WO2024090987A1 - 분자 진단용 어플리케이션을 관리하는 방법 및 장치 - Google Patents

분자 진단용 어플리케이션을 관리하는 방법 및 장치 Download PDF

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WO2024090987A1
WO2024090987A1 PCT/KR2023/016640 KR2023016640W WO2024090987A1 WO 2024090987 A1 WO2024090987 A1 WO 2024090987A1 KR 2023016640 W KR2023016640 W KR 2023016640W WO 2024090987 A1 WO2024090987 A1 WO 2024090987A1
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WO
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application
molecular
computer device
molecular diagnostic
parameter information
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Application number
PCT/KR2023/016640
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English (en)
French (fr)
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송창희
주원우
이형섭
최규수
제갈욱
Original Assignee
주식회사 씨젠
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Publication date
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    • G—PHYSICS
    • G16—INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
    • G16B—BIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
    • G16B25/00—ICT specially adapted for hybridisation; ICT specially adapted for gene or protein expression
    • G16B25/20—Polymerase chain reaction [PCR]; Primer or probe design; Probe optimisation
    • G—PHYSICS
    • G16—INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
    • G16B—BIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
    • G16B30/00—ICT specially adapted for sequence analysis involving nucleotides or amino acids
    • G16B30/10—Sequence alignment; Homology search
    • G—PHYSICS
    • G16—INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
    • G16B—BIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
    • G16B50/00—ICT programming tools or database systems specially adapted for bioinformatics

Definitions

  • the present invention relates to a method and device for managing applications for molecular diagnostics.
  • Molecular diagnostics is a technique used to identify and analyze nucleic acids or proteins at the molecular level.
  • Detailed technologies for such molecular diagnosis include polymerase chain reaction (PCR), isothermal nucleic acid amplification technology (INAAT), DNA sequencing & next-generation sequencing (NGS), in situ hybridization (ISH), and DNA microarray.
  • PCR polymerase chain reaction
  • INAAT isothermal nucleic acid amplification technology
  • NGS DNA sequencing & next-generation sequencing
  • ISH in situ hybridization
  • DNA microarray DNA microarray.
  • PCR testing can be performed by testing steps such as nucleic acid extraction, PCR setup, amplification reaction, and reaction analysis.
  • steps such as nucleic acid extraction, PCR setup, amplification reaction, and reaction analysis.
  • various devices are used to perform each step, and each device can be operated by a molecular diagnostic application, which is a software tool implemented to control the device and analyze the generated data.
  • the problem to be solved in one embodiment includes, but is not limited to, providing technology for managing the above-described molecular diagnostic application.
  • a method for managing a molecular diagnostic application is performed by a computer device, and includes displaying the name of a molecular diagnostic application executable on the computer device; Displaying parameter information used for processing and/or analysis of target nucleic acid amplification data during operation of the molecular diagnostic application; selecting the displayed application to be executed; selecting the displayed parameter information; and controlling the selected parameter information to be used during the operation of the selected molecular diagnostic application.
  • the molecular diagnostic application includes an application used in the preparation process of molecular diagnosis, an application used in processing and/or analysis of the target nucleic acid amplification data, an application used in the development of a molecular diagnostic reagent, and a combination thereof. At least one of the configured application groups may be included.
  • the location of an executable file for the executable molecular diagnostic application is stored in the memory of the computer device, and further includes the step of obtaining the storage location from the memory, wherein the execution of the selected molecular diagnostic application is performed by: It can be performed by an executable file stored in the storage location.
  • the computer device may execute a plurality of molecular diagnostic applications, and the step of displaying the names of the molecular diagnostic applications may display an application list including the names of at least some of the plurality of molecular diagnostic applications.
  • the configuration of applications included in the application list may change depending on the access authority information of the user of the computer device for each of the plurality of applications included in the application list.
  • the application list may be updated whenever a molecular diagnosis application is newly installed or deleted from the computer device.
  • the update may be performed by storing or deleting the executable file location of the molecular diagnostic application to be installed or deleted in the memory of the computer device.
  • the application list may include version information of molecular diagnostic applications installed on the computer device.
  • version information may be updated whenever the molecular diagnosis application installed on the computer device is updated.
  • the parameter information may include at least one of a parameter information group consisting of parameter information for controlling molecular diagnostic equipment, parameter information used for processing and/or analysis of amplification data, and a combination thereof.
  • the method for managing an application for molecular diagnosis includes obtaining access authority information of a user of the computer device for the displayed parameters from the memory of the computer device; And depending on the obtained access authority information, it may further include allowing or blocking use of the selected parameter.
  • a plurality of parameter information is stored in the memory of the computer device, and the method may further include displaying a parameter list each displaying a portion of the plurality of parameter information.
  • the configuration of parameters included in the parameter list may change depending on the access authority information of the user of the computer device for each parameter information included in the parameter list.
  • the parameter list may be updated whenever a parameter is newly installed or deleted from the computer device.
  • version information of parameters installed in the computer device may be described in the parameter list.
  • version information may be updated whenever parameters installed in the computer device are updated.
  • execution history and/or the usage history may be stored for each user of the computer device.
  • a computer-readable recording medium includes a computer program, and the computer program may be programmed to include and perform each step included in the above-described method.
  • a computer program according to one embodiment is stored in a computer-readable recording medium, and the computer program may be programmed to include and perform each step included in the above-described method.
  • a computer device includes a memory storing at least one instruction; and a processor, wherein the at least one instruction is executed by the processor to display the name of a molecular diagnostic application executable on the computer device, and to process and/or target nucleic acid amplification data during operation of the molecular diagnostic application.
  • Parameter information used for analysis is displayed, the displayed application can be selected to be executed, the displayed parameter information can be selected, and the selected parameter information can be controlled to be used during the operation of the selected molecular diagnostic application.
  • the user of the computer device can check what type of molecular diagnostic application is installed on the computer device through the management module included therein.
  • the user of the computer device can run each molecular diagnostic application through the management module included therein.
  • the above-described molecular diagnosis application may not be executed without passing through this management module.
  • the user of the computer device can manage applications for molecular diagnostics on this management module. For example, new installation, update, or deletion of molecular diagnostic applications can be performed on this management module.
  • management history that is, when new applications were installed, when and what information was updated, or when and which applications were deleted, can be checked through this management module.
  • exclusion of use for those who do not have permission to use molecular diagnostic applications is performed by this management module. For example, exclusion of use of all types of molecular diagnostic applications installed on a computer device or exclusion of use of some molecular diagnostic applications may be managed or controlled for each user.
  • FIG. 1 exemplarily illustrates a concept in which a computer device operates in connection with a preparation device and/or an analysis device according to an embodiment.
  • Figure 2 is a conceptual configuration diagram of a computer device according to one implementation.
  • Figure 3 is a conceptual configuration diagram of a memory according to an implementation example.
  • FIG. 4 is an exemplary configuration diagram of a user interface (USER INTERFACE) for managing a molecular diagnosis application displayed on a computer device, according to one embodiment.
  • USER INTERFACE user interface
  • FIG. 5 conceptually illustrates a configuration in which two databases included in a management module according to an implementation are connected and operated with a storage unit.
  • Figure 6 conceptually illustrates application execution through a management module according to an implementation example.
  • Figure 7 is a flowchart of a method for managing an application for molecular diagnosis according to an embodiment.
  • sample refers to a material that contains or is presumed to contain an analyte (analytes will be described later).
  • Such samples may include biological samples (e.g., cells, tissues, and body fluids from biological sources) or non-biological samples (e.g., food, water, and soil).
  • biological samples e.g., cells, tissues, and body fluids from biological sources
  • non-biological samples e.g., food, water, and soil.
  • biological samples include viruses, bacteria, tissues, cells, blood (including whole blood, plasma, and serum), lymph, bone marrow fluid, sputum, swab, aspiration, bronchial lavage fluid, and bronchopulmonary lavage fluid. , nasal wash, milk, urine, feces, ocular fluid, saliva, semen, brain extract, spinal fluid (SCF), synovial fluid, appendix, spleen and tonsil tissue extract, amniotic fluid or ascites. Additionally, naturally occurring or synthetic nucleic acid molecules isolated from biological sources may also be included in examples of such biological samples. However, biological samples are not limited to the examples described above.
  • Substances used for preservation, processing, detection, etc. of the sample may be added to the above-described sample.
  • additional substances such as amplification reagents, detection reagents, preservatives, water, deionized water, saline solution, pH buffer, acidic solution, and basic solution may be added to the sample.
  • sample may refer to a sample without the addition of the above-mentioned additional substances as well as a sample with the addition of the above-mentioned additional substances.
  • the above-described samples may be referred to in various ways depending on the stage of molecular diagnosis.
  • the term “raw sample” may refer to a sample before being processed in a first device, which will be described later.
  • analysis sample may refer to intermediates containing analytes prepared during the various steps of processing a sample for analysis.
  • sample may be used interchangeably with the term “specimen.”
  • sample itself refers to the object to be analyzed. More specifically, the term “specimen” may include saliva, blood, urine, stool, etc.
  • FIG. 1 exemplarily illustrates a concept in which a computer device 1000 operates in connection with a preparation device 2000 and/or an analysis device 3000 according to an embodiment.
  • Figure 1 is merely illustrative.
  • the preparation process of such an analysis sample may include a nucleic acid extraction process, a process of preparing an amplification reaction solution (for example, a reaction solution for polymerase chain reaction (PCR)), or a process of preparing a reaction solution for extraction and amplification of nucleic acids combined thereof.
  • a nucleic acid extraction process for example, a reaction solution for polymerase chain reaction (PCR)
  • PCR polymerase chain reaction
  • Sample analysis herein includes detecting the presence and measuring the content of the analyte.
  • This analysis device 3000 can amplify a nucleic acid having a specific nucleotide sequence and detect the amplified nucleic acid.
  • the analysis device 3000 may include a nucleic acid amplifier that performs a nucleic acid amplification reaction through temperature control.
  • Nucleic acid amplifiers typically include thermal cyclers.
  • nucleic acids can be amplified in various ways.
  • Ligase chain reaction (LCR), Reference Wiedmann M, et al., “Ligase chain reaction (LCR)—overview and applications.” PCR Methods and Applications 1994 Feb;3(4):S51-64), gap filling LCR (gap filling LCR; GLCR, see WO 90/01069, European Patent No. 439182 and WO 93/00447), Qbeta replicase amplification (Q-beta, see Cahill P, et al., Clin Chem. , 37(9): 1482-5 (1991), US Patent No.
  • the computer device 1000 is connected to the preparation device 2000 and/or the analysis device 3000 described above.
  • the molecular diagnostic device that can be connected and operated to the computer device 1000 is not limited to the preparation device 2000 and the detection device 3000.
  • other components not shown in FIG. 1 may be added to operate as a molecular diagnosis device, and at least one of the preparation device 2000 and the analysis device 3000 may not be connected to the computer device 1000.
  • the following description will be made on the assumption that the computer device 1000 operates in connection with the preparation device 2000 and the detection device 3000.
  • the computer device 1000 may be installed with a molecular diagnostic application used to control each of the above-described devices 2000 and 3000 or to analyze signals generated from each device 2000 and 3000.
  • the computer device 1000 may be installed with an application used in the preparation process of molecular diagnosis, an application used in processing and/or analysis of amplification data, an application used in the development of a molecular diagnostic reagent, etc.
  • the computer device 1000 may be installed with a molecular diagnostic application management module that can manage access to and additional information about various types of installed molecular diagnostic applications.
  • molecular diagnostic application management module can be utilized as follows:
  • the user of the computer device 1000 can check what type of molecular diagnostic application is installed on the computer device 1000 through this management module.
  • the user of the computer device 1000 can run each molecular diagnostic application on this management module.
  • the above-described molecular diagnosis application may not be executed without passing through this management module.
  • the user of the computer device 1000 can manage molecular diagnostic applications on this management module. For example, new installation, update, or deletion of molecular diagnostic applications can be performed on this management module.
  • management history that is, when new applications were installed, when and what information was updated, or when and which applications were deleted, can be checked through this management module.
  • exclusion of use for those who do not have permission to use molecular diagnostic applications is performed by this management module.
  • exclusion of use of all types of molecular diagnostic applications installed in the computer device 1000 or exclusion of use of some molecular diagnostic applications may be managed or controlled for each user.
  • various types of molecular diagnostic applications installed on the computer device 1000 can be easily managed.
  • FIG. 2 is an exemplary configuration diagram of a computer device 1000 according to one implementation.
  • Figure 2 is merely illustrative.
  • the computer device 1000 can be implemented in any type of user terminal and/or any type of server.
  • the user terminal may include any type of terminal capable of interacting with a server or other computing device.
  • user terminals include, for example, mobile phones, smart phones, laptop computers, personal digital assistants (PDAs), slate PCs, tablet PCs, and ultrabooks ( ultrabook).
  • PDAs personal digital assistants
  • slate PCs slate PCs
  • tablet PCs tablet PCs
  • ultrabooks ultrabook
  • servers may include any type of computing system or computing device, such as, for example, microprocessors, mainframe computers, digital processors, portable devices, and device controllers.
  • the computer device 1000 includes a communication unit 1100, a memory 1200, and a processor 1300.
  • the conceptual diagram shown in FIG. 2 is merely illustrative.
  • the computer device 1000 may further include components not shown in FIG. 2 or may not include at least one of the components shown in FIG. 2 .
  • the communication unit 1100 can be configured regardless of the communication mode, such as wired or wireless, and can be configured with various communication networks such as a personal area network (PAN) and a wide area network (WAN). .
  • the communication unit 1100 can operate based on the known World Wide Web (WWW) and uses wireless transmission technology used for short-distance communication, such as Infrared Data Association (IrDA) or Bluetooth. You can also use it.
  • WWW World Wide Web
  • IrDA Infrared Data Association
  • Bluetooth Bluetooth
  • the computer device 1000 can exchange data with, or control or manage, the above-described preparation device or analysis device through the communication unit 1100.
  • Memory 1200 may store at least one instruction that can be executed by processor 1300. In one embodiment, memory 1200 may store any form of information generated or determined by processor 1300 and any form of information received by computer device 1000.
  • the memory 1200 may be a storage medium or a computer-readable recording medium that stores computer software that allows the processor 1300 to perform operations according to embodiments of the present disclosure.
  • the memory 1200 may refer to computer readable media for storing software codes required to perform embodiments of the present disclosure, data to be executed by the codes, and execution results of the codes.
  • such software that can be stored in the memory 1200 may be a molecular diagnostic application or a management module of the aforementioned molecular diagnostic application.
  • a molecular diagnostic application or a management module of the aforementioned molecular diagnostic application.
  • memory 1200 may refer to any type of storage medium.
  • the memory 1200 may be a flash memory type, hard disk type, multimedia card micro type, or card type memory (e.g., SD or XD memory). etc.), RAM (Random Access Memory), SRAM (Static Random Access Memory), ROM (Read-Only Memory, ROM), EEPROM (Electrically Erasable Programmable Read-Only Memory), PROM (Programmable Read-Only Memory), It may include at least one type of storage medium among magnetic memory, magnetic disk, and optical disk.
  • the processor 1300 may perform technical features according to embodiments of the present disclosure, which will be described later, by executing at least one instruction stored in the memory 1200.
  • the processor 1300 may consist of at least one core, such as a central processing unit (CPU) and a general purpose graphics processing unit (GPGPU) of the computer device 1000.
  • the processor 1300 may include a processor for data analysis and/or processing, such as a tensor processing unit (TPU).
  • CPU central processing unit
  • GPU general purpose graphics processing unit
  • TPU tensor processing unit
  • FIG. 3 is an exemplary configuration diagram of a memory 1200 according to one implementation. However, Figure 3 is merely illustrative.
  • the memory 1200 may include a management module 1210, a molecular diagnosis application storage unit 1220, and a parameter information storage unit 1230.
  • the management module 1210 may be an application created to manage the molecular diagnosis application and additional information used therein stored in the molecular diagnosis application storage unit 1220 and the parameter information storage unit 1230.
  • the management module 1210 according to one implementation is executed by the processor 1300 shown in FIG. 2, the application storage unit 1220 and the parameter information storage unit 1230 are stored using a database connected to each. 1220) and the parameter information storage unit 1230 can be managed, and this will be described later with reference to FIGS. 4 and 5.
  • the molecular diagnosis application storage unit 1200 contains at least one of the applications used in the preparation process of molecular diagnosis, applications used in processing and/or analysis of amplification data, and applications used in the development of molecular diagnostic reagents. One application may be included.
  • the preparation of the molecular diagnosis refers to the process of preparing an analysis sample that contains or is presumed to contain an analyte, including extracting nucleic acids from the specimen and a reaction solution for amplification (e.g., PCR ( It includes the production of a reaction solution for polymerase chain reaction and the preparation of a reaction solution for extraction and amplification of nucleic acids combined with them.
  • a reaction solution for amplification e.g., PCR ( It includes the production of a reaction solution for polymerase chain reaction and the preparation of a reaction solution for extraction and amplification of nucleic acids combined with them.
  • amplification data may be data generated during a process performed to detect the presence or measure the content of an analyte.
  • analyte is a nucleic acid
  • data generated in the process of amplifying a nucleic acid having a specific nucleotide sequence can be referred to as amplification data.
  • the parameter information storage unit 1400 may store at least one piece of parameter information among parameter information for controlling molecular diagnostic equipment for each molecular diagnostic reagent and parameter information used for processing and/or analyzing amplification data.
  • the parameter information for controlling the molecular diagnostic equipment may be an input value or set value that can be input or set in advance for controlling the molecular diagnostic equipment including the above-described preparation device 2000 and analysis device 3000, for example, molecular It may be the type of analyte analyzed in the diagnostic equipment, the type of reagent used with the analyte, and the type of input value, setting value, and algorithm related to the process performed by the equipment.
  • a value that operates as a criterion for reading the presence or absence of a target analyte in a sample may be stored as the above-described parameter information.
  • FIG. 4 is an exemplary configuration diagram of a user interface 1410 that manages a molecular diagnosis application displayed on a display unit (not shown) of the computer device 1000, according to an embodiment.
  • Figure 4 is merely illustrative.
  • the user interface 1410 may be driven by executing the management module 1210 stored in the memory 1200 by the processor 1300, and a display unit (not shown) provided in the computer device 1000. It may be displayed, but is not limited to this.
  • the user interface 1410 may include a molecular diagnosis application selection unit 1411, a parameter information selection unit 1412, and a selection item display unit 1413.
  • the components included in the user interface 1410 are not limited to the molecular diagnosis application selection unit 1411, the parameter information selection unit 1412, and the selection item display unit 1413.
  • other components not shown in FIG. 4 may be added and operated to manage applications for molecular diagnosis.
  • the description below will be made on the assumption that the molecular diagnosis application management U/I 6000 includes a molecular diagnosis application selection unit 1411, a parameter information selection unit 1412, and a selection item display unit 1413.
  • the user interface 1410 may include a molecular diagnostic application selection unit 1411 that provides a list of executable applications in which the name of at least one molecular diagnostic application executable on the computer device 1000 is described.
  • the executable molecular diagnostic application refers to a state in which the molecular diagnostic application is executable installed on the computer device 1000, and the storage location of the application file is not limited. Any one of the molecular diagnostic applications listed in the executable application list can be selected through the user interface 1410. A description of the list-up of executable applications will be described later in the drawings below.
  • the user interface 1410 may include a parameter information selection unit 1412 that provides a list of parameter information.
  • the parameter information selection unit 1412 may be provided with a list containing at least one parameter information including information used for processing and/or analysis of amplification data during the operation of a molecular diagnostic application. Additionally, the parameter information selection unit 1412 may provide the parameter information for each molecular diagnostic reagent. Additionally, the parameter information selection unit 1412 may select at least one parameter information through the user interface 1410.
  • the user interface 1410 may include a selection item display unit 1413 that can display items selected in the molecular diagnosis application selection unit 1411 or the parameter information selection unit 1412.
  • the selection item display unit 1413 may display content related to the application, such as the operating status of the device linked with the application selected by the user and data analysis content calculated by the device. Additionally, the selection item display unit 1413 may display additional information related to parameter information selected by the user.
  • the parameter information displayed at this time may be displayed by selecting only parameters that can be used in the application selected by the user.
  • the user can check what type of molecular diagnostic application is installed on the computer device 1000, run each molecular diagnostic application, and also select parameter information applicable thereto. .
  • the user interface 1410 may also perform functions related to user access in addition to the functions related to installation confirmation and execution of the molecular diagnosis application as described above.
  • a user may not be able to execute the above-described molecular diagnostic application without going through the user interface 1410 on the computer device 1000.
  • exclusion of use by those who do not have permission to use the molecular diagnostic application may be one of the functions of the user interface 1410.
  • FIG. 5 conceptually illustrates a configuration in which two databases 1211 and 1212 included in the management module 1210 according to an implementation are connected and operated with storage units 1220 and 1230.
  • Figure 5 is merely illustrative.
  • the management module 1210 includes an executable file location database 1211 and a parameter information database 1212.
  • the management module 1210 may receive information from the molecular diagnostic application storage unit 1220 that stores at least one molecular diagnostic application. Among the information that the management module 1210 receives from the molecular diagnostic application storage unit 1220, the location of the executable file for each of the molecular diagnostic applications 1221 and 1222 stored in the molecular diagnostic application storage unit 1220 may be included.
  • the location of the executable file is a unique location on the user's computer device of a file that can execute a molecular diagnostic application on the user's computer device. This is also commonly referred to as the executable file path.
  • the location of the executable file delivered to the management module 1210 may be stored in the executable file location database 1211 included in the management module. Additionally, the executable file location database 1211 may be updated based on comparison between newly stored information and previously stored information.
  • the management module 1210 may receive information from the parameter information storage unit 1230 that stores at least one parameter information. Among the information that the management module 1210 receives from the parameter information storage unit 1230, information is stored for each molecular diagnostic reagent in the parameter information storage unit 1230 and is used for processing and/or analysis of amplification data during the operation of the molecular diagnostic application. At least some of the parameter information may be included.
  • parameter information transmitted to the management module 1210 may be stored in the parameter information database 1212 included in the management module. Additionally, the parameter information database 1230 may be updated based on a comparison between newly stored information and previously stored information.
  • FIG. 6 conceptually illustrates application execution through the management module 1210 according to an implementation example.
  • Figure 6 is merely illustrative.
  • the management module 1210 is implemented to store the location of at least one executable file by including an executable file location database 1211. At this time, the execution of the molecular diagnostic application connected to the management module 1210 is controlled by storing only the location of the executable file, not the executable file itself.
  • the method of storing or sharing an executable file may be performed by other configurations not shown in FIG. 6. However, the following description will be made on the premise that the management module 1210 controls the execution of the molecular diagnostic application by storing and controlling the executable file location.
  • the management module 1210 is implemented to store the executable file location of a molecular diagnostic application executable on the computer device 1000 by including an executable file location database 1211.
  • at least one executable molecular diagnostic application (1221, 1222) may be stored in the molecular diagnostic application storage unit 1220 provided in the computer device or a device connected thereto.
  • the location of the executable file which is its unique location in the computer device, may be stored in the executable file location database 1211.
  • the management module 1210 or the user interface executed by it may provide the user with an executable molecular diagnostic application by providing the location of the stored executable file.
  • 'executable' means that the molecular diagnostic application is installed in a computer device so that it can be executed.
  • the management module 1210 can deliver the executable molecular diagnostic application to the user by transmitting the name of the molecular diagnostic application for which the location of the executable file is known.
  • the management module 1210 can secure the user's account through the user's account verification process.
  • the user who can access the management module 1210 may be one of a plurality of users whose respective account information 1241 and 1242 are included in the user account information group 1240.
  • the user account for each of at least one user may be collected through a user account verification process when accessing the management module 1210, and the collected user account may be used to execute a molecular diagnostic application.
  • the management module 1210 may set access rights for each molecular diagnostic application for each at least one user. Additionally, the management module 1210 may collect user accounts when each user accesses the management module 1210. The management module 1210 may determine whether to run the molecular diagnosis application by comparing the user account accessed to the management module 1210 with the access rights for each application. The management module 1210 can check the access rights for each user to the molecular diagnostic application that the user wants to run, and then execute it only if the user account has access rights to the application.
  • the management module 1210 may create a variable including at least one item of access rights for each user and user account information. Variables including user-specific access rights and/or user account information may be entered into the computer device along with the location of the executable file of the molecular diagnostic application selected by the user. For example, the variables and executable file location may be entered into the operational system of the computer device. The computer device that has received the variables and the location of the executable file can execute the application only when the input variables match the access rights for each user and application pre-stored in the management module 1210.
  • the management module 1210 can run a molecular diagnostic application by using the user account information acquired during the platform access process and the executable file location of the executable file location database 1211 included in the platform.
  • the management module 1210 can strengthen the execution conditions for molecular diagnostic applications for cybersecurity. For example, if a user accesses an executable file through a path other than the executable file location in the executable file location database 1212, that is, other than through the management module 1210, the application may not be executed. . In this case, it can be implemented in such a way that variables including user account information created during the access process to the management module 1210 are essential for application execution.
  • the management module 1210 can control the execution of each application for molecular diagnosis by distinguishing them for a plurality of users. Additionally, access to molecular diagnostic applications other than through the management module 1210 can be controlled on the computer device. These configurations can enhance cybersecurity performance for molecular diagnostic applications.
  • the parameter information database 1212 included in the management module 1210 stores various types of parameter information that can be used in molecular diagnostic applications.
  • Parameter information may include parameter information for controlling molecular diagnostic equipment and parameter information used for processing and/or analysis of amplification data. This parameter information is stored in the parameter information database 1212 for each molecular diagnostic reagent.
  • Parameter information similar to an application for molecular diagnosis, storage status may be provided to the user through the management module 1210. Additionally, the user's authority information may be used in the process of controlling parameter information to be used in the operation process of the molecular diagnostic application.
  • the 'execution' of an application refers to the overall driving and operation process of the application in which the application starts and operates by the user's selection
  • the 'operation' of the application refers to the execution of the application's unique functions after the application starts running. It is a term that emphasizes the process of execution.
  • Figure 7 is a flowchart of a method for managing an application for molecular diagnosis according to an embodiment. However, Figure 7 is merely illustrative.
  • a method of managing a molecular diagnostic application performed on a computer device 1000 includes the steps of displaying an executable application list listing the names of molecular diagnostic applications executable on the computer device ( S100); Displaying parameter information used for processing and/or analysis of amplification data during operation of the molecular diagnostic application for each molecular diagnostic reagent (S200); Selecting one of the molecular diagnostic applications listed in the executable application list (S300); Selecting one of the displayed parameter information for each molecular diagnostic reagent (S400); and controlling the selected parameter information to be used during the operation of the selected molecular diagnostic application (S500).
  • step S100 an executable application list containing the names of molecular diagnostic applications executable on the computer device is displayed.
  • the executable application for molecular diagnosis refers to a state in which the application for molecular diagnosis is executable installed on a computer device, as described above, and the storage location of the application file is not limited.
  • the list of executable applications may be updated each time a molecular diagnostic application is newly installed or deleted from the computer device.
  • the executable application list may include version information of the molecular diagnostic application installed on the computer device.
  • the version information may be updated whenever the molecular diagnosis application installed on the computer device is updated.
  • a method for managing a molecular diagnostic application includes obtaining, from a memory of the computer device, access authority information of a user of the computer device for each molecular diagnostic application in the executable application list; And depending on the obtained access authority information, it may further include allowing or blocking the operation of the selected molecular diagnostic application.
  • the memory of a computer device executing the method for managing a molecular diagnostic application stores the location of an executable file for each molecular diagnostic application in the list of executable apps, and the management method includes: It may further include obtaining a location, and execution of the selected molecular diagnostic application may be performed by an executable file stored in the storage location.
  • the management method further includes the step of obtaining access authority information of the user of the computer device for each molecular diagnosis application in the executable app list from the memory, and the selected molecule by the executable file. Whether or not a diagnostic application can be executed may be determined depending on the obtained access authority information.
  • the method for managing a molecular diagnostic application may further include storing an execution history of the molecular diagnostic application or a usage history of the parameter information in the memory. At this time, the execution history and/or the usage history may be stored for each user of the computer device.
  • the molecular diagnostic application of the molecular diagnostic application management method includes an application used in the preparation process of molecular diagnostics, an application used in processing and/or analysis of amplification data, and an application used in the development of molecular diagnostic reagents. At least one app group selected from an application group including applications and combinations thereof may be included.
  • step S200 parameter information used for processing and/or analysis of amplification data during operation of the molecular diagnostic application is displayed for each molecular diagnostic reagent.
  • the parameter information may be updated when a new molecular diagnostic reagent is developed or when there are modifications to a previously developed molecular diagnostic reagent.
  • the parameter information includes version information, and the version information may be updated each time the parameter information is updated.
  • the parameter information includes at least one selected from the group of parameter information including parameter information for controlling molecular diagnostic equipment, parameter information used for processing and/or analysis of amplification data, and combinations thereof.
  • a group of parameter information may be included.
  • step S300 one of the molecular diagnostic applications listed in the executable application list is selected.
  • step S400 one of the displayed parameter information for each molecular diagnostic reagent is selected.
  • step S500 the selected parameter information is controlled to be used during the operation of the selected molecular diagnostic application.
  • each step included in the above-described method can be implemented in the form of a computer program stored in a computer-readable recording medium programmed to perform including each of these steps.
  • each step included in the above-described method can be implemented in the form of a computer-readable recording medium that stores a computer program programmed to perform and include each of these steps.

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Abstract

일 구현예에 따른 분자 진단용 어플리케이션 관리 방법은 컴퓨터 장치에 의해 수행되고, 상기 컴퓨터 장치에서 실행 가능한 분자 진단용 어플리케이션의 명칭이 기재되어 있는 실행 가능 어플리케이션 리스트를 디스플레이하는 단계; 상기 분자 진단용 어플리케이션의 동작 중에 증폭 데이터의 가공 및/또는 분석에 이용되는 파라미터 정보를, 분자 진단 시약 별로 디스플레이하는 단계; 상기 실행 가능 어플리케이션 리스트 내에 기재된 분자 진단용 어플리케이션 중 어느 하나를 선택받는 단계; 상기 디스플레이된 분자 진단 시약 별 파라미터 정보 중 어느 하나를 선택받는 단계; 및 상기 선택된 분자 진단용 어플리케이션의 동작 과정에서, 상기 선택된 파라미터 정보가 이용되도록 제어하는 단계를 포함한다.

Description

분자 진단용 어플리케이션을 관리하는 방법 및 장치
본 발명은 분자 진단용 어플리케이션을 관리하는 방법 및 장치에 관한 것이다.
분자 진단은 분자 수준에서 핵산 또는 단백질을 식별하고 분석하는데 사용되는 기법이다. 이러한 분자 진단의 세부 기술로는 중합효소 연쇄 반응(PCR), 등온핵산증폭기술(INAAT), DNA 시퀀싱&차세대 염기서열 분석(NGS), 현장혼성화(ISH), DNA 마이크로어레이 등이 알려져 있다.
각각의 기술에서는 타겟 물질을 식별하고 분석하기 위해 여러 단계가 수행된다. 예컨대, PCR 검사는 핵산 추출, PCR setup, 증폭 반응 및 반응 분석 등의 검사 단계에 의해 수행될 수 있다. 이 때, 각 단계를 수행하기 위한 다양한 장치가 사용되고, 각각의 장치는 장치의 제어 및 생성된 데이터 분석을 위해 구현된 소프트웨어 툴인 분자 진단용 어플리케이션에 의해 동작할 수 있다.
이러한 분자 진단용 어플리케이션은 국가별 기준에 따른 인허가 획득, 사이버 보안 강화 및 효율적 운영을 위해, 진단 검사실 및 진단 수행자에 따라 접근 가능한 어플리케이션 및 추가 정보(어플리케이션에서 사용되는 정보)가 관리될 필요가 있다.
일 실시예에서 해결하고자 하는 과제는, 전술한 분자 진단용 어플리케이션을 관리하는 기술의 제공을 포함하며, 다만 이에 한정되는 것은 아니다.
일 구현예에 따른 분자 진단용 어플리케이션 관리 방법은 컴퓨터 장치에 의해 수행되고, 상기 컴퓨터 장치에서 실행 가능한 분자 진단용 어플리케이션의 명칭을 디스플레이하는 단계; 상기 분자 진단용 어플리케이션의 동작 중에 타겟 핵산 증폭 데이터의 가공 및/또는 분석에 이용되는 파라미터 정보를 디스플레이하는 단계; 상기 디스플레이된 어플리케이션이 실행되도록 선택받는 단계; 상기 디스플레이된 파라미터 정보가 선택받는 단계; 및 상기 선택된 분자 진단용 어플리케이션의 동작 과정에서, 상기 선택된 파라미터 정보가 이용되도록 제어하는 단계를 포함한다.
또한 상기 분자 진단용 어플리케이션에는, 분자 진단의 준비(preparation) 과정에서 이용되는 어플리케이션, 상기 타겟 핵산 증폭 데이터의 가공 및/또는 분석에 이용되는 어플리케이션, 분자 진단 시약의 개발에 이용되는 어플리케이션 및 이들의 조합으로 구성된 어플리케이션 그룹 중 적어도 하나가 포함될 수 있다.
또한 상기 컴퓨터 장치의 메모리에는, 상기 실행 가능한 분자 진단용 어플리케이션에 대한 실행 파일의 위치가 저장되어 있으며, 상기 메모리로부터 상기 저장 위치를 획득하는 단계를 더 포함하고, 상기 선택된 분자 진단용 어플리케이션의 실행은, 상기 저장 위치에 저장되어 있는 실행 파일에 의해 수행될 수 있다.
또한 상기 선택된 분자 진단용 어플리케이션에 대한, 상기 컴퓨터 장치의 사용자의 접근 권한 정보를 상기 메모리로부터 획득하는 단계를 더 포함하고, 상기 선택된 분자 진단용 어플리케이션이 상기 실행 파일에 의해 실행되는 지의 가부는, 상기 획득된 접근 권한 정보에 의존적으로 결정될 수 있다.
또한 상기 컴퓨터 장치는 복수의 분자 진단용 어플리케이션을 실행 가능하며, 상기 분자 진단용 어플리케이션의 명칭을 디스플레이하는 단계는, 상기 복수의 분자 진단용 어플리케이션 중 적어도 일부의 명칭을 포함하는 어플리케이션 리스트를 디스플레이할 수 있다.
또한 상기 어플리케이션 리스트는, 상기 어플리케이션 리스트에 포함된 복수의 어플리케이션 각각에 대한 상기 컴퓨터 장치의 사용자의 접근 권한 정보에 따라, 상기 어플리케이션 리스트에 포함되는 어플리케이션의 구성이 변할 수 있다.
또한 상기 어플리케이션 리스트에 디스플레이되는 복수의 어플리케이션 각각에 대한, 상기 컴퓨터 장치의 사용자의 접근 권한 정보를 상기 컴퓨터 장치의 메모리로부터 획득하는 단계; 및 상기 획득된 접근 권한 정보에 의존적으로, 상기 선택된 분자 진단용 어플리케이션의 동작을 허용하거나 차단하는 단계를 더 포함할 수 있다.
또한 상기 어플리케이션 리스트는, 상기 컴퓨터 장치에서 분자 진단용 어플리케이션이 신규 설치되거나 삭제될 때마다 업데이트될 수 있다.
또한 상기 업데이트는, 상기 컴퓨터 장치의 메모리에 상기 설치되거나 삭제되는 분자 진단용 어플리케이션의 실행 파일 위치가 저장되거나 삭제됨으로써 업데이트가 수행될 수 있다.
또한 상기 어플리케이션 리스트에는 상기 컴퓨터 장치에 설치되어 있는 분자 진단용 어플리케이션의 버전 정보가 기재될 수 있다.
또한 상기 버전 정보는, 상기 컴퓨터 장치에 설치되어 있는 분자 진단용 어플리케이션이 업데이트될 때마다 갱신될 수 있다.
또한 상기 파라미터 정보에는, 분자 진단 장비의 제어용 파라미터 정보, 증폭 데이터의 가공 및/또는 분석에 이용되는 파라미터 정보 및 이들의 조합으로 구성된 파라미터 정보 그룹 중 적어도 하나가 포함될 수 있다.
또한 상기 분자 진단용 어플리케이션 관리 방법은 상기 디스플레이되는 파라미터에 대한, 상기 컴퓨터 장치의 사용자의 접근 권한 정보를 상기 컴퓨터 장치의 메모리로부터 획득하는 단계; 및 상기 획득된 접근 권한 정보에 의존적으로, 상기 선택된 파라미터의 이용을 허용하거나 차단하는 단계를 더 포함할 수 있다.
또한 상기 컴퓨터 장치의 메모리에는, 복수의 파라미터 정보가 저장되어 있으며, 상기 복수의 파리미터 정보 중 각각 일부의 정보를 디스플레이하는 파라미터 리스트를 디스플레이하는 단계를 더 포함할 수 있다.
또한 상기 파라미터 리스트는, 상기 파라미터 리스트에 포함된 각각의 파라미터 정보에 대한 상기 컴퓨터 장치의 사용자의 접근 권한 정보에 따라, 상기 파라미터 리스트에 포함되는 파라미터의 구성이 변할 수 있다.
또한 상기 파라미터 리스트는, 상기 컴퓨터 장치에서 파라미터가 신규 설치되거나 삭제될 때마다 업데이트될 수 있다.
또한 상기 파라미터 리스트에는 상기 컴퓨터 장치에 설치되어 있는 파라미터의 버전 정보가 기재될 수 있다.
또한 상기 버전 정보는, 상기 컴퓨터 장치에 설치되어 있는 파라미터가 업데이트될 때마다 갱신될 수 있다.
또한 상기 분자 진단용 어플리케이션의 실행 history 또는 상기 파라미터 정보의 이용 history를 상기 메모리에 저장하는 단계를 더 포함할 수 있다.
또한 상기 실행 history 및/또는 상기 이용 history는, 상기 컴퓨터 장치의 사용자 별로 저장될 수 있다.
일 구현예에 따른 컴퓨터 판독가능한 기록매체는 컴퓨터 프로그램을 포함하며, 상기 컴퓨터 프로그램은 전술한 방법에 포함된 각 단계를 포함해서 수행하도록 프로그램된 것일 수 있다.
일 구현예에 따른 컴퓨터 프로그램은 컴퓨터 판독가능한 기록매체에 저장되며, 상기 컴퓨터 프로그램은 전술한 방법에 포함된 각 단계를 포함해서 수행하도록 프로그램된 것일 수 있다.
일 구현예에 따른 컴퓨터 장치는 적어도 하나의 명령어를 저장하는 메모리; 및 프로세서를 포함하며, 상기 프로세서에 의해 상기 적어도 하나의 명령어가 실행됨으로써, 상기 컴퓨터 장치에서 실행 가능한 분자 진단용 어플리케이션의 명칭이 디스플레이되고, 상기 분자 진단용 어플리케이션의 동작 중에 타겟 핵산 증폭 데이터의 가공 및/또는 분석에 이용되는 파라미터 정보가 디스플레이되며, 상기 디스플레이된 어플리케이션이 실행되도록 선택받으며, 상기 디스플레이된 파라미터 정보를 선택받고, 상기 선택된 분자 진단용 어플리케이션의 동작 과정에서, 상기 선택된 파라미터 정보가 이용되도록 제어할 수 있다.
일 구현예에 따른 컴퓨터 장치에 의하면, 이하에서 설명될 다양한 효과가 발휘될 수 있다.
첫째, 컴퓨터 장치의 사용자는 이에 포함된 관리 모듈을 통해 컴퓨터 장치에 어떤 종류의 분자 진단용 어플리케이션이 설치되어 있는지 확인할 수 있다.
둘째, 컴퓨터 장치의 사용자는 이에 포함된 관리 모듈을 통해 각각의 분자 진단용 어플리케이션을 실행시킬 수 있다. 실시예에 따라, 이러한 관리 모듈을 통하지 않고서는 전술한 분자 진단용 어플리케이션을 실행되지 않을 수도 있다.
셋째, 컴퓨터 장치의 사용자는 이러한 관리 모듈 상에서, 분자 진단용 어플리케이션을 관리할 수 있다. 예컨대, 분자 진단용 어플리케이션의 신규 설치, 업데이트 또는 삭제 등이 이러한 관리 모듈 상에서 수행될 수 있다. 뿐만 아니라, 관리 history, 즉 언제 신규 어플리케이션이 설치되었는지, 언제 어떤 사항이 업데이트 되었는지 또는 언제 어떤 어플리케이션이 삭제되었는지가, 이러한 관리 모듈을 통해 확인 가능하다.
넷째, 분자 진단용 어플리케이션에 대한 사용 권한이 없는 자에 대한 사용 배제는, 이러한 관리 모듈에 의해서 수행된다. 예컨대, 컴퓨터 장치에 설치된 모든 종류의 분자 진단용 어플리케이션에 대한 사용 배제 또는 일부 분자 진단용 어플리케이션에 대한 사용 배제가, 각각의 사용자에 맞게 관리 내지 제어될 수 있다.
도 1에는 일 구현예에 따른 컴퓨터 장치가 준비 장치 및/또는 분석 장치와 연결되어서 동작되는 개념이 예시적으로 도시되어 있다.
도 2는 일 구현예에 따른 컴퓨터 장치에 대한 개념적으로 나타낸 구성도이다.
도 3은 일 구현예에 따른 메모리에 대한 개념적으로 나타낸 구성도이다.
도 4는 일 구현예에 따라, 컴퓨터 장치에서 디스플레이되는 분자 진단용 어플리케이션을 관리하는 사용자 인터페이스(USER INTERFACE)에 대한 예시적인 구성도이다.
도 5에는 일 구현예에 따른 관리 모듈에 포함된 두 개의 데이터 베이스가 저장부와 연결되어서 동작되는 구성이 개념적으로 도시되어 있다.
도 6에는 일 구현예에 따라 관리 모듈을 통한 어플리케이션 실행이 개념적으로 도시되어 있다.
도 7은 일 구현예에 따른 분자 진단용 어플리케이션 관리 방법의 순서도이다.
본 발명의 이점 및 특징, 그리고 그것들을 달성하는 방법은 첨부되는 도면과 함께 상세하게 후술되어 있는 실시예들을 참조하면 명확해질 것이다. 그러나 본 발명은 이하에서 개시되는 실시예들에 한정되는 것이 아니라 서로 다른 다양한 형태로 구현될 수 있으며, 단지 본 실시예들은 본 발명의 개시가 완전하도록 하고, 본 발명이 속하는 기술분야에서 통상의 지식을 가진 자에게 발명의 범주를 완전하게 알려주기 위해 제공되는 것이며, 본 발명은 청구항의 범주에 의해 정의될 뿐이다.
본 발명의 실시예들을 설명함에 있어서 공지 기능 또는 구성에 대한 구체적인 설명이 본 발명의 요지를 불필요하게 흐릴 수 있다고 판단되는 경우에는 그 상세한 설명을 생략할 것이다. 그리고 후술되는 용어들은 본 발명의 실시예에서의 기능을 고려하여 정의된 용어들로서 이는 사용자, 운용자의 의도 또는 관례 등에 따라 달라질 수 있다. 그러므로 그 정의는 본 명세서 전반에 걸친 내용을 토대로 내려져야 할 것이다.
도 1을 설명하기에 앞서, 본원에서 사용된 용어에 대해 살펴보기로 한다
용어 “샘플”(sample)은 분석물(analyte)(분석물에 대해서는 후술하기로 한다)을 포함하거나 포함할 것으로 추정되는 물질을 의미한다.
이러한 샘플은 생물학적 샘플(예컨대, 생물학적 공급원으로부터의 세포, 조직 및 체액) 또는 비생물학적 샘플(예컨데, 음식, 물 및 토양)을 포함할 수 있다.
생물학적 샘플의 예로서는, 바이러스, 세균, 조직, 세포, 혈액(전혈, 혈장 및 혈청 포함), 림프, 골수액, 객담(sputum), 도말(swab), 흡인물(aspiration), 기관지 세척액, 기관지 페포 세척액, 비강 세척액, 우유, 소변, 대변, 안구액, 타액, 정액, 뇌 추출물, 척수액(SCF), 관절액, 충수, 비장 및 편도 조직 추출물, 양수 또는 복수가 포함될 수 있다. 또한, 생물학적 공급원으로부터 단리된 자연발생 핵산 분자 또는 합성 핵산 분자 역시 이러한 생물학적 샘플의 예에 포함될 수 있다. 다만, 생물학적 샘플이 전술한 예로서 한정되는 것은 아니다.
전술한 샘플에는 해당 샘플의 보존, 처리, 검출 등에 사용되는 물질이 첨가될 수 있다. 예컨대, 샘플에는 증폭용 시약, 검출용 시약, 보존제, 물, 탈 이온수, 식염수, pH 완충액, 산성용액, 염기성 용액과 같은 추가 물질이 첨가될 수 있다. 여기서 용어 “샘플”은 전술한 추가 물질이 첨가되지 않은 샘플 뿐 아니라 전술한 추가 물질이 첨가된 상태의 샘플을 지칭할 수도 있다.
한편, 전술한 샘플은 분자 진단의 단계에 따라 다양하게 지칭될 수 있다. 예컨대, 용어 “원시 샘플” (raw sample)은 후술할 제1 장치에서 처리되기 전의 샘플을 지칭할 수 있다. 또한, 용어 “분석 샘플”(analysis sample)은 분석을 위하여 샘플을 처리하는 여러 단계의 과정에서 제조되는 분석물을 포함하는 중간물들을 지칭할 수 있다.
한편, 전술한 용어 “샘플”은 용어 “검체(specimen)”와 혼용될 수 있다. 여 기서, 용어 “검체” 그 자체는 분석하고자 하는 대상을 가리킨다. 보다 구체적으로, 용어 “검체”는 타액(sputum), 혈액(blood), 소변(urine), 대변(stool) 등을 포함할 수 있다.
이하 도면을 참조하여, 본 발명의 다양한 구현예에 대해 살펴보기로 한다.
도 1에는 일 구현예에 따른 컴퓨터 장치(1000)가 준비 장치(2000) 및/또는 분석 장치(3000)와 연결되어서 동작되는 개념이 예시적으로 도시되어 있다. 다만, 도 1은 예시적인 것에 불과하다.
먼저, 도 1에 도시된 준비 장치(2000)에서는 분석물(analyte)을 포함하거나 포함할 것으로 추정되는 분석 샘플(analysis sample)의 준비 과정이 수행된다.
이러한 분석 샘플의 준비 과정에는 핵산 추출 과정, 증폭용 반응액(예를 들어, PCR(polymerase chain reaction)용 반응액) 제작 과정 또는 이들이 결합된 핵산 추출 및 증폭용 반응액 제작 과정이 포함될 수 있다.
다음으로 분석 장치(analysis device, 3000)에서는 분석물(analyte)의 정성적 또는 정량적 분석 과정이 수행된다. 여기서의 샘플 분석은 분석물의 존재를 검출하는 것, 함량을 측정하는 것을 포함한다.
이러한 분석 장치(3000)에서는 특정 뉴클레오타이드 서열을 갖는 핵산을 증폭하고, 증폭된 핵산을 검출할 수 있다. 실시예에 따라, 분석 장치(3000)는 온도 제어를 통하여 핵산 증폭 반응을 수행하는 핵산 증폭기(nucleic acid amplifier)를 포함할 수 있다. 핵산 증폭기에는 대표적으로 써멀 사이클러(thermal cycler)가 포함된다.
아울러, 이러한 분석 장치(3000)에서 핵산은 다양한 방법으로 증폭될 수 있다. 리가아제 연쇄 반응(ligase chain reaction; LCR, 참조 Wiedmann M, 등, "Ligase chain reaction(LCR)- overview and applications." PCR Methods and Applications 1994 Feb;3(4):S51-64), 갭 필링 LCR(gap filling LCR; GLCR, 참조 WO 90/01069, 유럽 특허 제439182호 및 WO 93/00447), Q-베타 리플리카제 증폭(Qbeta replicase amplification; Q-beta, 참조 Cahill P, 등, Clin Chem., 37(9): 1482-5(1991), 미국 특허 제5556751호), 가닥 치환 증폭(strand displacement amplification; SDA, 참조 G T Walker 등, Nucleic Acids Res. 20(7):16911696(1992), 유럽 특허 제497272호), 핵산 서열-기반 증폭(nucleic acid sequence-based amplification; NASBA, 참조 Compton, J. Nature 350(6313):912(1991)), 전사 매개 증폭(Transcription-Mediated Amplification; TMA, 참조 Hofmann WP 등, J Clin Virol. 32(4):289-93(2005); 미국 특허 제5888779호) 또는 롤링 서클 증폭(Rolling Circle Amplification; RCA, 참조 Hutchison C.A. 등, Proc. Natl Acad. Sci. USA. 102:1733217336(2005))에 의해 실시된다.
컴퓨터 장치(1000)는 전술한 준비 장치(2000) 및/또는 분석 장치(3000)와 연결된다. 다만, 컴퓨터 장치(1000)에 연결되어 동작 가능한 분자 진단용 장치를 준비 장치(2000) 및 검출 장치(3000)로 한정하는 것은 아니다. 예컨대, 도 1에 도시되지 않은 타 구성이 추가되어 분자 진단용 장치로서 동작할 수 있고, 준비 장치(2000) 및 분석 장치(3000) 중 적어도 하나가 컴퓨터 장치(1000)에 연결되지 않을 수도 있다. 다만, 이하에서는 컴퓨터 장치(1000)가 준비 장치(2000) 및 검출 장치(3000)와 연결되어 동작하는 것을 전제로 설명하기로 한다.
아울러, 컴퓨터 장치(1000)에는, 전술한 장치(2000, 3000) 각각을 제어하는데 이용되거나 또는 각각의 장치(2000, 3000)에서 발생하는 신호의 분석에 이용되는 분자 진단용 어플리케이션이 설치될 수 있다. 예컨대, 컴퓨터 장치(1000)에는 분자 진단의 준비(preparation) 과정에서 이용되는 어플리케이션, 증폭 데이터의 가공 및/또는 분석에 이용되는 어플리케이션, 분자 진단 시약의 개발에 이용되는 어플리케이션 등이 설치될 수 있다.
또한, 컴퓨터 장치(1000)에는 이렇게 설치된 다양한 종류의 분자 진단용 어플리케이션에 대한 접근 및 추가 정보를 관리할 수 있는 분자 진단용 어플리케이션 관리 모듈이 설치될 수 있다. 이러한 관리 모듈은 다음과 같이 활용 가능하다.
첫째, 컴퓨터 장치(1000)의 사용자는 이러한 관리 모듈을 통해, 컴퓨터 장치(1000)에 어떤 종류의 분자 진단용 어플리케이션이 설치되어 있는지 확인할 수 있다.
둘째, 컴퓨터 장치(1000)의 사용자는 이러한 관리 모듈 상에서, 각각의 분자 진단용 어플리케이션을 실행시킬 수 있다. 실시예에 따라, 이러한 관리 모듈을 통하지 않고서는 전술한 분자 진단용 어플리케이션을 실행되지 않을 수도 있다.
셋째, 컴퓨터 장치(1000)의 사용자는 이러한 관리 모듈 상에서, 분자 진단용 어플리케이션을 관리할 수 있다. 예컨대, 분자 진단용 어플리케이션의 신규 설치, 업데이트 또는 삭제 등이 이러한 관리 모듈 상에서 수행될 수 있다. 뿐만 아니라, 관리 history, 즉 언제 신규 어플리케이션이 설치되었는지, 언제 어떤 사항이 업데이트 되었는지 또는 언제 어떤 어플리케이션이 삭제되었는지가, 이러한 관리 모듈을 통해 확인 가능하다.
넷째, 분자 진단용 어플리케이션에 대한 사용 권한이 없는 자에 대한 사용 배제는, 이러한 관리 모듈에 의해서 수행된다. 예컨대, 컴퓨터 장치(1000)에 설치된 모든 종류의 분자 진단용 어플리케이션에 대한 사용 배제 또는 일부 분자 진단용 어플리케이션에 대한 사용 배제가, 각각의 사용자에 맞게 관리 내지 제어될 수 있다.
즉, 일 실시예에 따르면, 컴퓨터 장치(1000)에 설치된 다양한 종류의 분자 진단용 어플리케이션이 용이하게 관리될 수 있다.
이하, 이러한 컴퓨터 장치(1000)에 대해 구체적으로 살펴보도록 한다.
도 2는 일 구현예에 따른 컴퓨터 장치(1000)에 대한 예시적인 구성도이다. 다만, 도 2는 예시적인 것에 불과하다.
도 2에 대해 설명하기에 앞서, 일 실시예에 따른 컴퓨터 장치(1000)는 임의의 형태의 사용자 단말 및/또는 임의의 형태의 서버에서 구현 가능하다.
이 때, 사용자 단말은 서버 또는 다른 컴퓨팅 장치와 상호작용 가능한 임의의 형태의 단말을 포함할 수 있다. 구체적으로, 사용자 단말은 예를 들어, 휴대폰, 스마트 폰(smart phone), 노트북 컴퓨터(laptop computer), PDA(personal digital assistants), 슬레이트 PC(slate PC), 태블릿 PC(tablet PC) 및 울트라북(ultrabook)을 포함할 수 있다.
아울러, 서버는 예를 들어, 마이크로프로세서, 메인프레임 컴퓨터, 디지털 프로세서, 휴대용 디바이스 및 디바이스 제어기 등과 같은 임의의 타입의 컴퓨팅 시스템 또는 컴퓨팅 장치를 포함할 수 있다.
이제 도 2를 참조하기로 한다. 컴퓨터 장치(1000)는 통신부(1100), 메모리(1200) 및 프로세서(1300)를 포함한다. 다만, 도 2에 도시된 개념도는 예시적인 것에 불과하다. 예컨대, 컴퓨터 장치(1000)는 도 2에 도시되지 않은 구성을 더 포함할 수 있으며, 또는 도 2에 도시된 구성 중 적어도 하나를 포함하지 않을 수도 있다.
먼저, 통신부(1100)는 유선 및 무선 등과 같은 그 통신 양태를 가리지 않고 구성될 수 있으며, 단거리 통신망(PAN: Personal Area Network), 근거리 통신망(WAN: Wide Area Network) 등 다양한 통신망으로 구성될 수 있다. 또한, 통신부(1100)는 공지의 월드와이드웹(WWW: World Wide Web) 기반으로 동작할 수 있으며, 적외선(IrDA: Infrared Data Association) 또는 블루투스(Bluetooth)와 같이 단거리 통신에 이용되는 무선 전송 기술을 이용할 수도 있다.
컴퓨터 장치(1000)는 이러한 통신부(1100)를 통해 전술한 준비 장치나 분석 장치와 데이터를 주고받거나 이들 장치를 제어 내지 관리할 수 있다.
메모리(1200)는 프로세서(1300)에 의해 실행될 수 있는 적어도 하나의 명령어를 저장할 수 있다. 일 실시예에서, 메모리(1200)는 프로세서(1300)가 생성하거나 결정한 임의의 형태의 정보 및 컴퓨터 장치(1000)가 수신한 임의의 형태의 정보를 저장할 수 있다.
일 실시예에서, 메모리(1200)는 프로세서(1300)가 본 개시의 실시예들에 따른 동작을 수행하도록 하는 컴퓨터 소프트웨어를 저장하는 저장매체 또는 컴퓨터 판독가능한 기록매체 일 수 있다. 이 경우, 메모리(1200)는 본 개시내용의 실시예들을 수행하는 데 필요한 소프트웨어 코드, 코드의 실행 대상이 되는 데이터, 코드의 실행 결과를 저장하기 위한 컴퓨터 판독 매체들을 의미할 수 있다.
여기서, 메모리(1200)에 저장 가능한 이러한 소프트웨어는 분자 진단용 어플리케이션 또는 전술한 분자 진단용 어플리케이션의 관리 모듈일 수 있다. 분자 진단용 어플리케이션의 관리 모듈에 대해서는 뒤에 보다 자세하게 살펴보기로 한다.
일 실시예에서, 메모리(1200)는 임의의 타입의 저장 매체를 의미할 수 있다. 예를 들어, 메모리(1200)는 플래시 메모리 타입(flash memory type), 하드디스크 타입(hard disk type), 멀티미디어 카드 마이크로 타입(multimedia card micro type), 카드 타입의 메모리(예를 들어 SD 또는 XD 메모리 등), 램(Random Access Memory, RAM), SRAM(Static Random Access Memory), 롬(Read-Only Memory, ROM), EEPROM(Electrically Erasable Programmable Read-Only Memory), PROM(Programmable Read-Only Memory), 자기 메모리, 자기 디스크, 광디스크 중 적어도 하나의 타입의 저장매체를 포함할 수 있다.
프로세서(1300)는 메모리(1200)에 저장된 적어도 하나의 명령어를 실행시킴으로써, 후술될 본 개시내용의 실시예들에 따른 기술적 특징들을 수행할 수 있다. 일 실시예에서, 프로세서(1300)는 적어도 하나의 코어로 구성될 수 있으며, 컴퓨터 장치(1000)의 중앙 처리 장치(CPU: central processing unit), 범용 그래픽 처리 장치 (GPGPU: general purpose graphics processing unit), 텐서 처리 장치(TPU: tensor processing unit) 등의 데이터 분석 및/또는 처리를 위한 프로세서를 포함할 수 있다.
이하, 일 실시예에 따른 분자 진단용 어플리케이션을 관리 방법을 수행하도록 구성된 메모리(1200)의 구조에 대해 살펴보자.
도 3은 일 구현예에 따른 메모리(1200)에 대한 예시적인 구성도이다. 다만, 도 3은 예시적인 것에 불과하다.
도 3을 참조하면 메모리(1200)는 관리 모듈(1210), 분자 진단용 어플리케이션 저장부(1220), 파라미터 정보 저장부(1230)를 포함할 수 있다.
먼저 관리 모듈(1210)은 분자 진단용 어플리케이션 저장부(1220) 및 파라미터 정보 저장부(1230)에 저장되는 분자 진단용 어플리케이션 및 이에 이용되는 추가 정보를 관리하도록 생성된 어플리케이션일 수 있다. 일 구현예에 따른 관리 모듈(1210)이 도 2에 도시된 프로세서(1300)에 의해 실행되면 어플리케이션 저장부(1220) 및 파라미터 정보 저장부(1230) 각각과 연결된 데이터 베이스를 이용하여 어플리케이션 저장부(1220) 및 파라미터 정보 저장부(1230)를 관리할 수 있으며, 이와 관련하여 도 4 및 5를 참조하여 후술한다.
다음으로, 분자 진단용 어플리케이션 저장부(1200)에는, 분자 진단의 준비(preparation) 과정에서 이용되는 어플리케이션, 증폭 데이터의 가공 및/또는 분석에 이용되는 어플리케이션 및 분자 진단 시약의 개발에 이용되는 어플리케이션 중 적어도 하나의 어플리케이션이 포함될 수 있다.
여기서, 상기 분자 진단의 준비란, 분석물(analyte)를 포함하거나 포함할 것으로 추정되는 분석 샘플(analysis sample)을 준비하는 과정으로서, 검체로부터 핵산 추출, 증폭용 반응액(예를 들어, PCR(polymerase chain reaction)용 반응액) 제작 및 이들이 결합된 핵산 추출 및 증폭용 반응액 제작 과정을 포함한다.
또한 증폭 데이터란, 분석물의 존재를 검출하거나, 함량을 측정하기 위해 수행하는 과정 중에서 생성된 데이터일 수 있다. 예를 들어, 분석물이 핵산일 경우 특정 뉴클레오타이드 서열을 갖는 핵산을 증폭하는 과정에서 생성된 데이터를 증폭 데이터라 할 수 있다.
다음으로, 파라미터 정보 저장부(1400)에는 분자 진단 시약 별 분자 진단 장비의 제어용 파라미터 정보 및 증폭 데이터의 가공 및/또는 분석에 이용되는 파라미터 정보 중 적어도 하나의 파라미터 정보가 저장될 수 있다.
여기서, 상기 분자 진단 장비의 제어용 파라미터 정보란 전술한 준비 장치(2000) 및 분석 장치(3000)를 포함한 분자 진단 장비의 제어를 위해 입력되거나 미리 설정될 수 있는 입력값 또는 설정값일 수 있으며, 예컨대 분자 진단 장비에서 분석되는 분석물의 종류, 상기 분석물과 함께 사용되는 시약의 종류 및 상기 장비들에서 수행하는 프로세스와 관련된 입력값, 설정값, 알고리즘의 종류일 수 있다.
또한 파라미터 정보 저장부(1230)에는 샘플 내 표적 분석물질의 존부 판독 프로세스에서 존부 판독용 기준(criterion)으로서 동작하는 값이 전술한 파라미터 정보로서 저장될 수 있다
이하, 이러한 메모리(1200)에 저장된 적어도 하나의 명령어가 실행됨으로써, 프로세서(1300)에 의해 컴퓨터 장치(1000)에서 수행 가능한 동작에 대해 살펴보자.
도 4는 일 구현예에 따라, 컴퓨터 장치(1000)의 디스플레이부(미도시)에서 디스플레이되는 분자 진단용 어플리케이션을 관리하는 사용자 인터페이스(1410)에 대한 예시적인 구성도이다. 다만, 도 4는 예시적인 것에 불과하다.
일 구현예에 따른 사용자 인터페이스(1410)는 메모리(1200)에 저장된 관리 모듈(1210)이 프로세서(1300)에 의해 실행됨으로써 구동될 수 있고, 컴퓨터 장치(1000)에 마련되어 있는 디스플레이부(미도시)에 디스플레이될 수 있으며, 다만 이에 한정되는 것은 아니다.
사용자 인터페이스(1410)는 분자 진단용 어플리케이션 선택부(1411), 파라미터 정보 선택부(1412) 및 선택 항목 표시부(1413)를 포함할 수 있다. 다만, 상기 사용자 인터페이스(1410)에 포함되는 구성이 분자 진단용 어플리케이션 선택부(1411), 파라미터 정보 선택부(1412) 및 선택 항목 표시부(1413)로 한정되는 것은 아니다. 예컨대, 도 4에 도시되지 않은 타 구성이 추가되어, 분자 진단용 어플리케이션 관리를 위해 동작할 수 있다. 다만, 이하에서는 분자 진단용 어플리케이션 관리 U/I(6000)가 분자 진단용 어플리케이션 선택부(1411), 파라미터 정보 선택부(1412) 및 선택 항목 표시부(1413)를 포함하는 것을 전제로 설명하기로 한다.
도 4를 참조하면, 사용자 인터페이스(1410)에는 컴퓨터 장치(1000)에서 적어도 하나의 실행 가능한 분자 진단용 어플리케이션의 명칭이 기재되어 있는 실행 가능 어플리케이션 리스트를 제공하는 분자 진단용 어플리케이션 선택부(1411)가 포함될 수 있다. 여기서 실행 가능한 분자 진단용 어플리케이션이란, 컴퓨터 장치(1000)에 분자 진단용 어플리케이션이 실행 가능하도록 설치된 상태를 의미하며, 어플리케이션 파일의 저장 장소는 제한되지 않는다. 사용자 인터페이스(1410)를 통해 상기 실행 가능 어플리케이션 리스트 내에 기재된 분자 진단용 어플리케이션 중 어느 하나는 선택받을 수 있다. 실행 가능 어플리케이션의 리스트 업에 대한 설명은 이하의 도면에서 후술한다.
또한, 사용자 인터페이스(1410)에는 파라미터 정보 리스트를 제공하는 파라미터 정보 선택부(1412)가 포함될 수 있다. 파라미터 정보 선택부(1412)는 분자 진단용 어플리케이션의 동작 중에 증폭 데이터의 가공 및/또는 분석에 이용되는 정보가 포함된 적어도 하나의 파라미터 정보를 담은 리스트가 제공될 수 있다. 또한 파라미터 정보 선택부(1412)는 상기 파라미터 정보를 분자 진단 시약 별로 제공할 수 있다. 또한 사용자 인터페이스(1410)를 통해 파라미터 정보 선택부(1412)는 적어도 하나의 파라미터 정보를 선택받을 수 있다.
또한, 사용자 인터페이스(1410)에는, 분자 진단용 어플리케이션 선택부(1411) 또는 파라미터 정보 선택부(1412)에서 선택한 항목을 표시할 수 있는 선택 항목 표시부(1413)가 포함될 수 있다. 선택 항목 표시부(1413)에서는 사용자가 선택한 어플리케이션과 연동되는 장치의 작동 상황, 장치에서 산출한 데이터 분석 내용 등 어플리케이션과 관련된 내용이 표시될 수 있다. 또한 선택 항목 표시부(1413)에서는 사용자가 선택한 파라미터 정보와 관련된 추가 정보를 표시할 수 있다.
이 때 표시되는 파라미터 정보는 사용자가 선택한 어플리케이션에 사용될 수 있는 파라미터만 선별되어 디스플레이될 수 있다.
이와 같이 사용자 인터페이스(1410)를 통해 사용자는 컴퓨터 장치(1000)에 어떤 종류의 분자 진단용 어플리케이션이 설치되어 있는지 확인할 수 있으며, 각각의 분자 진단용 어플리케이션을 실행시키고, 이에 적용될 수 있는 파라미터 정보 또한 선택할 수 있다.
한편, 일 구현예에 따른 사용자 인터페이스(1410)는 전술한 바와 같은, 분자 진단용 어플리케이션의 설치 확인 및 실행과 관련된 기능 외에 사용자 접근과 관련된 기능 또한 수행할 수 있다. 예를 들어, 사용자가 컴퓨터 장치(1000)에서 사용자 인터페이스(1410)를 통하지 않고서는 전술한 분자 진단용 어플리케이션을 실행하지 못할 수도 있다. 또한 분자 진단용 어플리케이션에 대한 사용 권한이 없는 자에 대한 사용 배제도 사용자 인터페이스(1410)의 기능 중 하나일 수 있다.
이하에서 사용자 인터페이스의 이러한 기능을 위한, 사용자 인터페이스의 동작과 관련된 관리 모듈(1210)의 구성 및 동작 예시에 대해 살펴보자.
도 5에는 일 구현예에 따른 관리 모듈(1210)에 포함된 두 개의 데이터 베이스(1211, 1212)가 저장부(1220, 1230)와 연결되어서 동작되는 구성이 개념적으로 도시되어 있다. 다만, 도 5는 예시적인 것에 불과하다.
도 5를 참조하면, 일 구현예에 따른 관리 모듈(1210)은 실행 파일 위치 데이터 베이스(1211) 및 파라미터 정보 데이터 베이스(1212)를 포함한다.
먼저 실행 파일 위치 데이터 베이스(1211)에 대해 설명한다. 관리 모듈(1210)은 적어도 하나의 분자 진단용 어플리케이션을 저장하고 있는 분자 진단용 어플리케이션 저장부(1220)로부터 정보를 전달받을 수 있다. 관리 모듈(1210)이 분자 진단용 어플리케이션 저장부(1220)로부터 전달받는 정보 중에는 분자 진단용 어플리케이션 저장부(1220)에 저장된 분자 진단용 어플리케이션 각각(1221, 1222)에 대한 실행 파일의 위치가 포함될 수 있다. 여기서 실행 파일의 위치란, 사용자 컴퓨터 장치에서 분자 진단용 어플리케이션을 실행시킬 수 있는 파일의, 사용자 컴퓨터 장치에서의 고유한 위치이다. 이는 통상, 실행 파일 경로라고도 한다.
한편, 관리 모듈(1210)로 전달된 실행 파일의 위치는 관리 모듈에 포함된 실행 파일 위치 데이터 베이스(1211)에 저장될 수 있다. 또한 실행 파일 위치 데이터 베이스(1211)는 새로 저장된 정보 및 기 저장된 정보 간의 비교에 기초하여 업데이트를 진행할 수 있다.
다음으로 파라미터 정보 데이터 베이스(1212)에 대해 설명한다. 관리 모듈(1210)은 적어도 하나의 파라미터 정보를 저장하고 있는 파라미터 정보 저장부(1230)로부터 정보를 전달받을 수 있다. 관리 모듈(1210)이 파라미터 정보 저장부(1230)로부터 전달받는 정보 중에는 파라미터 정보 저장부(1230)에 분자 진단 시약 별로 저장되어, 분자 진단용 어플리케이션의 동작 중에 증폭 데이터의 가공 및/또는 분석에 이용되는 파라미터 정보 중 적어도 일부가 포함될 수 있다.
한편, 관리 모듈(1210)로 전달된 파라미터 정보는 관리 모듈에 포함된 파라미터 정보 데이터 베이스(1212)에 저장될 수 있다. 또한 파라미터 정보 데이터 베이스(1230)는 새로 저장된 정보 및 기저장된 정보 간의 비교에 기초하여 업데이트를 진행할 수 있다.
이하에서 이러한 관리 모듈(1210)의 데이터 베이스 구조를 이용하여 실시하는 동작 예시에 대해 살펴보자.
도 6에는 일 구현예에 따라 관리 모듈(1210)을 통한 어플리케이션 실행이 개념적으로 도시되어 있다. 다만, 도 6은 예시적인 것에 불과하다.
도 6을 참조하여 전술한 관리 모듈(1210)의 데이터 베이스(1211, 1212)에 저장된 정보를 이용하여, 분자 진단용 어플리케이션이 실행되는 실시예를 살펴보고자 한다.
일 구현예에 따른 관리 모듈(1210)은 실행 파일 위치 데이터 베이스(1211)을 포함함으로써, 적어도 하나의 실행 파일 위치를 저장하도록 구현된다. 이 때 실행 파일 자체가 아닌 실행 파일의 위치만 저장함으로써, 관리 모듈(1210)에 연결된 분자 진단용 어플리케이션의 실행을 제어하도록 구현된다. 실행 파일을 저장하거나 공유하는 방법은 도 6에 도시되지 않은 타 구성에 의해 수행될 수도 있다. 다만 이하에서는 관리모듈(1210)이 실행 파일 위치를 저장하고, 제어함으로써 분자 진단용 어플리케이션의 실행을 제어하는 것을 전제로 설명하기로 한다.
일 구현예에 따른 관리 모듈(1210)은 실행 파일 위치 데이터 베이스(1211)을 포함함으로써, 컴퓨터 장치(1000)에서 실행 가능한 분자 진단용 어플리케이션의 실행 파일 위치를 저장하도록 구현된다. 이 때 실행 가능한 적어도 하나의 분자 진단용 어플리케이션(1221, 1222)은 컴퓨터 장치 또는 그와 연결된 장치에 마련된 분자 진단용 어플리케이션 저장부(1220)에 저장될 수 있다. 저장된 분자 진단용 어플리케이션 각각의 실행 파일에 대해, 컴퓨터 장치에서의 그 고유한 위치인 실행 파일의 위치가 실행 파일 위치 데이터 베이스(1211)에 저장될 수 있다. 관리 모듈(1210) 또는 이에 의해 실행되는 사용자 인터페이스는 저장된 실행 파일 위치를 제공함으로써, 사용자에게 실행 가능한 분자 진단용 어플리케이션을 제공할 수 있다. 이 때, '실행 가능'이란, 컴퓨터 장치에 분자 진단용 어플리케이션이 실행 가능하도록 설치된 상태를 의미한다. 이 때, 관리 모듈(1210)은 실행 파일의 위치를 알고 있는 분자 진단용 어플리케이션의 명칭을 전달함으로써, 사용자에게 실행 가능한 분자 진단용 어플리케이션을 전달할 수 있다.
도 6을 참조하면, 관리 모듈(1210)은 사용자의 계정 확인 절차를 통해, 사용자의 계정을 확보할 수 있다. 이 때 관리 모듈(1210)에 접속할 수 있는 사용자는 사용자 계정 정보 그룹(1240)에 각각의 계정 정보(1241, 1242)가 포함된 복수의 사용자 중 한 명일 수 있다. 적어도 한명 이상의 사용자 각각에 대한 사용자 계정은 관리 모듈(1210)에 대한 접속 시, 사용자 계정 확인 절차를 통해 수집될 수 있고, 수집된 사용자 계정은 분자 진단용 어플리케이션의 실행에 이용될 수 있다.
관리 모듈(1210)은 적어도 한명 이상의 사용자 각각에 대해 분자 진단용 어플리케이션별 접근 권한을 설정할 수 있다. 또한 관리 모듈(1210)은 각각의 사용자가 관리 모듈(1210)에 대한 접속 시, 사용자 계정을 수집할 수 있다. 관리 모듈(1210)은 관리 모듈(1210)에 접속한 사용자 계정을 어플리케이션별 접근 권한과 비교하여, 분자 진단용 어플리케이션 실행 여부를 결정할 수 있다. 관리 모듈(1210)은 사용자가 실행하고자 하는 분자 진단용 어플리케이션에 대한 사용자별 접근 권한을 확인한 후, 해당 사용자 계정의 해당 어플리케이션에 대한 접근 권한이 있을 경우에만 실행을 시킬 수 있다.
사용자별 접근 권한에 따른 어플리케이션 실행에 관한 다른 구현예를 살펴보면, 관리 모듈(1210)은 사용자별 접근 권한 및 사용자 계정 정보 중 적어도 하나의 항목을 포함한 변수를 생성할 수 있다. 사용자별 접근 권한 및/또는 사용자 계정 정보를 포함한 변수는 사용자가 선택한 분자 진단용 어플리케이션의 실행 파일 위치와 함께 컴퓨터 장치에 입력될 수 있다. 예를 들어, 상기 변수 및 실행 파일 위치는 컴퓨터 장치의 오퍼레이션 시스템(operational system)에 입력될 수 있다. 상기 변수 및 실행 파일 위치를 입력 받은 컴퓨터 장치는, 입력 받은 상기 변수가 관리 모듈(1210)에 기저장된 사용자별 어플리케이션별 접근 권한에 부합할 경우에만 어플리케이션을 실행할 수 있다.
관리 모듈(1210)은 플랫폼 접속 과정에서 획득한 사용자 계정 정보와, 플랫폼에 포함된 실행 파일 위치 데이터 베이스(1211)의 실행 파일 위치를 함께 이용하여 분자 진단용 어플리케이션을 실행시킬 수 있다. 관리 모듈(1210)은 사이버 보안을 위해 분자 진단용 어플리케이션 실행 조건을 강화할 수 있다. 예를 들어, 사용자가 실행 파일 위치 데이터 베이스(1212)의 실행 파일 위치가 아닌 다른 경로, 즉 관리 모듈(1210)을 통하지 않고 다른 경로로 실행 파일에 접근할 경우, 해당 어플리케이션은 실행되지 않을 수 있다. 이런 경우는 관리 모듈(1210) 접속 과정에서 생성된 사용자 계정 정보를 포함한 변수가 어플리케이션 실행에 필수적으로 요구되는 방식으로 구현이 가능하다.
상기와 같은 구현예들을 통해 관리 모듈(1210)은 분자 진단용 어플리케이션 각각의 실행을 복수의 사용자 별로 구별지어 제어할 수 있다. 또한 컴퓨터 장치에서 관리 모듈(1210)을 통하지 않은 분자 진단용 어플리케이션에 대한 접근을 통제할 수 있다. 이러한 구성들을 통해 분자 진단용 어플리케이션에 대한 사이버 보안 성능을 강화할 수 있다.
한편, 관리 모듈(1210)에 포함되는 파라미터 정보 데이터베이스(1212)에는 분자 진단용 어플리케이션에서 활용될 수 있는 다양한 형식의 파라미터 정보가 저장되어 있다. 파라미터 정보에는 분자 진단 장비의 제어용 파라미터 정보, 증폭 데이터의 가공 및/또는 분석에 이용되는 파라미터 정보가 포함될 수 있다. 이러한 파라미터 정보는 분자 진단 시약 별로 파라미터 정보 데이터베이스(1212)에 저장되어 있다. 파라미터 정보는 분자 진단용 어플리케이션과 유사하게, 관리 모듈(1210)을 통해 사용자에게 저장 현황이 제공될 수 있다. 또한 파라미터 정보가 분자 진단용 어플리케이션의 동작 과정에서 이용되도록 제어하는 과정에서 사용자의 권한 정보가 이용될 수 있다. 본 명세서에서 어플리케이션의 '실행'은 어플리케이션이 사용자의 선택에 의해 구동을 시작하고 동작하는 어플리케이션의 전반적인 구동 및 동작 과정을 뜻하고, 어플리케이션의 '동작'은 어플리케이션의 구동 시작 이후, 어플리케이션의 고유 기능을 수행하는 과정을 강조하는 용어이다.
도 7은 일 구현예에 따른 분자 진단용 어플리케이션 관리 방법의 순서도이다. 다만, 도 7은 예시적인 것에 불과하다.
도 7을 참조하자, 일 구현예에 따라 컴퓨터 장치(1000)에서 수행되는 분자 진단용 어플리케이션 관리 방법은, 상기 컴퓨터 장치에서 실행 가능한 분자 진단용 어플리케이션의 명칭이 기재되어 있는 실행 가능 어플리케이션 리스트를 디스플레이하는 단계(S100); 상기 분자 진단용 어플리케이션의 동작 중에 증폭 데이터의 가공 및/또는 분석에 이용되는 파라미터 정보를, 분자 진단 시약 별로 디스플레이하는 단계(S200); 상기 실행 가능 어플리케이션 리스트 내에 기재된 분자 진단용 어플리케이션 중 어느 하나를 선택받는 단계(S300); 상기 디스플레이된 분자 진단 시약 별 파라미터 정보 중 어느 하나를 선택받는 단계(S400); 및 상기 선택된 분자 진단용 어플리케이션의 동작 과정에서, 상기 선택된 파라미터 정보가 이용되도록 제어하는 단계(S500)를 포함한다.
구체적으로, 단계 S100에서는 컴퓨터 장치에서 실행 가능한 분자 진단용 어플리케이션의 명칭이 기재되어 있는 실행 가능 어플리케이션 리스트가 디스플레이된다. 여기서 실행 가능한 분자 진단용 어플리케이션이란, 전술한 바와 같이 컴퓨터 장치에 분자 진단용 어플리케이션이 실행 가능하도록 설치된 상태를 의미하며, 어플리케이션 파일의 저장 장소는 제한되지 않는다.
일 구현예에 따른 분자 진단용 어플리케이션 관리 방법에서 상기 실행 가능 어플리케이션 리스트는, 상기 컴퓨터 장치에서 분자 진단용 어플리케이션이 신규 설치되거나 삭제될 때마다 업데이트될 수 있다.
일 구현예에 따른 분자 진단용 어플리케이션 관리 방법에서 상기 실행 가능 어플리케이션 리스트에는, 상기 컴퓨터 장치에 설치되어 있는 분자 진단용 어플리케이션의 버전 정보가 기재되어 있을 수 있다. 이 때, 상기 버전 정보는, 상기 컴퓨터 장치에 설치되어 있는 분자 진단용 어플리케이션이 업데이트될 때마다 갱신될 수 있다.
일 구현예에 따른 분자 진단용 어플리케이션 관리 방법은 상기 실행 가능 어플리케이션 리스트 내의 분자 진단용 어플리케이션 각각에 대한, 상기 컴퓨터 장치의 사용자의 접근 권한 정보를 상기 컴퓨터 장치의 메모리로부터 획득하는 단계; 및 상기 획득된 접근 권한 정보에 의존적으로, 상기 선택된 분자 진단용 어플리케이션의 동작을 허용하거나 차단하는 단계를 더 포함할 수 있다.
일 구현예에 따른 분자 진단용 어플리케이션 관리 방법을 실행하는 컴퓨터 장치의 메모리에는, 상기 실행 가능 앱 리스트 내의 분자 진단용 어플리케이션 각각에 대한 실행 파일의 위치가 저장되어 있으며, 상기 관리 방법은, 상기 메모리로부터 상기 저장 위치를 획득하는 단계를 더 포함하고, 상기 선택된 분자 진단용 어플리케이션의 실행은, 상기 저장 위치에 저장되어 있는 실행 파일에 의해 수행될 수 있다. 이 때, 상기 관리 방법은, 상기 실행 가능 앱 리스트 내의 분자 진단용 어플리케이션 각각에 대한, 상기 컴퓨터 장치의 사용자의 접근 권한 정보를 상기 메모리로부터 획득하는 단계를 더 포함하고, 상기 실행 파일에 의한 상기 선택된 분자 진단용 어플리케이션의 실행 가부는, 상기 획득된 접근 권한 정보에 의존적으로 결정될 수 있다.
일 구현예에 따른 분자 진단용 어플리케이션 관리 방법은 상기 분자 진단용 어플리케이션의 실행 history 또는 상기 파라미터 정보의 이용 history를 상기 메모리에 저장하는 단계를 더 포함할 수 있다. 이 떄, 상기 실행 history 및/또는 상기 이용 history는, 상기 컴퓨터 장치의 사용자 별로 저장될 수 있다.
일 구현예에 따른 분자 진단용 어플리케이션 관리 방법의 상기 분자 진단용 어플리케이션에는, 분자 진단의 준비(preparation) 과정에서 이용되는 어플리케이션, 증폭 데이터의 가공 및/또는 분석에 이용되는 어플리케이션, 분자 진단 시약의 개발에 이용되는 어플리케이션 및 이들의 조합을 포함하는 어플리케이션 그룹에서 선택된 적어도 하나의 앱 그룹이 포함될 수 있다.
다음으로, 단계 S200에서, 상기 분자 진단용 어플리케이션의 동작 중에 증폭 데이터의 가공 및/또는 분석에 이용되는 파라미터 정보가, 분자 진단 시약 별로 디스플레이된다.
일 구현예에 따른 분자 진단용 어플리케이션 관리 방법에서 상기 파라미터 정보는, 분자 진단 시약의 신규 개발 시 또는 기 개발된 분자 진단 시약에 수정 사항이 있을 경우에 업데이트될 수 있다. 이 때, 상기 파라미터 정보에는 버전 정보가 포함되되, 상기 버전 정보는 상기 파라미터 정보의 업데이트 때마다 업데이트될 수 있다.
일 구현예에 따른 분자 진단용 어플리케이션 관리 방법에서 상기 파라미터 정보에는 분자 진단 장비의 제어용 파라미터 정보, 증폭 데이터의 가공 및/또는 분석에 이용되는 파라미터 정보 및 이들의 조합을 포함하는 파라미터 정보 그룹에서 선택된 적어도 하나의 파라미터 정보 그룹이 포함될 수 있다.
단계 S300에서는, 상기 실행 가능 어플리케이션 리스트 내에 기재된 분자 진단용 어플리케이션 중 어느 하나가 선택된다.
단계 S400에서는, 상기 디스플레이된 분자 진단 시약 별 파라미터 정보 중 어느 하나가 선택된다.
단계 S500에서는, 상기 선택된 분자 진단용 어플리케이션의 동작 과정에서, 상기 선택된 파라미터 정보가 이용되도록 제어된다.
한편, 일 실시예에 따르면, 전술한 방법에 포함된 각 단계는, 이러한 각 단계를 포함해서 수행하도록 프로그램된 컴퓨터 판독가능한 기록매체에 저장된 컴퓨터 프로그램의 형태로 구현 가능하다.
또한, 일 실시예에 따르면, 전술한 방법에 포함된 각 단계는, 이러한 각 단계를 포함해서 수행하도록 프로그램된 컴퓨터 프로그램을 저장하는 컴퓨터 판독가능한 기록매체의 형태로 구현 가능하다.
이상의 설명은 본 발명의 기술 사상을 예시적으로 설명한 것에 불과한 것으로서, 본 발명이 속하는 기술 분야에서 통상의 지식을 가진 자라면 본 발명의 본질적인 품질에서 벗어나지 않는 범위에서 다양한 수정 및 변형이 가능할 것이다. 따라서, 본 발명에 개시된 실시예들은 본 발명의 기술 사상을 한정하기 위한 것이 아니라 설명하기 위한 것이고, 이러한 실시예에 의하여 본 발명의 기술 사상의 범위가 한정되는 것은 아니다. 본 발명의 보호 범위는 아래의 청구범위에 의하여 해석되어야 하며, 그와 균등한 범위 내에 있는 모든 기술사상은 본 발명의 권리범위에 포함되는 것으로 해석되어야 할 것이다.

Claims (23)

  1. 분자 진단용 어플리케이션을 관리하는 방법으로서, 상기 방법은 컴퓨터 장치에 의해 수행되고,
    상기 컴퓨터 장치에서 실행 가능한 분자 진단용 어플리케이션의 명칭을 디스플레이하는 단계;
    상기 분자 진단용 어플리케이션의 동작 중에 타겟 핵산 증폭 데이터의 가공 및/또는 분석에 이용되는 파라미터 정보를 디스플레이하는 단계;
    상기 디스플레이된 어플리케이션이 실행되도록 선택받는 단계;
    상기 디스플레이된 파라미터 정보가 선택받는 단계; 및
    상기 선택된 분자 진단용 어플리케이션의 동작 과정에서, 상기 선택된 파라미터 정보가 이용되도록 제어하는 단계
    를 포함하는 분자 진단용 어플리케이션 관리 방법.
  2. 제 1 항에 있어서,
    상기 분자 진단용 어플리케이션에는,
    분자 진단의 준비(preparation) 과정에서 이용되는 어플리케이션, 상기 타겟 핵산 증폭 데이터의 가공 및/또는 분석에 이용되는 어플리케이션, 분자 진단 시약의 개발에 이용되는 어플리케이션 및 이들의 조합으로 구성된 어플리케이션 그룹 중 적어도 하나가 포함되는
    분자 진단용 어플리케이션 관리 방법.
  3. 제 1 항에 있어서,
    상기 컴퓨터 장치의 메모리에는, 상기 실행 가능한 분자 진단용 어플리케이션에 대한 실행 파일의 위치가 저장되어 있으며,
    상기 메모리로부터 상기 저장 위치를 획득하는 단계를 더 포함하고,
    상기 선택된 분자 진단용 어플리케이션의 실행은, 상기 저장 위치에 저장되어 있는 실행 파일에 의해 수행되는
    분자 진단용 어플리케이션 관리 방법.
  4. 제 3 항에 있어서,
    상기 선택된 분자 진단용 어플리케이션에 대한, 상기 컴퓨터 장치의 사용자의 접근 권한 정보를 상기 메모리로부터 획득하는 단계를 더 포함하고,
    상기 선택된 분자 진단용 어플리케이션이 상기 실행 파일에 의해 실행되는 지의 가부는, 상기 획득된 접근 권한 정보에 의존적으로 결정되는
    분자 진단용 어플리케이션 관리 방법.
  5. 제 1 항에 있어서,
    상기 컴퓨터 장치는 복수의 분자 진단용 어플리케이션을 실행 가능하며,
    상기 분자 진단용 어플리케이션의 명칭을 디스플레이하는 단계는,
    상기 복수의 분자 진단용 어플리케이션 중 적어도 일부의 명칭을 포함하는 어플리케이션 리스트를 디스플레이하는
    분자 진단용 어플리케이션 관리 방법.
  6. 제 5 항에 있어서,
    상기 어플리케이션 리스트는, 상기 어플리케이션 리스트에 포함된 복수의 어플리케이션 각각에 대한 상기 컴퓨터 장치의 사용자의 접근 권한 정보에 따라, 상기 어플리케이션 리스트에 포함되는 어플리케이션의 구성이 변하는
    분자 진단용 어플리케이션 관리 방법.
  7. 제 5 항에 있어서,
    상기 어플리케이션 리스트에 디스플레이되는 복수의 어플리케이션 각각에 대한, 상기 컴퓨터 장치의 사용자의 접근 권한 정보를 상기 컴퓨터 장치의 메모리로부터 획득하는 단계; 및
    상기 획득된 접근 권한 정보에 의존적으로, 상기 선택된 분자 진단용 어플리케이션의 동작을 허용하거나 차단하는 단계를 더 포함하는
    분자 진단용 어플리케이션 관리 방법.
  8. 제 5 항에 있어서,
    상기 어플리케이션 리스트는,
    상기 컴퓨터 장치에서 분자 진단용 어플리케이션이 신규 설치되거나 삭제될 때마다 업데이트되는
    분자 진단용 어플리케이션 관리 방법.
  9. 제 8 항에 있어서,
    상기 업데이트는,
    상기 컴퓨터 장치의 메모리에 상기 설치되거나 삭제되는 분자 진단용 어플리케이션의 실행 파일 위치가 저장되거나 삭제됨으로써 업데이트가 수행되는
    분자 진단용 어플리케이션 관리 방법.
  10. 제 5 항에 있어서,
    상기 어플리케이션 리스트에는
    상기 컴퓨터 장치에 설치되어 있는 분자 진단용 어플리케이션의 버전 정보가 기재되어 있는
    분자 진단용 어플리케이션 관리 방법.
  11. 제 10 항에 있어서,
    상기 버전 정보는,
    상기 컴퓨터 장치에 설치되어 있는 분자 진단용 어플리케이션이 업데이트될 때마다 갱신되는
    분자 진단용 어플리케이션 관리 방법.
  12. 제 1 항에 있어서,
    상기 파라미터 정보에는,
    분자 진단 장비의 제어용 파라미터 정보, 증폭 데이터의 가공 및/또는 분석에 이용되는 파라미터 정보 및 이들의 조합으로 구성된 파라미터 정보 그룹 중 적어도 하나가 포함되는
    분자 진단용 어플리케이션 관리 방법.
  13. 제 1 항에 있어서,
    상기 디스플레이되는 파라미터에 대한, 상기 컴퓨터 장치의 사용자의 접근 권한 정보를 상기 컴퓨터 장치의 메모리로부터 획득하는 단계; 및
    상기 획득된 접근 권한 정보에 의존적으로, 상기 선택된 파라미터의 이용을 허용하거나 차단하는 단계를 더 포함하는
    분자 진단용 어플리케이션 관리 방법.
  14. 제 1 항에 있어서,
    상기 컴퓨터 장치의 메모리에는, 복수의 파라미터 정보가 저장되어 있으며,
    상기 복수의 파리미터 정보 중 각각 일부의 정보를 디스플레이하는 파라미터 리스트를 디스플레이하는 단계를 더 포함하는
    분자 진단용 어플리케이션 관리 방법.
  15. 제 14 항에 있어서,
    상기 파라미터 리스트는, 상기 파라미터 리스트에 포함된 각각의 파라미터 정보에 대한 상기 컴퓨터 장치의 사용자의 접근 권한 정보에 따라, 상기 파라미터 리스트에 포함되는 파라미터의 구성이 변하는
    분자 진단용 어플리케이션 관리 방법.
  16. 제 15 항에 있어서,
    상기 파라미터 리스트는,
    상기 컴퓨터 장치에서 파라미터가 신규 설치되거나 삭제될 때마다 업데이트되는
    분자 진단용 어플리케이션 관리 방법.
  17. 제 14 항에 있어서,
    상기 파라미터 리스트에는
    상기 컴퓨터 장치에 설치되어 있는 파라미터의 버전 정보가 기재되어 있는
    분자 진단용 어플리케이션 관리 방법.
  18. 제 17 항에 있어서,
    상기 버전 정보는,
    상기 컴퓨터 장치에 설치되어 있는 파라미터가 업데이트될 때마다 갱신되는
    분자 진단용 어플리케이션 관리 방법.
  19. 제1 항에 있어서,
    상기 분자 진단용 어플리케이션의 실행 history 또는 상기 파라미터 정보의 이용 history를 상기 메모리에 저장하는 단계를 더 포함하는 분자 진단용 어플리케이션 관리 방법.
  20. 제 19 항에 있어서,
    상기 실행 history 및/또는 상기 이용 history는,
    상기 컴퓨터 장치의 사용자 별로 저장되는
    분자 진단용 어플리케이션 관리 방법.
  21. 제1 항 내지 제20 항 중 어느 한 항에 따른 방법에 포함된 각 단계를 포함해서 수행하도록 프로그램된 컴퓨터 판독가능한 기록매체에 저장된 컴퓨터 프로그램.
  22. 제1 항 내지 제21 항 중 어느 한 항에 따른 방법에 포함된 각 단계를 포함해서 수행하도록 프로그램된 컴퓨터 프로그램을 저장하는 컴퓨터 판독가능한 기록매체.
  23. 적어도 하나의 명령어를 저장하는 메모리; 및
    프로세서를 포함하며,
    상기 프로세서에 의해 상기 적어도 하나의 명령어가 실행됨으로써,
    상기 컴퓨터 장치에서 실행 가능한 분자 진단용 어플리케이션의 명칭이 디스플레이되고,
    상기 분자 진단용 어플리케이션의 동작 중에 타겟 핵산 증폭 데이터의 가공 및/또는 분석에 이용되는 파라미터 정보가 디스플레이되며,
    상기 디스플레이된 어플리케이션이 실행되도록 선택받으며,
    상기 디스플레이된 파라미터 정보를 선택받고,
    상기 선택된 분자 진단용 어플리케이션의 동작 과정에서, 상기 선택된 파라미터 정보가 이용되도록 제어하는
    컴퓨터 장치.
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