CN110317767B - 一种高产苏氨酸的基因工程菌及其应用方法 - Google Patents

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Abstract

本发明公开了一种高产苏氨酸的基因工程菌及其应用方法,属于基因工程和发酵工程领域。所述基因工程菌为TWF001/pFW01‑phaCAB,在三氯生表达质粒pFW01上过表达了phaCAB,可以在胞外合成苏氨酸,胞内合成PHB。本发明构建的菌株苏氨酸合成量大大提高,在摇瓶发酵水平产量为17.0g/L,在3‑L罐发酵水平,合成苏氨酸产量为96.4g/L,在10L罐发酵水平,合成苏氨酸产量为133.5g/L。所述基因工程菌为TWF001/pFW01‑phaCAB生长状况良好,未引入外源抗性基因序列,更有利于大规模工业化生产。

Description

一种高产苏氨酸的基因工程菌及其应用方法
技术领域
本发明涉及一种高产苏氨酸的基因工程菌及其应用方法,属于基因工程和发酵工程领域。
技术背景
作为8种必需氨基酸之一,L-苏氨酸是猪饲料的第二限制氨基酸和家禽饲料的第三限制氨基酸。以添加了苏氨酸的低蛋白配方饲料作为家禽日粮,不但降低了饲喂成本,还有利于家禽吸收,可促进家禽的生长。除了可以缓解天然蛋白质的匮乏,家禽饲料营养配比合理还可以有效减少动物氨的排放,从而减少环境污染,有利于社会的可持续发展。此外,L-苏氨酸在食品、医药和化妆品等领域的用量也呈长期稳定增长趋势。在食品领域,L-苏氨酸是各类氨基酸保健饮品的配方成分,也是重要的食品强化剂,可以与其他氨基酸共用起到抗氧化的作用,还可以与葡萄糖共热产生焦香味。在医药领域,L-苏氨酸有促进人体生长发育、促进骨髓T淋巴细胞前体分化发育成为成熟T淋巴细胞和抗脂肪肝的药用疗效,因此在临床方面有着广泛的应用。此外,L-苏氨酸还是制造高效低过敏的抗生素单酰胺菌素等药物的中间体。在化妆品领域,L-苏氨酸的分子具有羟基结构,因此可用作保湿剂。
苏氨酸的工业生产方法主要有蛋白水解、化学合成和微生物发酵。相对于前两种方法,发酵法优点是原料便宜、反应条件温和、环境污染小、效率高等。大肠杆菌由于其遗传背景清楚,基因操作简单,发酵周期短等优点,在工业生产饲料添加级苏氨酸中占主要地位。
由于目前苏氨酸生产高产菌是大肠杆菌,大肠杆菌虽生长迅速发酵周期短,但是转化率也并不高。该工业化生产的出发菌株,目前利用葡萄糖生产苏氨酸经济效益最好,但是转化率低,摇瓶作为对照时,转化率为40%。
发明内容
本发明目的在于提高该菌株的产量和转化率,并建立一种在大肠杆菌里高产苏氨酸的方法,同时这种方法可以运用到不同的产品生产。
本发明第一个目的是提供一株高产苏氨酸的基因工程菌,所述菌株以具有苏氨酸生产能力的菌株为出发菌株,过表达了来自罗氏真养菌基因组的phaCAB基因簇。
在本发明的一种实施方式中,所述基因工程菌以大肠杆菌TWF001为出发菌株,以质粒pFW01为表达质粒;所述TWF001和pFW01公开于2018年的论文《Increasing l-threonine production in Escherichia coli by engineering the glyoxylate shuntand the l-threonine biosynthesis pathway》。
在本发明的一种实施方式中,所述基因工程菌是在大肠杆菌TWF001中,过表达了来自罗氏真养菌基因组的phaCAB基因簇,该基因簇如GenBank登录号MH558939.1所示核苷酸序列。
在本发明的一种实施方法中,基因phaA、phaB和phaC分别编码的β-酮硫解酶,乙酰乙酰辅酶A还原酶和PHB合成酶,在大肠杆菌中可以以乙酰辅酶A为底物合成β-聚3-羟基丁酸酯(PHB)。
本发明的第二个目的是提供所述基因工程菌的构建方法,是将所述phaCAB基因簇与表达载体连接,在大肠杆菌宿主细胞中表达。
在本发明的一种实施方式中,所述表达载体为pFW01。
在本发明的一种实施方式中,所述宿主细胞是大肠杆菌TWF001。
本发明的第三个目的是提供一种联产L-苏氨酸和β-聚3-羟基丁酸酯的方法,应用所述基因工程菌进行发酵。
在本发明的一种实施方式中,所述发酵是将所述基因工程菌接种至发酵培养基中,35~37℃,180~220rpm发酵至少24h。
在本发明的一种实施方式中,所述发酵过程控制溶氧为30%,pH 6.8。
在本发明的一种实施方式中,所述基因工程菌经过两级种子培养。
在本发明的一种实施方式中,第一级种子培养基为LB培养基,第二级种子培养基含有32.5g/L葡萄糖,5g/L(NH4)2SO4,15g/L酵母浸提物,9.5g/L KH2PO4,24.35g/L K2HPO4,1g/LMgSO4·7H2O,pH 7.0。
在本发明的一种实施方式中,所述发酵过程中还进行补料。
在本发明的一种实施方式中,所述补料是当发酵体系残糖低于5g/L时则补加葡萄糖溶液至残糖达10g/L。
本发明还要求保护所述基因工程菌在生产含L-苏氨酸和/或β-聚3-羟基丁酸酯及其衍生物方面的应用。
本发明的效果:
(1)本发明构建的一株高产苏氨酸的菌株E.coli TWF001/pFW01-phaCAB,遗传性能非常稳定,应用时无需添加抗生素,只需要添加终浓度为1μM的三氯生即可保证质粒稳定遗传,适合工业化生产。
(2)在工业化生产苏氨酸的菌株里面,过表达了来自罗氏真养菌基因组的phaCAB基因簇,通过联产β-聚3-羟基丁酸酯(PHB)的方法,能有效提高苏氨酸产量。应用本发明的方法构建的菌株TWF001/pFW01-phaCAB的苏氨酸产量在10-L发酵罐水平达到133.5g/L,与对照菌株TWF001/pFW01相比提高了41.6%,转化率对应也提高了31.6%;在3-L发酵罐水平达到96.4g/L,与对照菌株TWF001/pFW01相比提高了31.7%,转化率对应也提高了31.7%;在摇瓶发酵水平达到17.0g/L,与对照菌株TWF001/pFW01相比提高了74.9%,转化率对应也提高了72.7%;该方法核心思想是通过联产PHB,拉动胞内碳源代谢,增加乙酰辅酶A合成量,减少副产物乙酸的合成,增强细胞的代谢平衡,并通过乙醛酸循环快速利用乙酰辅酶A。
(3)本发明的方法——通过偶联PHB和苏氨酸合成,能够有效提高苏氨酸产量,同时也适用于通过联产PHB的途径生产其他天冬氨酸族氨基酸,比如将苏氨酸合成基因改变为赖氨酸、异亮氨酸、天冬氨酸等途径的基因生产相应氨基酸;
附图说明
图1:重组质粒pFW01-phaCAB示意图。
图2:对照菌株TWF001/pFW01和基因工程菌TWF001/pFW01-phaCAB苏氨酸高产菌株的摇瓶发酵情况;其中,A为菌株生长,B为菌株发酵的耗糖情况,C为苏氨酸产量,D为发酵36h后的乙酸合成量。
图3:对照菌株TWF001/pFW01和基因工程菌TWF001/pFW01-phaCAB苏氨酸高产菌株的摇瓶发酵合成PHB的情况;其中,A为TWF001/pFW01-phaCAB合成PHB颗粒的激光共聚焦观察照片,B为对照菌TWF001/pFW01的激光共聚焦观察照片,C为PHB合成量。
图4:对照菌株TWF001/pFW01和基因工程菌TWF001/pFW01-phaCAB苏氨酸高产菌株的摇瓶发酵对数期合成乙酰辅酶A和苹果酸的情况。
图5:对照菌株TWF001/pFW01和基因工程菌TWF001/pFW01-phaCAB苏氨酸高产菌株的发酵情况;其中,A为菌株生长情况,B为菌株耗糖情况,C为菌株发酵的苏氨酸产量。
图6:对照菌株TWF001/pFW01和基因工程菌TWF001/pFW01-phaCAB苏氨酸高产菌株的10-L罐发酵情况;其中,A为菌株生长情况,B为菌株发酵的苏氨酸产量。
具体实施方式
实施例1重组菌TWF001/pFW01-phaCAB的构建
(1)以罗氏真养菌基因组NC_008313.1为模板,采用引物phaCAB-F/phaCAB-R扩增phaCAB基因簇,扩增phaCAB基因簇的引物phaCAB-F/phaCAB-R序列为
phaCAB-F:5’-CTGCTCGAGAGAAGGAGAATCAAATCATGGCTACCGG-3’
phaCAB-R:5’-CCGGAATTCAGGTCAGCCCATATGCAGG-3’
(2)用限制性内切酶XhoI和EcoRI消化PCR产物,载体pFW01(载体pFW01的构建方法参见文章《Increasing l-threonine production in Escherichia coli by engineeringthe glyoxylate shunt and the l-threonine biosynthesis pathway》)用EcoRI和XhoI消化处理,酶切产物纯化后,使用T4连接酶22℃过夜处理,转化至大肠杆菌DH5α,筛选正确转化子,对于得到的正确转化子,提取质粒后用1.8kV,5ms电转化入谷氨酸棒杆菌WM001感受态,再次筛选正确的基因工程重组菌TWF001/pFW01-phaCAB转化子。
(3)提取pFW01质粒后直接电转化入TWF001,获得正确转化子,命名为TWF001/pFW01,作为无异源表达phaCAB基因的空载质粒对照菌株。
实施例2应用大肠杆菌基因工程菌TWF001/pFW01-phaCAB摇瓶发酵生产PHB和L-苏氨酸(1)重组基因工程菌的摇瓶发酵
种子培养基I:LB培养基:10g/L蛋白胨,5g/L酵母粉,10g/L NaCl;
摇瓶发酵培养基I:30g/L葡萄糖、25g/L(NH4)2SO4、7.5g/L KH2PO4、2g/L酵母提取物、2g/L柠檬酸、1g/L MgSO4·7H2O、5mg/L FeSO4·7H2O、5mg/L MnSO4·4H2O、20g/L CaCO3,pH 6.8或pH 7.0;
培养方法:37℃,200rpm,培养36h。
发酵结束后,pH6.8条件下,苏氨酸合成量更多,基因工程菌TWF001/pFW01-phaCAB合成苏氨酸17.0g/L,葡萄糖转化系数为0.57g/g,乙酸合成2.83g/L;而对照菌TWF001/pFW01合成9.72g/L苏氨酸,葡萄糖转化系数为0.33g/g,乙酸合呈7.65g/L。
(2)重组基因工程菌的3-L罐发酵
一级种子培养基I:LB培养基:10g/L蛋白胨,5g/L酵母粉,10g/L NaCl;
二级种子培养基II:32.5g/L葡萄糖,5g/L(NH4)2SO4,15g/L酵母浸提物,9.5g/LKH2PO4,24.35g/L K2HPO4,1g/L MgSO4·7H2O,pH 7.0.
发酵培养基II:20g/L葡萄糖,3g/L酵母浸提物,2g/L KH2PO4,10g/L(NH4)2SO4,0.5g/LMgSO4·7H2O,5mg/L FeSO4·7H2O,5mg/L MnSO4·4H2O;
补料分批发酵条件:将甘油管中的菌体在LB平板上活化,然后接种到含有25mL种子培养基的250mL摇瓶培养4h,接着按初始OD=0.2接种到两瓶含有50mL种子培养基的500mL摇瓶,37℃、200rpm培养4h,接着把两瓶种子液转入含有1.1L的3-L罐中,溶氧控制在30%,pH控制在6.8,当体系残糖低于5g/L时则补加700g/L葡萄糖溶液至残糖约为10g/L,通气量为1.5L/min,发酵36h。
发酵结束后,基因工程菌TWF001/pFW01-phaCAB合成苏氨酸96.4g/L,葡萄糖转化系数为0.54g/g,而对照菌TWF001/pFW01合成73.2g/L苏氨酸,葡萄糖转化系数为0.41g/g。
(3)重组基因工程菌的10-L罐发酵
一级种子培养基III:1.2g/L蔗糖,10g/L胰蛋白胨,8g/L酵母浸提物,4g/L(NH4)2SO4,3g/L K2HPO4,0.4g/L MgSO4,0.01g/L FeSO4,0.01g/L MnSO4,5g/L谷氨酸钠,0.2g/L蛋氨酸,pH 7.0.;
二级种子培养基IV:30g/L葡萄糖,2.86g/L酵母浸提物,5.7g/L玉米糖浆,2.86g/LK2HPO4,0.57g/L MgSO4,4.29g/L氨基酸混合物(包括0.026g/g天冬氨酸,0.034g/g谷氨酸,0.025g/g丝氨酸,0.018g/g甘氨酸,0.014g/g苏氨酸,0.010g/g精氨酸,0.014g/g丙氨酸,0.0032色氨酸,0.0039g/g半胱氨酸,0.021g/g甲硫氨酸,0.011g/g苯丙氨酸,0.011g/g异亮氨酸,0.0088g/g亮氨酸,0.0041g/g赖氨酸),1mg/L维生素B1,0.1mg/L ATP,pH 7.0.
发酵培养基III:25g/L葡萄糖,3.2g/L玉米糖浆,0.63g/L盐酸甜菜碱,0.39g/LMgSO4,0.85g/L KCl,10mg/L FeSO4,10mg/L MnSO4,0.84g/L H3PO4,1.05g/L氨基酸混合物(包括0.026g/g天冬氨酸,0.034g/g谷氨酸,0.025g/g丝氨酸,0.018g/g甘氨酸,0.014g/g苏氨酸,0.010g/g精氨酸,0.014g/g丙氨酸,0.0032色氨酸,0.0039g/g半胱氨酸,0.021g/g甲硫氨酸,0.011g/g苯丙氨酸,0.011g/g异亮氨酸,0.0088g/g亮氨酸,0.0041g/g赖氨酸),24mg/L消泡油,pH 6.8;
补料分批发酵条件:将甘油管中的菌体在LB平板上活化16h,然后接种到含有100mL种子培养基的500mL摇瓶培养4h,接着将种子液按照初始OD600=0.1转接到两瓶含有500mL种子培养基的2L摇瓶,37℃、200rpm培养4h,接着把两瓶种子液转入含有4L的10-L罐中,溶氧控制在30%,pH控制在6.8-6.9,当溶氧过高和体系残糖低于5g/L时则补加700g/L葡萄糖溶液至残糖为10g/L以上,发酵36h。
发酵结束后,基因工程菌TWF001/pFW01-phaCAB合成苏氨酸133.5g/L,葡萄糖转化系数为0.50g/g,而对照菌TWF001/pFW01合成94.3g/L苏氨酸,葡萄糖转化系数为0.38g/g。
(4)实施例2中的基因工程菌TWF001/pFW01-phaCAB和TWF001/pFW01胞内PHB的酯化:将所得发酵液中的菌体离心后,用pH 7.0的磷酸盐缓冲液洗涤两次,在真空冷冻干燥机中过夜冻干,称取20mg左右(质量记为Wt)的干菌体,加入到酯化管中,再加入2mL氯仿和2mL甲醇溶液,其中甲醇溶液是在甲醇中加入了3%的浓硫酸,将酯化管置于100℃的水浴锅中,酯化6小时,置于室温下半个小时,加入1mL水,充分震荡后分层,吸取下相;
(3)标样PHB的酯化:称取约5mg的PHB标样(质量分别记为WtB)加入酯化管中进行酯化,之后步骤同上述(2);
(4)胞内PHB产量计算
得出基因工程菌TWF001/pFW01-phaCAB的酯化产物有一个特征峰,记为A,其面积记为As,对应标样PHB也有同样出峰时间的特征峰,标样特征峰面积记为A0s;那么所合成的PHB占细胞干重比为Wt%=(As/A0s*WtBV)/Wt。
摇瓶发酵36h后,基因工程菌TWF001/pFW01-phaCAB合成PHB占细胞干重12.2%,而对照菌TWF001/pFW01不合成PHB;3-L罐发酵36h后,基因工程菌TWF001/pFW01-phaCAB合成PHB占细胞干重11.5%,而对照菌TWF001/pFW01不合成PHB;10-L罐发酵36h后,基因工程菌TWF001/pFW01-phaCAB合成PHB占细胞干重13.0%,而对照菌TWF001/pFW01不合成PHB。
实施例4
(1)重组菌TWF001/pFW01-phaCAB和TWF001/pFW01的胞内乙酰辅酶A的测定
收集2mL实施例2中步骤(1)制备的OD600=9.0左右的发酵菌液,置于冰上,并采用试剂盒Acetyl-CoA Assay Kit(Solarbio,Beijing,China)进行乙酰辅酶A提取及测定,在340nm测定光吸收值,乙酰辅酶A的合成量通过公式Acetyl-CoA (nmol/g wetcell)=(1640*ΔA+0.012)/(OD600*1.7*0.002);ΔA=A80s-A20s计算获得,其中A80s为加入工作液后的80s的OD340nm,其中A20s为加入工作液后的20s的OD340n
基因工程菌TWF001/pFW01-phaCAB每克湿细胞合成乙酰辅酶A量为4.51μmol/g,而对照菌TWF001/pFW01每克湿细胞合成乙酰辅酶A量为1.43μmol/g;
(2)重组菌TWF001/pFW01-phaCAB和TWF001/pFW01的胞内苹果酸的测定
参照实施例4(1)中方法收集菌体,用冰水洗涤2次,采用1mL去离子水重悬并进行超声破碎10min,超声2s,停歇3s,工作效率为17%,然后离心10min,收集上清,进行高效液相测定,柱子采用Diamonsil C18column(5μm,250mm×4.6mm No.99603)(DiKMAtechnology,Beijing,China)。
基因工程菌TWF001/pFW01-phaCAB每克湿细胞合成苹果酸量为0.32μmol/g,而对照菌TWF001/pFW01每克湿细胞合成苹果酸量为0.22μmol/g。
虽然本发明以较佳实施例公开如上,但其并非用以限定本发明,任何熟悉此技术的人,在不脱离本发明的精神和范围内,都可做各种的改动与修饰,因此本发明的保护范围应该以权利要求书所界定的为准。
SEQUENCE LISTING
<110> 江南大学
<120> 一种高产苏氨酸的基因工程菌及其应用方法
<160> 2
<170> PatentIn version 3.3
<210> 1
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<213> 人工序列
<400> 1
ctgctcgaga gaaggagaat caaatcatgg ctaccgg 37
<210> 2
<211> 28
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 2
ccggaattca ggtcagccca tatgcagg 28

Claims (7)

1.一株基因工程菌,其特征在于,是过表达了来自罗氏真养菌的phaCAB基因簇的大肠杆菌,可联产L-苏氨酸和β-聚3-羟基丁酸酯;所述基因工程菌以大肠杆菌TWF001为宿主,以pFW01为表达载体,过表达了序列如GenBank登录号MH558939.1的phaCAB基因簇。
2.一种构建权利要求1所述基因工程菌的方法,其特征在于,将如GenBank登录号MH558939.1的phaCAB基因簇与表达载体pFW01连接,转化至大肠杆菌TWF001中。
3.一种联产L-苏氨酸和β-聚3-羟基丁酸酯的方法,其特征在于,应用权利要求2所述的基因工程菌进行发酵。
4.根据权利要求3所述的方法,其特征在于,将所述基因工程菌接种至发酵培养基中,35~37℃,180~220rpm发酵至少24h。
5.根据权利要求4所述的方法,其特征在于,发酵过程控制溶氧为30%,pH 6.8。
6.根据权利要求3-5任一所述的方法,其特征在于,所述发酵过程中还进行补料;所述补料是当发酵体系残糖低于5g/L时则补加葡萄糖溶液至残糖达10g/L。
7.权利要求1所述基因工程菌在生产含L-苏氨酸和/或β-聚3-羟基丁酸酯及其衍生物方面的应用。
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