CN110759982A - 大豆角共生固氮脂多糖基因或其蛋白与应用 - Google Patents

大豆角共生固氮脂多糖基因或其蛋白与应用 Download PDF

Info

Publication number
CN110759982A
CN110759982A CN201911114741.1A CN201911114741A CN110759982A CN 110759982 A CN110759982 A CN 110759982A CN 201911114741 A CN201911114741 A CN 201911114741A CN 110759982 A CN110759982 A CN 110759982A
Authority
CN
China
Prior art keywords
gmlbp6
protein
gene
plant
nodules
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Granted
Application number
CN201911114741.1A
Other languages
English (en)
Other versions
CN110759982B (zh
Inventor
冯献忠
杨素欣
高金珊
李祯
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Northeast Institute of Geography and Agroecology of CAS
Original Assignee
Northeast Institute of Geography and Agroecology of CAS
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Northeast Institute of Geography and Agroecology of CAS filed Critical Northeast Institute of Geography and Agroecology of CAS
Priority to CN201911114741.1A priority Critical patent/CN110759982B/zh
Publication of CN110759982A publication Critical patent/CN110759982A/zh
Application granted granted Critical
Publication of CN110759982B publication Critical patent/CN110759982B/zh
Active legal-status Critical Current
Anticipated expiration legal-status Critical

Links

Images

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/415Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from plants
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/79Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
    • C12N15/82Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for plant cells, e.g. plant artificial chromosomes (PACs)
    • C12N15/8241Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology
    • C12N15/8261Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield

Abstract

本发明涉及分子生物学技术领域,尤其涉及大豆角共生固氮脂多糖基因或其蛋白与应用。本发明研究表明,大豆共生固氮脂多糖基因突变,导致GmLBP6蛋白失活后,突变体的根瘤数比野生型的根瘤数显著增多,而对突变体进行GmLBP6基因的过表达则使根瘤数目恢复至与野生型一致。利用GmLBP6作为标志物,能够实现对植物种质,特别是大豆种质固氮能力的早期鉴定。

Description

大豆角共生固氮脂多糖基因或其蛋白与应用
技术领域
本发明涉及分子生物学技术领域,尤其涉及大豆角共生固氮脂多糖基因或其蛋白与应用。
背景技术
大豆(Glycine max)等豆科作物与其它经济作物相比,具有一种特有的农艺性状——可以与匹配的土壤根瘤菌相互作用,形成根瘤,将空气中的氮气转化成可以直接吸收的铵。根瘤所固定的氮不仅可为宿主植物提供氮素营养,还能改良土壤,减少化肥投入。Qin L等指出,在我国东北地区,减施50%氮肥的同时接种高效根瘤菌,比常规施肥增产大豆20%以上。可见,将根瘤菌接种技术应用于农业生产,充分发挥生物固氮作用,是大豆减肥增产的重要策略之一。因此,研究大豆共生固氮的规律并且将其应用于生产实践,对于提高国产大豆竞争力以及解决农业氮源污染具有重要意义。
目前的研究表明,根瘤的形成过程为:聚集在豆科植物根毛顶端的根瘤菌分泌纤维素酶,从而将根毛细胞壁溶解以便土壤中的根瘤菌从根毛尖端侵入根的内部,在根的皮层细胞内大量繁殖。在根瘤菌侵入的刺激下,根细胞分泌一种纤维素,将感染丝包围起来,形成一条分枝或不分枝的纤维素鞘,叫做侵入线。侵入线不断地延伸,直到根的内皮层。根的内皮层处的薄壁细胞,受到根瘤菌分泌物的刺激,产生大量的皮层细胞,从而使该处的组织膨大,最后形成根瘤。随着根瘤的形成和增大,根瘤菌在根瘤细胞内继续不断分裂繁殖,使得根瘤细胞的细胞质和细胞核逐渐解体,最后几乎全部占领根瘤细胞。
刘向东的调查研究称:Wan等应用蛋白质组学技术检测了大豆根与根瘤菌的相互作用,萌发4d的幼苗经B.japonicum野生型菌株和Nodc突变体菌株处理后,收集根和根毛,用水处理过的幼苗来对比,根与根毛的蛋白质组图谱比较显示,有96个蛋白表达差异,其中,共有12个蛋白是根毛中特有的。经MALDI-TOF MS分析,一共鉴定出23个蛋白,其中几丁质酶I 和胁迫诱导基因H4是根毛特有。另一方面,对照与B.japonicum野生型菌株处理的根毛采用NanoLC-Q-TOFMS/MS分析后差异表达的有16个蛋白点,其中,脂氧合酶、苯丙氨酸解氨酶和抗坏血酸过氧化物酶都是已知的对处理有反应的蛋白;也有一些是新鉴定出的。例如,肽链内切酶CLP ATP-结合酶、磷脂酶D、泡状融合酶和伴侣蛋白。10个蛋白在野生型菌株与突变体菌株处理的根毛中有表达量的变化,这组蛋白中包含一些已知的蛋白,一些新蛋白的鉴定还需要Nodc-功能表达分析。Panter等分离出大豆根瘤中环形细菌的膜蛋白,共获得17个膜蛋白的蛋白质数据,其中有6个蛋白质是已知功能的同源蛋白。Hoale等比较大豆根瘤和根线粒体的蛋白,在根线粒体中检测到特异蛋白,其中差异表达的蛋白参与根瘤的代谢。Sarma等研究大豆和土壤细菌间的共生固氮过程,利用双向电泳技术分离类菌体蛋白,证明类菌体在氮、碳代谢中表达了一个主要的、精细的蛋白网络。Larrainzar等确定了377个根瘤蛋白。Nathan等分析大豆根瘤细胞液,鉴定了69个蛋白,包括28%碳代谢,12%氮代谢,12%活性氧代谢蛋白,这些蛋白都参与了共生固氮作用。
脂多糖结合蛋白(lipopolysaccharide binding protein,LBP)是一种糖蛋白,在动物中,脂多糖结合蛋白作为脂多糖的载体,与脂多糖中类脂A高度亲和,从而引起一系列的炎症反应,但此前,并没有关于脂多糖结合蛋白对豆科植物共生固氮作用存在影响的相关报道。
发明内容
有鉴于此,本发明要解决的技术问题在于提供大豆角共生固氮脂多糖基因或其蛋白的用途,本发明通过研究表明,GmLBP1基因或蛋白能够调节根瘤数量,且不影响植株的生长,也不参与调控根固氮酶的活性。
本发明提供了如下I)~V)中的至少一种在调控植物根瘤数量中的应用,
I)、GmLBP6蛋白;
II)、GmLBP6蛋白的氨基酸序列中经取代、缺失或添加一个或几个氨基酸且与GmLBP6蛋白具有相同或相近功能的蛋白;
III)、编码I)或II)所述蛋白的核酸分子;
IV)、在III)所述核酸分子的核苷酸序列中经取代、缺失或添加一个或多个核苷酸,且能编码相同或相似功能蛋白的核酸分子;
V)、能够调控I)~V)中的至少一种的水平或活性的物质。
本发明中,所述GmLBP6蛋白的氨基酸序列如SEQ ID NO:1所示;
编码SEQ ID NO:1所示蛋白的核酸分子的序列如SEQ ID NO:2所示。
本发明中,所述植物为豆科植物;本发明中用以验证GmLBP6功能的植物为豆科植物大豆,具体为大豆Williams 82。
本发明还提供了增加植物根瘤数量的制剂,其包括如下i)~vi)中的至少一种:
i)、敲除或敲低GmLBP6基因的表达载体;
ii)、含有i)的重组宿主;
iii)、干扰GmLBP6基因表达的核酸分子;
iv)、GmLBP6基因表达的终止子或转座子;
v)、抑制GmLBP6基因转录的制剂;
vi)、GmLBP6蛋白活性抑制剂。
本发明提供的制剂在提高植物固氮能力中的应用。
豆科植物的根瘤中共生的根瘤菌能够将空气中游离态的氮转化为含氮化合物供给给豆科植物,根瘤数量的增加意味着共生根瘤菌数量的提高,有利于固氮作用的进行,从而有利于增加氮素来源,减少化学氮肥的施入,降低土壤板结。本发明提供的制剂能够敲除或敲低GmLBP6基因的表达、干扰 GmLBP6基因转录、降低植物内源GmLBP6蛋白的水平和/或活性,因此能够增加根瘤菌的数量从而提高植物固氮能力。
本发明所述敲除或敲低GmLBP6基因的表达载体,是指可以用于破坏原来基因的结构,使其失去活性,或者去除掉内源GmLBP6基因的表达载体。其可以通过同源重组的方式来改变基因结构。本发明中,所述载体可为质粒、黏粒、噬菌体或病毒载体。所述的宿主可为真菌、细菌、藻类或细胞。
所述干扰GmLBP6基因转录的核酸分子能够通过阻碍GmLBP6基因的翻译或转录来抑制基因表达,本发明中,其可为靶向GmLBP6基因的siRNA。
本发明还提供了一种提高植物固氮能力的方法,其以本发明所述的制剂,敲除或敲低GmLBP6基因的表达、干扰GmLBP6基因转录、降低植物内源 GmLBP6蛋白的水平和/或活性。
本发明还提供了一种预测植物根瘤数量多少的制剂,其包括:
检测GmLBP6基因转录水平的制剂;
和/或检测GmLBP6蛋白的表达水平或活性制剂。
本发明所述的制剂在鉴定植物固氮能力中的应用。
本发明还提供了鉴定植物固氮能力的方法,其以本发明所述的制剂检测植物种质的GmLBP6基因转录水平或检测GmLBP6蛋白的表达水平或活性。
本发明所述检测包括表达量或活性水平的检测。例如,对GmLBP6蛋白表达水平的检测采用Western blot的方法;对GmLBP6基因转录水平的检测采用real-time PCR的方式。利用本发明所述的鉴定方法,仅对植物幼嫩组织进行检测就可实现对该种质固氮能力的预测,缩短育种周期。
本发明还提供了Gmlbp6-5蛋白突变体,其第38位氨基酸由亮氨酸突变为脯氨酸。野生型GmLBP6蛋白的氨基酸序列如SEQ ID NO:1所示。
编码本发明所述突变体的核酸分子。作为优选,编码本发明突变体的核酸分子其序列如为在如SEQ ID NO:2所示的序列中,第114位碱基由T突变为C。
本发明还提供了含有编码本发明所述突变体的核酸分子的质粒载体,以及含有该质粒载体的重组宿主。
本发明还提供了,上述突变体或核酸分子在提高植物固氮能力、预测植物根瘤数量和/或鉴定植物固氮能力中的应用。
上述提高植物固氮能力是指使植株或种质材料中的GmLBP6蛋白发生突变,形成本发明所述的突变体。本发明所述预测根瘤数量和/或鉴定植物固氮能力,是指鉴定GmLBP6蛋白是否发生了突变,或者鉴定GmLBP6基因是否发生突变。
因此,本发明还提供了预测根瘤数量和/或鉴定植物固氮能力的试剂,其包括鉴定GmLBP6基因突变位点的试剂。
本发明研究表明,大豆角共生固氮脂多糖基因突变,导致突变体的根瘤数比野生型的根瘤数显著增多,而对突变体进行GmLBP6基因的过表达则使根瘤数目恢复至与野生型一致。利用GmLBP6作为标志物,能够实现对植物种质,特别是大豆种质固氮能力的早期鉴定。
附图说明
图1.显示了本发明大豆GmLPB6基因的基因组序列,其中粗体表示外显子序列,斜体表示内含子序列,
Figure RE-GDA0002326136600000051
表示启动子,
Figure RE-GDA0002326136600000052
表示终止子;
图2.显示了大豆Gmlbp6-5突变体较Williams82叶片轻微黄化,无其他表型差异;
图3.显示了大豆Gmlbp6-5突变体较Williams82根瘤数目增多,A和B 为Gmlbp6-5突变体较Williams82根瘤数目增多,C和D为接种根瘤菌后 Gmlbp6-5突变体较Williams82根瘤数目增多;
图4.显示了豆Gmlbp6-5突变体和Williams82根瘤数目和固氮酶活性,A 为Gmlbp6-5突变体较Williams82根瘤数目增多13倍,接种根瘤菌后Gmlbp6-5 突变体较Williams82根瘤数目增多2倍,B Gmlbp6-5为突变体形成根瘤的固氮酶活性与野生型比较无显著性差别;
图5示pCAMBIA3301H-LBP6过量表达载体图谱;
图6示转基因植株的表型得到恢复;
图7示转基因植株的根瘤数量与野生型对照一致。
具体实施方式
本发明提供了大豆角共生固氮脂多糖基因或其蛋白与应用,本领域技术人员可以借鉴本文内容,适当改进工艺参数实现。特别需要指出的是,所有类似的替换和改动对本领域技术人员来说是显而易见的,它们都被视为包括在本发明。本发明的方法及应用已经通过较佳实施例进行了描述,相关人员明显能在不脱离本发明内容、精神和范围内对本文的方法和应用进行改动或适当变更与组合,来实现和应用本发明技术。
本发明采用的试材皆为普通市售品,皆可于市场购得。
所述编码GmLPB6蛋白的核酸分子包括编码GmLPB6蛋白的基因组 DNA、cDNA、重组DNA或mRNA、hnRNA;或者与上述DNA、cDNA、重组DNA或mRNA呈反向互补的核酸分子。
上述核酸分子可根据实际需要进行修饰或优化,从而使基因表达更高效;例如,①可根据受体植物所偏爱的密码子,在保持本发明所述GmLPB6基因的氨基酸序列的同时改变其密码子以符合受体植物的偏爱性。②或修饰邻近起始甲硫氨酸的基因序列,以使翻译有效起始;例如,利用在植物中已知的有效的序列进行修饰。③与各种植物表达的启动子连接,以利于其在植物中的表达;所述启动子可包括组成型、诱导型、时序调节、发育调节、化学调节、组织优选和组织特异性启动子;启动子的选择将随着表达时间和空间需要而变化,而且也取决于靶物种;④引入增强子序列,如内含子序列(例如来源于Adhl和bronzel)和病毒前导序列(例如来源于TMV、MCMV和AMV)。
对于不含有GmLPB6的植物,可采用化学法、鸟枪法、微注射,电穿孔等方法,将GmLPB6的基因片段导入植物细胞,也可通过同源重组、锌指核酸酶、TALEN、CRISPR等方法将GmLPB6的基因片段导入植物细胞。
下面结合实施例,进一步阐述本发明:
实施例1.大豆中GmLBP6基因的分离和结构分析
(1)基因的分离
从大豆品种——Williams82幼嫩叶片中,分离mRNA,以此mRNA为模板, 以Oligo(T)17为引物合成cDNA第一条链。接着以该cDNA第一条链为模板,引物(5’-ATGGCACCCTCAATTGTTTTG-3’)和引物(5’- TTATGAAACATAAGCTAACT-3’)进行PCR扩增,获得了1个GmLPP6基因的长为1482bp的cDNA片段,克隆到pGEM T Easy载体(TaKaRa公司)中并命名为pGEM T Easy-GmLBP6。
pGEM T Easy-GmLBP6中所包含GmLBP6 CDS序列如SEQ ID NO:2所示,共1482bp,它编码一个493个氨基酸的蛋白(SEQ ID NO:1)。
(2)基因的结构分析
以Williams82幼嫩叶片为材料,提取其中的DNA,接着以该基因组DNA 为模板,扩增获得了GmLBP6基因组的片段,GmLBP1 DNA序列如SEQ ID NO:3所示,共5696bp,它含有5个内含子和6个外显子(如图1)。
实施例2.大豆GmLBP6基因不影响植株生长
以Williams82为背景,我们建立了大约包含5000个株系的Tilling群体。利用此平台,我们筛选了1200个株系共找到了15个碱基变化的突变株系,经鉴定,其中6个株系的LBP6蛋白氨基酸发生错义突变,在lbp6-5突变体中, LBP6蛋白的第38亮氨酸改变为脯氨酸。该位置是BPI结构域中非常保守的氨基酸,所以我们首先选取lbp6-5进行后续实验。通过检测接种根瘤菌前后植株生长形态,发现无论是否接种根瘤菌,Gmlbp6-5突变体相比于Williams82 野生型叶片稍微偏黄色,株高等其他表型无差异(图2)。
实施例3.大豆GmLBP6基因调控根瘤数量
(1)大豆GmLBP6基因调控根瘤数量
无论是否接种根瘤菌,Gmlbp6-5突变体的根瘤数比Williams82野生型的根瘤数多,并且在未接种根瘤菌的情况下,Gmlbp6-5突变体根瘤数是 Williams82野生型根瘤数的13倍,接种根瘤菌的情况下,Gmlbp6-5突变体根瘤数是Williams82野生型根瘤数的2倍多(图3)。
(2)大豆GmLBP6基因调不参与控根固氮酶活性
虽然接种根瘤菌以后,Gmlbp6-5突变体比野生型形成了更多的根瘤(前者是后者的2倍以上)。但是,该突变体形成根瘤的固氮酶活性与野生型比较无显著性差别(图4)。由此我们推测LBP可能参与调节根瘤发育。
(3)GmLBP6过量表达载体的构建和转基因植株的获得
提取大豆Williams82根的总RNA,反转录成cDNA,以反转录成的cDNA 为模板,扩增得到GmLBP6基因,利用BamHI和SmaI酶切纯化后的PCR产物,然后将酶切片段连入pCAMBIA3301H双元载体中(图5),测序正确后用于大豆转化。
为了研究大豆LBP基因的功能,利用农杆菌介导的半种子法转化大豆,再生出转基因植株。对已获得转基因植株繁种至T2代,进一步分析了LBP6 过量表达植株的结瘤固氮表型。转基因植株的表型得到恢复,根瘤数目与野生型对照一致(图6~7)。
以上仅是本发明的优选实施方式,应当指出,对于本技术领域的普通技术人员来说,在不脱离本发明原理的前提下,还可以做出若干改进和润饰,这些改进和润饰也应视为本发明的保护范围。
序列表
<110> 中国科学院东北地理与农业生态研究所
<120> 大豆角共生固氮脂多糖基因或其蛋白与应用
<130> MP1926531
<160> 3
<170> SIPOSequenceListing 1.0
<210> 1
<211> 493
<212> PRT
<213> 大豆(Glycine max)
<400> 1
Met Ala Pro Ser Ile Val Leu Ser Leu Leu Pro Leu Leu Leu Val Ser
1 5 10 15
Thr Cys Cys Tyr Ala Gln Pro Leu Glu Glu Gly Phe Ile Ser Gly Val
20 25 30
Ile Ser Asp Lys Gly Leu Glu Tyr Ala Lys Glu Leu Leu Ile Glu Lys
35 40 45
Gly Ile Ala Ser Ile Val Met Leu Gln Leu Pro Glu Ile Glu Asn Ser
50 55 60
Ala Gln Val Pro Leu Val Gly Asn Ala Lys Val Val Leu Ser Asp Ile
65 70 75 80
Thr Ile Lys Asp Val Glu Val Asn Ser Ser Ser Val Lys Thr Gly Glu
85 90 95
Ser Gly Ile Val Leu Val Ile Ser Gly Ala Ile Ala Asn Met Ser Met
100 105 110
Arg Trp Arg Tyr Thr Val Ser Ser Trp Leu Ile Pro Phe Gly Ile Ser
115 120 125
Asp Ser Gly Asn Ala Ser Val Lys Val Thr Gly Met Gln Val Gly Leu
130 135 140
Thr Val Asn Ile Arg Asn Gln Glu Gly Thr Leu Lys Leu Ala Leu Leu
145 150 155 160
Asp Tyr Gly Cys Tyr Val Gly Asp Leu Ser Ile Lys Leu Asp Gly Gly
165 170 175
Ala Ser Trp Leu Tyr Gln Leu Leu Val Asp Val Phe Glu Gly Asp Ile
180 185 190
Thr Ser Ala Val Glu Glu Gly Ile Ser Glu Lys Ile Lys Glu Gly Ile
195 200 205
Met Asn Leu Asp His Phe Leu Lys Ser Leu Pro Glu Gln Ile Ser Leu
210 215 220
Asp Lys Thr Ala Ala Leu Asn Val Ser Phe Val Gly Asn Pro Val Leu
225 230 235 240
Ser Asn Ser Ser Ile Ala Ile Ala Ile Asn Gly Leu Phe Thr Gly Lys
245 250 255
Asn Glu Val Leu Val Pro Gln Arg Tyr Tyr Gln Lys Gly Met Lys Ile
260 265 270
Ser Ala Ala Cys Gly Gly Leu Gln Lys Met Ile Lys Val Ser Ile His
275 280 285
Glu Asn Val Phe Lys Ser Ala Ser Leu Val Tyr Tyr Asn Ala Gly Lys
290 295 300
Met Gln Leu Ile Ile Asp Glu Leu Pro Asp Gln Asp Ile Leu Asn Thr
305 310 315 320
Ala Glu Trp Arg Phe Ile Val Pro Gln Leu Tyr Lys Arg Tyr Pro Asn
325 330 335
Asp Asp Met Gln Leu Asn Ile Ser Ile Ser Ser Pro Pro Val Ile Gln
340 345 350
Val Thr Tyr Gln Asp Ile Gly Ala Thr Ile Phe Val Asp Ile Thr Ile
355 360 365
Asp Val Leu Glu Asp Gly Glu Val Ile Pro Val Ala Cys Ile Ser Val
370 375 380
Glu Ile Ser Ala Ser Cys Ala Val Glu Ile Glu Gly Asn Asn Ile Ala
385 390 395 400
Gly Trp Leu Arg Leu Gln Thr Phe Ser Ala Tyr Leu Lys Trp Ser Lys
405 410 415
Ile Gly Lys Leu His Val Arg Leu Ile Gln Ser Leu Met Ser Ser Val
420 425 430
Leu Lys Thr Val Val Leu Pro Tyr Leu Asn Phe Lys Leu Lys Arg Gly
435 440 445
Phe Pro Leu Pro Ile Ile Asp Gly Tyr Gly Phe Gln Asn Ala Ile Ile
450 455 460
Leu Tyr Asn His Pro Trp Ile Met Val Cys Ser Asp Val Ser Phe Leu
465 470 475 480
Glu Asp Tyr Tyr Leu Gly Gln Gln Leu Ala Tyr Val Ser
485 490
<210> 2
<211> 1482
<212> DNA
<213> 大豆(Glycine max)
<400> 2
atggcaccct caattgtttt gtctctacta ccccttcttc tggtttcaac ttgttgttat 60
gcgcaacccc ttgaagaggg ttttatctct ggggtcatat ctgacaaggg tcttgaatat 120
gccaaggagt tgttgataga gaaaggtatt gcctccattg ttatgcttca gctgccagag 180
attgagaatt ctgcccaagt ccctttggtt ggaaatgcta aagtggttct ttctgacatc 240
acaatcaagg atgttgaagt caattcttca tctgttaaga ctggggagag tggcattgtt 300
ctagtgattt caggtgccat tgctaatatg agtatgaggt ggaggtacac tgtcagctct 360
tggttaatcc catttggaat ttcagatagt gggaatgctt cagtgaaggt tacaggtatg 420
caagtgggac tcacagtaaa tataaggaac caagaaggaa ctcttaaatt ggctctctta 480
gattatggat gttatgtggg agacttatct ataaagttgg acggtggtgc atcttggctt 540
taccaattgc tggtagatgt ttttgaaggg gatataacat ctgcagttga agagggtatt 600
tcagagaaaa taaaagaagg gataatgaat cttgatcatt ttttgaaatc tcttccagag 660
cagatctcac tagacaaaac tgctgcacta aatgtttctt ttgttggcaa tcctgtgttg 720
agtaactcct ctattgctat tgcaattaat ggtttattca cagggaaaaa tgaagtttta 780
gtacctcaac gttactacca gaaaggaatg aagatttctg ctgcctgtgg tggtttacaa 840
aagatgataa aggtttcaat acatgaaaat gtgttcaaat ctgcttccct agtttactac 900
aatgcaggta aaatgcaatt gattattgat gaactgcctg atcaggacat tttgaacact 960
gctgaatgga gattcatagt tccccaatta tacaagcgat atccaaatga tgacatgcaa 1020
cttaatatct ctatatcttc tccaccagtt atacaagtga cctaccaaga cattggtgca 1080
actatttttg tagatataac gattgatgtt ctggaagacg gtgaagtcat acctgttgca 1140
tgcatctcag tggaaattag tgcttcatgt gctgtggaaa ttgaaggaaa caatattgct 1200
ggttggctca gattacaaac attttctgca tacttgaagt ggagcaaaat agggaaactg 1260
cacgtgcgtc tgatccagtc actaatgtca agtgtcctca aaactgttgt ccttccatac 1320
ctgaacttca aattaaagag aggattccca ttaccaatta ttgatggtta tggctttcag 1380
aatgcaatta tcttgtacaa tcatccatgg attatggtgt gtagtgatgt ttccttctta 1440
gaagattact atctaggtca acagttagct tatgtttcat aa 1482
<210> 3
<211> 5696
<212> DNA
<213> 大豆(Glycine max)
<400> 3
catacctacc agttcctgct acacacgttt cctttcacag tgactagtcc ttgatttcag 60
acaccaaact ccaataacag tctcaacaaa acaaccatat taagaaaccc tttcttaacc 120
ctcttgtttc gtcacatggg tgtctcaaat ttttcatctt tcacatcatg aacatcacat 180
aaccatcatg ctcttacctt agcaaatttt ctttgtatct ttatgctaag ttgctgctat 240
tgctaactct gtccctctca taagatccta tctaaaaatt catggcaccc tcaattgttt 300
tgtctctact accccttctt ctggtttcaa cttgttgtta tgcgcaaccc cttgaagagg 360
gttttatctc tggggtcata tctgacaagg gtcttgaata tgccaaggag ttgttgatag 420
agaaaggtat tgcctccatt gttatgcttc agctgccaga gattgagaat tctgcccaag 480
tccctttggt tggaaatgct aaagtggttc tttctgacat cacaatcaag gatgttgaag 540
tcaattcttc atctgttaag actggggaga gtggcattgt tctagtgatt tcaggtgcca 600
ttgctaatat gagtatgagg tggaggtaca ctgtcagctc ttggttaatc ccatttggaa 660
tttcagatag tgggaatgct tcagtgaagg tacgaaatta gaatttcact ctcatgatta 720
cactttatac tatccccttt ggtctttttt ctgtagctgc agttgtagag ttttgttgaa 780
ttgtagttta cacgattgaa ttcaaatttc ggaagatttg acttcgtaaa acaaataaca 840
aatattttcc ttaagttgat tatgctgtca taattggtta gcctgtttgt cctagagaat 900
ctatatagaa gaatgttgga atggaatttt gcatttgcat cgtcttgcaa ttggaattaa 960
atcatagcag taaagatcat gggactggtt aaaaagtttt ttgattgctg tgcactgcag 1020
aatttctatt tcaaactttc aatatcttgt tcttgtaagt tgagttgatt ataagatcgc 1080
aaaaggaaga acaaagaata tctataatta tttcttgata tttcgataaa ggttgtaact 1140
aaaatggaaa tcataaacaa gtaattgtaa tagatccttt ttctaatatg atactccagg 1200
tcataagtca ttcggaaaag cttcacgggt ggtttggttt cattttaaaa tgcaaaaatg 1260
accttatttt cattttgttt ccgtttttaa gaagtttgta taggctaata gataacattt 1320
tctcaaacca aacagtctct aagtttttgg caagtttata aagtagctta tgaccttgtt 1380
aactcacctt aaagaagctt cacgttgaag cttatcaaaa taaacttatt taacattatc 1440
taattgaata ataactttag ttttttcccc cccactgtaa acacagaaaa aagatgttct 1500
atatagatga acaactaaac aagtgtattt cgatttcagt atctgatagg caaaaacctg 1560
tgaaaataac agacttttag tgtctagact cacacaaaca cttgctgttc aataaataat 1620
atctctcact tagttgtgtt gtactatggt ttggaaggtt acaggtatgc aagtgggact 1680
cacagtaaat ataaggaacc aagaaggaac tcttaaattg gctctcttag attatggatg 1740
ttatgtggga gacttatcta taaagttgga cggtggtgca tcttggcttt accaattgta 1800
agcaatcttc ttaatcgatg tttctgaaaa atgggtacta ttcatatttt ccttttttga 1860
taattattct ttgcttattg gagtttttac gttcccatgg cgagcatttg gtaaacaact 1920
actataacaa agctatattt caattctatt ttctactgct ttattcttta gtcaagtgtg 1980
acttgaaaca cacagcagaa aatagctgct atgcttataa aaaaaagaat agcttcttcc 2040
attaactctg ctacattttt ttttcatgag aatgcagagc tacagtttgt agaatatgtc 2100
aacttattct aaaaagagaa atagtagcct tttgcagttt gcttactact gaagatgtat 2160
atattggcaa agttagttgg attgcatttc ttctttggcc tttcttcttc tcacattcct 2220
gaactcttta tccgtgctat gcctttaagt tccaaattaa catgactagg aacataattt 2280
tgggggaaca tagaactgtt ttattttggt gtcaagattc agcagggaga ttatataaga 2340
caactaacga agatgatccc tagcttactg tttatggcta aatgttttgg ttatatttat 2400
gattgtaata tagtaatccc tatgtggttc ctgatttact ttcatagttt tcctgataaa 2460
gtgtgactct taacatgagg ttagaatata taaactttca tcatactcca ttccattaga 2520
agggaaaagg aaaaagcacg aatcagtgtt taccaggaga ttccagaatt cttgtttcca 2580
atcttttagg atcagtttgc caagagcaaa ggttgtcttg tcacctcttg aatgtggtga 2640
acttggatta aagaataagt gcatcgcttc cactttattg cttcttttct tggtgaagta 2700
gctagacttc ttatggagat aggtctgtcc ttgatttcac gaagacacta atataatggt 2760
tcttaactga aagttaagaa attcatacgt taatttttta ttttgttttt atttttagtg 2820
taaggactct tgatgggtaa taatattaaa gtggtttttc ttttcaaaca tctgttaatt 2880
gatagcacaa tcattttcat tttatgatat tacgaacttg gctaacatta ttgtcctata 2940
taactttaat gaagatattt tgccattggc ttctttatgt ttgtttcagg ctggtagatg 3000
tttttgaagg ggatataaca tctgcagttg aagagggtat ttcagagaaa ataaaagaag 3060
ggataatgaa tcttgatcat tttttgaaat ctcttccaga gcagatctca ctagacaaaa 3120
ctgctgcact aaatgtttct tttgttggca atcctgtgtt gagtaactcc tctattgcta 3180
ttgcaattaa tggtttattc acagggaaaa atgaagtttt agtacctcaa cgttactacc 3240
agaaaggaat gaagatttct gctgcctgtg gtggtttaca aaagatgata aaggtttcaa 3300
tacatgaaaa tgtgttcaaa tctgcttccc tagtttacta caatgtaagt ttctgaaatt 3360
tttatttctt actttgcatg ccttagtcca atctatctgt gatgtatagt agcttgttat 3420
aacctgttgc ataggatcta agctaggatt gctgttggta aatttgtttc tctttacgtt 3480
ctgacatcat caaaaacatt gcagaagaaa caatttaata attatatgaa accaagagat 3540
ggacagtctt ggctggacca aagcattgtc tttctacaat aaaatgaagg ttgggagctc 3600
tgacgttgtt gtactctcag tgaatttggg acagaaggat cattttttga gctcaaatag 3660
accttagatt gctagaatat gtcacagtaa cttcgaattg agtcttttat tcatttgttt 3720
ttaaatgcta taatagtgct aattctattt tatagactga ttgaatgcct tctattaact 3780
gttcatactt caggcatttt atgtcaacag gattagctaa atctctgatt ttacattatt 3840
gtagattaaa atatagttta acagtttata ttgttctcgt tctcaggcag gtaaaatgca 3900
attgattatt gatgaactgc ctgatcagga cattttgaac actgctgaat ggagattcat 3960
agttccccaa ttatacaagc gatatccaaa tgatgacatg caacttaata tctctatatc 4020
ttctccacca gttatacaag tgacctacca agacattggt gcaactattt ttgtagatat 4080
aacgattgat gttctggaag acggtgaagt catacctgtt gcatgcatct cagtggtatg 4140
ctaaattaag ttcagaaagg aagttaatgt gcttaagtga atagttaaaa attcctaaag 4200
ctaacaatca ttcaaggagc taaacatcat aatgtacttc ttttcaacat tcagattaag 4260
ctacgcagca ttcaaacttt tcactctttt gttttcatat tcccatatac aaaacaaatc 4320
gataatttga tcattttact aaagtttcaa agttgctaat tattttttct gtctcatcat 4380
gatcaatatc catttatcat atctaactaa ccggttgcat tattctgctt atgctacagg 4440
aaattagtgc ttcatgtgct gtggaaattg aaggaaacaa tattgctggt tggctcagat 4500
tacaaacatt ttctgcatac ttgaagtgga gcaaaatagg gaaactgcac gtgcgtctga 4560
tccaggtaaa tcagactagt attcatattt tcaccttgca acaatgtatg catttttttt 4620
taattaaaac ttggatgaaa ccaaaccgca tgatcaaatg atttccacct agtttgagga 4680
acattctagg ataggatagc aattcaatcc attagtattt ctgttttaca tttgtatttc 4740
cattatatca tttcaaatca ccagcatttc tgttacaagt tataacagat cagtaattag 4800
attgagcgga agagaagggg gagatagaca ttcattttat cctcttgtgt tggaagtgac 4860
attgacaggg cccttggggt gcataaatct cccatcgtgt agtatgagat gctcggtgga 4920
gtacttaagt ggcttagttt tctcccctta acaactaact tttaagggac gtaaattggt 4980
atcaaagtta actatagagg tgctgactag aaaggctgaa taaaatatca tagagtgtta 5040
gccgccgaga cattggctct taggggacca tttcacatat tttgctctta tccttcatgt 5100
ttcacttttt ggattcattt acaattctgc aagtagtata gcacatctgt aacatcatct 5160
cctaaattca cataaagaat tctaatttct actttcttat cattgtctat cctgctgact 5220
acaaattaat cttactcttc aacttttgtt aatatttgca gtcactaatg tcaagtgtcc 5280
tcaaaactgt tgtccttcca tacctgaact tcaaattaaa gagaggattc ccattaccaa 5340
ttattgatgg ttatggcttt cagaatgcaa ttatcttgta caatcatcca tggattatgg 5400
tgtgtagtga tgtttccttc ttagaagatt actatctagg tcaacagtta gcttatgttt 5460
cataaaataa agctacatta aaaaatttgc ctgctgtatt attgtggtaa gaaggttgta 5520
aatgaagaat atatatagaa acccatttgt aagttactcg tgtacatttc acaattagta 5580
taccttttgg atttagccta gtatacacat acatcctgcc atgaagatta cttgttaaaa 5640
atctatacca ttatttttgt gtcattgtat gtataaacac tcatagcttg tttgac 5696

Claims (10)

1.如下I)~V)中的至少一种在调控植物根瘤数量中的应用,
I)、GmLBP6蛋白;
II)、GmLBP6蛋白的氨基酸序列中经取代、缺失或添加一个或几个氨基酸且与GmLBP6蛋白具有相同或相近功能的蛋白;
III)、编码I)或II)所述蛋白的核酸分子;
IV)、在III)所述核酸分子的核苷酸序列中经取代、缺失或添加一个或多个核苷酸,且能编码相同或相似功能蛋白的核酸分子;
V)、能够调控I)~V)中的至少一种的水平或活性的物质。
2.根据权利要求1所述的应用,其特征在于,
所述GmLBP6蛋白的氨基酸序列如SEQ ID NO:1所示;
编码SEQ ID NO:1所示蛋白的核酸分子的序列如SEQ ID NO:2所示;
所述植物为豆科植物。
3.一种增加植物根瘤数量的制剂,其特征在于,包括如下i)~vi)中的至少一种:
i)、敲除或敲低GmLBP6基因的表达载体;
ii)、含有i)的重组宿主;
iii)、干扰GmLBP6基因转录的核酸分子;
iv)、GmLBP6基因表达的终止子或转座子;
v)、抑制GmLBP6基因表达的制剂;
vi)、GmLBP6蛋白活性抑制剂。
4.权利要求3所述的制剂在提高植物固氮能力中的应用。
5.一种提高植物固氮能力的方法,其特征在于,以权利要求3所述的制剂,敲除或敲低GmLBP6基因的表达、干扰GmLBP6基因转录、降低植物内源GmLBP6蛋白的水平和/或活性。
6.一种预测植物根瘤数量多少的制剂,其特征在于,包括:
检测GmLBP6基因转录水平的制剂;
和/或检测GmLBP6蛋白的表达水平或活性制剂。
7.一种鉴定植物固氮能力的方法,其特征在于,以权利要求6所述的制剂检测植物种质的GmLBP6基因转录水平或检测GmLBP6蛋白的表达水平或活性。
8.Gmlbp6-5蛋白突变体,其第38位氨基酸由亮氨酸突变为脯氨酸。
9.编码权利要求8所述突变体的核酸分子。
10.权利要求8所述的突变体或权利要求9所述的核酸分子在提高植物固氮能力、预测植物根瘤数量和/或鉴定植物固氮能力中的应用。
CN201911114741.1A 2019-11-14 2019-11-14 大豆共生固氮脂多糖基因或其蛋白与应用 Active CN110759982B (zh)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CN201911114741.1A CN110759982B (zh) 2019-11-14 2019-11-14 大豆共生固氮脂多糖基因或其蛋白与应用

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CN201911114741.1A CN110759982B (zh) 2019-11-14 2019-11-14 大豆共生固氮脂多糖基因或其蛋白与应用

Publications (2)

Publication Number Publication Date
CN110759982A true CN110759982A (zh) 2020-02-07
CN110759982B CN110759982B (zh) 2021-05-25

Family

ID=69338406

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CN201911114741.1A Active CN110759982B (zh) 2019-11-14 2019-11-14 大豆共生固氮脂多糖基因或其蛋白与应用

Country Status (1)

Country Link
CN (1) CN110759982B (zh)

Cited By (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN112470598A (zh) * 2020-12-11 2021-03-12 甘肃农业大学 一种促进紫花苜蓿快速结瘤的方法

Citations (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN108586592A (zh) * 2018-04-23 2018-09-28 中国科学院上海生命科学研究院 调控根瘤植物的根瘤数目的基因及其在高效固氮方面的应用
CN108728425A (zh) * 2017-04-13 2018-11-02 中国科学院上海生命科学研究院 调节根瘤植物的固氮能力的基因及其应用
CN110054671A (zh) * 2019-05-08 2019-07-26 中国农业科学院油料作物研究所 一种调控植物根瘤发育与衰老的方法及其应用
CN110144004A (zh) * 2019-07-01 2019-08-20 中国农业科学院油料作物研究所 Gmpplcyp8蛋白及其相关生物材料在调控植物固氮能力中的应用

Patent Citations (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN108728425A (zh) * 2017-04-13 2018-11-02 中国科学院上海生命科学研究院 调节根瘤植物的固氮能力的基因及其应用
CN108586592A (zh) * 2018-04-23 2018-09-28 中国科学院上海生命科学研究院 调控根瘤植物的根瘤数目的基因及其在高效固氮方面的应用
CN110054671A (zh) * 2019-05-08 2019-07-26 中国农业科学院油料作物研究所 一种调控植物根瘤发育与衰老的方法及其应用
CN110144004A (zh) * 2019-07-01 2019-08-20 中国农业科学院油料作物研究所 Gmpplcyp8蛋白及其相关生物材料在调控植物固氮能力中的应用

Non-Patent Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
GLYCINE MAX (SOYBEAN): "登录号为XP_003553049.1", 《GENBANK》 *
ZHIHUA WU: "A global coexpression network of soybean genes gives insights into the evolution of nodulation in nonlegumes and legumes", 《THE NEW PHYTOLOGIST 》 *

Cited By (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN112470598A (zh) * 2020-12-11 2021-03-12 甘肃农业大学 一种促进紫花苜蓿快速结瘤的方法
CN112470598B (zh) * 2020-12-11 2022-06-03 甘肃农业大学 一种促进紫花苜蓿快速结瘤的方法

Also Published As

Publication number Publication date
CN110759982B (zh) 2021-05-25

Similar Documents

Publication Publication Date Title
US8927807B2 (en) Nitrate-responsive promoter
CN109705198B (zh) OsCKX7蛋白质及其编码基因在调控植物纹枯病抗性中的应用
WO2020156367A1 (zh) 提高水稻产量和/或稻瘟病抗性的方法及其所用蛋白质
WO2018146481A1 (en) Expression of a phosphate transporter for improving plant yield
CN109912702B (zh) 蛋白质OsARE1在调控植物抗低氮性中的应用
CN108218968B (zh) 一种植物籽粒性状相关蛋白及其编码基因和应用
CN108642065A (zh) 一种水稻胚乳粉质相关基因OsSecY2及其编码蛋白质和应用
Russo et al. The upstream regulatory sequence of the light harvesting complex Lhcf2 gene of the marine diatom Phaeodactylum tricornutum enhances transcription in an orientation-and distance-independent fashion
CN113061171B (zh) 抗稻瘟病蛋白和基因、分离的核酸及其应用
CN101280007A (zh) 一种与植物耐冷性相关的蛋白及其编码基因与应用
CN113337536B (zh) Rs2z32基因作为植物免疫负调控因子在提高作物抗性中的应用
CN107326035B (zh) 一种调控水稻粒型和叶色的去泛素化酶基因ubp5及其应用
CN112175058B (zh) 耐盐相关基因剪切体的克隆、鉴定及其应用
CN110759982B (zh) 大豆共生固氮脂多糖基因或其蛋白与应用
CN113637658A (zh) 基于dCas9-oToV的基因转录系统及其应用
CN111826391B (zh) 一种nhx2-gcd1双基因或其蛋白的应用
CN102234328A (zh) 植物耐低磷胁迫相关的蛋白AtLPT2及其编码基因与应用
CN109207485A (zh) OsAPS1基因在改良水稻抗病性中的应用
CN112662681B (zh) OsNRAMP1在改良水稻抗病性中的应用
CN108841836B (zh) 大麦HvAIR12基因及其用途
CN112813067A (zh) 通过抑制sd1基因的表达降低四倍体野生稻株高的方法
CN114573669A (zh) 蛋白质Ghd7在调控植物抗低氮性中的应用
CN112029746A (zh) 植物tmk1基因及其抗核盘菌的应用
CN106349353B (zh) 一种调控植物淀粉合成相关蛋白OsFSE及其编码基因与应用
CN114958845B (zh) miR319-TaGAMYB3模块在调控小麦株型和增加产量上的应用

Legal Events

Date Code Title Description
PB01 Publication
PB01 Publication
SE01 Entry into force of request for substantive examination
SE01 Entry into force of request for substantive examination
GR01 Patent grant
GR01 Patent grant