CN110791466B - 一种合成丁三醇油酸酯的重组菌及其构建方法和应用 - Google Patents

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Abstract

本发明公开了一种合成丁三醇油酸酯的重组菌及其构建方法和应用,属于基因工程技术领域。所述重组菌是以大肠杆菌为出发菌株,将编码酰基转移酶的基因、编码脂酰CoA合成酶的基因、编码烯酰ACP还原酶的基因、编码甘油激酶的基因、编码3‑磷酸甘油酰基转移酶的基因和编码DAGP磷酸酶的基因导入大肠杆菌,得到重组菌。经过发酵,实现了1,2,4‑丁三醇油酸酯的首次合成。本发明所构建的重组菌,在LB培养基中发酵24h,可以实现丁三醇和油酸钠的酯化,得到丁三醇油酸酯,为丁三醇的分离纯化提供新的思路。

Description

一种合成丁三醇油酸酯的重组菌及其构建方法和应用
技术领域
本发明属于基因工程技术领域,具体涉及一种合成丁三醇油酸酯的重组菌及其构建方法和应用。
背景技术
1,2,4-丁三醇(丁三醇,BT)是一种与甘油相似的无色透明物质,其主要作用是作为有机合成的化学中间体,广泛的应用于JG、烟草、化妆品、造纸、医药和高分子材料等领域。其硝化衍生物相比硝酸甘油有热稳定性好,毒性、挥发性较小,冲击感小等优点,需求量逐年增加。目前,各国学者开展了一系列生物法合成BT的研究,取得了较大进展。但丁三醇属于醇类物质,易溶于水,难于从发酵液中分离。Frost团队曾经使用真空蒸馏法分离,但是在获得的产物中,有聚合物和降解物的污染;液相萃取的方法也有研究,实验结果表明乙酸乙酯和2-丁酮虽然可以萃取丁三醇,但是其萃取效率偏低;1-丁醇和2-丁醇可以高效萃取丁三醇,但是杂质偏多;目前还没有找到比较理想的萃取剂。
醇类物质和酸类物质可以很容易进行酯化反应。酯类物质难溶于水,并且易于水解重新得到醇类物质,现有的水解技术也比较成熟。有研究通过化学法将发酵液中的乳酸和甲醇、乙醇等低级醇类实现酯化,进一步离心水解获得乳酸,乳酸的回收率达到90%以上;相比传统的分离方法简化了实验步骤,减少了环境污染。BT作为醇类物质,同样可以实现酯化反应。但是目前合成BT的方法普遍为化学方法,而化学方法合成BT存在条件苛刻、污染严重等问题,所以开发新的BT合成方法是目前需要解决的问题。目前,已经有研究使用生物方法合成BT,但是仍然存在发酵液中的BT难以分离的问题。
发明内容
为解决上述问题,本发明提供了一种合成丁三醇油酸酯的重组菌及其构建方法和应用。
本发明首先提供了一种合成丁三醇油酸酯的重组菌。
所述重组菌过表达编码酰基转移酶的基因yqeF、编码脂酰CoA合成酶的基因fadD、编码烯酰ACP还原酶的基因fabI、编码甘油激酶的基因glpK、编码3-磷酸甘油酰基转移酶的基因plsB和编码DAGP磷酸酶的基因pgpB;出发菌株为大肠杆菌。
所述的编码酰基转移酶的基因yqeF、编码脂酰CoA合成酶的基因fadD、编码烯酰ACP还原酶的基因fabI、编码甘油激酶的基因glpK、编码3-磷酸甘油酰基转移酶的基因plsB和编码DAGP磷酸酶的基因pgpB来源于大肠杆菌。
所述编码酰基转移酶的基因yqeF在NCBI的基因ID为947324,编码脂酰CoA合成酶的基因fadD在NCBI的基因ID为946327、编码烯酰ACP还原酶的基因fabI在NCBI的基因ID为945870、编码甘油激酶的基因glpK在NCBI的基因ID为948423、编码3-磷酸甘油酰基转移酶的基因plsB在NCBI的基因ID为948541和编码DAGP磷酸酶的基因pgpB在NCBI的基因ID为945863。
本发明还提供构建上述重组菌的方法,包括以下步骤:
1)克隆酰基转移酶基因yqeF,将所得基因与质粒pACYCDuet-1进行酶切、连接,并转入E.coliDH5α感受态细胞中,筛选阳性克隆,提取质粒获得重组载体pACYCDuet-yqeF;
2)克隆脂酰CoA合成酶基因fadD,将所得基因与步骤1)所得载体pACYCDuet-yqeF进行酶切、连接,并转入E.coliDH5α感受态细胞中,筛选阳性克隆,提取质粒获得重组载体pACYCDuet-yqeF-fadD;
3)克隆烯酰ACP还原酶基因fabI,将所得基因与载体pCOLADuet-1进行酶切、连接,并转入E.coliDH5α感受态细胞中,筛选阳性克隆,提取质粒获得重组载体pCOLADuet-fabI;
4)克隆甘油激酶基因glpK,将所得基因与步骤3)所得载体pCOLADuet-fabI进行酶切、连接,并转入E.coliDH5α感受态细胞中,筛选阳性克隆,提取质粒获得重组载体pCOLADuet-fabI-glpK;
5)克隆3-磷酸甘油酰基转移酶基因plsB,将所得基因与步骤4)所得pCOLADuet-fabI-glpK进行酶切、连接,并转入E.coliDH5α感受态细胞中,筛选阳性克隆,提取质粒获得重组载体pCOLADuet-fabI-glpK-plsB;
6)克隆DAGP磷酸酶基因pgpB,将所得基因与步骤5)所得pCOLADuet-fabI-glpK-plsB进行酶切、连接,并转入E.coliDH5α感受态细胞中,筛选阳性克隆,提取质粒获得重组载体pCOLADuet-fabI-glpK-plsB-pgpB;
7)将步骤2)与步骤6)所获得的重组载体,转化到宿主EscherichiacoliBL21(DE3)感受态细胞中,获得大肠杆菌重组菌。
本发明还提供上述重组菌在发酵生产丁三醇油酸酯中的应用,步骤如下:
1)活化重组菌,获得种子液;
2)将步骤1)所得的种子液,接种至含有卡那霉素与氯霉素的发酵培养基,培养至OD600在0.6~0.8,获得培养液;
3)向所得的培养液中加入诱导剂、1,2,4-丁三醇和油酸钠,然后继续培养24~48小时;分离得到丁三醇油酸酯。
在本发明的一种实施方式中,步骤2)所述培养基为LB培养基;接种量为体积比种子液:发酵培养基=(1~2):(100~130)。
在本发明的一种实施方式中,步骤2)所述培养条件为:35℃~37℃,180~220rpm;进一步优选地,步骤2)所述培养条件为:37℃,180rpm。
在本发明的一种实施方式中,步骤2)所述卡那霉素和氯霉素在培养基中的浓度分别为:卡那霉素100μg·mL-1,氯霉素100μg·mL-1
在本发明的一种实施方式中,发酵培养基(LB)的配方为:10g/L氯化钠,10g/L蛋白胨,5g/L酵母粉。
在本发明的一种实施方式中,步骤3)所述诱导剂为异丙基-β-D-硫代半乳糖苷(IPTG),加入量为终浓度0.01~0.1mM;1,2,4-丁三醇加入量为终浓度1~10g/L;油酸钠加入量为终浓度1~10g/L。
在本发明的一种实施方式中,步骤3)所述培养条件为30~33℃,180~220rpm。
在本发明的一种实施方式中,将重组菌活化后,按1%的接种量接种到含100μg·mL-1卡那霉素和100μg·mL-1氯霉素的发酵培养基中,37℃、180rpm条件下振荡培养,待OD600达到0.6时,温度调节至30℃,并加入0.05mMIPTG进行诱导,同时加入10g/L的1,2,4-丁三醇和油酸钠,诱导后24h终止发酵。
有益效果
针对以上问题,本发明以Escherichia coli BL21(DE3)为宿主菌株,通过过表达甘油三酯途径的关键合成基因(glpK、plsB和pgpB)和发挥酯化作用的关键酶基因(yqeF、fabI和fadD),构建获得工程菌,实现了1,2,4-丁三醇油酸酯的首次合成。本发明所构建的重组菌,在LB培养基中发酵24h,可以实现丁三醇和油酸钠的酯化,得到丁三醇油酸酯,为丁三醇的分离纯化提供新的思路。
定义和缩写
在本文中使用下列的缩写或简称:
酰基转移酶基因:yqeF
脂酰CoA合成酶基因:fadD
烯酰ACP还原酶基因:fabI
甘油激酶基因:glpK
3-磷酸甘油酰基转移酶基因:plsB
DAGP磷酸酶基因:pgpB
大肠杆菌(Escherichia coli):E.coli
“过量表达”或“过表达”指特定的基因在生物体中大量表达,表达量超过正常水平(即,野生型表达水平),可以通过增强内源表达或引入外源基因来实现。
附图说明
图1 1,2,4-丁三醇三油酸酯的液相-质谱鉴定图谱。
具体实施方式
下面通过实例来进一步阐明本发明。但本发明并不限于以下实施例。
下述实施例中所使用的实验方法若无特殊说明,均为常规方法。
下述实施例中所使用的材料、试剂等若无特殊说明,均可从商业途径获得。
所用酶试剂购自MBI Fermentas公司,提取质粒所用的试剂盒和回收DNA片段所用的试剂盒购自美国OMEGA公司,相应的操作步骤按照产品说明书进行;所有培养基如无特别说明均用去离子水配制。
培养基配方:
LB培养基:5g/L酵母粉,10g/L NaCl,10g/L蛋白胨,其余为水,121℃,20min灭菌。
在实际培养过程中,可向上述培养基中添加一定浓度的抗生素以维持质粒的稳定性,如100μg·mL-1的卡那霉素和100μg·mL-1氯霉素。
实施例1一种合成丁三醇油酸酯的重组菌的构建
1)载体pACYCDuet-yqeF的构建
本实施例中,获取来源于E.coli的酰基转移酶基因yqeF(在NCBI的基因ID为947324),是以E.coli基因组为模板,通过PCR扩增获得(引物:5'-GGAATTCAAGGAGATATACCATGAAAGACGTTGTGATTG-3'和5'-GCGTCGACCTATTCGTCACGTTCAATG-3'),再利用回收试剂盒回收目的片段,目的片段大小为1182bp。
将获得的yqeF基因片段和质粒pACYCDuet-1用EcoRI和SalI酶切,回收酶切产物,再进行连接,载体与yqeF基因片段按照摩尔比1:5的比例,16℃连接6h以上,连接产物转化E.coliDH5α,然后涂布在加有100μg·mL-1氯霉素的LB固体平板上,PCR筛选阳性克隆。从阳性克隆中提取重组质粒pACYCDuet-yqeF后,再通过限制性酶酶切和测序鉴定。
2)载体pACYCDuet-yqeF-fadD的构建
获取来源于E.coli的脂酰CoA合成酶基因fadD(在NCBI的基因ID为946327),是以E.coli基因组为模板,通过PCR扩增分别获得(扩增引物:5'-AAATATGCGGCCGCTAATACGACTCACTATAGGGGAATTGTGAGCGGATAACAATTCCTTGAAGAAGGTTTGGCTTAAC-3'和5'-CGCTTAAGTCAGGCTTTATTGTCCAC-3'),利用回收试剂盒回收片段fadD,片段大小为1605bp。
将获得的fadD基因片段和载体pACYCDuet-yqeF用NotI和AflII酶切,回收酶切产物,再进行连接,载体与fadD基因片段按照摩尔比1:5的比例,16℃连接6h以上,连接产物转化E.coliDH5α,然后涂布在加有100μg·mL-1氯霉素的LB固体平板上,PCR筛选阳性克隆。从阳性克隆中提取重组载体pACYCDuet-yqeF-fadD后,再通过限制性酶酶切和测序鉴定。
3)载体pCOLA Duet-fabI的构建
获取来源于E.coli的烯酰ACP还原酶的基因fabI(在NCBI的基因ID为945870),是以E.coli基因组为模板,通过PCR扩增获得(引物:5'-GAAGATCTACAATAAGGATTAAAGCTATG-3'和5'-GGGGTACCTTATTTCAGTTCGAGTTC-3'),再利用回收试剂盒回收目的片段,目的片段大小为789bp。
将获得的fabI基因片段和质粒pCOLADuet用BglII和KpnI酶切,回收酶切产物,再进行连接,载体与fabI基因片段按照摩尔比1:5的比例,16℃连接6h以上,连接产物转化E.coliDH5α,然后涂布在加有100μg·mL-1卡那霉素的LB固体平板上,PCR筛选阳性克隆。从阳性克隆中提取重组载体pCOLADuet-fabI后,再通过限制性酶酶切和测序鉴定。
4)载体pCOLADuet-fabI-glpK的构建
获取来源于E.coli的甘油激酶基因glpK(在NCBI的基因ID为948423),是以E.coli基因组为模板,通过PCR扩增获得(引物:5'-GGAATTCACTACGGGACAATTAAACATG-3'和5'-CGAGCTCTTATTCGTCGTGTTCTTC-3'),再利用回收试剂盒回收目的片段,目的片段大小为1509bp。
将获得的glpK基因片段和载体pCOLADuet-fabI用EcoRI和SacI酶切,回收酶切产物,再进行连接,载体与glpK基因片段按照摩尔比1:5的比例,16℃连接6h以上,连接产物转化E.coliDH5α,然后涂布在加有100μg·mL-1卡那霉素的LB固体平板上,PCR筛选阳性克隆。从阳性克隆中提取重组载体pCOLADuet-fabI-glpK后,再通过限制性酶酶切和测序鉴定。
5)载体pCOLADuet-fabI-glpK-plsB的构建获取来源于E.coli的3-磷酸甘油酰基转移酶基因plsB(在NCBI的基因ID为948541),是以E.coli基因组为模板,通过PCR扩增获得(引物:5'-CGAGCTCACCAGAGGCTTTACATCGTTTATG-3'和5'-GCGTCGACTTACCCTTCGCCCTGCGTCGCA-3'),再利用回收试剂盒回收目的片段,目的片段大小为2424bp。
将获得的plsB基因片段和载体pCOLADuet-fabI-glpK用SacI和SalI酶切,回收酶切产物,再进行连接,载体与plsB基因片段按照摩尔比1:5的比例,16℃连接6h以上,连接产物转化E.coliDH5α,然后涂布在加有100μg·mL-1卡那霉素的LB固体平板上,PCR筛选阳性克隆。从阳性克隆中提取重组载体pCOLADuet-fabI-glpK-plsB后,再通过限制性酶酶切和测序鉴定。
6)载体pCOLADuet-fabI-glpK-plsB-pgpB的构建
获取来源于E.coli的DAGP磷酸酶基因pgpB(在NCBI的基因ID为945863),是以E.coli基因组为模板,通过PCR扩增获得(引物:5'-GCGTCGACTAATACGACTCACTATAGGGGAATTGTGAGCGGATAACAATTCCCCTATCAAAAAGGAGAGGCCATG-3'和5'-CCACATGTTTAACTTTCTTGTTCTCG-3'),再利用回收试剂盒回收目的片段,目的片段大小为765bp。
将获得的pgpB基因片段和载体pCOLADuet-fabI-glpK-plsB用SalI和AflII酶切,回收酶切产物,再进行连接,载体与pgpB基因片段按照摩尔比1:5的比例,16℃连接6h以上,连接产物转化E.coliDH5α,然后涂布在加有100μg·mL-1卡那霉素的LB固体平板上,PCR筛选阳性克隆。从阳性克隆中提取重组载体pCOLADuet-fabI-glpK-plsB-pgpB后,再通过限制性酶酶切和测序鉴定。
7)转化
将步骤2)与步骤6)所获得的重组载体pACYCDuet-yqeF-fadD和pCOLADuet-fabI-glpK-plsB-pgpB转化到宿主E.coli BL21(DE3)感受态细胞中,获得大肠杆菌重组菌。
实施例2发酵生产丁三醇油酸酯
将实施例1中获得的重组菌,涂布在含有100μg·mL-1卡那霉素和100μg·mL-1氯霉素的LB固体平板;涂布后的平板置于37℃恒温培养箱,继续培养至长出单克隆。
将获得的工程菌株单克隆在LB培养中进行活化,在37℃、180rpm条件下培养12h,得到种子液,种子液按与培养基体积比1:100的比例接种到含有100mL的LB液体培养基的500mL摇瓶中(内含100μg·mL-1卡那霉素和100μg·mL-1氯霉素),37℃、180rpm条件下振荡培养。OD600达到0.6左右时,温度调节至30℃,并加入终浓度0.05mM的IPTG进行诱导,同时加入终浓度10g/L的1,2,4-丁三醇和终浓度10g/L的油酸钠,诱导后24h终止发酵。
产物的检测
发酵结束后,离心发酵液收集菌体;加入5mL 100mM磷酸钾缓冲液重悬细胞,超声破碎菌体:40%,冰上,超声时间每次3s,间隔3s,共40min;在细胞破碎液中立即加入5mL氯仿/甲醇(2:1,V/V),上下颠倒使充分混合,在振荡仪上振荡15s后,8000×g离心10min,分离并收集氯仿有机层;重复添加氯仿/甲醇(2:1,V/V)进行二次萃取;利用旋蒸仪对样品进行浓缩,使氯仿/甲醇蒸发;加入1mL氯仿/甲醇(2:1,V/V)溶解蒸干的浓缩样品,过滤膜,-20℃保存。最终产物通过液相质谱分析,证明获得了1,2,4-丁三醇油酸酯,产量达到127mg/L。
以上所述仅为本发明的实施例,并非因此限制本发明的专利范围,凡是利用本发明说明书及附图内容所作的等效结构或等效流程变换,或直接或间接运用在其他相关的技术领域,均同理包括在本发明的专利保护范围内。
SEQUENCE LISTING
<110> 中国科学院青岛生物能源与过程研究所
<120> 一种合成丁三醇油酸酯的重组菌及其构建方法和应用
<130>
<160> 12
<170> PatentIn version 3.5
<210> 1
<211> 39
<212> DNA
<213> 实施例1 1)引物1
<400> 1
ggaattcaag gagatatacc atgaaagacg ttgtgattg 39
<210> 2
<211> 27
<212> DNA
<213> 实施例1 1)引物2
<400> 2
gcgtcgacct attcgtcacg ttcaatg 27
<210> 3
<211> 79
<212> DNA
<213> 实施例1 2)引物1
<400> 3
aaatatgcgg ccgctaatac gactcactat aggggaattg tgagcggata acaattcctt 60
gaagaaggtt tggcttaac 79
<210> 4
<211> 26
<212> DNA
<213> 实施例1 2)引物2
<400> 4
cgcttaagtc aggctttatt gtccac 26
<210> 5
<211> 29
<212> DNA
<213> 实施例1 3)引物1
<400> 5
gaagatctac aataaggatt aaagctatg 29
<210> 6
<211> 26
<212> DNA
<213> 实施例1 3)引物2
<400> 6
ggggtacctt atttcagttc gagttc 26
<210> 7
<211> 28
<212> DNA
<213> 实施例1 4)引物1
<400> 7
ggaattcact acgggacaat taaacatg 28
<210> 8
<211> 25
<212> DNA
<213> 实施例1 4)引物2
<400> 8
cgagctctta ttcgtcgtgt tcttc 25
<210> 9
<211> 31
<212> DNA
<213> 实施例1 5)引物1
<400> 9
cgagctcacc agaggcttta catcgtttat g 31
<210> 10
<211> 30
<212> DNA
<213> 实施例1 5)引物2
<400> 10
gcgtcgactt acccttcgcc ctgcgtcgca 30
<210> 11
<211> 75
<212> DNA
<213> 实施例1 6)引物1
<400> 11
gcgtcgacta atacgactca ctatagggga attgtgagcg gataacaatt cccctatcaa 60
aaaggagagg ccatg 75
<210> 12
<211> 26
<212> DNA
<213> 实施例1 6)引物2
<400> 12
ccacatgttt aactttcttg ttctcg 26

Claims (8)

1.一种合成丁三醇油酸酯的重组菌,其特征在于,所述重组菌,过表达编码酰基转移酶的基因yqeF、编码脂酰CoA合成酶的基因fadD、编码烯酰ACP还原酶的基因fabI、编码甘油激酶的基因glpK、编码3-磷酸甘油酰基转移酶的基因plsB和编码DAGP磷酸酶的基因pgpB,出发菌株为大肠杆菌,所述编码酰基转移酶的基因yqeF在NCBI的基因ID为947324,编码脂酰CoA合成酶的基因fadD在NCBI的基因ID为946327、编码烯酰ACP还原酶的基因fabI在NCBI的基因ID为945870、编码甘油激酶的基因glpK在NCBI的基因ID为948423、编码3-磷酸甘油酰基转移酶的基因plsB在NCBI的基因ID为948541和编码DAGP磷酸酶的基因pgpB在NCBI的基因ID为945863。
2.一种权利要求1所述重组菌的构建方法,其特征在于,包括以下步骤:
1)克隆酰基转移酶基因yqeF,将所得基因与质粒pACYCDuet-1进行酶切、连接,并转入E.coliDH5α感受态细胞中,筛选阳性克隆,提取质粒获得重组载体pACYCDuet-yqeF;
2)克隆脂酰CoA合成酶基因fadD,将所得基因与步骤1)所得载体pACYCDuet-yqeF进行酶切、连接,并转入E.coliDH5α感受态细胞中,筛选阳性克隆,提取质粒获得重组载体pACYCDuet-yqeF-fadD
3) 克隆烯酰ACP还原酶基因fabI,将所得基因与质粒pCOLA Duet-1进行酶切、连接,并转入E.coliDH5α感受态细胞中,筛选阳性克隆,提取质粒获得重组载体pCOLA Duet-fabI
4)克隆甘油激酶基因glpK,将所得基因与步骤3)所得载体pCOLADuet-fabI进行酶切、连接,并转入E.coliDH5α感受态细胞中,筛选阳性克隆,提取质粒获得重组载体pCOLADuet-fabI-glpK
5) 克隆3-磷酸甘油酰基转移酶基因plsB,将所得基因与步骤4)所得pCOLADuet-fabI- glpK进行酶切、连接,并转入E.coliDH5α感受态细胞中,筛选阳性克隆,提取质粒获得重组载体pCOLADuet-fabI-glpK-plsB
6)克隆DAGP磷酸酶基因pgpB,将所得基因与步骤5)所得pCOLADuet-fabI-glpK-plsB进行酶切、连接,并转入E.coliDH5α感受态细胞中,筛选阳性克隆,提取质粒获得重组载体pCOLADuet-fabI-glpK-plsB-pgpB
7)将步骤2)与步骤6)所获得的重组载体,转化到宿主Escherichia coli BL21感受态细胞中,获得大肠杆菌重组菌。
3.根据权利要求2所述的构建方法,其特征在于:所述的编码酰基转移酶的基因yqeF、编码脂酰CoA合成酶的基因fadD、编码烯酰ACP还原酶的基因fabI、编码甘油激酶的基因glpK、编码3-磷酸甘油酰基转移酶的基因plsB和编码DAGP磷酸酶的基因pgpB来源于大肠杆菌;所述编码酰基转移酶的基因yqeF在NCBI的基因ID为947324,编码脂酰CoA合成酶的基因fadD在NCBI的基因ID为946327、编码烯酰ACP还原酶的基因fabI在NCBI的基因ID为945870、编码甘油激酶的基因glpK在NCBI的基因ID为948423、编码3-磷酸甘油酰基转移酶的基因plsB在NCBI的基因ID为948541和编码DAGP磷酸酶的基因pgpB在NCBI的基因ID为945863。
4.一种权利要求1所述的重组菌在发酵生产丁三醇油酸酯中的应用,其特征在于,步骤如下:
1)活化重组菌,获得种子液;
2)将步骤1)所得的种子液,接种至含有卡那霉素与氯霉素的发酵培养基,培养至OD600在0.6~0.8,获得培养液;
3)向所得的培养液中加入诱导剂、1,2,4-丁三醇和油酸钠,然后继续培养24~48小时;分离得到丁三醇油酸酯,所述诱导剂为异丙基-β-D-硫代半乳糖苷。
5.根据权利要求4所述的应用,其特征在于,步骤2)所述培养基为LB培养基;接种量为体积比种子液:发酵培养基=(1~2 ): (100~130)。
6.根据权利要求4所述的应用,其特征在于,步骤2)所述培养条件为:35℃~37℃,180~220rpm。
7.根据权利要求4所述的应用,其特征在于,步骤3)所述诱导剂为异丙基-β-D-硫代半乳糖苷,加入量为终浓度0.01~0.1mM;1,2,4-丁三醇加入量为终浓度1~10g/L;油酸钠加入量为终浓度1~10g/L。
8.根据权利要求4所述的应用,其特征在于,步骤3)所述培养条件为30~33℃,180~220rpm。
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