CN108410871B - 香蕉枯萎菌milRNAs及低丰度milRNAs的体外验证方法 - Google Patents
香蕉枯萎菌milRNAs及低丰度milRNAs的体外验证方法 Download PDFInfo
- Publication number
- CN108410871B CN108410871B CN201810175831.0A CN201810175831A CN108410871B CN 108410871 B CN108410871 B CN 108410871B CN 201810175831 A CN201810175831 A CN 201810175831A CN 108410871 B CN108410871 B CN 108410871B
- Authority
- CN
- China
- Prior art keywords
- fusarium oxysporum
- rna
- dna
- banana
- banana fusarium
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Active
Links
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/11—DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
- C12N15/113—Non-coding nucleic acids modulating the expression of genes, e.g. antisense oligonucleotides; Antisense DNA or RNA; Triplex- forming oligonucleotides; Catalytic nucleic acids, e.g. ribozymes; Nucleic acids used in co-suppression or gene silencing
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
- C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
- C12N15/82—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for plant cells, e.g. plant artificial chromosomes (PACs)
- C12N15/8216—Methods for controlling, regulating or enhancing expression of transgenes in plant cells
- C12N15/8218—Antisense, co-suppression, viral induced gene silencing [VIGS], post-transcriptional induced gene silencing [PTGS]
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2310/00—Structure or type of the nucleic acid
- C12N2310/10—Type of nucleic acid
- C12N2310/14—Type of nucleic acid interfering N.A.
- C12N2310/141—MicroRNAs, miRNAs
Landscapes
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Zoology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Plant Pathology (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Cell Biology (AREA)
- Virology (AREA)
- Immunology (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
Abstract
本发明公开了香蕉枯萎菌编码内源milRNAs及低丰度表达milRNAs的体外验证方法。本发明通过Deep sequencing深度测序获得的香蕉枯萎菌编码的小RNA及其表达谱,为后续进一步开发、利用小RNA在香蕉枯萎菌中的作用机制提供前期工作铺垫。本发明还提供了一种低丰度milRNAs的体外验证方法,利用本生烟作为替代植物,可以对milRNAs的靶标及其功能进行有效的分析,可以对深度测序的数据进行高通量的分析和验证,克服了目前小RNA研究中的不足,具有广泛的应用前景。
Description
技术领域
本发明涉及生物技术领域,具体涉及香蕉枯萎菌milRNAs及低丰度milRNAs的体外验证方法。
背景技术
1、植物内源miRNA在转录后以基因沉默的方式负调控靶标基因的表达,在植物生长发育、抗逆抗病等多个方面发挥重要的作用
真核生物的小RNA主要分为microRNAs(miRNAs)、siRNAs和piRNAs。miRNA和siRNA长度约为20~25nt,均由类似RNase III的核酸内切酶Dicer(或Dicer类似蛋白)加工产生,它们的形成既有联系又有区别。siRNA途径是由是外源入侵,如病毒,转座子以及转基因等产生变体dsRNA引发的;而miRNA途径由内源性hpRNA诱导。siRNA和miRNA都由DCLs(或Dicer类似蛋白)剪切形成,其中与mRNA互补的链结合RNA诱导的沉默复合体(RNA-InducedSilencing Complex,RISC),以PTGS的方式作用序列同源的mRNA,通过mRNA剪切、翻译抑制或者甲基化等方式调控基因的表达。piRNA依赖PiWi蛋白加工成熟,仅存在动物细胞。
植物内源miRNA是由Ⅲ型RNase核酸酶Dicer从含有茎环结构的内源转录本中切割产生一类21-24nt长度的小分子非编码RNA,通过转录后水平以mRNA剪切或翻译抑制的方式沉默序列同源的mRNA靶标基因。miRNA基因广泛分布于植物基因组中,在基因组上通常具有独立的基因座位(1ocus),转录产物自身折叠成不完全配对的发卡结构(hairpin)。已经有大量的报道证实植物内源miRNAs参与植物对病原菌的PTI和ETI免疫,在植物生长发育、抗逆抗病等多个方面发挥重要的作用。
2、真菌中存在与植物miRNA在结构、长度、作用方式上类似的小RNAs(microRNA-like RNAs,milRNAs)。
milRNAs最早在粗糙脉孢霉(Neurospora crassa)中发现的,与植物microRNA在结构、小RNA长度以及作用方式上非常相似,因为与植物的miRNA类似而命名microRNA-likes(milRNAs)。粗糙脉孢霉的milRNAs通过Dicers,QDE-2,核酸外切酶活性的QIP效应蛋白以及具有III型RNase功能域的线粒体核糖体大亚基MRPL3蛋白(mitochondrial ribosomalprotein large subunit,MRPL3)的不同组合,产生有四种不同的生物形成途径。虽然四种途径中从基因间隔区转录的RNA前体序列长度各异,但都具有发卡结构,形成的milRNAs具有5'末端U的偏好性,能够特异与Argonaute(AGO)蛋白结合;此外,实验证明milR-1可以通过基因沉默的方式作用调靶标序列(NCU07311)mRNA,主要通过抑制mRNA翻译的方式进行,与植物microRNA通过mRNA剪切和抑制转录的方式不一致(Lee et al.,2010)。milR-1是构巢曲霉中丰度最高的miRNA-like RNAs,Xue et al.(2012)以milR-1为研究对象构建了依赖AGO的milR-1离体生物形成的生物化学研究框架,研究表明milR-1的加工成熟过程可以分为5个步骤,与植物microRNA的生物合成途径不一样的是,除了QDE-2,Dicer等核心蛋白组分外,还需要QIP以及RNA外来复合体(exosome)的共同参与,加工成为成熟的小RNA(Xueetal.,2012)。
随后,植物病原真菌的小RNA相关研究进展迅速,在稻瘟病(Magnaporthe oryzae)(Nunes etal.,2011)油菜核盘菌(Sclerotinia sclerotiorum)(Zhou et al.,2012)葡萄灰霉菌(Botrytis cinerea)(Weiberg et al.,2013;Wang et al.,2017a)疫霉(Phytophthora)(Fahlgren etal.,2013)尖孢镰刀菌番茄专化型(Fusariumoxysporumf.sp.lycopersici)(Chen etal.,2014)黄曲霉(Aspergillusflavus)(Baietal.,2015)小麦条锈(Puccinia striiformisf.sp.tritici)(Mueth etal.,2015;Wangetal.,2017b)中陆续都发现存在milRNAs。随着技术的进步,深度测序可以预测到低丰度milRNA及其骨架序列的存在,但是由于病原真菌中大部分的milRNAs表达本底水平太低,常规的同位素32p-ATP标记的miRNA探针无法检测到低丰度的milRNAs,因此,无法对低丰度的milRNAs及其发夹序列进行验证。
3、植物病原真菌与寄主之间存在跨界小RNA基因沉默,抑制寄主的免疫反应促进病原菌的侵染。
病原真菌利用小RNA作为效应因子(effector)进入植物细胞内部抑制植物免疫防卫反应。灰霉菌引发的灰霉病可以侵染200多种植物。Weiberg etal.(2013)的研究显示灰霉菌能够输送Bc-sRNAs进入寄主细胞通过与AGO1特异性结合抑制AGO1功能,沉默寄主的免疫相关基因促进病原菌侵染。拟南芥的Δago1缺失突变体由于丧失了AGO1功能,减少了对灰霉菌的敏感性;相反,灰霉菌的Δdcl1dcl2双突变体由于无法加工产生Bc-sRNAs而完全丧失了侵染性。因此,真菌病原物通过转移具有致病力的小RNA效应因子进入寄主细胞通过抑制寄主的防卫反应促进病原菌的侵染,该发现阐释了这种自然发生的跨界RNAi沉默现象作为病原真菌的一种更加高级的致病机制(Weiberg etal.,2013)。此外,在葡萄灰霉菌(Botrytis cinerea)中还发现一个低丰度表达的Bc-siR37,仅侵染时上调表达,而Bc-siR37的3个确定的作用靶标都是寄主免疫相关的(Wang etal.,2017)。Bc-DCL1和DCL2是产生Bc-sRNAs的主要组分,沉默DCLs可以显著减少病原菌的致病力。病原菌存在环境RNAi可以吸收外部的RNA,在水果、蔬菜以及鲜花的表面施用靶向DCLs的dsRNA和sRNA可以通过调控Bc-sRNAs表达从而明显减轻灰霉病的症状(Wang etal.,2016;Wang etal.,2017a)。
小RNA是病原真菌一类重要的致病因子。小麦条锈病编码的Pst-milR1仅仅在侵染时诱导表达,在Pst中通过BSMV基因沉默抑制Pst-milR1的表达明显减弱了条锈病的致病性,同时,在小麦中敲除其靶标小麦病程相关基因PR2(SM638)则增强了小麦对无毒菌株的感病性,正反实验证实Pst-milR1以跨界基因沉默方式靶向寄主免疫相关基因PR2(SM638)从而抑制寄主的免疫反应促进病原菌侵染(Wang etal.,2017b)。
4、香蕉枯萎菌的研究
香蕉枯萎病(Fusarium oxysporum f.sp.cubense,Foc)是破坏香蕉维管束导致植株死亡的毁灭性土传病害,其病菌腐生能力很强,在土壤中可长期存活,属于典型的潜伏型侵染。早期外部症状表现不明显,中后期才表现症状,因此,给香蕉产业和香蕉种植者造成巨大的经济损失。世界植蕉区已发现其有4个生理小种(还可能存在其它小种),其中生理小种1号侵染粉蕉(ABB组)、龙牙蕉(AAB组)类及部分AAA组品种;生理小种2号只侵染杂交三倍体棱香蕉(ABB),对香蕉栽培品种的危害较小;生理小种3号侵染野生的羯尾蕉属,对香蕉栽培品种不造成危害,在许多地区均有报道;生理小种4号侵染香牙蕉、龙牙蕉、大蕉,其寄主范围大于生理小种1号。4号生理小种又分为亚热带4号(Subtropical Race4,SR4)和热带4号小种(Tropical Race4,TR4),在我国主要是1号和4号生理小种,其中热带4号小种危害最严重。
目前,香蕉没有有效的抗性种质资源,生产上没有有效的化学防治方法,因此,培育抗性品系是解决香蕉枯萎病的根本途径之一。小RNA在介导病原物-寄主相互作用过程中发挥着重要的作用,具有提升植物抗病害能力的巨大潜力。香蕉枯萎菌是否编码小RNA,是否利用小RNA促进侵染等相关研究目前均没有文献报道,为此,我们开展了香蕉枯萎菌内源小RNA鉴定及检测验证工作。
发明内容
针对以上现有技术的不足之处,本发明提供了香蕉枯萎菌milRNAs及低丰度milRNAs的体外验证方法。
本发明采取的技术方案如下:
香蕉枯萎菌milRNAs,所述香蕉枯萎菌milRNAs的基因序列如SEQ ID NO:1至SEQID NO:309任一所示。
本发明还涉及一种载体,所述载体含有权利要求1所述的milRNA至少一种。
本发明还涉及一种感受态细胞,所述感受态细胞含有如权利要求1所述的milRNA至少一种或含有权利要求2所述的载体。
本发明还提供了一种低丰度milRNAs的体外验证方法,包括以下步骤:
S1:在Foc的基因组DNA中设计引物扩增含有候选milRNA骨架的DNA序列,将所述DNA序列克隆到表达载体上;
S2:构建好的载体转化到农杆菌感受态细胞,进行LB培养,得菌液;
S3:用菌液浸润本生烟叶片,2-3天后取叶片进行对应的小RNA探针杂交检测,判断候选milRNAs发夹序列是否可以加工成为成熟的milRNA。
优选的,所述候选milRNA骨架的DNA序列如SEQ ID NO:310至SEQ ID NO:325任一所示。
优选的,所述真菌为香蕉枯萎菌。
与现有技术相比,本发明的有益效果是:
通过深度测序获得香蕉枯萎菌编码的小RNA及其表达谱,为后续进一步开发、利用小RNA在香蕉枯萎菌中的作用机制提供前期工作铺垫。在此基础上,本发明还提供了一种低丰度milRNAs的体外验证方法,利用本生烟作为替代植物,可以对milRNAs的靶标及其功能进行有效的分析,可以对深度测序的数据进行高通量的分析和验证,克服了目前小RNA研究中的不足,具有广泛的应用前景。
附图说明
图1:小RNA测序结果统计图;
图中,(A)四个小RNA文库中小RNA的长度统计结果;(B)四个小RNA数据库小RNA序列的Venn图;(C)获得的小RNA 5末端碱基偏好性分析结果;(D)四个小RNA数据库中正链、负链来源的小RNA统计;
图2:高丰度milRNAs的同位素32P-ATP标记的反向互补DNA探针杂交结果;
图中,-:孢子;+:菌丝;M:混合样品,*:表示milRNA的伴随链小RNA;
图3:农杆菌浸润本生烟体外瞬时表达分析验证低丰度milRNAs结果;
图中,(A)香蕉枯萎菌Foc中含有21nt、5'-U结构特征候选milRNAs本生烟农杆菌浸润后,对应的32P-ATP标记的DNA探针杂交检测结果;(B)香蕉枯萎菌Foc中其他不同长度、不同5'末端碱基的milRNA本生烟农杆菌浸润后,对应的32P-ATP标记的DNA探针杂交检测结果。
具体实施方式
下面通过具体实施方式结合附图对本发明作进一步详细说明。
本发明实施例中涉及到的主要试剂:
Trizol(TRNzol Reagent,Tiangen,Cat#DP405-02)
PEG 8000沉淀缓冲液:20%(w/v)PEG 8000,1MNaCl。
EDC交联缓冲液(12ml):122.5μl 12.5M 1-甲基咪唑(pH8.0),0.373g 1-乙基-3-(3-二甲基氨基丙基)碳酰二亚胺盐酸盐(EDC)。
miRNANorthern blotting杂交缓冲液:5×SSC,20mM NaHPO4(pH7.2),7%SDS,3×Denhardt`s溶液。
17%dPAGE:尿素12.6g,水1.25ml,10×TBE 1.5ml,Acr/Bis(30%)17ml,在微波炉或者热水中溶解尿素,待冷却后加入240μl 10%AP,混匀后再加入10μl TEMED。
WashingBuffer:2×SSC,0.1%SDS。
1M MES(pH5.6,10ml):称取2.132g MES溶于无菌水中,用KOH调pH至5.6,定容至10ml,过滤除菌,分装到离心管中,-20℃保存。
100mMAS(10ml):称取0.1962gAS溶于DMSO,定容至10ml,分装到1.5ml离心管中,-20℃保存。
实施例1:小RNA测序及生物信息学分析
分别构建Foc1,Foc4的菌丝和孢子的小RNA文库,送北京华大基因测序,测序获得的数据如图1和表1所示。
表1小RNA测序数据一览表
经过生物信息学分析,鉴定得88个具有完整发夹(stem-loop structure)并且两端均产生小RNA的milRNAs,(见表2)此外,有133个预测到发夹结构仅一端产生小RNA的候选milRNAs(candidates)。(见表3)
表2 Foc测序获得的miRNA-likes(milRNAs)一览表
此外,还有133个预测到发夹结构仅一端产生小RNA的候选milRNAs(candidates),如下表3。
表3 Foc候选milRNAs一览表(仅发夹的一端产生小RNA)
实施例2:高丰度milRNAs的杂交检测
1、小RNA的提取:
1.1样品的获取
菌株PDA接种后28℃培养5-7天,用打孔器在PDA平板的边缘打菌饼(直径0.5cm),挑取5-6块菌饼接入装有100mLPDB培养液的250mL三角瓶中,于28℃、180rpm震荡培养5-7d后用三层滤纸过滤,分别获得孢子和菌丝进行后续的小RNA提取。
1.2、Trizol抽提
液氮保护下,将步骤1.1获得的样品研磨成粉后转入离心管,加入等体积的Trizol试剂,充分涡旋后室温放置5-10min。加入1/5体积的氯仿:异戊醇(24:1),涡旋后冰上静置3-5min,待自动分层后离心,12000g、4℃条件下离心10min。
1.3、分级沉淀高分子量RNA
离心后,上清转入新的离心管,然后加入等体积的65℃孵育的PEG8000沉淀缓冲液,颠倒混匀后室温静置直至冷却到室温,然后冰浴30-45min后离心10min沉淀高分子量RNA。
1.4、沉淀小RNA
离心后的上清液加入1/10体积的3M NaAc(pH5.2)和等体积的预冷的异丙醇,-20℃沉淀1-2hr,12000g、4℃离心20min,沉淀用80%的乙醇洗涤1-2次,DEPC水溶解后放入-80℃备用。
2、小RNA的杂交检测:
2.1、17%dPAGE分离
将步骤1提取的小RNA溶入等体积的milRNAs Loadingbuffer(ABI,cat.AM8547),100℃变性5min后,立即冰浴5min使RNA样品完全变性。变性后的milRNAs样品在17%dPAGE上样,0.5×TBE电泳缓冲液,300V电泳3-6h即可。
2.2、转膜及交联
将含有RNA的凝胶切下,先在1×TBE转膜缓冲液中浸润30s,同时准备好NX中性电荷的尼龙膜(Hybond-GE)和转膜滤纸,按照说明进行转膜。从上到下的顺序依次是:滤纸-凝胶-NX尼龙膜-滤纸。赶走气泡后用GE TE77PWR半干转膜仪进行转膜,用400mA转膜1h即可。转完膜后将膜放在EDC交联缓冲液浸润的滤纸上,转膜时接触RNA的一面朝上,避免交联缓冲液浸到RNA上,60℃烘烤2h后,清水冲洗膜上残留的EDC交联缓冲液,-20℃保存备用。
2.3、小RNA杂交
miRNA杂交采用miRNANorthern blotting杂交缓冲液,或者是公司的-Oligohybridizationbuffer(Cat#AM8663)杂交缓冲液。将交联后的膜放入杂交管,接触RNA的一面朝内接触杂交缓冲液,加入采用32P-ATP标记的与小RNA序列反向互补的DNA探针40-42℃先预杂交1hr,然后37℃杂交过夜。
2.4曝光及信号检测
杂交结束后倒掉带有同位素的杂交液,用washingbuffer洗膜2次,每次15-20min。洗完后用monitor检测信号,阳性区域的信号应比膜边缘地方的信号强,并且将信号控制在5μCi以内,如果信号过强,继续洗膜。洗完膜后将膜加载保鲜膜或者拉伸膜上,放在磷屏中曝光30min-3h左右,放入Typoon扫描保存图片。结果见图2。
实施例3:低丰度milRNAs的本生烟体外农杆菌介导的基因瞬时表达
1、本生烟的准备
本生烟种子保存在中国热带农业科学院环境与植物保护研究所实验室中,本生烟(N.benthamiana)于23-25℃,14h光照/10h黑暗(大约75μmol/m2.s)的光周期进行生长,6-8片叶时进行农杆菌浸润。浸润48-72hr后,用剪刀剪除没有被农杆菌菌液浸润的区域,采取后立即冻入液氮,-80℃保存直到使用。
2、候选milRNA表达载体构建
根据生物信息学的预测,在Foc的基因组DNA中设计引物扩增含有候选milRNA骨架的DNA序列,连接到T-vector上测序后与参考基因组序列进行对比,确定扩增的序列不含有编码区和外显子区域,然后通过Xba I-Kpn I或者Xba I-Sac I连接到表达载体pSuper1300(pCambia1300的改良载体)上,酶切验证或者PCR验证序列的正确性。详细信息见表4。
3、农杆菌浸润本生烟
(1)将构建好的克隆用电击转化的方法导入农杆菌感受态细胞,涂布于附加相应抗生素的LB固体平板上,28℃暗培养两天。
(2)待LB平板上长出菌落后挑取单菌落,接种到2ml附加相应抗生素的LB液体培养基中,28℃、250rpm振荡培养24hr。
(3)将2ml菌液接种到20ml附加相应抗生素的LB液体培养基中,加入200μl 1M MES(pH5.6)和8μl 100mMAS,28℃、250rpm振荡培养12hr。
(4)将菌液于4000rpm,离心15min,用10mM MgCl2悬浮菌体沉淀,调节OD600=1.0。
(5)加入100mMAS,所加体积与用MgCl2悬浮后的菌液体积关系为:VAS(μl)=VMgCl2(ml)×2,振荡混匀,室温静置不少于3hr。
(6)植物材料的准备:注射前一天应将植物置于弱光下,并浇足水,使植物更适于注射。
(7)注射时用白色枪头在叶片上扎数个小孔(注意不要将叶片撕裂),然后用去掉针头的一次性2ml注射器吸取菌液,一个手食指抵住叶背小孔处,另一只手用注射器抵住叶面小孔,轻推注射器活塞使菌液沿小孔注入叶片。
(8)注射后将植物置于弱光条件下培养一天,然后放于光下正常培养,2-3天后取样。
4、小RNA的检测:参见实施例2的方法。
植物miRNA的典型结构特征是21nt、5'-U,因此,首先对Foc中具有这两个结构特征的milRNA进行本生烟体外瞬时表达验证,所采用的DNA序列是从Foc基因组DNA上扩增而来,具体的序列信息见表2和表4(表4提供了部分milRNA的骨架序列和引物序列信息)。Foc共有6个符合条件的milRNA,本生烟叶片浸润后的小RNA杂交结果显示Foc具有21nt、5'-U结构特征的6个milRNAs的骨架序列都可以在本生烟中加工表达成为成熟的milRNAs(结果见图3-A)。接下来,发明人针对其他不同长度、不同5'末端碱基的milRNA都进行了本生烟农杆菌浸润体外验证分析(结果见图3-B),结果显示,都可以加工成为成熟的milRNAs。这说明本生烟可以作为真菌milRNA体外加工的替代植物。
表4候选milRNA瞬时表达所用的序列一览表
注:单下划线表示的序列是正向引物序列,波浪线表示的是反向引物序列,双下划线表示的是预测的milRNA的骨架(precursor)序列。
以上内容是结合具体的实施方式对本发明所作的进一步详细说明,不能认定本发明的具体实施只局限于这些说明。对于本发明所属技术领域的普通技术人员来说,在不脱离本发明构思的前提下,还可以做出若干简单推演或替换。
序列表
<110> 中国热带农业科学院环境与植物保护研究所
<120> 香蕉枯萎菌milRNAs及低丰度milRNAs的体外验证方法
<160> 325
<170> SIPOSequenceListing 1.0
<210> 1
<211> 22
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 1
aagagtgtag tttaattggc aa 22
<210> 2
<211> 21
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 2
aacggtagag tgcatttttg a 21
<210> 3
<211> 23
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 3
tggatgaatc aagcgtggta tga 23
<210> 4
<211> 23
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 4
gtatcatgcg tgattcatcc atc 23
<210> 5
<211> 23
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 5
gctactctgg ctgtgacgat ggc 23
<210> 6
<211> 21
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 6
cattgtcctc cagaacggcc c 21
<210> 7
<211> 23
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 7
gaaggagaag ctgtacatga cct 23
<210> 8
<211> 27
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 8
gtcctgtaca acaagacttt ccttcta 27
<210> 9
<211> 22
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 9
gcgcataact ctggtgactc ct 22
<210> 10
<211> 22
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 10
gagcacctct gcttgtgcgc tg 22
<210> 11
<211> 22
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 11
gagcacctct gcttgtgcgc tg 22
<210> 12
<211> 25
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 12
ccgctaccgt cttgaacaca cacgg 25
<210> 13
<211> 23
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 13
ccatcactga ggacaccgag ggt 23
<210> 14
<211> 23
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 14
ctgggagtct tccgctggtg gta 23
<210> 15
<211> 20
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 15
gctgtgttgc ggtggtaggt 20
<210> 16
<211> 21
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 16
ctaccgcatg cacctcggca g 21
<210> 17
<211> 21
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 17
gatggtgtgc gactgaagcc t 21
<210> 18
<211> 23
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 18
cttcttgtca ggataacggg cga 23
<210> 19
<211> 22
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 19
gcggtagcgg agggcatggc ca 22
<210> 20
<211> 21
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 20
gcctgtccaa cccaaccgca g 21
<210> 21
<211> 22
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 21
gcgggttgct gttcggctac ga 22
<210> 22
<211> 21
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 22
cgggctcgtc ggcgccggcc a 21
<210> 23
<211> 23
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 23
acctggaact ctaagaccgg caa 23
<210> 24
<211> 24
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 24
gtcggccacg agggtttcct ggct 24
<210> 25
<211> 21
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 25
accgcatcgt cgagagggac a 21
<210> 26
<211> 22
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 26
gtcccgtctc gcgatcgcgg ta 22
<210> 27
<211> 23
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 27
ggtggctatg aggtgtatga cat 23
<210> 28
<211> 24
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 28
gtcatcacca catccagcca ccga 24
<210> 29
<211> 23
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 29
gaaggacgta catgactgag gct 23
<210> 30
<211> 22
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 30
accgaagcat gtcacccttc aa 22
<210> 31
<211> 22
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 31
gtcgaagagt ggtctagtgg ta 22
<210> 32
<211> 23
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 32
acccactagg ctgctcttcg att 23
<210> 33
<211> 20
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 33
gagggtcaag cgggttatct 20
<210> 34
<211> 20
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 34
ataatcggct gggccctcat 20
<210> 35
<211> 22
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 35
gcgggctggc agattaaggc ca 22
<210> 36
<211> 21
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 36
gcactgatcc cagcaccgcc a 21
<210> 37
<211> 20
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 37
gaactccgaa tctgacgacg 20
<210> 38
<211> 20
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 38
cggtcaggtt cgaagttccc 20
<210> 39
<211> 20
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 39
ggctggtctg tcggttcgca 20
<210> 40
<211> 21
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 40
tggacatcga tgaaccggct a 21
<210> 41
<211> 20
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 41
tgaattgctg agcggcttct 20
<210> 42
<211> 19
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 42
aagctgtcgg cgaattgcc 19
<210> 43
<211> 22
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 43
agggtgggca gagtgcgggg ca 22
<210> 44
<211> 25
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 44
cgcagcaaca tcggcgccat gctta 25
<210> 45
<211> 23
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 45
gcatgcgcgg tcttgttgag cag 23
<210> 46
<211> 23
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 46
gctcaatctc gtcgcgcgtg cct 23
<210> 47
<211> 22
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 47
ggtgacgact cggcggccgc tt 22
<210> 48
<211> 23
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 48
gacggtcccg aatgcgccac cca 23
<210> 49
<211> 21
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 49
gggaagatgc agctcaagcc g 21
<210> 50
<211> 24
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 50
atgcttgcct tgcattcttc ttga 24
<210> 51
<211> 23
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 51
gcatacaagg cgttgggcaa gca 23
<210> 52
<211> 22
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 52
cttcccagcg gctacgatgc ac 22
<210> 53
<211> 20
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 53
gccgagtcgc tgggcctccg 20
<210> 54
<211> 23
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 54
aaggcctcct gtcgactcga ctc 23
<210> 55
<211> 23
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 55
ggcatgcgcg gtcttgttga gca 23
<210> 56
<211> 23
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 56
ctcaatctcg tcgcgcgtgc ctt 23
<210> 57
<211> 22
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 57
ggcgacgatg aggacttggc ct 22
<210> 58
<211> 20
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 58
gccgaattct ggctcgccgt 20
<210> 59
<211> 20
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 59
gcatcattcg acggacccta 20
<210> 60
<211> 21
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 60
gggtccgcga cgaagatgca c 21
<210> 61
<211> 23
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 61
cttgttgtcg tcaggcaagg ata 23
<210> 62
<211> 24
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 62
tccctgtctt ggtgccagca agat 24
<210> 63
<211> 21
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 63
gcagaactcg caggaatgct a 21
<210> 64
<211> 20
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 64
gcatttcccg agttctgcag 20
<210> 65
<211> 23
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 65
gcgagactcc cagatggttc tca 23
<210> 66
<211> 24
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 66
caagccttct gaggtctctc gccc 24
<210> 67
<211> 23
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 67
cctcgttggc cctgggagac gca 23
<210> 68
<211> 24
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 68
cgtcggcagg gaggtgacga ggtt 24
<210> 69
<211> 20
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 69
cgaagagtgg tctagtggta 20
<210> 70
<211> 22
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 70
tcccactagg ccactcttcg tt 22
<210> 71
<211> 21
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 71
gtgctggtct gttcgtcggt t 21
<210> 72
<211> 21
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 72
acgatgagga gacgggcaca a 21
<210> 73
<211> 23
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 73
cctggggtcg ttgcagttcg gtt 23
<210> 74
<211> 23
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 74
ctgaactcaa cgcaccccag gat 23
<210> 75
<211> 20
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 75
cccgggtctt ggggcaggct 20
<210> 76
<211> 22
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 76
cctgccaacc agggcccggg cg 22
<210> 77
<211> 20
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 77
ccggtgcagt ggaggaagtt 20
<210> 78
<211> 20
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 78
cttccacact cacaccggtt 20
<210> 79
<211> 21
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 79
ccgaggtaga cgaggatcag t 21
<210> 80
<211> 22
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 80
tgattctgat cgcgactcgg at 22
<210> 81
<211> 22
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 81
ggcgggaacg cagactctgg ta 22
<210> 82
<211> 24
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 82
ctggacctgc tagttcttcg cctt 24
<210> 83
<211> 21
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 83
gctttagaag cgtcgacaga a 21
<210> 84
<211> 22
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 84
ctgtcaccaa cttcaaaagc cg 22
<210> 85
<211> 23
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 85
cgacgcaatt ggacatagtc aca 23
<210> 86
<211> 24
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 86
tggcctgtcc tacattacgt ccct 24
<210> 87
<211> 21
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 87
ccacattaga gcctgggacg a 21
<210> 88
<211> 21
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 88
gctccaggaa ctcagtggga a 21
<210> 89
<211> 21
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 89
gcgtttccgg atgaggcgac t 21
<210> 90
<211> 21
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 90
tcgtctcact ggatggcgcg g 21
<210> 91
<211> 21
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 91
gcttcggaaa tgtgaagggt a 21
<210> 92
<211> 20
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 92
tccttgcatt ggctgagcat 20
<210> 93
<211> 23
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 93
gcttataggg cgatggttcg gga 23
<210> 94
<211> 22
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 94
ctgaacgtcg ttctacgagc ac 22
<210> 95
<211> 20
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 95
agaggccgag aagactccct 20
<210> 96
<211> 22
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 96
ggagcctatc tacggcccct ct 22
<210> 97
<211> 22
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 97
ccgacgagga tgggggatgt ct 22
<210> 98
<211> 24
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 98
acattttccc tgttgccgtc ggat 24
<210> 99
<211> 21
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 99
tccctacgtc gcgctgggct t 21
<210> 100
<211> 20
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 100
gctcagcgca tggttgggac 20
<210> 101
<211> 23
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 101
acgacttgtt ctgtgccggc gtt 23
<210> 102
<211> 23
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 102
acgccacaag tagaccagtc gta 23
<210> 103
<211> 23
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 103
gggtggaaac ggcatgggca acc 23
<210> 104
<211> 24
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 104
ttgccgacgc cttttctgac tcag 24
<210> 105
<211> 20
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 105
gggagtttga cgaacgtgct 20
<210> 106
<211> 18
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 106
catgtcgtcg actccctc 18
<210> 107
<211> 22
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 107
gaggtctacg gtcaggatat tg 22
<210> 108
<211> 22
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 108
atgtcttgac ccgtcacccc aa 22
<210> 109
<211> 20
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 109
gccaggcttc gttggacctc 20
<210> 110
<211> 23
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 110
ggtatcgacg aagaggatgg caa 23
<210> 111
<211> 23
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 111
gaggcctggt agtcgaggca cct 23
<210> 112
<211> 27
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 112
cgtgctcgtt ggctgctttt gtctcag 27
<210> 113
<211> 23
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 113
gcaacaagat ggctgttctg gct 23
<210> 114
<211> 22
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 114
ctaggcaggg catctgttgc gc 22
<210> 115
<211> 22
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 115
ccaggagttc atgaagggca tt 22
<210> 116
<211> 21
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 116
ggctctcttg aacttttggg a 21
<210> 117
<211> 21
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 117
gcttgaggag cgattgagac t 21
<210> 118
<211> 23
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 118
tctcccatct cctcctcaag cct 23
<210> 119
<211> 21
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 119
gctcacggac acagatgcac a 21
<210> 120
<211> 19
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 120
gcactgtttt cgagggcac 19
<210> 121
<211> 23
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 121
gtggctggaa cttgaggtgg cta 23
<210> 122
<211> 23
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 122
gccaacgtca agacccgcct cac 23
<210> 123
<211> 20
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 123
gcgaggacgc gcagctgctt 20
<210> 124
<211> 22
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 124
gccgctgaag ttgtccttgc tg 22
<210> 125
<211> 23
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 125
tgaggtcact ggctccaacg tcg 23
<210> 126
<211> 23
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 126
gctctgacca cgtcgacctc aac 23
<210> 127
<211> 22
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 127
ggatatgtat cgctctccgg ct 22
<210> 128
<211> 23
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 128
gccagtcgaa cgatgcaatc ctt 23
<210> 129
<211> 21
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 129
gccctcctgg agtcgttggc c 21
<210> 130
<211> 21
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 130
ccgttgacct ctggagggcc t 21
<210> 131
<211> 23
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 131
gattgggtta cggatttcag cga 23
<210> 132
<211> 21
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 132
gctgcatctg catctgatcc t 21
<210> 133
<211> 21
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 133
ggagaagcgc caggctctga t 21
<210> 134
<211> 21
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 134
cagattcccg gtcctctcca g 21
<210> 135
<211> 23
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 135
cccgaggtcg ctaaggagaa gtt 23
<210> 136
<211> 23
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 136
ctcctccacc gtgatctcgg tcc 23
<210> 137
<211> 20
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 137
ggttatctgg tcgcctggtt 20
<210> 138
<211> 20
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 138
cctggcgacg atgagaccaa 20
<210> 139
<211> 23
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 139
atgacatcgg cgagcaccag cat 23
<210> 140
<211> 24
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 140
gctgggagtt cggtgatctc aacg 24
<210> 141
<211> 20
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 141
gcgggatatg gcatcgatta 20
<210> 142
<211> 20
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 142
atcgtggcat actctcgtca 20
<210> 143
<211> 20
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 143
aggccttgta gatggtgtca 20
<210> 144
<211> 24
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 144
gctgctgttg agtgcgaggc cgag 24
<210> 145
<211> 23
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 145
acggctacca taggatagga tct 23
<210> 146
<211> 21
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 146
catcgtccat ggaagccgga a 21
<210> 147
<211> 23
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 147
ctctgtcgca gtagcacgag cta 23
<210> 148
<211> 21
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 148
gctttgtgtc tgtgcaggga t 21
<210> 149
<211> 21
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 149
gagaagttcg agcgcctgtc a 21
<210> 150
<211> 23
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 150
atgggacgtg gcgaacttct caa 23
<210> 151
<211> 20
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 151
gttcattctt cagtcggaca 20
<210> 152
<211> 21
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 152
tattgcactg aagatggact t 21
<210> 153
<211> 20
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 153
ccaggagttc atgaagggca 20
<210> 154
<211> 19
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 154
ctctcttgaa cttttggga 19
<210> 155
<211> 22
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 155
cgagtgggct ggcgatgcag gt 22
<210> 156
<211> 21
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 156
ctggatcgta gcctgttcga t 21
<210> 157
<211> 21
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 157
tcgacaagtg gttccttcgc a 21
<210> 158
<211> 20
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 158
cgagggatac actgtcgaca 20
<210> 159
<211> 20
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 159
gcttcggaaa tgtgaagggt 20
<210> 160
<211> 19
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 160
ccttgcattg gctgagcat 19
<210> 161
<211> 20
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 161
gcagctcgat gactggctta 20
<210> 162
<211> 24
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 162
agctggttct ctgtcgggct gcgc 24
<210> 163
<211> 23
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 163
gcgtgaggct gtcggtattt tcg 23
<210> 164
<211> 27
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 164
aagttcccag cagcatgact catgccg 27
<210> 165
<211> 23
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 165
ccagggtatg gatcgttgcg ctc 23
<210> 166
<211> 22
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 166
ccgcaacgat accaacctgg ag 22
<210> 167
<211> 22
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 167
gcagatgatg acgatatggg cg 22
<210> 168
<211> 23
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 168
cccattactg tcattttctg caa 23
<210> 169
<211> 20
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 169
gcagaacgga cgggaggcaa 20
<210> 170
<211> 20
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 170
gtttctcgtc tgatctgctc 20
<210> 171
<211> 21
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 171
gctatcaaga aggcccggac a 21
<210> 172
<211> 22
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 172
ttcggcgcca acttgacagc aa 22
<210> 173
<211> 23
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 173
ctcgtcaaac tcgaacaggg acg 23
<210> 174
<211> 22
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 174
ccttggtcgg cttgggcgag ac 22
<210> 175
<211> 20
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 175
cggtcaaccg gagtctggga 20
<210> 176
<211> 20
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 176
ccagattctc gttgactcta 20
<210> 177
<211> 22
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 177
ggtgagatgg ccgagttggt ta 22
<210> 178
<211> 21
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 178
tgcactgtat gtcttggtat g 21
<210> 179
<211> 21
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 179
gcgaggagtg gtgtagtggg a 21
<210> 180
<211> 20
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 180
gtcgtagagc aatgacggaa 20
<210> 181
<211> 22
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 181
atcggagaat ggtgtagtgg ta 22
<210> 182
<211> 22
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 182
ggggttcggg caacggtgaa cc 22
<210> 183
<211> 21
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 183
gcgacagaag aaagaacggg a 21
<210> 184
<211> 23
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 184
ggcgagatgg gctgctggct ggt 23
<210> 185
<211> 21
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 185
gcaggagcag gagcaggagc a 21
<210> 186
<211> 22
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 186
gacggatcgg gtcgccttgg ac 22
<210> 187
<211> 21
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 187
tcggtagtag ttggcaaatc c 21
<210> 188
<211> 23
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 188
gggatattct cggtagtagg cca 23
<210> 189
<211> 21
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 189
tcgggctggg ctgggacggg a 21
<210> 190
<211> 21
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 190
gctgttgtgt tgtggtacgg a 21
<210> 191
<211> 22
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 191
ggaaggacag aaggatcgtc at 22
<210> 192
<211> 23
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 192
gacggacttt tcaccaaagg gca 23
<210> 193
<211> 22
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 193
gcagaggtgg ctattctggg ct 22
<210> 194
<211> 23
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 194
gggtagagct ctttcgtggc gta 23
<210> 195
<211> 20
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 195
atgggtaggg agtttgggcg 20
<210> 196
<211> 21
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 196
acgggcttac cttgcggctg t 21
<210> 197
<211> 21
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 197
gagcttcaag ctactcggac a 21
<210> 198
<211> 23
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 198
ggcgatgtcc aaactgcggc cta 23
<210> 199
<211> 20
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 199
gcgcgtcgga tgggaggcgt 20
<210> 200
<211> 21
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 200
gagaagaggg tgtggagggg c 21
<210> 201
<211> 22
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 201
aggatgaggg atgcggaggg cc 22
<210> 202
<211> 23
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 202
gctgaaggtg aacctgcgcg gta 23
<210> 203
<211> 22
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 203
ggatgatcaa gttgggagag ca 22
<210> 204
<211> 22
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 204
gatgggattc agaggatggg ca 22
<210> 205
<211> 20
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 205
tggacggctt ccgtagctca 20
<210> 206
<211> 20
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 206
tatgaatgta gtccggtcga 20
<210> 207
<211> 23
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 207
tagggggtgg ttggtttcgt tta 23
<210> 208
<211> 23
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 208
gctgggattt agtggcatgg cga 23
<210> 209
<211> 21
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 209
cgaagggtga gtggtgcagt g 21
<210> 210
<211> 21
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 210
tggcggaaag attgggggcc a 21
<210> 211
<211> 23
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 211
ccatacaaca ccgggcgcag aca 23
<210> 212
<211> 20
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 212
agggcagagg gaggagggga 20
<210> 213
<211> 21
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 213
gaggattgag gagggggaag a 21
<210> 214
<211> 22
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 214
gggcactggt tgatgaagat gt 22
<210> 215
<211> 22
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 215
ggttcaggaa gaagagttgg gt 22
<210> 216
<211> 21
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 216
ccgaagagtg gtgtagcggt a 21
<210> 217
<211> 21
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 217
agagggccgt gtatcgtgtt a 21
<210> 218
<211> 22
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 218
gcttagggtg ttgagttggc ga 22
<210> 219
<211> 23
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 219
cgggcttggg atgggatgct tca 23
<210> 220
<211> 20
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 220
gaaggtgcgg gattggacct 20
<210> 221
<211> 20
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 221
tctgaaaggg ccggatctga 20
<210> 222
<211> 20
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 222
cgaggttcgg aagctcgcag 20
<210> 223
<211> 21
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 223
aggtcaccaa ggagagggac a 21
<210> 224
<211> 22
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 224
gcgccaggaa tatgaacagg ca 22
<210> 225
<211> 21
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 225
tcatgggaga caagctgggt a 21
<210> 226
<211> 22
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 226
agacgagtgg agcagcgaag cg 22
<210> 227
<211> 20
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 227
tgggagatga aggaagacta 20
<210> 228
<211> 22
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 228
gcatcgacca gtcgaaccag ct 22
<210> 229
<211> 23
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 229
ggaacctcct cgattgtcgg cta 23
<210> 230
<211> 21
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 230
gcaaggaaag gtggcggaac a 21
<210> 231
<211> 23
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 231
ggggatactg gcagactggc tct 23
<210> 232
<211> 22
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 232
gcagatgatg aggctactga ag 22
<210> 233
<211> 21
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 233
cctgaagttg agggggaacc a 21
<210> 234
<211> 21
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 234
gagtggtcgg ctgggagggc a 21
<210> 235
<211> 20
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 235
cctgaagttg agggggaacc 20
<210> 236
<211> 23
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 236
acctgtgttt gagatgagcg gcg 23
<210> 237
<211> 20
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 237
ggggcgctgg cgcaatggca 20
<210> 238
<211> 20
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 238
gcaaaggacg tgactgccaa 20
<210> 239
<211> 21
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 239
tggatggtat aagcgggtgt t 21
<210> 240
<211> 21
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 240
gcagacgagg gcactgaggc t 21
<210> 241
<211> 23
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 241
agcaagctgt gatgatgatg att 23
<210> 242
<211> 23
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 242
ggaaggacag aaggatcgtc atg 23
<210> 243
<211> 23
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 243
gtggcggact taccacggag act 23
<210> 244
<211> 21
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 244
gcaaggattc agaggcagac a 21
<210> 245
<211> 21
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 245
gaacacatgg cgagtgggac a 21
<210> 246
<211> 21
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 246
gcgaggacaa aggatggcct a 21
<210> 247
<211> 22
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 247
cccaagaaag cagcttggcg ca 22
<210> 248
<211> 20
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 248
cgattccgaa ccagagcacg 20
<210> 249
<211> 20
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 249
tgatttgagt cgtgcggaga 20
<210> 250
<211> 23
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 250
tggagttggg aaaatggcgc aca 23
<210> 251
<211> 21
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 251
gctttatttg acggctgtat g 21
<210> 252
<211> 22
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 252
gaagaacact atgagcggcc ca 22
<210> 253
<211> 21
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 253
agtgacagtt gggtggcatt a 21
<210> 254
<211> 21
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 254
gtcaatcgaa gtcgggcgtt a 21
<210> 255
<211> 20
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 255
taagcttgct tagttggcca 20
<210> 256
<211> 20
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 256
tcgagcggca gaattggata 20
<210> 257
<211> 23
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 257
ccgatgaacc ggatctatgg aca 23
<210> 258
<211> 20
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 258
ccgccctggg tcgatcggtg 20
<210> 259
<211> 23
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 259
gcgagactga cgggcgcggt tgt 23
<210> 260
<211> 23
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 260
gatcaagatt gacagcaagc tct 23
<210> 261
<211> 20
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 261
gaaaacaaca tcggcggaca 20
<210> 262
<211> 21
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 262
cggtcgcgag aaggatggca t 21
<210> 263
<211> 23
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 263
tcgagaagaa ggttgaggag tct 23
<210> 264
<211> 23
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 264
ggaagttggc gtcgtcaaga gca 23
<210> 265
<211> 22
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 265
gcatcgagat tgtgcatggc ca 22
<210> 266
<211> 22
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 266
ctcgagacgg cgggaaagca tg 22
<210> 267
<211> 21
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 267
tgctggtagc gatgaagacg a 21
<210> 268
<211> 21
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 268
gcccgagatc gaagaagccc a 21
<210> 269
<211> 23
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 269
tggctggcag ctctgcgagg cat 23
<210> 270
<211> 23
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 270
gacgatctgt tctacggcac ctg 23
<210> 271
<211> 21
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 271
ggtacgagtg tggagttggc a 21
<210> 272
<211> 22
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 272
gacgagatga agctgcgaac tg 22
<210> 273
<211> 20
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 273
ggcgcgggac tgaagcgaca 20
<210> 274
<211> 20
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 274
gatggaatgt agtggcatca 20
<210> 275
<211> 22
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 275
ggaggagttg taatgagcgg tt 22
<210> 276
<211> 21
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 276
ggcgaggact tcggaacggc a 21
<210> 277
<211> 21
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 277
agaaagaagt catgagttcc a 21
<210> 278
<211> 21
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 278
gagactgtct ctgggtatca t 21
<210> 279
<211> 20
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 279
cgaagagtgg tacagtggta 20
<210> 280
<211> 22
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 280
cggaagcgcg ggaacaacag ca 22
<210> 281
<211> 21
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 281
gcagtgtgat ggattctgtg a 21
<210> 282
<211> 23
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 282
ggcatggttg aggcccaaga aca 23
<210> 283
<211> 22
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 283
gcgaggtagg gaggaggagg ta 22
<210> 284
<211> 21
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 284
tgtgtggggc ggctgtgact a 21
<210> 285
<211> 21
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 285
cgagctcgga tgaggccgtc a 21
<210> 286
<211> 22
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 286
gggcagagag aactactcgg ta 22
<210> 287
<211> 21
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 287
gggacgacgg tggactgctc a 21
<210> 288
<211> 20
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 288
gggatattga gaatgcggtt 20
<210> 289
<211> 21
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 289
gaagagggtt tcgggcggag t 21
<210> 290
<211> 22
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 290
ggcgactact ctcaaggacc cc 22
<210> 291
<211> 21
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 291
ggaagagcgt gagagagtgc a 21
<210> 292
<211> 21
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 292
tctgaggggc tggagtggac a 21
<210> 293
<211> 22
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 293
cctagtagag catgcgctgt gt 22
<210> 294
<211> 22
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 294
gcacctaccg agaacatgca ca 22
<210> 295
<211> 23
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 295
gtaggacttc cgagacgaat tca 23
<210> 296
<211> 22
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 296
gtggacaaag agagggccgg tt 22
<210> 297
<211> 23
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 297
agtggtacgt cgatggtgct tca 23
<210> 298
<211> 22
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 298
gcggaagtag agttggcagt gt 22
<210> 299
<211> 23
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 299
agagataagg ctggccaggg tgt 23
<210> 300
<211> 21
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 300
ggcgtcggct tgcgttggga a 21
<210> 301
<211> 22
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 301
gtacataacg gagggaatgg ca 22
<210> 302
<211> 23
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 302
gacagtaagt gtcgttggtg ctg 23
<210> 303
<211> 21
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 303
gcatcggtga gctggagcat a 21
<210> 304
<211> 21
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 304
gcagatctaa taccggacaa c 21
<210> 305
<211> 21
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 305
ggaaaggccc gacgtggaac a 21
<210> 306
<211> 22
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 306
ggggaaccaa tcaactcgat ct 22
<210> 307
<211> 23
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 307
gaggatatag aactcgatga cgt 23
<210> 308
<211> 22
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 308
ggcatacctt tgctgagcgt cg 22
<210> 309
<211> 20
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 309
gccgggcgtg tttatggtat 20
<210> 310
<211> 581
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 310
gataaggccc tcgacacgta caaccaagca caacatgttg caacttgggc aagttcatga 60
accagaccag gcgaatgtgg ttactgacac tcgagcaaca gacgtcgagc tgccgattga 120
gcaggctaac agacgccgat ctgtcgattg agcaaggcgc ccgaatacat cactcgacat 180
tctgccactt gcccattgct tcatcttgca tcggcccttg actggcgatg cgacgtacac 240
gaaaccaaca aggactggaa caaacggcca atatccttcc ataccatcca tccacgactg 300
tcctgtacaa caagactttc cttctacctt gtatctataa gggaggaagg agaagctgta 360
catgaccttt tcggcctgta caacgtgtcc ttctccgcgc cgatgtcaag ctcaacatgg 420
aactgcacga ttgtatgacg agagatgtcc aacaaccacg agatcaatga gtgtgcacat 480
tgtgatggtg tatacccagt cagctagcgg gttcacctca actcatgtgt gcgagctgtt 540
gtccccttgt tccaatgtat cgcttctgtc gaaggtcttg c 581
<210> 311
<211> 592
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 311
gaccaccgac caagctttta cacccaattt actttttcca gccatgtctt atcaaacggc 60
tgttactacc gaggctcagg ccggcacaat tccactgcga caccccgata ccatgactga 120
tcgaccgccg cctcctcccc cggtgccctc ttccgatcct catttgatcg ccgacgaccc 180
ctccgcaccg aaaacctctg ccgatcatgg cctcttcgag atgtcaccag cagaagcact 240
cgctctgctg agcgctggcg tcgagcttct tgtcaggata acgggcgatg tacctccgac 300
accaccgcca aaatctccta ccgtgccgca catgagtggc atgcaagccg agaaggagaa 360
tattgtgcga tcatactctg ataagaatct ggcgaaattg aggaaacagg ctgagcttga 420
ggctaagaga ttggctgcca aagataagcc tgagcctgtg catgacaatc aaccagagtc 480
ggggaatatt gatggtgtgc gactgaagcc tcacccaggt ctcatgtcgc cgccacctca 540
atcagagcct tatgttgtcg tgggagccga ttctcagcct gtcaatttgc aa 592
<210> 312
<211> 401
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 312
agctgaagca ccgcatctat agcatctctt ctgcccttca gctctgacat actcaagaaa 60
catcgccgtc tcttcgtccc taggacactt gctcgcaaag tgccacctgc cattacaggc 120
gacacaaact ttagtgttgc accgatcaca acgagcagct ttgcgtcccg tctcgcgatc 180
gcggtaaata tcagctggtc gaatccattc accgcatcgt cgagagggac aatagagcct 240
gttcctgagg gagtactcga caaacttctt gttccatatt cttttgaacg tagaatcaaa 300
aagcttgtca acatgctcca gaccaatgtg ggcatcggtg cagcatgttg gcggcatatg 360
ttcagcttcc gtcattgatt gcttgaaccg cctcttcaga c 401
<210> 313
<211> 511
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 313
tgtgccccaa tatcctcttc ctcaaattgc cccaacacca gtgactcctc acggactccc 60
tgtatcgggc agcctcgctt cttacagtgt gactcgaggc cagcccggtc ctatcaacca 120
catgtctcgc cagactcaca ctggtggcta tgaggtgtat gacatacaag gtcatcacca 180
catccagcca ccgaacaaca acggcatgtt atatgagacc ggtagcacgc gcgaaatggg 240
ctaccatggg cgcatgtact gagaactcat cgttcgtatc atgagacgga gctaccgcac 300
aacttgaata tgactcggca gcgtcacgca tttcatttca ccaaatttta taacagtact 360
accatacggg aggcacaaca gcggttttat ttttaagaaa gaaaaaagca gaatttacag 420
aagcgcgggt gttttaaaag gagttgaaaa attggactct tctagaggcc acaacgaagc 480
ggttgatttt ctttgggtgg ttgtctgaac a 511
<210> 314
<211> 404
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 314
aatcccgaga ctcgttcagt tctccaagct ctccgcgatc tcgcctacca actaagcgag 60
agcgatccct tttacgccaa gcagcttctc aagaatcttc gtagcattga tgagatccgc 120
accatcccca gtgcttatcg aaaactcttc gtacaaccgt tccagcaaga agagcaacag 180
aaggcgattt acatcttcct cgatggtatc gatgaggcgg attctgctga agtcgaggaa 240
ctactccagc aaatgggctc agatgatgag tctgacaaga gaccgaagca tgtcaccctt 300
caagttgctc ttattggaag gacgtacatg actgaggctg ttacgtatac ccttgatcca 360
ggaaaccgag gaactcaagt catcacaaca cttcacgtca cacc 404
<210> 315
<211> 496
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 315
ctcttcaact tcctccctgc taccgccgct aagggagcca agttcaacct ccactttaag 60
caacccggtt tccacggccg tgccttcttc gatctcctga agggccctgt tgccaatgtc 120
gacgccgttg tcggccacga gggtttcctg gctggtgcct ccgctggcta tgatgctaac 180
aaggctgctc tgaccgccta cagcgctgct gttggctacg ctgctcccca gtacagcgct 240
gccatcaccg cctctgacaa cctcagcgtc ttcgctgcct cttactacca caaggtcaac 300
tcacaggtcg aggctggtgc caaggctacc tggaactcta agaccggcaa cgctgtcggc 360
cttgaggttg ccagcaagta ccgcatcgac cctgtctctt tcaccaaggt tcgtacaatc 420
aaattcggga tgctgtggaa atgcgtgact gactcgtgct ccaaaatata ggtcaagatc 480
aacgaccgtg gtattg 496
<210> 316
<211> 429
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 316
ggccatagac gtgagttgtg ttttttttgt caattatcat gctgctttgc tgggttttgt 60
tcgcgcgctc atgcgtcctc atcacgttgg cgttttcaaa acaaagttta gctacaacac 120
ctaccacgcg catgcttttg ctggtccctg ttctaacaca tggaatccct acagtctcct 180
cgtctaagat ttctcgtgcc gaagatgatg ctctggatca gccagtgccc aagcaggctg 240
ctaagatggc tggtctgtcg gttcgcaatg gtcctcttga agacgcaatg gacatcgatg 300
aaccggctac caacggagct agcaaacgta aatcgcgtac ctctatcagc aaggtcaact 360
acaaggacga tgagtctagt gatgatgctg cccctctggt tcgtattcat gacacaggaa 420
aacccttcc 429
<210> 317
<211> 667
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 317
ccaggagagt atcgggaaaa cgaagagagg gttggtgaga cgaattaatg gatcaacatc 60
atctaatgac cacatcgagg gatgccacga aacgggcgca tagttatatt tcccactttt 120
tctttttgag atcacggagg cagcaggatg ggagatggat ggtaatggag ttcaactggg 180
agtggttgga cctcactgtc gcttttgtat caaacatgcc ggcgttccga gggagtccga 240
actatacgga ctaatatctg ctgtgttgcg gtggtaggtt gccgagtcgg acaacataca 300
gccatacaat cacatgcgtg tacgaatcgt gcacacatgc atatggttgg cttgtcgtgt 360
caacattggg agccaagaga gcttcattca aatgaggcag tcgaaatgtc tttcgacgaa 420
ctcgtcaagc cattttggaa aagggggttc ctcacttata tgtgcaacac tctcgctggc 480
ctcaaatcaa cctaccgcat gcacctcggc agtacaccat ctccctcggg ccatgtattc 540
aagcacctat atcttcttgt acaatcacgc ttgccactat ctatttcgaa cacacttaat 600
aatactacca ccttgacgct cgctacctct accccccgac ccgcgtgcta ttcacactcc 660
tagcccc 667
<210> 318
<211> 391
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 318
agaccttcat tgggtttcct gcataccctt tcaactattg gacctttttt tcttggtttc 60
atttcttgga gttatacgta tatgccctca agaagatctt gagatgagga gttgccaaat 120
tcttttcatc agcatcaggc tctggtcagg ggtgggcggt cctggaggtt tggcgtgttt 180
atttgcattt acgatgatct gttatgtttg ggaggcctgt ccaacccaac cgcagcaatc 240
tgtttgcggt agcggagggc atggccaccg atttgctctc gcatatgtgt ggtcaatggt 300
gtgatgggat tgaagatatg tttattatac gacggcctca cttaaacttg tcaaaggggc 360
caatcagggg gggtacgaat agatgcatcg a 391
<210> 319
<211> 451
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 319
cagcaccaaa ggtattccgt acccagtgcg aggtctagca ctataacggc cgggctagaa 60
ggtcgaccag tggccagtcc catccaaata ttacccacac ggaaccgccc aatgtccccc 120
cgttgatctt ctcaaccctt caacctccac caaaatctcg ccgacccgga gcctttcgct 180
cttgatacct ctgaccctgg attgacgact tcaacacccg acaccatggc cattgccatg 240
ggctggcaga aacccgacaa tgtcgcgggc tcgtcggcgc cggccatcat ggtcggtctc 300
ttcgttgcct ctggcgggtt gctgttcggc tacgatactg ggtaagactg accaccattt 360
tcttttgact ttggatgcct ttggatatgg atggatcacg acatacgatg ctcgaagtcg 420
ccacaccaac gatgttgttc atgaggaggg a 451
<210> 320
<211> 362
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 320
atcgtcactg ttccccttac ctacacactc cttcgcccga accgcgacca agatgcgctt 60
gcgccacgga tcaagaccaa ctacaagtca gagcatgcgg ctactgtcga gtcgctcaag 120
tcagcacaga agcgtagcca atggagggtc aagcgggtta tctttgtgat aatcggctgg 180
gccctcatgg ctggcatggc ctacctgatt atggtcaccc agcgaactgt ccccaagctt 240
tggaaccctt acgatattct aggtatctcg gaggtaagct tcgcgacggc tatatcgtgc 300
tgaaatgaca ttgctgacac aatcgctgct agtctctcaa tgagaagcaa atcaagtcgc 360
ac 362
<210> 321
<211> 349
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 321
atttggccag gagtcagaac tacgcgcaag ggacccaagg gaagctccga aggaagcgcc 60
ccgaagaaaa cgctcgcaac caataatcag agcggtcagg ttcgaagttc ccccgaaacc 120
agcacctgtg gagcagaact ccgaatctga cgacgatgat gatatggccg actatttcga 180
catggagatt gggaagaccg aggctgaact aagtaaactg gagaagccga agttaccaac 240
tcaagtcatg gcccggtttg cagctctgtc tcacggctca atggtcaaga taatcggaga 300
aggggaggga ctgctcaaaa tggtgaaaaa actaccggag gcagtgaat 349
<210> 322
<211> 770
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 322
ctaattagga ggggcacttc gctccacagg aattagtggg ggtggctagg ctacagtaat 60
gctatgagct attaaggctg cgctagttaa aggttaaata aaaaaaatac agagcttctg 120
cctttctgca aaagcagtaa acctgtaaga aaaattagtt caatggtaga gcgattgttt 180
tacacacaat aagttgaagg ttcaaatcct tcatttttca gtattaaggg ttggtttatt 240
aagagctagt agctcggagt gctaattttc tagctagcat atttttccct agcgctagcg 300
aggtttatag ccgcctcata gccttaaaaa ataagctcta tataagattc cttaacttaa 360
acggtagagt gcatttttga taagaatgat atcagcgttc gattcgctga ggaattaaag 420
agaattggcc gagtggttta aggcggtaag cttgagtctt attaggttat attctagcca 480
catccgttca aatcggatat tctctgaaga gtgtagttta attggcaaaa taggaagctt 540
caaccttcaa attcttggtt caagtccaag tactcttgtt tttttttacg gattagggcc 600
ggcttgggta ggcacttcgt ttgggacgaa gactagttat gttcgaatca taataatccg 660
attaatttta gaagtattag agataaaaag atagataaat gaatatttct gctacaaaca 720
cattcctgca ctagctagta ctagctagtg ctaggtgagc cgataaggaa 770
<210> 323
<211> 420
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 323
ttagtagttg ggtcggtgac gaccagcgaa tccccgctgt tgtatgtttt tgccaaactt 60
caatctacct ttatatcgta tcatgcgtga ttcatccatc gcaaggcgac ataaccaccc 120
tttgttcctg gcgcatagcg atggatgaat caagcgtggt atgatgtaaa ggttgattga 180
agctttttta ggtgtgttga attatttgtt tttggttact gccctgggga ggtggcggtt 240
ggaaactgag gtgaggcgtt gttgttttgg tgttgattga atcttcttgc aggttgaggt 300
tgcaaggctt gacagcaatc tgagttttga taggatgctg ccattgtgca tccaattggc 360
agagagtcgg aaagcttatt ataacctcgt ttatcaattg caatttggag acacgttagg 420
<210> 324
<211> 621
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 324
atcagcctcc ctggtctgta tcacatcact ggaagctttg gggctattcg tggatcgaac 60
gaatggattg gatggttctg tacctgcaaa ctccccccca gtcagccccg tgcctagctc 120
cccgtaaagg ccccgtagct ccagcgcgag caatgtcgct ttatccttgg cgttttaagg 180
gtacctcgac aaggtatccg tatccttcca gcccatccaa tgcatcaatg aatccttgca 240
gcaccccaac taattcgagc tagcagaaac ggggagagag ccacaggcag aacgacctga 300
tcctgtgcta gcttggttgt gcctgttagg gaccttgcac aagagcagaa gcattgattg 360
aatctcgggc tgggctggga cgggagtgac ctaaggtaca gcacagtaca ggggcggtag 420
aggtggagga gggaggtacg tacccactca tcaccgcccc gactggaacc ttgaatttca 480
tctttctttt gcatcttcac ttacctttcc tcggacaaac cccataaaca acatcgaata 540
atccagcctc tccttcgaga ataggttggc ttcccgggac cctgctgact gctgtcttga 600
attacgcctc acatcgtcaa c 621
<210> 325
<211> 1085
<212> DNA/RNA
<213> 香蕉枯萎菌(Fusarium oxysporum)
<400> 325
taacgtctgg tagaggagga ttccacgctt gatgtattga tcaagaagag tatccctctt 60
gatccccacg gccgcgcaaa agttctcgaa acgacacctg atctcgcgac tgcgcataaa 120
gaagctgcta cacaaggcga cacacccgcg cccgctgcag aagacgacgt ggagctacac 180
tacgtatgct tcgccaaggg cacagacggt ggattgtggg aactcgacgg acggcgaaaa 240
ggacctatcc gacgaggcga tctggaggat aacgaggatg tgctgagtcc aaagggcctg 300
gcgctggggg cgttgaagtt tttggagagg gagggtaagg atttgaggtt tagtgctgtt 360
gcgcttgctg ggtctatgga ttaggattga tacccaaggc tggagcatgg tggactagat 420
ttgcatggaa atgaatagta tagttcaatc ctctcacgaa gactgtaaag cattacctcg 480
ttgccgaact agaatctgag gggctggagt ggacacttag cgtagttatt ttgagaagct 540
gaagagcaag gcagattctt gaagccacgt ctaatctcag ctccccactt caaggcagcg 600
actttgaata acatataaaa gagcctgtta tttctgtttc tgcttaatct tcaactcaat 660
tcaatcctca ataatcatgc gtaagtttta ttgtaagcag tggtcgtttc aatgctaatg 720
tcccaggcat cgctcgttgg ctcttgggcg gaggccgcga acatgtcggc ctcgttctag 780
gcaatgacgc atccggtaaa acaacatttc tatacagact caagtttaat gaagctgtgc 840
aggcccttcc gacaattggc ttcaatgtcg agactataga ctgtcctgat ggagagaaag 900
ttaccctctg ggacgttgga ggtaagctat cctctgtagc ccacgatctc agctaacaat 960
ctaggctgtg atgccattcg tcctctcata cgacactaca tggcccaaga tcgcttccta 1020
gtattcattc aaagctgcac cgacgcagat cctgatcgtg ttgagttctc gcttgagtat 1080
ctccg 1085
Claims (3)
1.香蕉枯萎菌milRNAs,其特征在于,所述香蕉枯萎菌milRNAs的基因序列如SEQ IDNO:1所示。
2.一种载体,其特征在于,所述载体含有权利要求1所述的milRNA。
3.一种感受态细胞,其特征在于,所述感受态细胞含有如权利要求1所述的milRNA或含有权利要求2所述的载体。
Priority Applications (6)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
CN201811630144.XA CN109576270A (zh) | 2018-03-02 | 2018-03-02 | 一种香蕉枯萎菌milRNA |
CN201811630152.4A CN109576271A (zh) | 2018-03-02 | 2018-03-02 | 一种香蕉枯萎菌milRNA |
CN201810175831.0A CN108410871B (zh) | 2018-03-02 | 2018-03-02 | 香蕉枯萎菌milRNAs及低丰度milRNAs的体外验证方法 |
CN201811630164.7A CN109504681A (zh) | 2018-03-02 | 2018-03-02 | 一种香蕉枯萎菌milRNA |
CN201811630268.8A CN109554367A (zh) | 2018-03-02 | 2018-03-02 | 一种香蕉枯萎菌milRNA |
CN201811630270.5A CN109679988B (zh) | 2018-03-02 | 2018-03-02 | 一种香蕉枯萎菌低丰度milRNAs的体外验证方法 |
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
CN201810175831.0A CN108410871B (zh) | 2018-03-02 | 2018-03-02 | 香蕉枯萎菌milRNAs及低丰度milRNAs的体外验证方法 |
Related Child Applications (5)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
CN201811630164.7A Division CN109504681A (zh) | 2018-03-02 | 2018-03-02 | 一种香蕉枯萎菌milRNA |
CN201811630268.8A Division CN109554367A (zh) | 2018-03-02 | 2018-03-02 | 一种香蕉枯萎菌milRNA |
CN201811630144.XA Division CN109576270A (zh) | 2018-03-02 | 2018-03-02 | 一种香蕉枯萎菌milRNA |
CN201811630270.5A Division CN109679988B (zh) | 2018-03-02 | 2018-03-02 | 一种香蕉枯萎菌低丰度milRNAs的体外验证方法 |
CN201811630152.4A Division CN109576271A (zh) | 2018-03-02 | 2018-03-02 | 一种香蕉枯萎菌milRNA |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
CN108410871A CN108410871A (zh) | 2018-08-17 |
CN108410871B true CN108410871B (zh) | 2019-03-01 |
Family
ID=63129590
Family Applications (6)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
CN201811630164.7A Pending CN109504681A (zh) | 2018-03-02 | 2018-03-02 | 一种香蕉枯萎菌milRNA |
CN201811630270.5A Active CN109679988B (zh) | 2018-03-02 | 2018-03-02 | 一种香蕉枯萎菌低丰度milRNAs的体外验证方法 |
CN201811630152.4A Pending CN109576271A (zh) | 2018-03-02 | 2018-03-02 | 一种香蕉枯萎菌milRNA |
CN201810175831.0A Active CN108410871B (zh) | 2018-03-02 | 2018-03-02 | 香蕉枯萎菌milRNAs及低丰度milRNAs的体外验证方法 |
CN201811630144.XA Pending CN109576270A (zh) | 2018-03-02 | 2018-03-02 | 一种香蕉枯萎菌milRNA |
CN201811630268.8A Pending CN109554367A (zh) | 2018-03-02 | 2018-03-02 | 一种香蕉枯萎菌milRNA |
Family Applications Before (3)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
CN201811630164.7A Pending CN109504681A (zh) | 2018-03-02 | 2018-03-02 | 一种香蕉枯萎菌milRNA |
CN201811630270.5A Active CN109679988B (zh) | 2018-03-02 | 2018-03-02 | 一种香蕉枯萎菌低丰度milRNAs的体外验证方法 |
CN201811630152.4A Pending CN109576271A (zh) | 2018-03-02 | 2018-03-02 | 一种香蕉枯萎菌milRNA |
Family Applications After (2)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
CN201811630144.XA Pending CN109576270A (zh) | 2018-03-02 | 2018-03-02 | 一种香蕉枯萎菌milRNA |
CN201811630268.8A Pending CN109554367A (zh) | 2018-03-02 | 2018-03-02 | 一种香蕉枯萎菌milRNA |
Country Status (1)
Country | Link |
---|---|
CN (6) | CN109504681A (zh) |
Families Citing this family (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN113234804B (zh) * | 2021-06-07 | 2022-11-29 | 华南农业大学 | 一种用于香蕉枯萎病菌milRNA检测的内参基因及其应用 |
Citations (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN104611451A (zh) * | 2015-02-16 | 2015-05-13 | 中国热带农业科学院环境与植物保护研究所 | 鉴定或辅助鉴定香蕉枯萎病菌的成套引物及应用 |
Family Cites Families (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN104694533A (zh) * | 2013-12-09 | 2015-06-10 | 江苏命码生物科技有限公司 | 沙门氏菌的非编码性rna及其鉴定和应用 |
-
2018
- 2018-03-02 CN CN201811630164.7A patent/CN109504681A/zh active Pending
- 2018-03-02 CN CN201811630270.5A patent/CN109679988B/zh active Active
- 2018-03-02 CN CN201811630152.4A patent/CN109576271A/zh active Pending
- 2018-03-02 CN CN201810175831.0A patent/CN108410871B/zh active Active
- 2018-03-02 CN CN201811630144.XA patent/CN109576270A/zh active Pending
- 2018-03-02 CN CN201811630268.8A patent/CN109554367A/zh active Pending
Patent Citations (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN104611451A (zh) * | 2015-02-16 | 2015-05-13 | 中国热带农业科学院环境与植物保护研究所 | 鉴定或辅助鉴定香蕉枯萎病菌的成套引物及应用 |
Non-Patent Citations (2)
Title |
---|
Exploring MicroRNA-Like Small RNAs in the Filamentous Fungus Fusarium oxysporum;Rui Chen;《PLoS ONE》;20140820;第9卷(第8期);全文 * |
MicroRNA-like RNAs in plant pathogenic fungus Fusarium oxysporum f. sp. niveum are involved in toxin gene expression fine tuning;Xuefei Jiang;《3 Biotech》;20170927;第7卷(第354期);全文 * |
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
CN109504681A (zh) | 2019-03-22 |
CN109679988B (zh) | 2020-08-14 |
CN108410871A (zh) | 2018-08-17 |
CN109554367A (zh) | 2019-04-02 |
CN109679988A (zh) | 2019-04-26 |
CN109576271A (zh) | 2019-04-05 |
CN109576270A (zh) | 2019-04-05 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
Zhou et al. | Genome-wide identification and profiling of microRNA-like RNAs from Metarhizium anisopliae during development | |
CN104560742A (zh) | 农杆菌介导茭白黑粉菌转化子菌株及其制备方法和应用 | |
RU2013135484A (ru) | Молекулы нуклеиновых кислот, которые придают устойчивость к насекомым-вредителям отряда жестокрылых | |
CN111304213A (zh) | 甜橙CsCNGC2和CsCNGC4基因用于提高植物柑橘黄龙病菌抗性的应用 | |
Shao et al. | milR4 and milR16 mediated fruiting body development in the medicinal fungus Cordyceps militaris | |
CN115820685A (zh) | 一种柑橘CsGSTF1基因及其应用 | |
CN108410871B (zh) | 香蕉枯萎菌milRNAs及低丰度milRNAs的体外验证方法 | |
CN109355290A (zh) | 一种植物环状rna表达框架及其应用 | |
CN110016519B (zh) | 一种香蕉枯萎菌4号生理小种dcl基因缺失突变体及其小rna | |
CN105039345B (zh) | 一种增强桑树耐盐能力的miRNA的克隆及其应用 | |
CN110016520B (zh) | 一种香蕉枯萎菌4号生理小种ago基因缺失突变体及其小rna | |
CN102533852A (zh) | 一个能诱导植物抗病性的大豆疫霉基因PsIR1的应用 | |
CN108998454B (zh) | 一种与菊花脑抗蚜性相关的miRNA160a及其应用 | |
CN104561019B (zh) | 家蚕受体表达增强蛋白BmREEPa基因及其重组表达载体和应用 | |
CN110628802B (zh) | 一种高产埃博霉素d的纤维堆囊菌及其构建方法和应用 | |
CN114107327A (zh) | 绿色木霉高温胁迫响应关键酶基因TvHSP70、重组表达载体、工程菌及其应用 | |
CN106119246B (zh) | 一种疫霉诱导性人工合成启动子pmp1及其重组表达载体和应用 | |
CN106047906A (zh) | 一种用于提高植物抗病性的基因及其应用 | |
CN110511936A (zh) | 茄二十八星瓢虫生长发育相关基因chs1及其应用 | |
CN110066799A (zh) | 靶向朱砂叶螨脱皮激素受体基因EcR的dsRNA及应用 | |
CN105255909B (zh) | 大丽轮枝菌寡糖基转移酶靶基因片段及其干扰载体和应用 | |
CN105861509B (zh) | 一种疫霉诱导性人工合成启动子pmp3及其重组表达载体和应用 | |
CN105861508B (zh) | 一种疫霉诱导性人工合成启动子pmp2及其重组表达载体和应用 | |
CN113005122B (zh) | 一种抗玉米病毒的小rna | |
CN112048517B (zh) | 干扰柑橘木虱卵黄蛋白原基因表达的转基因生防真菌及其制备方法和应用 |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
PB01 | Publication | ||
PB01 | Publication | ||
SE01 | Entry into force of request for substantive examination | ||
SE01 | Entry into force of request for substantive examination | ||
GR01 | Patent grant | ||
GR01 | Patent grant |