CN108896771A - Guca2a蛋白在骨关节炎中的用途 - Google Patents
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Abstract
本发明提供了GUCA2A蛋白或其特异性抗体的用途,用于制备骨关节炎诊断试剂或试剂盒中的应用。进一步,本发明还提供一种用于检测骨关节炎疾病的ELISA试剂盒,所述试剂盒检测样本为尿液标本,获取无创、可大规模重复取样、保存方便的优势。本发明提供的骨关节炎相关的尿液蛋白可作为骨关节炎的早期生物标志物,为进一步研究骨关节炎的病理机制,为探索骨关节炎早期防治的药物靶点提供了新的方向。
Description
技术领域
本发明涉及生物医学检测技术领域,具体涉及GUCA2A蛋白在骨关节炎中的用途。
背景技术
骨关节炎(osteoarthritis,OA)是一种多因素导致发病的,在中老年人群中十分常见的慢性退行性关节疾病,在全球分布广泛,女性多于男性,常见于膝关节、手指小关节、髋关节,也可见于肩关节、腕关节、踝关节等。骨关节炎是以关节软骨磨损、退变和关节周缘骨质增生为特征,急性期还常伴有滑膜炎。据调查,骨关节炎在60岁以上人群中患病率达50%以上,75岁以上人群患病率高达80%,该疾病的致残率可达53%。
膝关节骨关节炎造成膝关节疼痛、肿胀、僵硬、膝关节活动度受限和功能障碍等,严重影响患者的生活质量,最终也间接影响其预期寿命。目前,由于对OA的病因学尚缺乏根本性的认识,医学界对其根治仍然缺乏行之有效的药物手段,关节置换手术往往成为患者最终必须选择的治疗方式。为了走出OA治疗方面的困境,阐明OA的病因学机理并在其基础上探索治疗OA的有效方案,成为了医学界有待突破的研究方向。
蛋白质组的定义是指一个基因组、一个或多个细胞或某些组织所表达的所有蛋白质,无论是小到一个细胞还是大到一个生物体,都是从一个整体水平去研究参与生命活动的所有蛋白质。这些所有蛋白质并不是一个一成不变的集合,而是随时随地变化着的,因为随着生命活动的进行和稳态的调节总有不同的蛋白质在被表达或修饰。蛋白质是生命活动的承担者,也是大多数生物体结构的组成部分,蛋白质的形成要经过一系列的转录后修饰,因此,从基因组和转录组并不能直接推导出蛋白质组的情况。
蛋白质组学研究的标本可以是组织、细胞、血液、关节液、尿液等,早年对尿蛋白质组学的研究往往局限于泌尿系统疾病,后来逐渐扩展到全身性的以代谢紊乱为表现的疾病。由于尿液中很少有高丰度蛋白的影响,相比血液和关节液而言,尿蛋白质组学更有利于寻找疾病的生物标志物,同时可能在疾病机理上有所发现。
目前骨科关节领域用尿液为标本进行尿蛋白质组学的研究并不多,随着以iTRAQ技术等高通量蛋白质组学技术的出现和发展,这一领域的尿蛋白质组学研究呈现出逐渐增多的趋势。如前言所述,越来越多的证据表明骨关节炎的发生和发展与代谢因素有关,与此同时,很多学者多年来也在试图寻找骨关节炎的生物标志物未果,因此,很适合用尿蛋白质组学的方法来探索骨关节炎的生物标志物和研究其相关病理机制。
发明内容
为了解决上述问题,本发明的目的在于提供一种用于骨关节炎疾病早期检测的尿蛋白组学生物标志物GUCA2A,并提供其在制备检测骨关节炎产品中的应用。
本发明首先提供GUCA2A蛋白或其特异性抗体的用途,用于制备骨关节炎诊断试剂或试剂盒中的应用。
优选的,所述GUCA2A蛋白在骨关节炎样本中表达上调。
优选的,所述骨关节炎样本为尿液样本。
进一步地,本发明提供了一种用于检测骨关节炎疾病的ELISA试剂盒,所述试剂盒包括GUCA2A蛋白的特异性抗体试剂。
优选的,所述GUCA2A蛋白的特异性抗体为单克隆抗体和/或多克隆抗体。
本发明检测骨关节炎疾病的ELISA试剂盒采用的包被抗体为抗GUCA2A单克隆抗体,包被抗体的作用是捕获待测样品(例如,尿液)中的GUCA2A,其捕获原理是通过抗原抗体的特异性结合。本发明对包被抗体的要求是能够捕获抗原分子GUCA2A上的抗原决定簇,从而使二者能够有效的特异性结合,因此,满足可与抗原分子特异性结合的抗体,包括鼠、兔、鸡、狗或猴等种属源性的抗GUCA2A单克隆抗体均可采用为包被抗体。
GUCA2A本发明检测骨关节炎疾病的ELISA试剂盒采用的检测抗体为抗GUCA2A多克隆抗体,检测抗体的作用是与包被抗体上的抗原分子GUCA2A相结合,从而检测待测样品中的GUCA2A。本发明对检测抗体的要求是能够检测与抗原分子GUCA2A上的抗原决定簇上相结合的,因此,满足可与抗原分子特异性结合的抗体,包括鼠、兔、鸡、狗、猴等种属源性的抗GUCA2A多克隆抗体均可采用为检测抗体。
优选的,所述抗体可以通过商购途径获得,也可以自行制备,所述制备方法是所属技术领域人员已知的。
需要特别说明的是,包被抗体和检测抗体虽然同为抗GUCA2A抗体,但是不能采用同一种属的抗GUCA2A抗体。原因在于:采用不同种属的抗GUCA2A抗体是为了使检测抗体能够结合到与包被抗体不同的抗原位点上,从而检测不同的抗原表位,以及当采用同一种属的抗体时,带有显色反应酶的抗体可同时与捕获及检测抗体相结合,致使显色反应不具有特异性,无法确定待测抗原的量。因此,在选择包被抗体和检测抗体时,需要选取来自于不同种属的抗GUCA2A抗体。
优选的,所述试剂盒还包括抗GUCA2A单克隆抗体包被的酶标板、标记抗GUCA2A多克隆抗体、蛋白标准品GUCA2A、TMB底物溶液、稀释液、洗涤缓冲液、终止溶液。
进一步地,本发明提供的所述试剂盒在制备检测或辅助诊断骨关节炎的产品中的应用。
优选的,所述检测或辅助诊断骨关节炎的产品包括检测或辅助诊断骨关节炎的试剂、试剂盒或芯片。
进一步地,本发明还提供了一种GUCA2A抑制剂,所述的抑制剂包括抑制GUCA2A基因表达的抑制剂、和/或抑制GUCA2A基因或蛋白的功能抑制剂。
优选的,所述抑制GUCA2A基因表达的抑制剂包括GUCA2A核酸的反义RNA、siRNA、shRNA或microRNA;所述抑制GUCA2A基因或蛋白的功能抑制剂包括抗GUCA2A的抗体或其抗原的结合片段以及小分子化合物。
更进一步地,本发明提供了所述GUCA2A抑制剂在制备治疗骨关节炎药物组合物中的应用。
优选的,所述药物组合物包括所述GUCA2A抑制剂作为活性成分,和药学上可接受的载体。
优选的,所述药学上可接受的载体包括(但并不限于):稀释剂、赋形剂如乳糖、氯化钠、葡萄糖、尿素、淀粉、水等、填充剂如淀粉、蔗糖等;粘合剂如单糖浆、葡萄糖溶液、淀粉溶液、纤维素衍生物、藻酸盐、明胶和聚乙烯吡咯烷酮;湿润剂如甘油;崩解剂如干淀粉、海藻酸钠、海带多糖粉末、琼脂粉末、碳酸钙和碳酸氢钠;吸收促进剂季铵化合物、十二烷基硫酸钠等;表面活性剂如聚氧化乙烯山梨聚糖脂肪酸酯、十二烷基硫酸钠、硬脂酸单甘油酯、十六烷醇等;致湿剂如甘油、淀粉等;吸附载体如淀粉、乳糖、斑脱土、硅胶、高岭土和皂粘土等;润滑剂如滑石粉、硬脂酸钙和镁、聚乙二醇、硼酸粉末等。
再进一步,本发明提供一种在骨关节炎患者尿液样本中筛选差异表达蛋白的方法,包括以下步骤:
⑴获得骨关节炎患者和对照组的尿液;
⑵分离尿蛋白;
⑶分别对两组所述蛋白样本进行还原烷基化处理,得到两组蛋白样本溶液;
⑷分别向两组蛋白样本溶液中加入胰蛋白酶进行酶解处理;
⑸使用不同的标记试剂,分别对酶解处理后的两组样本进行iTRAQ标记处理,并将标记处理后的骨关节炎患者组与对照组的样本溶液混合;
⑹对混合后的样本进行液相色谱分离,再将液相色谱分离的肽段进行串联质谱分析;
⑻使用蛋白质鉴定软件对质谱分析结果进行蛋白质鉴定,根据蛋白质丰度水平,筛选分析得到骨关节炎患者与对照组的样本中的差异表达蛋白;
⑼经过生物信息学分析鉴定差异性蛋白并阐述差异性蛋白的生物学功能;
⑽最终筛选到与骨关节炎相关的GUCA2A蛋白。
优选的,所述步骤⑼中生物信息学分析包括差异蛋白GO富集分析和KEGG信号通路富集分析。
有益效果
本发明通过实验研究证实与对照组相比,GUCA2A蛋白在骨关节炎患者尿液中表达上调,并研究其作为分子靶点在骨关节炎早期检测、辅助诊断的试剂、试剂盒或治疗药物中的应用前景;进一步,本发明提供一种用于检测骨关节炎疾病的ELISA试剂盒,所述试剂盒检测样本为尿液标本,获取无创、可大规模重复取样、保存方便的优势。本发明提供的与骨关节炎相关的尿液蛋白可作为骨关节炎的早期生物标志物,为进一步研究骨关节炎的病理机制,为探索骨关节炎早期防治的药物靶点提供了新的方向。
附图说明
图1本实施例3中的GUCA2A表达量的标准曲线。
具体实施方式
以下实施例用于说明本发明,但不用来限制本发明的范围。若未特别指明,实施例中所用的技术手段为本领域技术人员所熟知的常规手段。
实施例中未注明具体条件的实验方法,通常为本领域常规方法。
本发明的发明人对4例骨关节炎样本及4例对照样本进行iTRAQ实验,结合生物信息学方法进行筛选,挑选出候选蛋白GUCA2A蛋白,现有研究中并没有GUCA2A蛋白作为标志物与骨关节炎相关的报道,进一步,发明人还采用ELISA验证上述蛋白在骨关节炎患者和对照组的尿液样本中的表达情况,证实了所述GUCA2A在骨关节炎尿液样本中表达上调,其相关产品可用于诊断、治疗骨关节炎。
本发明的GUCA2A蛋白是在本发明之前的已知蛋白,其基本信息如下:
GUCA2ANCBI Reference Sequence:NP_291031.2;
本发明应用iTRAQ联合质谱的方法鉴定到骨关节炎患者尿液中的蛋白标志物。同位素标记相对和绝对定量(isobaric tags for relative and absolute quantitation,iTRAQ)技术由AB SCIEX公司研发的一种体外同种同位素标记的相对与绝对定量技术。该技术利用多种同位素试剂标记蛋白多肽N末端或赖氨酸侧链基团,经高精度质谱仪串联分析,可同时比较多达8种样品之间的蛋白表达量,是近年来定量蛋白质组学常用的高通量筛选技术。iTRAQ定量蛋白质组学是蛋白酶切后形成多肽,用iTRAQ同位素试剂标记多肽N末端或赖氨酸侧链基团。标记后的肽段经过液相分离,进行一级质谱和二级质谱分析,在二级质谱前,被标记的不同样本中的同一肽段表现为相同的质荷比和其他理化性质。而在二级质谱中,信号离子表现为不同质荷比(114~121)的峰,根据波峰的高度及面积,可以鉴定出蛋白质和分析出同一蛋白质不同处理的定量信息。
iTRAQ试剂包括三部分:报告部分、肽反应部分、平衡部分。(1)报告部分有八种:113-121(无120),因此iTRAQ试剂可同时标记8组样品。(2)肽反应部分:能与肽段N端及赖氨酸侧链氨基发生共价连接而标记上肽段。(3)平衡部分:保证被标记的同一肽段的质荷比相同。与传统的双向电泳定量分析相比,iTRAQ具有以下技术服务优势:(1)灵敏度高,检测限低,可检测出低丰度蛋白;(2)分离能力强,分析范围广,iTRAQ可以对任何类型的蛋白质进行分离鉴定,包括高分子量蛋白质、酸性蛋白和碱性蛋白,膜蛋白和不溶性蛋白;(3)高通量:同时对8个样本进行分析,提高了实验通量,可同时对多个时间点或不同处理的蛋白质进行分析;(4)结果可靠:定性与定量分析结果更加可靠;(5)自动化程度高:液相与质谱连用,自动化操作,分析速度快,分离效果好。
本文中使用的术语“样本”包括从任何来源获得的样本或培养物。样本可以获自血液(包括任何血液制品,如全血、血浆、血清或特定类型的血细胞)、尿液、唾液等。样本还包括组织样本。在一个实施方式中,样本来自尿液。
本文使用的术语“表达水平”指通过本领域技术人员已知方法测定的给定核酸或蛋白质的可测量。
本文使用的术语“对照”指未显示任何OA症状并且未诊断为骨关节炎或OA的个体或个体组。优选地,所述对照个体未使用影响OA的药物,并且未诊断为患有任何其他疾病。更优选地,对照个体具有与测试样本相比相似的性别、年龄和体重指标(BMI)。
本发明使用的术语“酶联免疫吸附测定(enzyme-linked immunosorbent assay简称ELISA)”指是利用抗体分子能与抗原分子特异性结合的特点,将游离的杂蛋白和结合于固相载体的目的蛋白分离,并利用特殊的标记物对其定性或定量分析的一种检测方法。ELISA过程包括:抗原吸附在固相载体上,这个过程称为包被,加待测抗体,再加相应酶标记抗体,生成抗原—待测抗体—酶标记抗体的复合物,再与该酶的底物反应生成有色产物。借助分光光度计的光吸收计算抗体的量。待测抗体的量与有色产物成正比。同理也可包被抗体,测定抗原含量。ELISA最常用的四种方法:直接法测定抗原;间接法测定抗体;双抗体夹心法测定抗原;竞争法测定抗原。
实施例1样本的收集
病例-对照研究是本研究所采用的方法。实验组的研究对象为2015年度在北京协和医院骨科住院的患严重骨关节炎的但还未接受手术治疗的患者4例,对照组的研究对象为不患有骨关节炎的相对健康者4例,实验组符合中华医学会骨科学分会骨关节炎诊断标准。实验组的年龄为58.5±2.0岁(56-61岁),对照组的年龄为57.6±2.1岁(55-61岁)。根据中华人民共和国国家卫生与计划生育委员会2013年制定的《成人体重判定》标准,两组均选取BMI在24-28之间的超重者。实验方案经北京协和医院伦理委员会同意,并取得每位受试者的书面知情同意。实验组和对照组基本资料见表1。
收集实验组和对照组的晨起第二次中段尿,首先用无菌广口容器盛装,后转移至离心管,4,000g离心10min(4℃),上清液被等分进50mL无菌管,-80℃保存备用。
表1样本的基本资料
OA病例组的纳入标准:
有完整的临床资料和影像学资料(双膝正侧位加髌骨轴位X线片),根据病史和诊断标准诊断为严重骨关节炎(K-L分级4级)的体重超重女性患者,并签署知情同意书。
OA病例组的排除标准:
膝外伤手术史、膝关节感染、成年前膝关节畸形、代谢性骨病、下肢不等长、膝关节肿瘤史,骨质疏松症,肝肾疾病、高脂血症、高血压、糖尿病、甲状腺功能亢进、甲状旁腺功能亢进病史,近期服用雌激素、孕激素治疗者,痛风、类风湿关节炎等其它关节疾病,接受过改变病情抗风湿药或免疫抑制治疗,近6个月内接受过关节内注射药物治疗。BMI小于24或大于28。
对照组的纳入标准:
对照组选取的是不患有骨关节炎的超重女性患者,对照组的性别、年龄和BMI与OA病例组相匹配,并签署知情同意书。
对照组的排除标准:
膝外伤手术史、膝关节感染、成年前膝关节畸形、代谢性骨病、下肢不等长、膝关节肿瘤史,骨质疏松症,肝肾疾病、高脂血症、高血压、糖尿病、甲状腺功能亢进、甲状旁腺功能亢进病史,近期服用雌激素、孕激素治疗者,痛风、类风湿关节炎等其它关节疾病,接受过改变病情抗风湿药或免疫抑制治疗,近6个月内接受过关节内注射药物治疗。BMI小于24或大于28。
实施例2iTRAQ实验筛选差异蛋白
一、所用仪器和试剂
涡旋振荡器(海门市其林贝尔仪器制造有限公司,型号:QL-901)
离心机(Thermo,型号:PICO17)
超声波细胞破碎仪(南京先欧仪器制造有限公司,型号:XO)
酶标仪(Thermo,型号:MμLtiskanMK3)
恒温孵浴器(上海浦东荣丰科学仪器有限公司,型号:HH.S4)
真空冷冻干燥机(Thermo,型号:SPD2010-230)
RIGOL L-3000高效液相色谱系统(北京普源精电科技有限公司),流动相A:98%ddH2O,2%乙腈(pH 10);流动相B:98%乙腈,2%ddH2O(pH 10)高效液相色谱仪:(ThermoScientic EASY-nLC 1000System(Nano HPLC)),流动相A:100%超纯水,0.1%甲酸;流动相B:100%乙腈,0.1%甲酸质谱系统(Thermo,型号:Q-Exactive)
尿素(Bio-Rad,货号:161-0731,美国)
硫尿(Sigma-Aldrich,货号:T7875,美国)
CHAPS(Bio-Rad,货号:161-0460,美国)
Protease Inhibitor Cocktail(Roche,货号:04693116001,美国)
蛋白定量染液(Thermo Scientific,货号:23238,美国)
牛血清白蛋白(Bovine Serum Albumin,BSA)(Sigma-Aldrich,货号:A2058,美国)
DTT(Bio-Rad,货号:161-0611,美国)
碘乙酰胺(Bio-Rad,货号:163-2109,美国)
试剂盒中的DissolutionBuffer(AB Sciex,PN:4381664)
胰酶(Promega,货号:V5111,美国)
10K超滤管(milipore,PN:UFC5010BK)
8标试剂盒(AB Sciex,PN:4390812,PN:4381664)
Ziptip(Millipore,PN:ZTC18M096(2μg))
色谱柱:Durashell-C18,4.6mm×250mm,5μm,(Agela,货号:DC952505-0)
乙腈(Merck,货号:100030,德国)
氨水(Sigma-Aldrich,货号:17837,美国)
预柱(AcclaimPepMap100column,2cm x 100μm,C18,5μm)
色谱柱(EASY-Spray column,12cmx 75μm,C18,3μm)
进样瓶(Thermo,11190533)
瓶盖(Thermo,11150635)
喷针(Thermo,PN:ES542)
二、iTRAQ定量实验流程
1.样本蛋白提取
1)将样本按照1:10(W/V)加入lysis buffer(7M尿素,2M硫脲,0.1%CHAPS,片/50mL Protease Inhibitor Cocktail),涡旋混匀。
2)超声60s(0.2s on、2s off),振幅22%。
3)室温提取30分钟。
4)15,000g,4℃离心20min,小心取出上清,分装后冻存于-80℃。
2.蛋白定量(Bradford法)
1)采用Bradford法[Marion M.Bradford.AnalyticalBiochemistry,1976,72:248-254]测定样本提取的蛋白浓度。先将样本用lysis buffer(7M尿素、2M硫脲、0.1%CHAPS)进行一定倍数稀释使其终浓度落在标曲范围内,稀释好的样本和标准品(将BSA用lysis buffer溶解成系列浓度的标准蛋白)各取10μL分别和300μL蛋白定量染料避光反应20min,用酶标仪同时测定标准品和样本在595nm下的吸光值,根据标准品每管吸光值和浓度的关系绘制标准曲线(曲线公式:y=1.4337×x2+0.0406×x+0.03728,R2=0.98906)。
2)根据曲线公式计算各样本蛋白浓度。
3.蛋白酶解(FilterAided Sample Preparation,FASP)
1)蛋白定量后取200μg蛋白溶液置于离心管中;
2)加入终浓度25mM DTT,60度反应1小时;
3)加入终浓度50mM碘乙酰胺,室温10分钟;
4)将还原烷基化后的蛋白溶液加入10K的超滤管中,12,000转离心20分钟,弃掉收集管底部溶液;
5)加入iTRAQ试剂盒中的Dissolution Buffer 100μL,12,000转离心20分钟,弃掉收集管底部溶液,重复3次;
6)更换新的收集管,在超滤管中加入胰蛋白酶,总量4μg(与蛋白质量比1:50),体积50μL,37℃反应过夜;
7)次日,12,000转离心20分钟,酶解消化后的肽段溶液离心于收集管底部;8)在超滤管中加入50μL DissolutionBuffer,12,000转再次离心20分钟,与上步合并,收集管底部共得到100μL酶解后的样本。
4.iTRAQ标记
1)从冰箱中取出iTRAQ试剂,平衡到室温,将试剂离心至管底。
2)向每管试剂中加入150μL异丙醇,涡旋振荡,离心至管底。
3)取50μL样本(100μg酶解产物)转移到新的离心管中。
4)将iTRAQ试剂填加到样本中,涡旋振荡,离心至管底,室温反应2小时。
5)加入100μL水终止反应。
6)为了检测标记效率及定量准确性,从4组样本中各取出1μL混合,用Ziptip脱盐后进行MALDI-TOF-TOF(AB SCIEX 4800Plus)鉴定,确认标记反应良好;
7)混合标记后的样本,涡旋振荡,离心至管底。
8)真空冷冻离心干燥。
9)抽干后的样本冷冻保存待用。
5.酶解肽段离线预分离及LC-MS/MS质谱分析
5.1高pH条件下的反相色谱分离
1)混合标记后的样本用100μL流动相A溶解,14000g离心20min,取上清待用。
2)使用400μg酶解好的BSA进行分离(柱温45℃,检测波长214nm),检测系统情况。
3)取100μL准备好的样本上样、分离,流速0.7mL/min。
5.2纳升级反相色谱-Q Exactive进行蛋白质分析
1.实验步骤
1)将高pH反相分离得到的组份用20μL 2%甲醇,0.1%甲酸复溶。
2)12,000rpm离心10分钟,吸取上清上样。
3)上样体积10μL,采取夹心法上样。
4)Loading Pump流速350nl/min,15分钟。
5)分离流速300nl/min,分离梯度如下表2:
表2纳升级反相色谱分离梯度
2.质谱参数设置
a)离子源参数:
Spray voltage:2.3kv;
Capillary Temperature:320℃;
Ion Source:EASY-Spray source;
DP:100;
b)FμLl MS:
Resolution:70000FWHM;
FμLl Scan AGC target:3e6;
FμLl Scan Max.IT:20ms;
Scan range:300-1800m/z;
c)dd-MS2:
Resolution:17500FWHM;
AGC target:1e5;
Maximum IT:120ms;
Intensity threshold:8.30E+03;
Fragmentation Methods:HCD;
NCE:32%;
Top N:20;
6.质谱数据分析
6.1数据库
数据库的选择是以所需物种、数据库注释完备性及序列可靠性为参考依据的。在本次实验中选择的数据库来自UniProt(http://www.uniprot.org/),数据库本版为:UniProt.Rat.201509.fasta。
6.2检索软件
iTRAQ的质谱分析是由Thermo Q-Exactive型质谱完成,产生的质谱原始文件*.RAW采用Mascot 2.5.1软件搜库处理,采用scaffold软件对搜库结果进行质控。
7.生物信息学分析
7.1差异蛋白定量信息统计
对要比较的两组样本使用Perseus 1.3.0.4.(www.maxquant.org)软件进行统计分析,筛选P value≤0.05,并且两组样本中蛋白ratio≥1.25或ratio≤0.75的差异蛋白。
7.2差异蛋白质功能注释
使用UniProt(http://www.uniprot.org/)对全部蛋白质进行全面的生物学功能注释,获取与这些蛋白质所有相关的功能信息。包括Gene Ontology(GO)和通路等注释信息。
7.3差异蛋白功能富集分析
使用MetaCore软件对不同组别差异蛋白进行功能富集分析。使用MetaCore对各组差异表达蛋白质进行了基于Gene Ontology(GO)的生物学过程(biologicalprocess),细胞组分(cellμLar component)和分子功能(molecμLar function)的富集分析。该分析是指利用功能注释工具高通量地对每个蛋白质进行注释,得到实验鉴定蛋白质在各类生物学过程或分子功能上的分布情况,并将该分布与总体蛋白质的相应分布进行比较,从而确认实验鉴定的蛋白质在哪几类生物学过程或分子功能上显著富集(即p值小于0.05),从整体上把握鉴定的蛋白质与预期功能分布之间的吻合程度,还可以获得与某些特定功能相关的蛋白质分子。通过MetaCore分析,获得差异蛋白质的生物学过程、细胞组分、分子功能富集结果。
7.4差异蛋白质通路富集分析
使用MetaCore软件对差异表达蛋白质进行通路分析,获取与差异表达蛋白质所有相关的通路信息以及富集的通路。
8.结果
基于iTRAQ技术,本发明从实验组和对照组的尿液中共鉴定到了1413种蛋白质,其中两组间的差异蛋白总共有394个,170个蛋白质在OA实验组中上调,224个蛋白质在OA实验组中下调。根据GO分析可知:差异蛋白主要位于细胞外囊泡、细胞外分泌小体、细胞外基质部分以及细胞膜;差异蛋白与肽酶和肽链内切酶等的调节和抑制作用有关,还与细胞粘附分子和蛋白受体的结合等分子功能相关;差异蛋白主要参与细胞粘附、损伤修复的调节、应激反应等生物过程。
发明人通过Gene Onlogy和信号通路分析,以及结合文献发明人筛选了在骨关节炎患者的尿液中表达上调的差异蛋白GUCA2A。GUCA2A蛋白可以作为骨关节炎的尿液生物标志物,对于疾病的诊断、治疗和预后提供理论依据。
实施例3验证GUCA2A蛋白表达情况
按照实施例1中样本收集的方法,收集在北京协和医院骨科住院的患严重骨关节炎的但还未接受手术治疗的患者尿液25例,对照组为不患有骨关节炎的相对健康者尿液15例。
1、使用液体样品蛋白提取试剂盒(贝博生物)提取尿液蛋白,具体步骤如下:
1)取5mL离心管,加入500μL待提取液体样本,加入2mL试剂A,500μL试剂B,1.5mL试剂C,涡旋20秒充分混匀。
2)冰浴或4℃冰箱放置30分钟。
3)在4℃,11000rpm条件下离心15分钟。
4)小心吸取最上层和最下层丢弃,收集中间蛋白层。
5)在4℃,12000rpm条件下离心15分钟。
6)弃上清,收集沉淀。
7)加入20-50μL 1x蛋白Loadingbuffer;煮10min。
8)在4℃,11000rpm条件下离心10分钟。
9)收集上清直接用于下游实验。
2、酶联免疫吸附实验使用人GUCA2A(鸟苷酸环化酶激活剂2A)ELISA试剂盒(Elabscience)
具体步骤如下:
1)标准品稀释:10ng/mL、5ng/mL、2.5ng/mL、1.25ng/mL、0.63ng/mL、
0.32ng/mL、0.16ng/mL。
2)加样:每孔加入100μL标准品或样品。在37℃孵育90分钟。
3)去除液体。
4)加入100μL生物素化检测Ab。在37℃孵育1小时。吸取并洗涤3次。
5)加入100μL HRP结合物。在37℃孵育30分钟。吸出并洗5次。
6)加入90μL底物试剂。在37℃孵育15分钟。
7)加入50μL终止液。
8)15min内在450nm波长下测量各孔的吸光度值(OD值),以7个标准品OD值为纵坐标绘制标准曲线(如图1所示),计算曲线方程,计算出其中GUCA2A含量,可以用ng/mL表示。
3、统计学计算
采用SPSS18.0统计软件来进行统计分析的,计量资料结果以平均值±标准差的方式来表示,患者样本与正常对照的配对比较采用t检验,配对样本采用t检验,多样本采用均数的方差检验(ANOVA)进行分析,认为当P<0.05时具有统计学意义。
4、结果
结果显示,骨关节炎患者尿液中GUCA2A(0.340128±0.026)ng/mL高于对照组(0.2716±0.023)ng/mL,差异具有统计学意义(p<0.05)。
实施例4骨关节炎相关GUCA2A蛋白检测试剂盒组装
本发明的发明人以上述结果为依据,可应用GUCA2A蛋白和其抗体建立通过检测GUCA2A蛋白表达水平来诊断骨关节炎患者尿液样本的ELISA试剂盒。
以ELISA双夹心法为例组装检测骨关节炎的ELISA试剂盒:
1.ELISA实验中常规试剂:
包被缓冲液(pH9.6的碳酸盐缓冲液):Na2CO31.59g,NaHCO32.93g,加蒸馏水至1L。
洗涤缓冲液(pH7.4):8.0gNaCl;0.2g KH2PO4;2.9gNa2HPO4·12H2O;0.2g KCl;0.5mL 0.05%吐温-20,加ddH2O至1L。
稀释液:牛血清白蛋白(BSA)0.1g加洗涤缓冲液至100mL;
本试剂盒使用的抗人GUCA2A蛋白鼠源单克隆抗体和抗GUCA2A蛋白兔源多克隆抗体均可商业购买例如Abnova、Creative Diagnostics、Abcam等。
蛋白标准品GUCA2A为人源重组蛋白均商业购买例如Abcam。
2.酶标板的包被:
所述的抗GUCA2A蛋白鼠源单克隆抗体包被的酶标板通过如下方法制备:用pH9.6的碳酸盐包被缓冲液将纯化后抗GUCA2A单克隆抗体稀释成目的浓度0.63μg/mL;将稀释好的抗体溶液混匀后加入微孔中,100μL/孔,4℃过夜;洗板3次,200μL/孔;加入3%BSA封闭液,300μL/孔,4℃过夜;洗板3次,200μL/孔;-20℃保存。
3.酶标抗体的制备:
取抗GUCA2A蛋白兔源多克隆抗体,分别与HRP进行偶联,得到酶标记抗体。取一定量的酶标记抗体加入到稀释液中,充分混匀,使其终浓度为2μg/mL(可根据具体的条件而定),2-8℃避光保存。
4.试剂盒的组装:
检测骨关节炎的ELISA试剂盒具体包括以下组分:
1)GUCA2A蛋白标准品
2)GUCA2A单克隆抗体包被的酶标板
3)酶标抗体-HRP标记抗GUCA2A多克隆抗体
4)稀释液
5)洗涤缓冲液
6)TMB
7)终止液
8)封板膜
5、该试剂盒的使用方法如下:
(1)推荐标准品浓度梯度为:10ng/mL、5ng/mL、2.5ng/mL、1.25ng/mL、0.63ng/mL、0.32ng/mL、0.16ng/mL、0ng/mL;
(2)加样:每孔加入100μL标准品或样品,同时设立空白孔100μL稀释液。
(3)用封板膜封板后置37℃温育30分钟;
(4)小心揭掉封板膜,弃去液体,甩干,每孔加满洗涤液,静置30秒后弃去,如此重复3次,拍干;
(5)每孔加入酶标试剂100μL;
(6)温育,洗涤,步骤同上;
(7)每孔加入TMB底物100μL轻轻震荡混匀,室温避光孵育10-20分钟;
(8)每孔加终止液100μL,终止反应;
(9)以空白孔调零,450nm波长依序测量各孔的吸光度(OD值),计算各样本中蛋白含量。
本发明的ELISA试剂盒可在制备骨关节炎疾病检测试剂盒中的应用。
本发明试剂盒发挥尿液标本获取无创、可大规模重复取样、保存方便的优势,利用尿液标本检测GUCA2A蛋白及其多肽片段。
虽然,上文中已经用一般性说明及具体实施方案对本发明作了详尽的描述,但在本发明基础上,可以对之作一些修改或改进,这对本领域技术人员而言是显而易见的。因此,在不偏离本发明精神的基础上所做的这些修改或改进,均属于本发明要求保护的范围。
Claims (10)
1.GUCA2A蛋白或其特异性抗体的用途,其特征在于,用于制备骨关节炎诊断试剂或试剂盒中的应用。
2.如权利要求1所述的用途,其特征在于,所述GUCA2A蛋白在骨关节炎样本中表达上调。
3.根据权利要求2所述的用途,其特征在于,所述骨关节炎样本为尿液样本。
4.一种用于检测骨关节炎疾病的ELISA试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括GUCA2A蛋白的特异性抗体试剂。
5.根据权利要求5所述的试剂盒,其特征在于,所述GUCA2A蛋白的特异性抗体为单克隆抗体和/或多克隆抗体。
6.根据权利要求4所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括抗GUCA2A单克隆抗体包被的酶标板、标记抗GUCA2A多克隆抗体、蛋白标准品GUCA2A、TMB底物溶液、稀释液、洗涤缓冲液、终止溶液。
7.根据权利要求4-6任一项所述的试剂盒在制备检测或辅助诊断骨关节炎的产品中的应用。
8.一种GUCA2A抑制剂,其特征在于,所述的抑制剂包括抑制GUCA2A基因表达的抑制剂、和/或抑制GUCA2A基因或蛋白的功能抑制剂。
9.根据权利要求8所述的抑制剂,其特征在于,所述抑制GUCA2A基因表达的抑制剂包括GUCA2A核酸的反义RNA、siRNA、shRNA或microRNA;所述抑制GUCA2A基因或蛋白的功能抑制剂包括抗GUCA2A蛋白的特异性抗体或其抗原的结合片段以及小分子化合物。
10.GUCA2A抑制剂在制备治疗骨关节炎药物组合物中的应用。
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