实施例
本发明通式(I)所述的化合物或其可药用的盐的制备,可通过以下实施例中所述的示例性方法以及本领域技术人员所用的相关公开文献操作完成,但这些实施例并非限制着本发明的范围。
化合物的结构是通过核磁共振(NMR)或质谱(MS)来确定的。NMR的测定是用BrukerAVANCE-400或Varian Oxford-300核磁仪,测定溶剂为氘代二甲基亚砜(DMSO-d6),氘代氯仿(CDC13),氘代甲醇(CD3OD),内标为四甲基硅烷(TMS)化学位移是以10-6(ppm)作为单位给出。
MS的测定用Agilent SQD(ESI)质谱仪(生产商:Agilent,型号:6110)或ShimadzuSQD(ESI)质谱仪(生产商:Shimadzu,型号:2020)。
HPLC的测定使用安捷伦1200DAD高压液相色谱仪(Sunfirc C18,150X4.6mm,5wn,色谱柱)和Waters 2695-2996高压液相色谱仪(Gimini C18150X4.6mm,5ym,色谱柱)。
薄层层析硅胶板使用青岛海洋GF254硅胶板,薄层色谱法(TLC)使用的硅胶板采用的规格是0.15mm~0.2mm,薄层层析分离纯化产品采用的规格是0.4mm~0.5mm硅胶板。
柱层析一般使用青岛海洋200~300目硅胶为载体。
本发明的已知的起始原料可以采用或按照本领域已知的方法来合成,或可购买自ABCR GmbH&Co.KG,Acros Organics,Aldrich Chemical Company,韶远化学科技(AccelaChemBio Inc)、北京耦合化学品等公司。
实施例中如无特殊说明,反应均在氩气氛或氮气氛下进行。
氩气氛或氮气氛指反应瓶连接一个约1L容积的氩气或氮气气球
氢气氛是指反应瓶连接一个约1L容积的氢气气球。
氢化反应通常抽真空,充入氢气,反复操作3次。
实施例中如无特殊说明,反应的温度为室温。
实施例中的反应进程的监测采用薄层色谱法(TLC),反应所使用的展开剂的体系有二氯甲烷和甲醇体系和石油醚和乙酸乙酯体系,溶剂的体积比根据化合物的极性不同而进行调节。
纯化化合物采用的柱层析的洗脱剂的体系和薄层色谱法的展开剂的体系包括A:二氯甲烷和甲醇体系;B:石油醚和乙酸乙酯体系,溶剂的体积比根据化合物的极性不同而进行调节,也可以加入少量的三乙胺和酸性或碱性试剂等进行调节。
实施例1:合成式I-1所示化合物
合成路线:
制备方法:
第一步:合成化合物1B
将干燥后的碳酸钾(40g,292mmol)加入到无水DMF(500ml)中,冰水浴冷却到0到5摄氏度,然后缓慢滴加丙二酸二乙酯(22ml,146mmol),加完后15分钟内分批次加入化合物1A(25g,97mmol),然后将得到的混合物缓慢升温至室温并搅拌过夜。将混合物倒入2N HCl水溶液(1.5L)中并用乙酸乙酯(2.2L)稀释。分离有机层,用1M氯化锂水溶液(2×500mL)和饱和氯化钠溶液(500mL)洗涤,有机相用无水硫酸钠干燥,过滤除去干燥剂,减压脱溶,残余物用硅胶柱层析纯化(石油醚/乙酸乙酯=10:1(体积比V:V)),得到目标产物化合物1B(31g,白色固体),产率88%。
MS m/z(ESI):361/363[M+1].
1H NMR(400MHz,MeOD):8.88(1H,d,J=2.2Hz),8.63(1H,d,J=2.2Hz),5.45(1H,s),4.30-4.22(4H,m),1.25-1.20(6H,m).
第二步:合成化合物1C
将上一步得到的化合物1B(30g,83mmol)溶于DMSO(300ml)后,加入无水氯化锂(17.5g,416mmol)和水(2.2g,127mmol),得到的混合物在150℃加热过夜。TLC显示反应完成后,将混合物倒入水(1.5L)中并用乙酸乙酯(2×500m)萃取。合并的有机相用饱和氯化钠溶液(3×500mL)洗涤,有机相用无水硫酸钠干燥,过滤除去干燥剂,减压脱溶,残余物用硅胶柱层析纯化(石油醚/乙酸乙酯=30:1~10:1(体积比V:V)),得到目标产物化合物1C(18.2g,白色固体),产率76%。
1H NMR(400MHz,CDCl3):8.86(1H,d,J=2.0Hz),8.58(1H,d,J=2.0Hz),4.30(2H,s),4.20-4.12(2H,m),1.25-1.20(3H,m).
第三步:合成化合物1D
将上一步得到的化合物1C(18g,62.5mmol)溶于THF(200mL)中,然后加入湿的Raney-Ni(2.5g,50%),室温下30Psi压力下氢化过夜,反应完成后,将混合物通过硅藻土过滤,甲醇洗涤,浓缩滤液,得到粗品化合物1D(15.11g,类白色固体),其不经进一步纯化即用于下一步。
MS m/z(ESI):259[M+1].
1H NMR(300MHz,DMSO-d6):7.76(1H,d,J=2.4Hz),7.17(1H,d,J=2.4Hz),5.05(2H,br s),4.12-4.07(2H,m),3.66(2H,s),1.18-1.14(3H,m).
第四步:合成化合物1E
将上一步合成得到的化合物1D(15.11g,)加入到甲苯中(150ml),然后向得到的悬浮液中加入乙酸(10ml),将所得混合物加热回流4小时。将混合物冷却至室温,减压除去溶剂。将所得残余物悬浮于甲苯(50ml)中,过滤,用乙醚(2×20ml)洗涤并干燥,得到化合物1E(11.6g,淡黄色固体),收率93%。
MS m/z(ESI):213[M+1].
1H NMR(300MHz,DMSO-d6):10.70(1H,s),8.17(1H,s),7.31(1H,s),3.57(2H,s).
第五步:合成化合物1F
将上一步合成得到的化合物1E(10g,46mmol)加入到DMF(100ml)中,然后加入碳酸钾(12.8g,93mmol)和(R)-环己基(苯基)甲磺酸甲酯(25g,93mmol)(按照专利WO2015100282A1所描述的方法合成得到),将所得到的反应液加热到60摄氏度,搅拌反应过夜,TLC显示反应结束,将反应液倒入到500ml水中,用乙酸乙酯(2×500mL)萃取。合并的有机相用饱和氯化钠溶液(3×500mL)洗涤,有机相用无水硫酸钠干燥,过滤除去干燥剂,减压脱溶,残余物用硅胶柱层析纯化(石油醚/乙酸乙酯=3:1~1:1(体积比V:V)),得到目标产物化合物1F(8.2g,白色固体),产率46%。
MS m/z(ESI):387[M+1].
第六步:合成化合物1G
将上一步合成得到的化合物1F(1g,2.6mmol)加入到EtOH(30ml)中并搅拌混合物直至完全溶解。然后加5-甲酰基-1H-吡咯-2-羧酸甲酯(400mg,2.6mmol)和哌啶(22mg,0.26mmol),将混合物加热至90℃,保持5小时,TLC显示反应结束,然后冷却到室温后有沉淀析出,然后放于冰箱5摄氏度左右过夜充分沉淀,过滤得到的沉淀,用冷乙醇洗涤并干燥,得到目标化合物1G(1.02g,灰色固体),产率78%。
MS m/z(ESI):522[M+1].
第七步:合成化合物1H
将上一步得到的化合物1G(1.02g,1.9mmol)、1,4-二甲基-1H-1,2,3-三唑(380mg,3.8mmol)、四甲基乙酸铵(251mg,1.9mmol)和PdCl2(PPh 3)2(双三苯基磷二氯化钯)(100mg,0.14mmol)加入到DMF(20mL)并用氮气置换空气,然后在氮气保护下、在100度下搅拌过夜。TLC显示反应结束后,将反应物冷却至室温,倒入到200ml水中,用乙酸乙酯(2×100mL)萃取。合并的有机相用饱和氯化钠溶液(3×100mL)洗涤,有机相用无水硫酸钠干燥,过滤除去干燥剂,减压脱溶,残余物用硅胶柱层析纯化(石油醚/乙酸乙酯=3:1~1:1(体积比V:V)),得到目标产物化合物1H(430mg,黄色固体),产率42%。
MS m/z(ESI):539[M+1].
第八步:合成式I-1所示化合物
将上一步合成得到的化合物1H(430mg,0.8mmol)加入到无水THF(5ml)中,然后冷却到0℃-5℃,氮气保护下加入甲基溴化镁(2ml,2.0mmol,1M),室温搅拌过夜,TLC显示原料没有反应完,再补加甲基溴化镁(2ml,2.0mmol,1M)后升温到45度反应5小时,TLC显示原料消失。加入25ml饱和氯化铵溶液淬灭反应,用乙酸乙酯(2×10mL)萃取。合并的有机相用饱和氯化钠溶液(3×10mL)洗涤,有机相用无水硫酸钠干燥,过滤除去干燥剂,减压脱溶,残余物通过反相C18制备柱YMC ODSA 30x 100mm纯化(流动相用10-100%乙腈(0.05%TFA)/水),流速20mL/min,历时10分钟,得到目标产物式I-1所示化合物(102mg,白色固体),收率23.7%。
MS m/z(ESI):539[M+1].
1H NMR(300MHz,DMSO-d6):11.07(1H,s),8.22(1H,s),7.82(1H,s),7.62(1H,s),7.43-7.36(m,2H),7.32-7.26(m,2H),7.17-7.12(m,1H),6.88(s,1H),5.76(s,1H),5.59(d,J=10.5Hz,1H),4.06(s,3H),4.00(d,J=8.5Hz,1H),3.81(br.s,1H),3.66-3.57(m,1H),3.43-3.34(m,2H),2.36(s,3H),2.04-1.90(m,1H),1.70-1.61(m,7H),1.47-1.38(m,1H),1.31-1.21(m,1H),1.12-1.08(m,1H).
实施例2:合成式I-2所示化合物
参照实施例1中的操作步骤合成实施例2的化合物,但在第七步中用3,5-二甲基异恶唑替换掉1,4-二甲基-1H-1,2,3-三唑。
MS m/z(ESI):539[M+1].
1H NMR(300MHz,DMSO-d6):δppm 11.08(1H,s),8.23(1H,s),7.83(1H,s),7.63(1H,s),7.44-7.37(m,2H),7.33-7.27(m,2H),7.16-7.11(m,1H),6.87(s,1H),5.75(s,1H),5.62(d,J=10.5Hz,1H),4.03(d,J=8.5Hz,1H),3.82(s,1H),3.65-3.55(m,1H),3.42-3.33(m,2H),2.37(s,3H),2.05-1.91(m,4H),1.73-1.61(m,7H),1.48-1.39(m,1H),1.32-1.22(m,1H),1.13-1.09(m,1H).
实施例3:合成式I-3所示化合物
参照实施例1中的操作步骤合成实施例3的化合物,但在第五步中用(R)-(4-氟苯基)(四氢-2H-吡喃-4-基)甲磺酸甲酯(参考专利WO2016183118A1中所述方法合成得到)替换掉(R)-环己基(苯基)甲磺酸甲酯。
MS m/z(ESI):557[M+1].
1H NMR(300MHz,DMSO-d6):δppm 11.05(1H,s),8.21(1H,s),7.81(1H,s),7.61(1H,s),7.26-7.22(m,2H),7.19-7.12(m,2H),6.87(s,1H),5.77(s,1H),5.58(d,J=10.5Hz,1H),4.05(s,3H),4.01(d,J=8.5Hz,1H),3.82(br.s.,1H),3.65-3.55(m,1H),3.44-3.35(m,2H),2.37(s,3H),2.05-1.91(m,1H),1.71-1.62(m,7H),1.48-1.39(m,1H),1.32-1.22(m,1H),1.11-1.07(m,1H).
实施例4:合成式I-4所示化合物
参照实施例1中的操作步骤合成实施例4的化合物,但在第七步中用1-甲基-4-(氘代甲基)-1H-1,2,3-三唑替换掉1,4-二甲基-1H-1,2,3-三唑。
MS m/z(ESI):542[M+1].
1H NMR(300MHz,DMSO-d6):δppm 11.07(1H,s),8.22(1H,s),7.82(1H,s),7.62(1H,s),7.43-7.36(m,2H),7.32-7.26(m,2H),7.17-7.12(m,1H),6.88(s,1H),5.76(s,1H),5.59(d,J=10.5Hz,1H),4.06(s,3H),4.00(d,J=8.5Hz,1H),3.81(br.s.,1H),3.66-3.57(m,1H),3.43-3.34(m,2H),2.04-1.90(m,1H),1.70-1.61(m,7H),1.47-1.38(m,1H),1.31-1.21(m,1H),1.12-1.08(m,1H).
实施例5:合成式I-5所示化合物
参照实施例1中的操作步骤合成实施例5的化合物,但在第五步中用(R)-(4-氟苯基)(四氢-2H-吡喃-4-基)甲磺酸甲酯替换掉(R)-环己基(苯基)甲磺酸甲酯,在第七步中用3,5-二甲基异恶唑替换掉1,4-二甲基-1H-1,2,3-三唑。
MS m/z(ESI):557[M+1].
1H NMR(300MHz,DMSO-d6):δppm 11.08(1H,s),8.23(1H,s),7.83(1H,s),7.63(1H,s),7.44-7.37(m,2H),7.33-7.27(m,2H),6.87(s,1H),5.75(s,1H),5.62(d,J=10.5Hz,1H),4.03(d,J=8.5Hz,1H),3.82(s,1H),3.65-3.55(m,1H),3.42-3.33(m,2H),2.37(s,3H),2.05-1.91(m,4H),1.73-1.61(m,7H),1.48-1.39(m,1H),1.32-1.22(m,1H),1.13-1.09(m,1H).
实施例6:合成式I-6所示化合物
在一个25ml的水热反应釜中,将实施例1中合成得到的中间体化合物1H(538mg,1mmol)加到10ml乙醇中,然后加入氨甲醇溶液(5ml,5mmol),密封后于80摄氏度反应过夜,冷却到室温后,减压去掉溶剂,所得残余物通过反相C18制备柱YMC ODSA 30x 100mm纯化(流动相用10-100%乙腈(0.05%TFA)/水),流速20mL/min,历时10分钟,得到目标产物式I-6所示化合物(140mg,白色固体),收率26.6%。
MS m/z(ESI):524[M+1].
1H NMR(300MHz,DMSO-d6):δppm 11.12(1H,s),8.25(1H,s),7.842(1H,s),7.66(1H,s),7.55(brs,2H),7.42-7.32(m,2H),7.30-7.23(m,2H),7.17-7.12(m,1H),7.05(d,J=8Hz,1Hz),6.97(d,J=10Hz,1.2Hz),4.11(s,3H),4.03(d,J=8.5Hz,1H),3.82(br.s.,1H),3.61-3.55(m,1H),3.42-3.32(m,2H),2.38(s,3H),2.06-1.92(m,1H),1.78-1.69(m,1H),1.49-1.39(m,1H),1.30-1.21(m,1H),1.10-1.03(m,1H).
实施例7:合成式I-7所示化合物
参照实施例6中的操作步骤合成实施例7的化合物,在第七步中用3,5-二甲基异恶唑替换掉1,4-二甲基-1H-1,2,3-三唑。
MS m/z(ESI):524[M+1].
1H NMR(300MHz,DMSO-d6):δppm 11.07(1H,s),8.22(1H,s),7.82(1H,s),7.62(1H,s),7.52(brs,2H),7.43-7.36(m,2H),7.32-7.26(m,2H),7.17-7.12(m,1H),7.03(d,J=8Hz,1Hz),6.95(d,J=10Hz,1.2Hz),,4.00(d,J=8.5Hz,1H),3.81(br.s.,1H),3.66-3.57(m,1H),3.43-3.34(m,2H),2.36(s,3H),2.04-1.90(m,4H),1.70-1.61(m,1H),1.47-1.38(m,1H),1.31-1.21(m,1H),1.12-1.08(m,1H).
实施例8:合成式I-8所示化合物
参照实施例1中的操作步骤合成实施例8的化合物,但在第六步中用5-(甲基磺酰基)-1H-吡咯-2-甲醛(参考文献Tetrahedron Letters,vol.40,(11):2157-2160合成得到)替换掉5-甲酰基-1H-吡咯-2-羧酸甲酯。
MS m/z(ESI):559[M+1].
1H NMR(300MHz,DMSO-d6):δppm 11.07(1H,s),8.22(1H,s),7.82(1H,s),7.62(1H,s),7.43-7.36(m,2H),7.32-7.26(m,2H),7.17-7.12(m,1H),6.63(d,J=8Hz,1Hz),6.50(d,J=10Hz,1.2Hz),4.06(s,3H),4.00(d,J=8.5Hz,1H),3.81(br.s.,1H),3.66-3.57(m,1H),3.43-3.34(m,5H),2.36(s,3H),2.04-1.90(m,1H),1.70-1.55(m,2H),1.22-1.02(m,2H).
实施例9:合成式I-9所示化合物
参照实施例1中的操作步骤合成实施例9的化合物,但在第六步中用5-(甲基磺酰基)-1H-吡咯-2-甲醛替换掉5-甲酰基-1H-吡咯-2-羧酸甲酯,在第七步中用3,5-二甲基异恶唑替换掉1,4-二甲基-1H-1,2,3-三唑。
MS m/z(ESI):559[M+1].
1H NMR(300MHz,DMSO-d6):δppm 11.12(1H,s),8.23(1H,s),7.84(1H,s),7.63(1H,s),7.44-7.39(m,2H),7.33-7.28(m,2H),7.18-7.14(m,1H),6.68(d,J=8Hz,1Hz),6.55(d,J=10Hz,1.2Hz),4.05(d,J=8.5Hz,1H),3.83(br.s.,1H),3.68-3.58(m,1H),3.46-3.35(m,5H),2.38(s,3H),2.11-1.98(m,4H),1.77-1.58(m,2H),1.25-1.04(m,2H).
实施例10:生物学评价
1、BRD4生化IC50的测定
采用时间分辨荧光能量共振转移(TR-FRET)方法,对本发明式I所示化合物的BRD4作用进行测定。从N端带有His标签的大肠杆菌中表达和纯化重组的人源BRD4(1-477)。在含有25mM HEPES pH 7.5、100mM NaCl、0.1%BSA、0.05%CHAPS和检测试剂的缓冲液中,混合布罗莫结构域蛋白、0-10uM化合物与四乙酰化组蛋白肽(SGRGAC KGGAC KGLGAC KGGAACKRHGSGSK-生物素)以进行测定。当蛋白、化合物和肽段达到结合平衡后,加入含有链霉亲和素标记的Tb穴状化合物及XL665标记的抗-6xHis抗体的检测试剂。继续孵育一小时后,用BMG PHERAstar FS仪器记录TR-FRET信号。在酶标仪以TF-FRET模式上测定各孔在激发波长为304nm,发射波长为620nM和665nM的荧光强度值。通过与对照组(0.1%DMSO)的荧光强度比值进行比较计算化合物在各浓度下的百分比抑制率,并通过GraphPad Prism 5软件以化合物浓度对数值-抑制率进行非线性回归分析,得到化合物的IC50值。在本发明中,式I所示化合物对BRD4活性抑制的IC50数据值<100nM的标记为A;IC50值在100nM至500nM之间的标记为B;IC50值>500nM的标记为C。具体见表1。
表1:本发明式I所示化合物对BRD4活性抑制的IC50测定
化合物编号 |
BRD4/IC<sub>50</sub>(nM) |
I‐1 |
A |
I‐2 |
B |
I‐3 |
B |
I‐4 |
A |
I‐5 |
B |
I‐6 |
B |
I‐7 |
B |
I‐8 |
C |
I‐9 |
C |
从表1可以看出,本发明式I所示化合物对BRD4活性具有良好的抑制作用,可应用于治疗不期望BRD4活性的相关疾病中,本发明式I所示化合物可制备成治疗不期望BRD4活性的相关疾病的药物。
2、细胞活性检测
乳腺癌MDA-MB-231细胞培养于含10%胎牛血清、100U青霉素和100yg/mL链霉素的DMEM培养基中。培养在37度5%CO2培养箱内。细胞活性通过采用Cell Counting Kit-8试剂盒(Dojindo,东仁化学科技)来进行测定。
实验方法:
按照试剂盒说明书的步骤操作,简述如下:
受试化合物首先溶解于DMSO中制备为贮存液,随后以对应细胞的培养基进行梯度稀释,配制成测试样品,化合物的终浓度范围在30uM-0.01nM。将处于对数生长期的肿瘤细胞以适宜的密度接种至96孔细胞培养板中,在37℃,5%CO2培养箱内过夜后,加入测试化合物样品后继续培养细胞72小时。培养结束后,向每孔加入适宜体积的CCK-8检测液,并在37℃下孵育1-4小时,随后在酶标仪上读取样品各孔在450nM下的吸光度数值。通过与对照组(0.3%DMSO)的吸光度数值进行比较计算化合物在各浓度点的百分比抑制率,之后在GraphPad Prism 5软件中以化合物浓度对数-抑制率进行非线性回归分析,得到化合物抑制MDA-MB-231细胞增殖的IC50值。在本发明中,式I所示化合物对对乳腺癌MDA-MB-231细胞抑制的IC50数据值<50nM的标记为D;IC50值在50nM至200nM之间的标记为E;IC50值>200nM的标记为F。具体见表2。
表2:
化合物编号 |
IC<sub>50</sub>(nM)/MDA‐MB‐231 |
I‐1 |
D |
I‐2 |
D |
I‐3 |
E |
I‐4 |
D |
I‐5 |
D |
I‐6 |
F |
I‐7 |
D |
I‐8 |
D |
I‐9 |
E |
从表2可以看出,本发明式I所示化合物对乳腺癌细胞MDA-MB-231活性具有良好的抑制作用,可应用于乳腺癌疾病的治疗,可制备成治疗乳腺癌的药物。
在本说明书的描述中,参考术语“一个实施例”、“一些实施例”、“示例”、“具体示例”或“一些示例”等的描述意指结合该实施例或示例描述的具体特征、结构、材料或者特点包含于本发明的至少一个实施例或示例中。在本说明书中,对上述术语的示意性表述不一定指的是相同的实施例或示例。而且,描述的具体特征、结构、材料或者特点可以在任何的一个或多个实施例或示例中以合适的方式结合。
尽管上面已经示出和描述了本发明的实施例,可以理解的是,上述实施例是示例性的,不能理解为对本发明的限制,本领域的普通技术人员在不脱离本发明的原理和宗旨的情况下在本发明的范围内可以对上述实施例进行变化、修改、替换和变型。