CN108129571A - Taq DNA连接酶融合蛋白 - Google Patents

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周磊
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    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
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Abstract

本发明公开了Taq DNA连接酶融合蛋白,其Taq DNA连接酶的羧基末端引入古细菌的Sso7d的DNA,在构建融合蛋白的同时在Taq DNA连接酶的氨基末端引入6个组氨酸的亲和标签,用镍亲和柱进行纯化,Taq DNA连接酶和古细菌的Sso7dDNA结合功能域进行融合表达,得到了效率和活性更高的融合蛋白,Sso7d片段融合在Taq DNA连接酶羧基末端,融合在氨基末端,简化了酶的纯化方法,是将古细菌的Sso7d的DNA结合功能域和TaqDNA连接酶进行融合表达,融合基团设计在羧基末端,简化了酶的纯化方法,纯化工艺通过镍亲合柱和离子交换结合即可实现,新的酶分子用于SNP分析中的连接反应,显示出更高的效率,生产成本低,适合工业化。

Description

Taq DNA连接酶融合蛋白
技术领域
本发明涉及分子生物学领域,具体涉及Taq DNA连接酶融合蛋白。
背景技术
Taq DNA连接酶是连接酶检测反应(LDR)分型方法中不可少的一种工具酶。古细菌的 Sso7d的DNA结合功能域在分子生物学的工具酶上,也得到较为广泛的应用,如与Taq和Pfu DNA多聚酶进行融合表达,可使得酶的扩增速度增加几倍,显著性得提高酶效率。TaqDNA 连接酶是SNP分析中的关键酶,活性高低是试验是否成功的关键因素,为增强Taq DNA连接酶的效率,我们将古细菌的Sso7d的DNA结合功能域和Taq DNA连接酶融合表达,得到活性更高的连接酶,生产成本低,适合工业化使用。
发明内容
本发明的目的在于提供Taq DNA连接酶融合蛋白,活性更高,生产成本低,适合工业化使用。
为了解决上述技术问题,本发明提供了如下的技术方案:
本发明提供了Taq DNA连接酶融合蛋白,其Taq DNA连接酶的羧基末端引入古细菌的 Sso7d的DNA,在构建融合蛋白的同时在Taq DNA连接酶的氨基末端引入6个组氨酸的亲和标签,用镍亲和柱进行纯化。
作为本发明的一种优选技术方案,将所述Taq DNA连接酶和古细菌的所述Sso7dDNA结合功能域进行融合表达,得到了效率和活性更高的融合蛋白。
作为本发明的一种优选技术方案,将所述Sso7d片段融合在所述Taq DNA连接酶羧基末端,6个组氨酸标签融合在氨基末端。
作为本发明的一种优选技术方案,对于所述Sso7d也可以融合在其它高温连接酶分子上。
作为本发明的一种优选技术方案,所述Sso7d蛋白序列为:
作为本发明的一种优选技术方案,所述Taq DNA连接酶蛋白序列为:
作为本发明的一种优选技术方案,,所述Taq DNA连接酶蛋白序列为:
本发明所达到的有益效果是:该发明是Taq DNA连接酶融合蛋白,是将古细菌的Sso7d 的DNA结合功能域和TaqDNA连接酶进行融合表达,融合基团设计在羧基末端,在T4DNA连接酶的氨基末端引入6个组氨酸标签。预期得到的重组蛋白具有更高的连接效率,同时因在重组的融合蛋白氨基末端引入6个组氨酸标签,简化了酶的纯化方法,纯化工艺通过镍亲合柱和离子交换结合即可实现,新的酶分子用于SNP分析中的连接反应,显示出更高的效率,生产成本低,适合工业化。
除了上面所描述的目的、特征和优点之外,本发明还有其它的目的、特征和优点。下面通过实施例对本发明作进一步详细的说明。
具体实施方式
实施例1
本发明提供Taq DNA连接酶融合蛋白,其Taq DNA连接酶的羧基末端引入古细菌的Sso7d 的DNA,在构建融合蛋白的同时在Taq DNA连接酶的氨基末端引入6个组氨酸的亲和标签,用镍亲和柱进行纯化。
将所述Taq DNA连接酶和古细菌的所述Sso7dDNA结合功能域进行融合表达,得到了效率和活性更高的融合蛋白,更加适合于SNP分析。
将所述Sso7d片段融合在所述Taq DNA连接酶羧基末端,6个组氨酸标签融合在氨基末端。
对于所述Sso7d也可以融合在其它高温连接酶分子上,如Tth DNA连接酶等。
该发明是Taq DNA连接酶融合蛋白,首先将Sso7d-Taq DNA连接酶融合蛋白序列优化的核苷酸序列引入Nco I和Xho I位点序列,该人工合成序列,通过基因合成获得。克隆的载体选用pET28a,构建的表达载体转入BL21(DE3)进行表达;表达的融合蛋白,破菌后,上清蛋白在75℃处理20分钟,冰上30分钟,离心收集上清,先用DEAE-琼脂糖凝胶纯化,再用NTA-琼脂糖凝胶吸附,咪唑解离,得到纯度95%的酶液,酶液在10mM TrisHCl pH7.5,50mM KCl,1mM DTT,().1mM EDTA,50%甘油透析3次,-20度保存;为验证得到融合蛋白的酶活性,制备的酶和NEB的Taq DNA连接酶进行活性比较。试验方法是测定人基因组 DNArs177086686位点,序列为 AATGGAAAGAGGCTGGAAGCAGAGA[A/G]CGTTCCTCTCCGTGGAGCTTCCCAA。连接产物测序进行单核苷酸分析,理论上讲,酶的活性高,得到的连接产物量大,用于测序反应后,获得的测序产物的量也相应增大,毛细管电泳分析后,单核苷酸的峰值高,信号明显。下表是我们用相同摩尔量的的Taq DNA连接酶测定16个样品的结果,我们制备的Ssod7-Taq DNA连接酶的作用效果极显著高于NEB的Taq DNA连接酶。
其中作为本发明中的Sso7d蛋白序列为:
Taq DNA连接酶蛋白序列为:
Taq DNA连接酶融合蛋白序列为:
本发明所达到的有益效果是:该发明是Taq DNA连接酶融合蛋白,是将古细菌的Sso7d 的DNA结合功能域和TaqDNA连接酶进行融合表达,融合基团设计在羧基末端,在T4DNA连接酶的氨基末端引入6个组氨酸标签。预期得到的重组蛋白具有更高的连接效率,同时因在重组的融合蛋白氨基末端引入6个组氨酸标签,简化了酶的纯化方法,纯化工艺通过离子交换和镍亲合柱结合即可实现,新的酶分子用于SNP分析中的连接反应,显示出更高的效率,生产成本低,适合工业化。
最后应说明的是:以上所述仅为本发明的优选实施例而已,并不用于限制本发明,尽管参照前述实施例对本发明进行了详细的说明,对于本领域的技术人员来说,其依然可以对前述各实施例所记载的技术方案进行修改,或者对其中部分技术特征进行等同替换。凡在本发明的精神和原则之内,所作的任何修改、等同替换、改进等,均应包含在本发明的保护范围之内。

Claims (7)

1.Taq DNA连接酶融合蛋白:其特征在于,其Taq DNA连接酶的羧基末端引入古细菌的Sso7d的DNA,在构建融合蛋白的同时在Taq DNA连接酶的氨基末端引入6个组氨酸的亲和标签,用镍亲和柱进行纯化。
2.根据权利要求1所述的Taq DNA连接酶融合蛋白,其特征在于,将所述Taq DNA连接酶和古细菌的所述Sso7dDNA结合功能域进行融合表达,得到了效率和活性更高的融合蛋白。
3.根据权利要求1所述的Taq DNA连接酶融合蛋白,其特征在于,将所述Sso7d片段融合在所述Taq DNA连接酶羧基末端,融合在氨基末端。
4.根据权利要求1所述的Taq DNA连接酶融合蛋白,其特征在于,对于所述Sso7d也可以融合在其它高温连接酶分子上。
5.根据权利要求1所述的Taq DNA连接酶融合蛋白,其特征在于,所述Sso7d蛋白序列为:
1 MATVKFKYKG EEKEVDISKIK KVWRVGKMIS FTYDEGGGKT GRGAVSEKDA PKELLQMLE
61 KQ。
6.根据权利要求1所述的Taq DNA连接酶融合蛋白,其特征在于,所述Taq DNA连接酶蛋白序列为:
7.根据权利要求1所述的Taq DNA连接酶融合蛋白,其特征在于,所述Taq DNA连接酶蛋白序列为:
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Cited By (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN110577935A (zh) * 2019-07-29 2019-12-17 中山大学 一种增强t4 dna连接酶原核表达的方法
WO2020124319A1 (zh) * 2018-12-17 2020-06-25 深圳华大生命科学研究院 融合蛋白及其应用
CN111892658A (zh) * 2019-06-21 2020-11-06 南京瓦尔生物医药有限公司 一种Tth DNA聚合酶融合蛋白及其合成方法

Citations (6)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2003046206A2 (en) * 2001-11-28 2003-06-05 Mj Bioworks Incorporated Polymorphism and haplotype scoring by differential amplification of polymorphisms
WO2011040971A2 (en) * 2009-09-30 2011-04-07 Pacific Biosciences Of California, Inc. Generation of modified polymerases for improved accuracy in single molecule sequencing
CN102190730A (zh) * 2010-03-15 2011-09-21 上海泽润生物科技有限公司 一种生物素蛋白连接酶融合蛋白
CN102465146A (zh) * 2010-08-16 2012-05-23 重庆富进生物医药有限公司 融合表达重组制备t4核酸内切酶v
CN106661632A (zh) * 2014-08-19 2017-05-10 生物辐射实验室股份有限公司 Rna扩增方法
CN107475216A (zh) * 2017-08-15 2017-12-15 北京擎科新业生物技术有限公司 重组型耐热dna聚合酶及其应用

Patent Citations (6)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2003046206A2 (en) * 2001-11-28 2003-06-05 Mj Bioworks Incorporated Polymorphism and haplotype scoring by differential amplification of polymorphisms
WO2011040971A2 (en) * 2009-09-30 2011-04-07 Pacific Biosciences Of California, Inc. Generation of modified polymerases for improved accuracy in single molecule sequencing
CN102190730A (zh) * 2010-03-15 2011-09-21 上海泽润生物科技有限公司 一种生物素蛋白连接酶融合蛋白
CN102465146A (zh) * 2010-08-16 2012-05-23 重庆富进生物医药有限公司 融合表达重组制备t4核酸内切酶v
CN106661632A (zh) * 2014-08-19 2017-05-10 生物辐射实验室股份有限公司 Rna扩增方法
CN107475216A (zh) * 2017-08-15 2017-12-15 北京擎科新业生物技术有限公司 重组型耐热dna聚合酶及其应用

Cited By (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2020124319A1 (zh) * 2018-12-17 2020-06-25 深圳华大生命科学研究院 融合蛋白及其应用
CN111892658A (zh) * 2019-06-21 2020-11-06 南京瓦尔生物医药有限公司 一种Tth DNA聚合酶融合蛋白及其合成方法
CN110577935A (zh) * 2019-07-29 2019-12-17 中山大学 一种增强t4 dna连接酶原核表达的方法
CN110577935B (zh) * 2019-07-29 2021-01-05 中山大学 一种增强t4 dna连接酶原核表达的方法

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