CN109234277B - 转录效率提高的cbh1定向改造启动子Su-m3及其应用 - Google Patents
转录效率提高的cbh1定向改造启动子Su-m3及其应用 Download PDFInfo
- Publication number
- CN109234277B CN109234277B CN201811039014.9A CN201811039014A CN109234277B CN 109234277 B CN109234277 B CN 109234277B CN 201811039014 A CN201811039014 A CN 201811039014A CN 109234277 B CN109234277 B CN 109234277B
- Authority
- CN
- China
- Prior art keywords
- promoter
- cbh1
- sites
- gene
- transcription efficiency
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Active
Links
Images
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/14—Hydrolases (3)
- C12N9/24—Hydrolases (3) acting on glycosyl compounds (3.2)
- C12N9/2402—Hydrolases (3) acting on glycosyl compounds (3.2) hydrolysing O- and S- glycosyl compounds (3.2.1)
- C12N9/2405—Glucanases
- C12N9/2434—Glucanases acting on beta-1,4-glucosidic bonds
- C12N9/2437—Cellulases (3.2.1.4; 3.2.1.74; 3.2.1.91; 3.2.1.150)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
- C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
- C12N15/80—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for fungi
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/14—Hydrolases (3)
- C12N9/24—Hydrolases (3) acting on glycosyl compounds (3.2)
- C12N9/2402—Hydrolases (3) acting on glycosyl compounds (3.2) hydrolysing O- and S- glycosyl compounds (3.2.1)
- C12N9/2477—Hemicellulases not provided in a preceding group
- C12N9/2488—Mannanases
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Y—ENZYMES
- C12Y302/00—Hydrolases acting on glycosyl compounds, i.e. glycosylases (3.2)
- C12Y302/01—Glycosidases, i.e. enzymes hydrolysing O- and S-glycosyl compounds (3.2.1)
- C12Y302/01004—Cellulase (3.2.1.4), i.e. endo-1,4-beta-glucanase
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Y—ENZYMES
- C12Y302/00—Hydrolases acting on glycosyl compounds, i.e. glycosylases (3.2)
- C12Y302/01—Glycosidases, i.e. enzymes hydrolysing O- and S-glycosyl compounds (3.2.1)
- C12Y302/01025—Beta-mannosidase (3.2.1.25), i.e. mannanase
Landscapes
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Zoology (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Plant Pathology (AREA)
- Mycology (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
- Enzymes And Modification Thereof (AREA)
Abstract
本发明属于农业生物技术领域,具体涉及转录效率提高的cbh1定向改造启动子Su‑m3及其应用。将cbh1启动子的核苷酸序列上多处位点替换为5’‑GGCTAA‑3’,得到Su‑m3启动子。以红色荧光蛋白Dsred为报告基因,通过构建里氏木霉Su‑m3启动子的质粒表达载体,证明Su‑m3启动子的转录效率比cbh1启动子强,同时该启动子可用于其他外源基因的表达。
Description
技术领域
本发明属于农业生物技术领域,具体涉及转录效率提高的cbh1定向改造启动子Su-m3及其应用。
背景技术
里氏木霉作为主要的丝状真菌之一,具有强大的分泌纤维素酶的能力,其混合发酵液中,纤维二糖水解酶的表达占胞外总分泌蛋白的50%以上,所以cbh1启动子也被公认为很强的启动子,目前常将外源基因构建在cbh1启动子和终止子之间,构成外源基因的表达盒。cbh1启动子在转录基因表达时,受多方面因素的影响,转录效率不能满足现代工业的要求。对cbh1启动子定向改造以获得转录效率提高的启动子,用于其他外源基因的表达,具有重要意义。
发明内容
为了解决现有的cbh1启动子不能满足工业要求的问题,本发明提供一种转录效率提高的cbh1定向改造启动子,改造后的cbh1启动子转率性能提高。
本发明的目的是提供一种转录效率提高的cbh1定向改造启动子Su-m3。
本发明的再一目的在于提供含有上述启动子的重组表达载体。
本发明的再一目的在于提供含有上述启动子的重组菌株。
本发明的再一目的在于提供上述启动子的应用。
根据本发明的具体实施方式的转录效率提高的cbh1定向改造启动子,转录效率提高的cbh1定向改造启动子Su-m3,将cbh1启动子的核苷酸序列上的4处5’-AGGCA-3’序列及4处5’-TGCCT-3’序列均替换为5’-GGCTAA-3’,其中,cbh1启动子的核苷酸序列如SEQ IDNO.1所示。
cbh1启动子的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示:
CTCATTCCCGAAAAAACTCGGAGATTCCTAAGTAGCGATGGAACCGGAATAATATAATAGGCAATACATTGAGTTGCCTCGACGGTTGCAATGCAGGGGTACTGAGCTTGGACATAACTGTTCCGTACCCCACCTCTTCTCAACCTTTGGCGTTTCCCTGATTCAGCGTACCCGTACAAGTCGTAATCACTATTAACCCAGACTGACCGGACGTGTTTTGCCCTTCATTTGGAGAAATAATGTCATTGCGATGTGTAATTTGCCTGCTTGACCGACTGGGGCTGTTCGAAGCCCGAATGTAGGATTGTTATCCGAACTCTGCTCGTAGAGGCATGTTGTGAATCTGTGTCGGGCAGGACACGCCTCGAAGGTTCACGGCAAGGGAAACCACCGATAGCAGTGTCTAGTAGCAACCTGTAAAGCCGCAATGCAGCATCACTGGAAAATACAAACCAATGGCTAAAAGTACATAAGTTAATGCCTAAAGAAGTCATATACCAGCGGCTAATAATTGTACAATCAAGTGGCTAAACGTACCGTAATTTGCCAACGGCTTGTGGGGTTGCAGAAGCAACGGCAAAGCCCCACTTCCCCACGTTTGTTTCTTCACTCAGTCCAATCTCAGCTGGTGATCCCCCAATTGGGTCGCTTGTTTGTTCCGGTGAAGTGAAAGAAGACAGAGGTAAGAATGTCTGACTCGGAGCGTTTTGCATACAACCAAGGGCAGTGATGGAAGACAGTGAAATGTTGACATTCAAGGAGTATTTAGCCAGGGATGCTTGAGTGTATCGTGTAAGGAGGTTTGTCTGCCGATACGACGAATACTGTATAGTCACTTCTGATGAAGTGGTCCATATTGAAATGTAAGTCGGCACTGAACAGGCAAAAGATTGAGTTGAAACTGCCTAAGATCTCGGGCCCTCGGGCCTTCGGCCTTTGGGTGTACATGTTTGTGCTCCGGGCAAATGCAAAGTGTGGTAGGATCGAACACACTGCTGCCTTTACCAAGCAGCTGAGGGTATGTGATAGGCAAATGTTCAGGGGCCACTGCATGGTTTCGAATAGAAAGAGAAGCTTAGCCAAGAACAATAGCCGATAAAGATAGCCTCATTAAACGGAATGAGCTAGTAGGCAAAGTCAGCGAATGTGTATATATAAAGGTTCGAGGTCCGTGCCTCCCTCATGCTCTCCCCATCTACTCATCAACTCAGATCCTCCAGGAGACTTGTACACCATCTTTTGAGGCACAGAAACCCAATAGTCAACCGCGGACTGCGCATC
根据本发明的实施方式的所述Su-m3启动子,其核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示:
CTCATTCCCGAAAAAACTCGGAGATTCCTAAGTAGCGATGGAACCGGAATAATATAATGGCTAAATACATTGAGTTGCCTCGACGGTTGCAATGCAGGGGTACTGAGCTTGGACATAACTGTTCCGTACCCCACCTCTTCTCAACCTTTGGCGTTTCCCTGATTCAGCGTACCCGTACAAGTCGTAATCACTATTAACCCAGACTGACCGGACGTGTTTTGCCCTTCATTTGGAGAAATAATGTCATTGCGATGTGTAATTGGCTAAGCTTGACCGACTGGGGCTGTTCGAAGCCCGAATGTAGGATTGTTATCCGAACTCTGCTCGTAGAGGCATGTTGTGAATCTGTGTCGGGCAGGACACGCCTCGAAGGTTCACGGCAAGGGAAACCACCGATAGCAGTGTCTAGTAGCAACCTGTAAAGCCGCAATGCAGCATCACTGGAAAATACAAACCAATGGCTAAAAGTACATAAGTTAAGGCTAAAAAGAAGTCATATACCAGCGGCTAATAATTGTACAATCAAGTGGCTAAACGTACCGTAATTTGCCAACGGCTTGTGGGCTAACAGAAGCAACGGCAAAGCCAATCTTCCAATCGTTTGTTTCTTCACTCAGTCCAATCTCAGCTGGTGATCCCCCAATTGGGTCGCTTGTTTGTTCCGGTGAAGTGAAAGAAGACAGAGGTAAGAATGTCTGACTCGGAGCGTTTTGCATACAACCAAGGGCAGTGATGGAAGACAGTGAAATGTTGACATTCAAGGAGTATTTAGCCAGGGATGCTTGAGTGTATCGTGTAAGGAGGTTTGTCTGCCGATACGACGAATACTGTATAGTCACTTCTGATGAAGTGGTCCATATTGAAATGTAAGTCGGCACTGAACGGCTAAAAAGATTGAGTTGAAACGGCTAAAAGATCTCGGGCCCTCGGGCCTTCGGCCTTTGGGTGTACATGTTTGTGCTCCGGGCAAATGCAAAGTGTGGTAGGATCGAACACACTGCGGCTAATTACCAAGCAGCTGAGGGTATGTGATGGCTAAAATGTTCAGGGGCCACTGCATGGTTTCGAATAGAAAGAGAAGCTTAGCCAAGAACAATAGCCGATAAAGATAGCCTCATTAAACGGAATGAGCTAGTGGCTAAAAGTCAGCGAATGTGTATATATAAAGGTTCGAGGTCCGTGCCTCCCTCATGCTCTCCCCATCTACTCATCAACTCAGATCCTCCAGGAGACTTGTACACCATCTTTTGAGGCACAGAAACCCAATAGTCAACCGCGGACTGCGCATC
本发明还提供了包含上述启动子的重组表达载体,其中,在所述重组表达载体的基因表达盒的终止子的下游导入有多个重复序列TEL,重复序列TEL由序列TEL1和序列TEL2拼接,并在TEL1和TEL2之间加入限制性内切酶I-Ceu1。重复序列TEL以1-2拷贝的低拷贝数插入染色体末端、或以染色体外自主复制形式存在,其能够提高里氏木霉的转化效率。
序列TEL1的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示:
TTAGGGTTAGGGTTAGGGTTAGGGTTAGGGTTAGGGTTAGGGTTAGGGTTAGGGTTAGGGTTAGGGTTAGGGTTAGGGTTAGGGTTAGGG
序列TEL2的核苷酸序列如SEQ ID NO.4所示:
CCCTAACCCTAACCCTAACCCTAACCCTAACCCTAACCCTAACCCTAACCCTAACCCTAACCCTAACCCTAACCCTAACCCTAACCCTAA
序列TEL的核苷酸序列如SEQ ID NO.5所示:
TTAGGGTTAGGGTTAGGGTTAGGGTTAGGGTTAGGGTTAGGGTTAGGGTTAGGGTTAGGGTTAGGGTTAGGGTTAGGGTTAGGGTTAGGGtaactataacggtcctaaggtagcgaaCCCTAACCCTAACCCTAACCCTAACCCTAACCCTAACCCTAACCCTAACCCTAACCCTAACCCTAACCCTAACCCTAACCCTAACCCTAA
根据本发明的具体实施方式的重组表达载体,其含有红色荧光蛋白基因DsRed,作为报告基因验证经改造的cbh1启动子的转录效率。
根据本发明的具体实施方式的重组表达载体,将cbh1启动子、红色荧光蛋白基因DsRed、cbh1终止子、TEL、Pyr4-AmpR-Ori无缝串联拼接,得到重组表达载体pPcbh1-Dsred-Tcbh1-pyr4-TEL;将Su-m3启动子(经改造的cbh1启动子)、DsRed、cbh1终止子、TEL、Pyr4-AmpR-Ori无缝串联拼接,得到重组表达载体pSu-m3-Dsred-Tcbh1-pyr4-TEL。将cbh1启动子、AnMan5A(opt)、cbh1终止子、TEL、Pyr4-AmpR-Ori通过无缝串联拼接,得到重组表达载体pPcbh1-AnMan5A(opt)-AnMan5A(opt)-Tcbh1-TEL;将Su-m3启动子(经改造的cbh1启动子)、AnMan5A(opt)、cbh1终止子、TEL、Pyr4-AmpR-Ori无缝串联拼接得到重组表达载体pSu-m3-AnMan5A(opt)-Tcbh1-TEL。
本发明还提供了包含上述启动子的重组菌株,优选为里氏木霉。
本发明还提供一种提高基因表达效率的方法,该方法包括使用上述启动子Su-m3启动目的基因表达,其中目的基因包括纤维素酶基因及甘露聚糖酶基因。
本发明的有益效果:
本发明通过区段操作,将cbh1启动子上的多个序列进行替换,得到经改造的cbh1启动子,并将红色荧光蛋白DsRed连接到该启动子的下游,作为报告基因验证启动子的转录效率,与cbh1启动子相比,获得了红色荧光显著提高的转化子。因此,改造的cbh1启动子的转录效率优于原始cbh1启动子。
附图说明
图1-1显示乳糖平板法cbh1启动子驱动Dsred表达的里氏木霉菌落情况;图1-2显示乳糖平板法Su-m3启动子驱动Dsred表达的里氏木霉菌落情况;
图2显示转入不同启动子的转化子拷贝数;
图3显示PCR鉴定AnMan5A(opt)重组质粒在里氏木霉基因组中的插入结果;
图4为不同启动子驱动表达的甘露聚糖酶的酶活比较图。
具体实施方式
实施例1启动子Su-m3的改造过程
将野生型cbh1启动子上的8处位点进行替换,具体如下:-147~-152位点5’-AGGCA-3’;-249~-254位点5’-AGGCA-3’;-280~-285位点5’-TGCCT-3’;-374~-379位点5’-TGCCT-3’;-396~-401位点5’-AGGCA-3’;-798~-803位点5’-TGCCT-3’;-1016~-1021位点5’-TGCCT-3’;-1218~-1223位点5’-AGGCA-3’,将上述位点全部替换为5’-GGCTAA-3’,即得到Su-m3启动子。
实施例2构建含有启动子cbh1和启动子Su-m3的重组表达载体
为了验证启动子Su-m3的转录效率,将含Dsred表达质粒经转入里氏木霉中,观察是否在启动子的驱动下,转录出mRNA,并翻译成红色荧光蛋白。
1.构建表达红色荧光蛋白的重组质粒:pPcbh1-Dsred-Tcbh1-pyr4-TEL、pSu-m3-Dsred-Tcbh1-pyr4-TEL
将启动子cbh1和Su-m3启动子分别与TEL2以Overlap的方式连接;DsRed与Tcbh1以Overlap的方式连接;中间质粒载体是以3个片段:Pcbh1-TEL2和Su-m3-TEL2分别与Dsred-Tcbh1、Pyr4-AmpR-Ori片段以无缝拼接的方式连接。测序成功后,便得到了中间质粒载体pPcbh1-Dsred-Tcbh1-Pyr4-TEL2、pSu-m3-Dsred-Tcbh1-Pyr4-TEL2。
分别将上述两个中间质粒载体和TEL1片段用I-CeuI和SpeI双酶切,回收片段后,用T4连接酶连接两个片段。22℃连接1h,转化大肠杆菌Trans1后,挑单克隆验证阳性转化子。最终便得到了表达质粒载体pPcbh1-Dsred-Tcbh1-Pyr4-TEL、pSu-m3-Dsred-Tcbh1-Pyr4-TEL。
2.转化入里氏木霉
将里氏木霉TU-6接种于土豆培养基(PDA)平板上,28℃静置培养7d待其产孢,将孢子刮下并接种于100ml含有尿嘧啶的PDB培养基中,28℃、160rpm振摇培养过夜。200目筛过滤收集萌发的菌丝,加入10mg/mL的酵母破壁酶,在30℃消化2-3小时。收集原生质体后,将用I-CeuI酶切的质粒表达载体转化里氏木霉TU-6菌株。
3.筛选重组转化子
过表达质粒载体转化里氏木霉TU-6菌株,培养5-7天。待单克隆长出后,挑取单个转化子,接种于含MM-乳糖培养基的24孔板,于28℃培养5-7天。培养期间,随时观察转化子是否显色,并拍照做记录,如图1-1、1-2所示,表达红色荧光蛋白的菌落中,使用Su-m3启动子的菌落较cbh1启动子的菌落红色更强,说明Su-m3启动子可促进纤维酶的转录表达,且转录效率更高。
4.提取代表性转化子的基因组
为了验证cbh1启动子以及改造后的Su-m3启动子在里氏木霉中的拷贝数的数目,对不同启动子样本,选择代表性的转化子,提取真菌基因组。将代表性转化子接种PDA板生长、产孢7d后,接MM-glucose种子培养基2d后,收集菌丝并压干,分装于2mL EP管,迅速冻于液氮中。提取时,用机器研磨菌丝1分30s,提取方法参照真菌试剂盒Fungal DNA Kit。
5.鉴定转化子的启动子拷贝数
转化子的启动子拷贝数的鉴定采用qRT-PCR的方法,选择单一拷贝数的cbh1基因作为内参,DsRed作为检测的目标基因。各选择4株具有不同荧光强度的代表性的Pcbh1和Su-m3的转化子,基因组DNA的浓度稀释至1-2ng/μL,取1μL为模板;分别扩增cbh1基因和Dsred基因。Dsred基因的拷贝数用2-△△Ct法相对定量。
DsRed基因是和启动子物理联系在一起并驱动其转录表达的,所以理论上,DsRed的拷贝数的差异可以作为不同启动子的拷贝数的差异。如图2所示,包含Su-m3的转化子保持在1~2拷贝的低拷贝数。
实施例3.验证Su-m3启动子启动外源基因AnMan5A(opt)表达的效果
本发明应用改造的Su-m3启动子,在里氏木霉中表达异源甘露聚糖酶,与cbh1启动子相比,获得了甘露聚糖酶酶活显著提高的转化子。经转入里氏木霉SUS1中,在cbh1和Su-m3启动子的驱动下,转录出mRNA,并翻译成甘露聚糖酶。
1.构建pPcbh1-AnMan5A(opt)-Tcbh1-TEL、pSu-m3-AnMan5A(opt)-Tcbh1-TEL质粒
将片段Pcbh1-TEL和Su-m3-TEL分别与AnMan5A(opt)、Tcbh1-Ori-AmpR,按照无缝拼接试剂盒的方法在37℃,连接30min连接后,转化入大肠杆菌Trans1,挑单克隆验证阳性转化子。最终便得到了表达质粒载体pPcbh1-AnMan5A(opt)-Tcbh1-TEL、pSu-m3-AnMan5A(opt)-Tcbh1-TEL。提取质粒,备用于转化。
2.用质粒转化入里氏木霉
将里氏木霉SUS1接种于土豆培养基(PDA)平板上,28℃静置培养5d待其产孢后,将孢子刮下并接种于100mL含有尿嘧啶的PDB培养基中,28℃、160rpm振摇培养过夜。200目筛过滤收集萌发的菌丝,加入10mg/ml的酵母破壁酶,在30℃消化2-3小时。收集原生质体后,用I-CeuI酶切的质粒表达载体转化里氏木霉SUS1菌株。
3.筛选重组转化子
转化子在含1M山梨醇的MM-glucose琼脂培养基上生长、选择。挑取单个克隆,接种于25mL液体MM-glucose中,28℃、160rpm振摇培养2d。提取基因组DNA以其为模板,进行PCR验证,在1%琼脂糖凝胶上验证不同启动子驱动的AnMan5A(opt)载体是否成功转入里氏木霉。将鉴定为阳性的转化子和出发菌株的孢子,接种至PDA平板上,28℃培养4~7天。
如图3所示,在1%琼脂糖胶上电泳,其中,M为DNA分子量;1-8验证pPcbh1-AnMan5A(opt)-Tcbh1-TEL质粒在里氏木霉基因组中的插入情况,9-16验证pSu-m3-AnMan5A(opt)-Tcbh1-TEL在里氏木霉基因组中的插入情况,箭头所指为预期的目的条带。因此,这些转化子是含AnMan5A(opt)质粒转入的阳性转化子。将阳性转化子接种于PDA培养基上,30℃静置培养7d产孢,收集孢子备用。
4.测定甘露聚糖酶酶活
采用角豆胶作为底物进行甘露聚糖酶酶活的测定。称量0.5g角豆胶,用0.1M柠檬酸-0.2M磷酸氢二钠缓冲液(pH 5.0)定容至100mL,配置0.5%角豆胶底物。取酶液100μL,加入到900μL底物中,振荡混合均匀,50℃水浴保温15min后,向各试管中加入1.5mL DNS试剂,再向空白中加酶液0.1mL,混合均匀。在沸水中煮5min,迅速冷却,测定540nm的吸光度。在50℃、pH 5.0的条件下,每分钟水解角豆胶底物,产生1μmoL还原糖(以甘露糖计)所需要的酶量定义为一个酶活力单位(U)。
酶活测定如图4所示,转化子在MM-Avicel中培养6天后,Pcbh1-AnMan5A(opt)的甘露聚糖酶酶活为5.27U/mL,而Su-m3-AnMan5A(opt)的甘露聚糖酶酶活为24.2U/mL,较cbh1启动子的菌株提高了4.59倍。因此,使用Su-m1启动子的转化子表达甘露聚糖酶的活性要显著高于使用cbh1启动子的转化子。
序列表
<110> 中国农业科学院饲料研究所
<120> 转录效率提高的cbh1定向改造启动子Su-m3及其应用
<160> 5
<170> SIPOSequenceListing 1.0
<210> 1
<211> 1281
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 1
ctcattcccg aaaaaactcg gagattccta agtagcgatg gaaccggaat aatataatag 60
gcaatacatt gagttgcctc gacggttgca atgcaggggt actgagcttg gacataactg 120
ttccgtaccc cacctcttct caacctttgg cgtttccctg attcagcgta cccgtacaag 180
tcgtaatcac tattaaccca gactgaccgg acgtgttttg cccttcattt ggagaaataa 240
tgtcattgcg atgtgtaatt tgcctgcttg accgactggg gctgttcgaa gcccgaatgt 300
aggattgtta tccgaactct gctcgtagag gcatgttgtg aatctgtgtc gggcaggaca 360
cgcctcgaag gttcacggca agggaaacca ccgatagcag tgtctagtag caacctgtaa 420
agccgcaatg cagcatcact ggaaaataca aaccaatggc taaaagtaca taagttaatg 480
cctaaagaag tcatatacca gcggctaata attgtacaat caagtggcta aacgtaccgt 540
aatttgccaa cggcttgtgg ggttgcagaa gcaacggcaa agccccactt ccccacgttt 600
gtttcttcac tcagtccaat ctcagctggt gatcccccaa ttgggtcgct tgtttgttcc 660
ggtgaagtga aagaagacag aggtaagaat gtctgactcg gagcgttttg catacaacca 720
agggcagtga tggaagacag tgaaatgttg acattcaagg agtatttagc cagggatgct 780
tgagtgtatc gtgtaaggag gtttgtctgc cgatacgacg aatactgtat agtcacttct 840
gatgaagtgg tccatattga aatgtaagtc ggcactgaac aggcaaaaga ttgagttgaa 900
actgcctaag atctcgggcc ctcgggcctt cggcctttgg gtgtacatgt ttgtgctccg 960
ggcaaatgca aagtgtggta ggatcgaaca cactgctgcc tttaccaagc agctgagggt 1020
atgtgatagg caaatgttca ggggccactg catggtttcg aatagaaaga gaagcttagc 1080
caagaacaat agccgataaa gatagcctca ttaaacggaa tgagctagta ggcaaagtca 1140
gcgaatgtgt atatataaag gttcgaggtc cgtgcctccc tcatgctctc cccatctact 1200
catcaactca gatcctccag gagacttgta caccatcttt tgaggcacag aaacccaata 1260
gtcaaccgcg gactgcgcat c 1281
<210> 2
<211> 1289
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 2
ctcattcccg aaaaaactcg gagattccta agtagcgatg gaaccggaat aatataatgg 60
ctaaatacat tgagttgcct cgacggttgc aatgcagggg tactgagctt ggacataact 120
gttccgtacc ccacctcttc tcaacctttg gcgtttccct gattcagcgt acccgtacaa 180
gtcgtaatca ctattaaccc agactgaccg gacgtgtttt gcccttcatt tggagaaata 240
atgtcattgc gatgtgtaat tggctaagct tgaccgactg gggctgttcg aagcccgaat 300
gtaggattgt tatccgaact ctgctcgtag aggcatgttg tgaatctgtg tcgggcagga 360
cacgcctcga aggttcacgg caagggaaac caccgatagc agtgtctagt agcaacctgt 420
aaagccgcaa tgcagcatca ctggaaaata caaaccaatg gctaaaagta cataagttaa 480
ggctaaaaag aagtcatata ccagcggcta ataattgtac aatcaagtgg ctaaacgtac 540
cgtaatttgc caacggcttg tgggctaaca gaagcaacgg caaagccaat cttccaatcg 600
tttgtttctt cactcagtcc aatctcagct ggtgatcccc caattgggtc gcttgtttgt 660
tccggtgaag tgaaagaaga cagaggtaag aatgtctgac tcggagcgtt ttgcatacaa 720
ccaagggcag tgatggaaga cagtgaaatg ttgacattca aggagtattt agccagggat 780
gcttgagtgt atcgtgtaag gaggtttgtc tgccgatacg acgaatactg tatagtcact 840
tctgatgaag tggtccatat tgaaatgtaa gtcggcactg aacggctaaa aagattgagt 900
tgaaacggct aaaagatctc gggccctcgg gccttcggcc tttgggtgta catgtttgtg 960
ctccgggcaa atgcaaagtg tggtaggatc gaacacactg cggctaatta ccaagcagct 1020
gagggtatgt gatggctaaa atgttcaggg gccactgcat ggtttcgaat agaaagagaa 1080
gcttagccaa gaacaatagc cgataaagat agcctcatta aacggaatga gctagtggct 1140
aaaagtcagc gaatgtgtat atataaaggt tcgaggtccg tgcctccctc atgctctccc 1200
catctactca tcaactcaga tcctccagga gacttgtaca ccatcttttg aggcacagaa 1260
acccaatagt caaccgcgga ctgcgcatc 1289
<210> 3
<211> 90
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 3
ttagggttag ggttagggtt agggttaggg ttagggttag ggttagggtt agggttaggg 60
ttagggttag ggttagggtt agggttaggg 90
<210> 4
<211> 90
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 4
ccctaaccct aaccctaacc ctaaccctaa ccctaaccct aaccctaacc ctaaccctaa 60
ccctaaccct aaccctaacc ctaaccctaa 90
<210> 5
<211> 207
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 5
ttagggttag ggttagggtt agggttaggg ttagggttag ggttagggtt agggttaggg 60
ttagggttag ggttagggtt agggttaggg taactataac ggtcctaagg tagcgaaccc 120
taaccctaac cctaacccta accctaaccc taaccctaac cctaacccta accctaaccc 180
taaccctaac cctaacccta accctaa 207
Claims (7)
1.转录效率提高的cbh1定向改造启动子Su-m3,其特征在于,将野生型cbh1启动子上的第-147~-152位点5’-AGGCA-3’、第-249~-254位点5’-AGGCA-3’、第-280~-285位点5’-TGCCT-3’、第-374~-379位点5’-TGCCT-3’、第-396~-401位点5’-AGGCA-3’、第-798~-803位点5’-TGCCT-3’、第-1016~-1021位点5’-TGCCT-3’、第-1218~-1223位点5’-AGGCA-3’全部替换为5’-GGCTAA-3’,得到所述启动子Su-m3,其中,cbh1启动子的核苷酸序列如SEQ IDNO.1所示。
2.包含权利要求1所述的转录效率提高的cbh1定向改造启动子Su-m3的重组表达载体。
3.包含权利要求1所述的转录效率提高的cbh1定向改造启动子Su-m3的重组菌株。
4.根据权利要求3所述的重组菌株,其特征在于,所述重组菌株为里氏木霉。
5.权利要求1所述的转录效率提高的cbh1定向改造启动子Su-m3用于启动目的基因表达的应用,其中所述目的基因包括纤维素酶基因及甘露聚糖酶基因。
6.一种提高基因表达效率的方法,其特征在于,所述方法包括使用权利要求1所述的Su-m3启动子启动目的基因表达的步骤。
7.根据权利要求6所述的提高基因表达效率的方法,其特征在于,所述目的基因包括纤维素酶基因及甘露聚糖酶基因。
Priority Applications (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
CN201811039014.9A CN109234277B (zh) | 2018-09-06 | 2018-09-06 | 转录效率提高的cbh1定向改造启动子Su-m3及其应用 |
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
CN201811039014.9A CN109234277B (zh) | 2018-09-06 | 2018-09-06 | 转录效率提高的cbh1定向改造启动子Su-m3及其应用 |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
CN109234277A CN109234277A (zh) | 2019-01-18 |
CN109234277B true CN109234277B (zh) | 2021-05-25 |
Family
ID=65067312
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
CN201811039014.9A Active CN109234277B (zh) | 2018-09-06 | 2018-09-06 | 转录效率提高的cbh1定向改造启动子Su-m3及其应用 |
Country Status (1)
Country | Link |
---|---|
CN (1) | CN109234277B (zh) |
Family Cites Families (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
DK1578943T3 (da) * | 2002-08-16 | 2012-01-09 | Danisco Us Inc | Nye variant-Hypocrea jecorina-CBH1-cellulaser |
CN105647811A (zh) * | 2014-11-10 | 2016-06-08 | 中国科学院天津工业生物技术研究所 | 一种提高丝状真菌纤维素酶产量和木质纤维素降解利用的菌株构建方法及应用 |
-
2018
- 2018-09-06 CN CN201811039014.9A patent/CN109234277B/zh active Active
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
CN109234277A (zh) | 2019-01-18 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
CN106978360B (zh) | 一株高产纤维素酶里氏木霉重组菌株及其应用 | |
EP3831948B1 (en) | Recombinant expression vector applicable to rapid screening for recombinant strain and application | |
CN102268448B (zh) | 一种用于在里氏木霉细胞内表达外源蛋白的表达设备及其基因工程菌 | |
CN112513249B (zh) | 木霉属丝状菌的突变株和蛋白质的制造方法 | |
CN109852554A (zh) | 一株内切葡聚糖酶和β-葡萄糖苷酶双高分泌的里氏木霉工程菌及其构建方法与应用 | |
CN113106114B (zh) | 调控里氏木霉蛋白表达效率的因子、调控方法及应用 | |
CN103409458B (zh) | Ti质粒黑曲霉基因置换表达载体及其应用 | |
CN108753741B (zh) | 一种胞外AA9家族多糖单加氧酶AnLPMO15g及其应用 | |
CN104004760B (zh) | 一种用于在米曲霉细胞分泌表达外源蛋白的表达设备及其米曲霉基因工程菌 | |
CN103305426B (zh) | 产纤维素酶的突变菌株、高效表达目的蛋白的突变菌株及其构建方法与应用 | |
CN109234277B (zh) | 转录效率提高的cbh1定向改造启动子Su-m3及其应用 | |
CN114107360B (zh) | 一种通过干扰磷酸酶基因提高里氏木霉纤维素酶表达的方法 | |
CN113801801B (zh) | 一株高效生产碱性果胶酶的重组菌及其应用 | |
CN109234276B (zh) | 转录效率提高的Su-m1启动子及其应用 | |
CN113943662B (zh) | 一株异源表达木聚糖酶/纤维素酶CbXyn10c基因的里氏木霉菌株及应用 | |
CN106520766B (zh) | 一种海藻内源组成型启动子及其应用 | |
CN111733169B (zh) | 调控真菌木质纤维素降解酶系表达的元件及其应用 | |
CN108949579B (zh) | 嗜热子囊菌基因表达系统 | |
CN106480031B (zh) | 芽孢杆菌表达启动子及其应用 | |
CN114875059B (zh) | 一种新型里氏木霉异源蛋白表达系统的构建及其应用 | |
CN114854757B (zh) | 响应青枯菌侵染的马铃薯维管束特异表达启动子PStmlp1及其应用 | |
CN103740749B (zh) | 一种重组表达内切葡聚糖酶的工程菌株 | |
CN113897365B (zh) | 一种里氏木霉cbh1基因启动子突变体及其构建方法和应用 | |
CN108707574A (zh) | 一株产脂肪酶工程菌、其构建方法和应用 | |
CN117050163B (zh) | 一种分泌表达重组iii型胶原蛋白的毕赤酵母工程菌及其应用 |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
PB01 | Publication | ||
PB01 | Publication | ||
SE01 | Entry into force of request for substantive examination | ||
SE01 | Entry into force of request for substantive examination | ||
TA01 | Transfer of patent application right |
Effective date of registration: 20200828 Address after: 100193 Beijing Old Summer Palace West Road, Haidian District, No. 2 Applicant after: Beijing Institute of Animal Science and Veterinary Medicine, Chinese Academy of Agricultural Sciences Address before: 100081 Beijing, Zhongguancun, South Street, No. 12, No. Applicant before: FEED Research Institute CHINESE ACADEMY OF AGRICULTURAL SCIENCES |
|
TA01 | Transfer of patent application right | ||
GR01 | Patent grant | ||
GR01 | Patent grant |