CN114606146A - 一种生产d-柠檬烯的酵母及其应用 - Google Patents

一种生产d-柠檬烯的酵母及其应用 Download PDF

Info

Publication number
CN114606146A
CN114606146A CN202210243089.9A CN202210243089A CN114606146A CN 114606146 A CN114606146 A CN 114606146A CN 202210243089 A CN202210243089 A CN 202210243089A CN 114606146 A CN114606146 A CN 114606146A
Authority
CN
China
Prior art keywords
gene
limonene
seq
nucleotide sequence
erg20
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Granted
Application number
CN202210243089.9A
Other languages
English (en)
Other versions
CN114606146B (zh
Inventor
刘龙
陈坚
吕雪芹
堵国成
李江华
刘延峰
孔晓
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Jiangnan University
Original Assignee
Jiangnan University
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Jiangnan University filed Critical Jiangnan University
Priority to CN202210243089.9A priority Critical patent/CN114606146B/zh
Publication of CN114606146A publication Critical patent/CN114606146A/zh
Application granted granted Critical
Publication of CN114606146B publication Critical patent/CN114606146B/zh
Active legal-status Critical Current
Anticipated expiration legal-status Critical

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12PFERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
    • C12P5/00Preparation of hydrocarbons or halogenated hydrocarbons
    • C12P5/002Preparation of hydrocarbons or halogenated hydrocarbons cyclic
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/0004Oxidoreductases (1.)
    • C12N9/0006Oxidoreductases (1.) acting on CH-OH groups as donors (1.1)
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/10Transferases (2.)
    • C12N9/12Transferases (2.) transferring phosphorus containing groups, e.g. kinases (2.7)
    • C12N9/1205Phosphotransferases with an alcohol group as acceptor (2.7.1), e.g. protein kinases
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/14Hydrolases (3)
    • C12N9/16Hydrolases (3) acting on ester bonds (3.1)
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/88Lyases (4.)
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12YENZYMES
    • C12Y101/00Oxidoreductases acting on the CH-OH group of donors (1.1)
    • C12Y101/01Oxidoreductases acting on the CH-OH group of donors (1.1) with NAD+ or NADP+ as acceptor (1.1.1)
    • C12Y101/01088Hydroxymethylglutaryl-CoA reductase (1.1.1.88)
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12YENZYMES
    • C12Y207/00Transferases transferring phosphorus-containing groups (2.7)
    • C12Y207/01Phosphotransferases with an alcohol group as acceptor (2.7.1)
    • C12Y207/01036Mevalonate kinase (2.7.1.36)
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12YENZYMES
    • C12Y301/00Hydrolases acting on ester bonds (3.1)
    • C12Y301/02Thioester hydrolases (3.1.2)
    • C12Y301/02005Hydroxymethylglutaryl-CoA hydrolase (3.1.2.5)
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12YENZYMES
    • C12Y301/00Hydrolases acting on ester bonds (3.1)
    • C12Y301/02Thioester hydrolases (3.1.2)
    • C12Y301/02011Acetoacetyl-CoA hydrolase (3.1.2.11)
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12YENZYMES
    • C12Y301/00Hydrolases acting on ester bonds (3.1)
    • C12Y301/07Diphosphoric monoester hydrolases (3.1.7)
    • C12Y301/07006Farnesyl diphosphatase (3.1.7.6)
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12YENZYMES
    • C12Y401/00Carbon-carbon lyases (4.1)
    • C12Y401/01Carboxy-lyases (4.1.1)
    • C12Y401/01033Diphosphomevalonate decarboxylase (4.1.1.33), i.e. mevalonate-pyrophosphate decarboxylase
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12YENZYMES
    • C12Y402/00Carbon-oxygen lyases (4.2)
    • C12Y402/03Carbon-oxygen lyases (4.2) acting on phosphates (4.2.3)
    • C12Y402/03016(4S)-Limonene synthase (4.2.3.16)
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12YENZYMES
    • C12Y402/00Carbon-oxygen lyases (4.2)
    • C12Y402/03Carbon-oxygen lyases (4.2) acting on phosphates (4.2.3)
    • C12Y402/0302(R)-Limonene synthase (4.2.3.20)
    • YGENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
    • Y02TECHNOLOGIES OR APPLICATIONS FOR MITIGATION OR ADAPTATION AGAINST CLIMATE CHANGE
    • Y02EREDUCTION OF GREENHOUSE GAS [GHG] EMISSIONS, RELATED TO ENERGY GENERATION, TRANSMISSION OR DISTRIBUTION
    • Y02E50/00Technologies for the production of fuel of non-fossil origin
    • Y02E50/10Biofuels, e.g. bio-diesel

Landscapes

  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
  • Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)

Abstract

本发明属于代谢工程领域,具体涉及一种生产D‑柠檬烯的酿酒酵母及其应用。本发明以酿酒酵母为出发菌株,将自然界中不存在于同一生物体的柠檬烯合成酶基因有机整合到酿酒酵母中,优化外源基因的表达,过表达MVA途径基因关键基因、增加乙酰辅酶A和NADPH前体供应等方面,实现柠檬烯在酿酒酵母中的高效合成,最终得到的菌株相对于原菌株具有较好的生长速率。摇瓶发酵最终实现柠檬烯产量达657mg/L,比原产量提高2.021倍,实现柠檬烯在酿酒酵母中的高效合成,具有较大的应用推广价值。

Description

一种生产D-柠檬烯的酵母及其应用
技术领域
本发明属于代谢工程领域,具体涉及一种生产D-柠檬烯的酵母及其应用。
背景技术
萜类化合物,又称类异戊二烯,由异戊二烯单元组成的化合物及其衍生物构成,是植物的次生代谢产物。柠檬烯属于单环单萜类化合物,化学式为C10H16,是一种来源于植物的天然活性化合物,易挥发,性质较稳定,应用范围较广。在食品工业中,柠檬烯具有防腐保鲜、抑菌、抗氧化等功能;在医药行业中,柠檬烯可以用于制备具有抗肿瘤、祛痰平喘、利胆溶石功能的药物;在香料、洗护行业,柠檬烯做精油、温和洗涤剂等;在农业方面,柠檬烯可用于制备天然源农药,具有环境易降解的优点。2020年,全球柠檬烯市场规模达到了20亿元,预计2026年将达到24亿元,年复合增长率(CAGR)为2.3%。
目前D-柠檬烯的工业生产主要是从植物的果皮或者果肉中提取的,但提取方法存在着分离纯化复杂、产率低、能耗大等缺点。本世纪初合成生物学技术的兴起,为微生物异源合成天然活性化合物带来了全新的理念与工具,打破了物种间的界限,使微生物异源合成D-柠檬烯成为现实。构建定向、高效的异源合成D-柠檬烯的微生物细胞工厂,实现微生物发酵法替换传统的植物提取法,具有重要的经济与社会效益。目前代谢工程应用于柠檬烯的生产主要以酿酒酵母与大肠杆菌为底盘细胞,酿酒酵母作为极具潜力的细胞工厂,被广泛的应用于各种生物燃料、化工产品、医药保健品等的合成,酿酒酵母在萜类化合物的生产中应用较广泛。
2019年国外Codruta Ignea等人采用对正交途径的动态调节,ERG1启动子的动态设计以及关键基因ERG20启动子替换,引入工程化的NPPS等策略,连续发酵实现柠檬烯产量166.0mg/L。2019年Si Cheng等人通过工程改造竞争性基因ERG20的葡萄糖感应启动子HXT1以及引入由植物NPPS和植物LS利用底物NPP组成的OLB途径等策略,补料分批发酵实现柠檬烯产量917.7mg/L。2020年胡智慧等人采用过表达或共过表达MVA关键基因、关键酶启动子优化,关键酶点突变随机突变相结、表达相关转运蛋白以增加耐受性等策略,连续发酵实现柠檬烯产量62.31mg/L。
综上,柠檬烯的传统分离提取技术存在产率低、能耗大等问题,并且受到原料以及地域的限制。关于合成生物学的技术和方法,目前国内外现有技术柠檬烯产量无法满足工业化应用的要求。单萜类物质倾向于粘附或渗透细胞膜,最终导致酵母膜功能受损,因此还会存在柠檬烯对酵母生长的抑制问题。
发明内容
本发明旨在提供一种生产D-柠檬烯的酵母及其应用,从外源柠檬烯合成关键基因整合与优化、过表达MVA途径基因关键基因、增加乙酰辅酶A和NADPH前体供应三个方面,实现柠檬烯在酵母中的高效合成,具有较大的应用推广价值。
按照本发明的技术方案,所述重组酵母,以酵母为出发菌,异源表达截短的柠檬烯合成酶基因tLimS,表达了法尼基焦磷酸突变体基因ERG20ww,过表达内源MVA合成途径中关键基因和MVA途径相关基因;
所述截短的柠檬烯合成酶基因tLimS由柠檬烯合成酶基因LimS去除前56个氨基酸序列形成;
所述法尼基焦磷酸突变体基因ERG20ww是对法尼基焦磷酸基因ERG20的96与127位氨基酸进行突变得到;
所述内源MVA合成途径中关键基因为甲羟戊酸焦磷酸脱羧酶基因IDI和截短的3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶基因tHMG1;
所述截短的3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶基因tHMG1由3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶基因HMG1去除前530个氨基酸序列形成;
所述MVA途径相关基因为乙酰乙酰辅酶A硫解酶基因ERG10、β-羟-β-甲戊二酸单酰辅酶a合酶基因ERG13、甲羟戊酸激酶基因ERG12、磷酸甲羟戊酸ERG8和焦磷酸甲羟戊酸脱羧酶ERG19。
进一步的,所述酵母为酿酒酵母、异常汉逊氏酵母、粟酒裂殖酵母、黏红酵母、热带假丝酵母、产朊假丝酵母、解脂假丝酵母或巴斯德毕赤酵母。
进一步的,所述的柠檬烯合成酶的NCBI编号是AAC37366.1,所述的甲羟戊酸焦磷酸脱羧酶的NCBI编号是NP_015208.1,所述的3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶的NCBI编号是NP_013636.1,所述的乙酰乙酰辅酶A硫解酶基因的NCBI编号是NP_015297.1,β-羟-β-甲戊二酸单酰辅酶a合酶的NCBI编号是NP_013580.1,甲羟戊酸激酶的NCBI编号是NP_013935.1,磷酸甲羟戊酸的NCBI编号是NP_013947.1、焦磷酸甲羟戊酸脱羧酶的NCBI编号是NP_014441.1。
具体的,所述截短的柠檬烯合成酶基因tLimS的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示,所述法尼基焦磷酸突变体基因ERG20ww的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示,所述甲羟戊酸焦磷酸脱羧酶基因IDI的核苷酸序列如SEQ ID NO.4所示,所述截短的3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶基因tHMG1的核苷酸序列如SEQ ID NO.5所示,所述乙酰乙酰辅酶A硫解酶基因ERG10的核苷酸序列如SEQ ID NO.6所示,所述β-羟-β-甲戊二酸单酰辅酶a合酶基因ERG13的核苷酸序列如SEQ ID NO.7所示、所述甲羟戊酸激酶基因ERG12的核苷酸序列如SEQ IDNO.8所示、磷酸甲羟戊酸ERG8的核苷酸序列如SEQ ID NO.9所示,所述焦磷酸甲羟戊酸脱羧酶ERG19的核苷酸序列如SEQ ID NO.10所示。
进一步的,所述法尼基焦磷酸合酶突变体基因ERG20ww通过与截短的柠檬烯合成酶基因tLimS采用双向诱导型启动子GAL1,10进行表达。
进一步的,所述双向诱导型启动子GAL1,10的核苷酸序列如SEQ ID NO.11所示。
进一步的,所述重组酵母还将法尼基焦磷酸基因ERG20的启动子替换为葡萄糖感应型启动子。
进一步的,所述葡萄糖感应型启动子为PHXT1,核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示。
本发明采用诱导型启动子表达基因tLimS,以及D-柠檬烯合成关键基因ERG20ww,使得化合物IPP和DMAPP更趋向于合成D-柠檬烯的前体化合物GPP。采用诱导型启动子过表达MVA途径的多个基因,并优化了关键基因的拷贝数,用采用PHXT1动态调控ERG20,克服因前体供应不足而导致的D-柠檬烯产量发酵产量低的因素。
进一步的,所述重组酵母还敲除了乙醛酸循环的关键酶苹果酸合成酶基因MLS1,谷氨酸脱氢酶(NAD(+))GDH2。
进一步的,所述的苹果酸合成酶MLS1的NCBI编号为NP_014282.1,所述谷氨酸脱氢酶(NAD(+))GDH2的NCBI编号为NP_010066.1(SEQ ID NO.16)。
进一步的,依次敲除苹果酸合成酶基因MLS1和谷氨酸脱氢酶(NAD(+))基因GDH2。
本发明通过敲除乙醛酸循环的关键基因来增加乙酰辅酶A的含量,调节细胞代谢流往产物合成方向。由于类异戊二烯途径的过度表达导致细胞NADPH池的大量消耗,运用辅因子策略调控NADPH前体供应,克服因还原力不足而导致的D-柠檬烯发酵产量低的因素,促使氧化还原平衡以提高途径效率,摇瓶发酵最终实现柠檬烯产量达657mg/L,比原产量提高2.021倍,实现柠檬烯在酵母中的高效合成。
本发明的另一方面提供了上述重组酵母在发酵生产D-柠檬烯中的应用。
进一步的,所述发酵的温度为28-32℃,时间为80-120h。
本发明的技术方案相比现有技术具有以下优点:本发明以酿酒酵母为出发菌株,将自然界中不存在于同一生物体的柠檬烯合成酶基因有机整合到酿酒酵母中,优化外源基因的表达,过表达MVA途径基因关键基因、增加乙酰辅酶A和NADPH前体供应等方面,实现柠檬烯在酿酒酵母中的高效合成,最终得到的菌株相对于原菌株具有较好的生长速率。摇瓶发酵最终实现柠檬烯产量达657mg/L,比原产量提高2.021倍,实现柠檬烯在酿酒酵母中的高效合成,具有较大的应用推广价值。
具体实施方式
下面结合具体实施例对本发明作进一步说明,以使本领域的技术人员可以更好地理解本发明并能予以实施,但所举实施例不作为对本发明的限定。
下述实施例中气相-质谱联用检测方法如下:使用带有FID检测器和色谱柱(Thermo;25m,0.32mm,0.25μm)的Thermofisher Scientific TSQ8000仪器进行检测。进样器温度为180℃,载气为氦气,流速为1mL/min,压力为5.8psi。程序从70℃开始,以20℃/min的速率将温度升至150℃,保持3分钟,然后以2℃/min的速度将温度升至190℃,保持3分钟。
启动子PGAL1,10的核苷酸序列如SEQ ID NO.11所示,启动子PGAL7的核苷酸序列如SEQID NO.12所示,终止子TCYC1的核苷酸序列如SEQ ID NO.13所示,终止子TADH1的核苷酸序列如SEQ ID NO.14所示,终止子TTDH3的核苷酸序列如SEQ ID NO.15所示。
实施例1构建D-柠檬烯合成途径
(a)人工合成基因片段PGAL1-tLimS-TCYC1-PGAL10-ERG20WW-TADH1,其中tLimS基因是基因LIS去除前56个氨基酸序列所形成,ERG20WW基因是对ERG20基因的96与127位氨基酸进行突变得到,采用引物911b-F、911b-R对上述片段扩增;以酿酒酵母S288C基因组为模版,分别扩增得到基因片段911b-U(引物911b-U-F、911b-U-R)、基因片段911b-D(引物911b-D-F、911b-D-R);
(b)使用核酸酶SwaI和BelI*对pML104质粒进行酶切,得到线性化质粒片段;
(c)采用引物911b-oligo2-F和911b-oligo1-R梯度退火,具体方法是,体系中按照1:1比例加入上述两种引物,设置PCR仪温度从98℃至12℃,按照每秒0.1℃的速率退火;
(d)将(b)所得线性化质粒片段与(c)经退火后的引物使用T4 DNA连接酶连接,具体方法是加入(b)(c)所得体系各1μL、T4 DNA连接酶1μL,T4 DNA连接酶10×buffer 1μL,去离子水6μL,置于22℃反应3小时。即可得到pML104-911b CRISPR-Cas9的质粒;连接完成后转入大肠JM109或DH5α感受态均可。将转化成功的菌送测序,测序正确的单菌落接入2mL LB培养基内,培养16h后利用质粒提取试剂盒提取得到质粒用于后续酵母化转。
(e)制备酿酒酵母CEN.PK2-1C感受态,并将扩增好的基因片段911b-U、基因片段911b-D,PPGAL1-tLimS-TCYC1-PGAL10-ERG20WW-TADH1片段,pML104-911b质粒共同转入CEN.PK2-1C感受态中,待SD Ura筛选固体平板上长出单菌落后采用两对引物分别是YZ-911b-tLimS-F,YZ-tLimS-911b-R与
YZ-ERG20WW-911b-F,YZ-911b-ERG20WW-R进行菌落PCR验证。
(f)将步骤(e)中菌落PCR验证正确的单菌落接入YPD液体培养基内培养16h,之后划线于含有5-FOA的YPD固体平板上,30℃培养3d,之后将长出的单菌落分别转板于YPD固体平板与SD Ura筛选固体平板上对比验证,YPD平板上正常生长但SD Ura筛选平板无法生长的单菌落即为正确的基因工程菌,并命名为MKL1。
引物序列:
911b-F:TGAATGGGCATAAATATAAATGTATATATAAggccgcaaattaaagccttc
911b-R:tgctatttcaTTTTTCATTTACTTCTCCAgagcgacctcatgctatacct
911b-U-F:CACTCATCAAACAGCCTTAACAAT
911b-U-R:
aaggctttaatttgcggccTTATATATACATTTATATTTATGCCCATTCAACATCCG
911b-D-F:
aggtatagcatgaggtcgctcTGGAGAAGTAAATGAAAAATGAAATAGCATAC
911b-D-R:AATATGGGTACGAGAGAAACTCTCG
911b-oligo2-F:CTAGCTCTAAAACGGGAAACAAGACAATATTAC
911b-oligo1-R:gatcGTAATATTGTCTTGTTTCCCGTTTTAGAGCTAG
YZ-911b-tLimS-F:CCGCAATTTTCATTGCAGCACTG
YZ-tLimS-911b-R:cgcagaaagagtttctaaggattcacc
YZ-ERG20WW-911b-F:gcttccgcagaacaaagaaagac
YZ-911b-ERG20WW-R:GCCTATACAGCTACCGCGC。
实施例2优化内源MVA途径
(a)以酿酒酵母S288C基因组为模版,人工合成基因片段PGAL1-tHMG1-TADH1-PGAL10-IDI-TCYC1,后采用引物GAL80-F、GAL80-R将其扩增。以酿酒酵母S288C基因组为模版,采用引物GAL80-U-F、GAL80-U-R扩增得到GAL80上游1000bp基因片段,采用引物GAL80-D-F、GAL80-D-R扩增得到基因GAL80下游1000bp基因片段。
(b)参照实施例1中步骤(b)和(c)类似的方法,采用引物GAL80-oligo2-F和GAL80-oligo1-R梯度退火,参照例实施1中步骤(d)类似的方法,构建获得质粒pML104-GAL80CRISPR-Cas9的质粒。
(c)制备酿酒酵母MKL1感受态,并将扩增好的GAL80上、下游1000bp基因片段,基因片段PGAL1-tHMG1-TADH1-PGAL10-IDI-TCYC1,pML104-GAL80质粒共同转入MKL1感受态中,待SDUra筛选固体平板上长出单菌落后采用两对引物分别是YZ-GAL80U-IDI-F、YZ-IDI-GAL80-R与YZ-tHMG1-GAL80D-F、YZ-GAL80D-tHMG1-R进行菌落PCR验证。
(d)将步骤(c)中菌落PCR验证正确的单菌落接入YPD液体培养基内培养16h,之后划线于含有5-FOA的YPD固体平板上,30℃培养3d,之后将长出的单菌落分别转板于YPD固体平板与SD Ura筛选固体平板上对比验证,YPD平板上正常生长但SD Ura筛选平板无法生长的单菌落即为正确的基因工程菌,并命名为MKL2。
引物序列:
GAL80-F:CCAGGATAAATGCAATGGTTTTCAATAATAggccgcaaattaaagccttc
GAL80-R:cttggaatAAAAGATGATCCGGTACTGgagcgacctcatgctatacct
GAL80-U-F:TCTCTGTTTAAATGGCGCAAGTTT
GAL80-U-R:tttaatttgcggccTATTATTGAAAACCATTGCATTTATCCTGGAA
GAL80-D-F:ggtatagcatgaggtcgctcCAGTACCGGATCATCTTTTATTCCAAG
GAL80-D-R:CGGTGATAACAGCAAAACATGC
GAL80-oligo2-F:CTAGCTCTAAAACAATCGGTTACCACGCTCATC
GAL80-oligo1-R:gatcGATGAGCGTGGTAACCGATTGTTTTAGAGCTAG
YZ-GAL80U-IDI-F:AAGGCTGCTGCTGAACGT
YZ-IDI-GAL80-R:cttgactgtcaacccaaacgtc
YZ-tHMG1-GAL80D-F:cctggtaccaacgcacgt
YZ-GAL80D-tHMG1-R:TGCATCATACCCCGGGTCTAAAGG。
(e)以酿酒酵母S288C基因组为模版,人工合成基因片段PGAL1-ERG10-TADH1-PGAL10-ERG13-TCYC1,后采用引物ERG10-13-F、ERG10-13-R将其扩增,人工合成基因PGAL7-ERG12-TTDH3,后采用引物ERG12-F、ERG12-R将其扩增。以酿酒酵母S288C基因组为模版,采用引物416d-U-F、416d-U-R扩增得到416d上游500bp基因片段,采用引物416d-D-F、416d-D-R扩增得到整合位点416d下游500bp基因片段。采用引物loxP-HIS-F、loxP-HIS-R扩增loxP-HIS标签片段。
(f)制备酿酒酵母MKL2感受态,并将扩增好的基因片段PGAL1-ERG10-TADH1-PGAL10-ERG13-TCYC1,PGAL7-ERG12-TTDH3,416d上、下游500bp基因片段,loxP-HIS标签片段共同转入MKL2感受态中,待SD His筛选固体平板上长出单菌落后采用引物YZ-10-13-F,YZ-12-R进行菌落PCR验证,验证成功的菌送测序。测序无误的单菌落即为正确的基因工程菌,对并命名为MKL3。引物序列:
ERG10-13-F:GCaagtcgaccttggcactggccgtcgttttagttttcccagtcacgacgttgtaaaa
ERG10-13-R:CCGCTGTATAGCTCATATCTTTCCCTTgagcgacctcatgctatacctga
ERG12-F:tctcaggtatagcatgaggtcgctcAAGGGAAAGATATGAGCTATACAGCG
ERG12-R:
CCACATGTTAAAATAGTGAAGGAGCATCCTTTTGGAAAGCTATACTTCGGAG
416d-U-F:GGCCTTTTGAAAAGCAAGCATAA
416d-U-R:gtaatcatggtcatagctgtttcctgATGAGGCAACGCTAATTATCAACATA
416d-D-F:
TCCGAAGTATAGCTTTCCAAAAGGATGCTCCTTCACTATTTTAACATGTGGAA
416d-D-R:ATATCCACATCAATGGCTAATGGCAA
YZ-10-13-F:cgacttctaatctaccaattttgttgg
YZ-12-R:aattccaaggtctacaaaagatcttgt。
(g)以酿酒酵母S288C基因组为模版,人工合成基因片段PGAL1-ERG8-TADH1-PGAL10-ERG19-TCYC1,后采用引物ERG8-19-F、ERG8-19-R将其扩增,人工合成基因PGAL7-tHMG1-TTDH3,后采用引物tHMG1-F、tHMG1-R将其扩增。以酿酒酵母S288C基因组为模版,采用引物1309a-U-F、1309a-U-R扩增得到1309a上游500bp基因片段,采用引物1309a-D-F、1309a-D-R扩增得到整合位点1309a下游500bp基因片段。采用引物loxP-Trp-F、loxP-Trp-R扩增loxP-Trp标签片段。
(h)制备酿酒酵母MKL3感受态,并将扩增好的基因片段PGAL1-ERG8-TADH1-PGAL10-ERG19-TCYC1,PGAL7-tHMG1-TTDH3,1309a上、下游500bp基因片段,loxP-Trp标签片段共同转入MKL3感受态中,待SD His Trp筛选固体平板上长出单菌落后采用引物YZ-10-13-F,YZ-12-R进行菌落PCR验证,验证成功的菌送测序。测序无误的单菌落即为正确的基因工程菌,并命名为MKL4。
引物序列:
ERG8-19-F:gatgcggtattttctccttacgcatggccgcaaattaaagccttc
ERG8-19-R:ATTCCGCTGTATAGCTCATATCTTTCCCTTgagcgacctcatgctatacct
tHMG1-F:ctcaggtatagcatgaggtcgctcAAGGGAAAGATATGAGCTATACAGCG
tHMG1-R:
GGGGCTTTACGATGGAGTAGTAGACCTTCCTTTTGGAAAGCTATACTTCGGA
1309a-U-F:CAGAAAAACAGATGTGCCCAAATC
1309a-U-R:ttgttatccgctcacaattccacaGATCCTAAACTGCGTCATAGTAAGTTTC
1309a-D-F:
CTCCGAAGTATAGCTTTCCAAAAGGAAGGTCTACTACTCCATCGTAAAGC
1309a-D-R:TGAGGAATTTACAATAAGGTGGTTCCT
YZ-10-13-F:
AAGAAACTTACTATGACGCAGTTTAGGATCtgtggaattgtgagcggataacaa
YZ-12-R:gggacgctcgaaggctttaatttgcggccatgcgtaaggagaaaataccgca。
(i)将法尼基焦磷酸合酶基因ERG20的启动子替换为PHXT1,以酿酒酵母S288C基因组为模版,采用引物ERG20-U-F、ERG20-U-R扩增ERG20基因上游序列,采用引物ERG20-D-F、ERG20-D-R扩增ERG20基因下游序列,采用引物PHXT1-U、PHXT1-D扩增启动子PHXT1,采用引物Leu-ERG20-F、Leu-PHXT1-R,扩增Leu标签。
(j)制备酿酒酵母MKL4感受态,并将扩增好的启动子PHXT1基因片段,ERG20基因上、下游基因片段,loxP-Leu标签片段共同转入MKL4感受态中,待SD His Trp Leu筛选固体平板上长出单菌落后采用引物YZ-PHXT1-F,YZ-ERG20D-R进行菌落PCR验证,验证成功的菌送测序。测序无误的单菌落即为正确的基因工程菌,对上述测序成功的菌进行消标签并命名为MKL5。引物序列:
ERG20-U-F:GACAATCATTACCACAAGATGAACAC
ERG20-U-R:
GTAatcatggtcatagctgtttcctgACCGCTTAGAATACCTCACACTGTATA
ERG20-D-F:
ATCGTCAACTAGTTGATATACGTAAAATCATGGCTTCAGAAAAAGAAATTAGGAGA
ERG20-D-R:GTCGACTTTGTCTTCAGGTGC
PHXT1-U:gaccttggcactggccgtcgttttaTGCAGGTCTCATCTGGAATATAATTCC
PHXT1-D:
CTAATTTCTTTTTCTGAAGCCATGATTTTACGTATATCAACTAGTTGACGATTATG
Leu-ERG20-F:
ATACAGTGTGAGGTATTCTAAGCGGTcaggaaacagctatgaccatgattac
Leu-PHXT1-R:GGAATTATATTCCAGATGAGACCTGCAtaaaacgacggccagtgcca
YZ-PHXT1-F:GCGCACAAGATCCAATACGT
YZ-ERG20D-R:GCAATTTCCCCAACTTCAGGAACC。
实施例3优化D-柠檬烯合成途径关键基因拷贝数
(a)以酿酒酵母S288C基因组为模版,人工合成基因片段PGAL1-ERG20WW-TADH1-PGAL10-tLimS-TCYC1,后采用引物SAP155b-F、SAP155b-R将其扩增,以酿酒酵母S288C基因组为模版,采用引物SAP155b-U-F、SAP155b-U-R扩增得到SAP155b上游500bp基因片段,采用引物SAP155b-D-F、SAP155b-D-R扩增得到整合位点SAP155b下游500bp基因片段。
(b)参照实施例1步骤(b)(c)类似的方法,采用引物SAP155b-oligo2-F和SAP155b-oligo1-R梯度退火,参照实施例1步骤(d)类似的方法,构建获得质粒pML104-SAP155bCRISPR-Cas9的质粒。
(c)制备酿酒酵母MKL5感受态,并将扩增好的SAP155b上、下游500bp基因片段,pML104-SAP155b质粒,并将扩增好的基因片段PGAL1-ERG20WW-TADH1-PGAL10-tLimS-TCYC1共同转入MKL5感受态中,待SD Ura筛选固体平板上长出单菌落后采用两对引物分别是YZ-SAP155b-ERG20WW-F、YZ-tLimS-SAP155b-R与YZ-tLimS-SAP155b-F、YZ-SAP155b-tLimS-R进行菌落PCR验证。验证成功的菌送测序。测序无误的单菌落即为正确的基因工程菌,对上述测序成功的菌进行消标签并命名为MKL6。
引物序列:
SAP155b-F:ACGTTGATAATAAGAACACGGAAAATGGggccgcaaattaaagccttcga
SAP155b-R:ATGTTACTATTACTGTTCTTGTCCTCCGgagcgacctcatgctatacctg
SAP155b-U-F:CTACAGACTTCATATTAAGGGGCTAC
SAP155b-U-R:
cgctcgaaggctttaatttgcggccCCATTTTCCGTGTTCTTATTATCAACG
SAP155b-D-F:
ctcaggtatagcatgaggtcgctcCGGAGGACAAGAACAGTAATAGTAAC
SAP155b-D-R:TAGAGCCTGATGGAAGTGAAACACTA
SAP155b-oligo2-F:CTAGCTCTAAAACGCGGCCCCAGTATGAAAACC
SAP155b-oligo1-R:gatcGGTTTTCATACTGGGGCCGCGTTTTAGAGCTAG
YZ-SAP155b-ERG20WW-F:CATCATTCCGCAGCTGCCTG
YZ-tLimS-SAP155b-R:gggtacatctgttgaagaagtttcaag
YZ-tLimS-SAP155b-F:acttagactgcttcggtacccc
YZ-SAP155b-tLimS-R:GGCCAAAAGAAAATGGAATTGCCTAACG。
实施例4重构酿酒酵母工程菌MKL7
(a)以酿酒酵母S288C基因组为模版,采用引物MLS1-U-F、MLS1-U-R扩增得到基因MLS1上游500bp基因片段,采用引物MLS1-D-F、MLS1-D-R扩增得到基因MLS1下游500bp基因片段。
(b)参照实施例1中步骤(b)和(c)类似的方法,采用引物MLS1-oligo2-F和MLS1-oligo1-R梯度退火,参照例实施1中步骤(d)类似的方法,即可以得到pML104-MLS1 CRISPR-Cas9的质粒。
(c)制备酿酒酵母MKL6感受态,并将扩增好的MLS1上、下游500bp基因片段,pML104-MLS1质粒共同转入MKL6感受态中,待SD Ura筛选固体平板上长出单菌落后采用引物MLS1-U-F,MLS1-D-R进行菌落PCR验证。
(d)将步骤(e)中菌落PCR验证正确的单菌落接入YPD液体培养基内培养16h,之后划线于含有5-FOA的YPD固体平板上,30℃培养3d,之后将长出的单菌落分别转板于YPD固体平板与SD Ura筛选固体平板上对比验证,YPD平板上正常生长但SD Ura筛选平板无法生长的单菌落即为正确的基因工程菌,并命名为MKL7。
引物序列:
MLS1-U-F:ccattgggccgatgaagttag
MLS1-U-R:cttagacagtctttccacttgttctttttcttaattcttttatgtgcttttactactttgttt
MLS1-D-F:aaagcacataaaagaattaagaaaaagaacaagtggaaagactgtctaag
MLS1-D-R:gatgccttcgccgtcga
MLS1-oligo2-F:CTAGCTCTAAAACacttggaacaacatggttta
MLS1-oligo1-R:gatctaaaccatgttgttccaagtGTTTTAGAGCTAG。
实施例5重构酿酒酵母工程菌MKL8
(a)以酿酒酵母S288C基因组为模版,采用引物GDH2-U-F、GDH2-U-R扩增得到基因GDH2上游1000bp基因片段,采用引物GDH2-D-F、GDH2-D-R扩增得到基因GDH2下游1000bp基因片段。
(b)参照例1(b)(c)步骤类似的方法,采用引物GDH2-oligo2-F和GDH2-oligo1-R梯度退火,参照实施例1步骤(d)类似的方法,构建获得质粒pML104-GDH2 CRISPR-Cas9的质粒。
(c)制备酿酒酵母MKL7感受态,并将扩增好的GDH2上、下游1000bp基因片段,pML104-GDH2质粒共同转入MKL7感受态中,待SD Ura筛选固体平板上长出单菌落后采用引物YZ-GDH2U-F,YZ-GDH2D-R进行菌落PCR验证。
(d)将步骤(c)中菌落PCR验证正确的单菌落接入YPD液体培养基内培养16h,之后划线于含有5-FOA的YPD固体平板上,30℃培养3d,之后将长出的单菌落分别转板于YPD固体平板与SD Ura筛选固体平板上对比验证,YPD平板上正常生长但SD Ura筛选平板无法生长的单菌落即为正确的基因工程菌,并命名为MKL8。
引物序列:
GDH2-U-F:gagaagcaactagatcgtcgttc
GDH2-U-R:gaaaaagtggagccttttaagaatgggcccagatgaaggaactgc
GDH2-D-F:aaccagcagttccttcatctgggcccattcttaaaaggctccactttttccag
GDH2-D-R:gccgtcggaaacgatactttgg
GDH2-oligo2-F:CTAGCTCTAAAACggaacagactatacgaatac
GDH2-oligo1-R:gatcgtattcgtatagtctgttccGTTTTAGAGCTAG
YZ-GDH2U-F:ggtgtttctgaaggttgtgccg
YZ-GDH2D-R:ccagagacgtcaattctcgccc。
实施例6重构酿酒酵母工程菌的发酵培养
挑取固体YPD平板上的酿酒酵母工程菌单菌落,接种到在2ml YPD液体培养基中,30℃,220rpm培养16-20h后,按接种初始OD为0.2的原则接入含有40mL大豆蛋白胨液体培养基的250mL圆底带挡板摇瓶内,10%正12烷直接覆盖于发酵液上方进行双相发酵,30℃,220rpm培养96h。发酵结束后,发酵结束后离心取有机相用于气相质谱联用检测。
过表达MVA途径关键基因,增加ERG10,ERG13,tHMG1,ERG12,ERG8,ERG9及IDI的基因拷贝数,将柠檬烯产量提升至46.96mg/L。采用PHXT1动态调控ERG20,比较不同培养基下菌的生产能力,优化发酵培养基为大豆蛋白胨培养基,柠檬烯产量达到213.08mg/L。增加关键基因ERG20WW与tLimS拷贝数,柠檬烯产量提升至459.59mg/L。敲除MLS1基因的菌株产量明显提高至521.4mg/L,在单独敲除MLS1基因基础上敲除GDH2基因产量提升至656.8mg/L。
显然,上述实施例仅仅是为清楚地说明所作的举例,并非对实施方式的限定。对于所属领域的普通技术人员来说,在上述说明的基础上还可以做出其它不同形式变化或变动。这里无需也无法对所有的实施方式予以穷举。而由此所引申出的显而易见的变化或变动仍处于本发明创造的保护范围之中。
SEQUENCE LISTING
<110> 江南大学
<120> 一种生产D-柠檬烯的酵母及其应用
<130> 3.7
<160> 16
<170> PatentIn version 3.3
<210> 1
<211> 1632
<212> DNA
<213> (人工合成)
<400> 1
agcaaatggt tcgaacaatg ttctagtcat ttgttgatgg atgattggat gttgagtacc 60
atgaccgtca ccattatgat acattaattg tgccattcta cccaaatcaa cagcacaacc 120
gatgaaatct ttaccgaatg gtgaatcctt agaaactctt tctgcgttca ttttcttcca 180
aacttcagca atcaaccatt taacatgttt tcttgcttca gcttctgatg cattgtaatc 240
agacatgtaa cattgcaaag actttggaac gtcacctctt gaaacttctt caacagatgt 300
acccaaatca tcagccaatc tcaaaacgaa tgaagaccat ctaaccaaat catggtactt 360
gtacaatgaa tcaactgttt ccttagtaaa agaatctgta actctaaaga aaatatgagt 420
taacatacat ggacctgaga tagattgcca tgagttttct aagtattctt ccaaagatgg 480
cttatgacca ccgtagaacc atcttgcttc aaccatgtac ttatcagcca aatcaaccca 540
agattgtctc aagtatggga taacgttaac acccttttcc ttcataacat cgtatgaagt 600
atcatcaacg aagttgttca aagccaagaa acacaattgc atgtaatctg gcaattgatc 660
gatagagttg atatcccatc ttctgatcaa atcagtgaat tgttccaatt cttccaaagt 720
accgtaaaca tcatagatat catcaataac tgtgatcaat gcgttaactt tacccatcat 780
gattcttgca gaagcatgtt gtcttggttc aataatacca gtgttccaga agtaacattc 840
aaccaatcta tctctagcaa atggcaactt ttcaacgaaa cctgtgtttc tccaccatct 900
aaaagattcc ttcaattctt cttggaattg tgcttgaacg atgttcaaat ccaagatagc 960
caattccaaa acaactggat tcatatctgg tctttttctg taccattcaa tccaaactgg 1020
tgcatttggt cttttaattc tccaatgcaa tgggatatcc aaagagtaag cgattctagt 1080
caacaagtca ccatcaacac caccttcgtt aaccttttct tccaagaact tagttgcgaa 1140
ttctctagca gattccaatg tagtttcacc ttctgtcaac aaaaatgaag cttcgtacaa 1200
ttgcaacaaa cctctagtat catctgacaa agattctttg aattcaccct cttcgttttt 1260
aaaagaatcg aaaacttctt gtgcaacttg gaaaccatgt tctctcaaca atctaaaagc 1320
caatgatgta gagtacaaat ctctttcttc ctttgggaat gggttcttgt agtaatgatg 1380
atccaaatat attgaagaca agatttcttt gaattcgttt tggaaatgat cagacaaacc 1440
cattctttgc aaatcatcga tcaattccaa ttgtctgatt tgatctgttt ctttttccaa 1500
ttccatctta accaaagtaa ccaattctga tgctctgata acatgcttat cttctttata 1560
atctgacaac aaagattgga tgaagttaac atcccatctt gatgggttgt agttaccaga 1620
tcttctttcc at 1632
<210> 2
<211> 1059
<212> DNA
<213> (人工合成)
<400> 2
atggcttcag aaaaagaaat taggagagag agattcttga acgttttccc taaattagta 60
gaggaattga acgcatcgct tttggcttac ggtatgccta aggaagcatg tgactggtat 120
gcccactcat tgaactacaa cactccaggc ggtaagctaa atagaggttt gtccgttgtg 180
gacacgtatg ctattctctc caacaagacc gttgaacaat tggggcaaga agaatacgaa 240
aaggttgcca ttctaggttg gtgcattgag ttgttgcagg cttacttctt ggtcgccgat 300
gatatgatgg acaagtccat taccagaaga ggccaaccat gttggtacaa ggttcctgaa 360
gttggggaaa ttgccatcaa tgacgcattc atgttagagg ctgctatcta caagcttttg 420
aaatctcact tcagaaacga aaaatactac atagatatca ccgaattgtt ccatgaggtc 480
accttccaaa ccgaattggg ccaattgatg gacttaatca ctgcacctga agacaaagtc 540
gacttgagta agttctccct aaagaagcac tccttcatag ttactttcaa gactgcttac 600
tattctttct acttgcctgt cgcattggcc atgtacgttg ccggtatcac ggatgaaaag 660
gatttgaaac aagccagaga tgtcttgatt ccattgggtg aatacttcca aattcaagat 720
gactacttag actgcttcgg taccccagaa cagatcggta agatcggtac agatatccaa 780
gataacaaat gttcttgggt aatcaacaag gcattggaac ttgcttccgc agaacaaaga 840
aagactttag acgaaaatta cggtaagaag gactcagtcg cagaagccaa atgcaaaaag 900
attttcaatg acttgaaaat tgaacagcta taccacgaat atgaagagtc tattgccaag 960
gatttgaagg ccaaaatttc tcaggtcgat gagtctcgtg gcttcaaagc tgatgtctta 1020
actgcgttct tgaacaaagt ttacaagaga agcaaatag 1059
<210> 3
<211> 1123
<212> DNA
<213> (人工合成)
<400> 3
tgcaggtctc atctggaata taattccccc ctcctgaagc aaatttttcc tttgagccgg 60
aatttttgat attccgagtt ctttttttcc attcgcggag gttattccat tcctaaacga 120
gtggccacaa tgaaacttca attcatatcg accgactatt tttctccgaa ccaaaaaaat 180
agcagggcga gattggagct gcggaaaaaa gaggaaaaaa ttttttcgta gttttcttgt 240
gcaaattagg gtgtaaggtt tctagggctt attggttcaa gcagaagaga caacaattgt 300
aggtcctaaa ttcaaggcgg atgtaaggag tattggtttc gaaagttttt ccgaagcggc 360
atggcaggga ctacttgcgc atgcgctcgg attatcttca tttttgcttg caaaaacgta 420
gaatcatggt aaattacatg aagaattctc tttttttttt tttttttttt ttttttacct 480
ctaaagagtg ttgaccaact gaaaaaaccc ttcttcaaga gagttaaact aagactaacc 540
atcataactt ccaaggaatt aatcgatatc ttgcactcct gatttttctt caaagagaca 600
gcgcaaagga ttatgacact gttgcattga gtcaaaagtt tttccgaagt gacccagtgc 660
tctttttttt tttccgtgaa ggactgacaa atatgcgcac aagatccaat acgtaatgga 720
aattcggaaa aactaggaag aaatgctgca gggcattgcc gtgccgatct tttgtctttc 780
agatatatga gaaaaagaat attcatcaag tgctgataga agaataccac tcatatgacg 840
tgggcagaag acagcaaacg taaacatgag ctgctgcgac atttgatggc ttttatccga 900
caagccagga aactccacca ttatctaatg tagcaaaata tttcttaaca cccgaagttg 960
cgtgtccccc tcacgttttt aatcatttga attagtatat tgaaattata tataaaggca 1020
acaatgtccc cataatcaat tccatctggg gtctcatgtt ctttccccac cttaaaatct 1080
ataaagatat cataatcgtc aactagttga tatacgtaaa atc 1123
<210> 4
<211> 867
<212> DNA
<213> (人工合成)
<400> 4
ttatagcatt ctatgaattt gcctgtcatt ttccacttca gaaaggtcat ctaattgctc 60
ccaccagttg aataagtaat tctcgcaaat aatcttaaac caaggcgtaa acttgtaact 120
tgggtcagca aacatagttt tcaaatcatt tggtgaaacc catttgaagt ctctaacttc 180
attgacgttt gggttgacag tcaagttttc tttagcgttg atcttataaa ataggatgta 240
atcaatttca tgttcacccc atggttcatt gcttggtgcc atgtaatgga ttctgtttaa 300
aaagtgaaac ttaccccttg tcttagtttc atcttctgga atacctaatt catgatctag 360
ttttctcacc gccgcagtaa tagcgccctt aatcttatcg tctagcttac ccttcaaacc 420
taattcgtca tcaatacata gtggatgaga gcagcatgtg ttagtccaaa gatcagggaa 480
agttattttt tcagtggctc tttgttgtaa aagtaattca ccttgttcat tgaaaataaa 540
gacggagaat gcacgatgta gtaaaccctt ttcaatattt tccattaaat gacaaacttt 600
cttggtaccg gcaccaatag cattatcgtc ccaatccaaa acaatacaat tttcattcat 660
taacttaatt tgctcctcat catgaccaga aaaacatgtt tctccgcttt cgtcatttga 720
cgtctcacta gatcgggtat taggtctttg ttgtaatgga ataatttcag gaaactcttc 780
caaaatgtct tcaggtgttt ggttttgcac taatttggcg taactagata ctgcaccatg 840
gggcatacta ttgttgtcgg cagtcat 867
<210> 5
<211> 1578
<212> DNA
<213> (人工合成)
<400> 5
atggaccaat tggtgaaaac tgaagtcacc aagaagtctt ttactgctcc tgtacaaaag 60
gcttctacac cagttttaac caataaaaca gtcatttctg gatcgaaagt caaaagttta 120
tcatctgcgc aatcgagctc atcaggacct tcatcatcta gtgaggaaga tgattcccgc 180
gatattgaaa gcttggataa gaaaatacgt cctttagaag aattagaagc attattaagt 240
agtggaaata caaaacaatt gaagaacaaa gaggtcgctg ccttggttat tcacggtaag 300
ttacctttgt acgctttgga gaaaaaatta ggtgatacta cgagagcggt tgcggtacgt 360
aggaaggctc tttcaatttt ggcagaagct cctgtattag catctgatcg tttaccatat 420
aaaaattatg actacgaccg cgtatttggc gcttgttgtg aaaatgttat aggttacatg 480
cctttgcccg ttggtgttat aggccccttg gttatcgatg gtacatctta tcatatacca 540
atggcaacta cagagggttg tttggtagct tctgccatgc gtggctgtaa ggcaatcaat 600
gctggcggtg gtgcaacaac tgttttaact aaggatggta tgacaagagg cccagtagtc 660
cgtttcccaa ctttgaaaag atctggtgcc tgtaagatat ggttagactc agaagaggga 720
caaaacgcaa ttaaaaaagc ttttaactct acatcaagat ttgcacgtct gcaacatatt 780
caaacttgtc tagcaggaga tttactcttc atgagattta gaacaactac tggtgacgca 840
atgggtatga atatgatttc taaaggtgtc gaatactcat taaagcaaat ggtagaagag 900
tatggctggg aagatatgga ggttgtctcc gtttctggta actactgtac cgacaaaaaa 960
ccagctgcca tcaactggat cgaaggtcgt ggtaagagtg tcgtcgcaga agctactatt 1020
cctggtgatg ttgtcagaaa agtgttaaaa agtgatgttt ccgcattggt tgagttgaac 1080
attgctaaga atttggttgg atctgcaatg gctgggtctg ttggtggatt taacgcacat 1140
gcagctaatt tagtgacagc tgttttcttg gcattaggac aagatcctgc acaaaatgtt 1200
gaaagttcca actgtataac attgatgaaa gaagtggacg gtgatttgag aatttccgta 1260
tccatgccat ccatcgaagt aggtaccatc ggtggtggta ctgttctaga accacaaggt 1320
gccatgttgg acttattagg tgtaagaggc ccgcatgcta ccgctcctgg taccaacgca 1380
cgtcaattag caagaatagt tgcctgtgcc gtcttggcag gtgaattatc cttatgtgct 1440
gccctagcag ccggccattt ggttcaaagt catatgaccc acaacaggaa acctgctgaa 1500
ccaacaaaac ctaacaattt ggacgccact gatataaatc gtttgaaaga tgggtccgtc 1560
acctgcatta aatcctaa 1578
<210> 6
<211> 1197
<212> DNA
<213> (人工合成)
<400> 6
atgtctcaga acgtttacat tgtatcgact gccagaaccc caattggttc attccagggt 60
tctctatcct ccaagacagc agtggaattg ggtgctgttg ctttaaaagg cgccttggct 120
aaggttccag aattggatgc atccaaggat tttgacgaaa ttatttttgg taacgttctt 180
tctgccaatt tgggccaagc tccggccaga caagttgctt tggctgccgg tttgagtaat 240
catatcgttg caagcacagt taacaaggtc tgtgcatccg ctatgaaggc aatcattttg 300
ggtgctcaat ccatcaaatg tggtaatgct gatgttgtcg tagctggtgg ttgtgaatct 360
atgactaacg caccatacta catgccagca gcccgtgcgg gtgccaaatt tggccaaact 420
gttcttgttg atggtgtcga aagagatggg ttgaacgatg cgtacgatgg tctagccatg 480
ggtgtacacg cagaaaagtg tgcccgtgat tgggatatta ctagagaaca acaagacaat 540
tttgccatcg aatcctacca aaaatctcaa aaatctcaaa aggaaggtaa attcgacaat 600
gaaattgtac ctgttaccat taagggattt agaggtaagc ctgatactca agtcacgaag 660
gacgaggaac ctgctagatt acacgttgaa aaattgagat ctgcaaggac tgttttccaa 720
aaagaaaacg gtactgttac tgccgctaac gcttctccaa tcaacgatgg tgctgcagcc 780
gtcatcttgg tttccgaaaa agttttgaag gaaaagaatt tgaagccttt ggctattatc 840
aaaggttggg gtgaggccgc tcatcaacca gctgatttta catgggctcc atctcttgca 900
gttccaaagg ctttgaaaca tgctggcatc gaagacatca attctgttga ttactttgaa 960
ttcaatgaag ccttttcggt tgtcggtttg gtgaacacta agattttgaa gctagaccca 1020
tctaaggtta atgtatatgg tggtgctgtt gctctaggtc acccattggg ttgttctggt 1080
gctagagtgg ttgttacact gctatccatc ttacagcaag aaggaggtaa gatcggtgtt 1140
gccgccattt gtaatggtgg tggtggtgct tcctctattg tcattgaaaa gatatga 1197
<210> 7
<211> 1476
<212> DNA
<213> (人工合成)
<400> 7
ttatttttta acatcgtaag atcttctaaa tttgtcatcg atgttggtca agtagtaaac 60
accactttgc aaatgctcaa tggaaccttg aggtttgaag ttcttcttca aatgggcatt 120
ttctctcaat tcgatggcag cttcgtaatc ctttggagtt tcggtgattc tcttggctaa 180
tttgttagta atatctaatt ccttgataat atgttggacg tcaccaacaa ttttgcaaga 240
atatagagat gcagctaaac cggaaccgta agaaaataaa ccaacacgct tgccttgtaa 300
gtcgtcagat ccaacatagt ttaatagaga tgcaaaggcg gcataaacag atgcggtgta 360
catgttacct gtgtttgttg gaacaatcaa agattgggca actctctctt tgtggaatgg 420
cttagcaaca ttaacaaaag ttttttcaat gttcttatcg gttaaagatt cgtcataatc 480
gcgagtagct aattcggcgt caacttctgg gaacaattga ggattggctc tgaaatcgtt 540
atatagtaat ctaccgtatg attttgtgac caatttacag gttggaacat ggaaaacgtt 600
gtagtcgaaa tatttcaaaa cgttcaaagc atccgaacca gcgggatcgc taaccaaccc 660
tttagaaata gccttcttgg aataactctt gtaaacttga tcaagagcct tgacgtaaca 720
agttaatgaa aaatgaccat cgacgtaagg atattcgctg gtgaaatctg gcttgtaaaa 780
atcgtaggcg tgttccatgt aagaagctct tacagagtca aatacaattg gagcatcagg 840
accgatccac atagcaacag taccggcacc accggttggt cttgcggcac ccttatcgta 900
gatggcaata tcaccgcaaa ctacaatggc gtctctacca tcccatgcgt tagattcaat 960
ccagttcaaa gagttgaaca acgcgttggt accaccgtaa caggcattaa gcgtgtcaat 1020
accttcgacg tcagtgtttt caccaaacaa ttgcatcaag acagacttga cagacttgga 1080
cttgtcaatc agagtttcag taccgacttc taatctacca attttgttgg tgtcgatgtt 1140
gtaactcttg atcaacttag acaaaacagt tagggacatc gagtagatat cttctctgtc 1200
attgacaaaa gacatgttgg tttggcccag accaattgtg tatttacctt gagaaacgcc 1260
atcaaatttc tctagctcag attggttgac acattgagtt gggatgtaaa tttggatacc 1320
tttaataccg acattttgag gtctggtttt ttgttcagcg gtcttttgtt tttttagttc 1380
agtcatttgc aagtttgtat tgtgtaattg ttgttgcttt tgcggcctaa gtcttccttt 1440
aataccacac caacaaagtt tagttgagag tttcat 1476
<210> 8
<211> 1332
<212> DNA
<213> (人工合成)
<400> 8
ttatgaagtc catggtaaat tcgtgtttcc tggcaataat agatcgtcaa tttgttgctt 60
tgtggtagtt ttattttcaa ataattggaa tactagggat ttgattttaa gatctttatt 120
caaatttttt gcgcttaaca aacagcagcc agtcccaccc aagtctgttt caaatgtctc 180
gtaactaaaa tcatcttgca atttcttttt gaagctgtca atttgctctt gagtaatgtc 240
tcttcgtaac aaagtcaaag agcaaccgcc gccaccagca ccggtaagtt ttgtggagcc 300
aattctcaaa tcatcgctca gatttttaat aagttctaat ccaggatgag aaacaccgat 360
tgagacaagc agtccatgat ttattcttat caattccaat agttgttcat acagttcatt 420
attagtttct acagcctcgt catcggtgcc tttacattta cttaacttag tcatgatctc 480
taagccttgt agggcacatt cacccatggc atctagaatt ggcttcataa cttcaggaaa 540
tttctcggtg accaacacac gaacgcgagc aacaagatct tttgtagacc ttggaattct 600
agtataggtt aggatcattg gaatggctgg gaaatcatct aagaacttaa aattgtttgt 660
gtttattgtt ccattatgtg agtctttttc aaatagcagg gcattaccat aagtggccac 720
agcgttatct attcctgaag gggtaccgtg aatacacttt tcacctatga aggcccattg 780
attcactata tgcttatcgt tttctgacag cttttccaag tcattagatc ctattaaccc 840
ccccaagtag gccatagcta aggccagtga tacagaaata gaggcgcttg agcccaaccc 900
agcaccgatg ggtaaagtag actttaaaga aaacttaata ttcttggcat gggggcatag 960
gcaaacaaac atatacagga aacaaaacgc tgcatggtag tggaaggatt cggatagttg 1020
agctaacaac ggatccaaaa gactaacgag ttcctgagac aagccatcgg tggcttgttg 1080
agccttggcc aatttttggg agtttacttg atcctcggtg atggcattga aatcattgat 1140
ggaccactta tgattaaagc taatgtccgg gaagtccaat tcaatagtat ctggtgcaga 1200
tgactcgctt attagcaggt aggttctcaa cgcagacaca ctagcagcga cggcaggctt 1260
gttgtacaca gcagagtgtt caccaaaaat aataaccttt cccggtgcag aagttaagaa 1320
cggtaatgac at 1332
<210> 9
<211> 1356
<212> DNA
<213> (人工合成)
<400> 9
ttatttatca agataagttt ccggatcttt ttctttccta acaccccagt cagcctgagt 60
tacatccagc cattgaacct tagaaaatct tttgtcatta gcggtttgag ccctaagatc 120
aacatcttgc ttagtaatca ctgcaatggc gtcataacca ccagcaccag gtattaagca 180
agtaagaact ccttttaagg tctggcaatc atccaataag ctagtttgta cgggaggttc 240
gatatcggca ccagattctt tagttatttt tctaaaggaa cgtctaattg tggcaactgc 300
atctctaact tctgtgattt caggatactt ttgacaggta cagtcattcc tctcaagaga 360
ctcaaatatc tgatcgctgt aatcgtcatg agtctcgtgt aagcgatcta gtttagatag 420
tccatccata aatctagaat ttgcatgatc gagttctgta tatattttca agctttctgg 480
catatgcgaa tcataccaat tttttacctt ctggaccagt tttactgttt ctgaaccatt 540
cttaatatcg cccatccata aagttaatcc cgaaggtaaa tggttacttt taatcgtaat 600
attccagtct tcttcatcaa ccaaatgcgc cagtttactg ccgtaagtag cacttccaat 660
atctggcaaa ttagagatta atgcgggtgg gaatcttcta tatctgatag atccatatgc 720
tgccgccgct acatcaaacc cgcttccaat tttaccctga gcttgacaat gagcaacttg 780
tgctaaatta tgaataactt ctctatattt gtctacatta ttttccaggt ccgatacaaa 840
aaaggaggcc aaagctgtag ttaaaactgt gactaaacct gccgaggagc ccagccctgt 900
tttgggaact tcttcaattc tgtgcgaatg aaaactcaat cttctgttgc cacgatgttc 960
ggtaacgcta tcctcctgag aatggtaggc atcatcagag aaaatatcaa taacgaacaa 1020
gtttctattg cagtagtcgt ccatgttagg tttaaagtag ctaaatacgt tagcgataac 1080
tttttcaatg aaagggttct tagatccgcc tatcgaaaca ggaatgaagc cacttttagg 1140
acttatatgg tacagccact ccccatcttt aaattgttta cttttcacac gcacttcaaa 1200
cttatcagac ccttgcaatg aaccgtaagg atgggctaca gcatgcattc ttgccgataa 1260
tccgactaca aatgcttcat attttgtatc taaaactaaa tatccaccag ctagtaacgc 1320
tttccctggg gcactgaagg ctctcaactc tgacat 1356
<210> 10
<211> 1191
<212> DNA
<213> (人工合成)
<400> 10
atgaccgttt acacagcatc cgttaccgca cccgtcaaca tcgcaaccct taagtattgg 60
gggaaaaggg acacgaagtt gaatctgccc accaattcgt ccatatcagt gactttatcg 120
caagatgacc tcagaacgtt gacctctgcg gctactgcac ctgagtttga acgcgacact 180
ttgtggttaa atggagaacc acacagcatc gacaatgaaa gaactcaaaa ttgtctgcgc 240
gacctacgcc aattaagaaa ggaaatggaa tcgaaggacg cctcattgcc cacattatct 300
caatggaaac tccacattgt ctccgaaaat aactttccta cagcagctgg tttagcttcc 360
tccgctgctg gctttgctgc attggtctct gcaattgcta agttatacca attaccacag 420
tcaacttcag aaatatctag aatagcaaga aaggggtctg gttcagcttg tagatcgttg 480
tttggcggat acgtggcctg ggaaatggga aaagctgaag atggtcatga ttccatggca 540
gtacaaatcg cagacagctc tgactggcct cagatgaaag cttgtgtcct agttgtcagc 600
gatattaaaa aggatgtgag ttccactcag ggtatgcaat tgaccgtggc aacctccgaa 660
ctatttaaag aaagaattga acatgtcgta ccaaagagat ttgaagtcat gcgtaaagcc 720
attgttgaaa aagatttcgc cacctttgca aaggaaacaa tgatggattc caactctttc 780
catgccacat gtttggactc tttccctcca atattctaca tgaatgacac ttccaagcgt 840
atcatcagtt ggtgccacac cattaatcag ttttacggag aaacaatcgt tgcatacacg 900
tttgatgcag gtccaaatgc tgtgttgtac tacttagctg aaaatgagtc gaaactcttt 960
gcatttatct ataaattgtt tggctctgtt cctggatggg acaagaaatt tactactgag 1020
cagcttgagg ctttcaacca tcaatttgaa tcatctaact ttactgcacg tgaattggat 1080
cttgagttgc aaaaggatgt tgccagagtg attttaactc aagtcggttc aggcccacaa 1140
gaaacaaacg aatctttgat tgacgcaaag actggtctac caaaggaata a 1191
<210> 11
<211> 668
<212> DNA
<213> (人工合成)
<400> 11
ttatattgaa ttttcaaaaa ttcttacttt ttttttggat ggacgcaaag aagtttaata 60
atcatattac atggcattac caccatatac atatccatat ctaatcttac ttatatgttg 120
tggaaatgta aagagcccca ttatcttagc ctaaaaaaac cttctctttg gaactttcag 180
taatacgctt aactgctcat tgctatattg aagtacggat tagaagccgc cgagcgggcg 240
acagccctcc gacggaagac tctcctccgt gcgtcctcgt cttcaccggt cgcgttcctg 300
aaacgcagat gtgcctcgcg ccgcactgct ccgaacaata aagattctac aatactagct 360
tttatggtta tgaagaggaa aaattggcag taacctggcc ccacaaacct tcaaattaac 420
gaatcaaatt aacaaccata ggatgataat gcgattagtt ttttagcctt atttctgggg 480
taattaatca gcgaagcgat gatttttgat ctattaacag atatataaat ggaaaagctg 540
cataaccact ttaactaata ctttcaacat tttcagtttg tattacttct tattcaaatg 600
tcataaaagt atcaacaaaa aattgttaat atacctctat actttaacgt caaggagaaa 660
aaactata 668
<210> 12
<211> 300
<212> DNA
<213> (人工合成)
<400> 12
ttttgaggga atattcaact gttttttttt atcatgttga tgctctgcat aataatgccc 60
ataaatattt ccgacctgct tttatatctt tgctagccaa actaactgaa catagctaca 120
cattattttc agcttggcta ttttgtgaac actgtatagc cagtccttcg gatcacggtc 180
aacagttgtc cgagcgcttt ttggaccctt tcccttattt ttgggttaag gaaaatgaca 240
gaaaatatat ctaatgagcc ttcgctcaac agtgctccga agtatagctt tccaaaagga 300
<210> 13
<211> 252
<212> DNA
<213> (人工合成)
<400> 13
ggccgcaaat taaagccttc gagcgtccca aaaccttctc aagcaaggtt ttcagtataa 60
tgttacatgc gtacacgcgt ctgtacagaa aaaaaagaaa aatttgaaat ataaataacg 120
ttcttaatac taacataact ataaaaaaat aaatagggac ctagacttca ggttgtctaa 180
ctccttcctt ttcggttaga gcggatgtgg ggggagggcg tgaatgtaag cgtgacataa 240
ctaattacat ga 252
<210> 14
<211> 166
<212> DNA
<213> (人工合成)
<400> 14
gcgaatttct tatgatttat gatttttatt attaaataag ttataaaaaa aataagtgta 60
tacaaatttt aaagtgactc ttaggtttta aaacgaaaat tcttattctt gagtaactct 120
ttcctgtagg tcaggttgct ttctcaggta tagcatgagg tcgctc 166
<210> 15
<211> 582
<212> DNA
<213> (人工合成)
<400> 15
aagggaaaga tatgagctat acagcggaat ttccatatca ctcagatttt gttatctaat 60
tttttccttc ccacgtccgc gggaatctgt gtatattact gcatctagat atatgttatc 120
ttatcttggc gcgtacattt aattttcaac gtattctata agaaattgcg ggagtttttt 180
tcatgtagat gatactgact gcacgcaaat ataggcatga tttataggca tgatttgatg 240
gctgtaccga taggaacgct aagagtaact tcagaatcgt tatcctggcg gaaaaaattc 300
atttgtaaac tttaaaaaaa aaagccaata tccccaaaat tattaagagc gcctccatta 360
ttaactaaaa tttcactcag catccacaat gtatcaggta tctactacag atattacatg 420
tggcgaaaaa gacaagaaca atgcaatagc gcatcaagaa aaaacacaaa gctttcaatc 480
aatgaatcga aaatgtcatt aaaatagtat ataaattgaa actaagtcat aaagctataa 540
aaagaaaatt tatttaaatg caagatttaa agtaaattca ct 582
<210> 16
<211> 3279
<212> DNA
<213> (人工合成)
<400> 16
tcaagcactt gcctccgctt ctctttttaa cccaccaata aattccaaga attttccaat 60
gttaacatcg ataccgttct ggtaaacaaa agtgcttgat aagtaactcg acagaagaac 120
tttcaaatag ctctctggaa tgttttccaa tacggactga ggcccagcaa catcaatcag 180
aatttttgga attattttat ccaacaatag gtagtttctt aattttagat cattgagcca 240
caactcttga gaagcaacta gatcgtcgtt caatttgttt atagtgaagg acaattggtt 300
tgaaatttct gaaatgtggg ttccatttag ttgattcaaa ttccataact gaccaaactc 360
taattcagca tttttctgaa ttcttgactg cacttctaca acgtacgact tgtacaacgc 420
agacctctca ccactaacat ctccaataaa tttgtgcacg aagtcgttat cgttaagcgc 480
tagtgaggcc aacacttcca ttgatgaaga tgtgacacca cctttgtttg cagaagcatc 540
tttgaacaga atacagccat gttcctccaa agcattttta gcaggttgcg ttataaatag 600
attggcaccc tccacaatat atggaatttt acatttccca gtcttttcgt caacaaaata 660
atgtagatta tttagagtaa ttgagtttgg tctaccaccg catggaacaa aaatgtcgac 720
atgatccaca aatttgaaaa tttgagtatg aaaggtgttt ctgaaggttg tgccgttagc 780
tacaattgta ccatttggta gcatgatatc cattgcatcc acagaaacaa aaaatccgtt 840
gtttgataat ttggaagtgt cgaaatcgga aatcattttc ctttcatgtg ccaagcggca 900
taattcatct ttatctaaac ctttaggatc acacaggaca cctgaaccgt ccagaattgc 960
caaataacat tcgtttggcg aagataaaag aatttcattg gatcccaaat caccatccgg 1020
accaccagtt tggaatttgt aaacagtaga atttgtcaag tttaaagttt cgtaaatttt 1080
attaacataa gcacgaacac ccagagaagt cataccatat tcgtcatggg gaataccacc 1140
caaagatggg gattttccag tcaaaaatga tttccaccat gggcagttcc tcacacgagc 1200
atggttagtt gcccaatcca cgaaaccagc agttccttca tctgggccaa aaaataatat 1260
ttcctccttt ggtaaaaggt tgacatagtt ttcctttaat ggatcgttga ttagaatgtc 1320
aatcattgca tccacatatt gggaaaaggc gacaaatgtc tggtcatgtt ctaccaatcc 1380
tgggttcaat aagatgacac ctttagagcc accctctgga atatccttat ttttacgttg 1440
ctgagtagag gccaattgat agttctcatc aataacgttc ttggaattca aatcataaat 1500
atcctgattc ctggaacaga ctatacgaat accgcccctt gcgatatctc tgaacctgat 1560
atggaaccct ttgaaagtat taccaacgac aaaaaatata ccatagggtg tctctggata 1620
ttcgaatttt gtcatcacca gggaaggatc taatctgaat gatattgcta cttttcttgt 1680
aataaagaaa tttgtcttca aaatagactt gttgaagatg ttcagtgttt tcaggatcaa 1740
caaatcaggt gaatcatttg gaatgaattt attcaagtaa gcttcgaact cttggtcatt 1800
cttaaaaggc tccacttttt ccagtctttg aaaagataat gtcttctcca tatctttagt 1860
actattatga taatagtgaa tttgagcaaa atttttatac aacttggaaa ttatagtgta 1920
atgcttcgac atgatgttga taatagtttg ctgagttaag gtttcatttc ttaactttct 1980
ttttaggttt tctacaatct ccaaaagagt agtatcatta cgcttaatgg tgatttgaga 2040
taaaaggttt tgataatcag agcctaaacg attaacaaaa tggttaatga atatagcacc 2100
aatatgagca tatatagctt ctttgggcga gaattgacgt ctctggtaaa cctcatggaa 2160
agaattgttt gggatagcgt atagcaatga agcttctctt tcaacctgtt tcaatgctgc 2220
ctccacatcg tgaagtagaa catcttccaa ttgctggttc tcgttcaaat aaacggaaaa 2280
gataatgatg tcatcatcct taacattaaa cgactctaaa tagaacttag aaggtttcaa 2340
cttgtaatag tggaacaaag agttcaaagc agagtaataa cgcttagtgg tgaatcgctt 2400
gtaagcgact aataacctaa tttcatcctt attttctacg gagcgagtag tcttaatgac 2460
aggaccttct ctttctttaa ccaacttaag taagagaccg tatagttttt tattttcgtt 2520
cgacgaaact ttgtacatgg tcttatcact aatcgattca atatcacctt tcagcaaatc 2580
ctgagaggaa atatctacgc cggctggatc atcattaggg taaacactct cataaacaaa 2640
agttagcttt aattcgcttt ctggagccca aaaagaaact aatctgcagt ttttttgaga 2700
cttgttatcc aggaaaaggt catcaatttc ggaatctaat tcataaggtg gacaagaatc 2760
atccatttca atcctatttt ttttgatggt atccttacca tgctccaaag tatcgtttcc 2820
gacggcgtca ctagcaaatt taaagttttt ttgctgagaa tcgcttatgc tgacaccagt 2880
attagattcc ataaagatgg catgattatc attagttata attttgtttt taatgctgaa 2940
tagccttggc tgaattccgt tgaatttgga cttcgcaaag aaatctagct ttgaagcata 3000
caaagaatgt atgatattcg agattaattg gggagattct ctcgagaaga acaaatcgtc 3060
aatacccaat gagttataaa accaatctac ttcttgttcg atcaaatcgt cgggaataaa 3120
cccttgctga tctagcaaat ctatcacttc ctctctctgc aggtccttac cgggaaaatc 3180
aaacacgtga tagtccgaca tggatgatat tgataaagaa gcaatatctg gtgtgttcag 3240
tgagtttaaa gcaccgcgat ttttgttatc aaaaagcat 3279

Claims (10)

1.一种重组酵母,其特征在于,以酵母为出发菌,异源表达截短的柠檬烯合成酶基因tLimS,表达了法尼基焦磷酸突变体基因ERG20ww,过表达内源MVA合成途径中关键基因和MVA途径相关基因;
所述截短的柠檬烯合成酶基因tLimS由柠檬烯合成酶基因LimS去除前56个氨基酸序列形成;
所述法尼基焦磷酸合酶突变体基因ERG20ww是对法尼基焦磷酸合酶基因ERG20的96与127位氨基酸进行突变得到;
所述内源MVA合成途径中关键基因为甲羟戊酸焦磷酸脱羧酶基因IDI和截短的3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶基因tHMG1;
所述截短的3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶基因tHMG1由3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶基因HMG1去除前530个氨基酸序列形成;
所述MVA途径相关基因为乙酰乙酰辅酶A硫解酶基因ERG10、β-羟-β-甲戊二酸单酰辅酶a合酶基因ERG13、甲羟戊酸激酶基因ERG12、磷酸甲羟戊酸ERG8和焦磷酸甲羟戊酸脱羧酶ERG19。
2.如权利要求1所述的重组酵母,其特征在于,所述酵母为酿酒酵母、异常汉逊氏酵母、粟酒裂殖酵母、黏红酵母、热带假丝酵母、产朊假丝酵母、解脂假丝酵母或巴斯德毕赤酵母。
3.如权利要求1所述的重组酵母,其特征在于,所述截短的柠檬烯合成酶基因tLimS的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示,所述法尼基焦磷酸突变体基因ERG20ww的核苷酸序列如SEQID NO.2所示,所述甲羟戊酸焦磷酸脱羧酶基因IDI的核苷酸序列如SEQ ID NO.4所示,所述截短的3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶基因tHMG1的核苷酸序列如SEQ ID NO.5所示,所述乙酰乙酰辅酶A硫解酶基因ERG10的核苷酸序列如SEQ ID NO.6所示,所述β-羟-β-甲戊二酸单酰辅酶a合酶基因ERG13的核苷酸序列如SEQ ID NO.7所示、所述甲羟戊酸激酶基因ERG12的核苷酸序列如SEQ ID NO.8所示、磷酸甲羟戊酸ERG8的核苷酸序列如SEQ ID NO.9所示,所述焦磷酸甲羟戊酸脱羧酶ERG19的核苷酸序列如SEQ ID NO.10所示。
4.如权利要求1所述的重组酵母,其特征在于,所述法尼基焦磷酸合酶突变体基因ERG20ww通过与截短的柠檬烯合成酶基因tLimS采用双向诱导型启动子GAL1,10进行表达。
5.如权利要求4所述的重组酵母,其特征在于,所述双向诱导型启动子GAL1,10的核苷酸序列如SEQ ID NO.11所示。
6.如权利要求1所述的重组酵母,其特征在于,所述重组酵母还将法尼基焦磷酸基因ERG20的启动子替换为葡萄糖感应型启动子。
7.如权利要求6所述的重组酵母,其特征在于,所述葡萄糖感应型启动子为PHXT1,核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示。
8.如权利要求1所述的重组酵母,其特征在于,所述重组酵母还敲除了乙醛酸循环的关键酶苹果酸合成酶基因MLS1,谷氨酸脱氢酶(NAD(+))基因GDH2。
9.如权利要求1-8中任一项所述的重组酵母在发酵生产D-柠檬烯中的应用。
10.如权利要求9所述的应用,其特征在于,所述发酵的温度为28-32℃,时间为80-120h。
CN202210243089.9A 2022-03-11 2022-03-11 一种生产d-柠檬烯的酵母及其应用 Active CN114606146B (zh)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CN202210243089.9A CN114606146B (zh) 2022-03-11 2022-03-11 一种生产d-柠檬烯的酵母及其应用

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CN202210243089.9A CN114606146B (zh) 2022-03-11 2022-03-11 一种生产d-柠檬烯的酵母及其应用

Publications (2)

Publication Number Publication Date
CN114606146A true CN114606146A (zh) 2022-06-10
CN114606146B CN114606146B (zh) 2023-03-17

Family

ID=81862968

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CN202210243089.9A Active CN114606146B (zh) 2022-03-11 2022-03-11 一种生产d-柠檬烯的酵母及其应用

Country Status (1)

Country Link
CN (1) CN114606146B (zh)

Citations (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN102071153A (zh) * 2010-12-08 2011-05-25 江南大学 一种产d-柠檬烯的酵母工程菌及其构建方法
CN108587934A (zh) * 2018-05-10 2018-09-28 天津科技大学 一种产柠檬烯的解脂耶氏酵母及其构建方法与应用
CN110669713A (zh) * 2019-10-18 2020-01-10 中国科学院青岛生物能源与过程研究所 一种合成d-柠檬烯的基因工程菌及其构建方法与应用
CN112175849A (zh) * 2020-09-30 2021-01-05 江南大学 一种l-薄荷醇产量提高的重组酵母菌
CN113774079A (zh) * 2021-08-13 2021-12-10 中国科学院天津工业生物技术研究所 重组酿酒酵母及其构建方法和应用

Patent Citations (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN102071153A (zh) * 2010-12-08 2011-05-25 江南大学 一种产d-柠檬烯的酵母工程菌及其构建方法
CN108587934A (zh) * 2018-05-10 2018-09-28 天津科技大学 一种产柠檬烯的解脂耶氏酵母及其构建方法与应用
CN110669713A (zh) * 2019-10-18 2020-01-10 中国科学院青岛生物能源与过程研究所 一种合成d-柠檬烯的基因工程菌及其构建方法与应用
CN112175849A (zh) * 2020-09-30 2021-01-05 江南大学 一种l-薄荷醇产量提高的重组酵母菌
CN113774079A (zh) * 2021-08-13 2021-12-10 中国科学院天津工业生物技术研究所 重组酿酒酵母及其构建方法和应用

Non-Patent Citations (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
SI CHENG ET AL.: ""Orthogonal Engineering of Biosynthetic Pathway for Efficient Production of Limonene inSaccharomyces cerevisiae"", 《ACS SYNTH.BIOL.》 *
ZHIHUI HU ET AL.: ""Engineering Saccharomyces cerevisiae for production of the valuable monoterpene d-limonene during Chinese Baijiu fermentation"", 《JOURNAL OF INDUSTRIAL MICROBIOLOGY & BIOTECHNOLOGY》 *
ZHIHUI HU ET AL.: ""Improve the production of d-limonene by-regulating the mevalonate pathway of Saccharomyces cerevisiae during alcoholic beverage fermentation"", 《JOURNAL OF INDUSTRIAL MICROBIOLOGY & BIOTECHNOLOGY》 *
伏贝贝 等: ""酿酒酵母单萜合成的研究进展"", 《生物技术通报》 *
胡智慧 等: ""代谢工程改造酿酒酵母合成植物萜类D-柠檬烯的策略"", 《微生物学报》 *

Also Published As

Publication number Publication date
CN114606146B (zh) 2023-03-17

Similar Documents

Publication Publication Date Title
CN108949601B (zh) 利用木糖生产达玛烯二醇和原人参二醇的重组酿酒酵母菌及构建方法
CN111363759B (zh) 合成赤藓糖醇的重组解脂耶氏酵母菌的构建方法及其菌株
CN110607247B (zh) 一种提高酿酒酵母合成角鲨烯能力的方法
CN106715679A (zh) 用于生产乙偶姻的方法
CN114058525B (zh) 一种产角鲨烯基因工程菌及其构建方法与应用
CN110484572A (zh) 一种提高酿酒酵母橙花叔醇产量的方法
CN112175849B (zh) 一种l-薄荷醇产量提高的重组酵母菌
Weusthuis et al. Monascus ruber as cell factory for lactic acid production at low pH
CN110804561B (zh) 一种高产c6-c10乙基酯的酿酒酵母及其构建方法与用途
CN111088175A (zh) 一种产红没药烯的解脂耶氏酵母及其构建方法与用途
CN112159769A (zh) 一种产l-薄荷醇的基因工程菌及其构建方法与应用
CN114107078B (zh) 一种产瓦伦烯基因工程菌及其构建方法与应用
WO2023208037A1 (zh) 一种橙花叔醇合成酶及应用
CN112608936A (zh) 调控酵母外源基因表达的启动子,调控方法及其应用
CN102203238B (zh) 鲨肌醇产生细胞和使用该细胞的鲨肌醇制造方法
CN114606146B (zh) 一种生产d-柠檬烯的酵母及其应用
CN113969288B (zh) 一种产法尼醇基因工程菌及其构建方法与应用
CN111548946B (zh) 一种生产次丹参酮二烯的重组酵母工程菌
CN109929853B (zh) 嗜热菌来源的热激蛋白基因的应用
CN114277040A (zh) 一种高效合成β-胡萝卜素菌株的构建方法及其应用
WO2019233853A1 (en) Microorganisms and the production of fine chemicals
CN105132388A (zh) 一种酶活性提高的丙酮酸羧化酶突变体r485p及其应用
CN112920959B (zh) 一种提高酵母菌中l-薄荷醇产量的方法
CN114717250B (zh) 一种基于辅因子代谢工程策略改造蛹虫草菌提高虫草素产量的方法及应用
CN114854612B (zh) 一株产l-乳酸的酿酒酵母的改造及其应用

Legal Events

Date Code Title Description
PB01 Publication
PB01 Publication
SE01 Entry into force of request for substantive examination
SE01 Entry into force of request for substantive examination
GR01 Patent grant
GR01 Patent grant