CN113025705B - miRNA-214作为帕金森病前驱期生物标志物的应用 - Google Patents
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Abstract
本发明提供miRNA‑214作为帕金森病前驱期的生物标志物的应用。通过快速测定中老年人群静脉血中的miRNA‑214的含量,用以筛查并预测PD前驱期的风险,督促患者及时就医,延缓疾病进展,保障患者生命安全。研究发现,本发明提供的miRNA‑214在PD前驱期患者静脉血中的表达量明显高于正常人,通过对miRNA‑214进行特异性的监测能够达到辅助诊断PD前驱期的目的。
Description
技术领域
本发明涉及生物检测技术领域,特别是涉及一种miRNA-214作为帕金森病前驱期生物标志物的应用。
背景技术
帕金森病(Parkinson’s disease,PD)是一种常见的神经系统退行性疾病,临床表现为运动迟缓、静止性震颤、肌强直、步态姿势异常、嗅觉减退、抑郁等症状,其发病原因及机制迄今不明。大约1%的65岁以上的人患有PD。其主要病理特征是中脑黑质致密部多巴胺(DA)神经元的选择性和进行性变性,纹状体DA含量显著降低,残余神经元中的嗜酸性包涵体——路易小体,主要由α-突触核蛋白(α-syn)组成。经过几十年的研究,PD的诊断和治疗仍然不理想;目前,PD的临床诊断主要是通过病史评估、体格检查、影像学检查以及左旋多巴等药物的疗效评估,但只有当症状完全发展时,才能观察到特定的影像学异常。而此时,大多数患者确诊已处于中晚期,使得多数PD患者错失了最佳治疗时期。
PD前驱期指患者出现非运动症状,乃至轻微运动症状,但尚未达到PD临床诊断标准,这些患者未来可能发生PD的风险高于平均值。从患者出现第一个PD非运动症状到符合PD临床诊断标准之间的前驱期阶段可长达20年。那么这个时期就是一个非常关键的诊断时期;患者常见的非运动症状例如有抑郁、便秘、嗅觉障碍等,但是仅仅通过这些非运动症状无法准确判断其是否会发展为PD患者,而前驱期的生物标志物则是一个非常有效的手段,在现有技术中,并未有相关的PD前驱期诊断的生物标志物。因此,亟需探索出一种PD前驱期诊断的生物标志物,这对于中老年人群中筛查发现前驱期患者,以及PD的早期诊断、疾病干预具有重要的意义。
发明内容
为了解决现有问题,本发明提供一种用于PD前驱期诊断的生物标志物miRNA-214(SEQ ID NO.1:ACAGCAGGCACAGACAGGCAGU)。
本发明的有益效果在于,通过快速测定中老年人群静脉血中的miRNA-214的含量,用以筛查并预测PD前驱期的风险,督促患者及时就医,延缓疾病进展,保障患者生命安全。研究发现,本发明提供的miRNA-214在PD前驱期患者静脉血中的表达量明显高于正常人,通过对miRNA-214进行特异性的监测能够达到辅助诊断PD前驱期的目的。
附图说明
图1A为miRNA-31在四组中的表达情况图;
图1B为miRNA-214在四组中的表达情况图;
图2A为miRNA-31预测晚期PD的受试者工作特征曲线图;
图2B为miRNA-214预测前驱期PD的受试者工作特征曲线图。
具体实施方式
为了更清楚地表述本发明,下面结合附图对本发明作进一步地描述。
在下文描述中,给出了普选实例细节以便提供对本发明更为深入的理解。显然,所描述的实施例仅仅是本发明一部分实施例,而不是全部实施例。应当理解所述具体实施例仅用以解释本发明,并不用于限定本发明。
应当理解的是,当在本说明书中使用术语“包含”和/或“包括”时,其指明存在所述特征、整体、步骤、操作、元件或组件,但不排除存在或附加一个或多个其他特征、整体、步骤、操作、元件、组件或它们的组合。
随着微小RNA(microRNA,miRNA)研究的热潮,这种内源性非编码小RNAs已经作为一个基因表达调节的中心因子显露,参加许多重要的生理过程。miRNA是一类长度在22nt左右的内源非编码小RNA,广泛存在于动物、植物、病毒等多种有机体中。它主要通过与靶基因的3'UTR的完全或不完全配对,降解靶标基因mRNA或抑制其翻译,从而参与调控机体发育、细胞凋亡、增殖及分化等生命活动,预测超过1/3的人类基因都是保守的miRNA靶基因。在现有研究中,qPCR检测PD患者和健康对照组miRNA的表达。224个miRNAs中有8个在中脑高度表达,其中,PD组miRNA-133b表达下调最明显。然而,这些在人脑组织中发现的miRNAs不能直接作为临床应用的生物标志物,利用PD患者的脑组织样本来诊断PD是不可能的。早期诊断不仅需要确定疾病的特异性,还需要微创的生物标志物。
本发明中涉及的作为PD前驱期生物标志物的miRNA-214的序列为:SEQ ID NO.1:ACAGCAGGCACAGACAGGCAGU。
本发明中涉及的PD前驱期表示典型的疾病发展过程阶段中的一个,PD早期阶段包括临床前期、前驱期、临床期。
以下各实施例中使用的实验材料和试剂以及情况说明如下:伦理委员会批准了南京医科大学附属脑科医院的研究,该研究是根据1964年《赫尔辛基宣言》及其后修正案确立的伦理标准完成的。所有参与者均给予书面知情同意。所有测试对象均取等量静脉血进行测试。
一、总RNA提取步骤
试剂盒为:miRcute血清/血浆miRNA提取分离试剂盒DP503(采购自天根生化科技(北京)有限公司)。
1.样品处理:每200μL血清中加入900μL裂解液MZA(Buffer MZA),振荡器振荡混匀30sec至完全匀浆,加入1pmol外参,颠倒混匀;
2.室温放置5min,使得核酸蛋白复合物完全分离;
3.加入200μL氯仿,盖好管盖,剧烈振荡15sec,室温放置5min;
4.12,000rpm(~13,400×g),4℃,离心15min,样品会分成三层:黄色的有机相,白色的中间层和无色的水相,RNA主要在水相中,把水相转移到新管中,进行下一步操作;
5.量取转移液的体积,缓慢加入转移液2倍体积的无水乙醇(如:500μL的转移液加1mL无水乙醇),混匀(此时可能会出现沉淀)。将得到的溶液和沉淀一起转入吸附柱miRelute,室温放置2min,室温12,000rpm(~13,400×g)离心30sec,离心后弃掉流出液,保留吸附柱miRelute;
6.向吸附柱miRelute中加入700μL去蛋白液MRD(Buffer MRD),室温静置2min,室温12,000rpm(~13,400×g)离心30sec,弃废液;
7.向吸附柱miRelute中加入500μL漂洗液RW(Buffer RW),室温静置2min,室温12,000rpm(~13,400×g)离心30sec,弃废液;
8.重复步骤7一次;
9.室温12,000rpm(~13,400×g)离心2min,弃收集管;
10.将吸附柱miRelute转入一个新的RNase-Free 1.5mL离心管中,向吸附膜中心位置加15-30μL RNase-Free ddH2O,室温放置2min,室温12,000rpm(~13,400×g)离心2min。
二、miRNA第一链cDNA制备
1.miRNA-214的c-DNA制备
试剂盒为:miRcute增强型miRNA cDNA第一链合成试剂盒KR211(采购自天根生化科技(北京)有限公司)。
1)先通过E.coli Poly(A)Polymerase在miRNA 3’末端加多聚A尾Poly(A),再使用Oligo(dT)-Universal Tag通用逆转录引物进行逆转录反应,最终生成miRNA对应的cDNA第一链。
2)反转录体系(见表1)的配制
解冻2×miRNA反转录缓冲液并混匀,miRNA反转录混合酶放于冰中备用,在冰上预冷无RNA酶的反应管内加入以下试剂至总体积20μL(最后加入miRNA反转录混合酶)。
表1
试剂组分 | 体积 | 终浓度 |
Total RNA | - | 1μg |
2×miRNA反转录缓冲液 | 10μL | 1× |
miRNA反转录混合酶 | 2μL | - |
无RNA酶双蒸水 | 补至20μL | - |
3)反转录程序
移液器轻轻混匀上述配制的反应液,按下表(表2)程序进行miRNA的逆转录反应:
表2
反应温度 | 反应时间 | 说明 |
42℃ | 60<sub>min</sub> | miRNA加A尾反应和逆转录反应 |
95℃ | 3<sub>min</sub> | 酶失活反应 |
三、SYBR Green法检测miRNA-214的表达量
试剂盒为:miRcute增强型miRNA荧光定量检测试剂盒FP411(采购自天根生化科技(北京)有限公司)。
1.室温融化2×miRcute增强型miRNA定量预混试剂和下游引物;
2.使用时请将2×miRcute增强型miRNA定量预混试剂上下颠倒轻轻均匀混合,避免起泡,并经轻微离心后使用;
3.将试剂置于冰上,并按表3配制反应体系:
表3
组成成分 | 20μL体系 | 终浓度 |
2×miRcute增强型miRNA定量预混试剂(含SYBR&ROX) | 10μL | 1× |
上游引物(10μM,SEQ ID NO.2) | 0.4μL | 200nM |
下游引物(10μM,SEQ ID NO.3) | 0.4μL | 200nM |
miRNA第一链cDNA | 1μL | - |
双蒸水 | 至20μL | - |
注:上游引物的序列号为SEQ ID NO.2(ACACTCCAGCTGGG)
下游引物的序列号为SEQ ID NO.3(CTCAACTGGTGTCGTGGA)。
4.Real Time PCR反应条件如表4
表4
注:采用7300Real-Time PCR System扩增仪进行定量检测。
四、miRNA表达水平对比例
一共纳入90例,包括对照组21例,前驱期PD组25例,早期PD组20例,晚期PD组24例。早期PD和晚期PD患者来自南京医科大学附属脑科医院PD专病门诊,早期PD组为初诊未服药且H-Y≤2的患者,晚期PD组为服用抗PD药物且H-Y>2的患者,PD诊断符合英国脑库原发性PD的诊断标准。前驱期PD来自南京医科大学附属脑科医院进行的一项基于社区的前驱期PD前瞻性研究,诊断符合2015年国际运动障碍协会的PD前驱期诊断研究标准。
按照上述的方式采集所有测试人员的静脉血进行miRNA-214和miRNA-31的表达水平分析,由于在现有技术中,miRNA-214能预测早期PD,miRNA-31能预测PD,但是对于前驱期的预测还未有更加有利的发现;所以将miRNA-214和miRNA-31在各种不同时期的表达水平进行对比。
1.血清miRNA-31和和miRNA-214在四组中表达情况的比较
一共纳入90例,包括对照组21例,前驱期PD组25例,早期PD组20例,晚期PD组24例(见表5)。各组间年龄、性别比较无统计学差异(P>0.05)。与对照组相比,晚期PD组的血清miRNA-31相对表达量高(P=0.005,图1A)。而对照组与前驱期PD组和早期PD组比较,差异无统计学意义(P>0.05)。另外,晚期PD组的血清miRNA-31表达高于早期PD组(P=0.001,图1A)。结果表明,miRNA-31可作为晚期PD的生物标记物。与对照组相比,前驱期PD组的血清miRNA-214相对表达量高(P=0.003,图1B)。而对照组与早期PD组和晚期PD组比较,差异无统计学意义(P>0.05)。另外,晚期PD组的血清miR-214表达低于早期PD组和前驱期PD组(P=0.046vs0.001,图1B)。因此,miRNA-214可作为前驱期PD的生物标记物。
表5基本资料
注:性别以外的计量资料用中位数(四分位数)表示;UP:统一帕金森病评定量表;H-Y:Hoehn and Yahr分期;NMSQ:30项非运动症状问卷;MMSE:简易精神状态检查量表;MoCA:蒙特利尔认知评估量表;HAMD:汉密尔顿抑郁量表;HAMA:汉密尔顿焦虑量表;RBDQ-HK:香港中文大学快速眼动睡眠期行为障碍量表;PDSS:帕金森病睡眠量表。
2.血清miRNA-31和和miRNA-214评价晚期PD和前驱期PD的诊断价值分析
对照组21例,晚期PD组24例,以晚期PD为金标准,建立ROC曲线,约登指数最大为最佳界值,结果显示,血清miR-31预测晚期PD的最佳界值为0.0148,敏感度87.5%,特异度71.4%,AUC为0.744(95%CI=0.572-0.916,P=0.005,图2A)。对照组21例,前驱期PD组25例,以前驱期PD为金标准,建立ROC曲线,结果表明,血清miR-214预测前驱期PD的最佳界值为0.1962,敏感度72.0%,特异度76.2%,AUC为0.756(95%CI=0.614-0.898,P=0.003,图2B)。
3.血清miR-31和和miR-214与临床特征的相关性分析
早期PD组和晚期PD组合并为一组进行相关性分析。Spearman相关分析显示,早期PD组和晚期PD患者的发病年龄与miRNA-214呈正相关关系,而与miRNA-31呈负相关关系(见表6)。另外,miRNA-31与病程、UPⅡ、UPⅢ、H-Y、HAMD呈正相关关系,与PDSS呈负相关关系(见表6)。结果表明,miRNA-31和miRNA-214与前驱期PD患者的临床特征无相关性(见表7)。
表6血清miRNA与早期PD和晚期PD患者临床特征的相关性分析
注:UP:统一帕金森病评定量表;H-Y:Hoehn and Yahr分期;NMSQ:30项非运动症状问卷;MMSE:简易精神状态检查量表;MoCA:蒙特利尔认知评估量表;HAMD:汉密尔顿抑郁量表;HAMA:汉密尔顿焦虑量表;PDSS:帕金森病睡眠量表;*在0.05级别(双尾),相关性显著;**在0.01级别(双尾),相关性显著。
表7血清miRNA与前驱期PD患者临床特征的相关性分析
注:UP:统一帕金森病评定量表;NMSQ:30项非运动症状问卷;MMSE:简易精神状态检查量表;MoCA:蒙特利尔认知评估量表;HAMD:汉密尔顿抑郁量表;HAMA:汉密尔顿焦虑量表;RBDQ-HK:香港中文大学快速眼动睡眠期行为障碍量表。
本发明的技术效果有:
本发明提供的miRNA-214在PD前驱期患者静脉血中的表达量明显高于正常人,通过对miRNA-214进行特异性的监测能够达到辅助诊断PD前驱期的目的。
以上公开的仅为本发明的几个具体实施例,但是本发明并非局限于此,任何本领域的技术人员能思之的变化都应落入本发明的保护范围。
Claims (1)
1. 检测静脉血中miRNA-214的试剂在制备诊断帕金森前驱期产品中的应用,其特征在于,所述miRNA-214的序列如SEQ ID NO.1所示。
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A panel of four decreased serum microRNAs as a novel biomarker for early Parkinson’s disease;Hui Dong等;《Biomarkers》;20151203;摘要、表S6 * |
血清微小RNA-221、微小RNA-214在帕金森病中的表达及其与帕金森综合评分的相关性研究;周梅等;《中国医刊》;20201231;第55卷(第2期);第206-209页 * |
血清神经来源外泌体miR-221、miR-214与帕金森病认知障碍的相关性;于慧娟等;《国际神经病学神经外科学杂志》;20210228;第48卷(第2期);第110-114页 * |
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