CN110129244B - 链霉菌底盘菌株及其构建方法、在异源表达研究中的应用 - Google Patents

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Abstract

本发明公开了链霉菌底盘菌株及其构建方法、在异源表达研究中的应用,属于生物技术领域。本发明以土霉素高产工业生产菌株Streptomyces rimosus 461为出发株,通过删除土霉素生物合成基因簇(otc)得到了一株链霉菌底盘菌株SR0。利用该底盘菌株,构建了金霉素合成基因簇(ctc)和ctcB基因共表达菌株SRC1,成功实现了金霉素的异源表达,产量在摇瓶水平达到了1.51g/L。通过增强ctcB基因表达和提高宿主的金霉素耐受性,构建了SRC4菌株,使金霉素异源表达产量达到了3.80g/L。本发明构建的SR0菌株为其它II型聚酮,尤其是为四环类抗生素的合成生物学研究提供了良好的生物底盘。

Description

链霉菌底盘菌株及其构建方法、在异源表达研究中的应用
技术领域
本发明属于生物技术领域,具体涉及链霉菌底盘菌株及其构建方法、在异源表达研究中的应用。
背景技术
四环素类抗生素为广谱抗生素,通常都具有氢化并四苯(菲烷)结构,如金霉素(CTC)、土霉素(OTC)、四环素(TC)、去甲金霉素(DMCTC)、去甲四环素(DMTC)、强力霉素、米诺环素、替加环素等(Nguyen F,Starosta AL,Arenz S,Sohmen D,Donhofer A,Wilson DN(2014)Tetracycline antibiotics and resistance mechanisms.Biological chemistry395(5):559-75)。它们通过防止氨基酰-tRNA附着到核糖体受体(A)位点来抑制蛋白质合成,广泛应用于革兰氏阳性和革兰氏阴性细菌、支原体、衣原体、立克次体和原生动物寄生虫引起的感染。另外,还广泛应用于动物生长促进剂(Chopra I,Roberts M(2001)Tetracycline antibiotics:mode of action,applications,molecular biology,andepidemiology of bacterial resistance.Microbiology and molecular biologyreviews65(2):232-60)。在这些抗生素中,TC、CTC、OTC和DMCTC是天然产物,OTC由S.rimosus产生,TC、CTC和DMCTC由S.aureofaciens或其突变体产生。在以往的研究过程中,通过菌株随机诱变筛选、培养基优化和工艺开发,大大提高了这些产品的产量。目前,CTC的生产水平可达23g/L,DMCTC可达10g/L,OTC可达35g/L,但这些方法很难进一步提高这些产品的产量。代谢工程和合成生物学的发展为解决这一问题提供了希望。
生物合成基因簇的异源表达已经成为天然产物发现、产物产量提高、隐性基因簇功能研究等方面的重要方法。目前,异源表达常用的链霉菌宿主主要有Streptomycescoelicolor、S.avermitillis、S.venezuelae、S.lividans、S.albus等模式底盘(Liu R,Deng Z,Liu T(2018)Streptomyces species:Ideal chassis for natural productdiscovery and overproduction.Metabolic engineering 50:74-84;Baltz RH(2016)Genetic manipulation of secondary metabolite biosynthesis for improvedproduction in Streptomyces and other actinomycetes.Journal of industrialmicrobiology&biotechnology 43(2-3):343-70)。在这些宿主中进行异源表达生物合成基因簇的产量都比较低,大多在μg/L到mg/L水平,而在工业生产宿主中的产量可达到g/L水平(如,工业链霉菌产红霉素≥10g/L,四环素≥30g/L,盐霉素≥80g/L)(Bilyk B,Horbal L,Luzhetskyy A(2017)Chromosomal position effect influences the heterologousexpression of genes and biosynthetic gene clusters in Streptomyces albusJ1074.Microbial cell factories 16(1):5)。因此,基于工业生物底盘开发的异源表达宿主可能是更优的宿主底盘。因为土霉素工业底盘生长迅速,OTC产量远高于其他四环素和其他II型聚酮抗生素,因此是最可取的潜在底盘。在龟裂链霉菌(S.rimosus)中异源合成其它四环类抗生素及其他有价值的II型聚酮既具有经济价值,又具有典型的科学意义。
发明内容
本发明的目的在于提供一种链霉菌底盘菌株及其构建方法,旨在提供一种最合适的底盘,提高异源合成其它四环类抗生素及其他有价值的II型聚酮的经济价值以及科学意义。
本发明所提供的技术方案为:一种链霉菌底盘菌株,所述底盘菌株名称为龟裂链霉菌(Streptomyces rimosus)SR0,该菌株保藏在CGMCC,保藏编号为CGMCC NO.17208,保藏日期为2019年01月17日。
进一步的技术方案在于链霉菌底盘菌株的构建方法,其构建步骤是:
(1)以ori18-F1和ori18-R1为引物,以pSET152为模板,扩增pUC18的复制起点,1169bp;以pTOS-F1和pTOS-R1为引物,以pTOS为模板,扩增pTOS载体序列,2378bp;两片段Gibson组装构建pTOS18G;
所述的引物序列为:
ori18-F1:CTGTGGCATCTGCGTGGCATTTCCACACAACATACGAGCCG
ori18-R1:CGATCATAGCACGATCAACGGCACTGTTGCAAATAGTCGGTG
pTOS-F1:CACCGACTATTTGCAACAGTGCCGTTGATCGTGCTATGATC
pTOS-R1:GGCTCGTATGTTGTGTGGAAATGCCACGCAGATGCCACAGG
(2)以L-F和L-R为引物,以S.rimosus 461基因组为模板,扩增含有左臂同源臂的片段,2000bp;回收产物和质粒pTOS18G用EcoRⅤ+KpnⅠ双酶切,3286bp;然后将两片段进行连接,构建pTOS18G-L;
所述的引物序列为:
L-F:5'ATAGGTACCATATCGGCACCGGCACGTAC 3'(KpnⅠ)
L-R:5'AATGATATCGGTGCTCGCCCTGCTCGTGATGC 3'(EcoRⅤ)
(3)pTOS18G-L转化E.coli ETZ,然后E.coli ETZ(pTOS18G-L)与S.rimosus 461进行属间接合转移实验,筛选pTOS18G-L整合到基因组上的单交换菌株S.rimosus461-TL;
(4)质粒pUWLDRE转化E.coli ETZ,然后E.coli ETZ(pUWLDRE)与S.rimosus461-TL进行属间接合转移实验,筛选pTOS18G-L质粒骨架环出的菌株S.rimosus 461-L菌株,并通过传代培养,丢失pUWLDRE质粒;
(5)以1132-2-F和1132-2-R为引物,以pKC1132为模板,扩增pKC1132骨架序列,3038bp;以R-F和R-R为引物,以S.rimosus 461基因组为模板,扩增含有rox位点和右臂同源臂的片段,2165bp;两片段Gibson组装构建pKC1132-R;
所述的引物序列为:
1132-2-F:CCGGCAGCTCACCCAGGAGTGGATGGTGCCTAATGAGTGAGCTAAC
1132-2-R:ACCCTAACTTTAAATAATGCCAATTATTTAAAGTTAGATATCCACGCCCTCCTACATC
R-F:TATCTAACTTTAAATAATTGGCATTATTTAAAGTTAGGGTCCGGTGGTTTCAGGTGCC
R-R:TGAGTTAGCTCACTCATTAGGCACCATCCACTCCTGGGTGAGCTGC
(6)pKC1132-R转化E.coli ETZ,然后E.coli ETZ(pKC1132-R)与S.rimosus 461-L进行属间接合转移实验,筛选pKC1132-R整合到基因组上的单交换菌株S.rimosus 461-L-KR菌株;
(7)E.coli ETZ(pUWLDRE)与S.rimosus 461-L-KR进行属间接合转移实验,筛选pKC1132-R质粒骨架环出的菌株,并通过传代培养,丢失pUWLDRE质粒,从而得到链霉菌底盘菌株。
本发明的另一个目的在于提供链霉菌底盘菌株在异源表达研究中的应用,旨在提供链霉菌底盘菌株在异源表达的应用方法,提高研究的价值。
本发明所提供的技术方案为:链霉菌底盘菌株在异源表达研究中的应用。
链霉菌底盘菌株在异源表达研究中提升四环素类抗生素产量的方法,其特征在于,利用ctcB基因激活四环素类抗生素合成基因簇以提高其产量,所述ctcB基因序列如SEQID No.1位所示。
本发明的另一个目的在于提供异源表达金霉素的方法,旨在通过链霉菌底盘菌株异源表达金霉素,使得金霉素的生产以及产量的提高成为可能。
本发明所提供的技术方案为:一种异源表达金霉素的方法,其特征在于,在上述链霉菌底盘菌株中整合金霉素合成基因簇(ctc)载体pSET153-ctc,得到SRC0菌株,然后进一步整合ctcB基因表达载体pSOK616-PermE*-ctcB,得到金霉素生产菌株SRC1。
进一步的技术方案在于,载体pSET153-ctc含有的金霉素合成基因簇(ctc)序列如SEQ ID No.2所示。
进一步的技术方案在于,所述的ctcB基因表达载体pSOK616-PermE*-ctcB,使用组成型启动子PermE*启动ctcB基因表达,所述PermE*启动子序列如SEQ ID No.3所示。
进一步的技术方案在于,所述的ctcB基因表达载体构建方法为:以ctcB-s/ctcB-a为引物,以金色链霉菌(Streptomyces aureofaciens)基因组为模板,扩增ctcB基因,866bp;回收产物和质粒pSOK616-EotcR用NdeⅠ+SpeⅠ双酶切,6442bp;然后将两片段进行连接,构建pSOK616-PermE*-ctcB。
所述的引物序列为:
ctcB-s:ATACATATGGAGGGAAATCCGAGCGACATCGG(NdeⅠ)
ctcB-a:ATTACTAGTGACGGGCCTCAGGCCGAACGG(SpeⅠ)
进一步的技术方案在于,将上述所述一种异源表达金霉素的方法中的ctcB基因表达载体pSOK616-PermE*-ctcB的ctcB基因前启动子PermE*更换为组成型启动子Psf14或组成型启动子PkasO*。
进一步的技术方案在于,使用组成型启动子Psf14构建pSOK616-Psf14-ctcB载体,然后通过接合转移方法,得到金霉素生产菌株SRC2,所述的组成型启动子Psf14序列如SEQID No.4所示。
进一步的技术方案在于,所述的pSOK616-Psf14-ctcB载体构建方法为:利用质粒pSOK616-PermE*-ctcB,采用HindⅢ和NdeⅠ双酶切,回收7172bp片段;以Psf14-s/Psf14-a为引物,pSOK616为模板,扩增Psf14启动子序列,121bp;两片段Gibson组装构建;
所述的引物序列为:
Psf14-s:CTCATGGAGGGCGCGAAGCTTGGGCTGCAGGTCGACTCTAG(HindⅢ)
Psf14-a:GCTCGGATTTCCCTCCATATGACGTGGATCCCTAATCGAGTA(NdeⅠ)
进一步的技术方案在于,使用组成型启动子PkasO*构建pSOK616-PkasO*-ctcB载体,然后通过接合转移方法,得到金霉素生产菌株SRC3,所述的启动子PkasO*序列如SEQ IDNo.5所示。
进一步的技术方案在于,所述pSOK616-PkasO*-ctcB载体的构建方法为:质粒pSOK616-PermE*-ctcB,采用HindⅢ和NdeⅠ双酶切,回收7172bp片段;以PkasO*-s/PkasO*-a为引物,pDR4-K*为模板,扩增PkasO*启动子序列,127bp;两片段Gibson组装构;
所述的引物序列为:
PkasO*-s:CTCATGGAGGGCGCGAAGCTTTGTTCACATTCGAACGGTCTC(HindⅢ)
PkasO*-a:GCTCGGATTTCCCTCCATATGAACTCCCCCAGTCCTGCACG(NdeⅠ)
本发明的另一个目的在于提供一种提高金霉素产量的方法以及方法中使用的培养基,旨在提供金霉素产量,提高实用的的价值。
本发明所提供的技术方案为:一种提高金霉素产量的方法,其特征在于,在由上述方法得到的金霉素生产菌株基础上,提高金霉素生产菌株对金霉素的耐受性。
进一步的技术方案在于,使用金霉素抗性基因ctcR和ctcC,构建融合表达载体pSOK616-ctcB-ctcR-ctcC-1,然后通过接合转移方法,构建SRC4菌株。所述ctcR基因序列如SEQ ID No.6所示,所述ctcC基因序列如SEQ ID No.7所示。
进一步的技术方案在于,所述融合表达载体pSOK616-ctcB-ctcR-ctcC-1的构建方法为:以ctcR-s1/ctcR-a为引物,pSET153-ctc为模板,扩增ctcR1片段(1664bp),回收作为模板,以ctcR-s2和ctcR-a为引物,扩增ctcR2片段(1717bp);以ctcC-s和ctcC-a1为引物,pSET153-ctc为模板进行PCR,扩增ctcC片段(2107bp);片段ctcR2和ctcC为模板,ctcR-s和ctcC-a2为引物进行融合PCR,扩增ctcR-ctcC融合片段(3783bp);pSOK616-PkasO*-ctcB用HindⅢ酶切(7276bp),去磷酸化,回收;ctcR-ctcC融合片段用HindⅢ酶切,回收;两片段连接并转化E.coli DH5α;挑选得到pSOK616-ctcB-ctcR-ctcC-1载体。
所述的引物序列为:
ctcR-s1:TGTTGTAAAGTCGTGGCCAGGAGAATACGACAGCGTGCAGGACTGGGGGAGTTAGACCTTGTCGAATCCGGTG
ctcR-a:TGTCATATGGGTCCTCCTGTGGAGTGGTTCTGTGGAGGTCGCGCGCTCACTCCTCGTCG
ctcR-s2:ATTAAGCTTTGTTCACATTCGAACGGTCTCTGCTTTGACAACATGCTGTGCGGTGTTGTAAAGTCGTGGCCAG(HindⅢ)
ctcC-s:CGACCTCCACAGAACCACTCCACAGGAGGACCCATATGACAACCGTGAACATCGGAATC
ctcC-a1:TACAAGCTTCGACTGAGGACGGAGTGCGCCACGGCTGAGG
ctcR-s:ATTAAGCTTTGTTCACATTCGAACGGTCTCTG(HindⅢ)
ctcC-a2:TACAAGCTTCGACTGAGGACGGAGTGCGC(HindⅢ)
进一步的技术方案在于,一种用于上述方法中的培养基,其特征在于,每1000mL中,含有:淀粉150g,黄豆饼粉20g,硫酸铵14g,碳酸钙14g,氯化钠4g,玉米浆干物4g,磷酸二氢钾0.1g,氯化钴10μg,淀粉酶0.1%~0.2%;培养基需在温度121℃,压强1.01×105Pa条件下灭菌30min。
较之现有技术而言,本发明的优点在于:构建了一株链霉菌底盘,利用该底盘菌株,通过共表达金霉素合成基因簇ctc和ctcB基因成功实现了金霉素的异源表达,产量在摇瓶水平达到了1.51g/L。通过增强ctcB基因表达和提高宿主的金霉素耐受性,使金霉素异源表达产量达到了3.80g/L。本发明构建的SR0菌株为其它II型聚酮,尤其是四环类抗生素的合成生物学研究提供了良好的生物底盘。
附图说明
图1为底盘菌株SR0构建过程示意图。
图2为SR0菌株PCR鉴定。泳道1和2:随机挑选的SR0菌株作为模板;泳道3和4:S.rimosus 461作为模板;泳道5:Trans2K DNA Ladder。
图3为SR0菌株生产OTC分析。
图4为pSET153-ctc图谱。
图5为改造菌株发酵液HPLC分析。1:CTC standard;2:SRC0菌株;3:SR0菌株;4:SRC4菌株;5:SRC3菌株;6:SRC2菌株;7:SRC1菌株。
图6为金霉素相关合成基因转录分析。a:半定量PCR;b:qRT-PCR。
图7为构建的质粒图谱。a:pSOK616-PermE*-ctcB;b:pSOK616-Psf14-ctcB;c:pSOK616-PkasO*-ctcB;d:pSOK616-ctcB-ctcR-ctcC-1。
图8为改造菌株金霉素产量变化曲线。
图9为改造菌株生物量变化曲线。
图10为菌株金霉素耐受性分析。
具体实施方式
以下实施例进一步说明本发明的内容,但不应理解为对本发明的限制。
若未特别说明,实施例中所用的技术手段为本领域技术人员所熟知的常规手段。
本发明所说的链霉菌底盘菌株,其名称为龟裂链霉菌(Streptomyces rimosus)SR0,该菌株保藏在CGMCC,保藏编号为CGMCC NO.17208,保藏日期为2019年01月17日。
实施例1:链霉菌底盘菌株SR0构建
本发明以土霉素高产工业生产菌株Streptomyces rimosus 461为出发株,通过删除土霉素生物合成基因簇得到链霉菌底盘菌株S.rimosus SR0。本发明基于Dre/rox(Herrmann S,Siegl T,Luzhetska M,Petzke L,Jilg C,Welle E,Erb A,Leadlay PF,Bechthold A,Luzhetskyy A(2012)Site-specific recombination strategies forengineering actinomycete genomes.Applied and environmental microbiology 78(6):1804-12)系统设计实验方案,构建示意图如图1所示。
具体构建过程为:
(1)以ori18-F1和ori18-R1为引物,以pSET152为模板,扩增pUC18的复制起点,1169bp;以pTOS-F1和pTOS-R1为引物,以pTOS为模板,扩增pTOS载体序列,2378bp;两片段Gibson组装构建pTOS18G。
所述的引物序列为:
ori18-F1:CTGTGGCATCTGCGTGGCATTTCCACACAACATACGAGCCG
ori18-R1:CGATCATAGCACGATCAACGGCACTGTTGCAAATAGTCGGTG
pTOS-F1:CACCGACTATTTGCAACAGTGCCGTTGATCGTGCTATGATC
pTOS-R1:GGCTCGTATGTTGTGTGGAAATGCCACGCAGATGCCACAGG
PCR扩增体系为:
PCR扩增条件为:
PCR产物电泳检测后回收,ori pUC18片段和pTOS载体片段分别取2μL和3μL,与15μL的Gibson组装反应液(Gibson DG,Young L,Chuang RY,Venter JC,Hutchison CA,3rd,Smith HO(2009)Enzymatic assembly of DNA molecules up to several hundredkilobases.Nature methods 6(5):343-5)混匀,PCR仪50℃反应1h,然后取10μL转化E.coliDH5α。随机挑选转化平板上长出的单克隆进行菌落PCR验证(使用天根生物2×Taq PCRMasterMix,条件同说明书),验证引物为TOS18G-u-F/TOS18G-u-R,TOS18G-d-F/TOS18G-d-R。验证正确的转化子进一步测序验证,从而筛选得到pTOS18G。
所述的引物序列为:
TOS18G-u-F:TGCGACACCCGCTTTAGGAG
TOS18G-u-R:GAGCGAGGAAGCGGAAGAGC
TOS18G-d-F:GCGAGGTATGTAGGCGGTGC
TOS18G-d-R:CGCTACGGAAGGAGCTGTGG
(2)以L-F和L-R为引物,以S.rimosus 461基因组为模板,扩增含有左臂同源臂的片段,2000bp;回收产物和质粒pTOS18G用EcoRⅤ+KpnⅠ双酶切,3286bp;然后将两片段进行连接,构建pTOS18G-L;
所述的引物序列为:
L-F:5'ATAGGTACCATATCGGCACCGGCACGTAC 3'(KpnⅠ)
L-R:5'AATGATATCGGTGCTCGCCCTGCTCGTGATGC 3'(EcoRⅤ)
PCR扩增体系为:
PCR扩增条件为:
PCR产物电泳检测后回收,连同质粒pTOS18G用EcoRⅤ+KpnⅠ双酶切,然后回收,两片段分别取4μL和13μL,在20μL体系中使用T4 DNA ligase 16℃反应过夜,然后取10μL转化E.coli DH5α。随机挑选转化子进行EcoRⅤ+KpnⅠ双酶切和BamHⅠ单酶切验证,验证正确的转化子进一步测序验证,从而筛选得到pTOS18G-L。
(3)pTOS18G-L转化E.coli ETZ,然后E.coli ETZ(pTOS18G-L)与S.rimosus 461进行属间接合转移实验,筛选pTOS18G-L整合到基因组上的单交换菌株S.rimosus461-TL;
接合转移步骤如下:挑取E.coli ETZ(pTOS18G-L)单克隆接种于加有相应抗性的液体LB培养基中(Am 50μg/mL、Km 50μg/mL、Cm 50μg/mL),37℃,220rpm过夜培养;以1%接种量,转接至新鲜的LB(Am 50μg/mL、Km 50μg/mL、Cm 50μg/mL),37℃,220rpm至OD600=0.4~0.6;取2mL培养液,分装至2个Ep管中,7000rpm离心1min,弃上清;加入等体积的LB(洗涤抗生素),洗涤2次;将2个Ep管菌体重悬于0.5mL LB中;在洗涤大肠杆菌细胞的同时,用2×YT培养基收集链霉菌的孢子,用2×YT洗涤2次后(7000rpm,1min),于0.5mL 2×YT培养基,50℃热激10min,室温冷却;将0.5mL洗涤好的E.coli ETZ(pTOS18G-BL)和0.5mL热激过的链霉菌孢子混匀,全部涂布于MS平板(终浓度10mM MgCl2);37℃培养16-20h,加入1mL用无菌水稀释的NA(终浓度25μg/mL)和其它对应浓度的抗生素(Am浓度200μg/mL),涂布平板,继续培养5~7天。
经过接合转移和传代实验后(MS平板,Am浓度200μg/mL),得到单克隆菌株,pTOS18G-L没有链霉菌复制原点,作为自杀载体在链霉菌中不能自主复制,只有整合到基因组上跟随链霉菌基因组复制,所以通过安普霉素抗性筛选得到的菌株,应该为pTOS18G-L通过单交换整合到了S.rimosus 461基因组上。使用ori18-F1/ori18-R1和pTOS-2-F/pTOS-2-R引物进行PCR验证(使用天根生物2×Taq PCR MasterMix,条件同说明书),进一步筛选得到S.rimosus461-TL。
所述的引物序列为:
ori18-F1:CTGTGGCATCTGCGTGGCATTTCCACACAACATACGAGCCG
ori18-R1:CGATCATAGCACGATCAACGGCACTGTTGCAAATAGTCGGTG
pTOS-2-F:AAGCCTGAACTCACCGCGAC
pTOS-2-R:TCAACGGGAATCCTGCTCTG
(4)质粒pUWLDRE转化E.coli ETZ,然后E.coli ETZ(pUWLDRE)与S.rimosus461-TL进行属间接合转移实验,筛选pTOS18G-L质粒骨架环出的菌株S.rimosus 461-L菌株,并通过传代培养,丢失pUWLDRE质粒;
接合转移平板长出的菌落传代培养后接Am抗性平板和无抗平板进行影印筛选,挑选Am敏感的菌株分别使用L-dre-2-F/L-dre-2-R、pTOS-2-F/pTOS-2-R等2对引物进行PCR验证(使用天根生物2×Taq PCRMasterMix,条件同说明书),从而得到质粒骨架环出的菌株S.rimosus 461-L。然后将S.rimosus 461-L菌株接MS平板,37℃培养,丢失pUWLDRE质粒。菌落传代培养后接Tsr抗性平板和无抗平板进行影印筛选,挑选Tsr敏感的菌株使用L-dre-2-F/L-dre-1-R、L-dre-2-F/L-dre-2-R、pTOS-2-F/pTOS-2-R、L-dre-1-F/L-dre-1-R等4对引物进行PCR验证使用天根生物2×Taq PCR MasterMix,条件同说明书),从而得到质粒骨架环出并丢失pUWLDRE质粒的菌株S.rimosus 461-L。
所述的引物序列为:
L-dre-2-F:TCGAGGTTGCTGACGTAGTC
L-dre-2-R:TATTGGAGCTGGATCATCTGG
pTOS-2-F:AAGCCTGAACTCACCGCGAC
pTOS-2-R:TCAACGGGAATCCTGCTCTG
L-dre-1-F:ATTTAAAGTTAGAACGGTACCTGAC
L-dre-1-R:GGTCGTCGGCCATGAAGAGG
(5)以1132-2-F和1132-2-R为引物,以pKC1132为模板,扩增pKC1132骨架序列,3038bp;以R-F和R-R为引物,以S.rimosus 461基因组为模板,扩增含有rox位点和右臂同源臂的片段,2165bp;两片段Gibson组装构建pKC1132-R;
所述的引物序列为:
1132-2-F:CCGGCAGCTCACCCAGGAGTGGATGGTGCCTAATGAGTGAGCTAAC
1132-2-R:ACCCTAACTTTAAATAATGCCAATTATTTAAAGTTAGATATCCACGCCCTCCTACATC
R-F:TATCTAACTTTAAATAATTGGCATTATTTAAAGTTAGGGTCCGGTGGTTTCAGGTGCC
R-R:TGAGTTAGCTCACTCATTAGGCACCATCCACTCCTGGGTGAGCTGC
PCR扩增体系为:
PCR扩增条件为:
PCR产物电泳检测后回收,pKC1132载体片段和rox-right片段分别取1.5μL和3.5μL,与15μL的Gibson组装反应液混匀,PCR仪50℃反应1h,然后取10μL转化E.coli TOP10。随机挑选转化平板上长出的单克隆进行菌落PCR验证(使用天根生物2×Taq PCR MasterMix,条件同说明书),验证引物为R-u-F/R-u-R、R-d-F/R-d-R,验证正确的转化子进一步测序验证,从而筛选得到pKC1132-R。
所述的引物序列为:
R-u-F:GTACATCACCGACGAGCAAGG
R-u-R:CTGAGCAACAGCCAGATCGC
R-d-F:ACCTCAACACCGCGGTCATC
R-d-R:CAATACGCAAACCGCCTCTC
(6)pKC1132-R转化E.coli ETZ,然后E.coli ETZ(pKC1132-R)与S.rimosus 461-L进行属间接合转移实验,筛选pKC1132-R整合到基因组上的单交换菌株S.rimosus 461-L-KR菌株;
经过接合转移和传代实验后(MS平板,Am浓度200μg/mL),得到单克隆菌株,pKC1132-R没有链霉菌复制原点,作为自杀载体在链霉菌中不能自主复制,只有整合到基因组上跟随链霉菌基因组复制,所以通过安普霉素抗性筛选得到的菌株,应该为pKC1132-R通过单交换整合到了S.rimosus 461基因组上。使用R-u-F/R-u-R、R-d-F/R-d-R和L-dre-2-F/L-dre-2-R引物进行PCR验证(使用天根生物2×Taq PCR MasterMix,条件同说明书),进一步筛选得到S.rimosus 461-L-KR。
(7)E.coli ETZ(pUWLDRE)与S.rimosus 461-L-KR进行属间接合转移实验,筛选pKC1132-R质粒骨架环出的菌株,并通过传代培养,丢失pUWLDRE质粒,从而得到otc genecluster删除菌株S.rimosus SR0。
接合转移平板长出的菌落传代培养后接Am抗性平板和无抗平板进行影印筛选,挑选Am敏感的菌株接MS平板,37℃培养,丢失pUWLDRE质粒。菌落传代培养后接Tsr抗性平板和无抗平板进行影印筛选,挑选Tsr敏感的菌株使用L-dre-2-F/R-u-R进行PCR(681bp)验证(使用天根生物2×Taq PCR MasterMix,条件同说明书),结果如图2所示。从而得到otc敲除菌株,该菌株含有一个“疤痕”,即rox位点,将PCR产物(681bp)回收测序,结果表明,底盘菌株oxyDM构建成功,基因组上含有一个rox位点,序列如SEQ ID No.8中第409-440位所示。
(8)SR0菌株生产OTC分析
将SR0与S.rimosus 461接MS平板,孢子成熟后铲取约2cm2菌丝块接种至种瓶培养基:淀粉3%,黄豆饼粉0.3%,硫酸铵0.4%,碳酸钙0.5%,玉米浆0.4%,氯化钠0.5%,磷酸二氢钾0.015%,培养基灭菌条件:121℃,1.01×105Pa灭菌30min。30℃,220r/min培养26h,然后以5%接种量接种至发酵培养基:淀粉15%,黄豆饼粉2%,硫酸铵1.4%,碳酸钙1.4%,氯化钠0.4%;玉米浆0.4%,磷酸二氢钾0.01%,氯化钴0.001%,淀粉酶0.015%,培养基灭菌条件:121℃,1.01×105Pa灭菌30min。30℃,220r/min培养5d。取5mL发酵液,加9mol/L盐酸溶液酸化至pH1.5~1.7(酸化时不停涡旋振荡混匀),室温放置5min;12000rpm,室温离心5min;0.22μm滤器过滤后,取20μl上清进行HPLC检测分析(日本岛津,LC-20AT)检测土霉素。色谱柱选择Diamonsil C18反相柱(250×4.6mm),选择单相泵,流动相组成为60%去离子水,10%甲醇,20%乙腈和10%磷酸(2mM),流速为1.0mL/min,检测波长为350nm,结果如图3所示,SR0菌株删除otc成功,该菌株不再产生土霉素。
实施例2:金霉素基因簇在SR0中异源表达
将含有金霉素合成基因簇(ctc)的载体pSET153-ctc,如图4所示,转入E.coli ETZ(Am 50μg/mL、Km 50μg/mL、Cm 25μg/mL)中,然后E.coli ETZ(pSET153-ctc)与S.rimosusSR0菌株进行属间接合转移实验,方法同实施例1。经过接合转移和传代实验后得到单克隆菌株,使用Test-F2/Test-R2引物进行PCR验证(使用天根生物2×Taq PCR MasterMix,条件同说明书),筛选得到SRC0菌株。
所述的引物序列为:
Test-F2:GGCTTGAAGGGAAGGTGTTTGTGC
Test-R2:CCCAGGAGGACGACCTCCAGGTTGG
将SR0与SRC0菌株接MS平板,孢子成熟后铲取约2cm2菌丝块接种至种瓶培养基:淀粉3%,黄豆饼粉0.3%,硫酸铵0.4%,碳酸钙0.5%,玉米浆0.4%,氯化钠0.5%,磷酸二氢钾0.015%,培养基灭菌条件:121℃,1.01×105Pa灭菌30min。30℃,220r/min培养26h,然后以5%接种量接种至发酵培养基:淀粉15%,黄豆饼粉2%,硫酸铵1.4%,碳酸钙1.4%,氯化钠0.4%;玉米浆0.4%,磷酸二氢钾0.01%,氯化钴0.001%,淀粉酶0.015%,培养基灭菌条件:121℃,1.01×105Pa灭菌30min。30℃,220r/min培养5d。取5mL发酵液,使用草酸酸化至pH1.2~1.4(酸化时不停涡旋振荡混匀),室温放置5min;12000rpm,室温离心5min;0.22μm滤器过滤后,取20μL上清进行HPLC检测分析金霉素(Waters e2695HPLC系统)。色谱柱选择ZORBAX SB-C18柱(250×4.6mm),流动相组成为80%草酸溶液(0.1M,pH 2.2)和20%N,N-甲基甲酰胺,流速为1.0mL/min,检测波长为335nm。结果如图5所示,SRC0菌株发酵液HPLC未能检测到金霉素,提取SRC0菌株发酵液的RNA(全式金试剂盒TransZol Up Plus RNA Kit),然后反转录合成cDNA(康为试剂盒HiFiScript gDNA Removal cDNA Synthesis Kit)进行半定量PCR(使用天根生物2×Taq PCRMasterMix,条件同说明书),分析金霉素合成基因簇相关基因,使用引物如表1所示,结果如图6a所示,ctcB、ctcW、ctcH、ctcG、ctcM等基因扩增产物均未有明显条带,说明金霉素生物合成基因簇没有激活或表达很低。
表1:荧光定量PCR使用引物
为了激活金霉素合成基因簇,构建ctcB表达载体pSOK616-PermE*-ctcB,载体构建方法为:以ctcB-s/ctcB-a为引物,以金色链霉菌(Streptomyces aureofaciens)基因组为模板,扩增ctcB基因,866bp;回收产物和质粒pSOK616-EotcR用NdeⅠ+SpeⅠ双酶切,6442bp;然后将两片段进行连接,构建pSOK616-PermE*-ctcB。
所述的引物序列为:
ctcB-s:ATACATATGGAGGGAAATCCGAGCGACATCGG(NdeⅠ)
ctcB-a:ATTACTAGTGACGGGCCTCAGGCCGAACGG(SpeⅠ)
PCR扩增体系为:
PCR扩增条件为:
PCR产物电泳检测后回收,连同质粒pSOK616-EotcR用NdeⅠ+SpeⅠ双酶切,然后回收,两片段分别取5μL和12μL,在20μL体系中使用T4 DNA ligase 16℃反应过夜,然后取10μL转化E.coli DH5α。随机挑选转化子进行BamHⅠ+XhoⅠ双酶切和EcoRⅠ单酶切验证,验证正确的转化子进一步测序验证,从而筛选得到pSOK616-PermE*-ctcB,如图7所示。
将pSOK616-PermE*-ctcB转入E.coli ETZ中,然后E.coli ETZ(pSOK616-PermE*-ctcB)与SRC0菌株进行属间接合转移实验,方法同实施例1。经过接合转移和传代实验后得到单克隆菌株,使用616-seq-F/616-seq-R引物进行PCR验证(使用天根生物2×TaqPCRMasterMix,条件同说明书),筛选得到SRC1菌株。
所述的引物序列为:
616-seq-F:CTTCGGTGAACTTCGGGTACGC
616-seq-R:GAATAGCCTCTCCACCCAAGC
将SRC1菌株接发酵培养,使用HPLC方法检测金霉素生产情况,方法同上,结果如图5所示,SRC1菌株能够产生金霉素,即通过在底盘菌株SR0中共表达金霉素合成基因簇(ctc)载体pSET153-ctc和ctcB基因表达载体pSOK616-PermE*-ctcB,金霉素异源表达成功,金霉素产量如图8所示,9天达到1.51g/L,为了进一步证实金霉素生物合成基因簇被成功激活,提取RNA进行了半定量PCR(方法同上)和qRT-PCR(使用诺唯赞试剂盒ChamQ UniversalSYBR qPCR Master Mix进行,体系按说明书进行,条件:95℃,30s;95℃,30s,68℃,30s,72℃,30s,40个循环;溶解曲线使用仪器默认程序),使用引物如表1所示,结果如图6所示,结果表明金霉素生物合成基因簇被成功激活。
实施例3:通过增强ctcB基因表达提高金霉素产量
为了增强ctcB基因表达,提高金霉素产量,在pSOK616-PermE*-ctcB载体基础上,更换PermE*启动子为更强的启动子Psf14和PkasO*,构建pSOK616-Psf14-ctcB和pSOK616-PkasO*-ctcB。
载体构建过程:质粒pSOK616-PermE*-ctcB,采用HindⅢ和NdeⅠ双酶切,回收7172bp片段;
以Psf14-s/Psf14-a为引物,pSOK616为模板,扩增Psf14启动子序列,121bp;PkasO*-s/PkasO*-a为引物,pDR4-K*为模板,扩增PkasO*启动子序列,127bp;
PCR扩增体系为:
PCR扩增条件为:
pSOK616-PermE*-ctcB/HindⅢ+NdeⅠ片段与Psf14、PkasO启动子片段分别进行两片段Gibson组装,组装液取10μL转化E.coliDH5α。转化平板上长出的单克隆提质粒,使用616-ce引物测序,经过测序验证,分别筛选得到pSOK616-Psf14-ctcB和pSOK616-PkasO*-ctcB,如图7所示。
所述616-ce序列为:ACCACGGAACAGGGTGAGCAG
将pSOK616-Psf14-ctcB和pSOK616-PkasO*-ctcB分别转入E.coli ETZ中,然后与SRC0菌株进行属间接合转移实验,方法同实施例1。经过接合转移和传代实验后得到单克隆菌株,使用vwb-t3-s/vwb-t3-a引物进行PCR验证(使用天根生物2×Taq PCR MasterMix,条件同说明书),筛选得到SRC2菌株和SRC3菌株。
所述的引物序列为:
vwb-t3-s:AGCGTTCGAACACCCTCGGT
vwb-t3-a:AAGCCTGCGCCGAAGAGCAA
将SRC2菌株和SRC3菌株接发酵培养,使用HPLC方法检测金霉素生产情况,方法同实施例2。结果如图5所示,SRC2菌株和SRC3菌株均能产生金霉素。金霉素产量如图8所示,9天分别达到2.15g/L和3.27g/L。qRT-PCR(方法同实施例2)结果如图6所示,结果表明:随着启动子强度增强,金霉素生物合成基因簇转录依次增强,合成金霉素产量也依次增高。同时采用二苯胺测定DNA方法进行了生物量的测定(Zhao Y,Xiang S,Dai X,Yang K(2013)Asimplified diphenylamine colorimetric method for growthquantification.Applied microbiology and biotechnology 97(11):5069-77),结果如图9所示,改造菌株生长趋势基本一致,证明金霉素产量的提高是由于ctcB表达增强所致。
实施例4:通过增强宿主的金霉素耐受性提高金霉素产量
SRC0菌株、SRC3菌株和金霉素生产菌株S.aureofaciens 10接MS固体平板,孢子成熟后,收取并测定孢子悬液吸光度,根据吸光值对不同菌株的孢子悬液浓度进行归一,将归一后的孢子悬液进行梯度稀释。配制5mg/mL的金霉素母液,过滤除菌,加入到预热好的固体MS平板中,配成终浓度分别为0ug/mL、25μg/mL、50μg/mL、75μg/mL、100μg/mL、125μg/mL、150μg/mL、175μg/mL、200μg/mL、225μg/mL的平板。取5μL不同稀释度的孢子悬液点接到含有不同抗生素浓度的固体平板中,37℃静置培养3-5天后观察各菌株不同稀释梯度菌落的生长状况,确定不同菌株对金霉素的耐受性(Luo S,Chen XA,Mao XM,Li YQ(2018)Transposon-based identification of a negative regulator for the antibiotic hyper-production in Streptomyces.Applied microbiology and biotechnology 102(15):6581-6592;Yin S,Li Z,Wang X,Wang H,Jia X,Ai G,Bai Z,Shi M,Yuan F,Liu T,WangW,Yang K(2016)Heterologous expression of oxytetracycline biosynthetic genecluster in Streptomyces venezuelae WVR2006 to improve production level and toalter fermentation process.Applied microbiology and biotechnology 100(24):10563-10572)。结果如图10所示,SRC0菌株金霉素最低抑菌浓度为25μg/mL左右,SRC3菌株金霉素最低抑菌浓度为50μg/mL左右,而金霉素生产菌株S.aureofaciens 10最低抑菌浓度为225μg/mL左右,异源底盘宿主的金霉素耐受性明显低于金霉素生产菌株S.aureofaciens10,表明金霉素耐受性较低可能是产量的限制因素。
为了提高宿主的金霉素耐受性,使用金霉素抗性基因ctcR和ctcC,构建融合表达载体pSOK616-ctcB-ctcR-ctcC-1,构建方法为:以ctcR-s1/ctcR-a为引物,pSET153-ctc为模板,扩增ctcR1片段(1664bp),回收作为模板,以ctcR-s2和ctcR-a为引物,扩增ctcR2片段(1717bp);以ctcC-s和ctcC-a1为引物,pSET153-ctc为模板进行PCR,扩增ctcC片段(2107bp);片段ctcR2和ctcC为模板,ctcR-s和ctcC-a2为引物进行融合PCR,扩增ctcR-ctcC融合片段(3783bp)。
PCR扩增体系为:
PCR扩增条件为:
扩增ctcR1片段、ctcR2片段、ctcC片段,延伸1min20s,扩增ctcR-ctcC融合片段,延伸2min40s,PCR产物回收后电泳检测,pSOK616-PkasO*-ctcB用HindⅢ酶切(7276bp),去磷酸化,回收;ctcR-ctcC融合片段用HindⅢ酶切,回收,pSOK616-PkasO*-ctcB/HindⅢ片段和ctcR-ctcC融合产物/HindⅢ分别取3μL和14μL,在20μL体系中使用T4 DNA ligase 16℃反应过夜,然后取10μL转化E.coli DH5α。随机挑选转化子进行HindⅢ和NdeⅠ酶切验证,验证正确的转化子使用引物RC-u、RC-d、u-1、u-2、u-3、u-4测序验证,从而筛选得到pSOK616-ctcB-ctcR-ctcC-1载体,如图7所示。所述引物序列为:
RC-u:CGCTCTTCGGTGAACTTCGG
RC-d:CCAGCGGACCCAGAATGTTG
u-1:TGGTGCCGCTGCTGATCGTG
u-2:TTCATGTCGGTGCTGTTCGG
u-3:AGCTCTACCCGGTGCTCTTC
u-4:TGCCGCACGCCTTCCACAAG
将pSOK616-ctcB-ctcR-ctcC-1转入E.coli ETZ中,然后与SRC0菌株进行属间接合转移实验,方法同实施例1。经过接合转移和传代实验后得到单克隆菌株,使用vwb-t3-s/vwb-t3-a引物进行PCR验证(使用天根生物2×Taq PCR MasterMix,条件同说明书),筛选得到SRC4菌株。
将SRC4菌株接发酵培养,使用HPLC方法检测金霉素生产情况,方法同实施例2。结果如图5所示,SRC4菌株能够产生金霉素。金霉素产量如图8所示,9天达到3.80g/L。qRT-PCR(方法同实施例2)结果如图6所示,结果表明:抗性基因ctcR、ctcC和相关生物合成基因转录均增强。采用二苯胺测定DNA方法进行了生物量的测定,结果如图9所示,改造菌株生长趋势基本一致,证明金霉素产量的提高是由于ctcR、ctcC表达增强所致。同时金霉素耐受性,如图10所示,提高到100μg/mL左右。
尽管上述实施例对本发明进行了详细的说明,对于本领域的技术人员来说,依然可以对所述的实施例中的技术方案进行修改、替换、组合或简化,而这些在未背离本发明精神实质与原理下所做的改变均应视为等效的置换方式,都包含在本发明的保护范围之内。
序列表
<110> 河北圣雪大成制药有限责任公司
中国科学院微生物研究所
<120> 链霉菌底盘菌株及其构建方法、在异源表达研究中的应用
<160> 8
<170> SIPOSequenceListing 1.0
<210> 1
<211> 810
<212> DNA
<213> 金色链霉菌(Streptomyces aureofaciens)
<400> 1
gtgaagttca acattctggg tccgctggaa gtcctcgaca agggaattcc gtgcaccccg 60
agcgcgctga aggtccgctg gacgctggcg gtcctgctca tgaacgcgaa ccggatcgtg 120
gacctcggcc tcatcatcga ggagatctgg ggcagcagcc cgccacgcac ggtggtcacc 180
accgcgcaga cgtacatcta ccaactgcgc aagctctgcc gtccgctggg ccgcgaggtc 240
atcctcacca aggcccccgg ctacgtgctg ctgctggggg aggaggagct ggacgcccag 300
gagttcgagc ggctgcacca cgagggggac cgactgctgg tcgccggcca ccccgaggcg 360
gccgcccagc ggctgcggca ggcgctggac ctgtggcggg gcaccgccct ggcggacatc 420
ccggtgggtg ctccgctcgc cggtcacgtc gccgtcctgg aggagatgcg cctgcgcgcc 480
ctggagcacc gcatcctggc cgaccggcag ctcgggcgac accgggaact catccccgaa 540
ctgagactgt tgaccctgca ccagccgatg aacgagtggt accacgagca gctcatgctc 600
gccctggacg ccgccgggcg gcggagcgag gccctgcacg tctaccgcgt gctctaccgc 660
cgactcgacg aggacctcgg catcgccccc tcccgaccgc tgcaggagct gcacaacgac 720
ctgctcagcg gcacgtcgcc cactcggcag gagttccagg cgcttgccgc gcgggcgatg 780
gagcagggcc tgcgggcccg ttcggcctga 810
<210> 2
<211> 31565
<212> DNA
<213> 金色链霉菌(Streptomyces aureofaciens)
<400> 2
gcatggctgc tttccccggc cggccagagg cctcacgcca gttcacgggc gtggccgcac 60
cggcccgtgc cgcggccgcc cgatcggccg acggctccag gacagcccgg gccgtcccgg 120
cccccgcggc acggcccacc ccgcagcgac cccggcccgg ccgctccacg gcccggtccc 180
ggcccgcaca ccctccgggc cccactccga agaatcggtt ctcttgggcc cgccaccggg 240
cccggggcgt ccaccgcacc gcccgccgcg gccagcccgg atcgctccac tcatcggtca 300
ctcgcgcctg tcgccatcgg gggtcaaccg tgtcagtcgg caacaaccat ccgtcggttc 360
tcgtcgtcga ggacaacgtc ctgctgcgca cgggcctgca ggccctgctg tcggccgagc 420
ccgacctcgt cctccgcgcc gccgtcggcg gcgtggacga agcactcgcc gtcatggccg 480
ggcaccccgt ggacgtcgtg gtgtacggag cgggcgagtc ggtggccgac accgagcggg 540
gcctcgagcg cctgctcgac cggggcaccc gggtggtcgt actgagccgg cgggaccacc 600
ccggcgagat ggagacgtac ctcagcagcg gtgtgcacgc ctacctggcc gaggacgcgg 660
ccggggagtg cctcggcttg gtgatccggg gcctgacctc ggaccgggag cgggtctaca 720
tcatggcctc gcgctccggc ctcgactgga tggccggcca gcgcggcaac cgcctgtccg 780
gacgcgagcg ggaggtcatg ggcctggtcg cgaacgggct gagcaactcg gccatcgcgg 840
gccggctctg catctcgccc ggcaccgtca agcgccatct ccggaacgtg ttcgtcaagc 900
tcaacgccgt ctcccggatc gacgccgtga acaaggcccg ggccgcttcc atgctggtcc 960
cggccggccg ggcctgagcc ccgcggaccg gtccggcgcg gatccgtccg cggtgaccgg 1020
tccggcgcgg acccctgcgg ggacgacggc cccggcaggg agcggagcag ggctcggccg 1080
ggacgggcct caggccgaac gggcccgcag gccctgctcc atcgcccgcg cggcaagcgc 1140
ctggaactcc tgccgagtgg gcgacgtgcc gctgagcagg tcgttgtgca gctcctgcag 1200
cggtcgggag ggggcgatgc cgaggtcctc gtcgagtcgg cggtagagca cgcggtagac 1260
gtgcagggcc tcgctccgcc gcccggcggc gtccagggcg agcatgagct gctcgtggta 1320
ccactcgttc atcggctggt gcagggtcaa cagtctcagt tcggggatga gttcccggtg 1380
tcgcccgagc tgccggtcgg ccaggatgcg gtgctccagg gcgcgcaggc gcatctcctc 1440
caggacggcg acgtgaccgg cgagcggagc acccaccggg atgtccgcca gggcggtgcc 1500
ccgccacagg tccagcgcct gccgcagccg ctgggcggcc gcctcggggt ggccggcgac 1560
cagcagtcgg tccccctcgt ggtgcagccg ctcgaactcc tgggcgtcca gctcctcctc 1620
ccccagcagc agcacgtagc cgggggcctt ggtgaggatg acctcgcggc ccagcggacg 1680
gcagagcttg cgcagttggt agatgtacgt ctgcgcggtg gtgaccaccg tgcgtggcgg 1740
gctgctgccc cagatctcct cgatgatgag gccgaggtcc acgatccggt tcgcgttcat 1800
gagcaggacc gccagcgtcc agcggacctt cagcgcgctc ggggtgcacg gaattccctt 1860
gtcgaggact tccagcggac ccagaatgtt gaacttcacc atgcctccga tgtcgctcgg 1920
atttccctcg gccccaggta tatccgggtc cgcggacggg cctcaagagg aatccgcaca 1980
aggtggcagg cgcgcaattc caaggtggca ccgacgcatt tccagagcgg tccggctccc 2040
tgtcccgagg gaaacacccc cgccgaccga cccccgccga tcggctggcg gatcgacaag 2100
tcctgttagg ctgggggcgg ttggccccat gggccggcac cggtcacctg atacccgcga 2160
gacagagcca cgaggagaag gacgtgcccc gaaagatccg tgttgctccg gtaatccgta 2220
cgaagaccgc agaactaggg gacacacgtc ttgacaaccg tgaacatcgg aatcctggcc 2280
catgtcgacg ccggtaagac cagcctgacc gagcggctgc tgcacaccgc cggcgtcatc 2340
gaccgggtcg gcagcgtcga ccgcggcgac acccagaccg actcgcacga actcgagcgc 2400
cagcgcggca tcaccatccg gtccgcggtg gtgtccttca ccgtgggcga cgtcaaggtc 2460
aacctcatcg acacccccgg ccacccggac ttcatctccg aggtggaacg ggccctcggc 2520
gtgctcgacg gcgtggtgct ggtcatctcc gccgtggagg gcgtgcaggc ccagacccgg 2580
ctgctgatgc gcacgctggt gaaactgcgc atgccggtca tcctcttcgt caacaagatc 2640
gacaggatgg gcgcgcgcta ccacgagctc ctggacgaga tccgctccga gctcaccccg 2700
gccgtcgtcg ccctgacccg ggtcgaaggg ccgggcaccc ccggagcacg ggcgttcgcc 2760
cggaccgtcg ggaccgacga ccccgacttc gccgccgaac tggccgacat cctggccgag 2820
cacggcgacg acttcctggc ccgctacctc gaggacgaga cctccctgac cgcgcaggac 2880
tacagcgcgg aactcgcccg ccaggcggcc cggggccagc tctacccggt gctcttcggc 2940
tcggccgtgg ccggcgtcgg catcgatgcc ctggtcgacg ggatcaccag gctgtttccg 3000
gtcaatcacg gcggctccgg gggcaccctc cgcggtaccg tgttcaagat cgagcgcggg 3060
tgggcgggcg agaaggtcgc ctacgtccgg ttgcacgggg gcgagctcgg gtcgcgggag 3120
aaggtgtccg tgttccggcg cgaccagcac ggagccgtca ccgagattcc cggccgcacc 3180
acggtggtcg aggtgttcga ccggggctcg gccgtcgtcg agtcgcgggc ccgggccggg 3240
gacatcgcca aggtctgggg gctcaagggc atccggatcg gcgaccggct cggttcggcc 3300
gaggggctgg acggggagca cctgttcgcg ccgccgagcc tggagaccgt gatccgaccc 3360
tcccggccca gcgcgatgcc cgaactgtac gacgcgctgc tgcagttggc cgaccaggac 3420
ccgttcatca acgtccgcaa ggacgacgag gagcaggaga tcgccgtctc gctctacggt 3480
gaggtgcaga aggaggtcat cgcggccacc ctcgccgacg agttcaagct ggacgtggcc 3540
ttcgagggca cccggatcat ctgtgtcgag cgcccgatcg gggtcggcga gtcggtggag 3600
gagatcgact accggagcaa gaccttcttc tgggccacga tcggcctgcg ggtggaaccc 3660
ggggagccgg gatcaggggt cgtgttccgc cgctcggtgg agctcggctc gctgccgcac 3720
gccttccaca aggccgtcga ggaggccgtg cgggccaccc tgcagcaggg gctgaacggc 3780
tgggaggtgc tggacatcct ggtgaccctc acccgttccg ggttcgccag cccggtgagc 3840
gcggcgggcg acttccgcaa gctcacgccg ctcgtgctga tgaacgcgct caagcaggcg 3900
ggaacgcagg tgtacgaacc ggtcaaccgc ttcgagctgg aggtgccggg tgagaacgcc 3960
agcgccgccc tgctgagcct ggtggagtgc ggcgccaccc cggagagcac ccggggcctg 4020
ggcagcagct gcctggtgga ggggacgatc ccggcccgca cggtgcagga gttcgagcag 4080
cggctgccgg gcctgagcca gggccagggc gtgctggtca cccggttcca cagcttccag 4140
ccggtggtcg gggcggcgcc gaggcggcgg cggaccgacc tcaacccggt ggaccgctcg 4200
gagtacatgc tgcgggcctt cggccggatc tgacggggcg tcgtgaacgc tgagggcccg 4260
accaccgtga cggtggccgg gccctcagcc gtggcgcact ccgtcctcag tcgagcagcg 4320
ccaccgctcg cgtccaaccc gcccccgccc cggcgatctt gaccgggaac gcctgcacgg 4380
tgaacccggt cggcgcgggc agtgcgccca gattgctcag acgctcgatc tggcagtact 4440
cccgctgccg gcccgcgaag tgcgcgggcc acagcacgga acggtcgcgg gtgcgctgga 4500
actcggcgag catgtgcgtg aacggagcgt ccagcccgaa ggcgtccgtc ccgatgagcc 4560
gcacgccgag atcgagcaga aggttcgtcg ccgccccgtc caggcccgcg aaccgggtga 4620
agtactcggg agtcccggcg agtcgttcgg caccggtgtg cagcagcacg atctccccgg 4680
cgctcggccg gtggtcgatc tcgtcgaagg cgcgccgcag ccggtccacg ccgaccgtcc 4740
cgaccccgca gtcggtgagg tccagccgga cgcccggccc gatgaaccat tccagcggca 4800
actcgtcgat gtggcgcggc actccgtagg cggccctgct gccgtagtgg gagggtgcgt 4860
cgacgtgcgt gccggtgtgg gtggtcaggg tcagggtgtc cagcgagagc agttccccgt 4920
ccggcaggtc cgcgacgtcg aactcgaggc cgtggtcacg gagcatgccc tcggccatgt 4980
ggcgcgcgcc gtcggccggc gtcagcacct cgtggcggat gccgtccacc tcccaggcgt 5040
tggcgtcgat cgtcgaggag aggtcaatga ggcgcatgcg cggccccttc cggcagcaga 5100
gcgcagtccc gcaggacgtc gaggcagcgc tccggccccc gatcccgcgc ggcgaggtgg 5160
ccgtccggcc ggatcagcag gaactcccct ggtgccaggc cgagttcgcg gcgcagcaca 5220
cccccggggt cgggcagctc gcccggggct ccggggtcgg cgacggtacg gacggagacg 5280
gcggagccga acagccgctc cacccgggcg agcgcctccc ggtacccggt gctcccgccc 5340
tcggccgggg tggcgagcag ggtccagcgg gggtcggcga gttcggcgca gagcgcggac 5400
cagccggggt gcccggcggc cgtccgggcg tcgcagccca cccggtcccc gggcgagggc 5460
cgcccggcgc gcgagccggc cgggcgggtg agcgggctgt ccgggtaggc gagggccagt 5520
ccgcagaagc cccggatcat ccggccctcg accttgcgcc gcagcggcgt gatccggcgc 5580
agcgccgcgg tgcccacggt cagcagggcc ggggccagcg cggtgcgcag cgacaccagg 5640
gcggtggccg tgcgggtgga gcgcagcagc acggccccgg tcgggactcg ctcggcgtcg 5700
tagctgtcca gcagggcggg cccggcgtgg ccgcggatca cgtcggcgag cttccaggcg 5760
aggttgtagg cgtcctggat accgctgttc atgccctgcc cggaggccgg gctgtggacg 5820
tgggcggcat ccccggcgag gaagcagcgg ccctcgcgca tccgggtgat ctggcgttgc 5880
tggacggtga agacggagag ccaggtcggg gtgccgacct ggacggggcg cccgagcgcc 5940
cggccgatct tgtcggccag gcggcggcgg accagctcgc ggtcctcggc gccgtcggtg 6000
tccaccgtgt ccaccacgcg ccacttgccg ggctcgggga acgggacgag cagcagggtg 6060
ccgggctcgg tgtgcagcag gtggttgctg tccggcggga ggtcggcgtc gagggtgacg 6120
tcggcgttga gccagacctc ggtggagtcg ccgatcaggc gcatcccgag ctgcttgcgc 6180
acggtgctgc ggccgccgtc ggcgccgacc agccagggca cccgggtctc ctcggtgcgc 6240
ccgtcggcgt ggcggagggt gacgagcacg gagtcgggcc cggtctgcag cgcggtgagt 6300
tcgacgcccc attccacggg gacgccgagt tcggcggtgc gctcgcgcag cacctgctcg 6360
gtgaccactt gatcgaccat caggctgaac gggtaacggg tcggaagtga gcggtagttg 6420
gtgtcgaagc ggatgagggt gcggccccgg cggtgcatgg tgaagtgggt gacccgccgg 6480
ccgagcggca gcagccggtc gagggcgccc atctgctcga gcacctccat ggtccgggcg 6540
tgcaccgcca gggcccggct gctggtggcc gggccgggcg cggcgtcgac cagccggacg 6600
ggtacgccgc gcctggcgag ttcgtgggcc gtggtgaggc cgaccgggcc ggcccccgcg 6660
atcaggacgg ccggagcggg gtcagccacg gcgttcctcg gcgaagcgct tggccaggcc 6720
gagcgtggcg cggctgttgc cgccggcggc ctcgcggatg aagcggcggg cggtggcggc 6780
ggtggcgtcc gggccgagga cggtggggac cgcctcgggg ttgaggacga cggcgtgcca 6840
ggaggtgacc cgcactccgc ggtcggtcgg ctcgacggtc cagcggccgg tgtgggcggc 6900
catcatggag ggggtgcgca gctgcttgta ggcgatgccg gactccggga agcagatccg 6960
gatggactcg gtggtgtgtt cggagccgtc ggcggtgcgg gtgtccatgg acatgtgctg 7020
gatgccgccg gcctcctcgc gcaggtcgag gcgggcgacg tggggcagcc gggcgggcca 7080
ggcggcggcg tcccgcagga agtcgtagac ggcctccggg gcggcgtcga ccagcaccga 7140
gtcctcgaac tcgaactcga actcggcgag ccggttccag cgttcggcga ggtccttgat 7200
gccggcgagt tcgctgcggc tgttgcggtc cgtcgcctcg ctgatccagc gcaggccctg 7260
cgggtcgtcg tcgagcgcgc tgaactcgtg ggtgagggtg agggtggtgc cgccggggcg 7320
ctcggcgacc tgccactccc ccgccatcga ggagaccggg gccgaggagg cctcctggcg 7380
gaaacggatc cggcgcaggt cggcgtccag gtcgcggcgg gacgtccagt gcttgacctc 7440
gccgttggcc cgggcccaga tcttcaggcg ctcggcgccc ggccccagct cctcgcgctc 7500
gacgtggagg gtgggggcga agcgccgcgg ccaggccagg gcgtcggcga tgacggtgta 7560
gacgacctcg gcgggggcgt cgacgtcgat cgagtgggtg gtgtgctgga tggtgctcat 7620
gggtgggacc ggccctttcc gtcggcgggg tgaagctcgg cggggtgaag ttcggcgggg 7680
tgaagttcgg cggggtgcgt ggggtgcggc tcagtagatg ccgaggccac cgcagacgtt 7740
gatcgcctgc gcggtgaccg acgcggcgtc gggggtggtc aggtagtcga ccatgccggc 7800
gacctcctcc gcggtggagt agcggccgag cgggatcttc tgctcgaagc gtgagagcac 7860
gtcctcctcg gtggtcgccc aggtcgcggc gtacgcctgg cggacccgca cggccatcgg 7920
cgtctcgacg tagccggggc agacggcgtt gaccgtggta ccggtgtggg cgagctcctt 7980
ggccagcgcc ttggtgaagc cgatgacgcc ggccttggag gccgagtagg gggcgcccag 8040
cgggacaccc tgcttgccgc cggtggaggc gacgctgatg atccgcccgt gcccggccgc 8100
ctccatgccg ccggtggtga ggacctcgcg ggtgacgcgg aagacgctgg tgaggttggt 8160
gtcgatcacg tcctgccaca gctcgtcggt gagggtggag gtgacgccac cgccgttgcg 8220
tccggcgttg ttgaccagca cgccgatcgg gccgaagcgg tccaccgccg cccggacgac 8280
cgtgctcacg tcctgcgcgg agcggacgtc ggccgcgagg ccgtccacct ccaggccctc 8340
gccgcgcagg cgggcgaccg tctcggcgac gccctgcgcg gtgcgggcgc agatgaagac 8400
actcagcccg cgccgggcca gccgctcggc gctggccagt ccgatgccgc tggtcgcccc 8460
ggtcaccagg gcgacgtcgc cggtcgtcac ggtgctcatc gcatcgatct cctgtctcgc 8520
tcacgggtcg cgggcccggg cgggcccgcc ggtcggggcc cgcccccgcg ccccgtcggg 8580
aacccggggg gacaggcccc gggccgaccc tgcccggacg gcttcgactg cggttcgagc 8640
gcgcctcaca cgccgaccgc tccaacggga ttcgaagcgc gggtgggagc gtcggcgctg 8700
cccaaccacc gacgcaacga ggaggcccgg agcatgaccg gttcgctcta cgaggaggtc 8760
cagcacttct acgggcggca gatgcgccac ctggacgagg gtgaggtcac cgagtgggcc 8820
gcgaccttca ccgaggacgg cgtgttcgcc gccaacgccc gcccgcaccc gcaggagggt 8880
cgcgcggcga tcgagcaggg cgcccgggag gccgcccagc gcctggccga tgccggaatc 8940
cggcaccggc actggctggg gatgctggag gtcgccgcgc agccggacgg cctggtgctc 9000
gccaagacct acgcgctgat cgtcgcgacg cccaagggcg ggccggccgc cgtgcacctg 9060
agctgcagct gtgaggacca gctggtgcgc gtcgacggcg agttgaaggt ccggcaccgc 9120
caggtgcacc gggacgacct gcccgcctga gaggaggcca ccgtggacct cccacgggac 9180
agtacgacct tcggtccgcc gctggacgtg gtggcggagc tgatcggcgg gccccggatc 9240
gacgacctcg tccgccgtgc ggccgagctg acgcctcgtc atattgcttt ggtgcacggt 9300
gacctggtgc tcgaccacgc cgcgctggag gcccgggtga gcgactgcgc cgaggcgctg 9360
cgcgccgcgt tcggcggtcc cggcacggtc atcgcgatcg ccgccgagct gaccgtcgac 9420
ttcgccgtca ccttcctggg catctcccgc tccgggaaca ccagcgccat gttcaacccg 9480
ctcgtcccgg acgacaccct ggtgcacgtc ctgaactcct gcggcgcccg ggcggccgtg 9540
ctgtcgcccc ggatgcaccg ccgtgtccag gccctgcggg accggctgcc gctgctgcgg 9600
caactggtgg tgaccgccga cgcgctcgac ggcacgcccg tcctggacgc cctggagcgc 9660
accgccgtcc cggccggcga ggtggtggag accgcctgcc tgcagttcac cagcggcacc 9720
accggcgtgc cgaagaccgt ccggctcagc caccgcaacc tgctggtgaa cgcggcgcag 9780
tcggcgcacg cccaccggct gacggccgac gccgtctcgc tcaacaacct gccctccttc 9840
cacctgatgc acctgaacgc cgcgctcgcg gtcggcgcga cgcacgtgct ctgcccggag 9900
gaggaccgcg cggcgctggt gggactggcc cgtacctggc gggcctcgca cctgtacagc 9960
ctgccggtgc ggttgtcccg gctcgccggg gacgagcggc tgcccgactt ccgcatcccc 10020
tcgctacggg cggtgctgtc cggtggatcg gcgctgccgc cccggacgac gaccgtcctg 10080
caggagcact tcggggtgcc ggtcgtccag ggctacggcc tcgccgagac gtccccgtcg 10140
acgcacttcg acctgcccga ggggcccacc ctcggctcca gtgggccccc ggtcgccggg 10200
acggcctgcc ggatcgtgga cgtccgcacc ggcgcggtgc tgccggtggg cgagcgcggt 10260
gagatccagg tccggggccc gcagctgatg ctgggctacc tgggcgacgg gcccaccgac 10320
gccgtcgacg cggacggctg gttccgcacc ggtgacgtcg gccggatcga cgaggccggc 10380
cgcctgttcg tcgtcgaccg gatcaaggac gtcttcaagt gcgacaactg gctggtgtcg 10440
ccgaccgaga tcgagcgggt gctgatgcgg cacccggccg tcgccgactg cgtggtcttc 10500
gaccagcccg acgaactgag cggcgccgtc gccgtcggcc tcgtcgtgcc gcgcggcgag 10560
ggcgtcgacc cggccgccct ggccgcgttc gcgaacgccc ggctccccta ctacgagcac 10620
ctgaggcagc tgcgcctggt ggagggcatc ccgcgctccg ccacgggcaa ggtccagcgg 10680
cgcgaactcc gtgaccggct gttcggctcc ctctgacccg caccacccca cccgtccgac 10740
ccaccacagg aggaacaccg tgtacacctt catcaaccgc ttcaccgtca ccggggacgt 10800
cgccgagttc gagacgctcg tcggcgagat cagcgagttc atgagcggcc ggcccggctt 10860
ccgctcgcac cggctgtacc gctgcgccac ggacgcctcg gtgtacgtgg agaccgccga 10920
gtgggacgac gcggcctcgc accgggcggc gaccggctcg ccggagttcc gcgcccgggt 10980
cggcaaggtg atgagcctgg ccaaggccga gccggccccg ttcgacctgc tcgcgcagca 11040
cggcgcctga gagggggagc accatgacgg acaacggcga gatcattgcg cagccggtga 11100
tccagctgcg cgagctgggg ctggcggcgg ccggcgccgc cgccgtacgg gccgcggccc 11160
ggctgggcct ggctgacgcc ctgggcgagg agccggccgg cgcggccgag ctggcccggg 11220
ccgtgaacgc ggacccggac accctgcagc ggctgctgcg cgccctggcc tgctacggcg 11280
tgttcgccga gcagccggac ggtcggtacg tgcacaccgg cgcctcccgg ctgctgcgcg 11340
aggacacccc gcgcagcctg aaggacatgg tgctctgggg caccgagccg tggacctggg 11400
agctgtgggg ccacctcgac gaggcggtgc gcaccggcaa ggccgtcttc cccgagctgc 11460
acggcatgga cttcttcgac cacctgcacg cccactcccc cgagtcggcg gccgtgttcg 11520
accgggcgat gacccagtcc agtcggctct ccgcgctcgc gctggccgac cggctggacc 11580
tcggcggggt cggcacggtg gtggacatcg ccggtggcca ggggcacgtg ctggccaccc 11640
tgctggagcg caaccccggt ctgcgcggca ccctgctgga cctgcccgag gtcgtctccg 11700
gggccgacgc ccggctgcaa ccgggcggtg cgctggccgg gcgcgccacg ctgctcggcg 11760
gcgactgccg gcgggagatc ccggtgcagg ccgacgtcta cctgctgaag aacatcctgg 11820
agtgggacga cgagagcacc gtcctgacgc tgcgcaacgt cgtccgggcg gctgctccgg 11880
gcagccgggt gatcgtggtc gagaacctgg tggacggcag ccccgagctg cggttcacca 11940
cggcgatgga cctcctgctg ctgctcaacg tcggcggccg caagcacacc agggccggcc 12000
tggtctcgct gatcgaggag gcgggcctga cccgggccga ggtccgtccg gtcaactcct 12060
acctgcacct ggtggagagc gtggtgcccg aacggggctg acccgcccgc ccacggccgc 12120
cgcccccgga cccgtccggg ggcggcggcc gtgctgtccg ggggcggcgg ccctcgcact 12180
gtccggggcg gcggtgagcc ccgtcggcac ggccgacggg gctcgggggc gcaacgggaa 12240
ggggagcggg gtcagatgcc ctcggcgagc cgcttcaccg cctgctcgac ccgctcgtcg 12300
gtctcggtga cggccacccg cacgtgccgg gcggccgcgg cgccgtagaa ctcaccgggc 12360
gccaccagga tgccgcggtc ggccagcgca ccgacggtgg tccagcacgg ctcgtccctg 12420
gtcgcccaga ggaacagcgc accggccgag tgctcgatcc ggaagccggc gtccaccagc 12480
gccccgcgca gcagctcgcg ccgccgggcg tagcgccggc gctggcccgc caggtgcgcg 12540
tcgtcaccga gcgcggcgac catggcggcc tgcaccgggg cggggaccat gtggccggcg 12600
tgcttgcgca cctccagcag cgtcgcgatg acggccgggt cgccggcggc gaagcccgcc 12660
cggtagccgg ccaggttgaa gcgcttggac agcgagtgca ccgccagtac gccgtggtgg 12720
tcgccgccgg tgacctcggc gtggagcacc gagcgggtcg agcgctccca cacgtggtcc 12780
aggtagcact cgtcgttgac caccagggtg ccgcgctcgc gcgcccactc gacgaccccg 12840
cgcagttcgg cggcgtcgag cacccggccc tccgggttgg acggggagtt cagccacagc 12900
aggcgcggcg cggggccgtc gtagctcagc gggtcgtccg tccggacgaa ggtggcaccg 12960
gccagccgag cgctcacctc gtaggtgggg aaggacagtt ggggggcgag gacgacgtcc 13020
cccgggccca ggcccagcat ggtgggcagc caggcgatca gctccttggt gccgaccgcc 13080
gggatcacgg cctccggctc gacgctcacg ccctcgcggc gcagcagcca ggccgcggcg 13140
gcggcccgca gcgcgggcgt gccctcggtg gacgggtagc ccggggcgtc ggccgcggcg 13200
gccagggccg cgcgcacggc ctccggggtc gggtcgaccg ggtcaccgag cgccaggttg 13260
accaacccgt cggggtgggc ggccgcgcgc ctgcggtacg ggaacagaac gtcccagggg 13320
aacttcggca gccgctcgat catgcctgcg cccccgcccc gacgttgcgg gccagcggcg 13380
gagcctggca gtcggagtcg atgccccagg agacgatccg ctccggcgtg atccggatca 13440
gctcgtcgtc gacgtgcggc aggatctcct tgccgccggt cgccagcgcg acggcggtgc 13500
cccggatctc gatcccgcgg acgacccagc gctgcgcgtc cacgatgtcg tccaccacca 13560
gtgacacccg cggatgcccc tgcacgtggc ggtacttgag gctgcgggcc atgccgcgcc 13620
cggtcacgtc gacggtgccg agctcggcgt tgtagtggaa gcccagcggg acgacgtgcg 13680
gctgtccccg gccgtccacg gtggccaggc gggcgagcgg ctgcgaggcc aggtaggcgg 13740
cctctttcgc ggtgaatggc atggctgtcc tcggtgtctg cgggtcaggg tcggcgccca 13800
cgctaggcag cccgcttcga gcggccttgg tgccgttcgg cctgctcgcg tacccgcgct 13860
ggactccggc tcgaagtccg gctgacacgg tgaggccgtc gtaccggacc gagacgggag 13920
gtcgcgttgg actgcgatgt ggtggtggcg ggagcggggc cgaccggcct gatgctcgcc 13980
tgcgaactgg ccctgggcgg agcccgggcg gtggtggtgg aacggcgccg cgagccggag 14040
aagcactcca aggccatggg catgcagggc cgcaccgtgg aactgctcga actgcgcggg 14100
ctgctcgacc gcttcaagga gggcgcgggc gtgctgcagg gcggcaactt cgccagcctg 14160
ggcgtgccga tgcgcttcga ggagttcgac acccgccacc cgtacgtgct gctggtgccc 14220
caactgcgca ccgaggagct gctcgccgaa cgggcccgcg aactgggcgt gcggatcgtg 14280
cgcggctcgg gtgtcaccgg cttcgcccag gacgccgacg gggtcaccgt agagacggac 14340
acgggcccgc ttcgggcacg gtacctggtc ggctgcgacg gcggcggcag caccgtccgc 14400
aaggccgccg gcatcagctt caccggacag gacccgcaca tgtacgccct catcggcgac 14460
atgcgcttca gcggcgacct gccgcgcggc gagggcctcg gcccgatgcg gccggtgggc 14520
ctggtcaacc ccgccaagcg gtcctggttc ggcgccttcc agcaccagcc gggcgtctac 14580
cgggccaccg tcgcctggtt cgaccggccc ttcgccgacc gccgcgcccc ggtcaccgag 14640
gaggagatgc gcgccgcact ggtcgagcac accggcagtg accacgggat gcacgacgtc 14700
acctggctgt cccgcctcac cgacgtctcc cggctggccg actgctaccg gcagggccgg 14760
gtgctgctgg ccggcgacgc cgcgcacatc cacctgccgg ccggcggcca ggggctcaac 14820
ctgggtttcc aggacgccgt caacctcggc tggaagctgg ccgccgtggt ccgcggccac 14880
ggcaccgagg agctgctgga cagctacggc cgcgagcgtc gcccgatcgc cgacggcgtg 14940
gtgcgcaaca cccgcaccca ggccgtcctg atcgacccgg acccgcggta cgaggcactg 15000
cgccagacct tccgcgacct catggcgctg cccgacacca accgccacat cgccggcatg 15060
ctctccggct tcgacgtcgc ctacggcggc ggcgaccacc ctctggtcgg ccgccggatg 15120
ccggacgccg agctgatcac cgcggacggg ccgcggagga tcagcgattg cttcgccggg 15180
gcccgcggtc tgctgctgct ccccgaacag gccccgaccg cctcgccgct ggccgcctgg 15240
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acgcacgatg acctcgtcca ccgacagcgc cgccgcccgc gcgcgccgga tcgtcgccct 15480
caacaccgcc tacttccagg cgaaggcgct gcagagcgcg gtcgagctcg gcctcttcga 15540
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ccggctgttc aaggacttcc tgaacgccct ggtcggcctc ggcctgctgg acgagcagga 15660
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cggtttcacg gccgacgagt tggcgcgcgc gatcgactgg agccggtaca cctccttcgt 15960
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ggaggcggac gtggtgatct tcggtcacgt cctgccggac tggccggtcg gggaccgcag 16200
ggagctgctg cgccgcgccc acaaggcggt gcgcccgggc ggcctggtgg tgctgtacga 16260
cgccatgatc gacccggagg aacgcgaccc ggaggtcctg ctgcagcgga tcaaccacac 16320
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ggccggcttc accgtcgacc ggatcgccgc ctccgacacc atcacccgcg accacttcgc 16440
catcggcgtc aagtcggtct gaaggaaaag gagttcgaca tgaccgacac aaccgcggat 16500
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caccaccccc gcttcgccgt cggcgagtcc accatcgggc agacgctggt ggtgctgcgg 16680
ctgatctcgg accggtacgg ggtgccggag atcgccaacc tggcgagctt ccaggacgtc 16740
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gtgaccgtct ccggcgcgga cggcagcacc gtccgggccc gctacctggt cgacgccagc 17040
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ctgtgcagcg tcggcatcca gctcgacgag cgccgctacc ccgcccggcc ggacctgacg 17340
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gcgctgcgcg aggacgactt cgcggtcgag cgcttcgcct acgtggagga actggagcag 17640
ggcctgctgg actggaacga caagctggtc aacaactcct tcatctcctt ctcgcactac 17700
ccgctgtgga actcggtctt ccggatctgg gcctcggcca gcgtgatcgg cggcaagcgc 17760
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gacgacaacc cgtacccggg cctgtggtgt ccgctggact tctacaagga ggccttcgac 17880
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cgggtgctgg agcagcgggt ccgcgagtcg gactggatgc tgccggccct gggcttcaac 18000
gaccccgaca cccaccacat caacccgacg gcggacaaga tgatccggat cgcggagtgg 18060
gccaccggtc accaccgccc ggagatccgt gagctgctgg ccgccagtgc cgaggaggtc 18120
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cggctgctcc cggacgcggg cctcgccgtt cgccgcacgc gggtgggctc agccctcggc 18240
cgccagggtc agggcggccg tccgcggatc ctcctccacc ggccagcggg cgtaggagcg 18300
gcgccagtac atcagcgggc tgggcacctc gggccggggg ccgccggcca ccaccgcgcc 18360
gatcacgatg gtgtggtctc ccgcgtcgag ggccgcggcg acccggcact cggcgtgcgc 18420
gacgacgtcg gccgacatga ccggcacgcc accggcgctg cccggctccc accggacgtc 18480
ccggaagcgg tcgtccacgg gcgcggcgaa gcgcgcggac gtggactccc ctccgccgcg 18540
cagcacgttg acggcgaact cgccgcgctc caggagggcc ttcagcaccc ggctgtcgcg 18600
gttgatgcag accagcaaca ggggcggggc cttggagacg ctgcaggcgg ccgaacaggt 18660
caacccgtac ggctccccgt ccggtcccag ggtcgtcacc acggtgaccc cggtcggcag 18720
ggcgcccatg atcgacagga aggtgtctcc gtccaccagg ccgggggcca ggtccagcgg 18780
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cgtacccccg gcacgggggt gaccgggggt acgcgggttc agggggtgcg ggtgcgcgcg 19020
ctcactcctc gtcgctcagt tcccgcagcg ggaaggtgag caggaagccc accgcaagga 19080
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cgctcaggcc gccggtggag tccgggtcgg agagcgctcg gcgcacggcc tcgtccgggt 19200
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ccatcgtgat gccaccgcgc cggaacagcc gcagcgggac catcgcctcc agcccgcggg 19740
cccgctcggc gagcacgaac agcaccaggc cgatcagcga gacggcgaag agcgtcagcg 19800
aacgcgccga tccccagccc cagtcgaggc cctcctccgc cacgatcagc agcggcacca 19860
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ggaaggccca gcgccagccg gtcaccccga ggatctcgcc ggcgcccgcg aacaggcccc 20040
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gcccgcgctc gcgcaccggg gcgaggtcgg cgatgacggc cgtcggcagc gacatcagcc 20160
cggcgccgcc gaagccctgg aggacgcggg cgatcgccag cgtctccatc gagttcgcca 20220
tcgcgcaggc cgccgagccg acgatgaaga ccgcgatcgc cgccaggtag agcggcttgc 20280
ggccgtagat gtcggacagc ttgccgtaga acggcatcgc gatcgtggag ctgaccagat 20340
agccggtgat cacccaggcc tggacggtct ggccgtgcag ttggtcgccg atcgtacgca 20400
gcgcggtgga gacgatcgtc tggtcgagtg cggcgagcag cacggccaac aggagcccgg 20460
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cggcctcgcc ggtctgcgag gtggcgttcg ccattttcgt ttctcccacc ggattcgaca 20580
aggtcttgtc gaattgagcg tagtggctac cgtggcggaa tgacaagttc ttgccgaaat 20640
cccggcccgg acgaggctag gctggccgtg gagagcctgc ggctgccccc atgaccgatc 20700
tctcccccgc ggccgagacc ttgagtgaca tcaccacgga actgttcgcc gtcaacggag 20760
ccctgctgcg cgcgggcgac gcgctgtccg cccgcttcgg gctcacctcc gcgcgctggc 20820
aggtcctcgg gctgctggcc gaggggccac agagcgccgc ccacctggcg cgcgagcgcg 20880
ggctgcgccg ccaggccgtc cagcagaccg tggtgaagct ggtcgaggag ggcctggtca 20940
gcacctcccc caacccggcc gaccggcggg ccccgctggt ctcgctgacc gccaagggca 21000
ccgacgccct cgcccggatc gaacccgccg aacgcctgtg gatggagcac ctcgcgggcg 21060
gcctggatcc ggacgacctg aaggccacgc tgcggctgct gcgtggcctt cgggcggtcc 21120
tggccgaggg cctgcccccg gcggcggtcg gcggcgcgga cgccgccgac gtcacaggtc 21180
cagcgtgacc tcgtactcgg cgagccagga gttgagccac agcaccagct ccagactgcc 21240
ccggtcgtag ggccggctca ccgccccggt cggacgggca gccgcggcca gggcccgcgc 21300
gcggtccagc agcggcagca ccggagcgtc cggatcggcg agcaccccgg ccagttcggc 21360
ccgcagggcg ccctcgtagc ccggatcctg ggtcgccggg tacggggtct tcacccgctc 21420
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gtcgaaactc ttcatctccc agggcacgtt gaagacgtac tccacgagcc ggtggtcgca 21540
gaacggcacc cgcacctcga ggccgaccgc catgctcatc cggtccttgc ggtcgagcag 21600
ggtctgcacg aagcgggtca ggttcaggtg gccgatctcg cgcatccgcc tctcgggcgc 21660
cgactcgccc ggcagcaccg gcacttcggc gagcgcctcg gcgtaccggg ccgcccggta 21720
gccgtccagg tcgagcttgt ccagcagacc cggctggaac agcgagctgc cgccgaagta 21780
gcgcgccgaa cccggggtga gccacgggaa ggtggccgcc cgcagggcca acgggttgcg 21840
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gttctcccgc accgcgcgga agaacaggta gagcgagggc cacatgtcgc cccagtacgc 21960
gggcggcagg tcggtggcgc gcagcaccgc ggaacgcacc gccgggtccg acaggccggg 22020
gctgtccagc agcacctcca ggtggtccgc tccgacgtgc cccgccagct cgcgcacgta 22080
cggcgcgtcc gcctcccgcc ggacggcgtc ggaggcgaag gcgtcggcgg cgccccggaa 22140
gtccaccgag aaggagcgca ccggcccgct gcgggcggcc agcgccgtca cggccgacga 22200
gtccaggccg ccggagagca gcgtgcccag cgggacgtcc gagaccagct gacgggtgac 22260
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gcgggcctcc agccgccagt acgtctgccg gcgcaccccg ccgcgcccca cccggacgag 22380
ctgacccgga cggacctcga cgagcccgga gaaaacggcc gcctcgggcg tcttcaccat 22440
gtccagaacc tcgcacagcc cgtccgggcc gacccggcgg ggaagggtcc ggtccgccag 22500
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ggtgtcggtc atcgcctgga gcaggtcccg gcggtgttcg gccggggcgt cgtagtcgac 22980
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tcggtccgtc aaatccggaa ggtcaggcgg gcggtcggcc ggcccggtca actggtcagt 23340
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gccagttcgc gggcaccaag gccaccgccc tgatcgagga gggcggcttc gtccgcggtg 26520
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ccgcggacgg ccgcttctcc aaggtccgct cgctcgccgg gatcggctac cgtcgccagg 26640
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cggtgcccga ggcgctccag ctcggctgga ccctcccgca cggcggcttc cgcaagctgg 26820
ccgaccgcgg catcggccac atcgtcgacc aactcgtcga cgccgcaccg gagtacgccg 26880
acctgatccg ccaggagatc accggcttcg gcgacgtctc cctgctggac gtcttctccg 26940
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acagcccgat cggcgcccag gggatcaacc tggccgtccg cgacgccgtc gcggcccacc 27060
cggtgctggt cgaggccgtc cgcggcggcg acgccggcgc ggcccggctc gccccgtacg 27120
aacggcaacg ccgccccgaa gtggaacgga tcacccggat ccagcaggtc cagagccgca 27180
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ccaggacccc gctgtacggg gccatgctgc gccggatcgc cttcggcacc gcgcccgtcc 27300
ggctgcgcgc cgatctgctc gccggggcgg ggcggtgagc ggcggggcag cgatcgccgc 27360
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ggtgacagcg gtgtcgctca gctcggtggc cctgccgttc gcgctcggcg tggggctcgc 27720
ggtgctgctc tacccctggt tcgacaaggc ccagttgagc accgacggga ggctcggccc 27780
ggccctgttc ctgggcgcgg cgatgtccat cacggccttt cccgtcctcg cccggatcat 27840
cgccgagcga cggatgcagc acgacccgct cggcagcctg tcattggcct gcgcggcctt 27900
ccaggacttc ctcgcctggt gcgcgctggc ggtggtggtg gcggtggtgg aggccaaggg 27960
cctctggtcg ctgggacggc tggcgctcga cacggcggtg gtggtcctgg tgctggtcgg 28020
cgtcgtccgc ccgctcctgt cccggctgct cgcccccggc cggcgccgtc ccctcccccg 28080
gccgtggatc cacgcggtgc tcgtcaccgg caccctggtc accgcctggg tcacggccga 28140
gatcggcctg gacgcggtgt tcggggcgtt catgttcggt gcggcggtgc cccgggaccg 28200
gatcgaggcg atcgcgcccg acgtcccgga gcagatcgag cgggcgggtc tcctgctgct 28260
gccggccttc ttcgcggtga ccggcctcgc cgtcgacctc accggcctcg ggctgcgcgg 28320
cctggccgtc gtggcggcgg tgctggtggc ggcctgcgcc ggcaagttcg tcggtgcggt 28380
cgccgccgcc cgggccaccg gctcgagccg gcgcgaggcg cgggtgctcg gcatcctgct 28440
caacgcccgg ggcctgaccg agctggtcat cctcaacgtg ggccaccggc tcggggtgat 28500
cgacacccgg atgttcacgg ccatggtcgt gatggccctg gtcacgacgc tgatgacggg 28560
gccgctcctg gagcgccacg cggcgggctc cgccggatcc gccacgctcc cggacccggc 28620
gcccgaggcc gcacaggcct cgcgggcgcc ctcctgaggg cgggccggcc acgacctccg 28680
gggggcgtgc ccctcacggc ggctccgtcc acccggagac ccggcgcagc cgccgactca 28740
gccgccgctc gaccgggctg agtggaacgt cggggcgcag ccgctccggg tgccccgacg 28800
gtggcccgcc cccggcaggg ccgcccggct cgccgggccg ccggaccggc ccgggctgcg 28860
gcggcggggc cacgtagccg gccatctgcc ccagcgccgc cagtccgcgc aggagcacgg 28920
ccagcagatc gaggagccgt tcgttcggtt cgcacatccg ccgagcatgg cgaccggtcc 28980
tgaagcgcgg ttcgagcggt acgggagggg cgccgggcac ggcgaaggac agcccggcac 29040
cctcggaacc actggagcat ggccacggcg ccgtcggagc tgcgggtgcc cgtcacgctg 29100
acgatccgcc gcaggagggt cgggcgtgtc cgagggttcc cgccggaccg gccccgagcc 29160
tcactggtac cggtaggtgg cggccaccgc gaggtggtcg ctgccgtccc ggggcagggt 29220
gcgggagtcc accggcttca gcccgccctt gctcatgatc tggtcgatcc gcgccatcgg 29280
gaacgccgcg ggccagctga agccgaagcc gtccccggcc gcgccctggg ccgagcgcat 29340
ctgcgaggtg accggtgcca ggctgcggtc gttcatggtg ccgttgaggt cgccgagcag 29400
caggaccttc ttcaccggct cggcctggat cgcgtcgccg agcgcctggg cgctgacgtc 29460
ccgctggtgg gcggtgaagc cgctctcggc cttgagccgg acggacggca ggtgcgcgac 29520
gtacaccgcg accgggccct ggggggtggt gacccgggcc cggaaggccc tggtccagcc 29580
gatcttcagg tccaccgggg agacctcgcc gatcgggtac ttcgaccaga gcccgaccgt 29640
cccctccacc gtgtggtgcg ggtacgcccc ggcgagcccg gtctcgtacg accgcagctg 29700
gttgccggcc agttcctgga gcgcgacgat ctgggcgtcc gaggcgacca ggccgcggat 29760
ggtgcccggc acgtcggtgt tcccggcctc gacgttgtgg gtgaccaccg tccagtcgcc 29820
ggtgccgccg ctcttgtcgg acaccagccc gccgaacagg ttggcccaca gcacggcggg 29880
caccagcagg gcgagcagcg cggtggcgga gcggcgcagc agcgcgggca ccagcagcac 29940
cgggacggcc aggccgaccc agggcagaaa ggtctccagc aggctgccga ggttgccgac 30000
gctgttcggc atctcggcgt ggaaggccag cagcaccgcg gtgagcaggg ccagcagggc 30060
gatcaccagt ccgcgccgcc aggtgttgcc gcccctggcg tccggtcccc agtgccgcag 30120
gccgaggaag ccaccggtcc ggtcggcggg cgtgcccgcg tcctcgggga cggtggtccg 30180
ctcggtgctg tccgcctgcg ccatgcgtgg ctcccgtcgc tcgtgccgtc gccggtccgg 30240
cggccggtcc gtggtacggg cgcggcgccg gactggtgcc ggtttgatcg gatacccggc 30300
tcagcctatg ccgggacaga cgcgcgcttc cgggaccggg ttccggcgtg gcccggtttg 30360
gtgagccagg ccacgccggg cacgaagcat gcgctccgac gcgctatggg ggttcggagg 30420
acccgtttct agcggggggc gacgccgtcg aggacggagt cgaccagttt gcgggacagc 30480
tccgggtcct ccaggtcgga gtcctccgac aggatgctgc ggtagaggat cggccccatc 30540
agcaggtcgc cgagcagttc cacgtcgagg tcgtcgcgga tcacgccctc ggcgacggcc 30600
cgccggatca ggtgcagccc gacctcgcgg cgcggcctga tcacccgctc tcggtaggcg 30660
gtgtacagct cgggcagggt ctgcatctgc ccgagcgccg ccttgagcac ccagcgggtg 30720
cgcttggcga ggccgcggcg gcggatgtag tcgaccatcg cgatcaggtc ctcgcgggcg 30780
ccaccgccgg tgggggccgg gatcggctcc tccagccggc tgacgacgtc gaccagcagg 30840
gcctccttgt tgggccagcg ccggtagatg gtggccttgc cgacgccggc ggcggtggcg 30900
atgccctcga tggtgagttc ggacagcgtg ttgccgtccg ccatgaggtc ctcgacggcg 30960
gtgaagatgg cctgctcggc ggcctcgctg cggggccggc cgcggcgtac cgccgcgcag 31020
ggctgcccgg tgtcggcgct cggcgtgtcc gtcctcatcc cggctgtctc tccctcgctg 31080
ggtcccgggc ccgcgggcgc cgtggtgtgt cggtcgatcg ggtccacggg cggggtcgcc 31140
cccaccccgg gccgaggccc tgccgaccgg atgcaccggt cggcagggcc attgtcgctc 31200
agtcgactcg caggtcggtc gatccgcggg tcggacctcc gcgcgggtca ggcctccgcg 31260
gccgcggcct cccgggcccg gtcctgctgc tcgggggcac cggggccgcc cgggccggcg 31320
gccggggccg cggcgcggcg cggcagcagg aaccacgcga ccagcgcgcc gaccagcgag 31380
atgccgaccg agagcgcggc caccacgtgc atggcgtgga tgaaggcgtc gttcgccggg 31440
gcgatcagcg ccttgcccgc gccgttcggg agccggtcgg cgatggccag ggtggcctcc 31500
agcgactcgc ccgccttgtc gcgcagcccc tcgggcaggt gggtgagggt gtcggtcatc 31560
ccgtc 31565
<210> 3
<211> 116
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 3
gtgcacgcgg tcgatcttga cggctggcga gaggtgcggg gaggatctga ccgacgcggt 60
ccacacgtgg caccgcgatg ctgttgtggg cacaatcgtg ccggttggta ggatcc 116
<210> 4
<211> 48
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 4
gccttgacct tgatgaggcg gcgtgagcta caatcaatac tcgattag 48
<210> 5
<211> 97
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 5
tgttcacatt cgaacggtct ctgctttgac aacatgctgt gcggtgttgt aaagtcgtgg 60
ccaggagaat acgacagcgt gcaggactgg gggagtt 97
<210> 6
<211> 1533
<212> DNA
<213> 金色链霉菌(Streptomyces aureofaciens)
<400> 6
atggcgaacg ccacctcgca gaccggcgag gccgtcgcgg acgacgccgg cggccccgcc 60
ggcttcactc accgccagat catcaccgcg ctgtccgggc tcctgttggc cgtgctgctc 120
gccgcactcg accagacgat cgtctccacc gcgctgcgta cgatcggcga ccaactgcac 180
ggccagaccg tccaggcctg ggtgatcacc ggctatctgg tcagctccac gatcgcgatg 240
ccgttctacg gcaagctgtc cgacatctac ggccgcaagc cgctctacct ggcggcgatc 300
gcggtcttca tcgtcggctc ggcggcctgc gcgatggcga actcgatgga gacgctggcg 360
atcgcccgcg tcctccaggg cttcggcggc gccgggctga tgtcgctgcc gacggccgtc 420
atcgccgacc tcgccccggt gcgcgagcgc gggcgctact tctcgtacct gatgatggcc 480
tgggtggcgg ccagtgtgct cggcccgctc gtcgggggcc tgttcgcggg cgccggcgag 540
atcctcgggg tgaccggctg gcgctgggcc ttcctgatca acgtgccgct cggtctggtg 600
gcgctggtca gcgtgcgcaa ggcgctcaac ctgccgcacc gcagggtgga ccacccgatc 660
gacttccggg gggcgctcac cctggcgctc tgcctggtgc cgctgctgat cgtggcggag 720
gagggcctcg actggggctg gggatcggcg cgttcgctga cgctcttcgc cgtctcgctg 780
atcggcctgg tgctgttcgt gctcgccgag cgggcccgcg ggctggaggc gatggtcccg 840
ctgcggctgt tccggcgcgg tggcatcacg atggccacgg ccgtcaactt caccatcggc 900
gtcggcatct tcggtacggt ctccaccctg ccgctgttcc tgcagctggt gcaggggcgc 960
agtgccaccg tcgccggact ggtgatcatc ccggtgatga ccggggcgat cgtctcccag 1020
acgatctgcg ccaagatcat caagaagtgg aaccgctaca agaagcccgc gatcgtgggc 1080
ctcggctcga tggccggagc attgctgtcg ctctccgccg cgggcgcgga caccccgctc 1140
gcggtgatcg tggtgatcgc ggcctggctg ggcttcggca tcgggctctc ccagaccgtc 1200
atcaccctgg cgatccagag ctcggcgccc aagtccgagc tgggcgtggc caacgccgcc 1260
tccggtctgt tccgccagct cggcggcacg agcggcgccg ccgtcttcat gtcggtgctg 1320
ttcggcgtcg ccgccggcag gctcgacggg gccgacccgg acgaggccgt gcgccgagcg 1380
ctctccgacc cggactccac cggcggcctg agcgcctcgg cggtcgacgc cttcacctcg 1440
ggcttcgaca cgatgttcct ggtcggcggc ctgatccttg cggtgggctt cctgctcacc 1500
ttcccgctgc gggaactgag cgacgaggag tga 1533
<210> 7
<211> 1983
<212> DNA
<213> 金色链霉菌(Streptomyces aureofaciens)
<400> 7
atgacaaccg tgaacatcgg aatcctggcc catgtcgacg ccggtaagac cagcctgacc 60
gagcggctgc tgcacaccgc cggcgtcatc gaccgggtcg gcagcgtcga ccgcggcgac 120
acccagaccg actcgcacga actcgagcgc cagcgcggca tcaccatccg gtccgcggtg 180
gtgtccttca ccgtgggcga cgtcaaggtc aacctcatcg acacccccgg ccacccggac 240
ttcatctccg aggtggaacg ggccctcggc gtgctcgacg gcgtggtgct ggtcatctcc 300
gccgtggagg gcgtgcaggc ccagacccgg ctgctgatgc gcacgctggt gaaactgcgc 360
atgccggtca tcctcttcgt caacaagatc gacaggatgg gcgcgcgcta ccacgagctc 420
ctggacgaga tccgctccga gctcaccccg gccgtcgtcg ccctgacccg ggtcgaaggg 480
ccgggcaccc ccggagcacg ggcgttcgcc cggaccgtcg ggaccgacga ccccgacttc 540
gccgccgaac tggccgacat cctggccgag cacggcgacg acttcctggc ccgctacctc 600
gaggacgaga cctccctgac cgcgcaggac tacagcgcgg aactcgcccg ccaggcggcc 660
cggggccagc tctacccggt gctcttcggc tcggccgtgg ccggcgtcgg catcgatgcc 720
ctggtcgacg ggatcaccag gctgtttccg gtcaatcacg gcggctccgg gggcaccctc 780
cgcggtaccg tgttcaagat cgagcgcggg tgggcgggcg agaaggtcgc ctacgtccgg 840
ttgcacgggg gcgagctcgg gtcgcgggag aaggtgtccg tgttccggcg cgaccagcac 900
ggagccgtca ccgagattcc cggccgcacc acggtggtcg aggtgttcga ccggggctcg 960
gccgtcgtcg agtcgcgggc ccgggccggg gacatcgcca aggtctgggg gctcaagggc 1020
atccggatcg gcgaccggct cggttcggcc gaggggctgg acggggagca cctgttcgcg 1080
ccgccgagcc tggagaccgt gatccgaccc tcccggccca gcgcgatgcc cgaactgtac 1140
gacgcgctgc tgcagttggc cgaccaggac ccgttcatca acgtccgcaa ggacgacgag 1200
gagcaggaga tcgccgtctc gctctacggt gaggtgcaga aggaggtcat cgcggccacc 1260
ctcgccgacg agttcaagct ggacgtggcc ttcgagggca cccggatcat ctgtgtcgag 1320
cgcccgatcg gggtcggcga gtcggtggag gagatcgact accggagcaa gaccttcttc 1380
tgggccacga tcggcctgcg ggtggaaccc ggggagccgg gatcaggggt cgtgttccgc 1440
cgctcggtgg agctcggctc gctgccgcac gccttccaca aggccgtcga ggaggccgtg 1500
cgggccaccc tgcagcaggg gctgaacggc tgggaggtgc tggacatcct ggtgaccctc 1560
acccgttccg ggttcgccag cccggtgagc gcggcgggcg acttccgcaa gctcacgccg 1620
ctcgtgctga tgaacgcgct caagcaggcg ggaacgcagg tgtacgaacc ggtcaaccgc 1680
ttcgagctgg aggtgccggg tgagaacgcc agcgccgccc tgctgagcct ggtggagtgc 1740
ggcgccaccc cggagagcac ccggggcctg ggcagcagct gcctggtgga ggggacgatc 1800
ccggcccgca cggtgcagga gttcgagcag cggctgccgg gcctgagcca gggccagggc 1860
gtgctggtca cccggttcca cagcttccag ccggtggtcg gggcggcgcc gaggcggcgg 1920
cggaccgacc tcaacccggt ggaccgctcg gagtacatgc tgcgggcctt cggccggatc 1980
tga 1983
<210> 8
<211> 681
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 8
tcgaggttgc tgacgtagtc ccgcagcgcc cggccgcagg gcacgtcggc gaggggggtg 60
ccgcgccaca gggccagcgc ctcctcggcc caccggacgg cgccggcggc gtcgtgggcg 120
gcgtagcagg tctgggcccg gtcggccagg cgcgcgaagt ggtgggtgtc gagcgactcc 180
tcgggggtgt gcagcaggta gccgggcggc gcggtgacga tggcgcgctc ctgcgggtcc 240
acgcccagtt cctcgatgaa gtccttgcgc agctggtaga tgtaagtctg cgcggtggtg 300
accgcggtac gcggcagcgc gtcgccccac agttcgtcga ggatggactc caggctgacg 360
atctggttgg cccgcatcac gagcagggcg agcaccgata tcaagcgata actttaaata 420
attggcatta tttaaagtta gggtccggtg gtttcaggtg ccggcctgta cctggaggcg 480
gacctcaggc cgtggatacg ggctgtcctg ccgtgcgtac gggccggtgt tccgggagat 540
tccgaggatc agcatggatt tcgccttgtt cacggcatcg atccgggaaa ccgcgcccag 600
cttttcgaaa acattgctca aatggcgttt cacggtcgct tcggtgatgg tgagccgggc 660
ggcgatctgg ctgttgctca g 681

Claims (4)

1.一种异源表达金霉素的方法,其特征在于,所述底盘菌株名称为龟裂链霉菌(Streptomyces rimosus)SR0,该菌株保藏在CGMCC,保藏编号为CGMCCNO.17208,保藏日期为2019年01月17日,在所述链霉菌底盘菌株中整合金霉素合成基因簇载体pSET153-ctc,得到SRC0菌株,然后进一步整合ctcB基因表达载体pSOK616-PermE*-ctcB,所述的ctcB基因表达载体pSOK616-PermE*-ctcB,使用组成型启动子PermE*启动ctcB基因表达,得到金霉素生产菌株SRC1;进一步ctcB基因表达载体pSOK616-PermE*-ctcB的ctcB基因前启动子PermE*更换为组成型启动子PkasO*;使用组成型启动子PkasO*构建pSOK616-PkasO*-ctcB载体,然后通过接合转移方法,得到金霉素生产菌株SRC3;使用金霉素抗性基因ctcR和ctcC,构建融合表达载体pSOK616-PkasO*-ctcB-ctcR-ctcC-1,然后通过接合转移方法,构建SRC4菌株;所述ctcB基因序列如SEQ ID No.1所示,所述载体pSET153-ctc含有的金霉素合成基因簇(ctc)序列如SEQ ID No.2所示,所述PermE*启动子序列如SEQ ID No.3所示,所述的启动子PkasO*序列如SEQ ID No.5所示,所述ctcR基因序列如SEQ ID No.6所示,所述ctcC基因序列如SEQ ID No.7所示。
2.权利要求1所述一种异源表达金霉素的方法,其特征在于,所述的ctcB基因表达载体pSOK616-PermE*-ctcB构建方法为:以ctcB-s/ctcB-a为引物,以金色链霉菌(Streptomycesaureofaciens)基因组为模板,扩增ctcB基因,866bp;回收产物和质粒pSOK616-EotcR用NdeⅠ+SpeⅠ双酶切,6442bp;然后将两片段进行连接,构建pSOK616-PermE*-ctcB;
所述的引物序列为:
ctcB-s:ATACATATGGAGGGAAATCCGAGCGACATCGG
ctcB-a:ATTACTAGTGACGGGCCTCAGGCCGAACGG。
3.权利要求1所述一种异源表达金霉素的方法,其特征在于,所述pSOK616-PkasO*-ctcB载体的构建方法为:质粒pSOK616-PermE*-ctcB,采用HindⅢ和NdeⅠ双酶切,回收7172bp片段;以PkasO*-s/PkasO*-a为引物,pDR4-K*为模板,扩增PkasO*启动子序列,127bp;两片段Gibson组装构建;
所述的引物序列为:
PkasO*-s:CTCATGGAGGGCGCGAAGCTTTGTTCACATTCGAACGGTCTC
PkasO*-a:GCTCGGATTTCCCTCCATATGAACTCCCCCAGTCCTGCACG。
4.权利要求1所述一种异源表达金霉素的方法,其特征在于,所述融合表达载体pSOK616-ctcB-ctcR-ctcC-1的构建方法为:以ctcR-s1/ctcR-a为引物,pSET153-ctc为模板,扩增ctcR1片段(1664bp),回收作为模板,以ctcR-s2和ctcR-a为引物,扩增ctcR2片段(1717bp);以ctcC-s和ctcC-a1为引物,pSET153-ctc为模板进行PCR,扩增ctcC片段(2107bp);片段ctcR2和ctcC为模板,ctcR-s和ctcC-a2为引物进行融合PCR,扩增ctcR-ctcC融合片段(3783bp);pSOK616-PkasO*-ctcB用HindⅢ酶切(7276bp),去磷酸化,回收;ctcR-ctcC融合片段用HindⅢ酶切,回收;两片段连接并转化E.coliDH5α;挑选得到pSOK616-ctcB-ctcR-ctcC-1载体;所述的引物序列为:
ctcR-s1:TGTTGTAAAGTCGTGGCCAGGAGAATACGACAGCGTGCAGGACTGGGGGAGTTAGACCTTGTCGAATCCG GTG
ctcR-a:TGTCATATGGGTCCTCCTGTGGAGTGGTTCTGTGGAGGTCGCGCGCTCACTCCTCGTCG
ctcR-s2:ATTAAGCTTTGTTCACATTCGAACGGTCTCTGCTTTGACAACATGCTGTGCGGTGTTGTAAAGTCGTGGCCA G
ctcC-s:CGACCTCCACAGAACCACTCCACAGGAGGACCCATATGACAACCGTGAACATCGGAATC
ctcC-a1:TACAAGCTTCGACTGAGGACGGAGTGCGCCACGGCTGAGG
ctcR-s:ATTAAGCTTTGTTCACATTCGAACGGTCTCTGctcC-a2:TACAAGCTTCGACTGAGGACGGAGTGCGC。
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