CN110577935A - 一种增强t4 dna连接酶原核表达的方法 - Google Patents
一种增强t4 dna连接酶原核表达的方法 Download PDFInfo
- Publication number
- CN110577935A CN110577935A CN201910688896.XA CN201910688896A CN110577935A CN 110577935 A CN110577935 A CN 110577935A CN 201910688896 A CN201910688896 A CN 201910688896A CN 110577935 A CN110577935 A CN 110577935A
- Authority
- CN
- China
- Prior art keywords
- t4dna ligase
- hexanediol
- expression
- diol
- ligase
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Granted
Links
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
- C12N15/70—Vectors or expression systems specially adapted for E. coli
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/93—Ligases (6)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Y—ENZYMES
- C12Y605/00—Ligases forming phosphoric ester bonds (6.5)
- C12Y605/01—Ligases forming phosphoric ester bonds (6.5) forming phosphoric ester bonds (6.5.1)
- C12Y605/01001—DNA ligase (ATP) (6.5.1.1)
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Zoology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Plant Pathology (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Enzymes And Modification Thereof (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
Abstract
本发明公开了α,ω‑二元醇在提高T4 DNA连接酶原核表达中的应用。本发明利用1,6‑己二醇及其同分异构体(1,5‑己二醇或2,5‑己二醇),应用于T4 DNA连接酶原核表达体系中,从而有效地提高T4 DNA连接酶表达产量。由此可以解决现有技术中T4 DNA连接酶生产耗时、耗力的问题,本发明为T4 DNA连接酶的大规模工业化生产提供了很大的应用价值。
Description
技术领域
本发明涉及分子生物学及生物医药技术领域,更具体地,涉及一种ɑ,ω-二元醇及其同分异构体有效地促进T4 DNA连接酶原核表达的方法。
背景技术
DNA连接酶通过催化核酸切口处两个核苷酸的3’-羟基和5’-磷酸末端形成磷酸二酯键,从而连接两段双链DNA或RNA分子,在DNA的修复和重组过程中发挥重要作用,广泛存在于真核生物、古细菌和多种病毒中。T4 DNA连接酶是一种依赖于ATP供能的连接酶,能连接单缺口、粘性末端、平末端双链DN A、双链RNA或者DNA/RNA杂交体,作为一种基因工程工具酶被广泛应用于分子生物学领域。科学家最早于1967年从T4噬菌体感染的大肠杆菌中提取得到T4 DNA连接酶,但这种方法只能获得极其微量的T4 DNA连接酶。后来发现利用λT4噬菌体溶源菌分离纯化T4 DNA连接酶可以获得更高的产量。目前,将携带T4 DNA连接酶基因的质粒转入大肠杆菌中通过原核表达获取T4 DNA连接酶已成为常用方法。但是T4 DNA连接酶每年消耗量巨大,原核表达纯化T4DNA连接酶耗时、耗力。因此,寻找提高T4 DNA连接酶原核表达产量的方法具有重大工业价值。
1,6-己二醇是一种ɑ,ω-二元醇,分子式为C6H14O2,外表为白色针状晶体,可溶于水和乙醇,同分异构体有1,5-己二醇,2,5-己二醇,1,2-己二醇等。作为一种重要的化工中间体,能与有机酸、酸酐、异氰酸盐等反应产生各种类型的化合物,广泛应用于生产增塑剂、聚酯树脂、光固化剂、聚氨酯高弹体等领域。在基础生物医学研究领域,最新的研究表明1,6-己二醇可以通过破坏疏水作用,引起无膜结构颗粒的液-液相分离,因此可作为研究细胞无膜结构生理特性的工具。
目前鲜有关于1,6-己二醇应用于基础生物医药领域的研究报道,其应用前景值得我们进一步去发掘。
发明内容
本发明的目的是为了克服现有技术的不足,提供一种增强T4 DNA连接酶原核表达的方法。
本发明的第一个目的是提供α,ω-二元醇在提高T4 DNA连接酶原核表达中的应用。
本发明的第二个目的是提供一种T4 DNA连接酶原核表达的方法。
为了实现上述目的,本发明是通过以下技术方案予以实现的:
发明人经过创造的研究发现1,6-己二醇或者其同分异构体1,5-己二醇,2,5-己二醇应用于T4 DNA连接酶原核表达中,能在DNA水平和mRNA水平提高T4 DNA连接酶的表达量。因此本发明要求保护以下内容:
α,ω-二元醇在提高T4 DNA连接酶原核表达中的应用。
优选地,所述α,ω-二元醇为己二醇。
更优选地,所述α,ω-二元醇为1,6-己二醇、1,5-己二醇或2,5-己二醇中的一种或几种。
最优选地,所述α,ω-二元醇为1,6-己二醇。
一种T4 DNA连接酶原核表达的方法,在T4 DNA连接酶原核表达体系中添加α,ω-二元醇。
T4 DNA连接酶原核表达体系为培养有表达T4 DNA连接酶的原核表达菌株及其培养基。
所述的菌株为大肠杆菌BL21(DE3)。
优选地,在T4 DNA连接酶原核表达体系中,加入异丙基-β-D-硫代半乳糖苷启动诱导表达,同时加入α,ω-二元醇,进行T4 DNA连接酶的原核表达。
更优选地,其特征在于,培养原核表达T4 DNA连接酶的菌株的培养基中添加1,6-己二醇,终浓度不大于4%。
更优选地,其特征在于,培养原核表达T4 DNA连接酶的菌株的培养基中添加1,6-己二醇,终浓度为2%。
更优选地,其特征在于,IPTG的终浓度为1mM。
最优选地,在T4 DNA连接酶原核表达体系中,加入终浓度为1mM的IPTG启动诱导表达,同时加入α,ω-二元醇至终浓度为2%,进行T4 DNA连接酶的原核表达。
与现有技术相比,本发明具有如下有益效果:
本发明利用1,6-己二醇及其同分异构体,应用于T4 DNA连接酶原核表达体系中,从而有效地提高T4 DNA连接酶表达产量。由此可以解决现有技术中T4 DNA连接酶生产耗时、耗力的问题,本发明为T4 DNA连接酶的大规模工业化生产提供了很大的应用价值。
附图说明
图1为不同浓度的1,6-己二醇对大肠杆菌的毒性作用。
图2为连接了T4 DNA连接酶基因的pET15b表达质粒载体图。
图3为1,6-己二醇促进T4 DNA连接酶的原核表达以及浓度效应关系。
图4为2,5-己二醇、1,5-己二醇也能促进T4 DNA连接酶的原核表达。
图5为加入1,6-己二醇的条件下,小量表达和纯化T4 DNA连接酶。
图6为加入1,6-己二醇纯化的T4 DNA连接酶的功能验证。
图7为1,6-己二醇促进T4 DNA连接酶原核表达的机制研究。
具体实施方式
下面结合说明书附图和具体实施例对本发明作出进一步地详细阐述,所述实施例只用于解释本发明,并非用于限定本发明的范围。下述实施例中所使用的试验方法如无特殊说明,均为常规方法;所使用的材料、试剂等,如无特殊说明,为可从商业途径得到的试剂和材料。
实施例1 1,6-己二醇对大肠杆菌的毒性作用
1,6-己二醇是一种化学原料,在基础研究领域应用尚且有限,目前还没有关于1,6-己二醇对细菌的毒性作用的报道,因此我们检测了不同浓度的1,6-己二醇对大肠杆菌的毒性作用。
一、实验方法
将感受态BL21大肠杆菌接种到LB培养基,在37℃、220rpm细菌摇床中培养至OD值到0.6左右,加入终浓度分别为0.5%、1%、2%、4%、6%、8%、10%、20%的1,6-己二醇(sigma),继续培养12小时。由于诱导剂IPTG同样具有一定的细菌毒性,因此同时加入或不加终浓度为1mM的IPTG。
二、实验结果
结果如图1所示,1,6-己二醇对大肠杆菌有毒性,并且呈剂量依赖关系。因此在蛋白诱导表达过程中不宜加入过高浓度的1,6-己二醇。
实施例2不同浓度1,6-己二醇对T4 DNA连接酶的原核表达的作用
一、实验方法
将质粒pET15b-T4 DNA ligase(是连接了T4 DNA连接酶基因的pET15b表达质粒,图2所示)转入感受态BL21(DE3),挑取单克隆接种到LB培养基,在37℃、220rpm细菌摇床中培养至OD值到0.6左右。取1ml菌液,加入终浓度1mM的IPTG和不同终浓度的1,6-己二醇,设置1,6-己二醇质量百分浓度梯度为0、1%、2%、4%、6%、8%,在37℃、220rpm细菌摇床中诱导培养。4小时后,收集菌体,超声破碎,取上清,加入5×loading buffer,100℃煮10分钟,SDS-PAGE胶电泳,恒压60V 30分钟转120V 60分钟。取出胶,用考马斯亮蓝染液染色1小时后,脱色液进行脱色4~6小时。
为了进一步研究1,6-己二醇的浓度与T4 DNA连接酶产量的关系,增设1,6-己二醇浓度梯度0.5%和1.5%。
二、实验结果
结果如图3所示,1,6-己二醇能促进T4 DNA连接酶的原核表达,且随着1,6-己二醇浓度的提高,T4 DNA连接酶的原核表达增强。但1,6-己二醇浓度达到4%时,效果降低,进一步增加1,6-己二醇浓度,毒性过强导致细菌大量死亡,几乎检测不到T4 DNA连接酶的表达。因此最适宜的1,6-己二醇浓度为2%。
实施例3 2,5-己二醇、1,5-己二醇促进T4 DNA连接酶的原核表达
为了验证1,6-己二醇的同分异构体2,5-己二醇、1,5-己二醇对T4 DNA连接酶的原核表达是否有相同的促进作用,采用同样的小量诱导表达方法,在诱导阶段加入不同浓度的2,5-己二醇或1,5-己二醇。
一、实验方法
同实施例2。
二、实验结果
结果如图4所示,2,5-己二醇、1,5-己二醇也能促进T4 DNA连接酶的原核表达,并且呈现浓度效应关系。
实施例4表达和纯化T4 DNA连接酶
一、实验方法
将转化了pET15b-T4 DNA ligase的单克隆BL21(DE3),接种LB培养基,在37℃、220rpm细菌摇床中培养至OD值到0.6左右。加入终浓度1mM的IPTG和2%的1,6-己二醇,同时设置不加1,6-己二醇的对照组,在37℃、220rpm摇床诱导培养4小时。收集菌体,用CapturemTM his-tagged快速纯化试剂盒(Takara)纯化蛋白,用SDS-PAGE胶检验蛋白纯度,用BCA试剂盒(ThermoFisher Scientific)检测蛋白浓度。
二、实验结果
结果如图5所示,在相同的诱导条件下,加入2%1,6-己二醇可以提高T4DNA连接酶的产量至少5倍。
实施例5 T4 DNA连接酶的功能检测
一、实验方法
将加入或者不加入1,6-己二醇诱导表达纯化得到的T4 DNA连接酶,分别稀释5倍、10倍、20倍、100倍后去连接经HindⅢ消化的λDNA(ThermoFisher Scientific)。反应体系为:
16℃作用30分钟。同时用商业化的T4 DNA连接酶(takara)作阳性对照。
同时,为进一步验证T4 DNA连接酶对载体和酶切片段的连接效果,我们在连接反应体系中加入3μl酶切的线性化载体,14μl相同酶切的目的基因片段,2μl ATP缓冲液和1μl稀释的T4 DNA连接酶,16℃连接过夜。第二日用感受态stbl3转化,观察形成的单克隆数目,并做菌落PCR鉴定阳性克隆。
二、实验结果
结果如图6所示,加入1,6-己二醇诱导表达纯化得到的T4 DNA连接酶连接活性正常。
实施例6 1,6-己二醇促进T4 DNA连接酶原核表达的机制研究
一、实验方法
转化了pET15b-T4 DNA ligase的BL21(DE3)诱导培养4小时后,收集菌体,用TRIZOL(life)裂解提取细菌总RNA,用反转试剂盒(诺唯赞)反转合成cDNA,接着用SYBRPremix ExTaq II Kit(Takara)按照说明书使用CFX96 Real-Time System(Bio-Rad)进行定量PCR,用细菌16sRNA作为内参检测T4 DNA连接酶的mRNA表达水平。
转化了pET15b-T4 DNA ligase的BL21(DE3)诱导培养4小时后,收集菌体,经溶菌酶消化后,用细菌DNA提取试剂盒(omega)提取细菌总的DNA,用同样的方法进行定量PCR,检测T4 DNA连接酶的DNA表达水平。
二、实验结果
结果如图7所示,加入1,6-己二醇诱导的T4 DNA连接酶的mRNA水平和DNA水平均提高。
Claims (10)
1.α,ω-二元醇在提高T4 DNA连接酶原核表达中的应用。
2.根据权利要求1所述的应用,其特征在于,所述α,ω-二元醇为己二醇。
3.根据权利要求2所述的应用,其特征在于,所述α,ω-二元醇为1,6-己二醇、1,5-己二醇或2,5-己二醇中的一种或几种。
4.根据权利要求3所述的应用,其特征在于,所述α,ω-二元醇为1,6-己二醇。
5.一种T4 DNA连接酶原核表达的方法,其特征在于,在T4 DNA连接酶原核表达体系中添加α,ω-二元醇。
6.根据权利要求5所述的方法,其特征在于,在T4 DNA连接酶原核表达体系中,加入异丙基-β-D-硫代半乳糖苷启动诱导表达,同时加入α,ω-二元醇,进行T4 DNA连接酶的原核表达。
7.根据权利要求6所述的方法,其特征在于,培养原核表达T4 DNA连接酶的菌株的培养基中添加1,6-己二醇,终浓度不大于4%。
8.根据权利要求7所述的方法,其特征在于,培养原核表达T4 DNA连接酶的菌株的培养基中添加1,6-己二醇,终浓度为2%。
9.根据权利要求6所述的方法,其特征在于,IPTG的终浓度为1mM。
10.根据权利要求1到6任一所述方法,其特征在于,在T4 DNA连接酶原核表达体系中,加入终浓度为1mM的IPTG启动诱导表达,同时加入α,ω-二元醇至终浓度为2%,进行T4 DNA连接酶的原核表达。
Priority Applications (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
CN201910688896.XA CN110577935B (zh) | 2019-07-29 | 2019-07-29 | 一种增强t4 dna连接酶原核表达的方法 |
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
CN201910688896.XA CN110577935B (zh) | 2019-07-29 | 2019-07-29 | 一种增强t4 dna连接酶原核表达的方法 |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
CN110577935A true CN110577935A (zh) | 2019-12-17 |
CN110577935B CN110577935B (zh) | 2021-01-05 |
Family
ID=68810624
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
CN201910688896.XA Active CN110577935B (zh) | 2019-07-29 | 2019-07-29 | 一种增强t4 dna连接酶原核表达的方法 |
Country Status (1)
Country | Link |
---|---|
CN (1) | CN110577935B (zh) |
Citations (4)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US6194637B1 (en) * | 1998-11-17 | 2001-02-27 | Pioneer Hi-Bred International, Inc. | Maize DNA ligase I orthologue and uses thereof |
US20070037190A1 (en) * | 2005-08-10 | 2007-02-15 | Hirokazu Nishida | DNA ligase mutants |
CN106755041A (zh) * | 2016-12-28 | 2017-05-31 | 苏州旷世骏弛生物科技有限公司 | 一种低温型细菌dna连接酶的制备方法及其应用 |
CN108129571A (zh) * | 2017-12-25 | 2018-06-08 | 上海捷瑞生物工程有限公司 | Taq DNA连接酶融合蛋白 |
-
2019
- 2019-07-29 CN CN201910688896.XA patent/CN110577935B/zh active Active
Patent Citations (4)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US6194637B1 (en) * | 1998-11-17 | 2001-02-27 | Pioneer Hi-Bred International, Inc. | Maize DNA ligase I orthologue and uses thereof |
US20070037190A1 (en) * | 2005-08-10 | 2007-02-15 | Hirokazu Nishida | DNA ligase mutants |
CN106755041A (zh) * | 2016-12-28 | 2017-05-31 | 苏州旷世骏弛生物科技有限公司 | 一种低温型细菌dna连接酶的制备方法及其应用 |
CN108129571A (zh) * | 2017-12-25 | 2018-06-08 | 上海捷瑞生物工程有限公司 | Taq DNA连接酶融合蛋白 |
Non-Patent Citations (2)
Title |
---|
FOLKERT J. 等: "The use of biotin tagging in Saccharomyces cerevisiae improves the sensitivity of chromatin immunoprecipitation", 《NUCLEIC ACIDS RESEARCH》 * |
李书亚 等: "额外的错配碱基提高T4 DNA 连接酶等位特异性连接", 《中国生物化学与分子生物学报》 * |
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
CN110577935B (zh) | 2021-01-05 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
AU2012264606B2 (en) | Transcription terminator sequences | |
Korneli et al. | Getting the big beast to work—systems biotechnology of Bacillus megaterium for novel high-value proteins | |
Chen et al. | Improved glucosamine and N-acetylglucosamine production by an engineered Escherichia coli via step-wise regulation of dissolved oxygen level | |
DE102006017760A1 (de) | Verfahren zur enzymatischen Herstellung von 2-Hydroxy-2-methylcarbonsäuren | |
Lauersen et al. | Ice recrystallization inhibition mediated by a nuclear-expressed and-secreted recombinant ice-binding protein in the microalga Chlamydomonas reinhardtii | |
RU2014128987A (ru) | Быстрый способ клонирования и экспрессии сегментов гена родственной вариабельной области антитела | |
EA201001436A1 (ru) | Клетка, сбраживающая пентозный сахар | |
CN108350040A (zh) | 用于精细化学品的改进生产的重组微生物 | |
JPWO2021100640A5 (zh) | ||
EP4063482A1 (en) | Modified cyanobacterium, modified cyanobacterium production method, and protein production method | |
Xie et al. | Cold tolerance regulated by the pyruvate metabolism in Vibrio parahaemolyticus | |
CN108913737B (zh) | 使用重组大肠杆菌发酵制备环二核苷酸的方法 | |
CN110577935B (zh) | 一种增强t4 dna连接酶原核表达的方法 | |
WO2019100431A1 (zh) | 一种能够增强蛋白质合成效率的串联dna元件 | |
WO2022213477A1 (zh) | 一种从葡萄糖到氨基葡萄糖的酶法制备方法与酶用途 | |
CN106591347B (zh) | 一种包含噬菌体溶菌酶的表达系统及其运用 | |
JP6037339B2 (ja) | 形質転換植物細胞を用いたタンパク質製造方法 | |
AU2019470409A1 (en) | Candida utilis double gene co-expression strain that hydrolyzes protein components in food waste and construction method therefor | |
WO2020135549A1 (zh) | 诱导质粒拷贝数增加的培养基及其应用 | |
CN114540403B (zh) | 酯化虾青素的制造方法及酯化基因的应用 | |
CN110483516B (zh) | 可用作Cdc25A/B磷酸酶抑制剂的化合物 | |
RU2707525C1 (ru) | Рекомбинантная плазмида, экспрессирующая клонированный ген шаперона HFQ Vibrio cholerae, и штамм Escherichia coli - суперпродуцент шаперона HFQ Vibrio cholerae | |
CN110551769B (zh) | 一种间苯三酚的生产方法 | |
US20240084245A1 (en) | Modified cyanobacterium, modified cyanobacterium production method, and protein production method | |
CN108220317B (zh) | 一种重组表达质粒及其制备方法、用途 |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
PB01 | Publication | ||
PB01 | Publication | ||
SE01 | Entry into force of request for substantive examination | ||
SE01 | Entry into force of request for substantive examination | ||
GR01 | Patent grant | ||
GR01 | Patent grant |