol，0.20当量)和Pd2(dba)3CHCl3(520.07mg，0.502mmol，0.10当量)。将所得混合物在50℃下在氮气气氛下搅拌3小时。通过LCMS监测反应。使混合物冷却至室温。将残余物通过硅胶柱色谱法纯化，用PE/EtOAc(20:1至10:1)洗脱，得到呈灰白色固体的4-[(7-氯-1,6-萘啶-2-基)硫基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(1.8g，94％)。
4-[(7-[[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]氨基]-1,6-萘啶-2-基)硫基]哌啶-1-羧酸叔丁酯。在室温和氮气气氛下向搅拌的4-[(7-氯-1,6-萘啶-2-基)硫基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(100mg，0.263mmol，1当量)和2-氟-4-(吡唑-1-基)苯胺(51.30mg，0.290mmol，1.1当量)在1,4-二噁烷(8mL)中的混合物中添加XantPhos(30.46mg，0.053mmol，0.2当量)、Cs2CO3(171.53mg，0.526mmol，2当量)和Pd(OAc)2(5.91mg，0.026mmol，0.1当量)。将所得混合物在110℃下在氮气气氛下搅拌3小时。通过LCMS监测反应。使混合物冷却至室温。将所得混合物过滤，将滤饼用DCM(3×10mL)洗涤。将滤液在减压下浓缩。将残余物通过反相快速色谱法经以下条件纯化(柱：C18，330g；流动相A：水/0.05％NH4HCO3，流动相B：ACN；流速：80mL/min；梯度：20分钟内40％B到70％B；检测器，254nm，监测器，220nm，在65％B下收集所需产物)，得到呈黄色固体的4-[(7-[[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]氨基]-1,6-萘啶-2-基)硫基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(110mg，80％)。
N-[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]-2-(哌啶-4-基硫基)-1,6-萘啶-7-胺(化合物107)。在室温下向搅拌的4-[(7-[[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]氨基]-1,6-萘啶-2-基)硫基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(50mg，0.096mmol，1当量)在DCM(4mL)中的溶液中添加TFA(1mL)。将所得混合物在室温下搅拌2小时。通过LCMS监测反应。将所得混合物在减压下浓缩。将残余物用饱和NaHCO3(水溶液)碱化至pH 8。将所得混合物在减压下浓缩。将粗产物(40mg)通过制备型HPLC纯化，得到呈黄色固体的N-[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]-2-(哌啶-4-基硫基)-1,6-萘啶-7-胺(17.2mg，42％)。
化合物108、118、129和133遵循如对于化合物107的合成所述的方法和方案来合成，使用适当的材料开始。
实施例55.化合物134和136的制备
7-氯-2-(哌啶-4-基硫基)-1,6-萘啶。在室温下向搅拌的4-[(7-氯-1,6-萘啶-2-基)硫基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(1g，2.632mmol，1当量)在DCM(20mL)中的溶液中添加TFA(2mL，26.926mmol，10.23当量)。将所得混合物在室温下搅拌1小时。通过LCMS监测反应。将混合物用饱和NaHCO3(水溶液)碱化至pH 8。将所得混合物在减压下浓缩。将残余物通过反相快速色谱法经以下条件纯化(柱：C18，330g；流动相A：水/0.05％NH4HCO3，流动相B：ACN；流速：80mL/min；梯度：20分钟内20％B到50％B；检测器，254nm，监测器，220nm，在42％B下收集所需产物)，得到呈白色固体的7-氯-2-(哌啶-4-基硫基)-1,6-萘啶(650mg，88％)。
3-[[2-(哌啶-4-基硫基)-1,6-萘啶-7-基]氨基]苯甲酰胺(化合物134)和3-氨基-N-[2-(哌啶-4-基硫基)-1,6-萘啶-7-基]苯甲酰胺(化合物136)。在室温和氮气气氛下向搅拌的7-氯-2-(哌啶-4-基硫基)-1,6-萘啶(150mg，3.286mmol，1当量)和3-氨基苯甲酰胺(88mg，4.272mmol)在1,4-二噁烷(4mL)中的混合物中添加Pd(OAc)2(18mg，0.329mmol，0.15当量)、XantPhos(93mg，0.657mmol，0.30当量)和Cs2CO3(351mg，6.572mmol，2当量)。将所得混合物在110℃下在氮气气氛下搅拌2小时。通过LCMS监测反应。使混合物冷却至室温。将所得混合物过滤，将滤饼用EtOAc(3×10mL)洗涤。将滤液在减压下浓缩。将残余物通过制备型HPLC纯化，得到呈黄色固体的3-[[2-(哌啶-4-基硫基)-1,6-萘啶-7-基]氨基]苯甲酰胺；甲酸(7.9mg)和呈白色固体的3-氨基-N-[2-(哌啶-4-基硫基)-1,6-萘啶-7-基]苯甲酰胺；甲酸(14mg)。
实施例56.化合物138的制备
2-[4-[(7-氯-1,6-萘啶-2-基)硫基]哌啶-1-基]乙醇。在室温下向搅拌的7-氯-2-(哌啶-4-基硫基)-1,6-萘啶(化合物134，步骤1，120mg，3.286mmol，1当量)和2-碘-乙醇(89mg，4.272mmol，1.20当量)在THF(5mL，0.657mmol)中的混合物中添加TEA(87mg，0.329mmol，2当量)。将所得混合物在室温下搅拌1小时。通过LCMS监测反应。将所得混合物在减压下浓缩。将残余物通过反相快速色谱法经以下条件纯化(柱：C18，330g；流动相A：水/0.05％NH4HCO3，流动相B：ACN；流速：80mL/min；梯度：20分钟内20％B到50％B；检测器，254nm，监测器，220nm，在45％B下收集所需产物)，得到呈黄色固体的2-[4-[(7-氯-1,6-萘啶-2-基)硫基]哌啶-1-基]乙醇(100mg)。
2-(4-[[7-([2-氟-4-[3-(羟甲基)吡唑-1-基]苯基]氨基)-1,6-萘啶-2-基]硫基]哌啶-1-基)乙醇(化合物138)。在室温和氮气气氛下向搅拌的2-[4-[(7-氯-1,6-萘啶-2-基)硫基]哌啶-1-基]乙醇(60mg，3.286mmol，1当量)和[1-(4-氨基-3-氟苯基)吡唑-3-基]甲醇(77mg，4.272mmol，2当量)在1,4-二噁烷(5mL，0.038mmol)中的混合物中添加Pd(OAc)2(13mg，0.329mmol，0.15当量)、XantPhos(65mg，0.657mmol，0.30当量)和Cs2CO3(242mg，6.572mmol，4当量)。将所得混合物在110℃下在氮气气氛下搅拌2小时。通过LCMS监测反应。使混合物冷却至室温。将所得混合物过滤，将滤饼用EtOAc(3×10mL)洗涤。将滤液在减压下浓缩。将残余物通过制备型HPLC纯化，得到呈浅黄色固体的2-(4-[[7-([2-氟-4-[3-(羟甲基)吡唑-1-基]苯基]氨基)-1,6-萘啶-2-基]硫基]哌啶-1-基)乙醇(6.5mg)。
实施例57.化合物121的制备
N-[(1s,4s)-4-[(7-氯-1,6-萘啶-2-基)硫基]环己基]氨基甲酸叔丁酯。在氮气气氛下在0℃下向搅拌的7-氯-1,6-萘啶-2-硫醇(100mg，1当量)和N-[(1r,4r)-4-羟基环己基]氨基甲酸叔丁酯(548.47mg，5当量)在THF(10mL)中的混合物中逐滴添加DEAD(177.55mg，2当量)和PPh3(267.35mg，2当量)。将所得混合物在室温下在氮气气氛下搅拌16小时。通过LCMS监测反应。将所得混合物用EtOAc(3×200mL)萃取。将合并的有机层用盐水(2×100mL)洗涤，经无水Na2SO4干燥。过滤后，将滤液在减压下浓缩。将残余物通过反相快速色谱法经以下条件纯化：柱：Spherical C18，20-40um，330g；流动相A：水(加5mM NH4NO3)；流动相B：ACN；流速：80mL/min；梯度：5％-5％B，10min，30min内55％B-95％B梯度；检测器：254nm。在95％B下收集含有所需产物的级分，并在减压下浓缩，得到呈淡黄色固体的N-[(1s,4s)-4-[(7-氯-1,6-萘啶-2-基)硫基]环己基]氨基甲酸叔丁酯(260mg)。
N-[(1s,4s)-4-[(7-[[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]氨基]-1,6-萘啶-2-基)硫基]环己基]氨基甲酸叔丁酯。在室温和氮气气氛下向搅拌的N-[(1s,4s)-4-[(7-氯-1,6-萘啶-2-基)硫基]环己基]氨基甲酸叔丁酯(120mg，0.305mmol，1当量)和2-氟-4-(吡唑-1-基)苯胺(70.17mg，0.396mmol，1.30当量)在1,4-二噁烷(5mL)中的混合物中添加XantPhos(52.88mg，0.091mmol，0.30当量)、Cs2CO3(198.50mg，0.609mmol，2当量)和Pd(OAc)2(10.26mg，0.046mmol，0.15当量)。将所得混合物在100℃下在氮气气氛下搅拌2小时。通过LCMS监测反应。使混合物冷却至室温。将所得混合物在减压下浓缩。将所得混合物过滤，将滤饼用EtOAc(3×20mL)洗涤。将滤液在减压下浓缩。将残余物通过反相快速色谱法经以下条件纯化(柱：C18，330g；流动相A：水/0.05％TFA，流动相B：ACN；流速：80mL/min；梯度：20分钟内50％B到95％B；检测器，254nm和220nm，在95％B下收集所需产物)。在减压下浓缩，得到呈浅棕色固体的N-[(1s,4s)-4-[(7-[[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]氨基]-1,6-萘啶-2-基)硫基]环己基]氨基甲酸叔丁酯(110mg，67％)。
N-[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]-2-[(1s,4s)-4-氨基环己基]硫基]-1,6-萘啶-7-胺(化合物121)。在室温下向搅拌的N-[(1s,4s)-4-[(7-[[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]氨基]-1,6-萘啶-2-基)硫基]环己基]氨基甲酸叔丁酯(110mg，0.206mmol，1当量)在MeOH(10mL)中的溶液中分批添加1,4-二噁烷(12mL，394.943mmol，1919.60当量)中的HCl(气体)。将所得混合物在室温下搅拌30分钟。通过LCMS监测反应。将所得混合物在减压下浓缩。将残余物通过制备型HPLC纯化，得到呈淡黄色固体的N-[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]-2-[(1s,4s)-4-氨基环己基]硫基]-1,6-萘啶-7-胺(24.7mg，27％)。
化合物122、135、153、157、159和161遵循如对于化合物121的合成所述的方法和方案来合成，使用适当的材料开始。
实施例58.化合物138的制备
7-氯-2-[(1-甲基哌啶-4-基)硫基]-1,6-萘啶。在氮气气氛下在0℃下向搅拌的7-氯-1,6-萘啶-2-硫醇(6g，30.511mmol，1当量)和1-甲基-4-哌啶醇(17.57g，152.555mmol，5当量)在THF(100mL)中的混合物中逐滴添加DEAD(10.63g，61.022mmol，2当量)和PPh3(14.40g，54.920mmol，1.80当量)。将所得混合物在室温下在氮气气氛下搅拌16小时。通过LCMS监测反应。将残余物通过反相快速色谱法经以下条件纯化：柱：Spherical C18，20-40um，330g；流动相A：水(加5mM TFA)；流动相B：ACN；流速：80mL/min；梯度：5％-5％B，10min，30min内30％B-65％B梯度；检测器：254nm。在40％B下收集含有所需产物的级分，并在减压下浓缩，得到呈黄色固体的7-氯-2-[(1-甲基哌啶-4-基)硫基]-1,6-萘啶(3g，33％)。
3’-氟-4’-([2-[(1-甲基哌啶-4-基)硫基]-1,6-萘啶-7-基]氨基)-[1,1’-联苯]-3-腈(化合物138)。在室温和氮气气氛下向搅拌的7-氯-2-[(1-甲基哌啶-4-基)硫基]-1,6-萘啶(200mg，3.286mmol，1当量)和4-氨基-3-氟-[1,1-联苯]-3-腈(159mg，4.272mmol，1.10当量)在1,4-二噁烷(10mL)中的混合物中添加Pd(OAc)2(23mg，0.329mmol，0.15当量)、XantPhos(118.40mg，0.657mmol，0.30当量)和Cs2CO3(445mg，6.572mmol，2当量)。将所得混合物在110℃下在氮气气氛下搅拌2小时。通过LCMS监测反应。使混合物冷却至室温。将所得混合物过滤，将滤饼用EtOAc(3×10mL)洗涤。将滤液在减压下浓缩。将残余物通过制备型HPLC纯化，得到呈白色固体的3’-氟-4’-([2-[(1-甲基哌啶-4-基)硫基]-1,6-萘啶-7-基]氨基)-[1,1’-联苯]-3-腈(77mg)。
实施例59.化合物115和117的制备
4-(7-[[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]氨基]-1,6-萘啶-2-亚磺酰基)哌啶-1-羧酸叔丁酯。在0℃下向搅拌的4-[(7-[[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]氨基]-1,6-萘啶-2-基)硫基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(化合物107，步骤2，1g，1.921mmol，1当量)在DCM(30mL)中的溶液中添加m-CPBA(265.16mg，1.537mmol，0.80当量)。将所得混合物在0℃下搅拌1小时。通过LCMS监测反应。将反应用饱和NaHSO3(水溶液)在0℃下淬灭。将所得混合物用DCM(3×100mL)萃取。将合并的有机层用盐水(1×100mL)洗涤，经无水Na2SO4干燥。过滤后，将滤液在减压下浓缩。将残余物通过反相快速色谱法经以下条件纯化(柱：C18，330g；流动相A：水/0.05％NH4HCO3，流动相B：ACN；流速：80mL/min；梯度：20分钟内30％B到60％B；检测器，220nm，监测器，254nm，在60％B下收集所需产物)，得到呈黄色固体的4-(7-[[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]氨基]-1,6-萘啶-2-基亚磺酰基)哌啶-1-羧酸叔丁酯(450mg，43％)和呈黄色固体的4-(7-[[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]氨基]-1,6-萘啶-2-基磺酰基)哌啶-1-羧酸叔丁酯(100mg，9％)。
(R)-和(S)-N-[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]-2-[哌啶-4-亚磺酰基]-1,6-萘啶-7-胺(化合物115和117)。在室温下向搅拌的4-(7-[[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]氨基]-1,6-萘啶-2-亚磺酰基)哌啶-1-羧酸叔丁酯(150mg)在DCM(8mL)中的溶液中添加TFA(1mL)。将所得混合物在室温下搅拌1小时。通过LCMS监测反应。将所得混合物在减压下浓缩。将残余物用饱和NaHCO3(水溶液)碱化至pH 8。将所得混合物在减压下浓缩。将粗产物(120mg)通过制备型HPLC在以下条件下纯化(柱：XBridge制备型OBD C18柱，30×150mm 5μm)，得到P1和P2的混合物。将粗产物通过制备型HPLC纯化(70mg)，得到呈黄色固体的N-[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]-2-[(R)-哌啶-4-亚磺酰基]-1,6-萘啶-7-胺(21mg)和呈黄色固体的N-[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]-2-[(S)-哌啶-4-亚磺酰基]-1,6-萘啶-7-胺(18mg)。
化合物115-在14.727分钟洗脱；产率：21mg。化合物117-在18.838分钟洗脱；产率：18mg。
实施例60.化合物123的制备
4-[7-([2-氟-4-[3-(羟甲基)吡唑-1-基]苯基]氨基)-1,6-萘啶-2-基磺酰基]哌啶-1-羧酸叔丁酯。在室温下向搅拌的4-[[7-([2-氟-4-[3-(羟甲基)吡唑-1-基]苯基]氨基)-1,6-萘啶-2-基]硫基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(化合物108，步骤2，400mg，0.726mmol，1当量)在DCM(20mL)中的溶液中添加m-CPBA(250.71mg，1.453mmol，2当量)。将所得混合物在室温下搅拌2小时。通过LCMS监测反应。将所得混合物在减压下浓缩。将残余物通过反相快速色谱法经以下条件纯化(柱：C18，330g；流动相A：水/0.05％TFA，流动相B：ACN；流速：80mL/min；梯度：20分钟内30％B到60％B；检测器，254nm，监测器，220nm，在56％B下收集所需产物)，得到呈黄色固体的4-[7-([2-氟-4-[3-(羟甲基)吡唑-1-基]苯基]氨基)-1,6-萘啶-2-基磺酰基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(200mg，47％)。
[1-(3-氟-4-[[2-(哌啶-4-磺酰基)-1,6-萘啶-7-基]氨基]苯基)吡唑-3-基]甲醇(化合物123)。在室温下向搅拌的4-[7-([2-氟-4-[3-(羟甲基)吡唑-1-基]苯基]氨基)-1,6-萘啶-2-基磺酰基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(200mg，0.343mmol，1当量)在DCM(10mL)中的溶液中添加TFA(1mL，13.463mmol，39.22当量)。将所得混合物在室温下搅拌1小时。通过LCMS监测反应。将混合物用饱和NaHCO3(水溶液)碱化至pH 8。将所得混合物在减压下浓缩。将残余物通过反相快速色谱法经以下条件纯化(柱：C18，120g；流动相A：水/0.05％NH4HCO3，流动相B：ACN；流速：80mL/min；梯度：20分钟15％B到40％B；检测器，254nm，监测器，220nm，在32％B下收集所需产物)，得到呈橙色固体的[1-(3-氟-4-[[2-(哌啶-4-磺酰基)-1,6-萘啶-7-基]氨基]苯基)吡唑-3-基]甲醇(70mg，42％)。
化合物113、151、171、174、180、181、197、199、200、206、210、212和234遵循如对于化合物123的合成所述的方法和方案来合成，使用适当的材料开始。
实施例61.化合物127的制备
在室温下向搅拌的[1-(3-氟-4-[[2-(哌啶-4-基硫基)-1,6-萘啶-7-基]氨基]苯基)吡唑-3-基]甲醇(化合物108，90mg，0.200mmol，1当量)和TEA(40.43mg，0.400mmol，2当量)在THF(10mL，123.430mmol，617.89当量)中的混合物中逐滴添加NaBH(OAc)3(63.51mg，0.300mmol，1.50当量)和HCHO(7.80mg，0.260mmol，1.30当量)。将所得混合物在室温下搅拌1小时。通过LCMS监测反应。将混合物用饱和NaHCO3(水溶液)碱化至pH 8。将所得混合物过滤，将滤饼用EtOAc(3×10mL)洗涤。将滤液在减压下浓缩。将粗产物(60mg)通过制备型HPLC纯化，得到呈白色固体的[1-[3-氟-4-([2-[(1-甲基哌啶-4-基)硫基]-1,6-萘啶-7-基]氨基)苯基]吡唑-3-基]甲醇(29.3mg，31％)。
化合物128和148遵循如对于化合物127的合成所述的方法和方案来合成，使用适当的材料开始。
实施例62.化合物158的制备
4-(7-氯-1,6-萘啶-2-基磺酰基)哌啶-1-羧酸叔丁酯。在0℃下在氮气气氛下向搅拌的4-[(7-氯-1,6-萘啶-2-基)硫基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(500mg，1.316mmol，1当量)在DCM(40mL)中的溶液中分批添加m-CPBA(681.36mg，3.948mmol，3当量)。将所得混合物在室温下在氮气气氛下搅拌4小时。通过TLC监测反应。将所得混合物用DCM(3×300mL)萃取。将合并的有机层用盐水(2×200mL)洗涤，经无水Na2SO4干燥。过滤后，将滤液在减压下浓缩。将残余物通过反相快速色谱法经以下条件纯化：柱：Spherical C18，20-40um，330g；流动相A：水(加5mM FA)；流动相B：ACN；流速：80mL/min；梯度：5％-5％B，10min，30min内35％B-80％B梯度；检测器：220nm。在72％B下收集含有所需产物的级分，并在减压下浓缩，得到呈黄色固体的4-(7-氯-1,6-萘啶-2-基磺酰基)哌啶-1-羧酸叔丁酯(350mg，64％)。
7-氯-2-(哌啶-4-磺酰基)-1,6-萘啶。在室温下向搅拌的4-(7-氯-1,6-萘啶-2-基磺酰基)哌啶-1-羧酸叔丁酯(7g)在DCM(80mL)中的溶液中逐滴添加TFA(10mL)。将反应混合物在室温下搅拌2小时。通过TLC监测反应。将所得混合物在减压下浓缩。将残余物用饱和NaHCO3(水溶液)碱化至pH＝8。将所得混合物用DCM(3×1000mL)萃取。将合并的有机层用盐水(2x500 mL)洗涤，经无水Na2SO4干燥。过滤后，将滤液在减压下浓缩。这产生呈淡黄色固体的7-氯-2-(哌啶-4-磺酰基)-1,6-萘啶(5.5g)。
7-氯-2-(1-甲基哌啶-4-基磺酰基)-1,6-萘啶。在室温下向搅拌的7-氯-2-(哌啶-4-磺酰基)-1,6-萘啶(1g，3.207mmol，1当量)和HCHO(0.13g，04mmol，1.3当量)在THF(30mL)中的混合物中添加NaBH(OAc)3(1.02g，4.811mmol，1.5当量)。将所得混合物在室温下搅拌1小时。通过LCMS监测反应。将所得混合物在减压下浓缩。将残余物通过反向快速色谱法经以下条件纯化：柱，C18硅胶；流动相，MeOH水溶液，10分钟内30％至50％梯度；检测器，UV254nm，得到呈黄色固体的7-氯-2-(1-甲基哌啶-4-基磺酰基)-1,6-萘啶(980mg，93％)。
N-[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]-2-(1-甲基哌啶-4-基磺酰基)-1,6-萘啶-7-胺(化合物158)。在室温下在氮气气氛下向搅拌的7-氯-2-(1-甲基哌啶-4-基磺酰基)-1,6-萘啶(60mg，0.184mmol，1当量)和2-氟-4-(吡唑-1-基)苯胺(35.89mg，0.203mmol，1.10当量)在1,4-二噁烷(15mL)中的混合物中分批添加Pd(OAc)2(6.20mg，0.028mmol，0.15当量)、XantPhos(31.97mg，0.055mmol，0.30当量)和Cs2CO3(120mg，0.368mmol，2当量)。将所得混合物在110℃下在氮气气氛下搅拌2小时。通过LCMS监测反应。使混合物冷却至室温。将所得混合物用EtOAc(3×300mL)萃取。将合并的有机层用盐水(2×100mL)洗涤，经无水Na2SO4干燥。过滤后，将滤液在减压下浓缩。将残余物通过制备型HPLC纯化，得到呈黄色固体的N-[2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基]-2-(1-甲基哌啶-4-基磺酰基)-1,6-萘啶-7-胺(29.2mg，33％)。
化合物156、288、289、290、376、378、379、380、382、384和385遵循如对于化合物158的合成所述的方法和方案来合成，使用适当的材料开始。
实施例63.化合物183的制备
3,4'-二氟-[1,1'-联苯]-4-胺。将2-氟-4-碘苯胺(0.5g，2.11mmol，1当量)，4-氟苯基硼酸(0.47g，3.359mmol，1.592当量)和XPhos Pd G3(129mg，0.152mmol，0.072当量)在二噁烷(10mL，0.211摩尔，20体积)中的混合物用N2鼓泡，然后装入添加K3PO4(1.5g，7.066mmol，3.35当量)和水(2mL，1.055摩尔，4体积)。加热至100℃，持续4小时冷却至室温，分离各层，然后通过硅藻土过滤有机物，用EtOAc洗脱。将滤液真空浓缩到SiO2中，并通过快速色谱法(ISCO 40g，0-100％EtOAc/庚烷)纯化。获得呈黄色固体的3,4’-二氟-[1,1’-联苯]-4-胺(382.4mg，1.86mmol，产率88％)。
N-{3,4'-二氟-[1,1'-联苯]-4-基}-2-(1-甲基哌啶-4-基磺酰基)-1,6-萘啶-7-胺(化合物183)。将7-氯-2-(1-甲基哌啶-4-基磺酰基)-1,6-萘啶(化合物158，步骤3，30.6mg，0.094mmol，1当量)、3,4'-二氟-[1,1'-联苯]-4-胺(27.3mg，0.133mmol，1.416当量)和BrettPhos Pd G3(5mg，06mmol，0.059当量)在二噁烷(0.5mL，0.188摩尔，16.34体积)中的混合物用N2鼓泡，然后装入MTBD(0.102g，0.1mL，0.664mmol，7.074当量)。在60℃下搅拌4小时。LCMS显示产物物质形成。冷却至室温，通过硅藻土过滤，用EtOAc洗脱并在真空中浓缩。通过快速色谱法(ISCO 4g，0-20％MeOH/DCM)纯化。获得不纯的产物。再次纯化(ISCO4g，0-100％MeOH/EtOAc)。获得呈黄色固体的N-{3,4’-二氟-[1,1’-联苯]-4-基}-2-(1-甲基哌啶-4-基磺酰基)-1,6-萘啶-7-胺(6.4mg，0.013mmol，产率13.779％)。
化合物201、202、224、225、226、227、228、229、230、231、232、233、234、235、236、237、238、239和293遵循如对于化合物183的合成所述的方法和方案来合成，使用适当的材料开始。
化合物184、185、191、192、193、218、219、220、221、222、223、256、257、258、259、260、262、263、264、265、266、267、268、269、270、271、272、273、274、275、276、277、278、279、280、281、282、283、284、285、286、294、295、296、297、298、299、300、301、302、303、304、305、306、307、308和374遵循如对于化合物183的合成所述的方法和方案来合成，使用适当的材料开始。
实施例64.化合物198的制备
将1-(3-氟-4-[[2-(1-甲基哌啶-4-基磺酰基)-1,6-萘啶-7-基]氨基]苯基)吡唑-3-羧酸甲酯(100mg，0.191mmol，1当量)和LiOH(45.65mg，1.906mmol，10当量)在THF(20mL)和水(4mL)中的混合物在室温下搅拌2小时。通过LCMS监测反应。将所得混合物在减压下浓缩。将残余物通过制备型HPLC纯化，得到呈黄色固体的1-(3-氟-4-((2-((1-甲基哌啶-4-基)磺酰基)-1,6-萘啶-7-基)氨基)苯基)-1H-吡唑-3-羧酸(16.3mg，17％)。
化合物194遵循如对于化合物198的合成所述的方法和方案来合成，使用适当的材料开始。
实施例65.化合物317的制备
在室温和氮气气氛下向搅拌的1-(3-氟-4-[[2-(1-甲基哌啶-4-基磺酰基)-1,6-萘啶-7-基]氨基]苯基)吡唑-3-羧酸(60mg，0.118mmol，1当量)和HATU(89.37mg，0.235mmol，2当量)在DMF(3mL)中的混合物中添加NH4HCO3(46.45mg，0.588mmol，5当量)和TEA(35.68mg，0.353mmol，3当量)。将所得混合物在室温下在氮气气氛下搅拌4小时。通过LCMS监测反应。使混合物冷却至室温。将所得混合物过滤，将滤饼用EtOAc(3×10mL)洗涤。将粗产物(mg)通过制备型HPLC纯化，得到呈黄色固体的1-(3-氟-4-[[2-(1-甲基哌啶-4-基磺酰基)-1,6-萘啶-7-基]氨基]苯基)吡唑-3-甲酰胺(16.4mg，27％)。
图1中包括本发明的示例性化合物的NMR和MS数据。
实施例66.CDK5和CDK2迁移率变动测定
通过CDK5/p25和任选的CDK2/CycA2的酶活性的变化来测量化合物的效力。酶CDK5/p25和CDK2/CycA2购自Carna Biosciences(目录号分别是04-106和04-103)。将测试化合物储备液在100％DMSO中稀释，并使用TECAN EVO200(TECAN)在384孔板中连续稀释3倍。在所有测定中将星形孢菌素用作参考对照化合物。
使用Echo550(Labcyte Inc)将十二nL化合物转移到384孔板(Greiner 781201)中。将酶、ATP和10mM MgCl2与测定缓冲液(50mM HEPES pH 7.5、1mM EGTA、0.01％Brij-35、0.05％BSA，2mM DTT)中的化合物在室温下预孵育30分钟。添加肽底物(CDK5/p25的FL肽29(Perkin Elmer)；CDK2/CycA2的FL肽18(Perkin Elmer))来引发反应。最终测定含有0.154nM CDK5/p25或1.25nM CDK2/CycA2、10μM(对于CDK5/p25)或37μM(对于CDK2/CycA2)ATP和1.5μM的适当肽底物。最终DMSO浓度≤1％。
将CDK5/p25反应在室温下孵育60分钟。将CDK2/CycA2反应在室温下孵育120分钟。通过添加70μL含有0.5M EDTA的终止缓冲液来终止反应。使用EZ Reader(Perkin Elmer)分析样品。
结果表示为％媒介物，其中％媒介物＝100×(U-C2)/(C1-C2)，其中U是样品的信号，C1是高对照的平均值(没有添加化合物的信号)，并且C2是低对照的平均值(用缓冲液代替酶的信号)。IC50通过使用如下定义的4参数拟合将抑制百分比拟合为化合物浓度的函数来确定。
Y＝底部+(顶部-底部)/(1+10((LogIC50-X)*Hill斜率))，其中X是化合物浓度的对数，Y是在X处的％赋形剂或反应，顶部和底部是单位与Y相同的稳定期，Hill斜率是无单位的，并且IC50是半最大抑制浓度。
表1.示例性化合物的抑制活性和特异性
对于CDK2和CDK5活性:“A”＝小于10nM；“B”＝10与100nM之间；“C”＝大于100nM与小于或等于1μM之间；并且“D”＝大于1μM。就特异性而言：“+++”＝对CDK5的活性比CDK2大超过100倍；“++”＝对CDK5的活性比CDK2大超过10倍且小于或等于100倍；并且“+”＝对CDK5的活性比CDK2大10倍或更低倍数。
以引用的方式并入
本文引用的所有美国专利以及美国和PCT公布的专利申请据此以引用方式并入。
等效方案
前述书面说明足以使本领域技术人员能够实施本发明。本发明的范围不受所提供的实例的限制，因为这些实例旨在作为本发明一个方面的单一说明，并且其他功能等同的实施方案也在本发明的范围内。根据前述描述，除了本文示出和描述的那些修改外，本发明的各种修改对于本领域技术人员来说将变得显而易见并且落入所附权利要求的范围内。本发明的优点和目的不一定包含在本发明的每个实施方案中。
SEQ ID NO：1
以下是实施例66中使用的CDK5蛋白的氨基酸序列。
Claims (28)
1.一种具有结构式(I)的化合物：
环A是单环或双环环烷基或单环或双环饱和杂环基；
环B是单环或双环芳基、单环或双环杂芳基、或单环或双环杂环基；
R1为-N(R5)-、-C(O)-、-S-、-S(O)-、-S(O)2-、-[C(R4)2]1-2-、-[C(R4)2]0-1-CH＝、-N(R5)-S(O)2-、-S(O)2-N(R5)、-C(R4)2-N(R5)-、-N(R5)-C(R4)2-、-C(R4)2-S(O)2-、-C(＝N-OH)-、-C(＝N-O-C1-C4烷基)-或-S(O)2-C(R4)2-；
每个R2独立地是卤代、-OH、-C1-C6烷基、-C1-C6卤代烷基、-C1-C6羟基烷基、-(C0-C4亚烷基)-C(O)-OH、-(C0-C4亚烷基)-C(O)-O-C1-C4烷基、-(C0-C4亚烷基)-O-C1-C4烷基、-(C0-C4亚烷基)-O-C1-C4羟基烷基、-(C0-C4亚烷基)-C(O)-N(R6)2、-(C0-C4亚烷基)-N(R6)2或-(C0-C4亚烷基)-饱和杂环基，其中所述饱和杂环基任选地被卤代、-OH或-CH3取代；
每个R3独立地是卤代；-CN；-OH；-N(R6)2；-C1-C4烷基；-O-C1-C4烷基；-O-C1-C4亚烷基-C(O)-N(R6)2；-C(O)-O-C1-C4烷基；-C(O)-N(R6)2；-S(O)2-N(R6)2；-S(O)2-C1-C4烷基；任选地被一个或多个-OH取代的C2-C4炔基；1,2,4-三唑-1-基甲基；吗啉基甲基；环丙基；＝O；-CH2CH2-C(O)-O-CH3；-N(R6)-S(O)2-CH3；任选地取代的芳基；任选地取代的杂芳基；或任选地取代的杂环基，其中R3的任何烷基部分任选地被卤代、-CN或-N(R6)2或-OH中的一个或多个取代；
每个R4独立地是氢、卤代、-OH、-CN、-N(R6)2、任选地被-OH、卤代、-CN或-N(R6)2中的一个或多个取代的-C1-C4烷基；或任选地被-OH、卤代、-CN或-N(R6)2中的一个或多个取代的O-C1-C4烷基；
或者一个R4与环A中的环碳原子一起形成与环A螺稠合、稠合或桥连的环烷基或杂环基环；
或者键合至同一碳原子的两个R4一起形成＝CH2-(C0-C3烷基)、C3-C6环烷基或C4-C7杂环基；
R5是氢；任选地被-CN、-OH、-COOH、C(O)-O-C1-C4烷基或吡唑基中的一个或多个取代的C1-C4烷基；-S(O)2-C1-C4烷基；-C(O)C(O)OH；-COOH；或-C(O)-O-C1-C4烷基；
或者R5与环A中的环碳原子一起形成与环A螺稠合、稠合或桥连的杂环基环；
每个R6独立地是氢或-C1-C4烷基；
m是0、1、2、3、4、5或6；
n是0、1、2、3、4、5或6；并且
“----”表示单键或双键。
2.如权利要求1所述的化合物或盐，其中每个R3独立地是卤代；-CN；-OH；-N(R6)2；-C1-C4烷基；-O-C1-C4烷基；-O-C1-C4亚烷基-C(O)-N(R6)2；-C(O)-O-C1-C4烷基；-C(O)-N(R6)2；-S(O)2-N(R6)2；-S(O)2-C1-C4烷基；任选地取代的芳基；任选地取代的杂芳基；或任选地取代的杂环基，其中R3的任何烷基部分任选地被卤代、-CN或-N(R6)2或-OH中的一个或多个取代。
3.如权利要求1或2的化合物或盐，其中环B是苯基、-C(O)-苯基、1,3,4-噻二唑-2-基、咪唑并[1,2-b]哒嗪-3-基、异噁唑-3-基、1,3-二氢异苯并呋喃-5-基、2H-色烯-6-基、1,2,3,4-四氢异喹啉-6-基、1,2,3,4-四氢异喹啉-7-基、异吲哚啉-5-基、1,2-二氢吡啶-3-基、1,2-二氢吡啶-5-基、吡啶基或嘧啶基。
4.如权利要求1或3所述的化合物或盐，其中至少一个R3为氟、氯、-OH、＝O、-CH3、-CH2CH3、-C(CH3)3、-CH(CH3)2、-CN、-CH2CH2-C(O)-O-CH3、-C(O)-O-CH2CH3、-OCH3、-O-CH2CH2-C(O)-N(R6)2、-N(R6)2、-CH2-N(R6)2、-S(O)2-N(R6)2、-N(R6)-S(O)2-CH3、-S(O)2CH3、-C(O)-N(R6)2、-C((CH3)2)-OH、-C≡C-C((CH3)2)-OH或-CH2CN。
5.如权利要求1或3所述的化合物或盐，其中至少一个R3是1,2,4-三唑-1-基、1,2,4-三唑-1-基甲基、1,2,3,4-四唑-1-基、1,2,3,4-四唑-5-基、1,2,4-噁二唑-3-基、1,2-二氢吡啶-6-基、1,2-二氢吡啶-3-基、1,2-二氢吡啶-5-基、1,2-二氢吡啶-1-基、4,5-二氢-1,2,4-噁二唑-3-基、异噻唑烷-2-基、吡唑基、吡嗪-2-基、吡啶-2-基、吡啶-3-基、吡啶-4-基、嘧啶-4-基、吡咯烷-1-基、吗啉-4-基、吗啉-4-基甲基、硫代吗啉-4-基、哌啶-1-基、哌嗪-1-基、四氢吡喃-4-基、噁唑烷-3-基、咪唑烷-1-基、环丙基或苯基，其中所述至少一个R3任选地且独立地被多至3个独立地选自以下的取代基取代：卤代、＝O、-OH、CN、C1-C4烷基、C1-C4羟基烷基、C1-C4卤代烷基、-COOH、-C(O)-N(R6)2、-(C0-C4亚烷基)-C(O)-O-C1-C4烷基或-O-C1-C4烷基。
6.如权利要求1或3所述的化合物或盐，其中所述化合物的由
表示的部分为：
1,3-二氢异苯并呋喃-5-基、1-氟-2-甲基异吲哚啉-6-基、1-氧代-1,2,3,4-四氢异喹啉-6-基、1-氧代-1,2,3,4-四氢异喹啉-7-基、2-(1-羟基-1-甲基乙烷-1-基)吡啶-5-基、2-(吗啉-4-基)苯基、2-氟-4-(1,2,4-噁二唑-3-基)苯基、2-氟-4-(1,2,4-三唑-1-基甲基)苯基、2-氟-4-(1-乙基-2-氧代-1,2二氢吡啶-3-基)苯基、2-氟-4-(1-甲基-2-氧代-1,2-二氢吡啶-3-基)苯基、2-氟-4-(1-甲基-2-氧代-1,2-二氢吡啶-5-基)苯基、2-氟-4-(1-甲基-2-氧代-1,2-二氢吡啶-6-基)苯基、2-氟-4-(2-氨甲酰基苯基)苯基、2-氟-4-(2-氰基苯基)苯基、2-氟-4-(2-乙氧基羰基苯基)苯基、2-氟-4-(2-甲氧基吡啶-3-基)苯基、2-氟-4-(2-甲氧基吡啶-4-基)苯基、2-氟-4-(2-甲氧基吡啶-5-基)苯基、2-氟-4-(2-甲氧基吡啶-6-基)苯基、2-氟-4-(2-氧代-1,2-二氢吡啶-1-基)苯基、2-氟-4-(2-氧代-1,2-二氢吡啶-3-基)苯基、2-氟-4-(2-氧代-1,2-二氢吡啶-5-基)苯基、2-氟-4-(2-氧代-1,2-二氢吡啶-6-基)苯基、2-氟-4-(2-氧代-3-甲基咪唑烷-1基)苯基、2-氟-4-(3-(1-羟基-1-甲基乙烷-1-基)吡唑-1-基)苯基、2-氟-4-(3-氨甲酰基苯基)苯基、2-氟-4-(3-氨甲酰基吡唑-1-基)苯基、2-氟-4-(3-羧基苯基)苯基、2-氟-4-(3-羧基吡唑-1-基)苯基、2-氟-4-(3-氰基苯基)苯基、2-氟-4-(3-氰基吡唑-1-基)苯基、2-氟-4-(3-乙氧基羰基苯基)苯基、2-氟-4-(3-氟苯基)苯基、2-氟-4-(3-羟基甲基吡唑-1-基)苯基、2-氟-4-(3-甲氧基羰基吡唑-1-基)苯基、2-氟-4-(3-甲氧基苯基)苯基、2-氟-4-(3-甲氧基吡嗪-2-基)苯基、2-氟-4-(3-甲基氨甲酰基吡唑-1-基)苯基、2-氟-4-(3-甲基苯基)苯基、2-氟-4-(3-N,N-二甲基氨甲酰基吡唑-1-基)苯基、2-氟-4-(4-氨甲酰基苯基)苯基、2-氟-4-(4-羧基吡唑-1-基)苯基、2-氟-4-(4-氰基苯基)苯基、2-氟-4-(4-氰基吡唑-1-基)苯基、2-氟-4-(4-乙氧基羰基苯基)苯基、2-氟-4-(4-氟苯基)苯基、2-氟-4-(4-甲氧基羰基吡唑-1-基)苯基、2-氟-4-(4-甲氧基苯基)苯基、2-氟-4-(4-甲基苯基)苯基、2-氟-4-(5-氰基吡啶-2-基)苯基、2-氟-4-(5-羟基甲基吡唑-1-基)苯基、2-氟-4-(5-氧代-4,5-二氢-1,2,4-噁二唑-3-基)苯基、2-氟-4-(吗啉-4-基甲基)苯基、2-氟-4-(吡唑-1-基)苯基、2-氟-4-(吡唑-3-基)苯基、2-氟-4-(吡啶-3-基)苯基、2-氟-4-(吡啶-4-基)苯基、2-氟-4-(嘧啶-5-基)苯基、2-氟-4-甲基苯基、2-氟-5-(1-甲基-2-氧代-1,2-二氢吡啶-3-基)苯基、2-氟-5-(2-氧代吡咯烷-1-基)苯基、2-氟-5-(吗啉-4-基)苯基、2-氟-5-乙基苯基、2-氟苯基、2-羟基吡啶-3-基、2-甲基-4-(2-氨甲酰基乙氧基)苯基、2-甲基-4-(2-氧代吡咯烷-1-基)苯基、2-甲基-4-异丙基氨甲酰基苯基、2-甲基苯基、2-氧代-1,2-二氢吡啶-4-基、2-氧代-1,2-二氢吡啶-5-基、2-氧代-2H-色烯-6-基、3-(1,2,3,4-四唑-1-基)苯基、3-(2-氧代咪唑烷-1-基)苯基、3-(2-氧代-噁唑烷-3-基)苯基、3-(2-氧代吡咯烷-1-基)苯基、3-(3-羟基-3-甲基丁-1-炔-1-基)苯基、3-(4-甲基哌嗪-1-基)苯基、3-(氨基磺酰基)苯基、3-(氰基甲基)苯基、3-(乙氧基羰基)苯基、3-(甲基磺酰基)苯基、3-(吗啉-4-基)苯基、3-(吗啉-4-基甲基)苯基、3,5-二甲基苯基、3-氨基苯基羰基、3-氨甲酰基苯基、3-氰基苯基、3-环丙基苯基、3-乙基苯基、3-甲氧基-4-甲基磺酰基氨基苯基、3-甲基苯基、4-(1,1-二氧代异噻唑烷-2-基)苯基、4-(1,1-二氧代硫代吗啉-4-基)苯基、4-(1,2,3,4-四唑-5-基)苯基、4-(1,2,4-三唑-1-基)苯基、4-(2-甲氧基嘧啶-4-基)苯基、4-(2-氧代-噁唑烷-3-基)苯基、4-(3-氧代吗啉-4-基)苯基、4-(3-氧代哌嗪-1-基)苯基、4-(4-羟基哌啶-1-基)苯基、4-(4-甲基哌嗪-1-基)苯基、4-(4-甲基哌啶-1-基)苯基、4-(5-氧代-4,5-二氢-1,2,4-噁二唑-3-基)苯基、4-(吗啉-4-基)苯基、4-(吗啉-4-基甲基)苯基、4-(N,N-二甲基氨基甲基)苯基、4-(N,N-二甲基氨基磺酰基)苯基、4-(吡咯烷-1-基)苯基、4-(四氢吡喃-4-基)苯基、4-氰基甲基苯基、4-二甲基氨基苯基、4-异丙基苯基、4-甲基氨甲酰基苯基、4-甲基苯基、4-甲基磺酰基苯基、4-叔丁基苯基、5-(2-甲氧基羰基乙烷-1-基)-1,3,4-噻二唑-2-基、5-甲氧基吡啶-3-基、7-氯咪唑并[1,2-b]哒嗪-3-基、异噁唑-3-基、苯基或嘧啶-5-基。
7.如权利要求1-6中任一项所述的化合物或盐，其中环A是哌啶基、哌啶亚基、哌嗪基、吡咯烷基、氮杂环丁烷基、环己基、环戊基、环丁基、氮杂双环[3.3.1]壬烷基或氮杂双环[2.2.1]庚烷基。
8.如权利要求1到7中任一项所述的化合物或盐，其中每个R2独立地是-F、-OH、-CH3、-CH2CH3、-CH2CF3、-CH2CH2OH、-CH2CH(OH)CH2OH、-CH(CH3)2、-CH(CH3)-COOH、-COOH、-NH2、-NH(CH3)、-N(CH3)2-CH2C(O)NH2或氧杂环丁烷-3-基甲基。
9.如权利要求1-8中任一项所述的化合物或盐，其中所述化合物的由
表示的部分为：
1-(2,2,2-三氟乙基)哌啶-4-基、1-(2-羟乙基)哌啶-4-基、1-(2,3-二羟基丙基)哌啶-4-基、1-(氨甲酰基甲基)哌啶-4-基、1-(氧杂环丁烷-3-基甲基)哌啶-4-基、1,3-二甲基哌啶-4-基、1,4-二甲基哌啶-4-基、1-乙基哌啶-4-基、1-异丙基哌啶-4-基、1-甲基-1-氧代哌啶-4-基、1-甲基-3,3-二氟哌啶-4-基、1-甲基-4-羟基哌啶-4-基、1-甲基哌啶-4-基、1-甲基哌啶-4-亚基、1-甲基吡咯烷-3-基、2-氮杂双环[2.2.1]庚烷-5-基、2-甲基哌啶-4-基、3,3-二氟哌啶-4-基、3-氨基环丁基、3-氨基吡咯烷-1-基、3-氨基哌啶-1-基、3-羧基哌啶-4-基、3-甲基哌啶-4-基、4-(二甲基氨基)环己基、4-(甲基氨基)环己基、4-氨基-4-甲基环己基、4-氨基环己基、4-羟基环己基、4-羟基哌啶-4-基、4-甲基哌嗪-1-基、9-氮杂双环[3.3.1]壬烷-3-基、氮杂环丁烷-3-基、哌嗪-1-基、哌啶-4-基或哌啶-4-亚基。
10.如权利要求1-9中任一项所述的化合物或盐，其中R1为-N(CH3)-、-NH-、-N(CH2CH2OH)-、-N(CH2COOH)-、-N(CH2CH2COOH)-、-N(S(O)2CH3)-、-N(C(O)C(O)OH)-、-C(O)-、-S-、-S(O)-、-S(O)2-、-C(CH3)(OH)-、-C(CH3)(F)-、-C(CH2CH3)(OH)-、-C(CF3)(OH)-、-CH(CH3)-、-CH(CH2CH3)-、-CH(OH)-、-CH(CH2OH)-、-CH(＝CH2)-、-C(＝N-OH)、-C(＝N-OCH3)、-CF2-、-CHF-、-CH(OCH3)-、-CH＝、-CH2-、-CH(NH2)-、-CH(NHCH3)-、-NH-S(O)2-、-N(CH2CN)-、-S(O)2-NH-、-N(CH2COOCH3)-、-CH2-S(O)2-、-N(CH(CH3)COOH)-、吡唑-4-基甲基亚氨基、环丙烷-1,1-二基或氧杂环丁烷-2,2-二基。
11.如权利要求1所述的化合物或盐，其具有结构式(Ia)：
环B’为苯基、吡啶-3-基或1,3-二氢异苯并呋喃-5-基；
R11为-S-、-S(O)2-、-CF2-、-C(F)(CH3)-、-C(OH)(CH3)-、-CH(CH3)-或-C(O)-；
R12a是氢、-CH3、-CH2CH2OH或氧杂环丁烷-3-基甲基；
R12b是氢或-CH3；
每个R13如果存在的话独立地是氟；任选地被-CN和-OH中的一个或多个取代的C1-C4烷基；任选地被一个或多个-OH取代的C2-C4炔基；-C(O)N(R6)2；-C(O)O-C1-C4烷基；-N(R6)2；-S(O)2N(R6)2；-SO2-C1-C4烷基；任选地被氟、-CN、-C(O)N(R6)、-COOH、-O-C1-C4烷基和C1-C4羟基烷基中的一个或多个取代的苯基；任选地被一个或多个O-C1-C4烷基取代的吡啶基；任选地被-COOH、C1-C4羟基烷基、-C(O)O-C1-C4烷基中的一个或多个取代的吡唑基；任选地被O-C1-C4烷基取代的嘧啶基；氧代取代的1,2-二氢吡啶基；任选地被C1-C4烷基进一步取代的氧代取代的吡唑烷基；氧代取代的噁唑烷基；氧代取代的吡咯烷基；氧代取代的噻唑烷基；氧代取代的硫代吗啉基；吗啉基；或环丙基；
每个R6独立地是氢或C1-C4烷基；并且
p是0、1或2。
12.如权利要求11所述的化合物或盐，其中p是2，并且一个R13是氟。
13.如权利要求11或12所述的化合物或盐，其中环B是苯基。
14.如权利要求11到13中任一项所述的化合物或盐，其中每个R13独立地是氟、-CH3、-CH2CH3、-CH2CN、-CH(CH3)2、-C≡C-C(CH3)2OH、-C(OH)(CH3)CH3、-C(CH3)3、-C(O)NH2、-C(O)OCH2CH3、-N(CH3)2、-S(O)2NH2、-SO2CH3、1,1-二氧代噻唑烷-2-基、1,1-二氧代硫代吗啉-4-基、2-氰基苯基、2-甲氧基吡啶-4-基、2-甲氧基吡啶-5-基、2-甲氧基嘧啶-4-基、2-氧代-1,2-二氢吡啶-6-基、2-氧代-1,2-二氢吡啶-3-基、2-氧代-3-甲基吡唑烷-1-基、2-氧代噁唑-3-基、2-氧代吡咯烷-1-基、3-氨甲酰基苯基、3-羧基苯基、3-羧基吡唑-1-基、3-氰基苯基、3-氟苯基、3-羟基甲基吡唑-1-基、3-甲氧基苯基、4-羧基吡唑-1-基、4-氰基苯基、4-甲氧基羰基吡唑-1-基、4-甲氧基苯基、吗啉-4-基、吡唑-1-基、吡唑-3-基、吡啶-3-基、嘧啶-5-基或环丙基。
15.如权利要求1所述的化合物或盐，其具有结构式(Ib)：
R21为-CH(CH3)-、-CH(OH)-、-C(CH3)(OH)-、C(＝CH2)-、N(CH2C(O)OH)-、-S-或-S(O)2-；
R22是氢、-CH3、-CH2CH3、-CH2CH2OH或氮杂环丁烷-3-基甲基；
每个R23独立地是氟；C1-C4烷基；任选地被羟基取代的C2-C4炔基；-N(R6)2；-O-C1-C4亚烷基-C(O)-N(R6)2；任选地被卤代、-CN、C1-C4烷基、-O-C1-C4烷基、-C(O)N(R6)2和-C(O)-C1-C4烷基中的一个或多个取代的苯基；任选地被-O-C1-C4烷基取代的吡啶基；任选地被-CN、-C1-C4烷基、-C1-C4羟基烷基、-C(O)N(R6)2、-COOH和-C(O)-O-C1-C4烷基中的一个或多个取代的吡唑基；氧代取代的噁二唑基；吗啉基；吗啉基甲基；四氢吡喃基；吡咯烷基；嘧啶基；四唑基；任选地被C1-C4烷基取代的哌啶基；或环丙基；并且
q为1或2。
16.如权利要求15所述的化合物或盐，其中q是2；并且一个R23为-CH3或氟。
17.如权利要求15或16所述的化合物或盐，其中每个R23独立地是氟、-CH3、-CH2CH3、-CH(CH3)2、C≡C-C((CH3)2)OH、-N(CH3)2、-OCH2CH2C(O)NH2、1,2,3,4-四唑-5-基、2-甲氧基吡啶-3-基、2-甲氧基吡啶-4-基、2-甲氧基吡啶-5-基、2-甲氧基吡啶-6-基、3-(N,N-二甲基氨甲酰基)吡唑-1-基、3-氨甲酰基苯基、3-氨甲酰基吡唑-1-基、3-羧基吡唑-1-基、3-氰基苯基、3-氰基吡唑-1-基、3-乙氧基羰基苯基、3-氟苯基、3-羟基甲基吡唑-1-基、3-甲氧基羰基吡唑-1-基、3-甲氧基苯基、3-甲基苯基、4-氨甲酰基苯基、4-氰基苯基、4-乙氧基羰基苯基、4-氟苯基、4-甲氧基羰基吡唑-1-基、4-甲氧基苯基、4-甲基苯基、4-甲基哌啶-1-基、5-氧代-1,2,4-噁二唑-3-基、环丙基、氟、吗啉-4-基、吗啉-4-基甲基、吡唑-1-基、吡啶-3-基、吡啶-4-基、嘧啶-5-基、吡咯烷-1-基或四氢吡喃-4-基。
18.如权利要求1所述的化合物，其选自由图1中的化合物100-414组成的组，或其药学上可接受的盐。
19.一种药物组合物，其包含如权利要求1-18中任一项所述的化合物；和药学上可接受的载体。
20.一种治疗特征在于异常CDK5过度活性的疾病或病状的方法，其包括向有需要的受试者施用治疗有效量的如权利要求1-17中任一项的化合物或如权利要求18所述的组合物的步骤。
21.如权利要求20所述的方法，其中所述疾病或病状是肾脏的疾病或病状。
22.如权利要求21所述的方法，其中所述肾脏疾病或病状是囊性肾病、肾纤维化、糖尿病性肾病、实质性肾病或肾功能下降。
23.如权利要求22所述的方法，其中所述肾脏疾病或病状是慢性肾脏疾病、多囊性肾病、常染色体显性多囊性肾病、常染色体隐性多囊性肾病或肾消耗病-髓质囊性肾病。
24.如权利要求23所述的方法，其中所述疾病为多囊性肾病。
25.如权利要求20所述的方法，其中所述疾病或病状是纤毛类疾病。
26.如权利要求25所述的方法，其中所述纤毛类疾病是神经退行性疾病、肝病、炎症、癌症或肿瘤。
27.如权利要求26所述的方法，其中所述纤毛类疾病是神经退行性疾病；并且所述神经退行性疾病是阿尔茨海默病或帕金森病。
28.如权利要求26所述的方法，其中所述纤毛类疾病是肝病；并且所述肝病是多囊性肝病。
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