CN114044775A - 一种靶向泛素化诱导bcr-abl蛋白降解的化合物及其应用 - Google Patents
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Abstract
本发明提供一种靶向泛素化诱导BCR‑ABL蛋白降解的化合物;优点为:为该化合物不仅具有优异的BCR‑ABL蛋白降解作用和抗肿瘤活性,对人体毒副作用小,可用于制备抗肿瘤药物。
Description
技术领域
本发明属于化学领域,具体涉及一种靶向泛素化诱导BCR-ABL蛋白降解的化合物、制备方法及应用。
背景技术
蛋白降解靶向嵌合体(PROteolytic Targeting Chimera,PROTAC)技术是一种化学诱导靶蛋白多聚泛素化,并通过泛素-蛋白酶体系统降解靶蛋白的新兴技术。PROTAC是由靶蛋白配体和E3连接酶配体通过适当的连接链连接而成的双功能分子,能够同时招募靶蛋白和E3连接酶诱导靶蛋白泛素化降解,具有广泛的应用前景和发展空间。从PROTAC的特殊作用机制来看,PROTAC分子泛素化标记POI并促使蛋白降解后可与POI解离并在细胞内可以循环利用,起到亚化学计量催化的效果,减少药物的使用剂量从而减少体内药物暴露量,降低毒副作用;由于其短暂的结合,因此并不需要配体与受体较高的亲和力,对低亲和力或不可成药靶点具有一定的应用价值;与传统的小分子抑制剂的“占据驱动”作用机制不同,PROTAC是以“事件驱动”作用模式实现生物活性的,从根本上可逆、快速敲低致病蛋白,可以同时影响激酶依赖性和非依赖性的生物学功能,理论上可以推迟甚至是消除耐药性的发生。
由于PROTAC新技术的独特优势加之BCR-ABL激酶抑制剂的发展瓶颈以及不可避免地耐药性发生。
慢性粒细胞白血病(Chronic myeloid leukemia,CML)是一种起源于造血干细胞(Hematopoietic stem cells,HSCs)的多系骨髓增生恶性肿瘤,其典型特征是造血干细胞不受控制的增殖,特别是骨髓中会产生过多的粒性白细胞。据统计,CML约占所有癌症的0.3%,占成人白血病的20%,全世界每10万成年人中就有1-2人患有CML,任何年龄的人群都可发病,50岁以上人群较为常见且发病率随着年龄的增加而增加,通常男性患者多于女性患者。CML的细胞遗传学标志是长臂染色体9和22之间的相互异位(9号染色体上的BCR基因与22号染色体上的c-ABL基因融合形成新的BCR-ABL序列基因),t(9;22)(q34;q11)形成费城染色体(Philadelphia chromosome,Ph),95%的CML患者具有费城染色体。Ph染色体上的BCR-ABL融合基因编码致病蛋白(p210BCR-ABL)不断增加酪氨酸激酶活性,激活多条下游信号通路促进CML的发生发展,从而导致造血干细胞不受控制的增殖,细胞黏附的修饰以及细胞凋亡的抑制。CML的进展分为三个阶段:慢性期(Chronic phase,CP),占确诊时的85-90%;加速期(Accelerated phase,AP)以及髓细胞或淋巴细胞的急变期(Blast crisis)。随着BCR-ABL酪氨酸激酶抑制剂(Tyrosine kinase inhibitors,TKIs)的不断发展,现已大大延长了处于慢性期的CML患者的总生存期,特别是在伊马替尼(Imatinib)已成为黄金标准的一线用药的今天。然而,经过服用马替尼一段时间后会产生不同程度的的获得性耐药,严重阻碍了临床应用。
发明内容
本发明针对以上问题,提供一种靶向泛素化诱导BCR-ABL蛋白降解的化合物、制备方法及应用。
发明目的通过以下方案实现:一种式(I)所示的靶向泛素化诱导BCR-ABL蛋白降解的化合物:
式(I)中,n为5或6或10或11。
一种靶向泛素化诱导BCR-ABL蛋白降解的化合物的合成方法,合成路线如下:
n为5或6或10或11。
进一步的,化合物4合成路线如下:
一种药物组合物,包括靶向泛素化诱导BCR-ABL蛋白降解的化合物或其药学上可接受的盐和水合物,和药学上可接受的赋形剂。
一种药物组合物,包括靶向泛素化诱导BCR-ABL蛋白降解的化合物,在药物组合物中加入药学上可接受的辅料制成临床上可接受的剂型。
一种靶向泛素化诱导BCR-ABL蛋白降解的化合物在制备预防或/和治疗癌症的药物中应用。
进一步的,所述的癌症为慢性粒细胞性白血病、急性粒细胞性白血病、慢性淋巴性白血病、急性淋巴性白血病。
一种式(Ⅱ)所示的靶向泛素化诱导BCR-ABL蛋白降解的化合物:
一种式(Ⅲ)所示的靶向泛素化诱导BCR-ABL蛋白降解的化合物:
进一步的,式(Ⅲ)所示的靶向泛素化诱导BCR-ABL蛋白降解的化合物:其特征在于Linker的8种结构如下
本发明优点在于:该化合物不仅具有优异的BCR-ABL蛋白降解作用和抗肿瘤活性,对人体毒副作用小,可用于制备抗肿瘤药物。
附图说明
附图1是(I)化合物对K562细胞中BCR-ABL蛋白的降解作用(6h)。
附图2是(I)化合物DMP-011孵育6h对BCR-ABL蛋白降解的量效关系图。
附图3是大鼠尾静脉给予5mg/kg DMP-011后药动学参数及血药浓度曲线。
具体实施方式
实施例1结合附图1-3;一种式(I)所示的靶向泛素化诱导BCR-ABL蛋白降解的化合物:
式(I)中,n为5或6或10或11。
一种靶向泛素化诱导BCR-ABL蛋白降解的化合物的合成方法,合成路线如下:
n为5或6或10或11。
一种靶向泛素化诱导BCR-ABL蛋白降解的化合物的合成方法,化合物4合成路线如下:
化合物4的制备过程:2-氯嘧啶-5-羧酸乙酯(化合物1)2号位在碱性条件下受Boc哌嗪进攻,同理化合物2和3在碱性条件下亲核取代,在NaOH溶液中水解酯健得到化合物4。
称取1.9g化合物1(10mmol,1eq)、5.6g1-BOC-哌嗪(30mmol,3eq)、4.1g碳酸钾(30mmol,3eq)溶解于DMF中,缓慢加热到80℃,TLC薄层色谱监控反应,反应3h;反应结束冷却至室温,加入300mL的纯水,用盐酸调节ph,加入300mL×3的乙酸乙酯萃取,收集有机相,300mL×3饱和食盐水洗涤,加入无水硫酸钠脱水;收集有机相,减压蒸馏得粗品;硅胶层析柱分离(DCM:MeOH=5:1),烘干得化合物2白色粉末2.2g,产率94%;
称取2.0g化合物2(8.5mmol,1eq)、3.3g化合物3(8.5mmol,1eq)、3.5g碳酸钾(25.5mmol,3eq)溶解于DMF中,缓慢加热到80℃,TLC薄层色谱监控反应,反应3h;反应结束冷却至室温,加入0.5g氢氧化钠(12.75mmol,1.5eq),缓慢加热到50℃,TLC薄层色谱监控反应,反应3h;反应结束冷却至室温,加入300mL的纯水,加入300mL×3的乙酸乙酯萃取,收集有机相,300mL×3饱和食盐水洗涤,加入无水硫酸钠脱水;收集有机相,减压蒸馏得粗品;硅胶层析柱分离(DCM:MeOH=5:1),烘干得化合物4白色粉末4.0g,产率83%。
一种药物组合物,包括靶向泛素化诱导BCR-ABL蛋白降解的化合物或其药学上可接受的盐和水合物,和药学上可接受的赋形剂。
一种药物组合物,包括靶向泛素化诱导BCR-ABL蛋白降解的化合物,在药物组合物中加入药学上可接受的辅料制成临床上可接受的剂型。
一种靶向泛素化诱导BCR-ABL蛋白降解的化合物在制备预防或/和治疗癌症的药物中应用。
一种靶向泛素化诱导BCR-ABL蛋白降解的化合物的应用,所述的癌症为慢性粒细胞性白血病、急性粒细胞性白血病、慢性淋巴性白血病、急性淋巴性白血病。
所述药物上可接受的赋形剂是指任何可用于药物领域的稀释剂、辅助剂和/或载体。
一种式(I)所示的靶向泛素化诱导BCR-ABL蛋白降解的化合物;
称取3.31g化合物38(10mmol,1eq.),加入100mL THF溶解,加入3.87g DIPEA(30mmol,3eq),室温搅拌10min,加入5.70g HATU(15mmol,1.5eq.),40℃搅拌30min,加入3.10g化合物6(12mmol,1.2eq.),40℃反应5h,反应结束冷却至室温,减压旋蒸的淡黄色油状,加入200mL DCM溶解,加入10mL过量的TFA,室温反应2h,减压旋蒸得粗品,硅胶层析柱分离(DCM:MeOH=3:1),烘干得化合物46白色粉末2.83g,产率60%;
称取0.3g化合物4(0.60mmol,1eq.),加入50mLTHF溶解,加入0.232g DIPEA(1.80mmol,3eq),室温搅拌10min,加入0.34g HATU(0.9mmol,1.5eq.),40℃搅拌30min,加入0.339g化合物46(0.72mmol,1.2eq.),40℃反应5h,反应结束冷却至室温,减压旋蒸的黄色油状,硅胶层析柱分离(DCM:MeOH=15:1),烘干得化合物47白色粉末0.31g,产率50%。
称取3.86g化合物40(10mmol,1eq.),加入100mL THF溶解,加入3.87g DIPEA(30mmol,3eq),室温搅拌10min,加入5.70g HATU(15mmol,1.5eq.),40℃搅拌30min,加入3.10g化合物6(12mmol,1.2eq.),40℃反应5h,反应结束冷却至室温,减压旋蒸的淡黄色油状,加入200mL DCM溶解,加入10mL过量的TFA,室温反应2h,减压旋蒸得粗品,硅胶层析柱分离(DCM:MeOH=3:1),烘干得化合物48白色粉末3.16g,产率60%;
称取0.3g化合物4(0.60mmol,1eq.),加入50mLTHF溶解,加入0.232g DIPEA(1.80mmol,3eq),室温搅拌10min,加入0.34g HATU(0.9mmol,1.5eq.),40℃搅拌30min,加入0.379g化合物48(0.72mmol,1.2eq.),40℃反应5h,反应结束冷却至室温,减压旋蒸的黄色油状,硅胶层析柱分离(DCM:MeOH=15:1),烘干得化合物49白色粉末0.32g,产率50%。
称取4.14g化合物42(10mmol,1eq.),加入100mL THF溶解,加入3.87g DIPEA(30mmol,3eq),室温搅拌10min,加入5.70g HATU(15mmol,1.5eq.),40℃搅拌30min,加入3.10g化合物6(12mmol,1.2eq.),40℃反应5h,反应结束冷却至室温,减压旋蒸的淡黄色油状,加入200mL DCM溶解,加入10mL过量的TFA,室温反应2h,减压旋蒸得粗品,硅胶层析柱分离(DCM:MeOH=3:1),烘干得化合物50白色粉末3.33g,产率60%;
称取0.3g化合物4(0.60mmol,1eq.),加入50mLTHF溶解,加入0.232g DIPEA(1.80mmol,3eq),室温搅拌10min,加入0.34g HATU(0.9mmol,1.5eq.),40℃搅拌30min,加入0.400g化合物50(0.72mmol,1.2eq.),40℃反应5h,反应结束冷却至室温,减压旋蒸的黄色油状,硅胶层析柱分离(DCM:MeOH=15:1),烘干得化合物51白色粉末0.33g,产率50%。
称取3.86g化合物45(10mmol,1eq.),加入100mL THF溶解,加入3.87g DIPEA(30mmol,3eq),室温搅拌10min,加入5.70g HATU(15mmol,1.5eq.),40℃搅拌30min,加入3.10g化合物6(12mmol,1.2eq.),40℃反应5h,反应结束冷却至室温,减压旋蒸的淡黄色油状,加入200mL DCM溶解,加入10mL过量的TFA,室温反应2h,减压旋蒸得粗品,硅胶层析柱分离(DCM:MeOH=3:1),烘干得化合物52白色粉末3.16g,产率60%;
称取0.3g化合物4(0.60mmol,1eq.),加入50mLTHF溶解,加入0.232g DIPEA(1.80mmol,3eq),室温搅拌10min,加入0.34g HATU(0.9mmol,1.5eq.),40℃搅拌30min,加入0.379g化合物52(0.72mmol,1.2eq.),40℃反应5h,反应结束冷却至室温,减压旋蒸的黄色油状,硅胶层析柱分离(DCM:MeOH=15:1),烘干得化合物53白色粉末0.32g,产率50%。
本发明还公开了上述药物组合物制成的制剂,包括:在药物组合物中加入药学上可接受的辅料制成临床上可接受的剂型。所述临床上可接受的剂型为口服制剂、注射制剂或局部制剂。
其中,口服制剂可为片剂、胶囊剂、溶液或混悬液;注射制剂可为注射溶液或混悬剂或可注射的干燥粉末,在注射前加入注射用水可立即使用;局部制剂可为软膏或溶液。
其中,药学上可接受的辅料包括:口服制剂用的粘合剂、润滑剂、崩解剂、助溶剂、稀释剂、稳定剂、悬浮剂、色素或矫味剂;注射制剂用的防腐剂、加溶剂或稳定剂;局部制剂用的基质、稀释剂、润滑剂、防腐剂等。药物制剂可以经口服或胃肠外方式(如静脉内、皮下、腹膜内或局部)给药,如果某些药物在胃部条件下是不稳定的,可将其配制成肠衣片剂。
已经合成DMP系列连接链长度不同的四个化合物,纯度均大于96%;理化性质表明四个化合物在室温存放48h后未发生明显的降解,稳定性良好;目前已经完成了初步的降解活性实验以及考察了降解活性较好的DMP-011在大鼠体内药动学行为。
体外细胞活率实验表明,DMP系列化合物IC50较弹头达沙替尼有较明显的下降且DMP系列中个化合物的IC50相差200-400倍不等,表明连接链对细胞抑制活性有明显的影响。实验表明在DMP系列中化合物DMP-11抑制肿瘤细胞活性的效果较好,其对达沙替尼敏感的慢性粒细胞性白血病细胞系K562的IC50=0.49nM,对达沙替尼耐药的慢性粒细胞性白血病细胞系KA的IC50=6.35nM,对肿瘤细胞(包括耐药与非耐药株)活性的抑制率明显优于弹头达沙替尼,结果见表1。
表1.DMP系列及弹头的IC50值
IC<sub>50</sub>(nM)72h | K562 | KA |
Warhead | 2.71 | 973 |
DMP-06 | 126.30 | 978024 |
DMP-07 | 84.70 | 272169 |
DMP-11 | 0.49 | 6.35 |
DMP-12 | 192.0 | 5336 |
附图1中(I)化合物在100nM对K526细胞中的BCR-ABL降解表明化合物DMP11表现出较好的活性。
附图2中(I)化合物在对BCR-ABL的降解活性表现出剂量依赖性,且在125nM表现出明显的降解活性
附图3中(I)化合物在由于PROTAC化合物分子结构复杂,分子量庞大,为考察(I)化合物是否具有良好的药代动力学行为,我们分别进行了灌胃(10mg/kg)和尾静脉注射(5mg/kg)给予大鼠DMP-011考察药动学行为。实验结果表明,化合物DMP-011灌胃给药不吸收,静脉注射给药后药动学行为良好。
实施例2一种式(Ⅱ)所示的靶向泛素化诱导BCR-ABL蛋白降解的化合物:
一种式(Ⅱ)所示靶向泛素化诱导BCR-ABL蛋白降解的化合物的合成方法;合成路线如下:
称取2.83g化合物4(5mmol,1eq)溶解在10ml亚硫酰氯和3滴DMF中。将混合物加热至回流温度3小时,然后真空除去过量的亚硫酰氯,用20ml乙醚溶解固体,冰浴环境加入0.63g重氮甲烷(15mmol,3eq)反应15分钟,移除冰浴并将溶液在室温下搅拌3小时。用氮气流除去溶剂和过量的重氮甲烷。硅胶层析柱分离(甲苯:乙酸乙酯=1:1),烘干得化合物5黄色粉末2.23g,产率76%。
称取1.20g化合物61(10mmol,1eq.),加入100mL THF溶解,加入3.87g DIPEA(30mmol,3eq),室温搅拌10min,加入5.70g HATU(15mmol,1.5eq.),40℃搅拌30min,加入3.10g化合物6(12mmol,1.2eq.),40℃反应5h,反应结束冷却至室温,减压旋蒸减压旋蒸得粗品,硅胶层析柱分离(DCM:MeOH=3:1),烘干得化合物7白色粉末2.16g,产率60%;
称取0.36g化合物7(1mmol,1eq)、1.2g化合物5(2mmol,2eq.),溶于100ml乙醚中,加入5滴BF3·Et2O,室温静置2天,水性后处理得到油状残余物,硅胶层析柱分离(甲苯:乙酸乙酯=1:1),得到化合物8白色固体0.55g,产率58%。
称取1.64g化合物62(10mmol,1eq.),加入100mL THF溶解,加入3.87g DIPEA(30mmol,3eq),室温搅拌10min,加入5.70g HATU(15mmol,1.5eq.),40℃搅拌30min,加入3.10g化合物6(12mmol,1.2eq.),40℃反应5h,反应结束冷却至室温,减压旋蒸减压旋蒸得粗品,硅胶层析柱分离(DCM:MeOH=3:1),烘干得化合物9白色粉末2.36g,产率60%;
称取0.38g化合物9(1mmol,1eq)、1.2g化合物5(2mmol,2eq.),溶于100ml乙醚中,加入5滴BF3·Et2O,室温静置2天,水性后处理得到油状残余物,硅胶层析柱分离(甲苯:乙酸乙酯=1:1),得到化合物10白色固体0.56g,产率58%。
称取2.08g化合物63(10mmol,1eq.),加入100mL THF溶解,加入3.87g DIPEA(30mmol,3eq),室温搅拌10min,加入5.70g HATU(15mmol,1.5eq.),40℃搅拌30min,加入3.10g化合物6(12mmol,1.2eq.),40℃反应5h,反应结束冷却至室温,减压旋蒸减压旋蒸得粗品,硅胶层析柱分离(DCM:MeOH=3:1),烘干得化合物11白色粉末2.56g,产率60%;
称取0.40g化合物11(1mmol,1eq)、1.2g化合物5(2mmol,2eq.),溶于100ml乙醚中,加入5滴BF3·Et2O,室温静置2天,水性后处理得到油状残余物,硅胶层析柱分离(甲苯:乙酸乙酯=1:1),得到化合物12白色固体0.57g,产率58%。
称取2.52g化合物64(10mmol,1eq.),加入100mL THF溶解,加入3.87g DIPEA(30mmol,3eq),室温搅拌10min,加入5.70g HATU(15mmol,1.5eq.),40℃搅拌30min,加入3.10g化合物6(12mmol,1.2eq.),40℃反应5h,反应结束冷却至室温,减压旋蒸减压旋蒸得粗品,硅胶层析柱分离(DCM:MeOH=3:1),烘干得化合物13白色粉末2.72g,产率60%;
称取0.42g化合物13(1mmol,1eq)、1.2g化合物5(2mmol,2eq.),溶于100ml乙醚中,加入5滴BF3·Et2O,室温静置2天,水性后处理得到油状残余物,硅胶层析柱分离(甲苯:乙酸乙酯=1:1),得到化合物14白色固体0.58g,产率58%。
一种药物组合物,(Ⅱ)所示靶向泛素化诱导BCR-ABL蛋白降解的化合物或其药学上可接受的盐和水合物,和药学上可接受的赋形剂。
一种药物组合物,(Ⅱ)所示靶向泛素化诱导BCR-ABL蛋白降解的化合物,在药物组合物中加入药学上可接受的辅料制成临床上可接受的剂型。
一种(Ⅱ)所示靶向泛素化诱导BCR-ABL蛋白降解的化合物在制备预防或/和治疗癌症的药物中应用。
癌症为慢性粒细胞性白血病、急性粒细胞性白血病、慢性淋巴性白血病、急性淋巴性白血病。
实施例3一种式(Ⅲ)所示的靶向泛素化诱导BCR-ABL蛋白降解的化合物:
其中Linker为如下8种结构:
一种式(III)所示靶向泛素化诱导BCR-ABL蛋白降解的化合物的合成方法:8种式(III)所示靶向泛素化诱导BCR-ABL蛋白降解的化合物的合成方法
称取3.06g化合物15(10mmol,1eq.),加入100mL THF溶解,加入3.87g DIPEA(30mmol,3eq),室温搅拌10min,加入5.70g HATU(15mmol,1.5eq.),40℃搅拌30min,加入3.10g化合物6(12mmol,1.2eq.),40℃反应5h,反应结束冷却至室温,减压旋蒸的淡黄色油状,加入200mL DCM溶解,加入10mL过量的TFA,室温反应2h,减压旋蒸得粗品,硅胶层析柱分离(DCM:MeOH=3:1),烘干得化合物16白色粉末2.73g,产率60%;
称取0.3g化合物4(0.60mmol,1eq.),加入50mLTHF溶解,加入0.232g DIPEA(1.80mmol,3eq),室温搅拌10min,加入0.34g HATU(0.9mmol,1.5eq.),40℃搅拌30min,加入0.335g化合物16(0.72mmol,1.2eq.),40℃反应5h,反应结束冷却至室温,减压旋蒸的黄色油状,硅胶层析柱分离(DCM:MeOH=15:1),烘干得化合物17白色粉末0.30g,产率50%。
称取3.46g化合物18(10mmol,1eq.),加入100mL THF溶解,加入3.87g DIPEA(30mmol,3eq),室温搅拌10min,加入5.70g HATU(15mmol,1.5eq.),40℃搅拌30min,加入3.10g化合物6(12mmol,1.2eq.),40℃反应5h,反应结束冷却至室温,减压旋蒸的淡黄色油状,加入200mL DCM溶解,加入10mL过量的TFA,室温反应2h,减压旋蒸得粗品,硅胶层析柱分离(DCM:MeOH=3:1),烘干得化合物19白色粉末2.93g,产率60%;
称取0.3g化合物4(0.60mmol,1eq.),加入50mLTHF溶解,加入0.232g DIPEA(1.80mmol,3eq),室温搅拌10min,加入0.34g HATU(0.9mmol,1.5eq.),40℃搅拌30min,加入0.352g化合物19(0.72mmol,1.2eq.),40℃反应5h,反应结束冷却至室温,减压旋蒸的黄色油状,硅胶层析柱分离(DCM:MeOH=15:1),烘干得化合物20白色粉末0.31g,产率50%。
称取3.56g化合物21(10mmol,1eq.),加入100mL THF溶解,加入3.87g DIPEA(30mmol,3eq),室温搅拌10min,加入5.70g HATU(15mmol,1.5eq.),40℃搅拌30min,加入3.10g化合物6(12mmol,1.2eq.),40℃反应5h,反应结束冷却至室温,减压旋蒸的淡黄色油状,加入200mL DCM溶解,加入10mL过量的TFA,室温反应2h,减压旋蒸得粗品,硅胶层析柱分离(DCM:MeOH=3:1),烘干得化合物22白色粉末2.99g,产率60%;
称取0.3g化合物4(0.60mmol,1eq.),加入50mLTHF溶解,加入0.232g DIPEA(1.80mmol,3eq),室温搅拌10min,加入0.34g HATU(0.9mmol,1.5eq.),40℃搅拌30min,加入0.362g化合物22(0.72mmol,1.2eq.),40℃反应5h,反应结束冷却至室温,减压旋蒸的黄色油状,硅胶层析柱分离(DCM:MeOH=15:1),烘干得化合物23白色粉末0.32g,产率50%。
取3.46g化合物24(10mmol,1eq.),加入100mL THF溶解,加入3.87g DIPEA(30mmol,3eq),室温搅拌10min,加入5.70g HATU(15mmol,1.5eq.),40℃搅拌30min,加入3.10g化合物6(12mmol,1.2eq.),40℃反应5h,反应结束冷却至室温,减压旋蒸的淡黄色油状,加入200mL DCM溶解,加入10mL过量的TFA,室温反应2h,减压旋蒸得粗品,硅胶层析柱分离(DCM:MeOH=3:1),烘干得化合物325白色粉末2.93g,产率60%;
称取0.3g化合物4(0.60mmol,1eq.),加入50mLTHF溶解,加入0.232g DIPEA(1.80mmol,3eq),室温搅拌10min,加入0.34g HATU(0.9mmol,1.5eq.),40℃搅拌30min,加入0.352g化合物25(0.72mmol,1.2eq.),40℃反应5h,反应结束冷却至室温,减压旋蒸的黄色油状,硅胶层析柱分离(DCM:MeOH=15:1),烘干得化合物26白色粉末0.31g,产率50%。
称取2.83g N-Boc 6氨基酸(10mmol,1eq.),加入100mL THF溶解,加入3.87gDIPEA(30mmol,3eq),室温搅拌10min,加入5.70g HATU(15mmol,1.5eq.),40℃搅拌30min,加入3.10g化合物6(12mmol,1.2eq.),40℃反应5h,反应结束冷却至室温,减压旋蒸的淡黄色油状,加入200mL DCM溶解,加入10mL过量的TFA,室温反应2h,减压旋蒸得粗品,硅胶层析柱分离(DCM:MeOH=3:1),烘干得化合物27白色粉末3.18g,产率60%;
称取0.3g化合物4(0.60mmol,1eq.),加入50mLTHF溶解,加入0.232g DIPEA(1.80mmol,3eq),室温搅拌10min,加入0.34g HATU(0.9mmol,1.5eq.),40℃搅拌30min,加入0.318g化合物27(0.72mmol,1.2eq.),40℃反应5h,反应结束冷却至室温,减压旋蒸的黄色油状,硅胶层析柱分离(DCM:MeOH=15:1),烘干得化合物28白色粉末0.28g,产率50%。
称取2.88g N-Boc 7氨基酸(10mmol,1eq.),加入100mL THF溶解,加入3.87gDIPEA(30mmol,3eq),室温搅拌10min,加入5.70g HATU(15mmol,1.5eq.),40℃搅拌30min,加入3.10g化合物6(12mmol,1.2eq.),40℃反应5h,反应结束冷却至室温,减压旋蒸的淡黄色油状,加入200mL DCM溶解,加入10mL过量的TFA,室温反应2h,减压旋蒸得粗品,硅胶层析柱分离(DCM:MeOH=3:1),烘干得化合物29白色粉末3.18g,产率60%;
称取0.3g化合物4(0.60mmol,1eq.),加入50mLTHF溶解,加入0.232g DIPEA(1.80mmol,3eq),室温搅拌10min,加入0.34g HATU(0.9mmol,1.5eq.),40℃搅拌30min,加入0.318g化合物29(0.72mmol,1.2eq.),40℃反应5h,反应结束冷却至室温,减压旋蒸的黄色油状,硅胶层析柱分离(DCM:MeOH=15:1),烘干得化合物30白色粉末0.28g,产率50%。
称取2.88g N-Boc 10氨基酸(10mmol,1eq.),加入100mL THF溶解,加入3.87gDIPEA(30mmol,3eq),室温搅拌10min,加入5.70g HATU(15mmol,1.5eq.),40℃搅拌30min,加入3.10g化合物6(12mmol,1.2eq.),40℃反应5h,反应结束冷却至室温,减压旋蒸的淡黄色油状,加入200mL DCM溶解,加入10mL过量的TFA,室温反应2h,减压旋蒸得粗品,硅胶层析柱分离(DCM:MeOH=3:1),烘干得化合物31白色粉末3.18g,产率60%;
称取0.3g化合物4(0.60mmol,1eq.),加入50mLTHF溶解,加入0.232g DIPEA(1.80mmol,3eq),室温搅拌10min,加入0.34g HATU(0.9mmol,1.5eq.),40℃搅拌30min,加入0.318g化合物31(0.72mmol,1.2eq.),40℃反应5h,反应结束冷却至室温,减压旋蒸的黄色油状,硅胶层析柱分离(DCM:MeOH=15:1),烘干得化合物32白色粉末0.28g,产率50%。
称取3.08g N-Boc 12氨基酸(10mmol,1eq.),加入100mL THF溶解,加入3.87gDIPEA(30mmol,3eq),室温搅拌10min,加入5.70g HATU(15mmol,1.5eq.),40℃搅拌30min,加入3.10g化合物6(12mmol,1.2eq.),40℃反应5h,反应结束冷却至室温,减压旋蒸的淡黄色油状,加入200mL DCM溶解,加入10mL过量的TFA,室温反应2h,减压旋蒸得粗品,硅胶层析柱分离(DCM:MeOH=3:1),烘干得化合物33白色粉末3.18g,产率60%;
称取0.3g化合物4(0.60mmol,1eq.),加入50mLTHF溶解,加入0.232g DIPEA(1.80mmol,3eq),室温搅拌10min,加入0.34g HATU(0.9mmol,1.5eq.),40℃搅拌30min,加入0.318g化合物33(0.72mmol,1.2eq.),40℃反应5h,反应结束冷却至室温,减压旋蒸的黄色油状,硅胶层析柱分离(DCM:MeOH=15:1),烘干得化合物34白色粉末0.28g,产率50%。
称取2.09g化合物35(10mmol,1eq.)、3.72g化合物36(20mmol,2eq.)、1.9g CuI(10mmol,1eq.)、0.7g PdCl2(PPh3)2(1mmol,0.1eq.)加入100mL DMF溶解,100℃搅拌4h,反应结束冷却至室温,减压旋蒸的淡黄色油状,加入200mL DCM溶解,加入10mL过量的TFA,室温反应2h,减压旋蒸得粗品,硅胶层析柱分离(DCM:MeOH=3:1),烘干得化合物37白色粉末,溶于DCM,加入适量氢氧化钠(20mmol,2eq),常温水解反应3h,减压旋干,水相中加入过量的柠檬酸,析出白色絮状沉淀,减压过滤烘干得化合物38白色粉末2.65g,产率80%;
称取2.09g化合物35(10mmol,1eq.)、3.72g化合物36(20mmol,2eq.)、1.9g CuI(10mmol,1eq.)、0.7g PdCl2(PPh3)2(1mmol,0.1eq.)加入100mL DMF溶解,100℃搅拌4h,反应结束冷却至室温,减压旋蒸的淡黄色油状,加入200mL DCM溶解,加入10mL过量的TFA,室温反应2h,减压旋蒸得粗品,硅胶层析柱分离(DCM:MeOH=3:1),烘干得化合物34白色粉末;
称取2.59g化合物37(10mmol,1eq.)、1.71g化合物39(10mmol,1eq.)、0.93gNaBH3CN(15mmol,1.5eq.)、5mlAcOH、加入50ml MeOH溶解,50℃搅拌4h,反应结束冷却至室温,减压旋蒸的淡黄色油状,溶于DCM,加入适量氢氧化钠(20mmol,2eq),常温水解反应3h,减压旋干,水相中加入过量的柠檬酸,析出白色絮状沉淀,减压过滤烘干得化合物40白色粉末3.08g,产率80%;
称取2.09g化合物35(10mmol,1eq.)、3.72g化合物36(20mmol,2eq.)、1.9g CuI(10mmol,1eq.)、0.7g PdCl2(PPh3)2(1mmol,0.1eq.)加入100mL DMF溶解,100℃搅拌4h,反应结束冷却至室温,减压旋蒸的淡黄色油状,加入200mL DCM溶解,加入10mL过量的TFA,室温反应2h,减压旋蒸得粗品,硅胶层析柱分离(DCM:MeOH=3:1),烘干得化合物37白色粉末;
称取2.59g化合物37(10mmol,1eq.)、1.71g化合物41(10mmol,1eq.)、0.93gNaBH3CN(15mmol,1.5eq.)、5mlAcOH、加入50ml MeOH溶解,50℃搅拌4h,反应结束冷却至室温,减压旋蒸的淡黄色油状,溶于DCM,加入适量氢氧化钠(20mmol,2eq),常温水解反应3h,减压旋干,水相中加入过量的柠檬酸,析出白色絮状沉淀,减压过滤烘干得化合物42白色粉末3.20g,产率80%
称取1.81g化合物43(10mmol,1eq.)、3.72g化合物36(20mmol,2eq.)、1.9g CuI(10mmol,1eq.)、0.7g PdCl2(PPh3)2(1mmol,0.1eq.)加入100mL DMF溶解,100℃搅拌4h,反应结束冷却至室温,减压旋蒸的淡黄色油状,加入200mL DCM溶解,加入10mL过量的TFA,室温反应2h,减压旋蒸得粗品,硅胶层析柱分离(DCM:MeOH=3:1),烘干得化合物44白色粉末;
称取2.31g化合物44(10mmol,1eq.)、1.71g化合物41(10mmol,1eq.)、0.93gNaBH3CN(15mmol,1.5eq.)、5mlAcOH、加入50ml MeOH溶解,50℃搅拌4h,反应结束冷却至室温,减压旋蒸的淡黄色油状,溶于DCM,加入适量氢氧化钠(20mmol,2eq),常温水解反应3h,减压旋干,水相中加入过量的柠檬酸,析出白色絮状沉淀,减压过滤烘干得化合物45白色粉末3.08g,产率80%。
一种药物组合物,(Ⅲ)所示靶向泛素化诱导BCR-ABL蛋白降解的化合物或其药学上可接受的盐和水合物,和药学上可接受的赋形剂。
一种药物组合物,(Ⅲ)所示靶向泛素化诱导BCR-ABL蛋白降解的化合物,在药物组合物中加入药学上可接受的辅料制成临床上可接受的剂型。
一种(Ⅲ)所示靶向泛素化诱导BCR-ABL蛋白降解的化合物在制备预防或/和治疗癌症的药物中应用。
癌症为慢性粒细胞性白血病、急性粒细胞性白血病、慢性淋巴性白血病、急性淋巴性白血病。
实施例4
本发明所述的(I)(Ⅱ)(Ⅲ)化合物为一种蛋白水解靶向嵌合分子(PROTACs),其包括可以与BCR-ABL蛋白底物相结合的部分、可以与E3结合的部分以及连接链,利用这种双功能小分子可以将目标蛋白和细胞内的E3拉近,从而使本来不能与E3结合的BCR-ABL靶蛋白泛素化,进而被蛋白酶体识别并降解。
N为liner的不同长度,首次引入“Privileged Scaffold”——嘧啶环,考察不同组成Linker是否会对BCR-ABL融合蛋白降解作用产生影响。
(I)中N=11,优选的化合物降解BCR-ABL蛋白效果更好,其抗肿瘤活性也更强。
本发明还公开了一种药物组合物,包括上述化合物或其药学上可接受的盐,与药学上可接受的赋形剂。
所述药物上可接受的赋形剂是指任何可用于药物领域的稀释剂、辅助剂和/或载体。
本发明还公开了上述药物组合物制成的制剂,包括:在药物组合物中加入药学上可接受的辅料制成临床上可接受的剂型。所述临床上可接受的剂型为口服制剂、注射制剂或局部制剂。
其中,口服制剂可为片剂、胶囊剂、溶液或混悬液;注射制剂可为注射溶液或混悬剂或可注射的干燥粉末,在注射前加入注射用水可立即使用;局部制剂可为软膏或溶液。
其中,药学上可接受的辅料包括:口服制剂用的粘合剂、润滑剂、崩解剂、助溶剂、稀释剂、稳定剂、悬浮剂、色素或矫味剂;注射制剂用的防腐剂、加溶剂或稳定剂;局部制剂用的基质、稀释剂、润滑剂、防腐剂等。药物制剂可以经口服或胃肠外方式(如静脉内、皮下、腹膜内或局部)给药,如果某些药物在胃部条件下是不稳定的,可将其配制成肠衣片剂。
实施例5实施例1-3所述(I)(Ⅱ)(Ⅲ)化合物的氢谱预测,
DMP系列
DMP6
1H NMR(d6-DMSO)δ11.06(s,1H),10.21(s,1H),9.41(s,1H),8.47(s,1H),8.61(s,2H),8.34(m,1H),8.19(s,1H),7.68(m,1H),7.57(m,1H),7.53(m,1H),7.51(m,1H),7.17(m,1H),7.11(m,1H),5.28(s,1H),4.22(s,2H),4.44(m,1H),3.28(m,8H),3.06(m,2H),2.35(m,2H),2.29(s,3H),2.23-1.98(m,2H),2.21-2.11(m,2H),2.12(s,3H),1.63(m,2H),1.50(m,2H),1.33(m,2H);
DMP7
1H NMR(d6-DMSO)δ11.06(s,1H),10.21(s,1H),9.41(s,1H),8.47(s,1H),8.61(s,2H),8.34(m,1H),8.19(s,1H),7.68(m,1H),7.57(m,1H),7.53(m,1H),7.51(m,1H),7.17(m,1H),7.11(m,1H),5.28(s,1H),4.22(s,2H),4.44(m,1H),3.28(m,8H),3.06(m,2H),2.35(m,2H),2.29(s,3H),2.23-1.98(m,2H),2.21-2.11(m,2H),2.12(s,3H),1.63(m,2H),1.52(m,2H),1.33(m,2H),1.29(m,2H);
DMP11
1H NMR(d6-DMSO)δ11.06(s,1H),10.21(s,1H),9.41(s,1H),8.47(s,1H),8.61(s,2H),8.34(m,1H),8.19(s,1H),7.68(m,1H),7.57(m,1H),7.53(m,1H),7.51(m,1H),7.17(m,1H),7.11(m,1H),5.28(s,1H),4.22(s,2H),4.44(m,1H),3.28(m,8H),3.06(m,2H),2.35(m,2H),2.29(s,3H),2.23-1.98(m,2H),2.21-2.11(m,2H),2.12(s,3H),1.63(m,2H),1.57(m,2H),1.52(m,2H),1.30(m,2H),1.30(m,2H),1.30(m,2H),1.29(m,2H),1.28(m,2H),1.27(m,2H);
DMP12
1H NMR(d6-DMSO)δ11.06(s,1H),10.21(s,1H),9.41(s,1H),8.47(s,1H),8.61(s,2H),8.34(m,1H),8.19(s,1H),7.68(m,1H),7.57(m,1H),7.53(m,1H),7.51(m,1H),7.17(m,1H),7.11(m,1H),5.28(s,1H),4.22(s,2H),4.44(m,1H),3.28(m,8H),3.06(m,2H),2.35(m,2H),2.29(s,3H),2.23-1.98(m,2H),2.21-2.11(m,2H),2.12(s,3H),1.63(m,2H),1.57(m,2H),1.52(m,2H),1.30(m,2H),1.30(m,2H),1.30(m,2H),1.29(m,2H),1.28(m,2H),1.27(m,2H),1.26(m,2H);
PEG(n=1)
1H NMR(d6-DMSO)δ11.06(s,1H),10.21(s,1H),10.02(s,1H),8.47(s,1H),8.61(s,2H),8.34(m,1H),8.19(s,1H),7.68(m,1H),7.57(m,1H),7.53(m,1H),7.51(m,1H),7.17(m,1H),7.11(m,1H),5.28(s,1H),4.48(m,2H),4.44(m,1H),4.31(m,2H),4.22(s,2H),3.52(m,4H),3.28(m,8H),2.29(s,3H),2.23-1.98(m,2H),2.21-2.11(m,2H),2.12(s,3H),;
PEG(n=2)
1H NMR(d6-DMSO)δ11.06(s,1H),10.21(s,1H),10.02(s,1H),8.47(s,1H),8.61(s,2H),8.34(m,1H),8.19(s,1H),7.68(m,1H),7.57(m,1H),7.53(m,1H),7.51(m,1H),7.17(m,1H),7.11(m,1H),5.28(s,1H),4.48(m,2H),4.44(m,1H),4.31(m,2H),4.22(s,2H),3.52(m,8H),3.28(m,8H),2.29(s,3H),2.23-1.98(m,2H),2.21-2.11(m,2H),2.12(s,3H);
PEG(n=3)
1H NMR(d6-DMSO)δ11.06(s,1H),10.21(s,1H),10.02(s,1H),8.47(s,1H),8.61(s,2H),8.34(m,1H),8.19(s,1H),7.68(m,1H),7.57(m,1H),7.53(m,1H),7.51(m,1H),7.17(m,1H),7.11(m,1H),5.28(s,1H),4.48(m,2H),4.44(m,1H),4.31(m,2H),4.22(s,2H),3.52(m,12H),3.28(m,8H),2.29(s,3H),2.23-1.98(m,2H),2.21-2.11(m,2H),2.12(s,3H);
PEG(n=4)
1H NMR(d6-DMSO)δ11.06(s,1H),10.21(s,1H),10.02(s,1H),8.47(s,1H),8.61(s,2H),8.34(m,1H),8.19(s,1H),7.68(m,1H),7.57(m,1H),7.53(m,1H),7.51(m,1H),7.17(m,1H),7.11(m,1H),5.28(s,1H),4.48(m,2H),4.44(m,1H),4.31(m,2H),4.22(s,2H),3.52(m,16H),3.28(m,8H),2.29(s,3H),2.23-1.98(m,2H),2.21-2.11(m,2H),2.12(s,3H);
ZSX系列
1H NMR(d6-DMSO)δ11.06(s,1H),10.21(s,1H),9.79(s,1H),8.73(s,2H),8.47(s,1H),8.61(s,2H),8.34(m,1H),8.19(s,1H),7.68(m,1H),7.57(m,1H),7.53(m,1H),7.51(m,1H),7.17(m,1H),7.11(m,1H),5.28(s,1H),4.44(m,1H),4.22(s,2H),3.58(s,2H),3.28(m,8H),3.15(m,4H),2.55(m,4H),2.29(s,3H),2.23-1.98(m,2H),2.21-2.11(m,2H),2.12(s,3H);
1H NMR(d6-DMSO)δ11.06(s,1H),10.21(s,1H),9.79(s,1H),8.80(s,1H),8.67(s,1H),8.69(s,1H),8.53(s,1H),8.47(s,1H),8.34(m,1H),8.19(s,1H),7.68(m,1H),7.57(m,1H),7.53(m,1H),7.51(m,1H),7.17(m,1H),7.11(m,1H),5.28(s,1H),4.44(m,1H),4.22(s,2H),3.77(s,2H),3.58(s,2H),3.42(s,2H),3.28(m,8H),2.45(m,4H),2.29(s,3H),2.23-1.98(m,2H),2.21-2.11(m,2H),2.12(s,3H),1.38(m,4H);
1H NMR(d6-DMSO)δ11.06(s,1H),10.21(s,1H),9.79(s,1H),8.80(s,1H),8.67(s,1H),8.69(s,1H),8.53(s,1H),8.47(s,1H),8.34(m,1H),8.19(s,1H),7.68(m,1H),7.57(m,1H),7.53(m,1H),7.51(m,1H),7.17(m,1H),7.11(m,1H),5.28(s,1H),4.44(m,1H),4.22(s,2H),3.71(m,4H),3.58(s,2H),3.42(s,2H),3.28(m,8H),3.02(s,2H),2.29(s,3H),2.23-1.98(m,2H),2.21-2.11(m,2H),2.12(s,3H),1.38(m,4H);
1H NMR(d6-DMSO)δ11.06(s,1H),10.21(s,1H),9.79(s,1H),8.80(s,1H),8.67(s,1H),8.69(s,1H),8.53(s,1H),8.47(s,1H),8.34(m,1H),8.19(s,1H),7.68(m,1H),7.57(m,1H),7.53(m,1H),7.51(m,1H),7.17(m,1H),7.11(m,1H),5.28(s,1H),4.44(m,1H),4.22(s,2H),3.71(m,4H),3.58(s,2H),3.28(m,8H),2.45(m,4H),2.29(s,3H),2.23-1.98(m,2H),2.21-2.11(m,2H),2.12(s,3H),1.38(m,8H);
1H NMR(d6-DMSO)δ11.06(s,1H),10.21(s,1H),9.79(s,1H),8.98(s,1H),8.97(s,1H),8.80(s,1H),8.67(s,1H),8.47(s,1H),8.34(m,1H),8.19(s,1H),7.68(m,1H),7.57(m,1H),7.53(m,1H),7.51(m,1H),7.17(m,1H),7.11(m,1H),5.28(s,1H),4.44(m,1H),4.22(s,2H),3.58(s,2H),3.28(m,8H),2.54(m,1H),2.51-2.41(m,4H),2.29(s,3H),2.23-1.98(m,2H),2.21-2.11(m,2H),2.12(s,3H),1.75-1.50(m,4H);
1H NMR(d6-DMSO)δ11.06(s,1H),10.21(s,1H),9.79(s,1H),8.98(s,1H),8.97(s,1H),8.80(s,1H),8.67(s,1H),8.47(s,1H),8.34(m,1H),8.19(s,1H),7.68(m,1H),7.57(m,1H),7.53(m,1H),7.51(m,1H),7.17(m,1H),7.11(m,1H),5.28(s,1H),4.44(m,1H),4.22(s,2H),3.73-3.48(m,2H),3.36(m,1H),3.58(s,2H),3.33-3.08(m,2H),3.28(m,8H),2.54(m,1H),2.51-2.41(m,4H),2.29(s,3H),2.23-1.98(m,2H),2.21-2.11(m,2H),2.12(s,3H),1.75-1.50(m,4H);
1H NMR(d6-DMSO)δ11.06(s,1H),10.21(s,1H),9.79(s,1H),8.98(s,1H),8.97(s,1H),8.80(s,1H),8.67(s,1H),8.47(s,1H),8.34(m,1H),8.19(s,1H),7.68(m,1H),7.57(m,1H),7.53(m,1H),7.51(m,1H),7.17(m,1H),7.11(m,1H),5.28(s,1H),4.44(m,1H),4.22(s,2H),3.79-3.54(m,2H),3.27(m,1H),3.58(s,2H),3.40-3.15(m,2H),3.28(m,8H),2.63(m,1H),2.51-2.41(m,4H),2.29(s,3H),2.23-1.98(m,2H),2.21-2.11(m,2H),2.12(s,3H),1.69-1.44(m,4H);
1H NMR(d6-DMSO)δ11.06(s,1H),10.21(s,1H),9.79(s,1H),8.98(s,1H),8.97(s,1H),8.80(s,1H),8.67(s,1H),8.47(s,1H),8.34(m,1H),8.19(s,1H),7.68(m,1H),7.57(m,1H),7.53(m,1H),7.51(m,1H),7.17(m,1H),7.11(m,1H),5.28(s,1H),4.44(m,1H),4.22(s,2H),3.58(s,2H),3.28(m,8H),2.63(m,1H),2.54(m,1H),2.51-2.41(m,8H),2.29(s,3H),2.23-1.98(m,2H),2.21-2.11(m,2H),2.12(s,3H),1.75-1.50(m,4H),1.69-1.44(m,4H)。
虽然本发明已通过参考优选的实施例进行了描述,但是本领域技术人员应当了解,在权利要求书的范围内可作出形式和细节上的各种变化。
Claims (10)
4.一种药物组合物,其特征在于,包括权利要求1所述的化合物或其药学上可接受的盐和水合物,和药学上可接受的赋形剂。
5.一种药物组合物,其特征在于,包括权利要求1所述的化合物,在药物组合物中加入药学上可接受的辅料制成临床上可接受的剂型。
6.一种根据权利要求1所述的化合物在制备预防或/和治疗癌症的药物中应用。
7.根据权利要求7所述的应用,其特征在于,所述的癌症为慢性粒细胞性白血病、急性粒细胞性白血病、慢性淋巴性白血病、急性淋巴性白血病。
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