CN113966535A - 用于协同开发用于检测靶核酸的试剂的计算机实施的方法 - Google Patents

Abstract

本公开涉及用于协同开发用于检测靶核酸的试剂的计算机实施的方法、系统和存储介质。根据本公开，该方法、系统和存储介质响应于协同开发请求自动匹配适合协同开发特点的开发者和技术提供者，从而提高协同开发效率。

Description

用于协同开发用于检测靶核酸的试剂的计算机实施的方法

技术领域

本公开涉及用于协同开发用于检测靶核酸的试剂的计算机实施的方法、系统和存储介质。

背景技术

核酸扩增是分子生物学中多种方法的关键过程，因此已经提出了多种扩增方法。例如，Miller,H.I.等人(WO 89/06700)公开了一种扩增核酸的方法，包括将启动子/引物序列与靶单链DNA(“ssDNA”)杂交，然后转录该序列的许多RNA拷贝。其他已知的核酸扩增过程包括基于转录的扩增系统(Kwoh,D.等人,Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.,86:1173(1989)；和Gingeras T.R.等人,WO 88/10315)。

被称为聚合酶链反应(以下简称“PCR”)的核酸扩增最主要的过程是基于双链DNA变性的重复循环，然后是寡核苷酸引物退火到DNA模板，以及DNA聚合酶的引物延伸(Mullis等人的美国专利No.4,683,195、4,683,202和4,800,159；Saiki等人,(1985)Science 230,1350-1354)。

基于PCR的技术不仅被广泛用于靶DNA序列的扩增，而且还用于生物学和医学研究领域的科学应用或方法，诸如逆转录酶PCR(RT-PCR)、差异显示PCR(DD-PCR)、通过PCR克隆已知或未知基因、cDNA末端快速扩增(RACE)、任意引发PCR(AP-PCR)、多重PCR、SNP基因组分型和基于PCR的基因组分析(McPherson和Moller,(2000)PCR.BIOS ScientificPublishers,Springer-Verlag New York Berlin Heidelberg,NY)。

上面列出的基于PCR的技术扩增和检测靶核酸以确定靶核酸的存在或不存在。具体地，如果靶核酸与特定疾病相关(例如，当靶核酸源自特定病原体时)，靶核酸的存在可以帮助诊断受试者的疾病。

这种基于PCR的技术需要使用试剂来检测靶核酸，包括与靶核酸特异性杂交的寡核苷酸(例如引物和/或探针)、标记、DNA聚合酶、dNTP、Mg离子和缓冲液，以扩增和检测靶核酸。

然而，这种试剂的开发和商业化本质上需要对寡核苷酸进行复杂的设计和对设计的寡核苷酸进行复杂的性能测试，因此需要大量的时间和精力、专业知识和成本。用于性能测试的临床样本不易获取，导致试剂开发更加困难。

此外，与用于检测单个靶核酸的试剂相比，由于寡核苷酸数量的增加，用于在一个反应中同时检测多个靶核酸的试剂的开发需要更多的劳动力和成本。由于这些原因，只有少数制造者生产了用于同时检测多个靶核酸的试剂。

试剂开发者通常拥有限于特定领域的开发技术(例如，用于检测人体样本中的靶核酸)，并且很难开发用于其他领域的试剂，例如用于检测动物、植物或食物样本中的靶核酸。

为攻克试剂开发难点，一些团体曾尝试过协同开发，但由于难以找到/匹配合适的协作伙伴以及缺乏系统化管理或协同开发效率低，均未成功。

年平均气温较高的热带或丛林地区受害于各种遗传病或传染病或区域性流行病的爆发，但这些区域由于技术落后，分子诊断试剂的开发没有任何进展。大多位于发达国家的大型跨国分子诊断试剂制造者由于利润低，不愿开发用于诊断区域性流行病的产品。

需要一种新的方法和系统来解决这些问题。

在本申请中，引用了各种专利和出版物，并在括号中提供了引文。这些专利和出版物的全部公开内容通过引用结合到本申请中，以便更全面地描述本发明和本发明所属领域的现有技术。

发明内容

技术问题

发明人已努力想出一种方法或系统，用于以更有效和同时的方式开发用于检测靶核酸的各种试剂。结果，发明人发现通过技术提供者和开发者之间的协作，可以同时并且没有区域限制地开发用于检测靶核酸的各种试剂。

根据本公开，位于疾病爆发区域中的开发者可以通过经由协同开发从技术提供者接收专有技术，开发用于检测与疾病相关的靶核酸的试剂，并且因此开发的试剂可用于疾病爆发区域。

在一个区域发展后，传染病可能会传播到其他区域，在那里与疾病相关的靶核酸可能会发生突变，因此，需要加快开发用于检测靶核酸的试剂。疾病爆发区域的开发者可以通过协同开发来快速开发和使用用于检测靶核酸的试剂，通过协同开发，他们可以获得技术提供者的专有技术。

本发明的目的是提供一种用于协同开发用于检测靶核酸的试剂的计算机实施的方法。

本发明的另一目的是提供一种用于协同开发用于检测靶核酸的试剂的系统。

本发明的又一目的是提供一种计算机可读存储介质，其包括用于协同开发用于检测靶核酸的试剂的指令。

本发明的其他目的和优点将从下面结合所附权利要求和附图的详细描述中变得明显。

问题的解决方案

在本公开的一个方面，提供了用于通过协同开发系统协同开发用于检测靶核酸的试剂的计算机实施的方法，包括：从请求者终端接收对含有用于检测靶核酸的寡核苷酸的试剂的协同开发请求，其中协同开发请求包括关于使用试剂检测的靶核酸的特征信息；允许开发者终端访问技术提供者的开发工具包，其中开发工具包包括用于试剂中包含的寡核苷酸的性能测试工具，性能测试工具包括软件、设备和指导信息中的一个或多个；从开发者终端接收使用开发工具包获得的结果，其中结果包括寡核苷酸的性能数据；允许技术提供者终端或协同开发系统的监控模块对接收的结果进行审查；以及允许开发者终端访问审查的结果，从而选择要包含在试剂中的寡核苷酸。

在本公开的另一个方面，提供了一种用于使用存储在存储器中并配置为由处理器执行的一个或多个程序来协同开发用于检测靶核酸的试剂的系统，其中一个或多个程序包括由处理器执行的指令以执行：从请求者终端接收对含有用于检测靶核酸的寡核苷酸的试剂的协同开发请求，其中协同开发请求包括关于使用试剂检测的靶核酸的特征信息；允许开发者终端访问技术提供者的开发工具包，其中开发工具包包括用于试剂中包含的寡核苷酸的性能测试工具，性能测试工具包括软件、设备和指导信息中的一个或多个；从开发者终端接收使用开发工具包获得的结果，其中结果包括寡核苷酸的性能数据；允许技术提供者终端或协同开发系统的监控模块对接收的结果进行审查；以及允许开发者终端访问审查的结果，从而选择要包含在试剂中的寡核苷酸。

在本公开的另一个方面，提供了一种在计算设备中存储由一个或多个处理器执行的用于协同开发用于检测靶核酸的试剂的指令的非暂时性计算机可读存储介质，其中当由一个或多个处理器执行时，指令使计算设备执行以下操作：通过协同开发系统协同开发用于检测靶核酸的试剂的计算机实施的方法，包括：从请求者终端接收对含有用于检测靶核酸的寡核苷酸的试剂的协同开发请求，其中协同开发请求包括关于使用试剂检测的靶核酸的特征信息；允许开发者终端访问技术提供者的开发工具包，其中开发工具包包括用于试剂中包含的寡核苷酸的性能测试工具，性能测试工具包括软件、设备和指导信息中的一个或多个；从开发者终端接收使用开发工具包获得的结果，其中结果包括寡核苷酸的性能数据；允许技术提供者终端或协同开发系统的监控模块对接收的结果进行审查；以及允许开发者终端访问审查的结果，从而选择要包含在试剂中的寡核苷酸。

在本公开的又一个方面，提供了一种用于通过协同开发系统协同开发用于检测靶核酸的试剂的计算机实施的方法，包括：接收协同开发应用信息，包括关于靶核酸的特征信息；使用接收到的关于靶核酸的特征信息确定与靶核酸相关的疾病爆发的疾病区域；选择位于疾病区域中的开发者；以及从开发者终端接收由所选择的开发者通过技术提供者的支持对开发用于检测靶核酸的试剂执行测试的结果。

发明的有益效果

本公开的特征和优点可概括如下：

(1)根据本公开，方法、系统和存储介质响应于协同开发请求，自动匹配适合协同开发特点的开发者和技术提供者，从而提高协同开发效率。

(2)根据本公开，方法、系统和存储介质允许技术提供者和开发者之间通过网络的同时且无区域限制的协同开发(即技术提供者和开发者执行多个协同开发项目)，从而使得能够在短时间内开发各种试剂。

(3)根据本公开，方法、系统和存储介质允许能够开发用于检测靶核酸的试剂但没有空间进行复杂和耗时的测试的技术提供者为有能力进行测试的开发者提供开发技术，并指导他们进行开发测试，从而使得能够快速开发各种检测靶核酸的试剂。

(4)根据本公开，方法、系统和存储介质允许能够开发用于检测靶核酸的试剂但难以获得用于测试试剂性能的临床样本的技术提供者为可以轻松获得临床样本的开发者提供开发技术，并指导他们进行性能测试以开发各种所需的试剂。

(5)根据本公开，方法、系统和存储介质允许有能力进行开发用于检测靶核酸的试剂的测试但缺乏开发能力的开发者通过与技术提供者的协同开发获得试剂开发方法和专有技术。

(6)根据本公开，方法、系统和存储介质允许可以容易地获取临床样本以测试用于检测靶核酸的试剂的性能的开发者通过将临床样本提供给技术提供者来开发他们想要的试剂。

(7)根据本公开，方法、系统和存储介质允许无法在疾病爆发区域获取临床样本的技术提供者向位于可以获取临床样本地方的开发者提供专有技术。

(8)根据本公开，方法、系统和存储介质允许多个技术提供者和开发者同时进行能够诊断在不同区域爆发的各种疾病的用于检测靶核酸的试剂的协同开发。因此，可以在疾病爆发区域在短时间内开发出能够检测多种疾病的用于检测靶核酸的试剂，并用于疾病爆发区域的患者。

(9)根据本公开，方法、系统和存储介质允许位于一些高危疾病区域并且不能正确开发针对区域中爆发的一些疾病的用于检测靶核酸的试剂的开发者通过协同开发从技术提供者获得专有技术，并开发必要的用于检测靶核酸的试剂。

(10)根据本公开，方法、系统和存储介质允许位于疾病爆发地区的开发者从技术提供者获得专有技术，并且测试和开发否则不愿意开发的疾病检测试剂。可以使用开发的用于检测靶核酸的试剂来诊断疾病区域中的少数患者的疾病。

(11)在传染病从最初爆发区域传播到另一区域的情况下，由于疾病可能突变，开发用于疾病诊断的用于检测靶核酸的试剂需要针对最初爆发区域和第二感染区域中的每个区域的临床样本。方法、系统和存储介质允许技术提供者通过协同开发向初始爆发区域和第二感染区域中的开发者提供他们的专有技术，并允许他们进行开发用于检测靶核酸的试剂的测试。因此，可以在两个区域同时开发能够诊断疾病的用于检测靶核酸的试剂。

(12)由于技术提供者难以获得临床样本，用于检测仅在特定区域爆发的遗传病的用于检测靶核酸的试剂的开发延迟或不可能。然而，根据本公开，方法、系统和存储介质允许位于疾病区域的开发者通过协同开发利用技术提供者的专有技术来容易地开发用于检测靶核酸的试剂，以用于使用遗传病的临床样本进行测试。

(13)根据本公开，通过疾病区域的开发者与提供专有技术的技术提供者之间的协同开发所开发的用于检测靶核酸的试剂在疾病区域中销售和使用，同时允许诊断机构降低开发的用于检测靶核酸的试剂的诊断成本。

(14)根据本公开，通过协同开发系统将开发者获得的开发测试结果和技术提供者的审查的结果共享，从而提高协同开发效率。

(15)根据本公开，方法、系统和存储介质特别适用于开发一种耗费大量时间和精力的用于检测多个靶核酸的试剂。

附图说明

图1是示意性地示出根据本公开的通过网络连接协同开发系统、请求者终端、开发者终端和/或开发设备、技术提供者终端和可选的评估者终端的示例的视图；

图2是示意性地示出根据本公开的协同开发服务器的配置的视图；

图3是示出根据本公开实施例的协同开发方法的流程图；

图4是示出根据本公开实施例的协同开发方法的流程图；以及

图5是示出根据本公开的通过开发者终端或开发设备访问协同开发服务器中存储的开发工具包的配置的视图。

具体实施方式

现在结合其实施例更详细地描述本公开的配置和效果。提供实施例只是为了具体说明本公开，本领域的普通技术人员可以理解，本公开的范围不限于这些实施例。

本发明人已努力想出一种方法或系统，用于以更有效和同时的方式开发用于检测靶核酸的各种试剂。结果，发明人发现，通过提供技术的技术提供者和进行测试的开发者之间的协作，可以不分地点地同时开发用于检测靶核酸的各种试剂。

I.根据本公开的协同开发系统的配置

根据本公开，协同开发系统1000包括协同开发服务器100，协同开发服务器100通过网络与例如参与协同开发的终端和开发设备连接。

图1中示出了通过网络连接协同开发系统、请求者终端、开发者终端和/或开发设备、技术提供者终端和可选的评估者终端的示例。参考图1，根据本公开的协同开发系统1000从/向每个终端接收/发送协同开发所需的输入/输出，从而促进经由每个终端的协同开发。

协同开发系统1000的协同开发服务器100通过网络与请求者终端300、开发者终端400和技术提供者终端500连接。根据需要，协同开发服务器100通过网络与评估者终端600连接。

根据本公开的协同开发系统1000中的协同开发服务器100可以根据以下实施方式接收协同开发请求。

i)根据实施例，协同开发服务器100可以从请求者终端300接收协同开发请求。

ii)根据另一实施例，协同开发服务器100可以从开发者终端400接收协同开发请求。在这种情况下，开发者终端400对应于请求者终端300。

iii)根据又一实施例，协同开发服务器100可以从技术提供者终端500接收协同开发请求。在这种情况下，技术提供者终端500对应于请求者终端300。

协同开发服务器100可以使协同开发的开发者终端400能够访问协同开发的技术提供者的开发工具包。

根据实施例，设备可以被包括在技术提供者的开发工具包中并且被提供给开发者。根据本公开的另一实施例，可以通过连接到开发者终端400来向开发者提供开发者的设备。

协同开发服务器100可以从开发者终端400接收使用开发工具包得到的结果。或者，它可以从与开发者终端400连接的开发设备401被接收。协同开发服务器100开启协同开发服务器100或技术提供者终端500中的监控模块137以对接收到的结果进行审查。技术提供者终端500或监控模块137可以生成审查的结果，协同开发服务器100使开发者终端400能够访问生成的审查的结果。

根据本公开，对于每个测试重复执行对来自开发者终端400的结果的接收以及协同开发系统1000或技术提供者终端500的监控模块137对结果的审查。

因此，在结果被协同开发系统1000或技术提供者终端500的监控模块137审查时产生的审查的结果包括性能测试的重新执行或批准的指示。

一名或多名开发者可以参与协同开发。从希望参与协同开发的多个候选开发者中选出的任何一个或多个开发者可以参与协同开发。因此，开发者终端400是从多个候选开发者中选择进行协同开发的开发者的终端。根据本公开，协同开发系统1000可以根据以下实施示例选择开发者获得用于协同开发测试的临床样本。

根据实施例，所选择的开发者终端400是已经获得或能够获得包含或怀疑包含靶核酸的临床样本的开发者的终端。

根据另一实施例，所选择的开发者终端400是位于与靶核酸相关的疾病已经爆发的区域中的开发者的终端。

根据另一个实施例，选择的开发者终端400是位于与靶核酸相关的疾病爆发或已经爆发的区域并且已经获得或能够获得来自患有或怀疑患有该疾病的受试者的临床样本的开发者的终端。

根据另一实施例，所选择的开发者终端400是处于患有或怀疑患有与靶核酸相关的疾病的受试者所在区域的开发者的终端。

根据另一个实施例，所选择的开发者终端400是与靶核酸相关的疾病爆发的区域和/或疾病已爆发预定时间段的区域中已经获得或能够获得来自患有或怀疑患有疾病的受试者的临床样本的开发者的终端。

因此，从开发者终端400发送的结果可以包括使用由开发者获得的临床样本的测试结果。

根据本公开，协同开发系统1000可以被配置为实现多个协同开发。

根据本公开的协同开发系统1000可以响应于协同开发请求来执行协同开发的可行性的评估。

在示例中，协同开发服务器100可以通过将接收到的协同开发请求提供给评估者终端600来请求协同开发的可行性评估。评估者终端600可以响应于评估请求执行协同开发的可行性评估，并向协同开发服务器100提供协同开发的可行性评估结果。当从评估者终端600接收到的协同开发可行性评估结果为批准协同开发时，协同开发服务器100启动协同开发。

在另一示例中，协同开发服务器100可以响应于从请求者终端300、开发者终端400或技术提供者终端500接收到的协同开发请求，使协同开发服务器100中的评估管理模块122能够执行协同开发的可行性评估。评估管理模块122响应于协同开发请求执行评估，以产生协同开发的可行性的评估结果。当评估管理模块122产生批准结果时，协同开发服务器100启动协同开发。

在示例中，评估者终端600可以包括技术提供者终端500。换言之，技术提供者可以响应于经由技术提供者终端500的协同开发请求，执行协同开发的可行性评估，生成协同开发的可行性评估结果，将结果提供给协同开发服务器100。

响应于协同开发的批准，协同开发服务器100可以向开发者终端400和/或技术提供者终端500发送参与协同开发的请求和/或接收协同开发参与信息。

根据实施例，当从请求者终端300接收到协同开发请求并且协同开发被批准时，协同开发服务器100可以向一个或多个开发者终端400和/或技术提供者终端500发送协同开发参与请求.

响应于协同开发参与请求，协同开发服务器100可以从开发者终端400和/或技术提供者终端500接收指示是否参与协同开发的信息，并根据接收到的表示是否参加协同开发的信息选择开发者和/或技术提供者。

协同开发系统1000可以使用包含在接收到的协同开发请求中的关于靶核酸的特征信息推导用于指定疾病的特征关键词，并基于推导的特征关键词确定疾病爆发和/或已经爆发的疾病区域。

此后，协同开发系统1000可以使用来自希望参与协同开发的多个开发者终端的位置信息来检查每个开发者是否位于所确定的疾病区域中并选择位于疾病区域中的开发者。可以选择位于疾病区域中的一个开发者，或者根据需要可以选择位于疾病区域中的多个开发者。

协同开发系统1000可以将从希望参与协同开发的多个开发者终端接收的信息提供给评估者终端600，从而发送协同开发参与请求。协同开发系统1000响应于协同开发参与请求接收评估结果并选择开发者。

协同开发系统1000提供了平台，其中可以通过技术提供者终端500和选择的开发者终端400之间的协作来执行用于检测靶核酸的试剂的协同开发，以执行所公开的协同开发。必要时，开发者终端400可以包括开发设备401以执行协同开发。

协同开发系统1000可以接收关于是否获得含有或怀疑含有靶核酸的临床样本的信息。该信息可以从发送协同开发请求的开发者终端400或希望参与协同开发的开发者终端400被接收。根据实施例，关于是否获得临床样本的信息可以包括在协同开发请求或为参与协同开发而发送的信息中。根据实施例，在协同开发系统1000选择开发者以执行协同开发之前，可以从开发者终端400接收关于是否获得临床样本的信息。

图2是示意性地示出根据本公开的协同开发服务器的配置的视图。参考图2，协同开发系统1000中包括的协同开发服务器100包括以下组件。

协同开发服务器100包括用于控制每个组件的控制器110、用于管理协同开发的请求或评估的请求/评估管理单元120、用于实质上管理协同开发的协同管理单元130、和用于存储通过协同开发获得的测试数据和结果的数据库单元140。

控制器110控制用于协同开发检测多种靶核酸的试剂的协同开发服务器100的各个组件。与根据本公开的服务器的组件一起更详细地描述了控制器110对每个组件的控制。

请求/评估管理单元120包括请求管理模块121和评估管理模块122。

请求管理模块121管理协同开发请求的开始、以及协同开发评估之前的步骤。请求管理模块121执行提议管理，该提议管理从请求者(或开发者)接收协同开发请求，并根据接收到的协同开发请求将信息存储在数据库单元140的协同存储模块141中。请求管理模块121可以为请求者的协同开发请求分配管理编号。管理编号可以根据请求者的协同开发请求来顺序分配。

请求管理模块121可以接收来自请求者终端的协同开发请求，如下面的实施例所示。

根据实施例，请求管理模块121可以使用网页方案来请求协同开发，并允许请求者终端访问该网页并输入协同开发的内容

根据另一实施例，请求管理模块121可以提供其中可以创建用于协同开发请求的内容的文件，并且接收请求者已经以文件的形式输入到请求者终端的用于协同开发的内容。

请求管理模块121使用从协同开发请求方案中选择的方案接收协同开发请求。

请求管理模块121对接收到的协同开发请求中包含的协同开发内容进行审查，并确定是否有错误。审查可以包括对协同开发请求执行正式审查的初步评估和对协同开发范围和领域的优劣执行审查的实质评估。或者，评估管理模块122可以同时执行初步评估和实质评估。

在初步评估或实质评估期间，还会审查是否选择了用于实质上执行协同开发的开发者。请求可以在协同开发中负责实质开发，并且可以请求执行实质开发的单独的开发者。

在请求管理模块121执行初步评估的情况下，请求管理模块121将针对协同开发请求的初步评估结果提供给控制器110。

控制器110对接收到的协同开发请求的初步评估进行审查，如果没有错误，则控制评估管理模块122执行实质评估。初步评估的结果可以如下推导。

i)在对协同开发请求的审查的结果没有错误的情况下，

控制器110向评估管理模块122发送协同开发实质评估请求，以便能够对协同开发请求执行实质评估。

ii)在对协同开发请求的审查的结果发生错误的情况下，

控制器110向请求管理模块121发送补充协同开发请求的请求。响应于此，请求管理模块121请求该请求者终端补充协同开发请求。请求管理模块121接收补充后的协同开发请求，再次执行初步评估。

评估管理模块122分两步执行协同开发评估。

第一步是根据协同开发请求的请求评估步骤，第二步是根据协同开发结果的完成后评估步骤。在每个评估步骤中，评估管理模块122如下操作。

1)请求评估步骤中的评估管理模块

控制器110接收到协同开发请求后，响应于协同开发请求，控制评估管理模块122对协同开发的可行性执行评估。

当控制器110请求协同开发的评估时，评估管理模块122选择评估者。评估者应该能够使用协同开发请求来评估协同开发的可行性。

评估管理模块122可以从在协同开发系统1000中注册的多个候选评估者中选择一个或多个评估者。参与协同开发的技术提供者可以在评估管理模块122选择的评估者中。评估管理模块122可以只选择参与协同开发的技术提供者作为评估者。

评估管理模块122可以根据协同开发的领域选择提供给评估者的评估标准的评估项目。评估管理模块122向评估者终端提供包含选择的评估项目的开发评估请求。评估项目可以是预先确定的评估项目，或者可以是根据基于人工智能(AI)使用深度学习或机器学习训练的结果的评估项目。

根据实施例，评估管理模块122可以采用网页方案用于对协同开发可行性评估的请求，并允许评估者终端访问该网页并输入对每个评估项目的评估结果。

根据另一实施例，评估管理模块122可以向评估者终端提供包括评估项目的文件，评估者可以以文件的形式接收通过评估者终端输入的评估结果，并对协同开发执行评估。

评估管理模块122使用从评估请求方案中选择的方案确定接收到的评估者的评估结果，并将评估的确定结果提供给控制器110。

评估管理模块122执行的请求评估可以被执行一次或多次。

根据评估的确定结果，控制器110响应于协同开发请求向请求者终端提供批准或拒绝协同开发的指示。

如果评估确定结果是拒绝协同开发的指示，则控制器110可以指示补充协同开发请求或停止继续进行协同开发请求。相反，如果评估确定结果是批准协同开发的指示，则控制器110执行协同开发请求的下一个过程。

2)完成后评估步骤中的评估管理模块

评估管理模块122在从执行了协同开发的开发者终端(或开发设备)接收到最终的开发结果后，可以对利用最终结果生产试剂的可行性执行完成后评估。完成后评估以与对协同开发请求的请求评估相同的方式执行。

换言之，评估管理模块122可以选择可以执行完成后评估的评估者，向所选择的评估者发送完成后评估请求，从所选择的评估者的评估者终端接收评估结果，以及确定已完成的协同开发的试剂生产的可行性。

根据实施例，由评估管理模块122在完成后评估步骤中选择的评估者可以与在请求评估步骤中选择的评估者相同。这是为了由在请求评估步骤中评估了协同开发可行性的评估者来评估试剂生产的可行性。

根据另一实施例，由评估管理模块122在完成后评估步骤中选择的评估者可以不同于在请求评估步骤中选择的评估者。

由评估管理模块122执行的评估可以包括对协同开发请求的请求评估和对协同开发的结果的完成后评估，如上所述。协同开发系统1000可以在评估管理模块122的帮助下执行请求评估，并在所选评估者的帮助下执行完成后评估。替代地，协同开发系统1000可以在评估管理模块122的帮助下执行这两种评估。

当需要请求评估和/或完成后评估时，评估管理模块122使用评估管理模块122中存储(或操作)的评估标准来执行评估。

评估标准可以被配置为能够评估协同开发部分和/或最终结果部分中的每一个请求，并且可以按照协同开发的技术领域执行评估。

评估管理模块122可以如以下实施示例中进行操作。

i)评估管理模块122可以在不同评估者的帮助下执行请求评估和完成后评估中的每一个。

ii)评估管理模块122可以在评估管理模块122的帮助下执行请求评估和完成后评估中的一个，并且在评估者的帮助下执行请求评估和完成后评估中的另一个。

iii)评估管理模块122可以在评估管理模块122和评估者中的任何一个的帮助下仅执行请求评估和完成后评估中的一个。

iv)评估管理模块122可以省略请求评估和完成后评估两者。

v)协同开发服务器100可以不包括评估管理模块122，因此可以不执行请求评估和完成后评估两者。

如上所述，协同开发服务器100可以根据从五个实施示例中选择的任何一个来操作评估管理模块122。可以根据技术领域和/或协同开发的类型进行选择。

如果根据协同开发的可行性评估批准协同开发，则通过协同管理单元130执行协同开发的过程。

协同管理单元130包括数据管理模块131、主题管理模块132、终端管理模块133、开发设备管理模块134、工具包服务模块135、参与者选择模块136、监控模块137和疾病区域选择模块138。

根据实施例，协同管理单元130可以不包括参与者选择模块136。

根据另一实施例，协同管理单元130可以不包括疾病区域选择模块138。

数据管理模块131管理技术在提供者终端、协同开发系统1000和开发者终端之间相互提供的数据。

开发者终端(包括开发设备)将与开发者在开发者终端和/或开发设备上执行的协同开发相关的测试结果上传到协同开发系统1000。数据管理模块131使用分配给开发者的唯一标识符识别上传到协同开发系统1000的开发者的测试结果，并与之对应地将其存储在数据库单元140的协同开发存储模块中。

当技术提供者请求查看根据协同开发存储的测试结果时，为了进行审查的目的，数据管理模块131使用分配给技术提供者的唯一标识符来认证技术提供者和测试结果。数据管理模块131可以将测试结果提供给经过认证的技术提供者终端。提供的测试结果可以以技术提供者终端可以下载结果文件的方式提供，或者可以通过其中测试结果的复制、下载或截屏为不可用的查看器提供。

数据管理模块131接收审查的结果，该审查的结果是监控模块137和/或技术提供者根据对测试结果的审查而提供的反馈数据，并将其存储在数据库单元140的协同存储模块141中。数据管理模块131允许开发者查看审查的结果(反馈数据)。

根据需要，数据管理模块131可以加密和存储从开发者终端(包括开发设备)和/或技术提供者终端提供的各种数据。提供给协同开发系统1000的各种数据可以由开发者终端(包括开发设备)和/或技术提供者终端加密并提供给协同开发系统1000。数据管理模块131可以对之前加密的数据执行附加加密。

数据管理模块131可以使用分配给相应协同开发的用户标识符来加密各种数据。因此，开发者和技术提供者可以使用他们各自终端上的各自用户标识符来查看存储在数据库单元140的协同开发存储模块中的各种数据。分配给每个的用户标识符可以用作用于查看的解密密钥。

加密和解密可以由数据管理模块131优选地使用分配给每个的用户标识符来执行，但是也可以使用各种安全解决方案来执行，例如ID/PW方案或密码方案。

主题管理模块132根据从协同开发的开始到结束的开发过程来执行例如协同开发的主题编号的生成、用户标识符的生成和丢弃(终止)、以及协同开发的进展/终止的通知。具体地，主题管理模块132在每个协同开发过程中执行以下操作。

i)主题编号的生成

在请求评估(协同开发的可行性评估)中批准协同开发的情况下，主题管理模块132生成协同开发的主题编号。可以生成主题编号以便能够识别协同开发的技术领域和开发范围。另外，主题编号可以考虑主题周期来生成，并且可以包括但不限于字母和数字。

ii)用户标识符的生成和丢弃

在生成主题编号并选择开发者和技术提供者后，主题管理模块132向开发者和技术提供者提供用于识别协同开发的用户标识符。用户标识符可用于识别开发者和技术提供者、针对用于协同开发的开发设备或开发工具包的使用和访问的使用认证、以及对开发者和技术提供者生成的数据(包括文档)的加密。

因此，用户标识符包括例如与主题编号匹配的用户ID和密码，以便能够识别开发者和技术提供者。用户标识符包括例如用于访问和批准使用开发设备或开发工具包的证书。用户标识符包括用于数据加密的加密密钥。用户标识符包括解密密钥，参与协同开发的开发者或技术提供者可以通过该解密密钥查看加密数据。

当协同开发终止时，主题管理模块132丢弃或停止使用分别提供给开发者和技术提供者的用户标识符。必要时，即使在协同开发终止后，也可以维持用户标识符的某些功能，以便能够查看协同开发期间产生的数据。

主题管理模块132生成的用户标识符具有预定的开发周期，在此期间进行协同开发。因此，用户标识符可以在开发期期间被激活，但是可以在开发周期之后被自动停用。

iii)协同开发的进展/终止的通知

在请求评估(协同开发的可行性评估)中批准协同开发的过程的情况下，主题管理模块132向开发者终端和技术提供者终端提供启动主题的通知，包括生成的主题编号和用户标识符。

如果主题管理模块132接收到协同开发的最终结果并且完成后评估完成，则主题管理模块132向开发者终端和技术提供者终端提供协同开发终止(完成)的通知。

协同开发终止(完成)的通知可以包括用于停止使用用户标识符的数据。提供给开发者和技术提供者的用户标识符被配置为在协同开发周期后自动停止使用，协同开发终止(完成)的通知可以不包含停止使用用户标识符的数据。

终端管理模块133控制(例如，批准/拒绝)开发者终端和技术提供者终端对协同开发系统1000的访问，并管理其日志。当多个协同开发正在进行并且多个开发者终端和多个技术提供者终端请求连接到协同开发系统1000时，终端管理模块133识别每个终端并建立或停止会话。会话中的每个终端可以使用提供的用户标识符来使用工具包服务模块135、上传协同开发期间获得的数据、和/或查看或下载存储在数据库单元140中的数据。

优选只允许针对通过用户标识符认证的终端的会话。

开发设备管理模块134管理用于协同开发的开发设备。随着协同开发的进行，开发者将自己的设备和/或技术提供者提供的设备注册为用于协同开发的设备，并且开发设备管理模块134监控开发设备的状态。

例如，开发设备管理模块134确定是否已经安装或更新了适合开发设备的固件。

开发设备管理模块134根据协同开发确定开发设备是否可以充分执行测试。例如，开发设备管理模块134可以确定核酸扩增设备(例如，PCR设备)是否能够进行实时核酸扩增测试或者测试板中的孔数是否满足协同开发所需的标准。

此外，开发设备管理模块134接收注册用于协同开发的开发设备的错误报告，并将历史或日志提供给开发者终端和/或技术提供者终端。此后，开发者和/或技术提供者通过协同开发系统1000将对错误的解决方案发送到导致错误的开发者终端或开发设备。

作为代表性示例，核酸扩增设备可以连接到开发者终端。核酸扩增装置是开发用于检测靶核酸的多重试剂所必需的设备，并且具体地，包括实时核酸扩增设备，例如实时PCR设备。

工具包服务模块135以云类型或软件即服务(Saas)类型来服务由技术提供者提供给开发者终端和/或开发设备的开发工具包。

该工具包可以是封装的形式，并且在开发者终端和/或开发设备上下载、安装和/或使用。然而，根据需要，工具包虽然被开发者终端和/或开发设备使用，但可以不被下载而是可以通过访问协同开发系统1000来使用。

在这种情况下，协同开发系统1000允许开发者终端和/或开发设备使用工具包服务模块135以在线服务类型(例如，云类型)使用工具包。

当技术提供者被确定为协同开发请求被批准时，控制器110在工具包服务模块135中注册所确定的技术提供者的工具包以供开发者以云类型和/或SaaS类型使用。

协同开发服务器100的工具包服务模块135可以在线服务提供给开发者终端和/或开发设备的开发工具包。

工具包服务模块135可以在将工具在线提供给开发者终端和/或开发设备的同时接收用于工具测试的数据，如下。

i)可以从开发者终端和/或开发设备接收所接收到的用于在工具包服务模块135中包括的工具中执行测试的数据。

在这种情况下，从开发者终端和/或开发设备接收的数据可以由数据管理模块131存储在数据库单元140的协同存储模块141中，并提供给工具包服务模块135的工具。或者，从开发者终端和/或开发设备接收的数据可以由数据管理模块131临时存储在工具包服务模块135中，并提供给工具包服务模块135的工具。

ii)接收到的用于在工具包服务模块135中包括的工具中执行测试的数据可以是在工具包服务模块135的其他工具中执行的测试的结果。

在这种情况下，在其他工具中执行的测试的结果可以由数据管理模块131存储在数据库单元140的协同存储模块141中，并提供给工具包服务模块135的工具。或者，在另一个工具中执行的测试的结果可以临时存储在工具包服务模块135中，并提供给工具包服务模块135的工具。

同时，接收到的用于在工具包服务模块135的工具中执行测试的数据(结果)是在用于协同开发的工具包中执行的测试的结果。

此外，工具包服务模块135可以提供在任何一个工具执行测试时生成的数据，如下。

i)生成的数据可以用作工具包服务模块135的其他工具的输入数据。

ii)生成的数据可以提供给执行相应协同开发的开发者终端和/或开发设备。

iii)生成的数据可以提供给协同开发服务器100中的监控模块137，以供协同开发系统1000和/或技术提供者验证。

工具包服务模块135可以接收对输入数据的加密和输出数据的解密的支持。

i)在接收到的供在工具中使用的数据被加密和接收的情况下，工具包服务模块135可以从协同开发系统1000接收对加密数据的解密。

ii)在工具中执行测试生成的测试数据的情况下，工具包服务模块135可以从协同开发系统1000接收对测试数据的加密。

加密或解密可通过控制器110在协同开发服务器100中包含的数据管理模块131、主题管理模块132、终端管理模块133、开发设备管理模块134或工具包服务模块135中的任何一个或多个中执行。

协同开发由多个开发者根据多个协同开发执行，并且工具包服务模块135可以接收来自多个开发者终端和/或开发设备的工具使用请求。工具包服务模块135的每个工具可以依次处理来自多个开发者终端和/或开发设备的工具使用请求，并批准工具的使用。

在工具包服务模块135提供的任何一种工具用于不同的协同开发的情况下，工具包服务模块135可以自动改变例如用于工具的参数或其他设置值，以适合由请求使用该工具的开发者终端和/或开发设备执行的协同开发。在这种情况下，对于设置值的自动改变，控制器110可以识别尝试访问以使用工具的开发者终端和/或开发设备的用户标识符，并且工具包服务模块135可以做出改变以适合与控制器110识别的用户标识符相对应的协同开发。

根据实施例，工具包服务模块135可以被包括在协同开发服务器100中以向开发者提供服务。

根据另一实施例，工具包服务模块135可以不包括在协同开发服务器100中，而是可以在单独的位置提供服务。从多个技术提供者提供的工具包中的每一个都可以包括一个或多个工具。如果每个工具使用的资源较多，则可以将其配置为独立于协同开发服务器100的单独的工具包服务服务器，并且为开发者终端和/或开发设备提供服务。

根据实施例，从技术提供者提供给开发者的开发工具包包括开发用于检测靶核酸的试剂所必需的工具。

这些工具可以包括寡核苷酸设计工具、寡核苷酸性能测试工具、性能测试分析工具、性能测试文档工具、加密支持工具和/或其他开发工具。技术提供者可以具有上面列出的工具中的至少一种或多种，并且随着协同开发的进行，技术提供者可以选择性地向开发者提供其自己的工具。

在这些工具中，以软件形式提供的工具(包括指导信息)可以通过技术提供者终端发送到协同开发系统1000和/或开发者终端。在这种情况下：

i)工具可以是安装文件的形式，可以安装在开发者终端和/或开发设备上；或者

ii)工具可以是可执行文件的形式，无需安装即可执行。

指导信息为文档、图像、视频、音频或其他文件的形式，开发者可以通过开发者终端和/或开发设备进行视觉/听觉识别。

每个工具可以包括软件或/和指导信息中的一个或两个。

下面在根据本公开内容的用于协同开发用于检测靶核酸的试剂的方法的部分中更详细地描述每个工具。

根据实施例，当协同开发由请求者执行时，参与者选择模块136选择参与协同开发的开发者和/或技术提供者。参与者选择模块136可以使用存储在数据库单元140的协同存储模块141中的开发者信息和技术提供者信息来选择开发者和技术提供者。下面结合协同存储模块141来详细描述开发者信息和技术提供者信息。

根据另一实施例，参与者选择模块136选择包括在由疾病区域选择模块138选择的疾病区域中的开发者。在选择与待通过协同开发来开发的用于检测靶核酸的试剂相对应的疾病的疾病区域的情况下，可以从请求参与协同开发或请求申请协同开发的多个候选开发者中选择开发者。下面结合疾病区域选择模块138详细描述疾病区域的选择。

根据另一实施例，参与者选择模块136选择包括在由疾病区域选择模块138选择的疾病区域中的开发者。可以从请求参与协同开发或请求申请协同开发的多个候选开发者中选择已经获得或能够获得包含或怀疑包含待通过协同开发来开发的靶核酸的临床样本的开发者。

参与者选择模块136可以根据来自控制器110的指令在以下每种情况下选择参与协同开发的开发者和/或技术提供者。

1)如果选择开发者，

如果从请求者接收到协同开发请求，并且协同开发继续进行，则选择协同开发的开发者。根据协同开发的领域和/或试剂的种类，开发者可以是来自各个工业部门的人员。

在多个候选开发者中，选择适合协同开发的开发者。所选择的开发者是先前在协同开发系统1000中注册的开发者，并且可以在协同开发系统1000中注册可用于协同开发的技术领域和/或试剂的种类，使得这样的选择成为可能。根据需要，可以选择多个开发者。可以根据需要选择技术提供者和评估者。

参与者选择模块136向被选择的开发者提供参与(开发)协同开发的请求，并从开发者终端接收指示开发者是否参与协同开发的信息。参与者选择模块136在从开发者终端接收到指示被选择的开发者不能参与协同开发的信息后，选择其他开发者并提供参与协同开发的请求。

参与者选择模块136可以从申请协同开发的多个候选开发者中选择至少任意一个或多个开发者。在这种情况下，所选择的开发者可以是包括在疾病区域中的开发者或者已经获得或能够获得含有或怀疑含有靶核酸的临床样本的开发者。在已申请协同开发并被初选的开发者中，可二次选择包括在疾病区域中的开发者。

2)如果请求者和开发者相同，

在请求与开发者相同的情况下，请求者(开发者)可以参与并执行协同开发。换言之，协同开发请求中包含的开发领域和/或试剂种类是针对请求者(开发者)可以开发的协同开发的。因此，可以省略开发者选择。

另一方面，即使当请求者是开发者时，也可以执行开发者选择。例如，可以选择能够通过协同开发获得用于开发用于检测靶核酸的试剂的测试的“临床样本”的开发者。因此，对于请求协同开发的开发者，确定开发者是否位于根据靶核酸的特征信息设置的疾病区域中，或者开发者是否能够获得临床样本。在开发者位于疾病区域中或开发者能够获得临床样本的情况下，协同开发继续进行。除非请求协同开发的请求者(开发者)位于疾病区域中或能够获得临床样本，否则协同开发系统1000可以i)选择其他开发者进行协同开发或ii)停止协同开发。

因此，协同开发系统1000可以进一步执行确定请求协同开发的请求者(开发者)是否位于疾病区域中或者是否能够获得临床样本的步骤。这是为了选择位于与待通过协同开发来开发的用于检测靶核酸的试剂相对应的疾病爆发的区域中的开发者或能够获得临床样本的开发者。

即使当请求者是开发者时，也可以选择附加开发者。例如，请求者(开发者)可以负责整个协同开发的预定部分，而其他选择的开发者可以负责协同开发的其余部分。根据需要，可以选择多个开发者。

可以根据需要选择技术提供者和评估者。

参与者选择模块136向所选择的附加开发者提供参与(开发)协同开发的请求，并从开发者终端接收指示开发者是否参与协同开发的信息。参与者选择模块136在从开发者终端接收到被选择的开发者不能参与协同开发的信息后，选择其他开发者并提供参与协同开发的请求。

当有来自请求者(开发者)的协同开发请求时，参与者选择模块136可以从申请所请求的协同开发的多个候选附加开发者中选择至少如何一个或多个附加开发者。在这种情况下，所选择的附加开发者可以是包括在疾病区域中的开发者或者可获得临床样本的开发者。在已申请协同开发并被初选的开发者中，可二次选择包括在疾病区域中的开发者。

3)如果是多个技术提供者，

取决于根据协同开发的开发领域和/或试剂种类，在具有各种技能的技术提供者中，选择具有并能够提供适合要执行的协同开发的开发设备和/或工具包的技术提供者。在这种情况下，技术提供者是先前在协同开发系统1000中注册的技术提供者。技术提供者选择所选择的技术提供者的开发设备和/或开发工具包可以提供给开发者终端和/或技术提供者终端。

参与者选择模块136向所选择的技术提供者提供参与(开发)协同开发的请求，并从技术提供者终端接收指示技术提供者是否参与协同开发的信息。参与者选择模块136在从技术提供者终端接收到指示被选择的技术提供者不能参与协同开发的信息后，选择其他技术提供者，并提供参与协同开发的请求。

如果参与者选择模块136开始了具有并且能够提供适用于所请求的协同开发的开发设备和/或工具包的技术提供者的参与，则参与者选择模块136可以在申请参与协同开发的多个附加技术提供者之间选择至少任何一个或多个附加技术提供者。

监控模块137对从开发者终端和/或开发设备接收的结果进行审查。监控模块137可以向技术提供者提供访问接收到的结果的权限。数据库单元140的协同存储模块141存储协同开发的测试结果，每个存储的结果按照协同开发及其用户标识符进行分类和存储。监控模块137可以提供与技术提供者要访问的技术提供者的用户标识符相对应的用户标识符分配结果。

访问结果的示例可以包括技术提供者经由技术提供者终端查看存储在数据库单元140中的结果的方法、以及技术提供者下载结果的文件以能够使用技术提供者终端提供的开发工具包验证结果的方法。根据另一实施例，可以在协同开发系统1000的控制下向技术提供者提供可以通过其获得对开发者终端的访问的统一资源定位符(URL)，允许技术提供者直接查看和/或下载来自开发者终端的结果。在这种情况下，可以采用使用URL以外的其他方法来使用通信网络提供对开发者终端的访问。

从监控模块137提供给技术提供者的结果可以被加密，并且技术提供者可以使用用户标识符或单独的解密模块来识别加密的结果。

监控模块137从技术提供者终端接收审查的结果。审查的结果包括提供给技术提供者终端查看或下载的结果的反馈信息，并且审查的结果包括用于验证性能测试结果并对其重新执行或批准性能测试的信息。

监控模块137将从技术提供者终端接收到的审查的结果存储在数据库单元140的协同存储模块141中，以使用用户标识符进行分类。此后，监控模块137可以为开发者终端提供访问存储的审查的结果的权限。审查的结果包含技术提供者结果的反馈信息，因此需要开发者确认。为此，监控模块137将存储的审查的结果提供给开发者终端供开发者查看或下载，从而允许开发者查看或下载审查的结果。

监控模块137使用以下方法来提供接收到的测试结果和/或审查的结果。

第一种方法是主动方法，当接收到结果时，将结果发送到技术提供者终端和/或开发者终端。

第二种方法是被动方法，接收结果，并且在从技术提供者终端和/或开发者终端接收到对结果的请求时，发送结果。

监控模块137可以使用从技术提供者提供的结果验证技术来验证从开发者接收的结果，并为其生成审查的结果。结果验证技术是这样的技术，其可以用多个测试结果及其审查的结果来训练监控模块137，以允许监控模块137本身读取结果并推导结果，例如性能测试的批准或重新执行。

根据实施例，结果验证技术可以使用例如使用深度学习或机器学习的基于人工智能(AI)的训练结果。

或者，监控模块137可以具有结果验证技术，并且技术提供者可以提供用于结果验证技术的多个测试结果及其审查的结果。

疾病区域选择模块138可以从技术提供者、开发者或请求者的终端发送的请求协同开发的协同开发请求中关于靶核酸的特征信息中指定疾病，并且可以选择指定疾病爆发和/或指定疾病已在预定时间段内爆发的区域。

协同开发请求中关于靶核酸的特征信息包含用于指定待通过协同开发来开发的用于检测靶核酸的试剂的信息。

疾病区域选择模块138从关于靶核酸的特征信息中提取特征关键词，用于指定开发的试剂可以检测的疾病。根据实施例，将提取的特征关键词与存储的信息和疾病关键词进行比较，与它们在数据库单元140中的疾病区域选择模块138中存储的相应疾病匹配，并将匹配率高的疾病指定为可以通过待通过协同开发来开发的试剂进行检测的疾病。根据另一实施例，可以用关于靶核酸的特征信息中包含的疾病名称来指定疾病。根据另一实施例，可以用包含在关于靶核酸的特征信息中的疾病分类符号来指定疾病。

此后，疾病区域选择模块138参考数据库单元140中的疾病区域存储模块143，使用指定疾病的名称来选择指定疾病当前正在爆发和/或指定疾病已在预定时间段内爆发的区域。

疾病区域存储模块143存储疾病名称、疾病特征、疾病关键词或疾病爆发区域，它们被分类为各种类别，例如疾病、区域、爆发时间、第一爆发区域和二次感染区域。

下面结合疾病区域存储模块143更详细地描述疾病区域信息。

因此，疾病区域选择模块138可以通过将指定疾病与存储在疾病区域存储模块143中的疾病爆发区域进行比较来选择疾病区域，该疾病区域是指定疾病正在爆发和/或指定疾病已在预定时间段内爆发的区域。

此后，当参与者选择模块136选择开发者时，可以确定开发者是否位于所选择的疾病区域中，并且可以选择位于疾病区域中的开发者。

选择位于所选择的疾病区域中的开发者的原因是在疾病爆发的区域容易获取临床样本。位于非疾病爆发区域的区域中的大学、三级医院、研究中心或企业也可能拥有各种临床样本。然而，他们拥有的临床样本的种类和数量可能是有限的，对于某些疾病，他们可能没有或没获得临床样本。

因此，由位于疾病爆发区域中的开发者对用于检测靶核酸的试剂执行测试可能是优选的。

数据库单元140包括用于存储用于协同开发的信息的协同存储模块141和用于存储技术提供者提供的开发工具包的工具包存储模块142。虽然图2根据实施例示出了数据库单元140被包括在协同开发服务器100中，但是数据库单元140可以替代地位于协同开发服务器100之外。

虽然图2根据实施例示出了数据库单元140作为单个组件被包括在协同开发服务器100中，但是数据库单元140可以替代地作为多个单独的组件被包括在协同开发服务器1000中。

虽然图2根据实施例示出了数据库单元140包括协同存储模块141和开发工具包存储模块142，但根据另一实施例，一个或多个协同存储模块141和开发工具包存储模块142可以包括在多个数据库单元140中的每一个中。

协同存储模块141按照以下分类存储用于协同开发的信息。

(i)用户信息

协同存储模块141存储关于开发者、技术提供者、请求者或评估者的用户信息。用户可以是个人、研究中心、企业或医院。协同存储模块141存储用于确定每个用户是否可以参与协同开发的信息。

例如，协同存储模块141可以存储例如用于确定开发者是否能够执行协同开发中的各种性能测试的信息，例如他的专业、开发生涯或参与协同开发的历史。

协同存储模块141可以包括例如用于确定技术提供者的协同开发可提供的技术、开发工具包、开发设备和/或生产开发产品的能力的信息。

协同存储模块141可以包括例如用于综合确定协同开发的可行性、开发者的协同开发能力、以及使用从开发者或请求者接收的协同开发请求以用于评估者是否商业化的信息。

用户信息可以被提供给参与者选择模块136并且用于选择开发者和/或技术提供者。用户信息也可以在请求评估步骤中提供给评估者，并用于评估协同开发请求。

(ii)性能测试数据

协同存储模块141存储例如开发者在正在进行的协同开发中使用开发者终端和/或开发设备执行的性能测试的结果。协同开发系统1000可以同时执行多个协同开发，并且协同存储模块141接收多个开发者执行的性能测试的结果并存储它们以由数据管理模块131使用用户标识符进行分类。

(iii)审查的结果

协同存储模块141对从开发者接收的性能测试数据进行审查，并存储生成的审查的结果。审查的结果可以由监控模块137和/或技术提供者的技术提供者终端生成，并且协同存储模块141存储审查的结果并存储它以由数据管理模块131使用用户标识符进行分类。

(iv)用于结果验证技术的大数据

协同存储模块141存储用于监控模块137的结果验证技术的数据，例如无数的测试结果及其审查的结果。该数据从技术提供者终端接收并由数据管理模块131存储。该ii)在协同开发中生成的性能测试数据和/或iii)审查的结果也可以作为大数据由数据管理模块131存储。

(v)协同开发请求和评估信息

协同存储模块141存储关于从请求者接收的协同开发请求的信息。协同开发请求信息可以与请求者的用户信息相关联地存储。

协同存储模块141还存储关于评估者和/或评估管理模块122所执行的评估的评估信息。评估信息可以与评估者的用户信息相关联地存储。

评估信息可以分类为请求评估步骤中的评估信息和完成后评估步骤中的评估信息，并且当接收到每一类评估信息时，其被存储以由数据管理模块131使用用户标识符进行分类。

(vi)日志

协同存储模块141接收在使用由开发者和/或技术提供者使用的开发设备或开发工具包(包括开发工具包服务模块135)时产生的日志，并将其通过数据管理模块131进行存储。日志可包括日期、时间、用户、地点和/或次数、或用于开发设备和/或开发工具包的使用的此类信息中的至少任何一项或多项。

上述列举的信息可以由数据管理模块131进行加密和存储。提供给开发者、技术提供者和评估者中的每一个的终端的数据可以由数据管理模块131解密和发送。

工具包存储模块142存储从技术提供者提供的开发工具包。开发工具包以软件和/或文件的形式提供，并被存储以由数据管理模块131使用用户标识符进行分类。

工具包可以从技术提供者(i)在执行协同开发之前或(ii)在协同开发获得批准之后提供。

因此，工具包存储模块142中存储的各技术提供者的开发工具包可以是用于协同开发的开发工具包，或者可以是之前存储的用于将来执行的协同开发的开发工具包。

开发工具包可以从技术提供者提供，或者可以根据以下实施示例提供给开发者。

1)从技术提供者提供开发工具包的时间

协同开发系统1000可以根据以下实施示例通过技术提供者终端从技术提供者接收开发工具包。

i)技术提供者可以通过技术提供者终端向协同开发系统1000提供自己的开发工具包，同时向协同开发系统1000发送注册请求以进行协同开发。

ii)技术提供者在被选择参与协同开发后，可以通过技术提供者终端向协同开发系统1000提供自己的开发工具包。

iii)技术提供者在被选择参与协同开发后，可以通过技术提供者终端向开发者终端和/或开发设备提供自己的开发工具包。

2)提供开发工具包的途径

开发工具包可以从技术提供者终端提供给协同开发系统1000。开发工具包可以由协同开发系统1000提供给开发者终端。开发工具包可以从技术提供者终端提供给开发者终端。开发工具包可以由技术提供者提供给开发者。

在技术提供者终端、协同开发系统1000和/或开发者终端之间传输的开发工具包可以通过以下各种方法提供。

i)在线提供

在开发工具包中，以软件(包括指导信息)形式提供的工具可以通过技术提供者终端传输到协同开发系统1000和/或开发者终端。在这种情况下，工具优选为可以安装在开发者终端和/或开发设备上的安装文件或可执行文件的形式。指导信息为文档、图像、视频、音频或其他文件的形式，开发者可以通过开发者终端和/或开发设备进行视觉/听觉识别。

ii)离线提供

技术提供者可以直接离线向开发者提供用于协同开发的开发设备。由于开发设备包含技术提供者的专有技术，因此需要防止丢失或损坏。因此，技术提供者可以使用用于运输和安装的人员和/或设备将其提供给开发者。

此外，出于上述原因，可以在开发者终端和/或开发设备上操作的开发工具包可以存储在便携式存储设备中并提供给开发者。便携式存储设备可以从包括外部硬盘驱动器、通用串行总线(USB)驱动器、或光盘(CD)的各种类型中选择。

iii)以安装在开发设备上进行提供

在技术提供者的开发工具包中，用于开发设备的一些开发工具包可以预装在协同开发中并且提供给开发者。

3)使用开发工具包的实体

通过访问协同开发服务器100中的工具包服务模块135，开发工具包可以从协同开发系统1000或技术提供者终端(独立类型)下载或以在线服务类型(云类型)使用。

从协同开发系统1000提供的开发工具包允许被开发者终端或开发设备根据以下实施示例使用。

i)开发者终端对开发工具包的使用

使用开发工具包的实体可以是开发者终端。图5示出了其中开发者终端访问存储在协同开发服务器100中的开发工具包的示例方案。

图5是示出根据本公开的开发者终端或开发设备访问协同开发服务器中存储的开发工具包的配置的视图。如图5所示，开发者终端400访问协同开发服务器100的工具包存储模块142并下载开发工具包(独立类型)。

此外，开发者终端400访问协同开发服务器100的工具包服务模块135，并以在线服务类型(云类型)使用开发工具包。

ii)通过开发者终端使用开发设备的开发工具包

使用开发工具包的实体可以是开发设备。然而，开发设备并不直接访问协同开发服务器100，而是通过与协同开发服务器100链接的开发者终端间接访问协同开发服务器100，以使用开发工具包。

开发设备访问在协同开发服务器100中存储的开发工具包的方案可以描述如下。根据另一实施例，开发设备可以通过开发者终端间接访问协同开发服务器100的工具包存储模块142，并且下载并使用开发工具包。

另外，开发设备可以通过开发者终端访问协同开发服务器100的工具包服务模块135，并且以在线服务类型(云类型)使用开发工具包。

换言之，在另一实施例中，在开发设备能够与开发者终端进行通信连接但无法连接外部通信网络的情况下，开发设备可以通过开发者终端间接访问协同开发服务器100以下载开发工具包或以在线服务类型接收开发工具包。

iii)开发设备对开发工具包的使用

使用开发工具包的实体可以是开发设备。根据另一实施例的开发设备访问在协同开发服务器100中存储的开发工具包的另一种方案可以描述如下。

根据另一实施例，开发设备可以访问协同开发服务器100的工具包存储模块142以下载和使用开发工具包。

另外，开发设备可以访问协同开发服务器100的工具包服务模块135，并且以在线服务类型(云类型)使用开发工具包。

换言之，根据另一实施例，开发设备可通过通信网络直接访问协同开发服务器100以下载开发工具包或以在线服务类型服务开发工具包。

优选地，在协同开发服务器100的开发设备管理模块134中，预先将提供给开发者的开发设备注册为用于协同开发的设备。通过这样做，开发者和/或开发者终端使用的开发设备的状况可被监控。此外，协同开发系统1000可以接收并存储开发设备生成的日志。日志由数据管理模块131存储在数据库单元140的协同存储模块141中。

疾病区域存储模块143存储关于当前在全世界爆发和/或已经爆发的疾病的各种信息。存储的信息包括每种疾病的名称(定义)、疾病分类代码、疾病病原体、疾病传播途径、疾病爆发区域(当前和过去)、疾病的各种描述(例如，潜伏期、症状、治疗和护理、预防、诊断方法)或疾病关键词。疾病区域存储模块143中存储的疾病信息还包括传染病和遗传病。存储在疾病区域存储模块143中的每种疾病可以包括以下信息，并且在必要时还包括相关的附加信息。

i)疾病的名称

疾病可以分为传染病和遗传病，并且存储分类的传染病和遗传病的名称。

例如，传染病包括霍乱、伤寒、副伤寒、志贺氏菌病、甲型肝炎、白喉、麻疹、肺炎链球菌、疟疾、炭疽、AIDS(获得性免疫缺陷综合症)、流感、鼠疫、登革热、埃博拉病毒、MERS(中东呼吸综合征冠状病毒)、禽流感、黄热病、脊髓灰质炎等。

遗传病包括镰状细胞病、白化病、威尔逊病、亨廷顿病、法布里病、梅拉斯综合征、猫叫综合征、WARG综合征、Wolf-Hirschhorn综合征、Patau综合征、唐氏综合征、特纳综合征、Klinefelter综合征、癫痫、近视、糖尿病或其他各种疾病。

ii)疾病区域

疾病爆发可以按区域分类。可以将区域分类为例如地理区域、气候区域和/或行政区域。

例如，可以基于行政区域将疾病分类为例如主要在非洲大陆、具体地在南美洲、主要在亚洲、具体地在印度、或具体地在中国湖南爆发的疾病。或者，可以基于气候区域将疾病分类为例如具体地在地中海海岸线、主要在亚热带地区、或具体地在热带气候中爆发的疾病。还可以基于地理区域将疾病分类为例如主要在北纬24度以上区域和北纬15度至南纬15度之间的区域爆发的疾病。

特别是，每个国家控制旅行者检疫的疾病控制和预防中心(CDC)提供有关传染病爆发区域的信息。

根据实施例，埃博拉病毒正在刚果民主共和国传播。

根据另一实施例，MERS正在沙特阿拉伯、阿拉伯联合酋长国、阿曼和科威特爆发。必要时，可附加地指定污染区域的邻国也门、卡塔尔、巴林、约旦、伊朗和黎巴嫩。

根据另一实施例，禽流感(H5N1、H7N9)正在中国五个省份传播，包括广东、广西、云南、江苏和湖南。

根据另一实施例，黄热病正在非洲大陆上的喀麦隆、刚果民主共和国、刚果、安哥拉、贝宁、布基纳法索、布隆迪、中非共和国、乍得、象牙海岸、赤道几内亚、埃塞俄比亚、加蓬、冈比亚、加纳、几内亚、几内亚比绍、肯尼亚、利比里亚、马里、毛里塔尼亚、尼日尔、尼日利亚、塞拉利昂、塞内加尔、南苏丹、苏丹、多哥和乌干达、以及美洲的阿根廷、玻利维亚、巴西、哥伦比亚、厄瓜多尔、法属圭亚那、圭亚那、巴拿马、巴拉圭、秘鲁、苏里南、特立尼达和多巴哥以及委内瑞拉传播。

在另一实施例中，霍乱正在亚洲的也门、菲律宾和印度、非洲大陆上的喀麦隆、刚果、安哥拉、肯尼亚、马拉维、尼日尔、尼日利亚、乌干达、坦桑尼亚、索马里、莫桑比克、赞比亚、津巴布韦和阿尔及利亚传播。

在另一实施例中，脊髓灰质炎正在亚洲的巴基斯坦和阿富汗、非洲大陆上的刚果民主共和国、肯尼亚、尼日尔、尼日利亚、坦桑尼亚和巴布亚新几内亚传播。

在另一实施例中，鼠疫在非洲大陆上的马达加斯加出现了新病例。

在上述实施例中，虽然以基于行政区域划分的大陆和国名来存储每种疾病的爆发区域，但是必要时它们可以基于地理区域和/或气候区域进行分类和存储。

根据实施例，在地理区域中，可以用经纬度或GPS坐标来显示疾病区域，或者可以将整个地球划分为具有预定大小面积的格子并用格子地址来显示，或者可以通过其他方式用其他地理显示方法显示。

根据另一实施例，气候区域可以被显示为根据各种标准划分疾病区域所产生的气候区域。例如，疾病区域可以根据区域的温度分为热带气候、干燥气候、温带气候、微热气候和极地气候区域。

根据温度划分的每个气候被细分。例如，热带气候细分为热带雨林气候(Af)、热带季风气候(Am)、干湿气候(Aw)和热带稀树草原气候(As)。干燥气候细分为沙漠气候(BS)和草原气候(BW)。温带气候细分为亚热带湿润气候(Cfa)、西海岸海洋性气候(Cfb、Cfc)、温带冬季干燥气候(Cw)和地中海气候(Cs)。微热气候细分为大陆性湿润气候(Df)、大陆性冬季干燥气候(Dw)和地中海高原气候(Ds)。最后，极地气候细分为苔原气候(ET)和冰帽气候(EF)。

在另一实施例中，在行政区域中，可以将疾病区域显示为行政区域。例如，疾病区域可以分为大洲、国家、城市或这样的区域。

在疾病区域存储模块143中存储的关于疾病爆发区域的信息可以通过世界卫生组织(WHO)和/或各国疾病控制与预防中心(CDC)提供的信息获得。

例如，WHO或CDC提供有关全球爆发的疾病的信息。提供的信息包括每种疾病的定义和分类、全国和世界范围内的爆发、原因、传播途径、症状、诊断和治疗、患者护理、预防和感染地区信息。疾病区域存储模块143通过疾病信息存储疾病爆发区域，并且也可以通过相关疾病信息存储疾病关键词。

iii)疾病爆发时间

疾病在预定的时间段停止传播，但之后又会爆发。此外，由于感染者离开爆发区域的原因，可能会在另一个区域发现新病例。在这种情况下，即使两个区域之间的距离很远并且爆发时间不同，这些区域也可能会显示为同一疾病的爆发。

相比之下，尽管由于感染者从爆发区域移动而另一个地区出现了新病例，但该疾病可能会发生变异。在这种情况下，它们可能被确定为同一种疾病，但可能需要开发单独的试剂来确定它们是否被感染。

疾病区域存储模块143根据疾病名称、疾病爆发区域和疾病爆发时间存储疾病，并且还存储附加信息，例如用于识别疾病的疾病关键词。疾病关键词可以与含有靶核酸的生物体名称、含有靶核酸的基因名称、靶核酸的序列、检测靶核酸的试剂的期望用途、疾病名称、或靶核酸的特征信息中包含的疾病的分类符号进行比较，从而允许确定目标核酸的特征信息指定为什么疾病。

因此，疾病关键词是用于识别疾病的信息，通过与从协同开发请求信息中的靶核酸特征信息提取的特征关键词进行比较来指定疾病，从而可以选择疾病爆发的一个或多个区域作为疾病区域。

每个疾病关键词由用于指定疾病的各种信息组成。

在实施例中，MERS的疾病关键词可以包括中东呼吸综合征冠状病毒(MERS)、中东呼吸综合征、冠状病毒、急性呼吸系统疾病、MERS-CoV、β冠状病毒、HCoV-EMC/2012、进化枝A、进化枝B、Jordan-N3/2012、Vero Cells(Vero细胞)、人类β冠状病毒，HCoV-OC43、HCoV-HKU1、新型冠状病毒、沙特SARS、特定基因(UpE、ORF1a、ORF1b、N)、患病地区(沙特阿拉伯、UAE、阿曼、科威特、也门、卡塔尔、巴林、约旦、黎巴嫩、伊朗)、主要临床症状(发烧、咳嗽、呼吸困难、头痛、发冷、喉咙痛、流鼻涕、肌肉疼痛、厌食、恶心、呕吐、腹部疼痛、腹泻、肺炎)、并发症(呼吸衰竭、肺休克、多器官衰竭)、检查结果(白细胞减少症、淋巴细胞减少症、血小板减少症、LDH升高)。

在另一实施例中，埃博拉病毒的疾病关键词可以包括埃博拉病毒、病毒性出血热、埃博拉-扎伊尔、埃博拉-苏丹、埃博拉-科特迪瓦、埃博拉-雷斯顿、埃博拉出血热(EHF)、叶状病毒家族、动物嗜性病毒、患病地区(中非、刚果民主共和国、苏丹)、基因序列(3’-leader-NP-VP35-VP40-GP/sGP-VP30-VP24-L-tail-5)、主要临床症状(头痛、发烧、肌痛、恶心、呕吐)、腹泻、咳嗽、胸痛、皮疹、水肿、眼充血、喉咙痛)、检测结果(白细胞减少、血小板计数增加、肝酶增加)。

在另一实施例中，霍乱的疾病关键词可以包括霍乱(霍乱弧菌O1或霍乱弧菌O139)、孟加拉弧菌、ICD-10A00、弧菌科、霍乱毒素、霍乱弧菌经典型、霍乱弧菌El tor型、稻叶亚型、小川亚型、彦岛亚型、鱼贝类感染、口腔感染、主要临床(腹泻、呕吐、脱水、低血容量性休克)、并发症(肾功能衰竭、脱水、电解质紊乱)。

在另一实施例中，鼠疫的疾病关键词可以包括鼠疫、鼠疫杆菌、革兰氏阴性菌、太阳疫(黑死病)、败血性鼠疫、肺鼠疫、咽部疫、脑膜疫、机能不全、黑瘟、鼠疫、β受体阻滞、主要临床(寒战、发热、肌肉疼痛、关节痛、头痛、出血性化脓性炎症、淋巴结出血性炎症、恶心、呕吐、腹泻、出血点、肾功能下降、休克、急性呼吸衰竭综合征、全身无力、呼吸短促、咳嗽、咳痰、胸痛、咯血、呼吸衰竭、心血管衰竭、缺血性坏死)、并发症(弥散性血管内凝血、急性呼吸衰竭、脑膜炎)。

根据实施例，数据库单元140可以不包括疾病区域存储模块143。

II.用于协同开发用于检测靶核酸的试剂的计算机实施的方法

图3示意性地示出了根据本公开的协同开发方法的一个方面。下面分阶段详细描述根据本公开的协同开发方法。

步骤(a)：接收协同开发请求

首先，从请求者终端接收包含用于检测靶核酸的寡核苷酸的试剂的协同开发请求(S100)。协同开发请求包括关于使用试剂来检测的靶核酸的特征信息。协同开发系统接收协同开发请求并分配接收编号(S110)。

本公开内容涉及用于检测靶核酸的试剂的协同开发，其由技术提供者和开发者执行。

如本文所用，术语“协同开发”是指技术提供者和开发者在开发用于检测靶核酸的试剂过程中的共同贡献。特别地，本文中的术语“协同开发”包括在开发用于检测靶核酸的试剂的过程中由技术提供者提供开发技术和由开发者进行测试。

在协同开发中，技术提供者和开发者的共同贡献并不一定意味着技术提供者和开发者对开发的贡献相同。换言之，根据本公开的协同开发应理解为包括技术提供者和开发者的不同程度的贡献。

参与协同开发的技术提供者和开发者的贡献程度可以根据多种因素而变化，例如技术提供者和开发者的技术技能、资源、开发特征或合同。例如，在技术提供者提供的技术有限的情况下，技术提供者的贡献程度可能低于开发者的贡献程度。相反，在技术提供者提供的技术全面的情况下，技术提供者的贡献程度可能高于开发者的贡献程度。又如，技术提供者和开发者的贡献程度可以通过技术提供者与开发者之间的协议或合同进行调整。

根据本公开，尽管可能有其他第三方(例如请求者、评估者、制造者或投资者)参与协同开发，但他们的参与对于根据本公开的协同开发不是必不可少的，因为第三方不直接贡献于试剂的开发。

根据本公开的待开发试剂是指用于检测靶核酸的组分的混合物。该试剂包含在扩增/检测靶核酸中起作用的组分，例如与靶核酸特异性杂交的寡核苷酸(例如引物和/或探针)、酶(例如核酸聚合酶、核酸限制酶、具有限制酶活性的聚合酶)、标记和其他必要组分(缓冲液、金属离子、dNTP、盐等)。试剂组分的示例公开于WO 2015/147412，其公开内容通过引用整体并入本文。

根据实施例，待开发试剂包含用于检测靶核酸的寡核苷酸。在本公开中，寡核苷酸可以是引物和/或探针。

根据实施例，待开发试剂包含用于检测靶核酸的标记。

根据实施例，待开发试剂包含用于检测靶核酸的标记引物和/或标记探针。

根据实施例，待开发试剂包含酶。

根据实施例，待开发试剂包含缓冲液。

特别地，待开发试剂用于多重检测(检测多个靶核酸)。

本文所用的术语“引物”是指一种寡核苷酸，无论是天然存在的还是合成产生的，当置于引发对与核酸链(模板)互补的引物延伸产物的合成的条件下时，即在核苷酸和聚合试剂如DNA聚合酶的存在下并在合适的温度和pH下，其能够作为合成起始点。引物优选为单链以最大化扩增效率。优选地，引物是寡脱氧核糖核苷酸。本发明的引物可由天然存在的dNMP(即dAMP、dGM、dCMP和dTMP)、修饰核苷酸或非天然核苷酸组成。引物还可包括核糖核苷酸。引物必须足够长以在聚合试剂存在下引发延伸产物的合成。引物的确切长度将取决于许多因素，包括温度、应用和引物来源。

“探针”是包括与靶核酸序列基本互补的序列的单链核酸分子。术语“互补”在本文中用于指引物或探针在指定的退火条件或严格条件下充分互补以与靶核酸序列特异性杂交，包括术语“基本互补”和“完全互补”，优选完全互补。优选地，探针是单链脱氧核糖核苷酸。本公开中使用的引物可以包括天然存在的dNMP(即dAMP、dGMP、dCMP和dTMP)、修饰核苷酸或非天然核苷酸。探针还可以包括核糖核苷酸。探针可以包括能够产生用于检测靶的信号的标记。

如本文所用，短语“(单一或多重)靶核酸检测”是指在一次反应中检测到一种靶核酸。靶核酸检测不仅包括扩增靶核酸并检测扩增产物(扩增子)，而且还包括在不扩增靶核酸的情况下检测与寡核苷酸的杂交事件。

如本文所用，短语“多重靶核酸检测”是指在一次反应中同时检测两种或更多种靶核酸。多重靶核酸检测不仅包括同时扩增两种或更多种靶核酸并检测每个靶的扩增产物，而且还包括在不扩增两种或更多种靶核酸的情况下检测与寡核苷酸的杂交事件。

靶核酸分子的扩增可以通过本领域已知的各种涉及引物的核酸扩增方法执行。具体而言，靶核酸的扩增根据公开于美国专利No.4,683,195、No.4,683,202和No.4,800,159中的聚合酶链反应(PCR)执行。其他示例是连接酶链反应(LCR，美国专利No.4,683,195和No.4,683,202；以及PCR Protocols:A Guide to Methods and Applications(Innis etal.,eds,1990))、链置换扩增(SDA,Walker,et al.Nucleic Acids Res.20(7):1691-6(1992)；和Walker PCR Methods Appl.3(1):1-6(1993))、转录介导的扩增(Phyffer,etal.,J.Clin.Microbiol.34:834-841(1996)；和Vuorinen,et al.,J.Clin.Microbiol.33:1856-1859(1995))、基于核酸序列的扩增(NASBA,Compton,Nature 350(6313):91-2(1991))、滚环扩增(RCA,Lisby,Mol.Biotechnol.12(1):75-99(1999)；和Hatch et al.,Genet.Anal.15(2):35-40(1999))和Q-Beta复制酶(Lizardi et al.,BiolTechnology 6:1197(1988))。根据本公开的靶核酸检测可以通过实时PCR来执行(参见美国专利No.5,210,015、5,538,848和6,326,145)。

如本文所用，短语“用于检测靶核酸的试剂的协同开发”包括通过技术提供者和开发者的协作建立用于检测靶核酸的试剂的组合物。

根据实施例，用于检测靶核酸的试剂的协同开发包括设计待包含在用于检测靶核酸的试剂中的候选寡核苷酸。

根据实施例，用于检测靶核酸的试剂的协同开发包括测试寡核苷酸(特别是候选寡核苷酸)的性能。

根据实施例，用于检测靶核酸的试剂的协同开发包括从候选寡核苷酸中选择最佳寡核苷酸或最佳寡核苷酸组合。

本该步骤中，接收来自请求者终端的协同开发请求。

请求者/请求者终端

如本文所用，术语“请求者”是指提出通过本公开的协同开发系统检测特定生物体(特别是病原体)或其靶核酸的必要性的实体，并且可以与术语“提议者”互换使用。

如本文所用，术语“请求者终端”是指由请求者操作的终端。

本本公开中，请求者终端用于请求者与根据本公开的协同开发系统进行交互。请求者终端可以是计算机，例如个人计算机(PC)、台式计算机、膝上型计算机、笔记本、智能手机或平板PC，或者包括它们的任何设备。计算机是一种设备，包括一个或多个通用或专用处理器、存储器、存储装置和网络组件(有线或无线)。设备执行操作系统(OS)，例如MicrosoftWindows兼容OS、Apple OS X或iOS、Linux或Google Android OS。根据实施例，请求者终端可以使用网络浏览器，例如Microsoft Internet Explorer、Mozilla Firefox、GoogleChrome、Apple Safari和/或Opera，作为与本公开的协同开发系统交互的接口。根据实施例，请求者终端可以执行用于访问协同开发系统的专用应用程序。

以上对终端的描述也适用于下面公开的开发者终端和技术提供者终端。

根据实施例，请求者是个人。

根据另一实施例，请求者是组织，例如大学、研究中心、企业或医院。

根据实施例，请求者是单个请求者。例如，单个请求者可以提供对用于检测靶核酸的试剂的充分开发的请求，例如关于靶核酸的足够特征信息。

根据另一实施例，请求者是多个请求者。虽然来自单个请求者的请求可能不足以开发用于检测靶核酸的试剂，但是来自一个请求者的请求与来自其他请求者的请求的组合可能足以开发用于检测靶核酸的试剂。例如，来自第一请求者的请求可以包括关于第一目标核酸的特征信息，来自第二请求者的请求可以包括关于第二靶核酸的特征信息。来自第一请求者的请求和来自第二请求者的请求的组合可以实现用于检测两个靶核酸的试剂的充分开发。然而，当第一请求者和第二请求者提供关于同一靶核酸的特征信息时，可以将这两个请求者视为同一请求者。

在本公开中，关于请求者的信息可以注册也可以不注册在本公开的协同开发系统中。

该步骤中的请求者与其他步骤中的开发者和技术提供者之间的身份可以解释如下：

根据实施例，请求者与开发者相同。例如，提交协同开发请求后，请求者也可以作为开发者参与协同开发。

在另一实施例中，请求者不同于开发者。例如，提交协同开发请求后，请求者可能不参与协同开发。

根据实施例，请求者与技术提供者相同。例如，在提交协同开发请求后，请求者也可以作为技术提供者参与协同开发。

在另一实施例中，请求者不同于技术提供者。例如，提交协同开发后，请求者可能不参与协同开发。

可以以各种方式接收上述协同开发请求。

根据实施例，以使得请求者终端访问网页并输入协同开发请求的内容的方式接收协同开发请求。

根据另一实施例，以使得用于创建协同开发请求的内容的文件通过请求管理模块被提供给请求者终端、并且请求者输入到请求者终端的协同开发请求的内容以文件的形式被接收的方式接收协同开发请求。

根据本公开的方法还可以包括为从请求者终端接收的协同开发请求分配唯一标识符。

协同开发系统为参与协同开发的开发者和/或技术提供者生成唯一标识符，并将该标识符提供给每个开发者终端和/或技术提供者终端。标识符可用于识别开发者和技术提供者或开发者终端和技术提供者终端、对用于协同开发的开发设备或开发工具包的使用和访问的使用认证、以及对开发者和技术提供者生成的数据(包括文档)的加密。

因此，标识符包括例如与项目编号匹配的参与者的ID和密码，以便识别开发者和技术提供者。标识符还包括例如用于访问和批准使用开发设备或开发工具包的证书。标识符包括用于加密生成的数据的加密密钥或公钥。标识符包括解密(或解码)密钥或私钥，以供参与协同开发的开发者或技术提供者查看加密结果。

标识符可以赋予各种对象，诸如初步评估的协同开发请求、实质评估的协同开发请求、技术提供者提供的开发工具包、使用工具包获得的结果、技术提供者的审查的结果、验证结果、以及接收到的协同开发请求。

在本公开中，从请求者接收到的协同开发请求包括关于使用试剂进行检测的靶核酸的特征信息。

根据实施例，关于靶核酸的特征信息包括：(i)含有靶核酸的生物体的名称；(ii)含有靶核酸的基因的名称；(iii)靶核酸的序列；(iv)试剂的预期用途；(v)用试剂检测的疾病的名称；和/或(vi)用试剂检测的疾病的分类符号。

下面对关于靶核酸的特征信息进行描述：

(i)含有靶核酸的生物体的名称

生物体的名称可以包含在关于靶核酸的特征信息中。在请求者知晓待检测的生物体的名称的情况下，请求者可以在协同开发请求中包含生物体的名称。

生物体名称可以包括一个属、种、亚种、亚型、基因型、血清型、菌株、分离株和栽培品种。

生物体名称包括根据以下项的名称：(1)国际藻类、真菌和植物命名法典；(2)国际动物命名法典；(3)国际原核生物命名法典；(4)国际栽培植物命名法典；(5)国际细菌和病毒命名法典；或(6)国际植物社会学命名法典。通常，生物体名称包括根据双名法命名的名称，包括属和种。生物体名称包括其他各种名称，例如通用名称、别名或首字母缩略词。

除了生物体名称，关于靶核酸的特征信息中还可以包括关于生物体的其他信息，例如生物体的分类ID、来源、相关文献等。

(ii)含有靶核酸的基因的名称

基因的名称可以包括在关于靶核酸的特征信息中。在请求者知晓待检测生物体的固有基因的情况下，请求者可以在协同开发请求中包含基因的名称。

除了基因名称，关于靶核酸的特征信息中还可以包括关于基因的其他信息，例如基因的来源、登录号、相关文献等。

(iii)靶核酸的序列

靶核酸的序列可以包含在关于靶核酸的特征信息中。在请求者知晓待检测生物体内所含靶核酸序列的情况下，请求者可以在协同开发请求中包括靶核酸序列。

除了靶核酸序列，关于靶核酸的特征信息中还可以包括关于靶核酸序列的其他信息，例如靶核酸的来源、登录号、相关文献等。

(iv)试剂的预期用途

用于检测靶核酸的试剂的预期用途可以包括在关于靶核酸的特征信息中。

试剂的预期用途可以包括鉴定与待使用试剂检测的靶核酸相关的、即已知由含有靶核酸的生物体引起或极可能引起的疾病、障碍、病症、症状或综合征。

(v)由含有靶核酸的生物体引起的疾病的名称

由含有靶核酸的生物体引起的疾病的名称可以包括在关于靶核酸的特征信息中。

疾病的示例可包括但不限于霍乱、伤寒、副伤寒、志贺氏菌病、甲型肝炎、白喉、麻疹、肺炎链球菌、疟疾、炭疽、AIDS(获得性免疫缺陷综合征)、流感、鼠疫、登革热发烧、埃博拉病毒、MERS(中东呼吸综合征冠状病毒)、禽流感、黄热病、脊髓灰质炎或其他传染病；和镰状细胞病、白化病、威尔逊病、亨廷顿病、法布里病、梅拉斯综合征、猫叫综合征、WAGR综合征、Wolf-Hirschhorn综合征、Patau综合征、唐氏综合征、特纳综合征、Klinefelter综合征、癫痫、近视、糖尿病、或其他遗传病。

(vi)含有靶核酸的生物体引起的疾病的分类符号

用于检测靶核酸的试剂检测的疾病的分类符号可以包含在关于靶核酸的特征信息中。疾病的分类符号可以基于WHO的ICD(国际疾病及相关问题分类)或各国的ICD来确定。例如，韩国采用韩国标准疾病分类(KCD)。ICD-10和KCD的示例可见于本公开的其余部分。

在本公开中，从请求者接收到的协同开发请求可以包括在开发用于检测靶核酸的试剂时可以参考的附加信息，以及上述(i)至(iv)中所述的关于靶核酸的特征信息。附加信息的示例可以包括应用的样本、提取方法、检测设备、测试结果的解释方法、产品配置、周转时间(TAT)、性能要求、开发周期和开发成本。

在实施例中，根据本公开的方法还包括将从请求者终端接收到的协同开发请求发送到技术提供者终端。向技术提供者终端传输协同开发请求是为了创造一个环境，在该环境中技术提供者可以识别协同开发和对请求的响应。

本公开的方法还可以包括步骤(a)和步骤(b)之间的评估协同开发请求。下面描述评估步骤。

评估步骤

根据本公开的方法中包括的评估协同开发请求的步骤可以以多种方式执行。

根据执行评估的实体，根据本公开的方法中包括的评估协同开发请求的步骤可以由评估者执行，或者可以由协同开发系统的评估管理模块执行。

根据实施例，根据本公开的方法还包括响应于协同开发请求向评估者终端发送评估请求，并从评估者终端接收协同开发可行性的评估结果。

评估者可以是个人或组织，例如学校、公司或医院。评估者可以是单个评估者或多个评估者，包括例如第一评估者、第二评估者和第三评估者。评估者可以是选择的一个。作为示例，评估者是从多个评估者中选择的单个评估者。作为另一示例，评估者可以是从多个评估者中选择的多个评估者。

评估者的选择可以由开发者或技术提供者执行，或者可以根据开发者与技术提供者之间的协议执行，或者可以由协同开发系统的评估管理模块执行。

评估者终端可以包括技术提供者终端。作为示例，在评估者为单个评估者的情况下，评估者终端可以是第一技术提供者终端。作为另一示例，在评估者为多个评估者的情况下，评估者终端可以由第一评估者终端、第二评估者终端和第一技术提供者终端组成。

根据另一实施例，根据本公开的方法还包括响应于协同开发请求，通过协同开发系统的评估管理模块评估协同开发的可行性。

协同开发系统的评估管理模块可以包括用于评估协同开发的可行性的标准。

如本文所用，术语“标准”表示用于评估的评估要素，例如评估项目、分数和权重。标准中包含的评估项目可主要包括技术可行性、商业可行性、适销性、原创性、成本和开发难度。标准中包含的分数是评估者根据评估项目可选择的点范围。标准中包含的权重是用于与每个评估项目的重要性成比例调整评估分数的值。该标准可以是预先确定的标准，或者可以是根据基于人工智能(AI)使用深度学习或机器学习训练的结果的标准。评估管理模块可以根据标准对协同开发的可行性进行评分。

根据评估方案，根据本公开的方法中包括的评估协同开发请求的步骤可以包括初步评估和实质评估。初步评估包括协同开发请求的形式评估或简要实质评估，例如对协同开发请求是否包含必要内容的评估。实质评估包括对协同开发的优点的评估，例如协同开发的可行性评估。

初步评估和实质评估可以由评估者和协同开发系统的评估管理模块执行。作为示例，初步评估和实质评估都可以由评估者执行。作为另一示例，初步评估和实质评估都可以由评估管理模块执行。作为另一示例，在评估者执行初步评估后，可以由协同开发系统的评估管理模块执行实质评估。作为另一示例，在协同开发系统的评估管理模块执行初步评估后，可以由评估者执行实质评估。作为另一示例，初步评估和/或实质评估可以由评估者和协同开发系统的评估管理模块执行。

初步评估的结果可以是例如批准或补充。这里的批准是指请求通过了形式评估，而补充表示需要在形式上补充请求。

实质评估的结果可以是例如批准或拒绝。这里的批准是指所请求的协同开发适合继续，而拒绝是指所请求的协同开发不适合继续。在协同开发被批准的情况下，根据本公开的方法可以执行步骤(b)，如果协同开发被拒绝，根据本公开的方法可以包括由协同开发系统停止继续。

步骤(b)：开发者终端访问开发工具包

随后，允许开发者终端访问技术提供者的用于协同开发的开发工具包(S300)。开发工具包包括用于检测靶核酸的试剂中包含的寡核苷酸的性能测试工具。性能测试工具包括软件、设备和指导信息中的一个或多个。

开发者/开发者终端

如本文所用，术语“开发者”是指有助于通过根据本公开的方法协同开发用于检测靶核酸的试剂的实体，特别是负责大部分开发测试的实体。如本文所用，术语“开发者终端”是指由开发者操作的终端。

如本文所用，开发者可以是但不限于没有开发用于检测靶核酸的试剂的经验、没有使用技术提供者所提供的技术开发用于检测靶核酸的试剂的经验、具有测试环境、易于获取临床样本、或者需要协同开发的人。

根据实施例，开发者终端是已经获得或能够获得包含或怀疑包含靶核酸的临床样本的开发者的终端。

本文使用的术语“样本”是指来自生物来源的任何细胞、组织或流体，或可根据本公开有利地评估的任何其他介质，包括病毒、细菌、组织、细胞、血液、血清、血浆、淋巴、牛奶、尿液、粪便、眼液、唾液、精液、脑提取物、脊髓液(SCF)、阑尾、脾脏和扁桃体组织提取物、羊水、腹水和非生物样本(例如食物和水)。此外，样本包括从生物来源分离的天然存在的核酸分子和合成核酸分子。

特别地，如本文所用，术语“临床样本”表示含有或怀疑含有靶核酸并且用于测量和验证用于检测靶核酸(特别是寡核苷酸)的试剂的性能的样本。临床样来源自靶，优选为人类，更优选为人类患者。在开发者获得或能够获得临床样本的情况下，无法获得临床样本的技术提供者可以将其专有技术提供给开发者，从而允许使用临床样本开发用于检测靶核酸的试剂。

根据实施例，开发者终端是位于临床样本可以被取出或移动的区域中的开发者的终端。

根据实施例，开发者终端是位于存在能够处理临床样本的设施的区域中的开发者的终端。

根据实施例，开发者终端是位于与靶核酸相关的疾病正在爆发或已爆发的区域中的开发者的终端。可以根据开发者是否位于疾病区域中来选择开发者。

根据实施例，开发者终端是位于与靶核酸相关的疾病正在爆发或已爆发的区域中并且获得或能够获得含有或怀疑含有靶核酸的样本的开发者的终端。

如本文所用，短语“与靶核酸相关的疾病”是指疾病由含有靶核酸的生物体(例如，病毒或细菌)引起。

开发者/开发者终端的选择在本说明书的其他地方进行了更全面的讨论。

根据实施例，开发者是个人。

根据另一实施例，开发者是组织，例如大学、研究中心、企业或医院。

根据实施例，开发者是单个开发者。

根据另一实施例，开发者是多个开发者。例如，第一开发者和第二开发者可以共享一个协同开发。

根据本公开，开发者可以是被选择执行协同开发的开发者。换言之，开发者终端是从多个开发者中选择的执行协同开发的开发者的终端。作为示例，开发者终端是从多个开发者中选择执行协同开发的单个开发者的终端。作为另一示例，开发者终端是从多个开发者中选择执行协同开发的多个开发者的终端。

开发者的选择可以由请求者或技术提供者执行，或者可以根据请求者与技术提供者之间的协议执行，或者可以由协同开发系统的参与者选择模块执行。参与者选择模块向所选择的开发者提供参与协同开发的请求，并从开发者终端接收指示开发者是否参与协同开发的信息(S250)。参与者选择模块在从开发者终端接收到指示被选择的开发者不能参与协同开发的信息后，选择其他开发者并提供参与协同开发的请求。

可以基于预定的开发者选择标准来执行开发者的选择。开发者选择标准包括例如开发者对于协同开发请求的适合性。具体而言，开发者选择标准可以包括例如开发者用于协同开发的测试环境、测试技能、测试人员、测试经验、专业知识、知识和对临床样本的可访问性。

如上所述，开发者可以是请求者或可以不同于请求者。

在本公开中，关于开发者的信息可以注册也可以不注册在本公开的协同开发系统中。

上述开发者终端访问技术提供者的开发工具包以进行协同开发。

根据本公开，作为协同开发的另一实体的技术提供者描述如下。

技术提供者/技术提供者终端

如本文所用，术语“技术提供者”是指有助于通过根据本公开的方法协同开发用于检测靶核酸的试剂的实体，特别是协同开发的主导实体。在本公开中，技术提供者起到了为协同开发提供整体技术和测试指南的作用。如本文所用，术语“技术提供者终端”是指由技术提供者操作的终端。

在本公开中，技术提供者是拥有开发用于检测靶核酸的试剂的技术的技术提供者。在本公开中，技术提供者是具有用于检测靶核酸的试剂的开发经验或曾担任过类似协同开发中的技术提供者的技术提供者。具体地，在本公开中，技术提供者是具有用于开发用于检测靶核酸的试剂的工具包的技术提供者。

根据实施例，技术提供者是个人。根据另一实施例，技术提供者是组织，例如大学、研究中心、企业或医院。

根据实施例，技术提供者是单个。根据另一个实施例，技术提供者是多个。例如，多个技术提供者可以提供包括在开发工具包中的不同工具来开发用于检测靶核酸的试剂。

根据本公开，技术提供者可以是被选择来执行协同开发的技术提供者。换言之，技术提供者终端是从多个候选技术提供者中选择执行协同开发的技术提供者的终端。作为示例，技术提供者终端是从多个候选技术提供者中选择执行协同开发的单个技术提供者的终端。作为另一示例，技术提供者终端是从多个候选技术提供者中选择执行协同开发的多个技术提供者的终端。

技术提供者的选择可以由请求者或开发者执行，或者可以根据请求者与开发者之间的协议执行，或者可以由协同开发系统中包含的技术提供者选择模型执行。

技术提供者的选择可以由请求者或开发者执行，或者可以根据请求者与开发者之间的协议执行，或者可以由协同开发系统中包含的参与者选择模型执行。

参与者选择模块向所选择的技术提供者提供参与协同开发的请求，并从技术提供者终端接收指示技术提供者是否参与协同开发的信息。在技术提供者希望参与协同开发的情况下，技术提供者的开发工具包通过技术提供者终端提供给协同开发系统。

参与者选择模块在从技术提供者终端接收到指示所选择的技术提供者不能参与协同开发的信息后，选择其他候选技术提供者，并提供参与协同开发的请求。

可以基于预定的技术提供者选择标准来执行技术提供者的选择。技术提供者选择标准包括例如技术提供者对于协同开发请求的适合性。具体而言，技术提供者选择标准可包括技术提供者的开发经验、专业知识和协同开发知识。

在本公开中，关于技术提供者的信息可以注册或者可以不注册在本公开的协同开发系统中。

上述技术提供者提供了开发工具包。

开发工具包描述如下。

开发用于检测靶核酸的试剂的工具包

如本文所用，术语“开发工具包”是指用于开发用于检测靶核酸的试剂的一组工具。

在本公开中，开发工具包包括用于检测靶核酸的试剂中包含的寡核苷酸的性能测试工具。性能测试工具包括软件、设备和指导信息中的一个或多个。

寡核苷酸性能测试工具

寡核苷酸性能测试工具表示指导、指示、帮助或促进寡核苷酸性能测试的工具。

根据实施例，寡核苷酸性能测试工具包括用于确定寡核苷酸的灵敏度和/或特异性的工具。更具体地，寡核苷酸性能测试工具包括用于确定寡核苷酸的灵敏度、寡核苷酸的特异性和/或寡核苷酸间干扰(例如，寡核苷酸之间二聚体的形成)的工具。

在本公开中，寡核苷酸的灵敏度表示寡核苷酸精确确定阳性样本(例如含有与寡核苷酸对应的靶核酸的样本)为阳性的能力。灵敏度可以通过计算阳性样本中真阳性的比例来获得。例如，灵敏度可以如下计算：

灵敏度(％)＝(真阳性数)/(真阳性数+假阴性数)

在本公开中，寡核苷酸的特异性表示寡核苷酸精确确定阴性样本(例如不含与寡核苷酸对应的靶核酸的样本)为阴性的能力。特异性可以通过计算阴性样本中真阴性的比例来获得。例如，特异性可以如下计算：

特异性(％)＝(真阴性数)/(真阴性数+假阳性数)

在本公开中，将协同开发的用于检测靶核酸的试剂通常可以包括寡核苷酸(例如引物和/或探针)，还可以另外包括以下组分中的至少一种：标记、DNA聚合酶、反向转录酶、dNTP、Mg离子、KCl(或醋酸钾)和缓冲液。在上述组分中，除寡核苷酸以外的其他组分对靶核酸是非特异性的(即与靶核酸的类型无关)，而寡核苷酸是针对靶核酸进行特异性设计的(例如与靶核酸杂交)。因此，对用于检测靶核酸的试剂的开发在很大程度上依赖于寡核苷酸的性能。

从这个意义上说，用于检测靶核酸的试剂的开发可能主要包括候选寡核苷酸的设计、所设计的候选寡核苷酸的性能测试、以及基于性能测试的寡核苷酸的选择。

在本公开中，候选寡核苷酸的性能测试涉及确定候选寡核苷酸(例如由正向引物、反向引物和探针组成)检测靶核酸的能力。例如，在候选寡核苷酸由例如设计用于检测第一靶核酸的第一组第一正向引物、第一反向引物和第一探针；设计用于检测第二靶核酸的第二组第二正向引物、第二反向引物和第二探针；和设计用于检测第三靶核酸的第三组第三正向引物、第三反向引物和第三探针组成的情况下，候选寡核苷酸的性能测试包括确定是否第一组仅检测第一靶核酸、第二组仅检测第二靶核酸、以及第三组仅检测第三靶核酸。

用于确定寡核苷酸灵敏度或特异性的寡核苷酸性能测试包括允许含有所设计的寡核苷酸的试剂与含有靶核酸的阳性样本或不含靶核酸的阴性样本反应，以扩增靶核酸。

根据实施例，用于确定寡核苷酸的灵敏度或特异性的设备包括选自由下列项组成的组的一个或多个设备：核酸提取设备、核酸分配设备和核酸检测设备。设备可以由开发者选择并且是本领域已知的、由技术提供者选择并且是本领域已知的、或由技术提供者开发和提供。例如，核酸扩增设备和核酸检测设备可以是适合于实施技术提供者的技术的设备，并且可以是众所周知的设备或由技术提供者开发的设备。适合实施技术提供者技术的设备是表现出适合在技术提供者技术中采用的寡核苷酸的结构和设计方法、以及信号分析方法的性能的设备。

根据实施例，用于确定寡核苷酸的灵敏度或特异性的软件包括用于驱动核酸提取设备的指令。

根据实施例，用于确定寡核苷酸的灵敏度或特异性的软件包括用于驱动分配设备的指令。

根据实施例，用于确定寡核苷酸的灵敏度或特异性的软件包括驱动核酸扩增设备的指令。

根据实施例，用于确定寡核苷酸的灵敏度或特异性的软件包括驱动核酸检测设备的指令。

根据实施例，用于确定寡核苷酸的灵敏度或特异性的软件包括用于将寡核苷酸分配(定位)在反应容器(例如，反应板，例如96孔板)的指定位置的指令。更具体地，软件将用于检测靶核酸(包括寡核苷酸和模板)的每种试剂放置在反应板的指定孔中。试剂在反应板中的位置可由技术提供者确定，或者由技术提供者与开发者之间的协议确定。例如，软件可以将第一种试剂放置在96孔板(由A行到H行和1列到12列组成)的A行-1列的孔中，并将第二种试剂放置在96孔板的A行-2列的孔中。将试剂分配到指定位置有助于以简化和精确的方式分析各种试剂的性能测试结果。

根据实施例，用于确定寡核苷酸灵敏度或特异性的指导信息包括寡核苷酸性能测试的过程和条件。如本文所用，术语“指导信息”可以与用于测试的“协议”、“手册”或“教程”互换使用。特别地，指导信息可以包括关于测试的顺序过程、使用的组分的量、反应条件等的信息。指导信息可以是文档、图像、视频、音频或其他文件的形式，可以被开发者通过开发者终端和/或开发设备视觉/听觉识别，但不限于此。

根据实施例，用于寡核苷酸的性能测试工具还包括用于选择寡核苷酸的工具。用于选择寡核苷酸的工具可以包括用于从寡核苷酸性能结果中自动选择最佳寡核苷酸的软件、进一步用于选择的设备、或用于选择的测试的过程和条件。

根据本发明的开发工具包还可以包括用于优化用于检测靶核酸的试剂的性能测试工具。

用于寡核苷酸的性能测试工具被用于寡核苷酸性能测试，以便为靶核酸选择最佳寡核苷酸，而用于优化用于检测靶核酸的试剂的性能测试工具被用于检查寡核苷酸以外的其他组分对试剂性能的影响并且优化其他组分。用于检测靶核酸的试剂的优化包括确定所用组分的适当类型和量。

与寡核苷酸性能测试工具类似，用于优化用于检测靶核酸的试剂的性能测试工具可以包括软件、设备或指导信息。

根据本公开的开发工具包还可以包括以下中的一项或多项：(i)寡核苷酸的设计工具；(ii)性能测试的分析工具；(iii)性能测试的文档工具。

工具包的附加组件如下所述。

设计工具

寡核苷酸的设计工具可以包括自动设计用于检测靶核酸的一组候选寡核苷酸的软件。

根据实施例，软件包括用于确定靶核酸的区域(例如，扩增区域)的算法。大多数靶核酸，特别是来自RNA病毒的核酸，含有高度序列变异。因此，为了使用最少数量的寡核苷酸来检测具有各种序列变异的靶核酸，需要确定多个具有序列变异的靶核酸中的保守区域。软件包括用于确定靶核酸的保守区域(即靶核酸的独特区域)的算法。

根据实施例，软件包括以下项：

(i)用于自动设计检测靶核酸所需的每个寡核苷酸的候选序列，从而为每个寡核苷酸生成候选序列库的算法；(ii)用于将库中的候选序列与另一库中的不同候选序列自动组合，从而产生一组候选寡核苷酸的算法；(iii)用于将一组候选寡核苷酸与不同组寡核苷酸自动组合，从而产生用于检测多个靶核酸的多组候选寡核苷酸的组合的算法。

在设计用于检测两个靶核酸的寡核苷酸(例如，正向引物、反向引物和探针)的情况下，可以如下执行三个算法：

例如，用于为每个寡核苷酸自动生成候选序列库的算法设计用于检测第一核酸的1到100个正向引物的候选序列库、相同或不同数量的反向引物的候选序列库、和相同或不同数量的探针的候选序列库的库，以及以类似方式设计用于第二靶核酸的正向引物、反向引物和探针的候选序列库。

用于为每个靶核酸自动生成一组候选寡核苷酸的算法将正向引物库中的100个候选序列、反向引物库中的100个序列和探针库中的100个序列组合以生成用于第一靶核酸的一组10⁶(100*100*100)个候选寡核苷酸，并重复相同的过程以生成用于第一靶核酸的一组10⁶个候选寡核苷酸。

用于自动生成多组候选寡核苷酸的组合的算法将用于第一靶核酸的一组10⁶(100*100*100)个候选寡核苷酸与用于第二靶核酸的一组10⁶(100*100*100)个候选寡核苷酸组合以生成用于第一靶核酸和第二靶核酸的多组候选寡核苷酸的10¹²(10⁶*10⁶)个组合。

根据实施例，软件还可以包括评分算法以评估每个寡核苷酸的候选序列库、每个靶核酸的一组候选寡核苷酸、和多个靶核酸的多组候选寡核苷酸的组合，如上所述。可以基于设计的寡核苷酸的若干特征进行评分，例如灵敏度、特异性、覆盖度、二聚体形成、长度、Tm值、GC含量和发夹结构形成、自由能值。例如，软件对用于检测第一靶核酸的正向引物库中的100个候选序列、反向引物库中的100个候选序列和探针库中的100个候选序列进行评分，并对用于检测第二靶核酸序列的正向引物库、反向引物库和探针库中的候选序列执行相同的过程。通过该过程获得的库中每个候选序列的分数可用于从每个库中选择合适的候选序列以减少候选序列的数量。例如，在基于分数从正向引物库中的100个候选序列中选择10个序列并以类似方式对反向引物和探针选择10个序列以检测第一靶核酸的情况下，用于第一靶核酸的候选寡核苷酸的组数减少到10³(＝10*10*10)。还可以对每个靶核酸的一组候选寡核苷酸和多个靶核酸的多组候选寡核苷酸的组合执行基于评分的选择。基于评分的选择可以减少检测靶核酸所需的寡核苷酸数量，从而显著提高软件的驱动速度。

分析工具

用于性能测试的分析工具可以包括将原始性能数据自动转换为处理后的性能数据，以便更容易地从原始性能数据中获得性能信息的软件。

通常，对从性能测试中获得的原始性能数据的分析和解释需要相当多的技能，并且可能会导致每个人出现重大偏差和错误。因此，根据本公开的分析工具允许开发者和技术提供者通过预定算法将原始性能数据自动转换为处理后的性能数据来容易、快速和精确地获得寡核苷酸性能信息。

如本文所用，术语“处理后的性能数据集”可以表示通过对原始性能数据进行数学处理而获得的数据集，例如原始性能数据的一阶、二阶和三阶导数数据集。

根据实施例，用于性能测试的分析工具中包含的软件包括用于自动减去原始性能数据的背景的算法，例如WO 2016/052991中公开的背景减去算法，其公开内容通过引用整体并入本文。

根据实施例，用于性能测试的分析工具中包含的软件包括用于校准原始性能数据的算法，例如通过将归一化系数应用于信号值来获得校准数据的算法，如WO 2017/086762中公开的，其公开内容通过引用整体并入本文。

根据实施例，用于性能测试的分析工具中包含的软件包括用于将原始性能数据自动拟合成sigmoid函数的算法，例如WO 2019/066572中公开的sigmoid拟合和分析算法，其公开内容通过引用整体并入本文。

根据实施例，用于性能测试的分析工具中包含的软件包括用于从减去背景的数据或拟合函数中自动提取可以确定阳性/阴性的值的算法。用于确定阳性/阴性的值的示例可以包括但不限于Ct、ΔCt、熔解Tm和熔解峰。

根据实施例，用于性能测试的分析工具包括用于从针对多个靶核酸的多个不同温度下获得的数据中仅提取每个靶核酸的数据的算法，例如WO2015/147370、WO2015/147412、WO2015/147382和WO2016/093619中公开的算法，其公开内容通过引用整体并入本文。

根据实施例，用于性能测试的分析工具包括用于自动设置(或优化)可能导致假阳性或假阴性的参数的值的软件。可以使用各种参数将原始性能数据自动转换为处理后的性能数据。然而，使用固定参数值可能会导致某些反应出现假阳性或假阴性。因此，软件找到导致假阳性或假阴性的参数，并自动转换参数值。

根据实施例，由软件设置的参数包括以下项中的至少一项：用于确定Ct的阈值；用于减去背景的拟合开始循环和最终循环；参考值和参考循环，其中采用WO 2017/086762中公开的算法；R²，sigmoid拟合曲线的最大斜率，以及最大信号值和最小信号值之间的差值，其中使用sigmoid拟合算法；参考值，其中采用WO2015-147370、WO 2015/147412、WO2015/147382、WO2016/093619中公开的任意一种算法。

文档工具

用于经分析的测试数据的文档工具可以包括用于将上述分析工具获得的性能数据自动转换为指定格式的文档，以便参与协同开发的开发者或技术提供者以更直观和简化的方式查看性能数据的软件。

由于分析工具获得的性能数据分布在软件的各个存储空间中，所以整个数据的检索/审查需要相当多的时间和精力。由于根据本公开的文档工具将分布式性能数据自动整合到单个文档中，因此可以容易地确定寡核苷酸的性能。这种文档工具促进了开发者和技术提供者之间的通信，增强了用于检测靶核酸的试剂的协同开发。

根据实施例，文档工具包括一种算法，该算法仅在处理后的性能数据中提取必要的特定性能信息，并将提取的性能信息复制到文档的期望区域。

在本公开中，开发工具包还可以包括除上述工具之外的其他各种工具，例如加密支持工具。包含在开发工具包中的工具可根据技术提供者提供的技术数量或范围而有所不同。例如，第一技术提供者可能只提供性能测试工具和分析工具，第二技术提供者可能提供性能测试工具和设计工具，第三技术提供者可能提供性能测试工具、设计工具、分析工具和文档工具。

本该步骤中，技术提供者访问开发工具包以进行开发者终端的协同开发可以多种方式执行。

如本文所用，与工具包结合使用的术语“访问”意指以各种方式接触和使用工具包。访问可以包括阅读、查看、修改、复制或删除。可以控制访问。例如，对工具包的访问可以是只读访问，意指只允许开发者阅读或查看工具包，而不修改、复制或删除工具包。

本公开中，用于检测靶核酸的试剂的开发工具包随时从技术提供者终端提供。

用于检测靶核酸的试剂的开发工具包可以在协同开发请求之前从技术提供者终端接收，或者开发工具包可以响应于提供给技术提供者终端的协同开发请求来从技术提供者终端接收。

根据实施例，在协同开发请求之前，协同开发系统接收用于检测靶核酸的试剂的开发工具包。例如，在协同开发请求之前，从第一技术提供者接收第一开发工具包，从第二技术提供者接收第二开发工具包。此后，当接收到协同开发请求时，允许开发者终端访问来自所选择的第一技术提供者的第一开发工具包。

根据另一实施例，响应于协同开发请求，接收用于检测靶核酸的试剂的开发工具包。例如，如果接收到协同开发请求，则将协同开发请求发送给所有的技术提供者，并且从响应请求的一个或多个技术提供者中选择的一个或多个技术提供者提供开发工具包。作为另一示例，如果接收到协同开发请求，则将协同开发请求发送给一个或多个选择的技术提供者，并从技术提供者接收开发工具包。

根据实施例，对开发工具包的访问包括开发者连接到协同开发系统并且直接使用以云形式服务的工具包的情况，或者开发者连接到协同开发系统并在开发者终端上下载、安装和使用存储的工具包的情况。

根据实施例，对开发工具包的访问包括开发者直接使用技术提供者终端中存储的工具包的情况，或者开发者连接到技术提供者终端并在开发者终端上下载并使用存储的工具包的情况。开发者对技术提供者终端中存储的工具包的直接使用或下载使用可以由协同开发系统控制。

协同开发系统对工具包的使用的控制可以通过向技术提供者终端提供可以从其下载工具包的URL、向技术提供者终端提供用于访问URL的ID/PW、或者向技术提供者终端提供下载然后安装工具包的权限来完成。

因此，技术提供者的开发工具包可以存储在协同开发系统或技术提供者终端中。

可以控制对开发工具包的访问。根据本公开的方法还可以包括响应于协同开发请求，向开发者终端提供访问开发工具包的权限。

开发工具包可以离线访问。离线访问可以通过各种便携式存储设备完成，例如外部硬盘驱动器、USB驱动器或CD。

步骤(c)：从开发者终端接收结果

接下来，从开发者终端接收使用开发工具包获得的结果(S400)。结果包括寡核苷酸的性能数据。

开发者使用在步骤(b)中访问的开发工具包执行寡核苷酸开发测试以生成结果，并且在即时步骤中，协同开发系统从开发者终端接收结果。

开发者执行的开发测试的范围可以根据开发者与技术提供者之间的协作范围(例如，之间的协议)而变化。

在示例开发测试中，开发者确定要检测的靶核酸的区域。靶核酸区域的确定包括确定靶核酸中的保守位点。可以使用或可以不使用技术提供者提供的设计工具来执行靶核酸区域的确定。

在示例开发测试中，开发者为靶核酸序列的多个寡核苷酸中的每一个生成候选序列库。可以使用或可以不使用技术提供者提供的设计工具来执行候选序列库的生成。

在示例开发测试中，开发者通过将任何库中的候选序列与其他库中的候选序列组合，为每个靶核酸生成候选序列集。可以使用或可以不使用技术提供者提供的设计工具来执行候选序列集的生成。

在示例开发测试中，开发者通过将任何靶核酸的候选序列集与其他靶核酸的候选序列集组合来生成多个靶核酸的候选序列集。可以使用或可以不使用技术提供者提供的设计工具来执行候选序列集的生成。

在示例开发测试中，开发者对每个寡核苷酸的候选序列库、每个靶核酸的候选序列集、和多个靶核酸的候选序列集进行评分，并基于评分选择一些候选序列集。该评分和选择可以使用或可以不使用技术提供者提供的设计工具来执行。

在示例开发测试中，开发者使用技术提供者提供的性能测试工具来测试寡核苷酸的性能。

在示例开发测试中，开发者通过分析原始性能数据并从中获得性能信息来获得处理后的性能数据。可以使用或可以不使用技术提供者提供的分析工具来执行原始性能数据的分析。

在示例开发测试中，开发者记录性能信息。可以使用或可以不使用技术提供者提供的文档工具来执行记录。

开发者可选地可以在开发测试中使用核酸扩增设备。

如本文所用，术语“核酸扩增设备”旨在涵盖扩增反应容器以及包括温度计和检测器的扩增反应设备。

核酸扩增设备包括能够调节扩增反应温度的各种众所周知的设备。设备的示例包括但不限于CFX(Bio-Rad)、iCycler(Bio-Rad)、LightCycler(Roche)、StepOne(ABI)、7500(ABI)、ViiA7(ABI)、QuantStudio(ABI)、AriaMx(Agilent)和Eco(Illumina)。

扩增反应容器包括管、条、板或其他各种类型的容器。

从开发者终端接收到的结果根据开发工具包中包含的工具而变化。

根据本公开的方法，当步骤(b)中的开发工具包包括用于检测靶核酸的试剂中所含寡核苷酸的性能测试工具时，步骤(c)中的结果至少包括寡核苷酸性能数据。

在步骤(b)中的开发工具包还包括(i)寡核苷酸的设计工具、(ii)性能测试的分析工具、(iii)性能测试的文档工具中的一种或多种的情况下，步骤(c)中的结果包括与工具对应的数据。

下面详细描述从开发者终端接收到的结果。

关于寡核苷酸的设计信息

从开发者终端接收的结果可以包括关于寡核苷酸的设计信息。

根据实施例，寡核苷酸设计信息包括关于每个寡核苷酸的候选序列库、每个靶核酸的寡核苷酸候选序列集、或多个靶核酸的寡核苷酸候选序列集的信息。

具体地，寡核苷酸设计信息包括关于用于检测多个靶核酸的候选寡核苷酸的信息。例如，寡核苷酸信息包括关于用于检测第一靶核酸序列的候选寡核苷酸(例如，第一正向引物、第一反向引物、第一探针)的信息和关于用于检测第二靶核酸序列的候选寡核苷酸(例如，第二正向引物、第二反向引物、第二探针)的信息。可以提供正向引物、反向引物和探针中的每一者中的两个或更多个以检测每个靶核酸序列。

根据实施例，寡核苷酸设计信息包括候选寡核苷酸的序列或长度的指示。

根据实施例，寡核苷酸设计信息包括用于区分候选寡核苷酸的指示，例如名称或缩写。

根据实施例，寡核苷酸设计信息包括候选寡核苷酸的杂交位置，即寡核苷酸与靶核酸杂交的位点的起始核苷酸和最后核苷酸位置。

根据实施例，寡核苷酸设计信息包括将通过使用候选寡核苷酸产生的扩增子的大小。

根据实施例，寡核苷酸设计信息包括候选寡核苷酸的Tm。

寡核苷酸性能数据

从开发者终端接收的结果包括寡核苷酸性能数据。性能数据是指在各种测试中生成用于检查开发者执行的寡核苷酸的性能的数据。

寡核苷酸性能数据可以包括原始数据集、处理后的数据集、或文档化数据集。

根据实施例，性能数据是未经数学处理的原始数据。原始数据表示直接从设备(例如实时PCR设备)获得的数据(输出)。数据包括多个数据点。如本文所用，术语“数据点”是指包括循环和信号值的坐标值。通过信号产生过程特别是扩增反应获得的数据点可以用可以在二维直角坐标系中显示的坐标值来显示。在坐标值中，X轴表示循环数，Y轴表示循环中测量或处理的信号值。原始数据是通过使用技术提供者提供的性能测试工具获得的。

在另一实施例中，性能数据是处理后的性能数据。处理后的性能数据是基线减去数据，以去除原始数据的背景信号值。基线减去数据集可以通过本领域已知的各种方法获得(参见美国专利No.8,560,247)。处理后的性能数据是使用或不使用技术提供者提供的分析工具获得的。

在另一实施例中，性能数据是文档化性能数据。文档化性能数据是使用或不使用技术提供者提供的文档工具获得的。

关于所选寡核苷酸的信息

从开发者终端接收的结果包括关于所选寡核苷酸的信息。

关于所选寡核苷酸的信息包括关于多组寡核苷酸的最佳组合的信息，其是考虑到寡核苷酸的性能(性能数据)而从多个靶核酸的多组寡核苷酸的候选组合(使用或不使用设计工具生成)中选择的。

从候选寡核苷酸中选择合适的寡核苷酸是基于寡核苷酸的性能执行的，例如灵敏度或特异性。

从开发者终端接收的结果存储在协同开发系统中的协同开发服务器中。

从开发者终端接收的结果可以通过用户标识符进行识别和分类。

在本公开中，开发者终端可以包括通过网络与开发者终端连接的开发设备。因此，该步骤中的结果包括从开发设备接收到的结果。

步骤(d)：对结果进行审查

接下来，允许协同开发系统的技术提供者终端和/或监控模块对接收的结果进行审查(S500)。

根据实施例，对接收的结果进行审查由技术提供者终端执行。换句话说，将接收的结果提供给技术提供者终端并由技术提供者进行审查。与此相关，根据本公开的方法还可以包括向技术提供者终端提供访问接收的结果的权限，以允许技术提供者对通过使用开发工具包获得的结果进行审查。

可以以本领域已知的各种方式来执行技术提供者终端对接收结果的访问。例如，技术提供者终端对接收结果的访问可以通过为技术提供者终端分配用户标识符，并允许技术提供者终端通过标识符的认证访问结果来执行。作为另一示例，技术提供者终端对结果的访问可以通过对结果进行加密并允许技术提供者对结果进行解密来执行。

根据另一实施例，对接收的结果进行审查由协同开发系统的监控模块执行。

在本公开中，“审查”或“监控”表示用于确认接收的结果(例如性能数据)的过程。性能数据的确认包括对性能数据的精确性、可接受性、适用性、可靠性、稳健性或重要性的确认。

具体而言，技术提供者进行的审查包括确认开发者是否正确使用了技术提供者提供的开发工具包，即是否观察到了指示信息，以及开发者是否造成了任何测试错误。此外，技术提供者进行的审查包括技术提供者的反馈，以纠正测试中出现的错误。

即使在开发者使用开发工具包中包含的软件、设备和指导信息根据技术提供者的指南执行测试时，也可能由于例如技术提供者提供的工具包中的错误或开发者造成的测试错误而引起假结果。因此，技术提供者可用于对开发者的测试结果进行审查、分析错误的原因、并提供错误的解决方案。

根据实施例，对于每次测试重复执行对来自开发者终端的结果的接收以及监控模块或技术提供者终端对结果的审查。寡核苷酸性能测试可被执行多次，并且必要时可以重复对性能测试结果的接收和审查。

步骤(e)：访问审查的结果最后，允许开发者终端访问审查的结果(S600)。

根据实施例，访问审查的结果包括允许开发者通过开发者终端连接到协同开发系统并且直接查看存储在协同开发系统中的审查的结果，或允许开发者通过开发者终端连接到协同开发系统、将审查的结果下载到开发者终端中、并且查看开发者终端中存储的审查的结果。

根据实施例，访问审查的结果包括允许开发者直接查看存储在技术提供者终端中的审查的结果，或允许开发者通过开发者终端连接到技术提供者终端、将审查的结果下载到开发者终端中、并且查看开发者终端中存储的审查的结果。在这种情况下，开发者对存储在技术提供者终端中的审查的结果的直接查看或下载查看可以由协同开发系统控制。

因此，技术提供者的审查的结果可以存储在协同开发系统或技术提供者终端中。

可以控制对审查的结果的访问。根据本公开的方法还可以包括向开发者终端提供开发者终端访问审查的结果的权限。

在即时步骤中访问的审查的结果可以包括对重新执行或批准性能测试的指示。重新执行性能测试可能包括用于(i)重新设计寡核苷酸、(ii)改变酶、或(iii)调整反应条件的指示。此外，可以提供用于重新执行性能测试的修改指南。

根据本公开的协同开发方法是在接收到性能测试结果、技术提供者对性能测试结果进行审查、以及开发者对审查的结果进行识别后完成的。

在协同开发完成后，由技术提供者和/或协同开发系统生成完成结果。完成结果包括关于试剂生产的可行性的信息，诸如试剂的性能、适销性、竞争力、成本和销售利润。

根据本公开的方法还可以包括将完成结果提供给评估者终端以对其进行评估并从评估者终端接收评估结果。

一旦协同开发系统接收到评估结果，它就注册协同开发完成，以终止协同开发过程。

在注册协同开发完成后，协同开发系统可以根据需要向请求者终端、开发者终端和/或技术提供者终端提供协同开发完成的通知。在这种情况下，提供给开发者终端的协同开发完成通知可以包括评估结果。

如果试剂的可行性评估结果良好，则根据本公开的方法还可以包括向生产者终端(或技术提供者终端)发送生产用于检测靶核酸的试剂的请求。制造者可以是参与协同开发的技术提供者终端或开发者，或者可以是其他第三方。

相反，如果试剂的可行性评估结果不是很好，则根据本公开的方法可以放弃生产用于检测靶核酸的试剂，或者可以请求重新评估。

根据本公开，协同开发系统可以被配置为实现多个协同开发。根据本公开的协同开发系统包括用于管理多个协同开发的主题管理模块，并且主题管理模块允许根据上述步骤(a)至(e)执行每个协同开发。

通过上述本发明的方法，选择了包含在试剂中的寡核苷酸，从而开发了用于检测靶核酸的试剂。

III.用于检测靶核酸的试剂的协同开发系统

在本公开的另一方面，提供了一种用于使用存储在存储器中并被配置为由处理器执行的一个或多个程序来协同开发用于检测靶核酸的试剂的系统。

一个或多个程序包括由处理器执行的指令以执行以下操作：

从请求者终端接收对含有用于检测靶核酸的寡核苷酸的试剂的协同开发请求，其中协同开发请求包括关于使用试剂检测的靶核酸的特征信息；

允许开发者终端访问技术提供者的开发工具包，其中开发工具包包括用于试剂中包含的寡核苷酸的性能测试工具，性能测试工具包括软件、设备和指导信息中的一个或多个；

从开发者终端接收使用开发工具包获得的结果，其中结果包括寡核苷酸的性能数据；

允许技术提供者终端或协同开发系统的监控模块对接收的结果进行审查；以及

允许开发者终端访问审查的结果，从而选择要包含在试剂中的寡核苷酸。

根据本公开的示例性协同开发系统在图2中示出。

协同开发系统包括协同开发服务器，该协同开发服务器由包括一个或多个处理器和存储器的计算机组成，存储在存储介质中的指令被配置为操作协同开发服务器。

协同开发服务器包括用于控制每个组件的控制器110、用于管理协同开发请求和评估的请求/评估管理单元120、用于实质管理协同开发的协同管理单元130、和用于存储测试数据以及通过协同开发获得的结果的数据库单元140。在本说明书的其他地方更全面地讨论了每个组件。

IV.用于检测靶核酸的试剂的协同开发的存储介质

在本公开的又一方面，提供了一种非暂时性计算机可读存储介质，其存储指令，该指令由一个或多个处理器执行以用于协同开发用于检测靶核酸的试剂。

当由一个或多个处理器执行时，指令使计算设备能够执行：

从请求者终端接收对含有用于检测靶核酸的寡核苷酸的试剂的协同开发请求，其中协同开发请求包括关于使用试剂检测的靶核酸的特征信息；

允许开发者终端访问技术提供者的开发工具包，其中开发工具包包括用于试剂中包含的寡核苷酸的性能测试工具，性能测试工具包括软件、设备和指导信息中的一个或多个；

从开发者终端接收使用开发工具包获得的结果，其中结果包括寡核苷酸的性能数据；

允许技术提供者终端或协同开发系统的监控模块对接收的结果进行审查；以及

允许开发者终端访问审查的结果，从而选择要包含在试剂中的寡核苷酸。

V.用于协同开发用于检测区域特异性靶核酸的试剂的计算机实施的方法

在本公开的又一方面，提供了一种用于通过协同开发系统来协同开发用于检测靶核酸的试剂的计算机实施的方法，包括：

接收协同开发应用信息，包括关于靶核酸的特征信息；

使用接收到的关于靶核酸的特征信息确定与靶核酸相关的疾病爆发的疾病区域；

选择位于疾病区域中的开发者；以及

从开发者终端接收由所选择的开发者通过技术提供者的支持对开发用于检测靶核酸的试剂执行测试的结果。

有关每个步骤的详细说明参考说明书中的其他地方。

根据实施例，请求者终端、开发者终端、技术提供者终端和/或评估者终端表示对应于台式计算机、蜂窝设备或智能电话、个人数字助理(PDA)、膝上型计算机或平板设备的设备，能够提供网络连接和处理资源以通过一个或多个网络与协同开发系统进行通信。请求者终端、开发者终端、技术提供者终端和/或评估者终端均可以操作被配置为与协同开发系统通信的指定服务应用程序(例如，协同开发应用程序)。开发者终端可以与开发设备连接以共享或生成从协同开发系统发送/接收的数据。

本文描述的一个或多个示例提供了由计算设备执行的方法、技术和操作以编程方案或作为计算机实施的方法来执行。如本文所用，程序意味着使用代码或计算机可执行指令。指令可以存储在计算设备的一个或多个存储器资源中。在编程方案中执行的步骤可以自动执行或可以不自动执行。

本文描述的一个或多个示例可以使用服务器、单元或模块来实施。服务器、单元或模块可以包括能够执行程序的一部分或本文提及的一项或多项任务或功能的软件或硬件组件。如本文所用，单元或模块可以独立于其他单元或模块而存在于硬件组件上。替代地，单元或模块可以是其他单元、模块、程序或设备的共享元素或过程。

可以使用可由一个或多个处理器执行的指令来实施本文描述的一个或多个示例。指令可以在计算机可读存储介质上传输。参考附图示出和描述的协同开发系统提供了用于存储和/或执行用于实施本文描述的示例和处理资源的指令的计算机可读存储介质的示例。特别地，作为本文描述的示例示出的协同开发系统包括用于保存过程、数据和指令的各种类型的存储器。计算机可读存储介质的示例包括永久存储器存储设备，例如个人计算机或服务器中的硬盘驱动器。计算机可读存储介质的其他示例包括便携式存储单元，例如CD或DVD单元、闪存，例如智能手机、多功能设备或平板电脑中包括的那些，以及磁存储器。计算机、终端和网络设备(例如，诸如手机之类的移动设备)是利用存储在处理器、存储器和计算机可读存储介质上的指令的服务器和设备的示例。此类示例也可以以计算机程序或能够传输此类程序的计算机可用传输介质的形式来实施。

本文描述的示例与用于实施本公开中描述的技术的协同开发系统的使用有关。根据实施例，该技术由协同开发系统响应于执行包括在存储器中的一个或多个指令的一个或多个序列的过程而执行。指令可以从其他机器可读介质(例如存储介质)读取到存储器。包括在存储器中的指令序列的执行使得能够执行本文描述的处理步骤。在替代实施方式中，可以使用硬连线电路连同软件指令来代替软件指令，以便实施本文描述的示例。因此，所描述的示例不限于硬件电路和软件的任何特定组合。

本文描述的示例可以扩展到本文描述的各个元素和概念，独立于其他概念、想法或系统，并且可以与在本公开中任何地方引用的元素组合。尽管已经参考附图详细描述了一些示例，但是该概念不限于这些示例。因此，该概念的范围旨在由所附权利要求及其等同物来限定。此外，单独描述的或作为一些示例描述的特定特征可以与单独描述的其他特征或其他示例组合，尽管对于特定特征没有特别提及。因此，对这种组合的描述的缺失不应被解释为将这种组合排除在本公开的范围之外。

[相关申请的交叉引用]

本申请要求在韩国知识产权局于2019年6月14日提交的韩国专利申请No.10-2019-0070900、于2019年12月27日提交的韩国专利申请No.10-2019-0177063的优先权，其公开的全部内容以引用方式并入本文。

Claims (27)

1.一种用于通过协同开发系统协同开发用于检测靶核酸的试剂的计算机实施的方法，包括：

从请求者终端接收对含有用于检测靶核酸的寡核苷酸的试剂的协同开发请求，其中所述协同开发请求包括关于使用所述试剂检测的所述靶核酸的特征信息；

允许开发者终端访问技术提供者的开发工具包，其中所述开发工具包包括用于所述试剂中包含的寡核苷酸的性能测试工具，所述性能测试工具包括软件、设备和指导信息中的一个或多个；

从所述开发者终端接收使用所述开发工具包获得的结果，其中所述结果包括所述寡核苷酸的性能数据；

允许所述技术提供者终端或协同开发系统的监控模块对接收的结果进行审查；以及

允许所述开发者终端访问所述审查的结果，从而选择要包含在所述试剂中的寡核苷酸。

2.根据权利要求1所述的计算机实施的方法，其中所述开发者终端是已经获得或能够获得含有或怀疑含有所述靶核酸的临床样本的开发者的终端。

3.根据权利要求2所述的计算机实施的方法，其中使用所述开发工具包获得的结果包括对所获得的临床样本的测试结果。

4.根据权利要求1所述的计算机实施的方法，其中所述开发者终端是位于与所述靶核酸相关的疾病正在爆发或已爆发的区域中的开发者的终端。

5.根据权利要求1所述的计算机实施的方法，其中所述请求者终端与所述开发者终端相同。

6.根据权利要求1所述的计算机实施的方法，其中所述试剂用于检测多个靶核酸。

7.根据权利要求1所述的计算机实施的方法，其中关于所述靶核酸的特征信息包括：(i)含有所述靶核酸的生物体的名称；(ii)含有所述靶核酸的基因的名称；(iii)所述靶核酸的序列；(iv)所述试剂的预期用途；(v)用所述试剂检测的疾病的名称；和/或(vi)用所述试剂检测的疾病的分类符号。

8.根据权利要求1所述的计算机实施的方法，还包括：响应于所述协同开发请求向评估者终端发送评估请求，并从所述评估者终端接收协同开发的可行性的评估结果。

9.根据权利要求1所述的计算机实施的方法，还包括：响应于所述协同开发请求，由所述协同开发系统的评估管理模块评估协同开发的可行性。

10.根据权利要求1所述的计算机实施的方法，其中所述评估者终端包括技术提供者终端。

11.根据权利要求1所述的计算机实施的方法，其中所述开发者终端是从多个候选开发者中选择的开发者的终端。

12.根据权利要求1所述的计算机实施的方法，其中所述开发工具包是从多个候选技术提供者中选择的技术提供者提供的。

13.根据权利要求1所述的计算机实施的方法，其中包括在所述性能测试工具中的所述设备、软件或指导信息中的任何一个或多个被用于确定所述寡核苷酸的灵敏度或特异性。

14.根据权利要求13所述的计算机实施的方法，其中用于确定所述寡核苷酸的灵敏度或特异性的设备包括选自由下列项组成的组的一个或多个设备：核酸提取设备、核酸分配设备和核酸检测设备。

15.根据权利要求13所述的计算机实施的方法，其中用于确定所述寡核苷酸的灵敏度或特异性的软件包括用于将所述寡核苷酸分配(定位)在反应容器的指定位置的指令。

16.根据权利要求13所述的计算机实施的方法，其中用于确定所述寡核苷酸的灵敏度或特异性的指导信息包括用于所述寡核苷酸的性能测试的过程和条件。

17.根据权利要求1所述的计算机实施的方法，其中所述开发工具包还包括以下项中的一项或多项：

(i)用于所述寡核苷酸的设计工具；

(ii)用于性能测试的分析工具；以及

(iii)用于性能测试的文档工具。

18.根据权利要求17所述的计算机实施的方法，其中用于所述寡核苷酸的设计工具包括自动设计用于检测所述靶核酸的一组候选寡核苷酸的软件。

19.根据权利要求17所述的计算机实施的方法，其中用于性能测试的分析工具包括通过预定参数将原始性能数据自动转换为处理后的性能数据的软件。

20.根据权利要求17所述的计算机实施的方法，其中用于性能测试的分析工具包括自动设置导致假阳性或假阴性的参数值的软件。

21.根据权利要求17所述的计算机实施的方法，其中用于性能测试的文档工具包括将处理后的性能数据自动转换为指定格式的文档的软件。

22.根据权利要求1所述的计算机实施的方法，其中对于每个测试，重复执行从所述开发者终端接收所述结果以及由所述监控模块或所述技术提供者终端对所述结果进行审查。

23.根据权利要求1所述的计算机实施的方法，其中所述审查的结果包括重新执行或批准所述性能测试的指示。

24.根据权利要求1所述的计算机实施的方法，其中所述协同开发系统被配置为实现多个协同开发。

25.一种用于使用存储在存储器中并配置为由处理器执行的一个或多个程序来协同开发用于检测靶核酸的试剂的系统，其中

所述一个或多个程序包括由所述处理器执行的指令以执行以下操作：

从请求者终端接收对含有用于检测靶核酸的寡核苷酸的试剂的协同开发请求，其中所述协同开发请求包括关于使用所述试剂检测的所述靶核酸的特征信息；

允许开发者终端访问技术提供者的开发工具包，其中所述开发工具包包括用于所述试剂中包含的寡核苷酸的性能测试工具，所述性能测试工具包括软件、设备和指导信息中的一个或多个；

从所述开发者终端接收使用所述开发工具包获得的结果，其中所述结果包括所述寡核苷酸的性能数据；

允许所述技术提供者终端或协同开发系统的监控模块对接收的结果进行审查；以及

允许所述开发者终端访问所述审查的结果，从而选择要包含在所述试剂中的寡核苷酸。

26.一种在计算设备中存储由一个或多个处理器执行的用于协同开发用于检测靶核酸的试剂的指令的非暂时性计算机可读存储介质，其中

当由所述一个或多个处理器执行时，所述指令使所述计算设备执行以下操作：

从请求者终端接收对含有用于检测靶核酸的寡核苷酸的试剂的协同开发请求，其中所述协同开发请求包括关于使用所述试剂检测的所述靶核酸的特征信息；

允许开发者终端访问技术提供者的开发工具包，其中所述开发工具包包括用于所述试剂中包含的寡核苷酸的性能测试工具，所述性能测试工具包括软件、设备和指导信息中的一个或多个；

从所述开发者终端接收使用所述开发工具包获得的结果，其中所述结果包括所述寡核苷酸的性能数据；

允许所述技术提供者终端或协同开发系统的监控模块对接收的结果进行审查；以及

允许所述开发者终端访问所述审查的结果，从而选择要包含在所述试剂中的寡核苷酸。

27.一种用于通过协同开发系统协同开发用于检测靶核酸的试剂的计算机实施的方法，包括：

接收协同开发应用信息，包括关于靶核酸的特征信息；

使用接收到的关于所述靶核酸的特征信息确定与所述靶核酸相关的疾病爆发的疾病区域；

选择位于所述疾病区域中的开发者；以及

从开发者终端接收由所选择的开发者通过技术提供者的支持对开发用于检测所述靶核酸的所述试剂执行测试的结果。

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