CN110106281A - 六倍体I.trifida基因组特异SNP分子标记引物及应用 - Google Patents

六倍体I.trifida基因组特异SNP分子标记引物及应用 Download PDF

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Abstract

本发明公开了一种六倍体I.trifida基因组特异SNP分子标记引物及应用，引物有四对，分别为命名为SHS6tr‑6‑1、SHS6tr‑6‑2、SHS6tr‑6‑3和SHS6tr‑6‑4。本发明提供的六倍体I.trifida基因组特异SNP分子标记引物，可有效区分甘薯近缘野生种六倍体I.trifida的遗传物质。本发明提供的分子标记可用于在分子标记辅助选择育种过程中，简单、快速、高效地检测六倍体I.trifida的遗传物质，有利于加快六倍体I.trifida优良性状向受体甘薯材料的转移与利用，加速育种进程，促进六倍体I.trifida在甘薯遗传育种中的利用。

Description

六倍体I.trifida基因组特异SNP分子标记引物及应用
技术领域
本发明属于基因工程领域，具体涉及一种六倍体I.trifida基因组特异SNP分子标记引物及应用。
背景技术
单核苷酸多态性是由单碱基插入或缺失等引起的序列变异。与RAPD、SSR、AFLP等其它基因组多态性分子标记相比，具有分布密度高、遗传稳定、与表型性状相关性强等诸多优点，被称为第三代分子标记。目前单核苷酸多态性标记的检测主要依靠测序、芯片扫描、质谱检测等方法，操作复杂，成本昂贵，仪器设备要求高。相比之下，利用高分辨率熔解曲线分析技术通过监测产物的熔解曲线变化的差异，区分不同的SNP基因型，只需一对普通PCR引物就可以对SNP位点进行分型，具有灵敏度高、特异性强、适应性广、操作简便等优势，被广泛应用到各个领域的研究中。
我国培育的甘薯品种大多数是通过品种间杂交育成的。长期的品种间杂交导致遗传背景狭窄、杂交优势减退。研究表明，甘薯近缘野生种I.trifida极有可能是甘薯祖先种，具有抗病、抗逆等优良基因，用它作为甘薯育种材料被认为是今后甘薯杂交育种的重要方向。I.trifida包含二、四、六三种倍型。目前，只有六倍体I.trifida在甘薯育种中得到了成功应用。日本在上世纪70年代利用六倍体I.trifida育成了高淀粉种间杂交种品种“南丰”。我国研究者也先后育成了含有1/8六倍体I.trifida血缘的甘薯品种品苏渝303和渝苏297。
甘薯研究上使用的以RFLP为代表的分子杂交为核心的标记技术，是利用限制性内切酶对基因组DNA进行酶切，电泳分离酶切片段，然后用特异性探针进行Southern杂交，通过放射性自显影或者非同位素显色技术来显示DNA的多态性。该技术在检测SNP多态性上应用极少；操作费时、费力、费物，目前研究中使用较少。
在甘薯研究上，使用的以PCR技术为基础的标记技术主要包括RAPD，AFLP，SSR等分子标记。此类标记根据扩增的基因组区域设计约25bp的引物，以基因组DNA为模板，进行扩增。最后通过凝胶电泳技术进行分离，分析扩增片段的长度多态性，从而产生分子标记。该技术无法检测SNP位点的多态性，而且PCR产物电泳检测过程繁琐、耗时、分辨率有限，仅能应用于PCR扩增产物的长度多态性检测。
在甘薯研究上，已经使用的以测序技术为基础主要技术包括RAD、SLAF等技术。这些技术主要通过对不同甘薯材料基因组进行测序，然后进行序列间比对，寻找单核苷酸差异。该技术不适用于个别SNP位点多态性的检测，实验成本高、操作复杂、数据分析要求高。
根据我们文献检索结果显示，目前研究中，还没有可用于区分六倍体I.trifida基因组的特异分子标记。
发明内容
本发明所要解决的技术问题为：针对现有分子标记操作复杂、实验成本高等问题，开发了鉴别六倍体I.trifida基因组特异SNP分子标记引物及应用。
本发明的技术方案为：六倍体I.trifida基因组特异SNP分子标记引物，该引物有四对，分别为命名为SHS6tr-6-1、SHS6tr-6-2、SHS6tr-6-3和SHS6tr-6-4，其中，SHS6tr-6-1的前向引物序列如SEQ ID No.1所示，后向引物序列如SEQ ID No.2所示；SHS6tr-6-2的前向引物序列如SEQ ID No.3所示，后向引物序列如SEQ ID No.4所示；SHS6tr-6-3的前向引物序列如SEQ ID No.5所示，后向引物序列如SEQ ID No.6所示；SHS6tr-6-4的前向引物序列如SEQ ID No.7所示，后向引物序列如SEQ ID No.8所示。
本发明还公开了一种六倍体I.trifida基因组特异SNP基因分型的检测方法，包括如下步骤：
(1)提取待检测甘薯的DNA；
(2)以步骤(1)提取的DNA为模板，SHS6tr-6-1、SHS6tr-6-2、SHS6tr-6-3或SHS6tr-6-4中的任一引物进行PCR扩增；
(3)将步骤(2)的扩增产物加入高分辨熔解曲线分析系统中进行基因分型检测。
进一步地，步骤(1)中，提取待检测甘薯的DNA的方法为：取新鲜幼嫩叶片，液氮研磨成细粉后加预热至65℃采用CTAB法提取参试材料DNA，溶于1×TE溶液中，加入RNA酶至终浓度50μg/μl，120V恒定电压下，1.5％琼脂糖凝胶电泳30分钟，检测DNA浓度及质量。
进一步地，步骤(2)中，PCR扩增的反应体系为：
PCR扩增条件为：
与现有技术相比，本发明具有以下有益效果：
本发明提供的六倍体I.trifida基因组特异SNP分子标记引物，可有效区分甘薯近缘野生种六倍体I.trifida的遗传物质。本发明提供的分子标记可用于在分子标记辅助选择育种过程中，简单、快速、高效地检测六倍体I.trifida的遗传物质，有利于加快六倍体I.trifida优良性状向受体甘薯材料的转移与利用，加速育种进程，促进六倍体I.trifida在甘薯遗传育种中的利用。
附图说明
图1本发明技术流程示意图；
图2引物SHS6tr-6-1对供试材料试材料六倍体I.trifida/I.trifida(2X/4X)，以及42个甘薯品种的分型结果；其中图中箭头所指为引物对六倍体I.trifida扩增产物分析结果曲线，A为标准化差异曲线，B为标准化熔解曲线；
图3引物SHS6tr-6-2对供试材料试材料六倍体I.trifida/I.trifida(2X/4X)，以及42个甘薯品种的分型结果；其中图中箭头所指为引物对六倍体I.trifida扩增产物分析结果曲线，A为标准化差异曲线，B为标准化熔解曲线；
图4引物SHS6tr-6-3对供试材料试材料六倍体I.trifida/I.trifida(2X/4X)，以及42个甘薯品种的分型结果；其中图中箭头所指为引物对六倍体I.trifida扩增产物分析结果曲线，A为标准化差异曲线，B为标准化熔解曲线；
图5引物SHS6tr-6-4对供试材料试材料六倍体I.trifida/I.trifida(2X/4X)，以及42个甘薯品种的分型结果；其中图中箭头所指为引物对六倍体I.trifida扩增产物分析结果曲线，A为标准化差异曲线，B为标准化熔解曲线；
具体实施方式
实施例：
使用本发明的引物对六倍体I.trifida，四倍型I.trifid、二倍型I.trifid及42份甘薯进行分型，具体方法如下：
1)材料准备：选取不同倍型I.trifida(2X，4X，6X)，以及性状差异大、遗传多样性丰富的徐薯18、川薯20、524、坦桑尼亚等42个甘薯品种。于3月中旬在试验地进行种植。
2)DNA提取：取2g新鲜幼嫩叶片，液氮研磨成细粉后加预热至65℃采用CTAB法提取参试材料DNA，溶于1×TE溶液中。加入RNA酶至终浓度50μg/μl。120V恒定电压下，1.5％琼脂糖凝胶电泳30分钟，检测DNA浓度及质量。
3)PCR扩增使用的引物序列及退火温度如下表所示如下。引物合成由生工生物工程(上海)股份有限公司完成。
引物名称 F:5′-3′ R:5′-3′
SHS6tr-6-1 CAGAGCTAGGGTTCGGAGAA CCATTCTGCAACCGAGAAAC
SHS6tr-6-2 ATGATGAGGCACCTGGAAAC GGTCACTCAAAAACCCTCAAA
SHS6tr-6-3 AACGATCTCGAGTTCCCTGA ATAGCCGCGAGGATGGAG
SHS6tr-6-4 TTGAGAAATAAGGATGTTTAGTTGATT GGTCATTTGGGAAAGGAACA
4)PCR扩增：
PCR反应体系如下：
PCR扩增条件为：
本发明反应均在ABI-9700型PCR仪中进行。
5)扩增产物的HRM分型：引物SHS6tr-6-1、SHS6tr-6-2、SHSItr-6-3、SHS6tr-6-4，扩增产物依据高分辨溶解曲线分析系统LightScanner(Idaho Technology,Inc.Salt LakeCity,USA)使用方法，将PCR扩增产物8.5ul转移至LightScanner上样板中，每孔加入20ul矿物油，温度探测区间为70℃-98℃，6-7min常规程序检测进行分析。结果如图2-图5所示：由图可知，通过对扩增产物单核苷酸位点溶解曲线的微小差异，4对引物可将六倍体I.trifida与其他倍型I.trifida以及其它参试甘薯品种，清楚地区分开来。
以上所述实施例仅表达了本申请的具体实施方式，其描述较为具体和详细，但并不能因此而理解为对本申请保护范围的限制。应当指出的是，对于本领域的普通技术人员来说，在不脱离本申请技术方案构思的前提下，还可以做出若干变形和改进，这些都属于本申请的保护范围。
序列表
<110> 四川省农业科学院生物技术核技术研究所
<120> 六倍体I.trifida基因组特异SNP分子标记引物及应用
<160> 8
<170> SIPOSequenceListing 1.0
<210> 1
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 1
cagagctagg gttcggagaa 20
<210> 2
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 2
ccattctgca accgagaaac 20
<210> 3
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 3
atgatgaggc acctggaaac 20
<210> 4
<211> 21
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 4
ggtcactcaa aaaccctcaa a 21
<210> 5
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 5
aacgatctcg agttccctga 20
<210> 6
<211> 18
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 6
atagccgcga ggatggag 18
<210> 7
<211> 27
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 7
ttgagaaata aggatgttta gttgatt 27
<210> 8
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 8
ggtcatttgg gaaaggaaca 20

Claims (6)

1.六倍体I.trifida基因组特异SNP分子标记引物，其特征在于，引物有四对，分别为命名为SHS6tr-6-1、SHS6tr-6-2、SHS6tr-6-3和SHS6tr-6-4，其中，SHS6tr-6-1的前向引物序列如SEQ ID No.1所示，后向引物序列如SEQ ID No.2所示；SHS6tr-6-2的前向引物序列如SEQ ID No.3所示，后向引物序列如SEQ ID No.4所示；SHS6tr-6-3的前向引物序列如SEQID No.5所示，后向引物序列如SEQ ID No.6所示；SHS6tr-6-4的前向引物序列如SEQ IDNo.7所示，后向引物序列如SEQ ID No.8所示。
2.权利要求1所述的引物在六倍体I.trifida基因组检测上的应用。
3.权利要求1所述的引物在甘薯遗传育种上的应用。
4.一种六倍体I.trifida基因组特异SNP基因分型的检测方法，其特征在于，包括如下步骤：
(1)提取待检测甘薯的DNA；
(2)以步骤(1)提取的DNA为模板，以权利要求1所述的SHS6tr-6-1、SHS6tr-6-2、SHS6tr-6-3或SHS6tr-6-4中的任一引物进行PCR扩增；
(3)将步骤(2)的扩增产物加入高分辨熔解曲线分析系统中进行基因分型检测。
5.根据权利要求4所述的检测方法，其特征在于，步骤(1)中，提取待检测甘薯的DNA的方法为：取新鲜幼嫩叶片，液氮研磨成细粉后加预热至65℃采用CTAB法提取参试材料DNA，溶于1×TE溶液中，加入RNA酶至终浓度50μg/μl，120V恒定电压下，1.5％琼脂糖凝胶电泳30分钟，检测DNA浓度及质量。
6.根据权利要求4所述的检测方法，其特征在于，步骤(2)中，PCR扩增的反应体系为：
PCR扩增条件为：
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Cited By (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN114622032A (zh) * 2022-03-23 2022-06-14 中国科学院华南植物园 甘薯小象甲抗性位点spwr1、spwr2、分子标记及其应用

Citations (11)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN103397027A (zh) * 2013-08-08 2013-11-20 南京农业大学 一个基于高分辨率溶解曲线鉴定梨果皮红/绿色泽的snp 标记及其应用
CN105779574A (zh) * 2014-09-02 2016-07-20 深圳市作物分子设计育种研究院 抗稻瘟病基因Pi2的HRM检测方法及其应用
CN107022608A (zh) * 2017-03-21 2017-08-08 镇江华大检测有限公司 Snp标记及其应用
CN107058601A (zh) * 2017-06-23 2017-08-18 南京农业大学 基于高分辨率溶解曲线鉴定梨果肉低石细胞含量的snp标记及其应用
US20180127798A1 (en) * 2015-12-11 2018-05-10 National Institute Of Fisheries Science Genetic marker for discriminating and detecting causative bacteria of fish edwardsiellosis and streptococcosis, and method for discriminating and detecting causative bacteria using same
US20180195114A1 (en) * 2016-01-15 2018-07-12 National Institute Of Fisheries Science Genetic markers for discrimination and detection of viruses causing infectious aquatic organism diseases, and method of discriminating and detecting the viruses using the same
CN108411007A (zh) * 2018-05-25 2018-08-17 海南晨海水产有限公司 Snp标记及其应用
CN109504798A (zh) * 2019-01-10 2019-03-22 南京农业大学 一种基于高分辨率溶解曲线鉴定梨果核大小的snp标记及其应用
US20210332433A1 (en) * 2020-03-06 2021-10-28 Ningbo University Method for identifying genetic sex of Portunus trituberculatus
CN113736866A (zh) * 2021-09-30 2021-12-03 中国农业科学院农业基因组研究所 用于检测番茄黄化曲叶病毒病抗性的snp位点组合及其应用
CN113801947A (zh) * 2021-11-08 2021-12-17 游兆欣 与巴沙鱼生长速度性状相关的snp标记、检测引物和应用

Patent Citations (11)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN103397027A (zh) * 2013-08-08 2013-11-20 南京农业大学 一个基于高分辨率溶解曲线鉴定梨果皮红/绿色泽的snp 标记及其应用
CN105779574A (zh) * 2014-09-02 2016-07-20 深圳市作物分子设计育种研究院 抗稻瘟病基因Pi2的HRM检测方法及其应用
US20180127798A1 (en) * 2015-12-11 2018-05-10 National Institute Of Fisheries Science Genetic marker for discriminating and detecting causative bacteria of fish edwardsiellosis and streptococcosis, and method for discriminating and detecting causative bacteria using same
US20180195114A1 (en) * 2016-01-15 2018-07-12 National Institute Of Fisheries Science Genetic markers for discrimination and detection of viruses causing infectious aquatic organism diseases, and method of discriminating and detecting the viruses using the same
CN107022608A (zh) * 2017-03-21 2017-08-08 镇江华大检测有限公司 Snp标记及其应用
CN107058601A (zh) * 2017-06-23 2017-08-18 南京农业大学 基于高分辨率溶解曲线鉴定梨果肉低石细胞含量的snp标记及其应用
CN108411007A (zh) * 2018-05-25 2018-08-17 海南晨海水产有限公司 Snp标记及其应用
CN109504798A (zh) * 2019-01-10 2019-03-22 南京农业大学 一种基于高分辨率溶解曲线鉴定梨果核大小的snp标记及其应用
US20210332433A1 (en) * 2020-03-06 2021-10-28 Ningbo University Method for identifying genetic sex of Portunus trituberculatus
CN113736866A (zh) * 2021-09-30 2021-12-03 中国农业科学院农业基因组研究所 用于检测番茄黄化曲叶病毒病抗性的snp位点组合及其应用
CN113801947A (zh) * 2021-11-08 2021-12-17 游兆欣 与巴沙鱼生长速度性状相关的snp标记、检测引物和应用

Non-Patent Citations (15)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
J Y FENG等: "Analysis of evolution and genetic diversity of sweetpotato and its related different polyploidy wild species I. trifida using RAD-seq", 《BMC PLANT BIOL》 *
NCBI: "PREDICTED: Ipomoea triloba kinesin-like protein KIN-12B (LOC115996759), mRNA", 《NCBI GENBANK DATABASE》 *
任民等: "基于RAD重测序技术开发烟草品种SNP位点", 《中国烟草科学》 *
侯莉娟等: "用于羊草基因分型的SNP分子标记技术研究", 《草业学报》 *
冯俊彦等: "四种分子标记技术在甘薯及I.trifida遗传多样性研究中的应用", 《分子植物育种》 *
刘家榜等: "不同甘薯品种及其辐射诱变后代基因组变异的分子标记评价", 《山西农业科学》 *
卫波: "小麦抗旱相关基因TaDREB1的SNP标记开发与定位", 《万方硕士论文》 *
彭小松等: "利用等位基因特异性PCR检测水稻可溶性淀粉合酶基因的单核苷酸多态性", 《江西农业大学学报》 *
王大一等: "四川省高淀粉甘薯品种资源亲缘关系SRAP分析", 《西南农业学报》 *
王平等: "基于HRM体系的水稻不育系香味和抗稻瘟病基因分型研究", 《西南农业学报》 *
蒲志刚等: "甘薯抗黑斑病材料AFLP标记分子鉴定初步研究", 《西南农业学报》 *
许家磊等: "甘薯(Ipomoea batatas L.)SNP标记快速高效检测方法", 《分子植物育种》 *
钟亮等: "RAD-seq技术在柞蚕SNP开发及遗传图谱构建中的应用前景", 《蚕业科学》 *
陈孚尧等: "甘薯（I.batatas）及其近缘野生种I.trifida（6x）、I.triloba（2x）中两个重复序列Itf＿1、Itf＿2的比较分析", 《江苏省遗传学会第九次会员代表大会暨学术研讨会》 *
陈竹锋等: "基于HRM体系开发抗稻瘟病基因Pi2特异性分子标记", 《分子植物育种》 *

Cited By (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
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CN114622032A (zh) * 2022-03-23 2022-06-14 中国科学院华南植物园 甘薯小象甲抗性位点spwr1、spwr2、分子标记及其应用

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