CN109609522A - 博落回二氢苯并菲啶氧化酶基因优化序列及其应用 - Google Patents

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Abstract

本发明提供一种博落回二氢苯并菲啶氧化酶基因优化序列及其应用,具体包括对二氢苯并菲啶氧化酶基因MC6408进行密码子优化后得到优化序列MC6408opt,包括优化序列MC6408opt的重组表达载体,包括含有所述优化序列MC6408opt的重组表达载体的酵母工程菌以及其在制备血根碱中的应用。本发明将博落回中参与合成血根碱与白屈菜红碱的功能基因MC6408,根据酵母菌偏爱的密码子,进行密码子优化后得到的优化序列,整合到酿酒酵母中进行异源表达实现血根碱与白屈菜红碱的微生物转化,与未经优化的功能基因相比,能极大提高其酶催化效率,提高催化产物血根碱的含量,降低血根碱的生产成本。

Description

博落回二氢苯并菲啶氧化酶基因优化序列及其应用
技术领域
本发明涉及一种博落回二氢苯并菲啶氧化酶基因优化序列及其应用,属于基因工程与生物工程技术领域。
技术背景
药用植物是我国传统医学中具有防病治病的疗效而作为药物来源的植物,在我国医学中具有非常重要的地位。许多药用植物的有效成分就是它的次生代谢产物,由于其独特的疗效以及毒副作用小等特点引起了广泛关注。我国野生药用植物资源种类丰富,但是由于近年来自然环境的破坏加上对药用植物供不应求而致使的过度开采和滥用,导致我国的药用植物资源濒临枯竭。野生资源已经不能满足人们的需求,而人工栽培中又存在活性成分减少以及品种退化的问题,所以利用生物技术来调控药用植物的次生代谢能够有效的改善植物的代谢途径、提高植物的抗病性、抗逆性、其有效成分含量、药物的药效、产量以及品质,对于优化药用植物种质资源以及可持续发展具有重要的意义。
博落回(Macleaya cordata(Willd.)R.Br.)属于罂粟科博落回属植物,别名又叫号筒杆、落回、山号筒、山梧桐、三钱三等,生长于丘陵、低山、林边、草地、路旁,是一种野生草本植物。博落回主要分布于中国、东亚、北美洲和欧洲。博落回属植物包括博落回和小果博落回(M.microcarpa(Maxim)Fedde)两个种,作为一种传统中草药最早见于《本草拾遗》,在民间作为一种杀蛆青草药而广泛使用。随着研究的不断深入,发现博落回具有抑菌、抗炎、调节畜禽类肠道菌群等多重药理作用,博落回开始作为一种药源植物得到越来越广泛的应用。
国内外许多有关博落回化学成分的研究表明,博落回属植物的化学成分中,生物碱是最主要的次生代谢产物,其中主要包括了原阿片碱、血根碱、白屈菜红碱、小檗碱、别隐品碱、黄连碱、二氢血根碱、二氢白屈菜红碱等等。这些生物碱都具备各种用途以及多种药理作用,属于异喹啉类生物碱。研究表明,其中最主要的血根碱、白屈菜红碱以及小檗碱具有广谱抑菌的作用。另外,博落回中还有一些其他的物质如糖类、三萜化合物、甾体、挥发油、黄酮及其苷、氨基酸、蛋白质等等。因此博落回不仅具有较高的生态以及药用价值,而且具备较高的经济效益,近年来作为饲料添加剂收到广泛的关注,博落回的需求量逐年增长。然而,随着野生资源的不断开采,使得博落回资源的野生储备量逐年递减。
生物转化(biotransformation)也叫生物催化(biocatalysis),是指利用微生物全细胞或提取酶作为催化剂对外源底物进行结构修饰或定向合成而获得有价值产物的生理生化反应,其本质是生物体系中酶的催化反应。这种特定的酶催化反应具有以下特点:(1)具有高度的立体选择性。(2)反应条件温和,生产安全,不造成环境污染和后处理简单。(3)目标明确,副产物少,成本低。(4)微生物转化可以减少反应步骤。生物转化体系中以微生物转化体系应用得最为广泛。微生物分布广泛,种类繁多,易培养,周期短,在生长过程中产生丰富的酶系,利用微生物及其产生的酶进行生物转化可以生成许多有价值的化合物,且微生物的酶系所催化的反应很多是传统化学合成很难进行的反应。随着微生物的基因操作方法日渐成熟,利用现代分子生物学的手段,不仅能提高生物转化的转化率,而且能将几种不同的基因构建于同一个工程菌中,能同时进行几步转化反应,给微生物转化带来更美好的前景。
近年来,国内外对于血根碱生物合成途径的研究有过很多报道。罂粟,唐松草(Thalictrum aquilegifolium),黄唐松草(Thalictrum flavum),拟南芥,日本黄连(Coptis Japonica)和花菱草等植物中都有血根碱生源合成途径的相关功能酶基因。来自不同物种的功能基因异源表达效果不一样。D.Smolke团队比较了花菱草、蓟罂粟(A.mexicana)和罂粟的华紫堇碱合酶(cheilanthifoline synthase,CFS)基因与拟南芥、花菱草、罂粟以及酵母的CPR基因的表达情况,得出花菱草的CFS基因与拟南芥的CPR基因在酵母中有最好的表达效果,催化产生最高浓度的华紫堇碱。而迄今为止,未有学者对不同物种的P6H基因表达情况有所报道。
而如何提高外源基因的异源表达高效性是微生物合成研究中的一个亟待解决的重要问题。影响外源基因在酵母表达系统中高效表达的因素有很多,其中酵母对密码子的偏爱性,目的基因的密码子序列对产物的表达量有很大影响。在编码氨基酸的所有61个密码子中有25个是酵母所偏爱的,含有酵母本身所偏爱密码子的基因在酵母中往往有较高的表达。通过优化基因的密码子序列,可以提高宿主细胞内tRNA的丰度,同时也有利于翻译的二级结构的形成,从而使得产物表达量有所提高。
本发明拟提供一种博落回二氢苯并菲啶氧化酶(DBOX)基因进行密码子优化后的基因优化序列及其在制备血根碱中的应用。
发明内容
本发明要解决的技术问题是提供一种博落回二氢苯并菲啶氧化酶(DBOX)基因优化序列及其应用。
为了解决上述技术问题,本发明采用以下技术方案:
提供一种博落回二氢苯并菲啶氧化酶(DBOX)基因优化序列,所述优化序列为对二氢苯并菲啶氧化酶(DBOX)基因MC6408进行密码子优化后得到,记为MC6408opt,其包含如SEQ ID No.1所示的核苷酸序列;MC6408包含如SEQ ID No.3所示的核苷酸序列。
进一步地,
所述优化序列MC6408opt表达的氨基酸包含如SEQ ID No.2所示的氨基酸序列。
本发明还提供一种含有上述博落回普罗托品-6-羟基化酶(P6H)基因优化序列MC6408opt的重组表达载体。
进一步地,所述重组表达载体的质粒选自PYES2。
本发明还提供一种含有上述博落回二氢苯并菲啶氧化酶(DBOX)基因优化序列MC6408opt或上述重组表达载体的酵母工程菌株。
进一步地,
所述酵母工程菌株的宿主菌选自酵母菌株ivf。
进一步地,
本发明还提供上述博落回二氢苯并菲啶氧化酶(DBOX)基因优化序列MC6408opt、上述重组表达载体或上述酵母工程菌在制备血根碱中的应用。
本发明还提供一种采用上述博落回二氢苯并菲啶氧化酶(DBOX)基因优化序列MC6408opt、上述重组表达载体或上述酵母工程菌制备血根碱的方法,具体包括如下步骤:
(1)将上述含有博落回二氢苯并菲啶氧化酶(DBOX)基因优化序列MC6408opt与辅酶基因构建到表达载体PYES2上,然后转入酵母工程菌中,获得含有二氢苯并菲啶氧化酶(DBOX)基因优化序列MC6408opt的重组表达载体的酵母工程菌株;
(2)以pH=8.0的TE缓冲溶液作为前体溶液,加入10μmol/L~2mmol/L原阿片碱作为底物,前体饲喂步骤(1)构建的酵母工程菌;温度30°下,发酵培养24小时;
(3)收集培养后的酵母工程菌,裂解菌体、分离纯化,即得。
本发明的有益效果:
本发明将博落回中参与合成血根碱与白屈菜红碱的功能基因MC6408,根据酵母菌偏爱的密码子,进行密码子优化后,然后将得到的优化序列MC6408opt,整合到酿酒酵母中进行异源表达实现血根碱与白屈菜红碱的微生物转化,与未经优化的功能基因相比,能极大提高其酶催化效率,提高催化产物二氢血根碱及血根碱的含量,降低血根碱的生产成本。
附图说明
为了更清楚地说明本发明实施例或现有技术中的技术方案,下面将对实施例或现有技术描述中所需要使用的附图作简单地介绍,显而易见地,下面描述中的附图仅仅是本发明的一些实施例,对于本领域普通技术人员来讲,在不付出创造性劳动的前提下,还可以根据这些附图获得其他的附图。
图1为博落回中血根碱和白屈菜红碱的合成途径;
图2为密码子优化前后的功能基因MC6408、MC6408opt的催化效率比较图。
具体实施方式
为了更好地阐述该发明的内容,下面通过具体实施例对本发明进一步的验证。特在此说明,实施例只是为更直接地描述本发明,它们只是本发明的一部分,不能对本发明构成任何限制。
如附图1所示的博落回中血根碱和白屈菜红碱的合成途径,二氢苯并菲啶氧化酶(DBOX)基因参与了血根碱(SAN)和白屈菜红碱(CHE)生物合成的步骤,其能催化二氢白屈菜红碱(DHCHE)生成白屈菜红碱(CHE)以及催化二氢血根碱(DHSAN)生成血根碱(SAN)。二氢苯并菲啶氧化酶(DBOX)属于黄素蛋白氧化酶基因。
在本申请人之前的研究中,以其他物种(罂粟、花菱草)已公开在NCBI的合成血根碱与白屈菜红碱的黄素蛋白氧化酶相关基因序列为参照基因,在博落回De Novo全基因组序列中进行BLAST比对,找到2个同源性较高的基因序列(编号为Mc6407、Mc6408,参照专利:
CN106047904A,博落回中参与血根碱与白屈菜红碱合成的黄素蛋白氧化酶基因及其应用),并进行了酵母异源表达验证。
本发明对其中一个基因序列Mc6408(其核苷酸序列如SEQ ID No.3所示),根据酿酒酵母偏爱的密码子,进行密码子优化后,得到基因优化序列Mc6408opt,其核苷酸序列、氨基酸序列分别如SEQ ID No.1、SEQ ID No.2所示。
根据图1博落回中血根碱和白屈菜红碱生物合成途径图,二氢苯并菲啶氧化酶(DBOX)既可以催化二氢白屈菜红碱(DHCHE)生成白屈菜红碱(CHE)又可以催化二氢血根碱(DHSAN)生成血根碱(SAN),为了研究的方便、不重复,本发明实施例加入原阿片碱标准品作为前体物质同时加入普罗托品-6-羟基化酶(P6H)基因MC11229基因序列(其核苷酸序列如SEQ ID No.6所示)以及辅酶基因CuCPR(其核苷酸序列、氨基酸序列分别如SEQ IDNo.4、SEQID No.5所示)来研究优化后的二氢苯并菲啶氧化酶(DBOX)基因序列Mc6408opt的相关性能。由于CPR基因是P450基因在氧化底物中的一个辅酶基因,加入CPR有利于提高氧化反应效率。
基于已知的血根碱和白屈菜红碱生物合成途径,以直接前体物质二氢白屈菜红碱(DHCHE)或二氢血根碱(DHSAN)作为前体物质研究优化后的二氢苯并菲啶氧化酶(DBOX)基因序列Mc6408opt的酶催化效率也是可行的。
1、引物设计
根据infusion引物的设计原则设计各基因的引物,由上海生物工程股份有限公司合成,引物序列见下表1:
表1 PCR引物序列与产物长度
2、博落回cDNA的制备:用多糖多酚植物总RNA提取试剂盒提取博落回总RNA,并使用反转录试剂盒将其反转录为cDNA。
3、提取载体质粒
取3支经高压灭菌后的10mL离心管,分别加入5mL含100mg/L Amp的LB液体培养基,再分别加入200μL标签为PYES2-Ura、PYES2-Leu和PYES2-Trp的大肠杆菌菌液,放于台式恒温振荡仪中37℃,200rpm过夜培养。按质粒提取试剂盒说明书提取质粒测定含量。
4、基因克隆
Mc6408opt、Mc6408基因的扩增:以博落回cDNA为模板,分别选用Mc6408opt-Trp-F、Mc6408opt-Trp–R;MC Mc6408-Trp-F、MC Mc6408-Trp–R;MC11229-Ura-F、MC11229-Ura-R;CuCPR-Leu-F、CuCPR-Leu-R引物(引物序列见上表1)进行PCR扩增。PCR反应体系如下表2:
表2基因克隆PCR反应体系
轻轻混匀,短暂离心5sec。扩增条件:98℃预变性30sec,98℃10sec,58℃30sec,72℃2min(30个循环),72℃2min,4℃保持。扩增完成后,用1%的琼脂糖凝胶电泳鉴定扩增产物,目的条带用琼脂糖凝胶DNA回收试剂盒回收,并测定含量。
5、制备线性载体
取3支经高压灭菌后的10mL离心管,分别加入5mL含100mg/L Amp的LB液体培养基,再分别加入200μL标签为PYES2-Ura、PYES2-Leu和PYES2-Trp的大肠杆菌菌液,放于台式恒温振荡仪中37℃,200rpm过夜培养。按照质粒提取试剂盒说明书提取质粒测定含量。
用限制性内切酶KpnI-HF、XBal/Sph-HF将载体质粒PYES2-Ura、PYES2-Leu、PYES2-Trp回收产物分别进行双酶切,反应体系如下表3~表5:
表3载体质粒PYES2-Ura双酶切反应体系
表4载体质粒PYES2-Leu双酶切反应体系
表5载体质粒PYES2-Trp双酶切反应体系
置于37℃反应30min,反应完成后在1%的琼脂糖凝胶上电泳检测并测定含量。
6、构建表达载体
进入以下网站:
http://www.clontech.com/US/Support/xxclt_onlineToolsLoad.jsp?citemId =http://bioinfo.clontech.com/infusion/molarRatio.do&section=16260&xxheight =750,根据载体和目的基因的片段大小,计算出载体和基因所需的浓度。再根据上述所测得的基因和载体的含量,计算出相应的体积,加入Infusion酶充分混匀后,置于50℃反应20min。再将连接产物转入大肠杆菌感受态DH5α,涂板于含100mg/L Amp的LB筛选平板上,37℃倒置培养过夜。
7、构建重组质粒
将基因序列MC6408opt构建到表达载体上,并以优化前的基因序列MC6408为参照,按照同样的方法构建重组表达载体,获得重组质粒PYES2-Trp+MC6408、PYES2-Trp+MC6408opt,同时构建重组质粒PYES2-Leu+CuCPR、PYES2-Ura+MC11229;
以PYES2-Detect-F、PYES2-Detect-R为上下引物对上述重组质粒PCR扩增,PCR反应体系如下表6:
表6重组质粒PCR扩增反应体系
扩增条件:94℃预变性5min,94℃30sec,58℃30sec,72℃2min,(35个循环),72℃5min,4℃保持。经测序确认没有突变。
9、构建重组酵母菌并进行酵母工程菌发酵培养
将重组表达载体PYES2-Ura+MC6408、PYES2-His+MC6408opt分别与PYES2-Leu+CuCPR转入酵母(ivf,购自Thermo Fisher Scientific公司)中,获得酵母工程菌株MCY-3084(PYES2+MC11229+CuCPR+MC6408)、MCY-3085(PYES2+MC11229+CuCPR+MC6408opt),同时还将PYES2-Trp质粒单独转入酵母(ivf)菌株中,获得酵母工程菌株MCY-3060,作为空白对照;然后再分别在组氨酸(His)与Leu双缺陷以及Trp、Leu与Ura三缺陷的SD/Dropout选择培养基上培养48h,得到直径约l mm的单菌落。
以pH=8.0的TE缓冲溶液作为前体溶液,加入10μmol/L~2mmol/L原阿片碱作为底物,前体饲喂酵母工程菌;温度30°下发酵培养24小时。
10、样品的制备:收集培养后的酵母工程菌,裂解菌体、用甲醇抽提化合物,即得样品。
11、将制备好的样品用UPLC-Q-TOF进行检测,结果如下表1和图2所示。
本发明以MCY-3060作为空白对照,在相同条件下饲喂原阿片碱后未产生二氢血根碱和血根碱,证明酵母本身不会对实验产生影响。MCY-3084、MCY-3085均检测到了血根碱,含量结果经SPSS 19.0软件分析,P<0.05,样品之间差异显著,实验结果具有统计学意义。具体结果见表7:
表7优化前后的基因血根碱含量测定结果
上表:7的结果以及附图2表明,工程菌MC11229+CuCPR+MC6408opt催化产生的血根碱含量比MC11229+CuCPR+MC6408高,优化后的基因MC6408opt相比优化前的基因MC6408使得催化产物的含量得到了提高。具体地,优化后的MC11229+CuCPR+MC6408opt酵母工程菌使得血根碱的含量从51.770ng﹒mL-1提高到了56.361ng﹒mL-1,提高了8.9%。
以上所述为本发明的具体实施方式,但不能对本发明构成任何限制,因此需特别指出,凡是以本发明为基础,做出的任何修改与改进均落在本发明保护范围之内。
序列说明:SEQ ID No.1、SEQ ID No.2分别为MC6408opt的核苷酸序列和氨基酸序列;SEQ ID No.3为MC6408的核苷酸序列;
SEQ ID No.4、SEQ ID No.5分别为CuCPR的核苷酸序列和氨基酸序列;
SEQ ID No.6为MC11229的核苷酸序列;
SEQ ID No.7-16分别为引物MC6408opt-Trp-F、MC6408opt-Trp-R、MC6408-Trp-F、MC6408-Trp-R、PYES2-Detect-F、PYES2-Detect-R、CuCPR-Leu-F、CuCPR-Leu-R、MC11229-Ura-F、MC11229-Ura-R的核苷酸序列。
SEQUENCE LISTING
<110> 湖南美可达生物资源股份有限公司
<120> 博落回二氢苯并菲啶氧化酶基因优化序列及其应用
<130> 20181121
<160> 16
<170> PatentIn version 3.5
<210> 1
<211> 1584
<212> DNA
<213> MC6408opt 序列
<400> 1
atgggttatt tttctagatc ttctgctatt ttgtctattt tttctttttt ggttttttct 60
gcttctttgg gtatttcttc ttctgctagg gatgacttcg tccagtgctt gtctttgcag 120
cagccatcta ttccagttcc aatttatact ccaaatacta ctaattatac tactttgttt 180
agatcttctg ctagaaattt gagatatttg tctaatactt ctttgactcc agaagttatt 240
attactccaa ctcacgaatc tcacgtccaa gctgctgtta tttgttgtaa aaaacatggt 300
ttggacttga aggttagatc tggtggtcac gacgtcgaag gtttgtctta cgcttcagat 360
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gacttgttct gggctattag gggtggtggt gcttcttctt tcggtgtcat tttgtcttgg 720
aagattaagt tggtcccagt cccaccaatt gtcacagtcg ctactgtcga caggactttg 780
gagcaaggtg ctactggttt ggttcataaa tggcaatata ttgctgataa attagatgct 840
gatttgtata tggctccaac ttttactgtt gttaactctt ctagacaagg tgaaaaaact 900
gttcaagctc aattttcttt cttgtttttg ggtggtgttg ataaattgtt gcaaattatg 960
gaagctaact tcccagaatt aggtttgaag agaaacgata caatggaaat gtcttgggtt 1020
gaatctcatg tttattttta tagaagaggt tctccattgg aattgttgtt ggacagagat 1080
ccaattatga aatcattttt gaaagttaaa tcagattatg ttaaggaacc aatttcagaa 1140
gctggtttgg aagaaatttg gaagagatac attgagggtg acgctcctgc tatgttgttc 1200
actccattcg gtggtagaat gaatgaaatt tctgagttcg ctttgcctta cccacacaga 1260
gctggtaaca tttacaatat tatgtatgtt tctaattggt tgcaagagtc tgaatctgaa 1320
aaacaattag attggttgag aaaattttat tcttttatgg gacaatatgt ttctaaattt 1380
ccaagatctg cttacttaaa ttataaagat ttggatttgg gtgtcaataa taatcaagat 1440
ggtatttctg gttacttgaa cgcaaaaatt tggggtacta agtattttaa attgaatttt 1500
gaaagattgg ttttggttaa aactactgtt gatccagaaa acttttttaa aaacaagcaa 1560
tctattccat ctattacttc ttaa 1584
<210> 2
<211> 527
<212> PRT
<213> MC6408opt 序列
<400> 2
Met Gly Tyr Phe Ser Arg Ser Ser Ala Ile Leu Ser Ile Phe Ser Phe
1 5 10 15
Leu Val Phe Ser Ala Ser Leu Gly Ile Ser Ser Ser Ala Arg Asp Asp
20 25 30
Phe Val Gln Cys Leu Ser Leu Gln Gln Pro Ser Ile Pro Val Pro Ile
35 40 45
Tyr Thr Pro Asn Thr Thr Asn Tyr Thr Thr Leu Phe Arg Ser Ser Ala
50 55 60
Arg Asn Leu Arg Tyr Leu Ser Asn Thr Ser Leu Thr Pro Glu Val Ile
65 70 75 80
Ile Thr Pro Thr His Glu Ser His Val Gln Ala Ala Val Ile Cys Cys
85 90 95
Lys Lys His Gly Leu Asp Leu Lys Val Arg Ser Gly Gly His Asp Val
100 105 110
Glu Gly Leu Ser Tyr Ala Ser Asp Lys Pro Phe Val Ile Val Asp Leu
115 120 125
Val Asp Tyr Arg Asn Val Thr Val Asp Leu Lys Asp Asn Thr Ala Trp
130 135 140
Val Gln Ala Gly Ala Ser Leu Gly Glu Val Tyr Tyr Arg Ile Gly Glu
145 150 155 160
Lys Ser Lys Thr Leu Gly Phe Pro Ala Gly Phe Cys Pro Thr Val Gly
165 170 175
Val Gly Gly His Ile Ser Gly Gly Gly Phe Gly Ala Leu Val Arg Lys
180 185 190
Tyr Gly Leu Ala Ser Asp Gln Val Ile Asp Ala Tyr Ile Val Thr Val
195 200 205
Asp Gly Lys Ile Leu Asn Lys Glu Thr Met Gly Glu Asp Leu Phe Trp
210 215 220
Ala Ile Arg Gly Gly Gly Ala Ser Ser Phe Gly Val Ile Leu Ser Trp
225 230 235 240
Lys Ile Lys Leu Val Pro Val Pro Pro Ile Val Thr Val Ala Thr Val
245 250 255
Asp Arg Thr Leu Glu Gln Gly Ala Thr Gly Leu Val His Lys Trp Gln
260 265 270
Tyr Ile Ala Asp Lys Leu Asp Ala Asp Leu Tyr Met Ala Pro Thr Phe
275 280 285
Thr Val Val Asn Ser Ser Arg Gln Gly Glu Lys Thr Val Gln Ala Gln
290 295 300
Phe Ser Phe Leu Phe Leu Gly Gly Val Asp Lys Leu Leu Gln Ile Met
305 310 315 320
Glu Ala Asn Phe Pro Glu Leu Gly Leu Lys Arg Asn Asp Thr Met Glu
325 330 335
Met Ser Trp Val Glu Ser His Val Tyr Phe Tyr Arg Arg Gly Ser Pro
340 345 350
Leu Glu Leu Leu Leu Asp Arg Asp Pro Ile Met Lys Ser Phe Leu Lys
355 360 365
Val Lys Ser Asp Tyr Val Lys Glu Pro Ile Ser Glu Ala Gly Leu Glu
370 375 380
Glu Ile Trp Lys Arg Tyr Ile Glu Gly Asp Ala Pro Ala Met Leu Phe
385 390 395 400
Thr Pro Phe Gly Gly Arg Met Asn Glu Ile Ser Glu Phe Ala Leu Pro
405 410 415
Tyr Pro His Arg Ala Gly Asn Ile Tyr Asn Ile Met Tyr Val Ser Asn
420 425 430
Trp Leu Gln Glu Ser Glu Ser Glu Lys Gln Leu Asp Trp Leu Arg Lys
435 440 445
Phe Tyr Ser Phe Met Gly Gln Tyr Val Ser Lys Phe Pro Arg Ser Ala
450 455 460
Tyr Leu Asn Tyr Lys Asp Leu Asp Leu Gly Val Asn Asn Asn Gln Asp
465 470 475 480
Gly Ile Ser Gly Tyr Leu Asn Ala Lys Ile Trp Gly Thr Lys Tyr Phe
485 490 495
Lys Leu Asn Phe Glu Arg Leu Val Leu Val Lys Thr Thr Val Asp Pro
500 505 510
Glu Asn Phe Phe Lys Asn Lys Gln Ser Ile Pro Ser Ile Thr Ser
515 520 525
<210> 3
<211> 1584
<212> DNA
<213> MC6408序列
<400> 3
atggggtact tctcaagatc atctgcaatc ctctcaatct tttctttcct tgtcttctca 60
gcttctttgg gaatttcgag ttcagctcgc gacgactttg ttcaatgtct ttccctccaa 120
caaccttcca tcccagtccc tatctacaca ccaaacacca cgaattatac aacacttttc 180
agatcctctg cacgaaacct tagatattta tctaacactt ctcttacacc tgaagttatt 240
attacaccta cccatgaatc ccatgttcaa gcagctgtta tttgctgtaa gaaacatggg 300
ttagacctca aagttcgaag cggtggccat gatgtcgaag gcctctctta tgcatccgat 360
aaaccatttg ttatcgttga cttggtcgat tatagaaacg tcaccgttga tctaaaagac 420
aacactgcat gggtccaagc tggtgcttcc cttggggaag tttattatag aattggagag 480
aagagcaaga cccttgggtt cccagccggg ttttgcccca ccgttggtgt tggtgggcat 540
attagtggag gtggattcgg tgctttggtg cgaaaatatg gccttgcatc tgatcaagtc 600
attgatgctt acatagtcac tgttgatggc aagattctta acaaagaaac aatgggagaa 660
gatctatttt gggccattag aggtggggga gcatcgagct tcggagttat tctctcatgg 720
aaaatcaaat tggttcctgt tccacctatt gttactgttg ccacggtcga tagaacctta 780
gaacaaggag caacaggcct tgttcataag tggcaatata tcgccgataa actcgatgca 840
gacctctaca tggcgcccac atttactgtg gttaattcta gtagacaagg tgagaaaacg 900
gtgcaagctc aattctcctt cttgttcctt ggcggtgttg acaagctcct ccaaatcatg 960
gaagctaact tccctgaatt gggtttgaag agaaacgaca ccatggaaat gagttgggtc 1020
gaatctcatg tctatttcta caggcgtgga agtccattag aacttctatt ggacagagat 1080
cctataatga agagcttcct caaagtaaaa tctgactatg taaaggaacc aatatcagaa 1140
gctggattag aagagatatg gaaaaggtat atcgaaggag atgcaccagc aatgctattc 1200
actccttttg gtggaaggat gaatgagatc tctgagtttg cacttcctta cccacataga 1260
gccggaaaca tatacaatat tatgtacgtc tcgaactggc tacaagaaag tgaatcagaa 1320
aaacagttag actggttgcg aaaattctac agtttcatgg gtcaatatgt ttctaagttc 1380
ccaagaagtg catatctcaa ctacaaggat cttgacttgg gagtaaataa caaccaggat 1440
ggtatctcag gttacttaaa tgcgaaaatt tggggaacta aatactttaa gcttaacttc 1500
gagagattgg tacttgtgaa gaccacggtt gatcctgaaa atttcttcaa gaacaaacaa 1560
agtattccat ccattacttc atag 1584
<210> 4
<211> 2127
<212> DNA
<213> CuCPR序列
<400> 4
atgcaatcgg aatccagttc tatgaaggct tctccatttg acttcatgtc ggctataatt 60
aagggcagga tggatccgtc taattcttca tttcaatcga ctggcgaggg tgcctcagtt 120
attttcgaga atcgcgagct ggttgcgatc ttaactacct cgatcgctgt catgattggc 180
tgctttgttg ttcttgtgtg gcgaagatcc ggaaatcgaa aagttaagac tatagagctt 240
cctaagccgt tgcttgggaa ggagccagag ccagaagttg acgacgggaa gaagaaggtt 300
acgatattct ttggtacgca gactggtact gctgaaggct ttgcaaaggc tctatctgac 360
gaggcgaaag cacggtacga taaggccaag tttagagttg ttgatttgga tgattatggg 420
gctgacgaag atgaatacga acaaaaattg aaaaaggagt ctgtagctgt tttcttcttg 480
gcaacgtatg gcgatggaga gcccactgat aatgccgcaa gattctataa atggttcacc 540
gagggtaaag agagagggga atgtcttcag aacctcaatt atgcagtctt tggccttggc 600
aaccgacaat atgagcattt taataagatt gcaaaagtgg ttgatgagct gcttgagact 660
cagggtggta agcgccttgt aaaagttgga cttggagatg acgatcagtg catagaggat 720
gacttctctg cttggcgaga atcattgtgg cctgagttgg atcaattgct tcgggatgag 780
gatgatgcag caactgtgac cacaccttac acagctgcca tatcagaata ccgagtggta 840
ttccatgatc cttcagatgt aactgatgac aaaaagaact ggatgaatgc aaatggtcat 900
gctgtacatg acgcacaaca tccattcaga tctaatgtgg ttgtgagaaa ggagctccat 960
acacctgcgt ctgatcgttc ttgtactcat ctagagtttg atatttctga gtctgcactc 1020
aaatatgaaa caggggatca tgttggtgtt tactgtgaaa atttaaccga gactgttgat 1080
gaggctctaa atttattggg tttgtctcct gaaacgtatt tctccattca tactgataat 1140
gaggatggca cccaactagg tggaagctct ttaccacctc cttttccatc ctgcaccctc 1200
agaacagcat tgactcgata tgcagatctt ttaaattcac ccaaaaagtc agcattgctc 1260
gcattagcag cacatgcttc aaatcctata gaggctgacc gattaagata tcttgcatca 1320
cctgctggga aggatgaata ttctcagtct gtggttggta gccagaaaag cctgcttgaa 1380
gtcatggctg aatttccttc tgccaagcct ccacttggtg tcttctttgc agctgttgca 1440
ccacgtttac agcctcgatt ctactccata tcatcatctc caaggatggc tccatctaga 1500
attcatgtta cttgtgctct tgtctatgac aaaatgccaa ctggacgtat tcataaagga 1560
atttgctcta cttggatgaa gaattctgtg cccatggaga aaatccatga gtgcagttgg 1620
gctccaattt ttgtgaggca atcaaacttc aagcttcctt ctgatagtaa agtgcctatt 1680
atcatggttg gtcctggaac tggattggct cctttcagag gtttcttaca ggaaagatta 1740
gctttgaaag aatctggagt agaattgggg ccttccatat tgttctttgg atgcagaaac 1800
cgtgcaatgg attatatata cgaggatgag ctgaacaact ttgtcgagac tggtgctctc 1860
tccgagttgg ttatcgcctt ctcgcgtgaa ggtccaacga aagaatacgt gcaacataaa 1920
atgacagaga aggcgtcaga catctggaat ttgatatcac aaggtgctta cttatatgta 1980
tgcggtgatg caaagggaat ggctagagac gtccacagaa ctctccacac catcgtgcaa 2040
gaacagggat ctcttgacag ctcgaaagct gagagcatgg tgaagaatct acaaacgagc 2100
ggaaggtatc tgcgtgatgt gtggtga 2127
<210> 5
<211> 708
<212> PRT
<213> CuCPR序列
<400> 5
Met Gln Ser Glu Ser Ser Ser Met Lys Ala Ser Pro Phe Asp Phe Met
1 5 10 15
Ser Ala Ile Ile Lys Gly Arg Met Asp Pro Ser Asn Ser Ser Phe Gln
20 25 30
Ser Thr Gly Glu Gly Ala Ser Val Ile Phe Glu Asn Arg Glu Leu Val
35 40 45
Ala Ile Leu Thr Thr Ser Ile Ala Val Met Ile Gly Cys Phe Val Val
50 55 60
Leu Val Trp Arg Arg Ser Gly Asn Arg Lys Val Lys Thr Ile Glu Leu
65 70 75 80
Pro Lys Pro Leu Leu Gly Lys Glu Pro Glu Pro Glu Val Asp Asp Gly
85 90 95
Lys Lys Lys Val Thr Ile Phe Phe Gly Thr Gln Thr Gly Thr Ala Glu
100 105 110
Gly Phe Ala Lys Ala Leu Ser Asp Glu Ala Lys Ala Arg Tyr Asp Lys
115 120 125
Ala Lys Phe Arg Val Val Asp Leu Asp Asp Tyr Gly Ala Asp Glu Asp
130 135 140
Glu Tyr Glu Gln Lys Leu Lys Lys Glu Ser Val Ala Val Phe Phe Leu
145 150 155 160
Ala Thr Tyr Gly Asp Gly Glu Pro Thr Asp Asn Ala Ala Arg Phe Tyr
165 170 175
Lys Trp Phe Thr Glu Gly Lys Glu Arg Gly Glu Cys Leu Gln Asn Leu
180 185 190
Asn Tyr Ala Val Phe Gly Leu Gly Asn Arg Gln Tyr Glu His Phe Asn
195 200 205
Lys Ile Ala Lys Val Val Asp Glu Leu Leu Glu Thr Gln Gly Gly Lys
210 215 220
Arg Leu Val Lys Val Gly Leu Gly Asp Asp Asp Gln Cys Ile Glu Asp
225 230 235 240
Asp Phe Ser Ala Trp Arg Glu Ser Leu Trp Pro Glu Leu Asp Gln Leu
245 250 255
Leu Arg Asp Glu Asp Asp Ala Ala Thr Val Thr Thr Pro Tyr Thr Ala
260 265 270
Ala Ile Ser Glu Tyr Arg Val Val Phe His Asp Pro Ser Asp Val Thr
275 280 285
Asp Asp Lys Lys Asn Trp Met Asn Ala Asn Gly His Ala Val His Asp
290 295 300
Ala Gln His Pro Phe Arg Ser Asn Val Val Val Arg Lys Glu Leu His
305 310 315 320
Thr Pro Ala Ser Asp Arg Ser Cys Thr His Leu Glu Phe Asp Ile Ser
325 330 335
Glu Ser Ala Leu Lys Tyr Glu Thr Gly Asp His Val Gly Val Tyr Cys
340 345 350
Glu Asn Leu Thr Glu Thr Val Asp Glu Ala Leu Asn Leu Leu Gly Leu
355 360 365
Ser Pro Glu Thr Tyr Phe Ser Ile His Thr Asp Asn Glu Asp Gly Thr
370 375 380
Gln Leu Gly Gly Ser Ser Leu Pro Pro Pro Phe Pro Ser Cys Thr Leu
385 390 395 400
Arg Thr Ala Leu Thr Arg Tyr Ala Asp Leu Leu Asn Ser Pro Lys Lys
405 410 415
Ser Ala Leu Leu Ala Leu Ala Ala His Ala Ser Asn Pro Ile Glu Ala
420 425 430
Asp Arg Leu Arg Tyr Leu Ala Ser Pro Ala Gly Lys Asp Glu Tyr Ser
435 440 445
Gln Ser Val Val Gly Ser Gln Lys Ser Leu Leu Glu Val Met Ala Glu
450 455 460
Phe Pro Ser Ala Lys Pro Pro Leu Gly Val Phe Phe Ala Ala Val Ala
465 470 475 480
Pro Arg Leu Gln Pro Arg Phe Tyr Ser Ile Ser Ser Ser Pro Arg Met
485 490 495
Ala Pro Ser Arg Ile His Val Thr Cys Ala Leu Val Tyr Asp Lys Met
500 505 510
Pro Thr Gly Arg Ile His Lys Gly Ile Cys Ser Thr Trp Met Lys Asn
515 520 525
Ser Val Pro Met Glu Lys Ile His Glu Cys Ser Trp Ala Pro Ile Phe
530 535 540
Val Arg Gln Ser Asn Phe Lys Leu Pro Ser Asp Ser Lys Val Pro Ile
545 550 555 560
Ile Met Val Gly Pro Gly Thr Gly Leu Ala Pro Phe Arg Gly Phe Leu
565 570 575
Gln Glu Arg Leu Ala Leu Lys Glu Ser Gly Val Glu Leu Gly Pro Ser
580 585 590
Ile Leu Phe Phe Gly Cys Arg Asn Arg Ala Met Asp Tyr Ile Tyr Glu
595 600 605
Asp Glu Leu Asn Asn Phe Val Glu Thr Gly Ala Leu Ser Glu Leu Val
610 615 620
Ile Ala Phe Ser Arg Glu Gly Pro Thr Lys Glu Tyr Val Gln His Lys
625 630 635 640
Met Thr Glu Lys Ala Ser Asp Ile Trp Asn Leu Ile Ser Gln Gly Ala
645 650 655
Tyr Leu Tyr Val Cys Gly Asp Ala Lys Gly Met Ala Arg Asp Val His
660 665 670
Arg Thr Leu His Thr Ile Val Gln Glu Gln Gly Ser Leu Asp Ser Ser
675 680 685
Lys Ala Glu Ser Met Val Lys Asn Leu Gln Thr Ser Gly Arg Tyr Leu
690 695 700
Arg Asp Val Trp
705
<210> 6
<211> 1617
<212> DNA
<213> MC11229序列
<400> 6
atggctgctc ttcttgcctt ggttttcctc tacaatttca tcatcatctg gagctcatcc 60
ccaagaacca ctatcaacgg taagaaacaa attaggaagg cacccatggc agccggcgca 120
tggccgattc ttggtcacct tcatttgttt ggatccggtg agctgcctca caaaatgctt 180
gcagccatgg ctgaaaagta tggctccgcc ttcatgatga agttcggtaa gcacacaaca 240
ctagttgtga gtgacacccg catagtaaaa gaatgtttca ctactaatga taccctcttt 300
gctaaccgtc cttcgaccac cgcctttgat ctcatgactt atgccaatga ttccgttgct 360
ttcacaccct atggtcctta ttggcgagag cttagaaaga tatccactct caaacttctc 420
tctaaccacc gtctccaggc catcaaggac gttcgagcct ccgaggtgaa cgtatgcttc 480
agggaactat acaatttatg caataagcag aataaaaatg atggagctga tcatgttttg 540
gtggatatga agaaatggtt tgaagaggtc tcaaacaacg tcgtgatgag ggtaatcgtt 600
gggagacaga acttcgggtc taagattgtg cgtggtgagg aggaggccgt caattacaag 660
aaagtcatgg atgaactctt acgacttgct agtctgtcta tgttatctga tttcgctcct 720
ttacttggtt ggttggatat tttccaagga aacatgagcg ccatgaaacg aaatgccaag 780
aaagtcgaca ccatacttga gggctggttg gaagagcata ggaataagaa gaagaagagc 840
tcatcatcat catcatcatc atcatcatca tcatcatcat catcatctgg tgagaatgac 900
caagacttca tggatgttat gttgtcgatt attgaggaga ccaagttgtc tggccgtgat 960
gctgatactg ttattaaagc tacttgcttg gccatgatca tgggtgggac agacaccacg 1020
gcggtgagtc taacatggat cgtctcttta ctgatgaaca atcgtcatgt actgaagaag 1080
gctagagaag aattggacgc gctcgtgggg aaggatagac aagtggaaga ttcagatttg 1140
aagaatttgg tgtacatgaa tgccatcgtc aaggaaacga tgcgattatt cccattgggt 1200
gctcttcttg aacgtgaaac caaggaggac tgtgaggttg gtgggttcca gctccaaggt 1260
ggttcgcgtt tactagtgaa tgtatggaag ttacagcgag accccaacgt gtggtcggat 1320
ccaacagagt ttagaccaga gagatttcta tcggagaatg cggatataga cgtcgggggt 1380
caacatttcg aactactacc atttggggcc ggtagaaggg tgtgcccggg agtgtcgttc 1440
gcgctccaat tcatgcattt ggtactggct cgtctcatcc atggctatga attgggaacc 1500
cagaatgatg aggatgtgga tttaactgag agcacagaag gacatgttaa ccacaaagca 1560
tcccccctcg atctcatcct caccccacgc ctccatccca agctttatga gtattag 1617
<210> 7
<211> 36
<212> DNA
<213> MC6408opt-Trp-F序列
<400> 7
ggaatattaa gcttgatggg ttatttttct agatct 36
<210> 8
<211> 36
<212> DNA
<213> MC6408opt-Trp-R序列
<400> 8
gcggccctct agatgttaag aagtaataga tggaat 36
<210> 9
<211> 40
<212> DNA
<213> MC6408-Trp-F序列
<400> 9
ggaatattaa gcttgatggg gtacttctca agatcatctg 40
<210> 10
<211> 40
<212> DNA
<213> MC6408-Trp-R序列
<400> 10
gcggccctct agatgctatg aagtaatgga tggaatactt 40
<210> 11
<211> 21
<212> DNA
<213> PYES2-Detect-F序列
<400> 11
accccggatc ggactactag c 21
<210> 12
<211> 24
<212> DNA
<213> PYES2-Detect-R序列
<400> 12
tccttccttt tcggttagag cgga 24
<210> 13
<211> 36
<212> DNA
<213> CuCPR-Leu-F序列
<400> 13
ggaatattaa gcttgatgca atcggaatcc agttct 36
<210> 14
<211> 36
<212> DNA
<213> CuCPR-Leu-R序列
<400> 14
gatgcggccc tctagtcacc acacatcacg cagata 36
<210> 15
<211> 38
<212> DNA
<213> MC11229-Ura-F序列
<400> 15
ggaatattaa gcttgatggc tgctcttctt gccttggt 38
<210> 16
<211> 48
<212> DNA
<213> MC11229-Ura-R序列
<400> 16
gatgcggccc tctagctaat actcataaag cttgggatgg aggcgtgg 48

Claims (10)

1.一种博落回二氢苯并菲啶氧化酶基因优化序列,其特征在于,所述优化序列为对二氢苯并菲啶氧化酶基因MC6408进行密码子优化后得到,记为MC6408opt,其包含如SEQ IDNo.1所示的核苷酸序列;MC6408其包含如SEQ ID No.3所示的核苷酸序列。
2.根据权利要求1所述的博落回二氢苯并菲啶氧化酶基因优化序列,其特征在于,所述优化序列MC6408opt表达的氨基酸包含如SEQ ID No.2所示的氨基酸序列。
3.一种含有上述博落回二氢苯并菲啶氧化酶基因优化序列MC6408opt的重组表达载体。
4.根据权利要求3所述的含有上述博落回二氢苯并菲啶氧化酶基因优化序列MC6408opt的重组表达载体,其特征在于,其质粒选自PYES2。
5.一种含有权利要求1所述博落回二氢苯并菲啶氧化酶基因优化序列MC6408opt的酵母工程菌株。
6.根据权利要求5所述的博落回二氢苯并菲啶氧化酶基因优化序列MC6408opt的酵母工程菌株,其特征在于,所述酵母工程菌株的宿主菌选自酵母菌株ivf。
7.一种含有权利要求3所述含有博落回二氢苯并菲啶氧化酶基因优化序列MC6408opt的重组表达载体的酵母工程菌株。
8.根据权利要求7所述的含有博落回二氢苯并菲啶氧化酶基因优化序列MC6408opt的重组表达载体的酵母工程菌株,其特征在于,所述酵母工程菌株的宿主菌选自酵母菌株ivf。
9.如权利要求1所述的博落回二氢苯并菲啶氧化酶基因优化序列MC6408opt、如权利要求3所述的重组表达载体或如权利要求5所述酵母工程菌在制备血根碱中的应用。
10.采用权利要求1所述博落回普罗托品-6-羟基化酶基因优化序列制备血根碱的方法,其特征在于,具体包括如下步骤:
(1)将上述含有博落回二氢苯并菲啶氧化酶基因优化序列MC6408opt与辅酶基因构建到表达载体PYES2上,然后转入酵母工程菌中,获得含有二氢苯并菲啶氧化酶基因优化序列MC6408opt的重组表达载体的酵母工程菌株;
(2)以pH=8.0的TE缓冲溶液作为前体溶液,加入10μmol/L~2mmol/L原阿片碱作为底物,前体饲喂步骤(1)构建的酵母工程菌;温度30°下,发酵培养24小时;
(3)收集培养后的酵母工程菌,裂解菌体、分离纯化,即得。
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Cited By (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN112063647A (zh) * 2020-09-17 2020-12-11 云南农业大学 酿酒酵母重组菌Cuol01的构建方法、酿酒酵母重组菌Cuol02及应用

Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN105441464A (zh) * 2015-11-19 2016-03-30 江南大学 一种葡聚糖外切酶ii基因的密码子优化及其毕赤酵母表达系统
CN106047904A (zh) * 2016-06-30 2016-10-26 湖南美可达生物资源有限公司 博落回中参与血根碱与白屈菜红碱合成的黄素蛋白氧化酶基因及其应用

Patent Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN105441464A (zh) * 2015-11-19 2016-03-30 江南大学 一种葡聚糖外切酶ii基因的密码子优化及其毕赤酵母表达系统
CN106047904A (zh) * 2016-06-30 2016-10-26 湖南美可达生物资源有限公司 博落回中参与血根碱与白屈菜红碱合成的黄素蛋白氧化酶基因及其应用

Non-Patent Citations (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
HONG HU等: "Codon Optimization Significantly Improves the Expression Level of a Keratinase Gene in Pichia pastoris", 《PLOS ONE》 *
知识天堂360: "密码子的简并性及偏好性", 《360个人图书馆》 *
赵翔 等: "毕赤酵母的密码子用法分析", 《生物工程学报》 *

Cited By (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN112063647A (zh) * 2020-09-17 2020-12-11 云南农业大学 酿酒酵母重组菌Cuol01的构建方法、酿酒酵母重组菌Cuol02及应用
CN112063647B (zh) * 2020-09-17 2023-05-02 云南农业大学 酿酒酵母重组菌Cuol01的构建方法、酿酒酵母重组菌Cuol02及应用

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