CN109096339B - 一种三联吡啶钌配合物的制备及在逆转录酶抑制中的应用 - Google Patents

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Abstract

本发明属于艾滋病毒抑制剂研发领域,公开了一种三联吡啶钌(II)配合物的制备方法及其在艾滋病毒逆转录酶抑制中的应用。本发明的三联吡啶钌(II)配合物的阳离子部分的结构如式Ⅰ所示。本发明优化了三联吡啶钌(II)配合物的制备工艺,原料成本低,反应时间短。所得到的配合物纯度高、收率高,具有良好的水溶性和优异的光谱性质。本发明的三联吡啶钌(II)配合物具有对艾滋病毒RNA上的TAR区域选择性结合的能力,并能够阻断逆转录酶对病毒RNA的逆转录过程,抑制病毒RNA的复制。该三联吡啶钌(II)配合物是一种具有高亲和力的艾滋病毒RNA选择性结合试剂和高活性的艾滋病毒逆转录酶抑制剂,是极具应用潜力的艾滋病毒药物。

Description

一种三联吡啶钌配合物的制备及在逆转录酶抑制中的应用
技术领域
本发明属于艾滋病毒逆转录酶抑制剂研发领域,尤其涉及一种三联吡啶钌配合物的制备方法及其在艾滋病毒逆转录酶抑制中的应用。
背景技术
艾滋病是人类历史上最具破坏力的流行病。自2015年起,艾滋病已成为我国传染病死亡第一位。目前世界上尚未有任何药物或疗法能治愈艾滋病。2015年12月,世界卫生组织WHO的最新报告指出,逆转录酶抑制剂是目前最有希望治愈艾滋病的药物。大量实验证明,抑制逆转录酶对病毒RNA的逆转录作用,就可以控制病毒的产生和扩散,起到对艾滋病的治疗和早期防治作用(Science,1992,256,1783-1790;Biochemistry,2011,50,5042-5057)。因此,HIV逆转录酶成为当前抗艾滋病毒药物设计的首要靶点(Curr. Top. Med. Chem.,2004,4,1045-1057)。
目前,作为药物在临床中应用的逆转录酶抑制剂主要分为两类,即“核苷类逆转录酶抑制剂”和“非核苷类逆转录酶抑制剂”。核苷类逆转录酶抑制剂为核苷类似物,与病毒RNA逆转录形成的病毒DNA竞争结合逆转录酶,使病毒的复制得到一定程度上的抑制。然而,核苷类逆转录酶抑制剂的长期给药会产生严重的毒副作用(如抑制骨髓生长等)和出现明显的抗药性现象,面临着被淘汰的命运。通过大量新化合物的大规模活性筛选,人们陆续发现了一些结构各异的小分子化合物表现出较好的逆转录酶抑制活性,称其为非核苷类的逆转录酶抑制剂。它们对“酶-底物”复合物的亲和力比对酶的亲和力高,通过与逆转录酶的相互作用可以引起酶的构型变化,从而使底物活性部位的亲和性降低。由于非核苷类逆转录酶抑制剂不会直接损坏底物结合区域的功能,因此细胞毒性较小,并且在极低浓度即可抑制逆转录酶病毒的活性(Chem. Soc. Rev.,2012,41,4657-4670)。
TAR和RRE是艾滋病病毒RNA上两个重要的功能区域,对病毒RNA的逆转录活性起着至关重要的作用(Mol. Cell Biol.,1988,8,2555-2561)。新霉素(neomycin)等药物就是通过与病毒RNA上的TAR区域结合,从而阻断RNA与逆转录酶的结合并干扰病毒RNA的复制的(J. Am. Chem. Soc.,2000,122,12035-12036)。然而,能够特异性识别病毒RNA的TAR区域的小分子化合物的报道极少。最近,一种氨基噻唑类化合物表现出了较好的TAR RNA选择性(Chem. Eur. J.,2014,20,2071-2079;Chem. Commun.,2010,46,6162-6164)。该类化合物可以排除DNA和tRNA的影响,选择性的结合TAR RNA的U-A碱基对部位,抑制HIV-1菌株的生长,而对正常细胞的生长没有明显的影响。然而,作为有机小分子化合物,其水溶性低,缺乏能够应用的光吸收、荧光等光谱性质。
本专利发明了一种具有良好水溶性和光谱性质的三联吡啶钌(II)配合物,并在其结构中引入对艾滋病毒RNA具有特异性识别作用的氨基噻唑基团,使其能够选择性结合艾滋病毒RNA,并显著抑制艾滋病毒逆转录酶的活性。该三联吡啶钌(II)配合物不仅作为水溶性良好的艾滋病毒抑制剂,还能对RNA进行光谱响应,是潜在的艾滋病毒药物和光谱检测试剂。
发明内容
本发明的目的在于针对当前尚未攻克的艾滋病药物研究,提供一种具有良好水溶性和光谱性质的三联吡啶钌(II)配合物,其能够选择性结合艾滋病毒RNA,并显著抑制艾滋病毒逆转录酶的活性。
本发明的第二个目的是提供所述三联吡啶钌(II)配合物的制备方法。
本发明的第三个目的是提供所述三联吡啶钌(II)配合物在选择性结合RNA中的应用。
本发明的第四个目的是提供所述三联吡啶钌(II)配合物在抑制艾滋病毒逆转录酶中的应用。
本发明的上述目的通过如下技术方案予以实现:
一种三联吡啶钌(II)配合物,由阳离子和阴离子组成,所述阳离子结构式如式I所示:
Figure 239147DEST_PATH_IMAGE001
式Ⅰ
式Ⅰ中,-L-间隔基团分别为-CO-、-C6H4CO-、-CONHCH2CO-,对应三联吡啶钌(II)配合物RuTz1、RuTz2、RuTz3。
本发明所述三联吡啶钌(II)配合物并不限定阴离子的种类,本领域常规阴离子均能实现本发明目的,尤其是无机盐阴离子,如PF6 ,ClO4 、Cl等,作为一种最优选方案,本发明所述三联吡啶钌(II)配合物的阴离子为PF6
上述三联吡啶钌(II)配合物的制备方法,包括以下步骤:
S1. 2-乙酰吡啶和N,N-二甲基甲酰胺二甲基缩醛在二甲苯中回流,减压蒸馏除去二甲苯,正戊烷重结晶。晶体在四氢呋喃溶剂中再与2-乙酰吡啶反应,蒸馏除去四氢呋喃,甲苯作为洗脱剂做柱层析。得到的三联吡啶tpy与RuCl3在2-氯乙醇中回流,冷却至室温,抽滤,乙醇洗涤,真空干燥即得到前体配合物[Ru(tpy)Cl3]。
S2. 间硝基苯乙酮在乙醚中和溴素反应得到溴代硝基苯乙酮,并进一步与乙酰硫脲在乙醇中回流,得到硝基噻唑化合物(Tz-NO2)。硝基噻唑化合物在异丙醇中,用钯碳和硼氢化钠还原,二氯甲烷柱层析,得到氨基噻唑化合物(Tz-NH2),如式II所示:
Figure 156288DEST_PATH_IMAGE002
式II
S3. 氨基噻唑化合物Tz-NH2分别与羧基三联吡啶tpyCOOH和羧基苯基三联吡啶tpyphCOOH在缩合试剂DCC和溶剂DMF中回流。减压蒸馏DMF,得到固体用大量水洗,真空干燥,得到氨基噻唑取代的三联吡啶配体tpyL1和tpyL2,其结构如式III和式IV所示:
Figure 122976DEST_PATH_IMAGE003
式III
Figure 518185DEST_PATH_IMAGE004
式IV
S4. 氨基噻唑化合物Tz-NH2先与叔丁氧羰基保护的甘氨酸缩合,再在浓KOH溶液中回流脱掉叔丁氧羰基,进一步与羧基三联吡啶tpyCOOH缩合,得到氨基噻唑取代的三联吡啶配体tpyL3,其结构如式V所示。
Figure 332557DEST_PATH_IMAGE005
式V
S5. 前体配合物[Ru(tpy)Cl3]与氨基噻唑取代的三联吡啶配体在含4-乙基吗啉的乙二醇甲醚与水的混合溶液中回流,冷却过滤,滤液中加入KPF6水溶液,产生红色沉淀,过滤,真空干燥。经硅胶柱层析,以乙腈与甲醇混合溶剂洗脱唯一红色组分,得到所述目标三联吡啶钌(II)配合物。
优选地,上述步骤所述加热回流反应的条件为在80~120℃下回流2~4小时。
优选地,所述乙腈与甲醇混合溶剂为体积比4:1~2:1。
优选地,所述KPF6水溶液为质量分数10 %。
本发明具有以下有益效果:
本发明提供了一种新型三联吡啶钌(II)配合物,可作为艾滋病毒RNA选择性结合试剂和艾滋病毒逆转录酶抑制剂。本发明合成的三联吡啶钌(II)配合物结构稳定,具有良好的光谱性质,表现出良好的艾滋病毒RNA选择性结合和艾滋病毒逆转录酶抑制能力,是新型的艾滋病毒逆转录酶抑制剂。
本发明合成的三联吡啶钌(II)配合物在艾滋病毒逆转录酶抑制剂中的应用,具有以下优势:(1)具有良好的水溶性和稳定性;(2)具有良好的光谱性质,能够对艾滋病毒RNA进行光谱响应;(3)与氨基噻唑有机类化合物相比,具有更强的艾滋病毒逆转录酶抑制能力。
附图说明
图1为本发明所制备的三联吡啶钌(II)配合物分子结构图;
图2为前体配合物[Ru(tpy)Cl3]的合成途径;
图3为氨基噻唑化合物Tz-NH2的合成途径;
图4为氨基噻唑取代的三联吡啶配体tpyL1及其配合物RuTz1的合成途径;
图5为氨基噻唑取代的三联吡啶配体tpyL2及其配合物RuTz2的合成途径;
图6为氨基噻唑取代的三联吡啶配体tpyL3及其配合物RuTz3的合成途径;
图7为三联吡啶钌(II)配合物的紫外可见光谱随DNA或poly(A) RNA浓度变化;
图8为三联吡啶钌(II)配合物从结合tat多肽的TAR RNA上置换tat的电泳图;
图9为酶标仪记录的三联吡啶钌(II)配合物抑制艾滋病毒逆转录酶的活性曲线。
具体实施方式
以下结合说明书附图和具体实施例来进一步说明本发明。实施例仅用以解释本发明,而不用于对本发明做任何形式的限定。除非特别说明,本发明采用的试剂、方法和设备为本技术领域常规试剂、方法和设备,所用试剂和材料均为市购。
实施例1 三联吡啶钌(II)配合物的制备
所合成的三联吡啶钌(II)配合物分子结构如图1所示。
1、前体配合物[Ru(tpy)Cl3]的制备:
前体配合物[Ru(tpy)Cl3]按照图2所示的途径合成。称取2-乙酰吡啶(12.1 g,0.1mol)于圆底烧瓶中,加入N,N-二甲基甲酰胺二甲基缩醛(24.0 g,0.2 mol)和500 mL二甲苯,回流4小时。减压蒸馏除去二甲苯,正戊烷重结晶得到黄色晶体。该晶体加入到叔丁醇钾(23.0 g,0.2 mol)和2-乙酰吡啶(12.1 g,0.1 mol)的500 mL无水四氢呋喃溶液中,反应液由亮黄色转变为粉黄色。搅拌4小时,加入乙酸铵(77.0 g,1 mol)和醋酸(250 mL),搅拌5分钟。蒸馏除去所有溶剂,得到棕色固体。将该固体加入500 mL水中搅拌,加入碳酸钠固体调节pH值到7.0。二氯甲烷萃取,收集有机相并用硫酸镁干燥1小时。过滤,减压蒸干有机相得到浅黄色油状物,用二甲苯溶解,闪式柱层析(中性氧化铝100-200目),减压蒸干得到白色固体3.5 g,即为三联吡啶tpy。将三联吡啶(3.5 g,15 mmol)于圆底烧瓶中,加入水合三氯化钌(4.0 g,15 mmol),500 mL 2-氯乙醇,回流4小时,冷却静置1小时。过滤所得沉淀,用乙醇充分洗涤,真空干燥,得到棕色固体(5.6 g)。
2、氨基噻唑化合物(Tz-NH2)的制备:
氨基噻唑化合物(Tz-NH2)按照图3所示的途径合成。取间硝基苯乙酮(1.98 g,12mmol)于圆底烧瓶,加入无水乙醚(13 mL),冰水浴,搅拌,加入三氯化铝(80 mg),滴加溴素(0.7 mL,12 mmol),室温搅拌1小时。加水50 mL,乙醚萃取,收集有机相,减压蒸干得到白色固体。取白色固体(2.90 g,12 mmol)于圆底烧瓶,加入乙酰硫脲(1.42 g,12 mmol),在60mL无水乙醇回流30分钟,冷至室温,过滤,乙醇洗涤,干燥,得黄色固体,即为硝基噻唑化合物(Tz-NO2)。取硝基噻唑化合物(3.15 g,12 mmol)于圆底烧瓶,加入100 mL异丙醇,催化量的钯(5% Pd/C)和1.5 g硼氢化钠,室温搅拌3小时。减压蒸干溶剂,二氯甲烷柱层析,得白色固体,即为氨基噻唑化合物(Tz-NH2)。产量2.50 g,三步反应总收率90%。
3、氨基噻唑取代的三联吡啶配体tpyL1及其配合物RuTz1的制备:
按照图4所示的途径合成。于干燥的烧瓶中分别加入tpyCOOH(0.55 g,2 mmol)、氨基噻唑化合物Tz-NH2(0.47 g,2 mmol)、二环己基碳二亚胺DCC(0.41 g,2 mmol)、N,N-二甲基甲酰胺30 mL,室温搅拌3小时。减压蒸去溶剂,水洗,真空干燥,得到白色固体,即配体tpyL1。产量0.94 g,产率95%。取前体配合物[Ru(tpy)Cl3](0.79 g,1.8 mmol)和配体tpyL1(0.94 g,1.9 mmol)于烧瓶中,加入乙二醇甲醚50 mL和 4-乙基吗啉0.5 mL,回流4小时。冷至室温,过滤,向滤液中加入加入饱和KPF6(815 mg,5 mmol),析出沉淀,抽滤以收集沉淀,用水和乙醚洗,之后真空干燥得到粗产品。经硅胶柱层析,以乙腈与甲醇混合溶剂(体积比4:1)洗脱唯一红色组分,得到所述目标三联吡啶钌(II)配合物RuTz1。产量1.48 g,产率74%。1H NMR(300 MHz,DMSO-d 6):δ 12.33(s, 1H),11.05(s,1H),9.55(s,2H),9.14(d,J =6.0 Hz,2H),8.98(d,J = 6.0 Hz,2H),8.87(d,J = 6.0 Hz,2H),8.60(t,1H),8.54(s,1H),8.07(m,4H),7.82(dd,2H),7.62(d,J = 3.0 Hz,1H), 7.58(d,J = 6.0,1H ),7.50(t,4H),7.35(dt,4H),2.21(s,3H)。ESI-FTMS[CH3CN,m/z]=413.5687(理论值413.5700,[M-2PF6]2+)。
4、氨基噻唑取代的三联吡啶配体tpyL2及其配合物RuTz2的制备:
按照图5所示的途径合成。制备步骤同配合物RuTz1的制备,不同点在于将其中的tpyCOOH替代为tpyphCOOH(0.71 g,2 mmol),其余步骤及操作不变。配体tpyL2产量1.08 g,产率95%。目标三联吡啶钌(II)配合物RuTz2。产量1.80 g,产率83%。1H NMR(300 MHz,DMSO-d 6):δ 12.32(s,1H),10.60(s,1H),9.58(s,2H),9.14(t,4H),8.86(d,2H,J = 6.0 Hz),8.64(d,2H,J = 6.0 Hz),8.57(t,1H),8.50(s,1H),8.39(d,2H,J = 6.0 Hz),8.07(m,4H),7.77(d,1H),7.71(d,1H),7.58(m,6H),7.49(m,2H),7.32(q,2H),2.20(s,3H)。ESI-FTMS[CH3CN,m/z] = 451.5840(理论值:451.5850,[M-2PF6]2+)。
5、氨基噻唑取代的三联吡啶配体tpyL3及其配合物RuTz3的制备:
按照图6所示的途径合成。取叔丁氧羰基甘氨酸(0.35 g,2 mmol)和氨基噻唑化合物Tz-NH2(0.47 g,2 mmol)、二环己基碳二亚胺DCC(0.41 g,2 mmol)、N,N-二甲基甲酰胺30mL,室温搅拌3小时。减压蒸去溶剂,得到白色固体。固体用20 mL二氯甲烷溶解,再加入三氟醋酸(1.03 g,9 mmol),搅拌1小时,减压蒸干溶剂,得到油状固体。加入N,N-二甲基甲酰胺30 mL溶解,加入tpyCOOH(0.55 g,2 mmol)、二环己基碳二亚胺DCC(0.41 g,2 mmol)、30mL,室温搅拌3小时。减压蒸去溶剂,水洗,真空干燥,得到白色固体,即配体tpyL3。产量0.99g,产率90%。取前体配合物[Ru(tpy)Cl3](0.79 g,1.7 mmol)和配体tpyL3(0.99 g,1.8mmol)于烧瓶中,加入乙二醇甲醚50 mL和 4-乙基吗啉0.5 mL,回流4小时。冷至室温,过滤,向滤液中加入加入饱和KPF6(815 mg,5 mmol),析出沉淀,抽滤以收集沉淀,用水和乙醚洗,之后真空干燥得到粗产品。经硅胶柱层析,以乙腈与甲醇混合溶剂(体积比2:1)洗脱唯一红色组分,得到所述目标三联吡啶钌(II)配合物RuTz3。产量1.43 g,产率72%。1H NMR(300MHz,DMSO-d 6):δ 12.28(s,1H),10.41(s,1H),9.62(t,1H),9.51(s,2H),9.13(d,J = 8.4Hz,2H),8.87(t,5H),8.59(t,1H),8.28(s,1H),8.06(m,5H),7.61(dd,2H),7.47(m,4H),7.29(dt,4H),4.41(d,J = 5.7 Hz,2H),2.17(s,3H)。ESI-FTMS[CH3CN,m/z] = 442.0800(理论值:442.0800,[M-2PF6]2+)。
实施例2 三联吡啶钌(II)配合物的与RNA作用的紫外可见光谱检测
溶液的配置均采用称量法。溶剂为二次蒸馏水,缓冲体系为Tris-NaCl,pH 7.0。三联吡啶钌(II)配合物的浓度为2×10-5 mol/L,poly(A) RNA和DNA浓度范围约为5×10-6~5×10-5 mol/L,向固定浓度的三联吡啶钌(II)配合物的溶液中逐渐增加DNA或poly(A) RNA的浓度,分别记录配合物本身和不同RNA浓度下的紫外可见光谱。如图7所示,随着DNA或poly(A) RNA浓度的增加,三联吡啶钌(II)配合物RuTz1的紫外可见光谱基本没有变化,而RuTz2和RuTz3的紫外可见光谱随着poly(A) RNA的加入变化明显,而随着DNA的加入基本不变。这个结果证明,配合物RuTz2和RuTz3能够在紫外可见光谱上,对单链的RNA结构和双链的DNA结构进行差异性的光谱响应,其与poly(A) RNA相互作用的光谱变化幅度显著强于其与DNA相互作用的光谱变化。
实施例3 三联吡啶钌(II)配合物的与艾滋病毒RNA的识别作用
采用凝胶电泳法测试三联吡啶钌(II)配合物与艾滋病毒RNA的TAR区域的识别作用。在0.2 mL的PCR管中,配置一系列10μL溶液,其中分别含有2×10-6 mol/L的TAR RNA,2×10-6 mol/L的tat多肽,以及0~5×10-5 mol/L的三联吡啶钌(II)配合物。将溶液在37℃温浴30分钟,加入2μL的RNA电泳上样缓冲液,在10%聚丙烯酰胺凝胶电泳(尿素变性),110 V电压进行电泳1小时。经Gelred 4S核酸染料染色15分钟,于凝胶成像仪拍照,分析电泳条带。如图8所示,艾滋病毒TAR RNA本身显示一条带。在tat多肽存在时,部分TAR RNA与tat多肽以氢键结合,使得电泳显示两条带,即未结合和结合tat多肽的TAR RNA。当向该体系加入浓度逐渐升高的三联吡啶钌(II)配合物时,结合了tat的TAR RNA显著减少,证明配合物与TARRNA结合。实验证明,RuTz2的TAR RNA结合能力最强,其次为RuTz3,而RuTz1的结合能力最弱。该实验结果与实施例2中的紫外可见光谱变化规律相同。
实施例4 三联吡啶钌(II)配合物的艾滋病毒逆转录酶抑制活性
采用商用的艾滋病毒逆转录酶活性测试试剂盒(Reverse Transcriptase Assay,colorimetric, Roche)进行测试。如图9所示,在酶标仪上利用含有不同浓度配合物时逆转录结果的吸光度(405 nm)值,拟合该配合物抑制艾滋病毒逆转录酶活性的IC50值。从图中可得出RuTz1、RuTz2、RuTz3抑制艾滋病毒逆转录酶的IC50值分别为1.60、0.12、0.78μM,抑制活性显著高于同类有机化合物,是极具开发价值的潜在艾滋病毒药物。

Claims (4)

1.一种三联吡啶钌配合物,该配合物由阳离子和阴离子两部分组成,其特征在于,所述配合物阳离子为式Ⅰ所示结构式,阴离子为三种无机盐离子PF6 、Cl、ClO4 其中一种;
Figure FDA0002611468940000011
2.权利要求1所述三联吡啶钌配合物阴离子为PF6 的配合物制备方法,其特征在于,制备步骤如下:
S1.2-乙酰吡啶和N,N-二甲基甲酰胺二甲基缩醛在二甲苯中回流12小时,减压蒸馏除去二甲苯,正戊烷重结晶,晶体在四氢呋喃溶剂中再与2-乙酰吡啶反应,蒸馏除去四氢呋喃,甲苯作为洗脱剂做柱层析,得到的三联吡啶tpy与三氯化钌在2-氯乙醇中回流,冷却至室温,抽滤,乙醇洗涤,真空干燥即得到前体配合物[Ru(tpy)Cl3];
S2.间硝基苯乙酮在乙醚中和溴素反应得到溴代硝基苯乙酮,并进一步与乙酰硫脲在乙醇中回流,得到硝基噻唑化合物Tz-NO2,硝基噻唑化合物在异丙醇中,用钯碳和硼氢化钠还原,二氯甲烷柱层析,得到氨基噻唑化合物Tz-NH2,如式II所示;
Figure FDA0002611468940000012
S3.氨基噻唑化合物Tz-NH2分别与羧基三联吡啶tpyCOOH和羧基苯基三联吡啶tpyphCOOH缩合,得到两种氨基噻唑取代的三联吡啶配体tpyL1和tpyL2,其结构如式III和式IV所示;
Figure FDA0002611468940000021
S4.氨基噻唑化合物Tz-NH2先与叔丁氧羰基保护的甘氨酸缩合,再在浓KOH溶液中回流脱掉叔丁氧羰基,进一步与羧基三联吡啶tpyCOOH缩合,得到氨基噻唑取代的三联吡啶配体tpyL3,其结构如式V所示;
Figure FDA0002611468940000022
S5.前体配合物[Ru(tpy)Cl3]与氨基噻唑取代的三联吡啶配体在含4-乙基吗啉的乙二醇甲醚与水的混合溶液中回流,冷却过滤,滤液中加入KPF6水溶液,产生红色沉淀,过滤,真空干燥,经硅胶柱层析,以乙腈与甲醇混合溶剂洗脱唯一红色组分,得到权利要求1所述三联吡啶钌配合物,其阴离子为PF6
3.权利要求1中所述的三联吡啶钌配合物在制备艾滋病毒RNA选择性识别试剂的应用。
4.权利要求1中所述的三联吡啶钌配合物在制备艾滋病毒逆转录酶抑制剂的应用。
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