CN108085405A - 一种用于鉴别蜡杨梅雌雄的分子标记、引物对及其应用 - Google Patents

一种用于鉴别蜡杨梅雌雄的分子标记、引物对及其应用 Download PDF

Info

Publication number
CN108085405A
CN108085405A CN201710221205.6A CN201710221205A CN108085405A CN 108085405 A CN108085405 A CN 108085405A CN 201710221205 A CN201710221205 A CN 201710221205A CN 108085405 A CN108085405 A CN 108085405A
Authority
CN
China
Prior art keywords
candleberry
female
plant
primer pair
primer
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Granted
Application number
CN201710221205.6A
Other languages
English (en)
Other versions
CN108085405B (zh
Inventor
高中山
贾慧敏
王妍
赵海波
汪国云
焦云
柴春燕
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Zhejiang University ZJU
Original Assignee
Zhejiang University ZJU
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Zhejiang University ZJU filed Critical Zhejiang University ZJU
Priority to CN201710221205.6A priority Critical patent/CN108085405B/zh
Publication of CN108085405A publication Critical patent/CN108085405A/zh
Application granted granted Critical
Publication of CN108085405B publication Critical patent/CN108085405B/zh
Active legal-status Critical Current
Anticipated expiration legal-status Critical

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6876Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
    • C12Q1/6888Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for detection or identification of organisms
    • C12Q1/6895Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for detection or identification of organisms for plants, fungi or algae
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/13Plant traits

Landscapes

  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Mycology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Botany (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)

Abstract

本发明公开了一种用于鉴别蜡杨梅雌雄的分子标记、引物对及其应用。所述分子标记,为蜡杨梅雌性特异的基因片段MC‑FT1,其核苷酸序列如SEQ ID No.3所示。所述引物对,包括上游引物和下游引物,核苷酸序列为:上游引物:5′‑GGATCCTGATGCGCCCAGTCC‑3′;下游引物:5′‑GAAAAGATCGATTTGATAC‑3′。利用本发明引物对进行PCR鉴定蜡杨梅性别,对蜡杨梅的幼苗鉴定,尽早排除雄株,有效降低蜡杨梅雄株对人们健康的威胁,同时能避免栽培杨梅受到蜡杨梅花粉的影响,优化栽培杨梅的生长环境,以保证其果实质量和商品价值。

Description

一种用于鉴别蜡杨梅雌雄的分子标记、引物对及其应用
技术领域
本发明涉及分子鉴别技术领域,特别是涉及一种用于鉴别蜡杨梅雌雄的分子标记、引物对及其应用。
背景技术
蜡杨梅(Myrica cerifera L.或者Morella cerifera)属于杨梅科杨梅属植物,原产于美国海滨地区,是常绿灌木或小乔木,高2-3m,为雌雄异株植物。叶片蜡质,叶被充满黄色腺孔,具有浓烈香气;雌花为葇荑花序,自3月下旬至4月上旬开放,4月上旬为盛花期,花期约30天,雄花为复葇荑花序,自3月下旬至4月下旬陆续开放,4月中旬为盛花期,花期约50天,比杨梅花期略晚;果实蓝色,外被蜡质层,直径3mm左右,冬季不落。蜡杨梅为滨海植物,喜光,具有一定的耐盐碱、耐寒、耐水湿的能力,适生于沿海地区和滩涂地,目前,蜡杨梅在浙江余姚,慈溪等地均有栽培,生长旺盛,绿化效果好。
杨梅(Myrica rubra Sieb.&Zucc.)属于杨梅科杨梅属植物,原产于我国东南各省及云贵高原,栽培历史悠久,是我国南方的特色水果,目前杨梅主栽品种分布在我国浙江,江苏、福建、江西、湖南、广东、贵州和云南等省,其中浙江省的栽培面积、产量、质地等均为最佳。杨梅果实成熟期(6月份)恰逢一年中的水果淡季,能够有效填补市场上的水果空缺期,再加上杨梅果色艳丽,风味独特,同时富含花青苷,具有较高的营养价值,深受消费者的喜爱。
杨梅喜土质疏松、排水良好、富含石砾的土层深厚的土壤,不适宜在偏盐碱的滩涂地生长。有研究证明,以蜡杨梅为砧木,荸荠、东魁、晚稻杨梅为接穗,成活率均大于90%,使得这些栽培杨梅能够充分利用土地资源,逐渐形成沿海经济林树种,将绿化与生产有机结合在一起,具有较大的经济效益。
不过,蜡杨梅为雌雄异株植物,雄株花期比较长,花粉大量产生,其花粉能不能使栽培杨梅正常结实。此外,部分人群对蜡杨梅的花粉存在过敏现象,所以在生产上引种时应尽量避免雄株的产生,减少潜在的过敏原。开发一种方法,在蜡杨梅幼期快速鉴别其雌雄,从而尽早排除雄株,有效降低蜡杨梅雄株对人们健康的威胁,同时能避免栽培杨梅受到蜡杨梅花粉的影响,优化栽培杨梅的生长环境,以保证其果实质量和商品价值。
发明内容
本发明针对现有技术中缺乏有效手段对蜡杨梅进行早期性别鉴定,提供了一种用于鉴别蜡杨梅雌雄的分子标记,以及基于该分子标记设计的一种引物对,利用该引物对能够有效地对蜡杨梅植株进行早期性别鉴定。
一种用于鉴别蜡杨梅雌雄的分子标记,为蜡杨梅雌性特异的基因MC-FT1,其核苷酸序列如SEQ ID No.3所示。
引物对,包括上游引物和下游引物,核苷酸序列为:
上游引物:5′-GGATCCTGATGCGCCCAGTCC-3′;
下游引物:5′-GAAAAGATCGATTTGATAC-3′。
本发明又提供了所述引物对在鉴别蜡杨梅性别中的应用。
所述蜡杨梅为蜡杨梅幼苗。
本发明又提供了所述引物对在制备用于鉴别蜡杨梅性别的试剂盒中的应用。
本发明还提供了一种包含所述引物对的试剂盒。
本发明还提供了所述试剂盒在鉴别蜡杨梅性别中的应用。
本发明还提供了一种鉴别蜡杨梅性别的方法,包括以下步骤:
(1)对待检测蜡杨梅植株取样并提取基因组DNA;
(2)以所述基因组DNA为模板,利用所述引物对进行PCR扩增;
(3)PCR扩增产物进行电泳检测,
若电泳检测结果在159bp和197bp处均有特异性条带,则待检测蜡杨梅植株为雌株;
若电泳检测结果只在197bp处有特异性条带,则待检测蜡杨梅植株为雄株。
所述PCR扩增的体系为:
所述PCR扩增的条件为:
94℃预变性5min;94℃变性30s,53℃退火30s,72℃延伸10s,共35个循环;72℃延伸10min。
本发明通过对雌雄杨梅植株的基因组测序,发现了雌株特异性基因FT1以及与FT1基因具有较高序列同源性的雌雄植株共有的FT2基因,通过序列分析,针对保守区域设计引物,然后扩增蜡杨梅基因组获得蜡杨梅中的同源基因序列片段,其中MC-FT1为蜡杨梅雌株特异性基因片段,MC-FT2为雌雄共有基因片段,对MC-FT1和MC-FT2进行对比分析,设计获得本发明引物对MC-F,利用引物对MC-F对大量蜡杨梅雌雄植株进行检测,发现利用本发明引物对来鉴别蜡杨梅植株的性别,其预测雌株的准确性接近100%。利用本发明引物对进行PCR鉴定蜡杨梅性别,对蜡杨梅的幼苗鉴定,尽早排除雄株,有效降低蜡杨梅雄株对人们健康的威胁,同时能避免栽培杨梅受到蜡杨梅花粉的影响,优化栽培杨梅的生长环境,以保证其果实质量和商品价值
附图说明
图1为实施例6中部分植株的电泳结果图,其中,M为DL2000DNA Markers;泳道1~8为雌株个体;泳道9~16为雄株个体。
具体实施方式
实施例1
杨梅基因组DNA的提取。
用改良的CTAB法分别提取197份(雄株100份,雌株97份)杨梅品种的基因组DNA,具体方法如下:
1、配制缓冲液
CTAB缓冲液:2%CTAB,0.1M Tris,20mM EDTA,1.4M NaCl,pH 8.0;
DNA溶解缓冲液TE:10mM Tris;1mM EDTA;pH 8.0。
2、提取杨梅基因组DNA
①用天平迅速称取约1.0g贮藏于-80℃冰箱中的杨梅幼嫩叶片组织,加少许PVP防止氧化,用液氮于研钵中充分研磨后将粉末快速转入盛有在65℃预热的4mL CTAB溶液与80μLβ-巯基乙醇的10mL离心管中,65℃水浴1h;
②将步骤①混合物中加入4mL氯仿/异戊醇(24∶1),涡旋混匀,12000rpm离心10min,取上清液于新10mL管中,再次加入4mL氯仿/异戊醇(24∶1),涡旋混匀,12000rpm离心10min;
③将步骤②离心后所得的上清液转入新10mL管,并加入等体积-20℃预冷的异丙醇,轻轻混匀,在-20℃放置30min至DNA沉淀。10000rpm离心2min,去上清液;
④用75%的乙醇清洗步骤③DNA沉淀物3次;
⑤将步骤④洗涤后的DNA晾干并溶于200μL的TE缓冲液中,加入2μL RNA酶(10mg/mL)以除去RNA;DNA检测采用紫外分光光度计(Beckman coulter,USA),确定其浓度和质量,同时取1μL用TE缓冲液稀释5倍后在1.0%的琼脂糖凝胶上检测。DNA原液保存于-20℃,工作液稀释为30ng/μL备用。
实施例2
根据杨梅基因组参考序列,测序分析雌、雄各100个混池,发现雌性特异的基因组区段,2号染色体(chr2)上具有一个与开花相关的功能基因FT1(SEQ ID No.1),与此序列80%同源的基因序列FT2(SEQ ID No.2)在雌雄中都存在。根据两者序列比较,针对保守区域设计PCR引物Mr-F2,委托杭州金百奥生物科技有限公司合成,引物信息如表1所示。
表1
实施例3
蜡杨梅基因组DNA的提取。
Plant Mini Kit(Qiagen,德国)试剂盒分别提取97份(雄株49份,雌株48份)蜡杨梅品种的基因组DNA,具体方法如下:
a)称取0.1g鲜样或者0.02g冷冻干燥叶片,在液氮中快速研磨,置于2mL灭菌的离心管中;
b)加400μL Buffer AP1缓冲液和4μL RNaseA到上述离心管中,涡旋混匀,65℃水浴10min,并且在水浴过程中上下颠倒2-3次;
c)加130μL Buffer P3缓冲液到混合液中混匀,冰浴5min;
d)15-25℃,14000rpm离心5min;
e)吸取上清到QIAshredder离心柱(置于2mL回收管中)中,15-25℃,14000rpm离心2min;
f)转移回收管中的液体到2mL新管中(如果有颗粒,请不要振荡以免进入新的离心管中),加1.5倍的Buffer AW1缓冲液并吸打混匀;
g)吸取650μL混合液加到置于2mL回收管中的DNeasy Mini离心柱中,15-25℃,8000rpm离心1min,倒掉回收管中的液体
h)将步骤f的剩余混合液重复步骤g;
i)将DNeasy Mini离心柱置于新的2mL回收管中,加500μL Buffer AW2缓冲液,15-25℃,8000rpm离心1min,弃管中液体,留回收管;
j)加500μL Buffer AW2缓冲液到DNeasy Mini离心柱,15-25℃,14000rpm,2min(注:小心将离心柱拿出,以免接触弃液)并弃回收管;
k)将DNeasy Mini离心柱放入2mL离心管中,加100μL Buffer AE缓冲液洗脱,室温放置5min后(15-25℃),8000rpm离心1min;
l)洗脱产物倒回离心柱中重复洗脱一次。
蜡杨梅基因组DNA提取后,采用微量分光光度计(Biodrop,UK)确定其浓度;取1μL用Buffer AE稀释5倍后在1.0%的琼脂糖凝胶上检测,DNA原液保存于-20℃,工作液稀释为30ng/μL备用。
实施例4
蜡杨梅基因组中与杨梅FT1基因同源的确定。
(1)以蜡杨梅基因组DNA为模板,以实施例2中Mr-F2引物进行PCR扩增,扩增产物电泳检测后,经过TaKaRa MiniBEST Agarose Gel DNA Extraction Kit(TaKaRa,Japan)纯化回收试剂盒进行凝胶回收;
(2)将回收产物利用Simple Cloning Kit(Transgen,China)试剂盒进行连接、转化;
(3)将菌液均匀涂在含有IPTG、X-gal、氨苄的LB培养基上,37℃培养箱中过夜培养;
(4)在LB培养基上筛选出大小均匀的6-8个白色单克隆菌斑,经过菌液PCR扩增筛选出阳性克隆,过夜摇菌后,取1.0mL送上海华津生物科技有限公司测序;
(5)利用DNAMAN软件对测序结果分析,发现蜡杨梅雌雄植株存在差异区域。
蜡杨梅雌性特异序列MC-FT1(SEQ ID No.3),长度为371bp;和雌雄共有的序列MC-FT2(SEQ ID No.4),长度为413bp。
比对MC-FT1序列和MC-FT2序列,跨区域重新设计引物MC-F,由杭州金百奥生物科技有限公司合成,引物信息如表2所示。
表2
实施例5
PCR扩增。
①反应体系:
②反应程序:94℃预变性5min;94℃变性30s,53℃退火30s,72℃延伸10s,共35个循环;72℃延伸10min。
③产物在2.0%琼脂糖凝胶上电泳检测,紫外灯下观察并照相记录结果。
实施例6
以实施例3中提取的基因组DNA为模板,利用实施例4中设计的引物(MC-F),按照实施例5中的PCR扩增方法进行扩增检测。部分植株的电泳结果如图1所示。
100份(雄株49份,雌株51份)蜡杨梅群体检测结果如表3所示。结果显示:用MC-F引物扩增,雌株基因型为159/197bp(159bp片段序列如SEQ ID No.5所示,197bp片段序列如SEQ ID No.6所示),雄株基因型为197bp,将97份蜡杨梅植株的性别与扩增基因型相对应,结果除一株雌株样本未获得扩增产物外,其余均正确,利用MC-F引物预测蜡杨梅植株雌性的准确率100%。
表3
注:片段大小:bp;♀-雌;-雄。
SEQUENCE LISTING
<110> 浙江大学
<120> 一种用于鉴别蜡杨梅雌雄的分子标记、引物对及其应用
<130>
<160> 10
<170> PatentIn version 3.3
<210> 1
<211> 2635
<212> DNA
<213> 杨梅(Myrica rubra Sieb. & Zucc.)
<400> 1
atggccaggg aaagggacac tctcgctgtt gggcgtgtta taggagatgt gctggacccc 60
tttacaaggt ccattgctct gagggcaatt tataacagta gggaggttaa caacggttgt 120
gagctcaaac cctctcaggt tgtcaaccaa cctagggttg atgttggtgg tgaagatcta 180
aggacgttct atactctggt aaatgtatct tacctctttt ttcctttgct aagcgtcttt 240
ctcttcaact agcttttccc tcaagttgac caccattttt ctcatgagca tttttggttc 300
ttgatatttg acttatgatc atgtccactg cagcttatgg tggatcctga tgcgcccagt 360
ccaagtgatc ccaacctcag ggagtacttg cattggtgag cactctctct ctcattccac 420
aaatacacaa gcacattgca aaggtatcaa atcgatcttt tctctgccct cgatcgtctc 480
tgcgacataa atgcgtagac atccgtttct gactctctat ttgacttccc tcccttcata 540
aaaggactgg taggcggtat agtaatcagg attccatcaa aagctggtta gaagggctca 600
gcattttaaa aaataaatct aatgattgat cccaagtcaa acaaaaaact ctctttattt 660
catctcatta aataaatgaa atggttaaat tcaggccctt ggatttattt tttaaaatct 720
tgacccctcc ttgcaataac ttagaacaaa tgtccttatg atggaaccct ttggcatata 780
ggttggccaa aagaagagag agagaggaaa aagtgatgag aaccggaata ttcttgtttc 840
aattgttcag cctcttttcg ggaaagtagt tcatgcatct tacagaagaa agcaatccaa 900
aataggtagc tgtcgagggc gggatggcgg cggagccaga cattaatatt tgagaaacct 960
ctcgcaatgt actaattgtt taatacgttt aaaaattatg gttaattagt agatttattg 1020
accaacagga tcgatcgaaa gcctaagggg aagcaaaagg acaaggaaga agagttcccc 1080
ctgttgtgat ttttagataa gatacttttt ttcctttaag aagtttttga gcaaaagaaa 1140
aattagattt taaaaaaatt tcttgatttt taagaaaaat ctatacatat atttctatgt 1200
acctatgttg tccttttatt ttattttaat aatcaccaga aagcccaagt actggttttt 1260
tgtgtgaaat tgacaaatat ctttgtcctt ttgttttgct tcctggttga ccgattgagg 1320
gcacgtatga tctctcatgg aaagaaatca tttggaggac cactactaaa gtatctcagg 1380
atatataaag tttctgggat atgcaatgga accgtacatg catgtacgta ccaattacca 1440
tgatacagcc aacaatattg tcatcgtgct ttactcctat attctctccc aggctgtcct 1500
tttccttgtt tctttctctt tgcagttttg tctcctttct ttctcttata cgtacgcacg 1560
tacgtaattc ttcttattcc attgggtagt gatagactct ggaacgtcgc atgttgaata 1620
tttccacatc tgatgacttg tatagtagtg ttgatcgact accatgacaa aggctatcaa 1680
ctctccttaa tatattagag tgatttggca gccagttaat tattgtccgc tgtttaaatc 1740
tgccattgct aatgtaaata ttgcatttaa caaactaatt aattaagaaa ctgtctttaa 1800
gaggacttca agtgataatt tagttgccaa attactgaga agtactctct cgttctttgt 1860
agctattcta tcactattat tatttcttct tggcctttct taactcttgc gataattgtt 1920
aactttttgt catatattta tatatagtga tcaatgatta accgttacca aggcatcggg 1980
tgctattatt gtaacctttc tactttagtt tcatttgaag gtccatttgt cgtagttatg 2040
attttatatt ttgtctagga gaaatttgat attatccgta actgttactt ctactaagtt 2100
tttcaaaatt aagattaatt tgtcgtctcc ctctggtttg ttaggttggt gactgatatt 2160
ccagaaacta cgggggcaag ctttggtgag tatactacac atgcacatgt ggtttagtaa 2220
attatcaaga gttaaagaca cctctcttga gacatgcaaa gcactgtcgt acggcaaaca 2280
atgcttgtat ggctttgtga gaaggccaag catttgtagg gatagtttga tctagcagta 2340
ctattattgt ttgtatcttc atgagtaaca tgtatatatg atctatggcc aaattttttt 2400
gggcgtaggg caagaggttg tgtgctacga aagtccacga ccagtggtag ggatccatcg 2460
gtttgttttc gtgttgttcc gtcaactggg taggcagaca gtatatgcac cagggtggcg 2520
ccaaaatttc aacaccagag acttcgctga gcaatacaat ctcggattgc cagtggctgc 2580
actttacttt aactgccaga gggaaagcgg ctgtggtgga aggagaagat tgtga 2635
<210> 2
<211> 2620
<212> DNA
<213> 杨梅(Myrica rubra Sieb. & Zucc.)
<400> 2
atggctaggg aaagggaccc tctcactgtt gggcgtgtta taggagatgt gttggacccc 60
tttacgagat ccatcgctat gagggcaatt tataacagta gggaggttaa caacggttgt 120
gagctcaaac cctctcaggt tgtcaaccaa cctagggttg atattggtgg tgaagatctc 180
aggacgttct atactctggt aaatgtatct taccctcttt cttcctttgc cgtgcgtctt 240
tctcttcagc tagctcttcc ctcaagttga ccacctttct tttttctcat gagctttttt 300
ggttcttgat attttactta tgatcatgtc cactgcagct tatggtggat cctgatgcgc 360
ccagtccaag tgatcccagc ctcagggagt acttgcattg gtgagctctc tctctctctc 420
tctctcccca aaatacacaa gccctttgca aaggtactat atatatatag atatattttt 480
cttgtaaaga tgggggaaca tatatttttt cttcttgtaa agatgggaac atatatagta 540
tcaaatcgat cttttctctg ccctcgatcg tctctgcaat ataattccat atacatctgt 600
ttctgactct ctatttgaca tccctagctc cctccataaa acgactggta ggcggtatat 660
aggtcggcca aaaaaaaaaa cagagagagc aagaagagag aagaaccaga atattcttgt 720
ttcagtcgtt cagcctcttt ccgggaaagt agttcatctt ggagcatcaa taatcagcag 780
aaagcaatcc aaaataggta gctgttgagg acgtacggga tggcggcgga tccagaaatt 840
aatatttgag aaacctcgta atatactaat tatttatata cgtttttata gaatatatat 900
ttcttgatct ctcctatatg tatatataac gatagaaaaa ggtagggata taattcaaaa 960
tttaaaaatt atcgatgata tatagattta ttgaccaaca ggatcgatcg aaagcctaag 1020
gggaagcaaa aggacaagga agaagaaatc cccctattgt gattttcaga taagatactt 1080
tttgtttcct tttagaagtt tttgagcaaa agaaaaattg gattttcaaa atatttcttg 1140
atttttaaca aaaatctata catattatat atttctatgt atttatcagc ttgtcctttt 1200
gttttatttt aataattacc agaaagccca agtgctgttt tttcgtgtga aattgacaaa 1260
tatctcttgt ccttttgttt tgcttcctgc ctgatcgatt gagggcacgt atctctcatg 1320
gatgtgaaat tattggagga ccactactaa agtatctttc gatttataag gtttctggga 1380
tatgcatgca tatacgtacc atgataaagc caacaatatt gtcatcgtac gtgctttact 1440
cctatcttct ctccccgtcc ttttccttgt ttgatctttc tccttgaagt tttgtctcct 1500
ttctttctct tatattaata cgtacgcgcg tacgtaattc tccttattct tttttttttc 1560
ttcttgaaaa ttattctcct ttttccattg ggtagtgata gactctggaa cgcatataga 1620
atatttcccc atctaaggac ttgcatatat agtgttaatc gactaccatg ataagggcta 1680
tcaactctct ccttaatata ttagagtgat ttggcagcca gttaaatatt attgcccgct 1740
gtttaaatct agctagctac catgcattgc taatattgta aatatatatt gcatttaaca 1800
aactaagaaa ccatttttaa aaggacttca agtgataaac tattattttc ttcttggcct 1860
ttcttaactc ttacgataac tttttaactt ttgaattata tttatacttt tttgtggtat 1920
tgtcatacat acatatatat atatatatat ataaccgtca ctaaggtgtc aggatttatt 1980
attgtaaact ttctaattta gttttatttg aaggtgcata tgccgtagtt atgattattt 2040
tgtccagtta ggagaaattt gagattattc gtaacagttc tatacaaagt ttttcaaaac 2100
taaaattaat tccctctggt taatttgtca ggttggtgac tgatattcca gcaactacgg 2160
ggacaagctt tggtgagtat tatactatac atgcatgcac atgtggttta ttaaattatc 2220
aagagttaaa gacacctctc ttgagacatg gaaagcaatg tcgtacggga aacaatgctt 2280
gcatggcttt gtgagaatta ggccaagcat ttgtagggat agtttgatta gcactattat 2340
tgttggtatc cttgattgac atatgatgta ttggccaaat tcaatgggtg taggacaaga 2400
ggtggtgtgc tacgaaagtc cacgaccagt ggtagggatc catcggtttg ttttcgtgtt 2460
gttccgtcaa atgggtaggc agacagtata tgcaccgggg tggcgccaga atttcaacac 2520
caaggacttc gctgagctct acaatctcgg attgccagtg gctgcacatt acttcaactg 2580
ccagagggaa agcggttccg gtggaaggag aagatcgtga 2620
<210> 3
<211> 371
<212> DNA
<213> 蜡杨梅(Myrica cerifera L.)
<400> 3
cctctcaggt tgtcaaccaa cctagggttg atattggtgg tgaagatctc agaacgttct 60
atactctggt aaatgtatct tacctctttc ttccttggct atgtgtctct cttcagctag 120
ctcttccctc aagttgacca ccttcatttt tctcatgagc ttttttggtt cttgatattt 180
gacttatgat catgtccact gcagcttatg gtggatcctg atgcgcccag tccaagtgat 240
cccaacctca gggagtactt gcattggtga gcactctctc tctctctttc cacaaataca 300
caagcacatt gcaaaggtac atatttagac actaaagtgg aaattacata tagtatcaaa 360
tcgatctttt c 371
<210> 4
<211> 413
<212> DNA
<213> 蜡杨梅(Myrica cerifera L.)
<400> 4
cctctcaggt tgtcaaccaa cctagggttg atattggtgg tgaagatctc aggacgttct 60
atactctggt aaatgtatct taccctcttt cttcctttgc cgtgcgtctt tctcttcagc 120
tagctcttcc ctcaagttga ccacctttct tttttctcat gagctttttt ggttcttgat 180
attttactta tgatcatgtc cactgcagct tatggtggat cctgatgcgc ccagtccaag 240
tgatcccaac ctcagggagt acttgcattg gtgagctctc tctctctctc tccccaaaat 300
acacaagccc tttgcaaagg cactatattt tttttttctt ataaagatgg gggaacatat 360
attttttctt cttgtaaaga tgggaacatt tatagtatca aatcgatctt ttc 413
<210> 5
<211> 159
<212> DNA
<213> 蜡杨梅(Myrica cerifera L.)
<400> 5
ggatcctgat gcgcccagtc caagtgatcc caacctcagg gagtacttgc attggtgagc 60
actctctctc tctctttcca caaatacaca agcacattgc aaaggtacat atttagacac 120
taaagtggaa attacatata gtatcaaatc gatcttttc 159
<210> 6
<211> 197
<212> DNA
<213> 蜡杨梅(Myrica cerifera L.)
<400> 6
ggatcctgat gcgcccagtc caagtgatcc caacctcagg gagtacttgc attggtgagc 60
tctctctctc tctctcccca aaatacacaa gccctttgca aaggcactat attttttttt 120
tcttataaag atgggggaac atatattttt tcttcttgta aagatgggaa catttatagt 180
atcaaatcga tcttttc 197
<210> 7
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 7
cctctcaggt tgtcaaccaa 20
<210> 8
<211> 19
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 8
gaaaagatcg atttgatac 19
<210> 9
<211> 21
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 9
ggatcctgat gcgcccagtc c 21
<210> 10
<211> 19
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 10
gaaaagatcg atttgatac 19

Claims (10)

1.一种用于鉴别蜡杨梅雌雄的分子标记,为蜡杨梅雌性特异的基因片段MC-FT1,其核苷酸序列如SEQ ID No.3所示。
2.引物对,包括上游引物和下游引物,其特征在于,核苷酸序列为:
上游引物:5′-GGATCCTGATGCGCCCAGTCC-3′;
下游引物:5′-GAAAAGATCGATTTGATAC-3′。
3.如权利要求2所述引物对在鉴别蜡杨梅性别中的应用。
4.如权利要求3所述的应用,其特征在于,所述蜡杨梅为蜡杨梅幼苗。
5.如权利要求2所述引物对在制备用于鉴别蜡杨梅性别的试剂盒中的应用。
6.一种包含如权利要求2所述引物对的试剂盒。
7.如权利要求6所述试剂盒在鉴别蜡杨梅性别中的应用。
8.一种鉴别蜡杨梅性别的方法,其特征在于,包括以下步骤:
(1)对待检测蜡杨梅植株取样并提取基因组DNA;
(2)以所述基因组DNA为模板,利用权利要求2所述引物对进行PCR扩增;
(3)PCR扩增产物进行电泳检测,
若电泳检测结果在159bp和197bp处均有特异性条带,则待检测蜡杨梅植株为雌株;
若电泳检测结果只在197bp处有特异性条带,则待检测蜡杨梅植株为雄株。
9.如权利要求8所述的方法,其特征在于,所述PCR扩增的体系为:
10.如权利要求8所述的方法,其特征在于,所述PCR扩增的条件为:
94℃预变性5min;94℃变性30s,53℃退火30s,72℃延伸10s,共35个循环;72℃延伸10min。
CN201710221205.6A 2017-04-06 2017-04-06 一种用于鉴别蜡杨梅雌雄的分子标记、引物对及其应用 Active CN108085405B (zh)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CN201710221205.6A CN108085405B (zh) 2017-04-06 2017-04-06 一种用于鉴别蜡杨梅雌雄的分子标记、引物对及其应用

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CN201710221205.6A CN108085405B (zh) 2017-04-06 2017-04-06 一种用于鉴别蜡杨梅雌雄的分子标记、引物对及其应用

Publications (2)

Publication Number Publication Date
CN108085405A true CN108085405A (zh) 2018-05-29
CN108085405B CN108085405B (zh) 2021-03-26

Family

ID=62170723

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CN201710221205.6A Active CN108085405B (zh) 2017-04-06 2017-04-06 一种用于鉴别蜡杨梅雌雄的分子标记、引物对及其应用

Country Status (1)

Country Link
CN (1) CN108085405B (zh)

Cited By (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN111587694A (zh) * 2020-07-06 2020-08-28 方文贵 一种荸荠杨梅疏花方法
CN113308565A (zh) * 2021-07-09 2021-08-27 宁波市农业科学研究院 快速鉴定杨梅叶片形态性状的分子标记引物组合及其应用

Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN105441444A (zh) * 2016-01-04 2016-03-30 浙江大学 杨梅est-ssr分子标记及其应用

Patent Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN105441444A (zh) * 2016-01-04 2016-03-30 浙江大学 杨梅est-ssr分子标记及其应用

Cited By (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN111587694A (zh) * 2020-07-06 2020-08-28 方文贵 一种荸荠杨梅疏花方法
CN113308565A (zh) * 2021-07-09 2021-08-27 宁波市农业科学研究院 快速鉴定杨梅叶片形态性状的分子标记引物组合及其应用
CN113308565B (zh) * 2021-07-09 2022-03-01 宁波市农业科学研究院 快速鉴定杨梅叶片形态性状的分子标记引物组合及其应用

Also Published As

Publication number Publication date
CN108085405B (zh) 2021-03-26

Similar Documents

Publication Publication Date Title
CN109797157B (zh) 一种抗非生物逆境转录因子PbrbHLH92及其引物、编码的蛋白和应用
CN106480063A (zh) 一种茶树MYB转录因子CsAN1及其在调控花青素代谢中的应用
CN108103219A (zh) 一种用于鉴别杨梅雌雄的分子标记、引物对及其应用
CN109081865B (zh) 毛竹PeVQ28蛋白及其编码基因与应用
CN108660140B (zh) SlSL4基因在调控番茄果实成熟中的应用
CN107299103B (zh) 厚藤IpASR基因及其编码蛋白和应用
CN104805216B (zh) 一种快速鉴定黄瓜品系刺瘤稀密的分子标记、鉴定方法及应用
CN109852618A (zh) 一种节瓜WRKY类转录因子基因CqWRKY1及其应用
CN110004154B (zh) 茶树CsJAZ1基因的应用
CN107653335A (zh) 香蕉枯萎病抗性分子标记及其应用
CN108603198A (zh) 操纵植物发育的组合物和方法
CN110229818A (zh) 蜡梅CpSNAC1基因启动子及其应用
CN108085405A (zh) 一种用于鉴别蜡杨梅雌雄的分子标记、引物对及其应用
CN107365371A (zh) 甘蔗开花调控蛋白ScFT‑2及其编码基因
CN102604963B (zh) 柑橘早花基因PtELF5的分离克隆及应用
EP3599829B1 (en) Methods for improving traits in plants
CN104498514B (zh) 一种唐古特白刺NtCIPK9基因及其表达蛋白和应用
CN103183731A (zh) 石斛DnMYB类转录因子、编码基因、载体、工程菌及应用
CN106978499B (zh) 转基因大豆事件gc1-1外源插入片段旁侧序列及其应用
CN110106184A (zh) 一种紫花苜蓿抗旱耐盐基因MsBBX的克隆及应用
CN105132428B (zh) 一种与植物根系性状相关的ZmLRT基因及其相关生物材料与应用
CN107312077A (zh) 蜡梅CpSOC1基因及其编码的蛋白和应用
CN104293808B (zh) 一种杂交鹅掌楸LhMKK2基因及其表达蛋白和应用
CN108948162B (zh) 一种花生逆境胁迫基因AhDOG1L及其应用
CN109053870B (zh) AtERF49基因在植物响应高温胁迫过程中的应用

Legal Events

Date Code Title Description
PB01 Publication
PB01 Publication
SE01 Entry into force of request for substantive examination
SE01 Entry into force of request for substantive examination
GR01 Patent grant
GR01 Patent grant