CN112876471A - 吡啶并嘧啶类kras g12c突变蛋白抑制剂 - Google Patents

吡啶并嘧啶类kras g12c突变蛋白抑制剂 Download PDF

Info

Publication number
CN112876471A
CN112876471A CN202110015508.9A CN202110015508A CN112876471A CN 112876471 A CN112876471 A CN 112876471A CN 202110015508 A CN202110015508 A CN 202110015508A CN 112876471 A CN112876471 A CN 112876471A
Authority
CN
China
Prior art keywords
cancer
compound
alkyl
group
kras
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Granted
Application number
CN202110015508.9A
Other languages
English (en)
Other versions
CN112876471B (zh
Inventor
徐伟
吴曙光
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Guangzhou Baiting Medicine Technology Co ltd
Original Assignee
Guangzhou Baiting Medicine Technology Co ltd
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Guangzhou Baiting Medicine Technology Co ltd filed Critical Guangzhou Baiting Medicine Technology Co ltd
Publication of CN112876471A publication Critical patent/CN112876471A/zh
Application granted granted Critical
Publication of CN112876471B publication Critical patent/CN112876471B/zh
Active legal-status Critical Current
Anticipated expiration legal-status Critical

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07DHETEROCYCLIC COMPOUNDS
    • C07D471/00Heterocyclic compounds containing nitrogen atoms as the only ring hetero atoms in the condensed system, at least one ring being a six-membered ring with one nitrogen atom, not provided for by groups C07D451/00 - C07D463/00
    • C07D471/02Heterocyclic compounds containing nitrogen atoms as the only ring hetero atoms in the condensed system, at least one ring being a six-membered ring with one nitrogen atom, not provided for by groups C07D451/00 - C07D463/00 in which the condensed system contains two hetero rings
    • C07D471/04Ortho-condensed systems
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K31/00Medicinal preparations containing organic active ingredients
    • A61K31/33Heterocyclic compounds
    • A61K31/395Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins
    • A61K31/495Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins having six-membered rings with two or more nitrogen atoms as the only ring heteroatoms, e.g. piperazine or tetrazines
    • A61K31/505Pyrimidines; Hydrogenated pyrimidines, e.g. trimethoprim
    • A61K31/519Pyrimidines; Hydrogenated pyrimidines, e.g. trimethoprim ortho- or peri-condensed with heterocyclic rings
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K31/00Medicinal preparations containing organic active ingredients
    • A61K31/33Heterocyclic compounds
    • A61K31/395Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins
    • A61K31/495Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins having six-membered rings with two or more nitrogen atoms as the only ring heteroatoms, e.g. piperazine or tetrazines
    • A61K31/505Pyrimidines; Hydrogenated pyrimidines, e.g. trimethoprim
    • A61K31/519Pyrimidines; Hydrogenated pyrimidines, e.g. trimethoprim ortho- or peri-condensed with heterocyclic rings
    • A61K31/525Isoalloxazines, e.g. riboflavins, vitamin B2
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P35/00Antineoplastic agents
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P35/00Antineoplastic agents
    • A61P35/02Antineoplastic agents specific for leukemia

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • Hematology (AREA)
  • Oncology (AREA)
  • Epidemiology (AREA)
  • Pharmaceuticals Containing Other Organic And Inorganic Compounds (AREA)
  • Nitrogen Condensed Heterocyclic Rings (AREA)

Abstract

本发明属于医药技术领域,具体发明内容涉及通式(I)所示的吡啶并嘧啶类KRAS G12C突变蛋白抑制剂、其药学上可接受的盐、其立体异构体、其氘代物;本发明还涉及上述化合物的制备方法及其含有这些化合物在药学上可接受的盐、其药物制剂和药物组合物的制备方法;本发明还涉及上述化合物及其含有这些化合物在药学上可接受的盐,其药物制剂和药物组合物在治疗KRAS G12C突变蛋白引起的癌症增殖性疾病中的应用。

Description

吡啶并嘧啶类KRAS G12C突变蛋白抑制剂
技术领域
本发明属于医药技术领域;本发明涉及新的取代的吡啶并嘧啶类衍生物,具体涉及通式(I)所示的化合物,其异构体或其氘代物、其药学上可接受的盐、其药物制剂和药物组合物在制备治疗癌症增殖性疾病中的应用。
背景技术
RAS蛋白在调节正常的细胞生长和增殖中发挥重要作用。根据RAS氨基酸序列保守程度可分为KRAS、HRAS、和NRAS三种。RAS通过与低分子量的鸟嘌呤三核苷酸磷酸(GTP)或鸟嘌呤二核苷酸磷酸(GDP)的结合而处于不同的“活化”或“失活”的状态。正常情况下,RAS蛋白在静止细胞的质膜上与GDP结合,形成GDP-RAS,使RAS处于失活状态;当细胞受到丝裂原等激活因子的刺激时,与GDP-RAS结合的GDP与游离GTP发生交换,释放出GDP,并同时形成RAS与GTP结合的状态,即活化的GTP-RAS。只有活化的GTP-RAS才能激活RAS下游信号通路,传递正常的RAS信号。由于正常的RAS蛋白具有将GTP水解成GDP的GTP水解酶活性,因此可以调控活化型GTP-RAS和失活型GDP-RAS之间的交换,维持RAS活化和失活信号之间的平衡。当RAS蛋白发生突变时,调节活化型GTP-RAS和失活型GDP-RAS之间的交换功能失控,使RAS信号持续处于活化状态,不断地激活下游生长信号,刺激细胞的异常增殖,诱导肿瘤的发生以及维持肿瘤的生长(Nature Review cancer3:11-22,2003)。
人类肿瘤常表达通过点突变激活的RAS蛋白。KRAS、HRAS、和NRAS都能发生突变激活,其中K-RAS(Kirsten rat sarcoma virus oncogene)是在所有RAS驱动的肿瘤中突变率最高的癌基因。大部分K-RAS致癌突变集中在几个热点残基上,最常见的K-RAS突变出现在第12位的甘氨酸(G12)、第13位甘氨酸(G13)、以及第61位的谷氨酰胺(Q61)残疾上,其中G12位的突变发生率最高(Nat Rev Drug Discov 2014,13:828-851)。
K-RASRAS G12C突变是指K-RAS蛋白的第12位的甘氨酸突变为半胱氨酸,是K-RAS突变最常的见亚型。K-RAS G12C突变肿瘤的发生频率依次为胰腺癌(57%)、大肠癌(35%)、胆道癌(28%)、小肠癌(17%)、肺癌(16%)、子宫内膜癌(15%)和卵巢癌(14%)等(Seminars in Cancer Biology.2019Jun 27.pii:S1044-579X(18)30060-9)。由于K-RASG12C突变的恶性肿瘤对常规的治疗方法一般无反应,因此患者临床预后差,存活时间短。
虽然大量的研究揭示RAS突变蛋白是治疗人类癌症治疗的重要靶点,但从RAS癌基因发现30多年来以来,抗RAS疗法经历了很多的失败,目前医药界仍然对抗RAS药物,特别是抗K-RAS G12C突变的RAS抑制剂,保持着高度的兴趣和期待。K-RAS G12C突变蛋白抑制剂是近年来发现抗RAS靶向治疗的新型药物靶点(Nature 503:548-551,2013)。K-RAS G12C共价抑制剂是利用突变后的第12位半胱氨酸的亲核反应性来设计小分子化合物,通过用二硫键修饰,进入到K-RAS G12C变构口袋,阻断K-RAS G12C突变蛋白的激活而抑制肿瘤生长,但至今仍没有足够高效能和高安全性的新型K-RAS G12C抑制剂获得监管机构的批准上市。因此,在该技术领域仍然亟待发现新的选择性K-RAS G12C抑制剂用于K-RAS G2C突变肿瘤的靶向治疗。
发明内容
本发明提供通式(I)所示化合物、其异构体、其药学上可接受的盐或其氘代物:
Figure BDA0002886634210000021
其中,
X选自含有1或2个N原子的4-8元饱和或部分饱和的单环,或者含有1或2个N原子的6-12元饱和或部分饱和的双环、桥环、融合环、螺环的杂环烷基,可任选被1、2或3个相同或不同的R6取代;
R1、R2选自H、卤素、NH2、OH、C1-3烷基和C1-3杂烷基,所述的取代基可任选1个或多个取代;
R3选自4-6元单环或6-12元双环的芳基、杂芳基,环烷基、杂环烷基,所述的芳基、杂芳基,环烷基、杂环烷基可被1、2或3个相同或不同的R7取代;
R4选自H、烷基、氨基烷基、烷基氨基烷基、卤代烷基、羟基烷基、二羟基烷基、-A-NR8R9、4-6元杂环基、4-6元杂环基烷基、5-6元芳基、5-6元杂芳基或杂芳基烷基,其中,A、杂环基、杂环基烷基、芳基、杂芳基或杂芳基烷基可任选被1个或多个相同或不同的R10取代;
A选自C1-4亚烷基;
L是键或-NH-;
R5选自:
Figure BDA0002886634210000022
R6选自腈基、C1-3烷基、氨基、卤素,羟基;
R7选自卤素、氨基、羟基、C1-3烷基或卤素取代的C1-3烷基;
R8选自H、或C1-3烷基
R9选自H、C1-3烷基、杂烷基、羟基烷基、酰基;
R10选自H、羟基、卤素、
Z选自键、O、S、NR11
R11选自H、或C1-3亚烷基;
R12选自卤素、CF3、羟基烷基;
R13选自H、C1-3烷基、烷基氨基烷基、烷基氨基烷基、杂环基氨基烷基、卤素、酰胺基、腈基、羟基烷基、CF3、CF2、甲氧基、三氟甲基氨基、烯烃;
R14选自H、烷基、羟基烷基;
R15选自不存在、H或C1-3烷基;
在本发明方案中,“杂”指杂原子或杂原子团(含有杂原子的原子团),杂原子是指碳(C)和氢(H)以外的原子以及含有这些杂原子的原子团,例如氧(O)、氮(N)、硫(S)等;杂原子团指C1-3杂烷基、C1-6杂烷基、C1-8杂烷基、3-8元杂环烷基、5-6元杂环芳基、5-6元杂环烯基等;
在本发明的一些方案中,结构单元
Figure BDA0002886634210000031
选自:
Figure BDA0002886634210000032
在上述结构单元中,R5选自:
Figure BDA0002886634210000033
在本发明的一些方案中,上述R3选自:
Figure BDA0002886634210000034
Figure BDA0002886634210000041
在本发明的一些方案中,上述R4选自:
Figure BDA0002886634210000042
Figure BDA0002886634210000051
其他变量的结构单元或基团如本发明所定义。
本发明所示化合物、其异构体、其药学上可接受的盐或其氘代物,选自:
Figure BDA0002886634210000052
Figure BDA0002886634210000061
Figure BDA0002886634210000071
Figure BDA0002886634210000081
Figure BDA0002886634210000091
Figure BDA0002886634210000101
本文所示的某些化合物可以为立体异构体,包括光学异构体和构象异构体,以通用符号R或S表示。
本发明还提供了上述化合物,其药学上可接受的盐、其异构体、其氘代物应用于制备治疗癌症药物。
在本发明中,所述癌症包括肺癌、胰腺癌、直/结肠癌、胆管癌、小肠癌、子宫内膜癌、胃癌、卵巢癌、前列腺癌、子宫颈癌、肝癌、腹膜癌、软组织癌、白血病、淋巴瘤、乳腺癌、尿路上皮癌、睾丸癌、皮肤癌、食道癌、甲状腺癌、食管癌、骨癌和眼癌。
技术效果
本发明采用了电泳凝胶迁移分析法(gel mobility shift assay)测定化合物与细胞KRAS G12C突变蛋白形成的共价结合复合物特有的电泳迁移改变;其原理是基于化合物和K-RAS G12C突变蛋白结合形成的共价复合物的分子量增大,与游离的KRAS G12C突变蛋白相比,在电泳时出现相应的电泳带滞后。再用FluorChemR检测仪定量扫描电泳带,计算化合物-G12C突变蛋白的复合物与未结合化合物的G12C突变蛋白的电泳迁移比值,快速和直接测定本发明化合物与KRAS G12C突变蛋白的共价键结合特征。电泳凝胶迁移分析表明,本发明化合物能选择性地与含有KRAS G12C突变的人非小细胞肺癌NCI-H358细胞中的KRASG12C突变蛋白结合,形成的化合物-突变蛋白复合物,导致出现电泳凝胶迁滞后,但本发明化合物不能与无KRAS G12C突变的非小细胞肺癌A549细胞的KRAS蛋白结合,也不能与含有野生型KRAS的非小细胞肺癌HCC827细胞的KRAS蛋白结合,不出现上述电泳凝胶迁移的特征性改变。另外,在抗细胞增殖实验中也显示,本发明化合物对KRAS G12C突变的肿瘤细胞具有较强的抗增殖活性,而对无K-RAS G12C突变或野生型肿瘤细胞的抗增殖活性弱,与电泳凝胶迁移分析方法的结果一致。凝胶迁移分析和抗细胞增殖实验均显示本发明化合物选择性地抑制了KRAS G12C突变肿瘤细胞中异常激活的KRAS信号,对K-RAS G12C突变的肿瘤细胞和非突变的肿瘤细胞具有选择性的作用,显示出该类化合物作为KRAS G12C突变抑制剂具有较好的有效性和安全性。
定义和说明
本文所用的术语具有以下含义。
术语“药学上可接受的盐”是指本发明发现的具有特定取代基的化合物与相对无毒的酸或碱制备的盐。当本发明化合物中含有碱性官能团时,可以通过在合适的纯溶液或惰性溶剂中用足量的酸与中性形式的本发明化合物接触获得酸加成盐。药学上可接受的酸加成盐,包括无机酸盐和有机酸盐:无机酸包括盐酸、硫酸、硫酸氢根、碳酸、碳酸氢根、磷酸、亚磷酸、磷酸一氢根、磷酸二氢根、氢溴酸、氢碘酸和硝酸;有机酸包括如乳酸、苯磺酸、乙酸、丙酸、丙二酸、异丁酸、辛二酸、苯甲酸、邻苯二甲酸、对甲苯磺酸、柠檬酸、酒石酸、马来酸、氨基酸、葡萄糖醛酸。本发明中的特定化合物通式含有酸性或碱性基团,因此可以被转换成酸或碱加成盐。
术语“立体或几何异构体”是指顺式和反式异构体、(R)-和(S)-对映体、(-)-和(+)-对映体、(D)-异构体、(L)-异构体、非对映异构体、以及消旋混合物,都包括在本发明范围内。
术语“顺反异构体”或“几何异构体”是因双键或成环碳原子单键不能自由旋转所致。
术语“对映异构体”或“旋光异构体”指互为镜像关系的立体异构体。
术语“非对映异构体”指分子具有两个以上手性中心,而且分子间有非镜像关系的异构体。
术语“(D)”或(+)指右旋,“(L”或(-)指左旋,“DL”或“±”指外消旋。
用楔形虚线键
Figure BDA0002886634210000111
和楔形实线键
Figure BDA0002886634210000112
指分子中一个立体中心的绝对构型。
术语“互变异构体”指本发明化合物分子中不同官能团异构体处于动态平衡,并能快速相互转化。
术语“烷基”指直链或支链的饱和碳氢基团。在一些实施方案中,所属烷基为C1-3烷基;在另一些实施方案中,所属烷基为C1-6烷基。烷基实例包括但不限于甲基、乙基、丙基(包括异丙基和n-丙基)、丁基(包括n-丁基、异丁基)、戊基(包括n-戊基、异戊基和新戊基)、己基。所述的烷基可以是一价(如甲基)、二价(如亚甲基)、多价(如次甲基),可以是单取代(如-CH2F)或多取代(-CF3)。
术语“烯基”指直链或支链的含有一个或多个碳-碳双键的碳氢基团。在一些实施方案中,所述烯基为C2-4烯基;在另一些实施方案中,所述烯基为C2-6烯基;在另一些实施方案中,所述烯基为C2-8烯基。
术语“环”指被取代或未被取代的环烷基、环烯基、环炔基、芳基、杂环烷基、杂环烯基、杂环炔基、芳基。所述的环包括单环、双环、多环。环上原子的数目定义为环的元数。
术语“杂”指杂原子或杂原子团(含有杂原子的原子团),即碳(C)和氢(H)以外的原子以及含有这些杂原子的原子团,例如氧(O)、氮(N)、硫(S)等。
术语“环烷基”指包括单环,双环或三环体系的环状烷基,其中双环或三环体系包括螺环、桥环、并环;所述的烷基可以是一价、二价、多价,也可以是单取代或多取代。
术语“环烯基”指含有一个或多个不饱和的碳-碳双键的环状烯基,其中双环或三环体系包括螺环、桥环、并环;所述的烷基可以是一价、二价、多价,也可以是单取代或多取代。
术语“环炔基”指含有一个或多个碳-碳三键的环状烷基,包括单环,双环、多环体系,其中双环或三环体系包括螺环、并环和桥环。所述的烷基可以是一价、二价、多价,也可以是单取代或多取代。
术语“杂环烷基”指环化的杂烷基,包括单环,双环、多环体系,其中双环或三环体系包括螺环、并环和桥环。
术语“杂环烯基”指环化的杂烯基,包括单环,双环、多环体系,其中双环或三环体系包括螺环、并环和桥环。
术语“杂环炔基”指环化的杂环炔基,包括单环,双环、多环体系,其中双环或三环体系包括螺环、并环和桥环。
术语“芳环”或“芳基”指多不饱和的碳环体系,包括单环,双环、多环体系,其中至少一个环具有芳香性,可以是一价、二价、多价,也可以是单取代或多取代。
本发明化合物可通过本领域技术人员熟知的多种合成方法合制备,以下列举的具体实施方式以及优选的实施方式包括但不限于本发明的实施例。
具体实施方式
以下通过一般反应流程和具体的实施例对本发明进行详细的描述,但所述内容并不包含对本发明的任何限制。
一般反应流程(A)
Figure BDA0002886634210000121
通式(I)化合物的实施方式根据一般反应流程(A)制备,其中R1、R2、R3、R4、R5、X、L以及Z的定义如上文。根据一般反应流程所示,反应物A1与浓氨水在耐压管中加热反应得到化合物A2,A2与草酰氯反应得到的酰氯直接与液氨反应得到化合物A3,A3与草酰氯加热发生成环反应得到A4,A4与二异丙基乙胺,三氯氧磷反应得到化合物A5,A5与结构单元
Figure BDA0002886634210000122
中的X、R5依次反应得到化合物A6,A6与不同的R3基团反应得到化合物A7,A7与包含不同的R4基团取代的结构单元-Z-R5反应得到化合物A8。
一般反应流程(B)
Figure BDA0002886634210000131
通式(I)化合物的实施方式根据一般反应流程(B)制备,其中R1、R2、R3、R4、R5、X、L以及Z的定义如上文。根据一般反应流程所示,反应物B1与草酰氯反应得到化合物B2,B2与硫脲反应得到化合物B3,B3加热回流发生成环反应得到B4,B4与三氯氧磷反应得到化合物B5,B5与结构单元
Figure BDA0002886634210000132
中的X、R5依次反应得到化合物B6,B6与不同的R3基团反应得到化合物B7,B7与包含不同的R4基团取代的结构单元反应得到化合物B8。
实施例1:
Figure BDA0002886634210000133
化合物(S)-1-(4-(7-(萘-1-基)-2-((1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-4-基)哌嗪-1-基)丙-2-烯-1-酮的合成参考一般反应流程(A)和(B);MS(ESI)m/z509.26[M+H]+
合成路线和具体方法如下:
Figure BDA0002886634210000134
第一步
将化合物A(500.0mg,2.9mmol,1.00eq)溶解于5mL甲苯中,于氮气保护下加入草酰氯(443.8mg,3.5mmol,1.20eq)。混合物在110℃下搅拌15小时。冷却至室温,过滤,滤渣用甲苯洗涤(5mL×2),干燥。得到粗品化合物B(528mg,浅黄色固体),产物不经纯化直接进行下步反应。
第二步
将粗品化合物B(100.0mg,0.5mmol,1.00eq)溶解于0.6mL甲苯中,于氮气保护下加入N,N-二异丙基乙胺(196.3mg,1.5mmol,3.00eq)。混合物在70℃下搅拌30分钟,加入三氯氧磷(232.8mg,1.5mmol,3.00eq),在100℃下回流搅拌2.5小时。反应完成后,溶剂减压旋干,加水(1mL),乙酸乙酯萃取(1mL×3),合并的有机相用饱和氯化钠溶液洗涤(1mL),无水硫酸钠干燥,过滤,滤液减压浓缩,用快速液相色谱系统纯化所得残余物,得到化合物C(37.5mg,白色固体),产率:31.6%。
第三步
冰浴下将化合物C(300.0mg,1.28mmol,1.00eq)溶解于12.8mL二氯甲烷,加入N,N-二异丙基乙胺(165.3mg,1.28mmol,1.00eq),加入1-叔丁氧羰基哌嗪(238.3mg,1.28mmol,1.00eq),在室温下搅拌1小时。反应完成后,溶剂减压旋干,加水(12.8mL),乙酸乙酯萃取(12.8mL×3),合并的有机相用饱和氯化钠溶液洗涤(12.8mL),无水硫酸钠干燥,过滤,滤液减压浓缩,用快速液相色谱系统纯化所得残余物,得到化合物D(362.0mg,淡黄色固体),产率:73.6%。
第四步
将化合物D(50.0mg,0.13mmol,1.00eq)、碳酸钠(41.4mg,0.39mmol)和1-萘硼酸(24.6mg,0.14mmol,1.10eq)溶解于乙腈(0.65mL)和水(0.65mL),氮气鼓泡10分钟,加入四(三苯基磷)钯(7.5mg,0.006mmol,0.05eq),氮气鼓泡5分钟。混合物在80℃下回流搅拌3小时。反应完成后,溶剂减压旋干,加水(1.3mL),乙酸乙酯萃取(1.3mL×3),合并的有机相用饱和氯化钠溶液洗涤(1.3mL),无水硫酸钠干燥,过滤,滤液减压浓缩,用快速液相色谱系统纯化所得残余物,得到化合物E(50.9mg,淡黄色固体),产率:82.2%。
第五步
将化合物E(50.9mg,0.11mmol,1.00eq)溶解于1,4-二氧六环(0.27mL),加入N-甲基-L脯氨醇(61.6mg,0.54mmol,5.00eq)、碳酸铯(69.7mg,0.21mmol,2.00eq),将混合物置于密封管中90℃搅拌24小时。反应完成后,溶剂减压旋干,加水(1.5mL),乙酸乙酯萃取(1.5mL×3),合并的有机相用饱和氯化钠溶液洗涤(1.5mL),无水硫酸钠干燥,过滤,滤液减压浓缩,用快速液相色谱系统纯化所得残余物,得到化合物F(20.3mg,淡黄色固体),产率:34.2%。
第六步
将化合物F(20.3mg,0.036mmol,1.00eq)溶解于二氯甲烷(0.12mL)中,于氮气保护下加入三氟乙酸(125.2mg,1.10mmol,30.00eq),混合物在室温下搅拌1小时。反应完成后,溶剂减压旋干,加入饱和碳酸氢钠溶液(1.5mL),乙酸乙酯萃取(1.5mL×3),合并的有机相用饱和氯化钠溶液洗涤(1.5mL),无水硫酸钠干燥,过滤,滤液减压浓缩,得到化合物G(16.6mg,淡黄色固体),产率:99.9%。
第七步
冰浴下将化合物G(16.6mg,0.036mmol,1.00eq)溶解于二氯甲烷(0.12mL)中,于氮气保护下加入N,N-二异丙基乙胺(18.9mg,0.146mmol,4.00eq)、丙烯酰氯(3.3mg,0.036mmol,1.00eq),混合物在冰浴下反应10分钟。反应完成后,溶剂减压旋干,加入饱和碳酸氢钠溶液(1.5mL),乙酸乙酯萃取(1.5mL×3),合并的有机相用饱和氯化钠溶液洗涤(1.5mL),无水硫酸钠干燥,过滤,滤液减压浓缩,用快速液相色谱系统纯化所得残余物,得到化合物1(8.5mg,淡黄色固体),产率:45.7%。
实施例2
Figure BDA0002886634210000151
化合物1-((S)-3-甲基-4-(7-(萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-4-基)-3-甲基哌嗪-1-基)丙-2-烯-1-酮的合成参考一般反应流程(A)和(B);MS(ESI)m/z 523.28[M+H]+
合成路线和具体方法如下:
Figure BDA0002886634210000152
第一步
将化合物A(100.0mg,0.5mmol,1.00eq)溶解于0.6mL甲苯中,于氮气保护下加入N,N-二异丙基乙胺(196.3mg,1.5mmol,3.00eq)。混合物在70℃下搅拌30分钟,加入三氯氧磷(232.8mg,1.5mmol,3.00eq),在100℃下回流搅拌2.5小时。反应完成后,溶剂减压旋干,加水(1mL),乙酸乙酯萃取(1mL×3),合并的有机相用饱和氯化钠溶液洗涤(1mL),无水硫酸钠干燥,过滤,滤液减压浓缩,用快速液相色谱系统纯化所得残余物,得到化合物B(37.5mg,白色固体),产率:31.6%。
第二步
冰浴下将化合物B(90.6mg,0.39mmol,1.00eq)溶解于3.86mL二氯甲烷,加入N,N-二异丙基乙胺(49.94mg,0.39mmol,1.00eq),加入(S)-4N叔丁氧羰基-2甲基哌嗪(77.39mg,0.39mmol,1.00eq),在室温下搅拌1小时。反应完成后,溶剂减压旋干,加水(10.0mL),乙酸乙酯萃取(10.0mL×3),合并的有机相用饱和氯化钠溶液洗涤(10.0mL),无水硫酸钠干燥,过滤,滤液减压浓缩,用快速液相色谱系统纯化所得残余物,得到化合物D(121.8mg,淡黄色固体),产率:79.1%。
第三步
将化合物D(121.8mg,0.39mmol,1.00eq)、碳酸钠(97.24mg,0.92mmol,3.00eq)和1-萘硼酸(57.9mg,0.34mmol,1.10eq)溶解于乙腈(1.66mL)和水(1.66mL),氮气鼓泡10分钟,加入四(三苯基磷)钯(17.67mg,0.015mmol,0.05eq),氮气鼓泡5分钟。混合物在80℃下回流搅拌3小时。反应完成后,溶剂减压旋干,加水(5mL),乙酸乙酯萃取(5mL×3),合并的有机相用饱和氯化钠溶液洗涤(5mL),无水硫酸钠干燥,过滤,滤液减压浓缩,用快速液相色谱系统纯化所得残余物,得到化合物F(143.3mg,淡黄色固体),产率:95.63%。
第四步
将化合物F(143.3mg,0.29mmol,1.00eq)加入密闭管,溶解于1,4-二氧六环(0.25mL),再加入碳酸铯(190.6mg,0.58mmol,2eq)、N-甲基-L脯氨醇(168.41mg,0.19mL,1.46mmol,5eq),90℃高压反应搅拌24h,反应结束后,冷却到室温,加水(5.0mL),乙酸乙酯萃取(5.0mL×3),合并的有机相用饱和氯化钠溶液洗涤(5.0mL),无水硫酸钠干燥,过滤,滤液减压浓缩,用快速液相色谱系统纯化所得残余物,得到化合物H(57.8mg,浅灰色固体)产率:34.75%。
第五步
将化合物H(57.8mg,0.1mmol,1eq)溶解于二氯甲烷(0.3mL),于氮气保护下加入三氟乙酸(0.23mL,3.05mmol,30eq),室温搅拌1小时,溶剂减压旋干,冰浴下将混合物溶解于二氯甲烷(0.3mL),氮气保护下加入N,N-二异丙基乙胺(0.06mL,0.4mmol,4.00eq),丙烯酰氯的二氯甲烷溶液(8.085mmL,0.1mmol,1.00eq,0.03mL二氯甲烷),在0℃搅拌10分钟,反应结束后用饱和碳酸氢钠(5mL)淬灭,加入乙酸乙酯(5.0mL×3),水(5.0mL)萃取,合并的有机相用饱和氯化钠溶液洗涤(5.0mL),无水硫酸钠干燥,过滤,滤液减压浓缩,用快速液相色谱系统纯化所得残余物,得到化合物2(29.2mg,淡黄色固体),产率55%。
实施例3
Figure BDA0002886634210000161
化合物1-(4-(2-(2-(二甲基氨基)乙氧基)-7-(3-羟基萘-1-基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-4-基)哌嗪-1-基)丙-2-烯-1-酮的合成参考一般反应流程(A)和(B);MS(ESI)m/z499.24[M+H]+
实施例4
Figure BDA0002886634210000162
化合物1-(4-(6-氯-2-(2-(二甲基氨基)乙氧基)-7-(3-羟基萘-1-基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-4-基)哌嗪-1-基)丙-2-烯-1-酮的合成参考一般反应流程(A)和(B);MS(ESI)m/z533.20[M+H]+。
实施例5
Figure BDA0002886634210000171
化合物1-((S)-4-(7-(3-羟基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-4-基)-3-甲基哌嗪-1-基)丙-2-烯-1-酮的合成参考一般反应流程(A)和(B);MS(ESI)m/z 539.27[M+H]+
实施例6
Figure BDA0002886634210000172
化合物1-((S)-4-(7-(3-羟基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-4-基)-2,5-二甲基哌嗪-1-基)丙-2-烯-1-酮的合成参考一般反应流程(A)和(B);MS(ESI)m/z 553.29[M+H]+
实施例7
Figure BDA0002886634210000173
化合物(S)-7-(2,3-二甲基苯)-2-((1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-4-(4-乙烯磺酰基)哌嗪-1-基)吡啶并[2,3-d]嘧啶的合成参考一般反应流程(A)和(B);MS(ESI)m/z523.24[M+H]+
实施例8
Figure BDA0002886634210000174
化合物2-((S)-4-(7-(8-氯萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-吡啶并[2,3-d]嘧啶-4-基)-1-(丙炔酰基)哌嗪-2-基)乙腈的合成参考一般反应流程(A)和(B);MS(ESI)m/z 580.22[M+H]+
实施例9
Figure BDA0002886634210000175
化合物2-((S)-4-(7-(8-氯萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-吡啶并[2,3-d]嘧啶-4-基)-1-(丙烯酰基)哌嗪-2-基)乙腈的合成参考一般反应流程(A)和(B);MS(ESI)m/z 582.23[M+H]+
实施例10
Figure BDA0002886634210000181
化合物2-((S)-4-(7-(8-氯萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-吡啶并[2,3-d]嘧啶-4-基)-1-(2-氟丙烯酰基)哌嗪-2-基)乙腈的合成参考一般反应流程(A)和(B);MS(ESI)m/z 600.22[M+H]+
实施例11
Figure BDA0002886634210000182
化合物2-((S)-4-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-吡啶并[2,3-d]嘧啶-4-基)-1-(丙烯酰基)哌嗪-2-基)乙腈的合成参考一般反应流程(A)和(B);MS(ESI)m/z562.29[M+H]+
实施例12
Figure BDA0002886634210000183
化合物2-((S)-4-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-吡啶并[2,3-d]嘧啶-4-基)-1-(2-氟丙烯酰基)哌嗪-2-基)乙腈的合成参考一般反应流程(A)和(B);MS(ESI)m/z 580.28[M+H]+
实施例13
Figure BDA0002886634210000184
化合物2-((S)-4-(7-(3-羟基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-吡啶并[2,3-d]嘧啶-4-基)-1-(丙烯酰基)哌嗪-2-基)乙腈的合成参考一般反应流程(A)和(B);MS(ESI)m/z 564.27[M+H]+
实施例14
Figure BDA0002886634210000191
化合物2-((S)-4-(7-(3-羟基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-吡啶并[2,3-d]嘧啶-4-基)-1-(2-氟丙烯酰基)哌嗪-2-基)乙腈的合成参考一般反应流程(A)和(B);MS(ESI)m/z 582.26[M+H]+
实施例15
Figure BDA0002886634210000192
化合物2-((S)-4-(7-(3-羟基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基哌啶-2-基)甲氧基)-吡啶并[2,3-d]嘧啶-4-基)-1-(丙烯酰基)哌嗪-2-基)乙腈的合成参考一般反应流程(A)和(B);MS(ESI)m/z 596.27[M+H]+
实施例17
Figure BDA0002886634210000193
化合物2-((S)-4-(7-(3-甲氧基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-吡啶并[2,3-d]嘧啶-4-基)-1-(2-氟丙烯酰基)哌嗪-2-基)乙腈的合成参考一般反应流程(A)和(B);MS(ESI)m/z 596.27[M+H]+
实施例18
Figure BDA0002886634210000194
化合物2-((S)-4-(7-(2,3-二甲基苯)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-吡啶并[2,3-d]嘧啶-4-基)-1-(2-氟丙烯酰基)哌嗪-2-基)乙腈的合成参考一般反应流程(A)和(B);MS(ESI)m/z 544.28[M+H]+
实施例19
Figure BDA0002886634210000201
化合物2-((S)-4-(7-(2-氟-6-羟基苯)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-吡啶并[2,3-d]嘧啶-4-基)-1-(2-氟丙烯酰基)哌嗪-2-基)乙腈的合成参考一般反应流程(A)和(B);MS(ESI)m/z550.23[M+H]+
实施例20
Figure BDA0002886634210000202
化合物2-((S)-4-(7-(8-氯萘-1-基)-2-(((R)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-吡啶并[2,3-d]嘧啶-4-基)-1-(2-氟丙烯酰基)哌嗪-2-基)乙腈的合成参考一般反应流程(A)和(B);MS(ESI)m/z 600.22[M+H]+
实施例21
Figure BDA0002886634210000203
化合物2-((S)-4-(7-(5,6-二甲基1H-吲哚-4-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-吡啶并[2,3-d]嘧啶-4-基)-1-(2-氟丙烯酰基)哌嗪-2-基)乙腈的合成参考一般反应流程(A)和(B);MS(ESI)m/z 583.29[M+H]+
实施例22
Figure BDA0002886634210000204
化合物2-((S)-4-(7-(5,6-二甲基1H-吲哚-4-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-吡啶并[2,3-d]嘧啶-4-基)-1-(丙烯酰基)哌嗪-2-基)乙腈的合成参考一般反应流程(A)和(B);MS(ESI)m/z 565.30[M+H]+
实施例23
Figure BDA0002886634210000211
化合物2-((S)-4-(7-(5,6-二甲基1H-吲唑-4-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-吡啶并[2,3-d]嘧啶-4-基)-1-(丙烯酰基)哌嗪-2-基)乙腈的合成参考一般反应流程(A)和(B);MS(ESI)m/z 566.29[M+H]+
实施例24
Figure BDA0002886634210000212
化合物2-((S)-4-(7-(5,6-二甲基1H-吲唑-4-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-吡啶并[2,3-d]嘧啶-4-基)-1-(2-氟丙烯酰基)哌嗪-2-基)乙腈的合成参考一般反应流程(A)和(B);MS(ESI)m/z 584.29[M+H]+
实施例25
Figure BDA0002886634210000213
化合物2-((S)-4-(7-(5-甲基1H-吲唑-4-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-吡啶并[2,3-d]嘧啶-4-基)-1-(2-氟丙烯酰基)哌嗪-2-基)乙腈的合成参考一般反应流程(A)和(B);MS(ESI)m/z 570.27[M+H]+
实施例26
Figure BDA0002886634210000214
化合物2-((S)-4-(7-(5-甲基1H-吲唑-4-基)-2-(((S)4,4-二氟-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-吡啶并[2,3-d]嘧啶-4-基)-1-(2-氟丙烯酰基)哌嗪-2-基)乙腈的合成参考一般反应流程(A)和(B);MS(ESI)m/z 606.25[M+H]。
实施例27
Figure BDA0002886634210000221
化合物2-((S)-4-(7-(8-氯萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-3-基)甲氧基)-吡啶并[2,3-d]嘧啶-4-基)-1-(2-氟丙烯酰基)哌嗪-2-基)乙腈的合成参考一般反应流程(A)和(B);MS(ESI)m/z 600.22[M+H]+
实施例28
Figure BDA0002886634210000222
化合物2-((S)-1-(2-氟丙烯酰基)-4-(7-(2-甲基-3-甲氧基苯基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-吡啶并[2,3-d]嘧啶-4-基)哌嗪-2-基)乙腈的合成参考一般反应流程(A)和(B);MS(ESI)m/z 560.27[M+H]+
实施例29
Figure BDA0002886634210000223
化合物2-((S)-4-(7-(8-氯萘-1-基)-2-(((2S,4R)-4-氟-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-4-基)-1-(2-氟丙烯酰基)哌嗪-2-基)乙腈的合成参考一般反应流程(A)和(B);MS(ESI)m/z 618.22[M+H]+
实施例30
Figure BDA0002886634210000224
化合物2-((S)-4-(7-(5-氯异喹啉-4-基)-2-(((2S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-4-基)-1-(2-氟丙烯酰基)哌嗪-2-基)乙腈的合成参考一般反应流程(A)和(B);MS(ESI)m/z 601.22[M+H]+
实施例31
Figure BDA0002886634210000231
化合物1-(4-(6-氯-7-(5-氯-6-氟1H-吲唑-4-基)-2-(((3R,4R)-4-甲氧基-1-甲基吡咯烷-3-基)甲氧基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-4-基)哌嗪-1-基)丙-2-烯-1-酮的合成参考一般反应流程(A)和(B);MS(ESI)m/z 615.18[M+H]+
实施例32
Figure BDA0002886634210000232
化合物1-(4-(6-氯-7-(5-氯-6-氟1H-吲唑-4-基)-2-(((3R,4R)-4-甲氧基-1-甲基吡咯烷-3-基)甲氧基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-4-基)哌嗪-1-基)-2-氟丙-2-烯-1-酮的合成参考一般反应流程(A)和(B);MS(ESI)m/z 633.17[M+H]+
实施例35
Figure BDA0002886634210000233
化合物1-(4-(6-氯-7-(5-氯-6-氟1H-吲唑-4-基)-2-(((3R,4R)-4-乙氧基-1-甲基吡咯烷-3-基)氧基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-4-基)哌嗪-1-基)丙-2-烯-1-酮的合成参考一般反应流程(A)和(B);MS(ESI)m/z 615.18[M+H]+
实施例36
Figure BDA0002886634210000234
化合物1-(4-(6-氯-7-(5-氯-6-氟1H-吲唑-4-基)-2-(((3S,4R)-4-乙基-1-甲基吡咯烷-3-基)氧基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-4-基)哌嗪-1-基)丙-2-烯-1-酮的合成参考一般反应流程(A)和(B);MS(ESI)m/z 599.18[M+H]+
实施例37
Figure BDA0002886634210000241
化合物1-(4-(6-氯-7-(5,6-二氯-1H-吲唑-4-基)-2-(((3R,4R)-4-甲氧基-1-甲基吡咯烷-3-基)氧基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-4-基)哌嗪-1-基)丙-2-烯-1-酮的合成参考一般反应流程(A)和(B);MS(ESI)m/z 617.92[M+H]+
实施例38
Figure BDA0002886634210000242
化合物1-(4-(6-氯-7-(5-氯-6-氟1H-吲唑-4-基)-2-(((3S,4R)-1,4-二甲基吡咯烷-3-基)氧基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-4-基)哌嗪-1-基)丙-2-烯-1-酮的合成参考一般反应流程(A)和(B);MS(ESI)m/z 585.17[M+H]+
实施例39
Figure BDA0002886634210000243
化合物1-(4-(6-氯-7-(5-甲基-1H-吲唑-4-基)-2-(((3R,4R)-4-甲氧基-1-甲基吡咯烷-3-基)氧基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-4-基)哌嗪-1-基)丙-2-烯-1-酮的合成参考一般反应流程(A)和(B);MS(ESI)m/z 563.22[M+H]+
实施例40
Figure BDA0002886634210000244
化合物1-(4-(6-氯-7-(5-氯-1H-吲唑-4-基)-2-(((3R,4R)-4-甲氧基-1-甲基吡咯烷-3-基)氧基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-4-基)哌嗪-1-基)丙-2-烯-1-酮的合成参考一般反应流程(A)和(B);MS(ESI)m/z 583.47[M+H]+
实施例41
Figure BDA0002886634210000251
化合物1-(4-(6-氯-7-(5-氯-6-氟1H-吲唑-4-基)-2-(((3R,4R)-4-甲氧基-丙-2-炔-1-基)吡咯烷-3-基)氧基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-4-基)哌嗪-1-基)丙-2-烯-1-酮的合成参考一般反应流程(A)和(B);MS(ESI)m/z 625.49[M+H]+
实施例42
Figure BDA0002886634210000252
化合物1-(4-(7-(5-氯-6-氟1H-吲唑-4-基)-2-(((3R,4R)-1-乙基-4-甲氧基吡咯烷-3-基)氧基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-4-基)哌嗪-1-基)丙-2-烯-1-酮的合成参考一般反应流程(A)和(B);MS(ESI)m/z 581.05[M+H]+
实施例43
Figure BDA0002886634210000253
化合物1-(4-(7-(5-氯-6-氟1H-吲唑-4-基)-2-(((3R,4R)-1-乙基-4-甲氧基吡咯烷-3-基)氧基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-4-基)哌嗪-1-基)-2-氟丙-2-烯-1-酮的合成参考一般反应流程(A)和(B);MS(ESI)m/z 599.04[M+H]+
实施例44
Figure BDA0002886634210000254
化合物1-(4-(7-(5,6-二氯-1H-吲唑-4-基)-2-(((3R,4R)-1-甲基-4-甲氧基吡咯烷-3-基)氧基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-4-基)哌嗪-1-基)丙-2-烯-1-酮的合成参考一般反应流程(A)和(B);MS(ESI)m/z 583.17[M+H]+
实施例45
Figure BDA0002886634210000261
化合物1-(4-(7-(5,6-二氯-1H-吲唑-4-基)-2-(((3R,4R)-1-甲基-4-甲氧基吡咯烷-3-基)氧基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-4-基)哌嗪-1-基)-2-氟丙-2-烯-1-酮的合成参考一般反应流程(A)和(B);MS(ESI)m/z 601.46[M+H]+
实施例46
Figure BDA0002886634210000262
化合物1-(4-(7-(5-氯-6-氟-1H-吲唑-4-基)-2-(((3R,4R)-1-甲基-4-甲氧基吡咯烷-3-基)氧基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-4-基)哌嗪-1-基)丙-2-烯-1-酮的合成参考一般反应流程(A)和(B);MS(ESI)m/z 567.20[M+H]+
实施例47
Figure BDA0002886634210000263
化合物1-(4-(7-(5-氯-6-氟-1H-吲唑-4-基)-2-(((3R,4R)-1-甲基-4-甲氧基吡咯烷-3-基)氧基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-4-基)哌嗪-1-基)-2-氟丙-2-烯-1-酮的合成参考一般反应流程(A)和(B);MS(ESI)m/z 585.01[M+H]+
实施例48
Figure BDA0002886634210000264
化合物1-(4-(7-(5-氯-6-氟-1H-吲唑-4-基)-2-(((3R,4R)-1-异丙基-4-甲氧基吡咯烷-3-基)氧基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-4-基)哌嗪-1-基)丙-2-烯-1-酮的合成参考一般反应流程(A)和(B);MS(ESI)m/z 595.08[M+H]+
实施例49
Figure BDA0002886634210000271
化合物1-(4-(7-(5-氯-6-氟-1H-吲唑-4-基)-2-(((3R,4R)-1-异丙基-4-甲氧基吡咯烷-3-基)氧基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-4-基)哌嗪-1-基)-2-氟丙-2-烯-1-酮的合成参考一般反应流程(A)和(B);MS(ESI)m/z 613.07[M+H]+
实施例50
Figure BDA0002886634210000272
化合物1-(4-(7-(5-氯-6-氟-1H-吲唑-4-基)-2-((2-甲基-1,2,3,4-四氢异喹啉-5-基)氧基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-4-基)哌嗪-1-基)丙-2-烯-1-酮的合成参考一般反应流程(A)和(B);MS(ESI)m/z 599.20[M+H]+
实施例51
Figure BDA0002886634210000273
化合物1-(4-(7-(5-氯-6-氟-1H-吲唑-4-基)-2-(((3R,4R)-1-甲基-4-甲氧基吡咯烷-3-基)氧基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-4-基)-3-甲基哌嗪-1-基)丙-2-烯-1-酮的合成参考一般反应流程(A)和(B);MS(ESI)m/z 581.05[M+H]+
实施例52
Figure BDA0002886634210000274
化合物1-(4-(7-(5-氯-6-氟-1H-吲唑-4-基)-2-(((3R,4R)-1-甲基-4-甲氧基吡咯烷-3-基)氧基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-4-基)-3-甲基哌嗪-1-基)-2-氟丙-2-烯-1-酮的合成参考一般反应流程(A)和(B);MS(ESI)m/z 599.04[M+H]+
实施例53
Figure BDA0002886634210000281
化合物1-(4-(7-(5-甲基-6-氯-1H-吲唑-4-基)-2-(((3R,4R)-1-甲基-4-甲氧基吡咯烷-3-基)氧基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-4-基)哌嗪-1-基)丙-2-烯-1-酮的合成参考一般反应流程(A)和(B);MS(ESI)m/z 563.06[M+H]+
实施例54
Figure BDA0002886634210000282
化合物1-(4-(7-(5-甲基-6-氯-1H-吲唑-4-基)-2-(((3R,4R)-1-甲基-4-甲氧基吡咯烷-3-基)氧基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-4-基)哌嗪-1-基)-2-氟丙-2-烯-1-酮的合成参考一般反应流程(A)和(B);MS(ESI)m/z 581.05[M+H]+
实施例55
Figure BDA0002886634210000283
化合物1-(4-(7-(5-氯-6-氟-1H-吲唑-4-基)-2-((2-甲基异吲哚啉-4-基)氧基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-4-基)哌嗪-1-基)-2-氟丙-2-烯-1-酮的合成参考一般反应流程(A)和(B);MS(ESI)m/z 603.03[M+H]+
实施例56
Figure BDA0002886634210000284
化合物1-(4-(7-(5-氯-1H-吲唑-4-基)-2-((2-甲基-1,2,3,4-四氢异喹啉-5-基)氧基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-4-基)哌嗪-1-基)丙-2-烯-1-酮的合成参考一般反应流程(A)和(B);MS(ESI)m/z 599.07[M+H]+
实施例57
Figure BDA0002886634210000291
化合物1-(4-(2-(((3R,4R)-1-(叔丁基)-4-甲氧基吡咯烷-3-基)氧基)-7-(5-氯-6-氟-1H-吲唑-4-基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-4-基)哌嗪-1-基)丙-2-烯-1-酮的合成参考一般反应流程(A)和(B);MS(ESI)m/z 609.25[M+H]+
实施例58
Figure BDA0002886634210000292
化合物1-(4-(7-(5-氯-6-氟-1H-吲唑-4-基)-2-(((3R,4R)-4-(二氟甲基)-1-甲基吡咯烷-3-基)氧基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-4-基)哌嗪-1-基)丙-2-烯-1-酮的合成参考一般反应流程(A)和(B);MS(ESI)m/z 587.19[M+H]+
实施例59
Figure BDA0002886634210000293
化合物2-((S)-4-(7-(3-甲氧基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-吡啶并[2,3-d]嘧啶-4-基)-1-(丙烯酰基)哌嗪-2-基)乙腈,其合成在一般反应流程(A)和(B);MS M/Z 677.69。
实施例60
Figure BDA0002886634210000294
化合物2-(((S)-1-(2-氟丙烯酰基)-4-(7-(2-甲基-1,2,3,4-四氢异喹啉-8-基)-2-(1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-4-基)哌嗪-2-基)乙腈,其合成参考一般反应流程(A)和(B);MS M/Z 584.70。
实验例1
本实验目的是验证本发明化合物与人非小细胞肺癌NCI-H358细胞(KRAS G12C突变)、人非小细胞肺癌A549细胞(KRAS G12S突变)和非小细胞肺癌HCC827细胞(KRAS野生型)的KRAS G12C突变蛋白的共价结合活性。
肿瘤细胞株:三种人非小细胞肺癌细胞株:NCI-H358细胞(KRAS G12C突变)、A549细胞(KRAS G12S突变)和HCC827细胞(KRAS野生型)。
主要试剂和仪器:RPMI1640培养基、DMEM细胞培养基、胎牛血清、0.25%胰蛋白酶-0.53mM EDTA消化液、DMSO、青霉素-链霉素、KRAS抗体(Sigma),二抗为Anti-rabbit IgG-HRP、Cell Titer-Gio检测试剂盒。Promega微孔板检测仪、细胞培养瓶、细胞培养微孔板(96或384孔)、CO2恒温培养箱,FluorChemR检测仪(ProteinSimple)。
实验方法:
本发明采用了凝胶迁移分析法(gel mobility shift assay)测定化合物与细胞KRAS G12C突变蛋白形成的共价结合复合物特有的电泳迁移改变;其原理是基于化合物和K-RAS G12C突变蛋白结合形成的共价复合物的分子量增大,与游离的KRAS G12C突变蛋白相比,在电泳时出现相应的电泳带滞后。再用FluorChemR检测仪定量扫描电泳带,计算化合物-G12C突变蛋白的复合物与未结合化合物的G12C突变蛋白的电泳迁移比值,快速和直接测定本发明化合物与KRAS G12C突变蛋白的共价键结合特征;化合物与KRAS G12C突变蛋白结合结合越多,其计算的比值就也大。
将液氮冻存的肿瘤细胞复苏,用含10%胎牛血清,10%青霉素-链霉素的细胞培养液培养细胞,待细胞生长至指数增长期,消化离心收集细胞重悬于培养液中;按每孔5000-10000个细胞数接种细胞,置于恒温37℃、5%CO2、饱和湿度的二氧化碳培养箱中培养。
化合物以不同浓度和不同的时间处理细胞后,用磷酸盐缓冲液(PBS)洗涤细胞,然后在RIPA缓冲液(50mm Tris,pH7.5,150mm NaCl,1%NP-40,0.5%脱氧胆酸钠,0.1%SDS,含蛋白酶和磷酸酶抑制剂)中裂解细胞,提取细胞总蛋白,用BCA蛋白检测试剂盒测定蛋白质浓度;取等量蛋白质进行SDS-PAGE电泳,电泳结束后,将电泳凝胶转移至硝化纤维素膜上;转膜后在TBS-0.1%吐温-20中用5%脱脂牛奶阻断膜,然后加入一抗,并在4℃轻微震摇,孵育过夜。过夜孵育后的膜经洗涤后,在室温下与荧光结合的二抗孵育1小时,用FluorChemR检测仪(ProteinSimple)扫描电泳带。
实验结果
在凝胶迁移率分析中,本发明中的大部分化合物能选择性地与含有KRAS G12C突变的人非小细胞肺癌NCI-H358细胞中的KRAS G12C突变蛋白结合,形成的化合物-突变蛋白复合物出现凝胶迁移率阻滞,但化合物不能与KRAS G12S突变的非小细胞肺癌A549细胞的KRAS G12S突变蛋白结合,也不能和含有野生型KRAS的非小细胞肺癌HCC827细胞的野生型KRAS蛋白结合,不出现凝胶迁移率阻滞现象(表1)。实验结果表示如下:“A”≤25%比值;25%<“B”≤50%;“C”≥50%。
表1本发明实例化合物对KRAS G12C活性的抑制作用
Figure BDA0002886634210000301
Figure BDA0002886634210000311
Figure BDA0002886634210000321
实验例2
本实验目的是验证本发明化合物对人非小细胞肺癌NCI-H358细胞(KRAS G12C突变)、人非小细胞肺癌A549细胞(KRAS G12S突变)和非小细胞肺癌HCC827细胞(KRAS野生型)的抗增殖作用。
肿瘤细胞株:三种人非小细胞肺癌细胞株:NCI-H358细胞(KRAS G12C突变)、A549细胞(KRAS G12S突变)和HCC827细胞(KRAS野生型)。
主要试剂和仪器:RPMI1640培养基、DMEM细胞培养基、胎牛血清、0.25%胰蛋白酶-0.53mM EDTA消化液、DMSO、青霉素-链霉素、Cell Titer-Gio检测试剂盒。Promega微孔板检测仪、细胞培养瓶、细胞培养微孔板(96或384孔)、CO2恒温培养箱。
实验方法:
将液氮冻存的肿瘤细胞复苏,用含10%胎牛血清,10%青霉素-链霉素的细胞培养液培养细胞,待细胞生长至指数增长期,消化离心收集细胞重悬于培养液中;按每孔5000-10000个细胞数接种细胞,置于恒温37℃、5%CO2、饱和湿度二氧化碳培养箱中过夜培养。
药物作用72h后,从37℃孵箱中取出96孔板室温下放置30min以进行CTG检测,实验过程中不要晃动板。加入100μl CTG试剂,混匀2min,然后再室温下孵育10min,GloMax 96微孔板发光仪检测记录发光值(CellTiter-Glo Luminescent Cell Viability Assay,Promega),观察细胞活力。
将本发明的每个待测化合物稀释成10个浓度梯度,分别加入细胞板的相应孔中,然后将细胞板放回二氧化碳培养箱中继续培养72小时。培养结束后,向细胞板中每孔加入Promega CellTiter-Glo试剂,室温下孵育10min,采用Promega微孔板检测仪检测发光信号,并计算IC50值。本发明化合物抗增殖活性的结果以A、B、ND表示:0.001μM≤“A”≤1μM;“B”>1μM;ND=未测定。
实验结果:
本发明化合物对KRAS G12C突变的人非小细胞肺癌NCL-H358细胞显示出较高的抗增殖活性抑制活性,但对KRAS G12S突变的人非小细胞肺癌A549细胞以及KRAS野生型HCC827细胞显示出较弱的抗增殖活性(表2)。抗增殖实验结果与上述凝胶迁移率分析法得出的结果一致,表明了本发明化合物对KRAS G12C突变肿瘤细胞作用的高选择性。
表2典型化合物对KRAS-G12C介导的细胞增殖的抑制作用
Figure BDA0002886634210000322
Figure BDA0002886634210000331

Claims (9)

1.通式(I)所示化合物、其异构体、其药学上可接受的盐或其氘代物:
Figure FDA0002886634200000011
其中,
X选自含有1或2个N原子的4-8元饱和或部分饱和的单环,或者含有1或2个N原子的6-12元饱和或部分饱和的双环、桥环、融合环、螺环的杂环烷基,可任选被1、2或3个相同或不同的R6取代;
R1、R2选自H、卤素、NH2、OH、C1-3烷基和C1-3杂烷基,所述的取代基可任选1个或多个取代;
R3选自4-6元单环或6-12元双环的芳基、杂芳基,环烷基、杂环烷基,所述的芳基、杂芳基,环烷基、杂环烷基可被1、2或3个相同或不同的R7取代;
R4选自H、烷基、氨基烷基、烷基氨基烷基、卤代烷基、羟基烷基、二羟基烷基、-A-NR8R9、4-6元杂环基、4-6元杂环基烷基、5-6元芳基、5-6元杂芳基或杂芳基烷基,其中,A、杂环基、杂环基烷基、芳基、杂芳基或杂芳基烷基可任选被1个或多个相同或不同的R10取代;
A选自C1-4亚烷基;
L是键或-NH-;
R5选自
Figure FDA0002886634200000012
R6选自腈基、C1-3烷基、氨基、卤素,羟基;
R7选自卤素、氨基、羟基、C1-3烷基或卤素取代的C1-3烷基;
R8选自H、或C1-3烷基
R9选自H、C1-3烷基、杂烷基、羟基烷基、酰基;
R10选自H、羟基、卤素、
Z选自键、氧(O)、硫(S)、NR11
R11选自H、或C1-3亚烷基;
R12选自卤素、CF3、羟基烷基;
R13选自H、C1-3烷基、烷基氨基烷基、烷基氨基烷基、杂环基氨基烷基、卤素、酰胺基、腈基、羟基烷基、CF3、CF2、甲氧基、三氟甲基氨基、烯烃;
R14选自H、烷基、羟基烷基;
R15为不存在、H或C1-3烷基。
2.根据权利要求1所述化合物、其异构体、其药学上可接受的盐或其氘代物的异构体、药学上可接受的盐或氘代物。
3.根据权利要求1或2所述的化合物,结构单元
Figure FDA0002886634200000021
选自:
Figure FDA0002886634200000022
4.根据权利要求1、2或3所述的化合物,结构单元
Figure FDA0002886634200000023
中的R5选自:
Figure FDA0002886634200000024
5.根据权利要求1~4任意一项所述的化合物,R3选自:
Figure FDA0002886634200000025
Figure FDA0002886634200000031
6.根据权利要求1~5任意一项所述的化合物,R4选自:
Figure FDA0002886634200000032
Figure FDA0002886634200000041
7.根据权利要求1~6任意一项所述的化合物,选自:
Figure FDA0002886634200000042
Figure FDA0002886634200000051
Figure FDA0002886634200000061
Figure FDA0002886634200000071
Figure FDA0002886634200000081
Figure FDA0002886634200000091
8.权利要求1~7任意一项所述的化合物、其异构体、其药学上可接受的盐或其氘代物在制备治疗癌症药物中的应用。
9.根据权利要求8所述的应用,所述的癌症选自:肺癌、胰腺癌、直/结肠癌、胆管癌、小肠癌、子宫内膜癌、胃癌、卵巢癌、前列腺癌、子宫颈癌、肝癌、腹膜癌、软组织癌、白血病、淋巴瘤、乳腺癌、尿路上皮癌、睾丸癌、皮肤癌、食道癌、甲状腺癌、食管癌、骨癌和眼癌。
CN202110015508.9A 2020-01-07 2021-01-07 吡啶并嘧啶类kras g12c突变蛋白抑制剂 Active CN112876471B (zh)

Applications Claiming Priority (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CN2020100197848 2020-01-07
CN202010019784 2020-01-07

Publications (2)

Publication Number Publication Date
CN112876471A true CN112876471A (zh) 2021-06-01
CN112876471B CN112876471B (zh) 2022-12-23

Family

ID=76046948

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CN202110015508.9A Active CN112876471B (zh) 2020-01-07 2021-01-07 吡啶并嘧啶类kras g12c突变蛋白抑制剂

Country Status (2)

Country Link
CN (1) CN112876471B (zh)
WO (1) WO2021139678A1 (zh)

Cited By (7)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2021244603A1 (en) * 2020-06-04 2021-12-09 Shanghai Antengene Corporation Limited Inhibitors of kras g12c protein and uses thereof
WO2022135470A1 (zh) * 2020-12-22 2022-06-30 上海科州药物研发有限公司 作为kras抑制剂的杂环化合物的制备及其应用方法
WO2022193871A1 (zh) * 2021-03-15 2022-09-22 药雅科技(上海)有限公司 Krasg12d突变蛋白抑制剂的制备及其应用
CN115135650A (zh) * 2020-02-20 2022-09-30 贝达医药公司 作为kras抑制剂的吡啶并嘧啶衍生物
WO2022247760A1 (zh) * 2021-05-22 2022-12-01 上海科州药物研发有限公司 作为kras抑制剂的杂环化合物,及其制备和治疗用途
CN115703775A (zh) * 2021-08-06 2023-02-17 苏州阿尔脉生物科技有限公司 一种kras突变体g12c抑制剂及其制备方法和应用
CN116120315A (zh) * 2023-04-19 2023-05-16 山东绿叶制药有限公司 一种kras g12c抑制剂及其应用

Families Citing this family (18)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2019217307A1 (en) 2018-05-07 2019-11-14 Mirati Therapeutics, Inc. Kras g12c inhibitors
JP2022517222A (ja) 2019-01-10 2022-03-07 ミラティ セラピューティクス, インコーポレイテッド Kras g12c阻害剤
JP2022546043A (ja) 2019-08-29 2022-11-02 ミラティ セラピューティクス, インコーポレイテッド Kras g12d阻害剤
KR20220091480A (ko) 2019-09-24 2022-06-30 미라티 테라퓨틱스, 인크. 병용 요법
BR112022012106A2 (pt) 2019-12-20 2022-09-20 Mirati Therapeutics Inc Inibidores de sos1
AU2021344830A1 (en) 2020-09-03 2023-04-06 Revolution Medicines, Inc. Use of SOS1 inhibitors to treat malignancies with SHP2 mutations
EP4214209A1 (en) 2020-09-15 2023-07-26 Revolution Medicines, Inc. Indole derivatives as ras inhibitors in the treatment of cancer
TW202246261A (zh) * 2021-02-11 2022-12-01 大陸商晶銳醫藥(蘇州)有限公司 作為抗癌劑的化合物
TWI814234B (zh) * 2021-03-15 2023-09-01 大陸商藥雅科技(上海)有限公司 突變蛋白抑制劑的製備及其應用
PE20240089A1 (es) 2021-05-05 2024-01-16 Revolution Medicines Inc Inhibidores de ras para el tratamiento del cancer
IL308193A (en) 2021-05-05 2024-01-01 Revolution Medicines Inc RAS inhibitors
WO2022266206A1 (en) 2021-06-16 2022-12-22 Erasca, Inc. Kras inhibitor conjugates
AR127308A1 (es) 2021-10-08 2024-01-10 Revolution Medicines Inc Inhibidores ras
WO2023114954A1 (en) 2021-12-17 2023-06-22 Genzyme Corporation Pyrazolopyrazine compounds as shp2 inhibitors
EP4227307A1 (en) 2022-02-11 2023-08-16 Genzyme Corporation Pyrazolopyrazine compounds as shp2 inhibitors
WO2023172940A1 (en) 2022-03-08 2023-09-14 Revolution Medicines, Inc. Methods for treating immune refractory lung cancer
WO2023240263A1 (en) 2022-06-10 2023-12-14 Revolution Medicines, Inc. Macrocyclic ras inhibitors
WO2024081674A1 (en) 2022-10-11 2024-04-18 Aadi Bioscience, Inc. Combination therapies for the treatment of cancer

Citations (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2019213516A1 (en) * 2018-05-04 2019-11-07 Amgen Inc. Kras g12c inhibitors and methods of using the same
WO2020177629A1 (zh) * 2019-03-01 2020-09-10 劲方医药科技(上海)有限公司 螺环取代的嘧啶并环类化合物,其制法与医药上的用途
WO2020239077A1 (zh) * 2019-05-29 2020-12-03 上海翰森生物医药科技有限公司 含氮杂环类衍生物调节剂、其制备方法和应用
CN112851663A (zh) * 2019-11-12 2021-05-28 博瑞生物医药(苏州)股份有限公司 一种并杂环化合物及其用途

Family Cites Families (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JOP20190272A1 (ar) * 2017-05-22 2019-11-21 Amgen Inc مثبطات kras g12c وطرق لاستخدامها

Patent Citations (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2019213516A1 (en) * 2018-05-04 2019-11-07 Amgen Inc. Kras g12c inhibitors and methods of using the same
WO2020177629A1 (zh) * 2019-03-01 2020-09-10 劲方医药科技(上海)有限公司 螺环取代的嘧啶并环类化合物,其制法与医药上的用途
WO2020239077A1 (zh) * 2019-05-29 2020-12-03 上海翰森生物医药科技有限公司 含氮杂环类衍生物调节剂、其制备方法和应用
CN112851663A (zh) * 2019-11-12 2021-05-28 博瑞生物医药(苏州)股份有限公司 一种并杂环化合物及其用途

Cited By (8)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN115135650A (zh) * 2020-02-20 2022-09-30 贝达医药公司 作为kras抑制剂的吡啶并嘧啶衍生物
WO2021244603A1 (en) * 2020-06-04 2021-12-09 Shanghai Antengene Corporation Limited Inhibitors of kras g12c protein and uses thereof
WO2022135470A1 (zh) * 2020-12-22 2022-06-30 上海科州药物研发有限公司 作为kras抑制剂的杂环化合物的制备及其应用方法
WO2022193871A1 (zh) * 2021-03-15 2022-09-22 药雅科技(上海)有限公司 Krasg12d突变蛋白抑制剂的制备及其应用
WO2022247760A1 (zh) * 2021-05-22 2022-12-01 上海科州药物研发有限公司 作为kras抑制剂的杂环化合物,及其制备和治疗用途
CN115703775A (zh) * 2021-08-06 2023-02-17 苏州阿尔脉生物科技有限公司 一种kras突变体g12c抑制剂及其制备方法和应用
CN116120315A (zh) * 2023-04-19 2023-05-16 山东绿叶制药有限公司 一种kras g12c抑制剂及其应用
CN116120315B (zh) * 2023-04-19 2023-06-09 山东绿叶制药有限公司 一种kras g12c抑制剂及其应用

Also Published As

Publication number Publication date
CN112876471B (zh) 2022-12-23
WO2021139678A1 (zh) 2021-07-15

Similar Documents

Publication Publication Date Title
CN112876471B (zh) 吡啶并嘧啶类kras g12c突变蛋白抑制剂
AU2002360314B2 (en) Treatment of acute myeloid leukemia with indolinone compounds
JP7162915B2 (ja) 置換ピラゾロ[1,5-a]ピリミジン系大環状化合物
CN112839944B (zh) 用于治疗狂犬病的化合物及其方法
JP2021517555A (ja) フェニル−2−ヒドロキシ−アセチルアミノ−2−メチル−フェニル化合物
CN113683616A (zh) Kras g12c突变蛋白抑制剂
CN102300845A (zh) 用于治疗癌症的新型邻氨基酰胺类
WO2020259573A1 (zh) 作为kras g12c突变蛋白抑制剂的七元杂环类衍生物
CN113735828B (zh) 一种靶向降解egfr的化合物及其制备方法和应用
KR20210125024A (ko) Parp 억제제로서의 인돌로 헵타밀 옥심 유사체
CN109384774B (zh) 一类多取代的吡嗪/三嗪酰胺类化合物及其制备方法和应用
JP2022547200A (ja) 三環系構造を有する芳香複素環式化合物、およびその調製方法と適用
CN106032359B (zh) 吲唑类化合物及其制备方法和用途
CN113979999B (zh) 靶向泛素化降解bcr-abl激酶的化合物及其制备方法、组合物和用途
CN113527300B (zh) 布鲁顿酪氨酸蛋白激酶抑制剂
CN109608435B (zh) 喹啉取代吲哚类化合物、其制备方法及用途
CN109384784A (zh) 磺酰胺类衍生物、其制备方法及其在医药上的用途
CN111875583A (zh) 三氮唑衍生物及其制备方法和用途
WO2014086102A1 (zh) 作为酪氨酸激酶抑制剂的吲哚满酮衍生物
CN109384785A (zh) 吡咯并吡啶酮类衍生物、其制备方法及其在医药上的用途
CN113072550A (zh) 一种高选择性成纤维细胞生长因子受体抑制剂和应用
CN114276328B (zh) 作为小分子免疫抑制剂的化合物、其制备方法及其应用
CN109422739B (zh) 氘代的吲哚胺2,3-双加氧酶抑制剂及其应用
CN112004809A (zh) 作为抗肿瘤药物的5-氯-2,4-嘧啶衍生物
CN115073427B (zh) 吲哚联氮杂环化合物及其合成方法和应用

Legal Events

Date Code Title Description
PB01 Publication
PB01 Publication
SE01 Entry into force of request for substantive examination
SE01 Entry into force of request for substantive examination
GR01 Patent grant
GR01 Patent grant