CN109337963B - 一种连续体积梯度毛细管数字pcr方法和试剂盒 - Google Patents
一种连续体积梯度毛细管数字pcr方法和试剂盒 Download PDFInfo
- Publication number
- CN109337963B CN109337963B CN201811256687.XA CN201811256687A CN109337963B CN 109337963 B CN109337963 B CN 109337963B CN 201811256687 A CN201811256687 A CN 201811256687A CN 109337963 B CN109337963 B CN 109337963B
- Authority
- CN
- China
- Prior art keywords
- capillary
- oil phase
- digital pcr
- capillary tube
- pcr
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Active
Links
- 238000007847 digital PCR Methods 0.000 title claims abstract description 36
- 238000000034 method Methods 0.000 title claims abstract description 31
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 claims abstract description 18
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims abstract description 17
- 239000000203 mixture Substances 0.000 claims abstract description 11
- 238000002156 mixing Methods 0.000 claims abstract description 9
- 239000003921 oil Substances 0.000 claims description 37
- HVYWMOMLDIMFJA-DPAQBDIFSA-N cholesterol Chemical compound C1C=C2C[C@@H](O)CC[C@]2(C)[C@@H]2[C@@H]1[C@@H]1CC[C@H]([C@H](C)CCCC(C)C)[C@@]1(C)CC2 HVYWMOMLDIMFJA-DPAQBDIFSA-N 0.000 claims description 20
- 229920001214 Polysorbate 60 Polymers 0.000 claims description 10
- NWGKJDSIEKMTRX-AAZCQSIUSA-N Sorbitan monooleate Chemical group CCCCCCCC\C=C/CCCCCCCC(=O)OC[C@@H](O)[C@H]1OC[C@H](O)[C@H]1O NWGKJDSIEKMTRX-AAZCQSIUSA-N 0.000 claims description 10
- 239000004359 castor oil Substances 0.000 claims description 10
- 235000019438 castor oil Nutrition 0.000 claims description 10
- 235000012000 cholesterol Nutrition 0.000 claims description 10
- ZEMPKEQAKRGZGQ-XOQCFJPHSA-N glycerol triricinoleate Natural products CCCCCC[C@@H](O)CC=CCCCCCCCC(=O)OC[C@@H](COC(=O)CCCCCCCC=CC[C@@H](O)CCCCCC)OC(=O)CCCCCCCC=CC[C@H](O)CCCCCC ZEMPKEQAKRGZGQ-XOQCFJPHSA-N 0.000 claims description 10
- 239000004094 surface-active agent Substances 0.000 claims description 10
- 239000000523 sample Substances 0.000 claims description 9
- 239000005662 Paraffin oil Substances 0.000 claims description 8
- 238000010438 heat treatment Methods 0.000 claims description 6
- 239000007850 fluorescent dye Substances 0.000 claims description 4
- 239000012047 saturated solution Substances 0.000 claims description 4
- 238000007789 sealing Methods 0.000 claims description 4
- LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N Ethanol Chemical compound CCO LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 3
- ZEMPKEQAKRGZGQ-AAKVHIHISA-N 2,3-bis[[(z)-12-hydroxyoctadec-9-enoyl]oxy]propyl (z)-12-hydroxyoctadec-9-enoate Chemical compound CCCCCCC(O)C\C=C/CCCCCCCC(=O)OCC(OC(=O)CCCCCCC\C=C/CC(O)CCCCCC)COC(=O)CCCCCCC\C=C/CC(O)CCCCCC ZEMPKEQAKRGZGQ-AAKVHIHISA-N 0.000 claims description 2
- 230000003287 optical effect Effects 0.000 abstract 1
- 238000003752 polymerase chain reaction Methods 0.000 description 29
- 239000012071 phase Substances 0.000 description 20
- 235000019198 oils Nutrition 0.000 description 19
- 239000007788 liquid Substances 0.000 description 11
- 235000019476 oil-water mixture Nutrition 0.000 description 8
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 description 6
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 6
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 description 6
- 238000001514 detection method Methods 0.000 description 5
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 description 5
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 description 5
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 description 5
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 description 5
- 238000012408 PCR amplification Methods 0.000 description 4
- 230000003321 amplification Effects 0.000 description 4
- 238000003199 nucleic acid amplification method Methods 0.000 description 4
- 238000003753 real-time PCR Methods 0.000 description 4
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 description 3
- 238000011002 quantification Methods 0.000 description 3
- 101150039808 Egfr gene Proteins 0.000 description 2
- 206010028980 Neoplasm Diseases 0.000 description 2
- 238000004364 calculation method Methods 0.000 description 2
- 238000011161 development Methods 0.000 description 2
- 238000009826 distribution Methods 0.000 description 2
- 108700021358 erbB-1 Genes Proteins 0.000 description 2
- 230000005484 gravity Effects 0.000 description 2
- 238000011160 research Methods 0.000 description 2
- 239000012898 sample dilution Substances 0.000 description 2
- 229920006395 saturated elastomer Polymers 0.000 description 2
- 238000005245 sintering Methods 0.000 description 2
- 102000053602 DNA Human genes 0.000 description 1
- 230000004568 DNA-binding Effects 0.000 description 1
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 description 1
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 description 1
- JLVVSXFLKOJNIY-UHFFFAOYSA-N Magnesium ion Chemical compound [Mg+2] JLVVSXFLKOJNIY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- CGNLCCVKSWNSDG-UHFFFAOYSA-N SYBR Green I Chemical compound CN(C)CCCN(CCC)C1=CC(C=C2N(C3=CC=CC=C3S2)C)=C2C=CC=CC2=[N+]1C1=CC=CC=C1 CGNLCCVKSWNSDG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000004075 alteration Effects 0.000 description 1
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 1
- 238000000137 annealing Methods 0.000 description 1
- 239000008346 aqueous phase Substances 0.000 description 1
- 238000003556 assay Methods 0.000 description 1
- 239000008280 blood Substances 0.000 description 1
- 210000004369 blood Anatomy 0.000 description 1
- 239000000872 buffer Substances 0.000 description 1
- 239000007853 buffer solution Substances 0.000 description 1
- 201000011510 cancer Diseases 0.000 description 1
- 238000003759 clinical diagnosis Methods 0.000 description 1
- 239000002131 composite material Substances 0.000 description 1
- 238000004925 denaturation Methods 0.000 description 1
- 230000036425 denaturation Effects 0.000 description 1
- 238000011304 droplet digital PCR Methods 0.000 description 1
- 239000000975 dye Substances 0.000 description 1
- 230000000694 effects Effects 0.000 description 1
- 238000011068 loading method Methods 0.000 description 1
- 229910001425 magnesium ion Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000000463 material Substances 0.000 description 1
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 1
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 1
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 description 1
- 238000004445 quantitative analysis Methods 0.000 description 1
- 238000001507 sample dispersion Methods 0.000 description 1
- 238000012163 sequencing technique Methods 0.000 description 1
- 238000006467 substitution reaction Methods 0.000 description 1
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 1
- 230000001225 therapeutic effect Effects 0.000 description 1
- 238000012546 transfer Methods 0.000 description 1
- 238000011144 upstream manufacturing Methods 0.000 description 1
Images
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6844—Nucleic acid amplification reactions
- C12Q1/6851—Quantitative amplification
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Zoology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Immunology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
Abstract
一种连续体积梯度毛细管数字PCR方法,它包含以下步骤:将含荧光基团的PCR反应体系和与水等密度油相按照1∶(2~4)的体积比混匀,置入内径由大到小连续变化的毛细管中进行PCR反应,光学信号采集设备下统计阳性微滴占比25%~55%区域的微滴数和微滴半径,计算PCR模板拷贝数。本发明可以降低数字PCR的成本、并简化其操作过程。
Description
技术领域
本发明涉及数字PCR领域,特别涉及一种连续体积梯度毛细管数字PCR方法。
背景技术
现代生物学研究,特别是医学研究时常涉及对核酸定量分析的需求。比如检测血液中某些游离DNA及其含量,可以指导某些癌症的临床诊断,以及监控癌症的治疗效果。以往的定量主要采取荧光定量PCR进行相对定量,即选取一个表达稳定的基因的转录物作为参照,来评判目的核酸的量的高低。但这种方法易受非目的核酸分子(背景噪音)的干扰,只适用于定性或者低精度检测,无法满足某些含量特别稀少的目标核酸分子的检测。
数字PCR(dPCR)则能通过大规模的平行PCR扩增,将微弱的扩增信号从背景噪音中提炼出来,以“终点信号的有或无”来统计被扩增的分子的个数。近几年来,随着纳米制造技术和微流体技术的发展,及二代测序技术发展起来的“油包水PCR”技术,可以一次生成数万乃至数百万个纳升甚至皮升级别的单个油包水微滴,以此作为dPCR的样品分散载体,而产生的微滴式数字PCR(ddPCR)技术,是目前相对成熟的数字PCR平台。
一方面,ddPCR需要借助微滴发生器来实现均匀微滴的生成,将微滴转移到96孔板进行PCR后,又需要微滴分析仪进行信号读取。该过程涉及的仪器价格较高,普通实验室难以承受。
另一方面,由于数字PCR是根据阳性液滴个数来统计模板拷贝数的,数字PCR中每个液滴中模板的拷贝数不能太高也不能太低,太高会造成最终统计拷贝数偏少,太低又会导致统计误差过大,统计学上最完美的是1个左右。为了调试实验模板用量,主流数字PCR(包括ddPCR)都需要做预实验来确定实验模板用量;对于一些十分珍贵的核酸材料,做预实验的成本将非常高,甚至根本不够做一次预实验。
发明内容
为了解决现有技术中成本高和需要做预实验的问题,本发明提供了一种连续体积梯度毛细管数字PCR方法。
本发明提供了一种连续体积梯度毛细管数字PCR方法,其特征在于,包含以下步骤:
(1)将含荧光基团的PCR反应体系和油相按照1∶(2~4)的体积比震荡混匀,置入内径由大到小连续变化的毛细管中,封闭毛细管两端;所述油相密度等于水的密度;
(2)加热使油相和水相沿毛细管径向交替分布;
(3)进行PCR反应,荧光信号采集设备下统计阳性微滴占比25%~55%区域的微滴数和微滴半径,计算PCR模板拷贝数;优选统计阳性微滴占比30%~50%区域。
前述的毛细管数字PCR方法,其特征在于,所述毛细管细端内径为10~50μm,粗端内径≤1mm,毛细管长度为0.8~4cm。
前述的毛细管数字PCR方法,其特征在于,步骤(2)加热条件为,95℃下维持10min。
前述的毛细管数字PCR方法,其特征在于,所述PCR反应体系和与水等密度油相的比例是1∶3(v/v)。
前述的毛细管数字PCR方法,其特征在于,所述油相为蓖麻油与石蜡油按3∶1(v/v)比例混合,再用该混合物配制胆固醇饱和溶液,即得。
前述的毛细管数字PCR方法,其特征在于,所述油相还含有表面活性剂。
前述的毛细管数字PCR方法,其特征在于,所述表面活性剂是司盘80或吐温60;
所述司盘80占油相体积的0.5%;
所述吐温60占油相体积的0.1%。
前述的毛细管数字PCR方法,其特征在于,所述PCR反应体系的荧光基团位于探针上,或者位于双链荧光染料分子上。
本发明还提供了一种连续体积梯度毛细管数字PCR试剂盒,其特征在于,它包括PCR反应体系,与水的密度相密度的油相;所述油相为蓖麻油与石蜡油按3∶1(v/v)比例混合,再用该混合物配制胆固醇饱和溶液,即得。
如前所述的试剂盒,其特征在于:所述油相还包括表面活性剂;所述表面活性剂是司盘80或吐温60;
所述司盘80占油相体积的0.5%;
所述吐温60占油相体积的0.1%。
本发明的方法,通过内径由大到小连续变化的毛细管与高温处理,使液滴呈连续体积分布于毛细管内;液滴带有目标分子的概率随着液滴体积的增大而增大。PCR后,阳性液滴的分布状况为,大液滴阳性比例高,每个液滴含有多个初始拷贝,统计阳性液滴会低估初始拷贝数;小液滴阳性比例低,统计误差会很大;中间会有一段区域的阳性液滴比例适中,对应的液滴内初始拷贝数在1个左右,申请人通过实验发现在阳性微滴占比25%~55%区域时,可以通过阳性液滴的比例和液滴大小计算PCR模板的拷贝数,在阳性液滴占比是30%~50%的准确率较高。本发明选择合适的区域后,可以直接检测并计算,避免了常规数字PCR为了使阳性液滴比例适中而进行的多次样本稀释预实验。
本发明的技术方案中,由于液滴的体积非常小,含有的DNA拷贝非常少,可以实现与数字PCR相同的效果,检测待检样本中的微量DNA。
本发明的方法,由于耗材可以采用廉价的毛细管,相比现有的数字PCR,大大节约地了成本,且简化了操作步骤,且检测方法准确,具有很好的应用前景。
下面通过具体实施方式对本发明做进一步详细说明,但是并不是对本发明的限制,根据本发明的上述内容,按照本领域的普通技术知识和惯用手段,在不脱离本发明上述基本技术思想前提下,还可以做出其它多种形式的修改、替换或变更。
附图说明
图1为毛细管即毛细管内连续体积梯度的油包水液滴
具体实施方式
实施例一种连续体积梯度毛细管数字PCR方法
1.连续体积梯度毛细管制备
使用内径为1mm毛细管制作连续体积梯度毛细管,在酒精灯烧烤下,均匀用力拉制毛细管至断裂,修整毛细管尖端,暴露尖端孔通畅。得到粗端内径1mm、细端内径20μm、长3cm的毛细管。
2.油相制备
首先配制密度接近于水密度的油,本实施例用蓖麻油(0.98g/l)和石蜡油按照3∶1体积比配匀并加入胆固醇,比例为100ml蓖麻油加入过量胆固醇使之溶解为饱和状态,加入0.5%司盘80或者0.1%的tween 60表面活性剂,震荡均匀,使蓖麻油、石蜡油和胆固醇混合物混合稳定,均匀生长。
3.PCR油水混合物制备
配制常规荧光定量PCR体系,即混合DNA模板、Taq酶、镁离子、荧光探针、引物、dNTP、水和必要的缓冲液。
前述的荧光探针也可以换成不带荧光基团的探针,但要额外在PCR体系中添加双链DNA结合染料,如SYBR Green I。
混合20μlPCR体系和60μl前述油相,充分震荡均匀,得到PCR油水混合物。
4.连续体积梯度毛细管PCR反应
以大头端毛细管插入液面下,利用毛细管现象吸入配置好油水混合物,将毛细管尖端朝下放置,使油水混合物利用重力作用充满至毛细管尖端,用火焰烧结尖端,封闭毛细管,大头端使用封口胶封闭,将毛细管放入PCR管,PCR管注水放入定量PCR仪器内,加热至95℃维持10分钟,此时毛细管中会形成一排油包水液滴沿毛细管径向排列,液滴直径为液滴所在位置毛细管的内径(如图1所示)。然后进行PCR扩增,即变性、退火、延伸,进行35个循环完成扩增。
5.高内涵显微镜对毛细管内液滴荧光信号采集和统计计算
将毛细管取出后放到高内涵显微镜下观察读取数据。为了方便计算,选取含有50~100个液滴的毛细管区域,该区域内阳性液滴比例在30%~50%范围内。统计阳性液滴数目,测量该区域第一个液滴半径R1,区域中心的一个液滴半径R2,区域最后一个液滴半径R3。液滴总体积用下面公式计算:(4/3×πR1 3+4/3×πR2 3+4/3×πR3 3)/3×总液滴个数=液滴总体积;并用泊松分布方法校正计算平均每个液滴中阳性模板的拷贝个数,公式:每液滴阳性模板拷贝个数M=-ln(1-阳性概率);以该区域模板总数除以该区域液滴的总体积,即是单位体积内的拷贝数,再乘以加样体积即是所配制PCR反应体系中的模板拷贝总数。
实验例人工EGFR基因定量测试
本实验例以人工合成的EGFR基因为测试模板。
1.方法
1.1连续体积梯度毛细管制备
使用内径为1mm毛细管制作连续体积梯度毛细管,在酒精灯烧烤下,均匀用力拉制毛细管至断裂,修整毛细管尖端,暴露尖端孔通畅。得到粗端内径1mm、细端内径20μm、长3cm的毛细管。
1.2油相制备
首先配制密度接近于水密度的油,本实施例用蓖麻油(0.98g/l)和石蜡油按照3∶1体积比配匀并加入胆固醇,比例为100ml蓖麻油加入过量胆固醇使之溶解为饱和状态,加入0.5%司盘80或者0.1%的tween 60表面活性剂,震荡均匀,使蓖麻油、石蜡油和胆固醇混合物混合稳定,均匀生长。
1.3 PCR油水混合物制备
使用常规2×PCR预混缓冲液10μl,加入上下游引物、探针和模板,再用水补充体积至20μl,为PCR水相体系。水相体系中:引物和探针终浓度均为0.25μmol/l,模板浓度为300copies/μl。引物、探针、模板序列如下:
PCR引物:
VEGFR-F:GTGGACAACCCCCACGTGT(SEQ ID NO.1);
VEGFR-R:CCGAAGGGCATGAGCTTCG(SEQ ID NO.2)。
TaqMan探针:FAM-CCTCACCTCCACCGTGCAGCTC(SEQ ID NO.3)-TAMRA。
模板:
GTGGACAACCCCCACGTGTGGCATCTGCCTCACCTCCACCGTGCAGCTCATATGCAGCTCATGCCCTTCGGCAGCCTCCTGGACTATGTCCGGGGCCAAACTGCTGGGTGC(SEQ ID NO.4)。
混合20μl水相体系和60μl前述油相,充分震荡均匀,得到PCR油水混合物。
1.4连续体积梯度毛细管PCR反应
以大头端毛细管插入液面下,利用毛细管现象吸入配置好油水混合物,将毛细管尖端朝下放置,使油水混合物利用重力作用充满至毛细管尖端,用火焰烧结尖端,封闭毛细管,大头端使用封口胶封闭,将毛细管放入PCR管,PCR管注水放入定量PCR仪器内,加热至95℃维持10分钟,形成连续体积梯度的毛细管内油包水液滴(如图1所示),进行PCR扩增,即95℃维持10秒,50℃维持30秒,60℃维持30秒,进行35个循环完成扩增。
1.5高内涵显微镜对毛细管内液滴荧光信号采集和统计计算
将毛细管取出后放到高内涵显微镜下观察读取数据,为了方便计算,我们选取接近50%的阳性液滴处的液滴作为分析对象,按照实施例第5小节统计和计算PCR反应体系中的模板拷贝总数。
2.结果
所选取的50个油包水液滴扩增阳性的液滴数目为21个,计算得每个液滴阳性模板个数约为0.5447,50个液滴中约含有27.24个copies(模板拷贝)。
经测量,R1=1.36μm,R2=1.25μm,R3=1.13μm,纳入上述公式计算纳入统计的50个液滴总体积约为412nL,所以PCR扩增体系中模板浓度为27.24/0.412=66copies/μL,则20μL反应体系中含待测模板约20×66=1322copies,与已知的模板浓度1500copies/5μl基本相符。
综上,本发明提供的连续体积梯度毛细管数字PCR方法可以以较低的成本达到不错的DNA定量检测精度,且无需做样品稀释倍数的预实验,具有很好的应用前景。
Claims (10)
1.一种连续体积梯度毛细管数字PCR方法,其特征在于,包含以下步骤:
(1)将含荧光基团的PCR反应体系和油相按照1∶(2~4)的体积比震荡混匀,置入内径由大到小连续变化的毛细管中,封闭毛细管两端;所述油相密度等于水的密度;
(2)加热使油相和水相沿毛细管径向交替分布;
(3)进行PCR反应,荧光信号采集设备下统计阳性微滴占比25%~55%区域的微滴数和微滴半径,计算PCR模板拷贝数;
其中,步骤(1)所述内径由大到小连续变化的毛细管按照如下方法制备而成:
将内径为1mm毛细管在酒精灯烧烤下,均匀用力拉制毛细管至断裂,得到粗端内径1mm、细端内径20μm、长3cm的毛细管。
2.如权利要求1所述的毛细管数字PCR方法,其特征在于,步骤(3)为:进行PCR反应,荧光信号采集设备下统计阳性微滴占比30%~55%区域的微滴数和微滴半径,计算PCR模板拷贝数。
3.如权利要求1所述的毛细管数字PCR方法,其特征在于,步骤(2)加热条件为,95℃下维持10min。
4.如权利要求1所述的毛细管数字PCR方法,其特征在于,所述PCR反应体系和与水等密度油相的比例是1∶3(v/v)。
5.如权利要求1所述的毛细管数字PCR方法,其特征在于,所述油相为蓖麻油与石蜡油按3∶1(v/v)比例混合,再用该混合物配制胆固醇饱和溶液,即得。
6.如权利要求1或5所述的毛细管数字PCR方法,其特征在于,所述油相还含有表面活性剂。
7.如权利要求6所述的毛细管数字PCR方法,其特征在于,所述表面活性剂是司盘80或吐温60;
所述司盘80占油相体积的0.5%;
所述吐温60占油相体积的0.1%。
8.如权利要求1所述的毛细管数字PCR方法,其特征在于,所述PCR反应体系的荧光基团位于探针上,或者位于双链荧光染料分子上。
9.一种连续体积梯度毛细管数字PCR试剂盒,其特征在于,它包括PCR反应体系,与水的密度相等的油相;所述油相为蓖麻油与石蜡油按3∶1(v/v)比例混合,再用该混合物配制胆固醇饱和溶液,即得。
10.如权利要求9所述的试剂盒,其特征在于,所述油相还包括表面活性剂;所述表面活性剂是司盘80或吐温60;
所述司盘80占油相体积的0.5%;
所述吐温60占油相体积的0.1%。
Priority Applications (2)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
CN201811256687.XA CN109337963B (zh) | 2018-10-24 | 2018-10-24 | 一种连续体积梯度毛细管数字pcr方法和试剂盒 |
PCT/CN2019/075916 WO2020082649A1 (zh) | 2018-10-24 | 2019-02-22 | 一种连续体积梯度毛细管数字pcr方法和试剂盒 |
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
CN201811256687.XA CN109337963B (zh) | 2018-10-24 | 2018-10-24 | 一种连续体积梯度毛细管数字pcr方法和试剂盒 |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
CN109337963A CN109337963A (zh) | 2019-02-15 |
CN109337963B true CN109337963B (zh) | 2022-04-19 |
Family
ID=65311885
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
CN201811256687.XA Active CN109337963B (zh) | 2018-10-24 | 2018-10-24 | 一种连续体积梯度毛细管数字pcr方法和试剂盒 |
Country Status (2)
Country | Link |
---|---|
CN (1) | CN109337963B (zh) |
WO (1) | WO2020082649A1 (zh) |
Families Citing this family (5)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN109337963B (zh) * | 2018-10-24 | 2022-04-19 | 四川大学华西医院 | 一种连续体积梯度毛细管数字pcr方法和试剂盒 |
CN109355178B (zh) * | 2018-10-24 | 2022-04-26 | 四川大学华西医院 | 一种连续体积梯度毛细管数字pcr装置及其使用方法 |
CN112375814A (zh) * | 2020-11-10 | 2021-02-19 | 南通大学 | 能产生稳定油包水型小液滴用于数字化pcr灵敏检测的硅油配方 |
CN114752657A (zh) * | 2022-05-05 | 2022-07-15 | 中山大学 | 一种多分散液滴数字核酸检测方法及其应用 |
CN115200953A (zh) * | 2022-06-27 | 2022-10-18 | 北京本立科技有限公司 | 一种液体样本的数字化装置及方法 |
Citations (5)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN102574090A (zh) * | 2009-06-16 | 2012-07-11 | 生物芯片创新有限公司 | 在单个反应管中进行多个反应的方法 |
CN102586226A (zh) * | 2011-01-14 | 2012-07-18 | 中国科学院大连化学物理研究所 | 一种基于连续液滴操控的微流控芯片核酸纯化平台 |
CN103954786A (zh) * | 2014-04-21 | 2014-07-30 | 浙江大学 | 一种半接触式的油下液滴连续点样和加液方法 |
CN104511320A (zh) * | 2013-09-27 | 2015-04-15 | 王来 | 一种液滴发生毛细管微流控芯片及其制备方法 |
WO2015082931A2 (en) * | 2013-12-04 | 2015-06-11 | Isis Innovation Limited | Controlling fluid micro-compartments |
Family Cites Families (3)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CA2555060C (en) * | 2004-02-20 | 2014-12-23 | Research Foundation Of The State University Of New York | Method and device for manipulating liquids in microfluidic systems |
JP2015188377A (ja) * | 2014-03-28 | 2015-11-02 | セイコーエプソン株式会社 | 核酸増幅反応用カートリッジ及び核酸増幅装置 |
CN109337963B (zh) * | 2018-10-24 | 2022-04-19 | 四川大学华西医院 | 一种连续体积梯度毛细管数字pcr方法和试剂盒 |
-
2018
- 2018-10-24 CN CN201811256687.XA patent/CN109337963B/zh active Active
-
2019
- 2019-02-22 WO PCT/CN2019/075916 patent/WO2020082649A1/zh active Application Filing
Patent Citations (5)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN102574090A (zh) * | 2009-06-16 | 2012-07-11 | 生物芯片创新有限公司 | 在单个反应管中进行多个反应的方法 |
CN102586226A (zh) * | 2011-01-14 | 2012-07-18 | 中国科学院大连化学物理研究所 | 一种基于连续液滴操控的微流控芯片核酸纯化平台 |
CN104511320A (zh) * | 2013-09-27 | 2015-04-15 | 王来 | 一种液滴发生毛细管微流控芯片及其制备方法 |
WO2015082931A2 (en) * | 2013-12-04 | 2015-06-11 | Isis Innovation Limited | Controlling fluid micro-compartments |
CN103954786A (zh) * | 2014-04-21 | 2014-07-30 | 浙江大学 | 一种半接触式的油下液滴连续点样和加液方法 |
Non-Patent Citations (3)
Title |
---|
Inkjet Printing Based Droplet Generation for Integrated Online Digital Polymerase Chain Reaction;Weifei Zhang等;《Anal. Chem.》;20180329;第90卷;第5329-5334页 * |
基于毛细管刻蚀孔的单分散微液滴制备方法研究;贺秀娜;《中国优秀硕士学位论文全文数据库 工程科技Ⅰ辑》;20170315(第03期);第B014-1571页 * |
液滴微流控用于单细胞包裹和数字化PCR;李越;《中国优秀硕士学位论文全文数据库 信息科技辑》;20160915(第09期);第I135-62页 * |
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
WO2020082649A1 (zh) | 2020-04-30 |
CN109337963A (zh) | 2019-02-15 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
CN109337963B (zh) | 一种连续体积梯度毛细管数字pcr方法和试剂盒 | |
CN110724741B (zh) | 一种检测微小残留白血病相关融合基因的引物、探针及其试剂盒 | |
JP2005095179A (ja) | 多重拮抗逆転写酵素ポリメラーゼ連鎖反応を使用して遺伝子発現を定量的に測定する装置 | |
JP6271076B2 (ja) | 標的核酸検出法、アッセイキットおよびプローブ固定基体 | |
CN107868828A (zh) | 检测egfr基因t790m位点的特异性引物探针组合物及试剂盒和检测方法 | |
CN107267604A (zh) | 一种基于短链核酸探针和双链特异性核酸内切酶的高特异性microRNA荧光检测方法 | |
CN110863054A (zh) | 用于基因突变高发区突变检测的数字pcr检测试剂盒及其方法 | |
CN106148482B (zh) | 一种适用于小型测序仪的测序方法 | |
CN109355178B (zh) | 一种连续体积梯度毛细管数字pcr装置及其使用方法 | |
CN108342464A (zh) | 一步法检测HER2/neu基因表达量的试剂盒及其检测方法 | |
CN108531598B (zh) | Ros1基因融合检测引物、方法及试剂盒 | |
CN110511984A (zh) | Egfr基因19号外显子缺失突变的快速荧光检测方法及应用 | |
CN109251962B (zh) | 一种微米管传感器及其制备方法与应用 | |
US9528161B2 (en) | Materials and methods for quality-controlled two-color RT-QPCR diagnostic testing of formalin fixed embedded and/or fresh-frozen samples | |
CN112779324B (zh) | 用于单细胞检测和分析的方法及其应用 | |
CN116516003A (zh) | 一种基于数字pcr平台分型并定量检测bcr-abl p210融合基因的检测体系及其检测方法 | |
CN110396542A (zh) | 一种LncRNA标记物及其在糖尿病中的应用 | |
CN109055509A (zh) | 基于二代测序技术检测无对照样本的微卫星不稳定的方法、组合物和用途 | |
CN108330171A (zh) | 检测egfr基因第19号外显子缺失突变的试剂盒、方法及其应用 | |
CN114752657A (zh) | 一种多分散液滴数字核酸检测方法及其应用 | |
CN113373233A (zh) | 一种基于数字pcr检测eml4-alk融合基因的反应体系及其应用 | |
CN115074422A (zh) | 一种未知融合基因的检测方法 | |
CN109811041A (zh) | 一种检测pik3ca基因h1047r位点的特异性引物对、探针及试剂盒 | |
CN103740852B (zh) | 基于AllGlo探针荧光定量PCR的hsa-miR-137检测试剂盒及其检测方法 | |
CN113789389A (zh) | 人白血病bcr-abl融合突变一步法检测试剂盒 |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
PB01 | Publication | ||
PB01 | Publication | ||
SE01 | Entry into force of request for substantive examination | ||
SE01 | Entry into force of request for substantive examination | ||
GR01 | Patent grant | ||
GR01 | Patent grant |