CN110241204A - Sox11作为精神分裂症诊断标记物的应用 - Google Patents
Sox11作为精神分裂症诊断标记物的应用 Download PDFInfo
- Publication number
- CN110241204A CN110241204A CN201910602071.1A CN201910602071A CN110241204A CN 110241204 A CN110241204 A CN 110241204A CN 201910602071 A CN201910602071 A CN 201910602071A CN 110241204 A CN110241204 A CN 110241204A
- Authority
- CN
- China
- Prior art keywords
- sox11
- mrna
- albumen
- schizophrenia
- primer
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Pending
Links
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
- C12Q1/6883—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
- G01N33/68—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving proteins, peptides or amino acids
- G01N33/6893—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving proteins, peptides or amino acids related to diseases not provided for elsewhere
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
- C12Q2600/156—Polymorphic or mutational markers
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N2800/00—Detection or diagnosis of diseases
- G01N2800/30—Psychoses; Psychiatry
- G01N2800/302—Schizophrenia
Landscapes
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Immunology (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Urology & Nephrology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Pathology (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Zoology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Hematology (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Cell Biology (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Food Science & Technology (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- General Physics & Mathematics (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
Abstract
本发明涉及生物医学检测领域,具体而言,涉及SOX11作为精神分裂症诊断标记物的应用,更具体涉及SOX11 mRNA或蛋白的定量检测剂在制备用于诊断精神分裂症的试剂或试剂盒中的应用。SOX11 mRNA或蛋白对精神分裂症的诊断有较高的特异性和灵敏度,且属于外周血指标,可方便获取;单指标检测方法,只需测一个指标,方便将来推广使用。也可方便联合其它检测方式得出更可靠的结果。
Description
技术领域
本发明涉及生物医学检测领域,具体而言,涉及SOX11作为精神分裂症诊断标记物的应用。
背景技术
精神分裂症(schizophrenia,SC)是一类病因复杂、表型异质性高的慢性致残性疾病。常有知觉、思维、情感和行为等方面的障碍,一般无意识及智能障碍。目前普遍认为精神分裂症在普通人群中的终生患病率为1%,常起病于青壮年,大多预后不良,超过50%的患者存在长期的间歇性精神问题,约20%的患者有残留症状,并导致精神残疾。精神分裂症患者的失业率高达80%-90%,自杀的相对危险性增加12倍,预期寿命减少约10-20年。
精神分裂症概念的提出至今已有100余年,然而精神分裂症的发病及病理机制仍不清楚,这已成为当前医学界迫在眉睫的重点及难点问题。近50多年来,大量遗传流行病学研究显示,遗传因素是精神分裂症发生、发展的重要原因之一。正如1960年代在遗传流行病学研究结果的基础上所预测的一样,精神分裂症是高度多基因相关的疾病。全基因组关联研究已识别出超过100多个含有小遗传效应的常见等位基因的基因位点,数百个这样的基因位点具有整体遗传效应。这表明有一系列群体频率的单核苷酸多态性(singlenucleotide polymorphism,SNP)有致病风险。
目前,临床上对精神分裂症的诊断主要是根据病人的详细病史与精神症状,再参考其发病年龄、病期、病程等来做综合判断,因此总体上是一个依赖于医生主观经验的过程,诊断结果常常因人而异。为了使精神分裂症的诊断更加客观化,提高诊断的一致性和准确度,近年来,世界各地的科研工作者一直致力于寻找精神分裂症的生物标志物,建立有效的检测方法。生物标志物指可供客观测定和评价的普通生理或病理或治疗过程中的某种特征性的生化指标,通过对它的测定可以获知机体当前所处的生物学过程中的进程。生物标志物的化学本质可以是DNA、RNA、蛋白或代谢物,一般从体液获得。将生物标志物应用于精神分裂症,可以有效辅助当前诊断中不确定的人为因素,减少错/误诊率并有助于指导用药和康复过程。
因此,本领域亟需可用于诊断首发精神分裂症的生物标志物,该标志物应该可靠,还应具备良好的灵敏度和特异度。
有鉴于此,特提出本发明。
发明内容
本公开提供了一个用于诊断精神分裂症的客观检测方法,即检测外周血中的Sox11的表达水平。
具体的,本发明涉及SOX11 mRNA或蛋白的定量检测剂在制备用于诊断精神分裂症的试剂或试剂盒中的应用。
SOX11 mRNA或蛋白对精神分裂症的诊断有较高的特异性和灵敏度,且属于外周血指标,可方便获取;单指标检测方法,只需测一个指标,方便将来推广使用。也可方便联合其它检测方式得出更可靠的结果。
附图说明
为了更清楚地说明本发明具体实施方式或现有技术中的技术方案,下面将对具体实施方式或现有技术描述中所需要使用的附图作简单地介绍,显而易见地,下面描述中的附图是本发明的一些实施方式,对于本领域普通技术人员来讲,在不付出创造性劳动的前提下,还可以根据这些附图获得其他的附图。
图1为本申请一个实施例中SOX11 mRNA在暴力型精神分裂症患者和正常人血清中的表达情况;
图2本申请一个实施例在暴力型精神分裂症患者和正常人血液样本中SOX11蛋白表达情况。
具体实施方式
为更好的说明本发明的目的、技术方案和优点,下面将结合具体实施例对本发明作进一步说明。
本发明涉及SOX11 mRNA或蛋白的定量检测剂在制备用于诊断精神分裂症的试剂或试剂盒中的应用。
还可基于表达水平的差异测定病症和/或疾病的严重性和/或易感性。例如,当标志物基因是本文描述的基因之一时,标志物基因的表达水平的增加程度与病症和/或疾病的存在和/或严重性相关。
SOX11是一种细胞核转录因子,属于SRY(sex determining region on Y-chromosome)相关的HMG-box基因中的C亚群,该亚群包含三个成员:SOX4、SOX11和SOX12。人类SOX11位于染色体2p25.3,其编码的SOX11蛋白为46.7kDa,含有441个氨基酸。SOX11的表达对于胚胎神经发生和组织重塑是至关重要的,通常表达于人类胚胎发育中的神经系统,是神经突生长和神经元生存所必需的。
SOX11在临床上认为与某些肿瘤相关,例如在超过90%的套细胞淋巴瘤(MCL)中有过表达,包括少见的Cyclin D1阴性病例;在绝大多数的B和T淋巴母细胞性白血病/淋巴瘤和半数的儿童伯基特淋巴瘤中亦有强表达;在某些毛细胞白血病中可有弱表达。SOX11的表达也被推测与高级别上皮性卵巢癌的生存期相关。
尽管SOX11与神经系统的关联较为密切,但现有技术中并未有SOX11作为精神分裂症标志物的相关报道。目前关于SOX 11基因的表达水平或相关基因突变在人类精神疾病中作用的报道非常少,其机制调控相关的报道则更为罕见。本发明的发明人意外地发现精神疾病患者及对照人群中SOX11 mRNA(例如外周血中的SOX11 mRNA)或蛋白的水平具有显著性差异;可以单独/联合其它分子标记物进行诊断,结果客观可靠,在精神分裂症患者的诊断中具有很好的应用前景。
在本发明中,本文中描述的术语“精神分裂症病症”是指包括精神分裂症和相关精神病的系列精神障碍。该术语意欲特别地包括精神分裂症(一般包括首发精神分裂症或复发精神分裂症)、精神分裂症样精神障碍、情感性分裂症、妄想症、短时精神障碍和短时精神障碍,如精神障碍的诊断和统计手册,第4版(DSM-IV-TR)中定义的。
在一些实施方式中,所述精神分裂症是暴力型的。
暴力型精神分裂症病人常见的攻击性行为的症状凡是有精神病症状的病人都有可能出现攻击性行为。特别是患有精神分裂症、偏执性精神病和情感性精神障碍这三种精神疾病的精神病患者更是容易出现暴力行为的高发人群。
暴力型精神分裂症常见以下临床症状:幻听、妄想、扩大型自杀等。
术语“SOX11 mRNA的定量检测剂”在本发明中不应仅仅理解为对SOX11 mRNA的检测剂,而应包括被本领域被本领域技术人员所知的其余可反映SOX11 mRNA表达水平的检测试剂。例如可通过定量检测SOX11 mRNA反转录所得的cDNA对SOX11 mRNA的表达量进行间接检测。
在本发明中,若无特别声明,“SOX11 mRNA”以及“SOX11蛋白”可被“标志物”、“标志物基因”(特指SOX11 mRNA)、“生化标志物”、“标志物多肽”(特指SOX11蛋白)、“精神分裂症标志物”所替换。其具体指要用作分析患者实验样品的靶标的分子。
在本发明中用作标志物的SOX11 mRNA预期包括其全长核糖核苷酸序列,或天然存在的变体,或全长序列及变体的片段,特别是可被检测并确定具体序列的片段。优选地包含所述全长核糖核苷酸序列的至少7、8、9、10、11、12、15或20个连续的核糖核苷酸。
在本发明中用作标志物的SOX11蛋白预期包括所述蛋白的天然存在的变体以及所述蛋白或所述变体的片段,特别是免疫学上可检测的片段。免疫学上可检测的片段优选地包含所述标志物多肽的至少5、6、7、8、9、10、11、12、15或20个连续氨基酸。“SOX11蛋白”的表述包括SOX11的完整蛋白序列,及上述所定义的所述标志物多肽。
本领域的技术人员可认识到,由细胞释放的核糖核苷酸/蛋白/多肽或存在于胞外基质中的核糖核苷酸可能受到损害(例如,在炎症过程中),且可被降解或切割成这样的片段。如熟练的技术人员将明白的,mRNA、蛋白或其片段也可以作为复合物的部分而存在。这样的复合物也可以用作本发明意义上的标志物。另外,在替代方案中,标志物多肽或其变体可以携带翻译后修饰。翻译后修饰的非限制性实例是糖基化、酰化和/或磷酸化。
“天然存在的变体”应被理解为,高等动物的基因通常伴有高频率的多态性。也存在许多在剪接过程中产生含有相互不同的氨基酸序列的同种型的分子。与精神分裂症相关疾病相关的具有与标志物基因的活性相似的活性的任何基因包括在标志物基因中,即使其由于多态性或为同种型而具有核苷酸序列差异。
RNA的定量检测剂可选用本领域技术人员所公知的试剂,例如能够与该RNA杂交,且标记有荧光标记的核酸等;常见情况下RNA的检测剂可以选自RT-PCR的引物,以及用于扩增RT-PCR的产物——cDNA的引物。
在一些实施方式中,所述SOX11 mRNA的定量检测剂包括适用于如下至少一种方法的试剂:
实时荧光定量PCR、数字PCR、荧光染料法、共振光散射法、测序或生物质谱法。
在一些实施方式中,所述SOX11 mRNA的定量检测剂为能够特异性结合SOX11 mRNA或SOX11 cDNA的探针或引物。
也应理解,标志物基因可包括除了人外的其他物种的同源物。因此,除非明确指出,否则表述“标志物基因”是指对于物种独特的标志物基因的同源物或已被导入个体的外源标志物基因。同样,应理解,“标志物基因的同源物”在严格条件下可作为探针与人标志物基因杂交。这样的严格条件对于本领域技术人员(其可通过实验或凭经验选择适当的条件来产生相同严格性)来说是已知的。含有标志物基因的核苷酸序列或与标志物基因的核苷酸序列的互补链互补并且具有至少15个核苷酸的核苷酸序列的多核苷酸可用作引物或探针。因此,“互补链”是指由A:T(对于RNA为U)和G:C碱基对组成的双链DNA中相对于另一条链的一条链。
此外,“互补”不仅意指与至少15个连续核苷酸的区域完全互补的序列,而且还指具有在某些情况下至少40%,在某些情况下50%,在某些情况下60%,在某些情况下70%,在某些情况下80%,在某些情况下90%和在某些情况下95%或更高的核苷酸序列同源性的序列。核苷酸序列之间的同源性的程度可利用算法BLAST等来测定。
此类多核苷酸可用作检测标志物基因的探针,或用作扩增标志物基因的引物。当用作引物时,多核苷酸通常包含15bp至100bp,在某些实施方案中15bp至35bp的核苷酸。当用作探针时,DNA包含标志物基因的整个核苷酸序列(或其互补链),或具有至少15bp核苷酸的其部分序列。当用作引物时,3′区域必须与标志物基因互补,而5′区域可连接至限制性内切酶识别序列或标签(tag)。“多核苷酸”可以是DNA或RNA。此类多核苷酸可以是合成的或天然发生的。同样,通常也标记用作杂交探针的DNA。本领域技术人员易于理解此类标记方法。在本文中,术语“寡核苷酸”意指具有相对低的聚合程度的多核苷酸。寡核苷酸也包括在多核苷酸内。
可使用例如Northern杂交、斑点印迹杂交或DNA微阵列技术进行利用杂交技术的病症和/或疾病的检测。此外,可使用基因扩增技术例如RT-PCR法。通过在RT-PCR的基因扩增步骤中使用PCR扩增监控法,可更加定量地分析标志物基因的表达。
在一些实施方式中,所述探针或引物带有可检测的标记。
在PCR基因扩增监控法中,将检测靶(DNA或RNA的反转录物)与用荧光染料和吸收荧光的猝灭剂标记的探针杂交。当PCR进行并且Taq聚合酶以其5′-3′外切核酸酶活性降解探针时,荧光染料与猝灭剂彼此分离,从而检测到荧光。实时检测荧光。通过同时测量其中靶的拷贝数是已知的标准样品,可利用循环数(其中PCR扩增是线性的)测定受试者样品中靶的拷贝数。同样,本领域技术人员公认PCR扩增监控法可使用任何适当的方法来进行。
在一些实施方式中,所述SOX11 mRNA的定量检测剂为SOX11 mRNA的qRT-PCR引物,其上游引物如SEQ ID NO:1所示,下游引物如SEQ ID NO:2所示。
在一些实施方式中,SOX11蛋白的定量检测剂是特异性地测量SOX11蛋白所需的试剂。
在一些实施方式中,特异性地测量SOX11蛋白所需的试剂(特异性的结合剂)是,例如,SOX11蛋白的配体或受体(如果存在的话)、结合SOX11蛋白的凝集素、结合SOX11蛋白的适配体或结合SOX11蛋白的抗体及抗体片段。特异性的结合剂对其相应的靶分子具有至少107l/mol的亲和力。特异性的结合剂优选对其靶分子具有108l/mol、或更优选109l/mol的亲和力。技术人员将理解,使用术语"特异性的"表示,样品中存在的其它生物分子不与SOX11蛋白的特异性的结合剂发生显著的结合。
优选地,与除靶分子(SOX11蛋白)之外的生物分子结合的水平产生这样的结合亲和力,其最多分别是与靶分子亲和力的仅10%或更少、仅5%或更少、仅2%或更少、或仅1%或更少。优选的特异性的结合剂将同时满足上述关于亲和力和特异性的最小标准。
在一些实施方式中,所述能够特异性结合SOX11多肽的检测剂为抗体或抗体片段。
“抗体”此用语包括多克隆抗体及单克隆抗体,“抗体片段”此用语包括这些抗体的抗原化合物结合片段,包括Fab、F(ab’)2、Fd、Fv、scFv、双特异抗体和抗体最小识别单位,以及这些抗体和片段的单链衍生物,例如scFv-Fc等。抗体的类型可以选择IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgA、IgM、IgE、IgD。此外,“抗体”此用语包括天然发生的抗体以及非天然发生的抗体,包括例如嵌合型(chimeric)、双功能型(bifunctional)、人源化(humanized)抗体以及人抗体,以及相关的合成异构形式(isoforms)。“抗体”此用语可和“免疫球蛋白”互换使用。
在一些实施方式中,所述抗体或抗体片段可通过以SOX11蛋白或其片段作为抗原免疫得到,免疫对象可以选择包括人类及所有畜养(如家畜和宠物)和野生的动物及禽鸟,其非限制性地包括牛、马、乳牛、猪、绵羊、山羊、大鼠、小鼠、狗、猫、兔、骆驼、驴、鹿、貂、鸡、鸭、鹅、火鸡、斗鸡等。
在一些实施方式中,所述抗体或抗体片段标记有显示信号强度的指示剂。
在一些实施方式中,所述试剂盒中还包括另外一种或多种精神分裂症标志物的检测剂。
可将本文中描述的精神分裂症标志物与精神分裂症的其它风险因子组合。在某些实施方案中,此类另外的风险因子选自SNP、微卫星或插入/缺失多态型。
在一些实施方式中,所述试剂盒中还包括反转录试剂、血液抽提试剂、内参引物、用于指示DNA合成量的荧光物质、qPCR反应缓冲液、dNTPs、DNA聚合酶、水中的一种或多种。
在一些实施方式中,所述内参引物选自GAPDH、tubulin或actin的引物。
在一些实施方式中,所述水为无核酸酶的水,例如反渗水(Reverse osmosisWater)、蒸馏水(Distilled Water)、去离子水(Deionized Water)以及反渗水(Reverseosmosis Water)。
在一些实施方式中,所述DNA聚合酶选自Taq、Bst、Vent、Phi29、Pfu、Tru、Tth、Tl1、Tac、Tne、Tma、Tih、Tf1、Pwo、Kod、Sac、Sso、Poc、Pab、Mth、Pho、ES4DNA聚合酶、Klenow片段中的任一种。
在一些实施方式中,所述血液抽提试剂选自抗凝剂(例如枸橼酸或其盐、EDTA或其盐)、淋巴细胞分离液等。
本发明还提供了诊断人个体精神分裂症(特别是暴力型精神分裂症)的方法,所述方法包括:
(a)获取含有受试者SOX11 mRNA或蛋白的样品;(b)测量样品中的SOX11 mRNA或蛋白的表达量,(c)任选地,测量样品中的一种或更多种其它的精神分裂症标志物的浓度;(d)使用步骤(b)的测量结果和任选的步骤(c)的测量结果来诊断精神分裂症。
在一些实施方式中,步骤a)中使用如上所述的特异性地定量测量SOX11 mRNA/蛋白所需的试剂进行测量。
术语“受试者”是指任何动物,包括哺乳动物,例如但不限于灵长类动物(如人类)、啮齿目动物(如小鼠、大鼠、兔)、狗、猫、猪、牛、羊、马。
在一些实施方式中,所述样品为所述受试者的体液,例如是血液、血清或血浆和脑脊髓液、组织或组织裂解液、细胞培养上清、精液、唾液样品、或其它适当的包含SOX11mRNA/蛋白的样品,优选外周血;
在一些实施方式中,所述样品为从外周血中提取得到的总RNA;
在一些实施方式中,该方法是体外方法。
本发明所提供的技术方案有助于更客观地诊断精神分裂症。“诊断”此用语包括评估精神分裂症的易感性、精神分裂症的患病严重情况,或连同其它指标/病症进行精神分裂症的确诊,或进行精神分裂症的预后评估。
诊断精神分裂症病症的方法可包括另外的步骤,该步骤包括将易感性报告给至少一个实体,所述实体选自个人、个人的监护人、个人的代理人、基因服务提供商、医生、医疗机构和医疗保险公司。在特定实施方案中,其它单个实体,包括上述实体的任一种可被这样的报告所靶向,这同样可适用于上述实体的任何组合。
即使在常规检测中受试者未被诊断为患有病症和/或疾病(尽管症状暗示此类疾病),这样的受试者是否患有病症和/或疾病也可通过按照本文中所述的方法进行检测来容易地确定。
更特别地,在某些实施方案中,当标志物基因是本文描述的基因之一时,其症状至少暗示对病症和/或疾病的易感性的受试者中标志物的表达水平的增加或减少表明症状主要由所述病症和/或疾病引起。
此外,检测可用于确定病症和/或疾病是否在受试者中得到改善。换句话说,本文中描述的方法可用于判断用于所述病症和/或疾病的治疗的治疗效果。此外,当标志物是本文描述的标志物之一时(特别是SOX11 mRNA/蛋白),已被诊断为患有所述病症和/或疾病的受试者中标志物基因的表达水平的增加或减少意味着疾病已向前发展。
下面将结合实施例对本发明的实施方案进行详细描述,但是本领域技术人员将会理解,下列实施例仅用于说明本发明,而不应视为限制本发明的范围。实施例中未注明具体条件者,按照常规条件或制造商建议的条件进行。所用试剂或仪器未注明生产厂商者,均为可以通过市购获得的常规产品。
实施例1
精神分裂患者来自专门负责精神分裂疾病的医院(吉林省公安厅安康医院)及吉林省四平市一个家族成员中患精神分裂的人员,共46名,为暴力型精神分裂患者。正常人来自四平同一个家族中的正常成员以及其他与这个家族无关的正常人,共39名。本研究已通过吉林省公安厅安康医院医学伦理委员会审查,临床试验方案合乎道德原则。病例组和对照组均经过正式书面告知。
实验步骤:血液样品使用红细胞裂解液处理获得白细胞;对上述外周血白细胞样品提取总RNA;以总RNA为模板将SOX11特异性转录为cDNA,使用实时定量PCR(qPCR)技术检测SOX11的mRNA表达水平,比较SOX11在精神分裂患者及正常人血液中的水平。
SOX11qRCP反应体系:
按下列组份配制PCR反应液(在冰上进行)
SOX11qRCP反应条件:
反应条件
两步法PCR扩增标准程序:Stage 1:预变性
Reps:1
95℃30秒
Stage 2:PCR反应
Reps:40
95℃5秒
60℃30秒
Dissociation stage
结果分析:
导出SOX11 qPCR Ct值,利用公式△Ct=Ct(目的基因)-Ct(内参基因)计算得出△Ct用本次实验中待研究样本的△Ct减去对照组样本的△Ct,并同时对所有结果取相反数,运算得到的-△△Ct,最后,对-△△Ct进行2的幂运算,即2-△△Ct就得出Fold Change。
qPCR检测结果显示暴力型精神分裂症患者血液中SOX11 mRNA的表达与正常人相比存在明显的差异,暴力型精神分裂患者血液中SOX 11mRNA表达比正常人对照显著降低。结果如图1所示。
实施例2
SOX11蛋白水平检测(Western blot)
采用Western blot方法对上述精神分裂患者样本与正常人样本进行蛋白水平表达量的检测,具体方法如下:
(1)制胶:洗净玻璃板,并且烘干,安装好垂直电泳板。按照配方配制分离胶,7ml每块胶,灌注进垂直电泳板中,轻轻加入无水乙醇进行液封,室温静置30min等待胶凝固,倒出无水乙醇,利用吸水纸吸干。按照配方配制浓缩胶,3ml每块胶,灌注到分离胶上,插上梳子,室温静置30分钟凝固;
(2)样品处理:取样品(含50μg蛋白)按照4:1的比例与5*loading buffer混合,置于金属浴上,97℃,5min;
(3)上样:拔下梳子,依次将样品和蛋白Marker加入上样孔,每孔上样体积均应相同,空孔以1×上样缓冲液补齐体积;
(4)电泳:以80V恒压进行电泳,待溴酚蓝跑到分离胶内时,换用120V恒压电泳,待溴酚兰染料跑到胶底即可;
(5)电转:于电转胶夹内按如下顺序安装:阳极→海绵一层→滤纸三层→NC(PVDF)膜→凝胶→滤纸三层→海绵一层→阴极,去除胶、膜和滤纸之间的气泡,夹紧并移入电转槽,注入电转缓冲液,在冰上以200mA恒流电转2小时;
(6)将PVDF膜取出,右上角剪一缺口表明正面,放入5%脱脂奶粉中,于70rpm摇床上室温封闭1小时;
(7)一抗孵育(Novus Biologicals,nbp1-85823,0.4ug/ml),4℃过夜;
(8)PBST洗膜,5min×4次;然后加入荧光二抗孵育,室温1小时;
(9)PBST洗膜,5min×4次;
(10)使用Odessey仪器检,保存结果并进行数字化分析。
Westernblot数据显示,精神分裂患者(1#、3#、4#、7#、9#、10#、12#)血液中Sox11蛋白表达与正常人(2#、5#、6#、8#、11#)相比明显降低(p<0.05)。
最后应说明的是:以上各实施例仅用以说明本发明的技术方案,而非对其限制;尽管参照前述各实施例对本发明进行了详细的说明,但本领域的普通技术人员应当理解:其依然可以对前述各实施例所记载的技术方案进行修改,或者对其中部分或者全部技术特征进行等同替换;而这些修改或者替换,并不使相应技术方案的本质脱离本发明各实施例技术方案的范围。
SEQUENCE LISTING
<110> 北京太东生物科技有限公司
<120> SOX11作为精神分裂症诊断标记物的应用
<160> 2
<170> PatentIn version 3.3
<210> 1
<211> 19
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 1
agcaagaaat gcggcaagc 19
<210> 2
<211> 21
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 2
atccagaaac acgcacttga c 21
Claims (10)
1.SOX11 mRNA或蛋白的定量检测剂在制备用于诊断精神分裂症的试剂或试剂盒中的应用。
2.根据权利要求1所述的应用,其特征在于,所述精神分裂症是暴力型的。
3.根据权利要求1所述的应用,其特征在于,所述SOX11 mRNA的定量检测剂包括适用于如下至少一种方法的试剂:
实时荧光定量PCR、数字PCR、荧光染料法、共振光散射法、测序或生物质谱法。
4.根据权利要求1所述的应用,其特征在于,所述SOX11 mRNA的定量检测剂为能够特异性结合SOX11 mRNA或SOX11 cDNA的探针或引物。
5.根据权利要求4所述的应用,其特征在于,所述探针或引物带有可检测的标记。
6.根据权利要求1所述的应用,其特征在于,所述SOX11 mRNA的定量检测剂为SOX11mRNA的qRT-PCR引物,其上游引物如SEQ ID NO:1所示,下游引物如SEQ ID NO:2所示。
7.根据权利要求1所述的应用,其特征在于,所述SOX11蛋白的定量检测剂包括能够特异性结合SOX11蛋白的凝集素、适配体抗体或抗体片段中的一种或多种;
优选的,所述SOX11蛋白的定量检测剂为抗体或抗体片段。
8.根据权利要求1~7任一项所述的应用,其特征在于,所述试剂盒中还包括另外一种或多种精神分裂症标志物的检测剂。
9.根据权利要求8所述的应用,其特征在于,所述精神分裂症标志物选自SNP、微卫星或插入/缺失多态型。
10.根据权利要求1~7任一项所述的应用,其特征在于,所述试剂盒中还包括反转录试剂、血液抽提试剂、内参引物、用于指示DNA合成量的荧光物质、qPCR反应缓冲液、dNTPs、DNA聚合酶、水中的一种或多种。
Priority Applications (2)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
CN201910602071.1A CN110241204A (zh) | 2019-07-05 | 2019-07-05 | Sox11作为精神分裂症诊断标记物的应用 |
PCT/CN2020/092583 WO2020259189A1 (zh) | 2019-06-27 | 2020-05-27 | Sox11作为精神分裂症诊断标记物的应用 |
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
CN201910602071.1A CN110241204A (zh) | 2019-07-05 | 2019-07-05 | Sox11作为精神分裂症诊断标记物的应用 |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
CN110241204A true CN110241204A (zh) | 2019-09-17 |
Family
ID=67891054
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
CN201910602071.1A Pending CN110241204A (zh) | 2019-06-27 | 2019-07-05 | Sox11作为精神分裂症诊断标记物的应用 |
Country Status (1)
Country | Link |
---|---|
CN (1) | CN110241204A (zh) |
Cited By (3)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2020259189A1 (zh) * | 2019-06-27 | 2020-12-30 | 北京太东生物科技有限公司 | Sox11作为精神分裂症诊断标记物的应用 |
CN114057858A (zh) * | 2020-08-10 | 2022-02-18 | 北京太东生物科技有限公司 | 对引起神经变性和神经退行性疾病的蛋白聚集具有解聚作用的多肽 |
CN115261457A (zh) * | 2022-06-13 | 2022-11-01 | 广州市妇女儿童医疗中心 | 用于辅助诊断脑梗塞及其预后评价的标志物组合及含有其的试剂盒与应用 |
Citations (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN104862310A (zh) * | 2015-05-04 | 2015-08-26 | 张理义 | 精神分裂症生物标记物、筛选方法及试剂盒 |
US20180299430A1 (en) * | 2017-04-12 | 2018-10-18 | Academia Sinica | Kit for selecting neurological drug and uses thereof |
-
2019
- 2019-07-05 CN CN201910602071.1A patent/CN110241204A/zh active Pending
Patent Citations (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN104862310A (zh) * | 2015-05-04 | 2015-08-26 | 张理义 | 精神分裂症生物标记物、筛选方法及试剂盒 |
US20180299430A1 (en) * | 2017-04-12 | 2018-10-18 | Academia Sinica | Kit for selecting neurological drug and uses thereof |
Non-Patent Citations (2)
Title |
---|
LI SHA: "SOX11 target genes: implications for neurogenesis and neuropsychiatric illness", 《TRANSCRIPTIONAL REGULATION OF NEURODEVELOPMENTAL AND METABOLIC PATHWAYS BY THE PSYCHIATRIC ILLNESS CANDIDATE GENE NPAS3》 * |
LUAN,ZHILIN: "Association of SOX11 Polymorphisms in 3"UTR with Susceptibility for Schizophrenia", 《SUSCEPTIBILITY GENES FOR SCHIZOPHRENIA AND THEIR FUNCTIONAL RELATIONSHIPS》 * |
Cited By (5)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2020259189A1 (zh) * | 2019-06-27 | 2020-12-30 | 北京太东生物科技有限公司 | Sox11作为精神分裂症诊断标记物的应用 |
CN114057858A (zh) * | 2020-08-10 | 2022-02-18 | 北京太东生物科技有限公司 | 对引起神经变性和神经退行性疾病的蛋白聚集具有解聚作用的多肽 |
US11970517B2 (en) | 2020-08-10 | 2024-04-30 | Rejukon Biopharm Inc. | Compositions and methods for dissolving protein aggregates |
CN115261457A (zh) * | 2022-06-13 | 2022-11-01 | 广州市妇女儿童医疗中心 | 用于辅助诊断脑梗塞及其预后评价的标志物组合及含有其的试剂盒与应用 |
CN115261457B (zh) * | 2022-06-13 | 2023-10-27 | 广州市妇女儿童医疗中心 | 用于辅助诊断脑梗塞及其预后评价的标志物组合及含有其的试剂盒与应用 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
Martin et al. | Clinical whole-genome sequencing in severe early-onset epilepsy reveals new genes and improves molecular diagnosis | |
Chang et al. | The protocadherin 17 gene affects cognition, personality, amygdala structure and function, synapse development and risk of major mood disorders | |
US20130040844A1 (en) | Biomarkers of aging for detection and treatment of disorders | |
Gabitto et al. | Integrated multimodal cell atlas of Alzheimer’s disease | |
CN110241204A (zh) | Sox11作为精神分裂症诊断标记物的应用 | |
EP3545103B1 (en) | Method and biomarkers for in vitro diagnosis of mental disorders | |
CA2854333A1 (en) | Biomarkers for sanfilippo syndrome and uses thereof | |
CN103959067A (zh) | 用于检测和监测用于创伤后应激障碍(ptsd)的诊断生物标志物以及用于区分自杀式与非自杀式障碍的方法和试剂盒 | |
Goilav et al. | Biomarkers for kidney involvement in pediatric lupus | |
Paap et al. | Molecular biomarkers in multiple sclerosis | |
CN106062213A (zh) | 与自杀风险关联的遗传标志物及其使用方法 | |
Szigeti et al. | Neuronal actin cytoskeleton gain of function in the human brain | |
CN109097462A (zh) | Ap1m2基因作为诊断青光眼的分子标志物的应用 | |
US20150132744A1 (en) | Methods of detecting cells latently infected with hiv | |
JP7336517B2 (ja) | 虚弱性の診断および/または予測のためのバイオマーカー | |
CN106755563A (zh) | 生物标志物在诊断帕金森中的应用 | |
CN108034707B (zh) | Spag7基因在制备老年痴呆诊断制剂中的应用 | |
CN115948544A (zh) | Cited4和/或metrn在椎间盘退变程度的鉴别诊断中的应用 | |
CN105543400B (zh) | I型糖尿病的分子标志物 | |
WO2020259189A1 (zh) | Sox11作为精神分裂症诊断标记物的应用 | |
JP2009112266A (ja) | 精神神経疾患診断マーカ、診断方法、および治療薬評価方法 | |
JP2019007759A (ja) | 老化度を評価する方法及び老化度の評価用キット | |
US20160326587A1 (en) | Ovol1 as a new marker for moderate to severe acne | |
WO2015091769A1 (en) | Ap5b1 as a new marker for moderate to severe acne | |
RU2592228C2 (ru) | Способ (варианты) и набор для диагностики инфекции мочевыводящих путей, способ лечения и определения предрасположенности к инфекции мочевыводящих путей |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
PB01 | Publication | ||
PB01 | Publication | ||
SE01 | Entry into force of request for substantive examination | ||
SE01 | Entry into force of request for substantive examination | ||
CB02 | Change of applicant information |
Address after: Room D409, floor 4, building 1, No. 12, Shangdi Information Road, Haidian District, Beijing 100000 Applicant after: Beijing Taidong Biotechnology Co., Ltd. Address before: 100000 Floor C54, No. 19, Yufangyuan District, Fengtai District, Beijing Applicant before: Beijing Taidong Biotechnology Co., Ltd. |
|
CB02 | Change of applicant information | ||
RJ01 | Rejection of invention patent application after publication |
Application publication date: 20190917 |
|
RJ01 | Rejection of invention patent application after publication |