CN111948395A - 用于诊断三阴性乳腺癌免疫调节亚型的四联标志物及其应用 - Google Patents
用于诊断三阴性乳腺癌免疫调节亚型的四联标志物及其应用 Download PDFInfo
- Publication number
- CN111948395A CN111948395A CN202010837920.4A CN202010837920A CN111948395A CN 111948395 A CN111948395 A CN 111948395A CN 202010837920 A CN202010837920 A CN 202010837920A CN 111948395 A CN111948395 A CN 111948395A
- Authority
- CN
- China
- Prior art keywords
- breast cancer
- negative breast
- triple negative
- subtype
- csf2rb
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Pending
Links
- 208000003721 Triple Negative Breast Neoplasms Diseases 0.000 title claims abstract description 57
- 208000022679 triple-negative breast carcinoma Diseases 0.000 title claims abstract description 56
- 239000003550 marker Substances 0.000 title abstract description 8
- 230000003832 immune regulation Effects 0.000 title abstract description 6
- 108700003785 Baculoviral IAP Repeat-Containing 3 Proteins 0.000 claims abstract description 43
- 102000051819 Baculoviral IAP Repeat-Containing 3 Human genes 0.000 claims abstract description 43
- 101001090688 Homo sapiens Lymphocyte cytosolic protein 2 Proteins 0.000 claims abstract description 41
- 102100034709 Lymphocyte cytosolic protein 2 Human genes 0.000 claims abstract description 41
- 101150104237 Birc3 gene Proteins 0.000 claims abstract description 40
- 101100379220 Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) API2 gene Proteins 0.000 claims abstract description 40
- 230000004957 immunoregulator effect Effects 0.000 claims abstract description 5
- 102100027385 Hematopoietic lineage cell-specific protein Human genes 0.000 claims description 39
- 101001009091 Homo sapiens Hematopoietic lineage cell-specific protein Proteins 0.000 claims description 39
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 claims description 16
- 230000002519 immonomodulatory effect Effects 0.000 claims description 14
- 239000000090 biomarker Substances 0.000 claims description 12
- 230000004083 survival effect Effects 0.000 claims description 10
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 claims description 8
- 230000000694 effects Effects 0.000 claims description 6
- 239000003112 inhibitor Substances 0.000 claims description 5
- 239000003814 drug Substances 0.000 claims description 4
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 claims description 4
- 238000012360 testing method Methods 0.000 claims description 4
- 230000001024 immunotherapeutic effect Effects 0.000 claims description 2
- 102100039061 Cytokine receptor common subunit beta Human genes 0.000 claims 8
- 101001033280 Homo sapiens Cytokine receptor common subunit beta Proteins 0.000 claims 8
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 abstract description 10
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 abstract description 10
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 abstract description 7
- 206010028980 Neoplasm Diseases 0.000 abstract description 6
- 238000004393 prognosis Methods 0.000 abstract description 6
- 102100021662 Baculoviral IAP repeat-containing protein 3 Human genes 0.000 abstract description 2
- 101710177962 Baculoviral IAP repeat-containing protein 3 Proteins 0.000 abstract description 2
- 102000007644 Colony-Stimulating Factors Human genes 0.000 abstract description 2
- 108010071942 Colony-Stimulating Factors Proteins 0.000 abstract description 2
- 230000001086 cytosolic effect Effects 0.000 abstract description 2
- 238000007405 data analysis Methods 0.000 abstract description 2
- 210000003958 hematopoietic stem cell Anatomy 0.000 abstract description 2
- 210000004698 lymphocyte Anatomy 0.000 abstract description 2
- 230000006907 apoptotic process Effects 0.000 abstract 1
- 230000002401 inhibitory effect Effects 0.000 abstract 1
- -1 CSF2RB Proteins 0.000 description 30
- 101001117317 Homo sapiens Programmed cell death 1 ligand 1 Proteins 0.000 description 15
- 230000014509 gene expression Effects 0.000 description 14
- 108010074708 B7-H1 Antigen Proteins 0.000 description 13
- 102000008096 B7-H1 Antigen Human genes 0.000 description 13
- 102100024216 Programmed cell death 1 ligand 1 Human genes 0.000 description 13
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 11
- 239000000523 sample Substances 0.000 description 7
- 206010006187 Breast cancer Diseases 0.000 description 6
- 208000026310 Breast neoplasm Diseases 0.000 description 6
- LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N Ethanol Chemical compound CCO LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- CTQNGGLPUBDAKN-UHFFFAOYSA-N O-Xylene Chemical compound CC1=CC=CC=C1C CTQNGGLPUBDAKN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 238000000034 method Methods 0.000 description 6
- 239000008096 xylene Substances 0.000 description 6
- 239000000427 antigen Substances 0.000 description 5
- 102000036639 antigens Human genes 0.000 description 5
- 108091007433 antigens Proteins 0.000 description 5
- 210000000481 breast Anatomy 0.000 description 5
- 238000009169 immunotherapy Methods 0.000 description 5
- WZUVPPKBWHMQCE-UHFFFAOYSA-N Haematoxylin Chemical compound C12=CC(O)=C(O)C=C2CC2(O)C1C1=CC=C(O)C(O)=C1OC2 WZUVPPKBWHMQCE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 102000003992 Peroxidases Human genes 0.000 description 3
- 230000007365 immunoregulation Effects 0.000 description 3
- 108040007629 peroxidase activity proteins Proteins 0.000 description 3
- 238000007789 sealing Methods 0.000 description 3
- 239000001509 sodium citrate Substances 0.000 description 3
- NLJMYIDDQXHKNR-UHFFFAOYSA-K sodium citrate Chemical compound O.O.[Na+].[Na+].[Na+].[O-]C(=O)CC(O)(CC([O-])=O)C([O-])=O NLJMYIDDQXHKNR-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 3
- 238000005406 washing Methods 0.000 description 3
- 108091007065 BIRCs Proteins 0.000 description 2
- 102100038595 Estrogen receptor Human genes 0.000 description 2
- MHAJPDPJQMAIIY-UHFFFAOYSA-N Hydrogen peroxide Chemical compound OO MHAJPDPJQMAIIY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 102100025803 Progesterone receptor Human genes 0.000 description 2
- 229920004890 Triton X-100 Polymers 0.000 description 2
- 239000013504 Triton X-100 Substances 0.000 description 2
- 239000002250 absorbent Substances 0.000 description 2
- 230000002745 absorbent Effects 0.000 description 2
- 238000007792 addition Methods 0.000 description 2
- 238000011161 development Methods 0.000 description 2
- 238000003745 diagnosis Methods 0.000 description 2
- 108010038795 estrogen receptors Proteins 0.000 description 2
- 238000010438 heat treatment Methods 0.000 description 2
- 238000011534 incubation Methods 0.000 description 2
- 239000007788 liquid Substances 0.000 description 2
- 230000036210 malignancy Effects 0.000 description 2
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 2
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 2
- 108090000468 progesterone receptors Proteins 0.000 description 2
- 230000019491 signal transduction Effects 0.000 description 2
- UCSJYZPVAKXKNQ-HZYVHMACSA-N streptomycin Chemical compound CN[C@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](CO)O[C@H]1O[C@@H]1[C@](C=O)(O)[C@H](C)O[C@H]1O[C@@H]1[C@@H](NC(N)=N)[C@H](O)[C@@H](NC(N)=N)[C@H](O)[C@H]1O UCSJYZPVAKXKNQ-HZYVHMACSA-N 0.000 description 2
- 239000008399 tap water Substances 0.000 description 2
- 235000020679 tap water Nutrition 0.000 description 2
- 102100032187 Androgen receptor Human genes 0.000 description 1
- 229940088872 Apoptosis inhibitor Drugs 0.000 description 1
- 101100463133 Caenorhabditis elegans pdl-1 gene Proteins 0.000 description 1
- 101100314454 Caenorhabditis elegans tra-1 gene Proteins 0.000 description 1
- 102000004127 Cytokines Human genes 0.000 description 1
- 108090000695 Cytokines Proteins 0.000 description 1
- 102100024422 GTPase IMAP family member 7 Human genes 0.000 description 1
- 101000851181 Homo sapiens Epidermal growth factor receptor Proteins 0.000 description 1
- 101000833390 Homo sapiens GTPase IMAP family member 7 Proteins 0.000 description 1
- 101001012157 Homo sapiens Receptor tyrosine-protein kinase erbB-2 Proteins 0.000 description 1
- VEXZGXHMUGYJMC-UHFFFAOYSA-N Hydrochloric acid Chemical compound Cl VEXZGXHMUGYJMC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 101100519207 Mus musculus Pdcd1 gene Proteins 0.000 description 1
- 241000283973 Oryctolagus cuniculus Species 0.000 description 1
- 102100030086 Receptor tyrosine-protein kinase erbB-2 Human genes 0.000 description 1
- 108010080146 androgen receptors Proteins 0.000 description 1
- 230000001640 apoptogenic effect Effects 0.000 description 1
- 239000000158 apoptosis inhibitor Substances 0.000 description 1
- 230000000903 blocking effect Effects 0.000 description 1
- 238000009835 boiling Methods 0.000 description 1
- 239000012888 bovine serum Substances 0.000 description 1
- 201000011510 cancer Diseases 0.000 description 1
- 238000002619 cancer immunotherapy Methods 0.000 description 1
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 description 1
- 230000001413 cellular effect Effects 0.000 description 1
- 230000002596 correlated effect Effects 0.000 description 1
- 239000006059 cover glass Substances 0.000 description 1
- 230000007547 defect Effects 0.000 description 1
- 238000002405 diagnostic procedure Methods 0.000 description 1
- 238000010790 dilution Methods 0.000 description 1
- 239000012895 dilution Substances 0.000 description 1
- 201000010099 disease Diseases 0.000 description 1
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 description 1
- 238000004043 dyeing Methods 0.000 description 1
- 238000011223 gene expression profiling Methods 0.000 description 1
- 230000003394 haemopoietic effect Effects 0.000 description 1
- 210000002865 immune cell Anatomy 0.000 description 1
- 230000008105 immune reaction Effects 0.000 description 1
- 238000003364 immunohistochemistry Methods 0.000 description 1
- 229940088592 immunologic factor Drugs 0.000 description 1
- 239000000367 immunologic factor Substances 0.000 description 1
- 230000002779 inactivation Effects 0.000 description 1
- 230000008595 infiltration Effects 0.000 description 1
- 238000001764 infiltration Methods 0.000 description 1
- 108091006086 inhibitor proteins Proteins 0.000 description 1
- 230000009545 invasion Effects 0.000 description 1
- 239000012528 membrane Substances 0.000 description 1
- 230000007935 neutral effect Effects 0.000 description 1
- 238000012758 nuclear staining Methods 0.000 description 1
- 230000003287 optical effect Effects 0.000 description 1
- 239000012188 paraffin wax Substances 0.000 description 1
- 239000011541 reaction mixture Substances 0.000 description 1
- 230000004044 response Effects 0.000 description 1
- 238000012216 screening Methods 0.000 description 1
- 238000010186 staining Methods 0.000 description 1
- 239000012192 staining solution Substances 0.000 description 1
- 229960005322 streptomycin Drugs 0.000 description 1
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
Images
Classifications
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
- G01N33/53—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
- G01N33/574—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor for cancer
- G01N33/57407—Specifically defined cancers
- G01N33/57415—Specifically defined cancers of breast
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
- G01N33/53—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
- G01N33/574—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor for cancer
- G01N33/57484—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor for cancer involving compounds serving as markers for tumor, cancer, neoplasia, e.g. cellular determinants, receptors, heat shock/stress proteins, A-protein, oligosaccharides, metabolites
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Immunology (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Urology & Nephrology (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Hematology (AREA)
- Cell Biology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Oncology (AREA)
- Hospice & Palliative Care (AREA)
- Food Science & Technology (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- General Physics & Mathematics (AREA)
- Pathology (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
Abstract
本发明涉及用于诊断三阴性乳腺癌免疫调节亚型的四联标志物及其应用。本发明通过实验和肿瘤大数据分析，发现细胞凋亡抑制蛋白C‑IAP2(cIAP2，BIRC3)，集落刺激因子2受体β(CSF2RB)，造血系细胞特异蛋白(HCLS1)和淋巴细胞胞浆蛋白2(LCP2)在三阴性乳腺癌免疫调节亚型中高表达，可作为三阴性乳腺癌免疫调节亚型的诊断标志物，而且还具有潜在的预后和指导三阴性乳腺癌免疫治疗的价值。
Description
技术领域
本发明涉及疾病的分子诊断领域，具体地说，涉及用于诊断三阴性乳腺癌免疫调节亚型的四联标志物及其应用。
背景技术
三阴性乳腺癌(triple negative breast cancer，TNBC)是指雌激素受体(ER)、孕激素受体(PR)和人表皮生长因子受体(HER2)均阴性的一种特殊类型的乳腺癌。2011年，Lehmann等对587例TNBC的21组基因表达谱数据进行聚类分析，发现TNBC可进一步分为6种亚型，包括两种基底样亚型(BL1和BL2)、免疫调节亚型(IM)、间充质亚型(M)、间充质干细胞样亚型(MSL)、管腔雄激素受体亚型(LAR)以及不确定的亚型(UNS)。这6种亚型呈现独特的基因表达谱，且与不同的信号转导通路相关。三阴性乳腺癌免疫调节亚型的特点是高表达免疫因子、细胞因子等信号途径基因，存在大量与侵袭有关的免疫细胞浸润。免疫调节型三阴性乳腺癌与肿瘤免疫反应密切相关，为寻找有效的免疫治疗手段提供了突破口。但是目前能有效区分三阴性乳腺癌免疫调节型的分子标志物报道极少，而且除程序性死亡受体1(PD-1)和程序性死亡配体1(PD-L1)外，目前能预测三阴性乳腺癌免疫治疗反应的分子标志物也极少。
细胞凋亡抑制蛋白C-IAP2(cellular inhibitor of apoptotic protein-2，cIAP2，BIRC3)，集落刺激因子2受体β(colony stimulating factor 2receptor beta，CSF2RB)，造血系细胞特异蛋白(Hematopoietic lineage cell-specific protein，HCLS1)，淋巴细胞胞浆蛋白2(Lymphocyte cytosolic protein 2，LCP2)在三阴性乳腺癌免疫调节亚型中高表达和四者联合检测以提高乳腺癌的诊断率、且与患者PD-L1表达高度正相关目前尚未见报道。
发明内容
本发明的目的是针对现有技术中的不足，提供新型的三阴性乳腺癌免疫调节亚型的诊断、预后、免疫治疗效果评估的标志物。
第一方面，本发明提供了BIRC3，CSF2RB，HCLS1和LCP2中的任一种或几种作为生物标志物在制备三阴性乳腺癌免疫调节亚型的诊断试剂或试剂盒中的应用。
优选地，所述诊断试剂或试剂盒用于判断受试样品属于或不属于三阴性乳腺癌免疫调节亚型。
第二方面，本发明提供了BIRC3，CSF2RB，HCLS1和LCP2中的任一种或几种作为生物标志物在制备三阴性乳腺癌的诊断试剂或试剂盒中的应用。
优选地，所述诊断试剂或试剂盒用于判断受试样品属于或不属于三阴性乳腺癌。
第三方面，本发明提供了BIRC3，CSF2RB，HCLS1和LCP2中的任一种或几种作为生物标志物在制备三阴性乳腺癌免疫调节亚型的生存预后试剂或试剂盒中的应用。
第四方面，本发明提供了BIRC3，CSF2RB，HCLS1和LCP2中的任一种或几种作为生物标志物在制备三阴性乳腺癌的生存预后试剂或试剂盒中的应用。
第五方面，本发明提供了BIRC3，CSF2RB，HCLS1和LCP2中的任一种或几种作为生物标志物在制备预测三阴性乳腺癌免疫调节亚型的免疫治疗效果的试剂或试剂盒中的应用。
第六方面，本发明提供了BIRC3，CSF2RB，HCLS1和LCP2中的任一种或几种作为生物标志物在制备预测三阴性乳腺癌的免疫治疗效果的试剂或试剂盒中的应用。
第七方面，本发明提供了BIRC3，CSF2RB，HCLS1和LCP2中的任一种或几种的抑制剂在制备治疗三阴性乳腺癌免疫调节亚型的药物中的应用。
第八方面，本发明提供了BIRC3，CSF2RB，HCLS1和LCP2中的任一种或几种的抑制剂在制备治疗三阴性乳腺癌的药物中的应用。
以上所述“BIRC3”、“CSF2RB”、“HCLS1”、“LCP2”均代表蛋白或基因。对于BIRC3蛋白，可参见NM_001165.5；对于CSF2RB蛋白，可参见NM_000395.3；对于HCLS1蛋白，可参见NM_005335.6；对于LCP2蛋白，可参见NM_005565.5。
本发明优点在于：
1、目前关于三阴性乳腺癌免疫调节亚型的鉴定，主要依赖于高通量基因组学筛查，缺乏有效的分子诊断方法，及免疫治疗指导标志物。本发明通过实验和肿瘤大数据分析，发现BIRC3，CSF2RB，HCLS1和LCP2可作为三阴性乳腺癌免疫调节亚型的诊断标志物，且具有潜在的预后和三阴性乳腺癌免疫治疗价值。
2、本发明的各标志物具备很高的诊断效用。
3、本发明的四种标志物联合具备很高的诊断效用。
附图说明
图1：BIRC3，CSF2RB，HCLS1，LCP2和PD-L1在乳腺组织标本中的表达比较。TNBC，三阴性乳腺癌；Non-TNBC，非三阴性乳腺癌。
图2A～图2E：BIRC3，CSF2RB，HCLS1，LCP2和PDL1(CD274)在美国TCGA三阴性乳腺癌各亚型中表达比较。
图3A～图3F：BIRC3，CSF2RB，HCLS1，LCP2和PD-L1对三阴性乳腺癌患者生存预后的影响。
图4A～图4D：BIRC3，CSF2RB，HCLS1和LCP2与免疫检查点分子PD-L1(CD274)的相关性。
具体实施方式
下面结合附图对本发明提供的具体实施方式作详细说明。
实施例1
一、BIRC3，CSF2RB，HCLS1，LCP2和PD-L1在乳腺组织标本中的表达比较，包括5例三阴性乳腺恶性肿瘤和5例非三阴性乳腺恶性肿瘤
1实验方法
1)脱蜡和复水：把病人石蜡切片放在切片架上置于60℃烘箱中进行烘烤30分钟后，将放置好组织片的切片架放入二甲苯溶液脱蜡中和梯度乙醇溶液中复水。
2)抗原修复：抗原修复使用柠檬酸钠微波抗原法。在抗原修复盒中加满0.1mol/L，pH＝6.0的柠橼酸钠抗原修复液，置入微波炉中加热3分钟至沸腾，然后将切片连同切片架迅速放入沸腾的柠橼酸钠溶液中，并注意确保液平面超过切片，盖紧盖子，迅速放回微波炉中，用中高火持续加热12分钟。
3)灭活内源性过氧化物酶：滴加0.3％过氧化氢于标本上并确保组织被完全覆盖，用以灭活内源性过氧化物酶，室温静置15分钟后，再用PBS洗片5分钟×3次。
4)破膜：将冷却至室温的切片取出后用PBS洗片5分钟，然后平铺置于免疫组化专用的避光湿盒内。配制破膜液(0.01M PBS：tritonX-100，配制比例为300：3)，将破膜液滴加在切片组织上，室温静置15分钟后，PBS冲洗5分钟×3次。
5)封闭：吸水纸拭去组织外周的PBS，切片平铺于湿盒内。配制封闭液(0.01M PBS：10％牛血清：tritonX-100，配制比例为270：30：1)，将破膜液滴加在切片组织上，整体置于37℃水浴锅中封闭1h。
6)一抗孵育：倒去切片上的封闭液，分别滴加一定稀释比例的一抗a rabbitmonoclonal anti-BIRC3 antibody(24304-1-AP,ProteinTech Group,Chicago,IL,USA)，anti-CSF2RB antibody(27148-1-AP,ProteinTech Group,Chicago,IL,USA)，anti-HCLS1antibody(25003-1-AP,ProteinTech Group,Chicago,IL,USA)，anti-LCP2 antibody(12728-1-AP,ProteinTech Group,Chicago,IL,USA)，孵育过夜。
7)二抗孵育：将湿盒从4℃冰箱取出，用0.01M PBS冲洗5分钟×3次，吸水纸擦去切片周边的PBS。滴加二抗(免疫显色剂，上海杰浩，鼠兔通用)50μl室温孵育30分钟(已被链霉素标记，可亲和过氧化物酶)，PBS洗5分钟×3次。
8)DAB染色：取DAB染色液(上海杰浩)50μL滴加在组织上，确保溶液覆盖组织。
9)苏木素染核：切片放在切片架上，整体放入苏木素染缸中，等待2-3分钟，取出后用自来水冲洗2-3分钟，放入稀盐酸中酸化5秒钟，再在自来水下冲洗2-3分钟。
10)脱水及透明：在梯度乙醇中脱水各8分钟(乙醇梯度依次为75％、85％、95％、100％)，然后在二甲苯溶液中透明约10分钟(二甲苯溶液分为2个缸，依次为二甲苯Ⅰ、二甲苯Ⅱ)。
11)封片及拍照：取出切片，待二甲苯挥发后，滴加中性树胶，盖上盖玻片后固定盖玻片，然后在光学显微镜(BH-2，Olympus，日本)下观察及拍照。
2实验结果
BIRC3，CSF2RB，HCLS1，LCP2和PDL1在三阴性乳腺癌组织中表达增高。且与免疫检查点分子PDL1相比，BIRC3，CSF2RB，HCLS1和LCP2在三阴性乳腺癌的表达丰度更高(图1)。表明BIRC3，CSF2RB，HCLS1和LCP2是三阴性乳腺癌发生发展的标志物。
二、BIRC3，CSF2RB，HCLS1，LCP2和PDL1(CD274)在美国TCGA三阴性乳腺癌各亚型中表达比较
1实验方法
从TCGA数据库下载乳腺癌转录组数据以及病人的临床数据。共正常癌旁114例，Luminal型566例，HER2阳性37例，三阴性116例(其中BL1型13例，BL2型11例，IM型20例，LAR型8例，MSL型8例，M型29例以及未定义的亚型27例)。使用Ualcan数据库比较BIRC3，CSF2RB，HCLS1，LCP2和PDL1(CD274)在这些样品中的表达差异。
2实验结果
与正常乳腺组织相比，BIRC3，CSF2RB，HCLS1，LCP2和PDL1(CD274)在IM亚型中高表达。与TNBC其他亚型相比，BTN3A1，BIRC3，CSF2RB，GIMAP7和PD-L1(CD274)在TCGA数据库中免疫调节型三阴性乳腺癌亚型中均特异性高表达(图2A～图2E)。表明BIRC3，CSF2RB，HCLS1，LCP2和PDL1(CD274)是免疫调节型三阴性乳腺癌发生发展的标志物。
三、BIRC3，CSF2RB，HCLS1，LCP2和PD-L1对三阴性乳腺癌患者生存预后的影响
1实验方法
使用KM-PLOTTER在线数据库评价BIRC3，CSF2RB，HCLS1，LCP2和PD-L1对三阴性乳腺癌患者的生存预后的影响。对于BIRC3使用210538_s_at探针，高低表达临界值268；对于CSF2RB使用205159_at探针，高低表达临界值423；对于HCLS1使用202957_at探针，高低表达临界值1220；对于LCP2，使用205269_at探针，高低表达临界值642；对于PDL1使用探针223834_at，高低表达临界值115；四基因联合预测生存的高低表达临界值530。
2实验结果
BIRC3，CSF2RB，HCLS1，LCP2和PD-L1在三阴性乳腺癌中具有预后价值，且4个分子标记物联合在三阴性乳腺癌中也具有生存预后价值(图3A～图3F)。
四、BIRC3，CSF2RB，HCLS1和LCP2与免疫检查点分子PD-L1(CD274)的相关性。
1实验方法
从TCGA数据库下载乳腺癌转录组数据以及病人的临床数据。共计1104例乳腺癌样品，利用Starbase数据库分析BIRC3，CSF2RB，HCLS1和LCP2与PDL1的相关性。
2实验结果
BIRC3，CSF2RB，HCLS1和LCP2与免疫检查点分子PD-L1高度正相关，具有潜在的免疫治疗的分子指征(图4A～图4D)。
综上所述，BIRC3，CSF2RB，HCLS1和LCP2在三阴性乳腺癌免疫调节亚型中表达增高，且与患者生存预后相关，且与免疫检查点PDL1高度正相关，BIRC3，CSF2RB，HCLS1和LCP2可以作为检测三阴性乳腺癌免疫调节亚型的标志物和免疫治疗的潜在靶点。
以上所述仅是本发明的优选实施方式，应当指出，对于本技术领域的普通技术人员，在不脱离本发明方法的前提下，还可以做出若干改进和补充，这些改进和补充也应视为本发明的保护范围。
Claims (10)
1.BIRC3，CSF2RB，HCLS1和LCP2中的任一种或几种作为生物标志物在制备三阴性乳腺癌免疫调节亚型的诊断试剂或试剂盒中的应用。
2.根据权利要求1所述的应用，其特征在于，所述诊断试剂或试剂盒用于判断受试样品属于或不属于三阴性乳腺癌免疫调节亚型。
3.BIRC3，CSF2RB，HCLS1和LCP2中的任一种或几种作为生物标志物在制备三阴性乳腺癌的诊断试剂或试剂盒中的应用。
4.根据权利要求3所述的应用，其特征在于，所述诊断试剂或试剂盒用于判断受试样品属于或不属于三阴性乳腺癌。
5.BIRC3，CSF2RB，HCLS1和LCP2中的任一种或几种作为生物标志物在制备三阴性乳腺癌免疫调节亚型的生存预后试剂或试剂盒中的应用。
6.BIRC3，CSF2RB，HCLS1和LCP2中的任一种或几种作为生物标志物在制备三阴性乳腺癌的生存预后试剂或试剂盒中的应用。
7.BIRC3，CSF2RB，HCLS1和LCP2中的任一种或几种作为生物标志物在制备预测三阴性乳腺癌免疫调节亚型的免疫治疗效果的试剂或试剂盒中的应用。
8.BIRC3，CSF2RB，HCLS1和LCP2中的任一种或几种作为生物标志物在制备预测三阴性乳腺癌的免疫治疗效果的试剂或试剂盒中的应用。
9.BIRC3，CSF2RB，HCLS1和LCP2中的任一种或几种的抑制剂在制备治疗三阴性乳腺癌免疫调节亚型的药物中的应用。
10.BIRC3，CSF2RB，HCLS1和LCP2中的任一种或几种的抑制剂在制备治疗三阴性乳腺癌的药物中的应用。
Priority Applications (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| CN202010837920.4A CN111948395A (zh) | 2020-08-19 | 2020-08-19 | 用于诊断三阴性乳腺癌免疫调节亚型的四联标志物及其应用 |
Applications Claiming Priority (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| CN202010837920.4A CN111948395A (zh) | 2020-08-19 | 2020-08-19 | 用于诊断三阴性乳腺癌免疫调节亚型的四联标志物及其应用 |
Publications (1)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| CN111948395A true CN111948395A (zh) | 2020-11-17 |
Family
ID=73358598
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| CN202010837920.4A Pending CN111948395A (zh) | 2020-08-19 | 2020-08-19 | 用于诊断三阴性乳腺癌免疫调节亚型的四联标志物及其应用 |
Country Status (1)
| Country | Link |
|---|---|
| CN (1) | CN111948395A (zh) |
Cited By (1)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| CN116083590A (zh) * | 2023-03-23 | 2023-05-09 | 广州爱仁生物医药科技有限公司 | 一种基因检测试剂盒及其制备方法和应用 |
Citations (4)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| JP2012085554A (ja) * | 2010-10-18 | 2012-05-10 | Shinya Watanabe | 乳がんのサブタイプの判別方法 |
| US20140303133A1 (en) * | 2011-11-18 | 2014-10-09 | Vanderbilt University | Markers of Triple-Negative Breast Cancer And Uses Thereof |
| CN110004228A (zh) * | 2019-04-03 | 2019-07-12 | 清华大学深圳研究生院 | 一种与乳腺癌分子分型相关的诊断标志物及其用途 |
| CN111542542A (zh) * | 2017-12-21 | 2020-08-14 | 德比奥药物国际股份有限公司 | 使用iap拮抗剂和抗pd-1分子的联合抗癌疗法 |
-
2020
- 2020-08-19 CN CN202010837920.4A patent/CN111948395A/zh active Pending
Patent Citations (4)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| JP2012085554A (ja) * | 2010-10-18 | 2012-05-10 | Shinya Watanabe | 乳がんのサブタイプの判別方法 |
| US20140303133A1 (en) * | 2011-11-18 | 2014-10-09 | Vanderbilt University | Markers of Triple-Negative Breast Cancer And Uses Thereof |
| CN111542542A (zh) * | 2017-12-21 | 2020-08-14 | 德比奥药物国际股份有限公司 | 使用iap拮抗剂和抗pd-1分子的联合抗癌疗法 |
| CN110004228A (zh) * | 2019-04-03 | 2019-07-12 | 清华大学深圳研究生院 | 一种与乳腺癌分子分型相关的诊断标志物及其用途 |
Non-Patent Citations (4)
| Title |
|---|
| JILONG GUO 等: "Screening and identification of potential biomarkers in triple-negative breast cancer by integrated analysis", 《ONCOLOGY REPORTS》 * |
| JINGUO ZHANG 等: "Transcriptome-Based Network Analysis Unveils Eight Immune-Related Genes as Molecular Signatures in the Immunomodulatory Subtype of Triple-Negative Breast Cancer", 《FRONT ONCOL》 * |
| LIHONG WANG 等: "LncRNA HCP5 promotes triple negative breast cancer progression as a ceRNA to regulate BIRC3 by sponging miR-219a-5p", 《CANCER MEDICINE》 * |
| 周广林: "着丝粒蛋白-U（CENP-U）在三阴性乳腺癌血管生成中的作用研究", 《中国博士学位论文全文数据库——医药卫生科技辑》 * |
Cited By (2)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| CN116083590A (zh) * | 2023-03-23 | 2023-05-09 | 广州爱仁生物医药科技有限公司 | 一种基因检测试剂盒及其制备方法和应用 |
| CN116083590B (zh) * | 2023-03-23 | 2024-03-22 | 雄安妙心医学检验有限公司 | 一种基因检测试剂盒及其制备方法和应用 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| Burge et al. | Do the histologic features and results of breast cancer biomarker studies differ between core biopsy and surgical excision specimens? | |
| Lee et al. | ER-α36, a novel variant of ER-α, is expressed in ER-positive and-negative human breast carcinomas | |
| KR101976219B1 (ko) | 유방암의 바이오마커 | |
| CN107085106B (zh) | 用于前列腺癌进展预后的检测试剂及试剂盒 | |
| CN110187110B (zh) | 一种贲门癌预后预测标志物及其应用 | |
| CN108169490B (zh) | 一组用于评估胶质母细胞瘤预后的联合蛋白及其应用 | |
| CN113046438B (zh) | 一种纳入分子分型和免疫评分的子宫内膜癌预后评价系统 | |
| CN111948395A (zh) | 用于诊断三阴性乳腺癌免疫调节亚型的四联标志物及其应用 | |
| RU2383339C1 (ru) | Способ прогнозирования эффективности неоадъювантной химиотерапии при местнораспространенном раке яичников | |
| WO2013033933A1 (zh) | 用于测评卵巢癌原发化疗敏感性的试剂盒、方法及应用 | |
| CN105785004B (zh) | 细胞分裂周期相关蛋白2在胰腺癌诊断或预后中的用途 | |
| WO2012010105A1 (en) | Methods for detection of lethal system | |
| CN115389768A (zh) | Reg家族蛋白在诊断、筛查或评估动脉粥样硬化中的应用 | |
| CN109709333B (zh) | H4k20、h3k9及h3k36三甲基化量检测试剂在食管癌预后评估中的应用 | |
| CN114778844A (zh) | Pld1作为评估肿瘤患者对于化疗药物敏感性的分子标志物的用途 | |
| CN112877438A (zh) | 纳入分子分型和pdl1检测的高危子宫内膜癌预后评价系统 | |
| Nichols et al. | Automated immunohistochemical assay for estrogen receptor status in breast cancer using monoclonal antibody CC4-5 on the Ventana ES | |
| CN111665358A (zh) | Nalcn蛋白在食管鳞癌预后预测中的应用 | |
| CN112961921B (zh) | 一种用于判断早期子宫内膜癌预后的制剂及复发风险模型 | |
| KR20120004736A (ko) | 갑상선 유두암종의 림프절 전이 진단방법 | |
| CN112946268B (zh) | Hhla2作为预后标记物在制备肝癌预后预测试剂盒中的应用 | |
| CN114705863B (zh) | Ssh3蛋白在贲门腺癌预后预测中的应用 | |
| KR102424255B1 (ko) | 인간 유방암 및 동물 유선암의 진단 및 악성도 평가를 위한 바이오마커로서 smp30의 용도 | |
| US20170029898A1 (en) | Novel method for screening for prostate cancer | |
| Zhang et al. | Comparison of Her-2/Neu Gene Amplification or Expression between IHC and FISH in BC |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| PB01 | Publication | ||
| PB01 | Publication | ||
| SE01 | Entry into force of request for substantive examination | ||
| SE01 | Entry into force of request for substantive examination | ||
| RJ01 | Rejection of invention patent application after publication |
Application publication date: 20201117 |
|
| RJ01 | Rejection of invention patent application after publication |