CN111019921B - 一种高耐受性的脂类水解酶e93及其编码基因与应用 - Google Patents

一种高耐受性的脂类水解酶e93及其编码基因与应用 Download PDF

Info

Publication number
CN111019921B
CN111019921B CN201911211946.1A CN201911211946A CN111019921B CN 111019921 B CN111019921 B CN 111019921B CN 201911211946 A CN201911211946 A CN 201911211946A CN 111019921 B CN111019921 B CN 111019921B
Authority
CN
China
Prior art keywords
polypeptide
hydrolase
host
esters
ala
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Active
Application number
CN201911211946.1A
Other languages
English (en)
Other versions
CN111019921A (zh
Inventor
程虹
李杨
许学伟
吴月红
周鹏
孟凡旭
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Second Institute of Oceanography MNR
Original Assignee
Second Institute of Oceanography MNR
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Second Institute of Oceanography MNR filed Critical Second Institute of Oceanography MNR
Priority to CN201911211946.1A priority Critical patent/CN111019921B/zh
Publication of CN111019921A publication Critical patent/CN111019921A/zh
Application granted granted Critical
Publication of CN111019921B publication Critical patent/CN111019921B/zh
Active legal-status Critical Current
Anticipated expiration legal-status Critical

Links

Images

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/14Hydrolases (3)
    • C12N9/16Hydrolases (3) acting on ester bonds (3.1)
    • C12N9/18Carboxylic ester hydrolases (3.1.1)
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/70Vectors or expression systems specially adapted for E. coli
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12PFERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
    • C12P13/00Preparation of nitrogen-containing organic compounds
    • C12P13/008Preparation of nitrogen-containing organic compounds containing a N-O bond, e.g. nitro (-NO2), nitroso (-NO)
    • YGENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
    • Y02TECHNOLOGIES OR APPLICATIONS FOR MITIGATION OR ADAPTATION AGAINST CLIMATE CHANGE
    • Y02EREDUCTION OF GREENHOUSE GAS [GHG] EMISSIONS, RELATED TO ENERGY GENERATION, TRANSMISSION OR DISTRIBUTION
    • Y02E50/00Technologies for the production of fuel of non-fossil origin
    • Y02E50/10Biofuels, e.g. bio-diesel

Landscapes

  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
  • Enzymes And Modification Thereof (AREA)

Abstract

本发明公开了一种对金属离子及有机溶剂高耐受性催化酯类水解的脂类水解酶E93及其应用。本发明所涉及脂类水解酶基因来自海洋细菌Altererythrobacter indicus DSM18604,所述的脂类水解酶基因经大肠杆菌E.coli菌株异源表达后,对于短链脂肪酸具有高催化活性,具有较好的热稳定性和对金属离子和有机溶剂较强的适应性,使其可应用于废水处理、精细化工、制药和环境修复等含盐和含有机溶剂条件下的工业生产。

Description

一种高耐受性的脂类水解酶E93及其编码基因与应用
技术领域
本发明属于基因工程领域,具体涉及一种海洋细菌来源具有金属离子及有机溶剂耐受性的第七家族脂类水解酶及应用。
背景技术
脂类水解酶广泛存在于微生物、动物和植物中,是一种能够催化脂肪酸酯键水解或合成反应的一类水解酶的总称。脂类水解酶参与生物体多个代谢过程,在酯类运输、细胞结构构建以及能量代谢中发挥重要功能,是维持生命体生存所必需的酶类之一。
细菌第七家族酯类水解酶成员是酯类水解酶家族中分子量最大的,约55kDa,在系统发育地位上与来自哺乳动物的乙酰胆碱酯酶、肝/肠羧酸酯酶同源性较高,通常与生物体内的药物等化合物的水解息息相关。第七家族羧酸酯酶是具有广泛底物谱的一类水解酶。广泛底物谱和功能多样性使该家族水解酶在诸如食品、医药、纺织、洗涤、污水处理、环境修复等领域具有广泛的潜在应用价值,成为国内外研究热点。
本发明从一种海洋细菌中筛选到一种新型第七家族水解酶基因,并对该基因进行了重组表达。重组酶具有金属离子以及有机溶剂耐受性,可用于精细化工、制药、洗涤、废水处理和环境修复等工业领域。
发明内容
本发明的目的是提供一种新的海洋细菌来源水解酶、其编码基因及其制备方法,该水解酶可用于广泛pH条件下高温反应中酯类降解及其他酯类化合物的生物催化和转化。
本发明涉及具有水解酶活性的分离的多肽,其选自下组:
(a)多肽,其与SEQ ID NO:2的多肽所示序列一致;或
(b)多肽,其为SEQ ID NO:2所示多肽的远离催化中心位置进行各种取代、添加和/或缺失一个或几个氨基酸得到的突变体,该突变体具有与SEQ ID NO:2所示的蛋白序列至少90%以上的同源性及至少90%以上的水解酶活性。
本发明所述的具有水解酶活性的多肽,其来源于海水的中温细菌Altererythrobacter indicus。所述菌株购自德国DSMZ菌种保藏中心,保藏编号为:DSM18604。
本发明针对分离自海水的中温细菌Altererythrobacter indicus DSM18604,通过对其基因组DNA序列分析,筛选获得水解酶基因e93,其核苷酸序列如SEQ ID No.1所示。基因e93大小为1566bp,碱基组成为317A(20.24%)、314T(20.05%)、481C(30.71%)和454G(28.99%),编码蛋白大小为521个氨基酸残基,分子量57kDa。其氨基酸序列如SEQ ID No.2所示。将该水解酶E93氨基酸序列在GenBank数据库中进行同源搜索,与之一致性最高的是细菌菌株Erythrobacter xanthus来源羧酸酯酶,一致性为77.04%(其在GenBank数据库中的注册号为WP_119594820.1),序列功能迄今为止尚无正式论文或图书发表。
氨基酸序列分析结果表明,水解酶E93蛋白包含发挥酶活所需要的催化三联体Ser189-Gln314-His414,其中丝氨酸位于一段酯类水解酶家族保守序列内(Gly187-Gln188-Ser189-Gly190-Gly191),辅助催化作用顺利进行的氧离子洞位于His102-Gly103-Gly104-Gly105,在系统发育上的关系其它第七家族酯酶最近,与第七家族其它酯酶成员的序列相似度在40%以下。综上所述,E93应为第七家族羧酸酯酶家族中的一名新成员。
在不影响水解酶E93蛋白活性前提下,可对SEQ ID NO:2所示的远离催化中心氨基酸位置的氨基酸序列进行各种取代、添加和/或缺失一个或几个氨基酸得到水解酶突变体。如前所述,本发明所述的水解酶E93的催化中心为SEQ ID NO:2所示的187-191,314,414位点的氨基酸位置。根据本领域技术的公知常识,蛋白质的生物学活性是和其功能结构域密切相关的。一般来说,只有发生在功能结构域的位点突变可能对蛋白质的二维和三维结构产生影响,从而影响其生物学活性。而对于发生在远离功能结构域187-191,314,414位氨基酸位置的氨基酸位点,由于这一区域不参与蛋白功能构象,因而氨基酸的个别点突变不会对蛋白质的生物学活性产生实质性影响,从而能够基本保留原蛋白质的生物学功能。优选的水解酶E93具有至少与SEQ ID NO:2所示的氨基酸序列90%以上的同源性,更优选具有至少95%以上的同源性,最优选具有至少99%以上的同源性。所述的突变体能够基本保留水解酶E93的生物学功能,优选该突变体具有与SEQ ID NO:2所示氨基酸序列的水解酶E93至少90%以上的酶活性,更优选具有至少95%以上的酶活性,最优选至少99%以上的酶活性。更优选的,所述的突变体具有与SEQ ID NO:2所示的氨基酸序列至少95%以上的同源性及至少95%以上的水解酶活性。最优选的,所述的突变体具有与SEQ ID NO:2所示的氨基酸序列至少99%以上的同源性及至少99%以上的水解酶活性,且该水解酶E93来源于海水的中温细菌Altererythrobacter indicus。
本发明还涉及SEQ ID NO:2的成熟多肽或其同源序列的包含取代、缺失和/或插入一个或多个氨基酸的人工变体,突变位置优选小于5个,更优选小于3个,最优选仅为1个位置氨基酸的突变。保守取代的实例是在以下组之内:碱性氨基酸组(精氨酸、赖氨酸和组氨酸)、酸性氨基酸组(谷氨酸和天冬氨酸)、极性氨基酸组(谷氨酰胺和天冬酰胺)、疏水氨基酸组(亮氨酸、异亮氨酸和缬氨酸)、芳族氨基酸组(苯丙氨酸、色氨酸和酪氨酸)和小氨基酸组(甘氨酸、丙氨酸、丝氨酸、苏氨酸和甲硫氨酸)。通常不改变比活性的氨基酸取代是本领域已知的,并且由例如Η.Neurath和R.L.Hill,1979于The Proteins,Academic Press,NewYork中描述。最普遍发生的交换是Ala/Ser、Val/Ile、Asp/Glu、Thr/Ser、Ala/Gly、Ala/Thr、Ser/Asn、Ala/Val、Ser/Gly、Tyr/Phe、Ala/Pro、Lys/Arg、Asp/Asn、Leu/Ile、Leu/Val、Ala/Glu和Asp/Gly等。
可使用已知的诱变、重组和/或改组方法,然后进行相关的筛选过程,如由Reidhaar-Olson和Sauer,1988,Science,241:53-57;Bowie和Sauer,1989,Proc.Natl.Acad.Sci.USA86:2152-2156;WO95/17413或者WO95/22625所公开的那些,进行一个或多个氨基酸取代、缺失和/或插入并加以测试。其他可使用的方法包括易错PCR、噬菌体展示(例如Lowman等,1991,Biochemistry 30:10832-10837;美国专利号5,223,409;WO92/06204)和区域定向诱变(region-directed mutagenesis)(Derbyshire等,1986,Gene46:145和1988,DNA7:127)。
本发明还涉及分离的多核苷酸,其包含编码本发明具有水解酶活性的水解酶E93的核苷酸序列,或由编码本发明具有水解酶E93活性的突变体的核苷酸序列组成。
本发明涉及编码具有水解酶E93活性的分离的多核苷酸,其选自下组:
(a)多核苷酸,其与SEQ ID NO:1的核苷酸所示序列一致;或
(b)多核苷酸,其为对SEQ ID NO.1所示的核苷酸序列中除559-573、940-942、1240-1242位核苷酸外的其他核苷酸进行替换、添加和/或缺失一个或几个核苷酸得到的突变体基因,该多核苷酸具有与SEQ ID NO:1所示的核苷酸序列至少90%以上的同源性。
本发明还涉及分离的多核苷酸,其包含编码本发明水解酶E93的核苷酸序列。该序列与SEQ ID NO.1所示的核苷酸序列一致;将该水解酶基因序列在GenBank数据库中进行同源搜索,与之一致性最高的是细菌菌株Erythrobacter xanthus来源羧酸酯酶,一致性为77.04%(其在GenBank数据库中的注册号为WP_119594820.1)。
本发明还提供对SEQ ID NO.1所示的核苷酸序列中除559-573、940-942、1240-1242位核苷酸外的其他核苷酸进行替换、添加和/或缺失一个或几个核苷酸从而获得编码能基本保留水解酶E93蛋白生物学活性的突变体基因。优选的水解酶E93突变体基因具有至少与SEQ ID NO:1所示的核苷酸序列90%以上的同源性,更优选具有至少95%以上的同源性,最优选具有至少99%以上的同源性,且该水解酶E93来源于海水的中温细菌Altererythrobacter indicus。。
本发明还涉及包含本发明的分离的多核苷酸的核酸构建体,可以用许多方式操作编码本发明水解酶的分离的多核苷酸以提供水解酶的表达。所述分离的多核苷酸与一个或多个调控序列可操作地连接,所述调控序列在合适的宿主细胞中在与该调控序列相容的条件下指导编码序列的表达。调控序列可以是适当的启动子序列,其是由用于表达编码本发明多肽的多核苷酸的宿主细胞识别的核苷酸序列。启动子序列含有介导多肽的表达的转录调控序列。启动子可以是在所选的宿主细胞中显示转录活性的任何核苷酸序列,包括突变的、截短的和杂合的启动子,并且可以从编码与宿主细胞同源或异源的胞外或胞内多肽的基因获得。
利用基因克隆技术,可将克隆到的水解酶E93基因连接到合适的载体上。合适的载体为本领域技术人员所熟知的各种可商业化购买的原核或真核表达载体,原核表达载体如pET系列载体,pQE系列载体;酵母表达载体pPICZ-α-A,pHIL-D2,pPIC9,pHIL-S1(Invitrogen Corp.San Diego.California.USA);动物细胞表达载体pSVK3、pMSG(Amersham Pharmacia Biotech Inc.USA)等。
本发明还涉及重组宿主细胞,其包含本发明的分离的多核苷酸,可有利地用于水解酶E93的重组生产中。将包含本发明的多核苷酸的载体导入宿主细胞,宿主细胞的选择在很大程度上依赖于编码多肽的基因及其来源。宿主细胞可以是在本发明的水解酶E93的重组产生中有用的任何细胞,例如原核或真核细胞。利用基因克隆技术,可将克隆到的水解酶E93基因连接到合适的载体上,并转化或转染到原核生物或真核生物宿主表达制备重组水解酶E93。合适的原核生物宿主包括各种细菌如E.coli等,可通过如下原生质体转化或或电穿孔法将载体转化到原核细胞中。合适的真核生物宿主包括酵母(如甲醇酵母)及哺乳动物细胞(如中国仓鼠卵巢细胞)等。本发明优选采用原核表达系统E.coli表达水解酶E93。在一个优选的实施方案中,利用基因克隆技术,可将克隆到的水解酶E93基因连接到载体上pSMT3(Herrmann,J.1996)上,并转化至原核生物E.coli菌株,利用重组载体pSMT3-E93中强启动子大量表达E93融合蛋白。
本发明还涉及用于产生本发明所述水解酶E93的方法,其包括:
(a)在有助于产生水解酶E93的条件下培养重组宿主细胞,其中所述宿主细胞包含SEQ ID NO:1所示核苷酸或远离其559-573、940-942、1240-1242位核苷酸外至少一个突变位点的核苷酸;和
(b)回收所述多肽。
在本发明的产生方法中,使用本领域已知的方法在适合于产生所述水解酶E93的营养培养基中培养细胞。例如,可以通过在合适培养基中和允许表达和/或分离所述水解酶的条件下进行的摇瓶培养,和实验室或工业发酵罐中的小规模或大规模发酵(包括连续、分批、补料分批或固态发酵)来培养细胞。使用本领域已知的方法在合适的营养培养基中进行培养,所述营养培养基包含碳源和氮源和无机盐。合适的培养基能够从商业供应商获得或可以根据公开的组成制备。如果多肽分泌到营养培养基中,该多肽能够从所述培养基中直接回收。如果多肽不分泌,则其能够从细胞裂解物回收。
所得水解酶E93可以使用本领域已知的方法回收。例如,可以通过常规方法从营养培养基中回收,所述常规方法包括但不限于离心、过滤、提取、喷雾干燥、蒸发或沉淀。可以通过多种本领域已知的方法纯化,所述方法包括但不限于层析(例如,离子交换、亲和、疏水、层析聚焦和大小排阻)或差示溶解度(例如硫酸铵沉淀)等方法。
本发明还提供了水解酶E93或能表达水解酶E93的宿主菌在工业上的应用,例如可用于催化酯类水解。通过酯酶活力测定表明,水解酶E93具有酯酶活性。E93或上述能表达E93的宿主菌可用于水解短链脂肪酸酯,例如C2-C12链脂肪酸酯,包括对硝基苯酚乙酸酯(C2),对硝基苯酚丁酸酯(C4),对硝基苯酚己酸酯(C6),对硝基苯酚辛酸酯(C8),对硝基苯酚癸酸酯(C10),对硝基苯酚十二酸酯(C12)。
经测定表明,水解酶E93对酰基碳链较短脂类物质具有较好催化活性,对于短链脂类的水解活力优于长链脂类。因此,更优选E93水解酶用于催化水解C2-C8短链脂肪酸酯,例如对硝基苯酚乙酸酯(C2),对硝基苯酚丁酸酯(C4),对硝基苯酚己酸酯(C6),对硝基苯酚辛酸酯(C8),最适的短链脂肪酸脂底物为具有C6短碳链的对硝基苯酚酯,例如对硝基苯酚己酸酯。
E93催化水解活性在pH范围6.0~8.0有很高的活性(为最大酶活的60%以上),最适pH为6.0。温度范围为25~55℃,最适反应温度45℃,。在20~60℃中孵育6h,仍能保持50%以上活性;E93活性会被Cu2+、Ni2+、Cd2+、Co2+和Zn2+离子明显抑制,Sr2+、Ca2+和EDTA存在下对酶活有不同程度的促进作用。Triton X-100和SDS对E93活性抑制作用较为明显。
从海水分离的的细菌Altererythrobacter indicus DSM18604中筛选获得新的耐受金属离子及有机溶剂的水解酶基因,发现了该基因编码蛋白具有优良的酶学特性,可应用于催化酯类水解的生产过程中。获得的水解酶基因可克隆到合适的宿主中实现异源表达,实现工业化生产。该水解酶可应用于环境中,包括酸性、中性及碱性水解环境,为后续的工业应用提供成本低廉的热稳定水解酶。该酶的生产可在洗涤剂、废水处理、精细化工、制药和环境修复等不同pH环境的生产工艺中显示出重要的经济和社会价值。
附图说明
图1为水解酶E93的底物特异性图。C2:对硝基苯酚乙酸酯;C4:对硝基苯酚丁酸酯、C6:对硝基苯酚己酸酯;C8:对硝基苯酚辛酸酯;C10:对硝基苯酚癸酸酯;C12:对硝基苯酚十二酸酯;C14对硝基苯酚十四酸酯;C16:对硝基苯酚十六酸酯。定义底物为C6时测定值为100%。
图2为水解酶E93最适反应pH图。
图3为水解酶E93最适反应温度图。
图4为水解酶E93不同温度下热稳定性图。
图5为二价阳离子对水解酶E93活性影响图。
图6为有机溶剂对水解酶E93活性影响图。
图7 E93蛋白空间结构及与rCE结构比对图
具体实施方式
实施例1水解酶基因E93的获取
基于分离自海水的细菌Altererythrobacter indicus DSM18604全基因组、开放阅读框预测及基因注释结果,筛选脂类水解酶相关基因。通过Blastp(http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/)比对序列与数据库中已知水解酶基因序列的同源性。经数据库比对分析获得e93基因,含有1566bp,碱基组成为317A(20.24%)、314T(20.05%)、481C(30.71%)和454G(28.99%),其核苷酸序列如SEQ ID No:1所示。编码蛋白大小为521个氨基酸残基,分子量57kDa,其氨基酸序列如下所示(其三字母氨基酸序列如SEQ ID No.2所示):
Figure BDA0002298390650000111
将该水解酶E93氨基酸序列在GenBank数据库中进行同源搜索,与之一致性最高的是细菌菌株Erythrobacter xanthus来源羧酸酯酶,一致性为77.04%(其在GenBank数据库中的注册号为WP_119594820.1),序列功能迄今为止尚无正式论文或图书发表。氨基酸序列分析表明,该蛋白包含发挥酶活所需要的催化三联体Ser189-Gln314-His414,其中丝氨酸位于一段酯类水解酶家族保守序列内(Gly187-Gln188-Ser189-Gly190-Gly191),辅助催化作用顺利进行的氧离子洞位于His102-Gly103-Gly104-Gly105,在系统发育上的关系其它第七家族酯酶最近,与第七家族其它酯酶成员的序列相似度在40%以下。
综上所述,E93应为第七家族羧酸酯酶家族中的一名新成员。
实施例2 E93二级及三级蛋白结构分析
将本发明获得的E93氨基酸序列置于蛋白结构预测软件SWISS-MODEL分析,结果表明E93由25个α螺旋和13个β折叠构成。通过蛋白三维空间比对显示(图7),E93蛋白三级结构与rCE蛋白相近。
实施例3基因e93的重组表达质粒和重组菌株的构建
将本发明获得的基因e93克隆到表达载体上,构建重组表达菌株。基于NCBI ORFFinder的ORF分析获得的基因开放阅读框序列,设计扩增全基因的引物,其中:
上游引物e93F:
5’-TCGCGGATCCATGGCCCGCACTCGCTATG-3’,BamHI;
下游引物e93R:
5’-ATTTGCGGCCGCTCATGAAGACTTCTCCAATACG-3’,SacI;
PCR扩增确认基因全长序列。采用酶切克隆的方法构建表达质粒,即用BamHI和SacI双酶切PCR产物,纯化后的片段与经BamHI和SacI双酶切的质粒pSMT3连接,采用CaCl2转化法转化至E.coli DH5α中,卡那霉素抗性筛选阳性克隆。采用质粒抽提试剂盒(Omega,美国)提取阳性克隆的质粒,经BamHI和SacI双酶切鉴定,获得1566bp左右的DNA片段,经测序鉴定为基因e93。将重组表达质粒转化到E.coli(BL21)表达菌株中,构建表达重组菌株。
实施例4利用重组表达菌株表达重组基因e93
将构建好的3ml重组表达菌株转接到100ml含有50μg/ml卡那霉素和34μg/ml氯霉素的LB液体培养基中,37℃振荡培养至OD600达到0.6,加入终浓度为0.5mM的IPTG进行诱导表达,转入20℃以150r/min振荡培养16h。低温离心收集菌体,重悬于NTA-10溶液(500mM氯化钠,10mM咪唑,20mM Tris盐酸,pH 8.0)中,在冰上进行超声波破碎处理。低温离心收集上清,采用NTA-Ni2+亲和柱层析纯化表达蛋白。所表达的重组蛋白含有N端的6×His tag,可亲和吸附到层吸柱上,经过不同浓度的咪唑溶液梯度洗脱,收集洗脱液。经SDS-PAGE检测目的蛋白在洗脱液中的分布情况。利用ULP1酶在透析袋中切除重组蛋白N端的类泛素SUMO,并采用NTA-Ni2+亲和柱层析去除SUMO蛋白,收集样品进行SDS-PAGE检测。得到电泳纯的重组蛋白E93,分子量约57kDa。用Brandford法测定蛋白质浓度。
实施例5重组基因E93的活性检测
利用对硝基苯酚己酸酯法测定纯化的重组水解酶E93活性。具体操作:1ml反应体系中包括1mM对硝基苯酚己酸酯,100mM NaH2PO4-Na2HPO4缓冲液(pH 7.5)和1.54μg纯酶蛋白,采用紫外可见光分光光度计(Beckman DU800型,美国)于45℃条件下连续测定吸光值A405 2min,使用失活的酶液作为对照用于调零。一个酶活力单位定义为每分钟从对硝基苯酚酯催化产生lμmol对硝基苯酚的所需要的酶量。测得的酯酶活性为1.77U/mg。
实施例6水解酶E93底物特异性分析
水解酶E93的底物特异性分析采用体系(1ml):100mM NaH2PO4-Na2HPO4缓冲液(pH7.5),1mM底物,加入1.54μg纯酶蛋白,在45℃下连续测定吸光值A405 2min。测定采用的底物为:对硝基苯酚乙酸酯(C2),对硝基苯酚丁酸酯(C4),对硝基苯酚己酸酯(C6),对硝基苯酚辛酸酯(C8),对硝基苯酚癸酸酯(C10),对硝基苯酚十二酸酯(C12),对硝基苯酚十四酸酯(C14),对硝基苯酚十六酸酯(C16)。经测定表明,E93对酰基碳链较短的对硝基苯酚酯(C2、C4、C6和C8)具有较高催化活性,其中底物为对硝基苯酚己酸酯(C6)时催化活性最高(图1)。结果表明,水解酶E93对酰基碳链较短脂类物质具有较好催化活性,对于短链脂类的水解活力优于长链脂类。
实施例7水解酶E93最适反应条件分析
水解酶E93最适反应pH在6.0到8.0范围内测定。具体操作为:在不同pH缓冲液中加入1mM对硝基苯酚己酸酯和1.54μg纯酶蛋白,在45℃下连续测定吸光值A348 2min。测定使用的缓冲液为:100mM柠檬酸-柠檬酸钠缓冲液(pH 3.0~6.0),100mM磷酸二氢钾-氢氧化钠缓冲液(pH6.0~7.5),100mM Tris盐酸缓冲液(pH 7.5~9.0)和50mM 2-环己胺基乙磺酸-氢氧化钠缓冲液(pH 9.0~10.5)。测定结果表明,E93最适反应pH为6.0,在pH 6.0~8.0范围内具有活性(图2)。
水解酶E93最适反应温度在25~55摄氏度范围内测定。具体操作为:1ml反应体系中,加入1mM对硝基苯酚己酸酯,100mM NaH2PO4-Na2HPO4缓冲液(pH 7.5)和1.54μg纯酶蛋白,分别在15、20、25、30、35、40和45摄氏度条件下连续测定吸光值A405 2min。测定结果表明E93的反应温度范围为25~55摄氏度,最适反应温度为45摄氏度(图3)。
实施例8水解酶E93酶学稳定性分析
水解酶E93的热稳定性分析具体操作为:在20至60摄氏度温度区间内每10摄氏度为一个梯度建立温度梯度。将酶液分别在各温度梯度条件下孵育1h和2h,测定酶的活性;测活体系为:1ml反应体系中,加入1mM对硝基苯酚己酸酯,100mM NaH2PO4-Na2HPO4缓冲液(pH7.5)和1.54μg纯酶蛋白,于45℃下连续测定吸光值A405 2min。结果表明,在20~40摄氏度中孵育1h条件下,E93仍能保持50%以上活性(图4);说明E93具有较好的热稳定性。
二价阳离子对水解酶E93活性影响的测定具体操作为:在反应体系中分别加入10mM Ba2+、Ca2+、Cd2+、Co2+、Cu2+、Mg2+、Mn2+、Ni2+、Sr2+、Zn2+和乙二胺四乙酸(EDTA),测定酶活性。测酶活体系为:1ml反应体系中,加入1mM对硝基苯酚丁酸酯,100mM NaH2PO4-Na2HPO4缓冲液(pH 7.5)和1.54μg纯酶蛋白,于45℃下连续测定吸光值A405 2min。测定结果表明,E93活性会被Cu2+、Ni2+、Cd2+、Co2+和Zn2+离子明显抑制,Sr2+、Ca2+和EDTA存在下对酶活有不同程度的促进作用(图5)。
有机溶剂对水解酶E93活性影响的测定具体操作为:在反应体系中分别加入有机溶剂,测定酶的活性。加入有机溶剂的用量与种类有5%(v/v):丙酮(Acetone)、乙腈(Acetonitrile)、乙醇(Ethanol)、二甲基甲酰胺(DMF)、二甲基亚砜(DMSO)、甘油(Glycerol)、异丙醇(Isopropanol)和甲醇(Methanol)。1%(v/v):土温20(T20)、土温80(T80),或100倍Triton,测活体系为:1ml反应体系中,加入1mM对硝基苯酚己酸酯,100mMNaH2PO4-Na2HPO4缓冲液(pH 7.5)和1.54μg纯酶蛋白,于45℃下连续测定吸光值A405 2min。测定结果表明,Triton X-100和SDS对E93活性抑制作用较为明显(图6)。
Figure BDA0002298390650000171
Figure BDA0002298390650000181
Figure BDA0002298390650000191
Figure BDA0002298390650000201
Figure BDA0002298390650000211
Figure BDA0002298390650000221
序列表
<110> 自然资源部第二海洋研究所
<120> 一种高耐受性的脂类水解酶E93及其编码基因与应用
<160> 2
<170> SIPOSequenceListing 1.0
<210> 1
<211> 1566
<212> DNA
<213> Altererythrobacter indicus
<400> 1
atggcccgca ctcgctatgg cccggttatc ggcaaagtcg aacagggcgc actggccttc 60
aagggcattc catatggggc accgaccagc gggagcggcc ggttcatgcc ccctacgccc 120
ccgcagccat ggagcacccc gctgcgcgcc ttcgattatg ggccgactgc cccgcagagc 180
gatccgcaag acgctctgga atcgggagct gccgacgccc gcgaaagcga agattgcctg 240
accctcaatg tctggactcc ctccctcaac gatcagcgca aacgcccggt catggtctgg 300
ctccacggcg gcggcctgtg gcgcttgtcg gcagcgggag actatcaggc aggaacgcat 360
ctggcagccc atagcgatgt tgtcatggtc agccccaatc accggctcaa cgtgttggct 420
cacgcttatc tcgacgaata tgatccagct tttgcagggt cctccagtgc aggaatgctc 480
gatctggtgc tggcgctcaa atgggtgcgc gacaatatcg aggaatttgg cggtgatccg 540
gacaatgtga ctatttttgg ccagtccggc gggggacaga aagtgtcctt cctgatggcg 600
atgcccgccg cggcaggcct gttccataag gccatcatcc agagcggccc ggccccgctt 660
gcgcttgaaa aaccctatgc ccgtgaatta agcgcaagat tgctcacttt actggacatt 720
ccgaagaacc gggtgcgcga tattcagaat gtgccgcttg atgcgatcat gcgggcctat 780
taccagattt ttgaagagct gggcggcttc ggtgtcatgg gagtgattca ggatttcgct 840
ccggtcgtcg atgatgtggc gctgccgcag catcccttct ggaacggggc ctccccccta 900
tcgcgcgatg ttccgctgat gatcggctgc acccgcaccg aaatgaccga gtatttcctg 960
gccagcaacc ccggcgcggc caagcgggat tttgcggcag tgactgctca gctggagcct 1020
gtttttggca tgcaggcacc cgcagtcgtg gcccactatc gcgccaccca ccccacagcg 1080
agcccgtggg aagtggatgc actgatccgg tccgactggc caacccggct gttcacccaa 1140
cgcattgcag atgagcaggt caaattgggg ggcgcaccgg tctggatgta ccggatggac 1200
tggcagacga ctgcgcgtga cggattgtta atgtcgcccc acgcaattga catccccttc 1260
gtgctggaca cggtcggcac cgaaccggtc gagcccggtc agttggccga acagcagcgt 1320
atgatgcagc agatgaacaa tgcgtgggtg tcctttgccc gcaacggcaa tccgcaaaac 1380
aaatatattc caccatggca gccctataat tccacgtcgc ggccaacgat gatcttcaat 1440
ctgcacagcc acatggccaa cgatccagac ggatcagatc ttgctttcct gaaaaaagac 1500
ctcgccaatt tagaggtcgt cgcgggtggt gtcacccatc cccccgtatt ggagaagtct 1560
tcatga 1566
<210> 2
<211> 521
<212> PRT
<213> Altererythrobacter indicus
<400> 2
Met Ala Arg Thr Arg Tyr Gly Pro Val Ile Gly Lys Val Glu Gln Gly
1               5                   10                  15
Ala Leu Ala Phe Lys Gly Ile Pro Tyr Gly Ala Pro Thr Ser Gly Ser
            20                  25                  30
Gly Arg Phe Met Pro Pro Thr Pro Pro Gln Pro Trp Ser Thr Pro Leu
        35                  40                  45
Arg Ala Phe Asp Tyr Gly Pro Thr Ala Pro Gln Ser Asp Pro Gln Asp
    50                  55                  60
Ala Leu Glu Ser Gly Ala Ala Asp Ala Arg Glu Ser Glu Asp Cys Leu
65                  70                  75                  80
Thr Leu Asn Val Trp Thr Pro Ser Leu Asn Asp Gln Arg Lys Arg Pro
                85                  90                  95
Val Met Val Trp Leu His Gly Gly Gly Leu Trp Arg Leu Ser Ala Ala
            100                 105                 110
Gly Asp Tyr Gln Ala Gly Thr His Leu Ala Ala His Ser Asp Val Val
        115                 120                 125
Met Val Ser Pro Asn His Arg Leu Asn Val Leu Ala His Ala Tyr Leu
    130                 135                 140
Asp Glu Tyr Asp Pro Ala Phe Ala Gly Ser Ser Ser Ala Gly Met Leu
145                 150                 155                 160
Asp Leu Val Leu Ala Leu Lys Trp Val Arg Asp Asn Ile Glu Glu Phe
                165                 170                 175
Gly Gly Asp Pro Asp Asn Val Thr Ile Phe Gly Gln Ser Gly Gly Gly
            180                 185                 190
Gln Lys Val Ser Phe Leu Met Ala Met Pro Ala Ala Ala Gly Leu Phe
        195                 200                 205
His Lys Ala Ile Ile Gln Ser Gly Pro Ala Pro Leu Ala Leu Glu Lys
    210                 215                 220
Pro Tyr Ala Arg Glu Leu Ser Ala Arg Leu Leu Thr Leu Leu Asp Ile
225                 230                 235                 240
Pro Lys Asn Arg Val Arg Asp Ile Gln Asn Val Pro Leu Asp Ala Ile
                245                 250                 255
Met Arg Ala Tyr Tyr Gln Ile Phe Glu Glu Leu Gly Gly Phe Gly Val
            260                 265                 270
Met Gly Val Ile Gln Asp Phe Ala Pro Val Val Asp Asp Val Ala Leu
        275                 280                 285
Pro Gln His Pro Phe Trp Asn Gly Ala Ser Pro Leu Ser Arg Asp Val
    290                 295                 300
Pro Leu Met Ile Gly Cys Thr Arg Thr Glu Met Thr Glu Tyr Phe Leu
305                 310                 315                 320
Ala Ser Asn Pro Gly Ala Ala Lys Arg Asp Phe Ala Ala Val Thr Ala
                325                 330                 335
Gln Leu Glu Pro Val Phe Gly Met Gln Ala Pro Ala Val Val Ala His
            340                 345                 350
Tyr Arg Ala Thr His Pro Thr Ala Ser Pro Trp Glu Val Asp Ala Leu
        355                 360                 365
Ile Arg Ser Asp Trp Pro Thr Arg Leu Phe Thr Gln Arg Ile Ala Asp
    370                 375                 380
Glu Gln Val Lys Leu Gly Gly Ala Pro Val Trp Met Tyr Arg Met Asp
385                 390                 395                 400
Trp Gln Thr Thr Ala Arg Asp Gly Leu Leu Met Ser Pro His Ala Ile
                405                 410                 415
Asp Ile Pro Phe Val Leu Asp Thr Val Gly Thr Glu Pro Val Glu Pro
            420                 425                 430
Gly Gln Leu Ala Glu Gln Gln Arg Met Met Gln Gln Met Asn Asn Ala
        435                 440                 445
Trp Val Ser Phe Ala Arg Asn Gly Asn Pro Gln Asn Lys Tyr Ile Pro
    450                 455                 460
Pro Trp Gln Pro Tyr Asn Ser Thr Ser Arg Pro Thr Met Ile Phe Asn
465                 470                 475                 480
Leu His Ser His Met Ala Asn Asp Pro Asp Gly Ser Asp Leu Ala Phe
                485                 490                 495
Leu Lys Lys Asp Leu Ala Asn Leu Glu Val Val Ala Gly Gly Val Thr
            500                 505                 510
His Pro Pro Val Leu Glu Lys Ser Ser
        515                 520

Claims (25)

1.一种具有水解酶活性的分离的多肽,其与SEQ ID NO:2的多肽所示序列一致。
2.根据权利要求1所述的多肽,其特征在于:所述的具有水解酶活性的多肽,其来源于海水的中温细菌Altererythrobacter indicus。
3.根据权利要求1所述的多肽,其特征在于:所述的多肽包含发挥酶活所需要的催化三联体Ser189-Gln314-His414,其中丝氨酸位于酯类水解酶家族保守序列Gly187-Gln188-Ser189-Gly190-Gly191内,辅助催化作用顺利进行的氧离子洞位于His102-Gly103-Gly104-Gly105。
4.编码权利要求1所述多肽的多核苷酸,其与SEQ ID NO:1的核苷酸所示序列一致。
5.一种核酸构建体,其包含与一种或多种调控序列可操作地连接的如权利要求4所述的多核苷酸,所述调控序列在合适的表达宿主中指导所述多肽的产生。
6.一种重组表达载体,其包含权利要求5的核酸构建体。
7.根据权利要求6所述的重组表达载体,其特征在于:所述的载体为原核表达载体pET系列载体、pQE系列载体;酵母表达载体pPICZ-α-A、pHIL-D2、pPIC9、pHIL-S1;或动物细胞表达载体pSVK3、pMSG。
8.根据权利要求7所述的重组表达载体,其特征在于:所述的载体为大肠杆菌表达载体pSMT3。
9.一种宿主,其由权利要求6-8任一项所述的载体经转化或转染原核生物或真核生物宿主得到。
10.根据权利要求9所述的宿主,其为细菌、酵母或哺乳动物细胞。
11.根据权利要求10所述的宿主,其为E.coli细菌、甲醇酵母或中国仓鼠卵巢细胞。
12.根据权利要求11所述的宿主,其为E.coli细菌。
13.一种制备权利要求1-3任一项所述多肽的方法,其包括:
(a)、在有助于产生多肽的条件下培养权利要求9所述的宿主,其中所述宿主包含SEQID NO:1所示核苷酸;
(b)、回收所述多肽。
14.根据权利要求13所述的方法,其特征在于:所述方法步骤(2)中,回收方法包括离心、过滤、提取、喷雾干燥、蒸发或沉淀。
15.根据权利要求14所述的方法,其特征在于:所述方法步骤(2)中,通过多种本领域已知的方法纯化,所述方法包括离子交换层析、亲和层析、疏水层析、层析聚焦层析、大小排阻层析或差示溶解度方法。
16.权利要求1所述的多肽或权利要求9所述的能表达多肽的宿主在催化酯类水解中的应用。
17.根据权利要求16所述的应用,其特征在于,所述的酯类为C2-C12短链脂肪酸酯。
18.根据权利要求17所述的应用,其特征在于,所述的酯类为对硝基苯酚乙酸酯,对硝基苯酚丁酸酯,对硝基苯酚己酸酯,对硝基苯酚辛酸酯,对硝基苯酚癸酸酯,对硝基苯酚十二酸酯。
19.根据权利要求17所述的应用,其特征在于,所述的酯类为C2-C8短链脂肪酸酯。
20.根据权利要求19所述的应用,其特征在于,所述的酯类为具有C6短碳链的对硝基苯酚酯。
21.根据权利要求20所述的应用,其特征在于,所述的酯类为对硝基苯酚己酸酯。
22.根据权利要求16-21任一项所述的应用,其特征在于,所述的多肽水解酶催化水解温度范围为25~55℃。
23.根据权利要求22所述的应用,其特征在于,所述的多肽水解酶催化水解温度范围为45℃。
24.根据权利要求16-21任一项所述的应用,其特征在于,所述的多肽水解酶催化水解的pH值范围为6.0~8.0。
25.根据权利要求24所述的应用,其特征在于,所述的多肽水解酶催化水解的pH值为6.0。
CN201911211946.1A 2019-12-02 2019-12-02 一种高耐受性的脂类水解酶e93及其编码基因与应用 Active CN111019921B (zh)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CN201911211946.1A CN111019921B (zh) 2019-12-02 2019-12-02 一种高耐受性的脂类水解酶e93及其编码基因与应用

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CN201911211946.1A CN111019921B (zh) 2019-12-02 2019-12-02 一种高耐受性的脂类水解酶e93及其编码基因与应用

Publications (2)

Publication Number Publication Date
CN111019921A CN111019921A (zh) 2020-04-17
CN111019921B true CN111019921B (zh) 2023-04-28

Family

ID=70207739

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CN201911211946.1A Active CN111019921B (zh) 2019-12-02 2019-12-02 一种高耐受性的脂类水解酶e93及其编码基因与应用

Country Status (1)

Country Link
CN (1) CN111019921B (zh)

Families Citing this family (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN112662596B (zh) * 2021-01-25 2023-02-28 自然资源部第二海洋研究所 一株产耐碱耐金属离子耐有机溶剂酯类水解酶的中温细菌及其应用

Citations (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN107893060A (zh) * 2017-11-29 2018-04-10 国家海洋局第二海洋研究所 一种海洋细菌来源热稳定耐盐sgnh家族水解酶及应用
CN109943550A (zh) * 2019-03-26 2019-06-28 自然资源部第二海洋研究所 一种海洋细菌来源酯酶Erp3及其编码基因与应用
CN109971734A (zh) * 2019-01-14 2019-07-05 自然资源部第二海洋研究所 一种pH不敏感高温耐受性HSL家族脂类水解酶及应用

Patent Citations (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN107893060A (zh) * 2017-11-29 2018-04-10 国家海洋局第二海洋研究所 一种海洋细菌来源热稳定耐盐sgnh家族水解酶及应用
CN109971734A (zh) * 2019-01-14 2019-07-05 自然资源部第二海洋研究所 一种pH不敏感高温耐受性HSL家族脂类水解酶及应用
CN109943550A (zh) * 2019-03-26 2019-06-28 自然资源部第二海洋研究所 一种海洋细菌来源酯酶Erp3及其编码基因与应用

Non-Patent Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
None.登录号:WP_160740319.GenBank.2020,第1-521位. *

Also Published As

Publication number Publication date
CN111019921A (zh) 2020-04-17

Similar Documents

Publication Publication Date Title
CN107893060B (zh) 一种海洋细菌来源热稳定耐盐sgnh家族水解酶及应用
CN109971734B (zh) 一种pH不敏感高温耐受性HSL家族脂类水解酶及应用
CN106986922B (zh) 一种自组装双亲短肽及其应用
JP6690747B2 (ja) 改良型ニトリルヒドラターゼ
CN111139229B (zh) 一种新型gdsl家族脂类水解酶eii-2及其编码基因与应用
You et al. Characterization of a prodigiosin synthetase PigC from Serratia marcescens jx-1 and its application in prodigiosin analogue synthesis
CN111172142B (zh) 一种热稳定性高的头孢菌素c酰化酶突变体
CN110184254B (zh) 一种具有高耐碱性的酯酶突变体及其应用
CN110004125B (zh) 一种海洋细菌来源新型耐碱耐有机溶剂酯酶及应用
CN107384891A (zh) 一种深海细菌来源新型耐盐碱性酯酶及应用
CN111019921B (zh) 一种高耐受性的脂类水解酶e93及其编码基因与应用
CN108251400B (zh) 脂肪酶及其应用
CN111057691B (zh) 一种新型gdsl家族脂类水解酶eii-3及其编码基因与应用
CN109943550B (zh) 一种海洋细菌来源酯酶Erp3及其编码基因与应用
CN112760306B (zh) 一种具有高盐度、有机溶剂及去垢剂高耐受性的第六家族酯类水解酶及其编码基因、应用
CN113151234B (zh) 腈水合酶赖氨酸突变体hba-k2h2r、编码基因及应用
CN113151233B (zh) 腈水合酶赖氨酸突变体hba-k2h2、编码基因及应用
CN112226422B (zh) 一种活性提高的EstWY酶突变体
CN112430610B (zh) 低温酯酶功能基因DcaE及其应用
CN107189955B (zh) 一种深海新型热稳定性碱性酯酶及应用
CN110951711B (zh) 一种具有降解手性酯活性的酯酶及其编码基因和应用
CN110804602B (zh) 一种L-天冬氨酸β-脱羧酶突变体及其应用
KR102026836B1 (ko) 토양 메타게놈 유래 신규 리파아제 유전자 Lip-1420 및 이의 용도
CN109517811B (zh) 一种β-酮脂酰-ACP合成酶突变体
CN109628429B (zh) 一种极端嗜盐、耐表面活性剂的非钙离子依赖型α-淀粉酶及其基因和应用

Legal Events

Date Code Title Description
PB01 Publication
PB01 Publication
SE01 Entry into force of request for substantive examination
SE01 Entry into force of request for substantive examination
GR01 Patent grant
GR01 Patent grant