CN110862930B - 一种白色茶树菇及其分子标记鉴定方法 - Google Patents
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Abstract
本发明提供了一种白色茶树菇及其分子标记鉴定方法,属于茶树菇领域。本发明以白色茶树菇Ag.c0002和野生型茶树菇‘茶5’为亲本进行杂交选育出抗逆性强、产量高、子实体白色,朵形好,具有很好地开发应用前景的白色茶树菇(Agrocybe cylindracea)BC5。该菌种已于2019年12月05日保藏于中国典型培养物保藏中心,保藏编号CCTCC NO:M 20191017。同时提供了对该菌株专一性强、操作简便的分子标记鉴定方法。
Description
技术领域
本发明属于茶树菇领域,更涉及一种白色茶树菇及其分子标记鉴定方法。
背景技术
茶树菇Agrocybe cylindracea,中文名称为柱头田头菇,是我们熟悉的一种珍稀食用菌,其营养价值很高,味道鲜美,深受人们喜爱,同时还是民间传统药用菌,享有“中华神菇”之称。
子实体颜色是一个重要的商品性状,野生型茶树菇的子实体颜色为浅褐色或褐色(统称为褐色),白色是野生型出现的一个变异性状,属于珍稀的一个品种。目前栽培的茶树菇子实体颜色主要是褐色的品种,白色品种比较少,且种植的白色品种是自然变异的菌株,未经过性状的改良,产量比较低,然而在价格上,当前白色茶树菇的市场价格比褐色的高,干品白色茶树菇一斤比褐色的高约10元,具有较好的经济效益。
本发明开展白色茶树菇的育种,通过出菇筛选,获得一个性状比较好的白色茶树杂交种。
发明内容
本发明的目的在于提供一种白色茶树菇及其分子标记鉴定方法。
为实现上述目的,本发明采用以下技术方案:
一种白色茶树菇,其分类命名为白色茶树菇(Agrocybe cylindracea)BC5,该菌株已于2019年12月05日保藏于中国典型培养物保藏中心,保藏编号CCTCC NO: M 20191017。
上述白色茶树菇菌株(Agrocybe cylindracea)BC5,简称白色茶树菇BC5是以白色茶树菇和褐色茶树菇进行多次杂交选育的白色茶树菇BC5,其继承了白色茶树菇子实体白色的性状,又遗传了褐色茶树菇抗逆性强、产量高等优良性状,打破了现有白色茶树菇基因资源较单一的局面。白色茶树菇BC5子实体白色,朵形好,抗逆较好,栽培周期同常规的茶树菇,产量高,具有很好地开发应用前景。
白色茶树菇BC5(CCTCC NO: M 20191017)的母种培养基为马铃薯葡萄糖培养基,即培养基是PDA:马铃薯200g,葡萄糖20g,琼脂条20g,水1000mL;培养条件为常规的茶树菇培养,无特殊要求。
本发明还提供了所述白色茶树菇的分子标记鉴定方法,包括菌丝的培养与收集、基因组DNA的提取、ITS(Internal transcribed spacer转录间隔区)-PCR扩增、特异酶切片段标记的产生和酶切产物的电泳检测。
所述特异酶切片段标记的产生:在4~6 μL ITS-PCR扩增产物中, 加入1 μL AccⅡ酶的酶切Buffer,0.4~0.6 μL AccⅡ酶, 2.4~ 4.6 μL ddH2O,总体积10 μL,37℃水浴3.5~4 h,取酶切产物用于电泳检测;
所述酶切产物的电泳检测:经电泳检测,在一个泳道上只有同时出现分子量为680~695 bp、520~535 bp和150~165 bp的DNA标记条带,是白色茶树菇(Agrocybe cylindracea)BC5标记。其中电泳条件为:取酶切产物10μL,与1μL上样缓冲液混匀,点样于1.2%的琼脂糖凝胶上,于0.5 X TBE缓冲液中,5V/cm电压下电泳;所述上样缓冲液:0.1%溴酚蓝, 40% 蔗糖。
ITS-PCR扩增反应体系:1.2 μl 含量80~150 ng的DNA,2.5 μl 10×PCR buffer,2μl 浓度为2.5 m mol/L的 dNTP,1 μl 浓度为10 μmol/L的ITS1, ITS1序列为5’-TCCGTAGGTGAACCTGCGG -3’,1 μl 浓度为10 μmol/L的ITS4,ITS4序列为5’-TCCTCCGCTTATTGATATGC -3’,0.3 μl 酶活为5 U/ul 的Taq DNA Polymerase,17 μlddH2O;
ITS-PCR扩增反应程序:94℃预变性5 min;94℃变性0.8 min,55℃退火0.5 min,72℃延伸1 min, 35个循环;72℃延伸10 min。
本发明具有以下优点:
1、白色茶树菇BC5含有白色茶树菇与野生型茶树菇的基因,其子实体在颜色上继承了白色茶树菇白色的性状,和野生型茶树菇的抗逆性好、产量高等优良性状,具有很好的开发应用前景。
2、白色茶树菇BC5的分子标记鉴定方法具有真实可靠,一目了然的特点,比经典的形态鉴定误差小,不受环境条件的影响,判断更直观。
3、专一性强:本发明充分利用酶的专一性和高效性,且本发明使用的酶对白色茶树菇BC5具有特异性,产生特异识别性的标记片段,非白色茶树菇与野生型茶树的杂种得不到这种效果。
4、白色茶树菇BC5的分子标记鉴定方法操作简单,检测时间短,经典的形态鉴定需要检测的指标多,时间长且需要综合起来分析。在一般的分子实验室即可以完成检测,无需要特殊的仪器设备。
附图说明
图1为白色茶树菇BC5子实体。
图2为AccⅡ酶的酶切电泳图。其中,1~5为泳道编号,2~4泳道显示的分子量为690bp,530 bp和160 bp的DNA标记条带,是白色茶树菇BC5的标志;1泳道显示的分子量为530 bp和160 bp是白色茶树菇Ag.c0002的标志;5泳道显示的分子量为690 bp是野生型茶树菇‘茶5’的标志;M表示分量为DL 2000的DNA MARK。
具体实施方式
为了使本发明所述的内容更加便于理解,下面结合具体实施方式对本发明所述的技术方案做进一步的说明,但是下述的实例仅仅是本发明其中的例子而已,并不代表本发明所限定的权利保护范围,本发明的权利保护范围以权利要求书为准。
实施例1:白色茶树菇BC5的筛选
以白色茶树菇Ag.c0002和野生型茶树菇‘茶5’为亲本。通过原生质体单核化技术获得白色茶树菇Ag.c0002的两个单核体‘2-1’和‘2-2’ (刘新锐,陈威龙,周一卓,等.柱状田头菇白色变种遗传分析.菌物学报,2019,38(9): 1450-1456)。
(1)第一次杂交与筛选:‘茶5’分别与‘2-1’和‘2-2’配对,获得杂交子‘H3’和‘H4’。
(2)杂交子‘H3’和‘H4’的单胞菌株的筛选:将杂交子‘H3’和‘H4’按茶树菇常规的栽培方法进行出菇试验,分别弹射其担孢子,开展孢子萌发实验,获得‘H3’单孢菌株40个,‘H4’单孢菌株38个。‘H3’单孢菌株分别与‘2-2’配对、H4’单孢菌株分别与‘2-1’配对,配对后进行出菇实验,看配对后的子实体颜色,若子实体白色则是携带白色性状的基因,若是褐色,则携带的是野生型颜色的基因。
(3)第二次杂交与筛选:根据单孢菌株在PDA培养基上的生长速度与菌落特征,挑选‘H3’生长良好的单孢且携带白色性状的菌株10个,分别与挑选‘H4’ 生长良好的单孢且携带白色性状的菌株12个进行单-单杂交,共配对120组,获得120个杂交子,对这120个杂交子先进行在PDA上的生长速度观察,淘汰长势很慢的20个,先随机选择长势快的杂交子30个进入出菇实验。这30个杂交子出菇实验,观察其菌包污染情况、出菇快慢、子实体外观、菌盖开伞快慢、产量,发现杂交子BC5的性状优良。白色茶树菇BC5经多次出菇,子实体白色、菌盖半球形、柄较长较粗,抗逆性较好、产量较高,继承了其两个亲本较优的性状。
已于2019年12月05日保藏于中国典型培养物保藏中心,地址: 中国·武汉 武汉大学,保藏编号CCTCC NO: M 20191017。所述茶树菇‘茶5’来自福建建宁县茶树菇栽培场。
实施例2:白色茶树菇BC5(CCTCC NO: M 20191017)的出菇试验,包括以下步骤:
(1)白色茶树菇BC5菌种制作
将白色茶树菇BC5菌株在PDA培养上活化2次,转接于茶树菇原种常规培养基,25℃恒温培养至长满原种瓶。
(2)白色茶树菇BC5栽培管理
栽培白色茶树菇BC5时的选料、各种原料配方、装袋、消毒灭菌和发菌管理及后熟期管理同常规茶树菇。栽培管理参照黄年来等主编的中国食用菌-茶树菇(黄年来,林志彬,陈国梁,主编.中国食药用菌学.上海:上海科技文献出版社.2010,607~619.)
白色茶树菇BC5形态特征见图1,子实体白色,菌盖半球形、表面较光滑,盖大小2~4 cm,菌柄实心、长8~12 cm。白色茶树菇BC5的栽培周期同常规的茶树菇,出菇较集中,单袋平均产量350~420 g,具有很好地开发应用前景。
白色茶树菇BC5与亲本白色茶树菇Ag.c0002、野生型茶树菇‘茶5’、及现有白色品种“As-F”的农艺性状比较见表1。
表1
表1结果表明,本发明的白色茶树菇BC5相比于亲本野生型茶树菇‘茶5’的茶褐色,菇体颜色呈白色;相比于亲本白色茶树菇Ag.c0002及现有白色品种“As-F”其菌丝涨势增强,抗逆性增强,出菇更快,产量大幅提升。本发明的色茶树菇BC5的农艺性状显著由于其亲本性状及现有茶树菇白色品种的性状,取得了1+1>2的显著效果。
实施例3:白色茶树菇BC5(CCTCC NO: M 20191017)的分子标记鉴定方法,包括以下步骤:
(1)菌丝培养和收集
1、将白色茶树菇BC5、野生型茶树菇‘茶5’和白色茶树菇Ag.c0002转接含100mlPDA液体培养基的250 ml广口三角瓶中,其中茶树菇‘茶5’来自福建建宁县茶树菇栽培场;
2、放置在25℃摇床上,转速90~130 r/min培养7~10 d;
3、用纱布过滤培养好的菌丝,蒸馏水冲洗,滤纸吸干;
4、称取0.5~1.3g菌丝,用滤纸包好,保存于-20℃备用。
(2)CTAB法提取基因组DNA
茶树菇基因组DNA提取的具体操作步骤,按照陶永新等的方法(Tao Y, Xie B,Yang Z, et al. Identification and expression analysis of a new glycosidehydrolase family 55 exo-β-1, 3-glucanase-encoding gene in Volvariellavolvacea suggests a role in fruiting body development[J]. Gene, 2013, 527(1):154-160.)进行,提取的DNA放-20℃保存备用。
(3)ITS-PCR扩增
ITS-PCR扩增反应体系:1.2 μl 含量80~150 ng的DNA,2.5 μl 10×PCR buffer,2μl 浓度为2.5 mmol/L的dNTP,1 μl浓度为10 μmol/L的ITS1, ITS1序列为5’-TCCGTAGGTGAACCTGCGG -3’,1 μl 浓度为10 μmol/L的ITS4,ITS4序列为5’-TCCTCCGCTTATTGATATGC -3’,0.3 μl 酶活为5 U/ul 的Taq DNA Polymerase,17 μlddH2O;
ITS-PCR扩增反应程序:94℃预变性5 min;94℃变性0.8 min,55℃退火0.5 min,72℃延伸1 min, 35个循环;72℃延伸10 min。
(4)特异酶切片段标记的产生
5 μl ITS-PCR扩增产物, 1 μl AccⅡ酶的酶切Buffer, 0.5 μl AccⅡ酶, 3.5 μl ddH2O,37 ℃水浴4 h。
(5)酶切产物的电泳检测
取AccⅡ酶的酶切产物10 μl,与1 μl上样缓冲液混匀,点样于1.2%的琼脂糖凝胶上(含EB染料),同时使用DL 2000的DNA MARK作为片段大小的参照,于0.5 × TBE缓冲液中,5V/cm电压下电泳45 min,电泳结束后,然后在凝胶成像仪上照相。电泳图如图2所示, 2~4泳道显示的分子量为690 bp,530 bp和160 bp的DNA标记条带,是白色茶树菇BC5的标志;1泳道显示的分子量为530 bp和160 bp是白色茶树菇Ag.c0002的标志;5泳道显示的分子量为690 bp是野生型茶树菇‘茶5’的标志;M表示分量为DL 2000的DNA MARK。图2结果表明:白色茶树菇BC5同时携带白色茶树菇Ag.c0002和野生型茶树菇‘茶5’的DNA标记条带。
(6)试剂与仪器
CTAB抽提液:100 mmol/L Tris-HCl, 2.0% CTAB,20 mmol/L EDTA,1.4 mol/LNaCl,pH 8.0;
CTAB 沉淀液:50 mmol/L Tris-HCl,1.0% CTAB,10 mmol/L EDTA,pH 8.0;
CTAB/NaCl:0.7 mol/L NaCl, 10% CTAB;
氯仿异戊醇:体积比氯仿比异戊醇为24比1;
TE缓冲液:10 mmol/L Tris HCl ,1 mmol/L EDTA;
0.5×TBE:44.5 mmol/L Tris, 50 mmol/L HBO3、1 mmol/L EDTA;
上样缓冲液:0.1% 溴酚蓝, 40% 蔗糖;
EB:10 mg/mL溴化乙锭;
AccⅡ酶和PCR扩增试剂及酶均购自大连宝生物公司。
主要仪器:
SW-CJ-1FB型单人水平垂直两用净化工作台:苏州净化设备有限公司
灭菌锅:上海三申
HYG-A全温摇瓶柜:太仓市实验室
冷冻离心机:Sigma 3K30
PCR扩增仪:Eppendorf AG22331 Hamburg
掌型离心机:江苏海门市麒麟医用仪器厂Lx-100手掌型离心机
SDC-6节能型智能恒温槽:宁波新芝生物科技股份有限公司
凝胶成像系统:TANON-2008。
以上所述仅为本发明的较佳实施例,凡依本发明申请专利范围所做的均等变化与修饰,皆应属本发明的涵盖范围。
SEQUENCE LISTING
<110> 福建农林大学
<120> 一种白色茶树菇及其分子标记鉴定方法
<130> 2
<160> 2
<170> PatentIn version 3.3
<210> 1
<211> 19
<212> DNA
<213> ITS1
<400> 1
tccgtaggtg aacctgcgg 19
<210> 2
<211> 20
<212> DNA
<213> ITS4
<400> 2
tcctccgctt attgatatgc 20
Claims (3)
1.一种白色茶树菇,其特征在于:所述白色茶树菇其分类命名为:白色茶树菇(Agrocybe cylindracea)BC5,已于2019年12月05日保藏于中国典型培养物保藏中心,保藏编号CCTCC NO: M 20191017。
2.一种如权利要求1所述的白色茶树菇的分子标记鉴定方法,其特征在于:包括菌丝的培养与收集、基因组DNA的提取、ITS-PCR扩增、特异酶切片段标记的产生和酶切产物的电泳检测;
所述特异酶切片段标记的产生:在4~6 μL ITS-PCR扩增产物中, 加入1 μL AccⅡ酶的酶切Buffer,0.4~0.6 μL AccⅡ酶, 2.4~4.6 μL ddH2O,总体积10 μL,37℃水浴3.5~4 h,取酶切产物用于电泳检测;
所述酶切产物的电泳检测:经电泳检测,在一个泳道上只有同时出现分子量为680~695bp、520~535 bp和150~165bp的DNA标记条带,是白色茶树菇(Agrocybe cylindracea)BC5标记。
3.根据权利要求2所述的白色茶树菇的分子标记鉴定方法,其特征在于:所述ITS-PCR扩增的反应体系:1.2 μl 含量80~150 ng的DNA,2.5 μl 10×PCR buffer,2 μl 浓度为2.5m mol/L的 dNTP,1 μl 浓度为10 μmol/L的ITS1, ITS1序列为5’- TCCGTAGGTGAACCTGCGG-3’,1 μl 浓度为10 μmol/L的ITS4,ITS4序列为5’- TCCTCCGCTTATTGATATGC -3’,0.3 μl酶活为5 U/ul 的Taq DNA Polymerase,17 μl ddH2O;
ITS-PCR扩增反应程序:94℃预变性5 min;94℃变性1 min,55℃退火0.5 min,72℃延伸0.8~1 min, 30~35个循环;72℃延伸10 min。
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