CN111655688A - 经取代的吡咯并吡啶类化合物作为atr抑制剂 - Google Patents

经取代的吡咯并吡啶类化合物作为atr抑制剂 Download PDF

Info

Publication number
CN111655688A
CN111655688A CN201880072109.2A CN201880072109A CN111655688A CN 111655688 A CN111655688 A CN 111655688A CN 201880072109 A CN201880072109 A CN 201880072109A CN 111655688 A CN111655688 A CN 111655688A
Authority
CN
China
Prior art keywords
pyrimidin
pyrrolo
methyl
methylmorpholine
blv
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Granted
Application number
CN201880072109.2A
Other languages
English (en)
Other versions
CN111655688B (zh
Inventor
X·李
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Blue Valley Pharmaceutical Co ltd
Original Assignee
Blue Valley Pharmaceutical Co ltd
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Blue Valley Pharmaceutical Co ltd filed Critical Blue Valley Pharmaceutical Co ltd
Publication of CN111655688A publication Critical patent/CN111655688A/zh
Application granted granted Critical
Publication of CN111655688B publication Critical patent/CN111655688B/zh
Active legal-status Critical Current
Anticipated expiration legal-status Critical

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07DHETEROCYCLIC COMPOUNDS
    • C07D471/00Heterocyclic compounds containing nitrogen atoms as the only ring hetero atoms in the condensed system, at least one ring being a six-membered ring with one nitrogen atom, not provided for by groups C07D451/00 - C07D463/00
    • C07D471/02Heterocyclic compounds containing nitrogen atoms as the only ring hetero atoms in the condensed system, at least one ring being a six-membered ring with one nitrogen atom, not provided for by groups C07D451/00 - C07D463/00 in which the condensed system contains two hetero rings
    • C07D471/04Ortho-condensed systems
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P35/00Antineoplastic agents
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P35/00Antineoplastic agents
    • A61P35/04Antineoplastic agents specific for metastasis
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P37/00Drugs for immunological or allergic disorders

Landscapes

  • Organic Chemistry (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Oncology (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Pharmaceuticals Containing Other Organic And Inorganic Compounds (AREA)
  • Nitrogen Condensed Heterocyclic Rings (AREA)

Abstract

本申请包括式(I)的化合物
Figure DDA0002480458820000011
其中A,W,m,R5,R6,R7,和R8在本文中定义,本发明还公开了用这些化合物治疗肿瘤疾病的方法。

Description

经取代的吡咯并吡啶类化合物作为ATR抑制剂
相关申请
本申请要求2017年9月8日提交的美国临时申请号62/555,645和2018年1月12日提交的美国临时申请号62/616,642的申请日的权益,其每一个的全部内容通过引用并入本文。
背景技术
ATR(也称为FRAP相关蛋白1;FRP1;MEC1;SCKL;SECKL1)蛋白激酶是PI3-激酶样激酶(PIKK)蛋白家族的成员,ATR参与基因组的修复和维持及其稳定性(综述于Cimprich KA和Cortez D.2008,Nature Rev.Mol.Cell Biol.9:616-627)。这些蛋白质协调对DNA损伤,应激和细胞周期扰动的反应。实际上,同属蛋白质家族的两个成员ATM和ATR共享许多下游底物,这些底物本身就是细胞周期和DNA修复机制(例如DNA)的组成部分,比如Chkl,BRCA1,p53(Lakin ND等,1999,Oncogene;Tibbets RS等,2000,Genes&Dev)。虽然ATM和ATR的底物在一定程度上是共享的,但激活信号级联的触发却没有不相同,ATR主要响应的是复制叉停滞(Nyberg KA等人,2002,Ann。Rev.Genet。36:617-656;Shechter D.等人,2004,DNARepair 3:901-908)和块状的DNA损伤灶,例如由紫外线(UV)辐射形成的DNA损伤(WrightJA等人,1998,美国国家科学院学报,23;7445-7450)或UV模拟剂4-硝基喹啉-1-氧化物4NQO(Ikenaga M.et al。1975,Basic Life Sci,5b,763-771)。但是,ATM可以将检测到的双链断裂(DSB)处理后生成能激活ATR的单链断裂(SSB);类似地,ATR可以将检测到的SSB生成DSB,从而激活ATM。因此,ATM和ATR之间存在很大的相互作用。
能导致ATR蛋白表达完全丧失的ATR基因突变很少见,存活只能在杂合或亚型条件下产生。ATR基因突变与疾病之间的唯一明确联系存在于少数以生长迟缓和小头畸形为特征的Seckel综合征患者中(O'Driscoll M等,2003Nature Genet。Vol3,497-501)。与野生型细胞相比,在存在复制应激的情况下,患有ATR亚型生殖系突变(seckel综合征)的患者的细胞对脆弱部位的染色体断裂表现出更高的敏感性(Casper 2004)。ATR途径的破坏会导致基因组不稳定。Seckel综合征患者的癌症发生率也增加,这提示ATR在该疾病中维持基因组稳定性的作用。
此外,ATR基因的重复已被描述为横纹肌肉瘤的危险因素(Smith L等,1998,Nature Genetics 19,39-46)。癌基因驱动的肿瘤发生可能与ATM功能丧失有关,因此对ATR信号的依赖性增加(Gilad 2010)。也已经报道了在几种肿瘤类型中复制应激的证据,例如结肠癌和卵巢癌,并且最近在胶质母细胞瘤,膀胱癌,前列腺癌和乳腺癌中也有报道(Gorgoulis等,2005;Bartkova等,2005a;Fan等,2006;Norman等,2006)。Tort等,2006;Nuciforo等,2007;Bartkova等,2007a)。在肿瘤发生期间也经常观察到G1检查点的丢失。在G1检查点对照中缺乏的肿瘤细胞,特别是在p53缺乏中,易受ATR活性的抑制,并表现出过早的染色质凝聚(PCC)和细胞死亡(Ngheim等,PNAS,98,9092-9097)。
ATR对复制细胞的生存能力至关重要,并在S期被激活以调节复制起点的发射并修复受损的复制叉(Shechter D等人,2004,Nature cell Biology Vol 6(7)648-655)。复制叉的损坏可能是由于细胞暴露于临床相关的细胞毒性剂(例如羟基脲(HU)和铂)引起的(O'Connell and Cimprich 2005;118,1-6)。ATR被大多数癌症化学疗法激活(Wilsker D等人,2007,Mol。Cancer Ther。6(4)1406-1413)。已经评估了ATR抑制剂对多种化学疗法致敏能力的生物学评估。已经注意到在细胞生长测定法中肿瘤细胞对化学治疗剂的敏感性,并用于评估弱ATR抑制剂(例如咖啡因)对肿瘤细胞系对细胞毒性剂的敏感性(Wilsker D等人,2007,Mol Cancer Ther。6)。(4)1406-1413;Sarkaria JN等人,1999,Cancer Res.59,4375-4382)。此外,在癌细胞中使用显性负性ATR负型形式的siRNA或ATR敲入降低ATR活性已导致肿瘤细胞对多种治疗或实验药物如抗代谢物(5-FU,吉西他滨,羟基脲,甲氨蝶呤,Tomudex),烷基化剂(顺铂,丝裂霉素C,环磷酰胺,MMS)或双链断裂诱导剂(阿霉素,电离辐射)(Cortez D.等人,2001,Science,294:1713-1716);Collis SJ等人,2003,CancerRes.63:1550-1554;Cliby WA等人,1998,EMBO J.2:1 9-169)提示ATR抑制剂与某些细胞毒性剂的组合可能在治疗上是有益的。已经描述了定义特定的ATR抑制化合物的活性的另外的表型测定法是细胞周期图谱(PJ Hurley,D Wilsker和F Bunz,Oncogene,2007,26,2535-2542)。缺乏ATR的细胞已显示出有缺陷的细胞周期调控和独特的特征谱,特别是在细胞毒性细胞损伤后。此外,有人提出,在肿瘤和正常组织之间,由于对ATR的调控,存在不同的反应,这为ATR抑制剂分子的治疗干预提供了进一步的潜力(Rodnguez-Bravo V等人,CancerRes。,2007,67,11648-11656)。
ATR特异性表型的另一个引人注目的用途与合成致死的概念以及以下事实:观察到在Gl检查点对照中缺乏的肿瘤细胞,特别是p53缺乏,很容易抑制ATR活性,导致过早的染色质凝聚(PCC)细胞死亡和细胞死亡(Ngheim等,PNAS,98,9092-9097)。在这种情况下,会发生DNA的S期复制,但由于中间检查点的故障而导致M期启动之前未完成DNA复制,这是由于缺少ATR信号导致细胞死亡。G2/M检查站是涉及ATR的关键监管控制措施(Brown EJ和Baltimore D.,2003年,Genes Dev。17,615-628),这是该检查的折衷方案,也是防止ATR向下游合作伙伴发出信号的手段,导致PCC。由此,子代细胞的基因组受到损害并且细胞的活力丧失(Ngheim等,PNAS,98,9092-9097)。因此已经提出在ATM或其他S期检查点功能有缺陷的肿瘤中抑制ATR可能被证明是未来癌症治疗的有效方法(Collins I.和Garret MD,2005,Curr.Opin.Pharmacol。,5:366-373;Kaelin WG 2005,Nature Rev.癌症(5:689-698),
总之,ATR抑制剂具有敏化肿瘤细胞对电离辐射或诱导DNA损伤的化学治疗剂的潜力,具有诱导选择性杀伤肿瘤细胞以及在具有DNA损伤反应缺陷的肿瘤细胞亚群中诱导合成致死性的潜力。尽管诸如AZD-6738,VX-970之类的ATK抑制剂对本领域做出了重大贡献,但在本领域中仍有不断寻求改良的药物的巨大需要。
发明内容
本发明涉及一类嘧啶基化合物其制备方法,以及它们的药物组合物和其在治疗中的用途,比如在治疗增生性疾病(癌症),特别是在由ATR突变和RAD-3相关蛋白激酶,通常称为ATR,相关疾病中的用途。
在第一个实施方案中,本发明提供式(I)的化合物或其N-氧化物,或所述式(I)的化合物的药学上可接受的盐,溶剂化物,多晶型物,互变异构体,立体异构体,同位素形式或前药I)或其N-氧化物:
Figure GDA0002617172920000041
其中
A为氢,
Figure GDA0002617172920000042
氰基,环烷基,环烯基,杂环烷基,杂环烯基,芳基或杂芳基;
R1是烷基或-CD3
R2是烷基或卤代烷基;
R3和R4各自独立地为H,D,卤素,烷基或卤代烷基;或R3和R4与它们所连接的原子一起是环烷基或杂环烯基;
Z为H,D,OH,卤素,胺,氰基,C(O)OH,C(O)NH2,烷基,烯基,炔基,环烷基,环烯基,杂环烷基,杂环烯基,芳基或杂芳基,其中所述烷基,Z的环烷基,环烯基,杂环烷基,杂环烯基,芳基,杂芳基任选地被一个或多个Rd取代。
W是N或C(Ra);
R5,R6,R7,和R8,各自独立地为H,D,烷基,烯基,炔基,环烷基,环烯基,杂环烷基,杂环烯基,芳基,杂芳基,卤素,硝基,氧代,氰基,ORa,SRa,烷基-Ra,NH(CH2)pRa,C(O)Ra,S(O)Ra,SO2Ra,C(O)ORa,OC(O)Ra,NRbRc,P(O)RbRc,alkyl-P(O)RbRc,C(O)N(Rb)Rc,N(Rb)C(O)Rc,S(O)(=N(Rb))Rc,-N=S(O)RbRc,SO2N(Rb)Rc,or N(Rb)SO2Rc,,其中所述的环烷基,环烯基,杂环烷基,杂环烯基,芳基,杂芳基任选地被一个或多个Rd取代;
Ra,Rb,Rc和Rd独立地为H,D,烷基,烯基,炔基,卤素,氰基,胺,硝基,羟基,=O,C(O)NHOH,C(O)OH,C(O)NH2,烷氧基,烷氧基烷基,卤代烷基,羟烷基,氨基烷基,烷基羰基,烷氧基羰基,烷基羰基氨基,烷基氨基,氧代,卤代烷基氨基,环烷基,环烯基,杂环烷基,杂环烯基,芳基或杂芳基,其中所述烷基,环烷基,环烯基,杂环烷基,杂环烯基,芳基,杂芳基任选地被一个或多个Re取代;
Re是H,D,烷基,烯基,炔基,卤素,氰基,胺,硝基,羟基,=O,C(O)NHOH,烷氧基,烷氧基烷基,卤代烷基,羟烷基,氨基烷基,烷基羰基,烷氧基羰基,烷基羰基氨基,烷基氨基,氧代,卤代烷基氨基,环烷基,环烯基,杂环烷基,杂环烯基,芳基或杂芳基;
m和n分别为0、1、2或3。
在第二个实施方案中,本发明提供了由式(II)表示的化合物:
Figure GDA0002617172920000051
本发明的化合物可以包含一个或多个不对称碳原子。因此,化合物可以非对映异构体,对映异构体或其混合物的形式存在。每个不对称碳原子可以为R或S构型,并且这些构型均在本发明的范围内。
本发明还考虑了化合物中的任何一种的修饰的化合物,包括与未修饰的化合物相比具有改善的(例如,增强的,更大的)药物溶解性,稳定性,生物利用度和/或治疗指数的修饰。示例性的修饰包括(但不限于)适用的前药衍生物和富含氘的化合物。
本发明的化合物可以盐或溶剂化物的形式存在和任选地给药。本发明包括任何上述化合物及其修饰形式的任何药学上可接受的盐和溶剂化物。
本发明同样包含上述一种或多种化合物,修饰物和/或盐及其化合物的药物组合物,用于治疗赘生性疾病,以及该化合物在制备抗肿瘤药中的用途。
本发明还涉及通过向有需要的受试者施用有效量的上述一种或多种化合物,修饰物和/或盐及其组合物来治疗赘生性疾病的方法。
在下面的描述中阐述了本发明的一个或多个实施例的细节。通过说明书和权利要求书,本发明的其他特征,目的和优点将变得显而易见。应当理解,本文所述的本发明的所有成分/特征(化合物,药物组合物,制造/使用方法等),包括实施例和原始权利要求中所述的任何特定特征,可以相互组合。
具体实施方式
本文所述的示例性化合物包括但不限于以下化合物:
亚氨基(甲基)(1-(2-(5-甲基-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)-6-((R)-3-甲基吗啉代)嘧啶-4-基)环丙基)-16-砜,
(1-(2-(5-(叔丁基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)-6-(((R)-3-甲基吗啉代)嘧啶-4-基)环丙基)(亚氨基)(甲基)-16-砜,
亚氨基(1-(2-(5-异丙氧基-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)-6-(((R)-3-甲基吗啉代)嘧啶-4-基)环丙基)(甲基)-16-砜,
亚氨基(1-(2-(5-甲氧基-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)-6-((R)-3-甲基吗啉代)嘧啶-4-基)环丙基)(甲基)-16-砜,
亚氨基(甲基)(1-(2-(5-(甲基氨基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)-6-((R)-3-甲基吗啉代)嘧啶-4-基)环丙基)-16-砜,
亚氨基(1-(2-(5-(异丙基氨基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)-6-(((R)-3-甲基吗啉代)嘧啶-4-基)环丙基)(甲基)-16-砜,
(1-(2-(6-(叔丁基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)-6-(((R)-3-甲基吗啉代)嘧啶-4-基)环丙基)(亚氨基)(甲基)-16-砜,
亚氨基(1-(2-(6-甲氧基-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)-6-((R)-3-甲基吗啉代)嘧啶-4-基)环丙基)(甲基)-16-砜,
亚氨基(1-(2-(6-异丙氧基-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)-6-(((R)-3-甲基吗啉代)嘧啶-4-基)环丙基)(甲基)-16-砜,
亚氨基(甲基)(1-(2-(6-(6-氨基氨基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)-6-((R)-3-甲基吗啉代)嘧啶-4-基)环丙基)-16-砜,
亚氨基(1-(2-(6-(异丙基氨基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)-6-(((R)-3-甲基吗啉代)嘧啶-4-基)环丙基)(甲基)-16-砜,
(1-(5-氯-6-((R)-3-甲基吗啉代)-2-(1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)嘧啶-4-基)环丙基)(亚氨基)(甲基)-16-砜,
亚氨基(甲基)(1-(4-((R)-3-甲基吗啉代)-6-(1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)-1,3,5-三嗪-2-基)环丙基)-16-砜,
亚氨基(甲基)(1-(5-甲基-6-((R)-3-甲基吗啉代)-2-(1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)嘧啶-4-基)环丙基)-16-砜,
亚氨基(甲基)(1-(6-((R)-3-甲基吗啉代)-2-(1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)-5-(三氟甲基)嘧啶-4-基)环丙基)-16-砜,
(S)-甲基(甲基亚氨基)(1-(6-((R)-3-甲基吗啉代)-2-(1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)嘧啶-4-基)环丙基)-16-砜,
(S)-(异丙基亚氨基)(甲基)(1-(6-((R)-3-甲基吗啉代)-2-(1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)嘧啶-4-基)环丙基)-16-砜,
(S)-甲基(甲基亚氨基)(1-(6-((R)-3-甲基吗啉代)-2-(1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)嘧啶-4-基)环丁基)-16-砜,
(S)-(异丙基亚氨基)(甲基)(1-(6-((R)-3-甲基吗啉代)-2-(1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)嘧啶-4-基)环丁基)-16-砜,
(1-(6-(1,4-氧庚烷-4-基)-2-(1H-吡咯并[2,3-b]吡啶基-4-基)嘧啶-4-基)环丙基)(甲基)(甲基亚氨基)-16-砜,
(1-(6-((R)-4,4-二氟-2-甲基哌啶-1-基)-2-(1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)嘧啶-4-基)环丙基)(甲基)(甲基亚氨基)-16-砜,
(1-(6-((R)-4,4-二氟-2-甲基哌啶-1-基)-2-(1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)嘧啶-4-基)环丙基)(亚氨基)(甲基)-16-砜,
(1-(2-(1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)-6-(2-氧-7-氮杂螺[3.5]壬基-7-基)嘧啶-4-基)环丙基)(甲基)(甲基亚氨基)-16-砜,
(1-(2-(1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)-6-(2-氧-6-氮杂螺[3.4]辛6-基)嘧啶-4-基)环丙基)(甲基)(甲基亚氨基)-16-砜,
(1-(2-(1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)-6-(((S)-3-(三氟甲基)吗啉代)嘧啶-4-基)环丙基)(甲基)(甲基亚氨基)-16-砜,
4-(6-(1-(N,S-二甲基磺酰亚胺基)环丙基)-2-(1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)嘧啶-4-基)吗啉-3-羧酸,
甲基(甲基亚氨基)(1-(6-(2-甲基吗啉代)-2-(1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)嘧啶-4-基)环丙基)-16-砜,
4-(6-(1-(N,S-二甲基磺酰亚胺基)环丙基)-2-(1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)嘧啶-4-基)吗啉-2-羧酸,
亚氨基(1-(6-((R)-3-甲基吗啉代)-2-(1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)嘧啶-4-基)环丙基)(三氟甲基)-1-6-砜酮,
(甲基亚氨基)(1-(6-((R)-3-甲基吗啉代)-2-(1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)嘧啶-4-基)环丙基)(三氟甲基)-16-砜,
(1-(2-(2,3-二氢-6H-[1,4]二氧六环[2,3-b]吡咯[3,2-e]吡啶-9-基)-6-((R-3-甲基吗啉代)嘧啶-4-基)环丙基)(亚氨基)(甲基)-16-砜,
(1-(2-(5H-[1,3]二氧五环[4,5-b]吡咯[3,2-e]吡啶-8-基)-6-(((R)-3-甲基吗啉)嘧啶-4-基)环丙基)(亚氨基)(甲基)-16-砜,
(1-(2-(3,4-二氢-2H,7H-[1,4]二氧七环[2,3-b]吡咯[3,2-e]吡啶-10-基)-6-((R)-3-甲基吗啉代)嘧啶-4-基)环丙基)(亚氨基)(甲基)-16-砜,
(S)-甲基((氘代甲基)亚氨基)(1-(6-((R)-3-甲基吗啉代)-2-(1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)嘧啶-4-基)环丙基)-16-砜,
(R)-2-甲基-2-(6-(3-甲基吗啉代)-2-(1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)嘧啶-4-基)丙腈,
(R)-4-(2-(1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)-6-(1,1,1-三氟-2-甲基丙烷-2-基)嘧啶-4-基)-3-甲基吗啉,
1,1,1-三氟-2-(6-((R)-3-甲基吗啉代)-2-(1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)嘧啶-4-基)丙烷-2-醇,
(R)-2-(6-(3-甲基吗啉代)-2-(1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)嘧啶-4-基)丙-2-醇,
(R)-2-(6-(3-甲基吗啉代)-2-(1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)嘧啶-4-基)丙-2-胺,
(R)-N-(((3,3-二氟环丁基)甲基)-6-(3-甲基吗啉代)-2-(1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)嘧啶-4-胺;
6-((R)-3-甲基吗啉代)-2-(1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)-N-((((S)-四氢呋喃-3-基)甲基)嘧啶-4-胺,
6-((R)-3-甲基吗啉代)-2-(1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)-N-(((R-四氢呋喃-3-基)甲基)嘧啶-4-胺,
(R)-6-(3-甲基吗啉代)-N-(氧杂环丁-3-基甲基)-2-(1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)嘧啶-4-胺,
(R)-N-(((4,4-二氟环己基)甲基)-6-(3-甲基吗啉代)-2-(1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)嘧啶-4-胺,
(R)-6-(3-甲基吗啉代)-2-(1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)-N-(((四氢-2H-吡喃-4-基)甲基)嘧啶-4-胺,
(R)-N-乙基-6-(3-甲基吗啉代)-2-(1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)嘧啶-4-胺,
(R)-N-(2-氟-2-甲基丙基)-6-(3-甲基吗啉代)-2-(1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)嘧啶-4-胺,
(R)-N-(3,3-二氟环丁基)-6-(3-甲基吗啉代)-2-(1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)嘧啶-4-胺,
(R)-N-(环丙基甲基)-6-(3-甲基吗啉代)-2-(1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)嘧啶-4-胺,
(R)-3-甲基-4-(6-吗啉代-2-(1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)嘧啶-4-基)吗啉,
(R)-4-(2-(1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)嘧啶-4-基)-3-甲基吗啉,
(R)-3-甲基-4-(6-甲基-2-(1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)嘧啶-4-基)吗啉,
(R)-4-(6-异丙基-2-(1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)嘧啶-4-基)-3-甲基吗啉,
(R)-4-(2-(1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)-6-(三氟甲基)嘧啶-4-基)-3-甲基吗啉,
(R)-4-(6-甲氧基-2-(1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)嘧啶-4-基)-3-甲基吗啉,
(R)-6-(3-甲基吗啉代)-2-(1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)嘧啶-4-胺,
(R)-6-(3-甲基吗啉代)-2-(1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)嘧啶-4-腈,
(R)-3-甲基-4-(6-(吡啶-3-基)-2-(1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)嘧啶-4-基)吗啉,
(R)-4-(6-(4,4-二氟哌啶-1-基)-2-(1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)嘧啶-4-基)-3-甲基吗啉,
(R)-6-(3-甲基吗啉代)-2-(1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)-N-(2,2,2-三氟乙基)嘧啶-4-胺,
(R)-4-(6-(叔丁基)-2-(1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)嘧啶-4-基)-3-甲基吗啉,
(R)-3-甲基-4-(6-苯基-2-(1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)嘧啶-4-基)吗啉,
(R)-4-(6-(2-氟丙烷-2-基)-2-(1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)嘧啶-4-基)-3-甲基吗啉,
(R)-4-(6-环丙基-2-(1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)嘧啶-4-基)-3-甲基吗啉,
(R)-4-(6-环丁基-2-(1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)嘧啶-4-基)-3-甲基吗啉,
(R)-4-(6-环戊基-2-(1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)嘧啶-4-基)-3-甲基吗啉,
(R)-4-(6-环己基-2-(1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)嘧啶-4-基)-3-甲基吗啉,
(R)-2-甲基-2-(6-(3-甲基吗啉代)-2-(1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)嘧啶-4-基)丙烯酰胺,
(R)-2-甲基-2-(6-(3-甲基吗啉代)-2-(1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)嘧啶-4-基)丙酸,
(R)-4-(6-(1-甲氧基-2-甲基丙烷-2-基)-2-(1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)嘧啶-4-基)-3-甲基吗啉,
(R)-N-环丙基-6-(3-甲基吗啉代)-2-(1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)嘧啶-4-胺,
(R)-3-甲基-4-(6-(4-甲基哌嗪-1-基)-2-(1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)嘧啶-4-基)吗啉,
(R)-4-(6-(3,3-二氟吡咯烷-1-基)-2-(1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)嘧啶-4-基)-3-甲基吗啉,
N-(((3,3-二氟环戊基)甲基)-6-((R)-3-甲基吗啉代)-2-(1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)嘧啶-4-胺,
(R)-6-(3-甲基吗啉代)-N-(2-吗啉代乙基)-2-(1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)嘧啶-4-胺,
(R)-4-(6-(1-(4,4-二氟哌啶-1-基)-2-甲基丙烷-2-基)-2-(1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)嘧啶-4-基)-3-甲基吗啉,
(R)-4-(6-(1-(2-(甲氧基乙氧基)-2-甲基丙烷-2-基)-2-(1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)嘧啶-4-基)-3-甲基吗啉,
(R)-4-(2-(1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)-6-(6-(三氟甲基)吡啶-3-基)嘧啶-4-基)-3-甲基吗啉,
(R)-5-(6-(3-甲基吗啉代)-2-(1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)嘧啶-4-基)吡啶-2-胺,
(R)-N,N-二甲基-2-(2-甲基-2-(6-(3-甲基吗啉代)-2-(1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)嘧啶-4-基)丙氧基)乙烷-1-胺,
(R)-1-(6-(3-甲基吗啉代)-2-(1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)嘧啶-4-基)环丙烷-1-醇,
(R)-1-(6-(3-甲基吗啉代)-2-(1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)嘧啶-4-基)环丙烷-1-腈,
(R)-1-(6-(3-甲基吗啉代)-2-(1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)嘧啶-4-基)环丙烷-1-胺,
(3R)-4-(6-(2,2-二氟环丙基)-2-(1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)嘧啶-4-基)-3-甲基吗啉,
(R)-4-(6-(1-氟环丙基)-2-(1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)嘧啶-4-基)-3-甲基吗啉,
(R)-4-(6-(3,3-二氟环丁基)-2-(1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)嘧啶-4-基)-3-甲基吗啉,
(R)-1-甲基-3-(6-(3-甲基吗啉代)-2-(1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)嘧啶-4-基)环丁-1-醇,
(R)-1-甲基-3-(6-(3-甲基吗啉代)-2-(1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)嘧啶-4-基)环丁烷-1-腈,
(R)-1-(6-(3-甲基吗啉代)-2-(1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)嘧啶-4-基)环丁-1-胺。
本发明的化合物可以包含一个或多个不对称碳原子。因此,化合物可以非对映异构体,对映异构体或其混合物的形式存在。化合物的合成可以使用外消旋体,非对映体或对映体作为起始原料或中间体。非对映异构化合物可以通过色谱法或结晶法分离。类似地,对映体混合物可以使用相同的技术或本领域已知的其他技术分离。每个不对称碳原子可以是R或S构型,并且这些构型都在本发明的范围内。
本发明还包括任何一种经过改进的化合物,包括与未改进的化合物相比具有改善的(例如,增强的,更大的)药物溶解度,稳定性,生物利用度和/或治疗指数的改进。改进的实例包括但不限于前药衍生物和富含氘的化合物。例如:
·前药衍生物:前药在施用于受试者时,将在体内转化成本发明的活性化合物[Nature Reviews of Drug Discovery,2008,第7卷,p255]。注意,在许多情况下,前药本身也落在本发明化合物范围内。本发明化合物的前药可以通过标准的有机反应来制备,例如通过与氨基甲酰化剂(例如1,1-酰氧基烷基碳酰氯,碳酸对硝基苯酯等)或酰化剂反应来制备。制备前药的方法和策略的其他实例描述于Bioorganic and Medicinal ChemistryLetters,1994,Vol。4,1985年。
·富含氘的化合物:氘(D或2H)是氢的稳定,非放射性同位素,原子量为2.0144。氢自然以同位素XH(氢或pro),D(2H或氘)和T(3H或tri)的混合物形式存在。氘的自然丰度为0.015%。本领域普通技术人员认识到,在所有带有H原子的化合物中,H原子实际上代表H和D的混合物,其中约0.015%为D。因此,氘含量已经富集到大于其自然丰度0.015%的值,应被视为不自然的,因此,相对于其未富集的对应物而言是新颖的。
应该认识到,本发明的化合物可以盐和溶剂化物的形式存在和任选地给药。例如,根据本领域公知的方法,将本发明的化合物转化成并以其衍生自各种有机和无机酸和碱的药学上可接受的盐的形式在本发明的范围内。
当本发明的化合物具有游离碱形式时,可以通过使化合物的游离碱形式与药学上可接受的无机或有机酸例如氢卤化物如盐酸盐反应,将其制备为药学上可接受的酸加成盐。氢溴酸盐,氢碘酸盐;其他无机酸,例如硫酸盐,硝酸盐,磷酸盐等;烷基和单芳基磺酸盐,如乙磺酸盐,甲苯磺酸盐和苯磺酸盐;以及其他有机酸及其相应的盐,例如乙酸盐,酒石酸盐,马来酸盐,琥珀酸盐,柠檬酸盐,苯甲酸盐,水杨酸盐和抗坏血酸盐。本发明的其他酸加成盐包括但不限于:己二酸酯,藻酸盐,精氨酸盐,天冬氨酸盐,硫酸氢盐,亚硫酸氢盐,溴化物,丁酸盐,樟脑酸盐,樟脑磺酸盐,辛酸盐,氯化物,氯苯甲酸盐,环戊烷丙酸盐,二葡萄糖酸盐,磷酸二氢盐,二硝基苯甲酸盐,十二烷基硫酸盐,富马酸盐,半乳糖酸盐(来自粘酸),半乳糖醛酸盐,葡庚糖酸盐,葡萄糖酸盐,谷氨酸盐,甘油磷酸盐,半琥珀酸盐,半硫酸盐,庚酸盐,己酸,马尿酸盐,2-羟基乙磺酸盐,碘化物,乙磺酸盐,异戊酸,异丁酸,异丁酸,偏磷酸盐,甲磺酸盐,苯甲酸甲酯,磷酸一氢盐,2-萘磺酸盐,烟酸盐,草酸盐,油酸盐,棕榈酸盐,果胶酸盐,过硫酸盐,苯乙酸盐,3-苯基丙酸酯,膦酸盐和邻苯二甲酸盐。应该认识到,游离碱形式通常在物理性质例如在极性溶剂中的溶解性方面与它们各自的盐形式有些不同,但是对于本发明的目的,这些盐等同于它们各自的游离碱形式。
当本发明的化合物具有游离酸形式时,可以通过使化合物的游离酸形式与药学上可接受的无机或有机碱反应来制备药学上可接受的碱加成盐。这种碱的例子是碱金属氢氧化物,包括氢氧化钾,氢氧化钠和氢氧化锂;碱土金属氢氧化物,例如钡和氢氧化钙;碱金属醇盐,例如乙醇钾和丙醇钠;以及各种有机碱,例如氢氧化铵,哌啶,二乙醇胺和N-甲基谷氨酰胺。还包括本发明化合物的铝盐。本发明的其他碱式盐包括但不限于:铜,铁,亚铁,锂,镁,锰,锰,钾,钠和锌盐。有机碱盐包括但不限于伯,仲和叔胺的盐,取代的胺,包括天然存在的取代胺,环胺和碱性离子交换树脂,例如精氨酸,甜菜碱,咖啡因,氯普鲁卡因,胆碱,N,N'-二苄基乙二胺(benzathine),二环己胺,二乙醇胺,2-二乙基氨基乙醇,2-二甲基氨基乙醇,乙醇胺,乙二胺,N-乙基吗啉,N-乙基哌啶,葡糖胺,葡糖胺,组氨酸,联苯胺,异丙胺,利多卡因,赖氨酸,葡甲胺,N-甲基-D-葡萄糖胺,吗啉,哌嗪,哌啶,多胺树脂,普鲁卡因,嘌呤,可可碱,三乙醇胺,三乙胺,三甲胺,三丙胺和三-(羟甲基)-甲胺(三甲胺)。应当认识到,游离酸形式通常在物理性质例如在极性溶剂中的溶解度方面与它们各自的盐形式有些不同,但是出于本发明的目的,这些盐等同于它们各自的游离酸形式。
一方面,药学上可接受的盐是盐酸盐,氢溴酸盐,甲磺酸盐,甲苯磺酸盐,乙酸盐,富马酸盐,硫酸盐,硫酸氢盐,琥珀酸盐,柠檬酸盐,磷酸盐,马来酸盐,硝酸盐,酒石酸盐,苯甲酸盐,生物碳酸盐,碳酸盐,氢氧化钠盐,氢氧化钙盐,氢氧化钾盐,氨丁三醇盐或它们的混合物。
本发明中含有叔含氮基团的化合物可以用诸如(C1-4)烷基卤化物,例如甲基,乙基,异丙基和叔丁基氯化物,溴化物和碘化物的试剂季铵化。二-(C1-4)烷基硫酸盐,例如二甲基,二乙基和二戊基硫酸盐;烷基卤化物,例如癸基,十二烷基,月桂基,肉豆蔻基和硬脂基氯化物,溴化物和碘化物;芳基(C1-4)烷基卤化物,例如苄基氯和苯乙基溴化物。这样的盐允许制备本发明的水溶性和油溶性化合物。
具有叔氮原子的抗癌剂的氧化胺,也称为胺-N-氧化物和N-氧化物,已经被开发为前药[Mol Cancer Therapy。2004年3月;3(3):233-44]。包含叔氮原子的本发明化合物可被诸如过氧化氢(H 2O 2),卡罗酸或过酸如间氯过氧苯甲酸(mCPBA)之类的试剂氧化成氧化胺。
本发明涵盖药物组合物,其包含本发明的化合物和药物赋形剂,以及其他常规的药物惰性剂。通常用作载体或稀释剂的任何惰性赋形剂可以用于本发明的组合物中,例如糖,多元醇,可溶性聚合物,盐和脂质。可以使用的糖和多元醇包括但不限于乳糖,蔗糖,甘露醇和山梨糖醇。可以使用的可溶聚合物的例子是聚氧乙烯,泊洛沙姆,聚乙烯吡咯烷酮和葡聚糖。有用的盐包括但不限于氯化钠,氯化镁和氯化钙。可以使用的脂质包括但不限于脂肪酸,甘油脂肪酸酯,糖脂和磷脂。
另外,药物组合物还可包含粘合剂(例如阿拉伯胶,玉米淀粉,明胶,卡波姆,乙基纤维素,瓜尔豆胶,羟丙基纤维素,羟丙基甲基纤维素,聚维酮),崩解剂(例如玉米淀粉,马铃薯淀粉,藻酸,二氧化硅,交联羧甲基纤维素钠,交联维酮,瓜尔胶,淀粉羟乙酸钠,Primogel),各种pH和离子强度的缓冲液(例如tris-HCL,乙酸盐,磷酸盐),添加剂(如白蛋白或明胶)以防止吸收到表面上,洗涤剂(例如Tween 20,Tween 80,Pluronic F68,胆汁酸盐),蛋白酶抑制剂,表面活性剂(例如月桂基硫酸钠),渗透促进剂,增溶剂(例如甘油,聚甘油,环糊精),助流剂(例如胶体二氧化硅),抗氧化剂(例如抗坏血酸,焦亚硫酸钠,丁基化羟基茴香醚),稳定剂(例如羟丙基纤维素,羟丙基甲基纤维素),增粘剂s(例如卡波姆,胶体二氧化硅,乙基纤维素,瓜尔豆胶),甜味剂(例如蔗糖,阿斯巴甜,柠檬酸),调味剂(例如薄荷,水杨酸甲酯或橙色调味剂),防腐剂(例如硫柳汞,苯甲醇,对羟基苯甲酸酯),润滑剂(例如硬脂酸,硬脂酸镁,聚乙二醇,月桂基硫酸钠),助流剂(例如胶体二氧化硅),增塑剂(例如邻苯二甲酸二乙酯,柠檬酸三乙酯),乳化剂(例如卡波姆,羟丙基纤维素,十二烷基硫酸钠,甲基纤维素,羟乙基纤维素,羧甲基纤维素钠),聚合物涂料(例如泊洛沙姆或泊洛沙明),涂料和成膜剂(例如乙基纤维素,丙烯酸酯,聚甲基丙烯酸酯)和/或助剂。
在一个实施方案中,药物组合物与载体一起制备,所述载体将保护化合物免于从体内快速清除,例如控释制剂,包括植入物和微囊递送系统。可以使用可生物降解的生物相容性聚合物,例如乙烯乙酸乙烯酯,聚酸酐,聚乙醇酸,胶原蛋白,聚原酸酯和聚乳酸。这类制剂的制备方法对本领域技术人员而言是显而易见的。该材料也可以从Alza Corporation和Nova Pharmaceuticals,Inc.商购获得。脂质体悬浮液(包括用抗病毒抗原的单克隆抗体靶向感染细胞的脂质体)也可用作药学上可接受的载体。这些可以根据本领域技术人员已知的方法来制备,例如,如美国专利No.5,235,038中所述。4,522,811。
另外,本发明涵盖包含本发明化合物的任何固体或液体物理形式的药物组合物。例如,化合物可以是结晶形式,无定形形式并且具有任何粒径。颗粒可以被微粉化,或者可以是附聚的颗粒,颗粒,粉末,油,油性悬浮液或任何其他形式的固体或液体物理形式。
当根据本发明的化合物表现出不足的溶解度时,可以使用使化合物增溶的方法。这样的方法是本领域技术人员已知的,并且包括但不限于使用助溶剂例如乙醇,丙二醇,聚乙二醇(PEG)300,PEG 400,DMA的pH调节和成盐。(10-30%),DMSO(10-20%),NMP(10-20%),使用表面活性剂,例如聚山梨酯80,聚山梨酯20(1-10%),cremophor EL,CremophorRH40,Cremophor RH60(5-10%),Pluronic F68/Poloxamer 188(20-50%),Solutol HS15(20-50%),维生素E TPGS和d-α-生育酚PEG 1000琥珀酸酯(20-50%),使用诸如HPβCD和SBEβCD(10-40%),并使用先进的方法,例如胶束,添加聚合物,纳米颗粒悬浮液和脂质体形成。
多种给药方法可以与本发明的化合物结合使用。本发明的化合物可以通过吸入,阴道,眼内,通过局部递送(例如通过导管或口服)经口,肠胃外,腹膜内,静脉内,动脉内,经皮,舌下,肌内,直肠,经颊,鼻内,脂质体给药或共同给药。支架),皮下,脂肪内,关节内或鞘内。本发明的化合物也可以以缓释剂型给药或共同给药。化合物可以气态,液态,半液态或固态形式,以适合于所用给药途径的方式配制。对于口服给药,合适的固体口服制剂包括片剂,胶囊剂,丸剂,颗粒剂,丸剂,小药囊和泡腾剂,散剂等。合适的液体口服制剂包括溶液剂,混悬剂,分散剂,乳剂,油剂等。对于肠胃外给药,通常使用溶解后的冻干粉针。
如本文所用,“酰基”是指由式-C(O)-R表示的含羰基的取代基,其中R为H,烷基,碳环,杂环,碳环取代的烷基或杂环取代的烷基,其中烷基,烷氧基,碳环和杂环如本文所定义。酰基包括烷酰基(例如乙酰基),芳酰基(例如苯甲酰基)和杂芳酰基。
“脂族的”是指特征在于组成碳原子的直链或支链排列的部分,并且可以是饱和的或部分不饱和的,具有一个或多个双键或三键。
术语“烷基”是指含有1-20个碳原子的直链或支链烃(例如,C1-C10)。烷基的实例包括但不限于甲基,亚甲基,乙基,乙烯,正丙基,异丙基,正丁基,异丁基和叔丁基。优选地,烷基具有1至10个碳原子。更优选地,烷基具有1-4个碳原子。
术语“烯基”是指含有2-20个碳原子(例如,C2-C10)和一个或多个双键的直链或支链烃。烯基的实例包括但不限于乙烯基,丙烯基和烯丙基。优选地,亚烷基具有两个至十个碳原子。更优选地,亚烷基具有2-4个碳原子。
术语“炔基”是指含有2-20个碳原子(例如,C2-C10)和一个或多个三键的直链或支链烃。炔基的实例包括但不限于乙炔基,1-丙炔基,1-丁炔基和2-丁炔基以及1-甲基-2-丁炔基。优选地,炔基具有两个至十个碳原子。更优选地,炔基具有2-4个碳原子。
术语“烷基氨基”是指–N(R)-烷基,其中R可以是H,烷基,烯基,炔基,环烷基,环烯基,杂环烷基,杂环烯基,芳基或杂芳基。
“烷氧基”是指具有另外的烷基取代基的氧部分。
“烷氧羰基”是指连接于羰基的烷氧基。
“氧代烷基”是指进一步被羰基取代的烷基。羰基可以是醛,酮,酯,酰胺,酸或酰氯。
术语“环烷基”是指具有3至30个碳原子的饱和烃环系统(例如,C3-C12,C3-C8,C3-C6)。环烷基的实例包括但不限于环丙基,环丁基,环戊基,环己基,环庚基和环辛基。术语“环烯基”是指具有3至30个碳(例如,C3-C12)和一个或多个双键的非芳族烃环系统。实例包括环戊烯基,环己烯基和环庚烯基。
术语“杂环烷基”是指具有一个或多个杂原子(例如O,N,S,P或Se)的非芳族5-8元单环,8-12元双环或11-14元三环系统。杂环烷基的实例包括但不限于哌嗪基,吡咯烷基,二恶烷基,吗啉基和四氢呋喃基。
术语“杂环烯基”是指具有一个或多个杂原子(例如O,N,S,P或Se)和一个或多个的非芳香族5-8元单环,8-12元双环或11-14元三环系统或更多的双键。
术语“芳基”是指6个碳的单环,10个碳的双环,14个碳的三环芳族环系统。芳基的实例包括但不限于苯基,萘基和蒽基。术语“杂芳基”是指具有一个或多个杂原子(例如O,N,S,P或Se)的芳族5-8元单环,8-12元双环或11-14元三环系统。杂芳基的实例包括吡啶基,呋喃基,咪唑基,苯并咪唑基,嘧啶基,噻吩基,喹啉基,吲哚基和噻唑基。
上述的烷基,烯基,炔基,环烷基,杂环烷基,环烯基,杂环烯基,烷基氨基,芳基和杂芳基均包括取代和未取代的部分。烷基氨基,环烷基,杂环烷基,环烯基,杂环烯基,芳基和杂芳基上的可能取代基包括但不限于C1-C10烷基,C2-C10烯基,C2-C10炔基,C3-C20环烷基,C3-C20环烯基,C1-C20杂环烷基,C1-C20杂环烯基,C1-C10烷氧基,芳基,芳氧基,杂芳基,杂芳氧基,氨基,C1-C10烷基氨基,芳基氨基,羟基,卤素,氧代(O=),硫代(S=),硫代,甲硅烷基,C1-C10烷硫基,芳硫基,C1-C10烷基磺酰基,芳基磺酰基,酰基氨基,氨基酰基,氨基硫酰基,a基,巯基,酰胺基,硫脲基,硫氰酸根,磺酰胺基,胍,脲基,氰基,硝基,酰基,硫代羰基,酰基氨基甲酸酯,羧基和羧酸酯。另一方面,在烷基,烯基或炔基上的可能的取代基包括除C1-C10烷基以外的所有上述取代基。环烷基,环烯基,杂环烷基,杂环烯基,芳基和杂芳基也可以彼此稠合。
“氨基”是指具有两个另外的取代基的氮部分,其中每个取代基具有与氮键合的氢或碳原子α。除非另有说明,否则本发明的包含氨基部分的化合物可以包括其保护的衍生物。用于氨基部分的合适的保护基包括乙酰基,叔丁氧羰基,苄氧羰基等。
“芳族”是指这样的部分,其中组成原子构成不饱和环系统,该环系统中的所有原子都被sp2杂化,并且pi电子的总数等于4n+2。芳香环可以是这样的环原子仅是碳原子或可以包括碳原子和非碳原子(参见杂芳基)。
氨基甲酰基”是指基团-OC(O)NRaRb,其中Ra和Rb各自独立地是另外两个取代基,其中氢或碳原子为氮原子。注意氨基甲酰基部分可包括其保护的衍生物。用于氨基甲酰基部分的合适保护基的实例包括乙酰基,叔丁氧羰基,苄氧羰基等。应当指出,未保护的和受保护的衍生物均落入本发明的范围内。
“羰基”是指基团-C(O)-。注意,羰基可进一步被各种取代基取代以形成不同的羰基,包括酸,酰卤,酰胺,酯和酮。
“羧基”是指基团-C(O)O-。应当指出,本发明的含有羧基的化合物可以包括其被保护的衍生物,即其中的氧被保护基取代。羧基部分的合适的保护基包括苄基,叔丁基等。
“氰基”是指基团-CN。
“甲酰基”是指基团-CH=O。
“Formimino”是指基团–HC=NH。
“卤素”是指氟,氯,溴或碘。
如本申请中所定义的,作为独立基团或较大基团的一部分的“卤代烷基”是指被一个或多个“卤”原子取代的“烷基”。卤代烷基包括卤代烷基,二卤代烷基,三卤代烷基,全卤代烷基等。
“羟基”是指基团-OH。
“亚胺衍生物”是指包含-C(=NR)-部分的衍生物,其中R包含氢或氮的碳原子。
“异构体”是指具有相同分子式但其原子的键合性质或顺序或原子在空间中的排列不同的任何化合物。原子在空间中的排列不同的异构体称为“立体异构体”。不是彼此镜像的立体异构体被称为“非对映异构体”,而不能重叠镜像的立体异构体被称为“对映异构体”或有时称为“光学异构体”。与四个不同取代基键合的碳原子称为“手性中心”。具有一个手性中心的化合物具有相反手性的两种对映体形式。两种对映体形式的混合物称为“外消旋混合物”。
“硝基”是指基团-NO2
“受保护的衍生物”是指其中反应部位被保护基团封闭的化合物的衍生物。受保护的衍生物可用于制备药物或本身可作为抑制剂。合适的保护基团的完整列表可见于T.W.Greene,有机合成中的保护基团,第三版,Wiley&Sons,1999。
术语“取代”是指一个原子或原子团已取代氢作为与另一个基团相连的取代基。对于芳基和杂芳基,术语“取代的”是指任何取代水平,即单取代,二取代,三取代,四取代或五取代,其中允许这种取代。取代基是独立选择的,并且取代可以在任何化学可及的位置。术语“未取代的”是指给定部分可以通过可用化合价(未取代的)仅由氢取代基组成。
如果将官能团描述为“任选取代的”,则该官能团可以是(1)未取代的或(2)取代的。如果将官能团的碳描述为任选地被一个或多个取代基取代,则该碳上的一个或多个氢原子(在一定程度上)可以分别和/或一起被取代。独立选择的任选取代基。
“硫化物”是指-S-R,其中R是H,烷基,碳环,杂环,碳环烷基或杂环烷基。特定的硫化物基团是巯基,烷基硫化物,例如甲基硫化物(-S-Me);芳基硫醚,例如苯硫醚;芳烷基硫醚,例如苄基硫醚。
“亚磺酰基”是指基团-S(O)-。注意,亚磺酰基基团可以进一步被各种取代基取代以形成不同的亚磺酰基基团,包括亚磺酸,亚磺酰胺,亚磺酰基酯和亚砜。
“磺酰基”是指基团-S(O)(O)-。注意,磺酰基可以进一步被各种取代基取代以形成不同的磺酰基,包括磺酸,磺酰胺,磺酸酯和砜。
“硫代羰基”是指基团-C(S)-。注意,硫代羰基可进一步被各种取代基取代以形成不同的硫代羰基,包括硫代酸,硫代酰胺,硫代酸酯和硫代酮。
“动物”包括人类,非人类哺乳动物(例如非人类灵长类,啮齿动物,小鼠,大鼠,仓鼠,狗,猫,兔子,牛,马,马,绵羊,山羊,猪,鹿等)和非人类-哺乳动物(例如鸟类等)。
如本文所用,“生物利用度”是完整到达全身循环的药物或药物组合物的给药剂量的分数或百分比。通常,静脉内给药时,其生物利用度为100%。然而,当通过其他途径(例如,口服)施用药物时,其生物利用度降低(例如,由于吸收不完全和首过代谢)。改善生物利用度的方法包括前药方法,盐合成,减小粒径,络合,改变物理形式,固体分散体,喷雾干燥和热熔挤出。
“疾病”具体包括动物或其部分的任何不健康状况,并且包括可能由于对该动物施行的医学或兽医疗法(即此类疗法的“副作用”)引起或与之不健康的状况。
“药学上可接受的”是指可用于制备通常安全,无毒且生物学上或其他方面均不期望的药物组合物,包括兽医用和人用药学上可接受的药物组合物。
“药学上可接受的盐”是指如上所定义的药学上可接受的并且具有所需药理活性的本发明化合物的有机或无机盐。这样的盐包括与无机酸或有机酸形成的酸加成盐。药学上可接受的盐还包括碱加成盐,当存在的酸性质子能够与无机或有机碱反应时,可以形成碱加成盐。示例性盐包括但不限于硫酸盐,柠檬酸盐,乙酸盐,草酸盐,氯化物,溴化物,碘化物,硝酸盐,硫酸氢盐,磷酸盐,酸性磷酸盐,异烟酸酯,乳酸酯,水杨酸酯,柠檬酸,酒石酸酯,油酸酯,单宁酸酯,泛酸酯,酒石酸氢盐,抗坏血酸盐,琥珀酸盐,马来酸盐,龙胆酸盐,富马酸盐,葡萄糖酸盐,葡萄糖醛酸盐,蔗糖,甲酸盐,苯甲酸盐,谷氨酸盐,甲磺酸“甲磺酸盐”,乙磺酸盐,苯磺酸盐,对甲苯磺酸盐,pamoate(即1,(2-羟基-3-萘甲酸酯)盐,碱金属(例如钠和钾)盐,碱土金属(例如镁)盐和铵盐。药学上可接受的盐可包括包含另一种分子,例如乙酸根离子,琥珀酸根离子或其他抗衡离子。抗衡离子可以是任何能稳定母体化合物上电荷的有机或无机部分。此外,药学上可接受的盐在其结构中可以具有一个以上的带电原子。其中多个带电原子是药学上可接受的盐的一部分的实例可以具有多个抗衡离子。因此,药学上可接受的盐可具有一个或多个带电原子和/或一个或多个抗衡离子。
“药学上可接受的载体”是指与本发明化合物混合以形成药物组合物的无毒溶剂,分散剂,赋形剂,佐剂或其他材料,即能够向患者给药的剂型。药学上可接受的载体的实例包括合适的聚乙二醇(例如PEG400),表面活性剂(例如Cremophor)或环多糖(例如羟丙基-β-环糊精或磺丁基醚β-环糊精),聚合物,脂质体,胶束,纳米球等。
由国际纯粹与应用化学联合会定义的“药理基团”是空间和电子特征的集合,对于确保与特定生物靶标的最佳超分子相互作用并触发(或阻断)其生物反应是必不可少的。例如,喜树碱是众所周知的托泊替康和伊立替康的药效基团。甲氯乙胺是一系列广泛使用的氮芥类药物的药效基团,如Melphalan,环磷酰胺,苯达莫司汀等。
“前药”是指在体内代谢可转化为根据本发明的活性药物的化合物。例如,可以将包含羟基的抑制剂作为酯施用,该酯通过体内水解转化为羟基化合物。
“稳定性”通常是指药物保持其特性而不丧失效力的时间长度。有时这称为保质期。影响药物稳定性的因素包括:药物的化学结构,制剂中的杂质,pH,水分含量以及环境因素,例如温度,氧化,光和相对湿度。通过提供适当的化学和/或晶体修饰(例如,可以改变水合动力学的表面修饰;可以具有不同特性的不同晶体),赋形剂(例如,剂型中除活性物质以外的任何物质),包装,可以提高稳定性,储存条件等。
本文所述的组合物的“治疗有效量”是指以适用于任何药物治疗的合理的受益/风险比,对被治疗的受试者赋予治疗作用的组合物的量。治疗效果可以是客观的(即,可以通过某种测试或标记物进行测量)或主观的(即,受试者给出效果或感觉到效果)。上述组合物的有效量可以在约0.1mg/kg至约500mg/kg的范围内,优选约0.2至约50mg/kg。有效剂量也将根据给药途径以及与其他药物共同使用的可能性而变化。但是,应该理解,本发明组合物的每日总用量将由主治医师在合理的医学判断范围内决定。任何特定患者的具体治疗有效剂量水平将取决于多种因素,包括正在治疗的疾病和疾病的严重程度;所用特定化合物的活性;使用的具体组成;患者的年龄,体重,总体健康状况,性别和饮食;施用时间,施用途径和所用特定化合物的排泄速率;治疗的持续时间;与所使用的特定化合物组合或同时使用的药物;以及医学领域众所周知的因素。
如本文所用,术语“治疗”是指将化合物施用给患有赘生性或免疫性疾病或对其具有症状或易感性的对象,以治愈,治愈,缓解,减轻,改变,纠正,改善,改善或影响疾病,症状或对疾病的易感性。术语“有效量”是指在受试者中赋予预期的治疗效果所需的活性剂的量。如本领域技术人员所知,有效量可以变化,这取决于给药途径,赋形剂的使用以及与其他药物共同使用的可能性。
“受试者”是指人类和非人类动物。非人类动物的实例包括所有脊椎动物,例如哺乳动物,例如非人类灵长类动物(尤其是高等灵长类动物),狗,啮齿动物(例如小鼠或大鼠),豚鼠,猫和非哺乳动物,例如在一个优选的实施方案中,所述受试者是人类。在另一个实施方案中,受试者是实验动物或适合作为疾病模型的动物。
“组合疗法”包括将本发明的主题化合物与其他生物活性成分(例如但不限于第二和不同的抗肿瘤药)和非药物疗法(例如但不限于)进一步组合给药。仅限于手术或放射治疗)。例如,本发明的化合物可以与其他药物活性化合物或非药物疗法,优选能够增强本发明化合物作用的化合物组合使用。本发明的化合物可以同时施用(作为单一制剂或单独制剂)或相继施用于其他疗法。通常,组合疗法设想在单一周期或疗程中施用两种或更多种药物/疗法。
在一个实施方案中,本发明的化合物与一种或多种传统化学治疗剂组合施用。传统的化学治疗剂包括肿瘤学领域中的多种治疗方法。为了缩小肿瘤,破坏手术后剩余的剩余癌细胞,诱导缓解,维持缓解和/或缓解与癌症或其治疗有关的症状,在疾病的各个阶段施用这些试剂。此类试剂的实例包括但不限于烷基化试剂,例如氮芥子气(例如苯达莫司汀,环磷酰胺,美法仑,氯丁酸,异氟磺酰胺),亚硝基脲(例如卡莫斯汀,洛莫斯汀和链霉菌素),亚乙基亚胺(例如硫代特帕,六甲基黑素)),烷基磺酸盐(例如,白消安),肼和三嗪(例如,阿曲胺,丙卡巴嗪,达卡巴嗪和替莫唑胺),以及铂基试剂(例如,卡铂,顺铂和奥沙利铂);植物生物碱,例如鬼臼毒素(例如,依托泊苷和替尼索肽),紫杉烷类(例如,紫杉醇和多西他赛),长春花生物碱(例如,长春新碱,长春花碱和长春瑞滨);抗肿瘤抗生素,例如铬霉素(例如放线菌素和青霉素),蒽环类药物(例如阿霉素,柔红霉素,表柔比星,米托蒽醌和依达比星),以及杂类抗生素例如丝裂霉素和博来霉素;抗代谢物,例如叶酸拮抗剂(例如甲氨蝶呤),嘧啶拮抗剂(例如5-氟尿嘧啶,福库啶,阿糖胞苷,卡培他滨和吉西他滨),嘌呤拮抗剂(例如6-巯基嘌呤和6-硫代鸟嘌呤)和腺苷脱氨酶抑制剂(例如克拉屈滨,氟达拉滨,奈拉滨和戊抑素);拓扑异构酶抑制剂,例如拓扑异构酶I抑制剂(托泊替康,伊立替康),拓扑异构酶II抑制剂(例如Amsacrine,依托泊苷,依托泊苷磷酸酯,替尼泊苷),以及其他抗肿瘤药物,例如核糖核苷酸还原酶抑制剂(Hydroxyurea),肾上腺皮质激素抗微管药(雌莫司汀)和类维生素A(贝沙罗汀,异维A酸,维甲酸(ATRA)。
在本发明的一方面,可以将化合物与一种或多种靶向调节与多种疾病状态有关的蛋白激酶的靶向抗癌剂联合施用。此类激酶的实例可包括但不限于ABL1,ABL2/ARG,ACK1,AKT1,AKT2,AKT3,ALK,ALK1/ACVRL1,ALK2/ACVR1,ALK4/ACVR1B,ALK5/TGFBR1,ALK6/BMPR1B,AMPK(A1/B1/G1),AMPK(A1/B1/G2),AMPK(A1/B1/G3),AMPK(A1/B2/G1),AMPK(A2/B1/G1),AMPK(A2/B2/G1),AMPK(A2/B2/G2),ARAF,ARK5/NUAK1,ASK1/MAP3K5,ATM,AuroraA,Aurora B,Aurora C,AXL,BLK,BMPR2,BMX/ETK,BRAF,BRK,BRSK1,BRSK2,BTK,CAMK1a,CAMK1b,CAMK1d,CAMK1g,CAMKIIa,CAMKIIb,CAMKIId,CAMKIIg,CAMK4,CAMKK1,CAMKK2,CDC7-DBF4,CDK1-cyclin A,CDK1-cyclin B,CDK1-cyclin E,CDK2-cyclin A,CDK2-cyclinA1,CDK2-cyclin E,CDK3-cyclin E,CDK4-cyclin D1,CDK4-cyclin D3,CDK5-p25,CDK5-p35,CDK6-cyclin D1,CDK6-cyclin D3,CDK7-cyclin H,CDK9-cyclin K,CDK9-cyclin T1,CHK1,CHK2,CK1a1,CK1d,CK1epsilon,CK1g1,CK1g2,CK1g3,CK2a,CK2a2,c-KIT,CLK1,CLK2,CLK3,CLK4,c-MER,c-MET,COT1/MAP3K8,CSK,c-SRC,CTK/MATK,DAPK1,DAPK2,DCAMKL1,DCAMKL2,DDR1,DDR2,DLK/MAP3K12,DMPK,DMPK2/CDC42BPG,DNA-PK,DRAK1/STK17A,DYRK1/DYRK1A,DYRK1B,DYRK2,DYRK3,DYRK4,EEF2K,EGFR,EIF2AK1,EIF2AK2,EIF2AK3,EIF2AK4/GCN2,EPHA1,EPHA2,EPHA3,EPHA4,EPHA5,EPHA6,EPHA7,EPHA8,EPHB1,EPHB2,EPHB3,EPHB4,ERBB2/HER2,ERBB4/HER4,ERK1/MAPK3,ERK2/MAPK1,ERK5/MAPK7,FAK/PTK2,FER,FES/FPS,FGFR1,FGFR2,FGFR3,FGFR4,FGR,FLT1/VEGFR1,FLT3,FLT4/VEGFR3,FMS,FRK/PTK5,FYN,GCK/MAP4K2,GRK1,GRK2,GRK3,GRK4,GRK5,GRK6,GRK7,GSK3a,GSK3b,Haspin,HCK,HGK/MAP4K4,HIPK1,HIPK2,HIPK3,HIPK4,HPK1/MAP4K1,IGF1R,IKKa/CHUK,IKKb/IKBKB,IKKe/IKBKE,IR,IRAK1,IRAK4,IRR/INSRR,ITK,JAK1,JAK2,JAK3,JNK1,JNK2,JNK3,KDR/VEGFR2,KHS/MAP4K5,LATS1,LATS2,LCK,LCK2/ICK,LKB1,LIMK1,LOK/STK10,LRRK2,LYN,LYNB,MAPKAPK2,MAPKAPK3,MAPKAPK5/PRAK,MARK1,MARK2/PAR-1Ba,MARK3,MARK4,MEK1,MEK2,MEKK1,MEKK2,MEKK3,MELK,MINK/MINK1,MKK4,MKK6,MLCK/MYLK,MLCK2/MYLK2,MLK1/MAP3K9,MLK2/MAP3K10,MLK3/MAP3K11,MNK1,MNK2,MRCKa/,CDC42BPA,MRCKb/,CDC42BPB,MSK1/RPS6KA5,MSK2/RPS6KA4,MSSK1/STK23,MST1/STK4,MST2/STK3,MST3/STK24,MST4,mTOR/FRAP1,MUSK,MYLK3,MYO3b,NEK1,NEK2,NEK3,NEK4,NEK6,NEK7,NEK9,NEK11,NIK/MAP3K14,NLK,OSR1/OXSR1,P38a/MAPK14,P38b/MAPK11,P38d/MAPK13,P38g/MAPK12,P70S6K/RPS6KB1,p70S6Kb/,RPS6KB2,PAK1,PAK2,PAK3,PAK4,PAK5,PAK6,PASK,PBK/TOPK,PDGFRa,PDGFRb,PDK1/PDPK1,PDK1/PDHK1,PDK2/PDHK2,PDK3/PDHK3,PDK4/PDHK4,PHKg1,PHKg2,PI3Ka,(p110a/p85a),PI3Kb,(p110b/p85a),PI3Kd,(p110d/p85a),PI3Kg(p120g),PIM1,PIM2,PIM3,PKA,PKAcb,PKAcg,PKCa,PKCb1,PKCb2,PKCd,PKCepsilon,PKCeta,PKCg,PKCiota,PKCmu/PRKD1,PKCnu/PRKD3,PKCtheta,PKCzeta,PKD2/PRKD2,PKG1a,PKG1b,PKG2/PRKG2,PKN1/PRK1,PKN2/PRK2,PKN3/PRK3,PLK1,PLK2,PLK3,PLK4/SAK,PRKX,PYK2,RAF1,RET,RIPK2,RIPK3,RIPK5,ROCK1,ROCK2,RON/MST1R,ROS/ROS1,RSK1,RSK2,RSK3,RSK4,SGK1,SGK2,SGK3/SGKL,SIK1,SIK2,SLK/STK2,SNARK/NUAK2,SRMS,SSTK/TSSK6,STK16,STK22D/TSSK1,STK25/YSK1,STK32b/YANK2,STK32c/YANK3,STK33,STK38/NDR1,STK38L/NDR2,STK39/STLK3,SRPK1,SRPK2,SYK,TAK1,TAOK1,TAOK2/TAO1,TAOK3/JIK,TBK1,TEC,TESK1,TGFBR2,TIE2/TEK,TLK1,TLK2,TNIK,TNK1,TRKA,TRKB,TRKC,TRPM7/CHAK1,TSSK2,TSSK3/STK22C,TTBK1,TTBK2,TTK,TXK,TYK1/LTK,TYK2,TYRO3/SKY,ULK1,ULK2,ULK3,VRK1,VRK2,WEE1,WNK1,WNK2,WNK3,YES/YES1,ZAK/MLTK,ZAP70,ZIPK/DAPK3,KINASE,MUTANTS,ABL1(E255K),ABL1(F317I),ABL1(G250E),ABL1(H396P),ABL1(M351T),ABL1(Q252H),ABL1(T315I),ABL1(Y253F),ALK(C1156Y),ALK(L1196M),ALK(F1174L),ALK(R1275Q),BRAF(V599E),BTK(E41K),CHK2(I157T),c-Kit(A829P),c-KIT(D816H),c-KIT(D816V),c-Kit(D820E),c-Kit(N822K),C-Kit(T670I),c-Kit(V559D),c-Kit(V559D/V654A),c-Kit(V559D/T670I),C-Kit(V560G),c-KIT(V654A),C-MET(D1228H),C-MET(D1228N),C-MET(F1200I),c-MET(M1250T),C-MET(Y1230A),C-MET(Y1230C),C-MET(Y1230D),C-MET(Y1230H),c-Src(T341M),EGFR(G719C),EGFR(G719S),EGFR(L858R),EGFR(L861Q),EGFR(T790M),EGFR,(L858R,T790M),EGFR(d746-750/T790M),EGFR(d746-750),EGFR(d747-749/A750P),EGFR(d747-752/P753S),EGFR(d752-759),FGFR1(V561M),FGFR2(N549H),FGFR3(G697C),FGFR3(K650E),FGFR3(K650M),FGFR4(N535K),FGFR4(V550E),FGFR4(V550L),FLT3(D835Y),FLT3(ITD),JAK2(V617F),LRRK2(G2019S),LRRK2(I2020T),LRRK2(R1441C),p38a(T106M),PDGFRa(D842V),PDGFRa(T674I),PDGFRa(V561D),RET(E762Q),RET(G691S),RET(M918T),RET(R749T),RET(R813Q),RET(V804L),RET(V804M),RET(Y791F),TIF2(R849W),TIF2(Y897S),and TIF2(Y1108F).
在本发明的另一方面,本发明化合物可以与一种或多种调节非激酶生物学靶标,途径或过程的靶向抗癌剂联合给药。此类靶途径或过程包括但不限于热激蛋白(例如HSP90),聚ADP(二磷酸腺苷)-核糖聚合酶(PARP),缺氧诱导因子(HIF),蛋白酶体,Wnt/Hedgehog/Notch信号蛋白,TNF-α,基质金属蛋白酶,法呢基转移酶,凋亡途径(例如Bcl-xL,Bcl-2,Bcl-w),组蛋白脱乙酰基酶(HDAC),组蛋白乙酰基转移酶(HAT)和甲基转移酶(例如组蛋白赖氨酸甲基转移酶,组蛋白精氨酸)甲基转移酶,DNA甲基转移酶等)。
在本发明的另一方面,将本发明的化合物与一种或多种其他抗癌剂组合施用,所述其他抗癌剂包括但不限于基因疗法,RNAi癌症疗法,化学保护剂(例如,氨磺汀,mesna)。和右雷佐生),药物-抗体结合物(例如brentuximab vedotin,ibritumomab tioxetan),癌症免疫疗法(例如Interleukin-2),癌症疫苗(例如sipuleucel-T)或单克隆抗体(例如Bevacizumab,Alemtuzumab,Rituximab,曲妥珠单抗等)。
在本发明的另一方面,本发明化合物与放射疗法或外科手术联合给药。辐射通常在内部(在癌症部位附近植入放射性物质)或从使用光子(X射线或γ射线)或粒子辐射的机器外部传递。在组合疗法进一步包括放射治疗的情况下,可以在任何合适的时间进行放射治疗,只要获得了由治疗剂和放射治疗的组合的共同作用产生的有益效果即可。例如,在适当的情况下,当从治疗剂的施用暂时去除放射治疗时,可能直到几天甚至几周,仍可获得有益效果。
在某些实施方案中,本发明的化合物与放射疗法,手术或抗癌剂中的一种或多种结合施用,所述放射治疗剂,手术剂或抗癌剂包括但不限于DNA损伤剂,抗代谢物,拓扑异构酶抑制剂,抗微管剂。,激酶抑制剂,表观遗传因子,HSP90抑制剂,PARP抑制剂,BCL-2抑制剂,药物-抗体结合物以及靶向VEGF,HER2,EGFR,CD50,CD20,CD30,CD33等的抗体。
在某些实施方案中,本发明的化合物与阿巴拉西斯,乙酸阿比特龙,阿地白金,阿仑单抗,阿曲他明,阿那曲唑,天冬酰胺酶,苯达莫司汀,贝伐单抗,贝沙罗汀,比卡鲁胺,博来霉素,硼替佐比,布伦妥昔单抗,一种或多种联合给药卡培他滨,卡铂,卡莫司汀,西妥昔单抗,苯丁酸氮芥,顺铂,克拉屈滨,氯法拉滨,氯米芬,克唑替尼,环磷酰胺,达沙替尼,柔红霉素脂质体,地西他滨,地加瑞克,柔柔新霉素多柔比星,多柔比西索,埃罗替尼,雌莫司汀,依托泊苷磷酸酯,依维莫司,依西美坦,氟达拉滨,氟尿嘧啶,福美汀,氟维司群,吉非替尼,吉西他滨,吉妥珠单抗,奥古巴汀,醋酸戈舍瑞林,醋酸组氨酸,羟基脲,伊布替尼美沙芬,依沙贝比隆,拉帕替尼二甲苯磺酸盐,来那利domide,来曲唑,亚叶酸钙,乙酸亮丙瑞林,左旋咪唑,洛莫司汀,甲氧乙胺,美法仑,甲氨蝶呤,丝裂霉素C,米托蒽醌,奈拉拉滨,尼洛替尼,奥沙利铂,紫杉醇,紫杉醇蛋白结合颗粒,帕米膦酸,培他美哌曲酶,帕斯美曲美酯,帕潘美曲酯二钠,喷喷抑素,雷洛昔芬,利妥昔单抗,索拉非尼,链佐菌素,马来酸舒尼替尼,他莫昔芬,替莫罗莫司,替尼泊苷,沙利度胺,托瑞米芬,托西妥单抗,曲妥珠单抗,维甲酸,尿嘧啶,放疗,范德替尼,韦妥雷尼
在某些实施方案中,本发明的化合物与一种或多种抗炎剂组合施用。抗炎剂包括但不限于NSAID,非特异性和COX-2特异性环氧化酶抑制剂,金化合物,皮质类固醇,氨甲蝶呤,肿瘤坏死因子受体(TNF)受体拮抗剂,免疫抑制剂和甲氨蝶呤。NSAID的实例包括但不限于布洛芬,氟比洛芬,萘普生和萘普生钠,双氯芬酸,双氯芬酸钠和米索前列醇的组合,舒林酸,奥沙普嗪,双氟尼醛,吡罗昔康,吲哚美辛,依托度酸,非洛芬芬钠,酮巴那酮,酮戊嗪,托美汀钠和羟氯喹。NSAID的实例还包括COX-2特异性抑制剂,例如塞来昔布,伐地昔布,鲁米昔布和/或依托昔布。
在一些实施方案中,抗炎剂是水杨酸盐。水杨酸盐包括但不限于乙酰水杨酸或阿司匹林,水杨酸钠,胆碱和水杨酸镁。抗炎剂也可以是皮质类固醇。例如,皮质类固醇可以是可的松,地塞米松,甲基泼尼松龙,泼尼松龙,磷酸泼尼松龙钠或泼尼松。
在另外的实施方案中,抗炎剂是金化合物,例如硫代苹果酸金钠或金诺芬。
本发明还包括其中抗炎剂是代谢抑制剂,例如二氢叶酸还原酶抑制剂,例如甲氨蝶呤或二氢乳清酸酯脱氢酶抑制剂,例如来氟米特的实施方案。
本发明的其他实施方案涉及这样的组合,其中至少一种抗炎化合物是抗C5单克隆抗体(例如依库珠单抗或帕克珠单抗),TNF拮抗剂例如恩那西普或英夫利昔单抗,其是抗TNFα。单克隆抗体。
在某些实施方案中,本发明的化合物与一种或多种免疫抑制剂组合施用。
在一些实施方案中,免疫抑制剂是糖皮质激素,甲氨蝶呤,环磷酰胺,硫唑嘌呤,巯基嘌呤,来氟米特,环孢菌素,他克莫司和霉酚酸酯,放线菌素,蒽环类,丝裂霉素C,博莱霉素或丁香霉素。
本发明进一步提供了预防或治疗赘生性疾病,自身免疫和/或炎性疾病的方法。在一个实施方案中,本发明涉及一种在需要治疗的受试者中治疗肿瘤疾病,自身免疫和/或炎性疾病的方法,该方法包括向所述受试者施用治疗有效量的本发明化合物。在一个实施方案中,本发明进一步提供了本发明的化合物在制备用于中止或减少赘生性疾病,自身免疫和/或炎性疾病的药物中的用途。
在一个实施方案中,所述肿瘤性疾病是B细胞恶性肿瘤,包括但不限于B细胞淋巴瘤,淋巴瘤(包括霍奇金淋巴瘤和非霍奇金淋巴瘤),毛细胞淋巴瘤,小淋巴细胞淋巴瘤(SLL),套细胞淋巴瘤(MCL)和弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL),多发性骨髓瘤,慢性和急性骨髓性白血病以及慢性和急性淋巴细胞性白血病。
可以使用根据本发明的化合物和组合物影响的自身免疫和/或炎性疾病包括但不限于过敏,阿尔茨海默氏病,急性弥漫性脑脊髓炎,艾迪生氏病,强直性脊柱炎,抗磷脂抗体综合征,哮喘,动脉粥样硬化,自身免疫性溶血性贫血,自身免疫性溶血和血小板减少症,自身免疫性肝炎,自身免疫性内耳疾病,大疱性天疱疮,乳糜泻,南美锥虫病,慢性阻塞性肺疾病,慢性特发性血小板减少性紫癜(ITP),楚格-斯特劳综合征,克罗恩病,皮肌炎,1型子宫内膜异位症,Goodpasture综合征(及相关的肾小球肾炎和肺出血),坟墓病,guillain-barré综合征,桥本病,化脓性汗腺炎,特发性血小板减少性紫癜,间质性膀胱炎,肠易激综合征,红斑狼疮多发性硬化症,重症肌无力,嗜睡症,神经性肌强直,帕金森氏病,寻常型天疱疮,恶性贫血,多肌炎,原发性胆汁性肝硬化,牛皮癣,牛皮癣性关节炎,类风湿性关节炎,精神分裂症,结节性肌炎,败血症,),颞动脉炎,移植器官的组织移植排斥和超急性排斥,血管炎(与ANCA相关的血管炎和其他血管炎),白癜风和韦格纳肉芽肿病。
应当理解,本发明不限于在此示出和描述的特定实施例,而是可以在不脱离由权利要求限定的本发明的精神和范围的情况下进行各种改变和修改。
本发明的化合物可以根据多种反应方案合成。必要的原料可以通过有机化学的标准程序获得。结合以下代表性的合成方案和实施例,将更好地理解本发明的化合物和方法,所述合成方案和实施例仅用于说明而不是限制本发明的范围。对于所公开的实施例的各种改变和修改对于本领域技术人员将是显而易见的,并且可以进行这些改变和修改,包括但不限于与本发明的化学结构,取代基,衍生物和/或方法有关的那些改变和修改。根据本发明的精神和所附权利要求的范围。
A typical approach to synthesize the Formula(I)compounds in which Ais
Figure GDA0002617172920000321
is described in Scheme A.and W in general Scheme A are the sameas those described in the Summary section above.
方案A中描述了合成A为
Figure GDA0002617172920000322
的式(I)化合物的典型方法。方案A中的R1,R2,R3,R4,R5,R6,R7,R8,和W与在方案A中描述与上面的“摘要”部分相同。
Figure GDA0002617172920000323
式(I)可以在合适的溶剂例如N,N-二甲基甲酰胺,二甲氧基乙烷,水和乙醇的混合物中,在合适的Pd催化剂和膦配体存在下,合适的条件,例如在微波反应器中加热,由中间体A与中间体B反应制备得到。或者中间体甲酸酯C可以由中间体A通过与中间体B反应,在合适的溶剂例如N,N-二甲基甲酰胺或N,N-二甲基乙酰胺中,在合适的溶剂例如二恶烷中存在合适的Pd催化剂和膦配体下,与合适的碱例如NaH,Na2CO3,Cs2CO3或K2CO3反应制备得到。。
中间体B可以通过以下方案B制备:
Figure GDA0002617172920000331
在方案B中,起始原料B-1可以进行保护过程以获得中间体B-2,中间体B-2可以被氧化形成N-氧化物。此后,B-3可以进行卤化反应(例如溴化或氯化),然后还原N-氧化物,然后进行脱保护突起,形成卤代中间体B-4。最后,可以使用本领域熟知的条件将B-4转化为硼酸或酯中间体B。
R1为H且R3和R4一起形成环烷基的中间体A可以通过以下方案C制备。方案C中的R2,R5,m,Q和W与以上概述部分中所述的那些相同;n为0、1、2或3。
Figure GDA0002617172920000332
在方案C中,可以通过在合适的溶剂例如DCM中在合适的碱例如三乙胺存在下,合适的起始原料1与合适的环胺反应来制备中间体2。此后,可以使用本领域众所周知的条件将中间体2转化为3,然后转化为4,然后转化为5。中间体6可以通过在合适的碱例如三乙胺和溶剂例如N,N-二甲基甲酰胺的存在下使中间体5与CH3SH反应来制备。此后,中间体6可被氧化为中间体7,后者可与2,2,2-三氟乙酰胺反应形成中间体8。最后,中间体8可与1,2-二溴乙烷反应,然后进行脱保护过程以形成中间体A.
中间体A,其中R1为烷基且R3和R4一起是环烷基,可以通过以下方案D制备。方案D中的R2,R5,m,Q和W与以上概述部分中所述的那些相同;n为0、1、2或3。
Figure GDA0002617172920000341
在方案D中,中间体D-1可以与二溴化物反应以形成中间体D-2,D-2可以进一步与适当的烷基碘反应以产生目标中间体。
具有不同取代基的其他中间体A可以通过类似于方案C的方法,通过使用不同的起始原料和试剂来制备。
方案E中描述了合成A为
Figure GDA0002617172920000342
的式(I)化合物的典型方法。一般方案E中的R5,R6,R7,R8,和m与以上概述部分中所述的那些相同。
Figure GDA0002617172920000343
在方案E中,起始原料4,6-二氯-2-(甲硫基)嘧啶可与取代的吗啉反应形成间甲酸酯E-2,后者可与适当的胺反应以获得E-3。最后,E-3与中间体B偶联反应可产生目标化合物。
路线F中描述了合成其中A为
Figure GDA0002617172920000344
的式(I)化合物的典型方法。一般路线E中的R5,R6,R7,R8,和m与以上概述部分中描述的那些相同。
Figure GDA0002617172920000351
在方案F中,起始原料4,6-二氯-2-(甲硫基)嘧啶可与取代的吗啉反应形成间甲酸酯F-2,后者可与适当的醇反应以获得F-3。最后,将F-3与间质B偶联可产生目标化合物。
结合以下实施例将更好地理解本发明的化合物和方法,这些实施例仅用于举例说明,并不限制本发明的范围。对所公开的实施例的各种改变和修改对于本领域技术人员将是显而易见的,并且可以在不进行本发明的化学结构,取代基,衍生物,制剂和/或方法的情况下进行这些改变和修改,包括但不限于那些。背离本发明的精神和所附权利要求的范围。
本发明的NMR数据在XL400(400MHz)上获得1H光谱,记录Me4Si的ppm低场,质子数,复数和偶合常数。HPLC数据由Agilent 1100系统获得。LC/MS数据用Applied BiosystemsAPI-100质谱仪和Shimadzu SCL-10A LC色谱柱获得:
实施例CY-202:(1-(5-氯-6-((R)-3-甲基吗啉代)-2-(1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)嘧啶-4-基)环丙基)(亚氨基)(甲基)-16-砜的制备
5-氯-6-(氯甲基)-1,2,3,4-四氢嘧啶-2,4-二酮的合成:在1L圆底烧瓶中放入6-(氯甲基)-1,2,3,4-四氢嘧啶-2,4-二酮(15g,93.42mmol,1当量),乙酸(225mL),乙酰乙酸酯(15mL)。将所得溶液在油浴中在80℃下搅拌30分钟。然后在60℃加入NCS(16.2g,121.32mmol,1.30当量)。将所得溶液在油浴中于60℃搅拌3h。然后通过加入500mL水/冰将反应淬灭,过滤收集固体,将固体在烘箱中减压干燥。得到10.1g的灰白色固体状的5-氯-6-(氯甲基)-1,2,3,4-四氢嘧啶-2,4-二酮。LC-MS-BLV-CY-202-1:(ES,m/z):195[M+H]+1H-NMR-BLV-CY-202-1:(300MHz,DMSO,ppm):δ11.71(s,1H),11.56(s,1H),4.47(s,2H)。
5-氯-6-[[(甲基硫烷基)甲基]-1,2,3,4-四氢嘧啶-2,4-二酮的合成:在250-mL圆底烧瓶中放入5-氯-6-(氯甲基)-1,2,3,4-四氢嘧啶-2,4-二酮(7.75g,39.74mmol,1当量),DMF(40mL,0.55mmol,0.01当量),甲硫醇钠(7.34g,104.86mmol,2.64当量)。将所得溶液在室温搅拌18小时。用100mL EA稀释所得混合物,并通过过滤收集固体。得到8.65g(粗品)黄色固体状的5-氯-6-[((甲基硫烷基)甲基]-1,2,3,4-四氢嘧啶-2,4-二酮。LC-MS-BLV-CY-202-2:(ES,m/z):207[M+H]+1H-NMR-BLV-CY-202-2:(300MHz,DMSO,ppm):δ11.55(s,1H),11.27(s,1H),3.55(s,2H),2.15(s,3H)。
2,4,5-三氯-6-[[(甲基硫烷基)甲基]嘧啶的合成:在500-mL圆底烧瓶中,放入5-氯-6-[[(甲基硫烷基)甲基]-1,2,3,4-四氢嘧啶-2,4-二酮(8.65g,41.86mmol,1当量),三氯化磷(100mL,1.07mol,25当量)。将所得溶液在油浴中于100℃搅拌3小时。将得到的混合物浓缩,将残余物用500mL EA稀释,然后通过添加1L水/冰淬灭。用饱和NaHCO3水溶液将溶液的pH值调节至8-9。碳酸氢钠用3×500ml乙酸乙酯萃取所得溶液。浓缩所得EA层,并将残余物用乙酸乙酯/石油醚(PE)过硅胶柱层析纯化。得到4.4g(43.16%)的2,4,5-三氯-6-[((甲基硫烷基)甲基]嘧啶,为黄色固体。LC-MS-BLV-CY-202-3:(ES,m/z):243[M+H]+1H-NMR-BLV-CY-202-3:(300MHz,CDCl3,ppm):δ3.82(s,2H),2.19(s,3H)。
2,4,5-三氯-6-(甲亚磺酰基甲基)嘧啶的合成:在500-mL圆底烧瓶中,放入2,4,5-三氯-6-[(甲基硫烷基)甲基]嘧啶(4g,16.43mmol,1当量),EA(100mL),H2O(50mL),MeOH(50mL),高碘酸钠(4.28g,20.01mmol,1.22当量)。将所得溶液在室温搅拌15小时。滤出固体,将得到的混合物浓缩。将残余物用乙酸乙酯/石油醚(1/3-1/1)过硅胶柱层析纯化。得到4.1g(96.18%)的2,4,5-三氯-6-(甲亚磺酰基甲基)嘧啶,为灰白色固体。LC-MS-BLV-CY-202-4:(ES,m/z):259[M+H]+
(3R)-4-[2,5-二氯-6-(甲亚磺酰基甲基)嘧啶-4-基]-3-甲基吗啉的合成:在250-mL圆底烧瓶中放入2,4,5-三氯-6-(甲亚磺酰基甲基)嘧啶(3.1g,11.94mmol,1当量),DCM(150mL),TEA(1.58g,15.61mmol,1.31当量),(3R)-3-甲基吗啉(1.21g,11.96mmol,1.00当量)。将所得溶液在室温搅拌15小时。混合物浓缩,将残余物用乙酸乙酯/石油醚(1/3-1/1)过硅胶柱层析纯化。得到2.1g(54.23%)的(3R)-4-[2,5-二氯-6-(甲亚磺酰基甲基)嘧啶-4-基]-3-甲基吗啉,为黄色油。LC-MS-BLV-CY-202-41:(ES,m/z):324[M+H]+1H-NMR-BLV-CY-202-41:(300MHz,CDCl3,ppm):δ4.57(s,1H),4.33(t,J=12.6Hz,1H),4.17(t,J=11.4Hz,2H),3.94(d,J=9.6Hz,1H),3.72(s,2H),3.47-3.67(m,2H),2.76(s,3H),1.44(d,J=6.9Hz,3H)。
N-[([[2,5-二氯-6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]嘧啶-4-基]甲基](甲基)氧代-λ6-亚磺酰基]-2,2的合成:50mL圆底烧瓶中,用氮气保护并保持惰性气氛。将2-三氟乙酰胺放入(3R)-4-[2,5-二氯-6-(甲亚磺酰基甲基)嘧啶-4-基]-3-甲基吗啉(500mg,1.54mmol,1当量),DCM(20mL),三氟乙酰胺(350mg,3.10mmol,2.01当量),氧化镁(249mg,6.18mmol,4.01当量),1,1,1-三(乙酰氧基)乙酸-1-基-乙叉基乙酸酯(17mg,0.04mmol,0.02当量),PhI(AcO)2(496mg,1.55mmol,1.00当量)。将所得溶液在室温搅拌15小时,然后补加入三氟乙酰胺(87mg),PhI(AcO)2(125mg),氧化镁(62mg),1,1,1-三(乙酰氧基)乙酸-1-基-乙叉基乙酸酯(4.1mg)。将所得溶液在室温搅拌15小时。滤出固体,将得到的混合物浓缩,并用乙酸乙酯/石油醚(1/10)过硅胶柱层析纯化。得到490mg(73.0%)N-[([2,5-二氯-6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]嘧啶-4-基]甲基)(甲基)氧代-λ6-亚磺酰基]-2,2,2-三氟乙酰胺,为黄色油。LC-MS-BLV-CY-202-42:(ES,m/z):435[M+H]+1H-NMR-BLV-CY-202-42:(300MHz,CDCl3,ppm):δ4.58(s,1H),4.34(t,J=12.0Hz,1H),4.10-4.30(m,2H),3.94(d,J=9.6Hz,1H),3.72(s,2H),3.46-3.69(m,2H),2.78(s,3H),1.45(d,J=6.0Hz,3H)。
(1-[2,5-二氯-6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]嘧啶-4-基]环丙基)(亚氨基)甲基-λ6-砜的合成。50mL圆底烧瓶,将N-[([[2,5-二氯-6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]嘧啶-4-基]甲基)(甲基)氧代-λ6-亚磺酰基]-2,2,2-三氟乙酰胺(300mg,0.69mmol,1当量),2-MeTHF(25mL),1,2-二溴乙烷(518.7mg,2.76mmol,4.01当量),氢氧化钠(1.66g,41.50mmol,60.21当量),(C8H17)4NBr(38mg,0.07mmol,0.10当量)。将溶液在油浴中于60℃搅拌3小时。用2×10ml乙酸乙酯萃取,合并有机层并浓缩。粗产物通过Flash-Prep-HPLC在以下条件下纯化(IntelFlash-1):柱,C18硅胶,流动相,0.05%NH3.H2O溶液=25%增加到0.05%NH3.H2O=30%;检测器波长254nm和220nm。得到30mg(11.92%)(1-[2,5-二氯-6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]嘧啶-4-基]环丙基)(亚氨基)甲基-λ6-砜酮为黄色固体。LC-MS-BLV-CY-202-43:(ES,m/z):365[M+H]+1H-NMR-BLV-CY-202-43:(300MHz,CDCl3,ppm):δ4.54(s,1H),4.07-4.15(m,1H),3.92-4.07(m,1H),3.72(s,2H),3.51-3.67(m,2H),3.10(s,3H),2.59(s,1H),1.94-2.02(m,1H),1.73-1.80(m,1H),1.42(m,5H)。
(1-[5-氯-6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]-2-[1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基]嘧啶-4-基[环丙基](亚氨基)甲基-λ6-砜的合成。50mL圆底烧瓶,该烧瓶用氮气吹扫并维持惰性气氛,放入(1-[2,5-二氯-6-[(3R)-3–甲基吗啉-4-基]嘧啶-4-基]环丙基)(亚氨基)甲基-λ6-砜(25mg,0.07mmol,1当量),DME(4mL),水(1mL),4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼硼烷-2-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶(16.7mg,0.07mmol,1.00当量),二氯化钯双(三苯基膦)(4.8mg,0.01mmol,0.10当量),Na2CO3(14.5mg,0.14mmol,1.98当量)。将所得溶液在油浴中于90℃搅拌2小时,浓缩。粗产物(通过Flash-Prep-HPLC在以下条件下纯化(IntelFlash-1):色谱柱,C18硅胶;流动相,0.05%NH3.H2O/CH3CN=35%增至40%;检测器波长,254nm&220nm。得到5.0mg(16.35%)(1-[5-氯-6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]-2-[1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4]-基]嘧啶丁-4-基]环丙基)(亚氨基)甲基-λ6-砜酮,为浅黄色固体.LC-MS-BLV-CY-202-0:(ES,m/z):447[M+H]+1H-NMR-BLV-CY-202-0:(300MHz,CD3OD,ppm):δ8.34(d,J=4.8Hz,1H),8.15(d,J=5.4Hz,1H),7.58(s,1H),7.45(s,1H),4.61(s,1H),3.99-4.11(m,2H),3.64-3.86(m,4H),3.32(s,3H),1.81-2.08(m,2H),1.63(m,2H),1.48(m,3H)。
实施例CY-200-1:甲基[甲基(1-[6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]-2-[1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基]嘧啶-4-基]环丙基)氧代-λ-亚磺酰胺]胺的合成
(R)-2-氯-6-(3-甲基吗啉代)嘧啶-4-羧酸甲酯的合成:在500-mL圆底烧瓶中,放入2,6-二氯嘧啶-4-羧酸甲酯(10g,0.05mmol,1当量),DCM(200mL,2.35mmol,48.75当量),(3R)-3-甲基吗啉(4.9g,0.05mmol,1.00当量),TEA(6.37g,0.06mmol,1.30当量)。在室温搅拌18小时,然后用800mL H2O稀释,用4×400ml二氯甲烷萃取,并将有机相合并,用2×300ml盐水洗涤。浓缩有机层,并用乙酸乙酯/石油醚(10%)过硅胶柱层析纯化。得到10g(76.19%)的2-氯-6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]嘧啶-4-羧酸甲酯,为黄色固体。
LC-MS-BLV-CY-200-1-1:(ES,m/z):272[M+H]+1H-NMR-BLV-CY-200-1-1:(300MHz,d6-DMSO,ppm):δ7.15(s,1H),4.38(br s,1H),4.11-4.13(m,1H),4.01-4.09(m,1H),3.98(s,3H),3.81(d,J=11.7Hz,1H),3.70(d,J=11.7Hz,1H),3.55(t,J=12.3Hz,1H),3.34(t,J=12.9Hz,1H),1.35(d,J=6.9Hz,3H)。
[2-氯-6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]嘧啶-4-基]甲醇的合成:500毫升三口圆底烧瓶,用氮气保护并保持惰性气氛,放入2-氯-6-[[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]嘧啶-4-甲酸甲酯(10g,0.04mmol,1当量),环氧丙烷(200mL)。随后在搅拌下逐滴添加LiBH 4在THF中的溶液(11mL,0.6当量)。将所得溶液在室温搅拌18小时。然后加入150mL水淬灭反应,用2×100ml乙酸乙酯萃取所得溶液,并将EA相合并,用无水硫酸钠干燥并浓缩。得到8.97g(粗品)黄色固体状的[2-氯-6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]嘧啶-4-基]甲醇。LC-MS-BLV-CY-200-1-2:(ES,m/z):244[M+H]+1H-NMR-BLV-CY-200-1-2:(300MHz,d6-DMSO,ppm):δ6.44(s,1H),4.60(s,2H),4.32(br s,1H),4.01(d,J=11.4Hz,1H),3.79(d,J=11.4Hz,1H),3.69(d,J=11.7Hz,1H),3.54(t,J=12.3Hz,1H),3.30(t,J=13.2Hz,1H),2.38(br s,2H),1.33(d,J=6.9Hz,3H)。
[2-氯-6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]嘧啶-4-基]甲磺酸甲酯的合成。500mL的三口圆底烧瓶,用氮气保护并维持惰性气氛。放入[2-氯-6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]嘧啶-4-基]甲醇(8.97g,0.04mmol,1当量),DCM(200mL),TEA(4.85g,0.05mmol,1.30当量)。随后在搅拌下逐滴加入甲磺酰氯(9.13g,0.08mmol,2.17当量)。将所得溶液在0℃下在冰/盐浴中搅拌1小时。然后加入300mL水淬灭反应。所得溶液用3×300ml二氯甲烷萃取,有机相用2×400ml盐水洗涤,用Na2SO4干燥并浓缩。得到11g(92.87%)的甲磺酸盐[2-氯-6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]嘧啶-4-基]甲基磺酸甲酯,为黄色固体。
LC-MS-BLV-CY-200-1-3:(ES,m/z):322[M+H]+1H-NMR-BLV-CY-200-1-3:(300MHz,d6-DMSO,ppm):δ6.85(s,1H),5.10(s,2H),4.38(br,1H),3.94(d,J=11.4Hz,1H),3.72(d,J=11.7Hz,1H),3.58(d,J=11.7Hz,1H),3.45(t,J=12.0Hz,1H),3.18-3.26(m,1H),2.78-2.86(m,1H),2.43(s,3H),1.21(d,J=6.9Hz,3H)。
(3R)-4-[2-氯-6-(碘甲基)嘧啶-4-基]-3-甲基吗啉的合成。500mL圆底烧瓶,放入[2-氯-6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]嘧啶-4-基]甲磺酸甲酯(14.8g,0.05mmol,1当量),1,4-二氧六环(300mL),LiI(11.97g,0.09mmol,1.94当量)。将所得溶液在油浴中于100℃搅拌1小时。将得到的混合物冷却,并加入400ml的20%Na2S2O3溶液。用3×400ml乙酸乙酯萃取混合物。有机相合并经无水硫酸钠干燥,过滤,浓缩滤液。将残余物用乙酸乙酯/石油醚(9%)过硅胶柱层析纯化。得到7.45g(45.81%)的黄色固体状的(3R)-4-[2-氯-6-(碘甲基)嘧啶-4-基]-3-甲基吗啉。1H-NMR-BLV-CY-200-1-4:(300MHz,d6-DMSO,ppm):δ6.95(s,1H),4.58(s,2H),4.35(br,1H),3.91-4.10(m,2H),3.72(d,J=11.4Hz,1H),3.59(d,J=11.4Hz,1H),3.44(t,J=12.0Hz,1H),3.22(t,J=13.2Hz),1H),1.21(d,J=6.9Hz,3H)。
(3R)-4-[2-氯-6-[(甲基硫烷基)甲基]嘧啶-4-基]-3-甲基吗啉的合成:将(3R)-4-[2-氯-6-(碘甲基)嘧啶-4-基]-3-甲基吗啉(7.45g,21.07mmol,1当量)放入250-mL圆底烧瓶中,N,N-二甲基甲酰胺(50mL,0.68mmol),甲硫醇钠(2.83g,20.2mmol,1当量)。将所得溶液在25℃下搅拌1小时。然后通过加入150mL水/冰淬灭反应。用3×50ml乙酸乙酯萃取所得溶液。有机混合物经无水硫酸钠干燥,过滤,浓缩滤液。将残余物用乙酸乙酯/石油醚(10%)过硅胶柱层析纯化。得到4.48g(77.76%)的(3R)-4-[2-氯-6-[(甲基硫烷基)甲基]嘧啶-4-基]-3-甲基吗啉,为黄色油。LC-MS-BLV-CY-200-1-5:(ES,m/z):274[M+H]+1H-NMR-BLV-CY-200-1-5:(300MHz,d6-DMSO,ppm):δ6.77(s,1H),4.32(br,1H),3.95-4.01(m,2H),3.72(d,J=11.7Hz,1H),3.61(s,1H),3.54(s,2H),3.39-3.49(m,1H),3.13-3.22(m,1H),2.07(s,3H),1.20(d,J=6.6Hz,3H)。
(3R)-4-[2-氯-6-(甲亚磺酰基甲基)嘧啶-4-基]-3-甲基吗啉的合成:在250mL圆底烧瓶中,放入(3R)-4-[2-氯-6-[((甲基硫烷基)甲基]嘧啶-4-基]-3-甲基吗啉(4.4g,16.07mmol,1当量),水(15mL),EA(30mL),甲醇(15mL),钠高碘酸盐(3.45g,16.13mmol,1.00当量)。将所得溶液在25℃下搅拌18小时。将所得溶液用80mLDCM稀释,滤出固体。所得溶液用3×50ml二氯甲烷萃取。有机混合物经无水硫酸钠干燥,浓缩滤液。将残余物用甲醇/二氯甲烷(0-7%)过硅胶柱层析纯化。得到3.0g(64.42%)的灰白色固体状的(3R)-4-[2-氯-6-(甲亚磺酰基甲基)嘧啶-4-基]-3-甲基吗啉。LC-MS-BLV-CY-200-1-6:(ES,m/z):290[M+H]+1H-NMR-BLV-CY-200-1-6:(300MHz,d6-DMSO,ppm):δ6.81(s,1H),4.32(br,1H),4.08(d,J=12.3Hz,1H),3.89-4.00(m,3H),3.72(d,J=14.4Hz,1H),3.59(d,J=11.7Hz,1H),3.44(t,J=12.0Hz,1H),3.20(t,J=11.1Hz,1H),2.64(s,3H),1.21(d,J=6.6Hz,3H)。
N-[([2-氯-6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]嘧啶-4-基]甲基)(甲基)氧代-λ6-亚磺酰基]-2,2,2-三氟乙酰胺的合成:250mL圆底烧瓶,放入将(3R)-4-[2-氯-6-(甲亚磺酰基甲基)嘧啶-4-基]-3-甲基吗啉(2.9g,10.01mmol,1当量),DCM(95mL),三氟乙酰胺(2.27g,20.08mmol,2.01当量),PhI(AcO)2(3.23g,10.03mmol,1.00当量),氧化镁(1.6g,39.70mmol,3.97当量),1,1,1-三(乙酰氧基)乙酸-1-基铑(0.11g,0.25mmol,0.02当量)。将所得溶液在室温搅拌18小时。然后加入更多的三氟乙酰胺(0.57g),PhI(AcO)2(0.81g),氧化镁(0.4g),1,1,1-三(乙酰氧基)乙酸-1-基铑(27mg)。将所得溶液在室温下再搅拌18小时。滤出固体,将得到的混合物浓缩。将残余物用乙酸乙酯/石油醚(20%)过硅胶柱层析纯化。得到2.6g(64.82%)的N-[([2-氯-6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]嘧啶-4-基]甲基)(甲基)氧代-λ6-亚磺酰亚胺]-2,2,2-三氟乙酰胺,为浅黄色固体。LC-MS-BLV-CY-200-1-7:(ES,m/z):401[M+H]+1H-NMR-BLV-CY-200-1-7:(300MHz,CD3Cl,ppm):δ6.48(s,1H),4.84(dd,J=5.4Hz,13.5Hz,1H),4.65(d,J=13.8Hz,1H),4.20-4.40(br,1H),4.01(d,J=11.4Hz,2H),3.75(d,J=11.4Hz,1H),3.62-3.70(m,1H),3.47-3.57(m,1H),3.42(s,3H),3.25-3.37(m,1H),1.34(d,J=6.9Hz,3H)。
(1-[2-氯-6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]嘧啶-4-基]环丙基)(亚氨基)甲基-λ6-砜的合成:50-mL圆底将烧瓶吹扫并在惰性气氛中保持氮气,将N-[([2-氯-6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]嘧啶-4-基]甲基)(甲基)氧代-λ6-亚磺酰基]-2,2,2-三氟乙酰胺(400mg,1.00mmol,1当量),2-MeTHF(15mL),1,2-二溴乙烷(939mg,5.00mmol,5.01当量),(C8H17)4NBr(54.7mg,0.1当量),10%NaOH(10.0mmol,10.0当量)。将所得溶液在油浴中于60℃搅拌2小时。粗产物通过Flash-Prep-HPLC在以下条件下纯化(IntelFlash-1):柱,C18硅胶。流动相:0.5%NH3.H2O=52%增加到0.5%NH3.H2O=56%;探测器波长254nm和220nm。得到130mg(39.37%)的(1-[2-氯-6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]嘧啶丁-4-基]环丙基)(亚氨基)甲基-λ6-砜黄色固体。
LC-MS-BLV-CY-200-1-8:(ES,m/z):331[M+H]+
1H-NMR-BLV-CY-200-1-8:(300MHz,d6-DMSO,ppm):δ6.95(s,1H),4.37(br,1H),4.04-4.31(m,1H),3.90-3.99(m,1H),3.54-3.83(m,4H),3.01(s,3H),1.63-1.66(m,1H),1.24-1.43(m,4H),1.19(d,J=6.6Hz),3H)。
[(1-[2-氯-6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]嘧啶-4-基]环丙基)(甲基)氧代-λ-亚磺酰基](甲基)胺的合成:50毫升3颈圆底烧瓶,放入(1-[2-氯-6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]嘧啶-4-基]环丙基)(亚氨基)甲基λ-砜(150mg,0.45mmol,1当量),0℃加入DMF(6mL),NaH(16.3mg,0.68mmol,1.50当量),并在0℃下搅拌5分钟。向混合物中加入碘甲烷(160.9mg,1.13mmol,2.5当量),并在室温下搅拌20分钟。浓缩干的粗产物通过制备型HPLC纯化。得到100mg[(1-[2-氯-6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]嘧啶-4-基]环丙基)(甲基)氧代-λ-亚磺酰基](甲基)胺,黄色油(64%)。LC-MS-BLV-CY-200-1-9:(ES,m/z):345[M+H]+1H-NMR-PH-BLV-CY-200-1-9:(300MHz,d6-DMSO,ppm):δ7.06(s,0.5H),7.03(s,0.5H),4.37(br,1H),4.02-4.07(m,1H),3.94(d,J=11.7Hz,1H),3.71-3.74(m,1H),3.59(d,J=11.7Hz,1H),3.46(td,J=12.0,0.9Hz,1H),3.19(t,J=12Hz,1H),3.09(s,3H),2.61(s,3H),1.68-1.75(m,1H),1.52-1.62(m,1H),1.37-1.45(m,1H),1.25-1.34(m,1H),1.21(d,J=6.9Hz,3H),
甲基[甲基(1-[6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]-2-[1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基]嘧啶-4-基]环丙基)氧代-λ-亚磺酰胺]胺的合成:25-mL圆底烧瓶中,在氮气惰性气氛下吹扫并保持该烧瓶,放入[[1-[2-氯-6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]嘧啶-4-基]环丙基)(甲基)氧代-λ-亚磺酰基](甲基)胺(100mg,0.29mmol,1当量),4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼硼烷-2-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶(106.2mg,0.44mmol,1.50当量),Pd(PPh3)2Cl2(20.4mg,0.03mmol,0.1当量),Na2CO3(76.8mg,0.72mmol,2.50当量),DME(8mL),H2O(2mL)。将所得溶液在90℃下搅拌30分钟。将得到的混合物浓缩,并将粗产物通过制备型HPLC纯化。得到41mg(33%)甲基[甲基(1-[6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]-2-][1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-酰基]嘧啶-4-基]环丙基)氧代-λ-亚磺酰基]胺,为白色固体。LC-MS-BLV-CY-200-1-0:(ES,m/z):427[M+H]+1H-NMR-PH-BLV-CY-200-1-0:(300MHz,d6-DMSO,ppm):δ11.80(s,1H),8.34(d,J=5.1Hz,1H),7.96(d,J=5.1Hz,1H),7.60(m,1H),7.22(s,1H),7.10(s,0.5H),7.06(s,0.5H),4.57(br,1H),4.17-4.30(m,1H),4.02(d,J=10.8Hz,1H),3.79-3.83(m,1H),3.68(d,J=10.8Hz,1H),3.53(t,J=11.7Hz,1H),3.24-3.29(m,1H),3.18(s,3H),2.66(s,3H),1.78-1.88(m,1H),1.65-1.75(m,1H),1.39-1.54(m,2H),1.25-1.30(m,3H).
实施例CY-205:甲基[甲基(1-[6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]-2-[1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基]嘧啶-4-基]环丁基)氧代-λ6-亚磺酰胺]胺的制备
6-[((甲基硫烷基)甲基]-1,2,3,4-四氢嘧啶-2,4-二酮的合成:500-mL圆底烧瓶,放入6-(氯甲基)-1,2,3,4-四氢嘧啶-2,4-二酮(20g,124.56mmol,1当量),DMF(200mL),NaSCH3(23.0g,328.57mmol,2.64当量)。将所得溶液在室温搅拌过夜。溶液用乙酸乙酯稀释,并过滤收集固体,用水洗涤,滤饼收集并干燥。得到11g(51.28%)的6-[((甲基硫烷基)甲基]-1,2,3,4-四氢嘧啶-2,4-二酮,为白色固体。LC-MS-BLV-CY-205-1:(ES,m/z):173[M+H]+1H-NMR-BLV-CY-205-1:(300MHz,D2O,ppm):δ5.69(s,1H),3.42(s,2H),2.02(s,3H)。
2,4-二氯-6-[[(甲基硫烷基)甲基]嘧啶的合成:500-mL圆底烧瓶,将6-[[(甲基硫烷基)甲基]-1,2,3,4-四氢嘧啶-2,4-二酮(9.5g)放入,三氯化磷(60mL)。将所得溶液在90℃下搅拌过夜。将得到的混合物浓缩,然后加入NaHCO3淬灭,。用乙酸乙酯(100mL)萃取所得溶液,合并有机层,用盐水(100mL)洗涤。将残余物用PE(100%)过硅胶柱层析纯化。得到7.2g为无色油的2,4-二氯-6-[((甲基硫烷基)甲基]嘧啶。LC-MS-BLV-CY-205-2:(ES,m/z):209[M+H]+
1H-NMR-BLV-CY-205-2:(300MHz,d6-DMSO,ppm):δ7.80(s,1H),3.78(s,2H),2.07(s,3H)。
2,4-二氯-6-(甲亚磺酰基甲基)嘧啶的合成:50mL圆底烧瓶中,将放入2,4-二氯-6-[(甲基硫烷基)甲基]嘧啶(2g,9.57mmol,1当量),H2O(4mL),EA(8mL),MeOH(4mL)。在室温下向其中分批加入高碘酸钠(2.0g,9.57mmol,1.0当量)。将所得溶液在室温搅拌过夜。然后加入EA稀释,滤掉固体,并将合并的有机层浓缩。将残余物用乙酸乙酯/石油醚(3∶1)过硅胶柱层析纯化。得到1.5g(69.67%)的2,4-二氯-6-(甲亚磺酰基甲基)嘧啶,为无色油。LC-MS-BLV-CY-205-4:(ES,m/z):225[M+H]+1H-NMR-BLV-CY-205-4:(300MHz,d6-DMSO,ppm):δ7.76(s,1H),4.39(d,J=12.3Hz,1H),4.19(d,J=12.3)Hz,1H),2.65(s,3H)。
(3R)-4-[2-氯-6-(甲亚磺酰基甲基)嘧啶-4-基]-3-甲基吗啉的合成:在100-mL圆底烧瓶中,放入2,4-二氯-6-(甲亚磺酰基甲基)嘧啶(1.5g,6.66mmol,1当量),DCM(10mL)。随后加入(3R)-3-甲基吗啉(0.7g,6.66mmol,1.0当量),TEA(0.9g,8.66mmol,1.3当量)。将所得溶液在室温搅拌4小时。浓缩的粗产物通过Flash-Prep-HPLC在11分钟内从0.1%NH3H2O:MeCN从15%提高至41%。得到1.2g(62.14%)的(3R)-4-[2-氯-6-(甲亚磺酰基甲基)嘧啶丁-4-基]-3-甲基吗啉,为白色固体。LC-MS-BLV-CY-205-4:(ES,m/z):290[M+H]+
1H-NMR-BLV-CY-205-4:(300MHz,d6-DMSO,ppm):δ6.81(s,1H),4.33(br s,1H),4.10(d,J=12.6Hz,1H),4.00-3.89(m,3H),3.72(d,J=11.7Hz,1H),3.59(dd,J=11.4,3.0Hz,1H),3.44(td,J=12.0,3.0Hz,1H),3.20(td,J=13.2,3.6Hz,1H),2.64(s,3H),1.21(d,J=6.6Hz,3H)。
N-[([2-氯-6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]嘧啶-4-基]甲基)(甲基)氧代-λ6-亚磺酰基]-2,2,2-三氟乙酰胺的合成:将(3R)-4-[2-氯-6-(甲亚磺酰基甲基)嘧啶-4-基]-3-甲基吗啉(1.2克,4.14mmol,1当量)放入100毫升圆底烧瓶中,三氟乙酰胺(0.9g,8.28mmol,2.0当量),PhI(AcO)2(1.3g,4.14,1.0当量),MgO(0.7g,16.56mmol,4.0当量),Ph2(AcO)4(0.05g,0.11mmol,0.03当量),DCM(15mL)。将所得溶液在室温搅拌过夜。将得到的混合物浓缩,并用乙酸乙酯/石油醚(40:60)过硅胶柱层析纯化。得到1.2g(72.30%)的N-[([2-氯-6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]嘧啶-4-基]甲基)(甲基)氧代-λ6-亚磺酰基亚烷基]-2,2,2-三氟乙酰胺,为白色固体。LC-MS-BLV-CY-205-5:(ES,m/z):401[M+H]+1H-NMR-BLV-CY-205-5:(300MHz,CDCl3,ppm):δ6.48(s,1H),4.84(dd,J=13.5,5.4Hz,1H),4.65(d,J=13.8)Hz,1H),4.20-4.40(br s,1H),4.01(dd,J=11.7,3.6Hz,2H),3.79(d,J=11.7Hz,1H),3.71-3.62(m,1H),3.57-3.47(m,1H),3.42(s,3H),3.37-3.25(m,1H),1.33(d,J=6.9Hz,3H)。
([2-氯-6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]嘧啶-4-基]甲基)(亚氨基)甲基-λ6-砜的合成:50mL圆底烧瓶中,放入N-[([[2-氯-6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]嘧啶-4-基]甲基](甲基)氧代-λ6-亚磺酰基]-2,2,2-三氟乙酰胺(300mg,0.75mmol,1当量),MeOH(20mL),K2CO3(258.6mg,1.87mmol,2.5当量)。将所得溶液在室温搅拌30分钟。混合物浓缩,所得溶液用水稀释,用乙酸乙酯萃取,合并有机层,将合并的混合物浓缩。得到181mg(79.34%)的([2-氯-6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]嘧啶-4-4-基]甲基)(亚氨基)甲基-λ6-砜,黄色固体。
LC-MS-BLV-CY-205-6:(ES,m/z):305[M+H]+1H-NMR-BLV-CY-205-6:(300MHz,CD3OD,ppm):δ6.79(s,1H),4.48-4.34(m,2H),4.12-4.08(m,1H),4.00(dd,J=11.4,3.6Hz,1H),3.81(d,J=11.7Hz,1H),3.70(dd,J=11.7,3.0Hz,1H),3.56(td,J=12.0,3.0Hz,1H),3.37-3.27(m,2H),3.09(s,3H),1.33(d,J=6Hz,3H)。
([2-氯-6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]嘧啶-4-基]甲基)(甲基)(甲基亚氨基)-λ6-砜的合成:50-mL圆底烧瓶,放置([2-氯-6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]嘧啶-4-基]甲基)(亚氨基)甲基-λ6-砜(260mg,0.85mmol,1当量),Me3OBF4(138.9mg,0.94mmol,1.1当量),DCM(10mL)。将所得溶液在室温搅拌20分钟。然后加入MeOH淬灭反应,将得到的混合物浓缩。通过Flash-Prep-HPLC纯化粗产物,在9分钟内将0.1%NH4HCO3∶MeCN=22%增加至0.1%NH4HCO3∶MeCN=40%。得到100mg(36.77%)的([2-氯-6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]嘧啶丁-4-基]甲基)(甲基)(甲基亚氨基)-λ6-砜,白色固体。
LC-MS-BLV-CY-205-7:(ES,m/z):319[M+H]+
[(1-[2-氯-6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]嘧啶-4-基]环丁基)(甲基)氧代-λ6-亚磺酰基](甲基)胺的合成:50mL圆底烧瓶,放置([2-氯-6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]嘧啶-4-基]甲基)(甲基)(甲基亚氨基)-λ6-砜(100mg,0.31mmol,1当量),1,3-二溴丙烷(253.3mg,1.25mmol,4.0当量),(C8H17)4NBr(17.2mg,0.03mmol,0.1当量),2-MeTHF(8mL),NaOH(50%)(752.7mg,18.82mmol,60当量)。将所得溶液在60℃下搅拌过夜。然后加入水(20mL),并用EtOAc(2×20mL)萃取。合并的有机层,用盐水(150mL)洗涤,Na2SO4干燥,过滤并浓缩。将残余物用乙酸乙酯过硅胶柱层析纯化。得到38mg(33.75%)的[(1-[2-氯-6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]嘧啶-4-基]环丁基)(甲基)氧代-λ6-硫亚基](甲基)胺,为浅黄色固体。LC-MS-BLV-CY-205-8:(ES,m/z):359[M+H]+1H-NMR-BLV-CY-205-8:(300MHz,d6-DMSO,ppm):δ6.95(s,1H),5.68-5.59(m,1H),5.10-4.98(m,2H),4.48(d,J=11.7Hz,1H),4.34-4.23(m,1H),4.03-3.92(m,2H),3.73(d,J=11.4Hz,1H),3.61(d,J=11.4Hz,1H),3.46(t,J=11.1Hz,1H),3.20(t,J=9.3Hz,1H),2.98-2.82(m,4H),2.76-2.74(m,1H),2.64(d,J=5.7Hz,3H),1.21(d,J=6.9Hz,3H)。
甲基[甲基(1-[6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]-2-[1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基]嘧啶-4-基]环丁基)氧代-λ-亚磺酰胺]胺的合成:8-mL微波管,在氮气保护下放入4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼烷-2-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶(32.6mg,0.13mmol,1.2当量),[(1-[2-氯-6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]嘧啶-4-基]环丁基)(甲基)氧代-λ6-亚磺酰基](甲基)胺(40mg,0.11mmol,1当量),PdCl2(PPh3)2(15.6mg,0.02mmol,0.2当量),Na2CO3(23.5mg,0.22mmol,1.99当量),DME(2.5mL),H2O(0.8mL)。将所得溶液在90℃下搅拌40分钟。粗产物通过制备型HPLC纯化,得到23.8mg(48.47%)甲基[甲基(1-[6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]-2-][1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-酰基]嘧啶-4-基]环丁基)氧代-λ6-亚磺酰基]胺,为白色固体。
LC-MS-BLV-CY-205-0:(ES,m/z):441[M+H]+1H-NMR-BLV-CY-205-0:(300MHz,d6-DMSO,ppm):δ11.81(s,1H),8.34(dd,J=5.1,1.5Hz,1H),8.00(d,J=5.1Hz,1H),7.60(d,J=5.7Hz,1H),7.26-7.25(m,1H),6.97-6.95(m,1H),5.72-5.68(m,1H),5.11(d,J=16.2Hz,1H),4.97(d,J=10.2Hz,1H),4.62-4.56(m,2H),4.26-4.18(m,1H),4.03(d,J=8.7Hz,1H),3.82(d,J=11.4Hz,1H),3.69(d,J=11.4Hz,1H),3.55(t,J=11.7Hz,1H),3.33-3.24(m,2H),3.02-2.99(t,J=5.4Hz,3H),2.80-2.73(m,1H),2.69(s,2H),2.65(d,J=3.0Hz,1H),1.30-1.26(m,3H)。
实施例CY-206:亚氨基(甲基)[1-[6-(1,4-氧杂庚烷-4-基)-2-][1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基]嘧啶-4-基]环丙基的制备]-λ6-砜酮的制备
4-[2-氯-6-(甲亚磺酰基甲基)嘧啶-4-基]-1,4-氧杂庚烷的合成:在100-mL圆底烧瓶中,放入2,4-二氯-6-(甲亚磺酰基甲基)嘧啶(2.0g,8.89mmol,1当量),1,4-恶唑烷盐酸盐(1.2g,8.89mmol,1.0当量),TEA(2.2g,22.21mmol,2.5当量),DCM(20mL)。将所得溶液在室温搅拌4小时。将得到的混合物浓缩。粗产物用0.1%NH3.H2O:MeCN=12%纯化,在9分钟内增加到0.1%NH3.H2O:MeCN=28%。得到1.6g(62.14%)白色固体状的4-[2-氯-6-(甲亚磺酰基甲基)嘧啶-4-基]-1,4-氧杂庚烷。LC-MS-BLV-CY-206-1:(ES,m/z):290[M+H]+
N-([[[2-氯-6-(1,4-氧杂庚烷-4-基)嘧啶-4-基]甲基](甲基)氧代-λ6-亚磺酰基亚氨基)氨基甲酸叔丁酯的合成:250-毫升圆底烧瓶中,放入4-[2-氯-6-(甲亚磺酰基甲基)嘧啶-4-基]-1,4-氧杂庚烷(1.6g,5.52mmol,1当量),氨基甲酸叔丁酯(1.3g,11.10mmol,2.01当量),MgO(0.89g,22.08mmol,4.00当量),PhI(AcO)2(1.77g,5.52mmol,1.00当量),Rh2(AcO)4(61.0mg,0.14mmol,0.02当量)),DCM(50mL)。将所得溶液在60℃下搅拌过夜。滤出固体,所得溶液用二氯甲烷萃取,合并的有机层,浓缩。将残余物用乙酸乙酯/石油醚(60:40)过硅胶柱层析纯化。得到2.1g(93.93%)的叔丁基N-([[2-氯-6-(1,4-氧杂庚烷-4-基)嘧啶-4-基]甲基](甲基)氧代-λ6-亚磺酰基氨基甲酸酯,为白色固体。LC-MS-BLV-CY-206-2:(ES,m/z):405[M+H]+
N-([1-[2-氯-6-(1,4-氧杂庚烷-4-基)嘧啶-4-基]环丙基](甲基)氧代-λ6-亚磺酰胺基氨基甲酸叔丁酯的合成:50mL圆底烧瓶,放入1,2-二溴乙烷(980.81mg,5.221mmol,5.01当量),叔丁基-N-([[2-氯-6-(1,4-氧杂庚烷-4-基)氨基甲酸酯(700mg,1.23mmol,1当量),(C8H17)4NBr(94.53mg,0.173mmol,0.10当量),K2CO3(2867.12mg,20.745mmol,12.00当量),DMSO(25mL)。将所得溶液在60℃下搅拌3小时。然后加入水(50mL),并用EtOAc(2×50mL)萃取,合并的有机层用盐水(50mL)洗涤,Na2SO4干燥,过滤并浓缩。将残余物用乙酸乙酯/石油醚(1:1)过硅胶柱。得到130mg(17.45%)叔丁基-N-([1-[2-氯-6-(1,4-氧杂庚烷-4-基)嘧啶-4-基]环丙基](甲基)氧-λ6-亚磺酰基)氨基甲酸酯,为浅黄色固体。LC-MS-BLV-CY-206-3:(ES,m/z):431[M+H]+1H-NMR-BLV-CY-206-3:(300MHz,d6-DMSO,ppm):δ6.83(s,1H),3.86-3.62(m,8H),3.40(s,3H),1.88-1.83(m,4H),1.68-1.64(m,1H),1.45-1.40(m,1H),1.33(s,9H)。
叔丁基-N-[甲基([1-[6-(1,4-氧杂庚烷-4-基)-2-][1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基]嘧啶-4-基]环丙基])氧代-λ6-亚磺酰基]氨基甲酸酯的合成:8毫升微波管,在氮气保护下,加入N-([1-[2-氯-6-(1,4-氧杂庚烷-4-基]嘧啶-4-基]环丙基](甲基)氧代-λ6-亚磺酰基)氨基甲酸酯(130mg,0.302mmol,1当量),4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼硼烷-2-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶(110.45mg,0.452mmol,1.50当量),PdCl2(PPh3)2(42.35mg,0.06mmol,0.2当量),Na2CO3(63.94mg,0.603mmol,2.0当量),DME(3mL),H2O(0.5mL)。将所得溶液在90℃下搅拌40分钟。滤出固体,合并有机层,旋干,固体通过制备型HPLC纯化。得到58mg(37.51%)叔丁基-N-[甲基([1-[6-(1,4-氧杂庚烷-4-基)-2-][1H-吡咯并[2,3-b]]吡啶黄色固体状的-4-基]嘧啶-4-基]环丙基])氧代-λ6-亚磺酰基]氨基甲酸酯。LC-MS-LC-MS-BLV-CY-206-4:(ES,m/z):513[M+H]+
1H-NMR-BLV-CY-206-4:(300MHz,d6-DMSO,ppm):δ11.82(s,1H),8.34(d,J=5.1Hz,1H),7.94(d,J=5.1Hz,1H),7.60(t,J=3.0Hz,1H),7.21(s,1H),6.85(s,1H),3.98-3.71(m,6H),3.67(t,J=5.4Hz,2H),3.52(s,3H),1.99-1.92(m,4H),1.80-1.75(m,1H),1.55-1.50(m,1H),1.33(s,9H)。
亚氨基(甲基)[1-[6-(1,4-氧杂庚烷-4-基)-2-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基]嘧啶-4-基]环丙基的合成]-λ6-砜:25mL圆底烧瓶,放入N-[甲基([1-[6-(1,4-氧杂庚烷-4-基)-2-]-2-[1H-吡咯烷]]叔丁基[2,3-b]吡啶-4-基]嘧啶-4-基[环丙基])氧代-λ6-亚磺酰基]氨基甲酸酯(50mg),HCl(Et2O)(2mL)。将所得溶液在室温搅拌1小时。将所得混合物浓缩并通过制备型HPLC纯化。得到29.7mg的亚氨基(甲基)[1-[6-(1,4-氧杂庚烷-4-基)-2-[1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基]嘧啶-4-基]环丙基]-λ6-砜为白色固体。LC-MS-BLV-CY-206-0:(ES,m/z):413[M+H]+1H-NMR-BLV-CY-206-0:(300MHz,CD3OD,ppm):δ8.31(d,J=5.1Hz,1H),8.07(d,J=5.4Hz,1H),7.51(d,J=3.3Hz,1H),7.37(d,J=3.3Hz,1H),7.00(s,1H),4.22-3.87(m,6H),3.79(t,J=5.4Hz,2H),3.22(s,3H),2.12-2.05(m,2H),1.88-1.77(m,2H),1.62(s,2H)。
实施例CY-207:[甲基(1-[6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]-2-[1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基]嘧啶-4-基]环丙基)氧代-λ6-亚磺酰基](丙-2-基)胺的制备
2-氯-6-[[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]嘧啶-4-羧酸甲酯的合成:在500-mL圆底烧瓶中,放入2,6-二氯嘧啶-4-羧酸甲酯(10g,0.05mmol,1当量),DCM(200mL,2.35mmol,48.75当量),(3R)-3-甲基吗啉(4.9g,0.05mmol,1.00当量),TEA(6.37g,0.06mmol,1.30当量)。将所得溶液在室温搅拌18小时。将所得溶液用800mL H2O稀释,并用4×400mL二氯甲烷萃取,所得有机相用2×300mL盐水洗涤。浓缩有机层,并用乙酸乙酯/石油醚(10%)过硅胶柱层析纯化。得到10g(76.19%)黄色固体状的2-氯-6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]嘧啶-4-羧酸甲酯。LC-MS-BLV-CY-200-1:(ES,m/z):272[M+H]+
1H-NMR-BLV-CY-200-1:(300MHz,d6-DMSO,ppm):δ7.15(s,1H),4.38(br s,1H),4.11-4.13(m,1H),4.01 4.09(m,1H),3.98(s,3H),3.81(d,J=11.7Hz,1H),3.70(d,J=11.7Hz,1H),3.55(t,J=12.3Hz,1H),3.34(t,J=12.9Hz,1H),1.35(d,J=6.9Hz,3H)。
[2-氯-6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]嘧啶-4-基]甲醇的合成:在500毫升3颈圆底烧瓶,在氮气气氛下,加入2-氯-6-[[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]嘧啶-4-羧酸甲酯(10g,0.04mmol,1当量),THF(200mL)。随后在搅拌下逐滴添加LiBH4在THF中的溶液(11mL,0.6当量)。将所得溶液在室温搅拌18小时。然后加入150mL水淬灭反应。用2×100ml乙酸乙酯萃取,EA层用无水硫酸钠干燥并浓缩。得到8.97g(粗制)黄色固体状的[2-氯-6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]嘧啶-4-基]甲醇。
LC-MS-BLV-CY-200-2:(ES,m/z):244[M+H]+1H-NMR-BLV-CY-200-2:(300MHz,d6-DMSO,ppm):δ6.44(s,1H),4.60(s,2H),4.32(br s,1H),4.03(d,J=11.4Hz,1H),3.79(d,J=11.4Hz,1H),3.69(d,J=11.7Hz,1H),3.54(t,J=12.3Hz,1H),3.30(t,J=13.2Hz,1H),2.38(br s,2H),1.33(d,J=6.9Hz,3H)。
合成甲磺酸[2-氯-6-[((3R)-3-甲基吗啉-4-基]嘧啶-4-基]甲基磺酸甲酯:在500mL的3颈圆底烧瓶中,进行保氮气,加入(2-氯-6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]嘧啶-4-基]甲醇(8.97g,0.04mmol,1当量),DCM(200mL),TEA(4.85g,0.05mmol,1.30当量)。随后在搅拌下逐滴加入甲磺酰氯(9.13g,0.08mmol,2.17当量)。将所得溶液在0℃下在冰/盐浴中搅拌1小时。然后加入300mL水淬灭反应。用3×300ml二氯甲烷萃取。DCM层用2×400mL盐水洗涤,用Na2SO4干燥并浓缩,得到11g(92.87%)的甲磺酸盐[2-氯-6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]嘧啶-4-基]甲基磺酸甲酯,为黄色固体。
LC-MS-BLV-CY-200-3:(ES,m/z):322[M+H]+
H-NMR-BLV-CY-200-4:(300MHz,d6-DMSO,ppm):δ6.85(s,1H),5.10(s,2H),4.38(br,1H),3.94(d,J=11.4Hz,1H),3.72(d,J=11.7Hz,1H),3.58(d,J=11.7Hz,1H),3.45(t,J=12.0Hz,1H),3.18-3.26(m,1H)),2.78-2.86(m,1H),2.43(s,3H),1.21(d,J=6.9Hz,3H)。
(3R)-4-[2-氯-6-(碘甲基)嘧啶-4-基]-3-甲基吗啉的合成:将[2-氯-6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]嘧啶-4-基]甲磺酸甲酯(14.8g,0.05mmol,1当量),1,4-二氧六环(300mL),LiI(11.97g,0.09mmol,1.94当量)。将所得溶液在油浴中于100℃搅拌1小时。将得到的混合物冷却,并加入400ml的20%Na2S2O3溶液。用3×400mL乙酸乙酯萃取。有机混合物经过无水硫酸钠干燥,浓缩。将残余物用乙酸乙酯/石油醚(9%)过硅胶柱层析纯化。得到7.45g(45.81%)的黄色固体状的(3R)-4-[2-氯-6-(碘甲基)嘧啶-4-基]-3-甲基吗啉。1H-NMR-BLV-CY-200-4:(300MHz,d6-DMSO,ppm):δ6.95(s,1H),4.58(s,2H),4.35(br,1H),4.10-3.91(m,2H),3.72(d,J=11.4Hz,1H),3.59(d,J=11.4Hz,1H),3.44(t,J=12.0Hz,1H),3.22(t,J=13.2Hz,1H)),1.21(d,J=6.9Hz,3H)。
(3R)-4-[2-氯-6-[(甲基硫烷基)甲基]嘧啶-4-基]-3-甲基吗啉的合成:250-mL圆底烧瓶,放入(3R)-4-[2-氯-6-(碘甲基)嘧啶-4-基]-3-甲基吗啉(7.45g,21.07mmol,1当量),N,N-二甲基甲酰胺(50mL,0.68mmol),甲硫醇钠(2.83g,20.2mmol,1当量)。将所得溶液在25℃下搅拌1小时。然后加入150mL水/冰淬灭反应。用3×50ml乙酸乙酯萃取。有机混合物经无水硫酸钠干燥,浓缩。残余物用乙酸乙酯/石油醚(10%)过硅胶柱纯化。得4.48g(77.66%)的(3R)-4-[2-氯-6-[(甲基硫烷基)甲基]嘧啶-4-基]-3-甲基吗啉,为黄色油。
LC-MS-BLV-CY-200-5:(ES,m/z):274[M+H]+1H-NMR-BLV-CY-200-5:(300MHz,d6-DMSO,ppm):δ6.77(s,1H),4.32(br,1H),3.95-4.01(m,2H),3.72(d,J=11.7Hz,1H),3.61(s,1H),3.54(s,2H),3.39-3.49(m,1H),3.13-3.22(m,1H),2.07(s,3H),1.20(d,J=6.6Hz,3H)。
(3R)-4-[2-氯-6-(甲亚磺酰基甲基)嘧啶-4-基]-3-甲基吗啉的合成:在250mL圆底烧瓶中放入(3R)-4-[2-氯-6-[((甲基硫烷基)甲基]嘧啶-4-基]-3-甲基吗啉(4.4g,16.07mmol,1当量),水(15mL),EA(30mL),甲醇(15mL),钠高碘酸盐(3.45g,16.13mmol,1.00当量)。将所得溶液在25℃下搅拌18小时。将所得溶液用80mL DCM稀释,滤掉固体,用3×50mL二氯甲烷萃取。有机混合物经无水硫酸钠干燥,过滤,浓缩滤液。残余物用甲醇/二氯甲烷(0-7%)过硅胶柱纯化。得到3.0g(64.42%)的灰白色固体状的(3R)-4-[2-氯-6-(甲亚磺酰基甲基)嘧啶-4-基]-3-甲基吗啉。LC-MS-BLV-CY-200-6:(ES,m/z):290[M+H]+1H-NMR-BLV-CY-200-6:(300MHz,d6-DMSO,ppm):δ6.81(s,1H),4.32(br,1H),4.08(d,J=12.3Hz,1H),3.89-4.00(m,3H),3.72(d,J=14.4Hz,1H),3.59(d,J=11.7Hz,1H),3.44(t,J=12.0Hz,1H)。3.20(t,J=11.1Hz,1H),2.64(s,3H),1.21(d,J=6.6Hz,3H)。
N-[([2-氯-6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]嘧啶-4-基]甲基)(甲基)氧代-λ6-亚磺酰基]-2,2,2-三氟乙酰胺的合成:250mL圆底烧瓶,放入(3R)-4-[2-氯-6-(甲亚磺酰基甲基)嘧啶-4-基]-3-甲基吗啉(2.9g,10.01mmol,1当量),DCM(95mL),三氟乙酰胺(2.27g,20.08mmol,2.01当量),PhI(AcO)2(3.23g,10.03mmol,1.00当量),氧化镁(1.6g,39.70mmol,3.97当量),1,1,1-三(乙酰氧基)乙酸-1-基铑(0.11g,0.25mmol,0.02当量)。将所得溶液在室温搅拌18小时。然后加入更多的三氟乙酰胺(0.57g),PhI(AcO)2(0.81g),氧化镁(0.4g),1,1,1-三(乙酰氧基)乙酸铑-1-基乙酸酯(27mg)。将所得溶液在室温下再搅拌18小时,过滤除去固体,浓缩滤液。将残余物用乙酸乙酯/石油醚(20%)过硅胶柱层析纯化。得到2.6g(64.82%)的N-[([2-氯-6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]嘧啶-4-基]甲基)(甲基)氧代-λ6-亚磺酰亚胺]-2,2,2-三氟乙酰胺,为浅黄色固体。LC-MS-BLV-CY-200-7:(ES,m/z):401[M+H]+1H-NMR-BLV-CY-200-7:(300MHz,CDCl3,ppm):δ6.48(s,1H),4.84(dd,J=5.4Hz,13.5Hz,1H),4.65(d,J=13.8Hz,1H),3.84-4.40(m,3H),3.75(d,J=11.4Hz,1H),3.62-3.70(m,1H),3.47-3.57(m,1H),3.42(s,3H),3.25-3.37(m,1H),1.34(d,J=6.9Hz,3H)。
(1-[2-氯-6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]嘧啶-4-基]环丙基)(亚氨基)甲基-λ6-砜的合成:50-mL圆底烧瓶,在氮气保护下,将N-[([2-氯-6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]嘧啶-4-基]甲基)(甲基)氧代-λ6-亚磺酰基]-2,2,2-三氟乙酰胺(400mg,1.00mmol,1当量),2-MeTHF(15mL),1,2-二溴乙烷(939mg,5.00mmol,5.01当量),(C8H17)4NBr(54.7mg,0.1当量),10%NaOH(10.0mmol,10.0当量)。将所得溶液在油浴中于60℃搅拌2小时。粗产物浓缩,通过Flash-Prep-HPLC在以下条件下纯化(IntelFlash-1):柱,C18硅胶。流动相,0.5%NH3.H2O=52%,增加到0.5%NH3.H2O=56%;检测器波长:254nm和220nm,得到130mg(39.37%)的(1-[2-氯-6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]嘧啶-4-基]环丙基)(亚氨基)甲基-λ6-砜黄色固体。LC-MS-BLV-CY-200-8:(ES,m/z):331[M+H]+
[(1-[2-氯-6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]嘧啶-4-基]环丙基)(甲基)氧代-λ6-亚磺酰基](丙-2-基)胺的合成:50-mL 3颈圆底烧瓶,放入(1-[2-氯-6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]嘧啶-4-基]环丙基)(亚氨基甲基-λ-砜(180mg,0.54mmol,1当量),N,N-二甲基甲酰胺(3mL)。随后在0℃下加入NaH(55mg,1.38mmol,2.50当量)。将所得溶液在0℃下搅拌0.5小时。在0℃搅拌下向其中滴加2-碘丙烷(464mg,2.73mmol,5.02当量)。所得溶液在室温搅拌16小时。然后加
入1mL水淬灭反应。粗产物通过Flash-Prep-HPLC在以下条件下纯化(IntelFlash-1):柱,C18硅胶;流动相,在6分钟内将0.05%NH3.H2O/CH3CN=30%增加到0.05%NH3.H2O/CH3CN=40%;254nm和220nm波长的检测器,得到22mg(10.84%)的[(1-[2-氯-6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]嘧啶-4-基]环丙基)(甲基)氧代-λ6-硫亚基](丙-2-基)胺,为黄色固体。LC-MS-BLV-CY-207-1:(ES,m/z):373[M+H]+1H-NMR-BLV-CY-207-1:(300MHz,CDCl3,ppm):δ7.11(br s,1H),4.37(br s,1H),4.00(dd,J=11.4,3.6Hz,2H),3.81(d,J=11.7Hz,1H),3.65(dd,J=11.7,3.6Hz,2H),3.55(td,J=12.3,3.0Hz,1H),3.31(td,J=13.5,4.8Hz,1H),3.14-3.05(m,2H),2.07-1.92(m,1H),1.71-1.55(m,4H),1.35(d,J=6.9Hz,3H),1.21-1.18(m,6H)。
[甲基(1-[6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]-2-][1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基][嘧啶-4-基]环丙基)氧代-λ6-亚磺酰基](丙-2-基)胺的合成:20-mL微波管中,用氮气惰性气氛吹扫并维持,放入[(1-[2-氯-6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]嘧啶-4-基][环丙基)(甲基)氧代-λ6-亚磺酰基](丙-2-基)胺(20mg,0.05mmol,1当量),DME(2mL),4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼硼烷-2-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶(20mg,0.08mmol,1.53当量),二氯化钯双(三苯基膦)(8mg,0.01mmol,0.21当量),过氧甲酸钠(11mg,0.10mmol,1.92当量),水(0.5mL)。最终反应混合物在90℃下用微波辐射照射30分钟。将混合物冷却至室温,粗产物通过Flash-Prep-HPLC在以下条件下纯化(IntelFlash-1):柱,C18硅胶。流动相,在5分钟内将0.05%的HCOOH/CH3CN=35%增加到0.05%的HCOOH/CH3CN=40%;254nm和220nm波长检测器。得到15.2mg(62.34%)的[甲基(1-[6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]-2-][1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基][嘧啶-4-基]环丙基)氧代-λ6-亚磺酰基](丙-2-基)胺,为浅黄色固体。
LC-MS-BLV-CY-207-0:(ES,m/z):455[M+H]+1H-NMR-BLV-CY-207-0:(300MHz,CDCl3,ppm):δ9.38(s,1H),8.43(d,J=4.8Hz,1H),8.10(d,J=5.1Hz,1H),7.47(d,J=3.0Hz,1H),7.37(s,1H),7.25(d,J=2.7Hz,1H),4.56(br s,1H),4.21(d,J=12.0Hz),1H),4.11(dd,J=11.4Hz,3.0Hz,1H),3.89(d,J=11.7Hz,1H),3.81-3.72(m,2H),3.65(t,J=12.6Hz,1H),3.43(td,J=12.4Hz,3.0Hz,1H),3.16(d,J=3.0Hz,3H),2.13-2.10(m,1H),1.81-1.65(m,3H),1.42(d,J=6.6Hz,3H),1.24(dd,J=6.3,1.5Hz,3H),1.17(d,J=6.3Hz,3H)。
实施例CY-209:(2H3)甲基[甲基(1-[6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]-2-[1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基]嘧啶-4-基]环丙基)氧代-λ6-亚磺酰基]胺的合成
[(1-[2-氯-6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]嘧啶-4-基]环丙基)(甲基)氧代-λ6-亚磺酰基]((2H3)甲基)胺的合成:25-mL单口瓶,加入(1-[2-氯-6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]嘧啶丁-4-基]环丙基)(亚氨基)甲基-λ6-砜(100mg,0.302mmol,1当量),DMF(2mL),在0℃下搅拌5分钟。在0℃下向其中加入NaH(14.51mg,0.605mmol,2.0当量),搅拌5min。在0℃下向混合物中加入氘代碘甲烷(87.63mg,0.605mmol,2.0当量)。将所得溶液在室温搅拌30分钟。然后加水将反应淬灭,粗产物通过制备型HPLC纯化。得到43mg(40.89%)的[(1-[2-氯-6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]嘧啶-4-基]环丙基)(甲基)氧代-λ6-亚磺酰亚胺]((2H3)甲基)胺,为浅黄色油。LC-MS-BLV-CY-209-1:(ES,m/z):348[M+H]+1H-NMR-BLV-CY-209-1:(300MHz,d6-DMSO,ppm):δ7.04(d,J=9.9Hz,1H),4.38(brs,1H),4.04(d,J=12.0)Hz,1H),3.93(d,J=9.0Hz,1H),3.72(d,J=12.0Hz,1H),3.58(d,J=9.6Hz,1H),3.44(t,J=9.9Hz,1H),3.19(t,J=11.7Hz,1H),3.08(s,3H),1.75-1.67(m,1H),1.59-1.52(m,1H),1.44-1.28(m,1H),1.33-1.28(m,1H),1.21(d,J=6.0Hz,3H)。
(2H3)甲基[甲基(1-[6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]-2-[1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基]嘧啶-4-基]环丙基)氧代-λ6-亚磺酰基]胺的合成:8-mL微波,在氮气惰性气氛下,放入[[1-[2-氯-6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]嘧啶-4-基]环丙基)(甲基)氧代-λ6-亚磺酰基]((2H3)甲基)胺(40mg,0.115mmol,1当量),4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼硼烷-2-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶(40.21mg,0.172mmol,1.5当量),Na2CO3(24.37mg,0.23mmol,2.0当量),PdCl2(PPh3)2(16.14mg,0.023当量),DME(3mL),H2O(0.5mL)。将所得溶液在90℃下搅拌30分钟。粗产物通过制备型HPLC纯化。得到13mg(24.31%)(2H3)甲基[甲基(1-[6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]-2-][1H-吡咯并[2,3-b]吡啶]为白色固体的-4-基]嘧啶-4-基]环丙基)氧代-λ6-亚磺酰基]胺。LC-MS-BLV-CY-209-0:(ES,m/z):430[M+H]+1H-NMR-BLV-CY-209-0:(300MHz,CD3OD,ppm):δ8.31(d,J=5.4Hz,1H),8.07(d,J=5.1Hz,1H),7.52(d,J=3.6Hz,1H),7.36(d,J=3.3Hz,1H),7.05(d,J=5.4Hz,1H),4.66(brs,1H),4.28(dd,J=12.3Hz,2.4Hz),1H),4.08(dd,J=12.0Hz,3.6Hz,1H),3.89(d,J=11.4Hz,1H),3.79(dd,J=11.7Hz,3.0Hz,1H),3.65(td,J=11.4Hz,2.7Hz,1H),3.42(dd,J=13.8Hz,4.2Hz,1H),3.28(s,3H),2.07-2.00(m,1H),1.81-1.74(m,1H),1.70-1.63(m,1H),1.59-1.49(m,1H),1.40(d,J=6.9Hz,3H)。
实施例CY-212:2-[6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]-2-[1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基]嘧啶-4-基]丙烷-2-醇的制备
2-氯-6-[[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]嘧啶-4-羧酸甲酯的合成:在25-mL圆底烧瓶中,放入2,6-二氯嘧啶-4-羧酸甲酯(1g,4.831mmol,1当量),(3R)-3-甲基吗啉(0.54g,5.314mmol,1.1当量),TEA(0.64g,6.280mmol,1.3当量),DCM(10mL)。将所得溶液在室温搅拌过夜。混合物浓缩,用EA/PE(5:95)过硅胶柱纯化。得到1.1g(83.62%)的2-氯-6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]嘧啶-4-羧酸甲酯,为灰白色固体。
LC-MS-BLV-CY-212-1:(ES,m/z):272[M+H]+1H-NMR-BLV-CY-212-1:(300MHz,d6-DMSO,ppm):δ7.30(s,1H),4.45(br,1H),4.09(br,1H),3.94(dd,J=11.4,3.3Hz,1H),3.87(s,3H),3.72(d,J=11.7Hz,1H),3.60(dd,J=11.7,3.3Hz,1H),3.48(td,J=12.0,3.0Hz,1H),3.24(t,J=12.6Hz,1H),1.23(d,J=6.6Hz,3H)。
2-[2-氯-6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]嘧啶-4-基]丙-2-醇的合成:25mL的3颈圆底烧瓶中,氮气吹扫并保持在惰性气氛下,加入2-氯-6-[((3R)-3-甲基吗啉-4-基]嘧啶-4-羧酸甲酯(100mg,0.368mmol,1当量)放置。然后加入THF(3mL),在-60℃下搅拌5分钟。在-60℃搅拌下向其中滴加甲基氯化镁(68.81mg,0.92mmol,2.5当量)。溶液在-60℃下搅拌30分钟。然后加20mL NH4Cl溶液淬灭反应,用2×20mL乙酸乙酯萃取,并合并有机层,用盐水(25mL)洗涤,Na2SO4干燥,过滤并浓缩。将残余物用EA:PE(20:80)过硅胶柱层析纯化。得到60mg(60%)白色固体状的2-[2-氯-6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]嘧啶-4-基]丙烷-2-醇。LC-MS-BLV-CY-212-2:(ES,m/z):272[M+H]+
1H-NMR-BLV-CY-212-2:(300MHz,d6-DMSO,ppm):δ6.87(s,1H),5.32(s,1H),4.33(br.s,1H),3.94(td,J=11.1,3.6Hz,2H),3.71(d,J=11.7Hz,1H),3.58(dd,J=11.4,3.0Hz,1H),3.43(td,J=12.0,2.7Hz),1H),3.18(td,J=12.9,4.2Hz,1H),1.35(s,6H),1.20(d,J=6.0Hz,3H)。
2-[6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]-2-[1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基]嘧啶-4-基]丙烷-2-醇的合成:8mL微波中,在氮气保护下,将2-[2-氯-6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]嘧啶-4-基]丙-2-醇放入(60mg,0.221mmol,1当量),4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼烷-2-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶(91.62mg,0.375mmol,1.7当量),PdCl2(PPh3)2(30.99mg,0.044mmol,0.2当量),Na2CO3(46.80mg,0.442mmol,2.0当量),DME(2.0mL),H2O(1.0mL)。将所得溶液在90℃下搅拌40分钟,滤出固体。合并的有机层,浓缩,通过制备型HPLC纯化。得到了33mg(42.22%)2-[6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]-2-[1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基]嘧啶-4-基]丙-2-醇,白色固体状的。
LC-MS-BLV-CY-212-0:(ES,m/z):354[M+H]+1H-NMR-BLV-CY-212-0:(300MHz,d6-DMSO,ppm):δ11.75(s,1H),8.33(d,J=5.1Hz,1H),8.00(d,J=5.1Hz,1H),7.58(d,J=3.6Hz,1H),7.25(d,J=3.6Hz,1H),6.96(s,1H),5.31(s,1H),4.56(br.s,1H),4.16(d,J=12.6Hz,1H),4.02(dd,J=11.4,3.3Hz,1H),3.81(d,J=11.4Hz,1H),3.68(dd,J=11.1),2.7Hz,1H),3.52(td,J=12.0,2.7Hz,1H),3.27(td,J=12.9,4.2Hz,1H),1.52(s,6H),1.27(d,J=8.1Hz,3H)。
实施例CY-223:(3R)-3-甲基-4-(2-[1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基]嘧啶-4-基)吗啉的制备
(3R)-4-(2-氯嘧啶-4-基)-3-甲基吗啉的合成:在50-mL圆底烧瓶中,放入2,4-二氯嘧啶(500mg,3.356mmol,1当量),DCM(10mL),DMF(15mL),(3R)-3-甲基吗啉(340mg,3.361mmol,1.00当量),TEA(440mg,4.348mmol,1.30当量)。将溶液在室温搅拌15小时。溶液用100mL H2O稀释,用3×100mL乙酸乙酯萃取。浓缩有机层,并用乙酸乙酯/石油醚(1/2-1/1)过硅胶柱层析纯化。得到350mg(48.80%)的(3R)-4-(2-氯嘧啶-4-基)-3-甲基吗啉,为无色油。
LC-MS-BLV-CY-223-1:(ES,m/z):214[M+H]+1H-NMR-BLV-CY-223-1:(300MHz,CDCl3,ppm):δ8.09(d,J=6.3Hz,1H),6.37(d,J=6.3Hz,1H),4.30(brs,1H),4.03(dd,J=11.4,3.9Hz,2H),3.81(d,J=11.4Hz,1H),3.71(dd,J=11.7,3.0Hz,1H),3.56(td,J=12.3,3.3Hz,1H),3.29(td,J=12.9,3.6Hz,1H),1.34(d,J=6.9Hz,3H)。
将(3R)-3-甲基-4-(2-[1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基]嘧啶-4-基)吗啉合成:30mL微波管,在氮气保护下,放入(3R)-4-(2-氯嘧啶-4-基)-3-甲基吗啉(150mg,0.702mmol,1当量),DME(10mL),4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼硼烷-2-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶(257mg,1.053mmol,1.50当量),Pd(dppf)Cl2.CH2Cl2(57mg,0.070mmol,0.10当量),Na2CO3(150mg,1.415mmol,2.02当量),H2O(2.5mL)。在90℃下用微波辐射照射30分钟。将得到的混合物浓缩,粗产物通过Flash-Prep-HPLC在以下条件下纯化(IntelFlash-1):柱,C18硅胶。流动相,将0.05%的HCOOH/CH3CN=55%增加至0.05%的HCOOH/CH3CN=65%,检测器波长,220nm。得到40mg(19.32%)的(3R)-3-甲基-4-(2-[1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基]嘧啶-4-基)吗啉,黄色固体。LC-MS-BLV-CY-223-0:(ES,m/z):296[M+H]+
1H-NMR-BLV-CY-223-0:(300MHz,CDCl3,ppm):δ9.91(s,1H),8.46(d,J=6.0Hz,1H),8.41(d,J=5.1Hz,1H),8.07(d,J=5.1Hz,1H),7.45(d,J=3.3Hz,1H),7.36(d,J=3.3Hz,1H),6.48(d,J=6.3Hz,1H),4.49(brs,1H),4.18(d,J=12.9Hz,1H),4.09(dd,J=11.4,3.6Hz,1H),3.87(d,J=11.4Hz,1H),3.78(dd,J=11.4,3.0Hz,1H),3.64(td,J=12.0,3.0Hz,1H),3.38(td,J=12.9,3.9Hz,1H),1.39(d,J=6.9Hz,3H)。
实施例CY-224:(3R)-3-甲基-4-(6-甲基-2-[1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基]嘧啶-4-基)-吗啉的制备
(3R)-4-(2-氯-6-甲基嘧啶-基丁-4-基)-3-甲基吗啉的合成:50mL圆底烧瓶,加入2,4-二氯-6-甲基嘧啶(500mg,3.067mmol,1当量),DMF(15mL),DCM(25mL),(3R)-3-甲基吗啉(310mg,3.067mmol,1.00当量),TEA(405mg,4.002mmol,1.30当量)。溶液在油浴中于80℃搅拌5小时。溶液用150mL H2O稀释,用3×100mL乙酸乙酯萃取。浓缩有机层,并用乙酸乙酯/石油醚(1/2-1/1)过硅胶柱层析纯化。得到240mg(34.36%)的(3R)-4-(2-氯-6-甲基嘧啶-茚定-4-基)-3-甲基吗啉,为浅黄色固体。LC-MS-BLV-CY-224-1:(ES,m/z):228[M+H]+1H-NMR-BLV-CY-224-1:(300MHz,CDCl3,ppm):δ6.22(s,1H),4.30(s,1H),4.01(dd,J=11.4,3.6Hz,2H),3.79(d,J=11.4Hz,1H),3.69(dd,J=11.7,3.0Hz,1H),3.55(td,J=12.3,3.0Hz,1H),3.27(td,J=12.9,3.6Hz,1H),2.37(s,3H),1.32(d,J=6.9Hz,3H)。
(3R)-3-甲基-4-(6-甲基-2-[1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基]嘧啶-4-基)-吗啉的合成:30mL微波管,保持在氮气氛围下,放入(3R)-4-(2-氯-6-甲基嘧啶-4-基)-3-甲基吗啉(150mg,0.659mmol,1当量),DME(10mL),4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼硼烷-2-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶(241mg,0.987mmol,1.50当量),Pd(dppf)Cl2(43mg,0.05mmol,0.08当量),Na2CO3(141mg,1.330mmol,2.02当量),H2O(2.5mL),在90℃下用微波辐射照射30分钟。将得到的混合物浓缩,粗产物通过Flash-Prep-HPLC在以下条件下纯化(IntelFlash-1):柱,C18硅胶。流动相,将0.05%的HCOOH/CH3CN=45%增加至0.05%的HCOOH/CH3CN=55%;检测器波长,220nm。得到42mg(20.69%)(3R)-3-甲基-4-(6-甲基-2-[1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基]嘧啶-4-基)-吗啉,为浅黄色固体。LC-MS-BLV-CY-224-0:(ES,m/z):310[M+H]+。H-NMR-BLV-CY-224-0:(300MHz,CDCl3,ppm):δ9.89(s,1H),8.38(d,J=5.1Hz,1H),8.08(d,J=5.4Hz,1H),7.44(d,J=3.3Hz,1H),7.38(d,J=3.3Hz,1H),6.35(s,1H),4.49(s,1H),4.16(d,J=11.4Hz,1H),4.08(dd,J=11.4,3.6Hz,1H),3.86(d,J=11.4Hz,1H),3.77(dd,J=11.4,3.0Hz,1H),3.63(td,J=12.0,3.0Hz,1H),3.36(td,J=12.6,3.9Hz,1H),2.52(s,3H),1.38(d,J=6.9Hz,3H)。
实施例CY-225:(3R)-3-甲基-4-[6-(丙-2-基)-2-[1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基]嘧啶-4-基]吗啉的制备
2,4-二氯-6-(丙-2-基)嘧啶的合成:500mL 3颈圆颈烧瓶,放入2,4,6-三氯嘧啶(1g,5.452mmol,1当量),THF(20mL)。在-20℃下向其中加入异丙基氯化镁(5.46mL,2.0当量),CuI(52.92mg,0.273mmol,0.05当量)。所得溶液在0℃下搅拌1小时。然后加75mL的NH4Cl淬灭反应。所得溶液用100mL乙酸乙酯萃取,合并有机层,经无水硫酸钠干燥,过滤并浓缩。将残余物用EA:PE(2:98)过硅胶柱层析纯化。得到0.4g(38.31%)浅黄色油状的2,4-二氯-6-(丙-2-基)嘧啶。
LC-MS-BLV-CY-225-1:(ES,m/z):191[M+H]+
(3R)-4-[2-氯-6-(丙-2-基)嘧啶-4-基]-3-甲基吗啉的合成:在50mL圆底烧瓶中,放入2,4-二氯-6-(丙-2-基)嘧啶(300mg,1.579mmol,1当量),(3R)-3-甲基吗啉(0.174g,1.723mmol,1.09当量),TEA(0.24g,2.369mmol,1.50当量),乙醇(6mL)。所得溶液在70℃下搅拌过夜。将反应混合物冷却,浓缩所得混合物,用EA∶PE=(1:10)过硅胶柱层析纯化。得到161mg(40%)的无色油状的(3R)-4-[2-氯-6-(丙-2-基)嘧啶-4-基]-3-甲基吗啉。LC-MS-BLV-CY-225-2:(ES,m/z):256[M+H]+1H-NMR-BLV-CY-225-2:(300MHz,d6-DMSO,ppm):δ6.63(s,1H),4.38(br,1H),4.05-3.97(m,1H),3.94(dd,J=11.4,3.6Hz,1H),3.70(d,J=11.7Hz,1H),3.57(dd,J=11.7,3.0Hz,1H),3.40(td,J=12.3,3.0Hz,1H),3.18(td,J=13.2,3.9Hz,1H),2.83-2.74(m,1H),1.19-1.16(m,9H)。
(3R)-3-甲基-4-[6-(丙-2-基)-2-[1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基]嘧啶-4-基]吗啉的合成:8mL微波,在惰性氮气氛围下,加入(3R)-4-[2-氯-6-(丙-2-基)嘧啶-4-基]-3-甲基吗啉(140mg,0.574mmol,1当量),4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼硼烷-2-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶(213.8mg,0.876mmol,1.6当量),Pd(dppf)Cl2(44.5mg,0.055mmol,0.1当量),Na2CO3(116.04mg,1.095mmol,2.0当量),DME(6mL),H2O(1.5mL)。溶液在90℃下搅拌1小时。将反应混合物冷却,滤掉固体,母液并通过制备型HPLC纯化滤液。得到100mg(24.36%)(3R)-3-甲基-4-[6-(丙-2-基)-2-[1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基]嘧啶-4-基]吗啉,为浅黄色固体。
LC-MS-BLV-CY-225-0:(ES,m/z):338[M+H]+。H-NMR-BLV-CY-225-0:(300MHz,d6-DMSO,ppm):δ11.72(s,1H),8.32(d,J=5.1Hz,1H),7.99(d,J=4.8)Hz,1H),7.57(t,J=5.4Hz,1H),7.29(t,J=5.4Hz,1H),6.66(s,1H),4.59(br.s,1H),4.18(d,J=13.5Hz,1H),4.00(dd,J=11.7,3.6Hz,1H),3.79(d,J=11.4Hz,1H),3.66(dd,J=11.4,3.0Hz,1H),3.52(td,J=12.3,2.7Hz,1H),3.24(td,J=13.2,4.2Hz,1H),3.00-2.91(m,1H),1.31(d,J=6.9Hz,6H),1.26(d,J=6.6Hz,3H)。
实施例CY-226:(3R)-3-甲基-4-(2-[1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基]-6-(三氟甲基)嘧啶-4-基)吗啉的制备
(3R)-4-[2-氯-6-(三氟甲基)嘧啶-4-基]-3-甲基吗啉的合成:在50mL的圆底烧瓶中,放入2,4-二氯-6-(三氟甲基)嘧啶(500mg,2.304mmol,1当量),DCM(15mL),DMF(15mL),(3R)-3-甲基吗啉(235mg,2.323mmol,1.01当量),TEA(305mg,3.014mmol,1.31当量)。溶液在室温搅拌15小时。所得溶液用150mL H2O稀释,用3×100mL乙酸乙酯萃取,浓缩有机层,并用乙酸乙酯/石油醚(1/2-1/1)过硅胶柱纯化。得到400mg(61.63%)浅黄色固体状的(3R)-4-[2-氯-6-(三氟甲基)嘧啶-4-基]-3-甲基吗啉。LC-MS-BLV-CY-226-1:(ES,m/z):282[M+H]+。H-NMR-BLV-CY-226-1:(300MHz,CDCl3,ppm):δ6.67(s,1H),4.35(brs,1H),4.04(dd,J=11.4,3.6Hz,2H),3.82(d,J=11.7Hz,1H),3.70(dd,J=11.7,3.0Hz,1H),3.56(td,J=12.0,3.0Hz,1H),3.36(td,J=12.6,3.3Hz,1H),1.37(d,J=6.9Hz,3H)。
(3R)-3-甲基-4-(2-[1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基]-6-(三氟甲基)嘧啶-4-基)吗啉的合成:20-mL微波管,在惰性氮气氛围下加入(3R)-4-[2-氯-6-(三氟甲基)嘧啶-4-基]-3-甲基吗啉(150mg,0.533mmol,1当量),DME(2mL),4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼硼烷-2-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶(195mg,0.799摩尔,1.50当量),Pd(dppf)Cl2。CH2Cl2(37mg,0.045mmol,0.09当量),Na2CO3(114mg,1.076mmol,2.02当量),H2O(0.5mL)。在90℃下用微波辐射辐照0.5小时。将得到的混合物浓缩,粗产物通过Flash-Prep-HPLC在以下条件下纯化(IntelFlash-1):柱,C18硅胶。流动相,0.05%的HCOOH/CH3CN=40%至0.05%的HCOOH/CH3CN=50%;254nm和220nm波长检测器。得到35mg(18.13%)(3R)-3-甲基-4-(2-[1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基]-6-(三氟甲基)嘧啶-4-基)吗啉,为浅黄色固体。LC-MS-BLV-CY-226-0:(ES,m/z):364[M+H]+1H-NMR-BLV-CY-226-0:(300MHz,CDCl3,ppm):δ9.95(s,1H),8.45(d,J=5.1Hz,1H),8.11(d,J=4.8Hz,1H),7.49(d,J=3.6Hz,1H),7.42(d,J=3.3Hz,1H),6.77(s,1H),4.52(brs,1H),4.23(d,J=12.3Hz,1H),4.11(dd,J=11.4,3.9Hz,1H),3.89(d,J=11.7Hz,1H),3.79(dd,J=11.7,3.0Hz,1H),3.65(td,J=12.0,3.0Hz,1H),3.45(td,J=12.9,3.6Hz,1H),1.43(d,J=6.9Hz,3H)。
实施例CY-227:4-[4-甲氧基-6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]嘧啶-2-基]-1H-吲哚的制备
(3R)-4-(2-氯-6-甲氧嘧啶-4-基)-3-甲基吗啉的合成:在50-mL圆底烧瓶中,放入2,4-二氯-6-甲氧嘧啶(500mg,2.809mmol,1当量),(3R)-3-甲基吗啉(312.54mg,3.090mmol,1.10当量),TEA(567.42mg,5.618mmol,2.00当量),EtOH(10mL)。在70℃下搅拌过夜。将得到的混合物浓缩,并施加用EA:PE(5:95)过硅胶柱纯化。得到240mg(35.06%)的(3R)-4-(2-氯-6-甲氧基嘧啶-4-基)-3-甲基吗啉,为白色固体。LC-MS-BLV-CY-227-1:(ES,m/z):244[M+H]+
1H-NMR-BLV-CY-227-1:(300MHz,d6-DMSO,ppm):δ6.17(s,1H),4.54(br.s,1H),4.18(d,J=12.0Hz,1H),3.92-3.85(m,4H),3.69(d,J=11.7Hz,1H),3.54(dd,J=11.4,2.7Hz,1H),3.40(td,J=12.0,3.0Hz,1H),3.16(td,J=13.2,3.6Hz,1H),1.20(d,J=6.3Hz,3H)。
4-[4-甲氧基-6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]嘧啶-2-基]-1H-吲哚的合成:在8mL微波中,吹入并氮气保持在惰性氛围下,放置(3R)-4-(2-氯-6-甲氧嘧啶-4-基)-3-甲基吗啉(100mg,0.410mmol,1当量),Pd(dppf)Cl2(33.36mg,0.041mmol,0.1当量),4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼烷-2-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶(160.27mg,0.657mmol,1.6当量),Na2CO3(86.99mg,0.821mmol,2.0当量),DME(3mL),H2O(0.5mL)。所得溶液在90℃下搅拌40分钟。浓缩粗产物通过制备型HPLC纯化。得到30mg(22.53%)的浅黄色固体的4-[4-甲氧基-6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]嘧啶-2-基]-1H-吲哚。
LC-MS-BLV-CY-227-0:(ES,m/z):326[M+H]+1H-NMR-BLV-CY-227-0:(300MHz,d6-DMSO,ppm):δ11.97(s,1H),8.34(d,J=5.1Hz,1H),7.63(d,J=5.1Hz,2H),6.99(dd,J=5.1Hz,1.8Hz,1H),6.73(s,1H),4.74(dd,J=6.9Hz,2.4Hz,1H),4.38(d,J=13.2Hz,1H),4.00-3.93(m,4H),3.77(d,J=11.1Hz,1H),3.64(dd,J=11.4,3.3Hz,1H),3.49(td,J=12.0,2.7Hz,1H),3.27(td,J=13.2,3.6Hz,1H),1.28(d,J=6.9Hz,3H)。
实施例CY-228:6-[((3R)-3-甲基吗啉-4-基]-2-[1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基]嘧啶-4-腈的制备
2-氯-6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]嘧啶-4-胺的合成:在25mL圆底烧瓶中,放入2,6-二氯嘧啶-4-胺(0.3g,1.840mmol,1当量),(3R)-3-甲基吗啉(0.20g,1.977mmol,1.1当量),Cs2CO3(1.20g,3.681mmol,2.0当量),DMF(4mL)。溶液在80℃下搅拌过夜。将反应混合物冷却,然后加入10mL水淬灭,用2×10mL乙酸乙酯萃取,合并的有机层,并用盐水(15ml×2)洗涤,Na2SO4干燥,过滤并浓缩。将残余物用EA:PE(1:10)过硅胶柱纯化。得到40mg(9.53%)的2-氯-6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]嘧啶-4-胺为白色固体。
LC-MS-BLV-CY-228-1:(ES,m/z):229[M+H]+1H-NMR-BLV-CY-225-2:(300MHz,d6-DMSO,ppm):δ6.66(s,2H),5.46(s,1H),4.11(brs,1H),3.89(dd,J=11.7,3.9Hz,1H),3.72-3.66(m,2H),3.55(d,J=11.4,3.0Hz,1H),3.41(td,J=11.7,3.0Hz,1H),3.04(td,J=12.0,3.6Hz,1H),1.13(d,J=6.9Hz,3H)。
6-[((3R)-3-甲基吗啉-4-基]-2-[1H-吡咯并[2,3-b]吡啶基-4-基]嘧啶-4-腈的合成:在8mL微波中,保持在氮气惰性气氛下,放置2-氯-6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]嘧啶-4-腈(40mg,0.175mmol,1当量),4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼硼烷-2-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶(65.64mg,0.263mmol,1.6当量),Pd(dppf)Cl2(13.62mg,0.018mmol,0.1当量),Na2CO3(37.2mg,0.351mmol,2.0当量),DME(3mL),H2O(0.5mL)。将所得溶液在90℃下搅拌1小时。滤出固体,滤液通过制备型HPLC纯化,得到30mg(55.1%)6-[((3R)-3-甲基吗啉-4-基]-2-[1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基]嘧啶-4-甲腈为白色固体。LC-MS-BLV-CY-228-0:(ES,m/z):311[M+H]+。H-NMR-BLV-CY-228-0:(300MHz,d6-DMSO,ppm):δ11.99(s,1H),8.41(d,J=5.1Hz,1H),7.74(d,J=6.0Hz,1H),7.68-7.67(m,1H),7.08(s,1H),5.77(s,1H),4.43(brs,1H),4.02(dd,J=11.4,3.3Hz,2H),3.79(d,J=11.4Hz,1H),3.66(dd,J=11.1,2.7Hz,1H),3.52(td,J=12.0,3.0Hz,1H),3.32-3.25(m,1H),1.27(d,J=6.9Hz,3H)。
实施例CY-229:6-[((3R)-3-甲基吗啉-4-基]-2-[1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基]嘧啶-4-腈的制备
2-氯-6-[[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]嘧啶-4-腈的合成:在100-mL圆底烧瓶中,放入2,6-二氯嘧啶-4-腈(500mg,2.874mmol,1当量),(3R)-3-甲基吗啉(319.76mg,3.161mmol,1.1当量),TEA(581.62mg,5.748mmol,2.0当量),DCM(10mL)。将所得溶液在室温搅拌1.5小时。混合物浓缩,并用EA:PE(1:9)过硅胶柱纯化。得到600mg(87.47%)的2-氯-6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]嘧啶-4-腈为浅黄色固体。
LC-MS-BLV-CY-229-1:(ES,m/z):239[M+H]+。H-NMR-BLV-CY-229-1:(300MHz,d6-DMSO,ppm):δ7.61(s,1H),4.30(br,2H),3.94(dd,J=11.4,3.6Hz,1H),3.72(d,J=11.7Hz,1H),3.58(dd,J=11.7,3.0Hz,1H),3.44(td,J=12.3,3.0Hz,1H),3.31-3.26(m,1H),1.25(d,J=6.6Hz,3H)。
6-[((3R)-3-甲基吗啉-4-基]-2-[1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基]嘧啶-4-腈的合成:在8mL微波中,保持在氮气惰性氛围下,加入2-氯-6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]嘧啶-4-腈(150mg,0.630mmol,1当量),4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼硼烷-2-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶(246.1mg,1.008mmol,1.6当量),Pd(dppf)Cl2(51.09mg,0.063mmol,0.1当量),Na2CO3(133.6mg,1.262mmol,2.0当量),DME(6mL),H2O(1.5mL)。将所得溶液在90℃下搅拌1小时,滤出固体,并通过制备型HPLC纯化滤液。这样得到50mg(24.9%)6-[((3R)-3-甲基吗啉-4-基]-2-[1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基]嘧啶-4-腈,为白色固体。LC-MS-BLV-CY-229-0:(ES,m/z):321[M+H]+1H-NMR-BLV-CY-229-0:(300MHz,d6-DMSO,ppm):δ11.86(s,1H),8.36(d,J=6.0Hz,1H),7.95(d,J=5.1Hz,1H),7.63(t,J=3.0Hz,1H),7.55(s,1H),7.18-7.16(m,1H),4.62(br,1H),4.27(br,1H),4.01(dd,J=11.1,3.0Hz,1H),3.81(d,J=11.7Hz,1H),3.68(dd,J=11.7,3.0Hz,1H),3.53(td,J=12.0,2.7Hz,1H),3.36(dd,J=12.9,3.6Hz,1H),1.31(d,J=6.6Hz,3H)。
实施例CY-230-0:(R)-4-(2-(1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)-6-(1,1,1-三氟-2-甲基丙烷-2-基)嘧啶-4-基)-3-甲基吗啉的制备
1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-腈的合成。在100mL圆底烧瓶中,用氮气保护并保持惰性气氛,放入4-氯-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶(3g,19.662mmol,1当量),Pd2(dba)3(0.90g,0.983mmol,0.05当量),dppf(1086.05mg,1.966mmol,0.1当量),Zn(128.61mg,1.966mmol,0.1当量),Cs2CO3(12.81g,39.324mmol,2当量),Zn(CN)2(1270.04mg,10.814mmol,0.55当量),DMF(20mL)。将所得溶液在油浴中于120℃搅拌10小时。溶液用200mL水稀释,通过过滤收集固体,用EA(20ml)来重结晶纯化粗产物。得到1.5g(52.5%)的1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-腈,为灰色固体。LC-MS-BLV-CY-230-1:(ES,m/z):144[M+H]+1H-NMR-BLV-CY-200-1-2:(300MHz,d6-DMSO,ppm):δ12.37(s,1H),8.41(d,J=4.9Hz,1H),7.84(d,J=3.5Hz,1H),7.56(d,J=4.9Hz,1H),6.66(d,J=3.4Hz,1H)。
N-羟基-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-羧酰亚胺酰胺的合成:50mL圆底烧瓶,在氮气保护下加入1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-腈(700mg,4.890mmol,1当量),EtOH(20mL),羟胺水溶液(5mL)。将所得溶液在油浴中60℃搅拌5小时。混合物在真空下浓缩,得到800mg(92.86%)的N-羟基-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-羧酰亚胺酰胺为白色固体。
LC-MS-BLV-CY-230-2:(ES,m/z):177[M+H]+1H-NMR-BLV-CY-230-2:(300MHz,d6-DMSO,ppm):δ12.96(s,1H),11.95(s,1H),8.38(d,J=5.0Hz,1H),7.77(s,1H),7.67(t,J=2.9Hz,1H),7.11(s,1H),6.67(s,1H),1.60(s,6H)。
1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-羧酰亚胺醋酸盐的合成。在250mL圆底烧瓶中,用氮气吹扫并保持该惰性气氛,放入N-羟基-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-甲酰亚胺(500mg,2.838mmol,1当量),Ac2O(318.70mg,3.122mmol,1.1当量),Pd/C(70mg),MeOH(100mL)。用氮气置换3次,然后通入氢气。溶液在室温在氢气(气球)中搅拌4小时。滤出固体。将得到的混合物在真空下浓缩,得到600mg(95.14%)1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-羧酰亚胺酰胺醋酸盐,为灰色固体。
LC-MS-BLV-CY-230-3:(ES,m/z):161[M+H]+1H-NMR-BLV-CY-230-3:(300MHz,d6-DMSO,ppm):δ11.99(s,1H),8.42(d,J=5.0Hz,1H),8.03(d,J=5.0Hz,1H),7.99(s,1H),7.71(t,J=3.0Hz,1H),7.28(dd,J=3.4,1.9Hz,1H),1.73(s,3H)。
5,5,5-三氟-4,4-二甲基-3-氧戊酸乙酯的合成:在50ml单口瓶,把3,3,3-三氟-2,2-二甲基丙酸(5g,32mmol)溶在20mL THF溶液中,向其中加入CDI(5.7g,35mmol)和催化量的DMAP,搅拌4小时。另用一个瓶子,在室温下加入TMS-Cl(3.8g,35mmol)的20ml ACN,丙二酸单乙酯酸钾(5.5g,32mmol),搅拌8h,来制备(TMS)丙二酸乙基酯溶液。将溶液冷却至0℃,加入DBU(9.7g,64mmol),并在0℃下搅拌0.5h。在0℃下将3,3,3-三氟-1-(1H-咪唑-1-基)-2,2-二甲基丙烷-1-酮溶液滴加到(TMS)丙二酸乙酯溶液中,反应混合物在室温下搅拌10小时,并添加10%HCl水溶液淬灭,用乙酸乙酯萃取,乙酸乙酯萃取液用水洗涤。粗产物浓缩,并通过柱层析纯化。得到1.5g(21%)黄色油状的5,5,5-三氟-4,4-二甲基-3-氧戊酸乙酯。
H-NMR-BLV-CY-230-4:(300MHz,CCl3D,ppm):δ12.53(s,0.5H),5.26(s,0.5H),4.27-4.18(m,3H),3.66(s,2H),1.45-1.35(m,9H),1.35-1.25(m,4.5H)。
2-[1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基]-6-(1,1,1-三氟-2-甲基丙烷-2-基)嘧啶-4-醇的合成。10mL密封管,放入5,5,5-三氟-4,4-二甲基-3-氧戊酸乙酯(300mg,1.326mmol,1当量),1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-羧酰亚胺醋酸盐;(292.09mg,1.326mmol,1当量),Cs2CO3(1080.33mg,3.316mmol,2.5当量),NMP(8mL)。反应混合物在145℃下用微波辐射照射2小时。所得溶液用100mL水稀释,用HCl(6M)将溶液的pH值调节至3。通过过滤收集固体,将固体在烘箱中减压干燥。得到200mg(46.79%)2-[1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基]-6-(1,1,1-三氟-2-甲基丙烷-2-基)嘧啶-4-醇,为灰色固体。LC-MS-BLV-CY-230-5:(ES,m/z):323[M+H]+1H-NMR-BLV-CY-230-5:(300MHz,d6-DMSO,ppm):δ13.0(brs,1H),11.94(s,1H),8.38(d,J=5.0Hz,1H),7.77(s,1H),7.67(t,J=3.0Hz,1H),7.11(s,1H),6.67(s,1H),1.60(s,6H)。
4-(4-氯-6-(1,1,1-三氟-2-甲基丙烷-2-基)嘧啶-2-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶的合成。在100mL的圆底烧瓶中,加入2-[1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基]-6-(1,1,1-三氟-2-甲基丙烷-2-基)嘧啶-4-醇(180mg,0.559mmol,1当量),DCE(30mL),DIEA(108.27mg,0.838mmol,1.5当量)。随后在室温搅拌下滴加POCl3(1712.72mg,11.170mmol,20.00当量)。所得溶液在油浴中75℃搅拌15小时。用NaHCO3水溶液将溶液的pH值调节至9,用3×30mL二氯甲烷萃取,合并有机层,并用无水硫酸钠干燥,浓缩。得到160mg(84.08%)4-氯-2-[1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基]-6-(1,1,1-三氟-2-甲基丙烷-2-基)嘧啶,为灰色固体。LC-MS-BLV-CY-230-6:(ES,m/z):341[M+H]+1H-NMR-BLV-CY-230-6:(300MHz,d6-DMSO,ppm):δ11.98(s,1H),8.42(d,J=5.0Hz,1H),8.03(d,J=5.0Hz,1H),7.99(s,1H),7.71(t,J=3.0Hz,1H),7.28(dd,J=3.4,1.9Hz,1H),1.72(s,6H)。
(R)-4-(2-(1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)-6-(1,1,1-三氟-2-甲基丙烷-2-基)嘧啶-4-基)-3-甲基吗啉的合成。在25mL的圆底烧瓶中,放入4-氯-2-[1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基]-6-(1,1,1-三氟-2-甲基丙烷-2-基)嘧啶(100mg,0.293mmol,1当量),(3R)-3-甲基-吗啉(202.01mg,0.587mmol,2当量),DIEA(113.79mg,0.880mmol,3当量),NMP(4mL)。所得溶液在油浴中100℃搅拌3小时。粗产物通过Flash-Prep-HPLC在以下条件下纯化(IntelFlash-1):柱,C18硅胶。流动相,MeOH/水=20%,在10分钟内增加到MeOH/水=75%;检测器,254nm。得到22.7mg(19.08%)(3R)-3-甲基-4-(2-[1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基]-6-(1,1,1-三氟-2-甲基丙烷-2-基)嘧啶-4-基吗啉,为浅棕色固体。LC-MS-BLV-CY-230-0:(ES,m/z):406[M+H]+1H-NMR-BLV-CY-230-0:(300MHz,d6-DMSO,ppm):δ11.78(s,1H),8.34(d,J=5.0Hz,1H),8.00(d,J=5.0Hz,1H),7.66–7.55(m,1H),7.33-7.20(m,1H),6.89(s,1H),4.66(s,1H),4.25(d,J=13.4Hz,1H),4.11-3.95(m,1H),3.81(d,J=11.4Hz,1H),3.68(dd,J=11.5,3.1Hz,1H),3.63-3.47(m,1H),3.30-3.21(m,1H)),1.66(s,6H),1.27(d,J=6.7Hz,3H)。
实施例CY-231:(3R)-3-甲基-4-[6-(吡啶-3-基)-2-[1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基]嘧啶-4-基]吗啉的制备
(3R)-3-甲基-4-[2-(甲基硫烷基)-6-(吡啶-3-基)嘧啶-4-基]吗啉的合成:在40mL微波管中,放入(3R)-4-[6-氯-2-(甲基硫烷基)嘧啶-4-基]-3-甲基吗啉(500mg,1.925mmol,1当量),二氧六环(5mL),3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼硼烷-2-基)吡啶(592mg,2.887mmol,1.50当量),Pd(dppf)Cl2(141mg,0.193mmol,0.10当量),K2CO3(532mg,3.849mmol,2.00当量),水(0.5毫升)。反应混合物在100℃下用微波辐射照射40分钟。溶液用50mL H2O稀释,用4×30mL乙酸乙酯萃取,合并有机层并浓缩。残余物用乙酸乙酯/石油醚(1/3-1/1)用硅胶柱纯化。得到500mg(85.90%)的黄色固体状的(3R)-3-甲基-4-[2-(甲基硫烷基)-6-(吡啶-3-基)嘧啶-4-基]吗啉。1H-NMR-BLV-CY-231-1:(300MHz,CDCl3,ppm):δ9.19(s,1H),8.71(s,1H),8.36(d,J=7.8Hz,1H),7.43(s,1H),6.58(s,1H),4.45(brs,1H),4.18-4.06(m,2H),3.85(d,J=11.4Hz,1H),3.76(dd,J=11.4,2.4Hz),1H),3.62(td,J=12.0,2.4Hz,1H),3.34(td,J=12.6,3.6Hz,1H),2.60(s,3H),1.36(d,J=6.6Hz,3H)。
(3R)-4-[2-甲磺酰基-6-(吡啶-3-基)嘧啶-4-基]-3-甲基吗啉的合成:50mL圆底烧瓶,加入(3R)-3-甲基-4-[2-(甲基硫烷基)-6-(吡啶-3-基)嘧啶-4-基]吗啉(400mg,1.323mmol,1当量),DCM(5mL),m-CPBA(571mg,3.309mmol,2.50当量)。溶液在室温搅拌15小时。然后加入50mL饱和NaHCO3水溶液淬灭反应。用4×50mL二氯甲烷萃取,合并有机层并浓缩。得到300mg(67.82%)的(3R)-4-[2-甲磺酰基-6-(吡啶-3-基)嘧啶-4-基]-3-甲基吗啉,为黄色油。
4-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]-6-(吡啶-3-基)嘧啶-2-醇的合成:50mL圆底烧瓶中,放置(3R)-4-[[2-甲磺酰基-6-(吡啶-3-基)嘧啶-4-基]-3-甲基吗啉(270mg,0.807mmol,1当量),NaOH(3.7M)(4.8mL,17.764mmol,22.00当量)。溶液在油浴中100℃搅拌2小时。用HCl将溶液的pH值调节至4。粗产物通过Flash-Prep-HPLC在以下条件下纯化(IntelFlash-1):柱,C18硅胶。流动相CH3CN/0.1%HCOOH=32%;254nm和220nm检测器波长。得到100mg(45.48%)的4-[((3R)-3-甲基吗啉-4-基]-6-(吡啶-3-基)嘧啶-2-醇,为浅黄色固体。
LC-MS-BLV-CY-236-6:(ES,m/z):273[M+H]+1H-NMR-BLV-CY-236-6:(300MHz,CD3OD,ppm):δ9.13-8.60(m,2H),8.21(d,J=8.1Hz,1H),7.64(s,1H),6.45(s,1H),4.80-4.55(m,1H),4.40-4.10(m,1H),4.00(dd,J=11.4,3.0Hz,1H),3.81(d,J=11.7Hz,1H),3.70(dd,J=11.7,2.4Hz,1H),3.56(td,J=12.0,2.4Hz,1H),3.40-3.33(m,1H),1.37(d,J=6.6Hz,3H)。
(3R)-4-[2-氯-6-(吡啶-3-基)嘧啶-4-基]-3-甲基吗啉的合成:在一个50毫升圆底烧瓶中,放入4-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]-6-(吡啶-3-基)嘧啶-2-醇(85mg,0.312mmol,1当量),POCl3(3mL,32.185mmol)。溶液在油浴中100℃搅拌3小时。反应冷却至室温,倒入100mL饱和NaHCO3水溶液中,用3×60mL乙酸乙酯萃取,有机层合并,浓缩。粗产物通过Flash-Prep-HPLC在以下条件下纯化(IntelFlash-1):柱,C18硅胶。流动相,CH3CN/0.05%HCOOH=45%增至CH3CN/0.05%HCOOH=55%;254nm和220nm波长检测器。得到20mg(22.04%)黄色固体状的(3R)-4-[2-氯-6-(吡啶-3-基)嘧啶-4-基]-3-甲基吗啉。LC-MS-BLV-CY-231-5:(ES,m/z):291[M+H]+1H-NMR-BLV-CY-231-5:(300MHz,CDCl3,ppm):δ9.35-8.62(m,2H),8.36(d,J=7.5Hz,1H),7.47(s,1H),6.75(s,1H),4.41(s,1H),4.13-4.02(m,2H),3.83(d,J=11.4Hz,1H),3.73(dd,J=12.9,2.7Hz,1H),3.59(td,J=12.0,2.7Hz,1H),3.36(td,J=12.9,3.3Hz,1H),1.37(d,J=6.9Hz,3H)。
(3R)-3-甲基-4-[6-(吡啶-3-基)-2-[1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基]嘧啶-4-基]吗啉的合成:在10ml微波管中,在氮气氛围保护下,加入(3R)-4-[2-氯-6-(吡啶-3-基)嘧啶-4-基]-3-甲基吗啉(20mg,0.069mmol,1equiv),DME(4mL),4-(4,4,5,5-tetramethyl-1,3,2-dioxaborolan-2-yl)-1H-pyrrolo[2,3-b]吡啶(25mg,0.102mmol,1.49当量),Pd(dppf)Cl2(5mg,0.007mmol,0.10当量),K2CO3(19mg,0.137mmol,2.00当量),H2O(1mL)。在100℃下用微波照射1小时。粗产物通过Flash-Prep-HPLC在以下条件下纯化(IntelFlash-1):柱,C18硅胶。流动相,在15分钟内将CH3CN/0.05%NH3H2O=55%增加到CH3CN/0.05%NH3H2O=65%;254nm和220nm波长检测器。得到3.5mg(39.03%)(3R)-3-甲基-4-[6-(吡啶-3-基)-2-[1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基]嘧啶-4-基]吗啉,为黄色固体。LC-MS-BLV-CY-231-0:(ES,m/z):373[M+H]+1H-NMR-BLV-CY-231-0:(300MHz,CD3OD,ppm):δ9.40(s,1H),8.67(d,J=5.4Hz,2H),8.50(brs,1H),8.32(d,J=5.4Hz,1H),8.16(d,J=5.1Hz,1H),7.64-7.60(m,1H),7.52(d,J=3.3Hz,1H),7.41(d,J=3.3Hz,1H),7.25(s,1H),4.79-7.77(m,1H),4.35(d,J=12.3Hz,1H),4.09(dd,J=11.4,3.3Hz,1H),3.89(d,J=11.7Hz,1H),3.81(dd,J=11.7,2.4Hz,1H),3.65(td,J=11.7,3.0,1H),3.44(td,J=13.2,3.9Hz,1H),1.42(d,J=6.6Hz,3H)。
实施例CY-232:(3R)-4-[6-(4,4-二氟哌啶-1-基)-2-[1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基]嘧啶-4-基]-3-甲基吗啉的制备
甲基(3R)-4-[3-氯-5-(甲基硫烷基)苯基]-3-甲基吗啉的合成:在250-mL圆底烧瓶中,放入4,6-二氯-2-(甲基硫烷基)嘧啶(10g,51.266mmol,1当量),(3R)-3-甲基吗啉(6.74g,66.646mmol,1.3当量),DIEA(19.88g,153.799mmol,3.0当量),DCM(100mL)。溶液在40℃下搅拌过夜。将混合物浓缩。残余物用乙酸乙酯/石油醚(1:10)过硅胶柱纯化。得到9g(68.10%)的(3R)-4-[3-氯-5-(甲基硫烷基)苯基]-3-甲基吗啉,为白色固体。LC-MS-BLV-CY-232-1:(ES,m/z):260[M+H]+1H-NMR-BLV-CY-232-1:(300MHz,CDCl3,ppm):δ6.15(s,1H),4.26(brs,1H),4.06-3.92(m,2H),3.80(d,J=11.5Hz,1H),3.70(dd,J=11.6,2.9Hz,2H),3.56(td,J=11.8,3.1Hz,1H),3.27(td,J=12.8,4.0Hz,1H),2.51(s,3H),1.32(dd,J=6.9,0.7Hz,3H)。
甲基(3R)-4-[6-(4,4-二氟哌啶-1-基)-2-(甲基硫烷基)嘧啶-4-基]-3-甲基吗啉的合成:40mL微波,保持在氮气惰性气氛中,加入(3R)-4-[6-氯-2-(甲基硫烷基)嘧啶-4-基]-3-甲基吗啉(1g,3.85mmol,1当量),4,4-二氟哌啶(932.7mg,7.70mmol,2.0当量),Pd2(dba)3(352.5mg,0.38mmol,0.10当量),XantPhos(445.5mg,0.77mmol,0.20当量),Cs2CO3(2.5g,7.70mmol,2.00当量),二氧六环(10毫升)。溶液在90℃下搅拌1小时。滤出固体,浓缩有机层。将残余物用乙酸乙酯/石油醚(1∶3)过硅胶柱纯化。得到180mg(13.57%)的(3R)-4-[6-(4,4-二氟哌啶-1-基)-2-(甲基硫烷基)嘧啶-4-基]-3-甲基吗啉,为白色固体。LC-MS-BLV-CY-232-2:(ES,m/z):345[M+H]+1H-NMR-BLV-CY-232-2:(300MHz,d6-DMSO,ppm):δ5.73(s,1H),4.42-4.31(m,1H),3.97-3.87(m,2H),3.71-3.68(m,5H),3.56(dd,J=11.4,2.9Hz,1H),3.41(td,J=11.8,2.8Hz,1H),3.04(td,J=12.8,3.6Hz,1H),2.38(s,3H),2.02-1.89(m,4H),1.13(d,J=6.7Hz,3H)。
甲基(3R)-4-[6-(4,4-二氟哌啶-1-基)-2-[1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基]嘧啶-4-基]-3-甲基吗啉的合成:在40ml微波管中,在惰性氮气氛围下,放置(3R)-4-[6-(4,4-二氟哌啶-1-基)-2-(甲基硫烷基)嘧啶-4-基]-3-甲基吗啉(200mg,0.581mmol,1当量),4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼烷-2-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶(425.24mg,1.742mmol,3.0当量),Pd(PPh3)4(335.51mg,0.290mmol,0.5当量),CuMeSal(623.37mg,2.903mmol,5.0当量),二氧六环(10mL)。溶液在110℃下搅拌1.5小时。粗产物通过制备型HPLC纯化。得到12mg(4.99%)(3R)-4-[6-(4,4-二氟哌啶-1-基)-2-[1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基]嘧啶-4-基]-3-甲基吗啉,为浅黄色固体。
LC-MS-BLV-CY-232-0:(ES,m/z):415[M+H]+1H-NMR-BLV-CY-232-0:(300MHz,d6-DMSO,ppm):δ11.72(s,1H),8.30(d,J=5.0Hz,1H),7.93(d,J=5.0Hz,1H),7.57-7.53(m,1H),7.15(dd,J=3.3,1.9Hz,1H),6.06(s,1H),4.65-4.53(m,1H),4.12(d,J=12.8Hz,1H),3.98(dd,J=11.3,3.3Hz,1H),3.91-3.83(m,4H),3.78(d,J=11.5Hz,1H),3.66(dd,J=11.5,2.7Hz,1H),3.51(td,J=11.7,2.7Hz,1H),3.18(td,J=12.9,3.7Hz,1H),2.13-1.96(m,4H),1.23(d,J=6.7Hz),3H)。
实施例CY-233:6-[((3R)-3-甲基吗啉-4-基]-2-[1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基]-N-(2,2,2-三氟乙基)嘧啶-4-胺的制备
甲基-6-[((3R)-3-甲基吗啉-4-基]-2-(甲基硫烷基)-N-(2,2,2-三氟乙基)嘧啶-4-胺的合成:100mL圆底将烧瓶,用氮气吹扫并惰性气氛保护,加入(3R)-4-[6-氯-2-(甲基硫烷基)嘧啶-4-基]-3-甲基吗啉(1g,3.850mmol,1当量),2,2,2-三氟乙-1-胺(1.91g,19.249mmol,5.0当量),Pd2(dba)2(0.09g,0.385mmol,0.1当量),XantPhos(0.45g,0.770mmol,0.2当量),Cs2CO3(3.14g,9.625mmol,2.5当量),二氧六环(20mL)。将所得溶液在85℃下搅拌过夜,滤出固体,浓缩有机层。将残余物用乙酸乙酯/石油醚(20:80)过硅胶柱纯化。得到300mg(24.17%)6-[((3R)-3-甲基吗啉-4-基]-2-(甲基硫烷基)-N-(2,2,2-三氟乙基)嘧啶-4-胺,白色固体。LC-MS-BLV-CY-233-1:(ES,m/z):323[M+H]+1H-NMR-BLV-CY-233-1:(300MHz,CDCl3,ppm):δ5.23(s,1H),4.75(brs,1H),4.27(brs,1H),4.13-3.87(m,4H),3.78(d,J=11.4Hz,1H),3.71(dd,J=11.4,3.0Hz,1H),3.56(td,J=11.9,3.1Hz,1H),3.21(td,J=12.7,3.9Hz,1H),2.49(s,3H),1.27(d,J=6.6Hz,3H)。
甲基6-[[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]-2-[1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基]-N-(2,2,2-三氟乙基)嘧啶-4-胺的合成:40-mL微波管,在惰性氮气氛围保护下,加入6-[((3R)-3-甲基吗啉-4-基]-2-(甲基硫烷基)-N-(2,2,2-三氟乙基)嘧啶-4-胺(200mg,0.620mmol,1当量),4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼烷-2-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶(454.35mg,1.861mmol,3.0当量),Pd(PPh3)4(358.48mg,0.310mmol,0.5当量),CuMeSal(666.05mg,3.102mmol,5.0当量),二氧六环(10毫升)。溶液在110℃下搅拌1.5小时。浓缩粗产物通过制备型HPLC纯化。得到25mg(10.2%)6-[((3R)-3-甲基吗啉-4-基]-2-[1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基]-N-(2,2,2-三氟乙基)嘧啶-4-胺,为浅黄色固体。LC-MS-BLV-CY-233-0:(ES,m/z):393[M+H]+1H-NMR-BLV-CY-233-0:(300MHz,CD3OD,ppm):δ8.27(d,J=5.1Hz,1H),8.02(d,J=5.2Hz,1H),7.48(d,J=3.5Hz,1H),7.31(d,J=3.5Hz,1H),5.79(s,1H),4.52(brs,1H),4.30(q,J=9.4Hz,2H),4.09-4.00(m,2H),3.88-3.74(m,2H),3.72-3.57(m,1H),3.31-3.24(m,1H),1.34(d,J=6.8Hz,3H)。
实施例CY-234:(3R)-4-(6-叔丁基-2-[1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基]嘧啶-4-基)-3-甲基吗啉的制备
4-叔丁基-2,6-二氯嘧啶的合成:250mL三口圆颈烧瓶,放入2,4,6-三氯嘧啶(10g,54.520mmol,1当量),CuI(519.16mg,2.726mmol,0.05当量)。然后加入THF(100mL),在-10℃搅拌5分钟。在-10℃下搅拌下滴加入叔丁基氯化镁(27.2mL),0℃下搅拌1小时。然后加入150mL的NH4Cl淬灭反应。加入水(150ml),用EtOAc(2×150ml)萃取。合并的有机层,盐水(150ml)洗涤,Na2SO4干燥,过滤并浓缩。得到8g(71.55%)的4-叔丁基-2,6-二氯嘧啶,为浅黄色固体。LC-MS-BLV-CY-234-1:(ES,m/z):205[M+H]+
(3R)-4-(6-叔丁基-2-氯嘧啶-4-基)-3-甲基吗啉的合成:在100-mL圆底烧瓶中,放入2-叔丁基-2,6-二氯嘧啶(1g,4.876mmol,1当量),(3R)-3-甲基吗啉(0.49g,4.876mmol,1.0当量),TEA(0.99g,9.752mmol,2.0当量),EtOH(15mL)。溶液在50℃下搅拌过夜。将得到的混合物浓缩。将残余物用乙酸乙酯/石油醚(15:85)过硅胶柱纯化。得到600mg(45.61%)的(3R)-4-(6-叔丁基-2-氯嘧啶-4-基)-3-甲基吗啉,为无色油。LC-MS-BLV-CY-234-2:(ES,m/z):270[M+H]+
(3R)-4-(6-叔丁基-2-[1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基]嘧啶-4-基)-3-甲基吗啉的合成:40mL微管,在惰性氮气气氛下放入(3R)-4-(6-叔丁基-2-氯嘧啶-4-基)-3-甲基吗啉(200mg,0.741mmol,1当量),4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼硼烷-2-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶(289.55mg,1.186mmol,1.6当量),Pd(dppf)Cl2(120.70mg,0.148mmol,0.2当量),Na2CO3(157.15mg,1.483mmol,2.0当量),DME(8mL),H2O(2mL)。溶液在90℃下搅拌1小时。浓缩粗产物通过制备型HPLC纯化,得到41mg(15.74%)(3R)-4-(6-叔丁基-2-[1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基]嘧啶-4-基)-3-甲基吗啉,为白色固体。LC-MS-BLV-CY-234-0:(ES,m/z):352[M+H]+
1H-NMR-BLV-CY-234-0:(300MHz,d6-DMSO,ppm):δ11.73(s,1H),8.32(d,J=5.0Hz,1H),8.00(d,J=5.0Hz,1H),7.64-7.53(m,1H),7.30(dd,J=3.4,2.0Hz,1H),6.68(s,1H),4.64(brs,1H),4.20(d,J=11.5Hz,1H),4.00(dd,J=11.4,3.6Hz,1H),3.80(d,J=11.4Hz,1H),3.67(dd,J=11.5,3.0Hz,1H),3.52(td,J=11.9,2.9Hz,1H),3.24(td,J=12.9,3.9Hz,1H),1.38(s,9H),1.26(d,J=6.7Hz,3H)。
实施例CY-235:(3R)-3-甲基-4-(6-苯基-2-[1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基]嘧啶-4-基)吗啉的制备
甲基(3R)-4-(2-氯-6-苯基嘧啶-4-基)-3-甲基吗啉的合成:在250-mL圆底烧瓶中放入2,4-二氯-6-苯基嘧啶(2g,8.886mmol,1当量),(3R)-3-甲基吗啉(1.08g,10.663mmol,1.2当量),TEA(1.80g,17.772mmol,2.0当量),EtOH(20mL)。溶液在70℃下搅拌4小时。混合物浓缩,将残余物用乙酸乙酯/石油醚(15:85)过硅胶柱纯化。得到0.8g(31.07%)的(3R)-4-(2-氯-6-苯基嘧啶-4-基)-3-甲基吗啉,为无色油。LC-MS-BLV-CY-235-1:(ES,m/z):290[M+H]+
1H-NMR-BLV-CY-235-1:(300MHz,d6-DMSO,ppm):δ8.19-8.04(m,2H),7.61-7.43(m,3H),7.28(s,1H),4.53(brs,1H),4.17(d,J=13.3Hz,1H),3.95(dd,J=11.4,3.7Hz,1H),3.74(d,J=11.5Hz,1H),3.62(dd,J=11.6,3.0Hz,1H),3.47(td,J=11.9,2.9Hz,1H),3.25(td,J=13.1,3.7Hz,1H),1.24(d,J=6.7Hz,3H)。
甲基(3R)-4-(2-氯-6-苯基嘧啶-4-基)-3-甲基吗啉的合成:在40-mL微波中,保持氮气氛下加入(3R)-4-(2-氯-6-苯基嘧啶-4-基)-3-甲基吗啉(200mg,0.690mmol,1当量),4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼硼烷-2-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶(269.57mg,1.104mmol,1.6当量),Pd(dppf)Cl2(112.23mg,0.138mmol,0.2当量),Na2CO3(146.31mg,1.380mmol,2.0当量),DME(8毫升),H2O(2毫升)。溶液在90℃下搅拌1小时。粗产物通过制备型HPLC纯化,得到45mg(17.55%)的(3R)-3-甲基-4-(6-苯基-2-[1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基]嘧啶-4-基)吗啉,为褐色固体。LC-MS-BLV-CY-235-0:(ES,m/z):372[M+H]+。H-NMR-BLV-CY-235-0:(300MHz,d6-DMSO,ppm):δ11.79(s,1H),8.40-8.31(m,3H),8.14-8.11(m,1H),7.63-7.52(m,4H),7.36-7.32(m,2H),4.76(brs,1H),4.36(d,J=13.3Hz,1H),4.04(dd,J=11.6,3.6Hz,1H),3.83(d,J=11.4Hz,1H),3.72(dd,J=11.7,3.1Hz,1H),3.57(td,J=12.6,2.9Hz,1H),3.37(d,J=3.8Hz,1H)),1.31(d,J=6.6Hz,3H)。
实施例CY-236:(3R)-4-[6-(2-氟丙-2-基)-2-[1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基]嘧啶-4-基]-3-甲基吗啉的制备
2-氯-6-[[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]嘧啶-4-羧酸甲酯的合成:在500-mL圆底烧瓶中,放入2,6-二氯嘧啶-4-羧酸甲酯(5g,24.153mmol,1当量),DCM(100mL),TEA(2.7g,26.682mmol,1.10当量),(3R)-3-甲基吗啉(2.49g,24.617mmol,1.02当量)。溶液在室温搅拌2小时。混合物浓缩,将残余物用乙酸乙酯/石油醚(1/15-1/3)过硅胶柱纯化。得到3.8g(57.90%)黄色固体的2-氯-6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]嘧啶-4-羧酸甲酯。
2-[2-氯-6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]嘧啶-4-基]丙-2-醇的合成:在50mL圆底烧瓶中,保持在氮气惰性气氛下,放入2-氯-6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]嘧啶-4-羧酸甲酯(700mg,2.576mmol,1当量),THF(15mL)。随后在-60℃搅拌下逐滴加入CH3MgCl(2.15mL,6.441mmol,2.50当量)。溶液在-60℃下搅拌0.5小时。然后加入50mL饱和NH4Cl水溶液淬灭反应。用4×30mL乙酸乙酯萃取所得溶液,合并有机层并浓缩。将残余物用乙酸乙酯/石油醚(1/4)过硅胶柱纯化,得到500mg(71.42%)黄色油状的2-[2-氯-6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]嘧啶-4-基]丙烷-2-醇。
(3R)-4-[2-氯-6-(2-氟丙烷-2-基)嘧啶-4-基]-3-甲基吗啉的合成:50mL 3颈圆底烧瓶中,在惰性氮气气氛下,加入2-[2-氯-6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]嘧啶-4-基]丙烷-2-醇(200mg,0.736mmol,1当量),DCM(2毫升)。随后在0℃搅拌下逐滴加入DAST(178mg,1.104mmol,1.50当量)的DCM(0.5mL)溶液。溶液在室温搅拌1小时。然后加入50mL饱和NaHCO3水溶液淬灭反应,用3×30mL二氯甲烷萃取,合并有机层并浓缩。将残余物用乙酸乙酯/石油醚(1/4)过硅胶柱纯化,得到95mg(47.15%)黄色油状的(3R)-4-[2-氯-6-(2-氟丙烷-2-基)嘧啶-4-基]-3-甲基吗啉。LC-MS-BLV-CY-236-1:(ES,m/z):274[M+H]+。H-NMR-BLV-CY-236-1:(300MHz,CDCl3,ppm):δ6.61(s,1H),4.38(brs,1H),4.11-4.01(m,2H),3.81(d,J=11.4Hz,1H),3.71(dd,J=11.4,2.7Hz,1H),3.57(td,J=12.0,3.0Hz,1H),3.32(td,J=12.9,3.6Hz,1H),1.71(s,3H),1.67(s,3H),1.36(d,J=6.6Hz,3H)。
(3R)-4-[6-(2-氟丙烷-2-基)-2-[1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基]嘧啶-4-基]-3-甲基吗啉的合成:在20mL微波管中,并用惰性氮气保护并保持,放入(3R)-4-[2-氯-6-(2-氟丙烷-2-基)嘧啶-4-基]-3-甲基吗啉(90mg,0.329mmol,1当量),DME(4mL),4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼烷-2-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶(161mg,0.660mmol,2.01当量),Pd(dppf)Cl2(54mg,0.074mmol,0.22当量),Na2CO3(71mg,0.670mmol,2.04当量),H2O(1mL),在100℃下用微波照射0.5小时。粗产物通过Flash-Prep-HPLC在以下条件下纯化(IntelFlash-1):柱,C18硅胶。流动相,CH3CN/0.05%HCOOH=70%增至CH3CN/0.05%HCOOH=80%;254nm和220nm波长检测器。得到25mg(21.39%)(3R)-4-[6-(2-氟丙烷-2-基)-2-[1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基]嘧啶-4-基]-3-甲基吗啉,为浅黄色固体。
LC-MS-BLV-CY-236-0:(ES,m/z):356[M+H]+1H-NMR-BLV-CY-236-0:(300MHz,CDCl3,ppm):δ9.71(s,1H),δ8.42(d,J=5.1Hz,1H),8.11(d,J=5.1Hz,1H),7.45(d,J=3.6Hz,1H),7.38(d,J=3.3Hz,1H),6.72(s,1H),4.58(brs,1H),4.23(d,J=12.6、1H)),4.09(dd,J=11.1,3.3Hz,1H),3.87(d,J=11.4Hz,1H),3.78(dd,J=11.4,2.7Hz,1H),3.64(td,J=12.3,3.0,1H),3.39(td,J=12.6,3.6Hz,1H),1.82(s,3H),1.75(s,3H),1.40(d,J=6.9Hz,3H)。
实施例CY-237:2-甲基-2-[6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]-2-[1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基]嘧啶-4-基]丙腈的制备
(3R)-4-(2,6-二氯嘧啶-4-基)-3-甲基吗啉的合成:在1L三口瓶中,加入2,4,6-三氯嘧啶(36.5g,198.997mmol,1当量),DCM(550mL),DIEA(51.34g,397.236mmol,2.00当量)。然后在5℃搅拌下逐滴加入(3R)-3-甲基吗啉(22.11g,218.588mmol,1.10当量)。溶液在室温搅拌2小时。将得到的混合物浓缩,残余物用乙酸乙酯/石油醚(1/25-1/1)过硅胶柱层析纯化。得到30g(60.76%)的灰白色固体状的(3R)-4-(2,6-二氯嘧啶-4-基)-3-甲基吗啉。LC-MS-BLV-CY-233-1:(ES,m/z):248[M+H]+。H-NMR-BLV-CY-233-1:(300MHz,CDCl3,ppm):δ6.37(s,1H),4.25(brs,1H),4.03-3.98(m,2H),3.79(d,J=11.7Hz,1H),3.68(dd,J=11.7,3.0Hz,1H),3.54(td,J=12.0,3.0Hz,1H),3.30(td,J=13.2,3.9Hz,1H),1.33(d,J=6.6Hz,3H)。
2-[2-氯-6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]嘧啶-4-基]-2-甲基丙腈的合成:在500mL三口圆底烧瓶中,在氩气惰性气氛保护下,放置(3R)-4-(2,6-二氯嘧啶-4-基)-3-甲基吗啉(30g,120.914mmol,1当量),甲苯(200mL)。然后在5℃搅拌下逐滴加入NaHMDS(84.6mL,2M,169.280mmol,1.4当量)。所得溶液在5℃下搅拌0.5小时后,在5℃搅拌下,向其中滴加2-甲基丙腈(8.34g,120.682mmol,1.00当量)的甲苯(10mL)溶液。将所得溶液在室温下搅拌2小时。溶液用650mL H2O稀释,分离有机相,水相用4×500mL乙酸乙酯萃取,合并所有有机层,浓缩。粗产物通过Flash-Prep-HPLC在以下条件下纯化(IntelFlash-1):柱,C18硅胶。流动相,在42分钟内将比例CH3CN/0.1%NH4HCO3=48%增加到CH3CN/0.1%NH4HCO3=48%;254nm和220nm波长检测器。得到16g(47.13%)的2-[2-氯-6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]嘧啶丁-4-基]-2-甲基丙腈,为浅黄色油。LC-MS-BLV-CY-237-1:(ES,m/z):281[M+H]+1H-NMR-BLV-CY-237-1:(300MHz,CDCl3,ppm):δ6.67(s,1H),4.37(brs,1H),4.04-3.99(m,2H),3.80(d,J=11.7Hz,1H),3.69(dd,J=11.4,3.0Hz,1H),3.54(td,J=12.0,3.0Hz,1H),3.31(td,J=13.2,3.9Hz,1H),1.70(s,6H),1.34(d,J=6.9Hz,3H)。
2-甲基-2-[6-[([3R)-3-甲基吗啉-4-基]-2-[1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基]嘧啶-4-基]丙腈的合成:在2L圆底烧瓶中,用氮气保护,加入2-[2-氯-6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]嘧啶-4-基]-2-甲基丙腈(16g,56.988mmol,1当量),DME(320mL),4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼烷-2-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶(18.13g,74.273mmol,1.30当量),Pd(dppf)Cl2(4.65g,6.355mmol,0.11当量),K2CO3(15.78g,114.178mmol,2.00当量),H2O(32mL)。将所得溶液在100℃下搅拌15小时。降温,滤出固体,所得母液用500mL H2O稀释,用4×700mL乙酸乙酯萃取溶液,合并所有有机相,浓缩。将残余物用乙酸乙酯/石油醚(1/3-1/1)过硅胶柱层析纯化。粗产物通过Flash-Prep-HPLC在以下条件下进一步纯化(IntelFlash-1):柱,C18硅胶),流动相CH3CN/0.1%NH3.H2O=100%;254nm和220nm波长检测器,得到12g(58.10%)2-甲基-2-[6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]-2-[1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-酰基]嘧啶-4-基]丙腈,为灰白色固体。LC-MS-BLV-CY-237-0:(ES,m/z):363[M+H]+
1H-NMR-BLV-CY-237-0:(300MHz,CD3OD,ppm):δ8.31(d,J=5.4Hz,1H),8.13(d,J=5.1Hz,1H),7.51(d,J=3.3Hz,1H),7.47(d,J=3.6Hz,1H),6.84(s,1H),4.71(brs,1H),4.26(d,J=12.6,1H),4.09(dd,J=11.1,3.9Hz,1H),3.89(d,J=11.4Hz,1H),3.80(dd,J=11.4,3.0Hz,1H),3.66(td,J=12.3,3.0,1H),3.42(td,J=12.9,3.9Hz,1H),1.85(s,6H),1.40(d,J=6.6Hz,3H)。
实施例CY-238:(3R)-4-(6-环丙基-2-[1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基]嘧啶-4-基)-3-甲基吗啉的制备
(3R)-4-(6-环丙基-2-[1H-吡咯并[2,3-b]甲苯-4-基]甲苯-4-基)-3-甲基吗啉的制备:在50毫升圆底烧瓶中,放入2,4-二氯-6-环丙基嘧啶(350mg,1.851mmol,1当量),(3R)-3-甲基吗啉(206.00mg,2.037mmol,1.1当量),TEA(374.70mg,3.703mmol,2.0当量),EtOH(5mL)。溶液在70℃下搅拌过夜。粗产物通过Flash-Prep-HPLC纯化,梯度:在15分钟内将0.1%NH3.H2O:MeCN=50%增加至0.1%NH3.H2O:MeCN=70%。得到230mg(48.96%)的(3R)-4-(2-氯-6-环丙基嘧啶-4-基)-3-甲基吗啉,为无色油。LC-MS-BLV-CY-238-2:(ES,m/z):254[M+H]+1H-NMR-BLV-CY-238-2:(300MHz,CDCl3,ppm):δ6.22(s,1H),4.30(brs,1H),4.04-3.97(m,2H),3.79(d,J=11.5Hz,1H),3.70(dd,J=11.6,2.9Hz,1H),3.55(td,J=11.8,3.1Hz,1H),3.26(td,J=12.7,12.2,3.9Hz,1H),1.88-1.79(m,1H),1.32(d,J=6.7Hz,3H),1.17-1.08(m,2H),1.02-0.95(m,2H)。
(3R)-4-(6-环丙基-2-[1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基]嘧啶-4-基)-3-甲基吗啉的合成:在8mL微波管中,在氮气保持下,放入(3R)-4-(2-氯-6-环丙基嘧啶-4-基)-3-甲基吗啉(140mg,0.552mmol,1当量),4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼硼烷-2-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶(215.50mg,0.883mmol,1.6当量),Pd(dppf)Cl2(40.37mg,0.055mmol,0.10当量),Na2CO3(116.96mg,1.104mmol,2.00当量),DME(3mL),H2O(0.8mL)。溶液在90℃下搅拌40分钟。粗产物通过制备型HPLC纯化,得到40mg(21.6%)的(3R)-4-(6-环丙基-2-[1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基]嘧啶-4-基)-3-甲基吗啉,为白色固体。
LC-MS-BLV-CY-238-0:(ES,m/z):336[M+H]+1H-NMR-BLV-CY-238-0:(300MHz,d6-DMSO,ppm):δ11.75(s,1H),8.32(d,J=5.0Hz,1H),7.94(d,J=5.0Hz),1H),7.57(t,J=2.9Hz,1H),7.17-7.15(m,1H),6.77(s,1H),4.56(d,J=7.4Hz,1H),4.17(d,J=12.6Hz,1H),4.00(dd,J=11.3,3.6Hz,1H),3.79(d,J=11.4Hz,1H),3.66(dd,J=11.5,3.1Hz,1H),3.51(td,J=11.8,2.9Hz,1H),3.24(td,J=12.7,3.8Hz,1H),2.11-2.03(m,1H),1.26(d,J=6.7Hz,3H),1.17-1.13(m,2H),1.05-1.00(m,2H)。
实施例CY-239:(3R)-4-(6-环丁基-2-[1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基]嘧啶-4-基)-3-甲基吗啉的制备
2,4-二氯-6-环丁基嘧啶的合成:在100-mL圆底烧瓶中,放入2,4,6-三氯嘧啶(2g,10.904mmol,1当量)和THF(30mL)。随后在0℃下搅拌下,加入的环丁基溴化锌(20mL)。在0℃下,向其中加入Pd(PPh3)4(315.00mg,0.273mmol,0.02当量)。将所得溶液在70℃下搅拌3小时。混合物冷却至室温,粗产物通过Flash-Prep-HPLC纯化,在9分钟内将0.1%NH3.H2O:MeCN=45%增加到0.1%NH3.H2O:MeCN=75%。得到0.7g(31.61%)的2,4-二氯-6-环丁基嘧啶,为黄色固体。LC-MS-BLV-CY-239-1:(ES,m/z):203[M+H]+1H-NMR-BLV-CY-239-1:(300MHz,CDCl3,ppm):δ7.15(s,1H),3.68-3.56(m,1H),2.44-2.29(m,4H),2.19-2.07(m,1H),2.04-1.91(m,1H)。
(3R)-4-(2-氯-6-环丁基嘧啶-4-基)-3-甲基吗啉的合成:在50-mL圆底烧瓶中,放入2,4-二氯-6-环丁基嘧啶(1.4g,6.894mmol,1当量),(3R)-3-甲基吗啉(0.77g,7.584mmol,1.1当量),TEA(1.40g,13.788mmol,2.0当量),EtOH(14mL)。将所得溶液在70℃下搅拌2小时。粗产物通过Flash-Prep-HPLC纯化,在9分钟内将0.1%NH3.H2O:MeCN=50%增加到0.1%NH3.H2O:MeCN=70%。得到1.1g(59.59%)的黄色固体的(3R)-4-(2-氯-6-环丁基嘧啶-4-基)-3-甲基吗啉。LC-MS-BLV-CY-239-2:(ES,m/z):268[M+H]+
1H-NMR-BLV-CY-239-2:(300MHz,CDCl3,ppm):δ6.18(s,1H),4.32(brs,1H),4.08-3.94(m,2H),3.78(d,J=11.5Hz,1H),3.69(dd,J=11.6,2.9Hz,1H),3.60-3.38(m,2H),3.27(td,J=13.4,4.1Hz,1H),2.36-2.22(m,4H),2.12-1.97(m,1H),1.96-1.82(m,1H),1.31(dd,J=6.8,0.7Hz,3H)。
(3R)-4-(6-环丁基-2-[1H-吡咯并[2,3-b]吡啶基-4-基]嘧啶-4-基)-3-甲基吗啉的合成:在8mL微波管中,在氮气保护下,放入Pd(dppf)Cl2(32.79mg,0.045mmol,0.1当量),Na2CO3(95.00mg,0.896mmol,2.00当量),DME(3mL),H2O(1mL),(3R)-4-(2-氯-6-环丁基嘧啶-4-基)-3-甲基吗啉(120mg,0.448mmol,1当量),4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼硼烷-2-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶(175.03mg,0.717mmol,1.6当量)。将所得溶液在90℃下搅拌40分钟。粗产物通过制备型HPLC纯化。得到40mg(25.6%)(3R)-4-(6-环丁基-2-[1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基]嘧啶-4-基)-3-甲基吗啉,为白色固体。LC-MS-BLV-CY-239-0:(ES,m/z):349[M+H]+
1H-NMR-BLV-CY-239-0:(300MHz,d6-DMSO,ppm):δ11.74(s,1H),8.33(d,J=5.0Hz,1H),8.01(d,J=5.0Hz,1H),7.58(t,J=2.9Hz,1H),7.31(dd,J=3.3,1.9Hz,1H),6.62(s,1H),4.60(brs,1H),4.18(d,J=13.3Hz,1H),3.99(dd,J=11.3,3.6Hz,1H),3.79(d,J=11.5Hz,1H),3.71-3.44(m,3H),3.24(td,J=12.7,3.9Hz,1H),2.46-2.27(m,4H),2.12-1.90(m,2H),1.25(d,J=6.7Hz,3H)。
实施例CY-240:(3R)-4-(6-环戊基-2-[1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基]嘧啶-4-基)-3-甲基吗啉的制备
2,4-二氯-6-环戊基嘧啶的合成:在100mL圆底烧瓶中,放入2,4,6-三氯嘧啶(3g,16.356mmol,1当量),Fe(acac)3(1.16g,3.271mmol,0.20当量),THF(30mL)。随后0℃搅拌下加入NMP(5mL)。在0℃下,向该溶液中分批加入环戊基溴化镁(1M THF,16.5mL,1当量)。将所得溶液在室温下搅拌1小时。然后加50mL的NaHCO3水溶液淬灭反应,溶液用乙酸乙酯(2×100mL)萃取。合并的有机层,用2×50mL盐水洗涤,经无水硫酸钠干燥并浓缩。所得残余物用乙酸乙酯/石油醚(10:90)过硅胶柱。得到500mg(14.08%)的2,4-二氯-6-环戊基嘧啶,为无色油。LC-MS-BLV-CY-240-1:(ES,m/z):217[M+H]+
1H-NMR-BLV-CY-240-1:(300MHz,CDCl3,ppm):δ7.16(s,1H),3.17-3.06(m,1H),2.10-2.04(m,2H),1.94-1.69(m,6H)。
(3R)-4-(2-氯-6-环戊基嘧啶-4-基)-3-甲基吗啉的合成:在50-mL圆底烧瓶中,放入2,4-二氯-6-环戊基嘧啶(400mg,1.843mmol,1当量),(3R)-3-甲基吗啉(205.01mg,2.027mmol,1.1当量),TEA(372.90mg,3.685mmol,2.0当量),EtOH(10.00mL)。所得溶液在70℃下搅拌过夜。浓缩,将残余物用硅胶柱在乙酸乙酯/石油醚(1:10)条件下纯化,得到240mg(46.23%)无色油状的(3R)-4-(2-氯-6-环戊基嘧啶-4-基)-3-甲基吗啉.LC-MS-BLV-CY-240-1:(ES,m/z):282[M+H]+
(3R)-4-(6-环戊基-2-[1H-吡咯并[2,3-b]吡啶基-4-基]嘧啶丁-4-基)-3-甲基吗啉的合成:在8mL微波管中,在氮气保护下,加入(3R)-4-(2-氯-6-环戊基嘧啶-4-基)-3-甲基吗啉(100mg,0.355mmol,1当量),4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼硼烷-2-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶(129.94mg,0.532mmol,1.5当量),Pd(dppf)Cl2(25.97mg,0.035mmol,0.1当量),Na2CO3(75.23mg,0.710mmol,2.0当量),DME(3mL),H2O(1mL)。将所得溶液在90℃下搅拌40分钟。粗产物通过制备型HPLC纯化。得到40mg(31.01%)(3R)-4-(6-环戊基-2-[1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基]嘧啶-4-基)-3-甲基吗啉为白色固体。
LC-MS-BLV-CY-240-0:(ES,m/z):364[M+H]+1H-NMR-BLV-CY-240-0:(300MHz,CD3OD,ppm):δ8.28(d,J=5.2Hz,1H),8.03(d,J=5.2Hz,1H),7.48(d,J=3.5Hz,1H),7.35(d,J=3.5Hz,1H),6.58(s,1H),4.64(brs,1H),4.20(d,J=13.8Hz,1H),4.05(dd,J=12.2,3.9Hz,1H),3.86(d,J=11.5Hz,1H),3.78(dd,J=11.7,3.3Hz,1H),3.63(td,J=12.0,3.0Hz,1H),3.40-3.35(m,1H),3.22-3.10(m,1H),2.11-1.78(m,8H),1.36(d,J=6.6Hz,3H)。
实施例CY-241:(3R)-4-(6-环己基-2-[1H-吡咯并[2,3-b]-4-吡啶]嘧啶-4-基)-3-甲基吗啉的制备
2,4-二氯-6-环己基嘧啶的合成:在25mL圆底烧瓶中,放入2,4,6-三氯嘧啶(1当量),环己基溴化锌(1M THF,11mL),Pd(dppf)Cl2(110.95mg,0.136mmol,0.03当量)。将所得溶液在70℃下搅拌1小时。然后加入50mL的NaHCO3水溶液淬灭反应。用2×100mL乙酸乙酯萃取所得溶液,并合并有机层。用50mL食盐水洗涤。然后用无水硫酸钠干燥并浓缩。将残余物用硅胶柱在乙酸乙酯/石油醚(1:10)条件下纯化。得到300mg 2,4-二氯-6-环己基嘧啶,为无色油。
LC-MS-BLV-CY-241-1:(ES,m/z):231[M+H]+1H-NMR-BLV-CY-241-1:(300MHz,CDCl3,ppm):δ7.16(s,1H),2.68(m,1H),2.03-1.83(m,4H),1.83-1.73(m,1H),1.58-1.24(m,5H)。
(3R)-4-(2-氯-6-环己基嘧啶-4-基)-3-甲基吗啉的合成:在50mL圆底烧瓶中,放入2,4-二氯-6-环己基嘧啶(500mg,2.163mmol,1当量),(3R)-3-甲基吗啉(262.59mg,2.596mmol,1.2当量),TEA(437.82mg,4.327mmol,2.00当量),EtOH(10mL)。将所得溶液在70℃下搅拌4小时。将得到的混合物浓缩,将残余物用硅胶柱在乙酸乙酯/石油醚(1:8)条件下纯化。得到320mg(50.00%)无色油状的(3R)-4-(2-氯-6-环己基嘧啶-4-基)-3-甲基吗啉。
LC-MS-BLV-CY-241-2:(ES,m/z):296[M+H]+
(3R)-4-(6-环己基-2-[1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基]嘧啶-4-基)-3-甲基吗啉的合成:在8mL微波管中,保持在氮气氛围下,放置(3R)-4-(2-氯-6-环己基嘧啶-4-基)-3-甲基吗啉(100mg,0.338mmol,1当量),4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼硼烷-2-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶(123.78mg,0.507mmol,1.5当量),Pd(dppf)Cl2(27.52mg,0.034mmol,0.1当量),Na2CO3(71.66mg,0.676mmol,2.0当量),DME(4mL),H2O(1mL)。将所得溶液通过微波反应器在90℃下加热30分钟。粗产物通过制备型HPLC纯化。得到39mg(30.7%)(3R)-4-(6-环己基-2-[1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基]嘧啶-4-基)-3-甲基吗啉。LC-MS-BLV-CY-241-0:(ES,m/z):378[M+H]+1H-NMR-BLV-CY-241-0:(300MHz,d6-DMSO,ppm):δ11.72(s,1H),8.32(d,J=5.0Hz,1H),7.98(d,J=5.0Hz,1H),7.57(d,J=3.4Hz,1H),7.28(d,J=3.4Hz,1H),6.64(s,1H),4.57(brs,1H),4.18(d,J=13.3Hz,1H),3.99(dd,J=11.8Hz,3.2Hz,1H),3.79(d,J=11.3Hz,1H),3.66(dd,J=11.5Hz,3.1Hz,1H),3.51(td,J=11.7Hz,2.8Hz,1H),3.23(td,J=12.8Hz,3.9Hz,1H),2.68-2.59(m,1H),1.98-1.79(m,4H),1.78-1.56(m,3H),1.50-1.31(m,3H),1.25(d,J=6.6Hz,3H)。
实施例CY-242:2-[6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]-2-[1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基]-4-嘧啶]丙烷-2-胺的制备
2-[2-氯-6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]嘧啶-4-基]-2-甲基丙酰胺的合成:50mL 3颈圆底烧瓶中,放入2-[2-氯-6-[((3R)-3-甲基吗啉-4-基]-4-嘧啶]-2-甲基丙腈(1.45g,5.165mmol,1当量),MeOH(10mL),DCM(10mL)。然后在0℃加入KOH(87mg,1.551mmol,0.30当量)。在0℃下向其中加入H2O2(30%)(8.78g,77.47mmol,15.0当量)。将所得溶液在室温搅拌2小时。将得到的混合物浓缩。粗产物通过Flash-Prep-HPLC在以下条件下纯化(IntelFlash-1):柱,C18硅胶;流动相,CH3CN/0.05%NH3.H2O=45%增加到CH3CN/0.05%NH3.H2O=60%;紫外检测器为2 54nm和220nm得到600mg(38.88%)的2-[2-氯-6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]嘧啶丁-4-基]-2-甲基-丙酰胺,为浅黄色固体。LC-MS-BLV-CY-242-2:(ES,m/z):299[M+H]+
1H-NMR-BLV-CY-242-2:(300MHz,CDCl3,ppm):δ6.87(brs,1H),6.42(s,1H),5.37(brs,1H),4.36(brs,1H),4.05(d,J=3.9Hz,1H),4.01(d,J=3.6Hz,1H),3.81(d,J=11.4Hz,1H),3.70(dd,J=11.7Hz,3.3Hz,1H),3.56(td,J=11.7Hz,3.0Hz,1H),3.31(td,J=13.2Hz,3.9Hz,1H),1.60(s,6H),1.34(d,J=6.9Hz,3H)。
2-[2-氯-6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]-4-嘧啶]丙-2-胺的合成:在50毫升3颈圆底烧瓶中,加入2-[2-氯-6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]嘧啶-4-基]-2-甲基丙酰胺(800mg,2.678mmol,1当量),H2O(10mL)。在0℃下加入NaOH(428mg,10.701mmol,4.00当量)。在0℃下向其中加入NaClO(8%)(14.95g,16.066mmol,6.00当量)。将所得溶液在室温搅拌15小时。粗产物通过Flash-Prep-HPLC在以下条件下纯化(IntelFlash-1):柱,C18硅胶;流动相,CH3CN/0.05%NH3.H2O=35%增加到CH3CN/0.05%NH3.H2O=45%;紫外检测器为254nm和220nm,得到85mg(11.72%)黄色固体状的2-[2-氯-6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]-4-嘧啶]丙烷-2-胺。LC-MS-BLV-CY-242-3:(ES,m/z):271[M+H]+1H-NMR-BLV-CY-242-3:(300MHz,CDCl3,ppm):δ6.54(s,1H),4.36(brs,1H),4.02(d,J=3.3Hz,1H),3.98(d,J=3.9Hz,1H),3.78(d,J=11.4Hz,1H),3.68(dd,J=11.4Hz,3.0Hz,1H),3.54(td,J=12.3Hz,3.0Hz,1H),3.28(td,J=13.2Hz,3.9Hz,1H),1.46(s,6H),1.31(d,J=6.9Hz,3H)。
N-(2-[2-氯-6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]嘧啶-4-基]丙-2-基)氨基甲酸叔丁酯的合成:在50mL 3颈颈圆底烧瓶中,放入2-[2-氯-6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]-4-嘧啶]丙烷-2-胺(85mg,0.314mmol,1当量),DCM(3mL),TEA(48mg,0.474mmol,1.51当量)。随后在0℃加入二碳酸二叔丁酯(82mg,0.376mmol,1.20当量)。将所得溶液在室温搅拌15小时。然后加入50mL饱和NaHCO3水溶液淬灭反应。用2×30mL二氯甲烷萃取,合并有机层并浓缩。将残余物通过硅胶柱用乙酸乙酯/石油醚(1/3)纯化。得到65mg(55.83%)的叔丁基N-(2-[2-氯-6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]嘧啶-4-基]丙-2-基)氨基甲酸酯为黄色固体。LC-MS-BLV-CY-242-5:(ES,m/z):371[M+H]+
1H-NMR-BLV-CY-242-5:(300MHz,CDCl3,ppm):δ6.40(s,1H),5.31(brs,1H),4.30(s,1H),4.01-3.96(m,2H),3.77(d,J=11.7Hz,1H),3.68(dd,J=11.4,2.7Hz,1H),3.54(td,J=12.0Hz,3.0Hz,1H),3.27(td,J=12.9Hz,3.9Hz,1H),1.60(d,J=7.8Hz,6H),1.41(s,9H),1.31(d,J=6.6Hz,3H)。
叔丁基N-(2-[6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]-2-[1H-吡咯并[2,3-b]-4-吡啶]-4-嘧啶]丙-2-基氨基甲酸酯:20mL微波管,在氮气氛围下,将N-(2-[2-氯-6-[(3R)-3)叔丁基-甲基吗啉-4-基]-4-嘧啶]丙-2-基氨基甲酸酯(65mg,0.175mmol,1当量),1,4-二氧六环(3mL),4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼硼烷-2-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶(86mg,0.352mmol,2.01当量),Pd(dppf)Cl2(13mg,0.018mmol,0.10当量),K2CO3(48mg,0.347mmol,1.98当量),H2O(0.3mL)。在100℃下用微波反应器加热1小时。粗产物通过Flash-Prep-HPLC在以下条件下纯化(IntelFlash-1):柱,C18硅胶;流动相,CH3CN/0.05%HCOOH=40%增至CH3CN/0.05%HCOOH=50%;紫外检测器为254nm和220nm。得到50mg(63.04%)叔丁基N-(2-[6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]-2-[1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基]嘧啶-4-基]丙-2-基氨基甲酸酯呈黄色固体。LC-MS-BLV-CY-242-4:(ES,m/z):371[M+H]+
2-[6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]-2-[1H-吡咯并[2,3-b]-4-吡啶]-4-嘧啶]丙烷-2-胺的合成:在10mL反应瓶中,加入N-(2-[6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]-2-[1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基]-4-嘧啶]丙-2-基)氨基甲酸酯(50mg,0.110mmol,1当量),MeOH(1mL)。在室温下,加入HCl(g)的甲醇溶液(1mL)。将所得溶液在室温搅拌15小时。将得到的混合物浓缩。得到7.1mg(18.23%)2-[6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]-2-[1H-吡咯并[2,3-b]-4-吡啶]嘧啶-4-基]丙烷-2-胺为黄色固体的。LC-MS-BLV-CY-242-0:(ES,m/z):353[M+H]+1H-NMR-BLV-CY-242-0:(300MHz,CD3OD,ppm):δ8.70(d,J=5.7Hz,1H),8.58(d,J=5.7Hz,1H),7.88(d,J=3.0Hz,1H),7.68(d,J=3.3Hz,1H),7.02(s,1H),4.74(brs,1H),4.29(d,J=11.7Hz,1H),4.11(d,J=9.3Hz,1H),3.91(d,J=11.4Hz,1H),3.81(d,J=11.4Hz,1H),3.67(t,J=10.5Hz,1H),3.48(t,J=12.3Hz,1H),1.83(s,6H),1.43(d,J=6.9Hz,3H)。
实施例CY-243:2-甲基-2-[6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]-2-[1H-吡咯烷[2,3-b]-4-吡啶]-4-嘧啶]丙酰胺的制备
2-甲基-2-[6-[([3R)-3-甲基吗啉-4-基]-2-[1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基]-4-嘧啶基]丙酰胺的合成:在20mL反应瓶中,加入2-甲基-2-[6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]-2-[1H-吡咯并[2,3-b]-4-吡啶]嘧啶-4-基]丙腈(40mg,0.110mmol,1当量),MeOH(1mL),DCM(1mL),KOH(25%)(0.15mL)。随后在0℃搅拌下逐滴加入H2O2(30%)(50mg,0.441mmol,4.0当量)。将所得溶液在油浴中于50℃搅拌2小时。将得到的混合物浓缩。粗产物通过Flash-Prep-HPLC在以下条件下纯化(IntelFlash-1):柱,C18硅胶。流动相,CH3CN/0.05%HCOOH=35%增至CH3CN/0.05%HCOOH=50%;检测器为紫外254nm和220nm。得到20mg(47.63%)2-甲基-2-[6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]-2-[1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-酰基]嘧啶-4-基]丙酰胺,为浅黄色固体。
LC-MS-BLV-CY-243-0:(ES,m/z):381[M+H]+1H-NMR-BLV-CY-243-0:(300MHz,CD3OD,ppm):δ8.26(d,J=5.1Hz,1H),8.09(d,J=5.1Hz,1H),7.47(d,J=3.3Hz,1H),7.41(d,J=3.3Hz,1H),6.68(s,1H),4.66(brs,1H),4.21(d,J=12.0Hz,1H),4.05(dd,J=11.4Hz,3.6Hz,1H),3.86(d,J=11.4Hz,1H),3.77(dd,J=11.7Hz,3.0Hz,1H),3.63(td,J=12.3Hz,3.3Hz,1H),3.39(dd,J=13.2Hz,4.2Hz,1H),1.66(s,6H),1.39(d,J=6.9Hz,3H)。
实施例CY-244:2-甲基-2-[6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]-2-[1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基]嘧啶-4-基]丙酸的制备
2-甲基-2-[6-[([3R)-3-甲基吗啉-4-基]-2-[1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-酰基]-4-嘧啶基]丙酸的合成:在10mL反应瓶中,加入2-甲基-2-[6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]-2-[1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基]-4-嘧啶基]丙腈(150mg,0.414mmol,1当量),HCl(4mL),CH3COOH(1mL)。将所得溶液在油浴中于80℃搅拌15小时。将得到的混合物浓缩。粗产物通过Flash-Prep-HPLC在以下条件下纯化(IntelFlash-1):柱,C18硅胶;流动相,CH3CN/0.05%NH4HCO3=50%增至CH3CN/0.05%NH4HCO3=60%;检测器为紫外254nm和220nm得到4.4mg(2.79%)2-甲基-2-[6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]-2-[1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-酰基]嘧啶-4-基]丙酸为浅黄色固体。
LC-MS-BLV-CY-244-0:(ES,m/z):382[M+H]+1H-NMR-BLV-CY-244-0:(300MHz,CD3OD,ppm):δ8.40-8.15(m,2H),8.08(d,J=4.8Hz,1H),7.47(d,J=3.0Hz,1H),7.43(d,J=2.7Hz,1H),6.69(s,1H),4.67(brs,1H),4.22(d,J=12.9Hz,1H),4.06(dd,J=11.1Hz,3.0Hz,1H),3.87(d,J=11.7Hz,1H),3.78(dd,J=14.1Hz,2.7Hz,1H),3.64(td,J=12.0,2.4Hz,1H),3.39(td,J=12.9Hz,3.6Hz,1H),1.67(s,6H),1.37(d,J=6.6Hz,3H)。
实施例CY-245:(3R)-4-[6-(1-甲氧基-2-甲基丙烷-2-基)-2-[1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基]嘧啶-4-基]-3-甲基吗啉的制备
2-甲基-2-[2-甲基-6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]嘧啶-4-甲基]丙酸甲酯的合成:在50mL圆底烧瓶中,放入(3R)-4-(2,6-二氯嘧啶-4-基)-3-甲基吗啉(1g,4.030mmol,1当量),2-甲基丙酸甲酯(0.41g,4.030mmol,1.00当量)。随后加入甲苯(10mL)。在0℃搅拌下向其中滴加NaHMDS(2.8mL,1.4当量)。将所得溶液恢复至室温继续搅拌1小时。然后加入50mLNaHCO3水溶液淬灭反应。将所得溶液用2×100mL乙酸乙酯萃取。合并有机层,用100ml盐水洗涤。混合物经无水硫酸钠干燥并浓缩。将残余物通过硅胶柱在乙酸乙酯/石油醚(1:100)条件下纯化。得到500mg(42.29%)的甲基2-甲基-2-[2-甲基-6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]-4-嘧啶]丙酸酯,为无色油。LC-MS-BLV-CY-245-1:(ES,m/z):314[M+H]+1H-NMR-BLV-CY-245-1:(300MHz,CD3OD,ppm):δ6.56(s,1H),4.47(brs,1H),4.11-3.95(m,2H),3.83-3.66(m,5H),3.56(td,J=11.9Hz,3.0Hz,1H),3.31-3.23(m,1H),1.53(s,6H),1.34-1.27(m,3H)。
2-[2-氯-6-[[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]-4-嘧啶]-2-甲基丙烷-1-醇的合成:在50毫升3颈圆底烧瓶中,放入2-[2-氯-6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]嘧啶-4-基]-2-甲基丙酸甲酯(400mg,1.275mmol,1当量)。然后加入四氢呋喃(10mL)。在-60℃搅拌下向其中滴加氢化铝锂(1.0M在THF中)(10mL,0.319mmol,5当量)。将所得溶液在-60℃下搅拌1小时。然后加入60mL碳酸氢钠水溶液淬灭反应。将所得溶液用2×100mL乙酸乙酯萃取。有机层用150mL盐水洗涤。并用无水硫酸钠干燥并浓缩。得到270mg(74.12%)的无色油状2-[2-氯-6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]-4-嘧啶]-2-甲基丙烷-1-醇。LC-MS-BLV-CY-245-2:(ES,m/z):286[M+H]+
(3R)-4-[2-氯-6-(1-甲氧基-2-甲基丙烷-2-基)-4-嘧啶]-3-甲基吗啉的合成:在25mL圆底烧瓶中,放置2-[2-氯-6-[((3R)-3-甲基吗啉-4-基]嘧啶-4-基]-2-甲基丙烷-1-醇(400mg,1.400mmol,1当量)。随后加入DMF(5mL)。向其中加入NaH(100.77mg,4.199mmol,3.00当量)在0℃下并搅拌10分钟。在0℃下向混合物中加入MeI(298.01mg,2.100mmol,1.5当量)。将所得溶液恢复到室温继续搅拌4小时。然后加入100mL NaHCO3淬灭反应,并用2×50mL乙酸乙酯萃取。有机层用50mL盐水洗涤。混合物经无水硫酸钠干燥并浓缩。得到270mg(64.34%)浅黄色的(3R)-4-[2-氯-6-(1-甲氧基-2-甲基丙烷-2-基)嘧啶-4-基]-3-甲基吗啉固体。LC-MS-BLV-CY-245-3:(ES,m/z):300[M+H]+
(3R)-4-[6-(1-(1-甲氧基-2-甲基丙烷-2-基)-2-[1H-吡咯并[2,3-b]-4-吡啶]嘧啶-4-基]-3-甲基吗啉的合成:40mL微波管,在氮气气氛下,放入(3R)-4-[2-氯-6-(1-甲氧基-2-甲基丙烷-2-基)嘧啶-4-基]-3-甲基吗啉(200mg,0.667mmol,1当量),Pd(dppf)Cl2(97.63mg,0.133mmol,0.2当量),Na2CO3(141.41mg,1.334mmol,2.0当量),DME(5mL),4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼硼烷-2-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶(260.55mg,1.067mmol,1.6当量),H2O(0.5mL)。将所得溶液在90℃下搅拌1小时。粗产物通过制备型HPLC纯化。得到40mg(15.72%)(3R)-4-[6-(1-甲氧基-2-甲基丙烷-2-基)-2-[1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-酰基]-4-嘧啶]-3-甲基吗啉(FA盐),为白色固体。LC-MS-BLV-CY-245-0:(ES,m/z):382[M+H]+。1H-NMR-BLV-CY-245-0:(300MHz,CDCl3,ppm):δ9.68(s,1H),8.47(brs,1H),8.18(s,1H),7.51-7.45(m,2H),6.50(s,1H),4.59(brs,1H),4.22-4.06(m,2H),3.93-3.77(m,2H),3.75-3.59(m,3H),3.46-3.37(m,1H)),3.35(s,3H),1.49-1.35(m,9H)。
实施例CY-246:N-[(3,3-二氟环丁基)甲基]-6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]-2-[1H-吡咯并[2,3-b]-4-吡啶]嘧啶-4-胺的制备
(R)-N-(2-氟-2-甲基丙基)-6-(3-甲基吗啉)-2-(甲硫基)嘧啶-4-胺的合成:在40mL圆底烧瓶中,放入(3R)-4-[3-氯-5-(甲基硫烷基)苯基]-3-甲基吗啉(300mg,1当量),2-氟-2-甲基丙-1-胺盐酸盐(205.94mg,1.4当量),TEA(350.96mg,3.0当量),EtOH(4mL)。将所得溶液在70℃下搅拌过夜。粗产物通过Flash-Prep-HPLC纯化(纯化条件:在9分钟内将0.1%NH3.H2O:MeCN=55%增加到0.1%NH3.H2O:MeCN=65%。得到200mg白色固体状的(R)-N-(2-氟-2-甲基丙基)-6-(3-甲基吗啉)-2-(甲硫基)嘧啶-4-胺。LC-MS-BLV-CY-246-1:(ES,m/z):315[M+H]+
N-[(3,3-二氟环丁基)甲基]-6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]-2-[1H-吡咯并[2,3-b]-4-吡啶]嘧啶-4-胺的合成:40mL微波管,在氮气气氛下,放入(R)-N-(2-氟-2-甲基丙基)-6-(3-甲基吗啉代)-2-((甲硫基)嘧啶-4-胺(150mg,1当量),4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼烷-2-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶(174.84mg,1.5当量),Pd(PPh3)4(110.40mg,0.2当量),CuMeSal(307.69mg,3.0当量),1,4-二氧六环(10mL)。将所得溶液在110℃下搅拌1小时。粗产物通过制备型HPLC纯化。得到41mg N-[((3,3-二氟环丁基)甲基]-6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]-2-[1H-吡咯并[2,3-b]-4-吡啶]嘧啶-4-胺为白色固体。LC-MS-BLV-CY-246-0:(ES,m/z):385[M+H]++H-NMR-BLV-CY-246-0:(300MHz,CD3OD,ppm):δ8.29(d,J=5.1Hz,1H),7.51-7.47(m,2H),6.89(d,J=3.5Hz,1H),6.52(s,1H),4.56-4.45(m,1H),4.12(d,J=13.4Hz,1H),4.01(dd,J=11.5Hz,3.8Hz,1H),3.82(d,J=11.5Hz,1H),3.78-3.70(m,2H),3.70-3.53(m,2H),3.27(dd,J=12.8Hz,3.9Hz,1H),1.45(s,3H),1.38(s,3H),1.34(d,J=6.8Hz,3H)。
实施例CY-247:N-乙基-6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]-2-[1H-吡咯并[2,3-b]-4-吡啶]嘧啶-4-胺的制备
N-乙基-6-[[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]-2-(甲基硫烷基)嘧啶-4-胺的合成:在40mL反应瓶中放入(3R)-4-[6-氯-2-(甲基硫烷基)-4-嘧啶]-3-甲基吗啉(1g,3.850mmol,1当量),乙胺盐酸盐(0.94g,3.0当量),DIEA(1g,2.0当量),i-PrOH(10毫升)。将所得溶液在110℃下搅拌2天。通过Flash-Prep-HPLC纯化粗产物(纯化条件:在10分钟内将0.1%HCOOH:MeCN=40%增加到0.1%HCOOH:MeCN=55%。得到380mg黄色油状的N-乙基-6-[((3R)-3-甲基吗啉-4-基]-2-(甲基硫烷基)嘧啶-4-胺。LC-MS-BLV-CY-247-1:(ES,m/z):269[M+H]+1H-NMR-BLV-CY-247-1:(300MHz,CDCl3,ppm):δ5.07(s,1H),4.61(brs,1H),4.33-4.23(m,1H),4.03-3.88(m,2H),3.80-3.68(m,2H),3.57(td,J=12.3Hz,3.0Hz,1H),3.30-3.15(m,3H),2.48(s,3H),1.31-1.20(m,6H))。
N-乙基-6-[((3R)-3-甲基吗啉-4-基]-2-[1H-吡咯并[2,3-b]-4-吡啶]嘧啶-4-胺的合成:40mL微波管,在氮气气氛下,放置N-乙基-6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]-2-(甲基硫烷基)嘧啶-4-胺(200mg,0.745mmol,1equiv),4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼烷-2-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶(272.86mg,1.118mmol,1.5当量),Pd(PPh3)4(172.23mg,0.149mmol,0.2当量),CuMeSal(479.99mg,2.236mmol,3.0当量),1,4-二氧六环(10mL)。将所得溶液在110℃下搅拌1小时。粗产物通过制备型HPLC纯化,得到30mg(12.0%)N-乙基-6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]-2-[1H-吡咯并[2,3-b]-4-吡啶]嘧啶-4-胺,为白色固体。LC-MS-BLV-CY-247-0:(ES,m/z):339[M+H]+1H-NMR-BLV-CY-247-0:(300MHz,CD3OD,ppm):δ8.25(d,J=5.2Hz,1H),7.96(d,J=5.2Hz,1H),7.45(d,J=3.5Hz,1H),7.32(d,J=3.5Hz,1H),5.60(s,1H),4.53(brs,1H),4.07-3.98(m,2H),3.87-3.73(m,2H)),3.67-3.55(m,1H),3.50-3.42(m,2H),3.29-3.23(m,1H),1.37-1.23(m,6H)。
实施例CY-248:N-(环丙基甲基)-6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]-2-[1H-吡咯并[2,3-b]-4-吡啶]嘧啶-4-胺的制备
N-(环丙基甲基)-6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]-2-(甲基硫烷基)嘧啶-4-胺的合成:在40mL反应瓶中,放入(3R)-4-[6-氯-2-(甲基硫烷基)嘧啶-4-基]-3-甲基吗啉(1g,3.850mmol,1当量),氨甲基环丙烷(0.82g,3.0当量),DIEA(1g,2.0当量),i-PrOH(10毫升)。将所得溶液在110℃下搅拌2天。通过Flash-Prep-HPLC纯化粗产物(纯化条件:在10分钟内将0.1%HCOOH:MeCN=40%增加到0.1%HCOOH:MeCN=55%。得到240mg N-(环丙基甲基)-6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]-2-(甲基硫烷基)嘧啶-4-胺,为黄色油。LC-MS-BLV-CY-248-1:(ES,m/z):295[M+H]+
N-(环丙基甲基)-6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]-2-[1H-吡咯并[2,3-b]-4-吡啶]嘧啶-4-胺的合成:40mL反应瓶,在氮气气氛下,放置N-(环丙基甲基)-6-[[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]-2-(甲基硫烷基)嘧啶-4-胺(200mg,0.679mmol,1equiv),4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼烷-2-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶(248.73mg,1.019mmol,1.5当量),Pd(PPh3)4(156.99mg,0.136mmol,0.2当量),CuMeSal(437.54mg,2.038mmol,3.00当量),1,4-二氧六环(10mL)。将所得溶液在110℃下搅拌1小时。粗产物通过制备型HPLC纯化。得到24mg(10%)N-(环丙基甲基)-6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]-2-[1H-吡咯并[2,3-b]-4-吡啶]嘧啶-4-胺,为白色固体。
LC-MS-BLV-CY-248-0:(ES,m/z):365[M+H]+1H-NMR-BLV-CY-248-0:(300MHz,CD3OD,ppm):8.26(d,J=4.9Hz,1H),7.96(d,J=5.2Hz,1H),7.46(d,J=3.6Hz,1H),7.32(d,J=3.6Hz,1H),5.63(s,1H),4.95-4.91(m,1H),4.53(brs,1H),4.02(d,J=12.5Hz,2H),3.89-3.73(m,2H),3.67-3.54(m,1H),3.29-3.22(m,2H),1.32(d,J=6.9Hz,3H),1.17(s,1H),0.62-0.52(m,2H),0.35-0.29(m,2H)。
实施例CY-249:N-[(3,3-二氟环丁基)甲基]-6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]-2-[1H-吡咯并[2,3-b]-4-吡啶]-4-嘧啶胺的制备
N-[(3,3-二氟环丁基)甲基]-6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]-2-(甲基硫烷基)嘧啶-4-胺的合成:在40mL反应瓶中,放置(3R)-4-[6-氯-2-(甲基硫烷基)-4-嘧啶]-3-甲基吗啉(1g,3.850mmol,1当量),1-(3,3-二氟环丁基)甲胺(0.51g,4.235mmol,1.1当量),Cs2CO3(2.51g,7.700mmol,2.0当量),i-PrOH(10mL)。将所得溶液在110℃下搅拌过夜。粗产物通过Flash-Prep-HPLC纯化(纯化条件:在9分钟内将0.1%NH 3.H2O:MeCN=50%增加到0.1%NH3.H2O:MeCN=68%。得到180mg(13.57%)N-[((3,3-二氟环丁基)甲基]-6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]-2-(甲基硫烷基)嘧啶-4-胺棕色油。
LC-MS-BLV-CY-249-1:(ES,m/z):345[M+H]+
N-[(3,3-二氟环丁基)甲基]-6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]-2-[1H-吡咯并[2,3-b]-4-吡啶]嘧啶-4-胺的合成:40mL微波管,在氮气氛围下,放入N-[(3,3-二氟环丁基)甲基]-6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]-2-(甲基硫烷基)嘧啶-4-胺(150mg,0.436mmol,1当量),4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼烷-2-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶(159.46mg,0.653mmol,1.5当量),Pd(PPh3)4(100.65mg,0.087mmol,0.2当量),CuMeSal(280.52mg,1.307mmol,3.0当量),1,4-二氧六环(10毫升)。将所得溶液在110℃下搅拌1小时。粗产物通过制备型HPLC纯化。得到16mg(8.91%)N-[(3,3-二氟环丁基)甲基]-6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]-2-[1H-吡咯并[2,3-b]-4-吡啶]嘧啶-4-胺,为白色固体。LC-MS-BLV-CY-249-0:(ES,m/z):415[M+H]+1H-NMR-BLV-CY-249-0:(300MHz,CD3OD,ppm):δ8.26(d,J=5.2Hz,1H),8.00(d,J=5.2Hz,1H),7.46(d,J=3.5Hz,1H),7.33(d,J=3.5Hz,1H),5.64(s,1H),4.52(brs,1H),4.08-3.97(m,2H),3.89-3.74(m,2H)),3.69-3.55(m,3H),3.27(dd,J=12.5Hz,3.9Hz,1H),2.78-2.30(m,5H),1.33(d,J=6.7Hz,3H)。
实施例CY-250:N-环丙基-6-[((3R)-3-甲基吗啉-4-基]-2-[1H-吡咯并[2,3-b]-4-吡啶]嘧啶-4-胺的制备
N-环丙基-6-[[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]-2-(甲基硫烷基)嘧啶-4-胺的合成:在40mL反应瓶中,放入(3R)-4-[6-氯-2-(甲基硫烷基)嘧啶-4-基]-3-甲基吗啉(1g,3.850mmol,1当量),环丙胺(0.66g,11.550mmol,3.0当量),DIEA(1g,2.0当量),i-PrOH(10毫升)。将所得溶液在110℃下搅拌2天。通过Flash-Prep-HPLC纯化粗产物(纯化条件:在10分钟内将0.1%HCOOH:MeCN=40%增加到0.1%HCOOH:MeCN=55%)。得到130mg黄色油状的N-环丙基-6-[((3R)-3-甲基吗啉-4-基]-2-(甲基硫烷基)嘧啶-4-胺。LC-MS-BLV-CY-250-1:(ES,m/z):281[M+H]+1H-NMR-BLV-CY-250-1:(300MHz,CDCl3,ppm):δ5.49(s,1H),5.13(s,1H),4.42-4.28(m,1H),3.98(td,J=12.9,3.5Hz,2H),3.84-3.69(m,2H),3.60(td,J=11.8Hz,3.2Hz,1H),3.24(td,J=12.9,4.0Hz,1H),2.51-2.43(m,4H),1.30(d,J=6.7Hz,3H),0.84-0.75(m,2H),0.62-0.53(m,2H)。
N-环丙基-6-[((3R)-3-甲基吗啉-4-基]-2-[1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基]嘧啶-4-胺的合成:8mL微波管,在氮气气氛下,将N-环丙基-6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]-2-(甲基硫烷基)嘧啶-4-胺(100mg,0.357mmol,1equiv),4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼烷-2-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶(130.59mg,0.535mmol,1.5当量),Pd(PPh3)4(82.43mg,0.071mmol,0.2当量),CuMeSal(229.72mg,1.070mmol,3.0当量),1,4-二氧六环(4mL)。将所得溶液在110℃下搅拌1小时。粗产物通过制备型HPLC纯化。得到6mg(4.8%)N-环丙基-6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]-2-[1H-吡咯并[2,3-b]-4-吡啶]嘧啶-4-胺为白色固体。LC-MS-BLV-CY-250-0:(ES,m/z):351[M+H]+1H-NMR-BLV-CY-250-0:(300MHz,CD3OD,ppm):δ8.25(d,J=5.1Hz,1H),7.92(d,J=5.2Hz,1H),7.46(d,J=3.5Hz,1H),7.33(d,J=3.5Hz,1H),5.87(s,1H),4.58(brs,1H),4.07(t,J=12.5Hz,2H),3.88-3.80(m,2H),3.65(td,J=11.8,3.2Hz,1H),3.38-3.35(m,1H),2.67-2.60(m,1H),1.36(d,J=6.7Hz,3H),0.89-0.83(m,2H),0.64-0.59(m,2H)。
实施例CY-251:N-(3,3-二氟环丁基)-6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]-2-[1H-吡咯并[2,3-b]-4-吡啶]嘧啶-4-胺的制备
N-(3,3-二氟环丁基)-6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]-2-(甲基硫烷基)嘧啶-4-胺的合成:在100mL圆底烧瓶中,吹扫并保持在惰性氮气气氛下,放置(3R)-4-[6-氯-2-(甲基硫烷基)嘧啶-4-基]-3-甲基吗啉(1g,3.850mmol,1当量),3,3-二氟环-1-胺(0.62g,5.775mmol,1.5当量),Pd(OAc)2(86.43mg,0.385mmol,0.10当量),XantPhos(0.45g,0.770mmol,0.2当量),Cs2CO3(2.51g,7.700mmol,2.0当量),1,4-二氧六环(20mL)。将所得溶液在90℃下搅拌4小时。冷却后滤出固体。浓缩滤液。将残余物用硅胶柱在乙酸乙酯/石油醚(20:80)条件下纯化。得到240mg(18.87%)的N-(3,3-二氟环丁基)-6-[((3R)-3-甲基吗啉-4-基]-2-(甲基硫烷基)嘧啶-4-胺)为棕色固体。LC-MS-BLV-CY-251-1:(ES,m/z):331[M+H]+
N-(3,3-二氟环丁基)-6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]-2-[1H-吡咯并[2,3-b]-4-吡啶]嘧啶-4-胺的合成:40mL微波管在氮气氛围下,放入N-(3,3-二氟环丁基)-6-[((3R)-3-甲基吗啉-4-基]-2-(甲基硫烷基))嘧啶-4-胺(150mg,0.454mmol,1当量),4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼烷-2-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶(166.23mg,0.681mmol,1.50当量),Pd(PPh3)4(104.92mg,0.091mmol,0.2当量),CuMeSal(292.42mg,1.362mmol,3.0当量),1,4-二氧六环(10mL)。将所得溶液在110℃下搅拌1小时。得到7mg(3.85%)的N-(3,3-二氟环丁基)-6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]-2-[1H-吡咯并[2,3-b]-4-吡啶]嘧啶-4-胺,为白色固体。LC-MS-BLV-CY-251-0:(ES,m/z):401[M+H]+1H-NMR-BLV-CY-251-0:(300MHz,CD3OD,ppm):δ8.27(s,1H),8.00(d,J=5.1Hz,1H),7.48(d,J=3.5Hz,1H),7.33(d,J=3.4Hz,1H),5.63(s,1H),4.54(brs,1H),4.39(brs,1H),4.04(dd,J=10.9,3.4Hz,2H),3.92-3.72(m,2H),3.70-3.57(m,1H),3.27(dd,J=12.4,3.7Hz,1H),3.17-3.01(m,2H),2.71-2.50(m,2H),1.33(d,J=6.8Hz,3H)。
实施例CY-252:(3R)-4-[6-(3,3-二氟吡咯烷-1-基)-2-[1H-吡咯并[2,3-b]-4-吡啶]-4-嘧啶]-3-甲基吗啉的制备
(3R)-4-[6-(3,3-二氟吡咯烷-1-基)-2-(甲基硫烷基)-4-嘧啶]-3-甲基吗啉的合成:在50mL圆底烧瓶中,放置(3R)-4-[6-氯-2-(甲基硫烷基)-4-嘧啶]-3-甲基吗啉(800mg,3.080mmol,1当量),3,3-二氟吡咯烷盐酸盐(884.30mg,6.160mmol,2.0当量),DIEA(1194.16mg,9.240mmol,3.0当量),i-PrOH(15mL)。将所得溶液在100℃下搅拌2天。粗产物通过Flash-Prep-HPLC纯化(纯化条件:在8分钟内将0.1%HCOOH:MeCN=40%增加到0.1%HCOOH:MeCN=55%)。得到300mg(29.48%)的(3R)-4-[6-(3,3-二氟吡咯烷-1-基)-2-(甲基硫烷基)-4-嘧啶]-3-甲基吗啉,为黄色油。
LC-MS-BLV-CY-252-1:(ES,m/z):331[M+H]+1H-NMR-BLV-CY-252-1:(300MHz,CDCl3,ppm):δ5.00(s,1H),4.35-4.25(m,1H),3.99-3.67(m,8H),3.57(td,J=11.8Hz,3.1Hz,1H),3.21(td,J=12.7Hz,3.9Hz,1H),2.53-2.39(m,5H),1.27(d,J=6.6Hz,3H)。
(3R)-4-[6-(3,3-二氟吡咯烷-1-基)-2-[1H-吡咯并[2,3-b]-4-吡啶]-4-嘧啶]-3-甲基吗啉的合成:在40mL单口烧瓶中,在氮气保护下。放入(3R)-4-[6-(3,3-二氟吡咯烷-1-基)-2-(甲基硫烷基)-4-嘧啶]-3-甲基吗啉(200mg,0.605mmol,1当量),4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼烷-2-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶(221.64mg,0.908mmol,1.50当量),Pd(PPh3)4(139.90mg,0.121mmol,0.2当量),CuMeSal(389.89mg,1.816mmol,3.0当量),1,4-二氧六环(10mL)。将所得溶液在110℃下搅拌1小时。粗产物通过制备型HPLC纯化。得到38mg(15.7%)(3R)-4-[6-(3,3-二氟吡咯烷-1-基)-2-[1H-吡咯并[2,3-b]-4-吡啶]-4-嘧啶]-3-甲基吗啉为白色固体。
LC-MS-BLV-CY-252-0:(ES,m/z):401[M+H]+1H-NMR-BLV-CY-252-0:(300MHz,d6-DMSO,ppm):δ11.70(s,1H),8.29(d,J=5.0Hz,1H),7.97(d,J=5.0Hz,1H),7.54(d,J=3.4Hz,1H),7.24(d,J=3.4Hz,1H),5.68(s,1H),4.55(brs,1H),4.13-3.91(m,4H),3.85-3.73(m,3H),3.65(dd,J=11.8,3.0Hz,1H),3.51(td,J=13.2,2.4Hz,1H),3.18(td,J=12.9,3.9Hz,1H),2.63-2.55(m,2H),1.22(d,J=6.7Hz,3H)。
实施例CY-253:(3R)-3-甲基-4-[6-(吗啉-4-基)-2-[1H-吡咯并[2,3-b]-4-吡啶]-4-嘧啶]吗啉的制备
(3R)-3-甲基-4-[2-(甲基硫烷基)-6-(吗啉-4-基)-4-嘧啶]吗啉的合成:将在40mL单口烧瓶中,放入(3R)-4-[6-氯-2-(甲基硫烷基)-4-嘧啶]-3-甲基吗啉(500mg,1.925mmol,1当量),吗啉(184.47mg,2.117mmol,1.1当量),DIEA(746.35mg,5.775mmol,3.0当量),i-PrOH(10mL)。将所得溶液在90℃下搅拌2天。粗产物通过Flash-Prep-HPLC纯化(分离条件:8分钟内将0.1%HCOOH:MeCN=40%增加到0.1%HCOOH:MeCN=55%)。得到200mg(33.4%)棕色油状的(3R)-3-甲基-4-[2-(甲基硫烷基)-6-(吗啉-4-基)-4-嘧啶]吗啉。LC-MS-BLV-CY-232-1:(ES,m/z):311[M+H]+
(3R)-3-甲基-4-[6-(吗啉-4-基)-2-[1H-吡咯并[2,3-b]-4-吡啶]-4-嘧啶]吗啉的合成:40mL单口圆底烧瓶,在氮气保护下,加入(3R)-3-甲基-4-[2-(甲基硫烷基)-6-(吗啉-4-基)-4-嘧啶]吗啉(200mg,0.644mmol,1当量),4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼烷-2-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶(235.91mg,0.966mmol,1.5当量),Pd(PPh3)4(74.45mg,0.064mmol,0.1当量),CuMeSal(276.66mg,1.289mmol,2.0当量),1,4二氧六环(10mL)。将所得溶液在100℃下搅拌1小时,冷却,浓缩。粗产物通过制备型HPLC纯化。得到20mg(8.2%)的(3R)-3-甲基-4-[6-(吗啉-4-基)-2-[1H-吡咯并[2,3-b]-4-吡啶]-4-嘧啶]吗啉,为白色固体。LC-MS-BLV-CY-253-0:(ES,m/z):381[M+H]+1H-NMR-BLV-CY-253-0:(300MHz,CD3OD,ppm):δ8.59(brs,1H),8.27(s,1H),8.02(d,J=5.1Hz,1H),7.47(d,J=3.5Hz,1H),7.29(d,J=3.4Hz,1H),5.85(s,1H),4.69-4.57(m,1H),4.16-4.00(m,2H),3.90-3.75(m,6H),3.75-3.58(m,5H),3.31-3.24(m,1H),1.34(d,J=6.8Hz,3H)。
实施例CY-254:(3R)-3-甲基-4-[6-(4-甲基哌嗪-1-基)-2-[1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基]-4-嘧啶]吗啉的制备
(3R)-3-甲基-4-[6-(4-甲基哌嗪-1-基)-2-(甲基硫烷基)-4-嘧啶]吗啉的合成:40mL单口圆底烧瓶中,放入(3R)-4-[6-氯-2-(甲基硫烷基)-4-嘧啶]-3-甲基吗啉(500mg,1.925mmol,1当量),1-甲基哌嗪(212.09mg,2.117mmol,1.1当量),DIEA(746.35mg,5.775mmol,3.0当量),i-PrOH(10mL)。将所得溶液在90℃下搅拌2天。通过Flash-Prep-HPLC纯化粗产物(条件:C18硅胶柱,流动相:8分钟内将0.1%HCOOH:MeCN=40%增加至0.1%HCOOH:MeCN=55%,检测器254nm和220nm)。得到370mg(59.42%)棕色油状的(3R)-3-甲基-4-[6-(4-甲基哌嗪-1-基)-2-(甲基硫烷基)-4-嘧啶]吗啉。
LC-MS-BLV-CY-254-1:(ES,m/z):324[M+H]+1H-NMR-BLV-CY-254-1:(300MHz,CDCl3,ppm):δ5.25(s,1H),4.38-4.26(m,1H),3.98(dd,J=11.1,3.6Hz,1H),3.89(dd,J=13.2,3.0Hz,1H),3.79-3.69(m,2H),3.62-3.52(m,5H),3.20(td,J=12.7,3.9Hz,1H),2.49-2.46(m,7H),2.35(s,3H),1.26(d,J=6.7Hz,3H)。
(3R)-3-甲基-4-[6-(4-甲基哌嗪-1-基)-2-[1H-吡咯并[2,3-b]-4-吡啶]-4-嘧啶]吗啉的合成:50mL单口瓶,在氮气保护下,放入(3R)-3-甲基-4-[6-(4-甲基哌嗪-1-基)-2-(甲基硫烷基)-4-嘧啶]吗啉(200mg,0.618mmol,1当量),4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼硼烷-2-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶(226.40mg,0.927mmol,1.5当量),Pd(PPh3)4(71.45mg,0.062mmol,0.1当量),CuMeSal(265.50mg,1.237mmol,2.0当量),1,4二氧六环(10mL)。将所得溶液在100℃下搅拌1小时。粗产物通过制备型HPLC纯化。得到6mg(2.48%)(3R)-3-甲基-4-[6-(4-甲基哌嗪-1-基)-2-[1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4]酰基]-4-嘧啶吗啉为白色固体。
LC-MS-BLV-CY-254-0:(ES,m/z):394[M+H]+1H-NMR-BLV-CY-254-0:(300MHz,d6-DMSO,ppm)δ11.70(s,1H),8.28(d,J=5.0Hz,1H),7.92(d,J=5.0Hz,1H),7.54(s,1H),7.15(d,J=3.3Hz,1H),5.92(s,1H),4.59(brs,1H),4.07(d,J=12.9Hz,1H),3.96(d,J=11.5Hz,1H),3.78-3.75(m,1H),3.69-3.63(m,5H),3.54-3.45(m,1H),3.16(td,J=12.4,3.6Hz,1H),2.43-3.40(m,4H),2.23(s,3H),1.21(d,J=6.6Hz,3H)。
实施例CY-257-0:2-[2-氯-6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]-4-嘧啶]-1,1,1-三氟丙烷-2-醇的制备
1-(2,6-二氯嘧啶-4-基)乙-1-酮的合成:在250mL三颈圆底烧瓶中,氮气保护下,放入2,6-甲基二氯嘧啶-4-羧酸盐(5g,24.153mmol,1当量),THF(120mL)。随后在-78℃搅拌下逐滴加入CH3MgBr(3M)(13mL,39.0mmol,1.61当量)。将所得溶液在-78℃的液氮浴中搅拌1.5小时。然后通过加入低于0℃的40mL盐水淬灭反应。所得溶液用140mL H2O稀释。用150mL乙酸乙酯萃取两次,合并有机层并浓缩。粗产品用硅胶柱在乙酸乙酯/石油醚(1/30)下纯化。得到3.9g(84.53%)的1-(2,6-二氯嘧啶-4-基)乙-1-酮黄色油。1H-NMR-BLV-CY-230-4:(300MHz,CDCl3,ppm):δ7.85(s,1H),2.70(s,3H)。
1-[2-氯-6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]-4-嘧啶]乙-1-酮的合成:在250mL 3颈圆底烧瓶中放置1-(2,6-二氯嘧啶-4-基)乙-1-酮(2.9g,15.182mmol,1当量),DCM(60mL),TEA(2.0g,19.765mmol,1.30当量)。随后在0℃搅拌下逐滴加入(3R)-3-甲基吗啉(1.7g,16.807mmol,1.11当量)。将所得溶液在室温搅拌2小时。将得到的混合物浓缩。粗产品用硅胶柱在乙酸乙酯/石油醚(1/15-1/9)下纯化。得到1.58g(40.70%)的浅黄色固体的1-[2-氯-6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]-4-嘧啶]乙-1-酮。LC-MS-BLV-CY-230-6:(ES,m/z):256[M+H]+1H-NMR-BLV-CY-230-6:(300MHz,CDCl3,ppm):δ7.00(s,1H),4.33(brs,1H),4.13-4.09(m,1H),4.05-4.00(m,1H),3.80(d,J=11.7Hz,1H),3.69(dd,J=11.4,3.0Hz,1H),3.54(td,J=12.3,3.0Hz,1H),3.32(td,J=12.9,3.0Hz,1H),2.63(s,3H),1.35(d,J=6.9Hz,3H)。
2-[2-氯-6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]嘧啶-4-基]-1,1,1-三氟丙烷-2-醇的合成:在100mL 3-颈圆底烧瓶中加入1-[2-氯-6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]嘧啶-4-基]乙-1-酮(1.58g,6.179mmol,1当量),THF(20mL,246.860mmol,39.95当量)。随后在0℃搅拌下逐滴加入TMSCF3(4.4g,30.943mmol,5.01当量)。然后在0℃下向其中加入TBAF(16mg,0.061mmol,0.01当量)和CsF(188mg,1.238mmol,0.20当量)。将所得溶液在室温搅拌6小时。向其中加入TBAF(0.81g,3.098mmol,0.50当量)。将所得溶液在室温搅拌15小时。然后通过加入100mL冰水淬灭反应。分别用100mL乙酸乙酯萃取两次,合并有机层并浓缩。粗产物通过Flash-Prep-HPLC在以下条件下纯化(IntelFlash-1):C18硅胶柱。流动相,CH3CN/0.05%HCOOH=60%增加至CH3CN/0.05%HCOOH=70%;检测器为254nm和220nm。得到1.7g(84.47%)的2-[2-氯-6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]嘧啶-4-基]-1,1,1-三氟丙烷-2-醇为黄色固体。LC-MS-BLV-CY-230-7:(ES,m/z):326[M+H]+1H-NMR-BLV-CY-230-7:(300MHz,CDCl3,ppm):δ6.46(s,1H),5.38(d,J=4.5Hz,1H),4.36(brs,1H),4.05(dd,J=11.4,3.6Hz,2H),3.83(d,J=12.6Hz,1H),3.73(dd,J=11.7,3.3Hz,1H),3.59(td,J=11.7,3.0Hz,1H)),3.35(td,J=13.2,3.9Hz,1H),1.68(s,3H),1.37(dd,J=6.9,4.5Hz,3H)。
1,1,1-三氟-2-[6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]-2-[1H-吡咯并[2,3-b]-4-吡啶]-4-嘧啶]丙烷-2-醇的合成:20mL微波管中,放入2-[2-氯-6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]嘧啶-4-基]-1,1,1-三氟丙烷-2-醇(100mg,0.307mmol,1当量),DME(4mL),4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼烷-2-yl)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶(113mg,0.463mmol,1.51当量),Pd(dppf)Cl2(23mg,0.031mmol,0.10当量),K2CO3(85mg,0.615mmol,2.00当量),水(0.4毫升)。最终反应混合物在100℃下用微波反应器加热40分钟。粗产物通过Flash-Prep-HPLC在以下条件下纯化(IntelFlash-1):C18硅胶柱;流动相,CH3CN/0.05%NH3.H2O=45%增至CH3CN/0.05%NH3.H2O=55%;检测器为254nm和220nm,得到40mg(31.98%)1,1,1-三氟-2-[6-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]-2-[1H-吡咯并[2,3-b]-4-吡啶]-4-嘧啶]丙-2-醇为浅黄色固体。LC-MS-BLV-CY-257-0:(ES,m/z):408[M+H]+1H-NMR-BLV-CY-257-0:(300MHz,CD3OD,ppm):δ8.31(d,J=5.1Hz,1H),8.10(d,J=5.1Hz,1H),7.51(d,J=3.6Hz,1H),7.36(d,J=3.6Hz,1H),7.08(d,J=1.5Hz,1H),4.66(brs,1H),4.26(d,J=11.4Hz,1H),4.09(dd,J=11.4,3.9Hz,1H),3.89(d,J=11.7Hz,1H),3.80(dd,J=11.4,2.7Hz,1H),3.66(t,J=11.1Hz,1H),3.44(td,J=12.0,2.1Hz,1H),1.84(s,3H),1.40(d,J=6.6Hz,3H)。
实施例A:以下化合物通过与通用方案和以上实施例中公开的基本相同或相似的方法制备得到。
Figure GDA0002617172920001001
Figure GDA0002617172920001011
生物实施例1:ATR酶学活性测试
用于体外酶法测定的ATR从HeLa核提取物(CIL Biotech,比利时蒙斯)中通过兔多克隆抗血清升至ATR的第400-480位氨基酸进行免疫沉淀而获得(Tibbetts RS等,1999,1999,Genes Dev.13:152-157)并包含在以下缓冲液中(25mM HEPES(pH7.4),2mM MgCl2、250mM NaCl,0.5mM EDTA,0.1mM Na3VO4、10%v/v甘油和0.01%v/v吐温中20)。通过与蛋白A-琼脂糖珠(Sigma,#P3476)孵育1小时,然后离心以回收珠子,从核提取物中分离出ATR抗体复合物。在96孔板的孔中,将10个含ATR的琼脂糖珠与1μg底物谷胱甘肽S-转移酶-p53N66孵育(在大肠杆菌中表达与谷胱甘肽β-转移酶融合的p53的NH2-末端66个氨基酸)。在37℃的ATR分析缓冲液(50mM HEPES(pH 7.4),150mM NaCl,6mM MgCl2、4mM MnCl2、0.1mMNa3VO4、0.1mM DTT和10%(v/v)甘油)中,在轻轻摇动10分钟后,添加ATP至终浓度为3μM,并且反应在37℃下继续另外1小时。通过添加100μLPBS终止反应,并将反应转移至白色不透明谷胱甘肽包被的96孔板(NUNC#436033)中,并在4℃下孵育过夜。然后将该板用PBS/0.05%(v/v)Tween 20洗涤,吸干,然后用磷酸丝氨酸15p53(16G78)抗体通过标准ELISA(酶联免疫吸附测定)技术进行分析(Cell Signaling)技术,#9286)。磷酸化谷胱甘肽S-转移酶-pSSNee底物的检测与山羊抗小鼠辣根过氧化物酶结合的二抗(Pierce,#31430)结合进行。使用增强型化学发光溶液(NEN,波士顿,马萨诸塞州)产生信号,并通过TopCount(Packard,Meriden,CT)读板器进行化学发光检测。然后将所得的计算出的酶活性百分比(ActivityBase,IDBS)用于确定化合物的IC 50值(IC 50被视为抑制50%酶活性的浓度)。
下表列出了本发明某些化合物的IC 50值。
化合物 ATR IC50
AZD-6738 <3nM
CY-200-1 <3nM
CY-209 <3nM
CY-212 <3nM
CY-237 <3nM
CY-249 <3nM
CY-257 <3nM
生物学实例2:ATR细胞水平活性分析
ATM和ATR对DNA损伤有不同的重叠反应。他们必须共同参与和协调对DNA损伤的反应。ATM和ATR都可以通过电离辐射被激活,但是只有ATR被紫外线激活。由于在高通量细胞分析中不可行进行紫外线处理,因此选择了紫外线模拟物4NQ0(Sigma)来激活ATR DNA损伤反应途径。Chkl是ATR的下游蛋白激酶,在DNA损伤检查点控制中起关键作用。Chkl的激活涉及Ser317和Ser345的磷酸化(被视为ATR磷酸化/激活的优先靶标)。该测定法测量用化合物和UV模拟物4NQ0处理后,HT29结肠腺癌细胞中Chk1(Ser 345)磷酸化的减少。通过用100%DMSO稀释,然后使用Labcyte Echo Acoustic点胶仪器进一步将其加入测定介质(EMEM,10%FCS,1%谷氨酰胺)中来确定化合物的剂量范围。将细胞以每毫升9x 10 4个细胞在40μLEMEM,10%FCS,1%谷氨酰胺中的384个孔Costar平板中铺板,并生长24小时。加入化合物后,将细胞孵育60分钟。然后使用Labcyte Echo加入终浓度为3μM的4NQ0(在100%DMSO中制备),并将细胞再温育60分钟。然后通过添加40μL3.7%v/v甲醛溶液20分钟来固定细胞。除去固定物后,将细胞用PBS洗涤并在40μL的含0.1%Triton TM X-100的PBS中透化。然后洗涤细胞,并加入15μl一抗溶液(pChkl Ser345),并将板在4℃下孵育过夜。然后洗去第一抗体,并在室温下将20μl第二抗体溶液(山羊抗兔Alexa Fluor 488,Invitrogen)和1μMHoechst 33258(Invitrogen)加入90分钟。洗涤板,并留在40μlPBS中。然后在ArrayScanVti仪器上读取板,以确定染色强度,并获得剂量响应,并用于确定化合物的IC50值。
生物学实例3:ATM缺失的结直肠癌LoVo细胞系中的体外抗增殖测定
细胞抗增殖通过PerkinElmer ATPliteTM发光测定系统进行测定。简而言之,将各种测试癌细胞系以每孔约1×104个细胞的密度接种在Costar 96孔板中,并在添加5%FBS的培养基中与不同浓度的化合物孵育约72小时。然后通过加入5mL底物缓冲溶液来重构一个冻干的底物溶液小瓶,并轻轻搅拌直至溶液均匀。将约50μL哺乳动物细胞裂解液添加到微孔板每孔的100μL细胞悬液中,并将该板在定轨振荡器中以
Figure GDA0002617172920001031
700rpm摇动约五分钟。该程序用于裂解细胞并稳定ATP。接下来,将50μL底物溶液添加至孔中,并将微孔板在定轨振荡器中以
Figure GDA0002617172920001032
700rpm的速度振荡5分钟。最后,通过PerkinElmer TopCount?Microplate闪烁计数器测量发光度。用一定剂量范围的测试化合物进行的此类测定使得可以测定本发明化合物的细胞抗增殖IC50。下表列出了本发明的某些化合物的几种癌细胞系(5%FBS)的IC 50值。
化合物 LoVo IC50
AZD-6738 0.80uM
CY-237 0.48uM
CY-249 0.51uM
CY-257 0.83uM
生物学实例4:小鼠PK研究
通过静脉和口服给药,在CD-1小鼠中评估了化合物的药代动力学。静脉给药是在颈静脉缓慢推注,口服给药是通过管饲法给药。静脉内给药的配方是在20%HPBCD水中的5%DMSO,PO配方是2.5%DMSO,10%EtOH,20%Cremphor EL,67.5%D5W。静脉注射臂的PK时间点是给药后5、15、30分钟,1、2、4、6、8、12、24小时,而口服给药臂的PK时间点是15、30分钟,1、2、4、6给药后8、12、24小时。在每个时间点收集大约0.03mL血液。将每个样品的血液转移到装有EDTA-K2的塑料微型离心管中,并在4℃离心机中以4000g离心5分钟,在15分钟内收集血浆。血浆样品储存在聚丙烯管中。在分析之前,将样品存储在-75±15℃的冰箱中。使用LC-MS/MS方法分析血浆样品中化合物的浓度。WinNonlin(PhoenixTM,版本6.1)或其他类似软件用于药代动力学计算。在任何可能的情况下,均根据血浆浓度与时间的数据计算以下药代动力学参数:静脉内给药:C0,CL,Vd,T1/2,AUCinf,AUClast,MRT,回归点数;PO给药:Cmax,Tmax,T1/2,AUCinf,AUClast,F%,回归点数。使用描述性统计数据(例如平均值,标准差)描述了药代动力学数据。另外的药代动力学或统计学分析由贡献科学家酌情进行,并记录在数据摘要中。口服口服10mg/kg的AUClast示于下表。
化合物 AUC<sub>last</sub>(h*ng/mL)
AZD-6738 3,100
CY-237 4,392

Claims (5)

1.一种式(I)的化合物或其N-氧化物,或所述式(I)化合物或其N-氧化物的药学上可接受的盐,溶剂化物,多晶型物,互变异构体,立体异构体,同位素形式或前药:
Figure FDA0002480458800000011
其中
A为
Figure FDA0002480458800000012
R3和R4各自独立地为H,D,卤素,烷基或卤代烷基;R3和R4与它们所连接的原子一起形成环烷基或杂环烯基;
Z为H,D,OH,卤素,胺,氰基,C(O)OH,C(O)NH2,烷基,烯基,炔基,环烷基,环烯基,杂环烷基,杂环烯基,芳基或杂芳基,其中所述Z的烷基,环烷基,环烯基,杂环烷基,杂环烯基,芳基,杂芳基任选地被一个或多个Rd取代;
W为N或C(Ra);
R5,R6,R7,和R8各自独立地为H,D,烷基,烯基,炔基,环烷基,环烯基,杂环烷基,杂环烯基,芳基,杂芳基,卤素,硝基,氧代,氰基,ORa,SRa,烷基-Ra,NH(CH2)pRa,C(O)Ra,S(O)Ra,SO2Ra,C(O)ORa,OC(O)Ra,NRbRc,P(O)RbRc,烷基-P(O)RbRc,C(O)N(Rb)Rc,N(Rb)C(O)Rc,S(O)(=N(Rb))Rc,-N=S(O)RbRc,SO2N(Rb)Rc,或N(Rb)SO2Rc,其中所述环烷基,环烯基,杂环烷基,杂环烯基,芳基,杂芳基任选地被一个或多个Rd取代;
Ra,Rb,Rc和Rd独立地为H,D,烷基,烯基,炔基,卤素,氰基,胺,硝基,羟基,=O,C(O)NHOH,C(O)OH,C(O)NH2,烷氧基,烷氧基烷基,卤代烷基,羟烷基,氨基烷基,烷基羰基,烷氧基羰基,烷基羰基氨基,烷基氨基,氧代,卤代烷基氨基,环烷基,环烯基,杂环烷基,杂环烯基,芳基或杂芳基,其中所述烷基,环烷基,环烯基,杂环烷基,杂环烯基,芳基,杂芳基任选地被一个或多个Re取代;
Re是H,D,烷基,烯基,炔基,卤素,氰基,胺,硝基,羟基,=O,C(O)NHOH,烷氧基,烷氧基烷基,卤代烷基,羟烷基,氨基烷基,烷基羰基,烷氧基羰基,烷基羰基氨基,烷基氨基,氧代,卤代烷基氨基,环烷基,环烯基,杂环烷基,杂环烯基,芳基或杂芳基;
m和n分别为0、1、2或3。
2.根据权利要求1所述的化合物或其N-氧化物,或其药学上可接受的盐,溶剂化物,多晶型物,互变异构体,立体异构体,同位素形式或前药,其中所述化合物由式(II)表示
Figure FDA0002480458800000021
3.根据权利要求1所述的化合物或其N-氧化物,或其药学上可接受的盐,溶剂化物,多晶型物,互变异构体,立体异构体,同位素形式或前药,其中所述化合物为
(R)-2-甲基-2-(6-(3-甲基吗啉代)-2-(1H-吡咯并[2,3-b]-4-吡啶)嘧啶-4-基)丙腈,
(R)-4-(2-(1H-吡咯并[2,3-b]-4-吡啶)-6-(1,1,1-三氟-2-甲基丙烷-2-基)-4-嘧啶)-3-甲基吗啉,
1,1,1-三氟-2-(6-((R)-3-甲基吗啉)-2-(1H-吡咯并[2,3-b]-4-吡啶)-4-嘧啶)丙烷-2-醇,
(R)-2-(6-(3-甲基吗啉)-2-(1H-吡咯并[2,3-b]-4-吡啶)-4-嘧啶)丙-2-醇,
(R)-2-(6-(3-甲基吗啉)-2-(1H-吡咯并[2,3-b]-4-吡啶)-4-嘧啶)丙-2-胺,
(R)-N-(((3,3-二氟环丁基)甲基)-6-(3-甲基吗啉)-2-(1H-吡咯并[2,3-b]-4-吡啶)嘧啶-4-胺,
6-((R)-3-甲基吗啉)-2-(1H-吡咯并[2,3-b]-4-吡啶)-N-(((3-(S)-四氢呋喃)甲基)嘧啶-4-胺,
6-((R)-3-甲基吗啉)-2-(1H-吡咯并[2,3-b]-4-吡啶)-N-(((3-R-四氢呋喃)甲基)嘧啶-4-胺,
(R)-6-(3-甲基吗啉)-N-(3-甲基氧杂环丁基)-2-(1H-吡咯并[2,3-b]-4-吡啶)嘧啶-4-胺,
(R)-N-(((4,4-二氟环己基)甲基)-6-(3-甲基吗啉)-2-(1H-吡咯并[2,3-b]-4-吡啶)嘧啶-4-胺,
(R)-6-(3-甲基吗啉代)-2-(1H-吡咯并[2,3-b]-4-吡啶)-N-(((四氢-2H-吡喃-4-基)甲基)嘧啶-4-胺,
(R)-N-乙基-6-(3-甲基吗啉)-2-(1H-吡咯并[2,3-b]-4-吡啶)嘧啶-4-胺,
(R)-N-(2-氟-2-甲基丙基)-6-(3-甲基吗啉)-2-(1H-吡咯并[2,3-b]-4-吡啶)嘧啶-4-胺,
(R)-N-(3,3-二氟环丁基)-6-(3-甲基吗啉)-2-(1H-吡咯并[2,3-b]-4-吡啶)嘧啶-4-胺,
(R)-N-(环丙基甲基)-6-(3-甲基吗啉)-2-(1H-吡咯并[2,3-b]-4-吡啶)嘧啶-4-胺。
4.一种药物组合物,其包含权利要求1所定义的式(I)的化合物或其N-氧化物,或所述式(I)的化合物或其N-氧化物的药学上可接受的盐,溶剂化物,多晶型物,互变异构体,立体异构体,同位素形式或前药,以及药学上可接受的稀释剂或载体。
5.一种治疗赘生性疾病,自身免疫性疾病和炎性疾病的方法,包括向有需要的受试者施用有效量的权利要求1所定义的式(I)的化合物或其N-氧化物或所述式(I)的化合物或其N-氧化物的药学上可接受的盐,溶剂化物,多晶型物,互变异构体,立体异构体,同位素形式或前药。
CN201880072109.2A 2017-09-08 2018-09-05 经取代的吡咯并吡啶类化合物作为atr抑制剂 Active CN111655688B (zh)

Applications Claiming Priority (5)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US201762555645P 2017-09-08 2017-09-08
US62/555,645 2017-09-08
US201862616642P 2018-01-12 2018-01-12
US62/616,642 2018-01-12
PCT/US2018/049460 WO2019050889A1 (en) 2017-09-08 2018-09-05 SUBSTITUTED PYRROLOPYRIDINES AS ATR INHIBITORS

Publications (2)

Publication Number Publication Date
CN111655688A true CN111655688A (zh) 2020-09-11
CN111655688B CN111655688B (zh) 2023-09-29

Family

ID=63708446

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CN201880072109.2A Active CN111655688B (zh) 2017-09-08 2018-09-05 经取代的吡咯并吡啶类化合物作为atr抑制剂

Country Status (6)

Country Link
US (2) US11236089B2 (zh)
EP (1) EP3679041B1 (zh)
JP (1) JP7235338B2 (zh)
CN (1) CN111655688B (zh)
CA (1) CA3074719A1 (zh)
WO (1) WO2019050889A1 (zh)

Cited By (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN111712499A (zh) * 2018-02-07 2020-09-25 石家庄智康弘仁新药开发有限公司 一种atr抑制剂及其应用
WO2023093447A1 (zh) * 2021-11-26 2023-06-01 深圳市瓴方生物医药科技有限公司 氟代吡啶并吡咯类化合物的晶型及其制备方法

Families Citing this family (9)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN111848605B (zh) * 2019-04-30 2023-05-02 四川科伦博泰生物医药股份有限公司 一种取代吡啶并[3,4-b]吡嗪-2(1H)-酮化合物、其制备方法和用途
US20220378799A1 (en) * 2019-06-06 2022-12-01 Beijing Tide Pharmaceutical Co., Ltd. 2, 4, 6-tri-substituted pyrimidine compound as atr kinase inhibitor
JP2022543856A (ja) * 2019-08-06 2022-10-14 ウーシー・バイオシティ・バイオファーマシューティクス・カンパニー・リミテッド Atr阻害剤の結晶形及びその使用
CN112939966B (zh) * 2019-12-10 2023-03-24 武汉光谷亚太医药研究院有限公司 嘧啶衍生物、其制备及应用
WO2021143821A1 (zh) * 2020-01-17 2021-07-22 江苏恒瑞医药股份有限公司 稠合杂芳基类衍生物、其制备方法及其在医药上的应用
US20240150333A1 (en) * 2020-03-20 2024-05-09 H. Lee Moffitt Cancer Center And Research Institute, Inc. Taf1 inhibitors
US20230212160A1 (en) * 2020-05-20 2023-07-06 Beijing Tide Pharmaceutical Co., Ltd. 2,4,6-tri-substituted pyrimidine compounds as atr kinase inhibitors
WO2021238999A1 (zh) * 2020-05-29 2021-12-02 深圳市瓴方生物医药科技有限公司 氟代吡咯并吡啶类化合物及其应用
CN111646985A (zh) * 2020-06-01 2020-09-11 江苏集萃分子工程研究院有限公司 一种含嘧啶杂环抗肿瘤药物分子azd6738的合成方法

Citations (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2007080382A1 (en) * 2006-01-11 2007-07-19 Astrazeneca Ab Morpholino pyrimidine derivatives and their use in therapy
US20110306613A1 (en) * 2010-06-11 2011-12-15 Astrazeneca Ab Chemical compounds
WO2012101654A2 (en) * 2011-01-25 2012-08-02 Sphaera Pharma Pvt. Ltd Novel triazine compounds

Family Cites Families (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US4522811A (en) 1982-07-08 1985-06-11 Syntex (U.S.A.) Inc. Serial injection of muramyldipeptides and liposomes enhances the anti-infective activity of muramyldipeptides
WO2019014618A1 (en) * 2017-07-13 2019-01-17 Board Of Regents, University Of Texas System HETEROCYCLIC INHIBITORS OF KINASE ATR
EP3668839B1 (en) * 2017-08-17 2023-04-12 Board of Regents, The University of Texas System Heterocyclic inhibitors of atr kinase

Patent Citations (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2007080382A1 (en) * 2006-01-11 2007-07-19 Astrazeneca Ab Morpholino pyrimidine derivatives and their use in therapy
US20110306613A1 (en) * 2010-06-11 2011-12-15 Astrazeneca Ab Chemical compounds
CN103068391A (zh) * 2010-06-11 2013-04-24 阿斯利康(瑞典)有限公司 吗啉代嘧啶及其治疗用途
WO2012101654A2 (en) * 2011-01-25 2012-08-02 Sphaera Pharma Pvt. Ltd Novel triazine compounds
US20130303516A1 (en) * 2011-01-25 2013-11-14 Sphaera Pharma Pte. Ltd. Novel triazine compounds

Non-Patent Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
BRIAN F.KIESEL等: "LC-MS/MS assay for the simultaneous quantitation of the ATM inhibitor AZ31 and the ATR inhibitor AZD6738 in mouse plasma", 《JOURNAL OF PHARMACEUTICAL AND BIOMEDICAL ANALYSIS》 *

Cited By (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN111712499A (zh) * 2018-02-07 2020-09-25 石家庄智康弘仁新药开发有限公司 一种atr抑制剂及其应用
WO2023093447A1 (zh) * 2021-11-26 2023-06-01 深圳市瓴方生物医药科技有限公司 氟代吡啶并吡咯类化合物的晶型及其制备方法

Also Published As

Publication number Publication date
EP3679041B1 (en) 2022-07-06
JP2020533410A (ja) 2020-11-19
US11236089B2 (en) 2022-02-01
EP3679041A1 (en) 2020-07-15
CN111655688B (zh) 2023-09-29
US20200207763A1 (en) 2020-07-02
US20220227755A1 (en) 2022-07-21
WO2019050889A1 (en) 2019-03-14
CA3074719A1 (en) 2019-03-14
JP7235338B2 (ja) 2023-03-08

Similar Documents

Publication Publication Date Title
CN111655688A (zh) 经取代的吡咯并吡啶类化合物作为atr抑制剂
CN108699057B (zh) 5-取代的2-(吗啉-4-基)-1,7-萘啶
KR101964251B1 (ko) 약학적 화합물
EP2852596B1 (en) Thienopyrimidines
CN111511748B (zh) Bcl-2抑制剂
US20170275268A1 (en) Heteroaryl substituted indazoles
SA517380830B1 (ar) 2-(مورفولين-4- يل)-7،1- نفثيريدينات
US20170283396A1 (en) Diaminoheteroaryl substituted indazoles
CN111741959A (zh) Btk及其突变体的抑制剂
JP7328218B2 (ja) タンパク質アルギニンメチルトランスフェラーゼ5(prmt5)の選択的阻害剤
CN116323623A (zh) 作为SOS1抑制剂的吡啶并[2,3-d]嘧啶-4-胺
TW201625592A (zh) 苯甲基取代吲唑
US20150252047A1 (en) Substituted indazol-pyrrolopyrimidines useful in the treatment of hyperproliferative diseases
US20160297833A1 (en) Thienopyrimidines as mknk1 and mknk2 inhibitors
EP3390387B1 (en) Heteroarylbenzimidazole compounds
AU2018312836A1 (en) Novel heterocyclic compounds as CDK8/19 inhibitors
US20230019491A1 (en) PYRIMIDINE TBK/IKKe INHIBITOR COMPOUNDS AND USES THEREOF
CN117500507A (zh) 作为新的sos1抑制剂的磷衍生物
US20230391769A1 (en) Substituted heterocyclic compounds and therapeutic uses thereof
CN113939525A (zh) 吉西他滨的口服活性前药
EP3514149A1 (en) Heterocyclic amide compound
JP7284161B2 (ja) ピリミジンTBK/IKKεインヒビター化合物およびそれらの使用

Legal Events

Date Code Title Description
PB01 Publication
PB01 Publication
SE01 Entry into force of request for substantive examination
SE01 Entry into force of request for substantive examination
GR01 Patent grant
GR01 Patent grant