CN109295246B - 与玉米雄性生育力相关的dna分子标记及其应用 - Google Patents

Abstract

本发明提供与玉米雄性生育力相关的DNA分子标记，所述DNA分子标记位于玉米基因ZmABCG20核酸序列起始密码子后第326‑329位碱基，序列为TGCA，该4个碱基缺失的玉米品系表现出隐性雄性核不育性状。可将本发明的DNA分子标记用于鉴定或选育雄性不育玉米种质资源，还可用于玉米基因ZmABCG20分型以及玉米分子标记辅助育种。

Description

与玉米雄性生育力相关的DNA分子标记及其应用

技术领域

本发明属于基因工程和分子育种领域，具体地说，涉及与玉米雄性生育力相关的DNA分子标记及其应用。

背景技术

植物雄性不育突变是自然界中十分普遍的现象，至少己在43个科、162个属的617个物种中发现了雄性不育突变体。在遗传上植物雄性不育分为细胞核雄性不育，细胞质雄性不育和细胞核细胞质互作雄性不育三大类：1)细胞核雄性不育由细胞核基因突变产生，有显性突变和隐性突变，有孢子体基因突变和配子体基因突变。显性突变和配子体基因突变只能通过雌配子遗传，隐性突变既可通过雌配子也可通过雄配子进行遗传，而且遵循孟德尔定律。目前已克隆了一些孢子体隐性核不育基因，如拟南芥的ms2，玉米的ms45和水稻的mil1等(Aarts等，1997，The Arabidopsis MALE STERILITY 2 protein sharessimilarity with reductases in elongation/condensation complexes，PlantJournal，12:615-623；Albertsen，2006，Male tissue-preferred regulatory sequencesof MS45gene and method of using same，专利号：US7154024B2；Hong等，2012，Somaticand reproductive cell development in rice anther is regulated by a putativeglutaredoxin，Plant Cell，24:577-588)；一些配子体隐性核不育基因也被克隆，如拟南芥的两个小孢子有丝分裂异常的突变体sidecar pollen和gemini pollen(Oh等，2010，TheSIDECAR POLLEN gene encodes a microspore-specific LOB/AS2domain proteinrequired for the correct timing and orientation of asymmetric cell division，Plant Journal，64:839-50；Park等，1998，The Arabidopsis thaliana gametophyticmutation gemini pollen1disrupts microspore polarity,division asymmetry andpollen cell fate，Development，125:3789-99)；玉米上还克隆了一个孢子体显性核不育基因MS44(Cigan and Albertsen，1998，Reversible nuclear genetic system for malesterility in transgenic plants，US5750868)；2)细胞质雄性不育则是由细胞质基因控制，并没有相对应的核恢复基因，属母性遗传；3)细胞核细胞质互作雄性不育由细胞质基因和细胞核基因共同控制，其实质是细胞质与细胞核遗传物质不和的结果。不育细胞质是一些由突变线粒体基因引起，但有相对应的核恢复基因，能抑制不育细胞质基因。不育细胞质基因可产生一种新的蛋白质，够影响线粒体正常功能(Chen and Liu，2014，Malesterility and fertility restoration in crops，Annu Rev Plant Biol，65:5.1-5.28)。在育性恢复基因方面，目前水稻中已经克隆了Rf-1，Rf-2，Rf-4，Rf-5等基因(Komori等，2004，Map-based cloning of a fertility restorer gene,Rf-1,in rice(Oryzasativa L.)，Plant Journal，37:315-325；Itabashi等，2011，The fertility restorergene,Rf2,for Lead Rice-type cytoplasmic male sterility of rice encodes amitochondrial glycine-rich protein，Plant Journal，65:359-367；Tang等，2014，Therice restorer Rf4 for wild-abortive cytoplasmic male sterility encodes a PPRprotein that functions in reduction of WA352 transcripts，Molecular Plant，7:1497-500；Hu等，2012，The rice pentatricopeptide repeat protein RF5 restorersfertility in Hong-Lian Cytoplasmic male-sterile lines via a complex with theglycine-rich protein GRP162，Plant Cell，24:109-22)。

玉米已成为世界和我国第一大粮食作物，是饲料、食品加工、生物能源的重要原料，在国外也是消费量最大的蔬菜之一。目前国内种植的玉米几乎全部为杂交玉米。玉米杂交授粉主要通过人工去雄进行杂交，需耗费大量的劳动力，成本高昂；而且由于去雄损伤玉米顶部叶片，会造成制种产量损失。利用雄性不育系制种可解决人工去雄带来的问题。但玉米中曾经应用的胞质雄性不育系存在一些缺陷：首先由于胞质雄性不育系需要特定的恢复基因恢复育性，因此种质资源利用率很低，限制了优良品种的选育效率；其次部分不育系育性不稳定，在特定条件下可恢复育性，影响杂交种的纯度；最后，由于胞质基因型单一，造成玉米斑病大爆发，直接导致胞质雄性不育技术退出市场。普通核不育则可避免这些问题，如在玉米中得以应用，不但可以节省人工去雄所需的劳动力成本，而且可以提高制种产量。

植物ABC蛋白家族是一类膜转运蛋白，定位于细胞膜上，负责代谢物的跨膜转运；ABCG转运蛋白是其中最大的一个亚家族。ABCG蛋白按结构特征主要可分为两类：全尺寸蛋白含有2个核苷酸结合结构域和2个跨膜区，可独自形成完整的跨膜转运结构，完成底物的转运；半尺寸蛋白只有1个核苷酸结合结构域和1个跨膜区，需要与另一个半尺寸蛋白分子结合，才能形成完整的转运单位(Verrier等,2008,Plant ABC proteins–a unifiednomenclature and updated inventory.Cell,Trends in Plant Science,13(4):151-159.)。拟南芥的AtABCG26基因和水稻中的直系同源基因OsABCG15编码一个花粉壁成分孢粉素前体的跨膜转运蛋白，在花药绒粘层中表达，将孢粉素前体从绒粘层细胞转运到花药室中，在花粉细胞壁上合成孢粉素。突变体atabcg26表现为花粉数量和雄性育性均极低；水稻osabcg15突变体则完全雄性不育，没有花粉；此外，水稻OsABCG26突变后也表现出雄性完全不育，表型与osabcg15相似(Zhao等，2016，ATP binding cassette G transporters andplant male reproduction.Plant Signal and Behavior,11(3):e1136764.doi:10.1080/15592324.2015.1136764)。通过基因组生物信息学分析，Pang等(Pang等，2013，Inventoryand general analysis of the ATP-binding cassette(ABC)gene superfamily inmaize(Zea May L.).Gene,2013,526(2):411-428)从玉米种鉴定出54个ABCG基因，但目前仍然没有发现与雄性育性相关的基因。

发明内容

本发明的目的是提供与玉米雄性生育力相关的DNA分子标记及其应用。

为了实现本发明目的，第一方面，本发明提供玉米基因ZmABCG20在调控作物雄性育性中的应用，其中基因ZmABCG20的cDNA序列为：

i)SEQ ID NO:2所示的核苷酸序列；

ii)SEQ ID NO:2所示的核苷酸序列经取代、缺失和/或增加一个或多个核苷酸且表达相同功能蛋白质的核苷酸序列；

iii)在严格条件下与SEQ ID NO:2所示序列杂交且表达相同功能蛋白质的核苷酸序列，所述严格条件为在含0.1％SDS的0.1×SSPE或含0.1％SDS的0.1×SSC溶液中，在65℃下杂交，并用该溶液洗膜；或

iv)与i)、ii)或iii)的核苷酸序列具有85％以上同源性且表达相同功能蛋白质的核苷酸序列。

前述的应用，所述调控是指使作物具有雄性育性。所述应用包括：

1)使作物包含ZmABCG20基因；或

2)使作物表达ZmABCG20基因编码的蛋白。

本发明首先对玉米品种京科糯2000种子(M₀代)进行钴60辐射诱变处理，种植处理的种子获M₁代植株；M₁代植株自交产生种子(为M₂代)，种植M₂代植株，对M₂代植株进行形态学，组织学和遗传学鉴定，筛选不育植株；然后对不育植株进行基因测序和DNA序列分析，在分子水平上进行验证。最后获得纯合不育单株，并用于杂交育种和生物技术研究。

本发明提供的玉米ZmABCG20基因(花粉发育控制基因)，其突变后表现为完全雄性不育。其核苷酸序列如SEQ ID NO:1或SEQ ID NO:4所示；其编码区的DNA序列如SEQ ID NO:2或SEQ ID NO:5所示；其编码的蛋白序列如SEQ ID NO:3或SEQ ID NO:6所示。

第二方面，本发明提供玉米基因ZmABCG20在制备转基因植物中的应用。例如，将携带有基因ZmABCG20 cDNA或基因组序列的重组表达载体转入野生型玉米愈伤组织中，转化后的材料经过共培养-筛选-分化-生根-转基因苗的锻炼和移栽，筛选得到转基因植株，然后将转基因玉米与雄性不育玉米杂交，来恢复雄性不育玉米的育性。

第三方面，本发明提供玉米基因ZmABCG20在恢复雄性不育植物的育性中的应用，其中所述雄性不育性状是由该基因突变体所导致的。

第四方面，本发明提供通过抑制玉米ZmABCG20基因活性来制备雄性核不育的转基因玉米的方法，利用基因沉默、基因抑制、基因敲除或定向基因突变等技术使玉米中的ZmABCG20基因在转录、翻译或翻译后的蛋白活性水平方面下降，获得雄性核不育的转基因玉米。

例如，可将携带有针对基因ZmABCG20 cDNA序列的RNAi序列，与组成型启动子或花器官特异表达启动子可操作地连接，转入植物愈伤组织中，转化后的材料经过共培养-筛选-分化-生根-转基因苗的锻炼和移栽，筛选得到雄性核不育的转基因玉米。

在本发明的一个具体实施方式中，所述RNAi作用的靶DNA序列如SEQ ID NO:23所示。

第五方面，本发明提供由上述方法获得的生物材料在作物改良育种、制种中的应用。

第六方面，本发明提供玉米基因ZmABCG20在作物改良育种、制种中的应用。

前述的应用，使包含或表达所述ZmABCG20基因的植物，或按照上述方法或的ZmABCG20基因失活的植物，与同种具有优良农艺性状的作物进行杂交。

本发明中，所述作物是自花授粉或异花授粉作物，包括但不限于玉米、小麦或水稻等，优选玉米。

本发明中，所述优良农艺性状包括但不限于产量提高、品质提高、抗病虫害、抗逆、抗倒伏等。

第七方面，本发明提供用于抑制ZmABCG20基因活性的抑制剂，所述抑制剂选自shRNA、siRNA、dsRNA、miRNA、cDNA、反义RNA/DNA、低分子化合物、肽、抗体等中的至少一种。

第八方面，本发明提供含有编码上述核酸分子抑制剂的表达盒、表达载体或克隆载体。

第九方面，本发明提供玉米基因ZmABCG20的突变体zmabcg20-1基因，其核酸序列为：

i)玉米基因ZmABCG2核酸序列起始密码子后第326-329位碱基发生4个碱基TGCA缺失所形成的突变基因；

ii)SEQ ID NO:7所示的核苷酸序列；

iii)i)或ii)所示序列经取代、缺失和/或增加一个或多个核苷酸且表达相同功能蛋白质的核苷酸序列，且在与基因ZmABCG20的等同位置上包含4个碱基TGCA缺失；

iv)在严格条件下与i)或ii)所示序列杂交且表达相同功能蛋白质的核苷酸序列，且在与基因ZmABCG20的等同位置上包含4个碱基TGCA缺失；所述严格条件为在含0.1％SDS的0.1×SSPE或含0.1％SDS的0.1×SSC溶液中，在65℃下杂交，并用该溶液洗膜；或

v)与i)或ii)的核苷酸序列具有85％以上同源性且表达相同功能蛋白质的核苷酸序列，且在与基因ZmABCG20的等同位置上包含4个碱基TGCA缺失。

玉米基因zmabcg20-1的编码区DNA序列如SEQ ID NO:8所示。由玉米基因zmabcg20-1编码的蛋白，其氨基酸序列如SEQ ID NO:9所示，或该序列经替换、缺失或添加一个或几个氨基酸形成的具有同等功能的氨基酸序列。

第十方面，本发明提供基因zmabcg20-1在调控玉米育性中的应用，所述应用包括：

1)使作物包含zmabcg20-1基因；或

2)使作物表达zmabcg20-1基因编码的蛋白。

前述的应用，使包含或表达所述突变体zmabcg20-1基因的玉米表现出隐性雄性核不育。

第十一方面，本发明提供基因zmabcg20-1在玉米改良育种、制种中的应用。

前述的应用，使包含或表达所述突变体zmabcg20-1基因的玉米与具有优良农艺性状的玉米进行杂交。

第十二方面，本发明提供表达盒、表达载体或克隆载体，其包括包含如所述基因zmabcg20-1的核酸序列。

第十三方面，本发明提供含有所述基因zmabcg20-1、或所述表达盒、表达载体或克隆载体的工程菌、宿主细胞、转基因细胞系。

第十四方面，本发明提供包含或表达所述基因zmabcg20-1的生物材料在制备转基因玉米中的应用。

第十五方面，本发明提供雄花幼穗或雌雄同花的植物幼穗特异性启动子，所述启动子为：

i)SEQ ID NO:12所示的核苷酸序列；

ii)SEQ ID NO:12所示的核苷酸序列经取代、缺失和/或增加一个或多个核苷酸且具有相同功能的核苷酸序列；

iii)在严格条件下与SEQ ID NO:12所示序列杂交且具有相同功能的核苷酸序列，所述严格条件为在含0.1％SDS的0.1×SSPE或含0.1％SDS的0.1×SSC溶液中，在65℃下杂交，并用该溶液洗膜；或

iv)与i)、ii)或iii)的核苷酸序列具有85％以上同源性且具有相同功能的核苷酸序列。

第十六方面，本发明提供表达盒、表达载体或克隆载体，其包括包含如SEQ ID NO:12所示序列的核酸。

第十七方面，本发明提供工程菌、转基因细胞系，其含有所述特异性启动子、或所述表达盒或载体。

第十八方面，本发明提供所述特异性启动子在调控下游基因表达中的应用。

第十九方面，本发明提供所述特异性启动子在制备转基因植物中的应用。

例如，将启动子序列与目的基因可操作地连接，用所得构建体转化目标植株，启动子驱动该目的基因特异地在雄花幼穗或雌雄同花的植物幼穗中表达。

第二十方面，本发明提供一种与玉米雄性生育力相关的DNA分子标记，所述DNA分子标记位于玉米基因ZmABCG20核酸序列起始密码子后第326-329位碱基，序列为TGCA，该4个碱基缺失的玉米品系表现出隐性雄性核不育性状。

第二十一方面，本发明提供特异性扩增所述DNA分子标记的引物，包括：

上游引物3326_F1：5′-CCAGACGAGGGCAGACCAG-3′(SEQ ID NO:10)

下游引物3326_R1：5′-GATCTCGCCAGGGTCCACA-3′SEQ ID NO:11)

第二十二方面，本发明提供含有所述引物3326_F1和3326_R1的检测试剂或试剂盒。

第二十三方面，本发明提供所述DNA分子标记、所述引物或所述检测试剂或试剂盒在玉米分子标记辅助育种中的应用。

第二十四方面，本发明提供所述DNA分子标记、所述引物或所述检测试剂或试剂盒在鉴别或选育雄性不育玉米种质资源中的应用。具体方法如下：

提取待测玉米的基因组DNA，利用引物3326_F1和3326_R1进行PCR扩增反应，电泳检测扩增产物，若扩增产物出现一条大小为79bp的特征条带，则待测玉米的育性正常，对应的ZmABCG20基因型为野生型；若扩增产物出现一条大小为75bp的特征条带，则待测玉米为雄性不育品种，对应的ZmABCG20基因型为zmabcg20-1突变体；若扩增产物为79bp和75bp两条带型，则待测玉米为杂合基因型。

第二十五方面，本发明提供所述DNA分子标记、所述引物或所述检测试剂或试剂盒在玉米基因ZmABCG20分型中的应用。

本发明提供的ZmABCG20基因优点如下：

1)首次发现ZmABCG20突变可造成玉米雄性不育表型，对于该基因的利用和功能研究，以及玉米雄性育性调控机制的研究具有重要意义。

2)ZmABCG20突变只影响雄性育性，可造成雄性完全不育，但对雌雄育性和其它农艺性状没有影响，适用于杂交育种、制种和生产等产业化应用。

3)ZmABCG20只在植物雄花幼穗中表达，时间和组织特异性强，其启动子可用于驱动任何基因在雄花幼穗中特异性表达。

本发明提供的突变体zmabcg20-1优点如下：

1)zmabcg20-1是首次报道的ZmABCG20突变体，对于该基因的利用和功能研究具有重要意义。

2)该突变体只影响雄性育性，造成雄性完全不育，但对雌雄育性和其它农艺性状没有影响。

3)该突变体为4碱基缺失引起的基因删除突变，不会有育性恢复的潜在风险，也不会有遗传不稳定的风险。

4)该突变体为基因内4碱基删除，不会影响ZmABCG20两侧相邻基因的功能。

5)该突变体为4碱基删除突变，可设计Indel标记，用普通PCR和电泳即可完成高通量检测；同时也可设计为基因芯片检测标记。

6)该突变体遗传背景为中国当代主栽品种，可直接用于中国玉米品种的选育，无需漫长的改良过程。

附图说明

图1为本发明实施例2中突变体野生型和zmabcg20-1的雄花以及zmabcg20-1的果穗。

图2为本发明实施例3中野生型和突变体zmabcg20-1的花药以及花粉I₂-KI染色结果。

图3为本发明实施例7在京科糯2000的不同时期幼穗及不同组织中ZmABCG20基因荧光实时定量PCR结果。

图4为本发明实施例6和8中鉴定的ZmABCG20基因结构和zmabcg20-1的突变位点示意图。

图5为本发明实施例9中zmabcg20-1突变体开放授粉后自交F₂后代中的突变体和野生型植株ZmABCG20基因分子标记鉴定的电泳结果。

图6为本发明实施例10中构建ZmABCG20基因的RNAi载体的流程示意图。

图7为本发明实施例11中对照与RNAi雄性不育株的花粉碘染结果。

图8为本发明实施例13中所述的zmabcg20-1不育基因杂交转育的技术路线图。

具体实施方式

以下实施例用于说明本发明，但不用来限制本发明的范围。若未特别指明，实施例均按照常规实验条件，如Sambrook等分子克隆实验手册(Sambrook J&Russell DW,Molecular Cloning:a Laboratory Manual,2001)，或按照制造厂商说明书建议的条件。

实施例1钴60辐射诱变突变体库

2015年9月，于长沙用钴60(⁶⁰Co)辐射京科糯2000种子(M₀代)3公斤，辐射剂量250Gy。辐射的种子于2015年10月种植于海南三亚市崖城区田间，分单株严格自交，收获M₁代种子。

选取M₁代种子5400个株系，每个株系种植50棵单株，于2016年2月种植于海南临高田间。在苗期、抽穗期、开花期、灌浆期等经过仔细观察田间性状，筛查株型、穗型、育性、产量等各种类型突变体，对各类型突变体单株收种保存。

实施例2 M₂代种植与性状观察

在M₂代抽穗、开花期间，在田间对花药的形态进行观察，选取颜色浅白、形态小、花粉量小等表现异常的花药在显微镜下进一步镜检。在编号为3326的家系中发现9株育性异常的植株，不能正常散粉，但结实正常(图1)。该突变体花药比野生型瘪小，颜色浅黄，无可见花粉，但在营养生长、抽穗期、穗型均与野生型没有明显区别，被选作候选突变体材料进行下一步研究。根据最终鉴定的突变基因(参见实施例6、7、8)，该突变体命名为zmabcg20-1。

实施例3不育突变体花粉镜检和遗传分析

通过碘染着色与不着色花粉比例，统计花粉育性。在体式显微镜下观察zmabcg20-1雄花形态，花药比野生型小，颜色较浅(图2)。田间采集开花期小花，用镊子取出花药，在碘-碘化钾溶液(0.6％KI，0.3％I₂，w/w)中轻轻挤压花药，滴在载玻片上，盖上盖玻片，在显微镜下观察花粉碘染情况并拍照。野生型花粉多而染成蓝黑色，而突变体则看不到花粉粒(图2)。

突变体开放授粉下可正常结实(图1)，表明该突变体为雄性不育突变体，雌穗育性不受影响。收获zmabcg20-1开放授粉种子(F₁)并播种，抽穗后均可正常散粉，套袋自交可正常结实，单穗收获F₂种子。取一个单穗自交的F₂种子穗行播种，抽穗后鉴定育性，其中125株花粉正常碘染，38株无花粉，符合3:1分离(χ²＝0.30)，表明该不育性状由单个隐性基因控制。

实施例4叶片采样与DNA提取

本项研究采用CTAB法提取玉米叶片DNA，具体方法如下：称取约0.1g叶片，放入离心管，加入600μL CTAB提取缓冲液，5μL RNase A，震荡分散，65℃水浴0.5hr，其间轻摇2-3次；加入等体积氯仿/Tris-饱和酚(1:1，v/v)，混匀，轻摇10min；4℃10000rpm离心20min；转移上清至新管，加入1/10体积的3M乙酸钠(pH值5.2)、0.6-1倍体积的冷异丙醇；轻摇混匀，至絮状沉淀出现；4℃10000rpm离心10min；弃去上清，用体积百分含量70％乙醇洗沉淀2次；风干，加入50μL 1×TE溶解沉淀，-20℃保存。用Nanodrop2000检测DNA浓度，稀释至10ng/L用作PCR模板。

实施例5雄性不育候选基因染色体初步定位

根据IBM2 2008遗传图谱(www.maizegdb.org)筛选出在玉米各染色体上均匀分布的SSR和Indel标记，筛选出在京科糯2000亲本间存在多态的标记，对京科糯2000和M₂中的9株zmabcg20-1进行基因型鉴定。PCR程序为PCR反应体系为：1μL 10×反应缓冲液，0.25μLdNTP，0.25μL正向引物和0.25μL反向引物，0.5U Taq酶，1μL 10ng/μL模板DNA，加超纯水将总体积补至10μL。PCR反应程序为：94-98℃变性1-3min，然后执行以下循环：95℃变性20s，53-58℃复性20s，72℃延伸30s，30-40个循环。

反应产物在6％聚丙烯酰胺凝胶上进行电泳分离。聚丙烯酰胺凝胶电泳方法如下：(1)聚丙烯酰胺胶的配制：6％PA胶80mL，10％过硫酸胺250μL(冬天)/125μL(夏天)，四甲基乙二胺(TEMED)80μL。摇匀后灌胶。用洗涤剂把玻璃板反复擦洗干净，用酒精擦净、晾干。在通风橱中将凹板涂上2％的Repel Silane后，再用酒精擦净、干燥，将另一块平板涂上0.5％的Bingding Silane 1.5mL(在1.5ml离心管中加入7.5μL Binding Silane和7.5μL冰醋酸，补足95％乙醇至1.5mL)。操作过程中，防止两块玻璃板相互污染，彻底干燥后再进行玻璃板组装、灌胶。(2)预电泳：待胶凝固后，取出梳子，洗掉上边凝胶尤其注意接缝处定要洗净。先在电泳槽下槽(阴极)装入1×TBE的电极缓冲液，将聚合的凝胶板装在电泳槽内，在上槽中注入0.5×TBE的电极缓冲液。恒定功率40W-65W，预电泳约30min。用吸管清除胶面上沉淀的尿素和气泡，插入梳子。(3)电泳：扩增产物中加入5μl 5×Loading Buffer混合后95℃变性5分钟，立刻转移到冰上冷却，吸取1.5-3μl加入上样孔；恒定功率40W-65W进行电泳，至溴酚蓝到达电泳槽底部结束。视SSR扩增产物分子量大小及差异带型的可辨程度调整电泳时间。(4)银染显色，将带胶的一块玻璃板放入10％的冰乙酸固定液中，65r/min振荡约30min，直至二甲苯腈全部脱色；蒸馏水冲洗2次，每次5min；将冲洗后的胶板放入新配制的染色液(2L水中加入2g硝酸银、3mL 37％甲醛)中65r/min摇动30min；将染色后的胶板放入蒸馏水冲洗5s，立即拿出进行显影；将胶板快速转移到4℃预冷的显影液(2L水中加入30g氢氧化钠，10ml 37％甲醛)轻轻摇动至带纹出现；将胶板置于10％的冰乙酸固定液中至无气泡产生为止；用蒸馏水冲洗2次，每次2min；室温下自然干燥后，拍照保存图像。

在鉴定标记中，位于9号染色体的Indel标记IDP8150(正向引物：5’-TGCTCGCAGGAATAGAAAGC-3’；反向引物：5’-GACGCAATCGACAGAGTACG-3’)，在京科糯2000中的扩增带为杂合带型，而9株zmabcg20-1均为相同的纯合带型，表明控制育性的突变基因与IDP8150连锁，位于9号染色体。对已克隆的植物雄性育性控制基因分析，发现玉米的Ms45(GRMZM2G307906)，拟南芥AtABCG26和水稻OsABCG15的直系同源基因ZmABCG20(GRMZM2G076526/Zm00001d046537)均位于9号染色体。我们将这两个基因作为目标基因进行测序分析。

实施例6候选基因测序

根据玉米自交系B73的Ms45和ZmABCG20基因序列设计引物，扩增野生型京科糯2000和zmabcg20-1的基因组DNA，扩增产物测序后拼接出完整序列。用于扩增玉米ZmABCG20的引物对为ZmABCG20_1～3，用于扩增Ms45的引物对为Ms45_1～Ms45_4；序列见表1：

表1用于扩增玉米ZmABCG20和Ms45的引物对序列

PCR反应体系为：1μL 10×反应缓冲液，0.25μL dNTP，0.25μL正向引物和0.25μL反向引物，0.5U Taq酶，1μL 10ng/μL模板DNA，加超纯水将总体积补至10μL。PCR反应程序为：94-98℃变性1-3min，然后执行以下循环：95℃变性20s，53-58℃复性20s，72℃延伸30s，30-40个循环。循环结束后72℃补充延伸3-10min，结束反应。配置1.5％琼脂糖凝胶，在5V/cm电场下电泳30min；采用市面DNA凝胶回收试剂盒回收PCR产物。

将回收所得野生型与突变体的PCR产物DNA采用ABI3730测序仪进行测序，测序引物分别使用正向引物与反向引物。使用常见DNA序列分析软件DNAman6.0对双向测序结果进行拼接。分析表明，突变体zmabcg20-1的Ms45基因序列与野生型京科糯2000完全相同，没有发生突变。突变体zmabcg20-1的ZmABCG20基因全长核苷酸序列如SEQ ID NO:7所示，比京科糯2000缺失了4个碱基。

ZmABCG20与水稻中的OsABCG15以及拟南芥中的AtABCG26为直系同源基因，而后两者突变体表型也表现为雄性不育，其中水稻突变体osabcg15也无成熟花粉。

实施例7 ZmABCG20表达的组织特异性

选取从不同时期京科糯2000的花穗，时期从V7期(玉米雄穗开始成型)至V18期(玉米雄穗穗成熟)(How a Corn Plant Develops.Special Report No.48.Iowa StateUniversity of Science and Technology,Cooperative Extension Servce,Ames,Iowa.Reprinted 2/1996)，以及幼根、茎、叶、雄花外颖、内颖和雌穗；液氮运输，-80℃保存；用TRIzol RNA提取试剂盒(Invitrogen,美国)分别提取上述组织RNA,立即用PrimeScriptRT reagent试剂盒(TaKaRa,大连)，按照操作说明将RNA反转录为cDNA。

荧光定量PCR采用PowerUp^TM SYBR^TM Green Master Mix(Thermo Fisher美国),用PikoReal 96荧光定量PCR仪(Thermo Fisher,美国)扩增和检测荧光。选择玉米Actin1基因作为内参基因，扩增引物为actinI-F和actinI-R(SEQ ID NO:15-16)，用于ZmABCG20荧光定量的扩增引物为ABCG-2F和ABCG-2R(SEQ ID NO:17-18)。

荧光定量PCR反应体系如下：SYBR Green Mix 5μL，Forward Primer 0.5μL，Reverse Primer 0.5μL，cDNA 1μL，超纯水3μL。PCR反应程序为：95℃变性5min；95℃变性15s，60℃退火-延伸1min，循环40次；60℃30s。溶解曲线起始温度60℃；最终温度95℃；保持时间1s；温度增量0.2℃。

荧光实时定量PCR结果见图3，ZmABCG20基因仅在V10-V15时期的雄花幼穗中表达，其中在V12期表达急剧升高，其他时期仅有微量表达；在根、茎、叶、雌穗、以及雄花的内颖和外颖等其他组织均未检测到ZmABCG20的表达。V12期对应花粉单核期，其外壁正在形成，这一表达组织和时期与其拟南芥和水稻同源基因的功能是一致的。

实施例8 ZmABCG20转录本序列分析

在Gramene数据库中，ZmABCG20基因有两个基因注释号，分别为GRMZM2G076526和Zm00001d046537，共有8个预测的转录本。为确定该基因的编码区，用覆盖ZmABCG20编码区全长的引物对ZmABCG20_T1～T4(序列见表1)扩增从京科糯2000雄花幼穗中获得的cDNA扩增，产物按实施例6的方法分离测序。测序结果ZmABCG20编码区如SEQ ID NO:5所示，与GRMZM2G076526-T001(SEQ ID NO:2)一致。

比对突变体基因组、京科糯2000基因组和cDNA序列，发现zmabcg20-1在编码区第246位碱基，即基因组序列中起始密码子起第326位碱基后，位于第二个外显子的4个碱基TGCA缺失，导致翻译的蛋白质中第82个氨基酸残基后发生移码突变，翻译至第100个氨基酸残基后提前终止翻译。突变基因zmabcg20-1的编码区序列如SEQ ID NO:8所示，编码的蛋白序列如SEQ ID NO:9所示。B73的ZmABCG20基因组序列、编码区序列及蛋白质序列分别见SEQID NO:1、SEQ ID NO:2和SEQ ID NO:3；京科糯2000的ZmABCG20基因组序列、编码区序列及蛋白质序列分别见SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:5和SEQ ID NO:6。ZmABCG20基因结构及zmabcg20-1突变位点见图4。

实施例9功能标记鉴定F₂群体ZmABCG20基因型

根据实施例6中得到的突变位点两侧的序列设计一对基因特异引物：正向引物3326_F1，其核苷酸序列如SEQ ID NO:10所示；反向引物3326_R1，其核苷酸序列如SEQ IDNO:11所示。

用上述引物对扩增出的产物大小如果为79bp，则标志着该待测植物基因型为野生型；如果扩增产物大小为75bp，则标志着该待测植株为zmabcg20-1突变体；如果扩增产物大小为79bp和75bp两条带型，则标志着该待测植株ZmABCG20基因为野生型和zmabcg20-1突变体的杂合基因型。

在实施例3中获得的F₂株系中，随机选取野生型和突变体表型的植株，提取叶片DNA，与京科糯2000基因组DNA一起，分别用上述引物对进行扩增。PCR反应体系为：1μL 10×反应缓冲液，0.25μL dNTP，0.25μL正向引物和0.25μL反向引物，0.5U Taq酶，1μL 10ng/μL模板DNA，加超纯水将总体积补至10μL。PCR反应程序为：94-98℃变性1-3min，然后执行以下循环：95℃变性20s，53-58℃复性20s，72℃延伸30s，30-40个循环。扩增产物用6％聚丙烯酰胺凝胶电泳分离，40W恒功率电场下电泳1hr，硝酸银染色后拍照记录电泳图。

结果见图5，野生型对照的扩增产物大小为79bp；F₂穗行中不育株的扩增产物大小均为75bp；所有的可育株扩增产物大小为79bp，或79bp+75bp杂合带型，而没有纯合75bp带型。这一结果表明实施例6中所述突变位点与隐性核雄性不育基因是共分离的。

实施例10 ZmABCG20的RNAi载体构建

为验证ZmABCG20基因功能，本实施例构建了该基因的RNAi载体。载体构建过程如图6所示，具体方法如下：

1、选择ZmABCG20中高特异性cDNA片段SEQ ID NO:23作为RNAi靶序列。从实施例7得到的V12期cDNA中，用引物对17N19-F1(SEQ ID NO:21)和17N19-R1(SEQ ID NO:22)扩增出RNAi茎环结构的正向片段17N19-1；用引物对17N19-F2(SEQ ID NO:19)和17N19-R2(SEQID NO:20)扩增出RNAi茎环结构的反向片段17N19-2。

2、中间载体采用pBSK-RTM(成都皓宸生物科技有限公司提供，载体pBSK-RTM由质粒pBSK改造而来。其含有序列如SEQ ID NO:24所示的拟南芥RTM1基因的内含子，如图6所示，该内含子左侧为SacI和NotI酶切位点，右侧为XbaI和BamHI酶切位点)。采用SacI和NotI双酶切pBSK-RTM和正向片段，连接转化大肠杆菌，挑取8个转化子进行PCR验证，挑取两个阳性转化子提取质粒后送测序验证，得到pBSK-17N19-1载体。

3、以pBSK-17N19-1为模板进行17N19基因反向片段17N19-2的克隆。

采用XbaI和BamHI双酶切pBSK-17N19-1和反向片段17N19-2，连接转化大肠杆菌，挑取8个转化子进行PCR验证。挑取1个阳性转化子提取质粒后测序，证实为目的载体pBSK-17N19R。

用BamHI和SacI双酶切pBSK-17N19R载体，回收包含正向片段+RTM+反向片段的目标片段；同时用BamHI和SacI双酶切pCambia3301ky质粒(成都皓宸生物科技有限公司提供，在pCambia3301质粒的多克隆位点上游插入了一个35S启动子得到pCambia3301ky)。连接目标片段和pCambia3301ky，转化大肠杆菌。挑取1个PCR阳性的转化子提取质粒，用BamHI和SacI双酶切，电泳显示(正向片段+RTM+反向片段)大片段和pCambia3301ky质粒骨架条带，结果表明目标片段正确连接到pCambia3301ky多克隆载体中，为载体pCambia3301-17N19R，RNAi载体构建完成。

实施例11遗传转化与转化植株表型鉴定

MS和N6培养基成分如下：

其余步骤所用培养基如下：

YEB培养液：5.0g/L酵母，10.0g/L蛋白胨，5.0g/L NaCl，50.0mg/L卡那霉素和25.0mg/L利福平，pH6.8；

侵染液：N6基本培养基中加入2,4-D l.0mg/L，L-脯氨酸700mg/L，水解酪蛋白100mg/L，肌醇120mg/L，蔗糖68g/L，葡萄糖36g/L，乙酰丁香酮100μmol/L，pH5.2；

共培养基：N6基本培养基，添加脯氨酸1.38g/L，水解酪蛋白500mg/L，肌醇120mg/L，2,4-D 2.0mg/L，琼脂0.7％，蔗糖3％，乙酰丁香酮100μmol/L，半胱氨酸200mg/L，AgNO₃0.85mg/L，pH6.0；

恢复培养基：N6基本培养基中，添加脯氨酸1.38g/L，水解酪蛋白500mg/L，肌醇120mg/L，2,4-D 2.0mg/L，琼脂0.7％，蔗糖3％，AgNO₃ 0.85mg/L，头孢霉素400mg/L，pH5.8；

第一轮筛选培养基：N6基本培养基中，添加2,4-D l.0mg/L，L-脯氨酸700mg/L，水解酪蛋白100mg/L，甘露醇20g/L，肌醇120mg/L，琼脂0.7％，蔗糖3％，头孢霉素400mg/L，AgNO₃ 0.85mg/L，双丙氨膦0.3mg/L，pH5.8；

第二轮筛选培养基：在第一轮筛选培养基的基础上，将双丙氨膦浓度提高至0.6mg/L；

分化培养基：基本培养基MS中加入1mg/L激动素，100mg/L水解酪蛋白，200mg/L头孢霉素，0.7％琼脂，3％蔗糖，pH5.8；

生根培养基：1/2MS基本培养基中加入100mg/L水解酪蛋白，700mg/L L-脯氨酸，0.2mg/L IBA，0.7％琼脂，3％蔗糖，pH5.8。

按照以下步骤进行遗传转化与再生植株获得：

1)侵染材料的准备：取玉米自交系B104自交授粉后10-13d玉米果穗，挑取幼胚，用75％酒精浸泡15s，2.5％次氯酸钠浸泡消毒10min，蒸馏水浸洗3-5次。

2)浸染幼胚：从平板上挑取基因工程农杆菌的单菌落接种于YEB培养液中，在28℃、220rpm振荡培养20h-36h；当细菌达到对数生长期时，4℃、3000rpm离心10min，离心收集菌体，用侵染液重悬至OD≈0.5，即可用于侵染。将挑取好的150个幼胚用浸染液浸5min-10min，用滤纸轻轻吸干浸染液。

3)共培养和恢复培养：将完成浸染的幼胚转入共培养基上，22℃暗培养3d后，转移到恢复培养基上，28℃暗培养7d。

4)筛选：将按步骤3)处理后获得的愈伤组织转到筛选培养基上28℃暗培养，筛选两轮，每轮3周。

5)分化、生根：将筛选出的抗性愈伤组织转到分化培养基上25℃暗培养7d；再在25℃，16h光照(光照强度2000lux)-8h黑暗交替循环条件下培养，待苗长到5cm左右的长度时候转到生根培养基上，28℃光照培养15d。

6)炼苗移栽：将生根培养后的苗移栽到装有营养土的小花盆里，28℃光照培养10d；将幼苗移栽到温室(自然光照，日温32℃，夜温28℃)中培养。

将经过上述步骤移栽的幼苗用引物PCR鉴定，确认5株为转化阳性株，携带有实施例9设计的ZmABCG20 RNAi片段。

转化植株开花时，取对照与阳性转化植株的花药，用实施例3中的碘染方法鉴定花粉育性。结果如图7所示，野生型自交系B104花粉正常可育，而一株编号R02的转化植株表现为雄性不育，没有花粉，与zmabcg20-1突变体表型一致。这一结果表明，敲除ZmABCG20确实会引起雄性不育。

结合实施例1-10的结果，zmabcg20-1突变体表型、突变基因与拟南芥和水稻中ZmABCG20同源基因突变体一致；ZmABCG20基因在玉米雄花幼穗中特异表达，而在其他时期和组织均不表达；不育表型与zmabcg20-1突变基因共分离；敲除ZmABCG20基因可导致与zmabcg20-1一致的雄性不育表型。上述结果证明：ZmABCG20是玉米雄性育性发育的必须基因；其功能缺失可导致玉米雄性不育表型；zmabcg20-1突变体的雄性不育表型是由实施例6中所述的ZmABCG20基因发生点突变造成的。

实施例12 ZmABCG20启动子克隆

使用引物pZmABCG20_F(序列如SEQ ID NO:13所示)和pZmABCG20_R(序列如SEQ IDNO:14所示)扩增玉米基因组DNA，可以获得大小为1653bp的DNA片段，其中起始密码子ATG上游1634bp(SEQ ID NO:12)。用在线转录元件分析工具PlantCARE(http://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/plantcare/html/)对这段序列进行分析，发现在+1237和+1385分别为CAAT-box和TATA-box；此外还有一些激素响应元件：脱落酸响应元件ABRE(GCAACGTGTC，+1236)；茉莉酸响应元件TGACG_motif(TGACG，+655)和CGTCA_motif(CGTCA，+765)；赤霉素响应元件GRAE_motif(TCTGTTG，+513；AAACAGA，+1397)。在+973有一个昼夜节律调控元件CAANNNNATC。丰富的转录和调控元件表明这一区域即为ZmABCG20的启动子区域。

实施例13突变基因的杂交转育

本发明获得的突变体及实施例9中所述突变基因的功能标记可用于各种分子标记辅助选择的方法，以回交转育为例，可按图8的步骤将不育基因zmabcg20-1通过杂交转育到其它玉米遗传背景中：

①杂交：

以zmabcg20-1突变株为母本，与受体玉米材料为父本杂交获得F₁种子；

②第一轮回交：

F₁播种后获得F₁植株，将F₁植株与轮回亲本进行杂交，获得BC₁种子；

③BC₁不育基因选择(前景选择)：

播种BC₁种子，获得不少于500株幼苗，在幼苗期采集各单株叶片，按实施例4所述方法提取DNA，利用实施例9中引物对(3326_F1、3326_R1)进行扩增和电泳，选取基因型为杂合的单株继续种植，弃去纯合野生型的单株；

④BC₁背景选择：

采用一组(例如100个，或200个等)在突变体zmabcg20-1和轮回亲本之间存在多态的，且在基因组上均匀分布的分子标记(包括但不限于SSR、INDEL、SNP、EST、RFLP、AFLP、RAPD、SCAR等类型标记)，对步骤③中选出的单株进行鉴定，选取与轮回亲本相似度高(例如大于88％相似度，或2％中选率等)的材料；

⑤第二轮回交：用步骤④中选出的单株为父本，为轮回亲本授粉，获得BC₂种子；

⑥BC₂的前景与背景选择：对选出的材料重复步骤③至步骤④的操作，选出与轮回亲本相似度高于选择标准(如相似度大于98％，或2％中选率等)的BC₂代植株；

⑦自交获得BC₂F₂种子：对步骤⑥中选出的BC₂植株进行自交，获得BC₂F₂种子；

⑧BC₂F₂的前景选择：将步骤⑦中获得的BC₂F₂种子播种，获得500株以上幼苗，在幼苗期采集叶片，按实施例4所述方法提取DNA，利用实施例9中引物对(3326_F1、3326_R1)进行扩增和电泳，选出带型为纯合突变体和杂合型的单株继续栽培，剔除纯合野生型的单株；

⑨BC₂F₂的背景选择及应用：将步骤⑧中选出的单株按照步骤④的方法进行背景筛选，选出100％背景纯合的单株。如果中选单株的基因型为纯合突变体，则该单株为我们的最终目标材料，可进一步与轮回亲本杂交保存材料，或与其它玉米材料进行杂交。如果中选单株是杂合带型，可直接用于保存种质，或通过自交获得不育株用于杂交育种或制种。

虽然，上文中已经用一般性说明及具体实施方案对本发明作了详尽的描述，但在本发明基础上，可以对之做一些修改或改进，这对本领域技术人员而言是显而易见的。因此，在不偏离本发明精神的基础上所做的这些修改或改进，均属于本发明要求保护的范围。

序列表

<110> 海南波莲水稻基因科技有限公司

<120> 与玉米雄性生育力相关的DNA分子标记及其应用

<130> KHP171115877.8K

<160> 24

<170> SIPOSequenceListing 1.0

<210> 1

<211> 2366

<212> DNA

<213> 玉米(Zea mays)

<400> 1

atggagatca gcgacgagca gaggatgcaa gtggagtgcc agcgccttcc gccttcctgg 60

caaggcaacg gatcagacgc cgatgtcgaa gtggatcatc atctgtggcc gtcaaaagat 120

ggccctcttc caatattcct taaggtgtta gttgtgctac ctcactcctg ttttttttct 180

tttaggctga cgtgtgcaat gacttgctga actccaaaac ccagtttgag aacgtggagt 240

acagggtgaa gatgaccttg aagaaccccc tcacagcggc gagagtggcg tttgcgtccc 300

agacgagggc agaccagggc agcagctgca agcacatcct caagggcatc gctgggagtg 360

tggaccctgg cgagatcctg gcgctgatgg gtccatctgg cagcggcaag accaccttgc 420

tcaagatcct ggggggcagg cttggtggcg gcgtcaaggg ccacataacc tacaacgaca 480

ctccctacag cccctgcctc aaaaggaggt actgaaactg taatagctag caaacaagaa 540

tttttcactt cacttaataa tgaagatttt ttcactaatc tgtgctgtgc gctgcaggat 600

cggatttgtg actcaggacg acgtcctctt cccacagctg acggtggagg agaccctcgt 660

gttcgccgcc ttcttgaggc tccctgcttg catgtccaag cagcagaagc gcgacagggt 720

agacgccatc atcgccgagt tgaatctaga gaggttgcct ttcattccat ttcttgtatt 780

tatcggggaa tttgagtttt cgcctgtatg caaatgcaag catgcatgca tacatgttgt 840

gtggatcatc atttgaattg gtttaggtgc cggcacacca agatcggggg agcgttcgtg 900

aggggggtgt caggaggcga gaggaagagg accagcatcg ggaacgagat cctcgtcgac 960

ccgtcgctgc tcctcctcga cgagcccacc tccggcctcg actccacgtc ggcgagcaag 1020

ctcatcttta tcctccagcg cctggccaag gtacattaat ttgcgcgcag ctagcaacgc 1080

caccgacgag acgacgatca tgcacgttgc taattccatc gatgctggac gcatggtcgc 1140

agacgcggag gacgatcatc acgacgatcc accagccgtc gagccggatg ttccacatgt 1200

tcgacaagct gctgctcatc tccgacgggc acgccatcta ccacggcaag gcccgggact 1260

gcatgcacca cttctcctcg ctgggcttcg tcccggagat ccccatgaac ccggccgagt 1320

tcctgctgga cctcgccacc ggcaacctcg acgacatcag cgtccccgag gcgctgcgcg 1380

gctcgccgga cccgcaggag ttcaggtccc aggtcatcag gcacctgcag ctcaagtacc 1440

gggcgggcgc cgaggctccc gcggggagaa ggacgcccac tgagcagctg cgtctggcgg 1500

tgcgggcgca taacaaggac cgccgccggc ggagcatcgg ctggctccag cagttcgccg 1560

tgctgtcccg gcgcacgttc cgggagcgcg catccgacta cctggacaag atgcggctcg 1620

cgcaggccgt cggcgtggcg ctcctgctgg gtctcctctg gtggaagtcc cagaccggga 1680

acgaggccca gctgcgggac caggtcggtc tcatcttcta catctgcatc ttctggacgt 1740

cgtcgtcgct cttcggctcc gtctacgtgt tccccttcga gaagctgtac ctggtcaagg 1800

agcgcaaggc ggacatgtac cggctgagcg cctactacgc cagcagcacg ctgtgcgacg 1860

ccgtgccgca cgtcgtgtac ccggtgctct tcatggccat cctctacttc atggccggcc 1920

tccgccgcac cgtgccgtgc ttcttcctca cgctcctcgc cacgctgctc atcgtgttca 1980

ccagccaggg caccggggag ctgctgggcg ccgccatcct cagcgtcaag agggcggggg 2040

tcatggcgtc gctcgtgctc atgctcttcc tcctcaccgg cggctactac gtccagcaca 2100

tccccaagtt catccgctgg ctcaagtacg tctccttcat gcactacggc ttcaacctgc 2160

tgctcaaagc gcagtaccac ggccacctca cgtacaactg tgccagccgg ggcggctgcc 2220

agcgcctgca gtcgtcgccg tcgttcggca ccgtggacct cgacggcggc atgcgcgagg 2280

tctggatcct gctcgccatg gcgctcgcat accgactcct cgcctacttc tgcctcctca 2340

agcggatcag cctcacgccc ttgtga 2366

<210> 2

<211> 1992

<212> DNA

<213> 玉米(Zea mays)

<400> 2

atggagatca gcgacgagca gaggatgcaa gtggagtgcc agcgccttcc gccttcctgg 60

caaggcaacg gatcagacgc cgatgtcgaa gtggatcatc atctgtggcc gtcaaaagat 120

ggccctcttc caatattcct taagtttgag aacgtggagt acagggtgaa gatgaccttg 180

aagaaccccc tcacagcggc gagagtggcg tttgcgtccc agacgagggc agaccagggc 240

agcagctgca agcacatcct caagggcatc gctgggagtg tggaccctgg cgagatcctg 300

gcgctgatgg gtccatctgg cagcggcaag accaccttgc tcaagatcct ggggggcagg 360

cttggtggcg gcgtcaaggg ccacataacc tacaacgaca ctccctacag cccctgcctc 420

aaaaggagga tcggatttgt gactcaggac gacgtcctct tcccacagct gacggtggag 480

gagaccctcg tgttcgccgc cttcttgagg ctccctgctt gcatgtccaa gcagcagaag 540

cgcgacaggg tagacgccat catcgccgag ttgaatctag agaggtgccg gcacaccaag 600

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aacgagatcc tcgtcgaccc gtcgctgctc ctcctcgacg agcccacctc cggcctcgac 720

tccacgtcgg cgagcaagct catctttatc ctccagcgcc tggccaagac gcggaggacg 780

atcatcacga cgatccacca gccgtcgagc cggatgttcc acatgttcga caagctgctg 840

ctcatctccg acgggcacgc catctaccac ggcaaggccc gggactgcat gcaccacttc 900

tcctcgctgg gcttcgtccc ggagatcccc atgaacccgg ccgagttcct gctggacctc 960

gccaccggca acctcgacga catcagcgtc cccgaggcgc tgcgcggctc gccggacccg 1020

caggagttca ggtcccaggt catcaggcac ctgcagctca agtaccgggc gggcgccgag 1080

gctcccgcgg ggagaaggac gcccactgag cagctgcgtc tggcggtgcg ggcgcataac 1140

aaggaccgcc gccggcggag catcggctgg ctccagcagt tcgccgtgct gtcccggcgc 1200

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gtggcgctcc tgctgggtct cctctggtgg aagtcccaga ccgggaacga ggcccagctg 1320

cgggaccagg tcggtctcat cttctacatc tgcatcttct ggacgtcgtc gtcgctcttc 1380

ggctccgtct acgtgttccc cttcgagaag ctgtacctgg tcaaggagcg caaggcggac 1440

atgtaccggc tgagcgccta ctacgccagc agcacgctgt gcgacgccgt gccgcacgtc 1500

gtgtacccgg tgctcttcat ggccatcctc tacttcatgg ccggcctccg ccgcaccgtg 1560

ccgtgcttct tcctcacgct cctcgccacg ctgctcatcg tgttcaccag ccagggcacc 1620

ggggagctgc tgggcgccgc catcctcagc gtcaagaggg cgggggtcat ggcgtcgctc 1680

gtgctcatgc tcttcctcct caccggcggc tactacgtcc agcacatccc caagttcatc 1740

cgctggctca agtacgtctc cttcatgcac tacggcttca acctgctgct caaagcgcag 1800

taccacggcc acctcacgta caactgtgcc agccggggcg gctgccagcg cctgcagtcg 1860

tcgccgtcgt tcggcaccgt ggacctcgac ggcggcatgc gcgaggtctg gatcctgctc 1920

gccatggcgc tcgcataccg actcctcgcc tacttctgcc tcctcaagcg gatcagcctc 1980

acgcccttgt ga 1992

<210> 3

<211> 663

<212> PRT

<213> 玉米(Zea mays)

<400> 3

Met Glu Ile Ser Asp Glu Gln Arg Met Gln Val Glu Cys Gln Arg Leu

1 5 10 15

Pro Pro Ser Trp Gln Gly Asn Gly Ser Asp Ala Asp Val Glu Val Asp

20 25 30

His His Leu Trp Pro Ser Lys Asp Gly Pro Leu Pro Ile Phe Leu Lys

35 40 45

Phe Glu Asn Val Glu Tyr Arg Val Lys Met Thr Leu Lys Asn Pro Leu

50 55 60

Thr Ala Ala Arg Val Ala Phe Ala Ser Gln Thr Arg Ala Asp Gln Gly

65 70 75 80

Ser Ser Cys Lys His Ile Leu Lys Gly Ile Ala Gly Ser Val Asp Pro

85 90 95

Gly Glu Ile Leu Ala Leu Met Gly Pro Ser Gly Ser Gly Lys Thr Thr

100 105 110

Leu Leu Lys Ile Leu Gly Gly Arg Leu Gly Gly Gly Val Lys Gly His

115 120 125

Ile Thr Tyr Asn Asp Thr Pro Tyr Ser Pro Cys Leu Lys Arg Arg Ile

130 135 140

Gly Phe Val Thr Gln Asp Asp Val Leu Phe Pro Gln Leu Thr Val Glu

145 150 155 160

Glu Thr Leu Val Phe Ala Ala Phe Leu Arg Leu Pro Ala Cys Met Ser

165 170 175

Lys Gln Gln Lys Arg Asp Arg Val Asp Ala Ile Ile Ala Glu Leu Asn

180 185 190

Leu Glu Arg Cys Arg His Thr Lys Ile Gly Gly Ala Phe Val Arg Gly

195 200 205

Val Ser Gly Gly Glu Arg Lys Arg Thr Ser Ile Gly Asn Glu Ile Leu

210 215 220

Val Asp Pro Ser Leu Leu Leu Leu Asp Glu Pro Thr Ser Gly Leu Asp

225 230 235 240

Ser Thr Ser Ala Ser Lys Leu Ile Phe Ile Leu Gln Arg Leu Ala Lys

245 250 255

Thr Arg Arg Thr Ile Ile Thr Thr Ile His Gln Pro Ser Ser Arg Met

260 265 270

Phe His Met Phe Asp Lys Leu Leu Leu Ile Ser Asp Gly His Ala Ile

275 280 285

Tyr His Gly Lys Ala Arg Asp Cys Met His His Phe Ser Ser Leu Gly

290 295 300

Phe Val Pro Glu Ile Pro Met Asn Pro Ala Glu Phe Leu Leu Asp Leu

305 310 315 320

Ala Thr Gly Asn Leu Asp Asp Ile Ser Val Pro Glu Ala Leu Arg Gly

325 330 335

Ser Pro Asp Pro Gln Glu Phe Arg Ser Gln Val Ile Arg His Leu Gln

340 345 350

Leu Lys Tyr Arg Ala Gly Ala Glu Ala Pro Ala Gly Arg Arg Thr Pro

355 360 365

Thr Glu Gln Leu Arg Leu Ala Val Arg Ala His Asn Lys Asp Arg Arg

370 375 380

Arg Arg Ser Ile Gly Trp Leu Gln Gln Phe Ala Val Leu Ser Arg Arg

385 390 395 400

Thr Phe Arg Glu Arg Ala Ser Asp Tyr Leu Asp Lys Met Arg Leu Ala

405 410 415

Gln Ala Val Gly Val Ala Leu Leu Leu Gly Leu Leu Trp Trp Lys Ser

420 425 430

Gln Thr Gly Asn Glu Ala Gln Leu Arg Asp Gln Val Gly Leu Ile Phe

435 440 445

Tyr Ile Cys Ile Phe Trp Thr Ser Ser Ser Leu Phe Gly Ser Val Tyr

450 455 460

Val Phe Pro Phe Glu Lys Leu Tyr Leu Val Lys Glu Arg Lys Ala Asp

465 470 475 480

Met Tyr Arg Leu Ser Ala Tyr Tyr Ala Ser Ser Thr Leu Cys Asp Ala

485 490 495

Val Pro His Val Val Tyr Pro Val Leu Phe Met Ala Ile Leu Tyr Phe

500 505 510

Met Ala Gly Leu Arg Arg Thr Val Pro Cys Phe Phe Leu Thr Leu Leu

515 520 525

Ala Thr Leu Leu Ile Val Phe Thr Ser Gln Gly Thr Gly Glu Leu Leu

530 535 540

Gly Ala Ala Ile Leu Ser Val Lys Arg Ala Gly Val Met Ala Ser Leu

545 550 555 560

Val Leu Met Leu Phe Leu Leu Thr Gly Gly Tyr Tyr Val Gln His Ile

565 570 575

Pro Lys Phe Ile Arg Trp Leu Lys Tyr Val Ser Phe Met His Tyr Gly

580 585 590

Phe Asn Leu Leu Leu Lys Ala Gln Tyr His Gly His Leu Thr Tyr Asn

595 600 605

Cys Ala Ser Arg Gly Gly Cys Gln Arg Leu Gln Ser Ser Pro Ser Phe

610 615 620

Gly Thr Val Asp Leu Asp Gly Gly Met Arg Glu Val Trp Ile Leu Leu

625 630 635 640

Ala Met Ala Leu Ala Tyr Arg Leu Leu Ala Tyr Phe Cys Leu Leu Lys

645 650 655

Arg Ile Ser Leu Thr Pro Leu

660

<210> 4

<211> 2360

<212> DNA

<213> 玉米(Zea mays)

<400> 4

atggagatca gcgacgagca gaggatgcaa gtggagtgcc agcgccttcc gccttcctgg 60

caaggcaacg gatcagacgc cgatgtcgaa gtggatcatc atctgtggcc gtcaaaagat 120

ggccctcttc caatattcct taaggtgtta gttgtgctac ctcactcctg ttttttttct 180

tttaggctga cgtgtgcaat gacttgctga actccaaaac ccagtttgag aacgtggagt 240

acagggtgaa gatgaccttg aagaaccccc tcacagcggc gagagtggcg tttgcgtccc 300

agacgagggc agaccagggc agcagctgca agcacatcct caagggcatc gctgggagtg 360

tggaccctgg cgagatcctg gcgctgatgg gtccatctgg cagcggcaag accaccttgc 420

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ctccctacag cccctgcctc aaaaggaggt actgaaactg taatagctag caaacaagaa 540

tttttcactt cacttaataa tgaagaattt tcattaatct gtgctgtgcg ctgcaggatc 600

ggatttgtga ctcaggacga cgtcctcttc ccacagctga cggtggagga gaccctcgtg 660

ttcgccgcct tcttgaggct ccctgcctgc atgtccaagc agcagaagcg cgacagggtc 720

gacgccatca tcgccgagtt gaatctagag aggttgcctt tcattccatt tcttgtattt 780

atcggggaat ttgagttttc gcctgtatgc aagcatgcat gcatacatgt ggtgtggatc 840

accatttgaa ttggtttagg tgccggcaca ccaagatcgg gggagcgttc gtgagggggg 900

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tgctcctcct cgacgaaccc acctccggcc tcgactccac atcggcgagc aagctcatct 1020

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cgatacgacg atcatgcacg ttgctaattc gatcgatgct ggacgcatgg tcgcagacgc 1140

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accacttctc ctcgctgggc ttcgtcccgg agatccccat gaacccggcc gagttcctgc 1320

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<211> 1992

<212> DNA

<213> 玉米(Zea mays)

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<210> 6

<211> 663

<212> PRT

<213> 玉米(Zea mays)

<400> 6

Met Glu Ile Ser Asp Glu Gln Arg Met Gln Val Glu Cys Gln Arg Leu

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Pro Pro Ser Trp Gln Gly Asn Gly Ser Asp Ala Asp Val Glu Val Asp

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His His Leu Trp Pro Ser Lys Asp Gly Pro Leu Pro Ile Phe Leu Lys

35 40 45

Phe Glu Asn Val Glu Tyr Arg Val Lys Met Thr Leu Lys Asn Pro Leu

50 55 60

Thr Ala Ala Arg Val Ala Phe Ala Ser Gln Thr Arg Ala Asp Gln Gly

65 70 75 80

Ser Ser Cys Lys His Ile Leu Lys Gly Ile Ala Gly Ser Val Asp Pro

85 90 95

Gly Glu Ile Leu Ala Leu Met Gly Pro Ser Gly Ser Gly Lys Thr Thr

100 105 110

Leu Leu Lys Ile Leu Gly Gly Arg Leu Gly Gly Gly Val Lys Gly His

115 120 125

Ile Thr Tyr Asn Asp Thr Pro Tyr Ser Pro Cys Leu Lys Arg Arg Ile

130 135 140

Gly Phe Val Thr Gln Asp Asp Val Leu Phe Pro Gln Leu Thr Val Glu

145 150 155 160

Glu Thr Leu Val Phe Ala Ala Phe Leu Arg Leu Pro Ala Cys Met Ser

165 170 175

Lys Gln Gln Lys Arg Asp Arg Val Asp Ala Ile Ile Ala Glu Leu Asn

180 185 190

Leu Glu Arg Cys Arg His Thr Lys Ile Gly Gly Ala Phe Val Arg Gly

195 200 205

Val Ser Gly Gly Glu Arg Lys Arg Thr Ser Ile Gly Asn Glu Ile Leu

210 215 220

Val Asp Pro Ser Leu Leu Leu Leu Asp Glu Pro Thr Ser Gly Leu Asp

225 230 235 240

Ser Thr Ser Ala Ser Lys Leu Ile Phe Ile Leu Gln Arg Leu Ala Lys

245 250 255

Thr Arg Arg Thr Ile Ile Thr Thr Ile His Gln Pro Ser Ser Arg Met

260 265 270

Phe His Met Phe Asp Lys Leu Leu Leu Ile Ser Asp Gly His Ala Ile

275 280 285

Tyr His Gly Lys Ala Arg Asp Cys Met His His Phe Ser Ser Leu Gly

290 295 300

Phe Val Pro Glu Ile Pro Met Asn Pro Ala Glu Phe Leu Leu Asp Leu

305 310 315 320

Ala Thr Gly Asn Leu Asp Asp Ile Ser Val Pro Glu Ala Leu Arg Gly

325 330 335

Ser Pro Asp Pro Gln Glu Phe Arg Ser Gln Val Ile Arg His Leu Gln

340 345 350

Leu Lys Tyr Arg Ala Gly Ala Glu Ala Pro Ala Gly Arg Arg Thr Pro

355 360 365

Thr Glu Gln Leu Arg Leu Ala Val Arg Ala His Asn Lys Asp Arg Arg

370 375 380

Arg Arg Ser Ile Gly Trp Leu Gln Gln Phe Ala Val Leu Ser Arg Arg

385 390 395 400

Thr Phe Arg Glu Arg Ala Ser Asp Tyr Leu Asp Lys Met Arg Leu Ala

405 410 415

Gln Ala Val Gly Val Ala Leu Leu Leu Gly Leu Leu Trp Trp Lys Ser

420 425 430

Gln Thr Gly Asn Glu Ala Gln Leu Arg Asp Gln Val Gly Leu Ile Phe

435 440 445

Tyr Ile Cys Ile Phe Trp Thr Ser Ser Ser Leu Phe Gly Ser Val Tyr

450 455 460

Val Phe Pro Phe Glu Lys Leu Tyr Leu Val Lys Glu Arg Lys Ala Asp

465 470 475 480

Met Tyr Arg Leu Ser Ala Tyr Tyr Ala Ser Ser Thr Leu Cys Asp Ala

485 490 495

Val Pro His Val Val Tyr Pro Val Leu Phe Met Ala Ile Leu Tyr Phe

500 505 510

Met Ala Gly Leu Arg Arg Thr Val Pro Cys Phe Phe Leu Thr Leu Leu

515 520 525

Ala Thr Leu Leu Ile Val Phe Thr Ser Gln Gly Thr Gly Glu Leu Leu

530 535 540

Gly Ala Ala Ile Leu Ser Val Lys Arg Ala Gly Val Met Ala Ser Leu

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Val Leu Met Leu Phe Leu Leu Thr Gly Gly Tyr Tyr Val Gln His Ile

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Pro Lys Phe Ile Arg Trp Leu Lys Tyr Val Ser Phe Met His Tyr Gly

580 585 590

Phe Asn Leu Leu Leu Lys Ala Gln Tyr His Gly His Leu Met Tyr Asn

595 600 605

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Gly Thr Val Asp Leu Asp Gly Gly Met Arg Glu Val Trp Ile Leu Leu

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Ala Met Ala Leu Ala Tyr Arg Leu Leu Ala Tyr Phe Cys Leu Leu Lys

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660

<210> 7

<211> 2356

<212> DNA

<213> 玉米(Zea mays)

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atggagatca gcgacgagca gaggatgcaa gtggagtgcc agcgccttcc gccttcctgg 60

caaggcaacg gatcagacgc cgatgtcgaa gtggatcatc atctgtggcc gtcaaaagat 120

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<210> 8

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<212> DNA

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<213> 玉米(Zea mays)

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100

<210> 10

<211> 19

<212> DNA

<213> 人工序列(Artificial Sequence)

<400> 10

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<210> 11

<211> 19

<212> DNA

<213> 人工序列(Artificial Sequence)

<400> 11

gatctcgcca gggtccaca 19

<210> 12

<211> 1634

<212> DNA

<213> 玉米(Zea mays)

<400> 12

taccacctgt ataaaggttc tcgatatgac tggtctgaaa ttgtcagcac tacaccaaat 60

gaaggtacag cctgcaatat cattgtattc tattctcttc tgttctccaa actagaagaa 120

ttgattttca taacgtccgt aggggcgaca acgatgatta tatgcctata ttaagtaaaa 180

atcaatatgc tgtataaata aggccgcaca caaattagaa gactataaat agtacccatc 240

aaaataagta aaacgtgcac ggtgcaaatg ctatccactt ttttttaccc tactgctgac 300

taattattga tgtattacag attgtgactg caatatctac agttgatgat ttgaattacc 360

ctgaaaagac tgagacctat tatatagtaa acgctccata catattttct gcatgttgga 420

aggtgtgctt cttgagatta ctacaaatct taacactttt tttttcctgt aaatcttctc 480

taacgtttca tttgatttta ggtcgtgaag cctctgttgc aagagagaac aaggaagaaa 540

gttcatgtgt tgcgtggctg cgggagagac gagcttctac aggtaacgaa gatcgattac 600

tgtttacatg gcccttgatt tttaccctta aagcgtcttc tggcttaaag cctttgacga 660

tcacagtgca atgacatggg ggcagttctg gaacatgcag atcatggact actcctccct 720

cccccatttc tgcagacagg agggctcggg ctcatccaaa cattcgtcag gcgacgccga 780

taactgcttc tctctcgacc acccgttcca ccaggagctc tacagcttca tccaggagca 840

ggcgctgaac caggagctca tcaagcaggg ctccttgcac gtgaaaatcc ccgagcagga 900

ccctgaggac gcaaagatcg tggaggtcat cgaggccgag ttccacaagc ttggcgtgca 960

gaacgggtcc gccaatggca tcgaccaagc atagcacctt tgtctaataa ggccagcctg 1020

attcaaccga gacgttgctt gccacttctg atgcaactaa tcctactgtt taattttttt 1080

ggtggggtgg gcccaccccc attgctgttt cctgggggag gggggggggg gggggggtga 1140

ttggtattgg tggtatacat agcaaagtca tttgcagatc catccatgat gcaggactga 1200

gatagacgat atcacctgtg taaacttgca gatttgcaat gtgtcctcat ctcatatgta 1260

tgctgagttg agatgaaatg aataaatcat cctacaagtt ttttttgagt catcttcaga 1320

attgtgttgt gctcagtcag aaaagtaacc atgcgtttct gtgccgattc ttgctagccc 1380

taattaatat aaggcgaaac agataatgcc tatccattgg agggattaga ggaaggttct 1440

ccccttagaa agattgtggg tcaccaaaca aagggtaaac gaaccgaacc gaaccgtgca 1500

tatcaacaac attacaacaa agtaagcatg ctcttggttg gcagtagtta ccacttgata 1560

aaaagaagag ggagaccatg tgctttggct tcctctctga gccatctttc ttgctctagc 1620

cttaggcctt agca 1634

<210> 13

<211> 24

<212> DNA

<213> 人工序列(Artificial Sequence)

<400> 13

taccacctgt ataaaggttc tcga 24

<210> 14

<211> 18

<212> DNA

<213> 人工序列(Artificial Sequence)

<400> 14

gctcgtcgct gatctcca 18

<210> 15

<211> 21

<212> DNA

<213> 人工序列(Artificial Sequence)

<400> 15

atgtttcctg ggattgccga t 21

<210> 16

<211> 21

<212> DNA

<213> 人工序列(Artificial Sequence)

<400> 16

gcatcacaag ccagtttaac c 21

<210> 17

<211> 21

<212> DNA

<213> 人工序列(Artificial Sequence)

<400> 17

accttgaaga accccctcac a 21

<210> 18

<211> 19

<212> DNA

<213> 人工序列(Artificial Sequence)

<400> 18

ggtccacact cccagcgat 19

<210> 19

<211> 29

<212> DNA

<213> 人工序列(Artificial Sequence)

<400> 19

cgggatccga gaacgtggag tacagggtg 29

<210> 20

<211> 28

<212> DNA

<213> 人工序列(Artificial Sequence)

<400> 20

gctctagacc tccttttgag gcaggggc 28

<210> 21

<211> 28

<212> DNA

<213> 人工序列(Artificial Sequence)

<400> 21

cgagctcgag aacgtggagt acagggtg 28

<210> 22

<211> 32

<212> DNA

<213> 人工序列(Artificial Sequence)

<400> 22

atttgcggcc gccctccttt tgaggcaggg gc 32

<210> 23

<211> 282

<212> DNA

<213> 玉米(Zea mays)

<400> 23

gagaacgtgg agtacagggt gaagatgacc ttgaagaacc ccctcacagc ggcgagagtg 60

gcgtttgcgt cccagacgag ggcagaccag ggcagcagct gcaagcacat cctcaagggc 120

atcgctggga gtgtggaccc tggcgagatc ctggcgctga tgggtccatc tggcagcggc 180

aagaccacct tgctcaagat cctggggggc aggcttggtg gcggcgtcaa gggccacata 240

acctacaacg acactcccta cagcccctgc ctcaaaagga gg 282

<210> 24

<211> 128

<212> DNA

<213> 拟南芥(Arabidopsis thaliana)

<400> 24

acgttgtaag tctatttttg actcttcttt tttctccgtc acaatttcta cttccaacta 60

aaatgctaag aacatggtta taactttttt tttataactt aatatgtgat ttggacccag 120

cagataga 128

Claims (2)

1.DNA分子标记、引物、或检测试剂或试剂盒在鉴定或选育玉米普通核雄性不育种质资源中的应用；

所述DNA分子标记位于玉米基因ZmABCG20核酸序列起始密码子后第326-329位碱基，序列为TGCA，该4个碱基缺失的玉米品系表现出隐性雄性核不育性状；其中，基因ZmABCG20的突变体的序列为SEQ ID NO:7所示的核苷酸序列；

所述引物包括：

上游引物3326_F1：5′-CCAGACGAGGGCAGACCAG-3′和

下游引物3326_R1：5′-GATCTCGCCAGGGTCCACA-3′；

所述检测试剂或试剂盒中含有所述引物。

2.根据权利要求1所述的应用，其特征在于，提取待测玉米的基因组DNA，利用引物3326_F1和3326_R1进行PCR扩增反应，电泳检测扩增产物，若扩增产物出现一条大小为79bp的特征条带，则待测玉米的育性正常，对应的ZmABCG20基因型为野生型；若扩增产物出现一条大小为75bp的特征条带，则待测玉米为雄性不育品种，对应的ZmABCG20基因型为突变体；若扩增产物为79bp和75bp两条带型，则待测玉米为杂合基因型。

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