CN114685457B - 一种恩扎鲁胺光亲和探针及其制备方法 - Google Patents

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Abstract

本发明公开了一种恩扎鲁胺光亲和探针及其制备方法,涉及分子探针技术领域。本发明提供的恩扎鲁胺光亲和探针为鉴别恩扎鲁胺在治疗肿瘤中的作用靶点及其找出其作用机制提供了较为有力的援助,对了解这些信号传导途径并去确定未来的直接结合靶标将非常有意义。本发明制备出了恩扎鲁胺光亲和探针,利用核磁共振检测NMR测定其结构,结果与预期合成目标产物一致,可用于后续生物活性的检测与生物靶点鉴定工作。

Description

一种恩扎鲁胺光亲和探针及其制备方法
技术领域
本发明属于药物设计及合成领域,涉及一种新型恩扎鲁胺光亲和探针的制备方法。
背景技术
前列腺癌是男性生殖系肿瘤中非常重要的一种,在欧美常见恶性肿瘤中居第二位,而在美国前列腺发病率在所有恶性肿瘤中居第一位,死亡率居第二位。我国前列腺癌患者的发病率虽远低于西方国家,但近年来随老龄化增加呈显著增长趋势。由于雄激素在前列腺和前列腺癌的发展中起到举足轻重的作用,因此雄激素受体成为系统性治疗前列腺癌的基本靶标。
恩杂鲁胺(Enzalutamide)是由美国Medivation公司和日本安斯泰来(Astellas)公司合作开发新一代抗雄激素药物,于2012年和2013年分别被美国FDA和欧洲药品管理局批准上市,可用于治疗已扩散或复发的晚期(转移性)男性去势抵抗性前列腺癌(Castration-Resistant Prostate Cancer)。
恩扎鲁胺是一种新型结构非甾体类雄激素受体拮抗剂,具有如下结构:
恩扎鲁胺是与雄激素受体的结合能力增强,不会引发激动作用。
临床研究显示,其能延长转移性前列腺癌患者的总存活期达4.8个月,但存在一些不良反应,包括虚弱/疲劳,背痛,腹泻,关节痛,潮热,外周血水肿,肌肉骨骼痛,头痛,上呼吸道感染,肌肉无力,眩晕,失眠,下呼吸道感染,脊髓压迫症和马尾神经综合征,血尿,感觉异常,焦虑和高血压等。
为了对恩扎鲁胺的作用机制作一个深入的研究,进而为通过恩扎鲁胺结构针对性改造,同时为了尽早可以发现恩扎鲁胺分子结构导致潜在的缺陷,例如某些结构导致的毒副作用等,发现恩扎鲁胺分子在蛋白组层面的作用靶点进行明确化是非常有必要的。在生物体内,小分子化合物通过结合大分子靶标,可在基因组,转录组,蛋白质组和代谢组等各个层面引起表型变化。在这大多数情况下,大分子靶标通常会作为靶点蛋白,即与小分子起相互作用的蛋白质,这是因为蛋白质充当了细胞功能的主要执行者。
药物靶点的鉴定方法策略可分为两大类,第一类称为正向策略,它确定药物靶点的根据是药物引起的表型变化或者是依靠与之相关的已知信号通路和作用网络进行推测,它的方法包括差异基因组学/蛋白质组学分析,细胞形态分析差异等。第二类则是逆向策略,它则是以小分子药物为起点筛选靶点蛋白,包括化学蛋白质组学,化学基因组学和生物物理学等方法。
本发明所提供的探针用于逆向策略中的化学蛋白质组学方法。化学蛋白质组学是药物靶标鉴定最为常用的方法,他也被称作基于亲和性蛋白质组分析。
化学蛋白质组学技能的核心要素便是分子探针。分子探针的本质是将活性分子骨架和报告基团通过化学合成的手段,二者连接结合,组成的活性分子衍生物。报告基团就是可以特异性标记和富集相对应的蛋白质的特殊官能团,报告基团一般是固相介质、荧光或者生物素。
当活性分子骨架与报告基团连接成功后,活性分子的骨架端结构可以结合其对应的靶点蛋白,然后就可以对报告基团相连的活性分子和靶点蛋白结合的产物进行标记和富集,完成对靶点蛋白的富集、提取、洗脱和酶解,最后可以用质谱对该蛋白进行鉴定操作。
在最初的时候,当时的研究方案是用惰性树脂通过化学合成的方法与药物分子相结合而固定,这些惰性树脂采用的材料一般为可与生物相容的磁珠或者琼脂糖凝胶,这些树脂即可“钓取”与蛋白质组中能与其相互作用的蛋白质。这些固定化小分子的设计便是分子探针的最经典的设计策略。但是这种早期设计存在非常大的缺陷,因为化合物的活性非常容易受到影响,若是引入空间位阻较大的亲和标签,将很容易导致前者的活性降低甚至消失。因此需要找到新的方法来克服弥补这一经典方法的不足之处。
生物正交化学反应的发展有效缓解了上述的问题,最近以来应用最为广泛的靶点鉴定策略之一便是在引入生物正交反应基团到药物分子骨架之上。通过有机合成引入光亲和基团和生物正交基团,使修饰后的分子对原来的化合物的活性干扰较小,即可结合药物对应的靶点蛋白,结合的环境可以是活细胞或是细胞裂解液中,加大了灵活性和准确性。随后利用点击反应再将叠氮修饰的报告基团(生物素或荧光)连接到探针-靶标蛋白复合物上,最后就可以对靶标进行检测、富集和鉴定。
发明内容
本发明的目的是克服现有技术中不足,提供一种恩扎鲁胺光亲和探针。
根据本发明的第一个方面,本发明提供了一种式(I)结构的化合物Enza-Dayne,
根据本发明的第二个方面,发明提供了一种式(I)结构的化合物Enza-Dayne的用途,用于作为恩扎鲁胺光亲和探针。
根据本发明的第三个方面,本发明提供了一种式(I)结构的化合物Enza-Dayne的用途,用于制备治疗癌症药物中的用途;优选地,所述癌症为前列腺癌,更优选为LnCap细胞的前列腺癌。实验结果表明,本发明式(I)结构的化合物Enza-Dayne不仅可以用于恩扎鲁胺光亲和探针,标记标记重组雄激素受体(Androgen receptor,AR)蛋白,而且可以前列腺癌LnCap细胞增殖,起到抗癌效果。
根据本发明的第四个方面,本发明提供了一种式(I)结构的化合物Enza-Dayne的制备方法,由Enza-COOH与Dayne-NH2进行脱水缩合反应形成酰胺键,反应方程式如下:
优选地,所述缩合反应中加入缩合剂,本领域普通技术人员可以选择常规酰胺键形成的缩合剂,例如EDCI/HOBt体系,通常同时加入有机碱如DIEPA。
优选地,所述缩合反应中采用TLC或LC-MS检测反应进程,确认反应体系中不存在Enza-COOH,即表示反应完全。
优选地,所述缩合反应中反应完全后,将反应液用液氮冷冻,用冷冻干燥机除去溶剂。
本发明还提供的所述的式(I)结构的化合物Enza-Dayne作为恩扎鲁胺光亲和探针在生物活性的检测与生物靶点鉴定中的应用。
与现有技术相比,本发明所能达到的技术效果包括:
本发明提供的式(I)结构的恩扎鲁胺光亲和探针Enza-Dayne对于临床前列腺癌治疗药物恩扎鲁胺的作用靶点的鉴定非常关键。随着化学蛋白质组学、生物信息学、网络药理学等新兴学科和技术的交叉融合与不断完善,将会有更多、更新的药物靶标鉴定新方法、新技术出现,关于小分子药潜在靶标蛋白的报道也会越来越多,将持续推动小分子药物药理机制和副作用产生原因的研究。
对于小分子药物探针的设计与合成而言,本发明提供的一种恩扎鲁胺光亲和探针为恩扎鲁胺的作用靶点及其找出其作用机制提供了较为有力的援助,对了解这些信号传导途径并去确定未来的直接结合靶标将非常有意义。
本发明提供的制备一种恩扎鲁胺光亲和探针的方法,利用小分子恩扎鲁胺为基本原料,成功制备出了上述结构的恩扎鲁胺光亲和探针,使用薄层色谱分析法(TLC)监测反应的进行,得到粗产物后,进行液相色谱-质谱联用以(LC-MS)检测粗产物中的预期产物,得到其预期质谱峰和液相峰。然后对粗产物进行分离纯化,再采用高效液相色谱(HPLC)对目标产物提取分离。然后利用核磁共振检测NMR以测定其结构,结果与预期合成目标产物一致,可用于后续生物靶点鉴定工作。
附图说明
图1为本发明实施例1提供的制备式(1)结构的恩扎鲁胺光亲和探针1H-NMR检测的检测结果。
图2为本发明实施例1提供的制备式(1)结构的恩扎鲁胺光亲和探针13C-NMR检测的检测结果。
图3为恩扎鲁胺光亲和探针标记重组雄激素受体蛋白图。
图4为恩扎鲁胺竞争性标记组雄激素受体蛋白图。
图5为恩扎鲁胺光亲和探针抑制前列腺癌LnCap细胞增殖图。
具体实施方式
实施例1:恩扎鲁胺光亲和探针的合成
化合物Dayne-NH2根据参考文献的方法(Angew.Chem.Int.Ed,2013,52,8551)在本实验室合成;化学合成使用的试剂分别从Sigma-Aldrich、TCI、MedChemExpress或Aladdin等公司购买而得。
干燥的烧瓶中依次加入Enza-COOH(451mg,1mmol),EDCI(230mg,1.2mmol)和HOBt(180mg,1.2mmol),抽换氮气,加入5mL无水N,N-二甲基甲酰胺(DMF),室温搅拌10分钟后,置于冰浴。冰浴下加入溶于3mL无水DMF的3-(丁-3-炔基)-3-(2-胺基乙基)-3H-双吖丙啶(Dayne-NH2)(151mg,1.1mmol),缓慢升至室温并搅拌反应20小时,薄层层析(TLC)检测。反应完全后,加入50mL乙酸乙酯,再分别用10mL 10%HCl,20mL饱和碳酸氢钠溶液、20mL饱和食盐水洗涤。最后用无水硫酸钠干燥,并通过柱层析分离得到分子探针Enza-Dayne(白色固体,534mg,93.6%收率)。
化合物结构信息(图1~图2):
1H-NMR(500MHz,exists as isomers):8.30(t,1H,J=8.4Hz),7.97(d,1H,J=8.0,1.2Hz),7.84(dd,1H,J=8.0Hz),7.27(s,1H),7.21(dd,1H,J=8.2,1.2Hz),6.82(t,1H,J=8.4Hz),3.40(m,2H),2.09(m,2H),2.07(m,5H),1.64(s,6H).
13C-NMR(125MHz,exists as isomers):179.75,174.40,162.06,161.45,159.45,139.25,139.17,136.80,135.31,133.59,133.37,133.35,132.10,127.07,126.95,126.25,126.23,122.54,122.45,118.11,117.90,114.68,110.47,82.53,69.43,66.63,35.08,32.46,32.20,29.70,26.79,23.88,13.22.
HRMS-ESI calc’d.for C27H23F4N6O2S+[M+H]+:571.1534;Found:571.1602.
实施例2:恩扎鲁胺光亲和探针Enza-Dayne标记重组雄激素受体(Androgenreceptor,AR)蛋白。
将体外重组表达的AR蛋白(MCE,HY-P72088)在PBS中稀释至0.1mg/mL。每个样品中,加入20μLAR蛋白和不同浓度的探针Enza-Dayne室温孵育1小时后,冰浴条件下365nm紫外光照射15分钟。随后每个样品中分别加入0.2μL的羧基四甲基罗丹明-叠氮TAMRA-N3(10mM在DMSO中的储液)、CuSO4(100mM在水中的储液)、三(3-羟丙基三唑甲基)胺THPTA(10mM在水中的储液)和抗坏血酸钠(100mM在水中的储液),室温避光孵育1小时。加入5μL5×SDS上样缓冲液并且在95℃煮沸15分钟终止反应。将样品施加到10%Bis-tris变性凝胶并且用FUJIFILM FLA 9000plus荧光成像系统进行凝胶荧光扫描。如图3所示,探针Enza-Dayne可浓度依赖的标记重组AR蛋白,在1M时探针标记即达到饱和。
实施例3:恩扎鲁胺竞争性标记重组AR蛋白。
将体外重组表达的AR蛋白(MCE,HY-P72088)在PBS中稀释至0.1mg/mL。每个样品中,加入20μL AR蛋白和不同浓度的恩扎鲁胺,随后加入1M探针Enza-Dayne室温孵育1小时后,冰浴条件下365nm紫外光照射15分钟。随后每个样品中分别加入0.2μL的TAMRA-N3(10mM在DMSO中的储液)、CuSO4(100mM在水中的储液)、THPTA(10mM在水中的储液)和抗坏血酸钠(100mM在水中的储液),室温避光孵育1小时。加入5μL 5×SDS上样缓冲液并且在95℃煮沸15分钟终止反应。将样品施加到10%Bis-tris变性凝胶并且用FUJIFILM FLA 9000plus荧光成像系统进行凝胶荧光扫描。如图4所示,恩扎鲁胺可以浓度依赖地抑制探针Enza-Dayne标记重组AR蛋白。
实施例5:恩扎鲁胺光亲和探针Enza-Dayne抑制前列腺癌细胞增殖。
通过CellTiter发光法细胞活力检测试剂盒评价恩扎鲁胺光亲和探针Enza-Dayne对前列腺癌LnCap细胞增殖的影响。
由图5可见,恩扎鲁胺光亲和探针Enza-Dayne对前列腺癌LnCap细胞有显著的抗增殖活性,IC50值为12.8M。证明本发明所述恩扎鲁胺光亲和探针保持了恩扎鲁胺的抗肿瘤活性。
需要说明的是,对于包括恩扎鲁胺在内的广大具有副作用或脱靶效应的小分子药物,对它们的作用靶点进行鉴定仍然是非常有必要的。
上述实施例为本发明较佳的实施方式,但本发明的实施方式并不受上述实施例的限制,其他的任何未背离本发明的精神实质与原理下所作的改变、修饰、替代、组合、简化,均应为等效的置换方式,都包含在本发明的保护范围之内。

Claims (8)

1.一种式(I)结构的化合物Enza-Dayne,
式(I)。
2.一种权利要求1所述的式(I)结构的化合物Enza-Dayne的用途,用于作为恩扎鲁胺光亲和探针。
3.一种权利要求1所述的式(I)结构的化合物Enza-Dayne的用途,用于制备治疗癌症药物中的用途,所述癌症为前列腺癌。
4.一种式(I)结构的化合物Enza-Dayne的制备方法,由Enza-COOH与Dayne-NH2进行脱水缩合反应形成酰胺键,反应方程式如下:
5.根据权利要求4所述的方法,其特征在于:所述缩合反应中加入缩合剂。
6.根据权利要求4所述的方法,其特征在于:所述缩合反应中采用TLC或LC-MS检测反应进程,确认反应体系中不存在Enza-COOH,即表示反应完全。
7.根据权利要求4所述的方法,其特征在于:所述缩合反应中反应完全后,将反应液用液氮冷冻,用冷冻干燥机除去溶剂。
8.根据权利要求4所述的方法,其特征在于:干燥的烧瓶中依次加入Enza-COOH,EDCI和HOBt ,抽换氮气,加入无水N,N-二甲基甲酰胺,室温搅拌后,置于冰浴;冰浴下加入溶于无水DMF的Dayne-NH2,缓慢升至室温并搅拌反应,薄层层析检测;
反应完全后,加入乙酸乙酯,再分别用HCl,饱和碳酸氢钠溶液、饱和食盐水洗涤;最后用无水硫酸钠干燥,并通过柱层析分离得到化合物Enza-Dayne。
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