CN113150136A - 新型冠状病毒n蛋白单克隆抗体的制备 - Google Patents

新型冠状病毒n蛋白单克隆抗体的制备 Download PDF

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Abstract

本发明属于生物技术领域。本发明提供了一种重组蛋白,该重组蛋白氨基酸序列由新型冠状病毒N蛋白两个优势表位重复串联组成。本发明还涉及用该重组蛋白免疫小鼠建立噬菌体库,经淘选筛选得到对应新型冠状病毒N蛋白单链抗体scfv序列,将得到的scfv序列构建成完整鼠IgG1抗体序列表达载体,通过瞬转HEK293F细胞表达单克隆抗体,纯化单克隆抗体,通过胶体金正交实验确定两对最优单克隆抗体配对组合。

Description

新型冠状病毒N蛋白单克隆抗体的制备
技术领域
本发明属于生物技术领域。具体的说,本发明表达了一种新型冠状病毒N重组蛋白,涉及使用上述重组蛋白免疫小鼠建立噬菌体库,筛选得到特异性单链抗体scfv序列,还涉及将得到的scfv序列构建成真核表达载体表达新型冠状病毒N蛋白单克隆抗体,并应用于新型冠状病毒的感染诊断。
背景技术
2019新型冠状病毒,2020年1月12日,世界卫生组织正式将其命名为2019-nCoV。冠状病毒是一个大型病毒家族,在系统分类上属冠状病毒科(Coronaviridae)冠状病毒属(Coronavirus)。冠状病毒属的病毒是具外套膜(envelope)的正链单股RNA病毒,直径约80~120nm,其遗传物质是所有RNA病毒中最大的,只感染人、鼠、猪、猫、犬、禽类脊椎动物。冠状病毒粒子呈不规则形状,其蛋白分为:刺突糖蛋白(S蛋白)、包膜糖蛋白(E蛋白)、膜糖蛋白(M蛋白),和核衣壳蛋白(N蛋白)。N蛋白与病毒基因组RNA相互缠绕形成病毒核衣壳,在病毒RNA的合成过程中发挥着重要作用。同时,N蛋白相对保守,在病毒的结构蛋白中所占比例最大,感染早期机体就能产生抗N蛋白的高水平抗体。
目前,新型冠状病毒检测以核酸分子检测为主,需要从痰液、咽拭子、肺泡灌洗液等样本中提取核酸分子,然后再采用荧光PCR方法进行检测,总共需要3个小时左右。该方法虽然准确度高,但是需要专门的操作场地、专业的操作人员和设备,检测时间太长,要求较为苛刻,无法在基层医疗机构大面积使用。而新型冠状病毒疫情爆发后,疑似患者大量增加,急需一种检测产品能在短时间内快速鉴别筛查,而不仅仅是确诊。
免疫学检测方法因其操作简便,结果易于判定,适用于大量样本现场快速筛查等特点而得到非常广泛的应用。该方法主要是通过制备新型冠状病毒N蛋白的单克隆抗体来实现对新型冠状病毒的特异性检测。常规新型冠状病毒N蛋白单克隆抗体制备是将新型冠状病毒N蛋白单克隆细胞株制备Balb/c小鼠腹水,使用Protein A亲和层析法纯化单克隆抗体。但由于单只小鼠腹水产量不确定性且个体差异大,得到的新型冠状病毒N蛋白单克隆抗体批间差异大,使得检测准确性较差。
发明内容
设计目的:为解决传统制备单克隆抗体的不足之处,通过设计、合成重组新型冠状病毒N蛋白并通过建立噬菌体库和真核细胞表达来制备其单克隆抗体,比传统单克隆抗体制备大大缩短了时间,并且得到的单克隆抗体稳定性高,均一性好,大大减小了批间差异。
设计方案:为了实现上述设计目的。本申请:(1)以新型冠状病毒N蛋白为靶抗原,分析并选择该抗原两个优势抗原表位,序列比较结果显示所选择的两个抗原表位与其它蛋白序列无明显同源性。(2)为增强免疫效果并缩短单克隆抗体制备时间,将所选择的两个优势抗原表位串联,并在序列碳端加His标签,得到重组抗原氨基酸序列,将重组蛋白氨基酸序列转换为对应核苷酸序列。(3)化学合成上一步骤得到的核苷酸序列,并通过酶切连接,将合成得到的核苷酸片段插入表达载体pET-32a(+),构建重组N蛋白表达载体。(4)重组N蛋白表达载体转化大肠杆菌ER2566感受态细胞,筛选得到重组蛋白表达菌株。(5)重组蛋白表达菌株大规模培养后,经超声破菌并低温离心,取溶液上清通过镍琼脂糖亲和层析柱亲和层析,洗脱得到纯化重组N蛋白。(6)重组N蛋白多次免疫Balb/c小鼠后,取其脾脏分离淋巴细胞用来建立单链抗体scfv噬菌体展示库。(7)将步骤(3)合成得到的核苷酸片段插入表达载体pTT5,构建重组N蛋白表达载体。(8)重组N蛋白表达载体转化大肠杆菌DH5α感受态细胞,筛选鉴定得到重组表达质粒。(9)重组表达质粒瞬转CHO细胞,7天后收集细胞上清,上清通过镍琼脂糖亲和层析纯化得到真核表达重组N蛋白。(10)使用真核表达重组N蛋白对单链抗体scfv噬菌体展示库进行多轮淘选筛选最终得到能与真核表达重组N蛋白结合的单链抗体scfv序列。(11)将scfv序列构建成完整鼠IgG1表达载体并使用HEK293F细胞表达单克隆抗体,使用Protein A亲和层析法纯化单克隆抗体,并分别标记胶体金颗粒。(12)利用胶体金免疫层析平台筛选显示3A2单抗包被与4B9胶体金标记单抗配对,2C6单抗包被与6D8胶体金标记单抗配对为检测新型冠状病毒N蛋白的两个优势组合。
具体实施方式
以下实施例虽然对本发明的设计思路作了比较详细的文字描述,但是这些文字描述,只是对本发明设计思路的简单文字描述,而不是对本发明设计思路的限制,任何不超出本发明设计思路的组合、增加或修改,均落入到本发明的保护范围内。
实施例1:新型冠状病毒N蛋白优势抗原表位选择和串联
以新型冠状病毒N蛋白为靶抗原,利用生物软件DNAssist2.0分析其抗原表位序列的亲水性及抗原性,选择A优势抗原表位和B优势抗原表位。序列比较结果显示所选择的A、B两个优势抗原表位序列与其它蛋白序列无明显同源性。将新型冠状病毒N蛋白的A、B两个优势抗原表位序列分别重复后再通过柔性片段(连续四个甘氨酸)连接,并在序列碳端加His标签,得到重组蛋白氨基酸序列。
实施例2:构建重组N蛋白表达载体
将编码重组蛋白的氨基酸序列转化为对应核苷酸序列,并在其上下游分别添加酶切位点BamHI和EcoRI对应的核苷酸序列后,由通用生物系统安徽有限公司合成。合成后的目的基因克隆于pMD25-T载体(宝生物工程大连有限公司)中。将含目的基因的pMD25-T载体和pET-32a(+)载体(德国Novagen公司)通过限制性内切酶BamHI和EcoRI(宝生物工程大连有限公司)分别于37℃双酶切12小时,酶切产物分别进行1%琼脂糖凝胶电泳,并分别切胶回收目的基因和pET-32a(+)载体(本发明所使用的胶回收试剂盒均来自爱思进生物技术杭州有限公司)。使用T4连接酶(宝生物工程大连有限公司)将回收的目的基因和pET-32a(+)载体按一定的比例于4℃连接12小时后,连接产物转化DH5α感受态细胞(杭州贤至生物科技有限公司),并涂布于含氨苄青霉素抗性(50μg/mL)的LB平板,于37℃恒温培养12小时后,于平板上挑取单克隆菌株至含氨苄青霉素抗性(50μg/mL)的LB液体培养基,37℃恒温摇床培养12小时后,采用质粒纯化试剂盒(本发明所使用的质粒纯化试剂盒均来自爱思进生物技术杭州有限公司)提取质粒,经BamHI和EcoRI双酶切鉴定后得到正确的重组表达载体。
实施例3:构建重组N蛋白表达菌株
将构建好的重组表达载体转化E.coli ER2566感受态细胞,并涂布于含氨苄青霉素抗性(50μg/mL)的LB平板,于37℃过夜培养。第二日,挑取平板上单克隆菌株至含氨苄青霉素抗性(50μg/mL)的LB液体培养基,37℃恒温摇床培养8小时后,加诱导剂异丙基硫代-β-D-半乳糖苷(终浓度为1.0mmol/L)诱导表达4个小时后制备蛋白电泳样品。10%聚丙烯酰胺凝胶电泳结果表明重组蛋白成功表达,得到重组N蛋白表达菌株。
实施例4:纯化新型冠状病毒重组N蛋白
接种重组N蛋白表达菌株至LB液体培养基,加氨苄青霉素至终浓度为50μg/mL,37℃恒温摇床培养8小时后,用含50μg/mL氨苄青霉素的LB液体培养基将该菌按1:100比例稀释后,分装至细菌培养瓶中,置37℃恒温摇床培养至OD600=0.8,加诱导剂异丙基硫代-β-D-半乳糖苷至终浓度为1.0mmol/L,继续培养诱导4小时。离心收集菌体后,4度低温超声破菌,低温离心后取上清通过镍琼脂糖亲和层析柱,经洗涤、洗脱最终得到原核表达重组N蛋白。
实施例5:单链抗体scfv噬菌体库构建
取4-6周龄雌性Balb/c小鼠,基础免疫每只小鼠皮下多点注射弗氏完全佐剂乳化的100μg重组N蛋白,共400μl/只。20天后进行第二次加强免疫,方法为取80μg重组N蛋白用弗氏不完全佐剂乳化,共400μl/只,皮下多点注射。第三次加强免疫在15天以后,方法与第二次加强免疫相同。20天后,取120μg重组N蛋白腹腔加强注射,于72小时后,眼眶取血,并处死小鼠,取其脾脏用鼠脾脏淋巴细胞分离试剂盒(天津市灏洋生物制品科技有限责任公司)分离鼠脾脏淋巴细胞。用RNA提取试剂盒(天根生化科技有限公司)从分离的淋巴细胞中提取总RNA,用反转录试剂盒(Takara)反转录合成cDNA,用鼠源单链抗体scfv通用简并引物扩增重链可变区以及轻链可变区基因,PCR产物分别进行1%琼脂糖凝胶电泳,并分别切胶回收目的基因,回收的目的基因通过overlap PCR链接成scfv,PCR产物进行1%琼脂糖凝胶电泳,并切胶回收目的基因经NotI和SfiI酶切后使用T4连接酶和pCANTAB5e(北京宝科维食安生物技术有限公司)载体按一定比例于4℃连接12小时后,连接产物经胶回收试剂盒回收以去除里面的酶及缓冲物质,回收产物用细菌电转化仪(biorad)分多次电转入大肠杆菌TG1电转感受态,并涂布于含氨苄青霉素抗性(50μg/mL)及2%葡萄糖的2×YT-AG平板,于30℃恒温培养12小时后,取适量的2×YT培养基用无菌玻璃棒将平板上的菌落全部刮取下来并收集菌体悬液,此为构建好的噬菌体抗体库。
实施例6:真核表达新型冠状病毒重组N蛋白
用限制性内切酶EcoRI和BamHI(宝生物工程大连有限公司)于37℃分别双酶切含新型冠状病毒重组N蛋白目的基因的pMD25-T载体和pTT5载体12小时,酶切产物分别行1%琼脂糖凝胶电泳,并分别切胶回收目的基因和pTT5载体(本发明所使用的胶回收试剂盒均来自爱思进生物技术杭州有限公司),使用T4连接酶(宝生物工程大连有限公司)将回收的目的基因和pTT5载体按一定比例于4℃连接12小时后,连接产物转化DH5α感受态细胞(杭州贤至生物科技有限公司),并涂布于含氨苄青霉素抗性(50μg/mL)的LB平板,于37℃恒温培养12小时之后,于平板上挑取单克隆菌株至含氨苄青霉素抗性(50μg/mL)的LB液体培养基,37℃恒温摇床培养12小时后,采用质粒纯化试剂盒(本发明所使用的质粒纯化试剂盒均来自于爱思进生物技术杭州有限公司)提取质粒,经EcoRI和BamHI双酶切鉴定后得到正确的重组表达载体。
将构建好的重组表达载体转染CHO-K1细胞。转染前一天将CHO-K1细胞按照1×106/ml的密度传代以保证转染时细胞活力,转染当天将细胞密度调整为2×106/ml进行转染。根据转染体系每毫升中加入3.2ug重组表达载体,再根据转染体系每毫升中加入4.8ug转染试剂PEI(Polyscience),边加边摇匀。37℃,6%二氧化碳摇床转速120rpm培养4小时后,加入1%500mM VPA(sigma)以及1%30g/L L-盐酸半胱氨酸(索莱宝生物科技有限公司),32℃,6%二氧化碳摇床转速120rpm培养6天后离心收集上清通过镍琼脂糖亲和层析柱(常州天地人和生物科技有限公司),20mM咪唑溶液去除杂蛋白,300mM咪唑溶液洗脱目的蛋白,收液后,4℃静置30分钟,转至截留分子量为8kD-10kD的透析袋中,于PBS(10mmol/L,pH7.4)中过夜透析。透析后立即取出并分装,于-20℃保存备用。20mM咪唑配制:咪唑1.36g,加10mmol/L,pH7.4 PBS溶液溶解定容至1000mL。300mM咪唑配制:咪唑10.2g,加10mmol/L,pH7.4 PBS溶液溶解定容至500mL。
实施例7:单链抗体scfv的淘选及筛选
从噬菌体抗体库中取一定量的菌液接种到2×YT-AG培养液中使OD600为0.3。37℃,250rpm振荡1h左右,使OD600达0.5后加入辅助噬菌体M13K07超感染,感染比例为M13K07/TG1=20:1。37℃,250rpm振荡1h后3300g,4℃离心10min沉淀细菌,小心移弃上清。重悬细菌到含氨苄青霉素抗性(50μg/mL)及卡那青霉素抗性(50μg/mL)的2×YT-AK培养基中,30℃,250rpm振荡培养过夜。次日,10800g,4℃离心20min沉淀细菌。上清移入干净离心管中,加入1/5体积的PEG/NaCl,混合后冰浴2h。10800g,4℃离心20min沉淀细胞,小心移弃上清,扣干,将沉淀重悬于PBS中,用0.45μm膜过滤去除细菌碎片用于淘选步骤。将真核表达的新型冠状病毒重组N蛋白用包被液稀释至8μg/ml包被免疫管(Thermo),每个免疫管4ml,4℃过夜包被。次日,弃去包被液和未吸附的抗原,无菌PBST洗涤3次,每个免疫管加入封闭液5ml,37℃孵育2h。弃去封闭液,无菌PBST洗涤3次后将经PEG沉淀获得的噬菌体加入到免疫管中,每个免疫管加入4ml,37℃孵育1h。弃去免疫管中的液体,用无菌PBST洗涤10次再用无菌PBS洗涤10次后加入1ml 100mM三乙胺将结合的噬菌体洗脱下来,再立即加入500μl 1MTris-HCl,pH 7.4进行中和。将中和后的噬菌体加入到一定量处于对数生长期的TG1大肠杆菌中进行超感染,此为第一轮淘选富集过程。经过3轮淘选,新型冠状病毒N蛋白特异性scfv得以富集。将最后一轮洗脱中和后的噬菌体侵染TG1大肠杆菌后涂布于2×YT-AG平板上,于30℃恒温培养12小时后随机挑取400-600个单克隆菌落于96孔深孔板中,用2×YT-AG培养基37℃,250rpm振荡2h后加入一定量M13K07辅助噬菌体进行超感染,37℃,250rpm振荡1h后离心去掉上清加入含氨苄青霉素抗性(50μg/mL)及卡那青霉素抗性(50μg/mL)的2×YT-AK培养基30℃,250rpm过夜培养。第二天进行单克隆ELISA筛选,筛选步骤如下:
包被:用包被液稀释真核表达的新型冠状病毒重组N蛋白至终浓度为1μg/mL,100μL/孔加入酶标板(深圳金灿华实业有限公司),4℃过夜后通过DEM-3型洗板机(中山大学达安基因股份有限公司)用洗涤液洗涤1次;
封闭:以200μL/孔加入封闭液,37℃封闭2h,通过洗板机用洗涤液洗涤1次;
加样:加过夜诱导表达的细菌培养上清及对照血清,100μL/孔,37℃孵育1h,通过洗板机用洗涤液洗涤3次;
加酶标抗体:以100μL/孔加入新鲜稀释兔抗M13噬菌体HRP酶标二抗(购自北京义翘神州生物技术有限公司),37℃孵育30分钟后,通过洗板机用洗涤液洗涤4次;
加显色液:每孔加显色液A和显色液B各50μL,37℃避光显色10分钟;
终止反应:以50μL/孔加入2M H2SO4
结果判定:在酶标仪上,于450nm处,空白孔校零后读取OD值。以免疫小鼠血清作为阳性对照。结果显示有12个阳性克隆OD值较高,经测序得到7株scfv序列,分别为3A2,2A5,4B9,2C6,6D8,7E6,5G9。相关溶液配方如下:
包被液:Na2CO3 1.5g,NaHCO3 2.9g,加ddH2O定容至1000mL(pH9.6)。
封闭液:Na2HPO4.12H2O 2.68g,NaH2PO4.2H2O 0.39g,NaCl 8.5g,20g牛血清白蛋白,加ddH2O定容至1000mL(pH7.4)。
洗涤液:Na2HPO4.12H2O 2.68g,NaH2PO4.2H2O 0.39g,NaCl 8.5g,Tween-200.5mL,加ddH2O定容至1000mL(pH7.4)。
显色液A:200mg TMB溶于100mL无水乙醇,加ddH2O定容至1000mL。
显色液B:柠檬酸2.1g,Na2HPO4.12H2O 71g,加ddH2O定容至1000mL。
使用时:1mL显色液A+1mL显色液B+0.4μL 30%H2O2
终止液:2M H2SO4,21.7mL浓H2SO4加ddH2O定容至1000mL。
实施例8:真核表达载体构建及HEK293F细胞瞬转表达和纯化
将7株新型冠状病毒N蛋白单链抗体scfv序列分别构建成完整鼠IgG1抗体序列,即将scfv中重链可变区与轻链可变区通过PCR分别与鼠IgG1重链恒定区和轻链恒定区桥接,再分别插入到pcDNA3.1(德国Novagen公司)质粒中。分别通过PEI将构建好的重链质粒与轻链质粒共转染HEK293F细胞,37℃,5%二氧化碳,120rpm细胞摇床表达7天后离心沉淀,收集上清过0.45μm滤器。用50mL平衡缓冲液PBS(pH7.4)平衡琼脂糖亲和介质Protein A层析柱(南京金斯瑞生物科技有限公司)至电脑核酸蛋白检测仪(上海沪西分析仪器厂有限公司)显示吸光度为0。上清上样后加PBS洗涤至吸光度为0,然后用0.1M甘氨酸(pH3.0)洗脱,收集流出液并加入500mM Tris-HCl(pH8.5)缓冲液中和至pH7.0左右,得到纯化的单克隆抗体3A2,2A5,4B9,2C6,6D8,7E6,5G9。
实施例9:标记N蛋白单克隆抗体胶体金垫的制备
取5ml 0.01%胶体金溶液加入0.2mol/L碳酸钾溶液10uL,充分混匀后加入50ug N蛋白单克隆抗体,混匀,室温静置30min后,加入500ul 10%BSA(牛血清白蛋白)溶液进行封闭,封闭处理30min后,离心(10000rpm/min、20min),弃上清后,沉淀用500ul复溶液充分溶解。溶解后的金溶液采用喷金划膜仪(上海金标生物科技有限公司)按照10ul/cm均匀喷涂于6mm宽的玻纤上,后置于电热鼓风干燥箱(上海一恒科学仪器有限公司)中37℃鼓风干燥2小时。
相关溶液配方如下:
0.01%胶体金溶液:1%氯金酸溶液1ml,1%柠檬酸溶液1.4ml,加超纯水加热溶解反应并定容至100ml。
1%氯金酸溶液:AuCL3.HCl.4H2O粉末1g加超纯水溶解并定容至100ml。
1%柠檬酸三钠溶液:柠檬酸三钠1g加超纯水溶解并定容至100ml。
0.2mol/L碳酸钾溶液:碳酸钾27.64g,加超纯水溶解并定容至1000ml。
复溶液:Tris 6.057g溶解于800ml超纯水中,用适量HCL调节pH至8.0,加超纯水定容到1000ml。
实施例10:硝酸纤维素膜(NC膜)的制备
新型冠状病毒N蛋白单克隆抗体(3A2,2A5,4B9,2C6,6D8,7E6,5G9)分别经包被液稀释后(终浓度为1mg/ml),通过喷金划膜仪(上海金标生物科技有限公司)按照1ul/cm将其均匀包被于硝酸纤维素膜(Sartorius),此为T线。通过喷金划膜仪(上海金标生物科技有限公司)将羊抗鼠溶液(终浓度为1mg/ml)按照1ul/cm均匀包被于硝酸纤维素膜,此为C线。划膜包被结束后,将硝酸纤维素膜置于电热恒温培养箱(上海一恒科学仪器有限公司)37℃静置12小时。
实施例11:胶体金免疫层析检测卡的制备
组装试纸条:在PVC底板上依次搭接粘贴:(1)喷涂N蛋白单克隆抗体(3A2,2A5,4B9,2C6,6D8,7E6,5G9)作为检测区和羊抗鼠IgG作为质控区的NC膜;(2)喷涂有胶体金标记N蛋白单克隆抗体(3A2,2A5,4B9,2C6,6D8,7E6,5G9)的金垫;(3)样本垫为一种经过1%Tween-20处理的玻璃纤维膜;(4)吸水纸,组装完成后剪切成4mm的宽度,装上试剂卡条壳并压紧,即得胶体金免疫层析检测卡。
实施例12:配对单抗筛选
真核表达的新型冠状病毒重组N蛋白和正常人咽拭子样本,经裂解液处理后,70μL/孔上样,室温放置15min,通过胶体金层析读数仪(上海捷浩科学仪器有限公司)分别读值并计算P/N值(真核表达的新型冠状病毒重组N蛋白检测值与阴性样本检测值的比值),详见表1。
表1配对单抗P/N值统计
Figure BDA0003048994220000091
通过上表可知,3A2单抗包被与4B9胶体金标记单抗配对,2C6单抗包被与6D8胶体金标记单抗配对为检测新型冠状病毒N蛋白的两个优势组合。
SEQ ID NO1:新型冠状病毒N蛋白特异性单链抗体scfv-3A2轻链可变区氨基酸序列;
SEQ ID NO2:新型冠状病毒N蛋白特异性单链抗体scfv-3A2重链可变区氨基酸序列;
SEQ ID NO3:新型冠状病毒N蛋白特异性单链抗体scfv-4B9轻链可变区氨基酸序列;
SEQ ID NO4:新型冠状病毒N蛋白特异性单链抗体scfv-4B9重链可变区氨基酸序列;
SEQ ID NO5:新型冠状病毒N蛋白特异性单链抗体scfv-2C6轻链可变区氨基酸序列;
SEQ ID NO6:新型冠状病毒N蛋白特异性单链抗体scfv-2C6重链可变区氨基酸序列;
SEQ ID NO7:新型冠状病毒N蛋白特异性单链抗体scfv-6D8轻链可变区氨基酸序列;
SEQ ID NO8:新型冠状病毒N蛋白特异性单链抗体scfv-6D8重链可变区氨基酸序列;
SEQ ID NO9:新型冠状病毒N蛋白特异性单链抗体scfv-3A2轻链可变区核苷酸序列;
SEQ ID NO10:新型冠状病毒N蛋白特异性单链抗体scfv-3A2重链可变区核苷酸序列;
SEQ ID NO11:新型冠状病毒N蛋白特异性单链抗体scfv-4B9轻链可变区核苷酸序列;
SEQ ID NO12:新型冠状病毒N蛋白特异性单链抗体scfv-4B9重链可变区核苷酸序列;
SEQ ID NO13:新型冠状病毒N蛋白特异性单链抗体scfv-2C6轻链可变区核苷酸序列;
SEQ ID NO14:新型冠状病毒N蛋白特异性单链抗体scfv-2C6重链可变区核苷酸序列;
SEQ ID NO15:新型冠状病毒N蛋白特异性单链抗体scfv-6D8轻链可变区核苷酸序列;
SEQ ID NO16:新型冠状病毒N蛋白特异性单链抗体scfv-6D8重链可变区核苷酸序列;
Figure BDA0003048994220000111
Figure BDA0003048994220000121
Figure BDA0003048994220000131
Figure BDA0003048994220000141
Figure BDA0003048994220000151
Figure BDA0003048994220000161
Figure BDA0003048994220000171
Figure BDA0003048994220000181
Figure BDA0003048994220000191
Figure BDA0003048994220000201
Figure BDA0003048994220000211
Figure BDA0003048994220000221
Figure BDA0003048994220000231
序列表
<110> 杭州贤至生物科技有限公司
<120> 新型冠状病毒N蛋白单克隆抗体的制备
<160> 16
<170> SIPOSequenceListing 1.0
<210> 1
<211> 107
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 1
Asp Ile Glu Leu Thr Gln Ser Pro Ala Ile Met Ser Ala Ser Pro Gly
1 5 10 15
Glu Arg Val Thr Met Thr Cys Ser Ala Ser Ser Ser Ile Arg Tyr Ile
20 25 30
Tyr Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Ser Ser Pro Arg Leu Leu Ile Tyr
35 40 45
Asp Thr Ser Asn Val Ala Pro Gly Val Pro Phe Arg Phe Ser Gly Ser
50 55 60
Gly Ser Gly Thr Ser Tyr Ser Leu Thr Ile Asn Arg Met Glu Ala Glu
65 70 75 80
Asp Ala Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Glu Trp Ser Gly Tyr Pro Tyr Thr
85 90 95
Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys Arg
100 105
<210> 2
<211> 114
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 2
Gln Glu Ser Gly Thr Glu Val Val Lys Pro Gly Ala Ser Val Lys Leu
1 5 10 15
Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Ile Phe Thr Ser Tyr Asp Ile Asp Trp
20 25 30
Val Arg Gln Thr Pro Glu Gln Gly Leu Glu Trp Ile Gly Trp Ile Phe
35 40 45
Pro Gly Glu Gly Ser Thr Glu Tyr Asn Glu Lys Phe Lys Gly Arg Ala
50 55 60
Thr Leu Ser Val Asp Lys Ser Ser Ser Thr Ala Tyr Met Glu Leu Thr
65 70 75 80
Arg Leu Thr Ser Glu Asp Ser Ala Val Tyr Phe Cys Ala Arg Gly Asp
85 90 95
Tyr Tyr Arg Arg Tyr Phe Asp Leu Trp Gly Gln Gly Thr Thr Val Thr
100 105 110
Val Ser
<210> 3
<211> 108
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 3
Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ala Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly
1 5 10 15
Asp Thr Val Thr Ile Thr Cys Arg Ala Ser Glu Asn Ile Tyr Ser Tyr
20 25 30
Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Gln Gly Lys Ser Pro Gln Leu Leu Val
35 40 45
Tyr Asn Ala Lys Thr Phe Ala Glu Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly
50 55 60
Ser Gly Ser Gly Thr Gln Phe Ser Leu Lys Ile Thr Ser Leu Gln Pro
65 70 75 80
Glu Asp Phe Gly Thr Tyr Ser Cys Gln His His Tyr Ala Thr Pro Tyr
85 90 95
Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys Arg
100 105
<210> 4
<211> 118
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 4
Gln Val Gln Leu Gln Gln Pro Gly Thr Glu Val Val Lys Pro Gly Ala
1 5 10 15
Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Thr Ser Tyr
20 25 30
Trp Met His Trp Val Lys Gln Arg Pro Gly Gln Gly Leu Glu Trp Ile
35 40 45
Gly Glu Ile Tyr Pro Ser Asp Gly Arg Thr Asn Tyr Asn Glu Arg Phe
50 55 60
Thr Arg Lys Ala Thr Leu Thr Val Asp Lys Ser Ser Ser Thr Ala Tyr
65 70 75 80
Met Gln Leu Ser Ser Leu Thr Ser Glu Asp Ser Ala Val Phe Phe Cys
85 90 95
Ala Lys Lys Asp Tyr Gly Val Tyr Gly Phe Ala Tyr Trp Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser
115
<210> 5
<211> 108
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 5
Asp Ile Gln Met Thr Gln Thr Thr Ser Ser Leu Ser Ala Ser Leu Gly
1 5 10 15
Asp Arg Val Thr Ile Asn Cys Arg Ala Ser Gln Asp Ile Ser Asn Tyr
20 25 30
Leu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Asp Gly Thr Val Lys Leu Leu Ile
35 40 45
Tyr Tyr Thr Ser Arg Leu His Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly
50 55 60
Ser Gly Ser Gly Thr Asp Tyr Ser Leu Thr Ile Ser Asn Leu Glu Gln
65 70 75 80
Glu Asp Ile Ala Thr Tyr Phe Cys Gln Arg Gly Asn Thr Leu Pro Arg
85 90 95
Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys Arg
100 105
<210> 6
<211> 121
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 6
Gln Val Gln Leu Leu Gln Ser Gly Ala Glu Leu Met Lys Pro Gly Ala
1 5 10 15
Ser Val Lys Ile Ser Cys Lys Ala Thr Gly Tyr Thr Phe Ser Arg Tyr
20 25 30
Trp Ile Glu Trp Val Lys Gln Arg Pro Gly His Gly Leu Glu Trp Ile
35 40 45
Gly Glu Ile Leu Pro Gly Gly Gly Glu Thr Asn Tyr Tyr Glu Lys Phe
50 55 60
Lys Gly Lys Ala Thr Phe Thr Ala Asp Thr Ser Ser Asn Thr Ala Tyr
65 70 75 80
Met Gln Leu Ser Ser Leu Thr Ser Glu Asp Ser Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Glu Gly Tyr Gly Asn Tyr Gly Gly Tyr Tyr Phe Asp Tyr Trp
100 105 110
Gly Gln Gly Thr Thr Leu Thr Val Ser
115 120
<210> 7
<211> 108
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 7
Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Ser Ser Ser Phe Ser Ile Ser Leu Gly
1 5 10 15
Asp Arg Val Thr Ile Ser Cys Lys Ala Ser Glu Asp Ile Tyr Asn Arg
20 25 30
Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Asn Ala Pro Arg Leu Leu Ile
35 40 45
Ser Gly Ala Pro Ser Leu Glu Asn Gly Val Ser Ser Arg Phe Ser Gly
50 55 60
Ser Gly Ser Gly Lys Asp Tyr Thr Leu Ser Ile Thr Ser Leu Gln Thr
65 70 75 80
Glu Asp Val Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Phe Trp Ser Ser Pro Trp
85 90 95
Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys Arg
100 105
<210> 8
<211> 119
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 8
Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Lys Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Lys Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Gly Ser Tyr
20 25 30
Ala Met Ser Trp Ile Arg Gln Ser Pro Glu Lys Arg Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ala Glu Ile Ser Ser Gly Gly Ser Phe Thr Tyr Tyr Pro Ala Thr Val
50 55 60
Thr Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ala Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Asp Met Thr Ser Leu Arg Ser Glu Asp Thr Ala Met Tyr Tyr Cys
85 90 95
Thr Arg Gly Gly Tyr Ser Pro Gly Asn Ala Met Asp Tyr Trp Gly Gln
100 105 110
Gly Thr Ser Val Thr Val Ser
115
<210> 9
<211> 321
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 9
gacatcgagc tgacacagag ccctgccatt atgagcgcct ctcctggcga aagagtgaca 60
atgacatgct ccgccagctc ttctatcaga tacatctatt ggtaccagca gaaacctgga 120
tctagcccaa gactgctgat ctacgacacc agcaacgtgg cccctggcgt tccttttaga 180
ttcagcggct ccggcagcgg caccagctac agcctgacca tcaaccggat ggaagccgag 240
gacgccgcta catactactg ccaggagtgg tccggctacc cttacacctt cggcggcgga 300
accaaactgg aaatcaagcg g 321
<210> 10
<211> 342
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 10
caagagagcg gcacagaggt ggtgaagcct ggagccagcg tcaagctgtc ttgtaaagcc 60
tctggatata tcttcaccag ctacgacatc gactgggtgc ggcagacccc tgagcagggc 120
ctggaatgga tcggctggat cttccccggc gagggcagca cagagtacaa cgagaagttc 180
aagggcagag ctacactgag cgtggacaag tccagcagca ccgcctacat ggaactgacc 240
agactgacat ctgaagatag cgccgtgtac ttttgcgcca gaggcgatta ctaccggaga 300
tacttcgacc tgtggggcca gggcaccacc gtgaccgtgt cc 342
<210> 11
<211> 324
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 11
gatatccaga tgacccaaag ccctgcttct ctgtctgctt ccgtgggcga caccgtgacc 60
atcacctgta gagcctccga gaacatctac tcctacctgg cttggtacca gcagaagcag 120
ggcaagtctc ctcaactgct ggtgtacaac gccaagacat tcgccgaggg cgtgccttct 180
cgcttcagcg gttccggctc tggcacccag ttctccctga agatcaccag cctgcagcct 240
gaggattttg gcacctactc ctgccagcat cactacgcca caccttacac cttcggcggc 300
ggaacaaagc tggaaatcaa gcgg 324
<210> 12
<211> 354
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 12
caggtgcagc tgcagcagcc aggcaccgaa gtcgtgaaac ctggcgcttc tgtcaaggtg 60
tcctgcaagg cttctggcta caccttcacc tcctactgga tgcactgggt caagcagaga 120
cctggacaag gcctggaatg gatcggcgag atctaccctt ctgacggcag aaccaactac 180
aacgagcgct ttaccagaaa ggctaccctg accgtggaca agtcctcctc taccgcctac 240
atgcagctga gcagcctgac ctctgaggac tccgccgtgt tcttctgcgc caaaaaggac 300
tacggcgtgt atggcttcgc ctactggggc cagggcacac tggtcaccgt gtcc 354
<210> 13
<211> 324
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 13
gacatccaga tgacccagac cacctcctct ctgtccgcta gcctgggcga cagagtgacc 60
atcaattgca gggcctctca ggacatcagc aactacctga actggtacca gcagaagcct 120
gatggcaccg tcaagctgct gatctactac acctctcggc tgcatagcgg agtgccctct 180
agattctccg gctctggctc cggtaccgat tattccctga caatttccaa cctggaacaa 240
gaggacatcg ccacctactt ctgccagaga ggcaacaccc tgcctagaac ctttggaggc 300
ggcacaaaag tggaaatcaa gcgg 324
<210> 14
<211> 363
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 14
caggtgcaac tgctgcagag cggcgccgag ctgatgaagc ctggcgcttc tgtgaagatc 60
tcttgcaagg ctacaggcta cacattctcc agatactgga tcgagtgggt caagcagcgg 120
cctggacatg gcctggaatg gatcggcgag atcctgcccg gcggaggcga gacaaactac 180
tacgagaagt tcaagggcaa ggccaccttc accgccgaca cctcttccaa caccgcttac 240
atgcagctga gcagtctgac ctccgaggac tccgccgtgt actactgcgc cagagaaggc 300
tacggcaact acggcggcta ctatttcgac tactggggcc agggcaccac cctgaccgtg 360
tcc 363
<210> 15
<211> 324
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 15
gacatccaga tgacccagtc ttctagcagt tttagcattt ctctgggcga cagagtgaca 60
atctcctgca aggcctctga agatatctac aacagactgg cctggtacca gcaaaagccc 120
ggaaacgccc ctaggctgct gatctctggc gctccttccc tcgaaaatgg cgtctcctcc 180
agattctccg gctccggctc tggcaaggac tacaccctgt ccatcacctc cctgcagacc 240
gaggacgtgg ccacctacta ctgccagcag ttctggagca gcccttggac cttcggcggt 300
ggcaccaagc tggagatcaa gcgg 324
<210> 16
<211> 357
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 16
gaagtgcagc tggtggaatc tggcgggggc ctggtgaagc ctggaggctc tctgaagctg 60
tcctgcgccg cttctggctt caccttcggc tcctacgcca tgtcttggat cagacagtct 120
cccgaaaaga gactggaatg ggtggccgag atctctagcg gaggctcctt cacctactat 180
cccgctaccg tgaccggccg cttcaccatc tctcgggaca acgccaagaa cacactgtac 240
ctggacatga cctccctccg gtccgaggac accgccatgt actactgcac cagaggcggc 300
tactcccctg gcaatgctat ggactactgg ggccagggca cctctgtcac tgtgtcc 357

Claims (17)

1.新型冠状病毒N蛋白特异性单链抗体scfv-3A2,包括轻链和重链,其特征在于:
所述轻链可变区的氨基酸序列如SEQ ID NO.1所示;
所述重链可变区的氨基酸序列如SEQ ID NO.2所示。
2.新型冠状病毒N蛋白特异性单链抗体scfv-4B9,包括轻链和重链,其特征在于:
所述轻链可变区的氨基酸序列如SEQ ID NO.3所示;
所述重链可变区的氨基酸序列如SEQ ID NO.4所示。
3.新型冠状病毒N蛋白特异性单链抗体scfv-2C6,包括轻链和重链,其特征在于:
所述轻链可变区的氨基酸序列如SEQ ID NO.5所示;
所述重链可变区的氨基酸序列如SEQ ID NO.6所示。
4.新型冠状病毒N蛋白特异性单链抗体scfv-6D8,包括轻链和重链,其特征在于:
所述轻链可变区的氨基酸序列如SEQ ID NO.7所示;
所述重链可变区的氨基酸序列如SEQ ID NO.8所示。
5.一种编码权利要求1所述的新型冠状病毒N蛋白特异性单链抗体scfv-3A2的基因,其特征在于:
编码轻链可变区的核苷酸序列如SEQ ID NO.9所示;
编码重链可变区的核苷酸序列如SEQ ID NO.10所示。
6.一种编码权利要求2所述的新型冠状病毒N蛋白特异性单链抗体scfv-4B9的基因,其特征在于:
编码轻链可变区的核苷酸序列如SEQ ID NO.11所示;
编码重链可变区的核苷酸序列如SEQ ID NO.12所示。
7.一种编码权利要求1所述的新型冠状病毒N蛋白特异性单链抗体scfv-2C6的基因,其特征在于:
编码轻链可变区的核苷酸序列如SEQ ID NO.13所示;
编码重链可变区的核苷酸序列如SEQ ID NO.14所示。
8.一种编码权利要求2所述的新型冠状病毒N蛋白特异性单链抗体scfv-6D8的基因,其特征在于:
编码轻链可变区的核苷酸序列如SEQ ID NO.15所示;
编码重链可变区的核苷酸序列如SEQ ID NO.16所示。
9.一种质粒载体,其特征在于该质粒载体含有权利要求5所述的轻链可变区核苷酸序列。
10.一种质粒载体,其特征在于该质粒载体含有权利要求5所述的重链可变区核苷酸序列。
11.一种质粒载体,其特征在于该质粒载体含有权利要求6所述的轻链可变区核苷酸序列。
12.一种质粒载体,其特征在于该质粒载体含有权利要求6所述的重链可变区核苷酸序列。
13.一种质粒载体,其特征在于该质粒载体含有权利要求7所述的轻链可变区核苷酸序列。
14.一种质粒载体,其特征在于该质粒载体含有权利要求7所述的重链可变区核苷酸序列。
15.一种质粒载体,其特征在于该质粒载体含有权利要求8所述的轻链可变区核苷酸序列。
16.一种质粒载体,其特征在于该质粒载体含有权利要求8所述的重链可变区核苷酸序列。
17.权利要求9、10、11、12、13、14、15、16所述的质粒载体用于真核表达新型冠状病毒N蛋白单克隆抗体,包括:
(a)通过PCR将权利要求5、6、7、8中所述轻链和重链核苷酸序列分别与鼠IgG1轻链恒定区和重链恒定区核苷酸序列桥接后酶切,并分别连接质粒载体,构建真核细胞表达载体;
(b)将步骤(a)中真核表达载体转染至HEK293F细胞表达得到新型冠状病毒N蛋白单克隆抗体;
(c)纯化单克隆抗体通过胶体金正交实验确定最佳单抗配对组合。
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