CN112154207B - 油菜抗嘧啶水杨酸类除草剂基因及其应用 - Google Patents

油菜抗嘧啶水杨酸类除草剂基因及其应用 Download PDF

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Abstract

提供了一种油菜抗嘧啶水杨酸类除草剂基因及其应用,还提供了耐受嘧啶水杨酸类除草剂的油菜植物及其部分。

Description

油菜抗嘧啶水杨酸类除草剂基因及其应用
技术领域
本发明涉及植物基因工程技术领域,具体地,涉及油菜抗嘧啶水杨酸类除草剂基因及其应用。更具体地,本发明涉及耐受嘧啶水杨酸类除草剂的油菜植物及其部分、抗性基因、突变蛋白及其应用。
背景技术
油菜(Brassica napus L.)是我国第一大油料作物,为我国半数以上的人口提供食用油来源。油菜生产过程中一类重要的生物危害是农田杂草,其不但与油菜作物争水争肥争光,而且改变油菜作物田间小气候,甚至有些杂草还是油菜作物病虫害的中间寄主,加快病虫害的蔓延,严重影响油菜作物产量和品质。然而,人工除草费时、费力,增加生产成本。因此,应用除草剂防治田间杂草成为人们的必然选择。
除草剂主要是通过抑制或干扰植物关键的代谢过程而抑制植物生长或杀死植物。以氨基酸生物合成过程中的关键酶为靶标,是研发新型高效除草剂的一个重要方向和热点。以乙酰乳酸合酶(acetolactate synthase,ALS;EC2.2..16)为靶酶开发的除草剂,己经成为新型高效除草剂的主流产品。ALS是催化支链氨基酸(缬氨酸、亮氨酸和异亮氨酸)生物合成第一步的酶。ALS抑制剂类除草剂能抑制植物细胞内的ALS酶活性,阻碍支链氨基酸(缬氨酸、亮氨酸和异亮氨酸)生物合成,从而抑制植物细胞的分裂和生长。20世纪90年代初,日本组合化学公司以乙酰乳酸合酶为靶标开发了一类新型ALS类除草剂嘧啶水杨酸(pyrimidyl-benzoates,PB)类除草剂,也称嘧啶氧(硫)苯甲酸类除草剂。该类除草剂的第一个商品化品种为嘧草硫醚(pyrithiobac-sodium)。随后,于1993年开发了嘧草醚(pyriminobac-methyl)、1996年开发了双草醚(bispyribac-sodium,农美利)。
自从ALS类除草剂被应用到农业以来,观察到敏感的植物种类(包括天然存在的杂草)偶尔显现出对这类除草剂的自发耐受性。在ALS基因特定位点处的单碱基被取代通常导致或多或少的抗性,具有突变的ALS等位基因的植物显示出对ALS类除草剂的不同水平的耐受性,这依赖于所述ALS类除草剂的化学结构和ALS基因的点突变位点。
研究发现,ALS上氨基酸替换发生的位点及其位点处替换氨基酸不同产生的抗性功能存在显著差异(Yu Q,Han HP,Martin M,Vila-Aiub,Powles SB.AHAS herbicideresistance endowing mutations:effect on AHAS functionality and plant growth.JExp Botany,2010,61:3925-3934)。不同位点氨基酸替换产生的ALS抑制剂除草剂抗性效应存在显著差异,同时不同位点突变对其它ALS抑制剂除草剂存在比较复杂的交互抗性关系。
本领域还非常需要获得相对于强生命力的杂草具有生长优势的油菜植物,需要获得可耐受嘧啶水杨酸类除草剂的非转基因油菜植物。
发明概述
本发明解决了这种需要,并提供了突变的乙酰乳酸合酶(ALS)核酸和这些突变的核酸编码的蛋白。本发明还涉及包含这些突变核酸和蛋白的油菜植物、细胞和种子,所述突变赋予油菜植物对于嘧啶水杨酸类除草剂的耐受,其中所述ALS基因编码的ALS多肽在其位置556处含有不同于色氨酸的氨基酸并且在其位置635处含有不同于丝氨酸的氨基酸。在优选的实施方式中,所述ALS基因编码的ALS多肽具有选自下列的双重突变:W556L和S635N;W556L和S635T;W556L和S635I。在最优选的实施方式中,所述ALS基因编码的ALS多肽具有下列突变:W556L和S635N。
在一个实施方式中,本发明提供了编码突变的乙酰乳酸合酶(ALS3)的分离的核酸,所述突变的乙酰乳酸合酶(ALS3)蛋白包含如下的突变:
在对应于SEQ ID NO:2的位置556的位置处色氨酸(W)突变为亮氨酸(L);和
在对应于SEQ ID NO:2的位置635的位置处丝氨酸(S)突变为天冬酰胺(N)、苏氨酸(T)或异亮氨酸(I);
优选地,所述的分离的核酸的核苷酸序列如SEQ ID NO:3所示;
优选地,其中所述突变的ALS3蛋白的氨基酸序列如SEQ ID NO:4所示。
在一个方面,本发明提供了表达盒、载体或细胞,其含有本发明所述的核酸。相应地,本发明提供了本发明的核酸、表达盒、载体或细胞或突变的乙酰乳酸合酶(ALS3)蛋白用于产生抗嘧啶水杨酸类除草剂植物的用途,优选地,所述植物为油菜。
在另一个方面,本发明提供了产生具有嘧啶水杨酸类除草剂抗性的植物的方法,其特征在于,包括如下步骤:
将本发明所述的核酸导入植物,优选地通过转基因、杂交、回交或无性繁殖等步骤将本发明所述的核酸导入植物,其中所述植物表达本发明所述的突变的乙酰乳酸合酶(ALS3)蛋白并具有嘧啶水杨酸类除草剂抗性。
在又一个方面,本发明提供了抗嘧啶水杨酸类除草剂的非转基因植物或其部分,其包含编码突变的乙酰乳酸合酶蛋白的分离的核酸,所述突变的乙酰乳酸合酶蛋白包含如下的突变:
在对应于SEQ ID NO:2的位置556的位置处色氨酸(W)突变为亮氨酸(L);和
在对应于SEQ ID NO:2的位置635的位置处丝氨酸(S)突变为天冬酰胺(N)、苏氨酸(T)或异亮氨酸(I),
优选地,其中所述植物是油菜;其中所述部分为植物的器官、组织和细胞,并且优选种子;
优选地,其中所述蛋白包含在对应于SEQ ID NO:2的位置556的位置处色氨酸(W)突变为亮氨酸(L)和在对应于SEQ ID NO:2的位置635的位置处丝氨酸(S)突变为天冬酰胺(N);
更优选地,其中所述突变的ALS3蛋白的氨基酸序列如SEQ ID NO:4所示。
在另一个方面,本发明提供了在含有油菜植物的田地中控制杂草的方法,所述方法包括施用有效量的嘧啶水杨酸类除草剂至含有所述杂草和油菜植物的所述田地,所述油菜植物包含编码突变的乙酰乳酸合酶蛋白的分离的核酸,所述突变的乙酰乳酸合酶蛋白包含如下的突变:
在对应于SEQ ID NO:2的位置556的位置处色氨酸(W)突变为亮氨酸(L);和
在对应于SEQ ID NO:2的位置635的位置处丝氨酸(S)突变为天冬酰胺(N)、苏氨酸(T)或异亮氨酸(I);
优选地,其中所述蛋白包含在对应于SEQ ID NO:2的位置556的位置处色氨酸(W)突变为亮氨酸(L)和在对应于SEQ ID NO:2的位置635的位置处丝氨酸(S)突变为天冬酰胺(N);
更优选地,其中所述突变的ALS3蛋白的氨基酸序列如SEQ ID NO:4所示。
附图说明
图1显示了不同来源的油菜ALS3氨基酸部分序列比对结果。
ALS3,Genbank上参考序列(登录号:Z11526);ALS3_N131野生型品系N131的ALS3氨基酸部分序列;ALS3_EM28抗性品系EM28的ALS3氨基酸部分序列;ALS3_Sh4抗性材料Sh4的ALS3氨基酸部分序列;ALS3_Sh5抗性材料Sh5的ALS3氨基酸部分序列;ALS3_Sh6抗性材料Sh6的ALS3氨基酸部分序列;ALS3_Sh7抗性材料Sh7的ALS3氨基酸部分序列。箭头表示突变氨基酸。
图2显示了不同浓度的苯磺隆对野生型和突变体的ALS酶活性体外抑制。
图3显示了不同浓度的咪唑乙烟酸对野生型和突变体的ALS酶活性体外抑制。
图4显示了不同浓度的双草醚对野生型和突变体的ALS酶活性体外抑制。
图5显示了转入了抗除草剂基因的拟南芥和烟草喷施除草剂后的抗性表现(Col,野生型拟南芥,3A-1和3A-2转入了抗除草剂基因的拟南芥;Tob,野生型烟草,Y3A-1和Y3A-2转入了抗除草剂基因的烟草)。+表示喷施60g a.i.ha–1双草醚处理,-表示未用除草剂处理。
发明详述
通过参考在附图中描述和/或说明的并且在下面说明书中详细说明的非限制性实施方案以及实例将更全面地说明本发明的实施方案以及它们的不同特征以及有利的细节。应当注意的是在附图中所述的特征不必按比例绘制,并且当本领域技术人员可以认可时,一个实施方案的特征可以与其他实施方案一起使用,尽管在此没有清楚地说明。
定义
除非另外说明,权利要求以及说明书中所使用的术语是如下面列出定义的。
术语“非转基因”是指没有通过适当的生物载体或通过任何其他物理方式引入各个基因。但是,突变的基因可通过授粉(自然地或通过育种方法)被传递,以产生另一种含有该特定基因的非转基因植物。
“内源”基因意指植物中不是通过基因工程技术引入到所述植物中的基因。
术语“核苷酸序列”、“多核苷酸”、“核酸序列”、“核酸”、“核酸分子”在本文中可互换使用,其是指任意长度的聚合无支链形式的核苷酸,核糖核苷酸或者脱氧核糖核苷酸或其二者组合。核酸序列包括DNA、cDNA、基因组DNA、RNA,包括合成形式以及混合的聚合物,包括正义链和反义链,或可以含有非天然的或衍生的核苷酸碱基,本领域技术人员可理解这点。
当用于本文时,术语“多肽”或“蛋白质”(本文中这两个术语可互换地使用)意指包含给定长度的氨基酸链的肽、蛋白质或多肽,其中所述氨基酸残基通过共价的肽键连接。但是,本发明也包括所述蛋白质/多肽的肽模拟物(其中氨基酸和/或肽键已经被功能性类似物替换),以及除了所述20种基因编码的氨基酸之外的氨基酸例如硒代半胱氨酸。肽、寡肽和蛋白质可被称为多肽。所述术语多肽还指(不排除)多肽的修饰,例如糖基化、乙酰化、磷酸化等。这种修饰很好地记载于基础文献中,并更详细地记载于专著以及研究文献中。
氨基酸取代包括氨基酸改变,其中氨基酸被不同的天然存在的氨基酸残基代替。这种取代可被分类为“保守的”,其中野生型ALS蛋白质中含有的氨基酸残基被另外的天然存在且特性相似的氨基酸替换,例如或本发明中包括的取代还可能是“非保守的”,其中存在于野生型ALS蛋白质中的氨基酸残基被具有不同性质的氨基酸取代,例如来自于不同组的天然存在的氨基酸(例如用丙氨酸取代带电荷的或疏水的氨基酸)。本文使用的“相似的氨基酸”是指具有相似的氨基酸侧链的氨基酸,即具有极性、非极性或接近中性的侧链的氨基酸。本文使用的“不相似氨基酸”是指具有不同氨基酸侧链的氨基酸,例如具有极性侧链的氨基酸与具有非极性侧链的氨基酸是不相似的。极性侧链通常趋向存在于蛋白质的表面,在此它们可以与细胞中存在的水环境相互作用(“亲水性”氨基酸)。另一方面,“非极性”氨基酸趋向于位于蛋白质内的中心,在此它们可以与相似的非极性相邻分子相互作用(“疏水性”氨基酸)。具有极性侧链的氨基酸的实例为精氨酸、天冬酰胺、天冬氨酸、半胱氨酸、谷氨酰胺、谷氨酸、组氨酸、赖氨酸、丝氨酸和苏氨酸(全部为亲水性氨基酸,除了半胱氨酸为疏水性的)。具有非极性侧链的氨基酸的实例为丙氨酸、甘氨酸、异亮氨酸、亮氨酸、甲硫氨酸、苯丙氨酸、脯氨酸和色氨酸(全部为疏水性的,除了甘氨酸为中性的)。
通常,本领域技术人员根据其通常的常识和使用术语ALS、ALSL、AHAS或AHASL的上下文即可知晓分别是指所述核苷酸序列或核酸,或者是指所述氨基酸序列或多肽。
当用于本文时,术语“基因”是指任何长度的核苷酸(核糖核苷酸或脱氧核糖核苷的聚合形式。该术语包括双链和单链的DNA和RNA。其还包括已知类型的修饰,例如甲基化、“加帽”、用类似物取代一个或多个天然存在的核苷酸。优选地,基因包括编码本文所定义的多肽的编码序列。“编码序列”是当被置于或在适当调节序列的控制下可被转录为mRNA和/或被翻译为多肽的核苷酸序列。所述编码序列的界限是由5'末端的翻译起始密码子和3'末端的翻译终止密码子确定的。编码序列可以包括但不限于mRNA、cDNA、重组核酸序列或基因组DNA,但是某些情况下也可能存在内含子。
当用于本文时,术语“甘蓝型油菜(Brassica napus)”可缩写为“油菜(B.napus)”。此外,本文中使用了术语“油菜”。所述三个术语可互换使用并且应被理解为完全包括栽培形式的油菜。相似地,例如术语“拟南芥(Arabidopsis thaliana)”可缩写为“拟南芥(A.thaliana)”。在本文中这两个术语可互换地使用。
当用于本发明时,术语“位置”意指氨基酸在本文描述的氨基酸序列中的位置或核苷酸在本文描述的核苷酸序列中的位置,例如SEQ ID NO:1所示的野生型油菜ALS3蛋白的编码序列或SEQ ID NO:2所示的野生型油菜ALS3蛋白的氨基酸序列中的位置或其对应位置。本文使用的术语“对应的”还包括不仅由前述核苷酸/氨基酸的编号所确定的位置。由于在ALS 5'非翻译区(UTR)(包括启动子和/或任何其他的调节序列)或基因(包括外显子和内含子)中其他位置处核苷酸的缺失或插入,本发明中可被取代的给定核苷酸的位置可以不同。相似地,由于在ALS多肽中其他位置氨基酸的缺失或插入,本发明中可被替换的给定氨基酸的位置可以不同。因此,本发明中“对应位置”应被理解为在所指示编号处的核苷酸/氨基酸可以不同,但仍然可具有相似的相邻核苷酸/氨基酸。所述可被交换、缺失或插入的核苷酸/氨基酸也被术语“对应位置”所包括。为了确定在给定的ALS核苷酸/氨基酸序列中核苷酸残基或氨基酸残基是否对应于核苷酸序列SEQ ID NO:1或氨基酸序列SEQ ID NO:2中的某些位置,本领域技术人员可使用本领域中公知的工具和方法,例如人工地或通过使用计算机程序的比对,例如BLAST(Altschul et al.(1990),Journal of MolecularBiology,215,403-410)(其代表基本局部比对搜索工具)或ClustalW(Thompson et al.(1994),Nucleic Acid Res.,22,4673-4680)或任何其他适合于产生序列比对的适合程序。
具体地,本发明提供了一种油菜植物,在所述油菜植物的内源ALS基因编码的多肽位置556处发生色氨酸W→亮氨酸L取代,这是由于在对应于SEQ ID NO:1中示出的核苷酸序列位置1667的位置处"G"核苷酸突变为"T"核苷酸。并且,在所述油菜植物的内源ALS基因编码的多肽位置635处发生丝氨酸S→天冬酰胺N取代,这是由于在对应于SEQ ID NO:1中示出的核苷酸序列位置1904的位置处"G"核苷酸突变为"A"核苷酸。在最优选的实施方案中,本发明提供了一种油菜植物,在所述油菜植物的内源ALS3基因包含SEQ ID NO:3所示的核苷酸序列(或由其组成),其编码SEQ ID NO:4所示的突变的ALS3多肽。
可根据Singh(1991),Proc.Natl.Acad.Sci.88:4572-4576中描述的测定法来测量ALS活性。本文提到的编码ALS多肽的ALS核苷酸序列优选地可赋予对本文所述的一种或多种嘧啶水杨酸类除草剂的耐受性(或者,对嘧啶水杨酸类除草剂更低的敏感度)。这是由于本文所述的导致氨基酸取代的点突变。因此,对嘧啶水杨酸类除草剂的耐受性(或者,对嘧啶水杨酸类除草剂更低的敏感度)可通过在存在嘧啶水杨酸类除草剂的情况下,从来自含有突变ALS序列的植物和没有突变ALS序列的植物的细胞提取物中获得ALS并比较其活性来测量,例如Singh et al(1988)[J.Chromatogr.,444,251-261]中描述的方法。当使用植物时,优选地在存在多种浓度的嘧啶水杨酸类除草剂的情况下,更优选在存在多种浓度的嘧啶水杨酸类除草剂"双草醚的情况下,在野生型的细胞提取物或叶提取物以及在所获得突变体的油菜细胞提取物或叶提取物中测定ALS活性。当用于本文时,敏感度更低,反之亦然,可被看作是“耐受性更高”或“抗性更高”。相似地,“耐受性更高”或“抗性更高”,反之亦然,可被看作是“敏感度更低”。
术语“嘧啶水杨酸类除草剂”不意图受限于可干扰ALS酶活性的单一除草剂。因此,除非另有说明或可从上下文中明显看出,否则“嘧啶水杨酸类除草剂”可以是本领域中已知的一种除草剂或者两种、三种、四种或多种除草剂的混合物,所述除草剂优选为本文所列出的那些,例如嘧草硫醚、氯酯磺草胺、环酯草醚、双草醚、嘧草醚、嘧啶肟草醚等。
本发明提供了具有内源性乙酰乳酸合酶(ALS)基因突变的可耐受嘧啶水杨酸类除草剂的油菜植物。用于本文时,除非另有明确说明,否则术语“植物”意指处在任何发育阶段的植物。植物的部分可被连接到整个完整植物或者可从整个完整植物分离。这样的植物的部分包括但不限于植物的器官、组织和细胞,优选种子。本发明的油菜植物在内源ALS基因方面是非转基因的。当然,可通过基因工程或通过常规方法例如杂交来将外源基因转移到所述植物中。
以下基于实施例对本发明进行描述,但是本发明并不仅仅限于这些实施例。
实施例1
在之前申请的专利(胡茂龙等,中国专利:CN 107245480 A,具有除草剂抗性的乙酰乳酸合酶突变蛋白及其应用)中,通过对野生型油菜品系N131(公知公用,见浦惠明等,江苏农业学报,2010,26(6):1432-1434)进行甲磺酸乙酯(EMS)诱变处理,在诱变的M2代,我们筛选并鉴定获得了抗磺酰脲类除草剂突变体EM28。EM28植株种子于2017年06月19日保藏于中国微生物菌种保藏管理委员会普通微生物中心(CGMCC),地址:北京市朝阳区北辰西路1号院3号,邮编:100101,保藏编号为CGMCC No.14299,该菌株的分类命名为:甘蓝型油菜(Brassica napus)。后续的遗传和抗性鉴定研究发现,EM28的抗性性状是由1个核基因控制的不完全显性性状,对咪唑啉酮类、磺酰脲类除草剂具有抗性而对嘧啶水杨酸类除草剂敏感。因此,为期望获得抗嘧啶水杨酸类除草剂油菜种质或资源满足抗除草剂油菜品种选育的需求,我们再次对EM28种子进行EMS诱变处理,EMS诱变方法同前。待M2代菜苗长至3-4叶期时,喷施嘧啶水杨酸类除草剂双草醚[化学名称:2,6-双(4,6-二甲氧嘧啶基-2-氧基)苯酸钠。分子式:C19H17N4NaO8。CAS号:125401-92-5(钠盐)],喷施杂草防治推荐使用浓度60ga.i.ha–1的双草醚,进行抗嘧啶水杨酸除草剂种质的筛选。处理3周后,油菜幼苗几乎全部接近死亡,只有10株菜苗存活并正常生长。将这10株疑似为抗嘧啶水杨酸除草剂油菜单株编号为Sh1至Sh10,待菜苗生长至5-6叶期后,移至油菜育种大田,当年花期套袋自交收获得到M3种子。在光照培养室内,对M3种子苗期喷施双草醚除草剂杂草防治的推荐使用浓度,进行抗性效应鉴定。从喷药1周开始,每天观察药害反应。结果发现,其中编号为Sh1、Sh2、Sh3、Sh8、Sh9、Sh10的6个株系和对照在喷药后1周就有药害反应,菜苗心叶开始变黄,并渐渐腐烂,最后死亡,这几株菜苗应为高密度种植条件下药剂漏喷所致;其中编号为Sh4、Sh5、Sh6和Sh7的4个株系表现出较强抗性,无任何药害症状,能正常生长。至此,我们获得了4个抗嘧啶水杨酸类除草剂甘蓝型油菜新种质。后期通过经典遗传学研究发现,抗性性状在F2代群体中的成活株和死亡株的分离比例为3:1,符合单显性基因的遗传规律。也就是说,突变基因为显性遗传,单基因控制。
实施例2:抗嘧啶水杨酸类除草剂甘蓝型油菜新种质中抗性基因的分子克隆
嘧啶水杨酸类除草剂属于ALS抑制剂类除草剂大类,这类除草剂的靶标是乙酰乳酸合酶。在甘蓝型油菜基因组内共有3个具有功能的乙酰乳酸合酶基因,分别是位于A基因组ALS2和ALS3(Genebank登录号:Z11525和Z11526),C基因组的ALS1(Genebank登录号:Z11524)。根据这3个ALS基因序列,分别设计3对PCR引物。ALS1引物1:GTGGATCTAACTGTTCTTGA和引物2:AGAGATGAAGCTGGTGATC。ALS2引物1:GAGTGTTGCGAGAAATTGCTT和引物2:TTGATTATTCTATGCTCTCTTCTG。ALS3引物1:ATGGTTAGATGAGAGAGAGAGAG和引物2:GGTCGCACTAAGTACTGAGAG。采用CTAB法分别提取抗性株系Sh4、Sh5、Sh6、Sh7和不抗株系Sh1、Sh2、Sh3、Sh8、Sh9、Sh10以及N131、EM28的叶片基因组DNA,PCR克隆野生型与突变体ALS1、ALS2和ALS3基因。按东洋纺(上海)生物科技有限公司高保真性DNA聚合酶KOD-Plus试剂盒说明书配制50μL PCR反应体系。在MJ Research PTC-200型PCR仪上进行扩增,反应程序为94℃预变性5min;94℃变性30s,55℃退火30s,72℃延伸2.5min,共35个循环。产物经平末端加A后,在1.2%(V/W)琼脂糖凝胶电泳分离后,用北京Tiangen公司生产的琼脂糖凝胶DNA回收试剂盒(目录号:DP209)纯化回收,纯化的PCR产物委托南京金斯瑞生物有限公司测序。测序比对发现,4个抗性株系在ALS3基因上均检测到两个位点发生了点突变。即,ALS3基因的第+1667处发生点突变,核苷酸由G变为T,导致相应编码蛋白的第556位由色氨酸(W)突变为亮氨酸(L);第+1904处发生点突变,核苷酸由G变为A,导致相应编码蛋白的第635位由丝氨酸(S)突变为天冬酰胺酸(N)(图1)。因此,与突变体EM28相比,抗性株系中的ALS3基因增加了1个新的突变位点(S635N),其核苷酸如SEQ IDNO:3所示,氨基酸序列如SEQ ID NO:4所示。ALS3基因的双位点突变(W556L和S635N)增加了抗性突变体对嘧啶水杨酸类除草剂的抗性。
实施例3:抗性株系的除草剂抗性效应评价与鉴定
选择生长势强、株型好的Sh7,暂定名为RP-1,作为抗性株系代表,以N131和EM28作为对照材料,采用田间鉴定和温室盆栽试验两种方法对RP-1的抗性效应进行鉴定与评价。油菜田间鉴定试验在江苏省农业科学院油菜隔离繁殖区进行,温室盆栽试验在恒温光照培养室中进行。待所有处理材料播种出苗生长至3-4叶苗龄,分别喷施在我国广泛使用的3种ALS抑制剂类除草剂,其中嘧啶水杨酸类除草剂为双草醚[2,6-双(4,6-二甲氧嘧啶基-2-氧基)苯酸钠]、SU类除草剂为苯磺隆(2-[N-(4-甲氧基-6-甲基-1,3,5-三嗪-2-基)-N-甲基氨基甲酰胺基磺酰基]苯甲酸甲酯)、IMI类除草剂为咪唑乙烟酸[(RS)-5-乙基-2-(4-异丙基-4-甲基-5-氧代-1H-咪唑啉-2-基)烟酸]。喷药3周后,根据菜苗的生长表现确定不同用药浓度下菜苗的抗性效应,结果如表1所示。从表1可以看出,ALS3基因的双位点突变(W556L和S635N)材料RP-1增加了对嘧啶水杨酸类除草剂的抗性。
表1不同浓度的ALS抑制剂类除草剂处理3个油菜后的抗性表现
Figure BDA0002480968650000121
表注:R代表除草剂处理后油菜植株生长良好,无药害表现;S代表除草剂处理后油菜植株生长受到严重抑制,表现明显药害,最终菜苗死亡(以下同)。
实施例4:除草剂对ALS酶活性的抑制性试验
根据抗性表型鉴定结果,在体外进行酶活性离体测定试验,比较RP-1、EM28和原始野生型N131的中ALS酶被3种类型除草剂双草醚(PB类)、苯磺隆(SU类)和咪唑乙烟酸(IMI类)的抑制影响,比较3个材料间的差异。ALS酶活性测定参照Singh等的方法(Singh BK,etal.,Analytical Biochemistry,1988,171:173-179)。具体的,分别取0.2g叶片样品,在研钵中用液氮研磨粉碎,将磨好的样品加入含有4.5ml的初酶提取液[100mM K2HPO4、0.5mMMgCl2、0.5mM硫胺素焦磷酸(TPP)、10μM黄素腺嘌呤双核苷酸(FAD)、10mM丙酮酸钠、10%(v/v)丙三醇、1mM二硫苏糖醇、1mM苯甲基磺酰氟(PMSF)、0.5%(w/v)聚乙烯基吡咯烷酮]中,于4℃、12000rpm离心20min。取上清液,加入等体积的饱和(NH4)2SO4,于冰上放置30min后,4℃、12000rpm离心20min,弃上清液,加入1mL初酶提取液,振荡溶解,获得每个样品的ALS酶液。取200μL提取好的ALS酶液,分别加入360μL 50mM Hepes-NaOH(PH=7.5)酶反应缓冲液、80μL 20mM TPP、80μL 200μM FAD、80μL 2M丙酮酸钠+200mM MgCl2和不同浓度的ALS类除草剂,混匀、放入37℃反应1h后,加入160μL 3M H2SO4终止反应,60℃脱羧15min。然后加入780μL 5.5%α-萘酚溶液和780μL 0.55%肌酸,65℃显色15min,在530nm比色,读取吸光值,根据标准曲线计算酶活性。将未加入除草剂对照的ALS酶活性分别记为100%,计算双草醚(PB类)、苯磺隆(SU类)和咪唑乙烟酸(IMI类)除草剂对RP-1、EM28和原始野生型N131的ALS酶活性的影响。
从图2和3可以看出,随着SU类除草剂苯磺隆和IMI类除草剂咪唑乙烟酸浓度的增加,野生型N131、EM28和RP-1的ALS酶活性均受到抑制,但EM28和RP-1中的突变酶都表现对除草剂具有一定抗性,因为与野生型N131相比,随苯磺隆浓度增加,EM28和RP-1中的ALS酶活性抑制下降趋势较缓,二者变化趋势相同。
从图4可以看出,RP-1中的突变酶表现对嘧啶水杨酸类除草剂双草醚具有较强抗性,因为与N131和EM28相比,随双草醚浓度增加,N131和EM28中的ALS酶活性快速下降,且变化趋势相同,而RP-1中的突变酶活性受到除草剂抑制程度较轻,即使在高浓度(250μmol L-1)双草醚条件下,RP-1中的突变酶活性是对照的51%左右。然而,此时N131和EM28酶活性抑制率接近100%,即,N131和EM28中的ALS基本没有了活性,分别仅为对照的4%和10%。综上,突变体RP-1中的ALS酶对嘧啶水杨酸类除草剂双草醚的敏感性显著低于N131和EM28中ALS酶,从而进一步说明,ALS3基因的双位点突变(W556L和S635N)赋予了RP-1对嘧啶水杨酸类除草剂抗性。
实施例5:抗性基因在拟南芥中的功能验证
构建植物表达载体,通过常规的农杆菌介导法将抗性基因转入拟南芥植株,在转基因后代中PCR筛选阳性纯合转基因株系进行除草剂表型鉴定。过程简言之,根据ALS3基因序列设计特异引物,ALS3引物3:5'CGCGGTACCCTCTCTCTCTCTCATCTAACCAT3'和ALS3引物4:5'CGCACTAGTCTCTCAGTACTTAGTGCGACC3',其5'分别加入KpnI和SpeI酶切修饰位点,下划线序列为酶切位点。以突变体RP-1的基因组DNA为模板,PCR扩增获得抗性基因,其核苷酸如SEQID NO:3所示,氨基酸序列如SEQ ID NO:4所示。PCR产物按实施例2方法经回收、克隆、测序,获得带有突变酶编码基因的重组T载体。用KpnI和SpeI双酶切T载体获得含目的基因的片段回收、连接到同样经双酶切的pCAMBIA1390载体上(购自澳大利亚CAMBI公司),得到重组的植物表达载体。将构建好的重组载体转化大肠杆菌DH5α,提取质粒用于酶切和测序检测。将检测表明正确的含有目的基因的重组载体转化农杆菌EHA105菌株,提取质粒进行PCR和酶切鉴定。培养获得的重组菌株,利用农杆菌侵染花序法(flower dipping)转化拟南芥。T0代中在培养基上经抗生素筛选后,获得T1代植株移栽到盆钵中,置于人工培养箱中生长,PCR筛选、扩繁获得T3代的纯合转基因株系。在T3代转基因苗期,喷施60g a.i.ha–1双草醚进行抗性鉴定。喷药处理3周后,所有转基因拟南芥幼苗生长状态良好,而未转基因的拟南芥(Col)幼苗全部黄化死亡(图5),表明RP-1中核苷酸如SEQ ID NO:3所示的乙酰乳酸合酶突变基因在拟南芥中表达具有抗嘧啶水杨酸类除草剂的功能。
实施例6:抗性基因在烟草中的功能验证
按照实施例5的方法,将RP-1中核苷酸如SEQ ID NO:3所示的乙酰乳酸合酶突变基因克隆至植物表达载体pCAMBIA1390质粒(购自澳大利亚CAMBI公司)中。挑选阳性克隆转化农杆菌EHA105,采用常规的农杆菌介导法转化本氏烟叶盘,获得转基因植株烟草收种后,经PCR鉴定,在T3代转基因烟草苗期,喷施60g a.i.ha–1双草醚进行抗性鉴定。喷药处理3周后,所有转基因烟草幼苗生长状态良好,而未转基因的烟草(Tob)幼苗全部黄化死亡(图5),表明RP-1中核苷酸如SEQ ID NO:3所示的乙酰乳酸合酶突变基因在烟草中表达也具有抗嘧啶水杨酸类除草剂的功能。
实施例7:抗性基因在普通油菜中的功能验证
采用杂交转育方法将RP-1中核苷酸如SEQ ID NO:3所示的乙酰乳酸合酶突变基因导入其它对嘧啶水杨酸类除草剂无抗性的普通油菜品种或品系。过程简言之,用RP-1分别与无抗性的普通油菜品种恢复系3075R(浦惠明等,2002,江苏农业科学,4:33-34)和3018R(浦惠明等,1999,江苏农业科学,6:32-33)配制杂交组合,当年收获2个F1种子在油菜春化培养室进行加代种植,花期选生长一致的单株套袋自交,收获F2种子在南京江苏省农科院溧水植物科学基地播种,每个F2群体播种20行,苗期取F2群体单株叶片,提取DNA,PCR扩增ALS3基因,产物按实例2步骤纯化、回收、测序。根据测序结果,筛选具有RP-1中核苷酸如SEQID NO:3所示的乙酰乳酸合酶突变基因的纯合型F2单株。于油菜花期对每个入选的F2单株套袋自交,收获F3种子。在F3代苗期,喷施60g a.i.ha–1双草醚进行抗性鉴定。喷药处理3周后,所有入选的导入抗性基因的油菜幼苗生长状态良好,而未含抗性基因的油菜幼苗全部黄化死亡,表明RP-1中核苷酸如SEQ ID NO:3所示的乙酰乳酸合酶突变基因在油菜中表达也具有抗嘧啶水杨酸类除草剂的功能。
实施例8:抗性突变位点不同氨基酸替换的抗性功能研究
为明确本发明中ALS3在Trp556和Ser635的两个位点突变成其他氨基酸后产生的抗性功能,我们通过查阅大量相关文献,设计了5种氨基酸突变组合(表2),通过人工引入点突变位点并构建其植物表达载体,转化拟南芥验证其抗性功能。过程简言之,以突变体RP-1基因组为模板,利用PCR技术进行定点突变操作,实验委托南京钟鼎生物技术有限公司完成。结果获得了5个突变基因分别为:LT,ALS3基因的第+1667处核苷酸由G变为T,第+1904处核苷酸由G变为C,导致相应编码蛋白的第556位由色氨酸(W)突变为亮氨酸(L),第635位由丝氨酸(S)突变为苏氨酸(T);LI,ALS3基因的第+1667处核苷酸由G变为T和+1904处核苷酸由G变为T,导致相应编码蛋白的第556位由色氨酸(W)突变为亮氨酸(L)和635位由丝氨酸(S)突变为异亮氨酸(I);GN,ALS3基因的第+1666处核苷酸由T变为G和+1904处核苷酸由G变为A,导致相应编码蛋白的第556位由色氨酸(W)突变为甘氨酸(G)和635位由丝氨酸(S)突变为天冬酰胺酸(N);GT,ALS3基因的第+1666处核苷酸由T变为G和+1904处核苷酸由G变为C,导致相应编码蛋白的第556位由色氨酸(W)突变为甘氨酸(G)和635位由丝氨酸(S)突变为苏氨酸(T);GI,ALS3基因的第+1666处核苷酸由T变为G和+1904处核苷酸由G变为T,导致相应编码蛋白的第556位由色氨酸(W)突变为甘氨酸(G)和635位由丝氨酸(S)突变为异亮氨酸(I)(表2)。
按照实施例5的方法,将上述5个突变序列构建至植物表达载体pCAMBIA1390质粒(购自澳大利亚CAMBI公司)中,转化拟南芥,获得阳性转基因苗后,苗期喷施60g a.i.ha–1的双草醚进行抗性鉴定。喷药处理3周后,LT和LI的所有转基因拟南芥幼苗生长状态良好,而GN、GT和GI的转基因拟南芥以及未转基因的拟南芥幼苗全部黄化死亡(表2),表明LT和LI氨基酸突变组合的序列在拟南芥中表达具有抗嘧啶水杨酸类除草剂的功能。
表2不同氨基酸突变组合序列在拟南芥中的抗性表现
Figure BDA0002480968650000161
注:斜体加粗字母表示突变的碱基,R代表除草剂处理后,转基因植株生长良好,无药害表现,S代表除草剂处理后油菜植株生长受到严重抑制,表现明显药害,最终菜苗死亡。
虽然以上描述了本发明的具体实施方式,但是本领域的技术人员应当理解,这些仅是举例说明,本发明的保护范围是由所附权利要求书限定的。本领域的技术人员在不背离本发明的原理和实质的前提下,可以对这些实施方式作出多种变更或修改,但这些变更和修改均落入本发明的保护范围。
序列表
<110> 江苏省农业科学院
<120> 油菜抗嘧啶水杨酸类除草剂基因及其应用
<130> IDC200085
<160> 10
<170> PatentIn version 3.5
<210> 1
<211> 1959
<212> DNA
<213> Brassica napus
<400> 1
atggcggcgg caacatcgtc ttctccgatc tccttaaccg ctaaaccttc ttccaaatcc 60
cctctaccca tttccagatt ctcccttccc ttctccttaa ccccacagaa accctcctcc 120
cgtctccacc gtccactcgc catctccgcc gttctcaact cacccgtcaa tgtcgcacct 180
gaaaaaaccg acaagatcaa gactttcatc tcccgctacg ctcccgacga gccccgcaag 240
ggtgctgata tcctcgtgga agccctcgag cgtcaaggcg tcgaaaccgt cttcgcttat 300
cccggaggtg cctccatgga gatccaccaa gccttgactc gctcctccac catccgtaac 360
gtcctccccc gtcacgaaca aggaggagtc ttcgccgccg agggttacgc tcgttcctcc 420
ggcaaaccgg gaatctgcat agccacttcg ggtcccggag ctaccaacct cgtcagcggg 480
ttagccgacg cgatgcttga cagtgttcct ctcgtcgcca tcacaggaca ggtccctcgc 540
cggatgatcg gtactgacgc gttccaagag acgccaatcg ttgaggtaac gaggtctatt 600
acgaaacata actatctggt gatggatgtt gatgacatac ctaggatcgt tcaagaagca 660
ttctttctag ctacttccgg tagacccgga ccggttttgg ttgatgttcc taaggatatt 720
cagcagcagc ttgcgattcc taactgggat caacctatgc gcttgcctgg ctacatgtct 780
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tctaagaggc ctgttttgta cgttggtggt ggaagcttga actcgagtga agaactgggg 900
agatttgtcg agcttactgg gatccctgtt gcgagtacgt tgatggggct tggctcttat 960
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tacgctgtgg agcatagtga tttgttgctg gcgtttggtg ttaggtttga tgaccgtgtc 1080
acgggaaagc tcgaggcgtt tgcgagcagg gctaagattg tgcacataga cattgattct 1140
gctgagattg ggaagaataa gacacctcac gtgtctgtgt gtggtgatgt aaagctggct 1200
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ggagaagcca ttcctccgca gtacgcgatt caggtcctag acgagctaac ccaagggaag 1380
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gaagaactcc gagaagctat tcagacaatg ctggatacac ctggaccgta cctgttggat 1860
gtcatctgtc cgcaccaaga acatgtgtta ccgatgatcc caagtggtgg cactttcaaa 1920
gatgtaataa ccgaagggga tggtcgcact aagtactga 1959
<210> 2
<211> 652
<212> PRT
<213> Brassica napus
<400> 2
Met Ala Ala Ala Thr Ser Ser Ser Pro Ile Ser Leu Thr Ala Lys Pro
1 5 10 15
Ser Ser Lys Ser Pro Leu Pro Ile Ser Arg Phe Ser Leu Pro Phe Ser
20 25 30
Leu Thr Pro Gln Lys Pro Ser Ser Arg Leu His Arg Pro Leu Ala Ile
35 40 45
Ser Ala Val Leu Asn Ser Pro Val Asn Val Ala Pro Glu Lys Thr Asp
50 55 60
Lys Ile Lys Thr Phe Ile Ser Arg Tyr Ala Pro Asp Glu Pro Arg Lys
65 70 75 80
Gly Ala Asp Ile Leu Val Glu Ala Leu Glu Arg Gln Gly Val Glu Thr
85 90 95
Val Phe Ala Tyr Pro Gly Gly Ala Ser Met Glu Ile His Gln Ala Leu
100 105 110
Thr Arg Ser Ser Thr Ile Arg Asn Val Leu Pro Arg His Glu Gln Gly
115 120 125
Gly Val Phe Ala Ala Glu Gly Tyr Ala Arg Ser Ser Gly Lys Pro Gly
130 135 140
Ile Cys Ile Ala Thr Ser Gly Pro Gly Ala Thr Asn Leu Val Ser Gly
145 150 155 160
Leu Ala Asp Ala Met Leu Asp Ser Val Pro Leu Val Ala Ile Thr Gly
165 170 175
Gln Val Pro Arg Arg Met Ile Gly Thr Asp Ala Phe Gln Glu Thr Pro
180 185 190
Ile Val Glu Val Thr Arg Ser Ile Thr Lys His Asn Tyr Leu Val Met
195 200 205
Asp Val Asp Asp Ile Pro Arg Ile Val Gln Glu Ala Phe Phe Leu Ala
210 215 220
Thr Ser Gly Arg Pro Gly Pro Val Leu Val Asp Val Pro Lys Asp Ile
225 230 235 240
Gln Gln Gln Leu Ala Ile Pro Asn Trp Asp Gln Pro Met Arg Leu Pro
245 250 255
Gly Tyr Met Ser Arg Leu Pro Gln Pro Pro Glu Val Ser Gln Leu Gly
260 265 270
Gln Ile Val Arg Leu Ile Ser Glu Ser Lys Arg Pro Val Leu Tyr Val
275 280 285
Gly Gly Gly Ser Leu Asn Ser Ser Glu Glu Leu Gly Arg Phe Val Glu
290 295 300
Leu Thr Gly Ile Pro Val Ala Ser Thr Leu Met Gly Leu Gly Ser Tyr
305 310 315 320
Pro Cys Asn Asp Glu Leu Ser Leu Gln Met Leu Gly Met His Gly Thr
325 330 335
Val Tyr Ala Asn Tyr Ala Val Glu His Ser Asp Leu Leu Leu Ala Phe
340 345 350
Gly Val Arg Phe Asp Asp Arg Val Thr Gly Lys Leu Glu Ala Phe Ala
355 360 365
Ser Arg Ala Lys Ile Val His Ile Asp Ile Asp Ser Ala Glu Ile Gly
370 375 380
Lys Asn Lys Thr Pro His Val Ser Val Cys Gly Asp Val Lys Leu Ala
385 390 395 400
Leu Gln Gly Met Asn Lys Val Leu Glu Asn Arg Ala Glu Glu Leu Lys
405 410 415
Leu Asp Phe Gly Val Trp Arg Ser Glu Leu Ser Glu Gln Lys Gln Lys
420 425 430
Phe Pro Leu Ser Phe Lys Thr Phe Gly Glu Ala Ile Pro Pro Gln Tyr
435 440 445
Ala Ile Gln Val Leu Asp Glu Leu Thr Gln Gly Lys Ala Ile Ile Ser
450 455 460
Thr Gly Val Gly Gln His Gln Met Trp Ala Ala Gln Phe Tyr Lys Tyr
465 470 475 480
Arg Lys Pro Arg Gln Trp Leu Ser Ser Ser Gly Leu Gly Ala Met Gly
485 490 495
Phe Gly Leu Pro Ala Ala Ile Gly Ala Ser Val Ala Asn Pro Asp Ala
500 505 510
Ile Val Val Asp Ile Asp Gly Asp Gly Ser Phe Ile Met Asn Val Gln
515 520 525
Glu Leu Ala Thr Ile Arg Val Glu Asn Leu Pro Val Lys Ile Leu Leu
530 535 540
Leu Asn Asn Gln His Leu Gly Met Val Met Gln Trp Glu Asp Arg Phe
545 550 555 560
Tyr Lys Ala Asn Arg Ala His Thr Tyr Leu Gly Asp Pro Ala Arg Glu
565 570 575
Asn Glu Ile Phe Pro Asn Met Leu Gln Phe Ala Gly Ala Cys Gly Ile
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595 600 605
Thr Met Leu Asp Thr Pro Gly Pro Tyr Leu Leu Asp Val Ile Cys Pro
610 615 620
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625 630 635 640
Asp Val Ile Thr Glu Gly Asp Gly Arg Thr Lys Tyr
645 650
<210> 3
<211> 1959
<212> DNA
<213> Brassica napus
<400> 3
atggcggcgg caacatcgtc ttctccgatc tccttaaccg ctaaaccttc ttccaaatcc 60
cctctaccca tttccagatt ctcccttccc ttctccttaa ccccacagaa accctcctcc 120
cgtctccacc gtccactcgc catctccgcc gttctcaact cacccgtcaa tgtcgcacct 180
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ggcaaaccgg gaatctgcat agccacttcg ggtcccggag ctaccaacct cgtcagcggg 480
ttagccgacg cgatgcttga cagtgttcct ctcgtcgcca tcacaggaca ggtccctcgc 540
cggatgatcg gtactgacgc gttccaagag acgccaatcg ttgaggtaac gaggtctatt 600
acgaaacata actatctggt gatggatgtt gatgacatac ctaggatcgt tcaagaagca 660
ttctttctag ctacttccgg tagacccgga ccggttttgg ttgatgttcc taaggatatt 720
cagcagcagc ttgcgattcc taactgggat caacctatgc gcttgcctgg ctacatgtct 780
aggctgcctc agccaccgga agtttctcag ttaggccaaa tcgttaggtt gatctcggag 840
tctaagaggc ctgttttgta cgttggtggt ggaagcttga actcgagtga agaactgggg 900
agatttgtcg agcttactgg gatccctgtt gcgagtacgt tgatggggct tggctcttat 960
ccttgtaacg atgagttgtc cctgcagatg cttggcatgc acgggactgt gtatgctaac 1020
tacgctgtgg agcatagtga tttgttgctg gcgtttggtg ttaggtttga tgaccgtgtc 1080
acgggaaagc tcgaggcgtt tgcgagcagg gctaagattg tgcacataga cattgattct 1140
gctgagattg ggaagaataa gacacctcac gtgtctgtgt gtggtgatgt aaagctggct 1200
ttgcaaggga tgaacaaggt tcttgagaac cgggcggagg agctcaagct tgatttcggt 1260
gtttggagga gtgagttgag cgagcagaaa cagaagttcc cgttgagctt caaaacgttt 1320
ggagaagcca ttcctccgca gtacgcgatt caggtcctag acgagctaac ccaagggaag 1380
gcaattatca gtactggtgt tggacagcat cagatgtggg cggcgcagtt ttacaagtac 1440
aggaagccga ggcagtggct gtcgtcctca ggactcggag ctatgggttt cggacttcct 1500
gctgcgattg gagcgtctgt ggcgaaccct gatgcgattg ttgtggacat tgacggtgat 1560
ggaagcttca taatgaacgt tcaagagctg gccacaatcc gtgtagagaa tcttcctgtg 1620
aagatactct tgttaaacaa ccagcatctt gggatggtca tgcaattgga agatcggttc 1680
tacaaagcta acagagctca cacttatctc ggggacccgg caagggagaa cgagatcttc 1740
cctaacatgc tgcagtttgc aggagcttgc gggattccag ctgcgagagt gacgaagaaa 1800
gaagaactcc gagaagctat tcagacaatg ctggatacac ctggaccgta cctgttggat 1860
gtcatctgtc cgcaccaaga acatgtgtta ccgatgatcc caaatggtgg cactttcaaa 1920
gatgtaataa ccgaagggga tggtcgcact aagtactga 1959
<210> 4
<211> 652
<212> PRT
<213> Brassica napus
<400> 4
Met Ala Ala Ala Thr Ser Ser Ser Pro Ile Ser Leu Thr Ala Lys Pro
1 5 10 15
Ser Ser Lys Ser Pro Leu Pro Ile Ser Arg Phe Ser Leu Pro Phe Ser
20 25 30
Leu Thr Pro Gln Lys Pro Ser Ser Arg Leu His Arg Pro Leu Ala Ile
35 40 45
Ser Ala Val Leu Asn Ser Pro Val Asn Val Ala Pro Glu Lys Thr Asp
50 55 60
Lys Ile Lys Thr Phe Ile Ser Arg Tyr Ala Pro Asp Glu Pro Arg Lys
65 70 75 80
Gly Ala Asp Ile Leu Val Glu Ala Leu Glu Arg Gln Gly Val Glu Thr
85 90 95
Val Phe Ala Tyr Pro Gly Gly Ala Ser Met Glu Ile His Gln Ala Leu
100 105 110
Thr Arg Ser Ser Thr Ile Arg Asn Val Leu Pro Arg His Glu Gln Gly
115 120 125
Gly Val Phe Ala Ala Glu Gly Tyr Ala Arg Ser Ser Gly Lys Pro Gly
130 135 140
Ile Cys Ile Ala Thr Ser Gly Pro Gly Ala Thr Asn Leu Val Ser Gly
145 150 155 160
Leu Ala Asp Ala Met Leu Asp Ser Val Pro Leu Val Ala Ile Thr Gly
165 170 175
Gln Val Pro Arg Arg Met Ile Gly Thr Asp Ala Phe Gln Glu Thr Pro
180 185 190
Ile Val Glu Val Thr Arg Ser Ile Thr Lys His Asn Tyr Leu Val Met
195 200 205
Asp Val Asp Asp Ile Pro Arg Ile Val Gln Glu Ala Phe Phe Leu Ala
210 215 220
Thr Ser Gly Arg Pro Gly Pro Val Leu Val Asp Val Pro Lys Asp Ile
225 230 235 240
Gln Gln Gln Leu Ala Ile Pro Asn Trp Asp Gln Pro Met Arg Leu Pro
245 250 255
Gly Tyr Met Ser Arg Leu Pro Gln Pro Pro Glu Val Ser Gln Leu Gly
260 265 270
Gln Ile Val Arg Leu Ile Ser Glu Ser Lys Arg Pro Val Leu Tyr Val
275 280 285
Gly Gly Gly Ser Leu Asn Ser Ser Glu Glu Leu Gly Arg Phe Val Glu
290 295 300
Leu Thr Gly Ile Pro Val Ala Ser Thr Leu Met Gly Leu Gly Ser Tyr
305 310 315 320
Pro Cys Asn Asp Glu Leu Ser Leu Gln Met Leu Gly Met His Gly Thr
325 330 335
Val Tyr Ala Asn Tyr Ala Val Glu His Ser Asp Leu Leu Leu Ala Phe
340 345 350
Gly Val Arg Phe Asp Asp Arg Val Thr Gly Lys Leu Glu Ala Phe Ala
355 360 365
Ser Arg Ala Lys Ile Val His Ile Asp Ile Asp Ser Ala Glu Ile Gly
370 375 380
Lys Asn Lys Thr Pro His Val Ser Val Cys Gly Asp Val Lys Leu Ala
385 390 395 400
Leu Gln Gly Met Asn Lys Val Leu Glu Asn Arg Ala Glu Glu Leu Lys
405 410 415
Leu Asp Phe Gly Val Trp Arg Ser Glu Leu Ser Glu Gln Lys Gln Lys
420 425 430
Phe Pro Leu Ser Phe Lys Thr Phe Gly Glu Ala Ile Pro Pro Gln Tyr
435 440 445
Ala Ile Gln Val Leu Asp Glu Leu Thr Gln Gly Lys Ala Ile Ile Ser
450 455 460
Thr Gly Val Gly Gln His Gln Met Trp Ala Ala Gln Phe Tyr Lys Tyr
465 470 475 480
Arg Lys Pro Arg Gln Trp Leu Ser Ser Ser Gly Leu Gly Ala Met Gly
485 490 495
Phe Gly Leu Pro Ala Ala Ile Gly Ala Ser Val Ala Asn Pro Asp Ala
500 505 510
Ile Val Val Asp Ile Asp Gly Asp Gly Ser Phe Ile Met Asn Val Gln
515 520 525
Glu Leu Ala Thr Ile Arg Val Glu Asn Leu Pro Val Lys Ile Leu Leu
530 535 540
Leu Asn Asn Gln His Leu Gly Met Val Met Gln Leu Glu Asp Arg Phe
545 550 555 560
Tyr Lys Ala Asn Arg Ala His Thr Tyr Leu Gly Asp Pro Ala Arg Glu
565 570 575
Asn Glu Ile Phe Pro Asn Met Leu Gln Phe Ala Gly Ala Cys Gly Ile
580 585 590
Pro Ala Ala Arg Val Thr Lys Lys Glu Glu Leu Arg Glu Ala Ile Gln
595 600 605
Thr Met Leu Asp Thr Pro Gly Pro Tyr Leu Leu Asp Val Ile Cys Pro
610 615 620
His Gln Glu His Val Leu Pro Met Ile Pro Asn Gly Gly Thr Phe Lys
625 630 635 640
Asp Val Ile Thr Glu Gly Asp Gly Arg Thr Lys Tyr
645 650
<210> 5
<211> 20
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> ALS1 primer 1
<400> 5
gtggatctaa ctgttcttga 20
<210> 6
<211> 19
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> ALS1 primer 2
<400> 6
agagatgaag ctggtgatc 19
<210> 7
<211> 21
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> ALS2 primer 1
<400> 7
gagtgttgcg agaaattgct t 21
<210> 8
<211> 24
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> ALS2 primer 2
<400> 8
ttgattattc tatgctctct tctg 24
<210> 9
<211> 23
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> ALS3 primer 1
<400> 9
atggttagat gagagagaga gag 23
<210> 10
<211> 21
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> ALS3 primer 2
<400> 10
ggtcgcacta agtactgaga g 21

Claims (14)

1.编码突变的乙酰乳酸合酶蛋白的分离的核酸,所述突变的乙酰乳酸合酶蛋白发生如下的突变:
在对应于SEQ ID NO:2的位置556的位置处色氨酸(W)突变为亮氨酸(L);和
在对应于SEQ ID NO:2的位置635的位置处丝氨酸(S)突变为天冬酰胺(N)或苏氨酸(T)。
2.权利要求1所述的核酸,其中分离的核酸的核苷酸序列如SEQ ID NO:3所示。
3.权利要求1所述的核酸,其中突变的乙酰乳酸合酶蛋白的氨基酸序列如SEQ ID NO:4所示。
4.表达盒或载体,其包含权利要求1所述的核酸。
5.突变的乙酰乳酸合酶蛋白,其发生如下的突变:
在对应于SEQ ID NO:2的位置556的位置处色氨酸(W)突变为亮氨酸(L);和
在对应于SEQ ID NO:2的位置635的位置处丝氨酸(S)突变为天冬酰胺(N)或苏氨酸(T)。
6.权利要求5所述的突变的乙酰乳酸合酶蛋白,其中所述蛋白在对应于SEQ ID NO:2的位置556的位置处色氨酸(W)突变为亮氨酸(L)和在对应于SEQ ID NO:2的位置635的位置处丝氨酸(S)突变为天冬酰胺(N)。
7.权利要求5所述的乙酰乳酸合酶蛋白,其中所述突变的乙酰乳酸合酶蛋白的氨基酸序列如SEQ ID NO:4所示。
8.权利要求1所述的核酸或权利要求4所述的表达盒或载体或权利要求5所述的突变的乙酰乳酸合酶蛋白用于产生抗嘧啶水杨酸类除草剂植物的用途。
9.权利要求8所述的用途,其中所述植物为油菜,所述核酸编码甘蓝型油菜(Brassicanapus)ALS3蛋白。
10.产生具有嘧啶水杨酸类除草剂抗性的植物的方法,其特征在于,包括如下步骤:
将权利要求1所述的核酸导入植物,其中所述植物表达权利要求5所述的突变的乙酰乳酸合酶蛋白并具有嘧啶水杨酸类除草剂抗性。
11.权利要求10所述的方法,其中通过转基因、杂交、回交或无性繁殖步骤将权利要求1所述的核酸导入植物。
12.在含有油菜植物的田地中控制杂草的方法,所述方法包括施用有效量的嘧啶水杨酸类除草剂至含有所述杂草和油菜植物的所述田地,所述油菜植物包含编码突变的乙酰乳酸合酶蛋白的分离的核酸,所述突变的乙酰乳酸合酶蛋白发生如下的突变:
在对应于SEQ ID NO:2的位置556的位置处色氨酸(W)突变为亮氨酸(L);和
在对应于SEQ ID NO:2的位置635的位置处丝氨酸(S)突变为天冬酰胺(N)或苏氨酸(T)。
13.权利要求12所述的方法,其中所述突变的乙酰乳酸合酶蛋白在对应于SEQ ID NO:2的位置556的位置处色氨酸(W)突变为亮氨酸(L)和在对应于SEQ ID NO:2的位置635的位置处丝氨酸(S)突变为天冬酰胺(N)。
14.权利要求12所述的方法,其中所述突变的乙酰乳酸合酶蛋白的氨基酸序列如SEQID NO:4所示。
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