CN112442555A - 一种防止气溶胶污染的可视化lamp检测体系及其制备方法、使用方法和应用 - Google Patents
一种防止气溶胶污染的可视化lamp检测体系及其制备方法、使用方法和应用 Download PDFInfo
- Publication number
- CN112442555A CN112442555A CN202011429902.9A CN202011429902A CN112442555A CN 112442555 A CN112442555 A CN 112442555A CN 202011429902 A CN202011429902 A CN 202011429902A CN 112442555 A CN112442555 A CN 112442555A
- Authority
- CN
- China
- Prior art keywords
- indicator
- primer
- grease
- reaction
- detection system
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Granted
Links
- 238000001514 detection method Methods 0.000 title claims abstract description 63
- 238000000034 method Methods 0.000 title claims abstract description 38
- 239000000443 aerosol Substances 0.000 title claims abstract description 33
- 230000000007 visual effect Effects 0.000 title claims abstract description 23
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 title claims abstract description 14
- 230000003321 amplification Effects 0.000 claims abstract description 72
- 238000003199 nucleic acid amplification method Methods 0.000 claims abstract description 72
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 claims abstract description 51
- 239000000203 mixture Substances 0.000 claims abstract description 39
- 239000000843 powder Substances 0.000 claims abstract description 23
- 108010014303 DNA-directed DNA polymerase Proteins 0.000 claims abstract description 19
- 102000016928 DNA-directed DNA polymerase Human genes 0.000 claims abstract description 19
- 239000003223 protective agent Substances 0.000 claims abstract description 18
- 239000000243 solution Substances 0.000 claims abstract description 14
- 238000002156 mixing Methods 0.000 claims abstract description 12
- 239000011535 reaction buffer Substances 0.000 claims abstract description 9
- 239000004519 grease Substances 0.000 claims description 72
- PGSADBUBUOPOJS-UHFFFAOYSA-N neutral red Chemical group Cl.C1=C(C)C(N)=CC2=NC3=CC(N(C)C)=CC=C3N=C21 PGSADBUBUOPOJS-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 24
- 239000007787 solid Substances 0.000 claims description 23
- 239000007788 liquid Substances 0.000 claims description 20
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 claims description 20
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 claims description 20
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 claims description 20
- 239000003921 oil Substances 0.000 claims description 20
- 239000001993 wax Substances 0.000 claims description 19
- 238000004108 freeze drying Methods 0.000 claims description 15
- 238000002844 melting Methods 0.000 claims description 13
- 230000008018 melting Effects 0.000 claims description 13
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 claims description 12
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 claims description 12
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 claims description 11
- 102100034343 Integrase Human genes 0.000 claims description 9
- 108010092799 RNA-directed DNA polymerase Proteins 0.000 claims description 9
- 239000000126 substance Substances 0.000 claims description 9
- 238000001816 cooling Methods 0.000 claims description 6
- JLPULHDHAOZNQI-ZTIMHPMXSA-N 1-hexadecanoyl-2-(9Z,12Z-octadecadienoyl)-sn-glycero-3-phosphocholine Chemical compound CCCCCCCCCCCCCCCC(=O)OC[C@H](COP([O-])(=O)OCC[N+](C)(C)C)OC(=O)CCCCCCC\C=C/C\C=C/CCCCC JLPULHDHAOZNQI-ZTIMHPMXSA-N 0.000 claims description 5
- 108091003079 Bovine Serum Albumin Proteins 0.000 claims description 5
- FBPFZTCFMRRESA-KVTDHHQDSA-N D-Mannitol Chemical compound OC[C@@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H](O)CO FBPFZTCFMRRESA-KVTDHHQDSA-N 0.000 claims description 5
- 229920001612 Hydroxyethyl starch Polymers 0.000 claims description 5
- 229930195725 Mannitol Natural products 0.000 claims description 5
- 229940098773 bovine serum albumin Drugs 0.000 claims description 5
- 229940050526 hydroxyethylstarch Drugs 0.000 claims description 5
- 239000000594 mannitol Substances 0.000 claims description 5
- 229960001855 mannitol Drugs 0.000 claims description 5
- 235000010355 mannitol Nutrition 0.000 claims description 5
- 239000000346 nonvolatile oil Substances 0.000 claims description 5
- 229940083466 soybean lecithin Drugs 0.000 claims description 5
- 238000005520 cutting process Methods 0.000 claims description 4
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 claims description 4
- 235000019737 Animal fat Nutrition 0.000 claims description 3
- 241001678559 COVID-19 virus Species 0.000 claims description 3
- 235000013871 bee wax Nutrition 0.000 claims description 3
- 239000012166 beeswax Substances 0.000 claims description 3
- 239000008157 edible vegetable oil Substances 0.000 claims description 3
- 238000010438 heat treatment Methods 0.000 claims description 3
- 229940057995 liquid paraffin Drugs 0.000 claims description 3
- 229940099259 vaseline Drugs 0.000 claims description 3
- 101150013191 E gene Proteins 0.000 claims description 2
- 238000012544 monitoring process Methods 0.000 claims description 2
- 239000012192 staining solution Substances 0.000 claims 1
- 238000007397 LAMP assay Methods 0.000 description 32
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 10
- 230000000694 effects Effects 0.000 description 8
- 241000711573 Coronaviridae Species 0.000 description 7
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 description 7
- 238000011161 development Methods 0.000 description 6
- 150000002148 esters Chemical class 0.000 description 6
- 241000700605 Viruses Species 0.000 description 4
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 description 4
- 239000008176 lyophilized powder Substances 0.000 description 4
- 239000011259 mixed solution Substances 0.000 description 4
- 239000012188 paraffin wax Substances 0.000 description 4
- 239000000047 product Substances 0.000 description 4
- 238000007711 solidification Methods 0.000 description 4
- 201000003176 Severe Acute Respiratory Syndrome Diseases 0.000 description 3
- 239000012295 chemical reaction liquid Substances 0.000 description 3
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 3
- 235000019197 fats Nutrition 0.000 description 3
- 230000008023 solidification Effects 0.000 description 3
- 208000024891 symptom Diseases 0.000 description 3
- SWGJCIMEBVHMTA-UHFFFAOYSA-K trisodium;6-oxido-4-sulfo-5-[(4-sulfonatonaphthalen-1-yl)diazenyl]naphthalene-2-sulfonate Chemical group [Na+].[Na+].[Na+].C1=CC=C2C(N=NC3=C4C(=CC(=CC4=CC=C3O)S([O-])(=O)=O)S([O-])(=O)=O)=CC=C(S([O-])(=O)=O)C2=C1 SWGJCIMEBVHMTA-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 3
- QKNYBSVHEMOAJP-UHFFFAOYSA-N 2-amino-2-(hydroxymethyl)propane-1,3-diol;hydron;chloride Chemical compound Cl.OCC(N)(CO)CO QKNYBSVHEMOAJP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 208000001528 Coronaviridae Infections Diseases 0.000 description 2
- 208000025370 Middle East respiratory syndrome Diseases 0.000 description 2
- 239000005662 Paraffin oil Substances 0.000 description 2
- 239000000969 carrier Substances 0.000 description 2
- 238000005119 centrifugation Methods 0.000 description 2
- 230000007547 defect Effects 0.000 description 2
- 201000010099 disease Diseases 0.000 description 2
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 description 2
- 239000012634 fragment Substances 0.000 description 2
- 230000009965 odorless effect Effects 0.000 description 2
- 239000002244 precipitate Substances 0.000 description 2
- 239000001044 red dye Substances 0.000 description 2
- 230000035945 sensitivity Effects 0.000 description 2
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 2
- 206010001052 Acute respiratory distress syndrome Diseases 0.000 description 1
- KWIUHFFTVRNATP-UHFFFAOYSA-N Betaine Natural products C[N+](C)(C)CC([O-])=O KWIUHFFTVRNATP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 208000035473 Communicable disease Diseases 0.000 description 1
- 206010011224 Cough Diseases 0.000 description 1
- 206010015866 Extravasation Diseases 0.000 description 1
- KWIUHFFTVRNATP-UHFFFAOYSA-O N,N,N-trimethylglycinium Chemical compound C[N+](C)(C)CC(O)=O KWIUHFFTVRNATP-UHFFFAOYSA-O 0.000 description 1
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 description 1
- WCUXLLCKKVVCTQ-UHFFFAOYSA-M Potassium chloride Chemical compound [Cl-].[K+] WCUXLLCKKVVCTQ-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 206010037660 Pyrexia Diseases 0.000 description 1
- 208000013616 Respiratory Distress Syndrome Diseases 0.000 description 1
- 201000000028 adult respiratory distress syndrome Diseases 0.000 description 1
- 150000001335 aliphatic alkanes Chemical class 0.000 description 1
- 238000000137 annealing Methods 0.000 description 1
- 230000009286 beneficial effect Effects 0.000 description 1
- 229960003237 betaine Drugs 0.000 description 1
- 230000005540 biological transmission Effects 0.000 description 1
- 239000007853 buffer solution Substances 0.000 description 1
- 239000007795 chemical reaction product Substances 0.000 description 1
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 description 1
- 230000000295 complement effect Effects 0.000 description 1
- 238000012864 cross contamination Methods 0.000 description 1
- 239000008367 deionised water Substances 0.000 description 1
- 229910021641 deionized water Inorganic materials 0.000 description 1
- 238000004925 denaturation Methods 0.000 description 1
- 230000036425 denaturation Effects 0.000 description 1
- 238000003745 diagnosis Methods 0.000 description 1
- 239000006185 dispersion Substances 0.000 description 1
- 238000006073 displacement reaction Methods 0.000 description 1
- 230000036251 extravasation Effects 0.000 description 1
- 230000002349 favourable effect Effects 0.000 description 1
- 235000013305 food Nutrition 0.000 description 1
- 230000002068 genetic effect Effects 0.000 description 1
- 239000011521 glass Substances 0.000 description 1
- 230000005182 global health Effects 0.000 description 1
- 230000036541 health Effects 0.000 description 1
- 238000009396 hybridization Methods 0.000 description 1
- 230000036039 immunity Effects 0.000 description 1
- 238000000338 in vitro Methods 0.000 description 1
- 238000011065 in-situ storage Methods 0.000 description 1
- 208000015181 infectious disease Diseases 0.000 description 1
- 238000007689 inspection Methods 0.000 description 1
- 239000011810 insulating material Substances 0.000 description 1
- 238000011901 isothermal amplification Methods 0.000 description 1
- 150000002632 lipids Chemical class 0.000 description 1
- 229910052943 magnesium sulfate Inorganic materials 0.000 description 1
- CSNNHWWHGAXBCP-UHFFFAOYSA-L magnesium sulphate Substances [Mg+2].[O-][S+2]([O-])([O-])[O-] CSNNHWWHGAXBCP-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 229910021645 metal ion Inorganic materials 0.000 description 1
- 230000011987 methylation Effects 0.000 description 1
- 238000007069 methylation reaction Methods 0.000 description 1
- 244000005700 microbiome Species 0.000 description 1
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 1
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 1
- 238000001556 precipitation Methods 0.000 description 1
- 230000000241 respiratory effect Effects 0.000 description 1
- 238000003757 reverse transcription PCR Methods 0.000 description 1
- 238000011895 specific detection Methods 0.000 description 1
- 239000008223 sterile water Substances 0.000 description 1
- 230000009967 tasteless effect Effects 0.000 description 1
- 230000009261 transgenic effect Effects 0.000 description 1
- 238000005303 weighing Methods 0.000 description 1
Images
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/70—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving virus or bacteriophage
- C12Q1/701—Specific hybridization probes
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6844—Nucleic acid amplification reactions
- C12Q1/6848—Nucleic acid amplification reactions characterised by the means for preventing contamination or increasing the specificity or sensitivity of an amplification reaction
-
- Y—GENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
- Y02—TECHNOLOGIES OR APPLICATIONS FOR MITIGATION OR ADAPTATION AGAINST CLIMATE CHANGE
- Y02A—TECHNOLOGIES FOR ADAPTATION TO CLIMATE CHANGE
- Y02A50/00—TECHNOLOGIES FOR ADAPTATION TO CLIMATE CHANGE in human health protection, e.g. against extreme weather
- Y02A50/30—Against vector-borne diseases, e.g. mosquito-borne, fly-borne, tick-borne or waterborne diseases whose impact is exacerbated by climate change
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Zoology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Immunology (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Virology (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
Abstract
本发明公开了一种防止气溶胶污染的可视化的LAMP检测体系及其制备方法、使用方法和应用,该油脂相指示剂为将指示剂包埋于一定的固定油脂制成封闭指示剂油脂相微环境。另外一部分为含Bst DNA聚合酶、dNTP、引物混合物、保护剂等成分制成的低温冻干粉。本发明公开的防止气溶胶污染的可视化的LAMP检测体系在进行检测时,只需要向反应管中加入等体积的待测样品及反应缓冲液,盖上管盖,上下颠倒混匀后,即可进行恒温扩增检测。与目前的单独加入各个反应成分相比,此种方法更加简便、省时,并且获得的LAMP反应结果更容易判读,阳性结果和阴性结果的显色差异更加明显,极大地避免了对LAMP反应结果的误判,并且不易引起假阳性。
Description
技术领域
本发明属于生物医药技术领域,涉及一种防止气溶胶污染的可视化的LAMP 检测体系及其制备方法、使用方法和应用。
背景技术
新型冠状病毒(SARS-CoV-2)的爆发给全球卫生带来了巨大的挑战,严重威胁着人类的生命健康和财产,其传播速度远远超过了同为冠状病毒引发的严重急性呼吸综合征(SARS)和中东呼吸综合征(MERS)。新型冠状病毒主要经过呼吸道飞沫传播,亦可通过接触传播。人群普遍易感,其中老年人、免疫力低下、有基础性疾病人群更容易感染或变为重症,另外儿童及婴幼儿也有发病。新型冠状病毒的临床症状表现为发烧、咳嗽、浑身无力,严重者出现急性呼吸窘迫综合征等症状,甚至也发现了一些无明显症状的病毒携带者,因此尽早的筛查出病毒感染者和潜在的携带者,及时阻断病毒的来源和传播途径,针对性的治疗是战“疫”的关键。
目前针对新型冠状病毒的检测方法主要为RT-PCR,由于该方法检测周期长,需要昂贵的设备及训练有素的专业人员。所以亟待需要开发一种快速、准确并且能够在现场即时检测病毒的方法。
环介导等温扩增(LAMP)技术是由日本科学家Notomi等首次于2000年开发的一种新型的体外等温核酸扩增技术。该技术主要利用具有链置换反应活性的 DNA聚合酶,通过1对外引物(F3/B3)和1对内引物(FIP/BIP)与靶基因的6 个不同区域退火杂交,使产物自我配对形成一种特殊的哑铃状结构,再通过内引物与哑铃状结构的互补配对引发指数级扩增。该方法克服了传统PCR依赖反复高温变性获得单核苷酸片段的缺点,大大节省了反应升降温所需要的时间,能够在60℃-65℃恒温条件下,1h内实现对靶基因序列的指数级(109~1010)扩增。由于其具有灵敏度高、特异性强、反应快速等特点,目前已被广泛应用于临床微生物检测、遗传诊断、传染病检测、SNP分型、甲基化检测和转基因食品鉴定等多个领域。
LAMP技术主要基于对特定DNA序列的扩增,通过对各待检生物DNA的扩增及结果判定,达到快检的目的。常规的LAMP检测体系主要由DNA聚合酶、特异性引物、dNTP、金属离子及指示剂等配制成的液体状态。在进行实验前,需要单独将每一种LAMP反应体系成分添加到特定的PCR管中,最后加入待检测的模板样品,使各组分彻底混匀后,再进行恒温扩增。这种操作方法看起来简单易行,但在实际操作过程中,往往受制于待检样本数目和实验操作人员的专业技能水平的影响,一旦临床样本增多,难以满足快速旁检的要求,并且由于加样环节的增多,容易造成交叉污染。同时,反应结束后的“意外”开盖,极易造成气溶胶污染,给结果判定造成了严重的影响。
由于LAMP反应体系的Bst DNA聚合酶、dNTP、引物等需要在低温条件下运输和保存,为了简化加样环节,最小化气溶胶引起的污染,我们采用了一种在低温情况下快速冷冻的LAMP检测成分,该成分为Bst DNA聚合酶、引物、dNTP、引物混合物、保护剂等组成的冻干粉,可在常温情况下保存和运输。在制备冻干体系过程中发现,将Bst DNA聚合酶、dNTP、引物混合物、保护剂以及指示剂混匀冻干后,在检测时,对含有靶片段的试样扩增结果显色比较浅,不易区分非非特异性扩增和阳性。当将Bst DNA聚合酶、引物、dNTP、引物混合物、保护剂这几种成分组合起来混合冻干,将指示剂和反应缓冲液配置成混合溶液,单独将加入反应管中,在检测时发现,配制的含有显色剂的溶液长时间放置容易产生沉淀,使得有效显色成分大大降低,影响阳性样本的显色。另外LAMP加样时,长时间开盖易引起气溶胶污染的假阳性,给检测工作带来极大的不便。
发明内容
为了克服上述现有技术的缺点,本发明的目的在于提供一种新型冠状病毒 SARS-CoV2现场检测试剂盒及其制备方法、使用方法和应用。
为了达到上述目的,本发明采用以下技术方案予以实现:
本发明公开了一种防止气溶胶污染的可视化LAMP检测体系,由油脂相指示剂和低温冻干粉组成;
所述油脂相指示剂为将指示剂包埋于固定油脂中形成封闭的油脂相指示剂微环境;所述低温冻干粉中含有Bst DNA聚合酶、dNTP、引物混合物及保护剂;
未检测时,所述油脂相指示剂与低温冻干粉隔离;
检测时,将待测样本与低温冻干粉混匀后进行扩增,反应过程中受加热影响,封闭的油脂相指示剂微环境中的指示剂被释放至反应体系中,发生颜色变化,实现可视化监测,同时熔化的固体油脂将反应体系与外界空气隔绝防止气溶胶污染。
优选地,所述固定油脂是由固体油脂和脂溶性液体按照3g:1mL的用量比配制而成;
其中,所述固体油脂包括硬蜡、软蜡、蜂蜡、动物脂肪和凡士林中的一种或几种;所述脂溶性液体为液体石蜡或食用油。
优选地,所述指示剂为中性红染液,其浓度为5~10mM,所用体积为0.5~1μL。
优选地,所述低温冻干粉是由Bst DNA聚合酶、AMV反转录酶、dNTP、引物混合物及保护剂按照(1~2):1:(3~7):(1~2):(5~8)的体积比混合制成的预混试剂经过冷冻干燥处理后获得。
优选地,所述引物混合物中包含引物FIP、引物BIP、引物LF、引物LB、引物F3和引物B3,且引物FIP、LF和F3的物质的量浓度之比为(4~8):(2~ 4):(1~2),引物BIP的浓度与引物FIP相同,引物LB的浓度与引物LF相同,引物F3的浓度与引物B3相同。
优选地,所述保护剂是由牛血清白蛋白、大豆卵磷脂、甘露醇和羟乙基淀粉按照质量比为(50~150):(1~40):(10~50):(5~25)的比例混合而成。
本发明还公开了上述的防止气溶胶污染的可视化LAMP检测体系的制备方法,包括以下步骤:
1)将固定油脂在高温条件下熔化,导入至柱型模具中,室温冷却待其中的固定油脂凝固后切分为直径为4mm,厚度为3mm的蜡饼,即制得固定油脂;
2)将步骤1)制得的固定油脂加入PCR反应管中,熔化后、离心,快速加入指示剂,指示剂被包被在固定油脂中,形成封闭的油脂相指示剂微环境;
3)制备包含Bst DNA聚合酶、AMV反转录酶、dNTP、引物混合物及保护剂的预混试剂;
4)将步骤3)制得的预混试剂分装至步骤2)制得的封闭的油脂相指示剂微环境的上层,先在-80℃预冷2-4h,然后在-70~-80℃下冷冻干燥8~16h,制得防止气溶胶污染的可视化的LAMP检测体系。
本发明还公开了上述的防止气溶胶污染的可视化LAMP检测体系的使用方法,检测时,向PCR反应管中加入等体积的待测样本以及反应缓冲液,与低温冻干粉充分混匀后,放入检测仪中进行扩增处理;
在整个核酸扩增处理过程中,固定油脂经预热熔化为液态,将封闭的指示剂快速释放到反应体系中,熔化的油脂混合物在整个反应过程中漂浮于PCR反应管上空,形成油脂相封闭层,将反应体系和外界空气完全隔离;另外释放的指示剂通过与扩增的核酸产物形成颜色物质,用于监测反应进程;反应结束后,将检测管移至室温条件,通过肉眼能够判断阳性和阴性结果。
本发明还公开了上述的防止气溶胶污染的可视化LAMP检测体系在检测新型冠状病毒中的应用,在检测时,用于2019新型冠状病毒扩增检测的基因为E 基因;在LAMP扩增体系中另外加入逆转录酶和特异性扩增引物混合物;
所述特异性扩增引物混合物包括:
2019-nCoV-E3 F3,其核苷酸序列如SEQ.ID.NO.1所示;
2019-nCoV-E3 B3,其核苷酸序列如SEQ.ID.NO.2所示;
2019-nCoV-E3 FIP,其核苷酸序列如SEQ.ID.NO.3所示;
2019-nCoV-E3 BIP,其核苷酸序列如SEQ.ID.NO.4所示;
2019-nCoV-E3 LF,其核苷酸序列如SEQ.ID.NO.5所示;
2019-nCoV-E3 LB,其核苷酸序列如SEQ.ID.NO.6所示。
与现有技术相比,本发明具有以下有益效果:
本发明公开了一种有效防止LAMP气溶胶污染的可视化的核酸检测体系,为能够有效防止气溶胶污染的油脂相指示剂,该油脂相指示剂将指示剂包埋于一定的固定油脂制成封闭的油脂相指示剂微环境。另外一部分为含Bst DNA聚合酶、 dNTP、引物混合物、保护剂等成分制成的低温冻干粉。本发明利用固体油脂的低熔点和低密度等特点,将固体油脂与指示剂在常温下形成封闭指示剂油脂相微环境。在温度达到65℃时,熔化的固体油脂盖于反应液面上层,形成足够厚的油脂相。隔绝了核酸扩增反应液的弥散以及与外部空气的直接接触,有效避免核酸扩增过程中的溢出引起的气溶胶污染。此外,释放的指示剂可对反应产物进行动态实时监测,在反应结束后混合体系可直接通过肉眼判读结果,无需开盖检测,极大地提高了检测结果的准确性和可靠性。
本发明公开的上述防止气溶胶污染的可视化的LAMP检测体系的制备方法,首先制备独创的低熔点的固定油脂,当其处于凝固态与液态临界点时,向其中小心加入指示剂,最终形成封闭的油脂相指示剂微环境,达到与外界彻底隔绝的目的。在此基础上,将LAMP扩增体系的其余成分(Bst DNA聚合酶、dNTP、引物混合物、保护剂等)充分混匀后悬空加入到油脂相指示剂微环境的油脂相指示剂的正上方,将配置好的体系预冷后再进行冷冻干燥,取出反应管,可见下层为含指示剂的油脂相指示剂层,紧贴油脂相指示剂的上层的为LAMP扩增体系的低温冻干粉。此方法制备的LAMP检测体系对指示剂的包埋效果好,PCR管壁与固定油脂的粘附效果好,能够抵抗剧烈颠簸而不脱落。
本发明公开的防止气溶胶污染的可视化的LAMP检测体系在进行检测时,只需要向反应管中加入等体积的待测样品及反应缓冲液,盖上管盖,上下颠倒混匀后,即可进行恒温扩增检测。另外,固定油脂在温度稍微升高时即可快速溶解释放包埋于其中的指示剂,在整个扩增反应过程中成液态悬浮于扩增体系的上方,而不影响扩增反应(对扩增的特异性和灵敏性不影响)。与目前的单独加入各个反应成分相比,此种方法更加简便、省时,并且获得的LAMP反应结果更容易判读,阳性结果和阴性结果的显色差异更加明显,极大地避免了对LAMP反应结果的误判,并且不易引起假阳性。
附图说明
图1为含中性红指示剂的油脂相指示剂微环境;
图2为含1μL指示剂的冻干效果图;
图3为含2μL中性红指示剂的冻干效果图;
图4为本案例制备的体系扩增结果;
图5为冻干后指示剂溢散的扩增结果;
图6为利用现配的核酸扩增成分进行的扩增结果;
图7为未添加石蜡的冻干粉扩增结果。
具体实施方式
为了使本技术领域的人员更好地理解本发明方案,下面将结合本发明实施例中的附图,对本发明实施例中的技术方案进行清楚、完整地描述,显然,所描述的实施例仅仅是本发明一部分的实施例,而不是全部的实施例。基于本发明中的实施例,本领域普通技术人员在没有做出创造性劳动前提下所获得的所有其他实施例,都应当属于本发明保护的范围。
需要说明的是,本发明的说明书和权利要求书及上述附图中的术语“第一”、“第二”等是用于区别类似的对象,而不必用于描述特定的顺序或先后次序。应该理解这样使用的数据在适当情况下可以互换,以便这里描述的本发明的实施例能够以除了在这里图示或描述的那些以外的顺序实施。此外,术语“包括”和“具有”以及他们的任何变形,意图在于覆盖不排他的包含,例如,包含了一系列步骤或单元的过程、方法、系统、产品或设备不必限于清楚地列出的那些步骤或单元,而是可包括没有清楚地列出的或对于这些过程、方法、产品或设备固有的其它步骤或单元。
下面结合附图对本发明做进一步详细描述:
1、油脂相指示剂微环境的制备
(1)固定油脂的配制
这里的固定油脂是常温条件下为固态,预热后能够很快熔化为液体的低熔点、无色物质。例如石蜡,石蜡是固态高级烷烃混合物,通常是白色、无色或淡黄色的无味蜡状固体,熔点在47℃-64℃,密度比水低,约0.9g/cm3,不溶于水。其物理化学性质稳定,几乎不与任何化学物质发生反应,是良好的绝缘物质。液蜡又称石蜡油,为无色、无臭、无味,无萤光的油状液体,其熔点一般低于40℃。将一定量的石蜡和液蜡按照一定的配比混合,可降低整个混合物的熔点。通过实验条件的反复摸索发现当固体油脂(m)与脂溶性液体(v)按照3:1混合时,其混合物的熔点显著降低为40℃左右。此方法获得的固定油脂可在室温条件下形成密度均一的固体蜡,当温度高于室温时即可迅速熔化为液态,并且熔化后的液体蜡混合物可在室温环境下保持液体状态20-30s,为后期指示剂的加入提供有利条件。
制备好的油脂相混合物在高温条件下熔化,导入一定体积的长柱型模具中,室温冷却2-3min后,液体蜡变为具一定形状的致密固体状,在固态蜡未完全凝固时尽快切分为直径为4mm,厚度为3mm,质量大小为35mg左右的小蜡饼。这里的小蜡饼即为制备好的固体油脂相。
上述的固定油脂为固体油脂(m)与脂溶性液体(v)按照质量体积比3:1混合而成。其中,固体油脂可为硬蜡、软蜡、蜂蜡、动物脂肪、凡士林等,脂溶性液体可为液体石蜡、食用油等。
(2)油脂相指示剂微环境的制备
将(1)中得到的固定油脂相加入PCR管中,在45℃条件下熔化,短暂离心后,在凝固态临界点时快速加入一定体积浓度的指示剂,指示剂由于密度相对较大,在半凝固态的酯相层中缓慢沉降,当酯相层完全凝固时,指示剂恰好被截留在固体酯相层的某个位置,形成完全包埋的质地密实的油脂相指示剂微环境。
这里的指示剂为中性红,其浓度为5mM-10mM。为防止含水量多对冷冻干燥过程中石蜡油脂相层冲击力的影响,加入的中性红的体积应当控制在0.5~1μL。
2、LAMP等温扩增混合试剂的制备
LAMP核酸扩增体系冻干粉为一种可常温运输的环介导等温扩增混合试剂,其特征在于,包括Bst DNA Polymerase、dNTP、引物混合物、保护剂。
所述的引物混合物中包含引物FIP、BIP、LF、LB、F3和B3。
所述的保护剂中包含牛血清白蛋白、大豆卵磷脂、甘露醇和羟乙基淀粉。
所述预混试剂是由Bst DNA Polymerase、AMV Reverse Transcriptase、dNTP、引物混合物、指示剂、保护剂防剂按照体积比例为1~2:1:3~7:1~2:1~2: 5~8的比例混合。
所述的引物混合物是由FIP、LF和F3按照物质的量浓度比例为4~8:2~ 4:1~2混合,引物BIP的浓度与FIP相同,引物LB的浓度与LF相同,引物F3 的浓度与B3相同。
所述的保护剂是由牛血清白蛋白、大豆卵磷脂、甘露醇和羟乙基淀粉按照质量比为50~150:1~40:10~50:5~25的比例混合。
根据上述方法得到的核酸扩增混合试剂,其特征在于,将Bst DNA Polymerase、AMV Reverse Transcriptase、dNTP、引物混合物、指示剂、保护剂按照上述比例混合
3、LAMP核酸扩增体系冻干粉的制备
将2中得到的环介导等温扩增混合试剂在低温条件下小心悬空分装到1中得到的含指示剂的固体油脂相微环境上层,先在-80℃预冷2-4h,然后在-70~-80℃下冷冻干燥8~16h,即为有效防止气溶胶污染的LAMP检测体系冻干粉。
4、具体的检测过程
在实际检测时,一般具体的操作步骤为:向检测管中加入等体积反应缓冲液和待测模板(即核酸),然后置于63~67℃恒温条件中反应30~60min,再升温至83~87℃反应5min即可;最后从扩增仪器中拿出反应管,水平垂直放置于 PCR管架上室温冷却2-3min后,自然光下,直接观察反应孔中的颜色变化。阳性扩增结果呈紫红色,阴性扩增结果为浅粉色。根据扩增后的颜色变化可直接对待测样本进行结果评判。这里的缓冲液由甜菜碱、KCl、Tris-HCl、(NH4)2SO4、 MgSO4按照物质的量之比为50~100:2~5:2~5:1~2:0.8~1混合而成,Tris-HCl 的pH值为6.8~8.8。
以下给出本发明的具体实施例,需要说明的是本发明并不局限于以下具体实施例中,凡在本申请技术方案基础上做的等同变换均落入本发明的保护范围。
制备中性红指示剂:称取100mg中性红粉末,加入50mL去离子水中,既得7mM中性红指示剂。
制备固定油脂:分别称取1份脂溶性液体和3份固体油脂于玻璃容器中,在 50℃条件下使其彻底熔化,充分混匀。快速注入到直径为4mm的模具中,待其凝固后,裁剪成厚度为3mm左右,质量35mg的小蜡饼,即为制得的固定油脂。
制备含中性红指示剂的油脂相指示剂微环境:将上述得到的固定油脂利用小镊子加入反应管中,在45℃条件下使其快速溶解,短暂离心后,在凝固态临界点时快速加入一定体积浓度的中性红指示剂,指示剂由于密度相对较大,在半凝固态酯相层中缓慢沉降,当酯相层完全凝固时,指示剂恰好被截留在固定油脂的某个位置,带石蜡层彻底凝固后,将形成完全包裹的酯相密闭微环境。
制备保护剂混合液,将0.75mL 5%牛血清白蛋白、0.75mL 0.05%大豆卵磷脂、0.5mL 100mM甘露醇、0.5mL 1%羟乙基淀粉得到2.5×保护剂混合液。
取预冷的15ml离心管,分别加入0.45mL无菌水、1.15mL 10mM dNTP、 1.6mL保护剂混合液、0.32mL Bst DNA Polymerase、0.16mL AMV Reverse Transcriptase、及0.32mL引物混合物充分混匀后,冰浴保存。
上述所使用的引物序列分别为:
2019-nCoV-E3 F3:CGTTAATAGTTAATAGCGTACTT
2020-nCoV-E3 B3:GACCAGAAGATCAGGAACTC
2019-nCoV-E3 FIP:
GCAGTACGCACACAATCGAAGCTTGCTTTCGTGGTATTCTTG
2019-nCoV-E3 BIP:
CAATATTGTTAACGTGAGTCTTGTGAAGAATTCAGATTTTTAACACG
2019-nCoV-E3LF:CAGTAAGGATGGCTAGTGTAA
2019-nCoV-E3LB:AACCTTCTTTTTACGTTTACTCT
将配制好的核酸扩增混合液在冰浴条件下分装到油脂相指示剂微环境的反应管中,每管12μL。将反应管转移至PCR管架上,于-80℃条件下冷冻2h,随后放置于低温冷冻干燥机中冻干8-16h。
图1所示为本实施例获得油脂相指示剂微环境,可以看出,中性红指示剂被固定油脂完全包裹于其中,分布于PCR管底部。
图2所示为含1μL中性红指示剂的油脂相指示剂微环境及扩增冻干粉体系,可以看出冻干粉完全分布于固定油脂的上层,产品管壁干净整洁,水分子去除效果明显。
图3所示为含2μL中性红油脂相指示剂微环境及扩增冻干粉体系,可以看出冻干粉与固定油脂呈现不均一化分布,在管壁内形成严重的“飞溅”现象,并且中性红指示剂完全裸露于固定油脂外面,冻干水分去除不彻底,冻干效果极差。可能在冻干过程中,中性红含水量的增多引起固定油脂形态发生崩解。
图4所示为本案例制备的含中性红油脂相指示剂微环境及核酸扩增冻干体系应用于实际检测过程中的结果,其中扩增结果为阳性,显色紫红色,阴性扩增结果为淡黄色。阳性结果与阴性结果显色差异极大,肉眼即可区分。
图5所示为利用含2μL中性红的油脂相指示剂微环境及扩增冻干粉体系应用于实际检测过程中的扩增结果。前4孔为阳性扩增结果,后4孔为阴性扩增结果。阳性扩增呈现浅粉色,阴性扩增结果为淡黄色。阳性结果和阴性结果显色差异不明显,肉眼难以区分。可能由于在冻干过程中,固定油脂的崩解,引起中性红指示剂的飞溅,暴露在外的中性红指示剂在真空条件下与反应缓冲液在反应未知反应形成一定的沉淀,影响扩增结果的显色。
图6所示为本案例的对照试验即分别加入核酸扩增的各个成分,然后加入反应缓冲液和检测样品进行的扩增结果,可见阳性扩增结果呈现紫红色,阴性扩增结果为淡黄色。扩增效果与本案例制备的油脂相指示剂微环境的核酸扩增体系一致。可见油脂相指示剂微环境的加入不影响扩增结果,相比本案例制备的核酸扩增体系在实际检测环节中操作更为方便,阳性和阴性显色更容易区分,并且避免了多种可能性的气溶胶污染。
图7所示不含油脂相指示剂微环境,但添加有中性红指示剂的的核酸扩增体系冻干粉的检测结果。阳性扩增结果和阴性扩增结果颜色接近,不易区分。这种现象可能由于提前向扩增体系中引入的中性红指示剂在冷冻干燥过程中与反应液的发生某种未知的反应,形成少量的沉淀,降低了中性红对扩增产物的有效检测浓度,使得阳性和阴性扩增结果显色差异不明显。
以上内容仅为说明本发明的技术思想,不能以此限定本发明的保护范围,凡是按照本发明提出的技术思想,在技术方案基础上所做的任何改动,均落入本发明权利要求书的保护范围之内。
序列表
<110> 陕西师范大学
<120> 一种有效防止气溶胶污染的可视化的LAMP检测体系及其制备方法、使用方法和应用
<160> 6
<170> SIPOSequenceListing 1.0
<210> 1
<211> 23
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 1
cgttaatagt taatagcgta ctt 23
<210> 2
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 2
gaccagaaga tcaggaactc 20
<210> 3
<211> 42
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 3
gcagtacgca cacaatcgaa gcttgctttc gtggtattct tg 42
<210> 4
<211> 47
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 4
caatattgtt aacgtgagtc ttgtgaagaa ttcagatttt taacacg 47
<210> 5
<211> 21
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 5
cagtaaggat ggctagtgta a 21
<210> 6
<211> 23
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 6
aaccttcttt ttacgtttac tct 23
Claims (9)
1.一种防止气溶胶污染的可视化LAMP检测体系,其特征在于,由油脂相指示剂和低温冻干粉组成;
所述油脂相指示剂为将指示剂包埋于固定油脂中形成封闭的油脂相指示剂微环境;所述低温冻干粉中含有Bst DNA聚合酶、dNTP、引物混合物及保护剂;
未检测时,所述油脂相指示剂与低温冻干粉隔离;
检测时,将待测样本与低温冻干粉混匀后进行扩增,反应过程中受加热影响,封闭的油脂相指示剂微环境中的指示剂被释放至反应体系中,发生颜色变化,实现可视化监测,同时熔化的固体油脂将反应体系与外界空气隔绝防止气溶胶污染。
2.根据权利要求1所述的防止气溶胶污染的可视化LAMP检测体系,其特征在于,所述固定油脂是由固体油脂和脂溶性液体按照3g:1mL的用量比配制而成;
其中,所述固体油脂包括硬蜡、软蜡、蜂蜡、动物脂肪和凡士林中的一种或几种;所述脂溶性液体为液体石蜡或食用油。
3.根据权利要求1所述的防止气溶胶污染的可视化LAMP检测体系,其特征在于,所述指示剂为中性红染液,其浓度为5~10mM,所用体积为0.5~1μL。
4.根据权利要求1所述的防止气溶胶污染的可视化LAMP检测体系,其特征在于,所述低温冻干粉是由Bst DNA聚合酶、AMV反转录酶、dNTP、引物混合物及保护剂按照(1~2):1:(3~7):(1~2):(5~8)的体积比混合制成的预混试剂经过冷冻干燥处理后获得。
5.根据权利要求1或4所述的防止气溶胶污染的可视化LAMP检测体系,其特征在于,所述引物混合物中包含引物FIP、引物BIP、引物LF、引物LB、引物F3和引物B3,且引物FIP、LF和F3的物质的量浓度之比为(4~8):(2~4):(1~2),引物BIP的浓度与引物FIP相同,引物LB的浓度与引物LF相同,引物F3的浓度与引物B3相同。
6.根据权利要求1或4所述的防止气溶胶污染的可视化LAMP检测体系,其特征在于,所述保护剂是由牛血清白蛋白、大豆卵磷脂、甘露醇和羟乙基淀粉按照质量比为(50~150):(1~40):(10~50):(5~25)的比例混合而成。
7.权利要求1~6中任意一项所述的防止气溶胶污染的可视化LAMP检测体系的制备方法,其特征在于,包括以下步骤:
1)将固定油脂在高温条件下熔化,导入至柱型模具中,室温冷却待其中的固定油脂凝固后切分为直径为4mm,厚度为3mm的蜡饼,即制得固定油脂;
2)将步骤1)制得的固定油脂加入PCR反应管中,熔化后、离心,快速加入指示剂,指示剂被包被在固定油脂中,形成封闭的油脂相指示剂微环境;
3)制备包含Bst DNA聚合酶、AMV反转录酶、dNTP、引物混合物及保护剂的预混试剂;
4)将步骤3)制得的预混试剂分装至步骤2)制得的封闭的油脂相指示剂微环境的上层,先在-80℃预冷2-4h,然后在-70~-80℃下冷冻干燥8~16h,制得防止气溶胶污染的可视化的LAMP检测体系。
8.权利要求1~6中任意一项所述的防止气溶胶污染的可视化LAMP检测体系的使用方法,其特征在于:检测时,向PCR反应管中加入等体积的待测样本以及反应缓冲液,与低温冻干粉充分混匀后,放入检测仪中进行扩增处理;
在整个核酸扩增处理过程中,固定油脂经预热熔化为液态,将封闭的指示剂快速释放到反应体系中,熔化的油脂混合物在整个反应过程中漂浮于PCR反应管上空,形成油脂相封闭层,将反应体系和外界空气完全隔离;另外释放的指示剂通过与扩增的核酸产物形成颜色物质,用于监测反应进程;反应结束后,将检测管移至室温条件,通过肉眼能够判断阳性和阴性结果。
9.权利要求1~6中任意一项所述的防止气溶胶污染的可视化LAMP检测体系在检测新型冠状病毒中的应用,其特征在于,在检测时,用于2019新型冠状病毒扩增检测的基因为E基因;在LAMP扩增体系中另外加入逆转录酶和特异性扩增引物混合物;
所述特异性扩增引物混合物包括:
2019-nCoV-E3 F3,其核苷酸序列如SEQ.ID.NO.1所示;
2019-nCoV-E3 B3,其核苷酸序列如SEQ.ID.NO.2所示;
2019-nCoV-E3 FIP,其核苷酸序列如SEQ.ID.NO.3所示;
2019-nCoV-E3 BIP,其核苷酸序列如SEQ.ID.NO.4所示;
2019-nCoV-E3 LF,其核苷酸序列如SEQ.ID.NO.5所示;
2019-nCoV-E3 LB,其核苷酸序列如SEQ.ID.NO.6所示。
Priority Applications (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
CN202011429902.9A CN112442555B (zh) | 2020-12-09 | 2020-12-09 | 一种防止气溶胶污染的可视化lamp检测体系及其制备方法、使用方法和应用 |
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
CN202011429902.9A CN112442555B (zh) | 2020-12-09 | 2020-12-09 | 一种防止气溶胶污染的可视化lamp检测体系及其制备方法、使用方法和应用 |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
CN112442555A true CN112442555A (zh) | 2021-03-05 |
CN112442555B CN112442555B (zh) | 2023-05-26 |
Family
ID=74739004
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
CN202011429902.9A Active CN112442555B (zh) | 2020-12-09 | 2020-12-09 | 一种防止气溶胶污染的可视化lamp检测体系及其制备方法、使用方法和应用 |
Country Status (1)
Country | Link |
---|---|
CN (1) | CN112442555B (zh) |
Cited By (3)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN108588196A (zh) * | 2018-04-23 | 2018-09-28 | 北京中能通达科技发展中心(有限合伙) | 一种防止pcr形成气溶胶污染的方法 |
CN114015758A (zh) * | 2021-10-15 | 2022-02-08 | 无锡百泰克生物技术有限公司 | 一种冻干保护剂、荧光pcr检测试剂盒及冻干工艺 |
CN116218656A (zh) * | 2023-05-08 | 2023-06-06 | 深圳市科瑞达生物技术有限公司 | 染料管及其制备方法和核酸检测方法 |
Citations (12)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN1816737A (zh) * | 2003-06-30 | 2006-08-09 | 格罗宁根大学医学中心 | 组织加工的方法 |
CN101258388A (zh) * | 2005-07-27 | 2008-09-03 | Crc斯马克普林特有限公司 | 时间-温度指示物 |
CN102703431A (zh) * | 2012-06-05 | 2012-10-03 | 中国水产科学研究院黄海水产研究所 | 基于石蜡的核酸等温扩增反应试剂保存方法及反应试剂 |
CN102936623A (zh) * | 2012-09-28 | 2013-02-20 | 中国人民解放军疾病预防控制所 | 用于核酸恒温扩增反应中防止核酸污染和指示其反应结果的方法 |
CN104937108A (zh) * | 2012-08-23 | 2015-09-23 | 新英格兰生物实验室公司 | 利用pH敏感染料的扩增反应产物的检测 |
CN109161582A (zh) * | 2018-08-14 | 2019-01-08 | 关明 | 一种用于环介导等温扩增的试剂及其试剂盒和应用 |
CN109486907A (zh) * | 2018-12-21 | 2019-03-19 | 陕西师范大学 | 一种可常温运输的环介导等温扩增试剂、制备方法及应用 |
CN109706227A (zh) * | 2019-01-24 | 2019-05-03 | 浙江大学 | 一种快速可视化且可防止气溶胶污染的核酸现场检查方法 |
CN110564879A (zh) * | 2019-10-10 | 2019-12-13 | 中国检验检疫科学研究院 | 一种快速检测霍乱弧菌的试剂盒 |
CN111440793A (zh) * | 2020-03-20 | 2020-07-24 | 武汉博杰生物医学科技有限公司 | 一种新型冠状病毒核酸检测试剂盒 |
CN111926117A (zh) * | 2020-08-18 | 2020-11-13 | 上海交通大学 | SARS-CoV-2病毒核酸等温快速检测试剂盒及检测方法 |
US20200377617A1 (en) * | 2019-05-29 | 2020-12-03 | Duke University | Compositions and methods for detection and measurement of rna modifications through targeted rna editing |
-
2020
- 2020-12-09 CN CN202011429902.9A patent/CN112442555B/zh active Active
Patent Citations (12)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN1816737A (zh) * | 2003-06-30 | 2006-08-09 | 格罗宁根大学医学中心 | 组织加工的方法 |
CN101258388A (zh) * | 2005-07-27 | 2008-09-03 | Crc斯马克普林特有限公司 | 时间-温度指示物 |
CN102703431A (zh) * | 2012-06-05 | 2012-10-03 | 中国水产科学研究院黄海水产研究所 | 基于石蜡的核酸等温扩增反应试剂保存方法及反应试剂 |
CN104937108A (zh) * | 2012-08-23 | 2015-09-23 | 新英格兰生物实验室公司 | 利用pH敏感染料的扩增反应产物的检测 |
CN102936623A (zh) * | 2012-09-28 | 2013-02-20 | 中国人民解放军疾病预防控制所 | 用于核酸恒温扩增反应中防止核酸污染和指示其反应结果的方法 |
CN109161582A (zh) * | 2018-08-14 | 2019-01-08 | 关明 | 一种用于环介导等温扩增的试剂及其试剂盒和应用 |
CN109486907A (zh) * | 2018-12-21 | 2019-03-19 | 陕西师范大学 | 一种可常温运输的环介导等温扩增试剂、制备方法及应用 |
CN109706227A (zh) * | 2019-01-24 | 2019-05-03 | 浙江大学 | 一种快速可视化且可防止气溶胶污染的核酸现场检查方法 |
US20200377617A1 (en) * | 2019-05-29 | 2020-12-03 | Duke University | Compositions and methods for detection and measurement of rna modifications through targeted rna editing |
CN110564879A (zh) * | 2019-10-10 | 2019-12-13 | 中国检验检疫科学研究院 | 一种快速检测霍乱弧菌的试剂盒 |
CN111440793A (zh) * | 2020-03-20 | 2020-07-24 | 武汉博杰生物医学科技有限公司 | 一种新型冠状病毒核酸检测试剂盒 |
CN111926117A (zh) * | 2020-08-18 | 2020-11-13 | 上海交通大学 | SARS-CoV-2病毒核酸等温快速检测试剂盒及检测方法 |
Non-Patent Citations (3)
Title |
---|
WEIHUA YANG ET AL.: ""Rapid Detection of SARS-CoV-2 Using Reverse transcription RT-LAMP method"", 《MEDRXIV》 * |
ZHI-YONG TAO ET AL.: ""Adaptation of a visualized loop-mediated isothermal amplification technique for field detection of Plasmodium vivax infection"", 《PARASITES & VECTORS》 * |
赵娜等: ""环介导等温扩增技术在临床检测中的优势与展望"", 《中国病原生物学杂志》 * |
Cited By (4)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN108588196A (zh) * | 2018-04-23 | 2018-09-28 | 北京中能通达科技发展中心(有限合伙) | 一种防止pcr形成气溶胶污染的方法 |
CN108588196B (zh) * | 2018-04-23 | 2021-12-14 | 北京中能通达科技发展中心(有限合伙) | 一种防止pcr形成气溶胶污染的方法 |
CN114015758A (zh) * | 2021-10-15 | 2022-02-08 | 无锡百泰克生物技术有限公司 | 一种冻干保护剂、荧光pcr检测试剂盒及冻干工艺 |
CN116218656A (zh) * | 2023-05-08 | 2023-06-06 | 深圳市科瑞达生物技术有限公司 | 染料管及其制备方法和核酸检测方法 |
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
CN112442555B (zh) | 2023-05-26 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
CN112442555A (zh) | 一种防止气溶胶污染的可视化lamp检测体系及其制备方法、使用方法和应用 | |
Tseng et al. | DNA synthesis in human lymphocytes: Intermediates in DNA synthesis, in vitro and in vivo | |
Dennog et al. | Detection of DNA damage after hyperbaric oxygen (HBO) therapy | |
Eldadah et al. | Detection of flaviviruses by reverse‐transcriptase polymerase chain reaction | |
EP1347060A1 (en) | Method of detecting pathogenic microorganism | |
JPWO2009060847A1 (ja) | 核酸増幅用サンプルの調製方法及び調製キット | |
JPH11511982A (ja) | 細胞を分離する方法 | |
Whittaker et al. | Two histospecific enzyme expressions in the same cleavage‐arrested one‐celled ascidian embryos | |
CN105420416B (zh) | 一种分层包装带指示剂的直接实时定量荧光pcr方法 | |
CN107245534A (zh) | 用于寨卡病毒检测的rt‑lamp引物组、试剂盒及检测方法 | |
CN110229880A (zh) | 检测遗传性耳聋基因突变位点的引物、试剂盒和方法 | |
US6258320B1 (en) | Method for preservation of nucleic acids | |
JPH11332562A (ja) | 組織試料およびパラフィン包埋組織から核酸を抽出するための改良方法 | |
CN102888464B (zh) | 五重荧光pcr快速超敏检测试剂盒及其应用 | |
CN105695633B (zh) | 手足口病病原体检测引物组及试剂盒 | |
CN105483293B (zh) | 烈性传染病病原体检测引物组及试剂盒 | |
CN109593888A (zh) | 一种检测肠道病毒并区分柯萨奇病毒a16型和肠道病毒71型的试剂盒 | |
CN104212914A (zh) | 埃博拉五重荧光pcr快速超敏检测试剂盒及其应用 | |
CN107058305A (zh) | 一组核苷酸序列及在eml4‑alk融合基因快速检测中的应用 | |
US20210087617A1 (en) | Method for detecting flaviviridae | |
JPH11512602A (ja) | Pcrのための対照 | |
CN114381497B (zh) | Dna甲基化修饰的检测方法 | |
Nitsche et al. | Quantification of human cells in NOD/SCID mice by duplex real-time polymerase-chain reaction | |
CN110144386A (zh) | 用于检测pole基因突变的引物、探针及试剂盒 | |
CN111893201B (zh) | 等温扩增检测4种巴贝虫的试剂、试剂盒及其应用 |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
PB01 | Publication | ||
PB01 | Publication | ||
SE01 | Entry into force of request for substantive examination | ||
SE01 | Entry into force of request for substantive examination | ||
GR01 | Patent grant | ||
GR01 | Patent grant | ||
TR01 | Transfer of patent right |
Effective date of registration: 20231219 Address after: 710076 Unit 40502, Building 1, North District, Yichui Shangfu, No. 31 Zhangba'er Road, High tech Zone, Xi'an City, Shaanxi Province Patentee after: Xi'an Haitaike Biotechnology Co.,Ltd. Address before: 710119 No. 620 West Chang'an Street, Chang'an District, Xi'an City, Shaanxi Province Patentee before: Shaanxi Normal University |
|
TR01 | Transfer of patent right |