CN107365371A - 甘蔗开花调控蛋白ScFT‑2及其编码基因 - Google Patents

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Abstract

本发明涉及甘蔗开花调控蛋白ScFT‑2及其编码基因,属于植物基因工程技术领域。所述的甘蔗开花调控蛋白ScFT‑2为由SEQ ID NO.1所示氨基酸序列组成,编码基因及基因组DNA核苷酸序列如SEQ ID No. 2和SEQ ID No. 3。本发明是从甘蔗品种粤糖93‑159成熟期叶片提取总RNA和基因组DNA,用PCR方法结合RACE技术得到ScFT‑2 cDNA全长和基因组DNA。本发明中所述ScFT‑2基因作用部位在甘蔗的茎尖和幼叶,该基因参与了甘蔗花期调节和花穗形成发育过程,具有促进甘蔗开花的作用,本发明对探究甘蔗开花机制、促进甘蔗亲本开花和甘蔗花期调控技术的研发具有较大的实用价值。

Description

甘蔗开花调控蛋白ScFT-2及其编码基因
技术领域
本发明涉及分子生物学中的基因技术领域,属于植物基因工程技术领域,具体涉及甘蔗开花调控蛋白ScFT-2及其编码基因。
背景技术
从营养生长向生殖生长的转变是高等植物发育中的一个重大事件。在营养组织上出现生殖过程的转变是由内在的因素和环境因子共同调控的。茎尖分生组织(SAM)是一群未分化细胞,在营养生长期间发育成叶和枝。在受到环境和内因的影响下,SAM茎尖分生组织经历了一个特定的改变产生了花(芽)原基。通过对拟南芥成花诱导的分子生物学分析,鉴定出了许多包括自身调节途径、赤霉素途径、光周期途径和春化途径等4个在响应网络中起关键调控作用的花期基因。
FT-like亚家族属于FT/TFL1基因家族成员,均具有保守的PEBP结构域,它们编码的蛋白均含有保守的Tyr85和Gln140残基,在第4个外显子中含有对FT活性起关键作用的11个保守氨基酸残基和高度保守的LYN三联体模块,主要发挥促进开花的作用;FT是花发育途径中的汇集点,它可以整合来自光周期途径、春化途径和自主途径等不同花发育途径的信号,在植物花发育中发挥着重要作用。2007年,世界各地先后有不同的科学家在不同的植物材料中证实了FT蛋白就是人们苦苦寻找的“成花素”,它可以通过韧皮部从叶片运输到茎端分生组织,FT蛋白与bZIP转录因子FLOWERING LOCUS D(FD)互作,共同激活花分生组织基因APETALA 1(AP1)表达,从而促进成花转换并启动花发育过程。
甘蔗属于单子叶植物,是蔗糖生产的重要原料,占世界糖产量的三分之二。甘蔗是短日照植物,深入的认识甘蔗开花过程是很重要的,原因一,在热带地区甘蔗品种容易开花,甘蔗生殖生长的转变导致一些糖分运输到正在发育的花序中,从而使存储的蔗糖离开茎秆,因此逐渐减少了原料的糖产量。原因二,在中国内陆及其它非热带地区植蔗国,甘蔗亲本开花难且花期不遇成为甘蔗杂交育种和新亲本创制的主要“瓶颈”,限制了野生种质资源的杂交利用,阻碍了育种效率的提高。目前,常规杂交育种主要采用人工光周期调控技术诱导甘蔗亲本开花进行杂交利用,但还存在不同亲本诱导开花的难度不一,且花期不遇的问题,这导致很多甘蔗优良亲本及组合因花期不遇,甚至难开花而难以被杂交利用。甘蔗生长周期较长,亲本从种植到诱导开花需时一年到一年半,如何有效提高甘蔗诱导开花的效率,精准控制花期,缩短甘蔗育种年限,提升育种效率等都是目前甘蔗杂交育种需要解决的关键问题。
最近,巴西Coelho等从甘蔗EST数据库中鉴定了5个不完全的甘蔗FT基因序列,命名为ScFT1、ScFT2、ScFT3、ScFt4和ScFT5,其中ScFT2与玉米的ZCN8和ScFT1的关系最近。ScFT3和ScFT4与促进开花的Hd3a、FT和BvFT1基因聚在一起。对这些候选基因进行更进一步的功能分析将有助于了解这些基因在甘蔗花期调控中的作用。
人工光周期调控诱导甘蔗亲本开花技术体系的建立,实现了甘蔗有性杂交育种,让资源间的优异血缘得到交流,拓宽了品种的遗传基础,改良了品种的抗逆性、适应力、活力,极大推动了甘蔗遗传育种的发展,但依然存在一些问题,如有些亲本(特别是甘蔗原始亲本热带种)难被诱导开花,杂交组合亲本花期不遇以及花粉育性低等问题。解决以上问题,就需要研究者了解甘蔗开花的分子调控机制,找到影响甘蔗成花转变的关键调控节点,通过调控内源和外源因子控制甘蔗的开花时间,从而为甘蔗亲本花期的精准调控奠定重要的理论基础。
发明内容
本发明的目的是为了解决现有人工光周期调控技术的不足,提供甘蔗开花调控蛋白ScFT-2及其编码基因,生物信息学分析表明ScFT-2基因具有FT类蛋白的PEBP euk保守结构域。用实时荧光定量PCR技术对ScFT-2mRNA的时空表达模式进行分析。结果本发明所述ScFT-2基因在甘蔗孕穗早期茎尖和幼叶中表达量上调,说明了ScFT-2基因具有调控甘蔗花期和促进甘蔗花穗形成的功能。本发明对探究甘蔗开花机制、促进甘蔗亲本开花和甘蔗花期调控技术的研发具有较大的实用价值。
为实现上述目的,本发明采用的技术方案如下:
甘蔗开花调控蛋白ScFT-2,所述的甘蔗开花调控蛋白ScFT-2为由SEQ ID NO.1所示氨基酸序列组成。
编码权利要求上述甘蔗开花调控蛋白ScFT-2的核苷酸序列。
所述核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示。
所述的甘蔗开花调控蛋白ScFT-2,其cDNA全长为如SEQ ID NO.2所示的核苷酸序列。
扩增上述cDNA全长序列的引物为:
上游引物ScFT-2 99F:5’-cgagcctagcttcttccg-3’
下游引物ScFT-2 1058R:5’-gatacactccaccccaaatg-3’
本发明公开了甘蔗开花调控蛋白基因ScFT-2在人工光周期诱导开花和非诱导条件下的时空表达模式:结果表明甘蔗ScFT-2在甘蔗孕穗早期茎尖中(含10cm左右幼穗)和幼叶中表达量增加明显,此时ScFT-2在幼叶中起平衡开花抑制物的作用,在茎尖起促进甘蔗花穗形成发育的作用。ScFT-2在甘蔗成花转变时期成熟叶中昼夜表达情况:ScFT-2在早上06:00的表达量最高,其次是早上09:00和晚上24:00;表达量最低时刻为下午15:00和18:00。
在非诱导条件下,ScFT-2在甘蔗茎尖中变化不明显。
所述的甘蔗开花调控蛋白ScFT-2,其开放读码框如SEQ ID NO.2中第245~766位所示。与高粱(登录号:XM-021455232.1)相似度为97%,与玉米ZCN14(登录号:NM-001112780.2)相似度为96%。所述的甘蔗开花调控蛋白ScFT-2,其氨基酸序列SEQ IDNO.1,与高粱(登录号:XP-021455232.1)相似度为97%,与玉米ZCN14(登录号:NP-001106251.1)相似度为98%。
本发明同时提供所述的甘蔗开花调控蛋白ScFT-2在调控植物花期中的应用。优选的是,所述的植物为甘蔗,但不限于此。
本发明还提供所述的甘蔗开花调控蛋白ScFT-2在缩短植物育种年限中的应用。优选的是,所述的植物为甘蔗,但不限于此。
本发明是用PCR扩增结合RACE技术从甘蔗品种粤糖93-159成熟期叶片中获得甘蔗ScFT-2cDNA全长序列和基因组DNA序列。甘蔗ScFT-2开放读码框为522bp,编码173个氨基酸。在人工光周期诱导开花条件下,甘蔗ScFT-2时空表达模式:ScFT-2在甘蔗孕穗早期茎尖和幼叶中表达量上调,说明ScFT-2与甘蔗花期调节和花穗形成发育过程密切相关。研究利用该基因在诱导促进甘蔗开花、缩短甘蔗育种年限、提高甘蔗花粉育性和杂交效率等方面,具有较好的应用前景。申请人将该基因命名为ScFT-2。其氨基酸序列如序列表中SEQ IDNo.1所述;编码基因核苷酸序列如序列表中SEQ ID No.2(cDNA全长序列)和SEQ ID No.3(DNA序列)所述。
所说甘蔗开花调控蛋白ScFT-2还包括SEQ ID No.1所示的氨基酸序列中添加、取代、插入和缺失一个或多个氨基酸生成的植物衍生物。
所说核苷酸序列还包括在SEQ ID No.2或SEQ ID No.3所示的核苷酸序列中添加、取代、插入和缺失一个或多个核苷酸生成的植物衍生物。
1.甘蔗开花调控蛋白基因ScFT-2的同源克隆
①总RNA的提取
以甘蔗品种粤糖93-159为材料,在成熟期取新鲜+1叶叶片,使用Trans ZolTMPlant试剂盒(ET121),按照使用说明书提取甘蔗总RNA。
②cDNA第一链的合成
以甘蔗总RNA作为模板,利用TransOne-Step gDNA Removal and cDNASynthesis Super MIX反转录试剂盒(AE311)合成cDNA第一链。
③引物设计合成
从GenBank中下载近缘物种(高粱、玉米、水稻等)FT-like同源基因CDS序列,利用DNA man软件进行多序列比对,确定保守区,使用Primer Premier 5并以高粱FT同源基因为模板,在保守区序列设计引物,引物设计后交给上海生物工程公司合成。并使用合成的引物扩增目标基因中间片段。
扩基因中间片段的引物
上游引物ScFT-2 129F:5’-cgcaccttctacaccctcg-3’;(SEQ ID NO.5)
下游引物ScFT-2 472R:5’-cacattcttctcccagtt-3’。(SEQ ID NO.6)
④连接转化、单克隆培养及测序分析
PCR扩增产物用质量百分浓度为1.2%的琼脂糖凝胶电泳检测,从凝胶中纯化回收目标产物,将纯化的PCR产物克隆到Trans-T5Zero载体中,转化大肠杆菌Trans1-T1Phage Resistant Chemically Competent Cell感受态细胞中,在含有氨苄的固体培养基上培养过夜,挑取阳性克隆进行继代培养。以M13F和M13R引物PCR检测,将有目的条带的单克隆送华大基因科技有限公司(广州)进行双向测序。
M13F和M13R引物
上游引物M13F:5’-gtaaaacgacggccagt-3’;(SEQ ID NO.7)
下游引物M13R:5’-caggaaacagctatgac-3’。(SEQ ID NO.8)
2.甘蔗开花调控蛋白基因ScFT-2 3’和5’UTR的获得
根据已测定的目标基因中间片段序列搜索甘蔗表达标签(expressed sequencetags,ESTs)数据库,结果可以获得基因中间片段重叠群和完整的3’末端序列,而5’末端序列不完全,需要通过设计5’RACE的基因特异性引物(Gene Specific Primer,简称GSP),使用RACE 5’/3’Kit(Clontech Laboratories,Inc)试剂盒对目的基因5’末端进行扩增,具体操作步骤参照RACE试剂盒说明书。
以甘蔗成熟叶总RNA为模板,利用RACE试剂盒中自带的反转录接头引物及试剂,反转录合成带有接头的cDNA第一链。
在5’RACE中,利用巢式PCR的方法,提高PCR反应的特异性,首先利用5’RACE外侧基因特异引物和试剂盒中提供的外侧接头引物UPM Long primer进行第一次PCR反应,所得的产物稀释50倍后作为第二次PCR反应的模板,5’RACE内侧基因特异引物和试剂盒中提供的内侧接头引物UPM Short primer进行第二次巢式的PCR反应。
5’RACE外侧基因特异引物
RACE ScFT-2 445*R:5’-cgttgaagtagacagcggcgacca-3’;(SEQ ID NO.9)
5’RACE内侧基因特异引物
RACE ScFT-2 261R:5’-cccaaaagaaactccagtcgtcg-3’。(SEQ ID NO.10)
试剂盒中的通用引物
UPM Long primer:5’-ctaatacgactcactatagggcaagcagtggtatcaacgcagagt-3’;(SEQ ID NO.11)
UPM Short primer:5’-ctaatacgactcactatagggc-3’。(SEQ ID NO.12)
PCR扩增产物用质量百分浓度为1.2%的琼脂糖凝胶电泳检测,从凝胶中纯化回收5’RACE目标产物,将纯化的PCR产物克隆到Trans-T5Zero载体中,转化大肠杆菌Trans1-T1Phage Resistant Chemically Competent Cell感受态细胞中,在含有氨苄的固体培养基上培养过夜,挑取阳性克隆进行继代培养。以M13F和M13R引物PCR检测,将有目的条带的单克隆送华大基因科技有限公司(广州)进行双向测序。利用DNA man 6.0对测序结果与保守区序列设计引物扩增所得序列(基因中间片段)和3’末端EST序列进行拼接。
3.甘蔗开花调控蛋白基因ScFT-2cDNA全长及基因组DNA克隆测序
根据3’末端EST序列、5’RACE和基因中间片段拼接的序列设计cDNA全长引物和基因组DNA引物,通过PCR扩增获得包含起始密码子(ATG)和终止密码子(TGA)的cDNA全长产物(序列表SEQ ID No.2)和基因组DNA产物(序列表SEQ ID No.3),PCR扩增产物用质量百分浓度为1.2%的琼脂糖凝胶电泳检测,从凝胶中纯化回收目标产物,将纯化的PCR产物克隆到Trans-T5Zero载体中,转化大肠杆菌Trans1-T1Phage Resistant ChemicallyCompetent Cell感受态细胞中,在含有氨苄的固体培养基上培养过夜,挑取阳性克隆进行继代培养。以M13F和M13R引物PCR检测,将有目的条带的单克隆送华大基因科技有限公司(广州)进行双向测序。扩cDNA全长的引物
上游引物ScFT-2 99F:5’-cgagcctagcttcttccg-3’;(SEQ ID NO.13)
下游引物ScFT-2 1058R:5’-gatacactccaccccaaatg-3’。(SEQ ID NO.14)
扩基因组DNA的引物
上游引物ScFT-2 281F:5’-cggtggcccattattgct-3’。(SEQ ID NO.15)
下游引物ScFT-2 874R:5’-cggatcgagttcacattctt-3’。(SEQ ID NO.16)
4.甘蔗开花调控蛋白基因ScFT-2同源性比对分析
将测序得到的完整编码区序列(522bp,SEQ ID No.2中245bp~766bp)用NCBIblastn在线软件进行同源性比对测定,确定其是甘蔗ScFT-2同源序列。比对结果如图10所示。
将测序得到的cDNA全长序列用ORF Finder在线软件检测其编码的氨基酸序列,将编码的氨基酸序列用NCBI blastp在线软件进行同源性比对测定,也确定其是甘蔗ScFT-2同源序列。比对结果如图9所示。
5.甘蔗开花调控蛋白基因ScFT-2表达模式分析
采集人工光周期调控诱导开花和对照(非诱导)的甘蔗品种粤糖93-159不同生育期不同组织部位样品,使用Trans ZolTM Plant试剂盒(ET121)提取总RNA(按照使用说明书进行操作)。用质量百分浓度为1.2%的琼脂糖凝胶电泳和紫外分光光度计检测RNA的浓度和质量,取1μg RNA用All-in-One First-Strand cDNA Synthesis SuperMixfor qPCR(One-Step gDNA Removal)反转录试剂盒(AT341-01)合成cDNA第一链。然后用罗氏FastStart Universal SYBR Green Master(ROX)定量试剂盒(参考说明书进行)和ABIVii7Real time PCR System(Applied Biosystems,USA)检测ScFT-2的表达量。以甘蔗甘油醛-3-磷酸脱氢酶(glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase,GAPDH)作为内参基因,内参基因引物:
q-PCR GAPDH F:5’-cacggccactggaagca-3’;(SEQ ID NO.17)
q-PCR GAPDH R:5’-tcctcagggttcctgatgcc-3’。(SEQ ID NO.18)
ScFT-2荧光定量PCR特异性引物
q-PCR ScFT-2 103F:5’-atctccaacggctgcga-3’;(SEQ ID NO.19)
q-PCR ScFT-2 202R:5’-ccatcacgagggtgtagaaggt-3’。(SEQ ID NO.20)
本发明与现有技术相比,其有益效果为:
本发明用PCR扩增结合RACE技术从甘蔗品种粤糖93-159成熟期叶片中获得ScFT-2cDNA全长和基因组DNA序列。实时荧光定量PCR分析结果表明ScFT-2的功能作用部位在甘蔗的幼叶和茎尖,该基因在甘蔗孕穗早期茎尖和幼叶中表达量上调,且表达量增加明显,说明了该基因参与了甘蔗花期调节和花穗形成发育过程,具有促进甘蔗开花的作用。本发明对甘蔗FT家族基因进行研究,有助于了解甘蔗成花机理,可为利用基因工程技术等诱导促进甘蔗开花、缩短甘蔗育种年限、提高甘蔗花粉育性(早期开花能避开年底的低温,低温不利于甘蔗花穗发育及影响花粉育性等)和杂交效率等方面提供基因资源与理论依据。
附图说明
图1为甘蔗ScFT-2基因中间片段PCR扩增结果;其中泳道0为DNA分子量Marker,泳道1为基因中间片段PCR扩增结果。
图2为甘蔗ScFT-2 5’RACE PCR扩增结果;其中泳道0为DNA分子量Marker,泳道1为第一轮PCR扩增结果,泳道2为第二轮巢式PCR扩增结果(白色箭头指向目标条带)。
图3为甘蔗ScFT-2cDNA全长PCR扩增结果;其中泳道0为DNA分子量Marker,泳道1为cDNA全长PCR扩增结果。
图4为甘蔗ScFT-2基因组DNA序列PCR扩增结果;其中泳道0为DNA分子量Marker,泳道1为基因组DNA序列PCR扩增结果。
图5为甘蔗ScFT-2基因在光周期调控诱导开花条件下组织表达特异性研究结果。其中,A示营养生长时期成熟叶、幼叶和茎尖中的表达分析;B示成花转变时期成熟叶、幼叶和茎尖中的表达分析;C示孕穗早期成熟叶、幼叶和茎尖中的表达分析;D示孕穗晚期旗叶下+2叶成熟叶和旗叶下+4叶成熟叶的表达分析;横坐标1代表成熟叶,2代表幼叶,3代表茎尖,4代表旗叶下+2叶成熟叶,5代表旗叶下+4叶成熟叶。图中a、b、c分别表示不同样品相对表达量的差异显著性分析结果,p<0.05。
图6为甘蔗ScFT-2基因在光周期调控诱导开花条件下不同生育期同一组织部位中的相对表达量分析结果。A示不同生育期成熟叶中的表达分析;B示不同生育期幼叶中的表达分析;C示不同生育期茎尖中的表达分析;横坐标1代表营养生长,2代表成花转变,3代表孕穗早期,4代表孕穗晚期。图中a、b分别表示不同样品相对表达量的差异显著性分析结果,p<0.05。
图7为甘蔗ScFT-2基因在光周期调控诱导开花条件下成花转变时期成熟叶中1天8个不同时间点的相对表达量分析结果。图中a、b、c、d、e分别表示不同样品相对表达量的差异显著性分析结果,p<0.05。
图8为甘蔗ScFT-2基因在非诱导条件下(对照)不同时期成熟叶中的相对表达量分析;其中横坐标1代表采样日期为2016年6月3日,2代表采样日期为2016年8月4日,3代表采样日期为2016年8月25日;对照与诱导开花的采样日期相一致。图中a、b分别表示不同样品相对表达量的差异显著性分析结果,p<0.05。
图9为甘蔗ScFT-2氨基酸序列同源性比对结果。
图10为甘蔗ScFT-2核苷酸序列同源性比对结果。
图11为甘蔗ScFT-2蛋白质保守区分析结果。
具体实施方式
下面结合实施例对本发明作进一步的详细描述。
本领域技术人员将会理解,下列实施例仅用于说明本发明,而不应视为限定本发明的范围。实施例中未注明具体技术或条件者,按照本领域内的文献所描述的技术或条件或者按照产品说明书进行。所用材料或仪器未注明生产厂商者,均为可以通过购买获得的常规产品。
实施例1甘蔗开花调控蛋白基因ScFT-2的同源克隆
1.总RNA的提取
以甘蔗品种粤糖93-159为材料,在成熟期(2015年10月)取梢头芯叶部位外的第一片完全展开的成熟叶(即+1叶叶片,下同),剪0.1~0.2g中部叶片,用液氮研磨成粉末,使用Trans ZolTM Plant试剂盒(ET121),按照使用说明书提取甘蔗总RNA。
2.cDNA第一链的合成
以甘蔗总RNA作为模板,利用TransOne-Step gDNA Removal and cDNASynthesis Super MIX反转录试剂盒(AE311)合成cDNA第一链。体系成份:取甘蔗总RNA 1μg与Anchored Oligo(dT)18Primer(0.5μg/μl)1μl,2×ES Reaction Mix 10μl,RT/RI Enzyme Mix 1μl,gDNA Remover 1μl,RNase-free Water补足至20μl。42℃孵育反转录30min,85℃加热5s失活RT/RI和gDNA Remover。
3.引物设计合成
从GenBank中下载近缘物种(高粱、玉米、水稻等)FT同源基因CDS序列,利用DNAman软件进行多序列比对,确定保守区,使用Primer Premier 5并以高粱FT同源基因为模板,在保守区序列设计引物,引物设计后交给上海生物工程公司合成。PCR扩增体系(共25μl):10×TransHiFi buffer Ⅱ 2.5μl,10×GC Enhancer 2.5μl,2.5Mm dNTPs 2.0μl,Primer-F(10μM)1.0μl,Primer-R(10μM)1.0μl,TransHiFi DNA Polymerase(5Units/μl)0.5μl,cDNA模板2.5μl,ddH2O 13μl。扩增程序:94℃,3min;94℃,30s,55℃,40s,72℃,40s,32个循环;72℃,10min。所设计引物PCR扩增片段大小为344bp(如图1)。
引物为:
上游引物ScFT-2 129F:5’-cgcaccttctacaccctcg-3’;(SEQ ID NO.5)
下游引物ScFT-2 472R:5’-cacattcttctcccagtt-3’。(SEQ ID NO.6)
4.连接转化、单克隆培养及测序分析
PCR扩增产物用质量百分浓度为1.2%的琼脂糖凝胶电泳检测,用QuickGel Extraction Kit回收344bp目标产物,取4μl回收纯化后的PCR产物与1μl轻轻混匀,室温反应5min,用PCR仪25℃连接8min,将连接产物于50μl Trans-T1感受态细胞中(在感受态细胞刚刚解冻时加入连接产物),轻弹混匀,冰浴25min,42℃热激40s,立即置于冰上2min,加200μl平衡至室温的LB培养基(不含氨苄),200rpm、37℃培养1h,将200μl菌液均匀加在固体培养基上,向每个培养皿倒入约10颗灭菌过的玻璃珠,盖上盖子后用手左右摇动培养皿进行涂板,用封口膜封口,室温正置30min,然后将培养皿倒扣着放入培养箱中37℃培养过夜[含氨苄的固体培养基配置方法:称3.6g LB琼脂粉末(含蛋白胨1g,酵母膏粉0.5g,氯化钠0.5g,葡萄糖0.1g,琼脂1.5g)加入100ml ddH2O,用含有透气孔的封口膜封口,121℃灭菌30min,取出溶液,当溶液温度降到50℃左右时加100μl浓度为100mg/ml的氨苄溶液。将溶液混匀后倒入放置在生物安全柜中的玻璃培养皿中,每个培养皿约倒入25ml溶液,等溶液凝固吹干后可以使用,氨苄的工作浓度为100μg/ml]。挑选白色单克隆至10μl无菌水中,涡旋混合,取2μl菌液于25μl PCR体系,用M13F和M13R引物PCR检测鉴定阳性克隆。菌液PCR体系(共25μl):M13F(10μM)0.5μl,M13R(10μM)0.5μl,2×PCR SuperMix 10μl,菌液2μl,ddH2O 12μl。PCR扩增程序:94℃,3min;94℃,30s,55℃,30s,72℃,1min,32个循环;72℃,10min。剩余的8μl菌液加1ml含氨苄的LB液体培养基,以摇床200rpmin,37℃培养4~5h[含氨苄的液体LB培养基配置方法:称2.1g LB肉汤粉末(含蛋白胨1g,酵母膏粉0.5g,氯化钠0.5g,葡萄糖0.1g)加入100ml ddH2O,用含有透气孔的封口膜封口,121℃灭菌30min,取出溶液,当溶液温度降到室温时加100μl浓度为100mg/ml的氨苄溶液。将溶液混匀后可以使用,氨苄的工作浓度为100μg/ml]。将有目的条带的单克隆送华大基因科技有限公司(广州)进行双向测序。测序结果经BLAST在线软件分析表明,获得的344bp目的片段是甘蔗ScFT-2的片段。
M13F和M13R引物
上游引物M13F:5’-gtaaaacgacggccagt-3’;(SEQ ID NO.7)
下游引物M13R:5’-caggaaacagctatgac-3’。(SEQ ID NO.8)
实施例2甘蔗开花调控蛋白基因ScFT-2 3’和5’UTR的获得
根据已测定的目标基因中间片段序列搜索甘蔗表达标签(expressed sequencetags,ESTs)数据库,结果获得了基因中间片段重叠群和完整的3’末端序列,而5’末端序列不完全,需要通过设计5’RACE的基因特异性引物(Gene Specific Primer,简称GSP),使用RACE 5’/3’Kit(Clontech Laboratories,Inc)试剂盒对目的基因5’末端进行扩增,具体操作步骤参照RACE试剂盒说明书。
以甘蔗成熟叶总RNA为模板,利用SMARTer○R RACE试剂盒中自带的反转录接头引物及试剂,反转录合成带有接头的cDNA第一链。
5’cDNA第一链合成
①配制5’反转录合成cDNA反应液A(5.5μl):5×First-Strand Buffer 4.0μl,DTT(100mM)0.5μl,dNTPs(20mM)1.0μl。
②配制5’RACE用的反转录合成cDNA反应液B(11μl):根据RNA的浓度加入1.5μl甘蔗总RNA(总量为1μg),5’CDS Primer A 1.0μl,水7.5μl;将反应液B轻轻混匀,离心数秒,72℃温育3min;42℃温育2min;14000g离心10s收集反应液至管底。往5’RACE用的反转录合成cDNA反应液B中加入SMARTer II A Oligonucleotide 1.0μl,终体积达到12μl。
③往第①步中的5’反转录合成cDNA反应液A中分别顺序加入RNase Inhibitor(40U/μl)0.5μl,SMART Scribe Reverse Transcriptase(100U)2.0μl,总体积达8.0μl,得到反应液A’。
④将第③步的5’反转录合成cDNA反应液A’加入到第②步的5’RACE用的反转录合成cDNA反应液B中,这时终体积均达到20μl。轻轻混匀,离心数秒,42℃温育90min;70℃温育10min,最后以90μl Tricine-EDTA Buffer稀释,-20℃保存。
在5’RACE中,利用巢式PCR的方法,提高PCR反应的特异性,首先利用5’RACE外侧基因特异引物和试剂盒中提供的外侧接头引物UPM Long primer进行第一次PCR反应,所得的产物稀释50倍后作为第二次PCR反应的模板,5’RACE内侧基因特异引物和试剂盒中提供的内侧接头引物UPM Short primer进行第二次巢式的PCR反应,片段大小642bp(图2泳道2)。
5’RACE第一轮PCR反应体系(25μl体系):10×HiFi buffer Ⅱ 2.5μl,2.5mM dNTPs2μl,10×GC Enhancer 2.5μl,HiFi DNA Polymerase 0.5μl,5’RACEcDNA模板1.5μl,10×UPM Long primer接头引物(10μM)2.5μl,5’RACE外侧基因特异引物(10μM)1μl,水12.5μl,总体积为25μl。第一轮PCR扩增程序:94℃,5min;94℃,40s,58℃,40s,72℃,2min,25个循环;72℃,10min;12℃,∞。PCR产物为5’RACE第一轮PCR产物(图2泳道1)。
5’RACE第二轮PCR(巢式PCR)反应体系(25μl体系):10×HiFi buffer Ⅱ2.5μl,2.5mM dNTPs 2μl,10×GC Enhancer 2.5μl,HiFi DNA Polymerase 0.5μl,5’RACE巢式PCR模板(为5’RACE第一轮PCR产物稀释50倍)1.5μl,巢式PCR接头引物10×UPM Short primer(10μM)2.5μl,5’RACE巢式PCR内侧基因特异引物(10μM)1μl,水12.5μl,总体积为25μl。第二轮PCR扩增程序:94℃,5min;94℃,40s,53℃,40s,72℃,2min,20个循环;72℃,10min;12℃,∞。
5’RACE外侧基因特异引物
RACE ScFT-2 445*R:5’-cgttgaagtagacagcggcgacca-3’;(SEQ ID NO.9)
5’RACE内侧基因特异引物
RACE ScFT-2 261R:5’-cccaaaagaaactccagtcgtcg-3’。(SEQ ID NO.10)
试剂盒中的通用引物
UPM Long primer:5’-ctaatacgactcactatagggcaagcagtggtatcaacgcagagt-3’;(SEQ ID NO.11)
UPM Short primer:5’-ctaatacgactcactatagggc-3’。(SEQ ID NO.12)
PCR扩增产物用质量百分比浓度为1.2%的琼脂糖凝胶电泳检测,从凝胶中纯化回收5’RACE 642bp目标产物,取4μl 5’RACE回收纯化后的PCR产物,与1μl轻轻混匀,室温反应5min,用PCR仪25℃连接10min,将连接产物于50μl Trans-T1感受态细胞中(在感受态细胞刚刚解冻时加入连接产物),轻弹混匀,冰浴25min,42℃热激40s,立即置于冰上2min,加200μl平衡至室温的LB培养基(不含氨苄),200rpm、37℃培养1h,将200μl菌液均匀加在固体培养基上,向每个培养皿倒入约10颗灭菌过的玻璃珠,盖上盖子后用手左右摇动培养皿进行涂板,用封口膜封口,室温正置30min,然后将培养皿倒扣着放入培养箱中37℃培养过夜[含氨苄的固体培养基配置方法:称3.6g LB琼脂粉末(含蛋白胨1g,酵母膏粉0.5g,氯化钠0.5g,葡萄糖0.1g,琼脂1.5g)加入100ml ddH2O,用含有透气孔的封口膜封口,121℃灭菌30min,取出溶液,当溶液温度降到50℃左右时加100μl浓度为100mg/ml的氨苄溶液。将溶液混匀后倒入放置在生物安全柜中的玻璃培养皿中,每个培养皿约倒入25ml溶液,等溶液凝固吹干后可以使用,氨苄的工作浓度为100μg/ml]。挑选白色单克隆至10μl无菌水中,涡旋混合,取2μl菌液于25μl PCR体系,用M13F和M13R引物PCR检测鉴定阳性克隆。菌液PCR体系(共25μl):M13F(10μM)0.5μl,M13R(10μM)0.5μl,2×PCR SuperMix 10μl,菌液2μl,ddH2O 12μl。PCR扩增程序:94℃,3min;94℃,30s,55℃,30s,72℃,1min,32个循环;72℃,10min。剩余的8μl菌液加1ml含氨苄的LB液体培养基,以摇床200rpmin,37℃培养4~5h[含氨苄的液体LB培养基配置方法:称2.1g LB肉汤粉末(含蛋白胨1g,酵母膏粉0.5g,氯化钠0.5g,葡萄糖0.1g)加入100ml ddH2O,用含有透气孔的封口膜封口,121℃灭菌30min,取出溶液,当溶液温度降到室温时加100μl浓度为100mg/ml的氨苄溶液。将溶液混匀后可以使用,氨苄的工作浓度为100μg/ml]。将有目的条带的单克隆送华大基因科技有限公司(广州)进行双向测序。利用DNA man 6.0对3’EST序列、5’RACE测序结果与保守区序列设计引物扩增所得基因中间片段进行拼接,拼接结果为SEQ ID NO.4的序列,大小1131bp。
实施例3甘蔗开花调控蛋白基因ScFT-2cDNA全长及基因组DNA的获得
根据拼接的序列设计了全长cDNA及基因组DNA引物,通过PCR扩增获得包含起始密码子(ATG)和终止密码子(TGA)963bp的cDNA产物(序列表SEQ ID No.2)和3932bp基因组DNA序列(序列表SEQ ID No.3),PCR扩增产物用质量百分比浓度为1.2%的琼脂糖凝胶电泳检测,从凝胶中纯化回收目标产物,取4μl回收纯化后的PCR产物与1μl轻轻混匀,室温反应5min,用PCR仪25℃连接30min,将连接产物于50μl Trans-T 1感受态细胞中(在感受态细胞刚刚解冻时加入连接产物),轻弹混匀,冰浴25min,42℃热激40s,立即置于冰上2min,加200μl平衡至室温的LB培养基(不含氨苄),200rpm、37℃培养1h,将200μl菌液均匀加在固体培养基上,向每个培养皿倒入约10颗灭菌过的玻璃珠,盖上盖子后用手左右摇动培养皿进行涂板,用封口膜封口,室温正置30min,然后将培养皿倒扣着放入培养箱中37℃培养过夜[含氨苄的固体培养基配置方法:称3.6g LB琼脂粉末(含蛋白胨1g,酵母膏粉0.5g,氯化钠0.5g,葡萄糖0.1g,琼脂1.5g)加入100ml ddH2O,用含有透气孔的封口膜封口,121℃灭菌30min,取出溶液,当溶液温度降到50℃左右时加100μl浓度为100mg/ml的氨苄溶液。将溶液混匀后倒入放置在生物安全柜中的玻璃培养皿中,每个培养皿约倒入25ml溶液,等溶液凝固吹干后可以使用,氨苄的工作浓度为100μg/ml]。挑选白色单克隆至10μl无菌水中,涡旋混合,取2μl菌液于25μl PCR体系,用M13F和M13R引物PCR检测鉴定阳性克隆。菌液PCR体系(共25μl):M13F(10μM)0.5μl,M13R(10μM)0.5μl,2×PCR SuperMix 10μl,菌液2μl,ddH2O 12μl。PCR扩增程序:94℃,3min;94℃,30s,55℃,30s,72℃,1min,32个循环;72℃,10min。剩余的8μl菌液加1ml含氨苄的LB液体培养基,以摇床200rpmin,37℃培养4~5h[含氨苄的液体LB培养基配置方法:称2.1g LB肉汤粉末(含蛋白胨1g,酵母膏粉0.5g,氯化钠0.5g,葡萄糖0.1g)加入100ml ddH2O,用含有透气孔的封口膜封口,121℃灭菌30min,取出溶液,当溶液温度降到室温时加100μl浓度为100mg/ml的氨苄溶液。将溶液混匀后可以使用,氨苄的工作浓度为100μg/ml]。将有目的条带的单克隆送华大基因科技有限公司(广州)进行双向测序。
扩cDNA全长的引物:
上游引物ScFT-2 99F:5’-cgagcctagcttcttccg-3’;(SEQ ID NO.13)
下游引物ScFT-2 1058R:5’-gatacactccaccccaaatg-3’。(SEQ ID NO.14)
扩基因组DNA的引物
上游引物ScFT-2 281F:5’-cggtggcccattattgct-3’。(SEQ ID NO.15)
下游引物ScFT-2 874R:5’-cggatcgagttcacattctt-3’。(SEQ ID NO.16)
ScFT-2cDNA全长PCR扩增体系(共25μl):10×TransHiFi buffer Ⅱ2.5μl,10×GC Enhancer 2.5μl,2.5Mm dNTPs 2.0μl,上游引物ScFT-2 99F(10μM)1.0μl,下游引物ScFT-2 1058R(10μM)1.0μl,TransHiFi DNA Polymerase(5Units/μl)0.5μl,cDNA模板2.5μl,ddH2O 13μl。PCR扩增程序:94℃,3min;94℃,30s,55℃,40s,72℃,40s,32个循环;72℃,10min。所设计引物PCR扩增片段大小为963bp(如图3泳道1),序列表如SEQ ID NO.2。
ScFT-2基因组DNA PCR扩增体系(共25μl):10×TransHiFi bufferⅠ2.5μl,10×GC Enhancer 2.5μl,2.5Mm dNTPs 2.0μl,上游引物ScFT-2 281F(10μM)1.0μl,下游引物ScFT-2 874R(10μM)1.0μl,TransHiFi DNA Polymerase(5Units/μl)0.5μl,DNA模板(30ng/μl)2.5μl,ddH2O 13μl。PCR扩增程序:94℃,5min;94℃,30s,58℃,30s,72℃,2min,32个循环;72℃,10min。所设计引物PCR扩增结果如图4泳道1,序列表如SEQ ID NO.3,从ATG开始到TGA结束共3932bp。
实施例4甘蔗开花调控蛋白基因ScFT-2同源性比对分析
将测序得到的完整编码区序列(522bp,SEQ ID No.2中245bp~766bp)用NCBIblastn在线软件进行同源性比对测定,确定其是甘蔗ScFT-2同源序列。比对结果如图10所示。甘蔗ScFT-2编码区序列与高粱(登录号:XM-021455232.1)相似度为97%,与玉米ZCN 14(登录号:NM-001112780.2)相似度为96%。
将获得的cDNA全长序列测序结果用ORF Finder检测其编码的氨基酸序列,将编码的氨基酸序列用NCBI blastp在线软件进行同源性比对测定,也确定其是甘蔗ScFT-2同源序列。比对结果如图9所示。甘蔗开花调控蛋白ScFT-2氨基酸序列与高粱(登录号:XP-021455232.1)相似度为97%,与玉米ZCN14(登录号:NP-001106251.1)相似度为98%。图11为甘蔗ScFT-2蛋白质保守区分析结果。
实施例5甘蔗开花调控蛋白基因ScFT-2表达模式分析
以甘蔗品种粤糖93-159为材料,设置人工光周期诱导开花和对照(非诱导)两种处理,在营养生长时期(2016年6月3日)、成花转变时期(2016年8月4日)、孕穗时期[早期2016年8月25日(穗长约10cm)和晚期2016年10月27日(穗长约80cm)],采集成熟叶、幼叶和茎尖3个不同部位样品(含3个生物学重复),使用Trans ZolTM Plant试剂盒(ET121)提取总RNA(操作步骤同实施例1所述)。
用质量百分浓度为1.2%的琼脂糖凝胶电泳和紫外分光光度计检测RNA的浓度和质量,然后用All-in-One First-Strand cDNA Synthesis SuperMix for qPCR(One-Step gDNA Removal)反转录试剂盒(AT341-01)合成cDNA第一链。取甘蔗总RNA 1μg,5×Ⅱ All-in-One SuperMix for qPCR 4μl,gDNA Removal 1μl,用RNase-freeWater补足至20μl。轻轻混匀,55℃孵育15min,85℃加热5s失活Ⅱ RT/RI和gDNA Remover。
选用罗氏FastStart Universal SYBR Green Master(ROX)定量试剂盒(参考说明书进行)和ABI Vii7Real time PCR System(Applied Biosystems,USA)检测ScFT-2的时空表达情况。以甘蔗甘油醛-3-磷酸脱氢酶(glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase,GAPDH)作为内参基因,内参基因引物:
q-PCR GAPDH F:5’-cacggccactggaagca-3’;(SEQ ID NO.17)
q-PCR GAPDH R:5’-tcctcagggttcctgatgcc-3’。(SEQ ID NO.18)
ScFT-2荧光定量PCR特异性引物
q-PCR ScFT-2 103F:5’-atctccaacggctgcga-3’;(SEQ ID NO.19)
q-PCR ScFT-2 202R:5’-ccatcacgagggtgtagaaggt-3’。(SEQ ID NO.20)
目标基因ScFT-2荧光定量PCR体系(25μl):FastStart Universal SYBR GreenMaster(ROX)12.5μl,q-PCR ScFT-2 103F(120nM)0.25μl,q-PCR ScFT-2 202R(120nM)0.25μl,ddH2O 9.5μl,cDNA 2.5μl。荧光定量PCR扩增程序:采用两步法PCR扩增,50℃,2min,95℃,10min;95℃,15s,60℃,1min,40个循环;95℃,15s,60℃,1min,95℃,15s。
内参基因GAPDH荧光定量PCR体系(25μl):FastStart Universal SYBR GreenMaster(ROX)12.5μl,q-PCR GAPDH F(220nM)0.25μl,q-PCR GAPDH R(220nM)0.25μl,ddH2O9.5μl,cDNA 2.5μl。荧光定量PCR扩增程序:采用两步法PCR扩增,50℃,2min,95℃,10min;95℃,15s,60℃,1min,40个循环;95℃,15s,60℃,1min,95℃,15s。
在人工光周期调控诱导开花条件下,ScFT-2组织特异性表达分析结果(均为表达量相对比值):营养生长时期成熟叶:幼叶:茎尖=19.942:19.030:2.088(图5-A);成花转变(花芽分化)时期成熟叶:幼叶:茎尖=6.087:10.324:0.962(图5-B);孕穗早期成熟叶:幼叶:茎尖=0.968:4.167:6.701(图5-C);孕穗晚期旗叶下+2叶成熟叶:旗叶下+4叶成熟叶=0.895:1.436(图5-D)。
在人工光周期调控诱导开花条件下,ScFT-2在同一组织部位不同时期的相对表达量比值结果为:营养生长时期成熟叶(+1叶):成花转变时期成熟叶(+1叶):孕穗早期成熟叶(+1叶)=1.933:1.702:2.398(图6-A);营养生长时期幼叶:成花转变时期幼叶:孕穗早期幼叶=1.266:1.776:6.34(图6-B);营养生长时期茎尖:成花转变时期茎尖:孕穗早期茎尖=2.403:1.651:32.668(图6-C)。
在人工光周期调控诱导开花条件下,ScFT-2在甘蔗成花转变时期成熟叶中1天8个不同时间点的相对表达量比值结果为:15:00:18:00:21:0:24:00:03:00:06:00:09:00:12:00=1.222:1.359:3.263:6.116:4.820:9.266:6.191:3.111(图7)。
小结:甘蔗ScFT-2基因在人工光周期调控诱导开花条件下,在3个不同生育期成熟叶、幼叶和茎尖中均有表达,但表达量存在差异。ScFT-2基因在营养生长时期和成花转变时期的表达量均较低,在营养生长时期不同组织部位的分布情况为成熟叶>幼叶>茎尖;在成花转变时期,ScFT-2基因表达量的分布情况为幼叶>成熟叶>茎尖;ScFT-2基因在孕穗早期幼叶和茎尖中表达量均增加,特别在茎尖中增加明显,此时ScFT-2基因在甘蔗幼叶中起平衡成花抑制物的作用,在茎尖中参与调控甘蔗花穗的形成与发育过程,不同组织部位分布情况为茎尖>幼叶>成熟叶;在孕穗晚期旗叶下+2叶成熟叶和+4叶成熟叶中表达量差异不明显。说明了本发明中甘蔗ScFT-2基因功能作用部位在甘蔗的茎尖和幼叶,参与了甘蔗花穗形成发育过程和花期调控过程。
在非人工光周期诱导(对照)样品中,ScFT-2在成熟叶和茎尖中的变化不明显,在幼叶中表达量呈下降趋势。图8-A是3个不同采样时期成熟叶中的相对表达量分析结果2016年6月3日成熟叶:2016年8月4日成熟叶:2016年8月25日成熟叶=1.672:1.942:1.129;3个不同采样时期幼叶中的相对表达量分析结果(图8-B)2016年6月3日幼叶:2016年8月4日幼叶:2016年8月25日幼叶=1.993:1.418:1.072;3个不同采样时期茎尖中的相对表达量分析结果(图8-C)2016年6月3日茎尖:2016年8月4日茎尖:2016年8月25日茎尖=1.953:1.266:1.205。
本发明核苷酸如序列表中SEQ ID NO.2所述,并且为了清楚的表达,在SEQ IDNO.1提供了对应的氨基酸序列。
通过本发明氨基酸序列获得具有生物活性的纯化蛋白,研究甘蔗开花调控蛋白的生物学功能属于本专利的保护范围。对本发明核苷酸序列进行基因工程改造及应用也属于本专利的保护范围。使用外源植物生长调节剂、光温、水分、营养、蔗糖、剪叶和嫁接等处理方法诱导或抑制ScFT-2的表达从而实现调控甘蔗和其它植物花期的技术同样属于本专利的保护范围。
以上显示和描述了本发明的基本原理、主要特征和本发明的优点。本行业的技术人员应该了解,本发明不受上述实施例的限制,上述实施例和说明书中描述的只是说明本发明的原理,在不脱离本发明精神和范围的前提下,本发明还会有各种变化和改进,这些变化和改进都落入要求保护的本发明范围内。本发明要求保护范围由所附的权利要求书及其等效物界定。
序列表
<120> 甘蔗开花调控蛋白ScFT-2及其编码基因
<160> 20
<170> SIPOSequenceListing 1.0
<210> 1
<211> 173
<212> PRT
<213> 人工序列()
<400> 1
Met Gln Arg Gly Asp Pro Leu Ala Val Gly Arg Ile Ile Gly Asp Val
1 5 10 15
Val Asp Pro Phe Val Arg Arg Val Pro Leu Arg Val Ala Tyr Ala Ala
20 25 30
Arg Glu Ile Ser Asn Gly Cys Glu Leu Arg Pro Ser Ala Ile Ala Asp
35 40 45
Gln Pro Arg Val Glu Val Gly Gly Pro Asp Met Arg Thr Phe Tyr Thr
50 55 60
Leu Val Met Val Asp Pro Asp Ala Pro Ser Pro Ser Asp Pro Asn Leu
65 70 75 80
Arg Glu Tyr Leu His Trp Leu Val Thr Asp Ile Pro Ala Thr Thr Gly
85 90 95
Val Ser Phe Gly Thr Glu Val Val Cys Tyr Glu Ser Pro Arg Pro Val
100 105 110
Leu Gly Ile His Arg Ile Val Phe Leu Leu Phe Gln Gln Leu Gly Arg
115 120 125
Gln Thr Val Tyr Ala Pro Gly Trp Arg Gln Asn Phe Ser Thr Arg Asp
130 135 140
Phe Ala Glu Leu Tyr Asn Leu Gly Leu Pro Val Ala Ala Val Tyr Phe
145 150 155 160
Asn Cys Gln Arg Glu Ser Gly Thr Gly Gly Arg Arg Met
165 170
<210> 2
<211> 963
<212> DNA
<213> 人工序列()
<400> 2
cgagcctagc ttcttccggg ttccggcgcg gcccggctct ctctataagt agcagcggca 60
agagagctcc cacctcccag tcctctcccc tgggtcgtgt gcagtggtgc gtggtgcaag 120
tgcaacgacg tgcgcgcgcc gcgagctggt ggggtgagga ggtgcggtcg tcgtcgcctc 180
gtcggtggcc cattattgct gggctggccg tgatcgaccg gcacgcagca ccgcagcagc 240
ggccatgcag cgcggggacc cgctggctgt ggggcgcatc atcggcgacg tggtggaccc 300
cttcgtgcgc cgggtgccgc tccgcgtcgc ctacgccgcg cgcgagatct ccaacggctg 360
cgagctcagg ccctccgcca tcgccgacca gccgcgcgtc gaggtcggcg gacccgacat 420
gcgcaccttc tacaccctcg tgatggtgga tcctgatgcg ccaagcccca gcgatcccaa 480
cctcagggag tacctgcact ggctggtcac tgacattccg gcgacgactg gagtttcttt 540
tgggactgag gttgtgtgct acgagagccc acggccggtg ctgggaatcc acaggatagt 600
gtttctgctc ttccaacagc tcggccggca gacggtctac gccccagggt ggcggcagaa 660
cttcagcacc cgtgacttcg ccgagctcta caacctcggc ttgccggtcg ccgctgtcta 720
cttcaactgc caaagggagt ccggaactgg tgggagaaga atgtgaactc gatccgggtg 780
aaataagacg atgggtacgt agttgggtat attgtatata cgtgtgacaa catggagaaa 840
ttttttaaaa aaaactgcaa gatgtctgct taaaaaaata actccaaaat gaactatata 900
ttgtctaatt agttcagtta gtccatatgc tagcctttgg ttacatttgg ggtggagtgt 960
atc 963
<210> 3
<211> 3932
<212> DNA
<213> 人工序列()
<400> 3
atgcagcgcg gggacccgct ggctgtgggg cgcatcatcg gcgacgtggt ggaccccttc 60
gtgcgccggg tgccgctccg cgtcgcctac gccgcgcgcg agatctccaa cggctgcgag 120
ctcaggccct ccgccatcgc cgaccagccg cgcgtcgagg tcggcggacc cgacatgcgc 180
accttctaca ccctcgtacg tactatacta ctgtagctca ttcgcagtcg tcacagcatc 240
gaggatctct tgtctactgc tgctagctgc caccacctag ctagtagcta cacaaagcag 300
aagcaggtag ctaggaatct aggataattt cattcattca cacattcact gcatctgcta 360
catgcacatt attccaagcc agcaattagc tagtagctag cctgctgctt aaccgcatgc 420
ctgatctgat tctgaccgat ctgcaggtga tggtggatcc tgatgcgcca agccccagcg 480
atcccaacct cagggagtac ctgcactggt aatctgctac ctactgcttc gttcgttcgt 540
gttcgttcgt gaatcttttg tatttgtacg cacagcgtct tgcatatggt aaccagccgg 600
taaggtcacc atcacgctca cgctcacgcc atgtgataaa cttgctgtcc acccttcccg 660
tctctttctt ggaaagacat catacaacac acgtaactgt ccacattcca cctcgtacgg 720
tagtggcgtg gtgctgtgta ctgtataata aattaataaa ctaatcccag agtatccagc 780
ctcccgtccc agtaccagtt acatatatac tgtagatcaa atctatgtag acaagtatgc 840
atttcagtat ctcatcacag tatttttgac ttttgaggga agggatgcac aagcacacac 900
aacggttttg ttcattactt agatcattta tttaggcacc atcatataca gcttacaagt 960
aatcaaatcc tcacataaat atctaaaatc acagtttttc atgtgcaatc ctgcaagtac 1020
gactaacatc cttgttatcc tacctgcaca agaacagtac tttatttcaa gataatgcgt 1080
ggttagttct gacagtatgt gtatgttata ctacctcaag tgaaattttg acaatgaagt 1140
ggaataattc aactagtctt ggtggtatcc ttacacctgc aagaaaacag caatttcctg 1200
acaactaaaa atggtgcaca tatatgtctt gaattttcaa cgactagcta tagcagggta 1260
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tcagcattct cccacattat tatacaagga actaacccct tatgtagtga ctctcatcaa 1380
ccattgcctg accctttctg agtgtctggt tcaccaagga gtcgatctta atctaccagt 1440
taggcaataa ctaataaaga taccatcctc taaacttggg tgacaatact tggagatcta 1500
cttgctaaca catgtagaac cacacaccta tctaccaaaa cacacatgaa atgagaatgt 1560
gttgcataat gtcctcttct tgatcacata agggcatgtt ctaggtgtgg aagccctctc 1620
cacataacta ggtggttctt tgtctatcta ttgtaggtag ccaaccacaa aaagaattga 1680
cactttaaag gggcccaggt cttatggatt tgcttccaaa atgcaaagga aactaaaaca 1740
acaaagaaga aggcctaatg agctaatttt gtgaagtatt aataactaga agatgacaac 1800
atcagttgat catcccaagt ccttgacaat ttagcttgga aatcactcta ggtatagaag 1860
gtccctaatg tcaagatatt tggacaaagc accaccaaaa gagcctttgt atgtcctaga 1920
gccaactaag acctcttaca gtgtgcactt gttgtcatga tacttcagta ccaagcaaga 1980
ctagagccca atagaggtga gaaatccccc tcccctaaat tgatggccaa tgcttcatga 2040
ctcctaccta ctttaacaag ggctgctaac tgaatatccc aatgtacata tcaagtagaa 2100
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ctaggccaaa ttcatgtcac tgtagctcag tcactgttca cgtgcgttgc tatagcgtcg 3360
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caaaattaca ttgatcttct gttgcaggct ggtcactgac attccggcga cgactggagt 3600
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<210> 4
<211> 1131
<212> DNA
<213> 人工序列()
<400> 4
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gatctccaac ggctgcgagc tcaggccctc cgccatcgcc gaccagccgc gcgtcgaggt 480
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<212> DNA
<213> 人工序列()
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ccatcacgag ggtgtagaag gt 22

Claims (9)

1.甘蔗开花调控蛋白ScFT-2,其特征在于,所述的甘蔗开花调控蛋白ScFT-2为由SEQID NO.1所示氨基酸序列组成。
2.编码权利要求1所述甘蔗开花调控蛋白ScFT-2的核苷酸序列。
3.根据权利要求2所述的核苷酸序列,其特征在于,所述核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示。
4.根据权利要求1所述的甘蔗开花调控蛋白ScFT-2,其特征在于,其cDNA为如SEQ IDNO.2所示的核苷酸序列。
5.根据权利要求1所述的甘蔗开花调控蛋白ScFT-2,其特征在于,其开放读码框如SEQID NO.2中第245~766位所示。
6.权利要求1所述的甘蔗开花调控蛋白ScFT-2在调控植物花期中的应用。
7.根据权利要求6所述的甘蔗开花调控蛋白ScFT-2在调控植物花期中的应用,其特征在于,所述的植物为甘蔗。
8.权利要求1所述的甘蔗开花调控蛋白ScFT-2在缩短植物育种年限中的应用。
9.根据权利要求8所述的甘蔗开花调控蛋白ScFT-2在缩短植物育种年限中的应用,其特征在于,所述的植物为甘蔗。
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