CN112680445A - 一种靶向敲减Atf6α基因表达的shRNA、重组载体及其应用 - Google Patents
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Abstract
本发明提供了一种靶向敲减小鼠肝脏Atf6α基因表达的重组8型腺相关病毒(rAAV8)‑Atf6α shRNA构建及其应用,属于肝脏疾病治疗研究技术领域,本发明中,所述shRNA靶向的核苷酸序列如SEQ ID No.1所示,所述shRNA的核苷酸序列如SEQ ID No.2所示;所述靶向敲减小鼠肝脏Atf6α基因表达的重组载体,包括骨架载体pAAV8和所述shRNA。本发明所述靶向敲减Atf6α基因表达的shRNA能够敲减Atf6α基因表达,能够应用于肝内内质网应激相关的小鼠模型研究中,有利于进一步了解Atf6α基因表达在肝损伤中的作用;从而为临床防治肝脏疾病提供新思路和靶点。
Description
技术领域
本发明属于肝脏疾病治疗研究技术领域,尤其涉及一种靶向敲减Atf6α基因表达的shRNA、重组载体及其应用。
背景技术
肝脏作为人体重要的解毒与消化器官,易暴露于损伤因素中。因其含有丰富的内质网(ER),在受到刺激时易产生内质网应激(ERS)来促进细胞内环境恢复平衡。ERS被认为参与急性和慢性肝病的发病机制,如各种肝炎、脂肪变性、胆汁淤积、纤维化和肝细胞癌。ERS可通过影响细胞凋亡及程序性坏死与肝损伤密切相关。
研究表明,ATF6α是内质网应激感受器蛋白,在维持细胞内环境稳态中起着关键作用。调节Atf6α基因表达有利于研究ATF6α信号在肝损伤中的作用。
发明内容
有鉴于此,本发明的目的在于提供一种靶向敲减Atf6α基因表达的shRNA、重组载体及其应用;本发明提供的shRNA、重组载体能够敲减Atf6α基因的表达,适用于肝内内质网应激相关的小鼠模型研究中,利于进一步了解Atf6α基因表达在肝损伤中的作用;从而为临床防治肝脏疾病提供新思路和靶点。
为了实现上述发明目的,本发明提供了以下技术方案:
本发明提供了一种靶向敲减Atf6α基因表达的shRNA,所述shRNA靶向的核苷酸序列如SEQ ID No.1所示,具体如下5’-GCAGTCGATTATCAGCATACA-3’。
优选的,所述shRNA的核苷酸序列如SEQ ID No.2所示,具体如下:5’-TGTATGCTGATAATCGACTGC-3’。
本发明提供了一种靶向敲减Atf6α基因表达的重组载体,包括骨架载体pAAV8和所述的shRNA。
本发明提供了所述的shRNA、所述的重组载体在制备肝损伤的小鼠模型中的应用。
优选的,所述肝损伤包括由肝内内质网应激相关的肝损伤。
优选的,将所述靶向敲减Atf6α基因表达的重组载体导入小鼠体内。
优选的,所述靶向敲减Atf6α基因表达的重组载体共导入2次,间隔时间为40~60h。
优选的,所述靶向敲减Atf6α基因表达的重组载体每次导入的量为(0.5~1.5)×1010vg/只。
本发明的有益效果:本发明提供的靶向敲减Atf6α基因表达的shRNA以及重组载体,能够应用于肝损伤模型小鼠的肝内内质网应激相关研究中,从而为临床防治肝脏疾病提供新思路和靶点。
附图说明
图1本发明提供的基因沉默腺相关病毒骨架示意图;
图2为完成基因沉默腺相关病毒质粒构建后,对插入的shRNA序列进行测序比对鉴定结果;
图3为体内Atf6αshRNA预干预小鼠6周,后腹腔注射四氯化碳诱导24h的血清ALT水平变化;
图4为体内Atf6αshRNA预干预小鼠6周,后腹腔注射四氯化碳诱导24h的血清TBil水平变化;
图5为rAAV8-control shRNA和rAAV8-Atf6αshRNA分别转导6周,再给予四氯化碳干预24h后的病理HE染色;其中,左图为control shRNA+四氯化碳,右图为Atf6αshRNA+四氯化碳;
图6为rAAV8-control shRNA和rAAV8-Atf6 shRNA分别转导6周,再给予四氯化碳干预24h后肝组织坏死面积百分比变化;
图7为Atf6 shRNA预干预小鼠6周,随后给予四氯化碳干预24h诱导肝损伤,肝内ATF6α、CHOP、casepase-12和P-MLKL的蛋白水平变化。
具体实施方式
本发明提供了一种靶向敲减Atf6α基因表达的shRNA,所述shRNA靶向的核苷酸序列具体如下:5’-GCAGTCGATTATCAGCATACA-3’(SEQ ID No.1);所述shRNA的核苷酸序列优选具体如下:3’-TGTATGCTGATAATCGACTGC-5’(SEQ ID No.2)。在本发明中,所述shRNA(短发夹RNA)能够特异性靶向编码Atf6α基因中如SEQ ID No.1所示的序列,与相应的mRNA结合,由特异的核酸酶结合并降解mRNA,从而实现编码Atf6α基因的表达敲低。
本发明提供了一种靶向敲减Atf6α基因表达的重组载体,包括骨架载体pAAV8和所述shRNA。在本发明中,所述骨架载体pAAV8(骨架信息为pAAV-ITR-hU6-Atf6 shRNA(mouse,NM_001081304)-CAG-EGFP-WPRE-SV40_polyA-ITR;所述骨架载体的载体类型为沉默腺相关病毒;所述骨架载体优选的委托北京合生基因科技有限公司合成。在本发明中,所述重组载体命名为rAAV8-Atf6 shRNA。
本发明还提供了所述的shRNA、所述的重组载体在制备肝内内质网应激的小鼠模型中的应用。
在本发明中,优选的将所述靶向敲减Atf6α基因表达的shRNA或重组载体导入小鼠体内;所述靶向敲减Atf6蛋白的重组载体优选的共导入2次,间隔时间优选为40~60h,更优选为45~55h,最优选为48h。在本发明中,所述靶向敲减Atf6蛋白的重组载体每一次导入的用量优选为(0.5~1.5)×1010vg/0.1mL/只,更优选为1×1010vg/0.1mL/只。在本发明中,所述小鼠优选的为km小鼠,规格为20~25g/只。在本发明中,所述导入的方法优选为注射,所述注射优选为尾静脉注射。在本发明中,所述重组载体优选的与生理盐水混合后注射,所述重组载体混合与生理盐水的体积比优选为1:(6~10),更优选为1:8。
在本发明中,所述靶向敲减Atf6α基因表达的shRNA或重组载体导入小鼠体内后,能够显著增加四氯化碳诱导24h小鼠体内的血清ALT、TBil水平,能够使肝细胞损伤加重,细胞坏死显著,能够加重小鼠肝内内质网应激。本发明提供的靶向敲减Atf6α基因表达的shRNA或重组载体为防治肝脏疾病的研究提供了新的思路和靶点,具有重大意义。
下面结合实施例对本发明提供的技术方案进行详细的说明,但是不能把它们理解为对本发明保护范围的限定。
实施例1
1.构建重组载体:pAAV-ITR-hU6-Atf6 shRNA(mouse,NM_001081304)-CAG-EGFP-WPRE-SV40_polyA-ITR;委托北京合生基因科技有限公司合成,命名为rAAV8-Atf6 shRNA,质粒结构图谱如图1所示。
2.实验小鼠随机分为4组,每组12只小鼠,并按分组给予对应的干预;
1)Atf6 shRNA组:予rAAV8-Atf6 shRNA预干预+橄榄油;2)Control shRNA组:予rAAV8-control shRNA(control shRNA:5’-TTCTCCGAACGTGTCACGTTT-3’,SEQ ID No.3)预干预+橄榄油;3)四氯化碳组:予rAAV8-control shRNA预干预+四氯化碳;4)Atf6 shRNA+四氯化碳组:予rAAV8-Atf6 shRNA预干预+四氯化碳。
首先进行的是rAAV8-Atf6 shRNA和rAAV8-control shRNA的转导,具体步骤如下:
通过静脉可视小鼠尾静脉注射固定器固定小鼠,充分固定并暴露尾静脉,选择尾巴的外侧为常规静脉注射部位,应避开腹侧动脉;注射时斜面向上并倾斜45°进针,尽可能由小鼠尾部远端致近端。
75%的酒精消毒尾部静脉注射部位(用热纱布敷局部静脉显露效果更佳),予尾静脉注射的rAAV8-Atf6 shRNA(1×1010vg/0.1mL/只,每只小鼠的体重为22~25g);间隔48h重复一次,共2次;或对照rAAV8-control shRNA(1×1010vg/0.1mL/只,;间隔48h重复一次,共2次)。
在rAAV8-Atf6 shRNA和rAAV8-control shRNA转导6周后,小鼠四氯化碳组分别予以腹腔注射四氯化碳(1mL/kg),对照组小鼠分别腹腔注橄榄油(0.05mL/10g),待橄榄油或四氯化碳干预24h后开始小鼠标本收集。
橄榄油或四氯化碳干预24h后,摘取眼球留血送生化检测,每只实验小鼠取血1~1.5mL,采用速率法测定血清ALT水平(图3),采用重氮试剂法测定血清TBil水平(图4);图3为BALB/c小鼠经橄榄油或四氯化碳干预24h后,采用速率法测定血清ALT水平结果;与CCl4组小鼠相比,ATF6αshRNA+CCl4组小鼠血清ALT水平显著升高(P<0.001);BALB/c小鼠经橄榄油或四氯化碳干预24h后,采用重氮试剂法测定血清TBil水平,与CCl4组小鼠相比,ATF6αshRNA+CCl4组小鼠血清TBil水平较对照组明显升高(P<0.001)。
3.断颈处死小鼠,充分暴露、解剖,取肝脏组织0.5cm×0.5cm做病理切片HE染色。借助CaseViewer2.2软件打开后可以1~400倍任意倍数放大后进行观察。选取切片的目的区域进行100倍成像,成像时让组织充满整个视野,保证每张照片的背景光一致,进行坏死面积测量,结果如图5、6所示;BALB/c小鼠经橄榄油或四氯化碳干预24h后,肝脏组织做病理切片HE染色。与CCl4组小鼠相比,ATF6αshRNA+CCl4组肝细胞坏死亦显著增加(P<0.001)。
4.在小鼠肝右叶取出肝组织50mg放入5mL加有50μL PMSF液的免疫沉淀测定裂解缓冲液(成分:Tri-HCL,NACL,NP-40,SDS)中进行匀浆,接着用细胞超声破碎仪在4℃下进一步破碎组织至澄清。然后在4℃,12000rpm的条件下离心破碎组织5min,取上清液加入1/5体积的上样缓冲液(5×)(组成:SDS,DTT,溴酚蓝,缓冲盐溶液等,北京索莱宝科技有限公司,货号:P1040)充分混合,在100℃的沸水中煮10min,待其冷却后放入-20℃冰箱备用。通过免疫印迹法(western blot,WB)检测小鼠肝脏ATF6α、P-MLK、CHOP、casepase-12的表达,如图7所示,BALB/c小鼠经橄榄油或四氯化碳干预24h后,通过免疫印迹法(westernblot,WB)检测小鼠肝脏ATF6α、Caspase-12、CHOP、p-MLKL的蛋白水平。与CCl4组小鼠相比,ATF6αshRNA+CCl4组显著减少Atf6α蛋白水平,而肝内Caspase-12、CHOP、p-MLKL蛋白水平却显著增加(P<0.001)。
由以上实施例可知,本发明提供的靶向敲减小鼠肝脏Atf6的shRNA、重组载体及其在肝损伤的小鼠模型研究中的应用,通过将靶向敲减Atf6蛋白的shRNA导入小鼠体内,实现编码Atf6蛋白的基因表达量的敲减显著降低ATF6α表达,并加重肝损伤、肝细胞坏死和内质网应激,说明Atf6α在内质网应激及细胞坏死途径中有保护作用,从而为治疗临床肝脏疾病提供潜在靶点。
以上所述仅是本发明的优选实施方式,应当指出,对于本技术领域的普通技术人员来说,在不脱离本发明原理的前提下,还可以做出若干改进和润饰,这些改进和润饰也应视为本发明的保护范围。
序列表
<110> 遵义医科大学附属医院
<120> 一种靶向敲减Atf6α基因表达的shRNA、重组载体及其应用
<160> 3
<170> SIPOSequenceListing 1.0
<210> 1
<211> 21
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 1
gcagtcgatt atcagcatac a 21
<210> 2
<211> 21
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 2
tgtatgctga taatcgactg c 21
<210> 3
<211> 21
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 3
ttctccgaac gtgtcacgtt t 21
Claims (8)
1.一种靶向敲减Atf6α基因表达的shRNA,其特征在于,所述shRNA靶向的核苷酸序列如SEQ ID No.1所示,具体如下5’-GCAGTCGATTATCAGCATACA-3’。
2.根据权利要求1所述的shRNA,其特征在于,所述shRNA的核苷酸序列如SEQ ID No.2所示,具体如下:5’-TGTATGCTGATAATCGACTGC-3’。
3.一种靶向敲减Atf6α基因表达的重组载体,其特征在于,包括骨架载体pAAV8和权利要求1或2所述的shRNA。
4.权利要求1或2所述的shRNA、权利要求3所述的重组载体在制备肝损伤的小鼠模型中的应用。
5.根据权利要求4所述的应用,其特征在于,所述肝损伤包括由肝内内质网应激相关的肝损伤。
6.根据权利要求4或5所述的应用,其特征在于,将权利要求3所述靶向敲减Atf6α基因表达的重组载体导入小鼠体内。
7.根据权利要求6所述的应用,其特征在于,所述靶向敲减Atf6α基因表达的重组载体共导入2次,间隔时间为40~60h。
8.根据权利要求6所述的应用,其特征在于,所述靶向敲减Atf6α基因表达的重组载体每次导入的量为(0.5~1.5)×1010vg/只。
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WO2022266232A1 (en) * | 2021-06-16 | 2022-12-22 | Sanford Burnham Prebys Medical Discovery Institute | Methods and compositions for treating chronic liver disease and hepatocellular carcinoma |
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