CN111356925A - 自动分析系统 - Google Patents
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Abstract
在装置状态确认画面(100)上同时显示第一试样配置图像(111)和第二试样配置图像(121)，该第一试样配置图像(111)表示进行蛋白质去除等预处理的预处理装置的试样载置部的俯视图像，该第二试样配置图像(121)表示LC‑MS的自动进样器的试样载置部的俯视图像。在各试样配置图像(111、121)中，通过圆形状区域(113、122)来表示瓶的载置位置，对容纳有一个培养基试样的瓶和容纳有对该培养基试样进行预处理后的试样的瓶分配相同的瓶编号A1、A2、···。并且，各圆形状区域(113、122)通过与预处理动作或分析动作的进展状况相应的不同的显示颜色来进行显示。由此，操作员能够在视觉上容易且准确地掌握预处理装置的试样载置部所载置的大量的瓶的位置与自动进样器所载置的容纳有预处理完成试样的大量的瓶的位置的对应关系，从而能够防止取错试样。
Description
技术领域
本发明涉及一种对试样进行规定的预处理并对进行该预处理后的试样进行分析的自动分析系统。该自动分析系统特别适合于对包含源自生物体的化合物的生物体试样进行分析。在此处所说的生物体试样中，除了包含全血、血清、滤纸血、尿等以外，例如还包含培养上清液等，该培养上清液包含从培养多能性干细胞等各种细胞的培养基得到的各种代谢产物。
背景技术
在再生医疗领域中，近年来，盛行使用iPS细胞、ES细胞等多能性干细胞的研究、技术开发。在这种研究、技术开发中，需要大量培养维持多能性的状态的未分化的细胞。因此，需要进行适当的培养环境的选择以及环境的稳定的控制，并且需要高频度地确认培养中的细胞的状态。
例如，当细胞菌落内的细胞从未分化状态脱离时，由于细胞菌落内存在的所有的细胞都具有分化的能力，因此菌落内的细胞最终都转变成了脱离未分化的状态。因此，作业者需要每天确认在培养着的细胞中是否未产生已脱离未分化状态的细胞(已经分化的细胞、将要分化的细胞)、也就是细胞的分化状态。
以往，作为对细胞的分化状态进行评价的方法，广泛使用着利用了免疫染色的方法、或对标记基因的表达水平进行定量的方法。然而，在这种方法中，均需要对细胞进行侵入性的处理。因此，在评价了分化状态之后，无法将供于该评价的细胞利用于其它的目的，例如无法将供于该评价的细胞作为再生医疗的细胞源。另外，关于完全相同的样品，也不能评价随着时间经过而产生的变化。
对于此，在专利文献1～3中公开了如下的方法：使用液相色谱质谱联用仪(LC-MS)或气相色谱质谱联用仪(GC-MS)等，不对细胞本身而是对培养着细胞的培养基的培养上清液中的特定化合物的存在量进行分析，基于其结果来评价细胞的分化状态。另外，为了实施这种方法，还将用于进行培养细胞的培养基分析的LC-MS用的软件进行了实用化(参照非专利文献1)。根据这种方法，具有能够以非侵入方式对细胞评价细胞的分化状态这样的大的优点。
在上述的基于培养上清液中的特定化合物的分析结果来评价细胞的分化状态时，被检细胞在培养基中被培养之后，将源自该培养所使用的培养基的试样(培养基试样)从培养装置导入到液相色谱质谱联用仪等分析装置中。但是，在培养基试样中还包含细胞的分化状态的评价所不需要且可能随着时间经过而使目标化合物改性的蛋白质等。因此，一般地，在预处理装置中进行了去除蛋白质等预处理后的培养基试样被导入到LC-MS中。也就是说，培养基试样从培养装置经过预处理装置后被导入到LC-MS等分析装置中。作为预处理装置，例如在专利文献4、非专利文献2等中公开的能够自动对试样容器中容纳的大量的试样依次进行处理的装置是有用的。
现有技术文献
专利文献
专利文献1：国际公开第2015/166845号刊
专利文献2：国际公开第2017/068727号刊
专利文献3：国际公开第2017/068801号刊
专利文献4：日本特开2017-170079号公报
非专利文献
非专利文献1：“LC/MS/MSメソッドパッケージ細胞培養プロファイリング”、[online]、[平成29年11月21日检索]、株式会社岛津制作所、因特网<URL:http://www.an.shimadzu.co.jp/lcms/tq-option/mp_profiling_cell-culture.htm>
非专利文献2：“SCLAM-2000全自動LCMS前処理装置”、[online]、[平成29年11月21日检索]、株式会社岛津制作所、因特网<URL:http://www.an.shimadzu.co.jp/lcms/sclam2000-2.htm>
发明内容
发明要解决的问题
也如专利文献4等中所公开的那样，在如上所述的预处理装置中，具有如下结构：预先选择载置于试样载置部的大量的试样容器中的一个，对该试样容器中容纳的试样执行规定的预处理，将容纳有已完成该处理的试样的容器移送至能够由下一级的分析装置处理的位置。在由这种预处理装置实施了大量的试样的预处理之后进行由LC-MS等分析装置对该大量的试样依次进行分析的批量分析的情况下，在LC-MS中，在选择大量的试样中的一个试样并将该试样导入到LC-MS的自动进样器的试样载置部，载置大量的容纳有已完成预处理的试样的试样容器。
即，在预处理装置的试样载置部载置大量的试样容器，另一方面，在LC-MS的自动进样器的试样载置部也载置大量的试样容器。虽然还取决于装置的规格，但是在各个试样载置部载置的试样容器的数量接近百个或百个以上。对放置在预处理装置的试样载置部中的某个位置处的试样容器中的试样进行预处理而得到的预处理完成试样被放置于LC-MS的自动进样器的试样载置部的哪个位置是由对预处理装置和自动进样器的动作进行控制的程序决定的，因此是唯一决定的。然而，如上所述，在各试样载置部中试样容器的数量多，因此操作员难以掌握预处理装置的试样载置部中的试样容器的位置与LC-MS的自动进样器的试样载置部中的试样容器的位置的对应关系。
例如，对试样进行分析的结果明确得知在自动进样器的试样载置部中放置于某个位置的试样的状态差(例如细胞已经分化)的情况下，希望不只废弃已完成预处理的该试样，还废弃未进行预处理的试样。然而，如果操作员错误识别预处理装置的试样载置部中的试样容器的位置与LC-MS的自动进样器的试样载置部中的试样容器的位置的对应关系，则有可能弄错而废弃了本应留下的试样。
另外，有时也希望根据情况而对载置于自动进样器的试样载置部的大量的试样中的、特定的培养条件(培养名、播种日期时间或提取日期时间等)的试样选择性地进行分析，但是如果无法容易地掌握预处理装置的试样载置部中的试样容器的位置与LC-MS的自动进样器的试样载置部中的试样容器的位置的对应关系，则导致选择设为目标的试样费时费力。
本发明是为了解决上述问题而完成的，其目的在于提供如下一种自动分析系统：操作员能够容易且准确地掌握预处理装置的试样载置部中的试样容器的位置与容纳有或预计容纳对该容器内的试样进行预处理之后的试样的试样容器在分析装置的试样载置部中被放置的位置的对应关系。
用于解决问题的方案
为了解决上述问题而完成的本发明是一种自动分析系统，在对试样执行了规定的预处理之后，对已完成该预处理的试样执行规定的分析，所述自动分析系统具备：
a)预处理装置，其具有用于载置分别容纳有试样的多个试样容器的试样载置部，对载置于该试样载置部的试样容器中的试样执行预处理；
b)分析装置，其具有用于载置分别容纳有由所述预处理装置完成了预处理的试样的多个试样容器的试样载置部，对载置于该试样载置部的试样容器中的预处理完成试样执行分析；
c)试样容器标识符管理部，其对以下的试样容器分配相同的试样容器标识符来进行管理：所述预处理装置的试样载置部中的一个试样容器；以及容纳有对该试样容器中所容纳的试样进行了预处理所得到的预处理完成试样且被载置于所述分析装置的试样载置部的试样容器；以及
d)显示处理部，其将第一试样配置图像和第二试样配置图像显示于同一画面上的不同区域，并且按照所述试样容器标识符管理部所进行的管理，在所述第一试样配置图像内的与各试样容器对应的显示区域及所述第二试样配置图像内的与各试样容器对应的显示区域中，对容纳有源自相同试样的试样的各个试样容器的显示区域显示相同的试样容器标识符，所述第一试样配置图像表示所述预处理装置的试样载置部中的多个试样容器的配置状态，所述第二试样配置图像表示所述分析装置的试样载置部中的多个试样容器的配置状态。
本发明中的分析装置的分析手法虽未特别限定，但是分析装置例如是液相色谱仪(LC)、气相色谱仪(GC)、液相色谱质谱联用仪(LC-MS)、气相色谱质谱联用仪(GC-MS)等。另外，预处理装置中的预处理的内容也没有特别限定，但是例如在试样为生物体试样的情况下，预处理能够设为去除妨碍分析的各种各样的成分(蛋白质等)的处理等。此处所说的生物体试样有时也为血液等从生物体提取的试样本身，但是也可以为包含在培养如上所述的细胞或生物体组织时从它们中产生的成分的培养基试样。
在本发明中，在分析之前，例如在预处理装置的试样载置部准备分别容纳有培养基试样等生物体试样的大量的试样容器。试样容器例如为瓶(vial)，在该情况下，试样载置部例如为支架，该支架形成有能够容纳瓶的底部的凹部。当预处理开始时，预处理装置对所准备的试样容器中的试样依次执行预处理。例如，已结束预处理的试样被暂时容纳在与试样容器不同的容器中，该容器被移送到分析装置的规定位置。
在分析装置中，从被移送到了规定位置的容器中抽吸规定量的预处理完成试样，并注入到被放置于该分析装置的试样载置部的试样容器(与在预处理中使用的试样容器不同的试样容器)中。此时，也可以进行稀释等。通过重复进行该动作，在载置于分析装置的试样载置部的试样容器中分别容纳不同的预处理完成试样。分析装置对该试样容器中的预处理完成试样依次执行分析，并按每个试样获取分析结果。例如，在分析装置为LC-MS的情况下，分析结果为一个或多个质荷比下的规定时间范围内的提取离子色谱(也称为质量色谱)数据。
关于载置于预处理装置的试样载置部的各试样容器的试样容器标识符和载置于分析装置的试样载置部的各试样容器的试样容器标识符，试样容器标识符管理部以使源自相同试样的试样为相同的标识符的方式分配该标识符，并对该分配信息进行管理。典型地说，试样容器标识符为试样容器编号，但是也可以为适当的记号或符号。
根据操作员在分析开始前、分析中、或分析结束后等任意的时间点进行的规定的操作，显示处理部制作将第一试样配置图像和第二试样配置图像配置于同一画面上的不同区域的画面并显示于显示部，该第一试样配置图像表示预处理装置的试样载置部中的多个试样容器的配置状态，该第二试样配置图像表示分析装置的试样载置部中的多个试样容器的配置状态。此时，基于由试样容器标识符管理部管理标识符的管理信息，针对第一试样配置图像中的与各试样容器对应的显示区域和第二试样配置图像中的与各试样容器对应的显示区域，在与分别容纳有一个试样的预处理前及预处理后的试样的两个试样容器对应的显示区域内显示相同的标识符。
由此，预处理装置的试样载置部中的试样容器的配置状态和分析装置的试样载置部中的试样容器的配置状态被显示在同一画面上。而且，在表示各个试样载置部中的试样容器的配置状态的第一试样配置图像和第二试样配置图像中，对与容纳有某个试样的试样容器对应的显示区域以及与容纳有对该试样进行了预处理所得到的预处理完成试样的试样容器对应的显示区域，附加相同的试样容器标识符。因而，操作员能够根据该试样容器标识符容易且可靠地掌握两个试样载置部中的试样容器的位置的对应关系。
另外，在本发明中，优选构成为，所述显示处理部从所述预处理装置和所述分析装置分别接收表示动作的进展状况的信息，根据该进展状况分别变更所述第一试样配置图像内的与各试样容器对应的显示区域的显示方式以及所述第二试样配置图像内的与各试样容器对应的显示区域的显示方式。
关于显示方式的变更，典型的为变更显示颜色即可，但是也可以变更表示显示区域的线的种类、粗细，或者也可以变更与显示区域对应的试样容器编号的显示颜色、字体的种类等。
根据该结构，操作员能够在一个画面上容易且准确地掌握预处理的动作的进展状况和分析的动作的进展状况。
另外，在本发明中，能够构成为，还具备：
显示区域指示部，其用于由用户指示所述第一试样配置图像内的与各试样容器对应的显示区域中的一个或多个显示区域；
试样信息设定画面显示处理部，其包含在所述显示处理部中，在经由所述显示区域指示部指示了一个或多个显示区域时，显示输入设定画面，该输入设定画面用于使用户输入与所述一个或多个显示区域对应的试样容器中所容纳的试样的信息；以及
试样信息获取部，其将通过用户的操作来在由所述试样信息设定画面显示处理部显示的输入设定画面上输入的试样信息与试样容器标识符相对应地进行存储。
此处所说的试样信息的内容根据试样的种类而不同。例如，在试样为如上所述的源自培养着细胞的培养基的培养基试样的情况下，试样信息能够设为包含培养名、播种日期时间、试样的提取日期时间、培养板编号等中的至少一个。根据该结构，操作员能够通过简单的操作在能够确认预处理的动作的进展状况和分析的动作的进展状况的画面上输入并设定试样信息。
此外，较为方便的是，在对试样信息进行输入并设定时，在第一试样配置图像上一目了然预处理装置的试样载置部中的各试样容器是未设定试样信息的试样容器、或者是已设定试样信息的试样容器。
因此，在本发明中，优选构成为，所述显示处理部将所述第一试样配置图像内的与各试样容器对应的显示区域的显示方式按被设定了试样信息的试样和未被设定试样信息的试样来进行变更。
发明的效果
根据本发明，能够在视觉上容易且准确地掌握预处理装置的试样载置部中的试样容器的位置、与分析装置的试样载置部中的容纳有对该试样容器中所容纳的试样进行了预处理所得到的预处理完成试样的试样容器的位置的对应关系。由此，例如即使在操作员通过手动操作选择并分析试样或者提取试样的情况下，也能够防止弄错试样，并且能够改善作业效率。
附图说明
图1是作为本发明的一个实施例的培养基试样自动分析系统的概要模块结构图。
图2是示出在本实施例的培养基试样自动分析系统中显示于显示部的装置状态显示画面的一例的示意图。
图3是示出本实施例的培养基试样自动分析系统中的样品信息设定画面的一例的图。
图4是示出本实施例的培养基试样自动分析系统中的培养基试样的属性信息的一例的图。
图5是示出本实施例的培养基试样自动分析系统中的分析结果显示画面(主画面)的一例的图。
图6是示出图5所示的分析结果显示画面的左方的一部分的图。
图7是示出本实施例的培养基试样自动分析系统中的分析结果显示画面(比较画面)的一例的图。
图8是示出图7所示的分析结果显示画面的左方的一部分的图。
图9是示出本实施例的培养基试样自动分析系统中的分析结果显示画面(比较画面)的一例的图。
图10是示出图9所示的分析结果显示画面的左方的一部分的图。
图11是示出本实施例的培养基试样自动分析系统中的分析结果显示画面(比较画面)的一例的图。
图12是示出图11所示的分析结果显示画面的左方的一部分的图。
具体实施方式
下面，参照附图来详细地说明作为本发明所涉及的自动分析系统的一个实施例的培养基试样自动分析系统。
图1是本实施例的培养基试样自动分析系统的概要框结构图。本实施例的系统是用于基于培养多功能性细胞等被检细胞的培养基的培养上清液中的生物标记物(由细胞产生的代谢产物)的存在量来评价该被检细胞的分化状态的培养细胞评价系统。
本实施例的系统具备预处理装置2、液相色谱质谱联用仪(LC-MS)3、数据处理部4、控制部5、主控制部6、操作部7、显示部8等。图1中用虚线记载的模块的培养装置1不包括在本系统中，用于提供在本系统中成为分析对象的培养基试样。
概要地说，在本系统中，将在培养装置1中得到的大量的培养基试样提供给预处理装置2，在预处理装置2中，对大量的培养基试样依次执行规定的预处理。然后，由预处理装置2进行预处理之后的各培养基试样(预处理完成试样)被送到LC-MS 3，在该LC-MS 3中依次分析各培养基试样中的成分。通过该分析而得到的数据被发送到数据处理部4，数据处理部4实施规定的数据处理，并将其结果通过主控制部6输出到显示部8来呈现给用户(操作员)。控制部5控制预处理装置2、LC-MS 3以及数据处理部4以进行上述那样的处理。主控制部6主要具有通过操作部7、显示部8实现的用户接口的功能。
详细地说明各部的结构。
培养装置1是用于培养被检细胞的装置。在此，被检细胞例如是干细胞，典型的是ES细胞、iPS细胞等多能性干细胞。另外，从干细胞进行分化诱导而得到的细胞也能够使用为被检细胞。作为培养这样的被检细胞所使用的培养基，能够使用一般使用于培养干细胞的各种各样的培养基、例如DMEM/F12、以DMEM/F 12为主要成分的培养基(mTeSR1等)。在这样的培养基上培养细胞时，由细胞产生的各种代谢产物混入培养上清液中。操作员通过手动作业提取培养上清液的一部分并注入到规定的瓶(试样容器)中，来制备培养基试样。当然，也可以设为在每天决定好的时刻自动提取培养上清液的一部分，也就是说，自动制备培养基试样。
预处理装置2具备：试样载置部20，其包括载置大量的瓶的样品支架；预处理执行部21，其通过试样分注、试剂分注、搅拌、过滤等工序，对从载置于该试样载置部20的大量的瓶中选择出的一个瓶中的培养基试样执行用于去除例如蛋白质等不需要的成分的预处理；以及预处理完成试样送出部22，其将暂时容纳预处理结束后的培养基试样的容器移送至LC-MS 3的规定位置。
在本例中，如后述那样，在预处理装置2中使用的样品支架俯视呈大致圆弧状，在试样载置部20，沿着圆环的周向排列着6个样品支架。在1个样品支架上能够载置10个或11个瓶。即，在各样品支架形成有能够将多个瓶的底部分别容纳的大小的凹部，能够在该各凹部分别载置瓶。
另外，具体地说，用于去除蛋白质的预处理能够设为，将作为内部标准试样的异丙基苹果酸作为试剂添加到培养基试样中，例如在将甲醇、氯仿以及水以2.5:1:1的比率混合而成的提取溶液中进行处理。但是，预处理不限于蛋白质去除，也可以对培养基试样进行其它的预处理。此外，作为预处理装置2，例如能够利用专利文献4、非专利文献2等中公开的装置，但是本发明也不限于此。
LC-MS 3包括：液相色谱仪(LC)部31，其包括未图示的送液泵、喷射器、柱等；自动进样器30，其选择大量的培养基试样中的一个培养基试样并导入到LC部31；以及质谱分析(MS)部32，其对通过LC部31的柱沿时间方向分离出的试样中的成分进行质谱分析。自动进样器30包括：试样载置部302，其包括载置大量的与预处理装置2中使用的瓶不同的瓶的样品支架；试样稀释部301，其在抽吸由预处理装置2的预处理完成试样送出部22移送至规定位置的容器中的预处理完成培养基试样并添加超纯水来稀释成规定倍率之后，分注到载置于试样载置部302的瓶中；以及试样提取部303，其从载置于试样载置部302的大量的瓶中的一个瓶提取规定量的完成预处理和稀释的培养基试样并导入到LC部31的喷射器。
在本例中，如后述那样，自动进样器30中使用的样品支架俯视呈矩形状，能够在1个样品支架上将瓶排列成n行m列(在本例中为12行8列)的阵列状。
为了评价被检细胞的分化状态，在MS部32中，进行以作为生物标记物的、例如从由丁二胺、犬尿氨酸、胱硫醚、抗坏血酸、核黄素、丙酮酸、丝氨酸、半胱氨酸、苏糖酸、柠檬酸以及乳清酸组成的组中选择的至少一个化合物为靶材的质谱分析。作为MS部32而使用的质谱分析装置的方式只要具备大气压离子源即可，没有特别限定，例如能够使用四极杆质谱分析装置、串联四极杆质谱分析装置、四极杆飞行时间质谱分析装置等。
数据处理部4包括样品信息存储部40、数据存储部41、定量分析部42、分析结果存储部43、结果显示处理部44等功能模块。样品信息存储部40存储如后述那样针对预处理装置2中的容纳有培养基试样的各瓶输入并设定的样品信息。数据存储部41存储通过在LC-MS3中进行分析而收集到的数据。定量分析部42针对将特定的化合物作为靶材而得到的各数据制作提取离子色谱，利用预先制作出的校准曲线，基于在该色谱中观测到的峰的面积值或高度值来计算该化合物的浓度值等。分析结果存储部43存储由定量分析部42等得到的计算结果。结果显示处理部44制作基于所计算出的分析结果等的图表，并且制作配置有该图表的规定形式的画面，将该画面经由主控制部6输出到显示部8。
控制部5包括预处理执行控制部50、LC-MS执行控制部51、显示控制部52、输入处理部53、瓶编号管理部54、设定信息存储部55等功能模块。预处理执行控制部50对预处理装置2中的预处理动作进行控制。LC-MS执行控制部51对LC-MS 3中的分析动作进行控制。如后述那样，显示控制部52制作用于显示预处理装置2和LC-MS 3中的动作状态的画面、用于操作员对提供给预处理装置2的培养基试样的信息(样品信息)或与各样品有关的分析条件等进行设定的画面，并将画面经由主控制部6输出到显示部8。输入处理部53根据操作员对操作部7的输入操作来执行规定的处理。瓶编号管理部54按照预先决定的规则，或者根据用户的手动设定，对试样载置部20和试样载置部302各试样载置部中的瓶位置分配瓶编号，并对该分配的信息进行管理。另外，设定信息存储部55事先存储通过操作员的输入操作等输入并设定的关于各培养基试样的样品信息、分析条件等。
此外，数据处理部4、控制部5以及主控制部6的实体为个人计算机(或者为更高性能的工作站)，能够设为如下结构：通过使该计算机中所安装的专用的一个或多个软件在该计算机上运行，来达成上述各模块的功能。在该结构中，操作部7是附设于个人计算机等的键盘、鼠标等指示设备，显示部8是显示监视器。
如上所述，在本系统中，在预处理装置2中载置于试样载置部20的大量的瓶中的一个瓶所容纳的培养基试样接受预处理和稀释的操作后，被注入到载置于自动进样器30的试样载置部302的大量的瓶中的一个瓶。因而，载置于预处理装置2的试样载置部20的大量的瓶与载置于自动进样器30的试样载置部302的大量的瓶原则上能够一一对应起来。实施了具有特征的显示控制使得操作员能够容易且准确地掌握该瓶彼此的对应关系。接着，对该显示控制进行说明。
当操作员通过操作部7进行规定的操作时，经由主控制部6接收到指示的显示控制部52制作规定形式的装置状态确认画面并显示在显示部8的画面上。图2是示出该装置状态确认画面100的一例的示意图。该装置状态确认画面100是用于同时显示与预处理装置2的动作及LC-MS 3的动作有关的信息的画面。即，装置状态确认画面100大致分割为左右两部分，左侧为预处理状态显示区域110，右侧为分析状态显示区域120。
在装置状态确认画面100的预处理状态显示区域110内，显示有以图形方式表示预处理装置2的试样载置部20的俯视图像的第一试样配置图像111。与沿着圆环的周向排列的6个大致圆弧状的样品支架相对应地该第一试样配置图像111被分割为6个圆弧状区域112，使得与实际的试样载置部20相同，在该各圆弧状区域112内设置有与多个(在本例中为11支)瓶分别对应的圆形状区域113。
在此，如图2中记载的那样，对6个圆弧状区域112分别赋予英文字母“A”、“B”、“C”、“D”、“E”、“F”来作为区域名。另外，对各圆弧状区域112中的多个圆形状区域113分别赋予了“1”～“11”的作为连续编号的数字。第一试样配置图像111中的所有圆形状区域113是由将表示该圆形状区域113所属的圆弧状区域112的英文字母与该圆弧状区域112内的作为连续编号的数字组合而成的瓶编号来指定的，对放置于与该圆形状区域113对应的位置的瓶分配该瓶编号来作为试样容器标识符。试样载置部20中的瓶的位置与瓶编号的关系由瓶编号管理部54来进行管理。
各个圆形状区域113的显示颜色表示针对与该圆形状区域113对应的位置的瓶中的培养基试样进行的预处理的执行状况等。具体地说，作为此处所示的预处理的执行状况等，存在还未设定样品名等样品信息的“样品信息未设定”、虽然设定了样品信息但还未执行预处理的“样品信息设定完成”、正在执行预处理的“预处理执行中”、预处理已结束的“预处理执行完成”、表示在该位置不存在瓶的“无瓶”、在预处理中产生了异常的“数据异常”这6种。但是，在此由于附图的制约而无法表现颜色，因此通过填充的不同、表示区域的线类型的不同等来表示预处理的执行状况等。
在图2的例子中，与瓶编号为“A1”～“A5”的5支瓶对应的圆形状区域113处于“预处理执行完成”的状态，与瓶编号为“A6”的1支瓶对应的圆形状区域113处于“预处理执行中”的状态。另外，除此以外的瓶全部处于“样品信息设定完成”的状态。
在预处理状态显示区域110中的第一试样配置图像111的上部设置有表示预处理装置2的动作状态的动作状态显示部114。在本例中，由于处于能够进行预处理装置2中的预处理的动作的准备完成状态，因此在动作状态显示部114中显示为“准备完成”，但是例如在预处理装置2停止时，动作状态显示部114的显示切换为“停止中”等，另外，在被启动但准备尚未完成时，动作状态显示部114的显示切换为“准备中”等。
另一方面，在装置状态确认画面100的分析状态显示区域120中，显示有以图形方式表示自动进样器30的试样载置部302的俯视图像的第二试样配置图像121。在该第二试样配置图像121中，设置有与排列成n行m列(在本例中为12行8列)的阵列状的多个瓶分别对应的圆形状区域122，使得与实际的试样载置部302相同。
在此，如图2所示，对第二试样配置图像121中的各列分配英文字母“A”、“B”、“C”、“D”、“E”、“F”、“G”、“H”，并对各行分配“1”～“12”的作为连续编号的数字。第二试样配置图像121中的所有的圆形状区域122是由根据在该行上及列上的位置将英文字母与数字组合而成的瓶编号来指定的，对处于该圆形状区域122的位置的瓶分配该瓶编号来作为试样容器标识符。试样载置部302中的瓶的位置与瓶编号的关系也由瓶编号管理部54来进行管理。
各个圆形状区域122的显示颜色表示在自动进样器30中针对与该圆形状区域122对应的位置的瓶中的完成预处理及稀释的培养基试样进行的稀释动作的状况、以及在LC部31及MS部32中针对与该圆形状区域122对应的位置的瓶中的完成预处理及稀释的培养基试样进行的分析的执行状况等。具体地说，作为此处所示的稀释动作及分析的执行状况，有还未执行稀释处理的“未稀释”、虽然稀释处理已结束但没有进行测定的“稀释完成”、正在执行分析的“分析中”、分析已结束的“分析完成”这4种。当然，此处也可以取代颜色而通过填充的不同等来表示稀释动作及分析的执行状况等。
在图2的例子中，与样品编号为“A1”～“A5”的5支瓶对应的圆形状区域122处于“稀释完成”的状态。与除此以外的所有瓶对应的圆形状区域122为“未稀释”的状态。如上所述，在本系统中，由于进行了稀释的培养基试样被注入到各瓶，因此意味着在圆形状区域122为“未稀释”的状态的位置的瓶中还未注入培养基试样。
在分析状态显示区域120中的第二试样配置图像121的上部设置有表示LC部31和MS部32的动作状态的动作状态显示部123。在本例中，由于处于能够进行LC部31和MS部32的动作的准备完成状态，因此在动作状态显示部123中显示为“准备完成”，但是例如在LC部31和MS部32已停止时，动作状态显示部123的显示切换为“停止中”等，另外，在被启动但准备尚未完成时，动作状态显示部123的显示切换为“准备中”等。
另外，在装置状态确认画面100的最上部，配置有在开始分析时被操作的开始(Start)按钮130、在暂停分析时被操作的暂停(Pause)按钮131、在停止分析时被操作的停止(Stop)按钮132。分析者在选择了预先登记的分析方法之后，通过对开始按钮130进行点击操作，能够指示开始包含预处理的一系列分析。其中，在图2中，示出了已经操作开始按钮130且正在进行分析的状态。
如上所述，瓶编号管理部54对放置于预处理装置2的试样载置部20的瓶的位置与瓶编号的关系进行管理，并且还对放置于自动进样器30的试样载置部302的瓶与瓶编号的关系进行管理。试样载置部20中的瓶与试样载置部302中的瓶被对应起来，使得在该管理下，对放置于预处理装置2的试样载置部20的某个瓶编号的瓶中的培养基试样进行预处理后的试样(实际上为还进行了稀释的试样)被分注到放置于自动进样器30的试样载置部302的相同瓶编号的瓶中。因而，能够保证在与装置状态确认画面100内的第一试样配置图像111上及第二试样配置图像121上具有相同的瓶编号的区域相当的位置的瓶中，容纳有源自相同的培养基试样的试样。由此，操作员能够在显示上简单地掌握与放置于一方的试样载置部20或302的瓶中的试样相同的试样(其中，预处理、稀释的有无是不同的)存在于放置在另一方的试样载置部302或20的哪个位置处的瓶中。
另外，也能够在显示上简单地掌握放置于各个试样载置部20、302的瓶中的培养基试样处于怎样的预处理或分析的阶段。例如图2中一点划线所示的那样，关于第一试样配置图像111中瓶编号为“A1”～“A5”的5支瓶中的培养基试样，能够在第二试样配置图像121中容易地识别出处于结束预处理装置2中的预处理且它们被移送至自动进样器30后已经稀释完成的状态。
在图2所示的例子中，关于载置于预处理装置2的试样载置部20的所有的瓶，处于设定了样品信息并已经开始分析的状态。另一方面，在分析开始前，操作员针对载置于预处理装置2的试样载置部20的所有的瓶输入并设定与各瓶中的培养基试样有关的样品信息，并且输入并设定用于由LC-MS 4对各培养基试样进行分析的分析条件。样品信息包含播种日期时间、培养名、培养板编号、提取日期时间等。所设定的样品信息及包含分析条件的分析方法与瓶编号相对应地被存储到设定信息存储部55中。作为一个方法，能够如下面那样设定样品信息。
在如图2所示的装置状态确认画面100上的第一试样配置图像111中存在未设定样品信息的瓶的情况下，操作员通过操作部7中包括的指示设备对与想要设定样品信息的瓶对应的圆形状区域113进行点击操作。于是，显示控制部52接收到该操作，新打开如图3所示的与所指示的瓶编号对应的样品信息设定画面400并显示在显示部8的画面上。图3是指示了被分配“A1”的瓶编号的圆形状区域113时的例子。
在该样品信息设定画面400中配置有用于输入播种日期时间、培养名、培养板编号、提取日期时间、参考值等样品信息的文本框401。参考值是指在后述的分析结果的计算、处理时根据需要而使用的值，例如能够设为通过本系统中不包括的其它的装置中的测定、观察而获取到的得到了该培养基试样的原培养容器内的细胞数、乳酸值(在糖被消耗时生成的物质的量)、细菌的浓度、或者培养液的吸光度等任意项目的值。
操作员针对与样品信息有关的如上所述的各项目输入或选择适当的信息，之后对确定按钮402进行点击操作。于是，输入处理部53接收到该操作，确定此时的瓶编号所对应的样品信息，并针对各瓶编号制作包含样品信息的样品信息文件，将该文件存储到设定信息存储部55中。
在上述过程中，操作员需要针对每个瓶输入并设定样品信息，但是也能够针对多个瓶、也就是培养基试样，事先制作预先将播种日期时间、培养名、培养板编号、提取日期时间等样品信息汇总而成的表，在选择并指示了未设定样品信息的多个瓶之后，通过在上述表上选择对应的多个样品信息，一并设定与多个瓶对应的样品信息。
如上所述，输入处理部53按每个瓶将包含样品信息的样品信息文件存储到设定信息存储部55中，此时将样品信息的各项目的信息自动登记到作为该文件的属性信息之一的定制属性中。图4是示出在文件属性的对话窗口画面410上的定制属性411中自动登记有样品信息的状态的一例的图。在此，将文本设定为定制属性的值的种类，播种日期时间、提取日期时间、培养名、培养板编号、QC值的信息分别被登记为与“C2MAP_CultureStartingDate”、“C2MAP_CultureSamplingDate”、“C2MAP_CulturePlateNumber”、“C2MAP_CultureName”、“C2MAP_QC”这样的名称对应的值。
如上所述，在控制部5中，包含针对每个瓶设定的样品信息的文件在适当的时间点被转送至数据处理部4，还被存储到样品信息存储部40中。
保存样品信息的文件的数据形式存在根据制造本系统的制造商而不同的可能性，但是如果文件属性例如为基于WINDOWS(注册商标)等相同的OS，则是能够共享的。由此，例如即使在构成本系统的预处理装置2的制造商与LC-MS 3的制造商不同而无法通过对由LC-MS 3生成的数据进行处理的数据处理部4来读取上述保存有样品信息的文件的数据的情况下，也能够利用该文件的属性来获取样品信息。
接着，说明在本系统中对大量的培养基试样执行了分析之后的分析结果的显示方式。
如上所述那样由LC-MS 3对大量的培养基试样进行分析而收集到的数据被保存到数据存储部41中。定量分析部42使用该数据，按每个瓶来针对一个或多个规定的化合物制作提取离子色谱，计算与该化合物对应的峰的面积值。并且，参照预先制作的校准曲线，根据峰面积值来计算浓度值。由此，按每个瓶、也就是说按每个培养基试样求出关于一个或多个化合物的峰面积值和浓度值，将该峰面积值和浓度值作为一个文件被保存到分析结果存储部43中。
此时，使分析结果存储部43中存储的每个试样的分析结果的文件与将样品信息存储部40中存储的关于相同的培养基试样的样品信息作为数据的文件进行关联。另外，数据存储部41中保存的每个试样的数据文件也与样品信息的文件进行关联。由此，例如能够从样品信息简单地访问关于该试样的分析结果文件、数据文件，另外，反过来也能够简便地从分析结果文件、数据文件获取关于该试样的样品信息。其结果是，能够适当地管理与分析有关的可追溯性。
通常而言，在利用本系统的培养基分析中，为了评价培养中的被检细胞的分化状况，例如每天在相同的时刻持续地对一个培养容器中的培养上清液进行分析直到培养结束为止。因此，每天对附加有相同的培养名的培养基试样进行分析，分别制作并存储数据文件和分析结果文件。源自相同的培养容器的培养基试样中的化合物(例如由细胞产生的代谢产物)的量逐日变化，因此观察该随时间的变化在细胞评价中很重要。在本系统中，像下面那样将基于分析结果的图表与样品信息相对应地进行显示。
即，当操作员通过操作部7指定了培养名等之后进行规定的操作时，结果显示处理部44从样品信息存储部40和分析结果存储部43读出与所指定的信息对应的样品信息的文件及分析结果文件，基于该文件中的数据来制作如图5、图6所示那样的主分析结果显示画面200并显示于显示部8。图5是示出主分析结果显示画面200整体的图，图6是示出主分析结果显示画面200的左方的一部分的图。主分析结果显示画面200大致分割为上下两部分，在上方设置有表显示区域210，在下方设置有图表显示区域220。
在表显示区域210内的左方上部设置有显示作为样品信息的培养名、播种日期时间的样品信息显示区域211，在样品信息显示区域211的下面配置有趋势表212。趋势表212是沿纵向排列有分析对象的化合物(代谢产物)的种类且沿横向排列有培养日(从培养开始起的经过天数)以及每个提取日期时间的培养板编号的表。在本例中，在相同的条件下培养的培养容器(培养板)为三个，因此培养板编号只有1～3，但是该数量也能够再增加。
在趋势表212的各单元格显示有某一个种类的化合物的、与某个培养日的一个培养板编号对应的定量值。此处所说的定量值是峰面积值、相对于特定条件下的峰面积值的面积比(例如将提取日期时间中的第一天的面积值设为1时的面积比)、浓度值、相对于特定条件下的浓度值的浓度比(例如将提取日期时间中的第一天的浓度值设为1时的浓度比)、以及将这些值除以上述的参考值而得到的计算值中的任一个。能够由操作员在其它的设定画面上适当选择将哪个值显示为定量值，但是无论如何都会将由定量分析部42针对每个化合物计算出的分析结果显示于此处。
在表显示区域210内的右方上部设置有详细模式/平均显示模式选择按钮215。图5、图6是通过该按钮215选择了详细模式的状态，此时将相同的提取日期时间下的培养板编号不同的三个试样的结果全部显示。另一方面，当通过详细模式/平均显示模式选择按钮215选择了平均显示模式时，结果显示处理部44将相同的提取日期时间下的培养板编号不同的三个试样的结果按每个化合物进行平均，将该平均值显示于趋势表212中。即使在相同的条件下进行着培养，也无法避免细胞的增殖等产生差异，从而在相同的提取日期时间下的三个试样的结果中存在某种程度的偏差，因此通常而言通过平均显示模式只确认平均值即可。但是，在结果有意义等情况下，通过选择详细显示模式，能够通过确认各个峰面积值、浓度值，来进行有无异常值的确认等。
在主分析结果显示画面200的图表显示区域220中显示如下的图表(趋势图表)：该图表(趋势图表)表示在趋势表212中选择的一个化合物的峰面积值等的变化。当操作员通过操作部7在趋势表212上指示想要确认趋势图表的化合物时，结果显示处理部44针对被指示的化合物收集分析结果，制作趋势图表并更新图表显示区域220中的显示。在图5的例子中，趋势表212的第4行的“Hexose(Glucose)”被选择，显示了与其对应的表示峰面积值的变化的趋势图表。该图表上的值为相同的提取日期时间下的关于培养板编号不同的三个试样的平均值，通过误差条(error bar)来显示该值的偏差。能够由操作员在其它的设定画面上从方差、标准偏差等中选择用于该误差条显示的值。
另外，在误差条显示的值的偏差过大的情况下，产生了一些异常的可能性高。因此，也可以设为操作员能够在其它的设定画面上指定针对误差的阈值，在误差超过该阈值的情况下，通过将误差条用与通常的显示颜色不同的显示颜色进行显示等，能够向操作员发出误差的程度异常的警告。
在主分析结果显示画面200中，只能确认关于被指定的一个培养名的趋势图表，但是在想要将培养名不同的多个培养基试样的结果进行比较的情况下，操作员通过在主分析结果显示画面200的最上部显示的主模式/比较模式选择按钮216来选择比较模式。于是，结果显示处理部44将图7所示那样的比较分析结果显示画面300显示于显示部8。
图7是示出比较分析结果显示画面300的整体的图，图8是示出比较分析结果显示画面300的左方的一部分的图。比较分析结果显示画面300大致分割为三部分，在左上方设置有试样种类表显示区域310，在左下方设置有化合物表显示区域320，在它们的右方设置有图表显示区域330。在试样种类表显示区域310显示有将一个培养名设为一行的试样种类表，在化合物表显示区域320显示有将一个化合物设为一行的化合物表。在试样种类表和化合物表中，在各行设置有复选框，在图表显示区域330中显示作为复选框被勾选的项目的分析结果的趋势图表。
在图7、图8的例子中，在图表显示区域330显示有关于培养名为“Ecto”的培养基试样的除抗坏血酸-2-磷酸酯(Ascorbic acid 2-phosphate)以外的化合物的趋势图表。趋势图表本身与显示于主分析结果显示画面200的图表显示区域220的图表相同，显示每个提取日的峰面积值、浓度值等的平均值及误差条。由此，能够容易地比较不同化合物的峰面积值等随时间的变化。
另外，在比较分析结果显示画面300中，也能够比较不同培养名的培养基试样的分析结果。即，当操作员在其它的设定画面中指定想要比较的多个培养名时，结果显示处理部44将如图9、图10所示那样的比较分析结果显示画面300显示于显示部8。图9是示出比较分析结果显示画面300的整体的图，图10是示出比较分析结果显示画面300的左方的一部分的图。此时，在试样种类表显示区域310中显示将被指定的多个培养名并列记载的试样种类表。对各培养名分配各不相同的图表颜色。但是，在此由于无法表现颜色，因此将图表上的标绘点的形状设为不同。
而且，在图表显示区域330显示叠加有与培养名不同的试样对应的折线图表的趋势图表。在图9、图10的例子中，在图表显示区域330显示有关于培养名为“Ecto”、“Meso”、“End”、“No diff”的4种培养基试样的除抗坏血酸-2-磷酸酯以外的化合物的趋势图表。由此，能够容易地比较不同培养细胞中的相同化合物的定量值的变化。
另外，也能够以多个培养基试样中的任一个为基准来显示该基准的分析结果与其它的分析结果之差。即，如图11、图12所示，当操作员在显示于试样种类表显示区域310的试样种类表上选中与想要设为基准的一个试样对应的行的参照单选按钮312时，结果显示处理部44针对每个化合物分别计算设为基准的试样的峰面积值或浓度值与除此以外的试样的峰面积值或浓度值的差异，制作表示该差随时间的变化的趋势图表。而且，将该趋势图表显示于图表显示区域330。
在图11、图12的例子中，培养名为“No diff”的培养基试样被设为基准，将关于除此以外的3种试样的除抗坏血酸-2-磷酸酯以外的化合物的趋势图表显示于图表显示区域330。对于该趋势图表，能够更直观地掌握定量值相对于基准的差异的变化。
此外，上述实施例是本发明的一例，即使在本发明的宗旨的范围内适当地进行变更、修改、追加，当然也包含在本申请权利要求书中。
例如，在上述实施例的系统中，在试样载置部20、302能够载置的瓶的数量可以适当变更，在试样载置部20、302载置瓶的支架的形状也能够适当变更。另外，瓶编号的施加方式也能够适当变更。
另外，上述实施例是由LC-MS对培养基试样中包含的代谢产物等化合物进行分析的系统，但是也可以是对源自培养基试样以外的生物体的试样中的化合物进行分析。另外，分析装置不限于LC-MS，也可以是GC-MS，或者也可以是除此以外的光学分析装置等分析装置。另外，如上所述，由预处理装置进行的预处理不限于蛋白质或蛋白质以外的不期望的成分的去除，能够设为各种各样的预处理。另外，在上述实施例的系统中，通过LC-MS中的自动进样器实施了试样的稀释，但是也可以设为通过预处理装置来进行稀释。
附图标记说明
1：培养装置；2：预处理装置；20：试样载置部；21：预处理执行部；22：试样送出部；3：LC-MS；30：自动进样器；301：试样稀释部；302：试样载置部；303：试样提取部；31：LC部；32：MS部；4：数据处理部；40：样品信息存储部；41：数据存储部；42：定量分析部；43：分析结果存储部；44：结果显示处理部；5：控制部；50：预处理执行控制部；51：LC-MS执行控制部；52：显示控制部；53：输入处理部；54：瓶编号管理部；55：设定信息存储部；6：主控制部；7：操作部；8：显示部；100：装置状态确认画面；110：预处理状态显示区域；111：第一试样配置图像；112：圆弧状区域；113、122：圆形状区域；120：分析状态显示区域；121：第二试样配置图像；114、123：动作状态显示部；130：开始按钮；131：暂停按钮；132：停止按钮。
Claims (4)
1.一种自动分析系统，在对试样执行规定的预处理之后，对已完成该预处理的试样执行规定的分析，所述自动分析系统的特征在于，具备：
a)预处理装置，其具有用于载置分别容纳有试样的多个试样容器的试样载置部，对载置于该试样载置部的试样容器中的试样执行预处理；
b)分析装置，其具有用于载置分别容纳有由所述预处理装置完成了预处理的试样的多个试样容器的试样载置部，对载置于该试样载置部的试样容器中的预处理完成试样执行分析；
c)试样容器标识符管理部，其对以下的试样容器分配相同的试样容器标识符来进行管理：所述预处理装置的试样载置部中的一个试样容器；以及容纳有对该试样容器中所容纳的试样进行了预处理所得到的预处理完成试样且被载置于所述分析装置的试样载置部的试样容器；以及
d)显示处理部，其将第一试样配置图像和第二试样配置图像显示于同一画面上的不同区域，并且按照所述试样容器标识符管理部所进行的管理，在所述第一试样配置图像内的与各试样容器对应的显示区域及所述第二试样配置图像内的与各试样容器对应的显示区域中，对容纳有源自相同试样的试样的各个试样容器的显示区域显示相同的试样容器标识符，所述第一试样配置图像表示所述预处理装置的试样载置部中的多个试样容器的配置状态，所述第二试样配置图像表示所述分析装置的试样载置部中的多个试样容器的配置状态。
2.根据权利要求1所述的自动分析系统，其特征在于，
所述显示处理部从所述预处理装置和所述分析装置分别接收表示动作的进展状况的信息，根据该进展状况分别变更所述第一试样配置图像内的与各试样容器对应的显示区域的显示方式以及所述第二试样配置图像内的与各试样容器对应的显示区域的显示方式。
3.根据权利要求1或2所述的自动分析系统，其特征在于，还具备：
显示区域指示部，其用于由用户指示所述第一试样配置图像内的与各试样容器对应的显示区域中的一个或多个显示区域；
试样信息设定画面显示处理部，其包含在所述显示处理部中，在经由所述显示区域指示部指示了一个或多个显示区域时，显示输入设定画面，该输入设定画面用于使用户输入与所述一个或多个显示区域对应的试样容器中所容纳的试样的信息；以及
试样信息获取部，其将通过用户的操作来在由所述试样信息设定画面显示处理部显示的输入设定画面上输入的试样信息与试样容器标识符相对应地进行存储。
4.根据权利要求3所述的自动分析系统，其特征在于，
所述显示处理部将所述第一试样配置图像内的与各试样容器对应的显示区域的显示方式按被设定了试样信息的试样和未被设定试样信息的试样来进行变更。
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